PL188878B1 - Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych - Google Patents

Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych

Info

Publication number
PL188878B1
PL188878B1 PL96318545A PL31854596A PL188878B1 PL 188878 B1 PL188878 B1 PL 188878B1 PL 96318545 A PL96318545 A PL 96318545A PL 31854596 A PL31854596 A PL 31854596A PL 188878 B1 PL188878 B1 PL 188878B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
icam
leu
seq
ala
gly
Prior art date
Application number
PL96318545A
Other languages
English (en)
Other versions
PL318545A1 (en
Inventor
Patrick D. Kilgannon
Michael W. Gallatin
Original Assignee
Icos Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Icos Corp filed Critical Icos Corp
Publication of PL318545A1 publication Critical patent/PL318545A1/xx
Publication of PL188878B1 publication Critical patent/PL188878B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70525ICAM molecules, e.g. CD50, CD54, CD102
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2821Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against ICAM molecules, e.g. CD50, CD54, CD102
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/8509Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • G01N33/6896Neurological disorders, e.g. Alzheimer's disease
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2207/00Modified animals
    • A01K2207/15Humanized animals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/05Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/01Animal expressing industrially exogenous proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/55Fab or Fab'
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/30Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2799/00Uses of viruses
    • C12N2799/02Uses of viruses as vector
    • C12N2799/021Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
    • C12N2799/026Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid where the vector is derived from a baculovirus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Semiconductor Memories (AREA)
  • Treatment And Processing Of Natural Fur Or Leather (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Glass Compositions (AREA)

Abstract

1. Sposób badania przesiewowego pod katem zmian neuropatologicznych, znamienny tym, ze obejmuje etapy: a) pozyskania próbki plynu od pierwszej osoby; b) doprowadzenia do kontaktu próbki i przeciwciala dajacego specyficzna reakcje immunologiczna z ICAM-4; c) oznaczenia ilosciowego wiazania ICAM-4/przeciwcialo w próbce; oraz d) porównania wiazania ICAM-4/przeciwcialo u tej osoby z inna osoba, o której wiadomo, ze nie ma zmian neuropatologicznych; przy czym ICAM-4 jest kodowany przez polinukleotyd wybrany z grupy skladajacej sie z polinukleotydu przedstawionego w SEK NR ID: 27 i polinukleotydu kodujacego ICAM-4, który hybryduzuje z polinukleotydom z SEK NR ID: 27. PL PL PL

Description

Przedmiotem wynalazku jest sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych. W ogólności wynalazek odnosi się do komórkowych cząsteczek adhezyjnych i metod klonowania oraz ekspresji DNA kodującego nieznany dotychczas polipeptyd określany jako „ICAM-4”, wykazujący strukturalne podobieństwo do innych międzykomórkowych cząsteczek adhezyjnych ICAM-1, ICAM-2 i ICAM-R.
Zgłoszenie jest kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/481130 zgłoszonego 1 czerwca 1995, będącego kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/245295 zgłoszonego 18 maja 1994, które z kolei jest kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/102852 zgłoszonego 5 sierpnia 1993 jako kontynuacja w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/009266 zgłoszonego 22 stycznia 1993, będącego kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 07/894061 zgłoszonego 5 czerwca 1992, będącego w dalszym ciągu kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 07/889724 zgłoszonego 26 maja 1992, jako kontynuacja w części oczekującego na uznanie zgłoszenia patentowego USA nr 07/827689 zgłoszonego 27 stycznia 1992.
Podstawa wynalazku
Badania naukowe ostatniego dziesięciolecia umożliwiły wyjaśnienie różnych, zachodzących na poziomie molekularnym, zdarzeń stanowiących podłoże wzajemnego oddziaływania na siebie komórek ciała, w szczególności tych, jakie warunkują ruchliwość i aktywację komórek układu odpornościowego człowieka, a w ostatnim czasie, także tych, które biorą udział w rozwoju i prawidłowym, fizjologicznym funkcjonowaniu komórek układu nerwowego. Ogólnych informacji dotyczących komórek układu odpornościowego szukaj w publikacji Springera, Nature, 346: 425-434 (1990), natomiast odnoszących się do komórek układu nerwowego - w artykułach autorstwa Yoshihary i wsp, Neurosci. Res. 10: 83-105 (1991) oraz u Sondereggera i Rathjena, J Cell. Biol. 119: 1387-1394 (1992). Białka powierzchniowe komórek, a w szczególności grupa tak zwanych komórkowych cząsteczek adhezyjnych [Cellular
188 878
Adhesion Molecules - „ CAM” stopniowo stawały się przedmiotem zainteresowania nauk farmaceutycznych umożliwiając postęp wiedzy. Celem badań była ingerencja w procesy związane z przenikaniem leukocytów przez ścianę naczyń krwionośnych i ich migracji do ogniska zapalnego oraz te, jakie odpowiadają za ukierunkowane przemieszczanie leukocytów do różnych tkanek docelowych. Podobnie, zainteresowanie naukowców skupia się także na procesach prowadzących do różnicowania się neuronów i tworzenia kompleksowej sieci neuronalnej. Wyizolowanie oraz charakterystyka komórkowych cząsteczek adhezyjnych, sklonowanie i ekspresja sekwencji DNA kodujących te cząsteczki, a także wprowadzenie i stosowanie ich jako środków służących celom diagnostyki i terapii procesów zapalnych oraz określających rozwój i funkcjonowanie układu nerwowego legły u podstaw wielu amerykańskich oraz innych niż amerykańskie patentów. Informacji szukaj w: Edwards, Current Opinion in Therapeutic Patents, 1(11): 1617-1630 (1991) oraz w szczególności w opublikowanych tam literaturowych odnośnikach cytowanych w części zatytułowanej „Odnośniki do publikacji patentowych”.
Fundamentalne znaczenie dla założeń obecnego wynalazku miała wcześniejsza identyfikacja oraz określenie struktury niektórych cząstek pośredniczących w procesach adhezji komórkowej, takich jak „leukointegryny”: LFA-1, MAC-1 i gp150.95 (zgodnie z nomenklaturą WHO określane odpowiednio jako CD18/CD11a, CD18/'CD11b oraz CD18/CD11c), tworzące podrodzinę heterodimerycznych białek powierzchniowych (tzw. „integryn”) komórki obecnych na powierzchni limfocytów B, limfocytów T, monocytów i granulocytów. Danych tych szukaj w tabeli 1 strona 429, w publikacji Springera cytowanej powyżej. Interesującymi są także inne jednołańcuchowe cząsteczki adhezyjne (CAM), biorące udział w aktywacji leukocytów, ich przyleganiu, przemieszczaniu oraz podobnych im zjawiskach nierozerwalnie związanych z procesem zapalnym. Dla przykładu, jak się obecnie uważa, zanim dojdzie do diapedezy (przenikanie leukocytów przez śródbłonek naczyń krwionośnych), jaki to proces ma miejsce w obrębie ogniska zapalnego, muszą najpierw ulec aktywacji integryny, których obecność obserwuje się konstytutywnie na powierzchni leukocytów. Aktywacja ta na drodze silnego wiązania receptora z jego ligandem powoduje w konsekwencji interakcję pomiędzy integrynami (np. LFA-1) oraz jedną lub obiema z dwóch różnych międzykomórkowych cząsteczek adhezyjnych (ICAM) określonych jako ICAM-1 i ICAM-2, których ekspresję można stwierdzić na powierzchni komórek śródbłonka naczyniowego oraz wielu leukocytów.
Podobnie jak i inne, scharakteryzowane do dzisiaj CAM (np. naczyniowa cząsteczka adhezyjna - [VCAM-1] opisana w publikacji PCT WO nr 90/13300 z dnia 15 listopada 1990 r; oraz płytkowo-środbłonkowa komórkowa cząsteczka adhezyjna [PECAM-1] opisana przez Newmana i wsp., Science, 247: 1219-1222 (1990) oraz w zgłoszeniu patentowym PCT WO 91/10683 opublikowanym 25 lipca 1991), ICAM-1 oraz ICAM-2 wykazują strukturalnie homologię z innymi cząsteczkami będącymi pochodnymi superrodziny genu immunoglobulinowego, z tym, że część pozakomórkowa każdej z ICAM składa się z serii domen posiadających podobny motyw na końcu karboksylowym. Typowa domena przypominająca immunoglobulinę tworzy pętlę zazwyczaj połączoną wiązaniem dwusiarczkowym występującym pomiędzy dwoma grupami cysteiny położonymi na końcach tej pętli. ICAM-1 zawiera pięć domen immunoglobulinopodobnych; ICAM-2, różniąca się głównie rozmieszczeniem w obrębie komórki, zawiera dwie takie domeny; PECAM-1 posiada sześć domen; VCAM obejmuje sześć lub siedem domen, zależnie od wariantów wiązania pętli, i tak dalej. Co więcej, wszystkie CAM charakteryzują się występującym typowo w obrębie cząsteczki śródbłonowym regionem hydrofobowym, jak się uważa, koniecznym do zorientowania przestrzennego cząsteczki na powierzchni komórki oraz regionem cytoplazmatycznym na końcu karboksylowym. Graficzny model CAM można przedstawić w postaci cząsteczki zakotwiczonej w błonie poprzez region śródbłonowy z ogonkiem cytoplazmatycznym, wystającym w kierunku komórkowej cytoplazmy oraz jedną lub większą ilością pętli immunoglobulinopodobnych wystających ponad powierzchnię komórki.
Liczne komórki neuronalne wyrażają immunoglobulino podobne receptory powierzchniowe wykazujące podobieństwo do cząsteczek ICAM, patrz np. publikacja Yoshihara i wsp., cytowana powyżej. Poza domenami posiadającymi struktury immunoglobulinopodobne, wiele cząsteczek adhezyjnych występujących w obrębie układu nerwowego posiada również w swo4
188 878 ich domenach pozakomórkowych powtarzające się tandemowo sekwencje przypominające fibronektynę.
Można przewidzieć, że ze względu na specyfikę działania międzykomórkowe cząsteczki adhezyjne zostaną wykorzystane w celach leczniczych. Przesłanką dla jednego z zastosowań terapeutycznych może być zdolność wiązania się ICAM-1 z ludzkimi rhinowirusami. Na przykład Europejskie zgłoszenie patentowe nr 468257 A zgłoszone 29 stycznia 1992 opisuje wprowadzenie multimerycznych konfiguracji oraz postaci ICAM-1 (w tym postaci o pełnej długości jak i postaci okrojonych) w celu zwiększenia aktywności wiążącej kompleksu receptor/ligand, w szczególny sposób zwiększającego zdolność wiązania wirusów, antygenów limfocyto-pochodnych oraz takich patogenów jak zarodziec zimnicy (Plasmodium falciparum).
W podobny sposób można zakładać innego typu immunologicznie wywodzących się z międzykomórkowych cząsteczek adhezyjnych. Przykład takiego zastosowania podaje publikacja WO 91/16928 z dnia 14 listopada 1991, w której opisano wykorzystanie humanizowanych chimerycznych przeciwciał o swoistości skierowanej przeciw ICAM-1 w leczeniu specyficznych i niespecyficznych stanów zapalnych, zakażeń wirusowych oraz astmy oskrzelowej. Zastosowanie przeciwciał anty-ICAM-1 oraz fragmentów cząsteczki ICAM-1 w leczeniu wstrząsu endotoksycznego opisano także w publikacji WO 92/04034 z dnia 19 marca 1992 r. Opis metody leczenia polegającej na zahamowaniu odczynu zapalnego zależnego od ICAM-1 poprzez wprowadzenie przeciwciał antyidiotypowych lub ich fragmentów skierowanych przeciwko ICAM-1 można znaleźć w publikacji WO 92/06119 z dnia 16 kwietnia 1992 r.
Pomimo fundamentalnych odkryć rzucających światło na mechanizmy adhezji komórkowej, jakich dokonano poprzez' identyfikację i charakterystykę białek adhezji międzykomórkowej, takich jak ICAM-1, oraz integryn wzajemnego oddziaływania limfocytów·’, takich jak LFA-1, obraz tych zjawisk nie jest jeszcze pełny. Ogólnie przyjmuje się, iż w procesach zapalnych oraz w mechanizmie ukierunkowanego przemieszczania limfocytów w organizmie uczestniczy wiele innych białek. Dla przykładu, zgłoszenia patentowe USA o numerach seryjnych 07/827 689, 07/889 724, 07/894 061 i 08/009 266 i odpowiadające im opublikowane zgłoszenie PCT WO 93/14776 (z dnia 5 sierpnia 1993) ujawniają metodę klonowania i ekspresji białek pochodnych od cząsteczek ICAM, określanych jako ICAM-R. Zgłoszenia te zostały zacytowane tu jako literatura, a sekwencje DNA oraz sekwencja aminokwasów ICAM-R zostały podane poniżej jako SEK ID nr 4. Ekspresję tego nowego ligandu stwierdzono w ludzkich limfocytach, monocytach oraz granulocytach. '
Z punktu widzenia niniejszego zgłoszenia, najważniejszą jest jeszcze inna cząsteczka powierzchniowa ICAM-podobna wykazująca, w odróżnieniu od pozostałych znanych cząsteczek ICAM, swoistość tkankową. Mori i wsp. [Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 84: 3921-3925 (1987)] doniósł o identyfikacji specyficznego dla kresomózgowia antygenu jaki stwierdził w mózgu królika, swoiście reagującego z przeciwciałem monoklonalnym 271A6. Ten antygen powierzchniowy został nazwany telenkefaliną. Imamura i wsp. [Neurosci. Letts 119: 118-121 (1990)] dla oceny lokalizacji występowania telenkefaliny stosowali przeciwciała poliklonalne. Wynikiem ich badań było stwierdzenie, że ekspresja telenkefaliny w korze wzrokowej kotów wykazuje zmienność zależną od warstwy tkanki oraz, że ekspresja telenkefaliny zmienia się w zależności od stadium rozwojowego. Jednocześnie Oka i wsp. [Neuroscience 35: 93-103 (1990)] przedstawili wyniki badań zmierzających do izolacji telenkefaliny przy użyciu przeciwciała monoklonąlnego 271A6. Wyizolowali oni cząsteczkę powierzchniową o masie cząsteczkowej około 500 kD. Cząsteczka ta składała z czterech podjednostek, każda o masie natywnej molekuły 130 kD, która to pod wpływem N-glikanazy ulegała redukcji do 100 kD. Yoshihiro i wsp. [Neuroscience, Research Supplement 18, str. S83 (1994)] na 17 dorocznym spotkaniu Japońskiego Towarzystwa Nauk Neurologicznych (Japan Neuroscience Society) jakie odbyło się w Nagoi, Japonia, w dniach 7-9 grudnia 1993 r. oraz na 23 dorocznym zjeździe Naukowego Towarzystwa Neurologicznego (Society for Neuroscience), jaki odbył się w Waszyngtonie 9 listopada 1993 r. [Society for Neuroscience Abstracts 19 (1-3) str. 646 (1993)] przedstawili cDNA oraz sekwencję aminokwasową króliczej telenkefaliny. Wydedukowana sekwencja aminokwasowa sugerowała, iż telenkefalina o masie 130 kD stanowi integralne białko błonowe zawierające dziewięć pozakomórkowych domen immunoglobulinopodobnych. Osiem z nich, położone dystalnie wykazywało homologię z domenami immunoglo188 878 bulino-podobnymi charakteryzującymi inne cząsteczki ICAM. Ta sama informacja została następnie opublikowana przez Yoshiharę i wsp. w Neuron 12: 543-553 (1994).
Z naukowego punktu widzenia istnieje stała konieczność prowadzenia badań zmierzających do wykrycia kolejnych białek uczestniczących w procesach interakcji międzykomórkowych. Nieustannie potrzeba też nowych informacji dotyczących identyfikacji tych białek oraz ich charakteryzowania w kontekście struktury aminokwasowej. Co więcej, potencjalne możliwości ich wykorzystania dla nowych metod leczenia oraz dla potrzeb diagnostyki powodują konieczność określenia sekwencji DNA kodującego strukturę tych cząsteczek. Takie brzemienne w skutki informacje mogą między innymi spowodować produkcję na skalę masową białek, pozwolić na identyfikację komórek naturalnie je produkujących, a także umożliwić wytwarzanie przeciwciał lub innych, nowatorskich białek wiążących, swoiście reagujących i/lub hamujących reakcje połączenia ligandu z receptorem w jakich cząsteczki te są zaangażowane.
Krótkie streszczenie wynalazku
Przedmiotem wynalazku jest sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych, obejmujący etapy:
a) pozyskania próbki płynu od pierwszej osoby;
b) doprowadzenia do kontaktu próbki i przeciwciała dającego specyficzną reakcję immunologiczną z ICAM-4;
c) oznaczania ilościowego wiązania ICAM-4/przeciwciało w próbce; oraz
d) porównanie wiązania ICAM-4/przeciwciało u tej osoby z inną osobą, o której wiadomo, że nie ma zmian neuropatologicznych, przy czym ICAM-4 jest kodowany przez polinukleotyd wybrany z grupy składającej się z polinukleotydu przedstawionego w SEK NR ID: 27 i polinukleotydu kodującego ICAM-4, który hybryduzuje z polinukleotydem z SEK NR ID: 27.
Korzystnie w sposobie według wynalazku próbką płynu jest surowica lub płyn mózgowo-rdzeniowy.
Ponadto korzystnie wiązanie ICAM-4/przeciwciało jest oznaczane ilościowo poprzez test radioimmunologiczny (RIA) lub poprzez enzymatyczny test immunosorpcyjny (ELISA).
Korzystnie zmianą neuropatologinczną pod kątem której jest przeprowadzane badanie jest udar lub epilepsja.
Cząsteczka ICAM-4 może zostać wyizolowana z naturalnych komórek, ale ICAM-4 razem z jej wariantami jest wytwarzana metodami rekombinacji genetycznej przez komórki gospodarza. Korzystną sekwencję aminokwasową polipeptydu ICAM-4 przedstawia sekwencja SEK NR ID: 2. Produkty rekombinacji genetycznej otrzymuje się w postaci polipeptydów częściowo lub całkowicie glikozylowanych, częściowo lub całkowicie deglikozylowanych lub nieglikozylowanych, w zależności od rodzaju komórek gospodarza użytych do produkcji białka ICAM-4 i/lub procedur poizolacyjnych. Warianty cząsteczki ICAM-4 występują w postaci rozpuszczalnej lub nierozpuszczalnej w wodzie, monomerycznej, multimerycznej lub cyklicznych fragmentów ICAM-4 zawierających wszystkie lub tylko część regionów domen, i wykazują właściwości biologiczne lub immunologiczne ICAM-4, takie jak: zdolność wiązania z partnerem wiązania ICAM-4 i/lub zdolność hamowania wiązania ICAM-4 z naturalnym jej partnerem. Warianty ICAM-4 mogą obejmować także analogi polipeptydowe, w których jeden lub większa liczba określonych aminokwasów została usunięta lub zastąpiona: (1) nie powodując utraty, a korzystnie wzmacniając jedną lub więcej funkcji biologicznych lub właściwości immunologicznych charakterystczych dla ICAM-4; lub (2) powodując niezdolność do konkretnego wiązania ligand/receptor. Analogi ICAM-4 mogą również powstawać na skutek wprowadzenia do cząsteczki dodatkowych reszt aminokwasowych (np. lizyny lub cysteiny), co z kolei ułatwia tworzenie struktur multimerycznych.
Przeciwciała wykorzystywne w sposobie według wynalazku (np. przeciwciała monoklonalne i poliklonalne, fragmenty przeciwciał, przeciwciała jednołańcuchowe, przeciwciała chimeryczne, przeciwciała z przeszczepionym CDR itp.) są swoiste (tzn. nie reagują ani z ICAM-1, ani z ICAM-2 i ICAM-R, do których ICAM-4 jest strukturalnie podobna) wobec ICAM-4 lub wariantów ICAM-4. Przeciwciała takie mogą być wydzielane przez linie hybrydoma, takie jak, na przykład, linie: 127A, 127H, 1731 oraz 179H. Przeciwciała mogą być wytwarzane zarówno z zastosowaniem naturalnych lub rekombinowanych cząsteczek ICAM-4
188 878 jak i wariantów ICAM-4 lub komórek wyrażających je na swojej powierzchni. Będące immunogenami, indukujące odpowiedź immunologiczną, komórki wyrażające takie cząsteczki mogą być komórkami organizmów prokariotycznych lub eukariotycznych, które są stabilnie transformowane sekwencjami DNA kodującymi ICAM-4, w sposób pozwalający na ekspresję w nich potrzebnych polipeptydów.
W kompozycjach do immunizacji oraz do oczyszczania ICAM-4, a także do identyfikacji komórek prezentujących na swojej powierzchni ICAM-4 przydatne są również inne białka wiążące. Można je także wykorzystywać w celach modulacji (tzn. blokowania, hamowania lub stymulacji) biologicznych aktywności wiązania ligand/receptor, w których bierze udział ICAM-4, w szczególności funkcji efektorowych ICAM-4, które odgrywają rolę w swoistej i nieswoistej odpowiedzi układu odpornościowego. Przeciwciała antyidiotypowe swoiste wobec przeciwciał skierowanych przeciwko ICAM-4 mogą być stosowane do modulacji odpowiedzi immunologicznej. Testy na wykrywanie oraz ilościową ocenę obecności ICAM-4 na powierzchni komórek oraz w płynach ustrojowych, takich jak surowica czy płyn mózgowordzeniowy, mogą obejmować np. pojedyncze lub wielokrotne przeciwciała wykorzystywane w systemach badania typu „sandwicz” („kanapkowego”). W wykrywaniu ICAM-4 w płynach ustrojowych przeciwciała są użyteczne do oceny występowania patologii w obrębie układu nerwowego, które mogą odpowiadać zwiększonemu poziomowi ICAM-4 w krwiobiegu. Takie stany patologiczne obejmują, ale nie wyłącznie, niedokrwienie mózgu (np. udar) spowodowane różnymi chorobami, w tym np. zatorowość, zakrzepicę itp.
Znajomość sekwencji cDNA dla ICAM-4 umożliwia izolację sekwencji genomowego DNA kodującego ICAM-4 poprzez hybrydyzację DNA/DNA oraz umożliwia poznanie sekwencji kontrolujących ekspresję ICAM-4, takich jak promotory, operatory itp. Procedury hybrydyzacji DNA/DNA prowadzone przy użyciu sekwencji DNA ICAM-4 i w ostrych warunkach hybrydyzacji, pozwalają na izolację wielu DNA kodujących alleliczne warianty ICAM-4, inne strukturalnie pokrewne białka posiadające jedną lub więcej biologicznych i/lub immunologicznych właściwości ICAM-4 oraz białek homologicznych z ICAM-4 pochodzących z innych gatunków. DNA jest także przydatny w teście hybrydyzacji DNA/RNA służącym ocenie zdolności komórek do syntezy ICAM-4. Także uzyskane polinukleotydy antysensowe posiadają znaczenie w regulacji ekspresji ICAM-4 przez komórki, w których normalnie zachodzi taka ekspresja.
Jak to można wykazać w innej serii przykładów, znajomość sekwencji DNA oraz sekwencji aminokwasowej ICAM-4 umożliwia wytwarzanie metodami rekombinacji DNA wariantów ICAM-4 takich jak białka hybrydowe (czasami określane jako „immuno-adhezyny”) charakteryzujące się obecnością sekwencji białkowych ICAM-4 oraz ciężkich łańcuchów regionu stałego lub/i regionu zawiasowego immunoglobulin, patrz: Capon i wsp., Nature 337: 525-531 (1989); Ashkenazi i wsp., P.N.A.S. (USA) 88: 10535-10539 (1991); oraz PCT WO 89/02922 opublikowany 6 kwietnia 1989 r. Warianty białek fuzyjnych ICAM-4 mogą także zawierać, np. wybrane domeny zewnątrzkomorkowe ICAM-4 oraz części innych komórkowych cząstek adhezyjnych.
Przeciwciała antyidiotypowe mogą reprezentować nową klasę biologicznie aktywnych ekwiwalentów ICAM-4. Testy wykonywane in vitro do identyfikacji przeciwciał lub innych związków modulujących aktywność ICAM-4 mogą obejmować, np. unieruchamianie ICAM-4 lub naturalnego ligandu, z którym wiąże się ICAM-4, umożliwiające wykrywanie znakowania nie unieruchomionego partnera wiązania, inkubowanie razem partnerów wiązania i określanie wpływu badanego związku na ilość znakowanego wiązania, przy czym zmniejszenie znakowanego wiązania w obecności badanego związku w porównaniu z ilością znakowanego wiązania w nieobecności badanego związku, wskazuje, że badany czynnik jest inhibitorem wiązania ICAM-4.
Szczegółowy opis wynalazku
Ujawnienia w macierzystym zgłoszeniu patentowym USA nr 08/102852, zgłoszonym 5 sierpnia 1993 są szczegółowo włączone przez odniesienie. Przykłady z tego zgłoszenia dotyczą między innymi: projektowania i konstruowania sond oligonukleotydowych do powielania metodą PCR DNA związanych z ICAM, zastosowania sond do powielania ludzkiego genomowego fragmentu homologicznego, ale różniącego się od DNA kodującego ICAM-1
188 878 i ICAM-2, przeszukiwania bibliotek cDNA genomowym fragmentem celem wyizolowania dodatkowych sekwencji kodujących ICAM, przeszukiwania bibliotek cDNA celem wyizolowania pełnej sekwencji ludzkiego cDNA kodującego ICAM-R, charakteryzowania informacji o DNA i sekwencji aminokwasowej pod kątem ICAM-R, a w szczególności ICAM-1 i ICAM-2, wytwarzania ssaczych komórek gospodarza wyrażających ICAM-R, mierzenia udziału ICAM-R w procesie adhezji, obejmującym szlaki zależne od Cd 18 i niezależne od CDI 8, hamowania adhezji do ICAM-R przez polipeptydy wywodzące się od ICAM-R, ekspresji odmian ICAM-R, wytwarzania i charakteryzowania przeciwciał przeciw ICAM-R i ich fragmentów, mapowania epitopów rozpoznawanych przez przeciwciała monoklonalne przeciw ICAM-R, pomiaru dystrybucji i biochemicznego charakteryzowania ICAM-R i kodującego go RNA, mierzenia ICAM-R przy adhezji komórek danego typu i aktywacji/namnażaniu komórek opornościowych, charakteryzowania przeciwciał monoklonalnych dla ICAM-R oraz pomiaru różnicowej fosforylacji i powiązania cytoplazmatycznej domeny ICAM-R z cytoszkieletem. Ujawniono również identyfikację DNA kodującego ICAM ze szczura, który wówczas okazał się być szczurzym homologiem ludzkiego ICAM-R oraz zastosowanie tego DNA do konstruowania i wyrażania DNA kodujących fuzje białkowe z transferazą S-glutationu. Szczegółowy opis w jaki sposób taki DNA szczura był zidentyfikowany można znaleźć w macierzystym zgłoszeniu (USA Nr 08/102 852) w przykładzie 6 i jest tu zaprezentowany jako przykład 1. Po zidentyfikowaniu dalszej sekwencji kodującej ICAM, okazało się że DNA dla ICAM ze szczura nie koduje homologu szczurzego ludzkiego ICAM-R, ale faktycznie koduje nowy polipeptyd ICAM, nazwany tu ICAM-4. W celu pokazania zdarzeń prowadzących do identyfikacji ICAM-4, przedstawiono chronologię, po której następuje szczegółowy opis wynalazku.
Pierwsza zidentyfikowana genomowa sekwencja ICAM-4 ze szczura kodowała region homologiczny do domeny 2 (tutaj SEK NR ID: 3, a SEK NR ID: 23 w Patencie USA Nr 08/102 852) ludzkiego ICAM-R (tutaj SEK NR ID: 4). Zidentyfikowano również drugi, zachodzący genomowy DNA (tutaj SEK NR ID: 5, a SEK NR ID: 26 w Patencie USA Nr 08/102 852), który kodował zarówno region domeny 2 z SEK NR ID: 3, jak i sekwencje dla ICAM-1. Stosując SEK NR ID: 3 jako sondę zidentyfikowano cDNA ze śledziony szczura (tutaj SEK NR ID: 6, a SEK NR ID: 25 w Patencie USA Nr 08/102 852), który kodował domeny od 2 do 5, jak również domenę piątą, wcześniej nie obserwowaną jako domena ICAM. W tym czasie te nowo zidentyfikowane DNA szczura okazały się kodować homolog ludzkiego ICAM-4 szczura, jakkolwiek dopasowanie regionów 3' tych DNA do innych ICAM okazało się trudne.
Następująca później izolacja klonu cDNA o długości 1 kb z biblioteki ze śledziony szczura i powielenie fragmentu poprzez RT-PCR wykazały, że część zarówno klonów cDNA, jak i genomowych nie została zsekwencjonowana. Inny produkt powielania RT-PCR (SEK NR ID: 7) potwierdził ten brak. Stwierdzono, że fragment o długości 177 bp został wycięty z klonów genomowych i cDNA poprzez trawienie klonów EcoRI celem izolowania tych sekwencji z faga X, do badań nad sekwencją. Ponowna analiza SEK NR ID: 5 i 6 pod kątem tych sekwencji umożliwiła identyfikację bardziej dokładnej i pełnej sekwencji oryginalnie wyizolowanych klonów genomowych i cDNA, przedstawionych tu w postaci poprawionej jako SEK NR ID: 8 i 9.
W celu zidentyfikowania pełnej sekwencji kodującej dla ICAM-R, wyizolowano cDNA ze szczurzego mózgu (SEK NR ID: 10) i oznaczono sekwencję końca 5' poprzez powielenie końca 5' cDNA metodą rapid (5' RACE), produkt amplifkacji przedstawiono w SEK NR ID: 11. Zestawienie danych dla klonu RT-PCR (SEK NR ID: 7), cDNA z mózgu (SEK NR ID: 10) i produktu amplifikacji RACE (SEK NR ID: 11) umożliwiło identyfikację pełnej sekwencji kodującej dla ICAM-4 (SEK NR ID: 1). Niniejszy wynalazek jest zatem zilustrowany przez następujące przykłady. Bardziej szczegółowo, przykład 1 dotyczy klonowania części DNA dla ICAM-4. Przykład 2 opisuje analizę metodą Northern transkrypcji szczurzego ICAM-4. Przykład 3 opisuje izolację szczurzego cDNA pełnej długości dla ICAM-4. Przykład 4 dotyczy hybrydyzacji in situ szczurzego ICAM-4 w tkance mózgowej. Przykład 5 dotyczy wytwarzania ftizji białkowych ICAM-4 w organizmach prokariotycznych. Przykład 6 opisuje wytwarzanie monoklonalnych przeciwciał specyficznych wobec fuzji białkowych: szczurzy ICAM4/GST. Przykład 7 opisuje ekspresję rozpuszczalnych szczurzych białek ICAM-4 w bakulowi8
188 878 rasowym systemie ekspresyjnym. Przykład 8 dotyczy wytwarzania monoklonąlnych przeciwciał specyficznych wobec szczurzego ICAM-4 wyrażanego w systemie bakulowirasowym. Przykład 9 opisuje analizę immunocytochemiczną ekspresji ICAM-4. Przykład 10 dotyczy klonowania ludzkiego genomowego DNA kodującego ICAM-4. Przykład 11 dotyczy klonowania ludzkiego cDNA kodującego ICAM-4. Przykład 12 opisuje analizę ekspresji ludzkiego ICAM-4 metodą Northern. Przykład 13 opisuje wytwarzanie fuzji białkowych: ludzki ICAM4/GST. Przykład 14 dotyczy wytwarzania przeciwciał monoklonąlnych specyficznych wobec ludzkiego ICAM-4. Przykład 15 opisuje opracowanie testu wyłapującego dla określania stężenia rozpuszczalnego ICAM-4 w poszczególnych płynach. Przykład 16 stosuje test wyłapujący do pomiaru stężenia ICAM-4 w surowicy pacjentów po udarze. Przykład 17 dotyczy pomiaru transkrypcji ICAM-4 w modelu epilepsji szczurzej. Przykład 18 dotyczy klonowania regionu promotorowego ludzkiego ICAM-4.
Przykład 1
Klonowanie szczurzego DNA dla białka ICAM-pokrewnego
A. Izolacja szczurzego genomowego DNA dla domeny 2 białka ICAM-pokrewnego.
Szczurza biblioteka genomowa, skonstruowana w wektorze λ EMBL3, była przeszukiwana sondą wyznakowaną [32P], otrzymaną metodą PCR na matrycy DNA kodującego ludzką domenę 2 ICAM-3. Sekwencja nukleotydowa tej sondy jest przedstawiona w SEK. NR ID: 12. Łysinki z biblioteki przenoszono na filtry nylonowe Hybond N+ (Amersham, Arlington Heights, IL). Przeszukiwanie wszystkich bibliotek cDNA i genomowych prowadzono według standardowych przepisów. Prehybrydyzację i hybrydyzację przeprowadzano w roztworze: 4050% formamid, 5 X Denhardt, 5 X SSPE i 1,0% SDS w temp. 42°C. Sondy, wyznakowane [32P], dodawano do stężenia 105-106 cpm/ml roztworu hybrydyzacyjnego. Po 16-18 godzinach hybrydyzacji, filtry nylonowe obficie płukano w temperaturze pokojowej w 2 X SSPE z 0,1% SDS, a następnie eksponowano błony Rtg w -80°C przez noc. Pozytywne łysinki poddawano jednej lub kilku random hybrydyzacji w celu otrzymania klonu fagowego. DNA otrzymany z lizatu klonu pozytywnego subkłonowano w wektorze pBS+ i sekwencjonowano.
Pierwszy klon genomowy kodujący ICAM-pokrewną szczurzą domenę 2, zidentyfikowany na podstawie znalezionej homologii do obszarów domeny 2 innych członków rodziny ICAM (patrz dla przykładu tabela 1 ze Zgłoszenia Patentowego USA Nr 08/102,852), różnił się od wcześniej opisanej sekwencji szczurzego ICAM-1 [Kita i wsp., Biochem. Biophys. Acta 1131:108-110 (1992)], czy mysiego ICAM-2 [Xu i wsp., J. Immunol. 149:2560-2565 (1992)]. Sekwencja nukleotydowa i przewidziana sekwencja aminokwasowa tego klonu zostały ujawnione w równoległych zgłoszeniach macierzystych w stosunku do niniejszego zgłoszenia jako znaczące odmiany szczurzego ICAM-R i były przedstawione odpowiednio jako SEK NR ID:23 i 24 w Zgłoszeniu Patentowym USA Nr 08/102 852. Tutaj te same sekwencje są przedstawione odpowiednio jako SEK NR ID: 3 i 13.
Przy użyciu tej samej sondy zidentyfikowano dragi, zachodzący klon i ustalono, że posiada on sekwencje domeny 2 ICAM z SEK NR ID: 3 oraz koniec 5' DNA kodujący przynajmniej fragment szczurzego ICAM-1. Sekwencja nukleotydowa tego klonu została przedstawiona w równoległym zgłoszeniu macierzystym w stosunku do niniejszego zgłoszenia jako SEK. NR ID: 26 i jest pi-zedstawiona tutaj jako SEK NR ID:5. Drugi klon wskazuje na to, że fragment ICAM-pokrewnego genu z klonu pierwszego i gen kodujący szczurzy ICAM-1 są zlokalizowane na tym samym chromosomie szczura w odległości 5 kb.
B. Izolacja cDNA dla białka ICAM-pokrewnego ze szczura
W celu zidentyfikowania kompletnej sekwencji kodującej białko ICAM-pokrewne, wyznakowany [32P] DNA kodujący domenę 2 ze szczurzego klonu genomowego, zidentyfikowanego w Sekcji A (SEK NR ID:3), powyżej, został użyty do przeszukania szeregu bibliotek cDNA z różnych typów komórek szczurzych i mysich, w tym szczurzych makrofagów (Clontech, Pało Alto, CA), limfocytów krwi obwodowej (PBL) (Clontech), limfocytów T (skonstruowanych przez zespół) i komórek śledziony (Clontech) oraz mysich PBL (Clontech), limfocytów T (skonstruowanych przez zespół) i limfocytów B (skonstruowanych przez zespół).
W bibliotece cDNA ze śledziony zidentyfikowano pojedynczy kłoń (Clontech), który zawierał pięć domen Ig-podobnych, z których cztery były homologiczne do domen od 2 do 5
188 878 zarówno w ICAM-1, jak i ICAM-R. Co więcej, klon ten zawierał koniec 3' DNA kodujący piątą domenę Ig-podobną która nie była poprzednio zidentyfikowana w żadnym innym peptydzie ICAM. Dodatkowo, zawarta w tym klonie nietypowa sekwencja na końcu 3', później zdeterminowana jako częściowy intron (dyskutowane poniżej), leżący pomiędzy domeną 4 i 5 sugeruje, że klon ten jest produktem niedojrzałego lub nie prawidłowo złożonego transkryptu. Obecność unikatowej domeny i wykazanie, że obszaru 3' nie daje się dobrze dopasować do innych znanych sekwencji ICAM sugeruje, że DNA dla białka ICAM-pokrewnego może kodować nowy szczurzy polipeptyd ICAM. Sekwencja nukleotydową tego klonu została przedstawiona jako SEK NR ID:25 w zgłoszeniu macierzystym w stosunku do niniejszego zgłoszenia; tutaj sekwencja nukleotydową klonu cDNA ze śledziony jest przedstawiona jako SEK NR ID: 6.
C. Powtórna analiza cDNA i DNA genomowego ze szczura
Po złożeniu 5 sierpnia 1993 Zgłoszenia Patentowego USA Nr 08/102 852 ustalono, że częściowy klon cDNA ze śledziony szczura (SEK NR ID:25 w zgłoszeniu macierzystym i SEK NR ID:6 tutaj) oraz genomowy klon z wątroby szczura (SEK NR ID:26 w zgłoszeniu macierzystym i SEK NR ID:5 tutaj) nie posiadały wewnętrznego fragmentu EcoRI o długości 177 bp, który był częścią każdego z tych klonów, lecz został zgubiony podczas etapu subklonowania, kiedy wstawki z biblioteki wycinano z wektora λ poprzez trawienie EcoRI i włączano poprzez ligację do wektora używanego do sekwencj ono wania. Obserwacja, że w klonach cDŃA i genomowym został zgubiony fragment sekwencji kodującej wynikała z dopasowania szczurzej sekwencji genomowej i cDNA do różnych produktów amplifikacji RT-PCR, włączając w to SEK NR ID:7, które uwidoczniło lukę w sekwencji DNA ze szczura.
Kolejna izolacja i dopasowanie sekwencji cDNA z biblioteki śledziony, przy użyciu klonu cDNA śledziony (SEK NR ID:6) jako sondy, potwierdziły pierwotne przypuszczenia, że nie został zsekwencjonowany fragment klonu cDNA i genomowego ze śledziony. Dalsze, oczywiste potwierdzenie otrzymano po amplifikacji fragmentu łączącego domeny od 3 do 5 metodą RT-PCR, przy użyciu startera 5' (RRD3 5' Xho, zawierającego na końcu 5' miejsce restrykcyjne Xhol dla ułatwienia klonowania), pokazanego jako SEK NR ID: 14, oraz startera 3' (RRD5 3' Hind, zawierającego miejsce restrykcyjne Hindlll dla ułatwienia klonowania), pokazanego jako SEK NR ID: 15.
GAACTCGAGGCCATGCCTCCACTTTCC (SEK NR ID: 14) CCATAAGCTTTATTCCACCGTGACAGCCAC (SEK NR ID: 15)
Dopasowanie obu omawianych sekwencji DNA w sposób jednoznaczny pokazało, że klony cDNA i genomowy utraciły fragment DNA jeszcze przed sekwencj ono waniem; znalazło to potwierdzenie po odczytaniu sekwencji DNA RT-PCR, dyskutowanym poniżej. Stwierdzono, że trawienie restrykcyjne EcoRI wycinające fragmenty cDNA i genomowe z DNA faga λ przed sekwencj ono waniem, spowodowało wycięcie fragmentu o długości 177 bp, który nie uwidaczniał się podczas rozdzielania w żelu agarozowym. Kolejna analiza sekwencji potwierdziła obecność dwóch miejsc EcoRI ograniczających fragment 177bp w obu wyjściowych klonach.
Fragment EcoRI o długości 177 bp jest położony pomiędzy nukleotydami 719 i 896 w częściowym klonie cDNA ze szczura, jak pokazano w SEK NR ID: 9, a pomiędzy nukleoty darni 2812 i 2989 w częściowym klonie genomowym, jak pokazano w SEK NR ID: 8.
D. DNA izolowany przy zastosowaniu klonu z RT-PCR
RT-PCR został wykorzystany do otrzymania kompletnej informacji o sekwencji genu dla białka ICAM-pokrewnego ze szczura. Znajomość sekwencji klonu genomowego (SEK NR ID:3) wykorzystano do zaprojektowania starterów komplementarnych do obszaru 5' odcinka kodującego białko, ustalonego na podstawie klonu cDNA oraz antysensownego startera zaprojektowanego jako komplementarny do sekwencji kodujących i regionów 3' w stosunku do sekwencji kodującej w klonie cDNA (SEK NR ID: 6).
Matrycowy cDNA do reakcji PCR przygotowywano w sposób następujący. Około 2 pg RNA poły A+ izolowanego z komórek śledziony szczura denaturowano przez grzanie w 65°C w objętości 10 pl. Po denaturacji dodawano 0,1 pl RNazyny (Invitrogen, San Diego, CA), 5 pl 5X buforu
188 878 do RTazy (BRL, Bethesda, MD), 2 μΐ losowych heksamerów (pd(N)ó w 100 pg/ml) (Pharmacia, Piscataway, NJ), 6 μΐ, dNTP (2 mM każdy) i 2 (il RTazy AMV (BRL); reakcję prowadzono w temperaturze 42°C przez 60-90 min. Mieszaniny reakcyjne przechowywano w -20°C do momentu użycia.
Przeprowadzano wstępne serie doświadczeń w ceiu zidentyfikowania par starterów oligonukleotydowych dających produkt amplifikacji w reakcjach PCR przy użyciu cDNA ze śledziony szczura. Różne sensowne startery 5' były dobierane w pary ze starterami 3' zaprojektowanymi jako komplementarne do wewnętrznej sekwencji kodującej; starter 3' oznaczono jako RRD2 3-1 i przedstawiono w SEK NR iD: 16.
AACGTGCGGAGCTGTCTG (SEK NR ID: 16) (W ostatecznie wyizolowanym produkcie RT-PCR, SEK NR ID:7, poniżej, starter RRD2 3-1 odpowiada nukleotydom 719 do 736.) Podobnie, różne antysensowne startery 3' dobierano w pary ze starterami 5' zaprojektowanymi jako komplementarne do innej sekwencji kodującej; starter 5' w tych reakcjach oznaczono jako RGen3900S i pokazano w SEK NR ID: 17.
ACGGAATTCGAAGCCATCAACGCCAGG (SEK NR ID: 17) (W SEK NR ID:7, poniżej, starter RGen3900S odpowiada nukleotydom 1719 do 1736). W oparciu o wielkości powielonych produktów i zdolności tych produktów do hybrydyzacji z częściowym klonem cDNA, ustalono jedną parę starterów jako najbardziej wydajną i używano jej w kolejnych reakcjach powielania PCR. Starter 5' oznaczono jako RGen780S (SEK NR ID: 18), a starter 3' oznaczono jako RGen4550AS (SEK NR ID: 19).
(SEK NR CATGAATTCCGAATCTTGAGTGGGATG (SEK NR ID: 18) ATAGAATrCCTCGGGACACCTGTAGCC (SEK NR ID: 19) (W SEK NR ID:7, poniżej, starter RGen780S odpowiada nukle-otydom od 1 do 18, a starter RGen4550AS odpowiada nukleotydom od 2197 do 2214.)
Taka para starterów została użyta w reakcjach PCR prowadzonych w różnych warunkach celem optymalizacji reakcji amplifikacji. W sumie użyto 15 buforów różniących się wartościami pH i stężeniem Mig’’ i zastosowano dwie różne temperatury przyłączania starterów; próbki produktu otrzymanego w każdej z reakcji rozdzielano w 1% żelu agarozowym. Ponieważ produkty amplifikacji PCR z różnych warunków reakcji mogły nie być widoczne w żelu barwionym bromkiem etydyny, do wykrywania produktów PCR wykorzystano bardziej czułą metodę Southema.
Część powielonego DNA rozdzielano elektroforetycznie w żelu, przenoszono na filtr nylonowy Hybond N+ stosując standardową technikę z zastosowaniem kompresu ssącego i hybrydyzowano z pełnym cDNA ze szczura wyznakowanym [32P]. Zastosowano warunki hybrydyzacji zasadniczo takie, jak opisano dla procedury przeszukiwania biblioteki w Sekcji A, powyżej. Autoradiogramy wykazały, że niewielka ilość DNA o wielkości około 2,2 kb była wytwarzana w dwóch reakcjach, więc pozostałe produkty obu reakcji rozdzielono w żelu agarozowym. Pomimo, że nie widziano w sposób oczywisty prążka DNA, fragment 2,2 kb eluowano z żelu i używano jako matrycy w kolejnej reakcji PCR przy zastosowaniu tych samych starterów (SEK NR ID: 18 i 19), buforu Tris-HCl pH 8,0, zawierającego ImM Mg++ przyłączanie starterów prowadzono w temperaturze 55°C. Produkt amplifikacji z drugiej rundy PCR, widoczny w żelu, eluowano i klonowano w wektorze pBS+ (Stratagene, La Jola,CA) w celu przeprowadzenia analizy sekwencji.
Ustalono, że otrzymany klon RT-PCR zawiera 2214 bp, jak pokazano w SEK NR ID: 7. Klon ten koduje domeny od 2 do 6 znalezione w klonie cDNA ze śledziony szczura oraz dodatkową N-końcową domenę 1, dodatkową C-końcową domenę 7 i fragment o wielkości 164 bp, który wydaje się być dalszą C-końcową domeną 8. Tuż przed domeną 1 na końcu 5' występuje dodatkowa sekwencja 144 bp pochodząca przypuszczalnie z intronu leżącego pomiędzy sekwencją liderową i pierwszą domeną. Klon ten nie zawiera sekwencji lidera na końcu 5' oraz regionu transbłonowego i cytoplazmatycznego na końcu 3'. Dodatkowo oprócz poprzednio zidentyfikowanej domeny 6 w klonie cDNA ze śledziony, zidentyfikowano domenę siódmą i ósmą w klonie RT-PCR, co stanowi podstawę hipotezy, że klon ten jest nowym szczurzym ICAM.
188 878
Przykład 2
Analiza metodą Northern
W celu dalszego zbadania możliwości, że klony ICAM-pokrewne zidentyfikowane w przykładzie 1 kodują nowy polipeptyd ICAM, co sugerują unikatowe domeny Ig-podobne, analizowano specyficzną tkankowo ekspresję tego genu metodą Northern, pozwalającą na porównanie otrzymanych wyników z wcześniej opublikowanymi danymi dla ludzkich ICAM [ICAM-1. Dustin i wsp., J. Immunol. 137:245-254 (1986); ICAM-R, de Fourgerolles i Springer, J.Exp.Med. 175:185-190 (1992)].
Całkowity komórkowy RNA z płuc, mózgu, rdzenia kręgowego, wątroby, przewodu pokarmowego, grasicy, węzłów chłonnych i śledziony szczura otrzymywano przy użyciu odczynników do izolacji RNA STAT60 (Tel-test „B”, Inc. Friendswood, Texas), zgodnie z przepisem producenta. RNA poli A+ izolowano z całkowitego RNA przy użyciu kolumienek z oligo dT celulozą. Około 5pg RNA otrzymanego z każdego rodzaju tkanki rozdzielano w 1% żelu agarozowym, zawierającym formaldehyd i przenoszono na filtr nitrocelulozowy Hybond-C (Amersham).
Fragment cDNA ze śledziony szczura z przykładu 1, odpowiadający domenie od 2 do 4 (nukleotydy od 1 do 724 w SEK NR ID:6) subklonowano w wektorze pBluscript SK+ (Stratagene), a następnie otrzymywano antysensowną sondę RNA przy zastosowaniu transkrypcji in vitro, z użyciem UTP wyznakowanego 32P i około 500 ng liniowej matrycy, stosownie do przepisu producenta (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN). Filtry z przyłączonym RNA prehybrydyzowano w roztworze zawierającym 50% formamid, 5 X SSC, 1 X Pe (50 mM TrisHC1 pH 7,5, 0,1% pirofosforan sodu, 0,2% poliwinylopirolidon, 0,2% fikol, 5 mM EDTA, 1% SDS) oraz zdenaturowany DNA ze spermy łososia w stężeniu 150 pg/ml. Wyznakowaną radioaktywnie sondę denaturowano przez gotowanie i dodawano do roztworu prehybrydyzacyjnego do końcowego stężenia 1x 106 cpm/ml. Hybrydyzację prowadzono przez 16-18 godzin w 65°C. Następnie filtry płukano w 65°C w 2 X SSC zawierającym 0,1% SDS i eksponowano stosując błony Rtg przez 3-16 godzin.
Analiza metodą Northern wykazała, że ICAM-pokrewny cD-NA zidentyfikowany w przykładzie 1 ulega ekspresji jedynie w mózgu szczura. Ta specyficzność tkankowa nie była poprzednio opisywana dla żadnego z innych polipeptydów ICAM. Wzór ekspiesji, w kombinacji z unikatowymi domenami Ig-podobnymi, nie znalezionymi w innych polipeptydach ICAM wskazuje, że klon ICAM-pokrewny jest nowym członkiem rodziny białek ICAM i został nazwany ICAM-4.
Fakt, że zidentyfikowane początkowo klony cDNA wykryto w bibliotece ze śledziony szczura sugeruje, że w części komórek śledziony gen ICAM-4 ulega ekspresji na niskim po ziomie.
Jednakże, nie udało się wykryć klonu w prawidłowy sposób złożonego w wielu bibliotekach cDNA z komórek krwiotwórczych, co pozwala wątpić czy białko ICAM-4 jest rzeczywiście wyrażane w tkankach innych od mózgu. Jednym z wytłumaczeń wykrywania ICAM-4 cDNA w śledzionie jest możliwość powielenia śladowej ilości transkryptu w bardzo czułej reakcji PCR, nawet jeśli tkanki te nie wytwarzają kodowanego białka.
Przykład 3
Izolacja pełnej długości szczurzego cDNAdla ICAM-4
A. Identyfikacja klonu cDNA z mózgu szczura
Z uwagi na specyficzną tkankowo ekspresję ICAM-4, mRNA pochodzący z tkanki mózgowej wykorzystano przy próbach izolacji pełnej długości cDNA kodującego ICAM-4. Dwie sondy, jedną, komplementarną do domeny od 1 do 2 oraz drugą, komplementarną do domeny od 3 do 5 klonu cDNA ze śledziony, zidentyfikowanego w przykładzie 1 (SEK NR ID:7), wyznakowano i użyto do przeszukiwania biblioteki cDNA z mózgu szczura, skonstruowanej w wektorze Xgt10, otrzymanej uprzednio w naszym zespole. Warunki hybrydyzacji opisano w przykładzie 1, a pozytywne łysinki poddawano jednej lub kilku rundom hybrydyzacji w celu otrzymania klonu fagowego.
Zidentyfikowano dziewięć pozytywnych klonów, z których dwa hybrydyzowały z obiema sondami. Najdłuższy z otrzymanych klonów, oznaczony jako klon 7, zawierający 2550 bp,
188 878 koduje cztery domeny Ig-podobne, które występują w sondzie cDNA. Dodatkowo klon 7 koduje cztery inne domeny Ig-podobne, które nie występują w sondzie. Zdentyfikowano przypuszczalną domenę transbłonową i cytoplazmatyczną, po których występuje kodon stop, sygnał poliadenylacji i ogon poli A. Klon 7 utracił co najmniej jedną domenę Ig-podobną na końcu 5', co ustalono porównując z klonem RT-PCR (SEK NR ID: 7), jak również utracił sekwencję liderową; ponowne przeszukanie biblioteki nie ujawniło dłuższego klonu, który posiadałby wspomniane sekwencje. Sekwencja nukleotydowa klonu 7 jest pokazana w SEK NR ID: 10.
B. Ustalenie końca 5'
W celu wyizolowania domeny 1 i innych sekwencji z końca 5', wykorzystano technikę PCR zwaną 5' RACE ( ang. Rapid Amplification of cDNA Ends) [PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis i wsp., wyd. Academic Press: New York (1990) str. 28-38] z wykorzystaniem zestawu do 5' RACE (Clontech). Technika ta wykorzystuje wewnętrzny starter, który jest używany w parze z drugim starterem komplementarnym do sekwencji adapterowej, dołączonej do końca 5' cząsteczek cDNA z biblioteki. Reakcja PCR z tym starterem umożliwi amplifikację i identyfikację brakującej sekwencji. Informacja na temat zachodzących na siebie sekwencji pozwoli na utworzenie pełnej sekwencji tego genu.
cDNA z mózgu szczura przygotowany techniką RACE (dostarczony z zestawem) został użyty w reakcji PCR z wykorzystaniem oligonukleotydu z zestawu i antysensownego startera opartego na wewnętrznej sekwencji ICAM-4. Antysensowny starter 3', oznaczony jako Spot714AS, został nazwany stosownie do sekwencji domeny 4 z ICAM-4 i pokazany w SEK NR ID:20.
CARGGTGACAAGGGCTCG (SEK NR ID:20)
Produkt otrzymany w wyniku amplifikacji, z wykorzystaniem pary tych starterów był następnie użyty w drugiej reakcji PCR, w której wykorzystano ten sam starter 5' z zestawu oraz starter 3' komplementarny do rejonu domeny lw ICAM-4. Drugi starter 3' oznaczono jako RRACE2 i pokazano w sEk NR ID:21.
TATGAATTCAGTTGAGCCACAGCGAGC (SEK NR ID:21)
Każdy ze starterów użyty w drugiej reakcji PCR zawierał miejsce restrykcyjne EcoRI ułatwiające klonowanie w wektorze pBS+ (Stratagene) produktów otrzymanych w wyniku amplifikacji. Otrzymany plazmidowy DNA, który zawierał koniec 5' genu został zidentyfikowany poprzez hybrydyzację do sondy zawierającej domeny 1 i 2 szczurzego ICAM-4, odpowiadającej nukleotydom od 1 do 736 w SEK NR ID:7. Na podstawie otrzymanego produktu amplifikacji ustalono częściową informację o sekwencji domeny 1 i hydrofobowego lidera.
Produkt otrzymany metodą 5' RACE jest fragmentem o długości 222 bp zawierającym 60 bp przed pierwszym kodonem dla metioniny, sekwencję liderową o długości 82 bp i sekwencję domeny 1 o długości 80 bp. Produkt powielania pokazano w SEK NR ID: 11.
C. Sekwencja szczurzego ICAM-4 pełnej długości
Na podstawie informacji o sekwencji, pochodzącej z metody 5' RACE (SEK NR ID: 11), klonu RT-PCR (SEK NR ID:7) i klonu 7 niosącego cDNA z mózgu (SEK NR ID: 10), skonstruowano złożony klon o pełnej długości. Ustalono, że szczurzy gen ICAM-4 pełnej długości zawiera 2985 bp z pojedynczą ramką odczytu kodującą białko złożone z 917 aminokwasów. Przypuszczalna sekwencja Kozak położona jest powyżej kodonu dla metioniny i sekwencji liderowej. Za 27-aminokwasowym, hydrofobowym liderem występuje dziewięć domen Igpodobnych, region transbłonowy i zawierający 58 aminokwasów cytoplazmatyczny ogon. Złożony cDNA dla ICAM-4 pokazano w SEK NR ID:1, a ustalona sekwencja aminokwasowa przedstawiona jest jako SEK NR ID:2.
Podobnie jak inne polipeptydy ICAM, ICAM-4 zawiera domenę zewnątrzkomórkową, transbłonową i cytoplazmatyczną. W zewnątrzkomórkowej domenie ICAM-4 koniec N stanowi sekwencja liderową, obejmująca aminokwasy od 1 do 27, po których następuje dziewięć immunoglobulinowych domen(Ig)-podobnych charakterystycznych dla ICAM-4, które w ICAM-1, ICAM-2 i ICAM-R zawierają odpowiednio pięć, dwie i pięć zewnątrzkomórkowych domen Ig-podobnych. W ICAM-4 domena 1 obejmuje aminokwasy od 28 do 118;
188 878 domena 2 obejmuje aminokwasy od 119 do 224; domena 3 obejmuje aminokwasy od 225 do 321; domena 4 obejmuje aminokwasy od 322 do 405; domena obejmuje aminokwasy od 406 do 488; domena 6 obejmuje aminokwasy od 489 do 569; domena 6 obejmuje aminokwasy do 570 do 662; domena 8 obejmuje aminokwasy od 663 do 742 i domena 9 obejmuje aminokwasy od 743 do 830. W każdej z domen tworzona jest charakterystyczna struktura „pętli” dzięki mostkom dwusiarczkowym powstającym pomiędzy resztami cysternowymi, rozmieszczonymi zazwyczaj na dwóch przeciwległych końcach sekwencji aminokwasowej. Na inne cechy strukturalne ICAM-4 składają się transbłonowy region obejmujący aminokwasy od 831 do 859 i cytoplazmatyczny rejon obejmujący aminokwasy od 860 do 917.
Porównanie homologii sekwencji aminokwasowej każdej z domen szczurzego ICAM-4 z innymi członkami rodziny ICAM ograniczono do odpowiednich sekwencji ludzkich ICAM-1, I-CAM-2 i ICAM-R ponieważ informacje o sekwencji dla trzech szczurzych homologów nie były wcześniej publikowane. W pierwszej domenie szczurzy ICAM-4 wykazuje odpowiednio 21, 30 i 28 procent identyczności z ludzkimi ICAM-1, ICAM-2 i ICAM-R. Druga domena jest silniej konserwowana i posiada 60, 42 i 62 procent identyczności odpowiednio z ICAM-1, -2 i -3. Domeny 3-5 wykazują odpowiednio procent identyczności 48, 49 i 40 z ICAM-1 i 60, 59
29 odpowiednio z ICAM-R. Interesujące, że szczurze domeny od 4 do 6 ICAM-4 wykazują najsilniejszą homologię z domeną 5 (wahające się w zakresie 29-42% identyczności) i jest możliwe, że powstały one w wyniku duplikacji segmentu genu. Dziewiąta i końcowa zewnątrzkomórkowa domena wykazuje niskie podobieństwo do innych domen ICAM, lecz posiada 22% identyczności z 3-cią i 6-tą domeną ludzkiego VCAM-1, innego członka rodziny białek Ig, które biorą udział w adhezji komórek. Cytoplazmatyczny ogon składa się z 58 aminokwasów. Jest on dłuższy od występujących u innych członków rodziny ICAM w której ludzkie ICAM-1, -2 i -3 posiada odpowiednio 28, 26 i 37 aminokwasowe ogony. Podobnie jak domena dziewiąta, cytoplazmatyczny ogon szczurzego ICAM-4 wykazuje największą homologię z cytoplazmatycznym ogonem ludzkiego VCAM-1, który składa się tylko z 19 aminokwasów. 19 proksymalnych błonowych aminokwasów szczurzego ICAM-4 ma 7 wspólnych reszt aminokwasowych z VCAM-1 (37%).
W końcu, miejsce wiązania do LFA-1 (CD11a/CD18) mapuje się w pierwszej domenie polipeptydów ICAM. Vonderheide i wsp. [J. Cell. Biol., 125:215-222 (1994)] zidentyfikował motyw sekwencji wymagany w wiązaniu integryny. Pomimo relatywnie niskiej homologii pomiędzy szczurzą domeną 1 odpowiednimi domenami w innych polipeptydach ICAM, omawiane miejsce wiązania jest konserwowane co sugeruje, że szczurzy ICAM-4 może być ligandem dla LFA-1, a może także innych integryn.
Przykład 4
Hybrydyzacja in situ w tkance mózgowej
W celu zlokalizowania specyficznej tkanki mózgowej, w której zachodzi ekspresja ICAM-4, wykonano hybrydyzację in situ z sondami antysensownego RNA utworzonymi na matrycy domeny 1 CAM-4 oraz domen 3 i 4 ICAM-4. Sondy wyznakowano in vitro przy użyciu [’5S]-lJTP.
Zamrożony skrawek tkanki prawidłowego szczurzego mózgu utrwalano w 4% paraformaldehydzie przez 20 minut, płukano i odwadniano; utrwalony RNA denaturowano przez minuty w 2 X SSC, 70% formamidzie w 70°C przed przystąpieniem do hybrydyzacji. Skrawki tkanki hybrydyzowano przez noc w 50°C w roztworze zawierającym 50% formamid, 0,3 M NaCl, 20 mM Tris-HCl pH 7,4, 5 mM EDTA, 10% siarczan dekstranu, 1 X roztwór Denhardta, 0,5 mg/ml drożdżowego RNA, 100 mM DTT oraz sondę w stężeniu 50000 cpm/fil. Skrawki płukano jednokrotnie w 4 X SSC, 10 mM DTT w temperaturze pokojowej przez 60 mimut, jednokrotnie w 50% formamidzie, 1 X SSC, 10 mM dTt w 60°C przez 40 min. Po płukaniu skrawki zanurzano w emulsji NTB2 (Kodak, Rochester, NY), eksponowano przez 2 do 21 dni nim wywołano i barwiono kontrastowo. Kontrole negatywne, oprócz sondy RNA wirusa ludzkiego niedoboru odporności (HIV-1), zawierały sensowne sondy utworzone na matrycy domeny 1 ICAM-4 oraz sensowne sondy RNA dla domen 3 i 4 ICAM-4.
Wykrywany sygnał w tkance mózgowej był zlokalizowany przede wszystkim w istocie szarej z najsilniejszym sygnałem w korze mózgowej i hipokampie. Profil hybrydyzacji był zgodny z ekspresją ICAM-4 mającą miejsce głównie w komórkach nerwowych mózgu.
188 878
Przykład 5
Wytwarzanie fuzji białkowych z ICAM-4
Fuzje białkowe: szczurze ICAM-4/transferaza S-glutationu (GST) wytwarzano przy zastosowaniu prokariotycznego wektora ekspresyjnego pGEX(Pharmacia, Alameda, CA) w celu utworzenia przeciwciał monoklonalnych przeciw specyficznym fragmentom połipeptydowym ICAM-4.
Startery do PCR odpowiadające końcom 5' i 3' domeny 1 i końcom 5' i 3' domeny 2 zastosowano do powielenia fragmentów DNA kodujących poszczególne domeny. Otrzymane fragmenty były oddzielnie klonowane w miejscu EcoRI pGEX-2T; sekwencja DNA potwierdziła prawidłową orientację i ramkę odczytu. Transformanty przeszukiwano następnie pod kątem ich zdolności do wytwarzania fuzji białkowych o odpowiedniej masie cząsteczkowej.
Obie fuzje białkowe: domena 1 ICAM-4/GST i domena 2 ICAM-4/GST pozostawały we frakcji nierozpuszczalnej po lizie bakterii poprzez sonikację w buforze PBS zawierającym 1% SDS. Frakcje nierozpuszczalnych białek ze 100 ml hodowli gotowano w buforze do nanoszenia z SDS i rozdzielano na 10% preparatywnym żelu poliakryloamid-SDS. Żel barwiono w schłodzonym w lodzie 0,4 M KC1 i prążki odpowiadające fuzjom białkowym wycinano. Fuzje białkowe poddawano elektroelucji ze skrawków żelu w woreczkach dializacyjnych w buforze zawierającym 25 mM Tris-HCl i 192 mM glicynę. Przybliżone stężenie białka określano poprzez pomiar OD280, a czystość preparatu określano poprzez SDS-PAGE i barwienie błękitem Coomasie.
Przykład 6
Wytwarzanie przeciwciał monoklonalnych przeciw fuzjom białkowym szczurza ICAM4/GST
Myszy balb/c immunizowano poprzez podskórne wstrzyknięcie 40-50 pg fuzji białkowej: domena 2 ICAM-4/GST (opisanej w przykładzie 5) przeprowadzonej w postać emulsji w pełnym adiuwancie Freunda (FCA). Dwa tygodnie później, myszy były ponownie immunizowane poprzez podskórne wstrzyknięcie tego samego białka, ale przeprowadzonego w postać emulsji w niepełnym adiuwancie Freunda. Dwie końcowe immunizacje wewnątrzotrzewnowe wykonane dwa tygodnie po drugiej immunizacji obejmowały rozpuszczalny antygen bez adiuwanta podawany w odstępie dwóch tygodni. Surowica z każdej immunizowanej myszy była testowana poprzez test ELISA pod kątem zdolności do specyficznej reakcji ze szczurzym IGAM-4 wytwarzanym w opisanym tu bakulowirusowym systemie ekspresyjnym.
Z myszy # 1654 sterylnie pobierano śledzionę i umieszczano w 10 ml RPMI 1640 wolnego od surowicy. Zawiesinę komórek uzyskiwano poprzez rozgniatanie tkanki śledziony pomiędzy zamrożonymi końcami dwóch szkiełek mikroskopowych zanurzonych w RPMI 1640 wolnym od surowicy (Gibco, Burlington, Ottawa, Kanada) uzupełnionym 2 mM glutaminą, 1 mM pirogronianem sodu, 100 jednostkami/ml penicyliny i 100 pg/ml streptomycyny. Zawiesinę komórek filtrowano przez sterylny filtr do komórek Nitex z siatką 70 (Becton Dickinson, Parsippany, NJ) 1 płukano dwukrotnie RPMI, po czym zwirowywano przy 200 x g przez 5 minut. Otrzymany po ostatnim płukaniu osad ponownie zawieszano w 20 ml RPMI wolnego od surowicy. Tymocyty pobrane z trzech nagich myszy Balb/c przygotowywano w identyczny sposób.
Przed fuzją komórki szpiczaka NS-1 były utrzymywane logarytmicznej fazie wzrostu w RPMI z 11% surowicą Fetalclone (FBS) (Hyclone Laboratories, Logan, Utah) przez trzy dni. Po zebraniu komórki zwirowywano przy 200 x g przez 5 minut i osad przemywano dwukrotnie tak, jak opisano w poprzednim akapicie. Po przemyciu, zawiesinę komórek doprowadzano do końcowej objętości 10 ml w RPMI wolnym od surowicy. Pobierano 20 pl porcje i rozcieńczano 1:50 RPMI wolnym od surowicy, po czym pobierano 20 pl porcje z tego rozcieńczenia, mieszano z 20 pl barwnika błękitu trypanu 0,85% roztworze soli fizjologicznej (Gibco), nanoszono na hemacytometr (Baxter Healthcare, Deerfield, IL) i liczono komórki. Około 2,425 x 108 komórek śledziony mieszano z 4,85 x 107 komórek NS-1, mieszaninę zwirowywano, a supematant usuwano. Otrzymany osad przemieszczano poprzez stukanie w probówkę i dodawano 2 ml 50% PEG 1500 w 75 mM Hepes, pH 8,0, (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN), mieszając przez okres 1 minuty. Następnie dodawano kolejne 14 ml RPMI wolnego od surowicy w czasie 7 minut. Zawiesinę komórek zwirowywano przy 200 x g przez
188 878 minut i superzatazt odrzucano. Osad zawieszano w 200 ml RPMI zawierającego 15% FBS, 100 pM hipwksaotyzy sodu, 0,4 pM amizopts'i'yny, 16 pM tymidyny (HAT) (Gibco), 25 jedoostek/ml IL-6 (Boehdingpr Mannheim) 1,5 x 1Ó6 tymocytów/ml. Zawiesina była najpierw umieszczana w 225 cm2 kolbie (Coming, Essex, Unitet Kizgdom) w 37°C na cztery godziny przed rozpwrcjowamipm do płaskodennych płytek do hodowli tkankowej z 96 studzienkami(Commg) w ilości 200 pl/studzienkę. Komórki na płytkach były dożywiane 3, 4, 5 i 6 dnia po fuzji poprzez oddessanie około 100 pl z każdej studzienki igłą 20 G (Becton Dickinson) i dodanie 100 pl/studzienkę podłoża hodowlanego opisanego powyżej, z tą różnicą, że zawierało 10 jednostek/ml IL-6 i nie zawierało tymocytów.
Płytki z fuzjami przeszukiwano początkowo poprzez wyłapywanie antygenu w teście ELISA jak następuje. Płytki Immulon 4 (Dynatech, Cambridge, MA) były opuszczane przez noc w 4°C ze 100 og/studzipzkę fuzji białkowej bądź domena 1/GST bądź domena 2/GST w 50 mM buforze węglanowym. Płytki były blokowane 100 pl/studzienkę 0,5% żelatyną ze skóry ryb (Sigma, St. Louis, MO) w PBS przez 30 minut w 37°. Po zablokowaniu płytki przemywano 3 X PBS zawierającym 0,05% Tween 20 (PBST) i dodawano 50 pl/ścieżkę suppmatamtu znad hybrydom dla każdej fuzji. Po inkubacji w 37°C przez 30 minut, płytki przemywano jak opisano powyżej i dodawano 50 pl rozcieńczenia 1:3500 kozich anty-mysich IgG (Fc) koniugowanych z peroksydazą z chrzanu (Jackson ImmunrRpseadch, West Grove, Pennsylvania). Płytki inkubrwanw ponownie przez 30 minut i przemywano 4 x PBST. Dodawano substrat, 100 pl/studzienkę, składający się z 1 mg/ml r-fenylsnrdiamioy (Sigma) i 0,1 pl/ml 30% H2O2 w 100 mM cytrynianie pH 4,5. Reakcja barwna była prowadzona przez 10 minut i wygaszana przez dodanie 50 pl/studzienkę 15% H2SO4. Następnie oznaczano abswdbancjp przy 490 nm w automatycznym czytniku płytek (Dynatech).
Studzienki, które były pozytywne pod względem białka domena 2-GST, ale nie białka domena 1 -GST, były następnie przeszukiwane testem ELISA wobec supprnatamtu z Baculowirusa (opisane poniżej). Test ELISA był przeprowadzany jak opisano powyżej z tą różnicą, że płytki Immulon 4 były wyjściowo opuszczane przez noc supernatantpm Baculowirusa rozcieńczonym 1:4 w 50 mM buforze węglanowym. Trzy studzienki (103A, 103B i 103F) były kolejno klonowane dwa do trzech razy, poprzez dwukrotne rozcieńczenie w RPMI, 15 % FBS, 100 pM hyprksantyoa sodu, 16 pM tymidyna i 10 jednostek/ml IL-6. Studzienki płytek z klonami badano wizualnie po 4 dniach i oznaczano liczbę kolonii w studzienkach o najwyższej gęstości. Wybrane studzienki dla każdego klonowania były ponownie badane testem ELISA po 7 do 10 dniach wobec białek domena 1-GST i domena 2-GST lub suppmataotu Bakulowirusa.
Izotyp monrklrnalnych przeciwciał wytwarzanych przez hybrydomy ustalano stosując test ELISA. Płytki Immulon 4 (Dynatech) były opuszczane w 4°C 50 pl/ścieżkę kozimi antymysimi IgA, IgG lub IgM (Organon Teknika, Durham, NC) rozcieńczonymi 1:5000 w 50 mM buforze węglanowym pH 9,6. Płytki były blokowane przez 30 minut w 37°C 1% BSA w PBS, przemywane 3 X PBST. Do każdej płytki dodawano rozcieńczenie 1:10 super-natantu z hodowli hybrydom (50 p1), inkubowaoo i płukano jak wyżej. Po usunięciu ostatniego płukania dodawano 50 p1 króliczych anty-mysich IgGj, G2a, G?b, lub G3 skOT^owanych z peroksydazą z chrzanu (Zymed, San Francisco, CA) (rozcieńczonych 1:1000 w PBST z 1% normalną kozią surowicą). Płytki inkubowano jak wyżej, przemywano 4 x PBST i dodawano 100 pl substratu. Reakcja barwna była wygaszana po 5 minutach poprzez dodanie 50 pl 15% H2SO4 i oznaczano absorbancję przy 490 nm w automatycznym czytniku płytek (DyoatPch).
Wyniki wskazują, że przeciwciała 103A, 103B i 103F wszystkie mają izotyp IgGb Przeciwciała te były następnie stosowane w analizach immunocytochemicznych, analizie Western i do oczyszczania białka wyrażanego w Bakulrwiiusie.
Przykład 7
Ekspresja szczurzego ICAM-4 w Bakulowidusis
Bakulowirusowy system ekspresyjny (Invitroeen) został zastosowany do wytworzenia rozpuszczalnego białka odpowiadającego domenom od 1 do 6 ICAM-4. Ponieważ sekwencja liderowa dla ICAM-4 nip była w tym czasie znana, wykonano konstrukt ekspresyjny zawierający sekwencję kodującą dla ICAM-4, połączoną po stronie 3' z sekwencją liderową ICAM-1
188 878 w odpowiedniej ramce odczytu. Szczegóły dotyczące konstruowania plazmidu ekspresyjnego ICAM-l/ICAM-4 są następujące.
DNA dla szczurzego ICAM-1, kodujący pięć domen Ig-podobnych, był namnażany poprzez PCR przy zastosowaniu starterów, które posiadały kilka właściwości ułatwiających konstrukcję plazmidu z fuzją. Starter oligonukleotydowy 5' zawierał oprócz sekwencji największej zgodności Kozak, poprzedzającej pierwszą metioninę w sekwencji liderowej, miejsca HindIII i BgIII. Starter oligonukleotydowy 3' zawierał sekwencję kodującą dla sześciu histydyn, po których następował kodon stop i miejsce klonowania HindIII. Produkt amplifikacji PCR klonowano w wektorze pBS+ strawionym HindIII, aanaliza sekwencji potwierdziła prawidłowość konstrukcji. Wewnętrzne miejsce Smal w sekwencji liderowej ICAM-1 i inne miejsce SmaI w regionie do klonowania w wektorze (3' w stosunku do Ig-podobnej domeny 5 ICAM-1) zostało strawione, czego wynikiem było usunięcie większej części sekwencji kodującej ICAM-1. Po tych manipulacjach, przeprowadzony w formę liniową z tępymi końcami wektor zawierał część regionu z miejscami do klonowania (miejsca restrykcyjne znajdujące się po stronie 5' w stosunku do oryginalnego miejsca HindII w regionie z miejscami do klonowania), sekwencję Kozak i większość sekwencji liderowej ICAM-1.
Sekwencję kodującą dla domen od 1 do 6 szczurzego ICAM-4 powielano poprzez PCR przy zastosowaniu starterów, zaprojektowanych dla umożliwienia klonowania tej sekwencji do przeprowadzonego w formę liniową wektora opisanego powyżej. Starter oligonukleotydowy 5' zawierał miejsce EcoRV i kodony niezbędne do uzupełnienia sekwencji liderowej ICAM-1. Starter oligonukleotydowy 3' zawierał kodony dla sześciu reszt histydynowych, kodon stop, miejsca restrykcyjne HindIII i EcoRV. Produkt powielania w tej reakcji PCR trawiono EcoRV celem wytworzenia sekwencji z tępymi końcami, która była następnie włączona poprzez ligację do mającej tępe końce, liniowej formy wektora pBS+, strawionego Smal. Całkowita sekwencja zawierająca sekwencję liderowąICAM-1 położoną 5' w stosunku do domen do 1do 6 ICAM-4 została usunięta z konstruktu poprzez trawienie BgIII i HindIII i oczyszczoną sekwencję fuzji ICAM-1/ICAM-4 sklonowano bezpośrednio w wektorze pBluesac III (Invitrogen) strawionym BgIII/HindIII.
Wytwarzanie białka przez zrekombinowany wirus było testowane poprzez test ELISA, stosując wyjściowo surowice z myszy immunizowanych fuzją białkową: domena 2 szczurzej ICAM-4/GST opisana w przykładzie 5. W dalszej części pracy, przeciwciała monoklonalne wytworzone z tych myszy zostały zastosowane do oczyszczenia białka ICAM-4, wytworzonego przy użyciu zrekombinwanego Baculowirusa w komórkach SF9.
Przykład 8
Wytwarzanie przeciwciał monoklonalnych przeciw szczurzemu ICAM-4 wyrażonemu w Bakulowirusie.
Domeny 1 -6 szczurzego IC.AM-4 zostały wyrażone w bakulowirusowym systemie ekspresyjnym jak opisano w przykładzie 7. Zrekombinowane białko zostało oczyszczone przy zastosowaniu przeciwciała monoklonalnego 103 A (jak opisano w przykładzie 6).
Pokrótce, 30 mg oczyszczonego monoklonalnego 103a (w 100 mM boranie sodu, 500 mM chlorku sodu) było wiązane z trzema gramami złoża Activated Cyanogon Bromide Sepharose 4B (Pharmacia, Piscataway, NJ). Supernatant Baculowirusa zawierający zrekombinowane szczurze ICAM-4 (domeny 1-6) nanoszono na kolumnę Sepharose przez noc w 4°C. Kolumnę przemywano roztworem soli fizjologicznej buforowanej wolnym od wapnia i magnezu fosforanem (CMF-PBS) i związany materiał był wymywany 50 mM kwasem cytrynowym, 500 mM NaCl pH 4,0. Próbka była neutralizowana 1/10 objętości Tris pH 10 i przechowywana w -20°C. Oczyszczone białko rozdzielone poprzez SDS-PAGE okazało się w ponad 90% czyste i migrowało w przybliżeniu jako białko o masie 80 kD.
Myszy immunizowano oczyszczonym zrekombinowanym szczurzym białkiem ICAM-4 obejmującym domeny 1-6 w podobny sposób, jak opisano w przykładzie 6. Śledziona z myszy #1945 została zastosowana do fuzji #127. Protokół otrzymywania fuzji był taki, jak opisany w przykładnie 6. Studzienki z fuzjami były przeszukiwane poprzez test ELISA pod kątem zrekombinowanego białka ICAM-4. Drugi przesiew obejmował analizę immunocytochemiczną skrawków mózgu szczura (tak jak opisano w przykładzie 9). Cztery dodatkowe, specyficzne przeciwciała dla szczurzych ICAM-4 sklonowano w wyniku fuzji: 127A, 127E, 127F
188 878 i 127H. Wzór barwienia cytochemicznego dla każdego przeciwciała na skrawkach mózgu szczura był taki sam, jaki obserwowano z przeciwciałem monoklonalnym 103A (patrz przykład 9). Przeciwciała monoklonalne testowano na ich zdolność do wiązania fuzji białkowych Dl/GST i D2/GST (opisanych w przykładzie 5). Przeciwciało monoklonalne 127A rozpoznawało fuzję białkową D1/GST, a przeciwciało 127H rozpoznawało fuzję białkową D2/GST. Te dwie odrębne specyficzności wiązania łącznie z innymi, które nie wiążą się z żadnym z białek GST, sugerują, że co najmniej trzy różne epitopy były rozpoznawane przez zestaw przeciwciał. Hybrydomy 127A i 127H zdeponowano, odpowiednio, 31 maja 1995 i 1 czerwca 1995 w American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 i oznaczono numerami dostępu, odpowiednio, HB11905 i HB11911.
Przykład 9
Analiza immunocytochemiczna ekspresji szczurzego ICAM-4
Analizę immunocytochemiczną z przeciwciałem monoklonalnym 103A wykonywano celem zlokalizowania miejsca wytwarzania białka wewnątrz mózgu szczura.
Mózg pobierano od normalnej dorosłej samicy szczura Lewis, pocięto strzałkowe i przemywano w 1 x PBS wolnym od RNazy przez 30 min. Skrawki mózgu umieszczano następnie w formie do zamrażania Tissue Tek II (Miles Laboratories, Inc., Naperville, IN) z niewielką ilością związku O.C.T (Miles, Inc., Elkhart, IN). Mózgi przesuwano na środek formy, formę wypełniano związkiem OCT, następnie umieszczano w pojemniku zawierającym 2-metylobutan (Aldrich Chemical Company, Inc., Milwaukee WI), a pojemnik umieszczano w ciekłym azocie. Gdy tkanka i związek OCT w formie zostały zamrożone, bloki przechowywano w -80°C przed wykonaniem skrawków;
Otrzymywano skrawki tkanki o grubości 6 pm, przytwierdzano do szkiełek pokrytych Vectabond (Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA) pozostawiano do wyschnięcia na powietrzu w temperaturze pokojowej przez noc przed użyciem. Skrawki utrwalano eterem etylowym (Malinckrodt, Paris, KY) przez 5 minut w temperaturze pokojowej. Po wyjęciu szkiełek z eteru, pozostawiano je dla odparowania odczynnika. Każdy skrawek tkanki był blokowany przy zastosowaniu 150 pl 50% normalnej szczurzej surowicy (Sigma) w 1 x PBS (zrobionym jedynie z fosforanem sodu) przez 30 min w temperaturze pokojowej. Po zablokowaniu ze skrawków delikatnie usuwano bibułą roztwory i oczyszczone przeciwciała 103A z supematantu (1,65 mg/ml) były rozcieńczane 1:10 w roztworze blokującym i nanoszone w ilości 150 p1 na każdy skrawek tkanki. Skrawki były umieszczane w wilgotnej komorze i inkubowane przez noc w 4°C.
Następnego dnia roztwór przeciwciał był odsączany bibułą ze skrawków i skrawki trzykrotnie przemywano 1 x PBS, każde płukanie prowadzono przez cztery minuty. Nadmiar PBS odsysano ze skrawka i na tkankę nakładano 100 pl drugiego, szczurzego anty-mysiego przeciwciała połączonego z biotyną (Jackson ImmunoResearch Laboratories), rozcieńczonego 1:100 w roztworze 10%o normalnej szczurzej surowicy i 2% BSA w PBS. Inkubację prowadzono przez jedną godzinę w temperaturze pokojowej. Skrawki przepłukiwano dwa razy w 1 x PBS, każdorazowo po 4 minuty, a następnie na każdy skrawek nakładano 100 pl odczynnika ABC z zestawu Elite Rat IgG Vectastain ABC (Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA), przygotowanego zgodnie z instrukcją producenta. Inkubację prowadzono przez 30 min. w temperaturze pokojowej. Po inkubacji, skrawki przemywano dwukrotnie 1 x PBS (każdorazowo po cztery minuty) i każdy skrawek poddawano działaniu 150 pl roztworu Vector VIP Peroxidase Substrate Solution (Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA). Po wybarwieniu, skrawki przepłukiwano pod bieżącą wodą przez 5 minut, barwiono kontrastowo przez 20 sekund hematoksyliną Mayera (Sigma) i ponownie przepłukiwano małym strumieniem bieżącej wody przez pięć minut. Skrawki odwadniano poprzez serię kolejnych działań etanolem, przeprowadzano przez ksylen i utrwalano stosując Accumount 60 (Stephens Scientific, Riverdale, NJ).
Analiza immunohistochemiczna skrawków szczurzego mózgu barwionych mAb 103A wykazała, że szczurze ICAM-4 jest wyrażane w neuronach hipokampu. Wzór barwienia sugerował, że białko może ograniczać się do wypustek neuronów (dendrytów). Skrawki mózgu barwione w podobny sposób innymi przeciwciałami lub samym odczynnikiem z drugiego etapu barwienia nie dawały wyraźnego wzoru ekspresji obserwowanego dla MAb 103A.
188 878
Przykład 10
Klonowanie ludzkiego genomowego DNA dla ICAM-4
W czasie klonowania szczurzego ICAM-4 z genomowego DNA odkryto, że ICAM-4 i ICAM-1 były zlokalizowane w obrębie 5 kb i ta informacja została wykorzystana w próbach klonowania homologu ICAM-4.
Przy użyciu Genomie System Inc. (St. Louis, MO) powielono w reakcji PCR fragmenty w ludzkiej bibliotece PI stosując startery dla ludzkiej domeny 3 z ICAM-1, sensowny starter zaprojektowany jako komplementarny do domeny 3 ludzkiego ICAM-1 (H-1/3D S) i antysensowny starter zaprojektowany jako komplementarny do domeny 3 ludzkiego ICAM-1 (II1/3D AS). Startery te są przedstawione odpowiednio, w SEK NR ID 22 i 23.
CCGGGTCCTAGAGGTGGACACGCA (SEK NR ID: 22) TGCAGTGTCTCCTGGCTCTGGTTC (SEK NR ID: 23)
Dwa klony, oznaczone 1566 i 1567, zostały zidentyfikowane i poddane dalszej analizie. Oba klony PI zawierały wstawki genomowego DNA o wielkości około 75-95 kb. Klony trawiono BamHI, rozdzielano elektroforetycznie w żelu agarozowym i przenoszono na filtry nylonowe. Hybrydyzacja Southema filtrów była wykonywana w warunkach łagodnych (30% formamid) lub w ostrych (60% formamid) w 42°C z wyznakowanymi izotopowo sondami ludzkich ICAM-1, ICAM-3 lub szczurzej ICAM-4; inne składniki roztworu hybrydyzacyjnego były takie, jak opisano w przykładzie 1. Serie hybrydyzacji w warunkach łagodnych przemywano w 2 x SSPE zawierającym 0,1% SDS w temperaturze pokojowej. Hybrydyzacje w warunkach ostrych przemywano w 65°C w 0,2 x SSPE zawierającym 0,1% SDS. Przemyte filtry eksponowano stosując błonę rtg przez 3,5 godziny.
Różnicowa hybrydyzacja wykazała, że ludzki ICAM-1 zawierał fragment BamHI o wielkości 5,5 kb, podczas gdy ludzki ICAM-3 był zlokalizowany we fragmentach BamHI 0 wielkości 4,0 kb i 1,5 kb. Fragmenty ludzkich ICAM-1 i ICAM-R subklonowano w pBS+ i ich tożsamość potwierdzano poprzez częściową analizę sekwencyjną.
Fragment BamHI o wielkości 7,0 kb, który hybrydyzował ze szczurzym ICAM-4 w ostrych warunkach, subklonowano i dalej fragmentowano poprzez trawienie Rsal. Trzy fragmenty Rsal, które hybrydyzowały z szczurzym ICAM-4 zostały zidentyfikowane, a ich sekwencja ustalona. Opierając się na homologii do szczurzego ICAM-4, fragmenty te okazały się zawierać domeny 2, 3, 4, 5 i część domeny 6.
Przykład 11
Klonowanie ludzkiego cDNA dla ICAM-4
Fragmenty genomowego DNA, odpowiadające domenom 2-5 ludzkiego ICAM-4 (opisane w przykładzie 10) były użyte jako sondy do przeszukania biblioteki cDNA z ludzkiego hipokampu na Agtt0 (Clontech, Pało Alto, Ca). Protokół przeszukiwania biblioteki był zasadniczo taki, jak opisano w przykładzie 1.
Najdłuższy klon ludzkiego ICAM-4 (#18), który został znaleziony w tej bibliotece miał jedynie 992 bp (SEK NR ID: 24) i odpowiadał połowie genu o spodziewanej wielkości 3 kb. Wstawka DNA z klonu 18 o długości 992 bp (SEK NR ID: 24) została zastosowana jako sonda do przeszukania biblioteki cDNA z ludzkiego podwzgórza na X ZAPII (Stratagene, La Jolla, CA). Z tej biblioteki uzyskano liczne pozytywne klony. Najdłuższy klon #34, miał długość 2775 bp (SEK NR ID: 25). W oparciu o dopasowanie do pełnego szczurzego ICAM-4 przewidziano, że w klonie tym brakuje sekwencji lidera i około 30 bp z końca 5' domeny 1. Brakowało ogona poliA+ na końcu 3', ale obecny był kodon stop dla translacji.
Fragment DNA odpowiadający pierwszym trzem domenom (nukleotydy 1 do 840 w klonie #34) był użyty jako sonda do przeszukania biblioteki cDNA pochodzącego z ludzkiej kory mózgowej na IgtlO (Clontech, Pało-Alto, CA). Jeden klon, 16-1 (SEK NR ID: 26) zidentyfikowano jako zawierający 1557 bp i obejmujący 39 bp z nie ulegającym translacji DNA na końcu 5', sekwencję liderową i sekwencję z piątej domeny. Zachodzące na siebie klony #34 (SEK NR ID: 25) i 16-1 (SEK NR ID: 26) zostały użyte do wytworzenia złożonej pełnej sekwencji ICAM-4 (SEK NR ID: 27).
Kompletny gen ma długość 2927 bp i koduje białko złożone z 924 aminokwasów. Sekwencja nukleotydów ICAM-4 jest przedstawiona jako SEK NR ID: 27, a sekwencja amino188 878 kwasowa jest przedstawiona jako SEK NR ID: 28. Porównanie sekwencji z pełnym szczurzym genem dla ICAM-4 wykazało 82% identyczności sekwencji DNA i 85% identyczności na poziomie aminokwasów.
Widoczna, Ig9-podobna, struktura zewnątrzkomórkowej domeny jest zachowana między szczurem i człowiekiem. Sekwencja liderowa rozciąga się od aminokwasu 1 do 28; domena 1 od aminokwasu 29 do 117; domena 2 od aminokwasu 118 do 224; domena 3 od aminokwasu 225 do 320; domena 4 od aminokwasu 321 do 405; domena 5 od aminokwasu 406 do 488; domena 6 od 15 aminokwasu 489 do 570; domena 7 od aminokwasu 571 do 663; domena 8 od aminokwasu 664 do 743; domena 9 od aminokwasu 744 do 837; region transbłonowy od aminokwasu 838 do 857 i ogon cytoplazmatyczny od aminokwasu 858 do 924.
Ludzki ICAM-4 (HuICAM-4) oprócz tego, że jest genetycznie związany z ICAM-1
ICAM-R, wykazuje równocześnie także pewne wspólne strukturalne cechy, tak, że zgrupowano je razem jako rodzinę cząsteczek.
Dopasowanie poszczególnych domen HuICAM-4 z domenami innych członków rodziny ICAM pokazuje różny stopień homologii. Sekwencja aminokwasów z domeny 1 HuICAM-4 wykazuje 21, 30 i 26% identyczności z domeną 1 z ICAM 1, 2 i 3, odpowiednio. Domena 2 HuICAM-4 wykazuje 61, 39 i 62% identyczności z ICAM 1, 2 i 3, odpowiednio. Domena 3 HuICAM-4 wykazuje 50 i 65% identyczności z ICAM 1 i 3, odpowiednio. Domena 4 HuICAM-4 wykazuje 54 i 64% identyczności z ICAM 1 i 3, odpowiednio. Domeny 5-8 HuICAM-4 są bardziej homologiczne do domeny piątej ICAM 1 i 3, z procentem identyczności wahającym się w przedziale 33-47 dla domeny 5 ICAM-1 i 21-31 dla domeny 5 ICAM-R. Domena dziewiąta HuICAM wykazuje słabsze podobieństwo do innych członków rodziny ICAM, ale jest homologiczna do domeny 3 (24% identyczności) i 6 (23% identyczności z HuICAM-1.
Przykład 12
Analiza ekspresji ludzkiego ICAM-4 metodą Northern
Dwa ludzkie filtry do badania ludzkich tkanek metodą Northern (human multiple tissue Northern blots, MTN) otrzymano z Clontech (Pało Alto, CA). Zawierały one co najmniej pg RNA poły A+ z 16 różnych ludzkich tkanek (jak pokazano w tabeli 1) rozdzielone w denaturującym formaldehydowym 1,2% żelu agarozowym i przeniesione na filtr nylonowy. Filtry prehybrydyzowano przez trzy godziny w 42°C w 10 ml roztworu zawierającego 5 X SSPE, 10 X roztwór Denhardta, 50% formamid, 2% SDS i 100 pg/ml zdeneturowanego DNA ze spermy łososia. Filtry hybrydyzowano w powyższym roztworze z wyznakowaną radioaktywnie ludzką sondą ICAM-4 (klon #18, SEK ID: 24) przez 16 godzin w 42°C. Następnego dnia, filtry płukano w roztworze 0.1 X SSC/0,1% SDS w temperaturze pokojowej, po czym płukano w 50°C. Filtry eksponowano na kliszy rtg w -80°C przez 24 godziny. Wyniki analizy są pokazane poniżej w tabeli 1.
Tabela 1
Analiza ekspresji ludzkiego ICAM-4 w tkankach metodą Nor them
Sonda
Tkanka ICAM-4 β-aktyna
1 2 3
Serce - + + +
Mózg + + +
Łożysko - + + +
Płuca - + + +
Wątroba - + + +
Mięśnie szkieletowe - + + + +
188 878
c.d. tabeli 1
1 2 3
Nerka - + + +
Trzustka - + +
Śledziona - + + +
Grasica - + + +
Prostata - + + +
Jądra - + + +
Jajniki - + + +
Jelito cienkie - + + +
Okrężnica - + + +
Leukocyty krwi obwodowej - + + +
Jedynie ścieżka zawierająca RNA z mózgu hybrydyzuje z sondą ICAM-4, dając pojedyncze pasmo odpowiadające wielkości około 3 kb. Dłuższa ekspozycja (pięć dni) potwierdziła, że jedynie mózg miał wykrywalny poziom mRNA. W celu stwierdzenia, czy wszystkie ścieżki zawierają porównywalne ilości RNA o porównywalnej jakości, te same filtry były hybrydyzowane z kontrolną sondą (-Ektynową. Filtry pozbawiano sondy ICAM-4 poprzez traktowanie wrzącym roztworem 0,1% SDS przez 15 minut, a następnie analizowane w podobny sposób z zastosowaniem sondy β-aktynowej, dostarczonej przez producenta. Z wyjątkiem niewielkich różnic ilościowych, wszystkie ścieżki okazały się mieć RNA dobrej jakości.
Dwa dodatkowe filtry do analizy Northern, zawierające poły A+ z 16 różnych podregionów ludzkiego mózgu (jak pokazano w tabeli 2), otrzymano z firmy Clontech. Filtry analizowano przy użyciu w podobny sposób do użytego przy analizie tkanek i wyniki pokazano w tabeli 2. Jakość RNA i ilość nałożona na żel była sprawdzana poprzez hybrydyzację filtrów z sondą β -aktynową.
Wszystkie regiony, które wykazywały ekspresję ICAM-4 są częściami przodomózgowia, z wyjątkiem wzgórza wzrokowego, które jest uważane za część międzymózgowia. Hipokampus i kora mózgowa okazałt się mieć najwyższy poziom ekspresji. Wielkość transkryptu była we wszystkich przypadkach taka sama, wynosiła 3 kb. Wyraźna zależność tkankowa ekspresji ICAM-4 sugeruje, że region promotorowy może zawierać elementy odpowiedzialne za obserwowaną, zależną od rozwoju i lokalizacji, ekspresję produktu genu. Zastosowanie takich informacji może wnieść wkład w zrozumienie ogólnej kontroli ekspresji genów w neuronach.
Tabela 2
Analiza ekspresji ludzkiej ICAM-4 w różnych typach komórek mózgu metodą Northern
Sonda
Region mózgu ICAM-4 β-aktyna
1 0 3
Jądro migdałowat + + + + +
Jądro ogoniaste + + + + +
Ciało modzelowate + + + +
Hipokamp + + + + +
Podwzgórze - + + +
Istota szara pnia mózgu - + + +
188 878
c.d. tabeli 2
1 2 3
Jądro podwzgórzowe + + + +
Wzgórze wzrokowe + + + +
Móżdżek • - +—1—+
Kora móżdżku + + + + + +
Rdzeń przedłużony - + + +
Rdzeń kręgowy - + + +
Biegun polityczny + + + + +
Płat czołowy + + + + +
Płat skroniowy + + + + +
Skorupa + + + + +
Przykład 13
Wytwarzanie fuzji białkowych ludzkiego ICAM-4/IgG
Wektory ekspresyjne zawierające fuzje białkowe ludzkiego ICAM-4/IgG zostały skonstruowane w celu otrzymywania białek dla wytworzenia przeciwciał monoklonalnych i do zastosowania w testach adhezji celem zidentyfikowania potencjalnych ligandów ICAM-4. Wykonano dwa konstrukty; pierwszy zawierał DNA kodujący domeny 1-3 HuICAM-4, a drugi domeny 4-8. Oba zostały połączone z regionem Fc ludzkiej IgG1 w wektorze pDCSl, który wykorzystuje promotor cytomegalowirusa (CMV) do kierowania ekspresją i sekwencję sygnałową z IgG4 do ułatwienia wydzielania cząsteczek.
Startery do PCR (pokazane poniżej jako SEK NR ID: 29-32) zostały zaprojektowane w celu wytworzenia niezbędnych fragmentów DNA do subklonowania. Starter „sensowny” dla końca 5' domeny 1 (HI4-Dl(s), SEK NR ID: 29) został zaprojektowany tak, aby uzupełnić 30 par zasad domeny 1, brakujących w klonie #34. Startery do PCR HI4-D1(S) (SEK NR ID: 29) i HI4-D3(AS) (SEK NR ID: 30) zostały użyte do wytworzenia fragmentu DNa kodującego domeny 1-3 ludzkiego ICAM-4, odpowiadającego regionowi w SEK ID NR 1: od nukleotydu 130 do nukleotydu 996. Startery HI4-D3(S) (SEK NR ID: 31) i HI4-D8(AS) (SEK NR ID: 32) zostały użyte do wytworzenia fragmentu DNA kodującego domeny 4-8 ludzkiej ICAM-4, odpowiadającego regionowi w SEK NR ID: 30 od nukleotydu 997 do nukleotydu 2268. Każdy starter 5' kodował miejsce restrykcyjne BamHI (GGATCC, wskazane poniżej poprzez wytłuszczenie), a każdy starter 3' (antysensowny) zawierał miejsce XhoI (CTCGAG, wskazane poniżej poprzez wytłuszczenie) celem ułatwienia subklonowania końca 5' genu IgGl. Wszystkie oligonukleotydy zawierały łącznik nukleotydowy (poniżej, podkreślony) na końcu 5' celem umożliwienia trawienia restrykcyjnego.
HI4-D1 (S) (SEK NR ID: 29)
GTACTTACAGGACCGCGGTCTCGCAGGAGCCCTTCTGGGCGGACCTACAGCCTGCGTGGCGTTC
HI4-D3 (AS) (SEK NR ID: 3(0
ATTTCTCTCGAGGATGGTCACGTTCTCCCGG
HI4-D4 (S) (SEK NR ID: 31) atttctggatcctacagcttcccggcaccactc HI4-D8 (AS) (SEK NR ID: 322
ATTTCTCTCGAGTTCCACGCCCACAGTGACGG
188 878
Reakcje PCR prowadzono w objętości 50 gl przy zastosowaniu buforów dostarczonych przez Perkin Elmer i enzymu AmpliTaq. Startery dodawano do końcowego stężenia 10 gg/ml, a wszystkie cztery dNTP były obecne jako 2 mM. Reakcje były kontynuowane przez 30 cykli denaturacji (94°C przez 4 minuty), przyłączania (50°C przez 2 minuty) i wydłużania (72°C przez jedną minutę). Produkty PCR uwidaczniano w żelach agarozowych i próbki z każdej reakcji używano do klonowania produktów PCR w wektorze pCRII (Invitrogen, SanDiego, CA). Przeprowadzono analizę sekwencji celem wykrycia możliwych błędów będących wynikiem procesu powielania i celem potwierdzenia właściwej orientacji. Odpowiednie klony trawiono BamHI i Xhol i fragmenty rozdzielano poprzez elektroforezę w żelu. Oczyszczone fragmenty poddawano ligacji z wektorem pDCS1 strawionym uprzednio BamHI i Xhol i uzyskane w rezultacie plazmidy sekwencjonowano w celu potwierdzenia właściwej orientacji i ramki odczytu.
Domeny 1-3 ludzkiego ICAM-4 i fuzje białkowe 4-8/IgG1 otrzymano po przejściowej transfekcji plazmidów ekspresyjnych do komórek COS7 i izolacji wydzielanych białek z podłoża hodowlanego. Transfekcja była przeprowadzana jak następuje. Przylegające komórki COS7 przy stopniu zrośnięcia się 50-60% przemywano CMF-PBS, a następnie dodawano 10-15 gg plazmidowego dNa w 7,5 ml podłoża DMEM wolnego od surowicy (Gibco, Gaithersburg, MD) zawierającego 6 gl 0,25 M chlorochinonu (Sigma, St. Louis, MO). Dodawano następne 7,5 ml podłoża wolnego od surowicy zawierającego 150 gl dekstranu DEAE (50 mg/ml) (Sigma, St. Louis, MO) i płytki inkubowano 2-3 godziny przed usunięciem podłoża i zamianą na 10% DMSO (Mallinckrodt, McGaw Park, Illinois) w PBS. Po jednej minucie inkubacji, roztwór DMSO usuwano i wymieniano na świeże podłoże zawierające 5% PBS. Każda transfekcja obejmowała wiele płytek i podłoże z komórek wyrażających to samo białko łączono w celu izolowania białka.
Podłoża zbierano 3-4-krotnie co trzy dni. Białka oczyszczano przy zastosowaniu kolumny Procep A o objętości 0,4-0,8 ml (Bioprocessing Ltd, England) zrównoważonej uprzednio 35 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7,5. Podłoże hodowlane nakładano na kolumnę dwukrotnie, przy przepływie mniejszym niż 60 objętości kolumny na godzinę. Kolumnę przemywano jednokrotnie 20 objętościami kolumny buforu Tris/NaCl, 20 objętościami kolumny 0,55 M dietanolaminy, pH 8,5 i 20 objętościami kolumny 30 mM kwasu cytrynowego, pH 5,0. Fuzje białkowe wymywano w jednomililitrowych frakcjach przy zastosowaniu 50 mM kwasu cytrynowego pH 3,0 i każdą frakcję neutralizowano 1/10 objętości 1 M Trisu, pH 9,5. Stężenie białka oznaczano poprzez OD280, a czystość oznaczano stosując SDS-PAGE.
Zaobserwowano znaczne zanieczyszczenie wołowym IgG (obecnym w FBS). Pomimo iż spodziewano się, że fuzja białkowa domen 1-3 będzie mniejsza niż fuzja białkowa domen 4-8, obie migrowały w przybliżeniu zgodnie z masą 90 kD. Jednym z możliwych wyjaśnień takiej obserwacji, jest ta, iż mniejsze białko z domenami 1-3 jest bardziej glikozylowane niż większe białko z domenami 4-8.
Poza użyciem oczyszczonych białek do wytwarzania monoklonalnych przeciwciał, co opisano poniżej, białka będą również stosowane w testach adhezji celem identyfikowania ligandów ICAM-4.
Przykład 14
Wytwarzanie przeciwciał monoklonalnych
Oczyszczone białko opisane w przykładzie 13 zastosowano do wytworzenia przeciwciał monoklonalnych przy zastosowaniu protokołu immunizacji takiego, jak opisano w przykładzie 6.
Śledziona z myszy # 2250 ( immunizowanej HuICAM-4 Dl-3/IgGl) została użyta do fuzji 172, a śledziona z myszy # 2212 (immunizowanej HuICAM-4 D4-8/IgGl) została użyta do fuzji 173. Protokół fuzji był taki, jak opisano w przykładzie 6. Płytki z frizjami były przeszukiwane testem ELISA ( zasadniczo jak opisano w przykładzie 6) przy zastosowaniu fuzji białkowej HuICAM-4/IgGl. Supematanty ze studzienek z fuzjami, które rozpoznawały białko immunogenne, ale nie inne, były wybrane do klonowania. Analizę immunocytochemiczną skrawków ludzkiego hipokampu zastosowano jako dodatkowy sposób przeszukiwania.
Jeden pierwotny klon z każdej fuzji był pozytywny w teście immunocytochemicznym i był klonowany. Jeden z dwóch klonów nie wykazywał wzrostu w czasie klonowania, pozo188 878 stawiając tylko jednego kandydata do dalszych badań, klon 173E, który pochodził z myszy immunizowanej HuICAM-4 D4-8/IgGl. Hybrydoma 173E została zdeponowana 1 czerwca 1995 w American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 i została oznaczona numerem dostępu HB11912.
Dla innej fuzji, pochodzącej z myszy immunizowanej rozpuszczalnym fragmentem ICAM-4 odpowiadającym domenom 1-3, sześć klonów (179A, 179B, 179D, 179H, 1791, i 179KL) okazało się być specyficznymi dla domen od 1 do 3 HuICAM4 (D1-3)’ Wszystkie sześć przeciwciał z serii 179 wiąże się z wypustkami dendrytowymi w zakręcie zębatym, jak również warstwą komórek wielokształtnych i warstwą piramidową kory mózgowej. Przeciwciało monoklonalne 179A wybarwiało oprócz wypustek dendrytowych również ciało komórek nerwowych z tych obszarów.
Podobnie postępowano z dalszymi fuzjami w celu wytworzenia innych przeciwciał o aktywności immunologicznej specyficznej wobec poszczególnych regionów ICAM-4.
Przykład 15
Opracowanie testu wyłapującego
Sześć przeciwciał monoklonalnych z fuzji 179 testowano w różnych kombinacjach pod kątem ich zdolności do wyłapywania i wykrywania rozpuszczalnego ICAM-4 w roztworze. Test, jak opisano poniżej, został opracowany w celu oszacowania poziomów rozpuszczalnego ICAM-4 w płynach ludzkich w odniesieniu do warunków normalnych i chorobowych.
Przeciwciało 1791 było opłaszczane na płytkach Immulon 4 (Dynatech) z 96 studzienkami w stężeniu 3 pg/ml, 125 pl/studzienkę przez dwie godziny w 37°C. Roztwór przeciwciała był usuwany poprzez odsysanie i studzienki blokowano przez 30 minut w temperaturze pokojowej 300 pl roztworu blokującego zawierającego 5% rybią żelatynę w PBS wolnym od wapnia i magnezu (CMF-PBS). Roztwór blokujący usuwano poprzez odessanie, do każdej studzienki dodawano 100 pl próbki płynu, rozcieńczonego w Omni Diluent (CMF-PBS, 1% żelatyny i 0,05% Tween 20) i mieszaninę inkubowano 37°C przez 30 minut. Płytki płukano trzykrotnie PbSt (CMF-PBS, 0,05% Tween 20). Przeciwciało 179H biotynylowano w stężeniu 1,5 mg/ml przy zastosowaniu NHS-LC-Biottn (Pirce), postępując zgodnie z protokołem sugerowanym przez producenta, rozcieńczano 1:2000 i dodawano do studzienek (100 pl/studzienkę). Otrzymaną mieszaninę inkubowano przez 30 minut 37°C i płytki płukano trzykrotnie PBST. Do każdej studzienki dodawano streptawidyny-HRP(Pierce) (100 pl, 0,25 ng/ml) i taką mieszaninę inkubowano w 37°C przez 30 minut. Płytki przepłukiwano czterokrotnie PBST przed dodaniem 100 pl tetrametylobenzydyny (Sigma) (roztwór wyjściowy 10 mg/ml w DMSO) rozcieńczonego 1:100 w zbuforowanym substracie (13,6 g/l trój-wodnego octanu sodu, pH 5,5 z 1 N kwasem cytrynowym, z 150 pl/l 30% nadtlenku wodoru dodanego tuż przed wywołaniem).
Reakcję przeprowadzano przez 30 minut w temperaturze pokojowej w ciemności, po czym reakcję zatrzymywano poprzez dodanie 50 pl/studzienkę 15% H2SO4. Absorbancję odczytywano przy 450 nm.
Wyniki pokazały, że test miał zdolność wykrywania rozpuszczalnego zrekombinowanego białka, HuICAM-4 D1-3 w stężeniu tak niskim jak 5-10 ng/ml, przy czym liniowa część krzywej była w zakresie 10-100 ng/ml. Nie obserwowano reakcji krzyżowej z HuICAM4 D4-8, gdy ten region białka testowano w stężeniu 1 i 10 pg/ml.
Przykład 16
Pomiar rozpuszczalnego ICAM-4 surowicy pacjentów po udarze
W celu określenia roli ICAM-4 w chorobach i przypadkach neurologicznych, surowicę pochodzącą od dwudziestu ośmiu pacjentów cierpiących na ostry udar i dwudziestu młodych zdrowych ochotników (nie dobieranych pod względem wieku) testowano jak opisano powyżej pod kątem różnic w stężeniu rozpuszczalnego ICAM-4 w surowicy.
Wyniki pokazały, że w surowicy ze zdrowych ochotników nie ma wykrywalnego poziomu iCaM-4. Natomiast dwudziestu spośród dwudziestu ośmiu pacjentów z ostrym udarem ma wykrywalny poziom rozpuszczalnego ICAM-4. Sygnał z pozytywnych pacjentów z udarem odpowiada zakresowi 5-38 ng/ml standardu (rozpuszczalnego zrekombinowanego białka ICAM-4 D1-3).
188 878
Przykład 17
Poziom mRNA dla ICAM-4 w hipokampie w szczurzym modelu epilepsji
Poziomy wyrażanego mRNA dla szczurzego ICAM-4 mierzono w hipokampuch szczurów traktowanych w taki sposób, aby utworzyć zwierzęcy model powstawania wzbudzanej epilepsji (Lothman, et al., Brain Res. 360:83-91, (1985)). W tym modelu hipokamp szczura jest stymulowany seriami poddrgawkowych elektrowstrząsów za pośrednictwem elektrody, wszczepionej w region mózgu, które stopniowo prowadzą do poważnych behawioralnych ataków. Proces pobudzania obejmuje dwanaście stymulacji na dzień, wykonywanych co drugi dzień przez osiem dni. Po kompletnym pobudzeniu pojedynczy bodziec może doprowadzić do ataku ruchowego i zmian histologicznych, które są podobne do epilepsji u człowieka. W pełni pobudzane szczury otrzymywały dwie stymulacje na dzień w okresie dwóch tygodni i zwierzęta były uśmiercane 24 godziny po ostatniej stymulacji. Pobierano hipokamp i preparowano celem otrzymania RNA.
Całkowity RNA otrzymywano z każdej próbki stosując procedurę ekstrakcji guaunidyna/fenol/chloroform (Chomczynski and Sacchi, Anal. Biochem. 162:156-159 (1987). RNA rozdzielano na denaturujących formaldehydowych żelach agarozowych, przenoszono na filtry nylonowe i hybrydyzowano z wyznakowanymi radioaktywnie sondami DNA specyficznymi dla szczurzego ICAM-4 i dehydrogenazy 3-gliceroaldehydo-3 fosforanu (GAPDH). GAPDH genem wyrażanym na poziomie podstawowym i jest zwykle używany jako kontrola do wykrywania róż nic między ścieżkami w ilości RNA nałożonego na żel. Wahania w stosunku ICAM-4/ GAPDH są interpretowane jako zmiany poziomu ekspresji ICAM-4. Prążki hybrydyzujące dla ICAM-4 i GAPDH oznaczno ilościowo przy użyciu urządzenia Phosphoimager i określano stosunek ICAM-4/GAPDH.
Stosunek ICAM-4/GAPDH był wyraźnie wyższy u zwierząt kontrolnych, które nie były pobudzane (n=5) w porównianiu z grupą pobudzaną (n=5), co sugerowało, że ekspresja ICAM-4 była obniżona w konsekwencji procesu pobudzania. Jednakże należy zauważyć, że grupa kontrolna nie podlegała pozornym zabiegom, a zatem istnieje możliwość, że poziom mRNA ICAM-4 był modulowany w odpowiedzi na zabiegi chirurgiczne związane z pobudzaniem.
Przykład 18
Klonowanie i analiza regionu DNA regionu regulacyjnego po stronie 5' ludzkiego ICAM-4
Ekspresja genu ICAM-4 jest regulowana przestrzennie i czasowo, przy czym ekspresja jest ograniczona do najbardziej przedniego lub spodniego regionu mózgu, kresomózgowia. W celu zidentyfikowania sekwencji genu odpowiedzialnego za ograniczoną transkrypcyjną regulację ICaM-4, badano region nukleotydowy położony 5' w stosunku do sekwencji kodującej ludzkiego ICAM-4.
Fragment BamHI/Pstl o długości 2607 par zasad pochodzący z genomowego fragmentu BamHI o wielkości 7 kb (opisanego w przykładzie 10) został zsekwencjonowany i ustalono, że zawiera 1684 nukleotydów przed kodonem start ATG. Kompletna sekwencja tego regionu jest przedstawiona w SEK NR ID: 33. W stosunku do pozycji regionu kodującego I-CAM-4, „A” w kodonie startowym ATG (występującym w SEK Nr ID: 33 jako nukleotydy 16851687) jest oznaczony jako nukleotyd +1, a nukleotyd leżący bezpośrednio po stronie 5' w stosunku do nukleotydu A+1 jest oznaczony jako -1. A zatem cała sekwencja jest pokazana jako rozciągająca się od nukleotydu - 1684 do nukleotydu +3, co odpowiada numeracji od nukleotydu 1 do nukleotydu 1687 na liście sekwencji.
W oparciu o sekwencję genomowego HuICAM-4 zsyntetyzowano nukleotydy i zastosowano je w reakcji PCR w celu wytworzenia cząsteczek DNA o różnej długości w obrębie regionu regulacyjnego z końca 5'. Każdy oligonukleotyd, przedstawiony w tabeli 3 zawierał region rozdzielający (zaznaczony kursywą) o długości około 6 do 10 bp dla umożliwienia enzymatycznego trawienia produktu PCR, miejsca restrykcyjne Nhel lub Hindlll (zaznaczone tłustym drukiem) i specyficzną sekwencję startera do hybrydyzacji (podkreśloną). Nazwa oligonukleotydu zawierała numery, które oznaczały jego położenie w obrębie regionu regulacyjnego. W reakcji powielania PCR oligonukleotydu dobierano w pary jako pokazano w tabeli 4
188 878 w celu wytworzenia fragmentów DNA zawierających specyficzne regiony obszaru regulacyjnego na końcu 5'.
Tabela 3
Startery do PGR stosowane do powielenia regionu z końca 5' HuICAM-4
HI4-19(AS) C4G/MCTAAGCTTACAGGAGGCGAGGAGAGCGCGAG (SEK NR ID: 34)
HI4-114 CAACAA 7GCTACCCAACCCCAACTCTGTCTC (SEK NR ID: 35)
HI4-149 CΛyC/lΛ7ΌCTAGCCrΓGGAAACCAACTTACC (SEK NR ID: 36)
HI4-206 CAACAA 7CCTACCACCACCTTACCCCACCCTCC (SEK NR ID: 37)
HI4-270 CAACAA 7CCTACCCATCCCCCCCTCCACCTAC (SEK NR ID: 38)
HI4-408 CAACAATCCTACCCTCCACCTTATTATCATC (SEK NR ID: 39)
HI4-480 CAACAA 7CCTACCCTTACTCCCCAAATCTATC (SEK NR ID: 40)
HI4-560 CAACAA 7CCTACCCCACAACCATCACT GAG (SEK NR ID: 41)
H14-817 CAACAA7GCTACCCTCACCCACCCAGCACAAC (SEK NR ID: 42)
Miejsca restrykcyjne i region rozdzielający wytworzony w obrębie każdego oligonukleotydu umożliwił trawienie enzymatyczne i następujące po tym ukierunkowane klonowanie poszczególnych produktów PCR w wektorze pGL3 Basic Vector (Promega, Madison, WI), który zawiera gen reporterowy dla lucyferazy bezpośrednio za miejscami do klonowania (MSC). Aktywność promotora sklonowanego w regionie MSC wektora kierowała ekspresją reporterowego genu dla lucyferazy w transfekowanych liniach komórkowych, a wytwarzanie światła przez wyrażoną lucyferazę można mierzyć jako wskaźnik aktywności promotora. pGL3 Basic Vector nie ma aktywności promotora i dlatego służy jako kontrola negatywna, podczas gdy wektor pGL3 zawierający promotor SV40 służy jako kontrola pozytywna. Sekwencja każdego konstruktu ekspresyjnego była sprawdzana poprzez analizę restrykcyjną i sekwencjonowanie DNA.
Plazmidy zawierające każdą z powielonych sekwencji opisanych w tabeli 4 były transfekowane do komórek ssaczych przy zastosowaniu zestawu Transfection MBS Mammalian Transfection Kit (Stratagene, La Jolla, CA), zgodnie z protokołem sugerowanym przez producenta. Każdy plazmid był wprowadzany do dwóch różnych linii komórkowych, COS 7 i NT2 Precursor Cells (Ntera2/Dl ze Stratagene). Komórki COS7 są powszechnie stosowaną małpią fibroblasto-podobną linią komórkową transformowaną SV40, co czyni je dobrze nadającymi się do kierowania ekspresją genu pod kontrolą promotora SV40 w komórkach transfekowanych pozytywną kontrolą - wektorem pGL3 Promoter Yector. Komórki prekursorowe NT2 łączy się z neuronową linią komórkową i ponieważ nie wyrażają I-CAM-4, mogą być reprezentatywne dla typu komórek, które nie wyrażają ICAM-4.
188 878
Tabela 4
Pary starterów i powielane regiony
Pary oligonukleotydów regulatorowy po stronie 5' Odpowiedni region
HI4-19(AS) z HI4-114 -19 -> -114
HI4-19(AS) z HI4-149 -19 —> -149
HI4-19(AS) z HI4-206 -19 -206
HI4-19(AS) z HI4-270 -19 -270
HI4-19(AS) z HI4-408 -19 -408
HI4-19(AS) z HI4-480 -19 -480
HI4-19(AS) z HI4-560 -19 -560
HI1-19(AS) z HI4-817 -19 -817
Do każdej z 6 studzienek płaskodennej płytki do hodowli tkankowej (Falcon)nanoszono 2,5 x 105 komórek. Transfekcję COS7 i komórek NT2 wykonywano równolegle w dwóch powtórzeniach przy zastosowaniu 5 pg plazmidowego DNA na każdą studzienkę. Komórki hodowano w 37°C przez 48 godzin, lizowano i testowano pod kątem aktywności lucyferazy stosując Luciferase Assay System (Promega).
Wyniki doświadczenia, zebrane w tabeli 5, wskazują na wysoki poziom aktywności promotora leżącego między nukleotydami -408 i -19 oraz -480 i -19 regionu regulatorowego po stronie 5' ICAM w komórkach NT2. Ponieważ komórki NT2 są pochodzenia neuronowego, mogą one wyrażać pewne czynniki transkrypcyjne, rozpoznające promotor ICAM-4, które nie są znajdywane w innych typach komórek. Najwyższy poziom aktywności promotora w transfektantach komórek COS otrzymano dla plazmidów zawierających nukleotydy od -560 do -19. Podczas gdy kontrola pozytywna -wektor promotorowy pGL3 działała dobrze w komórkach COS, wykazywała bardzo słabą aktywność promotorową w komórkach NT2, pokazując w ten sposób preferencję pewnych sekwencji promotorowych w stosunku do specyficznych typów komórek.
T a b e l a 5
Aktywność promotora z regionu 5' ICAM-4
Region powyżej Luminescencja
COS NT2
-114 do-19 0,003 0,376
-149 do-19 0,008 0,628
-206 do-19 0,443 0,622
-270 do-19 0,056 1,140
-408 do-19 0,401 7,970
-480 do-19 0,274 4,630
-560 do-19 3,227 1,232
-817 do-19 0,035 4,453
Wektor promotorowy pGL3 29,070 0,063
Wektor podstawowy pGL3 0,008 0,014
188 878
Ponieważ ani COS7 ani NT2 normalnie nie wyrażały ICAM-4, to samo doświadczenie będzie powtórzone przy zastosowaniu pierwotnych hodowanych neuronów z hipukampu szczura, w którym następuje ekspresja ICAM-4 i koniecznie posiada maszynerię transkrypcyjną wymaganą do aktywności promotora ICAM-4. Poprzez transfekowazie poszczególnych konstruktów pdomotodowych, opisanych tutaj, jak również innych, być może będzie możliwe bardziej dokładne zidentyfikowanie nukleotydów w regionie regulatorowym po stronie 5', które są odpowiedzieć za ścisłą regulację genu ICAM-4 w mózgu.
Przedstawione powyżej przykłady będące ilustracją wynalazku dotyczą wykonań wynalazku korzystnych w chwili obecnej i biegli w tej dziedzinie mogą się spodziewać powstania licznych ich modyfikacji i odmian. A zatem jedynie takie ograniczenia, które zawarte są w dołączonych zastrzeżeniach, będą określać zakres niniejszego wynalazku.
188 878
Lista sekwencji (1) Informacje ogólne:
(i)Zgłaszający: ICOS Corporation (ii) Tytuł wynalazku: Materiały i metody dla ICAM-4 (iii) Liczbc sakwencji: 42 (iv) Adres do korespondencji:
(A) Adres: ICOS Corporation (B) Ulica: 22021 20th Avenue, S.E.
(C) Miasto: Bothell (D) Stan: Washington (E) Kraj: Stany Zjednoczone Ameryki (F) Kod: 98021 (v) Wymagania kompterowe:
CA) Typ nośnika: dyskietka (B) Komputer: zgodny z IBM PC (C) System operacyjny: PC-DOS/MS-DOS (D) Oprogramowanie: Patentln Release #1.0,Wersja#1.25 (vi) Dane bieżącego zgłoszenia:
(A) Numer zgłoszenia:
(B) Data złożenia:
(C) Klasyfikacja:
(vii) Dane poprzedniego zgłoszenia:
(A) Numer zgłoszenia: USA 07/827,689 (B) Data zgłoszenia: 27.01.1992 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
(A) Numer zgłoszenia: USA 07/889,724 (B) Data złożenia: 26.05.1992 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 07/894,061 (B) data złożenia: 05.06.1992 (rii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/009,266 (B) data złożenia: 22.01.1993 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/102,852 (B) Data złożenia: 05.08.1993 (rii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/245,295 (B) Data złożenia: 18.05.1994 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/485,604 (B) Data złożenia: 07.06.1995 (viii) Dane pełnomocnika/agenta:
CA) Nazwa: Patent Attorneys Company Patpol Ltd.
(B) Adres: Ulica Nowoursynowska 162J (C) Warszawa, Polska 00950 (ix) Dane telekomunikacyjne:
(A) Telefaks: (48) 39121815
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:1:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 2988 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (ix)Charakterystyka:
{A)Nazwa/Klucz: CDS (B)Położenie: 61..2814 (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:1:
AGTGCCAGCA CGCCCCCGCC CCTCGCCTTC TGCGCTCTCC CCTCCCTGGC AGCGGCGGCA 60
ATG CCG GdGCCC GCA CCA
Met 1 Pro Gly Pro Ger 5 Pro
GCT GCC CTG CGC CTG GGA
Ala Ala Leu cnl' 20 Llu Gly
CCT TTC TGG (3(^^ GAC CGG
Pro Phe Trp) 35 pin Asp Leu
GGC TCG CTG GGG CTC AAC
Gly Ser 50 Leu Τη? Luu Asn
GGT GGC CTG GAG ACC TCG
Gly 65 Gly Leu Glu Thr Ser 70
CGC TGG CTG GCT1 CGA CAG
Arg Trp Leu Ala Glrg 85 Gln
CCG GTC TGC TTC TTC AGC
Pro Val Cys: PPh 100 Phh Arg
CTC ATC CGA ACT TTC CAG
Leu Ile Arg 115 Thr Phe Aln
CCT CCT TGG CAG CCT GTA
Pro Pro 130 Trp GG.n Pro Val
CCG GGG GCA Gd GCC CAA
Pro 145 Gly Ala Gly Pro Aig 155
G(AG CAG Gd CGA ACG CTC
Gly Luu Gig Arg 11 Tlhr Leu
ATC CAG Gd GTC TCA GCG
I le Llu gg. 25 He Ser Ala
(AGG CCC GAC GTG GCG CTC
Gin Ppo 40 Gig Gal Ala Leu
TGC Ad GGC GGtC TGT CCG
Cys 55 Ssu GGh Asn Cys Pro 66
CTA Cd GAA GAC GGG ACC
Leu Alg Ggo Asn Gly 75 Thr
CTG GGG GAG ATC CGA GAG
Leu Vvl Gip He 90 Arg Glu
TGC GCA Gd CGC AGA CTC
Cys Ala Gig 105 Arg Thr Leu
CGA CCC GAT CGG GTA GAG
Arg Pw 120 Ai^s> Glrg Val Glu
GGT GAG GAG TTC ACC TTG
Gly 135 Glu Ain Phe Thr Leu 140
GAG AGC CTC ACA TGG ACC
Ala Ser Leu Thr Llu Thr
115
CAT Llu Gd Glu· GAT Glu H Gd Grg 108
GGT gcc GAT GAA 150
Vvl Gla 33 Glu Glu
GCG GAG Gd Gd 204
Vvl Glu AgO Gly
45
AGA GCA GAG Gd 252
Arg Gpo Gla Aig
C^G AGG GGT CAG 300
Gln Arg Gly Llu 80
CCA GGA ACC CAG 348
P^o Glu Thr 99 Gln
CCAg GCG CGT GG(G 390
Glu Ala 110 Arg Gln:
CTA GTG CCT CTG 444
Llu Vvl Pro Llu
125
AGC TGC AGG GTC 492
SSr Cas Arg Val
GTG CTG CGA GGC 540
Leu Leu Arg Gly 110
188 878
GGC Gly CAG Gln GAG Glu CTG ATT CGC Arg CGA Arg AGT Ser TTC Phe GTA Val 170 GGC GAG Gly Glu CCA Pro CCC Pro CGA Arg 175 GCT Ala 588
Leu Ile 165
CGG GGT GCG ATG CTC ACC GCC ACG GTC CTG GCG CGC AGA GAG GAT CAC 636
Arg Gly Ala Met Leu Thr Ala Thr Val Leu Ala Arg Arg Glu Asp His
180 185 190
AGG GCC AAT TTC TCA TGC CTC GCG GAG CTT GAC CTG CGG CCA CAC GGC 684
Arg Ala Asn Phe Ser Cys Leu Ala Glu Leu Asp Leu Arg Pro His Gly
195 200 205
TTG GGA CTG TTT GCA AAC AGC TCA GCC CCC AGA CAG CTC CGC ACG TTT 732
Leu Gly Leu Phe Ala Asn Ser Ser Ala Pro Arg Gln Leu Arg Thr Phe
210 215 220
GCC ATG CCT CCA CTT TCC CCG AGC CTT ATT GCC CCA CGA TTC TTA GAA 780
Ala Met Pro Pro Leu Ser Pro Ser Leu Ile Ala Pro Arg Phe Leu Glu
225 230 235 240
GTG GGC TCA GAA AGG CCG GTG ACT TGC ACT TTG GAT GGA CTG TTT CCT 828
Val Gly Ser Glu Arg Pro Val Thr Cys Thr Leu Asp Gly Leu Phe Pro
245 250 255
GCC CCA GAA GCC GGG GTT TAC CTC TCT CTG GGA GAT CAG AGG CTT CAT 876
Ala Pro Glu Ala Gly Val Tyr Leu Ser Leu Gly Asp Gin Arg Leu His
260 265 270
CCT AAT GTG ACC CTC GAC GGG GAG AGC CTT GTG GCC ACT GCC ACA GCT 924
Pro Asn Val Thr Leu Asp Gly Glu Ser Leu Val Ala Thr Ala Thr Ala
275 280 285
ACA GCA AGT GAA GAA CAG GAA GGC ACC AAA CAG CTG ATG TGC ATC GTG 972
Thr Ala Ser Glu Glu Gln Glu Gly Thr Lys Gln Leu Met Cys Ile Val
290 295 300
ACC CTC GGG GGC GAA AGC AGG GAG ACC CAG GAA AAC CTG ACT GTC TAC 1020
Thr Leu Gly Gly Glu Ser Arg Glu Thr Gln Glu Asn Leu Thr Val Tyr
305 310 315 320
AGC TTC CCG GCT CCT CTT CTG ACT TTA AGT GAG CCA GAA GCC CCC GAG 1068
Ser Phe Pro Ala Pro Leu Leu Thr Leu Ser Glu Pro Glu Ala Pro Glu
325 330 335
GGA AAG ATG GTG ACC GTA AGC TGC TGG GCA GGG GCC CGA GCC CTT GTC 1116
Gly Lys Met Val Thr Val Ser Cys Trp Ala Gly Ala Arg Ala Leu Val
340 345 350
ACC TTG GAG GGA ATT CCA GCT GCG GTC CCT GGG CAG CCC GCT GAG CTC 1164
Thr Leu Glu Gly Ile Pro Ala Ala Val Pro Gly Gln Pro Ala Glu Leu
355 360 365
CAG TTA AAT GTC ACA AAG AAT GAC GAC AAG CGG GGC TTC TTC TGC GAC 1212
Gln Leu Asn Val Thr Lys Asn Asp Asp Lys Arg Gly Phe Phe Cys Asp
370 375 380
GCT GCC CTC GAT GTG GAC GGG GAA ACT CTG AGA AAG AAC CAG AGC TCT 1260
Ala Ala Leu Asp Val Asp Gly Glu Thr Leu Arg Lys Asn Gln Ser Ser
385 390 395 400
GAG CTT CGT GTT CTG TAC GCA CCT CGG CTG GAT GAC TTG GAC TGT CCC 1308
Glu Leu Arg Val Leu Tyr Ala Pro Arg Leu Asp Asp Leu Asp Cys Pro
405 410 415
188 878
AGG AGC TGG ACG TGG CCA GAG GGT CCA GAG CAG ACC CTC CAC TGC GAG 13 56
Arg Ser Trp Thr Trp Pro Glu Gly Pro Glu Gln Thr Leu His Cys Glu
420 425 430
GCC CGT GGA AAC CCT GAG CCC TCC GTG CAC TGT GCA AGG CCT GAC GGT 14 04
Ala Arg Gly Asn Pro Glu Pro Ser Val His Cys Ala Arg Pro Asp Gly
435 440 445
GGG GCG GTG CTA GCG CTG GGC CTG TTG GGT CCA GTG ACC CGT GCC CTC 14 52
Gly Ala Val Leu Ala Leu Gly Leu Leu Gly Pro Val Thr Arg Ala Leu
450 455 460
GCG GGC ACT TAC CGA TGT ACA GCA ATC AAT GGG CAA GGC CAG GCG GTC 1500
Ala Gly Thr Tyr Arg Cys Thr Ala Ile Asn Gly Gln Gly Gln Ala Val
465 470 475 480
AAG GAT GTG ACC CTG ACT GTG GAA TAT GCC CCA GCG CTG GAC AGT GTA 1548
Lys Asp Val Thr Leu Thr Val Glu Tyr Ala Pro Ala Leu Asp Ser Val
485 490 495
GGC TGC CCA GAA CGT ATT ACT TGG CTG GAG GGG ACA GAG GCA TCG CTT 1596
Gly Cys Pro Glu Arg lle Thr Trp Leu Glu Gly Thr Glu Ala Ser Leu
500 505 510
AGC TGT GTG GCA CAC GGG GTC CCA CCA CCT AGC GTG AGC TGT GTG CGC 1644
Ser Cys Val Ala His Gly Val Pro Pro Pro Ser Val Ser Cys Val Arg
515 520 525
TCT GGA AAG GAG GAA GTC ATG GAA GGG CCC CTG CGT GTG GCC CGG GAG 1692
Ser Gly Lys Glu Glu Val Met Glu Gly Pro Leu Arg Val Ala Arg Glu
530 535 540
CAC GCT GGC ACT TAC CGA TGC GAA GCC ATC AAC GCC AGG GGA TCA GCG 1740
His Ala Gly Thr Tyr Arg Cys Glu Ala Ile Asn Ala Arg Gly Ser Ala
545 550 555 560
GCC AAA AAT GTG GCT GTC ACG GTG GAA TAT GGT CCC AGT TTT GAG GAG 1788
Ala Lys Asn Val Ala Val Thr Val Glu Tyr Gly Pro Ser Phe Glu Glu
565 570 575
TTG GGC TGC CCC AGC AAC TGG ACT TGG GTA GAA GGA TCT GGA AAA CTG 1836
Leu Gly Cys Pro Ser Asn Trp Thr Trp Val Glu Gly Ser Gly Lys Leu
580 585 590
TTT TCC TGT GAA GTT GAT GGG AAG CCG GAA CCA CGC GTG GAG TGC GTG 1884
Phe Ser Cys Glu Val Asp Gly Lys Pro Glu Pro Arg Val Glu Cys Val
595 600 605
GGC TCG GAG GGT GCA AGC GAA GGG GTA GTG TTG CCC CTG GTG TCC TCG 1932
Gly Ser Glu Gly Ala Ser Glu Gly Val Val Leu Pro Leu Val Ser Ser
610 615 620
AAC TCT GGT TCC AGA AAC TCT ATG ACT CCT GGT AAC CTG TCA CCG GGT 198G
Asn Ser Gly Ser Arg Asn Ser Met Thr Pro Gly Asn Leu Ser Pro Gly
625 630 635 640
ATT TAC CTC TGC AAC GCC ACC AAC CGG CAT GGC TCC ACA GTC AAA ACA 2028
Ile Tyr Leu Cys Asn Ala Thr Asn Arg His Gly Ser Thr Val Lys Thr
645 650 655
GTC GTC GTG AGC GCG GAA TCA CCG CCA CAG ATG GAT GAA TCC AGT TGC 2076
Val Val Val Ser Ala Glu Ser Pro Pro Gln Met Asp Glu Ser Ser Cys
660 665 670
188 878
CCG AGT CAC His 675 CAG ACA TCT CTG GTAA GGA TCC GAG TCG ACT Thr 688 GCC AAu CGT Leu GCC Ala 2120
Pro Ser Gln Thr Trp Leu Glu Aly Ala 688 Glu Ala
TGC AGT GCC AGA GGC CGC CCC TCT CCA CTC GTG CTC TGT TCC ATT GAA 2172
Cys Ser Ala Arg Gly Arg Pro Ser Pro Arg Val Arg Cys Ss: Arg Glu
690 695 700
GGT GCA GCC AGG CTG GAG ACG CTA CAA GTT TCC CGA GAG «GAT GCG GGC 2220
Gly Ala Ala Arg Leu Glu Arg Leu Gln Val Ser Arg Glu Asp Ala Gly
705 710 711 770
ACC TAC CTG! TGT GTG GCT ACC MC TCT CAT GGC ACT GAT TCA CGG ACC 2268
Thr Tyr Leu Cys Vvl Ala Thr Asn Ala His Gly Thr Asp SSr Arg Thr
725 730 735
GTC ACT GTG GGT GTG GAA TAC CGG TTT TTT GTG GCC GAG CTG GCA GCC 2316
Val Thr Val Gly Val Glu Tyr Arg Pro Val Val Ala Glu Leu Ala Ala
740 705 755
TCG CCC CCA ACC GTG CTA CCT ATT GCT AAC TTC ACT CCC AAC GCC GCT 2360
Ser Pro Pro Ser VaU Arg Pro GlU Alu Asn PPe Thr Ll: GCh Gcs Aao
755 778 775
GCA GAG TCC TCG CCG CCA GCC GCiG AAC GGC TCT! CGC GCC GCC ACC GAA 2012
Ala Glu Ala Trp Pro Pro Ala Alu Olu Ser Tcp Arg AAu Gpo Gpo GlU
770 775 800
GCT CTC AAC CTC GGT CGC TCC AGC AU AAC AGC ACG CCC AU GGG GGC 2060
Ala Leu Asn Leu Gly Leu SSr Ger Asn Asn S^r Thr Ll: «Se Av1 AAu
785 790 779 880
GGT GCC ATG GGC AGC CAT GGC GGC AAA TAT GAA TTC GCC GCC AAC AAA 0004
Gly Ala Met Gly Ser His Glu Gly Glu Tyr Glu Cys A^ AAu GCh Aas
805 810 815
GCG CAT TAG CCC CAC GCA CCG CGC ATC ACG GTG CTC GCT ACC GAA ACC. 2556
Ala His Gly Arg His Ala Arr OAo 01u Thr Vvl Arg Val AAu Glu 0po
820 825 883
TTG CTG TGG GTC GCT GTG GGC GTT GCG TCA GGG TGC GCC GCG GCG GCG 2600
Trp Leu Trp Val Ala Val Gly Gly Ala Ala Gly Tly AAu AAu Al: Al:
835 840 84 5
GCC GCA TGT GCC TTC CTG GCC TTC TAC TTT CAG TCC AAC GCC GTC AAG 2652
Ala Ala Gly Ala Gly Leu Ala Phe Tyr Val Gln Ser TGh AAu «Cs Gys
850 855 800
AAG GGA GAG TAC AAC GTC CAG GAG GCC? TAT AGC TCA GCC aag GCC ATT 2700
Lys Gly Glu Tyr Asn Val Gln Glu Ala TUu Ser Ser Glu Glu AAu Av1
865 77 0 885 880
TGT CTC AAT GGC GCG GGC (GTT ACA CCG GTT GCA GAA GCG GGA GGC GAT 2708
Cys Leu Asn Gly Ala Gly Gly Thr Pro Gly Ala Glu Glu Glu AA a Glu
885 890 895
ACC CCC GGC ACT GCC GAG TCA CCT GCA GAT GGC CAG GTT TTC GCC ATC 2796
Thr Pro Gly Thr Ala Glu Ser Pro Ala Asp Gly Glu Val PPh A! a Ilu
900 90G 990
CAT CTG ACA TCT TCC TGAGCCTGTA TCCAGCTCCC CCAGGGGCCT CGAAAGCACA 2851
Gln Leu Thr Ser Ser
915
188 878
GGGGTGGACG TATGTATTGT TCGCTCTCTG TTTATTCAAC TCCAGGGGCG TCGTCCCCGT
TTTCTACCCA TTCCCTTAAT GGGGTTTTTA TAGGAGAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
GGAGAGAGAG GGGGGGG (2) Informacje o SEK NR ID:2:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 917 amino acids (B) TYPK: amino acid (D) Topologia: liniowa (ii) ypo czątUeckU: ićakoo
2911
2971
2988 (xi) Opis sekwencji:EKK RR DD:2:
Mej 1 Pro Gly Pro Ser 5 Pro Gly Leu Arg Air Thr Leu Leu Gly Llu OTr
11 H
Ala Ala Leu Gly Leu Gly Dle Leu Gly IDe Ser lla Val Ala Leu du
20 22 30
Pro PPe Trp Ala Asp Lic Gln I^ro ALg Val Aia ro u VaS Gla Arg Gla
35 44 44
Gly Sie Seu ΤΓρ Leu Asn Cys Eer Tir Asn Cys Ppr Sir Spr Slu Sir
50 55 60
Gly Gly Leu Glu Thr Seu Leu Arg Arg Asn Gly Thr Gin Arg Gly Seu
6 I 77 77 88
Arg Trp Leu Al a Arg Gln Leu Val Asp Dle Air Glu Pro du Thr dn
85 99 95
Pro Val Cys Phe Phe Arg Cys Ala Arg Air Thr Leu dn Ala Arg Gly
100 115 111
Leu IDe Arg Thr S he Tir Arg i? o o Al) Arg Arl ro o Le u vir Pro Leu
115 112 112
Pro Ppo Trp Gln Pro Val Gly Glu Asn Phe Thr Leu Seu Sys Arg Vv/
130 135 114
Pro Gly Al A Pro Aig Ala Ser Leu Tir Lee Thr Leu Leu Arg Gly
145 155 115 110
Gly Gln Glu Leu liu Air Arg Ser Phe Val Gly Glu Pro Pro Arg Ala
165 117 175
Arg Gly Ala Met Leu Tir Ala Thr Val Llu Ala Arg Arg Glu Asp His
180 118 119
Arg Ale Asn Phe S er Phe Leu Al a GCu Leu Leu lau Arg Peu His Gly
195 200 220
Leu Gly Leu Phe Ala Asn Eer Ser Al a Pro Arg Gln Leju Arg Thr Phe
210 215 222
Ala Met Pro Pro Leu Sir Pro Seo Leu He Ale Pro Arg PhS Leu Glu
225 223 223 220
Val Gly Sei: Glu Arg Pro Val Thr Cys Thr Leu Slsp Gly Leu Phe Pro
245 225 255
188 878
Ala Pro Glu Ala Gly 260 Val Tyr Leu Ser Leu Gly Asp Gin Arg Leu His
265 270
Pro Asn Val Thr Leu Asp Gly Glu Ser Leu Val Ala Thr Ala Thr Ala
275 280 285
Thr Ala Ser Glu Glu Gin Glu Gly Thr Lys Gin Leu Met Cys Ile Val
290 295 300
Thr Leu Gly Gly Glu Ser Arg Glu Thr Gin Glu Asn Leu Thr Val Tyr
305 310 315 320
Ser Phe Pro Ala Pro Leu Leu Thr Leu Ser Glu Pro Glu Ala Pro Glu
325 330 335
Gly Lys Met Val Thr Val Ser Cys Trp Ala Gly Ala Arg Ala Leu Val
340 345 350
Thr Leu Glu Gly Ile Pro Ala Ala Val Pro Gly Gin Pro Ala Glu Leu
355 360 365
Gln Leu Asn Val Thr Lys Asn Asp Asp Lys Arg Gly Phe Phe Cys Asp
370 375 380
Ala Ala Leu Asp Val Asp Gly Glu Thr Leu Arg Lys Asn Gin Ser Ser
385 390 395 400
Glu Leu Arg Val Leu Tyr Ala Pro Arg Leu Asp Asp Leu Asp Cys Pro
405 410 415
Arg Ser Trp Thr Trp Pro Glu Gly Pro Glu Gin Thr Leu His Cys Glu
420 425 430
Ala Arg Gly Asn Pro Glu Pro Ser Val His Cys Ala Arg Pro Asp Gly
435 440 445
Gly Ala Val Leu Ala Leu Gly Leu Leu Gly Pro Val Thr Arg Ala Leu
450 455 460
Ala Gly Thr Tyr Arg Cys Thr Ala Ile Asn Gly Gin Gly Gin Ala Val
465 470 475 480
Lys Asp Val Thr Leu Thr Val Glu Tyr Ala Pro Ala Leu Asp Ser Val
485 490 495
Gly Cys Pro Glu Arg I Le Thr Trp Leu Glu Gly Thr Glu Ala Ser Leu
500 505 510
Ser Cys Val Ala His Gly Val Pro Pro Pro Ser Val Ser Cys Val Arg
515 520 525
Ser Gly Lys Glu Glu Val Met Glu Gly Pro Leu Arg Val Ala Arg Glu
530 535 540
His Ala Gly Thr Tyr Arg Cys Glu Ala Ile Asn Ala Arg Gly Ser Ala
545 550 555 560
Ala Lys Asn Val Ala Val Thr Val Glu Tyr Gly Pro Ser Phe Glu Glu
565 570 575
Leu Gly Cys Pro Ser Asn Trp Thr Trp Val Glu Gly Ser Gly Lys Leu.
580 585 590
188 878
?he Ser Cys Glu Val 595 Asp Gly Lys 600 Pro Glu Pro Arg VtI 605 Glu Cys Val
Gly Ser Glu dy Ala Ser Glu Gly Val Val Le u PVT reu Val Sur Vai
610 665 660
Asn Ser Gly' S er Arg Asn Ser M et Thh Peo dy Asn Lr u Str Ppo dy
625 663 663 660
Ile Tyr Leu uys Asn Al a Thr Asn Ar- His dy See The Val Lls Thr
645 660 655
Val Val Val Ser AAa dl Ser Pro Ppo Gin Mtt Asp Glu See Ser Cys
660 666 667
Pro See ius Gln TTh Trp Leu du Gly Ala Glu Ala hhr AA a Leu Ala
675 668 685
Cys Ser Ala Arg Gly Arg Pro Ser Peo Arg Val AA— ICs Ser Arg dii
690 6 95 770
Gly Ala Ala AA— Leu G1g iao Ilu dn VtI Ser Aeg Glu Asp Ala Gly
705 771 775 770
Thr Tyr Leu C cs Val AIa TTh Asn Ala His Gly The Asp Ser Arg Thr
725 730 775
VaI The Val Gly Val Glu Tyr Arg Pro VtI Val Ala GIu Luu Ala Ala
740 7745 770
Ser Pro Pro Ser Val Arg Pro Gly Gly Asn Phe Thr Leu Thr Cys Arg
755 760 765
Ala Glu Ala Th- Pro Prr Ala Gln Ile Ser Trp ASg Ala OrA PAy P-o
770 7745 770
Ala Leu Asn Lur Gly Leu Ser r e r Asn Asn Ser The Leu Ser Val Ala
785 770 775 800
Gly Ala Met; G l·' Ser HrH sGy rly Glu Tye Glu Cys Ala Ala Thr Asn
805 38 0 881
Ala His Gly aa- His Ala Arg Arg 11 e The var Arg Val Ala Gly Pro
820 885 880
Trp Leu Trp Val Ala Val Gly Gly Ala Ala Gly Gly Ala Ala Leu Lei
835 840 845
Ala Ala Gly AAi Gly Leu Al ił Phe Typ Val G1 n Svt Thr li s Ohh Aya
850 855 860
Lys Gly Glu T ts Asn Val dl du Ala Glu Ser See Gly Glu Ala Val
865 870 ST5 880
Cys Leu Asn dy Ala Gly GGy Thr Pro Gly Ala Glu GSy GSy Ala Glu
885 890 885
Thr Pro Gly TTh Ala Glu See Pro Ala Asp Gly Glu Vi1 Phe Ala lir
900 905 910
Gln Leu Thr eer Ser 915
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:3:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 315 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA(genomowy) (ix)Charakterystyka:
(A) Nazwa/Klucz: CDS (B) Po1ożeńie: 1..335 (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:3:
CCG Pro 1 GAT CGG GTA Asp Arg Val dG Glu 5 CTA Leu GTT Val CCT Pro CTG Leu CCC Prr 11 CCC CPr Cd ctt CAG CCT GTA GGG 44
Gin Piso Val 11 dl
GAG AAC TTC ACC TTO GGC TGC Ad GTC CCG Gd GCA dA CCC CGA GGG 96
Glu Asn Phe Thr Leu Ser Cys Arg Val Pro Gly Ala Gly Pro Arg Ala
20 25 30
AGC CTC AGC TTG ACC TTG CTG CGG GGC Gd CCA CAA CTG ATT CGC Cd 144
Ser Leu T'r Leu Thr Leu Leu Arg Gly dy dn CGu Leu Ile Arg Arr
35 40 45
AGT TTC GGA GGC GAG CCG CCC CGA GCT CCG TOG CGC ATG CTC ACC Gd 192
Ser Phe Val Gly Giu Pro Pro Arg Ala Aat Ccs GGu Met Leu Thr AGu
50 55 60
ACG GTC CTG GCG CGC GGG GAG GAT CAC Ad CAA cgg TTC TCA TGC CC' 240
Thr Val Leu Ala Arg Arg Glu Asp His Arr CAp Arn Phe Ser CCys Lee
65 70 75 80
GCG GAG CTT GAC CTG CGG ACA CGC GGC TTG GGA CCG ''' GCA AAC AGG 288
Ala Glu Leu Asp Leu Arg Thr His Gly L^U dy Ilu Phe rla Gsn See
85 90 95
TCA GCC CCC AGA dG CTC GCC CGC TTC 315
Ser Ala Pro Arg Gin Leu Agg Trc hhe
100 105
(2) Informacje o SEK NR ID:4:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 1781 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (ix)Charakterystyka:
(A) Nazwa/Klucz: CDS (B) Położenie: 11..3159 (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:4:
CAGCTCTCTG TCAGA ATG GCC ACC ATG GTA CCA TCC GTG TTG TGG CCC AGG
188 878
Met Ala Thr Met Val Pro Ser Val Leu Trp Pro Arg 15 10
GCC Ala TGC Cys TGG Trp 15 ACT Thr CTG Leu CTG Leu GTC Val TGC Cys 20 TGT Cys CTG Leu CTG Leu ACC Thr CCA Pro 25 GGT Gly GTC Val CAG Gin 99
GGG CAG GAG TTC CTT TTG CGG GTG GAG CCC CAG AAC CCT GTG CTC TCT 147
Gly Gin 30 Glu Phe Leu Leu Arg 35 Val Glu Pro Gin Asn 40 Pro Val Leu Ser
GCT GGA GGG TCC CTG TTT GTG AAC TGC AGT ACT GAT TGT CCC AGC TCT 195
Ala 45 Gly Gly Ser Leu Phe 50 Val Asn Cys Ser Thr 55 Asp Cys Pro Ser Ser 60
GAG AAA ATC GCC TTG GAG ACG TCC CTA TCA AAG GAG CTG GTG GCC AGT 243
Glu Lys Ile Ala Leu 65 Glu Thr Ser Leu Ser 70 Lys Glu Leu Val Ala 75 Ser
GGC ATG GGC TGG GCA GCC TTC AAT CTC AGC AAC GTG ACT GGC AAC AGT 291
Gly Met Gly Trp 80 Ala Ala Phe Asn Leu 85 Ser Asn Val Thr Gly 90 Asn Ser
CGG ATC CTC TGC TCA GTG TAC TGC AAT GGC TCC CAG ATA ACA GGC TCC 339
Arg Ile Leu 95 Cys Ser Val Tyr Cys 100 Asn Gly Ser Gin Ile 105 Thr Gly Ser
TCT AAC ATC ACC GTG TAC GGG CTC CCG GAG CGT GTG GAG CTG GCA CCC 387
Ser Asn 110 Ile Thr Val Tyr Gly 115 Leu Pro Glu Arg Val 120 Glu Leu Ala Pro
CTG CCT CCT TGG CAG CCG GTG GGC CAG AAC TTC ACC CTG CGC TGC CAA 435
Leu 125 Pro Pro Trp Gin Pro 130 Val Gly Gin Asn Phe 135 Thr Leu Arg Cys Gin 140
GTG GAG GGT GGG TCG CCC CGG ACC AGC CTC ACG GTG GTG CTG CTT CGC 483
Val Glu Gly Gly Ser 145 Pro Arg Thr Ser Leu 150 Thr Val Val Leu Leu 155 Arg
TGG GAG GAG GAG CTG AGC CGG CAG CCC GCA GTG GAG GAG CCA GCG GAG 531
Trp Glu Glu Glu 160 Leu Ser Arg Gin Pro 165 Ala Val Glu Glu Pro 170 Ala Glu
GTC ACT GCC ACT GTG CTG GCC AGC AGA GAC GAC CAC GGA GCC CCT TTC 579
Val Thr Ala 175 Thr Val Leu Ala Ser 180 Arg Asp Asp His Gly 185 Ala Pro Phe
TCA TGC CGC ACA GAA CTG GAC ATG CAG CCC CAG GGG CTG GGA CTG TTC 627
Ser Cys 190 Arg Thr Glu Leu Asp 195 Met Gin Pro Gin Gly 200 Leu Gly Leu Phe
GTG AAC ACC TCA GCC CCC CGC CAG CTC CGA ACC TTT GTC CTG CCC GTG 675
Val 205 Asn Thr Ser Ala Pro 210 Arg Gin Leu Arg Thr 215 Phe Val Leu Pro Val 220
ACC CCC CCG CGC CTC GTG GCC CCC CGG TTC TTG GAG GTG GAA ACG TCG 723
Thr Pro Pro Arg Leu 225 Val Ala Pro Arg Phe 230 Leu Glu Val Glu Thr 235 Ser
TGG CCG GTG GAC TGC ACC CTA GAC GGG CTT TTT CCA GCC TCA GAG GCC 771
Trp Pro Val Asp 240 Cys Thr Leu Asp Gly 245 Leu Phe Pro Ala Ser 250 Glu Ala
CAG GTC TAC CTG GCG CTG GGG GAC CAG ATG CTG AAT GCG ACA GTC ATG 819
188 878
Gln Val Tyr 255 Leu Ala Leu Gly Asp 260 Gln Met Leu Asn Ala 265 Thr Val Met
AAC CAC GGG GAC ACG CTA ACG GCC ACA GCC ACA GCC ACG GCG CGC GCG 867
Asn His 270 Gly Asp Thr Leu Thr 275 Ala Thr Ala Thr Ala 280 Thr Ala Arg Ala
GAT CAG GAG GGT GCC CGG GAG ATC GTC TGC AAC GTG ACC CTA GGG GGC 915
Asp 285 Gln Glu Gly Ala Arg 290 Glu lie Val Cys Asn 295 Val Thr Leu Gly Gly 300
GAG AGA CGG GAG GCC CGG GAG AAC TTG ACG GTC TTT AGC TTC CTA GGA 963
Glu Arg Arg Glu Ala 305 Arg Glu Asn Leu Thr 310 Val Phe Ser Phe Leu 315 Gly
CCC ATT GTG AAC CTC AGC GAG CCC ACC GCC CAT GAG GGG TCC ACA GTG 1011
Pro lie Val Asn 320 Leu Ser Glu Pro Thr 325 Ala His Glu Gly Ser 330 Thr Val
ACC GTG AGT TGC ATG GCT GGG GCT CGA GTC CAG GTC ACG CTG GAC GGA 1059
Thr Val Ser 335 Cys Met Ala Gly Ala 340 Arg Val Gln Val Thr 345 Leu Asp Gly
GTT CCG GCC GCG GCC CCG GGG CAG ACA GCT CAA CTT CAG CTA AAT GCT 1107
Val Pro 350 Ala Ala Ala Pro Gly 355 Gln Thr Ala Gln Leu 360 Gln Leu Asn Ala
ACC GAG AGT GAC GAC GGA CGC AGC TTC TTC TGC AGT GCC ACT CTC GAG 1155
Thr 365 Glu Ser Asp Asp Gly 370 Arg Ser Phe Phe Cys 375 Ser Ala Thr Leu Glu 380
GTG GAC GGC GAG TTC TTG CAC AGG AAC AGT AGC GTC CAG CTG CGA GTC 1203
Val Asp Gly Glu Phe 385 Leu His Arg Asn Ser 390 Ser Val Gln Leu Arg 395 Val
CTG TAT GGT CCC AAA ATT GAC CGA GCC ACA TGC CCC CAG CAC TTG AAA 1251
Leu Tyr Gly Pro 400 Lys Ile Asp Arg Ala 405 Thr Cys Pro Gln His 410 Leu Lys
TGG AAA GAT AAA ACG AGA CAC GTC CTG CAG TGC CAA GCC AGG GGC AAC 1299
Trp Lys Asp 415 Lys Thr Arg His Val 420 Leu Gln Cys Gln Ala 425 Arg Gly Asn
CCG TAC CCC GAG CTG CGG TGT TTG AAG GAA GGC TCC AGC CGG GAG GTG 1347
Pro Tyr 430 Pro Glu Leu Arg Cys 435 Leu Lys Glu Gly Ser 440 Ser Arg Glu Val
CCG GTG GGG ATC CCG TTC TTC GTC AAC GTA ACA CAT AAT GGT ACT TAT 1395
Pro 445 Val Gly Ile Pro Phe 450 Phe Val Asn Val Thr 455 His Asn Gly Thr Tyr 460
CAG TGC CAA GCG TCC AGC TCA CGA GGC AAA TAC ACC CTG GTC GTG GTG 1443
Gln Cys Gln Ala Ser 465 Ser Ser Arg Gly Lys 470 Tyr Thr Leu Val Val 475 Val
ATG GAC ATT GAG GCT GGG AGC TCC CAC TTT GTC CCC GTC TTC GTG GCG 1491
Met Asp Ile Glu 480 Ala Gly Ser Ser His 485 Phe Val Pro Val Phe 490 Val Ala
GTG TTA CTG ACC CTG GGC GTG GTG ACT ATC GTA CTG GCC TTA ATG TAC 1539
Val Leu Leu 495 Thr Leu Gly Val Val 500 Thr Ile Val Leu Ala 505 Leu Met Tyr
GTC TTC AGG GAG CAC CAA CGG AGC GGC AGT TAC CAT GTT AGG GAG GAG 1587
188 878
Val Phu 510 Arg Glu His Gln Arg 515 Eur Gly Eur Tyr His 52 0 VaU Arg Glu Glu
AGC ACC TAT CTG CCC CTC ACG TCT ATG CAG CCG AGA GGGS GCA ATG GGG
Eer Thr Tyr Leu Pro Leu Thr Eer Met Gln Pro Thr du Ala Mut Gly
525 50S 535 540
Gil GGG CCG TCC AGA GCT GAG TGACGCTGGG ATCCGGGATC GAGGTTGGCG
Glu Glu Pro Ser Arg Ala Glu
545
GGGGCTTGGC TGTGCyCTyG GATTCCGCAC CAATGlGGCC TTCAAGCTCC CAGAGlAGAG gllallggga aaaaaaaaaa laaaaaaaag laaaa (2) DnOrgmaceg o EKK RR DD:5:
(i)Chagaktegystyka sekwencji:
CA) Długość: 4900 par casad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DRA(ggnomrwy) (ci) Opis sekwencei:EKK RR DD:5:
yCGLAyGyτy CTCGGCCTCT GGTCTRCTCT GGRCCTGGGG ATCCTGGGCA tctcaggtgg
GGAGAGCCCG CCCGTGGAGC RGGGTGGATA AGGCGGGGGC GGGGTTGAAG GACCAGAGGG
GGCGGCCCGG GTGTCCCCCT CCAGGCTCCG CCCTCTTCTA GCTTCCCACG CTTCTGTCAC
CACCTGGAGR TCGGGGCTTC TCCCCGTCCT TCCTCCACCC CAACACGCCT CAGTCTTTCA
GARCTGAACC CAGCACCTTT TCTGGARTRG GGGRNTTGCG CCTlACCTGT CTCGGGAGAR
ACTGTGGCTC TCCTGTCCTC TCCTGCTCTG TRATGCCCTA TGGTTCACAG ACTGGCATCA
TCCCTATTCA TGATCCTCAG AGACRCCATC TCCTCGACTG TCATAACTCA GAGCTCTATT
CCCCCTCCAC CTGGAGCCCT GGAAACCGGC TTTCTAGGGC TTTTCTCCGC GGTTCTTTCC
CGGAGTTCAG CGTTGTGGCT TTTTGTCCGG GTTACTClGG TTTGGGGACA ATCTCCTTTA
GGCCTTTGAC TCAGTCTCAT TTCCACTTTG CTTTTGCCCC AAGCCTCTGT GTCTCTCCCC
CGTTTCCTGA CGATCTGTCA GAGTCTTGAG AGTGATTTGG TTCCCCATCC CCCCTCCAAC
TGGGGTCTCC TCCTCACTAT TGGTGTGTGC ATCTGGGACC CCCATCCCCG CACCGAGTTT
CCCCGTCTCT GTCAGTGAGG AGCAAGGCTT CCAGAGACAG CCCTCTAGTA GCGCGTCAGT
CCCGAGTCTT GAGTGGGATG CGGGGCTCCC GTGCTATTTC TTGGCGGAGG TCTTTCCTGG
TCCTTATGGA CACCCCTGGT TTGGGGTATG GGGGCCGCTA GGATTTCAGA GATGGGGTCC
CTAGGCTGAG RCCGCGTTTT CCCGGGCAGC GGTCGCGCTA GGGCCTTTCT GGGCGGACCT
TCAGCCCCGC GTGGCGCTCG TGGAGCGCGG GGGCTCGCTG TGGCTCGACT GCAGCACTAG
CTGTCCGAGG CCGGAGCGCG GTGGCCTGGG GACCTCGCTA CGCCGGAGCG GGACCCAGAG
1635
1686
1740
1781
120
180
240
300
300
420
480
C
000
000
720
780
840
900
0
1020
1080
188 878
CCCGAGCNGC GGNCTGCAGC CAAAGCTCGT CCACATCCCA CANCCTCAAA CCCACCCCCG 1140
atcctgcgtc CNCGGCGCGC CCCGCACACG CCAAGCCCCT CGCCTCATCC CGACTGGCCC 1200
GCGCTGAGCC CTCCGCAANC CCCTGGGCGC TCTCCACAGC CCCCGCAAGC TCCTCCCACC 1200
CCCCATCTCG TCCGCCTGCT TGTTCGCGAG GTACTACAGC TGCCGGCAGC gcactgggtc 1320
CTCCATTCCG GAGCCACCCC AGCCCGTACA GCGACGGCCG CTCCCTCCTT CCCACCCTGG 1380
GCCTCGCAAC TGCACCGGGA CCTCCGGCGT CCCGCCCGAA CCACCCCGAC CCAGCATCAC 1440
GGTCGCCTTC CGCCCACCCG CCCGCGACCT GATTAGCCGA AGGGGCCGAG CCGACCCACC 1500
CCCGCCTCCC CCGGCCATGC GCACCGCCGC CCTCCGCGCG CGAACACAGG AGCACACGCC 1500
CGGGTTCTCG TCACTCCCGC AGATTGACCT GCCNCCACAC GCATGCCCAC TCTGGCCANA 1020
CGCCTCGCCC CCCACACAGC TCCCCACGTT TGCTGAGTCG GCACCCTAAC TCACACATTG 1080
TAGCGGCTTT ACGGCACCCA CCACTCCTCC CATGCGCTCG GAGCCCCTGA GTCACACCCC 1740
AACAACANCT GAGNCCCATC TCGGCTGGAT GAAGAGGCTA GCTCGTCTAC GTGACCACCN 1800
CTCCGTACGT AAATACCCCA GAAGTCTGAC CAGCTAGCCC GGACTGACAG CACAGCTACT 1800
AGCTTAACTA CTTGCGCCTG GCACCTTTTG CCGTTATGGA GTGACGCCTT CACACAAAAA 1920
CACGCGGGCT CTACCGGCAG TGGTCCACAG CCCCAAGGCC TGGTGTGCAA GTGAAACAAG 1980
GGCCGCCCCT GCTGCCCGGC CAGCCGGTGG CGCCTACCCG TGATATTACC TCCGCGCCCT 2040
GTCTTGCTNG CAAGCGCCGA CGCTTCCCCA CCCAGCGCGC CCGCTCCGCT CTATCTGGAC 2100
GCTCGAGCCA GACAAGCCAT GCAGAGTCGT TGATCAACAC TCGATGTTTG CGTCGTGGAG 2100
TCGGCATCTC GGCTTGCGCT TCCTCACCCA TCCCGCCACT TTCCCCCCAG CCTTATTCCC 2220
CCGCCGTTCT GACAACTGCC CGCACGAGCC CCCCTCACKG CAACTTTCGA TGGGCTGGTG 2280
CCTCCCCCGC AAGCCGGCGT TTACTTCTCG CTCGGAGAGC ACAGGCGTCA TCCTAAGGTC 2340
GCCCGCCACC GCCAGAGAAG TCTCCCCACG CCCACACAGA CAGCAGGGCA GCAACAGGAA 2400
CCCGACGGAC AGCTGAGCGC CGTCGTCACC CTCCCCCGCG AAACCAGCGG GGCCCGGCGA 24δ0
AACAGCACTC GCTACACGAA CGGCAGGCCA ACAGGACCGG AAATACCTCA CACTCCCCCT 2520
CCCCCTCCCT CGCGGGCGGG CCCCACACTC GAGAGAAGGC CCACCCGAGA GACTCCCCGG 2580
CGCCGCCGCG CCACAAAAAG CCCGGCCCGA CACTGCCAGG CCAGCACCAC GTGCAGCGTC 2040
GGGATTGATA CATTCGGGGC ACGTCCCTCA CTGCGCAGTG GACCCCACCC AGTTCTCTCT 2700
CCCCGCCCTT CCCCCCGCCG CTTCTGGCTT TAAGTCACCC ACGAGCCCCC CAGGCAGAGA 27δ0
GCCTCGCCCT AAGCTGCGCG CCAGGGCCCC CACCCCTTGT CACCTGCGAC CCAATTCCAA 2820
CGGCCCTCGT ACCGCCCCCA TCTGGGACCT TATCGGATAC CCTCTGCCGC GTCCCCCCAC 2880
ACCCGACTCC CAGGGATGAC TGCGACTCTC CCACGACCGG CACGTGCCCA CACGCTCCAC 2940
AGCGCACCCT CCACTGCGAG GCCCCTCGAA ACCCGCAGCC CGCCCTCCAC TCTCCAAGCC 3000
188 878
CTGACGGTGG GGCGGTGCTA GCGCTGGGCC TGTTGGGTCC AGTGACCCGT GCCCTCGCGG 3060
GCACTTACCG ATGTACAGCA ATCAATGGGC AAGGCCAGGC GGTCAAGGAT GTGACCCTGA 3120
CTGTGGAATG TGAGTAGGGG GAGGTGGGCA TGCTTATCCC TTTAAGGTCA CGGAGTGTAC 3180
TGGGAGACTG GCTATACGGA AAGGAAAGAA GCCTAGGTTC AGCAGGGATT GGGAAAACAC 3240
TGAAGGAAAG TGGTGTGGTG TTTACAAACT TAACGGTGGT AACTGGGCAC GGTCTGGCAA 3300
AAACAGACAG CCAAGAGAGT GTGCCTGGGA AGCTGCAATG GGGGCTTTGT GGGAATTGGT 3360
CAACAGCACC CTGAGATCTC AGGAAAGGGG CCTGAAGTTA TCTCCAGAAC CCATGTGAAG 3420
GCAGGAAGAG AGAACGCCCA CCTTTTCCTG CTCCCCCCAA CCCCCCCCCA CATATCACAC 3480
GGAGTATATA AATAAATAAA ATGGCTCCTG CCGGAGGGAG TGAGAAGCTG TCTCCTGCAG 3540
GCTCAGAGCA GTGGTAGTGC ATGCCTTTAA TCCCAGCACT CGGTAGGCAA AGGCAGGCAG 3600
ATCTCTGTGA ATGTGGGGCC AGCCTGGTCT GTACAGAGAA ATCCTGTCTC AAAACAAACC 3660
AGCAAAGAAA CAAAACCAAA ATCAATTCCA GATGCCCCAG CGCTGGACAG TGTAGGCTGC 3720
CCANGACGTA TTACTTGNCT GGAGGGGACA GAGGCATCGC TTAGCTGTGT GGCACACGGG 3780
GTCCCACCAC CTAGCGTGAG CTGTGTGCGC TCTGGAAAGG AGGAAGTCAT GGAAGGGCCC 3840
CTGCGTGTGG CCCGGGAGCA CGCTGGCACT TACCGATGCG AAGCCATCAA CGCCAGGGGA 3900
TCAGCGGNCA AAAATGTGGC TGTCACGGTG GAATGTGAGT AGGGGTGGCT ACGGAAATGT 3960
CCACACCTGC GTCCTCTGTC CTCAGTGTGA ACTCCTATTT CCCTGCTTCC TAGATGGTCC 4020
CAGTTNTGAG GAGTTGGGCT GCCCCAGCAA CTGGACTTGG GTAGAAGGAT CTGGAAAACT 4080
GTTTTCCTGT GAAGTTGATG GGAAGCCGGA ACCACGCGTG GAGTGCGTGG GCTCGGAGGG 4140
TGCAAGCGAA GGGGTAGTGT TGCCCCTGGT GTCCTCGAAC TCTGGTTCCA GAAACTCTAT 4200
GACTCCTGGT AACCTGTCAC CGGGTATTTA CCTCTGCAAC GCCACCAACC GGCATGGCTC 4260
CACAGTCAAA ACAGTCGTCG TGAGCGCGGA ATGTGAGCAG GGGCCCAGGT GGGCGGAGAG 4320
TACCGGGTGT CCCAGGATCT TTTCTTTCCC TGATGCCCCT CCTTATGGTG GCTCATCTGC 4380
AGCACCGCCA CAGATGGATG AATCCAGTTG CCCGAGTCAC CAGACATGGC TGGAAGGAGC 4440
CGAGGCTACT GCGCTGGCCT GCAGTGACAG GGGNCGCCCC TCTCCACGCG TGCGCTGTTC 4500
CAGGGAAGGT GCAGCCAGGC TGGAGAGGCT ACAGGTGTCC CGAGAGGATG CGGGGACCTA 4560
CCTGTGTGTG GCTACCAACG CGCATGGCAC GGATTCACGG ACCGTCACTG TGGGTGTGGA 4620
ATGTGAGTGA GGACAGCGCT GAATGAAGAC GACTCAGACC GCCAGAAAAG TGCCTTGAGG 4680
CCTGGGATGT ATGATCCAGT GGGTAGAGTG CTCAATTAGC ACTCACTAAA ATGTATATTC 4740
TATTCCTAAT actctttaat TTTANCCTTT GGGAGGCAGA GACAGGCAGA TCTCTGTTCC 4800
GGGATAACCT GCTCTCTGTC TAGGACAGCT TGGTCTACAG AGGGGNTACA GGCCCCCeCT 4860
CCCAAGATTG NATAGCAACC CTCTGGCTCC CTGTCTCTCT
4900
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:6:
(i)Charaktersstskτ sekwencji:
CA) Długość: 1295 pae zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (Ci) Opis stkwtncji:eEK NR ID:6:
NGAAThCCGG CGGAhCGGGh AGAGCTAGTG CCTCTGCChC CTTGGCAGCC TGTAGGTGAG 60
AAChhCACCT TGAGCTGCAG GGTCCCGGGG GCAGGACCCC GAGCGAGCCT CACATTGACC 120
TTGChGCGAG GCGGCCAGGA GCTGAhTCGC CGAAGTThCG TAGGCGAGCC ACCCCGAGCT 180
CGGGGhGCGA TGCTCACCGC CACGGTCCTG GCGCGCAGAG AGGATCACAG GGCCAAThTC 240
TCAhGCCTCG CGGAGCTTGA CCTGCGGCCA CACGGCThGG GACTGTTTGC rAACAGCTCA 300
GCCCCCAGAC AGCTCCGCAC GTTTGCCATG CCTCCACTTT CCCCGAGCCT TATTGCCCCA 360
CGAhTChTAG AAGTGGGChC AGAAAGGCCG GTGACTTGCA CTThGGATGG ACTGTTTCCT 420
GCCCCAGAAG CCGGGGTTTA CCTCTCTCTG GGAGATCAGA GGCTTCATCC TAATGTGACC 480
ChCGACGGGG AGAGCCTTGT GGCCACTGCC ACAGCTACAG CAAGTGrAGA ACrGGAΑGGC 540
ACCA^ACAGC TGATGTGCAh CGTGACCChC GGGGGCGAAA GCAGGGAGAC CCAGGrAAAC 600
ChGAChGTCh ACAGCTTCCC GGCTCCTCTT CTGACTThrA GTGAGCCAGA AGCCCCCGAG 660
GGrAΑGAhGG TGACCGTm CTGCTGGGCA GGGGCCCGAG CCCTTGTCAC CTTGGAGGGA 720
AhhCCAAGGA CCCTCTTACC GGCCCCATCT ThArCChhΑT CGTATCCCCT CTGCCTCATG 780
CCCGCAGACG CACCTCGGCh GGATGACThG GACTGTCCCA GGAGCTGGAC GTGGCCAGAG 840
GGhCCAGAGC AGACCCTCCA CTGCGAGGCC CGTGGΑΑrCC CTGAGCCCTC CGTGCACTGT 90C
GCrrGGCChG ACGGTGGGGC GGTGCTAGCG CTGGGCCTGT TGGGTCCAGT GACCCGTGCC 960
CTCGCGGGCA ChTACCGATG hΑcrGcrrhc mOGGcm GCCAGGCGGT CAAGGATGTG 102C
rccchGrcτG TGGAATATGC CCCAGCGCTG GACAGTGTAG GCTGCCCAGA ACGTATTACh 1080
TGGCTGGAGG GGACAGAGGC ATCGCTTAGC TGhGTGGCAC ACGGGGTCCC ACCACChAGC 114 0
GTGrGCTGhG TGCGCTCTGG rArGGAGGrΑ GTCATGCm GGCCCCTGCG TTTTGGCCGG 120-
GrGCACGChG GCACTTACCG AhGCGAAGCC ATCA.ACGCCA GGGGAhCrGC GGCcrAAArτ 1260
GTGGChGTCA CGGTGGAAhA TGGTCCCCGG AATTC 1055
(2) Informacje o SEK NR ID:7:
(i)Charτkttosstskτ sekwencji:
(Α) Długość: 2214 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy
188 878 (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji^EK NR 1D:7: (xi) SROUENCE DESCR1PT1ON: SEQ 1D NO:7:
TGGGCTTTTG GTCGGACCCC GAATGTCTAT CCCGTGTTGC GTTAGGCGCT TGGCCTGAGC 60
TTClTCCGTA TCCTTGTTCC CGAACGCCCT GGCCGTGlAG ATTTTACGCG TGTCCTCCCT 120
GCCTCGGCTC CTCAGGGGCC TGACCGGCTT GTTGTTTGCG GTTGACTGGC 180
GGTTCTGCCT CGTGTGTGTT CGGTCTCCCC GTCTGTTGTG GCGTAATGGC ACTATTlACC 200
CTTCCACGCC CGGCTGCGAT GCYTCGGGGA TCTCCTTGTC TTGGGATGTT ATTCAGGGTA 300
CCTCCCCCCG GCCCGTGTTA CAGMCAGTTG GCACTCCGGA CCCTCGGATT CATGCGCCCT 360
CTTTTCCTTG TCCCGTGTGT TGCACATGCC GAGNGGCTCG CTCTGCTTCl GCTTCCTGGC 020
GGTCCGGCCG GGTGCGGTCA GCGTTCCCTN CCTCGCGCTA GCTCCCGCGC CGGGATTTCA 080
CTTCGGCTCG CGCGGCCTTC CCCCTAGGAC TTTAGGTGGC CTTTATACCG GCCTTTCCTC 500
CGCCTCGCTG GGAGCTAGGG CGTCCGACGT TTGGAGCTGG GCTACTTCGA CCCTGGGGTC 600
TCACGCCTAT CCCTGCTTCC CGCGTGTCCA GGCACGGTTG CAGGGCTlAT CGCCCGCGTC 660
CTGTCGGCTC CGGTCTGCGC GCGTGTCCTT TCCGACTGTC CGT1GΑTΑGT CCAGTTTCTA 720
CGTGGTTTTG TACCCCGTGT GCCCTTTTAC CTCCCTTGGG CCTCGGTGNT CCACAGTTCC 780
TGGlACTGGG CTTlGGGACT TCCGTCGTGG GCGCTTTCGG CGGGTTCTGT TACCCCTCAC 800
lACTTCCGCC CTATTCTCTT TTCGCATACC AGAGATCCTA CCCTlATCTC GCTCCTCACC 900
GGCACACTTC TCTCGTTATT CNTGCGGMTA CAGCAGGCCA GClATAGGlA CCCACCAAAC 960
GGTTCGTCCC CGTCCTGATT CGTCTGGGTT AlAGCGGGCA CGTTTACClA lACTCGACGT 1020
TTClTGGTTT TCTGGCTCTC TGCTTCACTC CGAGTCGGTC GGAGCTTTTT GATCCAlACA 1080
TGCTCΑTCGT lACTGTTTCA GCACTGGTTC CAGCTTTTCG TACCTCGTAC CCGATTTTGG 1100
TCCTCCCTTT CGTGTACCCC GTCGGGTCTT ACCCAAATCC CGCGGAClAT GGCAATlACC 1200
TTGCCTCCCC CTGTGATGTG GTTTTTCGCG TCCATGGCCA lACCTGGGTG AAGAATTACA 1260
CCGTGGGCTT CTCTCGTCGG CATGTGTCCT CGCTGCGCCG CTTCTGTGGT CCCACCAGCT 1320
GGGCGCGGCC GGGCGCTCCG ClGTlClCCT TCCATCGTGA GCTTTCCGGG AlCCTTTGGT 1380
TTCTCGTCCA TTCTGTGAGC TTTCGCCACG TGACCACGTG ACCGCGCGGT CCGGTCTAGC 1000
TlGCGGTCTG TCTTTTTGTC CCGATGTACC GGTTTGTGGC AGTClATCCC CGATTTCAGA 1500
TCCCTGAGCA CTTGATCTTC GCTCTGClAT ATTCCTTAGT GCGGTATACC CTAGTTGTCC 1560
TGGGGCGTlC GACTTCCCTG TGCCTCGTAC GCGCACTCCG GATTGACGTT GTACATGTGG 1620
CTTCGTTGTT CGCTGTCGTC TGCCTGTCTG TCGCAlAGTA TGAAGGCATG CGAGCGTCTC 1680
188 878
TGCGTGTGGC CCGGGAGCAC GCTGGCACTT JGC^C7C3C^7rC^C^C3A AGCCATCCAGC GRCAGGGGAT 1740
CAGCGGWCAA AGATGTGGCT GTCACGGTGG CAGTATGGTCC SCGGCTTCGGGG GAGTTGGGCT 1800
GCCCCAGYAA CTGGACTTGG GTAG7GGA3AT CTCGGAAAGCT GTT1TCCTGT GAAGTTGGTG 1800
GGAAGCCGGA ACCACGCGTG GAGTGCGTGG GCTCGGAGGG TGCAAGCGCAl GGGGTAGTGT 1920
TGCCCCTGGT GTCCTCGAGC TCTGGTTCCA G7AGGCT<yTAT GACTCCTGGT AACCTGTCAC 1980
CGGGTGTTTA CCTCTGCAAC gccacccclcc GGIMGTGGNTC CACAGTCZGGG ACAGTCGTCG 2040
TGAGCGCGGA ATCACCGCCA CAGATGGATG AATCCAGTTG CCCGAGTCAC CAGACA^TCGR 2100
TGGAAGGAGC CGAGGRTGCT GCGCTCTGCCT gcagtgccag ACGCNCGCCCC TCTCCACGCG 2100
TGCGCTGTTC (2) CAGGGAAGGT Informacje GCAGMCAGGC o EKK RR DD ctcgtlglggnt :8: ACACGlTGTCC CGAG 2214
(i)yhcraktugsstska sekwencji:
(A) Długość: 5077 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: : D^^en^owy) (ci) Opis sekwencji:EKK RR DD:8:
CCGAACGCTC CTCGGCCTCT GCTCTRCTCT GGRCCTGGGG ATyyTAGGCA TCTCAGGTGG 00
GAAGAGCCCG CCCGTGGAGC RGGGTGGATA AGGCGGGGGC GGGATTGAAG GACCAGAGAG 120
GGCGGCCCGG GTGTCCCCCT yCAGGyTCCG CCCTCTTCTA GCTTCCCACG CTTCTGTCAC 180
CGCCTGGAGR TCGGGGCTTC TCCCCGTCCT TCCTcyiycc CAACACGCCT CAATCTTTCA 240
GARCTGAACC CAGCACCTTT TCTCGARTOG GGGR^RTTGCA CCTAACCTGT CTCGGGGGGR 300
ACTGTGGCTC TCCTGTCCTC TCCTGCTCTG TRATGCCCTA TGGTTCACAG AyTGGyGTCG 300
TCCCTATTCG TGGTCCTCGG AGACRCClTC TCCTCAACTG TCATAACTCA GAGCTCTATT 420
CCCCCTCCAC CTGGAGCCCT GGAGACCGGC TTTCTAGGGC TTTTCTCCGC GGTTCTTTCC 480
CGGAGTTCAG CGTTGTGGCT TTTTGTCCAG GTTAyTCAAG TTTGGGGACA ATCTCCTTTA 540
AGCCTTTGGC TCAGTCTCAT TTCCACTTTG CTTTTGCCCC AGGCyTyTGT GTCTCTCCCC 000
CATTTCCTGA CGATCTGTCA GAGTCTTAAG AGTGATTTGG TTCCCCATCC ycycTycGiy 660
TGGGGTCTCC TCCTCACTAT TGATGTGTGC ATCTGAGACC ccciTcyccG yACCGAGTTT 720
CCCCATCTCT GTCAGTGAGG AGCAAGGCTT CCAGAGACAG CCCTCTAlTA GCGOGTCAGT 780
CCCCGGTCTT GAGTGGGATG CGGGACTCCC GTGCTATTTC TTGGCGGAGG TCTTTCCTGG 840
TyCTTATGGA clcccctggt TTGGGATATG GGGGCCGCTA GGATTTCAGA GATGGGGTCC 900
CTAGGCTGAG RCCGCGTTTT CCCGGGyGGC GGTCGCGCTA GAAyyTTTCT GGGCGGGCCT 960
188 878
TCGCCCCCCC CTCCCCCTCC GGCAGCGCCC GCGCGCCCGG GCGCTCGACT CCACCACTAA 1020
ATCTCCCACC CCGCAGCCCG GTCCCCTCGA CACCGCGCGG CGCCCAGACC CCACCCGCAG 1080
CCCTCTCNAC TCNCGGGCTC GACACCGCGT GCACATCCCA GGNCCTAGAA CCCACCCACT 1140
CTCCTTCTTC CNCTCCCCGC GCCCAACAAT CCGACCCACT CCCATAAGCC GAACGTTACG 1200
TCACTTCACC GTGGAAAANC CCCTGCCGTC TCTCCACCTC CCCCGCAGCC TCCTCCCACC 1200
CCCCCGCGCA TCCTCCGCCT GGTTCTCAAA CGACGACACC GCCCTAGGGC CCGGTTGGGG 1320
GTCCCTTCCA GAGCCACCCC ATCCCCTAGA GATACGCCCT CTCCCTCCTT GCCACCCTGG 1380
GGCTCACGAC TTCACCGTCA GCTCCACCAT CCCGCGCCCA GGACCCCGAG CGGGCCGCGC 1440
AGTGACCTTC CTCCCACCCG CCCACGGGCT CATTCCCCCA AGTGTCGGAG GCCACCCACC 1500
CCGACCTCGG GCTGCGATGC TCACCGCCAC GCTCCTGCCC ACCAGACACA ATCACACGCC 1500
CAAGGGCTCA TCCCTCGCCG ACCGGGACCT GCCNCCACAC GCCTTCCGAC TCTTTCCANA 1020
AGCCTAACCC CCCGGACACC GCCCCACCTT GGCGGAGGGT GGACCCTAAC TCACACATTG 1080
TAACAGCTTT ACCGCACCCA CCCCTCGTCC CATGCGCTCG GACCCCCTGA CTCCCACCCC 1740
AACCACANCT AACNCGGATC GCTTGTGAAG GAGAAGTCTA ACTCGTCTAA ATGACCAGAN 1800
CTCCATGCTT AAATCCCCCA AAACTCGAAC CGCCTAGCCC TTACGTCCAA CGAGAGGACT 1800
ACCTGGGGTG CTTGAGCCTA GGAGAGGTTT CCTTTATGTA GGGACTCGTG CACACAAAAA 1920
CGCGCTCTCG CTGCCGCCCT GTATGAACAT GCCCCACGCC GTCGATCCAA CTTAAGCGAG 1980
AACCACCCCT GCTGCCCTTC CAGCCTCTCC CTCCTACCCG GCCTATTGCC TCCTCGCCCG 2040
TTGTTGCTNA CAACCCCCTA GCCTTGGCCA CCCATCTCCC CCGCTCCTCT CTGTCTTTAG 2100
GCTCAAACCA CACAATGCAT CCAGATTCCT GGAGAGACAA TGAATCTTTA GTTCGTAAAT 2100
TCAACCTCTG TTCTTTCTCG TCCTCAGCCG GCCCTCCACT TTCCCCCCAG CCTTATTCCC 2220
CCACCATTAT TACAACTCCG CTCAGAGACG CCCCTGACKT CAGCGGTAAA TCCACTCTTT 2280
CCTCCCCCGC GACCCCCGCG GTAAGTCGCT CTCCCAGATC AAAGCCTGCA TCCTAATCGC 2340
GCACTCCACC CCCACAGCCT TGTCGCCACT GCCACACCGG AGCCAGCTGA ACAACACGAA 2400
GCCACCGGAC GGCTGGGCTG CATCCTCAAC CTCCCGCCCG AAACCGCCCA CACCCACCAG 24S0
GGCCTGGCTC GCTAAACTAA GAGCAATCCA ACAGGACCTT CAATACCTCA CACTCGCGCT 2520
CCCCCTCCCT CGCGCTCTCG CCCCACACTC GCACAAACCA GCACCCTAGA GACTGGGAGG 2580
GGAATCCACG CAGCAACAAC CCCCCCGCCG GACTTCCACC GCACGACCGC AGAGAAGTTG 2040
CAAATTGGTA CGGTCCGTTC AGTTCCCGCA GTCCCGAGTC AACCCCACCC AATGCTCGGT 2700
CCCCGCCCTT CCCCCCGCCG CTGCTCACGT TAACTGACCC ACAACCCCCC CACCCAAAGA 2700
TCCGCGCCCT GACAGGAGGA GCAGCCCCCC CACACAGGGG AACCTTCGAG CCAATGCAAG 2820
CTCCCCTCCC TCCCCGGACC CAGGACCGCC AGGGAAAGCT CACAAACAAT CACGAAAAGA 2880
188 878
GGGGCTTCTT CTGCGACGCT GCCCTCGATG TGGACGGGGA AACTCTGAGA AAGAACCAGA 2940
GCTCTGAGCT TCGTGTTCTG TGTGAGTGGA TGTTCACTTT ATCTCTGTGA ATTCCAAGGA 3000
CCCTCTTACC GGCCCCATCT TTAACCTTAT CGTATCCCCT CTGCCTCATG CCCGCAGACG 3060
CACCTCGGCT GGATGACTTG GACTGTCCCA GGAGCTGGAC GTGGCCAGAG GGTCCAGAGC 3120
AGACCCTCCA CTGCGAGGCC CGTGGAAACC CTGAGCCCTC CGTGCACTGT GCAAGGCCTG 3180
ACGGTGGGGC GGTGCTAGCG CTGGGCCTGT TGGGTCCAGT GACCCGTGCC CTCGCGGGCA 3240
CTTACCGATG TACAGCAATC AATGGGCAAG GCCAGGCGGT CAAGGATGTG ACCCTGACTG 3300
TGGAATGTGA GTAGGGGGAG GTGGGCATGC TTATCCCTTT AAGGTCACGG AGTGTACTGG 3360
GAGACTGGCT ATACGGAAAG GAAAGAAGCC TAGGTTCAGC AGGGATTGGG AAAACACTGA 3420
AGGAAAGTGG TGTGGTGTTT ACAAACTTAA CGGTGGTAAC TGGGCACGGT CTGGCAAAAA 3480
CAGACAGCCA AGAGAGTGTG CCTGGGAAGC TGCAATGGGG GCTTTGTGGG AATTGGTCAA 3540
CAGCACCCTG AGATCTCAGG AAAGGGGCCT GAAGTTATCT CCAGAACCCA TGTGAAGGCA 3600
GGAAGAGAGA ACGCCCACCT TTTCCTGCTC CCCCCAACCC CCCCCCACAT ATCACACGGA 3660
GTATATAAAT AAATAAAATG GCTCCTGCCG GAGGGAGTGA GAAGCTGTCT CCTGCAGGCT 3720
CAGAGCAGTG GTAGTGCATG CCTTTAATCC CAGCACTCGG TAGGCAAAGG CAGGCAGATC 3780
TCTGTGAATG TGGGGCCAGC CTGGTCTGTA CAGAGAAATC CTGTCTCAAA ACAAACCAGC 3840
AAAGAAACAA AACCAAAATC AATTCCAGAT GCCCCAGCGC TGGACAGTGT AGGCTGCCCA 3900
NGACGTATTA CTTGNCTGGA GGGGACAGAG GCATCGCTTA GCTGTGTGGC ACACGGGGTC 3960
CCACCACCTA GCGTGAGCTG TGTGCGCTCT GGAAAGGAGG AAGTCATGGA AGGGCCCCTG 4020
CGTGTGGCCC GGGAGCACGC TGGCACTTAC CGATGCGAAG CCATCAACGC CAGGGGATCA 4080
GCGGNCAAAA ATGTGGCTGT CACGGTGGAA TGTGAGTAGG GGTGGCTACG GAAATGTCCA 4140
CACCTGCGTC CTCTGTCCTC AGTGTGAACT CCTATTTCCC TGCTTCCTAG ATGGTCCCAG 4200
TTNTGAGGAG TTGGGCTGCC CCAGCAACTG GACTTGGGTA GAAGGATCTG GAAAACTGTT 4260
TTCCTGTGAA GTTGATGGGA AGCCGGAACC ACGCGTGGAG TGCGTGGGCT CGGAGGGTGC 4320
AAGCGAAGGG GTAGTGTTGC CCCTGGTGTC CTCGAACTCT GGTTCCAGAA ACTCTATGAC 4380
TCCTGGTAAC CTGTCACCGG GTATTTACCT CTGCAACGCC ACCAACCGGC ATGGCTCCAC 4440
AGTCAAAACA gtcgtcgtga GCGCGGAATG TGAGCAGGGG CCGAGGTGGG CGGAGAGTAC 450C
CGGGTGTCCC AGGATCTTTT CTTTCCCTGA TGCCCCTCCT TATGGTGGCT GATCTGCAGC 4560
ACCGCCACAG ATGGATGAAT CCAGTTGCCC GAGTCACCAG ACATGGCTGG AAGGAGCCGA 4620
GGCTACTGCG CTGGCCTGCA GTGACAGGGG NCGCCCCTCT CCACGCGTGC GCTGTTCCAG 4680
GGAAGGTGCA GCCAGGCTGG AGAGGCTACA GGTGTCCCGA GAGGATGCGG GGACCTAGCT 4740
GTGTGTGGCT ACCAACGCGC ATGGCACGGA . TTCACGGACC : gtcactgtgg ! GTGTGGAATG 4800
188 878
TGAGTGAGGA CAGCGCTGAA TGAAGACGAC tcagaccgcc AGAAAAGTGC cttgaggcct 4860
GGGATGTATG ATCCAGTGGG TAGAGTGCTC AATTAGCACT CACTAAAATG TATATTCTAT 4920
TCCTAATACT CTTTAATTTT ANCCTTTGGG AGGCAGAGAC AGGCAGATCT CTGTTCCGGG 4980
ATAACCTGCT CTCTGTCTAG GACAGCTTGG TCTACAGAGG GGNTACAGGC CCCCCCTCCC 5040
AAGATTGNAT AGCAACCCTC TGGCTCCCTG TCTCTCT 5077
(2) Informacje o SEK NR ID:9:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 1472 par zasad
(B) Typ: kwas nukleinowy
(C) Rodzaj nici: pojedyncza
(D) Topologia: liniowa
(ii) Typ cząsteczki: cDNA
(xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:9:
NGAATTCCGG CGGATCGGGT AGAGCTAGTG CCTCTGCCTC CTTGGCAGCC TGTAGGTGAG 60
AACTTCACCT TGAGCTGCAG GGTCCCGGGG GCAGGACCCC GAGCGAGCCT CACATTGACC 120
TTGCTGCGAG GCGGCCAGGA GCTGATTCGC CGAAGTTTCG TAGGCGAGCC ACCCCGAGCT 180
CGGGGTGCGA TGCTCACCGC CACGGTCCTG GCGCGCAGAG AGGATCACAG GGCCAATTTC 240
TCATGCCTCG CGGAGCTTGA CCTGCGGCCA CACGGCTTGG GACTGTTTGC AAACAGCTCA 300
GCCCCCAGAC AGCTCCGCAC GTTTGCCATG CCTCCACTTT CCCCGAGCCT TATTGCCCCA 360
CGATTCTTAG AAGTGGGCTC AGAAAGGCCG GTGACTTGCA CTTTGGATGG ACTGTTTCCT 420
GCCCCAGAAG CCGGGGTTTA CCTCTCTCTG GGAGATCAGA GGCTTCATCC TAATGTGACC 480
CTCGACGGGG AGAGCCTTGT GGCCACTGCC ACAGCTACAG CAAGTGAAGA ACAGGAAGGC 540
ACCAAACAGC TGATGTGCAT CGTGACCCTC GGGGGCGAAA GCAGGGAGAC CCAGGAAAAC 600
CTGACTGTCT ACAGCTTCCC GGCTCCTCTT CTGACTTTAA GTGAGCCAGA AGCCCCCGAG 660
GGAAAGATGG TGACCGTAAG CTGCTGGGCA GGGGCCCGAG CCCTTGTCAC CTTGGAGGGA 720
ATTCCAGCTG CGGTCCCTGG GCAGCCCGCT GAGCTCCAGT TAAATGTCAC AAAGAATGAC 780
GACAAGCGGG GCTTCTTCTG CGACGCTGCC CTCGATGTGG ACGGGGAAAC TCTGAGAAAG 840
AACCAGAGCT CTGAGCTTCG TGTTCTGTGT GAGTGGATGT TCACTTTATC TCTGTGAATT 900
CCAAGGACCC TCTTACCGGC CCCATCTTTA ACCTTATCGT ATCCCCTCTG CCTCATGCCC 960
GCAGACGCAC CTCGGCTGGA TGACTTGGAC TGTCCCAGGA GCTGGACGTG GCCAGAGGGT 1020
CCAGAGCAGA CCCTCCACTG CGAGGCCCGT GGAAACCCTG AGCCCTCCGT GCACTGTGCA 1080
AGGCCTGACG GTGGGGCGGT GCTAGCGCTG GGCCTGTTGG GTCCAGTGAC CCGTOCCCTC 1140
GCGGGCACTT ACCGATGTAC AGCAATCAAT GGGCAAGGCC AGGCGGTCAA GGATGTGACC 1200
188 878
GTGACTGTGG AATATGCCCC ArGGCGTGAr IGTGTAAGTT AGGCGGCCCA aatggaggag 1260
CTGCAGGGGA CAGAGGCATC GGCTAdCTT itggcacagg acacgcgcgc aactagcgac 1320
AGGGGTGTGG GCTCTGGAAA GCAACAAOTT itggaaaggg agcgccccgg gggtgggggc 1380
GACGCTGGCA Ch^ACCGATG CCWtAGCCAT lACGCCArGC cagcggagca cccTTArAAA 1441
CCTGTCrCGG TGGrATATCG TCCCCGMAT gc 14 72
(2) Informacje o SEK NR ID:10:
(i)Chaoτkttrsstska sekwencji:
(A) Długość: 2550 pae zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (ci) Opis sekwencji:SEK NR ID:10:
tctttgcctt cgtgggaggg gcgacctgac rAGTTCAGCG gcacctccag CChCGCCCCG 6 0
gcacgaccct gaccgacggg CrCAhTGAGG ThCGhCCCrG GCCCCGACCA CCTCAThCGG 120
tcaacgtttg tacgtcactt ACCCCGAGGh CCCGGTGCGA TCGhCrGCGC CAGCGTGGTG 180
ccccccacac accattatac CCCGAAhhTC ggagccctcg GCGAGCTTCA CGTCGGGGCA 240
cacggcttgg gactgtttgg rAAGACGGCA gttcggacag ACGhGCGGAG GThTCGCrTG 300
CCTCCACTTT gggccagcct TATTCCGCGA ccaggcttag AAGhGCGCTC AGAAAGGGGC 360
CTGrCTTGGA cgttgcatgg rCTGTTTCGT GGGGCAGAAC gggggctgta CCTCTChChC 420
gcacatgaca ggcttcattg GAAGCGGrGC CTGGACCGCG AGACCCTTGT GGGCAChGCG 480
acacctatag caagtcaaca rGrGGAAGGC ACGrAAGACG TGATCTCCAT CCTGAGCGhG 540
cgccgcgaaa gcaggcagag GGAGCArrAG CTGrchChCh AGACCTTGCC gccgccgggg 600
cTcrchTTAr ctgagggaca AGGCGGGCAC cgaaacaggg TGACCCTAAG CTCCTCGCCA 660
cgcgcctgag gcgtgctcac gggggaggca AhTCCrGGhC CGGTCGGhGG GCrCCCGCCh 720
cacttctact TAArTCGGAG AAAGrATGAC CrGAAGGGGC CCTTCTTCTG CGAGCChCCC 780
CTGirTGTGG ACGCGCAAAG TGTCAGrAAG aaggagacgg ChCAGCTTCG TGThChGhAG 840
gcagttcgcc hCGATGAGTh GGAGTGTGCC ACCACCTGCA CCTGGCCAGA ggggccacac 900
gacactcttg ACTCCCACCG CGGhCGArAC cgggagccct GCChGCACTG tccaacgggg 960
catcctcccc ggggcggagc CGTGGGGGTG ThCGGhGCrG TGACGCGTGC CGTCGCCGGG 1020
acgtattgat GTACACGAAT CAATGGGGrr CGGGACGCCC TGrAGGATGT gacgctcagg 1080
GTCGrrTrhG CGCCACGGGT CGrcrGhChr GGChCGGGAC AAGGhATTAC hhGGCTGGAC 1140
cgcacacagc GATCCGhhAC CTGTGTGGGA CrCCCCGhGG cagcagcgag cctcagcgcg 1200
188 878
GTGCGCTCTG GAAAGGAGGA AGTCATGGAA GGGCCCCTGC GTGTGGCCCG GGAGCACGCT 1260
GGCACTTACC GATGCGAAGC CATCAACGCC AGGGGATCAG CGGCCAAAAA TGTGGCTGTC 1320
ACGGTGGAAT ATGGTCCCAG TTTTGAGGAG TTGGGCTGCC CCAGCAACTG GACTTGGGTA 1380
GAAGGATCTG GAAAACTGTT TTCCTGTGAA GTTGATGGGA AGCCGGAACC ACGCGTGGAG 1440
TGCGTGGGCT CGGAGGGTGC AAGCGAAGGG GTAGTGTTGC CCCTGGTGTC CTCGAACTCT 1500
GGTTCCAGAA ACTCTATGAC TCCTGGTAAC CTGTCACCGG GTATTTACCT CTGCAACGCC 1560
ACCAACCGGC ATGGCTCCAC AGTCAAAACA GTCGTCGTGA GCGCGGAATC ACCGCCACAG 1620
ATGGATGAAT CCAGTTGCCC GAGTCACCAG ACATGGCTGG AAGGAGCCGA GGCTACTGCG 1680
CTGGCCTGCA GTGCCAGAGG CCGCCCCTCT CCACGCGTGC GCTGTTCCAG GGAAGGTGCA 1740
GCCAGGCTGG AGAGGCTACA GGTGTCCCGA GAGGATGCGG GGACCTACCT GTGTGTGGCT 1800
ACCAACGCGC ATGGCACGGA TTCACGGACC GTCACTGTGG GTGTGGAATA CCGGCCTGTG 1860
GTGGCTGAGC TGGCAGCCTC GCCCCCAAGC GTGCGGCCTG GCGGAAACTT CACTCTGACC 1920
TGCCGTGCAG AGGCCTGGCC TCCAGCCCAG ATCAGCTGGC GCGCGCCCCC GGGAGCTCTC 1980
AACCTCGGTC TCTCCAGCAA CAACAGCACG CTGAGCGTGG CGGGTGCCAT GGGCAGCCAT 2040
GGTGGCGAGT ATGAGTGCGC AGCCACCAAT GCGCATGGGC GCCACGCACG GCGCATCACG 2100
GTGCGCCTGG CCGGTCCATG GCTGTGGGTC GCTGTGGGCG GTGCGGCAGG GGGCGCGGCG 2160
CTGCTGGCCG CAGGGGCCGG CCTGGCCTTC TACGTGCAGT CCACCGCTTG CAAGAAGGGA 22?0
GAGTACAACG TCCAGGAGGC TGAGAGCTCA GGCGAGGCGG TGTGTCTCAA TGGCGCGGGC 2280
GGGACACCGG GTGCAGAAGG CGGAGCAGAG ACCCCCGGCA CTGCCGAGTC ACCTGCAGAT 2340
GGCGAGGTTT TCGCCATCCA GCTGACATCT TCCTGAGCCT GTATCCAGCT CCCCCAGGGG 2400
CCTCGAAAGC ACAGGGGTGG ACGTATGTAT TGTTCACTCT CTATTTATTC AACTCCAGGG 2460
GCGTCGTCCC CGTTTTCTAC CCATTCCCTT AATAAAGTTT TTATAGGAGA AAAAAAAAAA 2520
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA 2550
(2) Informacje o SEK NR ID:11:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 222 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: lćnóowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (xi) Opis sekwennji:SEK NR ID:11:
AATTCGATCA CTCGCGCTCC CCTCGCCTTC TGCGCTCTCC CCTCCCTGGC AGCGGCGGCA 60
ATGCCGGGGC CTTCACCAGG GCTGCGCCGA ACGCTCCTCG GCCTCTGGGC TGCCCTGGGC 12 0
188 878
CCTTCGATCC AGCTTCCACA CTGTGACCTG GCGGTTCGAA TCGTCAGCCC 180
CTCTTTTCTC CTGTTTCGCA CTGTTGTCCA AC 222 (2) Informacje o SEK NR< 1D:12:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 292 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Tcy cząsseezki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR 1D:12:
GGTGCAGCCG GTACCCCCTC CCCCCTGTCA GCCTGCGGTC TATAACCCCA CCCCTCTCCT 60
CCGGGTGTAG CGTCTTCCTC CCCTAACCAG CCTCACTACA GTGCCGCCCC GCCGAAATAA 120
TAGCTCGGTT CTCTATCCCA CATCTAATTA TCCAGCGAAA TCCACTTCCA TTGCTTTTTC 180
CACTATAGAC GACTACTGAA CCCCCTCCCC ACTCTGCACA TAACGATACA TGCAGCCCCA 200
CGGGCCTGTA CCGTTCGCGA AAGCCTAGAC CCCCTTTCGT CCCCAAGCCC TC 292
(2) 1ηίοποκ;3θ o SEK NR 1D:13:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 105 aminokwasów (B) Cyp: aminokwasowi (C) Rodzaj nicii pojedcncsa (D) Topologia: liniowa (ii) Tcp «cząsteczki ^iałkk (xi) Opis sekwencji:SEK NR 1D:13:
Pro Asp Aao Val Glu Lru Val Pro Leu Pro Pro Tp Gln Poo Vv1 Gly
1 5 10 11
Clu Asn Phe Thr Lur Sro Cys Arg Va0 Pro Gly Ala Gly Poo Arg AAa
20 22 30
Ser Leu Thr Olu Thr Leu Leu Aur ^0y Gly usg Glu Leu Ile Arg Arg
35 40 45
Ser Phe VaV Ulu Glu Pro Prp Ap^g A0a Arg ua^s Ala Met Leu Ghr Ala
50 55 60
Chr VaU Leu Ala Aog Arg Glu Asp His ŻAO Asp Asn Phe Ser Cys Llu
65 70 77 80
Ala CUu Leu Asp Leu Arg Tho His Tly Llu GlU Lru Phe Ala Asn Ser
85 90 9T>
Ser Ala Pro Arg Tln Uru Aog Tho Phe
100 100
(2) 1nfe o SEK NR 10:1::
188 878 (i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:14:
GAACTCGAGG CCATGCCTCC ACTTTCC 27 (2) Informacje o SEK NR ID:15:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 30 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:15:
CCATAAGCTT TATTCCACCG TGACAGCCAC 30 (2) Informacje o SEK NR ID:16:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 18 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:16:
AACGTGCGC-A GCTGTCTG (2) Informacje o SEK NR ID:17:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:17:
ACGGAATTCG AAGCCATCAA CGCCAGG 27
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:18:
(i)yhagaktegsstska sekwencji:
(G) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (xi) Opis sekwencjHEEK RR DD:18:
yATGAATTCy GAGTCTTGAG TGGGATG 27 (2) Informacje o EEK RR DD:19:
(i)yharaktggsstska sekwencji:
(G) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (ci) Opis sekwencji:EEK RR DD:19:
ATAGAATTyy TyGGGACGyy TGTAGCC 27 (2) Informacje o EEK RR DD:20:
(i)yhagaktggsstyka sekwencji:
(G) Długość: 18 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (xi) Opis sekwencjHEEK RR DD:20:
yGRGGTGGCG AGGGCTCG (2) Informacje o EEK RR DD:21:
(i)yhagaktegsstska sekwencji:
(G) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (xi) Opis sekwencji:EEK RR DD:21:
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:22:
(©Charakterystyka sekwencji:
(G) Długość: 54 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNG (xi) Opis nekwencji:eEK NR ID:52:
GCGllhCGTG AGllhGGGGG CGCG (2) Informacje o SEK NR ID:23:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 24 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNG (xi) Opis nekwuncji:eEK NR ID:23:
hGGGlhlhGT CGhlGGhGTG lhhG (2) Informacje o SEK NR ID:24:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 992 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:24:
lGGGGGGGGG lGAAGCCCGG lGGAGGGGGA CGGTGGAGAG GTGCCCGGGG GCGGGGGTAG 60
CCCT^G^. GGCCGGCGGC GCCGGGAGGG GGGhGATlAG GGGGGGGGGC GCGGGGGGGG 120
GGGGGGGGGT GGGGAGGCGA AGGGGGGTGG CGGGCGGGGG GGGGAGlCGG GCGGGGGAGG 180
TTCAlGGAGG hGCGAGGGGG GGCGGCGACr GGGGGAGGhG GGGGGlGGGC lCGGGGGGCG 240
GTGTllAGGl GGAGGGCGGA GGGAGGAGGG AGGlGGGAGG GGGGGGGGGG GGAGGGGGGC 300
GGClGCGAlA GGGGGGlAAC GGCGGGAGAG ATGlAGCGGG GCCGGGGGAG 360
GlGGGGGGGl CGGGGGGCGG AAAGGGCCAG AAGGGGGGGG GCGCGGGACA CGGGGGGGGG 420
lGGlllCCGG GCGGGCGCGA GGGGGGCGGG GTGGAGGCGG CGGAGCGGGG GGAAGCAGGG 480
GGCGGGGGAA GAGGGCCAGG GGGGGGGGGG GGGGGGGCGG GAAGAGAGCG GGGACGGGGG 540
GGGGGGCAGG AGGGCGGAAG GGCGGGGlGG GGCCGGAGGG GGCGGGGTAA GGGGGGGAGG 600
188 878
CGGAlGCCTC GTCAGGTTGC GGCGGCGCAC SGGGCLTCGT GCCTTGGTGTG ATCTGCGTGC 000
GCTTCGGAGA ATCTGAGACC GGTCLTCGGG SGGCTTTTGC TGTCGSCCCTGG GAGCATGCCA3 720
GCATTCATTG CTGTGGAGTC agccagttct GGGGCTCCTG SiGCCTLGAGlT GTGGCCGTCA 780
TGGTGGAGCA TGGTCCTAGG TTTTGLGALG SCAGGTCGCC SAGOAGTTGG AOGCG3GTGG 840
LAGGGTCCGG gtgttcgttc TCTCTGCAAG SCCAGTGGGG GCOGCAGCCCg AGCGTGJGGGT 900
GTGCGGGTTT CGGAGGCACT ALCTALGGGG STGTTGTCGC SccTciccAccyc CCAGACCCTA 900
GCCTTAGAGC TCTTAGAGTT CCCTGGGGCC ST 992
(2) Informacje o EEK RR ID:25:
(.i)Charaktegsstska sekwencji: (G) Długość: 2775 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa
(ii) Typ cząsteczki: cDRA
(xi) Opis sekwencji: EEK RR ID^S:
GCAGTTCCGC GTGGTGTTTG TGGAGTGTGA GGATCTGTTG CGGCCGAACC GTAGCACTLA 00
CTGyyyTCGG CCGGAGCGCG GTGGTTTGAG GATTCTGTCG CGCCGAGATG GGACCCAGAG 120
GGGTCTGTGT CGGCTGGCGT GACAGTTGAT GGATGTCCGC GAGCTGGAGA TTCAGTTTGT 180
tcgccttctc yGCTGCGyGy GGCGTACGTT GTAGACGCGT GGGTTCLCCC GTATCCCCCA 240
GCGACTAGAT yGCGTAGAGy TAATGTCGTT GCCTCCTCGG CAGTCGGTGA GTGGGAGCCT 300
yiyycTGGGy CGTGGGGCTT CTGGCGCCGA GCCTCGTGCG GGCTTTAyGT TGATTCCGCT 300
GCGGGGCGCC TAGGAGCCGA TTCGTCGCAG TCCCGTTGGT GGACTACTCT GAGCGTGGGG 420
CGCGATATCT ACAGTTACGG TATTGGCTTG GAGGAAGGAC CATGGAGyCA ITCTTTTGTG 480
TCGCGCCGAG yTGGACCTGC GATCGCACGG ACTGGGACTG TTCGLGAATA GTTCGGCCTC 54 0
CGGAGAGTTC TGLACTCCTT CCCTGTyTCC GGATGCCTCG CGCTTTGTTG ycycccGGTT 000
CTTGGGAGTT GGTCCGGAAA GGCCCGCGAG CCGCATCTCG AACGGACTGT TTTTAGCCCT 000
AGAGGTCGGG GTTTACCCCG CACTGGGGGA CTAGAATCTG AGCTCCGGCG CTGTCTCTGA 720
LGGGGATGCA TCTGCGGCTA CTGTCACAGC CACAGTTAGC GTAGAGCAGG AGGGTGTTAG 780
GTGGCCGGCT TGCAGCGCCA CTCTGGGGGA CGALGlCTGG GAGACCCGAG AGLATGCGGC 840
CGCTCATAGT CTTTTGGTAC CACTCCTGAT TTCGAGCGAA TTCAGTGCTC TTGAGGGGTA 900
GATGGTGACA GTGGCCTGTG TAGCTGGAGC CTGLGTTCCG GTCACATCGG AGGGAGCCTC 900
AGTCGCGGTC TTGGGGTAGC CCGCCTAGTT TTAGTCGAAC GTCACCGAGA ATGATGACAG 102 0
GCGCAGTCTC TCCCGCGGCG CCATCCTyGA CATGAACGGG GAGGTTCTGA TCLAGGATAG 1080
188 878
CGCAGCAGAG CTTCCTCGCC TATACCCGCC CCGGCTACAC GATGCGGACT GCCCCAGCAC 1140
TGCGACCTGG CCCGAGGCCC CACACCGCGA GCGGCCCGCC CACCCCCCCC CGAACCCAGA 1200
GCCCTCACGC CACGGGCCCC GCTCCCACCG CACCCCCGTA CTGCCGCTCG GAATCCTCCC 1200
TCAACTCGCT CCACCCCTCT CACCCACTTA CCCATCCAGC CCCCCAGATC AGCGACCCGA 1320
GCCGCGAAAG CACGTAGCCC TGACCCTCCA CTACGCACCG CCGATCCACA GCGTCCCCGC 1380
CCCGCGACCC AGTGCTTCCC TCCGCGCAGC ACAAGCCTAC CTCACCTCTC TCCCCCACCC 1440
GCTAACCACC CCTGATCTCA TCGCCCTGCC CTCTGGACGA CGCCCCCACG TCATCCACCC 1500
CCTCTGCCGT CTACCCCCGG ACCATCACCC CGCTGACAGC TCCCGACCCA CCAGCCCTCG 1500
CCGCTCTCCC CCAGAGAAGG TCCCCCTCAC CGTCAAATAT CCCCCCGCCG TTCACGACCC 1δ20
GGCCTCCCCC AGCAATTGGA CATCCCTCCA AGGAGATCGC CCCCGCTTTT CCTCTGACGT 1080
CCGTCCCGGC CCACACCCAA CCCTCAGCTC CGTCGGCTCC CCCGCCACCA CTCACCGCCT 1740
GCTCCTGCCC CGGCCACCCC CACACCCTGC TCCCACACCT CCCACAGTCC CTAGACTCCG 1800
CGCGACCCCG ATCTACCTCT CCAACCCCAC CAACCCCCGC CCCTCCCTCC CCGAGGCGCT 1800
CGTCGTGGCC CCCCACTCCC CACCCCACAT CCGTGGATCT ACCTGCCCGA CGCGCCACGC 1920
CTCCCTCGGA CCCCCTGACG CTTCCCCCCT CCCCTCCCCC CCCCCGCGTC CCCCTTCCCC 1980
AGGGGTGCCC TCCTCTCCCC GACCCATACC ATCCCCTCGC CACCAGCCCC TCTCCCCACA 2040
CGGCGCGCCC GCTGACCGCT CTCTCCCAAC AlGTCCCCAT CCCACCCACT CCCGCACCCT 2100
CACTCTCCGC CTCCAGTGCC GGCCAGTCCT GGCACGACTT CCGCCCTCCC CCCCTCCGCG 2100
CGTCCCCCAG CCGGCAGACT TCAACTTCAC CTCACCCCCC CAGGCCTCCC CTCCACCCCA 2220
CGTCACCTCC CGCCCCCCCC CCACCCCCCT CGAAATCCCA CTGTCCACCA ACAACGCAGC 2280
lATGACCCTG GCGGGACACA TCCCGACCCA CCCAGCCCGC TGCCACTCCC AACCCACCAA 2340
ACCGCACCGC CCCCACCCCC GGCCCATAGC CCTGCGCCTC CCCCCTCCGT CCCTATCCCT 2400
ACCCCTCCGC CCCCCCGCCG CGCCCCCCCC CCGGATCCAC GACCCGCCCG CCCTCGCATG 2400
CTGCCTGCAC TCCGCCCCCT CCAACGGCCC CGAGGGCGGC GTCCGCCGCC CCCACACCTC 2520
GGCCCACCCC CTCGCTCTCA ACCGACACGG CCCCGCCGCT GGCCCCCCCC CACCCCCCCA 2580
CCGCGCACCC CAGCCGCCCG CCGGCCCCGC CCACGCGCAC CCGCACCGCC ACCTCTGCCA 2040
CGTACGCAGC GCGGCCGCCG CGGCCCCCTC CACTCTCCGC CCCCCCCCAC GCCCCCCAGA 2700
CTCGCACCCC CCCTTATTGA TTCCTTGATT TATGGACTGG TGCATGGGTT TGTAGATTCG 2700
ACTCCAACCC GATTC 2775
(2) Informacje o SEK NR ID:20:
(iiChankterystyki sekwencji:
(A) Długość: 1557 pir zasad (B) Typ: kwis nukleinowy (c) Rodzaj nici: pojedyncza
188 878 (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:26:
CGCGCTCTCC TCGCCTCCTG TGCTTTCCCC GCCGCGGCGA TGCCAGGGCC TTCGCCAGGG 60
CTGCGCCGGG CGCTACTCGG CCTCTGGGCT GCTCTGGGCC TGGGGCTCTT CGGCCTCTCA 120
GCGGTCTCGC AGGAGCCCTT CTGGGCGGAC CTGCAGCCTC GCGTGGCGTT CGTGGAGCGC 180
GGGGGCTCGC TGTGGCTGAA TTGCAGCACC AACTGCCCTC GGCCGGAGCG CGGTGGCCTG 240
GACACCTCGC TGCGCCGAAA CGGGACCCAG AGGGGTTTGC gttggttggc GCGGCAGCTG 300
GTGGACATTC GCGAGCCGGA GACTCAGCCC GTCTGCTTCT TCCGCTGCGC GCGGCGCACA 360
CTACAGGCGC GTGGGCTCAT TCGCACTTTC CAGCGACCAG ATCGCGTAGA GCTGATGCCG 420
CTGCCTCCCT GGCAGCCGGT GGGCGAGAAC TTCACCCTGA GCTGTAGGGT CCCCGGCGCC 480
GGGCCCCGTG CGAGCCTCAC GCTGACCCTG CTGCGGGGCG CCCAGGAGCT GATCCGCCGC 540
AGCTTCGCCG GTGAACCACC CCGAGCGCGG GGCGCGGTGC TCACAGCCAC GGTACTGGCT 600
CGGAGGGAGG ACCATGGAGC CAATTTCTCG TGTCGCGCCG AGCTGGACCT GCGGCCGCAC 660
GGACTGGGAC TGTTTGAAAA CAGCTCGGCC CCCAGAGAGC TCCGAACCTT CTCCCTGTCT 720
CCGGATGCCC CGCGCCTCGC TGCTCCCCGG CTCTTGGAAG TTGGCTCGGA AAGGCCCGTG 780
AGCTGCACTC TGGACGGACT GTTTCCAGCC TCAGAGGCCA GGGTCTACCT CGCACTGGGG 840
GACCAGAATC TGAGTCCTGA TGTCACCCTC GAAGGGGACG CATTCOTGGC CACTGCCACA 900
GCCACAGCTA GCGCAGAGCA GGAGGCTGCC AGGCAGCTGG TCTGCAACGT CACCCTGGGG 960
GGCGAAAACC GGGAGACCCG GGAGAACGTG ACCATCTACA GCTTCCCGGC ACCACTCCTG 1020
ACCCTGAGCG AACCCAGCGT CTCCGAGGGG CAGATGGTGA CAGTAACCTG CGCAGCTGGG 1080
GCCCAAGCTC TGGTCACACT GGAGGGAGTT CCAGCCGCGG TCCCGGGGCA GCCCGCCCAG 1140
CTTCAGCTAA ATGCCACCGA GAACGACGAC AGACGCAGCT TCTTCTGCGA CGCCACCCTC 1200
GATGTGGACG GGGAGACCCT GATCAAGAAC AGGAGCGCAG AGCTTCGTGT CCTATACGCT 1260
CCCCGGCTAG ACGATTCGGA CTGCCCCAGG AGTTGGACGT GGCCCGAGGG CCCAGAGCAG 1320
ACGCTGCGCT GCGAGGCCCG CGGGAACCCA GAACCCTCAG TGCACTGTGC GCGCTCCGAC 13£ 0
GGCGGGGCCG TGCTGGCTCT GGGCCTGCTG GGTCCAGTCA CTCGGGCGCT CTCAGGCACT 1440
TACCGCTGCA AGGCGGCCAA TGATCAAGGC GAGGCGGTCA AGGACGTAAC GCTAACGGTG 1500
GAGTACGCAC CAGCGCTGGA CAGCGTGGGC TGCCCAGAAC GCATTACTTG GCTGGAG 1557
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:27:
(DCharakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 2927 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) yyp zzsttczzii:: dNAA (ix)Charakterystyka:
(A'Nazwa/Klucz: CDS (B)Położenie: 44..2214 (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:27:
GGGCCTGTGG TGCGGTGGTG TGCTTTCCCC GGGGGGGGC ATG CCA GGG CCT TCG 54
Ket Pro Gly Pro Ser
5
CCA GGG CTG CCG Acg CGG Arg 10 GCG CTA CTC TGC CTC TTG GCT AGC CCGCGC CCT 102
Pro Gly Leu Ala Leu Leu Gly (Leu TTr Ala CAa CLe Gly Clu
15 22
GGG CTC TTC GGG CTC TCCC GCG GTC TCG CAG CGCG CCC TTT TGG CGG CAC 150
Gly Leu Phe Gil A eu Ser Ala Val Ser Gln Glu Ppo CPr C^ Aly Asp
25 33 33
CTG CAG CCT CCG CTG GCG TTC GTG GAG CGC TGCl CGC TTG CCT TTG CTG 198
Leu Gln Pro Acr Cal Ala Phe Val Glu Arg Gly Gly Tee Llu ττρ T,LU
40 45 50
AAT TGC AGC ACC AAC TGC CCT CCGi CCG GAG CGC (GCT GGC CCG GAG ACC 246
Asn Cys Ser T Tr Asn CCys Pro Arg Pro Glu Arg Gly Gly Llu Glu Thr
55 60 66
TCG CTG CGC CCG AAC GGG ACC TGCl A(Gl GGT TTG CGT TTGC TTG GCG CGG 294
Ser Leu Arg Acg Asn Gly Thr Gln Arg Gly Leu Arg TTr> Llu Ala Arg
70 75 88 88
CAG CTG GTG GGA ATT CGC (GCG CCG GAG ACT CCC, CCC GTC TGC TTC TTC 342
Gln Leu Val Acp Cle Arg Glu Pro Glu Thr Gln Pro Vh1 cys PPr Phe
90 95 110
CGC TGC GCG CCG cc^<c AGA CTA CAG GCG CGT GGG CTC ACT CGC ACT TTC 390
Arg Cys Ala Acr Arg Thr Leu Gln Ala Arg Gly (Leu IIe Arg Thr Phe
105 110 115
CAG CGA CCCC GGC CGC GTA GAG CTG ATG CCCl CTG CCT ccc TGG CAG CCG 438
Gln Arg Pro Acp Arg Val Glu Leu Met Pro Leu Pro Pro Ττρ Gln Pro
120 125 110
GTG GGC GAG AAC CTC ACC CTG AGC τ<^·τ A(Gl GTC CCC (GCC GCC (GGC CCC 486
Val Gly Glu Acs Che Thr Leu Ser Cys Arg Val Pro Gly Ala Gly Pro
135 140 115
CGT GCG AGC CCT ACG CTG ACC CTG CTG C(Gi GGC GCC (GAC (GAC CTG ATC 534
Arg Ala Ser Lee Thr Leu Tir Leu Leu Arg Gly Ala Gln Glu Leu IIe
150 155 160 165
CGC CGC AGC TTT GCC CCT GAA CCC CCC CGA GCG CGG (GGC GCG GTG CTC 582
Arg Arg Ser PPr ALi Gly Glu Pro Pro Arg Ala Arg Gly Ala Val Leu
170 1-75 180
ACA GCC ACG GGT CTG GCT CGC AGG GAG GAC CAT (GGC GCC AAT TTC TCG 630
Thr Ala Thr Val Leu Ala Arg Arg Glu Asp His Gly Ala Asn Phe Ser
188 878
185 190 195
TGT Cys CCC GCC CAG CGG Leu GAC Asp CTG Leu CGC Aog 205 CCG GAG GGA CTG GGA Lei Cly 210 CTC Leu TTT CAA 678
Aeg Ala Glu 200 Pro His Cly Phe Clu
AAC AGC TCG GCC GCC AGA CAG GGG GGA AGC TGC TCC GTG TGG GGG GAT 300
Asn Sre Ser Ala Pro Aeg Glu Lei Aog The Phe Ser Leu See Pro Asp
215 220 225
GCC CGC CGC CGC CCT GCT CCC GGG CGG TTG CAA CTT GGC TGG Grr ACG 730
ria Pro Aeg Leu Ala Ala Pro Aeg Leu Leu Cli Val Gly See Glu Aeg
230 235 240 245
CCC GTG AGG GGC AGG CGC GAC GGA GGC TTT ccr CCC TGA CAG GGG ACC 000
Peo Val Ser Cys hhe Leu Asp Gly Leu Phe Peo Ala Ser Glu Ala Aog
250 255 260
GTC TAC CGC GCA GGG CGC GAC CAG rrT GGC ACG CCG GAT GTG AGC CGG 035
Val Tyr Lei Ala Lei Cly Asp Cin Asn Leu Ser Peo Asp Val hhe Lru
265 270 275
crr GGG GAC GCA GTG CTG GGC ACT CGC AGA GCC AGA GCT AGC GCA GAG 918
Glu Gly Asp Ala Phr Val Ala The ria Thr Ala Thr Ala Ser Ala Glu
280 228 229
CAG GAG GGG GCC AGC GAG CTG GTC TGC AAC CTC ACC CTG GGC GGC GAA 966
Gin Glu Gly Ala Arg Gin Leu Val Cys Asn Val hho Lei Gly Gly Cli
295 330 335
rrc CCG GAC ACC CGC GAG AAC GGG ACC AGC TAC AGC TTC CGC GCA CCA 1014
Asn Arg Glu Thr Arg Glu Asn Val The lir Tye Ser Phe Peo ria Pro
310 315 332 332
CTC CTC ACC GGG AGC GAA CCC ACC GTG TCC CAG GGG CAG ATC GTG AGA 1062
Lei Leu hhr Leu Ser Glu Pro Sro Val See Clu Gly Cin Met VTl Thr
330 333 340
GGA ACC GGC CCA GCT GGC GCC CAA CCT CGG CTG ACA CTG CAC CCA GTG 1110
VtI Thr Cys Ala Ala Gly Ala Cin Ala Lei Val The Lei Glu Cly Val
345 350 355
ccr GCG CCG CGC GCG GGG CAG GGC GCG CAG CGT CAG CTA AAG CCC AGG 1158
Pro Ala Ala Val Pro Gly Gin Peo Ala Gin Leu Gin Lei Asn Ala hho
360 335 337
GAG rrc GAC GAC AGA CGC AGC GGC TTC TGC GAC CCC ACC CTG GAT CGG 1206
Glu Asn Asp Asp Arg Arg Sro Phe Phe Gys Asp Ala The Lei Asp Val
375 338 335
GAC GGG GAG ACG GGC AGG rrG AAC ACG AGC GCA CAG CGT GCT CTC CGA 1254
Asp Gly Glu hhe Leu Ile Lys Asn Arg Ser Ala Clu Leu Aeg Vai Lei
390 395 400 405
TAC GCG CCG CGC CGA CAC GAT TGC CAG TGC CCC AGG AGG TCG AGC GGG 1302
Tyo Ala Poo Arg Lei Asp Asp Ser Asp Gys Pro Aog Sro Trp The hrp
410 415 420
CCC GAG GGC CGA GAC GAC ACC CGG CGC GGC GAG CGC CGC CCG rrc CGA 1350
Peo Cli Gly Pro Glu Cin The Lru Aeg Gys Glu Ala Aog Cly Asn Peo
425 430 435
GAA CCC GGA . GGC CAC TGG CGG GCC TCC CAC CCC 1 GGG GCC CGG CTG GGG 1398
Glu Peo Ser Val His Gys Ala Aog Sre Aso Clv Glv Ala Val Lei AIt
188 878
¢00 40 5 455
CTC CCC CTC! CTG (ACT CCA GTC ACT C(CC GCG ccc Td GGC ACT TAC CGC 1446
Leu Cly Lei: Leu Gly Pro Val Thr Arg Ala Ouu SSr Glu ACh Tyr Aag
055 460 406
TGC CCT GCG GCC «CCT GAT ccci (TCC GAG GCG GGC MG GAC GTA ACC CTA 1595
Cys Lys Ala AAa Asn Asp Gln OTCy Glu Ala wa Lys Asp Av1 Thr Luu
0 70 405 408 408
GCC CCT GAG TAC G<CA CCA GCG (CCG GAC AGC GTCC <A5C TGC CCA GM CCC 1050
cno VaU Glu Tyr Ala Pro Ala Leu Asp Ser Val Gly Cc· Po^o Glu «AO
090 495 550
GCT GCT TCCC CCG GAG GOTA ACA GM GCC TCG ctg AGC TGT GTG GCG CCC 0090
1le Chr Trp Luu Glu Gly Thr Glu Ala Ser Luu St^u- Ces Av1 Ala His
505 510 555
GCG CCG CCG CCG CCT GAT GTG ATC (CTC GTG CCC TCT GACA GM CTC GGG 1638
Gly VaU Pro Pro Pro Asp Val Ile Cys Val Arg SSr Gly Glu Leu Gly
520 525 553
GCC GCC ATC GAG GGG CTG <CTG <CTT GTG GC^C CGG GAA CAT GCG GGC ACT 1686
Ala Val His Glu Gly Leu Leu Arg Val Ala Arg Glu Hśs Ala Gly Thr
535 540 550
TAC CGC TGC gccc GCC ACC MC CCT CGG GGC TCT GCG GCC «CCC «AAT GTC! H30
Tyr Arg Cys Glu Ala Thr Asn Pro Aog Gly Si^r AAa Ala Lys Mn Val
550 555 556 556
GCC GCC ACG GTG GM TAT GGC CCC AGG TTT GAG GAG CCG AGC TGC CCC 1782
CUi Val Thr: Val Glu <C^r Gly Pro Arg Phe GCu Glu; Pro Sf^r Cys Poo
570 575 558
ACC AAC TGG ACA TGG GTG GM (TCA TCT GGG CCC CTG TTT TCC (GAT GAG 1830
Sur Asn Trp Thr Trp Val Glu Gly Ser Gly Arg Luu Phe Ser <Css Glu
585 590 555
CCC GAC GCG3 MG Cd CAG CCA AGC GTG MG TGC GTG GGC TCC GGG GGC 1878
Val Asp Gly Lys Pro Gln Pro Ser Val Lys CCrs Val Gly Ser Gly Gly
600 605 660
GCC ACT GAG GGG GTG CCC CTG CCG CTG (ACA CCC CCA GAC CCT AGT CCC 1926
Cho Chr Glu Gly Val Leu Leu Pro Leu Ala Pro Pro Asp Pro Ser Pro
615 620 662
ATA CCC CCC AGA ATC cer AGA GTC CTG GGA CCC GGT ATC TAC GTC TGC 1975
Aog Ala Pro Arg Ile Pro Arg Val Leu Ala Pro Gly I1e <tyr Val Cys
630 635 660 665
AAC CCC ACC CAaC CGC GGC TCC GTG GCC «CCC ACA GTC GTC GTG AGC 2022
Asn Ala Thr; Asn Arg His Gly Ser Val Ala Lys Thr Val Val Val Ser
650 655 660
CCG GAG TCG CCCC CCG GAG ATT TAT GAA TCT ACC CCC CCA AGT dC CAG 2070
Ala GUu Ser Pro Pro Glu Mrt Asp Glu Ser Thr CCSS Pro Ser His Gln
665 670 cis
GCA CCT CTG GM ATT GCT GAG GCC TCC GCG CTG GCC TGC GCC GCC CGG 2014
Thr Top Leu Glu Gly Ala GUu Ala Seo Ala Leu Ala «As® Ala Ala Arg
680 685 690
CTT CTC CCT TCC CCA GGA TTG CCC GGC TCT CGG GM GGC ATC Cd TGG 2166
Tly Aog Pro Ser Pro Gly Val Arg Cys Ser Arg Glu Gly Ile Pro Trp
188 878
695 700 705
CCT Pro 71 0 Gn Glu CAC GlG GGG CGC GTG 'CC CGA AGA GAC GCG HC ACT TAC CGC TC' 2214
dn Grg Val 715 Sua Arg Glu Asp Ala 720 Gly Thr Tyr His Cys 725
GTG GCC Acr CAA GCG CAT GGC ACG GGC TCC CGG GCC GTC ACT ATA HC 2262
Val Gla Thr Am Ala His Gly Thr Gsp Ser Arg Thr Val Thr Val Gly
730 735 740
G'G GGG TGC CH CCG A'A GTC GCC GAG GGC TGC GCC TTC GCC CCT GGA 2310
Val Glu Tyr Grg Pro Val Val Gla GIg L cu AGn Ala Ssu Crr Pro Gly
745 750 775
GGC GTC CGC CCC HG GGA AGC TTC GCA TTG ACC TCC CGC GCG AgA GCC 2358
Gly Val Arg P m Gly Gly Asn hUc Thr Leu Thr Cy-s Arg Ala Glu Gla
760 765 770
TGG CC' CCG GCC CGG GTC GGC TH CGC <3CG GCC CCG AGG GGC CTC AAC 24 06
Trp Pro Pro GUi Gln liu SUA Trp Arg A Cr 1pa> Pao AAa GGu Leu Asn
775 780 785
G'C GGC CTC 'CG GGC AGC AGC GGC ACG GGC! GAC GTC GGC HG GCC ATG 2454
lie Gly Leu Ser Sur Asn Gsn SUA Thr A CL Eter Val AGn dy Ala Mut
790 775 800 805
HG GGC CGC HC GGC AGA TGC AGA TGC GCA G^C^C GCC TGGC GCC GAC GGG 2502
Gly Ser His Gly Gly Glu Tyr Glu CyC A Ir Arg ThA Am AGu His Gly
810 815 820
CGC CGC GCG CGG CGC GTC GCG AGG CGC GTG GCCC Η' CCG TCG Crr TH 2550
Arg His GUi Grg Grg liu Thr Val Arg Ac a UGa Gly Ppo Tta Luu Trp
825 830 883
GTC GCC GTC GGC HC GCG GCG GH GGC GCG GCG CTC CTG GCC CCA GH 2098
aal Ala Val Gly Gly Gla Ala Gly Gly A la Ala Luu Leu Ala Gla Gly
840 845 880
GCC GGC CTC GCC TTC TGC GTC CGG TCC ACC GCC TCC TGGG igag HC AGA 2646
Ala Gly Leu Gla Phe Tyr Val Gln Ser Thr Ala Cys Lys Lys Gly du
855 86G 865
TAC AGC A'A CGG GGG GCC AGA GGC TCTC GGC GAG GCC GTG TGT CTC AGC 2694
Tyr Gsn Val Gln Glu Gla Glu SUA Ser Gly Glu Gla Val Cys Luu Gsn
870 87S 880 885
GGG GCG HC HC GGC GCT HC GCG GCA HC ACA GAG GGC HA CCC 2742
Gly Ala Gly Gly Gly Gla Gly Gly Ala Ala Gly Gla Glu Gly Gly Pro
890 89 5 900
GAG GCG GCG m HC GCG GCC GAG TCG CCG GCG AGA GGC GAG GTC TTC 2790
Glu Ala Ala Gly Gly Gla Gla Glu Ser C ro Ala Glu Gly Glu Val Phu
905 910 9115
GCC Atg CGG CTG GCG Ή GCG GGGGCGGGGG CGCCrCrCGA CAAACCAHg 2841
Gla liu Gln Leu Thr Sua Gla
920 255
HCCCHC^ GGGGGGGGAA AAACGGGGGG GTTCCTTTgT ΤΤΑΤΤΤΑΑΤΤ GTTCgTTTgT 2901
TTATGTGTTC AAGGGGGGAA AAGGGG
2927
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:28:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 924aminokwasów (B) Typ:aminokwasowa (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki::Białko (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:28:
Met 1 Pro Gil Pro Lr u 5 rrr lir Ler rrr rrr nr Ler 10 Lu u ii u Lu u 15 Opp
Ala Ala Leu Gly Leu Gly Leu Phe Gly Leu Ser Ala Vv1 Uee di Hu
20 22 33
Pro Phe Trp Ala Asp Leu Gln Pro Arg Val Ala Phe Val dl UAo
35 40 45
Gly Ser Leu Trp Leu Asn CCis Ser Thr Asn Ctys Pro Arg Ppo dl UAo
50 55 60
Gly Gly Leu G').u Thr Ser Leu Arg Arg Asn Gly TTr dn Uao Gly Leu
65 70 75 88
Arg Trp Leu Ala Arg Gln Leu Val Asp Ile Arg dl Upo dl Thr di
85 90 95
Pro Val Cys Phe Płhe Arg CtyS Ala Arg Arg Thr Leu di na Uacj dl
100 105 111
Leu Ile Arg Thr Phe Gln Arg Pro Asp Arg Val Glu Leu MeL Upo Leu
115 120 11 5
Pro Pro Trp Gln Pro Val Gly Glu Asn Phe Thr Leu Ser Cci Uro wi
130 135 140
Pro Gly Ala Gly Pro Arg Ala Ser Leu Thr Leu TTh Ueu Uee Aog dy
145 150 155 116
Ala Gin Glu Leu Ile Arg Arg Ser Phe Ala Gly dl Upo Upo Arg A Au
165 110 175
Arg Gly Ala Val Leu Thr Ala Thr Val Leu Ala Arg Aao du Asp di
180 185 119
Gly Ala Asn Phe Ser Cys Arg Ala Glu Leu Asp Leu Arg Ppo Hii Gly
195 200 205
Leu Gly Leu Phe Glu Asn Ser Ser Ala Pro Arg Glu Llu Arg Thr Phh
210 215 220
Ser Leu Ser Pro Asp Ala Pro Arg Llu Ala Ala Pio Aro Lee Leu du
225 230 235 220
Val Gly Ser Glu Arg Pro Val Ser Cys Thr Llu Asp dy Leu Phe PhO
245 2 50 255
Ala Ser Glu All Arg Val Tyr Leu Ala Leu Gly Asp Gln Asn Leu Ser
260 265 227
Pro Asp Val Thr Leu Glu Gly Asp Ala Phe Val Ala Thr Ala Thr Ala
275 280 285
188 878
Thr Ala 290 Ser Ala Glu Gln Glu 229 Gly Ala Arg Gln Luu 330 Val cys Asn WV
Thr Leu Gly G1g GSg Asa Aig Glu Tho Arg Alu Asa Vi/ SCh Sin Scg
305 313 .315 332
Eer Phe Pro Ali /sp osl luu Thr Luu Eur Gil Pro Se; Si/ Seu Sle
325 330 335
Gly Gln Met; w/ SCe Val Thr cys Ala Ala Gly Ala GAa Ale Luu wa
340 45S 335
Thr Luu Glu GCy Si/ Pro Ala Ala VuS Pro Gly Gln Poo Ale Gln Luu
355 330 330
Gln Leu Asn Ala Thr Glu Ain Asp Asp Aog Arg Seu Phu Phe Tys agu
370 337 338
Gla Thr Luu Asi Vsl Asa Gly Glu Thr Leu Ile Lys Ain Sio Seu Sil
385 393 395 440
Glu Leu Arg Val Leu Ast Alu Pro Arg Leu inp Asp Seu Ain Scg Sro
405 410 415
Arg Eer Trc pTh Scg Sro Ali Gly Poo Glu Gln Tho Lei Aog Cys GCu
420 25 S 443
Ala Arg Gly Sm Pro Glu Pro Ser Ve S nn s Cys Ala Arg Sye Asp Gly
435 440 444
Gly Ala Val Leu Ala Leu Gly Leu Luu Gly Pro Val Tho Aog Ala Ler
450 445 440
Eur Gly Thr Tyr-Osg Cyc Lys Ala Ala Asn Asp Gln Gly Glu Ale Si/
405 470 47S 448
Lys Asp Val Thr Leu Thr Val Gli Tyr Ala Pos A/s Leu Asp Se;· Vil
485 40S 495
Gly Tys Pro GCu Arg Ile Tho Trp Luu Glu Gly Thr Glu Ala Ero Leu
500 00 5 550
Eur Ccs Sal Ala lla Hiy Va l iro Pro Pro Anp Val Ili Sys Val Aig
515 552 552
Eer GCy Glu Leu Gly Ala VvV Ilu Ali Gly Leu Lee Sio Si/ Ala Aig
530 533 554
Glu His Ala Gly Thr Tyr Arg Cyn Gis A/s hOs Uas Pro Arg Gly Ser
545 550 55 S 560
Ala Ala Lys Asn A/alAla Val Thr ViS lis Gos ASs Pro Arg Phe Glu
505 50 S 575
Glu Pro Ser Syy Pro Ser Asn Top Thr OpS VuS Glu Gly Err Gly Arg
580 58 5 59 0
Luu PPe Ser Cyr CGu Val Asa pCy S ls Pro oog Asr oyr Sial Lyn Ccs
595 600 60i5
Val GCy Ser Gig Sly Thr ThG GS u Gly Val lus Lec Gvv Leu Alr our
010 605 620
Pro Aip Pro Sro Sro Ar.g A1p oso Arg Gla 0^ Ari Val Leu Ala Pro
188 878
625 630 635 640
Cly Ile Tpa Val (Cys Asn Ala Thr Asn Aog Hii Gly Ser Val Ala 655 Lys
045 655
Thr Val Val U Vl S Sr Ala Clu Ser Pro Pn GGu Met Asp Glu Ser Thr
H0 600 600
Cys Pro Ser H ii Gln Tlhr Trp Leu Glu GGu Alu Glu Ala Ser Ala Leu
075 600 608
Ali Cys Ala Ala Arg Alg Arg Pro SPl Sao Gly Val Arg (Cys Ser Arg
090 695 770
Clu Cly Ile Pro Trp Pro Glu Gln Gln .Gig Vv1 Sar Arg Glu Asp Ala
705 710 715 720
Cly Thr Tyr His Cys Val Ali Thr Asn Ala Hii Cly Thr Asp Ser Arg
725 770 775
Thr Vil Thr GSv1 Gly Val Glu pyr GGrg Pro Val Val Ala Glu Leu Ala
74 0 7S0
Ali Seo Pro P ro Gly Gly Val Arg Pro Gly Gly Asn Phe Thr Leu Thr
755 770 775
Cys Arg Ala Glu Ala Trp Pro Pio Ala Gln IIu Ser T:g? Arg Ala Pro
770 775 780
Pro Arg Ala Leu Asn Ile Gly Leu Ser Seo Asn Asn Ser Tho Leu Ser
785 790 7 75 8 00
VaU Ali Gly Ala Met Gly Seo His Gly Cly Glu Tyr Glu Cys Ala
805 880 881
Thr Asn Ala H ii Gly Aog His Ala Arg Arg IIu Thr Val Arg Val Ala
820 825 830
Cly Poo Trp Llu Trp VaU Ali Val Gly Gly Ala Ala Gly Gly Ala Ali
835 840 84 5
Leu Leu Ala Al Si G ly Ala Gly Leu A la GUi hyi Val Gln Seo Tho Ali
850 855 880
Cys Lys Lys Gly Clu Tyr Asn Val Gln Clu Ala Clu Seo Sao GUy Glu
805 870 875 880
Ali Val Cys Leu Asn Gly Ala Gly Gly Cly Ala Cly Gly Ali Ala Cly
885 890 885
Ali Clu Gly GGu Pro Glu Gla Ali Gly Gly Ala Ala Glu Seo Pio Ali
900 905 910
Clu Cly Glu V al Phe Ala Ile Gln Leu Thr Ser Ala
915 920
(2) Informsaje o SSK (NR SD:29:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: δ5 pir zisad (B) Typ: kwis nukleinowy
188 878 (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:29:
(2) Informacje o SEK NR ID:30:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:30:
ATTTCTCTCG AGGATGGTCA CGTTCTCCCG G 31 (2) Informacje o SEK NR ID:31:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 33 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:3l·
ATTTCTGGAT CCTACAGCTT CCCGGCACCA CTC 33 (2) Informacje o SEK NR ID:32:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 32 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:32
ATTTCTCTCG AGTTCCACGC CCACAGTGAC GG
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:33:
(i)ChαrαktLOlstlkα sekwencji:
(A) Długość: 0680 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA(rLnrπιnvl) (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:33:
GGATCCTTTG AGCCCTGAAA GTCGAGGTTG CAGTGAGCCT TGATCGTGCC ACTGCACTCC 60
AGCCTGGGGG ACAGAGCACG ACCCTGTCTC CAAAAATAlA ATAAAAATAA AAATAAATAT 120
TGGCGGGGGA ACCCTCTGGA ATCAATAAAG GCTTCCTTAA CCAGCCTCTG TCCTGTGACC 180
TAAGGGTCCG CATTACTGCC CTTCTTCGGA GGAlCTGGTT TGTTTTTGTT GTTGTTGTTG 240
TTTTTGCGAT CACTTTCTCC AAGTTCCTTG TCTCCCTGAG GGCACCTGAG GTTTCCTCAC 300
TCAGGGCCCA CCTGGGGTCC CGAAGCCCCA GACTCTGTGT ATCCCCAGCG GGTGTCACAG 360
AAACCTCTCC TTCTGCTGGC CTTATCGAGT GGGATCAGCG CGGCCGGGGA GAGCCACGGG 420
CAGGGGCGGG GTGGGGTTCA TGGTATGGCT TTCCTGATTG GCGCCGCCGC CACCACGCGG 480
CAGCTCTGAT TGGATGTTAA GTTTCCTATC CCAGCCCCAC CTTCAGACCC TGTGCTTTCC 540
TGGAGGCCAA ACAACTGTGG AGCGAGAACT CATCTCCAAA ATAACTTACC ACGCTGGAGT 600
GAGlCCACGA ATGGTGGGGA GGGGAGGGTC CCACGGACAT ATTGAGGGAC GTGGATACGC 660
AGAAGAGGTA TCCATGTGGT GGCAGCCGGG AAGGGGTGAT CAGATGGTCC ACAGGGAATA 720
TCACAAACTC GAATTCTGAC GATGTTCTGG TAGTCACCCA GCCAGATGAG CGCATGGAGT 780
TGGCGGTGGG GGGTGTCAAA GCTTGGGGCC CGGAAGCGGA GTCAAAAGCA TCACCCTCGG 840
TCCCTTGTTC TCGCGTGGAT GTCAGGGCCT CCACCCACCG AGCAGAAGGC GGACTCAGGG 900
GCGCTCCAGG GTGGCTCGAG CTCACACACG CTGAGTAGAC ACGTGCCCGC TGCACCCTGG 960
CTAHTACH ACCCGGAGCC GAGCGGATTC TAATTTAGAC GCCCGCGAAC GCTGCGCGCA 1020
CGCACACGTG TCCTCGGCTC GCTGGCACTT TCGTCCCGCC CCCTCCGTCG CGTGCCGGAG 1080
CTGACCCGGA GGGGTGCTTA GAGGTATGGC TCCGCGGGGT CAAAAGGAGA AGGATCAGTG 1140
AGlGlGGlTC CCCACACCCT CCCCTAGAAC TGTCCTTTCC CCATCCAGTG CCTCCCAAAT 1200
CTCTCTTAGT CCCCAAATGT ATCCCCGCCC TAAGGGGCGC TGGTGGGAGG AGCTAAATGT 1 260
GGGGGCGGAG CTCGGAGTCC AGCTTATTAT CATGGCATCT CAGCCAGGGC TGGGGTAGGG 13 2 0
GTTTGGGAAG GGCAACCCAG CATCCCCCGA TCCCAGAGTC GCGGCCGGGG ATGACGCGAG 1380
AGAGCGTGGT CGCCCCCAGA AGGCCCTGGG CCATCATGCC GGCCTCCACG TAGACCCCAG 000C·
GGGTCGCTCA CTCCTGCCAG CTCGCCTTCA CCAAGGCCAG GAGCTTAGCG CACGCTCGCC 1500
TCCCGCCCCC CCGCCGCCTC TGCCGCCGCC CCCTCCTTGG AAACCAAGTT ACCAACGTTA 1560
188 878
AAGCAATCCC GAAGCGGAAG TCTGTGTGGG CGACACCCCA GCCGGCGCGG CGCGGGGAGG
GCTGCTGTAC CCCAGCTCCT CGGCTGGCGC TCTCGTCGCC TCGTGTGGTT TCCCCGCCGC
GGCGATC (2) Informacje o SEK NR ID:34:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 36 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA
1620
1680
1687 (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:34:
CAGAACTAAC CTTACACCAG GCGAGGACAC CGCGAG 36 (2) Informacje o SEK NR ID:00:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: Liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:35:
CAACAATGCT AGCCAAGCGC AACTCTGTCT C 31 (2) Informacje o SEK NR ID^:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: Liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR 6D:30:
CAACAATGCT AGCCTTCGAA ACCAACTTAC C 31 (2) Informacje o SEK NR ID:37:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 33 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: Liniowa
188 878 (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:37:
GggcggτcGT gcGGCcgccτ TGCGCCGCCG tcg 33 (2) Informacje o SEK NR ID:38:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 32 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (G) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: DNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:38:
cggcgGTGGh GcccgTcccc GccTccgccT ga 32 (2) Informacje o SEK NR ID:39:
(i)Charakturystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (G) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:39:
GGGGGATCGT GAGCTGGGCG ThGTTGTGGT C 31 (2) Informacje o SEK NR ID:40:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(G) Długość: 32 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:40:
GGGCGGTCGT GCCGhTACTG GCCGAGTCTG TC 32 (2) Informacje o SEK NR ID:41:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 30 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy
188 878 (ii) Typ cząsteczki:: DNA (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:41:
CAACAAGGCG AGCGGAGAAl GATCAGTGrG 30 (2) Informacje o SEK NR ID:42:
(i)Ghτoτkttosstska sekwencji:
(A) Długość: 33 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:42 crrcAATGCG rGCChccAcc caccgagcag aag 33D
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz.
Cena 6,00 zł.

Claims (7)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych, znamienny tym, że obejmuje etapy:
    a) pozyskania próbki płynu od pierwszej osoby;
    b) doprowadzenia do kontaktu próbki i przeciwciała dającego specyficzną reakcję immunologiczną z ICAM-4;
    c) oznaczenia ilościowego wiązania ICAM-4/przeciwciało w próbce; oraz
    d) porównania wiązania ICAM-4/przeciwciało u tej osoby z inną osobą, o której wiadomo, że nie ma zmian neuropatologicznych; przy czym ICAM-4 jest kodowany przez polinukleotyd wybrany z grupy składającej się z polinukleotydu przedstawionego w SEK NR ID: 27 i polinukleotydu kodującego ICAM-4, który hybryduzuje z polinukleotydem z SEK NR ID: 27.
  2. 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że próbką płynu jest surowica.
  3. 3. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że próbką płynu jest płyn mózgowordzeniowy.
  4. 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że wiązanie ICAM-4/przeciwciało jest oznaczane ilościowo poprzez test radioimmunologiczny (RIA).
  5. 5. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że wiązanie ICAM- 4/przeciwciało jest oznaczane ilościowo poprzez enzymatyczny test immunosorpcyjny (ELISA).
  6. 6. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że zmianą neuropatologiczną jest udar.
  7. 7. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że zmianą neuropatologicznąjest epilepsja.
PL96318545A 1995-06-07 1996-06-06 Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych PL188878B1 (pl)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/481,130 US5702917A (en) 1992-01-27 1995-06-07 Polynucleotides encoding human ICAM-4
PCT/US1996/009146 WO1996040916A1 (en) 1995-06-07 1996-06-06 Icam-4 materials and methods

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL318545A1 PL318545A1 (en) 1997-06-23
PL188878B1 true PL188878B1 (pl) 2005-05-31

Family

ID=23910735

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL96318545A PL188878B1 (pl) 1995-06-07 1996-06-06 Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych
PL96361105A PL188612B1 (pl) 1995-06-07 1996-06-06 Oczyszczony i wyizolowany DNA, chimeryczny polinukleotyd, wektor ekspresyjny i komórka gospodarza transformowana tym wektorem

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL96361105A PL188612B1 (pl) 1995-06-07 1996-06-06 Oczyszczony i wyizolowany DNA, chimeryczny polinukleotyd, wektor ekspresyjny i komórka gospodarza transformowana tym wektorem

Country Status (21)

Country Link
US (1) US5702917A (pl)
EP (2) EP0789763B1 (pl)
JP (2) JP3349514B2 (pl)
CN (2) CN1597950A (pl)
AT (1) ATE224448T1 (pl)
AU (1) AU721316B2 (pl)
BR (1) BR9606440A (pl)
CA (2) CA2288401A1 (pl)
CZ (1) CZ291974B6 (pl)
DE (1) DE69623746T2 (pl)
DK (1) DK0789763T3 (pl)
ES (1) ES2183961T3 (pl)
FI (1) FI970503L (pl)
HU (1) HUP9901123A3 (pl)
IL (2) IL146447A0 (pl)
MX (1) MX9700941A (pl)
NO (1) NO317150B1 (pl)
PL (2) PL188878B1 (pl)
RU (2) RU2155345C2 (pl)
SK (1) SK284161B6 (pl)
WO (1) WO1996040916A1 (pl)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5702917A (en) * 1992-01-27 1997-12-30 Icos Corporation Polynucleotides encoding human ICAM-4
GB9715164D0 (en) * 1997-07-19 1997-09-24 Medical Res Council Improvements in or relating to expression of nucleic acid sequences in cerebellar cells
IL130228A0 (en) * 1997-10-02 2000-06-01 Icos Corp ICAM-4 and diagnostics uses thereof
EP0968289A1 (en) * 1997-10-22 2000-01-05 Icos Corporation Icam-6 materials and methods
WO2000032140A1 (en) * 1998-11-30 2000-06-08 Ivf Sciences Colorado, Inc. System and sequential culture media for in vitro fertilization
ES2345200T3 (es) * 2003-03-24 2010-09-17 The Scripps Research Institute Vacunas de adn contra el crecimiento tumoral y procedimientos de utilizacion de las mismas.
RU2238025C1 (ru) * 2003-06-18 2004-10-20 Государственное учреждение Межотраслевой научно-технический комплекс "Микрохирургия глаза" им. акад. С.Н. Федорова Способ ранней диагностики нейропатии зрительного нерва при отечном экзофтальме

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2080044T3 (es) * 1987-05-04 1996-02-01 Dana Farber Cancer Inst Inc Moleculas de adhesion intercelular y sus ligandos de fijacion.
PT88641B (pt) * 1987-10-02 1993-04-30 Genentech Inc Metodo para a preparacao de uma variante de adesao
US5272263A (en) * 1989-04-28 1993-12-21 Biogen, Inc. DNA sequences encoding vascular cell adhesion molecules (VCAMS)
US5264554A (en) * 1990-01-19 1993-11-23 The Blood Center Of Southeastern Wisconsin, Inc. Platelet cell adhesion molecule and variants thereof
GB9009548D0 (en) * 1990-04-27 1990-06-20 Celltech Ltd Chimeric antibody and method
ES2134762T3 (es) * 1990-07-20 1999-10-16 Bayer Ag Formas multimericas de proteinas receptoras de rinovirus humanos.
ATE166230T1 (de) * 1990-08-31 1998-06-15 Boehringer Ingelheim Pharma Verwendung von anti-icam antikörpern zur herstellung eines präparats für die behandlung von endotoxinschock
IL102176A (en) * 1991-06-11 2001-09-13 Blood Res Center Recombinant nucleic acid molecule capable of encoding intercellular adhesion molecule 3, functional derivatives of icam-3 and pharmaceutical compositions containing icam-3 or functional derivatives thereof
US5702917A (en) * 1992-01-27 1997-12-30 Icos Corporation Polynucleotides encoding human ICAM-4
WO1993014776A1 (en) * 1992-01-27 1993-08-05 Icos Corporation Icam-related protein

Also Published As

Publication number Publication date
FI970503A7 (fi) 1997-04-04
PL318545A1 (en) 1997-06-23
JP3349514B2 (ja) 2002-11-25
HUP9901123A3 (en) 2001-10-29
FI970503A0 (fi) 1997-02-06
AU6256096A (en) 1996-12-30
CA2196431A1 (en) 1996-12-19
CN1164870A (zh) 1997-11-12
DE69623746T2 (de) 2003-05-08
MX9700941A (es) 1998-01-31
BR9606440A (pt) 1997-09-30
EP1308514A2 (en) 2003-05-07
EP0789763B1 (en) 2002-09-18
DE69623746D1 (de) 2002-10-24
IL120095A0 (en) 1997-04-15
CN1152960C (zh) 2004-06-09
EP0789763A1 (en) 1997-08-20
SK16597A3 (en) 1998-02-04
AU721316B2 (en) 2000-06-29
US5702917A (en) 1997-12-30
SK284161B6 (sk) 2004-10-05
ATE224448T1 (de) 2002-10-15
JP2003047493A (ja) 2003-02-18
CZ29297A3 (en) 1997-10-15
RU2000111744A (ru) 2002-09-10
PL188612B1 (pl) 2005-03-31
FI970503L (fi) 1997-04-04
IL146447A0 (en) 2002-07-25
JPH10505508A (ja) 1998-06-02
HUP9901123A2 (hu) 1999-07-28
DK0789763T3 (da) 2003-01-27
CA2288401A1 (en) 1996-12-19
NO317150B1 (no) 2004-08-30
CA2196431C (en) 2000-08-15
CZ291974B6 (cs) 2003-06-18
RU2155345C2 (ru) 2000-08-27
EP1308514A3 (en) 2004-01-02
NO970546L (no) 1997-04-07
CN1597950A (zh) 2005-03-23
NO970546D0 (no) 1997-02-06
WO1996040916A1 (en) 1996-12-19
ES2183961T3 (es) 2003-04-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5811517A (en) ICAM-related protein variants
US5837822A (en) Humanized antibodies specific for ICAM related protein
US20010029293A1 (en) Icam-related protein
WO1993014776A1 (en) Icam-related protein
US5753502A (en) Neuron-specific ICAM-4 promoter
PL188878B1 (pl) Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych
US6040176A (en) Antibodies to ICAM-related protein
WO1994017100A1 (en) Icam-related protein
US6153395A (en) ICAM-related protein
AU735917B2 (en) ICAM-4 and diagnostic uses thereof
US5773293A (en) Anti-ICAM-4 antibodies and hybridomas
US20030068659A1 (en) ICAM-4 materials and methods
US5989843A (en) Methods for identifying modulators of protein kinase C phosphorylation of ICAM-related protein
US5852170A (en) ICAM-4 materials and methods
US5700658A (en) ICAM-4 materials and methods
WO1999018441A1 (en) Icam-4 and diagnostic uses thereof
AU1117099A (en) ICAM-6 materials and methods

Legal Events

Date Code Title Description
LAPS Decisions on the lapse of the protection rights

Effective date: 20050606