PL188878B1 - Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych - Google Patents
Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznychInfo
- Publication number
- PL188878B1 PL188878B1 PL96318545A PL31854596A PL188878B1 PL 188878 B1 PL188878 B1 PL 188878B1 PL 96318545 A PL96318545 A PL 96318545A PL 31854596 A PL31854596 A PL 31854596A PL 188878 B1 PL188878 B1 PL 188878B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- icam
- leu
- seq
- ala
- gly
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70525—ICAM molecules, e.g. CD50, CD54, CD102
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2803—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
- C07K16/2821—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against ICAM molecules, e.g. CD50, CD54, CD102
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/8509—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
- G01N33/6896—Neurological disorders, e.g. Alzheimer's disease
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2207/00—Modified animals
- A01K2207/15—Humanized animals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2217/00—Genetically modified animals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2217/00—Genetically modified animals
- A01K2217/05—Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2267/00—Animals characterised by purpose
- A01K2267/01—Animal expressing industrially exogenous proteins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
- C07K2317/24—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/55—Fab or Fab'
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2799/00—Uses of viruses
- C12N2799/02—Uses of viruses as vector
- C12N2799/021—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
- C12N2799/026—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid where the vector is derived from a baculovirus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Neurology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Semiconductor Memories (AREA)
- Treatment And Processing Of Natural Fur Or Leather (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Glass Compositions (AREA)
Abstract
1. Sposób badania przesiewowego pod katem zmian neuropatologicznych, znamienny tym, ze obejmuje etapy: a) pozyskania próbki plynu od pierwszej osoby; b) doprowadzenia do kontaktu próbki i przeciwciala dajacego specyficzna reakcje immunologiczna z ICAM-4; c) oznaczenia ilosciowego wiazania ICAM-4/przeciwcialo w próbce; oraz d) porównania wiazania ICAM-4/przeciwcialo u tej osoby z inna osoba, o której wiadomo, ze nie ma zmian neuropatologicznych; przy czym ICAM-4 jest kodowany przez polinukleotyd wybrany z grupy skladajacej sie z polinukleotydu przedstawionego w SEK NR ID: 27 i polinukleotydu kodujacego ICAM-4, który hybryduzuje z polinukleotydom z SEK NR ID: 27. PL PL PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych. W ogólności wynalazek odnosi się do komórkowych cząsteczek adhezyjnych i metod klonowania oraz ekspresji DNA kodującego nieznany dotychczas polipeptyd określany jako „ICAM-4”, wykazujący strukturalne podobieństwo do innych międzykomórkowych cząsteczek adhezyjnych ICAM-1, ICAM-2 i ICAM-R.
Zgłoszenie jest kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/481130 zgłoszonego 1 czerwca 1995, będącego kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/245295 zgłoszonego 18 maja 1994, które z kolei jest kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/102852 zgłoszonego 5 sierpnia 1993 jako kontynuacja w części zgłoszenia patentowego USA nr 08/009266 zgłoszonego 22 stycznia 1993, będącego kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 07/894061 zgłoszonego 5 czerwca 1992, będącego w dalszym ciągu kontynuacją w części zgłoszenia patentowego USA nr 07/889724 zgłoszonego 26 maja 1992, jako kontynuacja w części oczekującego na uznanie zgłoszenia patentowego USA nr 07/827689 zgłoszonego 27 stycznia 1992.
Podstawa wynalazku
Badania naukowe ostatniego dziesięciolecia umożliwiły wyjaśnienie różnych, zachodzących na poziomie molekularnym, zdarzeń stanowiących podłoże wzajemnego oddziaływania na siebie komórek ciała, w szczególności tych, jakie warunkują ruchliwość i aktywację komórek układu odpornościowego człowieka, a w ostatnim czasie, także tych, które biorą udział w rozwoju i prawidłowym, fizjologicznym funkcjonowaniu komórek układu nerwowego. Ogólnych informacji dotyczących komórek układu odpornościowego szukaj w publikacji Springera, Nature, 346: 425-434 (1990), natomiast odnoszących się do komórek układu nerwowego - w artykułach autorstwa Yoshihary i wsp, Neurosci. Res. 10: 83-105 (1991) oraz u Sondereggera i Rathjena, J Cell. Biol. 119: 1387-1394 (1992). Białka powierzchniowe komórek, a w szczególności grupa tak zwanych komórkowych cząsteczek adhezyjnych [Cellular
188 878
Adhesion Molecules - „ CAM” stopniowo stawały się przedmiotem zainteresowania nauk farmaceutycznych umożliwiając postęp wiedzy. Celem badań była ingerencja w procesy związane z przenikaniem leukocytów przez ścianę naczyń krwionośnych i ich migracji do ogniska zapalnego oraz te, jakie odpowiadają za ukierunkowane przemieszczanie leukocytów do różnych tkanek docelowych. Podobnie, zainteresowanie naukowców skupia się także na procesach prowadzących do różnicowania się neuronów i tworzenia kompleksowej sieci neuronalnej. Wyizolowanie oraz charakterystyka komórkowych cząsteczek adhezyjnych, sklonowanie i ekspresja sekwencji DNA kodujących te cząsteczki, a także wprowadzenie i stosowanie ich jako środków służących celom diagnostyki i terapii procesów zapalnych oraz określających rozwój i funkcjonowanie układu nerwowego legły u podstaw wielu amerykańskich oraz innych niż amerykańskie patentów. Informacji szukaj w: Edwards, Current Opinion in Therapeutic Patents, 1(11): 1617-1630 (1991) oraz w szczególności w opublikowanych tam literaturowych odnośnikach cytowanych w części zatytułowanej „Odnośniki do publikacji patentowych”.
Fundamentalne znaczenie dla założeń obecnego wynalazku miała wcześniejsza identyfikacja oraz określenie struktury niektórych cząstek pośredniczących w procesach adhezji komórkowej, takich jak „leukointegryny”: LFA-1, MAC-1 i gp150.95 (zgodnie z nomenklaturą WHO określane odpowiednio jako CD18/CD11a, CD18/'CD11b oraz CD18/CD11c), tworzące podrodzinę heterodimerycznych białek powierzchniowych (tzw. „integryn”) komórki obecnych na powierzchni limfocytów B, limfocytów T, monocytów i granulocytów. Danych tych szukaj w tabeli 1 strona 429, w publikacji Springera cytowanej powyżej. Interesującymi są także inne jednołańcuchowe cząsteczki adhezyjne (CAM), biorące udział w aktywacji leukocytów, ich przyleganiu, przemieszczaniu oraz podobnych im zjawiskach nierozerwalnie związanych z procesem zapalnym. Dla przykładu, jak się obecnie uważa, zanim dojdzie do diapedezy (przenikanie leukocytów przez śródbłonek naczyń krwionośnych), jaki to proces ma miejsce w obrębie ogniska zapalnego, muszą najpierw ulec aktywacji integryny, których obecność obserwuje się konstytutywnie na powierzchni leukocytów. Aktywacja ta na drodze silnego wiązania receptora z jego ligandem powoduje w konsekwencji interakcję pomiędzy integrynami (np. LFA-1) oraz jedną lub obiema z dwóch różnych międzykomórkowych cząsteczek adhezyjnych (ICAM) określonych jako ICAM-1 i ICAM-2, których ekspresję można stwierdzić na powierzchni komórek śródbłonka naczyniowego oraz wielu leukocytów.
Podobnie jak i inne, scharakteryzowane do dzisiaj CAM (np. naczyniowa cząsteczka adhezyjna - [VCAM-1] opisana w publikacji PCT WO nr 90/13300 z dnia 15 listopada 1990 r; oraz płytkowo-środbłonkowa komórkowa cząsteczka adhezyjna [PECAM-1] opisana przez Newmana i wsp., Science, 247: 1219-1222 (1990) oraz w zgłoszeniu patentowym PCT WO 91/10683 opublikowanym 25 lipca 1991), ICAM-1 oraz ICAM-2 wykazują strukturalnie homologię z innymi cząsteczkami będącymi pochodnymi superrodziny genu immunoglobulinowego, z tym, że część pozakomórkowa każdej z ICAM składa się z serii domen posiadających podobny motyw na końcu karboksylowym. Typowa domena przypominająca immunoglobulinę tworzy pętlę zazwyczaj połączoną wiązaniem dwusiarczkowym występującym pomiędzy dwoma grupami cysteiny położonymi na końcach tej pętli. ICAM-1 zawiera pięć domen immunoglobulinopodobnych; ICAM-2, różniąca się głównie rozmieszczeniem w obrębie komórki, zawiera dwie takie domeny; PECAM-1 posiada sześć domen; VCAM obejmuje sześć lub siedem domen, zależnie od wariantów wiązania pętli, i tak dalej. Co więcej, wszystkie CAM charakteryzują się występującym typowo w obrębie cząsteczki śródbłonowym regionem hydrofobowym, jak się uważa, koniecznym do zorientowania przestrzennego cząsteczki na powierzchni komórki oraz regionem cytoplazmatycznym na końcu karboksylowym. Graficzny model CAM można przedstawić w postaci cząsteczki zakotwiczonej w błonie poprzez region śródbłonowy z ogonkiem cytoplazmatycznym, wystającym w kierunku komórkowej cytoplazmy oraz jedną lub większą ilością pętli immunoglobulinopodobnych wystających ponad powierzchnię komórki.
Liczne komórki neuronalne wyrażają immunoglobulino podobne receptory powierzchniowe wykazujące podobieństwo do cząsteczek ICAM, patrz np. publikacja Yoshihara i wsp., cytowana powyżej. Poza domenami posiadającymi struktury immunoglobulinopodobne, wiele cząsteczek adhezyjnych występujących w obrębie układu nerwowego posiada również w swo4
188 878 ich domenach pozakomórkowych powtarzające się tandemowo sekwencje przypominające fibronektynę.
Można przewidzieć, że ze względu na specyfikę działania międzykomórkowe cząsteczki adhezyjne zostaną wykorzystane w celach leczniczych. Przesłanką dla jednego z zastosowań terapeutycznych może być zdolność wiązania się ICAM-1 z ludzkimi rhinowirusami. Na przykład Europejskie zgłoszenie patentowe nr 468257 A zgłoszone 29 stycznia 1992 opisuje wprowadzenie multimerycznych konfiguracji oraz postaci ICAM-1 (w tym postaci o pełnej długości jak i postaci okrojonych) w celu zwiększenia aktywności wiążącej kompleksu receptor/ligand, w szczególny sposób zwiększającego zdolność wiązania wirusów, antygenów limfocyto-pochodnych oraz takich patogenów jak zarodziec zimnicy (Plasmodium falciparum).
W podobny sposób można zakładać innego typu immunologicznie wywodzących się z międzykomórkowych cząsteczek adhezyjnych. Przykład takiego zastosowania podaje publikacja WO 91/16928 z dnia 14 listopada 1991, w której opisano wykorzystanie humanizowanych chimerycznych przeciwciał o swoistości skierowanej przeciw ICAM-1 w leczeniu specyficznych i niespecyficznych stanów zapalnych, zakażeń wirusowych oraz astmy oskrzelowej. Zastosowanie przeciwciał anty-ICAM-1 oraz fragmentów cząsteczki ICAM-1 w leczeniu wstrząsu endotoksycznego opisano także w publikacji WO 92/04034 z dnia 19 marca 1992 r. Opis metody leczenia polegającej na zahamowaniu odczynu zapalnego zależnego od ICAM-1 poprzez wprowadzenie przeciwciał antyidiotypowych lub ich fragmentów skierowanych przeciwko ICAM-1 można znaleźć w publikacji WO 92/06119 z dnia 16 kwietnia 1992 r.
Pomimo fundamentalnych odkryć rzucających światło na mechanizmy adhezji komórkowej, jakich dokonano poprzez' identyfikację i charakterystykę białek adhezji międzykomórkowej, takich jak ICAM-1, oraz integryn wzajemnego oddziaływania limfocytów·’, takich jak LFA-1, obraz tych zjawisk nie jest jeszcze pełny. Ogólnie przyjmuje się, iż w procesach zapalnych oraz w mechanizmie ukierunkowanego przemieszczania limfocytów w organizmie uczestniczy wiele innych białek. Dla przykładu, zgłoszenia patentowe USA o numerach seryjnych 07/827 689, 07/889 724, 07/894 061 i 08/009 266 i odpowiadające im opublikowane zgłoszenie PCT WO 93/14776 (z dnia 5 sierpnia 1993) ujawniają metodę klonowania i ekspresji białek pochodnych od cząsteczek ICAM, określanych jako ICAM-R. Zgłoszenia te zostały zacytowane tu jako literatura, a sekwencje DNA oraz sekwencja aminokwasów ICAM-R zostały podane poniżej jako SEK ID nr 4. Ekspresję tego nowego ligandu stwierdzono w ludzkich limfocytach, monocytach oraz granulocytach. '
Z punktu widzenia niniejszego zgłoszenia, najważniejszą jest jeszcze inna cząsteczka powierzchniowa ICAM-podobna wykazująca, w odróżnieniu od pozostałych znanych cząsteczek ICAM, swoistość tkankową. Mori i wsp. [Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 84: 3921-3925 (1987)] doniósł o identyfikacji specyficznego dla kresomózgowia antygenu jaki stwierdził w mózgu królika, swoiście reagującego z przeciwciałem monoklonalnym 271A6. Ten antygen powierzchniowy został nazwany telenkefaliną. Imamura i wsp. [Neurosci. Letts 119: 118-121 (1990)] dla oceny lokalizacji występowania telenkefaliny stosowali przeciwciała poliklonalne. Wynikiem ich badań było stwierdzenie, że ekspresja telenkefaliny w korze wzrokowej kotów wykazuje zmienność zależną od warstwy tkanki oraz, że ekspresja telenkefaliny zmienia się w zależności od stadium rozwojowego. Jednocześnie Oka i wsp. [Neuroscience 35: 93-103 (1990)] przedstawili wyniki badań zmierzających do izolacji telenkefaliny przy użyciu przeciwciała monoklonąlnego 271A6. Wyizolowali oni cząsteczkę powierzchniową o masie cząsteczkowej około 500 kD. Cząsteczka ta składała z czterech podjednostek, każda o masie natywnej molekuły 130 kD, która to pod wpływem N-glikanazy ulegała redukcji do 100 kD. Yoshihiro i wsp. [Neuroscience, Research Supplement 18, str. S83 (1994)] na 17 dorocznym spotkaniu Japońskiego Towarzystwa Nauk Neurologicznych (Japan Neuroscience Society) jakie odbyło się w Nagoi, Japonia, w dniach 7-9 grudnia 1993 r. oraz na 23 dorocznym zjeździe Naukowego Towarzystwa Neurologicznego (Society for Neuroscience), jaki odbył się w Waszyngtonie 9 listopada 1993 r. [Society for Neuroscience Abstracts 19 (1-3) str. 646 (1993)] przedstawili cDNA oraz sekwencję aminokwasową króliczej telenkefaliny. Wydedukowana sekwencja aminokwasowa sugerowała, iż telenkefalina o masie 130 kD stanowi integralne białko błonowe zawierające dziewięć pozakomórkowych domen immunoglobulinopodobnych. Osiem z nich, położone dystalnie wykazywało homologię z domenami immunoglo188 878 bulino-podobnymi charakteryzującymi inne cząsteczki ICAM. Ta sama informacja została następnie opublikowana przez Yoshiharę i wsp. w Neuron 12: 543-553 (1994).
Z naukowego punktu widzenia istnieje stała konieczność prowadzenia badań zmierzających do wykrycia kolejnych białek uczestniczących w procesach interakcji międzykomórkowych. Nieustannie potrzeba też nowych informacji dotyczących identyfikacji tych białek oraz ich charakteryzowania w kontekście struktury aminokwasowej. Co więcej, potencjalne możliwości ich wykorzystania dla nowych metod leczenia oraz dla potrzeb diagnostyki powodują konieczność określenia sekwencji DNA kodującego strukturę tych cząsteczek. Takie brzemienne w skutki informacje mogą między innymi spowodować produkcję na skalę masową białek, pozwolić na identyfikację komórek naturalnie je produkujących, a także umożliwić wytwarzanie przeciwciał lub innych, nowatorskich białek wiążących, swoiście reagujących i/lub hamujących reakcje połączenia ligandu z receptorem w jakich cząsteczki te są zaangażowane.
Krótkie streszczenie wynalazku
Przedmiotem wynalazku jest sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych, obejmujący etapy:
a) pozyskania próbki płynu od pierwszej osoby;
b) doprowadzenia do kontaktu próbki i przeciwciała dającego specyficzną reakcję immunologiczną z ICAM-4;
c) oznaczania ilościowego wiązania ICAM-4/przeciwciało w próbce; oraz
d) porównanie wiązania ICAM-4/przeciwciało u tej osoby z inną osobą, o której wiadomo, że nie ma zmian neuropatologicznych, przy czym ICAM-4 jest kodowany przez polinukleotyd wybrany z grupy składającej się z polinukleotydu przedstawionego w SEK NR ID: 27 i polinukleotydu kodującego ICAM-4, który hybryduzuje z polinukleotydem z SEK NR ID: 27.
Korzystnie w sposobie według wynalazku próbką płynu jest surowica lub płyn mózgowo-rdzeniowy.
Ponadto korzystnie wiązanie ICAM-4/przeciwciało jest oznaczane ilościowo poprzez test radioimmunologiczny (RIA) lub poprzez enzymatyczny test immunosorpcyjny (ELISA).
Korzystnie zmianą neuropatologinczną pod kątem której jest przeprowadzane badanie jest udar lub epilepsja.
Cząsteczka ICAM-4 może zostać wyizolowana z naturalnych komórek, ale ICAM-4 razem z jej wariantami jest wytwarzana metodami rekombinacji genetycznej przez komórki gospodarza. Korzystną sekwencję aminokwasową polipeptydu ICAM-4 przedstawia sekwencja SEK NR ID: 2. Produkty rekombinacji genetycznej otrzymuje się w postaci polipeptydów częściowo lub całkowicie glikozylowanych, częściowo lub całkowicie deglikozylowanych lub nieglikozylowanych, w zależności od rodzaju komórek gospodarza użytych do produkcji białka ICAM-4 i/lub procedur poizolacyjnych. Warianty cząsteczki ICAM-4 występują w postaci rozpuszczalnej lub nierozpuszczalnej w wodzie, monomerycznej, multimerycznej lub cyklicznych fragmentów ICAM-4 zawierających wszystkie lub tylko część regionów domen, i wykazują właściwości biologiczne lub immunologiczne ICAM-4, takie jak: zdolność wiązania z partnerem wiązania ICAM-4 i/lub zdolność hamowania wiązania ICAM-4 z naturalnym jej partnerem. Warianty ICAM-4 mogą obejmować także analogi polipeptydowe, w których jeden lub większa liczba określonych aminokwasów została usunięta lub zastąpiona: (1) nie powodując utraty, a korzystnie wzmacniając jedną lub więcej funkcji biologicznych lub właściwości immunologicznych charakterystczych dla ICAM-4; lub (2) powodując niezdolność do konkretnego wiązania ligand/receptor. Analogi ICAM-4 mogą również powstawać na skutek wprowadzenia do cząsteczki dodatkowych reszt aminokwasowych (np. lizyny lub cysteiny), co z kolei ułatwia tworzenie struktur multimerycznych.
Przeciwciała wykorzystywne w sposobie według wynalazku (np. przeciwciała monoklonalne i poliklonalne, fragmenty przeciwciał, przeciwciała jednołańcuchowe, przeciwciała chimeryczne, przeciwciała z przeszczepionym CDR itp.) są swoiste (tzn. nie reagują ani z ICAM-1, ani z ICAM-2 i ICAM-R, do których ICAM-4 jest strukturalnie podobna) wobec ICAM-4 lub wariantów ICAM-4. Przeciwciała takie mogą być wydzielane przez linie hybrydoma, takie jak, na przykład, linie: 127A, 127H, 1731 oraz 179H. Przeciwciała mogą być wytwarzane zarówno z zastosowaniem naturalnych lub rekombinowanych cząsteczek ICAM-4
188 878 jak i wariantów ICAM-4 lub komórek wyrażających je na swojej powierzchni. Będące immunogenami, indukujące odpowiedź immunologiczną, komórki wyrażające takie cząsteczki mogą być komórkami organizmów prokariotycznych lub eukariotycznych, które są stabilnie transformowane sekwencjami DNA kodującymi ICAM-4, w sposób pozwalający na ekspresję w nich potrzebnych polipeptydów.
W kompozycjach do immunizacji oraz do oczyszczania ICAM-4, a także do identyfikacji komórek prezentujących na swojej powierzchni ICAM-4 przydatne są również inne białka wiążące. Można je także wykorzystywać w celach modulacji (tzn. blokowania, hamowania lub stymulacji) biologicznych aktywności wiązania ligand/receptor, w których bierze udział ICAM-4, w szczególności funkcji efektorowych ICAM-4, które odgrywają rolę w swoistej i nieswoistej odpowiedzi układu odpornościowego. Przeciwciała antyidiotypowe swoiste wobec przeciwciał skierowanych przeciwko ICAM-4 mogą być stosowane do modulacji odpowiedzi immunologicznej. Testy na wykrywanie oraz ilościową ocenę obecności ICAM-4 na powierzchni komórek oraz w płynach ustrojowych, takich jak surowica czy płyn mózgowordzeniowy, mogą obejmować np. pojedyncze lub wielokrotne przeciwciała wykorzystywane w systemach badania typu „sandwicz” („kanapkowego”). W wykrywaniu ICAM-4 w płynach ustrojowych przeciwciała są użyteczne do oceny występowania patologii w obrębie układu nerwowego, które mogą odpowiadać zwiększonemu poziomowi ICAM-4 w krwiobiegu. Takie stany patologiczne obejmują, ale nie wyłącznie, niedokrwienie mózgu (np. udar) spowodowane różnymi chorobami, w tym np. zatorowość, zakrzepicę itp.
Znajomość sekwencji cDNA dla ICAM-4 umożliwia izolację sekwencji genomowego DNA kodującego ICAM-4 poprzez hybrydyzację DNA/DNA oraz umożliwia poznanie sekwencji kontrolujących ekspresję ICAM-4, takich jak promotory, operatory itp. Procedury hybrydyzacji DNA/DNA prowadzone przy użyciu sekwencji DNA ICAM-4 i w ostrych warunkach hybrydyzacji, pozwalają na izolację wielu DNA kodujących alleliczne warianty ICAM-4, inne strukturalnie pokrewne białka posiadające jedną lub więcej biologicznych i/lub immunologicznych właściwości ICAM-4 oraz białek homologicznych z ICAM-4 pochodzących z innych gatunków. DNA jest także przydatny w teście hybrydyzacji DNA/RNA służącym ocenie zdolności komórek do syntezy ICAM-4. Także uzyskane polinukleotydy antysensowe posiadają znaczenie w regulacji ekspresji ICAM-4 przez komórki, w których normalnie zachodzi taka ekspresja.
Jak to można wykazać w innej serii przykładów, znajomość sekwencji DNA oraz sekwencji aminokwasowej ICAM-4 umożliwia wytwarzanie metodami rekombinacji DNA wariantów ICAM-4 takich jak białka hybrydowe (czasami określane jako „immuno-adhezyny”) charakteryzujące się obecnością sekwencji białkowych ICAM-4 oraz ciężkich łańcuchów regionu stałego lub/i regionu zawiasowego immunoglobulin, patrz: Capon i wsp., Nature 337: 525-531 (1989); Ashkenazi i wsp., P.N.A.S. (USA) 88: 10535-10539 (1991); oraz PCT WO 89/02922 opublikowany 6 kwietnia 1989 r. Warianty białek fuzyjnych ICAM-4 mogą także zawierać, np. wybrane domeny zewnątrzkomorkowe ICAM-4 oraz części innych komórkowych cząstek adhezyjnych.
Przeciwciała antyidiotypowe mogą reprezentować nową klasę biologicznie aktywnych ekwiwalentów ICAM-4. Testy wykonywane in vitro do identyfikacji przeciwciał lub innych związków modulujących aktywność ICAM-4 mogą obejmować, np. unieruchamianie ICAM-4 lub naturalnego ligandu, z którym wiąże się ICAM-4, umożliwiające wykrywanie znakowania nie unieruchomionego partnera wiązania, inkubowanie razem partnerów wiązania i określanie wpływu badanego związku na ilość znakowanego wiązania, przy czym zmniejszenie znakowanego wiązania w obecności badanego związku w porównaniu z ilością znakowanego wiązania w nieobecności badanego związku, wskazuje, że badany czynnik jest inhibitorem wiązania ICAM-4.
Szczegółowy opis wynalazku
Ujawnienia w macierzystym zgłoszeniu patentowym USA nr 08/102852, zgłoszonym 5 sierpnia 1993 są szczegółowo włączone przez odniesienie. Przykłady z tego zgłoszenia dotyczą między innymi: projektowania i konstruowania sond oligonukleotydowych do powielania metodą PCR DNA związanych z ICAM, zastosowania sond do powielania ludzkiego genomowego fragmentu homologicznego, ale różniącego się od DNA kodującego ICAM-1
188 878 i ICAM-2, przeszukiwania bibliotek cDNA genomowym fragmentem celem wyizolowania dodatkowych sekwencji kodujących ICAM, przeszukiwania bibliotek cDNA celem wyizolowania pełnej sekwencji ludzkiego cDNA kodującego ICAM-R, charakteryzowania informacji o DNA i sekwencji aminokwasowej pod kątem ICAM-R, a w szczególności ICAM-1 i ICAM-2, wytwarzania ssaczych komórek gospodarza wyrażających ICAM-R, mierzenia udziału ICAM-R w procesie adhezji, obejmującym szlaki zależne od Cd 18 i niezależne od CDI 8, hamowania adhezji do ICAM-R przez polipeptydy wywodzące się od ICAM-R, ekspresji odmian ICAM-R, wytwarzania i charakteryzowania przeciwciał przeciw ICAM-R i ich fragmentów, mapowania epitopów rozpoznawanych przez przeciwciała monoklonalne przeciw ICAM-R, pomiaru dystrybucji i biochemicznego charakteryzowania ICAM-R i kodującego go RNA, mierzenia ICAM-R przy adhezji komórek danego typu i aktywacji/namnażaniu komórek opornościowych, charakteryzowania przeciwciał monoklonalnych dla ICAM-R oraz pomiaru różnicowej fosforylacji i powiązania cytoplazmatycznej domeny ICAM-R z cytoszkieletem. Ujawniono również identyfikację DNA kodującego ICAM ze szczura, który wówczas okazał się być szczurzym homologiem ludzkiego ICAM-R oraz zastosowanie tego DNA do konstruowania i wyrażania DNA kodujących fuzje białkowe z transferazą S-glutationu. Szczegółowy opis w jaki sposób taki DNA szczura był zidentyfikowany można znaleźć w macierzystym zgłoszeniu (USA Nr 08/102 852) w przykładzie 6 i jest tu zaprezentowany jako przykład 1. Po zidentyfikowaniu dalszej sekwencji kodującej ICAM, okazało się że DNA dla ICAM ze szczura nie koduje homologu szczurzego ludzkiego ICAM-R, ale faktycznie koduje nowy polipeptyd ICAM, nazwany tu ICAM-4. W celu pokazania zdarzeń prowadzących do identyfikacji ICAM-4, przedstawiono chronologię, po której następuje szczegółowy opis wynalazku.
Pierwsza zidentyfikowana genomowa sekwencja ICAM-4 ze szczura kodowała region homologiczny do domeny 2 (tutaj SEK NR ID: 3, a SEK NR ID: 23 w Patencie USA Nr 08/102 852) ludzkiego ICAM-R (tutaj SEK NR ID: 4). Zidentyfikowano również drugi, zachodzący genomowy DNA (tutaj SEK NR ID: 5, a SEK NR ID: 26 w Patencie USA Nr 08/102 852), który kodował zarówno region domeny 2 z SEK NR ID: 3, jak i sekwencje dla ICAM-1. Stosując SEK NR ID: 3 jako sondę zidentyfikowano cDNA ze śledziony szczura (tutaj SEK NR ID: 6, a SEK NR ID: 25 w Patencie USA Nr 08/102 852), który kodował domeny od 2 do 5, jak również domenę piątą, wcześniej nie obserwowaną jako domena ICAM. W tym czasie te nowo zidentyfikowane DNA szczura okazały się kodować homolog ludzkiego ICAM-4 szczura, jakkolwiek dopasowanie regionów 3' tych DNA do innych ICAM okazało się trudne.
Następująca później izolacja klonu cDNA o długości 1 kb z biblioteki ze śledziony szczura i powielenie fragmentu poprzez RT-PCR wykazały, że część zarówno klonów cDNA, jak i genomowych nie została zsekwencjonowana. Inny produkt powielania RT-PCR (SEK NR ID: 7) potwierdził ten brak. Stwierdzono, że fragment o długości 177 bp został wycięty z klonów genomowych i cDNA poprzez trawienie klonów EcoRI celem izolowania tych sekwencji z faga X, do badań nad sekwencją. Ponowna analiza SEK NR ID: 5 i 6 pod kątem tych sekwencji umożliwiła identyfikację bardziej dokładnej i pełnej sekwencji oryginalnie wyizolowanych klonów genomowych i cDNA, przedstawionych tu w postaci poprawionej jako SEK NR ID: 8 i 9.
W celu zidentyfikowania pełnej sekwencji kodującej dla ICAM-R, wyizolowano cDNA ze szczurzego mózgu (SEK NR ID: 10) i oznaczono sekwencję końca 5' poprzez powielenie końca 5' cDNA metodą rapid (5' RACE), produkt amplifkacji przedstawiono w SEK NR ID: 11. Zestawienie danych dla klonu RT-PCR (SEK NR ID: 7), cDNA z mózgu (SEK NR ID: 10) i produktu amplifikacji RACE (SEK NR ID: 11) umożliwiło identyfikację pełnej sekwencji kodującej dla ICAM-4 (SEK NR ID: 1). Niniejszy wynalazek jest zatem zilustrowany przez następujące przykłady. Bardziej szczegółowo, przykład 1 dotyczy klonowania części DNA dla ICAM-4. Przykład 2 opisuje analizę metodą Northern transkrypcji szczurzego ICAM-4. Przykład 3 opisuje izolację szczurzego cDNA pełnej długości dla ICAM-4. Przykład 4 dotyczy hybrydyzacji in situ szczurzego ICAM-4 w tkance mózgowej. Przykład 5 dotyczy wytwarzania ftizji białkowych ICAM-4 w organizmach prokariotycznych. Przykład 6 opisuje wytwarzanie monoklonalnych przeciwciał specyficznych wobec fuzji białkowych: szczurzy ICAM4/GST. Przykład 7 opisuje ekspresję rozpuszczalnych szczurzych białek ICAM-4 w bakulowi8
188 878 rasowym systemie ekspresyjnym. Przykład 8 dotyczy wytwarzania monoklonąlnych przeciwciał specyficznych wobec szczurzego ICAM-4 wyrażanego w systemie bakulowirasowym. Przykład 9 opisuje analizę immunocytochemiczną ekspresji ICAM-4. Przykład 10 dotyczy klonowania ludzkiego genomowego DNA kodującego ICAM-4. Przykład 11 dotyczy klonowania ludzkiego cDNA kodującego ICAM-4. Przykład 12 opisuje analizę ekspresji ludzkiego ICAM-4 metodą Northern. Przykład 13 opisuje wytwarzanie fuzji białkowych: ludzki ICAM4/GST. Przykład 14 dotyczy wytwarzania przeciwciał monoklonąlnych specyficznych wobec ludzkiego ICAM-4. Przykład 15 opisuje opracowanie testu wyłapującego dla określania stężenia rozpuszczalnego ICAM-4 w poszczególnych płynach. Przykład 16 stosuje test wyłapujący do pomiaru stężenia ICAM-4 w surowicy pacjentów po udarze. Przykład 17 dotyczy pomiaru transkrypcji ICAM-4 w modelu epilepsji szczurzej. Przykład 18 dotyczy klonowania regionu promotorowego ludzkiego ICAM-4.
Przykład 1
Klonowanie szczurzego DNA dla białka ICAM-pokrewnego
A. Izolacja szczurzego genomowego DNA dla domeny 2 białka ICAM-pokrewnego.
Szczurza biblioteka genomowa, skonstruowana w wektorze λ EMBL3, była przeszukiwana sondą wyznakowaną [32P], otrzymaną metodą PCR na matrycy DNA kodującego ludzką domenę 2 ICAM-3. Sekwencja nukleotydowa tej sondy jest przedstawiona w SEK. NR ID: 12. Łysinki z biblioteki przenoszono na filtry nylonowe Hybond N+ (Amersham, Arlington Heights, IL). Przeszukiwanie wszystkich bibliotek cDNA i genomowych prowadzono według standardowych przepisów. Prehybrydyzację i hybrydyzację przeprowadzano w roztworze: 4050% formamid, 5 X Denhardt, 5 X SSPE i 1,0% SDS w temp. 42°C. Sondy, wyznakowane [32P], dodawano do stężenia 105-106 cpm/ml roztworu hybrydyzacyjnego. Po 16-18 godzinach hybrydyzacji, filtry nylonowe obficie płukano w temperaturze pokojowej w 2 X SSPE z 0,1% SDS, a następnie eksponowano błony Rtg w -80°C przez noc. Pozytywne łysinki poddawano jednej lub kilku random hybrydyzacji w celu otrzymania klonu fagowego. DNA otrzymany z lizatu klonu pozytywnego subkłonowano w wektorze pBS+ i sekwencjonowano.
Pierwszy klon genomowy kodujący ICAM-pokrewną szczurzą domenę 2, zidentyfikowany na podstawie znalezionej homologii do obszarów domeny 2 innych członków rodziny ICAM (patrz dla przykładu tabela 1 ze Zgłoszenia Patentowego USA Nr 08/102,852), różnił się od wcześniej opisanej sekwencji szczurzego ICAM-1 [Kita i wsp., Biochem. Biophys. Acta 1131:108-110 (1992)], czy mysiego ICAM-2 [Xu i wsp., J. Immunol. 149:2560-2565 (1992)]. Sekwencja nukleotydowa i przewidziana sekwencja aminokwasowa tego klonu zostały ujawnione w równoległych zgłoszeniach macierzystych w stosunku do niniejszego zgłoszenia jako znaczące odmiany szczurzego ICAM-R i były przedstawione odpowiednio jako SEK NR ID:23 i 24 w Zgłoszeniu Patentowym USA Nr 08/102 852. Tutaj te same sekwencje są przedstawione odpowiednio jako SEK NR ID: 3 i 13.
Przy użyciu tej samej sondy zidentyfikowano dragi, zachodzący klon i ustalono, że posiada on sekwencje domeny 2 ICAM z SEK NR ID: 3 oraz koniec 5' DNA kodujący przynajmniej fragment szczurzego ICAM-1. Sekwencja nukleotydowa tego klonu została przedstawiona w równoległym zgłoszeniu macierzystym w stosunku do niniejszego zgłoszenia jako SEK. NR ID: 26 i jest pi-zedstawiona tutaj jako SEK NR ID:5. Drugi klon wskazuje na to, że fragment ICAM-pokrewnego genu z klonu pierwszego i gen kodujący szczurzy ICAM-1 są zlokalizowane na tym samym chromosomie szczura w odległości 5 kb.
B. Izolacja cDNA dla białka ICAM-pokrewnego ze szczura
W celu zidentyfikowania kompletnej sekwencji kodującej białko ICAM-pokrewne, wyznakowany [32P] DNA kodujący domenę 2 ze szczurzego klonu genomowego, zidentyfikowanego w Sekcji A (SEK NR ID:3), powyżej, został użyty do przeszukania szeregu bibliotek cDNA z różnych typów komórek szczurzych i mysich, w tym szczurzych makrofagów (Clontech, Pało Alto, CA), limfocytów krwi obwodowej (PBL) (Clontech), limfocytów T (skonstruowanych przez zespół) i komórek śledziony (Clontech) oraz mysich PBL (Clontech), limfocytów T (skonstruowanych przez zespół) i limfocytów B (skonstruowanych przez zespół).
W bibliotece cDNA ze śledziony zidentyfikowano pojedynczy kłoń (Clontech), który zawierał pięć domen Ig-podobnych, z których cztery były homologiczne do domen od 2 do 5
188 878 zarówno w ICAM-1, jak i ICAM-R. Co więcej, klon ten zawierał koniec 3' DNA kodujący piątą domenę Ig-podobną która nie była poprzednio zidentyfikowana w żadnym innym peptydzie ICAM. Dodatkowo, zawarta w tym klonie nietypowa sekwencja na końcu 3', później zdeterminowana jako częściowy intron (dyskutowane poniżej), leżący pomiędzy domeną 4 i 5 sugeruje, że klon ten jest produktem niedojrzałego lub nie prawidłowo złożonego transkryptu. Obecność unikatowej domeny i wykazanie, że obszaru 3' nie daje się dobrze dopasować do innych znanych sekwencji ICAM sugeruje, że DNA dla białka ICAM-pokrewnego może kodować nowy szczurzy polipeptyd ICAM. Sekwencja nukleotydową tego klonu została przedstawiona jako SEK NR ID:25 w zgłoszeniu macierzystym w stosunku do niniejszego zgłoszenia; tutaj sekwencja nukleotydową klonu cDNA ze śledziony jest przedstawiona jako SEK NR ID: 6.
C. Powtórna analiza cDNA i DNA genomowego ze szczura
Po złożeniu 5 sierpnia 1993 Zgłoszenia Patentowego USA Nr 08/102 852 ustalono, że częściowy klon cDNA ze śledziony szczura (SEK NR ID:25 w zgłoszeniu macierzystym i SEK NR ID:6 tutaj) oraz genomowy klon z wątroby szczura (SEK NR ID:26 w zgłoszeniu macierzystym i SEK NR ID:5 tutaj) nie posiadały wewnętrznego fragmentu EcoRI o długości 177 bp, który był częścią każdego z tych klonów, lecz został zgubiony podczas etapu subklonowania, kiedy wstawki z biblioteki wycinano z wektora λ poprzez trawienie EcoRI i włączano poprzez ligację do wektora używanego do sekwencj ono wania. Obserwacja, że w klonach cDŃA i genomowym został zgubiony fragment sekwencji kodującej wynikała z dopasowania szczurzej sekwencji genomowej i cDNA do różnych produktów amplifikacji RT-PCR, włączając w to SEK NR ID:7, które uwidoczniło lukę w sekwencji DNA ze szczura.
Kolejna izolacja i dopasowanie sekwencji cDNA z biblioteki śledziony, przy użyciu klonu cDNA śledziony (SEK NR ID:6) jako sondy, potwierdziły pierwotne przypuszczenia, że nie został zsekwencjonowany fragment klonu cDNA i genomowego ze śledziony. Dalsze, oczywiste potwierdzenie otrzymano po amplifikacji fragmentu łączącego domeny od 3 do 5 metodą RT-PCR, przy użyciu startera 5' (RRD3 5' Xho, zawierającego na końcu 5' miejsce restrykcyjne Xhol dla ułatwienia klonowania), pokazanego jako SEK NR ID: 14, oraz startera 3' (RRD5 3' Hind, zawierającego miejsce restrykcyjne Hindlll dla ułatwienia klonowania), pokazanego jako SEK NR ID: 15.
GAACTCGAGGCCATGCCTCCACTTTCC (SEK NR ID: 14) CCATAAGCTTTATTCCACCGTGACAGCCAC (SEK NR ID: 15)
Dopasowanie obu omawianych sekwencji DNA w sposób jednoznaczny pokazało, że klony cDNA i genomowy utraciły fragment DNA jeszcze przed sekwencj ono waniem; znalazło to potwierdzenie po odczytaniu sekwencji DNA RT-PCR, dyskutowanym poniżej. Stwierdzono, że trawienie restrykcyjne EcoRI wycinające fragmenty cDNA i genomowe z DNA faga λ przed sekwencj ono waniem, spowodowało wycięcie fragmentu o długości 177 bp, który nie uwidaczniał się podczas rozdzielania w żelu agarozowym. Kolejna analiza sekwencji potwierdziła obecność dwóch miejsc EcoRI ograniczających fragment 177bp w obu wyjściowych klonach.
Fragment EcoRI o długości 177 bp jest położony pomiędzy nukleotydami 719 i 896 w częściowym klonie cDNA ze szczura, jak pokazano w SEK NR ID: 9, a pomiędzy nukleoty darni 2812 i 2989 w częściowym klonie genomowym, jak pokazano w SEK NR ID: 8.
D. DNA izolowany przy zastosowaniu klonu z RT-PCR
RT-PCR został wykorzystany do otrzymania kompletnej informacji o sekwencji genu dla białka ICAM-pokrewnego ze szczura. Znajomość sekwencji klonu genomowego (SEK NR ID:3) wykorzystano do zaprojektowania starterów komplementarnych do obszaru 5' odcinka kodującego białko, ustalonego na podstawie klonu cDNA oraz antysensownego startera zaprojektowanego jako komplementarny do sekwencji kodujących i regionów 3' w stosunku do sekwencji kodującej w klonie cDNA (SEK NR ID: 6).
Matrycowy cDNA do reakcji PCR przygotowywano w sposób następujący. Około 2 pg RNA poły A+ izolowanego z komórek śledziony szczura denaturowano przez grzanie w 65°C w objętości 10 pl. Po denaturacji dodawano 0,1 pl RNazyny (Invitrogen, San Diego, CA), 5 pl 5X buforu
188 878 do RTazy (BRL, Bethesda, MD), 2 μΐ losowych heksamerów (pd(N)ó w 100 pg/ml) (Pharmacia, Piscataway, NJ), 6 μΐ, dNTP (2 mM każdy) i 2 (il RTazy AMV (BRL); reakcję prowadzono w temperaturze 42°C przez 60-90 min. Mieszaniny reakcyjne przechowywano w -20°C do momentu użycia.
Przeprowadzano wstępne serie doświadczeń w ceiu zidentyfikowania par starterów oligonukleotydowych dających produkt amplifikacji w reakcjach PCR przy użyciu cDNA ze śledziony szczura. Różne sensowne startery 5' były dobierane w pary ze starterami 3' zaprojektowanymi jako komplementarne do wewnętrznej sekwencji kodującej; starter 3' oznaczono jako RRD2 3-1 i przedstawiono w SEK NR iD: 16.
AACGTGCGGAGCTGTCTG (SEK NR ID: 16) (W ostatecznie wyizolowanym produkcie RT-PCR, SEK NR ID:7, poniżej, starter RRD2 3-1 odpowiada nukleotydom 719 do 736.) Podobnie, różne antysensowne startery 3' dobierano w pary ze starterami 5' zaprojektowanymi jako komplementarne do innej sekwencji kodującej; starter 5' w tych reakcjach oznaczono jako RGen3900S i pokazano w SEK NR ID: 17.
ACGGAATTCGAAGCCATCAACGCCAGG (SEK NR ID: 17) (W SEK NR ID:7, poniżej, starter RGen3900S odpowiada nukleotydom 1719 do 1736). W oparciu o wielkości powielonych produktów i zdolności tych produktów do hybrydyzacji z częściowym klonem cDNA, ustalono jedną parę starterów jako najbardziej wydajną i używano jej w kolejnych reakcjach powielania PCR. Starter 5' oznaczono jako RGen780S (SEK NR ID: 18), a starter 3' oznaczono jako RGen4550AS (SEK NR ID: 19).
(SEK NR CATGAATTCCGAATCTTGAGTGGGATG (SEK NR ID: 18) ATAGAATrCCTCGGGACACCTGTAGCC (SEK NR ID: 19) (W SEK NR ID:7, poniżej, starter RGen780S odpowiada nukle-otydom od 1 do 18, a starter RGen4550AS odpowiada nukleotydom od 2197 do 2214.)
Taka para starterów została użyta w reakcjach PCR prowadzonych w różnych warunkach celem optymalizacji reakcji amplifikacji. W sumie użyto 15 buforów różniących się wartościami pH i stężeniem Mig’’ i zastosowano dwie różne temperatury przyłączania starterów; próbki produktu otrzymanego w każdej z reakcji rozdzielano w 1% żelu agarozowym. Ponieważ produkty amplifikacji PCR z różnych warunków reakcji mogły nie być widoczne w żelu barwionym bromkiem etydyny, do wykrywania produktów PCR wykorzystano bardziej czułą metodę Southema.
Część powielonego DNA rozdzielano elektroforetycznie w żelu, przenoszono na filtr nylonowy Hybond N+ stosując standardową technikę z zastosowaniem kompresu ssącego i hybrydyzowano z pełnym cDNA ze szczura wyznakowanym [32P]. Zastosowano warunki hybrydyzacji zasadniczo takie, jak opisano dla procedury przeszukiwania biblioteki w Sekcji A, powyżej. Autoradiogramy wykazały, że niewielka ilość DNA o wielkości około 2,2 kb była wytwarzana w dwóch reakcjach, więc pozostałe produkty obu reakcji rozdzielono w żelu agarozowym. Pomimo, że nie widziano w sposób oczywisty prążka DNA, fragment 2,2 kb eluowano z żelu i używano jako matrycy w kolejnej reakcji PCR przy zastosowaniu tych samych starterów (SEK NR ID: 18 i 19), buforu Tris-HCl pH 8,0, zawierającego ImM Mg++ przyłączanie starterów prowadzono w temperaturze 55°C. Produkt amplifikacji z drugiej rundy PCR, widoczny w żelu, eluowano i klonowano w wektorze pBS+ (Stratagene, La Jola,CA) w celu przeprowadzenia analizy sekwencji.
Ustalono, że otrzymany klon RT-PCR zawiera 2214 bp, jak pokazano w SEK NR ID: 7. Klon ten koduje domeny od 2 do 6 znalezione w klonie cDNA ze śledziony szczura oraz dodatkową N-końcową domenę 1, dodatkową C-końcową domenę 7 i fragment o wielkości 164 bp, który wydaje się być dalszą C-końcową domeną 8. Tuż przed domeną 1 na końcu 5' występuje dodatkowa sekwencja 144 bp pochodząca przypuszczalnie z intronu leżącego pomiędzy sekwencją liderową i pierwszą domeną. Klon ten nie zawiera sekwencji lidera na końcu 5' oraz regionu transbłonowego i cytoplazmatycznego na końcu 3'. Dodatkowo oprócz poprzednio zidentyfikowanej domeny 6 w klonie cDNA ze śledziony, zidentyfikowano domenę siódmą i ósmą w klonie RT-PCR, co stanowi podstawę hipotezy, że klon ten jest nowym szczurzym ICAM.
188 878
Przykład 2
Analiza metodą Northern
W celu dalszego zbadania możliwości, że klony ICAM-pokrewne zidentyfikowane w przykładzie 1 kodują nowy polipeptyd ICAM, co sugerują unikatowe domeny Ig-podobne, analizowano specyficzną tkankowo ekspresję tego genu metodą Northern, pozwalającą na porównanie otrzymanych wyników z wcześniej opublikowanymi danymi dla ludzkich ICAM [ICAM-1. Dustin i wsp., J. Immunol. 137:245-254 (1986); ICAM-R, de Fourgerolles i Springer, J.Exp.Med. 175:185-190 (1992)].
Całkowity komórkowy RNA z płuc, mózgu, rdzenia kręgowego, wątroby, przewodu pokarmowego, grasicy, węzłów chłonnych i śledziony szczura otrzymywano przy użyciu odczynników do izolacji RNA STAT60 (Tel-test „B”, Inc. Friendswood, Texas), zgodnie z przepisem producenta. RNA poli A+ izolowano z całkowitego RNA przy użyciu kolumienek z oligo dT celulozą. Około 5pg RNA otrzymanego z każdego rodzaju tkanki rozdzielano w 1% żelu agarozowym, zawierającym formaldehyd i przenoszono na filtr nitrocelulozowy Hybond-C (Amersham).
Fragment cDNA ze śledziony szczura z przykładu 1, odpowiadający domenie od 2 do 4 (nukleotydy od 1 do 724 w SEK NR ID:6) subklonowano w wektorze pBluscript SK+ (Stratagene), a następnie otrzymywano antysensowną sondę RNA przy zastosowaniu transkrypcji in vitro, z użyciem UTP wyznakowanego 32P i około 500 ng liniowej matrycy, stosownie do przepisu producenta (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN). Filtry z przyłączonym RNA prehybrydyzowano w roztworze zawierającym 50% formamid, 5 X SSC, 1 X Pe (50 mM TrisHC1 pH 7,5, 0,1% pirofosforan sodu, 0,2% poliwinylopirolidon, 0,2% fikol, 5 mM EDTA, 1% SDS) oraz zdenaturowany DNA ze spermy łososia w stężeniu 150 pg/ml. Wyznakowaną radioaktywnie sondę denaturowano przez gotowanie i dodawano do roztworu prehybrydyzacyjnego do końcowego stężenia 1x 106 cpm/ml. Hybrydyzację prowadzono przez 16-18 godzin w 65°C. Następnie filtry płukano w 65°C w 2 X SSC zawierającym 0,1% SDS i eksponowano stosując błony Rtg przez 3-16 godzin.
Analiza metodą Northern wykazała, że ICAM-pokrewny cD-NA zidentyfikowany w przykładzie 1 ulega ekspresji jedynie w mózgu szczura. Ta specyficzność tkankowa nie była poprzednio opisywana dla żadnego z innych polipeptydów ICAM. Wzór ekspiesji, w kombinacji z unikatowymi domenami Ig-podobnymi, nie znalezionymi w innych polipeptydach ICAM wskazuje, że klon ICAM-pokrewny jest nowym członkiem rodziny białek ICAM i został nazwany ICAM-4.
Fakt, że zidentyfikowane początkowo klony cDNA wykryto w bibliotece ze śledziony szczura sugeruje, że w części komórek śledziony gen ICAM-4 ulega ekspresji na niskim po ziomie.
Jednakże, nie udało się wykryć klonu w prawidłowy sposób złożonego w wielu bibliotekach cDNA z komórek krwiotwórczych, co pozwala wątpić czy białko ICAM-4 jest rzeczywiście wyrażane w tkankach innych od mózgu. Jednym z wytłumaczeń wykrywania ICAM-4 cDNA w śledzionie jest możliwość powielenia śladowej ilości transkryptu w bardzo czułej reakcji PCR, nawet jeśli tkanki te nie wytwarzają kodowanego białka.
Przykład 3
Izolacja pełnej długości szczurzego cDNAdla ICAM-4
A. Identyfikacja klonu cDNA z mózgu szczura
Z uwagi na specyficzną tkankowo ekspresję ICAM-4, mRNA pochodzący z tkanki mózgowej wykorzystano przy próbach izolacji pełnej długości cDNA kodującego ICAM-4. Dwie sondy, jedną, komplementarną do domeny od 1 do 2 oraz drugą, komplementarną do domeny od 3 do 5 klonu cDNA ze śledziony, zidentyfikowanego w przykładzie 1 (SEK NR ID:7), wyznakowano i użyto do przeszukiwania biblioteki cDNA z mózgu szczura, skonstruowanej w wektorze Xgt10, otrzymanej uprzednio w naszym zespole. Warunki hybrydyzacji opisano w przykładzie 1, a pozytywne łysinki poddawano jednej lub kilku rundom hybrydyzacji w celu otrzymania klonu fagowego.
Zidentyfikowano dziewięć pozytywnych klonów, z których dwa hybrydyzowały z obiema sondami. Najdłuższy z otrzymanych klonów, oznaczony jako klon 7, zawierający 2550 bp,
188 878 koduje cztery domeny Ig-podobne, które występują w sondzie cDNA. Dodatkowo klon 7 koduje cztery inne domeny Ig-podobne, które nie występują w sondzie. Zdentyfikowano przypuszczalną domenę transbłonową i cytoplazmatyczną, po których występuje kodon stop, sygnał poliadenylacji i ogon poli A. Klon 7 utracił co najmniej jedną domenę Ig-podobną na końcu 5', co ustalono porównując z klonem RT-PCR (SEK NR ID: 7), jak również utracił sekwencję liderową; ponowne przeszukanie biblioteki nie ujawniło dłuższego klonu, który posiadałby wspomniane sekwencje. Sekwencja nukleotydowa klonu 7 jest pokazana w SEK NR ID: 10.
B. Ustalenie końca 5'
W celu wyizolowania domeny 1 i innych sekwencji z końca 5', wykorzystano technikę PCR zwaną 5' RACE ( ang. Rapid Amplification of cDNA Ends) [PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis i wsp., wyd. Academic Press: New York (1990) str. 28-38] z wykorzystaniem zestawu do 5' RACE (Clontech). Technika ta wykorzystuje wewnętrzny starter, który jest używany w parze z drugim starterem komplementarnym do sekwencji adapterowej, dołączonej do końca 5' cząsteczek cDNA z biblioteki. Reakcja PCR z tym starterem umożliwi amplifikację i identyfikację brakującej sekwencji. Informacja na temat zachodzących na siebie sekwencji pozwoli na utworzenie pełnej sekwencji tego genu.
cDNA z mózgu szczura przygotowany techniką RACE (dostarczony z zestawem) został użyty w reakcji PCR z wykorzystaniem oligonukleotydu z zestawu i antysensownego startera opartego na wewnętrznej sekwencji ICAM-4. Antysensowny starter 3', oznaczony jako Spot714AS, został nazwany stosownie do sekwencji domeny 4 z ICAM-4 i pokazany w SEK NR ID:20.
CARGGTGACAAGGGCTCG (SEK NR ID:20)
Produkt otrzymany w wyniku amplifikacji, z wykorzystaniem pary tych starterów był następnie użyty w drugiej reakcji PCR, w której wykorzystano ten sam starter 5' z zestawu oraz starter 3' komplementarny do rejonu domeny lw ICAM-4. Drugi starter 3' oznaczono jako RRACE2 i pokazano w sEk NR ID:21.
TATGAATTCAGTTGAGCCACAGCGAGC (SEK NR ID:21)
Każdy ze starterów użyty w drugiej reakcji PCR zawierał miejsce restrykcyjne EcoRI ułatwiające klonowanie w wektorze pBS+ (Stratagene) produktów otrzymanych w wyniku amplifikacji. Otrzymany plazmidowy DNA, który zawierał koniec 5' genu został zidentyfikowany poprzez hybrydyzację do sondy zawierającej domeny 1 i 2 szczurzego ICAM-4, odpowiadającej nukleotydom od 1 do 736 w SEK NR ID:7. Na podstawie otrzymanego produktu amplifikacji ustalono częściową informację o sekwencji domeny 1 i hydrofobowego lidera.
Produkt otrzymany metodą 5' RACE jest fragmentem o długości 222 bp zawierającym 60 bp przed pierwszym kodonem dla metioniny, sekwencję liderową o długości 82 bp i sekwencję domeny 1 o długości 80 bp. Produkt powielania pokazano w SEK NR ID: 11.
C. Sekwencja szczurzego ICAM-4 pełnej długości
Na podstawie informacji o sekwencji, pochodzącej z metody 5' RACE (SEK NR ID: 11), klonu RT-PCR (SEK NR ID:7) i klonu 7 niosącego cDNA z mózgu (SEK NR ID: 10), skonstruowano złożony klon o pełnej długości. Ustalono, że szczurzy gen ICAM-4 pełnej długości zawiera 2985 bp z pojedynczą ramką odczytu kodującą białko złożone z 917 aminokwasów. Przypuszczalna sekwencja Kozak położona jest powyżej kodonu dla metioniny i sekwencji liderowej. Za 27-aminokwasowym, hydrofobowym liderem występuje dziewięć domen Igpodobnych, region transbłonowy i zawierający 58 aminokwasów cytoplazmatyczny ogon. Złożony cDNA dla ICAM-4 pokazano w SEK NR ID:1, a ustalona sekwencja aminokwasowa przedstawiona jest jako SEK NR ID:2.
Podobnie jak inne polipeptydy ICAM, ICAM-4 zawiera domenę zewnątrzkomórkową, transbłonową i cytoplazmatyczną. W zewnątrzkomórkowej domenie ICAM-4 koniec N stanowi sekwencja liderową, obejmująca aminokwasy od 1 do 27, po których następuje dziewięć immunoglobulinowych domen(Ig)-podobnych charakterystycznych dla ICAM-4, które w ICAM-1, ICAM-2 i ICAM-R zawierają odpowiednio pięć, dwie i pięć zewnątrzkomórkowych domen Ig-podobnych. W ICAM-4 domena 1 obejmuje aminokwasy od 28 do 118;
188 878 domena 2 obejmuje aminokwasy od 119 do 224; domena 3 obejmuje aminokwasy od 225 do 321; domena 4 obejmuje aminokwasy od 322 do 405; domena obejmuje aminokwasy od 406 do 488; domena 6 obejmuje aminokwasy od 489 do 569; domena 6 obejmuje aminokwasy do 570 do 662; domena 8 obejmuje aminokwasy od 663 do 742 i domena 9 obejmuje aminokwasy od 743 do 830. W każdej z domen tworzona jest charakterystyczna struktura „pętli” dzięki mostkom dwusiarczkowym powstającym pomiędzy resztami cysternowymi, rozmieszczonymi zazwyczaj na dwóch przeciwległych końcach sekwencji aminokwasowej. Na inne cechy strukturalne ICAM-4 składają się transbłonowy region obejmujący aminokwasy od 831 do 859 i cytoplazmatyczny rejon obejmujący aminokwasy od 860 do 917.
Porównanie homologii sekwencji aminokwasowej każdej z domen szczurzego ICAM-4 z innymi członkami rodziny ICAM ograniczono do odpowiednich sekwencji ludzkich ICAM-1, I-CAM-2 i ICAM-R ponieważ informacje o sekwencji dla trzech szczurzych homologów nie były wcześniej publikowane. W pierwszej domenie szczurzy ICAM-4 wykazuje odpowiednio 21, 30 i 28 procent identyczności z ludzkimi ICAM-1, ICAM-2 i ICAM-R. Druga domena jest silniej konserwowana i posiada 60, 42 i 62 procent identyczności odpowiednio z ICAM-1, -2 i -3. Domeny 3-5 wykazują odpowiednio procent identyczności 48, 49 i 40 z ICAM-1 i 60, 59
29 odpowiednio z ICAM-R. Interesujące, że szczurze domeny od 4 do 6 ICAM-4 wykazują najsilniejszą homologię z domeną 5 (wahające się w zakresie 29-42% identyczności) i jest możliwe, że powstały one w wyniku duplikacji segmentu genu. Dziewiąta i końcowa zewnątrzkomórkowa domena wykazuje niskie podobieństwo do innych domen ICAM, lecz posiada 22% identyczności z 3-cią i 6-tą domeną ludzkiego VCAM-1, innego członka rodziny białek Ig, które biorą udział w adhezji komórek. Cytoplazmatyczny ogon składa się z 58 aminokwasów. Jest on dłuższy od występujących u innych członków rodziny ICAM w której ludzkie ICAM-1, -2 i -3 posiada odpowiednio 28, 26 i 37 aminokwasowe ogony. Podobnie jak domena dziewiąta, cytoplazmatyczny ogon szczurzego ICAM-4 wykazuje największą homologię z cytoplazmatycznym ogonem ludzkiego VCAM-1, który składa się tylko z 19 aminokwasów. 19 proksymalnych błonowych aminokwasów szczurzego ICAM-4 ma 7 wspólnych reszt aminokwasowych z VCAM-1 (37%).
W końcu, miejsce wiązania do LFA-1 (CD11a/CD18) mapuje się w pierwszej domenie polipeptydów ICAM. Vonderheide i wsp. [J. Cell. Biol., 125:215-222 (1994)] zidentyfikował motyw sekwencji wymagany w wiązaniu integryny. Pomimo relatywnie niskiej homologii pomiędzy szczurzą domeną 1 odpowiednimi domenami w innych polipeptydach ICAM, omawiane miejsce wiązania jest konserwowane co sugeruje, że szczurzy ICAM-4 może być ligandem dla LFA-1, a może także innych integryn.
Przykład 4
Hybrydyzacja in situ w tkance mózgowej
W celu zlokalizowania specyficznej tkanki mózgowej, w której zachodzi ekspresja ICAM-4, wykonano hybrydyzację in situ z sondami antysensownego RNA utworzonymi na matrycy domeny 1 CAM-4 oraz domen 3 i 4 ICAM-4. Sondy wyznakowano in vitro przy użyciu [’5S]-lJTP.
Zamrożony skrawek tkanki prawidłowego szczurzego mózgu utrwalano w 4% paraformaldehydzie przez 20 minut, płukano i odwadniano; utrwalony RNA denaturowano przez minuty w 2 X SSC, 70% formamidzie w 70°C przed przystąpieniem do hybrydyzacji. Skrawki tkanki hybrydyzowano przez noc w 50°C w roztworze zawierającym 50% formamid, 0,3 M NaCl, 20 mM Tris-HCl pH 7,4, 5 mM EDTA, 10% siarczan dekstranu, 1 X roztwór Denhardta, 0,5 mg/ml drożdżowego RNA, 100 mM DTT oraz sondę w stężeniu 50000 cpm/fil. Skrawki płukano jednokrotnie w 4 X SSC, 10 mM DTT w temperaturze pokojowej przez 60 mimut, jednokrotnie w 50% formamidzie, 1 X SSC, 10 mM dTt w 60°C przez 40 min. Po płukaniu skrawki zanurzano w emulsji NTB2 (Kodak, Rochester, NY), eksponowano przez 2 do 21 dni nim wywołano i barwiono kontrastowo. Kontrole negatywne, oprócz sondy RNA wirusa ludzkiego niedoboru odporności (HIV-1), zawierały sensowne sondy utworzone na matrycy domeny 1 ICAM-4 oraz sensowne sondy RNA dla domen 3 i 4 ICAM-4.
Wykrywany sygnał w tkance mózgowej był zlokalizowany przede wszystkim w istocie szarej z najsilniejszym sygnałem w korze mózgowej i hipokampie. Profil hybrydyzacji był zgodny z ekspresją ICAM-4 mającą miejsce głównie w komórkach nerwowych mózgu.
188 878
Przykład 5
Wytwarzanie fuzji białkowych z ICAM-4
Fuzje białkowe: szczurze ICAM-4/transferaza S-glutationu (GST) wytwarzano przy zastosowaniu prokariotycznego wektora ekspresyjnego pGEX(Pharmacia, Alameda, CA) w celu utworzenia przeciwciał monoklonalnych przeciw specyficznym fragmentom połipeptydowym ICAM-4.
Startery do PCR odpowiadające końcom 5' i 3' domeny 1 i końcom 5' i 3' domeny 2 zastosowano do powielenia fragmentów DNA kodujących poszczególne domeny. Otrzymane fragmenty były oddzielnie klonowane w miejscu EcoRI pGEX-2T; sekwencja DNA potwierdziła prawidłową orientację i ramkę odczytu. Transformanty przeszukiwano następnie pod kątem ich zdolności do wytwarzania fuzji białkowych o odpowiedniej masie cząsteczkowej.
Obie fuzje białkowe: domena 1 ICAM-4/GST i domena 2 ICAM-4/GST pozostawały we frakcji nierozpuszczalnej po lizie bakterii poprzez sonikację w buforze PBS zawierającym 1% SDS. Frakcje nierozpuszczalnych białek ze 100 ml hodowli gotowano w buforze do nanoszenia z SDS i rozdzielano na 10% preparatywnym żelu poliakryloamid-SDS. Żel barwiono w schłodzonym w lodzie 0,4 M KC1 i prążki odpowiadające fuzjom białkowym wycinano. Fuzje białkowe poddawano elektroelucji ze skrawków żelu w woreczkach dializacyjnych w buforze zawierającym 25 mM Tris-HCl i 192 mM glicynę. Przybliżone stężenie białka określano poprzez pomiar OD280, a czystość preparatu określano poprzez SDS-PAGE i barwienie błękitem Coomasie.
Przykład 6
Wytwarzanie przeciwciał monoklonalnych przeciw fuzjom białkowym szczurza ICAM4/GST
Myszy balb/c immunizowano poprzez podskórne wstrzyknięcie 40-50 pg fuzji białkowej: domena 2 ICAM-4/GST (opisanej w przykładzie 5) przeprowadzonej w postać emulsji w pełnym adiuwancie Freunda (FCA). Dwa tygodnie później, myszy były ponownie immunizowane poprzez podskórne wstrzyknięcie tego samego białka, ale przeprowadzonego w postać emulsji w niepełnym adiuwancie Freunda. Dwie końcowe immunizacje wewnątrzotrzewnowe wykonane dwa tygodnie po drugiej immunizacji obejmowały rozpuszczalny antygen bez adiuwanta podawany w odstępie dwóch tygodni. Surowica z każdej immunizowanej myszy była testowana poprzez test ELISA pod kątem zdolności do specyficznej reakcji ze szczurzym IGAM-4 wytwarzanym w opisanym tu bakulowirusowym systemie ekspresyjnym.
Z myszy # 1654 sterylnie pobierano śledzionę i umieszczano w 10 ml RPMI 1640 wolnego od surowicy. Zawiesinę komórek uzyskiwano poprzez rozgniatanie tkanki śledziony pomiędzy zamrożonymi końcami dwóch szkiełek mikroskopowych zanurzonych w RPMI 1640 wolnym od surowicy (Gibco, Burlington, Ottawa, Kanada) uzupełnionym 2 mM glutaminą, 1 mM pirogronianem sodu, 100 jednostkami/ml penicyliny i 100 pg/ml streptomycyny. Zawiesinę komórek filtrowano przez sterylny filtr do komórek Nitex z siatką 70 (Becton Dickinson, Parsippany, NJ) 1 płukano dwukrotnie RPMI, po czym zwirowywano przy 200 x g przez 5 minut. Otrzymany po ostatnim płukaniu osad ponownie zawieszano w 20 ml RPMI wolnego od surowicy. Tymocyty pobrane z trzech nagich myszy Balb/c przygotowywano w identyczny sposób.
Przed fuzją komórki szpiczaka NS-1 były utrzymywane logarytmicznej fazie wzrostu w RPMI z 11% surowicą Fetalclone (FBS) (Hyclone Laboratories, Logan, Utah) przez trzy dni. Po zebraniu komórki zwirowywano przy 200 x g przez 5 minut i osad przemywano dwukrotnie tak, jak opisano w poprzednim akapicie. Po przemyciu, zawiesinę komórek doprowadzano do końcowej objętości 10 ml w RPMI wolnym od surowicy. Pobierano 20 pl porcje i rozcieńczano 1:50 RPMI wolnym od surowicy, po czym pobierano 20 pl porcje z tego rozcieńczenia, mieszano z 20 pl barwnika błękitu trypanu 0,85% roztworze soli fizjologicznej (Gibco), nanoszono na hemacytometr (Baxter Healthcare, Deerfield, IL) i liczono komórki. Około 2,425 x 108 komórek śledziony mieszano z 4,85 x 107 komórek NS-1, mieszaninę zwirowywano, a supematant usuwano. Otrzymany osad przemieszczano poprzez stukanie w probówkę i dodawano 2 ml 50% PEG 1500 w 75 mM Hepes, pH 8,0, (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN), mieszając przez okres 1 minuty. Następnie dodawano kolejne 14 ml RPMI wolnego od surowicy w czasie 7 minut. Zawiesinę komórek zwirowywano przy 200 x g przez
188 878 minut i superzatazt odrzucano. Osad zawieszano w 200 ml RPMI zawierającego 15% FBS, 100 pM hipwksaotyzy sodu, 0,4 pM amizopts'i'yny, 16 pM tymidyny (HAT) (Gibco), 25 jedoostek/ml IL-6 (Boehdingpr Mannheim) 1,5 x 1Ó6 tymocytów/ml. Zawiesina była najpierw umieszczana w 225 cm2 kolbie (Coming, Essex, Unitet Kizgdom) w 37°C na cztery godziny przed rozpwrcjowamipm do płaskodennych płytek do hodowli tkankowej z 96 studzienkami(Commg) w ilości 200 pl/studzienkę. Komórki na płytkach były dożywiane 3, 4, 5 i 6 dnia po fuzji poprzez oddessanie około 100 pl z każdej studzienki igłą 20 G (Becton Dickinson) i dodanie 100 pl/studzienkę podłoża hodowlanego opisanego powyżej, z tą różnicą, że zawierało 10 jednostek/ml IL-6 i nie zawierało tymocytów.
Płytki z fuzjami przeszukiwano początkowo poprzez wyłapywanie antygenu w teście ELISA jak następuje. Płytki Immulon 4 (Dynatech, Cambridge, MA) były opuszczane przez noc w 4°C ze 100 og/studzipzkę fuzji białkowej bądź domena 1/GST bądź domena 2/GST w 50 mM buforze węglanowym. Płytki były blokowane 100 pl/studzienkę 0,5% żelatyną ze skóry ryb (Sigma, St. Louis, MO) w PBS przez 30 minut w 37°. Po zablokowaniu płytki przemywano 3 X PBS zawierającym 0,05% Tween 20 (PBST) i dodawano 50 pl/ścieżkę suppmatamtu znad hybrydom dla każdej fuzji. Po inkubacji w 37°C przez 30 minut, płytki przemywano jak opisano powyżej i dodawano 50 pl rozcieńczenia 1:3500 kozich anty-mysich IgG (Fc) koniugowanych z peroksydazą z chrzanu (Jackson ImmunrRpseadch, West Grove, Pennsylvania). Płytki inkubrwanw ponownie przez 30 minut i przemywano 4 x PBST. Dodawano substrat, 100 pl/studzienkę, składający się z 1 mg/ml r-fenylsnrdiamioy (Sigma) i 0,1 pl/ml 30% H2O2 w 100 mM cytrynianie pH 4,5. Reakcja barwna była prowadzona przez 10 minut i wygaszana przez dodanie 50 pl/studzienkę 15% H2SO4. Następnie oznaczano abswdbancjp przy 490 nm w automatycznym czytniku płytek (Dynatech).
Studzienki, które były pozytywne pod względem białka domena 2-GST, ale nie białka domena 1 -GST, były następnie przeszukiwane testem ELISA wobec supprnatamtu z Baculowirusa (opisane poniżej). Test ELISA był przeprowadzany jak opisano powyżej z tą różnicą, że płytki Immulon 4 były wyjściowo opuszczane przez noc supernatantpm Baculowirusa rozcieńczonym 1:4 w 50 mM buforze węglanowym. Trzy studzienki (103A, 103B i 103F) były kolejno klonowane dwa do trzech razy, poprzez dwukrotne rozcieńczenie w RPMI, 15 % FBS, 100 pM hyprksantyoa sodu, 16 pM tymidyna i 10 jednostek/ml IL-6. Studzienki płytek z klonami badano wizualnie po 4 dniach i oznaczano liczbę kolonii w studzienkach o najwyższej gęstości. Wybrane studzienki dla każdego klonowania były ponownie badane testem ELISA po 7 do 10 dniach wobec białek domena 1-GST i domena 2-GST lub suppmataotu Bakulowirusa.
Izotyp monrklrnalnych przeciwciał wytwarzanych przez hybrydomy ustalano stosując test ELISA. Płytki Immulon 4 (Dynatech) były opuszczane w 4°C 50 pl/ścieżkę kozimi antymysimi IgA, IgG lub IgM (Organon Teknika, Durham, NC) rozcieńczonymi 1:5000 w 50 mM buforze węglanowym pH 9,6. Płytki były blokowane przez 30 minut w 37°C 1% BSA w PBS, przemywane 3 X PBST. Do każdej płytki dodawano rozcieńczenie 1:10 super-natantu z hodowli hybrydom (50 p1), inkubowaoo i płukano jak wyżej. Po usunięciu ostatniego płukania dodawano 50 p1 króliczych anty-mysich IgGj, G2a, G?b, lub G3 skOT^owanych z peroksydazą z chrzanu (Zymed, San Francisco, CA) (rozcieńczonych 1:1000 w PBST z 1% normalną kozią surowicą). Płytki inkubowano jak wyżej, przemywano 4 x PBST i dodawano 100 pl substratu. Reakcja barwna była wygaszana po 5 minutach poprzez dodanie 50 pl 15% H2SO4 i oznaczano absorbancję przy 490 nm w automatycznym czytniku płytek (DyoatPch).
Wyniki wskazują, że przeciwciała 103A, 103B i 103F wszystkie mają izotyp IgGb Przeciwciała te były następnie stosowane w analizach immunocytochemicznych, analizie Western i do oczyszczania białka wyrażanego w Bakulrwiiusie.
Przykład 7
Ekspresja szczurzego ICAM-4 w Bakulowidusis
Bakulowirusowy system ekspresyjny (Invitroeen) został zastosowany do wytworzenia rozpuszczalnego białka odpowiadającego domenom od 1 do 6 ICAM-4. Ponieważ sekwencja liderowa dla ICAM-4 nip była w tym czasie znana, wykonano konstrukt ekspresyjny zawierający sekwencję kodującą dla ICAM-4, połączoną po stronie 3' z sekwencją liderową ICAM-1
188 878 w odpowiedniej ramce odczytu. Szczegóły dotyczące konstruowania plazmidu ekspresyjnego ICAM-l/ICAM-4 są następujące.
DNA dla szczurzego ICAM-1, kodujący pięć domen Ig-podobnych, był namnażany poprzez PCR przy zastosowaniu starterów, które posiadały kilka właściwości ułatwiających konstrukcję plazmidu z fuzją. Starter oligonukleotydowy 5' zawierał oprócz sekwencji największej zgodności Kozak, poprzedzającej pierwszą metioninę w sekwencji liderowej, miejsca HindIII i BgIII. Starter oligonukleotydowy 3' zawierał sekwencję kodującą dla sześciu histydyn, po których następował kodon stop i miejsce klonowania HindIII. Produkt amplifikacji PCR klonowano w wektorze pBS+ strawionym HindIII, aanaliza sekwencji potwierdziła prawidłowość konstrukcji. Wewnętrzne miejsce Smal w sekwencji liderowej ICAM-1 i inne miejsce SmaI w regionie do klonowania w wektorze (3' w stosunku do Ig-podobnej domeny 5 ICAM-1) zostało strawione, czego wynikiem było usunięcie większej części sekwencji kodującej ICAM-1. Po tych manipulacjach, przeprowadzony w formę liniową z tępymi końcami wektor zawierał część regionu z miejscami do klonowania (miejsca restrykcyjne znajdujące się po stronie 5' w stosunku do oryginalnego miejsca HindII w regionie z miejscami do klonowania), sekwencję Kozak i większość sekwencji liderowej ICAM-1.
Sekwencję kodującą dla domen od 1 do 6 szczurzego ICAM-4 powielano poprzez PCR przy zastosowaniu starterów, zaprojektowanych dla umożliwienia klonowania tej sekwencji do przeprowadzonego w formę liniową wektora opisanego powyżej. Starter oligonukleotydowy 5' zawierał miejsce EcoRV i kodony niezbędne do uzupełnienia sekwencji liderowej ICAM-1. Starter oligonukleotydowy 3' zawierał kodony dla sześciu reszt histydynowych, kodon stop, miejsca restrykcyjne HindIII i EcoRV. Produkt powielania w tej reakcji PCR trawiono EcoRV celem wytworzenia sekwencji z tępymi końcami, która była następnie włączona poprzez ligację do mającej tępe końce, liniowej formy wektora pBS+, strawionego Smal. Całkowita sekwencja zawierająca sekwencję liderowąICAM-1 położoną 5' w stosunku do domen do 1do 6 ICAM-4 została usunięta z konstruktu poprzez trawienie BgIII i HindIII i oczyszczoną sekwencję fuzji ICAM-1/ICAM-4 sklonowano bezpośrednio w wektorze pBluesac III (Invitrogen) strawionym BgIII/HindIII.
Wytwarzanie białka przez zrekombinowany wirus było testowane poprzez test ELISA, stosując wyjściowo surowice z myszy immunizowanych fuzją białkową: domena 2 szczurzej ICAM-4/GST opisana w przykładzie 5. W dalszej części pracy, przeciwciała monoklonalne wytworzone z tych myszy zostały zastosowane do oczyszczenia białka ICAM-4, wytworzonego przy użyciu zrekombinwanego Baculowirusa w komórkach SF9.
Przykład 8
Wytwarzanie przeciwciał monoklonalnych przeciw szczurzemu ICAM-4 wyrażonemu w Bakulowirusie.
Domeny 1 -6 szczurzego IC.AM-4 zostały wyrażone w bakulowirusowym systemie ekspresyjnym jak opisano w przykładzie 7. Zrekombinowane białko zostało oczyszczone przy zastosowaniu przeciwciała monoklonalnego 103 A (jak opisano w przykładzie 6).
Pokrótce, 30 mg oczyszczonego monoklonalnego 103a (w 100 mM boranie sodu, 500 mM chlorku sodu) było wiązane z trzema gramami złoża Activated Cyanogon Bromide Sepharose 4B (Pharmacia, Piscataway, NJ). Supernatant Baculowirusa zawierający zrekombinowane szczurze ICAM-4 (domeny 1-6) nanoszono na kolumnę Sepharose przez noc w 4°C. Kolumnę przemywano roztworem soli fizjologicznej buforowanej wolnym od wapnia i magnezu fosforanem (CMF-PBS) i związany materiał był wymywany 50 mM kwasem cytrynowym, 500 mM NaCl pH 4,0. Próbka była neutralizowana 1/10 objętości Tris pH 10 i przechowywana w -20°C. Oczyszczone białko rozdzielone poprzez SDS-PAGE okazało się w ponad 90% czyste i migrowało w przybliżeniu jako białko o masie 80 kD.
Myszy immunizowano oczyszczonym zrekombinowanym szczurzym białkiem ICAM-4 obejmującym domeny 1-6 w podobny sposób, jak opisano w przykładzie 6. Śledziona z myszy #1945 została zastosowana do fuzji #127. Protokół otrzymywania fuzji był taki, jak opisany w przykładnie 6. Studzienki z fuzjami były przeszukiwane poprzez test ELISA pod kątem zrekombinowanego białka ICAM-4. Drugi przesiew obejmował analizę immunocytochemiczną skrawków mózgu szczura (tak jak opisano w przykładzie 9). Cztery dodatkowe, specyficzne przeciwciała dla szczurzych ICAM-4 sklonowano w wyniku fuzji: 127A, 127E, 127F
188 878 i 127H. Wzór barwienia cytochemicznego dla każdego przeciwciała na skrawkach mózgu szczura był taki sam, jaki obserwowano z przeciwciałem monoklonalnym 103A (patrz przykład 9). Przeciwciała monoklonalne testowano na ich zdolność do wiązania fuzji białkowych Dl/GST i D2/GST (opisanych w przykładzie 5). Przeciwciało monoklonalne 127A rozpoznawało fuzję białkową D1/GST, a przeciwciało 127H rozpoznawało fuzję białkową D2/GST. Te dwie odrębne specyficzności wiązania łącznie z innymi, które nie wiążą się z żadnym z białek GST, sugerują, że co najmniej trzy różne epitopy były rozpoznawane przez zestaw przeciwciał. Hybrydomy 127A i 127H zdeponowano, odpowiednio, 31 maja 1995 i 1 czerwca 1995 w American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 i oznaczono numerami dostępu, odpowiednio, HB11905 i HB11911.
Przykład 9
Analiza immunocytochemiczna ekspresji szczurzego ICAM-4
Analizę immunocytochemiczną z przeciwciałem monoklonalnym 103A wykonywano celem zlokalizowania miejsca wytwarzania białka wewnątrz mózgu szczura.
Mózg pobierano od normalnej dorosłej samicy szczura Lewis, pocięto strzałkowe i przemywano w 1 x PBS wolnym od RNazy przez 30 min. Skrawki mózgu umieszczano następnie w formie do zamrażania Tissue Tek II (Miles Laboratories, Inc., Naperville, IN) z niewielką ilością związku O.C.T (Miles, Inc., Elkhart, IN). Mózgi przesuwano na środek formy, formę wypełniano związkiem OCT, następnie umieszczano w pojemniku zawierającym 2-metylobutan (Aldrich Chemical Company, Inc., Milwaukee WI), a pojemnik umieszczano w ciekłym azocie. Gdy tkanka i związek OCT w formie zostały zamrożone, bloki przechowywano w -80°C przed wykonaniem skrawków;
Otrzymywano skrawki tkanki o grubości 6 pm, przytwierdzano do szkiełek pokrytych Vectabond (Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA) pozostawiano do wyschnięcia na powietrzu w temperaturze pokojowej przez noc przed użyciem. Skrawki utrwalano eterem etylowym (Malinckrodt, Paris, KY) przez 5 minut w temperaturze pokojowej. Po wyjęciu szkiełek z eteru, pozostawiano je dla odparowania odczynnika. Każdy skrawek tkanki był blokowany przy zastosowaniu 150 pl 50% normalnej szczurzej surowicy (Sigma) w 1 x PBS (zrobionym jedynie z fosforanem sodu) przez 30 min w temperaturze pokojowej. Po zablokowaniu ze skrawków delikatnie usuwano bibułą roztwory i oczyszczone przeciwciała 103A z supematantu (1,65 mg/ml) były rozcieńczane 1:10 w roztworze blokującym i nanoszone w ilości 150 p1 na każdy skrawek tkanki. Skrawki były umieszczane w wilgotnej komorze i inkubowane przez noc w 4°C.
Następnego dnia roztwór przeciwciał był odsączany bibułą ze skrawków i skrawki trzykrotnie przemywano 1 x PBS, każde płukanie prowadzono przez cztery minuty. Nadmiar PBS odsysano ze skrawka i na tkankę nakładano 100 pl drugiego, szczurzego anty-mysiego przeciwciała połączonego z biotyną (Jackson ImmunoResearch Laboratories), rozcieńczonego 1:100 w roztworze 10%o normalnej szczurzej surowicy i 2% BSA w PBS. Inkubację prowadzono przez jedną godzinę w temperaturze pokojowej. Skrawki przepłukiwano dwa razy w 1 x PBS, każdorazowo po 4 minuty, a następnie na każdy skrawek nakładano 100 pl odczynnika ABC z zestawu Elite Rat IgG Vectastain ABC (Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA), przygotowanego zgodnie z instrukcją producenta. Inkubację prowadzono przez 30 min. w temperaturze pokojowej. Po inkubacji, skrawki przemywano dwukrotnie 1 x PBS (każdorazowo po cztery minuty) i każdy skrawek poddawano działaniu 150 pl roztworu Vector VIP Peroxidase Substrate Solution (Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA). Po wybarwieniu, skrawki przepłukiwano pod bieżącą wodą przez 5 minut, barwiono kontrastowo przez 20 sekund hematoksyliną Mayera (Sigma) i ponownie przepłukiwano małym strumieniem bieżącej wody przez pięć minut. Skrawki odwadniano poprzez serię kolejnych działań etanolem, przeprowadzano przez ksylen i utrwalano stosując Accumount 60 (Stephens Scientific, Riverdale, NJ).
Analiza immunohistochemiczna skrawków szczurzego mózgu barwionych mAb 103A wykazała, że szczurze ICAM-4 jest wyrażane w neuronach hipokampu. Wzór barwienia sugerował, że białko może ograniczać się do wypustek neuronów (dendrytów). Skrawki mózgu barwione w podobny sposób innymi przeciwciałami lub samym odczynnikiem z drugiego etapu barwienia nie dawały wyraźnego wzoru ekspresji obserwowanego dla MAb 103A.
188 878
Przykład 10
Klonowanie ludzkiego genomowego DNA dla ICAM-4
W czasie klonowania szczurzego ICAM-4 z genomowego DNA odkryto, że ICAM-4 i ICAM-1 były zlokalizowane w obrębie 5 kb i ta informacja została wykorzystana w próbach klonowania homologu ICAM-4.
Przy użyciu Genomie System Inc. (St. Louis, MO) powielono w reakcji PCR fragmenty w ludzkiej bibliotece PI stosując startery dla ludzkiej domeny 3 z ICAM-1, sensowny starter zaprojektowany jako komplementarny do domeny 3 ludzkiego ICAM-1 (H-1/3D S) i antysensowny starter zaprojektowany jako komplementarny do domeny 3 ludzkiego ICAM-1 (II1/3D AS). Startery te są przedstawione odpowiednio, w SEK NR ID 22 i 23.
CCGGGTCCTAGAGGTGGACACGCA (SEK NR ID: 22) TGCAGTGTCTCCTGGCTCTGGTTC (SEK NR ID: 23)
Dwa klony, oznaczone 1566 i 1567, zostały zidentyfikowane i poddane dalszej analizie. Oba klony PI zawierały wstawki genomowego DNA o wielkości około 75-95 kb. Klony trawiono BamHI, rozdzielano elektroforetycznie w żelu agarozowym i przenoszono na filtry nylonowe. Hybrydyzacja Southema filtrów była wykonywana w warunkach łagodnych (30% formamid) lub w ostrych (60% formamid) w 42°C z wyznakowanymi izotopowo sondami ludzkich ICAM-1, ICAM-3 lub szczurzej ICAM-4; inne składniki roztworu hybrydyzacyjnego były takie, jak opisano w przykładzie 1. Serie hybrydyzacji w warunkach łagodnych przemywano w 2 x SSPE zawierającym 0,1% SDS w temperaturze pokojowej. Hybrydyzacje w warunkach ostrych przemywano w 65°C w 0,2 x SSPE zawierającym 0,1% SDS. Przemyte filtry eksponowano stosując błonę rtg przez 3,5 godziny.
Różnicowa hybrydyzacja wykazała, że ludzki ICAM-1 zawierał fragment BamHI o wielkości 5,5 kb, podczas gdy ludzki ICAM-3 był zlokalizowany we fragmentach BamHI 0 wielkości 4,0 kb i 1,5 kb. Fragmenty ludzkich ICAM-1 i ICAM-R subklonowano w pBS+ i ich tożsamość potwierdzano poprzez częściową analizę sekwencyjną.
Fragment BamHI o wielkości 7,0 kb, który hybrydyzował ze szczurzym ICAM-4 w ostrych warunkach, subklonowano i dalej fragmentowano poprzez trawienie Rsal. Trzy fragmenty Rsal, które hybrydyzowały z szczurzym ICAM-4 zostały zidentyfikowane, a ich sekwencja ustalona. Opierając się na homologii do szczurzego ICAM-4, fragmenty te okazały się zawierać domeny 2, 3, 4, 5 i część domeny 6.
Przykład 11
Klonowanie ludzkiego cDNA dla ICAM-4
Fragmenty genomowego DNA, odpowiadające domenom 2-5 ludzkiego ICAM-4 (opisane w przykładzie 10) były użyte jako sondy do przeszukania biblioteki cDNA z ludzkiego hipokampu na Agtt0 (Clontech, Pało Alto, Ca). Protokół przeszukiwania biblioteki był zasadniczo taki, jak opisano w przykładzie 1.
Najdłuższy klon ludzkiego ICAM-4 (#18), który został znaleziony w tej bibliotece miał jedynie 992 bp (SEK NR ID: 24) i odpowiadał połowie genu o spodziewanej wielkości 3 kb. Wstawka DNA z klonu 18 o długości 992 bp (SEK NR ID: 24) została zastosowana jako sonda do przeszukania biblioteki cDNA z ludzkiego podwzgórza na X ZAPII (Stratagene, La Jolla, CA). Z tej biblioteki uzyskano liczne pozytywne klony. Najdłuższy klon #34, miał długość 2775 bp (SEK NR ID: 25). W oparciu o dopasowanie do pełnego szczurzego ICAM-4 przewidziano, że w klonie tym brakuje sekwencji lidera i około 30 bp z końca 5' domeny 1. Brakowało ogona poliA+ na końcu 3', ale obecny był kodon stop dla translacji.
Fragment DNA odpowiadający pierwszym trzem domenom (nukleotydy 1 do 840 w klonie #34) był użyty jako sonda do przeszukania biblioteki cDNA pochodzącego z ludzkiej kory mózgowej na IgtlO (Clontech, Pało-Alto, CA). Jeden klon, 16-1 (SEK NR ID: 26) zidentyfikowano jako zawierający 1557 bp i obejmujący 39 bp z nie ulegającym translacji DNA na końcu 5', sekwencję liderową i sekwencję z piątej domeny. Zachodzące na siebie klony #34 (SEK NR ID: 25) i 16-1 (SEK NR ID: 26) zostały użyte do wytworzenia złożonej pełnej sekwencji ICAM-4 (SEK NR ID: 27).
Kompletny gen ma długość 2927 bp i koduje białko złożone z 924 aminokwasów. Sekwencja nukleotydów ICAM-4 jest przedstawiona jako SEK NR ID: 27, a sekwencja amino188 878 kwasowa jest przedstawiona jako SEK NR ID: 28. Porównanie sekwencji z pełnym szczurzym genem dla ICAM-4 wykazało 82% identyczności sekwencji DNA i 85% identyczności na poziomie aminokwasów.
Widoczna, Ig9-podobna, struktura zewnątrzkomórkowej domeny jest zachowana między szczurem i człowiekiem. Sekwencja liderowa rozciąga się od aminokwasu 1 do 28; domena 1 od aminokwasu 29 do 117; domena 2 od aminokwasu 118 do 224; domena 3 od aminokwasu 225 do 320; domena 4 od aminokwasu 321 do 405; domena 5 od aminokwasu 406 do 488; domena 6 od 15 aminokwasu 489 do 570; domena 7 od aminokwasu 571 do 663; domena 8 od aminokwasu 664 do 743; domena 9 od aminokwasu 744 do 837; region transbłonowy od aminokwasu 838 do 857 i ogon cytoplazmatyczny od aminokwasu 858 do 924.
Ludzki ICAM-4 (HuICAM-4) oprócz tego, że jest genetycznie związany z ICAM-1
ICAM-R, wykazuje równocześnie także pewne wspólne strukturalne cechy, tak, że zgrupowano je razem jako rodzinę cząsteczek.
Dopasowanie poszczególnych domen HuICAM-4 z domenami innych członków rodziny ICAM pokazuje różny stopień homologii. Sekwencja aminokwasów z domeny 1 HuICAM-4 wykazuje 21, 30 i 26% identyczności z domeną 1 z ICAM 1, 2 i 3, odpowiednio. Domena 2 HuICAM-4 wykazuje 61, 39 i 62% identyczności z ICAM 1, 2 i 3, odpowiednio. Domena 3 HuICAM-4 wykazuje 50 i 65% identyczności z ICAM 1 i 3, odpowiednio. Domena 4 HuICAM-4 wykazuje 54 i 64% identyczności z ICAM 1 i 3, odpowiednio. Domeny 5-8 HuICAM-4 są bardziej homologiczne do domeny piątej ICAM 1 i 3, z procentem identyczności wahającym się w przedziale 33-47 dla domeny 5 ICAM-1 i 21-31 dla domeny 5 ICAM-R. Domena dziewiąta HuICAM wykazuje słabsze podobieństwo do innych członków rodziny ICAM, ale jest homologiczna do domeny 3 (24% identyczności) i 6 (23% identyczności z HuICAM-1.
Przykład 12
Analiza ekspresji ludzkiego ICAM-4 metodą Northern
Dwa ludzkie filtry do badania ludzkich tkanek metodą Northern (human multiple tissue Northern blots, MTN) otrzymano z Clontech (Pało Alto, CA). Zawierały one co najmniej pg RNA poły A+ z 16 różnych ludzkich tkanek (jak pokazano w tabeli 1) rozdzielone w denaturującym formaldehydowym 1,2% żelu agarozowym i przeniesione na filtr nylonowy. Filtry prehybrydyzowano przez trzy godziny w 42°C w 10 ml roztworu zawierającego 5 X SSPE, 10 X roztwór Denhardta, 50% formamid, 2% SDS i 100 pg/ml zdeneturowanego DNA ze spermy łososia. Filtry hybrydyzowano w powyższym roztworze z wyznakowaną radioaktywnie ludzką sondą ICAM-4 (klon #18, SEK ID: 24) przez 16 godzin w 42°C. Następnego dnia, filtry płukano w roztworze 0.1 X SSC/0,1% SDS w temperaturze pokojowej, po czym płukano w 50°C. Filtry eksponowano na kliszy rtg w -80°C przez 24 godziny. Wyniki analizy są pokazane poniżej w tabeli 1.
Tabela 1
Analiza ekspresji ludzkiego ICAM-4 w tkankach metodą Nor them
| Sonda | ||
| Tkanka | ICAM-4 | β-aktyna |
| 1 | 2 | 3 |
| Serce | - | + + + |
| Mózg | + | + + |
| Łożysko | - | + + + |
| Płuca | - | + + + |
| Wątroba | - | + + + |
| Mięśnie szkieletowe | - | + + + + |
188 878
c.d. tabeli 1
| 1 | 2 | 3 |
| Nerka | - | + + + |
| Trzustka | - | + + |
| Śledziona | - | + + + |
| Grasica | - | + + + |
| Prostata | - | + + + |
| Jądra | - | + + + |
| Jajniki | - | + + + |
| Jelito cienkie | - | + + + |
| Okrężnica | - | + + + |
| Leukocyty krwi obwodowej | - | + + + |
Jedynie ścieżka zawierająca RNA z mózgu hybrydyzuje z sondą ICAM-4, dając pojedyncze pasmo odpowiadające wielkości około 3 kb. Dłuższa ekspozycja (pięć dni) potwierdziła, że jedynie mózg miał wykrywalny poziom mRNA. W celu stwierdzenia, czy wszystkie ścieżki zawierają porównywalne ilości RNA o porównywalnej jakości, te same filtry były hybrydyzowane z kontrolną sondą (-Ektynową. Filtry pozbawiano sondy ICAM-4 poprzez traktowanie wrzącym roztworem 0,1% SDS przez 15 minut, a następnie analizowane w podobny sposób z zastosowaniem sondy β-aktynowej, dostarczonej przez producenta. Z wyjątkiem niewielkich różnic ilościowych, wszystkie ścieżki okazały się mieć RNA dobrej jakości.
Dwa dodatkowe filtry do analizy Northern, zawierające poły A+ z 16 różnych podregionów ludzkiego mózgu (jak pokazano w tabeli 2), otrzymano z firmy Clontech. Filtry analizowano przy użyciu w podobny sposób do użytego przy analizie tkanek i wyniki pokazano w tabeli 2. Jakość RNA i ilość nałożona na żel była sprawdzana poprzez hybrydyzację filtrów z sondą β -aktynową.
Wszystkie regiony, które wykazywały ekspresję ICAM-4 są częściami przodomózgowia, z wyjątkiem wzgórza wzrokowego, które jest uważane za część międzymózgowia. Hipokampus i kora mózgowa okazałt się mieć najwyższy poziom ekspresji. Wielkość transkryptu była we wszystkich przypadkach taka sama, wynosiła 3 kb. Wyraźna zależność tkankowa ekspresji ICAM-4 sugeruje, że region promotorowy może zawierać elementy odpowiedzialne za obserwowaną, zależną od rozwoju i lokalizacji, ekspresję produktu genu. Zastosowanie takich informacji może wnieść wkład w zrozumienie ogólnej kontroli ekspresji genów w neuronach.
Tabela 2
Analiza ekspresji ludzkiej ICAM-4 w różnych typach komórek mózgu metodą Northern
| Sonda | ||
| Region mózgu | ICAM-4 | β-aktyna |
| 1 | 0 | 3 |
| Jądro migdałowat | + + | + + + |
| Jądro ogoniaste | + + | + + + |
| Ciało modzelowate | + | + + + |
| Hipokamp | + + | + + + |
| Podwzgórze | - | + + + |
| Istota szara pnia mózgu | - | + + + |
188 878
c.d. tabeli 2
| 1 | 2 | 3 |
| Jądro podwzgórzowe | + | + + + |
| Wzgórze wzrokowe | + | + + + |
| Móżdżek | • - | +—1—+ |
| Kora móżdżku | + + + | + + + |
| Rdzeń przedłużony | - | + + + |
| Rdzeń kręgowy | - | + + + |
| Biegun polityczny | + + | + + + |
| Płat czołowy | + + | + + + |
| Płat skroniowy | + + | + + + |
| Skorupa | + + | + + + |
Przykład 13
Wytwarzanie fuzji białkowych ludzkiego ICAM-4/IgG
Wektory ekspresyjne zawierające fuzje białkowe ludzkiego ICAM-4/IgG zostały skonstruowane w celu otrzymywania białek dla wytworzenia przeciwciał monoklonalnych i do zastosowania w testach adhezji celem zidentyfikowania potencjalnych ligandów ICAM-4. Wykonano dwa konstrukty; pierwszy zawierał DNA kodujący domeny 1-3 HuICAM-4, a drugi domeny 4-8. Oba zostały połączone z regionem Fc ludzkiej IgG1 w wektorze pDCSl, który wykorzystuje promotor cytomegalowirusa (CMV) do kierowania ekspresją i sekwencję sygnałową z IgG4 do ułatwienia wydzielania cząsteczek.
Startery do PCR (pokazane poniżej jako SEK NR ID: 29-32) zostały zaprojektowane w celu wytworzenia niezbędnych fragmentów DNA do subklonowania. Starter „sensowny” dla końca 5' domeny 1 (HI4-Dl(s), SEK NR ID: 29) został zaprojektowany tak, aby uzupełnić 30 par zasad domeny 1, brakujących w klonie #34. Startery do PCR HI4-D1(S) (SEK NR ID: 29) i HI4-D3(AS) (SEK NR ID: 30) zostały użyte do wytworzenia fragmentu DNa kodującego domeny 1-3 ludzkiego ICAM-4, odpowiadającego regionowi w SEK ID NR 1: od nukleotydu 130 do nukleotydu 996. Startery HI4-D3(S) (SEK NR ID: 31) i HI4-D8(AS) (SEK NR ID: 32) zostały użyte do wytworzenia fragmentu DNA kodującego domeny 4-8 ludzkiej ICAM-4, odpowiadającego regionowi w SEK NR ID: 30 od nukleotydu 997 do nukleotydu 2268. Każdy starter 5' kodował miejsce restrykcyjne BamHI (GGATCC, wskazane poniżej poprzez wytłuszczenie), a każdy starter 3' (antysensowny) zawierał miejsce XhoI (CTCGAG, wskazane poniżej poprzez wytłuszczenie) celem ułatwienia subklonowania końca 5' genu IgGl. Wszystkie oligonukleotydy zawierały łącznik nukleotydowy (poniżej, podkreślony) na końcu 5' celem umożliwienia trawienia restrykcyjnego.
HI4-D1 (S) (SEK NR ID: 29)
GTACTTACAGGACCGCGGTCTCGCAGGAGCCCTTCTGGGCGGACCTACAGCCTGCGTGGCGTTC
HI4-D3 (AS) (SEK NR ID: 3(0
ATTTCTCTCGAGGATGGTCACGTTCTCCCGG
HI4-D4 (S) (SEK NR ID: 31) atttctggatcctacagcttcccggcaccactc HI4-D8 (AS) (SEK NR ID: 322
ATTTCTCTCGAGTTCCACGCCCACAGTGACGG
188 878
Reakcje PCR prowadzono w objętości 50 gl przy zastosowaniu buforów dostarczonych przez Perkin Elmer i enzymu AmpliTaq. Startery dodawano do końcowego stężenia 10 gg/ml, a wszystkie cztery dNTP były obecne jako 2 mM. Reakcje były kontynuowane przez 30 cykli denaturacji (94°C przez 4 minuty), przyłączania (50°C przez 2 minuty) i wydłużania (72°C przez jedną minutę). Produkty PCR uwidaczniano w żelach agarozowych i próbki z każdej reakcji używano do klonowania produktów PCR w wektorze pCRII (Invitrogen, SanDiego, CA). Przeprowadzono analizę sekwencji celem wykrycia możliwych błędów będących wynikiem procesu powielania i celem potwierdzenia właściwej orientacji. Odpowiednie klony trawiono BamHI i Xhol i fragmenty rozdzielano poprzez elektroforezę w żelu. Oczyszczone fragmenty poddawano ligacji z wektorem pDCS1 strawionym uprzednio BamHI i Xhol i uzyskane w rezultacie plazmidy sekwencjonowano w celu potwierdzenia właściwej orientacji i ramki odczytu.
Domeny 1-3 ludzkiego ICAM-4 i fuzje białkowe 4-8/IgG1 otrzymano po przejściowej transfekcji plazmidów ekspresyjnych do komórek COS7 i izolacji wydzielanych białek z podłoża hodowlanego. Transfekcja była przeprowadzana jak następuje. Przylegające komórki COS7 przy stopniu zrośnięcia się 50-60% przemywano CMF-PBS, a następnie dodawano 10-15 gg plazmidowego dNa w 7,5 ml podłoża DMEM wolnego od surowicy (Gibco, Gaithersburg, MD) zawierającego 6 gl 0,25 M chlorochinonu (Sigma, St. Louis, MO). Dodawano następne 7,5 ml podłoża wolnego od surowicy zawierającego 150 gl dekstranu DEAE (50 mg/ml) (Sigma, St. Louis, MO) i płytki inkubowano 2-3 godziny przed usunięciem podłoża i zamianą na 10% DMSO (Mallinckrodt, McGaw Park, Illinois) w PBS. Po jednej minucie inkubacji, roztwór DMSO usuwano i wymieniano na świeże podłoże zawierające 5% PBS. Każda transfekcja obejmowała wiele płytek i podłoże z komórek wyrażających to samo białko łączono w celu izolowania białka.
Podłoża zbierano 3-4-krotnie co trzy dni. Białka oczyszczano przy zastosowaniu kolumny Procep A o objętości 0,4-0,8 ml (Bioprocessing Ltd, England) zrównoważonej uprzednio 35 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7,5. Podłoże hodowlane nakładano na kolumnę dwukrotnie, przy przepływie mniejszym niż 60 objętości kolumny na godzinę. Kolumnę przemywano jednokrotnie 20 objętościami kolumny buforu Tris/NaCl, 20 objętościami kolumny 0,55 M dietanolaminy, pH 8,5 i 20 objętościami kolumny 30 mM kwasu cytrynowego, pH 5,0. Fuzje białkowe wymywano w jednomililitrowych frakcjach przy zastosowaniu 50 mM kwasu cytrynowego pH 3,0 i każdą frakcję neutralizowano 1/10 objętości 1 M Trisu, pH 9,5. Stężenie białka oznaczano poprzez OD280, a czystość oznaczano stosując SDS-PAGE.
Zaobserwowano znaczne zanieczyszczenie wołowym IgG (obecnym w FBS). Pomimo iż spodziewano się, że fuzja białkowa domen 1-3 będzie mniejsza niż fuzja białkowa domen 4-8, obie migrowały w przybliżeniu zgodnie z masą 90 kD. Jednym z możliwych wyjaśnień takiej obserwacji, jest ta, iż mniejsze białko z domenami 1-3 jest bardziej glikozylowane niż większe białko z domenami 4-8.
Poza użyciem oczyszczonych białek do wytwarzania monoklonalnych przeciwciał, co opisano poniżej, białka będą również stosowane w testach adhezji celem identyfikowania ligandów ICAM-4.
Przykład 14
Wytwarzanie przeciwciał monoklonalnych
Oczyszczone białko opisane w przykładzie 13 zastosowano do wytworzenia przeciwciał monoklonalnych przy zastosowaniu protokołu immunizacji takiego, jak opisano w przykładzie 6.
Śledziona z myszy # 2250 ( immunizowanej HuICAM-4 Dl-3/IgGl) została użyta do fuzji 172, a śledziona z myszy # 2212 (immunizowanej HuICAM-4 D4-8/IgGl) została użyta do fuzji 173. Protokół fuzji był taki, jak opisano w przykładzie 6. Płytki z frizjami były przeszukiwane testem ELISA ( zasadniczo jak opisano w przykładzie 6) przy zastosowaniu fuzji białkowej HuICAM-4/IgGl. Supematanty ze studzienek z fuzjami, które rozpoznawały białko immunogenne, ale nie inne, były wybrane do klonowania. Analizę immunocytochemiczną skrawków ludzkiego hipokampu zastosowano jako dodatkowy sposób przeszukiwania.
Jeden pierwotny klon z każdej fuzji był pozytywny w teście immunocytochemicznym i był klonowany. Jeden z dwóch klonów nie wykazywał wzrostu w czasie klonowania, pozo188 878 stawiając tylko jednego kandydata do dalszych badań, klon 173E, który pochodził z myszy immunizowanej HuICAM-4 D4-8/IgGl. Hybrydoma 173E została zdeponowana 1 czerwca 1995 w American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 i została oznaczona numerem dostępu HB11912.
Dla innej fuzji, pochodzącej z myszy immunizowanej rozpuszczalnym fragmentem ICAM-4 odpowiadającym domenom 1-3, sześć klonów (179A, 179B, 179D, 179H, 1791, i 179KL) okazało się być specyficznymi dla domen od 1 do 3 HuICAM4 (D1-3)’ Wszystkie sześć przeciwciał z serii 179 wiąże się z wypustkami dendrytowymi w zakręcie zębatym, jak również warstwą komórek wielokształtnych i warstwą piramidową kory mózgowej. Przeciwciało monoklonalne 179A wybarwiało oprócz wypustek dendrytowych również ciało komórek nerwowych z tych obszarów.
Podobnie postępowano z dalszymi fuzjami w celu wytworzenia innych przeciwciał o aktywności immunologicznej specyficznej wobec poszczególnych regionów ICAM-4.
Przykład 15
Opracowanie testu wyłapującego
Sześć przeciwciał monoklonalnych z fuzji 179 testowano w różnych kombinacjach pod kątem ich zdolności do wyłapywania i wykrywania rozpuszczalnego ICAM-4 w roztworze. Test, jak opisano poniżej, został opracowany w celu oszacowania poziomów rozpuszczalnego ICAM-4 w płynach ludzkich w odniesieniu do warunków normalnych i chorobowych.
Przeciwciało 1791 było opłaszczane na płytkach Immulon 4 (Dynatech) z 96 studzienkami w stężeniu 3 pg/ml, 125 pl/studzienkę przez dwie godziny w 37°C. Roztwór przeciwciała był usuwany poprzez odsysanie i studzienki blokowano przez 30 minut w temperaturze pokojowej 300 pl roztworu blokującego zawierającego 5% rybią żelatynę w PBS wolnym od wapnia i magnezu (CMF-PBS). Roztwór blokujący usuwano poprzez odessanie, do każdej studzienki dodawano 100 pl próbki płynu, rozcieńczonego w Omni Diluent (CMF-PBS, 1% żelatyny i 0,05% Tween 20) i mieszaninę inkubowano 37°C przez 30 minut. Płytki płukano trzykrotnie PbSt (CMF-PBS, 0,05% Tween 20). Przeciwciało 179H biotynylowano w stężeniu 1,5 mg/ml przy zastosowaniu NHS-LC-Biottn (Pirce), postępując zgodnie z protokołem sugerowanym przez producenta, rozcieńczano 1:2000 i dodawano do studzienek (100 pl/studzienkę). Otrzymaną mieszaninę inkubowano przez 30 minut 37°C i płytki płukano trzykrotnie PBST. Do każdej studzienki dodawano streptawidyny-HRP(Pierce) (100 pl, 0,25 ng/ml) i taką mieszaninę inkubowano w 37°C przez 30 minut. Płytki przepłukiwano czterokrotnie PBST przed dodaniem 100 pl tetrametylobenzydyny (Sigma) (roztwór wyjściowy 10 mg/ml w DMSO) rozcieńczonego 1:100 w zbuforowanym substracie (13,6 g/l trój-wodnego octanu sodu, pH 5,5 z 1 N kwasem cytrynowym, z 150 pl/l 30% nadtlenku wodoru dodanego tuż przed wywołaniem).
Reakcję przeprowadzano przez 30 minut w temperaturze pokojowej w ciemności, po czym reakcję zatrzymywano poprzez dodanie 50 pl/studzienkę 15% H2SO4. Absorbancję odczytywano przy 450 nm.
Wyniki pokazały, że test miał zdolność wykrywania rozpuszczalnego zrekombinowanego białka, HuICAM-4 D1-3 w stężeniu tak niskim jak 5-10 ng/ml, przy czym liniowa część krzywej była w zakresie 10-100 ng/ml. Nie obserwowano reakcji krzyżowej z HuICAM4 D4-8, gdy ten region białka testowano w stężeniu 1 i 10 pg/ml.
Przykład 16
Pomiar rozpuszczalnego ICAM-4 surowicy pacjentów po udarze
W celu określenia roli ICAM-4 w chorobach i przypadkach neurologicznych, surowicę pochodzącą od dwudziestu ośmiu pacjentów cierpiących na ostry udar i dwudziestu młodych zdrowych ochotników (nie dobieranych pod względem wieku) testowano jak opisano powyżej pod kątem różnic w stężeniu rozpuszczalnego ICAM-4 w surowicy.
Wyniki pokazały, że w surowicy ze zdrowych ochotników nie ma wykrywalnego poziomu iCaM-4. Natomiast dwudziestu spośród dwudziestu ośmiu pacjentów z ostrym udarem ma wykrywalny poziom rozpuszczalnego ICAM-4. Sygnał z pozytywnych pacjentów z udarem odpowiada zakresowi 5-38 ng/ml standardu (rozpuszczalnego zrekombinowanego białka ICAM-4 D1-3).
188 878
Przykład 17
Poziom mRNA dla ICAM-4 w hipokampie w szczurzym modelu epilepsji
Poziomy wyrażanego mRNA dla szczurzego ICAM-4 mierzono w hipokampuch szczurów traktowanych w taki sposób, aby utworzyć zwierzęcy model powstawania wzbudzanej epilepsji (Lothman, et al., Brain Res. 360:83-91, (1985)). W tym modelu hipokamp szczura jest stymulowany seriami poddrgawkowych elektrowstrząsów za pośrednictwem elektrody, wszczepionej w region mózgu, które stopniowo prowadzą do poważnych behawioralnych ataków. Proces pobudzania obejmuje dwanaście stymulacji na dzień, wykonywanych co drugi dzień przez osiem dni. Po kompletnym pobudzeniu pojedynczy bodziec może doprowadzić do ataku ruchowego i zmian histologicznych, które są podobne do epilepsji u człowieka. W pełni pobudzane szczury otrzymywały dwie stymulacje na dzień w okresie dwóch tygodni i zwierzęta były uśmiercane 24 godziny po ostatniej stymulacji. Pobierano hipokamp i preparowano celem otrzymania RNA.
Całkowity RNA otrzymywano z każdej próbki stosując procedurę ekstrakcji guaunidyna/fenol/chloroform (Chomczynski and Sacchi, Anal. Biochem. 162:156-159 (1987). RNA rozdzielano na denaturujących formaldehydowych żelach agarozowych, przenoszono na filtry nylonowe i hybrydyzowano z wyznakowanymi radioaktywnie sondami DNA specyficznymi dla szczurzego ICAM-4 i dehydrogenazy 3-gliceroaldehydo-3 fosforanu (GAPDH). GAPDH genem wyrażanym na poziomie podstawowym i jest zwykle używany jako kontrola do wykrywania róż nic między ścieżkami w ilości RNA nałożonego na żel. Wahania w stosunku ICAM-4/ GAPDH są interpretowane jako zmiany poziomu ekspresji ICAM-4. Prążki hybrydyzujące dla ICAM-4 i GAPDH oznaczno ilościowo przy użyciu urządzenia Phosphoimager i określano stosunek ICAM-4/GAPDH.
Stosunek ICAM-4/GAPDH był wyraźnie wyższy u zwierząt kontrolnych, które nie były pobudzane (n=5) w porównianiu z grupą pobudzaną (n=5), co sugerowało, że ekspresja ICAM-4 była obniżona w konsekwencji procesu pobudzania. Jednakże należy zauważyć, że grupa kontrolna nie podlegała pozornym zabiegom, a zatem istnieje możliwość, że poziom mRNA ICAM-4 był modulowany w odpowiedzi na zabiegi chirurgiczne związane z pobudzaniem.
Przykład 18
Klonowanie i analiza regionu DNA regionu regulacyjnego po stronie 5' ludzkiego ICAM-4
Ekspresja genu ICAM-4 jest regulowana przestrzennie i czasowo, przy czym ekspresja jest ograniczona do najbardziej przedniego lub spodniego regionu mózgu, kresomózgowia. W celu zidentyfikowania sekwencji genu odpowiedzialnego za ograniczoną transkrypcyjną regulację ICaM-4, badano region nukleotydowy położony 5' w stosunku do sekwencji kodującej ludzkiego ICAM-4.
Fragment BamHI/Pstl o długości 2607 par zasad pochodzący z genomowego fragmentu BamHI o wielkości 7 kb (opisanego w przykładzie 10) został zsekwencjonowany i ustalono, że zawiera 1684 nukleotydów przed kodonem start ATG. Kompletna sekwencja tego regionu jest przedstawiona w SEK NR ID: 33. W stosunku do pozycji regionu kodującego I-CAM-4, „A” w kodonie startowym ATG (występującym w SEK Nr ID: 33 jako nukleotydy 16851687) jest oznaczony jako nukleotyd +1, a nukleotyd leżący bezpośrednio po stronie 5' w stosunku do nukleotydu A+1 jest oznaczony jako -1. A zatem cała sekwencja jest pokazana jako rozciągająca się od nukleotydu - 1684 do nukleotydu +3, co odpowiada numeracji od nukleotydu 1 do nukleotydu 1687 na liście sekwencji.
W oparciu o sekwencję genomowego HuICAM-4 zsyntetyzowano nukleotydy i zastosowano je w reakcji PCR w celu wytworzenia cząsteczek DNA o różnej długości w obrębie regionu regulacyjnego z końca 5'. Każdy oligonukleotyd, przedstawiony w tabeli 3 zawierał region rozdzielający (zaznaczony kursywą) o długości około 6 do 10 bp dla umożliwienia enzymatycznego trawienia produktu PCR, miejsca restrykcyjne Nhel lub Hindlll (zaznaczone tłustym drukiem) i specyficzną sekwencję startera do hybrydyzacji (podkreśloną). Nazwa oligonukleotydu zawierała numery, które oznaczały jego położenie w obrębie regionu regulacyjnego. W reakcji powielania PCR oligonukleotydu dobierano w pary jako pokazano w tabeli 4
188 878 w celu wytworzenia fragmentów DNA zawierających specyficzne regiony obszaru regulacyjnego na końcu 5'.
Tabela 3
Startery do PGR stosowane do powielenia regionu z końca 5' HuICAM-4
| HI4-19(AS) | C4G/MCTAAGCTTACAGGAGGCGAGGAGAGCGCGAG (SEK NR ID: 34) |
| HI4-114 | CAACAA 7GCTACCCAACCCCAACTCTGTCTC (SEK NR ID: 35) |
| HI4-149 | CΛyC/lΛ7ΌCTAGCCrΓGGAAACCAACTTACC (SEK NR ID: 36) |
| HI4-206 | CAACAA 7CCTACCACCACCTTACCCCACCCTCC (SEK NR ID: 37) |
| HI4-270 | CAACAA 7CCTACCCATCCCCCCCTCCACCTAC (SEK NR ID: 38) |
| HI4-408 | CAACAATCCTACCCTCCACCTTATTATCATC (SEK NR ID: 39) |
| HI4-480 | CAACAA 7CCTACCCTTACTCCCCAAATCTATC (SEK NR ID: 40) |
| HI4-560 | CAACAA 7CCTACCCCACAACCATCACT GAG (SEK NR ID: 41) |
| H14-817 | CAACAA7GCTACCCTCACCCACCCAGCACAAC (SEK NR ID: 42) |
Miejsca restrykcyjne i region rozdzielający wytworzony w obrębie każdego oligonukleotydu umożliwił trawienie enzymatyczne i następujące po tym ukierunkowane klonowanie poszczególnych produktów PCR w wektorze pGL3 Basic Vector (Promega, Madison, WI), który zawiera gen reporterowy dla lucyferazy bezpośrednio za miejscami do klonowania (MSC). Aktywność promotora sklonowanego w regionie MSC wektora kierowała ekspresją reporterowego genu dla lucyferazy w transfekowanych liniach komórkowych, a wytwarzanie światła przez wyrażoną lucyferazę można mierzyć jako wskaźnik aktywności promotora. pGL3 Basic Vector nie ma aktywności promotora i dlatego służy jako kontrola negatywna, podczas gdy wektor pGL3 zawierający promotor SV40 służy jako kontrola pozytywna. Sekwencja każdego konstruktu ekspresyjnego była sprawdzana poprzez analizę restrykcyjną i sekwencjonowanie DNA.
Plazmidy zawierające każdą z powielonych sekwencji opisanych w tabeli 4 były transfekowane do komórek ssaczych przy zastosowaniu zestawu Transfection MBS Mammalian Transfection Kit (Stratagene, La Jolla, CA), zgodnie z protokołem sugerowanym przez producenta. Każdy plazmid był wprowadzany do dwóch różnych linii komórkowych, COS 7 i NT2 Precursor Cells (Ntera2/Dl ze Stratagene). Komórki COS7 są powszechnie stosowaną małpią fibroblasto-podobną linią komórkową transformowaną SV40, co czyni je dobrze nadającymi się do kierowania ekspresją genu pod kontrolą promotora SV40 w komórkach transfekowanych pozytywną kontrolą - wektorem pGL3 Promoter Yector. Komórki prekursorowe NT2 łączy się z neuronową linią komórkową i ponieważ nie wyrażają I-CAM-4, mogą być reprezentatywne dla typu komórek, które nie wyrażają ICAM-4.
188 878
Tabela 4
Pary starterów i powielane regiony
| Pary oligonukleotydów regulatorowy po stronie 5' | Odpowiedni region | |||
| HI4-19(AS) | z HI4-114 | -19 | -> | -114 |
| HI4-19(AS) | z HI4-149 | -19 | —> | -149 |
| HI4-19(AS) | z HI4-206 | -19 | -206 | |
| HI4-19(AS) | z HI4-270 | -19 | -270 | |
| HI4-19(AS) | z HI4-408 | -19 | -408 | |
| HI4-19(AS) | z HI4-480 | -19 | -480 | |
| HI4-19(AS) | z HI4-560 | -19 | -560 | |
| HI1-19(AS) | z HI4-817 | -19 | -817 |
Do każdej z 6 studzienek płaskodennej płytki do hodowli tkankowej (Falcon)nanoszono 2,5 x 105 komórek. Transfekcję COS7 i komórek NT2 wykonywano równolegle w dwóch powtórzeniach przy zastosowaniu 5 pg plazmidowego DNA na każdą studzienkę. Komórki hodowano w 37°C przez 48 godzin, lizowano i testowano pod kątem aktywności lucyferazy stosując Luciferase Assay System (Promega).
Wyniki doświadczenia, zebrane w tabeli 5, wskazują na wysoki poziom aktywności promotora leżącego między nukleotydami -408 i -19 oraz -480 i -19 regionu regulatorowego po stronie 5' ICAM w komórkach NT2. Ponieważ komórki NT2 są pochodzenia neuronowego, mogą one wyrażać pewne czynniki transkrypcyjne, rozpoznające promotor ICAM-4, które nie są znajdywane w innych typach komórek. Najwyższy poziom aktywności promotora w transfektantach komórek COS otrzymano dla plazmidów zawierających nukleotydy od -560 do -19. Podczas gdy kontrola pozytywna -wektor promotorowy pGL3 działała dobrze w komórkach COS, wykazywała bardzo słabą aktywność promotorową w komórkach NT2, pokazując w ten sposób preferencję pewnych sekwencji promotorowych w stosunku do specyficznych typów komórek.
T a b e l a 5
Aktywność promotora z regionu 5' ICAM-4
| Region powyżej | Luminescencja | |
| COS | NT2 | |
| -114 do-19 | 0,003 | 0,376 |
| -149 do-19 | 0,008 | 0,628 |
| -206 do-19 | 0,443 | 0,622 |
| -270 do-19 | 0,056 | 1,140 |
| -408 do-19 | 0,401 | 7,970 |
| -480 do-19 | 0,274 | 4,630 |
| -560 do-19 | 3,227 | 1,232 |
| -817 do-19 | 0,035 | 4,453 |
| Wektor promotorowy pGL3 | 29,070 | 0,063 |
| Wektor podstawowy pGL3 | 0,008 | 0,014 |
188 878
Ponieważ ani COS7 ani NT2 normalnie nie wyrażały ICAM-4, to samo doświadczenie będzie powtórzone przy zastosowaniu pierwotnych hodowanych neuronów z hipukampu szczura, w którym następuje ekspresja ICAM-4 i koniecznie posiada maszynerię transkrypcyjną wymaganą do aktywności promotora ICAM-4. Poprzez transfekowazie poszczególnych konstruktów pdomotodowych, opisanych tutaj, jak również innych, być może będzie możliwe bardziej dokładne zidentyfikowanie nukleotydów w regionie regulatorowym po stronie 5', które są odpowiedzieć za ścisłą regulację genu ICAM-4 w mózgu.
Przedstawione powyżej przykłady będące ilustracją wynalazku dotyczą wykonań wynalazku korzystnych w chwili obecnej i biegli w tej dziedzinie mogą się spodziewać powstania licznych ich modyfikacji i odmian. A zatem jedynie takie ograniczenia, które zawarte są w dołączonych zastrzeżeniach, będą określać zakres niniejszego wynalazku.
188 878
Lista sekwencji (1) Informacje ogólne:
(i)Zgłaszający: ICOS Corporation (ii) Tytuł wynalazku: Materiały i metody dla ICAM-4 (iii) Liczbc sakwencji: 42 (iv) Adres do korespondencji:
(A) Adres: ICOS Corporation (B) Ulica: 22021 20th Avenue, S.E.
(C) Miasto: Bothell (D) Stan: Washington (E) Kraj: Stany Zjednoczone Ameryki (F) Kod: 98021 (v) Wymagania kompterowe:
CA) Typ nośnika: dyskietka (B) Komputer: zgodny z IBM PC (C) System operacyjny: PC-DOS/MS-DOS (D) Oprogramowanie: Patentln Release #1.0,Wersja#1.25 (vi) Dane bieżącego zgłoszenia:
(A) Numer zgłoszenia:
(B) Data złożenia:
(C) Klasyfikacja:
(vii) Dane poprzedniego zgłoszenia:
(A) Numer zgłoszenia: USA 07/827,689 (B) Data zgłoszenia: 27.01.1992 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
(A) Numer zgłoszenia: USA 07/889,724 (B) Data złożenia: 26.05.1992 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 07/894,061 (B) data złożenia: 05.06.1992 (rii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/009,266 (B) data złożenia: 22.01.1993 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/102,852 (B) Data złożenia: 05.08.1993 (rii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/245,295 (B) Data złożenia: 18.05.1994 (vii) dane poprzedniego zgłoszenia:
CA) numer zgłoszenia: USA 08/485,604 (B) Data złożenia: 07.06.1995 (viii) Dane pełnomocnika/agenta:
CA) Nazwa: Patent Attorneys Company Patpol Ltd.
(B) Adres: Ulica Nowoursynowska 162J (C) Warszawa, Polska 00950 (ix) Dane telekomunikacyjne:
(A) Telefaks: (48) 39121815
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:1:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 2988 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (ix)Charakterystyka:
{A)Nazwa/Klucz: CDS (B)Położenie: 61..2814 (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:1:
AGTGCCAGCA CGCCCCCGCC CCTCGCCTTC TGCGCTCTCC CCTCCCTGGC AGCGGCGGCA 60
ATG CCG GdGCCC GCA CCA
| Met 1 | Pro | Gly | Pro | Ger 5 | Pro |
| GCT | GCC | CTG | CGC | CTG | GGA |
| Ala | Ala | Leu | cnl' 20 | Llu | Gly |
| CCT | TTC | TGG | (3(^^ | GAC | CGG |
| Pro | Phe | Trp) 35 | pin | Asp | Leu |
| GGC | TCG | CTG | GGG | CTC | AAC |
| Gly | Ser 50 | Leu | Τη? | Luu | Asn |
| GGT | GGC | CTG | GAG | ACC | TCG |
| Gly 65 | Gly | Leu | Glu | Thr | Ser 70 |
| CGC | TGG | CTG | GCT1 | CGA | CAG |
| Arg | Trp | Leu | Ala | Glrg 85 | Gln |
| CCG | GTC | TGC | TTC | TTC | AGC |
| Pro | Val | Cys: | PPh 100 | Phh | Arg |
| CTC | ATC | CGA | ACT | TTC | CAG |
| Leu | Ile | Arg 115 | Thr | Phe | Aln |
| CCT | CCT | TGG | CAG | CCT | GTA |
| Pro | Pro 130 | Trp | GG.n | Pro | Val |
| CCG | GGG | GCA | Gd | GCC | CAA |
| Pro 145 | Gly | Ala | Gly | Pro | Aig 155 |
| G(AG | CAG | Gd | CGA | ACG | CTC |
| Gly | Luu | Gig | Arg 11 | Tlhr | Leu |
| ATC | CAG | Gd | GTC | TCA | GCG |
| I le | Llu | gg. 25 | He | Ser | Ala |
| (AGG | CCC | GAC | GTG | GCG | CTC |
| Gin | Ppo 40 | Gig | Gal | Ala | Leu |
| TGC | Ad | GGC | GGtC | TGT | CCG |
| Cys 55 | Ssu | GGh | Asn | Cys | Pro 66 |
| CTA | Cd | GAA | GAC | GGG | ACC |
| Leu | Alg | Ggo | Asn | Gly 75 | Thr |
| CTG | GGG | GAG | ATC | CGA | GAG |
| Leu | Vvl | Gip | He 90 | Arg | Glu |
| TGC | GCA | Gd | CGC | AGA | CTC |
| Cys | Ala | Gig 105 | Arg | Thr | Leu |
| CGA | CCC | GAT | CGG | GTA | GAG |
| Arg | Pw 120 | Ai^s> | Glrg | Val | Glu |
| GGT | GAG | GAG | TTC | ACC | TTG |
| Gly 135 | Glu | Ain | Phe | Thr | Leu 140 |
| GAG | AGC | CTC | ACA | TGG | ACC |
| Ala | Ser | Leu | Thr | Llu | Thr |
115
| CAT Llu | Gd Glu· | GAT Glu H | Gd Grg | 108 |
| GGT | gcc | GAT | GAA | 150 |
| Vvl | Gla 33 | Glu | Glu | |
| GCG | GAG | Gd | Gd | 204 |
| Vvl | Glu | AgO | Gly | |
| 45 | ||||
| AGA | GCA | GAG | Gd | 252 |
| Arg | Gpo | Gla | Aig | |
| C^G | AGG | GGT | CAG | 300 |
| Gln | Arg | Gly | Llu 80 | |
| CCA | GGA | ACC | CAG | 348 |
| P^o | Glu | Thr 99 | Gln | |
| CCAg | GCG | CGT | GG(G | 390 |
| Glu | Ala 110 | Arg | Gln: | |
| CTA | GTG | CCT | CTG | 444 |
| Llu | Vvl | Pro | Llu | |
| 125 | ||||
| AGC | TGC | AGG | GTC | 492 |
| SSr | Cas | Arg | Val | |
| GTG | CTG | CGA | GGC | 540 |
| Leu | Leu | Arg | Gly 110 |
188 878
| GGC Gly | CAG Gln | GAG Glu | CTG ATT | CGC Arg | CGA Arg | AGT Ser | TTC Phe | GTA Val 170 | GGC GAG Gly Glu | CCA Pro | CCC Pro | CGA Arg 175 | GCT Ala | 588 | ||
| Leu | Ile 165 | |||||||||||||||
| CGG | GGT | GCG | ATG | CTC | ACC | GCC | ACG | GTC | CTG | GCG | CGC | AGA | GAG | GAT | CAC | 636 |
| Arg | Gly | Ala | Met | Leu | Thr | Ala | Thr | Val | Leu | Ala | Arg | Arg | Glu | Asp | His | |
| 180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
| AGG | GCC | AAT | TTC | TCA | TGC | CTC | GCG | GAG | CTT | GAC | CTG | CGG | CCA | CAC | GGC | 684 |
| Arg | Ala | Asn | Phe | Ser | Cys | Leu | Ala | Glu | Leu | Asp | Leu | Arg | Pro | His | Gly | |
| 195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
| TTG | GGA | CTG | TTT | GCA | AAC | AGC | TCA | GCC | CCC | AGA | CAG | CTC | CGC | ACG | TTT | 732 |
| Leu | Gly | Leu | Phe | Ala | Asn | Ser | Ser | Ala | Pro | Arg | Gln | Leu | Arg | Thr | Phe | |
| 210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
| GCC | ATG | CCT | CCA | CTT | TCC | CCG | AGC | CTT | ATT | GCC | CCA | CGA | TTC | TTA | GAA | 780 |
| Ala | Met | Pro | Pro | Leu | Ser | Pro | Ser | Leu | Ile | Ala | Pro | Arg | Phe | Leu | Glu | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
| GTG | GGC | TCA | GAA | AGG | CCG | GTG | ACT | TGC | ACT | TTG | GAT | GGA | CTG | TTT | CCT | 828 |
| Val | Gly | Ser | Glu | Arg | Pro | Val | Thr | Cys | Thr | Leu | Asp | Gly | Leu | Phe | Pro | |
| 245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
| GCC | CCA | GAA | GCC | GGG | GTT | TAC | CTC | TCT | CTG | GGA | GAT | CAG | AGG | CTT | CAT | 876 |
| Ala | Pro | Glu | Ala | Gly | Val | Tyr | Leu | Ser | Leu | Gly | Asp | Gin | Arg | Leu | His | |
| 260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
| CCT | AAT | GTG | ACC | CTC | GAC | GGG | GAG | AGC | CTT | GTG | GCC | ACT | GCC | ACA | GCT | 924 |
| Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Asp | Gly | Glu | Ser | Leu | Val | Ala | Thr | Ala | Thr | Ala | |
| 275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
| ACA | GCA | AGT | GAA | GAA | CAG | GAA | GGC | ACC | AAA | CAG | CTG | ATG | TGC | ATC | GTG | 972 |
| Thr | Ala | Ser | Glu | Glu | Gln | Glu | Gly | Thr | Lys | Gln | Leu | Met | Cys | Ile | Val | |
| 290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
| ACC | CTC | GGG | GGC | GAA | AGC | AGG | GAG | ACC | CAG | GAA | AAC | CTG | ACT | GTC | TAC | 1020 |
| Thr | Leu | Gly | Gly | Glu | Ser | Arg | Glu | Thr | Gln | Glu | Asn | Leu | Thr | Val | Tyr | |
| 305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
| AGC | TTC | CCG | GCT | CCT | CTT | CTG | ACT | TTA | AGT | GAG | CCA | GAA | GCC | CCC | GAG | 1068 |
| Ser | Phe | Pro | Ala | Pro | Leu | Leu | Thr | Leu | Ser | Glu | Pro | Glu | Ala | Pro | Glu | |
| 325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
| GGA | AAG | ATG | GTG | ACC | GTA | AGC | TGC | TGG | GCA | GGG | GCC | CGA | GCC | CTT | GTC | 1116 |
| Gly | Lys | Met | Val | Thr | Val | Ser | Cys | Trp | Ala | Gly | Ala | Arg | Ala | Leu | Val | |
| 340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
| ACC | TTG | GAG | GGA | ATT | CCA | GCT | GCG | GTC | CCT | GGG | CAG | CCC | GCT | GAG | CTC | 1164 |
| Thr | Leu | Glu | Gly | Ile | Pro | Ala | Ala | Val | Pro | Gly | Gln | Pro | Ala | Glu | Leu | |
| 355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
| CAG | TTA | AAT | GTC | ACA | AAG | AAT | GAC | GAC | AAG | CGG | GGC | TTC | TTC | TGC | GAC | 1212 |
| Gln | Leu | Asn | Val | Thr | Lys | Asn | Asp | Asp | Lys | Arg | Gly | Phe | Phe | Cys | Asp | |
| 370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
| GCT | GCC | CTC | GAT | GTG | GAC | GGG | GAA | ACT | CTG | AGA | AAG | AAC | CAG | AGC | TCT | 1260 |
| Ala | Ala | Leu | Asp | Val | Asp | Gly | Glu | Thr | Leu | Arg | Lys | Asn | Gln | Ser | Ser | |
| 385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
| GAG | CTT | CGT | GTT | CTG | TAC | GCA | CCT | CGG | CTG | GAT | GAC | TTG | GAC | TGT | CCC | 1308 |
| Glu | Leu | Arg | Val | Leu | Tyr | Ala | Pro | Arg | Leu | Asp | Asp | Leu | Asp | Cys | Pro | |
| 405 | 410 | 415 |
188 878
AGG AGC TGG ACG TGG CCA GAG GGT CCA GAG CAG ACC CTC CAC TGC GAG 13 56
Arg Ser Trp Thr Trp Pro Glu Gly Pro Glu Gln Thr Leu His Cys Glu
420 425 430
GCC CGT GGA AAC CCT GAG CCC TCC GTG CAC TGT GCA AGG CCT GAC GGT 14 04
Ala Arg Gly Asn Pro Glu Pro Ser Val His Cys Ala Arg Pro Asp Gly
435 440 445
GGG GCG GTG CTA GCG CTG GGC CTG TTG GGT CCA GTG ACC CGT GCC CTC 14 52
Gly Ala Val Leu Ala Leu Gly Leu Leu Gly Pro Val Thr Arg Ala Leu
450 455 460
GCG GGC ACT TAC CGA TGT ACA GCA ATC AAT GGG CAA GGC CAG GCG GTC 1500
Ala Gly Thr Tyr Arg Cys Thr Ala Ile Asn Gly Gln Gly Gln Ala Val
465 470 475 480
AAG GAT GTG ACC CTG ACT GTG GAA TAT GCC CCA GCG CTG GAC AGT GTA 1548
Lys Asp Val Thr Leu Thr Val Glu Tyr Ala Pro Ala Leu Asp Ser Val
485 490 495
GGC TGC CCA GAA CGT ATT ACT TGG CTG GAG GGG ACA GAG GCA TCG CTT 1596
Gly Cys Pro Glu Arg lle Thr Trp Leu Glu Gly Thr Glu Ala Ser Leu
500 505 510
AGC TGT GTG GCA CAC GGG GTC CCA CCA CCT AGC GTG AGC TGT GTG CGC 1644
Ser Cys Val Ala His Gly Val Pro Pro Pro Ser Val Ser Cys Val Arg
515 520 525
TCT GGA AAG GAG GAA GTC ATG GAA GGG CCC CTG CGT GTG GCC CGG GAG 1692
Ser Gly Lys Glu Glu Val Met Glu Gly Pro Leu Arg Val Ala Arg Glu
530 535 540
CAC GCT GGC ACT TAC CGA TGC GAA GCC ATC AAC GCC AGG GGA TCA GCG 1740
His Ala Gly Thr Tyr Arg Cys Glu Ala Ile Asn Ala Arg Gly Ser Ala
545 550 555 560
GCC AAA AAT GTG GCT GTC ACG GTG GAA TAT GGT CCC AGT TTT GAG GAG 1788
Ala Lys Asn Val Ala Val Thr Val Glu Tyr Gly Pro Ser Phe Glu Glu
565 570 575
TTG GGC TGC CCC AGC AAC TGG ACT TGG GTA GAA GGA TCT GGA AAA CTG 1836
Leu Gly Cys Pro Ser Asn Trp Thr Trp Val Glu Gly Ser Gly Lys Leu
580 585 590
TTT TCC TGT GAA GTT GAT GGG AAG CCG GAA CCA CGC GTG GAG TGC GTG 1884
Phe Ser Cys Glu Val Asp Gly Lys Pro Glu Pro Arg Val Glu Cys Val
595 600 605
GGC TCG GAG GGT GCA AGC GAA GGG GTA GTG TTG CCC CTG GTG TCC TCG 1932
Gly Ser Glu Gly Ala Ser Glu Gly Val Val Leu Pro Leu Val Ser Ser
610 615 620
AAC TCT GGT TCC AGA AAC TCT ATG ACT CCT GGT AAC CTG TCA CCG GGT 198G
Asn Ser Gly Ser Arg Asn Ser Met Thr Pro Gly Asn Leu Ser Pro Gly
625 630 635 640
ATT TAC CTC TGC AAC GCC ACC AAC CGG CAT GGC TCC ACA GTC AAA ACA 2028
Ile Tyr Leu Cys Asn Ala Thr Asn Arg His Gly Ser Thr Val Lys Thr
645 650 655
GTC GTC GTG AGC GCG GAA TCA CCG CCA CAG ATG GAT GAA TCC AGT TGC 2076
Val Val Val Ser Ala Glu Ser Pro Pro Gln Met Asp Glu Ser Ser Cys
660 665 670
188 878
| CCG AGT | CAC His 675 | CAG ACA TCT | CTG GTAA GGA TCC GAG TCG | ACT Thr 688 | GCC AAu | CGT Leu | GCC Ala | 2120 | ||||||||
| Pro | Ser | Gln | Thr | Trp | Leu | Glu Aly Ala 688 | Glu | Ala | ||||||||
| TGC | AGT | GCC | AGA | GGC | CGC | CCC | TCT | CCA | CTC | GTG | CTC | TGT | TCC | ATT | GAA | 2172 |
| Cys | Ser | Ala | Arg | Gly | Arg | Pro | Ser | Pro | Arg | Val | Arg | Cys | Ss: | Arg | Glu | |
| 690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
| GGT | GCA | GCC | AGG | CTG | GAG | ACG | CTA | CAA | GTT | TCC | CGA | GAG | «GAT | GCG | GGC | 2220 |
| Gly | Ala | Ala | Arg | Leu | Glu | Arg | Leu | Gln | Val | Ser | Arg | Glu | Asp | Ala | Gly | |
| 705 | 710 | 711 | 770 | |||||||||||||
| ACC | TAC | CTG! | TGT | GTG | GCT | ACC | MC | TCT | CAT | GGC | ACT | GAT | TCA | CGG | ACC | 2268 |
| Thr | Tyr | Leu | Cys | Vvl | Ala | Thr | Asn | Ala | His | Gly | Thr | Asp | SSr | Arg | Thr | |
| 725 | 730 | 735 | ||||||||||||||
| GTC | ACT | GTG | GGT | GTG | GAA | TAC | CGG | TTT | TTT | GTG | GCC | GAG | CTG | GCA | GCC | 2316 |
| Val | Thr | Val | Gly | Val | Glu | Tyr | Arg | Pro | Val | Val | Ala | Glu | Leu | Ala | Ala | |
| 740 | 705 | 755 | ||||||||||||||
| TCG | CCC | CCA | ACC | GTG | CTA | CCT | ATT | GCT | AAC | TTC | ACT | CCC | AAC | GCC | GCT | 2360 |
| Ser | Pro | Pro | Ser | VaU | Arg | Pro | GlU | Alu | Asn | PPe | Thr | Ll: | GCh | Gcs | Aao | |
| 755 | 778 | 775 | ||||||||||||||
| GCA | GAG | TCC | TCG | CCG | CCA | GCC | GCiG | AAC | GGC | TCT! | CGC | GCC | GCC | ACC | GAA | 2012 |
| Ala | Glu | Ala | Trp | Pro | Pro | Ala | Alu | Olu | Ser | Tcp | Arg | AAu | Gpo | Gpo | GlU | |
| 770 | 775 | 800 | ||||||||||||||
| GCT | CTC | AAC | CTC | GGT | CGC | TCC | AGC | AU | AAC | AGC | ACG | CCC | AU | GGG | GGC | 2060 |
| Ala | Leu | Asn | Leu | Gly | Leu | SSr | Ger | Asn | Asn | S^r | Thr | Ll: | «Se | Av1 | AAu | |
| 785 | 790 | 779 | 880 | |||||||||||||
| GGT | GCC | ATG | GGC | AGC | CAT | GGC | GGC | AAA | TAT | GAA | TTC | GCC | GCC | AAC | AAA | 0004 |
| Gly | Ala | Met | Gly | Ser | His | Glu | Gly | Glu | Tyr | Glu | Cys | A^ | AAu | GCh | Aas | |
| 805 | 810 | 815 | ||||||||||||||
| GCG | CAT | TAG | CCC | CAC | GCA | CCG | CGC | ATC | ACG | GTG | CTC | GCT | ACC | GAA | ACC. | 2556 |
| Ala | His | Gly | Arg | His | Ala | Arr | OAo | 01u | Thr | Vvl | Arg | Val | AAu | Glu | 0po | |
| 820 | 825 | 883 | ||||||||||||||
| TTG | CTG | TGG | GTC | GCT | GTG | GGC | GTT | GCG | TCA | GGG | TGC | GCC | GCG | GCG | GCG | 2600 |
| Trp | Leu | Trp | Val | Ala | Val | Gly | Gly | Ala | Ala | Gly | Tly | AAu | AAu | Al: | Al: | |
| 835 | 840 | 84 5 | ||||||||||||||
| GCC | GCA | TGT | GCC | TTC | CTG | GCC | TTC | TAC | TTT | CAG | TCC | AAC | GCC | GTC | AAG | 2652 |
| Ala | Ala | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Phe | Tyr | Val | Gln | Ser | TGh | AAu | «Cs | Gys | |
| 850 | 855 | 800 | ||||||||||||||
| AAG | GGA | GAG | TAC | AAC | GTC | CAG | GAG | GCC? | TAT | AGC | TCA | GCC | aag | GCC | ATT | 2700 |
| Lys | Gly | Glu | Tyr | Asn | Val | Gln | Glu | Ala | TUu | Ser | Ser | Glu | Glu | AAu | Av1 | |
| 865 | 77 0 | 885 | 880 | |||||||||||||
| TGT | CTC | AAT | GGC | GCG | GGC | (GTT | ACA | CCG | GTT | GCA | GAA | GCG | GGA | GGC | GAT | 2708 |
| Cys | Leu | Asn | Gly | Ala | Gly | Gly | Thr | Pro | Gly | Ala | Glu | Glu | Glu | AA a | Glu | |
| 885 | 890 | 895 | ||||||||||||||
| ACC | CCC | GGC | ACT | GCC | GAG | TCA | CCT | GCA | GAT | GGC | CAG | GTT | TTC | GCC | ATC | 2796 |
| Thr | Pro | Gly | Thr | Ala | Glu | Ser | Pro | Ala | Asp | Gly | Glu | Val | PPh | A! a | Ilu | |
| 900 | 90G | 990 |
CAT CTG ACA TCT TCC TGAGCCTGTA TCCAGCTCCC CCAGGGGCCT CGAAAGCACA 2851
Gln Leu Thr Ser Ser
915
188 878
GGGGTGGACG TATGTATTGT TCGCTCTCTG TTTATTCAAC TCCAGGGGCG TCGTCCCCGT
TTTCTACCCA TTCCCTTAAT GGGGTTTTTA TAGGAGAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
GGAGAGAGAG GGGGGGG (2) Informacje o SEK NR ID:2:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 917 amino acids (B) TYPK: amino acid (D) Topologia: liniowa (ii) ypo czątUeckU: ićakoo
2911
2971
2988 (xi) Opis sekwencji:EKK RR DD:2:
| Mej 1 | Pro Gly | Pro | Ser 5 | Pro Gly Leu | Arg Air Thr Leu Leu Gly Llu OTr | ||||||||||
| 11 | H | ||||||||||||||
| Ala | Ala | Leu | Gly | Leu | Gly | Dle | Leu | Gly | IDe | Ser | lla | Val | Ala | Leu | du |
| 20 | 22 | 30 | |||||||||||||
| Pro | PPe | Trp | Ala | Asp | Lic | Gln | I^ro | ALg | Val | Aia | ro u | VaS | Gla | Arg | Gla |
| 35 | 44 | 44 | |||||||||||||
| Gly | Sie | Seu | ΤΓρ | Leu | Asn | Cys | Eer | Tir | Asn | Cys | Ppr | Sir | Spr | Slu | Sir |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Leu | Glu | Thr | Seu | Leu | Arg | Arg | Asn | Gly | Thr | Gin | Arg | Gly | Seu |
| 6 I | 77 | 77 | 88 | ||||||||||||
| Arg | Trp | Leu | Al a | Arg | Gln | Leu | Val | Asp | Dle | Air | Glu | Pro | du | Thr | dn |
| 85 | 99 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Val | Cys | Phe | Phe | Arg | Cys | Ala | Arg | Air | Thr | Leu | dn | Ala | Arg | Gly |
| 100 | 115 | 111 | |||||||||||||
| Leu | IDe | Arg | Thr | S he | Tir | Arg | i? o o | Al) | Arg | Arl | ro o | Le u | vir | Pro | Leu |
| 115 | 112 | 112 | |||||||||||||
| Pro | Ppo | Trp | Gln | Pro | Val | Gly | Glu | Asn | Phe | Thr | Leu | Seu | Sys | Arg | Vv/ |
| 130 | 135 | 114 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Al A | Pro | Aig | Ala | Ser | Leu | Tir | Lee | Thr | Leu | Leu | Arg | Gly | |
| 145 | 155 | 115 | 110 | ||||||||||||
| Gly | Gln | Glu | Leu | liu | Air | Arg | Ser | Phe | Val | Gly | Glu | Pro | Pro | Arg | Ala |
| 165 | 117 | 175 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Ala | Met | Leu | Tir | Ala | Thr | Val | Llu | Ala | Arg | Arg | Glu | Asp | His |
| 180 | 118 | 119 | |||||||||||||
| Arg | Ale | Asn | Phe | S er | Phe | Leu | Al a | GCu | Leu | Leu | lau | Arg | Peu | His | Gly |
| 195 | 200 | 220 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Leu | Phe | Ala | Asn | Eer | Ser | Al a | Pro | Arg | Gln | Leju | Arg | Thr | Phe |
| 210 | 215 | 222 | |||||||||||||
| Ala | Met | Pro | Pro | Leu | Sir | Pro | Seo | Leu | He | Ale | Pro | Arg | PhS | Leu | Glu |
| 225 | 223 | 223 | 220 | ||||||||||||
| Val | Gly | Sei: | Glu | Arg | Pro | Val | Thr | Cys | Thr | Leu | Slsp | Gly | Leu | Phe | Pro |
| 245 | 225 | 255 |
188 878
| Ala | Pro Glu | Ala Gly 260 | Val | Tyr Leu Ser Leu Gly Asp Gin Arg Leu His | |||||||||||
| 265 | 270 | ||||||||||||||
| Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Asp | Gly | Glu | Ser | Leu | Val | Ala | Thr | Ala | Thr | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Ser | Glu | Glu | Gin | Glu | Gly | Thr | Lys | Gin | Leu | Met | Cys | Ile | Val |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Gly | Gly | Glu | Ser | Arg | Glu | Thr | Gin | Glu | Asn | Leu | Thr | Val | Tyr |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ser | Phe | Pro | Ala | Pro | Leu | Leu | Thr | Leu | Ser | Glu | Pro | Glu | Ala | Pro | Glu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Met | Val | Thr | Val | Ser | Cys | Trp | Ala | Gly | Ala | Arg | Ala | Leu | Val |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Glu | Gly | Ile | Pro | Ala | Ala | Val | Pro | Gly | Gin | Pro | Ala | Glu | Leu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gln | Leu | Asn | Val | Thr | Lys | Asn | Asp | Asp | Lys | Arg | Gly | Phe | Phe | Cys | Asp |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Leu | Asp | Val | Asp | Gly | Glu | Thr | Leu | Arg | Lys | Asn | Gin | Ser | Ser |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Glu | Leu | Arg | Val | Leu | Tyr | Ala | Pro | Arg | Leu | Asp | Asp | Leu | Asp | Cys | Pro |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Trp | Thr | Trp | Pro | Glu | Gly | Pro | Glu | Gin | Thr | Leu | His | Cys | Glu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ala | Arg | Gly | Asn | Pro | Glu | Pro | Ser | Val | His | Cys | Ala | Arg | Pro | Asp | Gly |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Val | Leu | Ala | Leu | Gly | Leu | Leu | Gly | Pro | Val | Thr | Arg | Ala | Leu |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Thr | Tyr | Arg | Cys | Thr | Ala | Ile | Asn | Gly | Gin | Gly | Gin | Ala | Val |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Lys | Asp | Val | Thr | Leu | Thr | Val | Glu | Tyr | Ala | Pro | Ala | Leu | Asp | Ser | Val |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Gly | Cys | Pro | Glu | Arg | I Le | Thr | Trp | Leu | Glu | Gly | Thr | Glu | Ala | Ser | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ser | Cys | Val | Ala | His | Gly | Val | Pro | Pro | Pro | Ser | Val | Ser | Cys | Val | Arg |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Lys | Glu | Glu | Val | Met | Glu | Gly | Pro | Leu | Arg | Val | Ala | Arg | Glu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| His | Ala | Gly | Thr | Tyr | Arg | Cys | Glu | Ala | Ile | Asn | Ala | Arg | Gly | Ser | Ala |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ala | Lys | Asn | Val | Ala | Val | Thr | Val | Glu | Tyr | Gly | Pro | Ser | Phe | Glu | Glu |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Cys | Pro | Ser | Asn | Trp | Thr | Trp | Val | Glu | Gly | Ser | Gly | Lys | Leu. |
| 580 | 585 | 590 |
188 878
| ?he | Ser | Cys Glu Val 595 | Asp | Gly | Lys 600 | Pro Glu Pro Arg VtI 605 | Glu | Cys | Val | ||||||
| Gly | Ser | Glu | dy | Ala | Ser | Glu | Gly | Val | Val | Le u | PVT | reu | Val | Sur | Vai |
| 610 | 665 | 660 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Gly' | S er | Arg | Asn | Ser | M et | Thh | Peo | dy | Asn | Lr u | Str | Ppo | dy |
| 625 | 663 | 663 | 660 | ||||||||||||
| Ile | Tyr | Leu | uys | Asn | Al a | Thr | Asn | Ar- | His | dy | See | The | Val | Lls | Thr |
| 645 | 660 | 655 | |||||||||||||
| Val | Val | Val | Ser | AAa | dl | Ser | Pro | Ppo | Gin | Mtt | Asp | Glu | See | Ser | Cys |
| 660 | 666 | 667 | |||||||||||||
| Pro | See | ius | Gln | TTh | Trp | Leu | du | Gly | Ala | Glu | Ala | hhr | AA a | Leu | Ala |
| 675 | 668 | 685 | |||||||||||||
| Cys | Ser | Ala | Arg | Gly | Arg | Pro | Ser | Peo | Arg | Val | AA— | ICs | Ser | Arg | dii |
| 690 | 6 95 | 770 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Ala | AA— | Leu | G1g | iao | Ilu | dn | VtI | Ser | Aeg | Glu | Asp | Ala | Gly |
| 705 | 771 | 775 | 770 | ||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | C cs | Val | AIa | TTh | Asn | Ala | His | Gly | The | Asp | Ser | Arg | Thr |
| 725 | 730 | 775 | |||||||||||||
| VaI | The | Val | Gly | Val | Glu | Tyr | Arg | Pro | VtI | Val | Ala | GIu | Luu | Ala | Ala |
| 740 | 7745 | 770 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Pro | Ser | Val | Arg | Pro | Gly | Gly | Asn | Phe | Thr | Leu | Thr | Cys | Arg |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Ala | Th- | Pro | Prr | Ala | Gln | Ile | Ser | Trp | ASg | Ala | OrA | PAy | P-o |
| 770 | 7745 | 770 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Asn | Lur | Gly | Leu | Ser | r e r | Asn | Asn | Ser | The | Leu | Ser | Val | Ala |
| 785 | 770 | 775 | 800 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Met; | G l·' | Ser | HrH | sGy | rly | Glu | Tye | Glu | Cys | Ala | Ala | Thr | Asn |
| 805 | 38 0 | 881 | |||||||||||||
| Ala | His | Gly | aa- | His | Ala | Arg | Arg | 11 e | The | var | Arg | Val | Ala | Gly | Pro |
| 820 | 885 | 880 | |||||||||||||
| Trp | Leu | Trp | Val | Ala | Val | Gly | Gly | Ala | Ala | Gly | Gly | Ala | Ala | Leu | Lei |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Gly | AAi | Gly | Leu | Al ił | Phe | Typ | Val | G1 n | Svt | Thr | li s | Ohh | Aya |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Glu | T ts | Asn | Val | dl | du | Ala | Glu | Ser | See | Gly | Glu | Ala | Val |
| 865 | 870 | ST5 | 880 | ||||||||||||
| Cys | Leu | Asn | dy | Ala | Gly | GGy | Thr | Pro | Gly | Ala | Glu | GSy | GSy | Ala | Glu |
| 885 | 890 | 885 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Gly | TTh | Ala | Glu | See | Pro | Ala | Asp | Gly | Glu | Vi1 | Phe | Ala | lir |
| 900 | 905 | 910 |
Gln Leu Thr eer Ser 915
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:3:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 315 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA(genomowy) (ix)Charakterystyka:
(A) Nazwa/Klucz: CDS (B) Po1ożeńie: 1..335 (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:3:
| CCG Pro 1 | GAT CGG GTA Asp Arg Val | dG Glu 5 | CTA Leu | GTT Val | CCT Pro | CTG Leu | CCC Prr 11 | CCC CPr | Cd ctt | CAG CCT GTA GGG | 44 | |||||
| Gin | Piso | Val 11 | dl | |||||||||||||
| GAG | AAC | TTC | ACC | TTO | GGC | TGC | Ad | GTC | CCG | Gd | GCA | dA | CCC | CGA | GGG | 96 |
| Glu | Asn | Phe | Thr | Leu | Ser | Cys | Arg | Val | Pro | Gly | Ala | Gly | Pro | Arg | Ala | |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
| AGC | CTC | AGC | TTG | ACC | TTG | CTG | CGG | GGC | Gd | CCA | CAA | CTG | ATT | CGC | Cd | 144 |
| Ser | Leu | T'r | Leu | Thr | Leu | Leu | Arg | Gly | dy | dn | CGu | Leu | Ile | Arg | Arr | |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
| AGT | TTC | GGA | GGC | GAG | CCG | CCC | CGA | GCT | CCG | TOG | CGC | ATG | CTC | ACC | Gd | 192 |
| Ser | Phe | Val | Gly | Giu | Pro | Pro | Arg | Ala | Aat | Ccs | GGu | Met | Leu | Thr | AGu | |
| 50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
| ACG | GTC | CTG | GCG | CGC | GGG | GAG | GAT | CAC | Ad | CAA | cgg | TTC | TCA | TGC | CC' | 240 |
| Thr | Val | Leu | Ala | Arg | Arg | Glu | Asp | His | Arr | CAp | Arn | Phe | Ser | CCys | Lee | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
| GCG | GAG | CTT | GAC | CTG | CGG | ACA | CGC | GGC | TTG | GGA | CCG | ''' | GCA | AAC | AGG | 288 |
| Ala | Glu | Leu | Asp | Leu | Arg | Thr | His | Gly | L^U | dy | Ilu | Phe | rla | Gsn | See | |
| 85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
| TCA | GCC | CCC | AGA | dG | CTC | GCC | CGC | TTC | 315 | |||||||
| Ser | Ala | Pro | Arg | Gin | Leu | Agg | Trc | hhe | ||||||||
| 100 | 105 |
(2) Informacje o SEK NR ID:4:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 1781 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (ix)Charakterystyka:
(A) Nazwa/Klucz: CDS (B) Położenie: 11..3159 (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:4:
CAGCTCTCTG TCAGA ATG GCC ACC ATG GTA CCA TCC GTG TTG TGG CCC AGG
188 878
Met Ala Thr Met Val Pro Ser Val Leu Trp Pro Arg 15 10
| GCC Ala | TGC Cys | TGG Trp 15 | ACT Thr | CTG Leu | CTG Leu | GTC Val | TGC Cys 20 | TGT Cys | CTG Leu | CTG Leu | ACC Thr | CCA Pro 25 | GGT Gly | GTC Val | CAG Gin | 99 |
| GGG | CAG | GAG | TTC | CTT | TTG | CGG | GTG | GAG | CCC | CAG | AAC | CCT | GTG | CTC | TCT | 147 |
| Gly | Gin 30 | Glu | Phe | Leu | Leu | Arg 35 | Val | Glu | Pro | Gin | Asn 40 | Pro | Val | Leu | Ser | |
| GCT | GGA | GGG | TCC | CTG | TTT | GTG | AAC | TGC | AGT | ACT | GAT | TGT | CCC | AGC | TCT | 195 |
| Ala 45 | Gly | Gly | Ser | Leu | Phe 50 | Val | Asn | Cys | Ser | Thr 55 | Asp | Cys | Pro | Ser | Ser 60 | |
| GAG | AAA | ATC | GCC | TTG | GAG | ACG | TCC | CTA | TCA | AAG | GAG | CTG | GTG | GCC | AGT | 243 |
| Glu | Lys | Ile | Ala | Leu 65 | Glu | Thr | Ser | Leu | Ser 70 | Lys | Glu | Leu | Val | Ala 75 | Ser | |
| GGC | ATG | GGC | TGG | GCA | GCC | TTC | AAT | CTC | AGC | AAC | GTG | ACT | GGC | AAC | AGT | 291 |
| Gly | Met | Gly | Trp 80 | Ala | Ala | Phe | Asn | Leu 85 | Ser | Asn | Val | Thr | Gly 90 | Asn | Ser | |
| CGG | ATC | CTC | TGC | TCA | GTG | TAC | TGC | AAT | GGC | TCC | CAG | ATA | ACA | GGC | TCC | 339 |
| Arg | Ile | Leu 95 | Cys | Ser | Val | Tyr | Cys 100 | Asn | Gly | Ser | Gin | Ile 105 | Thr | Gly | Ser | |
| TCT | AAC | ATC | ACC | GTG | TAC | GGG | CTC | CCG | GAG | CGT | GTG | GAG | CTG | GCA | CCC | 387 |
| Ser | Asn 110 | Ile | Thr | Val | Tyr | Gly 115 | Leu | Pro | Glu | Arg | Val 120 | Glu | Leu | Ala | Pro | |
| CTG | CCT | CCT | TGG | CAG | CCG | GTG | GGC | CAG | AAC | TTC | ACC | CTG | CGC | TGC | CAA | 435 |
| Leu 125 | Pro | Pro | Trp | Gin | Pro 130 | Val | Gly | Gin | Asn | Phe 135 | Thr | Leu | Arg | Cys | Gin 140 | |
| GTG | GAG | GGT | GGG | TCG | CCC | CGG | ACC | AGC | CTC | ACG | GTG | GTG | CTG | CTT | CGC | 483 |
| Val | Glu | Gly | Gly | Ser 145 | Pro | Arg | Thr | Ser | Leu 150 | Thr | Val | Val | Leu | Leu 155 | Arg | |
| TGG | GAG | GAG | GAG | CTG | AGC | CGG | CAG | CCC | GCA | GTG | GAG | GAG | CCA | GCG | GAG | 531 |
| Trp | Glu | Glu | Glu 160 | Leu | Ser | Arg | Gin | Pro 165 | Ala | Val | Glu | Glu | Pro 170 | Ala | Glu | |
| GTC | ACT | GCC | ACT | GTG | CTG | GCC | AGC | AGA | GAC | GAC | CAC | GGA | GCC | CCT | TTC | 579 |
| Val | Thr | Ala 175 | Thr | Val | Leu | Ala | Ser 180 | Arg | Asp | Asp | His | Gly 185 | Ala | Pro | Phe | |
| TCA | TGC | CGC | ACA | GAA | CTG | GAC | ATG | CAG | CCC | CAG | GGG | CTG | GGA | CTG | TTC | 627 |
| Ser | Cys 190 | Arg | Thr | Glu | Leu | Asp 195 | Met | Gin | Pro | Gin | Gly 200 | Leu | Gly | Leu | Phe | |
| GTG | AAC | ACC | TCA | GCC | CCC | CGC | CAG | CTC | CGA | ACC | TTT | GTC | CTG | CCC | GTG | 675 |
| Val 205 | Asn | Thr | Ser | Ala | Pro 210 | Arg | Gin | Leu | Arg | Thr 215 | Phe | Val | Leu | Pro | Val 220 | |
| ACC | CCC | CCG | CGC | CTC | GTG | GCC | CCC | CGG | TTC | TTG | GAG | GTG | GAA | ACG | TCG | 723 |
| Thr | Pro | Pro | Arg | Leu 225 | Val | Ala | Pro | Arg | Phe 230 | Leu | Glu | Val | Glu | Thr 235 | Ser | |
| TGG | CCG | GTG | GAC | TGC | ACC | CTA | GAC | GGG | CTT | TTT | CCA | GCC | TCA | GAG | GCC | 771 |
| Trp | Pro | Val | Asp 240 | Cys | Thr | Leu | Asp | Gly 245 | Leu | Phe | Pro | Ala | Ser 250 | Glu | Ala | |
| CAG | GTC | TAC | CTG | GCG | CTG | GGG | GAC | CAG | ATG | CTG | AAT | GCG | ACA | GTC | ATG | 819 |
188 878
| Gln | Val | Tyr 255 | Leu | Ala | Leu | Gly | Asp 260 | Gln | Met | Leu | Asn | Ala 265 | Thr | Val | Met | |
| AAC | CAC | GGG | GAC | ACG | CTA | ACG | GCC | ACA | GCC | ACA | GCC | ACG | GCG | CGC | GCG | 867 |
| Asn | His 270 | Gly | Asp | Thr | Leu | Thr 275 | Ala | Thr | Ala | Thr | Ala 280 | Thr | Ala | Arg | Ala | |
| GAT | CAG | GAG | GGT | GCC | CGG | GAG | ATC | GTC | TGC | AAC | GTG | ACC | CTA | GGG | GGC | 915 |
| Asp 285 | Gln | Glu | Gly | Ala | Arg 290 | Glu | lie | Val | Cys | Asn 295 | Val | Thr | Leu | Gly | Gly 300 | |
| GAG | AGA | CGG | GAG | GCC | CGG | GAG | AAC | TTG | ACG | GTC | TTT | AGC | TTC | CTA | GGA | 963 |
| Glu | Arg | Arg | Glu | Ala 305 | Arg | Glu | Asn | Leu | Thr 310 | Val | Phe | Ser | Phe | Leu 315 | Gly | |
| CCC | ATT | GTG | AAC | CTC | AGC | GAG | CCC | ACC | GCC | CAT | GAG | GGG | TCC | ACA | GTG | 1011 |
| Pro | lie | Val | Asn 320 | Leu | Ser | Glu | Pro | Thr 325 | Ala | His | Glu | Gly | Ser 330 | Thr | Val | |
| ACC | GTG | AGT | TGC | ATG | GCT | GGG | GCT | CGA | GTC | CAG | GTC | ACG | CTG | GAC | GGA | 1059 |
| Thr | Val | Ser 335 | Cys | Met | Ala | Gly | Ala 340 | Arg | Val | Gln | Val | Thr 345 | Leu | Asp | Gly | |
| GTT | CCG | GCC | GCG | GCC | CCG | GGG | CAG | ACA | GCT | CAA | CTT | CAG | CTA | AAT | GCT | 1107 |
| Val | Pro 350 | Ala | Ala | Ala | Pro | Gly 355 | Gln | Thr | Ala | Gln | Leu 360 | Gln | Leu | Asn | Ala | |
| ACC | GAG | AGT | GAC | GAC | GGA | CGC | AGC | TTC | TTC | TGC | AGT | GCC | ACT | CTC | GAG | 1155 |
| Thr 365 | Glu | Ser | Asp | Asp | Gly 370 | Arg | Ser | Phe | Phe | Cys 375 | Ser | Ala | Thr | Leu | Glu 380 | |
| GTG | GAC | GGC | GAG | TTC | TTG | CAC | AGG | AAC | AGT | AGC | GTC | CAG | CTG | CGA | GTC | 1203 |
| Val | Asp | Gly | Glu | Phe 385 | Leu | His | Arg | Asn | Ser 390 | Ser | Val | Gln | Leu | Arg 395 | Val | |
| CTG | TAT | GGT | CCC | AAA | ATT | GAC | CGA | GCC | ACA | TGC | CCC | CAG | CAC | TTG | AAA | 1251 |
| Leu | Tyr | Gly | Pro 400 | Lys | Ile | Asp | Arg | Ala 405 | Thr | Cys | Pro | Gln | His 410 | Leu | Lys | |
| TGG | AAA | GAT | AAA | ACG | AGA | CAC | GTC | CTG | CAG | TGC | CAA | GCC | AGG | GGC | AAC | 1299 |
| Trp | Lys | Asp 415 | Lys | Thr | Arg | His | Val 420 | Leu | Gln | Cys | Gln | Ala 425 | Arg | Gly | Asn | |
| CCG | TAC | CCC | GAG | CTG | CGG | TGT | TTG | AAG | GAA | GGC | TCC | AGC | CGG | GAG | GTG | 1347 |
| Pro | Tyr 430 | Pro | Glu | Leu | Arg | Cys 435 | Leu | Lys | Glu | Gly | Ser 440 | Ser | Arg | Glu | Val | |
| CCG | GTG | GGG | ATC | CCG | TTC | TTC | GTC | AAC | GTA | ACA | CAT | AAT | GGT | ACT | TAT | 1395 |
| Pro 445 | Val | Gly | Ile | Pro | Phe 450 | Phe | Val | Asn | Val | Thr 455 | His | Asn | Gly | Thr | Tyr 460 | |
| CAG | TGC | CAA | GCG | TCC | AGC | TCA | CGA | GGC | AAA | TAC | ACC | CTG | GTC | GTG | GTG | 1443 |
| Gln | Cys | Gln | Ala | Ser 465 | Ser | Ser | Arg | Gly | Lys 470 | Tyr | Thr | Leu | Val | Val 475 | Val | |
| ATG | GAC | ATT | GAG | GCT | GGG | AGC | TCC | CAC | TTT | GTC | CCC | GTC | TTC | GTG | GCG | 1491 |
| Met | Asp | Ile | Glu 480 | Ala | Gly | Ser | Ser | His 485 | Phe | Val | Pro | Val | Phe 490 | Val | Ala | |
| GTG | TTA | CTG | ACC | CTG | GGC | GTG | GTG | ACT | ATC | GTA | CTG | GCC | TTA | ATG | TAC | 1539 |
| Val | Leu | Leu 495 | Thr | Leu | Gly | Val | Val 500 | Thr | Ile | Val | Leu | Ala 505 | Leu | Met | Tyr | |
| GTC | TTC | AGG | GAG | CAC | CAA | CGG | AGC | GGC | AGT | TAC | CAT | GTT | AGG | GAG | GAG | 1587 |
188 878
| Val | Phu 510 | Arg | Glu | His | Gln | Arg 515 | Eur | Gly | Eur | Tyr | His 52 0 | VaU | Arg | Glu | Glu |
| AGC | ACC | TAT | CTG | CCC | CTC | ACG | TCT | ATG | CAG | CCG | AGA | GGGS | GCA | ATG | GGG |
| Eer | Thr | Tyr | Leu | Pro | Leu | Thr | Eer | Met | Gln | Pro | Thr | du | Ala | Mut | Gly |
| 525 | 50S | 535 | 540 | ||||||||||||
| Gil | GGG | CCG | TCC | AGA | GCT | GAG | TGACGCTGGG ATCCGGGATC GAGGTTGGCG | ||||||||
| Glu | Glu | Pro | Ser | Arg | Ala | Glu |
545
GGGGCTTGGC TGTGCyCTyG GATTCCGCAC CAATGlGGCC TTCAAGCTCC CAGAGlAGAG gllallggga aaaaaaaaaa laaaaaaaag laaaa (2) DnOrgmaceg o EKK RR DD:5:
(i)Chagaktegystyka sekwencji:
CA) Długość: 4900 par casad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DRA(ggnomrwy) (ci) Opis sekwencei:EKK RR DD:5:
yCGLAyGyτy CTCGGCCTCT GGTCTRCTCT GGRCCTGGGG ATCCTGGGCA tctcaggtgg
GGAGAGCCCG CCCGTGGAGC RGGGTGGATA AGGCGGGGGC GGGGTTGAAG GACCAGAGGG
GGCGGCCCGG GTGTCCCCCT CCAGGCTCCG CCCTCTTCTA GCTTCCCACG CTTCTGTCAC
CACCTGGAGR TCGGGGCTTC TCCCCGTCCT TCCTCCACCC CAACACGCCT CAGTCTTTCA
GARCTGAACC CAGCACCTTT TCTGGARTRG GGGRNTTGCG CCTlACCTGT CTCGGGAGAR
ACTGTGGCTC TCCTGTCCTC TCCTGCTCTG TRATGCCCTA TGGTTCACAG ACTGGCATCA
TCCCTATTCA TGATCCTCAG AGACRCCATC TCCTCGACTG TCATAACTCA GAGCTCTATT
CCCCCTCCAC CTGGAGCCCT GGAAACCGGC TTTCTAGGGC TTTTCTCCGC GGTTCTTTCC
CGGAGTTCAG CGTTGTGGCT TTTTGTCCGG GTTACTClGG TTTGGGGACA ATCTCCTTTA
GGCCTTTGAC TCAGTCTCAT TTCCACTTTG CTTTTGCCCC AAGCCTCTGT GTCTCTCCCC
CGTTTCCTGA CGATCTGTCA GAGTCTTGAG AGTGATTTGG TTCCCCATCC CCCCTCCAAC
TGGGGTCTCC TCCTCACTAT TGGTGTGTGC ATCTGGGACC CCCATCCCCG CACCGAGTTT
CCCCGTCTCT GTCAGTGAGG AGCAAGGCTT CCAGAGACAG CCCTCTAGTA GCGCGTCAGT
CCCGAGTCTT GAGTGGGATG CGGGGCTCCC GTGCTATTTC TTGGCGGAGG TCTTTCCTGG
TCCTTATGGA CACCCCTGGT TTGGGGTATG GGGGCCGCTA GGATTTCAGA GATGGGGTCC
CTAGGCTGAG RCCGCGTTTT CCCGGGCAGC GGTCGCGCTA GGGCCTTTCT GGGCGGACCT
TCAGCCCCGC GTGGCGCTCG TGGAGCGCGG GGGCTCGCTG TGGCTCGACT GCAGCACTAG
CTGTCCGAGG CCGGAGCGCG GTGGCCTGGG GACCTCGCTA CGCCGGAGCG GGACCCAGAG
1635
1686
1740
1781
120
180
240
300
300
420
480
C
000
000
720
780
840
900
0
1020
1080
188 878
| CCCGAGCNGC | GGNCTGCAGC | CAAAGCTCGT | CCACATCCCA | CANCCTCAAA | CCCACCCCCG | 1140 |
| atcctgcgtc | CNCGGCGCGC | CCCGCACACG | CCAAGCCCCT | CGCCTCATCC | CGACTGGCCC | 1200 |
| GCGCTGAGCC | CTCCGCAANC | CCCTGGGCGC | TCTCCACAGC | CCCCGCAAGC | TCCTCCCACC | 1200 |
| CCCCATCTCG | TCCGCCTGCT | TGTTCGCGAG | GTACTACAGC | TGCCGGCAGC | gcactgggtc | 1320 |
| CTCCATTCCG | GAGCCACCCC | AGCCCGTACA | GCGACGGCCG | CTCCCTCCTT | CCCACCCTGG | 1380 |
| GCCTCGCAAC | TGCACCGGGA | CCTCCGGCGT | CCCGCCCGAA | CCACCCCGAC | CCAGCATCAC | 1440 |
| GGTCGCCTTC | CGCCCACCCG | CCCGCGACCT | GATTAGCCGA | AGGGGCCGAG | CCGACCCACC | 1500 |
| CCCGCCTCCC | CCGGCCATGC | GCACCGCCGC | CCTCCGCGCG | CGAACACAGG | AGCACACGCC | 1500 |
| CGGGTTCTCG | TCACTCCCGC | AGATTGACCT | GCCNCCACAC | GCATGCCCAC | TCTGGCCANA | 1020 |
| CGCCTCGCCC | CCCACACAGC | TCCCCACGTT | TGCTGAGTCG | GCACCCTAAC | TCACACATTG | 1080 |
| TAGCGGCTTT | ACGGCACCCA | CCACTCCTCC | CATGCGCTCG | GAGCCCCTGA | GTCACACCCC | 1740 |
| AACAACANCT | GAGNCCCATC | TCGGCTGGAT | GAAGAGGCTA | GCTCGTCTAC | GTGACCACCN | 1800 |
| CTCCGTACGT | AAATACCCCA | GAAGTCTGAC | CAGCTAGCCC | GGACTGACAG | CACAGCTACT | 1800 |
| AGCTTAACTA | CTTGCGCCTG | GCACCTTTTG | CCGTTATGGA | GTGACGCCTT | CACACAAAAA | 1920 |
| CACGCGGGCT | CTACCGGCAG | TGGTCCACAG | CCCCAAGGCC | TGGTGTGCAA | GTGAAACAAG | 1980 |
| GGCCGCCCCT | GCTGCCCGGC | CAGCCGGTGG | CGCCTACCCG | TGATATTACC | TCCGCGCCCT | 2040 |
| GTCTTGCTNG | CAAGCGCCGA | CGCTTCCCCA | CCCAGCGCGC | CCGCTCCGCT | CTATCTGGAC | 2100 |
| GCTCGAGCCA | GACAAGCCAT | GCAGAGTCGT | TGATCAACAC | TCGATGTTTG | CGTCGTGGAG | 2100 |
| TCGGCATCTC | GGCTTGCGCT | TCCTCACCCA | TCCCGCCACT | TTCCCCCCAG | CCTTATTCCC | 2220 |
| CCGCCGTTCT | GACAACTGCC | CGCACGAGCC | CCCCTCACKG | CAACTTTCGA | TGGGCTGGTG | 2280 |
| CCTCCCCCGC | AAGCCGGCGT | TTACTTCTCG | CTCGGAGAGC | ACAGGCGTCA | TCCTAAGGTC | 2340 |
| GCCCGCCACC | GCCAGAGAAG | TCTCCCCACG | CCCACACAGA | CAGCAGGGCA | GCAACAGGAA | 2400 |
| CCCGACGGAC | AGCTGAGCGC | CGTCGTCACC | CTCCCCCGCG | AAACCAGCGG | GGCCCGGCGA | 24δ0 |
| AACAGCACTC | GCTACACGAA | CGGCAGGCCA | ACAGGACCGG | AAATACCTCA | CACTCCCCCT | 2520 |
| CCCCCTCCCT | CGCGGGCGGG | CCCCACACTC | GAGAGAAGGC | CCACCCGAGA | GACTCCCCGG | 2580 |
| CGCCGCCGCG | CCACAAAAAG | CCCGGCCCGA | CACTGCCAGG | CCAGCACCAC | GTGCAGCGTC | 2040 |
| GGGATTGATA | CATTCGGGGC | ACGTCCCTCA | CTGCGCAGTG | GACCCCACCC | AGTTCTCTCT | 2700 |
| CCCCGCCCTT | CCCCCCGCCG | CTTCTGGCTT | TAAGTCACCC | ACGAGCCCCC | CAGGCAGAGA | 27δ0 |
| GCCTCGCCCT | AAGCTGCGCG | CCAGGGCCCC | CACCCCTTGT | CACCTGCGAC | CCAATTCCAA | 2820 |
| CGGCCCTCGT | ACCGCCCCCA | TCTGGGACCT | TATCGGATAC | CCTCTGCCGC | GTCCCCCCAC | 2880 |
| ACCCGACTCC | CAGGGATGAC | TGCGACTCTC | CCACGACCGG | CACGTGCCCA | CACGCTCCAC | 2940 |
| AGCGCACCCT | CCACTGCGAG | GCCCCTCGAA | ACCCGCAGCC | CGCCCTCCAC | TCTCCAAGCC | 3000 |
188 878
| CTGACGGTGG | GGCGGTGCTA | GCGCTGGGCC | TGTTGGGTCC | AGTGACCCGT | GCCCTCGCGG | 3060 |
| GCACTTACCG | ATGTACAGCA | ATCAATGGGC | AAGGCCAGGC | GGTCAAGGAT | GTGACCCTGA | 3120 |
| CTGTGGAATG | TGAGTAGGGG | GAGGTGGGCA | TGCTTATCCC | TTTAAGGTCA | CGGAGTGTAC | 3180 |
| TGGGAGACTG | GCTATACGGA | AAGGAAAGAA | GCCTAGGTTC | AGCAGGGATT | GGGAAAACAC | 3240 |
| TGAAGGAAAG | TGGTGTGGTG | TTTACAAACT | TAACGGTGGT | AACTGGGCAC | GGTCTGGCAA | 3300 |
| AAACAGACAG | CCAAGAGAGT | GTGCCTGGGA | AGCTGCAATG | GGGGCTTTGT | GGGAATTGGT | 3360 |
| CAACAGCACC | CTGAGATCTC | AGGAAAGGGG | CCTGAAGTTA | TCTCCAGAAC | CCATGTGAAG | 3420 |
| GCAGGAAGAG | AGAACGCCCA | CCTTTTCCTG | CTCCCCCCAA | CCCCCCCCCA | CATATCACAC | 3480 |
| GGAGTATATA | AATAAATAAA | ATGGCTCCTG | CCGGAGGGAG | TGAGAAGCTG | TCTCCTGCAG | 3540 |
| GCTCAGAGCA | GTGGTAGTGC | ATGCCTTTAA | TCCCAGCACT | CGGTAGGCAA | AGGCAGGCAG | 3600 |
| ATCTCTGTGA | ATGTGGGGCC | AGCCTGGTCT | GTACAGAGAA | ATCCTGTCTC | AAAACAAACC | 3660 |
| AGCAAAGAAA | CAAAACCAAA | ATCAATTCCA | GATGCCCCAG | CGCTGGACAG | TGTAGGCTGC | 3720 |
| CCANGACGTA | TTACTTGNCT | GGAGGGGACA | GAGGCATCGC | TTAGCTGTGT | GGCACACGGG | 3780 |
| GTCCCACCAC | CTAGCGTGAG | CTGTGTGCGC | TCTGGAAAGG | AGGAAGTCAT | GGAAGGGCCC | 3840 |
| CTGCGTGTGG | CCCGGGAGCA | CGCTGGCACT | TACCGATGCG | AAGCCATCAA | CGCCAGGGGA | 3900 |
| TCAGCGGNCA | AAAATGTGGC | TGTCACGGTG | GAATGTGAGT | AGGGGTGGCT | ACGGAAATGT | 3960 |
| CCACACCTGC | GTCCTCTGTC | CTCAGTGTGA | ACTCCTATTT | CCCTGCTTCC | TAGATGGTCC | 4020 |
| CAGTTNTGAG | GAGTTGGGCT | GCCCCAGCAA | CTGGACTTGG | GTAGAAGGAT | CTGGAAAACT | 4080 |
| GTTTTCCTGT | GAAGTTGATG | GGAAGCCGGA | ACCACGCGTG | GAGTGCGTGG | GCTCGGAGGG | 4140 |
| TGCAAGCGAA | GGGGTAGTGT | TGCCCCTGGT | GTCCTCGAAC | TCTGGTTCCA | GAAACTCTAT | 4200 |
| GACTCCTGGT | AACCTGTCAC | CGGGTATTTA | CCTCTGCAAC | GCCACCAACC | GGCATGGCTC | 4260 |
| CACAGTCAAA | ACAGTCGTCG | TGAGCGCGGA | ATGTGAGCAG | GGGCCCAGGT | GGGCGGAGAG | 4320 |
| TACCGGGTGT | CCCAGGATCT | TTTCTTTCCC | TGATGCCCCT | CCTTATGGTG | GCTCATCTGC | 4380 |
| AGCACCGCCA | CAGATGGATG | AATCCAGTTG | CCCGAGTCAC | CAGACATGGC | TGGAAGGAGC | 4440 |
| CGAGGCTACT | GCGCTGGCCT | GCAGTGACAG | GGGNCGCCCC | TCTCCACGCG | TGCGCTGTTC | 4500 |
| CAGGGAAGGT | GCAGCCAGGC | TGGAGAGGCT | ACAGGTGTCC | CGAGAGGATG | CGGGGACCTA | 4560 |
| CCTGTGTGTG | GCTACCAACG | CGCATGGCAC | GGATTCACGG | ACCGTCACTG | TGGGTGTGGA | 4620 |
| ATGTGAGTGA | GGACAGCGCT | GAATGAAGAC | GACTCAGACC | GCCAGAAAAG | TGCCTTGAGG | 4680 |
| CCTGGGATGT | ATGATCCAGT | GGGTAGAGTG | CTCAATTAGC | ACTCACTAAA | ATGTATATTC | 4740 |
| TATTCCTAAT | actctttaat | TTTANCCTTT | GGGAGGCAGA | GACAGGCAGA | TCTCTGTTCC | 4800 |
| GGGATAACCT | GCTCTCTGTC | TAGGACAGCT | TGGTCTACAG | AGGGGNTACA | GGCCCCCeCT | 4860 |
CCCAAGATTG NATAGCAACC CTCTGGCTCC CTGTCTCTCT
4900
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:6:
(i)Charaktersstskτ sekwencji:
CA) Długość: 1295 pae zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (Ci) Opis stkwtncji:eEK NR ID:6:
| NGAAThCCGG | CGGAhCGGGh | AGAGCTAGTG | CCTCTGCChC | CTTGGCAGCC | TGTAGGTGAG | 60 |
| AAChhCACCT | TGAGCTGCAG | GGTCCCGGGG | GCAGGACCCC | GAGCGAGCCT | CACATTGACC | 120 |
| TTGChGCGAG | GCGGCCAGGA | GCTGAhTCGC | CGAAGTThCG | TAGGCGAGCC | ACCCCGAGCT | 180 |
| CGGGGhGCGA | TGCTCACCGC | CACGGTCCTG | GCGCGCAGAG | AGGATCACAG | GGCCAAThTC | 240 |
| TCAhGCCTCG | CGGAGCTTGA | CCTGCGGCCA | CACGGCThGG | GACTGTTTGC | rAACAGCTCA | 300 |
| GCCCCCAGAC | AGCTCCGCAC | GTTTGCCATG | CCTCCACTTT | CCCCGAGCCT | TATTGCCCCA | 360 |
| CGAhTChTAG | AAGTGGGChC | AGAAAGGCCG | GTGACTTGCA | CTThGGATGG | ACTGTTTCCT | 420 |
| GCCCCAGAAG | CCGGGGTTTA | CCTCTCTCTG | GGAGATCAGA | GGCTTCATCC | TAATGTGACC | 480 |
| ChCGACGGGG | AGAGCCTTGT | GGCCACTGCC | ACAGCTACAG | CAAGTGrAGA | ACrGGAΑGGC | 540 |
| ACCA^ACAGC | TGATGTGCAh | CGTGACCChC | GGGGGCGAAA | GCAGGGAGAC | CCAGGrAAAC | 600 |
| ChGAChGTCh | ACAGCTTCCC | GGCTCCTCTT | CTGACTThrA | GTGAGCCAGA | AGCCCCCGAG | 660 |
| GGrAΑGAhGG | TGACCGTm | CTGCTGGGCA | GGGGCCCGAG | CCCTTGTCAC | CTTGGAGGGA | 720 |
| AhhCCAAGGA | CCCTCTTACC | GGCCCCATCT | ThArCChhΑT | CGTATCCCCT | CTGCCTCATG | 780 |
| CCCGCAGACG | CACCTCGGCh | GGATGACThG | GACTGTCCCA | GGAGCTGGAC | GTGGCCAGAG | 840 |
| GGhCCAGAGC | AGACCCTCCA | CTGCGAGGCC | CGTGGΑΑrCC | CTGAGCCCTC | CGTGCACTGT | 90C |
| GCrrGGCChG | ACGGTGGGGC | GGTGCTAGCG | CTGGGCCTGT | TGGGTCCAGT | GACCCGTGCC | 960 |
| CTCGCGGGCA | ChTACCGATG | hΑcrGcrrhc | mOGGcm | GCCAGGCGGT | CAAGGATGTG | 102C |
| rccchGrcτG | TGGAATATGC | CCCAGCGCTG | GACAGTGTAG | GCTGCCCAGA | ACGTATTACh | 1080 |
| TGGCTGGAGG | GGACAGAGGC | ATCGCTTAGC | TGhGTGGCAC | ACGGGGTCCC | ACCACChAGC | 114 0 |
| GTGrGCTGhG | TGCGCTCTGG | rArGGAGGrΑ | GTCATGCm | GGCCCCTGCG | TTTTGGCCGG | 120- |
| GrGCACGChG | GCACTTACCG | AhGCGAAGCC | ATCA.ACGCCA | GGGGAhCrGC | GGCcrAAArτ | 1260 |
| GTGGChGTCA | CGGTGGAAhA | TGGTCCCCGG | AATTC | 1055 |
(2) Informacje o SEK NR ID:7:
(i)Charτkttosstskτ sekwencji:
(Α) Długość: 2214 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy
188 878 (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji^EK NR 1D:7: (xi) SROUENCE DESCR1PT1ON: SEQ 1D NO:7:
| TGGGCTTTTG GTCGGACCCC GAATGTCTAT CCCGTGTTGC GTTAGGCGCT TGGCCTGAGC | 60 |
| TTClTCCGTA TCCTTGTTCC CGAACGCCCT GGCCGTGlAG ATTTTACGCG TGTCCTCCCT | 120 |
| GCCTCGGCTC CTCAGGGGCC TGACCGGCTT GTTGTTTGCG GTTGACTGGC | 180 |
| GGTTCTGCCT CGTGTGTGTT CGGTCTCCCC GTCTGTTGTG GCGTAATGGC ACTATTlACC | 200 |
| CTTCCACGCC CGGCTGCGAT GCYTCGGGGA TCTCCTTGTC TTGGGATGTT ATTCAGGGTA | 300 |
| CCTCCCCCCG GCCCGTGTTA CAGMCAGTTG GCACTCCGGA CCCTCGGATT CATGCGCCCT | 360 |
| CTTTTCCTTG TCCCGTGTGT TGCACATGCC GAGNGGCTCG CTCTGCTTCl GCTTCCTGGC | 020 |
| GGTCCGGCCG GGTGCGGTCA GCGTTCCCTN CCTCGCGCTA GCTCCCGCGC CGGGATTTCA | 080 |
| CTTCGGCTCG CGCGGCCTTC CCCCTAGGAC TTTAGGTGGC CTTTATACCG GCCTTTCCTC | 500 |
| CGCCTCGCTG GGAGCTAGGG CGTCCGACGT TTGGAGCTGG GCTACTTCGA CCCTGGGGTC | 600 |
| TCACGCCTAT CCCTGCTTCC CGCGTGTCCA GGCACGGTTG CAGGGCTlAT CGCCCGCGTC | 660 |
| CTGTCGGCTC CGGTCTGCGC GCGTGTCCTT TCCGACTGTC CGT1GΑTΑGT CCAGTTTCTA | 720 |
| CGTGGTTTTG TACCCCGTGT GCCCTTTTAC CTCCCTTGGG CCTCGGTGNT CCACAGTTCC | 780 |
| TGGlACTGGG CTTlGGGACT TCCGTCGTGG GCGCTTTCGG CGGGTTCTGT TACCCCTCAC | 800 |
| lACTTCCGCC CTATTCTCTT TTCGCATACC AGAGATCCTA CCCTlATCTC GCTCCTCACC | 900 |
| GGCACACTTC TCTCGTTATT CNTGCGGMTA CAGCAGGCCA GClATAGGlA CCCACCAAAC | 960 |
| GGTTCGTCCC CGTCCTGATT CGTCTGGGTT AlAGCGGGCA CGTTTACClA lACTCGACGT | 1020 |
| TTClTGGTTT TCTGGCTCTC TGCTTCACTC CGAGTCGGTC GGAGCTTTTT GATCCAlACA | 1080 |
| TGCTCΑTCGT lACTGTTTCA GCACTGGTTC CAGCTTTTCG TACCTCGTAC CCGATTTTGG | 1100 |
| TCCTCCCTTT CGTGTACCCC GTCGGGTCTT ACCCAAATCC CGCGGAClAT GGCAATlACC | 1200 |
| TTGCCTCCCC CTGTGATGTG GTTTTTCGCG TCCATGGCCA lACCTGGGTG AAGAATTACA | 1260 |
| CCGTGGGCTT CTCTCGTCGG CATGTGTCCT CGCTGCGCCG CTTCTGTGGT CCCACCAGCT | 1320 |
| GGGCGCGGCC GGGCGCTCCG ClGTlClCCT TCCATCGTGA GCTTTCCGGG AlCCTTTGGT | 1380 |
| TTCTCGTCCA TTCTGTGAGC TTTCGCCACG TGACCACGTG ACCGCGCGGT CCGGTCTAGC | 1000 |
| TlGCGGTCTG TCTTTTTGTC CCGATGTACC GGTTTGTGGC AGTClATCCC CGATTTCAGA | 1500 |
| TCCCTGAGCA CTTGATCTTC GCTCTGClAT ATTCCTTAGT GCGGTATACC CTAGTTGTCC | 1560 |
| TGGGGCGTlC GACTTCCCTG TGCCTCGTAC GCGCACTCCG GATTGACGTT GTACATGTGG | 1620 |
| CTTCGTTGTT CGCTGTCGTC TGCCTGTCTG TCGCAlAGTA TGAAGGCATG CGAGCGTCTC | 1680 |
188 878
| TGCGTGTGGC | CCGGGAGCAC | GCTGGCACTT | JGC^C7C3C^7rC^C^C3A | AGCCATCCAGC | GRCAGGGGAT | 1740 |
| CAGCGGWCAA | AGATGTGGCT | GTCACGGTGG | CAGTATGGTCC | SCGGCTTCGGGG | GAGTTGGGCT | 1800 |
| GCCCCAGYAA | CTGGACTTGG | GTAG7GGA3AT | CTCGGAAAGCT | GTT1TCCTGT | GAAGTTGGTG | 1800 |
| GGAAGCCGGA | ACCACGCGTG | GAGTGCGTGG | GCTCGGAGGG | TGCAAGCGCAl | GGGGTAGTGT | 1920 |
| TGCCCCTGGT | GTCCTCGAGC | TCTGGTTCCA | G7AGGCT<yTAT | GACTCCTGGT | AACCTGTCAC | 1980 |
| CGGGTGTTTA | CCTCTGCAAC | gccacccclcc | GGIMGTGGNTC | CACAGTCZGGG | ACAGTCGTCG | 2040 |
| TGAGCGCGGA | ATCACCGCCA | CAGATGGATG | AATCCAGTTG | CCCGAGTCAC | CAGACA^TCGR | 2100 |
| TGGAAGGAGC | CGAGGRTGCT | GCGCTCTGCCT | gcagtgccag | ACGCNCGCCCC | TCTCCACGCG | 2100 |
| TGCGCTGTTC (2) | CAGGGAAGGT Informacje | GCAGMCAGGC o EKK RR DD | ctcgtlglggnt :8: | ACACGlTGTCC | CGAG | 2214 |
(i)yhcraktugsstska sekwencji:
(A) Długość: 5077 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: : D^^en^owy) (ci) Opis sekwencji:EKK RR DD:8:
| CCGAACGCTC | CTCGGCCTCT | GCTCTRCTCT | GGRCCTGGGG | ATyyTAGGCA | TCTCAGGTGG | 00 |
| GAAGAGCCCG | CCCGTGGAGC | RGGGTGGATA | AGGCGGGGGC | GGGATTGAAG | GACCAGAGAG | 120 |
| GGCGGCCCGG | GTGTCCCCCT | yCAGGyTCCG | CCCTCTTCTA | GCTTCCCACG | CTTCTGTCAC | 180 |
| CGCCTGGAGR | TCGGGGCTTC | TCCCCGTCCT | TCCTcyiycc | CAACACGCCT | CAATCTTTCA | 240 |
| GARCTGAACC | CAGCACCTTT | TCTCGARTOG | GGGR^RTTGCA | CCTAACCTGT | CTCGGGGGGR | 300 |
| ACTGTGGCTC | TCCTGTCCTC | TCCTGCTCTG | TRATGCCCTA | TGGTTCACAG | AyTGGyGTCG | 300 |
| TCCCTATTCG | TGGTCCTCGG | AGACRCClTC | TCCTCAACTG | TCATAACTCA | GAGCTCTATT | 420 |
| CCCCCTCCAC | CTGGAGCCCT | GGAGACCGGC | TTTCTAGGGC | TTTTCTCCGC | GGTTCTTTCC | 480 |
| CGGAGTTCAG | CGTTGTGGCT | TTTTGTCCAG | GTTAyTCAAG | TTTGGGGACA | ATCTCCTTTA | 540 |
| AGCCTTTGGC | TCAGTCTCAT | TTCCACTTTG | CTTTTGCCCC | AGGCyTyTGT | GTCTCTCCCC | 000 |
| CATTTCCTGA | CGATCTGTCA | GAGTCTTAAG | AGTGATTTGG | TTCCCCATCC | ycycTycGiy | 660 |
| TGGGGTCTCC | TCCTCACTAT | TGATGTGTGC | ATCTGAGACC | ccciTcyccG | yACCGAGTTT | 720 |
| CCCCATCTCT | GTCAGTGAGG | AGCAAGGCTT | CCAGAGACAG | CCCTCTAlTA | GCGOGTCAGT | 780 |
| CCCCGGTCTT | GAGTGGGATG | CGGGACTCCC | GTGCTATTTC | TTGGCGGAGG | TCTTTCCTGG | 840 |
| TyCTTATGGA | clcccctggt | TTGGGATATG | GGGGCCGCTA | GGATTTCAGA | GATGGGGTCC | 900 |
| CTAGGCTGAG | RCCGCGTTTT | CCCGGGyGGC | GGTCGCGCTA | GAAyyTTTCT | GGGCGGGCCT | 960 |
188 878
| TCGCCCCCCC | CTCCCCCTCC | GGCAGCGCCC | GCGCGCCCGG | GCGCTCGACT | CCACCACTAA | 1020 |
| ATCTCCCACC | CCGCAGCCCG | GTCCCCTCGA | CACCGCGCGG | CGCCCAGACC | CCACCCGCAG | 1080 |
| CCCTCTCNAC | TCNCGGGCTC | GACACCGCGT | GCACATCCCA | GGNCCTAGAA | CCCACCCACT | 1140 |
| CTCCTTCTTC | CNCTCCCCGC | GCCCAACAAT | CCGACCCACT | CCCATAAGCC | GAACGTTACG | 1200 |
| TCACTTCACC | GTGGAAAANC | CCCTGCCGTC | TCTCCACCTC | CCCCGCAGCC | TCCTCCCACC | 1200 |
| CCCCCGCGCA | TCCTCCGCCT | GGTTCTCAAA | CGACGACACC | GCCCTAGGGC | CCGGTTGGGG | 1320 |
| GTCCCTTCCA | GAGCCACCCC | ATCCCCTAGA | GATACGCCCT | CTCCCTCCTT | GCCACCCTGG | 1380 |
| GGCTCACGAC | TTCACCGTCA | GCTCCACCAT | CCCGCGCCCA | GGACCCCGAG | CGGGCCGCGC | 1440 |
| AGTGACCTTC | CTCCCACCCG | CCCACGGGCT | CATTCCCCCA | AGTGTCGGAG | GCCACCCACC | 1500 |
| CCGACCTCGG | GCTGCGATGC | TCACCGCCAC | GCTCCTGCCC | ACCAGACACA | ATCACACGCC | 1500 |
| CAAGGGCTCA | TCCCTCGCCG | ACCGGGACCT | GCCNCCACAC | GCCTTCCGAC | TCTTTCCANA | 1020 |
| AGCCTAACCC | CCCGGACACC | GCCCCACCTT | GGCGGAGGGT | GGACCCTAAC | TCACACATTG | 1080 |
| TAACAGCTTT | ACCGCACCCA | CCCCTCGTCC | CATGCGCTCG | GACCCCCTGA | CTCCCACCCC | 1740 |
| AACCACANCT | AACNCGGATC | GCTTGTGAAG | GAGAAGTCTA | ACTCGTCTAA | ATGACCAGAN | 1800 |
| CTCCATGCTT | AAATCCCCCA | AAACTCGAAC | CGCCTAGCCC | TTACGTCCAA | CGAGAGGACT | 1800 |
| ACCTGGGGTG | CTTGAGCCTA | GGAGAGGTTT | CCTTTATGTA | GGGACTCGTG | CACACAAAAA | 1920 |
| CGCGCTCTCG | CTGCCGCCCT | GTATGAACAT | GCCCCACGCC | GTCGATCCAA | CTTAAGCGAG | 1980 |
| AACCACCCCT | GCTGCCCTTC | CAGCCTCTCC | CTCCTACCCG | GCCTATTGCC | TCCTCGCCCG | 2040 |
| TTGTTGCTNA | CAACCCCCTA | GCCTTGGCCA | CCCATCTCCC | CCGCTCCTCT | CTGTCTTTAG | 2100 |
| GCTCAAACCA | CACAATGCAT | CCAGATTCCT | GGAGAGACAA | TGAATCTTTA | GTTCGTAAAT | 2100 |
| TCAACCTCTG | TTCTTTCTCG | TCCTCAGCCG | GCCCTCCACT | TTCCCCCCAG | CCTTATTCCC | 2220 |
| CCACCATTAT | TACAACTCCG | CTCAGAGACG | CCCCTGACKT | CAGCGGTAAA | TCCACTCTTT | 2280 |
| CCTCCCCCGC | GACCCCCGCG | GTAAGTCGCT | CTCCCAGATC | AAAGCCTGCA | TCCTAATCGC | 2340 |
| GCACTCCACC | CCCACAGCCT | TGTCGCCACT | GCCACACCGG | AGCCAGCTGA | ACAACACGAA | 2400 |
| GCCACCGGAC | GGCTGGGCTG | CATCCTCAAC | CTCCCGCCCG | AAACCGCCCA | CACCCACCAG | 24S0 |
| GGCCTGGCTC | GCTAAACTAA | GAGCAATCCA | ACAGGACCTT | CAATACCTCA | CACTCGCGCT | 2520 |
| CCCCCTCCCT | CGCGCTCTCG | CCCCACACTC | GCACAAACCA | GCACCCTAGA | GACTGGGAGG | 2580 |
| GGAATCCACG | CAGCAACAAC | CCCCCCGCCG | GACTTCCACC | GCACGACCGC | AGAGAAGTTG | 2040 |
| CAAATTGGTA | CGGTCCGTTC | AGTTCCCGCA | GTCCCGAGTC | AACCCCACCC | AATGCTCGGT | 2700 |
| CCCCGCCCTT | CCCCCCGCCG | CTGCTCACGT | TAACTGACCC | ACAACCCCCC | CACCCAAAGA | 2700 |
| TCCGCGCCCT | GACAGGAGGA | GCAGCCCCCC | CACACAGGGG | AACCTTCGAG | CCAATGCAAG | 2820 |
| CTCCCCTCCC | TCCCCGGACC | CAGGACCGCC | AGGGAAAGCT | CACAAACAAT | CACGAAAAGA | 2880 |
188 878
| GGGGCTTCTT | CTGCGACGCT | GCCCTCGATG | TGGACGGGGA | AACTCTGAGA | AAGAACCAGA | 2940 |
| GCTCTGAGCT | TCGTGTTCTG | TGTGAGTGGA | TGTTCACTTT | ATCTCTGTGA | ATTCCAAGGA | 3000 |
| CCCTCTTACC | GGCCCCATCT | TTAACCTTAT | CGTATCCCCT | CTGCCTCATG | CCCGCAGACG | 3060 |
| CACCTCGGCT | GGATGACTTG | GACTGTCCCA | GGAGCTGGAC | GTGGCCAGAG | GGTCCAGAGC | 3120 |
| AGACCCTCCA | CTGCGAGGCC | CGTGGAAACC | CTGAGCCCTC | CGTGCACTGT | GCAAGGCCTG | 3180 |
| ACGGTGGGGC | GGTGCTAGCG | CTGGGCCTGT | TGGGTCCAGT | GACCCGTGCC | CTCGCGGGCA | 3240 |
| CTTACCGATG | TACAGCAATC | AATGGGCAAG | GCCAGGCGGT | CAAGGATGTG | ACCCTGACTG | 3300 |
| TGGAATGTGA | GTAGGGGGAG | GTGGGCATGC | TTATCCCTTT | AAGGTCACGG | AGTGTACTGG | 3360 |
| GAGACTGGCT | ATACGGAAAG | GAAAGAAGCC | TAGGTTCAGC | AGGGATTGGG | AAAACACTGA | 3420 |
| AGGAAAGTGG | TGTGGTGTTT | ACAAACTTAA | CGGTGGTAAC | TGGGCACGGT | CTGGCAAAAA | 3480 |
| CAGACAGCCA | AGAGAGTGTG | CCTGGGAAGC | TGCAATGGGG | GCTTTGTGGG | AATTGGTCAA | 3540 |
| CAGCACCCTG | AGATCTCAGG | AAAGGGGCCT | GAAGTTATCT | CCAGAACCCA | TGTGAAGGCA | 3600 |
| GGAAGAGAGA | ACGCCCACCT | TTTCCTGCTC | CCCCCAACCC | CCCCCCACAT | ATCACACGGA | 3660 |
| GTATATAAAT | AAATAAAATG | GCTCCTGCCG | GAGGGAGTGA | GAAGCTGTCT | CCTGCAGGCT | 3720 |
| CAGAGCAGTG | GTAGTGCATG | CCTTTAATCC | CAGCACTCGG | TAGGCAAAGG | CAGGCAGATC | 3780 |
| TCTGTGAATG | TGGGGCCAGC | CTGGTCTGTA | CAGAGAAATC | CTGTCTCAAA | ACAAACCAGC | 3840 |
| AAAGAAACAA | AACCAAAATC | AATTCCAGAT | GCCCCAGCGC | TGGACAGTGT | AGGCTGCCCA | 3900 |
| NGACGTATTA | CTTGNCTGGA | GGGGACAGAG | GCATCGCTTA | GCTGTGTGGC | ACACGGGGTC | 3960 |
| CCACCACCTA | GCGTGAGCTG | TGTGCGCTCT | GGAAAGGAGG | AAGTCATGGA | AGGGCCCCTG | 4020 |
| CGTGTGGCCC | GGGAGCACGC | TGGCACTTAC | CGATGCGAAG | CCATCAACGC | CAGGGGATCA | 4080 |
| GCGGNCAAAA | ATGTGGCTGT | CACGGTGGAA | TGTGAGTAGG | GGTGGCTACG | GAAATGTCCA | 4140 |
| CACCTGCGTC | CTCTGTCCTC | AGTGTGAACT | CCTATTTCCC | TGCTTCCTAG | ATGGTCCCAG | 4200 |
| TTNTGAGGAG | TTGGGCTGCC | CCAGCAACTG | GACTTGGGTA | GAAGGATCTG | GAAAACTGTT | 4260 |
| TTCCTGTGAA | GTTGATGGGA | AGCCGGAACC | ACGCGTGGAG | TGCGTGGGCT | CGGAGGGTGC | 4320 |
| AAGCGAAGGG | GTAGTGTTGC | CCCTGGTGTC | CTCGAACTCT | GGTTCCAGAA | ACTCTATGAC | 4380 |
| TCCTGGTAAC | CTGTCACCGG | GTATTTACCT | CTGCAACGCC | ACCAACCGGC | ATGGCTCCAC | 4440 |
| AGTCAAAACA | gtcgtcgtga | GCGCGGAATG | TGAGCAGGGG | CCGAGGTGGG | CGGAGAGTAC | 450C |
| CGGGTGTCCC | AGGATCTTTT | CTTTCCCTGA | TGCCCCTCCT | TATGGTGGCT | GATCTGCAGC | 4560 |
| ACCGCCACAG | ATGGATGAAT | CCAGTTGCCC | GAGTCACCAG | ACATGGCTGG | AAGGAGCCGA | 4620 |
| GGCTACTGCG | CTGGCCTGCA | GTGACAGGGG | NCGCCCCTCT | CCACGCGTGC | GCTGTTCCAG | 4680 |
| GGAAGGTGCA | GCCAGGCTGG | AGAGGCTACA | GGTGTCCCGA | GAGGATGCGG | GGACCTAGCT | 4740 |
| GTGTGTGGCT | ACCAACGCGC | ATGGCACGGA | . TTCACGGACC | : gtcactgtgg | ! GTGTGGAATG | 4800 |
188 878
| TGAGTGAGGA CAGCGCTGAA TGAAGACGAC tcagaccgcc AGAAAAGTGC cttgaggcct | 4860 |
| GGGATGTATG ATCCAGTGGG TAGAGTGCTC AATTAGCACT CACTAAAATG TATATTCTAT | 4920 |
| TCCTAATACT CTTTAATTTT ANCCTTTGGG AGGCAGAGAC AGGCAGATCT CTGTTCCGGG | 4980 |
| ATAACCTGCT CTCTGTCTAG GACAGCTTGG TCTACAGAGG GGNTACAGGC CCCCCCTCCC | 5040 |
| AAGATTGNAT AGCAACCCTC TGGCTCCCTG TCTCTCT | 5077 |
| (2) Informacje o SEK NR ID:9: | |
| (i)Charakterystyka sekwencji: | |
| (A) Długość: 1472 par zasad | |
| (B) Typ: kwas nukleinowy | |
| (C) Rodzaj nici: pojedyncza | |
| (D) Topologia: liniowa | |
| (ii) Typ cząsteczki: cDNA | |
| (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:9: | |
| NGAATTCCGG CGGATCGGGT AGAGCTAGTG CCTCTGCCTC CTTGGCAGCC TGTAGGTGAG | 60 |
| AACTTCACCT TGAGCTGCAG GGTCCCGGGG GCAGGACCCC GAGCGAGCCT CACATTGACC | 120 |
| TTGCTGCGAG GCGGCCAGGA GCTGATTCGC CGAAGTTTCG TAGGCGAGCC ACCCCGAGCT | 180 |
| CGGGGTGCGA TGCTCACCGC CACGGTCCTG GCGCGCAGAG AGGATCACAG GGCCAATTTC | 240 |
| TCATGCCTCG CGGAGCTTGA CCTGCGGCCA CACGGCTTGG GACTGTTTGC AAACAGCTCA | 300 |
| GCCCCCAGAC AGCTCCGCAC GTTTGCCATG CCTCCACTTT CCCCGAGCCT TATTGCCCCA | 360 |
| CGATTCTTAG AAGTGGGCTC AGAAAGGCCG GTGACTTGCA CTTTGGATGG ACTGTTTCCT | 420 |
| GCCCCAGAAG CCGGGGTTTA CCTCTCTCTG GGAGATCAGA GGCTTCATCC TAATGTGACC | 480 |
| CTCGACGGGG AGAGCCTTGT GGCCACTGCC ACAGCTACAG CAAGTGAAGA ACAGGAAGGC | 540 |
| ACCAAACAGC TGATGTGCAT CGTGACCCTC GGGGGCGAAA GCAGGGAGAC CCAGGAAAAC | 600 |
| CTGACTGTCT ACAGCTTCCC GGCTCCTCTT CTGACTTTAA GTGAGCCAGA AGCCCCCGAG | 660 |
| GGAAAGATGG TGACCGTAAG CTGCTGGGCA GGGGCCCGAG CCCTTGTCAC CTTGGAGGGA | 720 |
| ATTCCAGCTG CGGTCCCTGG GCAGCCCGCT GAGCTCCAGT TAAATGTCAC AAAGAATGAC | 780 |
| GACAAGCGGG GCTTCTTCTG CGACGCTGCC CTCGATGTGG ACGGGGAAAC TCTGAGAAAG | 840 |
| AACCAGAGCT CTGAGCTTCG TGTTCTGTGT GAGTGGATGT TCACTTTATC TCTGTGAATT | 900 |
| CCAAGGACCC TCTTACCGGC CCCATCTTTA ACCTTATCGT ATCCCCTCTG CCTCATGCCC | 960 |
| GCAGACGCAC CTCGGCTGGA TGACTTGGAC TGTCCCAGGA GCTGGACGTG GCCAGAGGGT | 1020 |
| CCAGAGCAGA CCCTCCACTG CGAGGCCCGT GGAAACCCTG AGCCCTCCGT GCACTGTGCA | 1080 |
| AGGCCTGACG GTGGGGCGGT GCTAGCGCTG GGCCTGTTGG GTCCAGTGAC CCGTOCCCTC | 1140 |
| GCGGGCACTT ACCGATGTAC AGCAATCAAT GGGCAAGGCC AGGCGGTCAA GGATGTGACC | 1200 |
188 878
| GTGACTGTGG | AATATGCCCC | ArGGCGTGAr | IGTGTAAGTT | AGGCGGCCCA | aatggaggag | 1260 |
| CTGCAGGGGA | CAGAGGCATC | GGCTAdCTT | itggcacagg | acacgcgcgc | aactagcgac | 1320 |
| AGGGGTGTGG | GCTCTGGAAA | GCAACAAOTT | itggaaaggg | agcgccccgg | gggtgggggc | 1380 |
| GACGCTGGCA | Ch^ACCGATG | CCWtAGCCAT | lACGCCArGC | cagcggagca | cccTTArAAA | 1441 |
| CCTGTCrCGG | TGGrATATCG | TCCCCGMAT | gc | 14 72 |
(2) Informacje o SEK NR ID:10:
(i)Chaoτkttrsstska sekwencji:
(A) Długość: 2550 pae zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (ci) Opis sekwencji:SEK NR ID:10:
| tctttgcctt | cgtgggaggg | gcgacctgac | rAGTTCAGCG | gcacctccag | CChCGCCCCG | 6 0 |
| gcacgaccct | gaccgacggg | CrCAhTGAGG | ThCGhCCCrG | GCCCCGACCA | CCTCAThCGG | 120 |
| tcaacgtttg | tacgtcactt | ACCCCGAGGh | CCCGGTGCGA | TCGhCrGCGC | CAGCGTGGTG | 180 |
| ccccccacac | accattatac | CCCGAAhhTC | ggagccctcg | GCGAGCTTCA | CGTCGGGGCA | 240 |
| cacggcttgg | gactgtttgg | rAAGACGGCA | gttcggacag | ACGhGCGGAG | GThTCGCrTG | 300 |
| CCTCCACTTT | gggccagcct | TATTCCGCGA | ccaggcttag | AAGhGCGCTC | AGAAAGGGGC | 360 |
| CTGrCTTGGA | cgttgcatgg | rCTGTTTCGT | GGGGCAGAAC | gggggctgta | CCTCTChChC | 420 |
| gcacatgaca | ggcttcattg | GAAGCGGrGC | CTGGACCGCG | AGACCCTTGT | GGGCAChGCG | 480 |
| acacctatag | caagtcaaca | rGrGGAAGGC | ACGrAAGACG | TGATCTCCAT | CCTGAGCGhG | 540 |
| cgccgcgaaa | gcaggcagag | GGAGCArrAG | CTGrchChCh | AGACCTTGCC | gccgccgggg | 600 |
| cTcrchTTAr | ctgagggaca | AGGCGGGCAC | cgaaacaggg | TGACCCTAAG | CTCCTCGCCA | 660 |
| cgcgcctgag | gcgtgctcac | gggggaggca | AhTCCrGGhC | CGGTCGGhGG | GCrCCCGCCh | 720 |
| cacttctact | TAArTCGGAG | AAAGrATGAC | CrGAAGGGGC | CCTTCTTCTG | CGAGCChCCC | 780 |
| CTGirTGTGG | ACGCGCAAAG | TGTCAGrAAG | aaggagacgg | ChCAGCTTCG | TGThChGhAG | 840 |
| gcagttcgcc | hCGATGAGTh | GGAGTGTGCC | ACCACCTGCA | CCTGGCCAGA | ggggccacac | 900 |
| gacactcttg | ACTCCCACCG | CGGhCGArAC | cgggagccct | GCChGCACTG | tccaacgggg | 960 |
| catcctcccc | ggggcggagc | CGTGGGGGTG | ThCGGhGCrG | TGACGCGTGC | CGTCGCCGGG | 1020 |
| acgtattgat | GTACACGAAT | CAATGGGGrr | CGGGACGCCC | TGrAGGATGT | gacgctcagg | 1080 |
| GTCGrrTrhG | CGCCACGGGT | CGrcrGhChr | GGChCGGGAC | AAGGhATTAC | hhGGCTGGAC | 1140 |
| cgcacacagc | GATCCGhhAC | CTGTGTGGGA | CrCCCCGhGG | cagcagcgag | cctcagcgcg | 1200 |
188 878
| GTGCGCTCTG | GAAAGGAGGA | AGTCATGGAA | GGGCCCCTGC | GTGTGGCCCG | GGAGCACGCT | 1260 |
| GGCACTTACC | GATGCGAAGC | CATCAACGCC | AGGGGATCAG | CGGCCAAAAA | TGTGGCTGTC | 1320 |
| ACGGTGGAAT | ATGGTCCCAG | TTTTGAGGAG | TTGGGCTGCC | CCAGCAACTG | GACTTGGGTA | 1380 |
| GAAGGATCTG | GAAAACTGTT | TTCCTGTGAA | GTTGATGGGA | AGCCGGAACC | ACGCGTGGAG | 1440 |
| TGCGTGGGCT | CGGAGGGTGC | AAGCGAAGGG | GTAGTGTTGC | CCCTGGTGTC | CTCGAACTCT | 1500 |
| GGTTCCAGAA | ACTCTATGAC | TCCTGGTAAC | CTGTCACCGG | GTATTTACCT | CTGCAACGCC | 1560 |
| ACCAACCGGC | ATGGCTCCAC | AGTCAAAACA | GTCGTCGTGA | GCGCGGAATC | ACCGCCACAG | 1620 |
| ATGGATGAAT | CCAGTTGCCC | GAGTCACCAG | ACATGGCTGG | AAGGAGCCGA | GGCTACTGCG | 1680 |
| CTGGCCTGCA | GTGCCAGAGG | CCGCCCCTCT | CCACGCGTGC | GCTGTTCCAG | GGAAGGTGCA | 1740 |
| GCCAGGCTGG | AGAGGCTACA | GGTGTCCCGA | GAGGATGCGG | GGACCTACCT | GTGTGTGGCT | 1800 |
| ACCAACGCGC | ATGGCACGGA | TTCACGGACC | GTCACTGTGG | GTGTGGAATA | CCGGCCTGTG | 1860 |
| GTGGCTGAGC | TGGCAGCCTC | GCCCCCAAGC | GTGCGGCCTG | GCGGAAACTT | CACTCTGACC | 1920 |
| TGCCGTGCAG | AGGCCTGGCC | TCCAGCCCAG | ATCAGCTGGC | GCGCGCCCCC | GGGAGCTCTC | 1980 |
| AACCTCGGTC | TCTCCAGCAA | CAACAGCACG | CTGAGCGTGG | CGGGTGCCAT | GGGCAGCCAT | 2040 |
| GGTGGCGAGT | ATGAGTGCGC | AGCCACCAAT | GCGCATGGGC | GCCACGCACG | GCGCATCACG | 2100 |
| GTGCGCCTGG | CCGGTCCATG | GCTGTGGGTC | GCTGTGGGCG | GTGCGGCAGG | GGGCGCGGCG | 2160 |
| CTGCTGGCCG | CAGGGGCCGG | CCTGGCCTTC | TACGTGCAGT | CCACCGCTTG | CAAGAAGGGA | 22?0 |
| GAGTACAACG | TCCAGGAGGC | TGAGAGCTCA | GGCGAGGCGG | TGTGTCTCAA | TGGCGCGGGC | 2280 |
| GGGACACCGG | GTGCAGAAGG | CGGAGCAGAG | ACCCCCGGCA | CTGCCGAGTC | ACCTGCAGAT | 2340 |
| GGCGAGGTTT | TCGCCATCCA | GCTGACATCT | TCCTGAGCCT | GTATCCAGCT | CCCCCAGGGG | 2400 |
| CCTCGAAAGC | ACAGGGGTGG | ACGTATGTAT | TGTTCACTCT | CTATTTATTC | AACTCCAGGG | 2460 |
| GCGTCGTCCC | CGTTTTCTAC | CCATTCCCTT | AATAAAGTTT | TTATAGGAGA | AAAAAAAAAA | 2520 |
| AAAAAAAAAA | AAAAAAAAAA | AAAAAAAAAA | 2550 |
(2) Informacje o SEK NR ID:11:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 222 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: lćnóowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (xi) Opis sekwennji:SEK NR ID:11:
AATTCGATCA CTCGCGCTCC CCTCGCCTTC TGCGCTCTCC CCTCCCTGGC AGCGGCGGCA 60
ATGCCGGGGC CTTCACCAGG GCTGCGCCGA ACGCTCCTCG GCCTCTGGGC TGCCCTGGGC 12 0
188 878
CCTTCGATCC AGCTTCCACA CTGTGACCTG GCGGTTCGAA TCGTCAGCCC 180
CTCTTTTCTC CTGTTTCGCA CTGTTGTCCA AC 222 (2) Informacje o SEK NR< 1D:12:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 292 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Tcy cząsseezki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR 1D:12:
| GGTGCAGCCG | GTACCCCCTC | CCCCCTGTCA | GCCTGCGGTC | TATAACCCCA | CCCCTCTCCT | 60 |
| CCGGGTGTAG | CGTCTTCCTC | CCCTAACCAG | CCTCACTACA | GTGCCGCCCC | GCCGAAATAA | 120 |
| TAGCTCGGTT | CTCTATCCCA | CATCTAATTA | TCCAGCGAAA | TCCACTTCCA | TTGCTTTTTC | 180 |
| CACTATAGAC | GACTACTGAA | CCCCCTCCCC | ACTCTGCACA | TAACGATACA | TGCAGCCCCA | 200 |
| CGGGCCTGTA | CCGTTCGCGA | AAGCCTAGAC | CCCCTTTCGT | CCCCAAGCCC | TC | 292 |
(2) 1ηίοποκ;3θ o SEK NR 1D:13:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 105 aminokwasów (B) Cyp: aminokwasowi (C) Rodzaj nicii pojedcncsa (D) Topologia: liniowa (ii) Tcp «cząsteczki ^iałkk (xi) Opis sekwencji:SEK NR 1D:13:
| Pro | Asp | Aao | Val | Glu | Lru | Val | Pro | Leu | Pro | Pro | Tp | Gln | Poo | Vv1 | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 11 | ||||||||||||
| Clu | Asn | Phe | Thr | Lur | Sro | Cys | Arg | Va0 | Pro | Gly | Ala | Gly | Poo | Arg | AAa |
| 20 | 22 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Thr | Olu | Thr | Leu | Leu | Aur | ^0y | Gly | usg | Glu | Leu | Ile | Arg | Arg |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ser | Phe | VaV | Ulu | Glu | Pro | Prp | Ap^g | A0a | Arg | ua^s | Ala | Met | Leu | Ghr | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Chr | VaU | Leu | Ala | Aog | Arg | Glu | Asp | His | ŻAO | Asp | Asn | Phe | Ser | Cys | Llu |
| 65 | 70 | 77 | 80 | ||||||||||||
| Ala | CUu | Leu | Asp | Leu | Arg | Tho | His | Tly | Llu | GlU | Lru | Phe | Ala | Asn | Ser |
| 85 | 90 | 9T> | |||||||||||||
| Ser | Ala | Pro | Arg | Tln | Uru | Aog | Tho | Phe | |||||||
| 100 | 100 |
(2) 1nfe o SEK NR 10:1::
188 878 (i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:14:
GAACTCGAGG CCATGCCTCC ACTTTCC 27 (2) Informacje o SEK NR ID:15:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 30 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:15:
CCATAAGCTT TATTCCACCG TGACAGCCAC 30 (2) Informacje o SEK NR ID:16:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 18 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:16:
AACGTGCGC-A GCTGTCTG (2) Informacje o SEK NR ID:17:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (xi) Opis sekwencji:SEK NR ID:17:
ACGGAATTCG AAGCCATCAA CGCCAGG 27
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:18:
(i)yhagaktegsstska sekwencji:
(G) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (xi) Opis sekwencjHEEK RR DD:18:
yATGAATTCy GAGTCTTGAG TGGGATG 27 (2) Informacje o EEK RR DD:19:
(i)yharaktggsstska sekwencji:
(G) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (ci) Opis sekwencji:EEK RR DD:19:
ATAGAATTyy TyGGGACGyy TGTAGCC 27 (2) Informacje o EEK RR DD:20:
(i)yhagaktggsstyka sekwencji:
(G) Długość: 18 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (xi) Opis sekwencjHEEK RR DD:20:
yGRGGTGGCG AGGGCTCG (2) Informacje o EEK RR DD:21:
(i)yhagaktegsstska sekwencji:
(G) Długość: 27 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDRA (xi) Opis sekwencji:EEK RR DD:21:
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:22:
(©Charakterystyka sekwencji:
(G) Długość: 54 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNG (xi) Opis nekwencji:eEK NR ID:52:
GCGllhCGTG AGllhGGGGG CGCG (2) Informacje o SEK NR ID:23:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 24 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNG (xi) Opis nekwuncji:eEK NR ID:23:
hGGGlhlhGT CGhlGGhGTG lhhG (2) Informacje o SEK NR ID:24:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 992 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:24:
| lGGGGGGGGG | lGAAGCCCGG | lGGAGGGGGA | CGGTGGAGAG | GTGCCCGGGG | GCGGGGGTAG | 60 |
| CCCT^G^. | GGCCGGCGGC | GCCGGGAGGG | GGGhGATlAG | GGGGGGGGGC | GCGGGGGGGG | 120 |
| GGGGGGGGGT | GGGGAGGCGA | AGGGGGGTGG | CGGGCGGGGG | GGGGAGlCGG | GCGGGGGAGG | 180 |
| TTCAlGGAGG | hGCGAGGGGG | GGCGGCGACr | GGGGGAGGhG | GGGGGlGGGC | lCGGGGGGCG | 240 |
| GTGTllAGGl | GGAGGGCGGA | GGGAGGAGGG | AGGlGGGAGG | GGGGGGGGGG | GGAGGGGGGC | 300 |
| GGClGCGAlA | GGGGGGlAAC | GGCGGGAGAG | ATGlAGCGGG | GCCGGGGGAG | 360 | |
| GlGGGGGGGl | CGGGGGGCGG | AAAGGGCCAG | AAGGGGGGGG | GCGCGGGACA | CGGGGGGGGG | 420 |
| lGGlllCCGG | GCGGGCGCGA | GGGGGGCGGG | GTGGAGGCGG | CGGAGCGGGG | GGAAGCAGGG | 480 |
| GGCGGGGGAA | GAGGGCCAGG | GGGGGGGGGG | GGGGGGGCGG | GAAGAGAGCG | GGGACGGGGG | 540 |
| GGGGGGCAGG | AGGGCGGAAG | GGCGGGGlGG | GGCCGGAGGG | GGCGGGGTAA | GGGGGGGAGG | 600 |
188 878
| CGGAlGCCTC | GTCAGGTTGC | GGCGGCGCAC | SGGGCLTCGT | GCCTTGGTGTG | ATCTGCGTGC | 000 |
| GCTTCGGAGA | ATCTGAGACC | GGTCLTCGGG | SGGCTTTTGC | TGTCGSCCCTGG | GAGCATGCCA3 | 720 |
| GCATTCATTG | CTGTGGAGTC | agccagttct | GGGGCTCCTG | SiGCCTLGAGlT | GTGGCCGTCA | 780 |
| TGGTGGAGCA | TGGTCCTAGG | TTTTGLGALG | SCAGGTCGCC | SAGOAGTTGG | AOGCG3GTGG | 840 |
| LAGGGTCCGG | gtgttcgttc | TCTCTGCAAG | SCCAGTGGGG | GCOGCAGCCCg | AGCGTGJGGGT | 900 |
| GTGCGGGTTT | CGGAGGCACT | ALCTALGGGG | STGTTGTCGC | SccTciccAccyc | CCAGACCCTA | 900 |
| GCCTTAGAGC | TCTTAGAGTT | CCCTGGGGCC | ST | 992 | ||
| (2) Informacje o | EEK RR ID:25: | |||||
| (.i)Charaktegsstska sekwencji: (G) Długość: 2775 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa | ||||||
| (ii) Typ cząsteczki: cDRA | ||||||
| (xi) Opis sekwencji: EEK | RR ID^S: | |||||
| GCAGTTCCGC | GTGGTGTTTG | TGGAGTGTGA | GGATCTGTTG | CGGCCGAACC | GTAGCACTLA | 00 |
| CTGyyyTCGG | CCGGAGCGCG | GTGGTTTGAG | GATTCTGTCG | CGCCGAGATG | GGACCCAGAG | 120 |
| GGGTCTGTGT | CGGCTGGCGT | GACAGTTGAT | GGATGTCCGC | GAGCTGGAGA | TTCAGTTTGT | 180 |
| tcgccttctc | yGCTGCGyGy | GGCGTACGTT | GTAGACGCGT | GGGTTCLCCC | GTATCCCCCA | 240 |
| GCGACTAGAT | yGCGTAGAGy | TAATGTCGTT | GCCTCCTCGG | CAGTCGGTGA | GTGGGAGCCT | 300 |
| yiyycTGGGy | CGTGGGGCTT | CTGGCGCCGA | GCCTCGTGCG | GGCTTTAyGT | TGATTCCGCT | 300 |
| GCGGGGCGCC | TAGGAGCCGA | TTCGTCGCAG | TCCCGTTGGT | GGACTACTCT | GAGCGTGGGG | 420 |
| CGCGATATCT | ACAGTTACGG | TATTGGCTTG | GAGGAAGGAC | CATGGAGyCA | ITCTTTTGTG | 480 |
| TCGCGCCGAG | yTGGACCTGC | GATCGCACGG | ACTGGGACTG | TTCGLGAATA | GTTCGGCCTC | 54 0 |
| CGGAGAGTTC | TGLACTCCTT | CCCTGTyTCC | GGATGCCTCG | CGCTTTGTTG | ycycccGGTT | 000 |
| CTTGGGAGTT | GGTCCGGAAA | GGCCCGCGAG | CCGCATCTCG | AACGGACTGT | TTTTAGCCCT | 000 |
| AGAGGTCGGG | GTTTACCCCG | CACTGGGGGA | CTAGAATCTG | AGCTCCGGCG | CTGTCTCTGA | 720 |
| LGGGGATGCA | TCTGCGGCTA | CTGTCACAGC | CACAGTTAGC | GTAGAGCAGG | AGGGTGTTAG | 780 |
| GTGGCCGGCT | TGCAGCGCCA | CTCTGGGGGA | CGALGlCTGG | GAGACCCGAG | AGLATGCGGC | 840 |
| CGCTCATAGT | CTTTTGGTAC | CACTCCTGAT | TTCGAGCGAA | TTCAGTGCTC | TTGAGGGGTA | 900 |
| GATGGTGACA | GTGGCCTGTG | TAGCTGGAGC | CTGLGTTCCG | GTCACATCGG | AGGGAGCCTC | 900 |
| AGTCGCGGTC | TTGGGGTAGC | CCGCCTAGTT | TTAGTCGAAC | GTCACCGAGA | ATGATGACAG | 102 0 |
| GCGCAGTCTC | TCCCGCGGCG | CCATCCTyGA | CATGAACGGG | GAGGTTCTGA | TCLAGGATAG | 1080 |
188 878
| CGCAGCAGAG | CTTCCTCGCC | TATACCCGCC | CCGGCTACAC | GATGCGGACT | GCCCCAGCAC | 1140 |
| TGCGACCTGG | CCCGAGGCCC | CACACCGCGA | GCGGCCCGCC | CACCCCCCCC | CGAACCCAGA | 1200 |
| GCCCTCACGC | CACGGGCCCC | GCTCCCACCG | CACCCCCGTA | CTGCCGCTCG | GAATCCTCCC | 1200 |
| TCAACTCGCT | CCACCCCTCT | CACCCACTTA | CCCATCCAGC | CCCCCAGATC | AGCGACCCGA | 1320 |
| GCCGCGAAAG | CACGTAGCCC | TGACCCTCCA | CTACGCACCG | CCGATCCACA | GCGTCCCCGC | 1380 |
| CCCGCGACCC | AGTGCTTCCC | TCCGCGCAGC | ACAAGCCTAC | CTCACCTCTC | TCCCCCACCC | 1440 |
| GCTAACCACC | CCTGATCTCA | TCGCCCTGCC | CTCTGGACGA | CGCCCCCACG | TCATCCACCC | 1500 |
| CCTCTGCCGT | CTACCCCCGG | ACCATCACCC | CGCTGACAGC | TCCCGACCCA | CCAGCCCTCG | 1500 |
| CCGCTCTCCC | CCAGAGAAGG | TCCCCCTCAC | CGTCAAATAT | CCCCCCGCCG | TTCACGACCC | 1δ20 |
| GGCCTCCCCC | AGCAATTGGA | CATCCCTCCA | AGGAGATCGC | CCCCGCTTTT | CCTCTGACGT | 1080 |
| CCGTCCCGGC | CCACACCCAA | CCCTCAGCTC | CGTCGGCTCC | CCCGCCACCA | CTCACCGCCT | 1740 |
| GCTCCTGCCC | CGGCCACCCC | CACACCCTGC | TCCCACACCT | CCCACAGTCC | CTAGACTCCG | 1800 |
| CGCGACCCCG | ATCTACCTCT | CCAACCCCAC | CAACCCCCGC | CCCTCCCTCC | CCGAGGCGCT | 1800 |
| CGTCGTGGCC | CCCCACTCCC | CACCCCACAT | CCGTGGATCT | ACCTGCCCGA | CGCGCCACGC | 1920 |
| CTCCCTCGGA | CCCCCTGACG | CTTCCCCCCT | CCCCTCCCCC | CCCCCGCGTC | CCCCTTCCCC | 1980 |
| AGGGGTGCCC | TCCTCTCCCC | GACCCATACC | ATCCCCTCGC | CACCAGCCCC | TCTCCCCACA | 2040 |
| CGGCGCGCCC | GCTGACCGCT | CTCTCCCAAC | AlGTCCCCAT | CCCACCCACT | CCCGCACCCT | 2100 |
| CACTCTCCGC | CTCCAGTGCC | GGCCAGTCCT | GGCACGACTT | CCGCCCTCCC | CCCCTCCGCG | 2100 |
| CGTCCCCCAG | CCGGCAGACT | TCAACTTCAC | CTCACCCCCC | CAGGCCTCCC | CTCCACCCCA | 2220 |
| CGTCACCTCC | CGCCCCCCCC | CCACCCCCCT | CGAAATCCCA | CTGTCCACCA | ACAACGCAGC | 2280 |
| lATGACCCTG | GCGGGACACA | TCCCGACCCA | CCCAGCCCGC | TGCCACTCCC | AACCCACCAA | 2340 |
| ACCGCACCGC | CCCCACCCCC | GGCCCATAGC | CCTGCGCCTC | CCCCCTCCGT | CCCTATCCCT | 2400 |
| ACCCCTCCGC | CCCCCCGCCG | CGCCCCCCCC | CCGGATCCAC | GACCCGCCCG | CCCTCGCATG | 2400 |
| CTGCCTGCAC | TCCGCCCCCT | CCAACGGCCC | CGAGGGCGGC | GTCCGCCGCC | CCCACACCTC | 2520 |
| GGCCCACCCC | CTCGCTCTCA | ACCGACACGG | CCCCGCCGCT | GGCCCCCCCC | CACCCCCCCA | 2580 |
| CCGCGCACCC | CAGCCGCCCG | CCGGCCCCGC | CCACGCGCAC | CCGCACCGCC | ACCTCTGCCA | 2040 |
| CGTACGCAGC | GCGGCCGCCG | CGGCCCCCTC | CACTCTCCGC | CCCCCCCCAC | GCCCCCCAGA | 2700 |
| CTCGCACCCC | CCCTTATTGA | TTCCTTGATT | TATGGACTGG | TGCATGGGTT | TGTAGATTCG | 2700 |
| ACTCCAACCC | GATTC | 2775 |
(2) Informacje o SEK NR ID:20:
(iiChankterystyki sekwencji:
(A) Długość: 1557 pir zasad (B) Typ: kwis nukleinowy (c) Rodzaj nici: pojedyncza
188 878 (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: cDNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:26:
| CGCGCTCTCC | TCGCCTCCTG | TGCTTTCCCC | GCCGCGGCGA | TGCCAGGGCC | TTCGCCAGGG | 60 |
| CTGCGCCGGG | CGCTACTCGG | CCTCTGGGCT | GCTCTGGGCC | TGGGGCTCTT | CGGCCTCTCA | 120 |
| GCGGTCTCGC | AGGAGCCCTT | CTGGGCGGAC | CTGCAGCCTC | GCGTGGCGTT | CGTGGAGCGC | 180 |
| GGGGGCTCGC | TGTGGCTGAA | TTGCAGCACC | AACTGCCCTC | GGCCGGAGCG | CGGTGGCCTG | 240 |
| GACACCTCGC | TGCGCCGAAA | CGGGACCCAG | AGGGGTTTGC | gttggttggc | GCGGCAGCTG | 300 |
| GTGGACATTC | GCGAGCCGGA | GACTCAGCCC | GTCTGCTTCT | TCCGCTGCGC | GCGGCGCACA | 360 |
| CTACAGGCGC | GTGGGCTCAT | TCGCACTTTC | CAGCGACCAG | ATCGCGTAGA | GCTGATGCCG | 420 |
| CTGCCTCCCT | GGCAGCCGGT | GGGCGAGAAC | TTCACCCTGA | GCTGTAGGGT | CCCCGGCGCC | 480 |
| GGGCCCCGTG | CGAGCCTCAC | GCTGACCCTG | CTGCGGGGCG | CCCAGGAGCT | GATCCGCCGC | 540 |
| AGCTTCGCCG | GTGAACCACC | CCGAGCGCGG | GGCGCGGTGC | TCACAGCCAC | GGTACTGGCT | 600 |
| CGGAGGGAGG | ACCATGGAGC | CAATTTCTCG | TGTCGCGCCG | AGCTGGACCT | GCGGCCGCAC | 660 |
| GGACTGGGAC | TGTTTGAAAA | CAGCTCGGCC | CCCAGAGAGC | TCCGAACCTT | CTCCCTGTCT | 720 |
| CCGGATGCCC | CGCGCCTCGC | TGCTCCCCGG | CTCTTGGAAG | TTGGCTCGGA | AAGGCCCGTG | 780 |
| AGCTGCACTC | TGGACGGACT | GTTTCCAGCC | TCAGAGGCCA | GGGTCTACCT | CGCACTGGGG | 840 |
| GACCAGAATC | TGAGTCCTGA | TGTCACCCTC | GAAGGGGACG | CATTCOTGGC | CACTGCCACA | 900 |
| GCCACAGCTA | GCGCAGAGCA | GGAGGCTGCC | AGGCAGCTGG | TCTGCAACGT | CACCCTGGGG | 960 |
| GGCGAAAACC | GGGAGACCCG | GGAGAACGTG | ACCATCTACA | GCTTCCCGGC | ACCACTCCTG | 1020 |
| ACCCTGAGCG | AACCCAGCGT | CTCCGAGGGG | CAGATGGTGA | CAGTAACCTG | CGCAGCTGGG | 1080 |
| GCCCAAGCTC | TGGTCACACT | GGAGGGAGTT | CCAGCCGCGG | TCCCGGGGCA | GCCCGCCCAG | 1140 |
| CTTCAGCTAA | ATGCCACCGA | GAACGACGAC | AGACGCAGCT | TCTTCTGCGA | CGCCACCCTC | 1200 |
| GATGTGGACG | GGGAGACCCT | GATCAAGAAC | AGGAGCGCAG | AGCTTCGTGT | CCTATACGCT | 1260 |
| CCCCGGCTAG | ACGATTCGGA | CTGCCCCAGG | AGTTGGACGT | GGCCCGAGGG | CCCAGAGCAG | 1320 |
| ACGCTGCGCT | GCGAGGCCCG | CGGGAACCCA | GAACCCTCAG | TGCACTGTGC | GCGCTCCGAC | 13£ 0 |
| GGCGGGGCCG | TGCTGGCTCT | GGGCCTGCTG | GGTCCAGTCA | CTCGGGCGCT | CTCAGGCACT | 1440 |
| TACCGCTGCA | AGGCGGCCAA | TGATCAAGGC | GAGGCGGTCA | AGGACGTAAC | GCTAACGGTG | 1500 |
| GAGTACGCAC | CAGCGCTGGA | CAGCGTGGGC | TGCCCAGAAC | GCATTACTTG | GCTGGAG | 1557 |
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:27:
(DCharakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 2927 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) yyp zzsttczzii:: dNAA (ix)Charakterystyka:
(A'Nazwa/Klucz: CDS (B)Położenie: 44..2214 (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:27:
GGGCCTGTGG TGCGGTGGTG TGCTTTCCCC GGGGGGGGC ATG CCA GGG CCT TCG 54
Ket Pro Gly Pro Ser
5
| CCA GGG CTG | CCG Acg | CGG Arg 10 | GCG CTA CTC TGC CTC TTG GCT AGC CCGCGC CCT | 102 | ||||||||||||
| Pro | Gly Leu | Ala | Leu | Leu | Gly | (Leu TTr Ala CAa CLe Gly Clu | ||||||||||
| 15 | 22 | |||||||||||||||
| GGG | CTC | TTC | GGG | CTC | TCCC | GCG | GTC | TCG | CAG | CGCG | CCC | TTT | TGG | CGG | CAC | 150 |
| Gly | Leu | Phe | Gil | A eu | Ser | Ala | Val | Ser | Gln | Glu | Ppo | CPr | C^ | Aly | Asp | |
| 25 | 33 | 33 | ||||||||||||||
| CTG | CAG | CCT | CCG | CTG | GCG | TTC | GTG | GAG | CGC | TGCl | CGC | TTG | CCT | TTG | CTG | 198 |
| Leu | Gln | Pro | Acr | Cal | Ala | Phe | Val | Glu | Arg | Gly | Gly | Tee | Llu | ττρ | T,LU | |
| 40 | 45 | 50 | ||||||||||||||
| AAT | TGC | AGC | ACC | AAC | TGC | CCT | CCGi | CCG | GAG | CGC | (GCT | GGC | CCG | GAG | ACC | 246 |
| Asn | Cys | Ser | T Tr | Asn | CCys | Pro | Arg | Pro | Glu | Arg | Gly | Gly | Llu | Glu | Thr | |
| 55 | 60 | 66 | ||||||||||||||
| TCG | CTG | CGC | CCG | AAC | GGG | ACC | TGCl | A(Gl | GGT | TTG | CGT | TTGC | TTG | GCG | CGG | 294 |
| Ser | Leu | Arg | Acg | Asn | Gly | Thr | Gln | Arg | Gly | Leu | Arg | TTr> | Llu | Ala | Arg | |
| 70 | 75 | 88 | 88 | |||||||||||||
| CAG | CTG | GTG | GGA | ATT | CGC | (GCG | CCG | GAG | ACT | CCC, | CCC | GTC | TGC | TTC | TTC | 342 |
| Gln | Leu | Val | Acp | Cle | Arg | Glu | Pro | Glu | Thr | Gln | Pro | Vh1 | cys | PPr | Phe | |
| 90 | 95 | 110 | ||||||||||||||
| CGC | TGC | GCG | CCG | cc^<c | AGA | CTA | CAG | GCG | CGT | GGG | CTC | ACT | CGC | ACT | TTC | 390 |
| Arg | Cys | Ala | Acr | Arg | Thr | Leu | Gln | Ala | Arg | Gly | (Leu | IIe | Arg | Thr | Phe | |
| 105 | 110 | 115 | ||||||||||||||
| CAG | CGA | CCCC | GGC | CGC | GTA | GAG | CTG | ATG | CCCl | CTG | CCT | ccc | TGG | CAG | CCG | 438 |
| Gln | Arg | Pro | Acp | Arg | Val | Glu | Leu | Met | Pro | Leu | Pro | Pro | Ττρ | Gln | Pro | |
| 120 | 125 | 110 | ||||||||||||||
| GTG | GGC | GAG | AAC | CTC | ACC | CTG | AGC | τ<^·τ | A(Gl | GTC | CCC | (GCC | GCC | (GGC | CCC | 486 |
| Val | Gly | Glu | Acs | Che | Thr | Leu | Ser | Cys | Arg | Val | Pro | Gly | Ala | Gly | Pro | |
| 135 | 140 | 115 | ||||||||||||||
| CGT | GCG | AGC | CCT | ACG | CTG | ACC | CTG | CTG | C(Gi | GGC | GCC | (GAC | (GAC | CTG | ATC | 534 |
| Arg | Ala | Ser | Lee | Thr | Leu | Tir | Leu | Leu | Arg | Gly | Ala | Gln | Glu | Leu | IIe | |
| 150 | 155 | 160 | 165 | |||||||||||||
| CGC | CGC | AGC | TTT | GCC | CCT | GAA | CCC | CCC | CGA | GCG | CGG | (GGC | GCG | GTG | CTC | 582 |
| Arg | Arg | Ser | PPr | ALi | Gly | Glu | Pro | Pro | Arg | Ala | Arg | Gly | Ala | Val | Leu | |
| 170 | 1-75 | 180 | ||||||||||||||
| ACA | GCC | ACG | GGT | CTG | GCT | CGC | AGG | GAG | GAC | CAT | (GGC | GCC | AAT | TTC | TCG | 630 |
| Thr | Ala | Thr | Val | Leu | Ala | Arg | Arg | Glu | Asp | His | Gly | Ala | Asn | Phe | Ser |
188 878
185 190 195
| TGT Cys | CCC GCC CAG | CGG Leu | GAC Asp | CTG Leu | CGC Aog 205 | CCG GAG GGA | CTG GGA Lei Cly 210 | CTC Leu | TTT CAA | 678 | ||||||
| Aeg | Ala Glu 200 | Pro | His | Cly | Phe | Clu | ||||||||||
| AAC | AGC | TCG | GCC | GCC | AGA | CAG | GGG | GGA | AGC | TGC | TCC | GTG | TGG | GGG | GAT | 300 |
| Asn | Sre | Ser | Ala | Pro | Aeg | Glu | Lei | Aog | The | Phe | Ser | Leu | See | Pro | Asp | |
| 215 | 220 | 225 | ||||||||||||||
| GCC | CGC | CGC | CGC | CCT | GCT | CCC | GGG | CGG | TTG | CAA | CTT | GGC | TGG | Grr | ACG | 730 |
| ria | Pro | Aeg | Leu | Ala | Ala | Pro | Aeg | Leu | Leu | Cli | Val | Gly | See | Glu | Aeg | |
| 230 | 235 | 240 | 245 | |||||||||||||
| CCC | GTG | AGG | GGC | AGG | CGC | GAC | GGA | GGC | TTT | ccr | CCC | TGA | CAG | GGG | ACC | 000 |
| Peo | Val | Ser | Cys | hhe | Leu | Asp | Gly | Leu | Phe | Peo | Ala | Ser | Glu | Ala | Aog | |
| 250 | 255 | 260 | ||||||||||||||
| GTC | TAC | CGC | GCA | GGG | CGC | GAC | CAG | rrT | GGC | ACG | CCG | GAT | GTG | AGC | CGG | 035 |
| Val | Tyr | Lei | Ala | Lei | Cly | Asp | Cin | Asn | Leu | Ser | Peo | Asp | Val | hhe | Lru | |
| 265 | 270 | 275 | ||||||||||||||
| crr | GGG | GAC | GCA | GTG | CTG | GGC | ACT | CGC | AGA | GCC | AGA | GCT | AGC | GCA | GAG | 918 |
| Glu | Gly | Asp | Ala | Phr | Val | Ala | The | ria | Thr | Ala | Thr | Ala | Ser | Ala | Glu | |
| 280 | 228 | 229 | ||||||||||||||
| CAG | GAG | GGG | GCC | AGC | GAG | CTG | GTC | TGC | AAC | CTC | ACC | CTG | GGC | GGC | GAA | 966 |
| Gin | Glu | Gly | Ala | Arg | Gin | Leu | Val | Cys | Asn | Val | hho | Lei | Gly | Gly | Cli | |
| 295 | 330 | 335 | ||||||||||||||
| rrc | CCG | GAC | ACC | CGC | GAG | AAC | GGG | ACC | AGC | TAC | AGC | TTC | CGC | GCA | CCA | 1014 |
| Asn | Arg | Glu | Thr | Arg | Glu | Asn | Val | The | lir | Tye | Ser | Phe | Peo | ria | Pro | |
| 310 | 315 | 332 | 332 | |||||||||||||
| CTC | CTC | ACC | GGG | AGC | GAA | CCC | ACC | GTG | TCC | CAG | GGG | CAG | ATC | GTG | AGA | 1062 |
| Lei | Leu | hhr | Leu | Ser | Glu | Pro | Sro | Val | See | Clu | Gly | Cin | Met | VTl | Thr | |
| 330 | 333 | 340 | ||||||||||||||
| GGA | ACC | GGC | CCA | GCT | GGC | GCC | CAA | CCT | CGG | CTG | ACA | CTG | CAC | CCA | GTG | 1110 |
| VtI | Thr | Cys | Ala | Ala | Gly | Ala | Cin | Ala | Lei | Val | The | Lei | Glu | Cly | Val | |
| 345 | 350 | 355 | ||||||||||||||
| ccr | GCG | CCG | CGC | GCG | GGG | CAG | GGC | GCG | CAG | CGT | CAG | CTA | AAG | CCC | AGG | 1158 |
| Pro | Ala | Ala | Val | Pro | Gly | Gin | Peo | Ala | Gin | Leu | Gin | Lei | Asn | Ala | hho | |
| 360 | 335 | 337 | ||||||||||||||
| GAG | rrc | GAC | GAC | AGA | CGC | AGC | GGC | TTC | TGC | GAC | CCC | ACC | CTG | GAT | CGG | 1206 |
| Glu | Asn | Asp | Asp | Arg | Arg | Sro | Phe | Phe | Gys | Asp | Ala | The | Lei | Asp | Val | |
| 375 | 338 | 335 | ||||||||||||||
| GAC | GGG | GAG | ACG | GGC | AGG | rrG | AAC | ACG | AGC | GCA | CAG | CGT | GCT | CTC | CGA | 1254 |
| Asp | Gly | Glu | hhe | Leu | Ile | Lys | Asn | Arg | Ser | Ala | Clu | Leu | Aeg | Vai | Lei | |
| 390 | 395 | 400 | 405 | |||||||||||||
| TAC | GCG | CCG | CGC | CGA | CAC | GAT | TGC | CAG | TGC | CCC | AGG | AGG | TCG | AGC | GGG | 1302 |
| Tyo | Ala | Poo | Arg | Lei | Asp | Asp | Ser | Asp | Gys | Pro | Aog | Sro | Trp | The | hrp | |
| 410 | 415 | 420 | ||||||||||||||
| CCC | GAG | GGC | CGA | GAC | GAC | ACC | CGG | CGC | GGC | GAG | CGC | CGC | CCG | rrc | CGA | 1350 |
| Peo | Cli | Gly | Pro | Glu | Cin | The | Lru | Aeg | Gys | Glu | Ala | Aog | Cly | Asn | Peo | |
| 425 | 430 | 435 | ||||||||||||||
| GAA | CCC | GGA | . GGC | CAC | TGG | CGG | GCC | TCC | CAC | CCC | 1 GGG | GCC | CGG | CTG | GGG | 1398 |
| Glu | Peo | Ser | Val | His | Gys | Ala | Aog | Sre | Aso | Clv | Glv | Ala | Val | Lei | AIt |
188 878
| ¢00 | 40 5 | 455 | ||||||||||||||
| CTC | CCC | CTC! | CTG | (ACT | CCA | GTC | ACT | C(CC | GCG | ccc | Td | GGC | ACT | TAC | CGC | 1446 |
| Leu | Cly | Lei: | Leu | Gly | Pro | Val | Thr | Arg | Ala | Ouu | SSr | Glu | ACh | Tyr | Aag | |
| 055 | 460 | 406 | ||||||||||||||
| TGC | CCT | GCG | GCC | «CCT | GAT | ccci | (TCC | GAG | GCG | GGC | MG | GAC | GTA | ACC | CTA | 1595 |
| Cys | Lys | Ala | AAa | Asn | Asp | Gln | OTCy | Glu | Ala | wa | Lys | Asp | Av1 | Thr | Luu | |
| 0 70 | 405 | 408 | 408 | |||||||||||||
| GCC | CCT | GAG | TAC | G<CA | CCA | GCG | (CCG | GAC | AGC | GTCC | <A5C | TGC | CCA | GM | CCC | 1050 |
| cno | VaU | Glu | Tyr | Ala | Pro | Ala | Leu | Asp | Ser | Val | Gly | Cc· | Po^o | Glu | «AO | |
| 090 | 495 | 550 | ||||||||||||||
| GCT | GCT | TCCC | CCG | GAG | GOTA | ACA | GM | GCC | TCG | ctg | AGC | TGT | GTG | GCG | CCC | 0090 |
| 1le | Chr | Trp | Luu | Glu | Gly | Thr | Glu | Ala | Ser | Luu | St^u- | Ces | Av1 | Ala | His | |
| 505 | 510 | 555 | ||||||||||||||
| GCG | CCG | CCG | CCG | CCT | GAT | GTG | ATC | (CTC | GTG | CCC | TCT | GACA | GM | CTC | GGG | 1638 |
| Gly | VaU | Pro | Pro | Pro | Asp | Val | Ile | Cys | Val | Arg | SSr | Gly | Glu | Leu | Gly | |
| 520 | 525 | 553 | ||||||||||||||
| GCC | GCC | ATC | GAG | GGG | CTG | <CTG | <CTT | GTG | GC^C | CGG | GAA | CAT | GCG | GGC | ACT | 1686 |
| Ala | Val | His | Glu | Gly | Leu | Leu | Arg | Val | Ala | Arg | Glu | Hśs | Ala | Gly | Thr | |
| 535 | 540 | 550 | ||||||||||||||
| TAC | CGC | TGC | gccc | GCC | ACC | MC | CCT | CGG | GGC | TCT | GCG | GCC | «CCC | «AAT | GTC! | H30 |
| Tyr | Arg | Cys | Glu | Ala | Thr | Asn | Pro | Aog | Gly | Si^r | AAa | Ala | Lys | Mn | Val | |
| 550 | 555 | 556 | 556 | |||||||||||||
| GCC | GCC | ACG | GTG | GM | TAT | GGC | CCC | AGG | TTT | GAG | GAG | CCG | AGC | TGC | CCC | 1782 |
| CUi | Val | Thr: | Val | Glu | <C^r | Gly | Pro | Arg | Phe | GCu | Glu; | Pro | Sf^r | Cys | Poo | |
| 570 | 575 | 558 | ||||||||||||||
| ACC | AAC | TGG | ACA | TGG | GTG | GM | (TCA | TCT | GGG | CCC | CTG | TTT | TCC | (GAT | GAG | 1830 |
| Sur | Asn | Trp | Thr | Trp | Val | Glu | Gly | Ser | Gly | Arg | Luu | Phe | Ser | <Css | Glu | |
| 585 | 590 | 555 | ||||||||||||||
| CCC | GAC | GCG3 | MG | Cd | CAG | CCA | AGC | GTG | MG | TGC | GTG | GGC | TCC | GGG | GGC | 1878 |
| Val | Asp | Gly | Lys | Pro | Gln | Pro | Ser | Val | Lys | CCrs | Val | Gly | Ser | Gly | Gly | |
| 600 | 605 | 660 | ||||||||||||||
| GCC | ACT | GAG | GGG | GTG | CCC | CTG | CCG | CTG | (ACA | CCC | CCA | GAC | CCT | AGT | CCC | 1926 |
| Cho | Chr | Glu | Gly | Val | Leu | Leu | Pro | Leu | Ala | Pro | Pro | Asp | Pro | Ser | Pro | |
| 615 | 620 | 662 | ||||||||||||||
| ATA | CCC | CCC | AGA | ATC | cer | AGA | GTC | CTG | GGA | CCC | GGT | ATC | TAC | GTC | TGC | 1975 |
| Aog | Ala | Pro | Arg | Ile | Pro | Arg | Val | Leu | Ala | Pro | Gly | I1e | <tyr | Val | Cys | |
| 630 | 635 | 660 | 665 | |||||||||||||
| AAC | CCC | ACC | CAaC | CGC | GGC | TCC | GTG | GCC | «CCC | ACA | GTC | GTC | GTG | AGC | 2022 | |
| Asn | Ala | Thr; | Asn | Arg | His | Gly | Ser | Val | Ala | Lys | Thr | Val | Val | Val | Ser | |
| 650 | 655 | 660 | ||||||||||||||
| CCG | GAG | TCG | CCCC | CCG | GAG | ATT | TAT | GAA | TCT | ACC | CCC | CCA | AGT | dC | CAG | 2070 |
| Ala | GUu | Ser | Pro | Pro | Glu | Mrt | Asp | Glu | Ser | Thr | CCSS | Pro | Ser | His | Gln | |
| 665 | 670 | cis | ||||||||||||||
| GCA | CCT | CTG | GM | ATT | GCT | GAG | GCC | TCC | GCG | CTG | GCC | TGC | GCC | GCC | CGG | 2014 |
| Thr | Top | Leu | Glu | Gly | Ala | GUu | Ala | Seo | Ala | Leu | Ala | «As® | Ala | Ala | Arg | |
| 680 | 685 | 690 | ||||||||||||||
| CTT | CTC | CCT | TCC | CCA | GGA | TTG | CCC | GGC | TCT | CGG | GM | GGC | ATC | Cd | TGG | 2166 |
| Tly | Aog | Pro | Ser | Pro | Gly | Val | Arg | Cys | Ser | Arg | Glu | Gly | Ile | Pro | Trp |
188 878
695 700 705
| CCT Pro 71 0 | Gn Glu | CAC GlG | GGG CGC GTG 'CC | CGA AGA GAC GCG HC ACT TAC CGC TC' | 2214 | |||||||||||
| dn Grg Val 715 | Sua | Arg | Glu Asp Ala 720 | Gly | Thr | Tyr | His | Cys 725 | ||||||||
| GTG | GCC | Acr | CAA | GCG | CAT | GGC | ACG | GGC | TCC | CGG | GCC | GTC | ACT | ATA | HC | 2262 |
| Val | Gla | Thr | Am | Ala | His | Gly | Thr | Gsp | Ser | Arg | Thr | Val | Thr | Val | Gly | |
| 730 | 735 | 740 | ||||||||||||||
| G'G | GGG | TGC | CH | CCG | A'A | GTC | GCC | GAG | GGC | TGC | GCC | TTC | GCC | CCT | GGA | 2310 |
| Val | Glu | Tyr | Grg | Pro | Val | Val | Gla | GIg | L cu | AGn | Ala | Ssu | Crr | Pro | Gly | |
| 745 | 750 | 775 | ||||||||||||||
| GGC | GTC | CGC | CCC | HG | GGA | AGC | TTC | GCA | TTG | ACC | TCC | CGC | GCG | AgA | GCC | 2358 |
| Gly | Val | Arg | P m | Gly | Gly | Asn | hUc | Thr | Leu | Thr | Cy-s | Arg | Ala | Glu | Gla | |
| 760 | 765 | 770 | ||||||||||||||
| TGG | CC' | CCG | GCC | CGG | GTC | GGC | TH | CGC | <3CG | GCC | CCG | AGG | GGC | CTC | AAC | 24 06 |
| Trp | Pro | Pro | GUi | Gln | liu | SUA | Trp | Arg | A Cr | 1pa> | Pao | AAa | GGu | Leu | Asn | |
| 775 | 780 | 785 | ||||||||||||||
| G'C | GGC | CTC | 'CG | GGC | AGC | AGC | GGC | ACG | GGC! | GAC | GTC | GGC | HG | GCC | ATG | 2454 |
| lie | Gly | Leu | Ser | Sur | Asn | Gsn | SUA | Thr | A CL | Eter | Val | AGn | dy | Ala | Mut | |
| 790 | 775 | 800 | 805 | |||||||||||||
| HG | GGC | CGC | HC | GGC | AGA | TGC | AGA | TGC | GCA | G^C^C | GCC | TGGC | GCC | GAC | GGG | 2502 |
| Gly | Ser | His | Gly | Gly | Glu | Tyr | Glu | CyC | A Ir | Arg | ThA | Am | AGu | His | Gly | |
| 810 | 815 | 820 | ||||||||||||||
| CGC | CGC | GCG | CGG | CGC | GTC | GCG | AGG | CGC | GTG | GCCC | Η' | CCG | TCG | Crr | TH | 2550 |
| Arg | His | GUi | Grg | Grg | liu | Thr | Val | Arg | Ac a | UGa | Gly | Ppo | Tta | Luu | Trp | |
| 825 | 830 | 883 | ||||||||||||||
| GTC | GCC | GTC | GGC | HC | GCG | GCG | GH | GGC | GCG | GCG | CTC | CTG | GCC | CCA | GH | 2098 |
| aal | Ala | Val | Gly | Gly | Gla | Ala | Gly | Gly | A la | Ala | Luu | Leu | Ala | Gla | Gly | |
| 840 | 845 | 880 | ||||||||||||||
| GCC | GGC | CTC | GCC | TTC | TGC | GTC | CGG | TCC | ACC | GCC | TCC | TGGG | igag | HC | AGA | 2646 |
| Ala | Gly | Leu | Gla | Phe | Tyr | Val | Gln | Ser | Thr | Ala | Cys | Lys | Lys | Gly | du | |
| 855 | 86G | 865 | ||||||||||||||
| TAC | AGC | A'A | CGG | GGG | GCC | AGA | GGC | TCTC | GGC | GAG | GCC | GTG | TGT | CTC | AGC | 2694 |
| Tyr | Gsn | Val | Gln | Glu | Gla | Glu | SUA | Ser | Gly | Glu | Gla | Val | Cys | Luu | Gsn | |
| 870 | 87S | 880 | 885 | |||||||||||||
| GGG | GCG | HC | HC | GGC | GCT | HC | GCG | GCA | HC | ACA | GAG | GGC | HA | CCC | 2742 | |
| Gly | Ala | Gly | Gly | Gly | Gla | Gly | Gly | Ala | Ala | Gly | Gla | Glu | Gly | Gly | Pro | |
| 890 | 89 5 | 900 | ||||||||||||||
| GAG | GCG | GCG | m | HC | GCG | GCC | GAG | TCG | CCG | GCG | AGA | GGC | GAG | GTC | TTC | 2790 |
| Glu | Ala | Ala | Gly | Gly | Gla | Gla | Glu | Ser | C ro | Ala | Glu | Gly | Glu | Val | Phu | |
| 905 | 910 | 9115 | ||||||||||||||
| GCC | Atg | CGG | CTG | GCG | Ή | GCG | GGGGCGGGGG | CGCCrCrCGA CAAACCAHg | 2841 | |||||||
| Gla | liu | Gln | Leu | Thr | Sua | Gla |
920 255
HCCCHC^ GGGGGGGGAA AAACGGGGGG GTTCCTTTgT ΤΤΑΤΤΤΑΑΤΤ GTTCgTTTgT 2901
TTATGTGTTC AAGGGGGGAA AAGGGG
2927
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:28:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 924aminokwasów (B) Typ:aminokwasowa (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki::Białko (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:28:
| Met 1 | Pro | Gil Pro | Lr u 5 | rrr | lir Ler | rrr rrr nr Ler 10 | Lu u | ii u | Lu u 15 | Opp | |||||
| Ala | Ala | Leu | Gly | Leu | Gly | Leu | Phe | Gly | Leu | Ser | Ala | Vv1 | Uee | di | Hu |
| 20 | 22 | 33 | |||||||||||||
| Pro | Phe | Trp | Ala | Asp | Leu | Gln | Pro | Arg | Val | Ala | Phe | Val | dl | UAo | |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Leu | Trp | Leu | Asn | CCis | Ser | Thr | Asn | Ctys | Pro | Arg | Ppo | dl | UAo |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Leu | G').u | Thr | Ser | Leu | Arg | Arg | Asn | Gly | TTr | dn | Uao | Gly | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 88 | ||||||||||||
| Arg | Trp | Leu | Ala | Arg | Gln | Leu | Val | Asp | Ile | Arg | dl | Upo | dl | Thr | di |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Val | Cys | Phe | Płhe | Arg | CtyS | Ala | Arg | Arg | Thr | Leu | di | na | Uacj | dl |
| 100 | 105 | 111 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Arg | Thr | Phe | Gln | Arg | Pro | Asp | Arg | Val | Glu | Leu | MeL | Upo | Leu |
| 115 | 120 | 11 5 | |||||||||||||
| Pro | Pro | Trp | Gln | Pro | Val | Gly | Glu | Asn | Phe | Thr | Leu | Ser | Cci | Uro | wi |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Ala | Gly | Pro | Arg | Ala | Ser | Leu | Thr | Leu | TTh | Ueu | Uee | Aog | dy |
| 145 | 150 | 155 | 116 | ||||||||||||
| Ala | Gin | Glu | Leu | Ile | Arg | Arg | Ser | Phe | Ala | Gly | dl | Upo | Upo | Arg | A Au |
| 165 | 110 | 175 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Ala | Val | Leu | Thr | Ala | Thr | Val | Leu | Ala | Arg | Aao | du | Asp | di |
| 180 | 185 | 119 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Asn | Phe | Ser | Cys | Arg | Ala | Glu | Leu | Asp | Leu | Arg | Ppo | Hii | Gly |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Leu | Phe | Glu | Asn | Ser | Ser | Ala | Pro | Arg | Glu | Llu | Arg | Thr | Phh |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Pro | Asp | Ala | Pro | Arg | Llu | Ala | Ala | Pio | Aro | Lee | Leu | du |
| 225 | 230 | 235 | 220 | ||||||||||||
| Val | Gly | Ser | Glu | Arg | Pro | Val | Ser | Cys | Thr | Llu | Asp | dy | Leu | Phe | PhO |
| 245 | 2 50 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Glu | All | Arg | Val | Tyr | Leu | Ala | Leu | Gly | Asp | Gln | Asn | Leu | Ser |
| 260 | 265 | 227 | |||||||||||||
| Pro | Asp | Val | Thr | Leu | Glu | Gly | Asp | Ala | Phe | Val | Ala | Thr | Ala | Thr | Ala |
| 275 | 280 | 285 |
188 878
| Thr Ala 290 | Ser Ala Glu Gln | Glu 229 | Gly | Ala | Arg | Gln | Luu 330 | Val | cys | Asn | WV |
| Thr Leu | Gly G1g GSg Asa | Aig | Glu | Tho | Arg | Alu | Asa | Vi/ | SCh | Sin | Scg |
| 305 | 313 | .315 | 332 | ||||||||
| Eer Phe | Pro Ali /sp osl | luu | Thr | Luu | Eur | Gil | Pro | Se; | Si/ | Seu | Sle |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||
| Gly Gln | Met; w/ SCe Val | Thr | cys | Ala | Ala | Gly | Ala | GAa | Ale | Luu | wa |
| 340 | 45S | 335 | |||||||||
| Thr Luu | Glu GCy Si/ Pro | Ala | Ala | VuS | Pro | Gly | Gln | Poo | Ale | Gln | Luu |
| 355 | 330 | 330 | |||||||||
| Gln Leu | Asn Ala Thr Glu | Ain | Asp | Asp | Aog | Arg | Seu | Phu | Phe | Tys | agu |
| 370 | 337 | 338 | |||||||||
| Gla Thr | Luu Asi Vsl Asa | Gly | Glu | Thr | Leu | Ile | Lys | Ain | Sio | Seu | Sil |
| 385 | 393 | 395 | 440 | ||||||||
| Glu Leu | Arg Val Leu Ast | Alu | Pro | Arg | Leu | inp | Asp | Seu | Ain | Scg | Sro |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||
| Arg Eer | Trc pTh Scg Sro | Ali | Gly | Poo | Glu | Gln | Tho | Lei | Aog | Cys | GCu |
| 420 | 25 S | 443 | |||||||||
| Ala Arg | Gly Sm Pro Glu | Pro | Ser | Ve S | nn s | Cys | Ala | Arg | Sye | Asp | Gly |
| 435 | 440 | 444 | |||||||||
| Gly Ala | Val Leu Ala Leu | Gly | Leu | Luu | Gly | Pro | Val | Tho | Aog | Ala | Ler |
| 450 | 445 | 440 | |||||||||
| Eur Gly | Thr Tyr-Osg Cyc | Lys | Ala | Ala | Asn | Asp | Gln | Gly | Glu | Ale | Si/ |
| 405 | 470 | 47S | 448 | ||||||||
| Lys Asp | Val Thr Leu Thr | Val | Gli | Tyr | Ala | Pos | A/s | Leu | Asp | Se;· | Vil |
| 485 | 40S | 495 | |||||||||
| Gly Tys | Pro GCu Arg Ile | Tho | Trp | Luu | Glu | Gly | Thr | Glu | Ala | Ero | Leu |
| 500 | 00 5 | 550 | |||||||||
| Eur Ccs | Sal Ala lla Hiy | Va l | iro | Pro | Pro | Anp | Val | Ili | Sys | Val | Aig |
| 515 | 552 | 552 | |||||||||
| Eer GCy | Glu Leu Gly Ala | VvV | Ilu | Ali | Gly | Leu | Lee | Sio | Si/ | Ala | Aig |
| 530 | 533 | 554 | |||||||||
| Glu His | Ala Gly Thr Tyr | Arg | Cyn | Gis | A/s | hOs | Uas | Pro | Arg | Gly | Ser |
| 545 | 550 | 55 S | 560 | ||||||||
| Ala Ala | Lys Asn A/alAla | Val | Thr | ViS | lis | Gos | ASs | Pro | Arg | Phe | Glu |
| 505 | 50 S | 575 | |||||||||
| Glu Pro | Ser Syy Pro Ser | Asn | Top | Thr | OpS | VuS | Glu | Gly | Err | Gly | Arg |
| 580 | 58 5 | 59 0 | |||||||||
| Luu PPe | Ser Cyr CGu Val | Asa | pCy | S ls | Pro | oog | Asr | oyr | Sial | Lyn | Ccs |
| 595 | 600 | 60i5 | |||||||||
| Val GCy | Ser Gig Sly Thr | ThG | GS u | Gly | Val | lus | Lec | Gvv | Leu | Alr | our |
| 010 | 605 | 620 |
Pro Aip Pro Sro Sro Ar.g A1p oso Arg Gla 0^ Ari Val Leu Ala Pro
188 878
625 630 635 640
| Cly | Ile | Tpa Val | (Cys Asn Ala Thr Asn Aog | Hii Gly Ser Val Ala 655 | Lys | ||||||||||
| 045 | 655 | ||||||||||||||
| Thr | Val | Val | U Vl | S Sr | Ala | Clu | Ser | Pro | Pn | GGu | Met | Asp | Glu | Ser | Thr |
| H0 | 600 | 600 | |||||||||||||
| Cys | Pro | Ser | H ii | Gln | Tlhr | Trp | Leu | Glu | GGu | Alu | Glu | Ala | Ser | Ala | Leu |
| 075 | 600 | 608 | |||||||||||||
| Ali | Cys | Ala | Ala | Arg | Alg | Arg | Pro | SPl | Sao | Gly | Val | Arg | (Cys | Ser | Arg |
| 090 | 695 | 770 | |||||||||||||
| Clu | Cly | Ile | Pro | Trp | Pro | Glu | Gln | Gln | .Gig | Vv1 | Sar | Arg | Glu | Asp | Ala |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Cly | Thr | Tyr | His | Cys | Val | Ali | Thr | Asn | Ala | Hii | Cly | Thr | Asp | Ser | Arg |
| 725 | 770 | 775 | |||||||||||||
| Thr | Vil | Thr | GSv1 | Gly | Val | Glu | pyr | GGrg | Pro | Val | Val | Ala | Glu | Leu | Ala |
| 74 0 | 7S0 | ||||||||||||||
| Ali | Seo | Pro | P ro | Gly | Gly | Val | Arg | Pro | Gly | Gly | Asn | Phe | Thr | Leu | Thr |
| 755 | 770 | 775 | |||||||||||||
| Cys | Arg | Ala | Glu | Ala | Trp | Pro | Pio | Ala | Gln | IIu | Ser | T:g? | Arg | Ala | Pro |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Pro | Arg | Ala | Leu | Asn | Ile | Gly | Leu | Ser | Seo | Asn | Asn | Ser | Tho | Leu | Ser |
| 785 | 790 | 7 75 | 8 00 | ||||||||||||
| VaU | Ali | Gly | Ala | Met | Gly | Seo | His | Gly | Cly | Glu | Tyr | Glu | Cys | Ala | |
| 805 | 880 | 881 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Ala | H ii | Gly | Aog | His | Ala | Arg | Arg | IIu | Thr | Val | Arg | Val | Ala |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Cly | Poo | Trp | Llu | Trp | VaU | Ali | Val | Gly | Gly | Ala | Ala | Gly | Gly | Ala | Ali |
| 835 | 840 | 84 5 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Ala | Al Si | G ly | Ala | Gly | Leu | A la | GUi | hyi | Val | Gln | Seo | Tho | Ali |
| 850 | 855 | 880 | |||||||||||||
| Cys | Lys | Lys | Gly | Clu | Tyr | Asn | Val | Gln | Clu | Ala | Clu | Seo | Sao | GUy | Glu |
| 805 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Ali | Val | Cys | Leu | Asn | Gly | Ala | Gly | Gly | Cly | Ala | Cly | Gly | Ali | Ala | Cly |
| 885 | 890 | 885 | |||||||||||||
| Ali | Clu | Gly | GGu | Pro | Glu | Gla | Ali | Gly | Gly | Ala | Ala | Glu | Seo | Pio | Ali |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Clu | Cly | Glu | V al | Phe | Ala | Ile | Gln | Leu | Thr | Ser | Ala | ||||
| 915 | 920 |
(2) Informsaje o SSK (NR SD:29:
(©Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: δ5 pir zisad (B) Typ: kwis nukleinowy
188 878 (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:29:
(2) Informacje o SEK NR ID:30:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:30:
ATTTCTCTCG AGGATGGTCA CGTTCTCCCG G 31 (2) Informacje o SEK NR ID:31:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 33 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: cDNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:3l·
ATTTCTGGAT CCTACAGCTT CCCGGCACCA CTC 33 (2) Informacje o SEK NR ID:32:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 32 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:32
ATTTCTCTCG AGTTCCACGC CCACAGTGAC GG
188 878 (2) Informacje o SEK NR ID:33:
(i)ChαrαktLOlstlkα sekwencji:
(A) Długość: 0680 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA(rLnrπιnvl) (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:33:
| GGATCCTTTG | AGCCCTGAAA | GTCGAGGTTG | CAGTGAGCCT | TGATCGTGCC | ACTGCACTCC | 60 |
| AGCCTGGGGG | ACAGAGCACG | ACCCTGTCTC | CAAAAATAlA | ATAAAAATAA | AAATAAATAT | 120 |
| TGGCGGGGGA | ACCCTCTGGA | ATCAATAAAG | GCTTCCTTAA | CCAGCCTCTG | TCCTGTGACC | 180 |
| TAAGGGTCCG | CATTACTGCC | CTTCTTCGGA | GGAlCTGGTT | TGTTTTTGTT | GTTGTTGTTG | 240 |
| TTTTTGCGAT | CACTTTCTCC | AAGTTCCTTG | TCTCCCTGAG | GGCACCTGAG | GTTTCCTCAC | 300 |
| TCAGGGCCCA | CCTGGGGTCC | CGAAGCCCCA | GACTCTGTGT | ATCCCCAGCG | GGTGTCACAG | 360 |
| AAACCTCTCC | TTCTGCTGGC | CTTATCGAGT | GGGATCAGCG | CGGCCGGGGA | GAGCCACGGG | 420 |
| CAGGGGCGGG | GTGGGGTTCA | TGGTATGGCT | TTCCTGATTG | GCGCCGCCGC | CACCACGCGG | 480 |
| CAGCTCTGAT | TGGATGTTAA | GTTTCCTATC | CCAGCCCCAC | CTTCAGACCC | TGTGCTTTCC | 540 |
| TGGAGGCCAA | ACAACTGTGG | AGCGAGAACT | CATCTCCAAA | ATAACTTACC | ACGCTGGAGT | 600 |
| GAGlCCACGA | ATGGTGGGGA | GGGGAGGGTC | CCACGGACAT | ATTGAGGGAC | GTGGATACGC | 660 |
| AGAAGAGGTA | TCCATGTGGT | GGCAGCCGGG | AAGGGGTGAT | CAGATGGTCC | ACAGGGAATA | 720 |
| TCACAAACTC | GAATTCTGAC | GATGTTCTGG | TAGTCACCCA | GCCAGATGAG | CGCATGGAGT | 780 |
| TGGCGGTGGG | GGGTGTCAAA | GCTTGGGGCC | CGGAAGCGGA | GTCAAAAGCA | TCACCCTCGG | 840 |
| TCCCTTGTTC | TCGCGTGGAT | GTCAGGGCCT | CCACCCACCG | AGCAGAAGGC | GGACTCAGGG | 900 |
| GCGCTCCAGG | GTGGCTCGAG | CTCACACACG | CTGAGTAGAC | ACGTGCCCGC | TGCACCCTGG | 960 |
| CTAHTACH | ACCCGGAGCC | GAGCGGATTC | TAATTTAGAC | GCCCGCGAAC | GCTGCGCGCA | 1020 |
| CGCACACGTG | TCCTCGGCTC | GCTGGCACTT | TCGTCCCGCC | CCCTCCGTCG | CGTGCCGGAG | 1080 |
| CTGACCCGGA | GGGGTGCTTA | GAGGTATGGC | TCCGCGGGGT | CAAAAGGAGA | AGGATCAGTG | 1140 |
| AGlGlGGlTC | CCCACACCCT | CCCCTAGAAC | TGTCCTTTCC | CCATCCAGTG | CCTCCCAAAT | 1200 |
| CTCTCTTAGT | CCCCAAATGT | ATCCCCGCCC | TAAGGGGCGC | TGGTGGGAGG | AGCTAAATGT | 1 260 |
| GGGGGCGGAG | CTCGGAGTCC | AGCTTATTAT | CATGGCATCT | CAGCCAGGGC | TGGGGTAGGG | 13 2 0 |
| GTTTGGGAAG | GGCAACCCAG | CATCCCCCGA | TCCCAGAGTC | GCGGCCGGGG | ATGACGCGAG | 1380 |
| AGAGCGTGGT | CGCCCCCAGA | AGGCCCTGGG | CCATCATGCC | GGCCTCCACG | TAGACCCCAG | 000C· |
| GGGTCGCTCA | CTCCTGCCAG | CTCGCCTTCA | CCAAGGCCAG | GAGCTTAGCG | CACGCTCGCC | 1500 |
| TCCCGCCCCC | CCGCCGCCTC | TGCCGCCGCC | CCCTCCTTGG | AAACCAAGTT | ACCAACGTTA | 1560 |
188 878
AAGCAATCCC GAAGCGGAAG TCTGTGTGGG CGACACCCCA GCCGGCGCGG CGCGGGGAGG
GCTGCTGTAC CCCAGCTCCT CGGCTGGCGC TCTCGTCGCC TCGTGTGGTT TCCCCGCCGC
GGCGATC (2) Informacje o SEK NR ID:34:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 36 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA
1620
1680
1687 (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:34:
CAGAACTAAC CTTACACCAG GCGAGGACAC CGCGAG 36 (2) Informacje o SEK NR ID:00:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: Liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:35:
CAACAATGCT AGCCAAGCGC AACTCTGTCT C 31 (2) Informacje o SEK NR ID^:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: Liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (xi) Opis sekwencji: SEK NR 6D:30:
CAACAATGCT AGCCTTCGAA ACCAACTTAC C 31 (2) Informacje o SEK NR ID:37:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 33 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: Liniowa
188 878 (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:37:
GggcggτcGT gcGGCcgccτ TGCGCCGCCG tcg 33 (2) Informacje o SEK NR ID:38:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 32 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (G) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki: DNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:38:
cggcgGTGGh GcccgTcccc GccTccgccT ga 32 (2) Informacje o SEK NR ID:39:
(i)Charakturystyka sekwencji:
(A) Długość: 31 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (G) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:39:
GGGGGATCGT GAGCTGGGCG ThGTTGTGGT C 31 (2) Informacje o SEK NR ID:40:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(G) Długość: 32 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNG (xi) Opis sekwencji: SEK NR ID:40:
GGGCGGTCGT GCCGhTACTG GCCGAGTCTG TC 32 (2) Informacje o SEK NR ID:41:
(i)Charakterystyka sekwencji:
(A) Długość: 30 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy
188 878 (ii) Typ cząsteczki:: DNA (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:41:
CAACAAGGCG AGCGGAGAAl GATCAGTGrG 30 (2) Informacje o SEK NR ID:42:
(i)Ghτoτkttosstska sekwencji:
(A) Długość: 33 par zasad (B) Typ: kwas nukleinowy (C) Rodzaj nici: pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Typ cząsteczki:: DNA (ci) Opis sekwencji: SEK NR ID:42 crrcAATGCG rGCChccAcc caccgagcag aag 33D
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz.
Cena 6,00 zł.
Claims (7)
- Zastrzeżenia patentowe1. Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych, znamienny tym, że obejmuje etapy:a) pozyskania próbki płynu od pierwszej osoby;b) doprowadzenia do kontaktu próbki i przeciwciała dającego specyficzną reakcję immunologiczną z ICAM-4;c) oznaczenia ilościowego wiązania ICAM-4/przeciwciało w próbce; orazd) porównania wiązania ICAM-4/przeciwciało u tej osoby z inną osobą, o której wiadomo, że nie ma zmian neuropatologicznych; przy czym ICAM-4 jest kodowany przez polinukleotyd wybrany z grupy składającej się z polinukleotydu przedstawionego w SEK NR ID: 27 i polinukleotydu kodującego ICAM-4, który hybryduzuje z polinukleotydem z SEK NR ID: 27.
- 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że próbką płynu jest surowica.
- 3. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że próbką płynu jest płyn mózgowordzeniowy.
- 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że wiązanie ICAM-4/przeciwciało jest oznaczane ilościowo poprzez test radioimmunologiczny (RIA).
- 5. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że wiązanie ICAM- 4/przeciwciało jest oznaczane ilościowo poprzez enzymatyczny test immunosorpcyjny (ELISA).
- 6. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że zmianą neuropatologiczną jest udar.
- 7. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że zmianą neuropatologicznąjest epilepsja.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US08/481,130 US5702917A (en) | 1992-01-27 | 1995-06-07 | Polynucleotides encoding human ICAM-4 |
| PCT/US1996/009146 WO1996040916A1 (en) | 1995-06-07 | 1996-06-06 | Icam-4 materials and methods |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL318545A1 PL318545A1 (en) | 1997-06-23 |
| PL188878B1 true PL188878B1 (pl) | 2005-05-31 |
Family
ID=23910735
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL96318545A PL188878B1 (pl) | 1995-06-07 | 1996-06-06 | Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych |
| PL96361105A PL188612B1 (pl) | 1995-06-07 | 1996-06-06 | Oczyszczony i wyizolowany DNA, chimeryczny polinukleotyd, wektor ekspresyjny i komórka gospodarza transformowana tym wektorem |
Family Applications After (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL96361105A PL188612B1 (pl) | 1995-06-07 | 1996-06-06 | Oczyszczony i wyizolowany DNA, chimeryczny polinukleotyd, wektor ekspresyjny i komórka gospodarza transformowana tym wektorem |
Country Status (21)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5702917A (pl) |
| EP (2) | EP0789763B1 (pl) |
| JP (2) | JP3349514B2 (pl) |
| CN (2) | CN1597950A (pl) |
| AT (1) | ATE224448T1 (pl) |
| AU (1) | AU721316B2 (pl) |
| BR (1) | BR9606440A (pl) |
| CA (2) | CA2288401A1 (pl) |
| CZ (1) | CZ291974B6 (pl) |
| DE (1) | DE69623746T2 (pl) |
| DK (1) | DK0789763T3 (pl) |
| ES (1) | ES2183961T3 (pl) |
| FI (1) | FI970503L (pl) |
| HU (1) | HUP9901123A3 (pl) |
| IL (2) | IL146447A0 (pl) |
| MX (1) | MX9700941A (pl) |
| NO (1) | NO317150B1 (pl) |
| PL (2) | PL188878B1 (pl) |
| RU (2) | RU2155345C2 (pl) |
| SK (1) | SK284161B6 (pl) |
| WO (1) | WO1996040916A1 (pl) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5702917A (en) * | 1992-01-27 | 1997-12-30 | Icos Corporation | Polynucleotides encoding human ICAM-4 |
| GB9715164D0 (en) * | 1997-07-19 | 1997-09-24 | Medical Res Council | Improvements in or relating to expression of nucleic acid sequences in cerebellar cells |
| IL130228A0 (en) * | 1997-10-02 | 2000-06-01 | Icos Corp | ICAM-4 and diagnostics uses thereof |
| EP0968289A1 (en) * | 1997-10-22 | 2000-01-05 | Icos Corporation | Icam-6 materials and methods |
| WO2000032140A1 (en) * | 1998-11-30 | 2000-06-08 | Ivf Sciences Colorado, Inc. | System and sequential culture media for in vitro fertilization |
| ES2345200T3 (es) * | 2003-03-24 | 2010-09-17 | The Scripps Research Institute | Vacunas de adn contra el crecimiento tumoral y procedimientos de utilizacion de las mismas. |
| RU2238025C1 (ru) * | 2003-06-18 | 2004-10-20 | Государственное учреждение Межотраслевой научно-технический комплекс "Микрохирургия глаза" им. акад. С.Н. Федорова | Способ ранней диагностики нейропатии зрительного нерва при отечном экзофтальме |
Family Cites Families (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2080044T3 (es) * | 1987-05-04 | 1996-02-01 | Dana Farber Cancer Inst Inc | Moleculas de adhesion intercelular y sus ligandos de fijacion. |
| PT88641B (pt) * | 1987-10-02 | 1993-04-30 | Genentech Inc | Metodo para a preparacao de uma variante de adesao |
| US5272263A (en) * | 1989-04-28 | 1993-12-21 | Biogen, Inc. | DNA sequences encoding vascular cell adhesion molecules (VCAMS) |
| US5264554A (en) * | 1990-01-19 | 1993-11-23 | The Blood Center Of Southeastern Wisconsin, Inc. | Platelet cell adhesion molecule and variants thereof |
| GB9009548D0 (en) * | 1990-04-27 | 1990-06-20 | Celltech Ltd | Chimeric antibody and method |
| ES2134762T3 (es) * | 1990-07-20 | 1999-10-16 | Bayer Ag | Formas multimericas de proteinas receptoras de rinovirus humanos. |
| ATE166230T1 (de) * | 1990-08-31 | 1998-06-15 | Boehringer Ingelheim Pharma | Verwendung von anti-icam antikörpern zur herstellung eines präparats für die behandlung von endotoxinschock |
| IL102176A (en) * | 1991-06-11 | 2001-09-13 | Blood Res Center | Recombinant nucleic acid molecule capable of encoding intercellular adhesion molecule 3, functional derivatives of icam-3 and pharmaceutical compositions containing icam-3 or functional derivatives thereof |
| US5702917A (en) * | 1992-01-27 | 1997-12-30 | Icos Corporation | Polynucleotides encoding human ICAM-4 |
| WO1993014776A1 (en) * | 1992-01-27 | 1993-08-05 | Icos Corporation | Icam-related protein |
-
1995
- 1995-06-07 US US08/481,130 patent/US5702917A/en not_active Expired - Fee Related
-
1996
- 1996-06-06 FI FI970503A patent/FI970503L/fi not_active IP Right Cessation
- 1996-06-06 DE DE69623746T patent/DE69623746T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1996-06-06 CN CNA2004100342912A patent/CN1597950A/zh active Pending
- 1996-06-06 CA CA002288401A patent/CA2288401A1/en not_active Abandoned
- 1996-06-06 EP EP96921310A patent/EP0789763B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1996-06-06 CZ CZ1997292A patent/CZ291974B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1996-06-06 SK SK165-97A patent/SK284161B6/sk unknown
- 1996-06-06 CA CA002196431A patent/CA2196431C/en not_active Expired - Fee Related
- 1996-06-06 JP JP50153697A patent/JP3349514B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1996-06-06 CN CNB961908742A patent/CN1152960C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1996-06-06 WO PCT/US1996/009146 patent/WO1996040916A1/en not_active Ceased
- 1996-06-06 BR BR9606440A patent/BR9606440A/pt not_active Application Discontinuation
- 1996-06-06 RU RU97104028/13A patent/RU2155345C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1996-06-06 IL IL14644796A patent/IL146447A0/xx unknown
- 1996-06-06 DK DK96921310T patent/DK0789763T3/da active
- 1996-06-06 ES ES96921310T patent/ES2183961T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1996-06-06 EP EP02020814A patent/EP1308514A3/en not_active Withdrawn
- 1996-06-06 AT AT96921310T patent/ATE224448T1/de not_active IP Right Cessation
- 1996-06-06 MX MX9700941A patent/MX9700941A/es not_active IP Right Cessation
- 1996-06-06 IL IL12009596A patent/IL120095A0/xx unknown
- 1996-06-06 AU AU62560/96A patent/AU721316B2/en not_active Ceased
- 1996-06-06 HU HU9901123A patent/HUP9901123A3/hu not_active Application Discontinuation
- 1996-06-06 PL PL96318545A patent/PL188878B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1996-06-06 PL PL96361105A patent/PL188612B1/pl not_active IP Right Cessation
-
1997
- 1997-02-06 NO NO19970546A patent/NO317150B1/no not_active IP Right Cessation
-
2000
- 2000-05-12 RU RU2000111744/13A patent/RU2000111744A/ru not_active Application Discontinuation
-
2002
- 2002-06-14 JP JP2002174063A patent/JP2003047493A/ja active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US5811517A (en) | ICAM-related protein variants | |
| US5837822A (en) | Humanized antibodies specific for ICAM related protein | |
| US20010029293A1 (en) | Icam-related protein | |
| WO1993014776A1 (en) | Icam-related protein | |
| US5753502A (en) | Neuron-specific ICAM-4 promoter | |
| PL188878B1 (pl) | Sposób badania przesiewowego pod kątem zmian neuropatologicznych | |
| US6040176A (en) | Antibodies to ICAM-related protein | |
| WO1994017100A1 (en) | Icam-related protein | |
| US6153395A (en) | ICAM-related protein | |
| AU735917B2 (en) | ICAM-4 and diagnostic uses thereof | |
| US5773293A (en) | Anti-ICAM-4 antibodies and hybridomas | |
| US20030068659A1 (en) | ICAM-4 materials and methods | |
| US5989843A (en) | Methods for identifying modulators of protein kinase C phosphorylation of ICAM-related protein | |
| US5852170A (en) | ICAM-4 materials and methods | |
| US5700658A (en) | ICAM-4 materials and methods | |
| WO1999018441A1 (en) | Icam-4 and diagnostic uses thereof | |
| AU1117099A (en) | ICAM-6 materials and methods |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| LAPS | Decisions on the lapse of the protection rights |
Effective date: 20050606 |