PL205130B1 - Zastosowanie kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku do obniżenia obciążenia świńskim cirkowirusem typu 2 (PCV-2) w węzłach oskrzelowych i krezkowych świń - Google Patents
Zastosowanie kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku do obniżenia obciążenia świńskim cirkowirusem typu 2 (PCV-2) w węzłach oskrzelowych i krezkowych świńInfo
- Publication number
- PL205130B1 PL205130B1 PL353068A PL35306800A PL205130B1 PL 205130 B1 PL205130 B1 PL 205130B1 PL 353068 A PL353068 A PL 353068A PL 35306800 A PL35306800 A PL 35306800A PL 205130 B1 PL205130 B1 PL 205130B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- pcv
- virus
- seq
- plasmid
- porcine
- Prior art date
Links
- 241001673669 Porcine circovirus 2 Species 0.000 title claims description 297
- 208000009525 Myocarditis Diseases 0.000 title description 35
- 206010056254 Intrauterine infection Diseases 0.000 title description 23
- 230000002265 prevention Effects 0.000 title description 10
- 206010000210 abortion Diseases 0.000 title description 3
- 231100000176 abortion Toxicity 0.000 title description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 167
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 74
- 241000700663 Avipoxvirus Species 0.000 claims abstract description 13
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 169
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 131
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 92
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 92
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 77
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 76
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 claims description 54
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 35
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 33
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 33
- 102100031725 Cortactin-binding protein 2 Human genes 0.000 claims description 25
- 101710197985 Probable protein Rev Proteins 0.000 claims description 25
- 101000818108 Acholeplasma phage L2 Uncharacterized 81.3 kDa protein Proteins 0.000 claims description 23
- 101000912350 Haemophilus phage HP1 (strain HP1c1) DNA N-6-adenine-methyltransferase Proteins 0.000 claims description 23
- 101000790844 Klebsiella pneumoniae Uncharacterized 24.8 kDa protein in cps region Proteins 0.000 claims description 23
- 241000178270 Canarypox virus Species 0.000 claims description 16
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 claims description 15
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 15
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 claims description 14
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 11
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 10
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 9
- 241000701093 Suid alphaherpesvirus 1 Species 0.000 claims description 9
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 9
- 241000700565 Swinepox virus Species 0.000 claims description 6
- XSLXHSYIVPGEER-KZVJFYERSA-N Thr-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O XSLXHSYIVPGEER-KZVJFYERSA-N 0.000 claims description 4
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 claims description 3
- PAPSMOYMQDWIOR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PAPSMOYMQDWIOR-AVGNSLFASA-N 0.000 claims description 2
- CPTXATAOUQJQRO-GUBZILKMSA-N Arg-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CPTXATAOUQJQRO-GUBZILKMSA-N 0.000 claims description 2
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 claims description 2
- 230000001603 reducing effect Effects 0.000 claims description 2
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 claims 2
- CXVGEDCSTKKODG-UHFFFAOYSA-N sulisobenzone Chemical compound C1=C(S(O)(=O)=O)C(OC)=CC(O)=C1C(=O)C1=CC=CC=C1 CXVGEDCSTKKODG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- ABMMIOIRQJNRHG-XKNYDFJKSA-N Asn-Asn-Pro-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ABMMIOIRQJNRHG-XKNYDFJKSA-N 0.000 claims 1
- WXOFKRKAHJQKLT-BQBZGAKWSA-N Cys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CS WXOFKRKAHJQKLT-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims 1
- XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N IDUR Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 claims 1
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims 1
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 claims 1
- SCKXGHWQPPURGT-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SCKXGHWQPPURGT-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims 1
- KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N Phe-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N 0.000 claims 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 claims 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- UQTNIFUCMBFWEJ-IWGUZYHVSA-N Thr-Asn Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O UQTNIFUCMBFWEJ-IWGUZYHVSA-N 0.000 claims 1
- KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N Thr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N 0.000 claims 1
- 230000008569 process Effects 0.000 claims 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 claims 1
- 101150075675 tatC gene Proteins 0.000 claims 1
- 241000202347 Porcine circovirus Species 0.000 abstract description 49
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 abstract description 17
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 abstract description 14
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract description 13
- 230000028993 immune response Effects 0.000 abstract description 12
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 abstract description 11
- 201000010099 disease Diseases 0.000 abstract description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 abstract description 9
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 abstract description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 74
- 108090000623 proteins and genes Chemical group 0.000 description 70
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 60
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 53
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 53
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 48
- 101000833492 Homo sapiens Jouberin Proteins 0.000 description 42
- 101000651236 Homo sapiens NCK-interacting protein with SH3 domain Proteins 0.000 description 42
- 229940023860 canarypox virus HIV vaccine Drugs 0.000 description 42
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 42
- 102100024407 Jouberin Human genes 0.000 description 41
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 41
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 35
- 208000000995 spontaneous abortion Diseases 0.000 description 35
- 241001504982 Pepper cryptic virus 1 Species 0.000 description 34
- 239000000047 product Substances 0.000 description 33
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 33
- 101710159752 Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase subunit PhaE Proteins 0.000 description 30
- 101710130262 Probable Vpr-like protein Proteins 0.000 description 30
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 29
- 206010000234 Abortion spontaneous Diseases 0.000 description 28
- 208000015994 miscarriage Diseases 0.000 description 28
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 28
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 28
- 208000010399 Wasting Syndrome Diseases 0.000 description 27
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 26
- 229920002125 Sokalan® Polymers 0.000 description 26
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 26
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 26
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 26
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 24
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 24
- 241001533384 Circovirus Species 0.000 description 23
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 23
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 22
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 21
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 21
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 21
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 21
- 241000702619 Porcine parvovirus Species 0.000 description 19
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 18
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 17
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 16
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 16
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 15
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 15
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 14
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 14
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 13
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 13
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 13
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 13
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 13
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 13
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 13
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 13
- 208000008771 Lymphadenopathy Diseases 0.000 description 12
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 12
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 12
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 12
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 12
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 12
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 12
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 12
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 11
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 11
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 10
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 10
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 10
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101100382437 Porcine circovirus 2 Cap gene Proteins 0.000 description 9
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 9
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 9
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 9
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 9
- 230000004044 response Effects 0.000 description 9
- -1 supercoiled or not Substances 0.000 description 9
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 9
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 9
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 9
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 9
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 8
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 8
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 8
- 238000011888 autopsy Methods 0.000 description 8
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 8
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 8
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 8
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 8
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 8
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 8
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 8
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 8
- 208000018555 lymphatic system disease Diseases 0.000 description 8
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 8
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 8
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 8
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 8
- 101000748061 Acholeplasma phage L2 Uncharacterized 16.1 kDa protein Proteins 0.000 description 7
- 101000768957 Acholeplasma phage L2 Uncharacterized 37.2 kDa protein Proteins 0.000 description 7
- 101000823746 Acidianus ambivalens Uncharacterized 17.7 kDa protein in bps2 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000916369 Acidianus ambivalens Uncharacterized protein in sor 5'region Proteins 0.000 description 7
- 101000769342 Acinetobacter guillouiae Uncharacterized protein in rpoN-murA intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000823696 Actinobacillus pleuropneumoniae Uncharacterized glycosyltransferase in aroQ 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000786513 Agrobacterium tumefaciens (strain 15955) Uncharacterized protein outside the virF region Proteins 0.000 description 7
- 101000618005 Alkalihalobacillus pseudofirmus (strain ATCC BAA-2126 / JCM 17055 / OF4) Uncharacterized protein BpOF4_00885 Proteins 0.000 description 7
- 102100020724 Ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain-containing protein 1 Human genes 0.000 description 7
- 101000967489 Azorhizobium caulinodans (strain ATCC 43989 / DSM 5975 / JCM 20966 / LMG 6465 / NBRC 14845 / NCIMB 13405 / ORS 571) Uncharacterized protein AZC_3924 Proteins 0.000 description 7
- 101000823761 Bacillus licheniformis Uncharacterized 9.4 kDa protein in flaL 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000819719 Bacillus methanolicus Uncharacterized N-acetyltransferase in lysA 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000789586 Bacillus subtilis (strain 168) UPF0702 transmembrane protein YkjA Proteins 0.000 description 7
- 101000792624 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized protein YbxH Proteins 0.000 description 7
- 101000790792 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized protein YckC Proteins 0.000 description 7
- 101000819705 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized protein YlxR Proteins 0.000 description 7
- 101000948218 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized protein YtxJ Proteins 0.000 description 7
- 101000718627 Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki Putative RNA polymerase sigma-G factor Proteins 0.000 description 7
- 101000641200 Bombyx mori densovirus Putative non-structural protein Proteins 0.000 description 7
- 101000947633 Claviceps purpurea Uncharacterized 13.8 kDa protein Proteins 0.000 description 7
- 101000947615 Clostridium perfringens Uncharacterized 38.4 kDa protein Proteins 0.000 description 7
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 7
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 7
- 101000948901 Enterobacteria phage T4 Uncharacterized 16.0 kDa protein in segB-ipI intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000964391 Enterococcus faecalis UPF0145 protein Proteins 0.000 description 7
- 101000805958 Equine herpesvirus 4 (strain 1942) Virion protein US10 homolog Proteins 0.000 description 7
- 101000790442 Escherichia coli Insertion element IS2 uncharacterized 11.1 kDa protein Proteins 0.000 description 7
- 101000788354 Escherichia phage P2 Uncharacterized 8.2 kDa protein in gpA 5'region Proteins 0.000 description 7
- 101000770304 Frankia alni UPF0460 protein in nifX-nifW intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000797344 Geobacillus stearothermophilus Putative tRNA (cytidine(34)-2'-O)-methyltransferase Proteins 0.000 description 7
- 101000748410 Geobacillus stearothermophilus Uncharacterized protein in fumA 3'region Proteins 0.000 description 7
- 201000005569 Gout Diseases 0.000 description 7
- 101000772675 Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) UPF0438 protein HI_0847 Proteins 0.000 description 7
- 101000631019 Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) Uncharacterized protein HI_0350 Proteins 0.000 description 7
- 101000748063 Haemophilus phage HP1 (strain HP1c1) Uncharacterized 11.1 kDa protein in rep-hol intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000768938 Haemophilus phage HP1 (strain HP1c1) Uncharacterized 8.9 kDa protein in int-C1 intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000785414 Homo sapiens Ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain-containing protein 1 Proteins 0.000 description 7
- 101000782488 Junonia coenia densovirus (isolate pBRJ/1990) Putative non-structural protein NS2 Proteins 0.000 description 7
- 101000790840 Klebsiella pneumoniae Uncharacterized 49.5 kDa protein in cps region Proteins 0.000 description 7
- 101000811523 Klebsiella pneumoniae Uncharacterized 55.8 kDa protein in cps region Proteins 0.000 description 7
- 101000818409 Lactococcus lactis subsp. lactis Uncharacterized HTH-type transcriptional regulator in lacX 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000878851 Leptolyngbya boryana Putative Fe(2+) transport protein A Proteins 0.000 description 7
- 101000758828 Methanosarcina barkeri (strain Fusaro / DSM 804) Uncharacterized protein Mbar_A1602 Proteins 0.000 description 7
- 101001122401 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (isolate United Kingdom/H123990006/2012) Non-structural protein ORF3 Proteins 0.000 description 7
- 101001055788 Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) Pentapeptide repeat protein MfpA Proteins 0.000 description 7
- 101000740670 Orgyia pseudotsugata multicapsid polyhedrosis virus Protein C42 Proteins 0.000 description 7
- 101000769182 Photorhabdus luminescens Uncharacterized protein in pnp 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000961392 Pseudescherichia vulneris Uncharacterized 29.9 kDa protein in crtE 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000731030 Pseudomonas oleovorans Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase 2 Proteins 0.000 description 7
- 101001065485 Pseudomonas putida Probable fatty acid methyltransferase Proteins 0.000 description 7
- 101000711023 Rhizobium leguminosarum bv. trifolii Uncharacterized protein in tfuA 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000948156 Rhodococcus erythropolis Uncharacterized 47.3 kDa protein in thcA 5'region Proteins 0.000 description 7
- 101000917565 Rhodococcus fascians Uncharacterized 33.6 kDa protein in fasciation locus Proteins 0.000 description 7
- 101000790284 Saimiriine herpesvirus 2 (strain 488) Uncharacterized 9.5 kDa protein in DHFR 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000936719 Streptococcus gordonii Accessory Sec system protein Asp3 Proteins 0.000 description 7
- 101000788499 Streptomyces coelicolor Uncharacterized oxidoreductase in mprA 5'region Proteins 0.000 description 7
- 101001102841 Streptomyces griseus Purine nucleoside phosphorylase ORF3 Proteins 0.000 description 7
- 101000708557 Streptomyces lincolnensis Uncharacterized 17.2 kDa protein in melC2-rnhH intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000649826 Thermotoga neapolitana Putative anti-sigma factor antagonist TM1081 homolog Proteins 0.000 description 7
- 101710110895 Uncharacterized 7.3 kDa protein in cox-rep intergenic region Proteins 0.000 description 7
- 101000827562 Vibrio alginolyticus Uncharacterized protein in proC 3'region Proteins 0.000 description 7
- 101000778915 Vibrio parahaemolyticus serotype O3:K6 (strain RIMD 2210633) Uncharacterized membrane protein VP2115 Proteins 0.000 description 7
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 7
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 7
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 7
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 7
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 7
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 7
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 7
- SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxy-5-methylphenyl)ethanamine Chemical compound COC1=CC=C(C)C=C1CCN SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N Acrylic acid Chemical compound OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-N Methacrylic acid Chemical compound CC(=C)C(O)=O CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000188845 Porcine adenovirus Species 0.000 description 6
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 6
- 229960001631 carbomer Drugs 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 6
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 6
- FPYJFEHAWHCUMM-UHFFFAOYSA-N maleic anhydride Chemical compound O=C1OC(=O)C=C1 FPYJFEHAWHCUMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 6
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 6
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 6
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 6
- 101000787133 Acidithiobacillus ferridurans Uncharacterized 12.3 kDa protein in mobL 3'region Proteins 0.000 description 5
- 101100496860 Arabidopsis thaliana COL13 gene Proteins 0.000 description 5
- 101000827603 Bacillus phage SPP1 Uncharacterized 10.2 kDa protein in GP2-GP6 intergenic region Proteins 0.000 description 5
- 206010016852 Foetal damage Diseases 0.000 description 5
- 101000977786 Lymantria dispar multicapsid nuclear polyhedrosis virus Uncharacterized 9.7 kDa protein in PE 3'region Proteins 0.000 description 5
- 101150068419 ORF 1 gene Proteins 0.000 description 5
- 208000005342 Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Diseases 0.000 description 5
- 241001135989 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus Species 0.000 description 5
- 101001113905 Rice tungro bacilliform virus (isolate Philippines) Protein P4 Proteins 0.000 description 5
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 5
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 5
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 230000006870 function Effects 0.000 description 5
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 5
- 229940031551 inactivated vaccine Drugs 0.000 description 5
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 5
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 5
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 5
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 5
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- XDOFQFKRPWOURC-UHFFFAOYSA-N 16-methylheptadecanoic acid Chemical compound CC(C)CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O XDOFQFKRPWOURC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WALUVDCNGPQPOD-UHFFFAOYSA-M 2,3-di(tetradecoxy)propyl-(2-hydroxyethyl)-dimethylazanium;bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCOCC(C[N+](C)(C)CCO)OCCCCCCCCCCCCCC WALUVDCNGPQPOD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 101100328892 Arabidopsis thaliana COL4 gene Proteins 0.000 description 4
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 4
- 101150039990 B13R gene Proteins 0.000 description 4
- 206010008631 Cholera Diseases 0.000 description 4
- 241000710188 Encephalomyocarditis virus Species 0.000 description 4
- 241000709661 Enterovirus Species 0.000 description 4
- 241000700662 Fowlpox virus Species 0.000 description 4
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 4
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101150009852 ORF2 gene Proteins 0.000 description 4
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 4
- 101150071286 SPI-2 gene Proteins 0.000 description 4
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 4
- 101100237842 Xenopus laevis mmp18 gene Proteins 0.000 description 4
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 4
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 4
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 4
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 4
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 4
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 4
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 4
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 4
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 230000000527 lymphocytic effect Effects 0.000 description 4
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 4
- 230000013011 mating Effects 0.000 description 4
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 4
- 201000008383 nephritis Diseases 0.000 description 4
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 4
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 4
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N squalane Chemical compound CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 4
- 229940031626 subunit vaccine Drugs 0.000 description 4
- 201000010740 swine influenza Diseases 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 4
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 4
- 230000005570 vertical transmission Effects 0.000 description 4
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 4
- 241000606748 Actinobacillus pleuropneumoniae Species 0.000 description 3
- 244000068687 Amelanchier alnifolia Species 0.000 description 3
- 235000009027 Amelanchier alnifolia Nutrition 0.000 description 3
- SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N Asp-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 241000588779 Bordetella bronchiseptica Species 0.000 description 3
- 206010007572 Cardiac hypertrophy Diseases 0.000 description 3
- 208000006029 Cardiomegaly Diseases 0.000 description 3
- 241000725585 Chicken anemia virus Species 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 3
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 3
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 3
- 206010013975 Dyspnoeas Diseases 0.000 description 3
- IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N Ethylene oxide Chemical compound C1CO1 IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000000666 Fowlpox Diseases 0.000 description 3
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 3
- 101000746373 Homo sapiens Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Proteins 0.000 description 3
- 206010023126 Jaundice Diseases 0.000 description 3
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 3
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 3
- 241000606856 Pasteurella multocida Species 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 3
- 241000725681 Swine influenza virus Species 0.000 description 3
- 108010008038 Synthetic Vaccines Proteins 0.000 description 3
- 206010046865 Vaccinia virus infection Diseases 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 3
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 3
- VEZXCJBBBCKRPI-UHFFFAOYSA-N beta-propiolactone Chemical compound O=C1CCO1 VEZXCJBBBCKRPI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 3
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 3
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 3
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 3
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 3
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 3
- 244000144980 herd Species 0.000 description 3
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 3
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 3
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 3
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 3
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 3
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 3
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 3
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 3
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 229940124590 live attenuated vaccine Drugs 0.000 description 3
- 229940023012 live-attenuated vaccine Drugs 0.000 description 3
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 3
- 239000007764 o/w emulsion Substances 0.000 description 3
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 3
- 229940051027 pasteurella multocida Drugs 0.000 description 3
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 3
- 229960000380 propiolactone Drugs 0.000 description 3
- 229940124551 recombinant vaccine Drugs 0.000 description 3
- 230000029058 respiratory gaseous exchange Effects 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 3
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- 208000007089 vaccinia Diseases 0.000 description 3
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 3
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 3
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 3
- 208000016261 weight loss Diseases 0.000 description 3
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 3
- JNYAEWCLZODPBN-KVTDHHQDSA-N (2r,3r,4r)-2-[(1r)-1,2-dihydroxyethyl]oxolane-3,4-diol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@@H](O)[C@H]1O JNYAEWCLZODPBN-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RFIMISVNSAUMBU-UHFFFAOYSA-N 2-(hydroxymethyl)-2-(prop-2-enoxymethyl)propane-1,3-diol Chemical compound OCC(CO)(CO)COCC=C RFIMISVNSAUMBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 2
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GHUXAYLZEGLXDA-UHFFFAOYSA-N 8-azido-5-ethyl-6-phenylphenanthridin-5-ium-3-amine;bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N=[N+]=[N-])=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 GHUXAYLZEGLXDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000621943 Acholeplasma phage L2 Probable integrase/recombinase Proteins 0.000 description 2
- 101000818123 Acholeplasma phage L2 Uncharacterized 17.2 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- 101000818089 Acholeplasma phage L2 Uncharacterized 25.6 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- 101000618348 Allochromatium vinosum (strain ATCC 17899 / DSM 180 / NBRC 103801 / NCIMB 10441 / D) Uncharacterized protein Alvin_0065 Proteins 0.000 description 2
- OVVUNXXROOFSIM-SDDRHHMPSA-N Arg-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O OVVUNXXROOFSIM-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 2
- YBIAYFFIVAZXPK-AVGNSLFASA-N Arg-His-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O YBIAYFFIVAZXPK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- KZXPVYVSHUJCEO-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Lys Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KZXPVYVSHUJCEO-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N Arg-Thr-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- QMQZYILAWUOLPV-JYJNAYRXSA-N Arg-Tyr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QMQZYILAWUOLPV-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 2
- HCAUEJAQCXVQQM-ACZMJKKPSA-N Asn-Glu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HCAUEJAQCXVQQM-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- HOBNTSHITVVNBN-ZPFDUUQYSA-N Asp-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N HOBNTSHITVVNBN-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 101000781117 Autographa californica nuclear polyhedrosis virus Uncharacterized 12.4 kDa protein in CTL-LEF2 intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 101000770875 Autographa californica nuclear polyhedrosis virus Uncharacterized 14.2 kDa protein in PK1-LEF1 intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 241000711404 Avian avulavirus 1 Species 0.000 description 2
- NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N Aziridine Chemical compound C1CN1 NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000708323 Azospirillum brasilense Uncharacterized 28.8 kDa protein in nifR3-like 5'region Proteins 0.000 description 2
- 101000770311 Azotobacter chroococcum mcd 1 Uncharacterized 19.8 kDa protein in nifW 5'region Proteins 0.000 description 2
- 101000748761 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized MFS-type transporter YcxA Proteins 0.000 description 2
- 101000765620 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized protein YlxP Proteins 0.000 description 2
- 101000916134 Bacillus subtilis (strain 168) Uncharacterized protein YqxJ Proteins 0.000 description 2
- 101000754349 Bordetella pertussis (strain Tohama I / ATCC BAA-589 / NCTC 13251) UPF0065 protein BP0148 Proteins 0.000 description 2
- 101000827633 Caldicellulosiruptor sp. (strain Rt8B.4) Uncharacterized 23.9 kDa protein in xynA 3'region Proteins 0.000 description 2
- 101000736909 Campylobacter jejuni Probable nucleotidyltransferase Proteins 0.000 description 2
- 101000947628 Claviceps purpurea Uncharacterized 11.8 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- 101000686796 Clostridium perfringens Replication protein Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 2
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 2
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 208000000059 Dyspnea Diseases 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000186810 Erysipelothrix rhusiopathiae Species 0.000 description 2
- 101000788129 Escherichia coli Uncharacterized protein in sul1 3'region Proteins 0.000 description 2
- 101000788370 Escherichia phage P2 Uncharacterized 12.9 kDa protein in GpA 3'region Proteins 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 2
- 208000001951 Fetal Death Diseases 0.000 description 2
- 101000787096 Geobacillus stearothermophilus Uncharacterized protein in gldA 3'region Proteins 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- UQJNXZSSGQIPIQ-FBCQKBJTSA-N Gly-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN UQJNXZSSGQIPIQ-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000818121 Haemophilus phage HP1 (strain HP1c1) Uncharacterized 18.2 kDa protein in rep-hol intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 101000976889 Haemophilus phage HP1 (strain HP1c1) Uncharacterized 19.2 kDa protein in cox-rep intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 101000748060 Haemophilus phage HP1 (strain HP1c1) Uncharacterized 8.3 kDa protein in rep-hol intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 2
- 101000623276 Herpetosiphon aurantiacus Uncharacterized 10.2 kDa protein in HgiBIM 5'region Proteins 0.000 description 2
- 101000623175 Herpetosiphon aurantiacus Uncharacterized 10.2 kDa protein in HgiCIIM 5'region Proteins 0.000 description 2
- 101000626850 Herpetosiphon aurantiacus Uncharacterized 10.2 kDa protein in HgiEIM 5'region Proteins 0.000 description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 2
- AIPUZFXMXAHZKY-QWRGUYRKSA-N His-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O AIPUZFXMXAHZKY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- 206010020565 Hyperaemia Diseases 0.000 description 2
- VQTUBCCKSQIDNK-UHFFFAOYSA-N Isobutene Chemical compound CC(C)=C VQTUBCCKSQIDNK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000827627 Klebsiella pneumoniae Putative low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 101000790842 Klebsiella pneumoniae Uncharacterized 65.4 kDa protein in cps region Proteins 0.000 description 2
- 101000768313 Klebsiella pneumoniae Uncharacterized membrane protein in cps region Proteins 0.000 description 2
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N Lactic Acid Natural products CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 101000804418 Methanothermobacter thermautotrophicus (strain ATCC 29096 / DSM 1053 / JCM 10044 / NBRC 100330 / Delta H) Uncharacterized protein MTH_1463 Proteins 0.000 description 2
- 101001130841 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (isolate United Kingdom/H123990006/2012) Non-structural protein ORF5 Proteins 0.000 description 2
- 241000204045 Mycoplasma hyopneumoniae Species 0.000 description 2
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 description 2
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 description 2
- 101710087110 ORF6 protein Proteins 0.000 description 2
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 description 2
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000781204 Orgyia pseudotsugata multicapsid polyhedrosis virus Uncharacterized 36.6 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- 101000770870 Orgyia pseudotsugata multicapsid polyhedrosis virus Uncharacterized 37.2 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- 238000002944 PCR assay Methods 0.000 description 2
- 239000005662 Paraffin oil Substances 0.000 description 2
- HTKNPQZCMLBOTQ-XVSYOHENSA-N Phe-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O HTKNPQZCMLBOTQ-XVSYOHENSA-N 0.000 description 2
- MWQXFDIQXIXPMS-UNQGMJICSA-N Phe-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O MWQXFDIQXIXPMS-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 description 2
- IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- 102100040307 Protein FAM3B Human genes 0.000 description 2
- 206010037742 Rabies Diseases 0.000 description 2
- 101000974028 Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841) Putative cystathionine beta-lyase Proteins 0.000 description 2
- 101000756519 Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003) Uncharacterized protein RCAP_rcc00048 Proteins 0.000 description 2
- 101000948219 Rhodococcus erythropolis Uncharacterized 11.5 kDa protein in thcD 3'region Proteins 0.000 description 2
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 2
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 2
- 101000936711 Streptococcus gordonii Accessory secretory protein Asp4 Proteins 0.000 description 2
- 101000929863 Streptomyces cinnamonensis Monensin polyketide synthase putative ketoacyl reductase Proteins 0.000 description 2
- 101000788468 Streptomyces coelicolor Uncharacterized protein in mprR 3'region Proteins 0.000 description 2
- 101000845085 Streptomyces violaceoruber Granaticin polyketide synthase putative ketoacyl reductase 1 Proteins 0.000 description 2
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000711771 Thiocystis violacea Uncharacterized 76.5 kDa protein in phbC 3'region Proteins 0.000 description 2
- LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 2
- DIHPMRTXPYMDJZ-KAOXEZKKSA-N Thr-Tyr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N)O DIHPMRTXPYMDJZ-KAOXEZKKSA-N 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 2
- BIJDDZBDSJLWJY-PJODQICGSA-N Trp-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BIJDDZBDSJLWJY-PJODQICGSA-N 0.000 description 2
- WMBFONUKQXGLMU-WDSOQIARSA-N Trp-Leu-Val Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N WMBFONUKQXGLMU-WDSOQIARSA-N 0.000 description 2
- YLHFIMLKNPJRGY-BVSLBCMMSA-N Tyr-Arg-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O YLHFIMLKNPJRGY-BVSLBCMMSA-N 0.000 description 2
- 101710198378 Uncharacterized 10.8 kDa protein in cox-rep intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 101710134973 Uncharacterized 9.7 kDa protein in cox-rep intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 101710095001 Uncharacterized protein in nifU 5'region Proteins 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100534084 Vaccinia virus (strain Copenhagen) B14R gene Proteins 0.000 description 2
- 101100004092 Vaccinia virus (strain Western Reserve) VACWR196 gene Proteins 0.000 description 2
- GVJUTBOZZBTBIG-AVGNSLFASA-N Val-Lys-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N GVJUTBOZZBTBIG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- 101000711318 Vibrio alginolyticus Uncharacterized 11.6 kDa protein in scrR 3'region Proteins 0.000 description 2
- QYKIQEUNHZKYBP-UHFFFAOYSA-N Vinyl ether Chemical compound C=COC=C QYKIQEUNHZKYBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003929 acidic solution Substances 0.000 description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 2
- 229940086737 allyl sucrose Drugs 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 108010059459 arginyl-threonyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N beta-D-galactosamine Natural products NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 2
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 description 2
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 229940028617 conventional vaccine Drugs 0.000 description 2
- GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-M decanoate Chemical compound CCCCCCCCCC([O-])=O GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 2
- 150000002170 ethers Chemical class 0.000 description 2
- 229940052303 ethers for general anesthesia Drugs 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 2
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 2
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 2
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000002008 hemorrhagic effect Effects 0.000 description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 2
- 230000009851 immunogenic response Effects 0.000 description 2
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 2
- 238000012606 in vitro cell culture Methods 0.000 description 2
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 2
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 2
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 2
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 2
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 2
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 2
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-M octanoate Chemical compound CCCCCCCC([O-])=O WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229940049964 oleate Drugs 0.000 description 2
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 230000009984 peri-natal effect Effects 0.000 description 2
- 229940068196 placebo Drugs 0.000 description 2
- 239000000902 placebo Substances 0.000 description 2
- 229920000058 polyacrylate Polymers 0.000 description 2
- 244000144977 poultry Species 0.000 description 2
- 235000013594 poultry meat Nutrition 0.000 description 2
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 2
- 208000009305 pseudorabies Diseases 0.000 description 2
- 238000012770 revaccination Methods 0.000 description 2
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 2
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 2
- 235000017709 saponins Nutrition 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 230000001568 sexual effect Effects 0.000 description 2
- 208000013220 shortness of breath Diseases 0.000 description 2
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 description 2
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 2
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 2
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 2
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 2
- 150000005846 sugar alcohols Polymers 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 2
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 2
- 108010071635 tyrosyl-prolyl-arginine Proteins 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- 229960000834 vinyl ether Drugs 0.000 description 2
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 2
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 2
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 2
- 229960004854 viral vaccine Drugs 0.000 description 2
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 2
- JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N (2r,3r,4s)-2-[(1r)-1,2-dihydroxyethyl]oxolane-3,4-diol Chemical class OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N (2s)-2-amino-3-phenylpropanoic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O.OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N 0.000 description 1
- ULQISTXYYBZJSJ-UHFFFAOYSA-N 12-hydroxyoctadecanoic acid Chemical compound CCCCCCC(O)CCCCCCCCCCC(O)=O ULQISTXYYBZJSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KIHBGTRZFAVZRV-UHFFFAOYSA-N 2-Hydroxyoctadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(O)=O KIHBGTRZFAVZRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UMHYVXGZRGOICM-AUYXYSRISA-N 2-[(z)-octadec-9-enoyl]oxypropyl (z)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC UMHYVXGZRGOICM-AUYXYSRISA-N 0.000 description 1
- MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 0.000 description 1
- 125000000954 2-hydroxyethyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])O[H] 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- LHEJDBBHZGISGW-UHFFFAOYSA-N 5-fluoro-3-(3-oxo-1h-2-benzofuran-1-yl)-1h-pyrimidine-2,4-dione Chemical compound O=C1C(F)=CNC(=O)N1C1C2=CC=CC=C2C(=O)O1 LHEJDBBHZGISGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010000211 Abortions and stillbirth Diseases 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- CCUAQNUWXLYFRA-IMJSIDKUSA-N Ala-Asn Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC(N)=O CCUAQNUWXLYFRA-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- MKZCBYZBCINNJN-DLOVCJGASA-N Ala-Asp-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MKZCBYZBCINNJN-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- JQDFGZKKXBEANU-IMJSIDKUSA-N Ala-Cys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O JQDFGZKKXBEANU-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- NJPMYXWVWQWCSR-ACZMJKKPSA-N Ala-Glu-Asn Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJPMYXWVWQWCSR-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N Ala-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N Ala-Leu-Thr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- MAZZQZWCCYJQGZ-GUBZILKMSA-N Ala-Pro-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O MAZZQZWCCYJQGZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N Ala-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)N HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 241000710929 Alphavirus Species 0.000 description 1
- 244000105975 Antidesma platyphyllum Species 0.000 description 1
- 101100328883 Arabidopsis thaliana COL1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100275297 Arabidopsis thaliana COL10 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100114361 Arabidopsis thaliana COL7 gene Proteins 0.000 description 1
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JGDGLDNAQJJGJI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JGDGLDNAQJJGJI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KWTVWJPNHAOREN-IHRRRGAJSA-N Arg-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O KWTVWJPNHAOREN-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N Arg-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- CVKOQHYVDVYJSI-QTKMDUPCSA-N Arg-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O CVKOQHYVDVYJSI-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- HJDNZFIYILEIKR-OSUNSFLBSA-N Arg-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HJDNZFIYILEIKR-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- YKZJPIPFKGYHKY-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YKZJPIPFKGYHKY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NIUDXSFNLBIWOB-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N NIUDXSFNLBIWOB-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SSZGOKWBHLOCHK-DCAQKATOSA-N Arg-Lys-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N SSZGOKWBHLOCHK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NIELFHOLFTUZME-HJWJTTGWSA-N Arg-Phe-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NIELFHOLFTUZME-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- QLSRIZIDQXDQHK-RCWTZXSCSA-N Arg-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QLSRIZIDQXDQHK-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- MEFGKQUUYZOLHM-GMOBBJLQSA-N Asn-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MEFGKQUUYZOLHM-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JRVABKHPWDRUJF-UBHSHLNASA-N Asn-Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JRVABKHPWDRUJF-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- ZPMNECSEJXXNBE-CIUDSAMLSA-N Asn-Cys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ZPMNECSEJXXNBE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JREOBWLIZLXRIS-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JREOBWLIZLXRIS-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ODBSSLHUFPJRED-CIUDSAMLSA-N Asn-His-Asn Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N ODBSSLHUFPJRED-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N Asn-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- GLWFAWNYGWBMOC-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O GLWFAWNYGWBMOC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YVXRYLVELQYAEQ-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YVXRYLVELQYAEQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FBODFHMLALOPHP-GUBZILKMSA-N Asn-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FBODFHMLALOPHP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WXVGISRWSYGEDK-KKUMJFAQSA-N Asn-Lys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N WXVGISRWSYGEDK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XFJKRRCWLTZIQA-XIRDDKMYSA-N Asn-Lys-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N XFJKRRCWLTZIQA-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- CDGHMJJJHYKMPA-DLOVCJGASA-N Asn-Phe-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N CDGHMJJJHYKMPA-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- BYLSYQASFJJBCL-DCAQKATOSA-N Asn-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BYLSYQASFJJBCL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IDUUACUJKUXKKD-VEVYYDQMSA-N Asn-Pro-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IDUUACUJKUXKKD-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N Asn-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WLVLIYYBPPONRJ-GCJQMDKQSA-N Asn-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O WLVLIYYBPPONRJ-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- HCZQKHSRYHCPSD-IUKAMOBKSA-N Asn-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HCZQKHSRYHCPSD-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N Asn-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- DPSUVAPLRQDWAO-YDHLFZDLSA-N Asn-Tyr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N DPSUVAPLRQDWAO-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- XZFONYMRYTVLPL-NHCYSSNCSA-N Asn-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N XZFONYMRYTVLPL-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- JNCRAQVYJZGIOW-QSFUFRPTSA-N Asn-Val-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JNCRAQVYJZGIOW-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- CBHVAFXKOYAHOY-NHCYSSNCSA-N Asn-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CBHVAFXKOYAHOY-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- ILJQISGMGXRZQQ-IHRRRGAJSA-N Asp-Arg-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ILJQISGMGXRZQQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- HOQGTAIGQSDCHR-SRVKXCTJSA-N Asp-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O HOQGTAIGQSDCHR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BFOYULZBKYOKAN-OLHMAJIHSA-N Asp-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BFOYULZBKYOKAN-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- KTTCQQNRRLCIBC-GHCJXIJMSA-N Asp-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KTTCQQNRRLCIBC-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- TZOZNVLBTAFJRW-UGYAYLCHSA-N Asp-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N TZOZNVLBTAFJRW-UGYAYLCHSA-N 0.000 description 1
- YFSLJHLQOALGSY-ZPFDUUQYSA-N Asp-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N YFSLJHLQOALGSY-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N Asp-Pro-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- BKOIIURTQAJHAT-GUBZILKMSA-N Asp-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 BKOIIURTQAJHAT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- NJLLRXWFPQQPHV-SRVKXCTJSA-N Asp-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJLLRXWFPQQPHV-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SQIARYGNVQWOSB-BZSNNMDCSA-N Asp-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SQIARYGNVQWOSB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 102100022717 Atypical chemokine receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 101000666833 Autographa californica nuclear polyhedrosis virus Uncharacterized 20.8 kDa protein in FGF-VUBI intergenic region Proteins 0.000 description 1
- 101000977027 Azospirillum brasilense Uncharacterized protein in nodG 5'region Proteins 0.000 description 1
- 101000962005 Bacillus thuringiensis Uncharacterized 23.6 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 241001302800 Beak and feather disease virus Species 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000157302 Bison bison athabascae Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101710167800 Capsid assembly scaffolding protein Proteins 0.000 description 1
- 208000031229 Cardiomyopathies Diseases 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 1
- 241001533399 Circoviridae Species 0.000 description 1
- 108020004638 Circular DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010062580 Concanavalin A Proteins 0.000 description 1
- 206010056370 Congestive cardiomyopathy Diseases 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- DYBIDOHFRRUMLW-CIUDSAMLSA-N Cys-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CS)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O DYBIDOHFRRUMLW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N Cys-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YXPNKXFOBHRUBL-BJDJZHNGSA-N Cys-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CS)N YXPNKXFOBHRUBL-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- MBRWOKXNHTUJMB-CIUDSAMLSA-N Cys-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MBRWOKXNHTUJMB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- DSTWKJOBKSMVCV-UWVGGRQHSA-N Cys-Tyr Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 DSTWKJOBKSMVCV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 230000005778 DNA damage Effects 0.000 description 1
- 231100000277 DNA damage Toxicity 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 1
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 1
- 102100036912 Desmin Human genes 0.000 description 1
- 108010044052 Desmin Proteins 0.000 description 1
- 201000010046 Dilated cardiomyopathy Diseases 0.000 description 1
- 101000785191 Drosophila melanogaster Uncharacterized 50 kDa protein in type I retrotransposable element R1DM Proteins 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N Elaidinsaeure-aethylester Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 101000747704 Enterobacteria phage N4 Uncharacterized protein Gp1 Proteins 0.000 description 1
- 101000861206 Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) Uncharacterized protein EF_A0048 Proteins 0.000 description 1
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 1
- 101000769180 Escherichia coli Uncharacterized 11.1 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 206010016654 Fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 1
- 206010055690 Foetal death Diseases 0.000 description 1
- RLZBLVSJDFHDBL-KBIXCLLPSA-N Glu-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O RLZBLVSJDFHDBL-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- AFODTOLGSZQDSL-PEFMBERDSA-N Glu-Asn-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N AFODTOLGSZQDSL-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N Glu-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZZIFPJZQHRJERU-WDSKDSINSA-N Glu-Cys-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O ZZIFPJZQHRJERU-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N Glu-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- PXXGVUVQWQGGIG-YUMQZZPRSA-N Glu-Gly-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PXXGVUVQWQGGIG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OAGVHWYIBZMWLA-YFKPBYRVSA-N Glu-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O OAGVHWYIBZMWLA-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OQXDUSZKISQQSS-GUBZILKMSA-N Glu-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OQXDUSZKISQQSS-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N Glu-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- JZJGEKDPWVJOLD-QEWYBTABSA-N Glu-Phe-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JZJGEKDPWVJOLD-QEWYBTABSA-N 0.000 description 1
- CGWHAXBNGYQBBK-JBACZVJFSA-N Glu-Trp-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 CGWHAXBNGYQBBK-JBACZVJFSA-N 0.000 description 1
- MIWJDJAMMKHUAR-ZVZYQTTQSA-N Glu-Trp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N MIWJDJAMMKHUAR-ZVZYQTTQSA-N 0.000 description 1
- YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N Glu-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- WGYHAAXZWPEBDQ-IFFSRLJSSA-N Glu-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGYHAAXZWPEBDQ-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- PUUYVMYCMIWHFE-BQBZGAKWSA-N Gly-Ala-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PUUYVMYCMIWHFE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N Gly-Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N Gly-Arg-Pro Natural products NCC(=O)NC(CCNC(=N)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- NZAFOTBEULLEQB-WDSKDSINSA-N Gly-Asn-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)CN NZAFOTBEULLEQB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N Gly-Asp-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CEXINUGNTZFNRY-BYPYZUCNSA-N Gly-Cys-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC([O-])=O CEXINUGNTZFNRY-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- LPHQAFLNEHWKFF-QXEWZRGKSA-N Gly-Met-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LPHQAFLNEHWKFF-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- WMGHDYWNHNLGBV-ONGXEEELSA-N Gly-Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 WMGHDYWNHNLGBV-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- MTBIKIMYHUWBRX-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN MTBIKIMYHUWBRX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- OOCFXNOVSLSHAB-IUCAKERBSA-N Gly-Pro-Pro Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 OOCFXNOVSLSHAB-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- FFALDIDGPLUDKV-ZDLURKLDSA-N Gly-Thr-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FFALDIDGPLUDKV-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N Gly-Val-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 241000941423 Grom virus Species 0.000 description 1
- 206010069767 H1N1 influenza Diseases 0.000 description 1
- 101710189078 Helicase Proteins 0.000 description 1
- PROLDOGUBQJNPG-RWMBFGLXSA-N His-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)C(=O)O PROLDOGUBQJNPG-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- MTHDIEPOBSRDIV-ULQDDVLXSA-N His-Met-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 MTHDIEPOBSRDIV-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- FLXCRBXJRJSDHX-AVGNSLFASA-N His-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O FLXCRBXJRJSDHX-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UWSMZKRTOZEGDD-CUJWVEQBSA-N His-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UWSMZKRTOZEGDD-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- GBMSSORHVHAYLU-QTKMDUPCSA-N His-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O GBMSSORHVHAYLU-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- 101000678879 Homo sapiens Atypical chemokine receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101100462341 Homo sapiens OSBPL2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000992378 Homo sapiens Oxysterol-binding protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000992396 Homo sapiens Oxysterol-binding protein-related protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000739160 Homo sapiens Secretoglobin family 3A member 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000701074 Human alphaherpesvirus 2 Species 0.000 description 1
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 1
- BGZIJZJBXRVBGJ-SXTJYALSSA-N Ile-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N BGZIJZJBXRVBGJ-SXTJYALSSA-N 0.000 description 1
- KFVUBLZRFSVDGO-BYULHYEWSA-N Ile-Gly-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O KFVUBLZRFSVDGO-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- JWBXCSQZLLIOCI-GUBZILKMSA-N Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C JWBXCSQZLLIOCI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DBXXASNNDTXOLU-MXAVVETBSA-N Ile-Leu-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N DBXXASNNDTXOLU-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N Ile-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- OTSVBELRDMSPKY-PCBIJLKTSA-N Ile-Phe-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N OTSVBELRDMSPKY-PCBIJLKTSA-N 0.000 description 1
- MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 1
- JCGMFFQQHJQASB-PYJNHQTQSA-N Ile-Val-His Chemical compound N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)O JCGMFFQQHJQASB-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 101710125507 Integrase/recombinase Proteins 0.000 description 1
- 102000003996 Interferon-beta Human genes 0.000 description 1
- 108090000467 Interferon-beta Proteins 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 208000029523 Interstitial Lung disease Diseases 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N L-leucyl-L-phenylalanine Natural products CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- 101000976301 Leptospira interrogans Uncharacterized 35 kDa protein in sph 3'region Proteins 0.000 description 1
- LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N Leu-Ala-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KWTVLKBOQATPHJ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N KWTVLKBOQATPHJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BAJIJEGGUYXZGC-CIUDSAMLSA-N Leu-Asn-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N BAJIJEGGUYXZGC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PBGDOSARRIJMEV-DLOVCJGASA-N Leu-His-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PBGDOSARRIJMEV-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- YWYQSLOTVIRCFE-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YWYQSLOTVIRCFE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NRFGTHFONZYFNY-MGHWNKPDSA-N Leu-Ile-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NRFGTHFONZYFNY-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 1
- PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N Leu-Lys-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- LZHJZLHSRGWBBE-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LZHJZLHSRGWBBE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZAVCJRJOQKIOJW-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZAVCJRJOQKIOJW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- INCJJHQRZGQLFC-KBPBESRZSA-N Leu-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O INCJJHQRZGQLFC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- JLYUZRKPDKHUTC-WDSOQIARSA-N Leu-Pro-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JLYUZRKPDKHUTC-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-GARJFASQSA-N Leu-Ser-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N SBANPBVRHYIMRR-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N Leu-Ser-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ICYRCNICGBJLGM-HJGDQZAQSA-N Leu-Thr-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O ICYRCNICGBJLGM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- FPFOYSCDUWTZBF-IHPCNDPISA-N Leu-Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 FPFOYSCDUWTZBF-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- UCRJTSIIAYHOHE-ULQDDVLXSA-N Leu-Tyr-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N UCRJTSIIAYHOHE-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- BGGTYDNTOYRTTR-MEYUZBJRSA-N Leu-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O BGGTYDNTOYRTTR-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- QESXLSQLQHHTIX-RHYQMDGZSA-N Leu-Val-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QESXLSQLQHHTIX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- KNKHAVVBVXKOGX-JXUBOQSCSA-N Lys-Ala-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KNKHAVVBVXKOGX-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- GQUDMNDPQTXZRV-DCAQKATOSA-N Lys-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O GQUDMNDPQTXZRV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VHNOAIFVYUQOOY-XUXIUFHCSA-N Lys-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O VHNOAIFVYUQOOY-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N Lys-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- DGAAQRAUOFHBFJ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asn-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DGAAQRAUOFHBFJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KPJJOZUXFOLGMQ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Asn Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N KPJJOZUXFOLGMQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WGCKDDHUFPQSMZ-ZPFDUUQYSA-N Lys-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN WGCKDDHUFPQSMZ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N Lys-Glu-Gly Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CCC([O-])=O)C(=O)NCC([O-])=O GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CANPXOLVTMKURR-WEDXCCLWSA-N Lys-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN CANPXOLVTMKURR-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- IGRMTQMIDNDFAA-UWVGGRQHSA-N Lys-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IGRMTQMIDNDFAA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- QOJDBRUCOXQSSK-AJNGGQMLSA-N Lys-Ile-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O QOJDBRUCOXQSSK-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- IZJGPPIGYTVXLB-FQUUOJAGSA-N Lys-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N IZJGPPIGYTVXLB-FQUUOJAGSA-N 0.000 description 1
- VUTWYNQUSJWBHO-BZSNNMDCSA-N Lys-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VUTWYNQUSJWBHO-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RIJCHEVHFWMDKD-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RIJCHEVHFWMDKD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ODTZHNZPINULEU-KKUMJFAQSA-N Lys-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ODTZHNZPINULEU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YSPZCHGIWAQVKQ-AVGNSLFASA-N Lys-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCCN YSPZCHGIWAQVKQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- PELXPRPDQRFBGQ-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O PELXPRPDQRFBGQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RMKJOQSYLQQRFN-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RMKJOQSYLQQRFN-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XYLSGAWRCZECIQ-JYJNAYRXSA-N Lys-Tyr-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XYLSGAWRCZECIQ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- UGCIQUYEJIEHKX-GVXVVHGQSA-N Lys-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UGCIQUYEJIEHKX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- NYTDJEZBAAFLLG-IHRRRGAJSA-N Lys-Val-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O NYTDJEZBAAFLLG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 108010090054 Membrane Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000012750 Membrane Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010047562 NGR peptide Proteins 0.000 description 1
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010028851 Necrosis Diseases 0.000 description 1
- 101000658690 Neisseria meningitidis serogroup B Transposase for insertion sequence element IS1106 Proteins 0.000 description 1
- 101710113540 ORF2 protein Proteins 0.000 description 1
- 206010030113 Oedema Diseases 0.000 description 1
- 208000009620 Orthomyxoviridae Infections Diseases 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 102100032164 Oxysterol-binding protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100025925 Oxysterol-binding protein-related protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100032154 Oxysterol-binding protein-related protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 241000286209 Phasianidae Species 0.000 description 1
- MPGJIHFJCXTVEX-KKUMJFAQSA-N Phe-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MPGJIHFJCXTVEX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- HTTYNOXBBOWZTB-SRVKXCTJSA-N Phe-Asn-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N HTTYNOXBBOWZTB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- WIVCOAKLPICYGY-KKUMJFAQSA-N Phe-Asp-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N WIVCOAKLPICYGY-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FMMIYCMOVGXZIP-AVGNSLFASA-N Phe-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FMMIYCMOVGXZIP-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- BFYHIHGIHGROAT-HTUGSXCWSA-N Phe-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BFYHIHGIHGROAT-HTUGSXCWSA-N 0.000 description 1
- RORUIHAWOLADSH-HJWJTTGWSA-N Phe-Ile-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RORUIHAWOLADSH-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- KLXQWABNAWDRAY-ACRUOGEOSA-N Phe-Lys-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 KLXQWABNAWDRAY-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- OWSLLRKCHLTUND-BZSNNMDCSA-N Phe-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N OWSLLRKCHLTUND-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- RBRNEFJTEHPDSL-ACRUOGEOSA-N Phe-Phe-Lys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 RBRNEFJTEHPDSL-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- ODGNUUUDJONJSC-UFYCRDLUSA-N Phe-Pro-Tyr Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O ODGNUUUDJONJSC-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 1
- SHUFSZDAIPLZLF-BEAPCOKYSA-N Phe-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)O SHUFSZDAIPLZLF-BEAPCOKYSA-N 0.000 description 1
- YFXXRYFWJFQAFW-JHYOHUSXSA-N Phe-Thr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O YFXXRYFWJFQAFW-JHYOHUSXSA-N 0.000 description 1
- APXXVISUHOLGEE-ILWGZMRPSA-N Phe-Trp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)NC(=O)[C@H](CC4=CC=CC=C4)N)C(=O)O APXXVISUHOLGEE-ILWGZMRPSA-N 0.000 description 1
- 101000982320 Porcine circovirus 2 Anti-apoptotic ORF4 protein Proteins 0.000 description 1
- 101100406532 Porcine circovirus 2 ORF3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101900328733 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus Glycoprotein 5 Proteins 0.000 description 1
- WUUNPBLZLWVARQ-QAETUUGQSA-N Postin Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 WUUNPBLZLWVARQ-QAETUUGQSA-N 0.000 description 1
- 241000700625 Poxviridae Species 0.000 description 1
- OOLOTUZJUBOMAX-GUBZILKMSA-N Pro-Ala-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OOLOTUZJUBOMAX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MTHRMUXESFIAMS-DCAQKATOSA-N Pro-Asn-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O MTHRMUXESFIAMS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QEWBZBLXDKIQPS-STQMWFEESA-N Pro-Gly-Tyr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QEWBZBLXDKIQPS-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- BAKAHWWRCCUDAF-IHRRRGAJSA-N Pro-His-Lys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CN=CN1 BAKAHWWRCCUDAF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VZKBJNBZMZHKRC-XUXIUFHCSA-N Pro-Ile-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VZKBJNBZMZHKRC-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N Pro-Leu-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- JIWJRKNYLSHONY-KKUMJFAQSA-N Pro-Phe-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JIWJRKNYLSHONY-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LEIKGVHQTKHOLM-IUCAKERBSA-N Pro-Pro-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 LEIKGVHQTKHOLM-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 241000125945 Protoparvovirus Species 0.000 description 1
- 101000933967 Pseudomonas phage KPP25 Major capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 101000748660 Pseudomonas savastanoi Uncharacterized 21 kDa protein in iaaL 5'region Proteins 0.000 description 1
- 101710185720 Putative ethidium bromide resistance protein Proteins 0.000 description 1
- 101710090523 Putative movement protein Proteins 0.000 description 1
- 101710118046 RNA-directed RNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 241000700638 Raccoonpox virus Species 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000000505 Ribonucleotide Reductases Human genes 0.000 description 1
- 108010041388 Ribonucleotide Reductases Proteins 0.000 description 1
- 101000584469 Rice tungro bacilliform virus (isolate Philippines) Protein P1 Proteins 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 101100072644 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) INO2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100454372 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) LCB2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101001121313 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Oxysterol-binding protein homolog 1 Proteins 0.000 description 1
- 101100489624 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) RTS1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100518421 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) orc2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100037268 Secretoglobin family 3A member 1 Human genes 0.000 description 1
- WTUJZHKANPDPIN-CIUDSAMLSA-N Ser-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N WTUJZHKANPDPIN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SWSRFJZZMNLMLY-ZKWXMUAHSA-N Ser-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SWSRFJZZMNLMLY-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- KKKVOZNCLALMPV-XKBZYTNZSA-N Ser-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KKKVOZNCLALMPV-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N Ser-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- 241000287231 Serinus Species 0.000 description 1
- 241000287219 Serinus canaria Species 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 101000818096 Spirochaeta aurantia Uncharacterized 15.5 kDa protein in trpE 3'region Proteins 0.000 description 1
- 101000766081 Streptomyces ambofaciens Uncharacterized HTH-type transcriptional regulator in unstable DNA locus Proteins 0.000 description 1
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 1
- 101000804403 Synechococcus elongatus (strain PCC 7942 / FACHB-805) Uncharacterized HIT-like protein Synpcc7942_1390 Proteins 0.000 description 1
- 101000750910 Synechococcus elongatus (strain PCC 7942 / FACHB-805) Uncharacterized HTH-type transcriptional regulator Synpcc7942_2319 Proteins 0.000 description 1
- 101000644897 Synechococcus sp. (strain ATCC 27264 / PCC 7002 / PR-6) Uncharacterized protein SYNPCC7002_B0001 Proteins 0.000 description 1
- VFEHSAJCWWHDBH-RHYQMDGZSA-N Thr-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VFEHSAJCWWHDBH-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N Thr-Asn-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N Thr-Glu Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- VUSAEKOXGNEYNE-PBCZWWQYSA-N Thr-His-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O VUSAEKOXGNEYNE-PBCZWWQYSA-N 0.000 description 1
- IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- HPQHHRLWSAMMKG-KATARQTJSA-N Thr-Lys-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O HPQHHRLWSAMMKG-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- CGCMNOIQVAXYMA-UNQGMJICSA-N Thr-Met-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O CGCMNOIQVAXYMA-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- KZURUCDWKDEAFZ-XVSYOHENSA-N Thr-Phe-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O KZURUCDWKDEAFZ-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- NWECYMJLJGCBOD-UNQGMJICSA-N Thr-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NWECYMJLJGCBOD-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- JAJOFWABAUKAEJ-QTKMDUPCSA-N Thr-Pro-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O JAJOFWABAUKAEJ-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- DEGCBBCMYWNJNA-RHYQMDGZSA-N Thr-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O DEGCBBCMYWNJNA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- STUAPCLEDMKXKL-LKXGYXEUSA-N Thr-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O STUAPCLEDMKXKL-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- SJPDTIQHLBQPFO-VLCNGCBASA-N Thr-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O SJPDTIQHLBQPFO-VLCNGCBASA-N 0.000 description 1
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108090000373 Tissue Plasminogen Activator Proteins 0.000 description 1
- 108700029229 Transcriptional Regulatory Elements Proteins 0.000 description 1
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- BRBCKMMXKONBAA-KWBADKCTSA-N Trp-Ala-Ala Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)=CNC2=C1 BRBCKMMXKONBAA-KWBADKCTSA-N 0.000 description 1
- LHHDBONOFZDWMW-AAEUAGOBSA-N Trp-Asp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)NCC(=O)O)N LHHDBONOFZDWMW-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- WKQNLTQSCYXKQK-VFAJRCTISA-N Trp-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WKQNLTQSCYXKQK-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- IVBJBFSWJDNQFW-XIRDDKMYSA-N Trp-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IVBJBFSWJDNQFW-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- DYIXEGROAOVQPK-VFAJRCTISA-N Trp-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N)O DYIXEGROAOVQPK-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- DVLHKUWLNKDINO-PMVMPFDFSA-N Trp-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DVLHKUWLNKDINO-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- UOXPLPBMEPLZBW-WDSOQIARSA-N Trp-Val-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 UOXPLPBMEPLZBW-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- IEESWNWYUOETOT-BVSLBCMMSA-N Trp-Val-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O IEESWNWYUOETOT-BVSLBCMMSA-N 0.000 description 1
- TVOGEPLDNYTAHD-CQDKDKBSSA-N Tyr-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 TVOGEPLDNYTAHD-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 1
- AYHSJESDFKREAR-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AYHSJESDFKREAR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- AYPAIRCDLARHLM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O AYPAIRCDLARHLM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N Tyr-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)O NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- KLGFILUOTCBNLJ-IHRRRGAJSA-N Tyr-Cys-Arg Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O KLGFILUOTCBNLJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ULHJJQYGMWONTD-HKUYNNGSSA-N Tyr-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O ULHJJQYGMWONTD-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- ZQOOYCZQENFIMC-STQMWFEESA-N Tyr-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZQOOYCZQENFIMC-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N Tyr-His-Gly Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)NCC(=O)O)N)O MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- PJWCWGXAVIVXQC-STECZYCISA-N Tyr-Ile-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PJWCWGXAVIVXQC-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N Tyr-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- GYKDRHDMGQUZPU-MGHWNKPDSA-N Tyr-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N GYKDRHDMGQUZPU-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 1
- KYPMKDGKAYQCHO-RYUDHWBXSA-N Tyr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 KYPMKDGKAYQCHO-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- FASACHWGQBNSRO-ZEWNOJEFSA-N Tyr-Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N FASACHWGQBNSRO-ZEWNOJEFSA-N 0.000 description 1
- VBFVQTPETKJCQW-RPTUDFQQSA-N Tyr-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VBFVQTPETKJCQW-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 1
- MNWINJDPGBNOED-ULQDDVLXSA-N Tyr-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MNWINJDPGBNOED-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- QVYFTFIBKCDHIE-ACRUOGEOSA-N Tyr-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O QVYFTFIBKCDHIE-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- KHPLUFDSWGDRHD-SLFFLAALSA-N Tyr-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N)C(=O)O KHPLUFDSWGDRHD-SLFFLAALSA-N 0.000 description 1
- OYOQKMOWUDVWCR-RYUDHWBXSA-N Tyr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OYOQKMOWUDVWCR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- AEOFMCAKYIQQFY-YDHLFZDLSA-N Tyr-Val-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AEOFMCAKYIQQFY-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- YFOCMOVJBQDBCE-NRPADANISA-N Val-Ala-Glu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N YFOCMOVJBQDBCE-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- ZQGPWORGSNRQLN-NHCYSSNCSA-N Val-Asp-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N ZQGPWORGSNRQLN-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- XLDYBRXERHITNH-QSFUFRPTSA-N Val-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C XLDYBRXERHITNH-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- XIFAHCUNWWKUDE-DCAQKATOSA-N Val-Cys-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N XIFAHCUNWWKUDE-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CJDZKZFMAXGUOJ-IHRRRGAJSA-N Val-Cys-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N CJDZKZFMAXGUOJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ROLGIBMFNMZANA-GVXVVHGQSA-N Val-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ROLGIBMFNMZANA-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- XWYUBUYQMOUFRQ-IFFSRLJSSA-N Val-Glu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O XWYUBUYQMOUFRQ-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- WFENBJPLZMPVAX-XVKPBYJWSA-N Val-Gly-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O WFENBJPLZMPVAX-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- URIRWLJVWHYLET-ONGXEEELSA-N Val-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)C(C)C URIRWLJVWHYLET-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- KVRLNEILGGVBJX-IHRRRGAJSA-N Val-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)CC1=CN=CN1 KVRLNEILGGVBJX-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- LKUDRJSNRWVGMS-QSFUFRPTSA-N Val-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LKUDRJSNRWVGMS-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- UKEVLVBHRKWECS-LSJOCFKGSA-N Val-Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N UKEVLVBHRKWECS-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- BZWUSZGQOILYEU-STECZYCISA-N Val-Ile-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 BZWUSZGQOILYEU-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- DJQIUOKSNRBTSV-CYDGBPFRSA-N Val-Ile-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N DJQIUOKSNRBTSV-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- YMTOEGGOCHVGEH-IHRRRGAJSA-N Val-Lys-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O YMTOEGGOCHVGEH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JMCOXFSCTGKLLB-FKBYEOEOSA-N Val-Phe-Trp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)O)N JMCOXFSCTGKLLB-FKBYEOEOSA-N 0.000 description 1
- QIVPZSWBBHRNBA-JYJNAYRXSA-N Val-Pro-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O QIVPZSWBBHRNBA-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- PQSNETRGCRUOGP-KKHAAJSZSA-N Val-Thr-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O PQSNETRGCRUOGP-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- WBPFYNYTYASCQP-CYDGBPFRSA-N Val-Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N WBPFYNYTYASCQP-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- 206010058874 Viraemia Diseases 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 101000916336 Xenopus laevis Transposon TX1 uncharacterized 82 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101001000760 Zea mays Putative Pol polyprotein from transposon element Bs1 Proteins 0.000 description 1
- 101100261632 Zea mays TSB2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000678262 Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain ATCC 10988 / DSM 424 / LMG 404 / NCIMB 8938 / NRRL B-806 / ZM1) 65 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N [(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2r,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(2s,3r,4s,5s,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hy Chemical compound O([C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1CC[C@]2(C)[C@H]3CC=C4[C@@]([C@@]3(CC[C@H]2[C@@]1(C=O)C)C)(C)CC(O)[C@]1(CCC(CC14)(C)C)C(=O)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O[C@H]4[C@@H]([C@@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O5)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O4)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N 0.000 description 1
- 210000002718 aborted fetus Anatomy 0.000 description 1
- 108010081404 acein-2 Proteins 0.000 description 1
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000000787 affinity precipitation Methods 0.000 description 1
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZVDPYSVOZFINEE-BQBZGAKWSA-N alpha-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O ZVDPYSVOZFINEE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 208000007502 anemia Diseases 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- 229940031567 attenuated vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- MSWZFWKMSRAUBD-QZABAPFNSA-N beta-D-glucosamine Chemical compound N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-QZABAPFNSA-N 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000010241 blood sampling Methods 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 1
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 1
- 239000013553 cell monolayer Substances 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000011260 co-administration Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 239000000084 colloidal system Substances 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 108010004073 cysteinylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 238000012303 cytoplasmic staining Methods 0.000 description 1
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 210000005045 desmin Anatomy 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000001804 emulsifying effect Effects 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N ethyl oleate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N 0.000 description 1
- 229940093471 ethyl oleate Drugs 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 231100000479 fetal death Toxicity 0.000 description 1
- 230000004761 fibrosis Effects 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005187 foaming Methods 0.000 description 1
- 235000013355 food flavoring agent Nutrition 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 229960002442 glucosamine Drugs 0.000 description 1
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N glyclproline Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000036449 good health Effects 0.000 description 1
- 201000007192 granulomatous hepatitis Diseases 0.000 description 1
- 235000009424 haa Nutrition 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 1
- 230000036732 histological change Effects 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 210000004731 jugular vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 229940057995 liquid paraffin Drugs 0.000 description 1
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 235000010446 mineral oil Nutrition 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 229940031348 multivalent vaccine Drugs 0.000 description 1
- 208000010125 myocardial infarction Diseases 0.000 description 1
- 210000004165 myocardium Anatomy 0.000 description 1
- 210000000107 myocyte Anatomy 0.000 description 1
- JXTPJDDICSTXJX-UHFFFAOYSA-N n-Triacontane Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC JXTPJDDICSTXJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AFFLGGQVNFXPEV-UHFFFAOYSA-N n-decene Natural products CCCCCCCCC=C AFFLGGQVNFXPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 210000004237 neck muscle Anatomy 0.000 description 1
- 231100000989 no adverse effect Toxicity 0.000 description 1
- 244000309711 non-enveloped viruses Species 0.000 description 1
- 239000002736 nonionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 238000012758 nuclear staining Methods 0.000 description 1
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 1
- 150000002888 oleic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 230000008807 pathological lesion Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920001983 poloxamer Polymers 0.000 description 1
- 229920000223 polyglycerol Polymers 0.000 description 1
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 1
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 1
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 108700010945 porcine parvovirus VP2 Proteins 0.000 description 1
- 235000015277 pork Nutrition 0.000 description 1
- 238000011886 postmortem examination Methods 0.000 description 1
- 229940024231 poxvirus vaccine Drugs 0.000 description 1
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010087846 prolyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 229940010310 propylene glycol dioleate Drugs 0.000 description 1
- 150000003242 quaternary ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 208000017443 reproductive system disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- WBHHMMIMDMUBKC-XLNAKTSKSA-N ricinelaidic acid Chemical compound CCCCCC[C@@H](O)C\C=C\CCCCCCCC(O)=O WBHHMMIMDMUBKC-XLNAKTSKSA-N 0.000 description 1
- 229960003656 ricinoleic acid Drugs 0.000 description 1
- FEUQNCSVHBHROZ-UHFFFAOYSA-N ricinoleic acid Natural products CCCCCCC(O[Si](C)(C)C)CC=CCCCCCCCC(=O)OC FEUQNCSVHBHROZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 101150115143 shroom2 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 229940032094 squalane Drugs 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000008174 sterile solution Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 229920001059 synthetic polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 1
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 1
- 150000003505 terpenes Chemical class 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000014599 transmission of virus Effects 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 1
- 244000052613 viral pathogen Species 0.000 description 1
- 230000007923 virulence factor Effects 0.000 description 1
- 239000000304 virulence factor Substances 0.000 description 1
- 239000007762 w/o emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 230000004584 weight gain Effects 0.000 description 1
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/12—Viral antigens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
- A61P15/06—Antiabortive agents; Labour repressants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/53—DNA (RNA) vaccination
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2710/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
- C12N2710/00011—Details
- C12N2710/24011—Poxviridae
- C12N2710/24041—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2710/24043—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/10011—Circoviridae
- C12N2750/10022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Immunology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Pregnancy & Childbirth (AREA)
- Gynecology & Obstetrics (AREA)
- Cardiology (AREA)
- Heart & Thoracic Surgery (AREA)
- Mycology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Description
Opis wynalazku
Przedmiotem wynalazku jest zastosowanie kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku do obniżenia obciążenia świńskim cirkowirusem typu 2 (PCV-2) w węzłach oskrzelowych i krezkowych ś wiń .
Świński cirkowirus 2 (PCV-2, cirkowirus świń 2) został niedawno zidentyfikowany jako czynnik, który powtarzalnie był związany z poodsadzeniowym wielonarządowym zespołem wyniszczającym (PMWS) w populacjach świń w kilku częściach świata (Allan i wsp. 1998; Ellis i wsp. 1998). Izolaty PCV-2 otrzymane z zakażonych świń z kilku krajów są na ogół identyczne pod względem genetycznym, i są wyraźnie odrębne od PCV (CCL33, PCV-1), który był oryginalnie zidentyfikowany w latach 1970-tych jako niecytopatyczne zanieczyszczenie linii komórkowej nerki świń (PK/15) (Meehan i wsp. 1998; Tischer i wsp. 1974). U świń z naturalnie nabytymi lub eksperymentalnie zaindukowanymi zakażeniami PCV-2 obserwuje się postępującą utratę wagi, szybkie oddychanie, duszność i żółtaczkę (Allan i wsp. 1998; Allan i wsp. 1999; Ellis i wsp. 1998; Ellis i wsp. 1999). Do ogólnych objawów patologicznych, które bezpośrednio wiążą się z antygenem PCV-2 należą uogólnione powiększenie węzłów chłonnych (limfadenopatia), śródmiąższowe zapalenie płuc, zapalenie wątroby i zapalenie nerki (Allan i wsp. 1998; Allan i wsp. 1999; Ellis i wsp. 1998; Ellis i wsp. 1999). Patrz też WO-A-99 18214, WO-A-00 01409, WO-A-99 29717 i WO-A-99 29871. Wirus PCV-2 nie był dotychczas kojarzony bezpośrednio z poronieniami lub uszkodzeniami płodów u świń. Również dotychczas nie proponowano zbadania zależności występowania zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronień i/lub zakażeń wewnątrzmacicznych spowodowanych przez PCV-2.
Referencje ponadto dotyczą zgłoszenia US nr 09/082,558 złożonego 21 maja 1998 oraz zgłoszenia US nr 09/161,092 zgłoszonego 25 września 1998, które jest częściową kontynuacją zgłoszenia nr 09/082,558. Zgłoszenia te podane są jako odniesienia jak i każdy dokument cytowany w niniejszym zgłoszeniu jest również włączony jako odniesienie. Referencje odnoszą się do zgłoszenia US nr 09/161,092 złożonego 09/25/98 jako CIP zgłoszenia US 09/082,558 zgłoszonego 05/21/98, zastrzegającego pierwszeństwo z francuskich zgłoszeń nr 97/12382, 98/00873, 98/03707, złożonych 10/03/97, 1/22/98, 3/20/98, z których każdy oraz każdy dokument w nich cytowany jest niniejszym włączony jako odniesienie.
Opisane zostały konstrukty plazmidów kodujących i wyrażających immunogeny cirkowirusów świń (PCV - Porcine CircoVirus) odpowiedzialne za zespół PMWS (wieloukładowy układ wyniszczenia u świni lub poodsadzeniowy wielonarządowy zespół wyniszczający), sposoby szczepienia i szczepionki DNA, jak i sposoby wytwarzania i formułowania tych szczepionek. Wszystkie cytowane w niniejszym opisie dokumenty i wszystkie dokumenty podane w cytowanych tu dokumentach są niniejszym włączone jako referencje.
PCV oryginalnie wykryto jako niecytopatogenne zanieczyszczenie w liniach komórek nerki świni PK/15. Wirus ten został zaklasyfikowany wśród Circoviridae razem z wirusem zakaźnej anemii kurcząt (CAV - Chicken Anaemia Virus) i wirusem PBFDV (wirus choroby dzioba i piór u papug - Psittacine Beak and Feather Disease Virus). Są to małe wirusy bezotoczkowe (od 15 do 24 nm), których wspólną cechą jest posiadanie genomu w postaci kolistego jednoniciowego DNA o wielkości 1,76 do 2,31 tysiąca par zasad (kb). Początkowo sądzono, że genom ten koduje polipeptyd o wielkości około 30 kDa (Todd i wsp. Arch. Virol. 1991, 117: 129-135). Niedawne prace wykazały jednak bardziej złożoną transkrypcję (Meehan B.M. i wsp., J. Gen. Virol. 1997, 78: 221-227). Ponadto między trzema znanymi gatunkami cirkowirusów nie ma znaczących homologii sekwencji nukleotydowych lub na poziomie wspólnych determinant antygenowych. Wirus PCV pochodzący z komórek PK/15 jest uważany za nie patogenny. Jego sekwencja jest znana z B. M. Meehan i wsp., J. Gen. Virol. 1997 (78) 221-227. Dopiero bardzo niedawno niektórzy autorzy zaczęli sądzić, że pewne szczepy PCV mogą być patogenne i związane z występowaniem zespołu PMWS (G.P.S. Nayar i wsp. Can. Vet. J., 1997, 38: 385-387 i Clark E. G. Proc. Am. Assoc. Swine Prac. 1997: 499-501). Nayar i wsp. za pomocą technik PCR wykryli DNA PCV u świń z zespołem PMWS.
Przeciwciała monoklonalne i poliklonalne skierowane przeciwko cirkowirusom spotykanym u ś wiń, u których obserwuje się objawy charakterystyczne dla zespołu PMWS były w stanie wykazać różnice między tymi cirkowirusami a cirkowirusami świń wyizolowanymi z hodowli komórek PK-15 (Allan G.M. i wsp. Vet. Microbiol., 1999, 66: 115-123).
Zespół PWMS wykryty w Kanadzie, Stanach Zjednoczonych i Francji jest charakteryzowany klinicznie przez stopniową utratę wagi i objawy takie jak szybkie oddychanie, duszność i żółtaczka.
PL 205 130 B1
Z patologicznego punktu widzenia przejawia się jako nacieki limfocytowe lub ziarniniakowe, uogólnione powiększenie węzłów chłonnych (limfadenopatie) i rzadziej zapalenie wątroby i limfocytowe lub ziarniniakowe zapalenie nerek (Clark E.G. Proc. Am. Assoc. Swine Prac. 1997: 449-501; La Semaine
Veterinaire Nr 26, suplement do La Semaine Veterinaire 1996 (834): La Semaine Veterinaire 1997 (857): 54; G.P.S. Nayer i wsp. Can. Vet. J., 1997, 38: 385-387).
Te cirkowirusy uzyskane z Ameryki Północnej i Europy są bardzo blisko ze sobą spokrewnione ze stopniem identyczności dla sekwencji nukleotydowej wynoszącym ponad 96%, natomiast stopień identyczności jest mniejszy, od 80%, jeśli porównuje się sekwencje nukleotydowe tych cirkowirusów z sekwencjami cirkowirusów świń izolowanych z komórek PK-15. Zaproponowano dwie podgrupy wirusów: PCV-2 dla cirkowirusów sprzężonych z zespołem PMWS i PCV-1 dla cirkowirusów izolowanych z komórek PK-15 (Meehan B.M. i wsp., J. Gen. Virol. 1998 79: 2171-2179; WO-A-9918214).
Referencje również dotyczą amerykańskich zgłoszeń US nr 09/082,358 zgłoszonego 21 maja, 1998 i US nr 09/161,092 zgłoszonego 25 września 1998 jako częściowa kontynuacja US nr 09/082,558, z których każdy jest tu włączony w postaci odniesienia razem z cytowanymi w nich dokumentami.
W niniejszym zgłoszeniu odniesiono się do kilku publikacji. Referencje do tych dokumentów można znaleźć na końcu opisu i/lub tam gdzie określony dokument został powołany. Dokumenty te należą do dziedziny wynalazku i każdy dokument, do którego się odnoszono lub cytowano w tym zgłoszeniu („niniejszym cytowane dokumenty) jak i każdy dokument, na który się powołano lub zacytowano w niniejszym cytowanych dokumentach są również włączone jako odniesienia.
Poodsadzeniowy wielonarządowy zespół wyniszczający (PMWS) jest niedawno rozpoznaną chorobą młodych świń. PMWS charakteryzuje się klinicznie postępującą utratą wagi i innymi objawami takimi jak szybkie oddychanie, duszność i żółtaczka. Z objawów patologicznych zaobserwowano nacieki limfocytowe i ziarniakowe, uogólnione powiększenie węzłów chłonnych i rzadziej limfocytowe i ziarniakowe zapalenie wątroby i nerek (Clark, 1997; Harding, 1997).
Chorobę tę opisano w różnych krajach europejskich jak też w Ameryce Północnej. Nie są obecnie osiągalne metody leczenia i zapobiegania chorobie.
Wiele dowodów wskazuje na cirkowirus świń jako na czynnik etiologiczny PMWS (Ellis i wsp., 1998) Cirkowirusy odzyskiwano ze świń z PMWS i wykazano obecność przeciwciał przeciw świńskiemu cirkowirusowi u chorych świń.
Cirkowirusy są wirusami o jednoniciowym kolistym DNA znajdowanymi u wielu gatunków zwierząt i roślin. Cirkowirusy świńskie oryginalnie wyizolowano jako zanieczyszczenie z ustalonej linii komórkowej świńskiej nerki. Preparat wyizolowanej hodowli komórkowej oznaczono jako PK-15 (Meehan i wsp., 1997). Niedawno, świńskiego cirkowirusa otrzymanego ze świń z PMWS porównano z PK-15. Takie wirusy różnią się znacznie od PK-15 na poziomie sekwencji nukleotydowej jak i białkowej i zostały oznaczone jako PCV2 (Meehan i wsp., 1998; Hamel i wsp., 1998).
W genomie PVC2 zidentyfikowano aż trzynaście otwartych ramek odczytu (ORF) (COL1 do COL13 jak we francuskim zgłoszeniu patentowym 98 03707). Cztery z tych ORF wykazują znaczną homologię z analogicznymi ORF z genomu PK-15. ORF1 (Meehan i wsp., 1998; odpowiadający COL4 we francuskim zgłoszeniu patentowym 98 03707) obejmujący nt (nukleotydy) 398-1342 (GenBank numer dostępu AF055392) potencjalnie może kodować białko o przewidywanej masie cząsteczkowej 37,7 kD. ORF2 (Meehan i wsp., 1998; odpowiada COL13 we francuskim zgłoszeniu patentowym 98 03707) obejmuje nt 1381-1768 połączone z 1-314 (GenBank numer dostępu AF055392) może kodować białko o przewidywanej masie cząsteczkowej 27,8 kD. ORF3 (Meehan i wsp., 1998; odpowiada COL7 z francuskiego zgłoszenia patentowego 98 03707), obejmuje nt 1018-704 (GenBank numer dostępu AF055392) i może kodować białko o przewidywanej masie cząsteczkowej 11,9 kD. ORF4 (Meehan i wsp., 1998; który odpowiada COL10 we francuskim zgłoszeniu patentowym 98 03707) obejmuje nt 912-733 (GenBank numer dostępu AF055392) i może potencjalnie kodować białko o przewidywanej masie cząsteczkowej 6,5 kD.
ORF1 z PCV2 jest wysoce homologiczny (86% identyczności) do ORF1 izolatu PK-15 (Meehan i wsp., 1998). Białko kodowane przez ORF1 PK-15 częściowo scharakteryzowano (Meehan i wsp., 1997; Mankertz i wsp., 1998a). Wiadomo, że jest ono niezbędne do replikacji wirusa i prawdopodobnie jest zaangażowane w replikację wirusowego DNA. Identyczność sekwencji białkowej między odpowiadającymi ORP2 była niższa (66% identyczności) niż dla ORF1, ale każdy z ORF2 wykazywał obecność silnie konserwowanego, zasadowego obszaru na N-końcu, podobnego do obserwowanego w obszarze N-końca głównego białka strukturalnego ptasiego cirkowirusa wirusa zakaźnej anemii
PL 205 130 B1 kurcząt (CAV) (Meehan i wsp., 1998). Niedawno w publikacji Mankertz i wsp. (1998b) zasugerowali, że ORP2 izolatu PK-15 (określany jako ORP 1 w Mankertz i wsp., 1998b) koduje białko kapsydu.
Obserowano większe różnice między odpowiednimi ORP3 i ORP4 izolatu PK-15 i PCV2. W każdym przypadku występowała delecja C-końcowego regionu ORF4 i ORF3 PCV2 w porównaniu z odpowiednimi ORF-ami obecnymi w genomie izolatu PK-15. Najwyż szą homologię sekwencji biał kowych zaobserwowano dla N-końcowych obszarów zarówno ORF3 jak i ORF4 (Meehan i wsp., 1998).
Jak dotąd nie zostały opublikowane analizy transkrypcji genomu PCV2. Niedawno uzyskane dane dla izolatu PK-15 wskazują, że następuje wycinanie intronów w transkrypcie ORF2 (Mankertz i wsp., 1998b).
Wirus krowianki skutecznie wykorzystano do szczepień przeciwko ospie, co doprowadziło do ogólnoświatowej likwidacji ospy w roku 1980. Wraz z wykorzenieniem ospy, istotna stała się inna rola dla wirusów ospy jako wektorów poddanych inżynierii genetycznej przeznaczonych do ekspresji obcych genów (Panicali i Paoletti, 1982; Paoletti i wsp., 1984). Geny kodujące heterologiczne antygeny wyrażano w wirusie krowianki, często osiągając ochronną odporność przeciwko odpowiadającemu patogenowi (omówione przeglądowo w Tartaglia i wsp., 1990). Silnie osłabiony dla szczepionek szczep, oznaczony jako MVA wykorzystano także jako wektor dla szczepionek opartych na wirusie ospy. Wykorzystanie MVA opisano w amerykańskim patencie U.S. nr 5,185,146.
Dwa dodatkowe systemy wektorów szczepionkowych zakładają wykorzystanie wirusów ospy o naturalnym ograniczeniu gospodarza. Oba, wirus ospy drobiu (FPV, Taylor i wsp., 1988a, b) i wirus ospy kanarków (CPV, Taylor i wsp., 1991, 1992) poddano inżynierii genetycznej tak, aby wyrażały produkty obcych genów. Wirus ospy drobiu (FVP) jest modelowym wirusem rodzaju Avipoxvirus z rodziny Poxviridae (Pokswirusów). Wirus powoduje znaczą c ą ekonomicznie chorobę drobiu dobrze kontrolowaną od lat 1920 przez zastosowanie żywych atenuowanych szczepionek. Replikacja wirusów ptasiej ospy jest ograniczona do gatunków ptaków (Matthews, 1982) i nie ma doniesień w literaturze o wydajnej infekcji jakiegokolwiek gatunku nie będącego ptakiem, włączając człowieka, spowodowanej przez wirusa ptasiej ospy. Takie ograniczenie względem gospodarza dostarcza naturalnej bariery bezpieczeństwa przed przenoszeniem wirusa na inne gatunki i powoduje, że jest atrakcyjną propozycją zastosowanie wektorów szczepionkowych opartych na wirusach ptasiej ospy w zastosowaniach weterynaryjnych i podawaniu ludziom.
FPV korzystnie zastosowano jako wektor wyrażający antygeny z patogenów drobiu. Białko hemaglutyniny złośliwego wirusa ptasiej grypy wyrażano w rekombinancie FPV (Taylor i wsp., 1988c). Po zaszczepieniu rekombinantem kurczaków i indyków następowała indukcja odpowiedzi immunologicznej, która powodowała ochronę w stosunku do prowokacji zarówno homologicznym jak i heterologicznym zł oś liwym wirusem grypy (Taylor i wsp., 1988c). Wytworzono tak ż e rekombinanty FPV wyrażające glikoproteiny powierzchniowe wirusa choroby Newcastle (NDV - wirusa rzekomego pomoru drobiu) (Taylor i wsp., 1990; Edbauer i wsp., 1990).
Inne atenuowane wektory wirusów ospy wytworzono przez genetyczne modyfikacje szczepów wirusa typu dzikiego. Wektor NYVAC otrzymany przez usunięcie specyficznej wirulencji i genów specyficzności względem gospodarza z kopenhaskiego szczepu krowianki (Tartaglia i wsp., 1992) okazał się użyteczny jako wektor rekombinowany, w wywoływaniu ochronnej odpowiedzi immunologicznej przeciw wyrażanym obcym antygenom.
Innym uzyskanym technikami inżynierii genetycznej wirusem jest ALVAC, pochodzący od wirusa ospy kanarków. ALVAC nie replikuje się wydajnie w gospodarzu nie będących ptakiem, co zatem charakterystycznie zwiększa jego profil bezpieczeństwa (Taylor i wsp., 1991 i 1992). Zarówno ALVAC i NYVAC są wektorami BSL-1.
Jednym podejściem do opracowania podjednostkowej szczepionki PCV2 jest zastosowanie żywych wektorów wirusowych do wyrażania odpowiednich ORF PVC2. Zrekombinowane wirusy ospy można konstruować w dwóch etapach znanych w dziedzinie i analogicznych ze sposobami tworzenia sztucznych rekombinantów wirusów ospy, takich jak wirus krowianki i wirus ospy ptasiej opisanymi w patentach US Nr 4,769,330, 4,722,848, 4,603,112; 5,110,587; 5,174,993; 5,494,807 i 5,505,941, których ujawnienia niniejszym włączono jako odniesienia. Należy, więc uznać, że będzie bardzo korzystne względem obecnego stanu techniki dostarczenie rekombinowanych wirusów ospy z PCV2 i pochodzących od nich kompozycji i wytworów zwłaszcza rekombinantów PCV2 opartych o ALVAC oraz kompozycji i wytworów od nich pochodzących, a w szczególności takich rekombinantów zawierających ORF1 i/lub ORF2 z PCV2 oraz kompozycji i produktów od nich pochodzących.
PL 205 130 B1
Okazało się zadziwiająco, że PCV-2 jest czynnikiem powodującym zapalenie mięśnia sercowego, poronienia i zakażenia wewnątrzmaciczne, jak i poodsadzeniowy wielonarządowy zespół wyniszczający.
Istota wynalazku dotyczy zastosowania kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku do obniżenia obciążenia świńskim cirkowirusem typu 2 (PCV-2) w węzłach oskrzelowych i krezkowych świń, w której kompozycja szczepionkowa obejmuje farmaceutycznie lub weterynaryjnie dopuszczalny nośnik i/lub podłoże i/lub zaróbkę i/lub adiuwant, i immunogen PCV-2, przy czym immunogenem PCV-2 jest inaktywowany PCV-2, lub immunogenem PCV-2 jest atenuowany PCV-2, lub immunogen PCV-2 może być wyrażany z wektora obejmującego fragment DNA zawierający sekwencję nukleotydową kodująca ORF4 i /lub ORF13 z PCV-2.
Korzystnym wektorem jest wektor ekspresyjny i jest on wybrany z grupy składającej się z plazmidowego DNA, E.coli, bakulowirusów, wirusów herpes, wirusa choroby Aujeszkiego, świńskich adenowirusów, wirusów ospy, wirusa krowianki, wirusa ospy ptasiej, wirusa ospy kanarków i wirusa ospy świń, korzystniej wektorem jest plazmidowy wektor DNA.
Ponadto w równie korzystnym wykonaniu wynalazku wektor zawiera i wyraża ORF13 z PCV-2 lub ORF4 i ORF13 z PCV-2.
Z definicji immunogen PCV-2 ma obejmować ż ywy atenuowany lub inaktywowany PCV-2 lub podjednostkę (podjednostki) z PCV-2 uzyskane przez ekspresję in vitro lub ekstrakcję lub fragment(y) obejmujące przynajmniej jeden interesujący epitop, który może być uzyskany za pomocą syntezy chemicznej lub przez lub ekspresję in vitro rekombinantów jak również zrekombinowanego/ych wektora(ów) obejmującego/ych i wyrażającego/ych in vivo sekwencję/e lub fragment/y lub epitop/y genomu PCV-2 jak tu ujawniono lub takich jak w cytowanych dokumentach lub podanych jako odnośniki.
Podobna definicja dotyczy immunogenu innego patogenu świni jak zostało to ujawnione w opisie wynalazku.
Według definicji kompozycja immunogenna wywołuje odpowiedź immunogenną - lokalną lub ogólnoustrojową. Kompozycja szczepionki wywołuje odpowiedź ochronną lokalną lub ogólnoustrojową. Określenie „kompozycja immunogenna obejmuje „kompozycję szczepionkową (jako że poprzednie określenie może dotyczyć kompozycji ochronnej).
Tak więc opisane rozwiązania będą dotyczyć sposobów i/lub kompozycji dla zapobiegania i/lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego powodowanego przez PCV-2 i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego jak i poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego i/lub patologicznych następstw obejmujących, ale nie ograniczonych do, poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego; jak i sposobów formułowania takich kompozycji (które to kompozycje mogą także zawierać immunogen parwowirusa świni (PPV)) oraz również zastosowania immunogenu z PCV-2 do formułowania takich kompozycji.
Stąd możliwe jest zastosowanie immunogenów PCV-2 do przygotowania kompozycji przeznaczonej do zapobiegania i/lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronień i/lub zakażeń wewnątrzmacicznych powodowanych przez PCV-2.
Przedstawiono również izolację i charakterystykę nowych szczepów PCV-2 określonych jako 1103 (1103/1 P.2) i 1121 (1121/1 P.1) i ich zastosowanie do wytwarzania immunogenów jak i antygenów i przeciwciał do zastosowania w diagnostyce, w związku z zapaleniem mięśnia sercowego i/lub poronieniem i/lub zakażeniem wewnątrzmacicznym, jak i poodsadzeniowym wielonarządowym zespołem wyniszczającym i/lub związanym z nim patologicznymi następstwami powodowanym przez PCV-2.
Zgłaszający stwierdził, że konstrukty plazmidów kodujące i wyrażające immunogeny PCV-2 mogą być stosowane do immunizacji świń przeciwko zespołowi PMWS.
Immunogeny PCV-2 mogą być stosowane w kombinacji z immunogenami PCV-1 tak, aby również immunizować zwierzęta przeciwko PCV-2.
Jest mniej korzystne stosowanie samych immunogenów z PCV-1. Do immunizacji świń mogą być stosowane konstrukty plazmidów kodujące i wyrażające immunogen PCV-1 lub PCV-2, w szczególnoś ci obejmują ce otwarte ramki odczytu (ORF) 1 i/lub 2 z PCV-1 i ORF1 i/lub 2 z PVC-2.
Jest oczywiste, że w rozwiązaniach według wynalazku mogą być również wykorzystywane plazmidy kodujące i wyrażające ekwiwalentne sekwencje nukleotydowe to znaczy sekwencje, które nie zmieniają ani funkcjonalności ani specyficzności szczepu ze względu na rozważany gen lub polipeptydy kodowane przez ten gen. Będzie to również dotyczyło sekwencji różniących się ze względu na degenerację kodu.
PL 205 130 B1
Sekwencje PCV-2 stosowane w przykładach pochodzą z Meehan i wsp. powyżej (nukleotydy ORF1 389-1342; nukleotydy ORF2 1381-314; i odpowiadają odpowiednio ORF4 i ORF13 w US 09/161,092 z 25 września 1998 oraz COL4 i COL13 w WO-A-9918214). Inne sekwencje PCV-2 zostały opublikowane w WO-A-9918214 i są nazwane Imp1008, Imp999, Imp1011-48285 i Imp1011-48121 jak i w A.L. Hamel i wsp. J. Virol., czerwiec 1998, tom 72, 6: 5262-5267 (GenBank AF027217) oraz w I. Morozov i wsp. J. Clinical Microb. wrzesień 1998 tom 36, 9: 2535-2541 jak i GenBank jako AF086834, AF086835 i AF086836, co daje dostęp do ekwiwalentnych sekwencji ORF.
Rozwiązania opisane w wynalazku mogą również wykorzystywać ekwiwalentne sekwencje, w tym znaczeniu, ż e są one zdolne do hybrydyzacji do sekwencji nukleotydowej rozważ anego genu w warunkach o wysokiej ostrości. Wśród ekwiwalentnych sekwencji mogą być także wymienione fragmenty genów zachowujące immunogenność całej sekwencji. Inne ORF 1-3 i 5-11 ujawnione w US 09/161,092 z 25 wrześ nia 1998 (COL 1-3 i 5-12 w WO-A-9918214) w szczególnoś ci ORF7 i 10 mogą być stosowane w warunkach tu opisanych w kombinacjach lub inaczej ze sobą lub z ORF1 i ORF2 jak tu zdefiniowano.
Rozwiązania według wynalazku pozwalają na prowadzenie szczepienia samic świń (np. macior, loszek) kompozycją obejmującą (przynajmniej jeden) immunogen PCV-2 (która to kompozycja może też zawierać immunogen z parwowirusa świni) przed rozmnażaniem i/lub przed kopulacją, i/lub w czasie ciąży i/lub przed okresem okoł oporodowym lub prosieniem; i/lub wielokrotnie w czasie ż ycia, aby zapobiec zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniu i/lub zakażeniu wewnątrzmacicznemu związanemu z PCV-2 jak i poodsadzeniowemu wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu i innym patologicznym konsekwencjom zwią zanym z PCV-2 lub, aby wywoł a ć immunogenną lub ochronną odpowiedź przeciwko PCV-2 i w ten sposób zapobiec poodsadzeniowemu wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu i/lub zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniu i/lub zakażeniu wewnątrzmacicznemu związanemu z cirkowirusem-2 świni i/lub innym patologicznym następstwom związanym z PCV-2.
Korzystnie, co najmniej jedno szczepienie jest prowadzone przed pokryciem. Następnie korzystnie szczepienie wykonuje się w czasie ciąży tzn. w około połowie ciąży (w około 6-8 tygodniu ciąży) i/lub na końcu ciąży (w około 11-13 tygodniu ciąży). Tak, więc w korzystnym reżimie podawania szczepienie następuje przed pokryciem i przypominające szczepienie jest prowadzone w trakcie ciąży. Następnie może być prowadzone ponowne szczepienie przed każdym pokryciem i/lub w czasie ciąży w około połowie ciąży (w około 6-8 tygodniu ciąży) i/lub na końcu ciąży (w około 11-13 tygodniu ciąży). Korzystnie ponowne szczepienie można wykonywać jedynie w czasie ciąży.
W innym korzystnym wykonaniu prosiaki, takie jak prosiaki ze szczepionych samic (na przykł ad, zaszczepionych tak jak tu opisano) są szczepione w czasie pierwszych tygodni życia np. szczepienie jest przeprowadzone w wieku pierwszego i/lub drugiego i/lub trzeciego i/lub czwartego i/lub piątego tygodnia życia. Bardziej korzystnie prosiaki szczepi się najpierw w pierwszym tygodniu życia lub w trzecim tygodniu ż ycia (tzn. w momencie odstawienia od piersi). Jeszcze bardziej korzystnie takie prosiaki następnie otrzymują dawkę wspomagającą dwa (2) do cztery (4) tygodnie później (po pierwszym szczepieniu). Stąd zarówno potomstwo jak i świnie płci żeńskiej (np. maciory, loszki) mogą otrzymać kompozycje przedstawione w opisie wynalazku.
Zatem możliwe jest wytworzenie immunogennych lub szczepionkowych kompozycji zawierających immunogen(y) ze szczepu (szczepów) PCV-2 1103 i/lub 1121 do zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego związanego z PCV-2 jak i poodsadzeniowego wielonarzą dowego zespołu wyniszczają cego i innych patologicznych następstw związanych z PCV-2.
Immunogen PCV-2 może być zastosowany do formułowania kompozycji immunogennej lub szczepionkowej do zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego związanego z PCV-2 jak i poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego i innych patologicznych konsekwencji związanych z PCV-2.
Taka kompozycja immunogenna lub szczepionkowa przeznaczona do zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego związanego z PCV-2 jak i poodsadzeniowego wielonarzą dowego zespołu wyniszczają cego moż e zawierać noś nik i/lub podłoże i/lub zaróbkę i/lub adiuwant dopuszczalny farmaceutycznie lub w weterynarii i immunogen PCV-2.
Kompozycja może dodatkowo zawierać przynajmniej jeden immunogen, z co najmniej jednego dodatkowego patogenu świni, na przykład, zespołu rozrodczo-oddechowego świń (PRUS), MyPL 205 130 B1 coplasma hyopneumoniae, Actinobacillus pleuropneumoniae, E. coli, Bordetella bronchiseptica, Pasteurella multocida, Erysipelothrix rhusiopathiae, pseudowścieklizny, cholery świń, grypy świń i parwowirusa świń (PPV). Tak więc, kompozycje oparte na wektorach mogą zawierać co najmniej jeden immunogen świni z co najmniej jednego dodatkowego patogenu świni, taki jak wektor wyrażający sekwencję patogenu, przy czym wektor może również być wektorem wyrażającym immunogen PCV-2. Wektor wyrażający sekwencje PCV-2 może obejmować sekwencję lub fragment PCV-2. W opisie zostały przedstawione takie cząsteczki kwasu nukleinowego, wektory je zawierające, kompozycje obejmujące takie cząsteczki kwasu nukleinowego lub produkty ekspresji wektora z takich cząsteczek kwasu nukleinowego, kompozycje obejmujące takie produkty ekspresji, sondy lub startery dla takich cząsteczek kwasu nukleinowego i sposoby wytwarzania lub zastosowania dowolnego lub wszystkich wymienionych powyżej.
Wektor może obejmować DNA wektorowego plazmidu, bakterię taką jak E. coli, wirus taki jak bakulowirus, wirus opryszczki w tym herpeswirusy świni, w tym wirus choroby Aujeszky'ego, adenowirus w tym adenowirus świni, wirus ospy, w tym wirus krowianki, wirus ospy ptasiej, wirus ospy kanarków, wirus ospy szopa i wirus ospy świni, i tym podobne. Kompozycje oparte na wektorze mogą zawierać wektor, który zawiera i wyraża ORF wybrany z grupy złożonej z ORF 1 do 13, taki jak ORF wybrany z ORF 4, 7, 10 i 13, korzystnie ORF4 i/lub 13 z PCV-2, korzystnie z dowolnego ze szczepów PCV-2 tu zidentyfikowanych i w szczególności szczepów 1103 i/lub 1121. Ponadto immunogen w kompozycjach (albo PCV-2 i/lub z innego patogenu ś wini) moż e być wytworzony w sposób zrekombinowany.
Słowo plazmid ma obejmować dowolną jednostkę transkrypcyjną DNA w postaci sekwencji polinukleotydowej obejmującej sekwencję PCV, która ma ulec ekspresji. Korzystnie plazmid obejmuje elementy niezbędne do jego ekspresji, na przykład ekspresji in vivo. Korzystna będzie kolista forma plazmidu, superskręcona lub nie, jaki plazmid w formie liniowej. Plazmidowa kompozycja immunogenna lub szczepionkowa może być podawana za pomocą pistoletu genowego, śródskórnie przy pomocy bezigłowego wtryskiwacza, podskórnie lub domięśniowo lub poprzez śluzówki, lub w dowolny inny sposób, który pozwala na ekspresję in vivo, i korzystnie wytworzenie odpowiedzi immunogennej lub ochronnej.
Należy zauważyć, że produkt ekspresji wytwarzany przez opisane wektory lub rekombinanty może też dowolnie być izolowany i/lub oczyszczany z komórek zakażonych lub transfekowanych, przykładowo aby wytworzyć kompozycje do podawania świniom, jednak w niektórych przypadkach może być korzystne nie izolowanie i/lub oczyszczanie produktu ekspresji z komórki, szczególnie jeśli komórka lub jej części wzmagają efekt immunogenny polipeptydu. Ponadto są znane techniki oczyszczania i/lub izolacji białek, które mogą zostać zastosowane bez nadmiernego eksperymentowania, tak aby oczyszczać i/lub izolować produkty zrekombinowane i/lub produkty ekspresji wektora i/lub podjednostek PCV-2 i/lub innych patogenów świni. Takie techniki zasadniczo będą obejmować strącanie z wykorzystaniem przewagi rozpuszczalności interesującego białka w różnych stężeniach soli, strącanie rozpuszczalnikami organicznymi, polimery i inne materiały, strącanie przez powinowactwo i selektywną denaturację, chromatografię kolumnową, w tym wysoce wydajną chromatografię cieczową (HPLC), wymianę jonową, powinowactwo, immunopowinowactwo lub chromatografię z ligandami barwników; immunoprecypitację, filtrację na żelu, metody elektroforetyczne, ultrafiltrację oraz ogniskowanie izoelektryczne i ich kombinacje oraz kombinacje pomiędzy nimi.
W opisie wynalazku przedstawione są sposoby zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego związanego z PCV-2 jak i poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego i innych patologicznych konsekwencji związanych z PCV-2 obejmujące indukcję immunogennej lub ochronnej odpowiedzi przeciw PCV-2 u ś wini, która obejmuje podanie ś wini kompozycji wymienionej uprzednio lub tu ujawnionej.
Stąd opisane rozwiązania umożliwiają prowadzenie sposobu zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego związanego z PCV-2 jak i poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego i innych patologicznych konsekwencji związanym z PCV-2, który to sposób obejmuje indukcje odpowiedzi immunogennej lub ochronnej przeciw PCV-2 u świni i będzie obejmował podanie świni kompozycji zawierającej czynny składnik obejmujący immunogen PCV-2 oraz nośnik lub zaróbkę lub nośnik, korzystnie z adiuwantem dopuszczalne farmaceutycznie lub w weterynarii. Taki sposób może być prowadzony w celu zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego związanego z PCV-2 i może obejmować podanie kompozycji obejmującej nośnik dopuszczalny far8
PL 205 130 B1 maceutycznie lub w weterynarii i immunogen PCV-2. Immunogen PCV-2 może być atenuowanym żywym całym PCV-2 lub inaktywowanym PCV-2. W prowadzeniu sposobu może być wykorzystana kompozycja, która jest kompozycją podjednostkową, immunogenną lub szczepionkową. Sposób może być prowadzony przy wykorzystaniu kompozycji dodatkowo zawierającej przynajmniej jeden immunogen z przynajmniej jednego dodatkowego patogenu świni, zawierającej wektor wyrażający immunogen lub epitop, np. przynajmniej jeden dodatkowy patogen świni może być wybrany z grupy złożonej z PRRS, Mycoplasma hyopneumoniae, Actinobacillus pleuropneumoniae, E. coli, pseudowś cieklizny, cholery świń, Bordetella bronchiseptica, Pasteurella multocida, Erysipelothrix rhusiopathiae, świńskiej grypy i PPV oraz ich kombinacji. W prowadzeniu sposobu może być wykorzystany wektor, który jest plazmidem wektorowym DNA, bakterią taką jak E. coli, wirusem takim jak bakulowirus, wirusem opryszczki (herpeswirusem) w tym wirusem choroby Aujeszky'ego, adenowirusem w tym adenowirusem świni, wirusem ospy, w tym wirusem krowianki, wirusem ptasiej ospy, wirusem ospy kanarków, wirusem świńskiej ospy i im podobnymi. W sposobie może być wykorzystana kompozycja oparta na wektorze dodatkowo zawierającą przynajmniej jedną sekwencję, fragment lub epitop z przynajmniej jednego dodatkowego patogenu świni, lub wektor wyrażający taką sekwencję, fragment lub epitop, przy czym wektor może również być wektorem wyrażającym sekwencję, fragment lub epitop PCV-2. W prowadzeniu sposobu może być wykorzystany wektor, który zawiera i wyraża ORP wybrany z grupy zł o ż onej z ORF1 do 13, taki jak ORF wybrany z ORF 4, 7, 10 i 13, korzystnie ORF 4 i/lub 13. Sposób też może także być prowadzony z zastosowaniem kompozycji opartej na immunogenie, przy czym jeden lub więcej immunogenów jest wytwarzanych w sposób rekombinowany. W tym sposobie samice i/lub prosiaki są korzystnie szczepione jak to opisano powyżej.
W innym wykonaniu sposobów wytworzenia dowolnej z kompozycji wymienionych uprzednio lub tu ujawnionych będą one obejmowały domieszanie nośnika dopuszczalnego farmaceutycznie lub w weterynarii i ewentualnie adiuwanta i immunogenu PCV-2. Sposób moż e dalej obejmować transfekcję lub zakażenie komórki lub gospodarza zrekombinowanym wektorem, który zawiera DNA kodujący immunogen PCV-2 i wyraża ten immunogen oraz dowolnie oczyszczenie i/lub izolację immunogenu z komórki. Podobnie sposób może obejmować izolację i/lub oczyszczenie immunogenu PCV-2 z PCV-2 lub izolację PCV-2 z próbki.
Ujawnione rozwiązania pozwalają również wytworzyć zestaw umożliwiający wytworzenie dowolnej z kompozycji uprzednio wymienionych lub tu ujawnionych lub przeznaczonej do wykonania dowolnego z uprzednio wymienionych lub tu ujawnionych sposobów obejmujący w pierwszym pojemniku nośnik dopuszczalny farmaceutycznie lub w weterynarii lub podłoże lub zaróbkę i w drugim pojemniku składnik czynny zawierający immunogen PCV-2, przy czym pierwszy i drugi pojemnik mogą być pakowane razem lub osobno. Ponadto zestaw może zawierać instrukcję o sposobie mieszania składników kompozycji i/lub podawania kompozycji.
Każda z kompozycji wymienionej powyżej lub tu ujawnionej może być podawana świniom płci męskiej i/lub żeńskiej w celu zapobiegania przekazywaniu PCV-2 i dla zapobiegania i/lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego powodowanego przez PCV/2 i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego jak i poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego i/lub patologicznych konsekwencji związanych z PCV-2. Podawanie przeprowadza się korzystnie w sposób jak został opisany powyżej. Określenie „obejmujący w tym ujawnieniu może oznaczać „zawierający lub może mieć znaczenie szersze, powszechnie nadawane określeniu „obejmujący w Prawie Patentowym USA.
Świński cirkowirus-2 (PCV-2) jest czynnikiem związanym z poodsadzeniowym wielonarządowym zespołem wyniszczającym (PMWS) w populacjach świń. Jak pokazano w Przykładach 1 i 2, potencjalne spektrum choroby związanej z PCV-2 jest poszerzone przez dowody na przekaz pionowy i zwią zanym z nim niepowodzeniem rozmnaż ania.
W szczególności w przedstawionym Przykładzie 1 pokazano, że PCV-2 został wyizolowany z miotu poronionych prosiąt z gospodarstwa, w którym występowały poronienia w późnej ciąży oraz martwe porody. U jednego prosiaka stwierdzono ostre, rozproszone zapalenie mięśnia sercowego z rozległ ym barwieniem immunohistochemicznym na antygen PCV-2. Zmienne iloś ci antygenu PCV-2 były również obecne w wątrobie, płucach i nerkach wielu płodów. Nie stwierdzono obecności innych czynników, które były łączone z uszkodzeniami płodów i poronieniami u świń w tym parwowirusa świni, wirusa zespołu rozrodczo-oddechowego świń, wirus zapalenia mięśni i mózgu i mięśnia sercowego (wirus encephalomyocarditis) i enterowirusa.
PL 205 130 B1
Bardziej szczegółowo Przykład 2 wykazuje, że tkanki uzyskane z 30 wysoce zdrowych stad w okresie czterech lat i badane w rutynowych przypadkach poronień lub niepowodzenia rozmnaż ania były PCV-2 dodatnie w dwóch zgłoszeniach obejmujących kilka martwo urodzonych prosiaków i nieżywotnych noworodków z poważnym rozproszonym zapaleniem mięśnia sercowego, hipertrofią serca i oznakami przewlekłego biernego zastoju krwi. Dwa dodatnie przypadki były z tego samego gospodarstwa, ale wystąpiły w dwóch różnych okresach. Obecność PCV-2 w sercach i innych tkankach dotkniętych prosiąt była potwierdzona za pomocą immunohistochemii i izolacji wirusów. Brak wykrycia cikrowirusów świni w przypadkach niepowodzenia rozmnażania przed 1999 w obszarach zakażeń endemicznych potwierdza pogląd, że choroba reprodukcyjna jest nowym klinicznym przejawem zakażenia PCV-2 i dalej sugeruje, że sposoby transmisji płciowe jak i pionowe są odpowiedzialne za rozprzestrzenianie wirusa w populacji świni.
Tak więc, szczepienie świń np. świń płci żeńskiej takich jak maciory lub loszki kompozycją zawierającą przynajmniej jeden immunogen PCV-2 (np. z przynajmniej jednego szczepu wybranego ze szczepów Imp1008, Imp1010, Imp999, Imp1011-48285, Imp1011-48121, 1103 i 1121) (które to kompozycje mogą również zawierać przynajmniej jeden immunogen z co najmniej jednego innego patogenu świni takiego jak parwowirus świń, przy czym gdy jest stosowany wektor może z niego zachodzić jednoczesna ekspresja zarówno immunogenu PCV-2 i przynajmniej jednego immunogenu, z co najmniej jednego innego patogenu świni np. między innymi immunogenu PPV). Szczepienie w szczególności może być prowadzone w schemacie immunizacji jak opisanym powyżej i może zapobiegać zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniom i/lub zakażeniom wewnątrzmacicznym związanym z PCV-2 jaki poodsadzeniowemu wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu i innym patologicznym konsekwencjom związanym z PCV-2.
Zatem w opisanych sposobach i kompozycjach wykorzystany jest immunogen PCV-2 tak, aby zapobiegać zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniom i/lub zakażeniom wewnątrzmacicznym związanym z PCV-2 jak i poodsadzeniowym wielonarządowym zespołem wyniszczającymi innym patologicznym konsekwencjom związanym z PCV-2. Szczególnie korzystny będzie immunogen ze szczepu 1103 i/lub szczepu 1121 do zastosowania w sposobach i kompozycjach wykorzystujących immunogen PCV-2, aby zapobiegać zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniom i/lub zakażeniom wewnątrzmacicznym związanym z circovirusem-2 świni.
W celu wytworzenia kompozycji immunogennej lub szczepionkowej, dla zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażeń wewnątrzmacicznych związanych z PCV-2 jak i poodsadzeniowemu wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu i innym patologicznym konsekwencjom związanym z PCV-2 można zastosować dowolny znany szczep lub immunogen PCV-2. W szczególności szczepy te obejmują szczepy Imp1008, Imp1010, Imp999, Imp1011-48285, Imp1011-48121, 1103 i 1121, w szczególności, jeśli kompozycja ma być podawana prosiakom takim jak prosiaki od zaszczepionych samic a szczególnie samicom świni, w szczególności samicom w ciąży lub samicom, które będą kryte, korzystnie według schematów szczepień zdefiniowanych powyżej.
Bardziej szczegółowo możliwe jest zastosowanie do formułowania takich kompozycji, które są przeznaczone do zapobiegania lub leczenia zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronień i/lub zakażeń wewnątrzmacicznych związanych z PCV-2 w szczególności, jeśli kompozycja ma być podawana prosiakom takim jak prosiaki od zaszczepionych samic i bardziej szczególnie samicom świni, w szczególności samicom w ciąży lub samicom, które będą kryte; i bardziej szczególnie według schematów szczepień zdefiniowanych powyżej.
Przynajmniej jeden immunogen, z co najmniej jednego innego patogenu świni może być stosowany tak jak w znanych szczepionkach lub kompozycjach immunogennych dla świń lub jak zostało to opisane w WO 98/03658.
Kompozycje do stosowania zgodnie z ujawnieniem wynalazku mogą być wytworzone zgodnie ze standardowymi technikami dobrze znanymi specjalistom w naukach weterynaryjnych lub farmaceutycznych i biorąc pod uwagę takie czynniki jak wiek, płeć, waga, jej stan i konkretne traktowanie danej świni i sposób podania. Kompozycje mogą być podawane same lub mogą być podawane razem lub kolejno z innymi kompozycjami przedstawionymi w opisie wynalazku (np. innymi kompozycjami zawierającymi immunogen PCV-2) lub z innymi kompozycjami profilaktycznymi lub terapeutycznymi (np. innymi kompozycjami immunogennymi lub szczepionkowymi). Tak, więc zapewnione są kompozycje wielowartościowe, lub „koktailowe lub ich kombinacyjne oraz sposoby je wykorzystujące. Pod tym względem należy się odnieść do patentu US Nr 5,843,456 dotyczącego kompozycji przeciw wściekliźnie i kombinacji tych kompozycji i ich zastosowań.
PL 205 130 B1
Opisane kompozycje mogą być stosowane do podawania pozajelitowego lub dośluzówkowego korzystnie drogą śródskórną lub domięśniową. W szczególności dla drogi śródskórnej można zastosować iniekcje z wykorzystaniem wtryskiwacza bezigłowego. Gdy podawanie jest prowadzone drogą dośluzówkową, możliwe jest podawanie drogą doustną, donosową lub dooczną.
W takich kompozycjach immunogen(y) mogą być w mieszaninie z odpowiednim nośnikiem, rozcieńczalnikiem lub zaróbką takim jak sterylna woda, sól fizjologiczna, glukoza lub tym podobne, i/lub korzystnie z adiuwantem. Kompozycje mogą być też liofilizowane lub zamrożone. Kompozycje mogą również zawierać dodatkowe substancje takie jak czynniki buforujące pH, adiuwanty, środki konserwujące, zaróbki polimerowe stosowane do dróg śluzówkowych i tym podobne w zależności od drogi podania i pożądanego preparatu.
W celu przygotowania odpowiednich preparatów bez nadmiernego eksperymentowania można się odnieść do standardowych publikacji z tej dziedziny takich jak „Remington's Pharmaceutical Science, wydanie 17, z 1985 roku. Odpowiednie dawki mogą być także ustalone na podstawie wiadomości podanych na tym tekście oraz w cytowanych w nim dokumentach.
Adiuwanty są substancjami, które wzmagają odpowiedzi immunologiczne na immunogeny. Adiuwanty będą zawierać wodorotlenek glinu i fosforan glinu, saponiny np. Quil A, emulsję woda-w-oleju, emulsję olej-w-wodzie, emulsję woda-w oleju-w wodzie. Emulsja może być oparta w szczególności na bazie płynnego lekkiego oleju parafinowego (typu Farmakopea europejska); oleju izoprenoidowego takiego jak skwalan lub skwalen; oleju będącego wynikiem oligomeryzacji alkenów, w szczególności izobutenu lub decenu; estrów kwasów lub alkoholi z liniową grupą alkilową, bardziej szczególnie olei roślinnych, oleinianu etylu, di(kaprylanu/kaprynianu) glikolu propylenowego, tri(kaprylanu/kaprynianu) glicerolu lub dioleinianu glikolu propylenowego; estrów alkoholi lub kwasów tłuszczowych rozgałęzionych, w szczególności estrów kwasu izostearynowy. Olej jest stosowany w połączeniu z emulgantami, aby wytworzyć emulsję. Emulganty są korzystnie niejonowymi środkami powierzchniowo czynnymi w szczególności estrami sorbitanu, mannidu (np. oleinian anhydromannitolu), glicerolu, poliglicerolu, glikolu polipropylenowego i kwasu olejowego, izostearynowego, kwasu rycynolowego lub hydroksystearynowego, które są ewentualnie etoksylowane i bloki kopolimerów polioksypropylenpolioksyetylen w szczególności Pluronic®, w szczególności L121. Patrz Hunter i wsp., The Theory and Practical Application of Adjuvants (red. Stewart-Tull, D.E.S.), John Wiley and Sons, NY, str. 51-94 (1995) i Todd i wsp., Vaccine, 15:564-570 (1997).
Przykładowo możliwe jest stosowanie emulsji SPT opisanej na stronie 147 „Vaccine Design. The Subunit and Adjuvant Approach zredagowany przez M. Powell i M. Newman, Plenum Press, 1995, i emulsji MF59 opisanej na stronie 183 tej samej książki.
Na przykład, szczepionkę zawierającą adiuwant przygotowuje się w sposób następujący: 67% obj./obj. fazy wodnej obejmującej immunogen emulguje się w 2,3% wag./obj. oleinianu anhydromannitolu, 2,6% kwasu olejowego etoksylowanego 11 EO (tlenek etylenu) i 28,1% obj./obj. lekkiego płynnego oleju parafinowego (typ Farmakopea europejska) za pomocą emulgującego turbomiksera.
Alternatywny sposób przygotowania emulsji polega na emulgowaniu za pomocą pasaży przez homogenizator wysokociśnieniowy mieszaniny 5% wag./obj. skwalenu, 2,5% wag./obj. Pluronic® L121, 0,2% wag./obj. estru kwasu olejowego i anhydrosorbitolu etoksylowanego 20 EO, 92,3% obj./obj. fazy wodnej obejmującej immunogen.
Jest też możliwe formułowanie z syntetycznymi polimerami (np. homo- i kopolimery kwasu mlekowego i glikolowego, które są stosowane do produkcji mikrosfer, które kapsułkują immunogeny, (patrz Eldridge i wsp. Mol. Immunol. 28:287-294 (1993) np. biodegradowalne mikrosfery), z cytokinami takimi jak IL-2 i IL-12 (patrz np. Patent US Nr 5,334,379) i GMCSF, korzystnie GMCSF świni (czynnik stymulujący kolonie granulocytów i makrofagów; patrz opisy Patentów US 4,999,291 i 5,461,663 jak też między innymi Clark i wsp. Science 1987, 230:1229; Granti wsp., Drugs, 1992, 53:516). Niektóre adiuwanty mogą być wyrażane in vitro z immunogenem/ami i epitopem/ami np. cytokiny, GMCSF (patrz, na przykład, Inumaru i Takamatsu, Immunol. Cell. Biol. 1995, 73:474-76 dotyczący plazmidu kodującego i wyrażającego świński GM-CSF.
Dalszym przykładem adiuwanta jest związek wybrany z polimerów kwasu akrylowego lub metakrylowego i kopolimerów bezwodnika maleinowego i pochodnej alkenylowej. Korzystnymi związkami adiuwanta są polimery kwasu akrylowego lub metakrylowego, które są usieciowane eterami polialkenylowymi cukrów lub polialkoholi. Te związki są znane pod nazwą karbomerów (Pharmeuropa tom 8, nr 2, czerwiec 1996). Specjalista może też odnieść się do US Nr 2 909 462 (włączony jako odnośnik), który opisuje takie polimery akrylowe sieciowane związkiem polihyPL 205 130 B1 droksylowanym zawierającym przynajmniej 3 grupy hydroksylowe, korzystnie nie więcej niż 8, przy czym atomy wodorów przynajmniej trzech hydroksyli są zastąpione przez nienasycone reszty alifatyczne o przynajmniej 2 atomach węgla. Korzystne reszty mają od 2 do 4 atomów węgla, np. grup winylowych, allilowych i innych nienasyconych grup etylenowych. Reszty nienasycone mogą same zawierać inne podstawniki, takie jak metyl. Szczególnie odpowiednie są produkty sprzedawane pod nazwą Carbopol® (BF Goodrich, Ohio, USA) i są one usieciowane allilo-sacharozą lub allilopentaerytritolem. Wśród nich można podać Carbopol® 974P, 934P i 971P. Wśród kopolimerów bezwodnika maleinowego i pochodnych alkenylowych, korzystne są kopolimery EMA® (Monsanto), które są kopolimerami bezwodnika maleinowego i etylenu, liniowe albo usieciowane, przykładowo, usieciowane eterem diwinylowym. W tej kwestii można się odnieść się do J. Fields i wsp. Nature 186:778-780, 4 czerwca 1960.
Z punktu widzenia budowy polimery kwasu akrylowego lub metakrylowego oraz kopolimery EMA® są tworzone korzystnie z jednostek podstawowych o następującym wzorze:
Ri R2
----C-(CHJ x-C-(CH2) y---COOH COOH w którym:
R1 i R2, które są takie same lub różne reprezentują H lub CH3, x = 0 albo 1, korzystnie x = 1, y = 1 albo 2, przy czym x + y = 2.
Dla kopolimerów EMA®, x = 0, y = 2. Dla karbomerów x = y = 1.
Rozpuszczenie tych polimerów w wodzie daje roztwór kwaśny, który należy zneutralizować korzystnie do fizjologicznego pH, w celu otrzymania roztworu adiuwanta, do którego będzie włączona kompozycja immunogenna, immunologiczna lub szczepionkowa. Grupy karboksylowe polimeru są wówczas częściowo w postaci COO-.
Korzystnie roztwór adiuwanta stosowanego w rozwiązaniach według wynalazku, zwłaszcza karbomeru wytwarza się w wodzie destylowanej, korzystnie w obecności chlorku sodu, przy czym uzyskany roztwór ma kwaśny pH. Roztwór wyjściowy rozcieńcza się przez dodanie go do pożądanej ilości (dla uzyskania pożądanego stężenia końcowego) albo istotnej części tej ilości, wody albo roztworu NaCl, korzystnie roztworu fizjologicznego (NaCl 9 g/l) naraz lub w kilku porcjach z równoczesnym lub późniejszym zobojętnieniem (pH 7,3 do 7,4) korzystnie NaOH. Roztwór ten o fizjologicznym pH będzie stosowany jako taki do mieszania ze szczepionką która może być przechowywana w postaci liofilizowanej, płynnej lub zamrożonej.
Stężenie polimeru w końcowej kompozycji szczepionki będzie od 0,01% do 2% wag./obj., np. 0,06% do 1% wag./obj., tak jak od 0,1 do 0,6% wag./obj..
Z niniejszego ujawnienia oraz dziedziny techniki, specjalista moż e wybrać bez nadmiernego eksperymentowania odpowiedni adiuwant, o ile jest to pożądane oraz jego ilość do stosowania w kompozycji immunologicznej, immunogennej lub szczepionkowej.
Opisane kompozycje immunogenne lub szczepionkowe mogą być związane z przynajmniej jedną żywą atenuowaną, inaktywowaną lub podjednostkową szczepionką (jak np. wirus ospy jako wektor lub plazmid DNA) wyrażającą przynajmniej jeden interesujący immunogen lub epitop z przynajmniej jednego innego patogenu świni.
Kompozycje w postaciach przeznaczonych dla różnych dróg podawania są również przewidywane. Podobnie jak poprzednio zostało to opisane skuteczna dawka oraz droga podania są określane przez znane czynniki takie jak wiek, płeć, waga i inne procedury klasyfikacji, które są znane i nie wymagają nadmiernego eksperymentowania. Dawki każdego składnika czynnego mogą być jak jest przedstawione w zacytowanych dokumentach i/lub mogą mieścić się w zakresie od kilkuset lub kilku tysięcy mikrogramów, np. 1 μg do 1 mg, dla immunogennej lub szczepionkowej kompozycji podjednostkowej; i 104 do 1010 TCID50, korzystnie 106 do 108 TCID50 dla inaktywowanej (miano przed inaktywacją) kompozycji immunogennej lub kompozycji szczepionkowej. Dla żywej atenuowanej kompozycji
PL 205 130 B1 immunogennej lub szczepionkowej dawka może być między 101 do 108 TCID50 korzystnie 103 i 106 TCID50.
Rekombinanty lub wektory mogą być podawane w odpowiednich ilościach, tak, aby uzyskać ekspresję in vivo odpowiadającą dawkom niniejszym opisanym i/lub w cytowanych tu dokumentach. Na przykład, odpowiednie zakresy dla zawiesin wirusowych można określać empirycznie. Opisany wektor wirusowy lub rekombinant może być podawany świni drogą zakażenia lub transfekcji do komórek w ilości około przynajmniej 103 pfu (jednostek tworzących łysinki), korzystnie, około 104 pfu do około 1010 pfu, np. około 105 pfu do około 109 pfu, przykładowo około 106 pfu do około 108 pfu, na dawkę np. około 2 ml. I o ile wyrażany jest więcej niż jeden produkt genu przez więcej niż jeden rekombinant, każdy z rekombinantów może być podawany w takiej ilości; lub każdy rekombinant może być podawany tak, że łącznie w kombinacji da to sumę dla rekombinantów obejmującą wskazane ilości.
W kompozycjach plazmidowych stosowanych w rozwią zaniach wedł ug wynalazku mogą być zastosowane dawki tak jak niniejszym opisano lub jak opisano w cytowanych dokumentach. Na przykład odpowiednie ilości każdego plazmidowego DNA w kompozycjach plazmidowych mogą wynosić od 1 μg do 2 mg, korzystnie 50 μg do 1 mg. Zacytowane dokumenty dotyczące wektorów z plazmidowego DNA mogą być poddane konsultacji przez specjalistę bez nadmiernego eksperymentowania tak, aby ustalić odpowiednie dawki dla kompozycji z wektorów plazmidowych DNA, które mogą być wykorzystane w rozwiązaniach według wynalazku.
Dawka kompozycji oraz stężenie w niej składników jak i czas podawania kompozycji, które wywołują odpowiednią odpowiedź immunologiczną mogą być ustalone za pomocą sposobów takich jak miareczkowanie surowic przeciwciałami np. za pomocą oznaczenia ELISA i/lub seroneutralizacji, i/lub przez ocenę prowokacji przez szczepienie świni. Takie oznaczenia nie wymagają nadmiernego eksperymentowania przy stanie wiedzy dostępnym dla specjalisty, niniejszego ujawnienia i wobec zacytowanych tu dokumentów. Również czas właściwy dla kolejnych podań może być ustalony bez nadmiernego eksperymentowania za pomocą przedstawionych niniejszym sposobów oraz dostępnego ogólnie stanu wiedzy.
Immunogen PCV-2 może być uzyskany z PCV-2 lub może być uzyskany z ekspresji in vitro genu lub genów z rekombinantów, lub ich części lub epitopu (epitopów) PCV-2. Sposoby wytworzenia (i zastosowania) wektorów (lub rekombinantów) dla ekspresji mogą być prowadzone według metod ujawnionych między innymi w następujących patentach lub metod analogicznych: US Nr 4,603,112, 4,769,330, 5,174,993, 5,505,941, 5,338,683, 5,494,807, 4,722,848, 5,942,235, 5,364,773, 5,762,938, 5,770,212, 5,942,235, 5,756,103, 5,766,599, 6,004,777, 5,990,091, 6,033,904, 5,869,312, 5,382,425, publikacje PCT WO 94/16716, WO 96/39491, WO 95/30018, Paoletti „Applications of pox virus vectors to vaccination: An update, PNAS USA 93:11349-11353, październik 1996, Moss, „Genetically engineered poxviruses for recombinant gene expression, vaccination and safety PNAS USA 93:11341-11348, październik 1996, Smith i wsp. Patent USA Nr 4,745,051 (zrekombinowany baculowirus), Richardson CD. (redaktor) Methods in Molecular Biology 39, „Baculovirus Expression Protocols (1995 Humana Press Inc.), Smith i wsp. „Production of Huma Beta Interferon in Insect Cells Infected with a Baculovirus Expression Vector, Molecular and Cellular Biology, grudzień, 1983, tom 3, Nr 12, str. 2156-2165; Pennock i wsp. „Strong and Regulated Expression of Escherichia coli B-Galactosidase in Insect Cells with a Baculovirus vector, Molecular and Cellular Biology marzec 1984, tom 4, nr 3 str. 399-406; EPA 0 370 573, zgłoszenie US nr 920,197 złożone 16 października 1986, Patent EP publikacja nr 265785, Patent USA 4,769,331 (zrekombinowany wirus opryszczki), Roizman „The function of herpes simplex virus genes: A primer for genetic engineering of novel vectors, PNAS USA 93:11307-11312, październik 1996, Andreansky i wsp. „The application of genetically engineered herpes simplex viruses to the treatment of experimental brain tumors PNAS USA 93:11313-11318, październik 1996, Robertson i wsp. „Epstein-Barr virus vectors for gene delivery to Blymphocytes, PNAS USA 93:11334-11340, październik 1996, Frolov i wsp. „Alphavirus-based expression vectors: Strategies and applications, PNAS USA 93:11371-11377, październik 1996, Kitson i wsp., J. Virol. 65, 3068-3075, 1991; Patenty US Nr 5,591,439, 5,552,143, WO 98/00166, zaakceptowane zgłoszenia patentowe US Nr 08/675,556 i 08/675,566 oba złożone 3 lipca 1996 (rekombinowane adenowirusy), Grunhaus i wsp., 1992 Adenoviruses as cloning vectors, Seminars in Virology (tom 3) str. 237-52, 1993, Ballay i wsp. EMBO Journal tom 4, str. 3861-65, Graham, Tibtech 8, 85-87, kwiecień, 1990, Prevec i wsp., J. Gen. Virol. 70, 429-434, PCT W091/11525, Felgner i wsp. (1994) J. Biol. Chem. 269, 2550-2561, Science 259:1745-49, 1993 i McClements i wsp. immunization with
PL 205 130 B1
DNA vaccines encoding glycoprotein D or glycoprotein B, alone or in combination, induces protective immunity in animal models of herpes simplex virus-2 disease, PNAS USA 93:11414-11420, październik 1996 i Patenty US Nr 5,591,639, 5,589,466 i 5,580,859 jak i WO-A-90 11092, WO-A-93 19183, WO-A-94 21797, WO-A-95 11307, WO-A-95 20660, Tang i wsp., Nature 356, 152-154, 1992 i Furth i wsp. Analytical Biochemistry, 205, 365-368, 1992, dotyczące wektorów ekspresyjnych DNA, między innymi. Patrz też WO 98/33510; Ju i wsp. Jako referencje patrz również Diabetologia, 41:736-739, 1998 (system ekspresyjny lentiwirusów); Sanford i wsp. Patent USA Nr 4,945,050; Fischbach i wsp. (Intracel), WO 90/01543; Robinson i wsp. seminars in Immunology, tom 9, str. 271-283 (1997) (systemy wektorów DNA); Szoka i wsp. Patent US Nr 4,394,448 (sposób wstawiania DNA do żywych komórek); McCormick i wsp. Patent US Nr 5,677,178 (zastosowanie cytopatycznych wirusów); i Patent US Nr 5,928,913 (wektory do dostarczania genów) jak i w innych dokumentach tu cytowanych. Korzystnie mogą być stosowane wektory wirusowe wybrane z świńskich herpeswirusów, takich jak wirus choroby Aujeszky'ego, adenowirus świni, wirusy ospy, szczególnie wirus krowianki, wirus ospy ptasiej, wirus ospy kanarków, wirus świńskiej ospy jak i wektory DNA (plazmidy DNA).
Produkt ekspresji z genu (genów) PCV-2 lub ich części może być pożyteczny do wytwarzania przeciwciał takich jak przeciwciała monoklonalne lub poliklonalne, które są użyteczne dla celów diagnostycznych. Podobnie produkt(y) ekspresji genu (genów) PCV-2 lub ich części mogą być pożyteczne w zastosowaniach diagnostycznych.
Co więcej, specjalista może określić interesujący epitop w immunogenie PCV-2 lub w immunogenie innego patogenu świni bez nadmiernego eksperymentowania z obecnego ujawnienia i znajomoś ci dziedziny, patrz dla ogólnej informacji dotyczą cej okreś lenia interesują cego epitopu lub epitopowego regionu białka przykładowo między innymi WO 98/40500.
Tak jak przedstawiono korzystne kompozycje immunogenne lub szczepionkowe to przykładowo kompozycje tu wskazane. Przykładowo będzie to kompozycja immunogenna lub szczepionkowa zebrana z hodowli komórek in vitro, która była zakażona oczyszczonym preparatem PCV-2 takim jak oczyszczony preparat świńskiego cirkowirusa wybranego z grupy złożonej z preparatów zdeponowanych w ECACC (European Collection of Cell Cultures, Centre for Applied Microbiology & Research, Salisbury, Wiltshire, SP4 0JG, UK) pod następującymi numerami referencyjnymi: Nr dostępu V97100219 (szczep Imp. 1008), Nr V97100218 (szczep Imp. 1010) i Nr dostępu V97100217 (szczep Imp.999) zdeponowane 2 października, 1997, Nr dostępu V98011608 (szczep Imp. 1011-48285) i Nr V98011609 (szczep Imp.1011-48121) zdeponowane 16 stycznia 1998, Nr dostępu 00012710 (szczep 1103) i Nr 00012709 (szczep 1121) zdeponowane 2 lutego, 2000 lub kompozycja immunogenna lub szczepionkowa obejmująca cirkowirusa świni wyhodowanego na i wyizolowanego z hodowli komórek in vitro. Komórki te był y zakaż one cirkowirusem ś wini, który może być izolowany z próbki fizjologicznej lub próbki tkanki, szczególnie uszkodzeń, ze świni, u której wystą pił zespół PMWS. Przykł adowo bę dzie to taka kompozycja, która będzie obejmować cirkowirus świni wytwarzany i wyizolowany z linii nerki świni, na przykład, wytwarzany z i wyizolowany z komórek PK/15 wolnych od zanieczyszczenia PCV-1. Lub będzie to kompozycja zawierająca lub przygotowana z ekstraktu lub supernatantu hodowli, zebranego z hodowli komórek in vitro, która była zakażona takim cirkowirusem. Tak więc, świński cirkowirus może być immunogenem. Na przykład, kompozycja szczepionkowa lub immunogenna może obejmować cały atenuowany żywy immungen (np. wirus), korzystnie w nośniku lub rozcieńczalniku dopuszczalnym farmaceutycznie lub w weterynarii i ewentualnie adiuwant dopuszczalny farmaceutycznie lub w weterynarii jak i ewentualnie stabilizator dla liofilizacji. Immunogen (np. wirus) moż e być inaktywowany, a szczepionka lub kompozycja immunogenna może dodatkowo i/lub ewentualnie zawierać nośnik lub rozcieńczalnik dopuszczalny farmaceutycznie lub w weterynarii oraz ewentualnie adiuwant dopuszczalny farmaceutycznie lub w weterynarii. Kompozycja szczepionkowa lub immunogenna może obejmować immunogeny PCV-2 i/lub immunogeny kilku świńskich cirkowirusów (włączając PCV-2 lub kilka szczepów PCV-2 i włączając w to PVC-1) jak i ewentualnie dodatkowe immunogeny z innego patogenu świni np. PRRS, Mycoplasma hyopneumoniae, Actinobacillus pleuropneumoniae, E. coli, pseudowścieklizna, świńska cholera, Bordetella bronchiseptica, Pasteurella multocida, Erysipelothrix rhusiopathiae, świńska grypa i PPV (patrz też WO-A-00 01409).
W celu wytwarzania preparatów antygenowych cirkowirusa, cirkowirusy mogą być uzyskane po pasażu na komórkach w szczególności na liniach komórkowych np. komórkach PK/15. Stosowane mogą być supernatanty lub ekstrakty z hodowli, ewentualnie oczyszczane za pomocą standardowych
PL 205 130 B1 technik. Co się tyczy atenuowanego PCV, atenuacja może być przeprowadzona standardowymi metodami np. przez pasażowanie na komórkach, korzystnie przez pasaż na komórkach świni, korzystnie liniach komórkowych, szczególnie takich jak komórki PK/15 (przykładowo od 20 do 150 pasaży, szczególnie zalecane jest 40 do 100 pasaży).
Jeśli chodzi o inaktywowaną szczepionkę, PCV z frakcjami, które mogą być obecne jest inaktywowany zgodnie z technikami znanymi specjalistom w dziedzinie. Inaktywacja będzie korzystnie przeprowadzona drogą chemiczną, np. przez eksponowanie antygenu na czynnik chemiczny taki jak formaldehyd (formalina), paraformaldehyd, β-propiolakton lub etylenoimina lub jej pochodne, i/lub przez obróbkę fizyczną. Korzystnym sposobem inaktywacji będzie ekspozycja na czynnik chemiczny, a w szczególności na etlylenoiminę lub na β-propiolakton.
Immunogen w kompozycji immunogennej lub szczepionkowej może być wyrażany z fragmentu DNA zawierającego sekwencję nukleotydową PCV-2 lub jej fragment (korzystnie kodujący przynajmniej jeden epitop) np. wybrany z grupy złożonej z sekwencji określanych przez odnośniki SEQ ID No:1, SEQ ID No:2, SEQ ID No:3, SEQ ID No:4 jak i SEQ ID No:6 i SEQ ID No:7 (Figury 1-4 i 6-7). Immunogen w kompozycji szczepionkowej lub immunogennej może być wyrażany z fragmentu DNA zawierającego ORF wybrany z grupy złożonej z ORF 1 do 13 takich jak ORF 4, 7, 10 i 13, korzystnie ORF 4 i/lub 13 szczepu PCV-2, w szczególności jednego z powyżej zidentyfikowanych szczepów (jak określono w WO-A-99 18214 - patrz też Tabela 1 dalej). Tak, więc immunogen lub jego część taka jak interesujący epitop może być uzyskany przez jego ekspresję in vitro z rekombinanta lub wektora. Immunogen może być dalej oczyszczany i/lub zatężany konwencjonalnymi metodami.
Immunogen w kompozycji szczepionkowej lub immunogennej może być wyrażany in vivo przez wektor ekspresyjny zawierający fragment DNA zawierający sekwencję nukleotydową PCV-2 lub jej fragment (korzystnie kodujący przynajmniej jeden epitop) np. wybrany z grupy złożonej z sekwencji określanych przez odnośniki SEQ ID No:1, SEQ ID No:2, SEQ ID No:3, SEQ ID No:4, SEQ ID No:6 jak i SEQ ID No:6 oraz SEQ ID No:7 (Figury 1-4 i 6-7). Podobnie immunogen w szczepionce lub kompozycji immunogennej lub immunologicznej może być wyrażany in vivo przez wektor ekspresyjny obejmujący fragment DNA zawierający ORF wybrany z grupy złożonej z ORF 1 do 13 takich jak ORF 4, 7, 10 i 13, korzystnie ORF 4 i/lub 13 szczepu PCV-2, w szczególności jednego z powyżej zidentyfikowanych szczepów. Tak, więc szczepionka lub kompozycja immunogenna może obejmować wektor ekspresyjny, który wyraża in vivo immunogen lub jego część np. interesujący epitop.
Wektor ekspresyjny może być między innymi dowolnym odpowiednim wektorem wybranym z plazmidów DNA, bakterii takich jak E. coli, wirusów takich jak bakulowirusy, herpeswirusa (wirus opryszczki) takiego jak wirus choroby Aujeszky'ego, adenowirusa w tym adenowirusa świni, wirus ospy, szczególnie wirusa krowianki, wirus ospy ptasiej, wirusa ospy kanarków i wirusa ospy świń (specjalista może też odnieść się do zgłoszeń amerykańskich Audonnet i wsp. i Bublot i wsp., o numerach odpowiednio 60/138,352 i 60.138,478, oba złożone 10 czerwca 1999, zwłaszcza do szczegółów przedstawionych w opisie zgłoszenia, a w szczególności do przykładów („Szczepionka DNA-PCV i „Szczepionka rekombinowana przeciw cirkowirusom świni oparta na wirusach ospy, które odpowiednio zostały tu załączone i włączone w treść niniejszego opisu).
Przedstawione w wynalazku rozwiązania mogą również wykorzystywać cząsteczki kwasu nukleinowego oraz wektory je zawierające, jak i produkty ich ekspresji, kompozycje obejmujące takie cząsteczki kwasu nukleinowego i/lub wektory i/lub produkty ekspresji jak i sposoby wytwarzania i zastosowania dowolnego lub wszystkich tych wskazanych wykonań. W rozwiązaniach według wynalazku, w szczególności mogą zostać wykorzystane ORF i/lub fragmenty kodujące immunogen lub epitop jak i cząsteczki kwasów nukleinowych szczepów 1103 i/lub 1121, w szczególności ich ORF 4, 7, 10 i 13, korzystnie ORF 4 i/lub 13, i ich fragmenty, jak i wektory obejmujące te cząsteczki kwasu nukleinowego, kompozycje obejmujące te cząsteczki kwasu nukleinowego, wektory lub ich produkty ekspresji, kompozycje obejmujące takie produkty ekspresji, startery lub sondy dla takich cząsteczek kwasu nukleinowego, i zastosowania lub sposoby obejmujące te wykonania np. do detekcji, diagnozowania, oznaczania PCV-2, w celu wywołania odpowiedzi immunogenej lub ochronnej, lub tym podobne.
Jak wspomniano wcześniej, opisane są również przeciwciała, które mogą być wykorzystane w rozwiązaniach opisanych w wynalazku. Takie przeciwciała mogą być przeciwciałami poliklonalnymi lub monoklonalnymi na przykład wytworzonymi na podstawie wymienionego uprzednio cirkowirusa, lub na podstawie polipeptydu kodowanego przez fragment DNA zawierający sekwencję PCV-2, na
PL 205 130 B1 przykład, wybraną z grupy złożonej z SEQ ID NOS: 1, 2, 3, 4, 6 i 7 (Fig. 1-4 i 6-7) lub na podstawie polipeptydu wyrażanego przez wektor obejmujący sekwencję PCV-2, na przykład, wybraną z grupy złożonej z SEQ ID NOS: 1, 2, 3, 4, 6 i 7, lub na podstawie polipeptydu wyrażanego przez wektor obejmujący DNA zawierający ORF wybrany z grupy złożonej z ORF 1 do 13. Specjalista może zastosować techniki znane w dziedzinie, aby wywołać przeciwciała i wytworzyć przeciwciała monoklonalne lub poliklonalne. Przeciwciała i antygeny mogą być stosowane w diagnostyce.
Ujawnienie przedstawione w wynalazku pozwala również wytworzyć sondy łub startery ze szczepów PCV-2 1103 i/lub 1121, które mogą być pożyteczne na przykład w wykrywaniu DNA PCV-2, w szczególności pod kątem występowania zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub zakażenia wewnątrzmacicznego jak i do amplifikacji DNA PCV-2 np. do przygotowania wektora ekspresyjnego. Sondą lub starterem może być dowolny odcinek przynajmniej 8, korzystnie przynajmniej 10, bardziej korzystnie przynajmniej 12, 13, 14 lub 15, takich jak przynajmniej 20, np. przynajmniej 23 lub 25, na przykład przynajmniej 27 lub 30 nukleotydów z genomu PCV-2 lub genów PCV-2, które są unikalne dla PCV-2 i ewentualnie dla tych szczepów lub, które występują w PCV-2 i są przynajmniej konserwowane wśród PCV lub rodziny cirkowirusów. Jeśli chodzi o wybór optymalnej długości starterów oraz sond do PCR lub hybrydyzacji referencje można znaleźć w Kajimura i wsp., GATA 7(4):71-79. (1990). Hybrydyzacja jest korzystnie prowadzona w warunkach o wysokiej ostrości, czyli tak jak określenie „wysoka ostrość byłoby rozumiane przez specjalistów w dziedzinie (patrz, na przykład Sambrook i wsp., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. i Hames i Higgins, red. 1985, Nucleic Acid Hybridization, IRL Press, Oxford, UK). Przez hybrydyzację należy rozumieć zastosowanie dobrze znanych technik, obejmujących, ale nie ograniczonych do, hybrydyzacji metodą Southerna, hybrydyzacji typu Northern, hybrydyzacji in situ i korzystnie hybrydyzacji Southerna z użyciem fragmentów DNA amplifikowanych PCR.
Tak jak sondy lub startery, peptydy, które nie są białkami PCV-2 o pełnej długości mogą również być wykorzystane w rozwiązaniach według wynalazku i mogą być dowolnym odcinkiem przynajmniej 8, korzystnie przynajmniej 10, bardziej korzystnie przynajmniej 12, 13, 14 lub 15, takich jak przynajmniej 20, np. przynajmniej 23 lub 25, przykładowo przynajmniej 27 lub 30 aminokwasów w PCV-2, które są unikalne dla PCV-2 oraz możliwie dla wskazanych szczepów, lub które występują w PCV-2 i są przynajmniej konserwowane wśród PCV lub rodziny cirkowirusów. Alternatywnie lub dodatkowo aminokwasy opisane w wynalazku, które nie są pełnej długości białkami PCV-2 mogą być regionem epitopowym białka PCV-2.
Sekwencje PCV-2 są również ujawnione w Meehan i wsp., 1998 (szczepy Imp.1010; ORF1 nukleotydy 398-1342; ORF2 nukleotydy 1381-314; i odpowiadają odpowiednio ORF4 i ORT13 w terminologii wynalazku (patrz Tabela 1) w zgłoszeniu US Nr serii 09/161,092 z 25 września 1998 oraz COL4 i COL13 w WO-A-9918214). Kilka szczepów PCV-2 i ich sekwencji jest tu ujawnione i zostały one nazwane Imp1008, Imp999, Imp1011-48285, Imp1011-48121, 1103 i 1121. Inne szczepy są ujawnione w A.L. Hamel i wsp. J. Virol. Czerwiec 1998, tom 72, 6:5262-5267 (GenBank AF027217) i w I. Morozov i wsp. J. Clinical Microb. Wrzesień 1998 tom 36, 9:2535-2541, jak i w GenBank jako AF086834, AF086835 i AF086836. Te sekwencje, lub ORF z nich pochodzące, lub ich regiony kodujące antygen lub immunogen lub interesujący epitop też mogą być stosowane w rozwiązaniach według niniejszego wynalazku.
W rozwiązaniach według wynalazku mogą być również wykorzystane sekwencje ekwiwalentne do tutaj wskazanych lub wymienionych jak i w do sekwencji w cytowanych dokumentach, na przykład sekwencje, które są zdolne do hybrydyzacji z sekwencją nukleotydową w warunkach wysokiej ostrości (patrz np. Sambrook i wsp. (1989). Wśród ekwiwalentnych sekwencji można także wymienić fragmenty genów zachowujące immunogenność całkowitej sekwencji np. interesujący epitop.
Homologia między całym genomem PCV typów 1 i 2 wynosi około 75%. Ale w obrębie typu 2 homologia wynosi ogólnie ponad 95%. Tak, więc w wykonaniu rozwiązań według wynalazku możliwe jest zastosowanie dowolnego szczepu PCV-2, co jest równoważne. Stosowane mogą być następujące kryteria, że szczep jest typu 2, np. że homologia na poziomie nukleotydowym całego genomu jest równa lub większa niż 85%, korzystnie 90% lub większa, bardziej korzystnie 95% lub większa, korzystnie 97, 98 lub 99% lub większa, ze szczepami tu ujawnionymi, np. szczepem Imp1010.
PL 205 130 B1
Granice dla ORF-ów szczepu Imp1010 są podane w następującej tabeli 1:
| Nazwa | Początek | Koniec | Nić | Wielkość ORF (nukleotydy (nt)) | Wielkość białka (aminokwasy (aa)) |
| ORF1 | 103 | 210 | Sensowna | 108 nt | 35 aa |
| ORF2 | 1180 | 1317 | Sensowna | 138 nt | 45 aa |
| ORF3 | 1363 | 1524 | Sensowna | 162 nt | 53 aa |
| ORF4 | 398 | 1342 | Sensowna | 945 nt | 314 aa |
| ORF5 | 900 | 1079 | Sensowna | 180 nt | 59 aa |
| ORF6 | 1254 | 1334 | Sensowna | 81 nt | 26 aa |
| ORF7 | 1018 | 704 | Antysensowna | 315 nt | 104 aa |
| ORF8 | 439 | 311 | Antysensowna | 129 nt | 42 aa |
| ORF9 | 190 | 101 | Antysensowna | 90 nt | 29 aa |
| ORF10 | 912 | 733 | Antysensowna | 180 nt | 59 aa |
| ORF11 | 645 | 565 | Antysensowna | 81 nt | 26 aa |
| ORF12 | 1100 | 1035 | Antysensowna | 66 nt | 21 aa |
| ORF13 | 314 | 1381 | Antysensowna | 702 nt | 213 aa |
Poszczególne ORF są definiowane w odniesieniu do szczepu Imp1010. Możliwe jest również zastosowanie odpowiednich ORF z dowolnego innego szczepu PCV-2 jak i dowolnych szczepów PCV-2 jak zostały tutaj zdefiniowane lub w cytowanych dokumentach. Jest działaniem rutynowym w dziedzinie określenie ORF na podstawie sekwencji genomowej wykorzystując w tym celu standardowe oprogramowanie takie jak MacVector®. Także porównanie genomów ze szczepem 1010 i porównanie z ORF-ami szczepu 1010 pozwala specjaliś cie na ł atwe okreś lenie ORF w genomie innego szczepu (np. tych ujawnionych w WO-A-99 18214 na przykład Imp1008, Imp1011-48121, Imp1011-48285, Imp999 jak i nowych szczepów 1103 i 1121). Stosowanie programów lub prowadzenie porównań nie jest nadmiernym eksperymentowaniem i zapewnia bezpośredni dostęp do tych ORF.
Na przykład odnosząc się do Figur 6 i 7 odpowiednie ORF szczepów 1103 i 1121 są podane w nastę pują cej Tabeli 2:
| Nazwa | Początek | Koniec | Nić | Wielkość ORF (nukleotydy (nt)) | Wielkość białka (aminokwasy (aa)) |
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| ORF1 | 1524 | 1631 | Sensowna | 108 nt | 35 aa |
| ORF2 | 833 | 970 | Sensowna | 138 nt | 45 aa |
| ORF3 | 1016 | 1177 | Sensowna | 162 nt | 53 aa |
| ORF4 | 51 | 995 | Sensowna | 945 nt | 314aa |
| ORF5 | 553 | 732 | Sensowna | 180 nt | 59 aa |
| ORF6 | 907 | 987 | Sensowna | 81 nt | 26 aa |
| ORF7 | 671 | 354 | Antysensowna | 315 nt | 104 aa |
PL 205 130 B1 cd. tabeli 2
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| ORF8 | 92 | 1732 | Antysensowna | 129 nt | 42 aa |
| ORF9 | 1611 | 1522 | Antysensowna | 90 nt | 29 aa |
| ORF10 | 565 | 386 | Antysensowna | 180 nt | 59 aa |
| ORF11 | 298 | 218 | Antysensowna | 81 nt | 26 aa |
| ORF12 | 753 | 688 | Antysensowna | 66 nt | 21 aa |
| ORF13 | 1735 | 1037 | Antysensowna | 702 nt | 213 aa |
Także ekwiwalentne i pożyteczne w praktyce wynalazku będą sekwencje nukleotydowe, które nie zmieniają ani funkcjonalności ani specyficzności szczepu (np. szczepu 2) względem rozważanego genu lub kodowanych przez gen polipeptydów. Sekwencje różniące się ze względu na degenerację kodu są oczywiście włączone w ten zakres.
Dla ORF4 homologia pomiędzy PCV-1 i PCV-2 wynosi około 86%, a dla ORF13 homologia między PCV-1 i PCV-2 wynosi około 66%. Tak więc, do ekwiwalentnych sekwencji dla ORF4 użytecznych w zastosowaniach według wynalazku należy zaliczyć te sekwencje, które mają homologię równą lub większą niż 88%, korzystnie 90% lub większą, korzystnie 92% lub 95% lub większą homologię z ORF4 szczepu Imp1010, a dla ORF13, te sekwencje, które mają homologię równą lub większą od 80%, korzystnie 85% lub większą, korzystnie 90% lub 95% lub większą z ORF13 szczepu Imp1010 (Stosując terminologię Tabeli 1).
Odnośnie homologii dotyczącej pozostałych ORF można określić te sekwencje, które pochodzą ze szczepu PCV mającego ORF4 i/lub ORF13, które mają homologię do odpowiedniego ORF szczepu 1010. Dla ORF7, sekwencje, które mogą być wykorzystane w rozwiązaniach według wynalazku obejmują te sekwencje, które mają homologię, która jest korzystnie równa lub większa od 80%, bardziej korzystnie 85% lub większa, korzystnie 90% lub 95% lub większa z ORF7 szczepu Imp1010. Dla ORF10, sekwencje, które mogą być wykorzystane w rozwiązaniach według wynalazku obejmują sekwencje o homologii, która jest korzystnie równa lub większa od 86%, bardziej korzystnie 90% lub większa, korzystnie 95% lub większa do ORF10 szczepu Imp1010 (Stosując terminologię Tabeli 1).
Sekwencje ekwiwalentne dla ORF4 użyteczne w praktyce tego wynalazku będą to te sekwencje, które wykazują homologię, korzystnie równą lub większą od 88%, bardziej korzystnie 90% lub większą, korzystnie 92% lub 95% lub większą z ORF4 szczepu Imp1010. Natomiast dla ORF13 będą to te sekwencje, których homologia jest korzystnie równa lub większa od 80%, bardziej korzystnie 85% lub większa, korzystnie 90% lub 95% lub większa z ORF13 szczepu Imp1010.
ORF4 i ORF13 potencjalnie kodują a białka o przewidywanej masie cząsteczkowej odpowiednio 37,7 kD i 27,8 kD. ORF7 i ORF10 (odpowiadają ORF3 i ORF4 w Meehan i wsp. 1998) potencjalnie kodują białka o przewidywanych masach cząsteczkowych odpowiednio 11,9 i 6,5 kD. Sekwencje tych ORF są dostępne w GenBank AF 055392. Wskazane sekwencje mogą być również włączone do plazmidów i stosowane same lub w kombinacji np. z ORF4 i/lub ORF13.
Inne ORF 1-3 i 5, 6, 8-9, 11-12 ujawnione w powyższej tabeli (COL 1-3 i 5, 6, 8-9, 11-12 w WO-A-9918214) lub ich region(y) kodujące interesujący antygen lub epitop mogą być zastosowane w rozwiązaniach według wynalazku np. same lub w kombinacji lub inaczej ze sobą lub z ORF 4 i/lub 13 lub ich regionami kodującymi antygen(y) lub epitop(y). Podobnie ze względu na homologię można określić, że są ekwiwalentne sekwencje, które pochodzą ze szczepu PCV, którego ORF13 i/lub ORF4 mają homologię jak zdefiniowano powyżej z odpowiadającym ORF szczepu 1010 jak zdefiniowano tu, lub w Meehan i wsp. 1998. Dla ORF7 ekwiwalentna sekwencja ma do niego homologię, która jest korzystnie przykładowo większa lub równa 80%, na przykład 85% lub większa, korzystnie 90% lub 95% lub większa z ORF7 szczepu Imp1010. Natomiast dla ORF10 korzystna ekwiwalentna sekwencja ma homologię, która jest korzystnie na przykład większa lub równa 86%, korzystnie 90% lub więcej, korzystnie większa niż 95% lub większa z ORF10 szczepu Imp1010.
Homologię sekwencji nukleotydowej można ustalić stosując program „Align Myers i Miller, („Optimal Alignments in Linear Space, CABIOS 4, 11-17, 1988, który można uzyskać z NCBI). Alternatywnie albo dodatkowo, termin „homologia lub „identyczność przykładowo w odniesieniu do se18
PL 205 130 B1 kwencji nukleotydowej albo aminokwasowej może wskazywać ilościową miarę homologii między dwoma sekwencjami. Procentową homologię sekwencji można obliczyć jako (Nref - Ndif)*100/Nref, gdzie Ndif jest całkowitą liczbą nie identycznych reszt w dwóch przyrównanych sekwencjach, i w którym Nref jest liczbą reszt w jednej z sekwencji. Stad, sekwencja DNA AGTCAGTC będzie miała podobieństwo sekwencji wynoszące 75% z sekwencją AATCAATC (Nref = 8, Ndif = 2).
Alternatywnie lub dodatkowo, „homologia lub „identyczność w kontekście sekwencji może odnosić się do liczby pozycji o identycznych nukleotydach lub aminokwasach podzielonej przez liczbę nukleotydów lub aminokwasów w krótszej z dwóch sekwencji, w których przyrównanie dwóch sekwencji można ustalić w odniesieniu do algorytmu Wilbur i Lipman (Wilbur i Lipman, 1983 PNAS USA 80:726). Przykładowo stosując okno o rozmiarze 20 nukleotydów, długość słowa jako 4 nukleotydy i karę za przerwę 4 oraz analizę wspomaganą komputerem i interpretację danych sekwencyjnych włączając w nią przyrównanie można wygodnie przeprowadzić stosując handlowo dostępne programy (np. Intelligenetics™ Suite, Intelligenetics Inc. CA). Jeśli stwierdza się, że sekwencje RNA są podobne lub posiadają stopień identyczności sekwencji lub homologię z sekwencjami DNA, tymidyna (T) w sekwencji DNA jest rozważana jako równa uracylowi (U) w sekwencji RNA.
Dodatkowo lub alternatywnie podobieństwo lub identyczność lub homologia sekwencji aminokwasowej może być ustalona stosując program BlastP (Altschul i wsp. Nuci. Acids Res. 25, 3389-3402), który jest dostępny w NCBI. Następujące odniesienia dostarczają algorytmów do porównywania względnej identyczności lub homologii reszt aminokwasowych obu białek. Ponadto dodatkowo lub alternatywnie zgodnie z informacjami przedstawionymi w tych odniesieniach można je wykorzystać do ustalenia procentowej homologii lub identyczności: Needleman SB i Wunsch CD „A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequences of two proteins, J. Mol. Biol. 48:444-453 (1970); Smith TF i Waterman MS, „Comparison of Biosequencers, Advances in Applied Mathematics 2:482-489 (1981); Smith TF, Waterman MS i Sadler JR, „Statistical characterization of nucleic acid sequence funcitonal domains, Nucleic Acids Res. 11:2205-2220 (1983); Feng DF i Dolittle RF, Progressive sequence alignment as a prerequisite to correct phylogenetic trees, J. of Molec. Evol. 25:351-360 (1987); Higgins DG i Sharp PM, „Fast and sensitive multiple sequence alignment on a microcomputer, CABIOS, 5: 151-153 (1989); Thompson JD, Higgins DG i Gibson TJ, „ClusterW: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighing, positions-specific gap penalties and weight matrix choice, Nucleic Acid Res., 22: 4673-480 (1994); i Devereux J, Haberlie P i Smithies O „A comprehensive set of sequence analysis program for the VAX, Nucl. Acids Res. 12:387-395 (1984).
W rozwiązaniach według wynalazku możliwe jest stosowanie immunogenu PCV-2, albo samego albo w dalszej kombinacji z immunogenem innego patogenu świni, aby wytworzyć opisane kompozycje np. mieszając składniki. Możliwe jest również wytworzenie zestawów, w których składniki są indywidualnie opakowane i ewentualnie pojemniki są opakowane razem w celu ich zmieszania i/lub podania. Zestaw może również ewentualnie zawierać instrukcje opisującą sposób zmieszania i/lub podania.
Rozwiązania zostały opisane ze względu na możliwość podawania samicom świń kompozycji immunogennych lub szczepionkowych zawierających immunogen PCV-2, możliwe jest również podawanie takich kompozycji maciorze lub losze i/lub knurowi, tak jak zostało to opisane. Zarówno matka i potomstwo (np. maciora, loszka) i knur mogą otrzymać opisane w wynalazku kompozycje i/lub mogą być obiektem wykonania wskazanych zastosowań. Zatem, populacjom świń można podawać leki wytworzone z opisanych kompozycji i/lub mogą być one przedmiotem prowadzenia sposobów, w których są one wykorzystywane.
Zastosowane kompozycje immunogenne i szczepionkowe mogą zawierać immunogeny z więcej niż jednego szczepu PCV-2. Na przykład, jest możliwe łączenie immunogenów ze szczepów 1121 i 1103, z jednego lub obu tych szczepów z przynajmniej jednym innym szczepem tu ujawnionym lub dowolną inną ich kombinacją.
Ujawnione są również sposoby pozwalające specjaliście na ocenę skuteczności szczepionek przeciwko PCV-2. Pierwszym sposobem jest test ELISA, również z seroneutralizacją. Drugi sposób to szczepienie, a następnie prowokacja wirulentnym szczepem PCV-2, przykładowo jednym z ujawnio-nych szczepów. Przedstawione dane pozwalają na sprawdzanie immunogenów PCV, w tym immunogenów PCV-1, zdolnych do wywołania odpowiedzi immunogennej lub ochronnej przeciwko PCV-2. Takie immunogeny PCV są wówczas pożyteczne do zapobiegania lub leczenia świń, w szczególności zapalenia mięśnia sercowego i/lub poronienia i/lub wewnątrzmacicznych
PL 205 130 B1 zakażeń związanych z PCV-2 jak i przeciwko PMWS i/lub innym patologicznym konsekwencjom z tym związanym.
Stąd ujawnione są immunogenne lub szczepionkowe kompozycje obejmujące immunogen PCV i zdolne do wywołania odpowiedzi immunogennej lub ochronnej przeciwko PCV-2. Ponadto przedstawione są sposoby immunizacji lub szczepienia z zastosowaniem takich immunogenów, jak i zastosowanie takiego immunogenu do wytwarzania kompozycji immunogennej lub szczepionkowej, jak również zastosowania kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku.
Zgłaszający ponadto stwierdził, że konstrukty plazmidów kodujące i wyrażające immunogeny PCV-2 mogą być stosowane do immunizacji świń przeciwko zespołowi PMWS.
Immunogeny PCV-2 mogą być stosowane w kombinacji z immunogenami PCV-1 tak, aby również immunizować zwierzęta przeciwko PCV-2.
Jest mniej korzystne stosowanie samych immunogenów z PCV-1. Do immunizacji świń mogą być stosowane konstrukty plazmidów kodujące i wyrażające immunogen PCV-1 lub PCV-2, w szczególności obejmujące otwarte ramki odczytu (ORF) 1 i/lub 2 z PCV-1 i ORF 1 i/lub 2 z PVC-2.
Jest oczywiste, że w rozwiązaniach według wynalazku mogą być również wykorzystywane plazmidy kodujące i wyrażające ekwiwalentne sekwencje nukleotydowe to znaczy sekwencje, które nie zmieniają, ani funkcjonalności, ani specyficzności szczepu ze względu na rozważany gen lub polipeptydy kodowane przez ten gen. Będzie to również dotyczyło sekwencji różniących się ze względu na degenerację kodu.
Sekwencje PCV-2 stosowane w przykładach pochodzą z Meehan i wsp. powyżej (nukleotydy ORF1 389-1342; nukleotydy ORF2 1381-314; i odpowiadają odpowiednio ORF4 i ORF13 w US 09/161,092 z 25 września 1998 oraz COL4 i COL13 w WO-A-9918214). Inne sekwencje PCV-2 zostały opublikowane w WO-A-9918214 i są nazwane Imp1008, Imp999, Imp1011-48285 i Imp1011-48121 jak i w A.L. Hamel i wsp. J. Virol., czerwiec 1998, tom 72, 6: 5262-5267 (GenBank AF027217) oraz w I. Morozov i wsp. J. Clinical Microb. wrzesień 1998 tom 36, 9: 2535-2541 jak i GenBank jako AF086834, AF086835 i AF086836, co daje dostęp do ekwiwalentnych sekwencji ORF.
Rozwiązania opisane w wynalazku mogą również wykorzystywać ekwiwalentne sekwencje, w tym znaczeniu, że są one zdolne do hybrydyzacji do sekwencji nukleotydowej rozważanego genu w warunkach o wysokiej ostrości. Wśród ekwiwalentnych sekwencji mogą być także wymienione fragmenty genów zachowujące immunogenność całej sekwencji. Inne ORF 1-3 i 5-11 ujawnione w US 09/161,092 z 25 września 1998 (COL 1-3 i 5-12 w WO-A-9918214) w szczególności ORF 7 i 10 mogą być stosowane w warunkach tu opisanych w kombinacjach lub inaczej ze sobą lub z ORF1 i ORF2 jak tu zdefiniowano. Termin plazmid ma w użytym tu znaczeniu obejmować dowolną jednostkę transkrypcyjną DNA w postaci sekwencji polinukleotydowej obejmującej sekwencję PCV, która ma być wyrażana oraz elementy potrzebne do jej ekspresji in vivo. Korzystna jest kolista forma plazmidu, superskręcona, lub inna np. plazmid w formie liniowej.
W opisie wynalazku przedstawione są bardziej szczegółowo plazmidy nazwane pJP109 (zawierający gen ORF2 z PCV-2, figura 1.1), pJP111 (zawierający gen ORF1 z PCV-2, figura 1.2), pJP120 (zawierający gen ORF2 z PCV-1, figura 1.3) i pJP121 (zawierający gen ORF1 z PCV-1, figura 1.4).
Każdy plazmid obejmuje promotor zdolny do zapewnienia w komórkach gospodarza ekspresji genu wstawionego pod jego kontrolą. Będzie to zwykle silny promotor eukariotyczny, taki jak w szczególności wczesny promotor cytomegalowirusa CMV-IE, pochodzenia ludzkiego lub mysiego, lub dowolnie innego pochodzenia takiego jak ze szczura lub świnki morskiej. Bardziej ogólnie promotor jest albo pochodzenia wirusowego albo komórkowego. Jako promotor wirusowy inny niż CMV-IE można wymienić wczesny lub późny promotor wirusa SV40 lub promotor LTR wirusa mięsaka Rousa. Takim promotorem może być również promotor z wirusa, z którego pochodzi gen, na przykład promotor specyficzny dla genu. Jako promotor komórkowy można wymienić promotor genu cytoszkieletu taki jak, na przykład, promotor desminy lub ewentualnie promotor aktyny. Jeżeli kilka genów jest obecnych na tym samym plazmidzie, mogą się znajdować w tej samej jednostce transkrypcji lub w dwóch różnych jednostkach.
Plazmidy mogą też zawierać inne elementy regulujące transkrypcję takie jak na przykład sekwencje stabilizujące typu intron, korzystnie intron II genu β-globiny królika (van Ooyen i wsp. Science 1979, 206: 337-344), sekwencji sygnałowej białka kodowanego przez gen tkankowego aktywatora plazminogenu (tPA; Montgomery i wsp. Cell. Mol. Biol. 1997, 43: 285-292) i sygnał po20
PL 205 130 B1 liadenylacji (poliA) w szczególności genu bydlęcego hormonu wzrostu (bGH) (US-A-5,122,458) lub genu β-globiny królika.
Opisane są również preparaty immunogenne i szczepionki DNA obejmujące przynajmniej jeden plazmid kodujący i wyrażający jeden z immunogenów PCV-1 i PCV-2, korzystnie jeden z wymienionych powyżej ORF, a dodatkowo zaróbkę lub rozcieńczalnik dopuszczalny w weterynarii, ewentualnie z dodatkiem dopuszczalnego w weterynarii adiuwanta.
Bardziej szczegółowo opisane zostały immunogenne preparaty i szczepionki zawierające przynajmniej jeden plazmid kodujący i wyrażający jeden z immunogenów PCV-1 lub PCV-2, kompozycje formułowane z adiuwantem, w szczególności kationowym lipidem zawierającym czwartorzędową sól amonową np. korzystnie DMRIE (N-(2-hydroksyetylo)-N,N-dimetylo-2,3-bis-tetradecyloksy)-1-propanoamon; WO-A-9634109), korzystnie połączone z obojętnym lipidem, w szczególności DOPE (dioleilofosfatydyloetanoloaminą), tak aby wytworzyć DMRIE-DOPE. Korzystnie mieszaninę plazmidów z tym adiuwantem przygotowuje się bezpośrednio przed użyciem. Ponadto korzystne jeśli przed podaniem jej zwierzęciu, w przygotowanej mieszaninie umożliwi się wytworzenie kompleksu, przez odstawienie jej na pewien czas, przykładowo na okres od 10 do 60 minut, w szczególności zalecane jest 30 minut.
O ile DOPE jest obecny stosunek molarny DMRIE: DOPE jest korzystnie od 95:5 do 5:95, bardziej korzystnie 1:1.
Stosunek wagowy plazmid:DMRIE lub DMRIE-DOPE może w szczególności mieścić się w zakresie od 50:1 do 1:10, szczególnie od 10:1 do 1:5, a korzystniej od 1:1 do 1:2.
Jako adiuwant można stosować związki adiuwanta wybrane z polimerów kwasu akrylowego lub metakrylowego i kopolimerów bezwodnika maleinowego i pochodnej alkenylowej. Korzystne są polimery kwasu akrylowego lub metakrylowego, usieciowane w szczególności eterami polialkenylowymi cukrów lub polialkoholi. Te związki są znane jako karbomer (Pharmeuropa tom 8, nr 2, czerwiec 1996). Specjaliści w dziedzinie mogą się również odnieść do amerykańskiego patentu US-A-2,909,462 (włączonego jako referencje), w którym opisano takie polimery akrylowe usieciowane związkiem polihydroksylowanym zawierającym przynajmniej 3 grupy hydroksylowe, korzystnie nie więcej niż 8, przy czym atomy wodoru przynajmniej trzech grup hydroksowych są zastąpione przez nienasycone reszty alifatyczne o przynajmniej dwóch atomach węgla. Korzystne reszty zawierają 2 do 4 atomów węgla, np. grup winylowych, allilowych i innych nienasycone grup etylenowych. Reszty nienasycone mogą same zawierać inne podstawniki, takie jak metyl. Produkty sprzedawane pod nazwą Carbopol® (BF Goodrich, Ohio, USA) są szczególnie odpowiednie. Są one usieciowane alillo-sacharozą lub za pomocą allilo-pentaerytiritolem. Wśród nich można wymienić Carbopol® 974P, 934P i 971P.
Wśród kopolimerów bezwodnika maleinowego i pochodnej alkenylowej, korzystne są kopolimery EMA® (Monsanto), które są kopolimerami bezwodnika maleinowego i etylenu, liniowymi lub usieciowanymi, przykładowo usieciowanymi przez eter diwinylowy. W tej kwestii można się odnieść do publikacji J. Fields i wsp., Nature 186 : 778-780, 4 czerwca 1960, włączone tu jako referencje.
Z punktu widzenia budowy polimery kwasu akrylowego lub metakrylowego oraz kopolimery
EMA® są korzystnie utworzone z podstawowych jednostek o następującym wzorze:
Ri R2
----C-(CH2) x-C-(CH2) y
COOH COOH w którym:
-R1 i R2, które są takie same lub różne, oznaczają H lub CH3
- x = 0 albo 1, korzystnie x = 1
- y = 1 albo 2, przy czym x + y = 2.
Dla kopolimerów EMA® x = 0 i y = 2. Dla karbomerów x = y = 1.
PL 205 130 B1
Rozpuszczanie tych polimerów w wodzie daje roztwór kwaśny, który należy zneutralizować, korzystnie do pH fizjologicznego, w celu otrzymania roztworu adiuwanta, do którego włączona będzie szczepionka właściwa. Grupy karboksylowe polimeru są wówczas częściowo w postaci COO-.
Dla tego typu adiuwanta jest korzystne przygotowanie roztworu adiuwanta, w szczególności karbomeru w wodzie destylowanej, korzystnie w obecności chlorku sodu. Otrzymany roztwór ma kwaśny pH. Taki roztwór wyjściowy rozcieńcza się dodając go do pożądanej ilości (dla uzyskania odpowiedniego stężenia końcowego) lub istotnej części tej ilości, do wody z dodatkiem NaCl, korzystnie soli fizjologicznej (NaCl 9 g/l) w całości albo partiami z równoczesnym lub późniejszym zobojętnianiem (pH 7,3 do 7,4), korzystnie przy użyciu NaOH. Roztwór ten o fizjologicznym pH stosuje się jako taki do mieszania ze plazmidem, w szczególności przechowywanym w postaci liofilizowanej, ciekłej albo zamrożonej.
Stężenie polimeru w końcowej kompozycji szczepionki będzie wynosiło od 0,01% do 2% wag./obj., bardziej szczególnie 0,06 do 1% wag./obj., korzystniej od 0,1 do 0,6% wag./obj.
W specyficznym wykonaniu preparat immunogenny lub szczepionka zawiera plazmid lub mieszaninę plazmidów kodujących i wyrażających ORF1 i ORF2 z PCV-2.
Możliwe są również prowadzenie kombinowanego szczepienia przeciwko cirkowirusom świń ze szczepieniem przeciwko innym patogenom świń w szczególności tym, które mogą być związane z zespołem PMWS.
Rozwiązania takie będą dotyczyły mieszanin plazmidów zawierających przynajmniej jeden ujawniony tu plazmid i przynajmniej jeden inny plazmid kodujący i wyrażający świński immunogen wybrany, na przykład, z grupy złożonej z glikoprotein gB i gD, wirusa choroby Aujeszky'ego (wirus pseudowścieklizny lub PRV), hemaglutyniny i nukleoproteiny wirusa świńskiej grypy HIN1, hemaglutyniny i nukleoproteiny wirusa świńskiej grypy H3N2, genów ORF5 i ORF3 wirusa PRRS szczepów Lelystad i USA, białka VP2 parwowirusa świń, białek E1 i E2 wirusa świńskiej cholery (HCV), wydeletowanych genów apxl, apxll i apxIII z Actinobacillus pleuropenumoniae (plazmidy patrz na przykład WOA-9803658).
Te mieszaniny plazmidów są podnoszone w nośniku lub rozpuszczalniku dopuszczalnym w weterynarii, ewentualnie dodatkowo z dowolnym dopuszczalnym w weterynarii adiuwantem jak opisano powyżej, w ten sposób tworząc preparaty immungenne lub wielowartościowe szczepionki DNA. Te preparaty lub wielowartościowe szczepionki mogą być szczególnie korzystnie fomułowane z DMRIE, i korzystnie łączone z obojętnym lipidem, np. DOPE aby wytworzyć DMRIE-DOPE.
Preparaty lub jednowartościowe lub wielowartościowe szczepionki DNA według wynalazku formułowane lub nie z adiuwantem jak opisano powyżej, mogą być również korzystnie uzupełnione cytokiną, korzystnie pochodzącą ze świń, korzystnie GM-CSF świń. Dodanie GM-CSF świń (czynnik stymulujący kolonie granulocytów i makrofagów; Clark S.C. i wsp. Science 1987, 230: 1229; Grant S.M. i wsp. Drugs, 1992, 53:516) może być przeprowadzone przez włączenie do szczepionki lub preparatu albo białka świńskiej GM-CSF albo plazmidu kodującego i wyrażającego gen dla GM-CSF świń (Inumaru D. i Takamatsu H. Immunol. Cell. Biol. 1995, 73: 474-476). Korzystnie gen GM-CSF świni jest wstawiony do plazmidu innego od tych kodujących immunogeny PCV lub inne świńskie immunogeny.
W szczególności plazmidem kodującym i wyrażającym świńską GM-CSF może być plazmid pJP058 (Figura 1.5).
Immunogenne preparaty i jedno wartościowe lub wielowartościowe szczepionki DNA mogą być formułowane z przynajmniej jedną konwencjonalną szczepionką (atenuowaną żywą, inaktywowaną lub podjednostkową) lub rekombinowaną szczepionką (wektor wirusowy) skierowaną przeciw przynajmniej jednemu patogenowi świni, przy czym patogenem, przeciwko któremu kierowana jest szczepionka jest ten sam lub inny patogen. Możliwe są również kombinacje z zawierającymi adiuwant konwencjonalnymi szczepionkami (atenuowane żywe, inaktywowane lub podjednostkowe). Z szczepionek inaktywowanych lub podjednostkowych można wymienić te, zawierające w szczególności żel glinowy, sam lub zmieszany z saponiną jako adiuwantem, lub te formułowane w postaci emulsji olej-w-wodzie.
Rozwiązania według wynalazku pozwalają na prowadzenie sposobu immunizacji, który umożliwia indukcję odpowiedzi immunologicznej u świń w stosunku do cirkowirusów. W szczególności możliwe jest przeprowadzenie sposobu szczepienia, który jest skuteczny u świń. Sposoby immunizacji lub szczepienia będą obejmować podanie jednego z preparatów lub jednej z jednowartościowych lub wielowartościowych szczepionek DNA jak opisano powyżej. Te sposoby immunizacji i szczepienia obejmują podanie jednej lub większej liczby kolejnych dawek preparatu lub szczepionki DNA. Prepa22
PL 205 130 B1 raty i szczepionki DNA mogą być podane w ramach tego sposobu immunizacji lub szczepienia za pomocą różnych dróg podawania przedstawionych w stanie techniki dla szczepień polinukleotydami. W szczególności będą one podawane drogą domięśniową i śródskórną za pomocą znanych technik podawania, w szczególności strzykawką zaopatrzoną w igłę, strumieniem cieczy (Furth i wsp. Analytical Bioch, 1992, 205: 365-368) lub przez strzelanie cząsteczkami złota powleczonymi DNA (Tang i wsp. Nature, 1992, 356: 152-154).
Ten sposób nie tylko pozwala na podawanie dorosłym świniom, ale także młodym i ciężarnym samicom, w tym ostatnim przypadku umożliwia to w szczególności nadanie biernej odporności noworodkom (przez przeciwciała matczyne).
Ilość DNA stosowana w opisanych szczepionkach mieści się w zakresie około 10 μg i około 2000 μg, a korzystnie między około 50 μg i około 1000 μg. Specjaliści będą posiadać niezbędne kompetencje, by dokładnie określić skuteczną dawkę DNA do zastosowania w każdym protokole immunizacji lub szczepienia.
Objętości dawki mogą wynosić między 0,5 i 5 ml, a korzystnie między 2 i 3 ml.
Korzystny sposób immunizacji lub szczepienia polega na podawaniu szczepionek DNA drogą domięśniową.
Ponadto opisane zostały tutaj antygenowe, immunologiczne lub szczepionkowe kompozycje lub kompozycje terapeutyczne przeznaczone do indukcji odpowiedzi antygenowej lub immunologicznej u zwierzęcia gospodarza zaszczepionego kompozycją. Taka szczepionka zawiera nośnik i zmodyfikowany zrekombinowany wirus, w którym inaktywowano nieistotne kodowane przez niego funkcje genetyczne, co prowadzi do tego, że rekombinowany wirus posiada osłabioną wirulencję i wzmocnione bezpieczeństwo. Wirus wykorzystywany w takich kompozycjach będzie w szczególności wirusem ospy, zwłaszcza wirusem krowianki lub wirusem ospy ptasiej takim jak wirus ospy drobiu lub wirus ospy kanarków, a bardziej korzystnie ALVAC. Modyfikowany rekombinowany wirus może zawierać np. w obrębie nieistotnego obszaru genomu wirusa, heterologiczną sekwencję DNA kodującą białko antygenowe, np. pochodzące z ORF PCV2, np. ORF1 i/lub 2 PCV2.
Opisano również immunogenne kompozycje zawierające rekombinowane wirusy posiadające inaktywowane nieistotne, kodowane przez wirusa funkcje genetyczne takie, że rekombinowany wirus będzie posiadał osłabioną wirulencję i wzmocnione bezpieczeństwo. Modyfikowany, rekombinowany wirus zawiera np. w obrębie nieistotnego obszaru genomu wirusa, heterologiczną sekwencję DNA kodującą białko antygenowe (np. pochodzące z ORF PCV2, np. ORF1 i/lub 2 PCV2), przy czym kompozycja, po podaniu gospodarzowi będzie zdolna do indukowania odpowiedzi immunologicznej specyficznej względem antygenu.
Opisane są również modyfikowane rekombinowane wirusy, w których nieistotne kodowane przez wirusa funkcje genetyczne zostały inaktywowane tak, że wirus posiada osłabioną wirulencję. Taki modyfikowany rekombinowany wirus ponadto zawiera heterologiczny DNA, np. w nieistotnym obszarze genomu wirusa. DNA może kodować geny PCV2 takie jak jakikolwiek lub wszystkie z ORF1, ORF2, ORF3, ORF4 z PCV2 (Meeham i wsp., 1998). Funkcje genetyczne można inaktywować przez usunięcie otwartej ramki odczytu kodującej czynnik wirulencji lub przez wykorzystanie wirusów o naturalnym ograniczeniu względem gospodarza.
Takim wirusem będzie korzystnie wirus ospy, szczególnie wirus ospy krowianki lub wirus ospy ptaków taki jak wirus ospy drobiu lub wirus ospy kanarków. Korzystnie otwarta ramka odczytu jest wybrana z grupy złożonej z J2R, B13R + B14R, A26L. A56R, C7L-K1L i 14L (według terminologii podanej w Goebel i wsp., 1990) i ich kombinacji. Zgodnie z tym otwarta ramka odczytu obejmuje gen kinazy tymidynowej, gen obszaru krwotocznego, obszar ciałek inkluzyjnych typu A, gen hemaglutyniny, obszar genów specyficzności względem gospodarza lub dużą podjednostkę reduktazy rybonukleotydów, albo ich kombinację. Odpowiedni zmodyfikowany kopenhaski szczep wirusa krowianki określany jest jako NYVAC (Tartaglia i wsp., 1992) lub wirus krowianki, z którego wydeletowano J2R, B13R + B14R, A26L, A56R, C7L-K1L i 14L lub gen kinazy tymidyny, gen obszaru krwotocznego, obszar ciałek inkluzyjnych typu A, gen hemaglutyniny, obszar genów specyficzności względem gospodarza lub dużą podjednostkę reduktazy rybonukleotydów (patrz też Patent US Nr 5,364,773). Korzystnym wirusem ospy jest ALVAC albo wirus ospy kanarków (szczep szczepionkowy Rentschler), który był atenuowany, na przykład przez ponad 200 seryjnych pasaży na fibroblastach zarodka kurzego i który to tak uzyskany wzorcowy posiew poddano czterem następującym po sobie oczyszczaniom łysinek pod agarem. Oczyszczone klony łysinek namnażano następnie przez pięć kolejnych pasaży.
PL 205 130 B1
Rozwiązania według wynalazku mogą również odnosić się do produktów ekspresji wytworzonych z rekombinowanych wirusów ospy i ich zastosowań tak, aby stworzyć kompozycje antygenowe, immunologiczne lub szczepionkowe do leczenia, zapobiegania diagnostyki lub testowania. Ponadto DNA z rekombinowanego wirusa ospy może być wykorzystane do konstruowania sond do DNA jak i starterów do reakcji PCR.
Taki rekombinowny wirus ospy zawierający sekwencję DNA z PCV2 w nieistotnym obszarze genomu wirusa ospy. Wirus ospy jest korzystnie wirusem ptasiej ospy, takim jak wirus ospy drobiu, szczególnie atenuowanym wirusem ospy drobiu, lub wirusem ospy kanarków, szczególnie atenuowanym wirusem ospy kanarków, takim jak ALVAC.
Taki zrekombinowany wirus ospy wyraża produkty obcego genu PCV2. Specyficzne ORF PCV2 są wstawiane do wirusa ospy, a uzyskany zrekombinowany wirus wykorzystuje się do zakażania zwierzęcia. Ekspresja produktów genu PCV2 w zwierzęciu prowadzi do wytworzenia odpowiedzi immunologicznej u zwierzęcia na PCV2. Dlatego rekombinowany wirus ospy opisany w niniejszym wynalazku można wykorzystać w kompozycji immunologicznej lub szczepionce, tak aby dostarczyć środków do indukcji odpowiedzi immunologicznej, która może, ale nie musi, być ochronna.
Procedura podawania rekombinowanego wirusa ospy-PCV2 albo ekspresja jego produktu, w kompozycjach takich jak kompozycje immunologiczne, antygenowe lub szczepionkowe albo kompozycjach terapeutycznych może być prowadzona drogą pozajelitową (doskórnie, domięśniowo, podskórnie). Takie podawanie umożliwia wytworzenie układowej odpowiedzi immunologicznej, albo humoralnej albo komórkowej.
Bardziej ogólnie rekombinowane wirusy PCV2, kompozycje wirusa ospy -PCV2 antygenowe, immunogenne lub szczepionkowe, albo kompozycje terapeutyczne można przygotować zgodnie ze standardowymi technikami dobrze znanymi specjalistom w dziedzinie farmacji lub weterynarii. Takie kompozycje mogą być podawane w dawkach i technikami dobrze znanymi specjalistom w dziedzinie medycyny lub weterynarii z uwzględnieniem takich czynników jak wiek, płeć, waga, gatunek i stan konkretnego pacjenta oraz drogi podania. Kompozycje mogą być podawane same lub mogą być podawane razem lub kolejno z kompozycjami np. z „innymi kompozycjami immunologicznymi, antygenowymi lub szczepionkowymi lub terapeutycznymi w ten sposób dając kompozycje wielowartościowe, lub „koktailowe albo kombinowane kompozycje opisane w wynalazku, oraz sposoby ich zastosowania. Ponownie składniki i sposób podawania (podawanie kolejno lub razem) jak i dawki mogą być ustalone uwzględniając takie czynniki jak wiek, płeć, waga, gatunek i stan konkretnego pacjenta oraz drogę podania. W tym względzie referencje dotyczą patentu U.S. nr 5 843 456, niniejszym włączonego jako odniesienie i dotyczą kompozycji przeciw wściekliźnie i kombinacji kompozycji oraz ich zastosowań. Przykłady takich kompozycji obejmują preparaty płynne do podawania dootworowego np. ustnego, nosowego, doodbytniczego, dopochwowego, doustnego, dożołądkowego itd., podawane jako roztwory, syropy albo eliksiry; oraz preparaty do podawania pozajelitowego, podskórnego, doskórnego, domięśniowego lub dożylnego (np. podawanie przez wstrzykiwane), takie jak sterylne roztwory lub emulsje. W takich kompozycjach rekombinowane wirusy ospy albo antygeny mogą być domieszkowane odpowiednim nośnikiem, rozcieńczalnikiem lub zaróbką taką jak sterylna woda, sól fizjologiczna, glukoza lub podobne. Kompozycje mogą także być liofilizowane. Kompozycje mogą zawierać substancje pomocnicze takie jak czynniki zwilżające lub emulgujące, czynniki buforujące pH, adiuwanty, dodatki wzmacniające żelatynowanie lub lepkość, konserwanty, czynniki smakowe, barwniki i podobne zależnie od drogi podawania i pożądanego preparatu. W celu przygotowania odpowiednich preparatów, bez niepotrzebnych eksperymentów, odpowiednie do tego wskazówki znajdują się w typowej publikacji takiej jak „Remington's Pharmaceutical Science, wydanie 17, 1985 niniejszym włączonej jako odniesienie. Odpowiednie dawki można również wyznaczyć na podstawie poniższych przykładów.
Kompozycje mogą zawierać przynajmniej jeden składnik adiuwantowy jak zostało to opisane powyżej.
Kompozycje immunologiczne mogą być związane z przynajmniej jedną żywą atenuowaną, inaktywowaną lub podjednostkową szczepionką lub rekombinowaną szczepionką (przykładowo wirusem ospy jako wektorem lub plazmidem DNA) wyrażającą przynajmniej jeden immunogen z przynajmniej jednego innego patogenu świni.
Opisane rozwiązania dotyczą również zrekombinowanych wirusów ospy zawierających sekwencję DNA z PCV2 w regionie, który nie jest konieczny dla genomu wirusów ospy. Zrekombinowane wirusy ospy wyrażają produkty z obcego genu PCV2. W szczególności, wyizolowano dwa geny,
PL 205 130 B1
ORF1 i ORF2, kodujące białka PCV2, scharakteryzowano je i wprowadzono do rekombinantów ALVAC (wektor oparty na wirusie ospy kanarków). Zastosowane techniki biologii molekularnej opisane są w Sambrook i wsp. (1989).
Linie komórkowe i szczepy wirusowe. Szczep PCV2 oznaczony jako Imp.1010-Stoon opisano wcześniej (Meehan i wsp., 1998). Szczep ten został wyizolowany z tkanek krezkowych węzłów chłonnych chorej świni pochodzącej z Kanady. Klonowanie genomu PCV2 opisano w Meehan i wsp. (1998). Plazmid pGem7Z-Imp.1010-Stoon-EcoRI nr 14 zawiera genom PCV2 jako fragment EcoRI wprowadzony w miejsce EcoRI plazmidu pGem-7Z (Promega, Madison, WI). Całkowita sekwencja nukleotydowa szczepu Imp.1010-Stoon PCV2 została ustalona w Meehan i wsp. (1998) i jest dostępna w bazie danych GenBank pod numerem dostępu AF055392.
Wyjściowy szczep wirusa ospy kanarków (szczep Rentschler) jest szczepem szczepionkowym dla kanarków. Szczep szczepionkowy uzyskano z dzikiego izolatu i osłabiano/atenuowano przez ponad 200 seryjnych pasaży na fibroblastach zarodka kurzego. Wzorcowy posiew wirusa poddano czterem następującym po sobie izolacjom z łysinek pod agarem i jeden klon z łysinki namnażano przez pięć kolejnych pasaży, po których zapas wirusa używano jako wyjściowego wirusa w testach rekombinacji in vitro. Izolat wirusa ospy kanarków oczyszczony przez łysinki oznaczono jako ALVAC. ALVAC został zdeponowany 14 listopada 1996 zgodnie z warunkami Traktatu Budapesztańskiego w American Type Culture Collection pod numerem dostępu ATCC VR-2547.
Wytwarzanie rekombinantów wirusów ospy obejmuje różne etapy: (1) konstrukcja plazmidu insercyjnego zawierającego sekwencje („ramiona) otaczające locus insercyjne w genomie wirusa ospy oraz miejsce do wielokrotnego klonowania (polilinker) (MCS) zlokalizowane pomiędzy dwoma otaczającymi ramionami (np. patrz przykład 2.1); (2) konstrukcja plazmidów dawców składających się z plazmidu insercyjnego, do którego w miejsce MCS wstawiono kasetę ekspresyjną dla obcego genu (np. patrz przykłady 2.2 do 2.5); (3) rekombinacja in vitro w hodowli komórkowej między ramionami plazmidu dawcy i genomem wyjściowego wirusa ospy pozwalająca na wstawienie kasety ekspresyjnej dla obcego genu w odpowiednie locus genomu wirusa ospy, i oczyszczanie przez łysinki rekombinowanych wirusów (np. patrz przykład 2.6). Rekombinowane immunogeny PCV2 można stosować w połączeniu z immunogenami PCV2 do immunizacji zwierząt przeciw PMWS. W najmniej korzystnym podejściu, immunogeny PCV1 można stosować bez immunogenów PCV2.
Wynalazek będzie obecnie poniżej opisany bardziej szczegółowo za pomocą nieograniczających przykładowych wykonań z odniesieniem do rysunku, na których:
Figura 1 przedstawia SEQ ID No:1, sekwencję DNA PCV genomu szczepu Imp 1011-48121.
Figura 2 przedstawia SEQ ID No:2, sekwencję DNA genomu szczepu Imp 1011-48285.
Figura 3 przedstawia SEQ ID No:3, sekwencję DNA genomu szczepu Imp 999.
Figura 4 przedstawia SEQ ID No:4, sekwencję DNA genomu szczepu Imp 1010.
Figura 5 przedstawia SEQ ID No:5, sekwencję DNA genomu szczepu PK715.
Figura 6 przedstawia SEQ ID No:6, sekwencję DNA genomu szczepu 1103, wyizolowanego w Alberta, Kanada., k oznacza g(G) lub t(T), y oznacza c(C) lub t(T). Te warianty sekwencji obserwowano w populacji wirusów.
Figura 7 przedstawia SEQ ID No:7, sekwencję DNA genomu szczepu 1121 wyizolowanego w Saskatoon, Kanada.
Figura. 1.1 przedstawia plazmid pJP109.
Figura 1.2 przedstawia plazmid pJP111.
Figura 1.3 przedstawia plazmid pJP120.
Figura 1.4 przedstawia plazmid pJP121.
Figura 1.5 przedstawia plazmid pJP058.
Figura 2.1 (2.1. A do C) (SEQ ID NO: 16) przedstawia sekwencję nukleotydową fragmentu DNA ALVAC o wielkości 3,7 kb, zawierającego otwartą ramkę odczytu C6.
Figura 2.2 przedstawia mapę plazmidu donorowego pJP102.
Figura 2.3 (SEQ ID NO: 8) przedstawia sekwencję nukleotydową fragmentu o wielkości 2,5 kb z plazmidu donorowego pJP102, od miejsca restrykcyjnego KpnI (pozycja 653) do pozycji 1680.
Figura 2.4 przedstawia mapę plazmidu donorowego pJP105.
Figura 2.5 przedstawia mapę plazmidu donorowego pJP107.
Figura 2.6 (2.6 A do C) (SEQ ID NO: 11) przedstawia sekwencję nukleotydową fragmentu o wielkości 3,6 kb z plazmidu donorowego pJP107, od miejsca restrykcyjnego KpnI (pozycja 653) do miejsca restrykcyjnego SacI (pozycja 4255).
PL 205 130 B1
Wynalazek będzie dalej opisany za pomocą następujących przykładów oraz wyników, dostarczonych jedynie w celu zobrazowania wykonań wynalazku i nie mających być uważane za jakiekolwiek jego ograniczenie.
P r z y k ł a d y i w y n i k i
P r z y k ł a d/w y n i k 1 Zapalenie mięśnia sercowego, poronienia i zakażenie wewnątrzmaciczne związane z PCV-2
Późne poronienia i prosienia z zarówno martwo urodzonymi i zmumifikowanymi prosiakami wystąpiły w nowej hodowli dla 450 samic świń, w okresie wprowadzenia jej do produkcji. U kilku loch obserwowano także ciążę rzekomą. Przed rozmnażaniem lochy otrzymały dwie dawki inaktywowanej szczepionki zawierającej parwowirus i immunogeny leptospirum.
Otrzymany do badania pośmiertnego miot składał się z 9 płodów, które obumarły w różnych stadiach ciąży. Były 2 zmumifikowane, 2 zmacerowane, 3 autolizowane i 2 świeże martwo urodzone świnie. Przy całkowitej obserwacji patologicznej zauważono uszkodzenia tylko w jednym częściowo autolizowanym płodzie. U tego płodu obie komory serca były rozszerzone, wątroba była powiększona i sztywna i wystąpiły zarówno puchlina opłucnej jak i wodobrzusze. Histopatologicznie obserwowano rozległe obszary degeneracji mięśnia sercowego lub nekrozy z obrzękiem i łagodnym zwłóknieniem oraz rozproszonym umiarkowanym naciekiem limfocytów i makrofagów. Wystąpiło wyraźne uogólnione przekrwienie wątroby i utrata komórek wątroby. Śledziona i nerki także były przekrwione. Nie wykryto znacznych uszkodzeń histologicznych u pozostałych płodów.
Immunohistochemiczne barwienie na PCV-2 przeprowadzono jak opisano uprzednio na skrawkach utrwalonych w formalinie rutynowo obrabianych i zatapianych tkanek stosując poliklonalną surowicę królika i monoklonalne przeciwciało, które uzyskano przeciw PCV-2 (Ellis i wsp., 1998; Ellis i wsp., 1999). U płodu z rozszerzoną kardiomiopatią wystąpiło rozległe barwienie dla antygenu PCV-2 w całym dotkniętym mięśniu serca. Barwienie było najbardziej rozległe w obszarach nekrozy i wydawało się przede wszystkim dotyczyć miocytów. Wystąpiło zarówno barwienie cytoplazmy jak i jąder. U wielu płodów widoczne było rozległe barwienie w wątrobie. W niektórych skrawkach wydawało się obejmować przede wszystkim nabłonek sinusoidalny i komórki Kupfera, podczas gdy u innych płodów, w tym w płodzie z zapaleniem mięśnia sercowego, wystąpiło też barwienie jądrowe i cytoplazmatyczne hepatocytów. Dodatnio barwione komórki były rozproszone w płucu i wieloogniskowo w nerce. Reakcję łańcuchową polimerazy dla PCV-2 przeprowadzono jak opisano uprzednio stosując zamarzniętą tkankę (Ellis i wsp. 1999). Produkt PCR o wielkości oczekiwanej dla PCV-2 zamplifikowano z tkanki płodowej. PCV-2 izolowano z płodu z zapaleniem mięśnia sercowego i puli tkanki od innych płodów w miocie przez zaszczepianie homogenatów tkankowych na komórkach PK-15 wolnych od PCV.
Tkanki płodowe były badane również pod kątem występowania innych patogenów wirusowych, które były kojarzone z uszkodzeniami płodów i poronieniami u świń, włączając w to parwowirus świń (PPV), wirus zespołu rozrodczo-oddechowego świń (PRRSV), wirus zapalenia mózgu i mięśnia sercowego (EMCV) i enterowirusy. Nie wykryto antygenu PPV za pomocą testowania fluorescencyjnym przeciwciałem (FAT) na zamrożonych skrawkach płuca, wątroby i śledziony z zmumifikowanych i martwo urodzonych płodów. Homogenaty wątroby, płuc i śledziony z poronionych płodów również zaszczepiono do hodowli wolnych od PCV komórek PK-15, pierwotnych świńskich komórek jajowodu i komórek Vero. Nie wykryto wirusów cytopatycznych po trzech pasażach. Tkanki były negatywne dla PPV przy zastosowaniu PCR. Nie wykryto antygenu PRRSV przy pomocy barwienia immunohistochemicznego.
Stąd obecne uszkodzenia płodów i poronienia były bezpośrednio związane z PCV-2. Uzyskane wyniki wskazują również na pionowe przenoszenie wirusa.
W poprzednich badaniach PCV-1 wyizolowano u 2 ze 160 zbadanych płodów świń sugerując, że ta grupa wirusów może być przenoszona pionowo, jednak nie wykryto związku antygenu PCV-1 z jakimikolwiek uszkodzeniami w tkance (Allan i wsp., 1995). Wykluczenie innych czynników, które były związane z uszkodzeniami płodów i poronieniami u świń, w tym PPV (Boit i wsp., 1997; Molitor i wsp., 1991), PRRSV (Lager i wsp., 1996), EMCV (Kim i wsp., 1989) i enterowirusa (Molitor i wsp., 1991) wskazują, że PCV-2 może powodować znaczną patologię płodu i następnie poronienia.
Jednak immunogeny PCV-1 (zgodnie z ogólnymi definicjami podanymi na początku) mogą wywołać odpowiedź immunogenną lub ochronną przeciwko zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniom i /lub zakażeniom wewnątrzmacicznym jak i poodsadzeniowemu wielonarządowemu
PL 205 130 B1 zespołowi wyniszczającemu. Stąd immunogeny PCV-1 mogą być stosowane w praktyce niniejszego wynalazku (np. w sposobach, kompozycjach, zastosowaniach itd.) albo same albo w połączeniu z immuno-genami PCV-2 (wektor może zawierać i wyrażać DNA kodujący zarówno immunogen i/lub epitop PCV-1 i immunogen i/lub epitop PCV-2) i/lub same lub w połączeniu z immunogenem i/lub epitopem innego patogenu świni (jeśli jest stosowany wektor, wektor może zawierać i wyrażać DNA kodujący zarówno immunogen i/lub epitop PCV-1 i immunogen i/lub epitop innego patogenu świni, lub immunogen i/lub epitop PCV-1 i immunogen i/lub epitop PCV-2 i immunogen i/lub epitop innego patogenu świni). Tak, więc specjalista może alternatywnie lub dodatkowo stosować immunogen i/lub epitop PCV-1 i/lub wektor kodujący taki immunogen i/lub epitop w opisanych rozwiązaniach bez nadmiernego eksperymentowania. Aby to wykonać wystarczy zapoznać się z przestawionymi tu wskazówkami oraz wnioskami płynącymi z niniejszych przykładów i podstawić PCV-1 w miejsce „PCV-2 z ewentualnymi niewielkimi modyfikacjami opartymi na podanych tu wskazaniach.
Zespół wyniszczenia związany z zakażeniami PCV-2 najczęściej występuje u świń w wieku 5-12 tygodni (Allan i wsp., 1998; Ellis i wsp., 1998) Eksperymentalne zakażenie nowonarodzonych świń wskazuje na względnie długi okres zapowiadający między zakażeniem, a rozwojem klinicznych objawów związanych z PCV-2 (Allan i wsp., 1999; Ellis i wsp., 1999). Wyniki tu podane pokazują, że wirus jest przenoszony pionowo lub w okresie okołoporodowym. Pionowe przeniesienie wewnątrzmaciczne PCV-2 może spowodować, nie tylko poronienie, ale jest możliwe, że zakażone w macicy dawką subletalną prosiaki mogą być tymi zwierzętami, u których następnie rozwinie się PMWS.
Co więcej, wyniki te wykazują, że zaszczepienie samic świń kompozycją obejmującą immunogen PCV-2 (która to kompozycja może także zwierać immunogen z innego patogenu świni, np. parwowirus świni) przed rozmnażaniem lub pokrywaniem, lub przed okresem okołoporodowym i/lub w czasie ciąży może zapobiegać zapaleniu mięśnia sercowego i/lub poronieniom i/lub zakażeniu wewnątrzmacicznemu związanemu z cirkowirusem świni-2 jak i poodsadzeniowemu wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu i innym patologicznym konsekwencjom związanym z PCV-2, przez wywołanie odpowiedzi immunologicznej lub przeciwciał przeciw PCV-2.
Oczywiście kompozycje, sposoby i inne aspekty opisane w wynalazku mogą być stosowane lub praktykowane u zwierząt innych niż świnie np. owce, bizony, bydło, dziki, na przykład, jeśli PCV-2 zakaża takie inne zwierzęta.
P r z y k ł a d/w y n i k 2 Zapalenie mięśnia sercowego, poronienia i zakażenie wewnątrzmaciczne związane z PCV-2
Obecność PCV-2 u nowonarodzonych świń sugeruje, że pionowa transmisja może być ważnym sposobem przekazywania wirusów. Ten sposób transmisji może być związany nie tylko z niepowodzeniem rozmnażania, ale także z rozwojem wieloukładowego zespołu chorobowego w późniejszym okresie życia. Jest interesujące określenie, czy uprzednio niewykryty PCV-2 (i PCV-1) był przekazywany pionowo w regionach wytwarzających wieprzowinę, gdzie występował endemicznie PMWS, a przez to zakażenie PCV-2 było endemiczne przez przynajmniej kilka lat.
Oceniono trzydzieści osiem zgłoszeń dotyczących niepowodzenia rozmnażania otrzymanych w laboratorium diagnostycznym w Western College of Veterinary Medicine (WCVM), University of Saskatchewan, Saskatoon, Kanada przez okres czterech lat od łącznie 30 stad o dobrym stanie zdrowia. W pięciu z gospodarstw, z których otrzymano próbki zdiagnozowano przypadki PMWS. Dwadzieścia siedem z trzydziestu ośmiu zgłoszeń (71%) zaklasyfikowano jako poronienia, pięć z nich (13%) także obejmowały przynajmniej jeden zmumifikowany płód. Z pozostałych 10 przypadków: 5 dotyczyło martwo urodzonych prosiaków razem z nieżywotnymi prosiakami (13%); 2 z martwo urodzonymi i jednym lub więcej zmumifikowanymi płodami (5%); 2 tylko z martwo urodzonymi prosiakami (5%) i jeden z tylko zmumifikowanymi płodami (2,5%). Rutynowa diagnostyka przeprowadzona w kierunku wykrycia innych patogenów niż cirkowirusy wykryła 4 przypadki (11%), w których stwierdzono, że etiologią był parwowirus świń i 2 przypadki (5%), w których etiologia była pochodzenia bakteryjnego. Przeprowadzono całkowite autopsje. Zebrano i utrwalono tkanki w buforowanej formalinie (czas utrwalania 24-72 godzin) oraz w większości przypadków poddano również świeże tkanki rutynowej ocenie mikrobiologicznej. Żadnego z tych przypadków nie badano uprzednio pod kątem PCV-2.
Technika PCR została zastosowana do wykrycia PCV-1 i PCV-2 i reakcje przeprowadzano jak opisano uprzednio (Tischer i wsp. 1974). PCV-1 nie wykryto za pomocą PCR w żadnych zgłoszeniach obejmujących niepowodzenia rozmnażania z okresu czteroletniego. PCV-2 wykryto za pomocą PCR
PL 205 130 B1 w dwóch różnych zgłoszeniach, które pochodziły z tej samej wieloośrodkowej jednostki produkcyjnej, z dwóch różnych zdarzeń, które miały miejsce wiosną ostatniego roku czteroletniego okresu. Pierwsze z tych zgłoszeń obejmowało miot prosiąt ze zgrubnymi wskazaniami zapalenia mięśnia sercowego, przerostu serca i przewlekłego biernego przekrwienia.
Immunohistochemiczną identyfikację PCV-2 w tkankach przeprowadzono jak opisano uprzednio (Tischer i wsp. 1974). Barwienie immunohistochemiczne (IHC) na PCV-2 było dodatnie w sercach wszystkich sześciu ze zgłoszonych prosiąt, podczas gdy 4 z 6 były dodatnie w badaniu PCR na PCV-2 (patrz następująca Tabela).
Tabela: Wykrywanie PCV-2 w utrwalonych w formalinie sercach świń z zapaleniem mięśnia sercowego za pomocą PCR, IHC i izolację wirusów z hodowli komórkowej
| Tkanki PCV-2 dodatnie | PCR | IHC | Izolacja wirusa |
| Utrwalone | 5/6 | 6/6 | brak danych |
| Zamrożone | 4/4 | brak danych | 2/4 |
Drugie zgłoszenie z tego samego gospodarstwa było złożone z miotu czterech prosiaków, z których dwa były martwo urodzone i 2 pozostałe zmarły tuż po urodzeniu. U wszystkich czterech prosiaków wystąpiły ogólne dowody ostrego, rozproszonego zapalenia mięśnia sercowego, przerostu serca i przewlekłego biernego przekrwienia. Analizie poddano tylko świeże mrożone serca i połączone tkanki płuc/śledziony. Wynik reakcji PCR na PCV-2 był dodatni dla serc 2 z 4 prosiąt, a w połączonych tkankach płuc i śledziony dla 4 z 4 prosiąt. Izolacja PCV-2 z dotkniętych serc i/lub połączonej tkanki płuc i śledziony była dodatnia w 2 z 4 przypadków, które były PCV-2 dodatnie na podstawie PCR. W oparciu o serologię i/lub PCR inne czynniki związane z niepowodzeniem rozmnażania u świni, w tym wirus zespołu rozrodczo-oddechowego świń i parwowirus świń, wydawały się krążyć w obrębie rozmnażającego się stada.
Jednak nie udało się wykazać, aby czynniki te były związane z ostrymi uszkodzeniami serca (czy innymi) u dotkniętych prosiaków, ale mogą one mieć wpływ na PMWS.
Wirusa PCV-2 nie wykryto za pomocą PCR ani IHC w jakimkolwiek reprezentatywnym przypadku niepowodzenia rozmnażania zgłoszonych w czasie pierwszych trzech lat czteroletniego okresu (był wykryty w przypadkach niepowodzenia rozmnażania zgłoszonych w ciągu ostatniego roku czteroletniego okresu obserwacji). Aby wykluczyć uszkodzenia DNA w czasie utrwalania w formalinie, jako możliwy niekorzystny czynnik ograniczający zdolność do wykrywania PCV-2 za pomocą PCR, przeprowadzono PCR na tkankach zebranych z 4 odstawionych od piersi prosiaków z PMWS. DNA PCV-2 uległo amplifikacji we wszystkich badanych tkankach, w tym były to: płuca, wątroba, nerka i węzeł chłonny płuc, ze wszystkich czterech osobników. Co więcej, czułość PCR na PCV-2 była niezależna od okresu utrwalania każdej tkanki w formalinie.
Uzyskane wyniki potwierdzają i rozszerzają uprzednie obserwacje (West i wsp. 1999), że PCV-2 może być przenoszony pionowo i może być obecny w dużych ilościach w uszkodzeniach z prosiąt zakażonych w macicy. Pionowe przenoszenie PCV-2 i wynikające z tego uszkodzenia płodów, takie jak zapalenie mięśnia sercowego, są dodatkowym przejawem chorobowym PCV-2. Co więcej, niemożliwość wykrycia PCV-2 w przypadkach niepowodzenia rozmnażania zgłoszonych przed ostatnim rokiem czteroletniego okresu obserwacji, z obszaru endemicznego dla zakażenia PCV-2, może wskazywać, że przenoszenie pionowe nie było pierwotnym mechanizmem odpowiedzialnym za pierwotne rozprzestrzenianie zakażenia wirusem. Płciowe jak i pionowe sposoby przekazywania mogą być związane z rozprzestrzenianiem zakażenia PCV-2 u świń.
P r z y k ł a d/w y n i k 3 Hodowla i izolacja szczepów cirkowirusa świń
Wirusy 1103 oraz 1021 zostały wyizolowane odpowiednio w Alberta, lub odpowiednio Saskatoon, Kanada, z przypadków poronień sposobem opisanym przez J. Ellis i wsp. Can. J. Vet. 1998, tom 39, 44-51.
Hodowlę wirusa przeprowadza się na komórkach PK/15, o których wiadomo, że nie są zanieczyszczone cirkowirusami świń (PCV), pestiwirusami, adenowirusami świń i parwowirusami świń (Allan G. i wsp. Pathogenesis of porcine circovirus experimental infections of colostrum-deprived piglets and examination of pig foetal material. Vet. Microbiol. 1995, 44, 49-64).
PL 205 130 B1
Pojedyncze warstwy komórek PK/15 rozbijano za pomocą trypsynizacji (mieszaniną trypsyna-wersen) z konfluentnych hodowli, i podnoszono w podłożu MEM-SA zawierającym 15% płodową surowicę cielęcą nie skażoną przez pestiwirus (=podłoże MEM-G), w końcowym stężeniu około 400000 komórek na ml. 10 ml frakcje tej zawiesiny komórek następnie zmieszano z frakcjami próbek po 2 ml inokulum opisanych powyżej, i końcową mieszaninę rozporcjowano w objętościach 6 ml do dwóch kolb Falcon 25 cm2. Te hodowle następnie inkubowano w +37°C przez 18 godzin pod atmosferą zawierającą 10% CO2.
Po inkubacji podłoże hodowlane w połowie konfluentnych warstw pojedynczych poddano działaniu 300 mM D-glukozoaminy (Nr kat. G48175, Sigma-Aldrich Company, Limited, Poole, UK) (Tischr I. i wsp. Arch. Virol. 1987, 96 39-57), a następnie kontynuowano inkubację przez dodatkowy okres 48-72 godzin w +37°C. Po tej ostatniej inkubacji poddano jeden z dwóch Falconów każdego z inoculum 3 kolejnym cyklom zamrażania/rozmrażania. Komórki PK/15 z pozostałego Falcona poddano działaniu roztworu trypsyna-weresen, ponownie zawieszono w 20 ml podłoża MEM-G i następnie zaszczepiono w Falconach 75 cm2 w stężeniu 400000 komórek/ml. Świeżo zaszczepione kolby następnie „nadkażano przez dodanie 5 ml odpowiedniego lizatu otrzymanego po cyklach zamrażania/rozmrażania.
P r z y k ł a d/w y n i k 4 Technika wykrywania PCV za pomocą immunofluorescencji
Wstępne badania przesiewowe wszystkich preparatów hodowli komórkowych utrwalanych acetonem przeprowadzono za pomocą techniki pośredniej immunofluorescencji (IIF) stosując rozcieńczenie 1/100 puli surowic dojrzałych świń. Ta pula surowic zawiera surowice z 25 dojrzałych macior z Północnej Irlandii i wiadomo, że zawiera przeciwciała przeciwko szerokiemu zakresowi wirusów świń, w tym PCV, parwowirusa świń, adenowirusa świń i wirusa PRRS. Technikę IIF przeprowadzono przez kontaktowanie surowicy (rozcieńczonej w PBS) z hodowlami komórek przez jedną godzinę w +37°C, po czym płukano dwa razy PBS. Hodowle komórek barwiono przez jedną godzinę rozcieńczeniem 1/80 w PBS przeciwciała królika anty-immunoglobulina świni skoniugowanego z izotiocyjanianem fluoresceiny a następnie płukano PBS i umiejscawiano w buforze glicerolowym przed obserwowaniem pod mikroskopem w świetle ultrafioletowym.
P r z y k ł a d/w y n i k 5 Wytwarzanie antygenów PCV przez hodowlę in vitro
Hodowlę niezakażonych komórek PK715 i namnożenia wirusa przeprowadzono według tych samych metod jak opisane w Przykładzie 1.
Zakażone komórki zebrano po trypsynizacji po 4 dniach hodowli w 37°C i policzono. Następny pasaż zaszczepiono 400000 zakażonymi komórkami na ml.
W ten sposób hoduje się różne ujawnione tu szczepy PCV-2 np. szczepy 1103 i 1121.
P r z y k ł a d/w y n i k 6 Miareczkowanie PCV-2
Miareczkowanie przeprowadzono w 96-studzienkowych mikropłytkach.
Najpierw wprowadzono zawiesinę komórek PK/15 (150000 komórek/ml) (100 μl na studzienkę). Następnie przeprowadzono rozcieńczenia hodowli wirusa i wprowadzono je do studzienek po 100 gl. Inkubację przeprowadzono w 37°C z CO2. Po 24 godzinach przeprowadzano traktowanie glukozoaminą przez pół godziny w 37°C (co do warunków - patrz przykład 3). Następnie usunięto podłoże hodowlane i wprowadzono świeże podłoże. Przeprowadzono inkubację przez 72 godzin w 37°C. Ogniska wykazano wykorzystując przeciwciało monoklonalne anty-PCV-2 i koniugat mysi znakowany FITC.
Wskazana metoda może być stosowana do mianowania w celu przygotowania inaktywowanego jak i żywego atenuowanego PCV-2.
P r z y k ł a d/w y n i k 7 Inaktywacja antygenów wirusowych
Pod koniec hodowli wirusa zbiera się zakażone komórki i lizuje stosując ultradźwięki (sonikator Branson) lub za pomocą młyna koloidalnego typu rotor-stator (UltraTurrax, IKA). Zawiesinę następnie wirowano w 3700 g przez 30 minut. Zawiesinę wirusa inaktywowano 0,1% etylenoiminą przez 18 godzin w +37°C lub 0,5% betapropiolaktonem przez 24 godziny w +28°C. Jeśli miano wirusa przed inaktywacją jest nieodpowiednie, zawiesinę wirusa zatęża się przez ultrasączenie stosując membranę z odcięciem 300 kDa (Millipore PTMK300). Inaktywowaną mieszaninę wirusa przechowywano w +5°C.
P r z y k ł a d/w y n i k 8 Wytwarzanie szczepionki w postaci emulsji opartej na oleju mineralnym
Szczepionkę przygotowano według następującej formuły:
- zawiesina inaktywowanego cirkowirusa świń: 250 ml
- Montanide® ISA 70 (SEPPIC): 750 ml
PL 205 130 B1
Fazę wodną i fazę olejową sterylizowano oddzielnie za pomocą sączenia. Emulsję przygotowano przez mieszanie i homogenizowanie składników za pomocą emulgatora turbinowego Silverson.
Jedna dawka szczepionki zawiera około 107,5 TCID50. Objętość jednej dawki szczepionki wynosi 0,5 ml dla podawania drogą śródskórną i 2 ml dla podawania drogą domięśniową.
Szczepionka jest stosowana w programie szczepienia przeciwko wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu w kombinacji ze szczepionką Parvovax®.
P r z y k ł a d/w y n i k 9 Wytworzenie szczepionki w postaci metabolizowanej emulsji opartej na oleju
Szczepionkę przygotowano według następującej formuły:
- zawiesina inaktywowanego cirkowirusa świń: 200 ml
- Dehymuls HRE 7 (Henkel): 60 ml
- Radia 7204 (Oleofina): 740 ml
Fazę wodną i fazę olejową sterylizowano oddzielnie za pomocą sączenia. Emulsję przygotowano przez mieszanie i homogenizowanie składników za pomocą emulgatora turbinowego Silverson.
Jedna dawka szczepionki zawiera około 107,5 TCID50. Objętość jednej dawki szczepionki wynosi 2 ml dla podawania drogą domięśniową.
Szczepionka jest stosowana w programie szczepienia przeciwko wielonarządowemu zespołowi wyniszczającemu w kombinacji ze szczepionką Parvovax®.
P r z y k ł a d/w y n i k 10 Szczepienie prosiąt wektorem DNA (plazmidowym)
Grupy 3 lub 4 prosiąt urodzonych przez cesarskie ciecie w dniu 0 umieszczono w izolatorach. Prosięta szczepiono w dniu 2 albo (A) plazmidem zawierającym ORF13 albo (B) mieszaniną tego plazmidu i innego plazmidu zawierającego ORF4, a roztworem soli fizjologicznej dla grupy kontrolnej. Każdy plazmid rozcieńcza się w sterylnym roztworze soli fizjologicznej (0,9% NaCl) do końcowego stężenia 250 μg/ml. Wstrzykuje się objętość 2 ml domięśniowo w 2 punkty każdy po 1 ml (1 punkt z każdej strony szyi). Podaje się drugi zastrzyk szczepionki lub placebo w dniu 14. Szczepienie DNA jest dobrze tolerowane przez prosięta i nie ma żadnych obserwacji dotyczących niekorzystnego efektu szczepienia. Prosięta poddano prowokacji w dniu 21 przez podanie ustno-donosowe zawiesiny wirusa PCV-2, 1 ml do każdego nozdrza. Po prowokacji prosiaki ważono raz w tygodniu. Mierzono temperatury w odbycie w dniach 17, 21, 22, 24, 27, 29, 31, 34, 37, 41, 44. Zebrano wymazy kałowe w dniu 44 od każdego prosiaka w celu sprawdzenia wydalania PCV-2. Wirus wykrywano i oznaczano ilościowo za pomocą ilościowego PCR. W dniu 45 przeprowadzano autopsje i zebrano próbki do izolacji wirusa.
• Objawy kliniczne:
Nie ma znaczącej różnicy w średnich przyrostach masy ciała lub średnich temperaturach między grupami.
• Uszkodzenia zaobserwowane przy autopsji:
Jedyna zaobserwowana ogólna zmiana u prosiaków pod koniec to limfadenopatia oskrzeli (uogólnione powiększenie węzłów chłonnych oskrzelowych). Uszkodzenia określa się na podstawie następujących kryteriów:
= brak widocznego powiększenia węzłów chłonnych = łagodne powiększenie węzłów chłonnych, ograniczone do węzłów chłonnych oskrzelowych = umiarkowane powiększenie węzłów chłonnych, ograniczone do węzłów chłonnych oskrzelowych = silne powiększenie węzłów chłonnych, rozszerzone do węzłów chłonnych oskrzelowych, podżuchwowych, podłopatkowych i pachwinowych std jest skrótem dla odchylenia standardowego
| Grupy | średnia | std | Wyniki limfadenopatii N |
| (A) | 1,2 | 1,3 | 4 |
| (B) | 2,0 | 1,7 | 3 |
| kontrole | 3,0 | 0,0 | 3 |
N = liczba prosiąt w każdej grupie
Zaobserwowano zmniejszenie uszkodzeń węzłów chłonnych (limfatycznych) u 3 z 4 prosiąt immunizowanych (A) i u 1 z 3 prosiąt immunizowanych mieszaniną (B). Różnica ta nie jest znacząca (p>0,05) ze względu na wysokie wartości odchyleń standardowych (std).
PL 205 130 B1 • Obciążenie wirusem tkanek węzłów chłonnych
Ilościowa reizolacja wirusów jest przeprowadzana na homogenatach tkankowych przygotowanych z oskrzelowych i krezkowych węzłów chłonnych.
Przedstawione dane odpowiadają mianom wirusa w homogenatach tkankowych po przekształceniu w log10.
Miana PCV-2
Grupy węzły chłonne oskrzelowe węzły chłonne krezkowe
| średnia | std | średnia | std | N | |
| (A) | 0,9 | 0,8 | 0,9 | 0,8 | 4 |
| (B) | 0,7 | 0,6 | 0,2 | 0,2 | 3 |
| kontole | 2,0 | 1,1 | 1,8 | 1,1 | 4 |
Węzły chłonne oskrzelowe wydają się zawierać najbardziej zakaźne wirusy. Obserwuje się obciążenie wirusem w oskrzelowych i krezkowych węzłach chłonnych u prosiąt immunizowanych mieszaniną zarówno (A) jak i (B). Zmniejszenie jest znaczące (p < 0,05 dla mieszaniny plazmidów).
• Wydalanie wirusa:
Oceniano wymazy z kału od prosiąt po prowokacji pod kątem uwalniania PCV-2 stosując PCR w oparciu o amplifikację ORF13 z PCV-2. Każde oznaczenie przeprowadzono w trzech powtórzeniach na 2 ml próbki. Nieszczepione kontrole dają wynik ujemny przed prowokacją PCV-2 i dodatni po prowokacji, potwierdzając odpowiedniość oznaczenia PCR.
Wartości są wyrażone jako logio (liczba cząsteczek DNA PCV-2 w 2 μl próbce).
Log10 liczby cząsteczek DNA PCV-2
| Grupy | średnia | std | N |
| (A) | 3,3 | 0,3 | 4 |
| (A) | 2,9 | 0,7 | 3 |
| kontrole | 3,6 | 0,6 | 4 |
Różnice pomiędzy grupami nie są znaczące (p>0,05).
P r z y k ł a d/w y n i k 11 Szczepienie prosiąt żywym wektorem ospy kanarka i wyniki Grupy 3 lub 4 prosiąt urodzonych przez cesarskie ciecie w dniu 0 umieszczono w izolatorach.
Prosięta w dniu 2 szczepiono 108 pfu (C) wirusa ospy kanarków obejmującym ORF13 lub (D) wirusa ospy kanarka obejmującym ORF13 i ORF4, lub wyjściowym wirusem ospy kanarków w 1 ml PBS domięśniowo z boku szyi. W 14 dniu podawano drugą iniekcję szczepionki lub placebo. Szczepienie wirusem ospy kanarków jest dobrze tolerowane przez prosiaki i nie zaobserwowano żadnego niekorzystnego efektu szczepienia. Prosięta poddano prowokacji w dniu 21 przez podanie ustno-nosowe zawiesiny wirusa PCV-2, po 1 ml do każdego nozdrza. W dniu 45 przeprowadzono autopsje i zebrano próbki tkanek do izolacji wirusa.
Wyniki autopsji:
PWMS jest ogólnie charakteryzowany przez limfadenopatie i rzadziej przez zapalenie wątroby lub zapalenie nerek. Stąd określono otrzymane wyniki dla węzłów chłonnych u każdego prosięcia w następujący sposób: 0 = brak widocznego powiększenia węzłów chłonnych; 1 = łagodne powiększenie węzłów chłonnych, ograniczone do węzłów chłonnych oskrzelowych; 2 = umiarkowane powiększenie węzłów chłonnych, ograniczone do węzłów chłonnych oskrzelowych; 3 = silne powiększenie węzłów chłonnych, rozszerzone do węzłów chłonnych oskrzelowych, podżuchowych, podłopatkowych i pachwinowych.
Grupa wyniki (C) 0,5
0,0 0,0 1,0 0,38 średnia
PL 205 130 B1 odchylenie standardowe (D) średnia odchylenie standardowe kontrole średnia odchylenie standardowe
0,48
0,0
0,5
0,5
1,0
0,5
0,41
2,0
2,5
2,5
2,5
2,38
0,25
Oskrzelowe uogólnione powiększenie węzłów chłonnych (limfadenopatia oskrzelowa) jest przeważającym i wyróżniającym się objawem dla PCV2. Znaczące obniżenie uszkodzeń węzłów chłonnych w odniesieniu do grupy kontrolnej obserwuje się po immunizacji (C) i (D) (p<0,05). Choć przedstawiono powyżej szczegółowo opisane korzystne przykładowe wykonania wynalazku, należy rozumieć, że wynalazek określony przez załączone zastrzeżenia nie jest ograniczony do poszczególnych sposobów wykonania wskazanych w powyższym opisie, ale obejmuje inne warianty, które nie wykraczają poza zakres jego ujawnienia.
P r z y k ł a d 1.1 Konstrukcja plazmidu pJP109
Plazmid pGEM7Z-Imp1010 Snoon-EcoRI Nr 14 zawierający genom wirusa PCV-2 w postaci fragmentu EcoRJ (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1998. 79 2171-2179) strawiono EcoRI, aby wyizolować, po elektroforezie w żelu agarozowym, fragment EcoRI-EcoRI o długości 1768 par zasad (bp). Ten fragment zligowano sam ze sobą.
Gen ORF2 wirusa PCV-2 szczepu 1010-Stoon (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1998. 79. 2171-2179; sekwencja GenBank nr dostępu AF055392) zamplifikowano stosując matrycę złożoną z samozligowanego fragmentu EcoRI-EcoRI za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) stosując następujące oligonukleotydy:
JP779 (SEQ ID NO:27) (35 mer):
5'CATCATCATGTCGACATGACGTATCCAAGGAGGCG3' i
JP780 (SEQ ID NO:28) (36 mer):
5' TACTACTAC AG ATCTTTAGGGTTTAAGTGGGGGGTC3' tak aby wytworzyć fragment PCR 730 bp. Ten fragment strawiono Sall i Bglll i wyizolowano, po elektroforezie w żelu agarozowym, fragment restrykcyjny 715 bp Sall-BgIII. Uzyskany fragment następnie zligowano z plazmidem pVR1012 (Hartikka J. i wsp. Human Gene Therapy. 1996. 7. 1205-1217), uprzednio strawionym Sall i Bglll i w ten sposób otrzymano plazmid pJP109 (5567 bp) (Figura 1.1).
P r z y k ł a d 1.2 Konstrukcja plazmidu pJP111
Przeprowadzono reakcję łańcuchową polimerazy stosując plazmid pGem7Z-Imp1010-Stoon (patrz Przykład 1.1) (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1998. 79. 2171-2179) i następujące oligonukleotydy:
JP781 (SEQ ID NO:29) (35 mer):
5' CATCATCATGTCGACATGCCCAGCAAGAAGAATGG3' i
JP782 (SEQ ID NO:30) (36 mer):
5' TACTACTAC AGATCTTC AGTAATTTATTTC ATATGG3' tak aby wytworzyć fragment PCR 970 bp zawierający gen ORF1 wirusa PCV-2. Uzyskany fragment strawiono Sall i Bglll, aby po elektroforezie w żelu agarozowym, wyizolować fragment restrykcyjny 955 bp Sall-BgIII. Ten fragment następnie zligowano z plazmidem pVR1012 (Przykład 1.1) i uzyskano plazmid pJP111 (5810 bp) (Figura 1. 2).
P r z y k ł a d 1.3 Konstrukcja plazmidu pJP120 (PCV-1 ORF2)
Przeprowadzono reakcję łańcuchową polimerazy z plazmidem pPCV1 (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1997. 78. 221-227) i następującymi oligonukleotydami:
PL 205 130 B1
JP783 (SEQ ID NO:31) (35 mer):
5' CATC ATC ATGTCG AC ATGACGTGGCC AAGGAGGCG3' i
JP784 (SEQ ID NO:32) (40 mer):
'TACTACTAC AGATCTTTATTTATTTAGAGGGTCTTTTAGG3' tak, aby wytworzyć fragment PCR o długości 730 bp zawierający gen ORF2 wirusa PCV-1 (szczep PK-15, numer dostępu dla sekwencji w GenBank U49186). Uzyskany fragment strawiono Sall i Bglll, aby wyizolować, po elektroforezie w żelu agarozowym, fragment restrykcyjny 715 bp Sall-BgIII. Ten fragment następnie zligowano z plazmidem pVR1012 (Przykład 1.1) i uzyskano plazmid pJP120 (5565 bp) (Figura 1. 3).
P r z y k ł a d 1.4 Konstrukcja plazmidu pJP121 (PCV-1 ORF1)
Plazmid pPCV1 zawierający genom wirusa PCV1 w postaci fragmentu Pstl (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1997, 78, 221-227) strawiono Pstl, aby, po elektroforezie w żelu agarozowym, wyizolować fragment Pstl-Pstl o długości 1759 par zasad (bp). Ten fragment zligowano sam ze sobą.
Gen ORF1 wirusa PCV-1 szczep PK-15 (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1997. 78, 221-227; sekwencja w GenBank nr dostępu U49186) zamplifikowano stosując matrycę złożoną z samozligowanego fragmentu Pstl-Pstl za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) z następującymi oligonukleotydami:
JP785 (SEQ ID NO:33) (35 mer):
5' CATCATCATGTCGACATGCCAAGCAAGAAAAGCGG3' i
JP786 (SEQ ID NO:34) (36 mer):
5' TACTACTAC AGATCTTC AGTAATTTATTTTATATGG3' w celu wytworzenia fragmentu PCR o 965 bp zawierającego gen ORF1 wirusa PCV-1 (szczep PK-15). Ten fragment strawiono Sall i Bglll, aby, po elektroforezie w żelu agarozowym, wyizolować fragment restrykcyjny 946 bp Sall-BgIII. Ten fragment następnie zligowano z plazmidem pVR1012 (Przykład 1.1), i uzyskano plazmid pJP121 (5804 bp) (Figura 1. 4).
P r z y k ł a d 1.5 Konstrukcja plazmidu pJP058 (wyrażającego GM-CSF świń)
Krew świni zebrano w probówce zawierającej EDTA za pomocą pobrania krwi z żyły szyjnej. Komórki jednojądrzaste zebrano wirując na gradiencie Ficollu, a następnie umieszczono je w hodowli in vitro w podłożu RPMI 1640 (Gibco BRL) i stymulowano przez podanie konkanawaliny A (conA) (Sigma) w stężeniu końcowym około 5 μg/ml w podłożu hodowlanym. Po 72 godzinach stymulacji te limfoblasty zebrano, a całkowity RNA z tych komórek ekstrahowano stosując zestaw do ekstrakcji „Micro-Scale Total RNA Separation Kit (Clontech) według zaleceń producenta. Na całkowitym RNA wyekstrahowanym z świńskich limfoblastów przeprowadzono reakcję odwrotnej transkrypcji przy pomocy zestawu „1st Strand cDNA synthesis Kit (Perkin Elmer), a następnie przeprowadzono reakcję łańcuchową polimerazy z następującymi oligonukleotydami:
RG972 (33 mer) (SEQ ID NO:35)
5' TATGCGGCCGCC ACC ATGTGGCTGC AGAACCTG3' i RG973 (34 mer) (SEQ ID NO:36)
5'TATGCGGCCGCTACGTATCACTTCTGGGCTGGTT3' w celu wytworzenia fragmentu PCR o długości około 450 par zasad (bp). Ten fragment strawiono Notl, aby po elektroforezie w żelu agarozowym, wyizolować fragment Notl 450 bp. Ten fragment następnie zligowano z plazmidem pVR1012 (Przykład 1.1), korzystnie strawionym Notl i defosforylowanym i uzyskano plazmid pJP058 (5405 bp) (Figura 1.5). Sprawdzono sekwencję genu pGM-CSF sklonowanego w plazmidzie pJP058 i stwierdzono, że jest identyczny z dostępną w bazie danych GenBank (numer dostępu D21074).
P r z y k ł a d 1.6 Wytworzenie oczyszczonych plazmidów do szczepienia świń
Bakterie Escherichia coli K12 (szczepy DH10B lub SCS1) transformowano plazmidami pJP109, pJP111, pJP058, pJP120 i pJP121 z Przykładów 1.1 do 1.5 powyżej. Pięć odpowiednio otrzymanych transformowanych klonów z tymi pięcioma plazmidami następnie hodowano oddzielnie z wytrząsaniem w +37°C w podłożu pełnym (LB). Hodowle bakterii zebrano pod koniec fazy wykładniczej i plazmidy ekstrahowano techniką lizy alkalicznej. Wyekstrahowane plazmidy następnie oczyszczono na gradiencie chlorku cezu według metody opisanej przez Sambrook i wsp. (Molecular Biology: A Laboratory Manual, wyd. 2, 1989, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold
PL 205 130 B1
Spring Harbor, NY). Po ostatecznej ekstrakcji bromku etydyny i strąceniu w obecności alkoholu absolutnego oczyszczone plazmidy ponownie zawieszono w buforze TE (1 mM Tris/EDTA, pH 8,0) aby uzyskać roztwory podstawowe zawierające 2 mg plazmidu na ml. Te roztwory podstawowe przechowywano w -20°C przed użyciem.
P r z y k ł a d 1.7 Kontrola ekspresji ORF 1 i 2 wirusa PCV-2
W celu sprawdzenia produktów ekspresji genów PCV-2 ORF2 i PCV-2 ORF1 sklonowanych odpowiednio w plazmidach pJP109 i pJP111, plazmidy te transfekowano do komórek CHO-K1 (Jajnik chomika chińskiego) (ATCC Nr CCL-61) stosując zestaw do transfekcji Lipofectamine Plus® (GibcoBRL Nr Katalogu 10964-013), według zaleceń producenta. 48 godzin po transfekcji transfekowane komórki płukano i utrwalano roztworem 95% lodowatego kwasu octowego przez 3 minuty w temperaturze pokojowej. Zastosowano pięć przeciwciał monoklonalnych, specyficznych dla białek PCV-2 ORF1 (F199 1D3GA i F210 7G5GD) i białek ORF2 (F190 4C7CF, F190 2B1BC i F190 3A8BC) jako pierwsze przeciwciała. Do ujawnienia specyficznego znakowania stosowano koniugat anty-mysi IgG znakowany Cy3. Zaobserwowano fluorescencję specyficzną w stosunku do PCV-2 dla trzech monoklonalnych przeciwciał dla ORF2 w komórkach transfekowanych plazmidem pJP109, ale nie w tych transfekowanych plazmidem pJP111. Przeciwnie, fluorescencję specyficzną dla PCV-2 zaobserwowano dla dwóch przeciwciał monoklonalnych dla PCV-2 ORF1 w komórkach transfekowanych plazmidem pJP111, ale nie w tych transfekowanych plazmidem pJP109. Nie wykryto fluorescencji z monoklonalnymi przeciwciałami PCV-2 w komórkach CHO transfekowanych samym plazmidem pVR1012, ani w nietransfekowanych komórkach CHO.
Ten sam wynik ekspresji uzyskano z surowicą poliklonalną specyficzną dla wirusa PCV-2. W tym przypadku znakowany fluoresceiną koniugat anty-IgG świni był zastosowany do detekcji specyficznej fluorescencji. Nie wykryto fluorescencji z tą surowicą poliklonalną w komórkach CHO transfekowanych samym plazmidem pVR1012 ani w nietransfekowanych komórkach CHO.
P r z y k ł a d 1.8 Szczepienie świń nagim DNA
1.8.1 Jednodniowe prosiaki
Grupy prosiaków otrzymanych za pomocą cięcia cesarskiego w dniu 0 protokołu umieszczono w jednostce izolacyjnej. Prosięta szczepiono w wieku 2 dni drogą domięśniową różnymi roztworami szczepionkowymi plazmidu. Przygotowano roztwory szczepionki przez rozcieńczenie roztworów podstawowych w sterylnej soli fizjologicznej (0,9% NaCl).
Prosięta były szczepione:
albo samym plazmidem pJP109 albo mieszaniną plazmidów pJP109 i pJP111, albo mieszaniną plazmidów pJP109 i pJP058, albo mieszaniną plazmidów pJP109, pJP111 i pJP058.
Roztwory szczepionkowe zawierają 500 μg każdego plazmidu.
Objętość: Roztwory szczepionkowe wstrzykiwano drogą domięśniową w całkowitej objętości 2 ml. W praktyce ze względu na wiek prosiąt przy szczepieniu (1-2 dni) podaje się 1 ml zastrzyk z każdej strony szyi (=2x1 ml).
Przeprowadzano dwa zastrzyki szczepionki w odstępie dwóch tygodni, to znaczy w dniach D2 i D14 protokołu.
Przeprowadzano prowokację w D21 protokołu przez ustno-nosowe podanie wirusowej zawiesiny wirulentnego szczepu PCV-2. Prosięta następnie monitorowano przez 3 tygodnie pod kątem pojawienia się specyficznych objawów klinicznych dla poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego.
Monitorowane objawy to:
Temperatura w odbycie: codzienny pomiar przez pierwsze 14 dni, a następnie dwa pomiary w czasie 3 tygodnia po prowokacji.
Waga: ważenie prosiaków tuż przed prowokacją, a następnie raz na tydzień przez 3 tygodnie po prowokacji.
Pobieranie próbek krwi do testowania wiremii i przeciwciał: próbki krwi pobierano w D2, D14, D21, D28, D35 i D42.
Autopsja: w D42 przeżywające świnie humanitarnie zabijano i poddawano autopsji, w celu znalezienia uszkodzeń anatomopatologicznych i przygotowania preparatów histologicznych z wątroby, węzłów chłonnych, śledziony, nerki i grasicy, aby móc szukać uszkodzeń w tych tkankach.
PL 205 130 B1
1.8.2. 5-7 tygodniowe prosięta
5- do 7-tygodniowe prosiaki już nie posiadające matczynych przeciwciał na wirus PCV-2 szczepiono drogą domięśniową:
albo samym plazmidem pJP109, albo mieszaniną plazmidów pJP109 i pJP111, albo mieszaniną plazmidów pJP109 i pJP058, albo mieszaniną plazmidów pJP109, pJP111 i pJP058.
Dawki szczepionki są takie same jak wskazane w Przykładzie 1.8.1 (500 μg na plazmid). Szczepionkowe roztwory wstrzykiwano drogą domięśniową w objętości 2 ml (pojedyncze podanie 2 ml do mięśni szyi).
Przeprowadzano dwa szczepienia w odstępnie 21 dni (D0 i D21). Przeprowadzono prowokację 14 dni po ostatnim szczepieniu (D35) przez domięśniowe podanie wirusowej zawiesiny wirulentnego szczepu PCV-2.
Świnie następnie monitorowano przez 8 dni pod kątem występowania specyficznych klinicznych objawów poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego u prosiąt. Kliniczne śledzenie prosiaków po prowokacji było identyczne z tym opisanym w Przykładzie 1.8.1 poza tym, że całkowity czas obserwacji tym razem wynosił 8 tygodni.
P r z y k ł a d 1.9 Szczepienie świń DNA formułowanym z DMRIE-DOPE
Możliwe jest zastosowanie zamiast roztworów nagiego plazmidowego DNA opisanych w Przykładzie 1.8, roztworów plazmidowego DNA formułowanych z DMRIE-DOPE. Roztwór DNA (zawierający jeden lub więcej plazmidów według Przykładu 1.6) w 1 mg/ml przygotowuje się w 0,9% NaCl. Roztwór DMRIE-DOPE o stężeniu 0,75 mM przygotowuje się przez zawieszenie liofilizatu DMRIE-DOPE w odpowiedniej objętości sterylnej wody destylowanej.
Tworzenie kompleksów DNA plazmidowy-lipid kationowy przeprowadza się przez rozcieńczenie w równych częściach 0,75 mM roztworu DMRIE-DOPE roztworem DNA 1 mg/ml w 0,9% NaCl. Roztwór DNA wprowadza się stopniowo za pomocą sterylnej igły 26G wzdłuż ściany fiolki zawierającej roztwór kationowego lipidu, aby uniknąć wytwarzania piany. Następnie miesza się łagodnie do momentu zmieszania się dwóch roztworów. W ten sposób uzyskuje się końcową kompozycję zawierającą 0,375 mM DMRIE-DOPE i 500 pg/ml DNA.
Jest wskazane, aby wszystkie stosowane roztwory były w temperaturze pokojowej dla wszystkich operacji opisanych powyżej. Tworzenie kompleksu DNA/ DMRIE-DOPE przeprowadza się w temperaturze pokojowej przez 30 min przed immunizacją świń.
Następnie szczepi się świnie zgodnie z wskazaniami opisanymi w Przykładach 1.8.1 i 1.8.2.
P r z y k ł a d 2.1 Konstrukcja plazmidu insercyjnego w locus C6 wirusa ospy kanarków
Na figurze 2.1 (SEQ ID NO: 16) przedstawiona jest sekwencja segmentu o wielkości 3,7 kb DNA wirusa ospy kanarków. Analiza sekwencji ujawniła ORF, oznaczony jako C6L, rozpoczynający się w pozycji 377 i kończący się w pozycji 2254. Poniżej opisano plazmid insercyjny C6 skonstruowany przez delecję ORF C6 i zastąpienie jej polilinkerem (MCS) otoczonym przez sygnały dla transkrypcji i terminacji translacji. Fragment PCR o wielkości 380 bp zamplifikowano na matrycy genomowego DNA wirusa ospy kanarków z wykorzystaniem starterów oligonukleotydowych C6A1 (SEQ ID NO: 21) i C6B1 (SEQ ID NO: 22). Fragment PCR o wielkości 1155 bp zamplifikowano na matrycy genomowego DNA wirusa ospy kanarków stosując startery oligonukleotydowe C6C1 (SEQ ID NO: 23) i C6D1 (SEQ ID NO: 24). Fragmenty 380 bp i 1155 bp poddano fuzji przez dodanie ich razem jako matrycy i namnożenie metodą PCR fragmentu o długości 1613 bp stosując startery oligonukleotydowe C6A1 (SEQ ID NO 21) i C6D1 (SEQ ID NO 24). Fragment ten trawiono SacI i KpnI i ligowano w pBluescript SK+ (Stratagene, La Jolla, CA, USA) trawiony uprzednio SacI/KpnI. Uzyskany plazmid, pC6L potwierdzono przez analizę sekwencji DNA. Składa się on z 370 bp z DNA wirusa ospy kanarków powyżej C6 („lewe ramię C6), wczesnego sygnału terminacyjnego wirusa krowianki, kodonów stop dla translacji w sześciu ramkach odczytu oraz MCS zawierającego miejsca Smal, Pstl, XhoI i EcoRI, wczesnego sygnału terminacyjnego wirusa krowianki, kodonów stop dla translacji w sześciu ramkach odczytu oraz leżącej poniżej sekwencji wirusa ospy kanarków o wielkości 1156 bp („prawe ramię C6).
Plazmid pJP099 wyprowadzono z pC6L przez ligację kasety zawierającej promotor H6 wirusa krowianki (opisany przez Taylor i wsp. (1988c), Guo i wsp. (1989) i Perkus i wsp. (1989)) przyłączony do obcego genu w miejscach Smal/EcoRI z pC6L. Plazmid pJP099 zawiera unikalne miejsce EcoRV
PL 205 130 B1 i unikalne miejsce Nrul położone na końcu 3' promotora H6 oraz unikalne miejsce Sall położone pomiędzy kodonem stop obcego genu i lewym ramieniem C6. Fragment o wielkości ~ 4,5 kb EcoRI/Sall lub Nrul/Sall z pJP099 zawiera, zatem sekwencję plazmidu (pBluescript SK+; Stratagene, La Jolla, CA, USA), 2 ramiona C6 oraz koniec 5' promotora H6 aż do miejsca EcoRY lub Nrul.
Sekwencje starterów:
Starter C6A1 (SEQ ID NO: 21)
ATCATCGAGCTCGCGGCCGCCTATCAAAAGTCTTAATGAGTT Starter C6B1 (SEQ ID NO: 22)
GAATTCCTCGAGCTGCAGCCCGGGTTTTTATAGCTAATTAGTCATTTTT
TCGTAAGTAAGTATTTTTATTTAA
Starter C6C1 (SEQ ID NO: 23)
CCCGGGCTGCAGCTCGAGGAATTCTTTTTATTGATTAACTAGTCAAATG
AGTATATATAATTGAAAAAGTAA
Starter C6D1 (SEQ ID NO: 24)
GATGATGGTACCTTCATAAATACAAGTTTGATTAAACTTAAGTTG P r z y k ł a d 2.2 Konstrukcja plazmidu donorowego ALVAC dla ORF2 PCV2 Plazmid pGem7Z-Imp 1010-Stoon-EcoRI nr 14 zawierający genom PCV2 w postaci fragmentu EcoRI w plazmidzie pGem-7Z strawiono EcoRI, a fragment o wielkości 1768 bp wyizolowano i zligowano.
W celu wprowadzenia ORF2 z PCV2 do właściwego wektora insercyjnego
ALVAC do zamplifikowania ORF2 PCV2 ze zligowanego fragmentu EcoRI o wielkości 1768 bp (patrz powyżej) użyto starterów JP760 (SEQ ID NO: 25) i JP773 (SEQ ID NO: 26) i uzyskano produkt PCR J1304. Starter JP760 (SEQ ID NO: 25) zawiera koniec 3' promotora H6 od EcoRV i koniec 5' z ORF2 PCV2. Starter JP773 (SEQ ID NO: 26) zawiera koniec 3' z ORF2 PCV2, za którym występuje miejsce Sall. Następnie produkt PCR J1304 strawiono EcoRV/Sall i sklonowano jako fragment o wielkości ~ 750 bp we fragmencie EcoRV/Sall o wielkości ~ 4,5 kb z pJP099 (patrz powyżej Przykład 2.1). Uzyskany plazmid potwierdzono przez analizę sekwencji i oznaczono jako pJP102 (patrz mapa pJP102 przedstawiona na Figurze 2.2 oraz sekwencja (SEQ ID NO: 8) na Figurze 2.3). Sekwencja ORF2 odpowiada sekwencji dostępnej w bazie danych GenBank, numer dostępu AF055392. Plazmid donorowy pJP102 (linearyzowany Notl) użyto w teście rekombinacji in vitro (IVR) w celu wytworzenia rekombinanta ALVAC vCP1614 (patrz Przykład 2.6).
Sekwencje starterów:
JP760 (SEQ ID NO: 25)
CAT-CAT-CAT-GAT-ATC-CGT-TAA-GTT-TGT-ATC-GTA-ATG-ACG-TAT-CCA-AGG-AGG-GG JP760 (SEQ ID NO: 26)
TAC-TAC-TAC-GTC-GAC-TTA-GGG-TTT-AAG-TGG-GGG-GTC P r z y k ł a d 2.3 Konstrukcja plazmidu donorowego ALVAC dla ORF2 i ORF1 z PCV2 ORF1 PCV2 amplifikowano techniką PCR stosując startery JP774 (SEQ ID NO: 9) i JP775 (SEQ ID NO: 10) na plazmidzie pGem7Z-Imp1010-Stoon-EcoRI nr 14 uzyskując produkt PCR J1311. Starter JP774 (SEQ ID NO: 9) zawiera koniec 3' promotora H6 od miejsca Nrul i koniec 5' z ORF1 PCV2. Starter JP775 (SEQ ID NO: 10) zawiera koniec 3' z ORF1 PCV2, za którym występuje miejsce Sall. Produkt PCR J1311 (~ 1 kb) sklonowano w pCR2.1 (Invitrogen, Carlsbad, CA). Uzyskany plazmid potwierdzono przez analizę sekwencji i oznaczono jako pJP104. Sekwencja ORF1 odpowiada sekwencji dostępnej w bazie danych GenBank, numer dostępu AF055392. Fragment Nrul/Sall o wielkości ~ 970 bp wyizolowano z pJP104 i sklonowano we fragmencie Nrul/Sall o wielkości ~ 4,5 kb z pJP099 (patrz powyżej Przykład 2.1). Uzyskany plazmid potwierdzono przez analizę restrykcyjną i oznaczono jako pJP105 (patrz Figura 2.4). Plazmid donorowy pJP105 można użyć w teście rekombinacji in vitro (opisanym w Przykładzie 2.6) w celu wytworzenia rekombinanta ALVAC wyrażającego ORF1 PCV2.
Fragment BamHI/Sall o wielkości ~ 838 bp z pJP102 (patrz Przykład 2.2) tępiono używając fragmentu Klenowa polimerazy DNA i klonowano w wytępione za pomocą fragmentu Klenowa miejsce
EcoRI z PJP105. Klony badano pod względem orientacji wstawki za pomocą analizy restrykcyjnej i wybrano orientację głowa do głowy. Plazmid potwierdzono przez analizę sekwencji i oznaczono jako pJP107 (patrz mapa pJP107 na Figurze 2.5 oraz sekwencja (SEQ ID NO: 11) przedstawiona na Figu36
PL 205 130 B1 rze 2.6). Plazmid donorowy pJP107 (zlinearyzowany Notl) użyto w teście rekombinacji in vitro 5 (IVR) w celu wytworzenia rekombinanta ALVAC vCP1615 (patrz Przykład 2.6).
Sekwencje starterów:
JP774 (SEQ ID NO:9)
CAT-CAT-CAT-TCG-CGA-TAT-CCG-TTA-AGT-TTG-TAT-CGT-AAT-GCC-CAG-CAA-GAA-GAA-TGG
JP775 (SEQ ID NO: 10)
TAC-TAC-TAC-GTC-GAC-TCA-GTA-ATT-TAT-TTC-ATA-TGG
P r z y k ł a d 2.4 Konstrukcja plazmidu donorowego ALVAC dla ORF2 z PCV1
Plazmid pPCV1 (B. Meehan i wsp. J. Gen. Virol. 1997. 78. 221-227), zawierający genom PCV1 jako fragment Pstl w plazmidzie pGem-7Z, wykorzystano jako matrycę do namnożenia ORF2 PCV1.
W celu wprowadzenia ORF2 PCV2 do właściwego wektora insercyjnego ALVAC do amplifikowania ORF2 PCV1 z plazmidu pPCV1 (patrz powyżej) użyto starterów JP787 (SEQ ID NO: 12) i JP788 (SEQ ID NO: 13) i uzyskano produkt PCR J1315. Starter JP787 (SEQ ID NO: 12) zawiera koniec 3' promotora H6 od EcoRV i ORF2, za którym występuje miejsce Sall. Następnie produkt PCR J1315 strawiono EcoRV/Sall i sklonowano jako fragment o wielkości -750 bp we fragmencie EcoRV/Sall o wielkości ~ 4,5 kb z pJP099 (patrz powyżej Przykład 2.1). Konstrukcję otrzymanego plazmidu potwierdzono przez analizę sekwencji i oznaczono jako pJP113. Sekwencja ORF2 odpowiada sekwencji dostępnej w bazie danych GenBank, pod numerem dostępu U49186. Plazmid donorowy pJP113 (zlinearyzowany Notl) użyto w teście rekombinacji in vitro (IVR) w celu wytworzenia rekombinanta ALVAC vCP1621 (patrz Przykład 2.7).
Sekwencje starterów:
JP787 (SEQ ID NO: 12)
CAT-CAT-CAT-GAT-ATC-CGT-TAA-GTT-TGT-ATC-GTA-ATG-ACG-TGG-CCA-AGG-AGG-CG
JP788 (SEQ ID NO: 13)
TAC-TAC-TAC-GTC-GAC-TTA-TTT-ATT-TAG-AGG-GTC-TTT-TAG-G
P r z y k ł a d 2.5 Konstrukcja plazmidu donorowego ALVAC dla ORF2 i ORF1 z PCV1
Plazmid pPCV1 (patrz Przykład 2.4, powyżej), zawierający genom PCV1 w postaci fragmentu Pstl w plazmidzie pGem-7Z strawiono Pstl, a uzyskany fragment o wielkości 1759 bp wyizolowano i zligowano.
Do zamplifikowania ORF1 PCV1 ze zligowanego fragmentu Pstl o wielkości 1759 bp (patrz powyżej) użyto starterów JP789 (SEQ ID NO: 14) i JP790 (SEQ ID NO:15) i uzyskano produkt PCR J1316. Starter JP789 (SEQ ID NO: 14) zawiera koniec 3' promotora H6 od miejsca Nrul i koniec 5' z ORF1 PCV1. Starter JP790 (SEQ ID NO: 15) zawiera koniec 3' z ORF1 PCV1, za którym występuje miejsce Sall. Produkt PCR J1316 (~ 1 kb) sklonowano w pCR2.1 (Invitrogen, Carlsbad, CA). Uzyskany plazmid potwierdzono przez analizę sekwencji i oznaczono jako pJP114. Sekwencja ORF1 odpowiada sekwencji dostępnej w bazie danych GenBank, pod numerem dostępu U49186. Fragment Nrul/Sall o wielkości ~ 970 bp wyizolowano z pJP114 i sklonowano we fragmencie Nrul/Sall o wielkości ~ 4,5 kb z pJP099 (patrz Przykład 2.1). Uzyskany plazmid potwierdzono przez analizę restrykcyjną i oznaczono jako pJP115. Plazmid donorowy pJP115 można użyć w teście rekombinacji in vitro (opisanym w Przykładzie 2.7) w celu wytworzenia rekombinanta ALVAC wyrażającego ORF1 PCV1.
Fragment BamHI/Sall o wielkości ~ 838 bp z pJP113 (patrz Przykład 2.4) tępiono przy użyciu fragmentu Klenowa polimerazy DNA i sklonowano w wytępionym za pomocą fragmentu Klenowa miejscu EcoRI z PJP115. Klony badano pod względem orientacji wstawki za pomocą analizy restrykcyjnej i wybrano orientację głowa do głowy. Wytworzony plazmid potwierdzono przez analizę sekwencji i oznaczono jako pJP117. Plazmid donorowy pJP117 (zlinearyzowany Notl) użyto w teście rekombinacji in vitro (IVR) w celu wytworzenia rekombinanta ALVAC vCP1622 (patrz Przykład 2.7).
Sekwencje starterów:
JP789 (SEQ ID NO: 14)
CAT-CAT-CAT-TCG-CGA-TAT-CCG-TTA-AGT-TTG-TAT-CGT-AAT-GCC-AAG-CAA-GAAAAG-CGG
PL 205 130 B1
JP790 (SEQ ID NO: 15)
TAC-TAC-TAC-GTC-GAC-TCA-GTA-ATT-TAT-TTT-ATA-TGG
P r z y k ł a d 2.6 Wytworzenie rekombinantów ALVAC-PCV2
Plazmidy pJP102 (patrz Przykład 2.2 i Figura 2.2) oraz pJP107 (patrz Przykład 2.3 i Figura 2.5) zlinearyzowano za pomocą Notl i transfekowano nimi pierwotne komórki CEF zainfekowane ALVAC przy użyciu opisanej wcześniej metody precypitacji z fosforanem wapnia (Panicali i Paoletti, 1982; Piccini i wsp., 1987). Pozytywne łysinki selekcjonowano na podstawie hybrydyzacji do specyficznych sond PCV2 wyznakowanych radioaktywnie i poddawano czterem kolejnym rundom oczyszczania łysinek aż do uzyskania czystej populacji. Następnie zamplifikowano jedną reprezentatywną łysinkę z każdego IVR a uzyskane rekombinanty ALVAC oznaczono jako vCP1614 i vCP1615. Wirus vCP1614 powstał w wyniku rekombinacji pomiędzy ALVAC i plazmidem donorowym pJP102 i zawiera ORF2 PCV2 wprowadzony w locus C6 ALVAC. Wirus vCP1615 powstał w wyniku rekombinacji pomiędzy ALVAC i plazmidem donorowym pJP107 i zawiera ORF2 i ORF1 PCV2 wprowadzone w locus C6 ALVAC w orientacji głowa do głowy.
W podobny sposób można wytworzyć rekombinanta ALVAC wyrażającego wyłącznie ORF1 PCV2 wykorzystując w tym celu plazmid pJP105 opisany w Przykładzie 2.3.
Immunofluorescencja.
W celu ustalenia czy białka PCV2 były wyrażane w komórkach Vero zainfekowanych zrekombinowanym ALVAC przeprowadzono analizę immunofluorescencji (IF). Zainfekowane komórki Vero płukano PBS 24 godz. po infekcji (m.o.i. około 10) i utrwalano 95% zimnym acetonem przez 3 min w temperaturze pokojowej. Przeciwciała monoklonalne (MAb) z pięciu preparatów (nadsącz hybrydomy) specyficzne dla ORF1 PCV2 (PCV2 199 1D3GA i PCV2 210 7G5GD) lub ORF2 PCV2 (PCV2 190 4C7CF, PCV2 190 2B1BC i PCV2 190 3A8BC) zastosowano jako pierwsze przeciwciało. Swoiste przeciwciała monoklonalne otrzymano z Merial-Lyon. Przeciwciała monoklonalne można także otrzymać postępując zgodnie z wiedzą przekazaną w cytowanych niniejszym dokumentach np. U.S. nr 09/082,358 i 09/161,092. Reakcję IF prowadzono jak została opisana w publikacji Taylor i wsp. (1990).
Immunofluorescencję swoistą dla PCV2 z trzema przeciwciałami swoistymi dla ORF2 można było wykryć w komórkach zainfekowanych vCP1614 oraz komórkach zainfekowanych vCP1615. Immunofluorescencję swoistą dla PCV1 z dwoma przeciwciałami swoistymi dla ORF1 można było wykryć w komórkach zainfekowanych tylko vCP1614. Wyniki te pokazują, że tak jak się spodziewano, vCP1614 wyraża tylko ORF2, podczas gdy vCP1615 wyraża zarówno ORF1 jak ORF2. Nie obserwowano fluorescencji w komórkach Vero zainfekowanych rodzicielskim ALVAC, ani w nie zainfekowanych komórkach Vero.
P r z y k ł a d 2.7 Wytworzenie rekombinantów ALVAC-PCV1
Plazmidy pJP113 (patrz Przykład 2.4) oraz pJP117 (patrz Przykład 2.5) zlinearyzowano za pomocą Notl i stransfekowano nimi pierwotne komórki CEF zainfekowane ALVAC przy użyciu metody precypitacji z fosforanem wapnia opisanej wcześniej (Panicali i Paoletti, 1982; Piccini i wsp., 1987). Pozytywne łysinki selekcjonowano na podstawie hybrydyzacji do specyficznych sond PCV1 wyznakowanych radioaktywnie i poddano czterem kolejnym rundom oczyszczania łysinek aż do uzyskania czystej populacji. Następnie zamplifikowano jedną reprezentatywną łysinkę z każdego IVR, a uzyskane rekombinanty ALVAC oznaczono jako vCP1621 i vCP1622. Wirus vCP1621 powstał w wyniku rekombinacji pomiędzy ALVAC a plazmidem donorowym pJP113 i zawiera ORF2 PCV1 wprowadzony w locus C6 ALVAC. Wirus vCP1622 powstał w wyniku rekombinacji pomiędzy ALVAC a plazmidem donorowym pJP117 i zawiera ORF2 i ORF1 PCV1 wprowadzony w locus C6 ALVAC w orientacji głowa do głowy.
W podobny sposób można wytworzyć rekombinant ALVAC wyrażającego ORF1 PCV1 przy użyciu plazmidu donorowego pJP115 opisanego w Przykładzie 2.5.
Immunofluorescencja. W celu ustalenia czy białka PCV1 były wyrażane w komórkach Vero zainfekowanych zrekombinowanym ALVAC przeprowadzono analizę immunofluorescencji (IF). Zainfekowane komórki Vero płukano PBS 24 godziny po infekcji (m.o.i. około 10) i utrwalano 95% zimnym acetonem przez 3 min w temp. pokojowej. Jako pierwsze przeciwciało zastosowano świńską surowicę poliklonalną swoistą dla PCV1 (Allan G. i wsp. Vet. Microbiol. 1999, 66: 115-123). Reakcję IF prowadzono według opisu w Taylor i wsp. (1990).
PL 205 130 B1
Immunofluorescencję swoistą dla PCV1 można było wykryć w komórkach zainfekowanych vCP1621 oraz komórkach zainfekowanych vCP1622. Wyniki te pokazują, że tak jak się spodziewano, vCP1621 i vCP1622 wyraża produkty swoiste dla PCV1. Nie obserwowano fluorescencji dla świńskiej surowicy poliklonalnej swoistej dla PCV2 w komórkach zainfekowanych vCP1621 i w komórkach zainfekowanych vCP1622. Nie obserwowano fluorescencji w komórkach Vero zainfekowanych rodzicielskim ALVAC ani w nie zainfekowanych komórkach Vero.
P r z y k ł a d 2.8 Wytwarzanie zrekombinowanych wirusów ospy kanarków z Carbopolem™974P
W celu wytworzenia szczepionki zrekombinowane wirusy ospy kanarków vCP1614 i vCP1615 (Przykład 2.6) można zmieszać z roztworami karbomeru. W ten sam sposób zrekombinowane wirusy ospy kanarków vCP1621 i vCP1622 (Przykład 2.7) można zmieszać z roztworem karbomeru. Składnikiem karbomeru stosowanym do szczepienia świń w opisany sposób jest Carbopol™974P produkowany przez firmę BF Goodrich (masa cząsteczkowa #3,000,000). Najpierw wytwarzany jest roztwór podstawowy 1,5% Carbopolu™974P w wodzie destylowanej zawierającej 1 g/l chlorku sodu. Taki roztwór podstawowy jest następnie używany do wytworzenia roztworu Carbopolu™974P o stężeniu 4 mg/ml w wodzie fizjologicznej. Roztwór podstawowy jest mieszany z odpowiednią objętością wody fizjologicznej w jednym etapie lub w kilku kolejnych etapach, z ustawianiem wartości pH na każdym etapie przy użyciu 1N (lub bardziej stężonego) roztworu wodorotlenku sodu, do osiągnięcia końcowej wartości pH 7,3 - 7,4. Taki roztwór końcowy Carbopol™974P jest roztworem gotowym do użycia do rekonstytucji rekombinowanych wirusów w postaci liofilizowanej lub do rozcieńczenia stężonego roztworu podstawowego rekombinowanych wirusów. Przykładowo, aby wytworzyć zawiesinę wirusową zawierającą 10e8 pfu na 2 ml dawkę można rozpuścić 0,1 ml roztworu podstawowego o 10e9 pfu/ml w 1,9 ml gotowego do użycia roztworu 4 mg/ml Carbopolu™974P. W podobny sposób można także przygotować gotowe do użycia roztwory Carbopol™974P 2 mg/ml.
P r z y k ł a d 2.9 Immunizacja świń i następująca po niej prowokacja
2.9.1 Immunizacja jednodniowych prosiąt
Grupy prosiąt urodzonych przy pomocy cesarskiego cięcia w dniu 0 przenoszono do izolatorów. Prosięta szczepiono dnia 2 drogą domięśniową stosując różne roztwory szczepionkowe. Zawiesiny szczepionki wirusowej przygotowywano przez rozcieńczenie roztworów podstawowych zrekombinowanych wirusów w sterylnej soli fizjologicznej (0,9% NaCl). Odpowiednie zakresy zawiesin wirusowych można określić doświadczalnie, lecz będą się one zasadniczo mieścić w zakresie 106 do 1010, a korzystnie około 1010 pfu/dawkę. Roztwory szczepionki można także przygotować przez mieszanie zawiesiny zrekombinowanego wirusa z Carbopolem™974P, jak opisano w Przykładzie 2.8.
Prosięta szczepiono:
Zrekombinowanym wirusem vCP1614 (Przykład 2.2)
Zrekombinowanym wirusem vCP1615 (Przykład 2.3)
Zrekombinowanym wirusem vCP1614 zmieszanym z Carbopolem™974P (roztwór 4 mg/ml)
Zrekombinowanym wirusem vCP1615 zmieszanym z Carbopolem™974P (roztwór 4 mg/ml).
Zawiesiny wirusowe zawierają 10e8 jednostek tworzących łysinki (pfu) na dawkę. Każda zawiesina wirusowa była wstrzykiwana domięśniowo w objętości 1 ml. Domięśniowy zastrzyk podawany jest do mięśni na karku. Dwa zastrzyki zawiesin wirusowych podawano dnia 2 i dnia 14 doświadczenia. Prowokacja była prowadzona w dniu 21 przez ustno-nosowo podanie zawiesiny wirusowej przygotowanej z hodowli wirulentnego szczepu PCV-2. Po prowokacji prosięta monitorowano przez 3 tygodnie pod względem wystąpienia klinicznych objawów swoistych dla poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego.
Badano następujące objawy:
Temperatura w odbycie: codzienny pomiar przez 2 tygodnie po prowokacji, następnie dwa pomiary temperatury w odbycie w czasie 3 tygodnia.
Waga: prosięta ważono tuż przed prowokacją, a następnie raz w tygodniu podczas 3 pierwszych tygodni po prowokacji.
Próbki krwi pobierano dnia 2, dnia 14, dnia 21, dnia 28, dnia 35 i dnia 42 doświadczenia, w celu monitorowania poziomu wiremii i mian swoistych przeciwciał przeciwko PCV-2.
Sekcja: dnia 42 wszystkie prosięta, które przeżyły humanitarnie usypiano i przeprowadzano sekcję w celu zaobserwowania specyficznych zmian makroskopowych dla PWMS. Próbki tkanek pobierano z wątroby, węzłów chłonnych, śledziony, nerek i grasicy w celu zaobserwowania specyficznych zmian histologicznych.
PL 205 130 B1
9.2 Immunizacja 5-7 tygodniowych prosiąt
Prosięta w wieku 5-7 tygodni, wolne od matczynych swoistych przeciwciał skierowanych przeciwko PCV-2 szczepiono domięśniowo różnymi roztworami szczepionki. Zawiesiny wirusowej szczepionki przygotowywano przez rozcieńczenie roztworów podstawowych zrekombinowanych wirusów w sterylnej soli fizjologicznej (0,9% NaCl). Roztwory szczepionki można także przygotować przez mieszanie zawiesiny zrekombinowanego wirusa z Carbopolem™974P, jak opisano w Przykładzie 2.8.
Prosięta szczepiono:
Zrekombinowanym wirusem vCP1614 (Przykład 2.2)
Zrekombinowanym wirusem vCP1615 (Przykład 2.3)
Zrekombinowanym wirusem vCP1614 zmieszanym z Carbopolem™974P (roztwór 4 mg/ml)
Zrekombinowanym wirusem vCP1615 zmieszanym z Carbopolem™974P (roztwór 4 mg/ml).
Zawiesiny wirusowe zawierają 10e8 jednostek tworzących łysinki (pfu) na dawkę. Każda zawiesina wirusowa jest wstrzykiwana domięśniowo w objętości 2 ml. Domięśniowy zastrzyk podawany jest do mięśni na karku. Dwa zastrzyki zawiesin komórkowych podawano dnia 0 i dnia 21 doświadczenia. Prowokacja jest wykonywana dnia 35 przez podanie ustno-nosowo zawiesiny wirusowej przygotowanej z hodowli wirulentnego szczepu PCV-2. Po prowokacji prosięta monitorowano przez 8 tygodni pod względem klinicznych objawów swoistych dla poodsadzeniowego wielonarządowego zespołu wyniszczającego. Monitorowanie kliniczne jest identyczne jak to opisane w Przykładzie 2.9.1 z wyjątkiem tego, że czas trwania monitorowania wynosił 8 tygodni zamiast 3 tygodni. Przeprowadzano sekcje w czasie trwania doświadczenia na prosiętach padłych po prowokacji i na końcu doświadczenia (dzień 97) na wszystkich prosiętach, które przeżyły. Próbki tkanek są takie same jak opisano w Przykładzie 2.9.1.
Należy rozumieć, że wynalazek zdefiniowany przez załączone zastrzeżenia nie jest ograniczony do szczególnych wykonań wskazanych w opisie, powyżej, ale obejmuje jego warianty, które nie wykraczają poza zakres ujawnienia oraz koncepcję niniejszego wynalazku.
Informacja o sekwencjach:
SEQ ID NO:1 sekwencja DNA PCV genomu szczepu Imp. 1011-48121.
SEQ ID NO:2 sekwencja DNA genomu szczepu Imp. 1011-48285.
SEQ ID NO:3 sekwencja DNA genomu szczepu Imp. 999.
SEQ ID NO:4 sekwencja DNA genomu szczepu Imp. 1010.
SEQ ID NO:5 sekwencja DNA genomu szczepu PK/15.
SEQ ID NO:6 sekwencja DNA genomu szczepu Imp. 1103.
SEQ ID NO:7 sekwencja DNA genomu szczepu Imp. 1121.
SEQ ID NO:8 sekwencja nukleotydowa 1,68 kb frgmentu z donorowego plazmidu pJP102 od miejsca restrykcyjnego KpnI (pozycja 653) do pozycji 1680.
SEQ ID NO:9 oligonukleotydowy starter JP774.
SEQ ID NO:10 oligonukleotydowy starter JP775.
SEQ ID NO:11 sekwencja nukleotydowa fragmentu 3,6 kb z donorowego plazmidu pJP107 od miejsca restrykcyjnego KpnI (pozycja 653) do miejsca restrykcyjnego SacI (pozycja 4255).
SEQ ID NO:12 oligonukleotydowy starter JP787.
SEQ ID NO:13 oligonukleotydowy starter JP788.
SEQ ID NO:14 oligonukleotydowy starter JP789.
SEQ ID NO:15 oligonukleotydowy starter JP790.
SEQ ID NO:16 sekwencja nukleotydowa fragmentu 3,7 kb DNA z ALVAC (wirus ospy kanarków) zawierająca otwartą ramkę odczytu C6.
SEQ ID NO:17 sekwencja polipeptydowa wyprowadzona z sekwencji polinukleotydowej SEQ ID NO: 16.
SEQ ID NO:18 sekwencja polipeptydowa wyprowadzona z sekwencji polinukleotydowej SEQ ID
NO:8.
SEQ ID NO:19 sekwencja polipeptydowa wyprowadzona z sekwencji polinukleotydowej SEQ ID NO:11.
SEQ ID NO:20 sekwencja polipeptydowa wyprowadzona z sekwencji polinukleotydowej SEQ ID NO:11.
SEQ ID NO:21 oligonukleotydowy starter C6A1.
PL 205 130 B1
SEQ ID NO:22 o SEQ ID NO:23 o SEQ ID NO:24 o SEQ ID NO:25 o SEQ ID NO:26 o SEQ ID NO:27 o SEQ ID NO:28 o SEQ ID NO:29 o SEQ ID NO:30 o SEQ ID NO:31 o SEQ ID NO:32 o SEQ ID NO:33 o SEQ ID NO:34 o SEQ ID NO:35 o SEQ ID NO:36 o ligonukleotydowy starter C6B1. ligonukleotydowy starter C6C1. ligonukleotydowy starter C6D1. ligonukleotydowy starter JP760. ligonukleotydowy starter JP773. ligonukleotydowy starter JP779. ligonukleotydowy starter JP780. ligonukleotydowy starter JP781. ligonukleotydowy starter JP782. ligonukleotydowy starter JP783. ligonukleotydowy starter JP784. ligonukleotydowy starter JP785. ligonukleotydowy starter JP786. ligonukleotydowy starter RG972. ligonukleotydowy starter RG973.
Referencje:
1. Allan GM, McNeilly F, Cassady JP, et al.: 1995, Pathogenesis of porcine circovirus; experimental infections of colostrum deprived piglets and examination of pig foetal material. Vet Microbiol 44:49-641.
2. Allan GM, McNeilly F, Kennedy S, et al.: 1998, Isolation of porcine circovirus-like viruses from piglets with a wasting disease in the United States of America and Europe. J Vet Diag Invest 10:3-10.
3. Allan GM, Kennedy S, McNeilly F, et al.: 1999, Experimental reproduction of wasting disease and death by co-infection of pigs with porcine circovirus and porcine parvovirus, J Comp Path 121:1-11 (July 1999).
4. Bolt DM, Hani H, Muller E, and Waldvogel AS: 1997, Nonsuppurative myocarditis in piglets associated with porcine parvovirus infection. J Comp Path 117:107-118.
5. Clark, E.G. Proc. Amer. Assoc. Swine Pract, pp. 499-501 (1997).
6. Edbauer, C, R. Weinberg, J. Taylor, A. Rey-Senelonge, J.F. Bouquet, P. Desmettre and
E. Paoletti, Virology 179, 901-904 (1998).
7. Ellis, J., L. Hassard, E. Clark, J. Harding, G. Allan, P. Willson, J. Strakappe, K. Martin,
F. McNeilly, B. Meehan, D. Todd, D. Haines, Isolation of circovirus from lesions of piglets with postweaning multisystemic wasting syndrome Can. Vet. J. 39, 44-51(1998).
8. Ellis JA, Krakowka S, Lairmore M, et al.: 1999, Reproduction of lesions of postweaning multisystemic wasting syndrome in gnotobiotic piglets. J Vet Diag Invest 11:3-14.
9. Goebel, S.J., G.P. Johnson, M.E. Perkus, S.W. Davis, J.P. Winslow, E. Paoletti, Virology 179, 247-266, 517-563 (1990).
10. Guo, P., S. Goebel, S. Davis, M.E. Perkus, B. Languet, P. Desmettre, G. Allen, and E. Paoletti, J. Virol. 63, 4189-4198 (1989).
11. Hamel, A.L., L.L. Lin and G.P.S. Nayar, J. Virol. 72, 5262-5267 (1998).
12. Harding J.C., Proc. Am. Assoc. Swine Pract. 28, 503 (1997).
13. Kim HS, Jo HS and Bergeland ME: 1989, Serologic, virologic, and histopathologic observations of encephalomyocarditis virus infection in mummified and stillborn pigs- J Vet Diag Invest 1:101-104.
14. Lager KM and Halbur PG: 1996, Gross and microscopic lesions in porcine fetuses infected with porcine reproductive and respiratory syndrome virus. J Vet Diag Invest 8:275-282.
15. Mankertz, A., J. Mankertz, K. Wolf, H.-J. Buhk, Gen. Virol. 79, 381-384 (1998a).
16. Mankertz, J., H.-J. Bunk, G. Blaess, A. Mankertz, Virus Gene 16, 267-276 (1998b).
17. Matthews, R.E.F., Intervirology 17, 42-44 (1982).
18. Meehan BM, McNeilly F. Todd D, S. Kennedy, V.A. Jewhurst, J.A. Ellis, L.E. Hassard, E.G. Clark, D.M. Haines, G.M. Allan, J.: 1998, Characterization of novel circovirus DNA's associated wasting disease syndromes in pigs. J Gen Virol 79:2171-2179.
19. Meehan, B.M., J.L. Creelan, M.S. McNulty, D. Todd, J. Gen. Virol. 78, 221-227 (1997).
20. Mengeling WL 1992, Porcine parvovirus. In: Diseases of swine, ed. Leman AD, 7th ed-, pp.299-31 1. Iowa State University Press, Ames, IA.
PL 205 130 B1
21. Molitor TW, Orveerakul K, Zhang ZZ, et al.: 1991, Polymerase chain reaction (PRC) amplification for detection of porcine parvovirus. J Virol Meth 32:201-211.
22. Nayar, G.P.S., A. Hamel and L. Lin. Can. Vet. J. 38, 385-386 (1997).
23. Panicali, D. and E. Paoletti, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79, 4927-4931 (1982).
24. Paoletti, E., B.R. Lipinskaks, C. Samsonoff, S. Mercer, and D. Panicali, Proc, Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81, 193-197 (1984).
25. Pensaert M and DeMeurichy W: 1973, A porcine enterovirus causing fetal death and mummification. Experimental infection of pregnant female pigs. Zentralbl Veterinaermed Beih 11:2025.
26. Perkus, M.E., K. Limbach, and E. Paoletti, J. Virol. 63, 3829-3836 (1989).
27. Piccini, A., M.E. Perkus, and E. Paoletti, In Methods in Enzymology, Vol. 153, eds. Wu, R., and Grossman, L., (Academic Press) pp. 545-563 (1987).
28. Sambrook, J., E.F. Fritsch, and T. Maniatis, In Molecular cloning: A laboratory manual, 2nd edition, (Cold Spring Harbor Press, NY) (1989).
29. Tartaglia, J., J. Winslow, S. Goebel, G.P. Johnson, J. Taylor, and E. Paoletti, J. Gen. Virol.
71,1517-1524 (1990).
30. Tartaglia, J., Perkus ME, Taylor J, Norton EK, Audonnet JC, Cox WI, Davis SW, van der Hoeven J, Meignier B, Riviere M, and E. Paoletti, Virology 188, 217-32 (1992).
31. Taylor, J., R. Weinberg, B. Languet, Ph. Desmettre and E. Paoletti, Vaccine 6, 497-503 (1988a).
32. Taylor, J. and E. Paoletti, Vaccine 6, 466-468 (1988b).
33. Taylor, J., R. Weinberg, Y. Kawaoka, R. Webster and E. Paoletti, Vaccine 6, 504-508 (1988c).
34. Taylor, J., C. Edbauer, A. Rey-Senelonge, J.F. Bouquet, E. Norton, S. Goebel, P. Desmettre and E. Paoletti, J. Virol. 64, 1441-1450 (1990).
35. Taylor, J., C. Trimarchi, R. Weinberg, B. Languet, F. Guillemin, P. Desmettre and E. Paoletti, Vaccine 9, 190-193 (1991).
36. Taylor J, Weinberg R, Tartaglia J, Richardson C, Alkhatib G, Briedis D, Appel M, Norton E, Paoletti E., Virology 187, 321-328 (1992).
37. Tischer 1, Rasch R and Tochtermann G: 1974, Characterization of papovavirus- and picomavirus-like particles -in permanent piglet kidney cell lines. Zentralbl-Bakertiol-Org-A 226:153-167.
38. Todd, D., F.D. Niagro, B.W. Ritchie, W. Curran, G.M. Allan, P.D. Lukert. K.S. Latimer, W.L. Steffens, M.S. McNulty, Arch. Virol. 117, 129-135 (1991).
39. West KH, Bystrom, JM, Wojnarowicz C, et al.: 1999, Myocarditis and abortion associated with intrauterine infection of sows with porcine circovirus-2. J Vet Diag Invest 1.
PL 205 130 B1
WYKAZ SEKWENCJI <110> Merial, University of Saskatchewan oraz The Queen's University of Belfast.
<120> Zapobieganie zapaleniu mięśnia sercowego, poronieniom i zakażeniom wewnątrzmacicznym związanym z świńskim cirkowirusem 2 (PCV-2) <130> P020090EP <140> PCT/EP00/08781 <141> 2000-08-28 <150> US 60/151,564 <151> 1999-08-31 <150> US 09/583,350 <151> 2000-05-31 <160> 36 <170> Patentln wersja 3.3 <210> 1 <211> 1767 <212> DNA <213> Świński cirkowirus <400> 1
| aattcaacct | taacctttct | tattctgtag | tattcaaagg | gcacagagcg | ggggtttgag | 60 |
| ccccctcctg | ggggaagaaa | gtcattaata | ttgaatctca | tcatgtccac | cgcccaggag | 120 |
| ggcgttctga | ctgtggttcg | cttgacagta | tatccgaagg | tgcgggagag | gcgggtgttg | 180 |
| aagatgccat | ttttccttct | ccagcggtaa | cggtggcggg | ggtggacgag | ccaggggcgg | 240 |
| cggcggagga | tctggccaag | atggctgcgg | gggcggtgtc | ttcttctccg | gtaacgcctc | 300 |
| cttggatacg | tcatatctga | aaacgaaaga | agtgcgctgt | aagtattacc | agcgcacttc | 360 |
| ggcagcggca | gcacctcggc | agcacctcag | cagcaacatg | ccgagcaaga | agaatggaag | 420 |
| aagcggaccc | caaccccata | aaaggtgggt | gttcactctg | aataatcctt | ccgaagacga | 480 |
| gcgcaagaaa | atacgggatc | ttccaatatc | cctatttgat | tattttattg | ttggcgagga | 540 |
| gggtaatgag | gaaggacgaa | cacctcacct | ccaggggttc | gctaattttg | tgaagaagca | 600 |
| gacttttaat | aaagtgaagt | ggtatttggg | tgcccgctgc | cacatcgaga | aagcgaaagg | 660 |
PL 205 130 B1
| aacagatcag | cagaataaag | aatactgcag | taaagaaggc | aacttactga | tggagtgtgg | 720 |
| agctcctaga | tctcagggac | aacggagtga | cctgtctact | gctgtgagta | ccttgttgga | 780 |
| gagcgggagt | ctggtgaccg | ttgcagagca | gcaccctgta | acgtttgtca | gaaatttccg | 840 |
| cgggctggct | gaacttttga | aagtgagcgg | gaaaatgcag | aagcgtgatt | ggaagactaa | 900 |
| tgtacacgtc | attgtggggc | cacctgggtg | tggtaaaagc | aaatgggctg | ctaattttgc | 960 |
| agacccggaa | accacatact | ggaaaccacc | tagaaacaag | tggtgggatg | gttaccatgg | 1020 |
| tgaagaagtg | gttgttattg | atgactttta | tggctggctg | ccctgggatg | atctactgag | 1080 |
| actgtgtgat | cgatatccat | tgactgtaga | gactaaaggt | ggaactgtac | cttttttggc | 1140 |
| ccgcagtatt | ctgattacca | gcaatcagac | cccgttggaa | tggtactcct | caactgctgt | 1200 |
| cccagctgta | gaagctcttt | atcggaggat | tacttccttg | gtattttgga | agaatgctac | 1260 |
| agaacaatcc | acggaggaag | ggggccagtt | cgtcaccctt | tcccccccat | gccctgaatt | 1320 |
| tccatatgaa | ataaattact | gagtcttttt | tatcacttcg | taatggtttt | tattattcat | 1380 |
| taagggttaa | gtggggggtc | tttaagatta | aattctctga | attgtacata | catggttaca | 1440 |
| cggatattgt | attcctggtc | gtatatactg | ttttcgaacg | cagtgccgag | gcctacgtgg | 1500 |
| tctacatttc | cagcagtttg | tagtctcagc | cacagctggt | ttcttttgtt | gtttggttgg | 1560 |
| aagtaatcaa | tagtggaatc | taggacaggt | ttgggggtaa | agtagcggga | gtggtaggag | 1620 |
| aagggctggg | ttatggtatg | gcgggaggag | tagtttacat | aggggtcata | ggtgagggct | 1680 |
| gtggcctttg | ttacaaagtt | atcatctaga | ataacagcac | tggagcccac | tcccctgtca | 1740 |
| ccctgggtga | tcggggagca | gggccag | 1767 |
<210> 2 <211> 1767
| <212> DNA <213> Świński cirkowirus | ||||||
| <400> 2 aattcaacct | taacctttct | tattctgtag | tattcaaagg | gcacagagcg | ggggtttgag | 60 |
| ccccctcctg | ggggaagaaa | gtcattaata | ttgaatctca | tcatgtccac | cgcccaggag | 120 |
| ggcgttttga | ctgtggttcg | cttgacagta | tatccgaagg | tgcgggagag | gcgggtgttg | 180 |
| aagatgccat | ttttccttct | ccagcggtaa | cggtggcggg | ggtggacgag | ccaggggcgg | 240 |
| cggcggagga | tctggccaag | atggctgcgg | gggcggtgtc | ttcttctccg | gtaacgcctc | 300 |
| cttggatacg | tcatatctga | aaacgaaaga | agtgcgctgt | aagtattacc | agcgcacttc | 360 |
PL 205 130 B1
| ggcagcggca gcacctcggc agcacctcag cagcaacatg cccagcaaga agaatggaag | 420 |
| aagcggaccc caaccccata aaaggtgggt gttcactctg aataatcctt ccgaagacga | 480 |
| gcgcaagaaa atacgggatc ttccaatatc cctatttgat tattttattg ttggcgagga | 540 |
| gggtaatgag gaaggacgaa cacctcacct ccaggggttc gctaattttg taaagaagga | 600 |
| gacttttaat aaagtgaagt ggtatttggg tgcccgctgc cacatcgaga aagcgaaagg | 660 |
| aacagatcag cagaataaag aatactgcag taaagaaggc aacttactga tggagtgtgg | 720 |
| agctcctaga tctcagggac aacggagtga cctgtctact gctgtgagta ccttgttgga | 780 |
| gagcgggagt ctggtgaccg ttgcagagca gcaccctgta acgtttgtca gaaatttccg | 840 |
| cgggctggct gaacttttga aagtgagcgg gaaaatgcag aagcgtgatt ggaagactaa | 900 |
| tgtacacgtc attgtggggc cacctgggtg tggtaaaagc aaatgggctg ctaattttgc | 960 |
| agacccggaa accacatact ggaaaccacc tagaaacaag tggtgggatg gttaccatgg | 1020 |
| tgaagaagtg gttgttattg atgactttta tggctggctg ccctgggatg atctactgag | 1080 |
| actgtgtgat cgatatccat tgactgtaga gactaaaggt ggaactgtac cttttttggc | 1140 |
| ccgcagtatt ctgattacca gcaatcagac cccgttggaa tggtactcct caactgctgt | 1200 |
| cccagctgta gaagctcttt atcggaggat tacttccttg gtattttgga agaatgctac | 1260 |
| agaacaatcc acggaggaag ggggccagtt cgtcaccctt tcccccccat gccctgaatt | 1320 |
| tccatatgaa ataaattact gagtcttttt tatcacttcg taatggtttt tattattcat | 1380 |
| taagggttaa gtggggggtc tttaagatta aattctctga attgtacata catggttaca | 1440 |
| cggatattgt attcctggtc gtatatactg ttttcgaacg cagtgccgag gcctacgtgg | 1500 |
| tctacatttc cagtagtttg tagtctcagc cacagctgat ttcttttgtt gtttggttgg | 1560 |
| aagtaatcaa tagtggaatc taggacaggt ttgggggtaa agtagcggga gtggtaggag | 1620 |
| aagggctggg ttatggtatg gcgggaggag tagtttacat aggggtcata ggtgagggct | 1680 |
| gtggcctttg ttacaaagtt atcatctaga ataacagcac tggagcccac tcccctgtca | 1740 |
| ccctgggtga tcggggagca gggccag | 1767 |
<210> 3 <211> 1768
| <212> | DNA | ||||
| <213> | Świński cirkowirus | ||||
| <400> 3 aattcaacct taaccttttt tattctgtag | tattcaaagg | gtatagagat | tttgttggtc | 60 | |
| ccccctcccg ggggaacaaa gtcgtcaata | ttaaatctca | tcatgtccac | cgcccaggag | 120 |
PL 205 130 B1
| ggcgttctga ctgtggtagc cttgacagta tatccgaagg tgcgggagag gcgggtgttg | 180 |
| aagatgccat ttttccttct ccaacggtag cggtggcggg ggtggacgag ccaggggcgg | 240 |
| cggcggagga tctggccaag atggctgcgg gggcggtgtc ttcttctgcg gtaacgcctc | 300 |
| cttggatacg tcatagctga aaacgaaaga agtgcgctgt aagtattacc agcgcacttc | 360 |
| ggcagcggca gcacctcggc agcacctcag cagcaacatg cccagcaaga agaatggaag | 420 |
| aagcggaccc caaccacata aaaggtgggt gttcacgctg aataatcctt ccgaagacga | 480 |
| gcgcaagaaa atacgggagc tcccaatctc cctatttgat tattttattg ttggcgagga | 540 |
| gggtaatgag gaaggacgaa cacctcacct ccaggggttc gctaattttg tgaagaagca | 600 |
| aacttttaat aaagtgaagt ggtatttggg tgcccgctgc cacatcgaga aagccaaagg | 660 |
| aactgatcag cagaataaag aatattgcag taaagaaggc aacttactta ttgaatgtgg | 720 |
| agctcctcaa tctcaaggac aacggagtga cctgtctact gctgtgagta ccttgttgga | 780 |
| gagcgggagt ctggtgaccg ttgcagagca gcaccctgta acgtttgtca gaaatttccg | 840 |
| cgggctggct gaacttttga aagtgagcgg gaaaatgcag aagcgtgatt ggaagaccaa | 900 |
| tgtacacgtc attgtggggc cacctgggtg tggtaaaagc aaatgggctg ctaattttgc | 960 |
| agacccggaa accacatact ggaaaccacc tagaaacaag tggtgggatg gttaccatgg | 1020 |
| tgaagaagtg gttgttattg atgactttta tggctggctg ccgtgggatg atctactgag | 1080 |
| actgtgtgat cgatatccat tgactgtaga gactaaaggt ggaactgtac cttttttgtc | 1140 |
| ccgcagtatt ctgattacca gcaatcagac cccgttggaa tggtactcct caactgctgt | 1200 |
| cccagctata gaagctctct atcggaggat tacttccttg gtattttgga agaatgctac | 1260 |
| agaacaatcc acggaggaag ggggccagtt cgtcaccctt tcccccccat gccctgaatt | 1320 |
| tccatatgaa ataaattact gagtcttttt tatcacttcg taatggtttt tattattcat | 1380 |
| ttagggttta agtggggggt ctttaagatt aaattctctg aattgtacat acatggttac | 1440 |
| acggatattg tagtcctggt cgtatatact gttttcgaac gcagtgccga ggcctacgtg | 1500 |
| gtccacattt ctagaggttt gtagcctcag ccaaagctga ttccttttgt tatttggttg | 1560 |
| gaagtaatca atagtggagt caagaacagg tttgggtgtg aagtaacggg agtggtagga | 1620 |
| gaagggttgg gggattgtat ggcgggagga gtagtttaca tatgggtcat aggttagggc | 1680 |
| tgtggccttt gttacaaagt tatcatctag aataacagca gtggagccca ctcccctatc | 1740 |
| accctgggtg atgggggagc agggccag | 1768 |
PL 205 130 B1 <210> 4 <211> 1768 <212> DNA <213> Świński cirkowirus <400> 4
| aattcaacct | taacctttct | tattctgtag | tattcaaagg | gtatagagat | tttgttggtc | 60 |
| ccccctcccg | ggggaacaaa | gtcgtcaatt | ttaaatctca | tcatgtccac | cgcccaggag | 120 |
| ggcgttgtga | ctgtggtacg | cttgacagta | tatccgaagg | tgcgggagag | gcgggtgttg | 180 |
| aagatgccat | ttttccttct | ccaacggtag | cggtggcggg | ggtggacgag | ccaggggcgg | 240 |
| cggcggagga | tctggccaag | atggctgcgg | gggcggtgtc | ttcttctgcg | gtaacgcctc | 300 |
| cttggatacg | tcatagctga | aaacgaaaga | agtgcgctgt | aagtattacc | agcgcacttc | 360 |
| ggcagcggca | gcacctcggc | agcacctcag | cagcaacatg | cccagcaaga | agaatggaag | 420 |
| aagcggaccc | caaccacata | aaaggtgggt | gttcacgctg | aataatcctt | ccgaagacga | 480 |
| gcgcaagaaa | atacgggagc | tcccaatctc | cctatttgat | tattttattg | ttggcgagga | 540 |
| gggtaatgag | gaaggacgaa | cacctcacct | ccaggggttc | gctaattttg | tgaagaagca | 600 |
| aacttttaat | aaagtgaagt | ggtatttggg | tgcccgctgc | cacatcgaga | aagccaaagg | 660 |
| aactgatcag | cagaataaag | aatattgcag | taaagaaggc | aacttactta | ttgaatgtgg | 720 |
| agctcctcga | tctcaaggac | aacggagtga | cctgtctact | gctgtgagta | ccttgttgga | 780 |
| gagcgggagt | ctggtgaccg | ttgcagagca | gcaccctgta | acgtttgtca | gaaatttccg | 840 |
| cgggctggct | gaacttttga | aagtgaccgg | gaaaatgcag | aagcgtgatt | ggaagaccaa | 900 |
| tgtacacgtc | attgtggggc | cacctgggtg | tggtaaaagc | aaatgggctg | ctaattttgc | 960 |
| agacccggaa | accacatact | ggaaaccacc | tagaaacaag | tggtgggatg | gttaccatgg | 1020 |
| tgaagaagtg | gttgttattg | atgactttta | tggctggctg | ccgtgggatg | atctactgag | 1080 |
| actgtgtgat | cgatatccat | tgactgtaga | gactaaaggt | ggaactgtac | cttttttggc | 1140 |
| ccgcagtatt | ctgattacca | gcaatcagac | cccgttggaa | tggtactcct | caactgctgt | 1200 |
| cccagctgta | gaagctctct | atcggagtat | tacttccttg | gtattttgga | agaatgctac | 1260 |
| agaacaatcc | acggaggaag | ggggccagtt | cgtcaccctt | tcccccccat | gccctgaatt | 1320 |
| tccatatgaa | ataaattact | gagtcttttt | tatcacttcg | taatggtttt | tattattcat | 1380 |
| ttagggttta | agtggggggt | ctttaagatt | aaattctctg | aattgtacat | acatggttac | 1440 |
| acggatattg | tagtcctggt | cgtatttact | gttttcgaac | gcagcgccga | ggcctacgtg | 1500 |
PL 205 130 B1
| gtccacattt | ccagaggttt gtagtctcag ccaaagctga ttccttttgt tatttggttg | 1560 |
| gaagtaatca | atagtggagt caagaacagg tttgggtgtg aagtaacggg agtggtagga | 1620 |
| gaagggttgg | gggattgtat ggcgggagga gtagtttaca tatgggtcat aggttagggc | 1680 |
| tgtggccttt | gttacaaagt tatcatctag aataacagca gtggagccca ctcccctatc | 1740 |
| accctgggtg | ataggggagc agggccag | 1768 |
<210> 5 <211> 1759
| <212> DNA <213> Świński cirkowirus | ||||||
| <400> 5 aattcatatt | tagcctttct | aatacggtag | tattggaaag | gtaggggtag | ggggttggtg | 60 |
| ccgcctgagg | gggggaggaa | ctggccgatg | ttgaatttga | ggtagttaac | attccaagat | 120 |
| ggctgcgagt | atcctccttt | tatggtgagt | acaaattctg | tagaaaggcg | ggaattgaag | 180 |
| atacccgtct | ttcggcgcca | tctgtaacgg | tttctgaagg | cggggtgtgc | caaatatggt | 240 |
| cttctccgga | ggatgtttcc | aagaaggctg | cgggggcggg | tccttcttct | gcggtaacgc | 300 |
| ctccttggcc | acgtcatcct | ataaaagtga | aagaagtccg | ctgctgtagt | attaccagcg | 360 |
| cacttcggca | gcggcagcac | ctcggcagcg | tcagtgaaaa | tgccaagcaa | gaaaagcggc | 420 |
| ccgcaacccc | ataagaggtg | ggtgttcacc | cttaataatc | cttccgagga | ggagaaaaac | 480 |
| aaaatacggg | agcttccaat | ctcccttttt | gattattttg | tttgcggaga | ggaaggtttg | 540 |
| gaagagggta | gaactcctca | cctccagggg | tttgcgaatt | ttgctaagaa | gcagactttt | 600 |
| aacaaggtga | agtggtattt | tggtgcccgc | tgccacatcg | agaaagcgaa | aggaaccgac | 660 |
| cagcagaata | aagaatactg | cagtaaagaa | ggccacatac | ttatcgagtg | tggagctccg | 720 |
| cggaaccagg | ggaagcgcag | cgacctgtct | actgctgtga | gtaccctttt | ggagacgggg | 780 |
| tctttggtga | ctgtagccga | gcagttccct | gtaacgtatg | tgagaaattt | ccgcgggctg | 840 |
| gctgaacttt | tgaaagtgag | cgggaagatg | cagcagcgtg | attggaagac | agctgtacac | 900 |
| gtcatagtgg | gcccgcccgg | ttgtgggaag | agccagtggg | cccgtaattt | tgctgagcct | 960 |
| agggacacct | actggaagcc | tagtagaaat | aagtggtggg | atggatatca | tggagaagaa | 1020 |
| gttgttgttt | tggatgattt | ttatggctgg | ttaccttggg | atgatctact | gagactgtgt | 1080 |
| gaccggtatc | cattgactgt | agagactaaa | gggggtactg | ttcctttttt | ggcccgcagt | 1140 |
| attttgatta | ccagcaatca | ggccccccag | gaatggtact | cctcaactgc | tgtcccagct | 1200 |
| gtagaagctc | tctatcggag | gattactact | ttgcaatttt | ggaagactgc | tggagaacaa | 1260 |
PL 205 130 B1
| tccacggagg | tacccgaagg | ccgatttgaa | gcagtggacc | caccctgtgc | ccttttccca | 1320 |
| tataaaataa | attactgagt | cttttttttt | atcacatcgt | aatggttttt | atttttattt | 1380 |
| atttagaggg | tcttttagga | taaattctct | gaattgtaca | taaatagtca | gccttaccac | 1440 |
| ataattttgg | gctgtggctg | cattttggag | cgcatagccg | aagcctgtgt | gctcgacatt | 1500 |
| ggtgtgggta | tttaaatgga | gccacagctg | gtttctttta | ttatttgggt | ggaaccaatc | 1560 |
| aattgtttgg | tccagctcag | gtttgggggt | gaagtacctg | gagtggtagg | taaagggctg | 1620 |
| ccttatggtg | tggtggaagg | agtagttaat | ataggggtca | taggccaagt | tggtggaggg | 1680 |
| ggttacaaag | ttggcatcca | agataacaac | agtggaccca | acacctcttt | gattagaggt | 1740 |
| gattggttct | ctggggtaa | 1759 |
<210> 6 <211> 1768
| <212> DNA <213> Świński cirkowirus | ||||||
| <400> 6 accagcgcac | ttcggcagcg | gcagcacctc | ggcagcacct | cagcagcaac | atgcccagca | 60 |
| agaagaatgg | aagaagcgga | ccccaaccac | ataaaaggtg | ggtgttcacg | ctgaataatc | 120 |
| cttccgaaga | cgagcgcaag | aaaatacggg | agctcccaat | ctccctattt | gattatttta | 180 |
| ttgttggcga | ggagggtaat | gaggaaggac | gaacacctca | cctccagggg | ttcgctaatt | 240 |
| ttgtgaagaa | kcaaactttt | aataaagtga | agtggtattt | gggtgcccgc | tgccacatcg | 300 |
| agaaagccaa | aggaactgat | cagcagaata | aagaatattg | cagtaaagaa | ggcaacttac | 360 |
| ttattgaatg | tggagctcct | cgagctcaag | gacaacggag | tgacctgtct | actgctgtga | 420 |
| gtaccttgtt | ggagaacggg | agtctggtga | ccgttgcaga | gcagcaccct | gtaacgtttg | 480 |
| tcagaaattt | ccgcgggctg | gctgaacttt | tgaaagtgag | cgggaaaatg | cagaagcgtg | 540 |
| attggaagac | caatgtacac | gtcattgtgg | ggccacctgg | gtgtggtaaa | agcaaattgg | 600 |
| ctgctaattt | tgcagacccg | gaaaccacat | actggaaacc | acctagaaac | aagtggtggg | 660 |
| atggttacca | tggtgaagaa | gtggttgtta | ttgatgactt | ttatggctgg | cttccggggg | 720 |
| atgatctact | gagactgtgt | gatcgatatc | cattgactgt | agagactaaa | ggtggaactg | 780 |
| tacctttttt | ggcccgcagt | attctgatta | ccagcaatca | gaccccgttg | gaatggtact | 840 |
| cctcaactgc | tgtcccagct | gtagaagctc | tctatcggag | gattacttcc | ttggtatttt | 900 |
| ggaagaatgc | tacagaacaa | tccacggagg | aagagggcca | gttcgtcacc | ctttcccccc | 960 |
PL 205 130 B1
| catgccctga | atttccatat | gaaataaatt | actgagtcyt | ttttatcact | tcgtaatggt | 1020 |
| ttttattatt | catttagggg | ttaagtgggg | ggtctttaag | attaaattcc | ctgaattgta | 1080 |
| catacagggt | tacacggata | ttttagtcct | ggtcgtattt | actgttttcg | aacgcagtgc | 1140 |
| cgaggcctac | gtggtccaca | tttctagagg | tttgtagcct | cagccaaagc | tgattccttt | 1200 |
| tgttatttgg | ttggaagtaa | tcaatagtgg | agtcaagaac | aggtttgggt | gtgaagtaac | 1260 |
| gggagtggta | ggagaagggt | tgggggattg | tatggcggga | ggagtagttt | acatatgggt | 1320 |
| catatgtttg | ggctgtggcc | tttggtacaa | agttatcatc | tagaataaca | gcagtggagc | 1380 |
| ccactcccct | atcaccctgg | gtgatggggg | agcagggcca | gaattcaacc | ttaacctttc | 1440 |
| ttattctgta | gtattcaaag | ggtatagaga | ttttgttggt | cccccctccc | gggggaacaa | 1500 |
| agtcgtcaat | tttaaatctc | atcatgtcca | ccgcccagga | gggcgttgtg | actgtggtac | 1560 |
| gcttgacagt | atatccgaag | gtgcgggaga | ggcgggtgtt | gaagatgcca | tttttccttc | 1620 |
| tccaacggta | gcggtggcgg | gggtggacga | gccaggggcg | gcggcggagg | atctggccaa | 1680 |
| gatggctgcg | ggggcggtgt | cttcttctgc | ggtaacgcct | ccttggatat | gtcatagctg | 1740 |
| aaaacgaaag | aagtgcgctg | taagtatt | 1768 |
<210> 7 <211> 1768
| <212> DNA <213> Świński cirkowirus | ||||||
| <400> 7 accagcgcac | ttcggcagcg | gcagcacctc | ggcagcacct | cagcagcaac | atgcccagca | 60 |
| agaagaatgg | aagaagcgga | ccccaaccac | ataaaaggtg | ggtgttcacg | ctgaataatc | 120 |
| cttccgaaga | cgagcgcaag | aaaatacggg | agctcccaat | ctccctattt | gattatttta | 180 |
| ttgttggcga | ggagggtaat | gaggaaggac | gaacacctca | cctccagggg | ttcgctaatt | 240 |
| ttgtgaagaa | gcaaactttt | aataaagtga | agtggtattt | gggtgcccgc | tgccacatcg | 300 |
| agaaagccaa | aggaactgat | cagcagaata | aagaatattg | cagtaaagaa | ggcaacttac | 360 |
| ttattgaatg | tggagctcct | cgatcgcaag | gacaacggag | tgacctgtct | actgctgtga | 420 |
| gtaccttgtt | ggagaacggg | agtctggtga | ccgttgcaga | gcagcaccct | gtaacgtttg | 480 |
| tcagaaattt | ccgcgggctg | gctgaacttt | tgaaagtgag | cgggaaaatg | cagaagcgtg | 540 |
| attggaagac | caatgtacac | gtcattgtgg | ggccacctgg | gtgtggtaaa | agcaaattgg | 600 |
| ctgctaattt | tgcagacccg | gaaaccacat | actggaaacc | acctagaaac | aagtggtggg | 660 |
| atggttacca | tggtgaagaa | gtggttgtta | ttgatgactt | ttatggctgg | ctgccgtggg | 720 |
PL 205 130 B1
| atgatctact | gagactgtgt | gatcgatatc | cattgactgt | agagactaaa | ggtggaactg | 780 |
| tacctttttt | ggcccgcagt | attctgatta | ccagcaatca | gaccccgttg | gaatggtact | 840 |
| cctcaactgc | tgtcccagct | gtagaagctc | tctatcggag | gattacttcc | ttggtatttt | 900 |
| ggaagaatgc | tacagaacaa | tccacggagg | aagggggcca | gttcgtcacc | ctttcccccc | 960 |
| catgccctga | atttccatat | gaaataaatt | actgagtctt | ttttatcact | tcgtaatggt | 1020 |
| ttttattatt | catttagggg | ttaagtgggg | ggtctttaag | attaaattct | ctgaattgta | 1080 |
| catacatggt | tacacggata | ttgtactcct | ggtcgtattt | actgttttcg | aacgcagtgc | 1140 |
| cgaggcctac | gtggtccaca | tttctagagg | tttgtagcct | cagccaaagc | tgattccttt | 1200 |
| tgttatttgg | ttggaagtaa | tcaatagtgg | agtcaagaac | aggtttgggt | gtgaagtaac | 1260 |
| gggagtggta | ggagaagggt | tgggggattg | tatggcggga | ggagtagttt | acatatgggt | 1320 |
| cataggttag | ggctgtggcc | tttggtacaa | agttatcatc | tagaataaca | gcagtggagc | 1380 |
| ccactcccct | atcaccctgg | gtgatggggg | agcagggcca | gaattcaacc | ttaacctttt | 1440 |
| ttattctgta | gtattcaaag | ggtatagaga | ttttgttggt | cccccctccc | gggggaacaa | 1500 |
| agtcgtcaat | tttaaatctc | atcatgtcca | ccgcccagga | gggcgttgtg | actgtagtac | 1560 |
| gcttgacagt | atatccgaag | gtgcgggaga | ggcgggtgtt | gaagatgcca | tttttccttc | 1620 |
| tccaacggta | gcggtggcgg | gggtggacga | gccaggggcg | gcggcggagg | atctggccaa | 1680 |
| gatggctgcg | ggggcggtgt | cttcttctgc | ggtaacgcct | ccttggatac | gtcatagctg | 1740 |
| aaaacgaaag | aagtgcgctg | taagtatt | 1768 |
<210> 8 <211> 1680
| <212> DNA <213> Sztuczna <220> <223> Konstrukt plazmidowy <400> 8 ggtaccttca taaatacaag tttgattaaa | cttaagttgt | tctaaagttc | tttcctccga | 60 | ||
| aggtatagaa | caaagtattt | cttctacatc | cttactattt | attgcagctt | ttaacagcct | 120 |
| atcacgtatc | ctatttttag | tattggtaga | acgttttagt | tctaaagtta | aaatattaga | 180 |
| cataattggc | atattgctta | ttccttgcat | agttgagtct | gtagatcgtt | tcagtatatc | 240 |
| actgattaat | gtactactgt | tatgatgaaa | tatagaatcg | atattggcat | ttaactgttt | 300 |
| tgttatacta | agtctagatt | ttaaatcttc | tagtaatatg | ctatttaata | taaaagcttc | 360 |
PL 205 130 B1
| cacgtttttg | tatacatttc | tttccatatt | agtagctact | actaaatgat | tatcttcttt | 420 |
| catatcttgt | agataagata | gactatcttt | atctttatta | gtagaaaata | cttctggcca | 480 |
| tacatcgtta | aatttttttg | ttgttgttag | atataatatt | aaatatctag | aggatcctat | 540 |
| tatttgtggt | aaaatgttta | tagagtaaaa | tgatctggct | attaaacata | ggccagttac | 600 |
| catagaatgc | tgcttcccgt | tacagtgttt | taccataacc | atagatctgc | ctgtattgtt | 660 |
| gatacatata | acagctgtaa | atcctaaaaa | attcctatca | taattattaa | tattaggtaa | 720 |
| ttcatttcca | tgtgaaagat | agactaattt | tatatccttt | acctccaaat | aattatttac | 780 |
| atctcttaaa | caatctattt | taatatcatt | aactggtatt | ttataatatc | cagaaaggtt | 840 |
| tgaaggggtt | gatggaataa | gtctattaac | atcgttaagt | aaattattaa | tatcatgaat | 900 |
| ctttattata | ttatagcgat | aagttaaatt | tatatttact | ttctcatcat | ctgacttagt | 960 |
| tagtttgtaa | taaggtgtgt | ctgaaagaat | taaaaggtaa | ttcgttgaat | gaagctgtat | 1020 |
| ttgctgtatc | atttttatct | aattttggag | atttagcagt | acttacttca | ttagaagaag | 1080 |
| aatctgccag | ttcctgtcta | ttactgatat | ttcgtttcat | tattatatga | tttatatttt | 1140 |
| actttttcaa | ttatatatac | tcatttgact | agttaatcaa | taaaaagaat | tcctgcagcc | 1200 |
| ctgcagctaa | ttaattaagc | tacaaatagt | ttcgttttca | ccttgtctaa | taactaatta | 1260 |
| attaaggatc | ccccagcttc | tttattctat | acttaaaaag | tgaaaataaa | tacaaaggtt | 1320 |
| cttgagggtt | gtgttaaatt | gaaagcgaga | aataatcata | aattacttca | ttatcgcgat | 1380 |
| atccgttaag | tttgtatcgt | aatgacgtat | ccaaggaggc | gttaccgcag | aagaagacac | 1440 |
| cgcccccgca | gccatcttgg | ccagatcctc | cgccgccgcc | cctggctcgt | ccacccccgc | 1500 |
| caccgctacc | gttggagaag | gaaaaatggc | atcttcaaca | cccgcctctc | ccgcaccttc | 1560 |
| ggatatactg | tcaagcgtac | cacagtcaca | acgccctcct | gggcggtgga | catgatgaga | 1620 |
| tttaaaattg | acgactttgt | tcccccggga | ggggggacca | acaaaatctc | tatacccttt | 1680 |
| <210> 9 <211> 57 <212> DNA <213> Sztuczna |
<220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 9 catcatcatt cgcgatatcc gttaagtttg tatcgtaatg cccagcaaga agaatgg 57
PL 205 130 B1 <210> 10 <211> 36 <212> DNA <213> Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 10 tactactacg tcgactcagt aatttatttc atatgg 36
| <210> 11 <211> 3609 <212> DNA <213> Sztuczna <220> <223> Konstrukt plazmidowy <400> 11 ggtaccttca taaatacaag tttgattaaa | cttaagttgt | tctaaagttc | tttcctccga | 60 | ||
| aggtatagaa | caaagtattt | cttctacatc | cttactattt | attgcagctt | ttaacagcct | 120 |
| atcacgtatc | ctatttttag | tattggtaga | acgttttagt | tctaaagtta | aaatattaga | 180 |
| cataattggc | atattgctta | ttccttgcat | agttgagtct | gtagatcgtt | tcagtatatc | 240 |
| actgattaat | gtactactgt | tatgatgaaa | tatagaatcg | atattggcat | ttaactgttt | 300 |
| tgttatacta | agtctagatt | ttaaatcttc | tagtaatatg | ctatttaata | taaaagcttc | 360 |
| cacgtttttg | tatacatttc | tttccatatt | agtagctact | actaaatgat | tatcttcttt | 420 |
| catatcttgt | agataagata | gactatcttt | atctttatta | gtagaaaata | cttctggcca | 480 |
| tacatcgtta | aatttttttg | ttgttgttag | atataatatt | aaatatctag | aggatcctat | 540 |
| tatttgtggt | aaaatgttta | tagagtaaaa | tgatctggct | attaaacata | ggccagttac | 600 |
| catagaatgc | tgcttcccgt | tacagtgttt | taccataacc | atagatctgc | ctgtattgtt | 660 |
| gatacatata | acagctgtaa | atcctaaaaa | attcctatca | taattattaa | tattaggtaa | 720 |
| ttcatttcca | tgtgaaagat | agactaattt | tatatccttt | acctccaaat | aattatttac | 780 |
| atctcttaaa | caatctattt | taatatcatt | aactggtatt | ttataatatc | cagaaaggtt | 840 |
| tgaaggggtt | gatggaataa | gtctattaac | atcgttaagt | aaattattaa | tatgatgaat | 900 |
| ctttattata | ttatacccat | aagttaaatt | tatatttact | ttctcatcat | ctgacttagt | 960 |
| tagtttgtaa | taaggtgtgt | ctgaaaaaat | taaaaggtaa | ttcgttgaat | gaagctgtat | 1020 |
| ttgctgtatc | atttttatct | aattttggag | atttagcagt | acttacttca | ttagaagaag | 1080 |
| aatctgccag | ttcctgtcta | ttactgatat | ttcgtttcat | tattatatga | tttatatttt | 1140 |
PL 205 130 B1
| actttttcaa | ttatatatac | tcatttgact | agttaatcaa | taaaaagaat | ttcgacttag | 1200 |
| ggtttaagtg | gggggtcttt | aagattaaat | tctctgaatt | gtacatacat | ggttacacgg | 1260 |
| atattgtagt | cctggtcgta | tttactgttt | tcgaacgcag | cgccgaggcc | tacgtggtcc | 1320 |
| acatttccag | aggtttgtag | tctcagccaa | agctgattcc | ttttgttatt | tggttggaag | 1380 |
| taatcaatag | tggagtcaag | aacaggtttg | ggtgtgaagt | aacgggagtg | gtaggagaag | 1440 |
| ggttggggga | ttgtatggcg | ggaggagtag | tttacatatg | ggtcataggt | tagggctgtg | 1500 |
| gcctttgtta | caaagttatc | atctagaata | acagcagtgg | agcccactcc | cctatcaccc | 1560 |
| tgggtgatgg | gggagcaggg | ccagaattca | accttaacct | ttcttattct | gtagtattca | 1620 |
| aagggtatag | agattttgtt | ggtcccccct | cccgggggaa | caaagtcgtc | aattttaaat | 1680 |
| ctcatcatgt | ccaccgccca | ggagggcgtt | gtgactgtgg | tacgcttgac | agtatatccg | 1740 |
| aaggtgcggg | agaggcgggt | gttgaagatg | ccatttttcc | ttctccaacg | gtagcggtgg | 1800 |
| cgggggtgga | cgagccaggg | gcggcggcgg | aggatctggc | caagatggct | gcgggggcgg | 1860 |
| tgtcttcttc | tgcggtaacg | cctccttgga | tacgtcatta | cgatacaaac | ttaacggata | 1920 |
| tcgcgataat | gaaataattt | atgattattt | ctcgctttca | atttaacaca | accctcaaga | 1980 |
| acctttgtat | ttattttcac | tttttaagta | tagaataaag | aagctggggg | atcaattcct | 2040 |
| gcagccctgc | agctaattaa | ttaagctaca | aatagtttcg | ttttcacctt | gtctaataac | 2100 |
| taattaatta | aggatccccc | agcttcttta | ttctatactt | aaaaagtgaa | aataaataca | 2160 |
| aaggttcttg | agggttgtgt | taaattgaaa | gcgagaaata | atcataaatt | atttcattat | 2220 |
| cgcgatatcc | gttaagtttg | tatcgtaatg | cccagcaaga | agaatggaag | aagcggaccc | 2280 |
| caaccacata | aaaggtgggt | gttcacgctg | aataatcctt | ccgaagacga | gcgcaagaaa | 2340 |
| atacgggagc | tcccaatctc | cctatttgat | tattttattg | ttggcgagga | gggtaatgag | 2400 |
| gaaggacgaa | cacctcacct | ccaggggttc | gctaattttg | tgaagaagca | aacttttaat | 2460 |
| aaagtgaagt | ggtatttggg | tgcccgctgc | cacatcgaga | aagccaaagg | aactgatcag | 2520 |
| cagaataaag | aatattgcag | taaagaaggc | aacttactta | ttgaatgtgg | agctcctcga | 2580 |
| tctcaaggac | aacggagtga | cctgtctact | gctgtgagta | ccttgttgga | gagcgggagt | 2640 |
| ctggtgaccg | ttgcagagca | gcaccctgta | acgtttgtca | gaaatttccg | cgggctggct | 2700 |
| gaacttttga | aagtgagcgg | gaaaatgcag | aagcgtgatt | ggaagaccaa | tgtacacgtc | 2760 |
| attgtggggc | cacctgggtg | tggtaaaagc | aaatgggctg | ctaattttgc | agacccggaa | 2820 |
PL 205 130 B1
| accacatact | ggaaaccacc | tagaaacaag | tggtgggatg | gttaccatgg | tgaagaagtg | 2880 |
| gttgttattg | atgactttta | tggctggctg | ccgtgggatg | atctactgag | actgtgtgat | 2940 |
| cgatatccat | tgactgtaga | gactaaaggt | ggaactgtac | cttttttggc | ccgcagtatt | 3000 |
| ctgattacca | gcaatcagac | cccgttggaa | tggtactcct | caactgctgt | cccagctgta | 3060 |
| gaagctctct | atcggaggat | tacttccttg | gtattttgga | agaatgctac | agaacaatcc | 3120 |
| acggaggaag | ggggccagtt | cgtcaccctt | tcccccccat | gccctgaatt | tccatatgaa | 3180 |
| ataaattact | gagtcgaccc | cgggttttta | tagctaatta | gtcatttttt | cgtaagtaag | 3240 |
| tatttttatt | taatactttt | tattgtactt | atgttaaata | taactgatga | taacaaaatc | 3300 |
| cattatgtat | tatttataac | tgtaatttct | ttagcgtagt | tagatgtcca | atctctctca | 3360 |
| aatacatcgg | ctatcttttt | agtgagattt | tgatctatgc | agttgaaact | tatgaacgcg | 3420 |
| tgatgattaa | aatgtgaacc | gtccaaattt | gcagtcatta | tatgagcgta | tctattatct | 3480 |
| actatcatca | tctttgagtt | attaatatca | tctactttag | aattgatagg | aaatatgaat | 3540 |
| acctttgtag | taatatctat | actatctaca | cctaactcat | taagactttt | gataggcggc | 3600 |
cgcgagctc 3609 <210> 12 <211> 53 <212> DNA <213> Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 12 catcatcatg atatccgtta agtttgtatc gtaatgacgt ggccaaggag gcg 53 <210> 13 <211> 40 <212> DNA <213> Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter
| <400> | 13 | |
| tactactacg tcgacttatt tatttagagg gtcttttagg | 40 | |
| <210> | 14 | |
| <211> | 57 | |
| <212> | DNA | |
| <213> | Sztuczna |
<220>
<223> Oligonukleotydowy starter
PL 205 130 B1
| <400> | 14 | ||
| catcatcatt cgcgatatcc gttaagtttg | tatcgtaatg ccaagcaaga aaagcgg | 57 | |
| <210> | 15 | ||
| <211> | 36 | ||
| <212> | DNA | ||
| <213> | Sztuczna | ||
| <220> | |||
| <223> | Oligonukleotydowy starter | ||
| <400> | 15 | ||
| tactactacg tcgactcagt aatttatttt | atatgg | 36 |
<210> 16 <211> 3701 <212> DNA <213> Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 16
| aagcttctat | caaaagtctt | aatgagttag | gtgtagatag | tatagatatt | actacaaagg | 60 |
| tattcatatt | tcctatcaat | tctaaagtag | atgatattaa | taactcaaag | atgatgatag | 120 |
| tagataatag | atacgctcat | ataatgactg | caaatttgga | cggttcacat | tttaatcatc | 180 |
| acgcgttcat | aagtttcaac | tgcatagatc | aaaatctcac | taaaaagata | gccgatgtat | 240 |
| ttgagagaga | ttggacatct | aactacgcta | aagaaattac | agttataaat | aatacataat | 300 |
| ggattttgtt | atcatcagtt | atatttaaca | taagtacaat | aaaaagtatt | aaataaaaat | 360 |
| acttacttac | gaaaaaatgt | cattattaca | aaaactatat | tttacagaac | aatctatagt | 420 |
| agagtccttt | aagagttata | atttaaaaga | taaccataat | gtaatattta | ccacatcaga | 480 |
| tgatgatact | gttgtagtaa | taaatgaaga | taatgtactg | ttatctacaa | gattattatc | 540 |
| atttgataaa | attctgtttt | ttaactcctt | taataacggt | ttatcaaaat | acgaaactat | 600 |
| tagtgataca | atattagata | tagatactca | taattattat | atacctagtt | cttcttcttt | 660 |
| gttagatatt | ctaaaaaaaa | gagcgtgtga | tttagaatta | gaagatctaa | attatgcgtt | 720 |
| aataggagac | aatagtaaat | tatattataa | agatatgact | tacatgaata | attggttatt | 780 |
| tactaaagga | ttattagatt | acaagtttgt | attattgcgc | gatgtagata | aatgttacaa | 840 |
| acagtataat | aaaaagaata | ctataataga | tataatacat | cgcgataaca | gacagtataa | 900 |
| catatgggtt | aaaaatgtta | tagaatactg | ttctcctggc | tatatattat | ggttacatga | 960 |
| tctaaaagcc | gctgctgaag | atgattggtt | aagatacgat | aaccgtataa | acgaattatc | 1020 |
PL 205 130 B1
| tgcggataaa | ttatacactt | tcgagttcat | agttatatta | gaaaataata | taaaacattt | 1080 |
| acgagtaggt | acaataattg | tacatccaaa | caagataata | gctaatggta | catctaataa | 1140 |
| tatacttact | gattttctat | cttacgtaga | agaactaata | tatcatcata | attcatctat | 1200 |
| aatattggcc | ggatattttt | tagaattctt | tgagaccact | attttatcag | aatttatttc | 1260 |
| ttcatcttct | gaatgggtaa | tgaatagtaa | ctgtttagta | cacctgaaaa | cagggtatga | 1320 |
| agctatactc | tttgatgcta | gtttattttt | ccaactctct | actaaaagca | attatgtaaa | 1380 |
| atattggaca | aagaaaactt | tgcagtataa | gaactttttt | aaagacggta | aacagttagc | 1440 |
| aaaatatata | attaagaaag | atagtcaggt | gatagataga | gtatgttatt | tacacgcagc | 1500 |
| tgtatataat | cacgtaactt | acttaatgga | taactttaaa | attcctggtt | ttaattttaa | 1560 |
| attctccgga | atgatagata | tactactgtt | tggaatattg | cataaggata | atgagaatat | 1620 |
| attttatccg | aaacgtgttt | ctgtaactaa | tataatatca | gaatctatct | atgcagattt | 1680 |
| ttactttata | tcagatgtta | ataaattcag | taaaaggata | gaatataaaa | ctatgtttcc | 1740 |
| tatactcgca | gaaaactact | atccaaaagg | aaggccctat | tttacacata | catctaacga | 1800 |
| agatcttctg | tctatctgtt | tatgcgaagt | aacagtttgt | aaagatataa | aaaatccatt | 1860 |
| attatattct | aaaaaggata | tatcagcaaa | acgattcata | ggtttattta | catctgtcga | 1920 |
| tataaatacg | gctgttgagt | taagaggata | taaaataaga | gtaataggat | gtttagaatg | 1980 |
| gcctgaaaag | ataaaaatat | ttaattctaa | tcctacatac | attagattat | tactaacaga | 2040 |
| aagacgttta | gatattctac | attcctatct | gcttaaattt | aatataacag | aggatatagc | 2100 |
| taccagagat | ggagtcagaa | ataatttacc | tataatttct | tttatcgtca | gttattgtag | 2160 |
| atcgtatact | tataaattac | taaattgcca | tatgtacaat | tcgtgtaaga | taacaaagtg | 2220 |
| taaatataat | caggtaatat | ataatcctat | ataggagtat | atataattga | aaaagtaaaa | 2280 |
| tataaatcat | ataataatga | aacgaaatat | cagtaataga | caggaactgg | cagattcttc | 2340 |
| ttctaatgaa | gtaagtactg | ctaaatctcc | aaaattagat | aaaaatgata | cagcaaatac | 2400 |
| agcttcattc | aacgaattac | cttttaattt | tttcagacac | accttattac | aaactaacta | 2460 |
| agtcagatga | tgagaaagta | aatataaatt | taacttatgg | gtataatata | ataaagattc | 2520 |
| atgatattaa | taatttactt | aacgatgtta | atagacttat | tccatcaacc | ccttcaaacc | 2580 |
| tttctggata | ttataaaata | ccagttaatg | atattaaaat | agattgttta | agagatgtaa | 2640 |
| ataattattt | ggaggtaaag | gatataaaat | tagtctatct | ttcacatgga | aatgaattac | 2700 |
PL 205 130 B1
| ctaatattaa | taattatgat | aggaattttt | taggatttac | agctgttata | tgtatcaaca | 2760 |
| atacaggcag | atctatggtt | atggtaaaac | actgtaacgg | gaagcagcat | tctatggtaa | 2820 |
| ctggcctatg | tttaatagcc | agatcatttt | actctataaa | cattttacca | caaataatag | 2880 |
| gatcctctag | atatttaata | ttatatctaa | caacaacaaa | aaaatttaac | gatgtatggc | 2940 |
| cagaagtatt | ttctactaat | aaagataaag | atagtctatc | ttatctacaa | gatatgaaag | 3000 |
| aagataatca | tttagtagta | gctactaata | tggaaagaaa | tgtatacaaa | aacgtggaag | 3060 |
| cttttatatt | aaatagcata | ttactagaag | atttaaaatc | tagacttagt | ataacaaaac | 3120 |
| agttaaatgc | caatatcgat | tctatatttc | atcataacag | tagtacatta | atcagtgata | 3180 |
| tactgaaacg | atctacagac | tcaactatgc | aaggaataag | caatatgcca | attatgtcta | 3240 |
| atattttaac | tttagaacta | aaacgttcta | ccaatactaa | aaataggata | cgtgataggc | 3300 |
| tgttaaaagc | tgcaataaat | agtaaggatg | tagaagaaat | actttgttct | ataccttcgg | 3360 |
| aggaaagaac | tttagaacaa | cttaagttta | atcaaacttg | tatttatgaa | cactataaaa | 3420 |
| aaattatgga | agatacaagt | aaaagaatgg | atgttgaatg | tcgtagttta | gaacataact | 3480 |
| atacggctaa | cttatataaa | gtgtacggac | aaaacgaata | tatgattact | tatatactag | 3540 |
| ctctcataag | taggattaat | aatattatag | aaactttaaa | atataatctg | gtggggctag | 3600 |
| acgaatctac | aatacgtaat | ataaattata | taatttcaca | aagaacaaaa | aaaaatcaag | 3660 |
| tttctaatac | cttatagata | aactatattt | tttaccactg | a | 3701 |
<210> 17 <211> 625 <212> PRT <213> Sztuczna <220>
<223> Konstrukt plazmidowy <400> 17
| Met 1 | Ser | Leu | Leu | Gin 5 | Lys | Leu | Tyr | Phe | Thr 10 | Glu | Gin | Ser | Ile | Val 15 | Glu |
| Ser | Phe | Lys | Ser 20 | Tyr | Asn | Leu | Lys | Asp 25 | Asn | His | Asn | Val | Ile 30 | Phe | Thr |
| Thr | Ser | Asp 35 | Asp | Asp | Thr | Val | Val 40 | Val | Ile | Asn | Glu | Asp 45 | Asn | Val | Leu |
| Leu | Ser 50 | Thr | Arg | Leu | Leu | Ser 55 | Phe | Asp | Lys | Ile | Leu 60 | Phe | Phe | Asn | Ser |
| Phe | Asn | Asn | Gly | Leu | Ser | Lys | Tyr | Glu | Thr | Ile | Ser | Asp | Thr | Ile | Leu |
PL 205 130 B1
70
Asp Ile Asp Thr His Asn 85
Asp Ile Leu Lys Lys Arg 100
Tyr Ala Leu Ile Gly Asp 115
Tyr Met Asn Asn Trp Leu 130
Val Leu Leu Arg Asp Val 145 150
Asn Thr Ile Ile Asp Ile 165
Trp Val Lys Asn Val Ile 180
Leu His Asp Leu Lys Ala 195
Asn Arg Ile Asn Glu Leu 210
Ile Val Ile Leu Glu Asn 225 230
Ile Val His Pro Asn Lys 245
Leu Thr Asp Phe Leu Ser 260
Ser Ser Ile Ile Leu Ala 275
Ile Leu Ser Glu Phe Ile 290
Asn Cys Leu Val His Leu 305 310
Ala Ser Leu Phe Phe Gin 325
Trp Thr Lys Lys Thr Leu 340
Gin Leu Ala Lys Tyr Ile 355
Val Cys Tyr Leu His Ala
Tyr Tyr
Ala Cys
Asn Ser 120
Phe Thr 135
Asp Lys
Ile His
Glu Tyr
Ala Ala 200
Ser Ala 215
Asn Ile
Ile Ile
Tyr Val
Gly Tyr 280
Ser Ser 295
Lys Thr
Leu Ser
Gin Tyr
Ile Lys 360
Ala Val
Ile Pro 90
Asp Leu 105
Lys Leu
Lys Gly
Cys Tyr
Arg Asp 170
Cys Ser 185
Glu Asp
Asp Lys
Lys His
Ala Asn 250
Glu Glu 265
Phe Leu
Ser Ser
Gly Tyr
Thr Lys 330
Lys Asn 345
Lys Asp
Tyr Asn
Ser Ser Ser Ser Leu 95
Glu Leu Glu Asp Leu 110
Tyr Tyr Lys Asp Met 125
Leu Leu Asp Tyr Lys 140
Lys Gin Tyr Asn Lys 155
Asn Arg Gin Tyr Asn 175
Pro Gly Tyr Ile Leu 190
Asp Trp Leu Arg Tyr 205
Leu Tyr Thr Phe Glu 220
Leu Arg Val Gly Thr 235
Gly Thr Ser Asn Asn 255
Leu Ile Tyr His His 270
Glu Phe,Phe Glu Thr 285
Glu Trp Val Met Asn 300
Glu Ala Ile Leu Phe 315
Ser Asn Tyr Val Lys 335
Phe Phe Lys Asp Gly 350
Ser Gin Val Ile Asp 365
His Val Thr Tyr Leu
Leu
Asn
Thr
Phe
Lys
160
Ile
Trp
Asp
Phe
Ile
240
Ile
Asn
Thr
Ser
Asp
320
Tyr
Lys
Arg
Met
PL 205 130 B1
370
375
380
Asp Asn Phe Lys Ile Pro Gly Phe Asn Phe Lys Phe 385 390 395
Ser Gly Met Ile 400
Asp Ile Leu Leu Phe Gly Ile Leu His Lys Asp Asn 405 410
Glu Asn Ile Phe 415
Tyr Pro Lys Arg Val Ser Val Thr Asn 420 425
Ile Ile Ser
Glu Ser Ile Tyr 430
Ala Asp Phe Tyr Phe Ile Ser Asp Val Asn Lys Phe 435 440
Ser Lys Arg Ile 445
Glu Tyr Lys Thr Met Phe Pro Ile Leu Ala Glu Asn 450 455 460
Tyr Tyr Pro Lys
Gly Arg Pro Tyr Phe Thr His Thr Ser Asn Glu Asp 465 470 475
Leu Leu Ser Ile 480
Cys Leu Cys Glu Val Thr Val Cys Lys Asp Ile Lys 485 490
Asn Pro Leu Leu 495
Tyr Ser Lys Lys Asp Ile Ser Ala Lys: Arg Phe Ile 500 505
Ser Val Asp Ile Asn Thr Ala Val Glu Leu Arg Gly 515 520 Gly Leu Phe Thr 510
Tyr Lys Ile Arg 525
Val Ile Gly Cys Leu Glu Trp Pro Glu Lys Ile Lys 530 535 540
Ile Phe Asn Ser
Asn Pro Thr Tyr Ile Arg Leu Leu Leu Thr Glu Arg 545 550 555
Arg Leu Asp Ile 560
Leu His Ser Tyr Leu Leu Lys Phe Asn 565
Ile Thr Glu 570
Asp Ile Ala Thr 575
Arg Asp Gly Val Arg Asn Asn 580
Leu Pro 585
Ile Ile Ser
Phe Ile Val Ser 590
Tyr Cys Arg Ser Tyr Thr Tyr 595
Ser Cys Lys Ile Thr Lys Cys 610 615
Lys Leu 600
Leu Asn Cys His Met Tyr Asn 605
Lys Tyr Asn Gin Val Ile Tyr Asn Pro 620
| Ile 625 | |
| <210> | 18 |
| <211> | 93 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Konstruk |
PL 205 130 B1 <400> 18
| Met 1 | Thr | Tyr | Pro Arg 5 | Arg Arg | Tyr | Arg Arg 10 | Arg | Arg | His | Arg | Pro 15 | Arg | |||
| Ser | His | Leu | Gly | Gin | Ile | Leu | Arg | Arg | Arg | Pro | Trp | Leu | Val | His | Pro |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | His | Arg | Tyr | Arg | Trp | Arg | Arg | Lys | Asn | Gly | Ile | Phe | Asn | Thr | Arg |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Arg | Thr | Phe | Gly | Tyr | Thr | Val | Lys | Arg | Thr | Thr | Val | Thr | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Trp | Ala | Val | Asp | Met | Met | Arg | Phe | Lys | Ile | Asp | Asp | Phe | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Pro | Pro | Gly | Gly | Gly | Thr | Asn | Lys | Ile | Ser | Ile | Pro | Phe |
90 <210> 19 <211> 233 <212> PRT <213> Sztuczna <220>
| <223> Konstrukt | : plazmidowy | ||||||||||||||
| <400> 19 | |||||||||||||||
| Met | Thr | Tyr | Pro | Arg | Arg | Arg | Tyr | Arg | Arg | Arg | Arg | His | Arg | Pro | Arg |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | His | Leu | Gly | Gin | Ile | Leu | Arg | Arg | Arg | Pro | Trp | Leu | Val | His | Pro |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | His | Arg | Tyr | Arg | Trp | Arg | Arg | Lys | Asn | Gly | Ile | Phe | Asn | Thr | Arg |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Arg | Thr | Phe | Gly | Tyr | Thr | Val | Lys | Arg | Thr | Thr | Val | Thr | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Trp | Ala | Val | Asp | Met | Met | Arg | Phe | Lys | Ile | Asp | Asp | Phe | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Pro | Pro | Gly | Gly | Gly | Thr | Asn | Lys | Ile | Ser | Ile | Pro | Phe | Glu | Tyr | Tyr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Arg | Ile | Arg | Lys | Val | Lys | Val | Glu | Phe | Trp | Pro | Cys | Ser | Pro | Ile | Thr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin | Gly | Asp | Arg | Gly | Val | Gly | Ser | Thr | Ala | Val | Ile | Leu | Asp | Asp | Asn |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Phe | Val | Thr | Lys | Ala | Thr | Ala | Leu | Thr | Tyr | Asp | Pro | Tyr | Val | Asn | Tyr |
| 130 | 135 | 140 |
PL 205 130 B1
| Ser | Ser | Arg | His | Thr | Ile | Pro | Gin | Pro | Phe | Ser | Tyr | His | Ser | Arg | Tyr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Pro | Lys | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Thr | Ile | Asp | Tyr | Phe | Gin | Pro |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Lys | Arg | Asn | Gin | Leu | Trp | Leu | Arg | Leu | Gin | Thr | Ser | Gly | Asn |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Asp | His | Val | Gly | Leu | Gly | Ala | Ala | Phe | Glu | Asn | Ser | Lys | Tyr | Asp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gin | Asp | Tyr | Asn | Ile | Arg | Val | Thr | Met | Tyr | Val | Gin | Phe | Arg | Glu | Phe |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Lys | Asp | Pro | Pro | Leu | Lys | Pro |
225 230 <210> 20 <211> 314 <212> PRT <213> Sztuczna <220>
| <223> Konstrukt | : plazmidowy | ||||||||||||||
| <400> : | 20 | ||||||||||||||
| Met | Pro | Ser | Lys | Lys | Asn | Gly | Arg | Ser | Gly | Pro | Gin | Pro | His | Lys | Arg |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Trp | Val | Phe | Thr | Leu | Asn | Asn | Pro | Ser | Glu | Asp | Glu | Arg | Lys | Lys | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | Glu | Leu | Pro | Ile | Ser | Leu | Phe | Asp | Tyr | Phe | Ile | Val | Gly | Glu | Glu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Glu | Glu | Gly | Arg | Thr | Pro | His | Leu | Gin | Gly | Phe | Ala | Asn | Phe |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Val | Lys | Lys | Gin | Thr | Phe | Asn | Lys | Val | Lys | Trp | Tyr | Leu | Gly | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Cys | His | Ile | Glu | Lys | Ala | Lys | Gly | Thr | Asp | Gin | Gin | Asn | Lys | Glu | Tyr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Cys | Ser | Lys | Glu | Gly | Asn | Leu | Leu | Ile | Glu | Cys | Gly | Ala | Pro | Arg | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin | Gly | Gin | Arg | Ser | Asp | Leu | Ser | Thr | Ala | Val | Ser | Thr | Leu | Leu | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Leu | Val | Thr | Val | Ala | Glu | Gin | His | Pro | Val | Thr | Phe | Val |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Asn | Phe | Arg | Gly | Leu | Ala | Glu | Leu | Leu | Lys | Val | Ser | Gly | Lys | Met |
PL 205 130 B1
| 145 | 150 | 155 | 160 |
| Gin Lys Arg | Asp Trp Lys Thr | Asn Val His Val Ile | Val Gly Pro Pro |
| 165 | 170 | 175 | |
| Gly Cys Gly | Lys Ser Lys Trp | Ala Ala Asn Phe Ala | Asp Pro Glu Thr |
| 180 | 185 | 190 | |
| Thr Tyr Trp | Lys Pro Pro Arg | Asn Lys Trp Trp Asp | Gly Tyr His Gly |
| 195 | 200 | 205 | |
| Glu Glu Val | Val Val Ile Asp | Asp Phe Tyr Gly Trp | Leu Pro Trp Asp |
| 210 | 215 | 220 | |
| Asp Leu Leu | Arg Leu Cys Asp | Arg Tyr Pro Leu Thr | Val Glu Thr Lys |
| 225 | 230 | 235 | 240 |
| Gly Gly Thr | Val Pro Phe Leu | Ala Arg Ser Ile Leu | Ile Thr Ser Asn |
| 245 | 250 | 255 | |
| Gin Thr Pro | Leu Glu Trp Tyr | Ser Ser Thr Ala Val | Pro Ala Val Glu |
| 260 | 265 | 270 | |
| Ala Leu Tyr | Arg Arg Ile Thr | Ser Leu Val Phe Trp | Lys Asn Ala Thr |
| 275 | 280 | 285 | |
| Glu Gin Ser | Thr Glu Glu Gly | Gly Gin Phe Val Thr | Leu Ser Pro Pro |
| 290 | 295 | 300 | |
| Cys Pro Glu | Phe Pro Tyr Glu | Ile Asn Tyr | |
| 305 | 310 | ||
| <210> 21 | |||
| <211> 42 | |||
| <212> DNA | |||
| <213> Sztuczna | |||
| <220> | |||
| <223> Oligonukleotydowy starter | |||
| <400> 21 | |||
| atcatcgagc · | tcgcggccgc ctatcaaaag tcttaatgag tt | 42 |
<210> 22 <211> 73 <212> DNA <213> Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 22 gaattcctcg agctgcagcc cgggttttta tagctaatta gtcatttttt cgtaagtaag 60 tatttttatt taa 73
PL 205 130 B1 <210>
<211>
<212>
<213>
DNA
Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 23 cccgggctgc agctcgagga attcttttta ttgattaact agtcaaatga gtatatataa 60 ttgaaaaagt aa 72 <210>
<211>
<212>
<213>
DNA
Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 24 gatgatggta ccttcataaa tacaagtttg attaaactta agttg <210>
<211>
<212>
<213>
DNA
Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 25 catcatcatg atatccgtta agtttgtatc gtaatgacgt atccaaggag gcg <210>
<211>
<212>
<213>
DNA
Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 26 tactactacg tcgacttagg gtttaagtgg ggggtc <210> 27 <211> 35 <212> DNA <213> Sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydowy starter <400> 27 catcatcatg tcgacatgac gtatccaagg aggcg
PL 205 130 B1
PL 205 130 B1
Claims (4)
- Zastrzeżenia patentowe1. Zastosowanie kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku do obniżenia obciążenia świńskim cirkowirusem typu 2 (PCV-2) w węzłach oskrzelowych i krezkowych świń, znamienne tym, że kompozycja szczepionkowa obejmuje farmaceutycznie lub weterynaryjnie dopuszczalny nośnik i/lub podłoże i/lub zaróbkę i/lub adiuwant, i immunogen PCV-2, przy czym immunogenem PCV-2 jest inaktywowany PCV-2, lub immunogenem PCV-2 jest atenuowany PCV-2, lub immunogen PCV-2 może być wyrażany z wektora obejmującego fragment DNA zawierający sekwencję nukleotydową kodującą ORF4 i/lub ORF13 z PCV-2.
- 2. Zastosowanie według zastrz. 1, znamienne tym, że wektorem jest wektor ekspresyjny i jest wybrany z grupy składającej się z plazmidowego DNA, E.coli, bakulowirusów, wirusów herpes, wirusa choroby Aujeszkiego, świńskich adenowirusów, wirusów ospy, wirusa krowianki, wirusa ospy ptasiej, wirusa ospy kanarków i wirusa ospy świń.PL 205 130 B1
- 3. Zastosowanie według zastrz. 2, znamienne tym, że wektorem jest plazmidowy wektor DNA.
- 4. Zastosowanie według zastrz. 1 albo 2, albo 3, znamienne tym, że wektor zawiera i wyraża ORF13 z PCV-2 lub ORF4 i ORF13 z PCV-2.RysunkiFIGURA 1SEQ ID No. 1 aattcaacct taacctttct tattctgtag tattcaaagg gcacagagcg ggggtttgag 60 ccccctcctg ggggaagaaa gtcattaata ttgaatctca tcatgtccac cgcccaggag 120 ggcgttctga ctgtggttcg cttgacagta tatccgaagg tgcgggagag gcgggtgttg 180 aagatgccat ttttccttct ccagcggtaa cggtggcggg ggtggacgag ccaggggcgg 240 cggcggagga tctggccaag atggctgcgg gggcggtgtc ttcttctccg gtaacgcctc 300 cttggatacg tcatatctga aaacgaaaga agtgcgctgt aagtattacc agcgcacttc 360 ggcagcggca gcacctcggc agcacctcag cagcaacatg ccgagcaaga agaatggaag 420 aagcggaccc caaccccata aaaggtgggt gttcactctg aataatcctt ccgaagacga 480 gcgcaagaaa atacgggatc ttccaatatc cctatttgat tattttattg ttggcgagga 540 gggtaatgag gaaggacgaa cacctcacct ccaggggttc gctaattttg tgaagaagca 600 gacttttaat aaagtgaagt ggtatttggg tgcccgctgc cacatcgaga aagcgaaagg 660 aacagatcag cagaataaag aatactgcag taaagaaggc aacttactga tggagtgtgg 720 agctcctaga tctcagggac aacggagtga cctgtctact gctgtgagta ccttgttgga 780 gagcgggagt ctggtgaccg ttgcagagca gcaccctgta acgtttgtca gaaatttccg 840 cgggctggct gaacttttga aagtgagcgg gaaaatgcag aagcgtgatt ggaagactaa 900 tgtacacgtc attgtggggc cacctgggtg tggtaaaagc aaatgggctg ctaattttgc 960 agacccggaa accacatact ggaaaccacc tagaaacaag tggtgggatg gttaccatgg 1020 tgaagaagtg gttgttattg atgactttta tggctggctg ccctgggatg atctactgag 1080 actgtgtgat cgatatccat tgactgtaga gactaaaggt ggaactgtac cttttttggc 1140 ccgcagtatt ctgattacca gcaatcagac cccgttggaa tggtactcct caactgctgt 1200 cccagctgta gaagctcttt atcggaggat tacttccttg gtattttgga agaatgctac 1260 agaacaatcc acggaggaag ggggccagtt cgtcaccctt tcccccccat gccctgaatt 1320 tccatatgaa ataaattact gagtcttttt tatcacttcg taatggtttt tattattcat 1380 taagggttaa gtggggggtc tttaagatta aattctctga attgtacata catggttaca 1440 cggatattgt attcctggtc gtatatactg ttttcgaacg cagtgccgag gcctacgtgg 1500 tctacatttc cagcagtttg tagtctcagc cacagctggt ttcttttgtt gtttggttgg 1560 aagtaatcaa tagtggaatc taggacaggt ttgggggtaa agtagcggga gtggtaggag 1620 aagggctggg ttatggtatg gcgggaggag tagtttacat aggggtcata ggtgagggct 1680 gtggcctttg ttacaaagtt atcatctaga ataacagcac tggagcccac tcccctgtca 1740 ccctgggtga tcggggagca gggccag 1767PL 205 130 B1FIGURA 2SEQ ID No. 2 aattcaacct taacctttct tattctgtag tattcaaagg gcacagagcg ggggtttgag 60 ccccctcctg ggggaagaaa gtcattaata ttgaatctca tcatgtccac cgcccaggag 120 ggcgttttga ctgtggttcg cttgacagta tatccgaagg tgcgggagag gcgggtgttg 180 aagatgccat ttttccttct ccagcggtaa cggtggcggg ggtggacgag ccaggggcgg 240 cggcggagga tctggccaag atggctgcgg gggcggtgtc ttcttctccg gtaacgcctc 300 cttggatacg tcatatctga aaacgaaaga agtgcgctgt aagtattacc agcgcacttc 360 ggcagcggca gcacctcggc agcacctcag cagcaacatg cccagcaaga agaatggaag 420 aagcggaccc caaccccata aaaggtgggt gttcactctg aataatcctt ccgaagacga 480 gcgcaagaaa atacgggatc ttccaatatc cctatttgat tattttattg ttggcgagga 540 gggtaatgag gaaggacgaa cacctcacct ccaggggttc gctaattttg taaagaagga 600 gacttttaat aaagtgaagt ggtatttggg tgcccgctgc cacatcgaga aagcgaaagg 660 aacagatcag cagaataaag aatactgcag taaagaaggc aacttactga tggagtgtgg 720 agctcctaga tctcagggac aacggagtga cctgtctact gctgtgagta ccttgttgga 780 gagcgggagt ctggtgaccg ttgcagagca gcaccctgta acgtttgtca gaaatttccg 840 cgggctggct gaacttttga aagtgagcgg gaaaatgcag aagcgtgatt ggaagactaa 900 tgtacacgtc attgtggggc cacctgggtg tggtaaaagc aaatgggctg ctaattttgc 960 agacccggaa accacatact ggaaaccacc tagaaacaag tggtgggatg gttaccatgg 1020 tgaagaagtg gttgttattg atgactttta tggctggctg ccctgggatg atctactgag 1080 actgtgtgat cgatatccat tgactgtaga gactaaaggt ggaactgtac cttttttggc 1140 ccgcagtatt ctgattacca gcaatcagac cccgttggaa tggtactcct caactgctgt 1200 cccagctgta gaagctcttt atcggaggat tacttccttg gtattttgga agaatgctac 1260 agaacaatcc acggaggaag ggggccagtt cgtcaccctt tcccccccat gccctgaatt 1320 tccatatgaa ataaattact gagtcttttt tatcacttcg taatggtttt tattattcat 1380 taagggttaa gtggggggtc tttaagatta aattctctga attgtacata catggttaca 1440 cggatattgt attcctggtc gtatatactg ttttcgaacg cagtgccgag gcctacgtgg 1500 tctacatttc cagtagtttg tagtctcagc cacagctgat ttcttttgtt gtttggttgg 1560 aagtaatcaa tagtggaatc taggacaggt ttgggggtaa agtagcggga gtggtaggag 1620 aagggctggg ttatggtatg gcgggaggag tagtttacat aggggtcata ggtgagggct 1680 gtggcctttg ttacaaagtt atcatctaga ataacagcac tggagcccac tcccctgtca 1740 ccctgggtga tcggggagca gggccag 1767PL 205 130 B1FIGURA 3SEQ ID No. 3 aattcaacct taaccttttt tattctgtag tattcaaagg gtatagagat tttgttggtc 60 ccccctcccg ggggaacaaa gtcgtcaata ttaaatctca tcatgtccac cgcccaggag 120 ggcgttctga ctgtggtagc cttgacagta tatccgaagg tgcgggagag gcgggtgttg 180 aagatgccat ttttccttct ccaacggtag cggtggcggg ggtggacgag ccaggggcgg 240 cggcggagga tctggccaag atggctgcgg gggcggtgtc ttcttctgeg gtaacgcctc 300 cttggatacg tcatagctga aaacgaaaga agtgcgctgt aagtattacc agcgcacttc 360 ggcagcggca gcacctcggc agcacctcag cagcaacatg cccagcaaga agaatggaag 420 aagcggaccc caaccacata aaaggtgggt gttcacgctg aataatcctt ccgaagacga 480 gcgcaagaaa atacgggagc tcccaatctc cctatttgat tattttattg ttggcgagga 540 gggtaatgag gaaggacgaa cacctcacct ccaggggttc gctaattttg tgaagaagca 600 aacttttaat aaagtgaagt ggtatttggg tgcccgctgc cacatcgaga aagccaaagg 660 aactgatcag cagaataaag aatattgcag taaagaaggc aacttactta ttgaatgtgg 720 agctcctcaa tctcaaggac aacggagtga cctgtctact gctgtgagta ccttgttgga 780 gagcgggagt ctggtgaccg ttgcagagca gcaccctgta acgtttgtca gaaatttccg 840 cgggctggct gaacttttga aagtgagcgg gaaaatgcag aagcgtgatt ggaagaccaa 900 tgtacacgtc attgtggggc cacctgggtg tggtaaaagc aaatgggctg ctaattttgc 960 agacccggaa accacatact ggaaaccacc tagaaacaag tggtgggatg gttaccatgg 1020 tgaagaagtg gttgttattg atgactttta tggctggctg ccgtgggatg atctactgag 1080 actgtgtgat cgatatccat tgactgtaga gactaaaggt ggaactgtac cttttttgtc 1140 ccgcagtatt ctgattacca gcaatcagac cccgttggaa tggtactcct caactgctgt 1200 cccagctata gaagctctct atcggaggat tacttccttg gtattttgga agaatgctac 1260 agaacaatcc acggaggaag ggggccagtt cgtcaccctt tcccccccat gccctgaatt 1320 tccatatgaa ataaattact gagtcttttt tatcacttcg taatggtttt tattattcat 1380 ttagggttta agtggggggt ctttaagatt aaattctctg aattgtacat acatggttac 1440 acggatattg tagtcctggt cgtatatact gttttcgaac gcagtgccga ggcctacgtg 1500 gtccacattt ctagaggttt gtagcctcag ccaaagctga ttccttttgt tatttggttg 1560 gaagtaatca atagtggagt caagaacagg tttgggtgtg aagtaacggg agtggtagga 1620 gaagggttgg gggattgtat ggcgggagga gtagtttaca tatgggtcat aggttagggc 1680 tgtggccttt gttacaaagt tatcatctag aataacagca gtggagccca ctcccctatc 1740 accctgggtg atgggggagc agggccag 1768PL 205 130 B1FIGURA 4SEQ ID No. 4 aattcaacct taacctttct tattctgtag tattcaaagg gtatagagat tttgttggtc 60 ccccctcccg ggggaacaaa gtcgtcaatt ttaaatctca tcatgtccac cgcccaggag 120 ggcgttgtga ctgtggtacg cttgacagta tatccgaagg tgcgggagag gcgggtgttg 180 aagatgccat ttttccttct ccaacggtag cggtggcggg ggtggacgag ccaggggcgg 240 cggcggagga tctggccaag atggctgcgg gggcggtgtc ttcttctgcg gtaacgcctc 300 cttggatacg tcatagctga aaacgaaaga agtgcgctgt aagtattacc agcgcacttc 360 ggcagcggca gcacctcggc agcacctcag cagcaacatg cccagcaaga agaatggaag 420 aagcggaccc caaccacata aaaggtgggt gttcacgctg aataatcctt ccgaagacga 480 gcgcaagaaa atacgggagc tcccaatctc cctatttgat tattttattg ttggcgagga 540 gggtaatgag gaaggacgaa cacctcacct ccaggggttc gctaattttg tgaagaagca 600 aacttttaat aaagtgaagt ggtatttggg tgcccgctgc cacatcgaga aagccaaagg 660 aactgatcag cagaataaag aatattgcag taaagaaggc aacttactta ttgaatgtgg 720 agctcctcga tctcaaggac aacggagtga cctgtctact gctgtgagta ccttgttgga 780 gagcgggagt ctggtgaccg ttgcagagca gcaccctgta acgtttgtca gaaatttccg 840 cgggctggct gaacttttga aagtgagcgg gaaaatgcag aagcgtgatt ggaagaccaa 900 tgtacacgtc attgtggggc cacctgggtg tggtaaaagc aaatgggctg ctaattttgc 960 agacccggaa accacatact ggaaaccacc tagaaacaag tggtgggatg gttaccatgg 1020 tgaagaagtg gttgttattg atgactttta tggctggctg ccgtgggatg atctactgag 1080 actgtgtgat cgatatccat. tgactgtaga gactaaaggt ggaactgtac cctttttggc 1140 ccgcagtatt ctgattacca gcaatcagac cccgttggaa tggtactcct caactgctgt 1200 cccagctgta gaagctctct atcggaggat tacttccttg gtattttgga agaatgctac 1260 agaacaatcc acggaggaag ggggccagtt cgtcaccctt tcccccccat gccctgaatt 1320 tccatatgaa ataaattact gagtcttttt tatcacttcg taatggtttt tattattcat 1380 ttagggttta agtggggggt ctttaagatt aaattctctg aattgtacat acatggttac 1440 acggatattg tagtcctggt cgtatttact gttttcgaac gcagcgccga ggcctacgtg 1500 gtccacattt ccagaggttt gtagtctcag ccaaagctga ttccttttgt tatttggttg 1560 gaagtaatca atagtggagt caagaacagg tttgggtgtg aagtaacggg agtggtagga 1620 gaagggttgg gggattgtat ggcgggagga gtagtttaca tatgggtcat aggttagggc 1680 tgtggccttt gttacaaagt tatcatctag aataacagca gtggagccca ctcccctatc 1740 accctgggtg atgggggagc agggccag 1768PL 205 130 B1FIGURA 5SEQ ID No. 5 aattcatatt tagcctttct aatacggtag tattggaaag gtaggggtag ggggttggtg 60 ccgcctgagg gggggaggaa ctggccgatg ttgaatttga ggtagttaac attccaagat 120 ggctgcgagt atcctccttt tatggtgagt acaaattctg tagaaaggcg ggaattgaag 180 atacccgtct ttcggcgcca tctgtaacgg tttctgaagg cggggtgtgc caaatatggt 240 cttctccgga ggatgtttcc aagatggctg cgggggcggg tccttcttct gcggtaacgc 300 ctccttggcc acgtcatcct ataaaagtga aagaagtgcg ctgctgtagt attaccagcg 360 cacttcggca gcggcagcac ctcggcagcg tcagtgaaaa tgcoaagcaa gaaaagcggc 420 ccgcaacccc ataagaggtg ggtgttcacc cttaataatc cttccgagga ggagaaaaac 480 aaaatacggg agcttccaat cteccttttt gattattttg tttgcggaga ggaaggtttg 540 gaagagggta gaactcctca cctccagggg tttgcgaatt ttgctaagaa gcagactttt 600 aacaaggtga agtggtattt tggtgcccgc tgccacatcg agaaagcgaa aggaacogac 660 cagcagaata aagaatactg cagtaaagaa ggccacatac ttatcgagtg tggagctccg 720 cggaaccagg ggaagcgcag cgacctgtct actgctgtga gtaccctttt ggagacgggg 780 tctttggtga ctgtagccga gcagttccct gtaacgtatg tgagaaattt ccgcgggccg 840 gctgaacttt tgaaagtgag cgggaagatg cagcagcgtg attggaagac agctgtacac 900 gtcatagtgg gcccgcccgg ttgtgggaag agccagtggg cccgtaattt tgctgagcct 960 agggacacct actggaagcc tagtagaaat aagtggtggg atggatatca tggagaagaa 1020 gttgttgttt tggatgattt ttatggctgg ttaccttggg atgatctact gagactgtgt 1080 gaccggtatc cattgactgt agagactaaa gggggtactg ttcctttttt ggcccgcagt 1140 attttgatta ccagcaatca ggccccccag gaatggtact cctcaactgc tgtcccagct 1200 gtagaagctc tctatcggag gattactact ttgcaatttt ggaagactgc tggagaacaa 1260 tccacggagg tacccgaagg ccgatttgaa gcagtggacc caccctgtgo ccttttccca 1320 tataaaataa attactgagt cttttttgtt atcacatcgt aatggttttt atttttattt 1380 atttagaggg tcttttagga taaattctct gaattgtaca taaatagtca gccttaccac 1440 ataattttgg gctgtggctg cattttggag cgcatagccg aggcctgtgt gctcgacatt 1500 ggtgtgggta tttaaatgga gccacagctg gtttcfttta ttatttgggt ggaaccaatc 1560 aattgtttgg tccagctcag gtttgggggt gaagtacctg gagtggtagg taaagggctg 1620 ccttatggtg tggcgggagg agtagttaat ataggggtca fcaggccaagt tggtggaggg 1680 ggttacaaag ttggcatcca agataacaac agtggaccca acacctcttt gattagaggt 1740 gatggggtct ctggggtaa 1759PL 205 130 B1FIGURA 6SEQ ID No. 6 accagcgcac ttcggcagcg gcagcacctc ggcagcacct cagcagcaac atgcccagca 60 agaagaatgg aagaagcgga ccccaaccac ataaaaggtg ggtgttcacg ctgaataatc 120 cttccgaaga cgagcgcaag aaaatacggg agctcccaat ctccctattt gattatttta 180 ttgttggcga ggagggtaat gaggaaggac gaacacctca cctccagggg ttcgctaatt 240 ttgtgaagaa kcaaactttt aataaagtga agtggtattt gggtgcccgc tgccacatcg 300 agaaagccaa aggaactgat cagcagaata aagaatattg cagtaaagaa ggcaacttac 360 ttattgaatg tggagctcct cgatctcaag gacaacggag tgacctgtct actgctgtga 420 gtaccttgtt ggagagcggg agtctggtga ccgttgcaga gcagcaccct gtaacgtttg 480 tcagaaattt ccgcgggctg gctgaacttt tgaaagtgag cgggaaaatg cagaagcgtg 540 attggaagac caatgtacac gtcattgtgg ggccacctgg gtgtggtaaa agcaaatggg 600 ctgctaattt tgcagacccg gaaaccacat actggaaacc acctagaaac aagtggtggg 660 atggttacca tggtgaagaa gtggttgtta ttgatgactt ttatggctgg ctgccgtggg 720 atgatctact gagactgtgt gatcgatatc cattgactgt agagactaaa ggtggaactg 780 tacctttttt ggcccgcagt attctgatta ccagcaatca gaccccgttg gaatggtact 840 cctcaactgc tgtcccagct gtagaagctc tctatcggag gattacttcc ttggtatttt 900 ggaagaatgc tacagaacaa tccacggagg aagggggcca gttcgtcacc ctttcccccc 960 catgccctga atttccatat gaaataaatt actgagtcyt ttttatcact tcgtaatggt 1020 ttttattatt catttagggg ttaagtgggg ggtctttaag attaaattcc ctgaattgta 1080 catacagggt tacacggata ttgtagtcct ggtcgtattt actgttttcg aacgcagtgc 1140 cgaggcctac gtggtccaca tttctagagg tttgtagcct cagccaaagc tgattccttt 1200 tgttatttgg ttggaagtaa tcaatagtgg agtcaagaac aggtttgggt gtgaagtaac 1260 gggagtggta ggagaagggt tgggggattg tatggcggga ggagtagttt acatatgggt 1320 catatgtttg ggctgtggcc tttggtacaa agttatcatc tagaataaca gcagtggagc 1380 ccactcccct atcaccctgg gtgatggggg agcagggcca gaattcaacc ttaacctttc 1440 ttattctgta gtattcaaag ggtatagaga ttttgttggt cccccctccc gggggaacaa 1500 agtcgtcaat tttaaatctc atcatgtcca ccgcccagga gggcgttgtg actgtggtac 1560 gcttgacagt atatccgaag gtgcgggaga ggcgggtgtt gaagatgcca tttttccttc 1620 tccaacggta gcggtggcgg gggtggacga gccaggggcg gcggcggagg atctggccaa 1680 gatggctgcg ggggcggtgt cttcttctgc ggtaacgcct ccttggatat gtcatagctg 1740 aaaacgaaag aagtgcgctg taagtatt 1768PL 205 130 B1FIGURA 7SEQ ID No. 7 accagcgcac ttcggcagcg gcagcacctc agaagaatgg aagaagcgga ccccaaccac cttccgaaga cgagcgcaag aaaatacggg ttgttggcga ggagggtaat gaggaaggac ttgtgaagaa gcaaactttt aataaagtga agaaagccaa aggaactgat cagcagaata ttattgaatg tggagctcct cgatctcaag gtaccttgtt ggagagcggg agtctggtga tcagaaattt ccgcgggctg gctgaacttt attggaagac caatgtacac gtcattgtgg ctgctaattt tgcagacccg gaaaccacat atggttacca tggtgaagaa gtggttgtta atgatctact gagactgtgt gatcgatatc tacctttttt ggcccgcagt attctgatta cctcaactgc tgtcccagct gtagaagctc ggaagaatgc tacagaacaa tccacggagg catgccctga atttccatat gaaataaatt ttttattatt catttagggg ttaagtgggg catacatggt tacacggata ttgtagtcct cgaggcctac gtggtccaca tttctagagg tgttatttgg ttggaagtaa tcaatagtgg gggagtggta ggagaagggt tgggggattg cataggttag ggctgtggcc tttggtacaa ccactcccct atcaccctgg gtgatggggg ttattctgta gtattcaaag ggtatagaga agtcgtcaat tttaaatctc atcatgtcca gcttgacagt atatccgaag gtgcgggaga tccaacggta gcggtggcgg gggtggacga gatggctgcg ggggcggtgt cttcttctgc aaaacgaaag aagtgcgctg taagtatt ggcagcacct cagcagcaac atgcccagca 60 ataaaaggtg ggtgttcacg ctgaataatc 120 agctcccaat ctccctattt gattatttta 180 gaacacctca cctccagggg ttcgctaatt 240 agtggtattt gggtgcccgc tgccacatcg 300 aagaatattg cagtaaagaa ggcaacttac 360 gacaacggag tgacctgtct actgctgtga 420 ccgttgcaga gcagcaccct gtaacgtttg 480 tgaaagtgag cgggaaaatg cagaagcgtg 540 ggccacctgg gtgtggtaaa agcaaatggg 600 actggaaacc acctagaaac aagtggtggg 660 ttgatgactt ttatggctgg ctgccgtggg 720 cattgactgt agagactaaa ggtggaactg 780 ccagcaatca gaccccgttg gaatggtact 840 tctatcggag gattacttcc ttggtatttt 900 aagggggcca gttcgtcacc ctttcccccc 960 actgagtctt ttttatcact tcgtaatggt 1020 ggtctttaag attaaattct ctgaattgta 1080 ggtcgtattt actgttttcg aacgcagtgc 1140 tttgtagcct cagccaaagc tgattccttt 1200 agtcaagaac aggtttgggt gtgaagtaac 1260 tatggcggga ggagtagttt acatatgggt 1320 agttatcatc tagaataaca gcagtggagc 1380 agcagggcca gaattcaacc ttaacctttt 1440 ttttgttggt cccccctccc gggggaacaa 1500 ccgcccagga gggcgttgtg actgtagtac 1560_ ggcgggtgtt gaagatgcca tttttccttc 1620 gccaggggcg gcggcggagg atctggccaa 1680 ggtaacgcct ccttggatac gtcatagctg 17401768PL 205 130 B1PL 205 130 B1PL 205 130 B1PL 205 130 B1PL 205 130 B1PL 205 130 B1FIGURA 2.1AHindlll (1)1. AAGCTTCTATCAAAAGTCTTAATGAGTTAGGTGTAGATAGTATAGATATTACTACAAAGGTA.TTCATATT71 TCCTATCAATTCTAAAGTAGATGATATTAATAACTCAAAGATGATGATAGTAGATAATAGATACGCTCAT1 4 ATAATGACTGCAAATTTGGACGGTTCACATTTTAATCATCACGCGTTCATAAGTTTCAACTGCATAGATC211 AAAATCTCACTAAAAAGATAGCCGATGTATTTGAGAGAGATTGGACATCTAACTACGCTAAAGAAATTAC2 Β1 AGTTATAAATAATACATAATGGATTTTGTTATCATCAGTTATATTTAACATAAETACAATAAAAAGTATT351 AAArAAAAATACTTACTTACGAAAAAATGTCATTATTACAAAAACTAIATnTACAGAACAATCTATAGT l'Met Ser LeuLeuGI nLysLeuTy rPheThr Gl uGI nSer 11 eVa421 AGAGTCCTTTAAGAGTTATAATTTAAAAGATAACCATAATGTAATATTTACCACATCAGATGATGATACT 15> I Gl uSer PheLysSer TyrAsnLeuLysAspAsnHi sAsnVal 11 ePheThi Thr SerAspAspAspThr491 GTTGTAGTAATAAATGAAGATAATGTACrGTTATCTA.CAAGATTATTATCATTTGATAAAATTCTGTTTT 39' Val Val Val I I eAsnGI uAspAsnVal LeuleuSerThf ArgLeuLeuSer PheAspLysI 1 eLeuPheP561 TTAACTCCTTTAATAACGGTrTATCAAAATACGAAACTATTAGTGATACAiłTASTAGATATAGATAOTCA 62► heAsnSer PheAsnAsnGI yLeuSer LysTy rGI uThr 11 eSerAspThr 11 eLeuAsp 11 eAspThr Hi631 TAATTATTATATACCTAGTTGTTCTTCTTTGTTA.GATATTCTAAAAAAAAGAGCGTGTGATTTAGAATrA 85' sAsnTy rTy r I I eProSer Ser Ser Ser LeuLeuAspl I eLeuLysLysArgAl aCysAspLeuGI uLeu701 GAAGAT-CIAAATTATGCGTTAATAGGAGACAATAGTAACTTA.TATTATAAAGATATGACTTACATGAATA 109' Gl uAspLeuAsnTyr Al aLeul I eGI yAspAsnSerAsnLeuTy rT yrlysAspMetThr TyrMetAsnA771. ATTGGTTATTTACTAAAGGATTATTAGArrACAAGTTTGTATTATTGCGCGATGTAGATAAATGTTACAA 132' snT rpLeuPheThr LysGI yLeuLeuAspTy rLysPheVal LeuLeuArgAspValAspLysCysTyrLyNrut (880) - Ndel (901)841. ACAGTATAATAAAAAGAATA.CTATAATAGATATAATACATCGCGATAACAGACAGTATAACATATGGGTT 155' sGI nTyrAsnLysLysAsnThr 11 el I eAsp 11 el I eHi sArgAspAsnArgGI nTyrAsnl I eT rpVal913 AAAAATGTTATAG^JACTGTTCTCCTGGCTATATATTATGGTTACATGATCTAAAAGCCGCTGCrGAAG 179 ► LysAsnVa I 11 eGI uTyrCysSer ProGI yTy r 11 eleuT rpLeuHi sAspLeuLysAl aAI a Al aGl uA9 81 ATGATTGGrTAAGATACGATAACCGTATAAACGAATTATCTGCGGATAAATTATACACTTTCGAGlTCAT 202' spAspT rpLeuArgTyrAspAsnArg 11 eAsnGI uLeuSer Al aAspLysLeuTyrThr PheGI uPhel I1051 AGTTATATTAGAAAATAATA.TAAAACATTTACGAGTAGGTACAATAATTGTACATCCAAACAAGATAATA 225' eVa I 11 eLeuGI uAsnAsnl I eLysHi sLeuArgVal Gl yThr 11 el I eVat Hi sProAsnLysI I el I e1121 GCTAATGGTACJ^rCTAATAATATACTTACTGArTTTCTATCTTACGTAGAAGAACTAATATATCATCATA 249'Al aAsnGl yThr SerAsnAsnl l eLeuThrAspPheLeuSer T yrVa I Gl uGI uLeul I eTy rHi sHi sAEcoRI (1223)1191 ATTCATCTATAATATTGGCCGGATATTTTTTAGAMlTCTTTGAGACCACTATTTTATCASAATTTAnTC 272' snSer Serl leli eLeuAl aGlyTyrPneLeuGl uPhePheGI uThrThr 11 eLeuSer Gl uPhel I eSe1261 TTGATCTTCTGAATGGGTAATGAATAGTAACTGTTTAGTACACCTGAAAACAG33TA.TGAA&CTATACTC 295' r Ser Ser Ser Gl uT rpVa IMelAsnSer AsnCysLeuVa 1 Hi sLeuLysThr Gl yTyrGI uAl al I eLeu1331 TTTGATGGTAGTTTA.TTmCCAACTCTGTACTAAAAGCAAlTA.TGTAAAATATTGGACAAAGAAAACTr 319' PheAspAI aSer LeuPhePheGI nLeuSer Thr LysSerAsnTyrVa I LysTy rT rpThr LysLysThr L1401 TGCAGTATAAGAACITrTTTAAAGACGGTAAACAGTrAGCAAAATATATAATTAAGAAAGATAGTCAGGT 342' euGI nT yrLysAsnPhePheLysAspGI y LysGI nLeuAlalysTy r I leli eLysLysAspSer Gl nVaPL 205 130 B1FIGURA 2.1B1473 GATAGATAGAGTATGTTATTTACACGCAGCTGTATATAATCACGTAACTTACTTAATGGATACGTTTAAA 365> I 11 eAspArg Va I CysTy rLeuHi sAl aAI aVa 1 Tyr AsnHi sVa I Thr Ty rLeuMetAspThr Phelys1541 attcctggttttgattttaaattctccggaatgatagatatactactgtttggaata^gcataaggata389» I I eProGI yPheAspPhelysPheSer Gl yMet 11 eAsp I I eLeuLeuPheGI y 11 eLeuHi sLysAspA1611 ATGAGAATATATTTTATCCGAAACGTGTTTCTGTAACTAATATAATATCAGAATCTATCTATGCAGAITr 412» snGI uAsnl I ePheT y rP roLys ArgVal Ser Va I Thr Asn I leli eSer Gl uSer 11 eTyr Al aAspPb1681 TTACTrTATATCAGATGTTAATAAATTCAGTAAAAAGATAGAATATAAAACTATCTrrCCTPTACTCGCA 435» eT y rPhe 11 eSer AspVa I AsnLysPheSer LysLys 11 eGI uTyrLysThr Met PheProŃ eLeuAI a1751 GAAAAOTACTATCCAAAAGGAAGGCCCTATTTTACACATACATCTAACGAAGATCTTCTGTCTATCTGTT 459» Gl uAsnTy rTy rProlysGI yA rgProTyrPheThr Hi sThr SerAsnGI uAspLeuLeuSer I I eCysL1821 TATGCGAAGTAACAGTTTGTAAAGATAIAAAAAATCCATTATTATATTCTAAAAAGGATATOTCAGCAAA 482» euCysGI uValThr Val CysLysAspl I eLysAsnProLeuLeuTyrSer LysLysAspl I eSer Al aLy1893 ACGATTCATAGGTTTATTTACATCTCTCGATATAAATACGGCTGTTGAGTTAAGAGGATATAAAATAAGA 505» sArgPhe I I eGI yLeuPheThr Ser ValAspl I eAsnThr Al aVal Gl uLeuArgGi yTy rLys 11 eArg1961 gtaataggatgtttagaatggcctgaaaagataaaaatatttaattctaatcctacatacattagattat529» Va I 11 eGI yCysLeuGl uT rpProGi uLys 11 eLys 11 ePheAsnSerAsnProThr Tyrl I eArgleuL2031 TACTAACAGAAAGACGTTTAGATArrCTACATTCCTATCTGCrTAAATrTAATATAACAGAGGATATAGC 552 euLeuThr Gl uArgArgLeuAspl I eLeuHi sSer TyrLeuleuLysPheAsnl I eThr Gl uAspl I eAI2101 TACCAGAGAIGGAGTCAGAAATAAOTACCTATAATITCITTTATCGTCAGTTAffTGTAGArCGTATacr 575» aThrArgAspGI yVaiA rgAsnAsnLeuProl leli eSer Phel I eVal Ser TyrCysArgSer TyrThrNdel (2169)2171 TATAAATTACTAAATrGCCATATCTAĆAATTCGTGTAAGATAACAAAGTGTAAAlATAATCAGGTAATAT 599 TyrLysLeuLeuAsnCysHi sMelTyrAsnSer CysLys 11 eThr LysCysLysTyrAsnGI nVal 11 eT2241 ATAATCCTATATAGGAGTATATATAiJTGAAAAAGTAAAATATAAATCAIATAATAAIGAAACGAAATAT 622»yrAsnProl I e* · ·2311 CAGTAATAGACAGGAACTGGCAGATTCTTOTCTAATGAAGTAAGTACTGCTAAATCTCCAAAATTAGAr 2381 AA&AATGATACAGCAAATACAGCTTCATTCAACGAArTACCTTTTAATTTTTTCAGACACACCTTATrAC 245.1 AAACTAACTAAGTCAGATGATGAGAAAGTAAATATAAATTTAACTTATGGGTAZAATATAATAAAGATTC 2521 ATGATATTAATAATTTACTTAACGATGTTAATAGACTTATTCCATCAACCCCTTCAAACCTTTCTGGATA 2591 ITATAAAATACCAGTTAATGATATTAAAATAGATTGTTTAAGAGATGTAAATAArTATTTGGAGGTAAAG 2661 <»TATAAAOTAGTCTATCTTTCACATGGAAATGAATTACCTAATArrAATAAlTATGATAGGAATmT 2731 TAGGATTTACAGCTGTOATATGTATCAACAATACAGGCAGATCTATGGTTATGGTAAAACACTGTAACGG 2801 GAAGCAGCAITCTATGGTAACTGGGCTATGITrAATAGCa^GATCAlTTTACTCTAJAAACATTTTACCABamHI (2880)2871 CAAATAAIAGGATCCTCTAGATATTTAArATTATATCTAACAACAACAAAAAAAITTAACGATGTATGGC 2941 CAGAAGTATTTTCTACTAATAAAGATAAAGATAGTCTA.TCTTATCTACAAGATATGAAAGAAGATAATCA 301. TTTAGTACTAGOTACTAATATGGAAAGAAATGTATACAAAAACGTGGAAGCmTATATTAAATAGCATA 2 081 TTACTAGAAGATTTAAAATCTAGACTTAGTATAACAAAACAGTTAAATGCCAATATCGATTCTATATTTCPL 205 130 B1FIGURA 2.1C3153 ATCATAACAGTAGTACATTAATCAGTGATATACTGAAACGATCTACAGACTCAACTATGCAAGGAATAAG 322:. CAATATGCCAATTATGTCTAATATTTTAACTTTAGAACTAAAACGTTCTACCAATACTAAAAATAGGATA 3291 CGTGATAGGCTGTTAAAAGCTGCAATAAATAGTAAGGATGTAGAAGAAATACTTrGTTCTATACCTTCGG 3361 AGGAAAGAACTTTAGAACAACTTAAGTTTAATCAAACTTGTATTrATGAACACTATAAAAAAATrATGGA 3433. AGATACAAGTAAAAGAATGGATGTTGAATGTCGTAGTTTAGAACATAACTATACGGCTAAOTTATAIAAA 3503. GTGTACGGACAAAACGAATATATGATTACTTATATACTAGCTCTCATAAGTAGGATTAATAATA1TATAG 3573 AAACTTTAAAATATAATCTGGTGGGGCTAGACGAATCTACAATACGTAATiiTAAATTATATAATTTCACA 3643 AAGAACAAAAAAAAATCAAGTTTCTAATACCTTAIAGATAAACTArATTTlTTACCACTGAPL 205 130 B1PL 205 130 B1FIGURA 2.3Kpnl (l)1 GGTACCTrCATAAATACAAGTITGATTAAACTTAAGTTGTTCTAAAGTTCTTTCCTCCGAAGGTATAGAA 71 CAAAGTATTTCTTCTACATCCTTACTATTTATTGCAGCTTTTAACAGCCTATCACGTATCCTATTTITAG 141 TATTGGTAGAACGTTTTAGTTOTAAAGTTAAAATATTAGACATAATTGGCATA1TGCTTA.TTCCTTGCAT 211 agttgagtctgtagatcgtttcagtatatcactgattaatgtactaotgttatgatgaaatatagaatcg 281 atattggcatttaactgttttgttatactaagtctagattttaaatcttctagtaatatgctatttaata351 TAAAAGL-iuCCACGlTnu-uTATAGAli-icinnCCATATTAGTAGCTACTACTAAATGATTATCTTCTrr421. CATATCTTGTAGATAAGATAGACTATCTTTATCTTTATTAGTAGAAAATACTTCTGGCCATACATCGTTA _ BamHI (532)491.---------------561 TAGAGTAAAATGATCTGGCTATTAAACATAGGCCAGTTACCATAGAATGCrGCTrCCCGTTACAGTGTrT 631 TACCATAACCATAGATCTGCCTGTATTG7TGATACATATAACAGCTGTAAATCCTAAAAAATTCCTATCA 702 TAATTATIAATAITAGGTAATTCATTTCCATGTGAAAGATAGACTAATmATArCCTTTACCTCCAAAT 772 ^ITATTTACATCTCTTAAAaiArCTATTrrAATATCATTAACTGGTAaTrrAIAATATCCAGAAAGGTT 841 TGAAGGGG7TGATGGAATAAGTCTA2TAACATCGTTAAGTAAATTATTAATATCATGAA.TCTTTATTATA 911 TTATACCCArAAGTTAAATTTATATTTACTTTCTCATCATCTGACTTAGTOAGTTTGTAATAAGGTGTGT 981 CTGmAAAAATTAAAAGGTAATTCGTTGAATGAAGCTGTATTTGCTGTA.TCATTITTATCTAATTTTGGAG 1051 ATTTAGCAGTACTTACTTCATrAGAAGAAGAATCTGCCAGTTCCTGTCTATTACTGATATTTCGTTTCAT _ _ EcoRl (11121. TATTATATGATTTATATTTTACTTTTTCAATTATATAIACTCATTTGACTAGTTAATCAATAAAAAGAAT 1191 TCCTGCAGCCCTGCAGCTAAITAATTAAGCTACAAATAGTTiCGmTCACCTTGTCTAATAACTAAraABamHI (1266)12 61 ATTAAGGATCCCCCAGCTTCTTTATTCTATACTTAAAAAGTGAAAATAAATACAAAGGTTdTGAGGGTT EcoRV (1378) . Nrul (1374)1331 GTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAATTATTrCATTATCGCGATATCOGTTAAGTTTGTATCGT1401 AATGACG1ATCCAAGGAGGCGTTACCGCAGAAGAAGACACCGCCCCCGCAGCCATCTTGGCCAGATCCTC 1> Met Thr Ty rProArgArgArgTyrArgArgArgArgHi sArgProArgSer Hi sLeuGI yGI ni I eLeu1471 CGCCGCCCCCCCTGGCTCGTCCACCCCCGCCACCGCTACCGTTGGAGAAGGAAAAATGGCATCTTCAACA 24> ArgArgArgProT rpLeuVal Hi sProArgHi sArgTyrArgT rpArgArgLysAsnGI y I i ePheAsnT1541 CCCGCC7CTCCCGGACCTTCGGATATA.CTGTCAAGCGTACCACAGTCACAACGCCCTCCTGGGCGGTGGA 471» hr ArgLeuSerArgThr PheGI yTyrThrVa I LysArgThrThr VaIThrThr ProSerTrpAi aValAsSmal (1644)1611 CATGATGAGATT?AAAATTGACGACmGTTCCCCCGGGAGGGGGGACCAACAAAATCTCTA.TACCCm 701 pMetMetArgPheLys I1 eAspAspPheVa I ProProGl yGI yGI yThrAsnlys I I eSer 11 eProPhePL 205 130 B1EeoRV (274 B) Ncol (2671)FIGURA 2.4 pnl (653)PES-SK+ lamHI (1184) pJP105 (5619 bp)Prawe ramie C6EcoRI (1839) BamHI (1916)Nrul (2026) EcoRV (2030) Sacl (2153)Bell (2320) Sacl (2376)Sacl (3410)· Notl (3402)·Smal (3005) Sali (2999) Ndel (2979)PL 205 130 B1PL 205 130 B1FIGURA 2.6AKpnl (1)1 ggtaccttcataaatacaagtttgattaaacttaagttgttctaaagttctttcctccgaaggtatagaa 71 CAAAGTArrTCTTCTACATCCTTJO-ArrrArrGCAGCTTlTAACAGCCTATCACGTATCCTAITTrrAG 141 TATTGGTAGAACGTrrTAGTTCTAAAGTTAAAATATTAGACATAATTGGCATATrGCTTATTCCTTGCAT211 AGTTGAGTCTGTAGATCGTTTCAGTATATCACTGATTAATGTACTACTGTrATGKTGAAATATAGAATCG 281 ATATTGGCATTTAACTGTTOTGTTATACTAAGTCTAGATmAAATCTTCTAGTAAIATGCTATTTAATA 351 AAAAGCTTCCACGTTTTTGTATACATTTCTTTCCATATTAGTAGCTACTACTAAATGATTATCTTCTTT 421 CATATCTTGTAGATAAGATAGACTATCTTTATCTTTATTAGTAGAAAATACTTCTGGCCATACATCGTTA _ BamHI (532)491 AATrTTTTTGTTGTTGTTAGATATAATATTAAATATCTAGAGGATCCTATTATTTGTGGTAAAATGTTTA 562 TAGAGTAAAATGATCTGGCTAOTAAACATAGGCCAGTTACCATAGAATGCTGCTTCCCGTTACAGTGTTT 631 TACa^AACCATAGATCTGCCTGTATTGTTGATACATAIAACAGCTGTAAATCCTAAAAAAITCCTATCA 703 TAATTATIAATA2TAGG33WOTC3OTTCCAIGTGAAAaA3AGACTAATTTiaTKrCCrrTACCTCCAA»r 772 AATTA.TTTACA.TCTCTTAAACAATCTAUTnTAArATCATTAACTGGTATnTATAAirATCCAGAAAGGTT 841 TGAAGGGGTTGATGGAATAAGTCTAOTAACATCGlTAAGTAAATTATTAATATCATGAATCTTTATTArA 911 TTA.TACCCATAAG7TAAATTTATA.TTTACITTCTCATCATCTGACTTAGrXAGTTTGTAATAAGGTGTGT 981 CTGAAAAiA.TTAAAAGGTAATTCGTIGAATGAAGCTGTATITGCTGTATCATTTTTATCTAArTTTGGAG1121 TArTArATGArTTATATrrTACrrrTrCAATTATATArACTCATTrGACTAGTTAATCAATAAAAAGAAT1191 TTCGACTTAGGGTrrAAGTGGGGGGTCTTTAAGATTAAATTCTCTGAATrGTACATACATGGTTACACGG 223< P roLysLeuProProAspLysLeuAsnPheGI uArgPneGl nValTyrMetThr ValA rg IStut (1306)1261 ATATTGTAGTCCTGGTCGTATTTACTGTrrrCGAACGCAGCGCCGAGGCCTACGTGGTCCACATTTCCAG212 < I eAsnTyrAspGl nAspT yrlysSerAsnGI uPheAl aAI aGI yLeuGI yVal Hi sAspYalAsnGI ySe ” 1894 r Thr Gl nLeuArgLeuT rpLeuGI nAsnArgLysAsnAsnProGI nPheTyrAspl l eThr SerAspLeu1401 aacaggtitgggtgtgaagtaacgggagtggtaggagaagggttgggggattgtatggcgggaggagtag166< Val ProLysProTnr PheTyrArgSer Hi sTyrSer PheProGI nProli eThr Hi sArgSer Ser Tyr A Ndel (1475)1471 TTTACATATGGGTCATAGGTTAGGGCTGTGGCCTTTGTTACAAAGTTATCA3GTAGAATAACAGCAGTGG 142 < snVat Ty rProAspTyrThr LeuAI aThr Al aLysThr Val PheAsnAspAspLeu l I eVal At aThr SeEcoRI (1584)1541 AGCCCAerCCCCTATCACCCTGGGTGATGGGGGAGCAGGGCCAGAATTCAACCTTAACCTTrCTTATTCT 1194 t Gl yVa I Gl yA rgAspGI yGI nThr 11 eProSer CysProT rpPheGl uVal LysVa I Lys Arg 11 eArgSmal (1651)1611 gtagtattcaaagggtatagagattttgttggtcccccctcccgggggaacaaagtcgtcaattttaaat964TyrTyrGluPheProi leSer 11 eLysAsnThr Gl yGI yGIyProProVaI PheAspAspI I eLysPheAPL 205 130 B1FIGURA 2.6B16 8 _ CTCA.TCATGTCCACCGCCCAGGAGGGCGTTGTGACTGTGGTACGCTTGACAGTATATCCGAAGGTGCGGG 72<r gMelMetAspValAI aT rpSer PtoThr Thr Val Thr Thr ArglysVal Thr Ty rGI yPheThr ArgSe1751 agaggcgggtgttgaagatgccatttttccttctccaacggtagcggtggcgggggtggacgagccaggg4?« r LeuArgThrAsnPhel I eGI yAsnLysArgArgT rpArgTyrArgHi sArgP roHi sVa I LeuT rpPro1821 gcggcggcggaggatctggccaagatggctgcgggggcggtgtcttcttotgcggtaacgcctccttgga24 A rgArgArgLeu I I eGI nGI yLeuHi sSer A rgProArgHi sArgArgArgArgTyrArgArgArgProTNrul (1821)EcoRV (1917)1893 TACGTCATrACGATACAAACTTAACGGATATCGCGATAATGAAATAATTTATGATTATTTCTCGCTTOCA y rThrMet1961 ATTTAACACAACCCTCAAGAACCTTTGTA3TOATTTTCACTTTTTAAGTATAGAATAAAGAAGCTGGGGG 2031BamHI (2112)2101 TAATTAATTAAGGATCCCCCAGCTrCTTTATTCTATACTTAAAAAGTSAAAATAAArACAAAGGTTCTTGEcoRV (2224)Nrul (2220)2171 AGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAATTATTTCATTATCGCGAIATCCGTrAACTTTG2241 TATCGTAATGCCCAGCAAGAAGAATGGAAGAAGCGGACCCCAACCKCATAAAAGGTGGGTGTTCACGCTG l>Me1 ProSer LysLysAsnGI yArgSer GlyProGI nProHi sLysArgT rpVal PheThrLeuSacl (2347)2311 AATAATCCTTCCGAAGACGAGCGCAAGAAAATACGGGAGCTCCCAATCTCCCTA.TTTGATTA.TTTTATTG 21 > AsnAsnProSer Gl uAspGI uArgLysLys I I eArgGI uLeuProl I eSer LeuPheAspTyrPhel I eV2383 TTGGCGAGGAGGGTAATGAGGAAGGACGAACACCTCACCTCCAGGGGTTCGCTAATTTTGTGAAGAAGCA 45» al Gl yGI uGl uGI yAsnGI uG! uGI yA rgThr ProHi sLeuGI nGI yPheAl aAsnPheVal LysLysGI _ Bell (2514)2453 aacttttaataaagtgaagtggtatttgggtgcccgctgccacatcgagaaagccaaaggaactgatcag68> nThr PheAsnLysValLysT rpTyrLeuGlyAI a Arg CysHisI I eGI uLysAl aLysGI yThrAspGI nSacl (2570)2523 CAGAATAAAGAATArTGGAGTAAAGAAGGCAACTTACTTATTGAATGTGGAGCTCCTCGATCTCAAGGAC 92» Gl nAsnLysGl uTyrCysSer LysGI uGI yAsnLeuLeul 1 eGI uCysGI yAl aProArgSer Gl nGI yG2591 AACGGAGTGACCTGTCTACTGCTGTGAGTACCTTGTTGGAGAGCGGGAGTCTGGTGACCGTTGCAGAGCA 115»InArgSerAspLeuSer Thr AlaVal Ser Thr LeuLeuGl uSer Gl ySer LauVa I Thr Va I AlaGI uGI2661 GCACCCTGTAACGTTTGTCAGAAATTrCCGCGGGCTGGCTGAACmTGAAAGTGAGCGGGAAAATGCAG 138» nHisProValThr PheValArgAsnPheArgGlyLeuAI aGI uLeuLeuLysVal Ser Gl yLysMetGI n2731 AAGCGTGATTGGAAGACCAATCTACACGTCATTGTGGGGCCACCTGGGTGTGGTAAAAGCAAATGGGCTG 152» LysArgAspT rpLysThrAsnVal Hi sVal I I eVal Gl y P roP roGI yCysGI yLysSer LysTrpAI aA _ Ncol (28652801 CTAAITrTGCAGACGCGGAAACCACATACTGaAAACCACCTAGAAACAAGTGGTGGGATGGTTACCATGG185» laAsnPheAl aAspProGI uThrThrTyrT rpLysProProArgAsntysT rpT rpAspGI yTyrHi sGI2871 TGAAGAAGTGGTTGTTATTGATGACTTTTA.TGGCTGGCrGCCGTGGGATGATCTACTGAGACTGTGTGAT 208» yGI uGI uVal Val Val I I eAspAspPheT y rGI yT rpLeuProT rpAspAspLeuLeuArgLeuCysAspEcoRV (2942)2941 CGATATCCATTGACTGTAGAGACTAAAGGTGGAACTGTACCTTTTTTGGCCCGCAGTA.TTCTGATTACCA 232» A rgTy rP roleuThr Va I Gl uThr LysGI yGIyThr Va I ProPheLeuAI aArgSer I I eLeu 11 eThr SPL 205 130 B1FIGURA 2.6C3013. GCAATCAGACCCCGTrGGAATGGTACTCCTCAACTGCTGTCCCAGCTGTAGAAGCTCTCTATCGGAGGAT255 ► et AsnGI nThr P roLeuGI uT rpTy rSer Ser Thr Al aVa l ProAl aVa I Gl u Al aleuTyr Arg Arg I I3083. TACTTCCTTGGTA.TTTTGGAAGAATGCTACAGAACAATCCACGGAGGAAGGGGGCCAGTTCGTCACCCTT 27o> eThr Ser LeuVa I PheT rpLysAsnAl aThr Gl uGl nSer Thr Gl uGl uGI yGlyGI nPhe\Zal Thr LeuSmal (3399)Ndel (3173) Sali (3193)3151 TCCCCCCCATGCCCTGAATTTCCATATGAAATAAATrACTGAGTCGACCCCGGGTTTTTATAGCTAATTA 30S> Ser ProProCysProGI uPheProTyrGI ul I eAsnTyr3223 GTCATTTTTTCGTAAGTAAGTATTmATTTAATAOTTTTTATTGTACTTATGTTAAATATAACTGATGA3291. TAACAAAATCCATTATGTATTATTTATAACTGTAAITrCTTTAGCGTAGTTAGArGTCCAArCTCTCTCA3361 AATACATCGGCTATCTTTTTAGTGAGATTTTGATCTATGCAGTTGAAACTTATGAACGCGTGATGATTAA3433 AATCTGAACCGTCCAAATTTGCAGTCATTATATGAGCGTATCTATTA.TCTACTATCATCATCrrTGAGTT3503 AOTAArATCATCTACTTTAGAATTGATAGGAAATATGAATACCTTTGTAGIAAIATCTATACTATCTACASact (3604)Notl (3596)3573 CCTAACTCATTAAGACmTGATAGGCGGCCGCGAGCTC
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US15156499P | 1999-08-31 | 1999-08-31 | |
| US09/583,350 US6517843B1 (en) | 1999-08-31 | 2000-05-31 | Reduction of porcine circovirus-2 viral load with inactivated PCV-2 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL353068A1 PL353068A1 (pl) | 2003-10-06 |
| PL205130B1 true PL205130B1 (pl) | 2010-03-31 |
Family
ID=26848763
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL353068A PL205130B1 (pl) | 1999-08-31 | 2000-08-28 | Zastosowanie kompozycji szczepionkowej do wytwarzania leku do obniżenia obciążenia świńskim cirkowirusem typu 2 (PCV-2) w węzłach oskrzelowych i krezkowych świń |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6517843B1 (pl) |
| EP (1) | EP1246920B1 (pl) |
| JP (1) | JP2003513617A (pl) |
| KR (1) | KR20020068325A (pl) |
| CN (2) | CN102416173B (pl) |
| AT (1) | ATE527361T1 (pl) |
| AU (2) | AU782418B2 (pl) |
| BR (2) | BRPI0014155B1 (pl) |
| CA (1) | CA2383367C (pl) |
| DK (1) | DK1246920T3 (pl) |
| ES (1) | ES2376817T3 (pl) |
| HU (1) | HU229195B1 (pl) |
| MX (1) | MXPA02002208A (pl) |
| PL (1) | PL205130B1 (pl) |
| PT (1) | PT1246920E (pl) |
| WO (1) | WO2001016330A2 (pl) |
Families Citing this family (43)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| USRE39494E1 (en) * | 1992-02-27 | 2007-02-27 | Intervet Inc. | Inactivated mycoplasma hyopneumoniae and uses therefor |
| FR2781159B1 (fr) * | 1998-07-06 | 2000-10-06 | Merial Sas | Vaccin circovirus et parvovirus porcin |
| US20040062775A1 (en) * | 1997-12-05 | 2004-04-01 | Agence Francaise De Securite Sanitaire Des Aliments | Circovirus sequences associated with piglet weight loss disease (PWD) |
| FR2772047B1 (fr) * | 1997-12-05 | 2004-04-09 | Ct Nat D Etudes Veterinaires E | Sequence genomique et polypeptides de circovirus associe a la maladie de l'amaigrissement du porcelet (map), applications au diagnostic et a la prevention et/ou au traitement de l'infection |
| AU769539B2 (en) * | 1999-01-29 | 2004-01-29 | Zoetis Services Llc | Adjuvants for use in vaccines |
| US6497883B1 (en) * | 1999-06-10 | 2002-12-24 | Merial | Porcine circovirus recombinant poxvirus vaccine |
| WO2001014047A1 (en) * | 1999-08-20 | 2001-03-01 | Asahi Kasei Kabushiki Kaisha | Filter membranes for physiologically active substances |
| ES2170622B1 (es) * | 1999-12-03 | 2004-05-16 | Consejo Superior De Investigaciones Cientificas | Clones y vectores infectivos derivados de coronavirus y sus aplicaciones. |
| US7018638B2 (en) * | 2000-12-19 | 2006-03-28 | Wyeth | Mycoplasma hyopneumoniae bacterin vaccine |
| CN1309836C (zh) * | 2001-03-27 | 2007-04-11 | 萨斯喀彻温大学 | 培养环状病毒的方法 |
| US7279166B2 (en) | 2001-12-12 | 2007-10-09 | Virginia Tech Intellectual Properties, Inc. | Chimeric infectious DNA clones, chimeric porcine circoviruses and uses thereof |
| US7276353B2 (en) | 2001-12-12 | 2007-10-02 | Virginia Tech Intellectual Properties, Inc. | Chimeric infectious DNA clones, chimeric porcine circoviruses and uses thereof |
| US7906311B2 (en) | 2002-03-20 | 2011-03-15 | Merial Limited | Cotton rat lung cells for virus culture |
| WO2005007223A2 (en) * | 2003-07-16 | 2005-01-27 | Sasha John | Programmable medical drug delivery systems and methods for delivery of multiple fluids and concentrations |
| WO2005049794A2 (en) | 2003-11-13 | 2005-06-02 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Methods of characterizing infectious bursal disease virus |
| HUE025537T2 (en) * | 2004-12-30 | 2016-05-30 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Inc | PCV2-immunogenic compositions and methods for preparing such compositions |
| UA95602C2 (ru) * | 2004-12-30 | 2011-08-25 | Берингер Ингельхейм Ветмедика, Инк. | Иммуногенная композиция цвс2 и способы приготовления такой композиции |
| US7700285B1 (en) | 2005-12-29 | 2010-04-20 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | PCV2 immunogenic compositions and methods of producing such compositions |
| US7833707B2 (en) * | 2004-12-30 | 2010-11-16 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | Methods of overexpression and recovery of porcine circovirus type 2 ORF2 |
| US7566562B2 (en) | 2005-02-03 | 2009-07-28 | Universiteit Gent | Culturing circular ssDNA viruses for the production of vaccines |
| US7300785B2 (en) | 2005-02-03 | 2007-11-27 | Universiteit Ghent | Culturing circular ssDNA viruses for the production of vaccines |
| KR101347503B1 (ko) * | 2005-09-09 | 2014-01-02 | 인터벳 인터내셔널 비.브이. | Pcv-2 백신 |
| EP1968630B1 (en) | 2005-12-29 | 2018-01-24 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | Multivalent pcv2 immunogenic compositions |
| MX338626B (es) | 2005-12-29 | 2016-04-26 | Boehringer Ingelheim Vetmed | Uso de una composicion inmunogenica de pcv2 para producir los sintomas clinicos en cerdos. |
| US7862821B2 (en) | 2006-06-01 | 2011-01-04 | Merial Limited | Recombinant vaccine against bluetongue virus |
| EP2859900A1 (en) * | 2006-12-11 | 2015-04-15 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | Effective method of treatment of porcine circovirus and lawsonia intracellularis infections |
| JP5200223B2 (ja) * | 2006-12-15 | 2013-06-05 | ベーリンガー インゲルハイム フェトメディカ インコーポレイテッド | Pcv2抗原によるブタの処置 |
| EP1941903A1 (en) | 2007-01-03 | 2008-07-09 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Prophylaxis and treatment of PRDC |
| EP1958644A1 (en) | 2007-02-13 | 2008-08-20 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Prevention and treatment of sub-clinical pcvd |
| US7829274B2 (en) | 2007-09-04 | 2010-11-09 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | Reduction of concomitant infections in pigs by the use of PCV2 antigen |
| WO2009088950A2 (en) * | 2007-12-31 | 2009-07-16 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | Pcv2 orf2 virus like particle with foreign amino acid insertion |
| KR20100113582A (ko) * | 2008-01-23 | 2010-10-21 | 베링거잉겔하임베트메디카인코퍼레이티드 | Pcv2 마이코플라즈마 히오뉴모니에 면역원성 조성물 및 당해 조성물의 생산 방법 |
| US20110033495A1 (en) * | 2008-02-15 | 2011-02-10 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | Methods and compositions for reducing the impact of enteric diseases |
| CN102065890B (zh) * | 2008-04-16 | 2014-04-02 | 弗吉尼亚科技知识产权公司 | 嵌合体猪圆环病毒PCV2Gen-1Rep及其用途 |
| AR078253A1 (es) * | 2009-09-02 | 2011-10-26 | Boehringer Ingelheim Vetmed | Metodos para reducir la actividad antivirica en composiciones pcv-2 y composiciones pcv-2 con mejor inmunogenicidad |
| KR20110090711A (ko) * | 2010-02-04 | 2011-08-10 | 녹십자수의약품(주) | 신규한 돼지 써코바이러스 타입 2 및 그의 용도 |
| KR101484469B1 (ko) * | 2010-10-26 | 2015-01-21 | 주식회사 중앙백신연구소 | 돼지 써코바이러스 관련 질환을 예방하기 위한 pcv-2의 전체 바이러스를 포함하는 혼합백신 |
| TWI442935B (zh) | 2010-12-22 | 2014-07-01 | Sbc Virbac Ltd | 豬第二型環狀病毒(Porcine Circovirus Type 2)、含彼之免疫組合物、檢測套組及其應用 |
| EP3049106A1 (en) | 2013-09-25 | 2016-08-03 | Zoetis Services LLC | Pcv2b divergent vaccine composition and methods of use |
| US9505808B2 (en) | 2013-10-02 | 2016-11-29 | Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc. | PCV2 ORF2 protein variant and virus like particles composed thereof |
| HK1252427A1 (zh) | 2015-05-14 | 2019-05-24 | Boehringer Ingelheim Animal Health USA Inc. | 猪环状病毒生产方法和pcv2疫苗 |
| JP7657287B2 (ja) | 2020-07-24 | 2025-04-04 | ベーリンガー インゲルハイム アニマル ヘルス ユーエスエイ インコーポレイテッド | 組合せブタワクチン |
| CN112655566B (zh) * | 2020-12-18 | 2022-07-29 | 杭州惠通检测有限公司 | 一种在非洲猪瘟防控中应用的多层防御体系 |
Family Cites Families (52)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US2909462A (en) | 1955-12-08 | 1959-10-20 | Bristol Myers Co | Acrylic acid polymer laxative compositions |
| US4394448A (en) | 1978-02-24 | 1983-07-19 | Szoka Jr Francis C | Method of inserting DNA into living cells |
| US4769331A (en) | 1981-09-16 | 1988-09-06 | University Patents, Inc. | Recombinant methods and materials |
| US4603112A (en) | 1981-12-24 | 1986-07-29 | Health Research, Incorporated | Modified vaccinia virus |
| US5833975A (en) | 1989-03-08 | 1998-11-10 | Virogenetics Corporation | Canarypox virus expressing cytokine and/or tumor-associated antigen DNA sequence |
| US4722848A (en) | 1982-12-08 | 1988-02-02 | Health Research, Incorporated | Method for immunizing animals with synthetically modified vaccinia virus |
| US5174993A (en) | 1981-12-24 | 1992-12-29 | Health Research Inc. | Recombinant avipox virus and immunological use thereof |
| US5338683A (en) | 1981-12-24 | 1994-08-16 | Health Research Incorporated | Vaccinia virus containing DNA sequences encoding herpesvirus glycoproteins |
| US5505941A (en) | 1981-12-24 | 1996-04-09 | Health Research, Inc. | Recombinant avipox virus and method to induce an immune response |
| US4769330A (en) | 1981-12-24 | 1988-09-06 | Health Research, Incorporated | Modified vaccinia virus and methods for making and using the same |
| US5364773A (en) | 1991-03-07 | 1994-11-15 | Virogenetics Corporation | Genetically engineered vaccine strain |
| US4745051A (en) | 1983-05-27 | 1988-05-17 | The Texas A&M University System | Method for producing a recombinant baculovirus expression vector |
| EP0173552B1 (en) | 1984-08-24 | 1991-10-09 | The Upjohn Company | Recombinant dna compounds and the expression of polypeptides such as tpa |
| US4945050A (en) | 1984-11-13 | 1990-07-31 | Cornell Research Foundation, Inc. | Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor |
| JPS63500636A (ja) | 1985-08-23 | 1988-03-10 | 麒麟麦酒株式会社 | 多分化能性顆粒球コロニー刺激因子をコードするdna |
| IE872748L (en) | 1986-10-16 | 1988-04-16 | Arjomari Europ | Polypeptides derived from the evvelope gene of human¹immunodeficiency virus in recombinant baculovirus infected¹insect cells |
| GB8717430D0 (en) | 1987-07-23 | 1987-08-26 | Celltech Ltd | Recombinant dna product |
| EP0386185A1 (fr) | 1988-07-29 | 1990-09-12 | IntraCel Corporation | Procede d'expression genetique de proteines heterologues par des cellules transfectees in vivo |
| CA2003300A1 (en) | 1988-11-21 | 1990-05-21 | Franklin Volvovitz | Skin test and test kit for aids |
| CA2489769A1 (en) | 1989-03-21 | 1990-10-04 | Philip L. Felgner | Expression of exogenous polynucleotide sequences in a vertebrate |
| US5703055A (en) | 1989-03-21 | 1997-12-30 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery |
| US5552143A (en) | 1989-03-24 | 1996-09-03 | The Wistar Institute Of Anatomy & Biology | Recombinant cytomegalovirus vaccine |
| US5591439A (en) | 1989-03-24 | 1997-01-07 | The Wistar Institute Of Anatomy And Biology | Recombinant cytomegalovirus vaccine |
| KR920703114A (ko) | 1989-07-14 | 1992-12-17 | 원본미기재 | 접합체 백신을 위한 시토킨 및 호르몬 운반체 |
| GB9001766D0 (en) | 1990-01-25 | 1990-03-28 | Univ Court Of The University O | Vaccines |
| JPH04183026A (ja) | 1990-11-16 | 1992-06-30 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 表示付き選択呼出受信装置 |
| US5997878A (en) | 1991-03-07 | 1999-12-07 | Connaught Laboratories | Recombinant poxvirus-cytomegalovirus, compositions and uses |
| DE69233158T2 (de) | 1991-03-07 | 2004-05-13 | Connaught Technology Corp., Greenville | Gentechnologisch hergestellter stamm für impfstoffe |
| US5843456A (en) | 1991-03-07 | 1998-12-01 | Virogenetics Corporation | Alvac poxvirus-rabies compositions and combination compositions and uses |
| US6033904A (en) | 1992-01-13 | 2000-03-07 | Syntro Corporation | Recombinant swinepox virus |
| US5382425A (en) | 1992-01-13 | 1995-01-17 | Syntro Corporation | Recombinant swinepox virus |
| US5869312A (en) | 1992-01-13 | 1999-02-09 | Syntro Corporation | Recombinant swinepox virus |
| US5643578A (en) | 1992-03-23 | 1997-07-01 | University Of Massachusetts Medical Center | Immunization by inoculation of DNA transcription unit |
| US5801029A (en) | 1993-02-16 | 1998-09-01 | Onyx Pharmaceuticals, Inc. | Cytopathic viruses for therapy and prophylaxis of neoplasia |
| EP0620277A1 (en) | 1993-03-18 | 1994-10-19 | Merck & Co. Inc. | Nucleic acid pharmaceuticals |
| FR2711670B1 (fr) | 1993-10-22 | 1996-01-12 | Pasteur Institut | Vecteur nucléotidique, composition le contenant et vaccin pour l'immunisation à l'encontre d'une hépatite. |
| ATE475668T1 (de) | 1994-01-27 | 2010-08-15 | Univ Massachusetts Medical | Immunisierung durch impfung von dns transkriptionseinheit |
| ATE298370T1 (de) | 1994-04-29 | 2005-07-15 | Baxter Healthcare Sa | Rekombinante poxviren mit fremdenpolynukleotiden in wichtigen regionen |
| EP0871755A1 (en) | 1995-03-23 | 1998-10-21 | Cantab Pharmaceuticals Research Limited | Vectors for gene delivery |
| EP0979101B1 (en) | 1996-07-03 | 2010-10-27 | Merial, Inc. | Recombinant canine adenovirus 2 (cav2) containing exogenous dna |
| FR2751224B1 (fr) | 1996-07-19 | 1998-11-20 | Rhone Merieux | Formule de vaccin polynucleotidique contre les pathologies respiratoires et de reproduction des porcs |
| US6183752B1 (en) | 1997-02-05 | 2001-02-06 | Pasteur Merieux Serums Et Vaccins | Restenosis/atherosclerosis diagnosis, prophylaxis and therapy |
| US5990091A (en) | 1997-03-12 | 1999-11-23 | Virogenetics Corporation | Vectors having enhanced expression, and methods of making and uses thereof |
| US6004777A (en) | 1997-03-12 | 1999-12-21 | Virogenetics Corporation | Vectors having enhanced expression, and methods of making and uses thereof |
| FR2781159B1 (fr) | 1998-07-06 | 2000-10-06 | Merial Sas | Vaccin circovirus et parvovirus porcin |
| UA78180C2 (uk) * | 1997-10-03 | 2007-03-15 | Меріаль | Кільцевий вірус свині типу ii, вакцини та діагностичні реагенти |
| US6391314B1 (en) * | 1997-10-03 | 2002-05-21 | Merial | Porcine circoviruses vaccines diagnostic reagents |
| FR2772047B1 (fr) * | 1997-12-05 | 2004-04-09 | Ct Nat D Etudes Veterinaires E | Sequence genomique et polypeptides de circovirus associe a la maladie de l'amaigrissement du porcelet (map), applications au diagnostic et a la prevention et/ou au traitement de l'infection |
| JP3795751B2 (ja) | 1997-12-11 | 2006-07-12 | ユニバーシティ オブ サスカッチェワン | ブタからの離乳後多全身系消耗症候群ウイルス |
| US6497883B1 (en) * | 1999-06-10 | 2002-12-24 | Merial | Porcine circovirus recombinant poxvirus vaccine |
| US6943152B1 (en) * | 1999-06-10 | 2005-09-13 | Merial | DNA vaccine-PCV |
| WO2006026552A1 (en) | 2004-08-27 | 2006-03-09 | University Of Washington | Ultrasonic direct strain estimation using temporal and spatial correlation |
-
2000
- 2000-05-31 US US09/583,350 patent/US6517843B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-08-28 KR KR1020027002649A patent/KR20020068325A/ko not_active Ceased
- 2000-08-28 BR BRPI0014155-0A patent/BRPI0014155B1/pt unknown
- 2000-08-28 BR BR0014155-0A patent/BR0014155A/pt not_active IP Right Cessation
- 2000-08-28 AT AT00960628T patent/ATE527361T1/de active
- 2000-08-28 ES ES00960628T patent/ES2376817T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2000-08-28 PT PT00960628T patent/PT1246920E/pt unknown
- 2000-08-28 CA CA2383367A patent/CA2383367C/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-08-28 MX MXPA02002208A patent/MXPA02002208A/es active IP Right Grant
- 2000-08-28 HU HU0203834A patent/HU229195B1/hu unknown
- 2000-08-28 EP EP00960628A patent/EP1246920B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-08-28 CN CN200910252321.XA patent/CN102416173B/zh not_active Expired - Lifetime
- 2000-08-28 JP JP2001520876A patent/JP2003513617A/ja active Pending
- 2000-08-28 CN CN00813489A patent/CN1409765A/zh active Pending
- 2000-08-28 AU AU72855/00A patent/AU782418B2/en not_active Ceased
- 2000-08-28 WO PCT/EP2000/008781 patent/WO2001016330A2/en not_active Ceased
- 2000-08-28 DK DK00960628.6T patent/DK1246920T3/da active
- 2000-08-28 PL PL353068A patent/PL205130B1/pl unknown
-
2005
- 2005-10-07 AU AU2005220241A patent/AU2005220241B2/en not_active Expired
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| HUP0203834A3 (en) | 2004-07-28 |
| US6517843B1 (en) | 2003-02-11 |
| AU2005220241B2 (en) | 2009-12-10 |
| AU782418B2 (en) | 2005-07-28 |
| PT1246920E (pt) | 2011-10-24 |
| PL353068A1 (pl) | 2003-10-06 |
| CA2383367A1 (en) | 2001-03-08 |
| ATE527361T1 (de) | 2011-10-15 |
| BRPI0014155B1 (pt) | 2017-09-12 |
| EP1246920A2 (en) | 2002-10-09 |
| ES2376817T3 (es) | 2012-03-20 |
| DK1246920T3 (da) | 2011-10-31 |
| CN102416173B (zh) | 2016-08-03 |
| EP1246920B1 (en) | 2011-10-05 |
| AU7285500A (en) | 2001-03-26 |
| WO2001016330A2 (en) | 2001-03-08 |
| MXPA02002208A (es) | 2002-11-07 |
| HUP0203834A2 (hu) | 2003-03-28 |
| WO2001016330A3 (en) | 2002-08-08 |
| BR0014155A (pt) | 2002-05-07 |
| CN1409765A (zh) | 2003-04-09 |
| KR20020068325A (ko) | 2002-08-27 |
| JP2003513617A (ja) | 2003-04-15 |
| AU2005220241A1 (en) | 2005-12-01 |
| CA2383367C (en) | 2015-04-07 |
| HU229195B1 (en) | 2013-09-30 |
| CN102416173A (zh) | 2012-04-18 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CA2383367C (en) | Prevention of myocarditis, abortion and intrauterine infection associated with porcine circovirus-2 | |
| KR100837724B1 (ko) | 돼지 서코바이러스의 재조합 폭스바이러스 백신 | |
| US7211379B2 (en) | Prevention of myocarditis, abortion and intrauterine infection associated with porcine circovirus-2 | |
| JP4824233B2 (ja) | Pcv−dnaワクチン | |
| CN101277717A (zh) | Pcv-2疫苗 | |
| JP2003502303A5 (pl) | ||
| KR100805807B1 (ko) | 고양이 칼리시바이러스 유전자 및 백신, 특히 재조합 백신 | |
| JP4426761B2 (ja) | ウエストナイル熱ウイルスに対するワクチン | |
| ES2348219T3 (es) | Vacuna de virus pox recombinante contra el circovirus porcino. | |
| HK1219412B (en) | Vaccine against west nile fever |