PL412848A1 - Sposób wytwarzania polimeru z promotorową sekwencją TATAAA w sztucznej kasecie TATA i zastosowanie tego polimeru do rozpoznawania i/lub selektywnego oznaczania sześcionukleotydowej sekwencji DNA - Google Patents
Sposób wytwarzania polimeru z promotorową sekwencją TATAAA w sztucznej kasecie TATA i zastosowanie tego polimeru do rozpoznawania i/lub selektywnego oznaczania sześcionukleotydowej sekwencji DNAInfo
- Publication number
- PL412848A1 PL412848A1 PL412848A PL41284815A PL412848A1 PL 412848 A1 PL412848 A1 PL 412848A1 PL 412848 A PL412848 A PL 412848A PL 41284815 A PL41284815 A PL 41284815A PL 412848 A1 PL412848 A1 PL 412848A1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- polymer
- dna
- tata
- tataaa
- cassette
- Prior art date
Links
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 title abstract 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 abstract 3
- 229920000344 molecularly imprinted polymer Polymers 0.000 abstract 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 abstract 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 abstract 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 abstract 2
- 239000012491 analyte Substances 0.000 abstract 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 abstract 2
- 238000000157 electrochemical-induced impedance spectroscopy Methods 0.000 abstract 2
- 238000004401 flow injection analysis Methods 0.000 abstract 2
- VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N methane Chemical compound C VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 abstract 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 abstract 2
- 238000004566 IR spectroscopy Methods 0.000 abstract 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 abstract 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 abstract 1
- 102000006467 TATA-Box Binding Protein Human genes 0.000 abstract 1
- 108010044281 TATA-Box Binding Protein Proteins 0.000 abstract 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 abstract 1
- 125000000848 adenin-9-yl group Chemical group [H]N([H])C1=C2N=C([H])N(*)C2=NC([H])=N1 0.000 abstract 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 abstract 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 abstract 1
- 238000001903 differential pulse voltammetry Methods 0.000 abstract 1
- 125000001301 ethoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 abstract 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 abstract 1
- 238000005206 flow analysis Methods 0.000 abstract 1
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 abstract 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 abstract 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 abstract 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 abstract 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 abstract 1
- 238000000034 method Methods 0.000 abstract 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 abstract 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 abstract 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 abstract 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 abstract 1
- 238000011160 research Methods 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 abstract 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 abstract 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
Przedmiotem wynalazku jest sposób otrzymywania warstwy polimeru, rozpoznającego aminokwasy wybrane spośród aminokwasów występujących w białku wiążącym TATA, przyłączone przez kasetę TATA, metodą molekularnego wdrukowania prowadzącego do wytworzenia polimeru wdrukowanego molekularnie (MIP), za pomocą polimeryzacji elektrochemicznej w warunkach potencjodynamicznych. We wdrukowaniu tym jako monomery funkcyjne do elektropolimeryzacji stosuje się 4-[2-(6-amino-9H-puryn-9-ylo)etoksy]fenylo-4-[bis(2,2'-bitien-5-ylo)metan] i 1-tyminooctan 4-(di-2,2'-bitiofen-5-ylometylo)fenylu, a jako monomer sieciujący stosuje się (2,4,5,2',4',5'-heksa(tiofen-2-ylo)-3,3'-bitiofen. Wdrukowanie to charakteryzuje się tym, że jako szablon i analit stosuje się sześcionukleotydową sekwencję jednoniciowego DNA lub peptydowy analog jednoniciowego DNA, tj. PNA. Ponadto wynalazek obejmuje zastosowanie warstwy rozpoznającego MIPu, otrzymanej sposobem według wynalazku, jako elementu czujnika chemicznego do wykrywania i/lub selektywnego oznaczania sześcionukleotydowej sekwencji DNA, w płynach ustrojowych pacjenta, z wykorzystaniem impedimetrycznych pomiarów pojemnościowych (CI) w warunkach analizy przepływowo - wstrzykowej (FIA). Ponadto wynalazek obejmuje zastosowanie warstwy rozpoznającej MIPu do badania efektywności wdrukowania a następnie ekstrakcji szablonu TATAAA oraz przyłączania analitu TATAAA przez warstwę MIPu za pomocą elektrochemicznej spektroskopii impedancyjnej (EIS), odbiciowo - absorpcyjnej spektroskopii w podczerwieni (IRRAS) i różnicowej woltamperometrii pulsowej (DPV) oraz zastosowanie warstwy rozpoznającej MIPu do badania oddziaływań z aminokwasami oddziaływującymi z kasetą TATA za pomocą mikrograwimetrii piezoelektrycznej (PM) w warunkach analizy strzykowo - przepływowej (FIA). W szczególności wynalazek ma zastosowanie w inżynierii genetycznej, zwłaszcza do testów genetycznych przy wczesnym wykrywaniu dziedzicznych chorób genetycznych oraz do badań podstawowych modelu transkrypcji DNA.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL412848A PL230553B1 (pl) | 2014-08-29 | 2015-06-25 | Sposob wytwarzania polimeru z promotorowa sekwencja TATAAA w sztucznej kasecie TATA i zastosowanie tego polimeru do rozpoznawania i/lub selektywnego oznaczania szescionukleotydowej sekwencji DNA |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PLPL409329 | 2014-08-29 | ||
| PL409329A PL229588B1 (pl) | 2014-08-29 | 2014-08-29 | Nowy sztuczny oligomer o sekwencji zasad nukleinowych ATATTT komplementarny do promotorowej sekwencji TATAAA, sztuczna nić promotora DNA zawierająca ten oligomer i jej zastosowanie do selektywnego wykrywania i oznaczania oligonukleotydu TATAAA |
| PL412848A PL230553B1 (pl) | 2014-08-29 | 2015-06-25 | Sposob wytwarzania polimeru z promotorowa sekwencja TATAAA w sztucznej kasecie TATA i zastosowanie tego polimeru do rozpoznawania i/lub selektywnego oznaczania szescionukleotydowej sekwencji DNA |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL412848A1 true PL412848A1 (pl) | 2016-03-14 |
| PL230553B1 PL230553B1 (pl) | 2018-11-30 |
Family
ID=55450755
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL409329A PL229588B1 (pl) | 2014-08-29 | 2014-08-29 | Nowy sztuczny oligomer o sekwencji zasad nukleinowych ATATTT komplementarny do promotorowej sekwencji TATAAA, sztuczna nić promotora DNA zawierająca ten oligomer i jej zastosowanie do selektywnego wykrywania i oznaczania oligonukleotydu TATAAA |
| PL412848A PL230553B1 (pl) | 2014-08-29 | 2015-06-25 | Sposob wytwarzania polimeru z promotorowa sekwencja TATAAA w sztucznej kasecie TATA i zastosowanie tego polimeru do rozpoznawania i/lub selektywnego oznaczania szescionukleotydowej sekwencji DNA |
Family Applications Before (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL409329A PL229588B1 (pl) | 2014-08-29 | 2014-08-29 | Nowy sztuczny oligomer o sekwencji zasad nukleinowych ATATTT komplementarny do promotorowej sekwencji TATAAA, sztuczna nić promotora DNA zawierająca ten oligomer i jej zastosowanie do selektywnego wykrywania i oznaczania oligonukleotydu TATAAA |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| PL (2) | PL229588B1 (pl) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| PL422867A1 (pl) * | 2017-09-18 | 2019-03-25 | Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk | Nowy bisbitiofenowy analog oktanukleotydu o sekwencji nukleotydów CGCCGCCG, sposób jego otrzymywania, czujnik elektrochemiczny zawierający ten analog, sposób wytworzenia tego czujnika, pomiar z jego wykorzystaniem i jego zastosowanie |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| PL238942B1 (pl) * | 2017-11-24 | 2021-10-25 | Inst Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk | Syntetyczny polimer nukleotydowy z warstwą rozpoznającą, jego wytwarzanie i zastosowanie do selektywnego oznaczania rakotwórczej heterocyklicznej aminy aromatycznej za pomocą czujnika chemicznego |
-
2014
- 2014-08-29 PL PL409329A patent/PL229588B1/pl unknown
-
2015
- 2015-06-25 PL PL412848A patent/PL230553B1/pl unknown
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| PL422867A1 (pl) * | 2017-09-18 | 2019-03-25 | Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk | Nowy bisbitiofenowy analog oktanukleotydu o sekwencji nukleotydów CGCCGCCG, sposób jego otrzymywania, czujnik elektrochemiczny zawierający ten analog, sposób wytworzenia tego czujnika, pomiar z jego wykorzystaniem i jego zastosowanie |
| PL239699B1 (pl) * | 2017-09-18 | 2021-12-27 | Inst Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk | Nowy bisbitiofenowy analog oktanukleotydu o sekwencji nukleotydów CGCCGCCG, sposób jego otrzymywania, czujnik elektrochemiczny zawierający ten analog, sposób wytworzenia tego czujnika i zastosowanie czujnika elektrochemicznego |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| PL229588B1 (pl) | 2018-08-31 |
| PL230553B1 (pl) | 2018-11-30 |
| PL409329A1 (pl) | 2016-03-14 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Tu et al. | Luminescent biodetection based on lanthanide-doped inorganic nanoprobes | |
| Srivastava et al. | Biosensors/molecular tools for detection of waterborne pathogens | |
| Pisoschi et al. | Electrochemical methods for ascorbic acid determination | |
| Shasha et al. | Nanopore-based conformational analysis of a viral RNA drug target | |
| ATE504832T1 (de) | Mikrofluidik-vorrichtung und verfahren zur bestimmung der flüssigkeitsgerinnungszeit | |
| IL255446B2 (en) | Field-effect apparatus and methods for sequencing nucelic acids | |
| WO2004093644A3 (en) | Methods and apparatus for genetic evaluation | |
| ATE471512T1 (de) | Verwendung des proteins s100a 12 als marker für kolorektalkarzinom | |
| Zambry et al. | A label-free electrochemical DNA biosensor used a printed circuit board gold electrode (PCBGE) to detect SARS-CoV-2 without amplification | |
| ES2720999T3 (es) | Método y sistema para seleccionar un fármaco sobre la base de la información del daño de proteína individual para prevenir los efectos secundarios de un fármaco | |
| WO2008073175A3 (en) | Nanoplasmonic molecular ruler for nuclease activity and dna footprinting | |
| ATE528641T1 (de) | Verfahren unter verwendung eines elektrochemischen sensors und diesen sensor bildender elektroden | |
| ATE554389T1 (de) | Apex als marker für lungenkrebs | |
| WO2006033020A3 (en) | Methods and apparatus for the detection and validation of micrornas | |
| EP3803362C0 (en) | Electrochemical sensor, electrode, electrode production process, analyte detection process, and use of the electrochemical sensor | |
| CN105247358B (zh) | 利用具有脉冲式dc块的测试序列电化学测量分析物的方法及结合其的设备、装置和系统 | |
| DE60325382D1 (de) | Verfahren zur diagnose von gebärmutterhalskrebs | |
| ATE468535T1 (de) | Verwendung von nnmt als marker für lungenkrebs | |
| ATE550660T1 (de) | Diagnose einer erkrankung und einstufung von krebs mittels membranelektrophorese | |
| JP2012120540A5 (ja) | 遺伝子発現プロファイルによる胃癌の検出 | |
| Han et al. | Construction and Characterization of Cy3-or Cy5-Conjugated Hairpin Pyrrole/Imidazole Polyamides Binding to DNA in the Nucleosome | |
| Shao et al. | RIG-I from waterfowl and mammals differ in their abilities to induce antiviral responses against influenza A viruses | |
| ATE546527T1 (de) | Verfahren zum nachweis von leberkrebs, diagnose auf leberkrebs und heilmittel gegen krebs | |
| DE602005017252D1 (de) | Verfahren zur amplifikation von nukleinsäuren mittels promotor-templates | |
| PL409982A1 (pl) | Nowy przewodzący polimer bisbitiofenowy, wdrukowany molekularnie za pomocą białek, w tym ludzkiej albuminy, sposób jego przygotowania i jego zastosowanie |