RU2015100258A - Прогнозирование резистентности к заболеванию - Google Patents
Прогнозирование резистентности к заболеванию Download PDFInfo
- Publication number
- RU2015100258A RU2015100258A RU2015100258A RU2015100258A RU2015100258A RU 2015100258 A RU2015100258 A RU 2015100258A RU 2015100258 A RU2015100258 A RU 2015100258A RU 2015100258 A RU2015100258 A RU 2015100258A RU 2015100258 A RU2015100258 A RU 2015100258A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- salmon
- dna polymorphism
- dna
- resistance
- pancreatic necrosis
- Prior art date
Links
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title 1
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 23
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 claims abstract 18
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 claims abstract 18
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 claims abstract 10
- 208000009663 Acute Necrotizing Pancreatitis Diseases 0.000 claims abstract 8
- 206010058096 Pancreatic necrosis Diseases 0.000 claims abstract 8
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims abstract 8
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 claims abstract 8
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 claims abstract 4
- 241000277263 Salmo Species 0.000 claims abstract 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 238000013277 forecasting method Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
- C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/124—Animal traits, i.e. production traits, including athletic performance or the like
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
- Y02A40/80—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in fisheries management
- Y02A40/81—Aquaculture, e.g. of fish
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ прогнозирования резистентности к инфекционному некрозу поджелудочной железы у лосося, причем способ включает определение аллелей, присутствующих в ДНК-полиморфизме у лосося, и прогнозирование, является или нет лосось резистентным к инфекционному некрозу поджелудочной железы, на основе определения аллелей.2. Способ по п. 1, в котором способность ДНК-полиморфизмов прогнозировать резистентность к IPN может быть количественно оценена, как имеющих г-статистику выше 0,3.3. Способ по п. 1 или 2, в котором ДНК-полиморфизм является выбранным из группы, приведенной в таблице 1.4. Способ по п. 1 или 2, в котором ДНК-полиморфизм выбран из любого из нижеследующих: AGKD01281000.1_4157[Т/ТА], AGKD01281000.1_5527[Т/ТАТ], AGKD01021775.1_19790[G/A], AGKD01281000.1_5251[A/G] и AGKD01281000.1_4338[А/Т].5. Способ по п. 1 или 2, в котором определяют аллель, присутствующий в дополнительном ДНК-полиморфизме, и прогноз, является или нет лосось резистентным к инфекционному некрозу поджелудочной железы, основанный на определении аллелей в обоих ДНК-полиморфизмах.6. Способ по п. 5, в котором ДНК-полиморфизм и дополнительный ДНК-полиморфизм выбраны из любой из пар, приведенных в таблице 3.7. Способ по п. 1 или 2, в котором ДНК-полиморфизм(ы) расположен(ы) на хромосоме 26.8. Способ по п. 1 или 2, в котором лососем является атлантический лосось.9. Способ по п. 1 или 2, в котором стадию определения аллелей, присутствующих в ДНК-полиморфизме у лосося, выполняют на образце мышечной ткани, образце крови, образце печени и/или отрезанной части плавника.10. Способ отбора лосося для использования в качестве производителя, в котором лосося отбирают на основе прогнозирования способом по любому из пп. 1-8, что этот лосось будет иметь резистентность к инфекционному некрозу поджелудочной железы.
Claims (10)
1. Способ прогнозирования резистентности к инфекционному некрозу поджелудочной железы у лосося, причем способ включает определение аллелей, присутствующих в ДНК-полиморфизме у лосося, и прогнозирование, является или нет лосось резистентным к инфекционному некрозу поджелудочной железы, на основе определения аллелей.
2. Способ по п. 1, в котором способность ДНК-полиморфизмов прогнозировать резистентность к IPN может быть количественно оценена, как имеющих г2-статистику выше 0,3.
3. Способ по п. 1 или 2, в котором ДНК-полиморфизм является выбранным из группы, приведенной в таблице 1.
4. Способ по п. 1 или 2, в котором ДНК-полиморфизм выбран из любого из нижеследующих: AGKD01281000.1_4157[Т/ТА], AGKD01281000.1_5527[Т/ТАТ], AGKD01021775.1_19790[G/A], AGKD01281000.1_5251[A/G] и AGKD01281000.1_4338[А/Т].
5. Способ по п. 1 или 2, в котором определяют аллель, присутствующий в дополнительном ДНК-полиморфизме, и прогноз, является или нет лосось резистентным к инфекционному некрозу поджелудочной железы, основанный на определении аллелей в обоих ДНК-полиморфизмах.
6. Способ по п. 5, в котором ДНК-полиморфизм и дополнительный ДНК-полиморфизм выбраны из любой из пар, приведенных в таблице 3.
7. Способ по п. 1 или 2, в котором ДНК-полиморфизм(ы) расположен(ы) на хромосоме 26.
8. Способ по п. 1 или 2, в котором лососем является атлантический лосось.
9. Способ по п. 1 или 2, в котором стадию определения аллелей, присутствующих в ДНК-полиморфизме у лосося, выполняют на образце мышечной ткани, образце крови, образце печени и/или отрезанной части плавника.
10. Способ отбора лосося для использования в качестве производителя, в котором лосося отбирают на основе прогнозирования способом по любому из пп. 1-8, что этот лосось будет иметь резистентность к инфекционному некрозу поджелудочной железы.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GB1212069.7 | 2012-07-06 | ||
| GBGB1212069.7A GB201212069D0 (en) | 2012-07-06 | 2012-07-06 | Predicting resistance to disease |
| PCT/GB2013/051800 WO2014006428A1 (en) | 2012-07-06 | 2013-07-08 | Predicting resistance to disease |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015100258A true RU2015100258A (ru) | 2016-08-27 |
| RU2661100C2 RU2661100C2 (ru) | 2018-07-11 |
Family
ID=46766272
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015100258A RU2661100C2 (ru) | 2012-07-06 | 2013-07-08 | Способ прогнозирования резистентности к инфекционному некрозу поджелудочной железы у лосося |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US9920368B2 (ru) |
| EP (1) | EP2870262B1 (ru) |
| CA (1) | CA2878220A1 (ru) |
| CL (1) | CL2015000008A1 (ru) |
| DK (2) | DK2870262T3 (ru) |
| ES (1) | ES2643478T3 (ru) |
| GB (1) | GB201212069D0 (ru) |
| RU (1) | RU2661100C2 (ru) |
| WO (1) | WO2014006428A1 (ru) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB201212069D0 (en) | 2012-07-06 | 2012-08-22 | Aqua Gen As | Predicting resistance to disease |
| GB201400311D0 (en) * | 2014-01-08 | 2014-02-26 | Aqua Gen As | Treating Susceptibility |
| GB201400309D0 (en) * | 2014-01-08 | 2014-02-26 | Aqua Gen As | Predicting Resistance to disease |
| RU2754039C2 (ru) * | 2014-11-18 | 2021-08-25 | Аква Ген Ас | Способ прогнозирования резистентности |
| GB201522230D0 (en) * | 2015-12-16 | 2016-01-27 | Aquagen As | Characteristic test |
| GB201701480D0 (en) * | 2017-01-30 | 2017-03-15 | Aquagen As | Disease resistance |
| NO344938B1 (en) * | 2018-12-13 | 2020-07-20 | Patogen As | Pancreas Disease Virus Markers |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AU2003263693A1 (en) * | 2002-09-10 | 2004-04-30 | Unni Grimholt | Disease resistance in salmon |
| RU2310848C1 (ru) * | 2006-04-11 | 2007-11-20 | ГОУ ВПО "Красноярская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию" | Способ прогнозирования риска возникновения, клинического течения и исхода острого идиопатического панкреатита |
| GB201212069D0 (en) | 2012-07-06 | 2012-08-22 | Aqua Gen As | Predicting resistance to disease |
| USD1021775S1 (en) * | 2022-11-13 | 2024-04-09 | AUO Display Plus Corporation | Charging station |
-
2012
- 2012-07-06 GB GBGB1212069.7A patent/GB201212069D0/en not_active Ceased
-
2013
- 2013-07-08 DK DK13739245.2T patent/DK2870262T3/en active
- 2013-07-08 CA CA2878220A patent/CA2878220A1/en not_active Abandoned
- 2013-07-08 RU RU2015100258A patent/RU2661100C2/ru active
- 2013-07-08 WO PCT/GB2013/051800 patent/WO2014006428A1/en not_active Ceased
- 2013-07-08 US US14/412,829 patent/US9920368B2/en active Active
- 2013-07-08 EP EP13739245.2A patent/EP2870262B1/en active Active
- 2013-07-08 ES ES13739245.2T patent/ES2643478T3/es active Active
-
2014
- 2014-02-28 DK DKPA201400114A patent/DK178976B1/da active
-
2015
- 2015-01-05 CL CL2015000008A patent/CL2015000008A1/es unknown
-
2017
- 2017-12-20 US US15/848,386 patent/US10711301B2/en active Active
- 2017-12-20 US US15/848,434 patent/US10711302B2/en active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US10711301B2 (en) | 2020-07-14 |
| WO2014006428A1 (en) | 2014-01-09 |
| ES2643478T3 (es) | 2017-11-23 |
| DK178976B1 (da) | 2017-07-17 |
| DK201400114A (en) | 2014-02-28 |
| US20180105875A1 (en) | 2018-04-19 |
| CL2015000008A1 (es) | 2015-12-04 |
| EP2870262A1 (en) | 2015-05-13 |
| EP2870262B1 (en) | 2017-08-16 |
| US20180127820A1 (en) | 2018-05-10 |
| US9920368B2 (en) | 2018-03-20 |
| US20150329903A1 (en) | 2015-11-19 |
| GB201212069D0 (en) | 2012-08-22 |
| DK2870262T3 (en) | 2017-10-30 |
| CA2878220A1 (en) | 2014-01-09 |
| RU2661100C2 (ru) | 2018-07-11 |
| US10711302B2 (en) | 2020-07-14 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2015100258A (ru) | Прогнозирование резистентности к заболеванию | |
| Boulygina et al. | Whole genome sequencing of elite athletes | |
| Renaut et al. | Genome-wide patterns of divergence during speciation: the lake whitefish case study | |
| Van Der Harst et al. | Seventy-five genetic loci influencing the human red blood cell | |
| Albrechtsen et al. | Exome sequencing-driven discovery of coding polymorphisms associated with common metabolic phenotypes | |
| Larson et al. | The composite regulatory basis of the large X-effect in mouse speciation | |
| Pontillo et al. | Susceptibility to Mycobacterium tuberculosis infection in HIV-positive patients is associated with CARD8 genetic variant | |
| CA2812115C (en) | Epigenetic markers of colorectal cancers and diagnostic methods using the same | |
| BR112014009269A8 (pt) | diagnóstico de aneuploidia cromossômica fetal | |
| McInerney‐Leo et al. | Whole exome sequencing is an efficient and sensitive method for detection of germline mutations in patients with phaeochromcytomas and paragangliomas | |
| Naka et al. | Association of the endothelial protein C receptor (PROCR) rs867186-G allele with protection from severe malaria | |
| Liu et al. | Identification of single-nucleotide polymorphism markers associated with cortisol response to crowding in rainbow trout | |
| Ji et al. | Association of host genetics with intestinal microbial relevant to body weight in a chicken F2 resource population | |
| Walker et al. | DNA methylation in a Scottish family multiply affected by bipolar disorder and major depressive disorder | |
| MX377264B (es) | Métodos, herramientas y sistemas para la evaluación, prevención, manejo y selección de tratamiento para diabetes tipo 2. | |
| McIver et al. | Population-scale analysis of human microsatellites reveals novel sources of exonic variation | |
| Xue et al. | Evaluation of microhaplotype panels for complex kinship analysis using massively parallel sequencing | |
| Jónás et al. | The combined use of linkage disequilibrium–based haploblocks and allele frequency–based haplotype selection methods enhances genomic evaluation accuracy in dairy cattle | |
| Chow et al. | Sea turtle population genomic discovery: Global and locus-specific signatures of polymorphism, selection, and adaptive potential | |
| Lim et al. | Molecular diagnosis of congenital muscular dystrophies with defective glycosylation of alpha-dystroglycan using next-generation sequencing technology | |
| Surakka et al. | The rate of false polymorphisms introduced when imputing genotypes from global imputation panels | |
| Bu et al. | A novel splice donor site mutation in EPHA2 caused congenital cataract in a Chinese family | |
| Shibata et al. | Genome-wide association study of schizophrenia using microsatellite markers in the Japanese population | |
| Huynh et al. | UBE3B and ZRANB1 polymorphisms and transcript abundance are associated with water holding capacity of porcine M. longissimus dorsi | |
| RU2014110824A (ru) | Способ прогнозирования риска невынашивания первой половины беременности |