RU2015143164A - Пептиды kntc2 и содержащие их вакцины - Google Patents

Claims (45)

1. Выделенный пептид со способностью к индукции цитотоксических T-лимфоцитов (CTL), где пептид содержит последовательность аминокислот (a) или (b) ниже:

(a) последовательность аминокислот, выбранная из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 7, 17, 41, 53 и 68;

(b) последовательность аминокислот, в которой в последовательности аминокислот, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 7, 17, 41, 53 и 68, замещены, удалены, вставлены и/или добавлены 1, 2 или несколько аминокислот.

2. Пептид по п. 1, где пептид обладает одной или обеими из следующих характеристик:

(a) вторая аминокислота с N-конца представляет собой лейцин или метионин; и

(b) C-концевая аминокислота представляет собой валин или лейцин.

3. Пептид по любому из пп. 1 или 2, где пептид представляет собой нонапептид или декапептид.

4. Пептид по п. 3, где пептид состоит из последовательности аминокислот, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 7, 17, 41, 53 и 68.

5. Выделенный полинуклеотид, кодирующий пептид по любому из пп. 1-4.

6. Композиция для индукции CTL, где композиция содержит по меньшей мере один активный ингредиент, выбранный из группы, состоящей из:

(a) пептида по любому из пп. 1-4;

(b) полинуклеотида по п. 5;

(c) антигенпрезентирующей клетки (APC), которая презентирует на своей поверхности пептид по любому из п.п. 1-4; и

(d) экзосомы, которая презентирует на своей поверхности пептид по любому из пп. 1-4.

7. Фармацевтическая композиция для лечения и/или профилактики злокачественной опухоли и/или профилактики ее послеоперационного рецидива, где композиция содержит по меньшей мере один активный ингредиент, выбранный из группы, состоящей

из:

(a) пептида по любому из пп. 1-4;

(b) полинуклеотида по п. 5;

(c) APC, которая презентирует на своей поверхности пептид по любому из пп. 1-4;

(d) экзосомы, которая презентирует на своей поверхности пептид по любому из пп. 1-4; и

(e) CTL, который может распознавать клетку, презентирующую пептид по любому из пп. 1-4.

8. Фармацевтическая композиция по п. 7, где фармацевтическую композицию формулируют для введения индивидууму, HLA-антиген которого представляет собой HLA-A2.

9. Способ индукции APC со способностью индукции CTL, где способ включает стадию, выбранную из группы, состоящей из:

(a) приведения APC в контакт с пептидом по любому из п.п. 1-4, и

(b) введения полинуклеотида, кодирующего пептид по любому из п.п. 1-4, в APC.

10. Способ индукции CTL, где способ включает стадию, выбранную из группы, состоящей из:

(a) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с APC, которая презентирует на своей поверхности комплекс HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-4;

(b) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с экзосомой, которая презентирует на своей поверхности комплекс HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-4; и

(c) введения в CD8-положительную T-клетку полинуклеотида, кодирующего обе субъединицы T-клеточного рецептора (TCR), или полинуклеотидов, кодирующих каждую из субъединиц TCR, где TCR, формируемый указанными субъединицами, может связываться с комплексом пептида по любому из пп. 1-4 и HLA-антигена на клеточной поверхности.

11. Выделенная APC, которая презентирует на своей поверхности комплекс HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-4.

12. APC по п. 11, индуцированная способом по п. 9.

13. Выделенный CTL, направленный на пептид по любому из пп. 1-4.

14. CTL по п. 13, индуцируемый способом по п. 10.

15. Способ индукции иммунного ответа против злокачественной опухоли у индивидуума, где способ включает стадию введения индивидууму композиции, содержащей пептид по любому из пп. 1-4, или полинуклеотид, кодирующий пептид.

16. Антитело или его иммунологически активный фрагмент к пептиду по любому из пп. 1-4.

17. Вектор, содержащий последовательность нуклеотидов, кодирующую пептид по любому из пп. 1-4.

18. Клетка-хозяин, трансформированная или трансфицированная вектором по п. 17.

19. Диагностический набор, содержащий пептид по любому из пп. 1-4, полинуклеотид по п. 5 или антитело или иммунологически активный фрагмент по п. 16.

20. Способ скрининга на пептид со способностью индукции CTL, который обладает специфической цитотоксической активностью против клетки, которая презентирует фрагмент, получаемый из KNTC2, где способ включает стадии:

(i) предоставления последовательности-кандидата, состоящей из последовательности аминокислот, модифицированной посредством замены, делеции, вставки и/или добавления в исходной последовательности аминокислот одного, двух или нескольких остатков аминокислот, где исходная последовательность аминокислот выбрана из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 7, 17, 41, 53 и 68;

(ii) выбора последовательности-кандидата, которая не обладает значимой гомологией с пептидами, получаемыми из любых известных продуктов генов человека, отличных от KNTC2;

(iii) приведения пептида, состоящего из последовательности-кандидата, выбранной на стадии (ii), в контакт с антигенпрезентирующей клеткой;

(iv) приведения антигенпрезентирующей клетки со стадии (iii) в контакт с CD8-положительной T-клеткой; и

(v) идентификации пептида, способность к индукции CTL

которого является такой же или более высокой, чем у пептида, состоящего из исходной последовательности аминокислот.