TH60773A - ลำดับนิวคลิโอไทด์ใหม่ซึ่งใส่รหัสสำหรับจีน luxR - Google Patents

Abstract

DC60 (02/10/44) พอลินิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการแยกซึ่งมีลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ได้รับการเลือกจากกลุ่ม a) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเหมือนกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่ง ใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่ง มีลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 อย่างน้อยที่สุด 70% b) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งมีลำ ดับกรดอะมิโนซึ่งเหมือนกัน กับลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลข ที่ 2 อย่างน้อยที่สุด 70% c) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับพอลิ นิวคลิโอไทด์ของ a) หรือ b) และ d) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งมีอย่างน้อยที่สุด 15 นิวคลิโอไทด์ ที่ต่อเนื่องกันของลำดับพอลินิว คลิโอไทด์ของ a) b) หรือ c) และกระบวนการสำหรับการผลิตกรด L-อะมิโนโดยการหมักโดยใช้คอ รินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมีอย่าง น้อยที่สุดจีน luxR ได้รับ การปรากฏในรูปที่ได้รับการทำให้อ่อนฤทธิ์ และการใช้ลำดับพอ ลินิวคลิโอ ไทด์เป็นโพรบการทำให้ผสมกัน พอลินิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการแยกซึ่งมีลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ได้รับการเลือกจากกลุ่ม a) พอลินิวคลีโอไทด์ซึ่งเหมือนกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่ง ใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่ง มีลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 อย่างน้อยที่สุด 70% b) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งมีลำ ดับกรดอะมิโนซึ่งเหมือนกัน กับลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลข ที่ 2 อย่างน้อยที่สุด 70% c) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับพอลิ นิวคลิโอไทด์ของ a) หรือ b) และ d) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งมีอย่างน้อยที่สุด 15 นิวคลิโอไทต์ ที่ต่อเนื่องกันของลำดับพอลินิว คลิโอไทต์ของ a) b)หรือ c) และกระบวนการสำหรับการผลิตกรด L-อะมิโนโดยการหมักโดยใช้คอ รินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมีอย่าง น้อยที่สุดจีน luxR ได้รับ การปรากฏในรูปที่ได้รับการทำให้อ่อนฤทธิ์ และการใช้ลำดับพอ ลินิวคลิโอ ไทด์เป็นโพรบการทำให้ผสมกัน

Claims (1)

1. พอลินิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการแยกจากคอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมีลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ที่ใส่รหัส สำหรับจีน luxR ซึ่งได้รับการเลือกจากกลุ่ม a) พอลินิวคลีโอไทด์ซึ่งเหมือนกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่ง ใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งมี ลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 อย่างน้อยที่สุด 70% b) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งมีลำ ดับกรดอะมิโนซึ่งเหมือนกันกับ ลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลข ที่ 2 อย่างน้อยที่สุด 70% c) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับพอลิ นิวคลิโอไทด์ของ a) หรือ b) และ d) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งมีอย่างน้อยที่สุด 15 นิวคลิโอไทต์ ที่ต่อเนื่องกันของลำดับพอลินิวคลิ โอไทต์ของ a) b)หรือ c) พอลิเพปไทด์ อย่างที่ควรเลือกใช้ซึ่งแสดงความว่องไวของตัว ปลุกฤทธิ์การถอดรหัส LuxR 2. พอลินิวคลิโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 1 ซึ่ง พอลินิวคลิโอไทด์ คือ ดีเอ็นเอ อย่างที่ควร เลือกใช้ รีคอม บิแนนท์ดีเอ็นเอ ซึ่งสามารถถ่ายแบบได้ในคอรินิฟอร์ม แบคทีเรีย 3. พอลินิวคลิโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 1ซึ่ง พอลินิวคลิโอไทด์ คือ อาร์เอ็นเอ 4. ดีเอ็นเอที่สามารถถ่ายแบบได้ดังที่ถือสิทธิในข้อถือ สิทธิข้อ 2 ซึ่งมี (i) ลำดับนิวคลิโอไทด์ที่แสดงใน SEQ ID เลขที่ 1 หรือ (ii) อย่างน้อยที่สุด 1 ลำดับซึ่งตรงกันกับลำดับ (i) ภาย ในบริเวณของการเสื่อมของรหัสทางพันธุ กรรม หรือ (iii) อย่างน้อยที่สุด 1 ลำดับซึ่งผสมกันกับลำดับที่เป็น ส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับลำดับ (i) หรือ (ii) และอย่าง เป็นทางเลือก (iv) การกลายแบบเซนส์ (sense) ใน (i) ซึ่งเป็นกลางในเทอม ของฟังก์ชัน 6. คอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมีจีน luxP ได้รับการทำให้อ่อน ฤทธิ์ อย่างที่ควรเลือกใช้ได้รับการคัดออก 7. กระบวนการสำหรับสำหรับการเตรียมกรด L-อะมิโน โดยเฉพาะ อย่างยิ่ง L-ไลซีน ซึ่งกระบวนการ ประกอบรวมด้วยการทำให้ขั้น ตอนต่อไปนี้สำเร็จ (a) การหมักแบคทีเรียซึ่งผลิตกรด L-อะมิโนที่ต้องการ ซึ่ง อย่างน้อยที่สุดมีจีน luxR ได้รับการทำ ให้อ่อนฤทธิ์ (b) การทำให้ผลผลิตที่ต้องการเข้มข้นในตัวกลางหรือในเซลล์ ของแบคทีเรีย และ (c) การแยกกรด L-อะมิโน 8. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 7 ซึ่งมี แบคทีเรียทีได้รับการใช้ซึ่งมีจีนอื่นของวิถีทาง ชีว สังเคราะห์ของกรด L-อะมิโนที่ต้องการได้รับการทำให้เพิ่ม ขึ้นอีก 9. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 7 ซึ่งมี แบคทีเรียที่ได้รับการใช้ซึ่งมีอย่างน้อยที่สุดบาง วิถี ทางเมบอลิกซึ่งลดการก่อเกิดของกรด L-อะมิโนที่ต้องการได้ รับการคัดออก 10. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 7 ซึ่งการ แสดงออกของพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัส สำหรับจีน luxR ได้ รับการทำให้ลดลง โดยเฉพาะอย่างยิ่งได้รับการคัดออก 11. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 7 ซึ่งสมบัติ การบังคับของพอลิเพปไทด์สำหรับที่ซึ่ง พอลินิวคลิโอไทด์ luxR ใส่รหัส ได้รับการทำให้ลดลง 12. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 7 ซึ่งสำหรับ การผลิตกรด L-อะมิโน โดยเฉพาะ L -ไล ซีน แบคทีเรียได้รับการ หมัก ที่เวลาเดียวกัน ซึ่งมีจีนหนึ่งชนิดหรือมากกว่าซึ่ง ได้รับการเลือกจาก กลุ่ม 12.1จีน dapA ซึ่งใส่รหัสสำหรับไดไฮโดรไตพิคอลิเนทซินเทส 12.2 จีน eno ซึ่งใส่รหัสสำหรับอีนอเลส 12.3 จีน zwf ซึ่งใส่รหัสสำหรับผลผลิตจีน zwf 12.4 จีน pyc ซึ่งใส่รหัสสำหรับไพรูเวทคาร์บอกซิเลส 12.5 จีน lysE ซึ่งใส่รหัสสำหรับการส่งออกไลซีน ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ได้รับการทำให้ แสดงออกมากเกิน 13. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 7 ซึ่งที่ เวลาเดียวกัน จีนหนึ่งชนิดหรือมากกว่าได้รับ การเลือกจาก กลุ่ม 13.1 จีน pck ซึ่งใส่รหัสสำหรับฟอสฟออีนอลไพรูเวทคาร์บอกซิ ไคเนส 13.2 จีน pgi ซึ่งใส่รหัสสำหรับกลูโคส -6-ฟอสเฟทไอโซเมอเรส 13.3 จีน poxB ซึ่งใส่รหัสสำหรับไพรูเวทออกซิเดส ได้รับการ ทำให้อ่อนฤทธิ์ 14. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิก่อนหน้านี้ข้อใด ข้อหนึ่งซึ่งจุลินทรีย์ของชนิดคอรินิ- แบคทีเรียม กลูทามิคุม ได้รับการใช้ 15. วิธีการของการพบอาร์เอ็นเอ ซีดีเอ็นเอ และดีเอ็นเอ เพื่อที่จะแยกกรดนิวคลิอิก หรือพอลินิวคลิโอ ไทด์หรือจีน ซึ่งใส่รหัสสำหรับตัวปลุกฤทธิ์การถอดรหัส LuxR หรือมีระดับ ชั้นของความเหมือน สูงกับลำดับของจีน luxR ซึ่งวิธีการ ประกอบรวมด้วยการใช้ลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ดังที่ถือสิทธิ ใน ข้อถือสิทธิข้อ 1 ถึงข้อ 4 ข้อใดข้อหนึ่งเป็นโพรบการทำให้ ผสมกัน