TW201629101A - 抗ｔｉｍ３抗體及使用方法 - Google Patents

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奧利佛 波拉特納
亞德藍 茲微克
維克多 樂維斯基
蓋 喬治絲
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Abstract

本發明提供抗TIM3抗體及使用其之方法。

Description

抗TIM3抗體及使用方法
本發明係關於抗TIM3抗體及使用其之方法。
TIM3為屬於蛋白質之免疫球蛋白超家族及TIM家族之人類蛋白質。在人類中，與小鼠類似，TIM-3表現於T細胞以及諸如巨噬細胞及樹突狀細胞之吞噬細胞上。TIM-3與蛋白質配位體(例如半乳糖凝集素-9)之結合可經由細胞凋亡誘導機制來抑制Th1反應，且因此導致諸如誘導外周耐受性。用siRNA降低人類TIM-3之表現或藉由阻斷抗體抑制人類TIM-3增加自CD4陽性T細胞分泌干擾素α，支持人類T細胞中之TIM-3之抑制作用。在吞噬細胞中，TIM-3亦充當識別凋亡細胞之受體。來自自體免疫疾病患者之臨床樣品之分析顯示TIM-3未表現於CD4陽性細胞中。詳言之，在來源於患有多發性硬化症之患者之腦脊髓液的T細胞純系中，TIM-3之表現量低於且IFN-γ之分泌量高於來源於正常健康人之純系(Koguchi K等人，J Exp Med.203(2006)1413-1418)。
存在關於TIM-3與過敏性疾病或哮喘之關係的報導(WO96/27603及WO2003/063792)。
根據來自急性骨髓性白血病(在下文中稱為「AML」)患者之造血幹細胞及正常造血幹細胞之微陣列分析，TIM-3表現於AML幹細胞上且因此該分析提出TIM-3與血液科惡性病有關(Majeti R等人，PNAS, 106(2009)3396-3401及WO2009/091547)。
抗TIM-3單株抗體之實例包括抗人類TIM-3大鼠單株抗體(純系344823，由R&D Systems製得)及抗人類TIM-3小鼠單株抗體(純系F38-2E2，由R&D Systems製得)。WO2013/06490係關於用於治療癌症且減輕發炎之展示快速內化之抗TIM-3抗體及其免疫結合物。US2012/189617係關於對於與人類TIM-3表現細胞相關之疾病呈現較高效應活性(諸如抗體依賴性細胞細胞毒性(ADCC活性))之抗TIM-3抗體。
本發明提供抗TIM3抗體及使用其之方法。
本發明之一個態樣為結合至TIM3之分離之抗體，其中該抗體：
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)。
本發明之另一態樣為此類抗TIM3抗體，其中該抗體：
˙與包含SEQ ID NO：7之VH及SEQ ID NO：8之VL的抗Tim3抗體競爭以結合至TIM3
˙結合至人類及食蟹獼猴(cynomolgus)TIM3
˙以免疫結合物顯示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性
˙誘導干擾素-γ釋放。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體為單株抗體。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體為人類、人類化或嵌合抗體。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體為結合至TIM3之抗體片段。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體為Fab片段。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體包含 A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含 SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3； 或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3；本發明進一步提供一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
本發明進一步提供一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列，或ii)SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
本發明進一步提供一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
本發明提供一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列，或 ii)SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體為全長IgG1抗體。
在一個實施例中，本發明之抗TIM3抗體為具有突變L234A、L235A及P329G(根據Kabat之EU索引編號)之全長IgG1抗體。
本發明之另一態樣為編碼本發明抗體之分離之核酸。
本發明之另一態樣為包含本發明抗體及細胞毒性劑之免疫結合物。
在本發明之一個較佳實施例中，為此類免疫結合物，其中細胞毒性劑為綠膿桿菌外毒素A或毒傘毒素。
本發明之另一態樣為一種醫藥調配物，其包含本發明抗體或本發明免疫結合物及醫藥學上可接受之載劑。
本發明之另一態樣為本發明抗體或本發明免疫結合物，其係用作藥劑。
本發明之另一態樣為本發明抗體或本發明免疫結合物，其係用於治療癌症。
本發明之另一態樣為本發明抗體或本發明免疫結合物之用途，其係用於製造藥劑。
本發明之另一態樣為本發明抗體或本發明免疫結合物之用途，其係用於製造治療癌症之藥劑。
本發明之另一態樣為一種治療患有癌症之個體的方法，其包含向個體投與有效量之本發明抗體或本發明免疫結合物。
本發明之抗TIM3抗體展示極有價值之特性，如TIM3表現癌細胞上之快且強之內化、以免疫結合物形式(例如當與綠膿桿菌外毒素或毒傘毒素結合時)展示強細胞毒性活性。因此其為治療不同癌症之有用治療劑，尤其血液腫瘤，如白血病及淋巴瘤。此外，其展示混合淋巴細胞反應(MLR)中之強免疫刺激細胞激素釋放，且因此適用作免疫 刺激癌症治療。另外，與親本抗體相比時，人類化抗體型式對CD4 T細胞之結合及結合特異性改良。
圖1A：抗TIM3抗體Tim3_0022(縮寫為<TIM-3>Ab(022))之基於時間依賴性FACS之內化，在37℃下培育之後內化至表現huTIM-3之rec CHOK1細胞中。
圖1B：基於FACS之內化分析的結果展示在37℃下培育之後抗TIM3抗體Tim3_0022(縮寫為<TIM-3>Ab(022))之Fab片段以與完整IgG形式類似之動力學內化至表現huTIM-3之rec CHOK1細胞中。
圖2A：抗TIM3抗體與RPMI-8226細胞之結合(抗體命名純系0016係指抗體Tim3_0016，純系0016係指抗體Tim3_0016變異體(抗體Tim3_0018)，純系0022係指抗體Tim3_00122等)。
圖2B：抗TIM3抗體與Pfeiffer細胞之結合(抗體命名純系0016係指抗體Tim3_0016，純系0016係指抗體Tim3_0016變異體(抗體Tim3_0018)，純系0022係指抗體Tim3_00122等)。
圖3：藉由FACS使用抗TIM-3 mAb得到之不同患者AML細胞樣品上之TIM-3表現量。
圖4：TIM3抗體與不同周邊血液單核細胞(單核細胞、NK細胞、T細胞、CD4 T細胞)之結合的直接比較：
4A：與Tim3_0016變異體(抗體Tim3_0018)及人類化形式結合之陽性細胞的百分比。
4B：平均螢光強度-Tim3_0016變異體(抗體Tim3_0018)及人類化形式與不同周邊血液單核細胞之結合。
4C：Tim3_0028及嵌合及人類化形式結合之陽性細胞的百分比。
4D：平均值螢光強度-Tim3_0028及嵌合及人類化形式與不同周邊血液單核細胞之結合。
I. 定義
出於本文之目的，「接受體人類構架」為包含來源於如下文所定義之人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之輕鏈可變域(VL)構架或重鏈可變域(VH)構架之胺基酸序列的構架。「來源於」人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之接受體人類構架可包含人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之相同胺基酸序列，或其可含有胺基酸序列變化。在一些實施例中，胺基酸變化之數目為10個或10個以下、9個或9個以下、8個或8個以下、7個或7個以下、6個或6個以下、5個或5個以下、4個或4個以下、3個或3個以下、或2個或2個以下。在一些實施例中，VL接受體人類構架之序列與VL人類免疫球蛋白構架序列或人類共同構架序列一致。(適當時定義生殖系)
術語「抗TIM3抗體」及「結合至TIM3之抗體」係指能夠以足夠之親和力結合TIM3之抗體，以使得該抗體適用作靶向TIM3之診斷劑及/或治療劑。在一個實施例中，抗TIM3抗體與不相關非TIM3蛋白之結合程度小於該抗體與TIM3之結合的約10%，如例如藉由表面電漿子共振分析(例如BIACORE)所量測。在某些實施例中，結合至人類TIM3之抗原結合蛋白的結合至人類TIM3之結合親和力KD值1μM、100nM、10nM、1nM、0.1nM、0.01nM或0.001nM(例如10-8M或小於10-8M，例如10-8M至10-13M，例如10-9M至10-13M)。在一個較佳實施例中，在使用人類TIM3之細胞外域(ECD)(TIM3-ECD)對TIM3結合親和力進行之表面電漿子共振分析中確定結合親和力之各別KD值。
術語「抗體」在本文中以最廣泛意義使用且涵蓋各種抗體結構，包括(但不限於)單株抗體、多株抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)及抗體片段，只要其展示所需抗原結合活性即可。
「抗體片段」係指除完整抗體之外的分子，其包含完整抗體之一部分，該部分結合與完整抗體結合之抗原。抗體片段之實例包括(但不限於)Fv、Fab、Fab'、Fab'-SH、F(ab')2；雙功能抗體；線性抗體；單鏈抗體分子(例如scFv)；及由抗體片段形成之多特異性抗體。
與參考抗體「結合於相同抗原決定基之抗體」係指在競爭分析中，阻斷參考抗體與其抗原之結合50%或50%以上的抗體，且相反地，在競爭分析中，參考抗體阻斷該抗體與其抗原之結合50%或50%以上。本文提供一種例示性競爭分析。
術語「嵌合」抗體係指一部分重鏈及/或輕鏈來源於特定來源或物種，而剩餘重鏈及/或輕鏈來源於不同來源或物種之抗體。
抗體之「類別」係指其重鏈所具有之恆定域或恆定區之類型。存在五種主要類別之抗體：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM，且此等類別中之若干者可進一步分成亞類(同型)，例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。對應於不同類別之免疫球蛋白之重鏈恆定域分別稱為α、δ、ε、γ及μ。
如本文所用，術語「細胞毒性劑」係指抑制或防止細胞功能及/或引起細胞死亡或破壞之物質。細胞毒性劑包括(但不限於)放射性同位素(例如At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212及Lu之放射性同位素)；化學治療劑或藥物(例如甲胺喋呤(methotrexate)、阿德力黴素(adriamicin)、長春花生物鹼(長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、依託泊苷(etoposide))、小紅莓(doxorubicin)、美法侖(melphalan)、絲裂黴素C(mitomycin C)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、道諾黴素(daunorubicin)或其他插入劑)；生長抑制劑；酶及其片段，諸如溶核酶；抗生素；毒素，諸如小分子毒素或細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素，包括其片段及/或變異體；以及以下所揭示之各種抗腫瘤或抗癌劑。
在一個較佳實施例中，「細胞毒性劑」為綠膿桿菌外毒素A(或其變異體)，WO2005052006、WO2007016150、WO2007014743、WO2007031741、WO200932954、WO201132022、WO2012/154530及WO 2012/170617，Liu W等人，PNAS 109(2012)11782-11787，Mazor R等人，PNAS 111(2014)8571-8576及AlewineC等人，Mol Cancer Ther.(2014)2653-61。在一個較佳實施例中，「綠膿桿菌外毒素A」包含SEQ ID NO：69之胺基酸序列或包含SEQ ID NO：70之胺基酸序列(其製備亦表述於Mazor R等人，PNAS 111(2014)8571-8576及Alewine C等人，Mol Cancer Ther.(2014)2653-61中)。
在另一較佳實施例中，「細胞毒性劑」為毒傘毒素(或其變異體)，如例如WO2010/115630、WO2010/115629、WO2012/119787、WO2012/041504及WO2014135282中所述，且較佳變異體描述於WO2012/041504(例如經由毒傘毒素胺基酸4之6' C原子，詳言之經由結合至毒傘毒素胺基酸之6' C原子之氧原子結合，且其中TIM3抗體藉由連接子經由尿素部分連接)及WO2014135282中。
藥劑(例如醫藥調配物)之「有效量」係指以所需劑量及持續所需時間段有效達成所要治療或預防結果之量。
本文中之術語「Fc區」用於定義含有至少一部分恆定區之免疫球蛋白重鏈之C端區。該術語包括天然序列Fc區及變異Fc區。在一個實施例中，人類IgG重鏈Fc區自Cys226或自Pro230延伸至重鏈之羧基末端。然而，Fc區之C端離胺酸(Lys447)可存在或可不存在。除非本文另外說明，否則Fc區或恆定區中之胺基酸殘基之編號係根據EU編號系統，亦稱為EU索引，如Kabat,E.A.等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，公共衛生署(Public Health Service)，美國國家衛生研究院(National Institutes of Health),Bethesda,MD(1991)，美國國立衛生研究院公開案(NIH Publication)91-3242中所 述。
「構架」或「FR」係指除高變區(HVR)殘基外之可變域殘基。可變域之FR一般由四個FR域組成：FR1、FR2、FR3及FR4。因此，在VH(或VL)中，HVR及FR序列一般依以下序列呈現：FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
術語「全長抗體」、「完整抗體」及「全抗體」在本文中可互換使用且係指結構實質上類似於天然抗體結構或具有含有如本文所定義之Fc區之重鏈的抗體。
術語「宿主細胞」、「宿主細胞株」及「宿主細胞培養物」可互換使用且係指已引入外源核酸之細胞，包括此類細胞之子代。宿主細胞包括「轉型體」及「轉型細胞」，其包括初級轉型細胞及來源於其之子代(不考慮繼代次數)。子代之核酸含量可與親本細胞不完全相同，而且可含有突變。本文包括針對原始轉型細胞篩選或選擇之具有相同功能或生物活性之突變型子代。
「人類抗體」為胺基酸序列對應於由人類或人類細胞產生或來源於利用人類抗體譜系或其他人類抗體編碼序列之非人類來源之抗體的胺基酸序列之抗體。人類抗體之此定義特定排除包含非人類抗原結合殘基之人類化抗體。
「人類共同構架」為表示所選人類免疫球蛋白VL或VH構架序列中最常出現之胺基酸殘基之構架。一般而言，人類免疫球蛋白VL或VH序列係選自可變域序列之亞群。一般而言，序列亞群為如Kabat,E.A.等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，Bethesda MD(1991)，美國國立衛生研究院公開案91-3242，第1-3卷中之亞群。在一個實施例中，對於VL，亞群為如Kabat等人(同上)中之亞群κ I。在一個實施例中，對於VH，亞群為如Kabat等人(同上)中之亞群III。
「人類化」抗體係指包含來自非人類HVR之胺基酸殘基及來自人類FR之胺基酸殘基之嵌合抗體。在某些實施例中，人類化抗體將包含實質上全部至少一個且典型地兩個可變域，其中全部或實質上全部HVR(例如CDR)對應於非人類抗體之HVR，且全部或實質上全部FR對應於人類抗體之FR。人類化抗體視情況可包含來源於人類抗體之抗體恆定區之至少一部分。抗體(例如非人類抗體)之「人類化形式」係指已經歷人類化之抗體。
如本文所用，術語「高變區」或「HVR」係指抗體可變結構域中序列高變(「互補決定區」或「CDR」)及/或形成結構上定義為環(「高變環」)及/或含有抗原接觸殘基(「抗原觸點」)之各個區域。一般而言，抗體包含六個HVR：三個在VH(H1、H2、H3)中，且三個在VL(L1、L2、L3)中。本文中之例示性HVR包括：(a)出現在胺基酸殘基26-32(L1)、50-52(L2)、91-96(L3)、26-32(H1)、53-55(H2)及96-101(H3)處之高變環(Chothia及Lesk,J.Mol.Biol.196：901-917(1987))；(b)出現在胺基酸殘基24-34(L1)、50-56(L2)、89-97(L3)、31-35b(H1)、50-65(H2)及95-102(H3)處之CDR(Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版.公共衛生署，美國國家衛生研究院，Bethesda,MD(1991))；(c)出現在胺基酸殘基27c-36(L1)、46-55(L2)、89-96(L3)、30-35b(H1)、47-58(H2)及93-101(H3)處之抗原觸點(MacCallum等人，J.Mol.Biol.262：732-745(1996))；及(d)(a)、(b)及/或(c)之組合，包括HVR胺基酸殘基46-56(L2)、47-56(L2)、48-56(L2)、49-56(L2)、26-35(H1)、26-35b(H1)、49-65(H2)、93-102(H3)及94-102(H3)。
除非另外指示，否則在本文中根據Kabat等人(同上)對可變域中 之HVR殘基及其他殘基(例如FR殘基)進行編號。
「免疫結合物」為結合至一或多個異源分子，包括(但不限於)細胞毒性劑之抗體。在一個較佳實施例中，免疫結合物為結合至一或多種細胞毒性劑(較佳為綠膿桿菌外毒素A或毒傘毒素)之如本文所述之抗TIM3抗體。
「個體(individual)」或「個體(subject)」為哺乳動物。哺乳動物包括(但不限於)馴養動物(例如牛、羊、貓、狗及馬)、靈長類動物(例如人類及非人類靈長類，諸如猴)、兔及嚙齒動物(例如小鼠及大鼠)。在某些實施例中，該個體(individual)或個體(subject)為人類。
「分離之」抗體為已與其天然環境之組分分離之抗體。在一些實施例中，抗體純化達到大於95%或99%之純度，如藉由例如電泳(例如SDS-PAGE、等電聚焦(IEF)、毛細電泳法)或層析(例如離子交換或逆相HPLC)所確定。關於抗體純度評估方法之綜述，參見例如Flatman,S.等人，J.Chromatogr.B 848(2007)79-87。
「分離之」核酸係指已與其天然環境之組分分離之核酸分子。分離之核酸包括通常含有核酸分子之細胞中所含之核酸分子，但該核酸分子存在於染色體外或存在於不同於其天然染色體位置之染色體位置。
「編碼抗TIM3抗體之分離之核酸」係指編碼抗體重鏈及輕鏈(或其片段)之一或多個核酸分子，包括單一載體或各別載體中之此類核酸分子及存在於宿主細胞中之一或多個位置處之此類核酸分子。
如本文所使用，術語「單株抗體」係指自實質上均質抗體之群體獲得之抗體，亦即除可能之變異型抗體(例如含有天然存在之突變或在產生單株抗體製劑期間產生之變異抗體，此等變異體一般以較小量存在)之外，構成該群體之個別抗體相同及/或結合相同抗原決定基。相比於通常包括針對不同決定子(抗原決定基)之不同抗體的多株 抗體製劑，單株抗體製劑之各單株抗體係針對抗原上之單一決定子。因此，修飾語「單株」指示抗體之特徵為自實質上均質之抗體群體獲得，且不應解釋為需要藉由任何特定方法產生該抗體。舉例而言，根據本發明使用之單株抗體可藉由多種技術製得，包括(但不限於)融合瘤方法、重組DNA方法、噬菌體呈現方法及利用含有所有或部分人類免疫球蛋白基因座之轉殖基因動物的方法、本文所描述之製得單株抗體之此類方法及其他例示性方法。
「裸抗體」係指未與異源部分(例如細胞毒性部分)或放射性標記結合之抗體。裸抗體可存在於醫藥調配物中。(若先前技術具有免疫結合物，則包括)。
「天然抗體」係指具有不同結構之天然存在之免疫球蛋白分子。舉例而言，天然IgG抗體為約150,000道爾頓(dalton)之雜四聚體醣蛋白，其由二硫化物鍵結之兩條相同輕鏈及兩條相同重鏈構成。自N端至C端，各重鏈具有可變區(VH)，亦稱為可變重鏈域或重鏈可變域，隨後為三個恆定域(CH1、CH2及CH3)。類似地，自N端至C端，各輕鏈具有可變區(VL)，亦稱為可變輕鏈域或輕鏈可變域，隨後為恆定輕鏈(CL)域。抗體輕鏈可基於其恆定域之胺基酸序列歸為兩種類型中之一種，稱為(κ)及(λ)。
術語「藥品說明書」用於指通常包括於治療性產品之商業包裝中之說明書，其含有關於與使用此類治療性產品有關之適應症、用法、劑量、投藥、組合療法、禁忌及/或警告的資訊。
相對於參考多肽序列之「胺基酸序列一致性百分比(%)」定義為在比對序列且引入空位(若需要)以達到最大序列一致性百分比之後，候選序列中與參考多肽序列中之胺基酸殘基一致之胺基酸殘基的百分比，且任何保守性取代不視為序列一致性之一部分。出於確定胺基酸序列一致性百分比之目的之比對可以此項技術內之各種方式實現，例 如使用公開可獲得之電腦軟體，如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。熟習此項技術者可確定適用於比對序列之參數，包括在所比較序列之全長內達成最大比對所需的任何算法。然而，出於本文之目的，使用序列比較電腦程式ALIGN-2產生胺基酸序列一致性%值。ALIGN-2序列比較電腦程式由Genentech,Inc.創作，且原始碼已隨使用者文件一起提交於美國版權局(U.S.Copyright Office),Washington D.C.,20559，其在美國版權局以美國版權登記號TXU510087登記。ALIGN-2程序可公開獲自Genentech,Inc.,South San Francisco,California，或可自原始碼編寫。ALIGN-2程序經編寫可用於UNIX操作系統，包括數位UNIX V4.0D。所有序列比較參數由ALIGN-2程序設定且不變化。
在採用ALIGN-2進行胺基酸序列比較之情形下，既定胺基酸序列A與既定胺基酸序列B之胺基酸序列一致性%(或者，其可表述為與既定胺基酸序列B具有或包含一定胺基酸序列一致性%之既定胺基酸序列A)如下計算：100乘以分率X/Y
其中X為在A與B之比對程式中藉由序列比對程程式ALIGN-2評為一致匹配之胺基酸殘基之數目，且其中Y為B中之胺基酸殘基之總數目。應瞭解，在胺基酸序列A之長度與胺基酸序列B之長度不相等之情況下，A相對於B之胺基酸序列一致性%與B相對於A之胺基酸序列一致性%將不相等。除非另外特定陳述，否則本文所用之所有胺基酸序列一致性%值係如前一段落中剛剛所述使用ALIGN-2電腦程式獲得。
術語「醫藥調配物」係指呈准許其中所含活性成分之生物活性有效之形式且不含對調配物將投與之個體具有不可接受之毒性的其他組分的製劑。
「醫藥學上可接受之載劑」係指醫藥調配物中除活性成分外之對個體無毒的成分。醫藥學上可接受之載劑包括(但不限於)緩衝劑、賦形劑、穩定劑或防腐劑。
除非另有指示，否則如本文所用，術語「TIM3」係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)及嚙齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何天然T細胞免疫球蛋白黏蛋白3(TIM3)蛋白(亦稱為A型肝炎病毒細胞受體2(HAVcr-2)、腎臟損傷分子-3(KIM-3)、TIM-3、Tim3或Tim-3)。該術語涵蓋「全長」未經處理之TIM3以及由在該細胞中處理產生之任何形式之TIM3。該術語亦涵蓋天然存在之TIM3變異體，例如剪接變異體或對偶基因變異體。例示性人類TIM3之胺基酸序列以SEQ ID NO：77展示。TIM3之細胞外域(ECD)之胺基酸序列以SEQ ID NO：78展示。
TIM3為屬於蛋白質之免疫球蛋白超家族及TIM家族之人類蛋白質。在人類中，與小鼠類似，TIM-3表現於T細胞以及諸如巨噬細胞及樹突狀細胞之吞噬細胞上。TIM-3與蛋白質配位體(例如半乳糖凝集素-9)之結合可經由細胞凋亡誘導機制來抑制Th1反應，且因此導致諸如誘導外周耐受性。用siRNA降低人類TIM-3之表現或藉由阻斷抗體抑制人類TIM-3會增加自CD4陽性T細胞分泌干擾素α，支持人類T細胞中之TIM-3之抑制作用。在吞噬細胞中，TIM-3亦充當識別凋亡細胞之受體。來自自體免疫疾病患者之臨床樣品之分析顯示TIM-3未表現於CD4陽性細胞中。詳言之，在來源於患有多發性硬化症之患者之腦脊髓液的T細胞純系中，TIM-3之表現量低於且IFN-γ之分泌量高於來源於正常健康人之純系(Koguchi K等人，J Exp Med.203(2006)1413-1418)。
存在關於TIM-3與過敏性疾病或哮喘之關係的報導(WO96/27603及WO2003/063792)。
根據來自急性骨髓性白血病(在下文中稱為「AML」)患者之造血幹細胞及正常造血幹細胞之微陣列分析，TIM-3表現於AML幹細胞上且因此該分析提出TIM-3與血液科惡性病有關(Majeti R等人，PNAS,106(2009)3396-3401及WO2009/091547)。
抗TIM-3單株抗體之實例包括抗人類TIM-3大鼠單株抗體(純系344823，由R&D Systems製得)及抗人類TIM-3小鼠單株抗體(純系F38-2E2，由R&D Systems製得)。
如本文所用，「治療(treatment)」(及其語法變化形式，諸如「治療(treat)」或「治療(treating)」)係指試圖改變所治療個體之自然病程的臨床介入且可出於防治目的或在臨床病理學之病程期間進行。所需治療作用包括(但不限於)預防疾病發生或復發、緩解症狀、減輕疾病之任何直接或間接病理性後果、預防癌轉移、降低疾病進展速率、改善或緩和疾病病況及緩解或改善預後。在一些實施例中，本發明之抗體用於延遲疾病發展或減慢疾病進展。
術語「可變區」或「可變域」係指涉及抗體結合至抗原的抗體重鏈或輕鏈域。天然抗體之重鏈及輕鏈(分別為VH及VL)可變域一般具有類似的結構，其中各域包含四個保守性構架區(FR)及三個高變區(HVR)。(參見例如Kindt,T.J.等人，Kuby Immunology，第6版，W.H.Freeman and Co.,N.Y.(2007)，第91頁)單一VH或VL域可足以賦予抗原結合特異性。此外，可使用來自結合抗原之抗體的VH或VL域分離結合特定抗原之抗體以分別篩選互補VL或VH結構域之文庫。參見例如Portolano,S.等人，J.Immunol.150(1993)880-887；Clackson,T.等人，Nature 352(1991)624-628。
如本文所用，術語「載體」係指一種核酸分子，其能夠傳送其所連接之另一核酸。該術語包括呈自我複製核酸結構之載體以及併入至已引入其之宿主細胞之基因組中的載體。某些載體能夠導引可操作 地連接其之核酸的表現。此類載體在本文中稱為「表現載體」。
II. 組合物及方法
在一個態樣中，本發明部分基於所選本發明之抗TIM3抗體結合至TIM3之某些抗原決定基之研究結果，展示強且快之內化及/或以免疫結合物形式展示對癌細胞的高細胞毒性活性及/或展示強免疫刺激細胞激素(例如干擾素γ)釋放。在某些實施例中，提供結合至TIM3之抗體。本發明抗體適用於例如診斷或治療癌症。
A. 例示性抗TIM3抗體
在一個態樣中，本發明提供結合至TIM3之分離之抗體。在某些實施例中，提供一種抗TIM3，其中該抗體：
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少50%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後抗體誘導至少60%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
在某些實施例中，提供一種抗TIM3，其中該抗體：
˙與包含Tim3_0016之VH及VL的抗Tim3抗體競爭以結合至TIM3
˙結合至人類及食蟹獼猴TIM3
˙以免疫結合物形式展示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性(在一個實施例中，免疫結合物以綠膿桿菌外毒素A結合物形式對RPMI-8226細胞具有0.1或小於0.1之相對細胞毒性活性IC50值(如實例11中所量測)
˙誘導干擾素-γ釋放(在MLR分析中-參見實例5)。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺 基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及 (b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；或包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體(a)VH域，其包含：(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：7之VH序列及SEQ ID NO：8之VL序列；ii)SEQ ID NO：9之VH序列及SEQ ID NO：10之VL序列；iii)或i)或ii)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個較佳實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列，或ii)SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
一個較佳實施例為結合至人類TIM3抗體之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列。
一個較佳實施例為結合至人類TIM3抗體之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：17之 胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：19之VH序列及SEQ ID NO：20之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：21之 胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：27之VH序列及SEQ ID NO：28之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：35之VH序列及SEQ ID NO：36之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：43之VH序列及SEQ ID NO：44之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個較佳實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列，或ii)SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
一個較佳實施例為結合至人類TIM3抗體之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列。
一個較佳實施例為結合至人類TIM3抗體之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：51之VH序列及SEQ ID NO：52之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i) 包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：59之VH序列及SEQ ID NO：60之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個選自以下之HVR：(a)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體，其包含(a)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)包含至少一個、至少兩個或 所有三個選自以下之VH HVR序列的VH域：(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)包含至少一個、至少兩個或所有三個選自以下之VL HVR序列的VL域：(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1、(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(c)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1、(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個實施例中，此類抗TIM3抗體包含i)SEQ ID NO：67之VH序列及SEQ ID NO：68之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在以上實施例中之任一者中，抗TIM3抗體為人類化的。在一個實施例中，抗TIM3抗體包含如任何以上實施例中之HVR且進一步包含接受體人類構架，例如人類免疫球蛋白構架或人類共同構架。在另一實施例中，抗TIM3抗體包含如任何以上實施例中之HVR，且進一步包含包含此類HVR之VH及VL。
在另一態樣中，本發明提供一種結合至與本文提供抗TIM3抗體相同之抗原決定基的抗體。舉例而言，在某些實施例中，抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：7之VH序列及SEQ ID NO：8之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：9之VH序列及SEQ ID NO：10之VL序列的抗TIM3抗 體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：19之VH序列及SEQ ID NO：20之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：27之VH序列及SEQ ID NO：28之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：35之VH序列及SEQ ID NO：36之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：43之VH序列及SEQ ID NO：44之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：51之VH序列及SEQ ID NO：52之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：59之VH序列及SEQ ID NO：60之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基，或抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：67之VH序列及SEQ ID NO：68之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基。
在一個較佳實施例中，抗體之其限制條件為結合至與包含SEQ ID NO：7之VH序列及SEQ ID NO：8之VL序列的抗TIM3抗體相同之抗原決定基。
在一個較佳實施例中，抗體之其限制條件為與包含SEQ ID NO：7之VH序列及SEQ ID NO：8之VL序列的之抗TIM3抗體競爭以結合至人類TIM3(如實例4中關於RPMI-8226細胞(ATCC®CCL-155TM)所述之競爭分析中所確定)。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體(例如結合至人類TIM3之抗體)，其包含A)(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基 酸序列的HVR-L3；或B)(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或 G)(a)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
在另一態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體(例如結合至人類TIM3之抗體)，其包含A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸 序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR- H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含 SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
在一個態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體(例如結合至人類TIM3之抗體)，其Al)i)包含SEQ ID NO：7之VH序列及SEQ ID NO：8之VL序列；ii)包含SEQ ID NO：9之VH序列及SEQ ID NO：10之VL序列；iii)或i)或ii)下抗體之VH及VL之人類化變異體；或A2)i)包含SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列，或ii)包含SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
或B)i)包含SEQ ID NO：19之VH序列及SEQ ID NO：20之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體；或C)i)包含SEQ ID NO：27之VH序列及SEQ ID NO：28之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體；或D)i)包含SEQ ID NO：35之VH序列及SEQ ID NO：36之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體；或E)i)包含SEQ ID NO：43之VH序列及SEQ ID NO：44之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體；或F)i)包含SEQ ID NO：51之VH序列及SEQ ID NO：52之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體； 或G1)i)包含SEQ ID NO：59之VH序列及SEQ ID NO：60之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體；或G2)i)包含SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列，或ii)包含SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
或H)i)包含SEQ ID NO：67之VH序列及SEQ ID NO：68之VL序列；ii)或i)下抗體之VH及VL之人類化變異體。
在另一態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體(例如結合至人類TIM3之抗體)，其包含A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基 酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或 H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3；其中該抗體之特徵獨立地為以下特性中之一或多者：抗TIM3抗體
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少50%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見 實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後抗體誘導至少60%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
在另一態樣中，本發明提供一種抗TIM3抗體(例如結合至人類TIM3之抗體)，其包含A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或 D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自 SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3；其中該抗體之特徵獨立地為以下特性中之一或多者：抗TIM3抗體
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少50%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後抗體誘導至少60%之 TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙與包含SEQ ID NO：7之VH及SEQ ID NO：8之VL的抗Tim3抗體競爭以結合至TIM3。
˙結合至人類及食蟹獼猴TIM3
˙以免疫結合物形式展示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性(在一個實施例中，免疫結合物以綠膿桿菌外毒素A結合物形式對RPMI-8226細胞具有0.1或小於0.1之相對細胞毒性活性IC50值(如實例11中所量測),
˙誘導干擾素-γ釋放(在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中，如實例5中所述)。
在本發明之另一態樣中，根據以上實施例中之任一者之抗TIM3抗體為單株抗體，包括嵌合抗體、人類化抗體或人類抗體。在一個實施例中，抗TIM3抗體為抗體片段，例如Fv、Fab、Fab'、scFv、雙功能抗體或F(ab')2片段。在另一個實施例中，該抗體為全長抗體，例如完整IgG1或IgG4抗體或如本文所定義之其他抗體類別或同型。
在另一態樣中，根據以上實施例中之任一者之抗TIM3抗體可合併如以下部分1至7中所述之單一或組合之特徵中之任一者。
1. 抗體親和力
在某些實施例中，本文所提供之抗體之解離常數KD1μM、100nM、10nM、1nM、0.1nM、0.01nM或0.001nM(例如10-8M或小於10-8M，例如10-8M至10-13M，例如10-9M至10-13M)。
在一個較佳實施例中，使用表面電漿子共振分析、使用 BIACORE®、在25℃下用固定抗原CM5晶片在約10個響應單元(RU)下量測KD。簡言之，根據供應商之說明書，以N-乙基-N'-(3-二甲胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基丁二醯亞胺(NHS)活化羧甲基化葡聚糖生物感測器晶片(CM5,BIACORE,Inc.)。抗原用10mM乙酸鈉pH 4.8稀釋至5μg/ml(約0.2μM)，隨後在5微升/分鐘之流動速率下注射以獲得大約10個響應單元(RU)之偶合蛋白質。在抗原注射後，注射1M乙醇胺以阻斷未反應之基團。關於動力學量測，在25℃下，以約25μl/min之流動速率注射於含0.05%聚山梨醇酯20(TWEEN-20TM)界面活性劑之PBS(PBST)中之Fab兩倍連續稀釋液(0.78nM至500nM)。使用簡單的一比一朗格繆爾結合模型(one-to-one Langmuir binding model)(BIACORE®評估軟體3.2版)藉由同時擬合締合及解離感測圖譜來計算締合速率(kon或ka)及解離速率(koff或kd)。平衡解離常數KD計算為比率kd/ka(koff/kon)。參見例如Chen,Y.等人，J.Mol.Biol.293(1999)865-881。若藉由上文之表面電漿子共振分析得到之締合速率超過106M-1s-1，則締合速率可使用螢光淬滅技術確定，該技術在如光譜儀(諸如具有攪拌式光析槽之止流裝備型分光光度計(Aviv Instruments)或8000-系列SLM-AMINCOTM分光光度計(ThermoSpectronic))中所量測之濃度增加之抗原存在下、在25℃下量測PBS中之20nM抗-抗原抗體(Fab形式)(pH 7.2)之螢光發射強度(激發=295nm；發射=340nm，16nm帶通)之增加或減少。
2. 抗體片段
在某些實施例中，本文所提供之抗體為抗體片段。抗體片段包括(但不限於)Fab、Fab'、Fab'-SH、F(ab')2、Fv及scFv片段及下文所述之其他片段。關於某些抗體片段之綜述，參見Hudson,P.J.等人，Nat.Med.9(2003)129-134。關於scFv片段之評述，參見例如Plueckthun,A.,In；The Pharmacology of Monoclonal Antibodies，第113 卷，Rosenburg及Moore(編)，Springer-Verlag,New York(1994)，第269-315頁；亦參見WO 93/16185；及美國專利第5,571,894號及第5,587,458號。關於包含救助受體結合抗原決定基殘基及具有延長之活體內半衰期之Fab及F(ab')2片段的論述，參見美國專利第5,869,046號。
雙功能抗體為具有兩個抗原結合位點之抗體片段，其可為二價或雙特異性抗體片段。參見例如EP 0 404 097；WO 1993/01161；Hudson,P.J.等人，Nat.Med.9(2003)129-134；及Holliger,P.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90(1993)6444-6448。三功能抗體及四功能抗體亦描述於Hudson,P.J.等人，Nat.Med.9(20039 129-134)中。
單域抗體為包含抗體之重鏈可變域之全部或一部分或輕鏈可變域之全部或一部分的抗體片段。在某些實施例中，單域抗體為人類單域抗體(Domantis,Inc.,Waltham,MA；參見例如美國專利第6,248,516 B1號)。
抗體片段可藉由各種技術製得，包括(但不限於)完整抗體之蛋白分解消化以及藉由重組型宿主細胞(例如大腸桿菌或噬菌體)產生，如本文中所述。
3. 嵌合及人類化抗體
在某些實施例中，本文提供之抗體為一種嵌合抗體。某些嵌合抗體描述於例如美國專利第4,816,567號；及Morrison,S.L.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81(1984)6851-6855)中。在一個實例中，嵌合抗體包含非人類可變區(例如來源於小鼠、大鼠、倉鼠、兔或非人類靈長類動物(諸如猴)之可變區)及人類恆定區。在另一實例中，嵌合抗體為「類別轉換」抗體，其中類別或亞類已自親本抗體之類別或亞類變化。嵌合抗體包括其抗原結合片段。
在某些實施例中，嵌合抗體為人類化抗體。通常，對非人類抗 體進行人類化以降低對人類之免疫原性，同時保留親本非人類抗體之特異性及親和力。一般而言，人類化抗體包含一或多個可變域，其中HVR(例如CDR)(或其部分)來源於非人類抗體，且FR(或其部分)來源於人類抗體序列。人類化抗體視情況亦包含人類恆定區之至少一部分。在一些實施例中，人類化抗體中之一些FR殘基經來自非人類抗體(例如HVR殘基所來源之抗體)之相應殘基取代以例如恢復或提高抗體特異性或親和力。
人類化抗體及其製造方法綜述於例如Almagro,J.C.及Fransson,J.,Front.Biosci.13(2008)1619-1633中，且進一步描述於例如Riechmann,I.等人，Nature 332(1988)323-329；Queen,C.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86(1989)10029-10033；美國專利第5,821,337號、第7,527,791號、第6,982,321號及第7,087,409號；Kashmiri,S.V.等人，Methods 36(2005)25-34(描述SDR(a-CDR)移植)；Padlan,E.A.,Mol.Immunol.28(1991)489-498(描述「表面再塑」)；Dall'Acqua,W.F.等人，Methods 36(2005)43-60(描述「FR改組」)；及Osbourn,J.等人，Methods 36(2005)61-68及Klimka,A.等人，Br.J.Cancer 83(2000)252-260(描述FR改組之「導引選擇」方法)中。
可用於人類化之人類構架區包括(但不限於)：使用「最佳擬合」方法選擇之構架區(參見例如Sims,M.J.等人，J.Immunol.151(1993)2296-2308)；來源於具有輕鏈或重鏈可變區之特定亞群之人類抗體共同序列的構架區(參見例如Carter,P.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89(1992)4285-4289；及Presta,L.G.等人，J.Immunol.151(1993)2623-2632)；人類成熟(體細胞突變)構架區或人類生殖系構架區(參見例如Almagro,J.C.及Fransson,J.,Front.Biosci.13(2008)1619-1633)；及來源於篩選FR庫之構架區(參見例如Baca,M.等人，J.Biol.Chem.272(1997)10678-10684及Rosok,M.J.等人，J.Biol.Chem.271(19969 22611-22618))。
4. 人類抗體
在某些實施例中，本文所提供之抗體為人類抗體。可使用此項技術中已知之各種技術來產生人類抗體。人類抗體一般描述於van Dijk,M.A.及van de Winkel,J.G.,Curr.Opin.Pharmacol.5(2001)368-374及Lonberg,N.,Curr.Opin.Immunol.20(2008)450-459中。
人類抗體可藉由將免疫原投與已經改造可響應於抗原攻毒而產生完整人類抗體或具有人類可變區之完整抗體的轉殖基因動物來製備。此類動物通常含有人類免疫球蛋白基因座的全部或一部分，其置換內源性免疫球蛋白基因座，或存在於染色體外或隨機整合至動物染色體中。在此類轉殖基因小鼠中，內源性免疫球蛋白基因座一般已不活化。關於自轉殖基因動物獲得人類抗體之方法的綜述，參見Lonberg,N.,Nat.Biotech.23(2005)1117-1125。亦參見例如美國專利第6,075,181號及第6,150,584號，其描述XENOMOUSETM技術；美國專利第5,770,429號，其描述HUMAB®技術；美國專利第7,041,870號，其描述K-M MOUSE®技術及美國專利申請公開案第US 2007/0061900號，其描述VELOCIMOUSE®技術)。藉由此類動物產生之來自完整抗體之人類可變區可例如藉由與不同人類恆定區組合而經進一步修飾。
人類抗體亦可藉由基於融合瘤之方法製備。已描述用於產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類雜骨髓瘤細胞株。(參見例如Kozbor,D.,J.Immunol.133(1984)3001-3005；Brodeur,B.R.等人，Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,Marcel Dekker,Inc.,New York(1987)，第51-63頁；及Boerner,P.等人，J.Immunol.147(1991)86-95)經由人類B細胞融合瘤技術產生之人類抗體亦描述於Li,J.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 103(2006)3557- 3562。其他方法包括描述於例如美國專利第7,189,826號(描述自融合瘤細胞株產生單株人類IgM抗體)及Ni,J.,Xiandai Mianyixue 26(2006)265-268(描述人類-人類融合瘤)中之彼等方法。人類融合瘤技術(三源雜交瘤技術)亦描述於Vollmers,H.P.及Brandlein,S.,Histology and Histopathology 20(2005)927-937及Vollmers,H.P.及Brandlein,S.,Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology 27(2005)185-191中。
人類抗體亦可藉由分離選自人類源噬菌體呈現文庫之Fv純系可變域序列產生。此類可變域序列接著可與所需人類恆定域組合。下文描述用於自抗體文庫選擇人類抗體之技術。
5. 文庫源抗體
本發明抗體可藉由針對具有所需活性之抗體篩選組合文庫來分離。舉例而言，此項技術中已知多種方法用於產生噬菌體呈現文庫及針對具有所需結合特徵之抗體篩選此類文庫。此類方法綜述於例如Hoogenboom,H.R.等人，Methods in Molecular Biology 178(2001)1-37中，且進一步描述於例如McCafferty,J.等人，Nature 348(1990)552-554；Clackson,T.等人，Nature 352(1991)624-628；Marks,J.D.等人，J.Mol.Biol.222(1992)581-597；Marks,J.D.及Bradbury,A.,Methods in Molecular Biology 248(2003)161-175；Sidhu,S.S.等人，J.Mol.Biol.338(2004)299-310；Lee,C.V.等人，J.Mol.Biol.340(2004)1073-1093；Fellouse,F.A.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(2004)12467-12472；及Lee,C.V.等人，J.Immunol.Methods 284(2004)119-132中。
在某些噬菌體呈現方法中，VH及VL基因之譜系藉由聚合酶鏈式反應(PCR)單獨選殖且在噬菌體庫中隨機重組，其可接著如Winter等人，Ann.Rev.Immunol.12(1994)433-455中所述篩選抗原結合噬菌 體。噬菌體通常以單鏈Fv(scFv)片段或Fab片段形式呈現抗體片段。來自經免疫來源之文庫提供抗免疫原之高親和力抗體而無需構築融合瘤。或者，可將原始譜系純系化(例如自人類)以提供抗各種非自體抗原以及自體抗原之抗體之單一來源而無需任何免疫接種，如Griffiths,A.D.等人，EMBO J.12(1993)725-734所述。最後，亦可藉由自幹細胞選殖未重排之V基因區段且使用含有隨機序列之PCR引子編碼高可變CDR3區且完成活體外重排來以合成方式製造原始文庫，如Hoogenboom,H.R.及Winter,G.,J.Mol.Biol.227(1992)381-388所述。描述人類抗體噬菌體文庫之專利公開案包括例如：美國專利第5,750,373號及美國專利公開案第2005/0079574號、第2005/0119455號、第2005/0266000號、第2007/0117126號、第2007/0160598號、第2007/0237764號、第2007/0292936號及第2009/0002360號。
自人類抗體文庫分離之抗體或抗體片段在本文中視為人類抗體或人類抗體片段。
6. 多特異性抗體
在某些實施例中，本文所提供之抗體為多特異性抗體，例如雙特異性抗體。多特異性抗體為對至少兩個不同位點具有結合特異性之單株抗體。在某些實施例中，結合特異性中之一者係針對TIM3且另一者係針對任何其他抗原。在某些實施例中，雙特異性抗體可與TIM3之兩個不同抗原決定基結合。雙特異性抗體亦可用以使細胞毒素劑定位於表現TIM3之細胞上。雙特異性抗體可製備為全長抗體或抗體片段。
用於製造多特異性抗體之技術包括(但不限於)重組共表現具有不同特異性之兩個免疫球蛋白重鏈-輕鏈對(參見Milstein,C.及Cuello,A.C.,Nature 305(1983)537-540；WO 93/08829；及Traunecker,A.等人，EMBO J.10(1991)3655-3659)及「杵-臼」工程改造(參見例如美 國專利第5,731,168號)。多特異性抗體亦可由以下製得：製造抗體Fc-雜二聚分子之工程改造靜電轉向效應(WO 2009/089004)；交聯兩種或兩種以上抗體或片段(參見例如美國專利第4,676,980號及Brennan,M.等人，Science 229(1985)81-83)；使用白胺酸拉鏈產生雙特異性抗體(參見例如Kostelny,S.A.等人，J.Immunol.148(1992)1547-1553)；使用製造雙特異性抗體片段之「雙功能抗體」技術(參見例如Holliger,P.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90(1993)6444-6448)；及使用單鏈Fv(scFv)二聚體(參見例如Gruber,M等人，J.Immunol.152(1994)5368-5374)；及如例如Tutt,A.等人J.Immunol.147(1991)60-69中所述製備三特異性抗體。
本文中亦包括具有三個或三個以上功能性抗原結合位點之工程改造抗體，包括「章魚抗體」(參見例如US 2006/0025576)。
本文之抗體或片段亦包括包含結合至TIM3以及另一不同抗原之抗原結合位點的「雙作用Fab」或「DAF」(參見例如US 2008/0069820)。
在本文中抗體或片段亦包括以下中所述之多特異性抗體：WO 2009/080251、WO 2009/080252、WO 2009/080253、WO 2009/080254、WO 2010/112193、WO 2010/115589、WO 2010/136172、WO 2010/145792及WO 2010/145793、WO2011/117330、WO2012/025525、WO2012/025530、WO2013/026835、WO2013/026831、WO2013/164325或WO 2013/174873。
7. 抗體變異體
在某些實施例中，涵蓋本文所提供之抗體之胺基酸序列變異體。舉例而言，可能需要改進抗體之結合親和力及/或其他生物特性。抗體之胺基酸序列變異體可藉由將適當修飾引入編碼該抗體之核苷酸序列中或藉由肽合成製備。此類修飾包括例如發生於抗體胺基酸 序列內的殘基缺失及/或插入及/或取代。可進行缺失、插入及取代之任何組合以獲得最終構築體，其限制條件為最終構築體具有所需特徵，例如抗原結合。
a)取代、插入及缺失變異體
在某些實施例中，提供具有一或多個胺基酸取代之抗體變異體。用於取代突變誘發之相關位點包括HVR及FR。例示性變化以標題「例示性取代」提供於表1中，且如下文參考胺基酸側鏈類別進一步描述。保守取代以標題「較佳取代」展示於表1中。胺基酸取代可引入至相關抗體中且針對所需活性篩選產物，例如保留/提高之抗原結合、降低之免疫原性或改善之ADCC或CDC的產物。
胺基酸可根據共有側鏈特性進行分組：(1)疏水性：正白胺酸、Met、Ala、Val、Leu、Ile； (2)中性親水性：Cys、Ser、Thr、Asn、Gln；(3)酸性：Asp、Glu；(4)鹼性：His、Lys、Arg；(5)影響鏈取向之殘基：Gly、Pro；(6)芳族：Trp、Tyr、Phe。
非保守取代將需要將此等類別中之一者之成員換成另一類別。
一種類型之取代型變異體涉及取代親本抗體(例如人類化抗體或人類抗體)之一或多個高變區殘基。一般而言，選用於進一步研究之所得變異體相對於親本抗體將在某些生物特性方面具有修飾(例如改良)(例如親和力提高、免疫原性降低)及/或將實質上保留親本抗體之某些生物特性。例示性取代型變異體為親和力成熟抗體，其可例如使用基於噬菌體呈現之親和力成熟技術(諸如本文所描述之彼等技術)來便利地產生。簡言之，使一或多個HVR殘基突變，且在噬菌體上呈現變異抗體且針對特定生物活性(例如結合親和力)進行篩選。
改變(例如取代)可在HVR中進行以例如提高抗體親和力。此類改變可在HVR「熱點」，亦即藉由密碼子編碼之殘基中，該等殘基在體細胞成熟過程中經歷高頻突變(參見例如Chowdhury,P.S.,Methods Mol.Biol.207(2008)179-196)，及/或SDR(a-CDR)中進行，測試所得變異型VH或VL之結合親和力。藉由構築及自二級庫再選擇之親和力成熟已描述於例如Hoogenboom,H.R.等人Methods in Molecular Biology 178(2002)1-37中。在親和力成熟之一些實施例中，藉由多種方法(例如易錯PCR、鏈改組或寡核苷酸引導之突變誘發)中之任一者將多樣性引入所選用於成熟之可變基因中。接著產生二級文庫。接著篩選該庫以鑑別具有所需親和力之任何抗體變異體。引入多樣性之另一方法涉及HVR引導途徑，其中將若干HVR殘基(例如一次4-6個殘基)隨機分組。涉及抗原結合之HVR殘基可特定鑑別，例如使用丙胺 酸掃描突變誘發或模型化來鑑別。特定言之，通常靶向CDR-H3及CDR-L3。
在某些實施例中，取代、插入或缺失可發生在一或多個HVR內，只要此類改變不實質上降低抗體結合抗原之能力即可。舉例而言，可在HVR中進行不實質上降低結合親和力之保守改變(例如如本文所提供之保守取代)。此類改變可在HVR「熱點」或SDR外。在上文提供之變異型VH及VL序列之某些實施例中，各HVR未改變或含有不超過一個、兩個或三個胺基酸取代。
一種適用於鑑別可經靶向以用於突變誘發之抗體之殘基或區域的方法稱為「丙胺酸掃描突變誘發」，如由Cunningham,B.C.及Wells,J.A.,Science 244(1989)1081-1085所描述。在此方法中，鑑別出一個殘基或一組標靶殘基(例如帶電荷殘基，諸如arg、asp、his、lys及glu)且將其置換為中性或帶負電荷胺基酸(例如丙胺酸或聚丙胺酸)以判定抗體與抗原之相互作用是否受到影響。可在對初始取代展現功能敏感性之胺基酸位置處引入其他取代。或者或另外，抗原-抗體複合物之晶體結構用於鑑別抗體與抗原之間的接觸點。此類接觸殘基及鄰近殘基可作為取代候選物之目標或排除在取代候選物之外。可篩選變異體以確定其是否含有所需特性。
胺基酸序列插入包括長度在一個殘基至含有一百個或超過一百個殘基之多肽範圍內的胺基末端及/或羧基末端融合，以及單一或多個胺基酸殘基之序列內插入。末端插入之實例包括具有N端甲硫胺醯基殘基之抗體。抗體分子之其他插入型變體包括抗體之N端或C端與酶(例如對於ADEPT而言)或延長抗體之血清半衰期之多肽的融合體。
b)Fc區變異體
在某些實施例中，可將一或多個胺基酸修飾引入本文所提供之抗體之Fc區中，從而產生Fc區變異體。Fc區變異體可包含人類Fc區序 列(例如人類IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 Fc區)，其在一或多個胺基酸位置處包含胺基酸修飾(例如取代)。
效應功能降低之抗體包括Fc區殘基238、265、269、270、297、327及329中之一或多者發生取代之抗體(美國專利第6,737,056號)。此類Fc突變體包括具有胺基酸位置265、269、270、297及327中之兩者或兩者以上之取代的Fc突變體，包括殘基265及297取代為丙胺酸的所謂「DANA」Fc突變體(美國專利第7,332,581號)。
描述具有提高或降低之與FcR之結合的某些抗體變異體。(參見例如美國專利第6,737,056號；WO 2004/056312及Shields,R.L等人，J.Biol.Chem.276(2001)6591-6604)。
在本發明之一個實施例中，此類抗體為具有突變L234A及L235A或具有突變L234A、L235A及P329G之IgG1。在另一實施例中，為具有突變S228P及L235E或S228P、L235E及P329G之IgG4(根據Kabat等人之EU索引編號，Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，公共衛生署，美國國家衛生研究院，Bethesda,MD,1991)。
半衰期延長且與負責將母體IgG轉移至胎兒之新生兒Fc受體(FcRn)(Guyer,R.L.等人，J.Immunol.117(1976)587-593；及Kim,J.K.等人，J.Immunol.24(1994)2429-2434)之結合改良之抗體描述於US 2005/0014934中。彼等抗體包含具有一或多個取代之Fc區，在其中Fc區與FcRn之結合得以改良。此類Fc變異體包括以下Fc區殘基中之一或多者發生取代之彼等變異體：238、256、265、272、286、303、305、307、311、312、317、340、356、360、362、376、378、380、382、413、424或434，例如Fc區殘基434之取代(美國專利第7,371,826號)。
亦參見Duncan,A.R.及Winter,G.,Nature 322(1988)738-740；US 5,648,260；US 5,624,821；及與Fc區變異體之其他實例相關之WO 94/29351。
c)半胱胺酸工程改造之抗體變異體
在某些實施例中，可能需要產生半胱胺酸工程改造之抗體，例如「thioMAb」，其中抗體之一或多個殘基經半胱胺酸殘基取代。在特定實施例中，經取代之殘基存在於抗體之可達位點處。藉由用半胱胺酸取代彼等殘基，反應性硫醇基從而定位於抗體之可達位點處且可用於使抗體與其他部分(諸如藥物部分或連接子-藥物部分)結合以產生如本文中進一步描述之免疫結合物。在某些實施例中，以下殘基中之任一者或多者可經半胱胺酸取代：輕鏈之V205(Kabat編號)；重鏈之A118(EU編號)；及重鏈Fc區之S400(EU編號)。可如例如美國專利第7,521,541號中所述產生半胱胺酸工程改造之抗體。
d)抗體衍生物
在某些實施例中，可將本文所提供之抗體進一步修飾以含有此項技術中已知且可易於獲得的額外非蛋白質部分。適合於抗體衍生作用之部分包括(但不限於)水可溶聚合物。水可溶聚合物之非限制性實例包括(但不限於)聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇共聚物、羧甲基纖維素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯啶酮、聚-1,3-二氧雜環戊烷、聚-1,3,6-三噁烷、乙烯/順丁烯二酸酐共聚物、聚胺基酸(均聚物或無規共聚物)及葡聚糖或聚(n-乙烯吡咯啶酮)聚乙二醇、丙二醇均聚物、聚氧化丙烯/氧化乙烯共聚物、聚氧乙烯多元醇(例如甘油)、聚乙烯醇及其混合物。聚乙二醇丙醛歸因於其於水中之穩定性而可在製造中具有優勢。聚合物可具有任何分子量，且可為分支或未分支的。與抗體連接之聚合物的數目可變化，且若連接超過一個聚合物，則聚合物可為相同或不同分子。一般而言，用於衍生作用之聚合物之數目及/或類型可基於包括(但不限於)待改良抗體之特殊特性或功能，抗體衍生 物是否將用於指定條件下之療法等考慮因素來確定。
在另一實施例中，提供抗體與可藉由暴露於輻射選擇性地加熱之非蛋白質部分之結合物。在一個實施例中，非蛋白質部分為碳奈米管(Kam,N.W.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102(2005)11600-11605)。輻射可具有任何波長，且包括(但不限於)不損害一般細胞但將非蛋白質部分加熱至殺死抗體-非蛋白質部分近側之細胞之溫度的波長。
B. 重組方法及組合物
可使用例如如US 4,816,567中所描述之重組方法及組合物產生抗體。在一個實施例中，提供編碼本文所述之抗TIM3抗體之分離之核酸。此類核酸可編碼包含VL之胺基酸序列及/或包含抗體之VH之胺基酸序列(例如抗體之輕鏈及/或重鏈)。在另一實施例中，提供一或多個包含此類核酸之載體(例如表現載體)。在另一實施例中，提供包含此類核酸之宿主細胞。在一個此類實施例中，宿主細胞包含(例如已經以下轉型)：(1)包含核酸之載體，該核酸編碼包含抗體之VL的胺基酸序列及包含抗體之VH的胺基酸序列；或(2)包含編碼含有抗體之VL的胺基酸序列之核酸的第一載體及包含編碼含有抗體之VH的胺基酸序列之核酸的第二載體。在一個實施例中，宿主細胞為真核細胞，例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或淋巴細胞(例如Y0、NS0、Sp20細胞)。在一個實施例中，提供製造抗TIM3抗體之方法，其中該方法包含在適合於表現抗體之條件下培養如上文所提供之包含編碼抗體之核酸的宿主細胞且視情況自宿主細胞(或宿主細胞培養基)回收抗體。
對於重組製造抗TIM3抗體，將例如如上文所述之編碼抗體之核酸分離且插入至一或多個載體中以進一步選殖及/或表現於宿主細胞中。此類核酸可易於使用習知程序(例如藉由使用能夠與編碼抗體之重鏈及輕鏈之基因特異地結合之寡核苷酸探針)分離及定序。
適合用於選殖或表現編碼抗體之載體之宿主細胞包括本文所述之原核或真核細胞。舉例而言，抗體可於細菌中產生，在不需要糖基化及Fc效應功能時尤其如此。關於抗體片段及多肽在細菌中之表現，參見例如US 5,648,237、US 5,789,199及US 5,840,523。(亦參見Charlton,K.A.,In：Methods in Molecular Biology，第248卷，Lo,B.K.C.(編)，Humana Press,Totowa,NJ(2003)，第245-254頁，描述大腸桿菌中抗體片段之表現。)在表現之後，抗體可以可溶性部分自細菌細胞糊狀物分離且可進一步經純化。
除原核生物外，諸如絲狀真菌或酵母之真核微生物為抗體編碼載體之適合選殖或表現宿主，包括糖基化途徑已經「人類化」，從而使得產生之抗體具有部分或完全人類糖基化型態的真菌及酵母菌株。參見Gerngross,T.U.,Nat.Biotech.22(2004)1409-1414；及Li,H.等人，Nat.Biotech.24(2006)210-215。
適用於表現糖基化抗體之宿主細胞亦來源於多細胞生物體(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已鑑別出多種桿狀病毒株，其可與昆蟲細胞結合使用，尤其用於轉染草地黏蟲(Spodoptera frugiperda)細胞。
植物細胞培養物亦可用作宿主。參見例如美國專利第5,959,177號、第6,040,498號、第6,420,548號、第7,125,978號及第6,417,429號(描述在轉殖基因植物中產生抗體之PLANTIBODIESTM技術)。
脊椎動物細胞亦可用作宿主。舉例而言，適於在懸浮液中生長之哺乳動物細胞株可為適用的。適用哺乳動物宿主細胞株之其他實例為經SV40(COS-7)轉型之猴腎CV1細胞株；人類胚腎細胞株(如例如在Graham,F.L.等人，J.Gen Virol.36(1977)59-74中所述之293或293細胞)；幼倉鼠腎細胞(BHK)；小鼠塞特利氏細胞(mouse sertoli cell)(如例如在Mather,J.P.,Biol.Reprod.23(1980)243-252中所述之TM4 細胞)；猴腎細胞(CV1)；非洲綠猴腎細胞(VERO-76)；人類子宮頸癌細胞(HELA)；犬腎細胞(MDCK；布法羅大鼠肝細胞(buffalo rat liver cell)(BRL 3A)；人類肺細胞(W138)；人類肝細胞(Hep G2)；小鼠乳腺腫瘤(MMT 060562)；如例如在Mather,J.P.等人，Annals N.Y.Acad.Sci.383(1982)44-68中所述之TRI細胞；MRC 5細胞；及FS4細胞。其他適用哺乳動物宿主細胞株包括中國倉鼠卵巢(CHO)細胞，包括DHFR- CHO細胞(Urlaub,G.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77(1980)4216-4220)；及骨髓瘤細胞株，諸如Y0、NS0及Sp2/0。關於適用於抗體產生之某些哺乳動物宿主細胞株之綜述，參見例如Yazaki,P.及Wu,A.M.,Methods in Molecular Biology，第248卷，Lo,B.K.C.(編)，Humana Press,Totowa,NJ(2004)，第255-268頁。
C. 分析
可藉由此項技術中已知之各種分析對本文所提供之抗TIM3抗體針對其物理/化學特性及/或生物活性進行鑑別、篩選或表徵。
1. 結合分析及其他分析
在一個態樣中，例如藉由已知方法，諸如ELISA、西方墨點法等測試本發明抗體之抗原結合活性。
在另一態樣中，競爭分析可用於鑑別與Tim3_0016(包含SEQ ID NO：7之VH序列及SEQ ID NO：8之VL序列)競爭以結合至TIM3(或者與具有相同6個HVR之Tim3_0016變異體抗體Tim3_0018競爭)之抗體。因此，本發明之一個實施例為與包含SEQ ID NO：7之VH的所有3個HVR及SEQ ID NO：8之VL的所有3個HVR之抗TIM3抗體競爭以結合至人類TIM3之抗體。在某些實施例中，此類競爭抗體結合至由抗TIM3抗體Tim3_0016所結合者相同之抗原決定基(例如線性或構形抗原決定基)。用於定位抗體所結合之抗原決定基之詳細例示性方法提供於Morris,G.E.(編)，Epitope Mapping Protocols,Methods in Molecular Biology，第66卷，Humana Press,Totowa,NJ(1996)中。
在例示性競爭分析中，在某種溶液中培育固定TIM3(-ECD)，該溶液包含結合至TIM3之第一標記抗體(例如抗TIM3抗體aTim3_0016)及測試與第一抗體競爭結合至TIM3之能力的第二未標記抗體。第二抗體可存在於融合瘤清液層中。作為對照，在包含第一標記抗體但無第二未標記抗體之溶液中培育固定TIM3。在允許第一抗體結合至TIM3之條件下培育之後，移除過量未結合抗體，且量測與固定TIM3締合之標記之量。若測試樣品中與固定TIM3相關之標記之量相對於對照樣品中實質上降低，則表明第二抗體與第一抗體競爭結合至TIM3。參見Harlow,E.及Lane,D.,Antibodies：A Laboratory Manual,Chapter 14,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY(1988)。對於另一例示性競爭分析參見實例4。
2. 活性分析
在一個態樣中，提供用於鑑別具有生物活性之抗TIM3抗體的分析。生物活性可包括例如TIM3受體內化、或細胞激素釋放、或細胞毒性活性(以免疫結合物形式結合至毒素)、或食蟹獼猴結合交叉反應性以及結合至不同單元類型。亦提供具有類似活體內/或活體外生物活性之抗體。
在某些實施例中，測試本發明抗體之此類生物活性，如例如實例5至15中所述。
D. 免疫結合物(僅癌症或針對目標修飾)
本發明亦提供包含結合至一或多種細胞毒性劑之本文中之抗TIM3抗體的免疫結合物，該一或多種細胞毒性劑為諸如化學治療劑或藥物、生長抑制劑、毒素(例如蛋白質毒素、細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素或其片段)或放射性同位素。
在一個實施例中，免疫結合物為抗體-藥物結合物(ADC)，其中 抗體結合至一或多種藥物，包括(但不限於)類美登素(maytansinoid)(參見US 5,208,020、US 5,416,064及EP 0 425 235 B1)；奧瑞他汀(auristatin)，諸如單甲基奧瑞他汀藥物部分DE及DF(MMAE及MMAE)(參見US 5,635,483、US 5,780,588及US 7,498,298)；海兔毒素(dolastatin)；卡奇黴素(calicheamicin)或其衍生物(參見US 5,712,374、US 5,714,586、US 5,739,116、US 5,767,285、US 5,770,701、US 5,770,710、US 5,773,001及US 5,877,296；Hinman,L.M.等人，Cancer Res.53(1993)3336-3342；及Lode,H.N.等人，Cancer Res.58(1998)2925-2928)；蒽環黴素(anthracycline)，諸如柔紅黴素(daunomycin)小紅莓(doxorubicin)(參見Kratz,F.等人，Curr.Med.Chem.13(2006)477-523；Jeffrey,S.C.等人，Bioorg.Med.Chem.Lett.16(2006)358-362；Torgov,M.Y.等人，Bioconjug.Chem.16(2005)717-721；Nagy,A.等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 97(2000)829-834；Dubowchik,G.M.等人，Bioorg.& Med.Chem.Letters 12(2002)1529-1532；King,H.D.等人，J.Med.Chem.45(200294336-4343；及美國專利第6,630,579號)；甲胺喋呤；長春地辛；紫杉烷，諸如多烯紫杉醇、太平洋紫杉醇、拉洛他賽(larotaxel)、替司他賽(tesetaxel)及奧他賽(ortataxel)；單端孢黴烯族毒素；及CC1065。
在另一實施例中，免疫結合物包含結合至酶促活性毒素或其片段之如本文所述之抗體，該酶促活性毒素或其片段包括(但不限於)白喉A鏈(diphtheria A chain)、白喉毒素(diphtheria toxin)之非結合活性片段、外毒素A鏈(來自綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa))、蓖麻毒素A鏈(ricin A chain)、相思子毒素A鏈(abrin A chain)、莫迪素A鏈(modeccin A chain)、α-帚麴菌素(alpha-sarcin)、油桐(Aleurites fordii)蛋白、康乃馨(dianthin)蛋白、洋商陸(Phytolaca americana)蛋白(PAPI、PAPII及PAP-S)、苦瓜(momordica charantia)抑制劑、麻瘋樹毒 蛋白(curcin)、巴豆毒素(crotin)、肥皂草(sapaonaria officinalis)抑制劑、白樹素(gelonin)、有絲分裂素(mitogellin)、侷限麴菌素(restrictocin)、酚黴素(phenomycin)、伊諾黴素(enomycin)及單端孢黴烯族毒素。
在另一實施例中，免疫結合物包含結合至綠膿桿菌外毒素A(或其變異體)之如本文所述之抗體。綠膿桿菌外毒素A(PE)為具有細胞毒性活性之細菌毒素，其可有效毀壞或抑制不合需要之細胞，例如癌細胞的生長。相應地，PE可適用於治療或預防疾病，諸如癌症。此項技術中已知若干去免疫型綠膿桿菌外毒素(PE)。與含有II域之PE38相比，II域缺失形式(例如PE24)可為免疫原性較差且可產生較少副作用(諸如毛細管滲漏症候群及肝毒性)。不同弗林蛋白酶可裂解連接子可用於PE24變異體中。此類去免疫型綠膿桿菌外毒素(PE)描述於例如國際專利申請公開案WO2005052006、WO2007016150、WO2007014743、WO2007031741、WO200932954、WO201132022、WO2012/154530及WO 2012/170617中。如本文所用，術語「綠膿桿菌外毒素A」涵蓋野生型及去免疫型綠膿桿菌外毒素(PE)。在一個較佳實施例中，「綠膿桿菌外毒素A」是指如以下(但不限於)中所述之去免疫型PE24變異體：WO2009/32954、WO2011/32022、WO2012/154530、WO 2012/170617；LiuW等人，PNAS 109(2012)11782-11787；Mazor R等人，PNAS 111(2014)8571-8576及Alewine C等人，Mol Cancer Ther.(2014)2653-61。在一個較佳實施例中，「綠膿桿菌外毒素A」包含SEQ ID NO：69之胺基酸序列或包含SEQ ID NO：70之胺基酸序列(其製備描述於Mazor R等人，PNAS 111(2014)8571-8576及AlewineC等人，Mol Cancer Ther.(2014)2653-61)。
在另一實施例中，免疫結合物包含結合至毒傘毒素或其變異體之如本文所述之抗體。毒傘毒素(α-瓢菌素、β-瓢菌素、鵝膏素)為由8 個胺基酸構成之環狀肽。其可自條蕈蘑菇分離或藉由合成由建構嵌段製備。毒傘毒素特定抑制哺乳動物細胞之DNA依賴性RNA聚合酶II，且由此亦抑制所影響細胞之轉錄及蛋白質生物合成。細胞中轉錄之抑制引起生長及增殖停止。儘管不會共價結合，但瓢菌素與RNA聚合酶II之間的複合極緊密(KD=3nM)。自酶解離瓢菌素為一種極緩慢方法，該方法使得不大可能回收受影響之細胞。當在細胞中轉錄之抑制持續過長時，細胞經歷漸進式細胞死亡(細胞凋亡)，如與α-瓢菌素一起培育之Jurkat細胞之培養物中所示，或具有較高效率，在與膜可滲透O-甲基-α-瓢菌素油酸酯一起培育之Jurkat細胞中。在一個較佳實施例中，如本文所用，術語「毒傘毒素」係指α-瓢菌素或其變異體，如例如WO2010/115630、WO2010/115629、WO2012/119787、WO2012/041504及WO2014135282中所述，其中較佳變異體描述於WO2012/041504(例如經由毒傘毒素胺基酸4之6' C原子結合，詳言之經由毒傘毒素胺基酸之6' C原子的氧原子，且其中TIM3抗體藉由連接子經由脲部分連接)及WO2014135282中。
在另一實施例中，免疫結合物包含與放射性原子結合以形成放射性結合物之如本文所述之抗體。多種放射性同位素可用於製造放射性結合物。實例包括At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212及Lu之放射性同位素。當放射性結合物用於偵測時，其可包含用於閃爍攝影研究之放射性原子，例如TC99m或I123；或用於核磁共振(NMR)成像(亦稱磁共振成像，MRI)之自旋標記物，諸如碘-123、碘-131、銦-111、氟-19、碳-13、氮-15、氧-17、釓、錳或鐵。
可使用多種雙功能蛋白質偶合劑製得抗體與細胞毒性劑之結合物，該等雙功能蛋白質偶合劑為諸如N-丁二醯亞胺基-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)、丁二醯亞胺基-4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環 己烷-1-甲酸酯(SMCC)、亞胺基硫雜環戊烷(IT)、亞胺基酯之雙功能衍生物(諸如二亞胺代己二酸二甲酯HCl)、活性酯(諸如辛二酸二丁二醯亞胺基酯)、醛(諸如戊二醛)、雙疊氮基化合物(諸如雙(對疊氮基苯甲醯基)己二胺)、雙重氮衍生物(諸如雙(對重氮苯甲醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(諸如甲苯2,6-二異氰酸酯)及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。舉例而言，蓖麻毒素免疫毒素可如Vitetta,E.S.等人，Science 238(1987)1098-1104中所述來製備。碳-14標記之1-異硫氰氧基苯甲基-3-甲基二伸乙三胺五乙酸(MX-DTPA)為用於使放射性核苷酸與抗體結合之例示性螯合劑。參見WO 94/11026。連接子可為有助於細胞毒性藥物在細胞中釋放之「可裂解連接子」。舉例而言，可使用酸不穩定連接子、肽酶敏感連接子、光不穩定連接子、二甲基連接子或含二硫鍵連接子(Chari,R.V.等人，Cancer Res.52(1992)127-131；美國專利第5,208,020號)。
本文之免疫結合物或ADC明確涵蓋(但不限於)用包括(但不限於)以下之交聯試劑製備之此類結合物：BMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC-SMCC、MBS、MPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、SMPH、磺基-EMCS、磺基-GMBS、磺基-KMUS、磺基-MBS、磺基-SIAB、磺基-SMCC及磺基-SMPB及SVSB(丁二醯亞胺基-(4-乙烯基碸)苯甲酸酯)，該等交聯試劑可購得(例如來自Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.A)。
E. 用於診斷及偵測之方法及組合物
在某些實施例中，本文所提供之抗TIM3抗體中之任一者適用於偵測生物樣品中TIM3之存在。如本文所用，術語「偵測」涵蓋定量或定性偵測。在某些實施例中，生物樣品包含細胞或組織，諸如AML幹癌細胞。
在一個實施例中，提供一種用於診斷或偵測方法之抗TIM3抗 體。在又一態樣中，提供一種偵測生物樣品中TIM3之存在的方法。在某些實施例中，該方法包含使生物樣品與如本文所述之抗TIM3抗體在允許抗TIM3抗體結合至TIM3之條件下接觸，且偵測在抗TIM3抗體與TIM3之間是否形成複合物。此類方法可為活體外或活體內方法。在一個實施例中，使用抗TIM3抗體來選擇適於用抗TIM3抗體治療之個體，例如其中TIM3為用於患者選擇之生物標記。
可使用本發明抗體診斷之例示性病症包括癌症，包括不同形式之血液癌，如AML或多發性骨髓瘤(MM)。
在某些實施例中，提供標記之抗TIM3抗體。標記包括(但不限於)直接偵測之標記或部分(諸如螢光、發色、電子緻密、化學發光及放射性標記)，以及例如經由酶促反應或分子相互作用間接偵測之部分(諸如酶或配位體)。例示性標記包括(但不限於)放射性同位素32P、14C、125I、3H及131I；螢光團，諸如稀土螯合物或螢光素及其衍生物；若丹明及其衍生物；丹醯基；傘酮；螢光素酶，例如螢火蟲螢光素酶及細菌螢光素酶(美國專利第4,737,456號)；螢光素；2,3-二氫酞嗪二酮；辣根過氧化酶(HRP)；鹼性磷酸酶；β-半乳糖苷酶；葡糖澱粉酶；溶菌酶；醣氧化酶，例如葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶及葡萄糖-6-磷酸去氫酶；雜環氧化酶，諸如尿酸酶及黃嘌呤氧化酶，其與使用過氧化氫氧化染料前驅體之酶(諸如HRP、乳過氧化酶或微過氧化酶)偶合；生物素/抗生物素蛋白；自旋標記；噬菌體標記；穩定自由基及其類似標記。
F. 醫藥調配物
如本文所述之抗TIM3抗體之醫藥調配物係藉由將具有所要純度之此類抗體與一或多種視情況選用之醫藥學上可接受之載劑混合(Remington's Pharmaceutical Sciences，第16版，Osol,A.(編)(1980))，以凍乾調配物或水溶液形式來製備。醫藥學上可接受之載劑在所用劑 量及濃度下一般對接受者無毒，且包括(但不限於)：緩衝劑，諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；抗氧化劑，包括抗壞血酸及甲硫胺酸；防腐劑(諸如十八烷基二甲基苄基氯化銨；氯化六羥季銨；氯化苯甲烴銨；苄索氯銨；苯酚、丁醇或苄醇；對羥基苯甲酸烷酯，諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯；兒茶酚；間苯二酚；環己醇；3-戊醇；及間甲酚)；低分子量(小於約10個殘基)多肽；蛋白質，諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白；親水性聚合物，諸如聚(乙烯吡咯啶酮)；胺基酸，諸如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸；單醣、雙醣及其他碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，諸如EDTA；糖，諸如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖或山梨糖醇；成鹽相對離子，諸如鈉；金屬錯合物(例如Zn-蛋白質錯合物)；及/或非離子型界面活性劑，諸如聚乙二醇(PEG)。本文中之例示性醫藥學上可接受之載劑進一步包括間質性藥物分散劑，諸如可溶性中性活性玻尿酸酶糖蛋白(sHASEGP)，例如人類可溶性PH-20玻尿酸酶糖蛋白，諸如rhuPH20(HYLENEX®,Baxter International,Inc.)。某些例示性sHASEGP(包括rHuPH20)及使用方法描述於美國專利公開案第2005/0260186號及第2006/0104968號中。在一個態樣中，sHASEGP與一或多種額外葡萄糖胺聚糖酶(諸如軟骨素酶)組合。
例示性凍乾抗體調配物描述於美國專利第6,267,958號中。抗體調配物水溶液包括美國專利第6,171,586號及WO2006/044908中所述之彼等抗體調配物水溶液，WO2006/044908中所述之調配物包括組胺酸-乙酸鹽緩衝液。
本文之調配物亦可含有一種以上為所治療之特定適應症所必需之活性成分，較佳為具有不會對彼此產生不利影響之補充性活性的活性成分。舉例而言，可能需要進一步提供[[可與抗TIM3抗體組合之清單藥物]]。此類活性成分適合地以對預期目的有效之量存在於組合 中。
可例如藉由凝聚技術或藉由界面聚合將活性成分可包覆於所製備之微囊中，例如分別在膠狀藥物遞送系統(例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米囊劑)中或於巨乳液中之羥甲基纖維素或明膠微囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微囊。此類技術揭示於Remington's Pharmaceutical Sciences，第16版，Osol,A.(編)(1980)中。
可製備持續釋放型製劑。持續釋放型製劑之適合實例包括含有抗體之固體疏水性聚合物之半滲透基質，該等基質呈成形物品形式，例如薄膜或微膠囊。
用於活體內投與之調配物一般為無菌的。無菌性可容易地例如藉由經由無菌過濾膜過濾來實現。
G. 治療方法及組合物
本文提供之抗TIM3抗體(或抗原結合蛋白)或抗TIM3抗體(或抗原結合蛋白)結合至細胞毒性劑之免疫結合物中之任一者可用於治療性方法中。
在一個態樣中，提供抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物用作藥劑。在其他態樣中，提供抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物用於治療癌症。在某些實施例中，提供抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合細胞毒性劑之免疫結合物用於治療方法中。在某些實施例中，本發明提供抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物用於治療具有癌症之個體之方法中，該方法包含向個體投與有效量之抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物。
在其他實施例中，本發明提供抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物用於誘發癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖。在某些實施例中，本發明提供一種抗TIM3抗體或抗TIM3抗 體結合至細胞毒性劑之免疫結合物用於在個體中誘發癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖之方法中，該方法包含向個體投與有效之抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物以誘發癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖。
在其他實施例中，本發明提供抗TIM3抗體用作免疫刺激劑/或刺激IFNγ分泌。在某些實施例中，本發明提供抗TIM3抗體用於個體中免疫刺激/或刺激IFNγ分泌之方法，該方法包含向個體投與有效之抗TIM3抗體以刺激/或刺激IFNγ分泌。
根據以上實施例中之任一者之「個體」較佳為人類。在另一態樣中，本發明提供抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性劑之免疫結合物之用途，其係用於製造或製備藥劑。在一個實施例中，藥劑用於治療癌症。在另一實施例中，藥劑用於治療癌症之方法中，該方法包含向患有癌症之個體投與有效量之藥劑。在另一實施例中，藥劑用於誘發癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖。在另一實施例中，藥劑用於誘發患有癌症之個體中癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖之方法中，該方法包含向個體投與有效量之藥劑以誘發癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖。根據以上實施例中之任一者之「個體」可為人類。
在另一態樣中，本發明提供用於治療癌症之方法。在一個實施例中，該方法包含向患有癌症之個體投與有效量之抗TIM3抗體。根據以上實施例中之任一者之「個體」可為人類。
在另一態樣中，本發明提供一種誘發患有癌症之個體中之癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖之方法。在一個實施例中，該方法包含向個體投與有效量之抗TIM3抗體或抗TIM3抗體結合至細胞毒性化合物之免疫結合物以誘發患有癌症之個體中之癌細胞中之細胞凋亡/或抑制癌細胞增殖。在一個實施例中，「個體」為人類。
在另一態樣中，本發明提供包含本文所提供之抗TIM3抗體中之任一者的醫藥調配物，其例如用於上述治療方法中之任一者中。在一個實施例中，醫藥調配物包含本文所提供之抗TIM3抗體中之任一者及醫藥學上可接受之載劑。
本發明抗體(及任何其他治療劑)可藉由任何適合之手段投與，包括非經腸、肺內及鼻內投與，且必要時針對局部治療，包括病灶內投與。非經腸輸注包括肌肉內、靜脈內、動脈內、腹膜內或皮下投與。部分視投與之短期或長期性而定，可藉由任何適當途徑(例如藉由注射，諸如靜脈內或皮下注射)給藥。本文涵蓋各種給藥時程，包括(但不限於)單次投與或經各個時間點多次投與、快速投與及脈衝式輸注。
本發明抗體將以與良好醫療實務一致之方式調配、給藥及投與。在此情形中考慮之因素包括所治療之特定病症、所治療之特定哺乳動物、個別患者之臨床病狀、病症起因、藥劑傳遞部位、投藥方法、投藥時程及醫學從業者已知的其他因素。抗體無需但視情況可與一或多種當前用於預防或治療所述病症之藥劑一起調配。此類其他藥劑之有效量視存在於調配物中之抗體之量、病症或治療之類型及如上文所述之其他因素而定。此等藥劑一般以相同劑量且用如本文所述之投藥途徑使用，或以本文所述之劑量之約1%至99%使用，或以任何劑量且憑經驗/臨床上確定為適當之任何途徑使用。
為預防或治療疾病，本發明抗體之適當劑量(當單獨或與一或多種其他額外治療劑組合使用時)將視待治療疾病之類型、抗體類型、疾病之嚴重程度及病程、是出於預防還是出於治療目的投與抗體、先前療法、患者之臨床病史及對抗體之反應及主治醫師之判斷而定。一次性或歷經一系列治療向患者適當地投與該抗體。無論例如藉由一或多次單獨投與，或藉由連續輸注，視疾病類型及嚴重程度而定，抗體 投與至患者之初始候選劑量為約1μg/kg至15mg/kg(例如0.5mg/kg至10mg/kg)。一種典型日劑量視上文所提及之因素而定可在約1μg/kg至100mg/kg或100mg/kg以上之範圍內。經歷數日或更長時間重複投藥時，視病狀而定，治療一般持續至疾病症狀發生所需抑制為止。抗體之一種例示性劑量將在約0.05mg/kg至約10mg/kg範圍內。因此，可向患者投與約0.5mg/kg、2.0mg/kg、4.0mg/kg或10mg/kg(或其任何組合)之一或多種劑量。此類劑量可間歇地投與，例如每週或每三週(例如以使得患者接受約二至約二十，或例如約六種劑量之抗體)。初始可投與較高起始劑量，隨後可投與一或多個較低劑量。例示性給藥方案包含投與約4mg/kg之最初起始劑量，隨後每週投與約2mg/kg之化合物的維持劑量。然而，其他給藥方案可為適用的。此療法之進程易於藉由習知技術及分析來監控。
應瞭解，替代抗TIM3抗體或除抗TIM3抗體之外，可使用本發明之免疫結合物進行上述調配或治療方法中之任一者。
應瞭解，替代抗TIM3抗體或除抗TIM3抗體之外，可使用本發明之免疫結合物進行上述調配或治療方法中之任一者。
III. 製品
在本發明之另一態樣中，提供一種含有適用於治療、預防及/或診斷上文所述之病症之物質的製品。製品包含容器及容器上或容器隨附之標籤或藥品說明書。適合之容器包括例如瓶子、小瓶、注射器、IV溶液袋等。容器可由諸如玻璃或塑膠之多種材料形成。容器容納單獨或與有效治療、預防及/或診斷病狀之另一組合物組合之組合物，且可具有無菌接取口(例如容器可為具有可由皮下注射針刺穿之塞子的靜脈內溶液袋或小瓶)。組合物中之至少一種活性劑為本發明抗體。標籤或藥品說明書指示組合物用於治療所選病狀。此外，製品可包含(a)內含組合物之第一容器，其中該組合物包含本發明抗體；及 (b)內含組合物之第二容器，其中該組合物包含另一細胞毒性劑或治療劑。本發明之此實施例中之製品可進一步包含指示組合物可用於治療特定病狀之藥品說明書。或者或另外，該製品可進一步包含第二(或第三)容器，其包含醫藥學上可接受之緩衝液，諸如注射用抑菌水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液(Ringer's solution)及右旋糖溶液。其可進一步包括就商業及使用者觀點而言所需之其他物質，包括其他緩衝劑、稀釋劑、過濾器、針及注射器。
應瞭解，代替抗TIM3抗體或除抗TIM3抗體之外，上述製品中之任一者可包括本發明之免疫結合物。
胺基酸序列之描述
SEQ ID NO：1 重鏈HVR-H1，Tim3_0016
SEQ ID NO：2 重鏈HVR-H2，Tim3_0016
SEQ ID NO：3 重鏈HVR-H3，Tim3_0016
SEQ ID NO：4 輕鏈HVR-L1，Tim3_0016
SEQ ID NO：5 輕鏈HVR-L2，Tim3_0016
SEQ ID NO：6 輕鏈HVR-L3，Tim3_0016
SEQ ID NO：7 重鏈可變域VH，Tim3_0016
SEQ ID NO：8 輕鏈可變域VL，Tim3_0016
SEQ ID NO：9 重鏈可變域VH，Tim3_0016變異體(0018)
SEQ ID NO：10 輕鏈可變域VL，Tim3_0016變異體(0018)
SEQ ID NO：11 輕鏈HVR-L1，Tim3_0016_HVR-L1變異體1_NQ(藉由N至Q突變移除糖基化位點)
SEQ ID NO：12 輕鏈HVR-L1，Tim3_0016_HVR-L1變異體2_NS(藉由N至S突變移除糖基化位點)
SEQ ID NO：13 重鏈HVR-H1，Tim3_0021
SEQ ID NO：14 重鏈HVR-H2，Tim3_0021
SEQ ID NO：15 重鏈HVR-H3，Tim3_0021
SEQ ID NO：16 輕鏈HVR-L1，Tim3_0021
SEQ ID NO：17 輕鏈HVR-L2，Tim3_0021
SEQ ID NO：18 輕鏈HVR-L3，Tim3_0021
SEQ ID NO：19 重鏈可變域VH，Tim3_0021
SEQ ID NO：20 輕鏈可變域VL，Tim3_0021
SEQ ID NO：21 重鏈HVR-H1，Tim3_0022
SEQ ID NO：22 重鏈HVR-H2，Tim3_0022
SEQ ID NO：23 重鏈HVR-H3，Tim3_0022
SEQ ID NO：24 輕鏈HVR-L1，Tim3_0022
SEQ ID NO：25 輕鏈HVR-L2，Tim3_0022
SEQ ID NO：26 輕鏈HVR-L3，Tim3_0022
SEQ ID NO：27 重鏈可變域VH，Tim3_0022
SEQ ID NO：28 輕鏈可變域VL，Tim3_0022
SEQ ID NO：29 重鏈HVR-H1，Tim3_0026
SEQ ID NO：30 重鏈HVR-H2，Tim3_0026
SEQ ID NO：31 重鏈HVR-H3，Tim3_0026
SEQ ID NO：32 輕鏈HVR-L1，Tim3_0026
SEQ ID NO：33 輕鏈HVR-L2，Tim3_0026
SEQ ID NO：34 輕鏈HVR-L3，Tim3_0026
SEQ ID NO：35 重鏈可變域VH，Tim3_0026
SEQ ID NO：36 輕鏈可變域VL，Tim3_0026
SEQ ID NO：37 重鏈HVR-H1，Tim3_0028
SEQ ID NO：38 重鏈HVR-H2，Tim3_0028
SEQ ID NO：39 重鏈HVR-H3，Tim3_0028
SEQ ID NO：40 輕鏈HVR-L1，Tim3_0028
SEQ ID NO：41 輕鏈HVR-L2，Tim3_0028
SEQ ID NO：42 輕鏈HVR-L3，Tim3_0028
SEQ ID NO：43 重鏈可變域VH，Tim3_0028
SEQ ID NO：44 輕鏈可變域VL，Tim3_0028
SEQ ID NO：45 重鏈HVR-H1，Tim3_0030
SEQ ID NO：46 重鏈HVR-H2，Tim3_0030
SEQ ID NO：47 重鏈HVR-H3，Tim3_0030
SEQ ID NO：48 輕鏈HVR-L1，Tim3_0030
SEQ ID NO：49 輕鏈HVR-L2，Tim3_0030
SEQ ID NO：50 輕鏈HVR-L3，Tim3_0030
SEQ ID NO：51 重鏈可變域VH，Tim3_0030
SEQ ID NO：52 輕鏈可變域VL，Tim3_0030
SEQ ID NO：53 重鏈HVR-H1，Tim3_0033
SEQ ID NO：54 重鏈HVR-H2，Tim3_0033
SEQ ID NO：55 重鏈HVR-H3，Tim3_0033
SEQ ID NO：56 輕鏈HVR-L1，Tim3_0033
SEQ ID NO：57 輕鏈HVR-L2，Tim3_0033
SEQ ID NO：58 輕鏈HVR-L3，Tim3_0033
SEQ ID NO：59 重鏈可變域VH，Tim3_0033
SEQ ID NO：60 輕鏈可變域VL，Tim3_0033
SEQ ID NO：61 重鏈HVR-H1，Tim3_0038
SEQ ID NO：62 重鏈HVR-H2，Tim3_0038
SEQ ID NO：63 重鏈HVR-H3，Tim3_0038
SEQ ID NO：64 輕鏈HVR-L1，Tim3_0038
SEQ ID NO：65 輕鏈HVR-L2，Tim3_0038
SEQ ID NO：66 輕鏈HVR-L3，Tim3_0038
SEQ ID NO：67 重鏈可變域VH，Tim3_0038
SEQ ID NO：68 輕鏈可變域VL，Tim3_0038
SEQ ID NO：69 例示性綠膿桿菌外毒素A變異體1(去免疫型PE24實例)
SEQ ID NO：70 例示性綠膿桿菌外毒素A變異體2(去免疫型PE24實例)
SEQ ID NO：71 人類κ輕鏈恆定區
SEQ ID NO：72 人類λ輕鏈恆定區
SEQ ID NO：73 來源於IgG1之人類重鏈恆定區
SEQ ID NO：74 L234A及L235A上突變之來源於IgG1之人類重鏈恆定區
SEQ ID NO：75 L234A、L235A及P329G上突變之來源於IgG1之人類重鏈恆定區
SEQ ID NO：76 來源於IgG4之人類重鏈恆定區
SEQ ID NO：77 例示性人類TIM3序列
SEQ ID NO：78 人類TIM3細胞外域(ECD)
SEQ ID NO：79 Tim3_0016變異體(0018)之VH人類化形式(=Tim3-0433)
SEQ ID NO：80 Tim3_0016變異體(0018)之VL人類化形式(=Tim3-0433)
SEQ ID NO：81 Tim3_0016變異體(0018)之VH人類化形式(=Tim3-0434)
SEQ ID NO：82 Tim3_0016變異體(0018)之VL人類化形式(=Tim3-0434)
SEQ ID NO：83 Tim3-0028之VH人類化形式(=Tim3-0438)
SEQ ID NO：84 Tim3-0028之VL人類化形式(=Tim3-0438)
SEQ ID NO：85 Tim3-0028之VH人類化形式(=Tim3-0443)
SEQ ID NO：86 Tim3-0028之VL人類化形式(=Tim3-0443)
在下文中，列舉包括抗TIM3抗體Tim3-0016、Tim3-0016變異體(0018)及其人類化形式Tim3-0433及Tim3-0434、Tim3-0021、Tim3-0022、Tim3-0026、Tim3-0028及其人類化形式Tim3-0438及Tim3-0443、Tim3-0030及Tim3-0033、Tim3-0038之經標記HVR(HVR為粗體帶下劃線之字母)之VH及VL域之胺基酸序列：VH Tim3_0016：
VL Tim3_0016：
VH Tim3_0018(=VL Tim3_0016變異體)：
VL Tim3_0018(=VL Tim3_0016變異體)：
Tim3_0016變異體(0018)之VH人類化形式(=Tim3-0433)
Tim3_0016變異體(0018)之VL人類化形式(=Tim3-0433)
Tim3_0016變異體(0018)之VH人類化形式(=Tim3-0434)
Tim3_0016變異體(0018)之VL人類化形式(=Tim3-0434)
VH Tim3_0021：
VL Tim3_0021：
VH Tim3_0022：
VL aTim3_0022：
VH Tim3_0026：
VL Tim3_0026
VH Tim3_0028：
VL Tim3_0028：
Tim3-0028之VH人類化形式(=Tim3-0438)
Tim3-0028之VL人類化形式(=Tim3-0438)
Tim3-0028之VH人類化形式(=Tim3-0443)
Tim3-0028之VL人類化形式(=Tim3-0443)
VH aTim3_0030：
VL aTim3_0030：
VH aTim3_0033：
VL aTim3_0033：
VH aTim3_0038：
VL aTim3_0038：
在下文中，列舉本發明之特定實施例：
1.一種結合至TIM3之分離之抗體，其中該抗體：
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少50% 之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少60%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)進行之FACS分析中)(參見實例6)
2.如實施例1之抗TIM3抗體，其中該抗體：
˙與包含Tim3_0016之VH及VL的抗Tim3抗體競爭以結合至TIM3
˙結合至人類及食蟹獼猴TIM3
˙以免疫結合物形式展示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性(在一個實施例中，該等免疫結合物以綠膿桿菌外毒素A結合物形式對RPMI-8226細胞具有0.1或小於0.1之相對細胞毒性活性IC50值(如實例11中所量測)
˙誘導干擾素-γ釋放(在MLR分析中)。
3.如實施例1之抗體，其為人類、人類化或嵌合抗體。
4.如實施例1之抗體，其為結合至TIM3之抗體片段。
5.如實施例4之抗體片段，其為Fab片段。
6.如前述實施例中任一項之抗TIM3抗體，其包含A)(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含 SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：34之 胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
7.一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR- L3。
8.如實施例7之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列，或ii)SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
9.如實施例7之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列。
10.如實施例7之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
11.一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1；(b)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2；(c)包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；(d)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(e)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2；及(f)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
12.如實施例11之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列，或ii)SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
13.如實施例11之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列。
14.如實施例11之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
15.如前述實施例中任一項之抗TIM3抗體，其包含A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸 序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR- H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含 SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
16.一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
17.如實施例16之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列，或ii)SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
18.如實施例16之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列。
19.如實施例16之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
20.一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
21.如實施例20之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列，或ii)SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
22.如實施例20之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列。
23.如實施例20之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
24.如前述實施例中任一項之抗TIM3抗體，其包含A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或 E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自 SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3；其中該抗體之特徵獨立地為以下特性中之一或多者：抗TIM3抗體
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後抗體誘導至少50%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少60%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙與包含SEQ ID NO：7之VH及SEQ ID NO：8之VL的抗Tim3抗體競 爭以結合至TIM3。
˙結合至人類及食蟹獼猴TIM3
˙以免疫結合物形式展示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性(在一個實施例中，該等免疫結合物以綠膿桿菌外毒素A結合物形式對RPMI-8226細胞具有0.1或小於0.1之相對細胞毒性活性IC50值(如實例11中所量測)
˙誘導干擾素-γ釋放(在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中，如實例5中所述)。
25.一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；其中該抗體之特徵獨立地為以下特性中之一或多者：抗TIM3抗體
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少50%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少60%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參 見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙與包含SEQ ID NO：7之VH及SEQ ID NO：8之VL的抗Tim3抗體競爭以結合至TIM3。
˙結合至人類及食蟹獼猴TIM3
˙以免疫結合物形式展示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性(在一個實施例中，該等免疫結合物以綠膿桿菌外毒素A結合物形式對RPMI-8226細胞具有0.1或小於0.1之相對細胞毒性活性IC50值(如實例11中所量測)
˙誘導干擾素-γ釋放(在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中，如實例5中所述)。
26.一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；其中該抗體之特徵獨立地為以下特性中之一或多者：抗TIM3抗體
˙在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少50%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下120分鐘之後該抗體誘導至少55%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少60%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙在一個實施例中，在37℃下240分鐘之後該抗體誘導至少65%之TIM3內化(在對表現TIM3之RPMI8226細胞進行之FACS分析中)(參見實例6)
˙與包含SEQ ID NO：7之VH及SEQ ID NO：8之VL的抗Tim3抗體競爭以結合至TIM3。
˙結合至人類及食蟹獼猴TIM3
˙以免疫結合物形式展示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性(在一個實施例中，該等免疫結合物以綠膿桿菌外毒素A結合物形式對RPMI-8226細胞具有0.1或小於0.1之相對細胞毒性活性IC50值(如實例11中所量測)
˙誘導干擾素-γ釋放(在混合淋巴細胞反應(MLR)分析中，如實例5中所述)。
27.如前述實施例中任一項之抗體，其為全長IgG1抗體。
28.如前述實施例中任一項之抗體，其為具有L234A、L235A及P329G(根據Kabat之EU索引編號)之全長IgG1抗體。
29.一種分離之核酸，其編碼如前述實施例中任一項之抗體。
30.一種宿主細胞，其包含如實施例29之核酸。
31.一種產生抗體之方法，其包含培養如實施例30之宿主細胞以產生該抗體。
32.如請求項31之方法，其進一步包含自該宿主細胞回收該抗 體。
33.一種免疫結合物，其包含如實施例1至28中任一項之抗體及細胞毒性劑。
34.如實施例33之免疫結合物，其中該細胞毒性劑為綠膿桿菌外毒素A或毒傘毒素。
35.一種醫藥調配物，其包含如請求項1至28中任一項之抗體及醫藥學上可接受之載劑。
36.如實施例1至28中任一項之抗體或如實施例33或34中任一項之免疫結合物，其係用作藥劑。
37.如實施例1至28中任一項之抗體或如實施例33或34中任一項之免疫結合物，其係用於治療癌症。
38，一種如實施例1至28中任一項之抗體或如實施例33或34中任一項之免疫結合物之用途，其係用於製造藥劑。
39.如實施例38之用途，其中該藥劑係用於治療癌症。
40.一種治療患有癌症之個體之方法，其包含向該個體投與有效量之如實施例1之抗體或如實施例33之免疫結合物。
V. 實例
以下為本發明之方法及組合物之實例。應瞭解，考慮到上文提供之一般描述，可實施各種其他實施例。
儘管出於清楚理解之目的，已藉助於說明及實例相當詳細地描述前述本發明，但該等描述及實例不應解釋為限制本發明之範疇。本文引用的所有專利及科學文獻之揭示內容以全文引用的方式明確併入本文中。
實例1a：產生抗TIM3抗體 小鼠之免疫接種
NMRI小鼠使用編碼全長人類Tim-3之質體表現載體藉由皮內施 用100μg載體DNA(質體15304_hTIM3-fl)隨後電穿孔(2個1000V/cm之方形脈衝，持續時間0.1ms，時間間隔0.125s；隨後4個287.5V/cm之方形脈衝，持續時間10ms，時間間隔0.125s)進行基因免疫接種。小鼠在第0、14、28、42、56、70及84天接受6次連續免疫。在第36、78及92天獲取血液且製備血清，其用於藉由ELISA進行效價測定(參見下文)。選擇具有最高效價之動物在第96天藉由靜脈內注射50μg重組人類Tim-3人類Fc嵌合體增強免疫，且藉由融合瘤技術藉由在增強免疫之後3天使脾細胞融合至骨髓瘤細胞株分離單株抗體。
測定血清效價(ELISA)
將人類重組Tim-3人類Fc嵌合體以0.3μg/ml、100μl/孔於PBS中固定於96孔NUNC Maxisorp盤上，隨後：用200μl/孔於PBS中之2% Crotein C阻斷該盤；施用抗血清之連續稀釋液，一式兩份，以於PBS中之0.5% Crotein C，100μl/孔；用結合HRP之山羊抗小鼠抗體(Jackson Immunoresearch/Dianova 115-036-071；1/16000)偵測。對於所有步驟，將盤在37℃下培育1小時。在所有步驟之間，用含0.05% Tween 20之PBS洗滌盤3次。藉由以100μl/孔添加BM Blue POD可溶性底物(Roche)顯現信號；且藉由添加1M HCl，100μl/孔終止。在450nm下，對照690nm作為參考，讀出吸光度。將效價定義為產生半最大信號之抗血清之稀釋度。
實例1b：表徵抗Tim3抗體 對Tim3進行ELISA
Nunc-Maxi Sorp抗生蛋白鏈菌素盤(MicroCoat第11974998/MC1099號)藉由25μl/孔用Tim3-ECD-His-生物素(用BirA接合酶生物素標記)塗佈且在室溫下培育1小時，同時在400rpm旋轉下振盪。在洗滌(3×90μl/孔，用PBST緩衝液)之後，添加25μl aTim3樣品或經稀釋(1：2步驟)參考抗體aTim3 F38-2E2(Biolegend)且在室溫下 培育1h。在洗滌(3×90μl/孔，用PBST緩衝液)之後，以25μl/孔添加1：9000稀釋之羊-抗小鼠-POD(GE NA9310V)且在室溫下培育1h，同時在400rpm旋轉下振盪。在洗滌(4×90μl/孔，用PBST緩衝液)之後，添加25μl/孔TMB底物(Calbiochem，第CL07號)且培育直至OD 1.5-2.5。接著藉由添加25μl/孔1N HCl溶液終止反應。量測在370/492nm下進行。
ELISA結果以EC50值[ng/ml]列舉於以下概述性表2中。
實例：對Tim3進行細胞ELISA
用編碼全長人類Tim3之質體15312_hTIM3-fl_pUC_Neo穩定轉染且用G418(質體上之新黴素抗性標記)選擇之黏著性CHO-K1細胞株以1.2×10E6個細胞/毫升之濃度接種至384孔平底盤中且生長隔夜。
在次日，添加25μl/孔Tim3樣品或無疊氮化物之aTim3參考抗體F38-2E2(Biolegend，354004)且在4℃下培育2h(以避免內化)。在洗滌(3×90μl/孔PBST(BIOTEK Washer：Prog.29,1×90)之後，藉由倒掉剩餘緩衝液且添加50μl/孔0.05%戊二醛：用1×PBS緩衝液以1：500稀釋25%戊二醛(Sigma目錄號G5882)且在室溫下培育1h以固定細胞。在洗滌(3×90μl/孔PBST(BIOTEK Washer：Prog.21,3×90 GreinLysin)之後，添加25μl/孔二次抗體以進行偵測(羊-抗小鼠-POD；辣根POD連接之F(ab')2片段；GE NA9310)，隨後在室溫下培育2h同時在400rpm下振盪。在洗滌(3×90μl/孔PBST(BIOTEK Washer：Prog.21,3×90GreinLysin)之後，添加25μl/孔TMB底物溶液(Roche 11835033001)且培育直至OD 1.5-2.5。接著藉由添加25μl/孔1N HCl溶液終止反應。量測在370/492nm下進行。
細胞ELISA結果以「EC50 CHO-Tim3」值[ng/ml]列舉於概述之以下表2中。
表2：例示性抗體之結合親和力(ELISA及BIACORE)
(Tim3 AB之BIAcore表徵)
已使用基於表面電漿子共振(SPR)之分析以確定若干鼠類Tim3黏合劑以及市售人類Tim3結合參考之間的結合之動力學參數。因此，抗小鼠IgG藉由偶合至(BIAcore)CM5感測器晶片表面之胺固定。接著捕獲樣品且使單體hu/cy Tim3-ECD以及Fc標記之人類Tim3-ECD二聚體與其結合。在各分析週期之後使感測器晶片表面再生。平衡常數K D 最終藉由將資料擬合至1：1朗格繆爾相互作用模型獲得。
在BIAcore B4000中在pH 5.0下藉由使用GE Healthcare提供之胺偶合套組，將約12000個響應單元(RU)之30μg/ml抗小鼠IgG(GE Healthcare號BR-1008-38)偶合於CM5感測器晶片之流動細胞1-4之點1、2、4及5上(點1、5為活性點且點2、4為參考點)。
樣品及操作緩衝液為HBS-EP+(0.01M HEPES、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05% v/v表面活性劑P20，pH 7.4)。流動細胞溫度設定為25℃且樣品腔室溫度設定為12℃。系統用操作緩衝液預致敏。
以200μg/ml之濃度注射樣品30秒且結合至各流動細胞之點1及5，從而使得平行量測八個樣品。接著，對各樣品注射一整組不同(單體食蟹獼猴、單體人類及huFc融合二聚合人類Tim3-ECD)之濃度(s.表X)維持240秒，隨後為30/1800s之解離時間(s.表1)。接著注射甘胺酸-HCl(pH 1.7)30秒長再生各分析週期(捕獲樣品，點1及5 Tim3 ECD注射)。整個操作之流動速率設定為30μl/分鐘。
最終，用BIAcore B4000評估軟體將雙重參考之資料擬合至1：1朗 格繆爾相互作用模型。所得對單體人類、食蟹獼猴Tim3及huFc融合二聚合人類Tim3之親和力示於表2及3中。對hu Tim3二聚體之親和力最可能受親合力影響，且因此明顯強於對單體huTim3之親和力。
經由SPR確定對Tim3之親和力(嵌合TIM3-0016變異體(0018)及人類化形式)
藉由使胺偶合至(Biacore)CM5感測器晶片之表面固定蛋白A。接著捕獲樣品且hu Tim3-ECD與其結合。在各分析週期之後使感測器晶片表面再生。最終藉由將資料擬合至1：1朗格繆爾相互作用模型獲得平衡常數及動力學速率常數。
在Biacore B4000儀中使用GE Healthcare提供之胺偶合套組使約2000個響應單元(RU)之20μg/ml蛋白A偶合於CM5感測器晶片之所有流動細胞之點1、2、4及5上。
樣品及操作緩衝液為HBS-EP+(0.01M HEPES、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05% v/v表面活性劑P20，pH 7.4)。流動細胞溫度設定為25℃且樣品腔室溫度設定為12℃。系統用操作緩衝液預致敏。
注射濃度為10nM之不同樣品30秒，且連續結合至所有流動細胞中之點1及5。接著，對各樣品注射一整組單體人類Tim3-ECD稀釋液(600nM、200nM、66.7nM、2×22.2nM、7.4nM、2.5nM及2×0nM)維持300秒。各抗原注射之後為12s/1000s之解離時間及兩個用甘胺酸-HCl(pH 1.5)溶液進行之30s之再生步驟，其中最後一個在20秒注射後之含有穩定期。
最終，使用Biacore B4000評估軟體將雙重參考之資料擬合至1：1朗格繆爾相互作用模型。所得K D值示於表3b中。
經由SPR確定對Tim3之親和力((嵌合TIM3-0028及人類化形式))
抗人類Fc IgG藉由偶合至(Biacore)CM5感測器晶片表面之胺固定。接著捕獲樣品且hu Tim3-ECD與其結合。在各分析週期之後使感測器晶片表面再生。最終藉由將資料擬合至1：1朗格繆爾相互作用模型獲得平衡常數及動力學速率常數。
在Biacore B4000儀中使用GE Healthcare提供之胺偶合套組使約2500個響應單元(RU)之10μg/ml抗人類Fc IgG(GE Healthcare號BR-1008-39)偶合於CM5感測器晶片之所有流動細胞之點1、2、4及5上。
樣品及操作緩衝液為HBS-EP+(0.01M HEPES、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05% v/v表面活性劑P20，pH 7.4)。流動細胞溫度設定為25℃且樣品腔室溫度設定為12℃。系統用操作緩衝液預致敏。
注射濃度為10nM之不同樣品30秒，且連續結合至所有流動細胞中之點1及5。接著，對各樣品注射一整組單體人類Tim3-ECD稀釋液(600nM、200nM、66.7nM、2×22.2nM、7.4nM、2.5nM及2×0nM)維持300秒。各抗原注射之後為12s/700s之解離時間及兩個用3M MgCl2溶液進行之30s之再生步驟，其中最後一個含有用操作緩衝液「在注射後進行額外洗滌」。
最終，使用Biacore B4000評估軟體將雙重參考之資料擬合至1：1 朗格繆爾相互作用模型。所得K D值示於表3b中。
實例2：產生抗Tim3抗體衍生物 嵌合抗體衍生物
嵌合Tim3抗體如下產生：經由PCR擴增抗TIM3小鼠抗體Tim3-0016、Tim3-0016變異體(0018)、Tim3-0021、Tim3-0022、Tim3-0026、Tim3-0028、Tim3-0030及Tim3-0033、Tim3-0038之可變重鏈及輕鏈區且將其選殖至作為具有有LALA及PG突變(白胺酸234至丙胺酸、白胺酸235至丙胺酸、脯胺酸329至甘胺酸)從而消除效應功能之人類IgG1主鏈/人類CH1-鉸鏈-CH2-CH3之融合蛋白的重鏈表現載體及作為人類C-κ之融合蛋白的輕鏈表現載體中。LC及HC質體接著共轉染至HEK293中且在7天之後藉由抗體純化之標準方法自清液層純化。
移除糖基化位點NYT：藉由Q或S取代N修飾Tim3-0016、Tim3_0016變異體(稱為0018或Tim3_0018)中之1 HVR-L1位置
Tim3_0016及Tim3_0016變異體(0018)之可變輕鏈區內之突變使用Agilent「快速變化快速定點突變誘發套組」根據製造商之說明書藉由活體外突變誘發產生。藉由此方法，輕鏈HVR-L1(SEQ ID NO：4)中之糖基化位點基元NYT之天冬醯胺(N)經麩醯胺酸(Q)置換(產生SEQ ID NO：11=Tim3_0016_HVR-L1變異體1_NQ)，或者，天冬醯胺(N)經絲胺酸(S)置換(產生SEQ ID NO：12=Tim3_0016_HVR-L1變異體2_NS)。在兩者中，成功修飾糖基化位點基元NYT。編碼變異體之LC 及HC質體接著共轉染至HEK293中且在7天之後藉由抗體純化之標準方法自清液層純化。
藉由人類Tim3上之ELISA、食蟹獼猴Tim3上之ELISA及表現全長人類Tim3之黏著性CHO-K1細胞上之細胞ELISA測試產生之突變體。
發現所有產生之突變體展示，分別與親本抗體Tim3_0016或Tim3_0016抗體變異體Tim3_0018相比，以甚至更具功能性之方式結合至人類TIM3(人類)、CHO細胞上之食蟹獼猴TIM3(食蟹獼猴)或人類TIMR。
人類化抗體衍生物 鼠類抗Tim3-0016變異體(0018)及抗Tim3_0028之VH及VL域之人類化
基於a)抗Tim3抗體Tim3_0016變異體(0018)之VH及VL域之胺基酸序列(6個HVR之胺基酸序列，其中在輕鏈中使用HVR-L1變異體2_NS(藉由N至S突變移除糖基化位點)(SEQ ID NO：1、2、3、12、5及6))，產生人類化抗Tim3抗體變異體Tim3-0433及Tim3-0434，且基於b)抗Tim3抗體Tim3_0028之VH及VL域之胺基酸序列(6個HVR之胺基酸序列(SEQ ID NO：37、38、39、40、41及42))，產生人類化抗Tim3抗體變異體Tim3-0438及Tim3-0443。
重鏈及輕鏈可變區之人類化胺基酸序列回譯至DNA中且合成所 得cNDA(GenArt)且接著選殖至作為具有有LALA及PG突變(白胺酸234至丙胺酸、白胺酸235至丙胺酸、脯胺酸329至甘胺酸)從而消除效應功能之人類IgG1主鏈/人類CH1-鉸鏈-CH2-CH3之融合蛋白的重鏈表現載體及作為人類C-κ之融合蛋白的輕鏈表現載體中。LC及HC質體接著共轉染至HEK293中且在7天之後藉由抗體純化之標準方法自清液層純化。所得人類化Tim3-抗體如下命名：
實例3：純化單株抗體之螢光標記
藉由使用Alexa Fluor 488單株抗體標記套組(Invitrogen製造)根據製造商之說明書進行融合瘤源單株抗體之螢光標記。在標記之後，藉由對表現TIM-3之RPMI-8226及Pfeiffer細胞進行FACSCalibur(藉由BD Biosciences製造)分析確定各抗體用Alexa Fluor 488(在下文中稱為「Alexa-488」)進行陽性標記。
實例4：使用基於FACS之競爭分析對結合抗原決定基組進行分類
藉由基於FACS之結合競爭分析來分析產生之抗TIM3抗體與六個抗TIM3參考抗體之間的抗原決定基比例。TIM3參考抗體如下：如 US2012/189617中所述之抗體4177及8213、如WO2013/06490中所述之抗體1.7E10及27.12E12；抗體344823(純系344823，藉由R&D Systems製造)及抗體F38-2E2(純系F38-2E2，藉由BioLegend及R&D Systems製造)。簡言之，允許測試抗體與表現TIM-3之RPMI-8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)相互作用並結合，且接著藉由流動式細胞量測方法來評估，無論另一抗TIM-3抗體是否亦可結合至TIM-3表現細胞。
簡而言之，在室溫下使表現人類TIM3之RPMI-8226細胞與BD人類Fc嵌段一起培育10min，且在兩種不同實驗設定下染色以排除測試抗體之親和力差異對結合的影響：1)具有所揭示之純化抗TIM3(10μg/ml，於BD染色緩衝液中，在4℃下0.5h)，其根據製造商之說明書(Molecular Probes A-20181)以每抗體平均2.7個螢光團與Alexa*488結合。接著，a)在4℃下添加於BD SB中之未標記(1-4)參考重組抗TIM3抗體或同型對照(10μg/ml)0.5h，且在用由PE標記之抗huFcγ Ab(JIR，109-116-098，1：200，於BD SB中在4℃下0.5h)染色之BD SB洗滌之後，或b)在4℃下添加於BD SB中之PE標記之(5-6)可獲得之參考抗TIM3抗體或適當同型對照(10μg/ml)0.5h。在洗滌及離心之後，藉由BD Biosciences FACSCanto流式細胞儀分析染色之RPMI-8226細胞之MFI信號。
基於FACS之抗原決定基組定位之結果展示，Tim3_0016及Tim3_0016變異體Tim3_0018展示不與任何測試抗TIM-3參考抗體結合競爭且表明此等Ab會識別不同於所有先前所述TIM3參考抗體識別之抗原決定基的新穎抗原決定基，然而Tim3_0022、Tim3_0026、Tim3_0028及Tim3_0038與各種競爭者競爭以不同程度結合至JRPMI-8226細胞上表面表現之TIM3。
實例5：混合淋巴細胞反應(MLR)中人類抗TIM-3抗體對細胞激素產生之影響
混合淋巴細胞反應用以表明阻斷TIM-3路徑對淋巴細胞效應細胞之影響。測試分析中在存在或不存在抗TIM-3 mAb之情況下T細胞之活化及IFN-γ分泌。
藉由密度梯度離心使用Leukosep(Greiner Bio One,227 288)自健康供體之末梢血液分離人類淋巴球。簡言之，用三倍體積之PBS稀釋肝素化血液且稀釋之血液的25ml等分試樣以層狀放置於50ml Leukosep管中。在室溫下在800 x g下離心15min(有或無破裂)之後，收集含有淋巴細胞之部分，用PBS洗滌且直接用於功能性分析中或以1.0E+07個細胞/毫升再懸浮於冷凍介質(10% DMSO、90% FCS)中，且儲存於液氮中。在MLR分析中使用1：1之目標/反應細胞比率(亦即各MLR培養物在200μl之總體積中含有來自各供體之2.0E+05個PBMCs)。將不同抗體濃度之抗TIM3單株抗體Tim3_0016、Tim3_0016變異體(Tim3_0018)、Tim3_0021、Tim3_0022、Tim3_0026Tim3_0028、Tim3_0030、Tim3_0033、Tim3_0038及F38-2E2(BioLegend)添加至各培養物中。無抗體或同型對照抗體用作陰性對照且rec hu IL-2(20EU/ml)用作陽性對照。在37℃下培養該等細胞6天。在第6天之後，自用於細胞激素量測之各培養物取出100μl介質。使用OptEIA ELISA套組(BD Biosciences)量測IFN-γ之含量。
結果示於表6中(IFN-g分泌/釋放)。抗TIM-3單株抗體以濃度依賴性方式促進T細胞活化及IFN-γ分泌。與F38-2E2抗體相比，抗TIM3抗體Tim3_0021、Tim3_0022、Tim3_0028及Tim3_0038會減少發炎性細胞激素IFN-γ)之釋放。當與F38-2E2抗體比較時，Tim3_0016、Tim3_0016變異體(Tim3_0018)、Tim3_0033及Tim3_0038顯示類似釋放。相比之下，含有同型對照抗體之培養物不展示IFN-γ分泌增加。
在其他實驗中，量測與0.1μg/ml抗PDI mAb組合之以下嵌合及人類化抗體(如上文所述產生)之EC50值：在不同淋巴細胞供體混合物(分別為D2及D3或D1及D5)下量測嵌合chi_Tim3_018抗體及其人類化形式Tim3-433及Tim3-434、嵌合chi_Tim3_028抗體及其人類化形式Tim3-438及Tim3-443，結果示於表6b中。
實例6：抗TIM-3抗體內化至TIM-3表現細胞中
本文所述之TIM-3特異性抗體可內化至TIM-3表現細胞中，包括TIM-3表現淋巴瘤、多發性骨髓瘤及AML細胞。舉例而言，展示將本 發明之TIM-3特異性抗體及其片段內化至穩定表現人類TIM-3之rec TIM3 CHO細胞中，如由基於細胞之ELISA、流動式細胞測量術(FACS)及共軛焦顯微鏡所評估。
舉例而言，使用新鮮培養基將穩定之Tim3轉染之CHO-K1細胞(純系8)(4×104個細胞/孔/100μl)接種至98孔MTP中。在隔夜細胞連接之後，移除細胞培養基且將測試抗體添加至細胞中(10μg/ml，於細胞培養基中)且在4℃下培育0.5小時。作為參考，使用市售小鼠抗人類抗體(TIM3 MAB 11E365(US Biological,T5469-92P)。在洗滌(2次，用細胞培養基)及離心之後，在a)4℃或b)37℃下於200μl細胞培養基中培育細胞3小時。內化通常在37℃下，而非在4℃下發生，其提供反應之另一對照。接著，在室溫(RT)下用100μl/孔於1×PBS中之0.05%戊二醛(Sigma目錄號G5882)固定細胞10min。此後為三個200μl PBS-T進行之洗滌步驟，且在室溫下添加二次抗體羊-抗小鼠-POD(辣根POD連接之F(ab')2片段；GE NA9310))1小時。在最終洗滌步驟(3xPBS-T)之後，添加TMB底物(Roche序號11835033001)15min且使用1N HCl終止顯色。藉由用ELISA讀取器在450/620下量測來確定最終OD。此細胞ELISA程序用於自融合瘤清液層純化之測試抗體之內化能力的介質輸送量評估。
如下計算內化百分比：內化[%]=(1-OD樣品_37℃/OD樣品_4℃)×100
(內化)之結果示於圖1A及1B中。在37℃下培育3h之後幾乎所有測試之抗TIM-3單株抗體均類似地充分內化至穩定Tim3轉染之CHO-K1細胞中(並非顯示所有資料)。
EC50內化值(時間依賴性)之確定以及取決於單價相對於二價之內化動力學之比較藉由對選擇候選者進行FACS來評估。
簡言之，使用新鮮培養基將人類TIM3穩定表現CHO-K1細胞接種 (4×105個細胞/孔/50μl)至98孔v底MTP中且在室溫下與Redimune® NF液體一起培育10min以阻斷非特異性結合。接著，添加50μl/孔所選純化抗TIM3(10μg/ml，於細胞培養基中)且在4℃下培育1h。在洗滌(用細胞培養基)及離心之後，在a)4℃或b)37℃下於200μl細胞培養基中培育細胞0.25、0.5、1、2、3、4、6及24小時。接著，用PBS/1% BSA洗滌細胞且在4℃下添加二次抗體Alexa Fluor 488山羊-抗小鼠IgG1 F(ab)2小時。在洗滌及離心之後，添加125μl CellFix(BD Bioscience，1：1000)且藉由BD Biosciences FACSCanto流式細胞儀分析染色細胞之MFI信號。
如下計算內化百分比：內化[%]=(1-MFI樣品_37℃/MFI樣品_4℃)×100
評估抗RPMI-8226細胞(ATCC®CCL-155 TM )上TIM3抗體Tim3_0016、Tim3_0016變異體(Tim3_0018)、Tim3_0021、Tim3_0028、Tim3_0030、Tim3_0033、Tim3_0038之時間依賴性內化之實例：
本發明揭示之抗TIM3抗體以高含量快速內化至TIM3表現RPMI-8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)中。如上文所述用TIM3表現RPMI-8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)替代rec CHOK1細胞表現huTIM-3進行實驗。結果係顯示於表7中。使用以下抗體作為TIM3參考抗體：如US2012/189617中所述之抗體8213、如WO2013/06490中所述之抗體27.12E12。Tim3_0016、Tim3_0016變異體(Tim3_0018)、Tim3_0038用作人類IgG1嵌合形式。
從結果中，與參考抗體相比，本發明抗體在RPMI-8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)上以高百分比快速內化
實例7：抗TIM-3抗體與分離之人類單核細胞表現TIM-3之結合
藉由密度梯度離心使用Ficoll-Paque(GE Healthcare)(參見用戶手冊中之通用方案或訪問www.miltenyibiotec.com/protocols)及經由CD14微珠進行後續陽性選擇自健康供體之抗凝末梢血液分離CD14+單核細胞。首先用CD14微珠磁性標記CD14+細胞。接著，將細胞懸浮液裝載於置放於MACS分離器之磁場中的MACS®管柱上。磁性標記之CD14+細胞保留於管柱中。未標記細胞流過，此細胞溶離份無CD14+細胞。在自磁場移出管柱之後，可溶離以磁性方式保留之CD14+細胞作為陽性選擇之細胞溶離份。在室溫下200×g下離心10min之後，收集單核細胞且直接用於結合分析中或以1.0E+07個細胞/ml再懸浮於冷凍介質(10% DMSO，90% FCS)中且儲存於液氮中。
如文獻中所示，單核細胞將TIM3組成性表現於其表面上。將1×105個CD14+分離之人類單核細胞(50μl/孔)於新鮮培養基中置於98孔v底MTP中且在室溫下與Redimune® NF液體一起培育15min以阻斷非特異性結合。接著，添加50μl/孔之所揭示抗TIM3 mAb或參考抗TIM-3 mAb 344823(R&D)及F38-2E2(BioLegend)(10μg/ml，於細胞培養基中)且在4℃下培育1h。接著，用PBS/1% BSA洗滌細胞且在4℃下添加二次抗體PE-標記之山羊-抗小鼠F(ab')2(Jackson Lab 115-006-072)1小時。在洗滌及離心之後，藉由BD Biosciences FACSCanto流式細胞儀分析染色之細胞的MFI信號。
如下計算特異性結合：特異性結合[MFI]=幾何平均MFI樣品-幾何平均MFI同型對照
結果示於表8中：(結合至人類單核細胞)。TIM3純系Tim3_0016、Tim3_0018、Tim3_0020、Tim3_0028及Tim3_0038甚至比參考抗TIM-3Ab更佳地結合至不同供體之人類單核細胞。
實例8：抗TIM-3抗體與分離之食蟹獼猴單核細胞表現TIM-3之結合
藉由密度梯度離心使用Ficoll-Paque(GE Healthcare)(參見用戶手冊中之通用方案或訪問www.miltenyibiotec.com/protocols)及經由CD14微珠進行後續陽性選擇自食蟹獼猴抗凝末梢血液(Covance)分離CD14+單核細胞。首先用CD14微珠磁性標記CD14+細胞。接著，將細胞懸浮液裝載於置放於MACS分離器之磁場中的MACS®管柱上。磁性標記之CD14+細胞保留於管柱中。未標記細胞流過，此細胞溶離份無CD14+細胞。在自磁場移出管柱之後，可溶離以磁性方式保留之CD14+細胞作為陽性選擇之細胞溶離份。在室溫下200×g下離心10min之後，收集單核細胞且直接用於結合分析中或以1.0E+07個細胞/ml再懸浮於冷凍介質(10% DMSO，90% FCS)中且儲存於液氮中。
如文獻中所示，單核細胞將TIM3組成性表現於其表面上。將 1×105個CD14+分離之食蟹獼猴單核細胞(50μl/孔)於新鮮培養基中置於98孔v底MTP中且在室溫下與Redimune® NF液體一起培育15min以阻斷非特異性結合。接著，添加50μl/孔Alexa488標記之抗TIM3(10μg/ml，於細胞培養基中)且在4℃下培育1h。在洗滌及離心之後，藉由BD Biosciences FACSCanto流式細胞儀分析染色之細胞的MFI信號。
如下計算特異性結合：特異性結合[MFI]=幾何平均MFI樣品-幾何平均MFI同型對照
結果示於表9中(結合至食蟹獼猴單核細胞)。TIM3純系Tim3_0016、Tim3_0018、Tim3_0026、Tim3_0028及Tim3_0030結合至不同食蟹獼猴供體之食蟹獼猴單核細胞。
實例9：抗TIM-3抗體與表現TIM-3之NHL及MM細胞株之結合
藉由FACS分析所揭示之抗TIM3抗體及兩個抗TIM3參考抗體純系(1)4177及(2)8213(Kyowa)之結合能力。簡言之，在室溫下表現人類 TIM3之B細胞淋巴瘤細胞(例示為Pfeiffer細胞)及多發性骨髓瘤細胞(例示為RPMI-8226細胞)與BD人類Fc嵌鍛一起培育10min以阻斷非特異性結合。接著，將2×105細胞(50μl/孔)置於98孔v底MTP中且添加50μl/孔Alexa488標記之抗TIM3(10μg/ml，於BD染色緩衝液中)且在4℃下培育1h。在洗滌及離心之後，藉由BD Biosciences FACSCanto流式細胞儀分析染色之細胞的MFI信號。
如下計算特異性結合：特異性結合[MFI]=幾何平均MFI樣品-幾何平均MFI同型對照
結果示於圖2A及2B中(結合至RPMI-8226及Pfeiffer細胞)。
實例10：抗TIM-3抗體對表現TIM-3之NHL及MM細胞之細胞毒性活性
與綠膿桿菌外毒素(PE 24)結合之TIM3特異性抗體實際上會殺死TIM3表現細胞。
用Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析來分析所揭示之抗TIM3抗體及一種市售抗TIM3參考抗體純系11E365(可購自US Biological)之細胞毒性活性。簡言之，向5×103個(50μl/孔，於98孔MTP中，一式三份)穩定表現人類TIM-3之重組CHO K1或2×104個細胞(50μl/孔，於98孔MTP中，一式三份)表現人類TIM3之B細胞淋巴瘤細胞(例示為Pfeiffer細胞)或多發性骨髓瘤細胞(例示為RPMI-8226細胞)中添加25μl/孔之最高濃度為10μg/ml之所揭示抗TIM-3抗體之1：5連續稀釋液、或未處理細胞之適當培養基、或非靶向處理細胞之同型對照。處理在10μg/ml至1ng/ml之範圍內進行，重複三次。所有抗體用作全長小鼠Fcγ形式。為結合綠膿桿菌外毒素，添加10μg/ml與PE 24結合之小鼠Fcγ片段特異性Fab且在37℃下培育3天。真核生物中之已知蛋白質合成抑制劑環己醯亞胺用作陽性對照。用Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析量測處理細胞之存活力。
如下計算細胞毒性活性：相對抑制[%]=(1-(E樣品-E陰性對照)/(E陽性對照-E陰性對照))×100
結果示於表10中(抗TIM3 mAb對夾心形式之表現TIM-3之重組NHL及MM細胞株之細胞毒性活性)。
所有測試之TIM3純系對於穩定表現人類TIM-3之重組CHO K1及表現高及中等含量之TIM-3之Pfeiffer細胞極其有效(IC50範圍0.01-0.2nM)，且與強內化參考抗TIM-3 Ab純系11E365(US Biological)相比其細胞毒性活性中甚至更有效。TIM3純系0016、0018、0021、0022、0033及0038對與重組CHO TIM-3細胞相比TIM-3表現量低5倍之RPMI-8226細胞亦有效。
實例11：所揭示之抗TIM3抗體相對於兩個抗TIM3參考抗體1.7.E10及27-12E12(如WO2013/06490中所述)之細胞毒性活性之比較
用如上文所述Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析來分析所揭示之抗TIM3抗體及兩個抗TIM3參考抗體TIM3參考抗體1.7E10及 27.12E12(如WO2013/06490中所述)之細胞毒性活性。所有抗體以包括人類Fcγ部分之全長人類IgG1形式使用。在此實驗中，綠膿桿菌外毒素之結合經由添加且在37℃下培育5天之與PE 24(10μg/ml)結合之人類Fcγ片段特異性Fab實現。
結果示於表11中.-抗TIM3 mAb對表現TIM-3之NHL及MM細胞株之細胞毒性活性之比較
所有揭示之TIM3純系對表現TIM-3之Pfeiffer及RPMI-8226細胞極具活性(IC50範圍0.02-0.08nM)，且與強內化參考抗TIM-3 Ab純系27-12E12相比對其細胞毒性活性甚至更有效。所有抗體在相同條件下使用相同綠膿桿菌外毒素以綠膿桿菌外毒素(PE24)結合物形式進行比較。
實例12：所揭示之抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對MM、NHL及AML細胞株(表現TIM3，但不表現PSMA)之細胞毒性活性
用如上文所述Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析來分析細胞毒性活性。最高濃度為50μg/ml之直接結合至PE24所揭示之抗TIM3抗體之Fab片段之1：5連續稀釋液、或未處理細胞之適當培養基、或非靶向處理細胞之非結合抗PSMA Fab-PE24對照與7.5×103 Pfeiffer 細胞或2×103 RPMI-8226細胞(50μl/孔，於98孔MTP中)在37℃下一起培育4天。處理在50μg/ml至8ng/ml之範圍內進行，重複三次。環己醯亞胺用作陽性對照。
結果示於表12中。(所揭示之抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對MM、NHL及AML細胞株之細胞毒性活性)。
所揭示之抗TIM3抗體之所有測試之Fab-PE24構築體對TIM-3表現量中等之MM(RPMI-8226)及NHL(Karpas-299)細胞極其有效(IC50範圍為1-10nM)且表明對TIM-3表現量極低之AML細胞株(CMK、TF-1、MOLM-13)具有顯著細胞毒性活性。
實例13：免疫結合物(所揭示之抗TIM3之綠膿桿菌外毒素A結合物(Fab-PE24構築體)對來自復發/難治癒患者原代白血病幹/祖AML細胞之細胞毒性活性
來自復發/難治癒患者之末梢血液之CD34+細胞獲自AllCells,LLC,Alameda,CA。
表13：AML患者之臨床特徵
在確認所有樣品之純度及存活力之後(純度範圍為84-94%且存活力範圍為95-99%)，藉由如實例7中所述之FACS使用抗TIM-3 mAb 344823(R&D)評估TIM-3之表現量。(參見圖3)
所有測試(4/4)之來自復發/難治癒患者之主要白血病幹/祖(CD34+)AML樣品表明TIM-3以不同表現量均勻表現。
為評估所揭示之抗TIM3純系0016及0022之Fab-PE24構築體對原代CD34+AML細胞之細胞毒性活性，將1×104個細胞(50μl/孔，於98孔MTP中，一式三份)與最高濃度為50μg/ml之Fab片段之1：5連續稀釋液、或未處理細胞之適當培養基、或非靶向處理細胞之非結合抗PSMA Fab-PE24對照在37℃下一起培育3天。環己醯亞胺用作陽性對照。用如實例12中所述之Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析來分析細胞毒性活性。
結果示於表14中。(所揭示之抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對原代CD34+AML細胞之細胞毒性活性)。
表14：所揭示之抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對原代CD34+AML細胞之細胞毒性活性
抗TIM3抗體Tim3_0016及Tim3_0022之Fab-PE24構築體對(2/4)原代AML樣品(PB0142及PB0135)(IC50範圍為30-116nM)極其有效且表明對TIM-3表現量不同之所有(4/4)原代白血病幹/祖(CD34+)AML細胞具有顯著細胞毒性活性。
實例14：所選抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對NHL及MM細胞株之效力之比較
用如上文實例12所述之Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析來分析評估所選所揭示之抗TIM3抗體之分選酶偶合Fab-PE24構築體的細胞毒性活性。
結果示於表15中。(所選抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對NHL及MM細胞之細胞毒性活性)。
展示所有選擇所揭示之抗TIM3抗體之Fab-PE24構築體對TIM-3表現量中等之NHL(Pfeiffer)及MM(RPMI-8226)細胞具有高細胞毒性效力(IC50範圍為0.3-5nM)。
在所揭示之抗TIM3抗體Tim3_0016及Tim3_0038之Fab-PE24構築體下觀察到最高細胞毒性活性。
實例15：相同純系之所揭示之抗TIM-3抗體之Fab-PE24構築體相對於全IgG毒傘毒素結合物對Pfeiffer細胞之細胞毒性活性之比較
所揭示之抗TIM3純系0016之結合之Fab-PE24構築體相對於與毒傘毒素結合之相同純系之全IgG(根據WO2012/041504中所述之程序(經由毒傘毒素胺基酸4之6' C原子，詳言之經由結合至毒傘毒素胺基酸之6' C原子之氧原子結合，且其中TIM3抗體藉由連接子經由脲部分連接)的細胞毒性活性之評估用如上文實例12中所述之Promega CellTiter-Glo發光細胞存活力分析來分析。
結果示於表16中。(抗TIM3純系0016之Fab-PE24構築體相對於全IgG-毒傘毒素結合物對NHL細胞之細胞毒性活性)。
對於TIM-3之表現量中等之NHL(Pfeiffer)細胞，瓢菌素結合之抗TIM-3純系0016之細胞毒性活性(IC50 0.8nM)與相同純系之Fab-PE24構築體之細胞毒性活性(IC50 0.3nM)類似。
實例15：TIM3抗體與不同周邊血液單核細胞(PBMC)之結合之直接比較 結合分析
新近分離之PBMC或3天多選殖活化之(盤結合之抗CD3及可溶性抗CD28抗體，各1μg/ml，皆來自BD Pharmingen)CD4T細胞在4℃下用Alexa 647直接結合之抗TIM抗體Tim3-0018、Tim3-0028或其嵌合或人類化形式染色1小時。接著洗滌細胞以消除未結合之抗體且在4℃下染色表面標記30分鐘以辨別單核細胞(CD14+(BD Pharmingen))、NK細胞(CD16+(eBioscience)、CD56+(BioLegend)及CD3-)及T cells(CD3+(eBioscience))，之後用BD細胞固定來固定。在LSRFortessa,BD Biosciences下獲得細胞。
結果示於圖4A至4D中(在圖式中，使用以下名稱：Tim3-0018：0018(aTIM-3)，人類化Tim3-0018形式Tim3-0434：0434(h0018)，Tim3-0028：0028(aTIM-3)，嵌合Tim3-0028：chi0028，人類化Tim3-0028形式Tim3-0438：0438(h0028))。資料展示人類化抗體在與親本抗體相比時對CD4 T細胞具有改良之結合及結合特異性。
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<211> 119
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> Tim3-0028之VH人類化形式(=Tim3-0438)
<400> 83
<210> 84
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> Tim3-0028之VL人類化形式(=Tim3-0438)
<400> 84
<210> 85
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> Tim3-0028之VH人類化形式(=Tim3-0443)
<400> 85
<210> 86
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> Tim3-0028之VL人類化形式(=Tim3-0443)
<400> 86

Claims (27)

  1. 一種結合至TIM3之分離之抗體，其中該抗體：在37℃下120分鐘之後誘導至少45%之TIM3內化(在表現TIM3之RPMI8226細胞(ATCC ® CCL-155TM)之FACS分析中)。
  2. 如請求項1之分離之抗體，其中該抗體：與包含SEQ ID NO：7之VH及SEQ ID NO：8之VL的抗Tim3抗體競爭結合至TIM3結合至人類及食蟹獼猴(cynomolgus)TIM3以免疫結合物顯示對TIM3表現細胞之細胞毒性活性誘導干擾素-γ釋放。
  3. 如請求項1之分離之抗體，其為人類、人類化或嵌合抗體。
  4. 如請求項1之分離之抗體，其為結合至TIM3之抗體片段。
  5. 如請求項4之分離之抗體，其為Fab片段。
  6. 如請求項1至5中任一項之分離之抗體，其包含A)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或B)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：11之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基 酸序列的HVR-L3；或C)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3；或D)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：13之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：14之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：15之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列的HVR-L3；或E)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：23之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：25之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：26之胺基酸序列的HVR-L3；或F)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：31之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：32之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的HVR-L3；或G)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的 HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3；或H)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：45之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：46之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：47之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：48之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列的HVR-L3；或I)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：55之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：57之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HVR-L3；或J)(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：61之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：62之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：63之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：64之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：65之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：66之胺基酸序列的HVR-L3。
  7. 一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：3之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：12之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的HVR-L3。
  8. 如請求項7之分離之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列，或ii)SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
  9. 如請求項7之分離之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：79之VH序列及SEQ ID NO：80之VL序列。
  10. 如請求項7之分離之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：81之VH序列及SEQ ID NO：82之VL序列。
  11. 一種結合至人類TIM3之分離之抗體，其中該抗體包含(a)VH域，其包含(i)包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的HVR-H1，(ii)包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的HVR-H2及(iii)包含選自SEQ ID NO：39之胺基酸序列的HVR-H3；及(b)VL域，其包含(i)包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的HVR-L1；(ii)包含SEQ ID NO：41之胺基酸序列的HVR-L2及(iii)包含SEQ ID NO：42之胺基酸序列的HVR-L3。
  12. 如請求項11之分離之抗體，其中該抗體包含i)SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列，或ii)SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
  13. 如請求項11之分離之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：83之VH序列及SEQ ID NO：84之VL序列。
  14. 如請求項11之分離之抗體，其中該抗體包含SEQ ID NO：85之VH序列及SEQ ID NO：86之VL序列。
  15. 如請求項1至5及7至14中任一項之分離之抗體，其為全長IgG1抗 體。
  16. 如請求項1至5及7至14中任一項之分離之抗體，其為具有突變L234A、L235A及P329G(根據Kabat之EU索引編號)之全長IgG1抗體。
  17. 一種分離之核酸，其編碼如請求項1至16中任一項之抗體。
  18. 一種宿主細胞，其包含如請求項17之核酸。
  19. 一種產生抗體之方法，其包含培養如請求項18之宿主細胞以產生該抗體。
  20. 如請求項19之方法，其進一步包含自該宿主細胞回收該抗體。
  21. 一種免疫結合物，其包含如請求項1至16中任一項之抗體及細胞毒性劑。
  22. 一種醫藥調配物，其包含如請求項1至16中任一項之抗體或如請求項21之免疫結合物及醫藥學上可接受之載劑。
  23. 如請求項1至5及7至14中任一項之分離之抗體或如請求項21之免疫結合物，其係用作藥劑。
  24. 如請求項1至5及7至14中任一項之分離之抗體或如請求項21之免疫結合物，其係用於治療癌症。
  25. 一種如請求項1至16中任一項之抗體或如請求項21之免疫結合物之用途，其係用於製造藥劑。
  26. 如請求項25之用途，其中該藥劑用於治療癌症。
  27. 一種如請求項1至16中任一項之抗體或如請求項21之免疫結合物之用途，其係用於製造用以治療患有癌症之個體的藥劑。
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