ES2202469T3 - Proteina relacionada con el vegf. - Google Patents
Proteina relacionada con el vegf.Info
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Abstract
SE HA IDENTIFICADO Y AISLADO UNA PROTEINA RELACIONADA CON EL VEGF (PRV) QUE SE UNE Y ESTIMULA LA FOSFORILACION DEL RECEPTOR FLT4 DE LA TIROSINA CINASA. SE HA POSTULADO QUE LA PRV ES EL TERCER ELEMENTO DE LA FAMILIA DE PROTEINAS VEGF. SE PRESENTAN TAMBIEN LOS ANTICUERPOS QUE SE UNEN A LA PRV Y QUE NEUTRALIZAN LA ACTIVIDAD BIOLOGICA DE LA PRV, LAS COMPOSICIONES QUE CONTIENEN PRV O ANTICUERPOS, LOS METODOS DE USO, LOS POLIPEPTIDOS QUIMERICOS Y EL POLIPEPTIDO SEÑALIZADOR DE LA PRV.
Description
Proteína relacionada con el VEGF.
La presente invención pertenece generalmente a un
ligando de un receptor que es proteína quinasa de tirosina. Más
concretamente, la invención se refiere a un nuevo ligando,
denominado proteína relacionada con VEGF (VRP) o VH1, el cual se
une a, y estimula la fosforilación del receptor quinasa de tirosina
Flt4 (conocido también como el receptor Sal-S1), y
al aislamiento y producción recombinante del mismo.
La formación de vasos sanguíneos nuevos, bien a
partir de células endoteliales diferenciándose durante el desarrollo
embrionario (vasculogénesis) o a partir de vasos preexistentes
durante la vida adulta (angiogénesis), es una característica
esencial del desarrollo de órganos, de la reproducción, y de la
cicatrización de heridas en organismos superiores. Folkman y Shing,
J. Biol. Chem. 267: 10931-10934 (1992);
Reynolds et al., FASEB J. 6:886-892
(1992); Risau et al., Development
102:471-478 (1988). La angiogénesis es necesaria
también para ciertos procesos patológicos, incluyendo la
tumorigénesis (Folkman, Nature Medicine
1:27-31 (1995)) y la retinopatía (Miller et
al., Am. J. Pathol. 145:574-584
(1994)).
Mientras que varios factores de crecimiento
pueden estimular la angiogénesis (Klagsbrun y D'Amore, Ann. Rev.
Physiol. 53:217-239 (1991); Folkman y
Klagsbrun, Science 235:442-447 (1987)), el
factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) (Ferrara et
al., Endo. Rev. 13:18-32 (1992)) es un
factor angiogénico potente que actúa a través del receptor quinasa
de tirosina, específico de células endoteliales, de la quinasa de
tirosina parecida a fms (Flt1) (Shibuya et al.,
Oncogene 5:519-524 (1990); de Vries et
al., Science 255:989-991 (1992)) y de la
quinasa de hígado fetal (Flk1) (también denominado KDR). Quinn
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
90:7533-7537 (1993); Millauer et al.,
Cell 72:835-846 (1993); Matthews et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
88:9026-9030 (1991); Terman et al.,
Biochem. Biophys. Res. Commun. 187:1579-1586
(1992); Terman et al., Oncogene
6:1677-1683 (1991); Oelrichs et al.,
Oncogene 8:11-18 (1993). Estos dos receptores
VEGF y un tercer receptor huérfano, Flt4 (Pajusola et al.,
Cancer Res. 52:5738-5743 (1992); Galland
et al., Oncogene 8:1233-1240 (1993);
Finnerty et al., Oncogene 8:2293-2298
(1993)) constituyen una subfamilia de las quinasas de tirosina de
receptor de la clase III, que contiene siete dominios
extracelulares similares a inmunoglobulinas y un dominio quinasa de
tirosina intracelular separado. Mustonen y Alitalo, J. Cell
Biol. 129:895-898 (1995). Ver también la
W094/10.202, publicada el 11 de mayo de 1994, y la PCT/US93/00.586
registrada el 22 de enero de 1993 (Avraham et al.). Estos
tres receptores tienen un 31-36% de identidad de
aminoácidos en sus dominios extracelulares unidores de ligando.
Los ratones con Flt1 deficiente (Fong et
al., Nature 376:66-70 (1995)) o Flk1
(Shalaby et al., Nature 376:62-66
(1995)) (generados mediante manipulación génica en células
troncales embrionarias) tienen defectos graves en su vasculogénesis
y mueren en el útero en los días embrionarios 8-9.
El fenotipo de los ratones con Flt1 deficiente difiere
considerablemente, sin embargo, los ratones que carecen de Flt1
tiene un endotelio vascular desorganizado que afecta a los vasos
principales así como a la microvasculatura, mientras que la
diferenciación de células endoteliales parece ser normal. Fong et
al., ver más arriba. Los ratones que carecen de Flk1 tienen un
defecto principal en el desarrollo de células endoteliales maduras,
así como una importante reducción en los progenitores celulares
hematopoyéticos. Shalaby et al., ver más arriba. Por tanto,
el VEGF podría actuar sobre células endoteliales en más de una
etapa de la vasculogénesis.
El Flt4 también se expresa específicamente en
células endoteliales: se observa primero en embriones de ratón de
8,5 días en precursores de células endoteliales. Kaipainen et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
92:3566-3570 (1995); Kaipainen et al., J.
Exp. Med. 178:2077-2088 (1993). Ver también
Hatva et al., Am. J. Pathol.
146:368-378 (1995). A medida que progresa el
desarrollo, la expresión del Flt4 aparece confinada al endotelio
venoso y linfático, y finalmente se restringe a los vasos
linfáticos. De forma consistente con este hallazgo, los tejidos
adultos humanos presentan expresión del Flt4 en el endotelio
linfático, mientras que hay una ausencia de expresión en arterias,
venas y capilares. Kaipainen et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, ver más arriba. Se han aislado clones que codifican
el Flt4 humano y de ratón, bien mediante PCR con cebadores
procedentes de regiones conservadas de la quinasa de tirosina
(Finnerty et al., ver más arriba; PCT/US93/00.586, ver más
arriba; Aprelikova et al., Cancer Res.
52:746-748 (1992)) o mediante hibridación con baja
exigencia con una sonda Flk2. Galland et al.,
Genomics 13:475-478 (1992). El empalme
alternativo del mARN de Flt4 produce dos variantes de la proteína
que difieren en 65 aminoácidos en el extremo
C-terminal. Pajusola et al., Oncogene
8:2931-2937 (1993). Estas variantes migran como
bandas de 170-190 kDa, que son parcialmente
cortadas proteolíticamente en el dominio extracelular para producir
una forma de aproximadamente 125 kDa. Pajusola et al.,
Oncogene 8, ver más arriba; Pajusola et al.,
Oncogene 9:3545-3555 (1994). La expresión de
la forma empalmada más larga del Flt3 como una quimera, con el
dominio extracelular del receptor CSF-1, muestra que
el dominio intracelular del Flt3 puede señalizar una respuesta de
crecimiento dependiente de ligando en fibroblastos de roedor.
Pajusola et al., Oncogene 9, ver más arriba; Borg
et al., Oncogene 10:973-984 (1995).
El Flt4 ha sido localizado en el cromosoma humano
5q34-q35 (Aprelikova et al., ver más arriba;
Galland et al., Genomics, ver más arriba); el Flt1 y
el Flk1 están ubicados en el 13q12 (Imbert et al.,
Cytogenet. Cell Genet. 67:175-177 (1994)) y
4q12. Sait et al., Cytogenet. Cell Genet.
70:145-146 (1995); Spritz et al.,
Genomics 22:431-436 1994).
El VEGF es una proteína homodimérica, rica en
cisteínas, que puede ocurrir en al menos cuatro formas debido al
empalme alternativo de su mARN. Ferrara et al., ver más
arriba. Aunque el VEGF es un ligando de alta afinidad por el Flt1 y
el Flk1, no se une ni activa el Flt4. Pajusola et al.,
Oncogene 9, ver más arriba. El único otro miembro de la
familia VEGF estrechamente relacionado es un factor de crecimiento
placentario (PIGF), el cual tiene una identidad de aminoácidos del
47% con el VEGF. Maglione et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 88:9267-9271 (1991). El PIGF también existe
en dos formas montadas alternativamente, las cuales difieren en la
presencia o ausencia de un dominio unidor de heparina básico de 21
aminoácidos. Maglione et al., Oncogene
8:925-931 (1993); Hausser y Weich, Growth
Factors 9:259-268 (1993). El PIGF se une al Flt1
pero no al Flk1 (Park et al., J. Biol. Chem.
269:25.646-25.654 (1994)); se cree que su unión al
Flt4 no ha sido determinada. El PIGF no consigue duplicar la
mitogénesis de las células endoteliales capilares o las actividades
de permeabilidad del VEGF, sugiriendo que estas actividades son
mediadas por el receptor Flk1. Park et al., ver más
arriba.
En la literatura de patentes se descubren
moléculas que modulan el receptor Flk1 o que neutralizan la
activación de un receptor VEGF. Por ejemplo, la WO 95/21.613,
publicada el 17 de agosto de 1995, descubre compuestos que modulan
la transducción de señal del receptor KDR/Flk1, para regular y/o
modular la vasculogénesis y angiogénesis, y descubre el uso del
Flk1 para evaluar y buscar drogas y análogos del VEGF implicados en
la modulación del Flk1 a través de actividades agonistas o
antagonistas; la WO 95/21.865 publicada el 17 de agosto de 1995
descubre moléculas inmunointeractivas con la quinasa neuroepitelial
animal (NYK)/Flk1, moléculas que pueden usarse para proporcionar
agentes para el tratamiento, profilaxis, y diagnóstico de un
fenotipo angiogériico-dependiente; y la WO
95/21.868, publicada el 17 de agosto de 1995, descubre anticuerpos
monoclonales que se unen específicamente a un dominio extracelular
de un receptor de VEGF y neutralizan la activación del
receptor.
Se han identificado ahora clones de cADN que
codifican una proteína nueva, denominada VRP, la cual se une a y
estimula la fosforilación del receptor quinasa de tirosina Flt4. La
VRP está relacionada en su secuencia de aminoácidos al VEGF, pero
no interacciona apreciablemente con los receptores del VEGF, el Flt1
y Flk1.
En un aspecto, la invención proporciona la VRP
humana, biológicamente activa, aislada, que contiene al menos 265
aminoácidos, de la Figura 1. Preferiblemente, la proteína
relacionada con el VEGF (VRP) humana, biológicamente activa,
aislada, comprende una secuencia de aminoácidos que comprende al
menos los residuos +1 a 29, inclusive, de la Figura 1. En otro
aspecto, la invención proporciona VRP humana, biológicamente
activa, aislada, que comprende una secuencia de aminoácidos
mostrada como los residuos -20 a 399, inclusive, o los residuos 1 a
399, inclusive, de la Figura 1.
La invención también se refiere a quimeras que
comprenden la VRP unida a otro polipéptido. Por ejemplo, la
invención proporciona un polipéptido quimérico que comprende la VRP
fusionada a una secuencia polipeptídica tag. Un ejemplo de una
quimera tal es el VRP con epítopo marcado.
En otro aspecto, la invención proporciona una
composición que comprende VRP biológicamente activa y un portador
farmacéuticamente aceptable. En una realización más específica, la
invención proporciona una composición farmacéutica, útil para la
promoción del crecimiento celular endotelial vascular o linfático,
que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de la VRP en
un portador farmacéuticamente aceptable. En otro aspecto, esta
composición comprende además otro factor de crecimiento celular,
tal como el VEGF y/o el PDGF.
En un aspecto ulterior, la invención proporciona
el uso de la proteína. de la invención en la fabricación de un
medicamento para tratar traumas que afectan el endotelio vascular,
comprendiendo la administración a un mamífero que padece dicho
trauma de una cantidad efectiva de la composición que contiene la
VRP. El trauma es, por ejemplo, úlceras diabéticas o una herida de
los vasos sanguíneos o del corazón. En otra realización, la
invención proporciona el uso de la proteína de la invención en la
fabricación de un medicamento para tratar un estado disfuncional
caracterizado por la ausencia de activación o ausencia de
inhibición de un receptor por la VRP en un mamífero, comprendiendo
la administración al mamífero de una cantidad efectiva de la
composición que contiene la VRP.
La invención proporciona un procedimiento in
vitro que implica poner en contacto el receptor Flt4 con la VRP
para causar la fosforilación del dominio quinasa del mismo. Por
ejemplo, la invención proporciona un procedimiento para estimular
la fosforilación de un dominio de quinasa de tirosina de un
receptor Flt4, que comprende poner en contacto un dominio
extracelular del receptor Flt4 con la VRP.
La invención proporciona también un anticuerpo
monoclonal que se une a la VRP y, preferiblemente, neutraliza
también una actividad biológica de la proteína estando
caracterizada una actividad biológica como promotora de la
neovascularización, o de la permeabilidad vascular, o del
crecimiento de las células endoteliales vasculares en un mamífero.
Alternativa o conjuntamente, la invención proporciona un anticuerpo
monoclonal que se une a la porción N-terminal entre
los residuos -20 a 137, inclusive, o entre los residuos -1 a 137,
inclusive, de la secuencia de aminoácidos mostrada en la Figura 1.
El anticuerpo puede usarse, por ejemplo, para detectar la
presencia de la VRP en una muestra biológica sospechosa de contener
la proteína, o para tratar pacientes. La invención contempla una
composición farmacéutica que comprende tal anticuerpo y un portador
farmacéuticamente aceptable.
Además, la invención contempla un péptido
consistente en una secuencia de aminoácidos mostrados como los
residuos -20 a -1, inclusive, de la Figura 1.
En una realización ulterior, la invención
proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que codifica la
VRP o una quimera de la VRP. En un aspecto, la molécula de ácido
nucleico es ARN o ADN que codifica una VRP biológicamente activa, o
que es complementario a la secuencia de ácido nucleico que codifica
tal VRP, y permanece unido establemente a ella en condiciones
exigentes. La molécula de ácido nucleico incluye opcionalmente las
regiones de las secuencias de ácido nucleico de la Figura 1, las
cuales codifican secuencias señalizadoras. En una realización, la
secuencia de ácido nucleico se selecciona de entre:
- (a) la región codificante de la secuencia de ácido nucleico de la Figura 1 que codifica la preproteína, desde el residuo -20 hasta el residuo 399, o que codifica la proteína madura, desde el residuo 1 hasta el residuo 399 (es decir, los nucleótidos 372 a 1628, inclusive, o los nucleótidos 432 a 1628, inclusive, de la secuencia de ácido nucleico mostrada en la Figura 1 como SEC. N° ID.: 1); o
- (b) una secuencia correspondiente a la secuencia de (a) dentro del ámbito de degeneración del código genético.
En otro aspecto, la molécula de ácido nucleico
puede proporcionarse en un vector replicable, que comprende la
molécula de ácido nucleico operativamente unida a secuencias de
control reconocidas por una célula huésped transfectada o
transformada con el vector. La invención proporciona además una
célula huésped que comprende el vector o la molécula de ácido
nucleico. También se proporciona un procedimiento para producir la
VRP, el cual comprende cultivar una célula huésped que comprende la
molécula de ácido nucleico, y recuperar la proteína a partir del.
cultivo de la célula huésped.
Las Figuras 1A-1D ilustran la
secuencia del nucleótido codificante (SEC. N° ID.: 1), la secuencia
complementaria del nucleótido (SEC. N° ID.: 2), y la secuencia de
aminoácidos deducida (SEC. N° ID.: 3) de la VRP humana descrita en
ésta.
La Figura 2 ilustra la unión de Flt4/IgG y de
Rse/IgG (una proteína de fusión no relacionada con el receptor) a
la línea celular humana de glioma G61, unión que se evaluó mediante
análisis FACS.
Las Figuras 3A y 3B ilustran respectivamente un
mapa de los clones de cADN que codifican la VRP humana, y un
alineamiento de la secuencia proteica de la VRP (SEC. N° ID.: 3)
con la del VEGF_{121} (SEC. N° ID.: 4) y PIGF_{131} (SEC. N°
ID.: 5). La Figura 3A muestra el alcance de cuatro clones de cADN de
la VRP; las líneas discontinuas indican las porciones ausentes del
VH1.1 y VH1.3. Las flechas indican sitios de enzimas de
restricción; el recuadro sombreado indica la secuencia señalizadora
de secreción putativa; el recuadro vacío indica la proteína madura;
las denominaciones del tipo-Y dentro del recuadro
vacío indican los sitios de glicosilación unidos a N potenciales; y
las líneas verticales indican los residuos cisteína. Se muestra un
diagrama del VEGF_{121} por comparación. La gráfica de hidropatía
(Kyle y Doolittle, J. Mol. Biol. 157:105-132
(1982)) es para el VRP. En la Figura 3B, el "sobrerayado"
indica la región codificada mediante una marca de secuencia
expresada (EST) (secuencia de una porción de un clon de cADN),
procedente del GeneBank, denominada HSC1WF111.
La Figura 4 ilustra un mapa del clon de cADN para
la VRP humana de longitud completa en ésta, con respecto a once
EST conocidas. Los once fragmentos de la secuencia de aminoácidos
parcial de las EST son el H07991 y H07899 (respectivamente,
extremos 5' y 3' del mismo fragmento clonado), el H05134 y H05177
(respectivamente, extremos 3' y 5' del mismo fragmento clonado), el
HSC1WF112 y HSC1WF111 (respectivamente, extremos 3' y 5' del mismo
fragmento clonado), el R77495 (extremo 3' de un fragmento clonado),
y el T84377 y T89295 (respectivamente, extremos 5' y 3' del mismo
fragmento clonado).
La Figura 5 ilustra la unión de
^{125}I-Flt4/IgG a VRP purificada. La unión se
realizó en ausencia (-) o presencia (+) de proteína de fusión de
receptor e IgG (FIG. 5A) o con concentraciones crecientes de
Flt4/IgG (FIG. 5B).
La Figura 6 muestra una gráfica del recuento de
células de células endoteliales microvasculares de pulmón humano,
como una función de la concentración de VEGF o VRP en el medio de
cultivo, para verificar y comparar la actividad mitogénica.
Al describir la presente invención, se emplearán
los siguientes términos, y se pretende que se definan como se
indica más abajo.
"VRP humana" se define en ésta como una
secuencia polipeptídica que contiene al menos los residuos -20 a
399, inclusive, o los residuos +1 a 399, inclusive, de la secuencia
de aminoácidos mostrada en la Figura 1, incluyendo los residuos -5
a 399, inclusive, y los residuos -4 a 399, inclusive, de la
secuencia de aminoácidos mostrada en la Figura 1, así como las
variantes, mediante supresión, inserción o sustitución,
biológicamente activas de las secuencias anteriores, que tienen al
menos 265 aminoácidos, y que preferiblemente contienen al menos los
residuos +1 a 29, inclusive, de la Figura 1. En una realización
preferida, la secuencia de proteínas contiene al menos los residuos
+1 a 107, inclusive, de la Figura 1, más preferiblemente al menos
los residuos -20 a 29, inclusive, de la Figura 1, y más
preferiblemente al menos los residuos -20 a 137, inclusive, de la
Figura 1. En otra realización preferida, las variantes
biológicamente activas tienen una longitud de 265 a aproximadamente
450 residuos aminoácidos, más preferiblemente aproximadamente
300-450, incluso más preferiblemente aproximadamente
350-450, y más preferiblemente aproximadamente
399-419 residuos aminoácidos. Otro conjunto de
variantes preferido son las variantes que son variantes mediante
inserción o sustitución, o variantes mediante supresión en las que
la supresión está en la secuencia señal y/o no está en la región
N-terminal de la molécula (es decir, en los
residuos 1-29, preferiblemente en los residuos
1-137). La definición de la VRP excluye todas las
secuencias EST conocidas, tales como, por ejemplo, la H07991,
H05134, H05177, HSC1WF112, HSC1WF111, T81481, R77495, H07899,
T84377, T81690 y T89295, así como todas las formas del VEGF y
PIGF.
"Biológicamente activa", para los propósitos
en ésta, significa que tiene la capacidad de unirse al, y 35
estimular la fosforilación del, receptor Flt4. Generalmente, la
proteína se unirá al dominio extracelular del receptor Flt4 y, por
tanto, activará o inhibirá el dominio intracelular quinasa de
tirosina del mismo. En consecuencia, la unión de la proteína al
receptor podría resultar en la potenciación o inhibición de la
proliferación y/o diferenciación y/o activación in vivo o
in vitro de células que tienen el receptor Flt4 para la VRP.
La unión de la proteína al receptor Flt4 puede determinarse usando
técnicas convencionales, incluyendo procedimientos de unión
competitiva, tales como RIA, ELISA, y otros ensayos de unión
competitiva. Los complejos ligando/receptor pueden identificarse
usando procedimientos de separación tales como la filtración,
centrifugación, citometría de flujo (ver, por ejemplo, Lyman et
al., Cell 75:1157-1167 (1993); Urdal
et al., J. Biol. Chem. 263:2870--2877 (1988); y
Gearing et al., EMBO J. 8:3667-3676
(1989)), y similares. Los resultados procedentes de los estudios de
unión pueden analizarse usando cualquier representación gráfica
convencional de los datos de unión, tales como el análisis de
Scatchard (Scatchard, Ann. N.Y. Acad. Sci.
51:660-672 (1949); Goodwin et al.,
Cell 73:447-456 (1993)), y similares. Puesto
que la VRP induce la fosforilación del receptor Flt4, también
pueden usarse ensayos convencionales de fosforilación de la
tirosina, tales como el ensayo descrito en el Ejemplo 5 en ésta,
como una indicación de la formación del complejo receptor
Flt4/VRP.
El término "epítopo marcado" cuando se usa
en ésta se refiere a un polipéptido quimérico que comprende la VRP
entera, o una porción de la misma, fusionada a un "polipéptido
marca". El polipéptido marca tiene suficientes residuos para
proporcionar un epítopo contra el que puede prepararse un
anticuerpo, aunque es lo bastante corto como para no interferir con
la actividad de la VRP. El polipéptido marca preferiblemente también
es bastante único, de forma que el anticuerpo contra el mismo no
reaccione de forma cruzada con otros epítopos. Los polipéptidos
marca apropiados generalmente tienen al menos seis residuos
aminoácidos, y usualmente entre aproximadamente 8-50
residuos aminoácidos (preferiblemente entre aproximadamente
9-30 residuos).
"Aislado", cuando se usa para describir las
diversas proteínas descubiertas en ésta, significa una proteína que
se ha identificado y separado y/o recuperado a partir de un
componente de su entorno natural. Los componentes contaminantes de
su entorno natural son materiales que interferirían con los usos
diagnóstico y terapéutico de la proteína, y podrían incluir
enzimas, hormonas, y otros solutos proteicos y no proteicos. En las
realizaciones preferidas, la proteína se purificará (1) hasta un
grado suficiente para obtener al menos 15 residuos de la secuencia
N-terminal o interna mediante el uso de un
secuenciador de copa giratoria, o (2) hasta homogeneidad en
SDS-PAGE bajo condiciones no reductoras y reductoras
usando azul de Coomassie, o, preferiblemente, tinción de plata. La
proteína aislada incluye proteína in situ con células
recombinantes, puesto que al menos un componente del entorno
natural de la VRP no estará presente. No obstante, ordinariamente,
la proteína aislada se preparará mediante al menos un paso de
purificación.
Proteína "esencialmente pura" significa una
composición que comprende al menos aproximadamente el 90% en peso
de la proteína, en base al peso total de la composición,
preferiblemente al menos aproximadamente el 95% en peso. Proteína
"esencialmente homogénea" significa una composición que
comprende al menos aproximadamente el 99% en peso de proteína, en
base al peso total de la composición.
Una molécula de ácido nucleico de VRP aislada es
una molécula de ácido nucleico que es identificada y separada al
menos de una molécula de ácido nucleico contaminante, con la cual
está ordinariamente asociada en las fuentes naturales del ácido
nucleico de la VRP. Una molécula de ácido nucleico de VRP aislada
es distinta de la forma y disposición en la que se halla en la
naturaleza. Por tanto, las moléculas de ácido nucleico de VRP
aisladas se distinguen de la molécula de ácido nucleico de la VRP
tal como ésta existe en las células naturales. No obstante, una
molécula de ácido nucleico de VRP aislada incluye moléculas de ácido
nucleico de VRP contenidas en células que expresan ordinariamente
la VRP, en donde, por ejemplo, la molécula de ácido nucleico está
en una ubicación cromosómica diferente de la de las células
naturales.
El polipéptido de VRP aislado, el ácido nucleico
de VRP, o el anticuerpo contra la VRP podrían marcarse para
propósitos diagnósticos y de sondeo usando una marca, tal como se
describe y define más adelante en la discusión sobre los usos de
los anticuerpos contra la VRP.
La expresión "secuencias de control" se
refiere a secuencias de ADN necesarias para la expresión de una
secuencia codificante operativamente unida en un organismo huésped
particular. Las secuencias de control que son apropiadas para los
procariotas, por ejemplo, incluyen un promotor, opcionalmente una
secuencia operadora, un sitio de unión de ribosomas, y,
posiblemente, otras secuencias todavía pobremente comprendidas. Se
sabe que las células eucariotas utilizan promotores, señales de
poliadenilación, y pctenciadores.
Un ácido nucleico está "operativamente
unido" cuando se coloca en una relación funcional con respecto
otra secuencia de ácido nucleico. Por ejemplo, el ADN para una
pre-secuencia o líder secretor está operativamente
unido al ADN para un polipéptido si se expresa como una
pre-proteína que participa en la secreción del
polipéptido; un promotor o potenciador está operativamente unido a
una secuencia codificante si afecta la transcripción de la
secuencia; o un sitio de unión de ribosomas está operativamente
unido a una secuencia codificante si está ubicado para facilitar la
traducción. Generalmente, "operativamente unido" significa que
las secuencias de ADN que se unen son contiguas, y, en el caso de
un líder secretor, contiguas en la fase de lectura. Sin embargo,
los potenciadores no tienen porque ser contiguos. El engarce se
consigue mediante ligación en sitios de restricción convenientes.
Si tales sitios no existen, se usan adaptadores o engarces de
oligonucleótidos sintéticos de acuerdo con la práctica
convencional.
El término "anticuerpo" se usa en el sentido
más amplio, y específicamente cubre anticuerpos monoclonales
anti-VRP sencillos (incluyendo anticuerpos agonistas
y antagonistas) y composiciones de anticuerpos
anti-VRP con especificidad poliepitópica.
El término "anticuerpo monoclonal" tal como
se usa en ésta se refiere a un anticuerpo obtenido a partir de una
población de anticuerpos sustancialmente homogénea, es decir, los
anticuerpos individuales que forman la población son idénticos,
excepto por posibles mutaciones que ocurren naturalmente que
podrían estar presentes en cantidades menores.
Los anticuerpos monoclonales son altamente
específicos, estando dirigidos contra un único sitio antigénico.
Más aún, en contraste con tan convencionales preparaciones de
anticuerpos (policlonales), cada anticuerpo monoclonal está dirigido
contra un único determinante sobre el antígeno. Los anticuerpos
monoclonales en ésta incluyen anticuerpos híbridos y monoclonales
producidos empalmando un dominio variable (incluyendo hipervariable)
de un anticuerpo anti-VRP con un dominio constante
(por ejemplo, anticuerpos "humanizados"), o una cadena ligera
con una cadena pesada, o una cadena procedente de una especie con
una cadena de otra especie, o fusiones con proteínas heterólogas,
con independencia de las especies de origen o de la denominación de
la clase o subclase de inmunoglobulina, así como fragmentos de
anticuerpos (por ejemplo, Fab, F(ab')_{2}, y Fv), con tal
que exhiban la actividad biológica deseada. Ver, por ejemplo, la
patente estadounidense n° 4.816.567, y Mage y Lamoyi, en
Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,
pp. 79-97 (Marcel Dekker, Inc., Nueva York,
1987).
Por tanto, el modificador "monoclonal"
indica el carácter del anticuerpo, que se obtiene a partir de una
población sustancialmente homogénea de anticuerpos, y no debe
limitarse en el sentido de requerir la producción del anticuerpo
mediante cualquier procedimiento particular. Por ejemplo, los
anticuerpos monoclonales a usar de acuerdo con la presente invención
podrían prepararse mediante el procedimiento del hibridoma descrito
por primera vez por Kohler y Milstein, Nature 256:495 (1975),
o podría prepararse mediante procedimientos de ADN recombinante,
patente estadounidense n° 4.816.567. Los "anticuerpos
monoclonales" podrían aislarse también a partir de bibliotecas de
fagos generadas usando las técnicas descritas, por ejemplo, en
McCafferty et al., Nature 348:552-554
(1990).
Las formas "humanizadas" de anticuerpos no
humanos (por ejemplo, de ratón) son inmunoglobulinas quiméricas
específicas, cadenas de inmunoglobulinas, o fragmentos de las mismas
(tales como Fv, Fab, Fab', F(ab')_{2}, u otras
subsecuencias de anticuerpos unidoras de antígeno), las cuales
contienen una secuencia mínima derivada de una inmunoglobulina no
humana. En su mayor parte, los anticuerpos humanizados son
inmunoglobulinas humanas (anticuerpo receptor) en el que los
residuos de una región determinante de complementariedad (CDR) del
receptor son remplazados por residuos procedentes de un CDR de una
especie no humana (anticuerpo donante), tal como un ratón, rata o
conejo, que tiene la especificidad, afinidad y capacidad deseada. En
algunos casos, los residuos de la región estructural de Fv (FR) de
la inmunoglobulina humana son remplazados por residuos no humanos
correspondientes. Más aún, el anticuerpo humanizado podría
comprender residuos que no se encuentran no en el anticuerpo
receptor ni en la CDR o secuencias estructurales importadas. Estas
modificaciones se hacen para refinar y optimizar aún más las
prestaciones del anticuerpo. En general, el anticuerpo humanizado
comprenderá sustancialmente la totalidad de al menos uno, y
típicamente dos, dominios variables, en los que todas o
sustancialmente todas las regiones CDR corresponden a aquéllas de
la inmunoglobulina no humana, y todas o sustancialmente todas las
regiones FR son aquéllas de una secuencia consenso de
inmunoglobulina humana. El anticuerpo humanizado óptimamente
comprenderá también al menos una porción de una región constante de
inmunoglobulina (Fc), típicamente la de una inmunoglobulina
humana.
Tal como se usa en ésta, el término "factor de
crecimiento celular endotelial vascular", o "VEGF", se
refiere a un factor de crecimiento de mamíferos, derivado
originalmente de células foliculares de la pituitaria bovina, que
tiene la secuencia de aminoácidos de la Figura 2 de WO 90/13.649, y
que tiene la secuencia de aminoácidos humana de la Figura 10 de WO
90/13.649. Ver también la patente estadounidense n° 5.194.569, la
cual descubre el VEGF bovino de 120 aminoácidos, y el VEGF humano
de 121 aminoácidos. La actividad biológica del VEGF nativo es
capaz de promover el crecimiento selectivo de células endoteliales
vasculares, pero no el de células endoteliales de córneas bovinas,
células epiteliales del cristalino, células del córtex adrenal,
fibroblastos BHK-21, o queratinocitos.
La expresión "trauma que afecta el endotelio
vascular" se refiere a trauma, tal como lesiones, contra los
vasos sanguíneos o el corazón, incluyendo la red vascular de
órganos, a los cuales está sometido un animal o humano,
preferiblemente un mamífero, y más preferiblemente un humano. Los
ejemplos de tales traumas incluyen las heridas, incisiones, y
úlceras, más preferiblemente úlceras diabéticas y heridas o
laceraciones de los vasos sanguíneos del corazón. El trauma incluye
condiciones causadas por sucesos internos, así como aquéllas que
son impuestas por un agente extrínseco tal como un patógeno, las
cuales pueden mejorarse mediante la promoción del crecimiento de
células endoteliales vasculares. También se refiere al tratamiento
de heridas en las que se requiera la neovascularización o
re-endotelialización para la cicatrización.
"Promoción del crecimiento de células
endoteliales vasculares o linfáticas" se refiere a inducir o
incrementar el crecimiento de células endoteliales vasculares o
linfáticas, incluyendo las células endoteliales de la
microvasculatura pulmonar humana.
Las "alteraciones relacionadas con la
vasculogénesis y angiogénesis" incluyen el cáncer, la diabetes,
los hemangiomas, y el sarcoma de Kaposi.
"Enfermedades o alteraciones caracterizadas por
una neovascularización o permeabilidad vascular excesiva y no
deseable" se refiere a enfermedades o alteraciones que incluyen,
a modo de ejemplo, la neovascularización excesiva: los tumores, y
especialmente los tumores malignos sólidos, la artritis reumatoide,
la psoriasis, la ateroesclerosis, las retinopatias diabéticas y
otras, la fibroplasia retrolental, la degeneración macular
relacionada con la edad, el glaucoma neovascular, los hemangiomas,
las hiperplasias de tiroides (incluyendo la enfermedad de Grave),
los transplantes de córnea y otros tejidos, y la inflamación
crónica. Los ejemplos de enfermedades o alteraciones caracterizados
por una permeabilidad vascular excesiva incluyen el edema asociado
con tumores cerebrales, ascites asociados con cáncer, el síndrome
de Meig, la inflamación del pulmón, el síndrome nefrótico, la
efusión pericardíaca (tal como la asociada con pericarditis), y la
efusión pleural.
"Estados disfuncionales caracterizados por una
activación o inhibición excesiva de un receptor de la VRP"
(incluyendo tal receptor el Flt4) se refiere a alteraciones o
enfermedades que serían tratadas beneficiosamente proporcionando, a
un mamífero que presenta tal condición patológica, un antagonista de
la VRP, tal como una quimera del Flt4 o de su dominio extracelular
(por ejemplo, una fusión de IgG con Flt4) o un anticuerpo contra la
VRP.
"Estados disfuncionales caracterizados por una
ausencia de activación o ausencia de inhibición de un receptor de
la VRP" (incluyendo tal receptor el Flt4) se refiere a
alteraciones o enfermedades que serían tratadas beneficiosamente
proporcionando la VRP o un agonista del receptor de la VRP a un
mamífero que presenta tal condición patológica.
"Tratamiento" se refiere a ambos,
tratamiento terapéutico y medidas profilácticas o preventivas.
Aquéllos que necesitan tratamiento incluyen aquéllos que ya padecen
la alteración, así como aquéllos propensos a tener la alteración o
aquéllos en los que debe prevenirse la alteración.
"Mamífero", para los propósitos de
tratamiento, se refiere a cualquier animal clasificado como un
mamífero, incluyendo los humanos, animales domésticos y de granja, y
de zoo, de deportes, y animales de compañía, tales como perros,
caballos, gatos, vacas, etc. Preferiblemente, el mamífero en ésta
es humano.
"Cantidad efectiva" o "cantidad
terapéuticamente efectiva" de VRP, composición de VRP,
anticuerpo, o composición de anticuerpo, en una cantidad que es
efectiva bien para prevenir, disminuir la gravedad, o aliviar, o
curar la condición tratada. Por ejemplo, una cantidad efectiva de
VRP incluye la cantidad que es suficiente para potenciar el
crecimiento del endotelio vascular in vivo, o para tratar un
trauma, y una "cantidad efectiva" de anticuerpo contra la VRP
incluye la cantidad que es suficiente para reducir el exceso de
neovascularización y angiogénesis.
La presente invención se basa en el
descubrimiento de una nueva VRP, la cual se une a, y estimula la
fosforilación del receptor Flt4.
Se tomaron tres estrategias para identificar la
proteína que se uniría y estimularía la fosforilación del receptor
Flt4. Primero, el receptor de longitud completa se expresó
establemente en células 293 para establecer un ensayo de
fosforilación de receptor de quinasa de tirosina de la activación
del Flt4. Este ensayo se usó para examinar aproximadamente 400
sobrenadantes de células y extractos de tejidos, con resultados
positivos.
Segundo, el dominio extracelular del receptor se
expresó como una proteína de fusión con un dominio Fc de
inmunoglobulina. Mediante el uso de esta proteína de fusión
(Flt4/IgG) para examinar líneas celulares, en busca de ligando
unidos a membrana, mediante análisis de FACS, se identificó una
línea celular positiva. La línea de glioma humano, G61, dio
aproximadamente un desplazamiento de 10 veces en la intensidad del
pico de fluorescencia que era específico para la Flt4/IgG (Figura
2). Los intentos de clonar y expresar este ligando putativo unido a
membrana mediante la transfección de grupos de clones cADN en
células COS, seguidos por la verificación con Flt4/IgG marcado, no
dieron positivos a partir de 640 grupos de
1000-5000 clones cada uno. La Flt4/IgG también se
usó para generar antisuero policlonal y anticuerpos monoclonales
que tenían actividad agonista, y que se usaron para desarrollar el
ensayo de fosforilación de tirosina del Flt4 tal como se describe
más abajo en el Ejemplo 5.
Tercero, las proteínas ligando candidatas se
ensayaron por su capacidad para unir la Flt4/IgG o para activar el
ensayo de fosforilación del Flt4. El VEGF marcado no consiguió unir
la Flt4/IgG, aunque la unión esperada del VEGF a la Flt1/IgG o
Flk1/IgG. se detectó rutinariamente. La incapacidad del VEGF de
unir o estimular la fosforilación del Flt4 ha sido descrita por
Pajusola et al., Oncogene 9, ver más arriba. Se halló
una proteína ligando candidata adicional mediante el uso de
técnicas de clonación, los detalles de la cual se proporcionan más
abajo en el Ejemplo 3. La secuencia de cADN de la VRP humana se
ilustra en la Figura 1A-1D. El peso molecular
predicho de la proteína es de 44,8 KDa.
Sigue una descripción de cómo podría prepararse
la VRP humana biológicamente activa.
La mayoría de la siguiente discusión pertenece a
la producción de VRP mediante el cultivo de células transformadas
con un vector que contiene el ácido nucleico de la VRP, y la
recuperación del polipéptido a partir del cultivo de células. Se
contempla además que la VRP de esta invención podría producirse
mediante recombinación homóloga, tal como se proporcionándole en WO
91/06.667, publicada el 16 de mayo de 1991.
En resumen, este procedimiento implica
transformar células humanas primarias, que contienen un gen que
codifica la VRP humana, con una construcción (es decir, un vector)
que comprende un gen amplificable (tal como el de la reductasa de
dihidrofolato (DHFR) u otros discutidos más abajo) y al menos una
región flanqueante, con una longitud de al menos aproximadamente
150 p.b., que es homóloga con una secuencia de ADN en el locus de
la región codificante del gen de la VRP, para proporcionar
amplificación del gen de la VRP. El gen amplificable debe estar en
un sitio que no interfiera con la expresión del gen de la VRP. La
transformación se lleva a cabo de tal forma que la construcción
para a estar homólogamente integrada en el genoma de las células
primarias para definir una región amplificable.
Las células primarias que comprenden la
construcción se seleccionan a continuación mediante el gen
amplificable u otro marcador presente en la construcción. La
presencia del gen marcador establece la presencia e integración de
la construcción en el genoma huésped. No se precisa de ninguna
selección ulterior de las células primarias, puesto que la
selección se hará en el segundo huésped. Si se desea, la ocurrencia
del suceso de recombinación homóloga puede determinarse empleando la
PCR y, bien secuenciando las secuencias de ADN amplificadas
resultantes, o determinando la longitud apropiadá del fragmento de
la PCR cuando el ADN procedente de integrantes homólogos correctos
está presente, y expandiendo sólo aquellas células que contienen
tales fragmentos. También, si se desea, las células seleccionadas
podrían amplificarse en este punto estresando las células con el
agente amplificador apropiado (tal como el metotrexato si el gen
amplificable es el de la DHFR), de forma que se obtengan múltiples
copias del gen diana de cuño. Sin embargo, preferiblemente el paso
de amplificación no se lleva a cabo hasta después de la segunda
transformación descrita a continuación.
Después del paso de selección, se aíslan, a
partir de las células primarias seleccionadas, porciones de ADN del
genoma, suficientemente grandes para incluir la región amplificable
entera. A continuación se transforman células huésped de expresión
mamíferas secundarias con estas porciones de ADN genómico, y se
clonan, y se seleccionan los clones que contienen la región
amplificable. La región amplificable se amplifica entonces mediante
un gen amplificable, si no se ha amplificado ya en las células
primarias. Finalmente, las células huésped de expresión secundaria,
que comprenden ahora múltiples copias de la región amplificable que
contiene la VRP, se hacen crecer para expresar el gen y producir la
proteína.
El ADN que codifica la VRP podría obtenerse a
partir de cualquier biblioteca de cADN preparada a partir de tejido
que se cree posee el mARN de la VRP y lo expresa en un nivel
detectable. En consecuencia, el ADN de la VRP humana podría
obtenerse convenientemente a partir de una biblioteca de cADN
preparada a partir de tejido cerebral humano, por ejemplo, una
línea celular glial. El gen que codifica la VPR podría obtenerse
también a partir de una biblioteca genómica o mediante síntesis de
oligonucleótidos.
La bibliotecas se examinan con sondas (tales como
anticuerpos contra la VRP u oligonucleótidos de aproximadamente
20-80 bases) diseñadas para identificar el gen de
interés o la proteína codificada por él. El examen de bibliotecas
de cADN o genómicas con la sonda seleccionada podría realizarse
usando procedimientos estándares, tal como se describe en los
capítulos 10-12 de Sambrook et al.,
Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Nueva York, Cold
Spring Harbor Laboratory Press, 1989). Un medio alternativo de
aislar el gen que codifica la VRP es usar la metodología de la PCR
tal como describe en la sección 14 de Sambrook et al., ver
más arriba.
Un procedimiento preferido de practicar esta
invención es usar secuencias oligonucleotídicas cuidadosamente
seleccionadas para examinar bibliotecas de cADN procedentes de
varios tejidos humanos, preferiblemente líneas celulares de cerebro.
Las secuencias oligonucleotídicas seleccionadas como sondas
deberían tener una longitud suficiente y ser lo suficientemente no
ambiguas como para que los falsos positivos estén minimizados.
El oligonucleótido debe marcarse de forma que
pueda detectarse a partir de su hibridación con el ADN en la
biblioteca que se está examinando. El procedimiento de marcado
preferido es usar ATP marcado con ^{32}P con la quinasa de
polinucleótidos, como es bien conocido en la técnica. No obstante,
podrían usarse otros procedimientos para marcar el oligonucleótido,
incluyendo, pero no limitándose a, la biotinilación o el marcado
enzimático.
En algunas realizaciones preferidas, la secuencia
de ácido nucleico incluye la secuencia señal de la VRP nativa. El
ácido nucleico que tiene la totalidad de la secuencia que codifica
la proteína se obtiene examinando bibliotecas de cADN o genómicas
seleccionadas usando procedimiento como los descritos en la sección
7.79 de Sambrook et al., ver más arriba, para detectar
precursores e intermediarios de procesamiento del mARN que podrían
no haberse transcritos de forma inversa en cADN.
Las variantes en la secuencia de aminoácidos de
la VRP se preparan introduciendo cambios en los nucleótidos
apropiados en el ADN de la VRP, o mediante síntesis delpolipéptido
de VRP deseado. Tales variantes presentan inserciones,
sustituciones, y/o supresiones de, residuos en uno o ambos extremos
de la secuencia de aminoácidos mostrada para la VRP en la Figura 1.
Preferiblemente, estas variantes representan inserciones y/o
sustituciones en uno o ambos extremos de la secuencia madura, y/o
inserciones, sustituciones y /o supresiones en uno o ambos extremos
de la secuencia de señal de la VRP mostrada en la Figura 1.
Cualquier combinación de inserción, sustitución, y/o supresión se
hace para llegar a la construcción final, con tal que la
construcción final posea la actividad biológica deseada tal como se
define en ésta. Los cambios de aminoácidos podrían alterar también
los procesos posteriores a la traducción de la VRP, tales como
cambiar el número o posición de los sitios de glicosilación,
alterar las características de anclaje a la membrana, y/o alterar
la ubicación intracelular de la VRP insertando, suprimiendo, o
afectando de otro modo la secuencia líder de la VRP.
Las variaciones en la secuencia nativa, tal como
se describen más arriba, pueden hacerse usando cualquiera de las
técnicas e indicaciones para mutaciones conservadoras y no
conservadoras descritas en la patente estadounidense n° 5.364.934.
Estas incluyen la mutagénesis mediada por oligonucleótidos (dirigida
contra un sitio), el barrido con alanina, y la mutagénesis con PCR.
Ver también, por ejemplo, la Tabla 1 en ésta y la discusión que
rodea esta tabla para una guía sobre la selección de aminoácidos a
cambiar, añadir, o suprimir.
El ácido nucleico (por ejemplo, cADN o ADN
genómico) que codifica la VRP nativa o variante se inserta en un
vector replicable para su ulterior clonación (amplificación del ADN)
o para su expresión. Hay muchos vectores disponibles. Los
componentes del vector generalmente incluyen, pero no se limitan a,
uno o más de los siguientes: secuencia de señal, un origen de
replicación, uno o más genes marcadores, un elemento potenciador,
un promotor, y una secuencia de terminación de la
transcripción.
Las VRP de esta invención podrían producirse de
forma recombinante no sólo directamente, sino también como un
polipéptido de fusión con un polipéptido heterólogo, el cual
preferiblemente es una secuencia de señal u otro polipéptido que
tenga un sitio de corte específico en el extremo
N-terminal de la proteína o polipéptido maduro. En
general, la secuencia de señal podría ser un componente del vector,
o podría ser parte del ADN de la VRP que se inserta en el vector. La
secuencia de señal heteróloga seleccionada es preferiblemente una
que es reconocida y procesada (es decir, cortada por una peptidasa
señal) por la célula huésped. Para células procariotas que no
reconocen y procesan la secuencia señal de la VRP nativa, la
secuencia señal se sustituye con una secuencia señal procariota
seleccionada, por ejemplo, a partir del grupo de líderes de la
fosfatasa alcalina, la penicilinasa, la lpp, o la enterotoxina II
estable al calor. Para la secreción en levaduras, la secuencia señal
nativa se sustituye por, por ejemplo, el líder de la invertasa de la
levadura, el líder del factor alfa (incluyendo los líderes de los
factores-\alpha de Saccharomyces y
Kluyveromyces, éste último descrito en la patente
estadounidense n° 5.010.182, concedida el 4 de abril de 1991), o el
líder de la fosfatasa ácida, el líder de la glucoamilasa de C.
albicans (EP 362. 179, publicada el 4 de abril de 1990), o la
señal descrita en WO 90/13.646, publicada el 15 de noviembre de
1990. En la expresión en células de mamífero, la secuencia señal
nativa (por ejemplo, la pre-secuencia de la VRP que
normalmente dirige la secreción de la VRP en células humanas in
vivo) es satisfactoria, aunque podrían ser apropiadas otras
secuencias de señal de polipéptidos secretados, tales como
secuencias de señal procedentes de VRP de otros animales, y
secuencias de señal procedentes de polipéptidos secretados de la
misma especie o especies relacionadas, así como líderes secretores
vírales, por ejemplo, la señal gD del herpes simplex.
El ADN para tal región precursora está ligado al
marco de lectura del ADN que codifica la VRP mutante.
Ambos, los vectores de expresión y clonación
contienen una secuencia de ácido nucleico que permite al vector
replicarse en una o más células huésped seleccionadas. Generalmente,
en los vectores de clonación de esta secuencia hay uno que permite
al vector replicarse independientemente del ADN cromosómico del
huésped, e incluye orígenes de replicación o secuencias que se
replican autónomamente. Tales secuencias son bien conocidas para una
variedad de bacterias, levaduras y virus. El origen de replicación
del plásmido pBR322 es apropiado para la mayoría de las bacterias
Gram-negativas, el origen del plásmido 2\mu es
apropiado para levaduras, y varios orígenes virales (SV40, polioma,
adenovirus, VSV o BPV) son útiles para vectores de clonación en
células de mamífero. Generalmente, el componente origen de
replicación no es necesario para vectores de expresión en mamíferos
(el origen del SV40 podría usarse típicamente sólo porque contiene
el promotor temprano).
La mayoría de vectores de expresión son vectores
"lanzadera", es decir, son capaces de replicación en al menos
una clase de organismos pero pueden ser transfectados en otro
organismo para su expresión. Por ejemplo, un vector se clona en
E. coli, y a continuación el mismo vector se transfecta en
células de levadura o de mamífero para su expresión, aunque no es
capaz de replicarse independientemente del cromosoma de la célula
huésped.
El ADN podría amplificarse también mediante
inserción en el genoma del huésped. Esto se consigue fácilmente
usando especies de Bacillus como huéspedes, por ejemplo,
incluyendo en el vector una secuencia de ADN que es complementaria
a una secuencia hallada en el ADN genómico de Bacillus. La
transfección de Bacillus con este vector resulta en su
recombinación homóloga con el genoma y en la inserción del AND de
la VRP. No obstante, la recuperación de ADN genómico que codifica
la VRP es más compleja que la de un vector replicado exógenamente,
puesto que se requiere la digestión con enzimas de restricción para
cortar el ADN de la VRP.
Los vectores de clonación y expresión deberían
contener un gen de selección, también denominado gen seleccionable.
Este gen codifica un proteína necesaria para la supervivencia o
crecimiento de las células huésped transformadas cultivadas en un
medio de cultivo selectivo. Las células huésped no transformadas con
el vector que contiene el gen de selección no sobrevivirán en el
medio de cultivo. Los genes de selección típicos codifican
proteínas que (a) confieren resistencia frente a antibióticos u
otras toxinas, por ejemplo, ampicilina, neomicina, metotrexato, o
tetraciclina, (b) complementan deficiencias auxotróficas, o (c)
aportan nutrientes críticos no disponibles en medios complejos, por
ejemplo, el gen que codifica la racemasa de
D-alanina para Bacilli.
Un ejemplo de un esquema de selección utiliza una
droga para detener el crecimiento de una célula huésped. Aquellas
células que son transformadas exitosamente con un gen heterólogo
producen una proteína que confiere resistencia frente a la droga, y
por tanto sobreviven el régimen de selección. Los ejemplos de tal
selección dominante usan las drogas neomicina (Southern et
al., J. Molec. Appl. Genet. 1:327 (1982)), el ácido
micofenólico (Mulligan et al., Science 209:1422
(1980)) o la higromicina (Sugden et al., Mol. Cell
Biol. 5:410 (1985)). Los tres ejemplos citados más arriba
emplean genes bacterianos bajo control eucariota para conferir
resistencia frente a la droga apropiada, respectivamente: G418 o
neomicina (geneocina), xgpt (ácido micofenólico), o
higromicina.
Otro ejemplo de marcadores seleccionables
apropiados para células de mamífero son aquéllos que permiten la
identificación de células competentes para tomar el ácido nucleico
de la VRP, tales como el de la DHFR o de la quinasa de timidina.
Las células de mamífero transformantes se someten a presión de
selección que sólo los transformantes están únicamente adaptados a
sobrevivir gracias a haber ingerido el marcador. La presión de
selección se impone cultivando los transformantes en condiciones en
las que la concentración de agente de selección en el medio se
cambia sucesivamente, conduciendo por tanto a la amplificación de
ambos, el gen de selección y el ADN que codifica la VRP. La
amplificación es el proceso mediante el cual los genes más
solicitados para la producción de una proteína crítica para el
crecimiento son reiterados en tándem dentro de los cromosomas de
generaciones sucesivas de células recombinantes. Se sintetizan
cantidades crecientes de VRP a partir del ADN amplificado. Otros
ejemplos de genes amplificables incluyen los de la metalotioneína I
y II, preferiblemente los genes de la metalotioneína de primates,
los de la deaminasa de adenosina, los de la decarboxilada de
ornitina, etc.
Por ejemplo, las células transformadas con el gen
de selección de la DHFR se identifican primero cultivando todos
los transformantes en un medio de cultivo que contiene metotrexato
(Mtx), un agonista competitivo de la HFR. Una célula huésped
apropiada, cuando se emplea el tipo salvaje de la DHFR, es la línea
celular de ovarios de hámster chino (CHO) deficiente en su
actividad DHFR, preparada y propagada según se describieron Urlaub
y Chasin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980). Las
células transformadas se exponen entonces a niveles incrementados
de metotrexato. Esto conduce a la síntesis de múltiples copias del
gen de la DHFR, y, concomitantemente, de múltiples copias de otros
ADN comprendidos en los vectores de expresión, tales como el ADN
que codifica la VPR. Esta técnica de amplificación puede usarse con
cualquier otro huésped de otro modo apropiado, por ejemplo, la
CHO-K1 con N° ATCC CCL61, a pesar de la presencia
de DHFR endógena si, por ejemplo, se emplea un gen mutante de la
DHFR que es altamente resistente al Mtx (EP 117.060).
Alternativamente, las células huésped
(particularmente los huéspedes del tipo salvaje que contienen DHFR
endógena) se transforman o co-transforman con
secuencias de ADN que codifican la VRP, la proteína DHFR del tipo
salvaje, y otro marcador seleccionable, tal como la aminoglicósido
3'-fosfotransferasa (APH), puede seleccionarse
mediante el cultivo de las células en medio que contenga un agente
de selección para el marcador seleccionable, tal como un
antibiótico aminoglicósido, por ejemplo, kanamicina, neomicina, o el
G418. Ver la patente estadounidense n° 4.965.199.
Un gen de selección apropiado para su uso en
levaduras es el gen trpl presente en el plásmido YRp7 de levaduras
(Stinchcomb et al., Nature 282:39 (1979); Kingsman
et al., Gene 7:141 (1979); Tschemper et al.,
Gene 10:157 (1980)). El gen trp1 proporciona un
marcador de selección para una cepa mutante de levadura que carece
de la capacidad de crecer en triptófano, por ejemplo, la ATCC con
n° 44.076 o la PEP4-1 (Jones, Genetics 85:12
(1977)). La presencia de la lesión de trp1 en el genoma de la
célula de levadura huésped proporciona entonces un entorno
efectivo para detectar la transformación mediante cultivo en
ausencia de triptófano. De forma similar, las cepas de levadura
deficientes en leu2 (ATCC 20.622 ó 38.626) se complementan
mediante plásmidos conocidos portadores del gen Leu2.
Además, los vectores daivcd del plásmido circular
pKD1 de 1,6 \mum pueden usarse para la transformación de
levaduras Kluyveromyces (Bianchi et al., Curr.
Genet. 12:185 (1987)). Más recientemente, se ha informado sobre
un sistema de expresión para la producción a gran escala de
quimosina de ternera recombinante en K. lactis (Van den
Berg, Bio/Technology 8:135 (1990)). También se han
descubierto vectores de expresión multicopia estables para la
secreción de albúmina de suero humana recombinante y madura
mediante cepas industriales de Kluyveromyces (Fleer et
al., Bio/Technology 9:968-975
(1991)).
Los vectores de expresión y clonación contienen
usualmente un promotor que es reconocido por el organismo huésped y
está operativamente unido al ácido nucleico de la VRP. Los
promotores son secuencias no traducidas ubicadas cadena arriba (5')
respecto el codón de inicio de un gen estructural (generalmente
dentro de aproximadamente 100 a 1000 p.b.) que controla la
transcripción y traducción de una secuencia de ácido nucleico
particular, tal como la secuencia de ácido nucleico de la VRP, a la
cual están operativamente unidos. Tales promotores, típicamente se
agrupan en dos clases: inducibles y constitutivos. Los promotores
inducibles son promotores que inician niveles incrementados de
transcripción del ADN bajo su control en respuesta a algún cambio
en las condiciones de cultivo, por ejemplo, la presencia o ausencia
de un nutriente o un cambio en la temperatura. En este momento, se
conocen bien un gran número de promotores reconocidos por una
variedad de células huéspedes potenciales. Estos promotores se unen
operativamente al ADN que codifica la VRP, retirando el promotor del
ADN fuente mediante digestión con enzimas de restricción e
insertando la secuencia del promotor aislado en el vector. Ambos,
la secuencia promotor de la VRP nativa y muchos promotores
heterólogos podrían usarse para dirigir la amplificación y/o la
expresión del ADN de la VRP. No obstante, se prefieren los
promotores heterólogos, puesto que generalmente permiten una mayor
transcripción y rendimientos mayores de VRP en comparación con el
promotor nativo de la VRP.
Los promotores apropiados para su uso con
huéspedes procariotas incluyen los sistemas promotores de la
\beta-lactamasa y de la lactosa (Chang et al., Nature 275:615 (1978); Goeddel et al., Nature 281:544 (1979)), el de la fosfatasa alcalina, el del sistema promotor del triptófano (trp) (Goeddel, Nucleic Acids Res 8:4057 (1980); EP 36.776), y promotores híbridos tales como el promotor tac (dBoer et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:21-25 (1983)). No obstante, otros promotores bacterianos conocidos son apropiados. Sus secuencias nucleotídicas han sido publicadas, permitiendo por tanto, a un trabajador especialista, ligarlos operativamente al ADN que codifica la VPR (Siebenlist et al., Cell 20:269 (1980)) usando engarces o adaptadores para proporcionar cualquier sitio de restricción requerido. Los promotores para su uso en sistemas bacterianos también contendrán una secuencia Shine-Dalgarno (S.D.) unida operativamente al ADN que codifica la VRP.
\beta-lactamasa y de la lactosa (Chang et al., Nature 275:615 (1978); Goeddel et al., Nature 281:544 (1979)), el de la fosfatasa alcalina, el del sistema promotor del triptófano (trp) (Goeddel, Nucleic Acids Res 8:4057 (1980); EP 36.776), y promotores híbridos tales como el promotor tac (dBoer et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:21-25 (1983)). No obstante, otros promotores bacterianos conocidos son apropiados. Sus secuencias nucleotídicas han sido publicadas, permitiendo por tanto, a un trabajador especialista, ligarlos operativamente al ADN que codifica la VPR (Siebenlist et al., Cell 20:269 (1980)) usando engarces o adaptadores para proporcionar cualquier sitio de restricción requerido. Los promotores para su uso en sistemas bacterianos también contendrán una secuencia Shine-Dalgarno (S.D.) unida operativamente al ADN que codifica la VRP.
Se conocen secuencias promotoras para eucariotas.
Virtualmente todos los genes eucariotas tienen una región rica en
AT ubicada aproximadamente 25 a 30 bases cadena arriba respecto el
sitio donde se inicia la transcripción. Otra secuencia hallada 70 a
80 bases cadena arriba respecto el inicio de transcripción de
muchos genes es la región CXCAAT, en donde X puede ser cualquier
nucleótido. En el extremo 3' de la mayoría de genes eucariotas hay
una secuencia AATAAA que podría ser la señal para la adición de la
cola poli-A al extremo 3' de la secuencia
codificante. La totalidad de estas secuencias se insertan
apropiadamente en vectores de expresión de eucariotas.
Los ejemplos de secuencias promotoras apropiadas
para su uso con huéspedes de levadura incluyen los promotores para
la quinasa de 3-fosfoglicerato (Hitzeman et
al., J. Biol. Chem. 255:2073 (1980)) u otros enzimas
glicolíticos (Hess et al., J. Adv. Enzyme Reg. 7:149
(1968); Holland, Biochemistry 17:4900 (1978)), tales como la
enolasa, la deshidrogenasa de
gliceraldehído-3-fosfato, la
hexoquinasa, la decarboxilasa de piruvato, la fosfofructoquinasa,
la isomerasa de glucosa-6-fosfato,
la mutasa de 3-fosfoglicerato, la quinasa de
piruvato, la isomerasa de triosafosfato, la isomerasa de
fosfoglucosa, y la glucoquinasa.
Otros promotores de levaduras, los cuales son
promotores inducibles que tienen la ventaja adicional de tener
transcripción controlada por las condiciones de cultivo, son las
regiones promotoras de la deshidrogenasa de alcohol, del
isocitocromo C, de la fosfatasa ácida, de los enzimas degradadores
asociados con el metabolismo del nitrógeno, de la metalotioneína,
de la deshidrogenasa del
gliceraldehído-3-fosfato, y los
enzimas responsables de la utilización de la glucosa y maltosa. Los
vectores y promotores apropiados para su uso en la expresión en
levadura se describen aún más en EP 73.657. Los potenciadores de
levadura también se usan ventajosamente con los promotores de
levaduras.
La transcripción de la VRP a partir de vectores
en células huéspedes se controla, por ejemplo, mediante promotores
obtenidos a partir de genomas de virus tales como el virus del
polioma, el virus de la viruela de las gallinas
(UK-2.221.504, publicada el 5 de julio de 1989), el
adenovirus (tal como el Adenovirus 2), el virus del papiloma
bovino, el virus del sarcoma de las aves, el citomegalovirus, un
retrovirus, el virus de la hepatitis B, y más preferiblemente el
virus 40 de los simios (SV40), a partir de promotores de mamífero
heterólogos, por ejemplo, el promotor de la actina o un promotor de
inmunoglobulina, a partir de promotores de choque térmico, y a
partir del promotor asociado normalmente con la secuencia de la
VRP, siempre y cuando tales promotores sean compatibles con los
sistemas de células huéspedes.
Los promotores temprano y tardío del virus SV40
se obtienen convenientemente como un fragmento de restricción del
SV40 que también contiene el origen de replicación del SV40 (Fiers
et al., Nature 273:113 (1978); Mulligan y Berg,
Science 209:1422-1427 (1980); Pavlakis et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
78:7398-7402 (1981)). El promotor temprano
intermedio del citomegalovirus humano se obtiene convenientemente
como un fragmento de restricción HindIIIE (Greenaway et
al., Gene 18:355-360 (1982)). Un sistema
para la expresión de ADN en huéspedes mamíferos usando el virus del
papiloma bovino como un vector se descubre en la patente
estadounidense n° 4.419.446. En la patente estadounidense n°
4.601.978 se describe una modificación de este sistema. Ver también
Gray et al., Nature 295:503-508 (1982)
sobre la expresión de cADN que codifica el interferón inmune en
células de mono; Reyes et al., Nature
297:598-601 (1982) sobre la expresión del cADN del
interferón \beta humano en células de ratón bajo el control de un
promotor de la quinasa de timidina del virus herpes simplex; Canaani
y Berg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
79:5166-5170 (1982) sobre la expresión del gen del
interferón \beta1 humano en células cultivadas de ratón y conejo;
y German et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
79:6777-6781 (1982) sobre la expresión de secuencias
CAT bacterianas en células renales CV-1 de mono, en
fibroblastos embrionarios de pollos, en células ováricas de hámster
chino, en células HeLa, y en células NIH-3T3 de
ratón, usando como promotor la repetición terminal larga del virus
del sarcoma de Rous.
La transcripción de un ADN que codifica la VRP de
esta invención en eucariotas superiores se incrementa a menudo
insertando una secuencia potenciadora en el vector. Los
potenciadores son elementos del ADN que actúan en cis,
usualmente aproximadamente desde 10 a 300 p.b., que actúan sobre un
promotor para incrementar su transcripción. Los potenciadores son
relativamente independientes de su orientación y posición,
habiéndose hallado en posición 5' (Laimins et al., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 78:993 (1981)) y 3' (Lusky et al.,
Mol. Cell Biol. 3:1108 (1983)) respecto la unidad de
transcripción, dentro de un intrón (Banerji et al.,
Cell 33:729 (1983)), así como dentro de la propia secuencia
codificante (Osborne et al., Mol. Cell Biol. 4:1293
(1984)). Actualmente se conocen muchas secuencias potenciadoras
procedentes de genes de mamíferos (globina, elastasa, albúmina,
\alpha-fetoproteína, e insulina). Sin embargo,
típicamente se usará un potenciador procedente de un virus de
célula eucariota. Los ejemplos incluyen el potenciador del SV40 en
el lado tardío del origen de replicación (p.b.
100-270), el potenciador del promotor temprano del
citomegalovirus, el potenciador del polioma en el lado tardío del
origen de replicación, y los potenciadores de adenovirus. Ver
también Yaniv, Nature 297:17-18 (1982) sobre
elementos potenciadores para la activación de promotores
eucariotas. El potenciador podría empalmarse en el vector en una
posición 5' o 3' respecto la secuencia que codifica la VRP, pero
preferiblemente se ubica en un sitio 5' respecto el promotor.
Los vectores de expresión usados en células
huésped eucariotas (de levadura, hongos, insectos, plantas,
animales, humanas, o células nucleadas procedentes de otros
organismos multicelulares) también contendrán secuencias necesarias
para la terminación de la transcripción y/o para estabilizar el
mARN. Tales secuencias están comúnmente disponibles a partir de las
regiones 5', y ocasionalmente 3', no traducidas de sADN o cADN
eucariotas o virales. Estas regiones contienen segmentos de
nucleótidos transcritos como fragmentos poliadenilados en la
porción no traducida del mARN que codifica la VRP.
La construcción de vectores apropiados que
contengan uno o más ce los componentes listados más arriba emplea
técnicas de ligación. Los plásmidos o fragmentos de ADN aislados se
cortan, manipulan, y religan en la forma deseada para generar los
plásmidos requeridos.
Para los análisis destinados a confirmar las
secuencias correctas en los plásmidos construidos, se usan las
mezclas de ligación para transformar la cepa 294 de E. coli
K12 (ATCC 31.446), y los transformantes exitosos se seleccionan
mediante resistencia a la ampicilina y tetraciclina según sea
apropiado. Los plásmidos procedentes de los transformantes se
preparan, se analizan mediante digestión con endonucleasas de
restricción, y/o se secuencian mediante el procedimiento de Messing
et al., Nucleic Acids Res. 9:309 (1981) o mediante el
procedimiento de Maxam et al., Methods in Enzymology
65:499 (1980).
Son particularmente útiles en la práctica de esta
invención los vectores de expresión que proporcionan medios para la
expresión transitoria en células de mamíferos de ADN que codifica
la VRP. En general, la expresión transitoria implica el uso de un
vector de expresión que es capaz de replicarse eficientemente en
una célula huésped, de tal forma que la célula huésped acumula
muchas copias del vector de expresión, y, a su vez, sintetiza
niveles elevados de un polipéptido deseado codificado por el vector
de expresión (Sambrook et al., ver más arriba, pp.
16.17-16.22). Los sistemas de expresión
transitoria, que comprenden un vector de expresión apropiado y una
célula huésped, permiten la identificación positiva y conveniente
de polipéptidos codificados por los ADN clonados, así como la
verificación rápida de tales polipéptido en busca de propiedades
biológicas o fisiológicas deseadas. Por tanto, los sistemas de
expresión transitoria son particularmente útiles en la invención
para los propósitos de identificar análogos y variantes de la VRP
que son VRP biológicamente activa.
Otros procedimientos, vectores y células huésped
apropiados para su adaptación a la síntesis de la VRP en un cultivo
de células de vertebrado recombinantes se describen en Gething
et al., Nature 293:620-625 (1981);
Mantei et al., Nature 281:40-46
(1979); EP 111.060; y EP 117.058. El pRK5 (EP 307.247) o pSV16B (WO
91/08.291, publicada el 13 de junio de 1991) es un plásmido
particularmente útil para la expresión de la VRP en cultivos de
células de mamíferos.
Las células apropiadas para clonar y expresar el
ADN en vectores en ésta son las células procariotas, de levadura, o
eucariotas superiores descritas más arriba. Las procariotas
apropiadas para este propósito incluyen las eubacterias, tales como
los organismos Gram-negativos y
Gram-positivos, por ejemplo, enterobacterias tales
como Escherichia, por ejemplo, E. coli,
Enterobacter, Erwinia, Kleibsella,
Proteus, Salmonella, por ejemplo, Salmonella
typhimurium, Serratia, por ejemplo, Serratia marcescens,
y Shigella, asó como Bacilli tales como B.
subtilis y B. licheniformis (por ejemplo, B.
licheniformis 41P, descubierto en DD 266.710, publicada el 12 de
abril de 1989), Pseudomonas tales como P. aeruginosa,
y Streptomyces. Un huésped de clonación E. coli
preferido es E. coli 294 (ATCC 31.446), aunque son apropiadas
otras cepas tales como E. coli B, E. coli X1776 (ATCC
31.537), y E. coli W3110 (ATCC 27.325). Estos ejemplos son
ilustrativos en vez de limitantes. La cepa W3110 es un huésped o un
huésped progenitor particularmente preferido porque es un cepa
huésped común en las fermentaciones de productos de ADN
recombinante. Preferiblemente, la célula huésped debería secretar
cantidades mínimas de enzimas proteolíticos. Por ejemplo, la cepa
W3110 podría modificarse para efectuar una mutación genética en los
genes que codifican proteínas, los ejemplos de tales huéspedes
incluyen la cepa 27C7 de E. coli W3110. El genotipo completo
de la 27C7 es tonA \Delta prt3 phoA
\DeltaE15 \Delta (argF-lac) 169
ompT \Delta degP41kan^{r}. La cepa 27C7 se depositó
el 30 de octubre de 1991 en la American Type Culture Collection
como ATCC n° 55.244. Alternativamente, podría emplearse la cepa de
E. coli que tiene una proteasa periplasmática mutante
descubierta en la patente estadounidense n° 4.946.783, concedida el
7 de agosto de 1990. Todavía alternativamente, son apropiados los
procedimientos para donar, por ejemplo, la PCR u otras reacciones de
la polimerasa de ácido nucleico.
Además de los procariotas, los microbios
eucariotas, tales como los hongos filamentosos o las levaduras, son
huéspedes de donación o expresión apropiados para vectores que
codifican la VRP. Saccháromyces cerevisiae, o levadura común
de panadería, es el más comúnmente usado entre los microorganismos
huéspedes eucariotas inferiores. No obstante, un cierto número de
otros géneros, especies y cepas están comúnmente disponibles y son
útiles en esta, tales como Schizosaccharomyces pombe (Beach y
Nurse, Nature 290:140 (1981); EP 139.383, publicada el 2 de
mayo de 1995); huéspedes Kuyveromyces (patente
estadounidense n° 4.943.529; Fleer et al., ver más arriba)
tales como, por ejemplo, K. lactis (MW98-8C,
CBS683, CBS4574; Louvencourt et al., J. Bacteriol. 737
(1983)), K. fragilis (ATCC 12,424), K. bulgaricus
(ATCC 16.045), K. wickeramii (ATCC 24.178), K. waltii
(ATCC 56.500), K. drosophilarum (ATCC 39.906; Van den Berg
et al., ver más arriba), K. thermotolerans, K.
marxianus: yarrowia (EP 402.226); Pichia pastoris (EP
183.070; Sreekrishna et al., J. Basic Microbiol.
28:265-278 (1988)); Candida; Trichoderma
reesia (EP 244.234); Neurospora crassa (Case et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
76:5259-5263 (1979)); Schanniomyces tales
como Schanniomyces occidentalis (EP 394.538, publicada el 31
de octubre de 1990); y hongos filamentosos tales como, por ejemplo,
Neurospora, Penicillium, Tolypocladium (WO 91/00.357,
publicada el 10 de enero de 1991), y huéspedes Aspergillus
tales como A. nidulans (Ballance et al., Biochem.
Biophys. Res. Commun. 112:284-289 (1983);
Tilburn et al., Gene 26:205-221
(1983); Yelton et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA
81:1470-1474 (1984)) y A. niger (Kelly y
Hynes, EMBO J. 4:475-479 (1985)).
Las células huéspedes apropiadas para la
expresión de VRP glicosilada se derivan de organismos
multicelulares. Tales células huéspedes son capaces de
procesamiento complejo y actividades de glicosilación. En
principio, sirve cualquier cultivo de células eucariotas
superiores, tanto si procede de cultivo de vertebrados como de
invertebrados. Los ejemplos de células de invertebrados incluyen
células de plantas e insectos. Se han identificado numerosas cepas
y variantes de baculovirus, y las correspondientes células
huéspedes de insecto permisivas, procedentes de huéspedes tales
como Spodoptera frugiperda (oruga), Aedes aegypti
(mosquito), Aedes albopictus (mosquito), Drosophila
melanogaster (mosca del vinagre), y Bombyx morí. Ver, por
ejemplo, Luckow et al., Bio/Technology
6:47-55 (1988); Miller et al. en Genetic
Engineering, editores Setlow et al., Vol. 8, (Plenum
Publishing, 1986), pp. 277-279; y Maeda et
al., Nature 315:592-594 (:L985). Están
disponibles públicamente una variedad de cepas virales para la
transfección, por ejemplo, la variante L-1 del NPV
de Autographa californica y la cepa Bm-5 del
NPV de Bombyx mori, y tales virus podrían usarse como los
virus en ésta de acuerdo con la presente invención, particularmente
para la transfección de células de Spodoptera
frugiperda.
Los cultivos de células vegetales de algodón,
trigo, patata, soja, petunia, tomate y tabaco pueden utilizarse como
huéspedes. Típicamente, las células vegetales se transfectan
mediante incubación con ciertas cepas de la bacteria
Agrobacterium tumefaciens, la cual se ha manipulado
previamente para contener el ADN que codifica la VRP. Durante la
incubación del cultivo de células vegetales con. A.
tumefaciens, el ADN que codifica la VRP se transfiere a la
células vegetal huésped de tal forma que ésta es transfectada, y,
en condiciones apropiadas, expresará el ADN que codifica la VRP.
Además, hay disponibles secuencias reguladoras y señalizadoras
compatibles con células vegetales, tales como el promotor de la
sintasa de nopalina y la secuencias señalizadoras de
poliadenilación (Depicker et al., J. Mol. Appl. Gen.
1:561 (1982). Además, los segmentos de ADN aislados a partir de la
región situada cadena arriba respecto el gen 780 del
T-ADN son capaces de activar o incrementar los
niveles de transcripción de los genes expresables en plantas en
tejidos vegetales que contienen ADN recombinantes (EP 321.196,
publicada el 21 de junio de 1989).
No obstante, ha sido mayor el interés en células
de vertebrados, y la propagación de células de vertebrados en
cultivo (cultivo de tejidos) a devenido un procedimiento rutinario.
Ver, por ejemplo, Tissue Culture, Academic Press, editores
Kruse y Paterson (1973). Los ejemplos de líneas celulares de
mamíferos útiles son la línea CV1 de riñón de mono transformada
mediante el SV40 (COS-7, ATCC CRL 1651); la línea
renal embrionaria humana (células 293 ó 293 subclonadas para su
crecimiento en cultivos en suspensión, Graham et al., J.
Gen. Virol. 36:59 (1977)); las células renales de crías de
hámster (BHK, ATCC CCL 10); las células/-DHFR ováricas de hámster
chino (CHO, Urlaub y Chasin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
77:4216 (1980)); las células sertoli de ratón (TM4, Mather, Biol.
Reprod. 23:243-251 (1980)); las células renales
de mono (CV1, ATCC CCL 70); las células renales de mono verde
africano (VERO-76, ATCC CRL-1587);
la células de carcinoma cervical humano (HeLa, ATCC CCL 2); las
células renales caninas (MDCK, ATCC CCL 34); las células de hígado
de rata búfalo (BRL 3A, ATCC CRL 1442); las células pulmonares
humanas (W138, ATCC CCL 75); las células de hígado humanas (Heo G2,
HB 8065); el tumor mamario de ratón (MMT 060562, ATCC CCL51); las
células TRI (Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci.
383:44-68 (1982)); las células MRC 5; las células
FS4; y una línea de hepatoma humana (Hep G2).
Las células huéspedes se transfectan y
transforman preferiblemente con los vectores de expresión o
clonación descritos más arriba para la producción de la VRP, y se
cultivan en medios nutrientes convencionales según sean apropiados
para inducir promotores, seleccionar transformantes, o amplificar
los genes que codifican las secuencias deseadas.
La transfección se refiere a la ingestión de un
vector de expresión por parte de una célula huésped, tanto si las
secuencias codificantes se expresan de hecho o no. Numerosos
procedimientos de transfección son conocidos por el especialista
ordinariamente capacitado, por ejemplo, el CaPO_{4} y la
electroporación. La transfección exitosa se reconoce generalmente
cuando ocurre cualquier indicación de la operación de este vector
en el interior de la célula huésped.
Transformación significa introducir ADN en un
organismo de forma que el ADN sea replicable, bien como un elemento
extracromosómico o como integrante del cromosoma. Dependiendo de
las célula huésped usada, la transformación se realiza usando
técnicas estándares apropiadas para tales células. El tratamiento
con calcio empleando cloruro cálcico, tal como se describe en la
sección 1.82 de Sambrook et al., ver más arriba, o la
electroporación, se usan generalmente para procariotas u otras
células que contienen barreras sustanciales en forma de pared
celular. La infección con Agrobacterium tumefaciens se usa
para la transformación de ciertas células vegetales, tal como se
describe en Shaw et al., Gene 23:315 (1983) y en WO
89/05.859, publicada el 29 de junio de 1989. Además, ciertas
plantas podrían transfectarse usando tratamiento con ultrasonidos
tal como se describe en WO 91/00.358, publicada el 10 de enero de
1991.
Para células de mamíferos, sin tales paredes
celulares, se prefiere el procedimiento de precipitación con
cloruro cálcico de Graham y van der Eb, Virology
52:456-457 (1978). Los aspectos generales de las
transformaciones de sistemas de células huéspedes de mamíferos se
han descrito en la patente estadounidense n° 4.399.216, concedida
el 16 de agosto de 1983. Las transformaciones en levaduras se
realizan típicamente de acuerdo con el procedimiento de Van Solingen
et al., J. Bact. 130:946 (1977) y Hsiao et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76:3829 (1979). No
obstante, también podrían utilizarse otros procedimientos para
introducir ADN en células, tales como la microinyección nuclear, la
electroporación, la fusión de protoplastos bacterianos con células
intactas, o los policationes, por ejemplo, polibreno, poliornitina,
etc. Para varias técnicas para transformar células de mamíferos,
ver Keown et al., Methods in Enzymology
185:527-537 (1990) y Mansour et al.,
Nature 336:348-35 (1988).
Las células procariotas usadas para producir el
polipéptido de la VRP de esta invención se cultivan en medios
apropiados tal como se describe de forma general en Sambrook et
al., ver más arriba.
Las células huéspedes de mamíferos usadas para
producir la VRP de esta invención podrían cultivarse en una
diversidad de medios. Los medios disponibles comercialmente tales
como el F10 de Ham (Sigma), el Medio Esencial Mínimo (MEM, Sigma),
el RPMI-1640 (Sigma), y el Medio de Eagle
modificado por Dulbecco (DMEM, Sigma) son apropiados para cultivar
las células huéspedes. Además, cualquiera de los medios descritos en
Ham y Wallace, Meth. Enz. 58:44 (1979); en Barnes y Sato,
Anal. Biochem. 102:255 (1980); en las patentes
estadounidenses n° 4.767.704, 4.657.866, 4.927.762, 4.560.655, o
5.122.469; en WO 90/03.430, WO 87/00.195; o en la patente
estadounidense Re. 30.985, podrían usarse como medios de cultivo
para las células huéspedes. Cualquiera de estos medios podría
suplementarse según fuera necesario con hormonas y/o factores de
crecimiento (tales como insulina, transferrina, o factor de
crecimiento epidérmico), con sales (tales como cloruro sódico,
cálcico, magnésico, y fosfatos), tampones (tales como HEPES),
nucleósidos (tales como la adenosina y timidina), antibióticos
(tales como la droga Gentamicina^{TM}), elementos traza
(definidos como compuestos inorgánicos usualmente presentes en
concentraciones finales en el rango micromolar), y glucosa o una
fuente de energía equivalente. Cualquiera otros suplementos
necesarios podrían incluirse también en las concentraciones
apropiadas que serían conocidas por aquellos especialistas en la
técnica. Las condiciones de cultivo, tales como la temperatura,
pH, y similares, son aquéllas previamente usadas con la
célula huésped seleccionada para la expresión, y serán evidentes
para los especialistas ordinariamente formados.
En general, los principios, protocolos, y
técnicas prácticas para maximizar la productividad de los cultivos
de células de mamíferos pueden encontrarse en Mammalian Cell
Biotechnology: A Practical Approach, editor M. Butler (IRL
Press, 1991).
Las células huésped mencionadas en este
descubrimiento abarcan las células en cultivo así como las células
que están dentro de un animal huésped.
La amplificación y/o expresión de genes podría
medirse directamente en una muestra, por ejemplo, mediante
transferencia Southern convencional, transferencia Northern para
cuantificar la transcripción de mARN (Thomas, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 77:5201-5205 (1980)), transferencia en
punto (análisis de ADN), o hibridación in situ, usando una
sonda apropiadamente marcada, basada en las secuencias
proporcionadas en ésta. Podrían emplearse varias marcas, más
comúnmente radioisótopos, particularmente el ^{32}P. No obstante,
también podrían emplearse otras técnicas, tales como usar
nucleótidos modificados con biotina para su introducción en un
polinucleótido. A continuación la biotina sirve como el sitio de
unión para la avidina o anticuerpos, los cuales podrían marcarse
con una amplia variedad de marcas, tales como radionúcleos,
compuestos fluorescentes, enzimas, o similares. Alternativamente,
podrían emplearse anticuerpos que reconozcan dúplexes específicos,
incluyendo dúplexes de ADN, dúplexes de ARN, y dúplexes híbridos de
ADN-ARN o dúplexes de ADN-proteína.
A su vez, los anticuerpos podrían estar marcados, y podría
realizarse el ensayo en el que el dúplex se une a una superficie, de
forma que, a partir de la formación del dúplex sobre la superficie,
podría detectarse la presencia de un anticuerpo unido al
dúplex.
La expresión de genes, alternativamente, podría
medirse mediante procedimientos inmunológicos, tales como la
tinción inmunohistoquímica de secciones de tejidos y el ensayo de
cultivos celulares o fluidos corporales, para cuantificar
directamente la expresión del producto de los genes. Con las
técnicas de tinción inmunohistoquímica, se prepara una muestra de
células, típicamente mediante deshidratación y fijación, seguida
por reacción con anticuerpos marcados, específicos para el producto
de los genes, acoplados, en donde las marcas son usualmente
detectables visualmente, tales como marcas enzimáticas, marcas
fluorescentes, marcas luminiscentes, y similares. Una tinción
particularmente sensible para su uso en la presente invención es
descrita por Hsu et al., Am. J. Clin. Path.
75:734-738 (1980).
Los anticuerpos útiles para la tinción
inmunohistoquímica y/o ensayo de muestras fluidas podrían ser
monoclonales o policlonales, y podrían prepararse en cualquier
mamífero. Convenientemente, los anticuerpos podrían prepararse
contra un polipéptido de la VRP nativa o contra un péptido sintético
basado en las secuencias de ADN proporcionadas en ésta, tal como se
describe más en la Sección 4 más abajo.
La VRP se recupera preferiblemente a partir del
medio de cultivo como un polipéptido secretado, aunque también
podría recuperarse a partir de lisados de células huésped cuando se
produce directamente sin una señal secretora. Si la VRP está unida a
la membrana, podría liberarse de la membrana usando una solución de
detergente apropiada (por ejemplo, Triton-X
100).
Cuando la VRP se produce en un célula
recombinante distinta de una de origen humano, la VRP está
completamente libre de proteínas o polipéptidos de origen humano.
Sin embargo, es necesario purificar la VRP de proteínas o
polipéptidos de la célula recombinante para obtener preparaciones
que sean sustancialmente homogéneas como VRP 10. Como un primer
paso, el medio de cultivo o lisado se centrifuga para suprimir
restos celulares fragmentados. A continuación se purifica la VRP de
proteínas y polipéptidos solubles contaminantes, siendo los
siguientes procedimientos ejemplos de procedimientos de
purificación apropiados: mediante fraccionamiento en una columna de
intercambio iónico; precipitación con etanol; HPLC de fase inversa;
cromatografía sobre sílice o sobre una resina de intercambio
catiónico tal como la DEAE; cromatoenfoque;
SDS-PAGE; precipitación con sulfato amónico;
filtración en gel usando, por ejemplo, Sephadex
G-75; y columnas de
Sepharose-Proteína A para suprimir contaminantes
tales como la IgG.
En la realización más preferida, la fusión
receptor Flt4-IgG se inmoviliza sobre una columna de
cromatografía de afinidad, y la VRP puede aislarse mediarte
purificación por afinidad usando esta columna. Alternativamente, la
VRP se une en su extremo N-terminal a una
secuencia de glicoproteína D, y se pasa a través de una columna de
cromatografía de afinidad sobre la cual está inmovilizado un
anticuerpo monoclonal anti-gD tal como el 5B6, el
cual es específico para una secuencia de la glicoproteína D.
Las variantes de la VRP en las que se han
suprimido, insertado, o sustituido residuos, se recuperan de la
misma forma que la VRP nativa, tomando en consideración cualesquiera
cambios sustanciales en las propiedades ocasionados por la
variación. Por ejemplo, la preparación de una fusión de la VRP con
otra proteína o polipéptido, por ejemplo, un antígeno bacteriano o
viral, facilita la purificación; puede usarse una columna de
inmunoafinidad que contenga anticuerpo contra el antígeno para
adsorber el polipéptido de fusión. Pueden emplearse columnas de
inmunoafinidad tales como una columna de anti-VRP
policlonal de conejo para adsorber la variante de la VRP mediante
la unión de al menos un epítopo inmune restante.
Un inhibidor de proteasa, tal como el fluoruro de
fenilmetilsulfonilo (PMSF), también podría ser útil para inhibir
la degradación proteolítica durante la purificación, y podrían
incluirse antibióticos para prevenir el crecimiento de contaminantes
adventicios. Un especialista en la técnica apreciará que los
procedimientos de purificación apropiados para la VRP nativa
podrían requerir modificaciones para tomar en consideración los
cambios en el carácter de la VRP o de sus variantes a partir de su
expresión en cultivos de células recombinantes.
Las modificaciones covalentes de los polipéptidos
de la VRP se incluyen dentro del ámbito de esta invención. Podrían
modificarse covalentemente tanto la VRP nativa y las variantes de
la secuencia de aminoácidos de la VRP. Un tipo de modificación
covalente de la VRP se introduce en la molécula haciendo reaccionar
los residuos aminoácidos deseados de la VRP con un agente
derivatizante orgánico que es capaz de reaccionar con cadenas
laterales seleccionadas, o con los residuos N- o
C-terminales de la VRP.
Los residuos cisteinilo más comúnmente se hacen
reaccionar con \alpha-haloacetatos (y las aminas
correspondientes), tales como el ácido cloroacético o la
cloroacetamida, para rendir derivados carboximetilos o
carboxiamidometilos. Los residuos cisteinilo también se derivan
mediante reacción con bromotrifluoroacetona, ácido
\alpha-bromo-\beta-(5-imidozoil)propiónico
cloroacetil fosfato, N-alquilmaleimidas,
3-nitro-2-piridil
disulfuro, metil-2-piridil
disulfuro, p-cloromercuribenzoato,
2-cloromercuri-4-nitrofenol,
o
cloro-7-nitrobenzo-2-oxa-1,3-diazola.
Los residuos histidilo se derivan mediante
reacción con dietilpirocarbonato a pH 5,5-7,0
puesto que este agente es relativamente específico para la cadena
lateral histidila. El para-bromofenacilo es útil
también; la reacción se realiza preferiblemente en cacodilato
sódico 0,1 M a pH 6,0.
Los residuos lisinilo y
amino-terminal se hacen reaccionar con succínico u
otros ácidos carboxílicos anhídridos. La derivación con estos
agentes tiene el efecto de invertir la carga de los residuos
lisinilo. Otros reactivos apropiados para derivar residuos que
contienen \alpha-aminos incluyen los imidoésteres,
tales como el metil picolinimidato, el piridoxal fosfato, el
piridoxal, el cloroborohidruro, el ácido trinitrobencenosulfónico,
la O-metilisourea, el
2,4-pentanediona, y la reacción con glioxilato
catalizada por transaminasa. Los residuos arginilo se modifican
mediante reacción con uno o varios reactivos convencionales, entre
ellos, el feniglioxal, la 2,3-butenediona, la
1,2-ciclohexanediona, y la ninhidrina. La
derivación de residuos arginina requiere que la reacción se realice
en condiciones alcalinas a causa del pK_{a} elevado del
grupo funcional guanidino. Más aún, estos reactivos podrían
reaccionar con los grupos de lisina así como con el grupo
épsilon-amino de la arginina.
La modificación específica de los residuos
tirosilo podría hacerse, con interés particular en introducir
marcadores espectrales en los residuos tirosilo, mediante reacción
con compuestos de diazonio aromáticos o con tetranitrometano. Más
comúnmente, se usan la N-acetilimidazolia y el
tetranitrometano para formar respectivamente especies
0-acetil-tirosilo y derivados
3-nitro. Los residuos tirosilo se iodinan usando
^{125}I o ^{131}I para preparar proteínas marcadas para su uso
en radioinmunoensayos, siendo apropiado el procedimiento de la
cloramina T.
Los grupos carboxilo laterales (aspartilo y
glutamilo) se modifican selectivamente mediante reacción con
carbodiimidas (R-N = C = N-R'), en
donde R y R' son grupos alquilo diferentes, tales como
1-ciclohexil-3-(2-morfolinil-4-etilo)carbodiimida
o
1-etil-3-(4-azonia-4,4-dimetilpentil)carbodiimida.
Más aún, los residuos aspartilo y glutamilo se convierten en
residuos asparaginilo y glutaminilo mediante reacción con iones
amonio.
La derivación con agentes bifuncionales es útil
para entrecruzar la VRP con una matriz o superficie de un soporte
insoluble en agua, para su uso en el procedimiento para purificar
anticuerpos anti-VRP, y viceversa. Los agentes
entrecruzadores comúnmente usados incluyen, por ejemplo, el
1,1-bis(diazoacetil)-2-feniletano,
el glutaraldehído, los ésteres de
N-hidroxisuccinimida, por ejemplo, ésteres con el
ácido 4-acidosalicílico, imidoésteres bifuncionales,
incluyendo ésteres disuccinimidilo tales como el
3,3'-ditiobis (succinimidilpropionato), y maleimidas
bifuncionales tales como la
bis-N-maleimido-1,8-octano.
Los agentes derivadores tales como el
metil-3-[(p-azidofenil)
ditio]propioimidato rinden intermediarios fotoactivables que
son capaces de formar entrecruzamientos en presencia de luz.
Alternativamente, las matrices reactivas insolubles en agua, tales
como los carbohidratos activados con bromuro de cianógeno y los
sustratos reactivos descritos en las patentes estadounidenses n°
3.969.287, 3.691.016, 4.195.128, 4.247.642, 4.229.337, y 4.330.440
se emplean para la inmovilización de proteínas.
Los residuos glutaminilo y asparaginilo son
frecuentemente deamiados respectivamente a sus correspondientes
residuos glutamilo y aspartilo. Estos residuos de deamidan bajo
condiciones neutras o básicas. La forma deamidada de estos residuos
se halla bajo el ámbito de esta invención.
Otras modificaciones incluyen la hidroxilación de
la prolina y lisina, la fosforilación de grupos hidroxilo o de
residuos serilo o treonilo, la metilación de los grupos
\alpha-amino de las cadenas laterales de lisina,
arginina e histidina (T. E. Creighton, Proteins: Structure and
Molecular Properties, W. H. Freeman & Co., San Francisco,
pp. 79-86 (1983)), la acetilación de la amina
N-terminal, y la amidación de cualquier grupo
carboxilo C-terminal.
Otro tipo de modificación covalente del
polipéptido de la VRP incluida dentro del ámbito de esta invención
comprende alterar el patrón de glicosilación nativo del polipéptido.
Por alterar se quiere decir suprimir uno o más grupos carbohidratos
hallados en la VRP nativa, y/o añadir uno o más sitios de
glicosilación que no están presenten en la VRP nativa.
La glicosilación de polipéptidos está típicamente
unida a N o unida a O. Unida a N se refiere a la unión del grupo
carbohidrato a la cadena lateral de un residuo asparagina. Las
secuencias de tripéptido
asparagina-X-serina y
asparagina-X-treonina, donde X es
cualquier aminoácido excepto prolina, son las secuencias de
reconocimiento para la unión enzimática del grupo carbohidrato a la
cadena lateral de la asparagina. Por tanto, la presencia de uno de
estas secuencias de tripéptido en un polipéptido crea un sitio de
glicosilación potencial. La glicosilación unida a O se refiere a la
unión de uno de los azúcares N-acetilgalactosamina,
galactosa o xilosa a un hidroxilaminoácido, más comúnmente serina o
treonina, aunque también podrían usarse la
5-hidroxiprolina o la
5-hidroxilisina.
La adición de sitios de glicosilación al
polipéptido de la VRP se consigue convenientemente alterando la
secuencia de aminoácidos de forma que contenga uno o más de las
secuencias de tripéptido descritas más arriba (para los sitios de
glicosilación unidos a N). La alteración también podría hacerse
mediante la adición de, o sustitución por, uno o más residuos
serina o treonina a la secuencia de VRP nativa (para sitios de
glicosilación unidos a 0). Por simplicidad, la secuencia de
aminoácidos de la VRP se altera preferiblemente a través de cambios
a nivel de ADN, particularmente mutando el ADN que codifica el
polipéptido de la VRP en bases preseleccionadas, tales como codones
que son generados y que se traducirán en los aminoácidos deseados.
La(s) mutación(ones) del ADN podrían hacerse usando
procedimientos descritos en la patente estadounidense n° 5.364.9334,
ver más arriba.
Otros medios para incrementar el número de grupos
carbohidratos sobre el polipéptido de la VRP es mediante el
acoplamiento químico o enzimático de glicósidos al polipéptido.
Estos procedimientos son ventajosos en que no requieren la
producción del polipéptido en una célula huésped que tiene capacidad
de glicosilar para la glicosilación unida a N u O. Dependiendo del
modo de acoplamiento usado, el(los) azúcar(es)
podría(n) unirse a (a) arginina e histidina, (b) grupos
carboxilo libres, (c) grupos sulfhidrilo libres tales como los de
cisteína, (d) grupos hidroxilo libres tales como los de serina,
treonina, o hidroxiprolina, (e) residuos aromáticos tales como los
de la fenilalanina, tirosina, o triptófano, o (f) el grupo amino de
la glutamina. Estos procedimientos se describen en WO 87/05.330,
publicada el 11 de septiembre de 1987, y en Aplin y Wriston, CRC
Crit. Rev. Biochem. pp. 259-306 (1981).
La supresión de grupos carbohidratos presentes 10
sobre el polipéptido de la VRP podría conseguirse química o
enzimáticamente. La deglicosilación química requiere la exposición
del polipéptido al compuesto ácido trifluorometanesulfónico, o un
compuesto equivalente. Este tratamiento resulta en el corte de la
mayoría o totalidad de los azúcares, excepto el azúcar unidor
(N-acetilglucosamina o
N-acetilgalactosamina), mientras que deja el
polipéptido intacto. La deglicosilación química es descrita por
Hakimuddin et al., Arch. Biochem. Biophys. 259:52
(1987) y por Edge et al., Anal. Biochem. 118:131
(1981). El corte enzimático de carbohidratos sobre polipéptidos
puede conseguirse mediante el uso de una diversidad de endo- y
exo-glicosidasas, tal como describe Thotakura et
al., Meth. Enzymol. 138:350 (1987).
La glicosilación en sitio de glicosilación
potenciales podría impedirse mediante el uso del compuesto
tunicamicina según describen Duskin et al., J. Biol.
Chem. 257:3105 (1982). La tunicamicina bloquea la formación de
enlaces proteína-N-glicósido.
Otro tipo de modificación covalente de la VRP
comprende la unión del polipéptido de la VRP a uno de una variedad
de polímeros no proteicos, por ejemplo, polietilenglicol,
polipropilenglicol, o polioxialquilenos, en la forma establecida en
las patentes estadounidenses n° 4.640.835, 4.496.689, 4.301.144;
4.670.417; 4.791.192 ó 4.179.337.
Puesto que a menudo es difícil predecir por
anticipado las características de una variante de la VRP, se
apreciará que será necesario cierto examen de la variante
recuperada para seleccionar la variante óptima. Un cambio en el
carácter inmunológico de la molécula de VRP, tal como la afinidad
por un anticuerpo determinado, puede medirse también mediante un
inmunoensayo de tipo competitivo. La variante se ensaya en busca de
cambios en la supresión o potenciación de su actividad mitogénica
por comparación con la actividad observada con la VRP nativa en el
mismo ensayo. Por ejemplo, se puede examinar la capacidad de la
variante de la VRP para estimular la actividad quinasa de proteínas
del receptor Flt4 tal como se describe en el Ejemplo 5 en ésta.
Otras modificaciones potenciales de la proteína o de las propiedades
del polipéptido, tales como la estabilidad redox o térmica, la
hidrofobicidad, la susceptibilidad a la degradación proteolítica, o
la tendencia a agregarse con portadores o en multímeros, se ensayan
mediante procedimientos bien conocidos en la técnica.
Esta invención abarca los polipéptidos quiméricos
que comprenden la VRP unida a otro polipéptido. En una realización
preferida, el polipéptido quimérico comprende una fusión de la VRP
con un polipéptido etiqueta, el cual proporciona un epítopo al que
puede unirse selectivamente un anticuerpo
anti-etiqueta. El epítopo etiqueta se coloca
generalmente en los extremos amino- o
carboxi-terminal de la VRP. Tales formas de la VRP
etiquetadas con un epítopo son deseables, puesto que la presencia de
las mismas puede detectarse usando un anticuerpo marcado contra el
polipéptido etiqueta. También, la provisión del epítopo etiqueta
permite que la VRP sea fácilmente purificada mediante purificación
por afinidad usando el anticuerpo anti-etiqueta.
Las técnicas de purificación por afinidad y los ensayos de
diagnóstico que implican anticuerpos se describen más tarde en
ésta.
Los polipéptidos etiqueta y sus respectivos
anticuerpos son bien conocidos en la técnica. Los ejemplos incluyen
el polipéptido etiqueta flu HA y su anticuerpo 12CA5 (Field et
al., Mol. Cell Biol. 8:2159-2165 (1988));
la etiqueta c-myc y los anticuerpos 8F9, 3C7, 6E10,
G4, B7 Y 9E10 contra la misma (Evan et al., Molecular and
Cellular Biology 5:3610-3616 (1985)); y la
etiqueta glicoproteína D (gD) del virus Herpes Simplex y su
anticuerpo (Paborsky et al., Protein Engineering
3(6):547-553 (1990). Se han descubierto otros
polipéptidos etiqueta. Los ejemplos incluyen el péptido Flag (Hopp
et al., Bio/Technology 6:1204-1210
(1988)); el péptido del epítopo KT3 (Martin et al.,
Science 255:192-194 (1992)); un péptido del
epítopo de la \alpha-tubulina (Skinner et
al., J. Biol. Chem. 266:15163-15166
(1991)); y el péptido etiqueta de la proteína 10 del gen T7
(Lutz-Freyermuth et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 87:6393-6397 (1990)). Una vez se
ha seleccionado el polipéptido etiqueta, puede generarse un
anticuerpo contra el mismo usando las técnicas descubiertas en
ésta.
Los procedimientos generales apropiados para la
construcción y producción de VRP marcada con epítopo son los mismos
que los descubiertos en ésta más arriba en relación a la VRP (nativa
o variante). Las fusiones VRP-polipéptido etiqueta
se construyen de la forma más conveniente fusionando, en pauta, la
secuencia de cADN que codifica la porción VRP con la secuencia de
ADN del polipéptido etiqueta, y expresando la construcción de fusión
del ADN resultante en células huésped apropiadas. Ordinariamente,
cuando se preparan las quimeras de VRP-polipéptido
etiqueta de la presente invención, el ácido nucleico que codifica
la VRP se habrá fusionado en su extremo 3' al ácido nucleico que
codifica el extremo N-terminal del polipéptido
etiqueta, no obstante, las fusiones 5' también son posibles.
La VRP marcada con epítopo puede purificarse
convenientemente mediante cromatografía de afinidad usando el
anticuerpo anti-etiqueta. La matriz a la cual se une
el anticuerpo de afinidad es más frecuentemente agarosa, pero
otras matrices están disponibles (por ejemplo, vidrio con poro
controlado o poli(estirendivinil)benceno). La VRP
marcada con epítopo puede eluirse de la columna de afinidad, por
ejemplo, variando el pH o la fuerza iónica del tampón, o
añadiendo agentes caotrópicos.
Se cree que la VRP hallará uso terapéutico en el
tratamiento de mamíferos a través de la estimulación o inhibición
del crecimiento y/o diferenciación y/o activación de células que
tienen el receptor Flt4 o uno o más de otros receptores de la VRP.
La VRP exógena podría administrársele a un paciente en estas
condiciones. La VRP humana es claramente útil en tanto que puede
administrársele a un humano que tiene niveles deprimidos de VRP
endógena, preferiblemente en la situación en la que tales niveles
deprimidos conducen a una alteración patológica, o cuando hay
ausencia de activación o inhibición del receptor Flt4 o uno o más
de los otros receptores de la VRP.
Los diversos usos terapéuticos potenciales de la
VRP incluyen aquéllos en los que el VEGF es útil. Los ejemplos de
estos incluyen los usos asociados con el endotelio vascular, tales
como el tratamiento de traumas de la red vascular, en vista de la
probada rápida promoción, por parte del VEGF, de la proliferación de
células endoteliales vasculares que rodearían el trauma, y en
vista de la relación entre el VEGF y la VRP establecida en ésta.
Los ejemplos de tales traumas que podrían tratarse de este modo
incluyen, pero no se limitan a, las incisiones quirúrgicas,
particularmente aquéllas que implican el corazón, las heridas,
incluyendo las laceraciones, incisiones, y penetraciones de vasos
sanguíneos, y las úlceras de superficie que implican el endotelio
vascular, tales como las úlceras diabéticas, hemofílicas y
varicosas. También se incluyen en ésta otras condiciones
fisiológicas que podrían mejorarse en base al carácter
selectivamente mitogénico de la VRP.
Para las indicaciones traumáticas mencionadas más
arriba, la molécula de VRP se formularía y dosificaría de forma
consistente con la buena práctica médica, tomando en cuenta la
alteración específica a tratar, la condición del paciente
individual, el sitio de suministro de la VRP, el procedimiento de
administración, y otros factores 20 conocidos por los
practicantes.
Las indicaciones adicionales para la VRP se
hallan en el tratamiento de heridas profundas, tales como las
úlceras dérmicas, incluyendo las categorías de llagas por presión,
úlceras venosas, y úlceras diabéticas, así como las quemaduras y
lesiones profundas en las que se requiere la angiogénesis para
preparar la quemadura o sitio lesionado para un injerto o pliegue
de piel. En este caso, la VRP se aplica directamente sobre el sitio
o se usa para empapar la piel o pliegue que se transplantará antes
del injerto. De forma similar, la VRP puede usarse en cirugía
plástica cuando se requiere la reconstrucción después de una
quemadura u otro trauma, o con propósitos cosméticos.
La angiogénesis es también importante para
mantener las heridas limpias y no infectadas. Por tanto, la VRP
puede usarse en asociación con la cirugía general y a continuación
de la reparación de cortes y laceraciones. Es particularmente útil
en el tratamiento de heridas abdominales con un elevado riesgo de
infección. La neovascularización es también clave para la
reparación de fracturas, puesto que los vasos sanguíneos se
desarrollan en el sitio de la lesión ósea. La administración de VRP
en el sitio de una fractura es por tanto otra utilidad.
En los casos en los que la VRP se usa para la
cicatrización de heridas tópicas, tal como se describe más arriba,
podría administrarse mediante cualesquiera de las rutas descritas
más abajo para la re-endotelización del tejido
vascular, o más preferiblemente mediante medios tópicos. En estos
casos, se administrará como una solución, aerosol, gel, crema,
ungüento, o polvo seco, directamente sobre el sitio de la lesión.
También se usarán los aparatos de liberación lenta que dirigen la
VRP al sitio lesionado. En las aplicaciones tópicas, la VRP se
aplicará en una concentración que oscilará desde aproximadamente 50
hasta 1000 \mug/ml, bien en una única aplicación, o en regímenes
de dosis que son diarios o cada pocos días durante un período de
una semana a varias semanas. Generalmente, la cantidad de
formulación tópica administrada es aquélla que es suficiente para
aplicar desde aproximadamente 0,1 hasta 100 \mug/cm^{2} de la
VRP, en base al área de la superficie de la herida.
La VRP puede usarse como un agente cicatrizante
posterior a la operación en la angioplastia con globo, un
procedimiento en el que se suprimen o lesionan las células
endoteliales vasculares, junto con la compresión de placas
ateroescleróticas. La VRP puede aplicarse también a superficies
vasculares interiores mediante aplicación intravenosa sistémica o
local, tanto como inyecciones o infusiones de bolos intravenosos. Si
se desea, la VRP puede administrarse a lo largo del tiempo usando
una bomba micrométrica. Las composiciones apropiadas para la
administración intravenosa comprenden la VRP en una cantidad
efectiva para promover el crecimiento de las células endoteliales y
un material portador parenteral. La VRP puede estar presente en la
composición a lo largo de un amplio rango de concentraciones, por
ejemplo, desde aproximadamente 50 \mum/ml hasta aproximadamente
1000 \mug/ml, usando inyecciones de 3 a 10 ml por paciente,
administradas una vez o en regímenes de dosis que permiten
múltiples aplicaciones. Puede usarse cualquiera de los 0 vehículos
portadores parenterales conocidos, tales como la solución salina
normal o dextrosa al 5-10%.
La VRP puede usarse también para promover la
endotelización en la cirugía de injertos vasculares. En el caso de
injertos vasculares usando vasos transplantados o material
sintético, por ejemplo, la VRP puede aplicarse a las superficies
del injerto y/o en la uniones del injerto y la vasculatura
existente para promover el crecimiento de las células endoteliales
vasculares. Para tales aplicaciones, la VRP puede aplicarse
intravenosamente, tal como se ha descrito más arriba para la
angioplastia con globo, o puede aplicarse directamente a las
superficies del injerto y/o de la vasculatura existente, bien antes
o durante la operación. En tales casos, podría ser deseable
aplicar la VRP en un material portador engrosado, de forma que se
pegara a la superficie afectada. Los materiales portadores
apropiados incluyen, por ejemplo, el carbopol al
1-5%. La VRP puede estar presente en el portador en
un amplio rango de concentraciones, por ejemplo, desde
aproximadamente 50 µg/mg hasta aproximadamente 1000 \mug/mg.
Alternativamente, la VRP podría suministrarse en el sitio mediante
una bomba micrométrica como una solución parenteral.
La VRP puede emplearse también para reparar el
daño vascular que sigue al infarto de miocardio, y para salvar la
necesidad de cirugía de bypass coronario mediante la
estimulación del crecimiento de una circulación colateral. Para este
propósito, la VRP se administra intravenosamente, bien en
inyecciones individuales o mediante una bomba micrométrica a lo
largo de un período de tiempo, tal como se ha descrito más arriba,
o mediante infusión o inyección directa en el sitio del músculo
cardíaco lesionado.
Las formulaciones terapéuticas de la VRP se
preparan para su almacenamiento mezclando VRP que tiene el grado de
pureza deseado con portadores, excipientes, o estabilizadores
opcionales fisiológicamente aceptables (Remington's
Pharmaceutical Sciences, 16ª edición, editor A. Osol, 1980), en
forma de pastel liofilizado o soluciones acuosas. Los portadores,
excipientes o estabilizadores aceptables no son tóxicos para los
receptores en las dosis y concentraciones empleadas, e incluyen
tampones tales como el fosfato, citrato, y otras sales orgánicas;
antioxidantes, incluyendo el ácido ascórbico; polipéptidos de bajo
peso molecular (menos de aproximadamente 10 residuos); proteínas,
tales como la albúmina de suero, la gelatina, o inmunoglobulinas;
polímeros hidrofóbicos tales como la polivinilpirrolidona;
aminoácidos tales como la glicina, glutamina, asparagina o lisina;
monosacáridos, disacáridos y otros carbohidratos, incluyendo la
glucosa, manosa, o dextrinas; agentes quelantes tales como el EDTA;
azúcares alcohol tales como el manitol o sorbitol; contraiones
formadores de sales tales como el sodio; y/o tensioactivos no
fónicos tales como el Tween, Pluronics o polietilenglicol
(PEG).
La VRP también podría atraparse en microcápsulas
preparadas, por ejemplo, mediante técnicas de coacervación o
mediante polimerización interfacial (por ejemplo, respectivamente,
microcápsulas de hidroximetilcelulosa o gelatina, y microcápsulas
de poli-[metilnetacilato]), en sistemas coloidales de suministro de
drogas (por ejemplo, liposomas, microesferas de albúmina,
microemulsiones, nanopartículas, y nanocápsulas), o en
macroemulsiones. Tales técnicas se describen en Remington's
Pharmaceutical Sciences, ver más arriba.
La VRP a ser usada para la administración in
vivo debe ser estéril. Esto se consigue fácilmente mediante
filtración a través de membranas de filtración estériles, antes o
después de su liofilización y reconstitución. La VRP se almacenará
ordinariamente en forma liofilizada o en solución.
Las composiciones terapéuticas de la VRP
generalmente se colocan en un contenedor que tiene un puerto de
acceso estéril, por ejemplo, una bolsa de solución intravenosa o
una vial que tiene un tapón perforable mediante una aguja de
inyección hipodérmica.
La ruta de administración de la VRP está de
acuerdo con los procedimientos conocidos, por ejemplo, aquellas
rutas establecidas más arriba para indicaciones específicas, así
como las rutas generales de inyección o infusión mediante medios
intravenosos, intraperitoneales, intracerebrales, intramusculares,
intraoculares, intraarteriales, o intralesionales, o sistemas de
liberación continuada tal como se ha mencionado más arriba. La VRP
se administra continuamente mediante infusión o mediante inyección
de bolo. Generalmente, cuando la alteración lo permita, se debería
formular y dosificar la VRP para su suministro específico en un
sitio. Esto es conveniente en el caso de heridas y úlceras.
Los ejemplos apropiados de preparaciones de
liberación continuada incluyen las matrices semipermeables de
polímeros hidrofóbicos sólidos que contienen la proteína, matrices
que están en forma de artículos moldeados, por ejemplo, películas, o
microcápsulas. Los ejemplos de matrices de liberación continuada
incluyen los poliésteres, los hidrogeles (por ejemplo, el
poli(2-hidroxietilmetacrilato), tal como
describen Langer et al., J. Biomed. Mater. Res.
15:167-277 (1981) y Longer, Chem. Tech.
12:98-105 (1982), o el poli(vinilalcohol)),
los polilácticos (patente estadounidense n° 3.773.919, EP 58.481),
los copolímeros de ácido L-glutámico y
gamma-etil-L-glinamato
(Sidman et al., Biopolymers
22:547-556 (1983)), el acetato de etilenvinil no
degradable (Langer et al., ver más arriba), los copolímeros
degradables de 10 ácido láctico-ácido glicólico tales como el Lupron
Depot^{TM} (microesferas inyectables compuestas de copolímero de
ácido láctico-ácido glicólico y acetato de leuprólido), y el
poli-D-(-)-3-hidroxibutírato
(EP 133.988).
Los polímeros blancos tales como el etilenvinil
acetato y el ácido láctico-ácido glicólico permiten la liberación
de moléculas durante más de 100 días, ciertos hidrogeles liberan
proteínas durante períodos de tiempo más cortos. Cuando las
proteínas encapsuladas permanecen en el cuerpo durante un período
largo, se pueden desnaturalizar o agregar a resultas de la
exposición a temperatura a 37°C, resultando en una pérdida de
actividad biológica y posibles cambios en su inmunogenicidad.
Pueden desarrollarse estrategias racionales para la estabilización
de la proteína dependiendo del mecanismo implicado. Por ejemplo, si
se descubre que el mecanismo de agregación es la formación de
enlaces S-S intermoleculares a través del
intercambio tio-disulfuro, la estabilización podría
conseguirse modificando los residuos sulfhidrilo, liofilizando a
partir de soluciones ácidas, controlando el contenido en humedad,
usando aditivos apropiados, y desarrollando composiciones
específicas de matriz de polímeros.
Las composiciones de VRP de liberación
continuadatambién incluyen la VRP atrapada liposomalmente. Los
liposomas que contienen la VRP se preparan mediante procedimientos
conocidos por sí mismos: DE 3.218.121; Epstein et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:3688-3692
(1985); Hwang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
77:4030-4034 (1980); EP 52.322; EP 36.676; EP
88.046; EP 143.949; EP 142.641; la solicitud de patente japonesa
83-118.008; las patentes estadounidenses n°
4.485.045 y 4.544.545; y la EP 102.324. Ordinariamente, los
liposomas son del tipo unilamelar pequeño (aproximadamente
200-800 Angstroms), en los que el contenido de
lípidos es mayor de aproximadamente el 30% molar en colesterol,
ajustándose la proporción seleccionada para la terapia óptima con
VRP.
Cuando se aplica tópicamente, la VRP se combina
apropiadamente con otros ingredientes, tales como portadores y/o
adyuvantes. No ha limitaciones sobre la naturaleza de tales otros
ingredientes, excepto que deben ser farmacéuticamente aceptables y
eficaces para su pretendida administración, y que no pueden
degradar la actividad de los ingredientes activos de la
composición. Los ejemplos de vehículos apropiados incluyen los
ungüentos, las cremas, los geles, o suspensiones, con o sin
colágeno purificado. Las composiciones también podrían impregnarse
en parches transdérmicos, emplastos, y vendas, preferiblemente en
forma líquida o semi-líquida.
Para obtener una formulación en gel, la VRP
formulada en una composición líquida podría mezclarse con una
cantidad efectiva de un polisacárido soluble en agua, o de un
polímero sintético tal como el PEG, para formar un gel con la
viscosidad apropiada para ser aplicado tópicamente. Los
polisacáridos que podrían usarse incluyen, por ejemplo, los
derivados de la celulosa tales como los derivados eterificados de
la celulosa, incluyendo las alquilcelulosas, las
hidroxialquilcelulosas, y las alquihidroxialquicelulosas, por
ejemplo, la metilcelulosa, la hidroxietilcelulosa, la
carboximetilcelulosa, la hidroxipropil metilcelulosa, y la
hidroxipropilcelulosa; el almidón y el almidón fraccionado; el agar;
el ácido algínico y los alginatos; la goma arábica; el pululan; la
agarosa; el carragenato; los dextranos; las dextrinas; los
fructanos; la inulina; los mananos; los xilanos; los arabinanos; los
quitosanos; los glicógenos; los glucanos; y los biopolímeros
sintéticos; así como gomas como la goma de xantano, la goma de
guar, la goma del haba de locust, la goma arábica, la goma de
tragacanto, y la goma de karaya; y derivados y mezclas de los
mismos. El agente gelificante preferido en ésta es uno que es inerte
en sistemas biológicos, no tóxico, sencillo de preparar, y no
demasiado fluido o viscoso, y que no desestabilizará la VRP
contenida en el mismo.
Preferiblemente, el polisacárido es un derivado
eterificado de la celulosa, más preferiblemente uno que esté bien
definido, purificado, y listado en la USP, por ejemplo, la
metilcelulosa y los derivados hidroxialquilcelulosa, tales como
lahidroxipropilcelulosa, la hidroxietilcelulosa, y la hidroxipropil
metilcelulosa. El más preferido en ésta es la metilcelulosa.
El polietilenglicol útil para gelificar es
típicamente una mezcla de PEG de bajo y elevado peso molecular para
obtener una viscosidad apropiada. Por ejemplo, una mezcla de un PEG
con peso molecular de 400-600 con uno con peso
molecular de 1500 sería efectiva para este propósito cuando se
mezcla en la proporción apropiada para obtener una pasta.
El término "soluble en agua", tal como se
aplica a los polisacáridos y PEG, se pretende que incluya las
soluciones coloidales y las dispersiones. En general, la
solubilidad de los derivados de celulosa se determina por el grado
de sustitución de grupos éter, y los derivados estabilizantes
útiles en ésta deberían tener una cantidad suficiente de tales
grupos éter, por unidad de anhidroglucosa en la cadena de celulosa,
como para hacer a los derivados solubles en agua. Un grado de
sustitución éter de al menos 0,35 grupos éter por unidad de
anhidroglucosa es generalmente suficiente. Adicionalmente, los
derivados de celulosa podrían estar en la forma de sales de metales
alcalinos, por ejemplo, sales de Li, Na, K o Cs.
Si la metilcelulosa se emplea en el gel,
preferiblemente comprende aproximadamente el 2-5%,
más preferiblemente aproximadamente el 3%, de el gel, y la VRP está
presente en una cantidad de aproximadamente 300-1000
mg por ml de gel.
Una cantidad efectiva de VRP a emplearse
terapéuticamente dependerá, por ejemplo, de los objetivos
terapéuticos, la ruta de administración, y la condición del
paciente. En consecuencia, será necesario para el terapeuta valorar
la dosis y modificar la ruta de administración según se requiera
para obtener el efecto terapéutico óptimo. Típicamente, el clínico
administrará la VRP hasta que se alcance una dosis que consiga el
efecto deseado. Una dosis diaria típica para tratamiento sistémico
podría oscilar desde aproximadamente 1 \mug/kg hasta 10 mg/kg o
más, dependiendo de los factores mencionados más arriba. Como una
proposición general alternativa, la VRP se formula y suministra al
sitio o tejidos diana en una dosis capaz de establecer en el
tejido un nivel de VRP superior a aproximadamente 0,1 ng/cc, y
hasta una dosis máxima que es eficaz pero no indebidamente tóxica.
Esta concentración intra-tejido debería mantenerse
si es posible mediante infusión continuada, liberación sostenida,
aplicación tópica, o inyección con frecuencias determinadas
empíricamente. El progreso de esta terapia se monitoriza fácilmente
mediante ensayos convencionales.
Está dentro del ámbito de ésta el combinar la
terapia con VRP con otras terapias nuevas o convencionales (por
ejemplo, factores de crecimiento tales como el VEGF, el factor de
crecimiento de fibroblastos ácido o básico (aFGF o bFGF,
respectivamente), el factor de crecimiento derivado de plaquetas
(PDGF), el factor de crecimiento parecido a la insulina
(IGF-I o IGF-II), el factor de
crecimiento del nervio (NGF), los esteroides anabólicos, el EGF o
el TGF-\alpha, para potenciar la actividad de
cualquiera de los factores de crecimiento, incluyendo la VRP, en la
promoción de la proliferación celular y de la reparación. No es
necesario que tales drogas de co-tratamiento se
incluyan por sí mismas en las composiciones de la invención,
aunque esto podría ser conveniente cuando tales drogas son
proteicas. Tales mezclas se administran convenientemente de la misma
forma y para los mismos propósitos que la VRP usada sola. La
proporción molar útil de VRP respecto los factores de crecimiento
secundarios es típicamente 1:0,1-101, siendo
preferida con cantidades aproximadamente equimolares.
El ácido nucleico que codifica la VRP podría
utilizarse como un diagnóstico para la clasificación especifico de
tejido. Por ejemplo, procedimientos tales como la hibridación in
situ, la transferencia Northern y Southern, y el análisis con
PCR, podrían usarse para determinar si el ADN y/o ARN que codifica
la VRP están presentes en el(los) tipo(s) de
célula(s) que se está(n) evaluando. El ácido nucleico o
polipéptido de la VRP podrían usarse también como marcadores
diagnósticos. Por ejemplo, podría marcarse la VRP, usando las
técnicas descritas en ésta, y, usando la VRP marcada podría
cuantificarse la expresión de las moléculas de ácido nucleico que
codifican un receptor Flt4 u otro receptor de la VRP.
Si el ácido nucleico que codifica la VRP humana
se ubica en un cromosoma humano, el ácido nucleico para la VRP
humana podría usarse como un marcador de este cromosoma humano.
El ácido nucleico de la VRP también es útil para
la preparación de un polipéptido de la VRP mediante técnicas
recombinantes ejemplificadas en ésta.
El polipéptido de la VRP aislado podría usarse en
ensayos de diagnóstico cuantitativo como un estándar o control
contra el que podrían prepararse muestras conteniendo cantidades
desconocidas de VRP.
Las preparaciones de VRP son también útiles para
generar anticuerpos, como estándares en ensayos para la VRP (por
ejemplo, marcando la VRP para su uso como un estándar en un
radioinmunoensayos, ensayo de radioreceptor, o inmunoensayo unido a
enzima), para detectar la presencia del receptor Flt4, o uno o más
receptores distintos de la VRP en una muestra biológica (por
ejemplo, usando una VRP marcada), en técnicas de purificación por
afinidad, y en ensayos de unión a receptor del tipo competitivos
cuando se marcan con yodo radiactivo, enzimas, fluoróforos,
marcadores de espín, o similares.
La VRP es útil también como una herramienta
diagnóstica. Por ejemplo, la VRP puede producirse en células
procariotas usando las técnicas elaboradas en ésta, y la proteína
no glicosilada así producida puede usarse como un marcador de peso
molecular. El peso molecular (pm) deducido de la VRP es de
aproximadamente 44,8 kDa. Para usar la VRP como un marcador de peso
molecular, se usará por ejemplo cromatografía de filtración en gel
o SDS-PAGE para separar proteínas, de las que se
desea determinar sus pesos moleculares, sustancialmente de la forma
normal. La VRP y otros marcadores de peso molecular se usarán como
estándares para proporcionar un rango de pesos moleculares. Por
ejemplo, pueden usarse como marcadores la fosforilasa b (pm =
97.400), la albúmina de suero bovina (pm = 68.000), la ovoalbúmina
(pm = 46.000), la VRP (pm = 44.800), el inhibidor de la tripsina
(pm = 20.100), y el lisozima (pm = 14.400). Los otros marcadores de
peso molecular mencionados aquí se pueden comprar comercialmente a
Amersham Corporation, Arlington Heights, 1L, por ejemplo. A menudo,
los marcadores de peso molecular se marcarán para permitir su
detección fácil a continuación de su separación. Las técnicas para
marcar anticuerpos y proteínas se discuten en ésta y son bien
conocidas en la técnica. Por ejemplo, los marcadores de peso
molecular podrían biotinilarse y, a continuación de su separación,
por ejemplo sobre SDS-PAGE, la transferencia puede
incubarse con estreptoavidina-peroxidasa de rábano
silvestre. Las bandas pueden detectarse entonces mediante detección
con luz.
También podría ser útil cultivar ciertas células
que tienen el receptor Flt4, o uno o más receptores distintos de la
VRP, ex vivo usando la VRP como un factor angiogénico o
factor de crecimiento. Así pues, por ejemplo, la VRP puede usarse
como un factor de crecimiento en el cultivo in vitro de
células endoteliales. Para tales usos, la VRP puede añadirse al
medio de cultivo de células a una concentración de desde
aproximadamente 10 pg/ml hasta aproximadamente 10 ng/ml.
Estas células que se han de cultivar ex
vivo podrían exponerse simultáneamente a otros factores de
crecimiento conocidos o citoquinas. Las citoquinas de ejemplo
incluyen las interleucinas (por ejemplo, la IL-3),
el factor estimulante de las colonias de
granulocito-macrófagos (GM-CSF), el
VEGF, el factor estimulante de las colonias de macrófagos
(M-CSF), el factor estimulante de las colonias de
granulocitos (G-CSF), el factor estimulante de las
colonias de granulocito-macrófagos
(GM-CSF), la eritropoietina (Epo), la linfotoxina,
el factor "steel" (SLF), el factor de la necrosis
tumoral (TNF), y el interferón gamma. Esto resulta en la
proliferación y/o diferenciación de las células que tienen el
receptor Flt4 o uno o más de los otros receptores de la VRP.
En todavía otro aspecto de la invención, la VRP
podría usarse para la purificación mediante afinidad del receptor
Flt4, o de uno o más de los otros receptores de la VRP. En resumen,
esta técnica implica la unión covalente de la VRP a una matriz
inerte y porosa (por ejemplo, agarosa que ha reaccionado con
bromuro de cianógeno). A continuación puede pasarse una solución
que contiene el receptor Flt4, u otro(s) receptor(es)
de la VRP, a través del material cromatográfico y puede liberarse
subsiguientemente cambiando las condiciones de elución (por
ejemplo, cambiando el pH o la fuerza iónica).
El VRP purificado, y el ácido nucleico que lo
codifica, podrían venderse también como reactivos para estudios de
mecanismos de la VRP y sus receptores afines, para estudiar el
papel de la VRP y del receptor Flt4, u otros receptores de la VRP,
en el crecimiento normal y desarrollo, así como en el crecimiento y
desarrollo anormal, por ejemplo, en cánceres.
La VRP podría usarse para el examen competitivo
de agonistas y antagonistas potenciales para la unión al receptor
Flt4 u otros receptores de la VRP. Las variantes de la VRP son
útiles como estándares o controles en ensayos para la VRP, siempre y
cuando sean reconocidos por el sistema analítico empleado, por
ejemplo, un anticuerpo anti-VRP.
A continuación sigue una descripción de
anticuerpos de ejemplo tal como se definen en ésta. Estos
anticuerpos de ejemplo incluyen anticuerpos policlonales,
monoclonales, humanizados, biespecíficos, o heteroconjugados.
Los anticuerpos policlonales contra la VRP
generalmente se generan en animales mediante múltiples inyecciones
subcutáneas (sc) o intraperitoneales (ip) de la VRP y de un
adyuvante. Podría ser útil conjugar la VRP a una proteína que es
inmunogénica en las especies a inmunizar, por ejemplo, la
hemocianina de lapa con forma de ojo de cerradura, la albúmina de
suero, la tiroglobulina bovina, o el inhibidor de la tripsina de
soja, usando un agente bifuncional o derivatizante, por ejemplo, el
éster de maleimidobenzoil sulfosuccinimida (conjugación a través de
residuos cisteína), la N-hidroxisuccinimida (a
través de residuos lisina), el glutaraldehído, el anhídrido
succínico, el SOCl_{2}, o el R^{1}N = C = NR, en donde R y R'
son grupos alquilo diferentes.
Los animales se inmunizan contra los conjugados o
derivados inmunogénicos mediante la combinación de 1 mg o 1 \mug
de conjugado (respectivamente para conejos o ratones) con 3
volúmenes de adyuvante completo de Freud, e inyectando la solución
intradérmicamente en múltiples sitios. Un mes más tarde, los
animales se impulsan con 1/5 a 1/10 de la cantidad original de
conjugado en el adyuvante completo de Freud, mediante inyección
subcutánea en múltiples sitios. De siete a 14 días más tarde, se
sangran los animales y se ensaya el suero por su valoración de
anticuerpo anti-VRP. Los animales se impulsan hasta
que la valoración se estabiliza. Preferiblemente, el animal se
impulsa con un conjugado de la misma VRP con una proteína
diferente, y/o la conjugación tiene lugar a través de diferentes
reactivos entrecruzadores. Los conjugados se pueden preparar también
en cultivos de células recombinantes como fusiones de proteínas.
También se usan agentes agregadores como el alum para potenciar la
respuesta inmune.
Los anticuerpos monoclonales se obtienen a partir
de una población de anticuerpos sustancialmente homogénea, es
decir, los anticuerpos individuales que comprenden la población son
idénticos, excepto por posibles mutaciones que ocurren de forma
natural que podrían estar en cantidades menores. Por tanto, el
modificador "monoclonal" indica el carácter del anticuerpo
como que no es una mezcla de anticuerpos individuales.
Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales
anti-VRP de la invención podrían prepararse usando
el procedimiento del hibridoma descrito primero por Kohler y
Milstein, Nature 256:495 (1975), o podrían prepararse
mediante procedimientos recombinantes (patente estadounidense n°
4.816.567).
En el procedimiento del hibridoma, se inmuniza un
ratón u otro animal huésped apropiado, tal como el hámster, como
en ésta más arriba para elicitar linfocitos que producen, o son
capaces de producir, anticuerpos que se unirán específicamente a la
proteína usada para la inmunización. Alternativamente, los
linfocitos podrían inmunizarse in vitro. Los linfocitos se
fusionan a continuación con células de mieloma, usando un agente
apropiado, tal como el PEG, para formar una célula hibridoma
(Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.
59-103 (Academic Press, 1986).
Las células hibridoma así preparadas se siembran
y cultivan en un medio de cultivo apropiado que preferiblemente
contiene una o más sustancias que inhiben el crecimiento o
supervivencia de las células de mieloma progenitoras no fusionadas.
Por ejemplo, si las células de mieloma progenitoras carecen del
enzima fosforibosiltransferasa de hipoxantina guanina (HGPRT o
HPRT), el medio de cultivo para los hibridomas típicamente incluirá
hipoxantina, aminopterina, y timidina (medio HAT), sustancias que
impiden el crecimiento de células con HGPRT deficiente.
Las células de mieloma preferidas son aquéllas
que se fusionan eficientemente, soportan un nivel elevado y 5
estable de expresión de anticuerpo por parte de las células
productoras de anticuerpo seleccionadas, y no son sensibles a un
medio tal como el medio HAT. Entre éstas, las líneas celulares de
mieloma preferidas son las líneas de mieloma de ratón, tales como
aquéllas derivadas de los tumores de ratón MOPC-21 y
MPC-11, disponibles en el Salk Institute Cell
Distribution Center, San Diego, California, EE.UU., y las células
SP-2 disponibles en el American Type Culture
Collection, Rockville, Maryland, EE.UU. También se han descrito las
líneas celulares de mieloma humano y de heteromieloma de
ratón-humana para la producción de anticuerpos
monoclonales humanos (Kozbor, J. Immunol. 133:3001 (1984);
Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques
and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker,
Inc., Nueva York, 1987). Ver también, Boerner et al., J.
Immunol. 147:86-95 (1991) y WO 91/17.769,
publicada el 28 de noviembre de 1991, para técnicas para la
producción de anticuerpos monoclonales humanos.
El medio de cultivo en que se hacen crecer las
células de hibridoma se ensaya en busca de la producción de
anticuerpos monoclonales dirigidos contra la VRP. Preferiblemente,
la especificidad de unión de los anticuerpos monoclonales
producidos mediante células de hibridoma se determina mediante
inmunoprecipitación o mediante un ensayo de unión in vitro,
tal como un radioinmunoensayo (RIA) o un ensayo inmunoabsorbente
unido a enzima (ELISA).
La afinidad de unión del anticuerpo monoclonal
puede determinarse, por ejemplo, mediante el análisis Schatchard de
Munson y Pollard, Anal. Biochem. 107:220 (1980).
Después de que se hayan identificado las células
de hibridoma que producen anticuerpos con la especificidad,
afinidad, y/o actividad deseadas, los clones pueden subclonarse
mediante procedimiento de dilución limitada, y cultivarse mediante
procedimientos estándares (Goding, Monoclonal Antibodies:
Principles and Practice, pp. 59-104 (Academic
Press, 1986). Los medios de cultivo apropiados para este propósito
incluyen, por ejemplo, el medio de Eagle modificado por Dulbecco o
el medio RPMI-1640. Además, las células de hibridoma
podrían cultivarse in vivo es tumores ascites en un
animal.
Los anticuerpos monoclonales secretados por los
subclones se separan apropiadamente del medio de cultivo, del
fluido ascítico, o del suero, mediante procedimientos convencionales
de purificación de inmunoglobulinas, tales como, por ejemplo,
proteína A-Sepharose, la cromatografía con
hidroxilapatito, la electroforesis en gel, la diálisis, o la
cromatografía de afinidad.
Alternativamente, es actualmente posible producir
animales transgénicos (por ejemplo, ratones) que son capaces, a
partir de su inmunización, de producir un repertorio completo de
anticuerpos humanos en ausencia de producción de inmunoglobulina
endógena. Por ejemplo, se ha descrito que la supresión homocigótica
del gen de la región de unión de la cadena pesada del anticuerpo
(J_{H}) en ratones quiméricos y mutantes de la línea germinal
resulta en la completa inhibición de la producción de anticuerpo
endógeno. La transferencia del conjunto de genes de
inmunoglobulinas de la línea germinal humana en tales ratones
mutantes en su línea germinal, resultará en la producción de
anticuerpos humanos a partir del desafío con antígeno. Ver, por
ejemplo, Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 90:2551 (1983); Jakobovits et al., Nature
362:255-258 (1993).
En una realización ulterior, los anticuerpos o
fragmentos de anticuerpos pueden aislarse a partir de bibliotecas
de fagos de anticuerpos generadas usando las técnicas descritas en
McCafferty et al., Nature 348:552-554
(1990), usando la VRP para seleccionar un anticuerpo o fragmento de
anticuerpo apropiado. Clackson et al., Nature
352:624-628 (1991) y Marks et al., J. Mol.
Biol. 222:581-597 (1991), describen
respectivamente el aislamiento de anticuerpos de ratón y humanos,
usando bibliotecas de fagos. Las publicaciones subsiguientes
describen la producción de anticuerpos humanos de elevada afinidad
(rango nM) mediante reordenación de la cadena (Mark et al.,
Bio/Technology 10:779-783 (1992)), así como
mediante infección combinatoria y recombinación in vivo como
estrategia para construir bibliotecas de fagos muy extensas
(Waterhouse et al., Nucl. Acids Res.
21:2265-2266 (1993). Por tanto, estas técnicas son
alternativas viables a las técnicas tradicionales de hibridoma de
anticuerpo monoclonal para el aislamiento de anticuerpos
"monoclonales" (especialmente anticuerpos humanos) que son
abarcados por la presente invención.
El ADN que codifica los anticuerpos monoclonales
de la invención se aísla fácilmente y se secuencia usando
procedimientos convencionales (por ejemplo, usando sondas de
oligonucleótidos que son capaces de unirse específicamente a genes
que codifican las cadenas ligera y pesada de los anticuerpos de
ratón). Las células de hibridomas de la invención sirven como una
fuente preferida de tal ADN. Una vez aislado, el ADN podría
colocarse en vectores de expresión, los cuales de transfectan
entonces en células huéspedes tales como las células COS de mono,
las células ováricas de hámster chino (CHO), o las células de
mieloma que de otro modo no producen proteína inmunoglobulina, para
obtener la síntesis de anticuerpos monoclonales en las células
huéspedes recombinantes. El ADN también podría modificarse, por
ejemplo, sustituyendo la secuencia codificante por dominios
constantes de cadena pesada y ligera humana en lugar de las
secuencias homólogas de ratón (Morrison et al., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 81:6851 (1984)), o uniendo covalentemente a
la secuencia que codifica la inmunoglobulina la totalidad o parte
de la secuencia que codifica un polipéptido que no es de
inmunoglobulina. De esta manera, se preparan anticuerpos
"quiméricos" o "híbridos" que tienen la especificidad de
unión de un anticuerpo monoclonal anti-VRP de
ésta.
Típicamente, tales polipéptidos que no son de
inmunoglobulina sustituyen los dominios constantes de un anticuerpo
de la invención, o sustituyen los dominios variables de un sitio de
combinación con antígeno de un anticuerpo de la invención para crear
un anticuerpo bivalente quimérico, el cual comprende un sitio de
combinación con antígeno que tiene especificidad por una VRP y otro
sitio de combinación con antígeno que tiene especificidad por un
antígeno diferente.
Los anticuerpos quimérico o híbrido se podrían
preparar también in vitro usando procedimientos conocidos en
la química de proteínas sintéticas, incluyendo aquéllos que
implican agentes entrecruzadores. Por ejemplo, podrían construirse
inmunotoxinas usando una reacción de intercambio de disulfuro, o
formando un enlace tioéter. Los ejemplos de reactivos apropiados
para este propósito incluyen el iminotiolato y el
metil-4-mercaptobutirimidato.
Para aplicaciones diagnósticas, los anticuerpos
de la invención típicamente se marcarán con un grupo detectable. El
grupo detectable puede ser uno cualquiera que sea capaz de
producir, bien directa o indirectamente, una señal detectable. Por
ejemplo, la porción detectable podría ser un radioisótopo, tal como
^{3}H, ^{14}C, ^{32}P, ^{35}S o ^{125}I; un compuesto
fluorescente o quimioluminiscente, tal como el isotiocianato de
fluoresceína, la rodamina, o luciferina; o un enzma, tal como la
fosfatasa alcalina, la beta-galactosidasa, o la
peroxidasa de rábano silvestre.
Podría emplearse cualquier procedimiento conocido
en la técnica para conjugar separadamente el anticuerpo a la
porción detectable, incluyendo aquéllos procedimientos descritos
por Hunter et al., Nature 144:945 (1962); David et
al., Biochemistry 13:1014 (1974); Pain et al.,
J. Immunol. Meth. 40:219 (1981); y Nygren, J. Histochem.
and Cytochem. 30:407 (1982).
Los anticuerpos de la presente invención podrían
emplearse en cualquier procedimiento de ensayo conocido, tales como
ensayos de unión competitivos, ensayos en sándwich directos e
indirectos, y ensayos de inmunoprecipitación. Zola, Monoclonal
Antibodies: A Manual of Techniques, pp. 147-158
(CRC Press Inc., 1987).
Los ensayos de unión competitivos se basan en la
capacidad de un estándar marcado (el cual podría ser una VRP, o una
porción inmunológicamente reactiva de la misma) para competir con
el analito (VRP) de la muestra de ensayo por la unión con un número
limitado de anticuerpo. La cantidad de VRP en la muestra de ensayo
es inversamente proporcional a la cantidad de estándar que se une a
los anticuerpos. Para facilitar la determinación de la cantidad de
estándar que se une, los anticuerpos generalmente se insolubilizan
antes o después de la competición, de forma que el estándar y el
analito que están unidos a los anticuerpos podrían separarse
convenientemente del estándar y analito que permanecen sin
unir.
Los ensayos en sándwich implican el uso de dos
anticuerpos, cada uno capaz de unirse a una porción, o epítopo,
inmunogénicamente diferente de la proteína a detectar (VRP). En un
ensayo en sándwich, el analito de la muestra de ensayo se une
mediante un primer anticuerpo, el cual está inmovilizado sobre un
soporte sólido, y a continuación un segundo anticuerpo se une al
analito, formando por tanto un complejo insoluble a tres bandas.
Ver, por ejemplo, la patente estadounidense n° 4.376.110. El
segundo anticuerpo podría estar marcado con un grupo detectable
(ensayo en sándwich directo), o podría medirse usando un anticuerpo
anti-inmunoglobulina que está marcado con un grupo
detectable (ensayo en sándwich indirecto). Por ejemplo, un tipo de
ensayo en sándwich es un ensayo ELISA, caso en el cual el grupo
detectable es un enzima.
Los procedimientos para humanizar anticuerpos no
humanos son bien conocidos en la técnica. Generalmente, un
anticuerpo humanizado tiene uno o más residuos aminoácidos
introducidos en él a partir de una fuente que no es humana. Estos
residuos aminoácidos no humanos a menudo se denominan residuos
"importados", los cuales se toman típicamente de un dominio
variable "importado". La humanización puede realizarse
esencialmente siguiendo el procedimiento de Winter y colegas (Jones
et al., Nature 321:522-525 (1986);
Riechmann et al., Nature 332:323-327
(1988); Verhoeyen et al., Science
239:1534-1536 (1988)), sustituyendo CDR o secuencias
de CDR de roedores por las secuencias correspondientes de un
anticuerpo humano. En consecuencia, los anticuerpos
"humanizados" son anticuerpos quiméricos (patente
estadounidense n° 4.816.567, ver más arriba), en donde
sustancialmente menos de un dominio variables humano intacto ha
sido sustituido por la correspondiente secuencia de una especie no
humana. En la práctica, los anticuerpos humanizados son
típicamente anticuerpos humanos en los que algunos residuos CDR, y
posiblemente algunos residuos FR, son sustituidos por residuos de
sitios análogos en anticuerpos de roedores.
Es importante que los anticuerpos sean
humanizados reteniendo la elevada afinidad por el antígeno y otras
propiedades biológicas favorables. Para conseguir este objetivo, de
acuerdo con un procedimiento preferido, los anticuerpos humanizados
se preparan mediante un proceso de análisis de las secuencias
progenitoras y de varios productos humanizados conceptuales usando
modelos tridimensionales de las secuencias progenitoras y
humanizadas. Los modelos tridimensionales de inmunoglobulinas son
familiares a aquéllos formados en la técnica. Hay disponibles
programas de ordenador que ilustran y muestran les estructural
conformacionales tridimensionales probables de secuencias de
inmunoglobulina candidatas seleccionadas. La inspección de estas
visualizaciones permite el análisis del papel probable de los
residuos en el funcionamiento de la secuencia de inmunoglobulina
candidata, es decir, el análisis de los residuos que influyen en la
capacidad de la inmunoglobulina candidata para unir su antígeno. De
esta forma, pueden seleccionarse residuos FR, y combinarse a
partir de la secuencia consenso y importada, de forma que se
consiga la característica deseada del anticuerpo, tal como una
afinidad incrementada por el(los) antígeno(s)
diana(s). En general, los residuos CDR están directamente y
mayoritariamente sustancialmente implicados en influenciar la unión
de antígeno. Para más detalles consultar WO 92/22.653, publicada el
23 de diciembre de 1992.
Los anticuerpos biespecíficos son anticuerpos
monoclonales, preferiblemente humanos o humanizados, que tiene
especificidades de unión por al menos dos antígenos diferentes. En
el caso presente, una de las especificidades de unión es por la
VRP, la otra es por cualquier otro antígeno, y preferiblemente por
un receptor o subunidad de receptor. Por ejemplo, los anticuerpos
biespecíficos que específicamente unen el receptor Flt4 y la VRP se
hallan dentro del ámbito de la presente invención.
Los procedimientos para preparar anticuerpos
biespecíficos son conocidos en la técnica. Tradicionalmente, la
producción recombinante de anticuerpos biespecíficos se basa en la
co-expresión dedos pares de cadena-
pesada/cadena-ligera de inmunoglobulina, en donde
las dos cadenas pesadas tienen especificidades diferentes (Millstein
y Cuello, Nature 305:537-539 (1983)). A
causa del conjunto aleatorio de cadenas pesadas y ligeras de
inmunoglobulina, estos hibridomas (quadromas) producen una mezcla
potencial, a menudo moléculas anticuerpos diferentes, de las cuales
sólo una tiene la estructura biespecifica correcta. La purificación
de la molécula correcta, la cual se realiza usualmente mediante
pasos de cromatografia de afinidad, es bastante complicada, y los
rendimientos de producto son bajos. Se descubren procedimientos
similares en WO 93/08.329, publicada el 13 de mayo de 1993, y en
Traunecker et al., EMBO J.
10:3655-3659 (1991).
De acuerdo con una estrategia diferente y más
preferida, los dominios variables de anticuerpos con las
especificidades de unión deseadas (sitios de combinación
anticuerpo-antígeno) se fusionan a secuencias de
dominios constantes de inmunoglobulinas. La fusión preferiblemente
es con un dominio constante de cadena pesada de inmunoglobulina,
comprendiendo al menos parte del gozne, regiones CH2 y CH3. Se
prefiere tener la primera región constante de la cadena pesada
(CH1), que contiene el sitio necesario para la unión de la cadena
ligera, presente en la menos una de las fusiones. Los ADN que
codifican las fusiones de cadena pesada de inmunoglobulina y, si se
desea, la cadena ligera de inmunoglobulina, se insertan en vectores
de expresión separados, y se co-transfectan en un
organismo huésped apropiado. Esto proporciona una gran flexibilidad
para ajustar las proporciones mutuas de los tres fragmentos de
polipéptidos en las realizaciones cuando pueden usarse proporciones
diferentes, de las tres cadenas polipeptídicas usadas en la
construcción, para proporcionar los rendimientos óptimos. No
obstante, es posible insertar las secuencias codificantes de dos o
la totalidad de las tres cadenas polipeptídicas en un vector de
expresión, cuando la expresión de al menos dos cadenas
polipeptídicas en proporciones iguales resulta en rendimientos
mayores, o cuando las proporciones no tienen un importancia
particular. En una realización preferida de esta estrategia, los
anticuerpos biespecíficos se componen de una cadena pesada de
inmunoglobulina híbrida, con una primera especificidad de unión en
un brazo, y un par
cadena-pesada/cadena-ligera de
inmunoglobulina híbrida (que proporciona una segunda especificidad
de unión) en el otro brazo. Se encuentra que esta estructura
asimétrica facilita la separación del compuesto biespecífico
deseado de combinaciones no deseadas de cadenas de inmunoglobulina,
puesto que la presencia de una cadena ligera de inmunoglobulina
sólo en una mitad de la molécula biespecífica proporciona una forma
fácil de separación. Esta estrategia se descubre en WO 94/04.690,
publicada el 3 de marzo de 1994. Para más detalles sobre generar
anticuerpos biespecífico consultar, por ejemplo, Suresh et
al., Methods in Enzymology 121:210 (1986).
Los anticuerpos heteroconjugados están también
dentro del ámbito de la presente invención. Los anticuerpos
heteroconjugados se componen de dos anticuerpos covalentemente
unidos. Tales anticuerpos se han propuesto, por ejemplo, para
apuntar células del sistema inmune contra células no deseadas
(patente estadounidense n° 4.676.980), y para el tratamiento de la
infección con VIH (WO 91/00.360; WO 92/20.373; EP 03.089). Los
anticuerpos heteroconjugados podrían prepararse usando cualesquier
procedimientos de entrecruzamiento conveniente. Los agentes
entrecruzadores apropiados son bien conocidos en la técnica, y se
descubren, por ejemplo, en la patente estadounidense n° 4.676.980,
junto con un cierto número de técnicas de entrecruzamiento.
Los anticuerpos contra la VRP podrían ser útiles
en ciertas indicaciones terapéuticas para bloquear la actividad de
la VRP (por ejemplo, para bloquear el exceso de activación o
inhibición del receptor Flt4 u otro receptor que una la VRP, y para
bloquear la neovascularización, la
re-endotelización, y la angiogénesis).
Específicamente, los anticuerpos contra la VRP son útiles en el
tratamiento de varias enfermedades y alteraciones neoplásicas y no
neoplásicas. Los neoplasmas y las condiciones relacionadas que son
susceptibles de tratamiento incluyen los carcinomas de mama, los
carcinomas de pulmón, los carcinomas gástricos, los carcinomas
esofágicos, los carcinomas colorectales, los carcinomas de hígado,
los carcinomas ováricos, los tecomas, los arrenoblastomas, los
carcinomas cervicales, los carcinomas endometriales, la hiperplasia
endometrial, la endometriosis, los fibrosarcomas, los
coriocarcinomas, los cánceres de cabeza y cuello, los carcinomas
nasofaríngeos, los carcinomas de la laringe, los hepatoblastomas, el
sarcoma de Karposi, los melanoma, los carcinomas de la piel, los
hemangiomas, el hemangioma cavernoso, los hemangioblastomas, los
carcinomas de páncreas, los retinoblastomas, los astrocitomas, los
glioblastomas, los Schwannomas, los oligodendrogliomas, los
meduloblastomas, los neuroblastomas, los rabdomiosarcomas, el
sarcoma osteogénico, los leiomiosarcomas, los carcinomas del tracto
urinario, los carcinomas de tiroides, el tumor de Wilm, el
carcinoma de células renales, el carcinoma de próstata, la
proliferación vascular anormal asociada con facomatosas, edema (tal
como el que está asociado con tumores cerebrales), y el síndrome de
Meig.
Las condiciones no neoplásicas que son
susceptibles de tratamiento incluyen la artritis reumatoide, la
psoriasis, la ateroesclerosis, la retinopatía asociada a diabetes y
otras, la fibroplasia retrolental, el glaucoma neovascular, la
degeneración macular relacionad con la edad, las hiperplasias de
tiroides (incluyendo la enfermedad de Grave), los transplantes de
córnea y otros tejidos, la inflamación crónica, la inflamación de
pulmón, el síndrome nefrótico, la preeclampsia, los ascites, la
efusión pericardial (tal como la asociada con la pericarditis), y
la efusión pleural.
La degeneración macular relacionada con la edad
(AMD) es una causa líder de pérdida visual severa en la población
anciana. La forma exudativa de la AMD se caracteriza por una
neovascularización coroidal y el desprendimiento de las células del
epitelio retinal pigmentado. Puesto que la neovascularización
coroidal está asociada con un empeoramiento dramático en la
prognosis, los anticuerpos contra la VRP de la presente invención
se espera que sean especialmente útiles para reducir la gravedad
de la AMD.
Para aplicaciones terapéuticas, los anticuerpos
contra la VRP de esta invención se administran a un mamífero,
preferiblemente un humano, en una forma de dosificación
farmacéuticamente aceptable, incluyendo aquéllas que podrían
administrarse a un humano intravenosamente como un bolo o mediante
infusión continua a lo largo de un período de tiempo, mediante vías
intramusculares, intraperitoneales, intracerebroespinales,
subcutáneas, intra-articulares, intrasinoviales,
intratecales, orales, tópicas, o de inhalación. Los anticuerpos
contra la VRP se administran convenientemente mediante rutas
intratumorales, peritumorales, intralesionales, o perilesionales, o
a la linfa, para ejercer efectos terapéuticos locales así como
sistémicos. Se espera que la ruta intraperitoneal sea
particularmente útil, por ejemplo, en el tratamiento de tumores de
ovarios.
Tales formas de dosificación abarcan portadores
farmacéuticamente aceptables que son inherentemente no tóxicos y no
terapéuticos. Los ejemplos de tales portadores incluyen los
intercambiadores de iones, la alúmina, el estearato de aluminio, la
lecitina, las proteínas del suero, tales como la albúmina de suero
humana, sustancias tamponantes tales como los fosfatos, glicina,
ácido sórbico, sorbato potásico, mezclas parciales de glicéridos de
ácidos grasos vegetales saturados, agua, sales, o electrolitos tales
como el sulfato de protamina, el fosfato hidrógeno disódico, el
fosfato hidrógeno potásico, el cloruro sódico, las sales de zinc,
el sílice coloidal, el trisilicato de magnesio, la
polivinilpirrolidona, las sustancias basadas en celulosa, y el PEG.
Los portadores para formas tópicas o basadas en gel de los
anticuerpos contra la VRP incluyen los polisacáridos tales como la
carboximetilcelulosa sódica o metilcelulosa, la
polivinilpirrolidona, los poliacrilatos, los polímeros con bloque
polioxietilenopolioxipropileno, el PEG, y los alcoholes de ceras de
madera. Para todas las administraciones, se usan de forma
apropiada las formas de depósito. Tales formas incluyen, por
ejemplo, las microcápsulas, las nanocápsulas, los liposomas, los
emplastos, las formas para inhalación, los nebulizadores nasales,
las tabletas sublinguales, y las preparaciones de liberación
sostenida. El anticuerpo contra la VRP se formulará típicamente en
tales vehículos en una concentración de aproximadamente 0,1 mg/ml
hasta 100 mg/ml.
Los ejemplos apropiados de preparaciones de
liberación sostenida incluyen las matrices semipermeables de
polímeros hidrofóbicos sólidos que contienen el anticuerpo contra
la VRP, matrices que están en forma de artículos moldeados, por
ejemplo, películas, o microcápsulas. Los ejemplos de matrices de
liberación sostenida incluyen los poliésteres, los hidrogeles (por
ejemplo, el
poli(2-hidroxietil-metacrilato)
tal como se describen en Langer et al., ver más arriba, y en
Langer, ver más arriba, o los poli (vinil alcoholes), los
oliláctidos (patente estadounidense
n° 3.773.919), los copolímeros de ácido L-glutámico y gamma etil-L-glutatamo (Sidman et al., ver más arriba), el acetato de etilenvinilo no degradable (Langer et al., ver más arriba), los copolímeros degradables de ácido láctico-ácido glicólico tales como el Lupron Depot^{TM} (microesferas inyectables compuestas de copolímero de ácido láctico-ácido glicólico con acetato de leuprólido), y poli-D-(-)- 3-hidroxibutirato. Mientras que los polímeros tales como el acetato de etilenvinilo y ácido láctico-ácido glicólico permiten la liberación de moléculas durante 100 días, ciertos hidrogeles liberan proteínas durante períodos de tiempo más cortos. Cuando los anticuerpos contra la VRP permanecen encapsulados en el cuerpo durante un período largo, podrían desnaturalizarse o agregarse a resultas de su exposición a la humedad a 37°C, resultando en una pérdida de actividad biológica y posibles cambios en su inmunogenicidad. Pueden desarrollarse estrategias racionales para la estabilización dependiendo del mecanismo implicado. Por ejemplo, si se descubre que el 20 mecanismo de agregación es la formación de enlaces S-S intermoleculares a través del intercambio tio-disulfuro, la estabilización podría conseguirse modificando los residuos sulfhidrilo, liofilizando a partir de soluciones ácidas, controlando el contenido en humedad, usando aditivos apropiados, y desarrollando composiciones específicas de matriz de polímeros.
n° 3.773.919), los copolímeros de ácido L-glutámico y gamma etil-L-glutatamo (Sidman et al., ver más arriba), el acetato de etilenvinilo no degradable (Langer et al., ver más arriba), los copolímeros degradables de ácido láctico-ácido glicólico tales como el Lupron Depot^{TM} (microesferas inyectables compuestas de copolímero de ácido láctico-ácido glicólico con acetato de leuprólido), y poli-D-(-)- 3-hidroxibutirato. Mientras que los polímeros tales como el acetato de etilenvinilo y ácido láctico-ácido glicólico permiten la liberación de moléculas durante 100 días, ciertos hidrogeles liberan proteínas durante períodos de tiempo más cortos. Cuando los anticuerpos contra la VRP permanecen encapsulados en el cuerpo durante un período largo, podrían desnaturalizarse o agregarse a resultas de su exposición a la humedad a 37°C, resultando en una pérdida de actividad biológica y posibles cambios en su inmunogenicidad. Pueden desarrollarse estrategias racionales para la estabilización dependiendo del mecanismo implicado. Por ejemplo, si se descubre que el 20 mecanismo de agregación es la formación de enlaces S-S intermoleculares a través del intercambio tio-disulfuro, la estabilización podría conseguirse modificando los residuos sulfhidrilo, liofilizando a partir de soluciones ácidas, controlando el contenido en humedad, usando aditivos apropiados, y desarrollando composiciones específicas de matriz de polímeros.
Las composiciones de VRP de liberación continuada
también incluyen los anticuerpos atrapados liposomalmente. Los
liposomas que contienen los anticuerpos contra la VRP se preparan
mediante procedimientos conocidos por sí mismos en la técnica,
tales como los descritos en Epstein et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 82:3688 (1985); Hwang et al., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 77:4030 (1980); y en las patentes
estadounidenses n° 4.485.045 y 4.544.545. Ordinariamente, los
liposomas son del tipo unilamelar pequeño (aproximadamente
200-800 Angstroms), en los que el contenido de
lípidos es superior a aproximadamente el 30% molar en colesterol,
ajustándose la proporción seleccionada para la terapia óptima con
VRP. En la patente estadounidense n° 5.013.556 se descubren
liposomas con tiempo en circulación mejorado.
Otro uso de la presente invención comprende
incorporar los anticuerpos contra la VRP en artículos moldeados.
Tales artículos pueden usarse para modular el crecimiento de células
endoteliales y la angiogénesis. Además, la invasión del tumor y la
metástasis podrían modularse con estos artículos.
Para la prevención o tratamiento de enfermedades,
la dosificación apropiada del anticuerpo contra la VRP dependerá
del tipo de enfermedad a tratar, tal como se ha definido más
arriba, de la gravedad y evolución de la enfermedad, tanto si los
anticuerpos se administran con propósitos preventivos o
terapéuticos, de la terapia previa, del historial clínico del
paciente, y de la respuesta al anticuerpo contra la VRP, y del
criterio del médico responsable. El anticuerpo contra la VRP se
administra convenientemente al paciente de una vez o a lo largo de
series de tratamientos.
Dependiendo del tipo y gravedad de la enfermedad,
aproximadamente 1 \mug/kg hasta 15 \mug/kg de anticuerpo contra
la VRP es un dosis candidata inicial para la administración al
paciente, sea, por ejemplo, mediante una o más administraciones
separadas, o mediante infusión continua. Una dosis diaria típica
podría oscilar desde aproximadamente 1 \mug/kg hasta 100 \mug/kg
o más, dependiendo de los factores mencionados más arriba. Para
administraciones repetidas a lo largo de varios días o más,
dependiendo de la condición, el tratamiento se mantiene hasta que
ocurre una supresión deseada de los síntomas de la enfermedad. Sin
embargo, otros regímenes de dosis podrían ser útiles. El progreso de
esta terapia se monitoriza fácilmente mediante técnicas
convencionales y ensayos, incluyendo, por ejemplo, la visualización
radiográfica del tumor.
De acuerdo con otras realizaciones de la
invención, la efectividad del anticuerpo contra la VRP para
prevenir o tratar enfermedades podría mejorarse administrando el
anticuerpo contra la VRP en serie o en combinación con otro agente
proteico que es eficaz para estos propósitos, tales como los
enumerados más abajo, o uno o más agentes terapéuticos
convencionales tales como, por ejemplo, agentes alquilantes,
antagonistas del ácido fólico, anti-metabolitos del
metabolismo del ácido nucleico, antibióticos, análogos de
pirimidina, 5-fluorouracilo, cisplatino,
nucleósidos de purina, aminas, aminoácidos, nucleósidos de triazol,
o corticoesteroides. Tales otros agentes podrían estar presentes en
la composición que se está administrando o podrían administrarse
separadamente. También, el anticuerpo contra la VRP se administra
convenientemente en serie o en combinación con tratamientos
radiológicos, tanto si implican irradiación como administración de
sustancias radiactivas.
En una realización, la vascularización de tumores
se ataca mediante terapia de combinación. Se administran uno o más
anticuerpos contra la VRP a pacientes portadores de tumor, en dosis
terapéuticamente efectivas según se determina, por ejemplo,
observando la necrosis del tumor o de sus focos metastáticos, si hay
alguno. Esta terapia se continua hasta el momento en que no se
observan más beneficios, o hasta que el examen clínico no muestra
traza alguna del tumor o de cualquier foco metastático. A
continuación se administra el agente proteico auxiliar, sólo o en
combinación con otro agente auxiliar. Tales agentes incluyen, por
ejemplo, el TNF, un anticuerpo capaz de inhibir o neutralizar la
actividad angiogénica del aFGF o bFGF o del factor de crecimiento
de hepatocitos (HGF), un antagonista contra el rhVEGF tal como se
describe en WO 94/10.202, ver más arriba, el interferón alfa, beta,
o gamma, un anticuerpo anti-HER2, la heregulina, un
anticuerpo anti-heregulina, el factor D, la
interleucina-1 (IL-1), la
interleucina-2 (IL-2), el
GM-CSF, o agentes que promueven la coagulación
microvascular en tumores, tales como el anticuerpo
anti-proteína C, el anticuerpo
anti-proteína S, o la proteína unidora C4b (WO
91/01.753, publicada el 21 de febrero de 1991), o el calor o la
radiación.
Puesto que los agentes auxiliares variarán en su
efectividad, es deseable comparar su impacto sobre el tumor mediante
verificación en matriz de la forma convencional. La administración
de anticuerpo contra la VRP y de TNF, y/o otro agente auxiliar, se
repite hasta que se consigue el efecto clínico deseado.
Alternativamente, el anticuerpo o anticuerpos contra la VRP se
administran junto con el TNF y, opcionalmente, otro(s)
agente(s) auxiliar(es). En casos en los que el tumor
sólido se halla en las extremidades, o en otras ubicaciones
susceptibles de aislamiento de la circulación general, los agentes
terapéuticos descritos en ésta se administran al tumor u órgano
aislado. En otras realizaciones se administra un antagonista del
FGF o del factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF), tal
como un anticuerpo neutralizante anti-FGF o
anti-PDGF, al paciente en conjunción con el
anticuerpo contra la VRP. El tratamiento con anticuerpos contra la
VRP podría suspenderse óptimamente durante períodos de
cicatrización de heridas o de neovascularización deseable.
Los anticuerpos contra la VRP de la invención
también son útiles como agentes de purificación por afinidad. En
este proceso, los anticuerpos contra la VRP se inmovilizan sobre un
soporte apropiado, tal como una resina Sephadex o papel de filtro,
usando procedimientos bien conocidos en la técnica. El anticuerpo
inmovilizado se pone a continuación en contacto con una muestra que
contiene la VRP a purificar, y a continuación se lava el soporte
con un solvente apropiado que retirará sustancialmente todo el
material en la muestra excepto la VRP, la cual está unida al
anticuerpo inmovilizado. Finalmente, se lava el soporte con otro
solvente apropiado, tal como tampón glicina, pH 5,0, que
liberará la VRP del anticuerpo.
Los anticuerpos contra la VRP también podrían ser
útiles en ensayos diagnósticos para la VRP, por ejemplo,
detectando su expresión en células específicas, tejidos, o suero.
Los anticuerpos contra la VRP son también útiles para la
purificación por afinidad de la VRP a partir de cultivos de células
recombinantes o fuentes naturales. Los anticuerpos contra la VRP
que no reaccionan detectablemente de forma cruzada con otras
proteínas pueden usarse para purificar la VRP libre de estas otras
proteínas conocidas. Más arriba de describen ensayos diagnósticos
apropiados para la VRP y sus anticuerpos.
Más abajo hay ejemplos de realizaciones
específicas para llevar a cabo la presente invención. Los ejemplos
se ofrecen sólo con propósitos ilustrativos, y no se pretende que
limiten el ámbito de la presente invención en modo alguno.
Todas las publicaciones, patentes, y solicitudes
de patentes citadas en ésta, tanto más arriba como más abajo, se
incorporan en ésta por referencia en su totalidad.
El cADN, sintetizado a partir de mARN purificado
a a partir de la línea celular de leucemia megacariocítica humana
CMK11-5, se purificó con cebadores de la PCR
redundantes sobre las regiones conservadas de los receptores quinasa
de tirosina (Wilks, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
86:1603-1607 (1989)). Un fragmento amplificado de
aproximadamente 180 p.b., con una secuencia de ADN única
(denominado SAL-S1 o tk1; PCT/US93/00.586, ver más
arriba) se usó para examinar (Janssen et al., ver más
arriba) bibliotecas de cADN procedentes de células
CMK11-5 y DAM1, para obtener clones solapados que
codificaran la totalidad de la longitud de la forma corta del
receptor Flt4 (1298 aminoácidos). La secuencia de los clones
codificando el Flt4 ensamblados era igual a la descrita a la partir
de una línea celular de aneritroleucemia (Pajusola et al.,
Cancer Res, ver más arriba); codifica 8 diferencias de
aminoácidos respecto otras secuencias Flt4 descritas (Galland et
al., Oncogene, ver más arriba). Los clones que
codificaban la forma larga del Flt4 (1363 aminoácidos) se
construyeron sintetizando la secuencia de ADN 3' diferente, de
aproximadamente 200 p.b., en base a la secuencia publicada
(Pajusola et al., Oncogene 8, ver más arriba).
Se produjeron Flt1/IgG (Park et al., ver
más arriba), Flk1/IgG (Park et al., ver más arriba), Rse/IgG
(Godowski et al., Cell 82:355-358
(1995)), y Htk/IgG (Bennett et al., J. Biol. Chem.
269:14211-14218 (1994)) tal como se describe en
estas referencias. Para la Flt4/IgG, el ADN que codificaba el
dominio extracelular del receptor Flt4 (aminoácidos
1-775) se empalmó a la región Fc de una cadena
pesada de IgG humana en el único sitio BstEII en el plásmido
pBSSK-Fc (pBSSK-CH2CH3) (Bennett
et al., J. Biol. Chem. 266:23060-23067
(1991)). El marco de lectura abierto que codificaba la Flt4/IgG se
clonó en el vector de expresión en mamíferos pRK5 (Suva et
al., Science 237:893--896 (1987)) para rendir el plásmido
pRK5.tk1ig1.1. Este plásmido se transfectó mediante electroporación
(Janssen et al., ver más arriba) en células 293 (ATCC CR.L
1651), y después de 3-4 días, se purificó la
Flt4/IgG a partir del medio condicionado libre de suero con
agarosa-Proteína A (Calbiochem). El antisuero
contra la Flt4/IgG se generó mediante la inyección de Flt4/IgG
purificada en conejos.
Usando esta proteína de fusión para examinar
líneas celulares, en busca de VRP unida a membrana, mediante
análisis FACS, se identificó una línea celular positiva, la G61,
descrita más abajo.
La línea celular de glioma humana, G61 (Hamel
et al., J. Neurosci. Res. 34:147-157
(1993)) se cultivó en F12:
DMEM (50:50) (glucosa elevada) que contenía un 10% de suero fetal bovino, L-glutamina 2 mM, y antibióticos. Para el análisis FACS de la unión de Flt4/IgG a células G61, se incubaron 1 millón de células con proteína de fusión receptor-IgG 70 nM, en solución salina tamponada con fosfato (PBS), 5% de suero de cabra, 2% de suero de conejo, durante 60 minutos, a 4°C, y a continuación se tiñeron con 10 \mug/ml de anticuerpo de cabra anti-Fc humana conjugado con biotina-SP, y 10 \mug/ml de estreptoavidina conjugada con R-ficoeritrina (Jackson Immuno Research). La G61 causó aproximadamente un desplazamiento de 10 veces en la intensidad del pico de fluorescencia, que era específica para la Flt4/IgG en comparación con Rse/JgG, un complejo no relacionado con el receptor quinasa de tirosina (Figura 2). Los intentos para clonar la expresión de esta VRP putativa unida a membrana mediante la transfección de conjuntos de clones de cADN en células COS, seguida por examen con Flt4/IgG marcada, no rindió positivos a partir de 640 conjuntos de 1000-5000 clones cada uno.
DMEM (50:50) (glucosa elevada) que contenía un 10% de suero fetal bovino, L-glutamina 2 mM, y antibióticos. Para el análisis FACS de la unión de Flt4/IgG a células G61, se incubaron 1 millón de células con proteína de fusión receptor-IgG 70 nM, en solución salina tamponada con fosfato (PBS), 5% de suero de cabra, 2% de suero de conejo, durante 60 minutos, a 4°C, y a continuación se tiñeron con 10 \mug/ml de anticuerpo de cabra anti-Fc humana conjugado con biotina-SP, y 10 \mug/ml de estreptoavidina conjugada con R-ficoeritrina (Jackson Immuno Research). La G61 causó aproximadamente un desplazamiento de 10 veces en la intensidad del pico de fluorescencia, que era específica para la Flt4/IgG en comparación con Rse/JgG, un complejo no relacionado con el receptor quinasa de tirosina (Figura 2). Los intentos para clonar la expresión de esta VRP putativa unida a membrana mediante la transfección de conjuntos de clones de cADN en células COS, seguida por examen con Flt4/IgG marcada, no rindió positivos a partir de 640 conjuntos de 1000-5000 clones cada uno.
Se preparó una biblioteca de cADN a partir de
poliA+ARN aislado, tal como se describe en Cathala et al.,
ADN 2:329-335 (1983) y Aviv y Leder, Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 69:1408-1412 (1972),
procedente de la línea celular de glioma humano, G61 (Hamel et
al., ver más arriba). El cADN se preparó a partir de este ARN
con reactivos de GIBCO/BRL (Superscript) y se clonó en el plásmido
pRK5B (Holmes et al., Science
253:1278-1280 (1991)) digerido con XhoI y
NotI. Los clones que codificaban la VRP se aislaron
examinando la biblioteca de cADN con sondas de oligonucleótidos
sintéticas basadas en una secuencia de EST (GeneBank, locus
HSC1WF111), la cual mostraba un parecido razonable con el VEGF. La
secuencia EST del HSC1WF111 tiene 296 p.b. y es un 36% idéntica al
VEGF a los largo de 50 residuos, incluyendo una identidad de 11 de
13 residuos que empieza en el aminoácido 56 del VEGF. La secuencia
es como sigue:
Las secuencias de las sondas de oligonucleótidos
ovh 1.4 y ovh 1.5 empleadas se indican a continuación.
Estas dos sonda se marcaron con ^{32}P y se
hibridaron en 20% de formamida a 42°C, con una lavado final en NaCl
30 mM/citrato trisódico 3 mM a 55°C (Janssen, Current Protocols
in Molecular Biology, John Wiley & Sons (1995)). Se
identificaron y caracterizaron siete positivos a partir de 650.000
clones examinados. Los positivos se agrupaban en tres grupos
mediante mapado de restricción y secuenciación del ADN.
Los clones VH1.4 (pRK.vhl.4.1) y VH1.6 incluían
la región codificante completa (Figura 3A) y se secuenciaron
completamente. Diferían sólo en longitud y en la ausencia de dos T
precediendo la secuencia poli A 3' en el clon VH1.6. El VH1.2 es
colineal con el VH1.4. Los clones VR1.3, VH1.5 y VH1.7 son
idénticos, y tienen una supresión de 557 p.b. cuando se comparan con
el VH1.4 (una supresión. de los p.b. 519-1075), y el
clon VH1.1 tiene una supresión de 152 p.b. cuando se compara con el
VH1.4 (una supresión de los p.b. 924-1075). Las
secuencias de nucleótidos y de aminoácidos deducida del VH1.4 se
muestran en la Figura 1.
La secuencia contenía un marco de lectura abierto
de 419 aminoácidos, empezando con un codón ATG precedido por un
residuo purina en posición 3', tal como se esperaba para un sitio
de inicio de la traducción (Kozak, Nucl. Acids Res.
12:857-872 (1984). Aproximadamente a 250 p.b. 5'
respecto este ATG, hay dos codones ATG en pauta seguidos poco
después (4 a 10 aminoácidos) por un codón de detención. Ambos de
estos ATG tienen una pirimidina en posición 3', y no se esperaría
que funcionaran como un sitio de inicio fuerte de la traducción
(Kozak, ver más arriba). La secuencia de aminoácidos codificada que
sigue inmediatamente al inicio del marco de lectura de 419
aminoácidos es hidrofóbica, indicativa de una secuencia señal de
secreción amino-terminal (Perlman y Halvorson,
J. Mol. Biol. 167:391-409 (1983)). Ver la
Figura 3A. El sitio de corte más probable para esta secuencia sería
después del aminoácido 20, aunque no puede excluirse el corte a
continuación de los residuos 15 ó 16 (von Heijne, Nucl. Acids
Res. 14:4683-4690 (1986)). El marco de lectura
abierto está precedido por una región 5' no traducida, rica en GC,
de aproximadamente 380 p.b., y seguida por un región 3' no
traducida de aproximadamente 400 p.b.
La secuencia madura predicha de la VRP humana
contiene 399 residuos aminoácidos (M_{T} traducida = 44,8 kDa),
de los cuales 37 (9,3%) son residuos cisteína; hay tres potenciales
sitios de glicosilación unidos a N (Figura 3A). Un alineamiento de
la secuencia de aminoácidos de la VRP con las seis formas del VEGF y
PIGF muestra que es más similar al VEGF_{121} (32% idéntica) y al
PIGF_{131} (27% idéntica) (Figura 3B); las ubicaciones de 8 de
los 9 residuos cisteína se conservan. Mientras que la VRP no
contiene las regiones de aminoácidos básicos halladas en algunas
formas del VEGF y PIGF, es considerablemente mayor que el VEGF, y
contiene un mitad C-terminal de la molécula rica en
cisteínas que no se halla en el VEGF. Este dominio rico en
cisteínas tiene cuatro copias del patrón: Cys seguida por diez
residuos no-Cys, seguidos por Cys-X,
seguidos por Cys-X, y a continuación por Cys
(Figura 3B), una repetición hallada más de 50 veces en una proteína
3 anular diptran Balbiani (Paulsson et al., J. Mol.
Biol. 211:331-349 (1990)). Sin estar limitados
por teoría alguna, la VRP podría interaccionar con otros 10
proteínas unidas a membrana sobre estas células a través de los
residuos cisteína; una interacción molecular tal ha sido propuesta
para la proteína Balbiani (Paulsson et al., ver más
arriba).
Dos de los clones de cADN (VH1.1 y VH1.3)
contenían una supresión de 152 ó 557 p.b. cuando se comparaban con
el VH1.4 (Figura 3A). Ambas de estas supresiones acaban en el mismo
nucleótido, y se presume que son el resultado de un empalme
alternativo. Se esperaría que ambas supresiones codificaran la
misma proteína desplazada en su pauta 3' respecto de la supresión,
la cual termina en un codón de detención en 15 aminoácidos. La
proteína codificada por el VH1.3 no incluiría ninguna de la región
núcleo de cisteínas similar al VEGF. El VH1.1 contiene mucha de la
región que es similar al VEGF; su supresión, no obstante, no es
análogo a las diversas formas conocidas del VEGF o PIGF (Ferrara
et al., ver más arriba; Maglione et al., ver más
arriba; Hauser y Weich, ver más arriba).
La Figura 4 descubre un alineamiento del VH1.4
(arriba) con 11 secuencias de cADN de EST procedentes del GeneBank.
Se destaca que los EST 3' están en el extremo
poli-A, y que los EST cubren sólo un poco más de la
mitad de la secuencia de longitud completa del VH1.4.
Para determinar si la VRP es un ligando para el
Flt4, se transfectaron plásmidos de expresión que contenían el clon
de cAND VH1.4, así como plásmidos control (el vector de expresión
solo o con ADN de VEGF o PIGF), en células COS7, y la proteína se
marcó con ^{35}S-aminoácidos. El medio
condicionado procedente de estas células se precipitó con Flt4/IgG
y Flk1/IgG. Específicamente, el plásmido de expresión de la VRP,
pRK.vh1.4.2, se construyó suprimiendo aproximadamente 360 p.b. de
la secuencia 5' no traducida (5' respecto el sitio AgeI
(Figura 3A) del VH1.4). Este ADN y los plásmidos control que
codificaban el VEGF_{165} (Houck et al., Mol.
Endocrinol. 5:1806-1814 (1991)), el
PIGF_{152} (Park et al., ver más arriba), o el vector solo
(pRK5, Suva et al., ver más arriba), se transfectaron en
células COS7 con DEAE-dextrano (Janssen et
al., ver más arriba). Dos días después de la transfección, se
marcaron las células con un pulso en placas de 10 cm, durante 5
horas, con 5 ml de medio DMEM libre de metionina y cisteína,
suplementado con 100 \muCi/ml de
^{35}S-aminoácidos
(Pro-Mix^{TM}, marca Amersham #SJQ0079), a 37°C, y
a continuación se cazaron con DMEM durante 7 horas. El medio
condicionado marcado se concentró 10 veces mediante concentración
por rotación (Centricon-10^{TM}, marca Amicon
#4203). Cincuenta \mul del medio concentrado se incubaron con 3
\mug de receptor IgG, y 80 \mul de una papilla al 50% de
proteína A-agarosa (Calbiochem), durante la noche,
a 4°C. Los precipitados se lavaron con PBS/0,1% de Triton
X-100, se hirvieron en tampón de muestras SDS, y se
electroforaron en geles de poliacrilamida con 12% de SDS (Novex
#EC60052). Los geles se trataron con potenciador autoradiográfico
(duPont #NEF974) y se expusieron durante la noche a -70°C.
Se precipitaron dos bandas específicas de 53 kDa
y 33 kDa procedentes de la transfección con VRP con la Flt4/IgG;
estas bandas estaban ausentes en el vector de transfección. Se halló
poca o ninguna precipitación específica de estas dos bandas con
Flt1/IgG o Flk1/IgG. A veces se detectó cierta precipitación de VRP
con Flk1/IgG, lo que sugiere que la VRP podría tener una
interacción de baja afinidad con el Flk1. La transfección con un
plásmido expresando el VEGF mostró la esperada precipitación de una
banda intensa, de aproximadamente 22 kDa, con Flt1/IgG y Flk1/IgG
(DeVries et al., ver más arriba; Quinn et al., ver
más arriba; Millauer et al., ver más arriba; Terman et
al., Biochem. Biophys. Res. Commun., ver más arriba),
pero no hubo precipitación con Flt4/IgG. Experimentos similares con
PIGF marcado no mostraron precipitación por Flt4/IgG, aunque sí
rindieron la esperada precipitación con Flt1/IgG pero no con
Flk1/IgG (Park et al., ver más arriba). Estos datos indican
que la VRP es une al dominio extracelular del receptor Flt4, pero
que no interacciona (o lo hace mucho más débilmente) con los
receptores Flt1 y Flk1 del VEGF. También confirma la ausencia de
interacción del VEGF con el Flt4 (Pajusola et al.,
Oncogene 9, ver más arriba), e indica que el PIGF no es
tampoco un ligando para este receptor.
Para ensayar la fosforilación de tirosina del
Flt4 (también descrito en PCT/US93/00.568, ver más arriba), se
expresó Flt4 en células 293 y la fosforilación del Ftll4 se
monitorizó mediante inmunotransferencia de fosfotirosina.
Específicamente, el ADN codificando la forma larga del Flt4 humano
se clonó en el vector de expresión en mamíferos pRK5 (Suva et
al., ver más arriba) para dar lugar al plásmido
pRK.tk1-3.1. Este plásmido se cotransfectó, con un
plásmido que contenía una unidad de transcripción de
fosfotransferasa de miroglicósido (neo) en células 293, mediante
precipitación con fosfato cálcico (Janssen et al., ver más
arriba), y se seleccionaron las líneas transfectadas establemente
mediante cultivo sobre G418 (Gibco). Una línea celular clonal que
expresaba el Flt4 (clon 31), según. se determinó mediante análisis
FACS con antisuero contra la Flt4/IgG, y células 293 no
transfectadas, se usaron en los ensayos de fosforilación de
tirosina del Flt4. Un millón de células en 100 \mul de PBS/0,1%
albúmina de suero bovino (BSA) se mezclaron con 100 \mul de
muestra, y es incubaron a 37°C durante 15 minutos. A continuación
se recolectaron las células mediante centrifugación, y se lisaron
en 250 \mul de NaCl 0,15 M, 10% de glicerol, 1% de Triton
X-100, HEPES 50 mM pH 7,3, 4 \mug/ml de
PMSF, 0,02 u/ml de aprotinina (Sigma A6279), y ortovanadato de sodio
20 mM. El Flt4 se inmunoprecipitó mediante la adición de 8 \mul
de antisuero de conejo contra la Flt4/IgG, y 30 \mul de proteína
A-agarosa. Los precipitados lavados se hirvieron en
tampón de muestra SDS, se electroforaron en geles de poliacrilamida
(Novex), se transfirieron a nitrocelulosa (Janssen et al.,
ver más arriba), y se sondearon con un anticuerpo monoclonal
anti-fosfotirosina (Upstate Biotechnology) y un
sistema de detección con fosfatasa alcalina (Promega).
Las muestras conteniendo VRP y VEGF se prepararon
mediante la electroporación de plásmidos de expresión que
codificaban el VH1.4 (pRK.vh1.4.2) o VEGF (Houck et al., ver
más arriba), en células 293, y concentrando 20 veces
(Centricon-10, Amicon) el medio condicionado, libre
de precipitados, de 3 días. En los experimentos de competición
receptor-IgG, los medios condicionados concentrados
se preincubaron durante 1 hora, a 4°C, con
receptor-IgG.
Sin estimulación, las células 293 que expresaban
o no el Flt4 mostraron poca o ninguna fosforilación de tirosina del
Flt4. La estimulación de las células expresando el Flt4 mediante
antisuero contra la Flt4/IgG mostró la fosforilación de tirosina de
dos bandas de 180 y 120 kDa. No se observó incremento por encima de
la fosforilación basal con suero preinmune, y no se hallaron bandas
con la estimulación con Flt4/IgG de células que no expresaban. Se
han descrito dos bandas de Flt4 con aproximadamente este tamaño que
son expresadas por células DAM1 y HEL (Pajusola et al.,
Oncogene 8, ver más arriba). Además, el análisis en gel con
SDS de la Flt4/IgG purificada muestra que está compuesta por
péptidos de 150, 80 y 70 kDa. La secuencia
N-terminal de los péptidos de Flt4/IgG muestra que
las bandas de 150 y 70 kDa tienen la secuencia de aminoácidos
YSMTPPTL (SEC. N° ID.: 9) (que corresponde a la secuencia del Flt4
que empieza en el residuo 25), y que la banda de 80 kDa tiene la
secuencia SLRRRQQQD (SEC. N° ID.: 10) (que corresponde a la
secuencia del Flt4 que empieza en el residuo 473). Por tanto,
ambos, la Flt4/IgG y el Flt4 de longitud completa parecen estar
parcialmente cortados en el dominio extracelular, y las bandas
fosforiladas en tirosina de 180 y 120 kDa observadas en los ensayos
de fosforilación del Flt4 corresponderían a los péptidos de 150 y
80 kDa de la Flt4/IgG. La adición de antisuero policlonal a las
células expresando el Flt4 mostró la fosforilación de tirosina de
dos bandas de Flt4 de 180 y 120 kDa; no se observaron bandas en
células que no expresaban. Estos datos muestran que los anticuerpos
policlonales generados contra el dominio extracelular del receptor
Flt4 son capaces de activar la fosforilación de tirosinas del
Flt4.
Para determinar si la VRP podría activar la
fosforilación de tirosinas del Flt4, se ensayó medio condicionado
procedente de células de mamífero transfectadas con el plásmido de
expresión de la VRP. Este medio condicionado estimuló la
fosforilación de tirosinas de las mismas bandas de 180 y 120 kDa
halladas con los anticuerpos policlonales agonistas, demostrando
que la VRP es capaz de estimular la fosforilación de, así como
unirse a, el Flt4. El medio condicionado procedente de células
expresando el VEGF no consiguió activar la fosforilación de
tirosinas del Flt4.
Para confirmar la especificidad de la unión de la
VRP a los receptores de la familia VEGF, se ensayaron la Flt4/IgG,
Flt1/IgG, Flk1/IgG, y Htk/IgG por su capacidad para competir con la
fosforilación del Flt4 estimulada por la VRP. Tal como se esperaba,
si la VRP es un ligando para el Flt4, la Flt4/IgG impidió la
fosforilación estimulada por VRP, mientras que la Flt1/IgG,
Flk1/IgG, y Htk/IgG, una proteína de fusión de un receptor quinasa
de tirosina no relacionado, tenían poco o ningún efecto. Estos datos
muestran que la VRP es capaz de inducir la fosforilación de
tirosinas del Flt4.
El marco de lectura que codifica la secuencia
N-terminal señalizadora de secreción, y
aproximadamente 30 aminoácidos procedentes de la glicoproteína D del
herpes (Lasky y Dowbenko, DNA 3:23-29
(1984); Pennica et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
92:1142-1146 (1995)) se fusionaron con una secuencia
engarce corta a la secuencia madura putativa de la VRP. Se espera
que esta construcción, a continuación de su secreción a partir de
células de mamífero, tenga la secuencia N-terminal
de la glicoproteína D: KYALADASLKMADPNRFRGKDLPVLDQLLEGGAAHYALLP
(SEC. N° ID.: 11) seguida por la secuencia de la VRP madura
GPREAPAAAAAFE (SEC. N° ID.: 12). El ADN codificando esta proteína de
fusión se clonó en el vector pRK5 para rendir el plásmido pRK. vh
1.4.5. Este plásmido se transfectó en células 293 mediante
electroporación (Janssen et al., ver más arriba), y la VRP
se purificó a partir de medio condicionado libre de suero de
3-4 días mediante cromatografía de afinidad con
anticuerpo monoclonal (5B6), y se cuantificó mediante ensayó
colorimétrico (Bio-Rad). Este anticuerpo es
específico para la secuencia de la glicoproteína D fusionada al
extremo N-terminal de la VRP.
La Flt4/IgG se yodó hasta una actividad
específica de 1000-1500 Ci/mmol. con cuentas
yodadas de la marca Iodobeads^{TM} (Pierce). La unión se realizó
con ^{125}I-Flt4/IgG de \sim20.000 cpm, y 12 ng
de proteína de fusión VH1.4 gD en PBS, 0,5% de BSA, 0,02% del
tensioactivo Tween-20^{TM}, 1 \mug/ml de
heparina (tampón de unión) conteniendo 20 \mul de una papilla al
50% de cuentas de vidrio conjugadas con \sim30 \mug de
anticuerpo monoclonal anti-gD (5B6), en un volumen
final de 100 \mul, durante 4-6 horas, a 22°C. Las
cuentas se recogieron mediante filtración (Millipore
Multiscreen-HV), se lavaron cinco veces con 200
\mul de tampón de unión, y se contaron. Para uniones a
concentraciones mayores de Flt4/IgG (Figura 5B), el tampón de unión
fue DMEM (bajo en glucosa):F12 (50:50), HEPES sódico 20 mM,
pH 7,2, 10% de suero fetal bovino, 0,2% de gelatina, y 1
\mug/ml de heparina.
La VRP purificada se unión específicamente a la
^{125}I-Flt4/IgG, y la unión no fue disputada por
la Flt1/IgG o Flk1/IgG (Figura 5A). La competición de unión con
concentraciones crecientes de Flt4/IgG sin marcar (Figura 5B) dio
una EC_{50} para esta interacción de \sim0,7 nM, sugiriendo que
la unión de la VRP al Flt4 es de elevada afinidad, tal como se
esperaría si la VRP es un ligando biológicamente relevante del
Flt4.
Las transferencias conteniendo ARN humano
poli(A)^{+} procedían de Clontech. Para la línea
celular de glioma G61, se electroforaron 5 \mug de ARN
poli(A)^{+} y poli(A)- en un gel de agarosa
al 1% /formaldehído 2,2 M, y se transfirieron a nitrocelulosa
(Janssen et al., ver más arriba). Las transferencias se
hibridaron con las sondas ovhl.4 y ovhl.5 marcadas con ^{32}P, y
se lavaron con NaCl 30 mM/citrato trisódico 3 mM, a 55°C.
La línea celular de glioma G61 usada en la
clonación de la VRP expresa una banda principal de ARN de VRP de
aproximadamente 2,4 kb. También podría estar presente una banda
menor de aproximadamente 2,2 kb. Una banda de 2,4 kb se expresó en
tejidos humanos adultos procedentes del corazón, placenta, ovarios,
e intestino delgado; se halló una banda más débil en pulmón,
músculo esquelético, bazo, próstata, testículos, y colon. La
expresión de un mARN de 2,4 kb también se halló en pulmón y riñón
fetal.
Para ensayar si la VRP tiene una actividad
mitogénica similar a la hallada para el VEGF, se determinó el
crecimiento de células endoteliales de pulmón humano a
concentraciones crecientes de VRP o VEGF (Figura 6).
Específicamente, las células endoteliales de pulmón humano
(HMVEC-L, Clonetics, San Diego, CA) se mantuvieron
en el medio de cultivo recomendado (EGM-MV con un 5%
de suero fetal bovino). Para el ensayo de mitogénesis, se sembraron
células con un número bajo de pasajes (< 6) a 6500
células/pocillo en placas de 48 pocillos (Costar), y se mantuvieron
durante la noche en el medio de cultivo recomendado. Se retiró el
medio, y se mantuvieron las células en el medio de cultivo (2% de
suero fetal bovino) sin extracto de cerebro bovino, y suplementadas
con VEGF o VRP. Transcurridos cuatro días, se retiraron las células
con tripsina y se contaron con un contador Coulter (Hialeah,
FL).
La VRP promovió el crecimiento de estas células
endoteliales (ver Figura 6), y por tanto comparte esta actividad
mitogénica con el VEGF. Esto contrasta con el 15 PIGF, el cual se ha
descrito carece de tal actividad mitogénica
(< = 35 nM) (Park et al., ver más arriba). Aunque es un agente mitogénico efectivo, la VRP fue aproximadamente 100 veces menos potente que el VEGF en este ensayo.
(< = 35 nM) (Park et al., ver más arriba). Aunque es un agente mitogénico efectivo, la VRP fue aproximadamente 100 veces menos potente que el VEGF en este ensayo.
En conclusión, se ha identificado una nueva
proteína secretada, la VRP, que es un ligando del Flt4, u que
estimula la fosforilación de tirosina del receptor con quinasa de
tirosina, Flt4. La VRP es un tercer miembro de la familia de
proteínas del VEGF, y tiene aproximadamente un 30% de identidad en
aminoácidos con el VEGF y PIGF. Además del dominio similar al VEGF,
la VRP contiene un dominio C-terminal de \sim180
aminoácidos, rico en cisteínas, que no se halla en otros miembros
de la familia VEGF. La VRP no consigue interaccionar
apreciablemente con los 30 receptores Flt1 y Flk1 del VEGF.
El plásmido siguiente ha sido depositado en el
35 Americal Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, MD, EE.UU. (ATCC):
| Plásmido | N° de depósito de la ATCC | Fecha de depósito |
| pRK.vh1.4.1 | 97249 | 6 de septiembre de 1995 |
Este depósito se realizó bajo las provisiones del
Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento Internacional del
Depósito de Microorganismos con el Propósito de Procedimiento de
Patente y las Regulaciones bajo el mismo (Tratado de Budapest).
Esto asegura el mantenimiento de un cultivo viable del depósito
durante 30 años a partir de la fecha de depósito. E = L depósito
será hecho disponible por parte de la ATCC rajo los términos del
Tratado de Budapest, y sometido a un acuerdo entre Genentech, Inc.
y la ATCC, el cual asegura una disponibilidad permanente y no
restringida de la progenie del cultivo del depósito al público, a
partir de la concesión de la pertinente patente estadounidense, o a
partir de declarar abierta al público cualquier patente
estadounidense o extranjera, cualquiera que sea la primera, y
asegura la disponibilidad de la progenie a alguien, determinado por
el Comisionado de los Estados Unidos de Patentes y Marcas
Registradas, que esté cualificado para ello de acuerdo con 35 USC
#122, y la reglas del Comisionado que se derivan de la misma
(incluyendo 37 CFR #1,14, con particular referencia a 886 OG
638).
El asignatario de la presente solicitud ha
aceptado que, si un cultivo del plásmido en depósito muriese, o se
perdiera, o destruyera, al cultivarlo en condiciones apropiadas, el
plásmido será rápidamente remplazado, a partir de la notificación,
con otro del mismo plásmido. La disponibilidad del plásmido
depositado no debe entenderse como una licencia para practicar la
invención en contravención de los derechos garantizados bajo la
autoridad de cualquier gobierno en acuerdo con sus leyes sobre
patentes.
La especificación escrita anterior se considera
que es suficiente para permitir a un especialista en la técnica
practicar la invención. La presente invención no está limitada en
su ámbito por la construcción depositada, puesto que la realización
depositada se pretende como una única ilustración de ciertos
aspectos de la invención, y cualesquiera construcciones que son
funcionalmente equivalentes se hallan dentro del ámbito de esta
invención. El depósito de material en ésta no constituye una
admisión de que la descripción escrita contenida en ésta es
inadecuada para permitir la práctica de cualquier aspecto de la
invención, incluyendo el mejor modo de la misma, no debe
considerarse como limitante del ámbito de las reivindicaciones a
las ilustraciones específicas que representa. Más aún, varias
modificaciones de la invención, además de aquéllas mostradas y
descritas en ésta, serán evidentes a los especialista en la técnica
a partir de la descripción precedente, y cae dentro del ámbito de
las reivindicaciones anexas.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Genentech, Inc.
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Proteína relacionada con el VEGF.
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 12
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Genentech, Inc.
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- DIRECCIÓN: 460 Point San Bruno Blvd
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: South San Francisco
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: California
\vskip0.333000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Estados Unidos de América
\vskip0.333000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 94080
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete de 3,5 pulgadas, 1,44 Mb
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible con PC de IBM
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: WinPatin (Genentech)
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- DATOS ACTUALES DE LA SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO:
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN SOBRE AGENTE/REPRESENTANTE:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Lee, Wendy M.
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: P-40.378
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA: P0963PCT
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 415/225-1994
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 415/952-9881
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TELEX: 910/371-7168
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2031 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 2:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2031 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 419 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 147 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 149 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 6:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 299 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 7:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 50 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipCTGGTGTTCA TGCACTGCAG CCCCTCACTA TTGCAGCAAC
\hfill
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipCCCCACATCT
\hfill50
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 8:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 50 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGCATCTGCAG ATGTGATTAT TCCACATGTA ATTGGTGGGG
\hfill
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipCAGGTCTTGT
\hfill50
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 9:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 8 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Ser Met Thr Pro Pro Thr Leu}
\vskip-4.8mm\hskip45.1mm 8
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Leu Arg Arg Arg Gln Gln Gln Asp}
\vskip-4.8mm\hskip53.7mm 9
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 11:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC. N° ID: 12:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 13 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. N° ID: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Pro Arg Glu Ala Pro Ala Ala Ala
Ala}
\sac{Ala Phe Glu}
\vskip-4.8mm\hskip13.1mm 13
Claims (23)
1. Proteína relacionada con el VEGF (VRP) humana,
activa, aislada biológicamente, la cual contiene al menos 265
aminoácidos de la figura 1, y la cual se une al receptor de
tirosina quinasa Flt4.
2. Proteína de la reivindicación 1, la cual tiene
una longitud de 265 a aproximadamente 450 aminoácidos,
preferiblemente aproximadamente 300-450 aminoácidos,
más preferiblemente aproximadamente 350-450
aminoácidos, incluso más preferiblemente aproximadamente
399-419 aminoácidos.
3. Proteína de la reivindicación 1 que comprende
una secuencia de aminoácidos que tiene (a) al menos los residuos
+1 a 29, inclusive, de la figura 1, (b) al menos los residuos +1 a
137, inclusive, de la figura 1, (c) al menos los residuos -20 a 29,
inclusive, de la figura 1, (d) al menos los residuos -20 a 137,
inclusive, de la figura 1.
4. Proteína relacionada con el VEGF (VRP) humana,
activa, aislada biológicamente, que comprende una secuencia de
aminoácidos mostrada como los residuos -20 a 399, inclusive, o los
residuos 1 a 399, inclusive, de la figura 1.
5. Composición que comprende la proteína de una
de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, y un vehículo
farmacéuticamente aceptable.
6. Composición farmacéutica útil para la
promoción del crecimiento de células endoteliales vasculares, que
comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de la proteína de
una de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 en un vehículo
farmacéuticamente aceptable.
7. Composición de la reivindicación 6 que además
comprende un factor de crecimiento celular distinto de dicha
proteína.
8. Utilización de la proteína de una cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 4, o de la composición de la
reivindicación 5 o reivindicación 6, en la fabricación de un
medicamento para el tratamiento de un trauma que afecta el
endotelio vascular, o para el tratamiento de un estado disfuncional
caracterizado por la ausencia de activación o ausencia de
inhibición de un receptor para la VRP en un mamífero.
9. Utilización de la reivindicación 8, en donde
el medicamento además comprende un factor de crecimiento celular
distinto de dicha proteína.
10. Utilización de la reivindicación 8, en donde
el receptor de la VRP es un receptor Flt4.
11. Procedimiento in vitro para estimular
la fosforilación de un dominio de tirosina quinasa de un receptor
Flt4, que comprende poner en contacto un dominio extracelular del
receptor Flt4 con la proteína de una de 30 cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4.
12. Polipéptido quimérico que comprende la
proteína de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 fusionado
con una secuencia de polipéptido etiqueta.
13. Anticuerpo monoclonal que se une
específicamente la proteína de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4.
14. Anticuerpo monoclonal de la reivindicación 13
que se une específicamente a los aminoácidos 1 a 137 de la figura
1.
15. Anticuerpo monoclonal de la reivindicación 13
que se une específicamente a los aminoácidos -20 a 137 de la
figura 1.
16. Composición que comprende el anticuerpo de
una de las reivindicaciones 13 a 15, y un vehículo farmacéuticamente
aceptable.
17. Péptido consistente en una secuencia de
aminoácidos mostrada como los residuos -20 a -1, inclusive, de la
figura 1.
18. Molécula de ácido nucleico aislado que
codifica la proteína de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
4.
19. Molécula de ácido nucleico de la
reivindicación 18 que además comprende un promotor unido
operativamente a la molécula de ácido nucleico.
20. Vector que comprende la molécula de ácido
nucleico de la reivindicación 19.
21. Vector de expresión que comprende la molécula
de ácido nucleico de la reivindicación 18 unida operativamente a
secuencias de control reconocidas por un célula hospedadora
transformada con el vector.
22. Célula hospedadora que comprende la molécula
de ácido nucleico de la reivindicación 18.
23. Procedimiento para producir la VRP que
comprende, cultivar la célula hospedadora de la reivindicación 22, y
recuperar la VRP a partir del cultivo de la célula
hospedadora.
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