ES2243932T3 - Secuencias de nucleotidos mediadores de la fertilidad masculina y procedimientos de utilizacion correspondientes. - Google Patents

Secuencias de nucleotidos mediadores de la fertilidad masculina y procedimientos de utilizacion correspondientes.

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ES2243932T3
ES2243932T3 ES95901716T ES95901716T ES2243932T3 ES 2243932 T3 ES2243932 T3 ES 2243932T3 ES 95901716 T ES95901716 T ES 95901716T ES 95901716 T ES95901716 T ES 95901716T ES 2243932 T3 ES2243932 T3 ES 2243932T3
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John Howard
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Abstract

SE DESCRIBEN SECUENCIAS DE NUCLEOTIDO QUE MEDIAN LA FERTILIDAD MASCULINA EN PLANTAS, CON MOLECULA DE ADN Y SECUENCIAS DE AMINOACIDOS ESTABLECIDAS. TAMBIEN SE DESCRIBE EL USO DE LAS SECUENCIAS DE NUCLEOTIDO PARA MEDIAR LA FERTILIDAD EN PLANTAS. EN UN METODO, SE UTILIZA UN PROMOTOR INDUCIBLE PARA REGULAR LA EXPRESION DE LA MOLECULA DE ADN. LAS SECUENCIAS DE CONTROL SON MODIFICADAS POR LO QUE ESTAN NORMALMENTE "FUERA DE SITIO" Y COMO RESULTADO LAS PLANTAS SON ESTERILES MASCULINAS. CUANDO SE DESEA REPRODUCIR LAS PLANTAS ESTERILES MASCULINAS, LA FERTILIDAD MASCULINA SE RESTAURA TRATANDO A LAS PLANTAS CON UN PRODUCTO QUIMICO NO FITOTOXICO QUE INDUCE LA EXPRESION DEL GEN CRITICO.

Description

Secuencias de nucleótidos mediadores de la fertilidad masculina y procedimientos de utilización correspondientes.
Antecedentes de la invención
El objetivo de la mejora genética de plantas es combinar en una única variedad/híbrido varias características deseables de las líneas parentales. Para los cultivo se campo, estas características pueden incluir resistencia a enfermedades e insectos, tolerancia al calor y a la sequía, reducción del tiempo necesario para que madure el cultivo, mayor rendimiento y una mejor calidad agronómica. Con la recolección mecánica de muchos cultivos, es importante la uniformidad de las características de la planta tales como la germinación y la determinación de la cosecha en pie, la velocidad de crecimiento, la madurez y el tamaño de los frutos.
Los cultivos de campo son mejorados mediante técnicas que aprovechan el método de polinización de la planta. Una planta tiene autopolinización si el polen de una flor es transferido a la misma flor o a otra flor de la misma planta. Una planta tiene polinización cruzada si el polen procede de una flor de una planta diferente.
En el caso de Brassica, la planta es normalmente autoestéril y sólo puede ser polinizada de manera cruzada. En las especies con autopolinización, tales como la soja y el algodón, las plantas masculinas y femeninas son anatómicamente yuxtapuestas. Durante la polinización natural, los órganos reproductores masculinos de una flor dada polinizan los órganos reproductores femeninos de la misma flor.
Las plantas de maíz (Zea mays L.) presentan una única situación en cuanto a que pueden ser mejoradas genéticamente mediante técnicas de autopolinización y polinización cruzada. El maíz tiene flores masculinas, localizadas en la panoja, y flores femeninas, localizadas en la mazorca, en la misma planta. Puede autopolinizarse o tener polinización cruzada. La polinización natural tiene lugar en el maíz cuando el viento lleva el polen desde las panojas hasta las sedas que sobresalen de la parte superior de las mazorcas incipientes.
Un método fiable para controlar la fertilidad masculina en las plantas ofrecería la oportunidad de una genética mejorada de las plantas. Esto es especialmente cierto para el desarrollo de híbridos de maíz, que se basa en cierto tipo de sistema de esterilidad masculina.
La producción de híbridos de maíz requiere el desarrollo de líneas endógamas homozigotas, el cruce de estas líneas y la evaluación de los cruces. El método genealógico de mejora genética y la selección recurrente son dos de los métodos de mejora genética utilizados para desarrollar líneas endógamas a partir de poblaciones. Los programas de mejora genética combinan características deseables de dos o más líneas endógamas o de varias fuentes de base amplia en grupos de mejora a partir de los cuales se desarrollan nuevas líneas endógamas mediante autofecundación y selección de los fenotipos deseados. Una variedad de maíz híbrido es el cruce de dos de tales líneas endógamas, cada una de las cuales puede tener una o más características deseables de las que carece la otra línea o que complementan a la otra línea. Las nuevas endógamas son cruzadas con otras líneas endógamas y los híbridos de estos cruces son evaluados para determinar cuáles tienen potencial comercial. La progenie híbrida de la primera generación es denominada F_{1}. En el desarrollo de híbridos se buscan solamente las plantas híbridas F_{1}. El híbrido F_{1} es más vigoroso que sus padres endógamos. Este vigor del híbrido, o heterosis, puede ser manifestado de muchas formas, incluyendo un crecimiento vegetativo incrementado y un rendimiento incrementado.
La semilla de maíz híbrido se produce típicamente mediante un sistema de esterilidad masculina que incorpora el despanojamiento manual. Hileras alternas de dos variedades endógamas de maíz son plantadas en un campo y las panojas portadoras de polen son extraídas de una de las endógamas (femenina). Siempre que haya aislamiento suficiente de fuentes de polen de maíz foráneo, las mazorcas de la endógama despanojada serán fertilizadas únicamente con polen de la otra endógama (masculina), y la semilla resultante será por tanto híbrida y formará plantas híbridas. Desgraciadamente, el proceso de despanojamiento manual no es totalmente fiable. Ocasionalmente, una planta femenina será tumbada por una tormenta y escapará del despanojamiento. La variación natural en el desarrollo de las plantas puede tener también como resultado la formación de panojas en las plantas una vez que se ha completado el despanojamiento manual. O, un despanojador no extraerá completamente la panoja de la planta. En cualquiera de los casos, la planta femenina esparcirá polen con éxito y algunas plantas femeninas serán autopolinizadas. Esto tendrá como resultado semillas de la planta endógama femenina recogidas junto con las semillas híbridas que se producen normalmente.
Alternativamente, la planta endógama femenina puede ser despanojada mecánicamente. El despanojamiento mecánico es aproximadamente tan fiable como el despanojamiento manual, pero es más rápido y menos costoso. Sin embargo, la mayoría de las máquinas de despanojación producen más daño a las plantas que la despanojación manual. Por tanto, actualmente ninguna forma de despanojación es totalmente satisfactoria y continúa existiendo la necesidad de alternativas que reduzcan adicionalmente los costes de producción y eliminen la autopolinización en la producción de semillas híbridas.
El laborioso proceso de despanojamiento puede ser evitado mediante la utilización de plantas endógamas estériles masculinas citoplásmicas (CMS). Las plantas de una endógama CMS son estériles masculinas como resultado de factores resultantes del genoma citoplásmico, en lugar del genoma nuclear. De este modo, esta característica es heredada exclusivamente a través del parental femenino en las plantas de maíz, ya que solamente la hembra proporciona el citoplasma a la semilla fertilizada. Las plantas CMS son fertilizadas con polen de otra planta endógama que no sea estéril masculina. El polen procedente de la segunda planta endógama puede aportar o no genes que conviertan a las plantas híbridas en fértiles masculinas. Normalmente la semilla procedente del maíz normal despanojado y la semilla producida por la CMS del mismo híbrido deben ser mezcladas para asegurar que estén disponibles las cargas de polen adecuadas para la fertilización cuando se cultiven las plantas híbridas.
Puede haber otros inconvenientes con las CMS. Uno de ellos es una asociación observada históricamente de una variante específica de CMS con susceptibilidad a ciertas enfermedades de los cultivos. Este problema ha llevado al abandono virtual de la utilización de esa variante CMS en la producción de maíz híbrido.
Otra forma de esterilidad, la esterilidad masculina génica, está descrita en las Patentes de EE.UU. 4.654.465 y 4.727.219 para Brar y col. Sin embargo, esta forma de esterilidad masculina genética requiere el mantenimiento de múltiples genes mutantes en posiciones separadas dentro del genoma y requiere un complejo sistema de marcadores para seguir la pista a los genes y utilizar convenientemente el sistema. Patterson describió también un sistema génico de translocaciones cromosómicas que es eficaz pero complicado. Patentes de EE.UU. N^{os} 3.861.709 y 3.710.511.
Se han llevado a cabo otros muchos intentos para mejorar estas desventajas. Por ejemplo, Fabijanski y col. desarrollaron varios métodos para producir esterilidad masculina en plantas (ver EPO 89/3010153.8, nº de publicación 329.308 y solicitud PCT PCT/CA90/00037 publicada como WO 90/08828). Un método incluye el suministro a la planta de un gen que codifica una sustancia citotóxica asociado con un promotor específico de tejido masculino. Otro implica un sistema antisentido en el que se identifica un gen crítico para la fertilidad y se inserta en la planta un antisentido respecto al gen. Maniari y col. muestran también varias secuencias génicas que codifican citotoxinas, junto con promotores específicos de tejido masculino y mencionan un sistema antisentido. Ver EP 89/401.194. Otros sistemas más utilizan genes "represores" que inhiben la expresión de otro gen crítico para la esterilidad masculina. PCT/GB90/00102, publicada como WO 90/08829.
Según se ha indicado, un aspecto esencial de mucho del trabajo en marcha con sistemas de esterilidad masculina es la identificación de genes que afecten a la fertilidad masculina.
Tal gen puede ser utilizado en una variedad de sistemas para controlar la fertilidad masculina. Previamente, se ha identificado un gen de esterilidad masculina en Arabidopsis thaliana y se utilizado para producir una planta estéril masculina. Aarts y col., "Transposon Tagging of a Male Sterility Gene in Arabidopsis", Nature, 363:715-717 (24 de Junio, 1993). En la presente invención los inventores proporcionan una nueva molécula de ADN y la secuencia de aminoácidos que codifica la misma, la cual es crítica para la fertilidad masculina en plantas.
Además, los inventores presentan una única variación del método para controlar la esterilidad masculina mediante la utilización de la molécula de ADN para hacer que una planta sea estéril masculina después de la transformación, con fertilidad, no esterilidad, inducida.
Por tanto, un objeto de la invención es proporcionar una secuencia de ácido nucleico, cuya expresión es crítica para la fertilidad masculina en plantas.
Otro objeto de la invención es proporcionar una molécula de ADN que codifica una secuencia de aminoácidos, cuya expresión es crítica para la fertilidad masculina en plantas.
Un objeto más de la invención es proporcionar un método de utilización de tales moléculas de ADN para mediar la fertilidad masculina en plantas.
Otro objeto todavía más es proporcionar un método para mediar la fertilidad masculina en plantas mediante la regulación de la expresión de la molécula de ADN que existe de manera natural en la planta.
Otro objeto más es proporcionar un método para mediar la fertilidad masculina en plantas mediante el suministro de la molécula de ADN a una planta de tal manera que pueda controlarse la expresión de la molécula de ADN.
Otro objeto es proporcionar plantas en las que la fertilidad masculina de las plantas esté mediada por la molécula de ADN.
Un objeto adicional es la utilización de plantas con fertilidad masculina mediada por las moléculas de ADN en un sistema de mejora genética de plantas.
Objetos adicionales de la invención serán obvios en la descripción y reivindicaciones que siguen.
Resumen de la invención
Esta invención se refiere a secuencias de ácido nucleico y, específicamente, a moléculas de ADN y a las secuencias de aminoácidos codificadas por las moléculas de ADN, que son críticas para la fertilidad masculina. Se refiere también a la utilización de tales moléculas de ADN para mediar la fertilidad en plantas. Uno de tales métodos es convertir a las plantas en estériles masculinas de manera controlable mediante la utilización de un promotor inducible para regular la expresión de la molécula de ADN, de tal manera que el gen esté normalmente "inactivo" y la planta sea por tanto estéril. Cuando el promotor es inducido, la planta se vuelve fértil.
Breve descripción de las figuras
La Fig. 1 es un mapa de restricción del transposón Ac.
La Fig. 2 es un gel de un análisis de Transferencia Southern de ADN digerido con PvuII procedente de una familia de Ac que segregaba por esterilidad e hibridado con un fragmento interno de HindIII de 1,6 kb procedente de Ac.
La Fig. 3 es una representación esquemática de una reacción en cadena de la polimerasa inversa.
La Fig. 4 es una representación gráfica del aislado de ADN de 1,4 kb y sus secuencias intermedias.
La Fig. 5 es un gel de un análisis de Transferencia Southern de ADN digerido con PvuII procedente de una familia de Ac que segregaba por esterilidad e hibridado con el aislado de ADN de 1,4 kb.
La Fig. 6 es un gel de un análisis de Transferencia Northern hibridado con el gen de la fertilidad masculina MS45.
La Fig. 7 muestra la secuencia de nucleótidos y de aminoácidos del ADN de la planta convertida de nuevo en fértil después de la transposición de Ac.
La Fig. 8 es un mapa RFLP del cromosoma 9 que muestra el gen de la fertilidad masculina MS45.
Descripción de la invención
A no ser que se definan de otro modo, todos los términos técnicos y científicos utilizados en la presente tienen el mismo significado que el conocido comúnmente por una persona con experiencia habitual en la técnica a la que pertenece esta invención. A no ser que se mencione de otro modo, las técnicas empleadas o contempladas en la presente son metodologías estándar bien conocidas por las personas con experiencia habitual en la técnica. Los materiales, métodos y ejemplos son solamente ilustrativos y no limitantes.
Moléculas de ADN de la fertilidad masculina
La esterilidad masculina genética es el resultado de una mutación en uno de los genes responsables de una etapa específica de la microesporogénesis, aplicado el término al proceso completo de formación del polen. Estos genes pueden referidos colectivamente como genes de la fertilidad masculina. Hay muchas etapas de la ruta total en las que una mutación puede lugar a esterilidad masculina. Esto parece apoyado acertadamente por la frecuencia de esterilidad masculina genética en el maíz. Se han descubierto nuevos alelos de mutantes de esterilidad masculina en materiales que varían desde plantas endógamas de elite hasta poblaciones inadaptadas. Hasta la fecha, la investigación sobre la esterilidad masculina genética publicada ha sido en su mayoría descriptiva. Se han hecho algunos esfuerzos para determinar el mecanismo de la esterilidad en el maíz, pero pocos han sido satisfactorios. Esto no debería ser sorprendente dado el número de genes que han sido identificados como responsables de la esterilidad masculina. Es poco probable que un mecanismo sea aplicable a todas las mutaciones.
La invención tiene que ver con un gen fértil masculino de una planta. Se han descrito extensamente ADNcs específicos para el desarrollo del polen y para el desarrollo de la panoja. Hasta la fecha, ninguno de ellos ha dado lugar al clonaje de un gen que pueda ser referido como impactante para el desarrollo del polen.
Lo siguiente se presenta a manera de ilustración y no tiene la intención de limitar el ámbito de la invención.
Marcaje
El Ac (Activador) es un elemento transponible bien conocido caracterizado por primera vez por Barbara McClintock en 1954 (McClintock, B., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 21:197-216 (1956); McClintock, B., Carnegie Inst. Wash. Yrbook, 53:254-260 (1954); ver también Federoff, Patente de EE.UU. Nº 4.732.856 publicada el 22 de Marzo de 1988 y Dooner, Patente de EE.UU. Nº 5.013.658 publicada el 8 de Mayo de 1991). El Ac fue utilizado para clonar esta molécula de ADN. Un mapa de restricción de Ac utilizado en la presente está representado en la Figura 1. Los expertos en la técnica están familiarizados con los sitios de restricción de Ac. En resumen, el transposón Ac iba desde el locus P-vv en el cromosoma 1 al cromosoma 9. El único gen de esterilidad masculina actualmente descrito en el cromosoma 9 es ms2, que no ha sido nunca clonado ni secuenciado. Ver Albertsen, M. y Phillips, R.L., "Developmental cytology of 13 genetic male sterile loci in maize", Canadian Jnl. of Genetics and Cytology 23:195-208 (Enero de 1981). El único gen de fertilidad clonado es el gen de Arabidopsis descrito. Aarts y col., supra. El análisis de la progenie del cruce ha confirmado que los genes no son alélicos.
Materiales Vegetales
Se utilizaron tres líneas de maíz, todas las cuales están ampliamente disponibles para los genetistas del maíz y son utilizadas regularmente por los expertos en la técnica y están descritas en Chen y col., "Transposition of Ac from the P locus of maize into unreplicated chromosomal sites", Genetics 117:109-116 (Septiembre de 1987). Tales líneas pueden ser obtenidas, por ejemplo, de los autores del artículo anterior, de Pioneer Hi-Bred International, Inc., o de cualquiera de las muchas fuentes públicas tales como el Maize Genetics Stock Cooperation Center, University of Illinois, Urbana/Champagne, Department of Agronomy S-123 Turner Hall, 1102 South Goodwin Avenue, Urbana, Illinois, 61801.
La primera línea es W23P-vv. El alelo P-vv es producido por la inserción del elemento móvil Ac en el locus P. Emerson, R., "The inheritance of a recurring somatic variation in variegated ears of maize", Am. Nat. 48:87-115 (1914); Brink, R. y Nilan, R., "The relation between light variegated and medium variegated pericarp in maize", Genetics 37:519-544 (1952) y Barclay, P. y Brink, R., "The relation between modulator and Activator in maize", Proc. Nat'l. Acad Sci. USA 40:1118-1126 (1954). El gen P es un gen del maíz bien caracterizado y completamente detallado en la técnica. El gen P induce la pigmentación del pericarpio del maíz. La flavanona es reducida a flobafenos que producen la pigmentación del pericarpio. Un ejemplo de la información detallada sobre el gen P que está disponible para los expertos en la técnica es la discusión de Lechelt y col., "Isolation and molecular analysis of the maize P locus", Mol. Gen. Genet. 219:225-234 (1989) y Chen y col., "Molecular Analysis of Ac transposition and DNA replication" Genetics. Éste es un gen marcador excelente debido a su función en la regulación del color del pericarpio, y tiene como resultado un pericarpio de rayas rojas. Las rayas rojas muestran la escisión de Ac de P, restaurando la función del gen y proporcionando un pericarpio rojo.
El gen P (P-vv) está en el mismo cromosoma que los estériles masculinos genéticos conocidos mapeados previamente en el cromosoma 1. Se ha mostrado que Ac se transpone en el mismo cromosoma el 67% de las veces. Van Schaik, N.V. y Brink, R.A., "Transpositions of modulator, a component of the variegate pericarp allele in maize", Genetics 44:725-738 (1959). Sin embargo, esto no ocurría aquí, ya que el Ac se transponía al cromosoma 9. El propio P-vv facilita enormemente el marcaje de transposones, ya que es posible observar visualmente cuando el Ac se ha transpuesto desde el gen P y está en cualquier otro lugar del genoma.
La 4C063 es una línea endógama blanca que se combina bien con W23P-vv para dar buenas plantas híbridas con granos fácilmente valorados. W22r-sc:m3 es una línea con el elemento Ds en el locus R. La planta es genéticamente dominante en todos los genes de la ruta de la antocianina (A1, A2, Bz1, Bz2, C1, C2, Pr, R). Como Ds hace que R sea disfuncional, no se produce antocianina en el grano.
Ésta fue acoplada con la utilización de cepas de W22r-sc:m3, en las que Ds está integrado en el gen R. El elemento Ds responde a la presencia de Ac, por transposición a otro sitio en el genoma. Es de hecho un Ac defectuoso. El transposón Ac puede moverse dentro y fuera de un gen por sí mismo, mientras que Ds no puede moverse a no ser que esté presente Ac en algún lugar del genoma. El gen R es un gen del maíz estudiado en considerable profundidad. Se sabe que codifica enzimas requeridos para la síntesis de pigmentos antocianinas. Un ejemplo de la información detallada conocida concerniente al gen R es la descripción y la información sobre la secuenciación encontradas en Dellaporta y col., Stadler Symposium 18:263 (1988) y Ludwig y col., "Lc, a member of the maize R gene family responsible for tissue-specific anthocyanin production, encodes a protein similar to transcripcional activators and contains the myc-homology region", Proc. Nat. Acad. Sci. 86:7092-7096 (Septiembre de 1989) y la utilización del gen como marcador visual descrita en Bowen y col., "R Genes as visual markers for corn transformation", Abstract edit. Gallagher, Academic Press (Octubre de 1989) y Ludwig y col., "A regulatory gene as a novel visible marker for maize transformation", Science 247:449-450 (26 de Enero de 1990).
En la cepa W22r-sc:m3, todos los genes de la antocianina del grano son dominantes. Sin embargo, el color del grano es amarillo debido a que Ds interrumpe la función del gen R. En presencia de Ac, sin embargo, el elemento Ds puede transponerse, teniendo como resultado granos con manchas de color púrpura. Por tanto, era posible 1) determinar visualmente cuando Ac se transponía lejos del gen P (pericarpio con rayas rojas o completamente rojo) y 2) determinar si Ac era todavía activo (manchas de color púrpura en la aleurona). Mediante la selección de todos los granos rojos o de los granos con rayas rojas en el pericarpio sobre el embrión que tiene también manchas púrpura en la aleurona, era posible enriquecer enormemente con aquellos casos en los que un Ac activo se había transpuesto a otra posición en el genoma. Mediante la autofecundación de las plantas resultantes de estos granos, pueden someterse a selección familias de la progenie por cualquier mutación que afecte al desarrollo de la panoja o de la antera. En este caso, se crearon familias autofecundadas para la segregación de las plantas estériles masculinas.
Análisis de Cosegregación
La realización del análisis de cosegregación para el marcaje y el clonaje de genes específicos mediante un abordaje estrictamente molecular puede ser tediosa y de larga duración. El sistema Ac es, sin embargo, muy adecuado para el análisis de cosegregación a nivel de genética de campo. Puede utilizarse la interacción entre Ac y Ds activos en el gen R (r-sc:m3). Plantas cruzadas con Ac fueron autofecundadas y cultivadas, identificándose aquellas familias que se segregaban por esterilidad masculina. Una vez que se había identificado una familia que se había segregado por esterilidad masculina, se plantaron semillas adicionales para el cruce con r-sc:m3 para el análisis de la cosegregación. Cada planta (fértiles y estériles) fue cruzada con r-sc:m3, se observó la segregación de colores del grano en cada mazorca y se correlacionó con el hecho de que las plantas fueran fértiles masculinas o estériles masculinas.
Se observó una familia en la que las plantas eran mayoritariamente estériles masculinas, con unas cuantas anteras anormales extruidas alrededor de la panoja. En la mayoría de los casos, estas anteras anormales no tenían polen presente. Cuando cada planta de esta familia fue cruzada con r-sc:m3, se observó la cosegregación de Ac con el fenotipo estéril masculino, según se muestra en la tabla siguiente.
TABLA 1 Segregación de trhn-90-40 cruzada con r:m3
Fenotipo de Fenotipo de la Mazorca Número Número
la Planta Observado Esperado
Estéril Todos los granos con manchas de 8 8,25
color púrpura
Fértil 1/2 granos con manchas púrpura 16 16,50
1/2 granos sin manchas
Fértil Todos los granos sin manchas 9 8,25
Las plantas estériles masculinas producían siempre mazorcas con todos los granos con manchas de color púrpura. Dos tercios de las plantas fértiles tenían mazorcas que segregaban un 50% de granos con manchas y un 50% de granos amarillos. Un tercio de las fértiles producían mazorcas con todos los granos amarillos. Esto demostraba que Ac se había transpuesto a un gen responsable de la fertilidad masculina e interrumpía su función. El gen actúa como recesivo y, cuando está en homozigosis, tiene como resultado la esterilidad masculina. Esta segregación fue verificada en posteriores plantaciones.
Análisis Molecular
Se llevó a cabo un análisis Southern para confirmar la asociación de Ac con la esterilidad. El análisis Southern es una técnica bien conocida por los expertos en el oficio. Este procedimiento habitual implica el aislamiento del ADN de la planta, el corte con endonucleasas de restricción y el fraccionamiento del ADN cortado en un gel de agarosa y la transferencia a membranas de nitrocelulosa para separar el ADN por peso molecular. Posteriormente se hibrida con el fragmento de la sonda que estaba marcado radioactivamente con ^{32}P y se lava en una solución de SDS. Southern, E., "Detection of a specific sequence among DNA fragments by gel electrophoresis", J. Mol. Biol. 98:503-517 (1975).
El ADN fue aislado de la progenie cruzada estéril y de la progenie cruzada fértil, manteniendo las plántulas de grano con manchas de color púrpura separadas de las plántulas con grano amarillo. El ADN fue aislado de las dos hojas superiores de plantas de un mes de edad utilizando un procedimiento con urea según está descrito en Dellaporta y col., "A plant DNA minipreparation: version II", Plant Mol. Bio. Rep. 1:19-21 (1983). El ADN aislado fue cortado con PvuII con el fin de encontrar un fragmento de 2,5 kb asociado únicamente con Ac según se muestra en el mapa de restricción (Fig. 1). Aproximadamente 8 \mug de ADN fueron digeridos con el enzima apropiado de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Promega). Los digestos de ADN fueron sometidos a electroforesis en un gel de agarosa Sea Kem GTG al 0,75% y transferidos a una membrana de nailon Duralon-UV mediante transferencia capilar y fijados a la membrana por calentamiento en estufa durante 1 hora a 85ºC. El fragmento de HindIII de 1,6 kb de Ac fue utilizado como sonda en el análisis de Transferencia Southern.
Los resultados están mostrados en el gel de la Figura 2. En la Figura 2, los estériles masculinos son las calles 3-10. La calle 2 es la planta fértil heterozigota y la calle 1 el tipo salvaje. Según confirma este gel, aparecía una banda del fragmento de 2,5 kb en todas las plantas estériles (granos con manchas de color púrpura) y no aparecía en ninguna de las plantas fértiles (granos amarillos). Esto confirma que el Ac estaba ligado estrechamente al locus de la fertilidad masculina o bien estaba insertado en el locus, inhibiendo la función del gen y teniendo como resultado un fenotipo estéril masculino.
Clonaje
El ADN adyacente a la secuencia conocida del Ac fue clonado y utilizado en la obtención del gen completo.
Para resumir, el ADN de la planta fértil masculina y el ADN de la planta estéril masculina fueron digeridos con las endonucleasas de restricción PstI, EagI, SalI, SacI y XbaI para localizar una única banda con el elemento Ac. Los fragmentos fueron sometidos a electroforesis, sometidos a transferencia Southern e hibridados con el fragmento de HindIII de Ac. Se identificó un fragmento de PstI de 6 kb que cosegregaba con el elemento de la esterilidad masculina. Se utilizó el método de PCR inversa de Baker y col. para aislar el ADN asociado con Ac. Earp, D.J., Lowe, B. y Baker, B., "Amplification of genomic sequences flanking transposable elements in host and heterologous plants: a tool for transposon tagging and genomic characterization", Nucleic Acids Research 18:3271-3279 (1990).
Una representación esquemática del procedimiento bien conocido de la reacción en cadena de la polimerasa inversa está mostrado en la Figura 3. Después de obtener el fragmento de 6 kb, se volvieron a ligar los extremos. Los cebadores A y B fueron identificados fácilmente ya que se conoce la secuencia de Ac. De este modo, pudieron identificarse los oligonucleótidos 5' y 3' y, de acuerdo con la técnica de PCR inversa, se hicieron reaccionar para amplificar las secuencias intermedias. Los cebadores A y B se hicieron funcionar desde cada lado del círculo religado en el que había estado el Ac. De esta forma, se amplificó el ADN entre los extremos del Ac y se aisló un segmento de ADN de 1,3 kb. El fragmento de Ac de 4,8 kb conocido más el producto amplificado de la PCRI de 1,3 kb eran casi equivalentes al fragmento de PstI de 6,0 kb aislado previamente.
Los detalles de este procedimiento resumido anteriormente son según sigue. Se aisló el ADN genómico según se describió anteriormente. Se sometieron a digestión 20 \mug de ADN con 20 unidades de PstI de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Promega). El ADN digerido fue sometido a electroforesis según se describió anteriormente utilizando un peine preparativo. Un fragmento del gel, que contenía ADN con un peso molecular de entre 5,5 y 6,5 kilobases, fue escindido del gel. El ADN fue electroeluido de la agarosa mediante la utilización de una membrana #2 de Spectra/Por, con un corte de peso molecular de 12-14000 (Spectrum Medical Industries, Inc.) que contenía 0,4 ml de agua estéril y sometido de nuevo a electroforesis frente a tampón Tris-acetato 1X pH 8,0 (TAE). El ADN aislado fue extraído consecutivamente con fenol equilibrado con Tris pH 7,0:cloroformo (1:1), cloroformo, posteriormente fue precipitado con etanol, secado y resuspendido en agua estéril. Las ligaduras se realizaron de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Bethesda Research Laboratories) utilizando el ADN genómico digerido con PstI a una concentración final de 20 ng/u. Las ligaduras se realizaron durante 18 horas a 14ºC.
Los cebadores oligonucleotídicos fueron sintetizados en un sintetizador de ADN/ARN de Applied Biosystems modelo 394. El cebador B5 era esencialmente el mismo que el descrito por Earp y col., supra, excepto en que se había creado un sitio de EcoRI en el extremo 5' y tenía dos bases extra en el extremo 3'. Las secuencias de ambos cebadores utilizados en la reacción de PCR inversa de Ac son según sigue:
A5: 5' GATAGAATTCGGTACGGGATTTTCCCATCCTACTT 3'
B5: 5' GGTAGAATTCGTTTTCGTTTCCGTCCCGCAAGTT 3'
La PCR fue llevada a cabo utilizando 25 ng de ADN genómico circularizado molde en una reacción que contenía 2 \muM de cada cebador, 0,24 mM de cada dNTP, 3 unidades de polimerasa Hot Tub (Amersham) en un tampón de reacción 1X suministrado por el fabricante. La amplificación se realizó en un termociclador de MJ Research Inc. modelo PTC-100-96 bajo las mismas condiciones que las descritas por Earp y col., supra. Los productos de la reacción fueron sometidos a electroforesis en geles de agarosa LMP al 1% (Bethesda Research Laboratories). El producto de la amplificación fue aislado del gel utilizando un kit "Magic PCR Kit" (Promega) y reamplificado utilizando las condiciones anteriores.
Aislamiento del ADNc
Los procesos de selección de bibliotecas de ADNc son comúnmente conocidos entre las personas expertas en la técnica y están descrito en Maniatis, T. y col., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York. Las bibliotecas fueron creadas según sigue. Se aisló ARN de panojas de Z. mays utilizando el método del tiocianato de guanidina seguido por la formación de bandas en un gradiente de cloruro de cesio. Se seleccionó el ARN poli A+ utilizando oligo dT celulosa. Se construyeron dos bibliotecas de ADNc en los vectores pCDNAII (Invitrogen) y Uni-Zap XR (Stratagene) utilizando 5 \mug de ARNm para cada uno de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
El producto de la PCR inversa de 1,3 fue sondado sobre la biblioteca de ADNc de la panoja desplegada de 1000 clones aproximadamente y a partir de ésta se obtuvo un único clon homólogo con un tamaño de inserto de 1,4 kb aproximadamente. Tenía 1550 pares de bases y está representado gráficamente en la Figura 4. El fragmento genómico variará, por supuesto, de acuerdo con el fondo de la planta de la que se ha aislado y los intrones pueden estar o no presentes. Esto, sin embargo, muestra cómo el elemento Ac aparecía en este aislado.
Las 1,4 kb fueron hibridadas a la membrana de segregación de PvuII para asegurar que la banda de cosegregación de 3,4 kb encontrada con el producto de la PCR inversa era una nueva región genómica y no pequeñas cantidades de ADN de Ac contenidas en los extremos del fragmento. Los resultados están mostrados en el gel de la Figura 5. Como puede observarse, las 1,4 kb de la biblioteca hibridadan en las plantas estériles con el mismo fragmento de 3,4 kb que cosegregaba con el fenotipo estéril masculino y las plantas de grano con manchas de color púrpura procedentes del heterozigoto fértil.
El segmento de 1,4 kb fue utilizado posteriormente frente a una segunda biblioteca de ADNc de la panoja y se obtuvo el ADNc de longitud completa, y se denominó MS45.
Análisis Northern
Se aisló tejido de las panojas, mazorcas y hojas de plantas estériles y fértiles según se describió previamente, y se llevó a cabo en los extractos un análisis de Transferencia Northern. El análisis Northern es también una técnica comúnmente utilizada por los expertos en el oficio y es similar al análisis Southern excepto en que se aísla ARN y se coloca en un gel de agarosa. El ARN es luego hibridado con una sonda marcada. Potter, E. y col., "Thyrotropin releasing hormone exerts rapid nuclear effects to increase production of the primary prolactin mRNA transcript", Proc. Nat. Acad. Sci. USA 78:6662-6666 (1981); Lechelt y col., supra. Se aisló el ARN total de 1) hojas de plantas cultivadas aproximadamente 2 meses; 2) panojas en la etapa de vacuolización media aproximadamente y 3) mazorcas inmaduras de entre 4,5 - 5,0 cm de longitud. El tejido fue triturado en nitrógeno líquido y posteriormente tratado de manera secuencial con una extracción con detergente, una precipitación diferencial con LiCl y una precipitación con etanol. El gel fue hibridado con el ADNc MS45 aislado según se describió anteriormente. El ADNc hibridaba solamente con el ADN procedente de panojas fértiles según puede verse en la Fig. 6.
Plantas Revertidas
Para confirmar adicionalmente que el gen era crítico para la fertilidad masculina, se identificaron las plantas que habían revertido. Como no sería posible distinguir normalmente las plantas fértiles de las plantas que habían revertido, se seleccionaron las plantas que presentaban esterilidad pero desprendían algo de polen. Éstas fueron cruzadas como plantas masculinas con líneas no relacionadas y tuvieron como resultado plantas que no eran estériles masculinas. El ADNc MS45 fue recuperado y analizado para encontrar que el Ac había dejado una "huella" cuando se transpuso fuera del gen de seis pares de bases, manteniendo la secuencia en marco. Ver la Figura 7, que muestra que se han añadido dos aminoácidos, pero que el marco no se ha desplazado.
Elaboración de Mapas de RFLP
Se hicieron mapas de RFLP del fragmento IPCR en una población F2 de B73 X Mo17. Mapeaba en el cromosoma 9L entre las sondas y Burr 7.21 según está descrito en Maize Genetics Cooperation Newsletter 67:165 (15 de Marzo de 1990) y está representado en la Figura 8.
Secuenciación
La secuenciación del clon MS45 se llevó a cabo utilizando el método de la terminación de la cadena en didesoxi de Sanger y col., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 74:5463-5464 (1977).
Con referencia al ADN MS45, debe comprenderse que lo que se indica es una secuencia de ADN según se describe más adelante que produce la secuencia de aminoácidos también descrita más adelante. Una persona con experiencia en la técnica apreciará fácilmente que más de un codón de tres miembros puede codificar la misma secuencia de aminoácidos.
Métodos para controlar la fertilidad masculina con ADN MS45
Es evidente para una persona experta en la técnica que el ADN descrito en la presente puede ser utilizado en cualquiera de una amplia variedad de métodos para controlar la fertilidad masculina en plantas. Lo siguiente se presenta a manera de ilustración de varios de estos métodos y no tiene la intención de limitar las utilizaciones posibles de las moléculas de ADN aquí descritas, ni tampoco el ámbito de la invención.
Una vez que se tiene una molécula de ADN que es crítica para la fertilidad masculina en plantas, es posible crear una secuencia que esté en orientación inversa respecto a la orientación normal 5' a 3' de esa secuencia de ADN. Cuando esta molécula antisentido es suministrada a la planta, impide la expresión normal de la secuencia fértil masculina. Se cree que el ADN antisentido se transcribe para producir un ARN que es complementario a, y capaz de hibridar con, el ARNm producido por el gen de la fertilidad masculina e inhibir por tanto la traducción. La proteína codificada por el ARNm no se produce y no puede desempeñar su función en la fertilidad masculina. Con el gen de la fertilidad masculina descrito en la presente, se suministra una construcción a la planta que tiene en la misma ADN MS45, teniendo la construcción un segmento promotor de la transcripción, un segmento de terminación de la transcripción y un segmento de ADN que produce una secuencia de ribonucleótidos complementaria a una secuencia de ribonucleótidos del ADN MS45.
Esta utilización del antisentido para inhibir o controlar la expresión de un gen es conocida por los expertos en la técnica y está descrita con detalle en la Patente de EE.UU. 5.190.931 de Inouye, publicada el 2 de Marzo de 1993. En una realización, los inventores de la misma describen el corte del ADN con endonucleasas de restricción para tener como resultado un plásmido religado que ha perdido un fragmento entre dos sitios de restricción y en el cual puede insertarse otro fragmento de ADN. El ADN normal es digerido, purificado, y se inserta un fragmento en orientación opuesta. Inhibían así la expresión de lpp, OmpA y OmpC en bacterias y controlaban el desarrollo del colifago SP utilizando tales construcciones. Un ARN antisentido complementario a la región líder 5' del ARN de OmpA, pero que no incluía la secuencia de Shine-Dalgarno, era menos eficaz que un transcrito que incluía el sitio de unión de ribosomas y el codón de inicio. Una visión extensa de la regulación con secuencias antisentido es proporcionada por Claude Helene y Jean-Jacques Toulme en una revisión, "Specific regulation of gene expression by antisense, sense and antigene nucleic acids", Biochemica et Biophysica Acta (1990) 99-125.
Otro ejemplo de antisentido y su utilización en la inhibición o en el control de un gen incluye construcciones antisentido para genes que codifican la biosíntesis de flavonoides en las anteras para proporcionar esterilidad masculina. Van der Meer y col., "Antisense inhibition of flavonoid biosyntesis in petunia anthers results in male sterility", The Plant Cell 4:253-262 (Marzo de 1992). Genes de la síntesis de chalcona antisentido con secuencias homólogas a otros genes expresados en las anteras y un promotor de CaMV355, tienen como resultado un polen blanco estéril masculino. Como puede verse, la utilización de secuencias antisentido para controlar la expresión génica es bien conocida. Ver también, por ejemplo, Bourque, June E. y Folk, William R., "Suppression of gene expression in plant cells utilizing antisense sequences transcribed by RNA polimerase II", Plant Molecular Biology 19:641-647 (1992); Weintrab y col., Trends Gen. 1:22-25 (1985).
Otro método para controlar la expresión génica es mediante la modificación de activadores transcripcionales. Durante la expresión génica, el ADN de doble hebra es transcrito al ARN mensajero de hebra sencilla correspondiente. La hebra sentido se separa de su pareja antisentido y los enzimas ensamblan una molécula de ARN que complementa a la secuencia sobre la hebra antisentido. El ARNm migra hacia los ribosomas que leen la información codificada para producir aminoácidos.
La transcripción de genes eucarióticos está influenciada por varios elementos, incluyendo proteínas reguladoras de la transcripción que se unen al ADN de una forma específica de la secuencia. Estos activadores transcripcionales pueden ser modificados para que se unan al ADN pero no puedan llevar a cabo su función activadora normal. Los activadores transcripciones tienen dos dominios, un dominio de unión y un dominio de activación. Alterando la secuencia de aminoácidos de las proteínas activadoras de la transcripción de un gen, proporcionando una secuencia de ADN que codifica la misma, y suministrando ese ADN a la planta, puede bloquearse la expresión del gen diana. Ver Goff, S.A. y col., "Transactivation of the Anthocyanin pathway structural genes with wild-type and altered c1 proteins", Maize Genetics Cooperation Newsletter 64:6 (1 de Marzo de 1990).
Una variación de este método es el aislamiento de elementos supresores genéticos que codifican proteínas mutantes negativas dominantes o ARN antisentido inhibidor mediante fragmentación aleatoria del ADN y la identificación por selección funcional por el fenotipo asociado con la supresión de la diana. Esto es lo que Holzmayer y col., describieron en su artículo, "Isolation of dominant negative mutants and inhibitory antisense RNA sequences by expression selection of random DNA fragments", Nucleic Acids Research, Vol. 20, Nº 4, 711-717 (3 de Diciembre de 1991). En ese trabajo fragmentaron aleatoriamente ADN del bacteriófago lambda con el fin de proteger células de E. coli de la lisis inducida por lambda. Se aislaron múltiples elementos supresores genéticos que codificaban proteínas o fragmentos de ARN antisentido.
Se ha observado también inhibición de la expresión génica normal cuando se encontró que la expresión adicional o sobreexpresión de un gen endógeno suprimía la expresión génica. Esta "inhibición sentido", referida algunas veces como "cosupresión", ha sido bien documentada. Ver, por ejemplo, Brussian y col., "An Arabidopsis mutant with reduced level of cab 140 RNA is a result of cosuppression", The Plant Cell 5:667-677 (Junio de 1993); Van der Krol y col., "Flavonoid genes in Petunia: addition of a limited member of gene capus may lead to suppression of gene expression", The Plant Cell 2:291-299 (Abril de 1990).
Otro medio de regulación negativa control incluye la represión de la transcripción génica. En un sistema, factores que contienen dominios de unión a ADN pero que carecen de dominios de activación funcionales, compiten con activadores para unirse a los mismos sitios y bloquean la activación. Otros heterodimerizan con activadores, reduciendo su afinidad por la unión a ADN o su capacidad para activar la transcripción. Otros represores interaccionan con factores activadores cuando se unen al ADN y bloquean la función de transactivación. Un tipo más de reguladores por disminución comprende proteínas inhibidoras que secuestran al activador en un complejo que es incapaz de unirse al ADN. Ver revisiones por Jackson, M.E., J. Cell Sci. 100:1-7 (1991); Jones, N., Curr. Biol. 1:224-226 (1991); Mitchell, P.J. y Tjian, R., Science 245:371-378 (1989).
La mutación directa del propio gen endógeno cambiará también el gen de la fertilidad masculina en un gen de esterilidad masculina. La irradiación causa la ruptura y la reordenación de los cromosomas y la modificación de la composición de genes individuales. La exposición a rayos x es un método de mutación génica bien conocido desde hace tiempo. Ver, por ejemplo, Stadler, L.J., "On the genetic nature of induced mutations in plants", Reimpresión, Proceedings of the Sixth International Congress of Genetics, Vol. 1, 274-294 (1932). Otras técnicas incluyen la exposición a mutágenos químicos tales como metanosulfonato de etilo y N-metil-N-nitro-N-nitrosoguanidina, según fue realizado por Neuffer, M.G. y Coe Jr., E.H. en granos de polen y está descrito en uno de sus primeros trabajos: "Paraffin oil technique for treating mature corn pollen with chemical mutagens", Maydica XXIII (1978) 21-28; también, ver Thurling, N. y Depittayanan, "EMS induction of early flowering mutants in spring Rape (Brassica napus)", Plant Breeding, 108:177-184 (1992). Otros métodos incluyen el tratamiento con azida de sodio (Rao, B., "A case of genic male sterility induced by sodium azide in Pearl Millet", Biol. Zentralbl. 104:579-521 (1985); Conger, B.V. y Carabia, J.V., "Mutagenic effectiveness and efficiency of sodium azide versus ethyl methanesulfonate in maize: induction of somatic mutations at the yg_{2} locus by treatment of seeds differing in metabolic state and cell population", Mutation Research 46:285-296 (1977)) y la exposición a radiación gamma (Filippetti, A. y DePace, C., "Improvement of seed yield in Vicia falsa L. by using experimental mutagenesis II comparisons of gamma-radiation and ethyl-methanesulfonate (EMS) in production of morphological mutants", Euphytica 35:49-59 (1986)).
Por tanto, es claramente evidente para una persona con experiencia en la técnica, que un gen de la fertilidad masculina, una vez identificado, puede ser utilizado en una variedad de métodos para mediar la fertilidad masculina en las plantas. Todo lo anterior ilustra unos cuantos de tales métodos que pueden ser utilizados con un nuevo gen de la fertilidad masculina. Un nuevo método más creado por los inventores de esta solicitud se describe a continuación.
Método de Esterilidad Masculina Constitutiva
Esta invención difiere de los abordajes convencionales de la esterilidad masculina en la mejora genética de plantas y la producción de semillas, en que se utiliza un promotor inducible para regular la expresión del gen que se sabe que es crítico para la fertilidad masculina de la planta. La primera etapa en la práctica de esta invención es por tanto la selección de un gen del que dependa la fertilidad. Un tipo son las moléculas de ADN MS45 descritas supra.
El gen seleccionado es clonado, su promotor nativo activado y el gen modificado es insertado en una secuencia de expresión con un promotor inducible sensible a un control externo. Preferiblemente, el promotor es uno que responda a la aplicación a la planta de un agente químico no fitotóxico específico.
Utilizando transformación y sustitución génica, el gen es inactivado en el genoma de la planta y sustituido por el gen manipulado genéticamente incorporado a la secuencia de expresión con el promotor inducible.
Esta invención es única en cuanto a que el proceso tiene como resultado la utilización del promotor inducible para inducir fertilidad, no esterilidad. En esta invención, las secuencias promotoras del gen seleccionado son eliminadas, de tal manera que el gen no se transcribe y la planta es estéril masculina. Cuando se desea incrementar la planta estéril masculina, se restaura la fertilidad masculina mediante la inducción de la expresión del gen crítico. En la realización preferida esto se lleva a cabo mediante el tratamiento de plantas estériles masculinas en crecimiento con un agente químico específico no fitotóxico.
La inducción del promotor inducible por tratamiento químico dependerá de varios factores asociados con el propio tratamiento químico y de varias condiciones medioambientales en el momento del tratamiento. Si el gen crítico estuviera normalmente "activado", para ser inactivado mediante tratamiento químico, un fallo del tratamiento tendría como resultado la autopolinización y la producción y venta de semillas endógamas en lugar de semillas híbridas. Las leyes sobre las semillas que gobiernan la venta de semillas híbridas requieren un alto grado de pureza de las semillas, de tal manera que los porcentajes de semillas que no cumplan la especificación de híbridas deben ser mantenidos muy bajos. Como una planta de maíz puede producir más de seis millones de granos de polen, incluso un fallo limitado del tratamiento podría tener como resultado un elevado porcentaje de autopolinización. Por estas razones, la presente invención es practicada de tal manera que el gen está normalmente "inactivado" y no se expresa la característica correspondiente, de manera que bajo condiciones normales no puede tener lugar la autopolinización. Además, teniendo el gen crítico normalmente "inactivado" el tratamiento químico no es necesario en la producción a gran escala de semillas híbridas, de tal manera que se minimiza la utilización de agentes químicos (y los gastos asociados) y el riesgo de fracaso del tratamiento está presente solamente en la producción a escala limitada, cuidadosamente controlada, de la semilla parental, en la que se desea la autopolinización. Como el fracaso del tratamiento en tal caso tiene como resultado la subproducción de polen, y como normalmente el polen es superproducido en un amplio margen, el proceso de esta invención para la producción de semillas parentales tolerará una tasa de fallos del tratamiento tan elevada como del 70% al 80% con efectos mínimos sobre la producción de las semillas parentales.
En general, de acuerdo con la invención descrita en la presente, la molécula de ADN aquí descrita es incorporada a la planta junto con un promotor necesario que es inducible. La planta será estéril, ya que la molécula de ADN no se expresa, y cuando el promotor es inducido la planta será fértil. El gen nativo que produce el producto de la molécula de ADN está en una planta normalmente fértil y puede ser inactivado mediante una variedad de métodos descritos más adelante, tales como el retrocruzamiento o la recombinación homóloga.
Promotores Inducibles
En la práctica de esta invención la región promotora es eliminada de un gen clonado responsable de la fertilidad masculina y es sustituida por un promotor que responde solamente a un estímulo externo específico. De este modo, el gen no será transcrito excepto como respuesta al estímulo externo. Mientras que el gen no se transcriba, su producto génico - que es necesario para completar el desarrollo del polen - no se producirá. Esto produce una ruptura en una o más de las rutas bioquímicas/fisiológicas del desarrollo del polen, que tiene como resultado la esterilidad masculina. La planta sólo se convertirá en fértil bajo el estímulo específico que activa al promotor seleccionado.
Un ejemplo de un sistema promotor sensible que puede ser utilizado en la práctica de esta invención es el sistema de la glutation-S-transferasa (GST) en el maíz. Las GSTs son una familia de enzimas que pueden destoxificar varios compuestos electrofílicos hidrofóbicos que son a menudo utilizados como herbicidas preemergentes (Wiegand y col., "Messenger RNA Encoding a Glutathione-S-Transferase Responsible for Herbicide Tolerance in Maize is Induced in Response to Safener Treatment", Plant Molecular Biology 7:235-243, 1986). Se ha descubierto que el tratamiento de semillas de maíz con GSTs incrementa la tolerancia del maíz a los herbicidas. Hay estudios que han demostrado que las GSTs están implicadas directamente en la inducción de esta tolerancia incrementada. Esta acción está mediada primariamente a través de un producto específico de la transcripción de un ARNm de 1,1 kb. Brevemente, el maíz tiene un gen quiescente ya presente que existe de manera natural, que puede responder a las GSTs y que puede ser inducido con el fin de producir un producto génico. Este gen ya ha sido identificado y clonado. De este modo, en una realización de esta invención, se elimina el promotor del gen sensible a la GST y se une al gen de la fertilidad masculina del que se había eliminado previamente su promotor nativo. Este gen manipulado es la combinación de un promotor que responde a un estímulo químico externo y un gen responsable del desarrollo con éxito de polen fértil.
Introducción del Gen
Se conocen en la técnica varios métodos para transferir ADN clonado al maíz. Éstos incluyen la captación de ADN por los protoplastos del maíz facilitada por electroporación (Rhodes y col., "Genetically Transformed Maize Plants from Protoplasts", Science, Vol. 240 (8 de Abril de 1988)); el tratamiento de los protoplastos del maíz con polietilén glicol (Lyznik y col., "Stable Co-Transformation of Maize Protoplasts with Gus A and Neo Genes", Plant Molecular Biology 13:151-161, 1989); y el bombardeo de células del maíz con microproyectiles cargados de ADN (Klein y col., "Genetic Transformation of Maize Cells by Particle Bombardment", Plant Physiol. (1989) 91:440-444) y Klein y col., "Factors Influencing Gene Delivery into Zea Mays Cells by High-Velocity Microprojectiles", Bio/Technology Vol. 6, Mayo de 1988).
Cada una de estas técnicas tiene ventajas y desventajas. En cada una de las técnicas, ADN de un plásmido es manipulado genéticamente para que contenga no sólo el gen de interés sino también genes marcadores seleccionables y susceptibles de ser sometidos a cribado. Se utiliza un gen marcador seleccionable con el fin de seleccionar solamente aquellas células que tengan copias del plásmido integradas (la construcción es tal que el gen de interés y los genes seleccionables y susceptibles de ser sometidos a cribado son transferidos como una unidad). El gen susceptible de ser sometido a cribado proporciona otra comprobación del cultivo con éxito de únicamente aquellas células portadoras de los genes de interés. Un gen marcador seleccionable comúnmente utilizado es el de la fosfotransferasa de neomicina II (NPTII). Este gen transmite resistencia a kanamicina, un compuesto que puede ser añadido directamente al medio de crecimiento en el que crecen las células. Las células vegetales son normalmente susceptibles a kanamicina y, como resultado, mueren. La presencia del gen NPTII vence los efectos de la kanamicina y cada célula con este gen permanece viable. Otro gen marcador seleccionable que puede ser empleado en la práctica de esta invención es el gen que confiere resistencia al herbicida glufosinato (Basta). Un gen susceptible de ser sometido a cribado utilizado comúnmente es el gen de la b-glucuronidasa (GUS). La presencia de este gen es caracterizada mediante la utilización de una reacción histoquímica en la que una muestra de células supuestamente transformadas es tratada con una solución de ensayo de GUS. Después de una incubación apropiada, las células que contienen el gen GUS se convierten en azules. Otro gen susceptible de ser sometido a cribado es un activador transcripcional para la biosíntesis de antocianinas, según está descrito en Bowen y col., "R Genes as visual markers for corn transformation", Edición del Resumen Gallagher, Academic Press (Octubre de 1989); Ludwig y col., "A regulatory gene as a novel visible marker for maize transformation" Science 247:449-450 (26 de Enero de 1990). Este gen produce la síntesis del pigmento antocianina. Las células transformadas con un plásmido que contenga este gen se vuelven rojas. Preferiblemente, el plásmido contendrá genes marcadores seleccionables y genes marcadores susceptibles de ser sometidos a cribado.
El plásmido que contiene uno o más de estos genes es introducido en los protoplastos del maíz o en células del callo mediante cualquiera de las técnicas previamente mencionadas. Si el gen marcador es un gen seleccionable, solamente aquellas células que hayan incorporado el paquete de ADN sobrevivirán después de la selección con el agente fitotóxico apropiado. Una vez que las células apropiadas son identificadas y propagadas, se regeneran las plantas. La progenie de las plantas transformadas debe ser analizada para asegurarse de que el paquete de ADN se ha integrado con éxito en el genoma de la planta.
Inactivación del Gen Nativo
Será fácilmente apreciado por los expertos en la técnica que se conoce una amplia variedad de métodos para inactivar el gen nativo. La recombinación homóloga es uno de los métodos conocidos por los expertos en la técnica para convertir un gen nativo en inoperante. Por tanto, cuando el gen manipulado es recombinado homólogamente en la planta, el gen nativo se convertirá en inoperante. Un buen compendio de este proceso general está proporcionada por Yoder, J.I. y Kmic, Eric, en "Progress Towards Gene Targeting in Plants", Genetic Engineering, Vol. 13 (Plenum Press, New York, 1991). En la página 265 de esta referencia, los autores indican que "puede utilizarse la vectorización de genes para silenciar o sustituir el gen endógeno por un alelo manipulado; de este modo el fenotipo del gen alterado, o sus secuencias reguladoras, puede ser evaluado in planta". Se señala que tiene lugar recombinación genética mediante la ruptura y la nueva unión del ADN y que el mecanismo de reunificación aparea las secuencias de ADN complementarias. (Ver, por ejemplo, 271, supra).
Una discusión adicional de la recombinación homóloga intracromosómica en las plantas se discute en Peterhans, A., Schlupmann, H., Basse, C. y Paszkowski, J., "Intrachromosomal Recombination in Plants", The EMBO Journal, Vol. 9, Nº 11, pp. 3437-3445, 1990.
Una variedad de diferentes medios, además de estos ejemplos específicos, estaría disponible para una persona con experiencia en la técnica. Un ejemplo adicional más incluye el retrocruzamiento, utilizando técnicas de mejora genética de plantas generalmente aceptadas, para "eliminar" efectivamente el gen nativo. El retrocruzamiento se utiliza a menudo en la mejora genética de plantas para transferir una característica específica deseable desde una planta endógama o fuente a una planta endógama que carezca de esa característica. Esto puede ser realizado, por ejemplo, cruzando primeramente una planta endógama superior (A) (parental recurrente) con una planta endógama donante (parental no recurrente), que lleve el(los) gen(es) apropiado(s) para la característica en cuestión. La progenie de este cruce es vuelta a cruzar posteriormente con el parental recurrente superior (A), seguido por un proceso de selección en la progenie resultante por la característica deseada que iba a ser transferida desde el parental no recurrente. Después de cinco o más generaciones de retrocruzamiento con un proceso de selección por la característica deseada, la progenie será heterozigota para los loci que controlan la característica que está siendo transferida, pero será similar al parental superior para la mayoría o para casi todos los demás genes. La última generación de retrocruzamiento será autofecundada para dar una progenie genéticamente pura para el(los) gen(es) que está(n) siendo transferido(s). Un resultado de cualquier método de retrocruzamiento es que el gen "nativo" es sustituido por el gen deseado.
Se discute un único método en la revista Science de 1991, que informa sobre un trabajo anterior relacionado con la utilización de "tijeras transgénicas". Este artículo describe un método en el que los científicos pueden eliminar un gen marcador que está unido a un gen que tiene una característica deseada en una planta. La "tijera", de acuerdo con este método, es un enzima obtenido de un virus bacteriano conocido como "Cre" para el control de la recombinación. Science, p. 1457, 6 de Diciembre de 1991. El enzima es capaz de eliminar mediante corte cualquier ADN situado entre un par de secuencias de 34 pares de bases, denominadas lox, por locus de sobrecruzamiento. Esto está descrito con mayor detalle en la solicitud de patente registrada por Du Pont, y publicada como WO 91/09957.
Selección por Esterilidad y Restauración de la Fertilidad
Una vez que el gen ha sido introducido en una planta, se seleccionan los tipos de planta apropiados, esto es las plantas que son estériles masculinas. Estas plantas son estériles masculinas porque el gen de la fertilidad masculina aislado y clonado no tiene su promotor nativo y, por tanto, no está produciendo su producto génico que es crucial para el desarrollo con éxito del polen. Por tanto, el gen manipulado actúa como un alelo mutante recesivo de ese gen. En la biotecnología de plantas normales, una vez que se ha identificado el genotipo deseado después de la transformación y la regeneración, las plantas son autofecundadas para recuperar ese genotipo. Sin embargo, en la práctica de esta invención, el genotipo deseado no puede ser autofecundado en la primera generación porque es estéril masculino. Para obtener la progenie debe inducirse la fertilidad mediante la pulverización de las plantas con un compuesto que induzca la transcripción del gen por activación del promotor alterado. En el caso de los promotores de la GST, el compuesto es preferiblemente un compuesto inductor de GST tal como N,N-dialil-2-2-dicloroacetanida. El promotor unido al gen de la fertilidad masculina responde a este agente químico y hace que comience la transcripción del gen. Una vez que esto ocurre, se produce el producto génico normal a partir del gen y se induce cierto nivel de fertilidad masculina. El polen de esta planta es utilizado posteriormente para llevar a cabo la polinización del genotipo seleccionado original.
Una vez que se ha completado el aislamiento inicial y la propagación del genotipo deseado, el procedimiento es más directo. Solamente las plantas endógamas que son utilizadas como parentales hembra en los cruces de híbridos son transformadas en variantes estériles masculinas. Una vez que se han transformado, debe incrementarse la cantidad de semilla estéril masculina/fértil femenina. Esto se consigue plantando en un área aislada (lejos de otro polen de maíz) y pulverizando con un agente químico al que responda el promotor. La pulverización induce al promotor a iniciar la transcripción del gen unido a él. Esto producirá cierto grado de fertilidad. Una ventaja particular de este sistema, en comparación con los sistemas tales como el descrito en la publicación PCT WO 89/10396 de Mariani y col. (basada en la Solicitud Internacional Nº PCT/EP89/00495), en el que se induce esterilidad, es que el tratamiento no tiene que ser un 100% eficaz, ya que normalmente se produce mucho más polen por una planta de maíz que el que es realmente necesario para la fertilización de todas las sedas disponibles. Por tanto, incluso una baja restauración de la fertilidad será eficaz para obtener niveles aceptables de incremento de semillas. Al mismo tiempo, no tiene lugar autopolinización en la producción de semillas híbridas, ya que las plantas de esta invención son normalmente estériles masculinas y deben ser tratadas para convertirlas en fértiles. En los sistemas en los que se induce esterilidad, la inducción de esterilidad debe ser un 100% eficaz para evitar la autopolinización cuando se produce una semilla híbrida.
Todas las semillas recogidas continúan siendo homozigotas y estériles, ya que la fertilidad es restaurada únicamente en una sola generación parental mediante el tratamiento con el agente químico inductor de fertilidad. Esta semilla es luego utilizada en un campo de producción de híbridos, donde se utiliza como parental femenino. Como las plantas son estériles masculinas, no tienen que ser despanojadas. Todas las plantas híbridas producidas a partir de tales semillas son fértiles masculinas, ya que la progenie resultante hereda un gen modificado del parental femenino y un gen normal del parental masculino. Tiene lugar la producción de polen normal.
Aunque todo lo anterior ilustra la realización preferida de la invención, se apreciará que pueden realizarse varios cambios sin alejarse del espíritu y del ámbito de la invención.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
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(i)
SOLICITANTE: Pioneer Hi-Bred International, Inc.
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(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Secuencia de Nucleótidos que Media la Fertilidad Masculina y un Método de Utilización de la Misma
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(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 2
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(iv)
DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
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(A)
DESTINATARIO: Pioneer Hi-Bred International, Inc.
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(B)
CALLE: 700 Capital Square, 400 Locust Street
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(C)
CIUDAD: Des Moines
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(D)
ESTADO: Iowa
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(E)
PAÍS: Estados Unidos
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(F)
ZIP: 50309
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(v)
FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
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(A)
TIPO DE MEDIO: Disquete, 3,5 pulgadas, 1,44 Mb de capacidad
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(B)
ORDENADOR: IBM compatible
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(C)
SISTEMA OPERATIVO: MS-DOS
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(D)
PROGRAMA: Microsoft Windows Notepad
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(vi)
DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
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(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
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(B)
FECHA DE REGISTRO:
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(C)
CLASIFICACIÓN:
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(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
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(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: 07/537.183
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE REGISTRO: 12 de Junio de 1990
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(viii)
INFORMACIÓN SOBRE EL REPRESENTANTE/AGENTE:
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(A)
NOMBRE: Sweeney, Patricia A.
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(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 32.733
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 125R2-PCT
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (515) 248-4897
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: (515) 248-4844
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(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 1:
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(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
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(A)
LONGITUD: 1419 pares de bases
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(B)
TIPO: nucleótido
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(C)
TIPO DE HEBRA: doble
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(D)
TOPOLOGÍA: lineal
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(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
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(A)
DESCRIPCIÓN: Clon de ADNc MS45 de Zea mays
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(iii)
HIPOTÉTICA: No
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(iv)
ANTISENTIDO: No
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(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
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(vi)
FUENTE ORIGINAL:
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(A)
ORGANISMO: Zea mays
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(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 1:
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1
\newpage
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(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 2:
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(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
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(A)
LONGITUD: 473 aminoácidos
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(B)
TIPO: aminoácido
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(C)
TIPO DE HEBRA:
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(D)
TOPOLOGÍA: lineal
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(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: aminoácido
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(A)
DESCRIPCIÓN:
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(iii)
HIPOTÉTICA: No
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(iv)
ANTISENTIDO: No
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(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
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(vi)
FUENTE ORIGINAL:
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(A)
ORGANISMO: Zea mays
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(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 2:
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3
4
5

Claims (37)

1. Una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
2. Una molécula de ARN de acuerdo con la reivindicación 1.
3. Una molécula de ADN de acuerdo con la reivindicación 1, que media la fertilidad en plantas.
4. Una molécula de ADN de acuerdo con la reivindicación 3, ligada a un promotor inducible sensible a un control externo.
5. Una molécula de ADN que media la fertilidad en plantas, que comprende la secuencia de la SEC ID Nº 1.
6. Un vector plasmídico que contiene la secuencia de nucleótidos de la reivindicación 1.
7. Una planta o una célula vegetal transformada por la secuencia de nucleótidos de la reivindicación 4 ó 5.
8. Una planta de la reivindicación 7 que es una planta de maíz.
9. Una célula vegetal de la reivindicación 7 que es una célula vegetal de maíz.
10. Un método para mediar la fertilidad de una planta, que comprende la mediación en la planta de una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
11. El método de la reivindicación 10, en el que la secuencia de nucleótidos mediada es una molécula de ARN.
12. El método de la reivindicación 10, en el que la secuencia de nucleótidos mediada es una molécula de ADN.
13. Un método para mediar la fertilidad de una planta, que comprende la mediación de una molécula de ADN con la secuencia de la SEC ID Nº 1 en la planta.
14. Un método para mediar la fertilidad masculina en una planta, que comprende la producción de represión de la expresión de una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
15. Un método para mediar la fertilidad masculina en una planta, que comprende la producción de represión de la expresión de la molécula de ADN con la secuencia de la SEC ID Nº 1.
16. El método de la reivindicación 14, en el que la expresión de la secuencia de nucleótidos es reprimida por mutación de la secuencia de nucleótidos.
17. El método de la reivindicación 14, que comprende además el suministro a la planta de una segunda secuencia de nucleótidos que reprime la expresión de la secuencia de nucleótidos.
18. El método de la reivindicación 15, en el que la expresión de la molécula de ADN es reprimida por mutación de la molécula de ADN.
19. El método de la reivindicación 15, que comprende además el suministro a la planta de una segunda secuencia de nucleótidos orientada en dirección antisentido con relación a la molécula de ADN, reprimiendo de este modo la expresión de la molécula de ADN.
20. El método de la reivindicación 15, que comprende además el suministro a la planta de una segunda molécula de ADN que reprime la expresión de la molécula de ADN.
21. Una planta con fertilidad masculina mediada obtenible mediante el método de cualquiera de las reivindicaciones 10 a 20.
22. Un método para proporcionar a una planta esterilidad masculina heredable, controlable externamente, que comprende:
la unión de la molécula de ADN de la reivindicación 3 a una secuencia de expresión con un promotor inducible sensible a un control externo;
el suministro de la secuencia de expresión al genoma de la planta y
la inactivación de la molécula de ADN que codifica el producto de la molécula de ADN de la reivindicación 3 procedente del genoma nativo de la planta.
23. El método de la reivindicación 22, en el que la secuencia de aminoácidos de la secuencia de ADN está codificada por la molécula de ADN de la reivindicación 5.
24. Un método para reproducir una planta que tiene esterilidad masculina heredable, controlable externamente, resultante de la sustitución de una primera molécula de ADN nativa de la planta que codifica el producto de la molécula de ADN de la reivindicación 3, por una segunda molécula de ADN de la reivindicación 3 que está ligada en una secuencia de expresión con un promotor inducible, que comprende:
la plantación de las semillas de la planta para proporcionar plantas estériles masculinas en crecimiento;
la inducción de la conversión de las plantas en crecimiento en una forma fértil masculina bajo condiciones que inducen al promotor para que exprese la segunda molécula de ADN y
la polinización abierta de las plantas en crecimiento en aislamiento para producir semillas y
la recogida de las semillas.
25. El método de la reivindicación 24, en el que la secuencia de aminoácidos de la molécula de ADN está codificada por la molécula de ADN de la reivindicación 5.
26. Una planta estéril masculina transformada de manera controlable con una secuencia de nucleótidos de acuerdo con la reivindicación 1, unida a un promotor inducible sensible a un control externo; y en la que la molécula de ADN que codifica el producto de la molécula de ADN de la reivindicación 3 en el genoma nativo de la planta está inactivada, o la expresión de la molécula de ADN que codifica el producto de la molécula de ADN de la reivindicación 3 está reprimida.
27. Un casete de expresión que contiene la secuencia de nucleótidos de la reivindicación 1 unida operativamente a secuencias reguladoras vegetales que producen la expresión de la secuencia de nucleótidos en células vegetales.
28. Una planta con fertilidad masculina mediada, en la que una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2 está inactivada, o en la que la expresión de una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2 está reprimida.
29. Una planta de acuerdo con la reivindicación 28, en la que la expresión de dicha secuencia de nucleótidos está reprimida por la expresión de una molécula de ADN que reprime la expresión de la secuencia que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
30. Una planta de acuerdo con la reivindicación 29, en la que la expresión de dicha secuencia está reprimida por la expresión de una secuencia antisentido.
31. Una planta de acuerdo con la reivindicación 30, en la que dicha secuencia de nucleótidos es inactivada por mutación.
32. Una planta de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 26 ó 28 a 31, que es una planta de maíz.
33. Una semilla híbrida obtenible mediante:
la polinización cruzada como parental hembra de una planta que tiene esterilidad masculina resultante de la inactivación o la represión de la expresión de la secuencia de ADN que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2 en el genoma nativo de la planta, y que comprende una molécula de ADN adicional de la reivindicación 3 unida en una secuencia de expresión a un promotor inducible sensible a un control externo; con, como parental masculino, una planta fértil masculina;
semilla que contiene en su genoma dicha molécula de ADN de la reivindicación 3 unida a dicho promotor inducible.
34. La semilla de la reivindicación 33 en la que, en dicha planta parental femenina dicha represión es a través de una mutación de dicha secuencia de ADN que codifica dicha secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
35. La semilla de la reivindicación 33 en la que, en dicha planta parental femenina, dicha represión es a través de la introducción de una segunda secuencia de nucleótidos que reprime la expresión de dicha secuencia de ADN que codifica dicha secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
36. La semilla de la reivindicación 33 en la que, en dicha planta parental femenina, dicha represión es a través de la introducción de una segunda secuencia de nucleótidos orientada en dirección antisentido con relación a dicha secuencia de ADN que codifica dicha secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº 2.
37. Una semilla de cualquiera de las reivindicaciones 33 a 36 que es una semilla de maíz.
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