ES2270227T3 - Promotor met-1 del maiz. - Google Patents

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Abstract

Una molécula aislada de ácido nucleico con una secuencia para un promotor capaz de iniciar la transcripción en una célula vegetal, donde dicha secuencia nucleótida se selecciona de: a) Una secuencia nucleótida que incluye la secuencia notada en SEQ ID NO: 1; b) Una secuencia nucleótida depositada como Accesión ATCC No. 207120; c) Una secuencia nucleótida que incluye al menos 40 nucleótidos contiguos de la secuencia notada en SEQ ID No. 1; d) Una secuencia nucleótida que se hibrida bajo condiciones severas a una secuencia de a), b) o c); y e) Una secuencia nucleótida que tiene al menos 70% de la identidad de la secuencia notadas en a) o b).

Description

Promotor met-1 del maíz.
Campo de la invención
La presente invención tiene que ver con el campo de la biología molecular vegetal, más particularmente con la regulación de la expresión genética en las plantas.
Antecedentes de la invención
La expresión de secuencias heterogéneas de ADN en una planta huésped depende de la presencia de un promotor que esté unido en forma operacional y sea funcional dentro de la planta huésped. La escogencia de la secuencia del promotor determinará cuándo y dónde, dentro del organismo, se expresa la secuencia heterogénea de ADN. Así, donde se desea una expresión continua a través de las células de la planta, se utilizan promotores constitutivos. En contraste, donde se desea una expresión genética en respuesta a un estímulo, promotores inducibles son los elementos regulatorios de escogencia. En cualquiera de los casos, secuencias regulatorias adicionales corriente arriba y/o corriente abajo con relación al núcleo de la secuencia promotora, pueden ser incluidas en constructos de expresión de vectores de transformación con el fin de producir variados niveles de expresiones constitutivas o inducibles de secuencias nucleótidas heterólogas en una planta transgénica.
Con frecuencia es deseable tener la expresión constitutiva de una secuencia de ADN a través de las células de un organismo. Por ejemplo, la resistencia mejorada de una planta a infecciones por patógenos presentes en el suelo y el aire puede lograrse mediante manipulación genética del genoma de la planta con el fin de incluir un promotor constitutivo unido en forma operacional a un gen heterólogo que presente resistencia al patógeno, de tal manera que las proteínas resistentes al patógeno sean continuamente expresadas a través de los tejidos de la planta.
En forma alternativa, puede ser deseable el inhibir la expresión de una secuencia nativa de ADN dentro de los tejidos de una planta con el fin de obtener un fenotipo deseado. En este caso tal inhibición se puede llevar a cabo con la transformación de la planta para que incluya un promotor constitutivo unido en forma operacional a una secuencia nucleótida antisentido, de tal forma que la expresión constitutiva de la secuencia antisentido produzca una transcripción del ARN que interfiera con la traducción del mARN de la secuencia ADN nativa.
De ésta manera, el aislamiento y caracterización de los promotores constitutivos que pueden servir como regiones regulatorias para la expresión constitutiva de secuencias nucleótidas heterólogas de interés son requeridos para la manipulación genética de plantas que exhiban rasgos fenotípicos especiales.
Resumen de la invención
Se proveen composiciones y métodos para la regulación de secuencias nucleótidas heterólogas en una planta.
La invención, por lo tanto, provee una molécula de ácido nucleico aislada con una secuencia nucleótida para un promotor capaz de iniciar la traducción en una célula vegetal donde dicha secuencia nucleótida sea seleccionada de:
a) una secuencia nucleótida que incluya la secuencia expuesta en SEQ ID NO: 1;
b) una secuencia nucleótida depositada como adquisición ATCC No. 207120;
c) una secuencia nucleótida que incluya, al menos, 40 nucleótidos contiguos de la secuencia expuesta en SEQ ID NO: 1;
d) una secuencia nucleótida que se hibride, bajo condiciones estrictas, en una secuencia de a), b) o c); y
e) una secuencia nucleótida que tenga, al menos, el 70% de identidad con una secuencia expuesta en a) o b).
La invención también provee un constructo de ADN que incluye una secuencia nucleótida de la invención unida en forma operacional a una secuencia nucleótida heteróloga de interés.
La invención también provee un vector que incluye constructo de ADN de acuerdo a la invención.
La invención también provee una célula huésped que ha incorporado en su genoma, de una manera estable, el constructo de ADN de la invención.
Se provee una composición que incluye una secuencia nucleótida nueva para un promotor vegetal constitutivo aislado del gen del maíz que codifica una metalotioneína.
También se provee un método para expresar constitutivamente una secuencia nucleótida heteróloga en una planta utilizando la secuencia promotora revelada aquí. El método incluye el transformar una célula vegetal con un vector de transformación que incluye una secuencia nucleótida unida en forma operacional al promotor vegetal de la presente invención y el regenerar una planta transformada, de manera estable, a partir de la célula vegetal transformada.
La invención también provee una célula vegetal o planta transformada, de manera estable, con un constructo de ADN de acuerdo a la invención y una semilla de dicha planta.
Breve descripción de los dibujos
La figura 1 muestra el vector plásmido PHP3953 que incluye el gen GUS unido en forma operacional al promotor ubiquitina. Fragmentos promotores de la presente invención fueron reclonados en éste plásmido en lugar del promotor ubiquitina y el plásmido ADN resultante se puso a disposición para su uso en estudios de transformación con el fin de probar la actividad del promotor.
Descripción detallada de la invención
La composición de la presente invención es una molécula de ácido nucleico que incluye una secuencia nucleótida novedosa para un promotor vegetal, más particularmente el promotor constitutivo para el gen del maíz que codifica a la metalotioneina-1. La secuencia nucleótida para éste promotor es dado en SEQ ID NO: 1. En particular, la presente invención provee una molécula de ácido nucleico aislada que incluye una secuencia nucleótida que codifica a la secuencia de ADN depositada en una bacteria huésped como Adquisición ATCC No. 207120, sus variantes y fragmentos de la misma. El promotor para este gen del maíz fue aislado de la región 5' no traducida, flanqueando su respectivo sitio de inicio de la traducción. Los métodos para aislar las regiones promotoras son bien conocidos en el arte. El méto-
do específico utilizado para obtener el promotor de la presente invención es descrito más adelante en el ejemplo 1.
Un plásmido que contiene la secuencia nucleótida promotora de la invención ha sido depositado con American Type Culture Collection (ATCC), manassas, Virginia, y se le ha asignado la Adquisición No. 207120. Este depósito será mantenido bajo los términos del Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento Internacional de Depósitos de Microorganismos para Propósitos de Procedimientos de Patentes.
La invención abarca una composición de ácido nucleico aislado o substancialmente purificado. Una molécula de ácido nucleico "aislada" o "purificada", o una porción suya biológicamente activa, está substancialmente libre de otro material celular, o de medio de cultivo cuando es producida mediante técnicas recombinantes, o substancialmente libre de precursores químicos u otros productos químicos, cuando se le sintetiza químicamente. Preferiblemente, un ácido nucleico "aislado" es libre de secuencias (preferiblemente de secuencias que codifican proteínas) que flanquean de modo natural al ácido nucleico (por ej., secuencias localizadas en los extremos 5' y 3' del ácido nucleico) en el ADN genómico del organismo del cual se deriva el ácido nucleico. Por ejemplo, en varias modalidades, la molécula de ácido nucleico aislado puede contener menos de cerca de 5 kb, 4 kb, 3 kb, 2 kb, 1 kb, 0,5 kb o 0,1 kb de secuencias nucleótidas que en forma natural flanquean la molécula de ácido nucleico en el ADN genómico de la célula de la cual se deriva el ácido nucleico.
Por "promotor" se significa una región reguladora de ADN, que usualmente incluye una caja TATA, capaz de direccionar la ARN polimerasa II para que inicie la síntesis de ARN en el sitio adecuado de transcripción para una secuencia codificante en particular. Un promotor puede incluir adicionalmente otras secuencias de reconocimiento, generalmente posicionadas cadena arriba o 5' respecto a la caja TATA, a las cuales se hace referencia como elementos promotores corriente arriba, las cuales influyen en la velocidad de iniciación de la transcripción. Es reconocido que habiendo identificado la secuencia nucleótida para la región promotora revelada aquí, está dentro del estado del arte el aislar e identificar elementos reguladores adicionales en la región 5' no traducida corriente arriba de la región promotora en particular identificada aquí. De ésta manera la región promotora revelada aquí puede incluir elementos reguladores corriente arriba adicionales que confieren expresiones específicas de tejido de cualquier secuencia nucleótida heteróloga operacionalmente unida a la secuencia promotora revelada. Ver particularmente la Patente Australiana No. AU-A-77751/94 y las Patentes U.S Nos. 5'466.785 y 5'635.618.
Cuando la secuencia promotora del maíz de la presente invención es ensamblada con un constructo de ADN de tal manera que el promotor quede operacionalmente unido a una secuencia heteróloga de interés, se habilita la expresión constitutiva de la secuencia nucleótida heteróloga en las células de una planta transformada en forma estable con éste constructo de ADN. Por "secuencia nucleótida heteróloga" se entiende una secuencia que no esté ocurriendo en forma natural con la secuencia del promotor. Mientras que ésta secuencia nucleótida es heteróloga a la secuencia del promotor, puede ser homóloga, o nativa, o heteróloga o foránea para la planta huésped. Por "constitutiva" se entiende la expresión en las células a lo largo de una planta, la mayor parte del tiempo y en la mayoría de los tejidos.
La secuencia promotora aislada de la presente invención puede ser clasificada como un promotor constitutivo débil. Generalmente, por "promotor débil" se entiende un promotor que conduce la expresión de una secuencia codificante a un nivel bajo. Por "nivel bajo" se entiende niveles cercanos a, entre aproximadamente 1/10.000 transcritos y aproximadamente 1/500.000 transcritos. Por el contrario, un promotor fuerte conduce expresiones de una secuencia codificante a un nivel alto o a cerca de, entre 1/10 de transcritos a unos 1/1000 transcritos.
La secuencia nucleótida para el promotor constitutivo de la presente invención puede ser la secuencia que ocurre en forma natural o cualquier secuencia que posea una homología substancial. Por "homología substancial" se entiende una secuencia que exhibe una equivalencia funcional y estructural substancial con la secuencia nativa o de ocurrencia natural. Cualquier diferencia natural o estructural entre secuencias substancialmente homólogas no afecta la habilidad de la secuencia para funcionar como promotora tal como se revela en la presente invención. Así, cualquier secuencia que posea homología substancial de secuencia con la secuencia del promotor constitutivo de la presente invención va a dirigir la expresión constitutiva de una secuencia nucleótida heteróloga unida en forma operacional. Dos secuencias nucleótidas promotoras se consideran substancialmente homólogas cuando presentan al menos desde cerca del 50%, 60% hasta 70%, generalmente alrededor del 80%, preferiblemente cerca del 85%, 90%, hasta el 98% de la homología de la secuencia.
Las secuencias substancialmente homólogas de la presente invención incluyen variantes de las secuencias reveladas, tales como las que resultan de la mutagénesis específica puntual, así como de secuencias sintéticamente derivadas. Los métodos para mutagénesis y alteraciones de secuencias nucleótidas son bien conocidas en el arte. Ver, por ejemplo, Kunkel (1985) Proc. Natl. Acad Sci. USA 82: 488-492; Kunkel et al. (1987) Methods Enzymol. 154: 367-382; Patente U.S No. 4'873.192; Walker et al., eds. (1983) Techniques in Molecular Biology (MacMillan Publishing Company, New York) y las referencias citadas allí. De ésta forma, la secuencia nucleótida promotora de la invención incluye ambas, la secuencia de ocurrencia natural, así como las formas mutantes y derivadas sintéticamente. Generalmente, las variantes de la secuencia nucleótida de la invención tendrán al menos desde cerca del 50%, 60% hasta el 70%, generalmente al rededor del 80%, preferiblemente desde cerca del 85%, 90% hasta el 98% de la identidad de la secuencia con relación a su respectiva secuencia nucleótida nativa.
Los fragmentos de la secuencia nucleótida promotora revelada aquí también están incluidos en la presente invención. Por "fragmento" se entiende una porción de la secuencia nucleótida promotora. Los fragmentos de una secuencia nucleótida promotora pueden retener su actividad biológica. Así, por ejemplo, menos de la secuencia promotora completa revelada aquí puede ser utilizada para conducir la expresión de una secuencia nucleótida de interés unida en forma operacional tal como una secuencia nucleótida que codifique a una proteína heteróloga. Está dentro del arte el determinar si tales fragmentos disminuyen los niveles de expresión o alteran la naturaleza de la expresión, ej., expresión constitutiva. En forma alterna, los fragmentos de una secuencia nucleótida promotora que son útiles como sondas de hibridación generalmente no retienen esta actividad biológica.
Las moléculas de ácido nucleico que son fragmentos de una secuencia nucleótida promotora constan de por lo menos 40, 45, 50, 75, 100, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 800, 900, 1.000, 1.100, 1.200 ó 1.300 nucleótidos. O hasta el número de nucleótidos presentes en una secuencia nucleótida promotora completa revelada aquí (p. ej., 1300 para SEQ ID NO: 1). Generalmente, los fragmentos de una secuencia promotora que retienen su actividad biológica constan de al menos 40 nucleótidos contiguos, preferiblemente de al menos 50 nucleótidos contiguos, más preferiblemente de al menos 75 nucleótidos contiguos, aún más preferiblemente de al menos 100 nucleótidos contiguos de la secuencia nucleótida contigua revelada aquí. Las longitudes de fragmento preferidas dependen del objetivo y variarán también dependiendo de la secuencia promotora.
Las secuencias nucleótidas de tales fragmentos usualmente incluirán la secuencia de reconocimiento TATA de la secuencia promotora. Tales fragmentos pueden ser obtenidos por uso de enzimas de restricción para romper la secuencia nucleótida promotora que ocurre naturalmente y que es revelada aquí; sintetizando una secuencia nucleótida a partir de la secuencia de ocurrencia natural de la secuencia de ADN promotora.; o puede ser obtenida a través del uso de tecnología PCR. Ver, en particular, Mullis et al. (1987) Methods Enzymol. 155: 335-350, y Erlich, ed. (1989) PCR Technology (Stockton Press, New York). Variantes de estos fragmentos promotores, tales como aquellos resultantes de mutagénesis dirigida puntual, son abarcadas por las composiciones de la presente invención.
La secuencia nucleótida promotora revelada puede ser utilizada para aislar secuencias promotoras homólogas en otras especies vegetales. Métodos para la hibridación de secuencias de ácidos nucleicos se encuentran fácilmente disponibles en el arte. Secuencias promotoras de otras plantas pueden ser aisladas de acuerdo a técnicas bien conocidas basadas en sus homologías de secuencia con relación a la secuencia promotora establecida aquí. En estas técnicas parte o toda la secuencia nucleótida conocida se usa como una sonda que se hibrida selectivamente a otras secuencias nucleótidas promotoras presentes en una población de fragmentos de ADN genómico clonados o fragmentos cADN (ej., librerías genómicas o cADN) de un organismo seleccionado.
Para obtener secuencias promotoras homólogas, se puede utilizar la secuencia nucleótida promotora completa o porciones de la misma como sondas capaces de hibridarse específicamente a secuencias promotoras correspondientes. Con el fin de lograr una hibridación específica bajo una variedad de condiciones, tales sondas incluyen secuencias que son únicas y que preferiblemente se componen de, al menos, unos 10 nucleótidos en longitud, y lo más preferiblemente de al menos 20 nucleótidos en longitud. Tales sondas pueden ser usadas para amplificar las secuencias promotoras de interés a partir de un organismo seleccionado mediante el conocido proceso de la reacción de la cadena de polimerasa (PCR). Esta técnica puede ser empleada para aislar secuencias promotoras adicionales a partir de un organismo deseado o como un ensayo diagnóstico para determinar la presencia de secuencias promotoras en un organismo.
Tales técnicas incluyen hibridación preliminar de librerías de ADN plated (ya sea placas o colonias; ver, por ej., Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual(2d ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, New York) y amplificación por PCR utilizando oligonucleótidos cebadores (ver, por ej., Innis et al., eds. (1990) PCR Protocols, a Guide to Methods and Applications. Academic Press. New York).
Por ejemplo, la hibridación de tales secuencias puede efectuarse bajo condiciones de reducida restricción, restricción mediana o aún condiciones restringidas (ej., condiciones representadas por un lavado severo con formamida 35-40% con solución de Denhardt 5x, SDS 0,5% y SSPE 1x a 37°C; condiciones representadas por un lavado severo con formamida 40-45% con solución de Denhardt 5x, SDS 0,5% y SSPE 1x a 42ºC ; y condiciones representadas por un lavado severo con formamida 50% con solución de Denhardt 5x, SDS 0,5% y SSPE 1x a 42°C respectivamente) a ADN para la secuencia promotora revelada aquí en un ensayo estándar de hibridación. Ver Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2d ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, New York). En general, las secuencias homólogas que son secuencias promotoras y se hibridan a la secuencia promotora revelada aquí, serán al menos 70% homólogas, y aún 80%, 85%, 90%, 95% homólogas o más con relación a la secuencia revelada. Esto es, la similitud de secuencia de las secuencias puede variar, compartiendo al menos cerca al 70%, y aún cerca al 80%, 85%, 90%, 95%, 98% de la similitud de secuencia.
Los siguientes términos son empleados para describir las relaciones de secuencia entre dos o más ácidos nucléicos: (a) "secuencia de referencia", (b) "ventana de comparación", (c) "identidad de secuencia", (d) "porcentaje de identidad de secuencia" y (e) "identidad substancial".
(a) Como se utiliza aquí, "secuencia de referencia" es una secuencia definida usada como base comparativa de secuencias. Una secuencia de refencia puede ser subconjunto de una secuencia completa especificada o la secuencia completa; por ejemplo, como un segmento de una secuencia completa de cADN o gen, o como la secuencia completa cADN o gen.
(b) como se utiliza aquí, "ventana de comparación" hace referencia a un segmento contiguo y especificado de una secuencia polinucleótida, donde la secuencia polinucleótida en la ventana de comparación puede incluir adiciones o deleciones (ej., gaps) comparado con la secuencia de referencia (la cual no incluye adiciones o deleciones) para alineación óptima de las dos secuencias. Generalmente, la ventana de comparación tiene una longitud de al menos 20 nucleótidos contiguos y, opcionalmente, 30, 40, 50, 100 o más. Los entendidos en el arte comprenden que con el fin de evitar una alta similitud con una secuencia de referencia debido a una inclusión de gaps en la secuencia polinucleótida, generalmente se introduce una penalización de gap y se resta del número de coincidencias.
Métodos de alineación de secuencias son bien conocidos en el arte. Una alineación óptima de las secuencias que se van a comparar puede ser efectuada mediante el algoritmo de homología local de Smith et al. (1981) Adv. Appl. Math. 2:482; mediante el algoritmo de alineación de Needleman et al (1970) J. Mol. Biol. 48: 443; mediante el método de búsqueda de similitudes de Pearson et al.(1988) Proc. Natl. Acad. Sci. 85: 2444; mediante las implementaciones computarizadas de estos algoritmos, incluyendo pero no limitadas a: CLUSTAL en el programa PC/Gene de Intelligenetics, Mountain View, California; GAP, BESTFIT, BLAST y TFASTA en el paquete Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group (GCG), 575 Science Drive, Madison, Wisconsin; el programa CLUSTAL esta bien descrito por Higgins et al. (1988) Gene 73: 237-244 (1988); Higgins et al. (1988) Gene 73: 237-244 (1988); Higgins et al. (1989) CABIOS 5: 151-153; Corpet et al. (1988) Nuc. Acids Res. 16: 10881-90: Huang et al. (1992) Computer Applications in the Biosciences 8: 155-65, y Person et al. (1994) Meth. Mol. Biol. 24: 307-331; Los métodos preferidos de alineación por computador también incluyen los algoritmos BLASTP, BLASTN y BLASTX (ver Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215: 403-410). La alineación también es a menudo realizada por inspección y alineación manual.
(c) Como se utiliza aquí, "identidad de secuencia" o "identidad" en el contexto de dos secuencias de ADN, hace referencia a los residuos en las dos secuencias que son iguales cuando se han alineado con la máxima correspondencia sobre una ventana de comparación especificada.
(d) Como se utiliza aquí, "porcentaje de identidad de secuencia" significa el valor determinado por comparación de dos secuencias óptimamente alineadas sobre una ventana de comparación, donde la porción de la secuencia nucleótida en la ventana de comparación puede incluir adiciones o deleciones (ej., gaps) con relación a la secuencia de referencia (que no incluye adiciones o eliminaciones) para una alineación óptima de las dos secuencias. El porcentaje es calculado determinando el número de posiciones en las cuales la base de ácido nucleico ocurre en ambas secuencias con el fin de obtener el número de posiciones de coincidencia, dividiendo el número de coincidencias por el número total de posiciones en la ventana de comparación, y multiplicando el resultado por 100 para obtener el porcentaje de identidad de secuencia.
(e) (i) El término "identidad substancial" de las secuencias polinucleótidas significa que un polinucleótido incluye una secuencia que tiene al menos el 70% de identidad de secuencia, preferiblemente al menos 80%, más preferiblemente al menos 90% y, lo más preferiblemente, al menos 95%, comparado con una secuencia de referencia que utiliza uno de los programas de alineación descritos empleando parámetros estándares.
Otra indicación de que las secuencias nucleótidas son substancialmente idénticas es si dos moléculas se hibridan entre sí bajo condiciones restringidas. Generalmente las condiciones restringidas son seleccionadas para que sean aproximadamente desde 5ºC hasta cerca de 20ºC por debajo del punto térmico de fusión (T_{m}) de la secuencia específica a una fuerza iónica y pH definidos. El T_{m} es la temperatura (bajo fuerza iónica y pH definidos) a la cual el 50% de la secuencia objetivo se hibrida con una sonda perfectamente coincidente. Típicamente, las condiciones severas de lavado son aquellas en las cuales la concentración de la sal es de al rededor de 0,02 molar a pH 7 y la temperatura es, al menos, aproximadamente 50, 55 o 60ºC.
La secuencia nucleótida para el promotor constitutivo revelado en la presente invención, así como una variante o fragmento suyo, es útil en la manipulación genética de cualquier planta cuando se ensambla dentro de un constructo de ADN, de tal forma que la secuencia promotora este unida en forma operacional con una secuencia nucleótida heteróloga cuya expresión constitutiva se va a controlar con el fin de lograr una respuesta fenotípica deseada. Por "unido en forma operacional" se significa que la trascripción o traducción de la secuencia nucleótida heteróloga esta bajo la influencia de la secuencia promotora. De esta manera, la secuencia nucleótida para el promotor de la invención se provee en casetes de expresión junto con secuencias nucleótidas heterólogas para expresión en la planta de interés. Se reconoce que la secuencia promotora de la invención puede también ser usada con su secuencia codificante nativa con el fin de aumentar o disminuir la expresión de la secuencia codificante nativa, resultando de ahí en un cambio de fenotipo en la planta transformada.
Tales casetes de expresión van a incluir una región de iniciación de la traducción la cual incluye la secuencia nucleótida promotora de la presente invención o una variante o fragmento suyo, unida en forma operacional a la secuencia nucleótida heteróloga cuya expresión va a ser controlada por el promotor constitutivo revelado aquí. Tal casete de expresión es provisto con una pluralidad de sitios de restricción para la inserción de la secuencia nucleótida que estará bajo la regulación de trascripción de las regiones regulatorias. El casete de expresión puede contener adicionalmente marcadores genéticos seleccionables.
Con el fin de aumentar los niveles de trascripción, se pueden utilizar potenciadores en combinación con la región promotora de la invención. Los potenciadores son secuencias nucleótidas que actúan para incrementar la expresión de una región promotora. Los potenciadores son conocidos en el arte e incluyen la región potenciadora SV40, el elemento potenciador 35S y los afines.
El casete trascripcional incluirá, en la dirección 5'a 3'de la trascripción, una región de iniciación trascripcional y de traducción, una secuencia nucleótida heteróloga de interés y una región terminal trascripcional y de traducción funcional en las plantas. La región terminal puede ser nativa con la región de iniciación trascripcional, incluyendo la secuencia nucleótida promotora de la presente invención, puede ser nativa con la secuencia de ADN de interés o puede ser derivada de otra fuente. Regiones de interés convenientes son disponibles a partir del plásmido Ti del A. tumefaciens, tales como las regiones terminales octopine sintasa y nopalin sintasa. Ver también Guerineau et al. (1991) Mol. Gen. Genet. 262: 141-144; Proudfoot (1991) Cell 64: 671-674; Sanfacon et al. (1991) Genes Dev. 5: 141-149; Mogen et al. (1990) Plant Cell 2: 1261-1272; Munroe et al. (1990) Gene 91: 151-158; Ballas et al. (1989) Nuc. Acids Res. 15: 9627-9639.
El casete de expresión que incluye la secuencia promotora de la presente invención, unida en forma operable a una secuencia nucleótida heteróloga, también puede contener al menos una secuencia nucleótida adicional para que un gen sea cotransformado en el organismo. En forma alternativa, la(s) secuencia(s) adicional(es) pueden proveerse en otro casete de expresión.
Donde sea apropiado, la secuencia nucleótida heteróloga cuya expresión va a estar bajo el control de la secuencia promotora de la presente invención, y cualquier secuencia(s) adicional(es), puede ser optimizada para aumentar la expresión en la planta transformada. Esto es, éstas secuencias nucleótidas pueden ser sintetizadas utilizando codones preferidos por las plantas con el fin de mejorar la expresión. En el arte hay disponibles métodos para sintetizar secuencias nucleótidas preferidas por las plantas. Ver, por ejemplo, U.S. Patent Nos. 5,380,831 y 5,436,391, y Murray et al. (1989) Nuc. Acids Res. 17:477-498.
Se sabe que modificaciones adicionales a las secuencias mejoran la expresión del gen en un huésped celular. Estas incluyen eliminación de secuencias que codifican señales espurias de poliadenilación, señales de sitio de empalme exón-intrón, repeticiones tipo transposón y otras secuencias bien caracterizadas que pueden ser dañinas a la expresión génica. El contenido G-C de las secuencias nucleótidas heterólogas puede ser ajustado a niveles promedio para un huésped celular dado, como ha sido calculado por referencia a genes conocidos expresados en la célula huésped. Cuando sea posible, la secuencia es modificada para evitar estructuras secundarias predichas de mARN en forma de horquilla.
Los casetes de expresión pueden contener adicionalmente secuencias líderes 5' en el constructo del casete de expresión. Tales secuencias líderes pueden actuar para mejorar la traducción. Los traductores líderes se conocen en el arte e incluyen: líderes picornavirus, por ejemplo el líder EMCV (Región 5' encefalomiocarditis no codificante) (Elroy-Stein et al. (1989) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 86:6126-6130); líderes potivirus, por ejemplo, líder TEV (virus jaspeado del tabaco) (Allison et al. (1986)); leader MDMV (virus del mosaico enano del maíz) (Virology 154:9-20); proteína enlazante de cadena pesada de la inmunoglobulina humana (BiP) (Macejak y Samow (1991) Nature 353:90-94); líder no traducido de la proteína de la cápside mARN del virus del mosaico de la alfalfa (AMV RNA 4) (Jobling y Gehrke (1987) Nature 325: 622-625); líder virus del mosaico del tabaco (TMV) (Gallie et al. (1989) Molecular Biology of RNA, páginas 237-256); y líder virus del moteado clorótico del maíz (MCMV) (Lommet et al. (1991) Virology 81: 382-385). Ver también Della-Cioppa et al. (1987) Plant Physiology 84: 965-968. Se pueden utilizar también otros métodos conocidos para mejorar la traducción y/o estabilidad del mARN , por ejemplo intrónes y afines.
En aquellos casos donde es deseable tener en forma constitutiva el producto expresado de la secuencia nucleótida dirigido a un organelo en particular, tal como el cloroplasto o la mitocondria, o secretado en la superficie de la célula o extracelularmente, el casete de expresión puede incluir adicionalmente una secuencia codificante para un péptido de tránsito. Tales péptidos de tránsito son bien conocidos en el arte e incluyen, pero no están limitados a, el péptido de tránsito para la proteína transportadora del acilo, la pequeña subunidad del RUBISCO, sintasa vegetal EPSP y las afines.
Al preparar los casetes de expresión se puede manipular los diversos fragmentos de ADN de tal forma que se provea las secuencias de ADN en la orientación adecuada y, como es debido, en el marco de lectura adecuado. Hacia este fin se puede emplear adaptadores o sitios de unión para unir los fragmentos de ADN u otras manipulaciones pueden involucrarse con el fin de proveer sitios convenientes de restricción, remoción de ADN superfluo, remoción de sitios de restricción o afines. Para este propósito se puede involucrar mutagénesis in vitro, reparación de sebadores, restricción, hibridación, resubstituciones, por ejemplo, transiciones y transversiones.
El casete de expresión que incluye la secuencia promotora de la presente invención unida en forma operacional a una secuencia nucleótida heteróloga de interés puede ser utilizado para transformar cualquier vegetal. De ésta manera se puede obtener plantas genéticamente modificadas, células vegetales, tejidos vegetales, semillas y afines. Los protocolos de transformación pueden variar dependiendo del tipo de planta o célula vegetal, esto es, monocotiledónea o dicotiledónea, escogida para la transformación. Los métodos adecuados para transformar células vegetales incluyen microinyección (Crossway et al. (1986) Biotechniques 4: 320-334), electroporación (Riggs et al. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 5602-5606), transformación mediada por agrobacterium (Hinchee et al. (1988) Biotechnology 6: 915-921), transferencia directa de genes (Paszkowski et al. (1984) EMBO J. 3: 2717-2722) y aceleración balística de partículas (ver por ejemplo, Sanford et al. U.S. Patent 4,945.050; Tomes et al. (1995) en Plant Cell, Tissue, and Organ Culture: Fundamental Methods, ed. Gamborg y Phillips (Springer-Verlag, Berlín); y McCabe et al. (1988) Biotechnology 6: 923-926). Ver también Weissinger et al. (1988) Annual Rev. Genet. 22: 421-477; Sanford et al. (1987) Particulate Science and Technology 5: 27-7 (cebolla); Christou et al. (1988) Plant Physiol. 87: 671-674 (semilla de soya); McCabe et al. (1988) Biol Technology 6: 923-926 (semilla de soya); Datta et al. (1990) Biotechnology 8: 736-740 (arroz); Klein et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 4305-4309 (maiz); Klein et al. (1988) Biotechnology 6: 559-563 (arroz); Klein et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 4305-4309 (maiz); Klein et al. (1988) Biotechnology 6: 559-563 (maiz); Klein et al. (1988) Plant Physiol. 91: 440-444 (maiz); Fromm et al. (1990) Biotechnology 8: 833-839; Hooydaas-Van Slogteren and Hooykaas (1984) Nature (Londres) 311: 763-764; Bytebier et al. (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 5345-5349 (liliacea); De West et al. (1985) en The Experimental Manipulation of Ovule Tissues, ed. G. P. Chapman et al. (Longman, New York), pp. 197-209 (polen); Kaeppler et al. (1990) Plant Cell Reports 9: 415-418; y Kaeppler et al. (1992) Theor. Appl. Genet. 84: 560-566 (transformación mediada por Whiskers); D'Halluin et al. (1992) Plant Cell 4: 1495-1505 (electroporación); Li et al. (1993) Plant Cell Reports 12: 250-255 y Christou y Ford (1995) Annals of Botany. 75: 407-413 (arroz); Osjoda et al. (1996) Nature Biotechnology 14: 745-750 (maíz vía Agrobacterium tumefaciens).
Las células que han sido transformadas pueden ser crecidas en plantas en concordancia con vías convencionales. Ver por ejemplo, McCormick et al. (1986) Plant Cell Reports 5: 81-84. Estas plantas, entonces, pueden ser cultivadas, y polinizadas, ya sea, con la misma cepa o con cepas diferentes, y el híbrido resultante puede tener la expresión constitutiva de la característica fenotípica deseable identificada. Se puede cultivar dos o más generaciones para asegurar que la expresión constitutiva de la característica fenotípica deseable se mantiene y hereda en forma estable y entonces se ha logrado semillas cultivadas para asegurar la expresión constitutiva de la característica fenotípica deseable.
La secuencia nucleótida promotora y los métodos revelados aquí son útiles en la regulación de la expresión constitutiva de cualquier secuencia nucleótida constitutiva heteróloga en una planta huésped con el fin de variar el fenotipo de una planta. Varios cambios en el fenotipo son de interés incluyendo la modificación de la composición de ácidos grasos en una planta, la alteración del contenido de aminoácidos de una planta, la alteración del mecanismo de defensa contra patógenos de una planta, y los similares. Estos resultados pueden ser obtenidos suministrando la expresión de productos heterólogos o la expresión aumentada de productos endógenos en plantas. En forma alternativa, los resultados pueden ser obtenidos suministrando una reducción de la expresión de uno o más productos endógenos, particularmente enzimas o cofactores en la planta. Estos cambios dan como resultado una variación en el fenotipo de la planta transformada.
Los genes de interés son reflectivos a los mercados comerciales y a los intereses de aquellos involucrados en el desarrollo de los cultivos. Los cultivos y mercados de interés varían y, a medida que las naciones en desarrollo abren mercados mundiales, nuevos cultivos y tecnologías también van a emerger. Adicionalmente, a medida que nuestra comprensión de las tendencias agrícolas y características tales como producción y heterosis aumenta, la variedad de genes para transformación variará igualmente. Las categorías generales de genes de interés incluyen, por ejemplo, aquellos genes involucrados en la información, tales como dedos de cinc, aquellos involucrados en la comunicación, tales como quinasas y aquellos involucrados en la manutención de la casa tales como las proteínas de choque térmico. Categorías más específicas de transgenes, por ejemplo, incluyen genes que codifican importantes características agronómicas, resistencia a los insectos, resistencia a las enfermedades, resistencia a los herbicidas, esterilidad, características de grano y productos comerciales. Genes de interés incluyen, generalmente, aquellos involucrados en el metabolismo de los aceites, almidón, carbohidratos o nutrientes así como aquellos que afectan el tamaño del grano, carga de sacarosa y similares.
Características agronómicas importantes como contenido de aceite, almidón y proteína pueden ser alteradas genéticamente en adición a la utilización de los métodos tradicionales de cultivo. Las modificaciones incluyen contenido incrementado de ácido oleico, aceites saturados e insaturados, niveles incrementados de lisina y azufre, suministro de aminoácidos esenciales y también la modificación del almidón. En la U.S. Patent Application Serial Nos. 08/838,763, solicitada el 10 de abril de 1997, se describen modificaciones de la proteína hordotionina, de donde se deriva la WO 94/16078 publicada el 21 de julio de 1994; la 08/824,379 solicitada el 26 de marzo de 1997, de la cual se deriva la WO 96/38562, publicada el 5 de diciembre de 1996; la 08/824,382 solicitada el 26 de marzo de 1997 de la cual se deriva la WO 96/38563, publicada el 5 de diciembre de 1996 y la patente U.S. No. 5,703,409. Otro ejemplo es la proteína rica en lisina y/o azufre codificada por la albúmina 2S de la semilla de soya descrita en U.S. Serial No. 08/618,911 Solicitada el 20 de marzo de 1996 de la cual se deriva la WO 97/35023, publicada el 25 de septiembre de 1997; y el inhibidor quimotripsina de la cebada, Williamson et al. (1987) Eur. J. Biochem. 165: 99-106.
Se puede hacer derivaciones de las secuencias codificantes por mutagénesis dirigida de sitio para aumentar el nivel de aminoácidos preseleccionados en el polipéptido codificado. Por ejemplo, el gen que codifica el polipéptido alto de la lisina en los cereales (BHL) se deriva del inhibidor de la quimotripsina en los cereales, PCT/US97/20441, solicitada el 31 de octubre de 1997. Otras proteínas incluyen proteínas vegetales ricas en metionina tales como las obtenidas de la semilla de girasol (Lilley et al. (1989) Proceedings of the World Congress on Vegetable Protein Utilization in Human Foods and Animal Feedsuffs, ed. Applewhite (American Oil Chemists Society, Champaign, Illinois, pp. 497-502); el maíz (Pedersen et al. (1986) J. Biol. Chem. 261: 6279; Kirihara et al. (1988) Gene 71: 359) y arroz (Musumura et al. (1989) Plant Mol. Biol. 12: 123). Otros genes de importancia agronómica codifican al látex, Floury 2, factores de crecimiento, factores de almacenamiento de semilla y factores de transcripción.
Los genes con resistencia a los insectos pueden codificar resistencia a plagas que tienen gran despliegue tales como el gusano de la raíz, el gusano gris, la oruga taladradora del maíz y similares. Tales genes incluyen, por ejemplo los genes de la proteína tóxica Bacillus thuringiensis (U.S. Patent Nos. 5,366,892; 5,747,450; 5,737,514; 5,723,756; 5,593,881; Geiser et al. (1986) Gene 48: 109); lectinas (Van Damme et al. (1994) Plant Mol. Biol. 24: 825) y las similares.
Los genes que codifican resistencia a enfermedades incluyen genes de detoxificación tales como contra fumonosina (U.S. Patent Application Serial No. 08/484,815, solicitada el 7 de junio de 1995 de la cual se deriva la WO 96/06175 publicada el 29 de febrero de 1996); avirulencia (avr) y genes con resistencia a enfermedades (R) (Jones et al. (1994) Science 266: 789; Martin et al. (1993) Science 262: 1432; Mindrinos et al. (1994) Cell 78: 1089; y los afines.
Las características de resistencia a herbicidas pueden incluir genes que codifican para resistencia a los herbicidas que actúan para inhibir la acción de la acetolactato sintasa (ALS), en particular los herbicidas tipo sulfonilurea (ej. el gen de la acetolactato sintasa (ALS) contiene mutaciones que conducen a dicha resistencia, en particular las mutaciones S4 y/o Hra), genes que codifican para la resistencia a herbicidas que actúan para inhibir la acción de la glutamina sintasa tales como el fosfinotricin o basta (ej. el gen de barra) u otros genes similares conocidos en el arte. El gen de barra codifica resistencia al herbicida basta, el gen nptll codifica resistencia a los antibióticos kanamicina y geneticina, y el gen ALS codifica resistencia al herbicida clorsulfuron.
Los genes de la esterilidad también pueden ser codificados en un casete de expresión y proveer una alternativa al despenachado físico. Ejemplos de genes utilizados de estas maneras incluyen los genes con preferencia por tejidos masculinos y genes con fenotipos de esterilidad masculina tales como el QM descrito en la Patente U.S. No. 5,583,210. Otros genes incluyen quinasas y aquellos que codifican compuestos tóxicos para, bien sea, el desarrollo gametofítico masculino o femenino.
La calidad de grano se refleja en características tales como niveles y tipos de aceites, saturados e insaturados, calidad y cantidad de aminoácidos esenciales y niveles de celulosa. En el maíz, proteínas modificadas de hordotionina, descritas en las patentes U.S. Patent Application Serial Nos. 08/838,763, solicitada el 10 de abril de 1997, de la cual se deriva la WO 94/16078, publicada el 21 de julio de 1994; la 08/824,379, solicitada el 26 de marzo de 1997, de la cual se deriva la WO 96/38562, publicada el 5 de diciembre de 1996; la 08/824,382, solicitada el 26 de marzo de 1997, de la cual se deriva la WO 96/38563, publicada el 5 de diciembre de 1996 y la patente U.S. Patent No. 5,703,409 expedida el 30 de diciembre de 1997, proveen descripciones de modificaciones de proteínas para propósitos
deseados.
Las características comerciales también pueden ser codificadas sobre un gene o genes que pudieran incrementar, por ejemplo, el almidón para la producción de etanol o proveer expresiones para proteínas. Otro uso comercial importante de las plantas transformadas es la producción de polímeros y bioplásticos tales como los descritos en la patente U.S. Patent No. 5,602,321 emitida el 11 de febrero de 1997. Genes tales como la B-cetotiolasa, PHBase (polihidroxibutirato sintasa) y acetoacetil-CoA reductasa (ver Schubert et al. (1988) J. Bacteriol. 170: 5837-5847) facilitan la expresión de los polihidroxialcanoatos (PHAs).
Los productos exógenos incluyen enzimas vegetales y productos así como aquellos de otras fuentes incluyendo los procariotes y otros eucariotes. Tales productos incluyen enzimas, cofactores, hormonas y afines. Los niveles de proteínas, particularmente las proteínas modificadas que tienen distribución mejorada de aminoácidos con el fin de mejorar el valor nutritivo de la planta, pueden ser incrementados. Esto se logra mediante la expresión de tales proteínas que tienen contenido mejorado de aminoácidos.
Así, la secuencia nucleótida heteróloga unida en forma operable al promotor constitutivo revelado aquí puede ser un gen estructural que codifica una proteína de interés. Ejemplos de tales genes heterólogos incluyen, pero no están limitados a, genes que codifican proteínas que confieren resistencia a estrés abiótico como sequía, temperatura, salinidad y toxinas como pesticidas y herbicidas, o a estrés biótico como ataque por hongos, virus, bacterias, insectos y nemátodos, y desarrollo de enfermedades asociadas con estos organismos. Más particularmente, el promotor constitutivo revelado aquí e identificado como un promotor constitutivo débil es útil en la transformación de plantas para que expresen constitutivamente un gen de avirulencia como se revela en ambas solicitudes co-pendientes titulado: "Métodos para Mejorar la Resistencia de las Plantas a Enfermedades", U.S. Application Serial No. 60/075,151, solicitada el 26 de febrero de 1998 y U.S. Application Serial No. 60/092,464, solicitado el 11 de julio de 1988, de los cuales se deriva WO 99/43823, publicada el 2 de septiembre de 1999. Tal promotor débil puede causar activación del sistema defensivo de la planta corta en muerte celular hipersensible. Así, hay una activación del sistema defensivo de la planta a niveles suficientes para protegerla de invasión patógena. En este estado hay al menos una activación parcial del sistema defensivo de la planta donde la planta produce niveles incrementados de factores antipatogénos tales como proteínas PR, es decir, PR-1, cattiness, glucanasas-a, etc; metabolitos secundarios; fitoalexinas; especies reactivas al oxígeno y similares.
Alternativamente, la secuencia nucleótida heteróloga unida en forma operacional al promotor constitutivo revelado aquí puede ser una secuencia antisentido para un gen escogido. Por "secuencia nucleótida de ADN antisentido" se significa una secuencia que está en orientación inversa a la orientación normal 5' a 3' de la secuencia nucleótida. Cuando se suministra a una célula vegetal, la expresión de la secuencia ADN antisentido previene la expresión normal de la secuencia nucleótida de ADN para el gen escogido. La secuencia nucleótida antisentido codifica un constructo ARN que es complementario a, y capaz de hibridarse al ARN mensajero endógeno (mARN) producido por la transcripción de la secuencia nucleótida de ADN para el gen escogido. En este caso, la producción de una proteína nativa codificada por el gen escogido es inhibida para lograr una respuesta fenotípica deseable. Así, la secuencia promotora revelada aquí puede estar unida en forma operativa a las secuencias ADN antisentido para reducir o inhibir la expresión de una proteína nativa en la planta.
Los siguientes ejemplos se ofrecen a modo de ilustración y no a modo de limitación.
Experimental
La región promotora para el gen del maíz que codifica una metalotioneína fue aislada de plantas de maíz y clonada. Este gen fue seleccionado como una fuente de un promotor constitutivo basado en la expresión desarrolladora y espacial de su producto génico. El método para su aislamiento se describe abajo.
Las metalotioneínas conforman una clase de proteínas que son expresadas constitutivamente en bajo número de copias en las células a lo largo de la planta. La expresión de estas proteínas en células de mamíferos es inducible en respuesta a estrés y a concentraciones elevadas de elementos traza y hormonas. La novedosa secuencia promotora para un gen de maíz que codifica una de estas metalotioneínas, met-1, es tratada en SEQ ID NO: 1.
Ejemplo 1
Aislamiento de la Secuencia Promotora
El procedimiento para el aislamiento del promotor se describe en el Manual del Usuario del kit GenomeWalker vendido por Clontech Laboratories, Inc., Palo Alto, California. El ADN genómico de la línea del maíz A63 se extrajo moliendo en nitrógeno líquido hojas de semillero de 10 días y el ADN fue preparado como lo describen Chen y Dellaporta (1994) en The Maize Handbook, ed. Freeling y Walbot (Springer-Verlag, Berlín). Se adicionó RNasa A a 10 \mug/ml y luego se incubó a 37°C durante 1 hr. El ADN fue entonces extraído una vez con fenol-cloroformo, luego cloroformo, luego etanol, fue precipitado y resuspendido en TE (10 mM Tris pH 8,0, 1 mMEDTA). El ADN fue entonces utilizado exactamente como se describe en el Manual del Usuario del kit GenomeWalker (Clontech PT3042-1 versión PR68687). Brevemente, el ADN fue digerido en forma separada con enzimas de restricción Dral, EcoRV, Pvull, Scal y Stul, todas con cortadores de extremos romos. Los adaptadores GenomeWalker fueron entonces unidos a los extremos del ADN restringido. Al ADN resultante se le refiere como DL1-DL5, respecti-
vamente.
Para el aislamiento de la región promotora específica, se designaron dos cebadores no sobrelapantes de especificidad génica (27 bp en longitud) de las secuencias de ESTs abundantes en la base de datos Pioneer/HGS. Los primeros fueron designados para amplificar la región corriente arriba de la secuencia codificante, esto es, la región 5' no traducida y la región promotora del gen. Las secuencias de los primers se dan más adelante. La primer ronda de PCR se realizó sobre cada muestra de ADN (DL1-5) con sebador Clontech AP1 (secuencia 5'-gtaatacgactcactatagggc-3'; SEQ ID NO: 2) y el sebador de especificidad génica (gsp) 1 con la siguiente secuencia:
Secuencia metalotioneína gsp1: 5'-gtacttcttgccgcacttgcagcttga-3' (SEQ ID NO: 3)
El PCR se realizó en un termociclador modelo PTC-100 con HotBonnet de MJ Research (Watertown, Massachusetts) utilizando reactivos suministrados con el kit GenomeWalker. Se utilizaron los siguientes parámetros de ciclo: 7 ciclos de 94ºC durante 2 seg, luego 72ºC durante 3 min, seguido por 32 ciclos de 94ºC durante 2 seg y 67ºC durante 3 minutos. Finalmente, las muestras se mantuvieron a 67ºC durante 4 min, luego a 4ºC hasta posterior análisis. Tal como se describe en el Manual del Usuario, el ADN de la primera ronda de PCR fue entonces diluido y utilizado como una plantilla en una segunda ronda de PCR usando sebador Clontech AP2 (secuencia 5'-actatagggcacgcgtggt-3'; SEQ ID NO: 4) y sebador de especificidad génica (gsp)2 con la siguiente secuencia:
Secuencia metalotioneína gsp2: 5'-agccgcagcttgatccgcagttgcaag-3' (SEQ ID NO: 5).
Los parámetros del ciclo para la segunda ronda fueron: 5 ciclos de 94ºC durante 2 seg, luego 72ºC durante 3 min, seguido por 20 ciclos de 94ºC durante 2 seg y 67ºC durante 3 min. Finalmente, las muestras se mantuvieron a 67ºC durante 4 min y luego se mantuvieron a 4ºC.
Aproximadamente 10 \mul de cada reacción fueron corridos en un gel agarosa 0,8%, y se escinden bandas (usualmente de 500 bp o más largas), se purificaron con el kit Sephaglas BandPrep (Pharmacia, Piscataway, New Jersey) y clonadas en el vector TA pCR2.1 (Invitrogen, San Diego, California). Se secuenciaron los clones para verificación y luego se diluyó el mini-prep ADN 1:30 en agua y 1 \mul se amplificó con gene-specific primer (gsp)3 (secuencia más adelante) y el iniciador Clontech AP2 con los siguientes parámetros de ciclo: cinco ciclos de 94ºC durante 2 seg, 46ºC durante 30 seg, 72ºC durante min, (Víctor, en el original no dice cuantos minutos), seguido de 20 ciclos de 94ºC durante 2 seg, 67ºC durante 3 min, luego 67ºC durante 4 min y se mantuvo a 4ºC.
Secuencia metalotioneína gsp3: 5'-gaccatggtgtcgtgtggatccccttgtggtgc-3' (SEQ ID NO: 6).
Diez \mul del ADN resultante amplificado fueron corridos en un gel de agarosa 0,8%, se purificaron con Sephaglas y se clonaron en el vector PCR2.1 TA. La secuencia final fue determinada sobre los plásmidos resultantes.
Ejemplo 2 Datos de Expresión de Gen Transciente Usando la Secuencia del Promotor
Un ensayo de expresión de gen transiente fue utilizado para probar la actividad promotora del ADN clonado. El promotor fue reclonado en el plásmido PHP3953 (Figura 1), digerido con BGlll y Sphl o con Bglll y Pvull con el fin de remover al promotor ubiquitina. El nuevo fragmento promotor fue insertado en lugar del promotor ubiquitina de tal forma que la región 5' no traducida de la ubiquitina y el intrón estuvieran ahora entre el promotor de prueba y el gen reportero GUS.
Se realizaron experimentos con embriones inmaduros, esencialmente la superficie escutelar. Embriones inmaduros de maíz GS3 fueron aislados de orejas 9-11 días luego de la polinización utilizando un bisturí. Antes del aislamiento del embrión, a los orejas polinizados se les esterilizó la superficie con un microdetergente y 25% de mezcla blanqueadora comercial, luego se lavaron con 3 intercambios de H_{2}O esterilizada. Los embriones inmaduros aislados (1,4-1,7 mm) fueron colocados sobre medio de bombardeo y alineados en una malla blanco en preparación para bombardeo.
Los embriones inmaduros fueron entonces tranformados mediante el método biolístico de partículas de tungsteno (Tomes et al. (1995) en Plant Cell, Tissue, and Organ Culture: Fundamental Methods, ed. Gamborg y Phillips (Springer-Verlag, Berlin); Koziel et al. (1993) Biol Technology 11: 194-200) utilizando un sistema de suministro de partículas de alta presión (Sistema de Suministro de Partículas Biolísticas Modelo PDS-100 de Dupont). Se bombardeó sobre los embriones inmaduros del maíz ADN plásmido que incluye la secuencia promotora de la invención unido de forma operacional al gen de GUS. Luego de incubación durante 40 horas, los embriones bombardeados fueron teñidos con solución de tinción X-Gluc (McCabe et al. (1988) Biol Technology 6 (87) : 923-926) durante 12 h a 37 C en la oscuridad. Se midió entonces la actividad de GUS usando el promotor ubicuito como un control, contando los puntos azules luego del teñido para la actividad de GUS como se describe en otro trabajo (ver Jefferson (1987) Plant Mol. Biol. Rep. 5: 387-405). Los datos de la expresión transciente se muestran en la tabla 1.
TABLA 1 Actividad del promotor medida por la expresión transciente de GUS (ver Christensen y Quail (1989) Plant Mol. Biol. 12: 619-632 para detalles de la actividad del promotor ubiquitina).
Gen # de puntos azules Promedio
Ubiquitina (control) 395, 155, 307, 416 318
met-1 (metalotioneína) 163, 111, 27 100
La actividad promotora de la secuencia promotora para el gen metalotioneína fue considerablemente inferior que la del promotor ubiquitina, lo cual indica que este es un promotor constitutivo débil.
Ejemplo 3 Transformación y regeneración de plantas transgénicas
Embriones inmaduros de maíz GS3 fueron bombardeados con un plásmido que contenía la secuencia promotora unida en forma operacional al gen GUS más un plásmido que contenía el gen marcador seleccionable PAT (Wohlleben et al. (1988) Gene 70: 25-37) que confiere resistencia al herbicida Bialaphos. La transformación se realizó como se describe en el ejemplo 1. Ver apéndice para ejemplos de bombardeo (560Y), selección (560R), regeneración que contiene hormonas (288J) y medio libre de hormonas (272V).
Un día luego del bombardeo los embriones fueron transferidos del medio de bombardeo al medio de selección el cual contenía 3 mg/litro de Biolaphos y fueron sub-encubados en medio de selección cada 2 semanas. Luego de aproximadamente 10 semanas de selección, los clones callos resistentes a la selección fueron transferidos a un medio que contenía hormonas con el fin de iniciar la regeneración de la planta. Luego de la maduración somática del embrión (2-4 semanas), embriones somáticos bien desarrollados fueron transferidos a un medio para su germinación y transferidos al cuarto de incubación iluminado. Aproximadamente 7-10 días después, las plántulas en desarrollo fueron transferidas a un medio libre de hormonas en tubos durante 7-10 días hasta que las plántulas estuvieron bien establecidas. Las plantas fueron entonces transferidas a insertos en planos (equivalentes a materas de 2,5'') que contenían suelo de matera y se dejaron crecer durante 1 semana en una cámara de crecimiento, se dejaron crecer subsecuentemente durante 1-2 semanas adicionales en un invernadero y luego fueron transplantadas a pots 600 clásicos (1,6 galones) y se dejaron crecer hasta su madurez.
La actividad promotora en los tejidos vegetales transformados fue evaluada midiendo la expresión de GUS. Muestras de tejido vegetal fueron colocadas en los pozos de racimos de cultivo de 12 pozos y se tiñeron con solución de tinción X-Gluc durante 12 h a 37ºC en la oscuridad. A las muestras entonces se les calificó la tinción de GUS. La calificación de la tinción de GUS va desde 0 (negativo) hasta 6 (máximo). Estas calificaciones de teñido sirvieron como una medición del nivel de expresión de GUS. Los resultados se muestran en la Tabla 2.
Cuatro eventos de transformación han sido evaluados para el promotor met-1. En general, tres eventos tuvieron puntaje correspondiente a una expresión de GUS fuerte y un evento a una expresión mediana. La expresión de GUS fue hallada en todos los tejidos vegetales incluyendo hoja, raíz, cáscara, seda y bellota, estos tejidos tuvieron puntajes en su mayoría entre 4-5.
El promotor ubiquitina fue usado como control. Cinco eventos de transformación han sido evaluados. En general, dos eventos obtuvieron puntajes para la expresión de GUS fuerte y tres para expresión débil. La expresión de GUS fue hallada en todos los tejidos vegetales incluyendo hoja, raíz, cáscara, seda y bellota. Con los eventos de transformación que exhibían expresión débil Gus fue expresado en hoja, raíz y bellota, el puntaje de estos tejidos estuvo en su mayoría entre 1 y 3. Se dio muy poca expresión de GUS en los tejidos de cáscara y seda en aquellos eventos de transformación que exhibían expresión débil.
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TABLA 2 Expresión de Gus conducida por promotor met-1 de la invención
1
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Apéndice
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272 V
2
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288 J
4
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560 R
5
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\hskip1.3cm
560 Y
7
Todas las publicaciones y aplicaciones por patente mencionadas en la especificación son indicativo del nivel de aquellos expertos en el arte a quienes pertenece esta invención.
Aunque la actual invención ha sido descrita en algún detalle a modo de ilustración y ejemplo para propósitos de claridad de entendimiento, será obvio que ciertos cambios y modificaciones pueden ser practicadas dentro de las reivindicaciones anexas.
<110> Pioneer Hi-Bred International, Inc.
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<120> Promotor de maíz Met-1
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<130> N80441A
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<150> 60/076,075
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<151> 1998-02-26
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<110> Pioneer Hi-Bred International, Inc.
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Primer PCR
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<400> 11
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtaatacgac tcactatagg gc
\hfill
22
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
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\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgggctcc tcctccgccg gcttctt
\hfill
27
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<210> 13
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtacttcttg ccgcacttgc agcttga
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 14
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggtcttgtca ccgggcatct gaccatc
\hfill
27
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtcctgtggt ggtcgacttg ccagagt
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 16
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ttcttcctcc aggccttctg ctttcca
\hfill
27
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 17
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aggagacgac gacggcacgt tcacggc
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR de gen específico del maíz
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<400> 18
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\hskip-.1em\dddseqskip
taatcggtgc tgatgaaggg gtcgttc
\hfill
27
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<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
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<121> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 19
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\hskip-.1em\dddseqskip
actatagggc acgcgtggt
\hfill
19
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR
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<400> 20
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gggcttcttc tcggccttgg gcgccat
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
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\hskip-.1em\dddseqskip
agccgcagct tgatccgcag ttgcaag
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
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\hskip-.1em\dddseqskip
cccagcacgc gtttccgacc tggatac
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR de gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tggccaataa ccacaatgtt gatgtg
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
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<400> 24
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcttgtgca tcgagtcacg cgagata
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<313> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaaggctgtg gaggagaggg ccatggt
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
acccattgat cccgatcttg atct
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial; Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat ccgatgcggc tgct
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat ccccttgtgg tgc
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat ccggtgttgt tgaacg
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat ccgtgagatt gaac
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtcgtgtg gatccgtgaa gcttaa
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat ccgcctgctc cttgtc
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<121> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
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\vskip1.000000\baselineskip
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\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat cctgcactgc tac
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: Sebador PCR para gen específico del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaccatggtg tcgtgtggat ccacaaacac aagc
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip

Claims (13)

1. Una molécula aislada de ácido nucleico con una secuencia para un promotor capaz de iniciar la transcripción en una célula vegetal, donde dicha secuencia nucleótida se selecciona de:
a)
Una secuencia nucleótida que incluye la secuencia notada en SEQ ID NO: 1;
b)
Una secuencia nucleótida depositada como Accesión ATCC No. 207120;
c)
Una secuencia nucleótida que incluye al menos 40 nucleótidos contiguos de la secuencia notada en SEQ ID No. 1;
d)
Una secuencia nucleótida que se hibrida bajo condiciones severas a una secuencia de a), b) o c); y
e)
Una secuencia nucleótida que tiene al menos 70% de la identidad de la secuencia notadas en a) o b).
2. Un constructo de ADN que incluye una secuencia nucleótida de la reivindicación 1 unida en forma operacional a una secuencia nucleótida heteróloga de interés.
3. Un vector que incluye el constructo de la reivindicación 2.
4. Una célula huésped que tiene incorporado en su genoma el constructo de la reivindicación 2.
5. Un método de expresar en forma constitutiva una secuencia nucleótido en una planta, dicho método incluye el transformar una célula vegetal con un constructo de ADN como se define en la reivindicación 2.
6. Un método de la reivindicación 5, donde dicha planta es monocotiledónea o dicotiledónea.
7. El método de la reivindicación 6, donde dicha monocotiledónea es maíz.
8. Una célula vegetal transformada en forma estable con un constructo de ADN como se define en la reivindicación 2.
9. Una planta transformada en forma estable con un constructo de ADN como se define en la reivindicación 2.
10. Una célula vegetal de la reivindicación 8 donde dicha célula vegetal es de una monocotiledónea o de una dicotiledónea.
11. Una planta de la reivindicación 9 donde dicha planta es monocotiledónea o dicotiledónea
12. Una célula vegetal de la reivindicación 10 o planta de la reivindicación 11, donde dicha monocotiledónea es maíz.
13. Semilla de la planta de la reivindicación 9, 11 o 12 incluyendo un constructo de ADN de la reivindicación 2.
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