ES2332924T3 - Proteinas de fusion fc-interferon-beta. - Google Patents
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Abstract
Una proteína de fusión Fc-interferón-ß con plegamiento mejorado y agregación reducida que comprende: (i) una región de Fc de inmunoglobulina; y (ii) una proteína de interferón ligada por unión de péptido o una secuencia ligadora de péptido al terminal carboxi de la región Fc de inmunoglobulina, en donde la proteína interferón comprende sustituciones de aminoácido comparado con la secuencia de interferón madura natural en las posiciones 17 y 50 y 131 y 140, o 17 y 57 y 131 y 140.
Description
Proteínas de fusión
Fc-interferón-\beta.
La invención se relaciona con Proteínas de
fusión Fc. Más específicamente, la invención se relaciona con
expresión de alto nivel y secreción de Proteínas de fusión
Fc-interferón-beta y formas
variantes de las mismas, y métodos para elaborar y utilizar tales
proteínas.
Los interferones son polipéptidos de cadena
sencilla secretados por la mayoría de células de animal en respuesta
a una variedad de estímulos, que incluyen virus, mitógenos y
citoquinas. Los interferones participan en la regulación de las
funciones celulares y median los efectos inmunomoduladores,
antiproliferativos, y antivíricos. Así, ellos son de gran interés
terapéuticamente. Los interferones nativos se dividen en tres tipos
principales, con base en los tipos de células de las cuales existen
principalmente derivados, a saber,
interferón-\beta (de leucocitos),
interferón-\beta (de fibroblastos),
interferón-\beta (de células inmunes).
Interferón-\beta (IFN-\beta)
que exhibe varias actividades inmunológicas y biológicas y como un
resultado tiene aplicaciones potenciales en inmunoterapia, terapias
antineoplásicas, anticáncer y antivíricas. Se han conducido y se
conducen numerosas investigaciones y ensayos clínicos con base en
propiedades anticáncer y antivíricas tipo intacto y
IFN-\beta recombinante. También se han conducido
ensayos clínicos utilizando IFN-\beta recombinante
en el tratamiento de esclerosis múltiple.
La mayoría de las citoquinas, que incluyen
IFN-\beta nativo, tienen vidas útiles circulantes
relativamente cortas. Posteriormente, con el fin de que el
IFN-\beta sea efectivo como un agente terapéutico,
se puede administrar en dosis altas y frecuentes a un paciente; sin
embargo, esto frecuentemente conduce a efectos colaterales tóxicos.
Por lo tanto, es altamente deseable producir formas de
IFN-\beta que han prolongado las vidas útiles
circulantes comparado con la citoquina nativa. Adicionalmente, para
propósitos de producción es útil producir formas de
IFN-\beta que son fáciles de expresar y purificar
en grandes cantidades.
El IFN-\beta humano
(huIFN-\beta) es una glucoproteína de 166
aminoácidos y tiene una estructura de manojo de cuatro hélices. El
huIFN-\beta recombinante se puede producir
comúnmente para uso como un terapéutico en un sistema de expresión
de mamífero o procariótico. Sin embargo, cuando las proteínas que se
secretan normalmente, tal como huIFN-\beta, en un
ambiente de mamífero se producen en un procariote, necesita ser
dirigido el efecto de la expresión procariótica en el plegamiento
de proteína y en modificaciones post-traduccionales
potenciales. Por ejemplo, en células de mamífero, la mayoría de las
proteínas destinadas para el ambiente extracelular se pliegan en el
ambiente oxidado del retículo endoplásmico (ER), que promueve la
formación correcta de enlaces disulfuro. En contraste, el ambiente
de reducción de citosol procariótico interfiere con la formación de
enlaces cisteína. Adicionalmente, las proteínas expresadas en
sistemas procarióticos carecen de algunas modificaciones
post-transduccionales, tal como glucosilación ligada
a N, que ayudan de forma similar en el plegado correcto de la
proteína, incrementa la estabilidad de la proteína plegada, y reduce
la inmunogenicidad de la proteína administrada.
Por ejemplo, cuando el
IFN-\beta de tipo intacto se expresa en un sistema
de expresión procariótico, este no se pliega apropiadamente y forma
agregados. Esto se puede superar al mutar la cisteína libre en la
posición 17 de la proteína IFN-\beta madura a,
por ejemplo, una serina. Esta cisteína en la posición 17 no se
involucra en una unión disulfuro. Ver, por ejemplo, Patente
Estadounidense No. 4,737,462. En contraste, cuando el
IFN-\beta tipo intacto se produce en un sistema
de expresión eucariótico, cuando el ambiente es apropiado para el
plegado correcto de la proteína IFN-\beta, no se
observan plegado impropio ni agregación. Debido a que la proteína
IFN-\beta parece plegar apropiadamente y no
agregar cuando se expresa en un sistema de expresión eucariótico,
esto sugiere que la glucosilación juega un papel importante en
plegado propio de la proteína IFN-\beta. El
IFN-\beta recombinante se produce en un sistema de
expresión eucariótico que experimenta glucosilación, aunque no
puede tener el patrón de glucosilación preciso del
IFN-\beta nativo''. Ver, por ejemplo, Patente
Estadounidense No. 5,795,779. Aunque la glucosilación de
IFN-\beta no parece ser esencial para su actividad
biológica, la actividad específica del IFN-\beta
glucosilado en bioensayos es mayor que la de la forma no
glucosilada. De hecho, el IFN-\beta producido en
un sistema de expresión eucariótico, tal como un sistema de
expresión de mamífero, no se agrega sustancialmente, pero forma
agregados cuando se remueve el grupo funcional glicano. Por lo
tanto, la forma glucosilada de IFN-\beta es
deseable para uso terapéutico ya que sus propiedades biofísicas son
más cercanas que aquellas de la proteína nativa de la forma no
glucosilada.
Otra posibilidad para mejorar las propiedades
biológicas de IFN-\beta es reducir o eliminar la
inmunogenicidad: la WO 02/74783 describe una proteína de fusión
Fc-IFN\beta, en donde la porción
IFN-\beta se modifica en las posiciones 50, 57 y
130 y muestra una respuesta inmune reducida.
Adicionalmente, se ha encontrado que ligar una
proteína de interés "X" a un dominio Fc de inmunoglobulina
"Fc" para crear una proteína de fusión Fc-X
("inmunofusina") generalmente tiene el efecto de incrementar la
producción de proteína significativamente. Esto se considera que
ocurre, en parte, debido a que el grupo funcional Fc de la proteína
de fusión, comúnmente denominado como el casete de expresión, se
diseña para secreción eficiente de la proteína de fusión, y en
parte debido a que se producen las proteínas y se secreten de
células de mamífero que son normalmente activas para secreción. Una
ventaja adicional de crear Proteínas de fusión Fc-X
es que las inmunofusinas resultantes exhiben una vida media
circulante incrementada cuando se compara con las proteínas libres
de interés, que puede ser una ventaja terapéutica significativa.
Existe, por lo tanto, una necesidad en la
técnica de inmunofusinas biológicamente activas que incluyen un
grupo funcional Fc fusionado a un grupo funcional
IFN-\beta optimizado por tener propiedades
biofísicas que son cercanas a aquellas del
IFN-\beta nativo.
La invención proporciona métodos y composiciones
para expresar proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta biológicamente
activas, solubles y variantes de las mismas
(Fc-IFN-\beta^{sol}), Las
proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} de la
invención demuestran propiedades biológicas mejoradas sobre las
proteínas Fc-IFN-\beta no
alteradas tal como solubilidad incrementada, vida media circulante
prolongada, actividad biológica mejorada, e inmunogenicidad
reducida.
Para mejorar la vida útil circulante de
IFN-\beta, la invención proporciona una proteína
de fusión que incluye una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta que incluye una
región de Fc de inmunoglobulina y una proteína
IFN-\beta ligada al terminal carboxi de la región
Fc de inmunoglobulina. Para mejorar el plegamiento y para reducir
la agregación, la proteína IFN-\beta incluye
sustituciones de aminoácido en las posiciones 17, 50 o 57, 130, 131,
136, y 140, que corresponden a interferón-\beta
maduro natural.
En una realización, las sustituciones de
alteración de aminoácido serina, alanina, valina o metionina en
lugar de cisteína en la posición 17. En otra realización, las
sustituciones de alteración de aminoácido histidina en lugar de
fenilalanina en la posición 50. En todavía otra realización, las
sustituciones de alteración de aminoácido alanina en lugar de
leucina en la posición 57, mientras que en una realización
adicional, las sustituciones de alteración de aminoácido alanina en
lugar de leucina en la posición 130. Una realización adicional
permite una alteración de aminoácido que sustituye alanina en lugar
de histidina en la posición 131, mientras que una realización
adicional contempla que sustituye alanina en lugar de lisina en la
posición 136. En todavía otra realización, las sustituciones de
alteración de aminoácido alanina o treonina en lugar de histidina en
la posición 140.
La región Fc de inmunoglobulina puede incluir
una región de pivote de inmunoglobulina y una región constante de
cadena pesada de inmunoglobulina. En una realización, la región Fc
se deriva de IgG4, mientras que en otra ésta se deriva de IgG1, y
en todavía otra ésta se deriva de IgG2. En otra realización, la
región Fc se deriva de IgG4 pero incluye una región de pivote de
IgG1. En todavía otra realización, la región Fc se deriva de IgG2
pero incluye una región de pivote derivada de IgG1. Cuando la región
Fc incluye un dominio CH, la lisina de terminal C de la región Fc
de inmunoglobulina se puede reemplazar por un residuo alanina. En
una realización adicional, se muta un residuo cisteína de la región
de pivote.
La invención proporciona diferentes métodos para
unir el grupo funcional Fc y el grupo funcional
IFN-\beta para crear las proteínas de fusión de
acuerdo con la invención. Por ejemplo, en una realización la región
Fc de inmunoglobulina y la proteína interferón se fusionan mediante
a una unión de péptido. En otra realización, la región Fc de
inmunoglobulina y la proteína interferón se conectan por una
secuencia ligadora de péptido para facilitar el plegamiento de la
proteína. La secuencia ligadora preferiblemente se compone de
residuos serina y glicina. Por ejemplo, en una realización, la
secuencia ligadora de péptido es Giy4SerGly4SerGly3SerGly (SEQ ID
NO:1).
En una realización, la proteína de fusión
Fc-interferón-\beta incluye
sustituciones de aminoácido en las posiciones 17, 50, 131, y 140
para mejorar el plegamiento y reduce agregación. En una realización
específica, las alteraciones de aminoácido son serina sustituida en
lugar de cisteína en la posición 17, histidina sustituida en lugar
de fenilalanina en la posición 50, alanina sustituida en lugar de
histidina en la posición 131, y treonina o alanina sustituida en
lugar de histidina en la posición 140. En ciertas realizaciones, la
región Fc incluye IgG1, IgG2, o IgG4. La proteína de fusión también
puede incluir una secuencia ligadora de polipéptido que conecta la
proteína interferón y la región Fc de inmunoglobulina. En una
realización, se muta un residuo cisteína de la región de pivote.
En otra realización, la proteína de fusión
Fc-interferón-\beta incluye
sustituciones de aminoácido en las posiciones 17, 57, 131, y 140,
que mejoran el plegamiento y reducen la agregación de la proteína de
fusión expresada. En una realización específica, las alteraciones
de aminoácido son serina sustituida en lugar de cisteína en la
posición 17, alanina sustituida en lugar de leucina en la posición
57, alanina sustituida en lugar de histidina en la posición 131, y
treonina o alanina sustituida en lugar de histidina en la posición
140. En ciertas realizaciones, la región Fc incluye IgG1, IgG2, o
IgG4. En otra realización, la proteína de fusión también puede
incluir una secuencia ligadora de polipéptido que conecta la
proteína interferón y la región Fc de inmunoglobulina. En una
realización adicional, se muta un residuo cisteína de la región de
pivote.
La invención también proporciona métodos para
codificar y expresar las proteínas de fusión de la invención. Por
ejemplo, un aspecto de la invención se relaciona con moléculas de
ácido nucleico que codifica cualquiera de las proteínas de fusión
Fc-interferón\beta anteriormente mencionadas,
mientras que en otro aspecto, la invención se relaciona con células
que contienen un ácido nucleico que codifica cualquiera de las
proteínas de fusión Fc-interferón\beta
anteriormente mencionadas. En un aspecto adicional, las moléculas de
ácido nucleico de la invención se pueden incorporar en asociación
operativa en un vector de expresión replicable que luego se puede
introducir, por ejemplo, mediante transfección, en una célula
anfitriona de mamífero competente produce la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} de
inmunoglobulina. El vector incluye una molécula de ácido nucleico
que codifica una cualquiera de las proteínas de fusión
Fc-interferón\beta anteriormente mencionadas. La
invención también abarca un vector de expresión replicable para
transfectar una célula de mamífero. El vector incluye una molécula
de ácido nucleico que codifica una cualquiera de las proteínas de
fusión Fc-interferón\beta anteriormente
mencionadas.
En otro aspecto, la invención se relaciona con
métodos para estabilizar Las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta. En una realización,
el método incluye la etapa de elaborar cualquiera de las proteínas
de fusión Fc-interferón\beta anteriormente
mencionadas. En una realización adicional, estabilizar incluye
incrementar la vida útil circulante de la proteína de fusión
Fc-interferón relacionado con una proteína de fusión
Fc-interferón no alterada. En todavía otra
realización, estabilizar incluye reducir la agregación de la
proteína de fusión Fc-interferón relacionada con
una proteína de fusión Fc-interferón no alterada,
mientras que en una realización adicional, estabilizar incluye
incrementar la actividad biológica de la proteína de fusión
Fc-interferón relacionada con una proteína de fusión
Fc-interferón no alterada.
Un aspecto adicional de la invención se
relaciona con métodos para tratar un paciente para una afección
aliviada por la administración de
interferón-\beta. En una realización, el
tratamiento incluye administrar una cantidad efectiva de cualquiera
de las proteínas de fusión interferón-\beta
mencionadas anteriormente a un mamífero que tiene la afección. En
otra realización, el método incluye administrar un ácido nucleico
que codifica cualquiera de las proteínas de fusión
interferón-\beta mencionadas anteriormente a un
mamífero que tiene la afección, mientras que en todavía otra
realización, el método incluye administrar una célula que codifica
cualquiera de las proteínas de fusión
interferón-\beta mencionadas anteriormente a un
mamífero que tiene la afección. El resumen de la invención se
relaciona con la siguiente materia objeto:
- -
- Una proteína de fusión Fc-interferón-\beta con plegamiento mejorado y agregación reducida que comprende:(i) una región de Fc de inmunoglobulina; y (ii) una proteína de interferón ligada por unión de péptido o una secuencia ligadora de péptido al terminal carboxi de la región Fc de inmunoglobulina, en donde la proteína interferón comprende sustituciones de aminoácido comparado con la secuencia de interferón madura natural en las posiciones 17 y 50 y 131 y 140, o 17 y 57 y 131 y 140.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, que tiene las siguientes sustituciones de aminoácido dentro de la proteína interferón: C17S y F50H y H131A y H140T o A, o C17S y L57A y H131A y H140T o A.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde la región Fc de inmunoglobulina comprende una región de pivote de inmunoglobulina y una región constante de cadena pesada de inmunoglobulina.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG4, IgG2 o IgG1.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG4 y comprende adicionalmente una región de pivote de inmunoglobulina derivada de IgG1, por el que preferiblemente un residuo cisteína de la región de pivote se ha mutado.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG1, y un residuo alanina se sustituye en lugar de la lisina de terminal C de la región Fc de inmunoglobulina.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG2 y comprende adicionalmente una región de pivote de inmunoglobulina derivada de IgGI, por el que preferiblemente un residuo cisteína de la región de pivote se ha mutado.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde un residuo alanina se sustituye adicionalmente en lugar de la lisina de terminal C de la región Fc de inmunoglobulina.
- -
- Una proteína de fusión respectiva, en donde la secuencia ligadora de péptido es Gly4SerGly4SerGly3SerGly.
- -
- Una molécula de ácido nucleico que codifica una cualquiera de las proteínas de fusión Fc-interferón-\beta de acuerdo con la invención.
- -
- Un vector de expresión replicable para transfectar una célula de mamífero que comprende dicho ácido nucleico.
- -
- Una célula de mamífero, seleccionada del grupo que consiste de células de hibridoma inmortal, células de mieloma NS/0, células 293, células de ovario de hámster Chino, células HeLa y Células COS, dicha célula de mamífero contiene dicho vector de expresión.
- -
- Un método para estabilizar una proteína de fusión Fc-interferón-\beta que comprende expresar una proteína de fusión Fc-interferón-\beta respectiva en una célula de mamífero como se especifica, en donde estabilizar comprende (i) incrementar la vida útil circulante de la proteína de fusión Fc-interferón-\beta relacionada con una proteína de fusión Fc-interferón-\beta no alterada, o (ii) reducir la agregación de la proteína de fusión Fc-interferón-\beta relacionada con una proteína de fusión Fc-interferón-\beta no alterada, o (iii) incrementar la actividad biológica de la proteína de fusión Fc-interferón-\beta relacionada con una proteína de fusión Fc-interferón-\beta no alterada.
- -
- El uso de una proteína de fusión Fc-interferón-\beta como se especifica para la fabricación de un medicamento para el tratamiento de esclerosis múltiple, leucemia mieloide, mieloma múltiple, Enfermedad de Hodgkin, carcinoma de célula basal, displasia cervical, osteosarcoma, hepatitis vírica, herpes zóster y herpes genital, virus papiloma, encefalitis vírica y neumonía citomegalovirus.
\vskip1.000000\baselineskip
Figuras 1A-1C son ilustraciones
esquemáticas de ejemplos no limitantes de las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} construidas
de acuerdo con la invención.
Figura 2 es una fotografía de un gel
SDS-PAGE que muestra los patrones de migración de
las proteínas de fusión
HuFc-\beta4-IFN-\beta
y
HuFc-\beta4h-IFN-\beta
sin la mutación C175 y las proteínas de fusión
HuFc-\beta4h-IFN-\beta(C17S)
en ambos reducen y no reducen los ambientes químicos.
Figura 3 es la secuencia de aminoácido para
IFN-\beta maduro (SEQ ID NO:2).
Figura 4 es la secuencia de aminoácido para el
IFN-\beta humano maduro (C17S) (SEQ ID NO:3).
Figura 5 es la secuencia de aminoácido para
Fc-IFN-\beta^{sol} humano (C17S)
del isotipo \beta4 con un pivote \beta1 modificado
(Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol})
(SEQ ID NO:4).
Figura 6 es la secuencia de aminoácido para
Fc-(ligador)-IFN-\beta humano,
partiendo con el dominio CH3 del isotipo Fc\beta4 (SEQ ID
NO:5).
Figura 7 es la secuencia de aminoácido para el
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S)
humano, partiendo con el dominio CH3 del isotipo Fc\beta4 (SEQ ID
NO:6).
Figura 8 es la secuencia de aminoácido para el
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131A H140T) humano partiendo con el dominio CH3 del isotipo
Fc\beta4 (SEQ ID NO:7).
Figura 9 es la secuencia de aminoácido para el
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131A H140A) humano partiendo con el dominio CH3 del isotipo
Fc\beta4 (SEQ ID NO:8).
Figura 10 es la secuencia de aminoácido para el
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
F50A H131A, H140A) humano, partiendo con el dominio CH3 del isotipo
Fc\beta4 (SEQ ID NO:9).
Figura 11 es la secuencia de aminoácido para
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
F50A H131A H140T) humano, partiendo con el dominio CH3 del isotipo
Fc\beta4 (SEQ ID NO:10).
Figura 12 es la secuencia de aminoácido para
IFN-\beta maduro de ratón (SEQ ID NO:11).
Figura 13 es la secuencia de aminoácido para
IFN-\beta maduro de ratón (C17S) (SEQ ID
NO:12).
Figura 14 es la secuencia de ácido nucleico que
codifica la realización de la proteína de fusión
huFc\beta4h-IFN-\beta^{sol}
(C17S) (isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado en donde la
primera cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por una serina),
partiendo de la región de pivote (SEQ ID NO:13).
Figuras 15-1 a
15-3 muestran la secuencia de ácido nucleico
linearizada del los vectores pdCs que contienen
huFc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S)
(isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado en donde la primera
cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por una serina), en donde
la región Fc y el grupo funcional IFN-\beta se
adhieren por vía de un polipéptido ligador (SEQ ID NO:14).
Figura 16 es la secuencia de ácido nucleico que
codifica la realización de la proteína de fusión
Hufc-\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C175)
(isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado en donde la primera
cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por una serina), partiendo
de la región de pivote, en donde la región Fc y el grupo funcional
IFN-\beta se adhieren por vía de un polipéptido
ligador (SEQ ID NO:15).
Figuras 17-1 a
17-3 muestran la secuencia de ácido nucleico
linearizada de los vectores pdCs que contienen
huFc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131A H140A) (isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado
en donde la primera cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por
una serina), en donde la región Fc y el grupo funcional
IFN-\beta se adhieren por vía de un polipéptido
ligador (SEQ ID NO:16).
\newpage
Figura 18 es la secuencia de ácido nucleico de
huFc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131 H140A) (isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado en
donde la primera cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por una
serina), partiendo del pivote, en donde la región Fc y el grupo
funcional IFN-\beta se adhieren por vía de un
polipéptido ligador (SEQ ID NO:17).
Figura 19-1 a
19-3 muestra la secuencia de ácido nucleico
linearizada del los vectores pdCs que contienen
huFc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
F50H H131A H140A) (isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado
en donde la primera cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por
una serina), en donde la región Fc y el grupo funcional
IFN-\beta se adhieren por vía de un polipéptido
ligador (SEQ ID NO:18).
Figura 20 es la secuencia de ácido nucleico de
huFc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
F50H H131A H140A) (isotipo \beta4 con pivote \beta1 modificado
en donde la primera cisteína del pivote \beta1 se reemplaza por
una serina) partiendo del pivote, en donde la región Fc y el grupo
funcional IFN-\beta se adhieren por vía de un
polipéptido ligador (SEQ ID NO:19).
\vskip1.000000\baselineskip
El IFN-\betamedia efectos
antiproliferativos, antivíricos e inmunomoduladores y, en adición a
su utilidad en tratar esclerosis múltiple, se anticipa que se
pueden aliviar muchas otras afecciones mediante la administración
de IFN-\beta. Por ejemplo, es útil como
tratamiento para una variedad de neoplasias, tal como leucemia
mieloide aguda, mieloma múltiple, enfermedad de Hodgkin, carcinoma
de célula basal, displasia cervical y osteosarcoma que están bajo
evaluación. El IFN-\beta también se prueba como un
agente terapéutico contra una variedad de infecciones víricas, que
incluyen hepatitis vírica, herpes zoster y herpes genital, virus del
papiloma, virus de la encefalitis, y neumonía por
citomegalovirus.
Sin embargo, cuando se administra a un paciente,
el IFN-\beta Maduro recombinante tiene una vida
útil circulante corta, haciéndolo su optimo para uso en terapia.
Por lo tanto subsiste la necesidad en la técnica de producir
variantes de IFN-\beta con propiedades
farmacocinéticas mejoradas, que incluye vida útil de suero
mejorada.
Un método conocido en la técnica para prolongar
la vida útil de proteínas pequeñas involucra ligarlas a una región
Fc de inmunoglobulina. Las fusión es en las que se colocan la región
Fc en el Terminal N de un ligando (denominada "inmunofusión
es" o fusión es "Fc-X" en donde X es un
ligando tal como IFN-\beta) tiene un número de
propiedades útiles (Lo et al., Patentes estadounidenses Nos.
5,726,044 y 5,541,087; Lo et al. (1998) Protein Engineering
11: 495). Por ejemplo, si se administra leptina a un ratón como una
molécula de fusión de Fc-leptina (ver, por ejemplo,
publicación de solicitud de patente PCT WO 00/40615), la vida útil
de circulación de la leptina se incrementa de aproximadamente 18
minutos a más de 8 horas, de manera similar, la vida útil de
IL-2 en un ratón se incrementa de unos pocos
minutos a unas pocas horas cuando se administra como una proteína de
fusión Fc-IL2.
Otra proteína útil de las proteínas de
Fc-X es aquella de la porción Fc que tiene
generalmente el efecto de incrementar significativamente la
producción de proteína. Se considera que esto ocurre, en parte
debido a que el grupo funcional Fc de la proteína de fusión,
denominada comúnmente como el casete de expresión se diseña para
secreción eficiente de la proteína de fusión y, en parte, debido a
que las proteínas de fusión se pueden producir en y secretar a
partir de células de mamíferos anfitriones que expresan naturalmente
inmunoglobulina tal como la proteína de fusión que se secreta
fácilmente de la célula anfitriona.
Aunque puede ser posible producir estas
proteínas de fusión en un sistema de expresión procariótico, se
prefiere un sistema de expresión eucariótico y se prefiere más un
sistema de expresión mamario.
De manera sorprendente se ha encontrado que
cuando una inmunofusina
Fc-IFN-\beta no alterada se
produce en un sistema de expresión eucariótico, se expresa
pobremente, se desdobla y se agrega sustancialmente. En contraste,
las proteínas IFN-\beta recombinantes producidas
en un sistema de expresión eucarióticos son solubles y 98 %
monoméricas (Runkel et al. (1998), Pharmaceutical Research
15:641). Así parece que la ubicación del grupo funcional Fc en el
Terminal N- del grupo funcional IFN-\beta afectan
la capacidad de la proteína de fusión para plegarse correctamente
cuando no se observa agregación cuando se produce
IFN-\beta como una proteína de fusión en donde el
grupo funcional IFN-\beta procede del dominio Fc
(Ver Patente U.S. No. 5,908,626). Por lo tanto subsiste la
necesidad en la técnica de crear proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta que se plieguen
correctamente y no se agreguen sustancialmente.
Por consiguiente, la invención proporciona (i)
secuencias de ácidos nucleicos que facilitan la producción eficiente
de proteínas de fusión de inmunoglobulina
Fc-IFN-\beta^{sol}; (ii)
construcciones de ácido nucleico para producción eficiente y rápida
y secreción de proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} en una
variedad de células anfitrionas de mamíferos; y (iii) métodos para
la producción, secreción, y purificación de variantes de proteínas
de fusión Fc-IFN-\beta^{sol} de
inmunoglobulina.
En particular, la presente invención proporciona
moléculas de ácido nucleico, por ejemplo, moléculas de ADN o ARN,
que se codifican en serie en la dirección 5' a 3', un polipéptido
que incluye una región fusión Fc de inmunoglobulina y una proteína
IFN-\beta^{sol}.
\newpage
Las moléculas de ácido nucleico de la invención
se pueden incorporar en una asociación operativa en un vector de
expresión que se puede introducir luego, por ejemplo, por
transfección, en un componente de célula de anfitrión mamífero para
producir la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} de
inmunoglobulina.
La invención también proporciona métodos para
estabilizar proteínas de fusión
Fc=IFN-\beta^{sol} de inmunoglobulina. Aunque
muchas proteínas se han producido y purificado exitosamente como
fusión es Fc, que incluyen muchas proteínas de manojo de cuatro
hélices tal como IL-2 (huFc-IL2), se
ha encontrado que las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta, cuando
IFN-\beta pertenece a la clase de proteínas de
manojos de cuatro hélices, forma agregados por lo menos
parcialmente debido a enlaces de disulfuro aberrantes presentes en
la proteína ("agregación covalente"). Adicionalmente, se ha
encontrado que las proteína
Fc-IFN-\beta forman agregados a
través de interacciones no covalentes así como también
("agregación no covalente").
La presente invención alivia la agregación al
proporcionar métodos de estabilización de proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta que incluyen la etapa
de elaborar una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol}, en donde la
proteína de fusión incluye una proteína IFN-\beta
que tiene alteraciones en uno o más aminoácidos, ligados al
Terminal carboxi de una región Fc de inmunoglobulina. En
realizaciones de la invención, la estabilización incluye
incrementar la solubilidad de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{SOL} con relación
a una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta fusión, que
incrementa la vida útil circulante de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{SOL} con relación
a una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta no alterada, y/o
mejorar la actividad biológica de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{SOL} con relación
a una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta no alterada. La
estabilización incrementada se alcanza en parte mediante la
eliminación de un enlace de disulfuro aberrante en la proteína de
fusión y en parte al reducir la cantidad de agregación no covalente
de la proteína de fusión.
La invención también proporciona métodos para
tratar afecciones aliviadas por fragmentos bioactivos, y
IFN-\beta, o variantes activas de los mismos a la
administrar a un mamífero una cantidad efectiva de
IFN-\beta producida por un método de la invención
y/o una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{SOL} de la
invención. La invención también proporciona métodos para tratar
afecciones aliviadas por IFN-\beta o sus variantes
activas al administrar un ácido nucleico de la invención, por
ejemplo, un "ADN desnudo", o un vector que contiene ADN o ARN
de la invención, a un mamífero que tiene la afección.
La invención proporciona proteínas de fusión y
moléculas de ácido nucleico que codifican aquellas proteínas que
incluyen una proteína IFN-\beta alterada ligada al
Terminal C de una región Fc de inmunoglobulina. El grupo funcional
IFN-\beta de inmunoglobulina. El grupo funcional
IFN-\beta puede incluir una o más mutaciones a la
estructura de aminoácido del grupo funcional
IFN-\beta y la construcción
Fc-IFN-\beta mejora las
propiedades de plegamiento de la proteína de fusión, para reducir la
agregación, y para mejorar la expresión de proteína. Por ejemplo,
el grupo funcional IFN-\beta de la proteína de
fusión soluble
Fc-IFN-\beta^{SOL} puede
contener una alteración en la posición 17, que corresponde a una
cisterna IFN-\betamaduro natural ligado al
Terminal carboxi de una región IFN-\betade
inmunoglobulina. La secuencia de aminoácido para el
IFN-\beta humano maduro natural se muestra en la
Fig. 3. la alteración de aminoácido en la posición 17 de la
proteína IFN-\beta se puede generar mediante una
sustitución de aminoácido, eliminación de aminoácido o modificación
de aminoácido a través de métodos conocidos en la técnica. Las
alteraciones preferidas al grupo funcional
IFN-\beta incluyen sustitución de una serina
(C17S), valina (C17V), alanina (C17A) o metionina (C17M) en el
lugar de la cisteína en la posición 17. Una secuencia de aminoácido
de ejemplo de una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta humana soluble
contiene la mutación C17S
(huFc-IFN-\beta^{sol} (C17S))
que se muestra en la Fig. 5 (SEQ ID NO:4), aunque la secuencia de
aminoácido para un grupo funcional IFN-\beta
incluye la mutación C17S que se muestra en la Fig. 4 (SEQ ID NO:3).
La invención también incluye las construcciones de proteína de
fusión huFc-IFN-\beta^{sol}
(C17V), huFc-IFN-\beta^{sol}
(C17A) y huFc-IFN-\beta^{sol}
(C17M).
En adición a una alteración en la posición 17
del grupo funcional IFN-\beta maduro, la invención
proporciona proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta con otros residuos
alterados. Por ejemplo, el grupo funcional
IFN-\beta se puede alterar en una o más
posiciones 17, 50, 57, 130, 131, 136, y 140 que corresponden a,
respectivamente, una cisteína, una fenilalanina, una lisina, una
leucina, una histidina, una lisina, y una histidina en la proteína
IFN-\beta madura natural. El grupo funcional
IFN-\beta se liga al Terminal carboxi de una
región Fc de inmunoglobulina. Las alteraciones a la estructura de
aminoácido en una o más de las posiciones 17, 50, 57, 130, 131,
136, y 140 pueden incluir una sustitución de aminoácido, eliminación
de aminoácido o modificación de aminoácido y se pueden generar a
través de métodos conocidos en la técnica. Las alteraciones
introducidas en estos residuos se considera que alivian las causas
de la agregación no covalente. En una realización, la fenilalanina
en la posición 50 se reemplaza por histidina (F50H). En otra
realización, la leucina en la posición 57 se remplaza por alanina
(L57A). En una realización adicional, la histidina en la posición
131 se remplaza por alanina (H131A), aunque aún en otra
realización, la histidina en 140 se remplaza por alanina (H140A) o
treonina (H140T). En otra realización, la leucina en la posición 130
se remplaza por alanina (L130A), aunque aún en otra realización, la
lisina en el residuo 136 se remplaza por alanina (K136A). Aunque se
han enumerado ciertas sustituciones de aminoácidos aquí, la
invención no se limita a estas alteraciones enumeradas. Cualquier
aminoácido adecuado capaz de conferir las propiedades apropiadas
sobre la proteína de fusión se puede sustituir en lugar del residuo
de aminoácido original en la posición 17, 50, 57, 130, 131, 136, y/o
140 del grupo funcional IFN-\beta.
La invención contempla un grupo funcional
IFN-\beta de una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} que tiene
cualquier combinación de uno, dos, tres, cuatro, cinco, seis, o de
las alteraciones a las posiciones 17, 50, 57, 130, 131, 136 y/o 140
como se describe aquí.
Por ejemplo, el
Fc-IFN-\beta^{sol} en una
realización contiene alteraciones de aminoácidos en uno más de F50,
H131 y H140 de la forma madura del IFN-\beta,
combinado opcionalmente con una alteración C17. En otra
realización, el grupo funcional IFN-\beta de la
proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} contiene
alteraciones de aminoácidos en uno o más de L57, H131 y H140 de la
forma madura de IFN-\beta, combinado
opcionalmente con una alteración C17, en otra realización, el grupo
funcional IFN-\beta de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta incluye las
alteraciones C17S, F50H, H131A, y/o H140A. Las Figs.
8-11 muestran secuencias de aminoácido de ejemplo
de las realizaciones de las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} que
incorporan varias combinaciones de estas mutaciones. En aún otra
modalidad, el grupo funcional IFN-\beta de la
proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} incluye las
alteraciones C17S, F50H, H131A, y/o H140T. En aún otra modalidad,
el grupo funcional IFN-\beta de la proteína de
fusión Fc-IFN-\beta^{sol}
incluye las alteraciones C17S, L57A, H131A, y/o H140A, aunque en
una realización adicional, las proteínas de fusión incluyen las
alteraciones C17S, L57A, H131A, y/o H140T. La región Fc es
preferiblemente una región Fc humana.
Otra realización de la invención incluye una
secuencia de ácido nucleico que codifica variantes
Fc-IFN-\beta^{sol} con por lo
menos una sustitución de codón en la secuencia de proteína
IFN-\beta humana madura. En una realización, una
sustitución de codón reemplaza la cisteína que corresponde a la
posición 17 en la secuencia IFN-\beta humana
madura con una serina (C17S). La expresión de esta secuencia de
nucleótido, contenida en un plásmido apropiado, en un sistema de
cultivo celular de mamífero resulta en la producción eficiente de
la proteína de fusión
huFc-liuIFN-\beta^{sol} (C17S).
En realizaciones alternas, una sustitución de codón reemplaza la
cisteína en la posición 17 con una alanina, valina, o una metionina.
De manera similar, la expresión de cualquiera de estas secuencias
de nucleótido, contenidas en un plásmido apropiado, en un sistema
de cultivo celular de mamífero resultará en la producción eficiente
de proteína de fusión
huFc-huIFN-\beta^{sol} (C17A),
huFc-huIFN-\beta^{sol} (C17V), o
huFc-huIFN-\beta^{sol} (C17M).
En una realización, una secuencia de ácido nucleico que codifica
una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta sol representativa
huFcy4h-IFN-\beta^{sol} (C17S),
que parte del pivote, se describen en la Fig. 14 (SECUENCIA ID
NO:13). La invención también incluye secuencias de ácido nucleico
que codifican variantes
Fc-IFN-\beta sol con sustituciones
de codón que reemplazan los aminoácidos en una o más posiciones 17,
50, 57,130, 131, 136 y/o 140. Los ácidos nucleicos que incorporan
los codones alterados de la invención se pueden crear utilizando los
métodos conocidos en la técnica.
La región Fc de inmunoglobulina y el grupo
funcional IFN-\beta de una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta ^{sol} se pueden
ligar una a la otra en una variedad de formas. Aunque el Terminal C
del grupo funcional Fc se puede ligar directamente al Terminal N
del grupo funcional IFN-\beta por vía de un enlace
péptido, la invención incluye adicionalmente conectar el grupo
funcional Fc y el grupo funcional IFN-\beta a
través de un péptido ligador. El péptido ligador se ubica entre el
Terminal C del grupo funcional Fc y el Terminal N del grupo
funcional IFN-\beta maduro. La invención también
incluye una secuencia de ácido nucleico que codifica el péptido
ligador. El péptido ligador está compuesto preferiblemente de
residuos de serina y glicina. En una realización, el ligador tiene
la secuencia de aminoácido Gly_{4}SerGly_{4}SerGly_{3}SerGly
(SEQ ID NO:1), aunque en aún otra realización un ácido nucleico que
codifica un Fc-IFN-\beta^{sol}
incluye una secuencia de ácido nucleico que codifica el péptido
ligador Gly_{4}SerGly_{4}SerGly_{3}SerGly (SEQ ID NO:1).
Algunas secuencias de aminoácido
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
de ejemplo de la invención se muestran en las Figs.
6-11, aunque algunas pueden ser de ácido nucleico
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
de ejemplo de la invención se muestran en las Figs.
14-16. Por ejemplo, en una realización, la proteína
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
es
huFc#4-ligador-IFN-\beta^{sol}
(C17S), en donde la región Fc es una región Fc IgG4, y el ligador
es Gly_{4}SerGly_{4}SerGly_{3}SerGly (SEQ ID NO:1). La
expresión de la proteína de fusión de la invención de las
secuencias de nucleótido
Fe-IFN-\beta^{sol} y
Fc-ligador-FN-\beta^{sol},
tal como aquellas discutidas anteriormente, cuando están contenidas
en un plásmido apropiado, en un sistema de cultivo celular de
mamífero resultara en la producción eficiente de proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} y
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}.
Como se menciono anteriormente, las proteínas de
fusión Fc-IFN-\beta^{sol} de la
invención demuestran propiedades biológicamente mejoradas sobre las
proteínas de fusión Fc-IFN-\beta
no alteradas. Por ejemplo, se ha encontrado que las propiedades de
plegamiento exhibidas del
Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol}
(C17S) humano que son diferentes de, y sobre, la proteína de fusión
padre Fc\beta4-IFN-\beta^{sol}
y Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol}.
En particular; como se demuestra en la Fig. 2, se ha encontrado que
una especie predominantemente única de la proteína de de fusión
humana
Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol}
(C17S) 3, 4 se ve cuando se expresa en células de cultivo de tejido
de mamífero, como se comprueba por análisis de gel
SDS-PAGE sin reducción. Estas especies corresponden
a la proteína de fusión
Fc\beta4-IFN-\beta^{sol}
plegadas correctamente 3, 4. En contraste, para la molécula padre
Fc\beta4-IFN-\beta^{sol}1 y
para
Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol}2, se
observan muchas especies de alto peso molecular, como se evidencian
por un ensayo no resuelto de proteínas de alto peso molecular en un
gel SDS-PAGE de reducción 1, 2. En un sistema de gel
SDS-PAGE de reducción, se resuelve este ensayo a un
grado significativo dentro de una única banda para
Fc\beta4-IFN-\beta^{sol}5
humano y
Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol}6, lo
que sugiere que la agregación fue bastante controlada por la
presencia de enlaces de disulfuro covalentes. Por lo tanto, la
introducción del único punto de mutación C17S en la proteína de
fusión
Fc\beta4h-IFN-\beta^{sol}
humana 7 se almacena nuevamente en forma apropiada plegando la
proteína 7.
Más aún, se ha encontrado por cromatografía de
exclusión de tamaño (SEC), que, aunque la proteína no agregada de
la molécula padre no se puede obtener, por lo menos el 10% de la
Fc-IFN-\beta^{sol} (C17S) no se
agrega después de la purificación con Proteína A. Por lo tanto, la
introducción de una mutación de único punto C17S en la proteína de
fusión Fc-IFN-\beta^{sol}
facilita la producción de material no agregado. Adicionalmente la
introducción de un péptido ligador en la unión entre la región Fc el
grupo funcional IFN-\beta resulta en un
incremento aproximado de dos veces en el rendimiento de un material
no agregado sobre el
Fc-IFN-\beta^{sol} (C17S) sin
el ligador. La expresión de, por ejemplo, una secuencia de
nucleótido que codifica la proteína de fusión
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
(C17S F50H H131A H140A) en donde en donde el ligador es
Gly_{4}SerGly_{4}SerGly_{3}SerGly (SEQ ID NO:1), como se
muestran en las Figs. 19-1 a 19-3,
contenidas en un plásmido apropiado, en un sistema de cultivo
celular de mamífero resultado en la producción eficiente de la
proteína de fusión
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
(C17S F50H H131A H140A). Se ha encontrado que este producto de
proteína de fusión contiene aproximadamente 50% de material no
agregado después de la purificación por Proteína A, como evalúa por
SEC analítico, que representa una mejora adicional considerable
sobre los resultados obtenidos con la proteína
Fc-IFN-\beta^{sol} que contiene
un única mutación de punto en IFN-\beta,
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
(C17S). Un incremento adicional similar en las características de
expresión se puede ver con la proteína
Fc-IFN-\beta^{sol}
Fc-ligador-IFN-\beta^{sol}
(C17S L57A H131A H140T).
Como se mencionó previamente, la invención
proporciona secuencias de ácido nucleico codificante y secuencias
de aminoácidos que definen proteínas de fusión que incluyen una
región de Fc de inmunoglobulina y por lo menos una proteína
objetivo, denominada aquí como IFN-\beta o
variantes de las mismas. Tres realizaciones de ejemplo de
construcciones de proteínas que incorporan la invención se ilustra
en los dibujos como Figs. 1A-1C. debido a que se
prefieren construcciones diméricas, todas se ilustran como dímeros
reticulados por un par de enlaces de disulfuro entre cisteínas en
las subunidades adyacentes. En los dibujos, en los enlaces de
disulfuro 11, 12 se describen por ligar las dos regiones Fc de
cadena pesada de inmunoglobulina 1, 1' a través de una región de
pivote de inmunoglobulina dentro de cada cadena pesada, y así son
características de las formas naturales de estas moléculas. Aunque
las construcciones que incluyen la región de pivote del Fc se
prefieren y se han mostrado promisorios como agente terapéuticos,
la invención contempla que la reticulación en otras posiciones se
puede seleccionar según se desee. Adicionalmente, bajo algunas
circunstancias, los dímeros o multímeros útiles en la práctica de
la invención se pueden producir mediante asociación no covalente,
por ejemplo, mediante interacción hidrófoba. Debido a que las
construcciones homodiméricas son realizaciones importantes de la
invención, los dibujos ilustran tales construcciones. Se debe
apreciar, sin embargo, que las estructuras heterodiméricas también
son útiles en la práctica de la invención.
Fig. 1A ilustra una construcción dimérica,
también denominada una "unidad dímero", producido de acuerdo
con los principios establecidos aquí (ver, por ejemplo, Ejemplo 1).
Cada monómero del homodímero incluye una región de Fc de
inmunoglobulina 1 que incluye una región de pivote, un dominio CH2 y
un dominio CH3. Unido directamente, es decir, vía de un enlace
polipéptido, al terminal C de la región Fc que es
IFN-\beta^{sol}2. Se debe entender que la
región Fc se puede unir a la proteína
IFN-\beta^{sol} por vía un ligador polipéptido
(no mostrado).
La Figs. 1B y 1C describen construcciones de
proteína de la invención que incluyen como proteína objetivo una
pluralidad de proteínas IFN-\beta dispuestas en
tándem y y conectadas por un ligador. En la Fig. 1B, la proteína
objetivo incluye IFN-\beta2 de longitud completa,
un polipéptido ligador hecho de residuos glicina y serina 4, y una
variante activa de IFN-\beta3. Esta construcción
se puede describir por la fórmula
Fc-X-X en donde las X representan
diferentes proteínas objetivo. La Fig. 1C difiere de la construcción
de la Fig. 1B en que el dominio de la proteína de terminal C
incluye una segunda copia de terminal de longitud completa del
IFN-\beta2. Esta construcción se puede describir
por la fórmula Fc-X-X, en donde las
X representan proteínas objetivos idénticas. Aunque las Figs.
1A-1C representan construcciones
Fc-X, donde X es la proteína objetivo, se contempla
que las proteínas útiles de la invención también se pueden describir
por la fórmula X-Fc-X, en donde las
X pueden representar las mismas o diferentes proteínas objetivo.
Como se muestran en las Figs. 1B y 1C, la
proteína de fusión puede incluir una segunda proteína objetivo
(Fc-X-X). Por ejemplo, en adición a
una proteína de fusión que tiene una primera proteína objetivo
IFN-\beta, la proteína de fusión también puede
incluir una segunda variante madura, de longitud completa
IFN-\beta o una variante
IFN-\beta^{sol} activa o su fragmento bioactivo.
En un aspecto, la variante activa es una variante en la que uno o
más residuos de aminoácidos en el grupo IFN-\beta
se sustituye por otro residuo de aminoácido. Se discute previamente
varias variantes de sustitución IFN-\beta. Por
ejemplo, una cisteína en la posición 17, que corresponde al
IFN-\beta maduro natural se puede reemplazar con
una serina, una valina, una alanina o una metionina. En este tipo
de construcción, las primeras y las segundas proteínas pueden ser la
misma proteína, como en, por ejemplo, la Fig. 1C, o pueden ser
diferentes proteínas, como en, por ejemplo, la Fig. 1B. Las
primeras y la segundas proteínas se pueden ligar, ya sea
directamente o por medio de un ligador polipéptido.
Alternativamente, se pueden ligar ambas proteínas directamente o por
vía de un ligador de polipéptido, a la región Fc de
inmunoglobulina. En una realización adicional, la primera proteína
se puede conectar a la terminal N de la región Fc de
inmunoglobulina y la segunda proteína se puede conectar al terminal
C de la región Fc de inmunoglobulina.
En una realización, se pueden ligar dos
proteínas de fusión para formar dímeros. Las dos proteínas de fusión
se pueden asociar, covalentemente, por ejemplo, mediante un enlace
de disulfuro, un enlace de polipéptido o un agente de reticulación,
o no covalentemente, para producir una proteína dimérica. En una
realización preferida, las dos proteínas de fusión se asocian
covalentemente por medio de por lo menos uno y más preferiblemente
dos enlaces de dilsufuro intracadena a través de residuos cisteína,
ubicados preferiblemente dentro de regiones de pivote de
inmunoglobulina dispuestos dentro de las regiones Fc de
inmunoglobulina de cada cadena.
Otras realizaciones de la invención incluyen
formas multivalentes y multiméricas de proteínas de fusión
IFN-\beta y sus combinaciones.
Como utiliza aquí, el término
"multivalente" se refiere a una molécula recombinante que
incorpora dos o más segmentos biológicamente activos. Los fragmentos
de proteína que forman la molécula multivalente se pueden ligar
opcionalmente a través de un ligador polipéptido que une las partes
constituyentes y permite que cada una funcione
independientemente.
\newpage
Como utiliza aquí, el término "bivalente"
se refiere a una molécula recombinante multivalente que tiene la
configuración Fc-X, donde X es una proteína
IFN-\beta. Las dos proteínas se pueden ligar a
través de un ligador péptido. Las construcciones del tipo mostrado
pueden incrementar la afinidad de unión evidente entre la proteína y
su receptor.
Como utiliza aquí, el término "multímerico"
se refiere a la asociación estable de dos o más cadenas de
polipéptido covalentemente, por ejemplo, por medio de una
interacción covalente, por ejemplo, un enlace de disulfuro, o no
covalentemente, por ejemplo, mediante interacción hidrófoba. El
término multímero está destinado abarcar homomultímeros, en donde
las subunidades son las mismas, así como también, heteromultímeros,
en donde las subunidades son diferentes.
Como utiliza aquí, el término "dimérico" se
refiere a una molécula multimérica especifica en donde dos cadenas
de polipéptido se asocian establemente a través de interacciones
covalentes o no covalentes. Tales construcciones se muestran
esquemáticamente en Fig. 1A. se debe entender que la región Fc de
inmunoglobulina que incluyen por lo menos una porción de la región
de pivote, un dominio CH2 y un dominio CH3, forma típicamente un
dímero. Los ligandos de proteína principal se conocen por unirse a
sus receptores como un dímero. Si un ligando de proteína X se
dimeriza naturalmente, el grupo funcional X en una molécula
Fc-X se dimerizará a un grado mucho mayor, en razón
a que el proceso de dimerización es dependiente de la concentración.
La proximidad física de los dos grupos funcional es X conectados
por Fc harían de la dimerización un proceso intramolecular,
cambiando principalmente el equilibrio a favor del dímero y
mejorando su unión al receptor.
Como utiliza aquí, el término "ligador de
polipéptido" se entiende que significa una secuencia de
polipéptido que puede ligar dos proteínas que en la naturaleza no
se ligan naturalmente. El polipéptido ligador incluye
preferiblemente una pluralidad de aminoácidos tal como alanina,
glicina y serina o combinaciones de tales aminoácidos.
Preferiblemente, el polipéptido ligador incluye a series de péptidos
glicina y serina alrededor de 10-15 residuos de
longitud. Ver, por ejemplo, Patente Estadounidense Nos. 5,258,698 y
5,908,626. Un polipéptido ligador preferido de la invención es
Gly_{4}SerGly_{4}SerGly_{3}SerGly (SEQ ID NO:1). Sin embargo,
se contempla, que la longitud del ligador óptimo y la
com-
posición de aminoácido se puede determinar por métodos de experimentación de rutina bien conocidos en la técnica.
posición de aminoácido se puede determinar por métodos de experimentación de rutina bien conocidos en la técnica.
Como utiliza aquí, el término "interferón-"
o "IFN-\beta" se entiende que significa no
solo el interferón-\beta maduro de longitud
completa, por ejemplo, IFN-\beta humano, sino
también los homólogos, variantes y fragmentos bioactivos o
porciones de los mismos. Las secuencias conocidas de
IFN-\beta se pueden encontrar en GenBank. El
término "interferón-\beta" o
"IFN-\beta" también incluye
IFN-\beta y proteínas similares a
IFN-\beta, grupos funcional es y moléculas así
como también IFN-\beta que se produce de manera
recombinante o se sintetiza artificialmente.
El término "fragmentos bioactivo" o
porciones se refiera a cualquier fragmento de proteína
IFN-\beta que tiene por lo menos 5%, más
preferiblemente por lo menos 10%, y más preferiblemente por lo menos
20% y óptimamente por lo menos 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% o
100% de actividad biológica de la proteína
IFN-\beta humano de plantilla de la SEQ ID NO:2,
determinada utilizando el ensayo de actividad o ensayo de inhibición
de crecimiento celular, como se describe en los ejemplos 6 y 7. El
término "variantes" incluye variantes alélicas de especie, así
como también otras variantes de ocurrencia natural o no natural, por
ejemplo, generadas por protocolos de ingeniería genética, que son
por lo menos 70% similares o 60% idénticos, más preferiblemente por
lo menos 75% similar o 65% idéntico, y más preferiblemente por lo
menos 80% similar o 70% idéntico a la proteína humana
IFN-\beta madura en la SEQ ID NO:2.
A fin de determinar si un polipéptido candidato
tiene la identidad o porcentaje de similitud requisito con un
polipéptido de referencia, la secuencia de aminoácido candidata y la
secuencia de aminoácido de referencia se alinean primero utilizando
el algoritmo de programación dinámico descrito en Smith y Waterman
(1981) J. MOL. BIOL. 147:195-197, en combinación
con la matriz de sustitución BLOSUM62 descrita en la Fig. 2 de
Henikoff y Henikoff (1992), "Amino acid substitution matrix from
protein blocks", PROC. NATL. ACAD. SCI. USA
89:10915-10919. Para la presente invención, un
valor apropiado para la penalidad de inserción de espacio es -12, y
un valor apropiado para la penalidad de extensión de espacio es -4.
las alineaciones de desempeño de programas de computador que
utilizan el algoritmo Smith-Waterman y la matriz
BLOSUM62, tal como la suite de programas GCG (Oxparad Molecular
Group, Oxparad, Inglaterra), están disponibles comercialmente y se
utilizan ampliamente por aquellos expertos en la técnica.
Una vez se hace la alineación entre la secuencia
de referencia y candidata, se puede calcular un porcentaje de
clasificación de similitud. Los aminoácidos individuales de cada
secuencia se comparan secuencialmente de acuerdo con su similitud
uno al otro. Si el valor de la matriz BLOSUM62 que corresponde a los
dos aminoácidos alineados es cero o un número negativo, la
clasificación de similitud en forma de pares es cero; de otra forma,
la clasificación de similitud en forma de pares es 1.0. La
clasificación de similitud bruta es la suma de las clasificaciones
de similitud en forma de pares de los aminoácidos alineados. La
clasificación bruta se normaliza luego al dividirla por el número
de aminoácidos en las secuencias candidato o de referencia más
pequeñas. La clasificación bruta normalizada es porcentaje de
similitud. Alternativamente, para calcular un porcentaje de
identidad, los aminoácidos alineados de cada secuencia se comparan
de nuevo secuencialmente. Si los aminoácidos no son idénticos, la
clasificación de identidad en forma de pares es cero; de otra forma
la clasificación de identidad en forma de pares es 1.0. La
clasificación de identidad bruta es la suma de los aminoácidos
alineados idénticos. En la clasificación bruta se normaliza luego al
dividirla por el numero de aminoácidos en las secuencias candidato
de referencia más pequeñas. La clasificación bruta normalizada es
el porcentaje de identidad. Se ignoran las inserciones y
eliminaciones para los propósitos de calcular el porcentaje de
similitud de identidad. De acuerdo con lo anterior, no se utilizan
penalidades de espacio en este cálculo, aunque ellas utilizan en la
alineación inicial.
También se pueden incluir otras proteínas
mutantes IFN-\beta variantes que tienen actividad
similar a IFN-\beta. Las variantes alélicas y de
especie, que incluye, pero no se limitan a secuencias
IFN-\beta humanas y de ratón. Las proteínas
IFN-\beta maduras humanas y de ratón se describen
en la SEQ ID NOs.:2 y 11, y en las Figs. 3 y 12
respectiva-
mente.
mente.
Adicionalmente, la secuencia
IFN-\beta puede incluir una porción o todo de la
secuencia consesus establecida en la SEQ ID NO:2, en donde el
IFN-\beta tiene por lo menos 5%, preferiblemente
por lo menos 10%, más preferiblemente por lo menos 20%, 30% o 40%,
más preferiblemente por lo menos 50%, y óptimamente 60%, 70%, 80%,
90% o 100% de la actividad biológica del
IFN-\beta humano maduro de la SEQ ID NO:2, como se
determina utilizando el ensayo de actividad antivírica o el ensayo
de inhibición de crecimiento celular de los Ejemplos 6 y 7.
La estructura tridimensional del
IFN-\beta se ha resuelto por cristalografía de
rayos X- (Karpusas et al, 1997, PNAS 94: 11813). Aunque en
el estado cristalizado, la molécula IFN-\beta es
un dímero con un ión de zinc en la interfaz de dímero, considera
que el IFN-\beta no necesita ser un dímero con el
fin de ser activo. Estructuralmente el IFN-\beta
contiene un segmento alfa-helicoidal adicional con
respecto a las proteínas de manojo de cuatro hélices clásicas, que
se forma dentro del bucle C-D, de tal manera que se
forma la estructura de manojo por las hélices A, B, C y E. de
manera interesante, la estructura también revela una porción del
grupo funcional glicano que se acopla al aminoácido N80 al inicio de
la hélice C y se ordena junto con una porción de la proteína,
protege más probablemente algunos de los residuos de aminoácidos
hidrófobos expuestos a la superficie del disolvente. Se ha mostrado
que la glucosilación del IFN-\beta es importante
para la estabilidad y solubilidad de la molécula, y así puede
explicar la propensión de la molécula no glucosilada
IFN-\beta a agregarse. La cisteína libre en la
posición 17 en la hélice A parece próxima a la superficie pero
enterrado, y, sin desear estar limitado por la teoría, es posible
que los enlaces de disulfuro mezclados puedan a su vez evitar la
glucosilación correcta de la proteína.
La dimerización de un ligando puede incrementar
la evidente afinidad de unión entre el ligando y su receptor. Por
ejemplo, si un grupo funcional interferón-beta de
una proteína de fusión
Fc-interferón-beta se puede unir a
un receptor sobre una célula con una cierta afinidad, el segundo
grupo funcional interferón-beta de la misma
proteína de fusión
Fc-Interferón-beta se puede unir a
un segundo receptor en la misma célula con una avidez mucho mayor
(afinidad evidente). Esto puede ocurrir debido a la proximidad
física del segundo grupo funcional interferón-beta
del receptor después de que el primer grupo funcional
interferón-beta ya se ha unido. En el caso de una
unión de anticuerpo a un antígeno, la afinidad de evidente se puede
incrementar por lo menos diez mil veces, es decir, 104. Cada
subunidad de proteína, es decir, "X", tiene su propia función
independiente de tal manera que en una molécula multivalente, las
funciones de las subunidades de proteína pueden ser aditivas o
sinérgicas. Así, la fusión de la molécula Fc normalmente dimérica
para el interferón-beta puede incrementar la
actividad del interferón-beta. De acuerdo con lo
anterior, las construcciones de tipo mostrados en la Fig. 1A pueden
incrementar la evidente afinidad de unión entre el
interferón-beta y su receptor.
Las proteínas de fusión
IFN-\beta descritas aquí se expresan como
proteínas de fusión con una región Fc de una inmunoglobulina. Como
se sabe, cada región constante de cadena pesada de inmunoglobulina
incluye cuatro o cinco dominios. Los dominios se denominan
secuencialmente como sigue:
CH1-pivote-CH2-CH3(-CH4).
Las secuencias de ADN de los dominios de cadena pesada tienen
homología cruzada entre las clases de inmunoglobulina, por ejemplo,
el dominio CH2 del IgG es homologo al dominio CH2 del IgA e IgD, y
al dominio CH3 del IgM e IgE.
Como utiliza aquí, el término, "región Fc de
inmunoglobulina" se entiende que significa la porción de Terminal
carboxilo de una región constante de cadena de inmunoglobulina,
preferiblemente una región constante de cadena pesada de
inmunoglobulina, o una porción de la misma. Por ejemplo, una región
Fc de inmunoglobulina puede incluir 1) un dominio CH2 2) un dominio
CH3, 3) un dominio CH4 4) un dominio CH2 y un dominio CH3, 5) un
dominio CH2 y a CH4, 6) un dominio CH3 y un dominio CH4 o 7) una
combinación de una región de pivote de inmunoglobulina y/o un
dominio CH2 y/o un dominio CH3 y/o un dominio CH4. En una
realización, la región Fc de inmunoglobulina incluye por lo menos
una región de pivote de inmunoglobulina, aunque en otra realización
la región Fc de inmunoglobulina incluye por lo menos una región
pesada constante de inmunoglobulina, por ejemplo, un dominio CH2 o
un dominio CH3, y dependiendo del tipo de inmunoglobulina utilizada
para generar la región Fc, opcionalmente un dominio CH4. En otra
realización, la región Fc incluye una región de pivote, un dominio
CH2 y un dominio CH3, y preferiblemente carece del dominio CH1,
aunque en otra realización, la región Fc incluye una región de
pivote y un dominio CH2. En aun otra realización, la región Fc
incluye una región de pivote y un dominio CH3. En una realización
adicional, la región Fc contiene un sitio de unión funcional para el
receptor de protección Fc, FcRp. El sitio de unión del FcRp incluye
aminoácidos en los dominios CH2 y CH3 y la interacción
Fc-FcRp contribuye significativamente a la vida útil
extendida del suero de las proteínas de fusión Fc.
Aunque las regiones Fc de inmunoglobulina y el
componente de dominios pesados constantes pueden ser de cualquier
clase de inmunoglobulina, una clase preferida de inmunoglobulina
para las proteína s de fusión
Fc-IFN-\beta de la invención es
IgG (Ig\beta) (\beta subclases 1, 2, 3, o 4). Las secuencias de
aminoácido y de nucleótidos del Fc-\beta1 humano
se establecen en la SEQ ID NOs: 78 y 79. Otras clases de
inmunoglobulina IgA (Ig\beta), IgD (Ig\beta), IgE (Ig\beta) e
IgM (Igm), también se pueden utilizar. La elección de regiones
constantes de cadena pesada de inmunoglobulina se discute en
detalle en la Patente Estadounidense Nos. 5,541,087, y 5,726,044.
La elección de secuencias de región constante de cadena pesada de
inmunoglobulina particulares de ciertas clases de inmunoglobulina y
las subclases para alcanzar un resultado particular se considera que
están dentro del nivel del experto en la técnica. La porción de
construcción de ADN que codifica la región Fc de inmunoglobulina
incluye por lo menos una porción de un dominio de pivote, y
preferiblemente por lo menos una porción de un dominio CH3 del
Fc-\beta o los dominios homólogos de cualquier
IgA, IgD, IgE, o IgM.
Se contempla que la región Fc utilizada en la
generación de las proteínas de fusión que contienen las variantes
IFN-\beta se pueden adaptar a la aplicación
especifica de la molécula. En una realización, la región Fc se
deriva de un isotipo de inmunoglobulina \beta1 o sus variantes. El
uso del Fc\beta1 humano, la secuencia de región Fc tiene varias
ventajas. Por ejemplo, una región Fc derivada de un isotipo de
inmunoglobulina \beta1 se puede utilizar cuando se desea
objetivar la proteína de fusión al hígado. Adicionalmente, si la
proteína de fusión Fc se utiliza como un biofarmacéutico, el
dominio Fc\beta1 puede conferir actividad de función efectora a
la proteína de fusión. Los activos de función efectora incluyen los
activos biológicos tales como transferencia placentaria e
incremento de la vida útil de suero. La región Fc de inmunoglobulina
también proporciona la detección por detección mediante ELISA
anti-Fc y la purificación a trabes de la unión a la
proteína A Staphylococcus aureus ("Proteína A"). En
ciertas aplicaciones, sin embargo, puede ser deseable eliminar las
funciones efectoras específicas de la región Fc de inmunoglobulina,
tal como fijación completa y/o unión al receptor Fc. Cuando se
utiliza una región Fc derivada de inmunoglobulina \beta1, una
lisina en el Terminal carboxi de la región Fc de inmunoglobulina se
remplaza típicamente con una alanina. Esto mejora la vida útil
circulante de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol}.
Otras realizaciones de las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} utilizan
regiones Fc derivadas de un isotipo de inmunoglobulina \beta
diferente. Es decir \beta2, \beta3, o \beta4, o variantes de
las mismas. La región Fc puede incluir una región de pivote
derivada de un isotipo de inmunoglobulina diferente al de la región
Fc en sí misma. Por ejemplo, algunas realizaciones de las proteínas
de fusión Fc-IFN-\beta^{sol}
contienen una región de pivote derivada de una inmunoglobulina
\beta1 o una variante de la misma. Por ejemplo, la región de
inmunoglobulina Fc se puede derivar de un isotipo de inmunoglobulina
\beta2 e incluyen una región de pivote derivada de un isotipo de
inmunoglobulina \beta1 o una variante de la misma. En una
realización, un residuo cisteína del pivote \beta1 se modifica.
En una realización adicional, la primer cisteína del pivote
\beta1 se modifica. En todavía otra realización, se sustituye una
serina en lugar de la primer cisteína de la articulación \beta1.
Debido a que el isotipo \beta2 de inmunoglobulina no es efectivo
en mediar las funciones efectoras y presenta una unión muy reducida
al receptor Fc\beta (Fc\betaR), se puede esperar que está
configuración particular de la variante de fusión
IFN-\beta imite más cercanamente la actividad
biológica de la molécula IFN-\beta libre y en
adición tiene la mejor vida útil circulante cuando se administra a
un mamífero. Solo con el \beta1, es preferible mutar la lisina del
Terminal carboxi de la región Fc a alanina con el fin de mejorar la
vida útil circulante de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol}.
Como se estableció previamente, la región Fc de
las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} de la
invención se pueden derivar de un isotipo inmunoglobulina\beta4.
En algunas realizaciones de la invención, un isotipo de
inmunoglobulina\beta4 se modifica para contener una región de
pivote derivada de un isotipo de inmunoglobulina\beta1 o una
variante de la misma. En una realización, un residuo cisteína del
pivote\beta1 se modifica. En una realización adicional se
modifica la primer cisteína del pivote\beta1. En aún otra
realización se sustituye una serina en lugar de la primer cisteína
del pivote \beta1. Similar a los isotipos de
inmunoglobulina\beta2, los isotipos de inmunoglobulina\beta4
también exhiben menor afinidad hacia Fc\betaR y así ofrecen
similares ventajas en la reducción de las funciones efectoras.
Cuando se utiliza una región Fc región derivada de \beta1, 2, 3 o
4, una lisina en el Terminal carboxi de la región Fc de
inmunoglobulina se reemplaza típicamente con una alanina. La
inmunoglobulina\beta4 es una región Fc preferida para elaborar las
proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol}en donde el
grupo funcional IFN-\beta incluye alteraciones a
uno o más residuos de aminoácidos en las posiciones 17, 50, 57,
130, 131, 136 y/o 140. Una secuencia de aminoácido de ejemplo de una
proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} de la
presente invención que incluye una región Fc del isotipo de
inmunoglobulina\beta4 modificada para contener una región de
pivote derivada de una inmunoglobulina\beta1 que se muestran en
las Fig. 5 (SEQ ID NO:4).
Dependiendo de la aplicación, los genes de
región constante de las especies diferentes a la humana, por
ejemplo, ratón o tata, se pueden utilizar. La región Fc de
inmunoglobulina utilizada como una función padre de la construcción
de ADN puede ser generalmente de cualquier especie de mamífero.
Cuando es indeseable provocar una respuesta inmune en la célula
anfitrión o animal contra la región Fc, La región Fc se puede
derivar de la misma especie que la célula anfitriona o animal. Por
ejemplo, se puede utilizar una región Fc de inmunoglobulina cuando
el animal anfitrión o célula será un ratón.
Las secuencias de ácido nucleico modificantes, y
las secuencias de aminoácidos que definen una región Fc de
inmunoglobulina humana útiles en la práctica de la invención se
estableces en SEQ ID NO:78 y SEQ ID NO:79 respectivamente. Sin
embargo se contempla que otras secuencias de región Fc de
inmunoglobulinas útiles en la práctica de la invención se pueden
encontrar, por ejemplo, por aquellas codificadas por las secuencias
de nucleótido de la región de contraste de cadena pesada que incluye
la secuencia de región Fc como se describe en las bases de datos
Genbank y/o EMBL, por ejemplo, AF045536.1 (Macaca
fuscicularis, secuencia de nucleótido SEQ ID NO:20; secuencia
de aminoácido SEQ ID NO:21), AF045537.1 (Macaca mulata,
secuencia de nucleótido SEQ ID NO:22; secuencia de aminoácido SEQ
ID NO:23), AB016710 (Felis catus, secuencia de nucleótido SEQ
ID NO:24; secuencia de aminoácido SEQ ID NO:25), K00752
(Oryctolagus cuniculus, secuencia de nucleótido SEQ ID NO:26;
secuencia de aminoácido SEQ ID NO:27), U03780 (Sus scrofa,
secuencia de nucleótido SEQ ID NO:28; secuencia de aminoácido SEQID
NO:29), Z48947 (Camelus dromedaries, secuencia de nucleótido
SEQID NO:30), (Bos taurus, secuencia de nucleótido SEQ ID
NO:31; secuencia de aminoácido SEQ ID NO:32), L07789 (Mustela
vison, secuencia de nucleótido SEQ ID NO:33; secuencia de
aminoácido SEQ ID NO:34), X69797 (Ovis aries, secuencia de
nucleótido SEQ ID NO:35; secuencia de aminoácido SEQ ID NO:36),
U17166 (Cricetulus migratorius, secuencia de nucleótido SEQ
ID NO:37; secuencia de aminoácido SEQ ID NO:38), X07189 (Rattus
rattus, secuencia de nucleótido SEQ ID NO:39; secuencia de
aminoácido SEQ ID NO:40), AF157619.1 (Trichosurus vulpecula,
secuencia de nucleótido SEQ ID NO:41; secuencia de aminoácido SEQ
ID NO:42), o AF035195 (Monodelphis domestica, secuencia de
nucleótido SEQ ID NO:43; secuencia de aminoácido SEQ ID NO:44).
Adicionalmente, se contempla que la sustitución
o eliminación de aminoácidos dentro de las regiones constantes de
cadena pesada de inmunoglobulina pueden ser útiles en la práctica de
la invención. Un ejemplo puede incluir introducir sustituciones de
aminoácido en la región CH2 superior para crear una variante Fc con
afinidad reducida de receptores Fc (Cole et al. (1997) J.
Inmunol. 159:3613). Un experto en la técnica puede preparar tales
construcciones utilizando técnicas de biología molecular bien
conocidas.
Se entiende que la presente invención explota
las metodologías de ADN recombinante convencionales para generar
las proteínas de fusión Fc utilices en la práctica de la invención.
Las construcciones de fusión Fc se generan preferiblemente en el
nivel de ADN, y el ADN resultante integrado en los vectores de
expresión, y expresado para producir las proteínas de fusión de la
invención.
Como se utiliza aquí, el término "vector"
se entiende que significa cualquier ácido nucleico que incluye una
secuencia de nucleótidos competente para ser incorporada en una
célula anfitriona y ser recombinado con e integrado en el genoma de
la célula anfitriona, o para replicar autónomamente como un episoma.
Tales vectores incluyen ácidos nucleicos lineales, plásmidos,
fagémidos, comidos, vectores de ARN, vectores víricos y similares.
Ejemplos no limitantes de un vector vírico incluyen un retrovirus,
un adenovirus y un virus adenoasociado. Como se utiliza aquí, el
término "expresión génica" o "expresión" de una proteína
objetivo, se entiende que significa la transcripción de una
secuencia de ADN, la conversión de un trascrito de Marn, y la
secreción de un producto de proteína de fusión
Fc.
Fc.
Un vector de expresión útil es pdCs (Lo et
al. (1988) Protein Engineering 11:495), en la que la
transcripción del gen Fc-X utiliza el
mejorador/promotor del citomegalovirus y la señal de poliadenilacion
SV40. La secuencia promotora y mejoradora del citomegalovirus
humano utilizada se deriva de los nucleótidos -601 a +7 de la
secuencia suministrada en Boshart et al. (1985) Cell 41:521.
El vector también contiene el gen de reductasa dihidrofolato mutante
como un marcador de selección (Simonsen y Levinson (1983) Proc. Nat.
Acad. Sci. USA 80:2495).
Una célula anfitriona apropiada se puede
transformar o transfectar con una secuencia de ADN de la invención,
y es utilizada para la expresión y/o secreción de una proteína
objetivo. Actualmente se prefieren células anfitrionas para uso en
la invención e incluyen células de hibridoma inmortales, células de
mieloma NS/0, células 293, células de ovario de hámster chino,
Células HeLa, y Células COS.
Un sistema de expresión que se ha utilizado para
producir altos niveles de expresión de proteína de fusión en
células de mamífero es una construcción de ADN que codifica, en la
dirección 5' a 3' dirección, un casete de secreción, que incluye
una secuencia de señal y una región Fc de inmunoglobulina, y una
proteína objetivo tal con IFN-\beta. Varias
proteínas objetivo se han expresado exitosamente en tal un sistema e
incluyen, por ejemplo, IL2, CD26, Tat, Rev, OSF-2,
\betaIG-H3, Receptor IgE, PSMA, y gp120. Estas
construcciones de expresión se describen en las Patente
Estadounidense Nos. 5,541,087 y 5,726,044 otorgadas a Lo et
al.
Las proteínas de fusión de la invención pueden o
no incluir una secuencia de señal cuando se expresan. Como se
utiliza aquí, el término "secuencia de señal" se entiende que
significa un segmento que dirige la secreción de la proteína de
fusión IFN-\beta y después se divide luego de la
conversión en la célula anfitriona. La secuencia de señal de la
invención es un polinucleótido que codifica una secuencia de
aminoácidos que inician el transporte de una proteína a través de
la membrana del retículo endoplasmático. La secuencia de señal que
son útiles en la invención incluyen secuencias de señal de cadena
liviana de anticuerpo, por ejemplo, anticuerpo 14.18 (Gillies et
al. (1989) J. Inmunol. Meth. 125:191), anticuerpo de secuencia
de señal de cadena pesada, por ejemplo, las secuencia de señal de
cadena pesada de anticuerpo MOPC141 (Sakano et al. (1980)
Nature 286:5774), y cualquier otra secuencia de señal que se
conozca en la técnica (ver, por ejemplo., Watson (1984) Nucleic
Acids Research 12:5145).
Las secuencias de señal que se han caracterizado
bien en la técnica y se conocen típicamente contienen 16 a 30
residuos de aminoácido, y pueden contener más o menos residuos de
aminoácidos. Un péptido señal típico consiste de tres regiones: una
región de Terminal N básica, una región hidrófoba central, y una
región de terminal C más polar. La región hidrófoba central
contiene 4 a 12 residuos hidrófobos que anclan la péptida señal a
través de la bicapa del lípido de membrana durante el transporte del
polipéptido naciente. Luego de la iniciación, el péptido señal se
divide usualmente dentro del lumen del retículo endoplásmico
mediante enzimas celulares conocidas como peptidasas señal. Los
sitios de división potencial del péptido señal generalmente siguen
la "regla (-3, -1)". Así un péptido señal típico tiene residuos
de aminoácido neutros, pequeños y en las posiciones -1 y -3 y le
falta los residuos prolina en esta región. La peptidasa señal
dividida tal un péptido señal entre los aminoácidos -1 y +1. Así,
la secuencia de señal se puede dividir del terminal amino de la
proteína de fusión durante la secreción. Esto resulta en la
secreción de una proteína de fusión Fc que consiste de la región Fc
de inmunoglobulina y una proteína objetivo. Una discusión detallada
de las secuencias de péptido de señal se proporciona por von Heijne
(1986) Nucleic Acids Res.
14:4683.
14:4683.
\newpage
Como seria evidente para el experto en la
técnica, la adecuabilidad de una secuencia de señal particular para
uso en el casete de expresión puede requerir alguna rutina de
experimentación. Tal experimentación incluirá determinar la
capacidad de la secuencia de señal para dirigir la secreción de una
proteína de fusión Fc y también una determinación de la
configuración optima, genómica o cADN, de la secuencia a ser
utilizada con el fin de lograr la secreción eficiente de las
proteínas de fusión Fc adicionalmente, un experto en la técnica es
capaz de crear un péptido señal sintético siguiendo las reglas
presentadas por fusión las proteínas von Heijne, de referenciadas
anteriormente, y probar la eficacia de tal una secuencia de señal
sintética mediante la experimentación de rutina. Una secuencia de
señal también se puede denominar como un "péptido señal",
"secuencia líder", o "péptido líder".
La fusión de la secuencia de señal y la región
Fc de inmunoglobulina se denomina algunas veces aquí como casete de
secreción. Un casete de secreción de ejemplo útil en la práctica de
la presente invención es un polinucleótido codificante, en una
dirección 5' a 3', una secuencia de señal de un gen de cadena
liviana de inmunoglobulina y una región Fc\beta1 del gen de
inmunoglobulina\beta1 humano. La región Fc\beta1 del gen
Fc\beta1 de inmunoglobulina incluyen preferiblemente por lo menos
una porción del dominio de pivote de inmunoglobulina y por lo menos
el dominio CH3, o más preferiblemente por lo menos una porción una
porción del dominio de pivote, el dominio CH2 y el dominio CH3.
Como se utiliza aquí, la "porción" de la región de pivote de
inmunoglobulinas se entiende que significa una porción del pivote
de inmunoglobulina que contiene por lo menos uno, preferiblemente
dos residuos cisteína capaces de formar enlaces de disulfuro
intracadena. El ADN que codifica el casete de expresión puede estar
en su configuración genómica o su configuración de cADN bajo ciertas
circunstancias, puede ser ventajoso producir la región Fc de las
secuencias de cadena pesada de inmunoglobulina Fc\beta2 humana.
Aunque las fusiones Fc basadas en secuencias de inmunoglobulina
\beta1 y \beta2 humanas tienen se comportan de forma similar en
ratones, las fusiones Fc basadas en las secuencias \beta2 pueden
presentar farmacocinéticas superior en humanos.
En otra realización, la secuencia de ADN
codifica un sitio de división proteolítico interpuesto entre el
casete de secreción y la proteína objetivo. El sitio de división
proporciona la división proteolítica de la proteína de fusión
codificada separando así el dominio Fc de la proteína objetivo. Como
se utiliza aquí, "el sitio de división proteolítico" se
entiende que significa secuencias de aminoácidos que se dividen
preferencialmente por una enzima proteolítica u otro agente de
división proteolítico. Los sitios de división proteolíticos útiles
incluyen secuencias de aminoácidos que se reconocen por las enzimas
proteolítica tal como tripsina, plasmita o enteroquinas K. Muchos
pares de agentes de sitio de división/agentes de división (ver, por
ejemplo, Patente Estadounidense No. 5,726,044).
Adicionalmente, la sustitución o eliminación de
las construcciones de estas regiones constantes, las que uno o más
residuos de aminoácidos de los dominios de región constantes se
sustituyen o eliminan también sería útil. Un ejemplo sería
introducir sustituciones de aminoácidos en la región CH2 superior
para crear una variante Fc con afinidad reducida para los
receptores Fc (Cole et al. (1997) J. Inmunol. 159: 3613). Un
experto en la técnica puede preparar tales construcciones utilizando
técnicas de biología molecular bien conocidas.
Las construcciones de fusión descritas aquí
producen altos niveles de
Fc-IFN-\beta^{sol}. Los clones
iniciales producen aproximadamente 100 mg/mL de
Fc-IFN-\beta^{sol} alterado, que
se podría purificar hasta homogeneidad por cromatografía de
afinidad de Proteína A. Los niveles de expresión se pueden
incrementar frecuentemente varia veces mediante su clonación. Como
se estableció anteriormente, se encuentra que cuando el
IFN-\beta con cisteína en la posición 17 se
reemplaza con una serina, una alanina, una valina o una metionina se
expresa como molécula de fusión Fc , se obtienen altos niveles de
expresión, presumiblemente debido a la sustitución de aminoácidos
en la posición 17 de la proteína IFN-\beta^{sol}
que evita la formación de enlaces de disulfuro aberrantes en la
proteína y la región Fc actúa como un portador, ayudando al
polipéptido a plegarse correctamente y a ser secretado
eficientemente. De manera similar, otras proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} de la
invención incluyen la mutación C17S, tal como, por ejemplo
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
F50H H131A H140A) y
Fc-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131A H140T) que se expresan igualmente bien. Más aún, la
región Fc también se glucosila y se carga altamente en pH
fisiológico. Por lo tanto, La región Fc puede ayudar a solubilizar
las proteínas hidrófobas.
Adicionalmente a los altos niveles de expresión,
las proteínas Fc-IFN-\beta^{sol}
exhiben mayor bioactividad que la proteína de fusión padre
Fc-IFN-\beta (no modificada),
según se mide en un ensayo antivírico basado en células (Ejemplo
6), y son comparables con la bioactividad de una preparación
comercial de IFN-\beta obtenida de R&D Systems
(Mineapolis, MN).
En adición a los altos niveles de expresión, las
proteínas de fusión Fc-IFN-\beta
alteradas exhiben mayor vida útil de suero comparada con proteínas
de fusión Fc-IFN-\beta no
alteradas. Por ejemplo, la vida útil circulante del
Fc-IFN-\beta^{sol} que incluye
la mutación C17S se encuentra que es significativamente mayor que
aquella de la proteína de fusión
Fc-IFN-\beta padre (ver Ejemplo
8).
Las proteínas de fusión de la invención
proporcionan varios beneficios clínicos importantes. Como se
demuestran en las pruebas de ensayos biológicos en los Ejemplos 6 y
7, la actividad biológica del
Fc-IFN-\beta^{sol} alterado es
significativamente mayor que aquella del
Fc-IFN-\beta.
Otra realización de la presente invención
proporciona construcciones que tienen varias conformaciones
estructurales, por ejemplo, construcciones bivalentes o
multivalentes, construcciones diméricas o multiméricas y sus
combinaciones. Tales conformaciones de moléculas funcionales de la
invención permiten el efecto sinérgico del
IFN-\beta y otras proteínas
anti-víricas y anti-cáncer a ser
exploradas en modelos animales.
Un aspecto importante de la invención es que las
secuencias y propiedades de varias proteínas
IFN-\beta y ADN codificante son bastantes
similares. En el contexto de las fusiones Fc-X, las
propiedades de las proteína IFN-\beta y el ADN
codificante son esencialmente idénticos, de tal manera que un
conjunto común de técnicas se pueden utilizar para generar
cualquier fusión de ADN
Fc-IFN-\beta, para expresar la
fusión, para purificar la proteína de fusión, y para administrar la
proteína de fusión para propósitos terapéuticos.
La presente invención también proporciona
métodos para la producción de IFN-\beta de
especies no humanas como proteínas de fusión Fc. Las proteínas de
fusión IFN-\beta no humanas son utilices para
estudios preclínicos del IFN-\beta debido a los
estudios de eficacia y toxicidad de un fármaco de proteína que se
debe desarrollar en sistemas de modelos animales antes de probar en
seres humanos. Una proteína humana puede no trabajar en un modelo
de ratón en razón a que la proteína puede provocar una respuesta
inmune, y/o exhibir diferentes farmacocinéticas sesgando los
resultados de prueba. Por lo tanto, la proteína de ratón equivalente
es el mejor subrogado para la proteína humana para pruebas en un
modelo de ratón.
La presente invención proporciona métodos para
tratar varios cánceres, enfermedades víricas, otras enfermedades,
afecciones relacionadas y causas de la misma al administrar el ADN,
ARNA o las proteínas de la invención a un mamífero que tiene tal
afección. Las condiciones relacionadas pueden incluir, pero no se
limitan a esclerosis múltiple; una variedad de neoplasias, tal como
leucemia mieloide aguda, mieloma múltiple, enfermedad de Hodgkin,
carcinoma de célula basal, displasia cervical y osteosarcoma; una
variedad de infecciones víricas que incluyen hepatitis vírica,
herpes zoster y herpes genital, virus papiloma, encefalitis vírica,
y neumonías citomegalovirus.
En vista de los amplios papeles jugados por el
IFN-\beta en la modelación de las respuestas
inmunes, la presente invención también proporciona métodos para
tratar afecciones aliviadas por la administración de
IFN-\beta. Estos métodos incluyen administrar a
un mamífero que tiene una afección, que puede o no estar relacionado
directamente con una infección vírica o cáncer, una cantidad
efectiva de una composición de la invención. Por ejemplo, un ácido
nucleico, tal como ADN o ARN, que codifica una proteína de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} que se puede
administrar a un sujeto, preferiblemente un mamífero, como un agente
terapéutico. Adicionalmente, una célula que contiene un ácido
nucleico que codifica una proteína de fisión
Fc-IFN-\beta^{sol} se puede
administrar a un sujeto, preferiblemente a un mamífero, como agente
terapéutico. Adicionalmente, se puede administrar una proteína
Fc-IFN-\beta^{sol} a un sujeto,
preferiblemente un mamífero, como un agente terapéutico.
Las proteínas de la invención no solo son útiles
como agentes terapéuticos, pero un experto en la técnica reconoce
que las proteínas son útiles en la producción de anticuerpos para
uso diagnóstico. De la misma manera, la administración apropiada
del ADN o ARN, por ejemplo, en un vector u otro sistema de
suministro para tales usos, se incluyen en los métodos de uso de la
invención.
Las composiciones de la presente invención se
pueden administrar mediante cualquier ruta que sea compatible con
las moléculas particulares. Se contempla que la composición de la
presente invención se puede suministrar a un mamífero mediante
cualquier medio adecuado, directamente (por ejemplo, localmente,
como por inyección, implantación o administración tópica a un lugar
del tejido) o sistémicamente (por ejemplo, parenteralmente u
oralmente). Cuando la composición se proporciona parenteralmente,
tal como mediante administración intravenosa, subcutánea,
oftálmica, intraperitoneal, intramuscular, bucal, rectal, vaginal,
intraorbital, intracerebral, intracraneal, intraspinal,
intraventricular, intratecal, intracisternal, intracapsular,
intranasal o por administración de aerosol, la composición incluye
preferiblemente parte de una suspensión o solución de fluido acuosa
o fisiológicamente compatible. Así, el portador o vehículo es
fisiológicamente aceptable de tal manera que en adición al
suministro de la composición deseada al paciente, no afecta
adversamente o de otra forma el balance de volumen y/o electrolitos
del paciente. El medio de fluido para el agente puede así incluir
solución salina fisiológica normal.
Las construcciones de ADN (o construcciones de
gen) de la invención también se pueden utilizar como una parte de
un protocolo de terapia de gen para suministrar ácidos nucleicos que
codifican IFN-\beta o una construcción de
proteína de fusión de la misma. La invención caracteriza vectores de
expresión para transfección in vivo y la expresión del
IFN-\beta o una construcción de proteína de fusión
de la misma en tipos de células particulares con el fin de
reconstituir o complementar la función del
IFN-\beta. Las construcciones de expresión de
IFN-\beta, o construcciones de proteína de fusión
de la misma, se pueden administrar en cualquier portador
biológicamente efectivo, por ejemplo cualquier formulación o
composición capaz de suministrar efectivamente la construcción de
proteína de fusión o gen IFN-\beta de la misma a
las células in vivo. Los métodos incluyen la inserción del
gen objeto en los vectores víricos que incluyen retovirus
recombinante, adenovirus, virus adeno-asociados, y
virus herpes simplex 1, o plásmidos eucarióticos o bacterianos
recombinantes. Las dosificaciones preferidas por administración de
ácidos nucleicos que codifica las proteínas de fusión de la
invención están dentro del rango de 1 mg/m^{2} a 100 mg/m^{2},
más preferiblemente 20 mg/m^{2} a 10 mg/m^{2}, y más
preferiblemente 400 mg/m^{2} a 4 mg/m^{2}. Se contempla que la
dosificación óptima y el modo de administración se pueden determinar
mediante la experimentación de rutina que está dentro del nivel de
experticia del técnico.
Las dosificaciones preferidas de la proteína de
fusión por administración están dentro del rango de 0.1
mg/m^{2}-100 mg/m^{2}, más preferiblemente, 1
mg/m^{2}-20 mg/m^{2}, y más preferiblemente 2
mg/m^{2}-6 mg/m^{2}. Se contempla que la
dosificación óptima, sin embargo, también depende de la enfermedad
que se trata y de la existencia de efectos colaterales. Sin
embargo, se pueden determinar dosificaciones óptimas utilizando la
experimentación de rutina. La administración de la proteína de
fusión puede ser mediante inyecciones de bolo periódico, o mediante
administración intravenosa o intraperitoneal continua de un
reservorio externo (por ejemplo, de una bolsa intravenosa) o
interna (por ejemplo, de un implante bioreaccionable).
Adicionalmente, se contempla que las proteínas de fusión de la
invención también se pueden administrar al receptor destinado junto
con una pluralidad de moléculas biológicamente activas diferentes.
Se contempla, sin embargo, que la combinación optima de la proteína
de fusión y otras moléculas, modos de administración, dosificaciones
se pueden determinar por experimentación de rutina bien dentro del
nivel del experto en la técnica. La invención se ilustra
adicionalmente mediante los siguientes ejemplos no limitantes.
\vskip1.000000\baselineskip
Se ordena cADN de
interferón-\beta humano
(IFN-\beta) del American Type Culture Collection
(Número ATCC 31903). La secuencia para la forma madura se amplifica
por Reacciones de Cadena Polimerasa (PCR). El cebador delantero
utilizado en las reacciones de amplificación 5' C CCG GGT ATG AGC
TAC VAC TTG CTT (SEQ ID NO:45), en donde la secuencia CCCGGGT
codifica el terminal carboxi del CH3 sin el codón lisina, así como
también el sitio de restricción endonucleasa SmaI CCCGGG (Lo et
al., Protein Engineering (1998) 11:495), y la secuencia en
negrilla codifica el terminal N de la secuencia codificante
IFN-\beta madura. El cebador inverso para esta
reacción es 5' CTC GAG TCA GTT TCG GAG GTA ACC TGT (SEQ ID NO:46),
en donde TCA es al anticodón del codón de parada de traducción, y
CTCGAG es el sitio de restricción XhoI. EL producto 450 bp PCR
amplificado se clona en el vector pCRII (Invitrogen), y esta
secuencia se verifica.
El fragmento de restricción
SmaI-XhoI con la secuencia
IFN-\beta madura completamente correcta se utiliza
para clonar en el vector de expresión pdCs-huFc, de
tal manera que la secuencia codificante del
IFN-\beta maduro se fusiona en la estructura al
extremo 3 de la secuencia codificante Fc. El plásmido de expresión
pdCs-huFc-IFN-\beta
se construye al ligar la estructura de restricción
SmaI-XhoI que contiene el cADN de
IFN-\beta maduro con la estructura de restricción
SmaI-XhoI o del vector pdCs-huFc de
acuerdo con Lo et al., (Protein Engineering (1998) 11:495).
EL ADN de huFc corresponde a una secuencia que cuando se expresa
produce el fragmento Fc de la inmunoglobulina humana \beta4 con
una secuencia de pivote \beta1 modificada. La secuencia de
aminoácido se muestra en la SEQ ID NO:77.
Para generar las proteínas de fusión adicionales
que incluyen el IFN-\beta fusionado a Los grupos
funcionales Fc de un isotipo diferente o que contiene otras
alteraciones, la misma estrategia de clonación se utiliza, aunque
sustituye la versión apropiada del vector pdCs-huFc.
Así, la estructura de restricción SmaI-XhoI de
IFN-\beta se inserta en el vector
pdCS-huFc digerido con SmaI y XhoI, que codifica un
isotipo inmunoglobulina \beta4 con una región de pivote derivada
de \beta4, o un isotipo inmunoglobulina \beta1, o un isotipo
inmunoglobulina \beta2, o un isotipo inmunoglobulina \beta2 pero
con una región de pivote derivada de inmunoglobulina \beta1
alterada. Debido a la introducción del sitio de clonación SmaI en el
vector que codifica un isotipo inmunoglobulina \beta4 no resulta
en una mutación sinónima en la proteína expresada del grupo
funcional Fc, la secuencia de proteína codificada por la secuencia
de ácido nucleico alrededor del sitio SmaI es LSLSPG (SEQ ID
NO:53). La mutación ha sido sinónima, la secuencia estaría presente
LSLSLG (ver por ejemplo Figura 7, residuos 101-106 o
SEQ ID NO:76).
La mutación de cisteína 17 a serina (C17S) se
introduce en la secuencia de nucleótido IFN-\beta
mediante un método PCR traslapante (Daugherty et al., (1991)
Nucleic Acids Res. 19:2471) utilizando cebadores mutagénicos
complementarios. La secuencia de cebador delantero es: 5' AGA AGC
AGC AAT TTT CAG AGT CAG AAG CTC CTG TGG CA (SEQ ID NO:47), en donde
el nucleótido resaltado indica la mutación en el punto introducido
(TGT to AGT). De acuerdo con lo anterior, el cebador inverso es: 5'
TG CCACAGGAGCTT CTG ACTCTGAAAATTGCTGCTTCT(SEQIDNO:48). El
fragmento PCR generado por el método PCR traslapante se liga al
vector pCRII, la secuencia se verifica, y el fragmento
SmaI-XhoI se liga a cualquiera de los vectores de
expresión pdCs-huFc como se describió anteriormente.
La secuencia de aminoácido se muestra como SEQ ID NO:3. La
secuencia de contraparte de ratón con la mutación se describe en SEQ
ID NO:12.
Como se discutió anteriormente, la cisteína en
la posición 17 se muta a una serina en la proteína
Fc-IFN-\beta^{sol} que tiene la
porción Fc que incluye inmunoglobulina \beta4 con una secuencia de
pivote \beta1 modificada. La secuencia de aminoácido se muestra
como SEQ ID NO:4.
Para introducir una secuencia ligadora flexible
entre el grupo funcional huFc y el grupo funcional
IFN-\beta, se produce un dúplex de
oligonucleótido sintético de la secuencia 5' G GGT GCA GGG GGC GGG
GGC AGC GGG GGC GGA GGA TCC GGC GGG GGC TC 3' (SEQ ID NO:49). Este
dúplex bicatenario, de extremo romo, se inserta en el sitio SmaI
único del vector de expresión
pdCs-huFc-IFN-\beta
mediante ligado. La orientación del dúplex de extremo romo en el
vector resultante, pdCs-huFc-(GS
ligador)-IFN-\beta se confirma
mediante secuenciamiento. Como un resultado, la secuencia de
aminoácido GAGGGGSGGGGSGGGS (SEQ ID NO:50) se agrega entre los
residuos prolina (codón CCG) y glicina (codón GGT) codificados por
la secuencia C CCG GGT (SEQ ID NO:51) que contiene el sitio SmaI.
La secuencia de aminoácido de un huFc-(GS ligador)
IFN-\beta partiendo con el dominio CH3 del isotipo
Fc\beta4 se muestra en la Figura 6 (SEQIDNO:5).Cuando se utiliza
este ligador con construcciones de inmunoglobulina \beta4 de la
invención, es importante notar que la secuencia de aminoácido de
terminal C LSLSPG (SEQ ID NO:52) de inmunoglobulina \beta4 carece
del residuo alanina presente en la inmunoglobulina \beta1,
\beta2 o \beta3 de secuencia de terminal C LSLSPGA (SEQ ID
NO:53). Como se mencionó antes, la alanina es el resultado de mutar
el residuo lisina nativo. Cuando el ligador se inserta en la
construcción \beta1, \beta2 o \beta3, los residuos de alanina
y glicina terminales se sustituyen idénticamente por una glicina y
alanina del ligador. Así, cuando el ligador se inserta en la
inmunoglobulina \beta4
Fc-IFN-\beta, la secuencia de
aminoácido gana un residuo alanina adicional cuando la glicina de
terminal C se reemplaza por glicina y alanina. Esto se ejemplifica
al comparar, por ejemplo, Figura 5, residuos 226-231
(SEQ ID NO:4) y Figura 6, empezando en el residuo 101 (SEQ ID
NO:5).
Se pueden producir variantes de proteína
Fc-IFN-\beta^{sol} adicionales
que contienen mutaciones en el grupo funcional
IFN-\beta. Por ejemplo, el C17 se puede alterar
para otro aminoácido, por ejemplo alanina. Con el fin de introducir
la mutación C17A, se utilizan los siguientes oligonucleótidos
mutagénicos: el cebador delantero es 5'AGA AGC AGC AAT TTT CAG GCT
CAG AAG CTC CTG TGG CA 3', (SEQ ID NO:54), y el cebador inverso es
5' TG CCA CAG GAG CTT CTG AGC CTG AAA ATT GCT GCT TCT 3', (SEQ ID
NO:55), en donde el nucleótido resaltado indica las mutaciones
introducidas.
Se introducen mutaciones adicionales en
Fc-IFN-\beta^{sol} en el grupo
funcional IFN-\beta mediante PCR traslapante. Las
proteínas de fusión de la invención IFN-\beta
preferidas,
Fc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}
(C17S L57A H131A H140A) y
Fc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}
(C17S F50H H131A H140A), se producen partiendo con la plantilla
Fc\beta4h-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S)
preparada utilizando métodos previamente descritos aquí.
Para introducir la mutación H131A a la plantilla
Fc\beta4h-(ligador)-IFN-\beta^{sol}(C17S),
un primer fragmento de ácido nucleico se crea por PCR utilizando la
secuencia de cebador delantero 5'CTC CCT GTC CCC GGG TGC AGG GGG
(SEQ ID NO:56), que incorpora el sitio endonucleasa XmaI de
restricción, y la secuencia de cebador inverso 5' CTT GGC CTT CAG
GTA GGC CAG AAT CCT CCC ATA ATA TC (SEQ ID NO:57), en donde GGC
representa la mutación H131A. Un segundo fragmento de la proteína
de fusión se crea por PCR utilizando la secuencia de cebador
delantero 5'GAT ATT ATG GGA GGA TTC TGG CCT ACC TGA AGG CCA AG (SEQ
ID NO:58), en donde GGC representa la mutación H131A, y la
secuencia de cebador inverso 5' CTT ATC ATG TCT GGA TCC CTC GAG (SEQ
ID NO:59), que incorpora el sitio de restricción BamHI. Los
productos de estas reacciones se purifican en un gel electroforético
de acuerdo con los métodos estándar. Los fragmentos purificados de
gel luego se someten juntos a PCR utilizando la secuencia de
cebador delantero 5'CTC CCT GTC CCC GGG TGC AGG GGG (SEQ ID NO:60),
que incorpora el sito de restricción XmaI, y la secuencia de
cebador inverso 5' CTT ATC ATG TCT GGA TCC CTC GAG (SEQ ID NO:61),
que incorpora el sitio de restricción BamHI. Esto resulta en un
ácido nucleico que codifica
Fc\beta4h-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
H131A).
Luego, la mutación H140A se introduce al someter
el
Fc\betah-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
H131A) a PCR para crear un primer fragmento utilizando la secuencia
de cebador delantero 5'CTC CCT GTC CCC GGG TGC AGG GGG (SEQ ID
NO:62), que incorpora el sitio XmaI endonucleasa de restricción, y
la secuencia de cebador inverso 5' GGT CCA GGC ACA GGC ACT GTA CTC
CTT GGC (SEQ ID NO:63), en donde GGC representa la mutación H140A.
Un segundo fragmento de la proteína de fusión se crea por PCR
utilizando la secuencia de cebador delantero 5' GGC AAG GAG TAC AGT
GCC TGT GCC TGG ACC (SEQ ID NO:64), en donde GCC representa la
mutación H140A. La secuencia de cebador inverso es 5' CTT ATC ATG
TCT GGA TCC CTC GAG (SEQ ID NO:65), que incorpora el sitio de
restricción BamHI. Los productos de estas reacciones se purifican
en un gel electroforético de acuerdo con los métodos estándar. Los
fragmentos purificados de gel luego se someten juntos a PCR
utilizando la secuencia de cebador delantero 5'CTC CCT GTC CCC GGG
TGC AGG GGG (SEQ ID NO:66), que incorpora el sitio de restricción
XmaI, y la secuencia de cebador inverso 5' CTT ATC ATG TCT GGA TCC
CTC GAG (SEQ ID NO:67), que incorpora el sitio de restricción
BamHI. Esto resulta en un ácido nucleico que codifica
Fc\beta4hligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
H131A H140A). Alternativamente, este proceso se puede seguir en
lugar de insertar la mutación H140T de la invención al modificar los
cebadores apropiados para expresar el codón treonina ACC.
Finalmente, para introducir la mutación F50H o
la mutación L57A a la plantilla
Fc\beta4h-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
H131A H140A) preparada en la etapa previa, un primer fragmento de
ácido nucleico se crea por PCR utilizando el cebador delantero
5'CTC CCT GTC CCC GGG TGC AGG GGG (SEQ ID NO:68), que incorpora el
sitio XmaI endonucleasa de restricción, y la secuencia de cebador
inverso 5' GAG CAT CTC ATA GAT GGT GGC TGC GGC GTC CT C (SEQ ID
NO:69), en donde GGC representa el codón para crear la mutación L57A
o la secuencia de cebador inverso 5' GTC
CTCCTTCTGATGCTGCTGCAGCTG(SEQ ID NO:70), en donde ATG
representa el codón para crear la mutación F50H. Para crear el
segundo fragmento de la proteína de fusión para la mutación L57A, la
plantilla se somete a PCR utilizando la secuencia de cebador
delantero 5' GAG GAC GCC GCA GCC ACC ATC TAT GAG ATG CTC (SEQ ID
NO:71), en donde GCC representa la mutación L57A. Para crear el
segundo fragmento de la proteína de fusión para introducir la
mutación F50H, la plantilla se somete a PCR utilizando la secuencia
de cebador delantero 5' CAG CTG CAG CAG CAT CAG AAG GAG GAC (SEQ ID
NO:72), en donde CAT representa la mutación F50H. El cebador inverso
para la producción del segundo fragmento de mutación es 5' CTT ATC
ATG TCT GGA TCC CTC GAG (SEQ ID NO:73), que incorpora el sitio de
restricción BamHI. Los productos de estas reacciones se purifican en
un gel electroforético de acuerdo con los métodos estándar. Los
fragmentos purificados de gel luego se utilizan como el PCR para
producir un ácido nucleico que codifica
Fc\beta4h-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131A H140A) o
Fc\beta4h-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
F50H H131A H140A). Los cebadores inverso y delantero para esta
reacción son 5'CTC CCT GTC CCC GGG TGC AGG GGG (SEQ ID NO:74) y 5'
CTT ATC ATG TCT GGA TCC CTC GAG (SEQ ID NO:75), respectivamente,
como se utiliza en las etapas previas.
Para análisis rápido de la expresión de
proteína, el plásmido
pdCs-huFc-IFN-\beta,
pdCs-huFc-IFN-\beta^{sol}(C17S)
u otras variantes de proteína de fusión huFc que contienen
huIFN-\beta se introducen en células 293 HEK de
riñón embriónico humano (ATCC# CRL-1573) mediante
transfección transitorio utilizando lipofectamina (Invitrogen).
Para obtener clones establemente transfectados
que expresen
huFc-IFN-\beta^{sol}(C17S),
por ejemplo, el ADN de plásmido apropiado se introduce en las
células NS/0 de mieloma de ratón mediante electroporación. Se hacen
crecer células NS/0 en medio Eagle modificado de Dulbecco
complementado con 10% de suero bovino fetal inactivado por calor, 2
mM glutamina y penicilina/estreptomicina. Se lavan aproximadamente
5x10^{6} células una vez con PBS y se resuspenden en 0.5 ml PBS.
Luego se incuban 10 mg de ADN de plásmido linearizado con las
células en una cubeta Gene Pulser Cuvette (0.4 cm de espacio de
electrodo, BioRad) en hielo durante 10 min. Se desarrolla
electroporación utilizando un Gene Pulser (BioRad, Hercules, CA) con
configuración a 0.25 V y 500 mF. Se les permite a las células
recuperar durante 10 min en hielo, después de lo cual ellas se
resuspenden en medio de crecimiento y se colocan en dos placas de
96 pozos. Se seleccionan clones establemente transfectados mediante
su crecimiento en la presencia de 100 nM metotrexato (MTX), que se
agrega al medio de crecimiento dos días
post-transfección. Las células se cargan cada 3 días
durante dos a tres veces más, y los clones resistentes a MTX
aparecen de 2 a 3 semanas. Los sobrenadantes de los clones se
ensayan mediante anti-Fc ELISA para identificar
altos productores. Se aíslan clones altamente producidos y se
propagan en medio de crecimiento que contiene 100 nM MTX. El medio
de crecimiento típicamente utilizado es medio H-SFM
o CD (Life Technologies).
Alternativamente, los clones que expresan
establemente las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} hu se
obtienen en células 293 HEK de riñón embriónico humano mediante
selección de metotrexato, por un método similar a uno descrito
anteriormente. Se mantienen clones HEK 293 en DMEM complementado con
10% FBS.
\vskip1.000000\baselineskip
Las proteínas de fusión
HuFc-IFN-\beta se capturan
posteriormente del medio para análisis adicional. Para
caracterización de rutina mediante electrofóresis de gel, las
proteínas de fusión huFc-IFN-\beta
secretadas en el medio capturan glóbulos de Sefarosa de Proteína A
(Repligen, Cambridge, MA) y luego se eluyen al hervir la muestra en
el amortiguador de muestra de proteína, con o sin un agente de
reducción tal como \beta-mercaptoetanol. Las
muestras se analizan por SDS-PAGE y las bandas se
proteína se visualizan mediante teñido Coomassie.
Cuando la proteína
huFc-IFN-\beta que contiene un
isotipo de inmunoglobulina \beta4 se analiza por
SDS-PAGE, se encuentra que la proteína no se
expresa en células de cultivo de tejido de mamífero como una especie
uniforme. Como se muestra en la Figura 2, bajo condiciones no
reducidas, en adición a una banda principal 100 kDa que representa
el huFc-IFN-\beta, otras múltiples
bandas son claramente visibles, así como también un ensayo no
resuelto de proteínas de alto peso molecular. Estos resultados
indican que cuando se expresa como una proteína de fusión Fc, los
agregados forman IFN-\beta tipo natural. Este
hallazgo está en contraste al que se encuentra generalmente con
IFN-\beta no modificado; cuando la secuencia tipo
natural se clona en un vector de expresión, y se expresa y se
secreta en cultivo celular de mamífero este se encuentra por ser 98%
monomérico mediante cromatografía de tamaño de exclusión (Runkel
et al., (1998), Pharmaceutical Research 15:641). Este
resultado es adicionalmente inesperado en claridad del hecho que
IFN-\beta se puede producir como una proteína de
fusión de la forma IFN-\beta-Fc.
Ver, por ejemplo, Patente Estadounidense No. 5,908,626.
Una porción de estos agregados es estable para
reducir los agentes, como bandas adicionales para la banda 50 kDa
esperada para huFc-IFN-\beta
persiste en un sistema SDS-PAGE reducido. Sin
embargo, la cantidad de material que exhibe la migración anormal es
bastantemente disminuido. Este resultado sugiere que en un grado
significativo la agregación es debido a la formación de enlace de
disulfuro mezclado.
Se analiza una variante
Fc-IFN-\beta que contiene una
sustitución de la región de pivote con un derivado de
inmunoglobulina \beta1. Se encuentra que esta sustitución no tiene
impacto en el comportamiento de la proteína de fusión, aunque este
no contiene cuatro enlaces disulfuro similares a la región de pivote
de inmunoglobulina \beta4. De forma similar, utilizando un
isotipo Fc derivado de una inmunoglobulina \beta1 en la
construcción de fusión tampoco tiene efecto. Así, aunque la
agregación parece ser debido a la presencia del grupo funcional Fc,
la agregación no se puede aliviar por alteraciones en el grupo
funcional Fc.
Se ha reportado que cuando el
IFN-\beta se fusiona a la región de terminal N de
Fc, es útil la introducción de una secuencia ligadora. Ver, por
ejemplo, Patente Estadounidense No. 5,908,626. Similar a las
proteínas de fusión Fc-IFN-\beta
con las regiones pivote alteradas o regiones Fc alteradas, una
proteína de fusión Fc-IFN-\beta
contiene una región ligadora Gly-Ser, que separa la
región Fc del grupo funcional IFN-\beta también
produce el mismo resultado como anteriormente.
\newpage
En contraste, el análisis
SDS-PAGE de
huFc-IFN-\beta(C17S) revela
que esta proteína no se agrega sustancialmente. Bajo condiciones no
reducidas, la banda de 100 kDa que corresponde a
huFc-IFN-\beta (C17S) representa
prácticamente la banda solo visible en el gel. Más aún, bajo
condiciones de reducción, también está ausente la banda más
prominente que representa la proteína de fusión agregada, más
probablemente debido a la interacción de los parches hidrófobos
expuestos. Por lo tanto, la introducción de una sustitución de
cisteína en la posición 17 de la secuencia madura de
IFN-\beta promueve el plegado correcto de la
proteína de fusión. Este resultado es sorprendente en dos conteos:
para uno, la presencia de una cisteína libre en la porción "X"
de una proteína Fc-X no ha presentado un problema
en otras proteínas de fusión, tal como Fc-IL2; y la
presencia de la cisteína libre en IFN-\beta no ha
presentado un problema cuando la proteína libre o cuando una
proteína IFN-\beta-Fc se expresan
en un sistema de expresión de mamífero.
\vskip1.000000\baselineskip
Se determinan la concentración de productos de
proteína que contienen Fc humanos en los sobrenadantes de clones
resistentes a MTX y otras muestras de prueba mediante
anti-huFc ELISA. Los procedimientos estándar como se
describe en detalle adelante se siguen esencialmente.
\vskip1.000000\baselineskip
Se cubren placas ELISA con IgG antihumano de
Cabra AffiniPure (H+L) (JacksonInmunoResearch Laboratories, West
Grove, PA) a 5 mg/mL en PBS, y 100 mL/pozo en placas de 96 pozos
(placa Nunc-Ixnmuno Maxisorp). Se recuperan las
placas cubiertas y se incuban a 4ºC durante la noche. Las placas
luego se lavan 4 veces con 0.05% Tween (Tween 20) en PBS, y se
bloquean con 1% BSA/1% de suero de cabra en PBS, 200 mL/pozo.
Después de incubación con el amortiguador de bloqueo a 37ºC durante
2 hrs, las placas se lavan 4 veces con 0.05% Tween en PBS y se
atrapan secas en toallas de papel.
\vskip1.000000\baselineskip
Se diluyen muestras de prueba como sea apropiado
en el amortiguador de muestra (1% BSA/1% suero de cabra/0.05% Tween
en PBS). Se prepara una curva estándar utilizando un anticuerpo
quimérico (con un Fc humano), la concentración de la cual se
conoce. Para preparar una curva estándar, se hacen diluciones
seriales en el amortiguador de muestra para dar una curva estándar
que varía de 125 ng/mL a 3.9 mg/mL. Las muestras diluidas y los
estándares se agregan a la placa, 100 mL/pozo y la placa se incuba
a 37ºC durante 2 hr. Después de incubación, la placa se lava 8
veces con 0.05% Tween en PBS. Luego se agrega a cada pozo 100 mL del
anticuerpo secundario, el IgG antihumano conjugado con peroxidasa
de rábano (Jackson ImmuneResearch), se diluye aproximadamente
1:120,000 en el amortiguador de muestra. La dilución exacta del
anticuerpo secundario se ha determinado para cada lote del IgG
antihumano conjugado con HRP. Después de incubación a 37ºC durante 2
hr, la placa se lava 8 veces con 0.05%
Tween en PBS.
Tween en PBS.
\vskip1.000000\baselineskip
La solución de sustrato se agrega a la placa a
100 mL/pozo. La solución de sustrato se prepara al disolver 30 mg
de OPD (diclorhidrato o-fenilenodiamina (OPD), (1
comprimido) en 15 mL de amortiguador de 0.025M de ácido
cítrico/0.05M Na2HPO4, pH 5, que contiene 0.03% de peróxido de
hidrógeno frescamente agregado. Se le permite desarrollar color
durante 30 min. a temperatura ambiente en la oscuridad. El tiempo de
desarrollo se somete a cambio, dependiendo de la variabilidad de
lote a lote de las placas cubiertas, el anticuerpo secundario, etc.
Se detiene la reacción al agregar 4N de ácido sulfúrico, 100
mL/pozo. La placa se lee mediante un lector de placa, que se
establece a 490 y 650 nm y se programa para sustraer el OD anterior
a 650 nm del OD a 490 nm.
\vskip1.000000\baselineskip
La purificación estándar de proteínas de fusión
que contienen Fc se desarrolla con base en la afinidad del grupo
funcional de proteína Fc para la Proteína A. En resumen, los
sobrenadantes celulares (de células transfectadas con proteínas
mutantes o tipo natural) que contienen la proteína de fusión se
cargan en una columna de Flujo Rápido de Sefarosa de Proteína A
pre-equilibrada (50 mM Fosfato de Sodio, 150 mM NaCl
a pH neutro) y la columna se lava extensivamente en el amortiguador
(50 mM Fosfato de Sodio, 150 mM NaCl a pH neutro). Se eluye la
proteína de unión un pH bajo (pH 2.5) en el mismo amortiguador como
se hizo anteriormente y las fracciones se neutralizan
inmediatamente, opcionalmente al eluir directamente en una solución
de 1M Tris base, pH 11.
\newpage
Se analizan
huFc-IFN-\beta purificado con
Sefarosa de Proteína A y las proteínas de fusión
huFc-IFN-\beta^{sol} mediante
cromatografía de tamaño de exclusión analítica (SEC), y el % de
material no agregado se cuantifica al calcular el área baja la cura
de picos de cromatograma. La integridad y pureza de las proteínas de
fusión se verifica por electrofóresis SDS-PAGE.
\vskip1.000000\baselineskip
En una segunda etapa de purificación, la
Sefarosa de Proteína A neutralizada eluada que contiene las
proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta^{sol} se aplican a
una columna SEC preparativa y se recolectan las fracciones pico,
produciendo preparaciones de proteína
Fc-IFN-\beta^{sol} que consisten
de por lo menos 90% del material no agregado. Aunque la producción
del producto purificado para
Fc-\beta4h-ligador-IFN-\beta(C175)
es aproximadamente 10%, para
Fc-\beta4h-ligador-IFN-\beta^{sol}(C17S
L57A H131A H140T) este es aproximadamente 75%. Este resultado
indica que la combinación de las mutaciones C17S con, por ejemplo
L57A, H131A, y H140T en el grupo funcional
IFN-\beta promueve significativamente las
características de solubilidad de las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta.
\vskip1.000000\baselineskip
La replicación vírica en el cultivo celular
frecuentemente resulta en citotoxicidad, un efecto conocido como
efecto citopático (CPE). Los interferones pueden inhibir la
proliferación vírica y proteger las células de CPE. La actividad
antivírica de IFN-\beta se puede cuantificar
mediante reducción del efecto citopático (CPER), como se describe
en "Lymphokines and Interferons: A Practical Approach", editado
por M.J. Clemens, A.G. Morris, y A.J.H. Gearin, I.R.L. Press,
Oxford, 1987. Las actividades antivíricas de
huFc-IFN-\beta y
huFc-IFN-\beta^{sol} purificado
se comparan relacionado con un estándar
huIFN-\beta comercial (R&D Systems) o
Betaferón (Serono) utilizando la línea de carcinoma de pulmón
epitelial humana A549 (ATCC # CCL-185) y el virus
encefalomiocarditis s (EMCV; ATCC # VR 129B) de acuerdo con el
protocolo CPER descrito en la referencia anterior. La dosis
efectiva (ED50) se establece como la cantidad de proteína que
conduce a 50% CPER (es decir 50% de las células se han protegido de
lisis), determinado con relación a células de control no infectadas.
Los valores ED50 son el promedio de por lo menos tres experimentos
separados. Se encuentra que las dosis efectivas que dan 50% CPER
son 50 pg/ml para huFc-IFN-\beta
70 pg/ml para
huFc-IFN-\beta^{sol}(C17S),
14 pg/ml para
huFc-IFN-\beta^{sol}(C17S,
F50H, H131A, H140A) y 17 pg/ml para
huFc-IFN-\beta^{sol}(C17S,
L57A, H131A, H140T). Estos valores, que se han normalizado a la
cantidad de IFN-\beta en la proteína de fusión,
se correlacionan bien con el ED50 de 90 pg/ml o 40 pg/ml encontrado
con el estándar comercial o Betaferón, respectivamente. Por lo
tanto, las proteínas de fusión IFN-\beta retienen
actividad antivírica sustancial en un ensayo CPER, y las proteínas
de fusión huFc-IFN-\beta^{sol}
tienen un ED50 aproximadamente equivalente al del
huIFN-\beta libre.
\vskip1.000000\baselineskip
La actividad de las proteínas de fusión
Fc-IFN-\beta purificadas se
determina adicionalmente en un ensayo de inhibición de crecimiento
celular. La proliferación de células Daudi (ATCC #
CCL-123), una línea de linfoblasto B derivada de un
paciente con linfoma de Burkit, se inhibe normalmente por
IFN-\beta. De acuerdo con lo anterior, los
efectos antiproliferativos de las proteínas de fusión
huFc-IFN-\beta y
huFc-IFN-\beta^{sol} (C17S) en
células Daudi se comparan con relación a un estándar humano
comercial (Calbiochem). Para configurar el ensayo para cada una de
estas proteínas, una serie de dilución cubre aproximadamente un
rango de concentración miles de veces se prepara en medio RPMI
complementado con 10% de suero bovino fetal, y se forman alícuotas
de muestras de 100 ml en pozos de una placa de 96 pozos. Las células
Daudi en fase de crecimiento se lavan y se resuspenden a 2 x
10^{5} células/ml en el medio RPMI complementado con 10% de suero
bovino fetal, y 100 ml de las células se forman alícuotas a cada
pozo que contiene las diluciones IFN-\beta. Los
pozos de control adicionales contienen células no tratadas o el
medio solo. Después de incubación durante 72 horas adicionales se
mide la proliferación mediante actividad deshidrogenasa
mitocondrial, utilizando el sustrato de enzima cromogénico MTS
(Promega # G5421) en la presencia de del donante de electrón PMS
(Sigma # P 5812). Los valores ED50, que se determinan de las curvas
de actividad, se encuentran por estar alrededor de 3 ng/ml a 3.5
ng/ml para cada una de las proteínas de fusión así como también para
la proteína IFN-\beta comercial. Esto por lo
tanto concluye que las proteínas de fusión
IFN-\beta son tan efectivas como el
IFN-\beta libre en inhibir el crecimiento de
células Daudi.
\vskip1.000000\baselineskip
Las farmacocinéticas de
huFc-IFN-\beta y las proteínas de
fusión huFc-IFN-\beta^{sol} se
determinan en un grupo de 4 ratones Balb/c, para cada proteína. Se
inyecta veinticinco miligramos de la proteína de fusión en la vena
de la cola de cada ratón. Se obtiene sangre mediante mezcla
retro-orbital inmediatamente después de inyección
(es decir, a t = 0 min), y a 30 min, 1 hr, 2 hrs, 4 hrs, 8 hrs, y 24
hrs post-inyección. Se recolectan muestras
sanguíneas en tubos que contienen heparina para evitar división. Se
remueven las células mediante centrifugación en una microcentrífuga
de alta velocidad Eppendorf durante 4 min a 12,500 g. La
concentración de Fc-huIFN-\beta o
huFc-IFN-\beta^{sol} en el
plasma se mide por anti-huFc ELISA y análisis
Western blot utilizando el anticuerpo anti-huFc.
Alternativamente, se puede utilizar un IFN-\beta
ELISA. La integridad de la proteína de fusión circulante se
mantiene mediante un inmunoblot del suero probado con un anticuerpo
anti-huFc o con un anticuerpo
anti-IFN-\beta. Se encuentra que
la vida útil circulante de
huFc-IFN-\beta^{sol} es mayor
que la de huFc-IFN-\beta, y por lo
menos 5 veces que la del IFN-\beta libre.
Adicionalmente, se contempla que los efectos
específicos de
Fc-IFN-\beta^{sol} son más
pronunciados en el tratamiento de afecciones y enfermedades tal como
esclerosis múltiple, en donde se conoce la administración de
IFN-\beta por aliviar la afección.
Claims (18)
1. Una proteína de fusión
Fc-interferón-\beta con
plegamiento mejorado y agregación reducida que comprende:
- (i)
- una región de Fc de inmunoglobulina; y
- (ii)
- una proteína de interferón ligada por unión de péptido o una secuencia ligadora de péptido al terminal carboxi de la región Fc de inmunoglobulina,
en donde la proteína interferón comprende
sustituciones de aminoácido comparado con la secuencia de interferón
madura natural en las posiciones 17 y 50 y 131 y 140, o 17 y 57 y
131 y 140.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Una proteína de fusión de la reivindicación
1, que tiene las siguientes sustituciones de aminoácido dentro de la
proteína interferón-\beta: C17S y F50H y H131A y
H140T o A, o C17S y L57A y H131A y H140T o A.
3. Una proteína de fusión de acuerdo con la
reivindicación 1 o 2, en donde la región Fc de inmunoglobulina
comprende una región de pivote de inmunoglobulina y una región
constante de cadena pesada de inmunoglobulina.
4. Una proteína de fusión de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en donde la
región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG4, IgG2 o IgG1.
5. Una proteína de fusión de la reivindicación
4, en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG4 y
comprende adicionalmente una región de pivote de inmunoglobulina
derivada de IgG1.
6. Una proteína de fusión de la reivindicación
5, en donde un residuo cisteína de la región de pivote se ha
mutado.
7. La proteína de fusión de la reivindicación 4,
en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva de IgG1, y un
residuo alanina se sustituye en lugar de la lisina de terminal C de
la región Fc de inmunoglobulina.
8. Una proteína de fusión de acuerdo con la
reivindicación 4, en donde la región Fc de inmunoglobulina se deriva
de IgG2 y comprende adicionalmente una región de pivote de
inmunoglobulina derivada de IgG1.
9. Una proteína de fusión de la reivindicación
8, en donde un residuo cisteína de la región de pivote se ha
mutado.
10. Una proteína de fusión de la reivindicación
8 o 9, en donde un residuo alanina se sustituye adicionalmente en
lugar de la lisina de terminal C de la región Fc de
inmunoglobulina.
11. Una proteína de fusión de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en donde la
secuencia ligadora de péptido es Gly4SerGly4SerGly3SerGly.
12. Una molécula de ácido nucleico que codifica
una cualquiera de las proteínas de fusión
Fc-interferón-\beta de las
reivindicaciones 1-11.
13. Un vector de expresión replicable para
transfectar una célula de mamífero que comprende una molécula de
ácido nucleico de la reivindicación 12.
14. Una célula de mamífero, seleccionada del
grupo que consiste de células de hibridoma inmortal, Células de
mieloma NS/0, células 293, Células de ovario de hámster Chino,
Células HeLa y Células COS, dicha célula de mamífero contiene un
vector de expresión de la reivindicación 13.
15. Un método para estabilizar una proteína de
fusión Fc-interferón-\beta que
comprende expresar una proteína de fusión
Fc-interferón-\beta como se
especifica en cualquiera de las reivindicaciones
1-11 en una célula de mamífero como se especifica en
la reivindicación 14.
16. El método de la reivindicación 15, en donde
estabilizar comprende
- (i)
- incrementar la vida útil circulante de la proteína de fusión Fc-interferón-\beta relacionada con una proteína de fusión Fc-interferón-\beta no alterada, o
- (ii)
- reducir la agregación de la proteína de fusión Fc-interferón-\beta relacionada con una proteína de fusión Fc-interferón-\beta no alterada, o
- (iii)
- incrementar la actividad biológica de la proteína de fusión Fc-interferón-\beta relacionada con una proteína de fusión Fc-interferón-\beta no alterada.
\newpage
17. Uso de una proteína de fusión
Fc-interferón-\beta de cualquiera
de las reivindicaciones 1-11 para la fabricación de
un medicamento para el tratamiento de esclerosis múltiple, leucemia
mieloide, mieloma múltiple, Enfermedad de Hodgkin, carcinoma de
célula basal, displasia cervical, osteosarcoma, hepatitis vírica,
herpes zóster y herpes genital, virus papiloma, encefalitis vírica y
neumonía citomegalovirus.
18. Una proteína de fusión
Fc-interferón-\beta de cualquiera
de las reivindicaciones 1-11 para uso como un
medicamento para el tratamiento de esclerosis múltiple, leucemia
mieloide, mieloma múltiple, enfermedad de Hodgkin, carcinoma de
célula basal, displasia cervical, osteosarcoma, hepatitis vírica,
herpes zóster y herpes genital, virus papiloma, encefalitis vírica y
neumonía citomegalovirus.
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