ES2342264T3 - Familia de proteinas ee3 y secuencias de adn correspondientes. - Google Patents
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Abstract
Ácido nucleico, caracterizado porque se codifica para un polipéptido conforme a una de las Figuras 13 o 15A, o para variantes de éste, que tengan en el plano de aminoácidos al menos un 90% de la identidad respecto a un polipéptido conforme a una de las Figuras 13 o 15A, excepto un ácido nucleico conforme a la SEC ID NO:75 de la WO01/98353.
Description
Familia de proteínas EE3 y secuencias de ADN
correspondientes.
La presente invención se relaciona con
- (i)
- secuencias de ADN,
- (ii)
- vectores de expresión, que contengan secuencias de ADN conformes a la invención,
- (iv)
- células huésped, que presenten vectores de expresión conformes a la invención,
- (v)
- productos génicos, codificados por secuencias conformes a la invención,
- (vi)
- animales transgénicos modificados en lo que se refiere a secuencias conformes a la invención,
- (vii)
- anticuerpos dirigidos contra productos génicos conformes a la invención,
- (viii)
- procedimientos para la expresión y/o aislamiento de productos génicos conformes a la invención,
- (ix)
- el empleo de secuencias de ADN y/o productos génicos conformes a la invención como fármaco,
- (x) y (xi)
- empleos no-terapéuticos de secuencias de ADN y/o productos génicos conformes a la invención.
Gracias al estado actual de la técnica se
conocen numerosas proteínas, que pertenecen a la clase de los
receptores acoplados a la proteína G (GPCRs). Se trata además de la
mayor familia de moléculas superficiales, involucradas en la
transducción de señales. Son activadas por una gran variedad de
ligandos y otros estímulos, por ejemplo, luz (rodopsina), olores
(receptores de odorantes), calcio, aminoácidos o aminas biogénicas,
nucleótidos, péptidos, - y derivados, y diferentes polipéptidos. En
los mamíferos, se basa en que existen aprox. 1500 proteínas
diferentes de la clase de las GPCRs, codificando aprox. 1200 para
receptores de olor, de sabor o deleronasales. El número total de
GPCRs "huérfanos" (o sea receptores, a los que no podía
asignarse hasta ahora ninguna funcionalidad) se estima en
200-500 (Howard AD, McAllister G,
proteína-coupled receptors and natural ligand
discovery. Textoremoscias farmacol Sci
22:132-140.). En la Caenorhabditis elegans,
las secuencias de GPCR componen aprox. un 5% del genoma y codifican
para aprox. 1000 proteínas GPCR (Bargmann CI (1998) Neurobiology of
the Caenorhabditis elegans genome. Science
282:2028-2033 y Bargmann CI, Kaplan JM (1998) Señal
transducción en the Caenorhabditis elegans nervous System.
Annu Rev Neurosci 21: 279-308).
Para la Drosofila melanogaster hay
conocimientos gracias al estado actual de la técnica de que existen
aprox. 200 secuencias de GPCR (Brody T, Cravchik A (2000)
Drosofila melanogaster G proteína-coupled
receptors. J Cell Biol 150:83-88). Se parte del
hecho de que este gran grupo de moléculas topológicamente similares
se ha desarrollado convergentemente, es decir, con el fin del
acoplamiento a proteínas G.
La clase de las GPCRs se subdivide en 3 ó 4
familias según el estado actual de la técnica. La familia A tiene
además la gran mayoría de miembros, a ellos pertenecen por ejemplo,
también los receptores de odorantes (Buck L, Axel R (1991) A novel
multigene family may encode odorant receptors: a molecular base for
odor recognición. Cell 65:175-187.). A la familia B
pertenecen los receptores para secretina, VIP, y calcitonina. La
familia C consiste en receptores como los receptores metabotrópicos
del glutamato, los receptores del calcio, los receptores del
GABA-B, los receptores del sabor, y los receptores
de la feromona. Casi todas las denominadas secuencias
"huérfanas" de GPCR pertenecen, sin embargo, a la familia
A.
Una característica de las familias de GPCR es su
transducción de señales a través de las proteínas G. El enlace de
un ligando extracelular induce la activación de una proteína G, que
reexpide entonces la señal. Hay aprox. 200 proteínas G diferentes,
y cada tipo de célula puede tener otra dotación. La forma activa de
una proteína G es la ligada al GTP, en estado inactivo la proteína
G está ligada al GDP. La propia proteína G conlleva además su
inactivación tras el enlace al GTP, ya que representa una GTPasa.
Por tanto, la transducción de señales a través de proteínas G es
siempre un acontecimiento trasiente. Cada proteína G consiste en 3
subunidades, alfa, beta y gamma. Además, la subunidad alfa puede
ligar al GTP y puede controlar, por tanto, considerablemente las
moléculas de señalización de la parte inferior de la cascada de
señales ("second messenger" systems - sistemas de segundo
mensajero). La proteína G Gs, por ejemplo, activa (estimula) la
adenilato ciclasa y conlleva así un aumento de la concentración del
mensajero intracelular cAMP. La proteína G Gi inhibe la adenilato
ciclasa, y la Gq activa a la fosfolipasa C ("segundo
mensajero": inositoltrifosfato y diacilglicerol). Otros sistemas
segundo mensajero frecuentemente empleados son, por ejemplo, calcio,
K, cGMP, y otros. Hay también proteínas G quiméricas. Las
subunidades G beta y gamma pueden conducir asimismo a una
transducción de señales, después de que se hayan desacoplado del
complejo proteico trimérico, por ejemplo, posiblemente durante la
activación de las rutas de señal de la MAP quinasa. La
especificidad del acoplamiento a la proteína G de un determinado
GPCR representa una importante característica farmacológica, que
puede aprovecharse, entre otros, para el desarrollo del ensayo,
típicamente con determinación de las variaciones de la concentración
de las moléculas de señalización de la parte inferior de la cascada
de señales, por ejemplo, calcio, cAMP o inositoltrifosfato. Sólo
recientemente se ha encontrado en la literatura, con los resultados
preliminares, también la observación de las rutas de señal de la
MAP quinasa, que pueden transferir asimismo señales de GPCR
(Marinissen MJ, Gutkind JS (2001)
G-protein-coupled receptors and
signaling networks: emerging paradigms. Trends Pharmacol Sci
22:368-376.).
Finalmente es también en principio posible una
transducción de señales independiente de la proteína G. así por
ejemplo, modula la interacción directa del receptor de
beta-2-adrenérgicos con la proteína
NHERF la actividad de un intercambiador de Na/H (Hall RA, Premont
RT, Chow CW, Blitzer JT, Pitcher JA, Claing A, Sustanciasl RH,
Barak LS, Shenolikar S, Weinman EJ, Grinstein S, Lefkowitz RJ (1998)
The beta2-adrenergic receptor interacts with the
Na+/H+-exchanger regulatory factor to control Na+/H+ exchange.
Nature 392:626-630).
Otra característica, que se aplica a muchos,
cuando no a todos, los receptores de GPCR- son las
oligomerizaciones. Especialmente interesantes son, en este
contexto, las heterodimerizaciones entre diferentes GPCRs, que
pueden modificar el perfil farmacológico y la especificidad de los
ligandos (Bouvier M (2001) oligomerización of
G-proteína-coupled transcentror
receptors. Nat Rev Neurosci 2:274-286). Así funciona
por ejemplo, el receptor de GABA-B sólo como
heterodímero entre GBR1 y GBR2 (Kuner R, Kohr G, Grunewald S,
Aquírohardt G, Bach A, Granoau HC (1999) Role of heteromer
formation en GABAB receptor funcion. Science
283:74-77). Una heterodimerización de este tipo
describiría entretanto para una serie completa de GPCRs, por
ejemplo, el mGluR5, el receptor de delta-opioide, y
otros. Sólo recientemente se ha documentado en el caso de la
preclampsia, que la elevada expresión de un participante en un par
de heterodímeros de GPCR puede conducir a una enfermedad. Aquí
conlleva la elevada expresión del receptor de
Bradykinin-II una formación reforzada de
Heterodímeros receptores de
BradykininII-AngiotensinaII, cuya respuesta
farmacológica modificada puede aclara el fenotipo hipertónico
(AbdAlla, Lother, Massiery y Quitterer, Nat. Medicine (2001), 7,
1003-1009).
Finalmente, en el caso de las proteínas de la
clase GPCR se trata de una molécula diana farmacológica preferente.
En el caso de las proteínas de la clase GPCR se afectan
farmacológicamente más del 25% de los 100 medicamentos superventas
(Flower et al., 1999, Biochim. Biofys. Acta, 1422,
207-234). Así son particularmente agonistas y
antagonistas para los siguientes grupos de receptores de mayor
importancia farmacológica: el grupo de los adrenoreceptores, del
receptor de la angiotensina-II, receptores de la
serotonina, receptores de la dopamina, receptores de la histamina,
receptores del leucotrieno/prostaglandina. Los fármacos, que en
influyen estos receptores, cubren un espectro terapéuticamente
amplio de enfermedades, enfermedades psiquiátricas (esquizofrenias,
depresiones), o bien a través de su influencia sobre la
hipertensión sanguínea incluyendo los medicamentos de emergencia
para los casos de parada cardíaca. Ejemplos conocidos de
medicamentos habituales, que influyen sobre estos receptores, son,
por ejemplo, agonistas alfa adrenoceptores (norfenefrina), agonistas
beta-adrenoceptores (isoprenalina, fenoterol),
alfa-bloqueadores de adrenoceptores (prazosina),
beta-bloqueadores de adrenoceptores (propanolol),
antagonistas de 5-HT(ciproheptadina),
bloqueador de receptores de H2 (cimetidina), bloqueador de
receptores de H1 (terfenadina), agonistas de la dopamina
(bromocriptina) y otros.
A pesar de los intensivos esfuerzos de
investigación son sin embargo, las rutas de transducción de las
señales, que quedan afectadas por los receptores, aún
insuficientemente aclaradas. Por otra parte, hace falta una absoluta
comprensión de la estructura compleja la influencia mutua de los
diferentes sistemas de GPCR y su efecto sobre los procesos
intracelulares enlazados hacia la parte inferior de la cadena de
procesos, particularmente también con vista hacia los estados
fisiológicos externos.
Un objeto de la presente invención es
identificar otros miembros de la clase de las proteínas GPCR y sus
secuencias de nucleótidos correspondientes. Es posible proporcionar
procedimientos basados en las proteínas identificadas, que permitan
desarrollar sustancias terapéuticamente efectivas, que puedan
intervenir terapéuticamente en una patofisiología, originada, por
ejemplo, mediante control de errores de la expresión y/o expresión
de las variantes infuncionales, pero que también puede aparecer en
caso de expresión fisiológica.
La presente invención resuelve estos objetos
mediante los objetos de las Reivindicaciones 1 a 16. Particularmente
quedan comprendidos conforme al descubrimiento todos aquellos
incluidos en las secuencias complementarias en la doble hélice.
En otro modo de ejecución preferente se muestran
secuencias de ADN, cuyo producto génico se codifica para un
polipéptido, tal y como se reproduce en una de las Figuras 13 ó q5A,
para las secuencias con los números 5 y/o 7A excepto un ácido
nucleico conforme a la SEC ID No:75 de la WO 01/98353. También se
muestran secuencias de la hélice de ADN complementaria. Se
prefieren además las secuencias de ácidos nucleicos, particularmente
las secuencias de ADN, que codifican para una proteína, con las
secuencias conformes a la presente numeración 5 y 7 excepto un
ácido nucleico conforme a la SEC ID No. 75 de la WO 01/98353. Tras
el aislamiento y secuenciación, las secuencias de nucleótidos
conformes a la invención, por ejemplo, conformes a las Figuras 9 o
11A o su equivalente funcional o disfuncional, como por ejemplo,
variantes alélicos o isoformas, pueden obtenerse comercialmente. En
el sentido de la presente invención se entiende por variantes
alélicos aquellos variantes, que presentan preferentemente del 90
al 100% de homología a nivel de aminoácido. Los variantes alélicos
abarcan particularmente aquellos variantes funcionales, obtenibles
por supresión, inserción o sustitución de nucleótidos de secuencias
de ee3- nativas, por ejemplo, de secuencias representadas conforme
a las Figuras 9 o 11A, conservándose al menos aún una de las
importantes propiedades biológicas.
Las secuencias de ADN homólogas o afines a la
secuencia se pueden aislar de todas las especies de mamíferos u
otras especies, incluidos los humanos, por procedimientos habituales
mediante cribado de homología mediante hibridación con una muestra
de las secuencias de ácidos nucleicos conformes a la invención o
partes de éstas. Por equivalentes funcionales han de entenderse
también los homólogos de las secuencias de ee3 nativas, por
ejemplo, de las secuencias representadas en las Fig. 9 u 11A, por
ejemplo, sus homólogos de otros mamíferos, secuencias abreviadas,
ADN monocatenario o ARN de la secuencia de ADN codificadora o
no-codificadora excepto un ácido nucleico conforme
a la SEC ID No. 75 de la WO 01/98353. Estos equivalentes funcionales
se pueden aislar de otros vertebrados no mamíferos, por ejemplo,
partiendo de las secuencias de ADN representadas en las Fig. 9 u
11A o partes de estas secuencias, por ejemplo, con procedimientos
habituales de hibridación o la técnica de PCR.
Una estructura de ácidos nucleicos conforme a la
invención o un ácido nucleico conforme a la invención puede
expresarse también en forma terapéuticamente o diagnósticamente
apropiada. Para la generación de las proteínas recombinantes se
pueden emplear sistemas de vectores u oligonucleótidos, que
prolonguen los ácidos nucleicos o la estructura de ácidos nucleicos
una determinada secuencia de nucleótidos y codifican, por tanto,
para polipéptidos modificados, que sirven por ejemplo, para una
purificación más simple, en este contexto se atribuye
particularmente también a la prolongación mediante las secuencias
arriba descritas.
Se prefieren además las secuencias de ADN, que
contengan o correspondan a (c) secuencias de ADN de secuencias
genómicas de ADN conformes a la invención.
Se muestran además conforme a la invención
preferentemente todas las secuencias de ADN, que codifican para una
proteína, que corresponde esencialmente a la secuencia de
aminoácidos de las proteínas conformes a la invención con los
números de secuencia 5, y/o 7A, excepto un ácido nucleico conforme a
la SEC ID No: 75 de la WO 01/98353. Estas secuencias de ADN
conservan sólo un bajo número de modificaciones frente a las
secuencias indicadas en las figuras citadas anteriormente; por
ejemplo, puede tratarse de isoformas. El número de modificaciones
de secuencia no será típicamente mayor de 10. Estas secuencias de
ADN, esencialmente con las secuencias de ADN apropiadas,
codificadoras para las proteínas con los números de secuencia 5, y/o
7A, , que codifican igualmente para una proteína biológica activa,
pueden obtenerse por el procedimiento de mutagénesis generalmente
conocido e identificarse la actividad biológica de las proteínas
codificadas por los mutantes por el procedimiento de cribado
(screening), por ejemplo, estudio de enlaces o la capacidad para el
desarrollo de la función biológica, por ejemplo, en relación con
procedimientos neuronales o la apoptosis. A los procedimientos
apropiados de mutagénesis pertenecen la mutagénesis
sitio-dirigida, que prevé la síntesis efectuada
automáticamente de un imprimador con al menos una modificación de
base. Tras la reacción de polimerización se transfiere el vector
heteroduplex a un sistema celular apropiado (por ejemplo, E.
coli) y se aíslan los clones correspondientemente
transformados.
La funcionalidad de las secuencias conformes a
la invención está, entre otros, en relación directa con la
identificación de los elementos muy distales de la cascada de
señales activada por las proteínas conformes a la invención. En
este contexto se comprobó, que las MAP quinasas son estimuladas por
los receptores conformes a la invención. Además del empleo de
ensayos de informe apropiados (ver ejemplo de ejecución), para la
identificación de las MAP quinasas se pueden emplear
alternativamente para estos propósitos también kits prefabricados
(por ejemplo, Mercury in vivo kinase ensayo kits, Fa.
Clontech). Se expresa además el represor tet en fusión con el
dominio transactivador de una diana de fosforilación (factores de
transcripción, por ejemplo, Jun). La activación de una construcción
de luciferasa bajo control de un elemento represor tet se verifica
sólo cuando se lleva a cabo una fosforilación específica del
dominio transactivador mediante una quinasa. De este modo es
posible la clasificación de la actividad de un receptor conforme a
la invención de la familia ee3 o de una variante conforme a la
invención en una ruta celular de transducción de señales.
La identificación de las secuencias conformes a
la invención se basa entre otros, también en el conocimiento
funcional de que la alta regulación de los ee3_1_m múridos conformes
a la invención en un modelo animal con elevada expresión de EPO
señala una implicación patofisiológica de este receptor en los
procedimientos, que afectan a la supervivencia o a la adaptación de
células a este estado. En consecuencia, son los receptores,
conformes a la invención, los que tienen especial importancia
farmacológica para enfermedades que van acompañadas de un reducido
suministro de oxígeno, particularmente de un reducido suministro
cerebral de oxígeno.
Por otra parte, entran en consideración todos
los métodos familiares para el experto para la fabricación,
modificación y/o detección de secuencias de ADN conformes a la
invención, que pueden desarrollarse in vivo, in situ
o in vitro (PCR (Innis et al. PCR Protocols: A Guide
to Metods and Applications) o síntesis química. Mediante el
apropiado imprimador de PCR se pueden introducir, por ejemplo,
nuevas funciones en una secuencia de ADN conforme a la invención,
como por ejemplo, interfases de restricción y codones de
terminación. De este modo se pueden proyectar correspondientemente
secuencias conformes a la invención en vectores de clonación para
la transferencia.
Otro objeto de la presente invención se
relaciona con vectores de expresión o una estructura recombinante
de ácidos nucleicos, que contenga una secuencia de ácidos nucleicos
conforme a la invención, como la descrita anteriormente,
típicamente una secuencia de ADN. Más favorablemente se combinan en
este contexto funcionalmente las secuencias de ácidos nucleicos
conformes a la invención con al menos un elemento genético de
regulación, como por ejemplo, señales de transcripción y
traducción. Este enlace puede conducir, en función del empleo
deseado a una tasa nativa de expresión o también a un aumento y/o
reducción de la expresión genética nativa. Con los vectores de
expresión elaborados en tal medida se pueden transformar, a
continuación, organismos huésped y/o las células huésped, por
ejemplo, cultivos celulares de células de mamíferos.
En el caso del vector de expresión conforme a la
invención se emplea(n) típicamente el(los)
elemento(s) de regulación nativo(s), es decir, la,
por ejemplo, región promotora y/o potenciadora del gen para una
proteína conforme a la invención de la familia ee3, particularmente
para una proteína con el número de secuencia 5, ó 7A, por ejemplo,
de mamíferos, de manera particularmente apropiada secuencias de
regulación humanas. Dado el caso, estas secuencias de regulación
nativas indicadas anteriormente pueden estar también genéticamente
modificadas, para dar lugar a una intensidad de expresión
modificada. Adicionalmente a estas secuencias de regulación nativas
indicadas anteriormente o en su lugar se pueden acoplar para otros
genes elementos de regulación nativos antes o después de las
secuencias de ADN conformes a la invención (secuencias de regulación
5'- o 3'-) y, si fuera necesario, también estar genéticamente
modificados, de forma que la regulación natural bajo el control de
las secuencias de regulación nativas indicadas anteriormente esté
deshabilitada y la expresión de los genes pueda elevarse o
reducirse - a voluntad - de este modo.
Las secuencias de regulación favorables para el
procedimiento conforme a la invención están contenidas, por
ejemplo, en promotores como cos-, tac-, trp-, tet-,
trp-tet-, lpp-, lac-, lpp-lac-,
lacIq-, T7-, T5- , T3-, gal-, trc-, ara-, SP6-,
l-PR- o en el promotor l-PL-, que se
emplean más favorablemente en bacterias Gram negativas.. Otras
secuencias de regulación favorables están contenidas, por ejemplo,
en los promotores Gram positivos como amy y SPO2, en los promotores
de levadura como ADC1, MFa, AC, P-60, CYC1, GAPDH o
en promotores de mamíferos como CaM-Kinaha deI,
CMV, nestina, L7, BDNF, NF, MBP, NSE, beta-globina,
GFAP, GAP43, tirosin hidroxilasa, subunidad 1 del receptor de
cainata, subunidad B del receptor de glutamato. En principio, se
pueden emplear todos los promotores naturales con sus secuencias de
regulación como los, por ejemplo, citados anteriormente, para un
vector de expresión conforme a la invención.
Por otra parte, pueden emplearse también
favorablemente promotores sintéticos. Estas secuencias reguladoras
deberían posibilitar la expresión acertada de las secuencias de
ácidos nucleicos conformes a la invención. Esto puede significar,
por ejemplo, en función de organismo huésped, que el gen se exprese
o sobreexprese sólo tras la inducción, o que se exprese y/o
sobreexprese inmediatamente. Las secuencias y/o factores reguladores
pueden afectar además positivamente, de manera preferente, la
expresión/y elevarla de este modo. Así puede realizarse un refuerzo
de los elementos reguladores más favorablemente a nivel de
transcripción, mientras se empleen fuertes señales de transcripción
como promotores y/o "potenciador". Además, es también posible,
sin embargo, un refuerzo de la traducción, a medida que se mejora,
por ejemplo, la estabilidad del ARNm.
Se designan como secuencias de regulación todos
los elementos familiares al experto, que pueden influir, a nivel de
transcripción y/o de traducción, la expresión de las secuencias
conformes a la invención. Particularmente han de destacarse además
así las secuencias de promotores denominadas secuencias de
"potenciadores", que pueden originarse a través de una
interacción mejorada entre la ARN-polimerasa y el
ADN y una elevada expresión. Como otras secuencias de regulación
han de citarse ejemplarmente las denominadas "Locus Control
Regions", "Silencer" o respectivas secuencias parciales de
estas. Este secuencias se pueden emplear favorablemente para una
expresión n específica del tejido. También las denominadas
secuencias terminadoras se encuentran más favorablemente en un
vector de expresión conforme a la invención y se subsuman conforme
a la invención bajo el término "secuencia de regulación".
Un modo de ejecución preferente de la presente
invención es el enlace de la secuencia de ácidos nucleicos conforme
a la invención con un promotor, hallándose el promotor típicamente
5' "hacia arriba" de una secuencia de ADN conforme a la
invención. Otras señales de regulación, como por ejemplo, 3'-
situados como terminador, las señales de poliadenilización o
potenciador, pueden estar contenidas funcionalmente en el vector de
expresión. Por otra parte, las secuencias de ácidos nucleicos
conformes a la invención, para las proteínas apropiadas, pueden
localizarse en una o varias copias en una construcción génica, según
la invención, o también, dado el caso, localizarse en
construcciones génicas independientes.
Bajo el término "vector de expresión"
encuentran tanto las estructuras recombinantes de ácidos nucleicos
y/o construcciones génicas, tal y como se ha descrito anteriormente,
como también las construcciones vectoriales completas, que, además
de las secuencias de ADN conformes a la invención y posibles
secuencias de regulación, típicamente también pueden ser otros
elementos. Estas construcciones vectoriales o vectores se emplean
para la expresión en un organismo huésped apropiado. Más
favorablemente se inserta al menos una secuencia de ADN conforme a
la invención, por ejemplo, gen humano de la familia ee3,
particularmente ee3_1 o ee3_2, o por ejemplo, una secuencia parcial
de un gen tal, en un vector específico del huésped, que posibilita
una expresión óptima de los genes en el huésped seleccionado. Los
vectores son bien conocidos por el experto y se pueden extraer, por
ejemplo, de "Cloning Vectors" (Eds. Pouwels P. H. et al.
Elsecuatro, Amsterdam-New
York-Oxford, 1985, ISBN 0 444 904018). Por vectores
han de entenderse, además de los plásmidos, también todos los demás
vectores conocidos por el experto, como por ejemplo: fagos, virus
como SV40, CMV, Baculovirus, Adenovirus, virus Sindbis,
transposones, elementos IS-, fásmidos, fagémidos, cósmidos, ADN
lineal o circular. Estos vectores pueden replicarse autónomamente
en el organismo huésped o replicarse cromosómicamente. Para la
integración en los mamíferos se emplea típicamente ADN lineal.
La expresión de las secuencias de ácidos
nucleicos conformes a la invención puede elevarse favorablemente
aumentando el número de copias génicas y/o reforzando los factores
reguladores, que influyen positivamente en la expresión génica. Así
puede realizarse un refuerzo de los elementos reguladores
preferentemente a nivel de transcripción, a medida que se empleen
señales de transcripción más fuertes, como promotores y
potenciadores. Además resulta también, sin embargo, posible un
refuerzo de la traducción, a medida que se mejora, por ejemplo, la
estabilidad del ARNm o la eficiencia de lectura de este ARN en los
ribosomas. Para el aumento del número de copias génicas se pueden
incorporar las secuencias de ácidos nucleicos o genes homólogos, por
ejemplo, en un fragmento de ácido nucleico y/o en un vector, que
contenga preferentemente las secuencias de genes regulatorias
asignadas a los respectivos genes, o actividad promotora que actúe
de manera análoga. Se emplean particularmente aquellas secuencias
regulatorias, que refuercen la expresión génica.
Las secuencias de ácidos nucleicos conformes a
la invención se pueden clonar junto con las secuencias codificadoras
para las proteínas interactuadoras o para las proteínas
potencialmente interactuadoras en un vector individual y
expresarse, a continuación, in vitro en una célula huésped o
in vivo en un organismo huésped. Alternativamente puede
llevarse también cada una de las secuencias de ácidos nucleicos
potencialmente interactuadoras y las secuencias de la familia ee3
codificadoras conformes a la invención, cada una, a un vector
individual y llevar este por separado al respectivo organismo a
través de los métodos habituales, como por ejemplo, transformación,
transfección, transducción, electroporación o
partícula-cañón (técnica de biobalística).
En otro modo de ejecución favorable puede haber
al menos un gen marcador (por ejemplo, genes de resistencia a los
antibióticos y/o genes que codifiquen para una proteína
fluorescente, particularmente GFP) en un conforme vector de
expresión a la invención, particularmente una construcción vectorial
completa.
Otro objeto de la presente invención se
relaciona con las células huésped, transformadas con una secuencia
de ADN conforme a la invención y/o un vector de expresión conforme a
la invención, particularmente una construcción vectorial. Como
células huésped son, en principio, apropiadas todas las células, que
permitan una expresión de las secuencias de ADN conformes a la
invención (incluyéndose como derivado, por ejemplo, también sus
alelos o equivalentes funcionales) aislado o en conjunto con otras
secuencias, particularmente secuencias de regulación. Como células
huésped entran en consideración todas las células pro- o eucariotas,
por ejemplo, bacterias, hongos, levaduras, células vegetales o
animales. Las células huésped preferentes son las bacterias, como
Escherichia coli, Streptomyces, Bacilo o Pseudomonas,
microorganismos eucariotas, como Aspergillus o
Saccharomyces cerevisiae o las levaduras de panadero
habituales (Stinchcomb et al., Nature, 282:39, (1997)).
Particularmente, para poder elaborar mayores concentraciones de
proteínas conformes a la invención, sirven más favorablemente las
levaduras metilotrofas, particularmente Pichia pastoris. Los
receptores se clonan para ello en vectores de expresión apropiados,
que permitan, por ejemplo, también la expresión como proteína de
fusión con secuencias con "marcador" apropiadas para la
purificación. Tras la electroporación de las levaduras se
seleccionan finalmente clones estables. Una buena descripción del
método, así como todos los medios necesarios para ello son
comercializados por la empresa Invitrogen. A consecuencia, se
pueden caracterizar funcionalmente los productos de expresión y,
dado el caso, emplearse para el procedimiento de cribado conforme a
la invención.
En un modo de ejecución preferente se
seleccionan, sin embargo, células de organismos multicelulares para
la expresión de las secuencias de ADN conformes a la invención. Esto
se realiza también ante los antecedentes de una glicosilación
posiblemente necesaria (N- y/o O-se unen) de las
proteínas codificadas. Esta función puede implementarse en células
eucariotas mayores - en comparación con las células procariotas - de
manera apropiada. En principio, cada cultivo celular eucariota
mayor está disponible como célula huésped, cuando se prefieran
también totalmente células de mamíferos, por ejemplo, monos, ratas,
hamsters o seres humanos. El experto conoce un gran número de
líneas celulares estables. En una enumeración nada definitiva se
citan las siguientes líneas celulares: 293T (línea celular renal
embrionaria), (Graham et al., J. Gen. Virol., 36:59 (1997)),
BHK (células renales de cría de hamster), CHO (células de los
ovarios de hamster), (Urlaub y Chasin, P. N. A. S. (USA) 77:4216,
(1980)), HeLa (células humanas de carcinoma de cervix) y otras
líneas celulares - particularmente estables para el empleo en
laboratorio, como por ejemplo, CHO-, HeLa-, HEK293-, Sf9- o células
COS-. Se prefieren de manera totalmente especial las células
humanas, particularmente las células del sistema inmunológico o
células adultas de variedad, por ejemplo, células de variedad de la
sangre formando sistemas (de la médula). Las células humanas
transformadas conformes a la invención, particularmente células
autólogas del paciente, sirven tras (sobre todo ex vivo) la
transformación con secuencias de ADN conformes a la invención o
vectores de expresión conformes a la invención, muy especialmente
como fármaco para, por ejemplo, propósitos terapéuticos génicos, o
sea, tras la ejecución de una extracción celular, dado el caso,
expansión ex vivo, transformación, selección y
retransplantación terminal.
Las proteínas de la familia ee3 conformes a la
invención se pueden elaborar heterológicamente en células de
insectos para la caracterización funcional y para su empleo para
procedimiento de cribado. Ya que la concentración de proteínas G
endógenas en las células de insectos es relativamente baja, así no
han de comprobarse, por ejemplo, las proteínas Gi en el "Western
Blot", y las células de insectos no expresan generalmente al
receptor a analizar, son especialmente apropiadas para la
reconstitución in vivo de las rutas de transducción de
señales de los receptores de la familia ee3 conformes a la
invención. Los receptores de la familia ee3 son expresados en este
caso por medio del sistema de expresión de Baculovirus en diferentes
líneas celulares de los insectos, por ejemplo, Sf9, Sf21, Tn 368 o
Tn High Five, o células MB. Para ello se elabora, por ejemplo,
Baculovirus recombinantes con el Kit Baculo-Gold de
Pharmingen y se infectan las líneas celulares de los insectos
citadas anteriormente. Para analizar, conforme a la invención, el
acoplamiento a las proteínas G, se efectúan
co-Infecciones. Para ello se infectan las células
con el virus receptor y adicionalmente incluso con los virus que
expresan a las tres subunidades de proteína G y se efectúan los
ensayos apropiados, por ejemplo, ensayos cAMP. Así, puede
estudiarse la influencia de diferentes subunidades de proteína G
sobre la actividad del receptor. Las células de insectos expresan
los receptores o sus membranas que se pueden emplear asimismo en
ensayos de cribado (screening). Las células de insectos pueden
proliferar fácilmente en grandes concentraciones tanto en
fermentadores como también en pistones vibrantes y son, por tanto,
material de partida apropiado, para proporcionar material
recombinante celular o de membrana tanto para el procedimiento de
cribado como también para purificación de receptores.
La combinación de una célula huésped y un vector
de expresión conforme a la invención adaptado a las células
huésped, como plásmidos, virus o fagos, como por ejemplo, plásmidos
con el sistema ARN-polimerasa/promotor, los fagos
1, Mu u otros fagos temperados o transposones, y/u otras secuencias
reguladoras favorables, forman una célula huésped conforme a la
invención, que puede servir como sistema de expresión. Son sistemas
de expresión preferentes conforme a la invención, los basados en
las células huésped conformes a la invención, por ejemplo, la
combinación de células de mamíferos, como por ejemplo, células CHO,
y vectores, como por ejemplo, vector pcDNA3neo, o por ejemplo,
células HEK293 y vector CMV, que son especialmente apropiados para
las células de los mamíferos.
Otro aspecto de la presente invención son los
productos génicos de las secuencias de ADN conformes a la invención.
En el sentido de esta invención se conocen por productos génicos
tanto los transcritos primarios, o sea ARN, preferentemente ARNm,
como también las proteínas y/o polipéptidos, particularmente en
forma purificada. Estas proteínas regulan o transporten
particularmente señales apoptóticas o necróticas, dado el caso
también señales inflamatorias o señales concernientes al
crecimiento celular o a la plasticidad celular. Un producto génico
purificado puede contener un alelo, fragmento, análogo o derivado,
funcionalmente homólogo o inhibidor de la función (afuncional), de
esta secuencia o consistir en una secuencia de aminoácidos tal.
Homología funcional se define en el sentido de de la presente
invención como que se conserva al menos aún una de las importantes
propiedades funcionales de las proteínas representadas conforme a
las Figuras 13 o 15a.
Se entienden por derivados además
particularmente aquellas secuencias de AS, alterado mediante
modificaciones de sus cadenas laterales. Por ejemplo, mediante
conjugación de un anticuerpo derivado, enzima o receptor a una
secuencia del aminoácidos conforme a la invención, se pueden pero
también el acoplamiento de un azúcar (a través de un enlace N- u
O-glicosídico) o
radical-(ácido)-graso (por ejemplo, ácido
mirístico), de uno o también de varios grupo(s)
fosfato y/o cualquier modificación de una cadena lateral, particularmente de un grupo OH libre o grupo NH2 o en el término N- o C- de un oligo- o polipéptido conforme a la invención. Por otra parte, el término "derivado" engloba también a las proteínas de fusión, en las que una secuencia de aminoácidos conforme a la invención está unida a cualquier oligo- o polipéptido.
fosfato y/o cualquier modificación de una cadena lateral, particularmente de un grupo OH libre o grupo NH2 o en el término N- o C- de un oligo- o polipéptido conforme a la invención. Por otra parte, el término "derivado" engloba también a las proteínas de fusión, en las que una secuencia de aminoácidos conforme a la invención está unida a cualquier oligo- o polipéptido.
Se denominan "análogos" a las secuencias
que se distinguen por al menos una modificación de los aminoácidos
frente a la secuencia nativa (inserción, sustitución). En el
contexto de la presente invención se prefieren aquellas
sustituciones conservativas, en las que se conserva el carácter
físico-químico (propiedades de llenado, basicidad,
hidrofobicidad, etc) del aminoácido sustituido (aminoácido polar,
cadena alifática larga, cadena alifática corta, aminoácido cargado
negativa- o positivamente, aminoácido con grupo aromático). Las
sustituciones pueden producir secuencias biológicamente funcionales
o biológicamente disfuncionales. Por ejemplo se pueden intercambiar
radicales arginina por radicales lisina, radicales valina por
radicales isoleucina o radicales ácido aspárgico por radicales
ácido glutamínico. Sin embargo, también se pueden sustituir, agregar
o eliminar uno o varios aminoácidos en su secuencia, o se pueden
combinar varias de estas medidas. Las proteínas modificadas en tal
modo frente a las proteínas ee3 nativas, conformes a las Figuras 13,
o 15A, poseen típicamente al menos un 90% de identidad de secuencia
respecto a las secuencias en la Figuras citadas anteriormente,
calculada por el algoritmo de Altschul et al. (J. Mol.
Biol., 215, 403-410, 1990). La proteína aislada y
sus variantes funcionales pueden aislarse más favorablemente del
cerebro de mamíferos como Homo sapiens, Rattus norvegicus o
Mus musculus. También los homólogos de otros mamíferos han de
entenderse por variantes funcionales.
Conforme a la invención se prefieren los
análogos, cuando la estructura secundaria, tal y como aparece en la
secuencia nativa, se conserva también en ellos. Además de las
sustituciones conservativas se pueden emplear también menos
variaciones conservativas de aminoácido conforme a la invención en
la secuencia nativa. Además, conservan típicamente su función
biológica, particularmente como transductor de una señal apoptótica
o necrótica o de una señal para la proliferación celular,
plasticidad celular o crecimiento celular. El efecto de unir
sustitución o supresión puede comprobarse sin la menor dificultad
mediante las investigaciones apropiadas, ensayos de enlace o, por
ejemplo, exámenes citotóxicos.
A los productos génicos conformes a la invención
(proteínas) pertenecen pero también todos aquellos productos
génicos (proteínas), derivados tras la transcripción y traducción de
derivados de ADN, fragmentos de ADN o alelos de ADN conformes a la
invención de las secuencias de ADN indicadas en las Figuras.
Por otra parte, las proteínas conformes a la
invención pueden estar químicamente modificadas. Así puede existir
quizás un grupo protector en el término N. Puede haber grupos
glicosílicos adjuntos a grupos hidroxílicos o grupos amino, los
lípidos pueden enlazarse covalentemente con la proteína conforme a
la invención, asimismo grupos fosfato o acetílicos y similares.
También cualesquiera sustancias, compuestos o grupos químicos pueden
combinarse a la proteína conforme a la invención por cualquier ruta
de síntesis. También aminoácidos adicionales, por ejemplo,
aminoácidos en forma individual o en forma de péptidos o dominios en
forma de proteína y similares, pueden combinarse con el término N-
y/o C- de una proteína conforme a la invención.
Aquí se prefieren particularmente las
denominadas secuencias de señales o secuencias "leader" en el
término N- de la secuencia de aminoácidos de una proteína conforme
a la invención, que conduzcan al péptido
co-translacionalmente o
post-translacionalmente a un determinado orgánulo
celular o al área extracelular (y/o el medio de cultivo). En el
término N- o C- pueden existir también secuencias de aminoácidos,
que permitan como antígeno el enlace de la secuencia de
aminoácidos, conformes a la invención, al anticuerpo. Aquí hay que
nombrar particularmente el péptido bandera, cuya secuencia se
indica en el código de una letra: DYKDDDDK. O también una
His-Tag (etiqueta de Histidina) con al menos 3,
preferentemente al menos 6 radicales histidina. Estas secuencias
tienen fuertes propiedades anfígenas y permiten, por tanto, una
rápida verificación y fácil purificación de la proteína
recombinante. Los anticuerpos monoclonales, que ligan al péptido
bandera, son comercializados por la empresa Eastman Kodak Co.,
Scientific Imaging Systems Division, New Haven, Connecticut. Las
secuencias parciales de la proteína conforme a la invención,
compuesta por al menos 20, más preferentemente al menos 30 y aún más
preferentemente al menos 50 aminoácidos, comprendiendo secciones
parciales de las secuencias de ee3 nativas se pueden sintetizar por
procedimientos familiares al experto, por ejemplo, químicamente y se
pueden emplear preferentemente como anígenos para la producción de
anticuerpos. Estas secciones parciales y/o sus derivados, alelos o
fragmentos se tratan preferentemente de secuencias mostradas, que
forman en el modelo espacial aquellas regiones, que constituyen, o
al menos parcialmente, la superficie de la proteína en las
secuencias de ee3 nativas conformes a la invención. Las secuencias
parciales preferentes de al menos 20 aminoácidos de longitud
abarcan, al menos, la fracción citoplasmática de las proteínas de
la familia ee3 conformes a la invención. Presentan particularmente
una fracción parcial conforme a la invención de al menos 20
aminoácidos de longitud de un péptido de las secuencias conformes a
la invención conforme a la Figura 8 entre la posición 600 y la
posición 752 (conforme a la Figura 8), por ejemplo, el péptido
WWFGIRKDFCQFLLEIFPFLRE (Posiciones 609 a 630, 21 de aminoácidos de
longitud).
Las secuencias de aminoácidos, por ejemplo, las
secuencias de las proteínas humanas ee3_1 o ee3_2, presentan por
otra parte, motivos secuenciales específicos, que se encuentran de
nuevo también en forma similar en otros representantes de la clase
GPCR. Así aparece, por ejemplo, una secuencia típica
firma-triplete por debajo del ercer dominio
transmembranario en las proteínas de la clase GPCR (secuencia con la
continuación de secuencia DRY (aminoácidos en el código de una
letra).
En la ee3_1 conforme a la invención se encuentra
la continuación de secuencia DRI (posición 103-105)
por debajo de TM3 (83-102) (conforme a la Figura
15A). En los representantes de la clase GPCR conocidos según el
estado actual de la técnica (receptor de
galanina-2-, receptor de C5a- (ratas),
BK-2 (humano) o CXCR-5 (humano)) se
encuentra la continuación de secuencia DRY o DRF en posiciones
apropiadas.
Los animales transgénicos
no-humanos representan otro objeto de la presente
invención. Los animales transgénicos conforme a la invención son
animales, que se modifican genéticamente, a tal efecto que,
expresan y/o contienen una cantidad de un producto génico conforme
a la invención alterado en comparación con los animales normales,
en al menos un tejido (por ejemplo, mediante modificación del rango
del promotor de un gen conforme a la invención) o contienen o
expresan un producto génico modificado (por ejemplo, un derivado
conforme a la invención de una proteína de la familia ee3, por
ejemplo, también un fragmento). En este contexto son conformes a la
invención también aquellos animales, que presentan la secuencia de
ADN conforme a la invención nativamente existente (a) en el plano
genético o bien parcialmente o en absoluto o (b) aunque presentan
las secuencias de ADN conformes a la invención en el plano
genético, estas no pueden, sin embargo, transcribirse y/o reducirse
y por tanto, no contienen más el producto génico. Por otra parte,
en un animal transgénico puede añadirse a las secuencias nativas
conformes a la invención al menos una secuencia de ADN conforme a la
invención y/o sustituirse por al menos una secuencia de ADN
conforme a la invención. Particularmente en el caso de la(s)
secuencia(s) sustituida(s) y/o agregada(s)
puede tratarse de secuencias conformes a la invención, de naturaleza
no nativa.
La fabricación de animales transgénicos y/o
"noqueados" respecto a las secuencias conformes a la invención,
particularmente ratones, ratas, cerdos, ganado vacuno, ovejas,
moscas de la fruta (Drosofila), C. elegans o peces cebra, se
lleva a cabo de manera familiar al experto para ello se expresa, por
ejemplo, una secuencia de ADNc conforme a la invención o variante
nativa o no nativa en ratones transgénicos, por ejemplo, bajo un
promotor de NSE en las neuronas, bajo un promotor de MBP en las
oligodendrocitas, etc. Los animales genéticamente modificados
pueden estudiarse posteriormente en diversos modelos de enfermedad
(por ejemplo apoplejías originadas experimentalmente). La
fabricación de animales noqueados puede suministrar además
indicaciones del efecto o repercusiones de los inhibidores en los
organismos completos, ya que un "modelo noqueado" corresponde
siempre a la inhibición de secuencias nativas conformes a la
invención. Siempre puede emplearse un procedimiento de este tipo en
un examen preclínico de sustancias inhibidoras conformes a la
invención, por ejemplo, péptidos conforme a la invención, análogos
a péptidos u otros pequeños compuestos orgánicos.
Todos los organismos multicelulares se pueden
ejecutar conforme a la invención transgénicamente, particularmente
los mamíferos, por ejemplo, ratones, ratas, ovejas, vacuno o cerdos.
También pueden concebirse, en principio, las plantas transgénicas.
Los organismos transgénicos pueden tratarse también de los
denominados animales "noqueados". Además, los animales
transgénicos pueden contener una secuencia de ácidos nucleicos
funcional o no funcional conforme a la invención o una estructura
de ácidos nucleicos funcional o no funcional, aislado o en
combinación con una secuencia funcional o no funcional, que
codifique para proteínas conformes a la invención.
Una ordenación más amplia conforme a la
invención de los animales transgénicos no-humanos
descritos anteriormente, son los animales transgénicos, en cuyas
células embrionarias o la totalidad o una parte de las células
somáticas, las secuencia(s) de nucleótidos nativas de la
familia ee3 conformes a la invención, particularmente las secuencias
con los números 1 a 4), se modificaron mediante procedimientos o se
interrumpieron acoplando elementos de ADN. Otra posibilidad de
empleo de una secuencia de nucleótidos conforme a la invención o
partes de la misma es la fabricación de animales transgénicos o
noqueados o condicional o específicamente noqueados por regiones o
de mutaciones específicas en animales modificados genéticamente
(Ausubel et al. (eds.) 1998, Current Protocols en Molecular
Biology, John Wiley & Sons, New York y Torres et al.,
(eds.) 1997, Laboratory protocols for condicional gene targeting,
Oxford University Press, Oxford). Por otra parte, se pueden plantear
asimismo determinadas mutaciones, por ejemplo, modificaciones de
los promotores o inserción de potenciadores, para, por ejemplo,
producir proteínas ee3constitutivamente activas en los animales
transgénicos animales "noqueados"). También estos animales se
pueden emplear, por ejemplo, conforme a la invención para
suministrar modelos análogos en los estudios preclínicos para
antagonistas potenciales de la función proteica ee3.
Acerca de sobreexpresión transgénica o mutación
genética (mutación cero o supresiones, inserciones o modificaciones
específicas) mediante homólogos recombinación en células
embrionarias de variedad pueden elaborarse modelos animales, que
proporcionan otras informaciones valiosas acerca de la
pato-fisiología de las secuencias conformes a la
invención. Los modelos animales así elaborados pueden suponen
sistemas de ensayo esenciales para la evaluación de las nuevas
terapias, que afectan a la función biológica de las proteínas
conformes a la invención, particularmente de las proteínas con una
de las secuencias 5 para los procesos neuronales, inmunológicos,
proliferativos u
otros.
otros.
Otro objeto de la presente invención es un
anticuerpo, que reconoce un epítope en un producto génico
ee3conforme a la invención, particularmente una proteína conforme a
la invención conforme a las Figuras 13, o derivados, fragmentos o
isoformas o alelos, pero también puede estar dirigido contra, por
ejemplo, ARNm conforme a la invención. Del término
"anticuerpo" comprende de la presente invención tanto a los
anticuerpos policlonales como también a los monoclonales,
quiméricos, anti-idiotípicos (dirigidos contra los
anticuerpos conformes a la invención), que se encuentran todos en
forma combinada o disuelta y, dado el caso, pueden marcarse con
"etiquetas", así como también los fragmentos de los anticuerpos
citados anteriormente. Además de los fragmentos de anticuerpos
conformes a la invención aislados, los anticuerpos pueden aparecer
conforme a la invención también en forma recombinante como
proteínas de fusión con otros componentes (proteicos). Los
fragmentos como tales o los fragmentos de anticuerpos conformes a
la invención como componentes de proteínas de fusión se elaboran
típicamente por los métodos de descomposición enzimática, de
síntesis proteica o métodos de recombinación familiares al experto.
Se designan como anticuerpos según la presente invención tanto los
anticuerpos o fragmentos de estos que sean monocadena policlonales,
monoclonales, humanos o humanizados o también los anticuerpos
sintéticos.
Los anticuerpos policlonales son mezclas
heterogéneas de moléculas de anticuerpo, elaboradas a partir de
sueros de animales, inmunizadas con un antígeno. Al objeto de la
invención pertenecen, sin embargo, también los anticuerpos
policlonales monoespecíficos, obtenidos tras la purificación de los
anticuerpos (por ejemplo, a través de una columna, cargada con
péptidos de un epítope específico). Un anticuerpo monoclonal
contiene una población esencialmente homogénea de anticuerpos,
dirigidos específicamente contra los antígenos, teniendo los
anticuerpos esencialmente los mismos puntos de enlace del epítope.
Los anticuerpos monoclonales se pueden obtener por los
procedimientos conocidos en el estado actual de la técnica (por
ejemplo, Köhler y Milstein, Nature, 256, 495-397,
(1975); USPatente 4,376,110; Ausübel et al., Harlow y Lane
"anticuerpo": Laboratory Manual, Cold Spanillo, Harbor
Laboratory (1988); Ausubel et al., (eds), 1998, Current
Protocols en Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York).).
La descripción contenida en los impresos citados anteriormente se
incluye como componente de la presente invención en la revelación
de la presente invención.
Anticuerpos conformes a la invención
genéticamente manipulados se pueden elaborar también por
procedimientos como los descritos en los impresos citados
anteriormente. De manera abreviada, se extraen para ello células
productoras de anticuerpos y el ARNm se aísla de las células de
manera conocida a suficiente densidad óptica de las células por
medio de lisis celular con tiocianato de guanidinio, acidificación
mediante acetato sódico, extracción con fenol,
clooformo/isoamilalcohol, precipitación mediante isopropanol y
lavado con etanol. A continuación, se sintetiza con ayuda de la
ADNc transcriptasa inversa a partir del ARNm. el ADNc sintetizado
puede insertarse directamente o tras manipulación genética por
ejemplo, mediante "mutagénesis sitio-dirigida",
guía de inserciones, inversiones, supresiones o intercambios de
bases en vectores animales, fúngicos, bacterianos o virales
apropiados y expresarse en los organismos huésped apropiados. Se
prefieren los vectores bacterianos o Hefe como pBR322, pUC18/19,
pACYC184, Lambda o Hefe-mu-vectores
para la clonación del gen y la expresión de una bacteria como E.
coli y/o en fúngicos como Saccharomyces cerevisiae. Los
anticuerpos específicos contra las proteínas conformes a la
invención pueden servir tanto como reactivos diagnósticos como
también como terapéuticos en enfermedades, en las que las proteínas
de la familia ee3 tienen importancia patofisiológica.
Los anticuerpos conformes a la invención
pertenecen a una de las siguientes clases de inmunoglobulinas: IgG,
IdD, IgM, IgE, IgA, GILD y, dado el caso, a una subclase de las
clases citadas anteriormente, como las subclases de la IgG o sus
mezclas. Se prefieren las IgG y sus subclases, como por ejemplo,
IgG1, IgG2, IgG2a, IgG2b, IgG3 o IgGM. Se prefieren especialmente
los subtipos de IgG: IgG1/k o IgG2b/k. un clon celular híbrido, que
produce anticuerpos monoclonales conformes a la invención, puede
cultivarse in vitro, in situ o in vivo. La
elaboración de grandes títulos de anticuerpos monoclonales se lleva
a cabo preferentemente in vivo o in situ.
Los anticuerpos quiméricos conformes a la
invención son moléculas, que contienen diferentes componentes,
derivando éstos de diferentes tipos de animales (por ejemplo,
anticuerpos, con una región variable, derivada de un anticuerpo
monoclonal de ratón, y una región constante de una inmunoglobulina
humana). Los anticuerpos quiméricos se emplean preferentemente
para, por una parte, reducir la inmunogenicidad en la aplicación y,
por otro lado, elevar el rendimiento en la producción para, por
ejemplo, producir anticuerpos múridos monoclonales de mayores
volúmenes de producción a partir de líneas celulares híbridas,
aunque conducen también a una mayor inmunogenicidad en el ser
humano, de forma que los anticuerpos quiméricos humanos/múridos se
emplean preferentemente. Los anticuerpos quiméricos y los
procedimiento para su fabricación se conocen gracias al estado
actual de la técnica (Cabilly et al., Porc. Natl. Sci. USA
81: 3273-3277 (1984); Morrison et al. Porc.
Natl. Acad. Sci USA 81:6851-6855 (1984); Boulianne
et al. Nature 312 643-646 (1984); Cabilly
et al., EP-A-125023;
Neuberger et al., Nature 314: 268-270
(1985); Taniguchi et al.,
EP-A-171496; Morrion et al.,
EP-A-173494; Neuberger et
al., DONDE 86/01533; Kudo et al.,
EP-A-184187; Sahagan et al.,
J. Immunol. 137: 1066-1074 (1986); Robinson et
al., DONDE 87/02671; Liu et al., Porc. Natl. Acad. Sci
USA 84:3439-3443 (1987); Sun et al., Porc.
Natl. Acad. Sci USA 84:214218 (1987); Better et al., Science
240: 1041-1043 (1988) y Harlow y Lane, anticuerpo: A
Laboratory Manual, como se ha citado antes. Estas referencias se
incluyen en la presente invención como pertenecientes a la
revelación.
Se prefiere de manera totalmente especial un
anticuerpo, conforme a la invención, tal sea contra una fracción
extracelular en una proteína ee3 conforme a la invención,
particularmente una proteína conforme a las Figuras 13, u orientada
como epítope. Los anticuerpos conformes a la invención, en todas las
variaciones como se ha mostrado anteriormente, se pueden emplear
para la inhibición de las proteínas de la familia ee3 conformes a
la invención, por ejemplo, in vitro para estudios
experimentales, in situ para, por ejemplo, propósitos de
marcado o también in vivo para la aplicación terapéutica, en
la que se inyectan, por ejemplo, por vía intravenosa, subcutánea,
intraarterial o intramuscular.
Un anticuerpo anti-idiotípico
conforme a la invención es un anticuerpo, que reconoce un
determinante, asociado generalmente con la posición de enlace de
los antígenos de un anticuerpo conforme a la invención. Un
anticuerpo anti-idiotípico puede elaborarse
mediante la inmunización de un animal de un mismo tipo y del mismo
tipo genético (por ejemplo, de una variedad de ratón) como punto
final para un anticuerpo monoclonal, contra el que se orienta un
anticuerpo anti-idiotípico conforme a la invención.
El animal inmunizado reconoce el determinante idiotípico del
anticuerpo inmunizante mediante de producción de un anticuerpo, que
se orienta contra el determinante idiotípico (o sea un anticuerpo
anti-idiotípico conforme a la invención), (U.S.
4,699,880). Un anticuerpo anti-idiotípico conforme
a la invención puede emplearse también como immunogen, para
estimular una respuesta inmune en otro animal para conducir
entonces a la producción del denominado anticuerpo
anti-anti-idiotípico. El anticuerpo
anti-anti-idiotípico puede, pero no
tiene que, ser idéntico al anticuerpo monoclonal original respecto
a su estructura epitópica, que ha producido la reacción
anti-idiotípica. De este modo se pueden identificar
mediante el empleo de anticuerpos dirigidos contra determinantes
idiotípicos de un anticuerpo monoclonal, otros clones que expresan
los anticuerpos de idéntica especificidad.
Los anticuerpos monoclonales, dirigidos contra
proteínas conformes a la invención, análogos, fragmentos o
derivados de estas proteínas conformes a la invención, se pueden
utilizar para inducir el enlace de anticuerpos
anti-idiotípicos en los animales apropiados, como
por ejemplo, el ratón BALB/c. Las células de un ratón así
inmunizado se pueden emplear para producir líneas celulares híbridas
anti-idiopáticas, que secretan anticuerpos
monoclonales anti-idiopáticos. Además, los
anticuerpos monoclonales anti-idiopáticos se pueden
unir también un soporte (KLH, "keyhole limpet hemocyanin") y
emplearse entonces para inmunizar a otros ratones BALB/c. Los
sueros de estos ratones contienen entonces anticuerpos
anti-idiotípicos, que tienen las propiedades del
enlace del anticuerpo monoclonal original y son específicos para un
epítope de la proteína conforme a la invención o de un fragmento o
derivado de los mismos. Los anticuerpos monoclonales
anti-idiotípicos tienen de este modo sus propios
epítopes idiotípicos o "I-diotopos",
estructuralmente similares al epítope a analizar.
La designación "anticuerpo" debería abarcar
tanto las moléculas intactas como también los fragmentos de las
mismas. Como fragmentos han de citarse todos los fragmentos de
anticuerpo abreviados o modificados con uno o dos puntos de enlace
complementarios a los antígenos, como partes de anticuerpo con un
punto de enlace apropiado al anticuerpo, formado por cadenas
ligeras y más pesadas, como fragmentos Fv-, Fab- o F(ab')2- o
fragmentos de una cadena. Se prefieren los fragmentos abreviados de
doble cadena como los fragmentos Fv-, Fab- o F(ab')2. Fab y
F(ab')2- no cuentan con un fragmento Fc-, tal y como existen
quizás en un anticuerpo intacto, de forma que se puedan transportar
más rápidamente al circuito sanguíneo y tengan comparativamente
menos enlaces de red no específicos que los anticuerpos intactos.
En este contexto, debemos mencionar que los fragmentos Fab- y
F(ab')2- de los anticuerpos conformes a la invención,
asimismo como estos mismos, pueden emplearse en la detección
(cualitativa) y cuantificación de las proteínas conformes a la
invención (dado el caso también para la detección de la actividad
proteica (por ejemplo, fosforilaciones específicas) de las
proteínas conformes a la invención), por cuyo motivo también
procedimientos para la determinación cualitativa y cuantitativa y/o
para la cuantificación de la actividad proteica de las proteínas
conformes a la invención son objeto de la presente invención.
Estos fragmentos se elaboran típicamente
mediante descomposición proteolítica, empleándose enzimas, como por
ejemplo, papaína (para la fabricación de fragmentos Fab-) o pepsina
(para la fabricación de fragmentos F(ab')2,) emplearse, u
obteniéndose mediante oxidación química o mediante manipulación
genética de los genes de anti-
cuerpos.
cuerpos.
Objeto de la presente invención son también las
mezclas de anticuerpos en el sentido de la presente invención.
Además de los anticuerpos se pueden emplear también mezclas de
anticuerpos para todos los procedimientos o empleos descritos
conforme a la presente invención. Tanto las fracciones purificadas
de anticuerpos monoclonales, policlonales o mezclas de anticuerpos
monoclonales se emplean como fármaco y en la fabricación de fármacos
para el tratamiento de isquemias cerebrales (por ejemplo,
apoplejías), enfermedades degenerativas, particularmente
enfermedades neurodegenerativas, y enfermedades neurológicas, como
por ejemplo, epilepsia.
Los anticuerpos conformes a la invención,
incluyendo los fragmentos de estos anticuerpos, y/o sus mezclas se
pueden emplear en una muestra para la detección cuantitativa o
cualitativa de productos génicos ee3 conformes a la invención,
particularmente proteínas conformes a las Figuras 13, o sus
fragmentos o derivados, o también para la detección de células, que
expresen y dado el caso, secreten las proteínas conformes a la
invención. Siempre se muestra el empleo de anticuerpos conformes a
la invención a modo de diagnóstico. Así puede determinarse
aproximadamente a través de los anticuerpos conformes a la invención
la cantidad de producto génico conforme a la invención y, entre
otros, su actividad (por ejemplo, fosforilaciones específicas), por
ejemplo, de las proteínas conformes a las Figuras 13. La detección
puede efectuarse con ayuda de un procedimiento de
inmunofluorescencia, de los anticuerpos marcados por la
fluorescencia, en combinación con fotomicroscopía, flujocitometría o
detección
fluorométrica.
fluorométrica.
Los anticuerpos conformes a la invención (esto
incluye los fragmentos de estos anticuerpos o también las mezclas
de anticuerpos) sirven para las investigaciones histológicas, como
por ejemplo, en el contexto de la inmunofluorescencia o
inmunoespectrometría electrónica, para la detección in situ
de una proteína conforme a la invención. La detección in
situ puede realizarse tomando una muestra histológica de un
paciente y añadiendo a esta muestra un anticuerpo marcado conforme
a la invención. El anticuerpo (o un fragmento de este anticuerpo) se
aplica en forma marcada a la muestra biológica. De este modo no es
sólo posible determinar la presencia de proteínas conformes a la
invención en la muestra, sino también la distribución de la proteína
conforme a la invención en el tejido analizado. La muestra
biológica puede ser un líquido biológico, un extracto de tejido,
cultivos célulares, como por ejemplo, células inmunológicas o
células musculares cardíacas o del hígado, o generalmente células,
incubadas en un cultivo de tejido. La detección del anticuerpo
marcado puede realizarse por procedimientos conocidos en el estado
actual de la técnica (por ejemplo, por procedimientos de
fluorescencia), a semejanza del marcado. La muestra biológica puede
aplicarse, sin embargo, también sobre un soporte sólido, como por
ejemplo, nitrocelulosa u otro material portador, de forma que las
células, partes de células o proteínas solubles queden
inmovilizadas. El soporte puede lavarse entonces con un tampón
apropiado una o varias veces, tratándose a continuación con un
anticuerpo marcado conforme a la presente invención. El soporte
sólido puede lavarse entonces una segunda vez con el tampón para
eliminar los anticuerpos no combinados. La cantidad de marcador
combinado sobre el soporte sólido puede determinarse entonces por un
procedimiento habitual.
Como soporte sirven particularmente vidrio,
poliestirol, polipropileno, dextrano,
nylon-amilasas, celulosas naturales o modificadas,
poliacrilamidas y magnetita. El soporte puede tener carácter
condicionalmente soluble o insoluble, para desempeñar las
condiciones conformes a la presente invención. El material portador
puede adoptar cualquier forma, por ejemplo, tener forma de bolitas
("beads"), o cilíndrica o esférica, prefiriéndose las bolitas
de poliestirol como soporte.
Un marcado de anticuerpos detectable puede
realizarse de diferentes maneras. Por ejemplo, puede combinarse el
anticuerpo a una enzima, pudiendo emplearse la enzima finalmente en
un ensayo inmunológico (EIA). La enzima puede reaccionar entonces
después con un sustrato apropiado, de forma que se origine un
compuesto químico, que puede detectarse de una manera familiar al
experto y, dado el caso, cuantificarse, por ejemplo, mediante
espectrofotometría, fluorometría u otro procedimiento óptico. La
enzima puede ser: malato-deshidrogenasa,
estafilococos-nucleasa,
delta-5-esteroide isomerasa,
alcohol-deshidrogenasa de levadura,
alfa-glicerofosfato-deshidrogenasa,
triosa-fosfatoisomerasa, peroxidasa del rábano
picante-, fosfatasa alcalina, aspariginasa,
glucosa-oxidasa,
beta-galactosidasa, ribonucleasa, ureasa, catalasa,
glucosa-6-fosfato-deshidrogenasa,
glucoamilasa o acetilcolinesterasa. La detección se posibilita
entonces sobre un sustrato cromogéneo, específico para la enzima
empleada para el marcado, y puede realizarse finalmente, por
ejemplo, a través de comparación visual del sustrato transformado
por la reacción enzimática, en comparación con los estándares de
control.
La detección puede garantizarse mediante otros
ensayos inmunológicos, por ejemplo, por marcado radiactivo de los
anticuerpos o fragmentos de anticuerpos (o sea mediante un ensayo
radioinmunológico (RIA; Laboratory Techniques and Biochemistry en
Molecular Biology, Work, T. et al. North Holland Publishing
Company, New York (1978)). El isótopo radioactivo puede detectarse
y cuantificarse además mediante el empleo de contadores de
escintilación o mediante autoradiografía.
Los compuestos fluorescentes se pueden utilizar
igualmente para el marcado, por ejemplo, compuestos como
Fluorescina-isotiocianato, Rodamina-, fioeritrina,
ficocianina, aloficocianina, o-ftaldehído y
fluorescamina. También pueden emplearse metales emisores de
fluorescencia, como por ejemplo, 152E u otros metales del grupo de
los lantánidos. Estos metales se acoplan a los anticuerpos por
medio de grupos quelato, como por ejemplo, ácido
dietilentriaminpentaacético (ETPA) o EDTA. Además, el anticuerpo
conforme a la invención puede acoplarse a través de un compuesto que
actúa con ayuda de la quimiluminiscencia. La presencia del
anticuerpo marcado por quimiluminiscencia se detecta entonces por
medio de la luminiscencia originada en el transcurso de una reacción
química. Ejemplos de estos compuestos son luminol, isoluminol,
éster de acridinio, imidazol, sal de acridinio o éster de oxalato.
Del mismo modo se pueden emplear también compuestos
bioluminiscentes. La bioluminiscencia es un subtipo de
quimiluminiscencia, que se encuentra previamente en los sistemas
biológicos, reforzando una proteína catalítica la eficiencia de la
reacción quimiluminiscente. La detección de la proteína
bioluminiscente se lleva a cabo, por otra parte, por medio de la
luminiscencia, entrando en consideración como compuesto
bioluminiscente, por ejemplo, luciferina, luciferasa o
aequorina.
\newpage
Un anticuerpo conforme a la invención puede
utilizarse para el empleo en un ensayo inmunométrico, también
conocido como ensayo "two-site" o
"sandwich". Los sistemas típicos de ensayo inmunométrico
abarcan los denominados ensayos "hacia delante", que se
distinguen porque los anticuerpos conformes a la invención están
combinados con un sistema en fase sólida y porque los anticuerpos
se ponen en contacto de este modo con la muestra que se analiza. De
este modo se aísla el antígeno de la muestra mediante la formación
de un complejo binario fase
sólida-anticuerpo-antígeno. Tras un
tiempo de incubación apropiado, se lava el soporte sólido, para
eliminar los restos de líquidos remanentes, incluyendo el antígeno,
dado el caso, no combinado, y se pone en contacto, acto seguido,
con una disolución, que contiene una cantidad desconocida de
anticuerpo de detección marcado. El anticuerpo marcado sirve, en
este contexto, como la denominada molécula informadora. Tras un
segundo tiempo de incubación, que permite al anticuerpo marcado
asociarse con el antígeno combinado a la fase sólida, se lava
nuevamente el soporte sólido, para eliminar los anticuerpos marcados
que no hayan reaccionado.
En una forma alternativa de ensayo puede
emplearse también un ensayo denominado "sandwich" En este
contexto puede bastar un único paso de incubación, cuando los
anticuerpos combinados a la fase sólida y los anticuerpos marcados
se apliquen simultáneamente sobre la muestra a examinar. Tras la
conclusión de la incubación se lava el soporte sólido para eliminar
los residuos de la muestra líquida y anticuerpos marcados no
asociados. La presencia de anticuerpos marcados sobre el soporte
sólido se determina exactamente, del mismo modo que en los ensayos
sándwich "hacia delante" convencionales. En el denominado
ensayo inverso se añade una disolución del anticuerpo marcado a la
muestra líquida, seguido de la mezcla de anticuerpo no marcado,
combinado a un soporte sólido, tras el transcurso de un tiempo de
incubación apropiado. Tras un segundo paso de incubación se lava el
soporte sólido de manera habitual, para liberarlo de sobrantes de
muestra y de anticuerpo marcado que no haya reaccionado. La
determinación del anticuerpo marcado, que ha reaccionado con el
soporte sólido, se efectúa entonces, así como la descrita
anteriormente.
Conforme a la presente invención se muestran
además los procedimientos para la expresión de productos génicos de
ee3 conformes a la invención, particularmente incluso de los
polipéptidos conformes a las Figuras 13, o incluyendo a todos los
derivados, análogos y fragmentos, transformándose para ello las
células huésped con un vector de expresión conforme a la invención,
excepto un polipéptido conforme a la SEC ID No:31 de la U0
01/98353.. Este procedimiento para la expresión de productos
génicos, basados en una secuencia de ADN conforme a la invención,
no sirve para concentrar y limpiar el producto génico apropiado,
sino antes bien, para influir sobre el cambio de celulosa mediante
la inserción de las secuencias de ADN conformes a la invención a
través de la expresión del producto génico correspondiente. Aquí se
hace particularmente referencia al empleo de las células huésped
transformadas con la ayuda de los vectores de expresión como fármaco
y/o para la fabricación de un fármaco, particularmente con el
propósito del tratamiento de enfermedades, por ejemplo, de
enfermedades tumorales, enfermedades neurológicas, enfermedades
neurodegenerativas (por ejemplo, esclerosis múltiple, parkinson
mórbido) isquemias cerebrales (por ejemplo, apoplejía). conforme a
la invención, las células huésped se proporcionan generalmente en
enfermedades, basadas en una regulación errónea de la aptosa, de la
necrosa, del crecimiento celular, de la división celular, de la
diferenciación celular o de la plasticidad celular. Las células
huésped antólogas o alógenas transformadas ex vivo de tal
manera conforme a la invención pueden transplantarse entonces a los
pacientes.
Conforme a otro aspecto de la presente invención
se describe un procedimiento para el aislamiento de productos
génicos con al menos uno con las secuencias de aminoácidos conformes
a la invención, transformándose las células huésped con un vector
de expresión conforme a la invención y cultivándose entonces en
condiciones apropiadas, favorecedoras de la expresión, de forma que
el producto génico pueda purificarse finalmente a partir del
cultivo. El producto génico conforme a la invención de la secuencia
de ADN conforme a la invención puede aislarse además, en función
del sistema de expresión, a partir de un medio de cultivo o de
extractos celulares. El experto puede distinguir sin la menor
dificultad, que los respectivos métodos de aislamiento y el
procedimiento durante la depuración de la proteína recombinante
codificada por un ADN conforme a la invención dependen fuertemente
del tipo de célula huésped o también de la condición de si la
proteína se secreta en el medio. Por ejemplo, se pueden emplear
sistemas de expresión que conlleven la secreción de la proteína
recombinante desde la célula huésped. El medio de cultivo se tiene
que concentrar en este caso mediante filtros de concentración
proteica comerciales, por ejemplo, Amicon o Millipore Pelicon. Tras
el paso de concentración puede realizarse un paso de purificación,
por ejemplo, un paso de filtración en gel o una purificación con
ayuda de métodos cromatográficos de columna. Alternativamente puede
emplearse, sin embargo también un intercambiador aniónico, que tenga
una matriz con DEAE.
Como matriz sirven además todos los materiales
conocidos de la purificación proteica, por ejemplo, acrilamida o
agarosa o dextrano o similares. Sin embargo, pueden emplearse
también intercambiadores catiónicos, que contengan entonces
típicamente grupos carboximetilo. Para la purificación ulterior de
un polipéptido codificado por un ADN conforme a la invención pueden
servir entonces pasos de HPLC. Puede tratarse de uno o varios pasos.
Se emplea particularmente el método de "fase reversa". Estos
pasos sirven para la obtención de una proteína recombinante
esencialmente homogénea de una secuencia de ADN conforme a la
invención.
Además de los cultivos celulares bacterianos,
para el aislamiento del producto génico se pueden emplear también
células de levadura transformadas. En este caso puede secretarse la
proteína traducida, de forma que se simplifique la purificación
proteica. La proteína recombinante secretada puede obtenerse de una
célula huésped de levadura mediante métodos, como los mostrados en
Urdal et al. (J. Chromato. 296:171 (1994)) y que son
componentes de la revelación de la presente invención.
Las secuencias de ácidos nucleicos conformes a
la invención, particularmente las secuencias de ADN conformes a la
invención, y/o productos génicos conformes a la invención se pueden
emplear como fármacos y/o para la fabricación de un fármaco. Estos
se pueden administrar como tales (por ejemplo, oralmente, por vía
intravenosa, oral, parenteral, nasal, subcutánea) o en combinación
con otros aditivos activos, auxiliares o farmacológicamente
típicos. El ácido nucleico conforme a la invención puede inyectarse
como ácido nucleico desnudo, particularmente por vía intravenosa, o
administrarse, por el contrario, al paciente con ayuda de vectores.
Estos vectores pueden ser plásmidos como tales, pero también
vectores virales, particularmente retrovirales o adenovirales, o
también liposomas, que pueden presentar ADN desnudo conforme a la
invención o un plásmido, que contenga ADN conforme a la
invención.
invención.
El empleo de las secuencias conformes a la
invención, y/o sus variantes, así como heterómeros proteicos
conformes a la invención, así como reactivos conformes a la
invención derivados de estos (oligonucleótidos, anticuerpos,
péptidos) entra en consideración, por tanto, para la fabricación de
un fármaco para propósitos terapéuticos, es decir, para el
tratamiento de enfermedades. Se prefiere además de manera totalmente
especial el empleo terapéutico para el tratamiento y/o para la
fabricación de un fármaco para el tratamiento de enfermedades o
estados patofisiológicos, basados en la regulación erróneamente
dirigida de la hemostasis de los acontecimientos de muerte celular
y
proliferación.
proliferación.
En este contexto resulta particularmente
efectivo también el conocimiento conforme a la invención de que la
EPO, cuyo efecto se atribuye a la modificación del comportamiento de
transcripción de las células, induce de manera directa o indirecta
la regulación transcripcionalmente alta de los receptores conformes
a la invención, por ejemplo, ee3_1. Los receptores conformes a la
invención procuran, por tanto, el efecto de la EPO y tienen, por
tanto, también una importancia crítica para las enfermedades
relacionadas con ello. Esto significa, entre otros, que los
receptores conformes a la invención pueden influir selectivamente en
determinados efectos de la EPO, por ejemplo, un efecto
neuroprotector (por ejemplo, en enfermedades neurodegenerativas),
siendo, por ejemplo, la activación del factor de transcripción
NF-kappaB un paso importante en el efecto
neuroprotector de la EPO), o un aumento del rendimiento cerebral,
(por ejemplo, en demencias). Las investigaciones apropiadas en
experimentos con animales pueden una adscripción funcional de los
objetos conformes a la invención en modelos de enfermedades
neurológicas como isquemias cerebrales, encefalomielitis
experimentalmente inducidas o hemorragias subaracnoideas.
Esto es deseable para estos efectos parciales,
ya que la dosis de EPO además del efecto neuroprotector, originaría
un aumento del hematocrito, que contrarrestaría en parte el efecto
neuroprotector, ya que se empeorarían las propiedades reológicas de
la sangre, lo que repercute negativamente en la microcirculación,
tal y como se ha mostrado en ratones con sobrexpresión de
eritropoetina (Wiessner et al., 2001 , J Cereb Blood Flow
Metab, 21, 857-64).
Por eso entra en consideración el empleo de
objetos conformes a la invención, por ejemplo, secuencias de
nucleótidos, oligo- o polipéptido, vectores de expresión, o las
células huésped conformes a la invención particularmente para la
fabricación de fármacos para el tratamiento neurológico,
particularmente de enfermedades neurodege-
nerativas.
nerativas.
Mediante el empleo conforme a la invención se
puede influir sobre los procesos de muerte celular, por ejemplo,
cascadas que conduzcan a la apoptosis, o procesos que conlleven la
necrosis, en todos los tipos de células, que expresen proteínas de
la familia ee3 conformes a la invención o una variante nativa de las
mismas, particularmente en células neuronales, por ejemplo,
mediante modulación de las interacciones intercelulares,
particularmente aquellas en las que intervengan proteínas unidas a
su proteína G.
Las proteínas nativas conformes a la invención,
particularmente las proteínas citadas en las reivindicaciones son,
como los receptores, componente conforme a la invención de las rutas
intracelulares de transducción de señales, típicamente como inicio
de una cascada de señales, siendo su control de errores casual para
un gran número de enfermedades. Si las proteínas conformes a la
invención citadas anteriormente vuelven a encontrarse
particularmente como componentes en los siguientes pasos celulares y
presentan funciones celulares, por ejemplo, en: transducción de
señales en general, con efecto sobre la diferenciación celular,
división celular, crecimiento, plasticidad, regeneración,
diferenciación celular, proliferación o muerte celular.
Correspondientemente, puede activarse un estado patofisiológico
típicamente mediante la infuncionalidad de ee3_1 o ee3_2, o
mediante expresión infuncional o mediante sobreexpresión del mismo,
que va acompañado de un control de errores, por ejemplo, de la
diferenciación celular, del crecimiento celular, de la plasticidad
celular o de la regeneración celular. Por otro lado, otros
mecanismos pueden conllevar también estados patofisiológicos, por
ejemplo, una afuncionalidad o una sobrefuncionalidad del/de los
ligando/s nativo/s de receptores de ee3 conformes a la invención.
En función del mecanismo molecular del trastorno patofisiológico,
puede ser deseable para propósitos terapéuticos la dosis de
proteínas funcionales conformes a la invención o al menos una mayor
expresión del mismo o una inhibición de las proteínas afuncionales
sobreexpresadas celularmente o expresadas. Se prefiere de manera
totalmente especial el empleo de las secuencias conformes a la
invención, particularmente de las secuencias con los números 1, 3,
5, en relación con su función en los casos de muerte celular,
excitación y neurogénesis. de estos conocimientos conformes a la
invención se deduce el empleo de las secuencias conformes a la
invención (secuencias de nucleótidos y de aminoácidos), así como los
derivados apropiados (por ejemplo, péptidos, oligonucleótidos o
anticuerpos) para la fabricación de un fármaco para el tratamiento
de enfermedades tumorales y enfermedades neurológicas,
particularmente estados isquémicos (apoplejía), esclerosis múltiple,
enfermedades neurodegenerativas, como por ejemplo, parkinson
mórbido, esclerosis lateral amiotrófica, ataxias
heredodegenerativas, neuropatías, Huntington mórbido, epilepsias y
Alzheimer mórbido. Debido a la alta regulación en el caso de la
elevada expresión de eritropoetina-, entra en consideración, por
otra parte, el empleo de objetos conformes a la invención para
todos los procesos patológicos, en los que la EPO tiene un papel
(protector) (por ejemplo, la apoplejía, y todos los tipos de
hipoxias agudas y crónicas).
Para llegar a otras indicaciones basadas en las
relaciones moleculares, resultan apropiados los ensayos HTS de base
celular para la activación funcional del receptor, medida mediante
complementación enzimática, como. El ensayo se basa en el mecanismo
general de regulación de GPCRs y mide la interacción entre el
receptor activado y la beta-arrestina. Para ello se
fusionan fragmentos inactivos de beta-galactosidasa
complementarios al término C del receptor y a
beta-arrestina. Mediante la activación del receptor
se recruta beta-arrestina. De este modo se unen las
dos mitades de la, beta-galactosidasa, de forma que
se forme una enzima de beta-galactosidasa
funcional, que puede transformarse en los sustratos apropiados, que
sirven como señal de medida (sistema ICAST). En principio, este
ensayo puede efectuarse con todas las enzimas, que pueden expresarse
como proteínas de fusión de dos mitades complementarias y realizar
una reacción de sustrato comprobable mediante métodos habituales de
medida.
En relación con el empleo terapéutico de las
secuencias conformes a la invención, se emplea una secuencia de
ácidos nucleicos o proteínas conforme a la invención para la
genoterapia en mamíferos, por ejemplo, en seres humanos y/o también
estos procedimientos genoterapéuticos. La genoterapia comprende
además todas las formas de terapia, que aporten o bien secuencias
conformes a la invención conformes a una de las Reivindicaciones 1
a 3 en el cuerpo o partes del mismo, por ejemplo, tejidos
individuales, o afecten a la expresión de las secuencias conformes
a la invención. Para ello pueden emplearse todas las modificaciones
familiares al experto en el contexto de la genoterapia, por
ejemplo, oligonucleótidos, por ejemplo, oligonucleótidos antisentido
o híbrido-ARN-ADN, con cualquier
modificación, que contenga las secuencias conformes a la invención.
se pueden utilizar asimismo estructuras virales, conteniendo una
secuencia conforme a la invención (esto abarca todas las variantes,
como fragmentos, isoformas, alelos, derivados). También entran en
consideración las secuencias de ADN desnudas apropiadas conformes a
la invención, en el contexto de la genoterapia. Asimismo se pueden
utilizar secuencias de ácidos nucleicos con actividad enzimática
(por ejemplo, ribozimas) para propósitos genoterapéuticos.
Además de los empleos terapéuticos, entran
también en consideración los empleos diagnósticos de ácidos
nucleicos o polipéptidos conformes a la invención, heterómeros
proteicos conformes a la invención, así como reactivos derivados de
estos conformes a la invención (oligonucleótidos, anticuerpos,
péptidos), por ejemplo, para el diagnóstico de enfermedades humanas
o de predisposiciones genéticas, por ejemplo, también en el contexto
de las pruebas de embarazo. Estas enfermedades o predisposiciones
son particularmente las enfermedades citadas anteriormente en
relación con los usos terapéuticos, especialmente enfermedades
neurológicas, immunológicas o tumorales. Estos procedimientos
diagnósticos se pueden ejecutar como procedimientos in vivo,
aunque típicamente como procedimientos ex vivo. Ex
vivo servirá un empleo típico de un procedimiento diagnóstico
para la comprobación cuali- y/o cuantitativa de un ácido nucleico
conforme a la invención en una muestra biológica.
Junto a los propósitos terapéuticos y/o
diagnósticos de empleo en el ámbito de la medicina y/o veterinaria,
entra también en consideración el empleo de los ácidos nucleicos o
polipéptidos conformes a la invención para el empleo científico.
Las secuencias conformes a la invención permiten identificar
particularmente del modo conocido por el expero, por ejemplo,
secuencias relacionadas mediante bibliotecas de ADNc en organismos
uni- o pluricelulares o localizar secuencias vecinas en el genoma
humano. Las secuencias de nucleótidos conformes a la invención,
particularmente las secuencias con la numeración 1 y 3 (incluidas
todas las variantes), pueden emplearse, por tanto, para codificar
genes para mARNs, que codifican para estos ácidos nucleicos o sus
equivalentes funcionales, homólogos o derivados, en los genomas,
por ejemplo, múridos u otros genomas animales y en el genoma humano
con métodos habituales mediante cribado de homología aislar, hacer
un croquis y correlacionar con marcadores para enfermedades
hereditarias humanas. Este procedimiento permite, por ejemplo, la
correlación casual de las posiciones cromosomiales de las
secuencias de la familia ee3 en las seres humanos (cromosoma 2
(2q14.2); cromosoma X- (Xq28, LocusID: 84548); cromosoma 5,
cromosoma 8, cromosoma 3; cromosoma 7) a determinadas enfermedades
hereditarias conocidas, particularmente también enfermedades
tumorales (por ejemplo, carcinoma hepatocelular), lo que simplifica
considerablemente su diagnóstico y posibilita nuevos juegos de
terapias. Esto mismo es válido para las proteínas conformes a la
invención.
Con ayuda de los ácidos nucleicos conformes a la
invención se pueden diagnosticar, por tanto, particularmente
enfermedades hereditarias humanas, es decir, tanto enfermedades
monogénicas como también poligénicas, por cuyo motivo se emplean
como marcador, creciendo de aquí un procedimiento de diagnóstico
conforme a la invención para enfermedades hereditarias.
Particularmente para el empleo científico se
muestra un sistema de prueba, basado en secuencias de aminoácidos
y/o de nucleótidos conformes a la invención. En este contexto se
pueden emplear el ADNc, el ADN genómico, los elementos reguladores
de las secuencias de ácidos nucleicos conformes a la invención, como
también el polipéptido, así como emplearse fragmentos parciales de
estos en forma recombinante o no recombinante para la
elaboración/gestación/desarrollo de un sistema de pruebas. Un
sistema de prueba de este tipo es particularmente apropiado para
medir la actividad del promotor o de la proteína en presencia de la
sustancia de prueba. en este contexto se trata preferentemente de
simples métodos de medición (colorimétrico, luminométrico, basado
en la fluorescencia o radioactivo), que permitan la rápida medición
de un gran número de sustancias de prueba Böhm, Klebe, Kubinyi,
1996, Wirkstoffdesign, Spektrum-Verlag, Heidelberg).
Los sistemas de prueba descritos permiten el examen de bibliotecas
químicas en busca de sustancias, que tengan efectos inhibidores o
activadores sobre las proteínas conformes a la invención,
particularmente de las secuencias 5 (y/o sus derivados o
fragmentos). La identificación de tales sustancias representa el
primer paso en el camino para la identificación de nuevos
medicamentos, que actúen específicamente sobre la transducción de
señales asociada a las ee3. En este contexto se proporcionan
particularmente sistemas de prueba, que empleen las propiedades
conocidas de las proteínas acopladas a la proteína G, por ejemplo,
los sistemas de prueba mostrados posteriormente.
Una inhibición de la actividad biológica de las
proteínas conformes a la invención, particularmente de proteínas
conformes a la Figura 13, o típicamente de la actividad biológica en
relación con la apoptosis, proliferación, regeneración, crecimiento
celular, como son deseables, por ejemplo, en la apoplejía, el shock
séptico, GvHD (graft versus host disease), enfermedades
degenerativas, particularmente enfermedades neurodegenerativas,
hepatitis aguda u otras indicaciones mostradas en la presente
invención, puede también de este modo lograrse, mediante
procedimientos familiares al experto, oligonucleótidos de
típicamente al menos 10 nucleótidos de longitud, que codifican para
un (un fragmento parcial de un) hilo(s) antisentido las
secuencias nativas de las proteínas con el número de secuencia 7A,
en las células afectadas. De este modo en las células
correspondientemente transformadas, la traducción del ARNm nativo
de las proteínas de la familia ee3 conformes a la invención, por
ejemplo, ee3_1 o ee3_2 se bloquea, lo que como resultado
preferentemente eleva la capacidad de supervivencia de las células
transfectadas o actúa como modulador sobre el crecimiento celular,
plasticidad celular, proliferación celular. También en este caso
puede emplearse el procedimiento descrito anteriormente con ayuda de
virus recombinante.
La apoptosis celular elevada, dado el caso,
patológicamente, proliferación celular en enfermedades, basadas en
un control apropiado de errores de las secuencias conformes a la
invención (por ejemplo, en las indicaciones citadas anteriormente),
puede tratarse terapéuticamente también mediante métodos de
ribozima. Para ello se emplean ribozimas que pueden cortar un ARNm
diana.
Además de las posibilidades citadas
anteriormente para la modulación de la función biológica de los
productos génicos conformes a la invención, particularmente de los
productos génicos conformes a las Figuras 13, o típicamente para la
modulación de la función los productos génicos conformes a la
invención en la transducción apóptica o necrótica, proliferativa o
indicadora del crecimiento de señales, estas posibilidades se pueden
ejecutar también con ayuda de un compuesto químico. Un compuesto
químico de este tipo modula, típicamente inhibe o también activa,
particularmente la función intracelular de las proteínas conformes a
la invención de la familia ee3, o secuencias de ADN conformes a la
invención subyacentes, por ejemplo, mediante enlace al ADN (por
ejemplo, el ámbito promotor) o mediante enlace a uno de los
factores de transcripción controladores de un gen conforme a la
invención, influir sobre la función biológica. Estos compuestos se
ligan típicamente de manera específica a una proteína conforme a la
invención y/o a una secuencia de ácidos nucleicos conforme a la
invención y provocan, de este modo, un efecto farmacológico,
particularmente neuroprotector o inmunomodulador antiapóptico o
antiproliferativo.
A través de análisis estructurales de una
proteína conforme a la invención se pueden descubrir compuestos
adecuados, que tengan una afinidad específica de enlace (Rationales
Drug Design (Böhm, Klebe, Kubinyi, 1996, Wirkstoffdesign,
Spektrum-Editorial, Heidelberg)). Aquí se determina
la estructura o una estructura parcial, derivado, alelo, isoforma o
una parte de uno de estos de las proteínas conformes a la invención
a través de un procedimiento de RMN o cristalografía roentgen (tras
la cristalización apropiada, por ejemplo, por el método de la
"gota colgante") o, mientras no exista una estructura sin una
buena conformación tal, con ayuda de algoritmos de previsión
estructural, se crea un modelo estructural de una proteína conforme
a la invención, por ejemplo, también con ayuda de homólogos
proteínas ya estructuralmente esclarecidas (por ejemplo, de
rodopsina), y se utiliza para identificar compuestos con
asistencia de programas de modelado molecular, que puedan actuar
como agonistas o antagonistas, para los que pueda pronosticarse una
alta afinidad hacia la proteína conforme a la invención. Dado el
caso, los procedimientos anteriormente indicados pueden combinarse
también para el esclarecimiento estructural. Se utilizan los campos
de fuerza apropiados para la simulación de la afinidad de un
compuesto potencialmente afín a una subestructura interesante de una
proteína conforme a la invención, por ejemplo, el centro activo, un
dominio tipo bolsillo (pocket) o una región "bisagra"
("finge"). Estas sustancias se sintetizan entonces y se
analizan en procedimientos de prueba apropiados para determinar su
capacidad de enlace y su aplicabilidad terapéutica. Estos
procedimientos in silico para la identificación de principios
activos potenciales, que desarrollen su efecto mediante enlace a las
proteínas ee3 conformes a la invención, son igualmente objeto de la
presente invención.
La información de la secuencia primaria de
proteínas ee3 puede utilizarse para preparar estructuras
recombinantes, que aprovechen las propiedades ya caracterizadas y
GPCRs conocidos gracias al estado actual de la técnica. Así se
pueden intercambiar, por ejemplo, determinados rangos de secuencia
de las proteínas ee3 conformes a la invención, por determinados
rangos de secuencia de un GPCR conocido bien caracterizado. La
estructura resultante puede consultarse para con ligandos o
agonistas conocidos, identificar el acoplamiento de la proteína G, y
el sistema segundo mensajero empleado, o emplear acoplamientos
conocidos de la proteína G para la ubicación de ligandos, agonistas
o antagonistas. La fabricación de receptores quiméricos, por
ejemplo, para los usos citados anteriormente puede efectuarse,por
ejemplo, por un procedimiento, como los descritos por Kobilka et
al. (Kobilka BK, Kobilka TS, Daniel K, Regan JW, Caron MG,
Lefkowitz RJ (1988) Chimeric alfa 2-,beta
2-adrenergic receptors: delineation of domains
involved in effector coupling and ligand binding specificity.
Science 240:1310-1316).
Además pueden emplearse mutantes receptores
constitutivamente activos de la familia ee3 para la caracterización
del efecto de estos receptores en rutas de transducción de las
señales y para el cribado ("screening") en busca de ligandos.
Los receptores conformes a la invención como representantes de la
clase proteica 7TM se pueden mutar de determinada manera, para dar
lugar a modificaciones del comportamiento fisiológico y
farmacológico de estos receptores. Esto puede utilizarse, por
ejemplo, para identificar rutas intracelulares de señales, cuando
el ligando natural o un agonista son desconocidos. Particularmente
son mutaciones apropiadas en la secuencia de proteínas consenso ee3
DRI, promover aquellas modificaciones, por ejemplo, la mutación de R
en la secuencia DRY (Scheer A, Costa T, Fanelli F, De Benedetti PG,
Mhaouty Kodja S, Abuin L, Nenniger-Tosato M,
Cotecchia S (2000) mutacional analysis of the highly conserved
arginine within the Glu/Asp- Arg-Tyr motif of the
alfa(1b)-adrenergic receptor: effects on
receptor isomerización and activación. Mol farmacol
57:219-231)) por Lys, His, Glu, Asp, Ala, Asn e Ile
conlleva en el caso de mutación a Lys a un fuerte aumento de la
activación estructural. La mutación a His o Asp conduce a un menor
aumento de la activación estructural. La mutación a Arg conlleva de
manera interesante un aumento de la afinidad de los agonistas, de
forma que también mutantes son interesantes para las pruebas
HTS.
HTS.
De manera similar, una Arg conservada en el
tercer dominio TM puede ser un posible lugar de mutación
(Ballésteros J, Kitanovic S, Guarnieri F, Davies P, Fromme BJ,
Konvicka K, Chi L, Millar RP, Davidson JS, Weinstein H, Sealfon SC
(1998) Functional microdomains en
G-proteína-coupled receptors. The
conserved arginine-cage motif en the
gonadotropin-releasing hormoderno receptor. J Biol
Chem 273:10445.-10453).
Alternativamente, para la identificación de
ligandos endógenos o subrogados pueden emplearse procedimientos
basados en el empleo de los receptores funcionales inmovilizados
conformes a la invención. Los receptores de la familia ee3
conformes a la invención se expresan en este contexto como proteínas
de fusión con GST, el marcador bandera o el marcador TAP. Las
células apropiadas se insertan, o se transforman en estructura de
membranas por métodos habituales o se emplean directamente para la
solubilisación. Con los detergentes apropiados, por ejemplo,
dodecilmaltósido, digitonina, colato o mezclas de detergentes se
solubilizan los receptores y se combinan a las matrices de afinidad
apropiadas como GST-sefarosa,
Anti-Flag- M2-agarosa o
IgG-sefarosa, etc. Tras el lavado de las matrices
se incuban con extractos de tejidos o sobrenadantes celulares y se
lavan de nuevo. Si el extracto contiene un ligando activo, por
ejemplo, un péptido, éste se liga al receptor inmovilizado y puede
identificarse tras elución mediante métodos analíticos, por ejemplo,
por medio de espectrometría de masas.
Los ensayos denominados de internalización
representan otro procedimiento para poder identificar ligandos
naturales o particularmente ligandos sustitutos para los receptores
conformes a la invención, por ejemplo, ee3_1. En este contexto se
aprovechan asimismo las diversas propiedades de una proteína de la
clase GPCR. Por ejemplo, pueda recurrirse al comportamiento de
internalización de las proteínas de la clase GPCR. Esto ha de
entenderse como mecanismo de regulación tras la activación del
receptor. La ventaja de un método de cribado
("screening-method") basado en este
comportamiento, es que no es necesaria una información exacta del
respectivo receptor. Particularmente, no tiene que existir ninguna
información acerca de las proteínas G conectoras, y las rutas de
transducción de las señales empleadas.
Un ensayo de este tipo se describe, por ejemplo,
en Lenkei et al. (2000, J Histochem Cytochem, 48,
1553-64) y puede emplearse de manera análoga en los
receptores conformes a la invención. Para ello se elabora primero
una estructura de fusión C-terminal de las proteínas
conformes a la invención con EGFP. Posteriormente se elaboran
células CHO estables por procedimientos estándar. Se seleccionan los
clones estables con ayuda de una clasificadora FACS por
fluorescencia EGFP. La selección final se efectúa con ayuda de
evaluación microscópica de fluorescencia de la expresión
superficial. Las células se incuban posteriormente con fracciones de
HPLC de fragmentos de tejidos, y se determina la internalización
con ayuda de un microscopio confocal. La evaluación se lleva a cabo
con ayuda de software morfométrico (NIH Image) según el principio de
la distancia de señales fluorescentes del punto medio celular. Una
distribución de la frecuencia/distancia originó una buena
discriminación para la
internalización.
internalización.
Para la situación de los ligandos desconocidos
se efectúan sucesivos fraccionamientos, para aislar el péptido
apropiado hasta la pureza, e identificarlo posteriormente por
ejemplo, mediante secuenciación o MALDI-TOF. Otro
empleo del, en principio, mismo procedimiento es descrito por Ghosh
et al. (2000, Biotechniques, 29, 170-5;
Conway et al., 1999, J Biomol Screen, 4,
75-86), que son ambos componentes en todo su
contenido de la presente
revelación.
revelación.
Pero también se puede recurrir a un ensayo
aproximativo funcional para la identificación de ligandos y/o, dado
el caso, también para la caracterización del receptor conforme a la
invención. En este contexto, se aprovecha, que un gran número de
receptores de 7TM- (receptores con 7 dominios transmembranarios),
producidos en células HEK293, en células CHO u otras células, a
través del acoplamiento a proteínas G de la clase Gq conducen a la
activación del PLC y a la movilización de Ca intracelular. Para el
caso de que tales receptores conformes a la invención no deban
emparejarse a proteínas G de la clase Gq, éstos pueden forzarse
mediante la expresión de Co- de las proteínas G quiméricas o las
proteínas G emparejadas de manera relativamente inespecífica con
receptores (G15 o G16) para la transducción de señales a través de
PLC, es decir, para la liberación de Ca. Los receptores de la
familia ee3 conformes a la invención se expresan típicamente en
células HEK293 y CHO tanto de manera estable como también
transiente aislado y junto a la proteína G quimérica Gqi5 y
alternativamente con la proteína G Gq15. Las células se cargan
entonces preferentemente con un colorante fluorescente de membrana
permeable, por ejemplo, Fura-2 o
Fluo-3 y/o -4 y tras el lavado de las células se
mezcla con diferentes sustancias de prueba y simultáneamente se
mide la liberación de Ca, por ejemplo, con un aparato FLIPR de la
compañía Molecular Devices. Las sustancias de prueba que produzcan
una señal positiva se analizan finalmente preferentemente en
Células de control (sólo transfectadas con el vector) y cuando la
señal se manifiesta farmacológicamente como específica, es decir,
caracterizada con curvas de concentración-
respuesta.
respuesta.
Alternativamente puede medirse, sin embargo, la
respuesta de Ca producida por un ligando también mediante otros
detectores de Ca, por ejemplo, a través de AequoScreen de Euroscreen
(Bruselas, Bélgica; véase, por ejemplo,
http://www.farmaceuticaltechnology.com/contractors/compoyman/euroscreen/).
Se emplean además células, que expresen el gen de la proteína
apoaeuorina. Tras la carga de las células con coelenterazina, que se
liga a la apoaecuorina, se forma aecuorina. Si mediante un ligando
se libera Ca, el Ca activa la aecuorina para la oxidación de
coelenterazina, liberándo intensidad de la emisión de luz es
proporcional al aumento de la concentración intracelular de Ca y,
por tanto, una medida de la actividad del ligando existente
(teniendo en cuenta los controles apropiados).
Para identificar antagonistas, se estimulan los
receptores en presencia de concentraciones satisfactoriamente altas
de los más diversos ligandos con un agonista conocido. Una señal
modificada frente a los controles (sólo agonista, sin otros
ligandos), por ejemplo, una señal de Ca menor, denota un antagonista
competitivo.
Además, los ensayos cAMP pueden servir también
para la caracterización de los receptores la familia ee3 conformes
a la invención y para la identificación de los ligandos. El motivo
de esta inserción para la caracterización farmacológica de los
receptores de ee3 y/o para la identificación de los ligandos
(agonistas o antagonistas) es la propiedad de los receptores de la
clase de las GPCRs, por ejemplo, de las proteínas conformes a la
invención, de poder actuar de manera estimulante o inhibitoria
sobre las clases de adenilaciclasas, generalmente mediante
activación de las denominadas proteínas estimulantes Gs o
inhibidoras Gin. En función del efecto de las sustancias de prueba,
por ejemplo, en un cribado de alto rendimiento, puede estudiarse por
medio de mediciones directas o indirectas la modificación
relacionada con lo mencionado del nivel cAMP en las células. Los
genes receptores se expresan en este contexto de manera estable o
transiente en células mamarias (ver Ejemplo de ejecución 2). En las
GPCRs, que activan las adenilatociclasas, por lo que aumenta el
nivel cAMP en la célula, se identifica un agonista potencial bajo
las sustancias de prueba mediante una elavada concentración de cAMP
frente a las células de control. Los antagonistas bajo las
sustancias de prueba, por ejemplo, en una inserción de HTS, se
identifican mediante su bloqueo del aumento de la concentración de
cAMP producida por un agonista. En los receptores de ee3 conformes
a la invención acoplados a Gi se estimula en la prueba la
adenilatociclasa o bien directamente con forscolina o mediante la
activación de un receptor acoplado a Gs, por lo que aumenta el nivel
cAMP acoplado a Gi que contrarresta este aumento. Para las
mediciones directas de cAMP se puede emplear una serie de ensayos,
como por ejemplo, el sistema de ensayo cAMP[3H] de la empresa
Amersham, basado, por ejemplo, en el principio de la suplantación
competitiva del cAMP formado endogénicamente pcAMP marcado
radiactivamente por (tritio) añadido. Las mediciones indirectas de
cAMP se efectúan generalmente mediante ensayos de reporte. Para
ello se expresan los receptores en líneas celulares, que contengan
sistemas de reporte, por ejemplo, el sistema
CRE-luciferasa. El cAMP activa la expresión de la
luciferasa, cuya actividad se mide mediante la reacción de los
sustratos apropiados y medición fotométrica de los productos. Los
ensayos de reporte sirven muy especialmente para los métodos de
cribado en tandem de
masas.
masas.
Finalmente son posibles - junto a los ensayos
descritos anteriormente - también los siguientes sistemas de ensayo
para la caracterización de los sistemas
second-messenger (segundo mensajero) conformes a la
invención y/o para la identificación de los ligandos según los
receptores de ee3 conformes a la invención, particularmente para la
determinación de la actividad de la adenilatociclasa en las células
o las membranas según Salomon (Salomon et al., (1979). Adv.
Cyclic Nucleotide Res. 10, 35-55), para la
determinación de la concentración de
inositol-3-fosfato o para la
medición de una liberación de ácido araquídico modificada. Por
ejemplo, puede sobreexpresarse ee3_1 en líneas celulares
habituales, y tras la activación mediante fragmentos de tejidos
puede determinarse la actividad del o.a. sistema segundo mensajero.
Los ensayos para los sistemas segundo mensajero de la clase GPCR
son bien conocidos individualmente por el experto y han de
extraerse, en cada caso, de los impresos, por ejemplo, Signal
Transduction: A practical apporach, G. Milligan, Ed. Oxford
University Press, Oxford, Estrecholand. Otros ensayos de informe
para el cribado abarcan los sistemas MAP quinasa/luciferasa y NFAT-
luciferasa.
En base al conocimiento conforme a la invención
de que la transducción de señales del receptor de ee3 también se
lleva a cabo a través de las rutas de transducción de las señales de
la MAP quinasa, pueden emplearse también para ello los ensayos de
cribado para establecer la búsqueda de ligandos o identificación de
inhibidores, por ejemplo, a través de un sistema de informe
NF-kB o sistema de luciferasa.
Tal y como se ha citado anteriormente, la
activación del segundo mensajero sirve también para la
identificación de ligandos, agonistas o antagonistas, que se ligan
a los receptores conformes a la invención y pueden desarrollar de
tal manera su efecto agonista y/o antagonista para ciertos procesos
celulares. Por ejemplo, se pueden emplear microfisiómetros para la
identificación de ligandos, agonistas, o antagonistas. Mediante el
enlace de ligandos a un receptor de la familia ee3, las señales
activas representan procesos consumidores de energía. En
consecuencia, estos procedimientos van acompañados siempre de bajas
modificaciones metabólicas, entre otros, una baja desviación del
pH. Estas pueden detectarse extracelularmente por, por ejemplo, un
microfisiómetro (Cytosensor, Molecular
Devices).
Devices).
Tras la identificación de ligandos, agonistas o
antagonistas con potencial de enlace a las proteínas conformes a la
invención de la familia de receptores ee3 se pueden efectuar ensayos
de enlace de ligandos para su caracterización detallada. Los
ensayos de enlace de ligandos facilitan directamente la farmacología
de un receptor, es decir, poder medir la afinidad de los más
diversos ligandos por este receptor. Para estudios de enlace, en
este contexto, se marca típicamente manera radiactiva un ligando
químicamente puro, identificado por uno de los procedimientos
citados anteriormente o conocido de otro modo, con una alta
actividad específica (30-2000 Ci/mmol), de forma
que la marca radiactiva no reduzca la actividad del ligando respecto
al receptor. Las condiciones de ensayo se optimizan, tanto para el
empleo de las células que expresan al receptor como también de las
membranas elaboradas a partir de aquellas respecto a la composición
del tampón, sal, moduladores, como por ejemplo, nucleótidos o
estabilizadores, como por ejemplo, glicerina; de forma que la
medición origine una razón señal/trasfondo útil. Para este ensayo
de enlace, se define el enlace específico del receptor como la
diferencia de la radiactividad total asociada con la preparación
del receptor (células o membranas), es decir, medida en presencia de
sólo un enlace específico, o sea, del radioligando y de la
radiactividad, medida en presencia tanto del radioligando como
también de un exceso de ligando no marcado radiactivamente. Cuando
sea posible, se emplean dos ligandos competitivos químicamente
diferentes, para determinar el enlace no específico. Un enlace
específico, que ascienda a al menos el 50% del enlace total, es
óptimo. El ensayo de enlace se efectúa, o bien de manera
no-homogénea como ensayo de filtración o de manera
homogénea como ensayo "Scintillation Proximity Assay" (ensayo
de escintilación por
proximidad).
proximidad).
En el primer caso, se incuba la preparación que
contiene el receptor (células o membranas) con los ligandos en una
disolución tampón apropiada, hasta que se haya ajustado el
equilibrio de enlace típicamente 1 h a RT o a 4ºC toda la noche, y
entonces se filtra a través de un filtro apropiado, por ejemplo,
whatman o Schleicher&Schuell filtro de fibra de vidrio,
pretratado, si fuera necesario, por ejemplo, con polietilenoimina,
para separar los radioligandos no-combinados de los
combinados. Tras el lavado del filtro, se seca o se mezcla en húmedo
con un escilitador apropiado y tras la incubación eventualmente
necesaria se mide la radiactividad contenida en el contador de
escilitación. En el ensayo "Scintillation Proximity Assay" se
incuban las bolitas de escintilación apropiadas, por ejemplo,
bolitas de WGA, con los ligandos y las membranas que contienen
receptor en una disolución tampón apropiada, hasta que se haya
ajustado el equilibrio de enlace y entonces se mide la radiactividad
en un contador de escitilación apropiado. Ambos ensayos de enlace
pueden realizarse en el formato HTS.
Los receptores solubilizados o purificados se
miden con el ensayo "Scintillation Proximity Assay" o con
ensayos inhomogéneos habituales como el ensayo de filtración tras
la precipitación del PEG, el ensayo de adsorción o el ensayo de
filtración en gel (Hulme E, Birdsall N (1986) Distinctions in
acetylcholine receptor activity. Nature 323:396-
397).
397).
En vez de un radioligando puede emplearse un
ligando fluorescente, por ejemplo, un ligando que se haya combinado
covalentemente a un colorante fluorescente como BODIPY. El enlace
del ligando fluorescente al receptor se mide por medio de
polarización de fluorescencia. El método sirve tanto para cribados
primarios en formato HTS como también en ensayos secundarios.
Otro objeto de la presente invención se
relaciona con procedimientos para la identificación de los
participantes en la interacción celular de los polipéptidos de la
familia ee3 conformes a la invención. De este modo pueden
identificarse como participantes en la interacción las proteínas,
que tengan afinidades específicas de enlace, o para la
identificación de ácidos nucleicos, que codifiquen para proteínas,
que tengan afinidades específicas de enlace respecto a la proteína
conforme a la invención. Los participantes celulares en la
interacción de proteínas de las proteínas ee3 conformes a la
invención pueden ser, por ejemplo, otro GPCRs o canales iónicos.
Un procedimiento conforme a la invención de este
tipo y/o el empleo de los polipéptidos conformes a la invención,
secuencias de ácidos nucleicos conformes a la invención y/o
estructuras de ácidos nucleicos conformes a la invención para la
ejecución de este procedimiento se efectúa con ayuda de una
compilación "Yeast-two-hybrid"
("cribados"-y2h) aislado o en combinación con otro
procedimiento bioquímico (Fields and Song, 1989, Nature, 340,
245-6). Estos cribados se describen también en Van
Aelst et al. (1993, Porc Natl Acad Sci U S A, 90,
6213-7) y Vojtek et al. (1993, Cell, 74,
205-14). Típicamente se pueden emplear también
sistemas basados en mamíferos, en vez de los sistemas de levadura,
para la ejecución de un procedimiento conforme a la invención, por
ejemplo, como los descritos en Luo et al. (1997,
Biotechniques, 22, 350-2). Los enfoques
experimentales apropiados citados anteriormente utilizan además las
propiedades típicas de la clase de las proteínas GPCR, por ejemplo,
la transducción de señales, por ejemplo, a través de proteínas G, o
sea, por ejemplo, también los participantes en la interacción
intracelular
conocidos.
conocidos.
Para un cribado y2h se clona el marco abierto de
lectura de las secuencias conformes a la invención, particularmente
de las secuencias con los números 1 a 4, o una variante nativa, de
manera totalmente especialmente preferente rangos intracelulares de
las secuencias conformes a la invención, por ejemplo, en un
denominado vector bait "in-frame" con el
dominio de enlace GAL4 (por ejemplo, pGBT10 o pGBKT7, Fab.
Clontech). Con esto puede examinarse preferentemente una denominada
"pre-librería" en una variedad de levadura por
el protocolo habitual en busca de las proteínas que
interactúan.
Por otra parte, con los sistemas y2h pueden
efectuarse también los denominados experimentos de mapeo para
identificar dominios específicos de interacción.
\newpage
De manera equivalente, se prefieren también los
sistemas 2-híbridos, que emplean otros participantes
en la fusión u otros sistemas celulares, por ejemplo, el sistema
BacteroMatch, o el sistema CytoTrap, ambos del Fab. Stratagene.
Alternativamente al procedimiento y2h, conforme a la invención
pueden emplearse también sistemas apropiados de células de
mamíferos, como los descritos, por ejemplo en Luo et al.
(1997, Biotechniques, 22, 350-2) como componente de
la presente revelación.
La alta regulación de por ejemplo, ee3_1
mediante EPO muestra, que por ejemplo, ee3_1 se relaciona con la
supervivencia de las células, ya que la EPO tiene efectos
neuroprotectores. Los polipéptidos conformes a la invención,
particularmente las variantes nativas o también
no-nativas, artificiales, cuya función biológica
debería estudiarse, pueden emplearse, por tanto, en un ensayo de
apoptosis y/o en un procedimiento para la investigación de la
función y/o efectividad de los polipéptidos conformes a la invención
en la inducción, transducción o inhibición de las señales de muerte
celular u otros procesos fisiológicos celulares. La participación
de las proteínas conformes a la invención de la familia ee3 o de las
variantes conformes a la invención citadas anteriormente de, por
ejemplo, cascadas apoptóticas puede estudiarse, mientras se
transfecten las estructuras de expresión con las secuencias de ee3
conformes a la invención, particularmente con las secuencias con
los números 1 y 3 o variantes en las células eucarióticas (por cuyo
motivo se muestra también su empleo para estas investigaciones), y
posteriormente puede analizarse la inducción de apoptosis. Esto
puede ocurrir, por ejemplo, mediante tinción con anexina (Fab. Roche
Diagnostics), mediante anticuerpos, que reconozcan la forma activa
de caspasa-3 (Fab. New England Biolabs), o mediante
ELISAs, que reconozcan fragmentos de ADN-histona
(cell-death elisa, Roche Diagnostics). Esta
inducción de apoptosis es, dado el caso, específica del tipo
celular, por cuyo motivo conforme a la se analizan preferentemente
varias líneas celulares y células primarias. La inducción de la
apoptosis puede ser, dado el caso, también específica del estímulo.
Por tanto, en un procedimiento de este tipo se aplican
preferentemente varias situaciones de estrés, por ejemplo, golpes
de calor, condiciones de hipoxia, tratamientos de citoquina (por
ejemplo, IL-1, IL-6,
TNF-alfa) o tratamiento de H2O2. como tipos de
células típicos para un procedimiento de este tipo entran en
consideración las líneas celulares habituales, por ejemplo, células
Cos, células HEK, células PC12, células HP-1 o
células primarias, como por ejemplo, neuronas, astrositos, así como
otras lineas celulares inmortalizadas y primarias, según la
necesidad.
necesidad.
En resumen, hay que constatar, que se
identificó un receptor acoplado a una nueva familia de proteínas G
membranarias (GPCRs) en el sistema de los mamíferos,que puede
separarse claramente de las familias conocidas gracias al estado
actual de la técnica. La identificación de una nueva clase proteica
y de las secuencias de ADN subyacentes tuvo lugar debido a una
regulación diferencial de las mismas en el sistema nervioso central
y permiten la aclaración y caracterización de un gran número de
procesos fisiológicos y patofisiológicos.
La identificación se logra mediante la
regulación transcripcional alta inducida por la EPO (directa o
indirectamente) de la proteína ee3_1 conforme a la invención. Esto
significa, que por ejemplo, los agonistas y antagonistas de la
ee3_1pueden reforzar o sustituir los efectos de la EPO, o
antagonizar efectos no deseados. Posiblemente ha de influirse
selectivamente sobre determinados efectos de la EPO, por ejemplo, un
efecto neuroprotector (por ejemplo, en enfermedades
neurodegenerativas), o un aumento del rendimiento cerebral, (por
ejemplo, en demen-
cias).
cias).
El gen reproducido es una nueva proteína
7-transmembranaria en los ratones y seres humanos,
expresada v.a. en el cerebro. Se trata de un receptor acoplado a la
proteína G. una búsqueda de homología en el banco de datos de
secuencia EMBL resultó en una similaridad remota a las GPCRs de la
familia A, particularmente receptores peptídi-
cos.
cos.
Por otra parte, laee3_1 no se regula o sólo de
manera limitada mediante los siguientes modelos de enfermedades
neurológicas: Kindling (Hippocampus, seizure stage 5, 2 h post
seizure), apoplejía cortical (Cortex, 2.5 h occlusion y 2 y 6h
Reperfusion), isquemia global en ratas (cerebro completo, 3 y 6 h
post isquemia). Esto muestra una alta especificidad de la
regulación mediante EPO, en contraste, por ejemplo, con los genes
"immediate early".
La presente invención se describe más a fondo
mediante las siguientes Figuras:
La Fig 1. muestra una representación del
análisis de transcripción en el cerebro de ratones EPO. La gráfica
representa los datos del experimento de hibridación del ADN array.
Se representa la señal en los animales
EPO-transgénicos (eje y) frente a la señal en
ratones salvajes (eje x). la señal es una señal de fluorescencia
(relativa). Los puntos superiores a las diagonales representan
productos génicos altamente regulados en el cerebro de animales
EPO-transgénicos. Por encima de la diagonal 2 (doble
sobreexpresión en el animal transgénico frente al salvaje) pueden
observarse ocho señales positivas.
La Fig. 1b representa los resultados de los
experimentos de microarray. Se trata de una aplicación del factor
de inducción (rel.) de la ee3_1 de los ratones en el cerebro de
ratones EPO-transgénicos (derecha) en relación con
la inducción en el cerebro de animales salvajes, es decir, como
valores medios de inducción de 2 experimentos de inducción
independientes. Un factor de inducción de 1 corresponde a la
concentración en el cerebro del animal de control de una camada. La
expresión de una secuencia conforme a la invención obtiene casi el
cuádruple del
valor.
valor.
\newpage
La Fig. 2 muestra los resultados de los
experimentos con ratones consultados para la verificación de la
elevada inducción de la ee3_1 conforme a la invención en animales
EPO-transgénicos y del producto génico
alfa-globina altamente regulado asimismo en el
animal EPO-transgénico, es decir, con ayuda del PCR
cuantitativo (LightCycler). Los datos representan muestras de ARN
reunidos de 6 cerebros (transgénicos tg) o salvajes (wt). Sobre el
eje y se representa la inducción relativa. Frente a la medición del
control (inducción rel.=1), para la secuencia conforme a la
invención se deduce un aumento 11 veces de la inducción.
La Figura 3 da la expresión de la ee3_1 conforme
a la invención en el ratón (LightCycler) durante el desarrollo
(embrión tras 7, 11, 15 y 17 días) y de nuevo en diferentes tejidos
adultos (cerebro, corazón, hígado, riñón, pulmón, músculo
esquelético, bazo y testículo). Sobre el eje y se representa la
abundancia relativa de trasuntos ee3. como resultado se muestra una
expresión relativamente ubicua de ee3_1 en todos los estadios del
desarrollo embrionario murín y en todos los tejidos analizados. La
ee3_2 se expresa en el ratón según datos EST en carcinoma, tiñones,
hígado, células B, pulmón, mamas y útero embrionarios.
La Fig. 4 muestra la expresión de ee3_1, ee3_2 y
ee3_c5 humanas conformes a la invención en seres humanos en los
tejidos adultos (corazón, cerebro, placenta, pulmón, hígado,
músculos esqueléticos, riñones, páncreas). Los datos proceden de
experimentos de PCR cuantitativos (LightCycler). La aplicación sobre
el eje y corresponde a la de la Figura 3. se muestra una expresión
casi ubícua y paralela de los genes de la familia ee3 conforme a la
invención en los tejidos analizados. Resulta especialmente
sorprendente la fuerte expresión de la familia ee3 en los riñones y
el páncreas, mientras que la expresión en el cerebro y
esqueletomúsculo resulta baja. La expresión de ee3_1 y ee3_2
coincide considerablemente, de forma que, dado el caso, estas dos
proteínas conformes a la invención se deducen de una función
redundante. En las seres humanos se localizan ESTs con secuencias
de ee3_1 en los siguientes órganos: cerebro, ojo, células
embrionarias, corazón, riñón, pulmón, placenta, próstata, embrión
completo, glándula suprarrenal, mamas, colon, estómagos, testículos.
Esto se puede englobar en una expresión relativamente amplia. En
las seres humanos hay ESTs de ee3_2 en cerebro, colon, corazón,
riñón, pulmón, páncreas, paratiroides, próstata, testículos, útero,
vejiga, mamas, piel.
La Figura 5 representa el resultado de un
Northern-Blot, que la expresión de la ee3_1 humana
conforme a la invención en diferentes líneas celulares tumorales
humanas. Para la hibridación Northern-Blot (Fab.
Clontech) se inserta una sonda de ratón, que comprende los ORF de
la ee3_1 humana. Se muestra una expresión ubícua de un trasunto de
ARN ee3_1 humano conforme a la invención.
La Figura 6 representa la expresión de ee3_1 en
diferentes áreas del cerebro (rata). También aquí hay una
distribución ubícua en diferentes áreas del cerebro, algo más espesa
en el cerebelo y médula espinal sonda empleada: ratón ee3_1. por
debajo se representa la imagen del gel coloreado con bromuro de
etidio como control de carga.
La Figura 7 muestra un modelo de topología
proteica de ee3_1_m en base al pronóstico estructural con especial
consideración de los dominios transmembranarios. Se muestra una
topología típica de las proteínas GPCR con 7 dominios
transmembranarios (representados horizontalmente adyacentes, un
corto término N intracelular (situado por encima del dominio TM 1)
y un término C intracelular (representado por debajo del dominio TM
7). Los aminoácidos hidrófobos se caracterizan en verde.
La Figura 8 muestra una alineación (comparación
de secuencia) de las proteínas ee3_1 conformes a la invención
("human pro"), ee3_2 y un fragmento de proteína de ee3_5 con
diferentes proteínas GPCRn conocidas preliminarmente gracias al
estado actual de la técnica (por ejemplo, dc32_bio,
ccr5-human o dop21_human), y motivos de consenso de
las familias de GPCR A, B y C conocidas gracias al estado actual de
la técnica (en Figura 8 como cons fam A, cons fam B). "Pfam"
significa "familia proteica" y describe un grupo de motivos de
consenso, producidas a partir de las en agrupamiento de proteínas
"Clustering". Los motivos especificados se extraen de los
bancos de datos pfam. Se aclara que la familia de proteínas ee3
conforme a la invención tiene la similaridad más fuerte respecto a
las proteínas GPCRn de la familia A. para la familia proteica
conforme a la invención resultan especialmente características,
frente a las proteínas GPCR conocidas preliminarmente, las (la
siguiente numeración de aminoácidos corresponde a aquella de la
Figura 8) siguientes secciones de secuencia para las ee3_1 y ee3_2
humanas: de aminoácidos 75-85, de aminoácidos
129-135 (particularmente glicina y serina en las
posiciones 129 y/o 132, glicina en la posición 174, de aminoácidos
193-200 (particularmente glicina en la posición
198), de aminoácidos en las posiciones 260 y 261, de aminoácidos en
la posición 308 (cis), de aminoácidos 334-340, de
aminoácidos en la posición 539 (his), de aminoácidos en la pos 608
(his), de aminoácidos en la posición 611 (asp) y, finalmente la
fracción completa de secuencia C-terminal a partir
de la posición 637 (particularmente con el moivo ácido entre las
pos 640 y 655, el motivo básico entre 666 y 670 y el motivo ren
prolina entre las posiciones 680 y 685).deee3_c1 (ee3_1) del ratón
(secuencia
1).
1).
La Fig. 9A representa una secuencia de ADN
conforme a la invención bajo la designación ee3_c1 (ee3_1) del
ratón (secuencia 1), que comprende la zona traducida (versión en
todas las secuencias representadas: recorrido de izquierda a
derecha y de arriba hacia abajo, o sea, con continuación tras el
final de línea en la siguiente línea inferior, a la izquierda). Los
codones de inicio y parada en este rango de secuencia se destacan en
negrita.
La Figura 9B contiene otra secuencia conforme a
la invención, que representa una zona inferior (zona no traducida
en 3') de la secuencia conforme a la Figura 9a.
La Figura 10 representa, bajo la designación
ee3_2, una secuencia de ADN conforme a la invención del ratón
(secuencia 2), que comprende también el rango traducido.
Los codones de inicio y parada en este rango de
secuencia se destacan en negrita.
La Figura 11A representa, bajo la designación
ee3_1 una secuencia de ADN humano conforme a la invención (secuencia
3), que comprende también el rango traducido. Los codones de inicio
y parada en este rango de secuencia se destacan en negrita. por
otra parte, la señal de poliadenilización putativa se destaca en
negrita y subra-
yado.
yado.
Las Figuras 11B y 11C representan formas de
ajuste C-terminales alternativas, que codifican para
una proteína C-terminal truncada conforme a la
invención. Junto a los codones de inicio y parada destacados en
negrita, en la Figura 11B se destaca adicionalmente la secuencia de
consenso de la posición de ajuste.
La Figura 12 representa, bajo la designación
ee3_2, una secuencia de ADN humano conforme a la invención
(secuencia 4), que comprende también el rango traducido. Los
codones de inicio y parada en este rango de secuencia se destacan
en negrita (ATG y/o TAA). por otra parte, la señal de
poliadenilización putativa se destaca en negrita. La secuencia
inferior de la Figura 12 continúa la primera parte de secuencia
(rango solapante de la primera y segunda partes en cursiva).
La Figura 13 representa una secuencia de
aminoácidos múrido conforme a la invención, bajo la designación
ee3_1 (secuencia 5), es decir, recorrida desde el término N hasta
el término C (ver también la secuencia de ADN subyacente conforme a
la Figura 9).
La Figura 14 representa, bajo la designación
ee3_2, una secuencia de aminoácidos múrido conforme a la invención
(secuencia 6), es decir, recorrida desde el término N hasta el
término C (ver también la secuencia de ADN subyacente conforme a la
Figura 10).
La Figura 15A representa, bajo la designación
ee3_1, una secuencia de aminoácidos humana conforme a la invención
(secuencia 7), es decir, recorrida desde el término N hasta el
término C (ver también la secuencia de ADN subyacente conforme a la
Figura 11A).
La Figura 15B representa, bajo la designación
ee3_1b_h, una secuencia de aminoácidos humana conforme a la
invención (secuencia 7b), es decir, recorrida desde el término N
hasta el término C (ver también la secuencia de ADN subyacente
conforme a la Figura 11B).
La Figura 15C representa, bajo la designación
ee3_1b_h, una secuencia de aminoácidos humana conforme a la
invención (secuencia 7b), es decir, recorrida desde el término N
hasta el término C (ver también la secuencia de ADN subyacente
conforme a la Figura 11C).
Las secuencias conformes a las Figuras 15B y 15C
son las secuencias de aminoácidos de los productos de ajuste
alternativos de la secuencia de ADN representada conforme a la
Figura 11A.
La Figura 16 representa, bajo la designación
ee3_2, una secuencia de aminoácidos humana conforme a la invención
(secuencia 8), es decir, recorrida desde el término N hasta el
término C (ver también la secuencia de ADN subyacente conforme a la
Figura 12).
La Figura 17 representa, bajo la designación
ee3_5, una secuencia de ADN humano conforme a la invención
(secuencia 10), que comprende también el rango traducido. Los
codones de inicio y parada en este rango de secuencia se destacan
en negrita (ATG y/o TAA). por otra parte, la señal de
poliadenilización putativa se destaca en
negrita.
negrita.
La Figura 18 representa, bajo la designación
ee3_5, una secuencia de aminoácidos humana conforme a la invención
(secuencia 11), es decir, recorrida desde el término N hasta el
término C (ver también la secuencia de ADN subyacente conforme a la
Figura 19).
La Figura 19 muestra el resultado de un PCR
cuantitativo para ee3_1 en el cerebro de los ratones, tratado
intraperonealmente con 5000 U de eritropoetina_(EPO)/kg de
peso corporal, y se prefundieron posteriormente tras 6 o 24 horas
y se analizaron. si-6-1,
si-24-1:animales inyectados con sal
común tras 6 y/o 24 horas. ei-6-1,
ei-6-2 EPO tras 6 horas;
ei-24-1,
ei-24-2: animales inyectados con EPO
tras 24 horas. Se muestra una elevada expresión de ARN ee3, que
aumenta con el paso del tiempo. Los valores de los animales tratados
con EPO son significativamente diferentes, estadísticamente
hablando, de los tratados con sal común (ANOVA seguido de
Newman-Keuls post hoc
Test).
Test).
La Figura 20 muestra la figura de una
hibridación in situ en un corte horizontal de un cerebro de
ratón. Con la sonda radiactivamente marcada empleada (ee3_1.3as
AACGAAGGGCCAGDÍACACAGAGAACAGCAGCAGA
CAGGCADÍAATGAGG) podía hacerse ver la expresión de ee3_1 en el cerebelo (ce), hipocampo (hc), circunvolución dentada (dg) y en el córtex (co), particularmente en el córtex entorhinal, en el bulbo olfatorio (olf). Un control sonsorial apropiado (ee3_1.3s,CCTCATCTATGCCTGTCTGCTGCTGTTCTCTGTGCTACTGGCCCTTCGTT) no produjo ninguna señal específica (no mostrado).
CAGGCADÍAATGAGG) podía hacerse ver la expresión de ee3_1 en el cerebelo (ce), hipocampo (hc), circunvolución dentada (dg) y en el córtex (co), particularmente en el córtex entorhinal, en el bulbo olfatorio (olf). Un control sonsorial apropiado (ee3_1.3s,CCTCATCTATGCCTGTCTGCTGCTGTTCTCTGTGCTACTGGCCCTTCGTT) no produjo ninguna señal específica (no mostrado).
La Figura 21 ilustra la fabricación de un
antisuero policlonal C-terminal contra la proteína
ee3_1 (persona).
- A:
- selección de un epítope peptídico en el término carboxílico con alto potencial de antigenicidad (CLHHEDNEETEETPVPEP).
- b:
- Immunoblot, que muestra la comprobación específica de ee3_1 en células HEK293 transfectadas trasientes. Se representaron, en cada caso, las mismas concentraciones de lisado de células HEK293, transfectadas con la estructura Exp.ee3-1-h-Nter-myc, lo que conlleva la producción de proteína ee3_1 con myc-tag fusionado N-terminal.
- Huella 1:
- comprobación de la proteína ee3_1 con myc-tag fusionado N-terminalmente, a través de un anticuerpo myc-específico (Empresa Upstate Biotechnology (comercializados por Biomol Feinchemikalien GmbH), empleado en una dilución de 1:2000).
- Huellas 2-8:
- comprobación de ee3_1 con diferentes diluciones del antisuero específico para la ee3_1 AS4163 (1:500 - 1:12000). El antisuero detecta específicamente y de manera altamente sensitiva la banda específica de la ee3_1(aprox. 35 kDa).
- Huella 9:
- el suero preinmune apropiado (PIS) no detecta ninguna banda en una dilución de 1:500.
\vskip1.000000\baselineskip
La Figura 22 muestra la delección
inmunohistoquímica de ee3_1 en diferentes tejidos por medio del
antisuero AS4163.
- A:
- tinción específica de las neuronas de la capa V en el córtex somatosensorial.
- B:
- ampliación de A.
- C:
- neurona en el córtex entorhinal.
- D:
- expresión de ee3_1 en la circunvolución dentada y en la región CA3 del hipocampo.
- E:
- ampliación de la región CA3 del hipocampo.
- F:
- límite de la expresión de ee3_1 en el hipocampo entre CA3 y CA2.
- G:
- cerebelo, tinción inmunohistoquímica específica en la capa de células de Purkinje y en los núcleos del cerebelo.
- H:
- células de Purkinje en el cerebelo.
- I:
- bulbo olfatorio.
- J:
- ampliación, tinción de las células mitrales grandes.
- K:
- retina, tinción de las células gangliales y de las células sensoriales de la retina.
- L:
- ampliación de K. tinción de las células sensoriales de la retina.
- M:
- expresión de ee3_1 en las grandes neuronas motoras del cuerno ventral de la médula espinal.
- N:
- expresión de ee3_1 en el núcleo motor del Ncl. trigeminus.
- O:
- tinción de la sustancia negra, parte reticulada
- P:
- ampliación de Q. sustancia negra.
- Q:
- ee3_1 se expresa extraneuralmente en el pulmón. Tinción de células basales en los bronquiolos. Tinción de arteriosos, ninguna tinción de venolos.
- R:
- representación de la triada pulmonar típica bronquios, arterias y venas.
\newpage
- S:
- ampliación de los bronquiolos. Expresión en células basales específicas, aún no definidas a fondo.
- T:
- ampliación con pared arteriolar ( arriba a la izquierda) y pared bronquiolar (abajo a la derecha).
- U:
- representación de un arterioso en el proceso. Tinción del endotelio y células musculares planas en la pared del recipiente.
- V:
- arterioso en sección transversal con coloración inmunohistoquímica de las células musculares planas y células endoteliales individuales.
- W:
- intestino delgado con estructura de criptas y vellosidades, tinción de las proporciones basales de criptas por el anticuerpo contra ee3_1. en las vellosidades se colorean los nervios vegetativos individuales.
- X:
- ampliación de W.
- Y:
- representación de las fibras nerviosas en la pared del intestino delgado, que pertenecen al plexo mioentérico vegetativo propio del intestino delgado.
- Z:
- sección transversal de un nervio periférico en los tejidos grasos/conjuntivos subcutáneos.
- AA:
- músculo cardíaco con fibras nerviosas teñidas específicamente.
- BB:
- musculatura a rayas transversales (esqueletomúsculo). La coloración inmunohistoquímica en el centro de la imagen es muy compatible con una placa final motora. En el perimisio, fibras nerviosas periféricas individuales (abajo derecha).
\vskip1.000000\baselineskip
La Figura 23 muestra la posición frontal de una
coloración inmunohistoquímica de ee3_1 en la médula espinal de un
ratón salvaje (parte superior de la imagen) y de un ratón, que
sobreexpresa eritropoetina transgénica[(tg6) parte inferior de la
imagen]. En las mismas condiciones de coloración, se encuentra una
señal claramente más fuerte en los ratones transgénicos. Este
resultado se puede verificar en otros dos ratones.
La Figura 24 muestra una doble
inmunofluorescencia para ee3_1 y map1b en el ratón. Estas dos
proteínas se detectaron como participantes en la interacción en un
sistema y2h. se encuentra una coincidencia asombrosa de la
localización de ambas proteínas en el ZNS. Verde: coloración de
ee3_1; rojo: coloración de map1b; amarillo: superposición
electrónica de ambas señales. Se muestran ejemplos de la médula
espinal (spinal cord; sc) y del cerebelo (cb).
La Figura 25 muestra las coloraciones
inmunohistoquímicas de un mutante de ratón para el gen map1b
(Meixner, et al. (2000), J Cell Biol, 151,
1169-78.). se muestra que en los homocigotos de
map1b ko animales tan sólo han de justificarse trazas de ee3_1. a:
hipocampo, b: córtex, c: cerebelo.
La Figura 26 muestra una PCR de ee3_1 en células
madre neuronales adultas (nsc) del hipocampo de las ratas. No se
puede comprobar ninguna señal en la huella negativa (N). ee3_1 es
expresada por estas células madre neuro-
nales.
nales.
La Figura 27 muestra el alineamiento proteico
para proteínas ee3_1 de diferentes especies, considerando las
secuencias de X. laveis y D. rerio.
La presente invención se describe más a fondo
mediante el siguiente ejemplo de ejecución:
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo de ejecución
1
El cerebro de los ratones sobreexpresores de
eritropoietina se extrajo en anestesia tras perfusión transcardial
y se congela en nitrógeno líquido. El ARN se obtuvo por el método de
Chomczynski y Sacchi (Anal Biochem (1987), 162,
156-9). Los experimentos de hibridación de 2
transgénicos y 2 controles de camada en un array de ADNc de ratón
("Chip") se efectuaron por el procedimiento de Incyte (s.
http://www.incyte.com/reagents/lifearray/lifearray service.s html).
En este contexto se efectúa una hibridación competitiva con ayuda de
de dos muestras marcadas diferentes (marcadas con Cy5 y Cy3). El
experimento de hibridación ofrece como resultado una serie de
secuencias altamente reguladas.
\newpage
Se identificó particularmente el clon de EST
AA185432, altamente regulado en un experimento de repetición
asimismo en los ratones EPO-transgénicos. En el
factor relativo de inducción valió +3,9 0,1 frente a las camadas
no transgénicas (Fig. 1). Esta alta regulación se convalidó con
ayuda de un PCR cuantitativo con el sistema Lightcycler (Fig. 2,
imprimador delantero:
5'-GGTGTGGGAGAAATGGCTTA-3',
imprimador trasero: 5'-ATACCAGCAGAGCCTGGA
GA- 3').
GA- 3').
\vskip1.000000\baselineskip
La secuencia EST identificada podía prolongarse
con ayuda de búsquedas de BLASTN en bancos de datos EST. De este
Modo se identificó otra secuencia homóloga del ratón, ee3_2_m.
Mediante el empleo de búsquedas de homología con empleo de los
programas apropiados (BLAST, TBLASTN) podían identificarse homólogos
humanos en los bancos de datos de EST y genómicos (ensembl).
Para la confirmación de las secuencias obtenidas
se efectuaron compilaciones ("screens") con ayuda del
procedimiento de clonación del PCR de Shepard (Shepard AR, Rae JL
(1997) Magnetoic bead capture of cDNAs from
double-stranded plasmid cDNA libraries. Nucleic
Acids Res 25:3183-3185), es decir, en bancos
secuenciales de ratones y humanos. La publicación citada
anteriormente y el estado actual de la técnica allí citado es
componente, en todo su contenido, la revelación para la presente
invención. Este procedimiento se basa en la hibridación de moléculas
de ADNc de una biblioteca de plásmidos a una secuencia de
oligonucleóttidos acoplada a la biotina, posterior extracción de
los plásmidos con ayuda de perlas magnéticas acopladas a
estreptavidina ("beads"). Control del resultado por medio de
PCR diagnóstico y doble repetición de los pasos tras la
retransformación de la fracción de plásmido obtenida, hasta la
obtención del clon único. Se emplearon las siguientes combinaciones
de imprima-
dores:
dores:
(1) oligonucleótidos, con los que se clonó la
longitud total de la fracción de gen:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) Por otra parte, se clonó la zona
codificadora de las secuencias de ee3 en vectores compatibles con
GATEWAY(tm), para poder efectuar análisis funcionales. Para
ello se emplearon los siguientes oligonucleótidos:
Con el equipo de síntesis de ADNc del Fab.
Stratagene (Amsterdam, Holanda) se fabricaron, partiendo de 2 \mug
de ARNm cerebral fetal humano (Fab. Clontech, Heidelberg, Alemania)
y de 5 \mug de ARNm de cerebro de ratón adulto, las bibliotecas
apropiadas de ADNc. Además, se procedió esencialmente de manera
correspondiente a las descripciones del fabricante. Para la
síntesis del ADNc de cadena primaria se empleó un imprimador oligodT
según las descripciones del fabricante. Los fragmentos de ADNc de
doble cadena compatibles con la clonación
(Eco-RI/XhoI) se seleccionaron por su tamaño (según
las descripciones del fabricante/Fab. Stratagene) y se ligaron en
el vector de plásmidos pBluescript SKII (Stratagene). La ligación se
transformó mediante electroporación en E. coli (DH10B,
Gibco) y se amplificó sobre placas de agar
LB-ampicilina. El ADN plásmido se aisló por medio
de lisis alcalina y cromatografía de intercambiador de iones
(QIAfiltro-Kit, Fab. Qiagen, Hilden, Alemania).
La complejidad de clones simples ascendió, para
el banco de ADNc cerebral humano, a 4 millones. De cada banco de
ADNc se analizaron clones simples según el principio de Zusi según
los tamaños de inserto, que mostraron una distribución de tamaños
de 800 bp hasta 4.5 kB, la longitud media de los insertos de ADNc
alcanzó, para el banco humano, aprox. 1,2 kB.
Ejemplo de ejecución
2
ee3_1 se identificó como producto génico
altamente regulado en cerebros de ratones
EPO-transgénicos (líneas-ratón tg6
y tg21).
Los ratones empleados para los experimentos
conformes a la invención se caracterizaron primero repetidas veces
en lo que a su constitución se refiere (Ruschitzka, et al.,
2000, Porc Natl Acad Sci U S A, 97, 11609-13.;
Wagner, et al., 2001, Blood, 97, 536-42.;
Comossner, et al., 2001, J Cereb Blood Flow Metab, 21,
857-64.). Los ratones se fabricaron con una
estructura transgénica por el procedimiento descrito por
(Hergersberg et al., Hum. Mol. Genet. 4,
359-366). Esta estructura consiste en un promotor de
PDGF y la secuencia codificadora para eritropoetina. Se produjeron
además varias líneas transgénicas, de las que se analizaron las tg6
y tg21 presentes. Sólo tg6 ofrecía una expresión de EPO
sistemáticamente elevada, , lo que se probó mediante investigaciones
del suero por el método de Ruschitzka, et al. (2000, Porc
Natl Acad Sci U S A, 97, 11609-13). La línea tg21
no arrojó ningún nivel de EPO sistemáticamente elevado. De manera
análoga a los resultados de Sasahara, et al. (1991, Cell,
64, 217-27.) puede partirse de la base de que el
fragmento de promotor de PDGF empleado produce una expresión de la
EPO transgénica, especialmente en las células neuronales.
En los ratones de la línea tg6, la elevada
expresión sistemática de EPO conlleva un claro aumento de la
eritropoesis, con la consecuencia de una poliglobulia hasta un
hematocrito de 0.8 y un volumen sanguíneo claramente elevado (hasta
4.0 ml) (Wagner, et al., 2001, Blood, 97,
536-42.).
La línea tg21 no presenta, en contraste,
ninguna fuerte peculiaridad fenotípica.
Los productos de ARN, por ejemplo, del gen ee3_1
se expresaron de manera reforzada en el cerebro de ratones, que
sobreexpresan la eritropoietina transgénica (líneas tg6 y tg21
(Ruschitzka, et al., 2000, Porc Natl Acad Sci U S A, 97,
11609-13., Wagner, et al., 2001, Blood, 97,
536-42., Wiessner, et al., 2001, J Cereb
Blood Flow Metab, 21, 857-64.)), y se identificaron
mediante un experimento de selección de ADN. La importancia
fisiológica y patofisiológica de la regulación transcripcional de
ee3_1 mediante la sobreexpresión de EPO se se probó mediante la
situación de otro producto génico regulado, o sea la
alfa-globina. Esta se encuentra asimismo regulada
con ayuda de un análisis de transcripción con microselecciones en
ambas líneas transgénicas. Esto podía comprobarse con ayuda del
sistema Lightcycler (Fig. 2). El aumento se muestra, entre otros, en
los arenales del hipocampo (hibridación in situ).
Ejemplo de ejecución
3
El esquema del marco abierto de lectura de los
genes de la familia ee3 se clonó en un vector eucariota de
expresión habitual de la serie de ADNpc de Clontech (Heidelberg,
Alemania),. Con los plásmidos de expresión así obtenidos se
transfectaron células renales embrionarias humanas (HEK293)
particularmente por el método del calciofosfato, células CHO y
CHO-dhfr por medio de lipofectamina o células COS
por medio de bolitas de DEAE-dextrano y se
seleccionaron con 400-500 mg/ml de G418. Tres
semanas después de la selección se seleccionaron clones
individuales y se expandieron para el análisis ulterior. Se
analizaron aprox. 30 clones mediante los procedimientos
Northern-Blot- y Westeres-Blot. Para
la selección de las células CHO-dhfr transfectadas
en medio libre de nucleótidos se clonó el esquema de lectura
abierto de los genes de la familia ee3 en un vector de expresión
eucariota con el gen de dihidrofolatoreductasa como marcador de
selección y se empleó el plásmido de expresión resultante para la
transfección. Las células CHO-dhfr transfectadas,
pero también otras células transfectadas de este modo, se pueden
tratar con concentraciones crecientes de metotrexato y se trataron
de esta manera, seleccionándose células que expresen elevadas
concentraciones y, por tanto, también concentraciones elevadas de
receptor.
Ejemplo de ejecución
4
En el sistema
yeast-2-hybrid se clonó para la
identificación de participantes potenciales en la interacción de la
parte carboxiterminal de ee3_1 conforme a la invención en el vector
"bait" pGBKT7 (Clontech).
\newpage
\global\parskip0.950000\baselineskip
La secuencia proteica empleada fue:
La correspondiente secuencia de ácidos nucleicos
fue:
La búsqueda de los participantes en la
interacción se efectuó con una biblioteca cerebral humana, es decir,
por los procedimientos estándar familiares al experto (Mating
procedimiento, Fab. Clontech). Se obtuvieron además 2 clones (clon
11 y 36), que contenían las secuencias solapantes.
La secuencia en el clon 11 identificado
fue:
El producto génico interactuante podía
identificarse como RANBPM o RANBP9 (Nishitani H, Hirose E, Uchimura
Y, Nakamura M, Umeda M, Nishii K, Mori N, Nishimoto T (2001)
Full-sized RanBPM cDNA encodes a protein possessing
a long stretch of proline and glutamine within the
N-terminal region, comprising a large proteína
complex. Gene 272:25-33). Asimismo podían
identificarse otras dos proteínas interactuantes, o sea, Map1a y
Map1b. De manera interesante, en ambas proteínas, la parte
carboxiterminal se identificó como interactuante. Allí se encuentra
una zona homóloga en ambas proteínas. Se muestra una alineación de
Map1a y Map1b en esta zona, representando la secuencia superior
Map1a y la inferior Map1b (según datos de salida del software
utilizado):
ALIGN calculates a global alignment of two
sequences
version 2.0uPlease cite: Myers and Miller,
CABIOS (1989) 4: 11-17
- Sequence 1
- 212 aa vs.
- Sequence 2
- 177 aa
scoring matrix: BLOSUM50, gap penalties:
-12/-2
- 43.6% identity:
- Global alignment score: 614
Ejemplo de ejecución
5
Con ayuda de blastos t se determinó otra
secuencia homóloga en Cóntigos AC11406.00015 (según datos de salida
del software utilizado):
>AC011406.00015
Length: 40,820
Minus StrandHSPs:
Score = 389 (136.9 bits), Expect =
1.3e-41, Sum P(3) =
1.3e-41
Identities = 72/303 (71%), Positives = 78/303
(77%), Frame = -1
Sbjct:14312
LLTFEVLLVHRLDGRNTFSCISISVPLWLLLLTLMTTTFRPKRGNH
WWFGIRRDFCQFLL 14253
Sbjct: 14252
EIFPFLREYGNISYDLHQEDSEGAEETLVPEAPKIAPVFGK 14010
Score = 86 (30.3 bits), Expect =
1.3e-41, Sum P(3) =
1.3e-41
Identities = 15/51 (88%), Positives = 16/51
(94%), Frame = -3
\newpage
\global\parskip1.000000\baselineskip
Sbjct: 13992 PGKYVPPPPKLNIDMPD 13942 Score = 67
(23.6 bits), Expect = 1.3e-41, Sum P(3) =
1.3e-41 Identities - 12/57 (63%), Positives - 17/57
(89%), Frame = -2
Sbjct: 14368 Q*RTHVTMAISWITTVIVP 14312
Podía obtenerse el ADNc apropiado, evidentemente
la tradución se origina sólo en un fragmento carboxitermnal,homólogo
a las proteínas ee3.
La comparación de las secuencias con ee3_1_m
tuvo la siguiente apariencia (según datos de salida del software
utilizado):
ALIGN calculates a global alignment of two
sequences
version 2.0u Please cite: Myers and Miller,
CABIOS (1989) 4:11-17
- Sequence 1
- 350 aa vs.
- Sequence 2
- 148 aa
scoring matrix: BLOSUM50, gap penalties:
-12/-2
- 29.4% identity;
- Global alignment score: 649
La generación sólo de un fragmento de GPCR es
segura, ya que las secuencias de ADNc obtenidas coinciden totalmente
con los datos genómicos, y muestran la presencia de un codón de
parada in-frame antes del ATG (véase secuencia)
(según datos de salida del software utilizado):
Minus Strand HSPs:
Score = 6976 (1046.7 bits), Expect = 0.0, Sum
P(2) = 0.0
Identities = 1396/1397 (100%), Positives -
1396/1397 (100%),
Strand = Minus/Plus.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Se encuentra otra secuencia homóloga en cóntigos
de Ensembl Ac034174.
La secuencia proteica de una fracción de
nucleótido homóloga fue:
\vskip1.000000\baselineskip
Se encuentra una secuencia homóloga en el
cromosoma 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
>AC027722.00010 Length: 3,576 Minus Strand
HSPs:
Score = 65 (22.9 bits), Expect = 4.1e+02, Sum
P(2) = 1.0
Identities = 11/90 (37%), Positives = 19/90
(63%), Frame = -1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Sbjct: 1848 RIMSSLNWDSLTSCLPIWMTFISFSCLIAL
1759
Score = 57 (20.1 bits), Expect = 4.1e+02, Sum
P(2) = 1.0
Identities = 16/147 (33%), Positives = 24/147
(49%), Frame = -2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Sbjct: 2507
IGCCFLIVCFVCFVEDQMYVGLQHYFWALYSVPLFCVSVFVPVPCSFSY 2361
Las secuencias de nucleótidos apropiadas para
estas secciones de homología son:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
y
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Evidentemente falta la secuencia de consenso
DRI.
\vskip1.000000\baselineskip
Se encuentra un producto de empalme alternativo
al producto génico humano ee3_1_h, o sea ee3_1b_h (ver Fig. 11B,
número de secuencia 3B). Este se obtiene a partir de un centro de
donación de empalme de consenso en Exon 3, y conlleva un esquema de
lectura abierto modificado ("open reading frame") con términos
carboxílicos modificados, y parada más temprana de la tradución. De
ello se obtiene una proteína (166 aminoácidos, Pm: 19,2 kD), que
corta según el cuarto dominio TM (ver Fig. 15B, número de
secuencia7B). Por otra parte, se identificó otro producto de
empalme alternativo, o sea ee3_1c_h (ver la Fig. 11C, número de
secuencia 3C) con la secuencia proteica perteneciente conforme a la
Figura 15C (número de secuencia 7C), truncada tras el 2º dominio TM.
Los productos de empalme podían identificarse en el curso de las
clonaciones y secuenciaciones con ayuda del procedimiento de
clonación de Shepard et al. (véase el Ejemplo 1).
Una previsión de las zonas TM para ee3_1b_h
tiene el siguiente aspecto (según la salida del software
utilizado):
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Este producto de empalme tiene una importancia
funcional en la regulación de la función de los receptores Vollänge,
compárese, por ejemplo, receptor de V2-Vasopresina-
(Zhu y Wess, 1998, Biochemistry, 37, 15773-84;
Schulz, et al., 2000, J Biol Chem, 275,
2381-9)). Ya que las proteínas GPCR están sujetas a
homo- o heterodimerizaciones (Bouvier, 2001, Nat Rev Neurosci, 2,
274-86.), estas formas truncadas de las secuencias
conformes a la invención pueden desempeñar un papel dominantemente
negativo.
Con ello se muestra conforme a la invención
particularmente el empleo de estas formas de empalme (por ejemplo,
como ADN desnudo, en un vector de expresión conforme a la invención,
como secuencia de proteínas conformes a la invención , etc.) de las
proteínas ee3 conformes a la invención, así como las variantes de
estas formas de empalme para la fabricación de fármacos para el
tratamiento de enfermedades, tal y como se he citado anteriormente.
La revelación comprende asimismo también su empleo para la
investigación de la influenciabilidad farmacológica de lo
receptores de la familia ee3 conformes a la invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo de ejecución
6
Una búsqueda TM(Transmembranria) con el
Programa TMPred origina un modelo muy favorecido (según salida del
software utilizado):
(a) ee3_1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Las distancias de los segmentos entre los
dominios TM ascienden a 15, 7, 27, 10, 34, 20, 13 AS, el radical
intracelular tiene una longitud de 92 AS.
\newpage
(b) para ee3_2 se origina una imagen idéntica
(según salida del software utilizado).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Las distancias de los segmentos entre los
dominios TM ascienden a 15, 0, 33, 10, 34, 20, 16 AS, el radical
intracelular tiene una longitud de 90 AS.
(c) Como experimento de control sirve para la
comparación la topología del receptor CCR-5
(pertenece asimismo a la clase de los receptores 7TM) gracias al
estado actual de la técnica:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Las distancias de los segmentos entre los
dominios TM ascienden a 51, 13, 16, 18, 33, 21 y 17 AS, el radical
intracelular tiene una longitud de 46 AS.
Una comparación de la topología general (se
muestra el número de aminoácidos en las respectivas proporciones
transmembranarias de las proteínas, es decir, término N y término C
y las proporciones en bucle) de los receptores 7TM,
Bradykinin-2, CXCR5, Galanina-2 y
Anafilotaxina C5a, vecinos extraidos origina la siguiente imagen,
en comparación con la ee3_1 conforme a la invención:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Se encuentra una clara similitud de la topología
general en estas proteínas.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo de ejecución
7
Con el empleo del programa Prosite (salida del
software):
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Por lo tanto, se encuentra una posición de
fosforilación de CK2 en la posición 77, una posición de
glicosilación de aspargina en la posición 294 y 2 puntos de
miristilación en las posiciones 57 y 263 (numeración continua
conforme a la Figura 7). No se encuentra ningún punto típico de
fosforilación en el término carboxilico.
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Ejemplo de ejecución
8
Tal y como se mostró en la Fig. 19, ee3_1 se
induce en la rata mediante una única inyección intraperitoneal de
eritropoetina (Erypo, Janssen; 5000 U/kg Peso corporal) en el plano
transcripcional. 6 y 24 h tras la inyección de eritropoetina, se
narcotiza a la rata con inyección de rompun/ketanest terminal, y se
extrae el cerebro con cuidado. Las ratas de control se trataron con
sal común. Para la medición del ARN mensajero de ee3_1 en las ratas
se empleó el PCR-RT semicuantitativo en el
LightCycler (Roche, Mannheim, Germany). La cuantificación se
efectuó mediante la comparación de la fluorescencia relativa de la
muestra con una curva estándar par ciclofilina.
El ARN completo se aisló del cerebro anterior de
las ratas (sin cerebelo y bulbo olfactorio) con el método de
Chomczynski/Sacchi (extracción de fenol ácida) seguida de una
purificación con el equipo de extracción RNeasy conforme a las
instrucciones del fabricante (Qiagen, Santa Clarita, CA., USA). La
concentración de ARN se determinó fotométricamente y se valoró la
calidad de todo el ARN mediante electroforesis en gel de la
agarosa. El ARN se guardó hasta su uso a -80ºC. Tras la
transcripción inversa con Superscript II
(Invitrogen-Life Technologies, Carlsbad, CA, USA)
se cuantificaron relativamente los productos de reacción mediante
Real-time online PCR por medio de la tecnología
LightCycler. Para ello, se emplearon muestras de ARN total del
cerebro de tres ratones salvajes y tres ratones tg6 transgénicos.
Las secuencias específicas de imprimador de oligonucleótidos
significaban para la ciclofilina,
5'ACCCCACCGTGTTCTTCGAC-3' para el imprimador
anterior y 5'CATTTGCCATGGACAAGATG-3' para el
imprimador posterior, a una temperatura de enlace de 60ºC y para el
imprimador anterior de ee3_1 de las ratas
5'-GGTGTGGGAGAAATGGCTTA-3',
imprimador posterior
5'-ATACCAGCAGAGCCTGGAGA-3'.
Para la cuantificación se amplificaron
diluciones de ADNc seriales de 1:3, 1:9, 1:27, 1:81 y 1:243 según el
siguiente esquema: desnaturalización inicial durante 5 min a 94ºC,
amplificación a lo largo de 50 ciclos compuesta por 5s de
desnaturalización a 94ºC, 10s de enlace a 55 ó 60ºC - en función del
imprimador específico(s. o.) - y 30 s de extensión a 72ºC.
al final de cada ciclo se midió la fluorescencia de cada muestra a
80ºC durante 10 s. La especificidad del producto de reacción se
comprobó mediante electroforesis en gel de agarosa y análisis de la
curva de fusión (no mostrado). Cada reacción del PCR produjo
exactamente un producto de reacción.
Para la cuantificación se empleó la fase
logarítmica de la reacción del PCR. Además, la curva apropiada
dispuso una asíntota. Para la hemoglobina se obtuvo un aumento casi
paralelo del haz de rectas, de forma que los aumentos de estas
curvas podían acercarse, en comparación con las curvas estándar para
la ciclofilina. Las desviaciones estándares< de los valores
medios para cada dilución de ADNc se determina a partir del producto
normalizado<del PCR. Las diferencias cuantitativas así obtenidas
corresponden a modificaciones relativas de la expresión del ARN en
animales transgénicos y salvajes. Todas las reacciones conllevan un
único producto de reacción. El factor medio de inducción valió para
ee3 tras 6 horas 1,35, y tras 24 h 1,44-avo.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo de ejecución
9
Por medio de hibridación in situ con una
oligosonda marcada radiactivamente se estudió la localización del
transcriptor de ee3_1 en el ratón. Para ello se hicieron cortes
cerebrales de 15 \mug de espesor con un criostato a -20º, se
colocaron sobre un soporte de objetos recubierto de
poli-L- lisina y se fijaron en un 4% de
paraformaldehído en PBS (f 7.4). el oligonucleótido se marcó
radiactivamente por medio de transferasa terminal (Roche
Diagnostics, Mannheim) con
a-35S-dATP. La marcación se efectuó
como hibridación adyacente por un protocolo de Wisden & Morris
(in situ-hibridization protocols for the brain, Academic
Press 1994).
Con la sonda marcada radiactivamente empleada
(ee3_1.3as AACGAAGGGCCAGDÍACACAGAGAACAGCAG
CAGACAGGCADÍAATGAGG) podía hacerse ver la expresión de ee3_1 en el cerebelo(Ce), hipocampo (Hc), giro dentado (dg), y en el córtex (co), particularmente en el córtex entorhinal (ent), en el bulbo olfatorio (olf). Un control sensorial apropiado (ee3_1.3s,CCTCATCTATGCCTGTCTGCTGCTGTTCTCTGTGCTACTGGCCCTTCGTT) no originó ninguna señal específica (no mostrado) (Fig. 20).
CAGACAGGCADÍAATGAGG) podía hacerse ver la expresión de ee3_1 en el cerebelo(Ce), hipocampo (Hc), giro dentado (dg), y en el córtex (co), particularmente en el córtex entorhinal (ent), en el bulbo olfatorio (olf). Un control sensorial apropiado (ee3_1.3s,CCTCATCTATGCCTGTCTGCTGCTGTTCTCTGTGCTACTGGCCCTTCGTT) no originó ninguna señal específica (no mostrado) (Fig. 20).
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Ejemplo de ejecución
10
Se cortaron tejidos embebidos en parafina (2
\mug), se colocaron sobre soportes de objetos pretratados (DAKO,
Glostrup, Dinamarca), se dejaron secar al aire toda la noche y, a
continuación, se desparefinaron (xilol y serie alcohólica
decreciente). Tras un tratamiento de microondas en tampón de citrato
a 500W durante 10 min se incubaron los cortes con antisuero de
ee3_1(AS4163) en una dilución de 1:500 durante1 h a
temperatura ambiente en una cámara húmeda. La reacción inmune se
hizo visible mediante la técnica ABC con DAB como cromogen,
correspondientemente a las descripciones del fabricante (DAKO,
Glostrup, Denmark). Los controles negativos contienen igualmente
cortes tratados, en los que, sin embargo, sólo se ha omitido el
anticuerpo primero, así como cortes, en los que, en vez del primer
anticuerpo, se empleó el serum preinmune apropiado.
Los resultados de las coloraciones
inmunhistoquímicas se representan en la Fig. 22. En conjunto, se
muestra una localización de ee3 considerablemente específica de las
neuronas, a excepción de algunas estructuras en intestino y pulmón.
Frecuentemente se expresa ee3 de neuronas con dianas integradoras
(las grandes células piramidales de la capa cortical (Layer) V,
células mitrales en el bulbo olfatorio, células de Purkinje en el
cerebelo). Las imágenes A-C muestran localizaciones
corticales de ee3 en la capa V, con clara tinción de las apófisis
neuronales. En el córtex entorhinal puede verse una inmunocoloración
más intensiva (C). desde el punto de vista fisiológico, del córtex
entorhinal parten informaciones al hipocampo y contribuyen al
aprendizaje y memoria.
Las alteraciones del córtex entorhinal se
encuentran frecuentemente en pacientes con apoplejía, alzheimer o
tras trauma craneoencefálico. Mediante alteraciones del córtex
entorhinal pueden aparecer alteraciones comportamentales, que
engloban procesamiento ausente de impresiones sensoriales y
dificultades de aprendizaje. (Davis et. Al, Sólos Res 50 (2)
77-85 (2001)). Las imágenes D-F
muestran la muestra de distribución hipocampal de ee3. Además, es
evidente el nítido límite entre la expresión en el sector CA3, y la
expresión ausente en los sectores CA2 y CA1. Las neuronas de la
región CA1 y, en menor medida, también de la región CA4 son
especialmente sensibles a la necrosis y muerte celular libre de
inflamación (apoptosis), particularmente cuando existe un daño
nervioso central general (por ejemplo, (Hara, et al.,
Stroke, 31, 236-8, (2000)). En contraste a esto, el
giro dentado parece estar afectado más bien por un daño necrótico.
El giro dentado se pone en contacto con la nueva formación de
neuronas tras estímulo patológico (Takagi, et al., Brain Res,
831, 283-7, (1999)) (parent, et al., J
Neurosci, 17, 3727-38, (1997)). En ámbitos de
génesis no neocortical se encuentra asimismo ee3: en el cerebelo en
las células de Purkinje (G,H), que actúan allí como neurona
integradora, y en el bulbo olfatorio en las células de Mitral
(I,J). una expresión intensiva de ee3 se encuentra en las células de
los ganglio y en las células de los sentidos de la retina
(K, L).
(K, L).
Brevemente se mostró el efecto neuroprotector de
la eritropoetina en la retina (Junk et al., Erythropoietin
administration protects retinal neurons from acute
ischemiareperfusion injury. Porc Natl Acad Sci U S A. 2002 Aug 6;
99(16):10659-64.; Grimm et al.,
HIF-1-induced erythropoietin en the
hypoxic retina protects against light-induced
retinal degeneración. Nat Med. 2002 Jul;
8(7):718-24.) Estos dictámenes se basan en
que existe un contexto entre la inducción de Eloy la expresión de
ee3. ee3 es asimismo fuertemente expresada en las neuronas que
pertenecen al sistema motor. Así se encuentra en la médula espinal
una expresión específica en las grandes neuronas motoras del
telencéfalo (Fig. 22 M) y en las neuronas funcionalmente
equivalentes el núcleo motor del núcleo trigémino (Fig.. 22 N).
Esta distribución de ee3 en la médula puede
aprovecharse posiblemente para la intervención terapéutica y
diagnóstica en esclerosis lateral amiotrófica. La esclerosis
lateral amiotrófica (WIE; Lou-Gehrig's disease;
Charcot'sche Krankheit) es una enfermedad neurodegenerativa con una
incidencia anual de 0.4 a1.76 por 100.000 (Adams et al.,
Principles of neurology, 6th ed., Nueva York, pág.
1090-1095). Es la forma más frecuente de
enfermedades de las neuronas motoras con manifestaciones típicas
como fasciculaciones generalizadas, atrofia y debilitamiento
progresivos de la musculatura esquelética, espasticidad y signos
positivos del tracto piramidal, disartria, disfagia y disnea. La
patología consiste principalmente en la pérdidas de células
nerviosas en el cuerno anterior de la médula espinal y en los
núcleos motores del tronco cerebral, aunque puede afectar también a
las motoneuronas de primer ordenen el córtex. La patogénesis de
esta enfermedad es, en gran medida, desconocida, aunque el papel de
las dismutaciones del superóxido se cincelaba muy bien en casos
familiares. Hasta ahora se describieron más de 90 mutaciones en
la< proteína SOD1, que pueden disolver ALS (Cleveland and
Rojohstein (2001), Nat Rev Neurosci, 2, 806-19.).
También los neurofilamentos parecen jugar un papel en esta
enfermedad. La excitotoxicidad, un mecanismo activado por un exceso
de glutamato, es otro factor patogenético, lo que puede justificarse
mediante el efecto del aceite de ricino en los pacientes humanos.
La activación de las caspasas y apoptosis parece ser el recorrido
final de la patogénesis de las ALS (Ishigaki, et al. (2002),
J Neurochem, 82, 576-84. , Li, et al.
(2000), Science, 288, 335-9.). La localización de la
proteína ee3 en las neuronas afectadas por ALS muestra
evidentemente la aplicabilidad terapéutica/diagnóstica potencial de
los agonistas o antagonistas de ee3 en esta
enfermedad.
enfermedad.
La localización de ee3 en la sustancia negra del
cerebro medio (Fig. 22 O,P) abre posiblemente posibilidades
terapéuticas y diagnósticas en el parkinson mórbido. La enfermedad
de Parkinson es la enfermedad motriz más frecuente.(movement
disorder) con más o menos 1 millón de pacientes en norteamérica.
Aprox. Un 1% de la población por encima de los 65 años está
afectado. Los principales síntomas son rigor, temblor, aquinesia
(Adams et al., Principles of neurology, 6th ed., New York,
pp 1090-1095). La causa de la enfermedad es
desconocida. A pesar de todo, los análisis de tejidos
post-mortem y de modelos animales remiten a
un proceso progresivo de estrés oxidativo en la sustancia negra,
que podría mantenerla neurodegeneración por dopamina. El estrés
oxidativo, que puede producirse por las neurotoxinas como
6-hidroxidopamina y MPTP
(N-metil-4-fenil-1,2,3,6-tetrahidropiridina),
se empleo en modelos animales, para estudiar la operación de la
neurodegeneración. Aunque exista una terapia sintomática (p.e.
L-DOPA más un inhibidor de la descarboxilasa;
bromocriptina, Pergolid como dopamina agonistas y sustancias
anticolinérgicas como el tritrihexifenidil (Artane)), hay una clara
necesidad de una terapia causal, es decir, neuroprotectora, que
pueda detener el proceso de la enfermedad. Los mecanismos
apoptóticos contribuyen evidentemente a la patogénesis en el modelo
animal, así como en las seres humanos (Mochizuki, et al.
(2001), Porc. Natl. Acad. Sci. U S A, 98, 10918-23,
Xu et al. (2002), Nat. Med., 8, 600-6,
Viswanath, et al. (2001), J. Neurosci., 21,
9519-28, Duromann, et al. (2002), Neurology,
58, 308-10).
La localización de ee3 en el sistema nervioso
resulta, en gran medida, evidente para un contexto entre la
expresión de estas proteínas y y la muerte celular neuronal,
neurogénesis y plasticidad neuronal.
En el pulmón se encuentra ee3 en distintas
estructuras (Fig. 22 Q-V). Se descubren células
basales en los bronquiolos terminales, que expresan ee3.
Posiblemente se trata además de células neuroendocrínamente activas.
Esta localización supone una importancia terapéutica para ee3 en
enfermedades bronquiales. Hay asimismo una expresión n de los
endotelios y células musculares lisas de los arteriolos (12 U, V).
En contraste con esto, los venoles no muestran ninguna expresión
inmunohistoquímicamente comprensible de ee3 (Fig. 22 Q y R). La
expresión de determinados receptores mediante células endoteliales
es de mayor importancia farmacológica, ya que hay en la sangre
contacto terapéutico inmediato con esta capa celular. Importantes
medicamentos efectivos para la circulación sanguínea afectan a los
arteriolos, particularmente del endotelio o de la musculatura lisa.
En consecuencia, ee3 es una proteína diana muy atractiva para la
influencia sobre enfermedades circulatorias, por ejemplo, la alta
presión
arterial.
arterial.
En el intestino, se encuentra ee3 basal en las
criptas (Fig. 22 W, X) y en células nerviosas que pertenecen
presumiblemente al plexo intestinal (Fig. 22 Y). En la mayoría de
órganos analizados histológicamente no se encuentra ninguna tinción
específica de células organoespecíficas, sino sólo una clara tinción
de nervios (véase, por ejemplo, en el músculo cardíaco Fig. 22 AA,
o en el tejido conjuntivo Fig. 22 Z). Esta clara localización de
ee3 en axonas predispone la molécula para el diagnóstico y terapia
de enfermedades de los nervios periféricos (neuropatías), a las que
pertenece, por ejemplo, la polineuropatía diabética ampliamente
difundida Asimismo podrían aprovecharse enfermedades hereditarias
frecuentes del sistema nervioso periférico, por ejemplo, el grupo
HMSN (hereditary motor-sensory neuropathies) de
éste. En el esqueletomúsculo se encontró finalmente una muestra de
expresión, que ha de compatibilizarse a placas motoras finales (Fig.
22 BB). Esto es potencialmente interesante para enfermedades de la
placa final motora, por ejemplo, de la miastenia grave.
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Ejemplo de ejecución
11
Mediante la inmunohistoquímica (antisuero AS)
podía demostrarse también la claramente alta regulación de la
proteína ee3 por eritropoetina (Fig. 23). Los cortes paralelamente
tratados del ZNS presentan señales claramente reforzadas para ee3.
Esto se puede mostrar, en total, en 3 ratones (salvajes y
sobreexpresores de EPO (tg6)), que cegado, en cada caso, se
colorearon frente al genotipo y se valoraron.
\newpage
Ejemplo de ejecución
12
En un cribado
yeast-two-hybrid con el término
carboxílico de ee3_1 se identificaron las cadenas ligeras de map1a
y map1b como proteínas interactuantes (véase ejemplos previos,
Ejemplo de ejecución 4). La figura 24 muestra una
inmunofluorescencia doble para ee3_1 y map1b en el ratón, y
demuestra un solapamiento inesperado de la expresión de ee3_1 y
map1b en el ratón.
Para coloraciones de inmunofluorescencia doble
se incubaron cortes emparafinados tras el tratamiento por microondas
(tampón de citrato, 500W, 10 min) simultáneamente con el anticuerpo
de ee3_1 del caniche (AS4163) y un anticuerpo contra map1a de cabra
(MAP-1B (C20): sc-8971; Santa Cruz;
Santa Cruz, USA) durante 1hora a temperatura ambiente en una cámara
húmeda. Tras los apropiados pasos de lavado se incubó con una mezcla
de anticuerpo secundario FITC anti-canichey TRITC
anti-cabra durante30 min (ambos anticuerpos, en cada
caso, 1:30 diluido en PBS, relativo de Dianova, Hamburgo,
Alemania). Tras el lavado renovado de los cortes con PBS se taparon
los preparados con Histosafe y se analizaron en un microscopio de
fluorescencia (Olympus IX81, Olympus, Alemania) con empleo del
filtro de barrera apropiado. Los solapamientos de señales se
produjeron con ayuda del Software Analysis (soft imaging systems,
Stuttgart, Alemania). Las coloraciones únicas de fluorescencia en
paralelo muestran, en cada caso, la ausencia de señal en el otro
canal, lo que engloba el fenómeno del "sobreradiado " de
señales en el, en cada caso, otro canal, por ejemplo, mediante
insuficiencia del filtro. Se origina asimismo una doble coloración
con cromóforos cambiados para el anticuerpo segundo la misma imagen
(no mostrada).
La Figura 24 muestra una coincidencia
sorprendente de la localización de ambas proteínas en el ZNS. verde:
coloración de ee3_1; Rojo: coloración de Map1b; Amarillo:
solapamiento electrónico de ambas señales. Se muestran ejemplos de
la médula espinal (spinal cord; sc) y del cerebelo (cb).
Map1b es una importante proteína neuronal. Es
una de las primeras "microtubules associated proteins" (maps)
-proteínas asociadas a los microtúbulos "PAMTs"- , expresadas
durante el desarrollo del sistema nervioso central de los
mamíferos. Es probable una participación en la axonogénesis en las
neuronas (Gonzalez-Billault, et al. (2001),
Mol Biol Cell, 12, 2087-98., Gonzalez- Billault,
et al. (2002), Brain Res, 943, 56-67.). Un
papel funcionalmente importante de map1b para la interacción de las
neuronas está amparada por los últimos estudios, que muestran que
map1b está involucrada en la patogénesis del síndrome X frágil. Esto
es la forma más frecuentemente heredable de retraso mental. el ARNm
es controlado por la FMRP, una proteína, regulada directamente por
el ARNm X frágil. En un trabajo en Drosofila se encontró un papel
central para map1b (desaparecida en Drosofila) para el desarrollo
del fenotipo análogo al X frágil (Sohn (2001), Science, 294, 1809. ,
Zhang, et al. (2001), Cell, 107, 591-603.).
map1b se liga asimismo a la gigaxonina, una proteína cuyo gen
mutante es responsable de la enfermedad hereditaria recesiva Giant
axonal neuropathy (GAN) (Ding, et al. (2002), J Cell Biol,
158, 427-33.). tras la lesión de los nervios
periféricos se induce map1b de manera reforzada en las neuronas que
maduran de los nervios mielinizados, y contribuye probablemente a la
germinación axonal (Soares, et al. (2002), Eur J Neurosci,
16, 593-606.). Finalmente, map1b localiza
probablemente al receptor de GABA-C en su
localización sináptica (Pattnaik, et al. (2000), J Neurosci,
20, 6789-96.).
El gen Map1b se inactivó genéticamente en los
ratones (knock-out). El mejor
Knock-out disponible es el ratón descrito en
Meixner et al. (Meixner, Haverkamp, Wassle, Fuhrer,
Thalhammer, Kropf, Bittner, Lassmann, Wiche and Porpst (2000), J
Cell Biol, 151, 1169-78.). Se estudió
immunhistoquímicamente la expresión de ee3 de ratones con
inactivación homocigótica del gen. Se mostró una muy fuerte/muy
débil coloreabilidad de ee3_1 (Figura 25), lo que indica una
dependencia de la expresión o proteica de ee3_1 o estabilidad de la
interacción con map1b. Un inhibidor de esta interacción tendría
como consecuencia una expresión claramente reducida de ee3.
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Ejemplo de ejecución
13
La secuencia proteica de la proteína ee3_1
humana se analizó con el programa parcial Protean del paquete de
programas ADNStar (Lasergene) y correspondientemente a la previsión
secundaria, así como alta probabilidad superficial citada
previamente y alta antigenicidad el epítope LHHEDNEETEETPVPEP
colocada en el término C intracelular correspondientemente a los
aminoácidos 299-315. Esta secuencia peptídica se
sintetizó con cisteína adjunta N-terminalmente
(CLHHEDNEETEETPVPEP), para facilitar un acoplamiento específico
controlado a la proteína de soporte KLH (keyhole limpet
hemocyanine). Con el conjugado péptido-KLH se
inmunizaron dos caniches según un plan optimizado. La síntesis
peptídica, el acoplamiento adyacente a KLH, así como la inmunización
de dos caniches fueron aplicadas por la empresa BiotTrend
Chemikalien GmbH. Antes de la inmunización única se examinó la
reactividad cruzada del suero primario de varios caniches por
análisis de WesternBlot de células transfectadas de pega y
extractos cerebrales. Dos caniches con antecedentes negligibles
contuvieron, 3 semanas tras la inmunización única, el imprimador y,
otras 4 semanas más tarde, el segundo impulso. Una semana después se
extrajeron 20 ml de sangre a los caniches y se examinaron los
sueros en análisis de Western Blot y coloraciones
inmunocitoquímicas de células transientemente transfectadas
(HEK293, CHO-dhfr-).tras el 3º y/o 4º impulso se
desangraron los
caniches.
caniches.
Los sueros de ambos caniches fueron positivos.
Particularmente el antisuero AS4163 reconoció con ambos métodos muy
específicamente en diferentes células la proteína ee3_1 humana
transientemente expresada y podía emplearse en análisis de Western
Blot. El antisuero AS4163 sirve también para la inmunoprecipitación
de proteína ee3_1 y puede emplearse, por tanto, para la
precipitación de ee3_1 y, por tanto,de proteínas interactuantes de
células o tejidos nativos transfectados. El antisuero AS4163
reconoce particularmente el epítope apropiado en la secuencia de
ee3_1 del ratón, que sólo se distingue de la secuencia humana por un
aminoácido, o sea la mutación de N304 a serina. El antisuero AS4163
sirve, por tanto, muy bien para el análisis immunhistoquímico de la
expresión proteica de ee3_1 en ratones salvajes, transgénicos
knock-out, tal y como muestran las Figuras
22-24.
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Ejemplo de ejecución
14
Se aislaron células madres neuronales del
hipocampo de ratas Wistar humanas de 4-6 semanas de
edad, tal y como se ha descrito anteriormente (Ray et al.,
1993). Los protocolos satisfacen el derecho alemán. Los animales se
intoxicaron con un 1% (v/v) de isoflurano, 70% de N_{2}0, 29% de
oxígeno y murieron decapitados. Los cerebros se prepararon y
lavaron en 50 mL de Dulbecco's Phosphate Buffered Saline congelado
(DPBS) con 4.5 g/L de glucosa (DPBS/Glc). El hipocampo se extrajo
médicamente de 6 animales, se lavó en 10 mL de DPBS/Glc y se
centrifugó durante 5 min a 1600 x g a 4ºC. tras la reducción del
exceso se homogenizó el tejido con tijeras y escalpelo. Los
fragmentos de tejidos se lavaron con medio DPBS/Glc, se
centrifugaron 5 min a 800 g, y se resuspendió el pellet en un
0.01% (w/v) de papaína, 0.1% (w/v) de Dispase II (proteasa neutra),
0.01% (w/v) de DNase I, y 12.4 mM de Sulfato de manganeso en Hank's
Balanced Salt Solución (HBSS). El tejido se trituró con puntas de
pipeta, y se incubaron 40 min a temperatura ambiente, con mezcla
ocasional de la disolución (cada10 min). La suspensión se
centrifugó, a continuación, a800 x g durante 5 min a 4ºC, y se lavó
el pellet tres veces en 10 mL de medio DMEM-Ham's
F-12 con 2 mM de L-glutamina, 100
uds/mL de penicilina y 100 uds/mL de estrepotomicina.
Posteriormente se resuspendieron las células en 1 mL de medio
neurobasal con B27 (Invitrogen, Carlsbad, CA., USA), 2 mM de
L-glutamina, 100 uds/mL de penicilina y 100 uds/mL
de estrepotomicina, 20 ng/mL de EGF, 20 ng/mL de
FGF-2, y 2 \mug/mL de heparina. Las células se
diseminaron en condiciones estériles en placas de 6 orificios en
una concentración de 25,000-100,000 células/mL. Las
placas se incubaron a 37ºC en un 5% de CO_{2}. el medio de
cultivo celular se cambió una vez a la semana, recambiándose aprox.
sólo 2/3 del medio. (Ref: Ray J, Peterson YA QUE, Schinstine M,
Gage FH (1993) proliferation, differentiación, and
long-term culture of primary hippocampal neurons.
Porc Natl Acad Sci U S A 90: 3602-6.).
A el ARN se le aisló según protocolos estándar
(RNeasy kit, Qiagen) de células madre hipocampales, que se
mantuvieron en cultivo durante 3 semanas, después de que se
descongelaran de stocks congelados. El ADNc se sintetizó con empleo
de imprimadores oligodT y Superscript II Reverser transcriptasa
(Gibco) según protocolos estándar. El PCR se efectuó con los
siguientes parámetros de reacción:
Desnaturalización 94ºC 10 min, 30 ciclos hasta
94ºC 30 s, 55ºC 50 s, 72ºC 60 s; 72ºC 5 min 4ºC con los siguientes
pares de imprimadores: ee3_plus
5'-GGTGTGGGAGAAATGGCTTA-3' y
ee3_minus
5'-ATACCAGCAGAGCCTGGAGA-3'.
Durante los últimos años se reconoció la
importancia de la neoformación de células nerviosas (neurogénesis)
en el desarrollo de las enfermedades neurológicas. Al contrario de
muchos otros tejidos, el cerebro maduro tiene limitadas capacidades
regenerativas, y el inhabitualmente alto grado de especialización
celular encierra las posibilidades de asumir la función del tejido
destruido mediante el tejido que permanece sano. Las células
nerviosas, producidas en el cerebro adulto a partir de precursores
tienen, sin embargo, en principio, el potencial de asumir
estas
funciones.
funciones.
La neurogénesis aparece en regiones discretas
del cerebro adulto, (la zona facial subventricular (SVZ) del
ventrículo facial y la zona subgranular (SGZ) en el giro dentado
(DG). Muchos grupos muestran que la neurogénesis es inducida
particularmente por daños neurológicos (por ejemplo, isquemia
cerebral (Jin, et al. (2001), Porc. Natl. Acad. Sci. USA,
98, 4710-5, Jiang, et al. (2001), Stroke, 32,
1201-7, Kee, et al. (2001), Exp. Brain.
Res., 136, 313-20, Profilieva, et al. (2001),
J. Cereb. Blood Flow Metab., 21, 211-7)). La
neurogénesis aparece también en las seres humanos (Eriksson, et
al. (1998), Nat Med, 4, 1313-7.), y conlleva
realmente neuronas funcionales (van Praag, et al. (2002),
Nature, 415, 1030-4). Particularmente la zona
subgranular del giro dentado y del hilo tienen el potencial de
generar nuevas neuronas durante la vida adulta (Gage, et al.
(1998), J Neurobiol, 36, 249-66). Resulta llamativo
que ee3 pueda detectarse en células madre neuronales del hipocampo
(Fig. 25). Esto implica una gran importancia de ee3 para la
neurogénesis. Esta importancia en la neurogénesis significa otra
demostración de la utilidad de ee3 para generalmente todas las
enfermedades neurodegenerativas.
En comparación con el efecto de las células
endógenas de variedad en el cerebro, se pueden terapéuticos, que
interfieren con ee3 para la manipulación in Vitro de células
de variedad (por ejemplo, diferenciación y proliferación in
vitro). Las células de variedad se exploran en el momento para
su empleabilidad en enfermedades neurodegenerativas, la enfermedad
de Parkinson y apoplejía. Es, por ejemplo, deseable, diferenciar las
células in vitro para el transplante en pacientes con
Parkinson, y, para ello, compensar el déficit de dopamina tras la
inyección ("replacement therapy") (Arenas (2002), Brain Res.
Bull, 57, 795-808, Barker (2002), Mov. Disord., 17,
233-41). Otra posibilidad para la inserción de
células de variedad son, por ejemplo, inyecciones intraarteriales o
intravenosas en caso de apoplejía o conmoción cerebral (Mahmood,
et al. (2001), Neurosurgery, 49, 1196-203;
discussion 1203-4, Lu, et al. (2001), J
Neurotrauma, 18, 813-9, Lu, et al. (2002),
Cell Transplant, 11, 275-81, Li et al.
(2002), Neurology, 59, 514-23). Otra posibilidad de
empleo de ee3 en la terapia celular de variedad sería la
fabricación de células, que secreten constantemente un agonista o
antagonista para ee3.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo de ejecución
15
Se podían clonar miembros adicionales de la
familia de proteínas ee3, debido a los criterio de homología
conformes a la invención. Con TBLASTN se examinaron bancos de datos
EST con secuencias de proteínas de la proteína ee3_1 humana. Se
encontraron además ESTs de X. laevis (rana africana de
uñas)y de D. rerio (Zebrafisch). Estos ESTs se secuenciaron
con procedimientos estándar, y se obtuvieron las siguientes
secuencias (se muestra la salida del software utilizado):
secuencia de longitud total de xl_ee3
(Xaenopus laevis):
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Marco abierto de lectura ("open reading
frame") de xl_ee3:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
y la secuencia proteica de
xl_ee3:
para D. rerio son estas
secuencias
(dr_ee3):
El marco abierto de lectura de dr_ee3 ("open
reading frame"):
y la secuencia proteica de
dr_ee3:
La Figura 27 aclara una vez más la conservación
altamente evolucionaria de la familia ee3 con ayuda de ambas
proteínas de X. laevis y D. rerio.
Claims (16)
1. Ácido nucleico, caracterizado porque
se codifica para un polipéptido conforme a una de las Figuras 13 o
15A, o para variantes de éste, que tengan en el plano de
aminoácidos al menos un 90% de la identidad respecto a un
polipéptido conforme a una de las Figuras 13 o 15A, excepto un ácido
nucleico conforme a la SEC ID NO:75 de la WO01/98353.
2. Ácido nucleico según la Reivindicación 1,
caracterizado porque contiene una secuencia conforme a una de
las Figuras 9A o 11 A para el dominio traducido (en
mayúsculas).
3. Vector de expresión, caracterizado
porque contiene una secuencia de ADN según al menos una de las
reivindicaciones 1 o 2.
4. Célula huésped, caracterizada por
estar transformada con un vector de expresión según la
Reivindicación 3.
5. Célula huésped según la Reivindicación 4,
caracterizada por ser una célula mamaria, particularmente una
célula humana.
6. Producto génico purificado,
caracterizado porque se codifica mediante una secuencia de
ADN según al menos una de las reivindicaciones 1 o 2, excepto un
polipéptido conforme a la SEC ID NO:31 de la WO01/98353.
7. Producto génico purificado según la
Reivindicación 6, caracterizado porque es un polipéptido.
8. Animal transgénico no-humano,
caracterizado porque le falta su polipéptido
ee3-1 nativo conforme a la Reivindicación 7 o
partes del mismo.
9. Anticuerpo, caracterizado porque
reconoce un epítope de un producto génico según al menos una de las
reivindicaciones 6 o 7.
10. Anticuerpo según la Reivindicación 9,
caracterizado porque es monoclonal.
11. Anticuerpo según al menos una de las
reivindicaciones 9 o 10, caracterizado porque está dirigido
contra una fracción de secuencia del dominio extracelular como
epítope.
12. Procedimiento para la expresión de productos
génicos según al menos una de las reivindicaciones 6 o 7,
caracterizado porque las células huésped se transforman con
un vector de expresión según la Reivindicación 3.
13. Procedimiento para el aislamiento de
productos génicos según al menos una de las reivindicaciones 6 o 7,
caracterizado porque las células huésped según la
Reivindicación 4 o 5 se cultivan en condiciones apropiadas,
favorecedoras de la expresión y el producto génico se limpia, a
continuación, del cultivo.
14. Ácido nucleico según al menos una de las
reivindicaciones 1 o 2 o un producto génico según al menos una de
las reivindicaciones 6 o 7 como fármaco.
15. Ácido nucleico según al menos una de las
reivindicaciones 1 o 2 o producto génico según al menos una de las
reivindicaciones 6 o 7 para el tratamiento de enfermedades
neurológicas.
16. Procedimiento para la identificación de un
participante de la interacción celular de un polipéptido, codificado
por un ácido nucleico según al menos una de las reivindicaciones 1
o 2, empleándose un denominado sistema
"yeast-two-hybrid".
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