ES2364266T3 - Anticuerpo humanizado hacia el factor tisular humano (tf) y procedimiento para construir el anticuerpo humanizado. - Google Patents

Anticuerpo humanizado hacia el factor tisular humano (tf) y procedimiento para construir el anticuerpo humanizado. Download PDF

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Abstract

Un procedimiento de preparación de un anticuerpo humanizado natural que tiene regiones determinantes de la complementariedad (CDRs) derivadas de anticuerpos no humanos y una región estructural (FR) derivada de un anticuerpo humano natural y que tiene una inmunogenicidad reducida, y dicho método comprende las etapas de: (1) preparar un anticuerpo monoclonal no humano que responde a un antígeno de interés; (2) preparar una diversidad de anticuerpos humanos que tienen una homología elevada con las secuencias de aminoácidos de las FRs de los anticuerpos monoclonales del punto (1) anterior; (3) sustituir las cuatro FRs del anticuerpo monoclonal no humano del punto (1) anterior con las FRs correspondientes del anticuerpo humano del punto (2) anterior para generar un primer anticuerpo humanizado; (4) determinar la capacidad del anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior para unirse al antígeno o para neutralizar una actividad biológica del antígeno; (5) sustituir una a tres FRs del anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior con las FRs correspondientes del anticuerpo humano que son diferentes de las usadas en el punto (3) entre los anticuerpos humanos preparados en el punto (2) para generar el segundo anticuerpo humanizado; (6) comparar la capacidad del segundo anticuerpo humanizado generado en el punto (5) anterior y del primer anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior en función de la capacidad de unirse al antígeno o de neutralizar la actividad biológica del antígeno, por lo que se selecciona un anticuerpo humanizado que tiene una actividad favorable; (7) llevar a cabo las etapas anteriores de los puntos (3) a (6) para el anticuerpo humanizado seleccionado en el punto (6) anterior; y (8) repetir las etapas anteriores de los puntos (3) a (6) hasta que se obtiene un anticuerpo humanizado que tiene una actividad equivalente al anticuerpo monoclonal no humano del punto (1) anterior.

Description

Campo Técnico
La presente descripción se refiere a un anticuerpo quimérico humano/de ratón que comprende la región variable (región V) de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia el factor tisular humano (TF) y la región constante (región C) de un anticuerpo humano; un anticuerpo humanizado en el que las regiones determinantes de la complementariedad (CDRs) de la región V de la cadena ligera (cadena L) y la región V de la cadena pesada (cadena H) de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano se han injertado en un anticuerpo humano; la cadena L y la cadena H de dicho anticuerpo; y un fragmento de la región V que constituye la cadena L o la cadena H de dicho anticuerpo. La presente descripción se refiere además a un procedimiento para la producción de un anticuerpo humanizado hacia TF humano.
La presente descripción se refiere además al ADN que codifica el anticuerpo anterior, específicamente un fragmento de la región V del mismo, y al ADN que codifica una cadena L o una cadena H que contiene una región V. La presente descripción se refiere además a un vector recombinante que comprende dicho ADN, y a un hospedador transformado con dicho vector.
La presente descripción se refiere además a un procedimiento de preparación de un anticuerpo quimérico y un anticuerpo humanizado hacia TF humano. La presente descripción se refiere además a una composición farmacéutica y a un agente terapéutico para el síndrome de coagulación intravascular diseminada (CID) que comprende como ingrediente activo un anticuerpo humanizado hacia TF humano.
Técnica Antecedente
El factor tisular (TF), un receptor del factor VII de la coagulación expresado en la superficie celular, desempeña un papel indispensable en la activación de los factores IX y X de la coagulación por medio de la formación de un complejo con el factor VII de la coagulación, y se ha definido como un factor iniciador factible de las reacciones de la coagulación sanguínea.
Se sabe que TF se expresa en los fibroblastos, las células musculares lisas, etc., que constituyen el vaso sanguíneo, y que desempeña una función hemostática activando el sistema de la coagulación al lesionarse el vaso sanguíneo.
La CID es una enfermedad en la que la activación del sistema de coagulación en un vaso sanguíneo conduce a la aparición sistémica múltiple de coágulos sanguíneos, principalmente en la microvasculatura. No es infrecuente que la reducción de plaquetas y de factores de coagulación debida a su consumo conduzca a hemorragias, que son el fenómeno opuesto a la coagulación sanguínea. Los microtrombos múltiples pueden provocar una microcirculación deficiente en los órganos principales, que, una vez desarrollada, conduce a una deficiencia funcional irreversible y a un mal pronóstico de la CID, y en este sentido la CID se considera una enfermedad importante.
La incidencia de enfermedades subyacentes estimada a partir de los informes de investigación de 1990 y 1992 del Ministerio de Salud y Bienestar, de la Encuesta y Grupo de Estudio de Trastornos de la Coagulación Sanguínea y Enfermedades Específicas, es: neoplasias malignas hematológicas, alrededor del 30%; tumores sólidos, alrededor del 20%; infecciones, alrededor del 15%; enfermedades del embarazo, alrededor del 10%; enfermedades hepáticas, alrededor del 6%; choques, alrededor del 5%; y enfermedades cardiovasculares, alrededor del 3%. La incidencia de CID se eleva hasta alrededor del 15% en la leucemia y alrededor del 6 al 7% en el linfoma maligno, y alrededor del 3% en los tumores sólidos.
La CID se desarrolla acompañada por diversas enfermedades mencionadas anteriormente, pero su agente causal es el mismo, es decir, el TF. Así, se cree que el mecanismo de inicio de la CID es: la formación y/o la expresión anormalmente elevada de TF en las células cancerosas en la leucemia aguda, el linfoma maligno, y los tumores sólidos; la formación y/o expresión incrementada de TF en los monocitos y/o las células endoteliales en las infecciones (en particular, la septicemia provocada por bacilos gramnegativos); el flujo de TF hacia la sangre desde el tejido hepático necrosado en la hepatitis fulminante; la expresión de TF en la luz del vaso sanguíneo en el aneurisma aórtico, el aneurisma cardiaco, y el hemangioma gigante; y también el flujo TF hacia la sangre en las enfermedades del embarazo (embolismo de liquido amniótico y abruptio placentae) y en procedimientos quirúrgicos, lesiones y quemaduras.
El tratamiento de las enfermedades originales (subyacentes) es de sumo interés, lo que, sin embargo, no es sencillo en términos prácticos.
Como método actual de tratamiento de la CID, se está usando la terapia anticoagulante y la terapia de sustitución. Se usan principalmente preparaciones de heparina (heparina fraccionada, heparina de bajo peso molecular) para la terapia anti-coagulante. También se usan inhibidores de proteasas sintéticos (mesilato de gabexato, mesilato de nafamostat) y plasma concentrado (preparaciones de anti-trombina III, proteína C activada). Como terapia de sustitución, hay concentrados de plaquetas, plasmas recientes congelados (suministro de fibrinógeno), eritrocitos lavados, y similares.
Sin embargo, los agentes terapéuticos actuales no son satisfactorios en cuanto a la eficacia y los efectos secundarios, y en la mayoría de los casos es imposible la desaparición de la CID. Por lo tanto, existe la necesidad del uso de fármacos que tengan efectos terapéuticos elevados y efectos secundarios bajos.
Por otra parte, como otros intentos de tratamiento de la CID se pueden mencionar las preparaciones de trombomodulina, hirudina, y agentes anti-PAF, y el inhibidor de la ruta del factor tisular (TFPI). Los inhibidores selectivos de FXa están atrayendo la atención como agentes anticoagulantes y/o antitrombóticos administrables oralmente. Además, como agente que neutraliza la actividad del TF, el documento WO 88/07543 describe un anticuerpo monoclonal anti-TF humano de ratón, y el documento WO 96/40921 describe un anticuerpo anti-TF humano humanizado.
Se espera que los anticuerpos monoclonales anti-TF humano de ratón constituyan un agente terapéutico seguro y eficaz, ya que no exhiben los síntomas de hemorragia asociados a la eficacia principal en la CID. Sin embargo, los anticuerpos monoclonales de ratón son sumamente inmunógenos (a veces se denomina "antigénicos"), y así el valor terapéutico médico de los anticuerpos de ratón en seres humanos es limitado. Por ejemplo, la vida media de los anticuerpos de ratón en los seres humanos es relativamente corta, y por lo tanto no pueden exhibir completamente su efecto previsto. Además, el anticuerpo humano anti-ratón (HAMA) que se desarrolla en respuesta al anticuerpo de ratón administrado provoca reacciones inmunológicas que son desfavorables y peligrosas para los pacientes. Así, no se pueden administrar repetidamente anticuerpos monoclonales de ratón a seres humanos.
Para resolver estos problemas, se han desarrollado métodos que pretenden reducir la inmunogenicidad de los anticuerpos derivados de animales no humanos, tales como (los anticuerpos monoclonales derivados de) ratones. Uno de ellos es un método para la producción de un anticuerpo quimérico en el que una región variable (región V) del anticuerpo deriva de un anticuerpo monoclonal de ratón, y una región constante (región C) del mismo deriva de un anticuerpo humano adecuado.
Debido a que el anticuerpo quimérico obtenido contiene una región variable de un anticuerpo de ratón original en forma completa, se espera que se una a un antígeno con una afinidad idéntica a la del anticuerpo de ratón original. Además, en el anticuerpo quimérico la proporción de las secuencias de aminoácidos derivadas de animales no humanos está sustancialmente reducida, y por lo tanto se espera que tenga una inmunogenicidad reducida en comparación con el anticuerpo de ratón original. Sin embargo, todavía es posible que surja una respuesta inmunológica hacia la región variable de ratón (LoBuglio, A. F. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86: 4220-4224, 1989).
Se espera que un segundo método para reducir la inmunogenicidad de un anticuerpo de ratón, aunque mucho más complicado, reduzca drásticamente la inmunogenicidad potencial del anticuerpo de ratón. En este método, se injerta la región determinante de la complementariedad (CDR) sola de un anticuerpo de ratón en una región variable humana para producir una región variable humana "remodelada". Según se desee, sin embargo, algunas secuencias de aminoácidos de las regiones estructurales (FRs) que soportan las CDRs se pueden injertar de la región variable de un anticuerpo de ratón en la región variable humana para obtener la aproximación más cercana a la estructura del anticuerpo de ratón original. Después, la región variable humana remodelada humanizada se liga a la región constante humana. En el anticuerpo humanizado finalmente remodelado, las porciones derivadas de las secuencias de aminoácidos no humanas son solamente las CDRs y una pequeña porción de las FRs. Las CDRs comprenden secuencias de aminoácidos hipervariables, y no muestran secuencias específicas de especie.
Para un anticuerpo humanizado, véase además Riechmann, L. et al., Nature 332: 323-327, 1988; Verhoeye, M. et al., Science 239: 1534-1536, 1998; Kettleborough, C. A. et al., Protein Engng., 4: 773-783, 1991; Maeda, H., Human Antibodies and hybridoma, 2: 124-134, 1991; Gorman, S. D. et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 4181-4185, 1991; Tempest, P R., Bio/Technology, 9: 226-271, 1991; Co, M. S. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 2869-2873, 1991; Cater, P. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 4285-4289, 1992; Co, M. S. et al., J. Immunol., 148: 1149-1154, 1992; y Sato, K. et al., Cancer Res., 53: 851-856, 1993.
En la técnica de humanización convencional, parte de la región estructural (FR) incluye una secuencia de aminoácidos que se injertó de la región variable de un anticuerpo de ratón en la región variable humana. Así, cuando se administra como agente terapéutico en seres humanos, existe el riesgo de que se formen anticuerpos hacia un sitio que tenga una secuencia de aminoácidos que no está presente en seres humanos, aunque consista solamente en uno a unos cuantos aminoácidos. Para evitar este riesgo, se ideó una tercera técnica de humanización. Así, el método implica, para cuatro FRs (FR1 - 4) necesarias para soportar la estructura tridimensional de tres CDRs, la sustitución de la FR de un anticuerpo humano que tiene una homología elevada con la FR del anticuerpo de ratón presente en la base de datos mediante el uso de una FR como unidad. En este caso, se seleccionan varias FRs de anticuerpos humanos presentes en la base de datos, y se reordenan secuencialmente para preparar un anticuerpo humanizado que tiene una actividad elevada.
Al hacerlo, es posible construir anticuerpos humanizados en los que todas las FRs excepto las CDRs de la región variable tienen secuencias de aminoácidos derivadas del anticuerpo humano. Así, el anticuerpo humanizado que porta la CDR de ratón ya no debería tener inmunogenicidad más potente que un anticuerpo humano que contiene la CDR humana.
Aunque se espera que el anticuerpo humanizado sea útil para el tratamiento, como se mencionó anteriormente, no existe ningún procedimiento fijo presente que sea aplicable universalmente a cualquier anticuerpo en el método de producción de un anticuerpo humanizado, y por lo tanto son necesarias diversas estrategias para construir un anticuerpo humanizado que exhiba una actividad de unión y actividad neutralizante suficientes hacia un antígeno específico (véase, por ejemplo, Sato, K. et al., Cancer Res., 53: 851-856, 1993).
Descripción de la Invención
Un objetivo de la presente descripción es proporcionar un anticuerpo quimérico humano/de ratón que comprende la región variable (región V) de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia el factor tisular (TF) humano y la región constante (región C) de un anticuerpo humano, un anticuerpo humanizado en el que las regiones determinantes de la complementariedad (CDRs) de la región V de la cadena ligera (cadena L) y la región V de la cadena pesada (cadena H) de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano se han injertado en un anticuerpo humano, la cadena L y la cadena H de dicho anticuerpo, y un fragmento de la región V que constituye la cadena L o la cadena H de dicho anticuerpo. Un objetivo adicional de la presente descripción es proporcionar un procedimiento para la producción de un anticuerpo humanizado hacia TF humano.
Un objetivo adicional de la presente descripción es proporcionar un ADN que codifica el anticuerpo anterior, específicamente un fragmento de la región V del mismo, y un ADN que codifica una cadena L o una cadena H que contiene una región V. Un objetivo adicional de la presente descripción es proporcionar un vector de ADN recombinante que comprende dicho ADN, y un hospedador transformado con dicho vector. Un objetivo adicional de la presente descripción es proporcionar una composición farmacéutica y un agente terapéutico para el síndrome de coagulación intravascular diseminada (CID) que comprende como ingrediente activo un anticuerpo humanizado hacia TF humano.
Tras un estudio profundo para resolver los problemas anteriores, los inventores de la presente descripción han obtenido con éxito un anticuerpo en el que la inmunogenicidad en humanos del anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano está reducida, y además han desarrollado un procedimiento para la producción de un anticuerpo humanizado nuevo, y por lo tanto han completado la presente descripción.
Así, la presente descripción se refiere a una cadena H quimérica que comprende la región C de la cadena H de un anticuerpo humano y un fragmento de la región V de la cadena H de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano. Como región V de la cadena H, se puede mencionar una que comprende una secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº: 9, y como región C, se puede mencionar una que deriva de la región Cγ4.
Además, la presente descripción se refiere a una cadena L quimérica que comprende la región C de la cadena L de un anticuerpo humano y un fragmento de la región V de la cadena L de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano. Como región V de la cadena L, se puede mencionar una que comprende una secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº: 15, y como región C de la cadena L, se puede mencionar una que deriva de la región Cκ.
Además, la presente descripción se refiere a un anticuerpo monoclonal quimérico humano/de ratón hacia TF humano, y dicho anticuerpo comprende la cadena H quimérica y la cadena L quimérica anteriores.
La presente descripción se refiere además a un fragmento de la región V de la cadena H de un anticuerpo humanizado, y dicho fragmento comprende las regiones estructurales (FRs) 1-4 de la región V de la cadena H de un anticuerpo humano y las regiones determinantes de la complementariedad (CDRs) 1-3 de la región V de la cadena H de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano. Como CDR 1-3, se puede mencionar una que incluye la secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº: 133-135, respectivamente. Como FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo humano, se puede mencionar la FR1 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40%
o más con la FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón; como FR2, se puede mencionar la FR2 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40% o más con la FR2 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón; como FR3, se puede mencionar la FR3 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40% o más con la FR3 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón; y como FR4, se puede mencionar la FR4 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40% o más con la FR4 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón;
Preferiblemente, como FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo humano, se puede mencionar la FR1 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 50% o más con la FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón; como FR2, se puede mencionar la FR2 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 70% o más con la FR2 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón; como FR3, se puede mencionar la FR3 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 65% o más con la FR3 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón; y como FR4, se puede mencionar la FR4 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 80% o más con la FR4 de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón. Como ejemplos específicos, como FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo humano, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130; como FR2, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130, el anticuerpo humano P01742, y el anticuerpo humano Z80844; como FR3, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130, el anticuerpo humano Z34963, el anticuerpo humano P01825, el anticuerpo humano M62723, el anticuerpo humano Z80844, el anticuerpo humano L04345, el anticuerpo humano S78322, el anticuerpo humano Z26827, el anticuerpo humano U95239, y el anticuerpo humano L03147; y como FR4, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130.
Como ejemplos preferidos, como FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo humano, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130; como FR2, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130 y el anticuerpo humano Z80844; como FR3, se puede mencionar el anticuerpo humano Z34963, el anticuerpo humano M62723, y el anticuerpo humano U95239; y como FR4, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130. Como ejemplos más preferidos, como FR1 de la región V de la cadena H de un anticuerpo humano, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130; como FR2, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130; como FR3, se puede mencionar el anticuerpo humano Z34963 y el anticuerpo humano U95239; y como FR4, se puede mencionar el anticuerpo humano L39130.
Además, tal como se usa en la presente memoria, los números de las regiones estructurales se basan en la definición de Kabat (Kabat, E. A. et al., US Dept. Health and Services, US Government Printing Offices, 1991).
La presente descripción se refiere además a un fragmento de la región V de la cadena H de un anticuerpo humanizado, y dicho fragmento comprende cualquiera de las secuencias de aminoácidos expuestas en SEQ ID Nº: 30, 40, 42, 50, 52, 58, 60, 64, 70, 72, 76, 78, 82, y 84.
La presente descripción se refiere además a un fragmento de la región V de la cadena L de un anticuerpo humanizado, y dicho fragmento comprende las FRs 1-4 de la región V de la cadena L de un anticuerpo humano y las CDRs 1-3 de la región V de la cadena L de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano. Como CDRs 1-3, se puede mencionar una que incluye la secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº: 136-138, respectivamente. Como FR1 de la región V de la cadena L de un anticuerpo humano, se puede mencionar una que tiene una homología del 40% o más con la FR1 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; como FR2, se puede mencionar la FR2 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40% o más con la FR2 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; como FR3, se puede mencionar la FR3 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40% o más con la FR3 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; y como FR4, se puede mencionar la FR4 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 40% o más con la FR4 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón;
Preferiblemente, como FR1 de la región V de la cadena L de un anticuerpo humano, se puede mencionar la FR1 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 75% o más con la FR1 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; como FR2, se puede mencionar la FR2 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 80%
o más con la FR2 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; como FR3, se puede mencionar la FR3 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 70% o más con la FR3 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; y como FR4, se puede mencionar la FR4 de un anticuerpo humano que tiene una homología del 80% o más con la FR4 de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón; Como ejemplos específicos, como FR1 de la región V de la cadena L de un anticuerpo humano, se puede mencionar el anticuerpo humano Z37332; como FR2, se puede mencionar el anticuerpo humano Z37332 y el anticuerpo humano X93625; como FR3, se puede mencionar el anticuerpo humano Z37332, el anticuerpo humano S68699, y el anticuerpo humano P01607; y como FR4, se puede mencionar el anticuerpo humano Z37332. Como ejemplos más preferidos, como FR1 de la región V de la cadena L de un anticuerpo humano, se puede mencionar el anticuerpo humano Z37332; como FR2, se puede mencionar el anticuerpo humano X93625; como FR3, se puede mencionar el anticuerpo humano S68699; y como FR4, se puede mencionar el anticuerpo humano Z37332.
Además, tal como se usa en la presente memoria, los números de las regiones estructurales se basan en la definición de Kabat (Kabat, E. A. et al., US Dept. Health and Services, US Government Printing Offices, 1991).
La presente descripción se refiere además a un fragmento de la región V de la cadena L de un anticuerpo humanizado, y dicho fragmento comprende las secuencias de aminoácidos expuestas en SEQ ID Nº: 93, 99, 101, 107, y
109.
La presente descripción se refiere además a la cadena H de un anticuerpo humanizado hacia TF humano, y dicha cadena comprende un fragmento de la región V de la cadena H del anticuerpo humanizado anterior y un fragmento de la región C de la cadena H de un anticuerpo humano. Se puede mencionar la región Cγ4 como la región C; como FRs 1-4 derivadas de un anticuerpo humano, se pueden mencionar las derivadas cada una del anticuerpo humano L39130 (FR1), el anticuerpo humano L39130 (FR2), el anticuerpo humano Z34963 (FR3) o el anticuerpo humano U95239 (FR3), el anticuerpo humano L39130 (FR4); y como CDRs 1-3, se pueden mencionar las derivadas cada una de la secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº: 133-135, respectivamente.
La presente descripción se refiere además a la cadena L de un anticuerpo humanizado hacia TF humano, y dicha cadena comprende un fragmento de la región V de la cadena L del anticuerpo humanizado anterior y un fragmento de la región C de la cadena L de un anticuerpo humano. Se puede mencionar la región Cκ como la región C; como FRs 1-4 derivadas de un anticuerpo humano, se pueden mencionar las derivadas cada una del anticuerpo humano Z37332 (FR1), el anticuerpo humano X93625 (FR2), el anticuerpo humano S68699 (FR3), y el anticuerpo humano Z37332 (FR4); y como CDRs 1-3, se pueden mencionar las derivadas cada una de la secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº: 136-138, respectivamente.
La presente descripción se refiere además a un anticuerpo humanizado hacia TF humano, y dicho anticuerpo comprende la cadena L y la cadena H del anticuerpo humanizado anterior.
La presente descripción se refiere además a un procedimiento para la producción de un anticuerpo humanizado hacia TF humano. El proceso de humanización se refiere al método de seleccionar las FRs 1-4 que soportan la estructura de las CDRs 1-3 que son el sitio de reconocimiento del antígeno para la cadena H o la cadena L. Así, la presente descripción se refiere al método de seleccionar algunas de las FRs de un anticuerpo humano que tienen una homología elevada con la FR de un anticuerpo de ratón con cada FR como unidad, y generar un anticuerpo humanizado que tiene la actividad deseada mediante un reordenamiento secuencial de las FR.
Más específicamente, la invención reivindicada se refiere a un procedimiento de preparación de un anticuerpo humanizado natural que tiene una región determinante de la complementariedad (CDR) derivada de animales no humanos y una región estructural (FR) derivada de un anticuerpo humano natural, y que tiene una inmunogenicidad reducida, y dicho método comprende las etapas de:
(1)
preparar un anticuerpo monoclonal no humano que responde al antígeno de interés;
(2)
preparar anticuerpos humanos que tienen una homología elevada con la secuencia de aminoácidos de la FR del anticuerpo monoclonal del punto (1) anterior;
(3)
sustituir las cuatro FRs del anticuerpo humano del punto (2) anterior con las FRs correspondientes del anticuerpo monoclonal no humano del punto (1) anterior para generar el primer anticuerpo humanizado;
(4)
determinar la capacidad del anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior de unirse al antígeno
o de neutralizar la actividad biológica del antígeno;
(5)
sustituir una a tres FRs del anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior con las FRs correspondientes de un anticuerpo humano que es diferente del usado en el punto (3) entre los anticuerpos humanos preparados en el punto (2) para generar el segundo anticuerpo humanizado;
(6)
comparar la capacidad del segundo anticuerpo humanizado generado en el punto (5) anterior y el primer anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior en función de la capacidad de unirse al antígeno o de neutralizar la actividad biológica del antígeno, por lo que se selecciona un anticuerpo humanizado que tiene una actividad favorable;
(7)
lleva a cabo las etapas anteriores de los puntos (3) a (6) para el anticuerpo humanizado seleccionado en el punto (6) anterior; y
(8)
repetir las etapas anteriores de los puntos (3) a (6) hasta que se obtiene un anticuerpo humanizado que tiene una actividad equivalente al anticuerpo monoclonal no humano del punto (1) anterior.
La invención reivindicada se refiere además a un procedimiento según el párrafo anterior, en el que dicho antígeno de interés es el factor tisular (TF) humano.
La invención reivindicada se refiere además a un procedimiento para la producción de un anticuerpo humanizado natural según los dos párrafos previos que comprende las etapas de:
(1)
obtener un anticuerpo humanizado natural mediante un procedimiento según cualquiera de los dos párrafos previos;
(2)
introducir un ácido nucleico que codifica el anticuerpo humanizado natural en una célula hospedadora; y
(3)
cultivar la célula hospedadora.
Una vez que se obtiene un anticuerpo humanizado que tiene un cierto grado de actividad de neutralización de TF humano, se lleva a cabo una búsqueda de homología adicional para una FR específica en la región V de la cadena H y de la cadena L, de manera que se puede seleccionar un anticuerpo humano que tiene una homología elevada. Añadiendo el anticuerpo humano así obtenido a un grupo de anticuerpos humanos en la etapa (2) anterior y repitiendo adicionalmente las etapas de (3) a (6), se puede obtener un anticuerpo humanizado que tiene la actividad deseada.
La presente descripción se refiere además al ADN que codifica un fragmento de la región V de la cadena H o un fragmento de la región V de la cadena L de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano. Como secuencia de aminoácidos y ADN codificante del fragmento de la región V de la cadena H o del fragmento de la región V de la cadena L, se puede mencionar una que incluye la secuencia de nucleótidos expuesta en SEQ ID Nº: 9 ó 15, respectivamente.
La presente descripción se refiere además a un ADN que codifica la cadena H quimérica o la cadena L quimérica anteriores. Como ADN que codifica dicha cadena H, se puede mencionar uno que incluye la secuencia de nucleótidos expuesta en SEQ ID Nº: 9, y como ADN que codifica dicha cadena L, se puede mencionar uno que incluye la secuencia de nucleótidos expuesta en SEQ ID Nº: 15.
La presente descripción se refiere además al ADN que codifica un fragmento de la región V de la cadena H o un fragmento de la región V de la cadena L del anticuerpo humanizado anterior. Como ADN que codifica el fragmento de la región V de la cadena H, se puede mencionar uno que incluye cualquiera de las secuencias de nucleótidos expuestas en SEQ ID Nº: 29, 39, 41, 49, 51, 57, 59, 63, 69, 71, 75, 77, 81, o 83, y como ADN que codifica el fragmento de la región V de la cadena L, se puede mencionar uno que incluye cualquiera de las secuencias de nucleótidos expuestas en SEQ ID Nº: 92, 98, 100, 106, o 108.
La presente descripción se refiere además al ADN que codifica la cadena H de un anticuerpo humanizado.
La presente descripción se refiere además al ADN de la cadena H de un anticuerpo humanizado, y dicho ADN comprende el ADN que codifica cualquiera de las secuencias de aminoácidos expuestas en SEQ ID Nº: 30, 40, 42, 50, 52, 58, 60, 64, 70, 72, 76, 78, 82, o 84. Como dicho ADN, se puede mencionar uno que incluye cualquiera de las secuencias de nucleótidos expuestas en SEQ ID Nº: 29, 39, 41, 49, 51, 57, 59, 63, 69, 71, 75, 77, 81, o 83.
La presente descripción se refiere además al ADN que codifica la cadena L del anticuerpo humanizado anterior.
La presente descripción se refiere además al ADN de la cadena L de un anticuerpo humanizado, y dicho ADN comprende el ADN que codifica las secuencias de aminoácidos expuestas en SEQ ID Nº: 93, 99, 101, 107, o 109. Como dicho ADN, se puede mencionar uno que incluye cualquiera de las secuencias de nucleótidos expuestas en SEQ ID Nº: 92, 98, 100, 106, o 108.
La presente descripción se refiere además a un vector de ADN recombinante que contiene cualquiera de los ADNs descritos anteriormente.
La presente descripción se refiere además a un transformante transformado con un vector de ADN recombinante descrito anteriormente.
La presente descripción se refiere además a un procedimiento para generar un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado hacia TF humano, y dicho método comprende cultivar el transformante anterior y obtener un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado hacia TF humano a partir del cultivo recogido.
La presente descripción se refiere además a una composición farmacéutica y un agente terapéutico para CID que comprende el anticuerpo humanizado anterior como ingrediente activo.
Breve Descripción de los Dibujos
La Figura 1 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión a de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión a de la cadena L humanizada.
La Figura 2 es un gráfico que compara la actividad neutralizante hacia TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión a de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión a de la cadena L humanizada.
La Figura 3 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica y un anticuerpo de la versión a de la cadena H humanizada/versión a de la cadena L quimérica.
La Figura 4 es un gráfico que compara la actividad neutralizante hacia TF humano de un anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5, un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión a de la cadena H humanizada/versión a de la cadena L humanizada.
La Figura 5 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión a de la cadena L humanizada.
La Figura 6 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión c de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión d de la cadena H humanizada/cadena L quimérica.
La Figura 7 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión c de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión d de la cadena H humanizada/cadena L quimérica.
La Figura 8 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica y un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión a de la cadena L humanizada.
La Figura 9 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, anticuerpo de la cadena H quimérica/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión c de la cadena L humanizada.
La Figura 10 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión c de la cadena L humanizada.
La Figura 11 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión c de la cadena L humanizada.
La Figura 12 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión c de la cadena L humanizada.
La Figura 13 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión d de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 14 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión d de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 15 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión e de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión e de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 16 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica y un anticuerpo de la versión e de la cadena H humanizada/cadena L quimérica.
La Figura 17 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica y un anticuerpo de la versión g de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 18 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica y un anticuerpo de la versión g de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 19 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b3 de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión d3 de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 20 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b3 de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión d3 de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 21 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión j de la cadena H humanizada/cadena L quimérica.
La Figura 22 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión j de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 23 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/cadena L quimérica, y un anticuerpo de la versión j de la cadena H humanizada/cadena L quimérica.
La Figura 24 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión j de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada.
La Figura 25 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión b1 de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 26 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión b1 de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la cadena H quimérica/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 27 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica y un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 28 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 29 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b1 de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 30 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b1 de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 31 es un gráfico que compara la actividad de unión al antígeno de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 32 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano (la actividad para inhibir la producción del Factor Xa por el TF) de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 33 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano (la actividad para inhibir la unión del Factor X) de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 34 es un gráfico que compara la actividad de neutralización de TF humano (la actividad para inhibir la coagulación plasmática por el TF) de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
La Figura 35 es una figura que compara la reactividad hacia TF humano tratado bajo diversas condiciones de un anticuerpo de la cadena H quimérica/cadena L quimérica, un anticuerpo de la versión b de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b de la cadena L humanizada, y un anticuerpo de la versión i de la cadena H humanizada/versión b2 de la cadena L humanizada.
Mejor Modo de Llevar a Cabo la Descripción
La presente descripción se explicará a continuación con más detalle.
1. Preparación de un Anticuerpo Monoclonal de Ratón Hacia TF Humano
Se puede generar un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF generando un hibridoma mediante una fusión de células productoras del anticuerpo, obtenidas de animales inmunizados con el antígeno, a células de mieloma, y después seleccionando de los hibridomas obtenidos un clon que produzca el anticuerpo que inhibe de manera específica la actividad de TF.
Así, las células de bazo de un ratón inmunizado con TF como antígeno, que se purificó a partir de placenta humana, se fusionaron a células de mieloma para preparar un hibridoma. Con el fin de cribar los hibridomas, se determinó la capacidad de unión del anticuerpo a TF mediante un ELISA de células que empleaba la línea celular J82 con expresión elevada de TF, y se determinó su actividad de neutralización de TF en un sistema de ensayo que empleó como índice la actividad de inhibición de la activación del factor de coagulación X (Factor X: FX). Como resultado, se establecieron satisfactoriamente hibridomas que producían 6 anticuerpos que inhibieron intensamente la activación de FX del complejo TF/VIIa.
(1) Preparación del antígeno
Como TF para la inmunización de los animales, se puede mencionar un péptido que es parte de la secuencia de aminoácidos de TF generado mediante la técnica de ADN recombinante o mediante síntesis química, o TF derivado de placenta humana. Por ejemplo, se puede usar TF purificado a partir de placenta humana según el método de Ito et al. (Ito T. et al., J. Biochem. 114: 691-696, 1993) como antígeno.
El TF se mezcla con un adyuvante y después la mezcla se usa como antígeno. Como adyuvante, se puede mencionar el adyuvante completo de Freund o el adyuvante incompleto de Freund, cualquiera de los cuales se puede mezclar.
(2) Inmunización y recogida de las células productoras de anticuerpos
El antígeno obtenido como se describió anteriormente se puede administrar a mamíferos no humanos, por ejemplo mamíferos tales como ratones, ratas, caballos, monos, conejos, cabras, ovejas, y similares. La inmunización se puede llevar a cabo mediante el uso de cualquiera de los métodos existentes, y se lleva a cabo principalmente mediante inyección intravenosa, subcutánea e intraperitoneal, y similares. El periodo de inmunización se lleva a cabo, pero sin limitación, en un intervalo de unos cuantos días a unas cuantas semanas, preferiblemente un intervalo de 421 días.
Las células productoras de anticuerpos se pueden recoger 2-3 días después del último día de inmunización. Como células productoras de anticuerpos, se pueden mencionar las células del bazo, las células linfáticas, y las células de sangre periférica, y en general se usan las células del bazo. La cantidad de antígeno a usar para cada inmunización es 0,1-100 μg por ratón.
(3) Determinación del título de anticuerpos
Para confirmar el nivel de respuesta inmunitaria del animal inmunizado y para seleccionar el hibridoma deseado a partir de las células tras el tratamiento de fusión celular, se determina el título de anticuerpos en la sangre del animal inmunizado y en el sobrenadante del cultivo de las células productoras de anticuerpos.
Como métodos para la detección del anticuerpo, se pueden mencionar métodos conocidos, tales como el enzimoinmunoensayo (EIA), radioinmunoensayo (RIA), el ensayo inmunoadsorbente ligado a enzimas (ELISA), y similares.
(4) Fusión celular
Como células de mieloma fusionadas a las células productoras de anticuerpos, se usan células de líneas que derivan de ratones, ratas, seres humanos, etc., y que están disponibles en general para una persona experta en la técnica. Como líneas celulares a usar, se pueden mencionar aquellas que tienen las propiedades de ser resistentes a fármacos, ser incapaces de sobrevivir en el medio de selección (por ejemplo el medio HAT) en el estado sin fusionar, y ser capaces de sobrevivir únicamente en el estado fusionado. En general se usan las cepas resistentes a 8-azaguanina, y estas líneas celulares carecen de hipoxantina-guanina-fosforribosil transferasa, y por lo tanto no pueden sobrevivir en el medio que contiene hipoxantina, aminopterina, y timidina (HAT).
Como células de mieloma, se usan preferiblemente diversas líneas celulares conocidas tales como P3 (P3X63Ag8.653) (J. Immunol. 123: 1548-1550, 1979), P3X63Ag8.1 (Current Topics in Microbiology and Immunology
81:
1-7, 19778), NS-1 (Kohler, G. and Milstein, C., Eur. J. Immunol. 6: 511-519, 1976), MPC-11 (Margulies, D. H., Cell 8: 405-415, 1976), SP2/0 (Shulman, M. et al., Nature 276: 269-270, 1978), F0 (de St. Groth, S. F. et al., J. Immunol. Methods (1980) 35: 1-21, 1980), S194 (Trowbridge, I. S., J. Exp. Med. 148: 313-323, 1978), R210 (Galfre,
G.
et al., Nature 277: 131-133, 1979), y similares.
Se pueden obtener células productoras de anticuerpos a partir de células de bazo, células linfáticas, y similares. Así, se extraen o se recogen de los animales anteriores los bazos, los nódulos linfáticos, etc., y estos tejidos se dispersan. Las células dispersadas se suspenden en un medio o en un tampón tal como PBS, DMEM, y RPMI1640, se filtran con una malla de acero inoxidable, etc., y se centrifugan para preparar las células productoras de anticuerpos deseadas.
Las células de mieloma anteriores y las células productoras de anticuerpos se someten a la fusión celular.
La fusión celular se puede llevar a cabo poniendo en contacto las células de mieloma y las células productoras de anticuerpos a 30-37 °C durante 1-15 minutos en presencia de un agente acelerante de la fusión a una proporción de mezcla de 1:1 a 1:10 en un medio de cultivo para el cultivo de células animales tal como MEM, DMEM, RPMI1640, y similares. Para acelerar la fusión celular, se puede usar un agente acelerador de la fusión celular o un virus de fusión, tal como polietilen glicol (PEG) de un peso molecular de 1.000-6.000, poli(alcohol vinílico), o el virus Sendai (HVJ). Además, se pueden usar instrumentos de fusión celular disponibles comercialmente (por ejemplo, la electroporación) que utilizan la estimulación eléctrica para fusionar las células productoras de anticuerpos con las células de mieloma.
(5) Selección y clonación de un hibridoma
Se puede seleccionar el hibridoma deseado a partir de las células fusionadas. A modo de ejemplo, se pueden mencionar los métodos que utilizan el crecimiento selectivo de células en un medio de selección. Así, tras la dilución de una suspensión de células con un medio adecuado, se coloca en una placa de microtitulación y se le añade un medio de selección (tal como el medio HAT), que se cultiva con la sustitución adecuada del medio de selección. Como resultado, se pueden obtener como hibridoma las células en crecimiento.
Se lleva a cabo el cribado de un hibridoma mediante el método de dilución limitante, el método de separación celular activada por fluorescencia, y similares, y finalmente se puede obtener un hibridoma que produce un anticuerpo monoclonal.
La selección de un hibridoma que produce un anticuerpo monoclonal se puede llevar a cabo combinando diversos sistemas de ensayo. Por ejemplo, se combina un sistema de reconocimiento de antígenos tal como el ELISA de células, un sistema de ensayo de la actividad neutralizante de TF que utiliza la actividad del Factor Xa como índice, y un sistema de ensayo de la actividad neutralizante tal como el sistema de ensayo que mide la actividad de inhibición de la coagulación del plasma para obtener un hibridoma que produce un anticuerpo monoclonal que tiene la actividad deseada. Así, se puede obtener un hibridoma que produce un anticuerpo monoclonal tal como ATR-2, ATR-3, ATR-4, ATR-5, ATR-7, y ATR-8.
(6) Recogida del anticuerpo monoclonal
Como método de recogida del anticuerpo monoclonal a partir del hibridoma obtenido, se puede mencionar un método de cultivo celular convencional, un método de formación de líquido ascítico, y similares.
En el método de cultivo celular, se cultiva un hibridoma en un medio de cultivo para el cultivo de células animales tal como un medio RPMI1640 complementado con un 10-20% de suero bovino fetal, el medio DMEM, un medio exento de suero o similares, en condiciones de cultivo (por ejemplo, 37 °C, concentración del 5% de CO2) durante 2-14 días, y después se obtiene el anticuerpo a partir del sobrenadante del cultivo.
En el método de formación de líquido ascítico, se administra de manera intraperitoneal un hibridoma a una especie animal similar al mamífero del que proceden las células de mieloma, y el hibridoma se hace proliferar en gran cantidad. Después, se recoge el líquido ascítico o el suero 1-4 semanas más tarde.
Cuando es necesaria la purificación del anticuerpo en el método anterior de obtención del anticuerpo, se lleva a cabo la purificación seleccionando, según sea adecuado, un método conocido tal como el fraccionamiento con sulfato de amonio, la cromatografía de intercambio iónico, y la cromatografía de afinidad, o combinándolos.
2. Clonación del ADN que codifica la región V de un anticuerpo monoclonal hacia TF humano
(i)
Preparación del mARN
Para clonar el ADN que codifica la región V de la cadena H y de la cadena L de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano, se aísla el ARN total a partir del hibridoma recogido mediante un método conocido, tal como el método de ultracentrifugación con guanidina (Chirgwin, J. M. et al., Biochemistry, 18: 5294-5299, 1979), y el método AGPC (Chomczynski, P. et al., 162: 156-159, 1987), y después el mARN se purifica mediante una columna de centrifugación de oligo (dT)-celulosa asociada al equipo de purificación de mARN (Pharmacia Biotech), y similares. El mARN se puede purificar también, sin extraer el ARN total, mediante el uso del equipo de purificación de mARN QuickPrep (Pharmacia Biotech).
(ii)
Preparación y amplificación de cADN
A partir del mARN obtenido en el punto (i) anterior, se sintetiza el cADN de la región V de la cadena L y de la cadena H, respectivamente, mediante el uso de una transcriptasa inversa. La síntesis del cADN se puede llevar a cabo mediante el uso de un cebador de Oligo-dT o un cebador adecuado (por ejemplo, el cebador sintético de cADN adjunto con el equipo) que hibrida con la región C de la cadena L o la región C de la cadena H.
La amplificación del cADN se puede llevar a cabo mediante PCR basada en el método 5'-RACE (Frohman, M. A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 8998-9002, 1988; Belyavsky, A. et al., Nucleic Acids Res. 17: 2919-2932, 1989) que usa el equipo 5'-Ample FINDER RACE (CLONETECH) junto con la cadena L y la cadena H. Así, se une un adaptador de cADN a los extremos de un cADN bicatenario sintetizado anteriormente, y después se lleva a cabo una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para los ADNs que codifican la región V de la cadena H y la región V de la cadena L (el ADN que codifica un fragmento de la región V de la cadena L se abrevia más adelante en la presente memoria "ADN de la región V de la cadena L" o "ADN que codifica la región V de la cadena L"; lo mismo es cierto para la región V de la cadena H, etc.).
Como cebador para amplificar el ADN de una región V de la cadena H, se puede usar el cebador adaptador 1 para el cebador del extremo 5', y el cebador MHC-G1 de la región constante de la cadena H del anticuerpo de ratón (SEQ ID Nº: 1) (ATR-2, ATR-3, ATR-4, y ATR-5) (región cγ1) o el cebador MHC-G2a (SEQ ID Nº: 2) (ATR-7 y ATR-8) (región cγ2a) (S. T. Jones et al., Biotechnology, 9: 88, 1991). Por ejemplo, para el cribado del extremo 5', se puede usar el cebador adaptador 1 adjunto con el equipo, y para el cebador del extremo 3' se puede usar el cebador de la región constante de la cadena κ de la cadena L (región Cκ) de un anticuerpo de ratón (tal como el cebador MKC que tiene la secuencia de nucleótidos expuesta en SEQ ID Nº: 3).
(iii) Purificación del ADN y determinación de la secuencia de nucleótidos
Los productos de PCR se someten a electroforesis en gel de agarosa según un método conocido. Después de extraer el fragmento de ADN deseado, se recupera el ADN y se purifica, y después se liga en un vector de ADN.
El ADN se puede purificar mediante extracción con fenol y cloroformo (J. Sambrook et al., "Molecular Cloning", Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989) o mediante el uso de un equipo disponible comercialmente (por ejemplo, GENECLEAN II; BIO101). Un vector de ADN usado para mantener los fragmentos de ADN puede ser cualquiera de los que se conocen (por ejemplo, pUC19 y Bluescript, etc.).
Se liga el ADN anterior y un vector de ADN mediante el uso de un equipo de ligadura conocido (fabricado por Takara Shuzo) para obtener un vector recombinante. Después, el vector de ADN recombinante resultante se introduce en una célula competente de Escherichia coli JM109 (Nippongene) etc., se seleccionan las colonias resistentes a ampicilina, y después se prepara un vector de ADN basándose en un método conocido (J. Sambrook et al., "Molecular Cloning", Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989). Después de digerir el vector anterior con una enzima de restricción, se puede determinar la secuencia de nucleótidos del ADN de interés mediante un método conocido (por ejemplo, el método didesoxi) (J. Sambrook et al., "Molecular Cloning", Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989). Según la presente descripción, se puede usar un instrumento automático para la determinación de la secuencia de nucleótidos (DNA Sequencer 373A, Perkin-Elmer).
(iv) Región determinante de la complementariedad (CDR) La región V de la cadena H y la región V de la cadena L forman el sitio de unión al antígeno, y la estructura global es similar entre sí. Así, cuatro regiones estructurales (FRs) están ligadas por tres regiones hipervariables, es decir, regiones determinantes de la complementariedad (CDRs). Las secuencias de aminoácidos de las FRs están muy conservadas, mientras las secuencias de aminoácidos de las CDRs son sumamente variables (Kabat, E. A. et al., "Sequence of Proteins of Immunological Interest", US Dept. Health and Human Services, 1983).
Muchas regiones de las cuatro FRs anteriores tienen la forma de una estructura de lámina β, con el resultado de que la CDR forma un bucle. La CDR puede formar parte a veces de la estructura de lámina β. Así, las tres CDRs se mantienen en estrecha proximidad tridimensional entre sí, y las FRs constituyen el sitio de unión al antígeno junto con las tres CDRs.
Basándose en estos hechos, mediante el ajuste de la secuencia de aminoácidos de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano en la base de datos de las secuencias de aminoácidos de anticuerpos generada por Kabat ("Sequence of Proteins of Immunological Interest", US Dept. Health and Human Services, 1983), se puede examinar su homología, y por lo tanto se pueden hallar las CDRs.
Se pueden incluir las secuencias de las CDRs alteradas mediante inserción, sustitución, o deleción en la presente descripción, con tal de que mantengan la actividad de unión o de neutralización de TF humano cuando se genera un anticuerpo humanizado mediante su uso. Por ejemplo, se pueden mencionar las que tienen una homología del 90100% con cada una de las CDRs de SEQ ID Nº: 133-138 o con cada CDR de la región V de SEQ ID Nº: 139-141, 143-144, 145-147, y 149-150. Preferiblemente, se pueden mencionar las secuencias que tienen una homología del 95-100%. Más preferiblemente, se pueden mencionar las secuencias que tienen una homología del 98-100%.
3. Preparación de un vector de expresión de un anticuerpo quimérico
Una vez que se han clonado los fragmentos de un ADN que codifica la cadena L de ratón (la cadena L o la cadena H del anticuerpo se pueden denominar más adelante en la presente memoria "cadena L de ratón" para el anticuerpo de ratón y "cadena H humana" para la cadena H del anticuerpo humano) y la región V de la cadena H de ratón, el ADN que codifica la región V de ratón se liga a los ADNs que codifican la región constante de un anticuerpo humano y se expresa para obtener un anticuerpo quimérico anti-TF humano.
Los métodos básicos para generar un anticuerpo quimérico comprenden unir una secuencia líder y una secuencia de la región V de ratón del cADN clonado a una secuencia que codifica la región constante de un anticuerpo humano que ya está en un vector de expresión para células mamíferas. De manera alternativa, comprenden unir una secuencia líder y una secuencia de la región V de ratón del cADN clonado a una secuencia que codifica la región C de un anticuerpo humano, y después unirlo a un vector de expresión para células mamíferas.
Los fragmentos de las regiones C de un anticuerpo humano pueden ser los de la región C de la cadena H y los de la región C de la cadena L de cualquier anticuerpo humano. Por ejemplo, se pueden mencionar cγ1, cγ2, cγ3, o cγ4 para los de la cadena H humana, y Cλ o Cκ para la cadena L, respectivamente.
Para la producción de un anticuerpo quimérico, se prepara un vector de expresión que contiene ADN que codifica una región V de la cadena H de ratón y una región C de la cadena H humana bajo el control de una región regula-dora de la expresión, como un sistema potenciador/promotor, y un único vector de expresión (véase, por ejemplo, el documento WO 94/11523) que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena L de ratón y una región C de la cadena L humana bajo el control de una región reguladora de la expresión, como un sistema potenciador/promotor. Después, el vector de expresión se usa para co-transformar una célula hospedadora tal como una célula mamífera, y las células transformadas se cultivan in vitro o in vivo para producir un anticuerpo quimérico (véase, por ejemplo, el documento WO 91/16928). Como vector simple, se puede usar un vector N5KG1(V) de expresión de anticuerpos de tipo IgG1κ y un vector N5KG4P de expresión de anticuerpos de tipo IgG4κ.
(i) Construcción de la cadena H de un anticuerpo quimérico
Se puede obtener un vector de expresión para una cadena H de anticuerpo quimérico introduciendo un cADN que codifica una región V de la cadena H de ratón en un vector de expresión adecuado que contiene un ADN que codifica la región C de la cadena H de un anticuerpo humano. Como región C de la cadena H, se puede mencionar, por ejemplo, la región Cγ1, Cγ2, Cγ3, o Cγ4.
Tal como se usa en la presente memoria, para introducir un cADN que codifica una región V de la cadena H de ratón en un vector de expresión, se puede introducir una secuencia de nucleótidos adecuada en dicho cADN mediante el método de PCR. Por ejemplo, tal secuencia de nucleótidos adecuada se puede introducir en un vector de expresión llevando a cabo una PCR mediante el uso de cebadores de PCR diseñados para que tengan una secuencia de reconocimiento de una enzima de restricción adecuada en el extremo 5' de dicho cADN, y, para una eficacia de transcripción mejorada, la secuencia consenso de Kozak (Kozak, M. et al., J. Mol. Biol., 196: 947-950, 1987) inmediatamente antes del codón de inicio de dicho cADN, y cebadores de PCR diseñados para que tengan una secuencia de reconocimiento de una enzima de restricción adecuada en el extremo 3' de dicho cADN.
Después de tratar un cADN que codifica la región V de la cadena H de ratón así construida con una enzima de restricción adecuada, se inserta en el vector de expresión anterior y después se construye un vector de expresión de la cadena H quimérica que contiene ADN que codifica la región C de la cadena H (Cγ1 o Cγ4).
(ii) Construcción de un vector de expresión que contiene un cADN que codifica la cadena κ de la cadena L de un anticuerpo quimérico
Se puede obtener un vector de expresión para una cadena L de anticuerpo quimérico introduciendo un cADN que codifica una región V de la cadena L de ratón en un vector de expresión adecuado que contiene un ADN que codifica la región C de la cadena L de un anticuerpo humano. Como región C de la cadena L, se puede mencionar, por ejemplo, la región Cκ y Cλ.
Tal como se usa en la presente memoria, para construir un vector de expresión que contiene un cADN que codifica una región V de la cadena L de ratón, se puede introducir una secuencia de nucleótidos adecuada en dicho cADN mediante el método de PCR. Por ejemplo, tal secuencia de nucleótidos adecuada se puede introducir en dicho cADN llevando a cabo una PCR mediante el uso de cebadores de PCR diseñados para que tengan una secuencia de reconocimiento de una enzima de restricción adecuada en el extremo 5' de dicho cADN, y, para una eficacia de transcripción mejorada, la secuencia consenso de Kozak, y cebadores de PCR diseñados para que tengan una secuencia de reconocimiento de una enzima de restricción adecuada en el extremo 3' de dicho cADN.
Después de tratar un cADN que codifica la región V de la cadena L de ratón así construida con una enzima de restricción adecuada, se inserta en el vector de expresión anterior y después se construye un vector de expresión de la cadena L quimérica que contiene ADN que codifica la región C de la cadena L (región Cκ).
4. Preparación de un anticuerpo humanizado
(1) Búsqueda de homología de un anticuerpo humano
Para generar un anticuerpo humanizado en el que las CDRs de un anticuerpo monoclonal de ratón estén injertadas en un anticuerpo humano, existe preferiblemente una homología elevada entre las FRs de un anticuerpo monoclonal de ratón y las FRs de un anticuerpo humano. Así, las regiones V de la cadena H y de la cadena L de un anticuerpo monoclonal anti-TF humano de ratón se comparan con la región V de todos los anticuerpos conocidos cuya estructura se ha publicado mediante el uso de un banco de datos. Al mismo tiempo, se comparan con los subgrupos de anticuerpos humanos (HSG: subgrupo humano) (Kabat, E. A. et al., US Dep. Health and Human Services, US Government Printing Offices, 1991) clasificados por Kabat et al. basándose en la longitud de las FR y en la homología de los aminoácidos.
Basándose en la clasificación de HSG de Kabat et al., las regiones V de la cadena H humana se pueden agrupar en HSGI a III; por ejemplo, la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal anti-TF humano de ratón ATR-5 tiene una homología del 67,8% con la secuencia consenso de HSGI. Por otra parte, las regiones V de la cadena κ de la cadena L humana se pueden agrupar en HSGI a IV; por ejemplo, la región V de la cadena κ de la cadena L del anticuerpo monoclonal anti-TF humano de ratón ATR-5 tiene una homología del 72,3% con la secuencia consenso de HSGI.
Cuando se humaniza un anticuerpo de ratón mediante una técnica convencional, la secuencia de aminoácidos de las FRs de la región V de un anticuerpo de ratón que soportan las CDR se puede injertar en la FR de una región V humana, según se desee, de forma que la estructura de la CDR de una región V humanizada se puede parecer más a la del anticuerpo de ratón original. Sin embargo, no existen reglas fijas en cuanto a qué aminoácidos de la FR de la región V de un anticuerpo de ratón se deben injertar en la FR de la región V de un anticuerpo humano. Por lo tanto, es necesario un gran esfuerzo para especificar los aminoácidos que son esenciales para mantener la estructura de la CDR.
Existe también el riesgo de que se pueda formar un anticuerpo humano hacia la secuencia de aminoácidos injertada en la región V humana de la región V de un anticuerpo de ratón en parte de la FR. Según la presente descripción, para cambiar todas las secuencias de aminoácidos excepto la CDR en el anticuerpo humanizado por secuencias de aminoácidos derivadas de un anticuerpo humano, se buscaron las FRs de un anticuerpo humano que tuvieran una homología elevada con la FR de los anticuerpos de ratón presentes en la base de datos, con una FR como unidad, para las cuatro FRs (FR1-4) que son necesarias para mantener la estructura tridimensional de la CDR. Lo siguiente es el resultado de la búsqueda de homología con la base de datos para cada FR de la región V de la cadena H y de la región V de la cadena L de un anticuerpo monoclonal ATR-5.
Tabla 1
Nº de FR Nº de acceso Homología con cada FR SEQ ID Nº: de la región V de la cadena H de un anticuerpo de ratón (%) FR1 de la cadena H L39130 53,0 110 FR2 de la cadena H L39130 92,9 111 P01742 71,4 112 Z80844 78,6 113 FR3 de la cadena H L39130 62,5 114 Z34963 71,9 115 P01825 53,1 116 M62723 68,8 117 Z80844 68,8 118 L04345 65,6 119 S78322 75,0 120 Z26827 56,3 121 U95239 65,6 122 L03147 65,6 123 FR4 de la cadena H L39130 90,9 124
Tabla 2
Nº de FR Nº de acceso Homología con cada FR SEQ ID Nº: de la región V de la cadena L de un anticuerpo de ratón (%) FR1 de la cadena L Z37332 78,3 125 FR2 de la cadena L Z37332 80,0 126 S65921 80,0 127 X93625 80,0 128 FR3 de la cadena L Z37332 71,9 129 S68699 75,0 130 P01607 71,9 131 FR4 de la cadena L Z37332 90,0 132
(2) Diseño de un ADN que codifica una región V de un anticuerpo humanizado
10 La primera etapa en el diseño de un ADN que codifica una región V de un anticuerpo humanizado es seleccionar cada FR una región V de un anticuerpo humano en el que se basa el diseño. En el reordenamiento de FRs, es necesario seleccionar una FR muy variada de una región V de un anticuerpo humano para cada FR.
Para el anticuerpo monoclonal ATR-5, según la presente descripción, se seleccionaron tres FRs de la región V de un 15 anticuerpo humano para FR2 y 10 para FR3 basándose en el resultado de la búsqueda de homología entre la región V de la cadena H de todos los anticuerpos de ratón y cada FR para la cadena H. Para la cadena L, se pueden seleccionar tres FRs de la región V de un anticuerpo humano para FR2 y tres para FR3 basándose en el resultado de la búsqueda de homología entre la región V de la cadena L de los anticuerpos de ratón y cada FR.
20 Para las regiones V de la cadena H y de la cadena L humanizadas, es posible seleccionar las regiones V de la cadena L, L39130 y Z37332, que tienen una homología elevada con la región V de la cadena H y de la cadena L del anticuerpo de ratón ATR-5, respectivamente. Para permitir el reordenamiento sencillo de FR en la generación de estos anticuerpos humanizados, es posible diseñar sitios de reconocimiento para enzimas de restricción adecuadas en sitios adecuados en cada CDR y FR. Al hacerlo, se puede sustituir fácilmente solamente una de las FRs. 25 Los ejemplos de tales sitios incluyen un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción EcoT22I en la CDR1 de la cadena H humanizada, un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción BalI en CDR2, un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción NcoI en CDR3 y un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción XhoI en FR3, por ejemplo un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción AflII en la CDR1 de la cadena L humani30 zada, un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción SpeI en CDR2, un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción PstI en CDR3, y un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción AccIII en FR3.
Basándose en la versión así diseñada, se puede llevar a cabo el reordenamiento de FR para cada FR para obtener un anticuerpo humanizado que tiene la actividad deseada.
(3) Preparación de un fragmento de la región V de un anticuerpo humanizado
El anticuerpo humanizado de la presente invención es tal que las FRs de la región C y de la región V de dicho anticuerpo derivan de un anticuerpo humano y la CDR de la región V deriva de un anticuerpo de ratón. Se pueden generar fragmentos de la región V del anticuerpo humanizado de la presente invención mediante un método denominado injerto de CDR mediante el método de PCR, si están disponibles los fragmentos de ADN del anticuerpo humano como molde. Tal como se usa en la presente memoria, el "injerto de CDR" es un método en el que se genera un fragmento de ADN que codifica la CDR de un anticuerpo de ratón, el cual se intercambia por la CDR de un anticuerpo humano como molde.
Cuando no hay disponibles fragmentos de ADN de un anticuerpo humano como molde, se puede sintetizar la secuencia de nucleótidos registrada en la base de datos mediante el uso de un sintetizador de ADN, y se puede generar la región V del anticuerpo humanizado mediante el uso del método de PCR. Además, cuando la secuencia de aminoácidos solamente está registrada en la base de datos, se puede deducir la secuencia de nucleótidos completa basándose en la secuencia de aminoácidos basándose en la frecuencia del uso de los codones de los anticuerpos informados por Kabat, E. A. et al. (US Dep. Health and Human Services, US Government Printing Offices, 1991). La secuencia de nucleótidos se puede sintetizar mediante el uso de un sintetizador de ADN, y se pueden generar fragmentos de la región V del anticuerpo humanizado mediante el uso del método de PCR.
(i) Construcción del ADN y de un vector de expresión que codifica la región V de la cadena H humanizada
Según la presente descripción, se puede construir el ADN que codifica la región V de la cadena H humanizada obteniendo el gen que codifica la región V de la cadena H de un anticuerpo humano a usar como molde para el anticuerpo humanizado, y después sintetizando la secuencia de nucleótidos completa del ADN que codifica la región V de la cadena H humanizada mediante el uso de un sintetizador de ADN, seguido por el método de PCR. Por ejemplo, se puede generar L39130 que tiene una homología elevada con la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal anti-TF humano de ratón ATR-5 en forma de la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada. Para generar la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada, se usan por ejemplo los 5 cebadores expuestos en SEQ ID Nºs: 22-26 y 2 cebadores exógenos expuestos en SEQ ID Nºs: 27 y 28 por separado.
Los cebadores de injerto de CDR hR5Hv1S (SEQ ID Nº: 22), hR5Hv2S (SEQ ID Nº: 23), y hR5Hv4S (SEQ ID Nº: 24) tienen una secuencia de ADN directa, y los cebadores de injerto de CDR hR5Hv3A (SEQ ID Nº: 25) y hR5Hv5A (SEQ ID Nº: 26) tienen una secuencia de ADN inversa, y cada uno tiene una secuencia complementaria de 18-35 pb en ambos extremos de los cebadores. hR5Hv1S está diseñado de manera que tenga la secuencia consenso de Kozak (Kozak, M. et al., J. Mol. Biol. 196: 947-950, 1987) y un sitio de reconocimiento de SalI, y hR5Hv5A está diseñado de manera que tenga un sitio de reconocimiento de NheI. Los cebadores exógenos hR5HvPrS (SEQ ID Nº: 27) y hR5HvPrA (SEQ ID Nº: 28) también tienen homología con los cebadores de injerto de CDR hR5Hv1S y hR5Hv5A.
Mediante el uso del método de PCR, se construyen cinco cebadores para sintetizar el cADN de tamaño completo, y después de añadir un cebador exógeno se amplifica el ADN. La construcción mediante el método de PCR tal como se usa en la presente memoria significa que hR5Hv1S, hR5Hv2S, hR5Hv4S, hR5Hv3A, y hR5Hv5A se hibridan a sus secuencias complementarias y se sintetiza el ADN de la región V de la cadena H humanizada de tamaño completo.
La región C de la cadena H del anticuerpo humano puede ser cualquier región C de la cadena H humana, y por ejemplo se pueden mencionar las cadenas H humanas Cγ1, Cγ2, Cγ3, o Cγ4.
El ADN de la región V de la cadena H del anticuerpo humanizado construido como se indicó anteriormente se puede unir al ADN de cualquier región C de la cadena H de un anticuerpo humano, por ejemplo la región C de la cadena H humana Cγ1 oCγ4. Como se describió en la construcción de una cadena H del anticuerpo quimérico, después de tratar con una enzima de restricción adecuada, se une al ADN que codifica una región C de la cadena H humana bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor para generar un vector de expresión que contiene el ADN de la región V de la cadena H humanizada y la región C de la cadena H humana.
(ii) Construcción del ADN y de un vector de expresión que codifica la región V de la cadena L humanizada
Como en el caso del ADN que codifica la región V de la cadena H, según la presente descripción, se puede construir un ADN que codifica la región V de la cadena L humanizada obteniendo un gen de la región V de la cadena L de un anticuerpo humano a usar como molde, y después sintetizar la secuencia de nucleótidos completa del ADN que codifica la región V de la cadena L humanizada mediante el uso de un sintetizador de ADN, seguido por el método de PCR. Por ejemplo, se puede generar Z37332 que tiene una homología elevada con la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal anti-TF humano de ratón ATR-5 en forma de la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada.
Para generar la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada, los cebadores de injerto de CDR h5Lv1S (SEQ ID Nº: 85) y h5Lv4S (SEQ ID Nº: 86) tienen una secuencia de ADN directa, y los cebadores de injerto de CDR h5Lv2A (SEQ ID Nº: 87), h5Lv3A (SEQ ID Nº: 88), y h5Lv5A (SEQ ID Nº: 89) tienen una secuencia de ADN inversa, y cada uno tiene una secuencia complementaria de 20 pb a ambos extremos del cebador. El cebador h5Lv1S está diseñado de manera que tenga la secuencia consenso de Kozak (Kozak, M. et al., J. Mol. Biol. 196: 947-950, 1987) y un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción BglII, y h5Lv5A está diseñado también para que tenga un sitio de reconocimiento de la enzima de restricción SplI. Los cebadores exógenos h5LvS (SEQ ID Nº: 90) y h5LvA (SEQ ID Nº: 91) tienen también homología con los cebadores de injerto de CDR h5Lv1S y h5Lv5A.
Como para la región V de la cadena H humanizada, mediante el uso del método de PCR, se construyen cinco ceba-dores para sintetizar un cADN de tamaño completo, y después de añadir un cebador exógeno se puede amplificar el ADN.
La región C de la cadena L del anticuerpo humano puede ser cualquier región C de la cadena L humana, y por ejemplo se puede mencionar la región Cλ y la región Cκ de la cadena L humana.
El ADN de la región V de la cadena L del anticuerpo humanizado construido como se indicó anteriormente se puede unir al ADN de cualquier región C de la cadena L humana, por ejemplo una derivada de la región Cκ o de la región Cλ de la cadena L humana. Después del tratamiento con una enzima de restricción adecuada, se une al ADN que codifica una región C de la cadena L humana bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor para generar un vector de expresión que contiene el ADN que codifica la región V de la cadena L humanizada y la región C de la cadena κ de la cadena L humana.
Incluso si se genera un fragmento de la región V de un anticuerpo humanizado como se mencionó anteriormente, no está claro siempre si dicho fragmento de la región V tiene actividad como anticuerpo (es decir, actividad de unión al antígeno, de neutralización del antígeno, etc.). Así, es necesario investigar la presencia de la actividad combinándola con una cadena H humanizada y expresarla en una célula animal, tal como COS-7.
(iii) Reordenamiento de FRs de la región V de la cadena H y de la cadena L de un anticuerpo humanizado
Los presentes inventores han llevado a cabo la expresión transitoria de un anticuerpo humanizado que contiene una región V de la cadena H y de la cadena L humanizada en una célula animal tal como COS-7 para investigar la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante, y han descubierto que el anticuerpo tiene la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante, pero la actividad no es adecuada en comparación con el anticuerpo quimérico.
Los presentes inventores pueden resolver este problema reordenando secuencialmente cada FR de la región V de la cadena H y de la cadena L humanizadas. El anticuerpo usado en el reordenamiento de FR se puede seleccionar a partir de las bases de datos existentes. La FR del anticuerpo humano seleccionado se puede sintetizar basándose en la secuencia de nucleótidos mostrada en las bases de datos mediante el uso de un sintetizador de ADN. En este punto, como se mencionó anteriormente, añadiendo a CDR o FR la secuencia de reconocimiento diseñada para una enzima de restricción, se puede reordenar fácilmente con la FR de la región V de la cadena H y de la cadena L del anticuerpo humanizado generado anteriormente. Investigando la actividad del anticuerpo humanizado así generado, se puede obtener un anticuerpo humanizado que tenga la actividad de unión al antígeno y la actividad de neutralización.
Por ejemplo, se puede reordenar la FR3 de la cadena H de la región V del anticuerpo humanizado hasta la FR3 derivada del anticuerpo humano Z34963 (GenbBank, Borrentzen M. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91: 1291712921, 1994).
Los cebadores de reordenamiento de FR F3RFFS (SEQ ID Nº: 35) y F3RFBS (SEQ ID Nº: 36) tienen una secuencia de ADN directa, y F3RFFA (SEQ ID Nº: 37) y F3RFBA (SEQ ID Nº: 38) tienen una secuencia de ADN inversa. Los cebadores de reordenamiento de FR F3RFFS, F3RFBS, F3RFFA, y F3RFBA se pueden sintetizar mediante el uso de un sintetizador de ADN.
F3RFFS y F3RFFA, y F3RFBS y F3RFBA se hibridaron, y se digirieron con BalI y XhoI, y NcoI y XhoI, respectivamente. Introduciéndolos en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y confirmando la secuencia de nucleótidos del mismo, se puede obtener un plásmido que tiene la secuencia correcta. El plásmido así obtenido que contenía la cadena H del anticuerpo humanizado se denominó hATR5Hvb/CVIDEC, y la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvb/CVIDEC se denominó versión "b". La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente se muestran en SEQ ID Nº: 39, y la secuencia de aminoácidos de la versión "b" se muestra en SEQ ID Nº: 40.
De una manera similar, la FR derivada de la cadena H y de la cadena L de la región V de otro anticuerpo humano seleccionado a partir de la base de datos se puede reordenar también con la FR de la cadena H y de la cadena L de la región V de un anticuerpo humanizado.
5 Para seleccionar un anticuerpo humano más preferible para reordenar la FR de la región V de la cadena H y la región V de la cadena L de un anticuerpo humanizado, se puede llevar a cabo lo siguiente. Así, una combinación de la versión "b" de la cadena H del anticuerpo humanizado y una cadena L del anticuerpo quimérico tiene una actividad neutralizante igual a la de un anticuerpo quimérico o un anticuerpo de ratón. Sin embargo, la combinación de la
10 versión "b" de la cadena H del anticuerpo humanizado y la versión "a" de la cadena L del anticuerpo humanizado tiene una actividad neutralizante menor que la de un anticuerpo quimérico o un anticuerpo de ratón.
En tales casos, para seleccionar un anticuerpo humano para que sea un candidato para el reordenamiento de FR, se puede llevar a cabo una búsqueda de homología, por ejemplo, para la FR3 (nº de acceso Z34963: SEQ ID Nº: 115)
15 de la versión "b" de la cadena H del anticuerpo humanizado, y se puede obtener un anticuerpo humano que tiene una homología elevada con esta secuencia. Por ejemplo, como FR3 de la región V de la cadena H del anticuerpo humano así seleccionado, se puede mencionar U95239 (SEQ ID Nº: 122) y L03147 (SEQ ID Nº: 123).
Las secuencias de aminoácidos de la cadena H de la región V del anticuerpo humanizado así generado se muestran 20 en las Tablas 3 y 4, y la secuencia de aminoácidos de la cadena L de la región V del anticuerpo humanizado se muestra en la Tabla 5.
Tabla 3 Secuencias de aminoácidos de la región V de la cadena H
imagen1
Tabla 4 Secuencias de aminoácidos de la región V de la cadena H (continuación)
imagen2
Tabla 5 Secuencias de aminoácidos de la región V de la cadena L
imagen3
Cada versión de la región V de la cadena H y de la cadena L del anticuerpo humanizado así construido se puede unir al ADN de cualquier región C de la cadena H humana o región C de la cadena L, por ejemplo las regiones Cγ4 10 de la cadena H humana y Cκ de la cadena L humana, respectivamente. Después del tratamiento con una enzima de restricción adecuada, se une a un ADN que codifica la región Cγ4 de la cadena H humana y la región Cκ de la cadena L humana bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor, y se genera un vector de expresión que contiene un ADN que codifica cada versión de la región V de la cadena H y de la cadena L humanizadas y un ADN que codifica la región Cγ4 de la cadena H humana y Cκ de la cadena L humana.
15 Un ADN que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo humanizado y la región C de la cadena H humana construido como se mencionó anteriormente y un ADN que codifica la región V de la cadena L humanizada y la región C de la cadena L humana se introducen en un único vector (véase, por ejemplo, el documento WO 94/11523), y después se usa dicho vector para transformar una célula hospedadora. Después, el hospedador transformado se
20 puede cultivar in vivo o in vitro para producir el anticuerpo humanizado deseado.
5. Producción de un anticuerpo quimérico y de un anticuerpo humanizado
Para producir un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado, se puede unir un ADN que codifica una región V 25 de la cadena H y una región C de la cadena H y un ADN que codifica una región V de la cadena L y una región C de la cadena L en un único vector, que se transforma en una célula hospedadora adecuada para producir el anticuerpo.
Así, para la expresión del anticuerpo quimérico, se introduce un ADN que codifica una secuencia líder de ratón en el cADN clonado y una región V de la cadena H de ratón y una región C de la cadena H humana y un ADN que codifica una secuencia líder de ratón y una región V de la cadena L de ratón y una región C de la cadena H humana en un único vector de expresión (véase, por ejemplo, el documento WO 94/11523) bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor.
Para la expresión de un anticuerpo humanizado, se introduce un ADN que codifica una región V de la cadena H humanizada y una región C de la cadena H humana y un ADN que codifica una región V de la cadena L humanizada y una región C de la cadena H humana en un único vector de expresión (véase, por ejemplo, el documento WO 94/11523) bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor. Estos vectores se usan para transformar una célula hospedadora. Después, la célula hospedadora transformada se puede cultivar in vivo o in vitro, y por lo tanto se puede producir el anticuerpo quimérico o el anticuerpo humanizado.
También se pueden generar dos vectores de expresión, y cada uno contiene una región V de la cadena H y una región V de la cadena L. Así, para un anticuerpo quimérico se genera un vector de expresión que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena H de ratón y una región C de la cadena H humana bajo el control de un sistema potenciador/promotor y un vector de expresión que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena L de ratón y una región C de la cadena L humana bajo el control de un sistema potenciador/promotor, y para un anticuerpo humanizado se genera un vector de expresión que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena H humanizada y una región C de la cadena H humana bajo el control de un sistema potenciador/promotor y un vector de expresión que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena L humanizada y una región C de la cadena L humana bajo el control de un sistema potenciador/promotor.
De manera alternativa, para el anticuerpo quimérico se genera un vector de expresión que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena H de ratón y una región C de la cadena H humana y un ADN que codifica una región V de la cadena L de ratón y una región C de la cadena L humana bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor, y para el anticuerpo humanizado se genera un vector de expresión que contiene un ADN que codifica una región V de la cadena H humanizada y una región C de la cadena H humana y un ADN que codifica una región V de la cadena L humanizada y una región C de la cadena L humana bajo el control de una región reguladora de la expresión tal como un sistema potenciador/promotor.
Después, estos vectores de expresión se usan para co-transformar células hospedadoras tales como células mamíferas, y las células transformadas se cultivan in vitro o in vivo para producir un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado (véase, por ejemplo, el documento WO 91/16928).
Como se indicó anteriormente en la presente memoria, se cultiva un transformante transformado con un gen que codifica el anticuerpo quimérico o el anticuerpo humanizado deseado, y el anticuerpo quimérico o anticuerpo humanizado producido se puede separar del interior o del exterior de la célula y purificarlo hasta homogeneidad.
El aislamiento y/o la purificación del anticuerpo quimérico o del anticuerpo humanizado, o la proteína deseada de la presente descripción, se puede llevar a cabo mediante el uso de una columna de Proteína A-Sepharose. Otros métodos incluyen, pero sin limitación, los métodos de separación y/o purificación usados para las proteínas habituales. A modo de ejemplo, se puede aislar y/o purificar un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado combinando, según sea apropiado, diversos métodos cromatográficos, ultracentrifugación, desalación, diálisis, y similares.
Para producir el anticuerpo quimérico o el anticuerpo humanizado de la presente descripción hacia TF humano, se puede usar cualquier sistema de expresión. Por ejemplo, cuando se usan células eucarióticas, se pueden usar células animales (por ejemplo, líneas celulares mamíferas establecidas), células fúngicas o células de levadura, y cuando se usan células procarióticas se pueden usar células bacterianas (tales como células de Escherichia coli). Preferiblemente, el anticuerpo quimérico o el anticuerpo humanizado de la presente invención se expresa en células mamíferas tales como células COS o células CHO.
En estos casos, se pueden usar promotores habituales útiles para la expresión en las células mamíferas. Por ejemplo, se usa preferiblemente el promotor temprano inmediato de citomegalovirus humano (HCMV). Los ejemplos de vectores de expresión que contienen el promotor de HCMV incluyen HCMV-VH-HCγ1, HCMV-VL-HCκ, y similares, y los derivados de pSV2neo (documento WO 92-19759).
Otros promotores para la expresión génica en células mamíferas que se pueden usar en la presente descripción incluyen los promotores virales tales como los promotores de retrovirus, poliomavirus, adenovirus, y el virus simio 40 (SV40), y los promotores derivados de células mamíferas tales como el factor de elongación humano 1α de cadenas polipeptídicas (HEF1α). Por ejemplo, la expresión se puede llevar a cabo fácilmente mediante el método de Mulligan et al. (Nature (1979) 277: 108) cuando se usa el promotor de SV40, o mediante el método de Mizushima et al. (Nucleic Acids Res. (1990) 18: 5322) cuando se usa el promotor de HEF1α.
Como origen de replicación, se pueden usar los de SV40, poliomavirus, adenovirus, papilomavirus bovino (BPV) y similares. Además, para la amplificación del número de copias del gen en el sistema celular hospedador, los vectores de expresión pueden incluir como marcadores seleccionables el gen de la fosfotransferasa APH (3') II o I (neo), el gen de la timidina quinasa (TK), el gen de la xantina guaninafosforribosil transferasa (Ecogpt) de E. coli, el gen de la dihidrofolato reductasa (dhfr) y similares.
6. Evaluación de la actividad de unión al antígeno y de la actividad neutralizante del anticuerpo quimérico y del anticuerpo humanizado
(1) Medida de la concentración del anticuerpo mediante ELISA
La concentración del anticuerpo purificado obtenido se puede medir mediante ELISA.
Se pueden preparar placas de ELISA para la medida de la concentración del anticuerpo como sigue: Cada pocillo de una placa de ELISA de 96 pocillos (por ejemplo, Maxisorp, NUNC) se inmoviliza con 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humana de cabra (BioSource) preparado a una concentración de 1 μg/ml.
Después de bloquear con 200 μl del tampón de dilución (denominado más adelante en la presente memoria DB; Tris-HCl 50 mM, MgCl2 1 mM, NaCl 0,15 M, 0,05% de Tween 20, 0,02% de NaN3, 1% de albúmina de suero bovino (BSA), pH 7,2), se diluyen en serie los sobrenadantes del cultivo de células COS-7 o de células CHO en las que se expresaba el anticuerpo quimérico o el anticuerpo humanizado, o el anticuerpo quimérico o el anticuerpo humanizado purificado, y después se añaden a cada pocillo. Después se añaden 100 μl de anticuerpo anti-IgG humana de cabra conjugado a fosfatasa alcalina, se añaden 100 μl de 1 mg/ml de disolución de sustrato (Sigma104, fosfato de p-nitrofenilo, SIGMA), y después se mide la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso del lector de microplacas (Bio-Rad). Como patrón para la medida de la concentración, se puede usar IgG4κ humano (The Binding Site).
(2) Medida de la actividad de unión al antígeno
Se preparan placas de ELISA de células para la medida de la actividad de unión al antígeno como sigue: Se inoculan células de carcinoma de vejiga humana J82 (ATCC HTB-1) en 60 pocillos de una placa de cultivo celular de 96 pocillos a un recuento celular de 1 x 105 células. Esto se cultiva (medio RPMI1640 que contiene un 10% de suero bovino fetal (GIBCO)) durante un día en un incubador de CO2 para permitir que las células se unan. Después de desechar el líquido de cultivo, cada pocillo se lava dos veces con 300 μl de PBS. Se añaden 100 μl de PBS que contiene un 4% de paraformaldehído (denominado más adelante en la presente memoria PFA/PBS) a cada pocillo, y se colocan en hielo durante 10 minutos para inmovilizar las células.
Se desecha el PFA/PBS, y cada pocillo se lava dos veces con 300 μl de PBS, y después se bloquea con 250 μl de DB. Se diluyen en serie 100 μl de los sobrenadantes de cultivo que contienen un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado, o un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado purificado, y después se añaden a cada pocillo, y se incuban a temperatura ambiente durante 2 horas. Después de lavar con tampón de lavado (denominado más adelante en la presente memoria RB PBS que contiene un 0,05% de Tween 20), se añaden 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humano de cabra conjugado a fosfatasa alcalina (BioSource) diluido 1000 veces con DB. Después de incubar a temperatura ambiente durante 1 hora y lavar con RB, se añade la disolución de sustrato, y después se mide la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso del lector de microplacas (Bio-Rad).
(3) Medida de la actividad neutralizante
La actividad neutralizante de un anticuerpo de ratón, un anticuerpo quimérico, y los anticuerpos humanizados se puede medir con la actividad de inhibición de la producción del Factor Xa mediante tromboplastina derivada de placenta humana, Thromborel S (Boehringer AG), como índice. Así, se añaden 60 μl del tampón (TBS que contiene CaCl2 5 mM y un 0,1% de BSA) a 10 μl de 1,25 mg/ml de Thromborel S y 10 μl de un anticuerpo diluido de manera adecuada, que después se incuba en una placa de 96 pocillos a temperatura ambiente durante 1 hora.
Se le añaden 10 μl de 3,245 μg/ml de Factor X humano (Celsus Laboratories) y 82,5 ng/ml de Factor VIIa humano (Enzyme Research), y después se incuba a temperatura ambiente durante 1 hora más. Después de añadir 10 μl de EDTA 0,5 M para parar la reacción, se añaden 50 μl de la disolución de sustrato cromogénico y se determina la absorbancia a 405/655 nm. Después de hacer reaccionar a temperatura ambiente durante 1 hora, se determina de nuevo la absorbancia a 405/655 nm. La actividad neutralizante se puede determinar calculando la actividad residual (%) de cada cambio de absorbancia, con el cambio de absorbancia sin adición de anticuerpo como una actividad del 100%.
La disolución de sustrato cromogénico se prepara disolviendo el sustrato cromogénico S-2222 de Testzyme (Chromogenix) según las instrucciones adjuntas, diluyendo 2 veces con agua purificada y después mezclando con una disolución de polibreno (0,6 mg/ml de bromuro de hexadimetileno, SIGMA) a 1:1.
7. Análisis cinético en la interacción del anticuerpo humanizado y TF soluble
Se pueden determinar los parámetros cinéticos, es decir, las constantes de disociación (KD), las constantes de la velocidad de disociación (kdiss), y las constantes de la velocidad de unión (kass), del anticuerpo anti-TF de la presente descripción mediante BIACORE.
Se inmoviliza Proteína G recombinante sobre un chip sensor, al que está acoplado el anticuerpo, y se usa TF recombinante purificado (un TF 1-219 soluble que se marcó con el péptido FLAG) (en adelante denominado TF soluble) como antígeno, mientras se usa TF soluble preparado a diversas concentraciones como analito. A partir del sensorgrama obtenido, se calculan los parámetros cinéticos (constante de la velocidad de disociación kdiss, y constante de la velocidad de unión kass), a partir de los cuales se puede determinar la constante de disociación. Para el análisis cinético, véase, por ejemplo, "Kinetic analysis of monoclonal antibody-antigen interactions with a new biosensor based analytical system" (Karlsson, R. et al., (1991) J. Immunol. Methods 145: 229-240).
Se prefiere que el anticuerpo anti-TF de la presente descripción tenga un valor menor de las constantes de disociación (KD), ya que tendrá una actividad neutralizante superior. En el anticuerpo anti-TF de la presente descripción, los valores de KD preferiblemente son menores de 2,30 x 10−8 [1/M], más preferiblemente son menores de 2,30 x 10−9 [1/M], y lo más preferiblemente son menores de 1,17 x 10−9 [1/M].
Además, los valores de KD se determinan a partir de dos parámetros, la constante de la velocidad de disociación (kdiss) y la constante de la velocidad de unión (kass) (KD = kdiss/kass). Así, es evidente que cuando una kdiss es pequeña y una kass es grande, el valor de KD se hace pequeño.
De manera específica, en el caso del anticuerpo anti-TF de la presente descripción, los valores de kdiss pueden ser menores de 9,52 x 10−3 [1/seg]. Preferiblemente, los valores de kdiss son menores de 9,52 x 10−4 [1/seg], lo más preferiblemente son menores de 6,35 x 10−4 [1/seg].
Por otra parte, los valores de kass pueden ser mayores de 4,15 x 104 [1/M·seg]. Preferiblemente, los valores de kass son mayores de 4,15 x 105 [1/M·seg], y lo más preferiblemente son mayores de 4,65 x 105 [1/M·seg].
Además, los anticuerpos anti-TF tienen preferiblemente un valor de kdiss que es menor de 9,52 x 10−3 [1/seg] y un valor de kass que es mayor de 4,15 x 104 [1/M·seg].
Más específicamente, para el anticuerpo anti-TF de la presente descripción, los valores de KD están en el intervalo de 1,09 x 10−10 - 2,30 x 10−8 [1/M], preferiblemente 1,09 x 10−9 - 2,30 x 10−9 [1/M], y lo más preferiblemente 1,09 x 10−9 - 1,39 x 10−9 [1/M].
Además, los valores de kdiss están en el intervalo de 5,06 x 10−4 - 9,52 x 10−3 [1/seg], preferiblemente 5,06 x 10−4 -9,52 x 10−4 [1/seg], y lo más preferiblemente 5,06 x 10−4 - 6,49 x 10−4 [1/seg].
Y los valores de kass están en el intervalo de 4,15 x 104 - 5,44 x 105 [1/M·seg], preferiblemente 4,15 x 105 - 5,44 x 105 [1/M·seg], y lo más preferiblemente 4,65 x 105 - 5,44 x 105 [1/M·seg].
Aunque estos valores de KD, valores de kdiss, y valores de kass se pueden obtener, además de BIACORE, mediante análisis de Scatchard y similares, se prefiere usar BIACORE.
8. Medida de la reactividad del anticuerpo humanizado hacia TF humano
Se puede usar el método de hibridación de transferencia puntual para investigar la reactividad del TF sin desnaturalizar, el TF desnaturalizado en condiciones no reductoras, y el TF desnaturalizado en condiciones reductoras.
El TF puede ser el que se purificó a partir de tejido humano, o que se expresó en células mamíferas, tales como células CHO, y se purificó, y se puede usar para investigación. Como agente desnaturalizante, se puede usar hidrocloruro de guanidina o SDS, etc., en vez de urea. Como agente reductor, se puede usar un agente reductor de SH tal como 2-mercaptoetanol en vez de DTT. Para la detección del anticuerpo humanizado, se puede usar un anticuerpo anti-IgG humana marcado con diversas sustancias. Tal como se usa en la presente memoria, los agentes marcadores pueden ser radioisótopos, biotina, sustancias fluorescentes tales como FITC, enzimas tales como peroxidasa y fosfatasa alcalina, y similares. El anticuerpo anti-TF de la presente descripción reacciona con cualquiera de los TF sin desnaturalizar, TF desnaturalizado en condiciones no reductoras, y TF desnaturalizado en condiciones reductoras.
9. Composiciones farmacéuticas y agentes terapéuticos para CID que comprenden un anticuerpo humanizado como ingrediente activo
Para confirmar el efecto terapéutico del anticuerpo humanizado sobre el TF humano, se administra el anticuerpo anti-TF humano humanizado a un animal que tiene un síntoma de CID elevada, y después se miden los índices de CID para confirmar el efecto terapéutico.
El anticuerpo, tal como se usa en la presente memoria, es un anticuerpo humanizado hacia TF humano. El anticuerpo neutraliza la actividad de TF humano uniéndose al TF humano, y se puede mencionar preferiblemente un anticuerpo ATR5 humanizado. El método de generación del anticuerpo ATR5 humanizado se describe en los Ejemplos.
El anticuerpo, tal como se usa en la presente memoria, se puede purificar hasta una pureza elevada combinando métodos de purificación habituales tales como desalación, un método de filtración en gel tal como HPLC, cromatografía de afinidad mediante el uso de una columna de Proteína A, y similares. Se puede confirmar que el anticuerpo así purificado reconoce el TF humano con una precisión elevada mediante el uso de medios inmunológicos habituales tales como radioinmunoensayo (RIA), enzimoinmunoensayo (EIA, ELISA), o un método con un anticuerpo inmunofluorescente (análisis de inmunofluorescencia) y similares.
Las composiciones farmacéuticas o los agentes terapéuticos para CID de la presente descripción que comprenden como ingrediente activo el anticuerpo humanizado hacia TF se pueden administrar de manera no oral, sistémicamente o localmente. Por ejemplo, el método de administración se puede seleccionar de inyección intravenosa tal como infusión por goteo, inyección intramuscular, inyección intraperitoneal, e inyección subcutánea, y se puede seleccionar, según sea adecuado, basándose en la edad y el estado del paciente. La dosis eficaz se elige del intervalo de 0,01 mg a 1000 mg por kg de peso corporal por administración. De manera alternativa, se puede elegir la dosis de 10 mg/kg de peso corporal, preferiblemente 1 a 1000 mg/kg de peso corporal por paciente.
Las composiciones farmacéuticas y los agentes terapéuticos para CID de la presente descripción que contienen un anticuerpo humanizado hacia TF humano como ingrediente activo pueden contener vehículos o aditivos farmacéuticamente aceptables dependiendo de la vía de administración. Los ejemplos de tales vehículos o aditivos incluyen agua, un disolvente orgánico farmacéuticamente aceptable, colágeno, poli(alcohol vinílico), polivinilpirrolidona, un polímero de carboxivinilo, carboximetilcelulosa sódica, poliacrilato sódico, alginato sódico, dextrano hidrosoluble, carboximetil almidón sódico, pectina, metil celulosa, etil celulosa, goma de xantano, goma arábiga, caseína, gelatina, agar, diglicerina, glicerina, propilen glicol, polietilen glicol, vaselina, parafina, alcohol estearílico, ácido esteárico, albúmina de suero humana (HSA), manitol, sorbitol, lactosa, un tensoactivo farmacéuticamente aceptable y similares. Los aditivos usados se eligen, pero sin limitación, de los anteriores o de combinaciones de los mismos, según sea adecuado, dependiendo de la forma farmacéutica de la presente descripción.
Efectos de la Invención
Según la presente descripción, se proporciona un anticuerpo quimérico y un anticuerpo humanizado hacia TF humano, y un procedimiento reivindicado de generación de un anticuerpo humanizado. Estos anticuerpos son útiles como agentes terapéuticos debido a su baja antigenicidad.
Ejemplos
La presente invención se explicará a continuación con más detalle con referencia a los siguientes Ejemplos.
Ejemplo 1. Clonación del ADN que codifica la región V de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano
(1)
Preparación de mARN
Se preparó mARN a partir de los hibridomas ATR-2, ATR-3, ATR-4, ATR-5 (IgG1κ), ATR-7, y ATR-8 (IgG2aκ) mediante el uso del equipo de purificación de mARN QuickPrep (Pharmacia Biotech). Cada célula de hibridoma se homogeneizó completamente en el tampón de extracción según las instrucciones adjuntas con el equipo, y después se purificó el mARN mediante la columna de centrifugación de oligo (dT)-celulosa, seguido de precipitación con etanol. El precipitado de mARN se disolvió en el tampón de elución.
(2)
Preparación y amplificación del cADN del gen que codifica una región V de un anticuerpo de ratón
(i)
Clonación del cADN de la región V de la cadena H
Se llevó a cabo la clonación del gen que codifica la región V de la cadena H de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano mediante el uso del método 5'-RACE (Frohman, M. A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 89989002, 1988; Belyavsky, A. et al., Nucleic Acids Res. 17: 2919-2932, 1989). Para el método 5'-RACE, se usó el equipo de amplificación de cADN Marathon (CLONTECH) y el procedimiento se llevó a cabo según las instrucciones adjuntas con el equipo.
Mediante el uso de alrededor de 1 μg de mARN preparado como se mencionó anteriormente como molde, se añadió el cebador de síntesis de cADN adjunto con el equipo, que se hizo reaccionar con una transcriptasa inversa a 42 °C durante 60 minutos para llevar a cabo la transcripción inversa hasta el cADN. Esto se hizo reaccionar con la ADN polimerasa I, ADN ligasa, y RNasaH a 16 °C durante 1,5 hora, y con T4 ADN polimerasa a 16 °C durante 45 minutos, por lo que se sintetizó un cADN bicatenario. El cADN bicatenario se extrajo con fenol y cloroformo, y se recuperó mediante precipitación con etanol.
Mediante la reacción durante la noche con una T4 ADN ligasa a 16 °C, se ligó un adaptador de cADN a ambos extremos del cADN bicatenario. La mezcla de reacción se diluyó 50 veces con Tricina-KOH 10 mM (pH 8,5) que contenía EDTA 0,1 mM. Usando esto como molde, se amplificó del gen que codifica la región V de la cadena H mediante PCR. Se usó el cebador adaptador 1 adjunto con el equipo para el cebador del extremo 5', y para el cebador del extremo 3' se usó el cebador MHC-G1 (SEQ ID Nº: 1) (ATR-2, ATR-3, ATR-4, y ATR-5) o el cebador MHC-G2a (SEQ ID Nº: 2) (ATR-7 y ATR-8) (S. T. Jones, et al., Biotechnology, 9: 88-89, 1991).
Las disoluciones de PCR para la región V de la cadena H de los anticuerpos ATR-2, 3, 4, y 5 contuvieron, en 100 μl, Tris-HCl 120 mM (pH 8,0), KCl 10 mM, (NH4)2SO4 6 mM, 0,1% de Triton X-100, 0,001% de BSA, dNTPs 0,2 mM (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), MgCl2 1 mM, 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki), 30-50 pmoles de cebador adaptador 1, así como cebador MHC-G1, y 1-5 μl de una mezcla de reacción de cADN a la que se ligó el adaptador de cADN.
Todas las PCRs se llevaron a cabo mediante el uso del termociclador de ADN 480 (Perkin-Elmer), y la PCR se realizó durante treinta ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 55 °C durante 30 segundos, y 74 °C durante 1 minuto.
(ii) Clonación del cADN de la región V de la cadena L
Se llevó a cabo la clonación del gen que codifica la región V de la cadena L de un anticuerpo monoclonal de ratón hacia TF humano mediante el uso del método 5'-RACE (Frohman, M. A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 89989002, 1988; Belyavsky, A. et al., Nucleic Acids Res. 17: 2919-2932, 1989). Para el método 5'-RACE, se usó el equipo de amplificación de cADN Marathon (CLONTECH) y se llevó a cabo según las instrucciones adjuntas con el equipo. Mediante el uso de alrededor de 1 μg de mARN preparado como se mencionó anteriormente como molde, se añadió el cebador de síntesis de cADN, que se hizo reaccionar con una transcriptasa inversa a 42 °C durante 60 minutos para llevar a cabo la transcripción inversa hasta el cADN.
Esto se hizo reaccionar con la ADN polimerasa I, ADN ligasa, y RNasaH a 16 °C durante 1,5 horas, y con T4 ADN polimerasa a 16 °C durante 45 minutos, por lo que se sintetizó un cADN bicatenario. El cADN bicatenario se extrajo con fenol y cloroformo, y se recuperó mediante precipitación con etanol. Mediante la reacción durante la noche con una T4 ADN ligasa a 16 °C, se ligó un adaptador de cADN a ambos extremos del cADN bicatenario. La mezcla de reacción se diluyó 50 veces con Tricina-KOH 10 mM (pH 8,5) que contenía EDTA 0,1 mM. Usando esto como molde, se amplificó del gen que codifica la región V de la cadena L mediante PCR. Se usó el cebador adaptador 1 para el cebador del extremo 5', y para el cebador del extremo 3' se usó el cebador MKC (SEQ ID Nº: 3) (S. T. Jones, et al., Biotechnology, 9: 88-89, 1991).
Las disoluciones de PCR contenían, en 100 μl, Tris-HCl 120 mM (pH 8,0), KCl 10 mM, (NH4)2SO4 6 mM, 0,1% de Triton X-100, 0,001% de BSA, dNTPs 0,2 mM (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), MgCl2 1 mM, 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki), 30-50 pmoles de cebador adaptador 1, así como cebador MKC, y 1 μl de una mezcla de reacción de cADN a la que se ligó el adaptador de cADN.
Todas las PCRs se llevaron a cabo mediante el uso del termociclador de ADN 480 (Perkin-Elmer), y la PCR se realizó durante treinta ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 55 °C durante 30 segundos, y 74 °C durante 1 minuto.
(3) Purificación y fragmentación de los productos de PCR
La mezcla de reacción de PCR anterior se extrajo con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN amplificados se recuperaron mediante precipitación con etanol. Los fragmentos de ADN se digirieron con la enzima de restricción XmaI (New England Biolabs) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión de XmaI se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de agarosa NuSieve GTG del 2%-3% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 500 pb de la región V de la cadena H y fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 500 pb de la región V de la cadena L. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, se precipitaron los fragmentos de ADN con etanol, que se disolvieron después en 10 μl de Tris-HCl 10 mM (pH 8,0) que contenía EDTA 1 mM (denominado más adelante en la presente memoria TE).
Los fragmentos de ADN digeridos con XmaI preparados como se mencionó anteriormente que contenían un gen que codifica una región V de la cadena H de ratón y una región V de la cadena L de ratón y el vector plasmídico pUC19 preparado digiriendo con XmaI se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante reacción a 16 °C durante 1 hora según las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C.
Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), y se incubaron a 37 °C durante 1 hora. Después, se colocaron en placas las células de Escherichia coli en un medio de agar LB (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Sambrook, et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989) que contenía 100 μg/ml de ampicilina (denominado más adelante en la presente memoria medio de agar LBA), y se incubó durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli.
El transformante se cultivó durante la noche en 3 ml o 4 ml de un medio LB que contenía 50 μg/ml de ampicilina (denominado más adelante en la presente memoria medio LBA) a 37 °C, y a partir de las fracciones celulares, se preparó ADN plasmídico mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN), y después se determinó la secuencia de nucleótidos.
(4) Determinación de la secuencia de nucleótidos del gen que codifica una región V de un anticuerpo de ratón
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido anterior mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) (SEQ ID Nº: 4) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo) (SEQ ID Nº: 5), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones.
Los plásmidos así obtenidos que contenían el gen que codifica la región V de la cadena H de ratón derivada de los hibridomas ATR-2, ATR-3, ATR-4, ATR-5, ATR-7, y ATR-8 se denominaron ATR-xHv/pUC19 (x = 2, 3, 4, 5, 7, o 8), y los plásmidos así obtenidos que contenían el gen que codifica una región V de la cadena L de ratón derivados de los hibridomas ATR-2, ATR-3, ATR-4, ATR-5, ATR-7, y ATR-8 se denominaron ATR-xLv/pUC19 (x = 2, 3, 4, 5, 7, o 8). La secuencias de nucleótidos de los genes que codifican la región V de la cadena H de cada anticuerpo de ratón contenidas en el plásmido ATR-xHv/pUC19 (x = 2, 3, 4, 5, 7, o 8) (lo que incluye las secuencias de aminoácidos correspondientes) se muestran en SEQ ID Nº: 6 a 11, respectivamente, y las secuencias de nucleótidos de los genes que codifican la región V de la cadena L de cada anticuerpo de ratón contenidas en el plásmido ATR-xLv/pUC19 (x = 2, 3, 4, 5, 7, o 8) (lo que incluye las secuencias de aminoácidos correspondientes) se muestran en SEQ ID Nº: 12 a 17, respectivamente.
Ejemplo 2. Construcción de un anticuerpo quimérico
Se generó un anticuerpo ATR-5 quimérico en el que la región V del anticuerpo ATR-5 de ratón se ligó a la región C de un anticuerpo humano. Se construyó un vector de expresión del anticuerpo quimérico ligando el gen que codifica la región V del anticuerpo ATR-5 a un vector de expresión que codifica la región C de un anticuerpo humano.
(1) Construcción de una región V de la cadena H de un anticuerpo quimérico
Se modificó la región V de la cadena H del anticuerpo ATR-5 mediante el método de PCR para ligarla a un vector de expresión que codifica la región C de la cadena H del anticuerpo humano. El cebador del extremo 5' ch5HS (SEQ ID Nº: 18) se diseñó para que hibridase al extremo 5' del ADN que codifica la región V y para que tuviera la secuencia consenso de Kozak (Kozak, M. et al., J. Mol. Biol. 196: 947-950, 1987) y una secuencia de reconocimiento de la enzima de restricción SalI. El cebador del extremo 3' ch5HA (SEQ ID Nº: 19) se diseñó para que hibridase al extremo 3' del ADN que codifica la región J y para que tuviera una secuencia de reconocimiento de la enzima de restricción NheI.
Las disoluciones de PCR contuvieron, en 100 μl, Tris-HCl 120 mM (pH 8,0), KCl 10 mM, (NH4)2SO4 6 mM, 0,1% de Triton X-100, 0,001% de BSA, dNTPs 0,2 mM (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), MgCl2 1 mM, 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki), 50 pmoles del cebador ch5HS y del cebador ch5HA, así como 1 μl del plásmido ATR5Hv/pUC19 como molde de ADN. Para la PCR, se usó el termociclador de ADN 480 (Perkin-Elmer), y la PCR se llevó a cabo durante treinta ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 55 °C durante 30 segundos, y 74 °C durante 1 minuto.
La mezcla de reacción de PCR se extrajo con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN amplificados se recuperaron mediante precipitación con etanol. Los fragmentos de ADN se digirieron con la enzima de restricción NheI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora, y después con la enzima de restricción SalI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 3% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 450 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y después se disolvieron en 20 μl de TE.
Como vector de clonación, se usó un vector con promotor alterado (denominado más adelante en la presente memoria CVIDEC) en el que se introdujeron las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción NheI, SalI, y SplI, BglII. El fragmento del gen preparado como se mencionó anteriormente que codificaba la región V de la cadena H de ratón y el vector CVIDEC preparado digiriendo con NheI y SalI se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante una reacción a 16 °C durante 1 hora siguiendo las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con el medio de agar LBA y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 3 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN).
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones. El plásmido que contiene el gen que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo ATR-5, una secuencia de reconocimiento de SalI y la secuencia consenso de Kozak en el extremo 5', y una secuencia de reconocimiento de NheI en el extremo 3' se denominó chATR5Hv/CVIDEC.
(2) Construcción de una región V de la cadena L de un anticuerpo quimérico
Se modificó la región V de la cadena L del anticuerpo ATR-5 mediante el método de PCR para ligarla a un vector de expresión que codifica la región C de la cadena L del anticuerpo humano. El cebador del extremo 5' ch5LS (SEQ ID Nº: 20) se diseñó para que hibridase al extremo 5' del ADN que codifica la región V y para que tuviera la secuencia consenso de Kozak (Kozak, M. et al., J. Mol. Biol. 196: 947-950, 1987) y una secuencia de reconocimiento de la enzima de restricción BglII. El cebador del extremo 3' ch5LA (SEQ ID Nº: 21) se diseñó para que hibridase al extremo de 3' del ADN que codifica la región J y para que tuviese una secuencia de reconocimiento de la enzima de restricción SplI.
Las disoluciones de PCR contenían, en 100 μl, Tris-HCl 120 mM (pH 8,0), KCl 10 mM, (NH4)2SO4 6 mM, 0,1% de Triton X-100, 0,001% de BSA, dNTPs 0,2 mM (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), MgCl2 1 mM, 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki), 50 pmoles del cebador ch5LS y del cebador ch5LA, así como 1 μl del plásmido ATR 5Lv/pUC19 como molde de ADN. Para la PCR, se usó el termociclador de ADN 480 (Perkin-Elmer), y la PCR se llevó a cabo durante treinta ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 55 °C durante 30 segundos, y 74 °C durante 1 minuto.
La mezcla de reacción de PCR se extrajo con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN amplificados se recuperaron mediante precipitación con etanol. Los fragmentos de ADN se digirieron con la enzima de restricción SplI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora, y después con la enzima de restricción BglII (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 3% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 400 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y después se disolvieron en 20 μl de TE.
El fragmento del gen preparado como se mencionó anteriormente que codificaba la región V de la cadena L de ratón y el vector CVIDEC preparado digiriendo con SplI y BglII se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante una reacción a 16 °C durante 1 hora siguiendo las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con un medio de agar LBA de 100 μg/ml y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 3 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN).
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones. El plásmido que contiene el gen que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo ATR-5 y el que tiene una secuencia de reconocimiento de BglII y la secuencia consenso de Kozak en el extremo 5', y una secuencia de reconocimiento de SplI en el extremo 3' se denominó chATR5Lv/CVIDEC.
(3) Construcción de un vector de expresión de un anticuerpo quimérico
Se construyó un vector de expresión de un anticuerpo quimérico mediante el uso de un vector de expresión de anticuerpo de IDEC Pharmaceuticals. Como vector, se usó el vector de expresión de un anticuerpo de tipo IgG1 H5KG1(V) y el vector de expresión de un anticuerpo de tipo IgG4 N5KG4P. El vector de expresión del anticuerpo ATR-5 quimérico se generó ligando un gen que codificaba la región V de la cadena H de ATR-5 al sitio SalI-NheI localizado inmediatamente antes de la región C de la cadena H del anticuerpo humano del vector de expresión N5KG1(V) o N5KG4P y ligando un gen que codificaba la región V de la cadena L de ATR-5 al sitio BglII-SplI localizado inmediatamente antes de la región C de la cadena L del anticuerpo humano del vector de expresión N5KG1(V)
o N5KG4P.
(i) Introducción de la región V de la cadena H
El plásmido chATR5Hv/CVIDEC se digirió con la enzima de restricción NheI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 3 horas, y con la enzima de restricción SalI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 3 horas. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa mediante el uso de agarosa NuSieve GTG al 1,5% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 450 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y después se disolvieron en 20 μl de TE.
Los vectores de expresión N5KG1(V) y N5KG4P se digirieron con la enzima de restricción NheI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 3 horas, y con la enzima de restricción SalI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 3 horas. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa mediante el uso de agarosa NuSieve GTG al 1,5% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 9000 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y después se disolvieron en 20 μl de TE.
El fragmento de ADN SalI-NheI preparado como se mencionó anteriormente que contenía el gen que codifica la región V de la cadena H, y N5KG1(V) o N5KG4P digerido con SalI y NheI, se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante reacción a 16 °C durante 1 hora según las instrucciones adjuntas.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con un medio de agar LBA de 100 μg/ml y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 3 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN). Estos plásmidos que contenían los genes que codifican la cadena H del anticuerpo ATR-5 quimérico se denominaron chATR5Hv/N5KG1(V) y chATR5Hv/N5KG4P, respectivamente.
(ii) Introducción de la región V de la cadena L
El plásmido chATR5Lv/CVIDEC se digirió con las enzimas de restricción BglII (Takara Shuzo) y SplI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1,5 horas. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa mediante el uso de agarosa NuSieve GTG al 1,5% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 400 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y después se disolvieron en 20 μl de TE.
Los plásmidos chATR5Hv/N5KG1(V) y chATR5Hv/N5KG4P se digirieron con las enzimas de restricción BglII (Takara Shuzo) y SplI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1,5 horas. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa mediante el uso de agarosa NuSieve GTG al 1,5% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 9400 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y después se disolvieron en 20 μl de TE.
El fragmento de ADN SplI-BglII preparado como se mencionó anteriormente que contenía el gen que codifica la región V de la cadena L, y chATR5Hv/N5KG1(V) o chATR5Hv/N5KG4P digeridos con SplI y BglII, se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante reacción a 16 °C durante 1 hora según las instrucciones adjuntas.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con un medio de agar LBA de 100 μg/ml y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 1 l del medio 2xYT que contenía 50 μg/ml de ampicilina, y a partir de las fracciones celulares, se preparó ADN plasmídico mediante el uso del equipo Plasmid Maxi (QIAGEN). Estos plásmidos que contienen el gen que codifica el anticuerpo ATR-5 quimérico se denominaron chATR5/N5KG1(V) y chATR5/N5KG4P, respectivamente.
(4) Transfección en células COS-7
Para determinar la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante del anticuerpo quimérico, se transfectó el plásmido de expresión anterior a células COS-7 y el anticuerpo se expresó de manera transitoria.
El plásmido chATR5/N5KG1(V) o chATR5/N5KG4P se transdujo en células COS-7 mediante electroporación mediante el uso del instrumento Gene Pulser (Bio-Rad). Se añadieron 50 μg del plásmido a 0,78 ml de células COS-7 suspendidas en PBS Dulbecco (−) (denominado más adelante en la presente memoria PBS) a una concentración celular de 1 x 107 células/ml, que se sometieron a pulsos de 1.500 V y 25 μF de capacidad.
Después de 10 minutos de período de recuperación a temperatura ambiente, las células sometidas a electroporación se suspendieron en un medio DMEM que contenía un 5% de suero bovino fetal Ultra Low IgG (GIBCO), y se cultivaron mediante el uso de una placa de cultivo de 10 cm en un incubador con un 5% de CO2. Después de cultivar durante 24 horas, se aspiró el sobrenadante del cultivo, y después se añadió un medio HBCHO exento de suero (Irvine Scientific). Después de cultivar durante otras 72 horas, se recogió el sobrenadante del cultivo y se centrifugó para eliminar los restos celulares.
(5) Purificación del anticuerpo
A partir del sobrenadante del cultivo de células COS-7, se purificó el anticuerpo quimérico mediante el uso de rProtein A Sepharose Fast Flow (Pharmacia Biotech) como sigue.
Se colocó un ml de rProtein A Sepharose Fast Flow en una columna, y la columna se equilibró con 10 volúmenes de TBS. El sobrenadante del cultivo de células COS-7 se aplicó a la columna equilibrada, que después se lavó con 10 volúmenes de TBS.
La fracción de anticuerpo adsorbida se eluyó después con 13,5 ml de HCl 2,5 mM (pH 3,0), y el eluato se neutralizó inmediatamente mediante la adición de 1,5 ml de Tris-HCl 1 M (pH 8,0).
Llevando a cabo la ultrafiltración dos veces para la fracción de anticuerpo purificada mediante el uso de Centriprep 100 (Amicon), se sustituyó el disolvente por Tris-HCl 50 mM (pH 7,6) que contenía NaCl 150 mM (denominado más adelante en la presente memoria TBS), y finalmente se concentró hasta alrededor de 1,5 ml.
(6) Establecimiento de una línea celular CHO de producción estable
Para establecer una línea celular que produzca de manera estable el anticuerpo quimérico, el plásmido de expresión anterior se introdujo en células CHO (DG44) aclimatadas al medio CHO-S-SFMII exento de suero (GIBCO).
El plásmido chATR5/N5KG1(V) o chATR5/N5KG4P se escindió con la enzima de restricción SspI (Takara Shuzo) para linealizar el ADN, y tras la extracción con fenol y cloroformo, se recuperó el ADN mediante precipitación con etanol. El plásmido linealizado se transdujo en las células DG44 mediante electroporación mediante el uso del instrumento Gene Pulser (Bio-Rad). Se añadieron 10 μg del plásmido a 0,78 ml de células DG44 suspendidas en PBS a una concentración celular de 1 x 107 células/ml, que se sometieron a pulsos de 1.500 V y 25 μF de capacidad.
Después de 10 minutos de período de recuperación a temperatura ambiente, las células sometidas a electroporación se suspendieron en un medio CHO-S-SFMII (GIBCO) que contenía hipoxantina/timidina (GIBCO), y se cultivaron mediante el uso de dos placas de 96 pocillos (Falcon) en un incubador con un 5% de CO2. En el día después del inicio del cultivo, el medio se cambió por un medio de selección que contenía el medio CHO-S-SFMII (GIBCO) que contenía hipoxantina/timidina (GIBCO) y 500 μg/ml de GENETICIN (G418Sulfate, GIBCO) para seleccionar las células en las que se había introducido el gen del anticuerpo. Después de cambiar el medio de selección, se examinaron las células con un microscopio aproximadamente dos semanas más tarde. Después de observar un crecimiento celular favorable, se midió la cantidad de anticuerpo producido mediante el ELISA descrito más adelante para determinar la concentración del anticuerpo, y se seleccionaron las células que tenían un rendimiento elevado de producción de anticuerpo.
Ejemplo 3. Construcción de un anticuerpo humanizado
(1)
Construcción de la cadena H de un anticuerpo humanizado
(i)
Construcción de la versión "a" de la cadena H humanizada
Se generó la cadena H del anticuerpo ATR-5 humanizado mediante el uso del injerto de CDR con el método de PCR. Para generar la versión "a" de la cadena H del anticuerpo humanizado que tenía las FRs derivadas del anticuerpo humano L39130 (DDBJ, Gao L. et al., sin publicar, 1995), se usaron siete cebadores de PCR. Los cebadores de injerto de CDR hR5Hv1S (SEQ ID Nº: 22), hR5Hv2S (SEQ ID Nº: 23), y hR5Hv4S (SEQ ID Nº: 24) tienen una secuencia de ADN directa, y los cebadores de injerto de CDR hR5Hv3A (SEQ ID Nº: 25) y hR5Hv5A (SEQ ID Nº: 26) tienen una secuencia de ADN inversa, y cada cebador tiene una secuencia complementaria de 18-35 pb en ambos extremos.
hR5Hv1S se diseñó para que tuviera la secuencia consenso de Kozak (Kozak, M. et al., J. Mol. Biol. 196: 947-950, 1987) y un sitio de reconocimiento de SalI, y hR5Hv5A se diseñó de manera que tuviera un sitio de reconocimiento de NheI. El cebador exógeno hR5HvPrS (SEQ ID Nº: 27) tiene homología con el cebador de injerto de CDR hR5Hv1S, y hR5HvPrA (SEQ ID Nº: 28) tiene homología con el cebador de injerto de CDR hR5Hv5A.
Los cebadores de injerto de CDR hR5Hv1S, hR5Hv2S, hR5Hv3A, hR5Hv4S, y hR5Hv5A, y los cebadores exógenos hR5HvPrS y hR5HvPrA fueron sintetizados y purificados por Pharmacia Biotech.
La PCR se llevó a cabo mediante el uso de la KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki) y mediante el uso del tampón adjunto que contenía Tris-HCl 120 mM (pH 8,0), KCl 10 mM, (NH4)2SO4 6 mM, 0,1% de Triton X100, 0,001% de BSA, dNTPs 0,2 mM (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), MgCl2 1 mM, 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki), y 5 pmoles de cada uno de los cebadores de injerto de CDR hR5Hv1S, hR5Hv2S, hR5Hv3A, hR5Hv4S, y hR5Hv5A en 98 μl, durante 5 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 50 °C durante 1 minuto, y 72 °C durante 1 minuto. Tras la adición posterior de 100 pmoles de los cebadores exógenos hR5HvPrS y hR5HvPrA, se llevó a cabo la PCR durante 25 ciclos en un sistema de 100 μl con el mismo ciclo de temperaturas. Los fragmentos de ADN amplificados mediante el método de PCR se separaron mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 2% (FMC BioProducts).
Se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 430 pb, se les añadieron 3 volúmenes (ml/g) de TE, y después se extrajeron con fenol, fenol/cloroformo, y cloroformo para purificar los fragmentos de ADN. Después de precipitar el ADN purificado con etanol, se disolvió un tercio del volumen del mismo en 17 μl de agua. La mezcla de la reacción de PCR obtenida se digirió con NheI y SalI, y se ligó al vector plasmídico CVIDEC preparado mediante digestión con NheI y SalI, mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) según las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con el medio de agar LBA y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 3 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN).
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones.
Debido a que se observaron mutaciones y/o deleciones antes o después del sitio de reconocimiento de EcoT221, cada uno de los fragmentos que tenían la secuencia correcta se ligaron y después se subclonaron de nuevo en CVIDEC para determinar la secuencia de nucleótidos. El plásmido que tenía la secuencia correcta se denominó hATR5Hva/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "a" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC se muestran en SEQ ID Nº: 29. La secuencia de aminoácidos de la versión "a" se muestra también en SEQ ID Nº: 30.
(ii) Construcción de las versiones "b" y "c" de la cadena H humanizada
Las versiones "b" y "c" se generaron sustituyendo la FR3 de la versión "a" con la FR3 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR3 en la versión "b" con una derivada del anticuerpo humano Z34963 (DDBJ, Borretzen M. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91: 12917-12921, 1994), se generaron los cuatro cebadores de ADN que codificaban la FR3. Los cebadores de reordenamiento de FR F3RFFS (SEQ ID Nº: 31) y F3RFBS (SEQ ID Nº: 32) tienen una secuencia de ADN directa, y F3RFFA (SEQ ID Nº: 33) y F3RFBA (SEQ ID Nº: 34) tienen una secuencia de ADN inversa. F3RFFS y F3RFFA tienen una secuencia complementaria entre sí, y tienen secuencias de reconocimiento de BalI y XhoI en ambos extremos. F3RFBS y F3RFBA tienen una secuencia complementaria entre sí, y tienen secuencias de reconocimiento de XhoI y NcoI en ambos extremos.
Para sustituir la FR3 en la versión "c" con una derivada del anticuerpo humano P01825 (SWISS-PROT, Poljak RJ. et al., Biochemistry, 16: 3412-3420, 1977), se generaron cuatro cebadores de ADN que codificaban FR3. Los cebado-res de reordenamiento de FR F3NMFS (SEQ ID Nº: 35) y F3NMBS (SEQ ID Nº: 36) tienen una secuencia de ADN directa, y F3NMFA (SEQ ID Nº: 37) y F3NMBA (SEQ ID Nº: 38) tienen una secuencia de ADN inversa.
F3NMFS y F3NMFA tienen una secuencia complementaria entre sí, y tienen secuencias de reconocimiento de BalI y XhoI en ambos extremos.
F3NMBS y F3NMBA tienen secuencias de reconocimiento de XhoI y NcoI en ambos extremos.
F3RFFS, F3RFBS, F3RFFA, F3RFBA, F3NMFS, F3NMBS, F3NMFA, y F3NMBA fueron sintetizados por Pharmacia Biotech. F3RFFS y F3RFFA, y F3RFBS y F3RFBA se hibridaron, y se digirieron con BalI y XhoI, y NcoI y XhoI, respectivamente. Se introdujeron en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y se determinó la secuencia de nucleótidos. El plásmido que tenía la secuencia correcta se denominó hATR5Hvb/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "b" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvb/CVIDEC se muestran en SEQ ID Nº: 39. La secuencia de aminoácidos de la versión "b" se muestra también en SEQ ID Nº: 40.
F3NMFS y F3NMFA, y F3NMBS y F3NMBA se hibridaron, y se digirieron con BalI y XhoI, y NcoI y XhoI, respectivamente. Se introdujeron en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y se determinó la secuencia de nucleótidos. El plásmido que tenía la secuencia correcta se denominó hATR5Hvc/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "c" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvc/CVIDEC se muestran en SEQ ID Nº: 41. La secuencia de aminoácidos de la versión "c" se muestra también en SEQ ID Nº: 42.
(iii) Construcción de las versiones "d" y "e" de la cadena H humanizada
Las versiones "d" y "e" se generaron sustituyendo la FR3 de la versión "a" con la FR3 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR3 en la versión "d" con una derivada del anticuerpo humano M62723 (DDBJ, Pascual V. et al., J. Clin. Invest., 86: 1320-1328, 1990), se generaron cuatro cebadores de ADN que codificaban FR3. El cebador de reordenamiento de FR F3EPS (SEQ ID Nº: 43) tiene una secuencia de ADN directa, y F3EPA (SEQ ID Nº: 44) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb.
Los cebadores exógenos F3PrS (SEQ ID Nº: 45) y F3PrA (SEQ ID Nº: 46) tienen homología con los cebadores de reordenamiento de FR F3EPS y F3EPA, y se pueden usar también para otros reordenamientos de FR de FR3. Para sustituir la FR3 en la versión "e" con una derivada del anticuerpo humano Z80844 (DDBJ, Thomsett AR. et al., sin publicar), se generaron dos cebadores de ADN que codificaban FR3. El cebador de reordenamiento de FR F3VHS (SEQ ID Nº: 47) tiene una secuencia de ADN directa, y F3VHA (SEQ ID Nº: 48) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb. F3EPS, F3EPA, F3PrS, F3PrA, F3VHS y F3VHA fueron sintetizados por Pharmacia Biotech.
La PCR se llevó a cabo mediante el uso de la KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki) mediante el uso del tampón adjunto que contenía 5 μl de cada uno de los cebadores de reordenamiento de FR F3EPS y F3EPA 1 μM, o F3VHS y F3VHA, dNTPs 0,2 mM, MgCl2 1,0 mM, y 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa en 100 μl de mezcla de reacción, durante 5 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 50 °C durante 1 minuto, y 74 °C durante 1 minuto. Después de la adición posterior de 100 pmoles de los cebadores exógenos F3PrS y F3PrA, se llevó a cabo la PCR durante 25 ciclos con el mismo ciclo de temperaturas.
Los fragmentos de ADN amplificados mediante el método de PCR se separaron mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa Nu Sieve GTG al 2% (FMC BioProducts). Se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 424 pb, se les añadieron 3 volúmenes (ml/g) de TE, y después se extrajeron con fenol, fenol/cloroformo, y cloroformo para purificar los fragmentos de ADN. Después de precipitar el ADN purificado con etanol, se disolvió un tercio del volumen del mismo en 14 μl de agua. La mezcla de reacción de PCR obtenida se digirió con BalI y NcoI, y se introdujo en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y se determinó la secuencia de nucleótidos.
Los plásmidos que tenían la secuencia correcta se denominaron hATR5Hvd/CVIDEC y hATR5Hve/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "d" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvd/CVIDEC se muestran en SEQ ID Nº: 49, y la secuencia de aminoácidos de la versión "d" se muestra también en SEQ ID Nº: 50. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "e" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hve/CVIDEC se muestran en SEQ ID Nº: 51, y la secuencia de aminoácidos de la versión "e" se muestra también en SEQ ID Nº: 52.
(iv) Construcción de las versiones "f" y "g" de la cadena H humanizada
Las versiones "f" y "g" se generaron sustituyendo la FR3 de la versión "a" con la FR3 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR3 en la versión "f" con una derivada del anticuerpo humano L04345 (DDBJ, Hillson J L. et al., J. Exp. Med., 178: 331-336, 1993) y para sustituir la FR3 en la versión "g" con una derivada del anticuerpo humano S78322 (DDBJ, Bejcek BE. et al., Cancer Res., 55: 2346-2351, 1995), se sintetizaron dos cebadores que codificaban cada uno la FR3. El cebador de reordenamiento de FR F3SSS (SEQ ID Nº: 53) de la versión "f" tiene una secuencia de ADN directa, y F3SSA (SEQ ID Nº: 54) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb.
F3CDS (SEQ ID Nº: 55) de la versión "g" tiene una secuencia de ADN directa, y F3CDA (SEQ ID Nº: 56) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb. F3SSS, F3SSA, F3CDS, y F3CDA fueron sintetizados y purificados por Pharmacia Biotech. La PCR se llevó a cabo mediante el uso de la KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki) mediante el uso del tampón adjunto que contenía 5 μl de cada uno de los cebadores de reordenamiento de FR F3SSS y F3SSA 1 μM, o F3CDS y F3CDA, dNTPs 0,2 mM, MgCl2 1,0 mM, y 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa en 100 μl de mezcla de reacción, durante 5 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 50 °C durante 1 minuto, y 74 °C durante 1 minuto. Después de la adición posterior de 100 pmoles de los cebadores exógenos F3PrS y F3PrA, se llevó a cabo la PCR durante 25 ciclos con el mismo ciclo de temperaturas.
Los fragmentos de ADN amplificados mediante el método de PCR se separaron mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 2% (FMC BioProducts). Se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 424 pb, se les añadieron 3 volúmenes (ml/g) de TE, y después se extrajeron con fenol, fenol/cloroformo, y cloroformo para purificar los fragmentos de ADN. Después de precipitar el ADN purificado con etanol, se disolvió un tercio del volumen del mismo en 14 μl de agua. La mezcla de reacción de PCR obtenida se digirió con BalI y NcoI, y se introdujo en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y se determinó la secuencia de nucleótidos.
Los plásmidos que tenían la secuencia correcta se denominaron hATR5Hvf/CVIDEC y hATR5Hvg/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "f" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvf/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "f" se muestran en SEQ ID Nº: 57 y 58. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "g" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvg/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "g" se muestran en SEQ ID Nº: 59 y 60.
(v) Construcción de la versión "h" de la cadena H humanizada
La versión "h" se generó sustituyendo la FR3 de la versión "a" con la FR3 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR3 en la versión "h" con otra derivada del anticuerpo humano Z26827 (DDBJ, van Der Stoep et al., J. Exp. Med., 177: 99-107, 1993), se sintetizaron dos cebado-res que codificaban cada uno la FR3. El cebador de reordenamiento de FR F3ADS (SEQ ID Nº: 61) de la versión "h" tiene una secuencia de ADN directa, y F3ADA (SEQ ID Nº: 62) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb.
F3ADS y F3ADA fueron sintetizados y purificados por Pharmacia Biotech. La PCR se llevó a cabo mediante el uso de la KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki) mediante el uso del tampón adjunto que contenía 5 μl de cada uno de los cebadores de reordenamiento de FR F3ADS y F3ADA1 μM, dNTPs 0,2 mM, MgCl2 1,0 mM, y 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa en 100 μl de mezcla de reacción, durante 5 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 50 °C durante 1 minuto, y 74 °C durante 1 minuto. Después de la adición posterior de 100 pmoles de los cebadores exógenos F3PrS y F3PrA, se llevó a cabo la PCR durante 25 ciclos con el mismo ciclo de temperaturas. Los fragmentos de ADN amplificados mediante el método de PCR se separaron mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 2% (FMC BioProducts).
Se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 424 pb, se les añadieron 3 volúmenes (ml/g) de TE, y después se extrajeron con fenol, fenol/cloroformo, y cloroformo para purificar los fragmentos de ADN. Después de precipitar el ADN purificado con etanol, se disolvió un tercio del volumen del mismo en 14 μl de agua. La mezcla de reacción de PCR obtenida se digirió con BalI y NcoI, y se introdujo en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y se determinó la secuencia de nucleótidos. Los plásmidos que tenían la secuencia correcta se denominaron hATR5Hvh/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "h" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvh/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "h" se muestran en SEQ ID Nº: 63. La secuencia de aminoácidos de la versión "h" se muestra en SEQ ID Nº: 64.
(vi) Construcción de las versiones "i" y "j" de la cadena H humanizada
Las versiones "i" y "j" se generaron sustituyendo la FR3 de la versión "a" con la FR3 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR3 en la versión "i" con una derivada del anticuerpo humano U95239 (DDBJ, Manheimer-Lory AAJ., sin publicar) y para sustituir la FR3 en la versión "j" con una derivada del anticuerpo humano L03147 (DDBJ, Collect TA. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 1002610030, 1992), se sintetizaron dos cebadores que codificaban cada uno la FR3. El cebador de reordenamiento de FR F3MMS (SEQ ID Nº: 65) de la versión "i" tiene una secuencia de ADN directa, y F3MMA (SEQ ID Nº: 66) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb.
F3BMS (SEQ ID Nº: 67) de la versión "j" tiene una secuencia de ADN directa, y F3BMA (SEQ ID Nº: 68) tiene una secuencia de ADN inversa, y el extremo 3' de los cebadores tiene una secuencia complementaria de 18 pb. F3MMS, F3MMA, F3BMS, y F3BMA fueron sintetizados y purificados por Pharmacia Biotech. La PCR se llevó a cabo mediante el uso de Ampli Taq Gold (Perkin-Elmer) mediante el uso del tampón adjunto que contenía 5 μl de cada uno de los cebadores de reordenamiento de FR F3MMS y F3MMA 1 μM, o F3BMS y F3BMA, dNTPs 0,2 mM, MgCl2 1,0 mM, y 2,5 unidades de Ampli Taq Gold en 100 μl de mezcla de reacción, durante 5 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 50 °C durante 1 minuto, y 74 °C durante 1 minuto. Después de la adición posterior de 100 pmoles de los cebadores exógenos F3PrS y F3PrA, se llevó a cabo la PCR durante 25 ciclos con el mismo ciclo de temperaturas.
Los fragmentos de ADN amplificados mediante el método de PCR se separaron mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa Nu Sieve GTG al 2% (FMC BioProducts). Se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 424 pb, se les añadieron 3 volúmenes (ml/g) de TE, y después se extrajeron con fenol, fenol/cloroformo, y cloroformo para purificar los fragmentos de ADN. Después de precipitar el ADN purificado con etanol, se disolvió un tercio del volumen del mismo en 14 μl de agua. La mezcla de reacción de PCR obtenida se digirió con BalI y NcoI, y se introdujo en el plásmido hATR5Hva/CVIDEC (BalI/NcoI) preparado mediante digestión con BalI y NcoI, y se determinó la secuencia de nucleótidos.
Los plásmidos que tenían la secuencia correcta se denominaron hATR5Hvi/CVIDEC y hATR5Hvj/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "i" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvi/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "i" se muestran en SEQ ID Nº: 69 y 70. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "j" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvj/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "j" se muestran en SEQ ID Nº: 71 y 72.
(vii) Construcción de las versiones "b1" y "d1" de la cadena H humanizada
Las versiones "b1" y "d1" se generaron sustituyendo la FR2 de las versiones "b" y "d" con la FR2 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR2 con una derivada del anticuerpo humano P01742 (SWISS-PROT, Cunningham BA. et al., Biochemistry, 9: 3161-3170, 1970), se sintetizaron dos cebadores de ADN que codificaban cada uno la FR2. El vector de reordenamiento de FR F2MPS (SEQ ID Nº: 73) tiene una secuencia de ADN directa, y F2MPA (SEQ ID Nº: 74) tiene una secuencia de ADN inversa. También tienen una secuencia complementaria entre sí, y tienen secuencias de reconocimiento de EcoT221 y BalI a ambos extremos.
F2MPS y F2MPA fueron sintetizados y purificados por Pharmacia Biotech. F2MPS y F2MPA se hibridaron, y se digirieron con EcoT22I y BalI. Se introdujeron en los plásmidos hATR5Hvb/CVIDEC (EcoT22I/BalI) y hATR5Hvd/CVIDEC (EcoT22I/BalI) preparados mediante digestión con EcoT22I y BalI, y se determinó la secuencia de nucleótidos. Los plásmidos que tenían la secuencia correcta se denominaron hATR5Hvb1/CVIDEC y hATR5Hvd1/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "b1" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvb1/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "b1" se muestran en SEQ ID Nº: 75 y 76. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "d1" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvd1/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "d1" se muestran en SEQ ID Nº: 77 y 78.
(viii) Construcción de las versiones "b3" y "d3" de la cadena H humanizada
Las versiones "b3" y "d3" se generaron sustituyendo la FR2 de las versiones "b" y "d" con la FR2 derivada de otro anticuerpo humano mediante el uso del método de reordenamiento de FR. Para sustituir la FR2 con una derivada del anticuerpo humano Z80844 (DDDJ, Thomsett A R. et al., sin publicar), se sintetizaron dos cebadores que codificaban la FR2. El vector de reordenamiento de FR F2VHS (SEQ ID Nº: 79) tiene una secuencia de ADN directa, y F2VHA (SEQ ID Nº: 80) tiene una secuencia de ADN inversa. También tienen una secuencia complementaria entre sí, y tienen secuencias de reconocimiento de EcoT221 y BalI a ambos extremos. La síntesis y la purificación de F2VHS y F2VHA se encomendó a Pharmacia Biotech.
F2VHS y F2VHA se hibridaron, y se digirieron con EcoT22I y BalI. Se introdujeron en los plásmidos hATR5Hvb/CVIDEC (EcoT22I/BalI) y hATR5Hvd/CVIDEC (EcoT22I/BalI) preparados mediante digestión con EcoT22I y BalI, y se determinó la secuencia de nucleótidos. Los plásmidos que tenían la secuencia correcta se denominaron hATR5Hvb3/CVIDEC y hATR5Hvd3/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "b3" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvb3/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "b3" se muestran en SEQ ID Nº: 81 y 82. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "d3" de la cadena H humanizada contenida en el plásmido hATR5Hvd3/CVIDEC, y la secuencia de aminoácidos de la versión "d3" se muestran en SEQ ID Nº: 83 y 84.
(2)
Construcción de una región V de la cadena L de un anticuerpo humanizado
(i)
Versión "a"
Se generó la región V de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado mediante injerto de CDR mediante el uso del método de PCR. Para la generación de la cadena L (versión "a") de un anticuerpo humanizado que tiene regiones estructurales derivadas del anticuerpo humano Z37332 (DDBJ, Welschof M. et al., J. Immunol. Methods, 179: 203-214, 1995), se usaron siete cebadores de PCR.
Los cebadores de injerto de CDR h5Lv1S (SEQ ID Nº: 85) y h5Lv4S (SEQ ID Nº: 86) tienen una secuencia de ADN directa, los cebadores de injerto de CDR h5Lv2A (SEQ ID Nº: 87), h5Lv3A (SEQ ID Nº: 88), y h5Lv5A (SEQ ID Nº: 89) tienen una secuencia de ADN inversa, y cada cebador tiene secuencias complementarias de 20 pb en ambos extremos. Los cebadores exógenos h5LvS (SEQ ID Nº: 90) y h5LvA (SEQ ID Nº: 91) tienen homología con los cebadores de injerto de CDR h5Lv1S y h5Lv5A. La síntesis y la purificación de los cebadores de injerto de CDR h5Lv1S, h5Lv4S, h5Lv2A, h5Lv3A, h5Lv5A, h5LvS, y h5LvA se encomendó a Pharmacia Biotech.
Las disoluciones de PCR contienen, en 100 μl, Tris-HCl 120 mM (pH 8,0), KCl 10 mM, (NH4)2SO4 6 mM, 0,1% de Triton X-100, 0,001% de BSA, dNTPs 0,2 mM (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), MgCl2 1 mM, 2,5 unidades de KOD ADN polimerasa (Toyo Boseki), 50 pmoles de los cebadores de injerto de CDR h5Lv1S, h5Lv2A, h5Lv3A, h5Lv4S, y h5Lv5A.
La PCR se llevó a cabo mediante el uso del termociclador de ADN 480 (Perkin-Elmer) durante 5 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 50 °C durante 1 minuto, y 72 °C durante 1 minuto para construir 5 cebadores de injerto de CDR. Tras la adición posterior de 100 pmoles de los cebadores exógenos h5LvS y h5LvA a la mezcla de reacción, se llevó a cabo la PCR durante 30 ciclos con un ciclo de temperaturas de 94 °C durante 30 segundos, 52 °C durante 1 minuto, y 72 °C durante 1 minuto para amplificar los fragmentos de ADN construidos.
La mezcla reacción de PCR se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 3% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 400 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, y los fragmentos de ADN se recuperaron mediante precipitación con etanol. Los fragmentos de ADN recuperados se digirieron con las enzimas de restricción SplI (Takara Shuzo) y BglII (Takara Shuzo) a 37 °C durante 4 horas. La mezcla de digestión se extrajo con fenol y cloroformo, y tras la precipitación con etanol de los fragmentos de ADN, se disolvieron en 10 μl de TE. El fragmento de ADN SplI-BglII preparado como se mencionó anteriormente que codificaba la región V de la cadena L humanizada y el vector CVIDEC preparado digiriendo con SplI y BglII se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante una reacción a 16 °C durante 1 hora siguiendo las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con el medio de agar LBA y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche en 3 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN).
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones. El plásmido que contiene el gen que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo humanizado y el que tiene una secuencia de reconocimiento de BglII y la secuencia consenso de Kozak en el extremo 5', y una secuencia de reconocimiento de SplI en el extremo 3' se denominó hATR5Lva/CVIDEC. La secuencia de nucleótidos (que incluye la secuencia de aminoácidos correspondiente) de la versión "a" de la cadena L humanizada se muestra en SEQ ID Nº: 92. La secuencia de aminoácidos de la versión "a" se muestra también en SEQ ID Nº: 93.
(ii) Versiones "b" y "c"
Se generaron las versiones "b" y "c" sustituyendo (reordenamiento de FR) la FR3 de la versión "a". Para la versión "b", se usó la FR3 derivada del anticuerpo humano S68699 (DDBJ, Hougs L. et al., Exp. Clin. Immunogen, 10: 141151, 1993), y para la versión "c" se usó la FR3 derivada del anticuerpo humano P01607 (SWISS-PROT, Epp O et al., Biochemistry, 14:4943-4952, 1975), respectivamente.
Los cebadores F3SS (SEQ ID Nº: 94) y F3SA (SEQ ID Nº: 95) que codifican la FR3 de la versión "b", o los cebado-res F3RS (SEQ ID Nº: 96) y F3RA (SEQ ID Nº: 97) que codifican la FR3 de la versión "c" tienen complementariedad de secuencias entre sí, y tienen las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción KpnI y PstI en ambos extremos. La síntesis y la purificación de F3SS, F3SA, F3RS, y F3RA se encomendó a Pharmacia Biotech. Se hibridaron 100 pmoles de cada uno de F3SS y F3SA, o F3RS y F3RA, mediante tratamiento a 96 °C durante 2 minutos y a 50 °C durante 2 minutos, y se generaron los fragmentos de ADN bicatenarios.
Estos fragmentos de ADN bicatenarios se digirieron con la enzima de restricción KpnI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora, y después con la enzima de restricción PstI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión se extrajo con fenol y cloroformo, y después se precipitó con etanol, y se disolvió en TE.
El plásmido hATR5Lva/CVIDEC se digirió con la enzima de restricción KpnI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora, y después con la enzima de restricción PstI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 1,5% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 3000 pb. La tira de agarosa se extrajo con fenol y cloroformo, y después los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y se disolvieron en TE.
El fragmento de ADN KpnI-PstI preparado como se mencionó anteriormente que codificaba la FR3 de las versiones "b" o "c" y el vector hATR5Lva/CVIDEC en el que se eliminó la FR3 mediante digestión con KpnI y PstI se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante reacción a 16 °C durante 1 hora según las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con el medio de agar LBA y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche en 3 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN).
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones.
Los plásmidos que contenían el gen que codifica las versiones "b" o la versión "c" en las que se sustituyó la FR3 de la versión "a" de la cadena L del anticuerpo humanizado se denominaron hATR5Lvb/CVIDEC o hATR5Lvc/CVIDEC, respectivamente. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "b" de la cadena L humanizada contenida en el plásmido hATR5Lvb/CVIDEC y la secuencia de aminoácidos de la versión "b" se muestran en SEQ ID Nº: 98 y 99. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "c" de la cadena L humanizada contenida en el plásmido hATR5Lvc/CVIDEC y la secuencia de aminoácidos de la versión "c" se muestran en SEQ ID Nº: 100 y 101.
(iii) Versiones "b1" y "b2"
Se generaron las versiones "b1" y "b2" sustituyendo la FR2 de la versión "b". Para la versión "b1" se usó la FR2 derivada del anticuerpo humano S65921 (DDBJ, Tonge DW et al., Immunol., 7:56-62, 1993), y para la versión "b2" se usó la FR2 derivada del anticuerpo humano X93625 (DDBJ, Cox J P et al., Eur. J. Immunol., 24:827-836, 1994), respectivamente.
Los cebadores F2SS (SEQ ID Nº: 102) y F2SA (SEQ ID Nº: 103) que codifican la FR2 de la versión "b1", o los ceba-dores F2XS (SEQ ID Nº: 104) y F2XA (SEQ ID Nº: 105) que codifican la FR2 de la versión "b2" tienen complementariedad de secuencias entre sí, y tienen las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción AflII y SpeI en ambos extremos. F2SS, F2SA, F2XS, y F2XA fueron sintetizados por Pharmacia Biotech. Se hibridaron 100 pmoles de cada uno de F2SS y F2SA, o F2XS y F2XA, mediante tratamiento a 96 °C durante 2 minutos y a 50 °C durante 2 minutos, y se generaron los fragmentos de ADN bicatenarios.
Estos fragmentos de ADN bicatenarios se digirieron con las enzimas de restricción AflII (Takara Shuzo) y SpeI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión se extrajo con fenol y cloroformo, y después los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y se disolvieron en TE.
El plásmido hATR5Lvb/CVIDEC se digirió con las enzimas de restricción AflII (Takara Shuzo) y SpeI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 1 hora. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 1,5% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 3000 pb. La tira de agarosa se extrajo con fenol y cloroformo, y después los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y se disolvieron en TE.
El fragmento de ADN AflII-SpeI preparado como se mencionó anteriormente que codificaba la FR2 de las versiones "b1" o "b2" y el vector hATR5Lvb/CVIDEC en el que se eliminó la FR2 mediante digestión con AflII y SpeI se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante reacción a 16 °C durante 1 hora según las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con el medio de agar LBA y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli. El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 4 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó un plásmido de ADN mediante el uso del equipo QIAprep Spin Plasmid (QIAGEN).
Se determinó la secuencia de nucleótidos de la región codificante del cADN en el plásmido mediante el uso del equipo Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction (Perkin-Elmer) mediante el secuenciador de ADN 373A (Perkin-Elmer). Como cebadores de secuenciación, se usaron el cebador de M13 M4 (Takara Shuzo) y el cebador de M13 RV (Takara Shuzo), y se determinó la secuencia confirmando la secuencia de nucleótidos en ambas direcciones.
Los plásmidos que contenían el gen que codifica las versiones "b1" o "b2" en las que se sustituyó la FR2 de la versión "b" de la cadena L del anticuerpo humanizado se denominaron hATR5Lvb1/CVIDEC y hATR5Lv2/CVIDEC, respectivamente. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "b1" de la cadena L humanizada contenida en el plásmido hATR5Lvb1/CVIDEC y la secuencia de aminoácidos de la versión "b1" se muestran en SEQ ID Nº: 106 y 107. La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente de la versión "b2" de la cadena L humanizada contenida en el plásmido hATR5Lvb2/CVIDEC y la secuencia de aminoácidos de la versión "b2" se muestran en SEQ ID Nº: 108 y 109.
(3)
Construcción del vector de expresión del anticuerpo humanizado
(i)
Combinación de la cadena H humanizada y la cadena L quimérica
El plásmido hATR5Hva/CVIDEC que contenía una región V de la cadena H se digirió con NheI y SalI, y se recuperó un fragmento de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujo en chATR5/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de chATR5/N5KG4P, un vector plasmídico de expresión del anticuerpo chATR-5, con NheI y SalI. El plásmido así generado se denominó hHva-chLv/N5KG4P.
El plásmido hATR5Hvb/CVIDEC que contenía una región V de la cadena H se digirió con NheI y SalI, y se recuperó un fragmento de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujo en chATR5/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de chATR5/N5KG4P, un vector plasmídico de expresión del anticuerpo chATR-5, con NheI y SalI. El plásmido así generado se denominó hHvb-chLv/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvc/CVIDEC, hATR5Hvd/CVIDEC, y hATR5Hve/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en chATR5/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de chATR5/N5KG4P, un vector plasmídico de expresión del anticuerpo chATR-5, con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvc-chLv/N5KG4P, hHvd-chLv/N5KG4P, y hHve-chLv/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvf/CVIDEC y hATR5Hvh/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en chATR5/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de chATR5/N5KG4P, un vector plasmídico de expresión del anticuerpo chATR-5, con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvfchLv/N5KG4P y hHvh-chLv/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvi/CVIDEC y hATR5Hvj/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en chATR5/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de chATR5/N5KG4P, un vector plasmídico de expresión del anticuerpo chATR-5, con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvichLv/N5KG4P y hHvj-chLv/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hb1/CVIDEC y hATR5Hvd1/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en chATR5/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de chATR5/N5KG4P, un vector plasmídico de expresión del anticuerpo chATR-5, con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvb1chLv/N5KG4P y hHvd1-chLv/N5KG4P.
(ii) Combinación de la cadena L humanizada y la cadena H quimérica
Mediante el uso de un vector de expresión de anticuerpos N5KG4P, se combinó con una cadena H quimérica y se expresó, y se estudió la cadena L humanizada.
Los plásmidos hATR5Lva/CVIDEC, hATR5Lvb/CVIDEC, hATR5LvC/CVIDEC, hATR5Lvb1/CVIDEC, y hATR5Lvb2/CVIDEC se digirieron con las enzimas de restricción BglII (Takara Shuzo) y SplI (Takara Shuzo) a 37 °C durante 2-3 horas. La mezcla de digestión se separó mediante electroforesis en gel de agarosa con el uso de una agarosa NuSieve GTG al 1,5% o 2% (FMC BioProducts), y se cortaron las tiras de agarosa que contenían fragmentos de ADN de una longitud de alrededor de 400 pb. Las tiras de agarosa se extrajeron con fenol y cloroformo, y después los fragmentos de ADN se precipitaron con etanol, y se disolvieron en TE.
El fragmento de ADN SplI-BglII que contenía el gen que codifica la región V de la cadena L humanizada de cada una de estas versiones y el hATR5Hv/N5KG4P digerido con SplI y BglII se ligaron mediante el uso del equipo de ligadura de ADN ver.2 (Takara Shuzo) mediante reacción a 16 °C durante 1 hora según las instrucciones adjuntas con el equipo.
La mezcla de ligadura se añadió a 100 μl de células competentes de E. coli JM109 (Nippongene) y se incubó durante 30 minutos sobre hielo y durante 1 minuto a 42° C. Después, se le añadieron 300 μl del caldo Hi-Competence (Nippongene), se incubó a 37 °C durante 1 hora, y después las E. coli se colocaron en placas con el medio de agar LBA y se incubaron durante la noche a 37 °C para obtener un transformante de E. coli.
El transformante se cultivó durante la noche a 37 °C en 250 ml o 500 ml del medio LBA, y a partir de las fracciones celulares, se preparó ADN plasmídico mediante el uso del equipo Plasmid Maxi (QIAGEN). Los plásmidos en los que se introdujo un gen que codificaba la cadena H quimérica y la cadena L humanizada se denominaron chHvhLva/N5KG4P, chHv-hLvb/N5KG4P, chHv-hLvc/N5KG4P, chHv-hLvb1/N5KG4P, y chHv-hLvb2/N5KG4P.
(iii) Combinación de la cadena H humanizada y la cadena L humanizada
El plásmido hATR5Hva/CVIDEC que contenía una región V de la cadena H se digirió con NheI y SalI, y se recuperó un fragmento de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujo en hLva/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante la digestión del plásmido chHv-hLva/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "a" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. El plásmido así generado se denominó hHvahLva/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvb/CVIDEC y hATR5Hvc/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en hLva/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante la digestión del plásmido chHv-hLva/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "a" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvb-hLva/N5KG4P y hHvc-hLva/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvb/CVIDEC, hATR5Hvd/CVIDEC, y hATR5Hve/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada se recuperaron y se introdujeron en hLvb/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión del plásmido chHvhLvb/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "b" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvb-hLvb/N5KG4P, hHvd-hLvb/N5KG4P, y hHve-hLvb/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvf/CVIDEC, hATR5Hvg/CVIDEC, y hATR5Hvh/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada se recuperaron y se introdujeron en hLvb/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión del plásmido chHvhLvb/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "b" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvf-hLvb/N5KG4P, hHvg-hLvb/N5KG4P, y hHvh-hLvb/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvi/CVIDEC y hATR5Hvj/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en hLvb/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante la digestión del plásmido chHv-hLvb/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "b" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvi-hLvb/N5KG4P y hHvj-hLvb/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvb1/CVIDEC y hATR5Hvd1/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en hLvb/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante la digestión del plásmido chHv-hLvb/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "b" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvb1-hLvb/N5KG4P y hHvd1-hLvb/N5KG4P.
Los plásmidos hATR5Hvb3/CVIDEC y hATR5Hvd3/CVIDEC que contenían una región V de la cadena H se digirieron con NheI y SalI, y se recuperaron los fragmentos de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujeron en hLvb/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante la digestión del plásmido chHv-hLvb/N5KG4P que contenía la secuencia de cADN de la versión "b" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvb3-hLvb/N5KG4P y hHvd3-hLvb/N5KG4P.
El plásmido hATR5Hvb/CVIDEC que contenía una región V de la cadena H se digirió con NheI y SalI, y se recuperó un fragmento de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujo en hLvb1/N5KG4P (SalI/NheI) y hLvb2/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de los plásmidos chHv-hLvb1/N5KG4P y chHvhLvb2/N5KG4P que contenían la secuencia de cADN de las versiones "b1" y "b2" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvb-hLvb1/N5KG4P y hHvbhLvb2/N5KG4P.
El plásmido hATR5Hvi/CVIDEC que contenía una región V de la cadena H se digirió con NheI y SalI, y se recuperó un fragmento de cADN de la región V de la cadena H humanizada y se introdujo en hLvb1/N5KG4P (SalI/NheI) y hLvb2/N5KG4P (SalI/NheI) preparado mediante digestión de los plásmidos chHv-hLvb1/N5KG4P y chHvhLvb2/N5KG4P que contenían la secuencia de cADN de las versiones "b1" y "b2" de la cadena L del anticuerpo ATR-5 humanizado con NheI y SalI. Los plásmidos así generados se denominaron hHvi-hLvb1/N5KG4P y hHvihLvb2/N5KG4P.
(4) Transfección en células COS-7
Para estudiar la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante del anticuerpo humanizado, el anticuerpo anterior se expresó de manera transitoria en células COS-7.
El vector de expresión plasmídico construido se transdujo en células COS-7 mediante electroporación con el uso del instrumento Gene Pulser (Bio-Rad). Se añadieron 50 μg o 20 μg del plásmido a 0,78 ml de células COS-7 suspendidas en PBS a una concentración celular de 1 x 107 células/ml, que se sometieron a pulsos de 1.500 V y 25 μF de capacidad.
Después de 10 minutos de período de recuperación a temperatura ambiente, las células sometidas a electroporación se suspendieron en un medio DMEM (GIBCO) que contenía un 5% de suero bovino fetal Ultra Low IgG (GIBCO), y se cultivaron mediante el uso de una placa de cultivo de 10 cm o una placa de cultivo de 15 cm en un incubador con un 5% de CO2. Después de cultivar durante 24 horas, se aspiró el sobrenadante del cultivo, y después se añadió un medio HBCHO exento de suero (Irvine Scientific). Después de cultivar posteriormente durante 72 horas o 96 horas, se recogió el sobrenadante del cultivo y se centrifugó para eliminar los restos celulares.
(5) Purificación del anticuerpo
A partir del sobrenadante del cultivo de las células COS-7, el anticuerpo se purificó mediante el uso del equipo AffiGel Protein A MAPSII (Bio-Rad) o de rProtein A Sepharose Fast Flow (Pharmacia Biotech). La purificación mediante el uso del equipo AffiGel Protein A MAPSII se llevó a cabo según las instrucciones adjuntas con el equipo. La purificación mediante el uso de rProtein A Sepharose Fast Flow se llevó a cabo como sigue:
Se colocó un ml de rProtein A Sepharose Fast Flow en una columna, y la columna se equilibró con 10 volúmenes de TBS. El sobrenadante del cultivo de células COS-7 se aplicó a la columna equilibrada, que después se lavó con 10 volúmenes de TBS. La fracción de anticuerpo adsorbido se eluyó mediante 13,5 ml de HCl 2,5 mM (pH 3,0). El eluato se neutralizó añadiendo 1,5 ml de Tris-HCl 1 M (pH 8,0).
Llevando a cabo una ultrafiltración dos o tres veces para la fracción de anticuerpo purificado mediante el uso de Centriprep 30 ó 100 (amicon), se sustituyó el disolvente por TBS, y finalmente se concentró hasta alrededor de 1,5 ml.
Ejemplo 4. Cuantificación del anticuerpo y determinación de la actividad
(1) Medida de la concentración de anticuerpo mediante ELISA
Se prepararon placas de ELISA para la medida de la concentración del anticuerpo como sigue: Cada pocillo de una placa de ELISA de 96 pocillos (Maxisorp, NUNC) se inmovilizó mediante 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humana de cabra (BIO SOURCE) preparado a una concentración de 1 μg/ml en el tampón de inmovilización (NaHCO3 0,1 M, 0,02% de NaN3, pH 9,6) (denominado más adelante en la presente memoria CB). Después de bloquear con 200 μl del tampón de dilución (Tris-HCl 50 mM, MgCl2 1 mM, NaCl 0,1 M, 0,05% de Tween 20, 0,02% de NaN3, 1% de albúmina de suero bovino (BSA), pH 8,1) (denominado más adelante en la presente memoria DB), el sobrenadante del cultivo de las células COS-7 en el que se expresó el anticuerpo o en el que se purificó el anticuerpo se diluyó en serie con DB, y después se añadió a cada pocillo.
Después de incubar a temperatura ambiente durante 1 hora seguido por el lavado con PBS Dulbecco que contenía un 0,05% de Tween 20 (denominado más adelante en la presente memoria RB), se añadieron 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humana de cabra conjugado a fosfatasa alcalina (Biosource) que se diluyó 1000 veces con DB. Después de incubar a temperatura ambiente durante 1 hora seguido de lavado con RB, se añadió Sigma104 (fosfato de pnitrofenilo, SIGMA) disuelto en el tampón de sustrato (NaHCO3 50 mM, MgCl2 10 mM, pH 9,8) a 1 mg/ml, y después se midió la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso de un lector de microplacas (Bio-Rad). Como patrón para la medida de la concentración se usó IgG4κ (Binding Site).
(2) Medida de la actividad de unión al antígeno
Las placas de ELISA de células para la medida de la unión al antígeno se prepararon como sigue. Las células usadas fueron células J82 de carcinoma de vejiga humana (ATCC HTB-1). Se inocularon 1 x 105 células J82 en 60 pocillos de una placa de cultivo de células de 96 pocillos. Esto se cultivó (medio RPMI1640 que contenía un 10% de suero bovino fetal (GIBCO)) durante un día en un incubador de CO2 para permitir que las células se uniesen a la placa. Después de desechar el líquido de cultivo, cada pocillo se lavó dos veces con 300 μl de PBS. Se añadieron 100 μl de PBS que contenía un 4% de paraformaldehído (denominado más adelante en la presente memoria PFA/PBS) a cada pocillo, y se colocaron en hielo durante 10 minutos para inmovilizar las células.
Se desechó el PFA/PBS, y cada pocillo se lavó dos veces con 300 μl de PBS, y después se bloqueó con 250 μl de DB. El sobrenadante del cultivo o el anticuerpo purificado se diluyó en serie con DB, 100 μl del cual se añadió a cada pocillo. Después de incubar a temperatura ambiente durante 2 horas seguido de lavado con RB, se añadieron 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humana de cabra conjugado a fosfatasa alcalina (BioSource) diluido 1000 veces con DB. Después de incubar durante 1 hora seguido de lavado con RB, se añadió la disolución de sustrato, y después se midió la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso del lector de microplacas (Bio-Rad).
(3) Medida de la actividad neutralizante
La actividad neutralizante de un anticuerpo de ratón, un anticuerpo quimérico, y un anticuerpo humanizado se midió con la actividad de inhibición de la actividad de producción de Factor Xa mediante tromboplastina derivada de placenta humana, Thromborel S (Boehringer AG), como índice. Así, se añadieron 60 μl del tampón (TBS que contenía CaCl2 5 mM y un 0,1% de BSA) a 10 μl de 1,25 mg/ml de Thromborel S y 10 μl de un anticuerpo diluido de manera adecuada, que después se incubó en una placa de 96 pocillos a temperatura ambiente durante 1 hora. Se le añadieron 10 μl de 3,245 μg/ml de Factor X humano (Celsus Laboratories) y 82,5 ng/ml de Factor VIIa humano (Enzyme Research), y después se incubó a temperatura ambiente durante 1 hora más.
Se añadieron 10 μl de EDTA 0,5 M para parar la reacción, a la cual se le añadieron 50 μl de la disolución de sustrato cromogénico y se determinó la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso del lector de microplacas (Bio-Rad). Después de hacer reaccionar a temperatura ambiente durante 1 hora, se determinó de nuevo la absorbancia a 405/655 nm. La actividad neutralizante se puede determinar calculando la actividad residual (%) de cada cambio de absorbancia con el cambio de absorbancia cada hora sin adición de anticuerpo como una actividad del 100%.
La disolución de sustrato cromogénico se preparó disolviendo el sustrato cromogénico S-2222 de Testzyme (Chromogenix) según las instrucciones adjuntas, diluyendo 2 veces con agua purificada y después mezclando con una disolución de polibreno (0,6 mg/ml de bromuro de hexadimetileno, SIGMA) a 1:1.
(4)
Evaluación de la actividad
(i)
Combinación de la versión "a" de la cadena H humanizada y de la cadena L quimérica
Se generó un anticuerpo (a-ch) que es la versión "a" de la cadena H humanizada combinada con una cadena L quimérica, y se ensayó la actividad de unión al antígeno mediante el ELISA de células. Se descubrió que la cantidad unida al antígeno disminuía a la concentración elevada (Figura 1). La actividad neutralizante hacia el antígeno mediante la inhibición de la producción de FXa fue débil en comparación con la del anticuerpo quimérico de control positivo (ch-ch) (Figura 2). Por lo tanto, se decidió llevar a cabo la siguiente versión de la cadena H humanizada mediante reordenamiento de FR. El anticuerpo quimérico usado en la presente memoria fue el que se expresaba en células COS-7, se purificó y se estudió.
(ii)
Combinación de la versión "a" de la cadena L humanizada y una cadena H quimérica
Se generó un anticuerpo (ch-a) que es la versión "a" de la cadena L humanizada combinada con una cadena H quimérica, y se ensayó la actividad de unión al antígeno mediante el ELISA de células. Se descubrió que tenía una actividad de unión igual o mayor que la del anticuerpo quimérico (Figura 1). Por otra parte, la actividad neutralizante hacia el antígeno fue débil en comparación con la del anticuerpo quimérico de control positivo (Figura 2). Por lo tanto, se decidió llevar a cabo la siguiente versión de la cadena L humanizada mediante reordenamiento de FR. El anticuerpo quimérico usado en la presente memoria fue el que se expresaba en células COS-7, se purificó y se estudió.
(iii) Combinación de la versión "a" de la cadena H humanizada y la versión "a" de la cadena L humanizada
Se generó un anticuerpo (a-a) que es la versión "a" de la cadena H humanizada combinada con la versión "a" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno mediante el ELISA de células. Se descubrió que la cantidad unida al antígeno disminuía en el lado de concentración elevada (Figura 3). La actividad neutralizante hacia el antígeno mediante la inhibición de la producción de FXa fue débil en comparación con la del anticuerpo quimérico de control positivo (Figura 4). Por lo tanto, se decidió llevar a cabo la siguiente versión de la cadena H y de la cadena L humanizadas mediante reordenamiento de FR. El anticuerpo quimérico usado en la presente memoria fue el que se expresaba en células COS-7, se purificó y se estudió.
(iv)
Combinación de las versiones "b", "c", y "d" de la cadena H humanizada y una cadena L quimérica
Se generaron los anticuerpos ("b-ch", "c-ch", y "d-ch", respectivamente) que son la cadena H humanizada sometida la siguiente versión mediante reordenamiento de FR combinada con una cadena L quimérica, y se ensayó la actividad de unión al antígeno mediante ELISA de células. "d-ch" exhibió una actividad de unión igual a la del anticuerpo quimérico, y "b-ch" y "c-ch" exhibieron una actividad de unión ligeramente menor (Figuras 5 y 6). Por otra parte, la actividad neutralizante hacia el antígeno en comparación con la del anticuerpo quimérico de control positivo fue casi igual en "b-ch", y ligeramente débil en "d-ch". En la versión "c-ch", fue significativamente más débil que la del anticuerpo quimérico (Figura 7). Por lo tanto, las versiones "b" y "d" de la cadena H humanizada se consideraron las de la cadena H humanizada que exhibían una actividad elevada.
(v)
Combinación de la versión "b" de la cadena H humanizada y la versión "a" de la cadena L humanizada
Se generó un anticuerpo (b-a) que es la versión "b" de la cadena H humanizada sometida a la siguiente versión mediante reordenamiento de FR combinada con la versión "a" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno mediante el ELISA de células. Se descubrió que la cantidad unida al antígeno disminuía a la concentración elevada (Figura 5). Por otra parte, la actividad neutralizante hacia el antígeno fue significativamente débil en comparación con la del anticuerpo quimérico de control positivo (Figura 8). Por lo tanto, "b-a" y "a-a" son las que exhiben una actividad elevada. El anticuerpo quimérico usado en la presente memoria fue el que se expresaba en células COS-7, se purificó y se estudió.
(vi)
Combinación de las versiones "b" y "c" de la cadena L humanizada, y una cadena H quimérica
Se generaron los anticuerpos ("ch-b" y "ch-c", respectivamente) que son las versiones "b" y "c" de la cadena L humanizada combinadas con una cadena H quimérica, y se descubrió que ambos tenían la misma actividad de unión al antígeno y la misma actividad neutralizante hacia el antígeno que el anticuerpo quimérico (Figuras 9 y 10). Por lo tanto, se eligieron las versiones "b" y "c" como candidatos para una cadena L de un anticuerpo humanizado. Se considera que la versión "b" derivada de un anticuerpo de ratón que tiene un aminoácido menos en el número de residuos de aminoácidos es superior a la versión "c" en cuanto a la antigenicidad. El anticuerpo quimérico usado en la presente memoria fue el que se expresó en las células CHO DG44, se purificó y se estudió. En el estudio más adelante en la presente memoria se usó el anticuerpo como control positivo.
(vii) Combinación de la versión "b" de la cadena H humanizada y las versiones "b" y "c" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("b-b" y "b-c", respectivamente) que son la versión "b" de la cadena H humanizada combinada con las versiones "b" y "c" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante hacia el antígeno. Ambos tuvieron una actividad ligeramente menor que la del anticuerpo quimérico tanto en la actividad de unión como en la actividad neutralizante (Figuras 11 y 12).
(viii) Combinación de las versiones "b" y "d" de la cadena H humanizada, y la versión "b" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("b-b" y "d-b", respectivamente) que son la cadena H humanizada sometida a la siguiente versión mediante reordenamiento de FR combinada con la versión "b" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno mediante el ELISA de células. "d-b" exhibieron una actividad de unión igual a la del anticuerpo quimérico, y "b-b" exhibieron una actividad de unión ligeramente menor a la concentración elevada (Figura 13). Por otra parte, la actividad neutralizante hacia el antígeno en comparación con la del anticuerpo quimérico de control positivo fue ligeramente baja en "b-b", y significativamente débil en "d-b" (Figura 14). Por lo tanto, se demostró que "b-b" es una versión con una elevada actividad neutralizante, mientras "d-b" es una versión con una elevada actividad de unión.
(ix)
Combinación de la versión "e" de la cadena H humanizada, y una cadena L quimérica y la versión "b" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("e-ch" y "e-b", respectivamente) que son la versión "e" de la cadena L humanizada combinada con una cadena L quimérica y la versión "b" humanizada. "e-ch" exhibió una actividad de unión hacia el antígeno igual a la del anticuerpo quimérico, pero en "e-b" la cantidad de anticuerpo expresado fue muy pequeña, y se perdió la mayor parte de la actividad de unión (Figura 15). La actividad neutralizante hacia el antígeno de "e-ch" fue significativamente baja en comparación con la del anticuerpo quimérico (Figura 16). Por lo tanto, se concluyó que la versión "e" de la cadena H combinada con la versión "b" de la cadena L no funcionó bien.
(x)
Combinación de las versiones "f", "g", y "h" de la cadena H humanizada, y la versión "b" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("f-b", "g-b", y "h-b", respectivamente) que son las versiones "f", "g", y "h" de la cadena H humanizada combinadas con la versión "b" de la cadena L humanizada. En los anticuerpos "f-b" y "h-b", la cantidad de anticuerpo expresada fue muy pequeña. Para las versiones "f" y "h", se generaron anticuerpos combinados con la cadena L quimérica, pero no se expresaron. "g-b" alcanzó la saturación a una concentración baja, y exhibió una actividad de unión más débil que la del anticuerpo quimérico (Figura 17). La actividad neutralizante hacia el antígeno de "g-b" fue significativamente débil en comparación con la del anticuerpo quimérico (Figura 18).
(xi)
Combinación de las versiones "b1" y "d1" de la cadena H humanizada, y la versión "b" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("b1-b" y "d1-b", respectivamente) que son las versiones "b1" y "d1" de la cadena H humanizada combinadas con la versión "b" de la cadena L humanizada. Casi no se expresó anticuerpo en ninguno de ellos. Para éstos, se generaron anticuerpos combinados con una cadena L quimérica, pero no se expresaron.
(xii) Combinación de las versiones "b3" y "d3" de la cadena H humanizada, y la versión "b" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("b3-b" y "d3-b", respectivamente) que son las versiones "b3" y "d3" de la cadena H humanizada combinadas con la versión "b" de la cadena L humanizada. La actividad de unión al antígeno de "d3-b" fue ligeramente más baja que la del anticuerpo quimérico, y la de "b3-b" fue mucho más baja (Figura 19). La actividad neutralizante hacia el antígeno de "b3-b" fue mayor que la de "b-b", pero fue menor que la del anticuerpo quimérico, y "d3-b" y "b-b" tuvieron la misma actividad (Figura 20).
(xiii) Combinación de las versiones "i" y "j" de la cadena H humanizada, y una cadena L quimérica y la versión "b" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("i-ch" y "j-ch", respectivamente) que son las versiones "i" y "j" de la cadena H humanizada combinadas con una cadena L quimérica, y los anticuerpos ("i-b" y "j-b", respectivamente) combinados con la versión "b" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante hacia el antígeno. La actividad de unión de cualquiera de los anticuerpos fue casi igual a la del anticuerpo quimérico (Figuras 21 y 22). "i-ch" exhibió una actividad neutralizante mayor que la del anticuerpo quimérico, y "j-ch" fue significativamente menor que la del anticuerpo quimérico (Figura 23). "i-b" exhibió una actividad neutralizante igual a la del anticuerpo quimérico, y "j-b" exhibió una actividad neutralizante significativamente más débil que la del anticuerpo quimérico (Figura 24).
(xiv) Las versiones "b1" y "b2" de la cadena L humanizada Cuando se generaron los anticuerpos ("ch-b1" y "ch-b2", respectivamente) que son las versiones "b1" y "b2" de la cadena L humanizada combinadas con una cadena H quimérica, ambos exhibieron una actividad de unión al antígeno igual a la del anticuerpo quimérico (Figura 25). Para la actividad neutralizante hacia el antígeno, "ch-b1" exhibió una actividad de unión igual a la del anticuerpo quimérico, mientras "ch-b2" exhibió una actividad ligeramente mayor que la del anticuerpo quimérico a la concentración elevada (Figura 26). Las versiones "b1" y "b2" pueden ser candidatos para una cadena L de un anticuerpo humanizado, pero "b2" es superior ya que tiene una actividad más intensa.
(xv) Combinación de la versión "b" de la cadena H humanizada y la versión "b2" de la cadena L humanizada
Se generó un anticuerpo ("b-b2") que es la versión "b" de la cadena H humanizada combinada con la versión "b2" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante hacia el antígeno. La actividad de unión fue ligeramente menor que la del anticuerpo quimérico (Figura 27). La actividad neutralizante, aunque ligeramente mayor que la de "b-b", fue menor que la de "i-b" (Figura 28).
(xvi) Combinación de la versión "i" de la cadena H humanizada y la versión "b1" o "b2" de la cadena L humanizada
Se generaron los anticuerpos ("i-b1" y "i-b2", respectivamente) que son la versión "i" de la cadena H humanizada combinada con la versión "b1" o "b2" de la cadena L humanizada, y se ensayó la actividad de unión al antígeno y la actividad neutralizante hacia el antígeno. La actividad de unión de "i-b2" fue casi igual a la del anticuerpo quimérico, y la de "i-b1" fue ligeramente menor que la del anticuerpo quimérico (Figura 29). La actividad neutralizante de "i-b1" y "i-b2" fue mayor que la del anticuerpo quimérico y "i-b", que estaba en un orden decreciente de "i-b2" > "i-b1" (Figura 30).
Ejemplo 5. Preparación de células CHO que producen un anticuerpo humanizado y estudio de su actividad
(1) Establecimiento de una línea celular que produce de manera estable un anticuerpo
Para establecer líneas celulares que producen de manera estable un anticuerpo humanizado (b-b, i-b, e i-b2), se introdujo un vector de expresión génica de anticuerpo en células CHO (DG44) aclimatadas en un medio exento de suero.
El ADN plasmídico, hHvb-hLvb/N5KG4P, hHvi-hLvb/N5KG4P, y hHvi-hLvb2/N5KG4P se digirió con la enzima de restricción SspI (Takara Shuzo) y se linealizó, y se extrajo con fenol y cloroformo, y se purificó mediante precipitación con etanol. El vector de expresión génica linealizado se introdujo en las células DG44 mediante el uso de un instrumento de electroporación (Gene Pulser; Bio-Rad). Las células DG44 se suspendieron en PBS a una concentración celular de 1 x 107 células/ml, y a alrededor de 0,8 ml de esta suspensión se le añadieron 10 ó 50 μg del ADN, que se sometió a pulsos de 1.500 V y 25 μF de capacidad.
Después de 10 minutos de periodo de recuperación a temperatura ambiente, las células tratadas se suspendieron en un medio CHO-S-SFMII (GIBCO) que contenía hipoxantina/timidina (GIBCO) (denominada más adelante en la presente memoria HT), que se inoculó en dos placas de 96 pocillos (Falcon) a 100 μl/pocillo, y se cultivó en un incubador de CO2. Ocho a nueve horas después del inicio del cultivo, se añadieron 100 μl/pocillo del medio CHO-S-SFMII que contenía HT y 1 mg/ml de Geneticina (GIBCO) para cambiar a 500 μg/ml del medio de selección de Geneticina, y se seleccionaron las células en las que se había introducido el gen del anticuerpo. El medio se cambió por uno reciente una vez cada 3-4 días con ½ del volumen. Alrededor de 2 semanas después de cambiar al medio de selección, se recuperó una alícuota del sobrenadante del cultivo del pocillo en el que se observó un crecimiento celular favorable 4-5 días más tarde. Se midió la concentración del anticuerpo expresado en el sobrenadante del cultivo mediante el ELISA descrito anteriormente para la medición de la concentración del anticuerpo, y se seleccionaron las células que tenían un rendimiento elevado de producción del anticuerpo.
(2)
Purificación a gran escala del anticuerpo humanizado
Después de cultivar las líneas celulares DG44 seleccionadas como se mencionó anteriormente que producían el anticuerpo humanizado ("b-b", "i-b", y "i-b2") durante varios días en un frasco de 500 ml del medio CHO-S-SFMII mediante el uso de un frasco de 2 L (CORNING) de un mezclador de rodillos, se recogió el medio de cultivo y se añadió un medio CHO-S-SFMII reciente y se cultivó de nuevo. El medio de cultivo se centrifugó para eliminar los restos celulares, y se filtró con un filtro de 0,22 μm o de 0,45 μm. Repitiendo esto se obtuvo un total de alrededor de 2 L de cada sobrenadante de cultivo. A partir del sobrenadante obtenido, se purificó el anticuerpo mediante el sistema ConSep LC100 (Millipore) conectado a una columna de afinidad de Proteína A (Poros).
(3)
Medida de la concentración de anticuerpo mediante ELISA
Se prepararon placas de ELISA para la medida de la concentración del anticuerpo como sigue: Cada pocillo de una placa de ELISA de 96 pocillos (Maxisorp, NUNC) se inmovilizó con 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humana de cabra (BioSource) preparado a una concentración de 1 μg/ml con CB. Después de bloquear con 200 μl de DB, el sobrenadante del cultivo de las células CHO en las que se había expresado el anticuerpo o el anticuerpo purificado se diluyó en serie con DB, y se añadió a cada pocillo.
Después de incubar a temperatura ambiente durante 1 hora y lavar con RB, se añadieron 100 μl de anticuerpo antiIgGγ humana de cabra conjugado a fosfatasa alcalina (BioSource) diluido 1000 veces con DB. Después de incubar a temperatura ambiente durante 1 hora y lavar con RB, se añadieron 100 μl de la disolución de sustrato, y después se midió la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso del lector de microplacas (Bio-Rad). Como patrón para la medida de la concentración, se usó IgG4κ humana (The Binding Site).
(4) Medida de la actividad de unión al antígeno
Las placas de ELISA de células para la medida de la unión al antígeno se prepararon como sigue. Las células usadas fueron células J82 de carcinoma de vejiga humana (ATCC HTB-1), que se inocularon en una placa de cultivo celular de 96 pocillos a un recuento celular de 1 x 105 células. Esto se cultivó (medio RPMI1640 que contenía un 10% de suero bovino fetal (GIBCO)) durante un día en un incubador de CO2 para permitir que las células se uniesen a la placa. Después de desechar el líquido de cultivo, cada pocillo se lavó dos veces con PBS. Se añadieron 100 μl de PFA/PBS a cada pocillo, y se colocaron sobre hielo durante 10 minutos para inmovilizar las células.
Se desechó el PFA/PBS, y cada pocillo se lavó dos veces con 300 μl de PBS y después se bloqueó con 250 μl de DB. Basándose en el resultado de la medida anterior, el anticuerpo purificado se diluyó en serie con DB comenzando en 10 μg/ml mediante un factor de 2, y se añadieron 100 μl a cada pocillo. Después de incubar a temperatura ambiente durante 2 horas y lavar con RB, se añadieron 100 μl de anticuerpo anti-IgGγ humana de cabra conjugado a fosfatasa alcalina (BioSource) diluido 1000 veces con DB. Después de incubar a temperatura ambiente durante 1 hora y lavar con RB, se añadieron 100 μl de la disolución de sustrato, y después se midió la absorbancia a 405/655 nm mediante el uso del lector de microplacas (Bio-Rad).
(5) Medida de la actividad neutralizante hacia TF (actividad de inhibición de la producción de factor FXa)
Se midió la actividad de inhibición de la producción de Factor Xa del anticuerpo humanizado con la actividad de inhibición de la actividad de producción del Factor Xa mediante la tromboplastina derivada de placenta humana, Thromborel S (Boehringer AG), como índice. Así, se añadieron 60 μl del tampón (TBS que contenía CaCl2 5 mM y un 0,1% de BSA) a 10 μl de 5 mg/ml de Thromborel S y 10 μl del anticuerpo, que después se incubó en una placa de 96 pocillos a temperatura ambiente durante 1 hora. El anticuerpo se diluyó en serie con el tampón comenzando a 200 μg/ml mediante un factor de 5.
Se le añadieron 10 μl de 3,245 μg/ml de Factor X humano (Celsus Laboratories) y 82,5 ng/ml de Factor VIIa humano (Enzyme Research), y se incubó adicionalmente a temperatura ambiente durante 45 minutos. Se le añadieron 10 μl de EDTA 0,5 M para parar la reacción. Se le añadieron 50 μl de la disolución de sustrato cromogénico y se determinó la absorbancia a 405/655 nm mediante el lector de microplacas (Bio-Rad). Después de hacer reaccionar a temperatura ambiente durante 30 minutos, se midió de nuevo la absorbancia a 405/655 nm. Se determinó la actividad residual (%) a partir de cada cambio de absorbancia, con el cambio de absorbancia durante 30 minutos sin adición de anticuerpo como una actividad del 100%.
Se preparó la disolución de sustrato cromogénico disolviendo el sustrato cromogénico Testzyme S-2222 (Chromogenix) según las instrucciones adjuntas, y mezclando con una disolución de polibreno (0,6 mg/ml de bromuro de hexadimetileno, SIGMA) a 1:1.
(6) Medida de la actividad neutralizante hacia TF (actividad de inhibición de la unión de FX)
La actividad de inhibición de la unión de FX del anticuerpo humanizado se midió mediante el uso de tromboplastina derivada de placenta humana, Thromborel S (Boehringer AG), en la que se había formado previamente un complejo de TF y Factor VIIa, y la actividad de inhibición de la unión de FX se midió con la actividad de producción de Factor Xa del complejo TF-FVIIa como índice. Así, se añadieron 60 μl del tampón (TBS que contenía CaCl2 5 mM y 0,1% de BSA) a 10 μl de 5 mg/ml de Thromborel S y 10 μl de 82,5 ng/ml de Factor VIIa humano (Enzyme Research), que se preincubó en una placa de 96 pocillos a temperatura ambiente durante 1 hora.
Se le añadieron 10 μl de la disolución de anticuerpo, incubados a temperatura ambiente durante 5 minutos, y 10 μl de 3,245 μg/ml de Factor X humano (Celsus Laboratories), y se incubó adicionalmente a temperatura ambiente durante 45 minutos. El anticuerpo se diluyó en serie con el tampón comenzando a 200 μg/ml mediante un factor de
2. Se le añadieron 10 μl de EDTA 0,5 M para parar la reacción. Se le añadieron 50 μl de la disolución de sustrato cromogénico y se determinó la absorbancia a 405/655 nm mediante el lector de microplacas (Bio-Rad). Después de hacer reaccionar a temperatura ambiente durante 30 minutos, se midió de nuevo la absorbancia a 405/655 nm. Se determinó la actividad residual (%) a partir de cada cambio de absorbancia, con el cambio de absorbancia durante 30 minutos sin adición de anticuerpo como una actividad del 100%.
Se preparó la disolución de sustrato cromogénico disolviendo el sustrato cromogénico Testzyme S-2222 (Chromogenix) según las instrucciones adjuntas, y mezclando con una disolución de polibreno (0,6 mg/ml de bromuro de hexadimetileno, SIGMA) a 1:1.
(7) Medida de la actividad neutralizante hacia TF (actividad de inhibición de la coagulación plasmática)
La actividad neutralizante hacia TF (actividad de inhibición de la coagulación plasmática) del anticuerpo humanizado se midió mediante el uso, como índice, del tiempo de protrombina determinado mediante el uso de la tromboplastina derivada de placenta humana, Thromborel S (Boehringer AG). Así, se colocaron 100 μl de plasma humano (Cosmo Bio) en una cubeta de muestra, a la que se le añadieron 50 μl del anticuerpo diluido a diversas concentraciones, y se calentó a 37 °C durante 3 minutos. Se añadieron 50 μl de 1,25 mg/ml de Thromborel S que se habían precalentado previamente a 37 °C para iniciar la coagulación plasmática. El tiempo de coagulación se midió mediante el uso del Amelung KC-10A conectado al Amelung CR-A (ambos de M. C. Medical).
El anticuerpo se diluyó en serie con TBS que contenía un 0,1% de BSA (denominado más adelante en la presente memoria BSA-TBS) comenzando a 80 μg/ml mediante un factor de 2. Con el tiempo de coagulación sin adición de anticuerpo como el 100% de actividad de coagulación plasmática del TF, se calculó la actividad de TF residual a partir de cada tiempo de coagulación en la adición del anticuerpo basándose en una curva patrón obtenida representando la concentración de Thromborel S y el tiempo de coagulación.
La curva patrón se creó a partir de las diversas concentraciones de Thromborel S y del tiempo de coagulación medido. Se añadieron 50 μl de BSA-TBS a 50 μl de Thromborel S diluido de manera adecuada, que se calentó a 37 °C durante 3 minutos, y se añadieron 100 μl de plasma humano precalentado a 37 °C para comenzar la coagulación, y se determinó el tiempo de coagulación. Thromborel S se diluyó en serie con el tampón de Hank (GIBCO) que contenía CaCl2 25 mM comenzando a 6,25 mg/ml mediante un factor de 2. Se representó la concentración de Thromborel S en el eje de abscisas, y el tiempo de coagulación en el eje de ordenadas en un papel log-log, lo que representó una curva patrón.
(8) Estudio de la actividad
Todos los anticuerpos humanizados, "b-b", "i-b", y "i-b2" tuvieron una actividad igual o mayor que la del anticuerpo quimérico (Figura 31). Para la actividad de inhibición de la producción de FXa, la actividad de inhibición de la unión de FX, y también la actividad de inhibición de la coagulación plasmática, los anticuerpos humanizados, "b-b", "i-b", y "i-b2" tuvieron una actividad igual o mayor que la del anticuerpo quimérico, y la actividad fue en un orden decreciente "i-b2" > "i-b" > "b-b" (Figuras 32, 33, y 34).
Ejemplo 6. Análisis cinético de la interacción de TF y del anticuerpo anti-TF mediante el uso de BIACORE
Se llevó a cabo el análisis cinético de la reacción antígeno-anticuerpo mediante el uso de BIACORE. La Proteína G recombinante se inmovilizó sobre un chip sensor, al cual estaba acoplado el anticuerpo. Se usó como antígeno el TF recombinante purificado (un TF soluble en el que el péptido FLAG se utilizó como marcador en 1-219), y se usó como analito el TF soluble preparado a diversas concentraciones. A partir del sensorgrama obtenido, se calcularon los parámetros cinéticos (constantes de velocidad de disociación kdiss, y constantes de velocidad de unión kass). Para el análisis cinético, se hizo referencia a "Kinetic analysis of monoclonal antibody-antigen interactions with a new biosensor based analytical system" (Karlsson, R. et al., (1991) J. Immunol. Methods 145: 229-240).
(1) Inmovilización de la Proteína G al chip sensor
La Proteína G (ZYMED) se inmoviliza en el chip sensor CM5 (BIACORE).
Como tampón de funcionamiento se usó el tampón HBS-EP (HEPES 0,01 M, pH 7,4, NaCl 0,15 M, EDTA 3 mM, 0,005% de polisorbato 20 (v/v)) (BIACORE), y el caudal fue de 5 μl/min. Los grupos carboxilo del carboximetil dextrano en el chip sensor CM5 se activaron mediante la inyección de N-hidroxisuccinimida (NHS) 0,05 M/hidrocloruro de N-etil-N'-(3-dimetilaminopropil)-carbodiimida (EDC) 0,2 M. Posteriormente, se inyectaron 10 μl de 50 μg/ml de Proteína G, y esto se repitió tres veces para la inmovilización. La Proteína G se preparó disolviéndola en tampón Tris-HCl 10 mM (pH 7,5) a una concentración de 10 mg/ml, y diluyendo hasta 50 μg/ml con tampón de acetato sódico 10 mM (pH 4,0). Se inyectaron otros 100 μl de hidrocloruro de etanolamina 1,0 M (pH 8,5) para bloquear el exceso de grupos activos. A esto se le inyectaron 10 μl de tampón de glicina-ácido clorhídrico 0,1 M (pH 2,5) y 10 μl de ácido clorhídrico 10 mM para eliminar mediante lavado las sustancias unidas de manera no covalente. Llevando a cabo esto para cada celda de flujo e inyectando 10 μl de la versión "ib2" del anticuerpo anti-TF humanizado 72 nM, se confirmó que se unieron alrededor de 1000 RU.
(2) Interacción del anticuerpo anti-TF inmovilizado y TF humano Se expresó TF humano en el que se había unido el péptido FLAG al extremo C-terminal de la secuencia de aminoácidos 1-219 en células CHO, y se purificó. Esto se usó como TF soluble.
Como tampón de funcionamiento, se usó el tampón HBS-EP. Se inyectaron 10 μl de disolución de anticuerpo 72 mM
5 a un caudal de 20 μl/min para inmovilizar el anticuerpo. El anticuerpo se diluyó con el tampón HBS-EP. A esto se le inyectaron 40 μl de disolución de TF humano soluble a diversas concentraciones a un caudal de 30 μl/min. En el análisis, se establecieron 80 segundos para la inyección como fase de unión, y después se cambió al tampón HBSEP para establecer la fase de disociación de 120 segundos. Después de finalizar la fase de disociación, se inyectaron 10 μl de ácido clorhídrico 20 mM para reconstituir el chip sensor. La unión, disociación, y reconstitución se esta
10 blecieron en forma de un ciclo, y se obtuvo el sensorgrama para cada anticuerpo. La disolución de TF humano soluble se preparó a concentraciones de 250 nM, 125 nM, 62,5 nM, 31,3 nM, 15,6 nM, 7,81 nM, y 3,91 nM mediante el uso del tampón HBS-EP. Como blanco, se usó el sensorgrama obtenido inyectando el tampón HBS-EP usado para la dilución.
15 El procedimiento anterior se llevó a cabo para cada una de las celdas de flujo nº 1 a 3.
(3) Análisis cinético de la interacción
Se realizó la lectura del fichero de datos de interés, y se llevó a cabo la comparación de los patrones de reacción
20 mediante una superposición con el uso como línea base del sensorgrama del tampón HBS-EP. Además, mediante el uso del programa informático con aplicaciones analíticas "BIAevaluation 2.1" (Pharmacia) exclusivamente para BIACORE que calcula los parámetros cinéticos (constantes de velocidad de unión kass y constantes de velocidad de disociación kdiss) mediante ajuste de curvas, se llevó a cabo el análisis cinético de la interacción. Para determinar las constantes de la velocidad de unión kass, se usó el modelo de análisis de tipo 4 (BIAevaluation 2.1 Software
25 Handbook, A1-A5). Basándose en los valores calculados a partir de cada celda de flujo, se obtuvieron los parámetros cinéticos para cada anticuerpo. El resultado (media de los valores calculados a partir de cada celda de flujo ± desviación estándar) se muestra en la Tabla 6.
Tabla 6 Parámetros cinéticos del anticuerpo anti-TF quimérico y humanizado (n = 3)
quimérico
b-b i-b i-b2
kdiss [× 10−4 1/s]
5,06 ± 0,12 9,52 ± 0,22 6,49 ± 0,17 6,35 ± 0,15
kass [× 105 1/Ms]
4,65 ± 0,32 4,15 ± 0,27 4,67 ± 0,30 5,44 ± 0,36
KD [× 10−9 M]
1,09 ± 0,09 2,30 ± 0,15 1,39 ± 0,13 1,17 ± 0,11
30 Ejemplo 7. Medida de la reactividad del anticuerpo anti-TF humanizado hacia TF humano
Mediante el uso del método de hibridación de transferencia puntual ("Protein Experimental Method for Molecular Biological Research, Revised", Yodosha, editado por Takenawa Tadaomi, pág. 101), se investigó la reactividad hacia TF sin desnaturalizar, TF desnaturalizado en condiciones no reductoras, y TF desnaturalizado en condiciones re35 ductoras. Se expresó en células CHO el TF en el que se había utilizado como marcador FLAG en la región extracelular, y se purificó (shTF). shTF se diluyó con cada uno de tres tampones (tampón A: Tris-HCl 10 mM, pH 8,0; tampón B: Tris-HCl 10 mM (pH 8,0), urea 8 M; tampón C: Tris-HCl 10 mM, pH 8,0, urea 8 M, DTT 5 mM). El TF sin desnaturalizar se trató con el tampón A, mientras el TF desnaturalizado de manera no reductora se trató con el tampón B, y el TF desnaturalizado de manera reductora se trató con el tampón C. Cada muestra se trató durante 24 40 horas a temperatura ambiente. Después del tratamiento, la muestra se transfirió a una membrana de nitrocelulosa (Bio-Rad). Se transfirieron 0,5 μl, 1 μl, y 2 μl de la muestra (3 μg/ml) a la membrana, y la membrana se secó al aire. Se bloqueó con DB (Tris-HCl 50 mM, pH 8,1, NaCl 0,15 M, MgCl2 1 mM, 0,05% (v/v) de Tween 20, 0,02% (p/v) de NaN3, 1%(p/v) de BSA). La membrana se hizo reaccionar en DB que contenía el anticuerpo anti-TF humanizado o DB (control). Después de lavar con PBS que contenía un 0,05% (v/v) de Tween 20, se hizo reaccionar con DB que
45 contenía un anticuerpo anti-IgG humana marcado con peroxidasa (DAKO). Después de lavar con PBS que contenía un 0,05% (v/v) de Tween 20, se trató con el reactivo de transferencia de Western ECL (Amersham), y se expuso a una película de rayos X durante 30 segundos.
Como se muestra en la Figura 35, el anticuerpo anti-TF quimérico y los anticuerpos anti-TF humanizados (versiones
50 "bb", "ib", y "ib2" reaccionaron todos con el TF sin desnaturalizar, el TF desnaturalizado de manera no reductora, y el TF desnaturalizado de manera reductora.
Ejemplo 8. Confirmación del efecto antitrombótico en un modelo de rata de CID aguda - a título meramente informativo
El efecto antitrombótico del anticuerpo anti-TF se confirmó en un modelo de CID inducido con tromboplastina me
5 diante el uso de ratas. Así, se inyectó continuamente una disolución de tromboplastina humana en la vena de ratas macho SD a 40 mg/kg a lo largo de 3 horas para crear un modelo de CID. El anticuerpo anti-TF (el anticuerpo i-b2 anti-TF quimérico y humanizado) se administró de manera intravenosa a una dosis de 0,2 mg/kg cinco minutos antes del inicio de la inyección de la disolución de tromboplastina. Quince minutos tras la finalización de la inyección continua de la disolución de tromboplastina, se extrajo sangre de la aorta abdominal en un tubo de citrato, en la cual se
10 midió el recuento de plaquetas, el tiempo de tromboplastina parcial activada (aPTT), la concentración de fibrinógeno (Fib), la concentración de complejos de monómeros de fibrina solubles (sFMC), y el complejo trombina/antitrombina III (TAT).
El resultado mostrado en la Tabla 7 indicó que la inyección continua de tromboplastina provocó un recuento de pla
15 quetas disminuido, un aPTT prolongado, una concentración de fibrinógeno disminuida, concentraciones incrementadas de sFMC y TAT, y un estado hipercoagulado evidente. En contraste, los anticuerpos anti-TF tanto quiméricos como humanizados inhibieron estos cambios con igual intensidad.
Los resultados revelaron que el anticuerpo anti-TF humanizado es útil como agente antitrombótico. 20 Tabla 7
Objeto de la medida
Grupo normal de administración sin tromboplastina Grupo de control con administración de disolvente Grupo de administración de anticuerpo quimérico Grupo de administración de anticuerpo humanizado
Recuento de plaquetas (x 104 / mm3)
115,5 ± 11,8 82,9 ± 14,3 100,7 ± 12,9 96,1 ± 13,3
aPTT (seg)
20,1 ± 1,1 36,2 ± 13,9 22,3 ± 0,7 a) 21,8 ± 1,3 a)
Concentración de fibrinógeno (grupo normal = 100%)
100,0 ± 4,2 64,8 ± 20,0 101,0 ± 6,6 a) 98,9 ± 5,7 a)
Concentración de sFMC (μg/ml)
74,2 ± 5,5 3517 ± 3645 129,9 ± 46,8 a) 66,5 ± 23,0 a)
Concentración de TAT (ng/ml)
3,4 ± 0,6 29,6 ± 31,0 3,8 ± 0,7 b) 4,2 ± 0,9
(Media ± desviación estándar)
Significación de la diferencia respecto del grupo de control de administración del disolvente: a): p<0,01, b): p<0,05
25 Ejemplo de Referencia 1. Preparación de un anticuerpo monoclonal anti-TF
1. Purificación de TF humano
Se llevó a cabo la purificación de TF a partir de placenta humana según el método de Ito (Ito, T. et al., J. Biol. Chem.,
30 114: 691-696, 1993). Así, se homogeneizó placenta humana en solución salina tamponada con Tris (TBS, pH 7,5) que contenía hidrocloruro de benzamidina 1,0 mM, fluoruro de fenilmetilsulfonilo 1 mM, fosfato de diisopropilfluoro 1 mM, y 0,02% de azida sódica, y después se eliminaron los lípidos del precipitado con acetona fría. El polvo sin lípidos obtenido se suspendió en el tampón indicado anteriormente que contenía un 2% de Triton X-100 para solubilizar el TF.
35 El sobrenadante se sometió a cromatografía de afinidad mediante el uso de una columna de Concanavalina A-Sepharose 4B (Pharmacia) y una columna de Sepharose 4B unida a anticuerpo anti-TF (Pharmacia), y se obtuvo el TF purificado. Se concentró con una membrana de ultrafiltración (PM-10, Amicon) y se almacenó como una muestra purificada a 4° C.
40 Se cuantificó el contenido de TF en la muestra purificada mediante ELISA de tipo sándwich que se combinó con un anticuerpo monoclonal anti-TF disponible comercialmente (American Diagnostica) y un anticuerpo policlonal (American Diagnostica) con TF recombinante como patrón.
45 La pureza de la muestra purificada se confirmó sometiendo a la muestra a SDS-PAGE mediante el uso de un gel de poliacrilamida con un gradiente de densidad del 4-20%, y tinción con plata del producto.
2. Inmunización y preparación del hibridoma Después de mezclar el TF humano purificado (alrededor de 70 μg/ml) con un volumen igual de adyuvante completo de Freund (Difco), se inmunizó de manera subcutánea en el abdomen de ratones macho Balb/c de 5 semanas (Nippon Charles River) a 10 μg de TF/ratón. En los días 12, 18, y 25, se llevó a cabo una inyección de refuerzo subcutánea con TF mezclado con adyuvante incompleto de Freund a 5 μg/ratón, y como inmunización final se administró de manera intraperitoneal la disolución de TF diluida con PBS a 5 μg/ratón en el día 32.
Tres días después de la inmunización final, se prepararon células del bazo a partir de cuatro ratones, y se fusionaron a la línea de células de mieloma de ratón P3U1 a 1/5 del recuento celular de las mismas mediante el método de polietilen glicol. Las células fusionadas se suspendieron en el medio RPMI-1640 (denominado más adelante en la presente memoria medio RPMI) (Lifetech Oriental) que contenía un 10% de suero bovino fetal, que se inoculó en 400 pocillos por ratón (alrededor de 400 células/pocillo) de una placa de 96 pocillos. En los días 1, 2, 3, y 5 tras la fusión, se intercambió la mitad del volumen del medio por el medio RPMI (denominado más adelante en la presente memoria medio HAT) que contenía HAT (Dainippon Seiyaku) y H1 (Boehringer Mannheim GmbH) para llevar a cabo la selección mediante HAT del hibridoma.
Los hibridomas seleccionados mediante el método de cribado descrito más adelante se clonaron llevando a cabo una dilución limitante dos veces.
Para la dilución limitante, se inocularon 0,8 células por pocillo en dos placas de 96 pocillos. Para los pocillos en los que se confirmó una única colonia mediante examen microscópico, se seleccionaron los clones mediante la siguiente medida de la actividad de unión a TF y de la actividad neutralizante hacia TF. Los clones obtenidos se transfirieron del medio HAT al medio RPMI. Después de confirmar la ausencia de reducción en la capacidad de producción de anticuerpos debida a la aclimatación, se llevó a cabo de nuevo una dilución limitante para la clonación completa. Mediante el procedimiento anterior, se establecieron hibridomas que producen seis anticuerpos (ATR-2, 3, 4, 5, 7, y 8) que inhiben intensamente la unión del complejo TF/Factor VIIa y el Factor X.
3. Formación de líquido ascítico y purificación de anticuerpos
Se llevó a cabo la formación de líquido ascítico de los hibridomas establecidos según el método habitual. Así, se injertaron de manera intraperitoneal 106 hibridomas que se subcultivaron in vitro en ratones macho BALB/c que habían recibido previamente dos veces una administración intravenosa de aceite mineral. Se recogió el líquido ascítico de los ratones que mostraron un abdomen inflamado 1-2 semanas después del injerto.
La purificación del anticuerpo a partir del líquido ascítico se llevó a cabo mediante el uso del sistema ConSepLC100 (Millipore) equipado con una columna de Proteína A (Nippon Gaishi).
4. ELISA de células
Se obtuvieron células J82 de carcinoma de vejiga humana (Fair D. S. et al., J. Biol. Chem., 262: 11692-11698, 1987) que se sabe que expresan TF a nivel elevado de la ATCC, y se subcultivaron y se mantuvieron en el medio RPMI a 37 °C, 5% de CO2, y un 100% de humedad.
Las placas de ELISA de células se prepararon inoculando células J82 en una placa de 96 pocillos a 105 células/pocillo, cultivando durante un día en las condiciones anteriormente mencionadas, eliminando el medio y después lavando dos veces con solución salina tamponada con fosfato (PBS), añadiendo una disolución al 4% de paraformaldehído (PFA), y dejando reposar sobre hielo durante 10 minutos para la inmovilización. Después de eliminar el PFA, la placa se lavó con PBS, se le añadió el tampón Tris (tampón de bloqueo) que contenía un 1% de BSA y un 0,02% de azida sódica, y la placa se almacenó a 4 °C hasta su uso.
El ELISA de células se llevó a cabo de la siguiente manera. Así, el tampón de bloqueo se eliminó de la placa preparada como se mencionó anteriormente, a la que se le añadió una disolución de anticuerpo anti-TF o un sobrenadante de cultivo de hibridomas, y se hizo reaccionar a temperatura ambiente durante 1,5 horas. Después de lavar con PBS que contenía un 0,05% de Tween 20, se hizo reaccionar un anticuerpo anti-IgG de ratón (H+L) de cabra conjugado a fosfatasa alcalina (Zymed) durante 1 hora. Después de lavar, se añadió 1 mg/ml de p-nitrofenil fosfato disódico (Sigma), y una hora más tarde se midió la absorbancia a 405/655 nm para determinar la cantidad de anticuerpo anti-TF que se unió a las células J82.
5. Sistema de ensayo de la actividad neutralizante hacia TF con la actividad del Factor Xa como índice
A 50 μl de solución salina tamponada con Tris (TBS: pH 7,6) que contenía CaCl2 5 mM y 0,1% de albúmina de suero bovino, se le añadieron 10 μl de una disolución de tromboplastina derivada de placenta humana (5 mg/ml) (Thromborel S) (Boehring) y 10 μl de una disolución de Factor VIIa (82,5 ng/ml) (American Diagnostics), y se hizo reaccionar a temperatura ambiente durante 1 hora para permitir la formación del complejo TF/Factor VIIa. Después de añadir 10 μl de una concentración predeterminada de una disolución de anticuerpo anti-TF diluido o del sobrenadante del cultivo de hibridoma y 10 μl de una disolución de Factor X (3,245 μg/ml) (Celsus Laboratories) y hacerlos reaccionar durante 45 minutos, se añadieron 10 μl de EDTA 0,5 M para parar la reacción. Se le añadieron 50 μl de una disolución de S-2222 2 mM (Daiichi Kagaku Yakuhin), y se midieron los cambios de la absorbancia a 405/655 nm a lo largo de 30 minutos y se estableció la actividad de producción de Factor X del TF. En este método, se puede determinar la actividad del anticuerpo que inhibe la unión del complejo TF/Factor VIIa y del Factor X.
5
6.
Sistema de ensayo de la actividad de inhibición de la coagulación plasmática
Se mezclaron 50 μl de una disolución de anticuerpo anti-TF diluida de manera adecuada con 100 μl de un plasma humano normal disponible comercialmente (Kojin Bio), y se hizo reaccionar a 37 °C durante 3 minutos. Después se le añadieron 50 μl de disolución de tromboplastina derivada de placenta humana (1,25 mg/ml), y se midió el tiempo de coagulación del plasma mediante el uso del instrumento de medida de la coagulación plasmática (CR-A: Amelung).
7.
Determinación del isotipo del anticuerpo
15 Para el sobrenadante del cultivo del hibridoma y para el anticuerpo purificado, se usó el equipo de análisis del isotipo de anticuerpo monoclonal (fabricado por Amersham) para confirmar el isotipo del anticuerpo. El resultado se muestra más adelante.
Tabla 8 Isotipo de inmunoglobulina del anticuerpo monoclonal anti-TF ATR-2 IgG1, k ATR-3 IgG1, k ATR-4 IgG1, k ATR-5 IgG1, k ATR-7 IgG2a, k ATR-8 IgG2a, k
Ejemplo de Referencia 2. Método de preparación de TF humano soluble
25 Se preparó TF humano soluble (shTF) de la siguiente manera.
El gen que codifica la región penetrante del TF humano en el que los aminoácidos de la posición 220 y posteriores se han sustituido por el polipéptido FLAG M2 se insertó en el vector de expresión de células mamíferas (que contiene el gen de resistencia a neomicina y el gen DHFR), y se introdujo en las células CHO. Para la secuencia de cADN de TF humano, se hizo referencia a un artículo de James H. Morrissey et al. (Cell (1987) 50: 129-135). La secuencia del gen y la secuencia de aminoácidos de este TF humano soluble se muestran en SEQ ID Nº: 151. Tras la selección con fármacos con G418, se seleccionaron las células expresadas, que después se sometieron a la amplificación de la expresión con metotrexato, y se establecieron las células que expresaban shTF.
35 Las células se cultivaron en el medio exento de suero CHO-S-SFMII (GIBCO) para obtener un sobrenadante de cultivo que contenía shTF. Se diluyó 2 veces con un volumen igual de un tampón Tris-HCl 40 mM (pH 8,5), que se añadió a la columna Q-Sepharose Fast Flow (100 ml, Pharmacia Biotech) equilibrada con un tampón Tris-HCl 20 mM (pH 8,5). Después de lavar con el mismo tampón que contenía NaCl 0,1 M, la concentración de NaCl se cambió a 0,3 M, y se eluyó el shTF de la columna. A la fracción de shTF obtenida, se le añadió sulfato amónico a una concentración final de 2,5 M, y se centrifugó (10.000 rpm, 20 minutos) para precipitar las proteínas contaminantes. El sobrenadante se añadió a Butyl TOYOPEARL (30 ml, TOSOH), y después se lavó con un tampón Tris-HCl 50 mM (pH 6,8) que contenía sulfato amónico 2,5 M. En el tampón Tris-HCl 50 mM (pH 6,8), se redujo la concentración de sulfato amónico de manera lineal desde 2,5 M a 0 M para permitir la elución de shTF. Las fracciones de los picos que contenían shTF se concentraron mediante Centri-Prep 10 (Amicon). El concentrado se añadió a la columna
45 TSKgel G3000SWG (21,5 x 600 mm, TOSOH) equilibrada con un tampón Tris-HCl 20 mM (pH 7,0) que contenía NaCl 150 mM, y se recogió la fracción del pico de shTF. Se esterilizó mediante filtración con un filtro de membrana de 0,22 μm y el producto se estableció como el TF humano soluble (shTF). La concentración de la muestra se calculó suponiendo un coeficiente de extinción molar de la muestra ε = 40.130 y un peso molecular = 43.210.
Texto libre del listado de secuencias
El contenido de <223> del listado de secuencias es el siguiente:
SEQ ID Nº: 1: Cebador MHC-G1
55 SEQ ID Nº: 2: Cebador MHC-G2a
SEQ ID Nº: 3: Cebador MKC SEQ ID Nº: 4: Cebador de M13 M4 SEQ ID Nº: 5: Cebador de M13 RV SEQ ID Nº: 6: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-2 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 7: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 8: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-4 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 9: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 10: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-7 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 11: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-8 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 12: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-2 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 13: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 14: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-4 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 15: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 16: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-7 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 17: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-8 y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 18: Cebador ch5HS
SEQ ID Nº: 19: Cebador ch5HA
SEQ ID Nº: 20: Cebador ch5LS
SEQ ID Nº: 21: Cebador ch5LA
SEQ ID Nº: 22: Cebador de injerto de CDR hR5Hv1S
SEQ ID Nº: 23: Cebador de injerto de CDR hR5Hv28
SEQ ID Nº: 24: Cebador de injerto de CDR hR5Hv4S
SEQ ID Nº: 25: Cebador de injerto de CDR hR5Hv3A
SEQ ID Nº: 26: Cebador de injerto de CDR hR5Hv5A
SEQ ID Nº: 27: Cebador hR5HvPrS
SEQ ID Nº: 28: Cebador hR5HvPrA
SEQ ID Nº: 29: Secuencia de aminoácidos de la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 30: Secuencia de aminoácidos de la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 31: Cebador de reordenamiento de FR F3RFFS SEQ ID Nº: 32: Cebador de reordenamiento de FR F3RFBS SEQ ID Nº: 33: Cebador de reordenamiento de FR F3RFFA SEQ ID Nº: 34: Cebador de reordenamiento de FR F3RFBA SEQ ID Nº: 35: Cebador de reordenamiento de FR F3NMFS SEQ ID Nº: 36: Cebador de reordenamiento de FR F3NMBS SEQ ID Nº: 37: Cebador de reordenamiento de FR F3NMFA SEQ ID Nº: 38: Cebador de reordenamiento de FR F3NMBA SEQ ID Nº: 39: Secuencia de aminoácidos de la versión "b" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 40: Secuencia de aminoácidos de la versión "b" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 41: Secuencia de aminoácidos de la versión "c" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 42: Secuencia de aminoácidos de la versión "c" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 43: Cebador de reordenamiento de FR F3EPS SEQ ID Nº: 44: Cebador de reordenamiento de FR F3EPA SEQ ID Nº: 45: Cebador F3PrS SEQ ID Nº: 46: Cebador F3PrA SEQ ID Nº: 47: Cebador de reordenamiento de FR F3VHS SEQ ID Nº: 48: Cebador de reordenamiento de FR F3VHA SEQ ID Nº: 49: Secuencia de aminoácidos de la versión "d" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 50: Secuencia de aminoácidos de la versión "d" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 51: Secuencia de aminoácidos de la versión "e" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 52: Secuencia de aminoácidos de la versión "e" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 53: Cebador de reordenamiento de FR F3SSS SEQ ID Nº: 54: Cebador de reordenamiento de FR F3SSA SEQ ID Nº: 55: Cebador de reordenamiento de FR F3CDS SEQ ID Nº: 56: Cebador de reordenamiento de FR F3CDA SEQ ID Nº: 57: Secuencia de aminoácidos de la versión "f" de la región V de la cadena H humanizada y la secuencia
de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 58: Secuencia de aminoácidos de la versión "f" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 59: Secuencia de aminoácidos de la versión "g" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 60: Secuencia de aminoácidos de la versión "g" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 61: Cebador de reordenamiento de FR F3ADS SEQ ID Nº: 62: Cebador de reordenamiento de FR F3ADA SEQ ID Nº: 63: Secuencia de aminoácidos de la versión "h" de la región V de la cadena H humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 64: Secuencia de aminoácidos de la versión "h" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 65: Cebador de reordenamiento de FR F3MMS SEQ ID Nº: 66: Cebador de reordenamiento de FR F3MMA SEQ ID Nº: 67: Cebador de reordenamiento de FR F3BMS SEQ ID Nº: 68: Cebador de reordenamiento de FR F3BMA SEQ ID Nº: 69: Secuencia de aminoácidos de la versión "i" de la región V de la cadena H humanizada y la secuencia
de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 70: Secuencia de aminoácidos de la versión "i" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 71: Secuencia de aminoácidos de la versión "j" de la región V de la cadena H humanizada y la secuencia
de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 72: Secuencia de aminoácidos de la versión "j" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 73: Cebador de reordenamiento de FR F2MPS SEQ ID Nº: 74: Cebador de reordenamiento de FR F2MPA SEQ ID Nº: 75: Secuencia de aminoácidos de la versión "b1" de la región V de la cadena H humanizada y la se
cuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 76: Secuencia de aminoácidos de la versión "b1" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 77: Secuencia de aminoácidos de la versión "d1" de la región V de la cadena H humanizada y la se
cuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 78: Secuencia de aminoácidos de la versión "d1" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 79: Cebador de reordenamiento de FR F2VHS SEQ ID Nº: 80: Cebador de reordenamiento de FR F2VHA SEQ ID Nº: 81: Secuencia de aminoácidos de la versión "b3" de la región V de la cadena H humanizada y la se
cuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 82: Secuencia de aminoácidos de la versión "b3" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 83: Secuencia de aminoácidos de la versión "d3" de la región V de la cadena H humanizada y la se
cuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 84: Secuencia de aminoácidos de la versión "d3" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 85: Vector de reordenamiento de FR h5Lv1S SEQ ID Nº: 86: Vector de reordenamiento de FR h5Lv4S SEQ ID Nº: 87: Vector de reordenamiento de FR h5Lv2A SEQ ID Nº: 88: Vector de reordenamiento de FR h5Lv3A SEQ ID Nº: 89: Vector de reordenamiento de FR h5Lv5A SEQ ID Nº: 90: Cebador h5LvS SEQ ID Nº: 91: Cebador h5LvA SEQ ID Nº: 92: Secuencia de aminoácidos de la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 93: Secuencia de aminoácidos de la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 94: Cebador de reordenamiento de FR F3SS SEQ ID Nº: 95: Cebador de reordenamiento de FR F3SA SEQ ID Nº: 96: Cebador de reordenamiento de FR F3RS SEQ ID Nº: 97: Cebador de reordenamiento de FR F3RA SEQ ID Nº: 98: Secuencia de aminoácidos de la versión "b" de la región V de la cadena L humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 99: Secuencia de aminoácidos de la versión "b" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 100: Secuencia de aminoácidos de la versión "c" de la región V de la cadena L humanizada y la secuen
cia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 101: Secuencia de aminoácidos de la versión "c" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 102: Cebador de reordenamiento de FR F2SS SEQ ID Nº: 103: Cebador de reordenamiento de FR F2SA SEQ ID Nº: 104: Cebador de reordenamiento de FR F2XS SEQ ID Nº: 105: Cebador de reordenamiento de FR F2XA SEQ ID Nº: 106: Secuencia de aminoácidos de la versión "b1" de la región V de la cadena L humanizada y la se
cuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 107: Secuencia de aminoácidos de la versión "b1" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 108: Secuencia de aminoácidos de la versión "b2" de la región V de la cadena L humanizada y la se
cuencia de nucleótidos que codifica la misma SEQ ID Nº: 109: Secuencia de aminoácidos de la versión "b2" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 110: Secuencia de aminoácidos de FR1 de la versión completa de la región V de la cadena H humani
zada
SEQ ID Nº: 111: Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "a" a "j" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 112: Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "b1" y "d1" de la región V de la cadena H
humanizada
SEQ ID Nº: 113: Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "b3" y "d3" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 114: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 115: Secuencia de aminoácidos de FR3 de las versiones "b", "b1", y "b3" de la región V de la cadena H
humanizada SEQ ID Nº: 116: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "c" de la región V de la cadena H humanizada
SEQ ID Nº: 117: Secuencia de aminoácidos de FR3 de las versiones "d", "d1", y "d3" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 118: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "e" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 119: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "f" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 120: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "g" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 121: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "h" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 122: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "i" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 123: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "j" de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 124: Secuencia de aminoácidos de FR4 de todas las versiones de la región V de la cadena H humani
zada
SEQ ID Nº: 125: Secuencia de aminoácidos de FR1 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 126: Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "a", "b" y "c" de la región V de la cadena L
humanizada SEQ ID Nº: 127: Secuencia de aminoácidos de FR2 de la versión "b1" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 128: Secuencia de aminoácidos de FR2 de la versión "b2" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 129: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 130: Secuencia de aminoácidos de FR3 de las versiones "b", "b1" y "b2" de la región V de la cadena L
humanizada SEQ ID Nº: 131: Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "c" de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 132: Secuencia de aminoácidos de FR4 de todas las versiones de la región V de la cadena L humani
zada
SEQ ID Nº: 133: Secuencia de aminoácidos de CDR1 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 134: Secuencia de aminoácidos de CDR2 de todas las versiones de la región V de la cadena H humani
zada
SEQ ID Nº: 135: Secuencia de aminoácidos de CDR3 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada SEQ ID Nº: 136: Secuencia de aminoácidos de CDR1 de todas las versiones de la región V de la cadena L humani
zada
SEQ ID Nº: 137: Secuencia de aminoácidos de CDR2 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada SEQ ID Nº: 138: Secuencia de aminoácidos de CDR3 de todas las versiones de la región V de la cadena L humani
zada
SEQ ID Nº: 139: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-2 SEQ ID Nº: 140: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-
TF ATR-3 SEQ ID Nº: 141: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-4
SEQ ID Nº: 142: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5
SEQ ID Nº: 143: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-7
SEQ ID Nº: 144: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-8
SEQ ID Nº: 145: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-2
SEQ ID Nº: 146: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3
SEQ ID Nº: 147: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-4
SEQ ID Nº: 148: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5
SEQ ID Nº: 149: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-7
SEQ ID Nº: 150: Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-8
SEQ ID Nº: 151: Secuencia de aminoácidos de TF humano soluble y la secuencia de nucleótidos que codifica la misma
SEQ ID Nº: 152: Secuencia de aminoácidos de TF humano soluble.
LISTADO DE SECUENCIAS
<110> CHUGAI SEIYAKU KABUSHIKI KAISHA
<120> Anticuerpos humanizados hacia el factor tisular (TF) humano y procedimiento para la producción de los anticuerpos humanizados
<130> Número de Solicitud: 99912098.3
<150> JP 10-91850
<151> 03-04-1998
<160> 152
<210> 1
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador MHC-G1
<400> 1 28 ggatcccggg ccagtggata gacagatg
<210> 2
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador MHC-G2a
<400> 2 27 ggatcccggg agtggataga ccgatgg
<210> 3
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador MKC
<400> 3 27 ggatcccggg tggatggtgg gaagatg
<210> 4
<211> 17
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de M13 M4
<400> 4 17 gttttcccag tcacgac
<210> 5
<211> 17
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de M13 RV
<400> 5 17 caggaaacag ctatgac
5 <210> 6
<211> 411
<212> ADN
<213> Ratón
10 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1) ... (57)
<220>
<221> mat-péptido 15 <222> (55)...(441)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-2
<400> 6
imagen4
<210> 7
<211> 411
<212> ADN 25 <213> Ratón
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1) ... (57) 30 <220>
<221> mat-péptido
<222> (58) ... (441)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3
<400> 7
imagen2
<210> 8 5 <211> 408
<212> ADN
<213> Ratón
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(408)
15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-4
<400> 8
imagen2
imagen2
<210> 9 5 <211> 408
<212> ADN
<213> Ratón
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58) ... (408)
15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5
<400> 9
imagen2
20 <210> 10
<211> 411
<212> ADN
<213> Ratón
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(411)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-7
<400> 10
imagen5
<210> 11
<211> 411
<212> ADN 15 <213> Ratón
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57) 20 <220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(411)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF
ATR-8 25 <400> 11 <212> ADN
imagen2
imagen6
<213> Ratón
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(54)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (55)...(375)
15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-2
<400> 12
imagen2
<210> 13
<211> 375
<212> ADN
<213> Ratón
<220> 5 <221> sig-péptido
<222> (1)...(54)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (55)...(375)
10 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3
<400> 13
imagen2
15 <210> 14
<211> 387
<212> ADN
<213> Ratón
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(66)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (67)...(387)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-4
<400> 14 <212> ADN
imagen2
imagen7
<213> Ratón
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(60)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (61)...(381)
15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5
<400> 15
imagen2
<210> 16
<211> 393
<212> ADN
<213> Ratón
<220> 5 <221> sig-péptido
<222> (1) ... (57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(394)
10 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-7
<400> 16
imagen2
15 <210> 17
<211> 393
<212> ADN
<213> Ratón
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (58)...(393)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-8
<400> 17
imagen2
imagen2
<210> 18
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador ch5HS
<400> 18 gtctgtcgac ccaccatgaa atgcagctgg gtcat 35
<210> 19
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador ch5HA
<400> 19 28 tgttgctagc tgaggagacg gtgactga
<210> 20
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador ch5LS
<400> 20 gtctagatct ccaccatgag ggcccctgct cagtt 35
<210> 21
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial <220>
<223> Cebador ch5LA
<400> 21
imagen2
<210> 22
<211> 104
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de injerto de CDR hR5Hv1S
<400> 22
imagen2
<210> 23
<211> 108
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de injerto de CDR hR5Rv28
<400> 23
imagen2
<210> 24
<211> 108
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de injerto de CDR hR5Hv4S
<400> 24
imagen2
<210> 25
<211> 110
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de injerto de CDR hR5Hv3A
<400> 25
imagen2
<210> 26
<211> 110
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de injerto de CDR hR5Hv5A
<400> 26
imagen2
<210> 27
<211> 19
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador hR5HvPrS
<400> 27 19 ttctgtcgac ccaccatga
<210> 28
<211> 19
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador hR5HvPrA
<400> 28 19 agaagctagc tgaggagac
<210> 29
<211> 415
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(415)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 29 <212> PRT
imagen2
imagen8
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "a" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 30
imagen2
15 <210> 31
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3RFFS
<400> 31
imagen2
25
<210> 32
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial 30
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3RFBS
imagen9
<210> 33
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3RFFA
<400> 33
imagen2
<210> 34
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3RFBA
<400> 34
imagen2
<210> 35
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3NMFS
<400> 35
imagen2
<210> 36
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3NMBS
<400> 36
imagen2
<210> 37
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3NMFA
<400> 37 <210> 38
imagen2
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3NMBA
imagen10
<210> 39
<211> 414
<212> ADN 15 <213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57) 20 <220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "b" de la región V de la cadena H humanizada
25 <400> 39
imagen2
<210> 40
<211> 119 30 <212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "b" de la región V de la cadena H humanizada 35
<400> 40
imagen2
<210> 41 5 <211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414) 15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "c" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 41
imagen4
<210> 42
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "c" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 42
imagen2
10 <210> 43
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
15 <220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3EPS
<400> 43
imagen2
20
<210> 44
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
25
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3EPA
imagen11
<210> 45
<211> 20
<212> ADN 35 <213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador F3PrS
40 <400> 45 20 ttctcggcca tagtatgtat
<210> 46
<211> 18 45 <212> ADN
<213> Secuencia Artificial <220>
<223> Cebador F3PrA
<400> 46 agaaccatgg catagccc
<210> 47
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3vHS
<400> 47
imagen2
<210> 48
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3vHA
<400> 48
imagen2
<210> 49
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "d" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 49
imagen2
imagen12
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "d" de la cadena H humanizada
<400> 50
imagen2
15 <210> 51
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "e" de la región V de la cadena H humanizada <400> 51
imagen2
<210> 52 5 <211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "e" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 52
imagen2
15 <210> 53
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3SSS
<400> 53 <210> 54
imagen2
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3SSA
<400> 54
imagen2
<210> 55
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3CDS
<400> 55
imagen2
<210> 56
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3CDA
<400> 56
imagen2
<210> 57
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "f" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 57
imagen2
<210> 58 5 <211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "f" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 58
imagen2
15
<210> 59 <211> 414 <212> ADN <213> Secuencia Artificial
20
<220> <221> sig-péptido <222> (1)...(57) <220> <221> mat-péptido
77
<222> (53)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "g" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 59
imagen3
<210> 60
<211> 119
<212> PRT 10 <213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "g" de la región V de la cadena H humanizada
15 <400> 60
imagen2
<210> 61 20 <211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 25 <223> Cebador de reordenamiento de FR F3ADS
<400> 61
imagen2
<210> 62 5 <211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Cebador de reordenamiento de FR F3ADA
<400> 62
imagen2
15 <210> 63
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "h" de la cadena H humanizada
<400> 63
imagen13
<210> 64
<211> 119
<212> PRT 35 <213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "h" de la región V de la cadena H humanizada <400> 64
imagen2
<210> 65
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3MMS
<400> 65
imagen2
<210> 66
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3MMA
<400> 66
imagen2
<210> 67
<211> 100
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3BMS
<400> 67
imagen2
<210> 68
<211> 75
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3BMA
<400> 68
imagen2
<210> 69 5 <211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414) 15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "i" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 69
imagen2
20
<210> 70
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial 25
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "i" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 70
imagen2
<210> 71 5 <211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414) 15 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "j" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 71 <220>
imagen2
20
<210> 72
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
25
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "j" de la región V de la cadena H humanizada
imagen14
<210> 73
<211> 79
<212> ADN 10 <213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2MPS
15 <400> 73
imagen2
<210> 74
<211> 79 20 <212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2MPA 25
<400> 74
imagen2
<210> 75 30 <211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 35 <221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (58)...(414) 40 <223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "b1" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 75
imagen2
<210> 76 5 <211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "b1" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 76
imagen2
15
<210> 77
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial 20
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220> 25 <221> mat-péptido
<222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "d1" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 77
imagen2
5 <210> 78
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
10 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "d1" de la región V de la cadena H humanizada
<400>
78
<400>
79
imagen2
15
<210> 79
<211> 79
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2VHS
imagen2
<210> 80 5 <211> 79
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Cebador de reordenamiento de FR F2VHA
<400> 80
imagen2
15 <210> 81
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (58)...(414)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "b3" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 81
imagen2
30
<210> 82
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
35
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "b3" de la región V de la cadena H humanizada 86
<400> 82
imagen2
5 <210> 83
<211> 414
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
10 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(57)
<220>
<221> mat-péptido 15 <222> (58)...(419)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "d3" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 83 <220>
imagen2
20
<210> 84
<211> 119
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
25
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "d3" de la región V de la cadena H humanizada
imagen15
<210> 85
<211> 98 10 <212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Vector de reordenamiento de FR h5Lv1S 15
<400> 85
imagen2
<210> 86 20 <211> 98
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220> 25 <223> Vector de reordenamiento de FR h5Lv4S
<400> 86
imagen2
30 <210> 87
<211> 98
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
35 <220>
<223> Vector de reordenamiento de FR h5Lv2A
<400> 87 <220>
imagen2
40
<210> 88
<211> 98
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
45
<223> Vector de reordenamiento de FR h5Lv3A
<400> 88
imagen2
<210> 89
<211> 94
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Vector de reordenamiento de FR h5Lv5A
<400> 89
imagen2
<210> 90
<211> 20
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador h5LvS
<400> 90 20 gtctagatct ccaccatgag
<210> 91
<211> 19
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador h5LvA
<400> 91 19 tgttcgtacg tttgatctc
<210> 92
<211> 381
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(60)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (61)...(381)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 92
imagen2
5 <210> 93
<211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
10 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 93
imagen2
15
<210> 94
<211> 77
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3SS
imagen16
<210> 95
<211> 77
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3SA
<400> 95
imagen2
<210> 96
<211> 77
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3RS
<400> 96
imagen2
<210> 97
<211> 77
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F3RA
<400> 97
imagen2
<210> 98
<211> 381
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(60)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (61)...(381)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "b" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 98
imagen2
<210> 99 5 <211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "b" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 99
imagen2
15 <210> 100
<211> 381
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(60)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (61)...(381)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "c" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 100
imagen2
<210> 101 5 <211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "c" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 101
imagen2
15 <210> 102
<211> 72
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2SS
<400> 102 <210> 103
imagen2
<211> 72
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2SA
<400> 103
imagen2
<210> 104
<211> 72
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2XS
<400> 104
imagen2
<210> 105
<211> 72
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Cebador de reordenamiento de FR F2XA
<400> 105
imagen2
<210> 106
<211> 381
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
<220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(60)
<220>
<221> mat-péptido
<222> (61)...(381)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "b1" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 106
imagen2
<210> 107 5 <211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "b1" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 107
imagen2
15 <210> 108
<211> 381
<212> ADN
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<221> sig-péptido
<222> (1)...(60)
<220>
<221> mat-péptido 25 <222> (61)...(381)
<223> Secuencia de nucleótidos que codifica la versión "b2" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 108
imagen2
<210> 109 5 <211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la versión "b2" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 109
imagen2
15 <210> 110
<211> 30
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR1 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada
<400> 110 <210> 111
imagen2
<211> 14
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "a" a "j" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 111
imagen2
<210> 112
<211> 14
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "b1" y "d1" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 112
imagen2
<210> 113
<211> 14
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "b3" y "d3" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 113
imagen2
<210> 114
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de versión "a" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 114
imagen2
<210> 115
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de las versiones (b), (b1) y (b3) de la región V de la cadena H humanizada
<400> 115
imagen2
<210> 116 5 <211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "c" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 116
imagen2
15 <210> 117
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
20 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de las versiones "d", "d1" y "d3" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 117
imagen17
<210> 118
<211> 32
<212> PRT 30 <213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "e" de la región V de la cadena H humanizada
35 <400> 118
imagen2
<210> 119
<211> 32 40 <212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "f" de la región V de la cadena H humanizada 45
<400> 119
imagen2
<210> 120
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "g" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 120
imagen5
<210> 121
<211> 32
<212> PRT 15 <213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "h" de la región V de la cadena H humanizada
20 <400> 121
imagen2
<210> 122
<211> 32 25 <212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "i" de la región V de la cadena H humanizada 30
<400> 122
imagen2
<210> 123 35 <211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 40 <223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "j" de la región V de la cadena H humanizada
<400> 123
imagen2
45 <210> 124
<211> 13
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
50 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR4 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada
<400> 124
imagen2
<210> 125
<211> 23
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR1 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada
<400> 125
imagen2
<210> 126
<211> 15
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR2 de las versiones "a", "b" y "c" de la región V de la cadena L humanizada
imagen18
<210> 127
<211> 15
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR2 de la versión "b1" de la región V de la cadena L humanizada
35 <400> 127
imagen2
<210> 128
<211> 15
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR2 de la versión "b2" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 128
imagen2
<210> 129
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220> 55 <223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "a" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 129
imagen2
<210> 130
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de las versiones "b", "b1" y "b2" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 130
imagen2
15 <210> 131
<211> 32
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR3 de la versión "c" de la región V de la cadena L humanizada
<400> 131
imagen2
<210> 132
<211> 10
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de FR4 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada
imagen19
<210> 133
<211> 5
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de CDR1 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada
45 <400> 133
imagen2
<210> 134
<211> 17
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de CDR2 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada
<400> 134
imagen2
<210> 135
<211> 8
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de CDR3 de todas las versiones de la región V de la cadena H humanizada
<400> 135
imagen2
<210> 136
<211> 11
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de CDR1 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada
<400> 136
imagen2
<210> 137
<211> 7
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de CDR2 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada
<400> 137
imagen2
<210> 138
<211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia Artificial
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de CDR3 de todas las versiones de la región V de la cadena L humanizada
<400> 138
imagen2
<210> 139
<211> 118
<212> PRT
<213> Ratón
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-2
<400> 139
imagen2
<210> 140
<211> 118 10 <212> PRT
<213> Ratón
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3 15
<400> 140
imagen2
<210> 141 20 <211> 117
<212> PRT
<213> Ratón
<220> 25 <223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-4
<400> 141
imagen2
<210> 142 5 <211> 117
<212> PRT
<213> Ratón
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5
<400> 142
imagen2
15 <210> 143
<211> 118
<212> PRT
<213> Ratón
20 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-7
<400> 143
imagen2
imagen20
<212> PRT
<213> Ratón
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena H del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-8
<400> 144
imagen2
15 <210> 145
<211> 107
<212> PRT
<213> Ratón
20 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-2
<400> 145
imagen2
imagen21
<212> PRT
<213> Ratón
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-3
<400> 146
imagen2
15 <210> 147
<211> 107
<212> PRT
<213> Ratón
20 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-4
<400> 147
imagen2
25
<210> 148
<211> 107
<212> PRT
<213> Ratón
30
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-5 <400> 148
imagen2
<210> 149 5 <211> 112
<212> PRT
<213> Ratón
<220> 10 <223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-7
<400> 149
imagen2
15 <210> 150
<211> 112
<212> PRT
<213> Ratón
20 <220>
<223> Secuencia de aminoácidos de la región V de la cadena L del anticuerpo monoclonal de ratón anti-TF ATR-8
<400> 150
imagen2
imagen22
<212> ADN
<213> Homo sapiens
<220> 10 <223> ADN que codifica TF humano soluble
<400> 151 <212> PRT
imagen2
imagen23
<220>
<223> Secuencia de aminoácidos de TF humano soluble 10
<400> 152
imagen2

Claims (3)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un procedimiento de preparación de un anticuerpo humanizado natural que tiene regiones determinantes de la complementariedad (CDRs) derivadas de anticuerpos no humanos y una región estructural (FR) derivada de un anticuerpo humano natural y que tiene una inmunogenicidad reducida, y dicho método comprende las etapas de:
    (1)
    preparar un anticuerpo monoclonal no humano que responde a un antígeno de interés;
    (2)
    preparar una diversidad de anticuerpos humanos que tienen una homología elevada con las secuencias de aminoácidos de las FRs de los anticuerpos monoclonales del punto (1) anterior;
    (3)
    sustituir las cuatro FRs del anticuerpo monoclonal no humano del punto (1) anterior con las FRs correspondientes del anticuerpo humano del punto (2) anterior para generar un primer anticuerpo humanizado;
    (4)
    determinar la capacidad del anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior para unirse al antígeno o para neutralizar una actividad biológica del antígeno;
    (5)
    sustituir una a tres FRs del anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior con las FRs correspondientes del anticuerpo humano que son diferentes de las usadas en el punto (3) entre los anticuerpos humanos preparados en el punto (2) para generar el segundo anticuerpo humanizado;
    (6)
    comparar la capacidad del segundo anticuerpo humanizado generado en el punto (5) anterior y del primer anticuerpo humanizado generado en el punto (3) anterior en función de la capacidad de unirse al antígeno o de neutralizar la actividad biológica del antígeno, por lo que se selecciona un anticuerpo humanizado que tiene una actividad favorable;
    (7)
    llevar a cabo las etapas anteriores de los puntos (3) a (6) para el anticuerpo humanizado seleccionado en el punto (6) anterior; y
    (8)
    repetir las etapas anteriores de los puntos (3) a (6) hasta que se obtiene un anticuerpo humanizado que tiene una actividad equivalente al anticuerpo monoclonal no humano del punto (1) anterior.
  2. 2.
    El procedimiento según la reivindicación 1, en el que dicho antígeno de interés es el factor tisular (TF) humano.
  3. 3.
    Un procedimiento para la producción de un anticuerpo humanizado natural según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 2 que comprende las etapas de:
    (1)
    obtener un anticuerpo humanizado natural mediante un procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 2;
    (2)
    introducir un ácido nucleico que codifica el anticuerpo humanizado natural en una célula hospedadora; y
    (3)
    cultivar la célula hospedadora.
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