ES2437337T3 - Composiciones para diagnosis y terapia de enfermedades asociadas con la expresión aberrante de futrinas (R-Espondinas) - Google Patents

Composiciones para diagnosis y terapia de enfermedades asociadas con la expresión aberrante de futrinas (R-Espondinas) Download PDF

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Abstract

Uso de una molécula nucleotídica que codifica un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 para lapreparación de una composición farmacéutica para activación de la cascada de señales Wnt.

Description

Composiciones para diagnosis y terapia de enfermedades asociadas con la expresión aberrante de futrinas (R-Espondinas)
La presente invención se refiere a composiciones útiles para la terapia de enfermedades asociadas con la expresión aberrante de los genes que codifican las proteínas Futrina 2 (=R-Espondina 3). Estas enfermedades incluyen tumores de v.g. mama, ovario, hígado, útero, cérvix, colon, pulmón, ovario, recto, testículo, páncreas, huesos y piel, así como enfermedades que implican músculo, hueso, metabolismo de lípidos y glucosa, y obesidad. La presente invención se refiere también a un método para identificar activadores/agonistas o inhibidores/antagonistas de Futrina
2.
La cascada de señales Wnr juega un papel crucial en lo que respecta a la regulación de la supervivencia, proliferación y diferenciación de las células durante la embriogénesis, y el adulto como se muestra, v.g., en Drosophila, Xenopus y ratones (Nusse y Varmus, Cell 69 (1992), 1073-1087). Los genes Wnt codifican glicoproteínas secretoras que activan una cascada de señales bien caracterizada por la vía de un receptor Wnt denominado "frizzled" (ensortijado).
La cascada de señalización Wnt y sus componentes juegan también un papel importante en diversas enfermedades, lo que hace deseable modular su actividad:
i) Cáncer
La tumorigénesis representa un proceso multietápico complejo en el cual se cree que cambios genéticos y factores ambientales desregulan los procesos celulares que controlan la proliferación y diferenciación de las células. Varios estudios indican que una cascada de señales Wnt aberrante está implicada en el desarrollo de cáncer de colon, cáncer de mama y melanoma (Pfeifer, Science, 275 (1997), 1752-1753; Polakis, Genes Dev. 14 (2000), 1837-1851). El primer gen codificante de una proteína de la cascada de señales Wnt, int-1, fue aislado del virus del tumor mamario del ratón (MMTV) y pudo demostrarse que se trata de un oncogén. Por consiguiente, está bien establecido que una regulación aberrante de la actividad Wnt y/o componentes de la cascada de señales Wnt aguas abajo de la señal Wnt, v.g., beta-catenina y APC, están implicadas en la tumorigénesis.
ii) Enfermedad ósea
Las señales Wnt promueven la formación de hueso (v.g. Yang, Development, 130 (2003), 1003-15; Fischer,
J. Biol. Chem. 277 (2002) 30870-30878). Coherentemente con esta idea, una mutación de aumento de función del receptor Wnt LRP5 causa enfermedad grave de los huesos (Boyden, et al., 346 (2002) N Engl J Med, 1513-21.; Little, et al, 70 (2002) Am J Hum Genet, 11-9.). Inversamente, la desactivación de las mutaciones en LRP5 conduce a un síndrome de osteoporosis-pseudoglioma en humanos (Kato, et al., 157 (2002) J Cell Biol, 303-14.; Gong, et al., 107 (2001) Cell, 513-23.).
iii) Enfermedad oftálmica
La desactivación de la mutación en el receptor Wnt LRP5 conduce a pseudoglioma en humanos y malformaciones de los ojos en los ratones (Kato, et al, 157 (2002) J Cell Biol 303-314; Gong, et al, 107 (2001) Cell, 513-523).
iv) Riñón
La señalización aberrante Wnt está implicada en la fibrosis renal (Surendran, Am J Physiol Renal Physiol 282 (2002) 431-441) y la enfermedad de riñon poliquístico (Saadi-Kheddouci, Oncogene 20 (2001) 59725981).
v) Metabolismo de lípidos y glucosa, obesidad
La deficiencia del receptor Wnt LRP5 en los ratones conduce a niveles incrementados de colesterol en plasma en ratones alimentados con una dieta rica en grasa, debido al aclaramiento hepático reducido de los residuos de quilomicrones. Adicionalmente, cuando se alimentan con una dieta normal, los ratones deficientes en LRP5 exhiben una tolerancia notablemente empeorada a la glucosa (Fujino, et al., 100 (2003) Proc Natl. Acad. Sci. USA, 229-234). La administración del antagonista de LRP5 Dkkl a los ratones reduce la absorción de glucosa en diversas líneas de células y disminuye la deposición de grasa (WO 02/066509).
Está claro por consiguiente, partiendo de lo anterior, que el camino de señalización Wnt está implicado en una diversidad de enfermedades humanas. Sin embargo, están insuficientemente disponibles medios para la terapia o diagnosis de las enfermedades asociadas con una cascada de señales Wnt desregulada. Por ello, el uso de marcadores moleculares fiables de diagnóstico sería útil para una comprensión de la base molecular de las enfermedades asociadas con una cascada de señales Wnt aberrante. Puede esperarse que tales marcadores sean
también útiles para terapia y para el desarrollo de nuevas vías terapéuticas para tratamiento de las enfermedades dependientes de la cascada de señales Wnt, como se ha detallado arriba.
Así pues, el problema técnico que subyace en la presente invención es proporcionar medios para la terapia de enfermedades asociadas con una cascada de señalización Wnt aberrante.
La solución a dicho problema técnico se obtiene por la provisión de las realizaciones caracterizadas en las reivindicaciones.
Durante los experimentos que condujeron a la presente invención, pudo identificarse el gen 2, cuyo producto es un modulador del camino Wnt. Futrina 2 se identificó previamente como HPWTSR (Chen et al., 29 (2002), Mol. Biol. Rep. 287-292), una proteína de papel o función anteriormente desconocido, expresada en numerosos tipos de células. Adicionalmente, las Futrinas humanas 1, 2, 3 y 4 fueron descritas como Polipéptidos Semejantes a Factores del Crecimiento de las Células Madre, que son capaces de promover la proliferación de células madre hematopoyéticas (WO-A-01/77169; WO-A-01/07611).
En lo que sigue se demuestra por primera vez: 1) las Futrinas intensifican la señalización Wnt y esto tiene relevancia fisiológica, dado que la inhibición de Futrina 1 ó 2 da como resultado la inhibición de la cascada de señales Wnt (señalización Wnt/β-catenina). Estos datos demuestran que las Futrinas pueden considerarse como moduladores Wnt. La Futrina 1 (Rspo2) es co-expresada con y regulada positivamente por las señales Wnt y tiene efectos sinérgicos con Wnt para activar β-catenina. El análisis de la interacción funcional con los componentes del camino Wnt/β-catenina sugiere que Rspo2 funciona extracelularmente al nivel de la interacción receptor-ligando. Experimentos con morfolino antisentido en embriones de Xenopus y experimentos de RNAi en células HeLa revelaron que Rspo2 es necesaria para la señalización Wnt/β-catenina. En embriones de Xenopus empobrecidos en Rspo2, los marcadores musculares myoD y myf5 no pueden activarse y el desarrollo muscular posterior resulta deteriorado. Los resultados indican que Rspo2 es un nuevo activador de la cascada Wnt/β-catenina. Así, Futrinas tales como Rspo2 (Futrina 1) son útiles para la diagnosis y el desarrollo de terapias para enfermedades mediadas por Wnt-LRP, con inclusión de la supresión de tumores, formación de hueso, metabolismo de colesterol y glucosa (incluida diabetes), obesidad, enfermedad renal y enfermedad oftálmica. 2.) Dado que los datos obtenidos demuestran que se requiere Futrina 1 para la formación de músculo, Futrina 1 es útil para la diagnosis y el desarrollo de terapias para enfermedades relacionadas con los músculos, con inclusión de la regeneración muscular. 3.) Los datos demuestran que las Futrinas se expresan aberrantemente en una diversidad de tumores humanos. Así pues, las Futrinas son útiles para la diagnosis de tumores y el desarrollo de terapias del cáncer. Por ejemplo, se ha encontrado que en la mayoría de los tumores, la expresión de Futrinas 1-3 está reducida drásticamente (tumores de colon, estómago, pulmón, recto para Futrina 1, tumores de mama, ovario, vejiga, útero, cérvix, recto para Futrina 2, tumores de útero y cérvix para Futrina 3). En un pequeño número de casos, la expresión de Futrinas 1-3 está regulada en sentido creciente (un caso de tumor de estómago para Futrinas 1 y 2, tumor de ovario para Futrina 3). Futrina 4 exhibe un nivel muy bajo de expresión en la mayoría de los tejidos estudiados, excepto en el ovario.
Así pues, la inhibición de la cascada de señales Wnt por inhibición de la expresión/actividad de las Futrinas o por estimulación de la expresión/actividad de las Futrinas tendrá un efecto terapéutico. Análogamente, la activación de la cascada de señales Wnt por disminución de la expresión de Futrina y/o por represión de la actividad del polipéptido propiamente dicho tendrá un efecto terapéutico.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS
Figura 1: Identificación de Futrina 1 (Rspo2) de Xenopus
El informador TOP-FLASH, el DNA vector de agrupaciones de 250 clones cada una y pCSfrizzled8 se cotransfectaron. Se llevaron a cabo ensayos de informadores luciferasa en células 293T en placas de 96 pocillos por duplicado como se ha descrito (Wu et al., Curr Biol 10 (2000), 1611-1614). La actividad de luciferasa se normalizó contra la actividad de Renilla-luc co-transfectada utilizando un kit comercial (Clonetech). RLU: unidades relativas de luciferasa.
Figura 2: Futrina 1 (Rspo2) promueve la señalización Wnt/β-catenina
(A)
Identificación de Rspo2 de Xenopus por cribado de la expresión. Se llevó a cabo un cribado de la expresión en células 293T transfectadas con un informador sensible a Wnt (TOPFLASH) y agrupaciones de DNA plasmídico de un banco de cDNA de ojos de Xenopus. RLU: unidades relativas de luz.
(B)
El extremo C de Rspo2 media en la retención en la superficie celular. Se transfectaron Rspo2 marcada con Myc (wt) o Rspo2ΔC (ΔC) en células 293T, y se analizaron el lisado de células y el medio por transferencia Western. Co, células no transfectadas.
(C)
Rspo2 activa la señalización Wnt/β-catenina. Se llevaron a cabo ensayos del informador TOPFLASH de luciferasa en células 293T con los DNAs transfectados siguientes: Wntl de ratón (Wnt), 5 ng; frizzled8 (fz) de ratón, 1 ng; Rspo2 de Xenopus (Rspo2), 0,1, 0,3, 0,9 y 2,7 ng.
(D)
Rspo2 intensifica la señalización Wnt3a. Se añadieron Wnt3a de ratón, Rspo2ΔC de Xenopus (Rspo2ΔC) o medios falsamente acondicionados a células 293T, seguido por ensayos informadores luciferasa TOPFLASH.
(E)
Rspo2 estabiliza la β-catenina. (arriba) Se trataron células 293T con Rspo2ΔC, Wnt3a o medios falsamente acondicionados durante 1 ó 4 horas como se indica. Se sometieron fracciones de citosol a transferencia Western y se sondaron respecto a β-catenina y α-tubulina (control de carga), (abajo) Tinción inmunohistoquímica de β-catenina en células SHEP después de 3 horas de tratamiento con los medios acondicionados indicados. Las puntas de flecha indican β-catenina nuclear. El porcentaje de células que exhibían la tinción representada es 90% (Co), 85% (Rspo2), 80% (Wnt3a) y 90% (Wnt3a+Rspo2).
(F)
Análisis de dominios de Rspo2. (arriba) Dibujo esquemático de Rspo2 de Xenopus y constructos de deleción. sp, péptido señal; FU1, 2, dominios semejantes a furina; TSP1, dominio de trombospondina tipo 1; C, término C cargado positivamente, (abajo) Se llevaron a cabo ensayos con el informador luciferasa TOPFLASH en células 293T con los constructos indicados. Se confirmó una producción igual de proteínas por transferencia Western (datos no presentados).
Figura 3: Alineación de ácido nucleico multisecuencia de cDNAs codificantes de Futrinas humanas 1, 2, 3 y 4 y Futrina 1 de Xenopus
Los nucleótidos idénticos se resaltan en negro. Todas las secuencias de ácido nucleico comienzan con el codón ATG iniciador de la traducción indicado con un asterisco.
Figura 4: Alineación multisecuencia de aminoácidos de Futrinas humanas 1, 2, 3 y 4 deducida de los cDNAs humanos (véase la Figura 3)
Los aminoácidos idénticos se resaltan en negro, los aminoácidos similares se muestran en gris.
Figura 5: Las Futrinas promueven la señalización Wnt
Experimentos de cotransfección en células 293T. Se llevaron a cabo ensayos con el informador luciferasa sensible a Wnt en placas de 96 pocillos por triplicado como se ha descrito (Wu et al., Curr Biol 10 (2000), 1611-1614). La actividad de luciferasa se normalizó contra la actividad de Renilla utilizando un kit comercial (Clonetech). Wnt1 = Wnt1 de ratón, fz8 = frizzled8 de ratón, Futrina1 = Futrina1 de Xenopus, Wnt3A = Wnt3A de ratón, (0,1 ng) en A indica la cantidad de DNA plasmídico transfectada por pocillo, RLU = unidades relativas de luciferasa.
Figura 6: Comparación de secuencias de las proteínas Rspo humanas (hR-espondina 1 a 4)
(A) Alineación de proteínas Rspo humanas (h) (correspondiente a las alineaciones de Fut1-4 humana en la Figura 4, excepto que se utilizan designaciones diferentes). El péptido señal, los dominios semejantes a furina y el dominio de trombospondina tipo 1 están subrayados y los aminoácidos conservados se muestran en negro. (B, C) Matriz de homología de Rspo que muestra una vista de conjunto de la identidad de aminoácidos en % entre las proteínas Rspo humanas (B) y entre las proteínas Rspo2 de Xenopus (X) o ratón (m) y proteínas Rspo humanas, respectivamente (C).
Figura 7: Futrinas humanas 1 y 2 son necesarias para la señalización Wnt
Se transfectaron células HeLa en placas de 24 pocillos con el informador Wnt 7LEF-Rev-fosLuc y los plásmidos pRL-TK y pSuper que producen o bien siRNA contra Futrinas 1 y 2 humanas o un control sin sentido. Tres días después de la transfección, se añadió medio acondicionado Wnt3A de ratón al cultivo para estimular la señalización Wnt. 24 horas más tarde, se determinó la actividad de luciferasa.
Figura 8: Análisis de la expresión de R-espondinas de Xenopus y ratón
(A) Expresión de Rspo2 durante el desarrollo de Xenopus en las etapas embrionarias que se indican, analizada por RT-PCR. Se utilizó para normalización histona H4. -RT, control de transcripción inversa negativa.
(B-H) Hibridaciones in situ del montaje entero en Xenopus de los genes indicados. (B) Embriones en etapa 11, vista dorso-vegetal; dbl, labio blastoporal dorsal. (C) Embrión de etapa 12, vista dorsal con la parte anterior hacia arriba. Un dominio de expresión neural se indica por una punta de flecha. (D) Embrión de la etapa 15, vista dorsal con la parte anterior hacia arriba. (E) Embrión de la etapa 14, vista dorsal con la parte anterior hacia arriba. (F-G) Embriones de la etapa del primordio de la cola; ba, arcos branquiales; cm, musculatura craneal; di, diencéfalo; dnt, tubo neural dorsal; mhb, límite cerebro medio-cerebro posterior; ov, vesícula auricular; pn, pronefros; pdm, proctodeum; s, somitos; tb, mesodermo del primordio de la cola. El recuadro en (F) muestra una sección transversal al nivel indicado por la punta de flecha, mostrando la expresión en el tubo neural dorsal y en las partes extremas dorsales y ventrales de los somitos. (H) Cerebro del renacuajo de Xenopus disecado (vista lateral) que muestra la expresión en diencéfalos (di) y zona limitante intratalámica (zli), donde se expresa el erizo sónico (recuadro), dt, vt, tálamo dorsal y ventral, respectivamente, se, médula espinal; tel, telencéfalo.
(I-M) Hibridaciones in situ del montaje entero en el ratón de los genes indicados. (I) Primordios de los miembros de embriones de ratón de 12,5 días. AER, reborde ectodérmico apical. (J) Embrión de ratón de 7,5 días que muestra la expresión de Rspo3 en la línea primitiva. (K-M) Embriones de ratón de 9,5 días, di, diencéfalo; dnt, tubo neural dorsal; met (sic), metencéfalo; tel, telencéfalo.
Figura 9: Regulación de las R-espondinas de Xenopus por señalización Wnt
(A)
Comparación del patrón de expresión de XRspo2, XWnt8 y XWnt3a en embriones tempranos de néurula por hibridación in situ del montaje entero. Vista dorsal, parte anterior hacia arriba.
(B)
(arriba) Diagrama del experimento. Se inyectaron embriones de la etapa de cuatro células con 50 pg de pCS-ppl (preprolactina), pCSXWnt8 o pCS-β-catenina en cada blastómero, se disecaron las DMZs, se cultivaron hasta el equivalente de la etapa 11 y se analizaron por RT-PCR. (abajo) Análisis RT-PCR de los genes indicados. -RT = control de transcripción inversa negativo.
(C-E) Se inyectaron embriones de la etapa de cuatro células con 50 pg de pCS-Wnt8, pCS-Wizt3a o pCs-pp1 en un solo blastómero y se fijaron en la etapa 11 para hibridación in situ con XRspo2.
Figura 10: Se requiere Futrina2 para la formación de músculo
A.El empobrecimiento en Furrina 1 causa regulación decreciente de los marcadores musculares precoces y defectos musculares. (A, C, E, G, I, K) Embriones inyectados con oligomorfolino de control (5 ng), con Fut1-Mo (5 ng). Los oligos se mezclaron con el mRNA trazador de linaje (LacZ) (mancha azul) en (C, D, E, F, G, H)
o RNA de preprolactina (ppl), visualizado por hibridación in situ (mancha roja) (A, B, J, K, L). La hibridación in situ con sondas a Xmyf5 (A, B), XmyoD (C, D), Xbra (E, F), Xnot (G, H) y actina muscular (I-L) (tinción magenta). Los embriones en K y L están cortados transversalmente. Obsérvese la reducción de músculo en
(L)
(lado derecho).
B.Fut1-Mo actúan específicamente para inhibir la traducción de sus constructos de DNA cognados cuando se sobreexpresan en embriones. Se inyectó mRNA (fut1 marcado con mycC-terminal) ecuatorialmente en ambos blastómeros en embriones de la etapa de 2 células). Los mismos embriones se inyectaron luego en la etapa de 8 células con 5 ng de Fut1-Mo (pista 3) o morfolino de control (pista 2) en todos los blastómeros vegetales y se recogieron en la etapa 11. La proteína Furrina 1 marcada se visualizó luego con un anticuerpo a-myc.
C.Rescate de la reducción del marcador muscular causada por Fut1-Mo por co-inyección de mRNA de XFut1 que contenía mutaciones puntuales en la región 5' correspondiente a oligomorfolino. Se co-inyectaron los embriones con 5 ng de Fut1-Mo (1, 2) con 50 pg de ppl o mRNA de XFut1 radialmente en un solo blastómero en la etapa de 4 células.
Se analizó la expresión de MyoD (1, 3) y Myf5 (2,4) por hibridación in situ. Todos los embriones se agruparon en tres clases (ejemplos para MyoD se muestran en la parte inferior de la figura: embriones con nivel de expresión en el lado inyectado de 1-30% (clase A); 30-70% (clase B); y 70-100% (clase C) del nivel normal. Las barras representan el porcentaje de los embriones correspondiente al tipo A, B o C. (n para Fut-Mo+ppl: 57 embriones para MyoD, 45 embriones para Myf5; n para Fut-Mo+mRNA Ffut1: 39 embriones para MyoD y 41 embriones para Myf5).
Figura 11: Rspo2 promueve diferenciación neural y muscular en Xenopus
(A)
Se inyectaron físicamente a embriones en la etapa de 4 células 100 pg de Rspo2, 100 pg de Xwnt8 o 200 pg de mRNA de β-catenina en cada blastómero. En la etapa 8, el casquillo animal se disecó, se cultivó hasta la etapa equivalente 18 y se analizó respecto a la expresión de los genes marcadores indicados, -RT, control de transcripción inversa negativo.
(B)
Se inyectaron embriones de la etapa de dos células con 100 pg de Rspo2 o mRNA de preprolactina (ppl) en cada blastómero. Obsérvense las glándulas de cemento ectópicas (punta de flecha) y el eje corporal acortado en el embrión inyectado con Rspo2.
(C-J) Hibridaciones in situ del montaje entero de los genes indicados. Embriones en la etapa de ocho células con 100 pg de mRNAs de Rspo2 o ppl como se indica en un blastómero animal. Se co-inyectó mRNA de lacZ como trazador de linaje en todos los paneles excepto C, G y H.
(C-H) Néurulas de la etapa 15 en vista anterior.
(I-J) Gástrulas de la etapa 11 en vista vegetal con la parte dorsal hacia arriba.
(K-N) Rspo2 promueve la formación de músculo. (K) Diagrama de los experimentos. Se inyectaron embriones de la etapa de cuatro células con 50 pg de constructos de DNA plasmídico en todos los blastómeros, se explantaron los fragmentos indicados en la etapa 10,5, se cultivaron, y se procesaron por hibridación in situ del montaje entero (M) de RT-PCR (N).
(L)
VMZ equivalente de la etapa 40 de explantes LMZ. Obsérvense las estructuras semejantes a cola en VMZs de los embriones inyectados con Rspo2.
(M)
Hibridación in situ de VMZs de la etapa 25 para actina muscular.
(N)
Análisis RT-PCR para los genes indicados en los explantes VMZ equivalentes de la etapa 25 y DMZ equivalentes de la etapa 11. Xdd 1, dominante negativo. Xenopus dishevelled; Co, preprolactina.
Figura 12: Rspo2 interfiere con BMP-4, Activina y Nodal, pero no con FGF en Xenopus
(A-D) Se inyectaron físicamente embriones en la etapa de cuatro células con los RNAs indicados. En la etapa 8, se disecó el casquillo animal, se cultivó hasta el equivalente a la etapa 10 y se analizó respecto a la expresión de Vent2 (A) o Xbra (B-D). -RT, control de transcripción inversa negativo. Como control se utilizaron embriones inyectados con 100 pg de preprolactina (ppl). Cantidades de mRNAs utilizadas: 100 pg de Rspo2, 50 pg o 250 pg de BMP-4, 50 pg de activina, 25 ó 100 pg de Wnt8, 200 pg de β-catenina, 50 ó 100 pg de Xnrl, 2ó 20 pg de FGF8.
Figura 13: Se requiere Rspo2 de Xenopus para la formación de músculo
(A)
Rspo2Mo inhibe específicamente la traducción de su DNA cognado. Arriba, Diagrama del experimento. Se inyectaron embriones de Xenopus de la etapa de dos células con 100 pg de mRNA de Rspo2 marcado con Myc en la región animal, en la etapa de 8 células, se inyectaron luego los mismos embriones con 5 ng de Rspo2Mo de CoMo en todos los blastómeros de los animales, se cosecharon en la etapa 11 y se procesaron respecto a análisis por transferencia Western de Rspo2 marcado con Myc y α-tubulina.
(B)
El empobrecimiento en la proteína Rspo2 causa defectos musculares y regulación decreciente de los marcadores miogeneicos. Se inyectaron embriones en la etapa de cuatro células en posición ecuatorial en un solo blastómero con 5 ng de oligonucleótidos morfolino de control (CoMo) o Rspo2Mo como se indica junto con 50 pg de mRNA de ppl o 50 pg de RNA LacZ como trazador de linaje y se analizaron en la etapa gastrular del primordio de la cola por hibridación in situ para los genes indicados. En (a-f) se utilizó hibridación doble in situ para el gen de interés (azul oscuro) y para ppl (rojo), (a-d) Embriones de la etapa
25.
(a-b): miotomos, visualizados por expresión de actina muscular muestran malformaciones en el lado inyectado con Rspo2Mo (b). (c-d) Sección transversal a nivel del tronco que muestra volumen muscular reducido en (d). (e-h): expresión de myf5 y myoD (azul oscuro) está regulada en sentido decreciente en la región inyectada con Rspo2Mo (rojo en e,f o azul claro en g,h). (i-l): la expresión de Xbra y Xnot2 (azul oscuro) no se ve afectada en la región de las inyecciones de Rspo2Mo (azul claro).
(C)
Rspo2Mo actúa específicamente. Rescate de la reducción de myf5 por mRNA de Rspo2 co-inyectado. Se inyectaron embriones en la etapa de cuatro células en un solo blastómero con 5 ng de morfolino de control (CoMo), Rspo2Mo, 50 pg de mRNA de ppl de 50 pg de mRNA de Rspo2 que contenía desapareamientos respecto a Rspo2Mo. La expresión de myf5 se analizó por hibridación in situ en la etapa gastrular. Se indica el porcentaje de embriones con expresión fuertemente afectada (A), moderadamente reducida (B) y normal de myf5 (C) como se exhibía en los embriones representativos. Se calculó la desviación estándar a partir de tres experimentos independientes.
(D)
Rspo2Mo bloquea la señalización Wnt aguas arriba de dishevelled durante la formación de músculo. Se inyectaron radialmente embriones en la etapa de cuatro células con 5 ng de Rspo2Mo o CoMo, 50 pg de pCS-XWnt8, pCS-dishevelled (Xdsh), GSK-3β pCS-dominante negativo (dnGSK) o pCS-β-catenina. En la etapa 10,5, se explantaron DMZs (a) o VMZs (b) o LMZs (c-d) y se cultivaron hasta la etapa 11 (a, c) o 25 (b, d) para análisis RT-PCR de los genes indicados. -RT: control de transcripción inversa negativo.
Figura 14: Se requieren R-espondinas para la señalización Wnt en células HeLa
(A)
Análisis RT-PCR que muestra la expresión diferencial de Rspo1-4 humanas en líneas de células HeLa y 293T. Se utilizó actina para normalización.
(B)
Especificidad de siRNAs. Se cotransfectaron células 293T con pSUPER-Rspo2 ó-3 (siRNA), Rspo3 marcada con FLAG y GFP (control de transfección). La expresión de Rspo3 y GFP se analizó por transferencia Western.
(C-D) Se requieren R-espondinas para señalización Wnt/β-catenina en células HeLa. Ensayo del informador luciferasa Wnt en células HeLa cotransfectadas con los constructos indicados. Se añadió Wnt3a como medio acondicionado. RLU, unidades relativas de luz.
Figura 15: La expresión de futrina está desregulada en diversos tumores humanos
La expresión de Futrina 1, 2, 3 y 4 o ubiquitina (para mostrar carga igual) se analizó por hibridación radiactiva en
mRNAs desplegados (Clontech, Cancer Profiling Array II) de muestras de tejido normal y canceroso de diferentes pacientes. Abreviaturas: N, tejidos normales; T, tejidos tumorales.
Figura 16: Expresión de R-espondinas humanas en muestras tumorales
Análisis por transferencia de mancha de Rspo 1, 2 y 3 humanas en muestras normales y tumorales. Las mismas muestras de cDNA (Cancer Profiling Array II, Clontech) se hibridaron con Rspo1, 2, 3 y humanas y sondas de ubiquitina. (arriba) La Cancer Profiling Array contiene pares de cDNAs de muestras tumorales y de tejidos normales correspondientes de pacientes individuales y aplicadas paralelamente como se indica. Las abreviaturas de los órganos son: br, mama; ov, ovario; co, colon; st, estómago; lu, pulmones; riñon; bi, vejiga; vu, vulva; pr, próstata; tr, tráquea; liv, hígado; ut, útero; ce, cérvix; re, recto; th, glándula tiroides; te, testículos; sk, piel; sin, intestino delgado; pa, páncreas.
Figura 17: Interacción de R-espondinas con componentes del camino de señalización Wnt/β-catenina
(A-C) Ensayo del informador luciferasa Wnt en células 293T co-transfectadas con los constructos indicados. Los resultados se indican como número de veces de estimulación respecto al informador solo. Las dosis de DNA eran 5 ng de Wnt1, 1 ng de Fz8, 3 ng de LRP6, 10 ng de axina, 10 ng de dntcf3, 5 ng de dkk1, 10 ng de Xdsh y 1 ng de Wnt3a.
Como se utiliza en esta memoria, el término "polipéptido" se refiere no sólo a polipéptidos codificados por las secuencias de nucleótidos/aminoácidos que se representan en la Figura 3 y/o 4, sino también a polipéptidos que difieren en la secuencia de aminoácidos debido a inserción, deleción y/o sustitución de uno o más aminoácidos y que muestran al menos una actividad biológica de una Futrina, v.g. la capacidad de promover la señalización Wnt. Preferiblemente, los ácidos nucleicos y/o polipéptidos afines son ácidos nucleicos y/o polipéptidos cuya secuencia muestra una identidad de al menos 40%, en particular una identidad de al menos 65%, preferiblemente de al menos 80%, y de modo particularmente preferido de al menos 90% respecto a las secuencias de aminoácidos de los polipéptidos codificados por las secuencias de nucleótidos que se muestran en Figura 3.
Las moléculas de ácido nucleico útiles como sondas pueden ser moléculas tanto de DNA como de RNA, siendo preferiblemente moléculas de DNA monocatenario. Las mismas pueden aislarse de fuentes naturales o pueden sintetizarse de acuerdo con métodos conocidos.
Como sonda de hibridación pueden utilizarse moléculas de ácido nucleico, por ejemplo, que tienen una secuencia de nucleótidos que es exacta o básicamente complementaria a una secuencia de nucleótidos como la representada en las Figuras 3 y 4 o 6a, respectivamente, o partes de estas secuencias. Los fragmentos utilizados como sonda de hibridación pueden ser fragmentos sintéticos que se produjeron por medio de métodos de síntesis convencionales.
Como se utiliza en esta memoria, el término "hibridación" se refiere a hibridación en condiciones de hibridación convencionales, preferiblemente en condiciones rigurosas como se describe, por ejemplo, en Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2ª edición (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY. Sin embargo, en ciertos casos, puede detectarse también una molécula de ácido nucleico hibridante en condiciones de hibridación de menor rigurosidad. Los cambios en la rigurosidad de hibridación y la detección de señales se realizan fundamentalmente por la manipulación de la concentración de formamida (los porcentajes menores de formamida dan como resultado una rigurosidad reducida), condiciones de sales, o temperatura. Por ejemplo, condiciones de rigurosidad menor incluyen una incubación durante una noche a 37°C en una solución que comprende 6X SSPE (20X SSPE = NaCl 3M; NaH2P04 9,2M; EDTA 0,02M, pH 7,4), SDS al 0,5%, formamida al 30%, 100 μg/ml de DNA bloqueante de esperma de salmón, seguido por lavados a 50°C con 1 X SSPE, SDS al 0,1%. Adicionalmente, para alcanzar una rigurosidad aún menor, los lavados efectuados después de hibridación rigurosa pueden realizarse a concentraciones mayores de sal (v.g. 5X SSC). Las variaciones en las condiciones anteriores pueden realizarse por la inclusión y/o sustitución de reactivos de bloqueo alternativos utilizados para suprimir el ruido de fondo en los experimentos de hibridación. La inclusión de reactivos de bloqueo específicos puede requerir una modificación de las condiciones de hibridación arriba descritas, debido a problemas con la compatibilidad.
El término "ligando", como se utiliza en esta memoria, hace referencia a cualquier molécula que sea capaz de fijarse específicamente a Futrina 2, permitiendo así determinar el nivel de moléculas receptoras. Ejemplos de tales moléculas incluyen anticuerpos, oligonucleótidos, proteínas o moléculas pequeñas. La molécula puede ser el ligando natural de Futrinas, o puede estar relacionada estrechamente con dicho ligando, v.g., un fragmento del ligando, o un sustrato natural, un mimético estructural o funcional; véase, v.g. Coligan, Current Protocols in Immunology 1 (2) (1991); Capítulo 5. En cualquier caso, la molécula puede aislarse o diseñarse racionalmente utilizando técnicas conocidas; véase también más adelante.
Preferiblemente, el ligando es un anticuerpo. El término "anticuerpo" se refiere preferiblemente a anticuerpos que están constituidos esencialmente por anticuerpos monoclonales agrupados con especificidades de epítope diferentes, así como preparaciones de anticuerpos monoclonales distintas. Los anticuerpos monoclonales se producen a partir de un antígeno que contiene Futrina 1, 2, 3 ó 4 o fragmentos del mismo por métodos bien conocidos por los expertos en la técnica (véase, v.g., Köhler et al., Nature 256 (1975), 495). Como se utiliza en esta
memoria, el término "anticuerpo" (Ab) o "anticuerpo monoclonal" (Mab) debe entenderse que incluye moléculas intactas así como fragmentos de anticuerpo (tales como, por ejemplo, fragmentos Fab y F(ab')2) que son capaces de fijarse específicamente a Futrina 1, 2, 3 y/o 4. Los fragmentos Fab y F(ab')2 carecen del fragmento Fc del anticuerpo intacto, se aclaran más rápidamente de la circulación, y pueden tener menos fijación de tejido inespecífico que un anticuerpo intacto. (Wahl et al., J. Nucl. Med. 24:316-325 (1983)). Así pues, se prefieren estos fragmentos, así como los productos de un banco de expresión de FAB u otra inmunoglobulina. Además, los anticuerpos de la presente invención incluyen anticuerpos quiméricos, monocatenarios, y humanizados.
Para ciertos propósitos, v.g. métodos de diagnóstico, la molécula de ácido nucleico utilizada como sonda o el ligando, v.g., anticuerpo, pueden marcarse de modo detectable, por ejemplo, con un radioisótopo, un compuesto bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, un compuesto fluorescente, un quelato metálico, o una enzima.
Los fragmentos de ácido nucleico pueden utilizarse, por ejemplo, como sondas o cebadores en los ensayos de diagnóstico descritos más adelante y hacen posible, v.g., el análisis de la expresión de Futrina 1, 2, 3, ó 4 por determinación del nivel de mRNA o la determinación de mutaciones en la región codificante o regiones reguladoras que conducen a moléculas de polipéptido con actividad alterada, v.g. destruida, o que conducen a expresión alterada. Preferiblemente, las moléculas de ácido nucleico son oligonucleótidos que tienen una longitud de al menos 10, en particular de al menos 15 y de modo particularmente preferido de al menos 50 nucleótidos. Estas moléculas de ácido nucleico de la invención pueden utilizarse también, por ejemplo, como cebadores para una reacción PCR.
En una realización preferida, la diana a la que se híbrida la molécula de ácido nucleico es un mRNA.
También se proporciona un método de diagnosis de una enfermedad asociada con (a) la expresión aberrante de Futrina 1, 2, 3 ó 4 y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3, ó 4 en un individuo, que comprende:
(a)
determinar (a) la cantidad de expresión de Futrina 1, 2, 3 ó 4 y/o (b) la cantidad de polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 biológicamente activo en una muestra biológica; y
(b)
diagnosticar una enfermedad asociada con (a) la expresión aberrante de Futrina 1, 2, 3 y/o4 y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o un riesgo para el desarrollo de dicha enfermedad basado en una cantidad de expresión alterada de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y/o (b) actividades o cantidades alteradas de polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 biológicamente activo comparadas con un control.
Formatos de ensayo adecuados son bien conocidos por las personas expertas en la técnica y, adicionalmente, se describen más adelante. Muestras de control positivas adecuadas que expresan proteínas Futrina humanas son, v.g., las células HEK293.
El polipéptido de Futrina 1, 2, 3 ó 4 o el mRNA correspondiente v.g. en fluidos o tejidos biológicos, puede detectarse directamente in situ, v.g., por hibridación in situ, o puede aislarse de otros componentes celulares por métodos comunes conocidos por los expertos en la técnica antes de ponerse en contacto con una sonda. Métodos de detección incluyen análisis por transferencia Northern, protección de RNAsa, métodos in situ, v.g. hibridación in situ, métodos de amplificación in vitro (PCR, LCR, QRNA-replicasa o transcripción/amplificación de RNA (TAS, 3SR), transferencia inversa por puntos descrita en EP-B1 0 237 362), inmunoensayos, transferencia Western y otros ensayos de detección que son conocidos por los expertos en la técnica.
La sonda (v.g. un anticuerpo específico u oligonucleótido específico) de la composición de diagnóstico puede estar marcada de forma detectable. En una realización preferida, dicha composición de diagnóstico contiene un anticuerpo anti-Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y permite dicha diagnosis, v.g. por ELISA y contiene el anticuerpo fijado a un soporte sólido, por ejemplo una placa de microtitulación de poliestireno o papel de nitrocelulosa, utilizando métodos conocidos en la técnica. Alternativamente, dichas composiciones de diagnóstico están basadas en un RÍA y contienen dicho anticuerpo marcado con un isótopo radiactivo. Marcadores de ensayo de anticuerpos adecuados se conocen en la técnica e incluyen marcadores enzimáticos, tales como, glucosa-oxidasa, y radioisótopos, tales como yodo (125I,121I), carbono (14C), azufre (35S), tritio (3H), indio (112In), y tecnecio, rodamina y biotina. Además de ensayar los niveles de Futrina en una muestra biológica, el polipéptido puede detectarse también in vivo por formación de imagen. Identificadores o marcadores de anticuerpos para la obtención de imágenes in vivo de proteínas incluyen los detectables por radiografía de rayos X, NMR O ESR. Para la radiografía de rayos X, marcadores adecuados incluyen radioisótopos tales como bario o cesio, que emiten radiación detectable, pero no son abiertamente nocivos para el individuo. Marcadores adecuados para NRM y ESR incluyen aquéllos que tienen un espín característico detectable, tal como deuterio, que pueden incorporarse en el anticuerpo por marcación de nutrientes para el hibridoma relevante. Se introduce en el mamífero (por ejemplo, por vía parenteral, subcutánea o intraperitoneal) un anticuerpo
o fragmento de anticuerpo específico de proteína que ha sido marcado con un resto detectable de formación de imágenes apropiado, tal como un radioisótopo (por ejemplo 131I, 112In, 99mTc), una sustancia radio-opaca, o un material detectable por resonancia magnética nuclear. Se comprenderá en la técnica que el tamaño del individuo y el sistema de obtención de imágenes utilizado determinarán la cantidad del resto de formación de imagen necesaria para producir imágenes de diagnóstico. En el caso de un resto de radioisótopo, para un individuo humano, la
cantidad de radiactividad inyectada estará comprendida normalmente entre aproximadamente 5 y 20 milicuries de99mTc. El anticuerpo o fragmento de anticuerpo marcado se acumula luego preferentemente en la localización de las células que contienen el polipéptido de Futrina específico. La obtención de imágenes de tumores in vivo se describe, v.g., en S.W. Burchiel et al., Burchiel et al., "Immunopharmacokinetics of Radiolabeled Antibodies and Their Fragments". (Capítulo 13 en Tumor Imaging: The Radiochemical Detection of Cancer, S.W. Burchiel y B.A. Rhodes, eds., Masson Publishing Inc. (1982)).
Se describe un método para identificar una pareja de fijación para un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4:
(a)
poner en contacto dicho polipéptido con un compuesto a cribar; y
(b)
determinar si el compuesto afecta a una actividad del polipéptido.
La invención incluye también un método de identificación de compuestos que se fijan a un polipéptido de Futrina 2, que comprende los pasos de:
(a)
incubar un compuesto de fijación candidato con dicho polipéptido; y
(b)
determinar si se ha producido fijación.
Los polipéptidos de Futrina 1, 2, 3 ó 4 pueden utilizarse para el cribado de proteínas u otros compuestos que se fijan a Futrina 1, 2, 3 ó 4 o de proteínas u otros compuestos a los cuales se fija Futrina 1, 2, 3 y/o 4. La fijación de Futrina 1, 2, 3 ó 4 y la molécula puede activar (agonista), aumentar, inhibir (antagonista) o reducir la actividad de Futrina 1, 2, 3 ó 4 o de la molécula fijada. Ejemplos de tales moléculas incluyen anticuerpos, oligonucleótidos, proteínas (v.g. ligandos), o moléculas pequeñas.
Ventajosamente, la molécula está estrechamente relacionada con el ligando natural de Futrina 1, 2, 3 ó 4, v.g., un fragmento del ligando, o un sustrato natural, un ligando, un mimético estructural o funcional; véase, v.g., Coligan, Current Protocols in Immunology 1(2) (1991); Capítulo 5.
Preferiblemente, el cribado para estas moléculas implica producir células apropiadas que expresan Futrina 1, 2, 3 y/o 4 como una proteína secretada o en la membrana celular. Células preferidas incluyen células de mamíferos, levadura, Drosophila o E. coli. Las células que expresan Futrina 1, 2, 3 y/o 4 (o la membrana celular que contiene el polipéptido expresado) se ponen luego preferiblemente en contacto con un compuesto de ensayo que contiene potencialmente la molécula para observar la fijación, estimulación o inhibición de la actividad de Futrina 1, 2, 3 y/o 4.
El ensayo puede testar simplemente la fijación de un compuesto candidato a Futrina 1, 2, 3 y/o 4, en donde la fijación es detectada por un marcador, o en un ensayo que implica la competición con un competidor marcado. Adicionalmente, el ensayo puede testar si el compuesto candidato da como resultado una señal generada por fijación a Futrina 1, 2, 3 y/o 4. Ensayos adecuados para analizar la actividad de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 incluyen ensayos de informadores de luciferasa inducibles por Wnt en células HEK293 transfectadas, en que Futrina 1, 2, 3 y/o 4 actúa sinérgicamente con Wnt para aumentar una señal inducida por Wnt, tal como se muestra en la Figura 4.
Alternativamente, el ensayo puede llevarse a cabo utilizando preparaciones exentas de células, polipéptido/molécula fijado a un soporte sólido, bancos químicos, o mezclas de productos naturales. El ensayo puede comprender también simplemente los pasos de mezclar un compuesto candidato con una solución que contiene Futrina 1, 2, 3 y/o 4, medir la actividad o fijación Futrina/molécula, y comparar la actividad o fijación Futrina/molécula con un estándar.
Un ensayo ELISA puede medir el nivel o actividad de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 en una muestra (v.g. muestra biológica) utilizando un anticuerpo monoclonal o policlonal. El anticuerpo puede medir el nivel o actividad de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 por fijación, directa o indirectamente, a Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o por competición con Futrina 1, 2, 3 y/o 4 por un sustrato. La totalidad de estos ensayos anteriores pueden utilizarse como marcadores de diagnóstico o pronóstico. Las moléculas descubiertas utilizando estos ensayos pueden utilizarse para tratar enfermedades o para producir un resultado particular en un paciente (v.g. eliminación de un tumor, soporte de procesos regenerativos, etc.) por modulación, preferiblemente activación de la molécula de Futrina 1, 2, 3 y/o 4. Además, los ensayos pueden descubrir agentes que pueden inhibir o intensificar la producción de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 a partir de células o tejidos manipulados convenientemente.
Además, la invención incluye un método de identificación de activadores/agonistas o inhibidores/antagonistas de un polipéptido de Futrina 2, que comprende los pasos de:
(a)
incubar un compuesto candidato con dicho polipéptido;
(b)
ensayar una actividad biológica, y
(c)
determinar si se ha alterado una actividad biológica de dicho polipéptido.
Ensayos adecuados para analizar la actividad de Futrina 2 incluyen ensayos de informadores de luciferasa
inducibles por Wnt en células HEK293 transfectadas, en donde Futrina 2 actúa sinérgicamente con Wnt para aumentar una señal inducida por Wnt, tal como se muestra en la Figura 4.
En una realización adicional, la presente invención se refiere a un método de identificación y obtención de un fármaco candidato para la terapia de enfermedades asociadas con (a) una expresión aberrante de Futrina 2 y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de un polipéptido de Futrina 2, que comprende los pasos de:
(a)
poner en contacto un polipéptido de Futrina 2 o una célula que expresa dicho polipéptido, y opcionalmente el o los ligandos correspondientes, en presencia de componentes capaces de proporcionar una señal detectable en respuesta a la fijación a dicho fármaco candidato a cribar; y
(b)
detectar la presencia o ausencia de una señal o el aumento de la señal generada, en donde la presencia o aumento de la señal es indicativa de un fármaco supuesto.
Ensayos para analizar la actividad de Futrina 2 son ensayos informadores de luciferasa inducibles por Wnt en células HEK283 transfectadas, en donde Futrina 2 actúa sinérgicamente con Wnt para aumentar una señal inducida por Wnt, tal como se muestra en la Figura 5.
El fármaco candidato puede ser un solo compuesto o una pluralidad de compuestos. El término "pluralidad de compuestos" en un método de la invención debe entenderse como una pluralidad de sustancias que pueden ser o no idénticas.
Dicho compuesto o pluralidad de compuestos puede(n) sintetizarse químicamente o producirse microbiológicamente y/o pueden estar comprendidos en, por ejemplo, muestras, v.g. extractos de células de, v.g., plantas, animales o microorganismos. Adicionalmente, dicho o dichos compuestos pueden ser conocidos en la técnica, pero no conocidos hasta ahora como capaces de reprimir o activar polipéptidos de Futrina 2. La mezcla de reacción puede ser un extracto exento de células o puede comprender un cultivo de células o tejidos. Montajes adecuados para el método de la invención son conocidos por las personas expertas en la técnica y se describen, por ejemplo, generalmente en Alberts et al., Molecular Biology of the Cell, tercera edición (1994) y en los ejemplos adjuntos. La pluralidad de compuestos puede añadirse, v.g., a la mezcla de reacción, al medio de cultivo, puede inyectarse en una célula o puede aplicarse de otro modo a un animal transgénico. La célula o tejido que puede emplearse en el método de la invención es preferiblemente una célula hospedadora, célula de mamífero o animal no humano transgénico.
Si una muestra que contiene un compuesto o una pluralidad de compuestos se identifica en el método de la invención, entonces es posible aislar el compuesto de la muestra original identificada por contener el compuesto capaz de reprimir o activar un polipéptido de Futrina 2, o puede subdividirse ulteriormente la muestra original, por ejemplo, si la misma está constituida por una pluralidad de compuestos diferentes, a fin de reducir el número de sustancias diferentes por muestra y repetir el método con las subdivisiones de la muestra original. Dependiendo de la complejidad de las muestras, los pasos arriba descritos pueden realizarse varias veces, preferiblemente hasta que la muestra identificada de acuerdo con el método de la invención comprenda solamente un número limitado de o únicamente una sustancia o sustancias. Preferiblemente, dicha muestra comprende sustancias de propiedades químicas y/o físicas similares, y muy preferiblemente dichas sustancias son idénticas.
Se conocen varios métodos por las personas expertas en la técnica para producir y cribar grandes bancos a fin de identificar compuestos que tengan afinidad específica para una diana. Estos métodos incluyen el método de presentación de fago, en el cual péptidos aleatorizados se presentan en fago y se criban por cromatografía de afinidad a un receptor inmovilizado; véanse, v.g., los documentos WO 91/17271, WO 92/01047, US-A-5.223.409. En otro enfoque, se sintetizan bancos combinatorios de polímeros inmovilizados en un chip utilizando fotolitografía; véanse, v.g. los documentos US-A-5.143.854, WO 90/15070 y WO 92/10092. Los polímeros inmovilizados se ponen en contacto con un receptor marcado y se escanean respecto al marcador a fin de identificar polímeros que se fijen al receptor. La síntesis y el cribado de bancos de péptidos sobre soportes continuos de membrana de celulosa que pueden utilizarse para identificar ligandos de fijación de los polipéptidos de Futriría 2 y, por consiguiente, posibles inhibidores y activadores, se describen, por ejemplo, en Kramer, Methods Mol. Biol. 87 (1998), 25-39. Este método puede utilizarse también, por ejemplo, para determinar los sitios de fijación y los motivos de reconocimiento en el polipéptido de Futrina 2. De modo análogo, se determinó la especificidad del sustrato de la chaperona DnaK y los sitios de contacto entre la interleuquina-6 humana y su receptor; véase Rudiger, EMBO J. 16 (1997), 1501-1507 y Weiergraber, FEBS Lett. 379 (1996), 122-126, respectivamente. Además, los métodos arriba mencionados pueden utilizarse para la construcción de supertopes de fijación derivados del polipéptido de Futrina 2. Un enfoque similar se describió con éxito para antígenos peptídicos del anticuerpo monoclonal anti-p24 (HIV-1); véase Kramer, Cell 91 (1997), 799-809. Una ruta general para análisis de la huella dactilar de las interacciones péptido-anticuerpo utilizando la biblioteca de aminoácidos peptídicos agrupados se describió en Kramer, Mol. Immunol. 32 (1995), 459
465. Adicionalmente, antagonistas de un polipéptido de Futrina 2 puede derivarse e identificarse a partir de anticuerpos monoclonales que reaccionan específicamente con un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con los métodos que se describen en Doring, Mol. Immunol. 31 (1994), 1059-1067. Todos estos métodos pueden utilizarse de acuerdo con la presente invención a fin de identificar activadores/agonistas e inhibidores/antagonistas de un polipéptido de Futrina 2.
Pueden emplearse diversas fuentes de la estructura básica de un activador o inhibidor de esta clase y comprenden, por ejemplo, análogos miméticos de un polipéptido de Futrina 2. Análogos miméticos de un polipéptido de Futrina 2 o fragmentos biológicamente activos de los mismos pueden generarse mediante, por ejemplo, sustitución de los aminoácidos que se espera sean esenciales para la actividad biológica con, v.g., estereoisómeros, es decir, Daminoácidos; véase, v.g., Tsukida, J. Med. Chem. 40 (1997), 3534-3541. Adicionalmente, en el caso de que se utilicen fragmentos para el diseño de análogos biológicamente activos, pueden incorporarse componentes promiméticos en un péptido a fin de restablecer al menos algunas de las propiedades estructurales que pueden haberse perdido por la eliminación de parte del polipéptido original; véase, v.g., Nachman, Regul. Pept. 57 (1995), 359-370. Adicionalmente, puede utilizarse un polipéptido de Futrina 2 para identificar miméticos peptídicos químicos sintéticos que se fijan a o pueden funcionar como un ligando, sustrato o pareja de fijación de dicho o dichos polipéptidos tan eficazmente como lo hace el polipéptido natural; véase, v.g. Engleman, J. Clin. Invest. 99 (1997), 2284-2292. Por ejemplo, pueden realizarse simulaciones de plegamiento y rediseño por computadora de motivos estructurales de un polipéptido de Futrina 2 utilizando programas de computadora apropiados (Olszewski, Proteins 25 (1996), 286-299; Hoffman, Comput. Appl. Biosci. 11 (1995), 675-679). La modelización por computadora del plegamiento de las proteínas puede utilizarse para el análisis estructural y energético de modelos detallados de péptidos y proteínas (Monge, J. Mol. Biol. 247 (1995), 995-1012; Renouf, Adv. Exp. Med. Biol. 376 (1995), 37-45). En particular, los programas apropiados pueden utilizarse para la identificación de sitios interactivos de un polipéptido de Futrina 2 y su ligando u otras proteínas interaccionantes por búsquedas con ayuda de computadora para secuencias de péptidos complementarias (Fassina, Immunomethods 5 (1994), 114-120. Sistemas adicionales de computadora apropiados para el diseño de proteínas y péptidos se describen en la técnica anterior, por ejemplo en Berry, Biochem. Soc. Trans. 22 (1994), 1033-1036; Wodak, Ann. N.Y. Acad. Sci. 501 (1987), 1-13; Pabo, Biochemistry 25 (1986), 5987-5991. Los resultados obtenidos a partir de los análisis por computadora arriba descritos pueden utilizarse para, v.g., la preparación de miméticos peptídicos de un polipéptido de Futrina 2 o fragmentos del mismo. Tales análogos pseudopeptídicos de la secuencia natural de aminoácidos de la proteína pueden mimetizar muy eficazmente la proteína parental (Benkirane, J. Biol. Chem. 271 (1996), 33218-33224). Por ejemplo, la incorporación de residuos de α-aminoácidos aquirales fácilmente disponibles en un polipéptido de Futrina 2 o un fragmento del mismo da como resultado la sustitución de enlaces amídicos por unidades polimetileno de una cadena alifática, proporcionando con ello una estrategia conveniente para la construcción de un mimético peptídico (Banerjee, Biopolymers 39 (1996), 769-777). Análogos péptido-miméticos superactivos de pequeñas hormonas peptídicas en otros sistemas se describen en la técnica anterior (Zhang, Biochem. Biophys. Res. Commun. 224 (1996), 327-331). Miméticos peptídicos apropiados de un polipéptido de Futrina 2 pueden identificarse también por la síntesis de bancos combinatorios de miméticos peptídicos mediante alquilación sucesiva de amidas y testado de los compuestos resultantes, v.g., en cuanto a sus propiedades de fijación e inmunológicas. Métodos para la generación y el uso de bancos péptido-miméticos combinatorios se describen en la técnica anterior, por ejemplo en Ostresh, Methods in Enzymology 267 (1996), 220-234 y Dorner, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 709-715. Adicionalmente, una estructura tridimensional y/o cristalográfica de un polipéptido de Futrina 2 puede utilizarse para el diseño de inhibidores miméticos y péptidos de la actividad biológica del polipéptido (Rose, Biochemistry 35 (1996), 1293312944; Rutenber, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 1545-1558).
Es también bien conocido por las personas expertas en la técnica que es posible diseñar, sintetizar y evaluar miméticos de compuestos orgánicos pequeños que, por ejemplo, puedan actuar como un sustrato o ligando para un polipéptido de Futrina 2. Por ejemplo, se ha descrito que miméticos D-glucosídicos de hapalosina exhibían una eficiencia similar a la hapalosina en la antagonización de proteínas de resistencia a multifármacos asociada a asistencia en citotoxicidad; véase Dinh, J. Med. Chem. 41 (1998), 981-987.
La molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido de Futrina 2 puede servir también como diana para activadores e inhibidores. Los activadores pueden comprender, por ejemplo, proteínas que se fijan al mRNA de un gen codificante de un polipéptido de Futrina 2, estabilizando con ello la conformación nativa del mRNA y facilitando la transcripción y/o la traducción, v.g., de manera análoga a como actúa la proteína Tat sobre el RNA de HIV. Adicionalmente, se describen en la bibliografía métodos para la identificación de moléculas de ácido nucleico tales como un fragmento de RNA que mimetiza la estructura de una molécula de RNA diana definida o indefinida a la cual se fija un compuesto en el interior de una célula, dando como resultado el retardo del crecimiento celular o la muerte celular; véase, v.g., WO 98/18947 y las referencias citadas en el mismo. Estas moléculas de ácido nucleico pueden utilizarse para la identificación de compuestos desconocidos de interés farmacéutico, y para la identificación de dianas de RNA desconocidas para uso en el tratamiento de una enfermedad. Estos métodos y composiciones pueden utilizarse en el cribado para nuevos compuestos o para la identificación de compuestos útiles a fin de alterar los niveles de expresión de polipéptidos codificados por una molécula de ácido nucleico. Alternativamente, por ejemplo, la estructura de conformación del fragmento de RNA que mimetiza el sitio de fijación puede emplearse en el diseño racional de fármacos a fin de modificar fármacos conocidos para hacer que los mismos se fijen más ávidamente a la diana. Una metodología de este tipo es la resonancia magnética nuclear (NMR), que es útil para identificar estructuras de conformación de fármacos y RNA. Todavía otros métodos son, por ejemplo, los métodos de diseño de fármacos que se describen en los documentos WO 95/35367, US-A-5322933, en donde puede deducirse la estructura cristalina del fragmento de RNA y se utilizan programas de computadora para diseñar nuevos compuestos de fijación.
Los compuestos que pueden testarse e identificarse de acuerdo con un método de la invención pueden ser bancos
de expresión, v.g. bancos de expresión de cDNA, péptidos, proteínas, ácidos nucleicos, anticuerpos, pequeños compuestos orgánicos, hormonas, peptidomiméticos, PNAs o análogos (Milner, Nature Medicine 1 (1995), 879-880; Hupp, Cell 83 (1995), 237-245; Gibbs, Cell 79 (1994), 193-199 y las referencias citadas supra). Adicionalmente, genes que codifican un regulador supuesto de un polipéptido de Futriría 2 y/o que ejercen sus efectos aguas arriba o aguas abajo de un polipéptido de Futrina 2 pueden identificarse utilizando, por ejemplo, mutagénesis de inserción en la que se utilizan, por ejemplo, vectores de díreccionamiento de genes conocidos en la técnica. Dichos compuestos pueden ser también derivados funcionales o análogos de inhibidores o activadores conocidos. Tales compuestos útiles pueden ser, por ejemplo, factores de transacción que se fijan a un polipéptido de Futrina 2 o secuencias reguladoras del gen que codifica el mismo. La identificación de factores de transacción puede realizarse utilizando métodos estándar en la técnica, (véase, v.g., Sambrook, supra). Para determinar si una proteína se fija a la poliproteína propiamente dicha o a secuencias reguladoras, pueden llevarse a cabo análisis estándar de desplazamiento en gel nativo. Con objeto de identificar un factor de transacción que se fija a la proteína o secuencia reguladora, la proteína o secuencia reguladora puede utilizarse como reactivo de afinidad en métodos estándar de purificación de proteínas, o como una sonda para cribado de un banco de expresión. La identificación de moléculas de ácido nucleico que codifican polipéptidos que interactúan con un polipéptido de Futrina 2 arriba descrito puede realizarse también, por ejemplo, como se describe en Scofield (Science 274 (1996), 2063-2065) mediante el uso del denominado "sistema de dos híbridos" de levadura. En este sistema, el polipéptido de Futrina 2 o una parte más pequeña del mismo se enlaza al dominio de fijación de DNA del factor de transcripción GAL4. Una cepa de levadura que expresa este polipéptido de fusión y que comprende un gen informador lacZ dirigido por un promotor apropiado, que es reconocido por el factor de transcripción GAL4, se transforma con un banco de cDNAs que expresará proteínas de plantas o péptidos de las mismas fusionados a un dominio de activación. Así, si un péptido codificado por uno de los cDNAs es capaz de interactuar con el péptido de fusión que comprende un péptido de un polipéptido de Futrina 2, el complejo es capaz de dirigir la expresión del gen informador. De este modo, las moléculas de ácido nucleico que codifican Futrina 2, respectivamente, y el péptido codificado pueden utilizarse para identificar péptidos y proteínas que interactúan con un polipéptido de Futrina 2.
Una vez que se ha identificado el factor de transacción, puede proseguirse con la modulación de su fijación a o la regulación de la expresión de un polipéptido de Futrina 2, comenzando, por ejemplo, con el cribado de inhibidores contra la fijación del factor de transacción a un polipéptido de Futrina 2. La activación o represión de un polipéptido de Futrina 2 podría realizarse luego en animales por aplicación del factor de transacción (o su inhibidor) o el gen que codifica el mismo, v.g. en un vector de expresión. Adicionalmente, si la forma activa del factor de transacción es un dímero, podrían construirse imitantes dominantes negativos del factor de transacción a fin de inhibir su actividad. Adicionalmente, después de la identificación del factor de transacción, pueden identificarse luego componentes adicionales en la cascada de señales que conduce a la activación (v.g. transducción de la señal) o represión de un gen implicado en el control de un polipéptido de Futrina 2. La modulación de las actividades de estos componentes puede proseguirse luego, a fin de desarrollar fármacos adicionales y métodos para modulación del metabolismo de la degradación de las proteínas en los animales. Así pues, la presente invención se refiere también al uso de sistema de dos híbridos como se ha definido arriba para la identificación de activadores o inhibidores de un polipéptido de Futrina 2.
Los compuestos aislados por los métodos arriba indicados sirven también como compuestos cabeza de serie para el desarrollo de compuestos análogos. Los análogos deberían tener una configuración electrónica estabilizada y conformación molecular que permita que grupos funcionales clave se presenten a un polipéptido de Futrina 2 o su ligando sustancialmente del mismo modo que el compuesto cabeza de serie. En particular, los compuestos análogos tienen propiedades electrónicas espaciales que son comparables a la región de fijación, pero pueden ser moléculas más pequeñas que el compuesto cabeza de serie, teniendo frecuentemente un peso molecular inferior a aproximadamente 2 kD y preferiblemente inferior a aproximadamente 1 kD. La identificación de compuestos análogos puede realizarse mediante el uso de técnicas tales como análisis de campo autoconsistente (SCF), análisis de interacción de configuración (CI), y análisis de dinámica en modo normal. Están disponibles programas de computadora para la implementación de estas técnicas; v.g., Rein, Computer-Assisted Modeling of Receptor-Ligand Interactions (Alan Liss, Nueva York, 1989). Métodos para la preparación de derivados químicos y análogos son bien conocidos por los expertos en la técnica y se describen, por ejemplo, en Beilstein, Handbook of Organic Chemistry, Springer edition, New York Inc., 175 Fifth Avenue, Nueva York, N.Y. 10010 EE.UU. y Organic Synthesis, Wiley, Nueva York, EE.UU. Adicionalmente, dichos derivados y análogos pueden testarse respecto a sus efectos de acuerdo con métodos conocidos en la técnica; véase también supra. Adicionalmente, pueden utilizarse peptidomiméticos y/o diseño ayudado por computadora de derivados apropiados y análogos, por ejemplo, de acuerdo con los métodos descritos anteriormente.
Una vez que el compuesto descrito ha sido identificado y obtenido, el mismo se proporciona preferiblemente en una forma terapéuticamente aceptable.
De acuerdo con ello, se describe una composición farmacéutica que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido de Futrina 2, un polipéptido de Futrina 2 propiamente dicho, vector recombinante (para ejemplos, véase más adelante), anticuerpo, activador/agonista, inhibidor/antagonista y/o pareja de fijación de un polipéptido de Futrina 2 y un excipiente, diluyente o vehículo farmacéuticamente aceptable.
Preferiblemente, para propósitos terapéuticos, el polipéptido de Futrina 2 se produce recombinantemente por el uso
de las secuencias de ácido nucleico que se muestran en las Figuras 1 y 2. Vectores adecuados para la expresión recombinante son conocidos por las personas expertas en la técnica. Preferiblemente, los mismos son plásmidos, cósmidos, virus, bacteriófagos y otros vectores utilizados usualmente en el campo de la ingeniería genética. Vectores adecuados para uso incluyen, pero sin carácter limitante, el vector de expresión basado en T7 para la expresión en células de mamífero y vectores derivados de baculovirus para expresión en células de insectos. Con preferencia, la molécula de ácido nucleico está enlazada operativamente a los elementos reguladores en el vector recombinante que garantizan la transcripción y síntesis de un mRNA en células procariotas y/o eucariotas que puede traducirse. La secuencia de nucleótidos a transcribir puede estar enlazada operativamente a un promotor tal como un promotor T7, metalotioneína I o polihedrina. Las células hospedadoras utilizadas para la expresión recombinante son células procariotas o eucariotas, por ejemplo células de mamíferos, células bacterianas, células de insectos o células de levaduras. El polipéptido se aísla de las células cultivadas y/o del medio de cultivo. El aislamiento y la purificación del polipéptido producido recombinantemente pueden llevarse a cabo por medios convencionales que incluyen cromatografía preparativa y separaciones por afinidad e inmunológica utilizando, v.g., un anticuerpo anti-Futrina 2 o, v.g., pueden purificarse sustancialmente por el método de un solo paso descrito en Smith y Johnson, Gene 67; 31-40 (1988).
Ejemplos de vehículos farmacéuticos adecuados, etc. son bien conocidos en la técnica e incluyen soluciones salinas tamponadas con fosfato, agua, emulsiones, tales como emulsiones de aceite/agua, diversos tipos de agentes humectantes, soluciones estériles, etc. Tales vehículos pueden formularse por métodos convencionales y se pueden administrar al individuo en una dosis adecuada. La administración de las composiciones adecuadas puede efectuarse por diferentes vías, v.g. mediante administración intravenosa, intraperitoneal, subcutánea, intramuscular, tópica o intradérmica. La ruta de administración, por supuesto, depende de la naturaleza de la enfermedad y de la clase de compuesto contenida en la composición farmacéutica. El régimen de dosificación será determinado por el médico encargado del caso y otros factores clínicos. Como es bien conocido en las ciencias médicas, las dosificaciones para cualquier paciente dependen de muchos factores, e incluyen el volumen del paciente, la superficie corporal, la edad, el sexo, el compuesto particular a administrar, el tiempo y la vía de administración, la clase y estadio de la enfermedad, v.g., tumores, salud general y otros fármacos que se administren simultáneamente.
El suministro de las moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido de Futrina 2 puede realizarse por aplicación directa o, preferiblemente, por utilización de un vector de expresión recombinante tal como un virus quimérico que contenga estos compuestos o un sistema de dispersión coloidal. La aplicación directa al sitio diana puede realizarse, v.g., por suministro balístico, como un sistema de dispersión coloidal o mediante catéter a un sitio en una arteria. Los sistemas de dispersión coloidal que pueden utilizarse para suministro de las moléculas de ácido nucleico anteriores incluyen complejos macromoleculares, nanocápsulas, microesferas, cuentas y sistemas basados en lípidos que incluyen emulsiones de aceite en agua (mixtas), micelas, liposomas y lipoplexos. El sistema coloidal preferido es un liposoma. Pueden utilizarse liposomas específicos de órganos o específicos de células a fin de conseguir el suministro solamente al tejido deseado. El direccionamiento de los liposomas puede ser realizado por la persona experta en la técnica mediante aplicación de métodos de conocimiento común. Este direccionamiento incluye direccionamiento pasivo (utilizando la tendencia natural de los liposomas al distribuirse a las células del RES en órganos que contienen capilares sinusoidales) o direccionamiento activo (por ejemplo por acoplamiento del liposoma a un ligando específico, v.g., un anticuerpo, un receptor, azúcar, glicolípido, proteína, etc., por métodos bien conocidos). Se utilizan preferiblemente anticuerpos monoclonales para direccionar los liposomas a tejidos específicos, v.g. un tejido tumoral, por la vía de ligandos específicos de la superficie celular.
Vectores recombinantes útiles para la terapia génica son vectores virales, v.g. adenovirus, virus herpes, vaccinia, o, más preferiblemente, un virus de RNA tal como un retrovirus. Aún más preferiblemente, el vector retroviral es un derivado de un retrovirus murino o aviar. Ejemplos de tales vectores retrovirales que pueden utilizarse son: el virus de la leucemia murina de Moloney (MoMuLV), el virus del sarcoma murino de Harvey (HaMuSV), el virus del tumor mamario murino (MuMTV) y el virus del sarcoma de Rous (RSV). Muy preferiblemente, se emplea un vector retroviral de primate no humano, tal como el virus de la leucemia del gibón (GaLV), que proporciona un intervalo de hospedadores más amplio comparado con los vectores murinos. Dado que los retrovirus recombinantes son defectuosos, se requiere asistencia a fin de producir partículas infecciosas. Dicha asistencia puede ser proporcionada, v.g., utilizando líneas de células adyuvantes que contienen plásmidos que codifican la totalidad de los genes estructurales del retrovirus bajo el control de secuencias reguladoras incluidas en la LTR. Líneas de células adyuvantes adecuadas son bien conocidas por los expertos en la técnica. Dichos vectores pueden contener adicionalmente un gen que codifica un marcador seleccionable de tal modo que las células transducidas puedan identificarse. Además, los vectores retrovirales pueden modificarse de tal modo que los mismos se vuelvan específicos de la diana. Esto puede conseguirse, v.g., por inserción de un polinucleótido que codifique un azúcar, un glicolípido, o una proteína, preferiblemente un anticuerpo. Los expertos en la técnica conocen métodos adicionales para la generación de vectores específicos de dianas. Otros vectores adecuados y métodos para la terapia in vitro o in vivo se describen en la bibliografía y son conocidos por las personas expertas en la técnica; véase, v.g., WO 94/29469 o WO 97/00957.
Con objeto de conseguir expresión únicamente en el órgano diana, v.g., un tumor a tratar, las moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido de Futrina 2 pueden enlazarse a un promotor específico de tejido y utilizarse para la terapia génica. Tales promotores son bien conocidos por los expertos en la técnica (véase, v.g. Zimmermann
et al, (1994) Neuron 12,11-24; Vidal et al;, (1990) EMBO J. 9, 883-840; Mayford et al., (1995), Cell 81, 891-904; Pinkert et al, (1987) Genes & Dev. 1, 268-76).
La presente invención se refiere también al uso de los compuestos de la invención arriba indicados para la preparación de una composición farmacéutica para el tratamiento de una enfermedad asociada con (a) expresión aberrante de Futrina 2 y/o genes implicados en la cascada de señales Wnt, y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de una Futrina 2 y/o un polipéptido implicado en la cascada de señales Wnt. En una realización preferida, dicha enfermedad es una enfermedad renal, ósea o muscular o tumor, preferiblemente cáncer de mama, un carcinoma de colon o un melanoma.
Finalmente, la presente invención se refiere al uso de una molécula nucleotídica que codifica un polipéptido que tiene una actividad biológica de un polipéptido de Futrina 2, un activador/agonista de un polipéptido de Futrina 2 o pareja de fijación de dicho o dichos polipéptidos para la preparación de una composición farmacéutica para inhibir la cascada de señales Wnt que podría ser útil para soportar procesos regenerativos en un paciente, v.g., crecimiento de tejido tal como músculo, hueso, cabello, etc.
Los siguientes ejemplos ilustran la invención.
Ejemplo 1
Materiales y Métodos
(A) Aislamiento de Futrirías (= R-espondinas) y constructos
Se utilizó un banco de cDNA de ojos de Xenopus adulto en pCS2+ a fin de preparar agrupaciones de aproximadamente 250 colonias. Se transfectó transitoriamente DNA plasmídico de cada agrupación a células 293T junto con el receptor de Wnt frizzled8, el informador de Wnt TOPFLASH (Korinek et al, Science 275 (1997), 1784-7) y pRL-TK (Promega) utilizando el reactivo de transfección FuGENE6 (Roche). El ensayo de luciferasa se realizó 24 horas después de la transfección. Se aisló un clon positivo de la agrupación por selección de consanguinidad. Se obtuvieron cDNAs humanos de Rspo2 y 3 del RZPD. Fragmentos de hRspo1 y 4 se amplificaron por RT-PCR a partir del mRNA de células 293T y se utilizaron como sondas de hibridación. Se aislaron Rspo1 y 2 de ratón de longitud total a partir de un banco de cDNA de embrión de ratón de 13,5 días. La secuencia de X. tropicalis Rspo3 se obtuvo de la base de datos del Instituto Sanger y un fragmento de cDNA se clonó por RT-PCR a partir de embriones de X. tropicalis. Se crearon constructos C-terminales marcados con Myc o FLAG y todos los constructos de deleción por PCR. Se clonó Rspo2!C de Xenopus por deleción de los últimos 37 aminoácidos. Los cDNAs de Rspo3 se clonaron en vectores pCS2+ y Bluescript para uso en expresión génica y como sondas, respectivamente.
(B) Cultivo de células, proteínas recombinantes y ensayos informadores de luciferasa
Se mantuvieron líneas de células HER293T, SHEP y HeLa en DMEM, FCS al 10% y 10% de CO2. Se produjo medio acondicionado Rspo2!C de Xenopus por transfección transitoria en células 293T. Se produjo medio acondicionado Wnt3a de ratón a partir de células L de ratón transfectadas establemente con Wnt3a (ATCC nº CRL-2647) (Shibamoto et al, Genes Cells 3 (1998), 659-670). Los ensayos con el informador luciferasa en células 293T se llevaron a cabo en placas de 96 pocillos como se ha descrito (Wu et al, Curr. Biol. 10 (2000), 1611-1614). Los ensayos con el informador luciferasa en células HeLa se llevaron a cabo en placas de 24 pocillos por triplicado utilizando reactivo de transfección Lipofectamine Plus (Invitrogen). Se transfectaron por pocillo un total de 400 ng de DNA, incluyendo 80 ng de 7lef-fos-Luc (Novak et al, PNAS 95 (1998), 4374-4379), 10 ng de pRL-TK,10 ng de frizzled8 de ratón, 2 ng de lef1 de ratón y 300 ng de DNAs del plásmido pSuper. Tres días después de la transfección, se añadió medio acondicionado Wnt3a de ratón o medio que contenía LiCl 30 mM para estimular la señalización Wnt. 24 horas más tarde, se determinó la actividad de luciferasa utilizando el sistema de luciferasa Dual (Promega).
(C) Embriones, explantes, hibridación in situ y síntesis de RNA
Se realizaron fertilización in vitro, cultivo de embriones, estadificación, microinyección y cultivo de explantes de embriones de Xenopus como ha sido descrito (Gawantka et al., EMBO J. 14 (1995), 6268-79). Se llevó a cabo una hibridación in situ con marcación doble y simple del montaje entero de acuerdo con (Bradley et al., Development 122 (1996), 2739-50). Se utilizó un fragmento PCR de cDNA de Rspo3 tropicalis para la hibridación in situ en embriones de Xenopus laevis. Para el seccionamiento con vibratomo, se pusieron los embriones en medio de incrustación (0,4% de gelatina, 30% de albúmina, 20% de sacarosa en PBS) y se montaron en presencia de 2% de aldehido glutárico. El seccionamiento se llevó a cabo utilizando un vibratomo VT100E (Leica). Los cerebros de embriones de Xenopus de 4 días se cortaron en solución 1 x Barth y se fijaron para hibridación in situ. La elección in situ del montaje entero de los embriones de ratón se realizó de acuerdo con procedimientos descritos anteriormente (Koop et al., Mech. Dev. 59 (1996), 73-78). La preparación de mRNA para las inyecciones de Xenopus se llevó a cabo utilizando el kit de transcripción in vitro MegaScript (Ambion), de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
(D) Morfolino-oligonucleótidos antisentido y constructos de SiRNA
La secuencia de nucleótidos 5' de un (pseudo)-alelo adicional para el gen Rspo2 de Xenopus se obtuvo utilizando RACE 5' (kit GeneRacer, Invitrogen). Basándose en estas secuencias, se diseñó un morfolino-oligonucleótido antisentido que direccionaba ambos pseudoalelos alrededor del codón inicial ATG (Rspo2Mo): GCCGTCCAAATGCAGTTTCAAC. Se produjeron constructos PSuper que producían siRNA contra Rspo2,3 humano
o un control sin sentido de acuerdo con Brummelkamp et al., Science 296 (2002), 550-3. Las secuencias son: Rspo2 humano, TCCCATTTGCAAGGGTTGT; Rspo3 humano, AGCTGACTGTGATACCTGT; control sin sentido, ACTACCGTTGTTATAGGTG.
(E)
Inmunohistoquímica, transferencia Western y análisis por transferencia de mancha
La inmunohistoquímica para detectar ∀-catenina en células SHEP se llevó a cabo de acuerdo con (Scheiffele et al.,
J. Cell. Biol. 140 (1998), 795-806) utilizando anticuerpos anti-∀-catenina (Transduction Laboratories, Newington). Para la detección de las proteínas Rspo marcadas o controles de carga en la transferencia Western, se utilizaron anticuerpos anti-Myc (clon 9E10), anticuerpos monoclonales anti-FLAG (M2, SIGMA), anti-GFP de pollo (Chemicon, Hampshire) y anti-a-tubulina de ratón (SIGMA). La detección por quimioluminiscencia (solución SuperSignal®, Pierce) se llevó a cabo de acuerdo con las instrucciones del fabricante después de incubación de las transferencias con IgG-HRP anti-ratón (Pierce). Para el análisis de la expresión de Rspo en muestras de tumores se utilizó el sistema Cáncer Profiling Array II (Clontech, Palo Alto) y la hibridación se llevó a cabo de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
(F) RT-PCR
Los ensayos RT-PCR se llevaron a cabo como ha sido descrito (Dosch et al., Development 124 (1997), 2325-34; Glinka et al., Nature 389 (1997), 517-519); cebadores adicionales fueron: Rspo2 de Xenopus (directo, GAATGCCCAGAAGGATTTGC; inverso, GGGATGGTGTCTTTTGCTGG); Rspo3 de Xenopus (directo, GAAGCAAATTGGAGTCTGTCG; inverso, GATTGTTCTCAAACCCTTCAGG); Rspo1 humano (directo, ACAGACACAAGACACACACGC; inverso, TGTCTTCTGGTGGCCTCAG); Rspo2 humano (directo, CCGAGCCCCAGATATGAAC; inverso, TGACCAACTTCACATCCTTCC); Rspo3 humano (directo, AGGGACTGAAACACGGGTC; inverso, TGTCTTCTGGTGGCCTCAG); Rspo4 humano (directo, AAGCTGGGACACAGCACAG; inverso, GAAGCCTTGGAGCCTT GTC).
Ejemplo Comparativo 2
Aislamiento de un cDNA codificante de Futrina 1 de Xenopus
Se utilizó un banco de cDNA de ojos adultos de Xenopus en el vector de expresión pCS2+ para preparar agrupaciones de aproximadamente 250 colonias, y el DNA plasmídico de cada agrupación se transfectó transitoriamente en células 293T junto con el receptor de Wnt frizzled8, el informador de Wnt TOP-FLASH (Korinek et al., Science 275 (1997), 1784-1787) y luciferasa de Renilla para normalización, en placas de 96 pocilios utilizando FuGENE6 (Roche, Basilea). Después de 24 horas, se determinó la actividad relativa de luciferasa. Se identificó una agrupación que producía una señal por encima del ruido de fondo (Figuras 1 y 2A) y se aisló un gen que albergaba esta actividad a partir de la agrupación por selección de consanguinidad. El análisis de la secuenciación demostró que el mismo representa futrina 1 de Xenopus. Las búsquedas en bases de datos revelaron cuatro genes estrechamente afines en humanos, denominados hfutrina 1, 2, 3 y 4 (Figuras 3 y 4 ó 6a).
Se predice que la futrina 1 de Xenopus (Rspo2) codifica una proteína secretada con 243 aminoácidos (proteína madura) y un punto isoeléctrico de 9,8. Todas las R-espondinas contienen un péptido señal N-terminal (SP), dos dominios semejantes a furina (FU), un dominio de tromboespondina tipo 1 (TSP1) y una región C-terminal de baja complejidad enriquecida con aminoácidos cargados positivamente (C) (Figura 2F). El dominio rico en cisteína semejante a furina se encuentra, v.g., en endoproteasas semejantes a furina, el receptor EGF y el receptor de insulina. En la transducción de señales por ciertas tirosina-quinasas receptoras son necesarias repeticiones de furina para la agregación del receptor. Repeticiones de TSP1 se encuentran en tromboespondina y otras proteínas de la matriz extracelular como Mindina, F-espondina, SCO-espondina, así como en un cierto número de proteínas implicadas en la cascada del complemento. Proteínas que contienen repeticiones TSP1 están implicadas en la interacción célula-célula, la inhibición de la angiogénesis y la apoptosis (Adams y Tucker, Dev. Dyn. 218 (2000), 28099).
Si bien el Rspo2 de Xenopus contiene un péptido señal N-terminal predicho, la proteína secretada es casi indetectable en el medio de células 293T transfectadas transitoriamente. Dado que el extremo C está enriquecido con aminoácidos de carácter básico, lo cual promueve la retención en la superficie celular, se testó una proteína truncada C-terminalmente. Rspo2!C se secreta eficazmente en el medio a partir de las células 293T (Figura 2B) y es funcionalmente activo (Figura 2F). Dado que todas las R-espondinas comparten el extremo C de carácter básico y dado que no existen señales de retención evidentes en ER o Golgi, esto sugiere que las proteínas están asociadas normalmente con la superficie celular.
Ejemplo 3
Las Futrirías promueven la señalización Wnt
Futrina 1 de Xenopus y las Futrinas 1, 2 y 3 humanas son capaces de estimular la expresión de informadores sensibles a Wnt en células HEK 293T cuando se proporcionan por transfección transitoria (Figuras 2C y 5A). Adicionalmente, las mismas son capaces de aumentar la expresión de informadores inducida por Wnt (Wnt1/3A de ratón) sinérgicamente (Figuras 2D y 5B). Experimentos de cotransfección en células HEK 239T se llevaron a cabo con los genes indicados y en el informador de Wnt TOP-FLASH (Korinek et al. Science 275 (1997) 1784-1787) y luciferaza de Renilla para la normalización, en placas de 96 pocillos utilizando FuGENE 6 (Roche). Después de 24 horas, se determinó la actividad relativa de luciferasa.
Todos los miembros testados de la familia Rspo (v.g. Rspo1-3 murino, Rspo2, 3 humano) exhiben efectos equivalentes (Figura 6A y datos no presentados). La señalización de Rspo2 es sensible a los inhibidores del camino Wnt/∀-catenina dominantes negativos TCF y dickkopf1 (Figura 6B). Se observa un efecto de señalización sinérgico cuando Rspo2 se somete a cotransfección con componentes extracelulares, pero no con componentes intracelulares del camino Wnt/∀-catenina (Figura 6C). La máxima cooperación se observa de manera reproducible entre Rspo2 y Wnts, ya sea utilizando medios acondicionados (Figura 2D) o después de co-transfección (Figura 6C).
Un sello de activación de la señalización Wnt/∀-catenina es la acumulación citosólica de ∀-catenina debido a su estabilización. El tratamiento de células 293T con medio acondicionado Wnt3a induce ∀-catenina citosólica después de 1 hora y si bien el Rspo2!C recombinante no es capaz por sí solo de estabilizar la ∀-catenina durante este intervalo, el mismo aumenta fuertemente la actividad de Wnt3a para hacerlo (Figura 2E, arriba). Después de 4 horas de tratamiento, ambos medios acondicionados Wnt3a y Rspo2!C son capaces de inducir la acumulación de ∀catenina a niveles similares (figura 2E, arriba). Es sabido que ∀-catenina penetra en los núcleos en respuesta a la estimulación de Wnt y activa la expresión génica junto con los factores de transcripción Lef/Tcf. El tratamiento de células SHEP por medios acondicionados Wnt3a o Rspo2!C induce débilmente la localización nuclear de ∀catenina, mientras que el co-tratamiento con Wnt3a y Rspo2!C aumenta fuertemente la acumulación de nucleasas (Figura 2E, abajo). Puede llegarse a la conclusión de que las R-espondinas representan una nueva familia de proteínas secretadas capaces de promover la señalización Wnt/∀-catenina.
Para estudiar funcionalmente sus dominios de señalización, se crearon deleciones seriadas de Rspo2 de Xenopus (Figura 2F). Como se ha expuesto, el extremo C de carácter básico puede eliminarse sin pérdida de actividad, y esto sucede también para el dominio TSP1 (Figura 2F). Sin embargo, los dominios semejantes a furina son necesarios para la señalización Wnt/∀-catenina, dado que la deleción de cualquiera de los dominios furina 1 ó 2 anula la actividad en los ensayos informadores (Figura 2F).
Ejemplo 4
Las futrinas son necesarias para la señalización Wnt completa
Para testar el requerimiento de Futrinas en la señalización de Wnt, se utilizó la inactivación de genes mediada por siRNA (Brummelkamp et al., Science, 2002, 296 (5567): 550-3). Se transfectaron células HeLa utilizando Lipofectamine Plus con 80 ng del informador de Wnt 7LEF-Rev-fosLuc, 10 ng de pRL-TK (Promega) y 300 ng de constructos pSuper (Brummelkamp et al.) que producen siRNA contra Futrina 1 y 2 humana o un control sin sentido. El constructo de informador 7LEF-Rev-fosLuc que contenía siete sitios de fijación LEF frente al promotor fos mínimo seguido por el ORF de luciferasa de luciérnaga fue proporcionado amablemente por R. Grosschedl (Howard Hughes Medical Institute). Los constructos pSuper contienen secuencias de 19 nucleótidos de Futrina 1 humana (secuencia: TCCCATTTGCAAGGGTTGT), Futrina2 humana (secuencia: AGCTGACTGTGATACCTGT) o secuencia de control sin sentido (ACTACCGTTGTTATAGGTG).
Un día después de la transfección se cambió el medio de FCS al 10% a FCS al 0,5%. Tres días después de la transfección se añadió al cultivo medio acondicionado de ratón Wnt3A o medio de control de células 293 para estimular la señalización Wnt. 24 horas más tarde, se determinó la actividad de luciferasa. Como se muestra en la Figura 7, las células HeLa exhiben niveles reducidos de Futrina 1 y 2, y la señalización Wnt disminuyó al 50%, lo que indicaba que las Futrinas son necesarias para la señalización Wnt completa. Este efecto puede ser rescatado eficientemente por 5 ng de Futrina 1 recombinante de ratón, lo que confirma su especificidad. Los datos están normalizados para actividad de luciferasa de Renilla.
Ejemplo 5
Expresión de genes de R-espondina en embriones de Xenopus y ratón
En los embriones de Xenopus no se detecta RNA materno alguno de Rspo2 por RT-PCR. Su expresión cigótica comienza en la etapa precoz de la gástrula y se mantiene constante a lo largo de la neurulación y organogénesis (Figura 8A). Por hibridación in situ del montaje entero, se observa una expresión débil de Rspo2 en todo el ectodermo de las gástrulas precoces (no representado). Durante la gastrulación se detecta una expresión fuerte en la zona marginal tanto en el casquillo profundo como en las superficiales, pero se excluye del organizador Spemann (Figura 8B). En la etapa final de la gástrula, la expresión de Rspo2 persiste en el mesodermo de la placa lateral y se hace detectable en la placa neural anterior (Figura 8C). En la etapa 15, se observa la expresión en dos franjas longitudinales a lo largo de la placa neural (futura placa de techo), en la placa neural anterior y en el mesodermo
lateral y posterior (Figura 8D). La expresión de Rspo2 en la etapa del primordio de la cola (Figura 8F) está restringida a varias regiones del cerebro, que incluyen el diencéfalo y la zona límite cerebro medio-cerebro posterior, el pronefros y el tubo neural dorsal. Se detecta también expresión en las porciones dorsal y más ventral de los somitos, la aleta dorsal y el proctodeum. La expresión de Rspo2 en el cerebro de los renacuajos tardíos está restringida principalmente al diencéfalo, con inclusión de la zona intratalámica limitante (zli) (Figura 8H).
La expresión de Rspo3 de Xenopus está relacionada con la de Rspo2. La misma se detecta primeramente en la etapa gastrular (no representada) y en las néurulas se expresa en el borde anterior de la placa neural y el mesodermo posterior (Figura 8E). En la etapa del primordio de la cola, se coexpresa con Rspo2 en el sistema nervioso central pero exhibe una expresión adicional en los arcos branquiales y el primordio de la cola (Figura 8G).
En el ratón, los transcritos de Rspo3 se detectan por hibridación in situ el día 7,5 en la línea primitiva (Figura 8J) mientras que la expresión de Rspo1 y 2 no es detectable. El día 9,5, Rspo1-3 exhiben expresión diferencial en diversos derivados neurales y mesodérmicos (Figura 8K-M), principalmente a lo largo del tubo neural dorsal (Rspo1 y 3), el diencéfalo (Rspo1, 2, 3), los somitos (Rspo3) y el mesodermo del primordio de la cola (Rspo3). En los primordios de los miembros, los tres genes exhiben expresión diferencial prominente (Figura 8I), en particular en la región morfogenéticamente activa tal como el reborde apical ectodérmico (AER) (Rspo2).
Ejemplo 6
Las R-espondinas se co-expresan con y son reguladas por Wnts
Las R-espondinas no sólo exhiben una interacción funcional con la señalización Wnt, sino también una co-expresión con los genes Wnt en muchas regiones durante el desarrollo embrionario de Xenopus y de ratón. En el mesodermo gastrular, tanto de Xenopus como de ratón, Rspo2 y 3 se co-expresan con XWnt8 y mWnt3, respectivamente. Análogamente, en etapas posteriores, los miembros de la familia R-espondina se co-expresan ampliamente con cierto número de genes Wnt, v.g. en el límite cerebro medio-cerebro posterior, el tubo neural dorsal, el primordio de los miembros y el primordio de la cola. Una comparación directa entre los patrones de expresión de Rspo2 de Xenopus y Wnt8 y Wnt3a exhibe un gran solapamiento (Figura 9A).
De hecho, los Wnts son capaces de inducir la expresión de Rspo, dado que embriones de Xenopus inyectados con DNA de pCS-Wnt8 o pCS-∀-catenina regulan en sentido creciente tanto Rspo2 como Rspo3 por RT-PCR (Figura 9B). Análogamente, los embriones inyectados con DNA de pCS-Wnt8 o pCS-Wnt3a exhiben expresión ectópica de Rspo2 por hibridación in situ (Figuras 8C-E). Los resultados indican que la co-expresión observada es debida a la regulación de las R-espondinas por los Wnts. Esto es consistente con la observación de que la expresión de Rspo1 es reducida en el cordón medular dorsal de los embriones de ratón silenciados Wnt1 o Wnt3a.
Ejemplo Comparativo 7
Futrina 1 (R-espondina 2) activa los marcadores neurales y regula (promueve) la formación de músculo
El análisis de la pérdida de función en embriones de Xenopus demuestra que se requiere Futrina 1 para la formación de músculo. Inyecciones de oligomorfolino antisentido contra Futrina 1 (Fut1-Mo) causan regulación decreciente de los marcadores precoces de músculo MyoD y Myf5 e inducen defectos musculares (Figura 10A). La especificidad de este efecto fue documentada en primer lugar por la capacidad de Fut1-Mo para inhibir la traducción del constructo de DNA cognado cuando se sobre-expresaba en embriones (Figura 10B) y, en segundo lugar, por la capacidad del mRNA de Xfut1 para rescatar el efecto de Fut1-Mo (Figura 10C).
Cuando el camino Wnt/∀-catenina se sobreactiva en embriones de Xenopus, se observan una diversidad de respuestas: i) la inyección de mRNA de activadores del camino induce típicamente los ejes embrionarios secundarios en los embriones enteros y los marcadores neurales anteriores en el casquillo animal y los embriones enteros; ii) la inyección de DNA de activadores del camino que impulsan la expresión después de MBT, posterioriza el sistema nervioso central (CNS). Para testar si Rspo2 es capaz de mimetizar cualquiera de estos efectos, se microinyectó mRNA sintético en embriones de Xenopus. No obstante, la inyección de mRNA de Rspo2 no induce los ejes secundarios en los embriones enteros y la inyección de DNA de pCS-Rspo2 no posterioriza el CNS, dado que las cabezas son de tamaño normal, la expresión de Otx2 se expande y en2 no se ve afectado (Figura 11D, H).
En el casquillo animal, Rspo2 induce los marcadores pan-neurales NCAM y N-tubulina y el marcador neural anterior, Otx2, como lo hacen XWnt8 y ∀-catenina (Figura 11A). Análogamente, en los embriones enteros inyectados con mRNA de Rspo2, se observan glándulas de cemento ectópicas y expansión lateral de la placa neural en el lado inyectado, como se muestra por la expresión de los marcadores neurales Sox3, Otx2, not2, en2 y Rx1 (Figuras 11 B-H). La expresión ectópica de Otx2 se observa ya en los embriones de la etapa gastrular (Figura 11I+J). Estos resultados son consistentes con la capacidad de la señalización Wnt/∀-catenina para bloquear la expresión de BMP4 y activar con ello el desarrollo neural.
Para analizar ulteriormente el efecto de la sobre-expresión de mRNA de Rspo2 y la señalización por BMP4, Activina, Nodal y FGF, se llevaron a cabo ensayos del casquillo animal y se testaron respecto a la inducción de genes diana por señales de tres factores de crecimiento (Figura 12). Rspo2 bloquea como era de esperar la
expresión de Xvent2 mediada por BMP4, pero inhibe también sorprendentemente la inducción de Xbra mediada por Activina y Nodal (Figuras 12A-C). Esto es contrario a las inyecciones de mRNA de XWnt8 y ∀-catenina, que no afectan a la inducción de Xbra por Activina (Figura 12B). En contraste con la señalización por tres factores de crecimiento del tipo TGF-∀, la expresión de Xbra inducida por FGF8 no se ve afectada por el Rspo2 sobre-expresado (Figura 12D). Puede llegarse a la conclusión de que la sobre-expresión de Rspo2, además de activar el camino Wnt/∀-catenina es capaz también de interferir con la señalización por tres factores de crecimiento de la familia TGF∀.
Otro efecto bien conocido de la señalización cigótica Wnt/∀-catenina es su capacidad para promover la miogénesis. Por ejemplo, XWnt8 puede inducir la formación de músculo en las células mesodérmicas ventrales. Cuando las zonas ventrales marginales (VMZs) de embriones inyectados con Rspo2 se disecan y se cultivan hasta la etapa 40, se alargan, forman estructuras semejantes a colas, y son contráctiles. Este fenotipo es indistinguible de los explantes de zona marginal lateral (LMZs) de control, que diferencian típicamente el músculo (Fig. 4 K-L). La hibridación in situ confirmó la inducción de actina muscular en VMZs inyectadas tanto con Wnt8 como con Rspo2, pero no en las VMZs de control (inyectadas con preprolactina) (Figura 11M). Dado que las R-espondinas son capaces de aumentar la señalización Wnt en células 293T, se testó su cooperación en la miogénesis de Xenopus. Myf5 es un marcador miogénico expresado característicamente en el mesodermo lateral. No obstante, el mismo está excluido del mesodermo dorsal, y los explantes de zona dorsal marginal (DMZ) expresan solamente una pequeña cantidad de myf5 como se determina por RT-PCR (Figura 11N). En los DMZs de embriones inyectados con constructos de DNA que dirigen la expresión posterior de MBT, myf5 es débilmente inducido por Rspo2, moderadamente por Wnt8 y fuertemente por su combinación (Figura 11N, arriba). El efecto promotor de la miogénesis de Rspo2 es reprimido por los dominantes negativos dishevelled (Xdd1), dkk1 y GSK-3∀, que bloquean todos ellos la señalización Wnt (Figura 11N, abajo). En resumen, los resultados sugieren que Rspo2 puede promover la miogénesis por la vía del camino Wnt/∀-catenina.
Ejemplo Comparativo
Se requiere R-espondina2 para la miogénesis mediada por Wnt/ -catenina
Para investigar el papel fisiológico de Rspo2 durante la embriogénesis de Xenopus, se inyectaron morfolino-oligonucleótidos antisentido (Rspo2Mo). La capacidad de Rspo2Mo para bloquear la producción de la proteína Rspo2 se demuestra por transferencia Western (Figura 13A). La inyección de este morfolino en un blastómero dorso-animal en la etapa de ocho células da como resultado defectos en los ojos, aunque la expresión de marcadores precoces de ojo (Rx1, Pax6), neurales anteriores (Otx2) y pan-neurales (Sox3) no se ve afectada obviamente (no representado).
La inyección ecuatorial de Rspo2Mo en un blastómero en la etapa de ocho células conduce a defectos musculares en el lado inyectado (Figura 13B). La hibridación in situ para actina muscular y las secciones transversales de tronco demuestran que la inyección de Rspo2Mo causa somitos desorganizados (paneles a-b) y miotomos reducidos (paneles c-d). Los experimentos de seguimiento del linaje demostraron que las células inyectadas con Rspo2Mo contribuyen al mesodermo de la placa lateral en lugar de somitos o sufren una muerte celular (datos no mostrados). En la etapa gastrular, la expresión de los marcadores miogénicos myf5 y myoD se ve fuertemente regulada en sentido decreciente en el lado inyectado con Rspo2Mo (paneles e-h), mientras que el marcador pan-mesodérmico Xhra y el marcador organizador Xnot2 no se ven afectados (paneles i-i).
Para testar la especificidad de Rspo2Mo, se realizaron experimentos de rescate por co-inyección de Rspo2Mo junto con un RNA de Rspo2, en el cual seis nucleótidos no codificantes estaban mutados de tal modo que el mismo no podría ser direccionado por este morfolino. La expresión de myf5 (Figura 13C) y myoD (datos no mostrados) es rescatada eficazmente por este RNA mutante de Rspo2, lo que indica que el efecto de Rspo2Mo en la miogénesis es específico.
Se utilizó Rspo2Mo como herramienta para examinar la posición epistática de Rspo en el camino Wnt/∀-catenina. Como indicador de la señalización para Wnt/∀-catenina, se utilizó la expresión de myf5 y actina muscular en explantes de la zona marginal (Figura 13D). En los explantes DMZ y VMZ, el DNA de Wnt8 induce myf5 y actina muscular, y esta inducción es bloqueada significativamente por Rspo2Mo (Figura 13D, paneles a-b, pistas 3-4). Sin embargo, la inducción de myf5 y actina muscular por los activadores intracelulares del camino Wnt como dishevelled, dnGSK-3∀ y ∀-catenina no se ve afectada por Rspo2Mo (a-b, pistas 5-10). En los explantes LMZ, la inyección de Rspo2Mo regula decrecientemente la expresión endógena de myf5 y actina muscular (Figura 13B, paneles c-d, pistas 1-2). En las co-inyecciones de DNA, este efecto es rescatado eficazmente por ∀-catenina, pero sólo débilmente por XWnt8 (pistas 3-6). El efecto residual de xWnt8 es debido probablemente a su acción no autónoma de las células y las células que no recibieron Rspo2Mo. Considerados en su conjunto, estos resultados indican que Rspo2 afecta al camino Wnt/∀-catenina al nivel o aguas arriba de dishevelled.
Ejemplo 9
Las R-espondinas son necesarias para la señalización Wnt/∀-catenina en células HeLa
A continuación, se testó el requerimiento de Rspo2 para la señalización Wnt en células de mamífero utilizando
siRNA. Dado que existen cuatro R-espondinas con función aparentemente redundante, se seleccionaron células HeLa, que expresan únicamente Rspo3 y muy débilmente Rspo2 (Figura 14A). Diversas otras líneas de células, tales como células 293T, expresan los cuatro genes, complicando un enfoque de siRNA.
El silenciamiento de genes mediado por siRNA se llevó a cabo por transfección de constructos pSUPER (Brummelkamp et al., Science 296 (2002), 3286-3305) para producir siRNAs direccionados contra Rspo2 y -3 (siRNA Rspo2,3). Como control, se utilizó un siRNA sin sentido. Para testar la eficiencia del siRNA, Rspo3 humano marcado con FLAG se co-transfectó con siRNAs, y su producción fue reprimida por Rspo3 de siRNA, pero no por el Rspo2 de siRNA (Figura 14B).
En los ensayos del informador Wnt, los dos Rspo2 y -3 de siRNA disminuían la actividad de luciferasa inducida por Wnt3a comparados con el siRNA de control (Figura 14C). Cuando se co-transfectan Rspo2 y -3 de siRNA, la actividad del informador disminuye al 40%. Este efecto es específico, dado que la señalización Wnt reducida puede ser rescatada por el Rspo2 co-transfectado de ratón, que no es direccionado por siRNAs contra las R-espondinas humanas (Figura 14C). Adicionalmente, al contrario que la actividad del informador inducida por Wnt3a, Rspo2 + 3 de siRNA no afectan a la señalización Wnt/∀-catenina inducida por Li+ (Figura 14D). Dado que Li+ actúa por inhibición de la actividad de GSK3∀, esto es de nuevo consistente con la acción de Rspo2 al nivel o aguas arriba de dishevelled, llegándose a la conclusión de que en las células HeLa son necesarias las R-espondinas para la señalización total Wnt/∀-catenina.
Ejemplo 10
La expresión de futriría está desregulada en los tumores humanos
La regulación incorrecta de la señalización Wnt/∀-catenina está implicada en la tumorigénesis, v.g., cáncer de colon, cáncer de mama y melanoma (Barker et al., 2000; Bienz y Clevers, 2000; Polakis, 2000). Dado que las Respondinas (futrinas) promueven la señalización Wnt/∀-catenina, las mismas pueden jugar también un papel en la tumorigénesis. Así, la expresión de Futrina 1-4 en diversos tejidos humanos normales y cancerosos se estudió utilizando hibridación radiactiva en el sistema Clontech Cancer Profiling Array II. Se utilizó para la normalización la hibridación con la sonda ubiquitina. Los resultados demuestran que la expresión de las Futrinas 1-3 está desregulada drásticamente en los tejidos cancerosos humanos (Figura 15). En la mayoría de los tumores, la expresión de Futrinas 1-3 está desregulada drásticamente (tumores de colon, estómago, pulmón, recto para Futrina 1, tumores de mama, ovario, vejiga, útero, cérvix y recto para Futrina 2, tumores de útero y cérvix para Futrina 3). En un pequeño número de casos, la expresión de Futrinas 1-3 está regulada en sentido creciente (un caso de tumor de estómago para Futrinas 1 y 2, y tumor de ovario para Futrina 3). La Futrina 4 exhibe un nivel de expresión muy bajo en la mayoría de los tejidos estudiados, excepto en el ovario. Resultados adicionales se muestran en la Figura 16, indicando también que HRspo1 está expresado débilmente en los órganos adultos. El mismo exhibe regulación creciente en los tumores de ovario de dos pacientes y en una sola muestra de tumor de estómago. HRspo2 se expresa en órganos de origen endodérmico, con inclusión de colon, recto, intestino delgado y pulmón. Su expresión disminuía en las muestras de tumor correspondientes. HRspo3 se expresa ampliamente y disminuye en muchas muestras de tumor. En general, la expresión de hRspo1-3 está desregulada en numerosos tumores, mientras que la expresión de hRspo4 es muy débil tanto en los órganos adultos como en los tumores humanos (datos no mostrados).
En lo que sigue se describen otros aspectos como parte de la memoria descriptiva:
1. Una composición de diagnóstico, que comprende:
(a)
al menos una molécula de ácido nucleico que comprende la secuencia de
nucleótidos que codifica Futrina 1, 2, 3 ó 4 según se representa en la Figura 3; y/o
(b)
al menos una molécula de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos
que codifica Futrina 1, 2, 3 ó 4 según se representa en la Figura 4 ó 6a ; y/o
(c)
al menos una molécula de ácido nucleico, cuya hebra complementaria se híbrida a
una molécula de ácido nucleico de (a) y que codifica un polipéptido con la actividad
biológica de Futrina 1, 2, 3 ó 4; y/o
(d)
al menos un fragmento de (a), (b) o (c) que tiene la actividad biológica de Futrina 1,
2, 3 ó 4;
(e)
al menos una molécula de ácido nucleico, cuya secuencia difiere de la secuencia de la molécula de ácido nucleico de (a), (c) o (d) debido a la degeneración del código genético, y/o
45 (f) al menos un ligando que es capaz de fijarse específicamente a la molécula de (a), (b), (c), (d) o (e).
2.
La composición de diagnóstico del objeto 1, en donde el ligando es un anticuerpo.
3.
La composición de diagnóstico del objeto 1, en donde la molécula de ácido nucleico de la parte (d) tiene una longitud de al menos 10 nucleótidos.
4.
La composición de diagnóstico de los objetos 1 ó 2, en donde el ligando está marcado de manera detectable.
5.
La composición de diagnóstico del objeto 4, en donde el marcador se selecciona del grupo que consiste en un radioisótopo, un compuesto bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, un compuesto fluorescente, un quelato de metal o una enzima.
6.
La composición de diagnóstico de uno cualquiera de los objetos 1 a 3, en donde la molécula de ácido nucleico, el polipéptido o el ligando están fijados a un soporte sólido.
7.
Uso de una molécula de ácido nucleico, polipéptido y/o ligando para la preparación de una composición de diagnóstico según se define en cualquiera de los objetos 1 a 6, para la diagnosis de una enfermedad asociada con
(a) la expresión aberrante de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y/o (b) las actividades o cantidades aberrantes de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4.
8.
Uso de acuerdo con el objeto 7, en donde la diana a la que se hibrida la molécula de ácido nucleico es un mRNA.
9.
Un método de diagnosis de una enfermedad asociada con (a) la expresión aberrante de Futrina 1, 2, 3 ó 4 y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3, ó 4 en un individuo, que comprende:
(a)
determinar (a) la cantidad de expresión de Futrina 1, 2, 3 ó 4 y/o (b) la cantidad de polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 biológicamente activo en una muestra biológica; y
(b)
diagnosticar una enfermedad asociada con (a) la expresión aberrante de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o un riesgo para el desarrollo de dicha enfermedad basado en una cantidad de expresión alterada de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y/o (b) una cantidad alterada de polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 biológicamente activo comparadas con un control.
10.
Un método para identificar una pareja de fijación a un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, que comprende:
(a)
poner en contacto dicho polipéptido con un compuesto a cribar; y
(b)
determinar si el compuesto efectúa una actividad de dicho polipéptido o si se ha producido la fijación del compuesto a dicho polipéptido.
11.
Un método de identificación de activadores/agonistas o inhibidores/antagonistas de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, que comprende los pasos de:
(a)
incubar un compuesto candidato con dicho polipéptido;
(b)
ensayar una actividad biológica, y
(c)
determinar si se ha alterado una actividad biológica de dicho polipéptido.
12.
Un método de identificación y obtención de un fármaco candidato para la terapia de una enfermedad asociada con (a) una expresión aberrante del gen que codifica Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, que comprende los pasos de:
(a)
poner en contacto un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o una célula que expresa dicho polipéptido, y opcionalmente el o los ligandos correspondientes, en presencia de componentes capaces de proporcionar una señal detectable en respuesta a la fijación a dicho fármaco candidato a cribar; y
(b)
detectar la presencia o ausencia de una señal o el aumento de la señal generada, en donde la presencia o aumento de la señal es indicativa de un fármaco supuesto.
13.
Un activador/agonista o inhibidor/antagonista de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o pareja de fijación de dicho o dichos polipéptidos, obtenible mediante el método de uno cualquiera de los objetos 10 a 12.
14.
Una composición farmacéutica que comprende un compuesto que es capaz de modular la expresión de un gen que codifica Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o la actividad de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y un excipiente, diluyente o vehículo farmacéuticamente aceptable.
15.
La composición farmacéutica del objeto 14, en donde el compuesto estimula la expresión del gen que codifica Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o la actividad de Futrina 1, 2, 3 y/o 4.
16.
La composición farmacéutica del objeto 15, en donde el compuesto es una molécula de nucleótido que codifica un polipéptido que tiene una actividad biológica de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, un
5 activador/agonista o inhibidor/antagonista de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o pareja de fijación de dicho o dichos polipéptidos, obtenible mediante el método de uno cualquiera de los objetos 10 a 12.
17. Uso de un compuesto según se define en el objeto 16, para la preparación de una composición farmacéutica para el tratamiento de una enfermedad asociada con (a) la expresión aberrante de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 y/o un gen implicado en la cascada de señales de Wnt y/o (b) actividades o cantidades aberrantes de una Futrina 1, 2, 3 y/o 4
10 y/o un polipéptido implicado en la cascada de señales de Wnt.
18.
Uso de acuerdo con los objetos 7 ó 17, en donde la enfermedad es un tumor o una enfermedad de los riñones, músculo, huesos y ojos.
19.
Uso de una molécula de nucleótido que codifica un polipéptido que tiene una actividad biológica de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4, un activador/agonista de un polipéptido de Futrina 1, 2, 3 y/o 4 o
15 pareja de fijación de dicho o dichos polipéptidos, para la preparación de una composición farmacéutica para activar o inhibir la cascada de señales de Wnt.
20. Uso de acuerdo con el objeto 19 para soportar procesos regenerativos. LISTADO DE SECUENCIAS
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<210> 1 35 <211> 22
<212> DNA
<213> artificial
<220> 40 <223> oligonucleótido Rspo2Mo
<400> 1
5
<210> <211> <212> <213> 2 19 DNA artificial
10
<220> <223> <400> oligonucleótido Rspo2 humano antisentido 2
15
<210> <211> <212> <213> 3 19 DNA artificial
20
<220> <223> <400> oligonucleótido Rspo3 antisentido 3
25
<210> <211> <212> <213> 4 19 DNA artificial
30
<220> <223> oligonucleótido control sin sentido
<400>
4
35 <210> 5
<211> 20
<212> <213>
DNA artificial
5
<220> <223> Rspo2 cebador directo
<400>
5
10
<210> <211> <212> <213> 6 20 DNA artificial
15
<220> <223> Rspo2 cebador inverso
<400>
6
20 25
<210> <211> <212> <213> <220> <223> 7 21 DNA artificial Rspo3 cebador directo
<400>
7
30
35
<210> <211> <212> <213> 8 22 DNA artificial
<220>
<223>
Rspo3 cebador inverso
<400>
8
10
<210> <211> <212> <213> 9 21 DNA artificial
<220> <223>
Rspo1 cebador humano directo
15
<400> 9
20
<210> <211> <212> <213> 10 19 DNA artificial
25
<220> <223> <400> Rspo1 cebador humano inverso 10
30
<210> <211> <212> <213> 11 19 DNA artificial
35
<220> <223> Rspo2 cebador humano directo
<400> 11
5
<210> <211> <212> <213> 12 21 DNA artificial
10
<220> <223> Rspo2 cebador humano inverso
<400>
12
15
<210> <211> <212> <213> 13 19 DNA artificial
20
<220> <223> Rspo3 cebador humano directo
<400>
13
25
<210>
14
<211>
19
<212>
DNA
<213>
artificial
30
<220>
<223>
Rspo3 cebador humano inverso
<400>
14
5
<210> <211> <212> <213> <220> <223> 15 19 DNA artificial Rspo4 cebador humano directo
<400>
15
10
15
<210> <211> <212> <213> 16 K3195.txt 19 DNA artificial
<220> <223>
Rspo4 cebador humano inverso
20
<400> 16
25
<210> <211> <212> <213> 17 19 DNA Homo sapiens
<400>
17
30
<210>
18
<211>
19
<212>
DNA
<213>
Homo sapiens
35
<400>
18
5
<210> <211> <212> <213> 19 19 DNA artificial
10
<220> <223> <400> secuencia sin sentido de constructo psuper 19
15
<210> <211> <212> <213> 20 843 DNA Homo sapiens
<400>
20
5
<210> <211> <212> <213> 21 732 DNA Homo sapiens
<400>
21
10
<210> <211> <212> <213> 22 819 DNA Homo sapiens
15
<400> 22
5
<210> <211> <212> <213> 23 672 DNA Homo sapiens
<400>
23
<210>
24
<211>
732
<212>
DNA
<213>
Xenopus sp.
5
<400>
24
10
<210> <211> <212> <213> 25 262 PRT Homo sapiens
<400>
25
<210>
26
<211>
243
<212>
PRT
<213>
Homo sapiens
5
<400>
26
<210>
27
<211>
272
<212>
PRT
<213>
Homo sapiens
5
<400>
27
5
<210> <211> <212> <213> 28 224 PRT Homo sapiens
<400>
28
5
<210> <211> <212> 29 262 PRT
35
<213> Homo sapiens
<400> 29
5
<210> <211> <212> <213> 30 243 PRT Homo sapiens
<400>
30
<210>
31
<211>
272
<212>
PRT
<213>
Homo sapiens
5
<400>
31
5
<210> <211> <212> <213> 32 224 PRT Homo sapiens
<400>
32

Claims (12)

  1. REIVINDICACIONES
    1.-Uso de una molécula nucleotídica que codifica un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 para la
    preparación de una composición farmacéutica para activación de la cascada de señales Wnt.
    5 2.- Uso de un ligando que se fija específicamente a un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 para la preparación de una composición farmacéutica para inhibir la cascada de señales Wnt, en donde el ligando es un anticuerpo.
  2. 3.- Uso de un ligando que se fija específicamente a un ácido nucleico que codifica un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 para la preparación de una composición farmacéutica para inhibir la cascada de señales
    10 Wnt, en donde el ligando es una molécula de nucleótido que se fija a un ácido nucleico de Futrina 2 que codifica un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27.
  3. 4.- Uso de acuerdo con la reivindicación 2, en donde el ligando es un anticuerpo monoclonal.
  4. 5.- Uso de acuerdo con la reivindicación 4, en donde el anticuerpo es un anticuerpo quimérico, de cadena sencilla y/o humanizado.
    15 6.- Uso de acuerdo con la reivindicación 1 para soportar procesos regenerativos.
  5. 7.- Uso de acuerdo con la reivindicación 1 para promover el crecimiento de músculo.
  6. 8.- Uso de acuerdo con la reivindicación 2 ó 3 para uso en el tratamiento de tumores.
  7. 9.- Uso de acuerdo con la reivindicación 8, para uso en el tratamiento de tumores de mama, ovario, hígado, cérvix, colon, pulmón, recto, testículos, páncreas, hueso y piel.
    20 10.- Uso de acuerdo con la reivindicación 1, 2 ó 3, para modular la formación de hueso.
  8. 11.- Un método para identificar activadores/agonistas o inhibidores/antagonistas de un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 o un polipéptido que muestra una identidad de al menos 80% con el mismo, que comprende los pasos de:
    (a) incubar un compuesto candidato con dicho polipéptido;
    25 (b) ensayar la actividad biológica de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 o un polipéptido que muestra una identidad de al menos 80% con el mismo, en un ensayo de informadores de luciferasa inducibles por Wnt en células HEK 293 transfectadas, y
    (c) determinar si se ha alterado la actividad biológica de dicho polipéptido.
  9. 12. Un método para identificar y obtener un fármaco candidato para la terapia de una enfermedad asociada con
    30 actividades aberrantes de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 o un polipéptido que muestra una identidad de al menos 80% con el mismo, que comprende los pasos de:
    (a) poner en contacto un polipéptido de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº: 27 o un polipéptido que muestra una identidad de al menos 80% con el mismo o una célula que expresa dicho polipéptido, y opcionalmente el o los ligandos correspondientes, en presencia de componentes capaces de
    35 proporcionar una señal detectable en respuesta a la fijación a dicho fármaco candidato a cribar; y
    (b) detectar la presencia o ausencia de una señal o el aumento de la señal generada, en donde la presencia o aumento de la señal es indicativa de un fármaco supuesto.
    en donde la actividad de Futrina 2 de acuerdo con SEC ID Nº 27 o un polipéptido que muestra una identidad de al menos 80% con el mismo es analizado por un ensayo de informadores de luciferasa
    40 indubles por Wnt en células HEK 293 transfectadas.
  10. 13.- El método de acuerdo con la reivindicación 12, en el que el fármaco candidato es un solo compuesto o una pluralidad de compuestos.
  11. 14.- El método de acuerdo con las reivindicaciones 12-13, en el que el compuesto se sintetiza químicamente, se produce por microbiología y/o está comprendido en extractos de células
    45 15.- El método de acuerdo con la reivindicación 11, en el que los activadores/agonistas o inhibidores/antagonistas se seleccionan de anticuerpos, oligonucleótidos, proteínas o moléculas pequeñas.
  12. 16.- El método de acuerdo con las reivindicaciones 12-14, en el que la enfermedad es un tumor o una enfermedad
    de los riñones, músculos, huesos y ojos.
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