ES2622703T3 - Nuevos compuestos de estructuras miméticas de código inverso y uso de los mismos - Google Patents

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Abstract

Un compuesto seleccionado del grupo que consiste en:**Fórmula**

Description

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Nuevos compuestos de estructuras mimeticas de codigo inverso y uso de los mismos Campo tecnico
La presente invencion se refiere de forma general a nuevos compuestos de estructuras mimeticas de codigo inverso que se pueden usar para tratar o prevenir una leucemia mieloide aguda.
Tecnica antecedente
El cribado aleatorio de moleculas para determinar su posible actividad como agente terapeutico se ha realizado durante muchos anos y ha dado como resultado el descubrimiento de importantes farmacos. Aunque los avances en la biologfa molecular y en la qmmica computacional han suscitado mayor interes en los que se denomina "diseno racional de farmacos", dichas tecnicas no han demostrado ser tan rapidas o fiables como se predijo inicialmente. Asf pues, en los ultimos anos se ha producido un interes renovado y una vuelta al cribado aleatorio de farmacos. Para este fin, se han realizado avances especiales en nuevas tecnologfas basadas en el desarrollo de bibliotecas de qmmica combinatoria, y el cribado de dichas bibliotecas en la busqueda de elementos biologicamente activos.
Inicialmente, las bibliotecas de qmmica combinatoria estaban limitadas de forma general a los miembros de origen peptido o nucleotido.
Aunque las bibliotecas combinatorias que contienen miembros de origen peptido o nucleotido tienen un valor significativo, sigue existiendo una necesidad en la tecnica de bibliotecas que contienen miembros de origen diferente. Por ejemplo, las bibliotecas peptfdicas tradicionales, en gran medida, se limitan a variar la secuencia de aminoacidos para generar los miembros de la biblioteca. Aunque es bien reconocido que las estructuras secundarias de los peptidos son importantes para la actividad biologica, dichas bibliotecas de peptidos no transmiten una estructura secundaria con restricciones a los miembros de su biblioteca.
Para este fin, algunos investigadores han ciclado peptidos con puentes disulfuro en un intento de proporcionar una estructura secundaria mas limitada (Tumelty et al., J. Chem. Soc. 1067-68, 1994; Eichler et al., Peptide Res. 7:300306, 1994). No obstante, dichos peptidos ciclados siguen siendo generalmente bastante flexibles y estan poco biodisponibles, y de esta forma solo han encontrado un exito limitado.
Mas recientemente, se han desarrollado compuestos no peptfdicos que imitan mas estrechamente la estructura secundaria de codigo inverso que se encuentran en las protemas o los peptidos biologicamente activos. Por ejemplo, la patente de EE.UU. n.° 5.440.013 de Kahn y las solicitudes con numeros WO 94/03494, WO 01/00210A1, y Wo 01/16135A2 de Kahn divulgan, cada una de ellas, compuestos no peptfdicos limitados conformacionalmente, que imitan la estructura tridimensional del codigo inverso. Ademas, la patente de EE.UU. n.° 5.929.237 y su continuacion parcial en la patente de Estados Unidos n.° 6.013.458, ambas de Kahn, divulgan compuestos conformacionalmente limitados que imitan la estructura secundaria de las regiones de codigo inverso de los peptidos y las protemas biologicamente activos. La smtesis y la identificacion de estructuras mimeticas de codigo inverso conformacionalmente limitadas y su aplicacion a enfermedades se revision ampliamente en Obrecht (Advances in Med. Chem., 4,1-68, 1999).
Aunque se han realizado avances significativos en la smtesis e identificacion de estructuras mimeticas de codigo inverso conformacionalmente limitadas, sigue existiendo una necesidad en la tecnica de moleculas pequenas que imitan la estructura secundaria de peptidos.
Entretanto, un protooncogen es un gen normal que puede convertirse en un oncogen debido a mutaciones o aumento de la expresion. c-Myc (MYC) se conoce como uno de los protooncogenes, y la desregulacion de la c-Myc se considera una de una serie de eventos oncogenicos necesarios para la tumorigenesis en mairnferos (Pelengaris S, Khan M. The many faces of c-MYC. Arch Biochem Biophys. 2003; 416:129-136). La desregulacion de MYC, mediante una variedad de mecanismos, tambien se encontro asociada con las leucemias mieloides (Hoffman B, Amanullah A, Shafarenko M, Liebermann DA. The proto-oncogene c-myc in hematopoietic development and leukemogenesis. Oncogene. 2002; 21: 3414-3421). Ademas, se descubrio que c-Myc induce rapidamente leucemia mieloide aguda (Hui Luo et al. "c-Myc rapidly induces acute myeloid leukemia in mice without evidence of lymphoma- associated antiapoptotic mutations", Blood, 1 de octubre de 2005, volumen 106, Numero 7, pp 2452~2461).
Como c-Myc puede estar regulada en exceso en la leucemia mieloide aguda, se ha estudiado la funcion oncogenica de c-Myc y se ha estudiado su papel exacto en la leucemogenesis mieloide. Recientemente, algunos cientfficos han descubierto que Myc estimula preferentemente el crecimiento de celulas progenitoras mieloides en metil celulosa, y mostraron que Myc es un efector fundamental posterior en la leucemogenesis mieloide (ibid.).
El hallazgo de que c-Myc desempena un papel fundamental en la leucemogenesis mieloide indica que, mediante la inhibicion de la activacion de la protema c-Myc, se puede curar o prevenir la leucemia mieloide aguda.
Por otro lado, las enzimas de la superfamilia del citocromo P450 (CYP) son los principales determinantes de la
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semivida y realizan los efectos farmacologicos de muchos farmacos terapeuticos. La subfamilia 3A del citocromo P450 (CYP) humano incluye CYP3A4, que es el mas abundante en el hngado humano (~ 40%) y metaboliza mas del 50 % de los farmacos usados clmicamente (Shimada et al 1994; Rendic y Di Carlo 1997).
Debido al papel clave de CYP3A4 en el metabolismo de los farmacos, una inactivacion significativa de esta enzima podna dar como resultado importantes interacciones farmacocineticas entre farmacos. La inhibicion de CYP3A4 puede ocasionar una toxicidad a farmacos grave debido a la exposicion potenciada de los farmacos administrados simultaneamente (Dresser et al 2000). Por ejemplo, cuando los inhibidores irreversibles de CYP3A4 tales como eritromicina o claritromicina se administran conjuntamente con terfenadina, astemizol, o pimozida, los pacientes pueden experimentar Torsades de pointes (una arritmia ventricular potencialmente mortal asociada con la prolongacion del intervalo QT) (Spinier et al 1995; Dresser et al 2000). Los pacientes de cancer, a veces, pueden tener multiples regfmenes de tratamiento, lo que aumenta el riesgo de interacciones entre farmacos, seguido por reacciones adversas contra farmacos.
Por lo tanto, durante el desarrollo de agentes terapeuticos, especialmente cuando se deben administrar combinados con otros farmacos, existe una necesidad de proporcionar compuestos que tengan menor actividad inhibidora de CYP3A4.
Con respecto al presente texto, tambien se refiere a los documentos US 2007/021425 A1, US 2007/021431 A1, y al documentos WO 2005/116032 A2, divulgan compuestos conformacionalmente limitados que imitan la estructura secundaria de las regiones de codigo inverso de los peptidos y las protemas biologicamente activos.
Divulgacion de la invencion
Problema tecnico
El objeto de la presente invencion es proporcionar compuestos novedosos que imitan la estructura secundaria de regiones de codigo inverso de peptidos y protemas biologicamente activos y que tienen actividad biologica tal como un efecto contra el cancer.
Otro objeto de la presente invencion es proporcionar compuestos novedosos que inhiben la senalizacion Wnt.
Otro objeto mas de la presente invencion es proporcionar compuestos novedosos que se puedan usar como compuestos farmaceuticos, en particular con menos actividad de inhibicion de CYP3A4 (mayor CI50).
Otro objeto mas de la presente invencion es proporcionar compuestos novedosos para un tratamiento o una prevencion de la leucemia mieloide aguda mediante la regulacion negativa en la expresion de c-Myc.
Solucion tecnica
La presente invencion se dirige a un compuesto seleccionado entre el grupo que consiste en
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Con respecto a la presente invencion, el presente texto describe de forma general un tipo novedoso de compuestos conformacionalmente limitados incluidos profarmacos de los mismos, que imitan la estructura secundaria de las regiones de codigo inverso de los peptidos y las protemas biologicamente activos. El presente texto tambien divulga bibliotecas que contienen estos compuestos, asf como la smtesis y cribado de los mismos.
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Los compuestos descritos en el presente documento tienen la siguiente Formula General (I):
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en la que E es -ZR3- o -(C=O)-, en el que Z es CH o N; W es -(C=O)NH-, -(C=O)O-, -(C=O)S-, -S(O)2- o un enlace; y cada uno de R1, R2, R3, R4 y R5 es igual o diferente y es independientemente un resto de cadena lateral de aminoacido o un derivado de cadena lateral de aminoacido. El compuesto mimetico de codigo inverso puede estar presente como un estereoisomero aislado o una mezcla de estereoisomeros o como una sal farmaceuticamente aceptable del mismo.
En determinadas realizaciones, R1 de los compuestos de Formula (I) es benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido.
En la siguiente descripcion detallada se proporcionan ejemplos espedficos de R1, R2, R3, R4 y R5.
En una realizacion en la que E es CHR3, los compuestos descritos en el presente documento tienen la siguiente Formula (II):
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en la que W es como se ha definido anteriormente, y Ri, R2, R3, R4 y R5 son como se definen en la siguiente descripcion detallada.
En determinadas realizaciones, los compuestos descritos en el presente documento tienen la siguiente Formula general (III):
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en la que Ri, R4, R6, Xi, X2, y X3 se definen en la siguiente descripcion detallada.
El presente texto tambien esta relacionado con presentes compuestos que utilizan las bibliotecas que contienen uno o mas compuestos de Formula (I). Un profarmaco esta disenado de forma tfpica para liberar el principio activo en el organismo durante o despues de la absorcion mediante hidrolisis enzimatica y/o qrnmica. El enfoque del producto es un medio eficaz de mejorar la biodisponibilidad oral o la administracion intravenosa de farmacos poco solubles en agua mediante derivatizacion qrnmica a compuestos mas solubles en agua. El enfoque de profarmaco mas utilizado para aumentar la solubilidad de farmacos que contienen un grupo hidroxilo en medio acuoso es producir esteres que contienen un grupo ionizable; por ejemplo, grupo fosfato, grupo carboxilato, grupo alquilamino (Fleisher et al., Advanced Drug Delivery Reviews, 115-130, 1996; Davis et al., Cancer Res., 7247-7253, 2002, Golik et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1837-1842, 1996).
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Los ejemplos del grupo funcional que puede liberarse en el organismo pueden incluir fosfato,
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y
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pero pueden usarse otros grupos funcionales cualesquiera que se usen convencionalmente como el grupo ionizable en un profarmaco.
En determinadas realizaciones, los profarmacos del presente texto tienen la siguiente Formula general (IV):
(III)-R7 (IV)
en la que (III) es la Formula (III) como se ha descrito anteriormente; uno de Ri, R4, R6, X1, X2, y X3 esta unido a R7 mediante Y; Y es un oxfgeno, azufre, o nitrogeno en Ri, R4, o R6, o un oxfgeno en Xi, X2, o X3; y R7 es hidroxialquilo, glicosilo, fosforiloximetiloxicarbonilo, piperidin carboniloxi sustituido o sin sustituir, o una sal del mismo; o Y-R7 es un resto de aminoacido, una combinacion de restos de aminoacido, fosfato, hemimalato, hemisuccinato, dimetilaminoalquilcarbamato, dimetilaminoacetato, o una sal del mismo; y cuando no estan unidos a R7: Ri, R4, Ra, Xi, X2, y X3 se definen en la siguiente descripcion detallada.
En determinadas realizaciones, los profarmacos del presente texto son capaces de servir como sustrato para una fosfatasa, una carboxilasa, u otras enzimas y por tanto se convierten en compuestos que tienen la Formula general (III).
El presente texto tambien se dirige a bibliotecas que contienen uno o mas compuestos de la Formula (I) anterior, asf como a procedimientos para sintetizar tales bibliotecas y procedimientos para cribar las mismas para identificar compuestos biologicamente activos.
En un aspecto relacionado, el presente texto proporciona ademas nuevos compuestos que tienen menos actividad inhibidora de CYP3A4. El presente texto tambien proporciona nuevos compuestos que tienen actividad inhibidora frente a la senalizacion de Wnt.
La presente invencion tambien se refiere a un compuesto de acuerdo con la presente invencion (como se ha descrito anteriormente) para su uso en un procedimiento de tratamiento o prevencion de leucemia mieloide aguda.
Efectos ventajosos
La presente invencion proporciona compuestos novedosos de estructuras mimeticas de codigo inverso. Los compuestos de la presente invencion muestran una actividad inhibidora de CYP3A4 (mayor CI50) que permite los compuestos como posibles productos farmaceuticos, especialmente cuando se deben administrar combinados con otros farmacos. Los compuestos de la presente invencion mostraron una importante actividad de inhibicion contra la senalizacion Wnt y los compuestos inhibieron el crecimiento de celulas cancerosas AML y se puede usar en el tratamiento o la prevencion de una leucemia mieloide aguda.
Breve descripcion de los dibujos
Se hara referencia ahora detalladamente a las realizaciones preferidas de la presente invencion, asf como a las realizaciones preferidas, con respecto a otros aspectos descritos en el presente texto, cuyos ejemplos se ilustran en los dibujos adjuntos a las mismas. Las realizaciones se describen a continuacion de tal forma que expliquen la presente invencion y aspectos adicionales relacionados con la misma por mencion de las figuras.
La Figura 1 proporciona un esquema sintetico general para preparar las estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en el presente documento.
La Figura 2 muestra un efecto de los compuestos de ensayo (Compuestos A y B) sobre la actividad de CYP3A4. El grafico se basa en la medicion de la CI50 de los Compuestos A y B de la presente invencion en un ensayo de inhibicion de CYP3A4, en el que la inhibicion de CYP3A4 se midio en varias concentraciones del compuesto para obtener el valor de la CI50. Los procedimientos detallados se divulgan en el Ejemplo 1.
La Figura 3 muestra los resultados de la medicion de la CI50 del Compuesto A para celulas SW480 en un bioensayo de gen indicador TopFlash.
La Figura 4 muestra la inhibicion del crecimiento de celulas cancerosas AML mediante los compuestos de
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ensayo de acuerdo con la concentracion de los compuestos de ensayo (Compuestos A y C).
Mejor modo para realizar la invencion
Como se usa en la memoria descriptiva, a menos que se especifique lo contrario, los siguientes terminos tienen el significado indicado:
"Amino" se refiere al radical -NH2.
"Amidino" se refiere al radical -C(=NH)-NH2. Uno o ambos hidrogenos del grupo amina del amidino pueden estar reemplazados por uno o dos grupos alquilo, tal como se definen en el presente documento. Los radicales de amidino derivatizados con al quilo tambien se denominan "alquilamindino" y "dialquilamidino", respectivamente.
"Ciano" se refiere al radical -CN.
"Carboxi" se refiere al radical -COOR, en el que R es hidrogeno o alquilo, tal como se definen en el presente documento.
"Acilo" se refiere al radical -COR, en el que R es alquilo, arilo, cicloalquilo, heterociclilo, tal como se definen en el presente documento. Por ejemplo, R puede ser metilo, butenilo, ciclopropilo, y similares. El alquilo o arilo puede estar opcionalmente sustituido con los sustituyentes que se han descrito para un alquilo o un arilo, respectivamente. Los grupos acilo ejemplares incluyen, sin limitacion, fenilacilo, bencilacilo, acilo C1-6 (por ejemplo, acetilo) y similares.
"Alquilsulfonato" se refiere al radical -S(O)2-OR, en el que R es alquilo, tal como se definen en el presente documento.
"Amidosulfonato" se refiere al radical -OS(O)2-NR2, cada R es independientemente hidrogeno o alquilo. Los amidosulfonatos ejemplares incluyen -OS(O)2NH2, -OS(O)2NHMe.
"Aminocarbonilo" se refiere al radical -C(O)NR2, cada R es independientemente hidrogeno, alquilo, amino, cicloalquilalquilo, heterociclilo, alcoxialquilo, hidroxialquilo, hidroxilo, alcoxi, arilalquilo, heterociclilalquilo, o dos R, junto con el atomo de nitrogeno al que estan unidos forman un heterociclilo, tal como se definen en el presente documento. Cuando uno de los R es hidrogeno, el otro R es alquilo C1-4, aminocarbonilo puede representarse por "alquilformamidilo C1-4".
"W-formamidilo" se refiere al radical -NHC(O)H.
"Fenilsulfonilo" se refiere al radical -S(O)2-R, en el que R es fenilo, el fenilo puede estar adicionalmente sustituido con alquilo o cloro.
"Fenilsulfonato" se refiere al radical -O-S(O)2-R, en el que R es fenilo, el fenilo puede estar adicionalmente sustituido con alquilo o cloro.
"Alquilsulfonilo" se refiere al radical -S(O)2-R, en el que R es alquilo, tal como se definen en el presente documento. Los radicales alquilsulfonilo ejemplares incluyen metilsulfonilo.
"Alquiltio" se refiere al radical -SR, en el que R es alquilo, tal como se definen en el presente documento.
"Ariltio" se refiere al radical -SR, en el que R es arilo, tal como se definen en el presente documento. El grupo arilo del ariltio puede estar adicionalmente sustituido con alquilo o cloro.
"Ariloxi" se refiere al radical -OR, en el que R es arilo, tal como se definen en el presente documento. El grupo arilo puede estar adicionalmente sustituido con alquilo, alcoxi y similares.
"Aciloxialquilo" se refiere al radical -R'-OC(O)-R, en el que R es alquilo, arilo, cicloalquilo, heterociclilo, como se define en el presente documento; y R' es un alquilo.
"Guanidino" se refiere al radical -NH-C(=NH)-NH2. Uno o ambos hidrogenos del grupo amina del guanidino pueden estar reemplazados por uno o dos grupos alquilo, tal como se definen en el presente documento. Los radicales de guanidina derivatizados con al quilo tambien se denominan "alquilguanidino" y "dialquilguanidino", respectivamente.
"Nitro" se refiere al radical -NO2.
"Alquilo" se refiere a un radical de cadena de hidrocarburo lineal o ramificada que consiste unicamente en atomos de carbono e hidrogeno, Un alquilo puede ser saturado (que contienen carbonos unidos entre sf unicamente mediante enlaces sencillos) o insaturados (que contienen carbonos unidos entre sf mediante al menos un doble enlace o un triple enlace). Un alquilo que tiene de uno a doce atomos de carbono tambien se denomina "restos alquilo de cadena inferior" y pueden representarse mediante "alquilo C1-12". En otras realizaciones, un alquilo puede comprender de uno a cuatro carbonos y puede representarse mediante "alquilo C1-4". En otras realizaciones, un alquilo puede comprender de dos a cinco carbonos y puede representarse mediante "alquilo C2-5". Un alquilo unido al resto de la
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molecula mediante un enlace sencillo. Los ejemplos de alquilos saturados incluyen, sin limitacion, metilo, etilo, n- propilo, 1-metiletilo (iso-propilo), n-butilo, n-pentilo, 1,1-dimetiletilo (f-butilo), 3-metilhexilo, 2-metilhexilo, y similares. Los ejemplos de alquilos insaturados incluyen, sin limitacion, etenilo (es decir, vinilo), prop-1-enilo (es decir, alilo), but-1-enilo, pent-1-enilo, penta-1,4-dienilo, etinilo (es decir, acitilenilo), prop-1-inilo y similares.
Un alquilo tambien puede ser un radical de anillo de hidrocarburo monodcilco o bidclico, que pueden incluir sistemas de anillo condensados o puenteados. Un alquilo dclico tambien se denomina "cicloalquilo". En determinadas realizaciones, un cicloalquilo puede comprender de tres a seis atomos de carbono y puede representarse mediante "cicloalquilo C3-6". Los ejemplos de radicales cicloalquilo monodclicos incluyen, por ejemplo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, cicloheptilo y ciclooctilo. Un cicloalquilo insaturado contiene un doble enlace endo (es decir, un doble enlace en el anillo). Los ejemplos de un cicloalquilo insaturado incluyen ciclohexenilo. Los ejemplos de radicales cicloalquilo bidclicos incluyen, por ejemplo, norbornilo (es decir, biciclo[2,2,1]heptilo), 7,7-dimetil-biciclo[2,2,1]heptilo, y similares.
A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el termino "alquilo" pretende incluir alquilo y "alquilo sustituido", que se refiere a un radical alquilo en el que uno o mas atomos de hidrogeno estan reemplazados por uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: acilo, amidino, alquilamidino, dialquilamidino, alcoxi, arilo, ciano, cicloalquilo, guanidino, alquilguanidino, dialquilguanidino halo, heterociclilo, hidrazinilo, hidroxilo, nitro, -OC(O)-R11, -N(R11)2, -C(O)OR11, -C(O)N(Rl11)2, -N(R11)C(O)OR1, -N(R11)C(O)R11, - N(R11)S(O)tR11 (donde t es 1 o 2), -S(O)tOR11 (donde t es 1 o 2), -S(O)pR11 (donde p es 0, 1 o 2), y -S(O)tN(R11)2 (donde t es 1 o 2) donde cada R11 es independientemente hidrogeno, alquilo, arilo, arilalquilo, heterociclilo o heterociclilalquilo, tal como se definen en el presente documento.
"Alcoxi" se refiere a un radical representado por la formula alquil-O-, en la que alquilo es como se define en el presente documento. La porcion de alquilo puede estar adicionalmente sustituida con uno o mas halogenos. Un alcoxi tambien puede representarse mediante el numero de carbonos en el grupo alquilo, por ejemplo, alcoxi C1-6 o alcoxi C1-3.
"Arilo" se refiere a un radical obtenido a partir de un sistema de anillo monodclico o bidclico mediante la retirada de un atomo de hidrogeno de un atomo de carbono del anillo. El sistema de anillo hidrocarburo aromatico monodclico o bidclico comprende de seis a doces atomos de carbono (es decir, arilo C6-12), en el que al menos uno de los anillos en el sistema de anillos esta totalmente insaturado, es decir, contiene un sistema de electrones n (4n+2) dclico deslocalizado de acuerdo con la teoria de Huckel. Opcionalmente, uno o dos atomos de anillo del arilo pueden ser heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, oxfgeno o azufre. Los ejemplos de radicales arilo incluyen, pero sin limitacion, fenilo y naftilo. A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el termino "arilo" pretende incluir arilo y "arilo sustituido", que se refiere a un radical arilo en el que uno o mas atomos de hidrogeno estan reemplazados por uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: alquilo, acilo, amidino, amidosulfonato, alcoxi, ariloxi, ciano guanidino, alquilguanidino, dialquilguanidino, halo, hidrazinilo, hidroxilo, nitro, heterociclilo, -OC(O)-R11, -N(R11)2, -C(O)OR11, -C(O)N(R11)2, -N(R11)C(O)OR11, -N(R11)C(O)R11, - N(R11)S(O)tR11 (donde t es 1 o 2), -S(O)tOR11 (donde t es 1 o 2), -S(O)pR11 (donde p es 0, 1 o 2), y -S(O)tN(R11)2 (donde t es 1 o 2) donde cada R11 es independientemente hidrogeno, alquilo, arilo, arilalquilo, heterociclilo o heterociclilalquilo.
"Arilalquilo" se refiere a un radical alquilo en el que uno o mas hidrogenos del alquilo estan reemplazados por uno o mas grupos arilo, tal como se definen en el presente documento. En diversas realizaciones, los arilalquilos incluyen de 7 a 15 carbonos y pueden representarse mediante arilalquilo C7-15. En determinadas realizaciones, arilalquilo es aril-alquilo C1-4, en el que un alquilo C1-4 esta sustituido con un arilo o dos grupos arilo, denominandose tambien este ultimo "diarilalquilo" o "bisarilalquilo". Los ejemplos de aril-alquilo C1-4 incluyen, pero sin limitacion, arilmetilo, ariletilo, arilpropilo, arilbutilo, bisarilmetilo, bisariletilo, bisarilpropilo, bisarilbutilo. Los radicales arilalquilo ejemplares incluyen, sin limitacion, bencilo, naftilmetilo, difenilmetilo, 3,3-bisfenilpropilo y similares. A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el termino "arilalquilo" pretende incluir arilalquilo y "arilalquilo sustituido", en el que la parte de alquilo y/o la parte de arilo del radical arilalquilo puede estar sustituida como se describe en el presente documento para el radical alquilo y el radical arilo, respectivamente.
"Cicloalquilalquilo" se refiere a un radical alquilo en el que uno o mas hidrogenos del alquilo estan reemplazados por uno o mas grupos c, tal como se definen en el presente documento. En determinadas realizaciones, cicloalquilalquilo es cicloalquil-alquilo C1-2, tal como cicloalquilmetilo, cicloalquiletilo y similares. Los radicales cicloalquilalquilo ejemplares incluyen, sin limitacion, ciclohexilalquilo (por ejemplo, ciclohexilmetilo y ciclohexiletilo) y ciclopentilalquilo (por ejemplo, ciclopentilmetilo y ciclopentiletilo) y similares. A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el termino "cicloalquilalquilo" pretende incluir cicloalquilalquilo y "cicloalquilalquilo sustituido", en el que la parte de alquilo y/o la parte de cicloalquilo del radical cicloalquilalquilo puede estar sustituida como se describe en el presente documento para el radical alquilo y el radical cicloalquilo, respectivamente.
"Glicosilo" se refiere a un radical mediante retirada del grupo hidroxilo de hemiacetal a partir de una forma dclica de un monosacarido (por ejemplo, glucosa), disacarido, oligosacarido (que comprende de tres a diez monosacaridos), o polisacarido (que comprende mas de diez monosacaridos).
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"Halo" o "halogeno" se refiere a radicales, cloro, bromo o yodo.
"Haloalquilo" se refiere a un radical alquilo, tal como se define en el presente documento, que esta sustituido con uno o mas radicales halo, tal como se definen en el presente documento. Los haloalquilos ejemplares incluyen, sin limitacion: trifluorometilo, difluorometilo, triclorometilo, 2, 2,2-trifluoroetilo, 1-fluorometil-2-fluoroetilo, 3-bromo-2- fluoropropilo, 1-bromometil-2-bromoetilo, y similares. Un alquilo sustituido con uno o mas fluor tambien se denomina "perfluoroalquilo", por ejemplo, "perfluoalquilo C1.4". La parte alquilo del radical haloalquilo puede estar opcionalmente sustituida como se define en el presente documento para un grupo alquilo.
"Heterociclilo" se refiere a un anillo heterodclico estable que comprende de dos a once atomos de carbono y de uno a tres heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, oxfgeno y azufre. En determinadas realizaciones, el heterociclilo contiene uno o dos heteroatomos. A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el radical heterociclilo puede ser un sistema de anillos monodciico o polidclico, que pueden incluir sistemas de anillo condensados o puenteados. En determinadas realizaciones, el heterociclilo puede ser un anillo monodclico de 5, 6 o 7 miembros. En otras realizaciones, el heterociclilo puede ser un anillo bidclico condensado de 8, 9, 10, 11 o 12 miembros. Los heteroatomos en el radical heterociclilo pueden estar opcionalmente oxidados. Uno o mas atomos de nitrogeno, si estan presentes, pueden estar opcionalmente cuaternizados. El radical heterociclilo puede ser no aromatico o aromatico (es decir, al menos un anillo en el radical heterociclilo tiene un sistema de electrones n (4n+2) deslocalizado de acuerdo con la teona de Huckel). El heterociclilo puede estar unido al resto de la molecula a traves de cualquier atomo del anillo o anillos. Los ejemplos de radicales heterociclilo no aromaticos incluyen, pero sin limitacion, dioxolanilo, decahidroisoquinolilo, imidazolinilo, imidazolidinilo, isotiazolidinilo, isoxazolidinilo, morfolinilo, octahidroindolilo, octahidroisoindolilo, 2-oxopiperazinilo, 2-oxopiperidinilo, 2-oxopirrolidinilo, oxazolidinilo, piperidinilo (tambien denominado "piperidilo"), piperazinilo, 4-piperidonilo, 3-pirrolinilo, pirrolidinilo, pirazolidinilo, quinuclidinilo, tiazolidinilo, tetrahidrofurilo, tritianilo, tetrahidropiranilo, tiomorfolinilo y tiamorfolinilo. Los ejemplos de radicales heterociclilo aromaticos incluyen, pero sin limitacion, azepinilo, acridinilo, bencimidazolilo, bencindolilo, 1,3- benzodioxolilo, benzofuranilo, benzooxazolilo, benzoisoxazolilo, benzo[d]tiazolilo, benzotiadiazolilo, benzo[b][1,4]dioxepinilo, benzo[b][1,4]oxazinilo, 1,4-benzodioxanilo, benzoxazolilo, benzodioxolilo, benzodioxinilo, benzopiranilo, benzopirazolilo, benzofuranilo, benzofuranonilo, benzotienilo (benzotiofenilo), benzotieno[3,2- d]pirimidinilo, benzotriazolilo, carbazolilo, cromona, cinolinilo, ciclopenta[d]pirimidinilo, dibenzofuranilo,
dibenzotiofenilo, furanilo, furanonilo, furo[3,2-c]piridinilo, isotiazolilo, imidazolilo, indazolilo, indolilo, indazolilo, isoindolilo, indolinilo, isoindolinilo, isoquinolilo, indolizinilo, isoxazolilo, 5,8-metano-5,6,7,8-tetrahidroquinazolinilo, naftiridinilo, 1,6-naftiridinonilo, oxadiazolilo, 2-oxoazepinilo, oxazolilo, oxiranilo, 5,6,6a,7,8,9,10,10a- octahidrobenzo[h]quinazolinilo, fenazinilo, fenotiazinilo, fenoxazinilo, ftalazinilo, pteridinilo, purinilo, pirrolilo, pirazolilo, pirazolo[3,4-d]pirimidinilo, piridinilo (tambien denominado piridilo), pirido[3,2-d]pirimidinilo, pirido[3,4-d]pirimidinilo, pirazinilo, pirimidinilo, piridazinilo, pirrolilo, quinazolinilo, quinoxalinilo, quinolinilo, isoquinolinilo, tetrahidroquinolinilo, 1,2,3,4-tetrahidrocarbazolilo, 5,6,7,8-tetrahidroquinazolinilo, tiazolilo, tiadiazolilo, triazolilo, tetrazolilo, triazin-2-ilo, tieno[2,3-d]pirimidinilo, tieno[3,2-d]pirimidinilo, tieno[2,3-c]pridinilo, y tiofenilo (es decir, tienilo). A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el termino "heterociclilo" pretende incluir heterociclilo y "heterociclilo sustituido", que se refiere a un radical heterociclilo sustituido con uno o mas sustituyentes seleccionados entre alquilo, acilo, oxo (por ejemplo, piridinonilo, pirrolidonilo), arilo, arilalquilo, aciloxialquilo, amidino, alcoxi, ciano, guanidino, alquilguanidino, dialquilguanidino halo, hidrazinilo, hidroxilo, nitro, -OC(O)-R11, -N(R11)2, - C(O)OR11, -C(O)N(R11)2, -N(Rfl)C(O)OR11, -N(Rfl)C(O)R, -N(R11)S(O)tR11 (donde t es 1 o 2), -S(O)tOR11 (donde t es 1 o 2), -S(O)pR11 (donde p es 0, 1 o 2), y -S(O)tN(R”)2 (donde t es 1 o 2), donde cada R11 es independientemente hidrogeno, alquilo, arilo, arilalquilo, heterociclilo o heterociclilalquilo.
"Heterociclilalquilo" se refiere a un radical alquilo en el que uno o mas hidrogenos del alquilo estan reemplazados por uno o mas grupos heterociclilo, tal como se definen en el presente documento. Si el heterociclilo es un heterociclilo que contiene nitrogeno, el heterociclilo puede estar unido al radical alquilo en el atomo de nitrogeno. En determinadas realizaciones, la parte alquilo del heterociclilalquilo contiene 1-4 atomos de carbono y puede representarse mediante heterociclil-alquilo C1-4. Los ejemplos de radicales heterociclilalquilo incluyen, sin limitacion, morfolinilalquilo, tal como morfolinilmetilo, piperidilalquilo, tal como piperidilmetilo, imidazolidinilalquilo, tal como imidazolidinilmetilo y similares. Los ejemplos adicionales de radicales heterociclilalquilo, en el que la parte heterociclilo es aromatica, incluyen, pero sin limitacion: piridilmetilo, piridiletilo, piridilpropilo, piridilbutilo, quinolinilmetilo, quinoliniletilo, quinolinilpropilo, quinolinilbutilo, indazolilmetilo, indazoliletilo, indazolilpropilo, indazolilbutilo, benzopirazolilmetilo, benzopirazoliletilo, benzopirazolilpropilo, benzopirazolilbutilo, isoquinolinilmetilo, isoquinoliniletilo, isoquinolinilpropilo, isoquinolinilbutilo, benzotriazolilmetilo, benzotriazoliletilo, benzotriazolilpropilo, benzotriazolilbutilo y similares. A menos que se indique espedficamente lo contrario en la memoria descriptiva, el termino "heterociclilalquilo" pretende incluir heterociclilalquilo y "heterociclilalquilo sustituido", en el que la parte alquilo y/o la parte heterociclilo del radical heterociclilalquilo puede estar sustituida como se describe en el presente documento para el radical alquilo y el radical heterociclilo, respectivamente.
Los compuestos, o sus sales farmaceuticamente aceptables pueden contener uno o mas centros asimetricos y por tanto pueden dar lugar a enantiomeros, diastereomeros, y otras formas estereoisomericas que pueden definirse, en cuanto a su estequiometna absoluta, como (R) o (S) o, como (D) o (L) para aminoacidos. Cuando los compuestos descritos en el presente documento contienen dobles enlaces olefrnicos u otros centros de geometna asimetrica, y a menos que se especifique otra cosa, se pretende que los compuestos incluyan tanto isomeros geometricos E como Z (por ejemplo, cis o trans). Del mismo modo, todos los isomeros posibles, asf como sus formas racemicas y
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opticamente puras, y todas las formas tautomericas tambien estan destinadas a estar incluidas en el presente texto.
Como se usa en el presente documento, "aminoacido" pretende incluir a-aminoacidos de origen natural y/o aminoacidos de origen no natural, tales como p-aminoacidos y homoaminoacidos. Los ejemplos de aminoacidos incluyen, pero sin limitacion: alanina, arginina, asparagina, acido aspartico, cistema, glutamina, acido glutamico, glicina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, prolina, serina, treonina, triptofano, tirosina, valina, fosfoserina, fosfotreonina, fosfotirosina, 4-hidroxiprolina, hidroxilisina, demosina, isodemosina, gamma- carboxiglutamato, acido hipurico, acido octahidroindol-2-carboxflico, estatina, acido 1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-3- carboxflico, penicilamina, ornitina, 3-metilhistidina, norvalina, beta-alanina, acido gamma-aminobutilico, cirtulina, homocistema, homoserina, metilalanina, para-benzoilfenilalanina, fenilglicina, propargilglicina, sarcosina, metioninsulfona, terc-butilglicina, 3,5-dibromotirosina y 3,5-diyodotirosina.
"Resto de amionoacido" o "resto de cadena lateral de aminoacido" se refiere a la porcion de un aminoacido que permanece despues de perder una molecula de agua (o alcohol) cuando el aminoacido se condensa con una molecula. Tfpicamente, un aminoacido se condensa con una molecula, incluyendo un compuesto de cualquiera de las Formulas (I)-(IV), mediante formacion de un enlace de peptido. En determinadas realizaciones, el grupo funcional de amino del aminoacido puede condensarse con un grupo de acido carboxflico o su equivalente reactivo (por ejemplo, antudrido carboxflico) de la molecula. En otras realizaciones, el grupo funcional de acido carboxflico del aminoacido puede condensarse con un grupo amina de la molecula. Tfpicamente, una molecula de agua se pierde durante la formacion del enlace de peptido. Los ejemplos de los "restos de aminoacido" o "resto de cadena lateral de aminoacido" incluyen, pero sin limitacion, restos de alanina, arginina, asparagina, acido aspartico, cistema, glutamina, acido glutamico, glicina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, prolina, serina, treonina, triptofano, tirosina, valina, fosfoserina, fosfotreonina, fosfotirosina, 4-hidroxiprolina, hidroxilisina, demosina, isodemosina, gamma-carboxiglutamato, acido hipurico, acido octahidroindol-2-carboxflico, estatina, acido 1,2,3,4- tetrahidroisoquinolin-3-carboxflico, penicilamina, ornitina, 3-metilhistidina, norvalina, beta-alanina, acido gamma- aminobutilico, cirtulina, homocistema, homoserina, metil-alanina, para-benzoilfenilalanina, fenilglicina,
propargilglicina, sarcosina, metionina sulfona, terc-butilglicina, 3,5-dibromotirosina, 3,5-diyodotirosina, treonina glicosilada, serina glicosilada, y asparagina flicosilada.
Un "derivado de cadena lateral de aminoacido" se refiere a un derivado de cualquier resto de cadena lateral de aminoacido como se describe en la Tabla 1. En determinadas realizaciones, el derivado de cadena lateral de aminoacido es alquilo, acilo, alcoxi, arilo, arilalquilo, heterociclilo, o heterociclilalquilo, tal como se definen en el presente documento.
[TABLA 1]
Resto de cadena lateral de aminoacidoAminoacido
-H
-CH3
-CH(CHs)2
-CH2CH(CH3)2
-CH(CH3)CH2CH3
-(CH2)4NH3+
-CH2COO'
-CH2CH2COO-
-CH2CONH2
-CH2CH2CONH2
Glicina
Alanina
Valina
Leucina
Isoleucina
Lisina
Arginina
Histidina
Acido aspartico Acido glutamico Asparagina Glutamina
-(CH2)3NHC(NH2)NH2+
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(continuacion)
Resto de cadena lateral de aminoacidoAminoacido
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Fenilalanina
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CH
H
-CH2SH
-CH2CH2SCH3
-CH2OH,
-CH(OH)CH3
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Tirosina
Triptofano
Cistema
Metionina
Serina
Treonina
Prolina
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Hidroxiprolina
Un "estereoisomero" se refiere a un compuesto constituido por los mismos atomos enlazados mediante los mismos enlaces, pero que tienen estructuras tridimensionales diferentes, que no son intercambiables. Por tanto, se 5 contemplan diversos estereoisomeros y mezclas de los mismos e incluyen "enantiomeros", que se refieren a dos estereoisomeros cuyas moleculas son imagenes especulares no superponibles entre sl
Un "tautomero" se refiere a un proton desplazado de un atomo de una molecula a otro atomo de la misma molecula.
"Profarmacos" esta destinado a indicar un compuesto que puede convertirse en condiciones fisiologicas o mediante solvolisis en un compuesto biologicamente activo descrito en el presente documento. Por tanto, el termino 10 "profarmaco" se refiere a un precursor de un compuesto biologicamente activo que es farmaceuticamente aceptable. Un profarmaco puede ser inactivo cuando se administra a un sujeto, pero se convierte in vivo en un compuesto activo, por ejemplo, mediante hidrolisis. el precursor suele ofrecer ventajas de solubilidad, compatibilidad con tejidos o liberacion retardada en el organismo de un mairnfero (vease, Bundgard, H., Design of Prodrugs (1985), pags. 7-9, 21-24 (Elsevier, Amsterdam).
15 Se proporciona una discusion sobre profarmacos en Higuchi, T., et al., "Pro-drugs as Novel Delivery Systems, " A.C.S. Symposium Series, Volumen 14, y en Bioreversible Carriers in Drug Design, ed. Edward B. Roche, American farmaceutical Association y Pergamon Press, 1987, ambos de los cuales se incorporan en su totalidad por referencia en el presente documento.
El termino "profarmaco" tambien pretende incluir cualquier vehfculo enlazado covalentemente, que libere el 20 compuesto activo in vivo cuando se administra dicho profarmaco a un sujeto mai^ero. Los profarmacos de un compuesto activo, tal como se describe en la presente memoria, pueden prepararse modificando grupos funcionales presentes en el compuesto activo de tal forma que las modificaciones se escinden, bien en la manipulacion rutinaria o bien in vivo, al precursor activo. Los profarmacos incluyen compuestos en los que un grupo hidroxilo, amino o mercapto se une a cualquier grupo que, cuando el profarmaco del compuesto activo se administra a un sujeto
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mairnfero, se escinde para formar un grupo hidroxilo libre, amino libre o un grupo mercapto libre, respectivamente. Los ejemplos de los profarmacos incluyen, pero sin limitacion, derivados de acetato, succinato, fosfato, hemisuccinato, malato, hemimalato, formiato y benzoato de grupos funcionales alcohol o amina en los compuestos activos y similares. Otros ejemplos de profarmaco incluyen, pero sin limitacion, derivados de aminoacido de grupos funcionales de alcohol o amina en los compuestos activos y similares.
El presente texto se dirige generalmente a compuestos restringidos conformacionalmente que imitan la estructura secundaria de regiones de codigo inverso de protemas y peptido biologico (tambien denominadas en el presente documento "mimeticos de codigo inverso"), y tambien se dirige a bibliotecas qmmicas que se refieren a los mismos.
Las estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en este documento son utiles como agentes bioactivos, incluyendo (pero sin limitacion) su uso como agente diagnostico, profilactico y/o terapeutico. Las bibliotecas de estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en el presente documento son de utilidad para identificar agentes bioactivos que tienen dichos usos. Las bibliotecas pueden contener de decenas a cientos a miles (o mas) de estructuras mimeticas de codigo inverso individuales (tambien denominadas en el presente documento como "miembros").
En un aspecto del presente texto, una estructura mimetica de codigo inverso se desvela como que tiene la siguiente Formula (I):
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en la que E es -ZR3- o -(C=O)-, en el que Z es CH o N; W es -(C=O)NH-, -(C=O)O-, -(C=O)S-, -S(O)2- o un enlace; y cada uno de R1, R2, R3, R4 y R5 es igual o diferente y es independientemente un resto de cadena lateral de aminoacido o un derivado de cadena lateral de aminoacido. El compuesto mimetico de codigo inverso puede estar presente como un estereoisomero aislado o una mezcla de estereoisomeros o como una sal farmaceuticamente aceptable del mismo.
En determinadas realizaciones, Ri de los compuestos de Formula (I) es benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido.
En determinadas realizaciones, Ri de compuestos de Formula (I) puede ser benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre alquilo C1-7, carboxialquilo, alquil Ci-2-heterociclilcarbonilalquilo, y aminocarbonilo.
En una determinada realizacion de los compuestos descritos en el parrafo anterior, alquilo C1-7 es metilo.
En determinadas realizaciones, R2, R4 y R5 de compuestos de Formula (I) se seleccionan independientemente entre el grupo que consiste en:
alquilo C1-12 o alquilo C1-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, ciano, alcoxi C1-6, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino
C1-4,
dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
alquenilo C2-12 o alquenilo C2-12 sustituid que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
arilo C6-12 o arilo C6-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1.4, amidino, alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo; alcoxi C1-6;
heterociclilalquilo C6-13, que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, ox^geno o azufre, o heterociclilalquilo C6-13 sustituido que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, oxfgeno o azufre y tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, alquilo C1-6, alcoxi C1- 6, ciano, e hidroxilo; y arilalquilo C7-13 o arilalquilo C7-13 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1.6, alcoxi C1-6, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; y R3 se selecciona entre el grupo que consiste en:
hidrogeno;
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alquilo C1-12 o alquilo C1-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente
entre: halogeno, ciano, alcoxi C1-6, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino,
alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
alquenilo C2-12 o alquenilo C2-12 sustituid que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados
independientemente entre: amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino,
alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4,
alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
arilo C6-12 o arilo C6-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4,
alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo; alcoxi C1-6;
heterociclilalquilo C6-13, que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, ox^geno o azufre, o heterociclilalquilo C6-13 sustituido que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, oxfgeno o azufre y tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, alquilo C1-6, alcoxi C1-6, ciano, e hidroxilo; y arilalquilo C7-13 o arilalquilo C7-13 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-6, alcoxi C1-6, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo.
En determinadas realizaciones, R2, R4 y R5 de compuestos de Formula (I) se seleccionan independientemente entre el grupo que consiste en:
aminoalquilo C2-5; guanidinoalquilo C2-5; alquilguanidino C1-4-alquilo C2-5, dialquilguanidino C1-4-alquilo C2-5; amidino-alquilo C2-5; alquilamidino C1-4-alquilo C2-5; dialquilamidino C1-4-alquilo C2-5; alcoxi C1-3; alquilo C1-12; arilo C6-12; arilalquilo C6-12; alquenilo C2-12;
fenilo o fenilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
naftilo o naftilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino,
amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4,
alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo, e hidroxilo;
bencilo o bencilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
bisfenilmetilo o bisfenilmetilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
piridilo o piridilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino,
amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alcoxi C1-3,
nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
piridilalquilo C1-4, o piridilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
pirimidilalquilo C1-4, o pirimidilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
triazin-2-il-alquilo C1-4, o triazin-2-ilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
imidazolilalquilo C1-4 o imidazolilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados
independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno,
perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
N-amidinopiperazinil-N-alquilo C0-4, N-amidinopiperidinil-alquilo C1-4; y
4-aminociclohexil-alquilo C0-2; y
R3 se selecciona entre el grupo que consiste en:
hidrogeno; aminoalquilo C2-5; guanidinoalquilo C2-5; alquilguanidino C1-4-alquilo C2-5, dialquilguanidino C1-4- alquilo C2-5; amidino-alquilo C2-5; alquilamidino C1-4-alquilo C2-5; dialquilamidino C1-4-alquilo C2-5; alcoxi C1.3; alquilo C1.12; arilo C6-12; arilalquilo C6-12; alquenilo C2-12;
fenilo o fenilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1.4, alquilo C1-4, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
naftilo o naftilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1.4, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo, e hidroxilo;
bencilo o bencilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4,
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alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
bisfenilmetilo o bisfenilmetilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo Ci- 4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
piridilo o piridilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
piridilalquilo C1-4, o piridilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; pirimidilalquilo C1-4, o pirimidilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; triazin-2-il-alquilo C1-4, o triazin-2-ilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
halogeno, perfluoroalquilo C1.4, alquilo C1.4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; imidazolilalquilo C1.4 o imidazolilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
halogeno, perfluoroalquilo C1.4, alquilo C1.4, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; N-amidinopiperazinil-N-alquilo C0-4, N-amidinopiperidinil-alquilo C1.4; y 4-aminociclohexil-alquilo C0.2.
En determinadas realizaciones, R1 de compuestos de Formula (I) puede ser benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre metilo, carboximetilo, morfolinilcarbonilmetilo, metilpiperazinil-carbonilmetilo, alquilaminocarbonilmetilo C1-7, dialquilaminocarbonilmetilo C1- 4, metoxietilaminocarboniletilo, aminocarbonilmetilo, y piridinilmetil-aminocarbonilmetilo, pero sin limitarse a ese. Los ejemplos espedficos de R1 incluyen 1-metil-1H-benzotriazolilo, 2-metil-2H-benzotriazolilo, 1-etoxicarbonilmetil-1H- benzotriazolilo, 1-hidroxicarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-morfolinil-N-carbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-N-
metilpiperazinil-N-carbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-aminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-
metilaminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, y 1-piridinilmetilaminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo.
En determinadas realizaciones, R2, R4 y R5 de compuestos de Formula (I) se seleccionan independientemente entre el grupo que consiste en:
alquilo C1-12 o alquilo C1-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: acilo, carboxi, alquiltio, y fenilsulfonilo;
alquenilo C2-12 o alquenilo C2-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente
entre acilo, carboxi, alquiltio, y fenilsulfonilo;
arilo Ca-12 sustituido, sustituido con amidosulfonato;
arilalquilo C1-4 o arilalquilo C1.4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, cicloalquilo C3-a, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-a, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo, hidroxilo, alquiloxi C1-a-acilo C1-a, morforlinilalquilo C1-a, arilo, ariloxi, (alquil)(arilalquil)amino, heterociclilo, acilo, amidosulfonato, aminocarbonilo, alquilsulfonato, alquilsulfonilo, alquiltio, ariltio, fenilsulfonato, fenilsulfonilo, morforlinilalcoxi C1-3, W-formamidilo, y pirrolidonilo; heterociclilo o heterociclilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1.4, halogeno, perfluoroalquilo C1.4, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
heterociclilalquilo C1-4 o heterociclilalquilo C1.4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, cicloalquilo C3-a, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-a, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo, hidroxilo, alquiloxi C1-a- acilo C1-a, morforlinilalquilo C1-a, arilalquilo, arilo, heterociclilo, acilo, fenilsulfonilo, cicloalquilalquilo, aciloxialquilo, aminocarbonilo y alquilformamidilo C1-4;
cicloalquilo o cicloalquilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1.4, alcoxi C1.3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; y
cicloalquilalquilo o cicloalquilalquilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1.4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; y R3 se selecciona entre el grupo que consiste en:
hidrogeno;
alquilo C1-12 o alquilo C1-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: acilo, carboxi, alquiltio, y fenilsulfonilo;
alquenilo C2-12 o alquenilo C2-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados
independientemente entre acilo, carboxi, alquiltio, y fenilsulfonilo; arilo Ca-12 sustituido, sustituido con amidosulfonato;
arilalquilo C1-4 o arilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados
independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
cicloalquilo C3-6, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-6, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo,
hidroxilo, alquiloxi C1-6-acilo C1-6, morforlinilalquilo C1-6, arilo, ariloxi, (alquil)(arilalquil)amino, heterociclilo,
acilo, amidosulfonato, aminocarbonilo, alquilsulfonato, alquilsulfonilo, alquiltio, ariltio, fenilsulfonato, fenilsulfonilo, morforlinilalcoxi C1-3, W-formamidilo, y pirrolidonilo; heterociclilo o heterociclilo sustituido que 5 tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino,
hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo;
heterociclilalquilo C1-4 o heterociclilalquilo C1-4 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
10 cicloalquilo C3-6, halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-6, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo,
hidroxilo, alquiloxi C1-6-acilo C1-6, morforlinilalquilo C1-6, arilalquilo, arilo, heterociclilo, acilo, fenilsulfonilo, cicloalquilalquilo, aciloxialquilo, aminocarbonilo y alquilformamidilo C1-4;
cicloalquilo o cicloalquilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1- 15 4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo; y
cicloalquilalquilo o cicloalquilalquilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados
independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4,
halogeno, perfluoroalquilo C1-4, alquilo C1-4, alcoxi C1-3, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo.
En una determinada realizacion de los compuestos descritos en el parrafo anterior, arilalquilo C1-4 es bencilo, 20 bisfenilmetilo, naftilmetilo o 3,3-bisfenilpropilo; y heterociclilalquilo C1-4 es benzotriazolilalquilo C1-4,
benzopirazolilalquilo C1-4, indazolilalquilo C1-4, isoquinolilalquilo C1-4, benzotiazolilalquilo C1-4, quinolinilalquilo C1-4, imidazolinilalquilo C1-4, tienilalquilo C1-4, tetrahidrofuranilalquilo C1-4, piridinilalquilo C1-4, bencimidazolilalquilo C1-4, o indolilalquilo C1-4.
En una realizacion donde E es CHR3, el compuesto mimetico de codigo inverso tiene una estructura de Formula (II):
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en la que W es -(C=O)NH-, -(C=O)O-, -(C=O)S-, -S(O)2- o un enlace; y cada uno de R1, R2, R3, R4 y R5 es igual o diferente y es independientemente un resto de cadena lateral de amino o un derivado de cadena lateral de aminoacido.
En determinadas realizaciones, R1 de compuestos de Formula (II) es benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido y 30 puede ser benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre alquilo C1-7, carboxialquilo, alquil C1-2-heterociclilcarbonilalquilo, y aminocarbonilo;
R2, R4 y R5 se seleccionan independientemente entre el grupo que consiste en:
alquilo C1-12 o alquilo C1-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, ciano, alcoxi C1-6, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino 35 C1-4, dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
alquenilo C2-12 o alquenilo C2-12 sustituid que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
arilo C6-12 o arilo C6-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: 40 halogeno, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino C1-4,
dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo; alcoxi C1-6;
heterociclilalquilo C6-13, que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, ox^geno o azufre, o heterociclilalquilo C6-13 sustituido que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, oxfgeno o 45 azufre y tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, alquilo C1-6, alcoxi C1-
6, ciano, e hidroxilo; y arilalquilo C7-13 o arilalquilo C7-13 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-6, alcoxi C1-6, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo, hidroxilo, fosfato, dimetilaminoacetato, dimetilaminoalquilcarbamato, y dietilfosfono-acetamido; y
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R3 se selecciona entre el grupo que consiste en: hidrogeno;
alquilo C1-12 o alquilo C1-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente
entre: halogeno, ciano, alcoxi C1-6, amino, guanidino, alquilguanidino C1.4, dialquilguanidino C1.4, amidino,
alquilamidino C1.4, dialquilamidino C1.4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1.5, e hidroxilo;
alquenilo C2-12 o alquenilo C2-12 sustituid que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados
independientemente entre: amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino,
alquilamidino C1-4, dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
arilo C6-12 o arilo C6-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre:
halogeno, amino, guanidino, alquilguanidino C1-4, dialquilguanidino C1-4, amidino, alquilamidino C1-4,
dialquilamidino C1-4, alquilamino C1-5, dialquilamino C1-5, e hidroxilo;
alcoxi C1-6;
heterociclilalquilo C6-13, que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, ox^geno o azufre, o heterociclilalquilo C6-13 sustituido que tiene de 1 a 2 heteroatomos seleccionados entre nitrogeno, oxfgeno o azufre y tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, alquilo C1-6, alcoxi C1-6, ciano, e hidroxilo; y arilalquilo C7-13 o arilalquilo C7-13 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: amino, amidino, guanidino, hidrazino, alquilamino C1-4, dialquilamino C1-4, halogeno, perfluoroalquilo C1-6, alcoxi C1-6, nitro, carboxi, ciano, sulfurilo e hidroxilo.
En una determinada realizacion de los compuestos descritos en el parrafo anterior, R1 de compuestos de Formula (II) es benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre metilo, carboximetilo, morfolinilcarbonilmetilo, metilpiperazinil-carbonilmetilo, alquilaminocarbonilmetilo C1-7, dialquilaminocarbonilmetilo C1-4, metoxietilaminocarboniletilo, aminocarbonilmetilo, y piridinilmetilaminocarbonilmetilo y los ejemplos espedficos de R1 incluyen, pero sin limitarse a estos, 1-metil-1H- benzotriazolilo, 2-metil-2H-benzotriazolilo, 1-etoxicarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-hidroxicarbonilmetil-1H- benzotriazolilo, 1-morfolinil-N-carbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-N-metilpiperazinil-N-carbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-aminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-metilaminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, y 1-
piridinilmetilaminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo;
En una determinada realizacion de los compuestos descritos en el parrafo anterior, R2 y R5 son independientemente alquilo C1.12, arilo C6-12, arilalquilo C7-12, heterociclilalquilo C6-11, hidroxibencilo, o bencilo sustituido que tiene sustituyentes seleccionados entre fosfato, dimetilaminoacetato, (2-dimetilamino-etil)-carbamato, y dietil-fosfono- acetamido;
R3 es hidrogeno o alquilo C1-12; y
R4 es alquilo C1.12, arilalquilo C7-12, o alquenilo C2-12.
Estos compuestos pueden prepararse utilizando moleculas de componente de material de partida adecuadas (en lo sucesivo denominados "piezas de componente"). En resumen, en la smtesis de estructuras mimeticas de codigo inverso que tienen la Formula (I), las estructuras mimeticas de codigo inverso de Formula (I) pueden prepararse mediante acoplamiento secuencial de las piezas de componente individuales tanto por etapas en solucion o por smtesis de fase solida como se realiza habitualmente en smtesis de peptidos en fase solida, seguido de ciclacion para producir las estructuras mimeticas de codigo inverso de las descritas en el presente documento. Como alternativa, la primera y segunda piezas de componente se acoplan para formar un intermedio primero-segundo combinado, si es necesario, las tercera y/o cuarta piezas de componente se acoplan para formar un intermedio de tercero-cuarto combinado (o, si esta disponible en el mercado, puede usarse un solo tercer intermedio), el intermedio primero-segundo combinado y el intermedio tercero-cuarto (o tercer intermedio) se acoplan despues para proporcionar un intermedio primero-segundo-tercero-cuarto (o un intermedio primero-segundo-tercero) que se cicla para producir las estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en el presente documento.
En la Figura 1 se ilustran piezas de componente espedficas y el montaje de las mismas para preparar compuestos descritos en el presente documento. Por ejemplo, una "primera pieza de componente" puede tener la siguiente formula S1:
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en la que R1 es como se ha definido anteriormente, y R es un grupo protector adecuado para su uso en la smtesis de peptidos, donde este grupo protector puede unirse a un soporte polimerico para posibilitar la smtesis en fase solida. Los grupos R adecuados incluyen grupos alquilo y, en una realizacion preferida, R es un grupo metilo. En la figura 1, uno de los grupos R es un soporte polimerico (solido), indicado por "Pol" en la Figura. Tales primeras piezas de componente pueden sintetizarse facilmente mediante aminacion reductora de H2N-C-R1 con CH(OR)2-CHO, o mediante una reaccion de desplazamiento entre H2N-C-R1 y CH(OR)2-CH2-LG (en el que LG se refiere a un grupo
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saliente, por ejemplo, un grupo halogeno (Hal)).
Una "segunda pieza de componente" puede tener la siguiente formula S2:
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donde P es un grupo protector de amino adecuado para su uso en una smtesis de peptidos, Li es hidroxilo o un grupo de activacion de carboxilo, y R2 es como se ha definido anteriormente. Los grupos protectores preferidos incluyen t-butil dimetilsililo (TBDMS), t-butiloxicarbonilo (BOC), metiloxicarbonilo (MOC), 9H-fluorenilmetiloxicarbonilo (FMOC), y aliloxicarbonilo (Alloc). Los aminoacidos N-protegidos estan disponibles en el mercado; por ejemplo, los aminoacidos de FMOC estan disponibles de una diversidad de fuentes. Para que la segunda pieza de componente sea reactiva con la primera pieza de componente, Li es un grupo de activacion de carboxilo, y la conversion de grupos carboxilo en grupos de carboxilo activado puede conseguirse facilmente por procedimientos conocidos en la tecnica para la activacion de grupos carboxilo. Los grupos de acido carboxflico activados adecuados incluyen haluros de acido donde Li es un haluro, tal como cloruro o bromuro, anhfdridos de acido donde Li es un grupo acilo, tal como acetilo, esteres reactivos, tales como esteres de N-hidroxisuccinimida y esteres de pentafluorofenilo, y otros intermedios activados, tales como el intermedio activo formado en una reaccion de acoplamiento usando una carbodiimida, tal como diciclohexilcarbodiimida (DCC).
Por consiguiente, los aminoacidos N-protegidos disponibles en el mercado pueden convertirse en formas activadas carboxflicas por medios conocidos para un experto en la materia.
En el caso del derivado de azido de un aminoacido que sirve como la segunda pieza de componente, tales compuestos pueden prepararse a partir del aminoacido correspondiente mediante la reaccion desvelada por Zaloom y col. (J. Org. Chem. 46:5173-76, 1981).
Una "tercera pieza de componente" puede tener la siguiente formula S3:
Fmoc
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O
en la que R4, E, y L1 son como se han definido anteriormente. Las terceras piezas de componente adecuadas estan disponibles en el mercado de una diversidad de fuentes o pueden prepararse por procedimientos bien conocidos en qmmica organica.
La Figura 1 ilustra la preparacion de compuestos de Formula (1).
Por tanto, como se ha ilustrado anteriormente, los compuestos mimeticos de codigo inverso de Formula (I) pueden sintetizarse haciendo reaccionar una primera pieza de componente con una segunda pieza de componente para producir un intermedio combinado primero-segundo, seguido de hacer reaccionar el intermedio combinado primero- segundo con unas terceras piezas de componente secuencialmente para proporcionar un intermedio combinado primero-segundo-tercero-cuarto, y despues ciclando este intermedio para producir la estructura mimetica de codigo inverso.
La smtesis de piezas de componente representativas de los aspectos descritos en el presente documento se describen en los ejemplos de Preparacion.
Las estructuras mimeticas de codigo inverso de las Formulas (I) y (II) pueden fabricarse por tecnicas analogas a las smtesis de componente modulares desveladas anteriormente, pero con modificaciones adecuadas a las piezas de componente.
Las estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en el presente documento son utiles como agentes bioactivos, tales como agentes de diagnostico, profilactivos y terapeuticos. Por ejemplo, las estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en el presente documento pueden usarse para modular peptidos relacionados con un factor de transcripcion de senalizacion celular en un animal de sangre caliente, mediante un procedimiento que comprende
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administrar al animal, una cantidad eficaz del compuesto de Formula (I).
Adicionalmente, las estructuras mimeticas de codigo inverso descritas en el presente documento tambien pueden ser eficaces para inhibir la union de peptido a dominios de PTB en un animal de sangre caliente; para modular el receptor acoplado a protema G (GPCR) y el canal ionico en un animal de sangre caliente; para modular citocinas en un animal de sangre caliente.
Se ha descubierto que los compuestos de la Formula (I), especialmente compuestos de Formula (III) son eficaces para inhibir o tratar trastornos modulados por la ruta de senalizacion de Wnt, tales como cancer.
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La Formula (III) se ha mostrado anteriormente, en la que cada uno de Ri, R4, y R6 es igual o diferente y es independientemente un resto de cadena lateral de aminoacido o un derivado de cadena lateral de amino. Xi puede ser hidrogeno, hidroxilo, o halogeno, y X2 y X3 puede ser independientemente hidrogeno, hidroxilo, o cualquiera de los grupos que puedan hacer al compuesto un profarmaco, tal como fosfato, carboxilato, carbamato y amina sustituida.
En determinadas realizaciones de los compuestos de la Formula (III),
Ri es benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre alquilo C1-7, carboxialquilo, alquil Ci-2-heterociclilcarbonilalquilo, y aminocarbonilo;
R6 es arilo C6-12 o arilo C6-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre el grupo que consiste en: halogeno; hidroxilo; ciano; alquilo C1-6; y alcoxi C1-6; o heterociclilo C5-12 o heterociclilo C5-12 sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, hidroxilo, ciano, alquilo C1-6, y alcoxi C1-6;
R4 es alquilo C1-6, alcoxi C1-6, alquenilo C2-6 o perfluoroalquilo C1-6;
X1 es hidrogeno, hidroxilo o halogeno; y
cada uno de X2y X3 es independientemente hidrogeno, hidroxilo, fosfato, dimetilaminoacetato, (2-dimetilamino-etil)- carbamato, dietil-fosfono-acetamido o halogeno.
En una determinada realizacion de los compuestos descritos en el parrafo anterior,
R1 se selecciona entre el grupo que consiste en benzotriazolilo o benzotriazolilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre metilo, carboximetilo, morfolinilcarbonilmetilo, metilpiperazinil- carbonilmetilo, alquilaminocarbonilmetilo C1-7, dialquilaminocarbonilmetilo C1-4, metoxietilaminocarboniletilo, aminocarbonilmetilo, y piridinilmetil-aminocarbonilmetilo, y los ejemplos de R1 incluyen, pero sin limitarse a estos, 1- metil-1H-benzotriazolilo, 2-metil-2H-benzotriazolilo, 1-etoxicarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-hidroxicarbonilmetil-1H- benzotriazolilo, 1-morfolinil-N-carbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-N-metilpiperazinil-N-carbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-aminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, 1-metilaminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo, y 1-
piridinilmetilaminocarbonilmetil-1H-benzotriazolilo; y R4 es alquilo C1.3 o alilo; y
R6 es fenilo o fenilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, hidroxilo, ciano, alquilo C1-6 y alcoxi C1 halosustituido; o piridilo o piridilo sustituido que tiene uno o mas sustituyentes seleccionados independientemente entre: halogeno, hidroxilo, ciano, alquilo C1-6 y alcoxi C1-6.
En otro aspecto descrito en el presente documento, se desvelan profarmacos obtenidos a partir de compuestos que tienen la Formula general (I). Los profarmacos aumentan generalmente la solubilidad acuosa y por tanto la biodisponibilidad de compuestos que tienen la Formula general (I). En determinadas realizaciones, los profarmacos descritos en el presente documento tienen la siguiente Formula general (IV):
(III)-R7 (IV)
en la que uno de R1, R4, R6, X1, X2, y X3 esta unido a R7 mediante Y, en el que:
Y es un oxfgeno, azufre, o nitrogeno en R1, R4, o R6, o un ox^geno X1, X2, o X3; y
R7 es hidroxialquilo, glicosilo, fosforiloximetiloxicarbonilo, piperidin carboniloxi sustituido o sin sustituir, o una sal del mismo; o Y-R7 es un resto de aminoacido, una combinacion de restos de aminoacido, fosfato, hemimalato, hemisuccinato, dimetilaminoalquilcarbamato, dimetilaminoacetato, o una sal del mismo; y cuando no estan
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
unidos a R7; Ri, R4, R6, X1, X2, y X3 se definen segun estan en la Formula (III).
En otro aspecto descrito en el presente documento, se desvelan bibliotecas que contienen estructuras mimeticas de codigo inverso del presente texto. Una vez ensambladas, las bibliotecas descritas en el presente documento pueden cribarse para identificar miembros individuales que tengan bioactividad. Tal cribado de las bibliotecas para miembros bioactivos puede implicar; por ejemplo, evaluar la actividad de union de los miembros de la biblioteca o evaluar el efecto que tienen los miembros de la biblioteca en un ensayo funcional. El cribado se completa normalmente poniendo en contacto los miembros de la biblioteca (o un subconjunto de miembros de biblioteca) con una diana de interes, tal como, por ejemplo, un anticuerpo, una enzima, un receptor o una lmea celular. Los miembros de la biblioteca que son capaces de interactuar con la diana de interes se denominan "miembros de biblioteca bioactivos" o "mimeticos bioactivos". Por ejemplo, un mimetico bioactivo puede ser un miembro de la biblioteca que sea capaz de unirse a un anticuerpo o receptor, o que es capaz de inhibir una enzima, o que es capaz de inducir o antagonizar una respuesta funcional asociada, por ejemplo, con una lmea celular. En otras palabras, el cribado de las bibliotecas descritas en el presente documento determina que miembros de la biblioteca son capaces de interactuar con una o mas dianas biologicas de interes. Ademas, cuando no sucede la interaccion, el mimetico bioactivo (o mimeticos) pueden despues identificarse a partir de los miembros de la biblioteca. La identificacion de uno solo (o un numero limitado) de mimetico o mimeticos bioactivos a partir de la biblioteca produce estructuras mimeticas de codigo inverso que son en sf mismas biologicamente activas, y por tanto son utiles como agentes de diagnostico, profilacticos o terapeuticos, y pueden usarse adicionalmente para un avance significativo en la identificacion de compuestos lfder en estos campos.
La smtesis de mimeticos de peptido de la biblioteca descrita en el presente documento puede completarse usando tecnicas de smtesis de peptidos conocidas, en combinacion con la primera, segunda y tercera piezas de componente descritas en el presente documento. Mas espedficamente, cualquier secuencia de aminoacido puede anadirse al terminal N y/o terminal C del mimetico de codigo inverso restringido conformacionalmente. Para este fin, los mimeticos pueden sintetizarse en un soporte solido (tal como resina PAM) por tecnicas conocidas (vease, por ejemplo, John M. Stewart y Janis D. Young, Solid Phase Peptide Synthesis, 1984, Pierce Chemical Comp., Rockford, Ill.) o en una resina unida a sililo mediante una union de alcohol (vease Randolph y col., J. Am Chem. Soc. 117:5712-14, 1995).
Ademas, una combinacion de tecnicas de smtesis tanto en fase de solucion como en fase solida puede utilizarse para sintetizar los mimeticos de peptido del presente texto. Por ejemplo, un soporte solido puede utilizarse para sintetizar la secuencia de peptido lineal hasta el punto que el codigo inverso restringido conformacionalmente se anade a la secuencia. Una estructura mimetica de codigo inverso restringida conformacionalmente que se ha sintetizado previamente mediante tecnicas de smtesis en solucion puede despues anadirse como el siguiente "aminoacido" a la smtesis en fase solida (es decir, el mimetico de codigo inverso restringido conformacionalmente, que tienen tanto un termino N como un termino C, puede utilizarse como el siguiente aminoacido que debe anadirse al peptido lineal). Tras la incorporacion de las estructuras mimeticas de codigo inverso restringidas conformacionalmente en la secuencia, pueden despues anadirse aminoacidos adicionales para completar el enlace de peptido al soporte solido. Como alternativa, las secuencias de peptido lineales protegidas en el termino N y el termino C pueden sintetizarse en un soporte solido, retirarse del soporte, y despues acoplarse a las estructuras mimeticas de codigo inverso restringidas conformacionalmente en la solucion usando tecnicas de acoplamiento en solucion conocidas.
En un aspecto de este texto, se desvelan procedimientos para construir las bibliotecas. Las tecnicas convencionales te qmmica combinatoria (vease, por ejemplo, Gallop y col., J. Med. Chem. 37:1233-1251, 1994) permiten preparar rapidamente un gran numero de compuestos mediante la combinacion secuencial de reactivos con un armazon molecular basico. Se han usado tecnicas combinatorias para construir bibliotecas de peptidos derivados de aminoacidos de origen natural. Por ejemplo, tomando 20 mezclas de 20 aminoacidos adecuadamente protegidos y diferentes y acoplando cada una con uno de los 20 aminoacidos, se crea una biblioteca de 400 (es decir, 202) dipeptidos. La repeticion del procedimiento siete veces da como resultado la preparacion de una biblioteca de peptidos compuesta de aproximadamente 26 mil millones (es decir, 208) octapeptidos.
Espedficamente, la smtesis de los mimeticos de peptido de la biblioteca del presente texto puede completarse usando tecnicas de smtesis de peptidos conocidas, por ejemplo, El Esquema general de biblioteca mimetica de codigo inverso, del modo siguiente:
Pol
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imagen20
DMSO, 60°C
Pol
imagen21
+
imagen22
PyBOP, HOAT DIEA, CH2CI2, ta
5
10
15
20
25
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La smtesis de mimeticos de peptido de las bibliotecas del presente texto se completo usando un reactor de bloque FlexChem que tiene placas de 96 pocillos por tecnicas conocidas. En el Esquema anterior "Pol" representa una resina de bromoacetal (Advanced ChemTech) y mas adelante se ilustra un procedimiento detallado.
Etapa 1
Una resina de bromoacetal (37 mg, 0,98 mmol/g) y una solucion de Ri-amina en DMSO (1,4 ml) se pusieron en un bloque Robbins (FlexChem) que tema placas de 96 pocillos. La mezcla de reaccion se agito a 60 °C usando un horno rotatorio [Robbins Scientific] durante 12 horas. La resina se lavo con DMF, MeOH, y despues con DCM
Etapa 2
Una solucion de Fmoc-NH-CH(R2)-COOH disponible en el mercado (4 equiv.), PyBob (4 equiv.), HOAt (4 equiv.), y DIEA (12 equiv.) en DMF se anadio a la resina. Despues de agitar la mezcla de reaccion durante 12 horas a temperatura ambiente, la resina se lavo con DMF, MeOH, y despues DCM.
Etapa 3
A la resina hinchada por DMF antes de la reaccion se le anadio piperidina al 25 % en DMF y la mezcla de reaccion se agito durante 30 min a temperatura ambiente. Esta etapa de desproteccion se repitio de nuevo y la resina se lavo con DMF, metanol, y despues DCM. Una solucion de acido de hidrazina (4 equiv.), HOBt (4 equiv.), y DIC (4 equiv.) en DMF se anadio a la resina y la mezcla de reaccion se agito durante 12 horas a temperatura ambiente. La resina se lavo con DMF, MeOH, y despues DCM.
Etapa 4
La resina obtenida en la Etapa 3 se trato con acido formico (1,2 ml caca pocillo) durante 18 horas a temperatura ambiente. Despues de retirar la resina por filtracion, el filtrado se condenso a presion reducida usando SpeedVac [SAVANT] para dar el producto en bruto en forma de un aceite. El producto se destilo con agua al 50 %/acetonitrilo y despues se liofilizo tras congelacion.
Para generar estas bibliotecas de bloque los acidos de hidrazina intermedios clave se sintetizaron de acuerdo con el procedimiento ilustrado en el Ejemplo de Preparacion 1.
La Tabla 2 muestra los compuestos que se prepararon de acuerdo con el presente texto, de los cuales se da una preparacion representativa en los Ejemplos de Preparacion.
[Tabla 2]
BIBLIOTECA DE MIMETICOS DE CODIGO INVERSO
N.°
Estructura P.M. Formula M+H
1
Xl H VNY^o X/X ° ^OH 594,66 C32H34N8O4 595
2
Ok/N^O ,ISL N N "Y^'N | v, VN^0 XXn o ' XXOH 594,66 C32H34N8O4 595
3
XX-N ° 594,66 C32H34N8O4 595
4
> o Xli H x° N^N^VkrN V"^ kJ ° "XXOH 666,73 C35H38N8O6 668
5
n h HOr° L^-nY'° Vn SrNr^° kJ ° Vi 638,67 C33H34N8O6 640
BIBLIOTECA DE MIMETICOS DE CODIGO INVERSO
N.°
Estructura P.M. Formula M+H
6
o V_-M rAi h ,c Vn Y^vA-oU1 ° "Cl 707,78 C37H41N9O6 709
7
n h x° CC-Ny-O |S|-N __ N ^ JL 'N Sr V>° '"J ° "'Q. 720,82 C38H44N10O5 722
8
0cf° n=n °. _ XNX° kj 0 XX AoH 666,73 C35H38N8O6 668
9
CXny° n=n Xoh —N-Nr"N-XN 0 XX A0H 638,67 C33H34N8O6 640
10
X-ny0 n=n YiCl ^VnVA ^ VXoX 0 XX 707,78 C37H41N9O6 709
BIBLIOTECA DE MIMETICOS DE CODIGO INVERSO
N.°
Estructura P.M. Formula M+H
11
/ n h ^Nr° N-N Vn-^ao 1^ ° CCi 665,74 C35H39N9O5 667
12
Q H Vn °' N'N N N V^o H ° "Ci 695,77 C36H41N9O6 697
13
CCn^O n=n 9. / ^nYY N V'Co^i 0 cc ^OH 665,74 C35H39N9O5 667
14
CCny° n=n ^N-NY^N'^AfN^ lfNrl> ll 0 Cl ^OH 622,67 C33H34N8O5 624
15
N=M 1NH ^nVnCyN^ 2 VNCo n 0 "Cl ^OH 720,82 C38H44N10O5 722
16
CLSr° NsN V^N-N^NCyN H VvlC 0 Cl ^OH 637,69 C33H35N9O5 639
BIBLIOTECA DE MIMETICOS DE CODIGO INVERSO
N.°
Estructura P.M. Formula M+H
17
h2n _ XX H X ^nY° Sm-n 'X-'''' N'N N k^N^A-0 XX ° vCi 695,77 C36H41N9O6 697
18
h2n _ XX H X kA_Nro Vn n 'N y^xN ''X^^xX X^Ad X® ° 'XX X^-OH 637,69 C33H35N9O5 639
19
H xxny° VM*o ^x=n/N O = - ° |l XoNa o' ''ONa 718,61 C32H33N8Na2O7P 720
20
f |] i X i. XJ U ° U, 728,81 C39H40N10O5 730
21
CIm « *=* o y'Xi ^aXX'XX ° "Y\ 651,72 C34H37N9O5 653
Mas adelante hay datos de RMN de algunos de los compuestos preparados de acuerdo con el procedimiento anterior:
bencilamida del acido 2-alil-6-(4-hidroxi-bencil)-8-(2-metil-2H-benzotriazol-5-ilmetil)-4,7-dioxo-hexahidro- 5 pirazino[2,1-c][1,2,4]triazin-1-carboxilico
5
10
15
20
25
30
imagen25
RMN 1H (CDCI3): 5 7,849-7,819 (d, J = 8,8 Hz, 1H), 7,629 (s, 1H), 7,376~7,209 (m, 5H), 7,003-6,975 (d, J = 8,4 Hz, 2 H), 6,712~6,670 (t, J = 6,0 Hz, 1H), 6,682~6,654 (d, J = 8,4 Hz, 2 H), 5,698~5,589 (td, J = 17,0 Hz, J = 10,3 Hz, 1H), 5,438 ~ 5,389 (dd, J = 10,6 Hz, J = 4,0 Hz, 1H), 5,364~5,078 (t, J = 5,5 Hz, 1H), 5,112-5,078 (d, J = 10,4 Hz, 1H), 4,987~4,927 (d, J = 18,0 Hz, 1H), 4,919~4,869 (d, J = 14,8 Hz, 1H), 4,682-4,633 (d, J = 14,8 Hz, 1H), 4,497 (s, 3 H), 4,438~ 4,270 (dc, J = 15,0 Hz, J = 6,1Hz, 2 H), 3,479~3,261 (m, 7 H)
bencilamida del acido 2-alil-6-(4-hidroxi-bencil)-8-(3-metil-3H-benzotriazol-5-ilmetil)-4,7-dioxo-hexahidro- pirazino[2,1-c][1,2,4]triazin-1-carboxMico
imagen26
RMN 1H (CDCI3): 5 8,006-7,978 (d, J = 8,4 Hz, 1H), 7,394-7,221 (m, 7 H), 6,951-6,923 (d, J = 8,5 Hz, 2 H), 6,7586,718 (t, J = 6,2 Hz, 1H), 6,609-6,581 (d, J = 8,5 Hz, 2 H), 5,689-5,555 (td, J = 16,7Hz, J = 6,4 Hz, 1H), 5,386-5,294 (m, 2 H), 5,152-5,118 (d, J = 10,2 Hz, 1H), 5,042-4,988 (d, J = 16,2 Hz, 1H), 4,802 (s, 3 H), 4,445~4,266 (m, 6 H), 3,531-3,315 (m, 8 H),
bencilamida del acido 2-alil-6-(4-hidroxi-bencil)-8-(1-metil-1H-benzotriazol-5-ilmetil)-4,7-dioxo-hexahidro- pirazino[2,1-c][1,2,4]triazin-1-carboxMico
imagen27
RMN 1H (CDCI3): 5 7,736 (s, 1H), 7,529-7,500 (d, J = 8,7 Hz, 1H), 7,404~7,211 (m, 6 H), 7,011~6,983 (d, J = 8,4 Hz, 2 H), 6,748~6,720 (d, J = 8,4 Hz, 2 H), 6,675~6,635 (t, J = 6,0 Hz, 1H), 5,680~5,547 (td, J = 16,6 Hz, J = 6,2 Hz, 1H), 5,680~5,547 (m, 2 H), 5,337~4,961 (m, 5H), 4,607~4,558 (d, J = 14,8 Hz, 1H), 4,428~4,245 (m, 2 H), 4,295 (s, 3 H), 3,514~3,223 (m, 9 H).
Las bibliotecas del presente texto se cribaron para determinar la bioactividad mediante diferentes tecnicas y procedimiento. En general, el ensayo de cribado se puede llevar a cabo (1) poniendo el contacto la estructura mimetica de una biblioteca con una diana biologica de interes, como un receptor, para permitir que se produzca la union entre la estructura mimetica de la biblioteca y la diana, y (2) detectar el evento de union mediante un ensayo adecuado, tal como un ensayo calorimetrico divulgado en Lam et al. (Nature 354:82-84, 1991) o Griminski et al. (Biotechnology 12:1008-1011, 1994) (ambas incorporadas al presente documento como referencia). En una realizacion preferida, los miembros de la biblioteca estan en solucion, y la diana esta inmovilizada en una fase solida. Como alternativa, la biblioteca puede estar inmovilizada en una fase solida y se puede sondear poniendola en contacto con la diana en solucion.
La actividad inhibidora frente a la senalizacion Wnt se midio con el indicador TopFlash. El valor de la CI50 menor significa la mayor actividad de inhibicion. Un compuesto se puede clasificar como activo si la CI50 es 10 mM o inferior. Cuando la CI50 es 5~10 pM, el compuesto puede ser candidato a sustancia farmaceuticamente activa. Un
compuesto se considera fuerte si la CI50 es 1~5 pM, y un compuestos se considera muy fuerte si la CI50 es 1 pM o inferior.
La mayona de los compuestos descritos en el presente documento mostraron una CI50 de 5 pM o menor, lo que significa que tienen una fuerte actividad de inhibicion contra la senalizacion de Wnt.
5 La Tabla 3 siguiente muestra los compuestos para ensayos de bioactividad seleccionados a partir de la biblioteca del presente texto y los valores de la CI50 de los mismos, que se midieron mediante el ensayo del gen indicador descrito en el Ejemplo 2.
[Tabla 3]
CI50 (pM) MEDIDA MEDIANTE EL ENSAYO DEL GEN INDICADOR TopFlash DE COMPUESTOS
SELECCIONADOS DE LA BIBLIOTECA
N.°
Estructura
P.M.
Formula
RGA, CI50 (pM)
TopF
imagen28
594,66
C32H34N804
1,00 ± 0,25
imagen29
594,66
C32H34N804
3,73 ± 0,67
1
2
10 Se ha descubierto, con respecto a la presente invencion, que los compuestos de la Formula general (I) tienen una actividad inhibidora de CYP3A4 inferior (mayor CI50). Los detalles de la medicion de la actividad inhibidora de CYP3A4 se divulgan en el Ejemplo 1. Una actividad inhibidora de CYP3A4 menor significa que los compuestos descritos en el presente documento son mas farmacologicamente favorables en terminos de reacciones adversas.
La Tabla 4 siguiente muestra los compuestos para ensayos de bioactividad seleccionados a partir de la biblioteca del 15 presente texto y los valores de la CI50 de los mismos, que se midieron mediante el cribado de la actividad inhibidora P450 CYP3A4 tal como se describe en el Ejemplo 1.
[Tabla 4]
CI50 (|JM) MEDIDA MEDIANTE EL CRIBADO DE LA ACTIVIDAD INHIBIDORA P450 CYP3A4 DE COMPUESTOS SELECCIONADOS DE LA BIBLIOTECA
N.°
Estructura P.M. Formula inhibicion de CYP3A4, IC50 (mM) ensayo fluorescente
1
m h kkA-N^O ^mAa kkN' ° kX 594,66 C32H34N8O4 19,2
2
kk H k^N^Ao O-N ° A/^. N 594,66 C32H34N8O4 18,8
3
n« HOr° kkk_Nro Vn -nVnYiN SrNr^° ^ ° " k-^OH 638,67 C33H34N8O6 >50
4
0"^X> ri « '■'A kkA-N^o Vn ^nnAnVyN VvA, A^ ° vo. ^OH 707,78 C37H41N9O6 6,23
CI50 (|JM) MEDIDA MEDIANTE EL CRIBADO DE LA ACTIVIDAD INHIBIDORA P450 CYP3A4 DE COMPUESTOS SELECCIONADOS DE LA BIBLIOTECA
N.°
Estructura P.M. Formula inhibicion de CYP3A4, IC50 (mM) ensayo fluorescente
5
CL-v n=n ^ ^ V-A ^ 0 k ^OH 666,73 C35H38N8O6 7,40
6
VV° 0 ^, l * ^ a ;n-^0H V^o ^ 0 vi ^OH 638,67 C33H34N8O6 >50
7
CVV o i~ V rl VV ^ 0 Vi V0H 665,74 C35H39N9O5 41,10
8
C> H kk-N O <, O' n 'NN"k'Sf N VN^o ^ ° \x 695,77 C36H41N9O6 46,90
9
CVV 0 7 —nVnVA^ 0 Vi k^OH 665,74 C35H39N9O5 38,00
CI50 (|JM) MEDIDA MEDIANTE EL CRIBADO DE LA ACTIVIDAD INHIBIDORA P450 CYP3A4 DE COMPUESTOS SELECCIONADOS DE LA BIBLIOTECA
N.°
Estructura P.M. Formula inhibicion de CYP3A4, IC50 (mM) ensayo fluorescente
10
Ojro n=n o °- ^N'N^nVyN " 0 T1 637,69 C33H35N9O5 12,20
11
h2n _ n h c o Vn ^ ^ C;n V"AU ° CC 695,77 C36H41N9O6 37,80
12
h2n _ Vn N'N N N ° "Ci 637,69 C33H35N9O5 33,20
13
yp n=#l 0 0 \x 651,72 C34H37N9O5 32,40
El presente texto tambien esta relacionado con procedimientos para prevenir o tratar una leucemia mieloide aguda que comprende administrar al sujeto el compuesto que tiene la Formula (I) anterior.
En un aspecto, el presente texto proporciona compuestos que inhiben la formacion de un complejo de p-catenina, 5 union de p300 y TCF a la protema c-Myc y la formacion de un complejo de p-catenina, union de p300 y TCF al promotor de survivina.
En otro aspecto, el presente texto proporciona compuestos, en particular los que tienen la Formula (II), que controla la protema c-Myc.
Se ha descubierto, con respecto a la presente invencion, que los compuestos de la Formula general (I) afectan la proliferacion celular e inhiben el crecimiento de celulas cancerosas AML, tal como se describe en el Ejemplo 3.
IG50 de MV-4-11 muestra una actividad de inhibicion del crecimiento celular frente a las celulas cancerosas AML. El valor de la IG50 menor significa la mayor actividad de inhibicion. Un compuesto se puede clasificar como activo si la 5 GI50 es 10 mM o inferior. Cuando la GI50 es 5~10 jM, el compuesto puede ser candidato a sustancia farmaceuticamente activa. Un compuesto se considera fuerte si la GI50 es 1~5 jM, y un compuestos se considera muy fuerte si la GI50 es 1 jM o inferior.
La mayona de los compuestos descritos en el presente documento mostraron una GI50 de 5 jM o menor, lo que significa que tienen una fuerte actividad de inhibicion contra las celulas cancerosas AML.
10 La Tabla 5 siguiente muestra los compuestos para ensayos de bioactividad seleccionados a partir de la biblioteca del presente texto y los valores de la Gl50 de los mismos, que se midieron mediante el ensayo de inhibicion del crecimiento celular) tal como se describe en el Ejemplo 3.
[Tabla 5]
ACTIVIDAD DE INHIBICION DEL CRECIMIENTO CELULAR (GI50) EN CELULAS CANCEROSAS AML DE COMPUESTOS DE LA BIBLIOTECA SELECCIONADOS
N.°
Estructura MV-4-11, GI50 (mM)
1
° "a. 0,26
2
f^\ H ^COCCcI;- ° 1,45
3
X Oi h °r° ^^N-NY^N'-Y^SrN XNX° ^ ° XX ^OH 0,71
ACTIVIDAD DE INHIBICION DEL CRECIMIENTO CELULAR (GI50) EN CELULAS CANCEROSAS AML DE COMPUESTOS DE LA BIBLIOTECA SELECCIONADOS
N.°
Estructura MV-4-11, GI50 (mM)
4
x—N „ XX h X Vn —- N C-CN CCo1^ ° -Cl ^"OH 0,93
5
Xs|— n - ^Nr° CLC-n^o Vn ^—n n-C'n—rXX ° "XX 2,97
6
C^NY° N=N Xn/- v-nYnXX^ 0 xi ^OH 0,65
7
Xy N-N <5- VNC<X 0 Tl XX0H 0,37
8
/ —N ^ m h x XXX^N^o Vn ° '-Cl —~x—OH 1,92
ACTIVIDAD DE INHIBICION DEL CRECIMIENTO CELULAR (GI50) EN CELULAS CANCEROSAS AML DE COMPUESTOS DE LA BIBLIOTECA SELECCIONADOS
N.°
Estructura MV-4-11, GI50 (mM)
9
Os H ^-nY0 n-n N NN^Tlf N V^o kJ ° TX 1,85
10
Q-v n=n °«/ N S ^ kkxN---/ ^ ^NVY ' 0 Cl ^OH 0,5
11
0Lny° n=n ^N'NfNyYN^ on" kfNv40 ^ 0 1C ^OH 0,19
12
0^nT° n=n 1nh v-n-YnVy^ 2 CCokJ 0 "Cl ^OH 0,56
13
h2n _ pAi H 1 kA_Nr° Vn AX ° CC 3,27
ACTIVIDAD DE INHIBICION DEL CRECIMIENTO CELULAR (GI50) EN CELULAS CANCEROSAS AML DE COMPUESTOS DE LA BIBLIOTECA SELECCIONADOS
N.°
Estructura MV-4-11, GI50 (mM)
14
A 1 ^ J1 ^ 0,6
15
0,18
5
Los siguientes ejemplos no limitantes ilustran los compuestos, y el uso descrito en el presente documento. Ejemplo de preparacion 1
Preparacion de acido (W-Fmoc-W'-R4-hidrazino)-acetico 1
imagen30
1. DIBOC/NaHCO,/THF
Fmoc.
R4 2. Fmoc-Cl/THF/0°C 3. HCl/MeOH/0°C
Cs2C03/tolueno/Nal/reflujo
imagen31
(1) Preparacion de W-Fmoc-W'-metil hidrazina
H
Fmoc,. -l\L
^"i\r X H
Un matraz de fondo redondo de dos bocas y 2 l se equipo con un tapon de vidrio y un tubo de calcio. Una solucion 10 de R4-hidrazina (20 g, 139 mmol, donde R4 es metilo) en THF (300 ml) se anadio, y se anadio una solucion de DiBoc (33 g, 153 mmol) en THF. Se anadio gota a gota una solucion acuosa saturada de bicarbonato sodico (500 ml) mediante un embudo de adicion durante 2 horas con agitacion vigorosa. Despues de 6 horas, se anadio lentamente una solucion de Fmoc-Cl (39 g, 153 mmol) en THF. La suspension resultante se agito durante 6 horas a 0 °C. La mezcla se extrajo con acetato de etilo (AE, 500 ml) y la capa organica se conservo. La solucion se seco con sulfato 15 sodico y se evaporo al vado. La siguiente etapa tuvo lugar sin purificacion.
R4 (R4 = -CH3)
Un matraz de fondo redondo de dos bocas y 1 l se equipo con un tapon de vidrio y un tubo de calcio. Se anadio una solucion del producto de la etapa anterior en MeOH (300 ml) y se anadio lentamente HCl conc. (30 ml, 12 N)
mediante un embudo de adicion con agitacion magnetica en un bano de agua enfriada con hielo y se agito durante una noche. La mezcla se extrajo con AE (1000 ml) y la fase organica se conservo. La solucion se seco con sulfato sodico y se evaporo al vado. El residuo se purifico mediante recristalizacion con n-hexano y AE para dar N-Fmoc-N'- metil hidrazina (32,2 g, 83 %). RMN 1H (DMSO-D6) 8 7,90~7,88 (d, J = 6 Hz, 2H, ), 8 7,73~7,70 (d, J = 9 Hz, 2H, ), 5 7,44~7,31 (m, 4H), 4,52~4,50 (d, J = 6 Hz, 2H), 4,31~4,26 (t, J = 6 Hz, 1H), 2,69 (s, 1H).
(2) Preparacion de ester t-butflico del acido (N-Fmoc-N'-R4-hidrazino)-acetico
imagen32
Un matraz de fondo redondo de dos bocas y 1 l se equipo con un tapon de vidrio y un condensador de reflujo 10 conectado a un tubo de calcio. Se anadio una solucion de N-Fmoc-N'-R4 hidrazina (20 g, 75 mmol) en tolueno (300 ml). Se anadio lentamente una solucion de acetato de t-butilbromo (22 g, 111 mmol) en tolueno (50 ml). Se anadio lentamente Cs2CO3 (49 g, 149 mmol). Se anadio muy lentamente Nal (11 g, 74 mmol) con agitacion vigorosa. La mezcla de reaccion se agito a temperatura de reflujo durante 1 dia. La mezcla de producto se filtro y se extrajo con AE (500 ml). La solucion se seco sobre sulfato sodico y se evaporo al vacfo. El producto se purifico mediante 15 cromatograffa con una solucion de hexano:AE = 2:1 para dar ester t-butflico del acido (N-Fmoc-N'-metil-hidrazino)-
acetico (19,8 g, 70 %). RMN 1H (CDCla-d) 8 7,78~7,75 (d, J = 9 Hz, 2H, ), 8 7,61 ~7,59 (d, J = 6 Hz, 2H, ), 7,43~7,26 (m, 4H), 4,42~4,40 (d, J = 6 Hz, 2H), 4,23 (a, 1H), 3,57 (s, 2H), 2,78 (s, 3H), 1,50 (s, 9H).
(3) Preparacion de acido (N-Fmoc-N'-metil-hidrazino)-acetico
20
Un matraz de fondo redondo de dos bocas y 1 l se equipo con un tapon de vidrio y un condensador de reflujo conectado a un tubo de calcio. Se anadio ester t-butflico del acido (N-Fmoc-N'-R4-hidrazino)-acetico (20 g, 52 mmol). Se anadio lentamente con agitacion vigorosa una solucion de HCl (150 ml, solucion 4 M en dioxano) en un bano de agua enfriada con hielo. La mezcla de reaccion se agito a TA durante 1 dia. La solucion se concentro por completo a 25 presion reducida a 40 °C. Se anadio una solucion ac. saturada de NaHCO3 (100 ml) y la fase acuosa se lavo con eter dietflico (100 ml). Se anadio gota a gota HCl conc. lentamente a 0 °C (pH 2-3). La mezcla se extrajo y la fase organica se conservo (500 ml, MC). La solucion se seco con sulfato sodico y se evaporo al vacfo. El residuo se purifico mediante recristalizacion con n-hexano y acetato de etilo para dar acido (N-Fmoc-N'-metil-hidrazino)-acetico (12 g, 72 %). RMN 1H (DMSO-d6) 8 12,38 (s, 1H), 8,56 (a, 1H), 7,89-7,86 (d, J = 9 Hz, 2H, ), 7,70-7,67 (d, J = 9 Hz, 30 2H, ), 7,43~7,29 (m, 4H), 4,29~4,27 (d, J = 6 Hz, 2H), 4,25~4,20 (t, J = 6 Hz, 1H), 3,47 (s, 2H), 2,56 (s, 3H).
Ejemplo de preparacion 2
Compuesto del tftulo:
imagen33
Para preparar el compuesto del tftulo, se realizo el Esquema General de Biblioteca mimetica de codigo inverso que 35 se ha descrito anteriormente en la presente memoria descriptiva mediante el siguiente esquema:
imagen34
5
10
15
20
25
30
imagen35
En el esquema anterior "Pol" representa una resina de bromoacetal (Advanced ChemTech) y a continuacion se ilustra el procedimiento detallado:
Etapa 1
Una resina de bromoacetal (37 mg, 0,98 mmol/g) y una solucion de (2-metil-2H-benzo[d][1,2,3]triazol-5- il)metanamina en DMSO (1,4 ml) se pusieron en un bloque Robbins (FlexChem) que tema placas de 96 pocillos. La mezcla de reaccion se agito a 60 °C usando un horno rotatorio [Robbins Scientific] durante 12 horas. La resina se lavo con DMF, MeOH, y despues DCM.
Etapa 2
Una solucion de Fmoc-Tyr(OtBu)-OH disponible en el mercado (4 equiv.), PyBob (4 equiv.), HOAt (4 equiv.), y DIEA (12 equiv.) en DMF se anadio a la resina. Despues de agitar la mezcla de reaccion durante 12 horas a temperatura ambiente, la resina se lavo con DMF, MeOH, y despues DCM.
Etapa 3
A la resina hinchada por DMF antes de la reaccion se le anadio piperidina al 25 % en DMF y la mezcla de reaccion se agito durante 30 min a temperatura ambiente. Esta etapa de desproteccion se repitio de nuevo y la resina se lavo con DMF, metanol, y despues DCM. Una solucion de acido de hidrazina (4 equiv.), HOBt (4 equiv.), y DIC (4 equiv.) en DMF se anadio a la resina y la mezcla de reaccion se agito durante 12 horas a temperatura ambiente. La resina se lavo con DMF, MeOH, y despues DCM.
Etapa 4
La resina obtenida en la Etapa 3 se trato con acido formico (1,2 ml caca pocillo) durante 18 horas a temperatura ambiente. Despues de retirar la resina por filtracion, el filtrado se condenso a presion reducida usando SpeedVac [SAVANT] para dar el producto en bruto en forma de un aceite. El producto se destilo con agua al 50 %/acetonitrilo y despues se liofilizo tras congelacion. RMN 1H (CDCh): 8 7,849~7,819 (d, J = 8,8 Hz, 1H), 7,629 (s, 1H), 7,376~7,209 (m, 5H), 7,003~6,975 (d, J = 8,4 Hz, 2 H), 6,712~6,670 (t, J = 6,0 Hz, 1H), 6,682~6,654 (d, J = 8,4 Hz, 2 H), 5,698~5,589 (td, J = 17,0 Hz, J = 10,3 Hz, 1H), 5,438 ~ 5,389 (dd, J = 10,6 Hz, J = 4,0 Hz, 1H), 5,364~5,078 (t, J = 5,5 Hz, 1H), 5,112~5,078 (d, J = 10,4 Hz, 1H), 4,987~4,927 (d, J = 18,0 Hz, 1H), 4,919~4,869 (d, J = 14,8Hz, 1H), 4,682~4,633 (d, J = 14,8 Hz, 1H), 4,497 (s, 3 H), 4,438~4,270 (dc, J = 15, Hz, J = 6,1 Hz, 2 H), 3,479~3,261 (m, 7 H).
Ejemplo de preparacion 3
Preparacion de 4-((2-alil-1-(bencilcarbamoil)-8-((2-metil-2H-benzo[d][1,2,3]triazol-5-il)metil)-4,7-dioxo-octahidro-1H- pirazino[2,1 -c][1,2,4]triazin-6-il)metil)fenilfosfato de disodio (3):
imagen36
A una solucion de 2-alil-N-bencil-6-(4-hidroxibencil)-8-((2-metil-2H-benzo[d][1,2,3]triazol-5-il)metil)-4,7-dioxo- hexahidro-2H-pirazino[2,1-c][1,2,4]triazin-1(6H)-carboxamida (1) (1,0 eq.) en THF (10ml/mmol) se le anadio POCI3 (4,0 eq.) y TEA (3,0 eq.) a 0 °C. Despues de agitarse a temperatura ambiente durante 1 h, se vertio lentamente una 5 solucion ac. sat. de NaHCO3 y se agito durante 1 h. La mezcla resultante se lavo con EtOAc, y despues la fase acuosa se acidifico con una solucion ac. 1 N de HCl a 0 °C, y despues se extrajo con EtOAc. La fase organica se seco con Na2SO4 y se concentro al vado. El residuo se cristalizo con EtOAc y n-hexano para dar un compuesto intermedio (2) en forma de un solido de color blanco. El solido se ajusto con una solucion ac. 0,1 N de NaOH a pH 11,0 y se liofilizo para dar el compuesto deseado (3) (80 %).
10 Ejemplo 1
Cribado de la actividad inhibidora de P450 CYP3A4 Compuestos de ensayo:
imagen37
15 El ensayo se llevo a cabo en un volumen de 200 pl en placas de microtitulacion de 96 pocillos usando ADNc expresado de CYP3A4 hepatico humano (supersoma, BD Gentest™ n.° 456202). Se uso 7-benciloxi-4-trifluorometil- cumarina (BFC) como sustrato de CYP3A4. Los artfculos de ensayo y el sustrato BFC se disolvieron en acetonitrilo al 100 %. El volumen final de acetonitrilo en la mezcla de incubacion fue menor del 1% (volumen/volumen). Tampon fosfato de potasio (pH 7,4, concentracion final 0,1 M), MgCh (concentracion final 8,3 mM), EDTA (concentracion final
5
10
15
20
25
30
35
1,67 mM), una solucion madre de artfculo de ensayo, un supersoma CYP3A4 y NADPH (concentracion final 0,25 mM) se anadieron a cada pocillo. La reaccion se inicio mediante la adicion de sustrato (BFC, concentracion final 30 M) despues de una preincubacion de 10 min a 37 °C. Despues de una incubacion de 10 min a 37 °C, la reaccion se finalizo mediante la adicion de 75 jl de acetonitrilo: 0,5 M base Tris-Base = 4 1 (volumen/volumen). A continuacion, la senal fluorescente se midio con un fluorometro. El metabolito de BFC, 7-hidroxi-4-trifluorometil-cumarina, se midio usando una longitud de onda de excitacion de 409 nm y una longitud de onda de emision de 530 nm. La Figura 2 muestra la CI50 de los compuestos de ensayo del ensayo de inhibicion de CYP3A4. Los Compuestos A y B mostraron una debil inhibicion de una enzima CYP3A4.
[Tabla 6]
Valores de CI50 del Compuesto A y Compuesto B frente a la actividad de CYP3A4
Compuesto de ensayo
CI50 (jM)
Compuesto A
19,2
Compuesto B
18,8
Ejemplo 2
Bioensayo de gen indicador TopFlash para la medicion de IC50 frente a las celulas SW480
El compuesto de ensayo (Compuesto A) usado en este ejemplo se ha preparado en el Ejemplo de preparacion 2. Las celulas SW480 se transfectaron con el uso del reactivo de transfeccion Superfect™ (Qiagen, 301307). Las celulas se tripsinizaron poco tiempo durante 1 dfa antes de la transfeccion, y se sembraron en placas de 6 pocillos (5 x 105 celulas/pocillo) de forma que teman una confluencia del 50-80% el dfa de la transfeccion.
Cuatro microgramos (TopFlash) y un microgramo (pRL-null) de los ADN se diluyo en 150 jl de medio exento de suero, y se anadieron 30 jl de reactivo de transfeccion Superfect™. La mezcla ADN-Superfect se incubo a temperatura ambiente durante 15 min, y despues, se anadio 1 ml de FBS al 10 % en DMEM a este complejo con 3 horas mas de incubacion. Mientras se forman los complejos, las celulas se lavaron con PBS dos veces sin antibioticos.
Los complejos de reactivo de transfeccion DNA-Superfect™ se aplicaron a las celulas antes de incubarlas a 37 °C al 5 % de CO2 durante 3 horas. Despues de la incubacion, se anadio medio recuperado con FBS al 10 % para llevar el volumen final a 1,18 ml. Despues de una incubacion de 3 horas, las celulas se recogieron y se volvieron a sembrar en una placa de 96 pocillos (3 x 104 celulas/pocillos). Despues de incubar durante la noche a 37 °C al 5 % de CO2, las celulas se trataron con el compuesto A durante 24 horas. Finalmente, la actividad se comprobo mediante el ensayo de luciferasa (Promla, E1960).
La Figura 3 ilustra los resultados de la medicion de la CI50 del Compuesto A para celulas SW480. La CI50 fue 1,003 ± 0,254 jM.
Ejemplo 3
Actividad de inhibicion en celulas cancerosas AML (ensayo de inhibicion del crecimiento celular)
Compuestos de ensayo:
imagen38
El ensayo de inhibicion del crecimiento celular se llevo a cabo para investigar la tasa de inhibicion de la proliferacion celular mediante los compuestos de ensayo. Las celulas MV-4-11 (lmea celular de leucemia mieloide aguda humana) se cultivaron en medio de Dulbecco modificado por Iscove (IMDM) incluyendo suero de feto (FBS) de
ternera al 10%, 1x penicilina/estreptomicina (10.000 unidades/ml de penicilina, 10.000 g/ml de estreptomicina en NaCI al 0,85 %). Las celulas MV-4-11 se recogieron en medio IMDM y 5 x 104 celulas/pocillo se transfirieron a cada pocillo de placas de cultivo de 96 pocillos (Nunc, n.° 167008). Los compuestos de ensayo se trataron con la dilucion en serie y se duplicaron para cada concentracion. Para la dilucion en serie, los compuestos de ensayo se diluyeron 5 varias veces con el mismo volumen de medio en un bloque de ensayo de 96 pocillos (Costar, n.° 3956). Tras la dilucion, cada compuesto se anadio a cada pocillo. La absorbancia del fondo tambien se midio durante el tratamiento con los compuestos de ensayo anadiendo el medio IMDM en sustitucion del compuesto de ensayo a la placa de control negativo. Las placas se incubaron durante 3 dfas (72 horas) a 37° C en la incubadora humidificada que contema CO2 al 5 %. El ultimo dfa, se anadieron 20 pl de solucion CellTiter 96 Aqueous One Solution (Promega n.° 10 G3581) al cultivo de cada pocillo, y las placas se incubaron unas pocas horas a 37°C en la incubadora modificada
que contiene 5% de CO2. Despues de la incubacion, la absorbancia de cada celda se mide a 490 nm con un EnVision (PerkinElmer, EE.UU.). Los valores de IG50 se calcularon con el programa Prism 3.0. Los resultados mostraron que los compuestos del ensayo alteraron la proliferacion celular e inhibieron el crecimiento de las celulas cancerosas AML. La Figura 4 muestra el resultado de la inhibicion del Compuesto A. La GI 50 del Compuesto A y el 15 Compuesto C fueron 0,262 |jM y 0,56 |jM.
Tal como se ha descrito anteriormente, la presente invencion y el presente texto proporcionar compuestos novedosos de estructuras mimeticas de codigo inverso, que se pueden usar como compuestos farmaceuticos, especialmente en celulas cancerosas AML. La invencion se ha descrito en detalle con referencia a realizaciones preferidas de la misma.
20

Claims (2)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un compuesto seleccionado del grupo que consiste en:
    5
    imagen1
    imagen2
    imagen3
  2. 2. Un compuesto de acuerdo con la reivindicacion 1, para su uso en un procedimiento de tratamiento o prevencion de una leucemia mieloide aguda.
    5
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