JPH04148698A - 固相化プライマーと鋳型rnaとのハイブリダイズ物を用いる逆転写酵素の測定法 - Google Patents
固相化プライマーと鋳型rnaとのハイブリダイズ物を用いる逆転写酵素の測定法Info
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Abstract
め要約のデータは記録されません。
Description
中の逆転写酵素中和抗体測定による被検者のレトロウィ
ルス感染の確認法に関する。
はアデニンリボポリヌクレオチド(以下、ポリAと略す
ことがある)とオリゴデオキシチミンヌクレオチド(以
下、オリゴdTと略すことがある)とを用い、基質とし
てトリチウム化デオキシチミジン5”−トリホスフェー
ト(以下、(3H)dTTPと略称することがある)を
用い、反応液中の逆転写酵素活性を利用してオリゴdT
を伸長させ、これをフィルターで濾過し、フィルター中
の放射活性を測定する方法が報告されている( Dav
id Baltimore Nature、 22
6.1209−1211、 (1970) ; Ho
ward M、 Tem1n & SatoshiMi
zutani、 Nature、 226.1211−
1213.(1970))。
たレトロウィルスの一種であるエイズウィルスの感染を
診断する方法が報告されている〔特開昭63−2522
53号公報〕。
ロジーに用いられる多くの操作は、通常同位体水素(”
H)、リン(II2P)、炭素(”C)、ヨウ素(12
%工)等で放射標識されたポリヌクレオチドの使用に大
きく依存している。 そして、このような放射性化合物
は、たとえ核酸又は他の科学的註又は臨床上興昧ある分
子が極めて微量で存在していても、それらを検出し、監
視し、局在化し、又は単離することが可能であるので、
有用な指示プローブとして使用されている。
重大な欠点が伴っている。 すなわち、まず第一に、放
射性物質を取り扱う人は、潜在的に高レベルの放射線に
曝されがねない危険があるので、放射性同位体の製造、
使用、後処理の間、倉入すな安全策を請じ維持しなけれ
ばならないという問題点があった。
の使用においては経費が高くなるという問題がある。
第三に、必要な感度を得るには、高い比放射能の放射性
物質を用いなければならないが、比放射能の高い放射性
物質はそれに対応して半減期が短く、貯蔵寿命が限られ
ており使用に制約が加えられるという問題があった。
る方法が検討されているが、例えば、鳥型ミエローマ由
来の逆転写酵素を用い、鋳型として天然型mRNA、ブ
ライマーとしてオリゴdT及び基質としてビオチン化デ
オキシウリジン5′−トリホスフェート(以下、ビオチ
ン化dUTPと略すことがある)を用いて反応せしめた
ところ、ビオチン化dUTPは何ら基質として利用され
ず、オリゴdTの伸長は見られず、逆転写酵素の活性測
定に利用し得ないことが報告されており[Penn1n
a R,Langer、 Alex A、 Waldr
op &David C,Ward Proc、 Na
tl、 Acad、 Sci、 usA。
オチン化ヌクレオチドは逆転写合成酵素の活性測定には
適用できないとされていた。
活性の測定系を得べく、鋭意研究を行なった結果、特定
の鋳型DNAおよびブライマーを用いれば逆転写酵素の
存在下においてビオチン化dUTPは基質として利用さ
れ、逆転写酵素活性が容易に測定しうろことを見出した
。
改善が求められていた。すなわち、上記方法では操作手
順に煩雑な点があり、また、反応開始後、測定が可能と
なるまでに若干の時間がかかるという問題があり、操作
手順が簡便で、短時間で測定可能な方法の確立が求めら
れていた。
果、固相化ブライマーを使用すれば上記の問題点を解消
することができ、簡便かつ迅速に逆転写酵素活性が測定
しうろことを見出し本発明を完成した。
製されたアデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNAと該
アデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNAに相補的な固
相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチドとをハイ
ブリダイズせしめたハイブリダイズ物と、ビオチン化デ
オキシウリジントリホスフェートとを被検液の存在下反
応せしめ、該反応の反応生成物と未反応のビオチン化デ
オキシウリジントリホスフェートを分離した後、反応生
成物もしくは未反応のビオチン化デオキシウリジントリ
ホスフェートの量を測定することを特徴とする被検液中
の逆転写酵素の決定方法である。
製されたアデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNAと該
アデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNAに相補的な固
相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチドとをハイ
ブリダイズせしめたハイブリダイズ物と、ビオチン化デ
オキシウリジントリホスフェートとを被検体液および逆
転写酵素の存在下反応せしめ、該反応の反応生成物と未
反応のビオチン化デオキシウリジントリホスフェートを
分離した後、反応生成物もしくは未反応のビオチン化デ
オキシウリジントリホスフェートの量を測定し、この量
から被検体液中の逆転写酵素中和抗体価を求めることを
特徴とする被検者のレトロウィルスの感染確認法である
。
的に調製されたアデニンリボポリヌクレオチドである(
以下、このようなRNAをポリAと略称することがある
)。
術を用いて合成することにより人為的に調製され、特に
好ましい態様としては100〜500塩基からなるポリ
Aを挙げることができ、通常有利に利用できるものとし
ては、平均鎖長255塩基程度のポリAが例示される。
、固相化オリゴdTと略すことがある)はプライマーと
して作用するもので、好ましい態様としては、11塩基
以上のデオキシチミジンのオリゴマーであり、長いもの
ほど好ましいが、通常有利に利用できるものとして例示
されるものは、平均鎖長15塩基ないし21塩基程度の
固相化オリゴdTである。
オチド(オリゴdT)を同相に固定化したものである。
ルロース、ポリスチレン等の天然または合成高分子の担
体等が用いられる。
ンや置換基としてスルホン酸基、カルボキシル基、アミ
ノ基を有するスチレン(以下、スチレン誘導体モノマー
という〉の単一重合物もしくは共重合物であるポリスチ
レンや、スチレンまたはスチレン誘導体モノマーとメチ
ルスチレン、エチルスチレン、クロルスチレン、エチレ
ン、プロピレン、アクリル酸、アクリル酸メチルエステ
ル、アクリル酸エチルエステル、メタクリル酸、メタク
リル酸メチルエステル、メタクリル酸エチルエステル、
アクリロニトリル、アクリルアミド、マレイン酸、フマ
ル酸、ブタジェン、クロルプレン、イソプレン、塩化ビ
ニル、塩化ビニリデン、酢酸ビニル、ビニルトルエン、
ジビニルベンゼンなどとの共重合体、ポリビニルトルエ
ン、ポリエステル、ポリアクリル酸、ポリメタクリル酸
、ポリアクリロニトリル、ポリビニルピロリドン、ポリ
酢酸ビニルアクリレート、塩化ビニル−アクリレートな
どとの共重合体などが挙げられる。また、この合成高分
子担体は、その表面を非イオン界面活性剤で前処理した
ものであっても良い。
、アクリル酸、ビニルトルエン、メタクリル酸メチルエ
ステルの重合または共重合体が例示される。
吸着法および化学結合法のいずれをも利用することがで
きるが、より高い感度を得られる点で化学結合法が好ま
しい。
る方法が好ましく、例えば、アミノ基を有するポリスチ
レンやポリペプチド等のアミノ基を有するかこれを導入
した固相のアミノ基にオリゴdTの5”末端に存在する
リン#!歿基を縮合剤等の存在下活性化し、アミン基と
リン酸基を縮合する方法、例えば1−エチル−3−(3
−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩等の
縮合剤の存在下、好ましくは1−メチルイミダゾールを
添加して縮合せしめれば良い。
るスチレン等のカルボキシル基を有しまたはこれを導入
した固相のカルボキシル基に対し、オリゴdTの5゛末
端のリン酸残基に上記縮合剤により予めアミノ基を結合
導入せしめ、次いで、カルボキシル基とアミノ基を脱水
縮合せしめる方法が挙げられる。
官能基を有するかまたはこれを導入した固相とオリゴd
TまたはオリゴdTの5°末端を適当な官能基となし、
適当なスペーサーを用いて両者を結合しても良い。
の表面や、プレート、容器等の壁面に固相化したもので
あっても良い。
、好ましくは 1.2pmol/Cm2以上であればよ
く、通常は、5.0 pmol/Cm2の結合量までに
は最高の吸光度を与え、それ以上の結合量においても測
定可能であるが、結合量が多すぎると感度の面および経
済性の面から好ましくなく、好ましくは1.2〜5.0
pmol/cm2の範囲が例示される。
トリホスフェート(以下、ビオチン化dUTPあるいは
標識基質と略称することがある)は、例えば、ビオチン
基とウラシルデオキシヌクレオシド基がアリールアミン
等の適当なスペーサーを介して結合した化合物があげら
れ、具体的な化合物例としては、例えば、5− (N−
(N−ビオチニル−ε−アミノカプロイル)−3−アミ
ノアリール〕−デオキシウリジントリフオスフェート(
ピオチン化−11−dUTP)、5− (N−〔N−(
ビオチニル−ε−アミノカプロイル)−γ−アミノブチ
リル〕−3−アミノアリール〕−デオキシウリジントリ
フオスフェート(ビオチン化−16−dUTP)等のよ
うにビオチニル基が適当なスペーサーを介してdUTP
と結合された化合物である。ビオチン化−11−dUT
P及びピオチン化−16−dUTPは、市販されている
化合物であり、また、それ以外の化合物も特開昭57−
209297号公報等の公知文献に記載の方法に準じて
容易に調製される。
物としては、一般にビオチン量を測定するために用いら
れるものを採用することができ、例えばFITC(フル
オレラセンイソチオシアネート)蛍光検出用組成物、パ
ーオキシダーゼ検出用組成物、酸性ホスファターゼ検出
用組成物、アルカリホスファターゼ検出用組成物、β−
ガラクトシダーゼ検出用組成物等が挙げられる。
ビオチン抗体およびFITC結合山羊抗兎IgG抗体か
らなる組成物並びにFITC結合アビジン等が挙げられ
、また、パーオキシダーゼ検出用組成物としては、例え
ばストレプトアビジン−ビオチン化西洋わさびパーオキ
シダーゼ複合体、リン酸Ili新液等の適当な緩衝液お
よびオルトフェニレンジアミンおよび過酸化水素からな
る組成物が挙げられる。 更に、酸性ホスファターゼ検
出用組成物としては、例えばストレプトアビジン−ビオ
チン化酸性ホスファターゼ複合体、リン酸緩衝液等の適
当なm新液、パラニトロフェニルホスフェート等の発色
基質あるいは4−メチルウンベリフェリルホスフェート
等の蛍光基質からなる組成物等が、アルカリホスファタ
ーゼ検出用組成物としては、例えばストレプトアビジン
−ビオチン化アルカリホスファターゼ複合体、トリス塩
酸緩衝液等の適当なyi衝新液よびパラニトロフェニル
ホスフェート等の発色基質あるいは4−メチルウンベリ
フェリルホスフェート等の蛍光基質からなる組成物、ス
トレプトアビジン化アルカリホスファターゼ、トリス−
塩酸緩衝液等の適当な!!衝新液よびパラニトロフェニ
ルホスフェート等の発色基質あるいは4−メチルウンベ
リフェリルホスフェート等の蛍光基質からなる組成物が
、また、β−ガラクトシダーゼ検出用組成物としては、
例えば、ストレプトアビジン−β−ガラクトシダーゼ結
合体、リン酸緩衝液等の適当な緩衝液および2−ニトロ
フェニル−β−ガラクトシド等の発色基質あるいは4−
メチルウンベリフェリル−β−ガラクトシド等の蛍光基
質からなる組成物等が挙げられる。
もよく、また、公知文献を参考にして、種々調製し、ビ
オチン量測定用試薬組成物としても良い。
るには、まず、ポリAと固相化オリゴdTとをハイブリ
ダイズせしめ、次いで充分洗浄せしめて調製したハイブ
リダイズ物を用い、該ハイブリダイズ物とビオチン化d
UTPとを被検液の存在下反応させ、未反応のビオチン
化dUTPを除去した後、ビオチン化dUTP量を測定
すればよい。
平均鎖長: 21.5塩基)の量的関係は、固相化オリ
ゴdTを1(モル比)としたときに、ポリAを3〜0.
07の比とすることが好ましく、適宜、固相化オリゴd
Tの単位表面積当たりの結合量において好ましいポリA
の量とすれば良い。
整した各種緩衝液や生理食塩水等の水性媒体中で行なわ
れるが、これに塩等を添加しても良く、又ハイブリダイ
ズを阻害′せしぬない限りホルムアミド等の有機溶媒を
添加しても良い。さらに、ハイブリダイズせしめやすい
という点で、水性媒体中の各種電解質の温度は高いほう
が好ましい。
24時間、十分にハイブリダイズせしめるためには10
時間以上が好ましく、より好ましくは15〜24時間程
度であり、ハイブリダイズ温度は、通常、凍結しない温
度以上であり、約50℃以下程度、好ましくは4〜42
℃程度とされる。
塩水等の水性媒体が用いられ、その電解質濃度はその後
の逆転写酵素測定液の濃度と同じか又はそれ以上である
ことが好ましい。本発明においては固相化ブライマーを
使用していることからハイブリダイズ物の洗浄は濾過、
遠心分離、デカンテーション等により容易に実施するこ
とが出来、洗浄回数は、通常、十分量で3〜5回程度と
され、十分に洗浄される量と回数で行なわれれば良い。
リダイズ物および標識基質としてのビオチン化dtJT
Pを、pH6,5〜8に調整したトリス−塩酸緩衝液、
リン酸緩新液等ノvIi衛液中、37°C付近で0.5
〜24時間インキュベートし、系中に存在する逆転写酵
素の作用により、前記ビオチン化dUTPをポリA−固
相化オリゴdTハイブリダイズ物のブライマ一部に結合
せしめる。
写酵素の酵素活性を測定しようとする検液であれば良く
、例えば、レトロウィルス感染細胞の培養液を挙げるこ
とができる。
合したビオチン化dUTP (以下、反応生成物という
ことがある)と未反応のビオチン化dUTPとの分離は
、固相化オリゴdTを用いているので、濾過、遠心分離
、デカンテーション等により容易に実施することができ
る。
、すなわち反応ピオチン化dUTP量は、伸長工程を経
てブライマーに結合したビオチン化デオキシウリジンの
ビオチン量をビオチンの測定用試薬を用いて測定すれば
良く、例えば、ビオチン含量の測定用試薬として、スト
レプトアビジン化アルカリホスファターゼ、トリス−塩
酸緩衝液、パラニトロフェニルホスフェートからなる組
成物を用いた場合には、次の様にして実施される。
,5〜9.5に調整したトリス塩酸緩衝液に0.05〜
10 、ug/mH!度のストレプトアビジン化アルカ
リフォスファターゼを含有させて得た溶液に、ビオチン
化dUTPの反応した固相担体を10〜60分程度浸漬
させる。十分量の上述l1m液で少なくとも3回以上同
相担体を洗浄し、次に例えば1 mM Mg C12を
含む50mMジエタノ−ルアミンー塩酸緩lti澄(p
H9,5〜10)に1mg/mlのパラニトロフェニル
ホスフェートを溶解させて得た溶液に、固相担体を 0
.1〜2時間浸漬させて発色せしめる。発色量の定量は
、波長405nmの吸光度を測定すれば良い。
中の逆転写酵素量、すなわち被検液中の逆転写酵素量を
反映するものであるので、これから逆転写酵素量等を決
定することができる。
基質としてデオキシチミジントリホスフェート(以下、
dTTPと略すこともある)を加えることができる。こ
のような目的のために使用されるdTTPO量は、通常
、標識基質であるビオチン化dUTP量に比して、モル
比で2〜20倍、好ましくは3〜4倍である。
05〜1ユニット程度の逆転写酵素が決定しうる感度の
良いものである。
被検者のレトロウィルス感染の確認法を行なうに際して
は、被検体液および逆転写酵素存在下、基質として少な
くともビオチン化dUTPを用い、これをポリ人および
固相化オリゴdTのハイブリダイズ物と反応させる。こ
の工程は、予め酵素活性を測定した逆転写酵素含有溶液
を通常0.001〜1ユニツト、好ましくは0.001
〜0.01ユニツトに調製し、これと被検体液とを混合
し、約4°Cで通常0.1〜2時間、好ましくは 10
〜60分間ブレインキュベートした後、更に基質として
のビオチン化dUTPを通常0.5〜100μM、好ま
しくは1〜5μM含有する、pH6,5〜8に調整した
トリス−塩12m5液等の11面溶液が存在するポリA
および固相化オリゴdTのハイブリダイズ物へ加え、約
37°Cで0.5〜24時間程度インキュベートする。
■)、ヒト免疫不全ウィルス2型、アカゲザル免疫不全
ウィルス、マウス乳腺腫ウィルス、ヒトT細胞白血病ウ
ィルス丁型、ラウス株トリ肉腫ウィルス、ラウス関連ウ
ィルス2型、B型肝炎ウィルス(HBV)などのレトロ
ウィルス等のウィルス粒子を非イオン性界面活性剤、例
えば、ポリオキシエチレンアルキルフェニルエーテル(
トリトンX−100,NP−40)で溶解処理して得た
ものを使用することができる。
つ人体に含有されまたは産生される任意の体液であれば
よく、好ましくは血清である。
いはDEAE、QAE−セファデックス等陽イオン交換
樹脂を通過させたものが通常用いられる。
らの量を測定する方法も、前述の逆転写酵素の決定方法
に準じれば良い。
P量が求められるのであるが、系中の逆転写酵素は被検
体液由来の抗体により失活され、この結果、反応ピオチ
ン化dUTP量が減少する。 従って、陽性体液コント
ロールおよび陰性体液コントロールを指標とすることに
より体液中の逆転写酵素中和抗体価を測定することがで
き、この抗体価はその被検体液を持つ被検者のレトロウ
ィルス感染の有無のN、認の指標となる。
固相化オリゴdT(平均鎖長: 21.5塩基)の量的
関係は、固相化オリゴdTを1(モル比)としたときに
、ポリAを3〜0.07の比とすることが好ましく、適
宜、固相化オリゴdTの単位表面積出たりの結合量にお
いて好ましいポリAの量とすれば良い。
基質としてdTTPを加えることができる。 このよう
な目的のために使用されるdTTPの量は、通常標識基
質であるピオチン化dUTP量に比しモル比で2倍〜2
0倍、好ましくは3〜4倍である。
型RNAと鋳型RNAに相補的な固相化オリゴデオキシ
チミンヌクレオチドのハイブリダイズ物 ■ピオチン化デオキシウリジントリホスフェート、およ
び ■ピオチン量測定用試薬、 を含有してなる逆転写酵素測定用キットを利用すること
ができる。
用時に脱イオン水、生理食塩水、各種緩衝液等で溶解す
るような凍結乾燥試薬とすることもできる。
養土清中の逆転写酵素活性を放射性標識を使わずに検出
することが可能となった。また、AIDS発症と密接に
関連のある抗進転写酵素中和抗体量も放射性物質を使用
せず測定できるようになったので、HIVキャリヤーの
発症の可能性等を容易に監視することができる。
化オリゴdTハイブリダイズ物を使用するので、反応時
間が短くてすみ、また、反応生成物と未反応物の分離が
極めて容易であるので、測定時間の短縮、多数のサンプ
ル数を処理すること等が可能となり、機械化に好都合で
ある。
7〜3の比とした場合には感度良く、さらにポリAtt
O,5〜2.6とした場合には更に好ましく測定するこ
とが可能となった。
、本発明は何らこれに限定されるものではない。
反応と液相系逆転写酵素 反応との反応速度の比較: (1)オリゴd T 、、、!lのアミノ化プレートへ
の固定 100mM 1−−Cチル−3−(3−ジメチルアミ
ノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(CDIと略す;ペ
プチド研究所説)と100mM 1−メチル−イミダ
ゾール−塩酸緩衝液(pH7,0、IMDと略す;SI
GMA社製)を含む水溶液に“、オリゴdT+2−+s
(平均鎖長:15塩基、平均分子量:4,950ダルト
ン;ファルマシア社製)を200 n g 750μl
となるように溶解し、その50μmずつをアミノプレー
ト(底面積0.32cm”;住人ベークライト社製)の
ウェルに分注(反応液が接触するウェルの表面積は0.
63cm’) し、室温で24時間反応させた。反応後
、この溶液を捨て、0.15M NaC1を含む0.1
M トリス−塩酸緩衝液(pH7,5;以下、TBS
と呼ぶ)の200μmでウェルを洗浄し、同じく2回、
緩衝液200μmでウェルを洗浄し、同じく2回TBS
200μmで洗浄し、これを固相化プライマー(オリゴ
dT+2−to固定プレート)とした。
ーション 0.5MNaC1を含む0.1Mトリス−塩酸緩衝液(
pH7,5;以下高塩濃度TBSと呼ぶ)にて100
n g / 50μlとなるように調製したポリA(平
均鎖長:255塩基、平均分子量:86,700ダルト
ン;ファルマシア社製)50μmを上記(1)で調製し
たオリゴdT+2−+e固定プレートに添加し、4°C
で18時間ハイブリダイズせしめた後、高塩濃度TBS
にて5回洗浄した。
2箔製度の反応緩ff1li液(100mM トリス
−塩酸緩衝液(pH7,8)、24mMジチオスレイト
ール、2.4mM還元型グルタチオン、20 m M
k(g C12,320mM KCI、2mM xチレ
ングリコール四酢酸、0.4% トリトンX−100,
4%エチレンゲルコールからなる緩衝液)の50μmに
0.4nmolのビオチン化−11−dUTP (エ
ンゾ社製)を添加し、これを上記(2)に記載の如くし
て得られた固相化ブライマーとポリAがハイブリダイズ
したウェルに分取した。次にリン酸!!衛生理食塩水(
pH7,4、以下、PBSと呼ぶ)にて15mU150
μlに調製した逆転写酵素(ラウス関連ウィルス2型(
RAV−2)由来、宝酒造製)を50μmウェルに加え
、混合した後、37°Cで1.2.3および24時間作
用せしめた。
に10μmの5M NaC1を添加し、5分間放M後、
0.5MNaC1と0.05M MgC1゜を含む0.
1M トリス−塩酸mfi液(pH9,5、以下、洗
浄液と呼ぶ〉の200μmにてウェルを洗浄し、同じく
2回から4回洗浄液200μlで洗浄した。
0μlをウェルに分取し、37°Cで1時間インキュベ
ートした。3%牛血清アルブミン液を捨てた後、洗浄液
で1000倍に希釈したアルカリホスファターゼ標識ス
トレプトアビジン(最終濃度0.088μg/ m 1
、BRL社製)の50μmをウェルに分取し、室温で1
時間インキュベートした。
浄して余分なアルカリホスファターゼ標識ストレプトア
ビジンを除去した後、ウェルに残っているアルカリホス
ファターゼの酵素活性を測定することにより、ビオチン
化DNAの定量とした。
ロフェニルホスフェートを1m M M g C12を
含む50mM ジェタノールアミン−塩酸緩衝液(p
H9,5)にて1m g / m 1になるよう溶解し
、その50μlを各ウェルに加え、37゛Cで30分イ
ンキュベートし、次いで、0.5規定NaOHの50μ
mをその反応液へ添加することにより酵素反応を終了さ
せ、アルカリホスファターゼ活性により呈色した吸収波
長405nmの吸光度をプレートリーダー(J−200
0型、インターメッド社製)にて測定することによって
行なった。
間、及び24時間反応せしめた時に得られた吸光度を第
1表に示す。
った。そして、この測定法においては、吸光度0.1以
上にて信頼できる測定値が得られることが知られている
ので、本発明方法によれば、反応開始後1時間で既に定
量を行なうことができることが理解される。これに対し
、以下に示す参考例1の比較方法(液相系での反応)で
は反応開始後2時間においてやつと測定できた。
せる本発明方法は、液相系での反応の時よりも短い時間
で逆転写酵素の活性を測定することが出来、より優れた
ものであることが明らかである。
衝液50μmに、1μgのオリゴdT+2−+s、0.
1μgのポリA、0.4nmolのビオチン化−11−
dUTPを添加し、そこへ 15mUのRAV−2由来
逆転写酵素を加えて全量を100μmとし、37°Cで
1.2.3および24時間の各時間作用せしめた。
ナトリウム塩を含む溶液を添加し、撹拌混合した後、1
0分間氷冷した。
:商品名バイオダイン)を装着した96穴マニホールド
(BRL社製)で吸引、濾過し、伸長操作をせしめたビ
オチン化DNA鎖をナイロン膜へと吸着せしめた。
に、緩衝液1 (0,1M トリス−塩酸I!衝新液
pH7,5) 、0.15MNaC1とからなる緩衝液
)に3%BSAを添加し、65°Cで1時間インキュベ
ートした。
りだし、次に緩衝液1で1000倍に希釈したアルカリ
ホスファターゼI識ストレプトアビジン溶液中に、ナイ
ロン膜100cm’当り該溶液7mlの割合で10分間
装いた。続いて、ナイロン膜を緩衝液 1100mlに
15分間曝し、同じく佳2回ビオチン化DNAgを吸着
したナイロン膜を緩衝液 1 100m1に15分間曝
し洗浄した。
し、緩衝液2 (0,1M トリス−mMfiffi
液(pH9,5) 、0.1MNaC1及び50 m
M M g Cl 2からなる緩衝液)100mlで1
0分間洗浄した。
テトラゾリウム(NET)と0.17mg/mlの5−
ブロモ−4−クロロ−3−インドール−リン酸塩(BC
IP)を含む緩衝液2(ナイロン膜100cm”当り7
.5mlの割合で使用する)中に30分分間−た。ナイ
ロン膜上に出現した発色スポットを、デンシトメーター
(C8−930、島原製作所製)を用い、波長550n
mで測定した。
時間に於ける反応生成物の面積強度を第2表に示す。
信頼できる測定が可能である。
間ではまだ定量性のある十分な面積強度は得られず、開
始後2時間から定量可能な面積強度が得られた。
反応 実施例1(1)の手法により、オリゴ d T l−24(平均鎖長: 21.5塩基、平均分
子量ニア、095ダルトン;ファルマシア社製)を固定
した固相化ブライマーに、実施例1(2)の手法に準じ
て10μg、1μg、1100n、Longおよびln
gのポリAをハイブリダイズせしめ、洗浄してハイブリ
ダイズ物を調製した。このハイブリダイズ物に、実施例
1(3)記載のピオチン化−11−dUTP含有2倍濃
度箔製転写酵素緩衝液に更に0.96nmo1のdTT
P (ベーリンガーマンハイム社製)を添加した混合液
を 50μm添加し、更に0.1mTJのRAV−2由
来逆転写酵素を37°Cで18時間作用せしめた。その
後、実施例1(4)に記載の手法で固相に伸長したビオ
チン化DNAを測定した。
始時にポリAを添加した場合の逆転写酵素反応 実施例1(3)に記載した2倍の濃度の反応緩衝液の5
0μlに、0.24nmolのピオチン化−11−dU
TPおよび0.96nmo1のdTTPと、10μg、
1μg、1100n、10ngおよびlngの各員のポ
リAとを添加し、これを実施例2で調製したオリゴd
Tlo−2a固定化プレートの各ウェルに分取した。次
に、同様にPBSにて0゜1mU150μlに調製した
RAV−2逆転写酵素50μlを該ウェルに加え、混合
した後、37°Cで18時間インキュベートして逆転写
酵素を作用せしめた。その後、実施例1(4)に記載の
手法で、固相に伸長したビオチン化DNAを測定した。
物させた場合(実施例2)と逆転写酵素反応開始時に各
量ポリAを添加した場合(参考例2)とについて、0.
1mUのRAV−2由来逆転写酵素を37°Cで18時
間作用せしめた時に得られた吸光度を第3表に示した。
0.0380 0.1360100
0.2920 0.17351.000
0.2g70 0.155010 00
0 0.2655 0.2325以上の結
果から、1100n以上のポリAを用いる場合には予め
固定オリゴd Tl9−14とハイブリダイズさせてお
いた実施例2の方が予めハイブリダイズせしめずに測定
を行なった参考例2より高い感度が得られた。
ポリAをハイブリダイズせしめて洗浄し調製したハイブ
リダイズ物を用い、実施例2に従って、37°C118
時間逆転写酵素反応を行なった。
0.01.0.02.0.04.0.08、o、16.
0.31、 0.63.1.25.2.5および5mU
(以上、溶液量は各々50μl)として各々実施し、
その後、実施例1(4)に従って吸光度を測定した。
に、0.24nmolのピオチン化−11−dUTP、
0.96nmolのdTTP及び1.OOOngのポリ
Aとを添加し、これを実施例2にて調製した固相化オリ
ボd T t。−24の各ウェルに分取した。これにP
BSにて 50μl溶液量としたRAV−2由来逆転写
酵素を0,0.01.0.02.0.04.0.08.
0.16.0.31.0.63.1.25.2.5およ
び5mU加え、各添加量で逆転写酵素反応を行なった。
同表が示すとおり、実施例3では、逆転写酵素が0.0
4mU位から測定し得るのに対し、参考例3では0.0
8mUにおいても測定しにくいという結果であった。
0.015 0.0130.02
0.021 0.0230.04
0.0g2 0.0270.08 0
.159 0.0650.16 0.3
51 0.1220.31 0.752
0.3010.63 1゜167
0.6381.25 2.239
1.8012.5 2.476 2.
1275 2.777 2.625
ネ λ=405nm 実施例4 逆転写酵素反応に至適な固相化オリゴ d Tl9−24量とそれにハイブリダイズするポリA
の量 逆転写酵素反応にとって最も効率の良V)プライマーと
鋳型の実質量比を決定する為に、以下の実験を行なった
。
−24量の決定 ■オリゴd T 19−2aの標識 10μgのオリゴdTIo−2aを20μmの水に溶解
し、これに10倍の濃度のカイネーション緩衝液 (5
00mM)リス−塩酸緩衝液(pH7−,6)、100
mM MgCl2.100mM 2−メルカプトエタ
ノール)を2μl、10μCi/μlの[γ−32P]
ATPを1μl、20ユニツト/μl T、ポリヌク
レオチドキナーゼを1μm添加し、37℃で30分イン
キュベートすることにより、オリゴd T 1G−2a
の5°末端を[γ−32P]標識した。30分後、反応
生成物のうち2ngをペーパ゛−クロマトグラフ法によ
り展開しく展開液は350tpMギ酸アンモニウム)、
濾紙を乾燥後5等分して原点に放射活性があること、即
ちオリゴdTが[γ−32p ] 標識されていること
を確認した。展開し、5等分した濾紙を原点から1.2
.3.4.5と番号をつけ、測定したそれぞれの放射活
性を第5表に示した。
在する両分にあり、オリゴdT、。
。
lとし、これに等量のフェノール(予め1mMEDTA
を含む10mM トリス−塩酸緩衝液(pH7,5)
で飽和させたもの)を加えて撹拌した後、水層を回収し
た。 これに5μlの3M酢酸ナトリウムならびに15
0μlの冷エタノールを加え、−80°Cで15分間冷
却した。遠心分wi後、上清を除き、残ったベレットを
冷75%エタノールで2回洗浄した。
定と結合したオリゴd TlCl−24の定量残ったベ
レット(標識オリゴdT)を真空乾燥し、水で0.1μ
g/μlになる様に溶解し、これを2 、 OOOn
g / 50 u l、200ng150μl、20n
g150μlおよび2 n g / 50μlとなるよ
うに実施例1(1)記載のCDIとIMDを含む水溶液
で希釈し、その50μmをひとつのウェルずつに分断し
たアミノブレートに分注し、室温で24時間反応させた
。反応後、実施例1(1)の記載通りに洗浄し、ウェル
に残った放射活性を測定した。各標識オリゴdT量を使
用したときにアミノブレートのウェルに残った放射活性
と標識オリゴdTの比活性(2,3xlO’cpm/μ
g)ならびに平均分子量(7,095ダルトン)から計
算されるアミノブレートへ結合したオリゴ dT+o−2a実質量(重量ならびにモル数)を第6表
に示し、またオリゴd T19−24反応液が接触する
ウェルの表面積(0,63cm2)から計算される単位
面積当りのオリゴ dT+o−24の結合量を第6表に示す。
0.10020 13.003
5.67 0.799200 2
6.555 11.58 1.6332
、OQO47,79820J 2.933
以上の結果がら、アミノブレートの1ウエルに結合した
オリゴdT、。−24量は、添加したオリゴdT、。−
24量に比例して増加し、オリゴd Tlo−zaミラ
、000 n g添加した場合に、20 n g /
1ウ工ル結合した。
−24の結合反応の総液量が50μmであることから、
オリゴdT’+o−2aが結合し得るウェル上の表面積
は0.63cm2となり、オリゴdT、。−24(平均
鎖長: 21.5塩基)の平均分子量が7.095ダル
トンであるがら、ウェル単位表面積当りの結合オリゴd
T量は、4.655pmo l/am2程度までであっ
た。
量 ■ポリAの[γ−32P]標識 50量gのポリAを100μlの水に溶解し、これに実
施例4(1)■に記述した10倍の濃度のカイネーショ
ン緩衝液を 10μl、10μCi/μlの[γ−”P
EATPを1μm、20ユニツト/μlのT、ポリヌク
レオチドキナーゼを2μl添加し、37℃で30分イン
キュベートすることにより、ポリAを[γ−32P]標
識した。30分律、反応生成物の25量gを実施例4(
1)■と同様にペーパークロマトグラフ法により展開し
、展開した濾紙を乾燥後、原点から1cmずつ6等分し
て原点に放射活性があること、即ちポリAが[γ−32
P]標識されていることを確認した。展開し、6等分し
た濾紙を原点から1.2.3.4.5.6と番号をつけ
、測定したそれぞれの放射活性を第7表に示した。
4の局在する画分にあり、オリゴdTlG−2aは[γ
−32P]標識されたことが確認された。また、第7表
から、 ラベル率: 85.8% 比活性: 1.14X10’cpm/μgと計算された
。
除蛋白、エタノール沈澱した。
ブリダイゼーション 実施例4(2)■により除蛋白、エタノール沈澱して得
たベレット(1!識ポリA)を真空乾燥し、水で1ag
/μmになるように溶解し、これを10μg750μl
、1ag150μm、100 n g / 50 p
1、Long150μlおよび1 n g / 50
μmとなるように高塩濃度TBSにて希釈した。実施例
4(1)■で判明した各員のオリゴdT、。
識ポリAを50μl添加し、4℃で18時間ハイブリダ
イズせしめた後、実施例1(2)の手法に準じてウェル
を5回洗浄し、ウェルに残った放射活性を測定した。各
員のオリゴdT+o−2a固定プレートに各員の標識ポ
リAを用いてハイブリダイズさせたときのウェルに残っ
た放射活性と標識ポリAの比活性(1,14x 10’
c pm/μg)ならびに平均分子量(86,700ダ
ルトン)から計算される各量固相化オリゴd Tly−
2aと実際にハイブリダイズした標識ポリ重量(重量な
らびにモル数)を第8表に示し、また、ポリA液が接触
する各オリゴd T 、、2.固定プレートのウェルの
表面積(0,63cm2)から計算される単位面積当り
のポリAのハイブリダイズ量を第9表に示す。
と固相化プライマーの至適量の検討 実施例4(2)■で判明した各社のポリAと各固相化オ
リゴdT+o−24のハイブリダイズ物について、0.
1mUのRAV−2由来逆転写酵素を用い、実施例2の
手法により逆転写酵素を作用せしめた。実施例1(4)
の手法により伸長したビオチン化DNAを測定し、逆転
写酵素反応に対して最も感度よく測定できる至適な固定
化オリゴdT、。−24とポリAのハイブリダイズ量を
調べた。
のハイブリダイズ物のモル比と、その各モル比で、0.
1mUのRAV−2由来逆転写酵素を37°Cで18時
間作用せしめた時に得られた吸光度を第9表に示した。
度)を得る為の固相化オリゴdT19−24とポリAの
至適量は、固相化オリゴd T IG−2−(平均鎖長
: 21.5塩基、平均分子量7,095ダルトン)の
量は5.6ng(1,2pmo 1/am”)から20
ng (5pmol/cm”)程度、好ましくは11.
5ng (2,6pmol/cm’)程度であった。
オリゴd T 1.−24とハイブリダイズさせるポリ
A(平均鎖長:255塩基、平均分子量86,700ダ
ルトン)の量は19ng(0,3pmo 17am2)
から567ng(10pmol/cm2)で、好ましく
は82ng (1,5pmol/cm2)であった。
オリゴd T +o−2a :ポリAのハイブリダイズ
量は、18ng/cm”: 130n g / Cm
2であり、モル比としてはおよそ1: 0.6であっ
た。
1100nのポリA、あるいはポリdAをハイブリダイ
ズせしめ、洗浄してハイブリダイズ物を調製した。この
ハイブリダイズ物を用い、実施例2に記載の手法により
1mU150.ulのRAV−2由来逆転写酵素を37
°Cで18時間作用せしめ、実施例1(4)の手法によ
り伸長したピオチン化DNAを測定した。鋳型にポリA
およびポリdAを使用して逆転写酵素を作用せしめた時
に得られた吸光度を第10表に示す。
ポリAにすることで逆転写酵素を特異的に測定すること
が出来た。
不全ウィルス(Human Immunodefici
ency Virus ; HI V )に感染させ、
この細胞を10%牛脂児血清を添加したRPMI−16
40培地(ギブコ社製)中、炭酸ガス濃度5%、37°
Cで2週間前後培養した。培養上清を30,000rp
mで1時間遠心してウィルス粒子ベレット(106個)
を取得し、これを0.5% トリトンX−100,0,
8mM NaC1,0,5mM フェニルメチルスルフ
ォニルフロライド、20%グリセリン及び50mM ト
リス−塩酸(pH7゜8)とからなる緩i!i液に懸濁
し、酵素液とした。
アミン−酢酸緩衝液(pH7,0)にて20倍に希釈し
、その1mlをQAE−セファデックスA −50カラ
ム(ゲルペット1m1)へ通し、その素通り画分4ml
を、部分精製した坑道転写酵素抗体として使用した。
液、1/10及び1/100希釈液あるいはPBSをそ
れぞれ混合し、4°Cで30分間インキュベートした。
−□4固定プレートに、実施例1(2)の手法に準じて
1100n/のポリAをハイブリダイズせしめ、洗浄し
調製したハイブリダイズ物を用い、実施例2で記述した
手法に従ってこの混合液中に残存している逆転写酵素活
性を測定した。その結果、第11表に示すような吸光度
が得られ、血清中に存在する坑道転写酵素抗体が定量さ
れた。
19〜24.25〜3oおよび272のオリゴdT(す
べてファルマシア社製)の200ngずつを実施例1(
1)に記載した方法でアミノプレートに固定し、実施例
1(2)の記載に準じて100nHのポリAを使用して
各固相化オリゴdTとハイブリダイズせしめ、洗浄して
それぞれハイブリダイズ物を調製した。各ハイブリダイ
ズ物について、実施例2の条件で0.1mUの逆転写酵
素を作用せしめ、実施例1(4)に記載の方法に準じて
伸長したビオチン化DNAを測定した。オリゴdTの長
さと吸光度の程度の関係を第12表に示した。オリゴd
T鎖の長さに応じて吸光度は上昇した。鎖の長さは10
以下においては好ましくはなく、12以上において好ま
しい結果であり、従って通常、鎖の長さは11以上で用
いられることが確認された。
oongのポリAを使用してハイブリダイズせしめ、こ
れに実施例1(3)で記載した2倍浪度の反応緩衝液4
6μlを分取した。一方、ビオチン化−11−dUTP
とdTTPをその混合モル比でそれぞれ1:0.1:3
.1;4.1:5゜7.1:9.1 : 12.3.1
:19、1:24.1:29.1:39.1:49およ
び1:99となるように混合し、これらの混合液をビオ
チン化−11−dUTPとdTTPを併せて最終濃度が
0.3mMになる様に調製した。これらの0.3mM
ビオチン化−11−dUTPとdTTPの混合液をそれ
ぞれ4μmずつ、前述のポリAがハイブリダイズしたオ
リゴdT’+o−2a固定プレートに加え、反応緩衝液
と混合した。更にPBSで 1mU150μmとなる様
に調製したRAV−2由来逆転写酵素の50μlを各ウ
ェルに加え、混合した後に37℃で18詩間インキュベ
ートし、実施例1(4)の記述に準じてビオチン化DN
Aを定量した。ピオチン化−11−dUTPとdTTP
の各混合モル比に於ける吸光度を第13表に示した。
合モル比 この結果から明らかなように、ビオチン化−11−dU
TPとdTTPの混合モル比が1:4の時に最も良い感
度が得られた。
Claims (10)
- (1)少なくとも、水性媒体中で、人為的に調製された
アデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNAと該アデニン
リボポリヌクレオチド鋳型RNAに相補的な固相化され
たオリゴデオキシチミンヌクレオチドとをハイブリダイ
ズせしめたハイブリダイズ物と、 ビオチン化デオキシウリジントリホスフェートとを被検
液の存在下反応せしめ、該反応の反応生成物と未反応の
ビオチン化デオキシウリジントリホスフェートを分離し
た後、反応生成物もしくは未反応のビオチン化デオキシ
ウリジントリホスフェートの量を測定することを特徴と
する被検液中の逆転写酵素の決定方法。 - (2)固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチド
が、オリゴデオキシチミンヌクレオチドの5′末端と固
相とが化学結合している固相化されたオリゴデオキシチ
ミンヌクレオチドである請求項第1項記載の決定方法。 - (3)固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチド
が、11塩基以上のヌクレオチド残基からなる請求項第
1項記載の決定方法。 - (4)固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチド
が、1.2pmol/cm^2〜5.0pmol/cm
^2であり、アデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNA
が、固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチドを
1としてモル比で3〜0.07の比でハイブリダイズせ
しめたものである請求項第1項記載の決定方法。 - (5)反応に際し、さらにデオキシチミジントリホスフ
ェートを含有せしめることを特徴とする請求項第1項記
載の決定方法。 - (6)少なくとも、水性媒体中で、人為的に調製された
アデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNAと該アデニン
リボポリヌクレオチド鋳型RNAに相補的な固相化され
たオリゴデオキシチミンヌクレオチドとをハイブリダイ
ズせしめたハイブリダイズ物と、 ビオチン化デオキシウリジントリホスフェートとを被検
体液および逆転写酵素の存在下反応せしめ、該反応の反
応生成物と未反応のビオチン化デオキシウリジントリホ
スフェートを分離した後、反応生成物もしくは未反応の
ビオチン化デオキシウリジントリホスフェートの量を測
定し、この量から被検体液中の逆転写酵素中和抗体価を
求めることを特徴とする被検者のレトロウイルスの感染
確認法。 - (7)固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチド
が、オリゴデオキシチミンヌクレオチドの5′末端と固
相とが化学結合している固相化されたオリゴデオキシチ
ミンヌクレオチドである請求項第6項記載の感染確認法
。 - (8)固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチド
が、11塩基以上のヌクレオチド残基からなる請求項第
6項記載の感染確認法。 - (9)固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチド
が、1.2pmol/cm^2〜5.0pmol/cm
^2であり、アデニンリボポリヌクレオチド鋳型RNA
が、固相化されたオリゴデオキシチミンヌクレオチドを
1としてモル比で3〜0.07の比で混合してハイブリ
ダイズせしめた請求項第6項記載の感染確認法。 - (10)反応に際し、さらにデオキシチミジントリホス
フェートを含有せしめることを特徴とする請求項第6項
記載の感染確認法。
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|---|---|---|---|
| JP2272750A JP3011988B2 (ja) | 1990-10-11 | 1990-10-11 | 固相化プライマーと鋳型rnaとのハイブリダイズ物を用いる逆転写酵素の測定法 |
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| JP2024521001A (ja) * | 2021-05-25 | 2024-05-28 | カビディ エービー | 高感度な分析物検出アッセイのための方法及びそのためのキット |
-
1990
- 1990-10-11 JP JP2272750A patent/JP3011988B2/ja not_active Expired - Fee Related
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