JPH0564388B2 - - Google Patents

Info

Publication number
JPH0564388B2
JPH0564388B2 JP60185386A JP18538685A JPH0564388B2 JP H0564388 B2 JPH0564388 B2 JP H0564388B2 JP 60185386 A JP60185386 A JP 60185386A JP 18538685 A JP18538685 A JP 18538685A JP H0564388 B2 JPH0564388 B2 JP H0564388B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
bonds
nodes
starting material
product
exist
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
JP60185386A
Other languages
English (en)
Other versions
JPS6244828A (ja
Inventor
Shinsaku Fujita
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Fujifilm Holdings Corp
Original Assignee
Fuji Photo Film Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Fuji Photo Film Co Ltd filed Critical Fuji Photo Film Co Ltd
Priority to JP60185386A priority Critical patent/JPS6244828A/ja
Priority to DE3689965T priority patent/DE3689965T2/de
Priority to EP86111173A priority patent/EP0213483B1/en
Publication of JPS6244828A publication Critical patent/JPS6244828A/ja
Priority to US07/368,919 priority patent/US4982338A/en
Publication of JPH0564388B2 publication Critical patent/JPH0564388B2/ja
Granted legal-status Critical Current

Links

Landscapes

  • Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)

Description

【発明の詳細な説明】 [発明の分野] 本発明は、コンピユータを利用する化学反応情
報の記録・検索方法に関するものであり、さらに
詳しくは、化学反応に関与する物質の構造変化に
関する情報をコンピユータを用いて検索、および
類似化合物や類似反応への考察、類似の化学構造
を有する新規化合物の合成方法の研究が容易とな
るように記録し、検索する方法に関するものであ
る。 [発明の技術的背景] 近年において、コンピユータの発達に伴ない、
化学物質、特に有機化合物の構造情報の記録方法
について各種の方法が提案され、利用されつつあ
る。今日までに研究され、解明された有機化合物
および有機化学反応は膨大な量にのぼるが、これ
らの既知の情報を有効に利用して公知の化学物質
または化学反応を短時間のうちに検索したり、さ
らには所望の特性を有する新規物質の合成方法を
見い出すことが望まれている。そのためには、化
学物質および化学反応の表現形態として、技術者
にとつてその構造的特徴を把握することが容易な
従来の化学構造式の代りに、コンピユータが処理
できる(すなわち、コンピユータが論理判断しう
る)表現形態を開発し、利用することが要求され
ている。 化学物質の記録方法としては、WLN
(Wiswesser Linear Notation)などの線型表記
法および結合表による方法が代表的なものであ
り、その詳細はたとえば、W.T.Wipke、S.R.
Heller、R.J.Feldmann、E.Hyde(Eds):
“Computer Representation and Manipulation
of Chemical Information”(John Wiley and
Sons、New York、1974)に記載されている。
結合表(connection table)は、たとえば化学物
質の構造式における各原子の種類、それに結合す
る相手の原子および結合の種類などを一覧表にま
とめたものであり、上記の線型表記法に比べて化
学物質を原子単位で検索することができるとの利
点がある。 また、化学物質の構造変化(化学反応)に関す
る情報を記録する方法についても提案されている
が、今までのところ満足できる表現方法は知られ
ていない。たとえば、化学反応に関する情報を記
録する方法として反応コードによる方法があり、
具体的にはJ.Valls、O.Scheiner:“Chemical
Information Systems”、E.Ash、E.Hyde(Eds)、
(Ellis Horwood Limited、1975)p.241−258に
記載された方法、M.A.Lobeck、Angew.Chem.
Intern.Ed.Engl.、、578(1970)に記載された方
法、およびH.J.Ziegler、J.Chem.Inf.Comput.
Sci.、19、141(1979)に記載された方法などがあ
る。この方法では化学反応表現の観点が固定され
ているために、新しい化学反応が見い出された場
合に記録できないとの欠点がある。また、化学物
質の構造情報とその変化の情報とが別個の形態で
記録されているので有効な情報検索を行なうこと
ができないとの欠点がある。 別に、化学物質の合成経路を設計する立場から
案出された記録方法も知られている。たとえば、
E.J.Corey、R.D.Cramer、W.J.Howe、J.Am.
Chem.Soc.、94、440(1972)、I.Ugi、J.Bauer、J.
Braodt、J.Friedrich、J.Gasteiger、L.Jochum、
W.Schubert、Angew.Chem.Intern.Ed.Engl.、
18、111(1979)に記載された方法がある。しかし
ながら、この方法は個々の化学反応を記録するの
には適していない。 [発明の要旨] 本発明は、化学反応情報に基づいて化学物質に
関する情報をコンピユータ利用して記録保存し、
検索するための新規な処理方法を提供することを
その目的とするものである。 本発明は、少なくとも一つの出発物質から少な
くとも一つの生成物質を生じる化学反応の出発物
質の構造と生成物質の構造とをトポロジカルに重
ね合わせる工程; トポロジカルに重ね合わされた出発物質の構造
と生成物質の構造との間で(1)出発物質および生成
物質に共通して存在するノード間の結合、(2)出発
物質のみに存在するノード間の結合および(3)生成
物質のみに存在するノード間の結合をそれぞれ区
別して表わす虚遷移構造あるいは結合表を作成す
る工程; 上記の虚遷移構造あるいは結合表をコンピユー
タに付設された記録媒体に記録保存する工程; そして 上記の虚遷移構造あるいは結合表から、生成物
質のみに存在するノード間の結合(3)をコンピユー
タ上で削除することにより、出発物質の構造を検
索する工程; を含む化学反応情報の記録・検索方法にある。 また、本発明は、少なくとも一つの出発物質か
ら少なくとも一つの生成物質を生じる化学反応の
出発物質の構造と生成物質の構造とをトポロジカ
ルに重ね合わせる工程; トポロジカルに重ね合わされた出発物質の構造
と生成物質の構造との間で(1)出発物質および生成
物質に共通して存在するノード間の結合、(2)出発
物質のみに存在するノード間の結合および(3)生成
物質のみに存在するノード間の結合をそれぞれ区
別して表わす虚遷移構造あるいは結合表を作成す
る工程; 上記の虚遷移構造あるいは結合表をコンピユー
タに付設された記録媒体に記録保存する工程; そして 上記の虚遷移構造あるいは結合表から、出発物
質のみに存在するノード間の結合(2)をコンピユー
タ上で削除することにより、生成物質の構造を検
索する工程; を含む化学反応情報の記録・検索方法にもある。 本発明の方法によれば、虚遷移構造および/ま
たは結合表としてコンピユータに付設された記録
媒体に入力(記録)された化学反応情報にコンピ
ユータによる演算処理を利用した好適な処理を行
なうことにより、反応に関与する化学物質につい
ての情報を自動的に単独に得ることができる。 本発明において虚遷移構造(imaginary
transition structures、以下においてITSと略称
する)とは、化学反応に関与する物質の構造変化
を、(1)出発物質のみに存在する結合、(2)生成物質
のみに存在する結合および(3)両者に共通に存在す
る結合からなる三種類に区別して表わした二次元
もしくは三次元の構造図(図形)をいう。この構
造図は、化合物についての従来の構造式および三
次元的構造図に準じて技術者が視覚的になじみや
すく、また容易に理解できる形態で化学反応を表
わすことができるものである。 また、結合表(connection table)は、化学反
応におけるノードの種類、該ノードに結合する相
手ノードおよび上記三種類に区別して表わしたこ
れらノード間の結合などの組合せからなる簡単か
つ明瞭な一覧表であり、そしてこの結合表は化学
反応情報をたいして大きな容量を必要とせずにコ
ンピユータに付設された記録媒体に蓄積保存する
ことができるものである。 上記虚遷移構造および結合表において、化学反
応は基本的に原子、原子団等からなるノード
(節、node)とノードとの間の結合についての簡
易な表現で表わされ、かつ反応系におけるノード
間の結合は上記三種類に区別して表されている。
そのために、コンピユータに付設された磁気記録
媒体、光記録媒体、光磁気記録媒体などの、電磁
気的、光学的、あるいはそれらを組合せた記録媒
体に付設された記録媒体に記録保存(登録)され
た虚遷移構造または結合表について、この結合の
区別に着目して簡単な図形処理もしくは演算処理
を施すことにより、化学反応情報から化学物質情
報に変換することができる。 また、本発明の方法によつて化学物質情報が結
合表の形態で得られる場合には、同じく結合表と
して表わされた化学反応情報との比較照合が容易
であり、かつ大きな容量をとることなくコンピユ
ータに登録することができるとの利点がある。 さらに、本発明においては、得られた結合表が
各ノードの位置座標についての情報をも包含する
場合には、上記構造図と結合表との間で相互に任
意に変換することが可能であり、いずれの形態で
も化学物質を表示記録することができる。 そして、このコンピユータに接続されている記
録媒体に登録(保存)された構造図および/また
は結合表からコンピユータによる演算処理を利用
して化学物質を原子単位で検索、照合することが
できる。 特に、化学物質情報を結合表(または結合表と
構造図)の形態で登録することにより、コンピユ
ータによる情報の処理が容易となり、そして記録
媒体への化学物質の登録を簡便に行なうことがで
きるため、これらの情報の蓄積、管理が容易とな
る。また、登録された化学物質情報に基づいて化
学物質等に関する情報検索を短時間のうちに効率
良く行なうことができるため、技術者の個々の研
究において情報の収集、調査等に要する時間を短
縮化し、かつ得られる情報の密度を高めることが
可能であり、研究を効率的に進めることができ
る。 これらの利点に加えて、本発明の方法によつて
得られる化学物質情報と既にコンピユータの記録
媒体に入力(記録保存)されている化学反応情報
とを組み合わせて利用することにより、薬品製造
等にたずさわる技術者にとつて要望が大である化
学物質の構造解析、分子設計(molecular
modeling)、有機合成経路設計(heuristic
analysis of organic synthesis)を行なうことが
可能である。さらに、化学物質の部分構造検索、
構造−活性相関、未知化合物の構造自動決定、お
よび複雑な化合物をある条件下で反応させた場合
の反応機構および反応生成物の予測
(mechanastic evaluation of organic reaction)
などを短時間のうちに十分実用可能な範囲内で行
なうことが可能である。 [発明の具体的な説明] 本発明の化学反応情報の記録・検索方法におい
ては、ノード間の結合を出発物質のみに存在する
結合、生成物質のみに存在する結合および両者に
共通に存在する結合からなる三種類は区別して表
わした虚遷移構造および/または結合表として記
録保存されている化学反応情報について、コンピ
ユータ処理によつて特定の結合のみを削除する操
作が行なわれ、これにより反応に関与する化学物
質についての情報が構造図および/または結合表
として得られる。 本発明の方法を、具体的に酢酸エチルを塩酸に
よつて加水分解する反応を例に挙げて説明する。 化学反応例 1 酢酸エチルを塩酸によつて加水分解する反応 この化学反応は、 CH3COOCH2CH3+H2O+HCl →CH3COOH+CH3CH2OH+HCl (反応式1) で表わされる。反応の虚遷移構造(ITS)はたと
えば以下のように表わされる。 ここで、 (i) 記号−は、出発物質および生成物質に共通し
て存在する結合を表わし、 (i) 記号+は、出発物質にのみ存在する結合を表
わし、そして (iii) 記号…は、生成物質にのみ存在する結合を表
わしている。 すなわち、虚遷移構造(ITS)とは、出発物質
の構造と生成物質の構造とをトポロジカルに重ね
合わせて、各ノード間の結合を上記(i)〜(iii)の三種
類で区別した二次元もしくは三次元の構造をい
う。なお、『トポロジカルに重ね合わせる』とは
具合的に、出発物質に構造に現れるノードと生成
物質の構造に現れるノードとを一致させてこれら
の構造を一つに組み合わせることをいう。 本発明に係る虚遷移構造(ITS)において、化
学反応に関与する物質のノードは、原系(出発物
質群)および生成系(生成物質群)に含まれる原
子を単位として表わされていてもよいし、あるい
はメチル基[上記ノード(1)、(5)]、メチレン基
[上記ノード(4)]のような官能基などの原子団て
もよい。また、化学反応を表現するに際して、原
系および生成系に現れるノードを一部省略して表
わされていてもよい。 また、三種類の結合の区別は上記(i)〜(iii)のよう
な記号による表示に限定されるものではなく、た
とえば数字(1、2、3)等の簡単な文字による
表示、あるいは色彩(黒色、赤色、緑色)による
色分け表示など利用者が五感により判断でき、か
つコンピユータ処理が可能である限り、いかなる
手段が用いられていてもよい。 以下本発明において、 (i) 出発物質および生成物質に共通の結合(記号
−)を『無色の結合』と呼び、 (ii) 出発物質にのみ存在する結合(記号+)を
『出結合』と呼び、 (iii) 生成物質にのみ存在する記号(記号…)を
『入結合』と呼び、 そして、出結合と入結合とを総称して『有色の
結合』と呼ぶことにする。 具体的に、本発明における虚遷移構造に現れる
結合の種類を第1表にまとめて示す。なお、第1
表において横の数値は結合の出入の指標を意味す
る。 【表】 【表】 三重結合 + + +
− 〓〓〓 〓〓〓 〓〓〓
+ + −
− − 〓〓〓 〓〓〓
+ − −
− − − 〓〓〓
(3−3) (3−2) (3−1) (3
+0) (2+1) (1+2) (0+3)

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1 少なくとも一つの出発物質から少なくとも一
    つの生成物質を生じる化学反応の出発物質の構造
    と生成物質の構造とをトポロジカルに重ね合わせ
    る工程; トポロジカルに重ね合わされた出発物質の構造
    と生成物質の構造との間で(1)出発物質および生成
    物質に共通して存在するノード間の結合、(2)出発
    物質のみに存在するノード間の結合および(3)生成
    物質のみに存在するノード間の結合をそれぞれ区
    別して表わす虚遷移構造あるいは結合表を作成す
    る工程; 上記の虚遷移構造あるいは結合表をコンピユー
    タに付設された記録媒体に記録保存する工程; そして 上記の虚遷移構造あるいは結合表から、生成物
    質のみに存在するノード間の結合(3)をコンピユー
    タ上で削除することにより、出発物質の構造を検
    索する工程; を含む化学反応情報の記録・検索方法。 2 少なくとも一つの出発物質から少なくとも一
    つの生成物質を生じる化学反応の出発物質の構造
    と生成物質の構造とをトポロジカルに重ね合わせ
    る工程; トポロジカルに重ね合わされた出発物質の構造
    と生成物質の構造との間で(1)出発物質および生成
    物質に共通して存在するノード間の結合、(2)出発
    物質のみに存在するノード間の結合および(3)生成
    物質のみに存在するノード間の結合をそれぞれ区
    別して表わす虚遷移構造あるいは結合表を作成す
    る工程; 上記の虚遷移構造あるいは結合表をコンピユー
    タに付設された記録媒体に記録保存する工程; そして 上記の虚遷移構造あるいは結合表から、出発物
    質のみに存在するノード間の結合(2)をコンピユー
    タ上で削除することにより、生成物質の構造を検
    索する工程; を含む化学反応情報の記録・検索方法。
JP60185386A 1985-08-12 1985-08-22 化学反応情報の記録・検索方法 Granted JPS6244828A (ja)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP60185386A JPS6244828A (ja) 1985-08-22 1985-08-22 化学反応情報の記録・検索方法
DE3689965T DE3689965T2 (de) 1985-08-12 1986-08-12 Verfahren zum Verarbeiten von Informationen bezüglich chemischer Reaktionen.
EP86111173A EP0213483B1 (en) 1985-08-12 1986-08-12 Method for processing information on chemical reactions
US07/368,919 US4982338A (en) 1985-08-12 1989-06-16 Method for processing information on chemical reactions

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP60185386A JPS6244828A (ja) 1985-08-22 1985-08-22 化学反応情報の記録・検索方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JPS6244828A JPS6244828A (ja) 1987-02-26
JPH0564388B2 true JPH0564388B2 (ja) 1993-09-14

Family

ID=16169902

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP60185386A Granted JPS6244828A (ja) 1985-08-12 1985-08-22 化学反応情報の記録・検索方法

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JPS6244828A (ja)

Also Published As

Publication number Publication date
JPS6244828A (ja) 1987-02-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5056035A (en) Method for processing information on chemical reactions
US4982338A (en) Method for processing information on chemical reactions
JPH0564389B2 (ja)
JPH08153121A (ja) 文書情報分類方法および文書情報分類装置
CN111461711B (zh) 一种区块链交易的追踪系统
US5023802A (en) Method for processing information on chemical reactions
JPH0564388B2 (ja)
JP3928000B2 (ja) 生理活性化合物の設計方法
Breen et al. Movement of the multicellular slug stage of Dictyostelium discoideum; an analytical approach
JPH0564386B2 (ja)
JP3478331B2 (ja) 構造表示方法およびその方法をコンピュータに実行させるプログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体
JPH0740272B2 (ja) 化学反応情報の記録・検索方法
JPH0564387B2 (ja)
JPH0564390B2 (ja)
TWI296380B (en) Method and apparatus for electronic document collection
JPS6279520A (ja) 化学反応の検索処理方法
JPH0740271B2 (ja) 化学反応情報の記録・検索方法
JPS63247827A (ja) 化学反応情報の処理方法
JPH0740270B2 (ja) 化学反応情報の記録・検索方法
JPS63197224A (ja) 化学反応情報の処理方法
JPS63247828A (ja) 化学反応情報の処理方法
JPS6285331A (ja) 化学物質の合成経路の設計処理方法
Schindler et al. Fanconi Anemia: A paradigmatic disease for the understanding of cancer and aging
JPH0564391B2 (ja)
JPS62178526A (ja) 化学反応情報の処理方法

Legal Events

Date Code Title Description
LAPS Cancellation because of no payment of annual fees