JPH0612996B2 - 部分的合成遺伝子の微生物学的発現法 - Google Patents

部分的合成遺伝子の微生物学的発現法

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JPH0612996B2 JP55092161A JP9216180A JPH0612996B2 JP H0612996 B2 JPH0612996 B2 JP H0612996B2 JP 55092161 A JP55092161 A JP 55092161A JP 9216180 A JP9216180 A JP 9216180A JP H0612996 B2 JPH0612996 B2 JP H0612996B2
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Description

【発明の詳細な説明】 本発明は、目的とする蛋白質生成物の観点からは不完全
なメッセンジャーRNA(以下mRNAと略す)配列か
らの酵素による逆転写と有機合成を組み合わせることに
より、部分的合成遺伝子を作製する方法及びこれを微生
物により発現させる方法に関する。
発現された好ましい生成物には、微生物を開裂させて生
物活性物質を生産する際に問題となる、真核性の発現生
成物に共通して存在する、生物活性を不活性化するリー
ダー配列が含まれていない。本明細書では、好ましい列
として、ヒトの生長ホルモン(例えば下垂体機能減退矮
小発育症の治療に有用である)をコードする(暗号化す
る)遺伝子の作製およびその発現について例示する。
遺伝子を構成しているDNA(デオキシリボ核酸)は、
蛋白質を暗号づけている遺伝子、即ち構造遺伝子と、R
NAポリメラーゼの結合部位、リボゾーム結合のための
情報部位などを提供することによって構造遺伝子の情報
の発現化の仲立ちをつとめる調節領域の両者を含んでい
る。暗号化づけされた蛋白質は、その対応するDNAか
ら、微生物内で、複数の過程を経て発現される。即ち、 1.調節領域(以下プロモーターという)内で酵素RNA
ポリメラーゼが活性化され、これは構造遺伝子に沿って
移動し、その暗号づけされた情報をメッセンジャーリボ
核酸(mRNA)に転写する。この転写は1個またはそ
れ以上の終止コードンの位置で終了する。
2.mRNAの「伝言」は、リボゾームにおいて、そのm
RNAが暗号づけているアミノ酸配列を持った蛋白質に
翻訳される。翻訳は開始信号、大抵はATG(これはf
−メチオニンと翻訳される)から始まる。
DNAは遺伝暗号に従い、トリプレット、即ち、アデノ
シン、チミジン、シチジンおよびグアニン(以下各々
A,T,CおよびGと表わす)から個々別々に選ばれる
隣接する3個のヌクレオチドの「コドン」によって個々
のアミノ酸を指定する。これらはコードストランド(暗
号鎖)、即ち2本鎖(duplex)DNAの暗号配列中にあ
る。2本鎖の残りの鎖、即ち「相補ストランド」は、コ
ードストランド中の相補体と水素結合するヌクレオチド
(塩基)で形成されている。AとT、およびCとGが相
補関係にある。本発明の背景となる上記の事実およびそ
の他の関連事項はGene Expressionに詳しく述べられて
いる(Benjamin Lewin,Gene Expression1,2(19
74年)および3(1977年),John Wiley and Son
s,N.Y.)。
本明細書で言及するこの文献およびその他の文献につい
ては、参考までにその都度言及することとする。
DNAの組み換えには、別々のDNA断片の結合を促進
するために、その隣接末端を色々の態様に修復する種々
の方法を利用することができる。ここでいう「結合」と
は、隣接するヌクレオチド間にホスホジエステル結合が
形成することであり、これは大抵の場合、酵素T4DN
Aリガーゼにより達成される。例えば平滑末端(鈍感末
端)も直接結合することができる。あるいはまた、隣接
末端に相補性の1本鎖を含んでいる断片は、水素結合に
よって、「結合」のためのそれぞれの位置に配置される
ので好都合である。このような接着末端と呼ばれる1本
鎖は、ターミナルトランスフエラーゼを用いて鈍感末端
にヌクレオチドを付加することにより生成させることが
できる。またこれは、鈍感末端の1本の鎖をλ−エキソ
ヌクレアーゼの如き酵素で切り取ることにより生成させ
ることもできる。しかしこれは、制限エンドヌクレアー
ゼ(以下制限酵素という)によるのが最も普通である。
この制限酵素は、塩基対が4ないし6個の長さのヌクレ
オチドの特異な配列(制限部位という)内またはその隣
接部位のホスホジエステル結合を切断するものであり、
多くの制限酵素およびその認識部位が知られている(例
えばR.J.Roberts,CRC Critical Reviews in Biochemis
try,123,(1976年11月)参照)。多くのも
のは互い違いに切断し、2本鎖断片の端に短い相補性の
1本鎖配列ができる。相補性配列であるので、はみでた
末端、即ち接着末端は塩基対によって再結合することが
できる。2個の異なった分子をこの酵素で切断すると、
相補性1本鎖が交叉した対をつくり、新しいDNA分子
ができる。この新しいDNA分子は、アニーリングした
位置にある1本鎖の切断点を結合するリガーゼを用い
て、共有結合した完全なDNA分子とすることができ
る。開裂した2本鎖DNAに「コターミナル」、即ち鈍
感末端を残す様な制限酵素の場合は、この鈍感末端を他
の鈍感末端配列のものと、例えばT4リガーゼにより再
結合して組換えすることができる。
本発明の目的に使用される「クローニング媒体」は完全
な「レプリコン」を含有する非染色体性の1つの2本鎖
DNAであり、この媒体は形質転換により単細胞生物
(微生物)に入れられた時、複製され得るものである。
この様に形質転換された微生物は形質転換体と呼ばれて
いる。現在クローニング媒体として一般に使用されてい
るのはビールスまたは細菌から得られるものであり、最
も普通にはプラスミッドと呼ばれる環状の細菌DNAで
ある。
最近の生化学の進歩により、例えばプラスミッドが外来
性のDNAを含む様な、「組換型」クローニング媒体が
作製される様になった。特殊な例では、この組み換え体
はヘテロローガスDNAを含有することができる。ここ
でいうヘテロロー音ガスDNAとは、この組換型媒体に
より形質転換することのできる微生物によって通常は産
生されないポリペプチドをコードするDNAを意味す
る。例えば、プラスミッドを制限酵素で切断して結合可
能な末端を有する直鎖状DNAを得る。これを結合可能
な末端を持った外来性遺伝子と結合させると、生物学的
機能部分に完全なレプリコンと形質転換体を選択するの
に有用な表現型の性質が付与されることになる。この組
み換え体を微生物に挿入して形質転換し、この形質転換
体を単離してクローン化する。この目的は外来性遺伝子
のコピーを含有している多数の転換体を得ることであ
り、また特殊な場合には、さらにその遺伝子がコードし
ている蛋白質を発現することにある。これに関連する技
術およびその応用についてはRecombinant Moleculesに
詳しく記載されている(Miles International Symposiu
m Series 10:Recombinant Mol−ecules:Impact on Sc
ience and Society, Beers and Bosseff,eds., Raven P
ress, N.Y.1977年)。
複製により遺伝子の数を増やすためにクローニング媒体
を使用することとは別に、遺伝子がコードしている蛋白
質を実際に発現しようという試みがなされ、そのいくつ
かは成功している。その最初の例として、脳ホルモン、
ソマトスタチンがlacプロモーターのコントロールの下
に大腸菌中で発現された(K.Itakura et al. Science 1
98 1056. 1977年)。極く最近、ヒトインシュリンのA
鎖およびB鎖が同じ方法で発現され、結合されてこのホ
ルモンを生成した(D.V.Goeddel et al.Proc.Nat′l. A
cad. Sci., USA 76 106、1979年)。この両者では、遺
伝子はその全てを合成により作製したものであった。い
づれの場合も、細胞内で蛋白質分解酵素が目的とする生
成物を分解するのは明らかであるので、その生成物を複
合体の形で、即ち、「隔離」(compartmental−izatio
n)により目的物を保護し、そして細胞外で切り離され
ることができて所望の生成物を与え得る別の蛋白質と結
合した複合体の形で生成させる必要があった。この研究
は本出願人の出願に係る英国特許GB2007675A
号、GB2007670A号、GB2007676A号
およびGB2008123A号明細書に記載されてい
る。
以上述べたいくつかの例で合成遺伝子による方法が有用
であることがわかったが、生成物がもっと大きい蛋白質
である場合、例えば生長ホルモン、インターフエロンな
どである場合には、それらの遺伝子はこれに応じてさら
に複雑であり、手軽に合成することができないという現
実的な問題がある。同時に、複合蛋白質を伴なっていな
い生成物を発現することが望ましいであろうが、この様
な発現の必要性から、使用する微生物を、目的とする生
成物を製造するのにもってと好適な微生物に変更しなけ
ればならない。
ある研究者たちは、有機合成からではなく、組織から精
製した相当するmRNAからの逆転写により得られた遺
伝子を発現しようと試みた。この試みには2つの問題が
あった。まず第1は、逆転写酵素は所望の全アミノ酸配
列のためのcDNA(相補DNA)を完成しない前に、
mRNAからの転写を停止することがある、ということ
である。従って、例えばVilla−Komaroffらはラットの
プロインシュリンのためのcDNAを得たが、それには
そのインシュリンプリカーサー(前駆体)の最初の3個
のアミノ酸のためのコードンが欠落していた(Proc.Na
t′l.Acad.Sci., USA、75 3727、1978
年)。次に、プリカーサーの形で発現されるポリペプチ
ドのためのmRNAを逆転写したところ、生物活性蛋白
質ではなくそのプリカーサーのためのcDNAが生成し
た。ところでこの生物活性蛋白質は、真核細胞内におい
てはリーダー配列が酵素的に切断除去された結果として
生成するものである。現在まで、この様な機能を発揮す
る細菌は知られていない。従って、mRNA転写体は、
生物活性蛋白質自体ではなくプリカーサーの形の、リー
ダー配列を含んだ発現生成物を製造してしまうのである
(Villa-Komaroff、前記(ラットプロインシュリン)、
P.H.Seeburg et al Nature 276、276、1978年(ラット
のプレ生長ホルモン))。最後に、ヒトのホルモン類
(またはそれらのプリカーサー)をmRNA転写体から
細菌により発現しようという試みでは、明らかに細胞外
で開裂され得ない複合蛋白質が製造されただけであった
(例えば、Villa-Komaroff、前記(ペニシリナーゼ、プ
ロインシュリン)、Seeburg、前記(ベーターラクタマ
ーゼープレ生長ホルモン))。
ヒト生長ホルモン(HGH)はヒトの脳下垂体で分泌さ
れる。191個のアミノ酸からなり、分子量が約21,
500であるこのHGHはインシュリンの3倍以上大き
い。これまで、HGHは限られた供給源、即ちヒトの死
体の下垂体から面倒な抽出によって得られるだけであっ
た。この物質は絶えず不足しており、その適用は下垂体
機能減退矮小発育症の治療に制限されており、またそれ
ですら、信頼できる計算によると、ヒト由来のHGHは
約50%の患者に供給するのがやっとである。
従って、HGHおよびその他のポリペプチド生成物を多
量に製造し得る新規な方法を開発する必要があり、この
要求は、有機合成で製造するには大きすぎるか、従って
また、全合成遺伝子を用いて微生物に発現させることが
困難なポリペプチド類において特に火急を要するもので
ある。哺乳類のホルモンをmRNA転写体から発現する
方法は、合成法に伴なう困難さを回避し得ることを約束
するものではあるが、現在のところ、所望のホルモンを
実際に切り離すことのできない、生物活性のない複合体
を微生物により製造することができるに過ぎない。
本発明は、面倒な全合成による作製に頼らず、暗号配列
の実質的な部分、好ましくは大部分を逆転写により得、
一方その暗号配列の残りを合成することにより、生物活
性を不活性化するリーダー配列またはその他の異質蛋白
質を伴なっていない所望のポリペプチドを発現すること
のできる完全な遺伝子を得、この部分的合成遺伝子を発
現する方法を提供するものである。あるいは、この合成
による残りの部分は、外来性蛋白質が細胞外で開裂され
て生物活性体が得られる様に設計された、蛋白質分解に
抵抗する複合体を生成させるものであってもよい。従っ
て、本発明は、従来、組織から多額の費用をかけて抽出
することにより、限られた量だけ生産されていた種々の
物質、およびこれまで工業的に生産することの出来なか
ったその他の物質を、微生物学的に生産する方法を可能
にするものである。本明細書では、その最も好ましい実
施形式として、細胞内での蛋白質分解を避け、かつ細胞
外での開裂の間生物活性体を異質蛋白質中に隔離してお
く必要性を避けながら、医学的に重要なポリペプチドホ
ルモン(HGH)を細菌により発現する最初の例を提供
する。本発明によって利用できる様になったHGHのた
めの微生物資源により、下垂体機能減退矮小発育症の治
療、並びにこれまで組織から得ていたホルモンではまか
ないきれなかったその他の症状、例えば汎発性胃内出
血、仮関節、火傷治療、傷治療、ジストロフィーおよび
骨結合用として、このホルモンを多量に提供することが
初めて可能となった。
本発明の以上述べた、およびその他の目的や特徴は以下
の記載および好ましい実施形式を例示した添付の図面か
ら、より明らかになるであろう。
第1図は、クローニングに使用するリンカー、開始信号
ATGおよびHGHの最初の24個のアミノ酸をコード
する遺伝子断片を作製するための合成機構を示す。コー
ドストランド、即ち上側の鎖(U)および相補性ストラ
ンド、即ち下側の鎖(L)の矢印は、描かれた断片の形
成に使用されるオリゴヌクレオチドを表わしている。
第2図は、UおよびLオリゴヌクレオチドを結合させて
第1図の遺伝子断片を形成させる結合媒体および該遺伝
子断片のプラスミッドクローニング媒体への挿入を示し
ている。
第3図には、下垂体mRNA転写体のHaeIII制限酵素断
片のDNA配列(コードストランドのみ)が描かれてお
り、それらがコードしているヒト生長ホルモンのアミノ
酸も番号付けして記入してある。ここには非翻訳mRN
Aに相当するDNA(ストップ以下)および主要な制限
部位も示されている。
第4図には、合成に由来しないHGHのアミノ酸をコー
ドする遺伝子断片のためのクローニング媒体の作製およ
びヒト下垂体から単離されたmRNAからの逆転写による相
補DNAの形の該遺伝子断片の作製が示されている。
第5図は、第2図および第4図のプラスミッドを用い
て、細菌内でHGHを発現し得るプラスミッドを作製す
る方法を示す。
本発明の一般的手法は、一緒になって所望の生成物の発
現をコードする複数個の遺伝子断片を、1つのクローニ
ング媒体中に組み合わせることにある。これらの内少な
くとも1個は、Ullrichらの方法(A.Ullrich et al,Scie
nce 196 1313、1977年)などにより組織から単離さ
れたmRNAの逆転写によって得られるcDNA断片であ
る。このcDNAは目的生成物のためのコドンの実質的
な部分、好ましくは少なくとも大部分を提供し、一方遺
伝子の残りの部分は合成により供給される。この合成に
より断片およびmRNA転写による断片は別々にクロー
ンし、最後の組合わせ段階での使用のために量産する。
合成遺伝子と、MaxamおよびGilbert(Proc. Nat′l. Aca
d. Sci. USA 74 560、1977年)の方法で
決定された相補DNAの間に、目的産物のためのコドン
をどの様に分配するかは、種々の考え方によって影響を
受ける。逆転写によって得られる相補DNAは必ず、少
なくとも目的生成物のカルボキシル末端部のためのコー
ドンを含有しており、そのカルボキシル末端に隣接する
翻訳終止信号の下流に非翻訳mRNAのためのその他の
コードンを合せて含有している。非翻訳RNAのための
DNAの存在は、ほとんど無関係である。この種の不当
に長い配列は、所望の生成物のためのDNAを複製し、
発現するのに使用される細胞源を確保しつつ、制限酵素
による開裂等によって除去してもよい。特殊な場合に
は、このcDNAは所望の全てのアミノ酸配列と共に、
目的産物のアミノ末端の上流に異質のコドンを含んでい
る。例えば、全部ではないが、多くのポリペプチドホル
モンは、リーダー配列や例えば細胞膜移送に関連する蛋
白質の信号配列を含んだプリカーサーの形で発現され
る。真核細胞内で表現される場合には、これらの配列は
酵素により除去され、ホルモンはその遊離した形、即ち
生物活性な形でペリプラズム域に入る。しかし微生物細
胞がこの様な機能を営むことは期待し得ないので、mRNA
転写体からこの様な信号配列やリーダー配列を除去して
おくことが望ましい。この様な除去操作中に、翻訳開始
信号も失なわれ、またほとんどの場合、目的産物のため
のコドンの一部も失なわれる。本発明の部分的合成遺伝
子の合成による成分は、これらの後者のコドンを回復す
るものであり、さらに、このハイブリッド(雑種)遺伝
子を最終的に挿入しようとしている媒体が適切に配置さ
れた開始信号を欠いている場合には、新たに翻訳開始信
号を供給するものである。
前駆体生長ホルモンcDNAからのリーダー配列の除去
は、遺伝子の生長ホルモンを暗号づけている部分の内部
にある制限部位を利用することによって好適に行なうこ
とができる。しかし本発明はこの様な部位を利用できる
かどうかに無関係に実施することもできる。即ち、mR
NAに由来しない遺伝子を広範囲に合成する必要性を避
けるための、所望のポリペプチドのアミノ末端に十分近
い場所の制限部位を利用できるかどうかに無関係に実施
することができる。所望のポリペプチドおよびリーダー
配列または他の生物活性を不活性化する配列をコードし
ているcDNAにおいて、後者のコドンと完全(成熟)
なポリペプチドのためのコドンとの境界は、その完全な
ポリペプチドのアミノ酸配列からわかる。単に選択した
そのペプチドをコードしている遺伝子内へ消化してい
き、望ましくないリーダー配列またはその他の配列を除
去すればよい。従って、例えば次の様なcDNAである
とすると、 〔ここで矢印は消化の終止を表わす〕 上側の配列aおよびbを除去する様にエキソヌクレアー
ゼ消化の反応条件を選ぶと、その後S1ヌクレアーゼ消
化により下側の配列cおよびdが自動的に除去される。
あるいは、より正確には、デオキシヌクレオチドトリホ
スフェート(d(A,T,C,G)TP)の存在下でDNAポ
リメラーゼ消化を行なうこともできる。例えば、上の例
では、dGTPの存在下でDNAポリメラーゼを作用さ
せて配列Cを除去し(Gで停止する)、次いでS1ヌクレ
アーゼでaを消化する。dTTPの存在下でDNAポリ
メラーゼを作用させてdを除去し(Tで停止する)、次
いでS1ヌクレアーゼでbを切断する、等々(A.Kornbe
rg,DNA Synthesis,p87−88、T.H.Freeman and Co.,San
Fra−ncisco、1974年参照)。
より好ましくは、Razinらのミスマッチ(不適切な組み
合せ)修復合成法(A.Razin et al,Proc.Nat′l Acad.
Sci. USA 75,4268、1978年)を利用して、目的産物
をコードしているcDNAの部分内の好都合な位置に制
限部位を作製してもよい。この方法によって、ミスマッ
チ置換分を含んでいるプライマーを用いて存在している
DNA配列中の1個またはそれ以上の塩基を置換するこ
とができる。少なくとも7種の回文的4−塩基対配列
が、既知の制限酵素によって特異的に認識される。それ
らは、AGCT(Alu I)、CCGG(Hpa II)、CGCG
(Tha I)、GATC(San 3A)、GCGC(Hha)、GGCC
(Hae III)およびTCGA(Taq I)である。確率的には非
常にしばしばあり得ることであるが、cDNA配列が、
上記の様な認識部位と1個の塩基だけが異なっている配
列を含んでいる場合は、修復合成によって、適切な置換
塩基を含んでる、従って所望の制限部位を含有している
複製cDNAが得られる。開裂によって望ましくないリ
ーダー配列のDNAが除去され、その後、完全なポリペ
プチドの発現に必要なコドンが合成により回復される
(下式参照)。
勿論、所望によりもっと長い制限部位を同様にして挿入
することができるし、また、希望する位置に、この制限
部位に共通している塩基が2個しか存在しない場合で
も、連続修復によって4−塩基制限部位を作製すること
ができることは容易に理解されるはずである。
この技術は、目的生成物のアミノ酸配列だけでなく、外
来性ではあるが特別に設計したある大きさの蛋白質を発
現するのが望ましい場合にも応用される。この様な応用
例として次の4種類のものを挙げることができる。まず
第1に、この部分的合成遺伝子は、付加蛋白と結合する
ことによって免疫原性が付与されるハプテンまたはその
他の免疫決定因子を発現してもよく、この様にしてワク
チンが製造され得る(英国特許第2008123A号明
細書参照)。また、生物学的安全性の見地から、目的と
する生成物を、細胞外で開裂して活性体に変換し得る様
に設計したその他の生物活性不活性化蛋白質との複合体
の形で発現してもよい。第3の応用は、細胞膜を通って
排泄された生成物の輸送信号ポリペプチドを開裂するこ
とが出来るならば、所望の生成物の前に輸送信号ポリペ
プチドをつけて、細胞膜を通して排泄させることにより
目的産物を製造することができる。最後に、細胞外で特
異的に開裂され得る様に設計された外来性蛋白質との複
合体は、そうしなければ微生物宿主にとって内因性の蛋
白質分解酵素で容易に分解されてしまう目的産物を隔離
するのに使用し得る。これらの内、少なくとも最後の3
つの応用例では、mRNA転写体の暗号配列を完全にす
る為に使用される合成によるこの「アダプター分子」
は、例えば酵素の作用によって特異的に開裂され得るア
ミノ酸配列のためのコドンをさらに持っていてもよい。
例えば、トリプシンまたはキモトリプシンはアルギニン
−アルギニン(arg−arg)またはリジン−リジン(lys
−lys)などで特異的に開裂する(英国特許第2008
123A号、前記) 以上記載したことから明なかな様に、本発明は非常に多
方面の応用性を持っており、それらはいづれも以下に述
べる共通した特質を持っている。
1.目的とするポリペプチドのアミノ酸配列の実質的な部
分をコードしているmRNA転写体であるが、それ自体
を発現した場合、目的産物より大きいかあるいは小さ
い、異なったポリペプチドが産生されるであろうmRN
A転写体を使用する。
2.目的産物に含まれているアミノ酸配列以外のアミノ酸
配列のための蛋白質暗号化コドンが存在する場合は、こ
れを除去する。
3.有機合成により、所望の配列の残りの部分をコードす
る断片を製造する。
4.mRNA転写体および合成断片を結合し、プロモータ
ーを含有しているクローニング媒体に入れ、これを複製
し、そして異質複合蛋白質を含まない目的産物、または
異質蛋白質と複合してはいるがそれから特異的に切断し
得る目的産物を発現する。
勿論、発現生成物はいづれの場合も、翻訳開始信号によ
って暗号化されているアミノ酸から始まる(ATGの場
合はf−メチオニン)。これは細胞内で除去されると期
待し得るし、またいづれにせよ、最終生成物の生物活性
には本質的な影響を与えないと期待し得る。
本発明は抗体、酵素などの有用な蛋白質の製造に一般に
利用し得るものであるが、特に哺乳動物のポリペプチド
ホルモン類およびその他の医療に使用し得る物質、例え
ばグルカゴン、胃腸抑制ポリペプチド、すい臓性ポリペ
プチド、アドレノコルチコトロピン、ベーターエンドル
フィン、インターフエロン、ウロキナーゼ、凝血因子、
ヒトアルブミンなどを発現するのに特に適している。以
下に本発明の好ましい実施形式を記載するが、これは、
ヒト生長ホルモンをコードする部分的合成遺伝子を作製
し、クローンし、そして微生物により発現するものであ
る。
ヒト生長ホルモンのためのクローニング媒体の作製およ
び発現 1.mRNA転写体のHae III断片のクローニング Ullrichらの方法により、HGHのためのポリアデニル
化mRNAを、下垂体生長ホルモン産生腫瘍から作製し
た(A.Ullrich et al.Science 196,1313、1977年)。Wi
ckensらの方法に従い、このRNA5μgから2本鎖(ds
と略す)cDNA1.5μgを作製した(Wickens et al.
J.Biol.Chem. 253 2483、1978年)。ただし、2番目の鎖
の合成には、DNAポリメラーゼIの代りにRNAポリ
メラーゼ「Klenow frag−ment」を使用した(H.Klenow,Pro
c.Nat′l.Aci.USA.65 168,1970年)。HGHの制限パタ
ーンについては第3図に示す様に、Hae III制限部位が
3′非暗号領域内およびHGHの23および24番目の
アミノ酸をコードする配列内に存在する。このds HGH c
DNAをHae IIIで処理するとHGHの24から191番目の
アミノ酸をコードする551の塩基対(bpと略す)から
なるDNA断片が得られる。例えばcDNA90ngをHa
e IIIで処理し、8%ポリアクリルアミドゲルで電気泳
動し、550bpの領域を溶離すると、約1ngのcDN
Aが得られる。
Bolivarらの方法によって調製したpB322を、このcDN
Aのためのクローニング媒体として選択した(F.Boliva
r et al.Gene 2 95−113、1977年)。pBR322の特徴
は十分に解明されており(J.G.Sutcliffe,Cold Spring
Harbor Symposium 43 70、1978年参照)、これは多
数のコピーを複製するプラスミッドである。また、この
プラスミッドはアンピシリンおよびテトラサイクル耐性
遺伝子(それぞれApR、TcRと表わす。第4図参照)を含
んでいるのでアンピシリンおよびテトラサイクリンの両
者に対して耐性を有し、また、制限酵素Pst I、EcoRIお
よびHind IIIの認識部位を含んでいる。
Hae IIIおよびPst Iの両者とも、それによる開裂生成
物は鈍感末端を有する。従ってChangらの「GCテイリング
法」(Chang.A.C.Y.et al.Nature 275 617、1978年)を用
いて、pBR322をPst Iで開裂した鈍感末端生成物とmR
NA転写体をHae IIIで消化したものを結合することが
でき、cDNA断片をpBR322のpst I部位に挿入してc
DNA上にHae III制限部位(GG↓CC)を復元する
一方、その挿入体のそれぞれの末端にPst I制限部位
(CTGCA↓G)を復元することができる。
前記した様に、ターミナルデオキシヌクレオチジルトラ
ンスフエラーゼ(TdT)を用いて、3′末端に約20
dCを付加した(Chang.A.Y.C.,前記)。同様にして、60
ngのPstIで処理したpBR322の3′末端に約10個の
dGを付加した。このdC付加Dds cDNAとdG付加ベク
ター(媒体)DNAを、10mMトリス−Hcl(pH
7.5)、100mM NaCl、0.25mM EDTAの130μ
l中でアニーリングした。この混合物をE.Coli×1776の
形質転換に使用する前に、70℃に加熱し、徐々に37
℃まで冷却し(12時間)、次いで20℃に冷却した
(6時間)。×1776でクローンしたこのプラスミッドpH
GH31につき、MaxamおよびGilbertの方法(Proc.NaT′
l.Acad.Sci.USA 74 560、1977年)を用いてDNA配列を
分析した結果、第3図に示す様にHGHの24から19
1のアミノ酸のためのコドンが確認された。
E.Coli K−12株×1776はF-tonA53dapD8min A1 supE42
△40〔gal−uvrB〕λminB2 rfb−2 nalA25 oms−2 th
yA57* metC65 oms−1 △29〔bioH−asd〕 cycB2 cycA1
hadR2の遺伝子型を有する。×1776はアメリカ予防衛生
研究所(NIH)により、EK2宿主ベクター系として
公認されている。
×1776はジアミノピメリン酸(DAP)偏性要求性菌で
あり、ムコ多糖類コラン酸(colanic acid)を合成するこ
とができない。従って、細胞の代謝および生長を支える
に十分な栄養は存在しているが、DAPが欠乏している
環境ではDAP欠乏で死亡する。これはチミンまたはチ
ミジンを要求し、代謝活性を維持するに十分な栄養はあ
るがチミンおよびチミジンがない環境では、DNAの崩
壊を伴なってチミン欠乏で死滅する。×1776は胆汁に対
する感受性が極めて強く生存することができない。従っ
てラットの胃腸管を生きて通過することができない。ま
た、×1776は洗剤、抗生物質、薬物および化学薬品に対
して感受性が非常に強い。さらに×1776は紫外線による
損傷を暗回復または光回復することができず、従って野
生型のE.Coli(大腸菌)より太陽光に対する感受性が数
オーダー強い。×1776は多くの形質導入フアージに対し
て抵抗し、種々の突然変異がために、異なったタイプの
複合プラスミッド(conjugative plasmids)の遺伝には複
合が不十分である(con−jugation deficient)。×1776
は、ナリジクシックアシッド(nalidixic acid)、サイク
ロセリンおよびトリメトプリムに対して抵抗性がある。
従って、これらの薬物を培地に加えることにより、この
株をモニターし、形質転換中、汚染菌の形質転換を不可
能にすることができる。
×1776は、100μg DAP/mlおよび4μgチミジン/ml
を追加したLブロスまたはペナセイ(Penassay)ブロス
中、約50分の世代時間で生長し、定常期には8〜10
×108細胞/mlの密度に達する。1〜2分渦巻き状に
そして前後にゆっくり振盪して細胞を100%生存可能
の状態に保って懸濁する。×1776についてのさらに詳し
いことはCurtisらの文献を参照のこと(R.Curtis et a
l.,Molecular Cloning of Recombinant DNA、99−177、
Scott and Werner eds.,Academic Press、N.Y.1977
年)。×1776は1979年7月3日、アメリカン・タイ
プ・カルチャー・コレクション(ATCC)に寄託され
た(ATCC番目31537、無制限寄託)。
2.合成遺伝子断片の作製およびクローニング(第1図お
よび第2図参照) HGH部分的合成遺伝子の作製計画は、mRNA転写体と結
合するであろう位置に隣接して鈍感末端制限開裂部位を
有する合成遺伝子を作成することであった。従って、第
1図に示す様に、このHGHの最初の24個のアミノ酸
のための合成遺伝子は、23番目のアミノ酸に続いてHa
e III開裂部位を含んでいる。この合成断片の遠位末端
にはリンカーが設けられている。このリンカーにより、
合成断片は、mRNA転写体および合成断片が最終的に
結合するプラスミッドの、制限開裂によって生じる1本
鎖末端とアニーリングすることができる。
第1図に示す様に、2本鎖断片の5′末端には、Eco RI
およびHindIII制限エンドヌクレアーゼのための一本鎖
接着末端が含まれており、これによりプラスミッドの作
製が容易に促進される。左末端のメチオニンコドンは翻
訳開始部位を提供している。11量体から16量体の種
々の大きさの12本の異なったオリゴヌクレオチドをCr
eaの改良ホスホトリエステル法により合成した(Crea,R.
Proc.,Nat′l.Acad.Sci.USA 75 5765、1978年)。U1から
U6、およびL1からL6のこれらのオリゴヌクレオチドは矢
印で示してある。
10μgのUからUおよびLからLを、公知の
方法に従い、Tポリヌクレオチドキナーゼおよび(γ
32−P)ATPを用いて加燐酸化(phosphorylate)した
(Goeddel,D.V.ら、Proc.Nat′l.Acad.Sci.USA 76 106、
1979年)。Tリガーゼを触媒として用いた3つの別々
の反応を行なった:即ち、10μgの5′−OH断片U1
を加燐酸化したU,LおよびLと結合し;加燐酸
化したU3,U4,L3およびLを結合し;そして10μg
の5′−OH断片L1を加燐酸化したL2,U5およびU6と結
合した。これらの結合反応は300μlの20mMトリ
ス−塩酸(pH7.5)、1 mM MgCl2、10mMジチオトレ
イット、0.5mMATP中、Tリガーゼ100単位を
用い、4℃で6時間行なった。次いで、これらの3種の
結合混合物を合わせ、Tリガーゼ100単位を加え、
20℃で12時間反応させた。この混合物をエタノール
で沈殿させ、10%ポリアクリルアミドゲル上で電気泳
動した。84塩基対移動帯をゲルから切取り、溶離し
た。pBR322(1μg)をEco RIおよびHibd IIIで
処理し、大きい断片をゲル電気泳動法で単離し、合成D
NAと結合した。この混合体を用いてE.Coli.K−12株2
94(end A.thi- hsr-、hsmk +)を形質転換した。294株は
1978年10月30日、ATCCに寄託された(AT
CC番目31446、無制限寄託)。1個の形質転換体
のプラスミッドpHGHからのEco RI−Hind III挿入
体の配列をMaxamおよびGilbertの方法(前記)により分
析した結果、第1図に示した通りであることを確認し
た。
3.細菌によるHGHの発現のためのプラスミッドの作製
(第5図) pHGH3中の合成断片およびpHGH31中のmRN
A転写体を用い、発現用プラスミッドPGH6を使用し
て、第5図に示す様に、両方の断片を含有する複製可能
なプラスミッドを作製した。まず、縦列lacプロモータ
ーを含有するこの発現用プラスミッドを次の様にして作
製した。Backmanらの方法に従い、95塩基対の非相同
(heterologous)DNA断片で分離されている2個の95
塩基対UV5lacプロモーター断片を含有する285塩
基対Eco RI断片をプラスミッドpKB268から単離し
た(K.Backman,et al.,Cell13巻 65−71、197
8年)。この285塩基対断片をpBR322のEco RI
部位に挿入し、テトラサイクリン耐性遺伝子を持った適
切な解読相内に向って配置しているプロモーター群を有
するクローンPGH1を単離した。このテトラサイクリ
ン耐性遺伝子から遠位のEco RI部位をEco RIによる部分
消化で破壊し、その結果得られる1本鎖Eco RI末端をD
NAポリメラーゼIで修復し、鈍感末端結合によりプラ
スミッドを再環化した。作成されたプラスミッドpGH6
は、完成したHGH用遺伝子を挿入することができるプ
ロモーター系について適切に配置された単一のEco RI部
位を含有している。
RNA転写体と結合させるための合成断片を得るため
に、10μgのpHGH3をEco RIおよびHae III制限エ
ンドヌクレアーゼで開裂させ、HGHアミノ酸1〜23
の暗号配列を含有している77塩基対断片を8%ポリア
クリルアミドゲルで分離した。
次いで5μgのプラスミッドpHGH31をHae IIIで
切断した。551塩基対HGH配列および一緒に移動し
たpBR322の540塩基対をゲル電気泳動法により
精製した。次いでXma Iで処理してHGH配列のみを切
断し、3′非コード領域から39塩基対を除去した。得
られた512塩基対断片を、540塩基対のpBR32
2Hae III切片から、6%ポリアクリルアミドゲルを用
いた電気泳動により分離した。0.3μgの77塩基対
Eco RI−Hae III断片を16μlの反応液中、T4リガー
ゼを用いて4℃で14時間ポリメリ化した。リガーゼを
不活性化するために、この混合物を70℃で5分間加熱
し、次いでEco RI(Eco RI部位によってダイマー化(二
量化)した断片を開裂するため)およびSma I(Xma I
ダイマーを開裂するため)で処理し、Eco RI接着末端お
よびSma I鈍感末端を有する591塩基対断片を得た。
6%のポリアクリルアミドゲルを用いて精製し、この断
片約30ngを得た。ところで、発現性プラスミッドp
GH6はXma I認識部位を含んでいないことに留意すべ
きである。しかしながら、Sma IはXma Iと同じ部位を
認識し、しかしその中間部を切断し、鈍感末端を生成す
るのである。従ってpHGH31から導かれたこの断片
のSma−切断末端は、鈍感末端でpGH6に結合していくこ
とができる。
縦列lac UV5プロモーターを含む発現用プラスミッドp
GH6を、順次Hind III、ヌクレアーゼS1およびEco
RIで処理し、ゲル電気泳動法により精製した。この様に
して得た1個のEco RI接着末端および1個の鈍感末端を
有するベクター50ngを、10ngの591塩基対H
GH DNAと結合させた。この結合混合物を用いてE.
Coli×1776を形質転換した。テトラサイクリン(12.5μ
g/ml)に抵抗して生長するコロリーを選択した。ハイ
ブリッド(雑種)HGH遺伝子をpGH6に挿入するこ
とによってテトラサイクリン耐性遺伝子のためのプロモ
ーターが破壊されるが、縦列lacプロモーターによって
テトラサイクリン耐性のための構造遺伝子が通読され、
この選択特性が保持されることに注目すべきである。こ
の様にして約400の形質転換体を得た。Grunstein−H
ognessの方法によるフィルターハイブリダイゼーシヨン
によってHGH配列を含む12のコロニーを確認した(P
roc.Nat′l.Acad.Sci.USA,72 3961、1975年)。これら
のコロニーの内、3種のコロニーから分離したプラスミ
ッドが、Hae III、Pvu IIおよびPst Iで開裂した時、
期待する制限パターンを示した。1個のクローン、pH
GH107のDNA配列を測定した。
この形質転換体によって発現されたヒト生長ホルモン
は、フアデバスHGHプライストキット(Phadebas HGH
PRIST Kit、Farmacia)を用い、溶菌上澄液を順次希釈
したものを直接放射免疫分析することにより簡単に検出
された。
HGHの発現がlacプロモーターのコントロール下(支
配下)で行なわれたことを示すために、pHGH107
をlacレプレッサーを過剰生産するE.Coli株D1210l
ac+(iQo+Zty+)に入れた。インデューサー、IPT
G(イソプロピルチオガラクトシド)を添加するまで、
有意な量のHGH発現生成物は検出されなかった。
pHGH107のEca RI部位を除去することにより、la
cプロモーターのリボゾーム結合部位コドンとATG開
始信号との距離は、天然におけるそのリボゾーム結合部
位コドンとβ−ガラクトシダーゼのための開始信号との
間の距離と同じになるであろう。この天然の距離を模倣
することによって発現が増加するかどうかを調べる為
に、pHGH107をEco RIで開裂し、得られた1本鎖
末端をS1エンドヌクレアーゼで消化し、次いでT4リ
ガーゼを用いて鈍感末端結合して再環化することによ
り、pHGH107をpHGH107−1に変換した。
この様にして得たプラスミッドは同様にHGHを発現す
ることができるけれども、驚くべきことに、発現の程度
はpGH107より低いことが直接放射免疫分析によっ
てわかった。
本発明は上に述べた好ましい実施形式に限定されるので
はなく、特許請求の範囲の記載によってのみ限定される
ものであることは、当業者には容易に理解されるだろ
う。プロモーター系、親プラスミッド、目的とするポリ
ペプチド生成物またはその他の因子を種々選択し直すこ
とにより、これまで述べたものに種々の変更を加えるこ
とは勿論可能である。例えば、他のプロモーター系を本
発明において使用することができる。この様なプロモー
ター系としてはラムダープロモーター、アルビノースオ
ペロン(Phi 80 d ara)、またはコリシンE1、ガラク
トース、アルカリホスフアターゼあるいはトリプトフア
ンプロモーター系などを挙げることができる。細菌によ
る発現のために使用する宿主生物としては、例えばエン
テロバクテリアケア(Enterobacteriaceae)、例えば大腸
菌株、サルモネラ(Salmonella);バシラーケア(Bacilla
ceae)、例えば枯草菌(bacillus subtilis);肺炎球菌(P
neumococcus);連鎖球菌(Streptococcus);およびイル
フルエンザ菌(Haemophilus influenzae)などが挙げられ
る。勿論、どの微生物を選ぶかによって、アメリカ予防
衛生研究所の組み換えDNAのためのガイドライン(43F
ed.Reg.60,080、1978年)に従って行なわなければならな
いクローニングおよび発現操作において、物理的封じ込
めの程度を調節しなければならない。
本発明は実験室規模で実施するのは好ましいけれども、
E.Coli×1776は、生物学的安全性の為に故意に虚弱性が
導入されているので、大規模に工業生産するには限界が
あることがわかった。生物学的封じ込めよりも、むしろ
適当な物理学的封じ込めを行えば、E.Coli.K−12株294
(前記)およびE.Colf.株RRI、遺伝子型:Pro- Leu-
Thi- RB - recA+Strr Lacy-の様な微生物を大規模操作
に使用することができる。E.Coli.RRIは、Hfrドナー
(高頻度組換型供与菌)としてのE.Coli.K12株KL
16とかけあわせることにより、E.Coli HB101(H.W.Boy
erら、J.Mol.Bio.41 459−472、1969年参
照)から得ることができる(J.H.Miller,Experiments in
Molecular Genetics;Cold Spring Harbor,New York,
1972年参照)。E.Coli.RRIは、1978年10月3
0日、ATCCに寄託された(無制限寄託、ATCC番
号31343)。×1776株そ同様に1979年7月3
日、ATCCに寄託された(ATCC番号3153
7)。その他、プラスミッドpHGH107(ATCC
番号40011)、プラスミッドpGH6(ATCC番
号40012)、pHGH107で形質転換した×1776株
(ATCC番号31538)およびpGH6で形質転換
したE.Coli K12株294(ATCC番号3153
9)も1979年7月3日、ATCCに寄託された。
本発明によって製造される微生物は、ヒト生長ホルモン
を工業的スケールで発酵により製造する方法に使用する
ことができ、多量の生成物を得ることができ、従来不可
能であった分野に使用することができる。例えば形質転
換E.Coli株は、常法により通気し、攪拌している鋼鉄製
またはその他の発酵容器中の水性培地、例えば、適当な
栄養物(例えば炭水化物またはグリセロール)、硫酸ア
ンモニウムの様な窒素源、燐酸カリウムの如きカリウム
源、微量元素、硫酸マグチシウムなどを含んだ、ほぼ中
性pHの(例えばpH7±0.3)、約37℃の水性培
地中で増殖させることができる。形質転換微生物は、抗
生物質耐性の如き1またはそれ以上の選択特性を示すこ
とが好ましく、それによって選択圧がかかって野生型E.
Coliの競合増殖が抑制される。例えば、アンピシリンま
たはテトラサイクリン耐性微生物の場合、その抗生物質
を発酵培地に加え、それに対する耐性を持っていない野
生型生物を選別することができる。
発酵が完了したら細菌懸濁液を遠心分離するかあるいは
ブロスから細胞固形物を集め、次いで物理的または化学
的方法で細胞溶解する。上澄から細胞の残骸を除去し、
可溶性生長ホルモンを単離精製する。
ヒト生長ホルモンは、細胞抽出物から、以下のいづれか
の方法により、またはそれらを組み合わせることによっ
て精製することができる。(1)ポリエチレンイミン分別
法、(2)セフアクリル(Sephacr-yl)S−200によるゲ
ル過クロマトグラフィー、(3)ビオレックス(Biorex)
−70レジンまたはCMセフアデックスによるイオン交
換クロマトグラフィー、(4)硫酸アンモニウムおよび/
またはpH分別法、および(5)ハイブリードマス(hybrid
omas)または免疫感作動物から単離した抗−HGH IgG
から調製した抗体レジンを用いたアフィニィティークロ
マトグラフィー;このホルモンは酸性条件または僅かに
変性させた条件下で脱着させる。
【図面の簡単な説明】
第1図はHGHの最初の24個のアミノ酸をコードする
遺伝子を含有する合成遺伝子断片の模式図、第2図は合
成遺伝子のプラスミッドへの挿入を示す模式図、第3図
はHGHをコードしているmRNA転写体のDNA配列
を示す模式図、第4図はmRNA転写体のプラスミッド
への挿入を示す模式図、第5図はHGHを発現し得るプ
ラスミッドの作製を示す模式図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 (C12N 1/21 C12R 1:19) 微生物の受託番号 ATCC 31539 (56)参考文献 特開 昭55−45395(JP,A) 特開 昭54−163600(JP,A) Science Vol.198(1977) 1056−1063 Nature Vol.275(1978)617 −624

Claims (9)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】アミノ酸配列が知られている特定のポリペ
    プチドをコードしている遺伝子をクローニング媒体に挿
    入して発現プロモーターの支配下に置くことにより該ポ
    リペプチドを細菌中で発現する技術における複製可能な
    クローニング媒体の作製方法であって、 a)メッセンジャーRNAからの逆転写により、該ポリペ
    プチドのための暗号配列の少なくとも実質的な部分を含
    んではいるが、該ポリペプチドとは異なった生成物を発
    現する第1遺伝子断片を得、 b)該第1遺伝子断片が、該ポリペプチドに含まれている
    アミノ酸配列以外のアミノ酸配列のための蛋白質暗号化
    コドンを含んでいる場合には、該ポリペプチドのための
    暗号配列の少なくとも実質的な部分を保持しながら該蛋
    白質暗号化コドンを除去し(この場合、得られた断片が
    尚該ポリペプチドとは異なる発現生成物をコードする様
    に該蛋白質暗号化コドンを除去する)、 (ただし、工程a)または、要すれば工程b)の生成物は
    該ポリペプチドの全てのアミノ酸配列より少ないアミノ
    酸配列を暗号化している断片であり)、 c)該ポリペプチドのアミノ酸配列の残部を暗号化する1
    個またはそれ以上の遺伝子断片を有機合成により得(少
    なくとも1個の遺伝子断片は、該ポリペプチドをコード
    するDNAの先端に位置する開始コドンATGを含む該
    ポリペプチドのアミノ末端部を暗号化している)、そし
    て、 d)工程c)の合成遺伝子断片および、その時の事情次第で
    工程a)またはb)により作製した断片を、複製可能なクロ
    ーニング媒体の、発現プロモーターの支配下にあるお互
    いにとって適当な読み取り相に位置づけ、該ポリペプチ
    ド全長をコードするDNAがその5′末端に開始コドン
    ATGを含む様にすることからなる、 該ポリペプチドのアミノ酸配列を発現し得る複製可能な
    クローニング媒体の作製方法。
  2. 【請求項2】工程d)のクローニング媒体が細菌プラスミ
    ッドである第1項に記載の方法。
  3. 【請求項3】該ポリペプチドのアミノ末端部を暗号化し
    ている合成断片は、さらに特異的に切断し得るアミノ酸
    配列の発現を暗号化しており、この断片は発現された蛋
    白質暗号化コドンの下流であって、しかも同じ読み取り
    相内に挿入されており、これによって複合プラスミッド
    発現生成物は特異的に切断されて該ポリペプチドを生成
    する、第2項に記載の方法。
  4. 【請求項4】該ポリペプチドのアミノ酸配列が異質蛋白
    質を伴なわずに発現され得る第2項に記載の方法。
  5. 【請求項5】工程a)の断片が、少なくとも該ポリペプチ
    ドの暗号配列の大部分を有している第4項に記載の方
    法。
  6. 【請求項6】合成断片およびメッセンジャーRNA転写
    体断片をクローニング媒体中に挿入する前に互いに結合
    させる(ここでこの合成断片および転写体断片の両末端
    は、この2個の断片が該ポリペプチドを発現するために
    適切な順序で結合する様に、種々の一本鎖末端または平
    滑末端としておく)、第2項に記載の方法。
  7. 【請求項7】該ポリペプチドがヒト生長ホルモンであ
    り、該第1断片がヒト生長ホルモンのアミノ酸配列以外
    のアミノ酸配列のための蛋白質暗号化コドンを含んでお
    り、b)の除去工程によって第1断片のHaeIII制限酵素
    断片を生成する第5項に記載の方法。
  8. 【請求項8】工程b)が、HaeIII断片を異なった制限酵
    素で消化することにより、非翻訳メッセンジャーRNA
    のコドンを切断除去すると共に生成した断片の一端に一
    本鎖末端を与える操作を包含する第7項に記載の方法。
  9. 【請求項9】第2の制限酵素がXmaIである第8項に記
    載の方法。
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