JPH06501842A - 修飾リボザイム - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
修飾リポザイム
一定の天然に生じるリポ核酸(RN A S )は、自己切断を行なう。第1に
報告された例は、補助因子としてのグアノシンを必要とする原生動物テトラヒメ
ナ(Cech、^nn、Rev、Biochem、59 (1990)、543
−568参照)のリポソームRNA前駆物質の切断である。その後に、RN A
切断の多数の例がウィロイド、ウイルソイドおよびサテライトRNA中に見い出
された( 5held。
n他、Nucleic Ac1ds and Mo1ecular Biolo
gy (1990)第4巻、第227〜242頁、F、 Ecksteinおよ
びり。
M、 J、 Li1ley41. Springer Verlag Berl
in [Ieidelberg; Symons、 TlB514 (1989
)、 445−450) 、この切断は、5′−ヒドロキシルおよび2’、3’
一環式ホスホジエステル末端を生じるM g 2“のような二価陽イオンの存
在下にホスホジエステル結合の部位特異的切断を包含する。このような幾つかの
RNAの自己切断の部位の周囲の連続的分析により、“ハンマーヘッド(ha■
erhead)”構造と名付けられた切断にとって本質的な共通の構造特徴の一
致を導いた( Hutchins他、 Nucleic Ac1ds Res、
14 (1986) 3627−3640) 、この構造は、1つの特殊な位
置で切断を受け入れる三次元構造を形成する、3個の螺旋および13個の保存ヌ
クレオチド(下記の図の中で枠で囲んだ部分)から構成されている。自己触媒さ
れた切断は、通常、筋肉内プロセスであり、即ち単RNA分子は、切断に必要な
全ての機能を有する。しかし、ウーレンベック(Uhlenbeck)CNat
ure 328 (1987)、 596−600)は、このハンマーヘッド構
造が一本鎖中に埋封されなければならないのではなく、二本鎖から構成させるこ
とができることが証明された。これら2つの鎖は結合してハンマーヘッド構造を
形成し、このハンマーヘッド構造は、鎖の1つ(S鎖)中で(矢印で示されたよ
うな)ホスホジエステル結合の切断を導き、これとは異なり、鎖の他方(AE鎖
)は、老化しないままでありかつ多数の切断反応を期待することができる。この
鎖は酵素の定義に適合し、リポザイムと呼ばれる。枠で囲まれた配列(下記の図
)は、保存されているけれども、他のものは変化可能であり、但し、一対の塩基
構造および一本鎖領域は、無傷のままである。
ppp
G
G
A
トリヌクレオチドGUC後の切断反応は、詳細に研究された( Ruffner
他、 Gene 82 (1989)、 31−41; Fed。
r and Uhlenbeck、 Proc、 Natl、^cad、 Sc
i、 USA87(1990)、 1668−1672)。新しい特異性を有す
るリポザイムも構成され(HaseloffおよびGerlach、 Natu
re 334(1988)、 585−591) 、この場合には、例えば配列
GUA1GUU、CUC,AUCおよびUUCの後に切断が起こり得ることが指
摘されている。
更に、RNA酵素の例は、ヘアピンRN A (HaIIlpel池、 Nuc
leic Ac1ds Res、 1g (1990)、 299−304)
、ならびにタンパク質を含有するRNA1例えばテロメラーゼ(Greider
およびBlackburn、 Nature 337 (1989)。
331−337)およびRNアーゼP (Baer他、 Nucleic Ac
1ds and Mo1ecular Biology (1988)、第3巻
、第231〜250頁、 F、 Ecksteinおよびり、 M、 J、 L
illey編、 Springer Verlag、 Berlin#Ieid
elberg)である。
リボザイムは、治療剤としての使用に特に重要である(Rossi and 5
arver、TIBTECU 8(1990) 、179−183、参照)。1
つの可能な方法により、例えばウィルス遺伝子および特殊な内因性遺伝子のよう
な2つの異質遺伝子の表現に必要とされるRNAは破壊されうる。このことは、
標的RNAと一緒にハンマーヘッド構造またはヘアピン構造を形成することがで
きかつこの構造を予め定められた位置で切断することができるRNA分子の構成
を必要とする。この方法によりHIV−1ウイルスを阻害するための最初の適用
は、報告された( 5arver池、 5cience 247 (1990)
、1222−1224)。生体内での標的ハンマーへッドリボザイムの作用の
他の例は、カンメロン(Caa+maron)およびジエニングス(Jenni
ngs)によって報告されており(Proc、 Natl、^cad、 Sci
、 USA 86 (1986) 、9139−9143) 、かつ試験管内で
の場合は、コツテン(Cotten)池によって報告されている( Mo1.
Ce11. Biol、 9 (1989) 、 4479−4487)。
更に、リポザイムの他の有用な触媒作用の性質、例えばデホスホリラーゼ活性お
よびヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性は、公知である(国際公開WQ88
104300、参照)。この場合には、公知のタンパク質酵素と区別される、高
い配列特異性を有するオリゴヌクレオチド基質をデホスホリル化することができ
るRNA酵素が開示されている。RNA分子は、RNAポリメラーゼとして作用
することができ、外側鋳型よりもむしろ内側鋳型を使用するようなタンパク質酵
素と区別される。従って、種々のヘテロポリマーは、変異型RN A酵素形によ
って構成されうる。このことは、例えば特殊なタンパク質またはペプチドのため
にメツセンジャーRNA分子を形成することができる。更に、ヘルシュラーク(
Herschlag)およびチェック (Cech) (Nature 344
. (1990) 、405−409) は 、DNアーゼ活性を有するRNA
酵素を記載している。
RNA酵素は、治療剤として有用であるために、標的細胞中に導入されなければ
ならない。リポザイムを標的細胞中に運搬するために主要な2つの方法が存在す
る:
(a)予め形成された合成RNAの外因性の運搬;(b)プラスミド上に位置し
たりポザイム解読遺伝子の内因性転写。
方法(a)の重大な欠点は、生存している細胞内に存在する種々のりボヌクレア
ーゼ酵素による迅速な崩壊に基づく生理的条件下でのRNA分子の著しく低い安
定性にある。方法(b)の欠点は、特異的および安定的にリポザイム解読遺伝子
を高級有機物の細胞中に挿入することの著しい困難さをまねく。更に、生体内で
合成されたRNA分子を用いた場合には、崩壊の問題も起こる。
従って、本発明の基礎を為す問題は、治療剤として使用することもでき、生化学
的または生物工学的方法で生物触媒として使用することもできる、触媒活性と、
化学的崩壊および酵素的崩壊に対する増大された安定性の双方を有するRNA分
子を提供することであった。
しかし、パーロールド(Perreault)他による最近の刊行物(Natu
rc344 (1990) 、565−567)の記載から、RNA酵素の一定
の修飾、例えばリボザイムの少数の位置での2′−デオキシリボヌクレオチドの
取り込みにより触媒活性の著しい損傷が生じることは、知られていた。
ところで、意外なことに、一定の化学的修飾は、RNA分子の安定性を増大させ
るリポース糖の2′位でリボザイムの触媒作用の性質に殆ど影響を与えずおよび
/またはこの性質を破壊しないことが見い出された従って、本発明の目的は、リ
ポース糖の2′位でのヒドロキシ基がハロゲン原子、スルフヒドリル基、アンド
基、アミノ基、モノ置換アミノ基およびジ置換アミノ基から選択された変更因子
基によって代替されているような少なくとも1つの修飾ヌクレオシドからなる触
媒活性を有するRNA分子を提供することである本発明によるRNA分子の触媒
活性は、有利にヌクレオチジルトランスフエラーゼ活性、デホスホリラーゼ活性
、デオキシリボヌクレアーゼ活性および配列特異的エンドリボヌクレアーゼ活性
からなる群の少なくとも1つを有する。有利に触媒活性は、配列特異的エンドリ
ボヌクレアーゼ活性を有する。よりいっそう有利ニハ、RNAは、上記のような
ハンマーへッドリポザイムである。殊に有利なのは、リボザイムが別のRNA鎖
と結合することができ、2本の鎖からなるハンマーヘッド構造を形成することで
あり、この場合修飾RNA鎖は、上記のようにE鎖である。
ハンマーへッドリボザイムは殊に好ましいけれども、他のRNA#素、例えば天
然に生じる形またはその短縮された形(Zang他、Biochemistry
27 (1988)、 8924−8931)のテトラヒメナリボザイム(C
ech、^nn、 Rev、 Biochem、 59 (1990)、 54
3−568)および殊にヘアピンRN A (Hampel他、Nucleic
Ac1ds Res、1g (1990)299−304)またはRNA含有
タンパク質、例えばRNアーゼ p (Baer他、 Nucleic Ac1
ds & Mo1ecular Biology (1988)、第3巻、第2
31〜250頁、F、Ecksteinおよびり、 M、 J、 Li1ley
、 Springer Verlag Heidelberg) 、トoメラー
ゼ(GreiderおよびBlackburn。
Nature 337 (1989)、 331−337)も、本発明によッテ
包含される。
また、リボース糖の2′位での変更因子基の配合は、選択の二者択一的作業周期
(TuerkおよびGold、 5cience 249 (1990)、 5
05−510: Ellingtonおよび5zostark、 Nature
346 (1990)、 81L822)に依存する方法によって誘導された
かまたは任意の他の方法によって誘導された新しい官能基を有するRNAに特に
有用であると思われる。
リボース糖の2′位のヒドロキシ基の代わりの変更因子基は、ハロゲン原子、ス
ルフヒドリル基、アジド基、アミノ基、モノ置換アミノ基およびジ置換アミノ基
から選択される。ハロゲン原子は、弗素原子、塩素原子、臭素原子または沃素原
子であることができ、この場合には弗素原子が好ましい。置換アミノ基の置換骨
は、有利に01〜C3アルキル基および/またはヒドロキシアルキル基である。
最も好ましくは、変更因子基は、ハロゲン原子または非置換アミノ基である。
リボース糖の2′位での変更因子基の配合は、酵素切断に対するR N A安定
性を著しく増大させる。リポザイムの特異的位置で配合された2′〜デオキシ−
2′−フルオロウリジンおよび2′−デオキシ−2′−アミノウリジンは、これ
らの位置でRNアーゼ Aによって切断を阻止することが確認された(第3図お
よび第4図、参照)。この酵素は、ピリミジンヌクレオシドの3′位で切断され
、かつ2′−ヒドロキシル基の存在を必要とする( UchidaおよびEga
mi (1971)、 TheEnzyIies第■巻、第3編(P、 D、
Boyerjm ) 、 Acadetaic Press、第205〜250
頁)。更に、ポリヌクレオチドを用いて得られた結果は、2′−アミノ官能基の
存在により、ヘビ毒ホスホジェステラーゼのような非特異的ヌクレアーゼによる
分解が減退されることを示す(Hobbs他、Biochemistry 12
(1973)、 513g−5145)。2′−ハロゲン原子の存在は、DN
アーゼ ■のようなヌクレアーゼを阻害する( Hobbs他、 Bioche
mistry 11 (1972)、 4336−4344)。また、ポリヌク
レオチドを用いての結果は、ヌクレオチドの2′位でのハロゲン原子の存在によ
り、ヒト血清ヌクレアーゼの作用から保護されることを示す(、B1ack他、
Virolagy 4g (1972) 537−545)。従って、修飾リボ
ース糖の配合による保護は、むしろ一般的であり、かつ2′−ヒドロキシル基の
存在に依存するRNアーゼに制限されないリボ核酸の場合、リポース糖は、N−
グリコシド結合を介してヌクレオチド塩基に結合されている。本発明のRNA分
子において修飾リボース糖に結合されているヌクレオチド塩基は、RNA中で天
然に生じる塩基および置換塩基からなる群から選択されている。有利に修飾リポ
ースは、RNA中の天然塩基であるアデニン、グアニン、サイトシンおよび/ま
たはウラシルに結合している。しかし、修飾リボースは、有利にキサンチン、ハ
イポキサンチン、2.6−ジアミノプリン、2−ヒドロキシ−6−メルカプトプ
リンから選択された置換塩基および硫黄により6位で置換されたプリン塩基また
はハロゲン原子もしくは01〜C5アルキル基、殊に臭素原子もしくはメチル基
により5位で置換されたピリミジン塩基に結合されていてもよい。
修飾リボースに結合された最も有利なヌクレオチド塩基はウラシルである。
RNA分子中に配合されている修飾ヌクレオシドは、早期に記載された化合物で
あるかまたは公知化合物と同様に製造することができる化合物である。リポヌク
レオシドの最も好ましいフルオロ類縁物およびアミノ類縁物、例えば2′−デオ
キシ−2′ −フルオロサイチジン(Doerr & Fax、 J、 Org
、 Cheva、32 (1967)。
1462; i[engel & Guschlbauer、 Ang、 Ch
ew、 90 (1978)、 557−558) : 2’ −チオキシ−2
′−フロオロアデノシン(Ikehara & Miki、 Che+*、 P
harm、 Bull、 26 (1978)、2449−2453) 、2’
−チオキシ−2′−フロオロウリジン(Codington他、 J、 Or
g、 Chew、 29 (1964)、 558−564) 、2’ −チオ
キシ−2′−アミノウリジン(aVerheyden池、J、Org、Chew
、36 (1971)、250)および2′−デオキシ−2−アミノサイチジン
(Verheyden他、(1971)上掲書)は、早期に記載されたものであ
る。前記化合物の幾つかの合成には、最近の合成法を使用することができる。2
′−デオキシ−2′−フルオロサイチジンは、サンプ(J、 Org、 Che
m、 47 (1982)、 3623−3628)の方法により2′−デオキ
シ−2′−フロオロウリジンから得ることができる。同様の方法は、2′−デオ
キシ−2′−アジドサイチジンへの2′−デオキシ−2′−アジドウリジンの形
質転換に使用することができる( Verheyden他、 (1971)上掲
書)。この2′−デオキシ−2′−アジドサイチジンは、ムンガル(Munga
ll)他(J、 Org、 Chew、 40 (1975)、 1659)の
方法によって2′−デオキシ−2′−アミノサイチジンに還元することができる
。
2′−フルオロヌクレオシド 5′−トリホスフェートの合成は、ルートビッヒ
(Ludwig) (Acta Biochet et Biophys、^c
ad、 Sci、 Hung、 16 (1981)、 131−133)の方
法により実施することができるかまたはルートビッヒ(Ludvig)およびニ
ックシュタイン(Eckstein) (J、 Org、 Chew、54 (
1989)、 631−635)の方法により実施することができる。2′−デ
オキシ−2′−アミノウリジンおよび一すイチジン 5′−トリホスフェートは
、ホップス(Hobbs)他(Bioche+*1stry 12 (1973
)、 5138−5145)によるジホスフェートに関する記載と同様にして、
ピロホスフェートをホスフェートの代わりに使用する変法を用いて得ることがで
きる。自動化オリゴヌクレオチド合成のための2′−デオキシ−2′−フルオロ
ヌクレオチド 3′−ホスホルアミダイトは、シンハ(5inha)他(Nuc
leic Ac1ds Res。
12 (1984)、 4539−4557)の方法によって得ることができる
。相応する2′−アミノ誘導体の合成に関連して、アミノ基は、イマザワ(Im
azawa)およびエノクンユタイン(Eckstein) (J、 Org、
Chew、 44 (1979)、 2039−2041)の記載によりトリ
フルオロアセチル化(こよって保護されていてもよい。
本発明によるRNAは、少なくとも1つの修飾ヌクレオシドを有し、この場合リ
ボースの2′位でのヒドロキシ基は、変更因子基によって代替されてL)る。本
発明の1つの好ましい実施態様は、残存する3個のヌクレオシドは非修飾糖を含
有するけれども、1種類の全部のヌクレオシド(即ち、アデノシンまた(まグア
ノシンまたはサイチジンまたはウリジン)力く修飾筒を含有するような1つのR
NA分子にある。よりし)ツそう好ましくは、修飾ヌクレオシドは、ビリミジン
ヌクレオシド、即ちサイチジンもしくはウリジンまた(よその!換誘導体である
。最も好ましくは、修飾筒:ま、2′−フルオロリボースまたは2′−アミノリ
ボースである。この実施態様の例は、フエドール(Fedor)およびウーレン
ベック(Uhlenbeck) (Proc、 Natl、^cad。
Sci、 LIS^87 (1990)、 1668−1672)iこよって3
己載されたハンマーへンドリポザイムE1から誘導された/1ンマルオロウリジ
ンによって代替されており、E3の場合には、全てのウリジン残基は、2′−デ
オキシ−2′−アミノウリノン残基によって代替されている。リボザイムE2お
よびE3は、非修飾RNA分子Elの場合と比較可能であるリボヌクレアーゼ活
性を示す。
本発明のもう1つの好ましい実施態様の場合、残存する2個のヌクレオシドは非
修飾糖を含有するけれども、2つの異なる種類の全てのヌクレオシドは、修飾筒
を含有する。よりいっそう好ましくは、全てのビリミジンヌクレオシド、即ちサ
イチジンおよびウリジン(fl換ピリミジン塩基を含む)は、修飾筒を含有し、
最も好ましくは、2′−フルオロまたは2′−アミノリボース誘導体を含有する
。
更に、なお本発明による実施態様は、所謂“選択的修飾パターン”と表わされる
(即ち、ヌクレオシドが修飾されており、非修飾である)修飾パターンを有する
RNA分子にある。他の特異的に選択された位置でのヌクレオシドは非修飾であ
ることができるけれども、選択的修飾パターンを有するRNAは、特異的に選択
された位置でのヌクレオシドが修飾されていてもよい1つの分子にある。例えば
、リボヌクレアーゼに対する高感受性部位であることが知られている(例えば、
RNA分子の二次構造に基づく)ヌクレオシドは、修飾され、RNA分子の延長
された生存時間を達成する。リボヌクレアーゼ高感受性部位の1つの例は、リポ
ザイムE1の21位で得られる。第3図で示したように、RNA分子は、この位
置でRNアーゼによって著しく強力に切断される。
更に、本発明のもう1つの実施態様は、付加的に少なくとも1つの修飾インター
ヌクレオチドホスホジエステル結合を有するRNA分子にある。適当な修飾ホス
ホジエステル結合の例は、メチルホスホネート基またはホスホロチオエート基で
あり、このホスホロチオエート基は、殊に好ましい。好ましくは、少なくともR
NA分子の5′−末端ホスホジエステル結合および/または3′−ホスホジエス
テル結合は、修飾されている。よりいっそう好ましくは、5′−末端ホスホジエ
ステル結合および最後の3個の3′−末端ホスホジエステル結合は、修飾されて
いる。
分解に対する増大された安定性を得るためには、修飾インターヌクレオチド結合
だけの存在では不十分であることが見い出された。しかし、2′ −修飾リボー
スと、修飾インターヌクレオチド結合との合わされた存在により、付加的な安定
性を向上させる効果を示した。双方の修飾による50倍を上層る安定性の増大に
より、非修飾リポザイムと比較して切断の減少された効率は凌駕される。
修飾インターヌクレオチド結合を有するRNA分子の合成は、有利に下記したよ
うな化学合成により達成される。
本発明のもう1つの目的は、RNA鎖中に少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを
配合し、その際にリボース糖の2′位でのヒドロキシ基をハロゲン原子、スルフ
ヒドリル基、アジド基、アミノ基、モノ置換アミノ基およびジ置換アミノ基から
選択された変更因子基によって代替することを特徴とする、触媒活性を有するR
NA分子の合成法である。
有利に、変更因子基は、ハロゲン原子(即ち、弗素原子、塩素原子、臭素原子ま
たは沃素原子)またはアミノ基であり、よりいっそう有利には、弗素原子または
非置換アミノ基である。また、本発明による方法が少な(とも2個の異なる変更
因子基(即ち、弗素原子およびアミン基)を有するヌクレオチドを配合するよう
なRNA分子の合成からなることは、注目すべきである。
この修飾ヌクレオチドをRNA中に配合するためには、有利に2つの方法が存在
する。1つの方法は、有利にヌクレオチド前駆物質としてのそれぞれのホスホル
アミダイトまたはH−ホスホネートを用いて固体支持体上または溶液中で実施す
ることができるRNA分子の自動化化学合成によるものであり、他の方法は、2
′−修飾ヌクレオシド5′−トリホスフェートを使用して適当な核酸、有利に核
酸ポリメラーゼを有するDNA鋳型の転写による酵素配合を包含する。自動化化
学合成を用いて、修飾インターヌクレオチド結合を有するRNA分子は、相応す
る化学的に修飾されたヌクレオチド前駆物質、例えばメチルホスホネート誘導体
をRNA鎖中に配合することによって得ることができる。ホスホロチオエート結
合を配合するためには、標準ホスホルアミダイト誘導体は、ヌクレオチド前駆物
質として使用される。しかし、RNA鎖に対する前駆物質のカップリングが起こ
った後に、その後の酸化工程は、非修飾結合の場合と同様に沃素を用いて実施さ
れないが、しかし硫黄または硫化剤を用いて実施され、それによってホスホロチ
オエート基が得られる。
修飾RNA分子の化学合成は、当業界で知られている、非修飾RNAまたはD
N A分子の場合と同様に実施される。よりいっそう詳細には、RNA合成は、
それぞれのヌクレオチド前駆物質の段階的添加を包含する固体支持体上での化学
合成によって実施される。望ましい長さのRNA生産物を合成した後、RNAは
、常用の方法によって固体支持体から除去され、かつ有利にゲル電気泳動法によ
って精製される。また、化学的RNA合或は、固体支持体を使用することなしに
任意の他の公知技術によって実施することもできる。即ち、RNAは、溶解可能
な形で合成させることができ、かつその後に当業界で知られた方法で精製させる
ことができる。
2′−アミノ変更因子基をRNA鎖中に配合する場合には、この基は、ホスフィ
チル化反応(即ち、ヌクレオチド前駆物質の製造)の前に保護されなければなら
ず、かつその後の使用のためにカップリング反応で保護されなければならない。
この目的のために、ホリフルオロアセチル基は、有利に保護基として使用される
。それというのも、この基は、核酸合成剤上での合成の作業周期の間に安定であ
り、かつアンモニアを用いて常用の処理をしながら除去可能である。
また、RNA鎖の合成は、適当な核酸ポリメラーゼによる核酸鋳型からの転写に
よって実施することができる。好ましくは、鋳型はDNA鋳型であり、核酸ポリ
メラーゼはDNA依存RNAポリメラーゼである。
よりいっそう好ましくは、DNA依存RNAポリメラーゼは、著しく進行的なバ
クテリオファージRNAポリメラーゼであるT7、T3およびSP6ポリメラー
ゼからなる群から選択される。これらのポリメラーゼの中で、T7RNAポリメ
ラーゼが最も好ましい。修飾RNA分子の合成のためのDNA鋳型は、本発明に
よれば、有利に望ましいRNA配列を解読する合成りNA断片をプラスミドの適
当な部位中に挿入することによって構成され、この場合このプラスミドは、それ
ぞれのRNAポリメラーゼに対するプロモーターからなり、部位は、プラスミド
のこのような1つの位置に位置しており、したがって合成りNA断片は、プロモ
ーターから転写されることができる。転写反応は、有利にランオフ転写として実
施される。また、合成りNA断片は、プラスミド部分なしに転写鋳型として役立
つことができる。しかし、効果的なRNA合成を可能にする断片は、転写出発信
号を有する。
2′−チオキシ−2′−ハロゲンヌクレオチド、例えば2′−デオキシ−2′−
フルオロウリジン、−オクチジン、−アデノシン、−グアノシンおよびそれぞれ
のクロコ化合物の重合は、有利に補助因子としてのMn2”イオンの存在下にT
7ポリメラーゼによって実施される。また、2′−アミノヌクレオチド、例えば
2′−チオキシ−2′−アミノウリジン、2′−チオキシ−2′−アミノサイチ
ジン、2′−デオキシ−2′−アミノアデノシンおよび2′−デオキシ−2′−
アミノグアノシンの重合は、有利に補助因子としてのM g 2 ”イオンの存
在下に実施される。
次の実施例の実験データから、ハンマーへッドリポザイム中での2′−デオキシ
−2′−フルオロウリジンおよび2′−デオキシ−2′−アミノウリジンの存在
により、触媒活性が破壊されないことは明らかである。このことは、基質部分で
2′−フルオロウリジンの存在に関して第3図に品質的に示されており、種々の
他の1対の酵素/基質に関して第1表に量的に示されている。実際に、全ての修
飾によりアミノ置換の最も代表的な例であるに、値が増大した。しかし、活性構
造のこの摂動は、異なる塩基組成物を用いてハンマーヘッド系について観察され
るに、、変量の範囲内に十分存在する(Fedor & Llhlenbeck
、上掲書)。付加的に、著しく意外なことに、単独の2′−アミノウリジン、直
接に切断部位の5′を基質中に配合することにより、Ke、は著しく増大しく第
1表)、シたがって特異的部位での2′−修飾ヌクレオシドの選択的な導入によ
って向上された活性のりポザイムを生産するものと考えられる。この結果は、明
らかに、触媒活性に関してハンマーヘッド構造の酵素部分を通じての2−ヒドロ
キシル基の存在は不必要であるが、しかし本発明による修飾は少な(とも一定の
位置で許容されることを示す。これとは異なり、2′−デオキシヌクレオチド1
5%のみをハンマーへッドリボザイム中に配合することは、K、に影響を及ぼす
ことはないけれども、触媒作用の効率を2程度のマグニチュードで減少させるこ
とが報告されている( Perreault他(1990) 、前掲書)。切断
速度は、切断部位で燐上への2′−ヒドロキシルの攻撃角度によって定められる
ので、この切断速度はハンマーヘッド系の全ての構造によって著しく影響を及ぼ
される。従って、速度に対する2′−修飾の観察される影響により、2′−フル
オロ類縁物は、デオキシリボヌクレオタイドの場合よりも類似したりポヌクレオ
タイドの構造に適合していることに注目すべきである。このことは、明らかに、
アミノ類縁物に対しても支持される。本発明による他の2′−修飾ヌクレオシド
は、同様に触媒活性を示す。
更に、本発明の他の目的は、殊にウィルスもしくは他の異質遺伝的物質またはウ
ィルスもしくは他の異質遺伝的物質からの転写物の特異的切断のために治療剤と
してかまたは生化学的もしくは生物工学的方法における生物触媒として、少なく
とも1つの修飾ヌクレオチドからなる触媒活性を有するRNA分子の使用にある
。前記目的のために、本発明のRNA分子は、非修飾の類縁物よりも適当である
と思われる。それというのも、このRNA分子により、化学的切断および/また
は酵素的切断に対しての安定性が増大するからである。
更に、本発明は、第1図〜第7図の組合せで次の実施例によって詳説される。し
かし、これらの実施例は、本発明の範囲を狭くする意図のものではない。
第1図は、PAGE後のプラスミドpUCR5のT7RNAポリメラーゼ ラン
オフ転写物のオートラジオグラフを示す。
第2図は、PAGE後の2′−アミノウリジンを含有するプラスミドpUCRE
のT7 RNAポリメラーゼ ランオフ転写物のオートラジオグラフを示す。
第3図は、P、八GEによって分離された5′−標識化ランオフ転写物E1およ
びE2の部分的リボヌクレアーゼA切断のオートラジオグラフを示す。
第4図は、RNアーゼAIこよるSlおよびS2の全崩壊のオートラジオグラフ
を示す。
第5図は、リボザイムElによる2′−フルオロウリジンおよび32P−AMP
含有基質S3の切断のオートラジオグラフを示す。
第6図は、E2と81とのりボザイム反応のエディー−ホフステーのプロットを
示す。
第7図は、E3と81とのりボザイム反応のラインウィーヴアーーバークのプロ
ットを示す。
第8図は、HIV−1配列をpOTH33中1:り。
−ン化した体制を示す。
第9図は、リポザイムRE115のヌクレオチド配列を示す。
実施例
例1
オリゴリボヌクレオチドの調製
オリゴリボヌクレオチドの自動化合成:自動化オリゴリボヌクレオチド合成を、
ミリケン/バイオサーチ社(Milligen/Biosearch)によって
供給される単量体リボヌクレオチドホスホルアミダイトを使用して1マイクロモ
ルの規模でアプライドバイオシステムズ(Applied Biosystem
s) 380 B D N A 合成装置を用いて実施した。対照多孔質ガラス
カラムにカップリングしたりポヌクレオシドを有する対照多孔質ガラスカラムは
、ミリケン/バイオサーチ社(Milligen/Biosearch)または
ベニンスラ社(Pen1nsula)の製品であった。オリゴマーをリボヌクレ
オチドホスホルアミダイトの供給業者(Milligen/Biosearch
)の仕様書に応じて後処理した。保護基の除去後、オリゴリボヌクレオチドをア
ミコン(Am1con)フィルター膜セントリコン(centricon) l
Q上でスピン透析(spin dialysis)によって濃縮し、エタノー
ルを沈殿させた。乾燥したペレツトを水50μl中に入れ、PAGEを行なった
。バンドをUV照射によって可視化し、切断し、RNAを緩衝液(酢酸アンモニ
ウム0.25モル、トリス/HC110ミリモル pH8,O,EDTA1ミリ
モル) (Feder & Uhlenbeck、 PNAS US八へ7(1
990)、 1668−1672)中で37℃で1晩中溶離することによって単
離した。刊行物(Feder & l1hlenbeck 1990)に記載さ
れた6 600M−1cm−1のヌクレオチドにつき吸光係数を使用して濃度を
測定した。オリゴリボヌクレオチドの水溶液を一20℃で貯蔵した。
ランオフ転写のための鋳型を含有するプラスミドの構成:
次のオリゴデオキシヌクレオチドをアプライドバイオシステムズ(Applie
d Biosystems) 380 B D NA 合成装置を用いてホスホ
ルアミダイト方法によってプラスミド構成のために合成した:
R32−T、5’ −d (GATATCCTGACTCCCTATAGTGA
GTCGTATTA)−3; R32−T、5’ −d (TAATACGAC
TCACTATAGGGAGTCAGGATATCTGCA)−3’ :REl
−T、s’ −d (GGAGTTTCGGCCTAACGGCCTCATCA
GAGGACCCTATAGTGAGTCGTATTA)−3’およびRE2−
C,5’ −d (TAATACGACTCACTATAGGGTCCTCTG
ATGAGGCCGTTAGGCCGAAACTCCTGCA)−3゜リポザイ
ムpUCR3およびpUCRE 16クローンの調製:
市場で入手できるプラスミドpUc19を1工程反応で制限酵素l5o−3ac
lおよびPstIを使用して切断した。次に、DNAを2%の寒天ゲル電気泳動
によって精製し、引続きアミコン(八m1con)社によって供給されるセント
リコン(Centricon) 30中心溶離装@ (centroeluti
on apparatus)を使用して電気溶離によって精製した。1対のオリ
ゴヌクレオチドプライマー、REI−TおよびRE2−C(リポザイム酵素)ま
たはR32−TおよびR82−C(リポザイム基質)を前記の記載のようにして
ホスホリル化した( Taylor他、Nucleic Ac1ds Res、
13 (1985)、8749−8764)。これらの1対のオリゴヌクレオチ
ドを、キングおよびブレイクスレー(King & Blakesley) (
F。
cus 8 (1986)、 1−3)の方法によりpUCRE 16を生じる
リポザイムのDNA配列またはpUCR5を生じるリポザイム基質と一緒にT7
プロモーターのクローニングに使用した。感応細胞(01sen & Ecks
tein。
PNAS US八へ7 (1990)、 1451−1456)の形質転換後に
、白色コロニーを、pUcRE16の場合には第2AvalI部位の存在に対し
てスクリーニングし、pUCR8に関してはユニークEcoRV部位の存在に対
してスクリーニングした。それぞれのクローンからの精製二本鎖DNAの配列を
オルセン(01sen)およびニックシュタイン(Eckstein) (Nu
cleic Ac1ds Res、17(1989)、 9613−9620)
の方法によって測定した。
T7 RNAポリメラーゼランオフ転写物:T7 RNAポリメラーゼランオフ
転写物を、ミリガン(Milligan)およびウーレンベック(Uhlenb
eck) (Meth、 in Enzymology 180^(1989)
、 5l−62)によって記載された方法に適合させることによって150μm
〜500μlの規模で合成させた。転写反応をトリス40ミリモル pH8,0
,スペルミジン1ミリモル、DTT5ミリモル、トリトンX−1000,01%
、MgCl220ミリモル、ヌクレオチド2.5ミリモル、DNA鋳型200n
M、ヒト胎盤RNアーゼ阻害剤0.2U/μmおよびT7 RNA100U/μ
m中で実施した。2′−デオキシ−2′−フルオロヌクレオチドトリホスフェー
トを使用した場合には、MgC12をMnCl220ミリモルによって代替した
。反応を37℃で3時間実施した。転写物を上記のようにPAGEによって精製
した。オリゴリボヌクレオチドの水溶液を一20℃で貯蔵した。
東1図は、PAGE後のpUCR3のT7 RNAポリメラーゼ ランオフ転写
のオートラジオグラフを示す。A:転写を150μmの規模でMgCl220ミ
リモルおよび4つのヌクレオシドトリホスフェートそれぞれ2.5ミリモル宛の
存在下に37℃で3時間実施した。反応混合物をアルカリホスファターゼでデホ
スホリル化し、かつポリヌクレオチドキナーゼおよび[γ−32pコーATPと
の反応によって5’ 32p標識化した。標識化された転写混合物にPAGEを
行なった。B:150μlの規模でM n C1220ミリモル、ATPo、5
ミリモル、[α−32P]−ATP25μCi、CTPおよびCTP2.5ミリ
モルおよび2′−フルオロウリジントリホスフェート2.5ミリモルの存在下に
37℃で3時間転写を実施した。転写混合物に直接PAGEを行なった。記号ア
ステリスクは、32P−標識化されたホスフェートを示す。′N′は、鋳型DN
Aの全長に及ぶT7 RNAポリメラーゼによって添加された任意のヌクレオチ
ドを表わす(Milligan and tlhlenbeck、 Meth、
in Enzymology 180^(1989)、 5l−62)。
第2図は、PAGE後の2′−アミノウリジンを含有するpUcRE16のT7
RNAポリメラーゼランオフ転写物のオートラジオグラフを示す。方法1:化
学的に合成された、34番目の遺伝標識E3を含有する2′−アミノウリジン。
方法2 :150μmの規模でMgCl220ミリモル、[α−32P]−AT
P60μCi、CTPおよびGTPIミリモルおよび2′−アミノウリノントリ
ホスフェート1ミリモルの存在下に37℃で3時間転写を実施した。転写混合物
に直接にPAGEを施こした。
オリゴリボヌクレオチドの調製二次のオリゴリボヌクレオチドを
a、)ランオフ転写によって調製した(5’−1−リホスフエートなしに記載さ
れる配列):
El、5’ −GGGUCCUCUGAUGAGGCCGUUAGGCCGAA
ACUCC−3’ ;E2. 5’ −GGG (2’−FU)CC(2’ −
FU)C(2’−FU)GA (2’−FU)GAGGCCG (2’ −FU
) (2’−FU)AGGCCGAAAC(2’−FU)CC−3’および
E3. 5’ −GGG (2’ −NH2U)CC(2’ −NH2U)C(
2’ −NH2U)GA (2’ −NH2U)GAGGCCG (2’ −N
H2U) (2’ −MH’ 2 U)AGGCCGAAAC(2’ −NH2
U)CC−3′ :
SL、5’ −GGGAGUCAGGAU−3’ ;S3、 5’ −GGGA
G (2’−FU)CAGGA (2’−FU)−3′およびS4,5’ GG
GAGU (2’−FC)AGGAU−3’
b、)化学合成によって調製したコオリゴリボヌクレオチドE1、E2、E3、
Sllよびs2.5′−GGGAC(2’ −NH2U)CAGGAU−3’。
オリゴリボヌクレオチドの5’ 32p−標識化:ランオフ転写から得られたオ
リゴリボヌクレオチドを、製造業者(Diagen Inc、 )によって記載
された記録によるキアゲンチップ(Quiagen tip) 20−カラムに
よって精製されかつT4 ポリヌクレオチドキナーゼおよびγ−32P−ATP
で処理されたRNアーゼ遊離牛アルカリホスファターゼを用いての処理によって
デホスホリル化した。標識化オリゴリボヌクレオチドをPAGEによって精製し
た。
実施例2
RNNアーゼ−用いてのオリゴリボヌクレオチドの消化
RNNアーゼ−用いてのオリゴリボヌクレオチドの部分的消化、オリゴリボヌク
レオチドE1およびE2にドニスーケラ−(Donis−Keller)他(N
ucleic Ac1ds Res、 4 (1977)、 2527−253
8)の方法による5’ 32P標識化後にRNアーゼA消化を行ない、次に変化
させた。5’ 32p−標識化RNA約25μモルを、尿素7モル、EDTA5
0ミリモル、ブロモフェノールブルー0.04%、キシレンシアツールFF0.
04%および水上のtRNAo、25mg/mlを含有する緩′ffr液50μ
mに添加した。次に、RNAを5本の標識化管中に等量に分配し、5分間50℃
に加熱し、次いで直接に氷上に置いた。リボヌクレアーゼA、 2μ](2X1
0−4単位)を第1の管に添加し、かつピペットを用いて混合した。次に、酵素
を5倍に希釈して連続的に、1つの管から次の管へのそのつどの転写の後に新し
いピペットチップを使用して3本の付加的な雪中に入れた。5本目の管は対照の
試料であり、これには、酵素を添加しなかった。次に、全ての管を50℃で5分
間恒温保持し、氷上に置き、かつPAGEによって分析した。
RNNアーゼ−よるオリゴリボヌクレオチドの全崩壊二オリゴリボヌクレオチド
S1およびS2を次の記録による5’−32p標識化後にRNNアーゼ−消化し
た、オリゴマー(20μlの最終的容量中8.5μモル) をRN7−t/A1
.25X10=単位と、トリス/HCl50ミリモル pH7,5およ[Mgc
1210ミリモルを含有する緩衝液中で37℃で10分間反応させた。生成物を
PAGEによって分析した。
第3図は、PAGEによって分離された5′−標識化ランオフ転写物E1および
E2の部分的リボヌクレアーゼA切断のオートラジオグラフを示す。条件は、前
記のものと同様である。番号付けされた方法は、1)添加された酵素なし、2)
RNNアーゼA2X10ル単位、3)RN7−ゼA3xlO−5単位、4)RN
7−ゼA8x 10−4.5)RN7−ゼA16X10−7に相当する。塩基の
番号付けを、非修飾転写物のM n 2“仲介切断のバンドをカウントすること
によって簡易化した(MnC1210ミリモル中で3分間90℃に加熱したRN
A 10μモル)。丸付は数字は、RNNアーゼ−敏感な切断位置から予想され
るバンドを示す。矢印は、切断位置3′からウリジンを生じかつリボザイムを含
有する2′−フルオロウリジンが切断されるような方法で不在であるバンドを示
す。
第4図は、PAGE後のRNNアーゼ−ょるslおよびS2の全崩壊のオートラ
ジオグラフを示す。この反応の詳細は、上記に記載されて入る。方法1:12番
目のS2の全消化;方法2:12番目の31の全消化:方法3.長さ標準として
90℃で3分間MnCl220ミリモルと反応させることによる34番目のEl
の切断ラダー。S2の切断生成物は、6位で2′−アミノウリジンの存在を示す
Slよりも長いヌクレオチドである。
実施例3
リボザイムによるオリゴリボヌクレオチド基質の切断切断速度の測定:切断反応
をフェーダ−(Fedor)およびウーレンベック(Uhlenbeck) (
1990,上掲書)からの適した方法によって実施した。リボザイム酵素(典型
的に最終的容量20μl、最終的濃度10100n トリス/HCl50ミリモ
ル、pH7,5)および基it(典型的に40μl、最終的濃度2μモル)の貯
蔵溶液を別々に90℃で1分間加熱し、2価金属イオ7(MIICI2またはM
g CI 2 、最終的濃度10ミリモル)の添加前に15分間室温に冷却し
た。この貯蔵溶液を分解反応の開始前に25℃で15分間別々に恒温保持した。
酵素10nMおよび基質50〜5000nMの典型的な濃度で、酵素を基質(ト
リス/HCl50ミリモル、pH7,5、MgC12、最終的容量20μ11最
終的濃度10ミリモル)に添加することによって反応を開始させた。規定時間で
アリコート10μmを尿素停止混合物10μl中に移し、かつPAGEを行なっ
た。オートラジオグラフをLKBULTRO5CAN XLレーザー デンシト
メーター上で分析した。
研究されたハンマーへッドリボザイム系の場合には、12番目の基質オリゴヌク
レオチド(Sとして示した)を冒頭の構造式中で矢印で示したサイチジンー7の
3′位で34番目の酵素オリゴヌクレオチド(Eとして示した)によって分解し
た。この分解により、2′−3′一環式ホスフエート末端を有するヘプタマー(
生産物1)および5′−ヒドロキシル末端を有するヘプタマー(生産物2)が発
生する( Ruffner他、 Gene 82 (1989)、 3l−41
)。これらの型の切断生産物は、オリゴリボヌクレオチドE1およびslを有す
るだけでな(,2′−フルオロウリジン含有基質s3をも有することが観察され
る(第5図)。予想されたように、2′−フルオロウリジンを分解位置で含有す
る基質オリゴヌクレオチドS4は、同一の条件下では分解されなかった。これら
2つの反応は、基質のオリゴヌクレオチド中に2′−フルオロウリジンを含有し
ていた。
しかし、有利に将来の用途によりいっそう重要なことは、リボザイムの酵素部分
中でのこの修飾の存在により、このリポザイムの触媒活性が干渉されるが否かの
問題にある。従って、2′−フルオロウリジン含有リポザイムE2と非修飾基質
S1との反応が研究された。実際に、ゲル分析により、基質は1対のElおよび
Slと同じ効率をもって分解されることが指摘された。2′ −フルオロウリジ
ン含有リボザイムE2の触媒定数は、測定され(第6図)、かつ非修飾リボザイ
ムE1の場合と比較された。この比較により、前者の速度定数の第2次数(k、
−=/に一=0.0026nM−1 )は、後者(k−11/に、=0.002
3nM−1)の場合よりも小さいマグニチュードの1つの次数であることは明ら
かである(Feder & Uhlenbeck (1990)。
上掲書)。この触媒効率の減少は、第1に切断速度の減少に基づくものであり、
これとは異なり、リボザイム双方のに、値は、はぼ同一のものである。しかし、
この減少された切断速度は、異なる塩基組成物を用いて種々のハンマーヘッド系
に関して観察される切断効率の範囲内に十分存在する(Feder & Uhl
enbeck (1990)、上掲書)。ハンマーへッドリボザイム反応は、金
属イオン補助因子としてのM g CI 2ならびにM n C12を用いて実
施することができ、切断の半減期は、後者の補助因子の存在下にほぼ10倍減少
さ、れる(Uhlenbeck、 Nature 328 (19g?)、 5
96−609)。また、このようにMg2”からM n ”“へりスイッチング
の下で切断条件下で基質の半減期が減少することにより、2′−フルオロウリジ
ン含有酵素E2と基質S1との反応が観察された。従って、切断反応に必要とさ
れる金属イオンは、2′−フルオロヌクレオチド類縁物の配合では老化されない
。
リボザイム中の2′−アミノウリジンの存在の効果は、研究された。2′−アミ
ノウリジン含有リボザイムE3を非修飾基質S1と反応させる場合には、触媒効
率は、k、、、/に、=0.0015nM−1のマグニチュードの程度に減少す
る。k eatは殆んど非老化のままであるけれども、この効率の減少は、明ら
かにより高いに、に基づ(ものである。従って、2′−アミノウリノンリボザイ
ムの全効率は、2′−フルオロウリジン含有リボザイムの1つと比較可能である
。非修飾リボザイムE1と選択的2′−アミノウリジン修飾基1i!ts2との
補足的な反応の場合には、触媒効率は、上記反応と比較されてに、、=/に、=
0.0063nM−1に増大される。この効果は、全体的にk eatの増大に
基づく。この傾向は、2′−アミノウリジン含有リポザイムE3と82との反応
の場合により一層顕著になり、この場合触媒効率は、k、、、/に、=0.00
11nM−1に増大され、また主として増大されたk c m +に基づ(もの
である。上記反応の全ての反応速度パラメーターは、第1表にまとめられて入る
。
第1表。
2′−変性ヌクレオチド含有リボザイムの反応速度定数。゛従って、本明細書中
に記載された反応速度のデータは、2′−フルオロ−および2′〜アミノウリジ
ン修飾リポザイムの切断効率が若干減少されるけれども、なお異なる塩基組成物
のハンマーヘッド系に関して観察される範囲内にあることを示す。また、特異的
位置で選択的に2′−修飾を導入することによって触媒効率を増大させることが
可能であることも明らかになる。後者の効果は基質のオリゴリボヌクレオチドに
関して証明されたけれども、触媒の対する同様の影響を酵素の中で選択的修飾に
関して見い出すことができることが期待される。
第5図は、リボザイムE1による2′−フルオロウリジンおよび32P−AMP
含有基質S3の切断のオートラジオグラフを示す。この切断反応は、MgC+2
1Oミリモルの存在下にトリス/HCI 50ミリモル、pH7,5中で40μ
mの規模で25℃で実施された。Elおよびs3の濃度は、それぞれ2.5μM
および7.5μMであった。他の全ての詳細は、上記に記載されている(Det
ermination of Cleavage Kinetics)。記載さ
れた時間で、アリコート10μmをPAGEの前に水10μmおよび尿素停止混
合物10μm中に移した。方法1:0.5分間後の反応:方法2:15分間後の
反応:方法3:3分間後の反応。アステリスクは、32P−標識化ホスフェート
を示す。
第6図は、E2と81とのりポザイム反応のエディー−ホフステーのプロットを
示す。この切断反応は、20 u Iノffl模TMgC1210mM+7)存
在下i:E 2の10nMの濃度ならびに50nM、1100n、200nM、
400nM、500nおよび700nMのS1濃度を用いて実施された。7分間
後に、アリコート10μIをPAGE前に水10μmおよび尿素停止混合物10
μm中に移した。この時間ポイントは、開始速度の線状範囲内で減少することが
先に確立された。オートラジオグラフをレーザーデンシトメーター上での光学密
度の組込みによって評価した。
第7図は、E3と81とのりボザイム反応のラインウィーヴアーーパークのプロ
ットを示す。この切断反応は、20μIの規模テM g C1210mMノ存在
下にE 3 L7) 1.0 n Mの濃度ならびに50nM、loonM、2
00nM、400nM、500nおよび700nMの5lfi度を用いて実施さ
れた。他の全ての詳細は、第6図の場合と同様である。
実施例4
リボザイムを使用してのHIV−I LTRRNAの切断
プラスミドの構成 プラスミド、pOTH33、を位置−525〜386のHI
V−1配列(Ratr+erf[ll!。
Nature 313 (1985)、 277−284の配列番号付けによる
)を市場で入手し得るプラスミドp S P T 19 (Pharmacia
)にクローン化することによって構成させた。H1■配列は、T7プロモーター
(T7)の転写制御下にある。pOTH33の場合のHIV挿入の図面による提
示は、第8図に記載されている。HIV−I LTR領域は、U3領域、R領域
およびU5領域からなる。このHIV−I LTR領域は、ポリブレントラクト
によって5′−末位に隣接し、かつプライマー結合部位(PBS) 、リーダー
配列およびgag遺伝子の一部によって3′−末位に隣接している。位置−52
5および386での矢印は、pOTH33の構成に使用される制限部位を示す。
位置115の矢印は、リボザイム仲介切断のための部位を示す。
ヌクレオチド−453〜182の長い末端繰り返し配列を有する位置−525〜
386のHIV−1のRNAを、EcoRI切断プラスミドpOTH33(DN
A鋳型1100n/、czl、DTT 10mM、それぞれrNTP500uM
、 トリス−CI 5QmM。
pH7,5、スペルミジン2mMSMgC126mM、Ca−32P] −AT
P 2ttCi/μl、RN7−ゼ阻害剤50U/μmおよびT7 RNAポリ
メラーゼ15U/μm、4℃で2時間)をランオフ転写し、そのil:DNy−
ゼ■(IU/μI、37℃で10分I%1ff) (RNアーゼ不含)との反応
混合物を恒温保持し、かつフェノール−クロロポルム抽出することによって得た
。得られたRNAは、LTRRNAとして記載されている。
有用な切断部位GUCを含有するHIV−ILTRRNAの位置115をリボザ
イム触媒切断のための標的として選択した。この部位に対する標的のハンマーへ
ッドリポザイムを、化学的に合成した。非修飾ハンマーヘッド酵素RE115の
ヌクレオチド配列は、第9図に記載されている。
LTRRNAを用いての切断反応速度:kc、、/に1値を単代謝回転の条件下
で測定した。リポザイムをトリス−CI 50mM、pH7,5の存在下に75
℃で1分間予め恒温保持し、引続き37℃で5分間恒温保持することにょつて測
定した。MgC+2を10mMの最終濃度に添加し、この溶液を再び37℃で5
分間恒温保持した。LTRRNAを直接に水溶液として使用した。反応混合物(
10μm)は、リボザイム20nM〜1μM1 トリス−CI 50mM5pH
7,5およびMgC1210mMを含有していた。
LTRRNAを10nMの最終濃度に添加することによって反応を開始させた。
37℃で1時間後に、停止混合物10μmを添加することによって反応を停止さ
せ、かつPAGE4%(長さ4Qcm、尿素8モル)によって分析した。50W
での1時間の電気泳動および引続くオートラジオグラフィーの後に、非切断LT
RRNAの画分をレーザー走査デンシトメーター測定によって測定した。ke、
、/に、値を、次の等式:〔式中、kは観察される反応速度であり、tは1時間
の反応時間である〕により、リボザイム濃度([REI)に対してLTRRNA
の残留断片(Frac S)をプロットすることによって得た。
2′−フルオロまたは2′−デオキシ置換基および/または末端ホスホロチオエ
ート結合を含有するRE115のリボザイムの幾つかの類縁物の触媒効率に対す
る化学修飾の影響を研究するために、合成した。2′−フルオロウリジン置換基
は触媒効率に対して何らの効果も有しないけれども[第2表、RE115(FC
,)]、フルオロウリジン置換基は、k e、、/ K、の5倍の減少を生じた
[第2表、REI 15 (FU)]。3個の3′−末端ホスホロチオエート基
との組合せ物中の1つの5′−末端ホスホロチオエート基は、無視できる程度に
のみ触媒効率を減少させた[第2表、RE115(S)]。同様のことは、2′
−フルオロウリジン置換基と一緒の末端ホスホロチオエート結合の組合せに関し
て実際のことであり、この場合には、kcm/に、の他の減少は観察されなかっ
た[第2表、RE115 (FU)、SF。全てのピリミジンリボヌクレオチド
を2′フルオロ類縁物によって置換し、かつ4個のホスホロチオエート結合を導
入することにより、非修飾リボザイムと比較して7倍だけ触媒効率は減少した[
第2表、RE115 (FC,FU、S)]。これとは異なり、全てのピリミジ
ンリボヌクレオチドをホスホロチオエートと結合した2′−デオキシヌクレオシ
ド類縁物によって置換することにより、50倍のkc、、/に、の減少を生じた
[第2表、RE115(dC,dU、S)]。従って、RE115 (dC。
dU、S)は、RE115 (FC,FU、S)よりも7倍少ない効率を有する
。
第2表
RE115によるLTRの切断に対する化学的修飾の影響リボザイム ke、
、/に、、 k e、、/に、。
RE115 500 1
RE115(S) 360 0.72
RE115(FC)’ 490 0.98RE115(FU)1 89 0.1
8RE115(FU、S)1 59 0.12RE115(FC,FU、S)1
69 0.14RE115(dC,dU、S)2 10 0.0201本発明
の実施例
2比較例
実施例5
オリゴリボヌクレオチドの安定性
実施例4のリポザイムをヌクレアーゼ消化に対する安定性に関して試験した。
試験条件:
媒体RMPI 1640中で細胞的106/mlの細胞濃度に成長した脱皮4ク
ローン8細胞(Jurkierwicz、Deutsches Prinmat
enzentrum、 GOttingenから入手可能)の1000gをヘラ
オイス ミニヒューゲ(Heraeus Minifuge)中で5分間遠心分
離した。5′=32p−標識化リボザイムを90℃で1分間予め加熱し、氷上で
冷却し、細胞上澄み液に添加して300nMの最終濃度にし、かつ37℃で恒温
保持した。アリコートを指摘された時間ポイントで取り出し、尿素8モルを含有
する20%のPAGEによって分析し、引続きオートラジオグラフィー処理した
。
結果・
80%を上形るRE115が、PAGEを変性することによって指摘されるよう
に細胞上澄み液中での2分間の恒温保持後に分解された。しかし、1時間以内の
RE115 (FC,FU、S)の分解は観察されなかった。非修飾リボザイム
の分解速度との比較により、2′−修飾ビリミジンヌクレオシドと末端ホスホロ
チオエート結合との組合せにより、T細胞上澄み液中に存在するヌクレアーゼに
よる消化に対するリボザイム安定性よりも50倍増大したものと評価される。ホ
スホロチオエート基なしの2′−修飾リボザイムは、RE115 (FC,FU
、S)の安定性よりも約2倍低い安定性を示す。
Fig、6
マ/Sl/岨)
百ツ 階箋 −21c 壽ロ d=
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(81)指定国 EP(AT、BE、CH,DE。
DK、ES、FR,GB、 GR,IT、 LU、 NL、 SE)、0A(B
F、BJ、CF、CG、CI、CM、GA、GN、ML、MR,SN、TD、T
G)、AT、AU、 BB、 BG、 BR,CA、 CH,C3,DE、 D
K。
ES、FI、 GB、 HU、JP、 KP、 KR,LK、 LU、MC,M
G、MN、MW、NL、No、PL、ROドイツ連邦共和国 D−3400ゲッ
チンゲン ハインリッヒーヴアルネッケーシュトラーセ 4
(72)発明者 オルセン、 デイヴイド ビー。
アメリカ合衆国 ペンシルケアニア
19486 ウェストポイント ダヴリュービ−42−300ケア オヴ メル
ク、シン 力ロリーネンヴエーク 15
Claims (43)
- 1.少なくとも1つの修飾ヌクレオチドからなる触媒活性を有するRNA分子に おいて、リボース糖の2′−でのヒドロキシ基が、ハロゲン原子、スルフヒドリ ル基、アジド基、アミノ基、モノ置換アミノ基およびジ置換アミノ基から選択さ れた1つの修飾基によって代替されていることを特徴とする、触媒活性を有する RNA分子。
- 2.修飾基がハロゲン原子またはアミノ基である、請求項1記載のRNA。
- 3.ハロゲン原子が弗素原子である、請求項1または2に記載のRNA。
- 4.触媒活性がヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性、デホスホリラーゼ活性 、デオキシリボヌクレアーゼ活性および配列特異的エンドリボヌクレアーゼ活性 からなる群の少なくとも1つを有する、請求項1記載のRNA。
- 5.触媒活性が配列特異的エンドリボヌクレアーゼ活性を有する、請求項4記載 のRNA。
- 6.ハンマーヘッドリボザイムまたはヘアピンRNAである、請求項5記載のR NA。
- 7.修飾リボース糖に結合したヌクレオチド塩基がRNA中で天然に生じる塩基 および置換塩基からなる群から選択されたものである、請求項1から6までのい ずれか1項に記載のRNA。
- 8.置換ヌクレオチド塩基がキサンチン、ハイポキサンチン、2,6−ジアミノ プリン、2−ヒドロキシ−6−メルカプトプリンおよび硫黄により6位で置換さ れたプリン塩基またはハロゲン原子もしくはC1〜C5アルキル基により5位で 置換されたピリミジン塩基から選択されている、請求項7記載のRNA。
- 9.修飾リボース糖に結合したヌクレオチド塩基がRNA中で天然に生じる塩基 である、請求項7記載のRNA。
- 10.修飾リボース糖に結合したヌクレオチド塩基がピリミジン塩基である、請 求項9記載のRNA。
- 11.1つの特異的種類の全てのヌクレオチド塩基が修飾リボース糖に結合して いる、請求項1から10までのいずれか1項に記載のRNA。
- 12.全てのウラシルヌクレオチド塩基が修節リボース糖に結合している、請求 項11記載のRNA。
- 13.全てのサイトシンヌクレオチド塩基が修飾リボース糖に結合している、請 求項11記載のRNA。
- 14.2つの特異的種類の全てのヌクレオチド塩基が修飾リボース糖に結合して いる、請求項1から10までのいずれか1項に記載のRNA。
- 15.全てのサイトシンおよびウラシルヌクレオチド塩基が修飾糖に結合してい る、請求項14記載のRNA。
- 16.修飾リボース糖が2′−フルオロ基または2′−アミノ基を有している、 請求項11から15までのいずれか1項に記載のRNA。
- 17.ヌクレオチド配列E2:5′−GGG(2′−FU)CC(2′−FU) C(2′−FU)GA(2′−FU)GAGGCCG(2′−FU)(2′−F U)AGGCCGAAAC(2′−FU)CC−3′からなるRNAにおいて、 2′−FUが2′−デオキシ−2′−フルオロウリジンモノホスフェートを表わ すことを特徴とする、RNA。
- 18.ヌクレオチド配列E3:5′−GGG(2′−NH2U)CC(2′−N H2U)C(2′−NH2U)GA(2′−NH2U)GAGGCCG(2′− NH2U)(2′−NH2U)AGGCCGAAAC(2′−NH2U)CC− 3′からなるRNAにおいて、2′−NH2Uが2′−デオキシ−2′−アミノ ウリジンモノホスフェートを表わすことを特徴とする、RNA。
- 19.分子の構造特性に基づく選択的な修飾パターンを有する、請求項1から1 0までのいずれか1項に記載のRNA。
- 20.リボヌクレアーゼに対する高感受性部位でのヌクレオチドが修飾されてい る、請求項19記載のRNA。
- 21.さらに少なくとも1つの修飾インターヌクレオチドホスホジエステル結合 を有する、請求項1から20までのいずれか1項に記載のRNA。
- 22.修飾ホスホジエステル結合がホスホロチオエートである、請求項21記載 のRNA。
- 23.少なくとも5′−末端ホスホジエステル結合が修飾されている、請求項2 1または22に記載のRNA。
- 24.少なくとも3′−末端ホスホジエステル結合が修飾されている、請求項2 1から23までのいずれか1項に記載のRNA。
- 25.5′−末端ホスホジエステル結合および最後の3つの3′−末端ホスホジ エステル結合が修飾されている、請求項21から24までのいずれか1項に記載 のRNA。
- 26.RNA鎖中に少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを配合することにより、 触媒活性を有するRNA分子を合成する方法において、リボース糖の2′位での ヒドロキシ基をハロゲン原子、スルフヒドリル基、アジド基、アミノ基、モノ置 換アミノ基およびジ置換アミノ基から選択された1つの修飾基によって代替する ことを特徴とする、触媒活性を有するRNA分子の合成方法。
- 27.修飾基がハロゲン原子またはアミノ基である、請求項26記載の方法。
- 28.ハロゲン原子が弗素原子である、請求項26または27に記載のに記載の 方法。
- 29.RNA鎖の合成を固体支持体上でヌクレオチド前駆物質からの化学合成に よって実施し、RNA生産物を固体支持体から除去し、かつ除去したRNA生産 物を精製する、請求項27または28に記載の方法。
- 30.RNA鎖の合成を溶液中でヌクレオチド前駆物質からの化学合成によって 実施し、かつRNA生産物を精製する、請求項27または28に記載の方法。
- 31.それぞれホスホルアミダイトまたはH−ホスホネートをヌクレオチド前駆 物質として使用する、請求項29または30に記載の方法。
- 32.アミノ修飾基をトリフルオロアセチルアミド基の形でRNA鎖中に配合し 、その後にトリフルオロアセチル保護基をアンモニアとの処理によって除去する 、請求項29から31までのいずれか1項に記載の方法。
- 33.さらにRNA鎖中に少なくとも1つの修飾インターヌクレオチドホスホジ エステル結合を配合する、請求項26から32までのいずれか1項に記載の方法 。
- 34.修飾ホスホジエステル結合がホスホロチオエート基である、請求項33記 載の方法。
- 35.RNA鎖の合成を核酸ポリメラーゼを用いて核酸鋳型からの転写によって 実施する、請求項26から28までのいずれか1項に記載の方法。
- 36.核酸鋳型がDNA鋳型であり、核酸ポリメラーゼがDNA依存RNAポリ メラーゼである、請求項35記載の方法。
- 37.DNA依存RNAポリメラーゼがT7、T3およびSP6ポリメラーゼか らなる群から選択される、請求項36記載の方法。
- 38.DNA依存RNAポリメラーゼがT7ポリメラーゼである、請求項37記 載の方法。
- 39.修飾基がハロゲン原子であり、RNA鎖の合成をMn2+イオンの存在下 に実施する、請求項35から38までのいずれか1項に記載の方法。
- 40.修飾基がアミノ基、モノ置換アミノ基またはジ置換アミノ基であり、RN A鎖の合成をMg2+イオンの存在下に実施する、請求項35から38までのい ずれか1項に記載の方法。
- 41.請求項1から25までのいずれか1項に記載のRNAを使用している治療 剤または生物触媒。
- 42.治療剤において、作用成分としての請求項1から25までのいずれか1項 に記載のRNAを、場合によっては常用の充填剤、賦形剤、担持剤および希釈剤 と一緒に含有することを特徴とする、治療剤。
- 43.治療剤を製造する方法において、治療剤が作用成分としての請求項1から 25までのいずれか1項に記載のRNAを場合によっては常用の充填剤、賦形剤 、担持剤および希釈剤と一緒に含有することを特徴とする、治療剤の製造法。
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