JPH09504424A - 生物活性成分を合成、同定するための生体触媒的方法 - Google Patents

生物活性成分を合成、同定するための生体触媒的方法

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JPH09504424A JP7507105A JP50710595A JPH09504424A JP H09504424 A JPH09504424 A JP H09504424A JP 7507105 A JP7507105 A JP 7507105A JP 50710595 A JP50710595 A JP 50710595A JP H09504424 A JPH09504424 A JP H09504424A
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、ある出発化合物に生体触媒反応を行って改変した出発化合物群からなるライブラリーを生成して最適な希望の活性を有する改変出発化合物を同定するための方法に関する。本発明においては、出発化合物、改変化合物は溶液中で遊離している。本方法は、希望の特異的活性を有する修飾医薬化合物の生産に有用である。

Description

【発明の詳細な説明】 発明の名称 生物活性成分を合成、同定するための生体触媒的方法 発明の背景 (a) 本発明は、生物活性成分の合成および同定の分野に属する。 (b) 先行技術の記載 先行技術には化学的、細菌学的、あるいは酵素学的手法によって生物活性を有 する化合物を合成する例が多数存在する。これらの手法の最終目標は新規で改善 された医薬化合物を見いだすことにある。 新規医薬化合物の発見のプロセスの大部分は試行錯誤である。効果的な医薬化 合物の構築には多岐にわたる要因が関与するので、新規化合物発見のプロセスを 系統的な手法へと整理するのは非常に困難である。一つの医薬化合物が見いださ れるまでには、典型的には数千もの有機化合物を生物学的ソースから単離するか あるいは化学的に合成して試験しなければならない。 新しい化合物を合成してその生物活性を試験することは新規合成薬を同定する ための第一ステップであるが、これには時間と費用がかかる。活性化合物を同定 したり最適な活性を有する化合物を同定するための典型的なプロセスでは、多く の化合物を合成し、精製し、試験し、かつ他の化合物と比較しなければならない 。新しい化合物の合成の大部分は標準的な化学的方法によってなされる。化学的 方法は実質的にあらゆるタイプの有機化合物の合成に適用されるが、化学反応は 非特異的であるために、最終化合物が製造され試験に供せられる段階に到るまで には有機化合物の合成には多数の工程と複数回の精製が必要である。 最近、新しい生物学的および化学的手法が各種開発されているが、これによる と、小さなペプチドやオリゴヌクレオチドの大きなライブラリーのスクリーニン グや合成が提供される。これらの方法は、幅広い化学的化合物を合成するもので あるとともに生物活性化合物を同定することができる手段を提供するものである 。これら膨大な数の天然のあるいは非天然の高分子化合物の化学合成は複雑では あるが、処理可能ではある。なぜなら、各化合物は同一の化学的プロトコールの セットによって合成されるのであって、違いは単にアミノ酸やヌクレオチドが反 応 シーケンスに導入される順番が任意であるに過ぎないからである。 フォドール(Fodor)、S.P.A.ら(1990年)、サイエンス、251、 767−773は、生物活性レセプターに結合する新ペプチドリガンドを発見す るための方法を記載している。この方法は、固相化学と光リソグラフィーを組み 合わせて多岐にわたる小ペプチドを製作するものである。この文献に記載の研究 および関連する研究については、フォドール(Fodor)の国際特許第921009 2号、ダウワー(Dower)の国際特許第9119818号、バレット(Barett)の国 際特許第9107087号、およびピルング(Pirrung)の国際特許第90150 70号にも記載されている。 ヒューテン(Houghten)、R.A.ら(1991年)、ネーチャー、354、8 4−86は、遊離ペプチドのライブラリーの合成手法と共に最適なペプチドのリ ガンドを系統的に同定するための反復選択工程を記載している。この研究は国際 特許出願第9209300号にも記載されている。 ラム(Lam)、K.S.ら(1991年)、ネーチャー、354、82−84は 、“1ビーズ、1ペプチド”の手法に基づいてペプチドライブラリーを固相マイ クロプレート支持体上で系統的に合成、スクリーニングするための方法を記載し ている。 クワーラ(Cwirla)、S.E.ら(1990年)、Proc.Natl.Aca d.Sci.USA、87、6378−6382は、ランダムに合成したオリゴ ヌクレオチドを特定のファージ遺伝子の5’領域にクローニングしてペプチドラ イブラリーをファージの表面で構築する方法を記載しており、これによって表面 タンパクのN末端で数百万の異なった6アミノ酸ペプチドを発現させている。 これらの方法は生物活性を有するペプチドやオリゴヌクレオチドの同定を促進 するものである。しかし、ペプチドやオリゴヌクレオチドは生物学的利用能が低 く、インビボでは安定性に問題があるため、治療剤としての用途には制限がある 。通常、有効な薬物の構造が同定される前の段階として、活性ペプチドやオリゴ ヌクレオチドの構造を模倣する非生物学的化合物を当該ペプチドやオリゴヌクレ オチドの大まかな3次元構造に基づいて合成しなければならない。 ブーニン(Bunin)ら、J.Am.Chem.Soc.(1992年)、114, 10997−10998は、固相合成技法を利用した、多くの1,4−ベンゾジ アザピン誘導体の合成を記載している。 先行技術には、非生理的物質を種々の条件下で酵素的に転換させる例が多数存 在する。酵素の特異性は変更/工作可能であることを記載する参考文献 1.Zaks,A.とKlibanov,A.M.、−酵素の基質特異性は有機 溶媒中と水中で逆転する−、ジャーナル・オブ・ザ・アメリカン・ケミカル・ソ サイアティー、108、2767−2768、1986。 2.Ferjancic,A.、Puigserver,A.およびGaert ner,H.、−有機溶媒中で促進されたペプチド合成におけるPEG修飾サー モリシンの例外的特異性−、バイオテクノロジー・レターズ、10(2)、10 1−106、1988。 3.Nasri,MとThomas,D.、−有機溶媒の存在下における、特異 性リラクゼーションによる制限エンドヌクレアーゼの能力向上−、Ann.N. 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酵素は非常に選択的な触媒である。酵素の特徴は精巧な立体的、領域的、およ び化学的選択性をもって反応を触媒する点にあって、これらは従来の合成化学で はすべてを同時に達成しえないものである。さらに、酵素は非常に多様に変更可 能であって、有機溶媒中で機能するように工作することもできるし、極端なpH や温度でも作用でき、また、天然における生理学的基質とは構造的に無関係の化 合物の反応を触媒することもできる。 酵素は広範な天然および非天然の基質に対して反応性を有し、実質的にあらゆ る有機鉛化合物を修飾することが可能である。さらに、伝統的な化学触媒と異な って、酵素は高度に鏡像選択性および領域選択性である。酵素が示す高度な官能 基選択性によって、新しい活性化合物に至る合成系列における各反応を辿ること ができる。酵素はまた、天然においては生理的機能とは無関係である多くの反応 を触媒することもできる。例えば、ペロキシダーゼは、過酸化水素によるフェノ ールの酸化を触媒する。ペロキシダーゼは、この酵素の元来の機能とは無関係の 水酸化をも触媒することができる。その他の例としては、プロテアーゼが挙げら れ、これはポリペプチドの分解を触媒する。有機溶液中では、ある種のプロテア ーゼは糖類をアシル化することができるが、この機能はプロテアーゼの元来の機 能とは無関係なものである。 本発明は、酵素における特徴的な触媒特性を利用するものである。生体触媒( 例えば精製酵素や粗酵素、さらに死んだ細胞や生きている細胞)を化学的転換に 使用するには、特定の出発化合物と反応する特定の生体触媒の同定が通常必要で あるが、本発明においては、多くの出発化合物中に存在する官能基に対して特異 的であるような、選択された生体触媒と反応条件が用いられる。各生体触媒は一 つの官能基に対して特異的であるか、あるいは幾つかの官能基に対して特異的で あって、この官能基を含有する多くの出発化合物と反応することができる。 生体触媒反応によって一つの出発化合物から誘導体集団が導かれる。この誘導 体をさらなる生体触媒反応工程に付して第二の誘導体集団を得ることもできる。 このような生体触媒誘導体生成の各繰り返し単位ごとに、元の化合物の数千もの 変形物を生産することができる。 酵素は、出発化合物の特定の部位と反応しつつも当該化合物分子の残部には影 響を及ぼさないが、このプロセスは伝統的な化学的方法によっては到底達成しえ ない。この高度な生体触媒的特異性が、ライブラリー中で一つの活性化合物を同 定する手段を提供する。ライブラリーは、これを生産するのに用いられる一連の 生体触媒的反応、即ちいわゆる“生合成ヒストリー”によって特徴付けられる。 ライブラリーを生物活性についてスクリーニングし、生合成ヒストリーを追跡す れば、活性化合物を産する特定の反応系列が同定される。この反応系列を繰り返 すと合成された化合物の構造が決定される。この同定法は他の合成、スクリーニ ング手法と異なり、不動化の技術を要さず、化合物は実質的にどのようなタイプ のスクリーニングアッセイによっても自由に溶液中で合成し、試験することがで きる。官能基に関し酵素反応が高度な特異性を有することによって、生体触媒的 に生成されたライブラリーを構築する特異的な酵素反応を“追跡する”ことがで きる、という点を認識することが重要である。 多くの手続段階がロボットによってオートメ化され、一日に何千もの生体触媒 反応やスクリーニングアッセイを処理することを可能としているとともに、高レ ベルの精度および再現性を確実なものとしている。その結果、現行の化学的方法 では数年かからないと得られなかったであろう誘導体化合物のライブラリーを数 週間程度で得ることができる。 本発明の特徴は、溶解した状態の出発化合物とそれに由来する誘導体を包含す る点にある。この点が本発明における特に特徴的な様相であって、これまでは障 害と考えられていたものである。生物活性化合物を同定するための従前の有機的 改変技術においては、不溶性の支持体に付着した誘導体と出発化合物とが使用さ れた。この例はエルマン(Ellman)(ブーニン、B.S.;エルマン、J.A.“ 1,4−ベンゾジアゼピン誘導体の固相合成のための一般的および便宜的方法” J.Am.Chem.Soc.1992年、114、10997−10998) 、ゴードンら(ゴードン、E.M.;バレット、R.W.;ダウワー、W.J. ;フォドール、S.P.A.;ギャロップ、M.A.“薬剤発見のための組合せ 技術の適用 1.背景とペプチド組合せライブラリー”、J.Med.Chem 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(USA)、1993、90、6909−6913)。溶解した状態でライブラ リーを合成することに加え、本発明のライブラリーは、固相支持体からのライブ ラリー除去を行うことなく即座にスクリーニングすることができる。よって、成 分を溶解状態に保持することによって、本発明は出発化合物および誘導体のライ ブラリーを生成しかつスクリーニングするための有用で便利でかつ効率のよい方 法を提供する。 本発明は、具体的には数々の多岐にわたる技術を利用するものである。例えば 、(1)薬剤候補のライブラリーを生産するための酵素反応の利用;(2)溶液 中で遊離している酵素または粒子表面に不動化された酵素、および溶液に溶解し ている状態で誘導された有機化合物の使用;(3)レセプターの使用(以下、こ の 用語は、ライブラリー中において有望な医薬候補を同定するために有用でかつ、 生体化合物やその他の結合分子に対して親和性を示す、真のレセプター、酵素、 抗体、およびその他の生体分子を指すものとし、このようなレセプターが細胞膜 あるいは完全な細胞に結合している場合も含む);(4)ライブラリーを試験し て希望する活性の有無を調べるための生体触媒プロセス全体の自動化および操作 工程の多くの自動化;および(5)生体触媒反応を、合成された化合物とレセプ ター分子との結合を即座に測定できる薬剤スクリーニング機器と組み合わせ、あ るいは生体触媒反応を全細胞アッセイにおいて組合せ、これによって生物活性化 合物の元となる特異的反応系列を即座に同定すること。 特に、本発明は薬剤を同定するための方法に関し、本方法は次の(a)−(d ): (a)生体触媒群を出発化合物と混合することにより一連の生体触媒反応群を 引き起して反応混合物を得、次いで改変された出発化合物群からなるライブラリ ーを生成すること、 (b)前記改変された出発化合物群からなるライブラリーを試験して、希望の 活性を示す改変された出発化合物が当該ライブラリー中に存在するかどうかを決 定すること、 (c)前記ライブラリーの一部を生産するために用いられた生体触媒反応群を 構成する各触媒反応を系統的に消去し、次いでこのライブラリーの前記一部の中 に産生された化合物群を試験して前記希望の活性を示す改変された出発化合物の 存在、不存在を確認することによって、前記希望の活性を示す改変された出発化 合物を産生する特異的な生体触媒反応群を同定すること、および (d)前記希望の活性を示す改変された化合物を産生する生体触媒反応群を繰 り返して反応生成物の化学組成を決定すること、 からなる。 具体的には、前記の酵素反応は、−出発化合物の構造内に存在し差別化しうる 別個の構造部分(moleties)と反応する酵素群との反応である。各酵素はある一つ の構造部分、あるいは関連する複数の構造部分からなる群に対して特異的である 。さらに、各酵素は、上記した別個の構造部分を含有する多くの異なった出発化 合 物と反応する。系統的に各反応を消去するほかに、本発明は、各反応を構築する 系統的プロセスを提供するが、これは反応経路の終点からのアプローチである。 本発明の格別の特徴は、出発化合物およびこれに引き続く誘導体が溶解した状態 である点に存する。 図面の簡単な説明 図1は、出発活性化合物AZTと、生体触媒誘導体生成の可能性を有する4つ の部位、および誘導体化合物群からなるライブラリーを生産するために用いられ 得る可能性を有する8つの可能な生体触媒反応を示す。 図2は、一日に数百の生体触媒反応とスクリーニングアッセイをロボットによ る自動化によって行う自動化システムを示す。 図3は、活性化合物を産生する反応系列を同定するための生体触媒反応群の追 跡を示し、これは、後でその活性化合物を生産してその構造を同定するために利 用される。 図4aは、カスタノスペルミンの生体触媒修飾を示す。 図4bは、メトトレキセートの生体触媒修飾を示す。 発明の開示 以下、好ましい実施態様に関連させつつ本発明を記載するが、本発明は掲載さ れた特定の態様によって限定されるものではない。本発明の態様は、まずAZT について次いでタキソールについて記載するが、これらは本発明の単に一部の態 様であるに過ぎない。実際、添付の請求の範囲に記載された発明の範囲と精神に 沿うものであるかぎり、全ての代替物、改変物、および等価物が本発明に包含さ れ、保護の対象とされるものである。 本発明の好ましい態様を次の例で説明する。 a)AZT(3’−アジドチミジン)等の出発化合物を選択する。この出発化 合物は、薬物活性を示すかあるいは所与の疾病や障害に対して薬物活性を示すと 信じられている化合物である。この化合物を、その官能基の内容および構造の変 更に関して分析する。分析には選択された生体触媒反応を利用する。選択された 生体触媒反応によって化学的に改変されうる官能基を表Iに示す。これらの官能 基の一以上の官能基は、実質的に全ての有機化合物中に存在する。これらの官能 基を修飾、改変する為に用いられる可能性を有する酵素反応の一部のリストを表 IIに示す。 b)選択された生体触媒反応を用いてこれらの官能基を系統的に改変し、かつ 生物活性に関するスクリーニング対象となる誘導体化合物群のライブラリーを生 産するための戦略的方法を適用する。AZTは、生体触媒的改変のために選択さ れる4つの官能基を有する。これらは即ち主たるヒドロキシル基、二つのカルボ ニル基、および第3級アミンである。 生合成戦略は、生体触媒“反応ボックス”の番号の形態で指定されるが、これ は、出発化合物中に存在する特定の官能基に作用する特定のタイプの生体触媒反 応群に対応する番号である。これらの“反応ボックス”を表IIIに示す。次の 生体触媒“反応ボックス”を選択してAZT誘導体ライブラリーの合成に使用す る:A3、A11、C2、G6、G10およびG12。図1は、これらの選択さ れた生体触媒反応ボックスとAZTとの反応を示す。 c)生体触媒反応ボックスを図2に示す自動化システムに加える。本システム は前記の生体触媒反応と誘導体生成物のライブラリーの合成を自動的に行うよう にプログラムされている。単一の自動化システムで一日に数百もの予めプログラ ムされた生体触媒反応を行うことができる。各“反応ボックス”で生産される反 応生成物を分析し結果を掛け算することで、生成可能な化合物の全数の概数を算 出することができる。表IVに、各反応ボックスで産生される可能性のある反応 生成物の数を示す。AZTの場合においては、最大1.75×1011個の新規化 合物が合成できる。これはペプチドライブラリーとも好ましく比較されうるもの である点に留意されたい。例えば、ヘキサペプチドのライブラリーは206個即 ち64百万個の化合物を含有するであろう。この数は、本明細書に記載する生合 成手法の利用によって達成可能な化合物の単に一部、約0.04%に過ぎない。 表Vは、11個の他の出発薬物化合物についての同様の分析結果を示す。この表 から判るように、本発明の生合成反応によって、医薬スクリーニングに供するた めの膨大な数の誘導体化合物を生成することができる。 d)新規化合物群からなる合成ライブラリーをアッセイに付す。アッセイとし ては酵素阻害アッセイ、レセプター結合アッセイ、イムノアッセイ、および/ま たは細胞アッセイが挙げられ、これによって生物活性化合物を同定する。誘導体 化合物のライブラリーをアッセイに付す前に、当該ライブラリーに存在する残存 AZTを除去するかあるいは阻止して、スクリーニングアッセイ結果の解釈を簡 略化する。これはHPLC、TLC、または出発化合物に対して特異的なモノク ローナル抗体の添加によって容易に達成可能である。数々のインビトロアッセイ を利用して、抗ウイルス活性、抗癌活性、抗高血圧活性、およびその他の良く知 られた医薬活性が試験される。これらのアッセイの幾つかを表VIに記載する。 これらのアッセイの多くは、自動化システム上でも実行可能である。 e)陽性の結果が出たライブラリーは、生体触媒追跡プロトコールを用いてさ らに分析する。このプロトコールによって、スクリーニングアッセイで陽性とな る化合物の合成のための反応系列を迅速に同定する。生体触媒が示す高度な特異 性(即ち、所与の官能基と反応する所与の酵素の能力)によって、本アプローチ を容易に行うことができる。ライブラリーは、このライブラリーを生産するため に用いる一連の生体触媒反応、即ち所謂“生合成ヒストリー”によって特徴付け られる。このライブラリーを構成する各部分が生物活性を有するか否かについて スクリーニングを繰り返して調べ、活性化合物を産生する特定の反応系列を同定 する。図3にこの追跡プロセスを示す。例えば、太線のパス15は最も活性の高 い化合物に至る反応経路を示す。反応系列を繰り返し、化学分析に供するに十分 な量の生成物を生成する。この生体触媒反応の特異性はまた、活性化合物を産生 する反応経路を正確に再現することを可能とする。活性化合物の構造は出発化合 物、基質、および同定された生体触媒反応系列を分析することによって定性的に 決定される。次いでこの構造を、ガスクロマトグラフィー、質量分析法、NMR 分析法、その他の有機分析方法によって確認する。この同定法においては生成物 の精製工程は不要であって、かつ有望な新規薬物化合物を同定するために必要な 試験スクリーニングも少ない。本プロセスは新規薬物化合物の合成、同定に必要 な時間を驚異的に短縮する。加えて、この活性化合物同定法は不動化技術を要せ ず、かつ化合物の合成および試験は、実質的にどのようなタイプのスクリーニン グアッセイ(レセプターアッセイ、酵素阻止アッセイ、イムノアッセイ、細胞、 動物モデル)によってもインビボ様の条件下で溶液中で遊離体のままで行うこと ができる。 医薬の分野の当業者は、表IIおよび表IIIに掲載したような多くの生体触 媒転換、並びに表VIに掲載したインビトロの薬剤スクリーニングアッセイを承 知しているであろう。 また、溶媒、バッファー、pH、イオン強度、試薬濃度、および温度などのフ ァクターを制御、調整することによって生体触媒反応が最適化されうるというこ とは、医薬分野の当業者の了解事項であろう。 生体触媒反応に用いられる生体触媒は未精製酵素や精製酵素、細胞溶解調製物 、部分精製溶解産物調製物、生きた細胞や生きていない完全な形の細胞などであ って、これらは溶液、懸濁液として、または磁性体や非磁性体表面上に不動化さ せて使用する。 加えて、非特異的な化学反応を前記生体触媒反応と組み合わせて行うことによ り、出発化合物の改変物ライブラリーを得ることができる。そのような非特異的 化学反応の例としては次のものが挙げられる:芳香族化合物や脂肪族化合物のヒ ドロキシル化;酸化反応;還元反応;水和反応;脱水反応;加水分解反応;酸又 は塩基を使用する触媒されたエステル化反応;エステル交換反応;アルドール縮 合反応;還元的アミノ化;アミノ分解反応;脱水素ハロゲン化反応;ハロゲン化 反応;アシル化反応;アシル基置換反応;芳香族基置換反応;グリニャール合成 反応;フリーデル−クラフツアシル化反応;エステル化反応。 前記生体触媒反応は、磁性生体触媒を形成する磁性粒子に不動化された生体触 媒を用いて行うことができる。この態様での方法は、不動化された生体触媒を基 質(群)、コファクター(群)、および特異的生体触媒反応に用いられる溶媒/ バッファー条件と組合せることにより、前記生体触媒反応を開始することによっ て行われる。次いで磁性生体触媒を生体触媒反応混合物から除去して生体触媒反 応を停止する。除去は、外部磁界を印加して生体触媒が不動化された磁性粒子を 磁界源に引きつけ、凝集させることにより、効果的に磁性生体触媒を生体触媒反 応混合物から分離することにより行われる。これによって磁性生体触媒は第一反 応容器に残しつつ、磁性生体触媒が除去された反応混合物を第一反応容器から第 二反応容器に移すことができる。第二の生体触媒反応は第一の生体触媒反応とは 完全に独立して行われる。この第二の生体触媒反応では、磁性粒子に不動化され た第二の生体触媒を、前記第一の反応容器から移された生体触媒反応混合物を含 有する第二の反応容器に添加する。最後にこれらの工程を繰り返し、それぞれ別 個の独立した一連の生体触媒反応群を達成する。ここにおいて、各反応はそれぞ れ対応する出発化合物改変物を産生する反応である。 このような生体触媒反応は、生体触媒反応混合物に生体触媒を添加したり、除 去したりするのに好都合である表面であればどのような表面上に不動化された生 体触媒を用いても行うことができ、これによってもそれぞれ別個の独立した一連 の生体触媒反応群が達成される。ここにおいて、各反応はそれぞれ対応する出発 化合物改変物を産生する反応である。 また、生体触媒反応は、公知の薬物化合物を誘導してそのような薬物化合物の 新規誘導体群を産生し、そのライブラリーから最適な活性を示す個々の化合物を 選択するために用いることもできる。これを達成するには、高度の親和性を有す るレセプターを生体触媒反応混合物に組み込む。このような組み込みが可能な理 由は、生合成の反応条件とスクリーニングの反応条件が適合するためである。高 度の親和性を有するレセプターを出発活性化合物のモル濃度の約二分の一で反応 混合物に加えると、基本的に全てのレセプターが出発活性化合物に結合するとと もに等モル濃度の出発活性化合物が溶液中に遊離し、生体触媒による改変のため に利用できる。もし生体触媒反応混合物が、レセプターに対するより高度な結合 親和性を有する誘導体を生産し、これが改善された医薬性能に転換できる場合、 この誘導体は結合した出発活性化合物と置き代わるとともにレセプターとは複合 体を形成したままで、よってさらなる生体触媒転換から保護されるであろう。実 験の最後にレセプター複合体を単離し、解離して、結合化合物を分析する。本手 法によれば、個々の化合物を精製したり試験したりする必要なしに、改良された 薬剤化合物の同定を行うことができる。 生体触媒反応とインビトロのスクリーニングアッセイは、自動化したロボット 装置を用いて行うことができる。この自動化ロボット装置は、 (a)付属XYZピペッティングブームを有するXYテーブル(ここでブーム は、XYテーブル上に位置する試薬容器群から、酵素、基質、コファクター、溶 媒溶液、およびアッセイ試薬の容積量を、同じXYテーブル上に位置する反応お よびアッセイ容器に添加する)、 (b)前記XYテーブルに取り付けられたXYZ反応容器移動ブームであって 、XYテーブル上に位置する反応およびアッセイ容器を、同じXYテーブル上の 異なった位置に移動するために用いられるXYZ反応容器移動ブーム、 (c)前記XYテーブルに取り付けられ、反応およびアッセイ容器をインキュ ベーション期間中内包するとともに反応混合物の温度を制御する温度インキュベ ーションブロック、 (d)前記XYテーブルに取り付けられた磁気分離ブロックであって、外部磁 界を適用することによって磁気粒子上に不動化された生体触媒を生体触媒混合物 から分離し、磁性粒子を磁界源に引きつけ凝集させて、効果的に磁性粒子を生体 触媒反応混合物のバルクから分離する磁気分離ブロック、および (e)XYZピペッティングブーム、XYZ反応容器移動ブーム、温度ブロッ クおよび磁気分離ブロックのそれぞれと接続されたプログラム可能なマイクロプ ロセッサであって、生体触媒反応を引き起こして出発化合物の改変物を産生する にあたってのこれらの機能的ユニットの運動と操作の全て、および所望の活性を 決定するためのアッセイを精密に制御しかつ調整するマイクロプロセッサ、を有 するものである。 図2は、本発明による自動化ロボット装置を示す。本システムのフレーム1に は、出発化合物群2のためのコンテナ群、酵素、コファクター、およびバッファ ーなどの試薬群3のためのコンテナ群が搭載されている。また、種々のカテゴリ ーの反応に対する試薬を含有する特定の生合成ボックス4がある。フレームには さらに、反応容器5の列、および特定の温度で反応を行うためのウェル7を有す る加熱ブロック6が配置される。本フレームは、スクリーニング試験8の試薬の ための領域8を有し、これはスクリーニングテストを行うために用いる試薬を含 有する。また、領域9はスクリーニングテストを行うためのアッセイ容器を有す る。本自動化システムはX−Y−Zピペッティングおよび容器移動ブーム10を 用いて全試薬および溶液を分配するとともに反応容器を移動させる。 操作に当たっては、X−Y−Z反応容器移動ブームは、特定の出発化合物改変 物を作るための特定の位置へと出発化合物と試薬を移送することができるが、移 送されたこれらの改変物はアッセイを行うための特定の位置へとさらに移送され る。このようにして、出発化合物の改変物の生成および最適活性のための試験の プロセスの大部分が自動化される。 図4aと4bは、カスタノスペルミン(castanospermine)およびメトトレキセ ート(methotrexate)の誘導体生成を示す。これらの態様の全ては、表IIに記載 する生体触媒転換および表VIに記載するアッセイを利用している。 本明細書に記載する発明は医薬を指向するものであるが、食物添加剤、殺虫剤 、除草剤、および植物や動物の成長ホルモンを始めとする各種の生物活性化合物 にも同様に本発明方法を適用可能であることは生物学の分野の当業者にとって認 識されるであろう。 実施例1 1.酵素によるタキソールのエステル化 1.1 反応生成物の分析 タキソールの酵素によるエステル化生成物の分析は、逆相HPLCをWate rsシステム(990光ダイオードアレー検出器装備)に適用し、3.9×30 0mmμBondapakC18カラムを用いて行った。使用した溶媒系は、水/ アセトニトリル混合物(40:15v/v)とイソプロパノールから なるものであった。下記の線型勾配プログラムで1ml/分で溶出させた。 生成物のピークは光ダイオードアレー検出器によって227nmで検出した。 1.2 タキソールエステルの酵素による合成−活性生体触媒の同定 (反応ボックスB−4) 粗リパーゼ類、粗プロテアーゼ類、および精製プロテアーゼ類からなる55の 酵素(表VII)の混合物(総重量:600mg)を、タキソール(17.0m g、20μmol)とビニルブチレート(0.25ml、1.5mmol)を2 .9mlのtert−アミルアルコールに溶解した溶液中に添加した。これを隔 壁でシールされたガラス製試験管に入れ30秒超音波処理し、オービット・シェ ーカーにて250rpm、35℃で48時間処理した。その後、遠心分離により 懸濁固体触媒を除去することで反応を停止した。タキソールエステルを含有する 上清を真空中で蒸発乾固し0.3mlのメタノール中に再溶解した。得られた濃 縮溶液の分割量(15μl)を250μlのメタノールで希釈し、HPLCによ って1.1に記載のようにして分析した。クロマトグラフィー分析によって、保 持時間9.7分(未反応タキソール)に一ピーク、14.6分(2’−タキソー ル・ブチレート、収率7%)に一ピークの結果を得た。 次いで酵素を3グループに分けた。即ち、26のリパーゼ(100mg/ml )、26の粗プロテアーゼ(100mg/ml)、および4精製プロテアーゼ( 10mg/ml)の3グループに分け、上記と同じ反応を行った。精製プロ テアーゼのみが顕著な活性を示し、48時間後の2’−ブチレートの収率は15 %であった。次いでこの精製プロテアーゼを個々の酵素に分割(全て濃度10m g/mlで使用)すると、サーモリシン(バチルス・サーモプロテオリチカス・ ロッコa.k.a.サーモリシンからの細菌性プロテアーゼ)が48時間後の収 率2 4%で最も活性の高い酵素として同定された。この手法は、未反応生体触 媒を除去する一連のプロセスに活性生体触媒を付すことによって、活性生体触媒 が容易に同定できることを示すものである。 1.3 タキソールエステル混合物の酵素による合成−一連の反応ボックスに よるタキソールの誘導体生成 この合成に用いた酵素触媒の最適なものは、サーモリシン、KC1、およびリ ン酸カリウムバッファーを含有する水溶液(pH7.5)を凍結乾燥して得たも のであった。凍結乾燥後に得た固体触媒は5%の酵素、94%のKC1、および 1%のリン酸カリウムを含有していた。粉末状にした酵素触媒(335mg−1 6.75mgのサーモリシン含有)をタキソール(17.0mg、20μmol )とビニルカプロエート(直鎖;C6エステル)(0.24ml、1.5mmo l)を2.9mlのtert−アミルアルコールに溶解した溶液中に添加した。 この混合物を隔壁でシールされたガラス製試験管に入れ30秒超音 波処理し、オービット・シェーカーにて250rpm、35℃で処理した。28 時間処理後、反応混合物(酵素含有)を取り出し、この混合物の全量を、ビニル プロピオネート(0.24ml、2.2mmol)、ビニルアクリレート(0. 24ml、2.2mmol)、およびビニルブチレート(0.24ml、1.9 mmol)を含有する別の溶液に添加した。この第二の反応物を攪拌機に入れ、 250rpm35℃でインキュベートした。24時間後、反応混合物(酵素含有 )を取り出し、この混合物の全量を、ビニルアセテート(0.25ml、2.6 mmol)およびビニルクロロアセテート(0.24ml、1.8mmol)を 含有する別の溶液に添加した。反応は35℃、250rpmで24時間行った。 次いで、懸濁固体触媒を遠心分離することによって反応を停止した。一連の反応 は、タキソールとタキソール誘導体が溶解性であるという性質によってスムーズ に進行した。タキソールエステルを含有する上清を真空中で蒸発乾固し、0.3 mlのメタノール中に再溶解した。得られた濃縮溶液の分割量(15μl)を2 50μlのメタノールで希釈し、HPLCによって1.1に記載のようにして分 析した。クロマトグラフィー分析によって、保持時間9.7分(未反応タキソー ル)のピーク、11分と13分の間(全概算収率:52%)のブロードなピーク 、14.6分のピーク(収率:9%)、17.4分のピーク(収率18%)、お よび18.4分の小ピーク(収率0.2%)という結果が得られた。全反応収率 は約80%であった。 1.4 反応混合物からのタキソールの取り出し 1.3で生成した反応生成物の濃縮メタノール溶液を分取TLCシリカプレー ト(ワットマン、20×20cm、シリカ層厚:500μm、蛍光マーカー含有 )に付し、プレートを、クロロホルム:アセトニトリル(4:1v/v)の混合溶 媒で展開した。生成物のスポットの位置は、スポットに紫外線を照射して決定し た。タキソールのRf値は0.16でタキソールエステルのRf値は0.28〜 0.71の間であった。生成物をTLCプレートから取り出し、エチルアセテー トに溶解した。次いで生成物を真空中で乾燥した。 1.5 タキソールエステル混合物のスクリーニング 上記のタキソール誘導体のライブラリーを、HL−60細胞(前骨髄球白血病 細胞系)およびMOLT−4細胞(リンパ芽球白血病細胞系)に対する細胞毒性 に関してスクリーニングした。細胞を、96穴プレートに各ウェル30,000 個の細胞濃度で播種し、10%のウシ胎児血清を含有するRPMI−1640培 地で37℃で24時間生育させた。その後培地を、タキソール誘導体をDMSO に最終濃度100nM〜0.1nMとなるように溶解させた新鮮培地(既に分取 薄層クロマトグラフィーで除去されているタキソールは除く)と交換した。細胞 培地中におけるDMSOの最終濃度は0.5%(v/v)であった。72時間後、サ ンプルを取り出し細胞数を数えた。トリパンブルー除去および血球計算盤上での マニュアル細胞計数によって全細胞数と生存度を決定した。用量に対する応答デ ータを表IXに示す。血球計算盤での計数の結果、上記タキソール誘導体ライブ ラリーには少なくとも一つの細胞毒性誘導体が含有されていることが判明した。 1.6 活性生成物(群)を同定するための追跡調査 1.6.1 個々のタキソールエステルの酵素による合成 − 上記1.3に 記載のタキソールのアシル化を含む反応を組み立てることによって活性タキソー ルエステルを同定する。 酵素によるアシル化反応は予測可能な性質を有するので、混合物の化学組成を 分析することなくあり得る生成物を同定することができる。そこでそれらのあり 得る生成物を下記のようにして個々に合成し、次いで追跡プロセスの一環として これら個々のエステル生成物に関するスクリーニングを開始する。 上記1.3の記載に従って調整した粉末状酵素触媒(140mg)をタキソー ル溶液(5.5mg、6.5μmol)に添加し、1.0mlのtert−アミ ルアルコールに溶解した個々のビニルエステル(80μl、約2mmol)上に 加えた。アシル化剤としては次のビニルエステルを用いた:アセテート、クロロ アセテート、アクリレート、プロピオネート、ブチレート、およびカプロエート 。各混合物は、隔壁でシールされたガラス試験管に入れ、30秒間超音波処理し た。次いでオービット・シェーカーにて250rpm、35℃で処理した。96 時間後、遠心分離により懸濁固体触媒を除去することで反応を停止した。タキソ ールエステルを含有する上清を真空中で蒸発乾固し0.3mlのメタノール中に 再溶解した。得られた各濃縮溶液からその分割量(20μl)を取り、80μl のメ タノールで希釈し、HPLCによって1.1に記載のように分析した。HPLC 分析の結果を表VIIIに示す。 1.6.2 薄層クロマトグラフィー(TLC)による反応生成物の回収 個々のエステル反応生成物をTLCによってタキソールから単離した。1.6 の記載によって得た反応生成物の濃縮メタノール溶液を分取TLCシリカプレー ト(ワットマン、20×20cm、シリカ層の厚さ:500μm、蛍光マーカー 含有)に付し、プレートを、クロロホルム:アセトニトリル(4:1v/v)の混 合溶媒で展開した。生成物のスポットの位置は、スポットに紫外線を照射して決 定した。各生成物のRf値を表VIIIに示す。生成物のスポットを別々にプレ ートから掻き取り、掻き屑を15mlのエチルアセテートによって溶出して生成 物を回収した。真空中でエチルアセテートを蒸発させて乾燥生成物を得た。 1.6.3 個々のタキソールエステルのスクリーニング 新たに合成された生成物(群)の何れが活性を有するかを決定するために、ラ イブラリーの合成ヒストリーを“追跡調査”した。この追跡調査にあたっては、 可能性のある全エステル生成物を個々に(上記のようにして)酵素的に合成した 。TLCで生成物を単離後、各誘導体の細胞毒性の有無を、上記の手続きによっ て試験した。細胞毒性試験の結果、二つの誘導体、2’−クロロアセチルタキソ ールおよび2’−アクリロイルタキソールが両細胞株に対して活性を有すること が判明した(表IX)。 実施例 2 2.酵素によるタキソールの加水分解 2.1 反応生成物の分析 タキソールの酵素による加水分解生成物の分析は、逆相HPLCをWater sシステム(990光ダイオードアレー検出器装備)に適用し、3.9×300 mmμBondapakC18カラムを用いて行った。使用した溶媒系は、水/ア セトニトリル混合物からなるものであった。下記の直線勾配プログラムで1ml /分で溶媒をHPLCシステムに供給した。 生成物のピークは光ダイオードアレー検出器によって227nmで検出した。 2.2.タキソールの酵素による加水分解 (反応ボックスJ−8とS−8) 加水分解に用いた酵素触媒は、等量のサーモリシン、サブチリシン・カールス バーグ、キモトリプシン、およびトリプシンを含有する水溶液(pH7.5に調 整)を凍結乾燥することによって調整した。酵素触媒(1.1mg)を0.7m lの0.1Mリン酸カリウム緩衝液(pH7.5)に溶解した。水性酵素溶液は 、タキソール(2.0mg、2.4μmol)を0.3mlのtert−アミル アルコールに溶解した溶液中に加えた。このようにして生成した二層性の反応系 を、隔壁でシールしたガラス試験管に入れ、オービット・シェーカーにて75ス トローク/分、20℃で攪拌した。26時間後、有機溶媒層を取り出し、蒸発乾 燥し0.2mlのメタノール中に再溶解してHPLC分析に付した。水相を3. 5mlのメタノールで希釈し、遠心分離により不溶性の固体(沈降酵素)を除去 した。清澄な上清を蒸発乾燥し、0.2mlのメタノール中に再溶解してHPL C分析に付した。HPLC分析は2.1の記載に従って行った。前記二相性の反 応系の水相を精査したが得られたメタノール溶液にはタキソールも、また何らの 加水分解産物も検出されなかった。一方、有機層から得た乾燥残渣のメタノール 溶液をクロマトグラフィーに付すと、酵素によるタキソール加水分解産物 の生成を示す、保持時間20.4分(未反応タキソール)のピークと18.4分 のピークを得、これはUV吸収の特性カーブによって同定された。この生成物の 収率は9%と見積もられた。 実施例 3 3.酵素によるタキソールのグリコシル化 3.1 反応生成物の分析 タキソールの酵素によるグリコシル化生成物の分析は、逆相HPLCをWat ersシステム(990光ダイオードアレー検出器装備)に適用し、3.9×3 00mmμBondapakC18カラムを用いて行った。使用した溶媒系は、水 /メタノール混合物からなるものであった。下記の直線勾配プログラムで1ml /分で溶媒をHPLCシステムに供給した。 生成物のピークは光ダイオードアレー検出器によって227nmで検出した。 3.2.タキソールの酵素によるグリコシル化 タキソールのグリコシル化は、パン屋から入手したα−グルコシダーゼを生体 触媒として用いて行った。なお、用いた酵素は以下のとおりである:醸造業者か ら入手したα−グルコシダーゼ(pH7.0)、パン屋から入手したα−グルコ シダーゼ(pH7.0)、大腸菌からのβ−ガラクトシダーゼ(pH5.0)、 A.オリーゼからのβ−ガラクトシダーゼ(pH5.0)、およびウシ肝臓から のβ−グルクロニダーゼ(pH5.0)であった。これらの酵素を2種の混合物 (1つはpH7.0、1つはpH5.0)で使用した所、pH7.0の混合物の みがグリコシル化タキソール中で活性を有した。次いでこの混合物を個々の酵素 に分けた所、パン屋から入手したα−グルコシダーゼが活性な生体触媒であるこ とが判明した。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ドルディック,ジョナサン エス. アメリカ合衆国 52240 アイオワ州 ア イオワシティ,ウォルナット リッジ レ ーン 2996 (72)発明者 クラーク,ドーラス エス. アメリカ合衆国 94611 カリフォルニア 州 オークランド,ホリーロード ドライ ブ 3066

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.次の(a)−(d): (a)生体触媒群を出発化合物と混合することにより一連の生体触媒反応群を 引き起して反応混合物を得、次いで改変された出発化合物群からなるライブラリ ーを生成すること、 (b)前記改変された出発化合物群からなるライブラリーを試験して、希望の 活性を示す改変された出発化合物が当該ライブラリー中に存在するかどうかを決 定すること、 (c)前記ライブラリーの一部を生産するために用いられた生体触媒反応群を 構成する各触媒反応を系統的に消去し、次いでこのライブラリーの前記一部の中 に産生された化合物群を試験して前記希望の活性を示す改変された出発化合物の 存在、不存在を確認することによって、前記希望の活性を示す改変された出発化 合物を産生する特異的な生体触媒反応群を同定すること、および (d)前記希望の活性を示す改変された化合物を産生する特異的な生体触媒反 応群を繰り返して反応生成物の化学組成を決定すること、 の各段階を含むことを特徴とする薬剤の同定方法。 2.(a)前記生体触媒反応が、出発物質の構造内に存在する別個の構造部分 と反応する生体触媒群との反応であり、 (b)各生体触媒が、ある一つの構造部分、あるいは関連する複数の構造部分 からなる群に対して特異的であり、かつ、 (c)各生体触媒が、前記別個の構造部分を含有する多くの異なった出発化合 物と反応するものである、請求項1記載の薬剤の同定方法。 3.次の(a)−(e): (a)出発化合物に対して一連の生体触媒反応を行って改変された出発化合物 群のライブラリーを生成すること、 (b)希望の活性を有する出発化合物のための高親和性レセプターを提供し、 各生体触媒反応によって形成された改変化合物を前記高親和性レセプターに暴露 すること、 (c)高親和性レセプター−改変出発化合物複合体を生体触媒反応混合物から 単離すること、 (d)前記複合体を各成分部分に解離すること、および (e)解離された改変出発化合物の化学組成を決定すること、 の各段階を含むことを特徴とする薬剤の同定方法。 4.次の(a)〜(g): (a)出発化合物に高親和性のレセプターを添加するにあたり、基本的に当該 高親和性レセプターの全てが当該出発化合物に結合しほぼ等モル量の出発化合物 が溶液中に遊離の形態で残存して生体触媒による改変に利用可能であるような濃 度で当該レセプターを添加して生体触媒反応混合物を形成すること、 (b)出発化合物よりも高い親和性を示す改変された出発化合物を生成し、こ れによって前記出発化合物を前記高親和性レセプターから排除すること、 (c)前記改変された出発化合物と前記高親和性レセプターとの複合体を形成 し、これによって前記改変された出発化合物をさらなる生体触媒反応から保護す ること、 (d)前記複合体を前記生体触媒反応混合物から分離すること、 (e)前記複合体を各成分部分に解離すること、 (f)解離された改変出発化合物の化学組成を決定すること、および (g)上記の段階(a)〜(b)を繰り返して改変された出発化合物のライブ ラリーを生成すること、 の各段階を含むことを特徴とする薬剤の同定方法。 5.前記高親和性レセプターが、生きた細胞表面上若しくは生きた細胞内に存 在するかまたは天然若しくは人工支持体に不動化されて存在するものである、請 求項4記載の薬剤の同定方法。 6.前記生体触媒反応は、次の(a)〜(g): (a)第一および第二アルコールの酸化、 (b)アルデヒドおよびケトンの還元、 (c)第一および第二アルコールのアシル化、 (d)第一および第二アルコールのグリコシル転移、 (e)第一および第二アルコールのエーテル化、 (f)一級および二級アミンのアシル化、および (g)カルボン酸のエステル化 からなる群から選択される反応である請求項1記載の薬剤の同定方法。 7.前記生体触媒が、粗酵素若しくは精製酵素、細胞溶解調製物、部分精製溶 解産物調製物、生存細胞若しくは完全な非生存細胞を、溶解可能な形態、懸濁さ れた形態、あるいは不動化された形態で用いられるものである、請求項1記載の 薬剤の同定方法。 8.前記生体触媒反応が、非特異的な化学反応群と組み合わせて行って改変さ れた出発化合物群のライブラリーを生成する反応である請求項1記載の薬剤の同 定方法。 9.さらに、 (a)前記反応混合物を、希望の活性を有する化合物と、極在する若しくは不動 化されたレセプター分子もしくは細胞との結合を測定する薬剤スクリーニング装 置に暴露すること、 (b)前記薬剤スクリーニング装置からの陽性測定値を、前記反応混合物の合 成に用いた一連の生体触媒反応および希望の活性を有する改変された出発化合物 を生成する特異的反応シーケンスに関連付けること、および (c)前記生体触媒反応シーケンスを繰り返して希望の活性を有する改変出発 化合物を生成し、その化学組成を決定すること、 を含むものである請求項1記載の薬剤の同定方法。 10.前記生体触媒反応が磁性粒子に不動化されて磁性生体触媒を形成している 生体触媒を用いて行い、当該方法がさらに次の(a)〜(d): (a)前記不動化された生体触媒を、基質(群)、コファクター(群)、およ び特異的生体触媒反応に用いられる溶媒/バッファー条件と組合せることによっ て生体触媒反応を開始すること、 (b)前記磁性生体触媒を前記生体触媒反応混合液から除去して生体触媒反応 を停止するにあたり、外部磁界を印加して生体触媒が不動化された磁性粒子を磁 界源に引きつけ、凝集させることによって効果的に磁性生体触媒をバルクの生体 触媒反応混合物から分離し、これによって磁性生体触媒を第一反応容器に残しつ つ、磁性生体触媒が除去された反応混合物を第一反応容器から第二反応容器に移 すこと、 (c)磁性粒子に不動化された第二の生体触媒を、前記第一の反応容器から移 された前記生体触媒反応混合物を含有する第二の反応容器に添加することにより 、前記第一の生体触媒反応とは完全に独立した第二の生体触媒反応を行い、さら に、 (d)前記の段階a)からc)を繰り返し、別個の独立した一連の生体触媒反 応群を完成して、それぞれ対応する出発化合物改変物を産生すること、を含むも のである請求項1記載の薬剤の同定方法。 11.粒子に不動化された生体触媒を用いて生体触媒反応を行うとともに、前記 生体触媒が遠心分離または濾過によって生体触媒反応混合物から除去されるもの である、請求項10記載の薬剤の同定方法。 12.(a)付属XYZピペッティングブームを有するXYテーブル(ここで当 該ブームは、前記XYテーブル上に位置する反応容器群からの酵素、基質、コフ ァクター、溶媒溶液、およびアッセイ試薬の容積量を、同じ前記XYテーブル上 に位置する反応およびアッセイ容器に添加する)、 (b)前記XYテーブルに取り付けられたXYZ反応容器移動ブームであって 、前記XYテーブル上に位置する反応およびアッセイ容器を、同じ前記XYテー ブル上の異なった位置に移動するために用いられるXYZ反応容器移動ブーム、 (c)前記XYテーブルに取り付けられて反応およびアッセイ容器をインキュ ベーション期間中内包するとともに反応混合物の温度を制御する温度インキュベ ーションブロック、 (d)前記XYテーブルに取り付けられた磁気分離ブロックであって、外部磁 界を適用することによって磁気粒子上に不動化された生体触媒を生体触媒混合物 から分離し、前記磁性粒子を前記磁界源に引きつけ凝集させて、効果的に磁性粒 子を生体触媒反応混合物のバルクから分離するものである磁気分離ブロック、お よび (e)XYZピペッティングブーム、XYZ反応容器移動ブーム、温度ブロッ クおよび磁気分離ブロックのそれぞれと接続されたプログラム可能なマイクロプ ロセッサであって、生体触媒反応を引き起こして出発化合物の改変物を産生する にあたってのこれらの機能的ユニットの運動と操作の全て、および希望の活性を 決定するためのアッセイを精密に制御しかつ調整するマイクロプロセッサ、 を包含する自動化ロボット装置を使用するものである請求項1記載の薬剤の同定 方法。 13.次の(a)〜(g): (a)出発薬剤化合物のモル濃度の約1/2で高親和性のレセプターを出発薬 剤化合物と混合して、基本的に当該高親和性レセプターの全てが当該出発薬剤化 合物に結合するとともにほぼ等モル量の出発薬剤化合物が溶液中に遊離の形態で 残存して生体触媒による改変に利用可能であるようになすこと、 (b)前記出発薬剤化合物とレセプターの間の生体触媒反応によって、前記出 発薬剤化合物よりも高い結合親和性を有する改変薬剤化合物を生成すること、 (c)前記出発薬剤化合物を、改変薬剤化合物によって前記レセプターから排 除すること、 (d)前記結合した改変薬剤化合物をさらなる生体触媒反応から保護すること 、 (e)前記改変薬剤化合物とレセプターとの複合体を各成分部分に解離するこ と、 (f)解離された改変出発薬剤化合物の化学組成を決定すること、および (g)上記の段階a)〜e)を繰り返し、出発薬剤化合物に対し一連の生体触 媒反応を行って、より高い結合親和性を有する改変薬剤化合物のライブラリーを 生成すること、 を含むことを特徴とする迅速な薬剤開発方法。 14.前記高親和性レセプターが、生きた細胞表面上若しくは生きた細胞内に存 在するかまたは天然若しくは人工支持体に不動化されて存在するものである、請 求項1に記載の迅速な薬剤開発方法。 15.前記生体触媒反応が表IIに掲載した反応群から選択される、請求項1に 記載の迅速な薬剤開発方法。 16.改変された出発化合物群のライブラリーの試験が表VIに掲載したアッセ イ群から選択される、請求項1に記載の迅速な薬剤開発方法。 17.前記生体触媒反応が、磁性粒子に不動化されて磁性生体触媒を形成してい る生体触媒を用いて行い、ここにおいて、 (a)前記不動化された生体触媒を、基質(群)、コファクター(群)、およ び特異的生体触媒反応に用いられる溶媒/バッファー条件と組合せることによっ て生体触媒反応を開始して前記生体触媒反応混合物を形成し、 (b)前記磁性生体触媒を前記生体触媒反応混合液から除去して前記生体触媒 反応を停止するにあたり、外部磁界を印加して生体触媒が不動化された磁性粒子 を磁界源に引きつけ、凝集させることによって効果的に磁性生体触媒をバルクの 生体触媒反応混合物から分離し、これによって磁性生体触媒を第一反応容器に残 しつつ、磁性生体触媒が除去された反応混合物を第一反応容器から第二反応容器 に移し、 (c)磁性粒子に不動化された第二の生体触媒を、前記第一の反応容器から移 された前記生体触媒反応混合物(前記第一の生体触媒反応で用いられた前記磁性 生体触媒を第一の生体触媒反応で除いた後のもの)を含有する第二の反応容器に 添加することにより、前記第一の生体触媒反応とは完全に独立した第二の生体触 媒反応を開始し、 (d)前記の生体触媒反応サイクルを繰り返し、別個の独立した一連の生体触 媒反応群を完成して、それぞれ対応する出発化合物改変物を産生し、 (e)前記生体触媒反応混合物から、磁性粒子に不動化された前記生体触媒を 分離するために、前記同一のXYテーブルに取り付けられた磁性分離ブロックに よって外部磁界を印加し、磁性粒子を磁界源に引きつけ凝集させることによって 効果的に磁性生体触媒をバルクの生体触媒反応混合物から分離し、さらに (f)前記XYZピペッティングブーム、前記XYZ反応容器移動ブーム、前 記温度ブロックおよび前記磁気分離ブロックのそれぞれと接続されたプログラム 可能なマイクロプロセッサを用いて、生体触媒反応の遂行によって出発化合物の 改変物を産生するにあたってのこれらの機能的ユニットの運動と操作の全て、お よび希望の活性を決定するためのアッセイを精密に制御しかつ調整すること、 を含む請求項1記載の迅速な薬剤開発方法。 18.前記出発化合物が反応混合物中で溶解可能である、請求項1、3、4およ び13記載の方法。 19.前記出発化合物およびこれに由来する誘導体が溶解可能であって、スクリ ーニング操作中の使用時において溶解した形態のままである、請求項18記載の 方法。 20.希望の活性を有する改変された出発化合物を生成する特異的な生体触媒反 応の同定が、前記ライブラリーの一部を産生するために用いる生体触媒反応の個 々のものを系統的に構築することによって行われる請求項1記載の方法。
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