JPH10509185A - アミノジオールモノマーサブユニットを有するコンビナトリアルライブラリ - Google Patents
アミノジオールモノマーサブユニットを有するコンビナトリアルライブラリInfo
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Abstract
(57)【要約】
ホスホジエステル、ホスホロチオエート、またはホスホルアミデート結合成分により連結されたアミノジオールモノマーサブユニットを含むコンビナトリアルライブラリが構築される。本発明のコンビナトリアルライブラリは、主鎖およびホスホルアミデートコンビナトリアル部位に結合した複数の官能基を特徴とする。
Description
【発明の詳細な説明】
アミノジオールモノマーサブユニットを有するコンビナトリアルライブラリ関連出願のクロスリファレンス
本出願は、1995年6月7日に出願された米国特許出願08/483,31
1の一部継続出願であり、該出願は、1995年1月11日に出願されたPCT
出願PCT/US95/00356の一部継続出願であり、該出願は、1994
年1月11日に出願された米国特許出願08/180,134の一部継続出願で
ある;また、該出願は、1994年1月11日に出願され、1996年5月21
日に米国特許第5519134として発行された米国特許出願08/179,9
70の一部継続出願である。これらの特許出願のそれぞれは本出願の譲受人に譲
渡されており、本明細書の一部としてここに引用する。発明の背景
薬剤発見の伝統的なプロセスは、複雑な発酵培地および植物抽出物を所望の生
物活性についてスクリーニングするか、または多くの新規化合物を化学的に合成
して、潜在的薬剤として評価することを含む。生物学的源からの混合物をスクリ
ーニングすることの利点は、多数の化合物を同時にスクリーニングしうることで
あり、場合によっては、他の方法では予測しえなかったであろう活性を有する新
規かつ複雑な天然産物の発見につながる。欠点は、多くの異なる試料をスクリー
ニングしなければならず、しばしば痕跡量でのみ存在する活性成分を同定するた
めには多くの精製を実施しなければならないことである。一方、実験室の合成は
明白な生成物を与えるが、それぞれの新規な構造の製造は非常に多くの資源を必
要とする。一般に、酵素の高次構造に基づいて活性化合物を新規に設計すること
は成功していない。
したがって、コンビナトリアルライブラリがそれ自体有用であること、および
そのようなライブラリおよびそれを含む化合物が商業的に非常に重要であること
が現在広く理解されている。実際、コンビナトリアルライブラリの多くの商業的
観点を利用する化学の一部門が開発されている。
それぞれの古典的方法の利点を最大化するために、コンビナトリアルデコンボ
リューションのための新規な戦略がいくつかのグループにより別々に開発されて
いる。選択の技術は、ペプチド(Geysen,H.M.,Rodda,S.J
.,Mason,T.J.,Tribbick,G.and Schoofs,
P.G.,J.Immun.Meth.1987,102,259−274;H
oughten,R.A.,Pinilla,C.,Blondelle,S.
E.,Appel,J.R.,Dooley,C.T.and Cuervo,
J.H.,Nature,1991,354,84−86;Owens,R.A
.,Gesellchen,P.D.,Houchins,B.J.& DiM
archi,R.D.,Biochem.Biophys.Res.Commu
n.,1991,181,402−408;Doyle,M.V.,PCTWO
94/28424;Brennan,T.M.,PCT WO94/27719
);核酸(Wyatt,J.R.,et al.,Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA,1994,91,1356−1360);Ecker,D
.J.,Vickers,T.A.,Hanecak,R.,Driver,V
.and Anderson,K.,Nucleic Acids Res.,
1993,21,1853−1856);非ペプチドおよび小分子(Simon
,R.J.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,
1992,89,9367−9371;Zuckermann,R.N.,et
al.,J.Amer.Chem.Soc.,1992,114,10646
−10647;Bartlett,Santi,Simon,PCT WO91
/19735;Ohlmeyer,M.H.,et al.,Proc.Nat
l.Acad.Sci.USA,1993,90,10922−10926;D
eWitt,S.H.,Kiely,J.S.,Stankovic,C.J.
,Schroeder,M.C.Reynolds Cody,D.M.and
Pavia,M.R.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1
993,90,6909−6913;Cody et al.,米国特許 5,
324,483;Houghten et al.,PCT WO94/267
75;Ellman,米国特許5,288,514;Still et al.
,PCT WO94/08051;Kauffman et al.,PCT
W
O94/24314;Carell,T.,Wintner,D.A.,Bas
hir−Hashemi,A.and Rebek,J.,Angew.Che
m.Int.Ed.Engel.,1994,33,2059−2061;Ca
rell,T.,Wintner,D.A.and Rebek,J.,Ang
ew.Chem.Int.Ed.Engel.,1994,33,2061−2
064;Lebl,et al.,PCTWO94/28028)のライブラリ
で用いられてきた。上述の参考文献を検討すると、これらの技術の最も進歩した
ものはペプチドおよび核酸の選択のためのものであることが明らかになる。いく
つかのグループがベンゾジアゼピン等の複素環の選択について研究している。R
ebekらをのぞき、他の種類の分子のコンビナトリアル発見にはあまり注意が
払われてこなかった。
今日までに報告された技術の大部分は、単純さが増大していくオリゴマーのサ
ブセットの繰り返し合成およびスクリーニングを含むものである。用いられてき
たモノマーまたはサブモノマーには、アミノ酸、アミノ酸様分子、すなわちカル
バメート前駆体、およびヌクレオチドが含まれ、これらはいずれも二官能性であ
る。これらの技術を用いて、ライブラリは、細胞に基づくアッセイにおける活性
または精製された蛋白質標的の結合および/または阻害についてアッセイされて
きた。
SURFTM(ランダム化されたフラグメントの合成非ランダム化)と称される
技術は、一つの固定された位置に既知の残基を含み、他のすべての位置に残基の
等モル混合物を含むオリゴマーのサブセットの合成を含む。3つのモノマー(A
,B,C)を含む4残基長さのオリゴマーのライブラリについては、それぞれ2
7の化合物を含む3つのサブセット(NNAN,NNBN,NNCN,ここでN
は3つのモノマーのそれぞれが等しく取り込まれることを表す)が合成される。
次に、それぞれのサブセットを機能的アッセイにおいてスクリーニングし、最良
のサブセットを同定する(例えばNNAN)。それぞれが前のラウンドからの固
定された残基および第2の固定残基を含むライブラリの第2のセット(例えばA
NAN,BNAN,CNAN、それぞれ9分子を含む)を合成し、スクリーニン
グする。スクリーニングおよび合成の連続するラウンドにより、機能的アッ
セイにおいて活性を有するユニークな配列を同定することができる。SURFTM
技術は、Ecker,D.J.,Vickers,T.A.,Hanecak,
R.,Driver,V.& Anderson,K.,Nucleic Ac
ids Res.,1993,21,1853−1856に記載されている。S
URFTM法は、さらにPCT特許出願WO93/04204において記載されて
おり、このすべての開示を本明細書の一部としてここに引用する。
今日までに最も利用されてきたコンビナトリアル化学アプローチは、モノマー
ユニットおよび定義された連結化学を用いる固体支持体からのオリゴマー化を利
用するもの、すなわち固体支持体モノマーアプローチである。このアプローチは
、前述の引用文献により例示されるように、アミドまたはカルバメート結合によ
り連結されたペプチド、ペプトイド、カルバメートおよびビニル含有ペプチド、
またはリン酸結合により連結された核酸のライブラリの合成において用いられて
きた。オリゴマーの混合物(プールまたはライブラリ)は、カップリング工程中
での活性化モノマーの混合物の付加により、または、個々のモノマーを支持体の
一部とカップリング(ビーズスプリット)させ、次に支持体を再混合した後、次
のカップリングのために等分することにより得られる。このモノマー性アプロー
チにおいては、それぞれのモノマー性ユニットはつなげられた(tethere
d)文字、すなわち、標的との相互作用のための官能基を有するであろう。化学
的に活性化された中間体の段階においてつなげられた文字の挿入を可能にするさ
らなるカップリング化学は、サブモノマーアプローチと称される。
オリゴマー性プールの多様性は、それぞれのモノマーの固有の物理的特性、そ
れぞれのカップリングで混合される異なるモノマーの数、カップリング化学から
生ずる化学結合の物理的特性(主鎖)、カップリングの数(オリゴマーの長さ)
、および主鎖とモノマー化学との相互作用により表される。これらの相互作用は
一緒になって、それぞれの個々の分子についてのユニークなコンホメーションを
提供する。
蛋白質および酵素、核酸、脂質および他の標的等の標的の幾何学と適合する、
固定され予め系統だてられた幾何学を有する分予についての要求が当該技術分野
に存在する。そのような分子の主鎖は、剛性でありかつある程度の柔軟性を有す
るべきであり、そのような分子は、固体支持体上での自動化された合成において
容易に構築されるべきである。発明の概要
本発明に従えば、連結基により結合された複数のアミノジオールモノマーサブ
ユニットを含むオリゴマー性化合物およびそのような化合物のライブラリが提供
され、ここで、前記アミノジオールモノマーサブユニットのそれぞれは、以下の
構造I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、IX、XまたはX
Iの1つを有する:
[式中、
それぞれのxは、独立して0から5であり;
na、nbおよびncは、それぞれ独立して0から2であり、na、nbおよび
ncの合計は1から5であり;
R1は、−T−Lまたは塩基不安定性保護基であり;
Tは単結合、メチレン基または次の構造を有する基である:
{[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q−
式中、
R10は、=O、=S、=NR11であり;
R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH、C≡C、O、S、NR11、ま
たはC6−C14アリールであり;
それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か
ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル;2から約10個の
炭素原子を有するアルケニル;2から約10個の炭素原子を有するアルキニル;
または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり;
mおよびnは、独立して、0から5であり;
pは0または1であり;
qは1から約10であり;そして
LはH、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10
アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換のC4
−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニル、置
換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6−C14
アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を
有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、金属配
位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(SH)
、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、アミジ
ン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13)、
グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニトレート
(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロ
メチル(CF3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アル
キル、NH−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、N
H−アラルキル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)
、ヒドロキシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)
、スルフィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオシド性塩基
、アミノ酸側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結合しうる基
であり、ここで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、ベ
ンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、
アリール、アルケニル、およびアルキニル基から選択され;
R2は、水素またはC1−C10アルキルであり;
R3およびR4は、独立して、水素、酸不安定性ヒドロキシル保護基、連結基また
はコンジュゲート基であり、ここで前記連結基は次の式を有し:
[式中、
J1は、=Oまたは=Sであり;
J2は、OHまたはN(Y0)T0であり;
Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり;
T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し
;
Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2−
C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキル、C4−C7炭素環式アルケニル、複
素環、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有す
るエーテル、ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり;
jおよびkは、独立して、0または1であり;
Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、C2
−C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、
CH=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12
R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C(
=O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素含有複
素環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチ
レングリコール基であり;
ただし、前記オリゴマー性化合物中の前記アミノジオールモノマーサブユニット
の少なくとも1つは構造IIIを有しない]。
さらに、本発明にしたがえば、オリゴマー性化合物およびそのような化合物の
ライブラリを製造する方法が提供される。該方法は、
(a) 構造I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、X、X、
またはXIを有するアミノジオールモノマーサブユニットを選択し:
[式中、
それぞれのxは、独立して、0から5であり;
na、nbおよびncは、それぞれ独立して、0から2であり、na、nbおよ
びncの合計は、1から5であり;
R1は、塩基不安定性保護基であり;
R2は、水素またはC1−C10アルキルであり;および
R3またはR4の一方は、水素または活性化ホスファイト基であり、R3またはR4
の他方は酸不安定性ヒドロキシル保護基であり;
(b) 前記アミノジオールモノマーサブユニットを固体支持体に結合させて、
固体支持体に結合したアミノジオールモノマーサブユニットを形成し;
(c) 前記酸不安定性ヒドロキシル保護基を希酸で処理して遊離ヒドロキシル
基を形成し;
(d) 前記遊離ヒドロキシル基を構造I、II、III、IV、V、VI、V
II、VIII、IX、X、またはXIを有する別のアミノジオールモノマーサ
ブユニットと反応させ、このことにより前記固体支持体に結合したオリゴマー性
化合物を形成し、前記オリゴマー性化合物は、ホスファイト結合を含み;
(e) 随意に、工程(c)および(d)を繰り返して、前記固体支持体に結合
したオリゴマー性化合物の長さを増加させ;
(f) 随意に、工程(c)の前または工程(d)の後に、前記ホスファイト結
合を酸化して、ホスフェート連結基を形成し、ここで前記連結基は、次の式から
選択される:
[式中、
J1は、=Oまたは=Sであり;
J2は、OHまたはN(Y0)T0であり;
Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり;
T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し
;
Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2−
C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキルまたはアルケニル、複素環、2から
10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有するエーテル、
ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり;
jおよびkは、独立して、0または1であり;
Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、
C2−C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、
CH=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12
R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C(
=O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素含有複
素環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチ
レングリコール基であり;そして
(g) 工程(e)の前または工程(f)の後に、前記固体支持体に結合したア
ミノジオールモノマーサブユニットまたは前記支持体に結合したオリゴマー性化
合物を塩基と反応させて前記塩基不安定性アミノ保護基を除去して、固体支持体
に結合したアミノジオールモノマーサブユニットまたは支持体に結合した遊離ア
ミンを有するオリゴマー性化合物を形成し、前記遊離アミンを式−T−Lの基で
誘導化し;
[式中、
Tは、単結合、メチレン基または次式を有する基であり:
{[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q−
式中、
R10は、=O、=S、または=NR11であり;
R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH、C≡C、O、S、NR11、ま
たはC6−C14アリールであり;
それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か
ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル、2から約10個の
炭素原子を有するアルケニル、2から約10個の炭素原子を有するアルキニル、
または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり;
mおよびnは、独立して、0から5であり;
pは、0または1であり;
qは、1から約10であり;
Lは、H、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10
アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換の
C4−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニ
ル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6
−C14アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ
原子を有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、
金属配位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(
SH)、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、
アミジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13
)、グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニト
レート(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル
(CF3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、
NH−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−ア
ラルキル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)、ヒド
ロキシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)、スル
フィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオシド性塩基、アミ
ノ酸側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結合しうる基であり
、ここで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、ベンジル
、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリー
ル、アルケニル、およびアルキニル基から選択され;
(h) 随意に、工程(c)および(d)、続いて工程(g)を繰り返して、前
記固体支持体に結合したオリゴマー性化合物の長さを増加させ;
(i) 前記固体支持体に結合した前記オリゴマー性化合物を酸と反応させて任
意の保護基を脱保護し;そして
(j) 前記オリゴマー性化合物を前記固体支持体から切断する、
の各工程を含む。図面の簡単な説明
図1Aおよび図1Bは、本発明のあるプロセスを示すフロースキームである。好ましい態様の記載
本発明は、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、およびホスホルアミデー
ト結合を有する、ホスフェート結合したアミノジオールモノマーサブユニットの
コンビナトリアルライブラリを提供する。本発明の文脈において用いる場合、ア
ミノジオールモノマーサブユニット(モノマーサブユニットもしくは主鎖セグメ
ント)は、第1または第2のいずれかである保護された反応性アミノ基、および
第1または第2のいずれであってもよい2つのヒドロキシルを有する環状のまた
は非環状の化合物である。ヒドロキシルの一方は、酸不安定性保護基で保護され
ており、他方は遊離ヒドロキシルの形またはH−ホスホネートの形である。本発
明のモノマーサブユニットは、H−ホスホネート化学を用いてカップリングし、
多様な官能基で置換されたオリゴマー性化合物を形成する。
本発明のオリゴマー性化合物は、多様な官能基でコンビナトリアル化すること
ができる、コンビナトリアル部位とも称される反応性部位を有する。コンビナト
リアル化に利用可能な部位には、反応性アミノ基、末端ヒドロキシル基およびH
−ホスホネートリン基が含まれ、これは、例えば、a)四塩化炭素および第1ま
たは第2アミンで酸化してホスホルアミデートを形成する、b)ヨウ素および水
で酸化してホスホジエステルを形成する、またはc)二硫化炭素中のイオウで酸
化してホスホロチオエートおよび末端ヒドロキシルを形成することができる。末
端ヒドロキシルはまた、種々の官能基、例えば、ヌクレオチドまたはヌクレオシ
ドで置換して、キメラ化合物を形成することができるか、またはコンジュゲート
、およびレポーター基等の種々の他の基を含むことができる。
官能基は、コンビナトリアル部位に直接結合させるか、または空間中における
その配向を変化させるためにテザー基を含むことができる。官能基は、介在テザ
ー基を用いてまたは用いずに、主鎖セグメントおよびホスホルアミデート部分に
結合させる。本発明の文脈において用いる場合、テザー基は、本発明のHホスホ
ネート主鎖セグメントと反応するための第1または第2アミンまたは他の適当な
基、ならびに”文字”を結合することができる第2の官能基を有する2価または
多価の基である。そのようなテザーは、”文字”を合成されたオリゴマー性化合
物の直鎖状の主鎖から離して配置するために、または文字の固有の部分としてそ
れ自体ホスホルアミデート連結を形成するのに必要なアミン基を含まない文字を
連結するために用いることができる。必要な場合には適当なアミン官能基で置換
された場台に、テザー基として有用な特に好ましい化合物の群には、C2−C10
アルキル、C2−C10アルケニル、C2−C10アルキニル、C4−C7炭素環式−
アルキルまたはアルケニル、複素環、2から10個の炭素原予および1から4個
の酸素またはイオウ原子を有するエーテル、ポリアルキレングリコールおよびC7
−C14アラルキル基が含まれるが、これらに限定されない。本発明の実施にお
いて有用な他の代表的なテザーは、”Thiol−Derivatized N
ucleosides and Oligonucleosides”と題する
米国特許出願第08/116,801(1993年9月3日出願)および”Am
ine−Derivatized Nucleosides and Olig
onucleosides”と題する米国特許出願第117,363号(199
3年9月3日出願)に開示されており、これらの開示を本明細書の一部としてこ
こに引用する。
本発明は、固体支持体上のオリゴマー性化合物の主鎖上への官能基の付加を提
供する。従来方法とは異なり、種々の官能基を有する大きな組のモノマーサブユ
ニットの合成は不要である。1つの観点においては、本発明のオリゴマー性化合
物は3つの成分から構成される。コンビナトリアルライブラリの製造は、合成条
件に安定なリンカーを介して固体支持体に直接結合されたアミノジオールモノマ
ーサブユニットから出発するが、合成の最後に化合物を切断して溶液中に放出す
る。好ましいリンカーには、エステル、特にコハク酸が含まれる。あるいは、モ
ノマーを、CPGに結合した不変成分、例えばDMTエチレングリコールまたは
同様のジオールにカップリングさせることができる。固体支持体への他の結合点
、例えばヌクレオシド、アミノ酸、または薬物動態学的、薬力学的または他の望
ましい特性を付与する他の基も可能である。
主鎖セグメントは、官能基の各種の相対配向を与える構造的に多様なアミノジ
オールの組である。主鎖セグメントアミン官能基は、反応性アミノ基もしくはア
ミノコンビナトリアル部位とも称され、塩基不安定性保護基で保護され、1つの
ヒドロキシルは穏やかな酸で除去可能な保護基、例えばジメトキシトリチル(D
MT)エーテルでブロックされる。窒素保護基を最初に主鎖セグメント(単数ま
たは複数)から除去し、多様な官能基を反応性アミノ基に付加する。これを行う
方法は以下に記載される。次に、固体支持体上の化合物の末端にある酸不安定性
保護基を、例えば希酸で処理することにより除去した後、第2のモノマーサブユ
ニットをH−ホスホネートカップリングにより付加することができる。中間体水
素ホスホネートジエステルは、例えば、10%(v/v)の第1または第2アミ
ンを含むCCl4ピリジン(1:1)の溶液で酸化することができ、このことに
よりホスホルアミデート結合が形成される。あるいは、標準的な方法および技術
を用いて、H−ホスホネート結合を酸化してホスホジエステルまたはホスホロチ
オエートとすることができる。次に、第2主鎖セグメントを上述のように多様な
官能基で置換することができる。主鎖セグメントと主鎖セグメントのアミノコン
ビナトリアル部位の官能基との任意の組み合わせを、オリゴマーの任意の位置に
導入することができ、酸化工程において多数のアミンを用いることができる。こ
れらの合成工程を繰り返すことにより、官能基の任意の所望の配列をモノマーサ
ブユニット上に有し、アミデート誘導体を任意の連結位置に有するオリゴマー性
化合物が合成される。適当な試薬を添加する前に固体支持体を部分に分割するこ
とにより、ランダム位置をライブラリ中に導入する。モノマー、モノマー置換基
またはアミンのいずれかをランダム化することができる。オリゴマーサブセット
中の少なくとも1つの位置を固定して、繰り返しデコンボリューションを可能と
しなければならない。問題とする生物学的アッセイにおいてライブラリサブセッ
トをスクリーニングする。最も活性なサブセットは、固定位置における最も活性
な残基を規定する。合成およびスクリーニングのさらなるラウンドを用いて、ラ
イブラリ中で最も活性な化合物の配列を決定する。
本発明の1つの特徴は、窒素ブロッキング基を使用して反応性アミノ部位をブ
ロックすることである。第1のアミノジオールモノマーサブユニットがいったん
固体支持体に結合されれば、塩基性(非加水分解)条件下で窒素ブロッキング基
を除去することができる。次に、窒素を選択された多様な官能基で誘導化する。
この基は、種々の結合基:アミド、スルホンアミド、カルバメート、尿素、アミ
ノアルカン、チオカルバメート、チオウレア等により、アミノコンビナトリアル
部位に結合することができる。これは、適当な求電子基を選択して窒素を誘導化
することにより実施することができる。例えば、ペプチドカップリング試薬、例
えば、EDC、BOPまたはHATUを用いてカルボン酸を活性化することがで
きる。用いることができる他の試薬には、酸塩化物、酸フッ化物、酸イミダゾリ
ル化物、酸無水物、塩化スルホニル、クロロギ酸、イソシアネート、アルデヒド
(還元的アルキル化条件下)、アルキルハロゲン化物、イソチオシアネート等が
含まれる。すなわち、官能基がライブラリ中に望まれる各時点において、これは
簡単な出発物質を用いて適当なカップリング条件により導入される。
コンビナトリアルライブラリ中のアミノジオールモノマーサブユニットは、結
合を形成する官能基に加えて、それぞれ官能基、例えば”文字”を含む。アミノ
ジオールモノマーサブユニットが一緒に結合されたとき、これらの官能基は得ら
れるオリゴマー性化合物に多様な特性(”多様性”)を提供する。官能基には、
水素結合ドナーおよびアクセプター、イオン性成分、極性成分、疎水性成分、芳
香族性中心、および電子ドナーおよびアクセプターが含まれる。個々のモノマー
の特性は、一緒になって、それらが見いだされるオリゴマー性化合物のユニーク
さに寄与する。すなわち、そのようなオリゴマーのライブラリは、無数の特性、
すなわち、”多様性”を有するであろう。オリゴマー性化合物を一緒に形成する
個々のモノマーの特性は、集合的に、そのようなオリゴマー性化合物のユニーク
さに寄与し、オリゴマー性化合物に細胞性、酵素的または核酸標的部位との相互
作用のためのある種の特性を付与する。
トリチルファミリーのメンバー等の保護基を、アミノジオールモノマーサブユ
ニットの2つのヒドロキシルの1つの酸不安定性保護基として用いることができ
る。トリチルファミリーには、少なくともトリチル、モノメトキシトリチル、ジ
メトキシトリチルおよびトリメトキシトリチルが含まれる。ジメトキシトリチル
基が好ましく、これは第1ヒドロキシル基を塩化4,4’−ジメトキシトリチル
と反応させることにより付加することができる。他のヒドロキシル保護基を用い
ることもできる。代表的なヒドロキシル保護基は、Beaucage,etal
.,Tetrahedron 1992,48,2223により記載されている
。好ましいヒドロキシル保護基は、酸不安定性のもの、例えば、トリチル、モノ
メトキシトリチル、ジメトキシトリチル、トリメトキシトリチル、9−フェニル
キサンチン−9−イル(Pixyl)および9−(p−メトキシフェニル)キサ
ンチン−9−イル(MOX)である。
本発明の別の観点においては、DMT除去に用いられるトリクロロ酢酸処理に
安定な酸不安定性基、例えばBOCタイプの保護基を使用する。これらは、延長
されたTCA処理に安定であるが、トリフルオロ酢酸溶液(例えば、CH2Cl2
中5%)により除去される。この方法論に適用しうる別の種類の保護基はアリル
類である。これらの基は遷移金属触媒を用いて切断される。これらのタイプの保
護基は、オリゴマーがまだ固体支持体に結合している間に特定の官能基を選択的
に脱保護して、新たな反応性部位を暴露することが望まれる場合に、特に価値が
ある。別の保護基戦術も可能である:例えば光不安定性保護基もまたこの方法論
に適用しうる。
本発明の別の観点においては、酸処理に対して安定であり、塩基処理により選
択的に除去される窒素保護基を用いて、反応性アミノ基を置換に対して選択的に
利用可能にする。そのような基の例は、FMOC(E.Atherton,R.
C.Sheppard in The Peptides.S.Udenfri
end,J.Meienhofer,Eds.Academic Press,
Orlando,1987,vol 9,pl−38)、およびNsc基に代表
される種々の置換スルホニルエチルカルバメート(V.V.Samukov,A
.N.Sabirov,P.I.Pozdnyakov,Tetrahedro
n Lett,1994,35,p7821;C.G.J.Verhart,G
.I.Tesser,Rec.Trav.Chim.Pays−Bas,198
7,107,p.621)である。
官能基として用いるのに適当な複素環(例えば窒素複素環)としては、イミダ
ゾール、ピロール、ピラゾール、インドール、1H−インダゾール、a−カルボ
リン、カルバゾール、フェノチアジン、フェノキサジン、テトラゾール、チアゾ
ール、オキサゾール、オキサジアゾール、ベンズオキサゾール、ベンズイミダゾ
ール、トリアゾール、ピロリジン、ピペリジン、ピリジン、キノリン、ピペラジ
ンおよびモルホリン基が挙げられるが、これらに限定されない。
官能基として用いるのに適当なプリンおよびピリミジンとしては、アデニン、
グアニン、シトシン、ウリジン、およびチミン、ならびに他の合成および天然の
核酸塩基(核酸性塩基)、例えばキサンチン、ヒポキサンチン、2−アミノアデ
ニン、アデニンおよびグアニンの6−メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニ
ンおよびグアニンの2−プロピルおよび他のアルキル誘導体、5−ハロウラシル
およびシトシン、6−アゾウラシル、シトシンおよびチミン、5−ウラシル(シ
ュードウラシル)、4−チオウラシル、8−ハロ、アミノ、チオール、チオアル
キル、ヒドロキシルおよび他の8−置換アデニンおよびグアニン、5−トリフル
オロメチルおよび他の5−置換ウラシルおよびシトシン、7−メチルグアニンが
挙げられる。さらに別のプリンおよびピリミジンには、米国特許3,687,8
08に開示されるもの、Concise Encyclopedia Of P
olymer Science And Engineering、pages
858−859,Kroschwitz,J.I.,ed.John Wile
y & Sons,1990に開示されるもの、およびEnglisch et
al.,Angewandte Chemie,International
Edition1991,30,613に開示されるものが含まれる。
本発明にしたがうアルキル、アルケニルおよびアルキニル基には、置換および
非置換の直鎖、分枝鎖、および脂環式炭化水素が含まれるが、これらに限定され
ない。さらに、本発明の文脈においては、直鎖化合物とは開放鎖化合物、例えば
脂肪族化合物(例えばアルキル、アルケニル、またはアルキニル化合物)を意味
する。本明細書で用いられる場合、分枝鎖化合物は、直鎖の炭素原子に結合した
さらなる直鎖または分枝鎖を有する直鎖化合物、例えばアルキル、アルケニル、
アルキニル化合物を表す。本明細書で用いられる場合、環状化合物とは、閉塞鎖
化合物、すなわち炭素原子の環、例えば脂環式または芳香族性化合物を表す。直
鎖、分枝鎖または環状化合物は、アルコキシまたは複素環式化合物においてみら
れるように、内部で遮断されていてもよい。本発明の文脈においては、内部で遮
断されるとは、炭素鎖がO、N、またはS等の複素原子で遮断されていてもよい
ことを表す。しかし、所望の場合には、炭素鎖は複素原子を有しなくてもよい。
さらに、本明細書の文脈においては、アリール基には置換および非置換芳香族
性ヒドロカルビル基が含まれるがこれらに限定されない。アラルキル基にはアリ
ールおよびアルキル官能基の両方を有する基、例えば、ベンジルおよびキシリル
基が含まれるがこれらに限定されない。好ましいアリールおよびアラルキルには
、フェニル、ベンジル、キシリル、ナフチル、トリル、ピレニル、アントラニル
、
アズリル、フェネチル、シンナミル、ベンズヒドリル、およびメシチルが含まれ
るが、これらに限定されない。これらは置換されていても非置換でもよい。
上述したように、脂肪族性および芳香族性基は置換されていても非置換でもよ
い。本発明の文脈においては、置換または非置換とは、化合物が、例えば化合物
中の1つまたはそれ以上の水素原子の代わりに種々の置換基の任意のものを有し
ていてもよいこと、または置換基を有していなくてもよいことを意味する。置換
のための典型的な置換基としては、ヒドロキシル、アルコキシ、アルコール、ベ
ンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、またはアル
キル、アリール、アルケニル、またはアルキニル基が挙げられるが、これらに限
定されない。
本発明のコンジュゲート基としては、インターカレーター、レポーター分子、
ポリアミン、ポリアミド、ポリエチレングリコール等のポリエーテル、および薬
力学的特性または薬物動態学的特性を増強することが当該技術分野において知ら
れている他の成分が挙げられる。典型的なコンジュゲート基には、PEG基、コ
レステロール、リン脂質、ビオチン、フェナントロリン、フェナジン、フェナン
トリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリ
ン、および染料が含まれる。
本発明にしたがう金属配位基としては、ヒドロキサミン酸、カテコールアミド
、アセチルアセトン、2,2’−ビピリジン、1,10−フェナントロリン、二
酢酸、ピリジン−2−カルボキサミド、イソアルキルジアミン、チオカルバメー
ト、オキサレート、グリシル、ヒスチジルおよびテルピリジルが挙げられるが、
これらに限定されない。他の金属配位基も知られている(例えば、Mellor
,D.P.,Chemistry of Chelation and Che
lating Agents,International Encyclop
edia of Pharmacology and Therapeutic
s,Section 70,The Chelation of Heavy
Metals,Levine,W.G.Ed.,Pergamon Press
,Elmford,N.Y.,1979を参照されたい)。
本発明にしたがう固体支持体には、制御孔ガラス(CPG)、オキサリル−制
御孔ガラス、またはポリスチレン/ジビニルベンゼンのコポリマーであるPor
osが含まれる。
化学官能基として用いられる非反応性官能基、例えば薬力学的特性を増強する
基には、取り込みを改良し、酵素的または化学的分解に対する耐性を増強する基
が含まれる。非反応性官能基はまた、薬物動態学的特性を増強しうる。本発明の
文脈においては、そのような基は、取り込み、分布、代謝または排泄を改良する
。非反応性官能基としては、上述したような、結合のための窒素含有部位のいず
れかに結合した、アルキル鎖、ポリアミン、エチレングリコール、ステロイド、
ポリアミド、アミノアルキル鎖、両親媒性部分、およびコンジュゲート基が挙げ
られるが、これらに限定されない。
多数の化学官能基をブロックされた形態で本発明の化合物に導入し、次に脱ブ
ロックして最終的な所望の化合物を形成することができる。一般に、ブロック基
は、分子の化学官能基を特定の反応条件に対して不活性にし、後に分子の残りの
部分に実質的に傷害を与えることなく分子中のそのような官能基から除去するこ
とができる(Green and Wuts,Protective Grou
ps in Organic Synthesis,2d edition,J
ohn Wiley & Sons,New York,1991)。例えば、
アミノ基は、フタルイミド基として、9−フルオレニルメトキシカルボニル(F
MOC)基として、およびトリフェニルメチルスルフェニル、t−BOCまたは
CBZ基でブロックすることができる。ヒドロキシル基はアセチル基として保護
することができる。代表的なヒドロキシル保護基は、Beaucage et
al.,Tetrahedron 1992,48,2223により記載されて
いる。好ましいヒドロキシル保護基は、酸不安定性のもの、例えばトリチル、モ
ノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、トリメトキシトリチル、9−フェニ
ルキサンチン−9−イル(Pixyl)および9−(p−メトキシフェニル)キ
サンチン−9−イル(MOX)である。化学官能基はまた、前駆体形態中にこれ
らを含めることにより”ブロック”することができる。すなわち、アジド基は容
易にアミンに転換することができるため、アジド基はアミンの”ブロックされた
”形態であると考えて使用することができる。
本発明にしたがう別の官能基には、H、アルキルまたは置換アルキル、アルケ
ニルまたは置換アルケニル、アルキニルまたは置換アルキニル、炭素環式アルキ
ル、アルケニルまたはアルキニルまたは置換炭素環式、またはアリールまたは置
換アリール(ここで置換基はヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、
ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル
、アリール、アルケニル、またはアルキニル基から選択される);2から10個
の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有するエーテル;窒素、
イオウまたは酸素含有複素環;金属配位基;コンジュゲート基;ハロゲン;ヒド
ロキシル(OH);チオール(SH);ケト(C=O);カルボキシル(COO
H);アミド(CONR12)、アミジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジ
ン(NHC(=NH)NR12R13)、グルタミル(R1OOCCH(NR12R13
)(CH2)2C(=O)、ニトレート(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル
(CN)、トリフルオロメチル(CF3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、
O−アルキル、S−アルキル、NH−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキ
ル、S−アラルキル、NH−アラルキル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒ
ドラジノ(NHNH2)、ヒドロキシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO
)、スルホン(SO2)、スルフィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリ
ル、ヌクレオシド性塩基、アミノ酸側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、
または水素結合しうる基(ここで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ
、アルコール、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロ
ゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニル基から選択される)
が含まれるが、これらに限定されない。
本発明の官能基は、次の構造により表すことができる:
−T−L
式中、Tは、単結合、メチレン基または次式を有する基であり:
{[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q−
式中、
R10は、=O、=S、または=NR11であり;
R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH、C≡C、O、S、NR11、ま
たはC6−C14アリールであり;
それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か
ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル、2から約10個の
炭素原子を有するアルケニル、2から約10個の炭素原子を有するアルキニル、
または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり;
mおよびnは、独立して、0から5であり;
pは、0または1であり;
qは、1から約10であり;
Lは、H、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10
アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換の
C4−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニル、
置換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6−C1 4
アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子
を有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、金属
配位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(SH
)、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、アミ
ジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13)
、グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニトレー
ト(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル(C
F3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、NH
−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−アラル
キル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)、ヒドロキ
シルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)、スルフィ
ド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオシド性塩基、アミノ酸
側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結合しうる基であり、こ
こで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、ベンジル、フ
ェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、
アルケニル、およびアルキニル基から選択される]。
本明細書において用いられる場合、”官能”基とは、親分子に結合したとき、
その分子に特別かつユニークな特性を付与する基を表す。これは、親分子をその
基の結合の前と何らかの様式で異なるものとすることにより、親分子の多様性に
寄与する。いくつかの化学官能基を特定の分子に結合させることができ、これら
を一緒に考慮したとき、それらの特性の合計は親分子に広い多様性特性を付与す
るであろう。特定の親分子上の化学官能基の組み合わせのそれぞれの組は、基の
それぞれの特定の組み合わせを有する親分子が他の基の組み合わせのいずれかを
有する親分子と異なるように親分子を改変させるであろう。親分子の上の基のす
べての組み合わせを考慮すると、化合物のライブラリは、基の可能な組み合わせ
のすべてを含むように形成されるであろう。
本発明のオリゴマー性化合物は、予め決定された位置および化学官能基の選択
の両方で合成するか、またはコンビナトリアル選択により選択されることができ
る。本発明の文脈においては、”コンビナトリアル”とは、任意の、でたらめな
または無差別のという意味ではない。本発明の文脈においては、”コンビナトリ
アル”とは、特定の官能基の組およびオリゴマー性化合物中のコンビナトリアル
部位の特定の位置を用いて形成しうるオリゴマー性化合物の集団の全体中におい
て、可能な種のそれぞれのサブ集団があることを意味すると解釈される。すなわ
ち、a)官能基の選択、およびb)官能基の配置、の異なる組み合わせのそれぞ
れを表す。
”コンビナトリアル”は”ランダム”とは区別される。この区別を説明するた
めには、すべてのまたはほとんどすべての可能な組み合わせが全体の分子集団に
存在する場合、これは分子のコンビナトリアル集団である。しかし、その全体集
団からただ1つのまたは少数の分子が選択される場合には、選択される分子(単
数または複数)は、それが気まぐれでまたは随意に全体集団から取り出されれば
ランダムに選択されるであろう。集団の全体性を考慮するとき、すべての種が存
在し、これはランダム集団ではない。集団の全体を使い尽くすまで系統的選択を
行えば、種のすべてが最終的に選択されるが、選択の順番はランダムであろう。
すなわち、ある好ましい態様においては、予め順番づけられた(pre−ord
ered)選択および/または化学官能基の位置が存在するであろう。別の好ま
しい態様においては、すべての可能な組み合わせおよび化学官能基の順序のコン
ビナトリアル化された集団が存在する。さらに別の好ましい態様においては、配
列は固定とコンビナトリアルとの間で調節される。これは、例えばある種のデコ
ンボリューション戦略において特に有用である。
”デコンボリューション”とは、集団の全体性を取り上げ、その集団を通して
系統的に作業して、集団の特定のメンバー、選択されたメンバー、またはすべて
のメンバーの同一性を確立することを意味すると解釈される。化合物のコンビナ
トリアルライブラリのデコンボリューションにおいては、特定の性質を有する、
例えば特定の機能的アッセイにおいて活性な種である、個々のオリゴマー性化合
物または個々のオリゴマー性化合物の群が同定されるまで、系統的選択が実施さ
れる。
本発明においては、官能基としてコンジュゲート基を用いることもできる。コ
ンジュゲート基には、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリ
アミド、ポリエチレングリコール、ポリエーテル、オリゴマーの薬力学的特性を
増強する基、およびオリゴマーの薬物動態学的特性を増強する基が含まれる。典
型的なコンジュゲート基には、コレステロール、リン脂質、ビオチン、フェナン
トロリン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フル
オレセイン、ローダミン、クマリン、および染料が含まれる。本発明の文脈にお
いては、薬力学的特性を増強する基には、オリゴマーの取り込みを改良し、分解
に対するオリゴマーの耐性を増強し、および/またはRNAもしくは蛋白質標的
との配列特異的ハイブリダイゼーションを強化する基が含まれる。本発明の文脈
においては、薬物動態学的特性を増強する基には、化合物の取り込み、分布、代
謝または排泄を改良する基が含まれる。代表的なコンジュゲート基は、国際出願
PCT/US92/09196(1992年10月23日出願)、米国特許出
願116,801(1993年9月3日出願)、および米国特許5,218,1
05に開示される。上述のそれぞれは本出願の出願人に共通に譲渡されている。
それぞれの全開示を本明細書の一部としてここに引用する。
アミンには、上述のアルキル、アルケニルおよびアリール基のすべてのアミン
が含まれ、第1、第2アミンならびに”マスクされた”アミン、例えばフタルイ
ミドが含まれる。本発明のアミンはまた、ポリアルキルアミノ化合物およびアミ
ノアルキルアミン、例えばアミノプロピルアミン、およびさらにテトラシクロア
ルキルアミン、例えばイミダゾール−1,2,または4−イルプロピルアミンを
含むことを意味する。
本発明に適用しうるアミノ基は、次式を有する:
N(Y0)T0
式中、
Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり;
T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し
;
Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2−
C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキルまたはアルケニル、複素環、2から
10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有するエーテル、
ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり;
jおよびkは、独立して、0または1であり;
Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、C2
−C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、C
H=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12
R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C(=
O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素含有複素
環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレ
ングリコール基である。
ある好ましい態様においては、本発明のオリゴマー性化合物は、2から約30
のアミノジオールモノマーの長さである。より好ましい態様は、2から約15の
アミノジオールモノマーを有し、特に好ましい態様は2から約6個のアミノジオ
ールモノマーを有する。
大きな化学的多様性を有するコンビナトリアルライブラリを合成することは、
本発明の重要な観点である。化学的多様性は、1つのレベルでは、リン結合の性
質を変化させることにより導入することができる。本発明に適用しうるリン結合
には、ホスホジエステル(OPO)、ホスホロチオエート(OPS)、およびホ
スホルアミデート(OPN)が含まれる。所望のコンビナトリアルライブラリは
、オリゴマーのそれぞれの位置において、単一のタイプのリン結合を有するよう
に、または異なる結合を有するように製造することができる。例えば、OPOオ
リゴマー中の任意の位置に1つのOPS結合を選択的に導入することができる。
実際、OPO、OPS、およびOPN結合のすべての可能な組み合わせを、オリ
ゴマー性化合物中に選択的に導入することができる。オリゴマー中の特定の位置
にあるタイプの結合が存在するか存在しないかは、分子の性質に大きな影響を有
するであろう。
ホスホルアミデート結合ライブラリの場合、H−ホスホネートジエステル結合
を溶液、例えば10%(v/v)の第1または第2アミンを含むCCl4ピリジ
ン(1:1)で酸化して、ホスホルアミデート結合を形成することにより、さら
なるレベルの多様性が可能である。H−ホスホネートモノマーサブユニットの任
意のものをオリゴマーの任意の位置に導入することができ、多数のアミンを酸化
工程において用いることができる。すなわち、OPN結合への酸化により、広範
な種類のアミンをH−ホスホネート結合においてオリゴマー性化合物に導入する
ことが可能である。同一のアミン置換基を各OPN結合に有すること、または異
なるアミンを各位置に有することが可能である。1組のモノマーサブユニット、
アミンおよび官能基からのコンビナトリアルライブラリの製造においては、すべ
ての可能な組み合わせが同時に合成される。
SURFTMライブラリにおいて、いくつかのレベルで化学的多様性を生成する
ことができる。我々は、以下に多数のモノマーサブユニットの製造を記載する。
これらのモノマーは、化学的多様性の2つの観点を探究するように製造された。
第1に、ある範囲の化学的性質をカバーする多数の官能基が利用可能である。第
2に、これらの官能基は、直接コンビナトリアル部位にまたはテザー基を介して
コンビナトリアル部位に結合することができる。多くの異なるテザー基が市販さ
れており、本発明に適用することができる。テザー基の使用は、官能基の空間的
存在を異なる様式で変更し、種々の融通性を可能とする。
水素ホスホネート化学は、さらなる化学的修飾をオリゴマー性化合物に導入す
ることを可能とするオリゴヌクレオチドホスホジエステルおよびホスホロチオエ
ート(Froehler,B.C.,Matteucci,M.D.Tetra
hedron Lett.1986,27,469−472を参照されたい)、
ならびにオリゴヌクレオチドホスホルアミデート(Froehler,B.C.
Tetrahedron Lett.1986,27,5575−5579,L
etsinger,R.L.,Singman,C.N.,Histand,G
.,Salunkhe,M.J.Am.Chem.Soc.1988,110,
4470−4471を参照されたい)がこのアプローチを用いて製造された。ホ
スホジエステルおよびホスホルアミデートの両方を含むオリゴマー性化合物の合
成、ならびにホスホルアミデートの合成と組み合わせたホスホルアミダイト化学
の使用が報告されている(Jung,P.M.,Histand,G.,Let
singer,R.L.Nucleosides & Nucleotides
,1994,13,1597−1605を参照されたい)。この後者の仕事にお
いては、ホスホルアミダイトおよびH−ホスホネートを成長しつつあるオリゴマ
ーにカップリングさせ、次に適当な酸化工程を行うことにより、交互のホスホジ
エステルおよびホスホルアミデートのオリゴマー性化合物が製造された。しかし
、一般には、これまでに記載されたすべての例は、オリゴマー中のすべてのホス
ホルアミデート結合に同一のアミン置換を取り込ませている。これらの研究は、
ホスホルアミデート結合を多様な官能基の取り込みのための追加の部位として用
いることの実施可能性を示している。
広範な種類のアミンを酸化的工程において用いることができ、本発明のモノマ
ー支持体は必要な化学を支持する。すなわち、ホスホルアミデート結合を取り込
むコンビナトリアルライブラリの製造については、対応するH−ホスホネートモ
ノエステルとして本発明のモノマーサブユニットが用いられる。本発明の1つの
観点においては、これは、PCl3およびイミダゾールをホスフィチル化試薬と
して用いることにより実施される(Garegg,P.J.,Regberg,
1986,26,59−62を参照されたい)。これらのH−ホスホネートモノ
マーサブユニットは、塩化ピバロイル、塩化アダマントイルまたは他の適当な活
性化試薬により活性化することにより固体支持体上でオリゴマー化することがで
きる。中間体H−ホスホネートジエステルは、水性ピリジン中のヨウ素を用いて
、高収率でホスフェートジエステルに酸化することができる。このことにより、
H−ホスホネートとホスホルアミダイト法とのカップリング効率の比較が可能と
なった。両方の方法論で本質的に同一のカップリング効率が達成される。H−ホ
スホネートジエステルは、ピリジン/CCl4(1:1)中の適当なアミンの1
0%溶液を用いることにより、ホスホルアミデートに変換される。これらの条件
下、H−ホスホネートジエステルは、アルブゾフ(Arbuzov)反応を経由
して塩化ホスホリルに酸化され、続いて第1または第2アミンで塩素を置換する
。第2の工程は、非常に一般的であることが証明されており、広範な種類のアミ
ンを用いて満足できる収率が得られている。さらに、ホスホルアミデートの収率
は、ホスホジエステルの収率に匹敵する。
いくつかのタイプのライブラリがこの方法論により利用可能である。最も簡単
な種類のものは、本発明の1組のモノマーサブユニット、および4から16個ま
たはそれ以上の官能基の組から作成され、リンにおいて単一のアミンにより置換
された、2から10個またはそれ以上のモノマーサブユニットの長さのライブラ
リである。これらのライブラリは、ホスホルアミダイト化学ではなく、スプリッ
トビーズ合成、およびそれに続くH−ホスホネート合成プロトコルにより製造さ
れる。
本発明の1つの観点においては、中間体H−ホスホネートジエステルを最終工
程までそのままにしておく。この時点において、10%の適当な第1または第2
アミンを含むCCl4/ピリジンでオリゴマーライブラリプールを酸化する。し
たがって、ライブラリは、モノマーのすべての可能な配列からなり、固定位置に
おいてユニークなサブセットに分割し、不変ホスホルアミデート結合により一緒
に結合されている。ライブラリの最終的な特性が酸化工程において用いられるア
ミンの選択により決定されるであろうことが明らかである。すなわち、ライブラ
リ成分の水溶解性、薬物動態学および薬力学は、アミンの選択により調節するこ
とができる。
中間体酸化工程を用いることにより、混合された結合を有するオリゴマーライ
ブラリを製造することも可能である(Gryaznov,S.M.,Sokol
ova,N.I.Tetrahedron Lett.1990,31,320
5−3208;Gryaznov,S.M.,Potapov,V.K.Tet
rahedron Lett.1991,32,3715−3718;Faro
oqui,F.,Sarin,P.S.,Sun,D.,Letsinger,
R.L.Bioconjugate Chem.,1991,2,422−42
6;Iso,Y.,Yoneda,F.,Ikeda,H.,Tanaka,K
.,Fuji,K.Tetrahedron Lett.1992,33,50
3−506を参照されたい)。すなわち、オリゴマーライブラリの一部を、H−
ホスホネート化学により合成し、これを(R2NH、CCl4/PyまたはS8、
CS2/TEAまたはH2O、CCl4/Py)で酸化し、ライブラリの第2の部
分を第2のセットの試薬で合成し酸化することができる。このことにより、各サ
ブセット中のランダムオリゴマー性化合物のセグメントが分子の残りと異なる結
合であるキメラライブラリが得られる。
方法論を拡張することによって、それぞれのモノマーサブユニットカップリン
グの後に異なる酸化工程を行うことにより、オリゴマーライブラリの各位置に異
なる結合を取り込ませることが可能である。H−ホスホネートジエステル結合固
体支持体の一部で別々の酸化を実施し、続いてモノマーサブユニット位置をラン
ダム化するのと同一の方法でサブセットをプールすることにより、結合をコンビ
ナトリアル化することができる。すなわち、それぞれのモノマーおよびそれらの
間の結合は、スプリット合成戦略によりランダム化することができる。
本発明の1つの利点は、本発明のモノマーサブユニットの簡単な設計により、
合理的薬剤設計と数千の化合物のためのスクリーニングメカニズムとを組み合わ
せることが可能なことである。これは、コンビナトリアル技術、例えばSURFTM
戦略において本発明のモノマーサブユニットを用いることにより達成される。
1つの好ましい態様においては、本発明のオリゴマー性化合物に結合した官能
基は、酵素PLA2と相互作用し、好ましくはこれを阻害するその可能性により
選択する。すなわち、本発明のオリゴマー性化合物を用いて、アトピー性皮膚炎
および炎症性腸疾患等の炎症性疾患の局所的および/または全身的処置を行うこ
とができる。官能基の選択においては、PLA2が両性ベヒクルよりアニオン性
ベヒクルを好むことを利用することができる。これらの官能基を有する主鎖セグ
メントの選択においては、PLA2の天然の基質がホスフェート基を含むという
事実をさらに利用することができる。したがって、ホスホジエステルまたはホス
ホロチオエートおよび他のホスフェート結合オリゴマー性化合物を選択し、PL
A2の正に荷電した界面結合部位に結合させるために負に荷電した化合物を提供
することができる。
本発明の化合物はまた、PLA2酵素の割れ目への結合を容易にするために芳
香族性官能基を含む(Oinuma,et al.,J.Med.Chem.1
991,34,2260;Marki,et al.,Agents Acti
ons 1993,38,202;およびTanaka,et al.,J.A
ntibiotics 1992,45,1071を参照されたい)。ベンジル
および4−ヘキシルベンジル基は好ましい芳香族性基である。本発明の化合物は
、さらに疎水性官能基、例えばテトラエチレングリコール基を含むことができる
。PLA2酵素は疎水性チャネルを有するため、疎水性は酵素の阻害剤の重要な
性質であると考えられる。
本発明のある態様においては、アミノジオールモノマーサブユニットをオリゴ
マー性化合物のライブラリ中に取り込ませ、コンビナトリアルスクリーニング技
術、例えば上述のSURFTM技術において、スクリーニングの連続するラウンド
により複雑性の減少していくオリゴマー性化合物のサブセットを同定する。コン
ビナトリアルスクリーニング戦略、例えばSURFTM戦略を用いてPLA2アッ
セイを行うことができる。このアッセイのためには、オリゴマー性化合物のライ
ブラリを、ヒトタイプIIPLA2酵素活性の阻害についてスクリーニングする
。典型的には、これらのライブラリは、約100から100,000個の異なる
化合物を含む。SURFTM技術の連続する繰返しを行って、ユニークなオリゴマ
ー性化合物をライブラリから選択する。他のインビトロアッセイにおいてライブ
ラリをさらにスクリーニングして、阻害のさらなるメカニズムを決定することが
できる。
スクリーニングの最初の段階でオリゴマー性化合物を同定した後、オリゴマー
性化合物のライブラリの成分にさらなる変更を行うことができる。例えば、スク
リーニングの第1の繰返しによりベンジル基を含む活性化合物が得られた場合、
続くスクリーニングの繰返しにおいて、この芳香族性残基を置換ベンジル基を用
いて変化させることができる。このようにして、段階的様式で構造的活性を同定
し、酵素活性の強力な阻害剤を明らかにする。
PLA2の堅く結合したオリゴマー性阻害剤のコンビナトリアルアプローチに
よる同定を最大化するために、典型的には、ランダム化されたライブラリに官能
基のアレイを含ませる。
アミノジオールモノマーサブユニットを互いに連結して、ホモポリマー構造を
形成することができ、またはこれらをヌクレオチドおよび/または他の成分と連
結してキメラ構造を形成することができる。例えば、キメラ構造は、天然に生ず
るまたは合成のオリゴヌクレオチドの1つまたはそれ以上の領域もしくは”スト
レッチ”に、または他の合成または天然のオリゴマー性化合物、例えばペプチド
、ペプドイド、ペプチド核酸、オリゴ糖類および/または多糖類に結合した本発
明のモノマーサブユニットの1つまたはそれ以上の領域もしくは”ストレッチ”
を含むように形成することができる。さらに、本発明のオリゴマー性化合物は、
”Monomeric Diols And Phosphate Linke
d Oligomeric Compounds Formed Theref
rom,”と題する米国特許出願08/179,970(1994年1月11日
出願);これはPCT/US95/0049(1995年1月11日出願)の親
出願である;および”Oligonucleotide Mimics Hav
ing Nitrogen−Containing Linkages”と題す
る米国特許出願08/180,124(1994年1月11日出願);これは、
1995年1月11日に出願され代理人書類番号ISIS−1852を有するP
CT出願の親出願である、に開示される化合物とともにキメラ構造中に取り込ま
せることができる。上述の特許出願は共通に譲渡されており、これらを本明細書
の一部としてここに引用する。
本発明の1つの観点においては、オリゴマー性化合物のコンビナトリアルライ
ブラリは、まず、それぞれが以下の構造I、II、III、IV、V、VI、V
II、VIII、IX、X、またはXIを有する複数のアミノジオールモノマー
サブユニットを固体支持体に結合させることにより合成する。
第1のアミノジオールモノマーサブユニットは、R1として塩基不安定性保護
基を有し、存在する場合にはR2として水素またはアルキル基を有する。R3およ
びR4の一方は酸不安定性保護基であり、他方は水素、例えば遊離ヒドロキシル
である。遊離ヒドロキシルを固体支持体上の基と反応させ、アミノジオールモノ
マーサブユニットを固体支持体に結合させる。あるいは他の二官能性基、例えば
エチレングリコールを固体支持体に結合させる。多くのこのような化合物が当該
技術分野において知られており、多くが市販されている。誘導化工程なしですぐ
に使用できる、予め結合した連結基を有する固体支持体もまた利用可能である。
反応性アミノ基上の塩基不安定性保護基は、塩基、例えばDMF中の10%ピ
ペリジンまたはピリジン中のDBU(ジアザビシクロウンデセン)と接触させる
ことにより除去し、次に、標準的なカップリング方法(例えばBodansky
,M.,Principles of Peptide Synthesis,
1984,Springer−Verlag,Berlinを参照されたい)を
用いて、置換カルボン酸または他の求電子試薬(塩酸、塩化スルホニル等)を主
鎖セグメントのアミノコンビナトリアル部位に共有結合させる。カルバメートは
、アミンを適当なアルキルまたはアリールクロロギ酸で処理することにより得る
ことができる。カルバメートは、ピリジン等の触媒の存在下で、アミンを適当な
アルキルまたはアリールクロロギ酸で処理することにより得ることができる。尿
素またはチオウレアは、主鎖セグメントのアミノコンビナトリアル部位をイソシ
アネートまたはイソチオシアネートと反応させることにより、または、塩基の存
在下でカルボニルジイミダゾールで、次に第2アミンで処理することにより、形
成することができる。スルホンアミドは、塩基の存在下で塩化スルホニルと反応
させることによりアミンから製造することができる。窒素は、ハロゲン化物、例
えば以下の実施例において用いられた例示的ハロゲン化物(臭化ベンジル、臭化
3−メチルベンジル、臭化3−メトキシベンジルまたは臭化3−ニトロベンジル
)で処理することにより、アルキル化することができる。この目的のためには、
広範な種類のハロゲン化物を用いることができる。さらに、アミノ化合物は、ア
ルデヒドまたはケトンと反応させてシッフ塩基を形成することにより官能化する
ことができる。次に、還元剤、例えばNaCNBH3の存在下でシッフ塩基を還
元する。
保護を必要とする官能基は、TCAに対して安定な酸不安定性保護基を用いて
誘導化することができる。酸不安定性ヒドロキシル保護基は、酸(ジクロロメタ
ン中3%TCA)で処理し、得られる遊離ヒドロキシルを、R1として塩基不安
定性保護基を、存在する場合にはR2として水素またはアルキル基を有する第2
のアミノジオールモノマーサブユニットH−ホスホネートと反応させることによ
り、除去することができる。R3およびR4の一方は酸不安定性保護基であり、他
方は活性化ホスファイトである。固体支持体上の最初のモノマーサブユニット
の遊離ヒドロキシルを、第2のモノマーサブユニットの活性化ホスファイトと反
応させてホスファイト結合を形成し、このことにより、1つのモノマーサブユニ
ットにより、成長しつつあるオリゴマー性化合物の長さを増加させる。
CCl4/ピリジン中の第1または第2アミンの10%溶液を用いて、ホスフ
ァイト結合を酸化してホスホルアミデートとする。次に、第2のモノマーサブユ
ニット上の塩基不安定性保護基を上述のようにピペリジンで除去する。得られる
アミノ基をさらに活性化官能基と反応させる。所望ならば、上述の合成工程を繰
り返すことにより、追加のモノマーサブユニットを付加することができる。
本発明のモノマーサブユニットを用いて、予め選択された配列またはコンビナ
トリアル戦略により決定された配列のいずれかを有するオリゴマー性化合物を製
造することができる。1つの有用なコンビナトリアル戦略は、上述のSURFTM
戦略であり、これは米国特許出願749,000(1991年8月23日出願)
およびPCT出願US92/07121(1992年8月21日出願)に開示さ
れかつ特許請求されている。これらの両方とも本願と共通して譲渡されている。
これらの出願の全開示を本明細書の一部としてここに引用する。
以下は、簡単なコンビナトリアルライブラリの合成において用いられる方法の
例である。制御することができる可変パラメータは以下のものである:主鎖セグ
メント、主鎖セグメントのアミノコンビナトリアル部位に結合する官能基、ホス
ホルアミデート結合に結合するアミン、およびオリゴマーの長さ。本明細書に記
載される例においては、32分子のみからなる非常に簡単なライブラリが記載さ
れる。このライブラリは、2つの異なる主鎖セグメント、AおよびB、2つのカ
ルボン酸XおよびY、および2つのアミン、PおよびQを用いることにより製造
する。1)AおよびBで誘導化された等量の固体支持体を秤量することにより始
める。ゲルをDMF/ジクロロメタン(1:1)または他の溶媒中に懸濁し、穏
やかに混合することにより、2つの固体支持体を一緒に混合する。ライブラリに
おいて3つ以上の主鎖セグメントを用いる場合、この段階において各種の支持体
のすべてを一緒に混合する。次に、支持体の混合物をDMF中のピペリジンで処
理して、両方の支持体からN−保護基を除去する。2)混合物を次の工程で付加
すべき試薬の数、この場合は2つ、に対応する数の等量の部分に分ける。第1の
混合物に活性化したカルボン酸Xを加え、第2の混合物に活性化したYを加える
。反応が完了したら、固体支持体を上述のように混合して、すべての4つの可能
な組み合わせの等モル混合物を得る。次に、この混合物をトリクロロ酢酸で処理
して、モノマーサブユニット上のDMT保護基を除去し、遊離OH基を与える。
3)混合物を付加すべきモノマーサブユニットの数、この場合には2つ、に対応
する数の等しい部分に分ける。次に、各混合物にモノマーサブユニットH−ホス
ホネートをカップリングさせ、固体支持体を再び混合し、再び支持体を付加すべ
きアミンの数、この場合には2つ、に対応する数の等しい部分に分ける。4)こ
の段階において、すべての8つの可能な組み合わせが存在する。各部分を別々に
アミン、PまたはQのCCl4/ピリジン中の溶液で処理する。次に、部分をプ
ールし、DMF中のピペリジンで処理し、等分する。5)固体支持体上の16化
合物の各混合物を活性化カルボン酸、XおよびYで処理する。その結果、それぞ
れ16化合物の2つのユニークなプールが得られ、次にこれを脱保護して、末端
DMT基および官能基上の任意の保護基を除去し、そして固体支持体から切断す
る。追加のモノマーサブユニットをカップリングし、ライブラリ分子を伸長する
ことにより、さらに別のコンビナトリアル部位を付加することも可能である。我
々は、化合物の混合物を簡明に記載するために、以下の命名法を用いた。Xは固
定位置を表す。すなわち、アミノコンビナトリアル部位上のその位置の主鎖セグ
メントまたは官能基はユニークであり、プール組成物を規定するために働く。N
は特定の位置におけるすべての可能な構造の等モル混合物を表す。下付文字は、
ライブラリ合成における合成工程を規定する。上述の例においては、作成される
ライブラリはX5N4N3N2N1(ここで、X5はXまたはYであり、N4はPおよ
びQの等量混合物であり、N3はAおよびBであり、N2はXおよびYであり、そ
してN1はAおよびBである)である。この場合、固定位置は最後の位置である
が、同様の方法を用いてライブラリ中の任意の位置を独立して固定することがで
きる。単一の構造または官能性を任意の位置に有することも可能である。位置5
において特定のアッセイについて最も活性な成分、例えばAが一旦決定されれば
、すべての場合にこの残基を有する2つの追加のプールを合成する。第2の位置
を固定し、残りをランダム化する:例えばA5X4N3N2N1(ここで、N1-3
は上述したとおりであり、X4はPまたはQである)。5ラウンドの合成および
スクリーニングの後にユニークな構造が決定される。3つ以上の可能な成分を各
位置において用いる場合、利点が明らかである。各位置において10個の異なる
成分が利用可能であれば、100,000個のユニークな構造が存在し、それで
も5ラウンドの合成およびスクリーニングのみが必要である。
SURFTM法の例は、以下の表Iに示される、2’−O−メチルオリゴヌクレ
オチドライブラリ(Ecker et.al.,ibid.を参照されたい)で
ある。表Iは、RNAヘアピンへの結合のための2’−O−メチルオリゴヌクレ
オチドの選択を記述する。KD、すなわち結合定数は、ゲルシフトにより決定さ
れた。”X”は、変更される位置を示すために用いられ、下線は、SURFTM法
の連続する繰り返しの間に固定された位置を示すために用いられる。
本発明の1つの観点は、本発明のモノマーサブユニットを上述のSURFTM戦
略に包含させることである。SURFTM戦略は、完全にパラレルな様式で本発明
の化学化合物のライブラリに等しく適用しうる。最も高い活性を有する勝者配列
を導き出すための選択基準として多くの他のアッセイも用いられる。本発明のオ
リゴマー性化合物の反応性アミノ基に結合した官能基は、オリゴマー性化合物に
特定の相互作用特性を付与する種々の構造のものでありうる。これらの化学官能
基は、以下のタイプのものの少なくとも1つの相互作用を行うことができる:水
素結合ドナーおよびアクセプター、イオン性、極性、疎水性、芳香族性、電子ド
ナーおよびアクセプター、パイ結合スタッキングまたは金属結合。そのような相
互作用の結果として、本発明のオリゴマー性化合物は、総合的な全体形状、コン
ホメーション的空間、電子密度、双極モーメント、および化合物が酵素ポケット
および他の結合部位と相互作用する能力、ならびに他の同様の性質を与えるユニ
ークな性質を有する。
コンビナトリアル技術により生成した活性な配列を検出するためには、活性な
分子の濃度を、選択されたアッセイの感度内で分子が検出されることができるの
に十分に高いものであるように選択する。認識されるように、コンビナトリアル
技術により生成するサブセット中のユニークな構造の数は、オリゴマーの長さお
よび用いられる各種の官能基の数に依存する。構造の数は、各可変位置における
成分の数の積により与えられる。これは、表IIに示される。表IIはまた、サ
ブセット濃度が典型的な高試験濃度である100μMであるときの、それぞれの
配列の濃度を示す。我々は、ライブラリの複雑性は、最終のオリゴマー性化合物
中において望ましい予測IC50(すなわち、酵素活性の50%が阻害される濃度
)の見積もりに基づくことができることを見いだした。予測IC50が100
nMである場合、表IIに示される複雑性は許容可能であり、すなわち、表II
に示されるライブラリは、約100nMまたはそれより低いIC50を有するユニ
ークな配列の検出が可能である複雑性を有する。
官能基または成分はまた、”文字”として表すことができる。そのような用語
の使用は、本発明の化合物上の各種の官能基がちょうどアルファベットの文字の
ようにある配列で位置する(予め決定された、またはランダムな選択により)と
いう事実を反映し、したがって用語”文字”を用いる。これらの文字は、”反応
性”であってもよく、または”非反応性”であってもよい。”反応性”とは、こ
れらがある様式(これは予め定義されていてもよいが、その必要はない)で標的
分子と相互作用するであろうことを意味する。”非反応性”とは、これらが本来
標的分子と相互作用するように設計されていないことを意味し、実際にはこれら
は標的分子と相互作用するかもしれないが、非反応性成分の本来の目的は、分子
に他の特性、例えば取り込み、分布、代謝または同定を行う特性(これらに限定
されない)を付与することである。
本発明のさらなる利点は、多様な官能基の配列における可変性に加えて、また
はその代わりに、モノマーサブユニットの非対称配列を有するオリゴマー性化合
物を合成する能力である。とくに断らないかぎり、モノマーサブユニットもオリ
ゴマー性化合物中で様々であってもよい。これは、最終的にオリゴマー性化合物
の主鎖となる各種のアミノジオールモノマーサブユニットを用いることにより容
易に達成される。
本発明のオリゴマー性化合物は、診断、治療において、および研究試薬および
キットとして用いることができる。これらは、適当な薬学的に許容しうる希釈剤
または担体を含ませることにより、医薬組成物中で用いることができる。好まし
い態様においては、本発明の化合物は、ホスホリパーゼA2等の酵素の阻害剤と
して;ウイルス、マイコバクテリウム、細菌(グラム陰性およびグラム陽性)、
原生動物および寄生生物等の病原体の阻害剤として;PDGF(結晶板由来成長
因子)、LTB4(ロイコトリエンB4)、IL−6および補体C5A等のリガン
ド−レセプター相互作用の阻害剤として;p50(NFκB蛋白質)およびfo
s/jun等の転写因子を含む蛋白質/蛋白質相互作用の阻害剤として;ICA
M誘導(IL1−β、TNFおよびLPS等の誘導剤を用いる)等の細胞に基づ
く相互作用の阻害のために;および除草剤および殺虫剤として作用する。他の好
ましい態様においては、本発明の化合物は、上述の生物学的物質のそれぞれにつ
いての診断試薬として、およびアッセイにおける試薬としておよびプローブとし
て用いられる。他の好ましい態様においては、本発明の化合物は、重金属のキレ
ートのためにおよびイメージング剤として用いられる。
化学官能基は、鎖長、すなわち短いか長いかに基づいて、環状基を用いるか直
線状基を用いるかに基づいて、芳香族性基を用いるか脂肪族基を用いるかに基づ
いて、官能化された基を用いるか非官能化基を用いるかに基づいて選択し、利用
可能な広範な化学官能基のわずかのみに言及することができる。実際、単一の主
鎖セグメントのアミノコンビナトリアル部位、例えば、単純なアルキル基上で、
単に官能性成分、例えば、酸、アルコール、アルデヒド、アミド、アミン、アミ
ジン、アゾ、アゾキシ、二重結合、エーテル、エチレンオキシド、グアニジン、
ハロゲン化物、ハロアルキル、ヒドラジン、ヒドロキシルアミン、ケトン、メル
カプタン、ニトレート、ニトリル、ニトロ、ニトロソ、第4窒素、スルフィド、
スルホン、スルホキシド、三重結合、尿素等を変更することにより、多様な機能
を有する莫大なアレイが得られる。これを主鎖の広範なプラットフォーム上にこ
のような種々の官能性成分、例えば、一連のアルキル化合物、一連のアリール化
合物、一連の脂環式化合物等を配置することを含むように拡張すると、化学官能
基の莫大なアレイの可能性が明らかである。他の化学官能基には、アルキル、ア
ルケニル、アルキニル、脂環式および置換アルキル、アルケニル、アルキニル、
脂環式;アリールおよび置換アリール;アラルキル、置換アラルキル、複素環、
ピリミジンおよびプリン等の核酸塩基、金属キレート基、およびアミノ酸のα位
に見いだされるような成分、例えば以下に示されるものが含まれる。
本発明の教示を用いて行うことができる種々の反応の組み合わせは、論理的フ
ロースキームを用いることによりさらに説明することができる。このフロースキ
ームは、図1Aおよび1Bに記載される。
図面を参照すると、合成のスタート10において、アミノジオールモノマーサ
ブユニットまたは一群のアミノジオールモノマーサブユニットが選択される。選
択されたモノマー(単数または複数)は、プロセスステップ12において処理さ
れる。ここでは、下記の実施例26、30、35、45、46、57、55、お
よび61に記載されるように、アミノジオールモノマーサブユニット(単数また
は複数)を固体支持体に結合する。アミノジオールモノマーサブユニットは、H
−ホスホネートジエステル結合を介して、スクシニル結合により、またはエチレ
ングリコール結合により、固体支持体に結合させることができる。多くの他のタ
イプの結合が当該技術分野において知られており、本発明に適用することができ
る。一群のアミノジオールモノマーサブユニットは、この工程においてスプリッ
トビーズ合成を用いることにより有利に結合させることができる。さもなければ
、プロセスステップ12において実施されるプロセスステップは、ボックス10
2により表される選択および結合の方法として特徴づけることができる。手順ボ
ックス102から、フロースキームの経路が収束点14で交わる。収束点14は
、以下に説明するように、本発明の繰り返しプロセスにおいて、後の工程からの
成長しつつあるオリゴマー性化合物がこの繰り返しプロセスを経由して再導入さ
れて、さらに酸化、アミン基の官能化および伸長が行われる点を表す。
収束点14の下流においては、本発明のプロセスはさらに、ボックス104に
より表される一般酸化手順に含まれる手順により実施される酸化工程を含む。ボ
ックス104において一般に表される酸化手順中の判定ブロック16においては
、プロセスステップ12の生成物(または収束点14において導入された成長し
つつあるオリゴマー性化合物)は、この工程のYESブランチを経由してPIII
からPV化合物への酸化により変換されるか、またはPIIIホスファイト結合は酸
化されず、化合物はPIII結合を維持したまま判定ブロック16のNOブランチ
を経由して次の判定工程に至り、収束点42に進む。このプロセスの繰返しの間
に酸化が望まれるようなプロセスステップ12の生成物(または収束点14にお
いて導入された成長しつつあるオリゴマー性化合物)、すなわち判定ブロック1
6のYESブランチに沿って動くものについては、判定ブロック18において、
判定ブロック18からのYESブランチを経由してホスホルアミデートに変換さ
れるか、または判定ブロック18からのNOブランチを経由してホスホロチオエ
ートまたはホスホジエステルに変換される。
判定ブロック20においては、成長しつつあるオリゴマー性化合物は、判定ブ
ロック20のYESブランチを経由してプロセスステップ24においてホスホジ
エステルに酸化されるか、または判定ブロック20のNOブランチを経由してプ
ロセスステップ25においてホスホロチオエートに酸化される。ホスホロチオエ
ートまたはホスホジエステルのいずれかへの酸化は、実施例69に記載されるよ
うに、例えば1回またはそれ以上の前のプロセスの繰返しにおいて判定ブロック
16のNOブランチをとった場合、同一の成長しつつあるオリゴマー性化合物上
の多数の位置において同時に実施することができる。前に酸化されていない部位
があり、現在の繰返しの間に判定ブロック16のYESブランチが選択される場
合には、多数のモノマー性ユニットが同時に酸化される。得られるホスホジエス
テルおよびホスホロチオエートは、収束点38で収束し、ここから収束点40に
至る。
判定ブロック18からYESブランチにしたがった、判定ブロック22におけ
る成長しつつあるオリゴマー性化合物は、3つのプロセスステップのうちの1つ
によりホスホルアミデートに変換することができる。第1に、判定ブロック22
において、単一のアミンを用いて置換するか否かを判定する。判定ブロック22
からのYESブランチにしたがう成長しつつあるオリゴマー性化合物は、実施例
67に記載されるように、プロセスステップ26において溶液中の単一のアミン
を用いて変換されて、均一な置換基を有するホスホルアミデート結合が得られる
。判定ブロック22からのNOブランチにしたがう成長しつつあるオリゴマー性
化合物は、2つのプロセスの1つによりコンビナトリアル化される。競合コンビ
ナトリアル化判定ブロック28からのNOブランチにしたがう成長しつつあるオ
リゴマー性化合物は、プロセスステップ30においてスプリットビーズ合成によ
りコンビナトリアル化される。判定ブロック28のYESブランチにしたがう成
長しつつあるオリゴマー性化合物は、プロセスステップ32において、実施例6
7の方法Bに記載されるように、アミンの混合物を用いてコンビナトリアル化さ
れる。
酸化された(判定ブロック16のYESブランチを経由して)または酸化され
ていない(判定ブロック16のNOブランチを経由して)成長しつつあるオリゴ
マー性化合物は、一般酸化手順ボックス106中の収束点42で収束する。プロ
セスは、収束点42から、図1Aと図1Bとを接続する接続点44を経由して図
1Bに続く。別の接続点である点46は、図1Bから図1Aに戻る。
ボックス106により表される一般官能化手順中の判定ブロック48において
は、判定ブロック48のYESブランチにしたがうと、成長しつつあるオリゴマ
ー性化合物はプロセスステップ50で脱ブロックされて、成長しつつあるオリゴ
マー性化合物上に遊離アミノ部位を顕示する。この遊離アミノ部位は、この時点
で官能化に利用可能である。あるいは、判定ブロック48からNOブランチにし
たがうと、アミノ脱ブロッキングおよび官能化を迂回する。判定ブロック48の
NOブランチにしたがうと、アミン保護基は維持され、成長しつつあるオリゴマ
ー性化合物は直接収束点66に至る。
1回またはそれ以上の前のプロセス繰返しにおいて、判定ブロック48のNO
ブランチが選択された場合、この時点で保護されており、官能化するために脱ブ
ロックすることができる多数のアミノ部位が存在する。すなわち、官能化は、手
順ボックス106に一般に表される官能化手順の任意の1回の繰返しの間に、1
つの部位または2以上の部位で実施することができる。
官能化手順の判定ブロック48のYESブランチにしたがうと、プロセスステ
ップ50における脱ブロッキングの後、得られる遊離アミノ部位(単数または複
数)の官能化にいくつかの別法が利用可能である。判定ブロック52において、
単一の官能基で官能化するかまたは多数の官能基で官能化するかが問われる。判
定ブロック52からのYESブランチにしたがうと、官能化は単一の官能基で行
われる。この官能化は単一の位置で実施することができ、または上述したように
プロセスの前の繰返しにおいて官能化手順が迂回された場合には、成長しつつあ
るオリゴマー性化合物またはそのような化合物のコンビナトリアルライブラリの
多数のアミノ位置を同時に官能化することができる。判定ブロック52のNOブ
ランチから判定ブロック56に至り、ここで、成長しつつあるオリゴマー性化合
物上の脱保護されたアミノ部位は、多数の試薬を用いて2つの異なるコンビナト
リアル化手順により官能化することができる。判定ブロック56からのNOブラ
ンチにしたがうと、成長しつつあるオリゴマー性化合物(単数または複数)の遊
離アミノ部位(単数または複数)のコンビナトリアル化は、プロセスステップ5
8においてスプリットビーズ合成を用いて実施する。判定ブロック56からのY
ESブランチにしたがうと、遊離アミノ部位(単数または複数)のコンビナトリ
アル化は、プロセスステップ60において、化合物(例えばカルボン酸または酸
ハロゲン化物)の混合物を用いることにより、例えば実施例63および65にし
たがって実施することができる。
プロセスステップ58および60の生成物は収束点62で収束し、これらは次
に収束点64でプロセスステップ54の生成物と収束する。これらの点の両方と
も収束点66で収束し、ここで、判定ブロック48のNOブランチを経由して脱
ブロックプロセスステップ50からそれた中間体もまた収束する。
判定ブロック68において、合成を中止するかまたは成長しつつあるオリゴマ
ー性化合物をさらに伸長するかが問われる。現在のオリゴマー性化合物が十分な
長さであれば、判定ブロック68において、ボックス108で一般に表される最
終脱ブロッキングを実施すべきとの判定がなされる。判定ブロック68のNOブ
ランチにしたがうと、プロセスステップ72において最終脱ブロッキングが実施
され、最終生成物すなわち生成物78が得られる。
成長しつつあるオリゴマー性化合物のさらなる伸長が望まれる場合には、判定
ブロック68のYESブランチにしたがう。これは、ボックス110に一般に表
される伸長手順に至る。オリゴマー性化合物の伸長を実施するためには、プロセ
スステップ70においてヒドロキシル保護基を除去し、プロセスステップ74に
おいて追加のアミノジオールモノマーサブユニットを付加する。この時点で、成
長しつつあるオリゴマー性化合物は、収束点14で再導入され(接続点46を経
由)、図1Aに表される合成のさらなる繰返しのプロセスループに入る。ここで
、独立して酸化および/または官能化に進むかまたはこれを迂回するかの経路の
選択のプロセスを繰り返す。
本発明のプロセスは、一般に、最初に1つまたはそれ以上のモノマーサブユニ
ットを選択し、これを支持体に結合させることを特徴とする。これは、一般に図
の手順ボックス102に対応する。ボックス104により一般に表される酸化手
順、およびボックス106により一般に表される官能化手順を迂回する場合には
、モノマー性サブユニットのヒドロキシルブロッキング基を除去し、モノマーユ
ニットの付加のさらなる繰返しを行うことができる。これは、ボックス110に
より一般に表される伸長手順により行われる。
プロセスのこの繰返しの間に、ホスフェートリンカーを酸化することが望まれ
る場合には、酸化は、ボックス104により一般に表される酸化手順により実施
されるであろう。さらに、酸化手順の後、次の繰返しの前に、付加された最後の
モノマーサブユニット(単数または複数)のアミノ基を官能化することが望まれ
る場合には、官能化は、ボックス106により一般に表される官能化手順により
実施される。
成長しつつあるオリゴマー性化合物(単数または複数)が十分な長さを有する
場合には、合成を停止し、ボックス108に一般に表される最終脱ブロッキング
手順により、化合物(単数または複数)を脱ブロックし、その支持体から切断す
る。
最初のモノマーサブユニットの酸化工程を実施することができ、またはそれぞ
れの次に付加されたモノマーサブユニットの酸化を、プロセスの繰返しの間にこ
れらが付加されたときに実施することができることは、もちろん認識されるであ
ろう。あるいは、付加されたそれぞれのモノマー性サブユニットについて酸化を
行う必要はないが、プロセスのいくつかの次の繰返しの間に行うことができる。
さらに、最初のモノマーサブユニットについてアミノ部位の官能化を行うことが
でき、これはそれぞれの付加されたモノマーサブユニットについて行うことがで
きることが認識されるであろう。あるいは、付加されたそれぞれのモノマー性サ
ブユニットについて官能化を行う必要はないが、プロセスのいくつかの次の繰返
しの間に行うことができる。実施例1 N‐FMOC‐トランス‐4‐ヒドロキシ‐L‐プロリン
トランス‐4‐ヒドロキシ‐L‐プロリン(5.00g、38.2mmoL)
とNaHCO3(8.00g、95.2mmoL)を150mLのH2O/ジオキ
サン(1:1)中に懸濁させた。25mLのトルエンに溶かしたフルオレニルメ
チルクロロホーメート(11.4g、44.0mmoL)を滴下して加えた。こ
の添加の間、反応温度が25℃以上に上がらないようにした。この混合物を一晩
激しく撹拌し、次いで50mLの飽和NaHCO3溶液と50mLの水で反応を
停止させた。次いで、この溶液を100mLのジエチルエーテルで抽出した。水
層を濃塩酸でpH1まで酸性にし、酢酸エチルで2回抽出し、この有機抽出物を
を食塩水で洗った。この溶液をMgSO4で乾燥し、ろ過し、そして溶媒を減圧
下で除去した。その濃縮溶液から、純粋の生成物が析出した。収量:13.4g
(100%)。1H‐NMR:(CDCl3、200MHz)δ7.75‐7.1
5(8H、m,ArH)、4.55‐4.05(5H,m、ArCHCH2、H
2、H4)、3.65‐3.45(2H,m,2H5)、2.35‐2.10(
2H、m、2H3)。実施例2 N‐FMOC‐3‐ヒドロキシピロリジン‐5‐メタノール
250mLのTHFに溶かしたN‐FMOC‐トランス‐4‐ヒドロキシ‐L
‐プロリン(13.4g、38.1mmoL)の溶液にボラン‐メチルスルフィ
ド(78mmoL,5.78g,7.22mL)を室温で滴下して加えた。H2
の発生が止んだ後、その溶液を機械的に撹拌しながら、還流するまで加熱した。
1時間後白色の沈殿が生成した。メタノールを注意深く添加し、そして得られた
溶液をさらに15分間還流下で加熱した。この溶液を室温まで冷却し、溶媒を減
圧下で蒸発させ、そして残留ガム状物を2×100mLのメタノールで共蒸発処
理した。得られた結晶性の生成物の秤量は12.0g(35.3mmoL、93
%)であった。1H‐NMR:(CDCl3、200MHz)δ7.85‐7.2
5(8H、m、ArH)、4.50‐4.10(5H、m、ArCHCH2、H
3、H5)、3.80‐3.40(4H、m、2H2、2H6)、2.15‐1
.95(1H、m、H2a)、1.80‐1.60(1H、m,H2b)。実施例3 N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐3‐ヒドロキシピロリジ ン
このジオール、N‐FMOC‐3‐ヒドロキシピロリジン‐5‐メタノール(
10.59g、31.2mmoL)を乾燥ピリジン(2×50mL)と共蒸発処
理し、200mLの乾燥ピリジンに再溶解し、氷浴中で冷却した。ジメトキシト
リチルクロリド(11.0g、32.5mmoL)を少量ずつ30分かけて添加
し、そしてその溶液を、一晩0℃で撹拌した。次いで、メタノール(10mL)
を加え、そして溶媒を減圧下で除去した。得られたガム状物をトルエン(100
mL)に再溶解し、ろ過してピリジン塩酸塩を除去し、そして再び乾固させた。
この残留物をCH2Cl2(300mL)に溶解し、150mLの0.1Mクエン
酸溶液、150mLの飽和NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で
乾燥して、次いで蒸発処理した。この残留物をメタノールから結晶化させ、乾燥
すると、収量は、15.4g(23.9mmoL,77%)であった。実施例4 5‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐3‐ヒドロキシピロリジン
15mLのDMFに溶かしたN‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメ
チル‐3‐ヒドロキシピロリジン(3.40g、5.30mmoL)の溶液にピ
ペリジン(1.09mL、0.935g,11.0mmoL)を添加した。この
溶液を室温で1時間撹拌し、水(100mL)を加え、次いで、この水溶液を酢
酸エチル(2×75mL)で抽出した。この有機抽出物を、NaHCO3水溶液
、食塩水で洗い、MgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理した。この残留物をフ
ラッシュ・カラムクロマトグラフィーで、0.5%のトリエチルアミンを含んだ
CH2Cl2中、1‐3%範囲のMeOH勾配を用いて精製した。純粋な生成物が
得られた(1.86g、84%)。1H‐NMR:(CDCl3、200MHz)
δ7.42‐6.80(13H、ArH)、4.35(1H、m、H5)、3.
77(6H、s、2OCH3)、3.62(1H、m、H3)、3.13‐2.
88(4H、m、2H6、2H2)、1.87(1H、q、H4a)、1.65
(1H、m、H4b)。実施例5 N‐(フェニルアセチル)‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐3‐ヒドロ キシピロリジン
フェニル酢酸(1.50g、11mmoL)およびHOBT(1.63g、1
2mmoL)を100mLのCH2Cl2に溶解し、そしてEDC(15mmoL
、2.88g)を加えた。15分後、5‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐3
‐ヒドロキシピロリジンを添加し、次いでDIEA(20mmoL、3.5mL
)を加えた。撹拌しながら、出発原料が消費されるまで反応を行い、10mLの
NaHCO3水溶液で停止させた。この混合物を酢酸エチルで2回抽出し、Na
HCO3水溶液、食塩水で洗い、MgSO4で乾燥し、次いで蒸発処理した。この
生成物をフラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製し、4.0g(75%)
の生成物を得た。1H‐NMR:(CDCl3、200MHz)(2回転異性体、
3'-O‐TMS)δ7.43‐7.13、6.88‐6.74(13ArH)、
4.67、4.49、4.37、4.13、(4m、2H、H3、H5)、3.
78(s、6H、OCH3)、3.78‐3.50(m、2H、H2a,b)、
3.66(s、2H,CH2Ar)、3.35(q、1H、H6a)、3.12
(m、1H、H6b)、2.14‐1.70、(m、2H、H4a、b)、0.
10(d、9H、OSi(CH3)3)。実施例6 コハク酸フルオレニルメチルエステル
フルオレンメタノール(10.0g、51.0mmoL)を150mLのCH2
Cl2に溶解し、そしてコハク酸無水物(5.6g、56mmoL)を加えた。
この溶液を6時間撹拌し、さらにコハク酸無水物(2.5g、25mmoL)を
追加し、一晩撹拌を続けた。TLCにより反応の完結を明らかにした。次いで溶
媒を除去し、そして、残留物を酢酸エチルで抽出し、1%HCl、水、食塩水で
洗い、乾燥(MgSO4)し、そして、放置すると結晶化するオイルになるまで
蒸発処理した。定量的収率の粗生成物が得られ、これは、さらに精製することな
く使用された。実施例7 (N1‐チミン)‐2‐酢酸
ブロモ酢酸メチル(25.5g、15.2mL、160mmoL)を500m
Lの乾燥DMFに分散させたK2CO3(44.2g、320mmoL)とチミン
(20.2g、160mmoL)の懸濁液に加え、一晩撹拌した。この懸濁液を
ろ過し、溶媒を減圧下で除去した。その残留物を120mLの水と20mLの4
N‐HCl中に懸濁させ、30分間撹拌し、そして、もう一度ろ過した。その固
体を250mLのH2Oに懸濁させ、それに100mLの2.5M‐NaOHを
加えた。この溶液を沸騰するまで加熱してから冷却し、濃塩酸でpH1まで酸性
にした。この沈殿を減圧下で乾燥し、13.6gの(73.6mmoL.46%
)の純粋な生成物を得た。1H‐NMR:(DMSO‐d6、200MHz)δ
7.48(s、1H、H6)、4.37(s、2H、CH2)、1.76(s、
3H、CH3)。実施例8 (N‐FMOC‐3‐アミノプロピオン酸
炭酸水素ナトリウム(2.52g、30mmoL)と3‐アミノプロピオン酸
(1.00g、11.2mmoL)を50mLの水に溶解し、そして50mLの
ジオキサンを加えた。50mLのジオキサンに溶かしたフルオレニルメチルクロ
ロホーメート(3.10g、12.0mmoL)の溶液を撹拌下に滴下した。6
時間後に、溶液を水(100mL)と飽和炭酸水素ナトリウム溶液(50mL)
で稀釈し、ジエチルエーテルで一度抽出し、そして、その水層を濃塩酸でpH2
まで酸性にした。この濁った溶液を酢酸エチル(2×100mL)で抽出し、食
塩水で洗い、MgSO4で乾燥した。標題化合物とそのペプチド二量体の混合物
を得た。フラッシュ・クロマトグラフィーで純粋の生成物を得た。1H‐NMR
:(CDCl3、200MHz)δ7.95‐7.26(8H、m、ArH)、
7.40‐7.15(3H、m、CHCH2O)、3.20(2H、t、J=8
Hz、CH2N)、2.40(2H,t、J=8Hz、H00CCH2) 。実施例9 N‐イミダゾリル‐2‐酢酸
イミダゾール(3.7g、54mmoL)を50mLの乾燥THF中に分散さ
せた水素化ナトリウム(油中60%分散液2.6g,60mmoL)懸濁液に加
えた。次いで、ブロモ酢酸(3.4g、24mmoL)を加え、そしてその混合
物を一晩撹拌した。次いで、水(1mL)を加え、そして溶媒を減圧下で除去し
た。残留物を水に溶かし(50mL、pH>10)、エーテルで抽出し、そして
有機層は捨てた。水層を濃塩酸でpH1まで酸性にし、エーテルでもう一度抽出
した。この水層を乾燥するまで蒸発処理した。オイル状残留物を無水アルコール
(EtOH)に溶解し、NaClを沈殿させ、そしてアセトン/メタノールから
再結晶して、1.22g(7.5mmoL.30%)の純粋な生成物を塩酸塩と
して得た。1H‐NMR:(DMSO‐d6、200MHz)δ9.20(s、
H2)、7.76(d、J=1.5Hz)、7.69(d、J=1.5Hz)、
5.20(s、CH2)。実施例10 (9‐アデニン)‐2‐酢酸エチルエステル
500mLのDMF中に分散させたアデニン(25.0g、185mmoL)
の懸濁液に、水素化ナトリウム(油中60%分散液8.20g,205mmoL
)を添加した。機械的撹拌機を用いて2時間の間、激しく撹拌すると、H2の発
生が止み、粘ちょうなスラリーが得られた。ブロモ酢酸エチル(55.6g、3
6.9mL、333mmoL)を3時間かけて滴下し、そして、さらに1時間
撹拌を続けた。水(10mL)とH2SO4を、pH4になるまで添加した。溶媒
を蒸発させ、残留物を500mLのH2Oに懸濁させ、ろ過して、水で洗った。
この残留物を400mLのエタノールから再結晶し、23.8g(108mmo
L.58%)の純粋な生成物を得た。実施例11 (N‐ベンゾイル‐9‐アデニン)‐2‐酢酸
250mLの乾燥ピリジン中に分散させた(9‐アデニリル)‐2‐酢酸エチ
ルエステル(6.06g、27.4mmoL)の懸濁液に、塩化ベンゾイル(9
.60mL、11.6g、82mmoL)を添加し、そして、その溶液を室温で
4時間撹拌した。メタノール(25mL)を加え、溶媒を蒸発させた。この残留
物を酢酸エチル(2×250mL)に溶解し、0.1N‐HCl、水、飽和Na
HCO3水溶液、食塩水で洗浄し、Na2SO4で乾燥した。この有機抽出物を蒸
発処理し、そして、その固形残留物を250mLのTHFに0℃で再溶解し、そ
れに100mLの1M‐NaOHを添加した。この溶液を0℃で、1時間撹拌し
、そして濃塩酸でpH1まで酸性にし、その水系部分をエーテルで1回抽出した
。殆ど直ちに結晶化し始める生成物を濾取し、収量は4.69g(61%)であ
った。1H‐NMR:(DMSO‐d6、200MHz)δ8.86、8.84
(d、H2、H8)、8.1(d、2H、J=7.0Hz、ArH)、7.69
‐7.58(m、3H、Ar‐H)、5.22(s、2H、CH2)。実施例12 N‐4‐ベンゾイルシトシン
シトシン・ヘミヒドラート(12.0g、100mmoL)をピリジンと共蒸
発脱水し、そして、250mLの乾燥ピリジン中に再懸濁させた。塩化ベンゾイ
ル(58mL、70.3g、500mmoL)を滴下して加えた(発熱)。この
溶液を室温で一晩撹拌し、そして、水(50mL)を注意して加えた。溶媒を蒸
発させ、残留物を55gのNaOHを含む700mLの水に溶解した。この溶液
を、原料が完全に溶解した後1時間撹拌した。次いで、pHが4.0になるまで
濃塩酸を加え、得られた白色の沈殿を捕集し、1リットルのEtOH中で煮沸し
、室温まで冷却し、そしてろ過して、16.1gの生成物(75%)を得た。実施例13 N‐4‐ベンゾイル−1‐シトシン‐2‐酢酸
500mLのDMF中に分散させたN‐4‐ベンゾイルシトシン(15.0g
、69.7mmoL)とK2CO3(9.7g、70mmoL)の懸濁液に、ブロ
モ酢酸メチル(6.6mL、10.7g、70mmoL)を加えた。この懸濁液
を3日間激しく撹拌し、ろ過して、蒸発処理した。残留物を水(120mL)と
10mLの4N‐HClで15分間処理し、固形分を濾取した。この残留物を1
20mLの水に再懸濁させ、次いで60mLの2N‐NaOHを加えた。この懸
濁液を室温で、固体が全部溶解するまで、45分間撹拌した。この溶液を濃塩酸
でpH2まで酸性にし、ろ過し、次いでその固体を減圧下60℃で乾燥して11
.6gの生成物(61%)を得た。実施例14 N‐2‐イソブチロイル‐9‐グアニン‐2‐酢酸
DMF(25mL)中に分散させた2‐アミノ‐6‐クロロプリン(10mm
oL)とK2CO3(15mmoL)の懸濁液に、ブロモ酢酸エチル(10mmo
L)を加える。この混合物を24時間激しく撹拌し、ろ過して、次いで溶媒を蒸
発させる。残留物を25mLのピリジンに再懸濁させ、そしてイソブチロイルク
ロリド(20mmoL)を添加する。18時間撹拌後、水を加え、溶媒を除去す
る。この残留物を1N‐HCl中に懸濁し、1時間還流するまで加熱する。次い
で、この懸濁液を0℃まで冷却し、NaOHを加えて、pH12にし、さらにこ
の懸濁液を1時間撹拌する。この溶液をpH3まで酸性にし、そして生成物を濾
取する。実施例15 ベンジル‐3,6,9,12‐テトラオキサトリデカノエート
トリエチレングリコール‐モノメチルエーテル(10mmoL)とブロモ酢酸
ベンジル(11mmoL)を、50mLの無水DMFに分散させた無水のK2C
O3(15mmoL)の懸濁液に加える。この懸濁液を室温で一晩撹拌する。水
を加え、そのエマルションを酢酸エチル(3×200mL)で抽出し、水、食塩
水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。溶媒を蒸発させ、そして残留オイ
ルをフラッシュ・クロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が得られる。実施例16 3,6,9,12‐テトラオキサトリデカン酸
ベンジル‐3,6,9,12‐テトラオキサトリデカノエート(5mmoL)
をメタノール(50mL)に溶かし、カーボンに担持した10%パラジウム(1
00mg触媒/mmoL)を加える。この懸濁液を30psiのH2下で、出発
原料が消費されるまで振とうする。この懸濁液をセライトの薄いパッドを通し、
メタノールで完全に洗浄し、次いで溶媒を蒸発させる。この生成物は、精製せず
に直接使用される。実施例17 ベンジル‐ビス‐[(2‐ピリジル)‐2‐エチル]‐アミノアセタート
25mLのDMF中に分散させたK2CO3(15mmoL)懸濁液に、2,2
'-ビス(2‐ピリジルエチル)‐アミン(10mmoL)とそれに次いでブロモ
酢酸ベンジル(12mmoL)を加えた。この懸濁液を室温で4時間撹拌した。
次いで水を加え、その懸濁液を酢酸エチル(2×100mL)で抽出し、5%N
a2CO3水溶液、水、食塩水で洗い、MgSO4で乾燥し、そして溶媒を除去し
た。生成物はオイルとして定量的な収率で得られた。生成物をNMR法で同定し
た。実施例18 ビス‐(2‐(2‐ピリジル)エチル)‐アミノ酢酸
ベンジル‐ビス‐[(2‐ピリジル)‐2‐エチル]‐アミノアセタート(5
mmoL)をメタノール(50mL)に溶かし、カーボン上に担持した10%パ
ラジウム(100mg触媒/mmoL)を加える。この懸濁液を30psiのH2
下で、出発原料が消費されるまで振とうする。この懸濁液をセライトの薄いパ
ッドを通し、メタノールで完全に洗浄し、次いで溶媒を蒸発させる。この生成物
は、精製せずに直接使用される。実施例19 N‐カルバゾリル‐2‐酢酸
標題化合物は、出発複素環状化合物としてカルバゾールを用いて、実施例13
と同様にして合成される。実施例20 N‐ピロリル‐2‐酢酸
標題化合物は、出発複素環状化合物としてピロールを用いて、実施例13と同
様にして合成される。実施例21 N‐トリフルオロアセチル‐グリシン‐トリエチルアンモニウム塩
100mLのメタノールに分散したグリシン(1.50g、20mmoL)の
懸濁液にトリエチルアミン(3.5mL、2.5g、25mmoL)とトリフル
オロ酢酸エチル(3.0mL、3.55g、25mmoL)を添加した。この混
合物を一晩撹拌し、均質の溶液を得た。溶媒を除去し、得られたオイルをトルエ
ンと共蒸発して痕跡量のメタノールを除去した。この生成物は精製しないで使用
された。実施例22 2‐O‐(ジメトキシトリチル)エタノール
エチレングリコール(2.45mL、44mmoL)の乾燥ピリジン(25m
L)溶液を氷浴中で0℃に冷却した。過剰のトリエチルアミン(7mL)と4‐
ジメチルアミノピリジン触媒(120mg、1mmoL)を加え、次いでジメト
キシトリチルクロリド(7.42g、21.9mmoL)を30分かけてゆっく
り添加した。この混合物を、0℃で1時間、次いで室温で1時間撹拌した。得ら
れた溶液の反応をメタノールで中止し、減圧下で乾固まで蒸発処理した。残留物
を飽和NaHCO3水溶液に溶かし、そして酢酸エチルで抽出した。このEtO
Ac抽出物を冷飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と食塩水で洗った。有機相を分離
し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、ろ過して、次いで減圧下で蒸発処理した。得ら
れた残留物を、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで、酢酸エチル‐ヘキサ
ン(勾配10から20%)を用い、シリカゲル上で精製した。標題化合物を単離
し収量は、5.53g(70%)であった。1H‐NMR:(CDCl3)δ7.
50‐7.20、6.90‐6.80(m、13H、ArH)、3.80(s、
6H、OCH3)、3.75(t、2H、CH2OH)、3.25(t,
2H、DMTOCH2)。実施例23 2‐ジメトキシトリチルエタノール・ヘミスクシナート・トリエチルアンモニウ ム塩
2‐O‐(ジメトキシトリチル)エタノール(1.0g、2.77mmoL)
、トリエチルアミン(0.4mL、3mmoL)および4‐ジメチルアミノピリ
ジン触媒(120mg、1mmoL)の乾燥ジクロロエタン溶液をコハク酸無水
物(410mg、0.41mmoL)で処理した。この混合物を室温で16時間
撹拌した。この混合物をろ過し、そしてその濾液をシリカゲル・フラッシュ・カ
ラムクロマトグラフィーで、クロロホルム‐メタノール‐トリエチルアミン系を
用いて精製し、標題化合物をトリエチルアンモニウム塩として得た。1H‐NM
R:(CDCl3)δ7.50‐7.20、6.90‐6.80(m、13H、
ArH)、4.26(t、2H、CH2OCO)、3.80、(s、6H、OC
H3)、3.25(t、2H、DMTOCH2)、3.05(q、6H、N(CH2
CH3)3)、2.70(m、4H、OOCCH2CH2COO),1.25(t
、9H、N(CH2CH3)3)。実施例24 2‐O‐(ジメトキシトリチル)エトキシホスホン酸
乾燥アセトニトリル(100mL)に溶したイミダゾール(4.29g、63
mmoL)の溶液に、0℃で、PCl3(1.77mL、20.3mmoL)を
30分かけて滴下し、処理した。得られた溶液を、さらにトリエチルアミン(9
.06mL、65mmoL)で処理した。この粘ちょうなスラリーに、無水のア
セトニトリルに溶かした2‐O‐(ジメトキシトリチル)エタノール(2.10
g、5.81mmoL)を30分かけてゆっくり添加した。この混合物を室温に
なるまで放置し、15分間撹拌した。この混合物の反応を1MのTEABで中止
させ、そしてこの混合物を減圧下で、最小容積まで蒸発処理し、そしてジクロロ
メタン(2×150mL)で抽出した。このジクロロメタン抽出物をTEAB溶
液で洗い、減圧下で蒸発処理した。この残留物をフラッシュ・カラムクロマトグ
ラフィーで、ジクロロメタン/1%トリエチルアミン中、0%から5%のメ
タノール勾配を用いて精製して1.3gの精製物(43%)を得た。1H‐NM
R:(CDCl3)δ7.50‐7.20、6.90‐6.80(m、13H、
ArH)、6.96(d、1H、JPH=624Hz,PH)、4.06(m、2
H、CH2OP)、3.80(s、6H、OCH3)、3.25(t、2H、DM
TOCH2)、3.05(q、6H、N(CH2CH3)3)、1.25(t、9H
、N(CH2CH3)3))。31P‐NMR:(CDCl3);5.89。実施例25 2‐O‐(ジメトキシトリチル)エチルスクシナート・ハーフエステルの合成
2‐O‐(ジメトキシトリチル)エタノール(1.0g、2.77mmoL)
、トリエチルアミン(0.4mL、3mmoL)および4‐ジメチルアミノピリ
ジン触媒(120mg、1mmoL)の乾燥ジクロロエタン溶液をコハク酸無水
物(410mg、0.41mmoL)で処理した。この混合物を室温で16時間
撹拌した。この混合物をろ過し、そしてその濾液をシリカゲル・フラッシュ・カ
ラムクロマトグラフィーで、クロロホルム‐メタノール‐トリエチルアミン系を
用いて精製し、標題化合物をトリエチルアンモニウム塩として得た。1H‐NM
R:(CDCl3)δ7.50‐7.20、6.90‐6.80(m、13H、
ArH)、4.26(t、2H、CH2OCO)、3.80、(s、6H、OC
H3)、3.25(t、2H、DMTOCH2)、3.05(q、6H、N(CH2
CH3)3)、2.70(m、4H、OOCCH2CH2COO),1.25(t
、9H、N(CH2CH3)3)。実施例26 2‐O‐(ジメトキシトリチル)エチルスクシナート・ハーフエステルによるL CAA CPGの誘導化
2‐O‐(ジメトキシトリチル)エチルスクシナート・ハーフエステル・トリ
エチルアンモニウム塩(135mg)をジクロロメタン(5mL)に溶解した。
4‐ジメチルアミノピリジン触媒(40mg、0.2mmoL)を、次いでトル
エンジイソシアナート(0.029mL、0.2mmoL)を添加した。この混
合物を、18分間振とうした。長鎖アルキルアミン調整多孔性ガラス(LCAA
CPG)(1.0g)を加え、そして、この混合物を、光を排除して16時間振
とうした。この混合物をろ過し、ジクロロメタンで、次いでジエチルエーテル(
各々、3×10mL)で洗った。このCPGをピリジン/水(4:1)中で16
時間振とうし、そしてピリジン(5×5mL)で洗滌した。この乾燥CPGの1
0mgの試料を、トリクロロ酢酸の3%ジクロロメタン溶液で処理した。トリチ
ルイオンの存在により、誘導化されていることを定性的に確かめた。ジメトキシ
トリチルカチオンの吸光度の測定で求めた、負荷量(loading)は、30
μmoL/gであった。実施例27 10‐O‐(ジメトキシトリチル)‐1‐デカノールの合成
過剰のトリエチルアミンを含む乾燥ピリジンに溶かしたデカン‐1,10‐ジ
オールの溶液を、1当量のジメトキシトリチルクロリドで、6時間処理する。得
られた溶液を減圧下で乾燥するまで蒸発処理し、その残留物を塩化メチレンに再
溶解し、その溶液を冷飽和炭酸水素ナトリウム溶液、水および食塩水で洗う。有
機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、ろ過し、再び減圧下で蒸発処理する
。得られる残留物を、シリカゲル上、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで
、酢酸エチル‐ヘキサンを用いて単離し精製された生成物を得る。H‐NMRに
より特性化し、DMT基(多重項、8.0‐7.0ppm)、デカン基(多重項
、1.2‐4.0ppm)およびアルコール(可変)に対応するシグナルが得ら
れる。実施例28 10‐O‐(ジメトキシトリチル)デシルオキシ‐ホスホン酸の合成
3当量のイミダゾールの乾燥アセトニトリル溶液に、1当量のPCl3を30
分かけて滴下し処理する。反応を完結させるために、この溶液を過剰のトリエチ
ルアミンでさらに処理する。1時間後に、この混合物を1当量の10‐O‐(ジ
メトキシトリチル)デカン‐1,10‐ジオールを含む乾燥アセトニトリル溶液
で処理し、そしてその混合物を室温でさらに1時間撹拌する。この混合物を過剰
の炭酸水素トリエチルアンモニウムの溶液で、pH8で処理すると、標題化合物
が得られる。この炭酸水素塩の溶液を酢酸エチルで繰返し抽出して、この化
合物を精製した。これら抽出液を集めて、炭酸水素ナトリウム上で乾燥し、次い
で溶媒を減圧下で蒸発すると化合物が得られ、この化合物はさらに精製すること
なしに用いられる。31P‐NMR(二重項、6ppm、JP‐H=600Hz)
および1H‐NMRによる特性化により、DMTと10‐O‐(ジメトキシトリ
チル)デカンジオールのデカン基にに対応するシグナルおよびトリエチルアンモ
ニウム基(二重項、三重項、3.2‐2.2ppm)が認められる。実施例29 10‐O‐(ジメトキシトリチル)デシルスクシナート・ハーフエステルの合成
10‐O‐(ジメトキシトリチル)デカン‐1,10‐ジオールの乾燥ジクロロ
メタン溶液を、1当量のコハク酸無水物、過剰のトリエチルアミンおよび5モル
%の4‐ジメチルアミノピリジン触媒で処理する。この混合物を無水条件下で、
一晩撹拌し、次いで、さらにジクロロメタンで稀釈する。この溶液を冷飽和炭酸
水素ナトリウム溶液、水および食塩水で洗う。。次いでこの溶液を硫酸マグネシ
ウム上で乾燥し、そして減圧下で乾固まで蒸発処理する。得られる固体をシリカ
ゲル・フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで、酢酸エチル‐メタノール‐ト
リエチルアミン系を用いて精製すると、標題化合物がトリエチルアンモニウム塩
として得られる。この物質を湿潤メタノールと繰返し共蒸発処理すると遊離の酸
が得られる。1H‐NMRによる特性化により、10‐O‐(ジメトキシトリチ
ル)デカン‐1,10‐ジオールのDMTおよびデシレン基に対応するシグナル
およびコハク酸基に対応するシグナル(二つの近接した二重項から成る二重項、
2.5‐3.0ppm)を得た。実施例30 10‐O‐(ジメトキシトリチル)デシルスクシナート・ハーフエステルによる LCAA CPGの誘導化
長鎖アルキルアミンで誘導化された調整多孔性ガラス(LCAA CPG)の
市販試料を乾燥アセトニトリル中に懸濁させる。別の乾燥した容器中で、10‐
O‐(ジメトキシトリチル)デシルスクシナート・ハーフエステルを二当量のペ
ンタフルオロフェノール、過剰のトリエチルアミンおよび二当量のジシクロヘキ
シルカルボジイミドで処理する。活性化10‐O‐(ジメトキシトリチル)デシ
ルスクシナート・ハーフエステルを含むこの混合物をアルゴン雰囲気下で1時間
撹拌し、次いで無水の条件を維持しながらCPGの懸濁液に添入する。次いで、
この混合物をゆっくり6時間振とうし、その上澄み液を分離し、そしてこの工程
をさらに二度繰返す。各処理に用いられる10‐O‐(ジメトキシトリチル)デ
シルスクシナート・ハーフエステルの量は、LCAA CPGのグラム当たり利
用できるアミノ基の濃度を基にして、一般に25‐40mmoL/gであること
が知られている。次いで、このCPGをピリジンに溶した無水酢酸の稀薄溶液で
1時間処理し、全ての未反応のアミン官能基を保護(cap)し、次いでアセト
ニトリルで数回洗滌する。このCPGが誘導化された程度は、得られたCPGの
正確に秤量した試料を、アセトニトリル中2%のジクロロ酢酸で処理し、そして
少量のその上澄み液の498nmでの吸光度を測定することにより求められる。実施例31 2‐FMOC‐2‐アミノ‐1,3‐プロパンジオール
2‐アミノ‐1,3‐プロパンジオール(3.48g、38.2mmoL)およ
びNaHCO3(8.00g、95.2mmoL)を150mLのH2O/ジオキ
サン(1:1)中に懸濁させる。25mLのトルエンに溶したフルオレニルメチ
ルクロロホーメート(11.4g、44.0mmoL)を滴下して加える。この
添加の間、反応温度が25℃以下に維持する。この混合物を一晩激しく撹拌し、
次いで50mLの飽和NaHCO3溶液と50mLの水で反応を停止させる。こ
の溶液を100mLのジエチルエーテルで抽出する。水層を濃塩酸でpH1まで
酸性にし、酢酸エチルで2回抽出し、この有機抽出物をを食塩水で洗う。この溶
液をMgSO4で乾燥し、ろ過し、そして溶媒を減圧下で除去する。この粗生成
物をフラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が得られ
る。実施例32 1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノプロパン‐3‐オール
N‐FMOC‐2‐アミノ‐1,3‐プロパンジオール(13.79g、44m
moL)の乾燥ピリジン溶液を氷浴中で0℃に冷却する。過剰のトリエチルアミ
ン(7mL)と4‐ジメチルアミノピリジン触媒(120mg、1mmoL)を
加え、次いでジメトキシトリチルクロリド(14.8g、44mmoL)を30
分かけてゆっくり添加する。この混合物を、0℃で、反応が完結するまで撹拌す
る。得られた溶液の反応をメタノールで中止し、減圧下で乾固まで蒸発処理する
。残留物を飽和NaHCO3水溶液に溶かし、そしてEtOAcで抽出する。こ
のEtOAc抽出物を冷飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と食塩水で洗う。有機相
を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、ろ過して、次いで減圧下で蒸発処理する
。得られる残留物を、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで、シリカゲル上
で精製すると標題化合物が得られる。実施例33 1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノプロパン‐3‐O‐ホ スホン酸
イミダゾール(4.29g、63mmoL)の乾燥アセトニトリル(300m
L)溶液に、0℃で、PCl3(1.77mL、20.3mmoL)を30分か
けて滴下し、処理する。得られる溶液をトリエチルアミン(9.06mL、65
mmoL)でさらに処理する。この粘ちょうなスラリーに、無水のアセトニトリ
ル(150mmoL)に溶した1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2
‐アミノプロパン‐3‐オール(3.58g、5.81mmoL)を、30分か
けてゆっくり添加する。この混合物が室温になるまで放置し、15分間撹拌する
。この混合物の反応をピリジン/水9:1(100mL)で中止させ、そしてこ
の混合物を減圧下で、最小容積まで蒸発処理し、そしてジクロロメタン(2×1
50mL)で抽出する。このジクロロメタン抽出物を水で洗い、減圧下で蒸発処
理する。残留物をシリカゲル・カラムクロマトグラフィーで、ジクロロメタン/
MeOH/ピリジンを用いて精製すると、標題の化合物が得られる。実施例34 1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノプロパン‐3‐O‐ス クシナート
1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノプロパン‐3‐オ‐
ルを、実施例60の一般的方法によりコハク酸無水物で処理すると標題お化合物
が得られる。実施例35 1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノプロパン‐3‐O‐ス クシナートによるLCAA CPGの誘導化
1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノプロパン‐3‐O‐
スクシナートエステルを、実施例61の一般的方法によりLCAA CPGに結
合させると。その誘導化樹脂が得られる。実施例36 1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐アミノプロパン‐3‐オール・スクシナート 誘導化樹脂
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐アミノプロパン‐3‐オール・スクシナー
ト誘導化CPGの2‐アミノ基のFMOC保護基は、ジメチルホルムアミド(D
MF)中でピリジンで処理することにより除去される。CPGに結合した1‐O
‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノ‐1,3‐プロパンジオール
は、DMF中で2当量のピペリジンで処理される。次いで、このCPGは、アセ
トニトリル/ピリジン(1:1)で洗滌され、第2回目は、DMF中で2当量の
ピペリジンで処理される。最後にこのCPGは、アセトニトリル‐ピリジンで、
次いででアセトニトリルで洗うと脱保護された材料が得られる。実施例37 1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐(アセチルチミン)アミノ‐1,3‐プ ロパンジオール・スクシナート誘導化樹脂
方法A
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐アミノプロパン‐3‐オール・スクシナー
ト誘導化樹脂(2.0g、負荷:1.0mmoL/g、1%架橋)をジクロロメ
タン中(200mL)で膨潤させ、次いでこれに、チミン‐2‐酢酸(2.0g
、10mmoL)、[O‐(7‐アザベンゾトリアゾール‐1‐イル)‐1,1
,3‐テトラメチルウロニウム・ヘキサフルオロホスフェート(3.8g、10
mmoL)およびトリエチルアミン(2.0g、20mmoL)を加えた。30
〜60分後、この樹脂をジクロロメタン(50mL)で5回、次いでジエチルエ
ーテル(100mL)で3回洗い、そして窒素気流下で乾燥する。この自由に流
動
する樹脂粉末は、そのまま使用される。
方法B
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐アミノ‐1,3‐プロパンジオール・スク
シナート誘導化樹脂(2.0g、負荷:1.0mmoL/g、1%架橋)をジク
ロロメタン中で膨潤させ、次いでこれに、HOBt(0.1M)、PyBOP(
0.1M)、N‐メチルモルホリン(0.15M)、をDMF溶液として加え、
次いでチミン‐2‐酢酸(2.0g、10mmoL)を加える。2‐3時間若し
くは一晩放置して、カップリングを進行させる。この樹脂をジクロロメタン(5
0mL)で5回、次いでジエチルエーテル(100mL)で3回洗い、そして窒
素気流下で乾燥する。この自由に流動する樹脂粉末は、そのまま使用される。実施例38 n主鎖セグメントの逐次付加と官能基化
実施例37の誘導化樹脂のジメトキシトリチル保護基は、トリクロロ酢酸のジ
クロロメタン溶液(3%w/v)で処理することにより除去される。この溶液を
、そのDMTカチオンの色が完全に無くなるまで、固体支持体の上を通す。この
固体支持体を、酸の痕跡が残らなくなるまでジクロロメタンで洗う。次いで、こ
の樹脂をアセトニトリル‐ピリジン(4:1)で洗い、次いで、アセトニトリル
‐ピリジン(1:1)中で、10当量の1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FM
OC‐2‐アミノ‐3‐O‐ホスホン酸と30当量のアダマンタンカルボニルク
ロリドで同時処理する。この混合物を合成容器中で、これらの試薬を循環させる
ことにより、2分間かき混ぜる。次いで、このCPGをアセトニトリル‐ピリジ
ンで簡単に洗い、次いで。全ての未反応のヒドロキシル基を塞ぐ(cap)ため
にジイソプロピルホシファイトアダマンタンカルボニルクロリドで処理する。こ
のCPGをアセトニトリル‐ピリジンで、次いでアセトニトリルで洗う。得られ
るホスホン酸ジエステルを、四塩化炭素/ピリジン(1:1)に溶した、大モル
過剰の10%ジエチルアミン(そのアミン文字)と反応させる。この固体支持体
を15分間振とうし、上澄み液をろ過して除く。この固体支持体をピリジンで洗
う。四塩化炭素/ピリジン中でのジエチルアミンでの第2処理に続いて、ホスホ
ルアミデートに効率良く酸化されるように振とうする。FMOC‐保護基は、実
施例
62の一般法で除去される。得られるフリーのアミノ基は、実施例37の方法で
、チミン‐2‐酢酸で処理される。この方法を二回繰返すと、その文字に対応す
るチミンアセチル基と主鎖セグメント中の炭素に付いているアミノ基に共有結合
しているテーサー(tether)を有する二量体が得られる。ホスホルアミデ
ートの窒素に結合している官能基はエチル基である。この方法をn回繰返すと、
主鎖セグメントの長さが、n+1の十分官能基化されたオリゴマーが得られるで
あろう。
希望の長さとコンフィギュレーションのオリゴマー配列の最後の付加が完了し
たら、その固体支持体をピリジン‐アセトニトリルで洗い、そして、濃アンモニ
ア水で、室温で3時間処理することにより、そのホスホルアミデートを樹脂から
切離す。上澄み液を蒸発処理し、そのホスホルアミデートを、RP‐18HPL
Cカラムで精製すると目的のオリゴマーが得られる。実施例39 N‐FMOC‐アスパラギン酸‐β‐ベンジルエステル
アスパラギン酸‐β‐ベンジルエステル(150mL)とジイソプロピルエチ
ルアミン(66.3mL、49.1g,380mmoL)を150mLH2 O/
300mLジオキサン中に懸濁させる。100mLのジオキサンに溶かしたフル
オレニルメチル・クロロホーメート(43.25g、1.1当量)を滴下して加
える。この添加の間、反応温度が25℃以上に上がらないようにする。この混合
物を一晩激しく撹拌し、そして溶媒の大半を減圧下で除去する。水と飽和NaH
CO3溶液(各250mL)を加え、そしてこの溶液を250mLのジエチルエ
ーテルで抽出し、その液は捨てる。水層を濃塩酸でpH1まで酸性にし、酢酸エ
チルで2回抽出し、この有機抽出物をを食塩水で洗う。この溶液をMgSO4で
乾燥し、ろ過しそして溶媒を減圧下で除去すると標題の化合物を得られる。実施例40 4‐ヒドロキシ‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン酸
2‐N‐FMOC‐アスパラギン酸‐β‐ベンジルエステル(10mmoL)
を乾燥THF(100mL)に溶かし、0℃に冷却し、そして水素化ホウ素リチ
ウム(15mmoL)を加える。この溶液を0℃で、次いで室温で、出発原料が
完全に無くなるまで撹拌する。次いで、過剰の酢酸エチルを加え、そしてこの溶
液を0.1Mクエン酸溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥した。この
粗生成物をフラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が
得られる。実施例41 4‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン酸
4‐ヒドロキシ‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン酸(30mmoL)を乾燥
ピリジン(2×50mL)と共蒸発処理し、200mLの乾燥ピリジンに再溶解
し、氷浴中で冷却した。ジメトキシトリチルクロリド(22.0g、65mmo
L)を少量ずつ30分かけて添加し、そしてその溶液を、一晩室温で撹拌した。
次いで、水(10mL)を加え、そしてこの溶液を、トリチルエステルが完全に
加水分解されるまで撹拌する。溶媒を減圧下で除去する。この残存物をCH2C
l2(300mL)に溶解し、150mLの0.1Mクエン酸溶液、150mL
の飽和NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥し、次いで、蒸
発処理する。残留物をフラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製する。実施例42 4‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン‐1‐オール
500mLのTHFに溶かした4‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMO
C‐アミノブタン酸(140mmoL)溶液に、撹拌しながら、ボラン・メチル
スルフィド(290mmoL、21.8g、27.3mL)を室温で、滴下して
加える。反応が完了するまで撹拌を続ける。メタノールを注意しながら加え(激
しくH2発生)、そして、得られる溶液さらに15分撹拌する。溶媒を減圧下で
蒸発し、残留ガム状物をメタノール(2×300mL)で共蒸発処理する。この
生成物は、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製される。実施例43 1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン‐4‐O‐ホス ホン酸
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン‐1‐オール
を実施例59の一般法で処理すると標題の化合物が得られる。
実施例444‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐2‐アミノブタン‐4‐O‐ スクシナート
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐2‐アミノブタン‐1‐オ
ールを実施例60の一般法で処理すると標題の化合物が得られる。実施例45 1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐2‐アミノブタン‐4‐O‐ スクシナートによるLCAA CPGの誘導化
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐2‐アミノブタン‐4‐O
‐スクシナートを実施例61の一般法で処理するとこの誘導化樹脂が得られる。実施例46 1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐アミノブタン‐4‐O‐スクシナート誘導化 樹脂
実施例45の誘導化樹脂を、FMOC保護基を除去するために、実施例62の
一般法で処理すると、樹脂に付いた標題化合物が得られる。実施例47 1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐(N‐2‐アセチルチミン)‐アミノブタン ‐4‐O‐スクシナート誘導化樹脂
実施例46の誘導化樹脂を、実施例37の方法でチミン‐2‐酢酸で処理する
と、樹脂に付いた標題化合物が得られる。実施例48 2‐アミノ‐1,4‐ブタンジオール主鎖セグメントを有する3量体の合成
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐(N‐2‐アセチルチミン)‐アミノブタン
誘導化樹脂を実施例38および実施例126の方法で、1‐O‐ジメトキシトリ
チル‐2‐N‐FMOC‐アミノ‐4‐ホスホン酸‐1,4‐ブタンジオール、
モルホリンおよびN‐1‐チミン酢酸で処理すると、そのアミノ基に結合した2
‐N‐アセチルチミンとホスホルアミデート置換基としてのモルホリン基を有す
る3量体が得られる。実施例49 2‐(N‐FMOC)‐グルタミン酸‐γ‐メチルエステル
グルタミン酸‐γ‐メチルエステル(150mmoL)とジイソプロピルエチ
ルアミン(66.3mL、49.1g,380mmoL)を150mLH2O+
300mLジオキサン中に懸濁させる。100mLのジオキサンに溶かしたフル
オレニルメチル・クロロホーメート(43.25g、1.1当量)を滴下して加
える。この添加の間、反応温度が10℃以上に上がらないようにする。この混合
物を一晩激しく撹拌し、そして溶媒の大半を減圧下で除去する。水と飽和炭酸水
素塩の溶液(各250mL)を加え、そして、この溶液を250mLのジエチル
エーテルで抽出し、その液は捨てる。水層を濃塩酸でpH1まで酸性にし、酢酸
エチルで2回(2×300mL)抽出し、この有機抽出物をを食塩水で洗う。こ
の溶液をMgSO4で乾燥し、ろ過し、そして溶媒を減圧下で除去すると、標題
の化合物が得られる。実施例50 5‐ヒドロキシ‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン酸メチルエステル
500mLのTHFに溶かした2‐(N‐FMOC)‐グルタミン酸‐γ‐メ
チルエステル(140mmoL)溶液に、ボラン・メチルスルフィド(290m
moL、21.8g、27.3mL)を室温で、滴下して加える(三つ口フラス
コ、機械撹拌機、凝縮器、滴下ロート)。H2の発生が止んだ後、その溶液を、
激しく撹拌しながら、還流するまで加熱する。1時間後、白色の沈殿が生成する
。メタノールを注意しながら加え(激しくH2発生)、そして、得られる溶液を
さらに15分撹拌する。この溶液を室温まで冷却し、溶媒を減圧下で蒸発し、残
留ガム状物をメタノール(2×300mL)で共蒸発処理する。この生成物は、
フラッシュ・クロマトグラフィーで精製される。実施例51 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐FMOC‐アミノペンタン酸メチルエステル
5‐ヒドロキシ‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン酸メチルエステル(30m
moL)を乾燥ピリジン(2×50mL)と共蒸発処理し、200mLの乾燥ピ
リジンに再溶解し、そして氷浴中で冷却する。ジメトキシトリチルクロリド(1
1.0g、32.5mmoL)を少量ずつ30分かけて添加し、そしてその溶液
を、0℃で1晩撹拌する。次いで、メタノール(10mL)を加え、溶媒を減圧
下で除去する。得られたガム状物をトルエン(100mL)に再溶解し、ろ過し
てピリジン塩酸塩を除去し、そして再び乾固させた。この残留物をCH2Cl2(
300mL)に溶解し、150mLの0.1Mクエン酸溶液、150mLの飽和
NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理
した。この残留物を、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製すると、標
題化合物が得られる。実施例52 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐FMOC‐アミノペンタン‐1‐オール
5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐FMOC‐アミノペンタン酸メチルエステ
ル(10mmoL)を乾燥THF(100mL)に溶かし、0℃に冷却し、そし
て水素化ホウ素リチウム(10mmoL)を加える。この溶液を0℃で、次いで
室温で、出発原料が完全に無くなるまで撹拌した。次いで過剰の酢酸エチルを加
え、そしてこの溶液を0.1Mクエン酸溶液、飽和NaHCO3溶液、食塩水で
洗い、そして、MgSO4で乾燥する。この生成物はフラッシュ・クロマトグラ
フィーで精製される。実施例53 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン‐1‐オール 水素ホスホン酸エステル
イミダゾール(6.81g、100mmoL)を400mLの乾燥アセトニト
リルに溶かし、0℃に冷却する。三塩化リン(2.62mL、4.12g,30
mmoL)を、次いでトリエチルアミン(21mL、15.2g、150mmo
L)を滴下して加える。粘ちょうになったスラリーに、50mLのCH3CNに
溶した、5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐FMOC‐2‐アミノ‐1,5
‐ペンタンジオール(10mmoL)の溶液を15分かけて加える。添加が終わ
ってから、氷浴を外し、その溶液を室温で30分撹拌する。100mLのピリジ
ン/水(9:1)を加えて反応を停止させる。溶媒を除去し、残留物をCH2C
l2(3×200mL)で抽出し、そして水で洗う。有機相をMgSO4で
乾燥し、減圧下で濃縮する。この生成物はフラッシュ・クロマトグラフィーで、
ジクロロメタン+1%ピリジン中、メタノールの勾配(1‐10%)を用いてさ
らに精製される。実施例54 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン‐1‐O‐コ ハク酸ハーフエステル
5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン‐1‐オー
ルを実施例60の一般法で処理すると標題の化合物が得られる。実施例55 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン‐1‐O‐コ ハク酸ハーフエステルによるLCAA CPGの誘導化
5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐FMOC‐アミノペンタン‐1‐O‐
コハク酸ハーフエステルを実施例61の一般法で処理するとこの誘導化樹脂が得
られる。実施例56 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐アミノペンタン‐1‐O‐コハク酸誘導化樹 脂
実施例55の誘導化樹脂を、FMOC保護基を除去するために、実施例62の
一般法で処理すると、樹脂に付いた標題化合物が得られる。実施例57 5‐O‐ジメトキシトリチル‐4‐N‐フェニルアセチル‐アミノペンタン‐1 ‐O‐コハク酸誘導化樹脂
実施例56の誘導化樹脂を、実施例38の方法でフェニル酢酸で処理すると、
樹脂に付いた標題化合物が得られる。実施例58 2‐アミノ‐1,5‐ペンタンジオール主鎖セグメントを有する3量体の合成
1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐(フェニルアセチル)‐アミノ‐5‐ホスホ
ン酸‐1,5‐ペンタンジオール誘導化樹脂を、実施例38および実施例126
の方法で、1‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐アミノ‐5‐ホス
ホン酸‐1,5‐ペンタンジオール、モルホリンおよびフェニル酢酸で処理する
と、そのアミノ基に結合したフェニルアセチル基とホスホルアミデート置換基と
してのモルホリン基を有する3量体が得られる。実施例59 アミノジオールモノマーサブユニットをH‐ホスホン酸モノエステルに変える一 般法
. N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチルピロリジン‐3‐ O‐水素ホスホン酸トリエチルアンモニウム塩
イミダゾール(6.81g、100mmoL)を400mLの乾燥アセトニト
リルに溶かし、0℃に冷却した。三塩化リン(2.62mL、4.12g,30
mmoL)を、次いでトリエチルアミン(21mL、15.2g、150mmo
L)を滴下して加えた。粘ちょうになったスラリーに、50mLのCH3CNに
溶解した、N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐3‐ヒドロキ
シピロリジン(10mmoL)の溶液を15分かけて加えた。添加が終わってか
ら、氷浴を外し、その溶液を室温で30分間撹拌した。100mLのピリジンと
10mLの水を加えて反応を停止させた。溶媒を除去し、そして、残留物を10
0mLのピリジンで、次いで100mLのトルエンで共蒸発処理した。その残留
物を、0.05MのTEABに溶かし、CH2Cl2(3×200mL)で抽出し
、そして、その抽出液を0.05MのTEABで洗った。この有機相をMgSO4
で乾燥し、そして減圧下で濃縮した。この生成物をさらに、フラッシュ・クロ
マトグラフィーで、CH2Cl2+0.5%TEA中、メタノールの勾配(1‐1
0%)を用いて精製した。実施例60 アミノジオールモノマーサブユニットをコハク酸誘導体に変える一般法 N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチルピロリジン‐3‐O‐スク シナート
N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチルピロリジン(2.0mm
oL)、コハク酸無水物(300mg、3.0mmoL)、DMAP(1.0m
moL、120mg)およびトリエチルアミン(0.4mL、3.0mmoL)
を乾燥ジクロロエタンに溶かし、一晩撹拌する。この溶液をジクロロメタンで抽
出し、0.1Mクエン酸、水、食塩水で洗い、乾燥し、そして蒸発処理する。こ
の残留物をシリカの短いパッドを通してろ過し、そして直接使用する。実施例61 N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチルピロリジン‐調整多孔性ガ ラス(N‐FMOC‐5‐DMT‐hp‐CPG)
N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチルピロリジン‐3‐O‐ス
クシナートを乾燥ジクロロメタン(50mL)に溶解し、DMAP(250mg
、2mmoL)を、次いでトルエンジイソシアナート(288mL、2.0mm
oL)を添加する。この混合物を、10分間かき混ぜ、次いで10gのLCAA
‐CPG)(1.0g)を加え、続いてDIEA(2mmoL、0.34mL)
を加える。この懸濁液を暗所に置き、周期的に。6‐16時間振とうする。この
固体をろ過し、ジクロロメタンとエーテルで洗い、次いで80mLピリジン+2
0mL水の中に懸濁させる。1時間後、この支持体をろ過し、乾燥ピリジン(5
X)、ジクロロメタン(3X)で洗滌し、そして60mLのジクロロメタン中に
懸濁させ、その懸濁液10mLのTEA、10mLの無水酢酸、3mLのN‐メ
チルイミダゾールを加える。1時間後、この支持体をろ過し、ジクロロメタンと
エーテルで十分洗い、乾燥する。CPGの一部を秤量し、0.1Mトルエンスル
ホン酸に溶かし、498nmでの吸光度を測定することにより、このCPGのロ
ーディング(負荷量)分析される。実施例62 主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位保護基の脱保護の一般法、
FMOC保護アミンを有するこの固体支持体(1‐μmoL)を、DMFに溶
したピペリジンの10%溶液(v/v)で15秒洗滌し、そしてピペリジン溶液
中に15分間懸濁させる。溶媒を除き、そして新しいピペリジン/DMFを加え
さらに15分間懸濁させる。次いで、この固体支持体をDMFで数回洗って痕跡
量のピペリジンを完全に除く。
この方法を用いて、実施例61のN‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキ
シメチルピロリジンを結合した固体支持体のFMOC保護主鎖セグメント・アミ
ノコンビナトリアル部位は、脱保護される。実施例63 主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位へのカルボン酸のカップリングの 一般法
脱保護主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位を、カルボン酸(0.4
mmoL/mL)およびジイソプロピルエチルアミン(0.8mmoL/mL)
のDMF溶液、およびBOP試薬またはHATU(0.4mmoL/mL)のD
MF溶液で同時に処理する。10μmoL添加水準で、10倍過剰量の試薬が加
えられる。30分間放置して反応を進行させ、そしてさらに、10当量のカルボ
ン酸とBOPが添加される。30分後、この固体支持体は、全ての試薬が除去さ
れるまでDMFで洗滌される。実施例64 DMT保護基の除去の一般法
ジメトキシトリチル保護基を有するアミノジオールモノマーサブユニットは、
トリクロロ酢酸のジクロロメタン溶液(3%、w/v)を用いて脱保護される。
この溶液は、そのDMTカチオンの色が完全に無くなるまで、固体支持体の上を
通される。この固体支持体は、酸の痕跡が残らなくなるまでジクロロメタンで洗
滌される。実施例65 主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位へのスルホニルクロリドのカップ リングの一般法
FMOC保護主鎖セグメントのピペリジン処理により得られる固体支持体上のフ
リーアミンに、スルホニルクロリド(0.1mmoL/mL)およびジイソプロ
ピルエチルアミン(0.25mmoL/mL)のピリジン/CH3CN溶液を同
時に加える。10μmoLスケール水準で、10倍過剰量の試薬が加えられる。
30分間放置して反応を進行させ、そして、この固体支持体は、全ての試薬が除
去されるまでピリジン/CH3CNで洗滌された。実施例66 主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位へのアシル基のカップリングの一 般法
固体支持体上のフリーアミンに、活性化アシル化剤(0.1mmoL/mL)
およびジイソプロピルエチルアミン(0.25mmoL/mL)のピリジン/C
H3CN溶液を同時に加える。10μmoLスケール水準で、10倍過剰量の試
薬が加えられる。30分間放置して反応を進行させ、そして、この固体支持体は
、全ての試薬が除去されるまでピリジン/CH3CNで洗滌される。フリーアミ
ンコンビナトリアル部位のアシル化に有用な基に含まれるのは、酸ハライド、酸
フルオリド、酸イミダゾリド、酸無水物、スルホニルクロリド、クロロホルメー
ト、イソシアナート、イソチオシアナートである。実施例67 ホスホルアミデートライブラリ合成の一般法
以下に説明する一般法は、ホスホルアミデートライブラリの調製のための方法
の概略を示している。全ての操作は、通常に調整された多孔性ガラス(CPG)
またはテンタゲル(TG)(Tentagel)である固体支持体に取付けられ
た、反応試薬を含む反応容器に溶媒および試薬を送達する自動合成装置を用いて
行なうことができる。このような合成装置の設計と固体支持体のローディングの
設計により、若し希望するなら、50pmoLから10mmoLの範囲のスケー
ルで操作することが可能である。操作は、反応容器としてのガラスフリット(f
rit)の付いたシリンジを用い、そのシリンジに適切な溶液を吸入することに
より、手動でも行なうことができる。説明される反応は、その固体支持体に付い
ている単一の化合物、若しくはビーズ分割/混合法で調製した複合混合物で行わ
れる。簡単に言えば、これらの方法は、固体支持体の別々の分割部分の同じ数の
唯一つの試薬を、付加することを含んでいる。その個々の反応が完了すると、そ
の固体支持体の分割部分を合せて、適当な溶媒の中でスラリーにして完全に混合
し、そして次の工程では異なる試薬の数により要求される分割部分の数に再び分
割される。この方法で、化合物の混合物に唯一つの試薬を付加させて、異なる試
薬の全ての可能な組合せが創られる。
文字を有するホスホルアミデート結合を生成させるH‐ホスホン酸ジエステル テル結合の酸化
方法A:予め決められた配列中への文字の組込み
固体支持体(例えば、LCAA CPG)は、第1モノマーサブユニットまた
は第1級もしくは第2級アミンと共有結合を形成する能力のある末端反応性基を
有する他の基で誘導化される。実施例26は、固体支持体に付いた非‐アミノジ
オールモノマーサブユニットを例示しており、そして実施例45は固体支持体へ
のアミノジオールモノマーサブユニットの結合を例示している。アミノジオール
モノマーサブユニットがその固体支持体に誘導化されると、そのアミノ基は、実
施例62の一般法を用いて脱保護され、そして、実施例36、37、63、およ
び65(実施例122‐130も参照)に例示されているように、場合により用
いられるテーサー(optional tether)を有する文字と結合され
る。次いで、ヒドロキシル保護基は実施例64に例示されているように除去され
、そして、次に希望される、そのヒドロキシル基の一つにホスホン酸モノエステ
ル基を有する、アミノジオールモノマーサブユニットが、実施例48の方法によ
り誘導化固体支持体の末端のフリーのヒドロキシル基に縮合される。得られるホ
スホン酸ジエステルが、四塩化炭素/ピリジン中で、大モル過剰の第1級もしく
は第2級アミンと反応され、それに付いた文字を有するホスホルアミデートが生
成する。このアミン文字は、四塩化炭素/ピリジンの溶液に添加される。この固
体支持体は、ピリジンで洗浄される。四塩化炭素/ピリジン中での大モル過剰の
アミン文字による第2処理は、続いて行われる振とう処理により、ホスホルアミ
デートへの効率的な酸化を保証するであろう。第2の主鎖置換基のアミノ保護基
は、ピペリジン処理を用いて除去され、そして、そのフリーアミノ基は、上のよ
うな文字にカップルされる。このケースでは、この方法により2ユニットの長さ
のオリゴマー化合物が得られる。
追加の官能化モノマーユニットは、次の工程を所望の頻度繰返すことにより付
加される:1)酸素保護基の除去、2)追加のスカフォード(scaffold
)ホスホン酸モノエステルのカップリング、3)希望のアミン文字の存在下で四
塩化炭素によるホスホン酸ジエステルの酸化、4)最終スカフォードモノマーユ
ニットの窒素保護基の除去、5)希望の官能基数を有するアミノ基の官能化。
ホスホルアミデート連結を作るための文字の酸化的組入れは、段階的に、また
は、複数の文字の均一な置換のためには全部一度に行われる。そのオリゴマー構
造中での二つの近接する類似の文字の付加では、この酸化工程は、これら文字を
全て支持するための主鎖が合成され、次いで、この文字を保持するであろうHホ
スホン酸エステル部位が同時に酸化されるまで遅延することがある。
上の工程は、そのオリゴマーの文字の全てが付加されるまで繰返される。この
合成法では、全ての文字は予め決められている。そのオリゴマー化合物の希望の
長さとコンフィギュレーションの最後一つの付加が完了したら、その固体支持体
はピリジン/アセトニトリルで洗滌され、そしてホスホルアミデートは、室温で
3時間、濃アンモニア水で処理することにより樹脂から切離される。上澄み液を
蒸発し、ホスホルアミデートをRP‐18HPLCカラムで精製して、目的のオ
リゴマーが得られる。
方法B:ランダム配列での、ホスホルアミデート文字の組入れ
上の方法Aに説明したオリゴマー合成法を繰返して、希望の長さのオリゴマー
が合成される。そのオリゴマー上でアミン文字のランダム化は、上の方法Aで説
明した文字を付加する方法に従って行われるが、ただ、複数のアミン文字が混合
物として、望ましくは相対的反応性を考慮して規準化された混合物として、四塩
化炭素と適した共溶媒に中に加えられる。アミン文字の混合物からのアミン文字
のランダム分布は、オリゴマーをアミン文字の混合物で予め処理し、反応させ、
そのアミン文字を放すために10%ギ酸水溶液で50‐70℃で処理して精製す
ることにより実験的に確かめられる。個々のアミン文字が組入れられる実際のパ
ーセンテージを、その反応混合物のHPLC分析で求め、個々の相対速度を計算
する。この相対速度が一度求められると、その配列をさらに繰返す場合には、混
合物中のアミン文字の濃度は、これらの速度の差を反映させて調整される。
このランダム化法の一つの変法では、その全ての部位がランダム化されるべき
五量体では、酸化は同時に行われる。五量体の主鎖は、上記のようにして合成さ
れ、そして文字の混合物が付加される。主鎖の合成が完了してから、アミン文字
の酸化は、五つの全ての部位で、単一工程で行われる。
このランダム化のこの方法のさらなる変法では、最初の主鎖セグメントの合成
が完了してから、その樹脂を5つの部分に等分し、各部分を、個々に、アミン文
字の一つで酸化する。この樹脂の個々の分割部分を再び合せ、そしてさらなる主
鎖セグメントが付加され、それにより、そのオリゴマー化合物がさらに一ユニッ
ト延ばされる。次いで、この樹脂を再び等分し、そして個々の部分を一つのアミ
ン文字で、各々酸化する。このサイクルを繰返して、この合成が完成する。
フリーのアミン位置への文字のカップリングで、予め配列が決められている場
合には、方法Aで行われ、ランダム配列では、方法Bで行われる。
方法C:固定/ランダム配列での、アミン文字の組込み
オリゴマー化合物が合成される場合、特定の位置を固定化し、一方他の位置を
ランダム化するために、方法AとBの組合せが用いられる。この方法は、さらに
、SURFTMコンビナトリアル・ストラテジーと組合せて用いられる。
アミン文字の代表的な物の一覧表は以下の通りである:
アリルアミン、
3,3‐ジメチルアミノプロピルアミン、
1‐フェニル‐1,3,8‐トリアザスピロ[4.5]デカン‐4‐オン、
アゼチジン、
ベンジルアミン、
ブチルアミン、
L‐(−)‐2‐アミノカプロラクタム、
ヘプタメチレンイミン、
シクロプロピルアミン、
ジエチルアミン、
ジメトキシエチルアミン、
2,5‐ジメチル‐N‐フェニルピペラジン、
メチルアミノメチル‐1,3‐ジオキソラン、
N‐アセチルエチレンジアミン、
3‐アミノプロピルイミダゾール、
メトキシエチルアミン、
モルホリン、
3‐アミノプロピルモルホリン、
イソニペコタミド、
ピペロニルアミン、
2‐アミノメチルピリジン、
ピペリジン、
ピペリドン・エチレンケタール、
2‐アミノエチル‐1‐メチルピロリジン、
N(2‐ピリジル)ピペラジン、
ピペロニルピペラジン、
3‐イソプロポキシプロピルアミン、
ピペラジン、
チエニルエチルアミン、
3‐トリフルオロメトキシベンジルアミン、
トリプタミン、
テトラヒドロフルフリルアミン。実施例68 1‐アセチルチミン/ベンジルアミンホスホルアミデート・オリゴマーの合成
固体支持体を、実施例26のような2‐O‐(ジメトキシトリチル)エチルス
クシナート・ハーフエステルで誘導化する。そのDMT保護基を、実施例64の
標準法を用いて除去する。4‐O-ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐ア
ミノブタン‐1‐オールを実施例28のようにしてPCl3で処理するとホスホ
ン酸が生成し、それが、実施例38におけるように誘導化樹脂に縮合される。こ
のFMOCアミノ保護基を実施例4のようにして除去し、そして、得られたフリ
ーのアミノ基に(N1‐チミン)‐2‐酢酸(実施例7)を、実施例38の方法
でカップリングさせる。上の実施例64、28、37および38の方法を、上記
ホスホン酸残基の6個が組入れられるまで繰返す。得られる六量体を実施例67
の方法を用いて、四塩化炭素/ピリジン中で、大過剰のベンジルアミンで処理す
る。この固体支持体を15分間振とうし、上澄み液を濾別し、次いでピリジンで
洗う。四塩化炭素/ピリジン中での大過剰のベンジルアミンによる第2回目の処
理に続いて、振とうすることにより、ホスホルアミデートへの効率的な酸化が確
保されるであろう。この樹脂をピリジン/アセトニトリルで洗い、次いで、濃
アンモニア水で、室温で3時間処理することにより、そのホスホルアミデートが
樹脂から切離される。上澄み液をを蒸発し、このホスホルアミデートをRP‐1
8HPLCカラムで精製すると、目的のオリゴマーが得られる。この段階的Hホ
スホン酸エステル・カップリング効率は、トリチルイオンの吸光度の測定で求め
られる。得られるこの六量体は、そのホスホルアミデート連鎖の各々にベンジル
アミン基を有し、そして主鎖セグメントアミノコンビナトリアル部位の各々にア
セチルチミン基を有しているであろう。実施例69 水素ホスホン酸エステル・カップリングの一般法
スクシナート・リンカー(1μmol)により連結されたDMT保護アルコー
ルで誘導化されている固体支持体(CPGまたは他の高分子支持体、例えば、テ
ンタゲル)の一部を、DNA合成カラムに装填し、以下のように作動するように
プログラムされた、自動DNA合成装置に取付ける;
1)ジクロロメタンにより洗滌する;
2)DMT保護基を除去するために、トリクロロ酢酸の3%ジクロロメタンによ
り処理する;
3)ジクロロメタンおよびCH3CN/ピリジン(1:1)により洗滌する;
4)カップリング:アダマントイルクロリドまたはピバロイルクロリドの0.2
M‐CH3CN/ピリジン(1:1)溶液、およびH‐ホスホン酸エステルモノ
マーの0.05M‐CH3CN/ピリジン(1:1)溶液の少量ずつを、1分間
交互に添加する;
5)CH3CN/ピリジン(1:1)で洗滌する;
6)停止し、そして、各結合を独立に酸化する酸化工程に進むか、若しくは、酸
化に先立って追加のモノマーサブユニットを付加するために工程1)から5)を
繰返す。
この一連の反応の生成物は、H‐ホスホン酸ジエステルであり、下に説明する
方法を含む数種の方法により酸化される。
酸化法1:ホスホジエステル
この固体支持体‐結合‐H‐ホスホン酸ジエステルを、(手動、もしくは自動
で)同量の、溶液A(0.2M‐I2/THF)と溶液B(N‐メチルモルホリ
ン/H2O/THF:1:1:8)で5分間処理し、次いで、同量の、溶液Aと
溶液C(TEA/H2O/THF:1:1:8)で5分間処理し、次いで、CH3
CN/ピリジン(1:1)で洗滌する。
酸化法2:ホスホロチオエート
この固体支持体‐結合‐H‐ホスホン酸ジエステルを、(手動、もしくは自動
で)CS2/ルチジンに溶かしたS8の溶液で30分間処理する。次いで、この固
体支持体をCH3CN/ピリジン(1:1)で洗滌する。
酸化法3:ホスホルアミデート
この固体支持体‐結合‐H‐ホスホン酸ジエステルを、(手動、もしくは自動
で)要求されるアミンの四塩化炭素/ピリジン(1:1)溶液(10%v/v)
で15‐30分間処理する。次いで、この固体支持体をCH3CN/ピリジン(
1:1)で洗滌する。実施例70 ホスホルアミデート連鎖を有するコンビナトリアル・ライブラリ合成
N‐FMOC‐5‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐3‐ヒドロキシピロリ
ジン(実施例3)、1‐O‐ジメトキシトリチル‐N‐FMOC‐2‐アミノ‐
1,3‐プロパンジオール(実施例32)、および4‐O‐ジメトキシトリチル
‐2‐N‐FMOC‐アミノブタン‐1‐オール(実施例42)を、別々の反応
で、実施例60のようにコハク酸無水物で処理すると、対応するコハク酸誘導体
が得られる。別々の一組の反応で、上のアミノジオール・サブユニットを、実施
例28のようにPCl3で処理すると、対応するH‐ホスホン酸モノエステルが
得られる。固体支持体を等しい三つの部分に分割し、各分割部分をコハク酸誘導
化アミノジオール・サブユニットの一つで、実施例61のように処理する。この
固体支持体を一緒にし、そのアミノ保護基を実施例62の一般法により除去する
。この固体支持体をピリジン/アセトニトリルで洗い、乾燥し、そして三つの同
量の部分に再分割する。
この固体支持体の各分割部分を、(N1‐チミン)‐2‐酢酸(実施例7)、
(N‐6‐ベンゾイル‐9‐アデニン)‐2‐酢酸(実施例11)またはN‐4
‐ベンゾイル-1‐シトシン‐2‐酢酸(実施例13)の一つで、実施例63の
一般法により処理する。この固体支持体の混合、乾燥および再分割を繰返す。
固体支持体の各分割部分を、実施例30の方法により、上のH‐ホスホン酸モ
ノエステルの一つで処理すると、H‐ホスホン酸ジエステルが生成する。この固
体支持体の混合、乾燥および再分割法を繰返す。この固体支持体の各分割部分を
、四塩化炭素/ピリジン中で、大モル過剰の、ベンジルアミン、2‐(2‐アミ
ノエチル)‐1‐メチルピロリジンあるいはピペロニルアミンの一つで処理する
。この固体支持体を15分間振とうし、上澄み液を濾別し、次いでピリジンで洗
滌する。四塩化炭素/ピリジン中での、大モル過剰の各アミン文字での第2回目
の処理に続く振とうにより、ホスホルアミデートへの効率的な酸化が保証される
であろう。この分割固体支持体を一緒にし、そしてアミノ保護基を上記のように
して除去する。この固体支持体をピリジン/アセトニトリルで洗い、乾燥し、そ
して再分割する。
この固体支持体の各分割部分を、(N1‐チミン)‐2‐酢酸(実施例7)、
(N‐6‐ベンゾイル‐9‐アデニン)‐2‐酢酸(実施例11)もしくは4‐
ベンゾイル‐1‐シトシン‐2‐酢酸(実施例13)の一つで、実施例63の一
般法により処理する。この固体支持体の混合、実施例64による、ヒドロキシル
保護基の脱保護、乾燥および再分割を繰返す。
固体支持体の各分割部分を、実施例69の方法により、上のH‐ホスホン酸モ
ノエステルの一つで処理すると、H‐ホスホン酸ジエステルが生成する。この固
体支持体の混合、乾燥および再分割を繰返す。この固体支持体の各分割部分を、
四塩化炭素/ピリジン中で、大モル過剰のベンジルアミン、2‐(2‐アミノエ
チル)‐1‐メチルピロリジンあるいはピペロニルアミンの一つで処理する。こ
の固体支持体を15分間振とうし、上澄み液を濾別し、次いでピリジンで洗滌す
る。四塩化炭素/ピリジン中での、大モル過剰の各アミン文字での第2回目の処
理に続く振とうにより、ホスホルアミデートへの効率的な酸化が確保されるであ
ろう。この固体支持体を一緒にし、そしてアミノ保護基を上記のようにして除去
する。この固体支持体をピリジン/アセトニトリルで洗い、乾燥し、そして再分
割する。
この固体支持体の各分割部分を、(N1‐チミン)‐2‐酢酸(実施例7)、
(N‐6‐ベンゾイル‐9‐アデニン)‐2‐酢酸(実施例11)あるいはN‐
4‐ベンゾイル‐1‐シトシン‐2‐酢酸(実施例13)の一つで、実施例63
の一般法により処理する。
得られるオリゴマー化合物は、濃アンモニア水で、室温で3時間処理すること
により、その固体支持体から切離される。その上澄み液をを蒸発し、このホスホ
ルアミデート連結オリゴマー化合物をRP‐18HPLCカラムで精製すると、
三種のアミノジオールモノマーユニット、三種の官能基および三種のアミンを用
いて合成することができる全ての可能なオリゴマー化合物から成る目的のコンビ
ナトリアル・ライブラリが得られるであろう。実施例71 ホスホジエステルまたはポスホルチオエート連鎖を有するコンビナトリアル・ラ イブラリの合成
実施例68の試薬と方法を用いて、三量体が合成される。但し、H‐ホスホン
酸ジエステルの連鎖の酸化は、実施例69に例示した方法、方法1または2を用
いて行われ、均一なホスホジエステル結合または均一なポスホルチオエート連鎖
のいずれかが得られる。実施例72 混合ホスホジエステル、ポスホルチオエートおよびホスホルアミデート連鎖を有 するコンビナトリアル・ライブラリの合成
実施例68の試薬と方法を用いて、三量体が、合成される。但し、H‐ホスホ
ン酸ジエステル連鎖の酸化は、その固体支持体を同量の三つの部分に分割し、そ
して実施例69に例示した方法、方法1、2または3を用いて行われ、ホスホジ
エステル、ポスホルチオエートまたはホスホルアミデート連鎖が得られる。実施例73 標準DNA合成プロトコールを用いる標準オリゴマー・カップリングサイクル
本発明のオリゴマー化合物は、自動DNA合成装置(Applied Bio
systems model 380B)で、ヨウ素による酸化により標準ホス
ホルアミデート化学を用いる標準オリゴヌクレオチドで行われるようにして合成
される。(Oligonucleotide Synthesis,A Pra
ctical Approach,M.J.Gait.,ed.,Oxford
University Press,New York,1990.参照)。
ホスホルチオエートオリゴマー化合物では、この標準酸化びんの内容が、ホスフ
ァイト結合の段階的チエート化(thiation)用の、3H‐1,2‐ベン
ゾジチオール‐3‐オン‐1,1‐ジオキシドの0.2M‐アセトニトリル溶液
で置換えられた。チエート化待機工程は、68秒に延長され、それに続いて、保
護化(capping)が行われる。CPGカラムからの切離しと、濃アンモニ
ア水中、55℃(18時間)での脱保護の後で、このオリゴマー化合物は、0.
5M‐NaCl溶液からの、2.5倍容量のエタノールによる2回の沈殿により
、またはRP‐18カラムを用いるHPLCクロマトグラフィーにより精製され
る。ゲル電気泳動分析は、20%アクリルアミド、8M‐尿素、454mM‐ト
リス硼酸塩緩衝液中、pH=7.0で行われる。ホスホジエステルおよびホスホ
ルチオエートオリゴマー化合物は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動で、物質長
(material length)から判別される。実施例74 ホスホジエステル連鎖を有する配列特異性ピロリジンオリゴマーの合成
“アフォルヴィルセン”(“Aforvirsen”)は、次のヌクレオチド
配列を有する、抗‐乳頭腫瘍剤である:
TTG CTT CAA TCT TCC TCG TC
この予め選定された配列の、ピロリジン・ホスホジエステル連結オリゴマーは、
それぞれ、実施例7、11、13および14からのT、A、CおよびG試薬を用
いて、実施例73の方法によりヨウ素を酸化剤として合成され、“アフォルヴィ
ルセン”配列を有するホスホジエステル連結オリゴマー化合物が得られる。実施例75 ホスホルチオエート連鎖を有する配列特異性ピロリジンオリゴマーの合成
TTG CTT CAA TCT TCC TCG TC配列のピロリジンホス
ホルチオエート連結オリゴマーは、それぞれ、実施例7、11、13および14
からのT、A、CおよびG試薬を用いて、実施例73の方法により、3H‐1,
2‐ベンゾジチオール‐3‐オン1,1‐ジオキシドを酸化剤として合成され、
ホスホルチオエート連結オリゴマー化合物が得られる。実施例76 N‐(2‐[1‐チロシニル]‐アセチル)‐2‐ヒドロキシメチルピロリジン ‐4‐モルホリノホスオルアミデート‐チミジン‐ホスホジエステル‐チミジン 三量体の合成
チミジン[5'-DMT‐O‐T‐O‐P(=O)‐O‐T‐CPG]の3'-5
'-ホスホジエステル連結二量体で誘導化した調整多孔性ガラス樹脂を標準法で合
成した。この樹脂の少量の二試料(各24.6mg、47.5mmoL/g樹脂
)を、それぞれ、ジクロロメタンに溶した3%トリクロロ酢酸の溶液を用いて、
脱トリチル化し、次いで、無水アセトニトリルとピリジンで順次洗滌した。各試
料を、アダマントイルクロリド(50mM)とピリジンに溶かしたN‐(2‐[
1‐チロシニル]‐アセチル)‐2‐O‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピ
ロリジン‐3‐H‐ホスホナートモノマー(25mM)の溶液1mLと共に5分
間激しく混合した。次いで、この樹脂を無水のピリジンで繰返し洗い、そしてア
ルゴンガスを吹付けて乾燥した。一つのカラムに、ヨウ素/ピリジン/水(2/
90/8)溶液1mLを加えて激しく振とうし;第2のカラムに、モルホリン/
四塩化炭素/ピリジン(1/5/5)溶液1mLを加え、両者を30分間振とう
した。次いで、これらカラムをピリジンとアセトニトリルで洗い、次いでアルゴ
ンガスを吹付けて乾燥した。このCPGを濃アンモニア水1mLで30分間処理
して、生成物をCPGから切離した。このアンモニア溶液を蒸発乾固し、次いで
、水中で80%酢酸で30分処理し、トリチル基を除去した。第1カラムからの
溶液の少量をHPLC分析[Vyadec C‐18、260nm、酢酸アンモ
ニウム(pH=7)‐アセトニトリルの線形勾配、52分で0〜75%アセトニ
トリル]し、ホスホジエステル三量体に対応する単一ピーク(27.8分)を観
測した。類似の分析で、ホスホルアミデート・ジアステレオマー三量体に対応す
る一対のピーク(39.7および39.9分)を観測した。
HPP‐チロシン‐H‐ホスホン酸エステルモノマーと5'-DMT‐O‐T‐
O‐P(=O)‐O‐T‐CPGを使用する一組の平行実験で、ジエチルアミン
/四塩化炭素を用いて、ホスホジエステル三量体またはホスホルアミデート三量
体に酸化された。これらの実験で、前記の条件下で、ホスホジエステル三量体と
、(HPLC分析で12.4分の位置に)分離できないジメチルアミンホスホル
アミデート三量体が得られた。実施例77 (5R)‐O‐(t‐ブチルジメチルシリル)‐(3R)‐ヒドロキシピペリジ ン
N‐ベンジル‐(5R)‐O‐(t‐ブチルジメチルシリル)‐(3R)‐ヒ
ドロキシピペリジン(J.Cossy,C.Dumas,P.Michel,D
.Gomez Pardo,Tetrahedron Lett.,1955,
36,549)をエタノールに溶解する。触媒量の10%Pd/Cを加え、その
溶液を、3気圧のH2下で振とうする。出発原料が消費されたら、触媒をろ過し
溶媒を減圧下で除去する。この生成物は、さらに精製しないで使用される。実施例78 N‐(FMOC)‐(5R)‐O‐(t‐ブチルジメチルシリル)‐(3R)‐ ヒドロキシピペリジン
(5R)‐O‐(t‐ブチルジメチルシリル)‐(3R)‐ヒドロキシピペリ
ジンとNa2CO3をH2O/ジオキサン(1:1)(0.1M)中に分散させる
。トルエンに溶かしたフルオレニルメチルクロロホーメート(1.1当量)を滴
下して加える。添加の間、反応温度が25℃以上に上がらないようにする。この
混合物を一晩激しく撹拌し、濃塩酸でpH3まで酸性にし、酢酸エチルで2度抽
出する。この有機抽出物を食塩水で洗う。この溶液をMgSO4で乾燥し、ろ過
し、そして溶媒を減圧下で除去する。この生成物をシリカゲル・フラッシュカラ
ム・クロマトグラフィーで精製する。実施例79 N‐(FMOC)‐(3R)‐O‐ジメトキシトリチル‐(5R)‐O‐(t‐ ブチルジメチルシリル)‐ピペリジン
N‐(FMOC)‐(5R)‐O‐(t‐ブチルジメチルシリル)‐(3R)
‐ヒドロキシピペリジンを乾燥ピリジンで共蒸発させ、乾燥ピリジン(0.1
M)に再溶解する。ジメトキシトリチルクロリド(1.2当量)を少量ずつ15
分かけて添加し、そしてその溶液を室温で一晩撹拌する。次いで、メタノール(
10mL)を加え、そして溶媒を減圧下で除去する。得られたガム状物を酢酸エ
チルに再溶解し、0.1Mクエン酸溶液、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そ
してMgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理する。この生成物をシリカゲル・フ
ラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例80 N‐(FMOC)‐(3R)‐O‐ジメトキシトリチル‐(5R)‐ヒドロキシ ピペリジン
N‐(FMOC)‐(3R)‐O‐ジメトキシトリチル‐(5R)‐O‐(t
‐ブチルジメチルシリル)‐ピペリジンを、THF(0.1M)に溶かし、そし
てTHFに溶したテトラブチルアンモニウム・フルオリド(3当量)と酢酸(9
当量)の溶液に加える。この溶液を、出発原料が消費されるまで撹拌する。Na
HCO3で反応を中止し、ジエチルエーテルで抽出し、NaHCO3溶液、食塩水
で洗い、MgSO4で乾燥する。実施例81 N‐(FMOC)‐(3R)‐O‐ジメトキシトリチル‐ピペリジン‐(
5R) ‐O−水素ホスホナート・トリエチルアンモニウム塩
標題化合物は、実施例59の一般法を用いて、N‐(FMOC)‐(3R)‐
O‐ジメトキシトリチル‐(5R)‐ヒドロキシピペリジンから合成される。実施例82 N‐(FMOC)‐(3R)‐O‐ジメトキシトリチル‐ピペリジン‐(5R) ‐O‐スクシナート
標題化合物は、実施例60の一般法を用いて、N‐(FMOC)‐(3R)‐
O‐ジメトキシトリチル‐(5R)‐ヒドロキシピペリジンから合成される。実施例83 N‐(FMOC)‐(3R)‐O‐ジメトキシトリチル‐ピペリジン‐(5R) ‐O‐スクシニルCPG
標題化合物は、実施例61の一般法を用いて、N‐(FMOC)‐(3R)‐
O‐ジメトキシトリチル‐(5R)‐O‐スクシナートから合成される。実施例84 (2S)‐カルボキシエチル‐ピロリジン‐5‐カルボン酸‐4‐メチルフェニ ルチオエステル
標題化合物は、J.Ezquerra,A.,Rubio,C.,Pedre
gal,G.,Sanz,J.H.,Rodrigez,J.L.,Garci
a R.,Tetrahedron Lett.1993,34,4989、の
方法を用いて、N‐BOC‐ピログルタミン酸エチルエステルから、C5位のエ
ピマーとして得られる。実施例85 N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐ピロリジン‐5‐カルボン酸 ‐4‐メチルフェニルチオエステル
(2S)‐カルボキシエチル‐ピロリジン‐5‐カルボン酸‐4‐メチルフェ
ニルチオエステルととNa2CO3(1.3当量)をH2/ジオキサン(1:1)
(0.1M)中に懸濁させる。トルエンに溶かしたフルオレニルメチルクロロホ
ーメート(1.1当量)滴下して加える。てんかの間、反応温度が25℃以上に
上がらないようにする。この混合物を一晩激しく撹拌し、濃塩酸でpH3まで酸
性にし、酢酸エチルで2度抽する。この有機抽出物を食塩水で洗う。この溶液を
MgSO4で乾燥し、ろ過し、そして溶媒を減圧下で除去する。この生成物をシ
リカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例86 N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5R)‐ヒドロキシメチル ‐ピロリジンおよびN‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5S) ‐ヒドロキシメチル‐ピロリジン
実施例85からのチオエステル類の混合物をTHFに溶かし、Pd(OAc)2
とトリエチルシランで処理する。これらチオエステルがアルデヒドに還元され
たら、この溶液を0℃に冷却し、そして1当量のLiBH4を添加する。酢酸を
加えてこの反応を停止させる。溶媒を除去し、そして残留物を酢酸エチルで抽出
し、5%NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。
この生成物(複数のエピマー)は、シリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグ
ラフィーで分離される。実施例87 N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5R)‐ジメトキシトリチ ルオキシメチルピロリジン
N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5R)‐ヒドロキシメチ
ル‐ピロリジンを乾燥ピリジンで共蒸発させ、そして乾燥ピリジン(0.1M)
に再溶解する。ジメトキシトリチルクロリド(1.2当量)を少量ずつ15分か
けて添加し、そしてその溶液を室温で一晩撹拌する。次いで、メタノール(10
mL)を加え、そして溶媒を減圧下で除去する。得られたガム状物を酢酸エチル
に再溶解し、0.1Mクエン酸溶液、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そして
MgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理する。この残留物をシリカゲル・フラッ
シュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例88 N‐(FMOC)‐(2S)‐ヒドロキシメチル‐(5R)‐ジメトキシトリチ ルオキシメチルピロリジン
N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5R)‐ジメトキシトリ
チルオキシメチルピロリジンを乾燥THFに溶かし、0℃に冷却し、そして2当
量のLiBH4を加える。この溶液を、出発原料が消費されるまで、室温まで暖
める。酢酸エチルで反応を中止させ、次いで0.1Mクエン酸溶液、NaHCO3
溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理する。この
生成物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例89 N‐(FMOC)‐(5R)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐ (2S)‐オキシメチル‐水素ホスホナート・トリエチルアンモニウム塩
標題生成物は、実施例59の一般法を用い、N‐(FMOC)‐(2S)‐ヒ
ドロキシメチル‐(5R)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジンから
合成される。実施例90 N‐(FMOC)‐(5R)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐ (2S)‐オキシメチルスクシナート
標題生成物は、実施例60の一般法を用い、N‐(FMOC)‐(2S)‐ヒ
ドロキシメチル‐(5R)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジンから
合成される。実施例91 N‐(FMOC)‐(5R)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐ (2S)‐オキシメチルスクシニル‐CPG
標題生成物は、実施例61の一般法を用い、N‐(FMOC)‐(5R)‐ジ
メトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐(2S)‐オキシメチル‐スクシ
ナートから合成される。実施例92 N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5S)‐ジメトキシトリチ ルオキシメチルピロリジン
N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5S)‐ヒドロキシメチ
ル‐ピロリジンを乾燥ピリジンで共蒸発させ、そして乾燥ピリジン(0.1M)
に再溶解する。ジメトキシトリチルクロリド(1.2当量)を少量ずつ15分か
けて添加し、そしてその溶液を、室温で、一晩撹拌する。次いで、メタノール(
10mL)を加え、そして溶媒を減圧下で除去する。得られたガム状物を酢酸エ
チルに再溶解し、0.1Mクエン酸溶液、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そ
してMgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理する。この残留物をシリカゲル・フ
ラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例93 N‐(FMOC)‐(2S)‐ヒドロキシメチル‐(5S)‐ジメトキシトリチ ルオキシメチルピロリジン
N‐(FMOC)‐(2S)‐カルボキシエチル‐(5S)‐ジメトキシトリ
チルオキシメチルピロリジンを乾燥THFに溶かし、0℃に冷却し、そして2当
量のLiBH4を加える。この溶液を、出発原料が消費されるまで、室温まで暖
める。酢酸エチルで反応を中止させ、次いで、0.1Mクエン酸溶液、NaH
CO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥し、そして蒸発処理する。こ
の生成物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例94 N‐(FMOC)‐(5S)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐ (2S)‐オキシメチル‐水素ホスホン酸トリエチルアンモニウム塩
標題生成物は、実施例59の一般法を用い、N‐(FMOC)‐(2S)‐ヒ
ドロキシメチル‐(5S)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジンから
合成される。実施例95 N‐(FMOC)‐(5S)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐ (2S)‐オキシメチルスクシナート
標題生成物は、実施例60の一般法を用い、N‐(FMOC)‐(2S)‐ヒ
ドロキシメチル‐(5S)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジンから
合成される。実施例96 N‐(FMOC)‐(5S)‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐ (2S)‐オキシメチルスクシニル‐CPG
標題生成物は、実施例61の一般法を用い、N‐(FMOC)‐(5S)‐ジ
メトキシトリチルオキシメチル‐ピロリジン‐(2S)‐オキシメチル‐スクシ
ナートから合成される。実施例97 N‐(FMOC)‐2,2'-ジヒドロキシエチルアミン
ジエタノールアミンとNa2CO3(1.3当量)をH2O/ジオキサン(1:
1)(0.1M)中に懸濁される。フルオレニルメチルクロロホーメート(1.
1当量)を滴下して加える。この添加の間、反応温度が25℃以上に上がらない
ようにする。この混合物を一晩激しく撹拌し、濃塩酸でpH3まで酸性にし、酢
酸エチルで2度抽出する。この有機抽出物を食塩水で洗い、MgSO4で乾燥し
、ろ過し、そして溶媒を減圧下で除去する。この生成物をシリカゲル・フラッシ
ュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例98 N‐(FMOC)‐2'-ヒドロキシエチル‐2‐O‐ジメトキシトリチルエチル アミン
N‐(FMOC)‐2,2'-ジヒドロキシエチルアミンを乾燥ピリジンで共蒸
発させ、そして乾燥ピリジン(0.1M)に再溶解する。ジメトキシトリチルク
ロリド(1.2当量)を少量ずつ15分かけて添加し、そしてその溶液を、室温
で一晩撹拌する。次いで、メタノール(10mL)を加え、そして溶媒を減圧下
で除去する。得られたガム状物を酢酸エチルに再溶解し、0.1Mクエン酸溶液
、濃厚NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥して、次いで蒸
発処理する。この残留物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィー
で精製する。実施例99 N‐(FMOC)‐2‐O‐ジメトキシトリチルエチルアミノ‐2'-O‐エチル ‐水素ホスホン酸トリエチルアンモニウム塩
標題生成物は、実施例59の一般法を用い、N‐(FMOC)‐2'-ヒドロキ
シエチル‐2‐O‐ジメトキシトリチルエチルアミンから合成される。実施例100 N‐(FMOC)‐2‐3‐プロパンジオール
1‐アミノプロパンジオールとNa2CO3(1.3当量)をH2O/ジオキサ
ン(1:1)(0.1M)中に懸濁させる。トルエンに溶かしたフルオレニルメ
チルクロロホーメート(1.1当量)を滴下して加える。この添加の間、反応温
度が25℃以上に上がらないようにする。この混合物を一晩激しく撹拌し、濃塩
酸でpH3まで酸性にし、酢酸エチルで2度抽出する。この有機抽出物を食塩水
で洗い、MgSO4で乾燥し、ろ過し、そして溶媒を減圧下で除去する。この生
成物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例101 N‐(FMOC)‐2‐ヒドロキシ‐3‐O‐ジメトキシトリチル‐プロパン
N‐(FMOC)‐2,3‐プロパンジオールを乾燥ピリジンと共蒸発させ、
そして乾燥ピリジン(0.1M)に再溶解する。ジメトキシトリチルクロリド
(1.2当量)を少量ずつ15分かけて添加し、その溶液を、室温で一晩撹拌す
る。次いで、メタノール(10mL)を加え、そして溶媒を減圧下で除去する。
得られたガム状物を酢酸エチルに再溶解し、0.1Mクエン酸溶液、濃厚NaH
CO3溶液、食塩水で洗い、MgSO4で乾燥して、次いで蒸発処理する。この残
留物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例102 尿素を生成させる主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位の誘導化の一般 法
固体支持体上のフリーのアミンに、カルボニルジイミダゾールのDMF溶液(
0.1mmoL/mL)を加える。10μmoL水準の添加規模で、10倍過剰
の試薬を加える。放置して反応を30分進行させ、試薬をDMFで除去する。次
いで希望のアミンのDMF溶液(10%v/v)を加える。30分後、固体支持
体を、尿素誘導化主鎖セグメント・アミノコンビナトリアル部位を得るために、
全ての試薬が除去されるまでDMFで洗滌する。実施例103 N‐(FMOC)‐3,4‐トランス‐ジカルボキシメチルピロリジン
フマル酸ジメチル(36.7g、268mmoL)を1LのCH2Cl2に溶解
し、そしてトリフルオロ酢酸(3mL.40mmoL)を添加した。アゾメチン
‐イリド前駆体N‐ベンジル‐N‐メトキシメチル‐N‐(トリメチルシリルメ
チル)‐アミン(60.4g、255mmoL)を、撹拌しながら、滴下して加
えた。この溶液を、室温で一晩撹拌する。溶媒を除去し、この粗生成物を1.5
Lのメタノールに再溶解した。300mLの1N‐HClを加えた。この溶液を
Arで脱気し、そして10%Pd/Cを添加した。H2ガスを吹込み、次いでH2
風船を取付けて、この溶液を原料が消費されるまで(24時間)撹拌した。触媒
を濾別し、溶媒を除去し、そして残存物を500mLのH2Oと500mLのジ
オキサンに再溶解し、それに32g(300mmoL)のNa2CO3を加えた。
500mLのジオキサンに溶解したFMOC‐Clの溶液(66g、255mm
oL)を滴下して加えた。この溶液を16時間撹拌し、pH3まで酸性にし、そ
して溶媒を蒸発させた。残留物を酢酸エチルで抽出し、水、食
塩水で洗滌し、MgSO4で乾燥し、そして蒸発処理した。92gの標題生成物
が得られた。実施例104 N‐(FMOC)‐3,4‐トランス‐ジヒドロキシメチルピロリジン
N‐FMOC‐3,4‐トランス‐ジカルボキシメチルピロリジン(92g、
225mmoL)を1000mLのTHFに溶解し、そして250mLのLiB
H4(THF中2M,アルドリッチ社)を冷却しながら加えた(発熱)。この溶
液を室温で24時間撹拌し、そして50%のHClでpH2にして、注意して反
応を中止させた。溶媒を蒸発した。残留物を酢酸エチル(2×500mL)で抽
出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥して、次いで蒸
発処理した。76.8gの粗生成物が得られた(100%)。この生成物を30
0mLのアセトニトリルから再結晶して60gの生成物を得た。実施例105 N‐FMOC‐3‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐4‐ヒドロキシメチルピ ロリジン
N‐FMOC‐3,4‐トランス‐ジヒドロキシメチルピロリジンをCH2C
l2/ピリジン(9:1)に溶解し、0℃に冷却して、そしてDMT‐Clを少
々ずつ加えた(1.0当量)。この溶液を0℃で一晩撹拌した。メタノールで反
応を中止させ、蒸発処理し、そしてトルエンとの共沸蒸留により過剰の溶媒を除
去した。この生成物を酢酸エチルに再溶解し、5%クエン酸溶液、NaHCO3
溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥した。シリカゲル・フラッシュ・
カラムクロマトグラフィーで、CH2Cl2中、0から30%のメタノール勾配を
用いて、精製した。この生成物は、50%の収率で得られ、その他、25%のジ
トリチル化物(保存して置いて、再利用する)および25%の未反応の出発原料
が得られた。実施例106 N‐FMOC‐トランス‐3(オキシメチル)‐4‐(ジメトキシトリチルオキ シメチル)‐ピロリジン‐水素ホスホン酸トリエチルアンモニウム塩
標題生成物は、実施例59の一般法により、N‐FMOC‐3‐ジメトキシト
リチルオキシメチル‐4‐ヒドロキシメチルピロリジンから合成される。実施例107 N‐FMOC‐トランス‐3(オキシメチル)‐4‐(ジメトキシトリチルオキ シメチル)ピロリジン‐スクシナート
標題生成物は、実施例60の一般法により、N‐FMOC‐トランス‐3‐(
ヒドロキシメチル)‐4‐(ジメトキシトリチルオキシメチル)‐ピロリジンか
ら合成される。実施例108 N‐FMOC‐トランス‐3‐(オキシメチル)‐4‐(ジメトキシトリチルオ キシメチル)ピロリジン‐スクシニルCPG
標題生成物は、実施例61の一般法により、N‐FMOC‐トランス‐3‐(
ヒドロキシメチル)‐4‐(ジメトキシトリチルオキシメチル)‐ピロリジンか
ら合成される。実施例109 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐シクロペンテン‐1‐オール
この生成物は、A.R.Ritter,M.J.Miller,Tetrah
edron Lett.1994,35,9379、の方法で合成される。実施例110 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2,3‐オキソシクロペンタン‐1‐オール
N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐シクロペンテン‐1‐オールをジクロロ
メタンに溶かし、そしてm‐クロロ‐安息香酸を加える。この溶液を、出発原料
が無くなるまで撹拌する。亜硫酸水素ナトリウムの5%溶液を添加して、反応を
停止させ、ジクロロメタンで抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そして
乾燥する。この標題化合物は、シリカゲル・フラッシュ・カラムクロマトグラフ
ィーで精製される。実施例111 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノシクロペンタン‐1,2‐ジオール
実施例110のエポキシドをTHFに溶かし、そして触媒量のTi(OiP
r)4の存在下で、2当量のLiBH4で処理する。反応が完了するまで撹拌を続
ける。反応混合物を酢酸エチルで稀釈し、0.1%クエン酸溶液、NaHCO3
溶液、食塩水で洗い、MgSO4で乾燥し、そして蒸発処理する。この標題化合
物は、シリカゲル・フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製される。実施例112 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロペンタン‐ 1‐オール
N‐CBZ‐シス‐4‐アミノシクロペンタン‐1,2‐ジオールを乾燥ピリ
ジンと共蒸発させ、そして乾燥ピリジン(0.1M)に再溶解する。ジメトキシ
トリチルクロリド(1.0当量)を少量ずつ15分かけて添加し、そしてその溶
液を、室温で一晩撹拌する。次いで、メタノール(10mL)を加え、そして溶
媒を減圧下で除去する。得られたガム状物を酢酸エチルに再溶解し、0.1Mク
エン酸溶液、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥して、そ
して蒸発処理する。この生成物はシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラ
フィーで精製される。実施例113 N‐FMOC‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロペンタン ‐1‐オール
N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロペンタン
‐1‐オールをエタノールに溶解し、10%Pd/Cを加える。この混合物を、
1気圧のH2下で、全ての出発原料が消費されるまで振とうする。触媒を濾過し
、溶媒を除去する。残留物とNa2CO3(1.3当量)をH2O/ジオキサン(
1:1)(0.1M)中に懸濁させる。トルエンに溶かしたフルオレニルメチル
クロロホーメート(1.1当量)を滴下して加える。添加の間、反応温度が25
℃以上に上がらないようにする。この混合物を一晩激しく撹拌し、濃塩酸でpH
3まで酸性にし、そして酢酸エチルで2度抽出する。この有機抽出物を食塩水で
洗い、MgSO4で乾燥し、濾過し、そして溶媒を減圧下で除去する。この生成
物はシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製される。実施例114 N‐FMOC‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロペンタン ‐1‐O‐水素ホスホン酸トリエチルアンモニウム塩
標題化合物は、実施例59の一般法を用いて合成される。実施例115 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐シクロヘキサン‐1‐オール
この生成物は、A.R.Ritter,M.J.Miller,J.Org.
Chem.1994,59,4602、の方法で合成される。実施例116 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2,3‐オキソシクロヘキサン‐1‐オール
N‐CBZ‐シス‐4‐アミノシクロヘキサン‐1‐オールをジクロロメタン
に溶かし、そしてm‐クロロ‐安息香酸を加える。この溶液を、出発原料が無く
なるまで撹拌する。亜硫酸水素ナトリウムの5%溶液を添加して、反応を停止さ
せ、ジクロロメタンで抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そして乾燥す
る。この標題化合物は、シリカゲル・フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで
精製される。実施例117 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノシクロヘキサン‐1,2‐ジオール
前の実施例のエポキシドをTHFに溶かし、そして触媒量のTi(OiPr)4
の存在下で、2当量のLiBH4で処理する。この反応が完了するまで撹拌を続
ける。反応混合物を酢酸エチルで稀釈し、0.1%クエン酸溶液、NaHCO3
溶液、食塩水で洗い、MgSO4で乾燥し、そして蒸発処理する。この標題化合
物は、シリカゲル・フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製される。実施例118 N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロヘキサン‐ 1‐オール
N‐CBZ‐シス‐4‐アミノシクロヘキサン‐1,2ジオールを乾燥ピリジ
ンと共蒸発させ、そして乾燥ピリジン(0.1M)に再溶解する。ジメトキシト
リチルクロリド(1.0当量)を少量ずつ15分かけて添加し、そしてその溶液
を、室温で一晩撹拌する。次いで、メタノール(10mL)を加え、そして溶媒
を減圧下で除去する。得られたガム状物を酢酸エチルに再溶解し、0.1Mクエ
ン酸溶液、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥し、そして
蒸発処理する。この標題化合物は、シリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグ
ラフィーで精製される。実施例119 N‐FMOC‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロヘキサン ‐1‐オール
N‐CBZ‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロヘキサン
‐1‐オールをエタノールに溶解し、10%Pd/Cを加える。この混合物を、
1気圧のH2下で、全ての出発原料が消費されるまで振とうする。触媒を濾過し
、溶媒を除去する。残留物とNa2CO3(1.3当量)をH2O/ジオキサン(
1:1)(0.1M)中に懸濁させる。トルエンに溶かしたフルオレニルメチル
クロロホーメート(1.1当量)を滴下して加える。添加の間、反応温度が25
℃以上に上がらないようにする。この混合物を一晩激しく撹拌し、濃塩酸でpH
3まで酸性にし、酢酸エチルで2度抽出する。この有機抽出物を食塩水で洗い、
MgSO4で乾燥し、濾過し、そして溶媒を減圧下で除去する。この標題化合物
をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する。実施例120 N‐FMOC‐シス‐4‐アミノ‐2‐O‐ジメトキシトリチルシクロヘキサン ‐1‐O‐水素ホスホン酸トリエチルアンモニウム塩
標題化合物は、実施例59の一般法で合成される。実施例121 アルデヒド類:ベンズアルデヒド、アルドリッチ‐B133‐4;m‐トルアル デヒド、アルドリッチ‐T3,550‐5;m‐アニスアルデヒド、アルドリッ チ‐12,965‐8;および3‐ニトロベンズアルデヒド、アルドリッチ‐N 1,084‐5、でコンビナトリアル化された、主鎖セグメントアミノコンビナ トリアル部位有する四量体の合成
方法1:ビーズスプリット
固体支持体を、実施例26のような2‐O‐(ジメトキシトリチル)エチルス
クシナート・ハーフエステルで誘導化する。そのDMT保護基を、実施例64の
標準法を用いて除去する。4‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐ア
ミノブタン‐1‐オールを実施例28のようにしてPCl3で処理するとホスホ
ン酸が生成し、実施例38におけるように誘導化樹脂に縮合される。このFMO
Cアミノ保護基を実施例4のようにして除去し、そしてこの固体支持体を四つの
同量の部分に分割し、そして各分割部分をベンズアルデヒド、m‐トルアルデヒ
ド、m‐アニスアルデヒドまたは3‐ニトロベンズアルデヒド、の一種と反応さ
せて、実施例66の方法および、Look,G.C.,etal.,Tetra
hedron Lett.,1995,36,2937‐2940、の方法によ
り、フリーのアミノ基にカップリングさせ、そして固体支持体の分割部分を再び
混ぜ合わせ、この一緒にした固体支持体をテトラヒドロフラン中でNaCNBH3
またはLiBH4の溶液で30分処理し次いで、この固体支持体をメタノールで
洗滌する。この方法を、アミノ部位の各々に、等モル混合物の各アルデヒド文字
を有するアミンジオールモノマーサブユニットが組込まれるまで繰返す。得られ
る四量体は、実施例67の方法を用い、四塩化炭素/ピリジン中で、大過剰のベ
ンジルアミンで処理される。この固体支持体を15分間振とうし、上澄み液を濾
別し、次いでピリジンで洗う。四塩化炭素/ピリジン中での大過剰のベンジルア
ミンによる第2回目の処理に続いて、振とうすることにより、ホスホルアミデー
トへの効率的な酸化が確保されるであろう。この樹脂をピリジン/アセトニトリ
ルで洗い、次いで、濃アンモニア水で、室温で3時間処理することにより、その
ホスホルアミデートが、樹脂から切離される。上澄み液をを蒸発し、このホスホ
ルアミデートをRP‐18HPLCカラムで精製すると、目的のオリゴマーが得
られる。方法2
固体支持体を、実施例26のような2‐O‐(ジメトキシトリチル)エチルス
クシナート・ハーフエステルで誘導化する。そのDMT保護基を、実施例64の
標準法を用いて除去する。4‐O‐ジメトキシトリチル‐2‐N‐FMOC‐ア
ミノブタン‐1‐オールを実施例28のようにしてPCl3で処理するとホスホ
ン酸が生成し、実施例38におけるように誘導化樹脂に縮合される。この方法
により、上の4回の繰返しにより四量体合成される。このFMOCアミノ保護基
を実施例4のようにして除去し、そして、一つの反応器中で、同時にベンズアル
デヒド、m‐トルアルデヒド、m‐アニスアルデヒドおよび3‐ニトロベンズア
ルデヒドと反応させる。この同時反応を行うために、固体支持体に付いている5
0μmoLのオリゴマー化合物を、トリエチルオルトホーメート中で、50μm
oLのベンズアルデヒド、50μmoLのm‐トルアルデヒド、50μmoLの
m‐アニスアルデヒドおよび50μmoLの3‐ニトロベンズアルデヒドと反応
させる。得られるイミン類を上の方法1の方法で還元される。この方法により、
この固体支持体に付いているオリガマー混合物の四つのアミノコンビナトリアル
部位が、アルデヒドの混合物を含む競争機構によりコンビナトリアル化される。
この得られる四量体は、実施例67の方法を用い、四塩化炭素/ピリジン中で、
大過剰のベンジルアミンで処理される。この固体支持体を15分間振とうし、上
澄み液を濾別し、次いでピリジンで洗う。四塩化炭素/ピリジン中での大過剰の
ベンジルアミンによる第2回目の処理に続いて、振とうすることにより、ホスホ
ルアミデートへの効率的な酸化が確保されるであろう。この樹脂をピリジン/ア
セトニトリルで洗い、次いで、濃アンモニア水で、室温で3時間処理することに
より、そのホスホルアミデートが樹脂から切離される。上澄み液を蒸発し、この
ホスホルアミデートをRP‐18HPLCカラムで精製すると、目的のオリゴマ
ーが得られる。実施例122 種々の選択されたアルデヒドを用いるコンビナトリアルライブラリの合成
実施例121の方法を用い、Aldrich Chemical Compa
ny,Inc.,Milwaukee,WIから入手可能な以下のアルデヒドの
1つ、2つ、3つ、4つまたはそれ以上で誘導体化される本発明のオリゴマー性
化合物からライブラリを製造する。Aldrichカタログ番号は欄の左側に与
えられており、化合物名は欄の右側に与えられている:
芳香族アルデヒド
10793−5 フェニルアセトアルデヒド
D20425 ジフェニルアセトアルデヒド
24582−8 ヒドロシンナムアルデヒド
24136−9 フェニルプロピルアルデヒド
28902−7 (+/−)−3−フェニルブチルアルデヒド
28899−3 アルファ−アミルシンナムアルデヒド
16116−0 アルファ−ブロモシンナムアルデヒド
26813−5 4−スチルベンカルボキサアルデヒド
B133−4 ベンズアルデヒド
11755−2 o−トルアルデヒド
25069−4 アルファ.アルファ.アルファートリフルオロ−o−ト
ルアルデヒド
F48O−7 2−フルオロベンズアルデヒド
12497−4 2−クロロベンズアルデヒド
B5700−1 2−ブロモベンズアルデヒド
10962−2 o−アニスアルデヒド
15372−9 2−エトキシベンズアルデヒド
N1080−2 2−ニトロベンズアルデヒド
T3550−5 m−トルアルデヒド
19687−8 アルファ.アルファ.アルファ−トリフルオロ−m−ト
ルアルデヒド
F500−5 3−フルオロベンズアルデヒド
C2340−3 3−クロロベンズアルデヒド
B5720−6 3−クロロベンズアルデヒド
12965−8 m−アニスアルデヒド
34648−9 3−(トリフロオロメトキシ)−ベンズアルデヒド
34199−1 3−(1,1,2,2‐テトラフルオロエトキシ)−ベ
ンズアルデヒド
H1980−8 3−ヒドロキシベンズアルデヒド
N1084−5 3−ニトロベンズアルデヒド
11528−2 イソフタルアルデヒド
T3560−2 p−トルアルデヒド
23363−3 4−エチルベンズアルデヒド
13517−8 4−イソプロピルベンズアルデヒド
22494−4 アルファ.アルファ.アルファ−トリフルオロ−p−ト
ルアルデヒド
12837−6 4−フルオロベンズアルデヒド
11221−6 4−クロロベンズアルデヒド
B5740−0 4−ブロモベンズアルデヒド
A8810−7 p−アニスアルデヒド
17360−6 4−エトキシベンズアルデヒド
33363−8 4−プロポキシベンズアルデヒド
23808−2 4−ブトキシベンズアルデヒド
37060−6 4−(トリフロオロメトキシ)−ベンズアルデヒド
27486−0 テレフタルアルデヒド−モノ−(ジエチルアセタール)
14408−8 4−ヒドロキシベンズアルデヒド
22277−1 4−(メチルチオ)ベンズアルデヒド
10976−2 4−(ジメチルアミノ)ベンズアルデヒド
D8625−6 4−(ジメチルアミノ)ベンズアルデヒド
33851−6 4−(ジブチルアミノ)ベンズアルデヒド
29355−5 4−(3−ジメチルアミノプロポキシ)ベンズアルデヒ
ド
13017−6 4−ニトロベンズアルデヒド
T220−7 テレフタルジカルボキサアルデヒド
34252−1 3‐フルオロ−2−メチルベンズアルデヒド
34649−7 2−フルオロ−3−(トリフルオロメチル)−ベンズア
ルデヒド
26514−4 2,3−ジフルオロベンズアルデヒド
26515−2 2,6−ジフルオロベンズアルデヒド
14124−0 2−クロロ−6−フルオロベンズアルデヒド
D5650−0 2,6−ジクロロベンズアルデヒド
25483−5 2,3−ジクロロベンズアルデヒド
D13020−6 2,3−ジメトキシベンズアルデヒド
29250−8 2,6−ジメトキシベンズアルデヒド
31980−5 3−フルオロサリチルアルデヒド
12080−4 o−バニリン
18983−9 2,3−ジヒドロキシベンズアルデヒド
10604−6 2−クロロ−6−ニトロベンズアルデヒド
16382−1 3−メトキシ−2−ニトロベンズアルデヒド
11750−1 2,6−ジニトロベンズアルデヒド
15104−1 2,4−ジメチルベンズアルデヒド
15106−8 2,5−ジメチルベンズアルデヒド
37682−5 2−クロロ−5−(トリフルオロメチル)ベンズアルデ
ヒド
26516−0 3,4−ジフルオロベンズアルデヒド
26517−9 2,4−ジフルオロベンズアルデヒド
26518−7 2,5−ジフルオロベンズアルデヒド
30600−2 3−クロロ−4−フルオロベンズアルデヒド
34807−4 2−クロロ−4−フルオロベンズアルデヒド
33954−7 3−ブロモ−3−フルオロベンズアルデヒド
D5660−8 3,4−ジクロロベンズアルデヒド
14675−7 2,4−ジクロロベンズアルデヒド
15212−9 3−メチル−p−アニスアルデヒド
15558−6 3−フルオロ−p−アニスアルデヒド
15429−6 5−ブロモ−o−アニスアルデヒド
D13040−0 2,4−ジメトキスベンズアルデヒド
D13060−5 2,5−ジメトキスベンズアルデヒド
14375−8 3,4−ジメトキスベンズアルデヒド
25275−1 3−エトキシ−4−メトキシベンズアルデヒド
P4910−4 ピペロナール
26459−8 1,4−ベンゾジオキサン−6−カルボキサアルデヒド
31691−1 4−ヒドロキシ−3−メチルベンズアルデヒド
34606−3 2−クロロ−4−ヒドロキシベンズアルデヒド
25975−6 5−クロロサリチルアルデヒド
13728−6 5−ブロモサリチルアルデヒド
14686−2 2−ヒドロキシ−5−メトキシベンズアルデヒド
16069−5 2−ヒドロキシ−4−メトキシベンズアルデヒド
14368−5 3−ヒドロキシ−4−メトキシベンズアルデヒド
VllO−4 バニリン
12809−0 3−エトキシ−4−ヒドロキシベンズアルデヒド
34215−7 5−(トリフルオロメトキシ)サリチルアルデヒド
D10840−5 3,4−ジヒドロキシベンズアルデヒド
D10820−0 2,5−ジヒドロキシベンズアルデヒド
16863−7 2,4−ジヒドロキシベンズアルデヒド
22568−1 4−(ジエチルアミノ)サリチルアルデヒド
C5880−0 5−クロロ−2−ニトロベンズアルデヒド
13903−3 2−クロロ−5−ニトロベンズアルデヒド
C5870−3 4−クロロ−3−ニトロベンズアルデヒド
14432−0 4−ヒドロキシ−3−ニトロベンズアルデヒド
15616−7 3−ヒドロキシ−4−ニトロベンズアルデヒド
27535−2 2−ヒドロキシ−5−ニトロベンズアルデヒド
H4810−7 5−ヒドロキシ−2−ニトロベンズアルデヒド
D19360−7 2,4−ニトロベンズアルデヒド
29013−0 3,5−ビス(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド
29017−3 3,5−ジフルオロベンズアルデヒド
13940−8 3,5−ジクロロベンズアルデヒド
36811−3 3,5−ジヒドロキシベンズアルデヒド
12269−2 3,5−ジメトキシベンズアルデヒド
36810−5 3,5−ジベンジルオキシベンズアルデヒド
M680−8 メシトアルデヒド
29233−8 2,3,5−トリクロロベンズアルデヒド
13061−3 5−ブロモベラトルムアルデヒド
13871−1 2,4,6−トリメトキシベンズアルデヒド
T6840−3 3,4,5−トリメトキシベンズアルデヒド
14039−2 3,5−ジメチル−4−ヒドロキシベンズアルデヒド
35768−5 2,6−ジメチル−4−ヒドロキシベンズアルデヒド
14040−6 3,5−ジ−tert−ブチル−4−ヒドロキシベンズ
アルデヒド 半水和物
26181−5 3,5−ジクロロサリチルアルデヒド
12213−0 3,5−ジブロモサリチルアルデヒド
28344−4 3,5−ジヨードサリチルアルデヒド
13060−5 5−ブロモバニリン
12948−8 5−ヨードバニリン
13879−7 4,6−ジメトキシサリチルアルデヒド
25871−7 5−ニトロバニリン
S760−2 3,5−ジニトロサリチルアルデヒド
25959−4 2,5−ジメチル−p−アニスアルデヒド
T6540−4 5−ブロモ−2,4−ジメトキシベンズアルデヒド
N2800−0 4−ニトロバニリン
27680−4 3,5−ジニトロサリチルアルデヒド
15205−6 2,5−ジメチル−p−アニスアルデヒド
29251−6 5−ブロモ−2,4−ジメトキシベンズアルデヒド
15557−8 6−ブロモベラトルムアルデヒド
13215−2 2,4,5−トリメトキシベンズアルデヒド
27960−9 6−ニトロベラトルムアルデヒド
13765−0 6−ニトロピペロナール
27679−0 2,5−ジクロロテレフタルアルデヒド
33066−3 2,3,4−トリフルオロベンズアルデヒド
29231−1 2,3,6−トリフルオロベンズアルデヒド
15201−3 2,3−ジメチル−p−アニスアルデヒド
29627−9 2,4−ジメトキシ−3−メチルベンズアルデヒド
15209−9 2,3,4−トリメトキシベンズアルデヒド
26084−3 2,3,4−トリヒドロキシベンズアルデヒド
32893−6 テトラフルオロベンズアルデヒド
10374−8 ペンタフルオロベンズアルデヒド
B3468−0 4−ビフェニルカルボキサアルデヒド
19175−2 3−フェノキシベンズアルデヒド
B2700−5 3−ベンジルオキシベンズアルデヒド
19540−5 3−(4−メチルフェノキシ)ベンズアルデヒド
19592−8 3−(4−tert−ブチルフェノキシ)ベンズアルデ
ヒド
19539−1 3−[3−(トリフルオロメチル)フェノキシ]ベンズ
アルデヒド
19530−8 3−(4−クロロフェノキシ)ベンズアルデヒド
19590−1 3−(3,4−ジクロロフェノキシ)ベンズアルデヒド
19774−2 3−(3,5−ジクロロフェノキシ)ベンズアルデヒド
19589−8 3−(4−メトキシフェノキシ)ベンズアルデヒド
21126−5 4−フェノキシベンズアルデヒド
12371−4 4−ベンジルオキシベンズアルデヒド
16361−9 4−ベンジルオキシ−3−メトキシベンズアルデヒド
16395−3 3−ベンジルオキシ−4−メトキシベンズアルデヒド
34603−9 3−メトキシ−4−(4−ニトロベンジルオキシ)ベン
ズアルデヒド
D3600−3 3,4−ジベンジルオキシベンズアルデヒド
N10−9 1−ナフトアルデヒド
N20−6 2−ナフトアルデヒド
15134−3 2−メトキシ−1−ナフトアルデヒド
10324−1 4−メトキシ−1−ナフトアルデヒド
H4535−3 2−ヒドロキシ−1−ナフトアルデヒド
27208−6 4−ジメチルアミノ−1−ナフトアルデヒド
38201−9 2,3−ナフタレンジカルボキサアルデヒド
15014−2 2−フルオレンカルボキサアルデヒド
27868−8 9−アントラアルデヒド
M2965−7 10−メチルアントラセン−9−カルボキサアルデヒド
15211−0 10−クロロ−9−アントラアルデヒド
P1160−3 フェナントレン−9−カルボキサアルデヒド
14403−7 1−ピレンカルボキサアルデヒド
脂肪族アルデヒド
25254−9 ホルムアルデヒド
11007−8 アセトアルデヒド
P5145−1 プロピオンアルデヒド
24078−8 イソブチルアルデヒド
T7150−1 トリメチルアセトアルデヒド
B10328−4 ブチルアルデヒド
M3347−6 2−メチルブチルアルデヒド
11009−4 2−エチルブチルアルデヒド
14645−5 イソ吉草酸アルデヒド
35990−4 3,3−ジメチルブチルアルデヒド
11013−2 吉草酸アルデヒド
25856−3 2−メチル吉草酸アルデヒド
D19050−0 2,4−ジメチル吉草酸アルデヒド
11560−6 ヘキサナール
E2910−9 2−エチルヘキサナール
30355−0 3,5,5−トリメチルヘキサナール
H212−0 ヘプトアルデヒド
0560−8 オクチルアルデヒド
N3080−3 ノニルアルデヒド
12577−6 デシルアルデヒド
U220−2 ウンデシルアルデヒド
M8675−8 2−メチルウンデカナール
D22200−3 ドデシルアルデヒド
26923−9 トリデカナール
T1000−6 テトラデシルアルデヒド
11022−1 アクロレイン
13303−5 メタクロレイン
25614−5 2−エチルアクロレイン
25613−7 2−ブチルアクロレイン
13298−5 クロトンアルデヒド
19261−9 トランス−2−メチル−2−ブテナール
29468−3 2−エチル−トランス−2−ブテナール
30407−7 3−メチル−2−ブテナール
26925−5 トランス−2−ペンテナール
29466−7 2−メチル−2−ペンテナール
29097−1 2,2−ジメチル−4−ペンテナール
13265−9 トランス−2−ヘキセナール
25176−3 トランス−2−ヘプテナール
30796−3 2,6−ジメチル−5−ヘプテナール
26995−6 トランス−2−オクテナール
34364−1 (R)−(+)−シトロネラール
37375−3 (S)−(−)−シトロネラール
25565−3 トランス−2−ノネナール
37562−4 シス−4−デセナール
36733−8 トランス−4−デセナール
13227−6 ウンデシレンアルデヒド
24911−4 シス−9−ヘキサデセナール
27221−3 シクロプロパンカルボキサアルデヒド
10846−4 シクロヘキサンカルボキサアルデヒド
10933−9 シクロオクタンカルボキサアルデヒド
30441−7 3−シクロヘキシルプロピオンアルデヒド
T1220−3 テトラヒドロベンズアルデヒド
21829−4 (S)−(−)−ペリリルアルデヒド
26467−9 2,6,6−トリメチル−1−シクロヘキセン−1−ア
セトアルデヒド
10937−1 5−ノルボルネン−2−カルボキサアルデヒド
21824−3 (1R)−(−)−ペリリルアルデヒド
37531−4 グリオキサール−1,1,−ジメチルアセタール
21877−4 7−メトキシ−3,7−ジメチルオクタナール
23254−8 3−エトキシメタクロレイン
27525−5 2,5−ジメトキシ−3−テトラヒドロフランカルボキ
サアルデヒド
26918−2 2,2−ジメチル−3−ヒドロキシプロピオンアルデヒ
ド
G480−2 DL−グリセルアルデヒド
G478−0 D−グリセルアルデヒド
21665−8 L−グリセルアルデヒド
34140−1 3−(メチルチオ)プロピオンアルデヒド
30583−9 3−(ジメチルアミノ)アクロレイン
36549−9 3−(ジメチルアミノ)−2−メチル−2−プロペナー
ル
17733−4 ピルビンアルデヒド
27706−1 (s)−(−)−2−(メトキシメチル)−1−ピロリ
ジンカルボキサアルデヒド
29211−7 2−メトキシ−1−ピロリジンカルボキサアルデヒド
29210−9 2−メトキシ−1−ピペリジンカルボキサアルデヒド実施例123 アリール酸ハロゲン化物を用いるオリゴマー性化合物からのライブラリの合成 例示的文字として、ベンゾイルクロリド Aldrich;3−メチルベンゾイ ルクロリド Aldrich−T3,550−5;3−メトキシベンゾイルクロ リド Aldrich−12,965−8;および3−ニトロベンゾイルクロリ ド Aldrich−N1,084−5を用いる
実施例121にしたがうコンビナトリアルライブラリの製造は、上記ベンジル
アルデヒドの代わりに安息香酸および安息香酸誘導体を用いて、実施例63およ
び65の一般的方法を用いて行う。
上述の方法を用い、Aldrich Chemical Company,I
nc.,Milwaukee,WIから入手可能な以下のハロゲン化物の1つ、
2つ、3つ、4つまたはそれ以上で誘導体化されるオリゴマー性化合物からライ
ブラリを製造する。Aldrichカタログ番号は欄の左側に与えられており、
化合物名は欄の右側に与えられている:
10663−1 p−トルオイルクロリド
30253−8 3−シアノベンゾイルクロリド
13096−6 (+/−)−2−クロロ−2−フェニルアセチルクロリ
ド
26366−4 3−(クロロメチル)ベンゾイルクロリド
27078−4 4−(クロロメチル)ベンゾイルクロリド
24947−5 4−(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリド
19394−1 4−クロロフェノキシアセチルクロリド
24948−3 2−(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリド
19394−1 4−クロロフェノキシアセチルクロリド
24948−3 2−(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリド
10663−1 p−トルオイルクロリド
25027−9 3−(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリド
S67828−7 2−(2,4,5−トリクロロフェノキシ)アセチルク
ロリド
12201−7 o−トルオイルクロリド
40248−6 4−(トリフルオロメトキシ)ベンゾイルクロリド
37502−0 3−(ジクロロメチル)ベンゾイルクロリド
12225−4 m−トルオイルクロリド
12482−6 4−シアノベンゾイルクロリド
P1675−3 フェニルアセチルクロリド
S88415−4 2−(フェニルチオ)プロピオニルクロリド
15862−3 フェノキシアセチルクロリド
36475−4 トランス−4−ニトロシンナモイルクロリド
28882−9 4−エトキシベンゾイルクロリド
23024−3 m−アニソイルクロリド
S67595−4 2,3−ジブロモ−3−フェニルプロピオニルクロリド
30101−9 ベンジルオキシアセチルクロリド
25470−3 o−アニソイルクロリド
C8110−1 シンナモイルクロリド
31693−8 3−メトキシフェニルアセチルクロリド
A8847−6 p−アニソイルクロリド
16519−0 アセチルサリチルオキシクロリド
36569−6 4−メトキシフェニルアセチルクロリド
24944−0 ヒドロシンナモイルクロリド
26528−4 3,5−ビス(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリ
ド
28350−94 エチルベンゾイルクロリド
S40503−5 2−フェノキシプロピオニルクロリド
33304−2 2,5−ビス(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリ
ド
S62043−2 p−トリルアセチルクロリド
16171−3 3,5−ジメトキシベンゾイルクロリド
42339−4 (R)−(−)−A−メトキシ−A−(トリフルオロメ
チル)−フェニルアセチルクロリド
26480−6 2,5−ジメトキシフェニルアセチルクロリド
25804−0 3,4−ジメトキシベンゾイルクロリド
T6980−9 3,4,5−トリメトキシベンゾイルクロリド
26242−0 2,6−ジメトキシベンゾイルクロリド
13430−9 トランス−2−フェニル−1−シクロプロパンカルボニ
ルクロリド
S62264−8 5−(ジメチルスルファモイル)−2−メトキシベンゾ
イルクロリド
37383−4 2,4−ジメトキシベンゾイルクロリド
A1740−4 o−アセチルマンデル酸クロリド
24945−9 4−フェニル−1,2,3,4−テトラクロロ−1,3
−ブタジエン−1−カルボニルクロリド
36848−2 トランス−3−(トリフルオロメチル)シンナモイルク
ロリド
15712−0 4−tert−ブチルベンゾイルクロリド
S42860−4 2−フェニルブチリルクロリド
22203−8 4−ブチルベンゾイルクロリド
23747−7 3,4−ジメトキシフェニルアセチルクロリド
22204−6 4−ブトキシベンゾイルクロリド
S65659−3 2−(4−クロロベンゾイル)ベンゾイルクロリド
22214−3 4−ペンチルベンゾイルクロリド
C3928−8 2−クロロ−2,2−ジフェニルアセチルクロリド
S43639−9 4(4−ニトロフェニルアゾ)ベンゾイルクロリド
33158−9 ジフェニルアセチルクロリド
S80926−8 4−(フェニルアゾ)ベンゾイルクロリド
S61661−3 2−ジフェニルアセチルクロリド
16114−4 4−ビフェニルカルボニルクロリド
22209−7 4−ヘキシルベンゾイルクロリド
22205−4 4−ヘプチルオキシベンゾイルクロリド
22211−9 4−ヘキシルオキシベンゾイルクロリド
22206−2 4−ヘプチルオキシベンゾイルクロリド実施例124 固体支持体のローディング、一般法 方法1:アミノジオールモノマーのスクシニル化と活性化
FMOC保護モノ‐DMTアミノジオール(36mmoL)を400mLのC
H2Cl2に溶かし、そしてトリエチルアミン(45mmoL、6.25mL)と
コハク酸無水物(40mmoL、4.0g)を加えた。触媒量のDMAP(5m
oL%)を加え、そして室温で一晩撹拌した。TLCは、全ての出発原料が、よ
り極性の大きいスポット位置に移っていることを示した。次いで、この溶液にペ
ンタフルオロフェニル・トリフルオロアセタート(6.9mL、40mmoL)
を加えた。この溶液を1時間撹拌すると、その極性物質は、TLC上で非‐極性
スポット位置に移っていた。トルエン(150mL)を加え、そして溶媒を蒸発
させた。油状の残留物をフラッシュカラム・クロマトグラフィーカラムに入れ、
酢酸エチルとヘキサンで展開して、生成物(33mmoL,93%)を得た。方 法2:テンタゲルの誘導化
テンタゲル‐NH2(50g,11mmoL NH2)を150mLのCH2C
l2に膨潤させ、次いでCH2Cl2に溶したジイソプロピルエチルアミンの5%
溶液で、次いでCH2Cl2で洗滌した。この樹脂を吸引して乾燥し、120mL
のCH2Cl2に溶したコハク酸PFPエステルモノマー(17mmoL)の溶液
とトリエチルアミン(3.5mL、25mmoL)を加えた。この溶液を回転振
とう機で6時間かき混ぜ、濾過し、CH2Cl2で洗滌し、次いでPFPエステル
(16mmoL)の第2部分とトリエチルアミン(3.5mL)を加えた。この
固体支持体を一晩振とうし、濾過し、そして再び60mLのCH2Cl2に懸濁さ
せ、60mLのピリジンと10mLの酢酸無水物を加えた。1時間後、この樹脂
濾過し、CH2Cl2、ピリジン/CH2Cl2/メタノール(1:8:1)および
ジエチルエーテルで洗滌した。このローディング
(負荷量)をDMTカチオンで測定し、0.14‐0.20mmoL/gの値を
得た。実施例125 固体支持体上のスカフォールドの誘導化.スカフォールドモノマーのカルボン酸 によるアシル化の一般法
固体支持体(0.5gテンタゲル、0.15mmoL/g)に付いたアミノジ
オールを振とうフラスコに入れ、アルゴンで15分間パージする。この固体支持
体は予めCH2Cl2中で膨潤させ(60分)次いでDMF(6mL)で洗ってお
く。FMOC保護基が付いているなら、ピペリジン/DMF(10%,6mL、
〜80当量)の溶液を加えて除去し、次いで、この反応混合物を15分振とうす
る。この支持体をDMF(6mL×5)で洗う。DMFに溶したカルボン酸(0
.4M、〜5当量)とDIEA(0.8M、〜10当量)の溶液を加え、次いで
DMFに溶した活性化剤:BOPもしくはHATU(0.4M、〜5当量)を加
えた。この反応混合物を振とうし(30分)、次いでDMF(6mL×3)とC
H2Cl26mL×3)で洗った。数種の他の活性化剤も使用できる。これらに含
まれるのは、ジシクロヘキシル・カルボジイミド(DCC)、ジイソプロピル・
カルボジイミド(DIC)、ジメチルアミノアミノプロピルエチル・カルボジイ
ミド塩酸塩(EDC)のようなカルボジイミド、EEDQおよびIIDQ、カル
ボニルジイミダゾールであり、ジメチルアミノピリジン、N‐ヒドロキシベンゾ
トリアゾール、N‐ヒドロキシ‐7‐アザベンゾトリアゾール、およびこの技術
分野の習熟者に知られた他の添加物と共に或いは添加物なしに用いられる。他の
有用なカップリング剤に含まれるのは、HBTU、TBTU、BOP、PyBR
OPおよび他の類似の試薬のようなウロニウム塩およびホスホニウム塩、および
シアヌール酸フルオリドのようなアシルフルオリド生成用試薬である。これら各
試薬のそれぞれの代表的な例は、Bodanszky,M.Principle
s of Peptide Synthesis,2nd Ed.Spring
er‐Verlag,Berlin,1993、に見られる。
本発明のアミノジオールのアミノ基を誘導化するために利用できる代表的カル
ボン酸に含まれる化合物は:
2‐オキソ吉草酸、
2‐オキソ‐オクタン酸、
2‐オキソ‐2‐(2‐フリル)酢酸、
インドール‐3‐ピルビン酸、
2‐ニトロフェニルピルビン酸、
2‐フリルチオピルビン酸、
メタクリル酸、
メチルプロピオン酸(イソブチル酪酸)、
シアノ酢酸、
メトキシ酢酸、
3‐メチルチオプロピオン酸、
4‐メチルペンタノン酸、
3‐トリメチルシリルプロピオン酸ナトリウム塩、
N‐BOC‐5‐アミノ吉草酸、
(N,N‐ジエチルアミノ)プロピオン酸塩酸塩、
モノメチルグルタレート、
7‐オキソ‐オクタン酸、
1,2,3‐チアジアゾール‐4‐カルボン酸、
3‐アミノ‐1,2,4‐トリアゾール‐5‐カルボン酸、
3‐フロン酸、
2‐フロン酸、
4‐(S)‐ブチロラクトン‐4‐カルボン酸、
1‐メチルピロール‐2‐カルボン酸、
4‐メチル‐2‐フェニル‐1,2,3‐トリアゾール‐5‐カルボン酸、
1‐(3'-アミノフェニル)‐3‐カルボキシ‐5‐ピラゾロン、
4‐フェニル‐5‐トリフルオロメチル‐チオフェン‐2‐カルボン酸、
3‐(4‐クロロフェニルチオ)チオフェン‐4‐カルボン酸、
5‐(2‐ピリジルチオメチル)‐2‐フランカルボン酸、
インドール‐2‐カルボン酸、
1‐メチルインドール‐2‐カルボン酸、
7‐ベンジルオキシインドール‐2‐カルボン酸、
4‐オキソ‐4,5,6,7‐テトラヒドロベンゾ[b]フラン‐3‐カルボン
酸、
1‐メチルインデン‐2‐カルボン酸、
4‐クロロ‐3‐スルファモイル安息香酸、
2‐ヒドロキシ安息香酸(サリチル酸)、
a‐メルカプト‐p‐トルイル酸、
BOC‐4‐(アミノエチル)安息香酸、
BOC‐4‐(メチルアミノ)安息香酸、
N‐アセチル‐4‐アミノ安息香酸、
4‐イソプロポキシ安息香酸、
4‐(2‐[メチルスルホンアミド]エトキシ)安息香酸、
4‐(1H‐ピロール‐1‐イル)安息香酸、
4‐(3‐メチル‐5‐オキソ‐2‐ピラゾリン‐1‐イル)安息香酸、
4'-(トリフルオロメチル)‐2‐ビフェニルカルボン酸、
2‐(4‐ニトロフェニルチオ)安息香酸、
2‐フェノキシ安息香酸、
2‐(4‐クロロベンゾイル)安息香酸、
2‐ベンゾイル安息香酸、
a‐フェニル‐o‐トルイル酸、
a‐(4‐メトキシ‐1‐ナフチル)‐o‐トルイル酸、
2‐(1,2,3,4‐テトラヒドロ‐6‐ナフチルメチル)安息香酸、
2‐(2‐ピリジルカルボニル)安息香酸、
4‐(3‐フルオロベンズアミド)安息香酸、
3'-カルボキシ‐3‐メチルベンズアニリド、
2'-メトキシフタルアニル酸、
3‐ベンジルオキシ‐4‐メトキシ安息香酸、
N‐(3‐メチルシ‐2‐ピリジル)フタルアミン酸、
1‐(4‐カルボキシフェニル)‐3‐(o‐トリル)尿素、
ベンゾトリアゾール‐5‐カルボン酸、
5‐ベンゾイミダゾールカルボン酸、
ピペロニル酸、
2,2,5,7‐テトラメチル‐1‐オン‐4‐カルボン酸、
2‐ナフトエ酸、
2‐ピラジンカルボン酸、
ピコリン酸、
ニコチン酸、
イソニコチン酸、
6‐ヒドロキシニコチン酸、
テトラヒドロピラン‐4‐カルボン酸、
N‐BOC‐4‐ピペリジンカルボン酸(イソニペコチン酸)、
1,3‐ジメチル‐6‐ウラシルカルボン酸、
2‐ピロールピリジン‐5‐カルボン酸、
2‐フェノキシニコチン酸、
2‐(4‐メチルフェノキシ)ピリジン‐3‐カルボン酸、
2‐フェニルイミダゾ(1,2‐A)ピリジン‐6‐カルボン酸、
3‐イソキノリンカルボン酸、
4‐キノリンカルボン酸、
4‐ヒドロキシ‐7‐トリフルオロメチル‐3‐キノリンカルボン酸、
2‐p‐トリルシンコニン酸、
ナリディキシ酸(nalidixic acid)、
チオフェン‐2‐酢酸、
5‐(1‐ピロリジン)‐2‐テトラゾール酢酸、
N‐フタロイルグリシン、
インドール‐3‐酢酸、
シクロペンチル酢酸、
3‐インダニル酢酸、
ペンタフルオロフェニル酢酸、
2‐(2‐フルオロフェニル)酢酸、
(S)‐(+)‐マンデル酸、
(a,a,a‐トリフルオロ‐m‐トリル)酢酸、
R‐(−)‐a‐メトキシフェニル酢酸、
2‐(4‐クロロフェニル)‐2,2‐ジメチル酢酸、
R‐(−)‐2‐フェニル酪酸、
(3,4‐ジメトキシフェニル)酢酸、
4‐(ジメチルアミノ)フェニル酢酸、
4‐ビフェニル酢酸、
2‐ベンジルオキシフェニル酢酸、
1‐(4‐メチルフェニル)‐1‐シクロプロパンカルボン酸、
ベンジル酸、
オロチン酸、
4‐ピリジル酢酸塩酸塩、
フェニル酢酸、
2‐(2‐フェニル‐1‐シクロヘキシル)酢酸、
トランス‐3‐フランアクリル酸、
2‐メチル‐4‐ニトロ‐1‐イミダゾールプロピオン酸、
5‐フェニル‐2‐ピロールプロピオン酸、
2‐(4‐クロロフェノキシ)酢酸、
フェノキシ酢酸、
N‐フェニルグリシン、
2,5‐ジフルオロ・ケイ皮酸、
3‐(4‐インドフェニル)プロピオン酸、
N‐(2,4‐ジニトロフェニル)‐L‐アラニン、
3‐(3‐ヒドロキシフェニル)プロピオン酸、
p‐トルエンスルホニル酢酸、
BOC‐3‐(p‐アミノフェニル)プロピオン酸、
4‐シアノ・ケイ皮酸、
4‐メトキシ・ケイ皮酸、
2‐(p‐クロロエノキシ)‐2‐メチルプロピオン酸、
p‐(p‐ニトロベンジルオキシ)ケイ皮酸、
2‐ナフトキシ酢酸、
3,3‐ジフェニルプロピオン酸、
3,5,6‐トリクロロ‐2‐ピリドキシ酢酸、
4‐ピリジルチオ酢酸、
5‐トリフルオロメチル‐2‐ピリジルチオ酢酸、
1‐ピペリジンプロピオン酸、
4‐オキソ‐4‐(1‐ピロリジン)酪酸、
3‐(4‐フルオロベンゾイル)プロピオン酸、
3‐ベンゾイルプロピオン酸
N‐メチルヒプリン酸、
4‐オキソ‐4‐(2‐トリフルオロメチルフェニル)酪酸、
3‐(4‐メトキシベンゾイル)プロピオン酸、
3‐(4‐メチルスルホニルベンゾイル)プロピオン酸、
4‐(4‐アセチルフェニル)酪酸、
4‐オキソ‐4‐(2‐ナフチル)酪酸、
ダンシルグリシン、
3‐(4‐メトキシ‐1‐ナフトイル)プロピオン酸、
(−)‐O,O´‐ジベンゾイル‐L‐酒石酸モノ(ジメチルアミド)、
1‐(3‐カルボキシ‐1‐オキシプロピル)‐,2,3,4テトラヒドロキノ
リン、
1,2‐ジヒドロ‐2‐メチル‐1‐オキソ‐3‐イソキノリン酪酸、
2‐(2‐カルボキシエチルチオ)3,5,6‐トリメチル‐1,4‐ベンゾキ
ノン、
(+)‐ビオチン、
4‐(2‐メルカプトベンゾチアゾリル)酪酸、
Z‐スチレンスルホニル酢酸、
4‐(p‐クロロフェノキシ)酪酸、
3‐(ベンジルチオ)プロピオン酸、
N‐(2‐ピリジル)スクシナム酸、
Cbz‐グリシン、
2‐[(2‐フェノキシエチル)チオ]酢酸、
2‐(ベンゼンスルホニル)エチルチオ酢酸、
2'-カルバモイルグルタルアニリン酸、である。実施例126 酸クロリド、酸無水物および活性化カルボン酸誘導体によるスカフォールドモノ マーのアシル化
固体支持体(0.5gテンタゲル、0.15mmoL/g)に付いたアミノジ
オールを振とうフラスコに入れ、アルゴンでパージした(15分間)。この支持
体は予めCH2Cl2中で膨潤させ(60分)次いでDMF(6mL)で洗った。
FMOC保護基が付いているなら、ピペリジン/DMF(10%,6mL、〜8
0当量)の溶液を加えて除去し、次いで、この反応混合物を15分振とうした。
この支持体をDMF(6mL×5)で洗った。ピリジン/DMF(10%,3m
L、〜50当量)、酸クロリド/DMF(0.12M、3mL、〜5当量)を加
え、そしてその反応混合物を30分間振とうした。酸クロリドの代りに、DMF
に溶した酸無水物もしくは他の活性化誘導体を使用することができる。次いでこ
の支持体をDMF(6mL×3)とCH2Cl26mL×3)で洗った。酸クロリ
ドの代りになり得る試薬の例は、酸無水物および混合酸無水物、イミダゾリド類
もしくは、N‐ヒドロキシ・スクシンイミドエステル類、および他のO‐アシル
ヒドロキシルアミン誘導体、アシルアジド、4‐ニトロフェニルエステル、ペン
タクロロフェニルあるいはペンタフルオロフェニルエステルおよびその他の活性
アリールおよびビニールエステルのような活性エステル類である。これら各試薬
のそれぞれの代表的な例は、Bodanszky,M.Principles
of Peptide Synthesis,2nd Ed.Springer
‐Verlag,Berlin,1993、に見られる。実施例127 スカフォールドモノマーのスルホニル化
固体支持体(0.5gテンタゲル、0.15mmoL/g)に付いたアミノジ
オールを振とうフラスコに入れ、アルゴンでパージした(15分間)。この支持
体は予めCH2Cl2中で膨潤させ(60分)次いでDMF(6mL)で洗った。
FMOC保護基が付いているなら、ピペリジン/DMF(10%,6mL、〜8
0当量)の溶液を加えて除去し、次いで、この反応混合物を15分振とうした。
この支持体をDMF(6mL×5)で洗った。TEA/CH3CN(10%、3
mL、〜30当量)の溶液を加え、次いで、CH3CN/ピリジンに溶したスル
ホニルクロリド(0.12M、3mL〜5当量)を加え、そしてこの反応混合物
を30分振とうした。この支持体をDMF(6mL×3)とCH2Cl26mL×
3)で洗った。
本発明で使用するのに適した代表的スルホリニルクロリドに含まれるのは:
メタンスルホニルクロリド、
ジメチルスルファモイルクロリド、
1‐ブタンスルホニルクロリド、
3,5‐ジメチルイソオキサゾール‐4‐スルホニルクロリド、
5‐(4クロロベンズアミドメチル)チオフェン‐2‐スルホニルクロリド、
ベンゼンスルホニルクロリド、
o‐カルボメトキシベンゼンスルホニルクロリド、
N‐アセチルスルファニルクロリド、
2,5‐ジメトキシベンゼンスルホニルクロリド、
3‐(クロロスルホニル)安息香酸、
2‐ジベンゾフランスルホニルクロリド、
2‐ナフタレンスルホニルクロリド、
8‐キノリンスルホニルクロリド、
フェニルメタンスルホニルクロリド、
(+/−)‐10‐カンファースルホニルクロリド、
N‐アセチルスルファニリルクロリド、
3,5‐ジクロロベンゼンスルホニルクロリド、
ダンシルクロリド、である。実施例128 スカフォールドモノマーのアルキル化
固体支持体(0.5gテンタゲル、0.15mmoL/g)に付いたアミノジ
オールを振とうフラスコに入れ、アルゴンでパージした(15分間)。この支持
体は予めCH2Cl2中で膨潤させ(60分)次いでDMF(6mL)で洗った。
FMOC保護基が付いているなら、ピペリジン/DMF(10%,6mL、〜8
0当量)の溶液を加えて除去し、次いで、この反応混合物を15分振とうした。
この支持体をDMF(6mL×5)で洗った。DMFに溶したDIEA溶液(1
0%、3mL、〜50当量)、DMFに溶したアルキル化剤、(アルキルハライ
ド、メシレート、トシレートもしくはトリフレート)(0.2M、3mL、〜5
当量)を加え、そしてこの反応混合物を20分振とうした。この支持体をDMF
(6mL×3)とCH2Cl26mL×3)で洗った。実施例129 固体支持体上での尿素の合成
固体支持体(0.5gテンタゲル、0.15mmoL/g)に付いたアミノジ
オールを振とうフラスコに入れ、アルゴンでパージした(15分間)。この支持
体は予めCH2Cl2中で膨潤させ(60分)次いでDMF(6mL)で洗った。
FMOC保護基が付いているなら、ピペリジン/DMF(10%,6mL、〜8
0当量)の溶液を加えて除去し、次いで、この反応混合物を15分振とうする。
この支持体をDMF(6mL×5)で洗った。DMFに溶したイソシアナートの
溶液(2.0mL、0.2M)を加え、次いで、DMFに溶したDMAPを加え
、そして得られた混合物を振とうする(120分)。次いで、この支持体をDM
F(6mL×3)とCH2Cl26mL×3)で洗う。
本発明で使用するのに適した代表的なイソシアナートに含まれるのは:
ベンゾイルイソシアナート、
4‐クロロベンゼンスルホニルイソシアナート、
ベンゼンスルホニルイソシアナート、
3‐ニトロフェニルイソシアナート、
4‐アセチルフェニルイソシアナート、
2,5‐ジメチルフェニルイソシアナート、
エチル‐4‐イソシアナートベンゾエート、
2‐フェニルフェニルイソシアナート、
4‐フェノキシフェニルイソシアナート、
1‐ナフチルイソシアナート、
R‐(+)‐a‐メチルベンジルイソシアナート、
メチルイソシアナート、
イソプロピルイソシアナート、
シクロヘキシルイソシアナート、
アリルイソシアナート、
クロロメチルイソシアナート、
クロロプロピルイソシアナート、
エチルイソシアナートアセタート、
4‐(クロロメチル)フェニルイソシアナート、
3‐クロロフェニルイソシアナート、
4‐フルオロフェニルイソシアナート、
エチル‐4‐イソシアナートベンゾエート、
3,5‐ジクロロフェニルイソシアナート、である。実施例130 品質管理
:誘導化されている固体支持体に付いているスカフォールドの一部(5
mg)を、ガラスウールの栓の付いた使い捨ての1mLシリンジに入れる。TC
A/CH2Cl2(3%、0.4mL×5)を吸い入れ、この反応混合物を手で振
り、DMTを除去する。この支持体をCH2Cl2(6mL×3)とDMF(6m
L×3)で洗う。DMT‐デオキシチミジンH‐ホスホナート/ピリジン‐CH3
CN(0.1M,0.4mL、〜50当量)を加え、そしてその反応混合物を
手で3分間振る。この支持体をピリジン‐CH3CN(1mL×3)およびTH
F(1mL×3)で洗う。H‐ホスホン酸ジエステルの酸化は、
I2のTHF溶液(0.2M、0.4mL、〜100当量)とH2O/TEA/T
HF(1:1:8、0.4mL)を加え、そして断続的に振って行った。この支
持体をTHF(1mL×3)、ピリジン‐CH3CN(1mL×5)、DMF(
1mL×3)、CH2Cl2(1mL×3)、およびMeOH(1mL×3)で洗
う。NH4OH(28‐30%、0.5mL)加えて、生成物を支持体から切離
す。1‐2時間後、このアンモニア溶液をバイアル中に捕集して、HPLCおよ
び質量スペクトル分析にかける。実施例131 (S)‐2‐t‐ブトキシカルボニル‐1,2,3,4‐テトラヒドロ‐7‐ヒ ドロキシイソキノリン‐3‐カルボン酸
標題化合物は、Verschueren,K.,Thoth,G.,Tour
w,D.,Lebl,M.,Van Binst,G.,Hruby,V.Sy
nthesis,1992,5,458‐ら4602、の方法で調製された。実施例132 (S)‐2‐t‐ブトキシカルボニル‐1,2,3,4‐テトラヒドロ‐3‐ヒ ドロキシメチル‐7‐ヒドロキシイソキノリン
(S)‐2‐t‐ブトキシカルボニル‐1,2,3,4‐テトラヒドロ‐7‐
ヒドロキシイソキノリン‐3‐カルボン酸(100mL)をTHF(1L)に溶
す。ボランメチルスルフィド錯体(200mmoL)を注意して加え、そして、
この溶液を還流下で1時間加熱する。この溶液を冷却し、MeOHで反応を止め
、1Nの塩酸でpHを2にする。この溶液をNaHCO3でpH7‐8に中和し
、そして溶媒を蒸発する。油状の残留物を水で稀釈し、酢酸エチルで抽出し、N
aHCO3溶液、食塩溶液で洗い、MgSO4で乾燥し、そして蒸発させて、標題
化合物を得る。実施例133 (S)‐2‐t‐ブトキシカルボニル‐3‐ヒドロキシメチル‐7‐ヒドロキシ オクタヒドロイソキノリン
t‐ブチルアルコール(9.1g、123mmoL)、50mLのエーテル、お
よびアンモニア(150mL)の溶液に、(S)‐2‐t‐ブトキシカルボニル
‐1,2,3,4‐テトラヒドロ‐3‐ヒドロキシメチル‐7‐ヒドロキシイソ
キノリン(5mmoL)を加える。この溶液を還流するまで加熱し、次いで、リ
チウム・ショット(0.51g、82mmoL)を30分かけて加えた。この溶
液を3時間還流させ、そして、液の色が消えるまで固体のNH4Clを、加える
。そのアンモニアを一晩蒸発させ、氷水を加え、そして有機相を分離する。この
水層をクロロホルムで抽出し、そして合わせた有機相を食塩水で洗い、乾燥し、
そして蒸発処理する。この粗生成物をメタノールに再溶解し、5%Pt/Cを加
え、3気圧のH2中で6時間振とうして完全に還元っする。触媒を濾別し、溶媒
を蒸発させる。得られる残留物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラ
フィーで精製すると、標題化合物が得られる。実施例134 (S)‐2‐FMOC‐3‐ヒドロキシメチル‐7‐ヒドロキシオクタヒドロイ ソキノリン
前実施例からのBOC保護化合物を酢酸エチルに溶し、1N‐HC/酢酸エチ
ル溶液を加える。この溶液を出発原料が完全に消費されるまで撹拌する。溶媒を
蒸発し、そして残存物を2M‐NaHCO3(25mL)とジオキサン(25m
L)に再溶解する。FMOC‐Clを加え、そしてその溶液を6時間撹拌する。
溶媒を蒸発し、生成物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶液、そして食塩水
で洗い、そしてMgSO4で乾燥し、蒸発処理する。得られる残留物を、フラッ
シュ・カラムクロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が得られる。実施例135 (S)‐2‐FMOC‐3‐ジメトキシトリチルオキシメチル‐7‐ヒドロキシ オクタヒドロイソキノリン
前実施例からの生成物をピリジンに溶し、0℃に冷却し、そして1.2当量の
DMT‐Clを加える。この溶液を0℃で一晩撹拌し、メタノールで反応を中止
させ、そして溶媒を蒸発する。残留物を酢酸エチルで抽出し、5%クエン酸溶液
、NaHCO3溶液、および食塩水で洗い蒸発処理する。得られる残留物をフラ
ッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が得られる。実施例136 1‐BOC‐3‐ヒドロキシメチルピロール
標題化合物は、Davies,H.M.L.,Matasi,J.J.Ahm
ed,G.J.Org.Chem.1996,61,235,の方法で合成され
る。実施例137 1‐BOC‐3‐O‐TBDMS‐ヒドロキシメチルピロール
1‐BOC‐3‐ヒドロキシメチルピロール(2.5当量)とイミダゾール(
2.5当量)をDMFに溶かし、TBDMS‐Cl(1.2当量)を加える。こ
の溶液を0℃で一晩撹拌し、水で反応を中止させ、そして酢酸エチルで抽出する
。この抽出物を水、NaHCO3溶液、および食塩水で洗い、そしてMgSO4で
乾燥する。得られる残留物を、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製す
ると、標題化合物が得られる。実施例138 メチル‐3‐O‐TBDMS‐6‐(TBDMS)‐オキシメチル‐8‐BOC ‐8‐アザビシクロ[3.2.1]オクタ‐2,6‐ジエン‐2‐カルボキシレ ート
CH2Cl2に溶した、メチル2‐ジアゾアセトアセタート(25mmoL)と
トリエチルアミン(35mmoL)の溶液を0℃に冷却し、そして、TBDMS
‐トリフレート(27mmoL)を加える。この溶液を0℃で30分撹拌し、ヘ
キサンで稀釈し、そして5%NaHCO3で洗う。この抽出物を乾燥し、そして
蒸発処理する。この粗製のエノールシリルエーテルは、直接使用できる。このエ
ノールエーテルをヘキサン(50mL)に溶し、そして、還流ヘキサン(50m
L)に溶した1‐BOC‐3‐O‐TBDMS‐ヒドロキシメチルピロール、(
25mmoL)とロジウム(II)ヘキサノエートの溶液に、アルゴン雰囲気下で
、ゆっくり加える。この溶液をさらに12時間加熱し、そして蒸発処理する。こ
の生成物は、フラッシュクロマトグラフィーで精製される。得られる残留物をシ
リカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が
得られる。実施例139 メチル‐3‐O‐TBDMS‐6‐(TBDMS)‐オキシメチル‐8‐BOC ‐8‐アザビシクロ[3.2.1]オクタ‐2‐エン‐2‐カルボキシレート
前実施例のジエン生成物とトリス(トリフェニルホスフィン)ロジウムクロリ
ド(5moL%)をエタノールに溶し、そして45psiのH2下で、12時間
振とうする。溶媒を蒸発し、そして得られる残留物をシリカゲル・フラッシュカ
ラム・クロマトグラフィーで精製すると、標題化合物が得られる。実施例140 メチル‐3‐オキソ‐6‐ヒドロキシメチル‐8‐BOC‐8‐アザビシクロ[ 3.2.1]オクタン‐2‐カルボキシレート
前実施例のビスシリルエーテルをTHFに溶し、そしてTHFに溶したテトラ
ブチルアンモニウムフルオリドの溶液に加える(3当量)。出発原料が消費され
るまで、この溶液を室温で撹拌する。溶媒を蒸発し、残留物をエーテルに再溶解
し、稀薄NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この得
られる粗製品を、フラッシュ・カラムクロマトグラフィーで精製すると、標題化
合物が得られる。実施例141 3‐オキソ‐6‐ヒドロキシメチル‐8‐BOC‐8‐アザビシクロ[3.2. 1]オクタン
前実施例のケトエステルをDMSOに溶し、そして1当量のNaClと1当量
のH2Oを加える。この溶液を開放容器中で160℃まで1時間加熱し、室温に
冷やし、そして水で稀釈する。この懸濁物液を酢酸エチルで抽出し、5%のNa
HCO3溶液、食塩水で洗い、MgSO4上で乾燥して、そして蒸発処理する。得
られる残留物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフィーで精製する
と標題の化合物が得られる。実施例142 3‐オキソ‐6‐O‐DMT‐オキシメチル‐8‐FMOC‐8‐アザビシクロ [3.2.1]オクタン
3‐オキソ‐6‐ヒドロキシメチル‐8‐BOC‐8‐アザビシクロ[3.2
.1.]オクタンを酢酸エチルに溶し、そして1N‐HCl/酢酸エチルを加え
る。
全ての出発原料が消費されるまで、この溶液を撹拌する。溶媒を蒸発し、そして
残留物を2M‐NaHCO3(25mL)とジオキサン(25mL)に再溶解す
る。FMOC‐Clを加え、この溶液を6時間撹拌する。溶媒を蒸発し、そして
、その生成物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、MgS
O4上で乾燥して、そして蒸発処理する。この粗製品をピリジンに溶し、0℃に
冷やして、そして1,2当量のDMT‐Clを加える。この溶液を0℃で一晩撹
拌し、メタノールで反応を止め、そして溶媒を蒸発する。この残留物を酢酸エチ
ルに再溶解し、5%クエン酸溶液、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そして蒸
発処理する。得られる残留物をシリカゲル・フラッシュカラム・クロマトグラフ
ィーで精製すると標題の化合物が得られる。実施例143 3‐オキソ‐6‐O‐DMT‐オキシメチル‐8‐FMOC‐8‐アザビシクロ [3.2.1]オクタン
前実施例の生成物をTHFに溶解し、そして1当量のLiBH4の溶液を加え
る。この溶液を、出発原料が消費されるまで撹拌する。pHを4(湿潤リトマス
)にして反応を注意して停止させ、そしてNaHCO3で中和する。溶媒を蒸発
し、この残留物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、乾燥
し、そして蒸発処理する。この生成物は、フラッシュクロマトグラフィーで精製
される。実施例144 N‐メチル‐2,6ジアセトキシ‐9‐アザビシクロ[3.3.1]ノナン
標題化合物は、Clousdale,I,S.,Kluge,A.F.,Mc
Clure,N.L.J.Org.Chem.1982,47,919,の方法
で合成される。実施例145 2,6ジアセトキシ‐9‐アザビシクロ[3.3.1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を100mLの1,2‐ジクロロエタン
に溶解し、0℃に冷却し、1‐クロロエチル・クロロホルメート(11mmoL
)を加える。この溶液を、15分で還流温度になるように加温し、そして出発
原料が消失するまで加熱する。次いで溶媒を除去し、その残留物を無水のメタノ
ールに再溶解し、1時間の間50℃に加温する。溶媒を除去すると、標題化合物
が、塩酸塩として得られる。実施例146 2,6‐ジヒドロキシ‐9‐FMOC‐9‐アザビシクロ[3.3.1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を50mLのTHFの1:1水溶液に溶解
し、そして50mmoLのLiOHを加える。この二相溶液を、室温で6時間撹
拌する。次いで、THFに溶かしたFMOC‐Cl(11mmoL)を、室温で
、15分かけて、滴下して加える。1時間後、溶液を10%HClでpH2まで
酸性にし、酢酸エチルで抽出し、水、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥す
る。この生成物は、フラッシュクロマトグラフィーで精製される。実施例147
2‐O‐DMT‐6‐ヒドロキシ‐9‐FMOC‐9‐アザビシクロ[3.3 .1]ノナン
前実施例からのジオール(10mmoL)を、CH2Cl2/ピリジン(9:1
)に溶解し、0℃に冷却して、そしてDMT‐Cl(10mmoL)を少々ずつ
加える(1.0当量)。この溶液を0℃で一晩撹拌する。メタノールで反応を中
止させ、蒸発処理し、そしてトルエンとの共沸蒸留により過剰の溶媒を除去する
。この残留物を酢酸エチルに再溶解し、5%クエン酸溶液、NaHCO3溶液、
食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この生成物をシリカゲル・フラッ
シュ・カラムクロマトグラフィーで、CH2Cl2中、MeOHの勾配を用いて精
製する。この生成物は、50%の収率で得られ、その他、25%のジトリチル化
物(保存して置いて、再利用する)および25%の未反応の出発原料が得られる
。実施例148 ジメチル3‐O‐TBDMS‐グルタレート
ジメチル3‐ヒドロキシグルタレート(34mmoL)とイミダゾール(85
mmoL)を150mLのDMFに溶かし、そして、TBDMS‐Cl(40m
moL)を加える。この溶液を0℃で一晩撹拌し、水で反応を中止させ、そして
酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥
すると、標題化合物が得られる。実施例149 3‐O‐TBDMS‐1,5‐ペンタンジオール
前実施例からの原料をTHFに溶解し、そしてTHFに溶かした2M‐LiB
H4の溶液35mLを加える。この溶液を1.5時間還流下で加熱し、室温に冷
却し、10%塩酸でpHを2にして反応を注意して停止させ、NaHCO3で中
和し、そして蒸発処理する。この残留物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶
液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥すると、標題化合物が得られる。実施例150 N‐メチル‐3‐O‐TBDMS‐7‐ケト‐9‐アザビシクロ[3.3.1] ノナン
20mLのTHFに溶したオキサリルクロリド(10mmoL)の撹拌してい
る溶液に、−78℃で、11mmoLのジメチルスルホキシドを加える。この溶
液を、5分間−35℃に暖め、そして再び−78℃に冷却する。10mLのTH
Fに溶した3‐O‐TBDMS‐1,5‐ペンタンジオール(5mmoL)の溶
液を加え、その溶液を0℃に暖める。15分後、トリエチルアミン(40mmo
L)を加え、そして、その溶液室温で撹拌し、ジアルデヒドに完全に転化させる
。溶媒を減圧下で蒸発し、この粗製ジアルデヒドを40mLのクエン酸塩/リン
酸塩緩衝液(pH5.5)に再溶解し、それに50mLの水に溶した15mmo
Lのメチルアミン塩酸塩を加え、次いで、80mLの水に溶した12mmoLの
アセトンジカルボキシレートを加える。この溶液を24時間撹拌し、濃塩酸5m
Lを加え、そしてその溶液を90℃で1時間加熱して、完全に脱カルボキシル化
させる。水酸化ナトリウムを加えて、pH12にし、この溶液をCH2Cl2で抽
出し、MgSO4で乾燥し、そしてアルミナ上でクロマトグラフィー法で精製す
ると製品が得られる。実施例151 N‐FMOC‐3‐O‐TBDMS‐7‐ケト‐9‐アザビシクロ[3.3. 1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を100mLの1,2‐ジクロロエタン
に溶解し、0℃に冷却し、1‐クロロエチル・クロロホルメート(22mmoL
)を加える。この溶液を、15分で還流温度になるように加温し、そして出発原
料が消失するまで加熱する。次いで溶媒を除去し、その残留物を無水のメタノー
ルに再溶解し、1時間の間50℃に加温する。溶媒を除去し、その残留物を25
mLのTHFと25mLの飽和NaHCO3溶液に再溶解する。THFに溶した
FMOC‐Cl(11mmoL)を、室温で15分かけて滴下して加える、1時
間後、この溶液を10%HClでpH2まで酸性にし、酢酸エチルで抽出し、水
、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この生成物を、フラッシュクロ
マトグラフィーで精製する。実施例152 N‐FMOC‐3‐O‐TBDMS‐7‐ヒドロキシ‐9‐アザビシクロ[3. 3.1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を乾燥THFに溶解し、そしてTHFに
溶かした2M‐LiBH4の溶液6mLを加える。この溶液を室温で撹拌し、そ
して10%塩酸でpHを2にして反応を注意して停止させ、NaHCO3で中和
し、そして蒸発処理する。この残留物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶液
、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する実施例153 N‐FMOC‐3‐O‐TBDMS‐7‐O‐DMT‐9‐アザビシクロ[3. 3.1]ノナン
前実施例からのアルコール(10mmoL)を、CH2Cl2/ピリジン(9:
1)に溶解し、0℃に冷却して、そしてDMT‐Cl(11mmoL)を少しず
つ加える(1.0当量)。この溶液を室温で一晩撹拌する。メタノールで反応を
中止させ、蒸発処理し、そしてトルエンとの共沸蒸留により過剰の溶媒を除去す
る。この残留物を酢酸エチルに再溶解し、5%クエン酸溶液、NaHCO3溶液
、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この生成物をシリカゲル・フラ
ッシュ・カラムクロマトグラフィーで、CH2Cl2中、MeOHの
勾配を用いて精製する。実施例154 N‐FMOC‐3‐ヒドロキシ‐7‐O‐DMT‐9‐アザビシクロ[3.3. 1]ノナン
前実施例の生成物を50mLのTHFに溶したトリエチルアミン・ヒドロフル
オリド(100mmoL)とトリエチルアミン(50mmoL)の溶液に加える
。この溶液を出発原料が完全に消費されるまで撹拌する。飽和NaHCO3溶液
を添加して反応を停止させ、次いで、溶媒を蒸発する。この残留物を酢酸エチル
で抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この
生成物をフラッシュ・クロマトグラフィーで精製する実施例155 N‐メチル‐2,6ジアセトキシ‐9‐アザビシクロ[3.3.1]ノナン
標題化合物は、Clousdale,I,S.,Kluge,A.F.,Mc
Clure,N.L.J.Org.Chem.1982,47,919,の方法
で合成される。実施例156 2,6ジアセトキシ‐9‐アザビシクロ[3.3.1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を100mLの1,2‐ジクロロエタン
に溶解し、0℃に冷却し、そして1‐クロロエチル・クロロホルメート(11m
moL)を加える。この溶液を、15分で還流温度になるように加温し、そして
出発原料が消失するまで加熱する。次いで溶媒を除去し、その残留物を無水のメ
タノールに再溶解し、1時間の間50℃に加温する。溶媒を除去すると、標題化
合物が、塩酸塩として得られる。実施例157 2,6‐ジヒドロキシ‐9‐FMOC‐9‐アザビシクロ[3.3.1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を50mLのTHFの1:1水溶液に溶解
し、そして50mmoLのLiOHを加える。この二相溶液を、室温で6時間撹
拌する。次いで、THFに溶かしたFMOC‐Cl(11mmoL)を、室温で
、15分かけて、滴下して加える。1時間後、溶液を10%HClでpH2まで
酸
性にし、酢酸エチルで抽出し、水、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する
。この生成物は、フラッシュクロマトグラフィーで精製される。実施例158
2‐O‐DMT‐6‐ヒドロキシ‐9‐FMOC‐9‐アザビシクロ[3.3 .1]ノナン
前実施例からのジオール(10mmoL)を、CH2Cl2/ピリジン(9:1
)に溶解し、0℃に冷却して、そしてDMT‐Cl(10mmoL)を少々ずつ
加える(1.0当量)。この溶液を0℃で一晩撹拌する。メタノールで反応を中
止させ、蒸発処理し、そしてトルエンとの共沸蒸留により過剰の溶媒を除去する
。この残留物を酢酸エチルに再溶解し、5%クエン酸溶液、NaHCO3溶液、
食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この生成物をシリカゲル・フラッ
シュ・カラムクロマトグラフィーで、CH2Cl2中、MeOHの勾配を用いて精
製する。この生成物は、50%の収率で得られ、その他、25%のジトリチル化
物(保存して置いて、再利用する)および25%の未反応の出発原料が得られる
。実施例159 ジメチル3‐O‐TBDMS‐グルタレート
ジメチル3‐ヒドロキシグルタレート(34mmoL)とイミダゾール(85
mmoL)を150mLのDMFに溶かし、そしてTBDMS‐Cl(40mm
oL)を加える。この溶液を0℃で一晩撹拌し水で反応を中止させ、酢酸エチル
で抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。実施例160 3‐O‐TBDMS‐1,5‐ペンタンジオール
前実施例からの原料をTHFに溶解し、そしてTHFに溶かした2M‐LiB
H4の溶液35mLを加える。この溶液を1.5時間還流下で加熱し、室温に冷
却し、10%塩酸でpHを2にして反応を注意して停止させ、NaHCO3で中
和し、そして蒸発処理する。この残留物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶
液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。実施例161 N‐メチル‐3‐O‐TBDMS‐7‐ケト‐9‐アザビシクロ[3.3.1] ノナン
20mLのTHFに溶したオキサリルクロリド(10mmoL)の撹拌してい
る溶液に、−78℃で、11mmoLのジメチルスルホキシドを加える。この溶
液を、5分間−35℃に暖め、そして再び−78℃に冷却する。10mLのTH
Fに溶した3‐O‐TBDMS‐1,5‐ペンタンジオール(5mmoL)の溶
液を加え、その溶液を0℃に暖める。15分後、トリエチルアミン(40mmo
L)を加え、そして、その溶液を室温で撹拌し、ジアルデヒドに完全に転化させ
る。溶媒を減圧下で蒸発し、そしてこの粗製ジアルデヒドを40mLのクエン酸
塩/リン酸塩緩衝液(pH5.5)に再溶解し、それに50mLの水に溶した1
5mmoLのメチルアミン塩酸塩を加え、次いで、80mLの水に溶した12m
moLのアセトンジカルボキシレートを加える。この溶液を24時間撹拌し、濃
塩酸5mLを加え、そしてその溶液を90℃で1時間加熱して、完全に脱カルボ
キシル化させる。水酸化ナトリウムを加えて、pH12にし、この溶液をCH2
Cl2で抽出し、MgSO4で乾燥し、そしてアルミナ上でクロマトグラフィー法
で精製する。実施例162 N‐FMOC‐3‐O‐TBDMS‐7‐ケト‐9‐アザビシクロ[3.3.1 ]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を100mLの1,2‐ジクロロエタン
に溶解し、0℃に冷却し、1‐クロロエチル・クロロホルメート(22mmoL
)を加える。この溶液を、15分で還流温度になるように加温し、そして出発原
料が消失するまで加熱する。次いで溶媒を除去し、その残留物を無水のメタノー
ルに再溶解し、1時間の間50℃に加温する。溶媒を除去し、その残留物を25
mLのTHFと25mLの飽和NaHCO3溶液に再溶解する。THFに溶した
FMOC‐Cl(11mmoL)を、室温で15分かけて滴下して加える、1時
間後、この溶液を10%HClでpH2まで酸性にし、そして酢酸エチルで抽出
し、水、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この生成物を、フラッシ
ュクロマトグラフィーで精製する。実施例163 N‐FMOC‐3‐O‐TBDMS‐7‐ヒドロキシ‐9‐アザビシクロ[3. 3.1]ノナン
前実施例からの原料(10mmoL)を乾燥THFに溶解し、そしてTHFに
溶かした2M‐LiBH4の溶液6mLを加える。この溶液を室温で撹拌し、そ
して10%塩酸でpHを2にして反応を注意して停止させ、NaHCO3で中和
し、そして蒸発処理する。この残留物を酢酸エチルで抽出し、NaHCO3溶液
、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。実施例164 N‐FMOC‐3‐O‐TBDMS‐7‐O‐DMT‐9‐アザビシクロ[3. 3.1]ノナン
前実施例からのアルコール(10mmoL)を、CH2Cl2/ピリジン(9:
1)に溶解し、0℃に冷却して、そしてDMT‐Cl(11mmoL)を少しず
つ加える(1.0当量)。この溶液を室温で一晩撹拌する。メタノールで反応を
中止させ、蒸発処理し、そしてトルエンとの共沸蒸留により過剰の溶媒を除去す
る。この残留物を酢酸エチルに再溶解し、5%クエン酸溶液、NaHCO3溶液
、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この生成物をシリカゲル・フラ
ッシュ・カラムクロマトグラフィーで、CH2Cl2中、MeOHの勾配を用いて
精製する。実施例165 N‐FMOC‐3‐ヒドロキシ‐7‐O‐DMT‐9‐アザビシクロ[3.3. 1]ノナン
前実施例の生成物を50mLのTHFに溶したトリエチルアミン・ヒドロフル
オリド(100mmoL)とトリエチルアミン(50mmoL)の溶液に加える
。この溶液を出発原料が完全に消費されるまで撹拌する。飽和NaHCO3溶液
を添加して反応を停止させ、次いで、溶媒を蒸発する。この残留物を酢酸エチル
で抽出し、NaHCO3溶液、食塩水で洗い、そしてMgSO4で乾燥する。この
生成物をフラッシュ・クロマトグラフィーで精製する。実施例166 異なるアミノジオール主鎖ユニットを含む三量体の合成
実施例98のN‐FMOC‐2'-ヒドロキシエチル‐2‐O‐DMT‐エチル
アミンのスクシニル化とそれに続く、実施例124の一般に法を用いるアミノテ
ンタゲルへのカップリングによって調製された、N‐FMOC‐2‐O‐ジエチ
ルアミノ‐2'-Oのスクシニルアミノ‐テンタゲル(DMT‐FMOC‐dea
‐TGと略記)の10μm0L(約67mg)を振とうフラスコに装填する。こ
のDMT‐FMOC‐ジエタノールアミン‐TGを、ピペリジンの10%DMF
溶液で処理し、FMOC基を除去し、DMF次いでCH2Cl2で洗滌する。この
フリーのアミンを、実施例125および実施例126の一般法に従って、カップ
リング剤としてHATUを用いシクロヘキサン・カルボン酸によりアシル化する
と、DMT‐de(CH)‐TGが得られる。この樹脂をDMFとCH2Cl2で
洗い、3%TCA/CH2Cl2でトリチル基を除去し、そしてこの樹脂をCH2
Cl2およびピリジン/CH3CN(1:1)で洗う。次いで、この樹脂を、実施
例69および実施例73の一般法の方法を用い、実施例81の第2スカフォール
ドH‐ホスホナート(DMT‐FMOC‐pd‐Hphosと略記)とピリジン
/CH3CNに溶したアダマントイルクロリドで処理する。ピリジン/CH3CN
で洗滌後、この樹脂を、四塩化炭素/ピリジン(1:1)に溶したイソプロポキ
シエチルアミンの10%溶液で20分間処理する。このアミン溶液を除去し、樹
脂を、DMF、次いで10%ピペリジン/DMFで洗って第2FMOC基を除去
する。この樹脂をDMFで洗った後、この二量体を、一般法を用いチオフェンカ
ルボン酸とHATUでアシル化する。アシル化が完了してから、樹脂をもう一度
DMF、CH2Cl2で洗い、そして、3%TCA/CH2Cl2でトリチル基を除
去し、次いで、ピリジン/CH3CN(1:1)で洗う。次いで、この樹脂を、
一般法である実施例69および実施例73の方法を用い、実施例59の第3スカ
フォールドH‐ホスホナート(DMT‐FMOC‐hp‐Hphosと略記)と
ピリジン/CH3CNに溶したアダマントイルクロリドで処理する。ピリジン/
CH3CNで洗滌後、この樹脂を、四塩化炭素/ピリジン(1:1)に溶した3
‐アミノメチルピルジンの10%溶液で20分間処理する。
このアミン溶液を除去し、樹脂を、DMF、次いで10%ピペリジン/DMFで
洗って第3FMOC基を除去する。この樹脂をDMFで洗った後、この三量体を
、一般法を用い4‐ニトロ安息香酸とHATUでアシル化する。この樹脂をDM
F、CH2Cl2で洗い、そして、3%TCA/CH2Cl2でトリチル基を除去す
る。この樹脂をCH2Cl2で洗って、痕跡量の酸を除き、この固体支持体をNH4
OHで処理して、生成物を固体支持体から切離す。このアンモニア溶液を減圧
下で除去すると、三種の異なるカルボン酸(1:シクロヘキサンカルボン酸、2
:チオフェンカルボン酸および3:4‐ニトロ安息香酸)でアシル化され、そし
て二種の異なる置換ホスホルアミデート(1‐2:イソプロポキシエチルアミン
、および2‐3:3‐アミノメチルピリジン)で連結されている、三種の異なる
スカフォールド(1:ジエタノールアミン、2:ピペリジンジオールおよび3:
ヒドロキシプロリノール)から構成される最終化合物が得られる。評価 方法1 抗菌アッセイ 黄色ブドウ球菌
黄色ブドウ球菌は貧困な衛生状態、軽外傷、乾癬または湿疹の結果としての局
所皮膚感染を起こすことが知られている。、それはまた呼吸系感染、肺炎、毒性
ショック症候群および敗血症も起こす。それはペニシリン、セファロスポリン、
バンコマイシンおよびナフシリンに対する薬剤耐性の急速な出現を示す。
本アッセイにおいては黄色ブドウ球菌株ATCC25923(America
n Type Culture Collection)がバイオアッセイで使
用される。アッセイに先だって細菌増殖の対数期を開始させるため、チプトカー
ゼ大豆ブロス(BBL)中、37℃で一夜増殖させた細菌試料が96ウェルマイ
クロタイタープレートの試料ウェルへの再接種に使用される。アッセイは96ウ
ェルマイクロタイタープレート中、ウェル当たり約1x106細胞を含む150
μLの容量で実施された。
マイクロタイタープレートの個々のウェル内の化合物混合物水溶液75μLヘ
チプトカーゼ大豆ブロス(75μL)に含まれる細菌を加える。化合物混合物の
最終濃度は25μM、10μMおよび1μMである。化合物混合物の各々の濃度
は3重にアッセイされた。プレートは37℃でインキュベートし、BioRad
モデル3550UVマイクロプレートリーダーを用いて595nmでの光学密度
を測定することにより24時間に渡って増殖をモニターする。化合物を含まない
ウェルに対する増殖のパーセントが決定される。各々のスクリーニングアッセイ
においてアンピシリンおよびテトラサイクリン抗生物質陽性対照が同時に試験さ
れた。方法2 抗菌機構的アッセイ 細菌DNAジャイレース
DNAジャイレースはATP加水分解に由来する自由エネルギーを利用してD
NA内へ負の超コイルを導入できる細菌酵素である。この活性はDNA複製にお
いて重大なものであり、細菌増殖の抗生物質阻害でよく特性付けられた標的であ
る。このアッセイにおいて、本発明の化合物のライブラリはDNAジャイレース
の阻害でスクリーニングされる。本アッセイは、アガロースゲル上の電気泳動的
シフトとしてDNAジャイレースによる弛緩したプラスミドの超コイル化を測定
する。最初に30μMでの阻害活性をすべてのライブラリプールについてスクリ
ーニングし、次に活性なサブセットについて用量応答分析を行う。DNAジャイ
レースのβサブユニットに結合する抗生物質であるノボビオシンが本アッセイで
の陽性対照として用いられる。DNAジャイレースアッセイの感度は、超コイル
化アッセイにおいて既知のDNAジャイレース阻害剤(ノボビオシン)の濃度を
滴定することにより決定された。IC50は8nMであることが決定され、これは
30μM濃度を持つライブラリにおいて同じような活性の単一の活性種の活性を
同定するのに十分である。方法3 金属キレート剤およびイメージング剤を同定するためのコンビナトリアルライブ ラリの使用
この方法はそれぞれが紫外発色団を含む環を含む化合物のライブラリに含まれ
る本発明の特定の化合物を同定するのに使用される。さらに、本発明のオリゴマ
ー性化合物が重金属およびイメージング剤と配位化合物を形成できるように、化
合物架橋へ結合された多様性基はアミン、ヒドロキシルおよびカルボニル基およ
びその他の孤立電子対を持つ基のような金属結合基、配位基から選択される。本
方法は、産業廃水、廃棄物溶離液、家畜動物の重金属中毒およびその他の重金属
夾雑源から重金属をキレート化および除去するための本発明のオリゴマー性化合
物を同定するため、およびテクネシウム99の担体のようなイメージング剤の同
定に使用される。
既知の濃度の所望のイオンまたはイメージング剤を含む試験溶液の一部をアッ
セイされる本発明の化合物のプールの標準溶液の一部に加える。この溶液のUV
スペクトルを測定し、試験イオンまたはイメージング剤を欠く同一の溶液のUV
スペクトルと比較する。吸光係数のシフトはアッセイされているライブラリプー
ル中の化合物への金属イオンまたはイメージングイオンの結合を示している。方法4 PLA2阻害剤のためのコンビナトリアルライブラリのアッセイ
化合物のコンビナトリアル化により発生させたプールのアッセイに好適な標的
はホスホリパーゼA2ファミリーである。ホスホリパーゼA2(PLA2)は膜リ
ン脂質のsn−2エステル結合を加水分解し、遊離脂肪酸およびリゾリン脂質を
放出させる一群の酵素である(Dennis,E.A.The Enzyme,
Vol16,pp.307−353,Boyer,P.D.,ed.,Acad
emic Press,New York,1983)。タイプIIPLA2レベ
ルの上昇は多くのヒト炎症性疾患と相関している。PLA2触媒反応は多くの前
炎症性仲介物の放出における律速段階である。sn−2位に通常結合されている
脂肪酸、アラキドン酸はロイコトリエン、プロスタグランジン、リポキシンおよ
びトロンボキサンの前駆体として働いている。リゾリン脂質は血小板活性化因子
の前駆体でありえる。PLA2は前炎症性サイトカインにより制御されており、
従って、炎症性カスケードの中心的位置を占めている(Dennis、上記文献
;Glaserら、TiPs Reviews 1992,14,92;および
Pruzanskiら、Inflammation 1992,16,451)
。すべての哺乳類組織は広くPLA2活性を示すことが評価されている。少なく
とも3つの異なった型のPLA2がヒトにおいて観察されている:膵性(タイプ
I)、滑液(タイプII)および細胞質ゾル性。追加のイソ酵素の存在も示唆され
ている。タイプIおよびタイプII(PLA2の分泌形)は蛇毒から単離されたホ
スホリパーゼと強い類似性を共有している。PLA2酵素は消化、細胞膜リモデ
リングおよび修復、および炎症応答の仲介を含む正常の機能のために重要である
。細胞質ゾル性およびタイプII酵素は治療の標的として興味が引かれる。タイプ
IIPLA2のレベルの上昇は慢性関節リウマチ、骨関節炎、炎症性腸疾患および
敗血症ショックを含む種々の炎症性疾患と相関しており、この酵素の阻害は治療
的有用性を持つであろうことを示唆している。ある種の慢性炎症性疾患で観察さ
れた病因生理学の促進におけるPLA2の役割をさらに支持するものは、ラット
足蹟内(Vishwanathら、Inflammation 1988,12
,549)またはウサギ関節間隙内(Bomalaskiら、J.Immuno l
.1991,146,3904)へのタイプIIPLA2の注射が炎症性応答を
引き起こすという観察である。蛋白質が注射前に変性された場合、炎症応答は起
こされなかった。
滑液からのタイプIIPLA2酵素は比較的小さな酵素であり(約14kD)、
配列およびそのジスルフィド結合の型によりタイプI酵素(例えば、膵性)と区
別できる。両方の型の酵素ともその活性にカルシウムを必要とする。毒液からの
分泌PLA2酵素および膵性PLA2の結晶構造(阻害剤と、および阻害剤なしで
)が報告されている(scottら、Science 1990,250,15
41)。最近、ヒト滑液からのPLA2の結晶構造が決定された(Weryら、Nature
1991,352,79)。その構造は触媒におけるカルシウム
およびアミノ酸残基の役割を明らかにしている。カルシウムは1,2−ジアシル
グリセロリン脂質の切れやすいエステルカルボニル結合を活性化するためにルイ
ス酸として働き、脂質に結合する、およびHis−Asp側鎖2分子は水分子求
核試薬を活性化するため一般塩基触媒として作用する。このことはアシル酵素中
間体が存在しないことと一致しており、およびセリンプロテアーゼの触媒機構に
も匹敵している。触媒残基およびカルシウムイオンは酵素中の深い切れ目(約1
4A)の末端に存在している。この切れ目の壁はリン脂質の炭化水素部分と接
触し、疎水性および芳香族残基から構成されている。陽性に荷電されたアミノ末
端ヘリックスは疎水性切れ目の開口部の上に位置している。いくつかの証拠はN
−末端部分は界面結合部位であることを示唆している(Achariら、Col d Spring Harbor Symp.Quant.Biol
.1987
,52,441;Choら、J.Biol.Chem.1988,263,11
237;Yangら、Biochem.J.1989,262,855;および
Noelら、J.Am.Chem.Soc.1990,112,3704)。
リン脂質のPLA2触媒加水分解の機構および特性に関する研究が最近多く報
告されている。インビトロアッセイにおいて、PLA2は遅滞期を示し、その間
酵素が基質二重層へ吸着され、界面活性化と称される過程が起こる。この活性化
は酵素/脂質界面の脱溶媒和または切れ目開口部付近の脂質の物理的状態の変化
が含まれているであろう。この仮説に味方する証拠は、膜プローブの蛍光変化と
同時にPLA2活性の急速な変化が起こることを明らかにした研究からきている
(Burackら、Biochemistry 1993,32,583)。こ
のことは脂質再配置が界面活性化過程の間に起こっていることを示唆している。
PLA2活性はゲルおよび液晶脂質の領域が共存する脂質の融解温度付近で最大
である。このことはPLA2活性が温度および基質の組成に敏感であることとも
一致しており、それらの両方とも境界領域により分離されている構造的に異なっ
た脂質配置を導くことができる。蛍光顕微鏡法が触媒作用の間の脂質の物理的状
態および酵素の位置を同時に同定するために使用された(Graingerら、FEBS Lett
.1989,252,73)。これらの研究はPLA2は液
体および固体相脂質の境界領域に独占的に結合していることを明らかに示してい
る。酵素により触媒される1,2−ジアシルグリセロリン脂質の二位のエステル
結合の加水分解は比較的単純であるが、機構的および動力学的な面は酵素−基質
相互作用の複雑さのためにはっきりとはしていない。PLA2の著しい特徴は、
最大触媒活性が凝集している基質(すなわち、限界ミセル濃度以上のリン脂質)
に対して観察され、一方、モノマー基質には低レベルの活性しか観察されないこ
とである。その結果、PLA2の競合阻害剤は、基質二重層へ結合または膜内へ
分配される前の酵素の活性部位に対して高い親和性を持つか、活性部位をリン脂
質基質と競合する。しかしながら、多くの阻害剤が生化学アッセイにおけるPL
A2の有望な阻害を示しているようであるが(Yuanら、J.Am.Chem .Soc
.1987,109,8071;Lombardoら、J.Biol. Chem
.1985,260,7234;Washburnら、J.Biol. Chem
.1991,266,5042;Campbellら、J.Chem. Soc.,Chem.Commun
.1988,1560;およびDavids
onら、Biochem.Biophys.Res.Commun.1986,137
,587)、インビボ活性は制限されていることを報告は記載している(
Miyakeら、J.Pharmcol.Exp.Ther.1992,263
,1)。
一つの好適な態様において、本発明のオリゴマー性化合物は酵素PLA2と相
互作用する、好適には阻害する能力で選択される。従って、本発明の化合物はア
トピー性皮膚炎および炎症性腸疾患を含む炎症性疾患の局所的および/または全
身的処置に使用できる。官能基の選択においてはPLA2が双性イオン性ベシク
ルよりも陰イオン性ベシクルを好むことを利用できた。PLA2のアッセイに好
適な本発明の化合物にはPLA2酵素の切れ目への結合を容易にするために芳香
族多様性基を持つものが含まれる(Oinumaら、J.Med.Chem.1
991,34,2260;Markiら、Agents Actions 19
93,38,202;Tanakaら、J.Antibioics 1992,45
,1071)。ベンジルおよび4−ヘキシルベンジル基が好適な芳香族多様
性基である。PLA2に関する本発明の巨大分予化合物はさらにテトラエチレン
グリコール基のような疎水性官能基を含むことができる。PLA2酵素は疎水性
チャンネルを持っているので、疎水性は酵素阻害剤の重要な特性であるべきと信
じられている。
前記の実施例に記載したような各々のラウンドの合成後、得られた化合物のプ
ールはヒトタイプIIPLA2酵素活性の阻害でスクリーニングされた。その合成
からの勝利化合物を同定するため、合成の結論でアッセイが行われた。同時に、
ライブラリはさらに阻害の機構を決定するために別のインビトロアッセイでもス
クリーニングできる。
オリゴマー性化合物ライブラリのプールは基質として3H−オレイン酸で標識
された大腸菌を用いるアッセイ(Fransonら、J.Lipid Res.
1974,15,380;Davidsonら、J.Biol.Chem.19
87,262,1698)でPLA2の阻害がスクリーニングされる。バキュロ
ウイルス系で発現され部分的に精製されたタイプIIPLA2(最初に滑液から単
離された)が酵素源である。各々のライブラリプールの一連の希釈は水で行う:
10μlの各々のプールを10μlのPLA2、20μlの5xPLA2緩衝液(
500mMトリス7.0−7.5、5mM CaCl2)および50μlの水と
室温で5分間インキュベートする。各々のプールの試料は二重に試験された。こ
の時点で、10μlの3H大腸菌細胞を加える。この混合物は37℃で15分間
インキュベートする。酵素反応は50μlの2M HClおよび50μlの脂肪
酸を含まないBSA(20mg/ml PBS)を加えて停止させ、5秒間ボル
テックスし、5分間高速で遠心分離する。165μlの各々の上清液を6mlの
シンチレーション剤(ScintiVerse)を含むシンチレーションバイア
ルに入れ、Beckman液体シンチレーションカウンターでcpmを測定した
。対照としてコンビナトリアルプールを含まない反応、オリゴマー性化合物並び
にPLA2酵素を含まないベースライン反応を相並べて実施する。cpmは各々
の反応データポイントからベースラインを差し引くことにより補正した。
”勝利者”の確認はオリゴマー性化合物が基質よりも酵素に結合することおよ
び選択されたオリゴマー性化合物の阻害がタイプIIPLA2に対して特異的であ
ることを確認することにより行われた。基質として大腸菌膜ではなく14C−ホス
ファチジルエタノールアミン(14C−PE)を用いるアッセイが基質特異性より
も酵素の保証に使用される。14C−PEおよびデオキシコレートのミセルを酵素
およびオリゴマーとインキュベートする。PLA2触媒加水分解の結果として放
出された14C−標識アラキドン酸は薄層クロマトグラフィーにより基質から分離
し、放射活性生成物を定量する。”勝利者”はその活性を確認するためにヒトタ
イプIIPLA2の好適な基質であるホスファチジルエタノールアミンと比較され
た。他からのPLA2(蛇毒、膵性、ミツバチ毒)およびホスホリパーゼC、ホ
スホリパーゼDおよびリゾホスホリパーゼは阻害がヒトタイプIIPLA2
に特異的であるかをさらに確認するために使用できる。方法5 生物試料中の特異的蛋白質およびmRNA検出のためのプローブ
他の細胞成分から蛋白質またはmRNAを精製する必要なく、生物試料中の多
数の種類の蛋白質またはmRNAの信頼できる、迅速な、同時定量のため、適し
た生物試料(すなわち、血液運搬ウイルス、便中の細菌性病原生成物、尿および
他の類似の生物試料)から問題とする蛋白質またはmRNAが標準微生物学的技
術を用いて同定される。本発明のオリゴマー性化合物を含むプローブは前記の実
施例で示したようなコンビナトリアル研究で同定される。mRNAプローブに好
適であるのはmRNAの核酸配列の少なくとも一部と相補的である”核塩基”多
様性基(文字としてアデニン、グアニン、チミンおよびシトシン)を含むように
合成された化合物である。蛋白質プローブに好適であるのは、水素結合供与体お
よび受容体、スルフヒドリル基、疎水的相互作用が可能な疎水的および親油的残
基およびイオン性相互作用が可能な基として働く化学官能基を含むように合成さ
れた化合物である。プローブはPon,R.T.,Protocols for
Oligonucleotides and Analogs,Agraea
l,S.,Ed.,Humana Press,Totowa,NJ,1993
,p465−496の方法を利用して不溶性CPG固体支持体上に固定化される
。検査している生物試料の既知量をプローブを持つ不溶性CPG支持体と、プロ
ーブヘ蛋白質またはmRNAがハイブリダイズし、それらがプローブを通して固
形支持体へ結合されるのに十分な時間インキュベートする。このことで試料中に
存在する蛋白質またはmRNAをCPG支持体へ固定化する。他の固定化されな
い物質および成分は次に生物試料に使用するのに適した洗浄媒質で洗い流す。支
持体上のmRNAはエチジウムブロミド、ビオチンまたは市販の放射性核種で標
識され、生物試料中に存在するmRNAの量を示すためにCPG支持体上に固定
された標識の量が測定される。同様に蛋白質もまた標識され定量される。方法6 ロイコトリエンB4アッセイ
ロイコトリエンB4(LTB4)は種々のヒト炎症性疾患で示唆されてきてお
り、その薬理学的効果は特定の細胞表面レセプターとの相互作用を経て媒介され
る。ライブラリサブセットはレセプター調製試料への放射標識LTB4との拮抗
阻害でスクリーニングされる。NenquestTM薬剤発見システムキット(N
EN Research Product,Boston,MA)がモルモット
脾臓膜試料のレセプターとロイコトリエンB4(LTB4)との相互作用の阻害剤
の選択に使用される。[3H]ロイコトリエンB4試薬は5mLのリガンド希釈液
(NaCl、MgCl2、EDTAおよびバシトラシンを含むリン酸緩衝液、p
H7.2)を0.25mLの放射性リガンドに加えることにより調製される。レ
セプター調製試料は濃縮液を融解させることにより作製させ、35mLのリガン
ド希釈液を加え、レセプターを均一に再懸濁させるために穏やかに渦をまかせる
。試薬は実験の間中、氷上に保ち、残った部分は−20℃で保存する。
前記実施例の一般法により製造されたライブラリサブセットはリン酸緩衝液(
1xPBS,0.1%アジドおよび0.1%BSA、pH7.2)で5μM、5
0μMおよび500μMに希釈され、各々0.5μM、5μMおよび50μMの
最終試験濃度を得る。試料は2重にアッセイされる。[3H]LTB4(25μL
)を適切に希釈された標準液(非標識LTB4)またはライブラリセット25μ
Lに加える。レセプター懸濁液(0.2mL)が各々のチューブに加えられる。
試料は4℃で2時間インキュベートする。対照には、レセプター懸濁液を含まな
い[3H]LTB4(全計数バイアル)およびライブラリ分子を含まないリガンド
およびレセプターの試料(標準)が含まれる。
インキュベーション期間後、前もって冷塩溶液で洗浄したGF/B紙を通して
試料を濾過した。各々のチューブの内容物は濾紙上で吸引することにより膜調製
試料からの非結合リガンドを除去し、チューブは冷塩溶液(2x4mL)で洗浄
する。濾紙を濾過ユニットからのぞき、円形濾紙はシンチレーション計数のため
に適したバイアルに入れる。ホタル石を加えてバイアルを振とうし、計数の前に
2から3時間室温で放置する。各々の試料で得られた計数値/分(cpm)は、
各々の試料の総cpmを決定するために全計数バイアルから得られたcpmから
差し引かれる。各々のライブラリサブセットの結合阻害の程度は標準(ライブラ
リ分子を含まないリガンドおよびレセプターの試料)と相対的なものとして決定
される。
本明細書中で言及した刊行物のそれぞれについて、その全体を本明細書の一部
としてここに引用する。
当業者は本発明の好適な態様に多くの変更および修正ができるであろうこと、
およびそのような変更および修正が本発明の精神から離れることなくできること
を理解するであろう。従って、付随する請求の範囲はすべてのそのような均等な
変形物が本発明の真の精神および範囲内に含まれることを意図している。
【手続補正書】特許法第184条の8第1項
【提出日】1998年2月3日
【補正内容】
(誤訳訂正1) 第59頁第13行の「2−FMOC−2−アミノ−1,3−プ
ロパンジオール」を『2−N−FMOC−2−アミノ−1,3−プロパンジオー
ル』と訂正します。
(誤訳訂正2) 第61頁第10−11行の「1−O−ジメトキシトリチル−2
−アミノプロパン−3−オール・スクシナート誘導化CPG」を『1−O−ジメ
トキシトリチル−N−FMOC−2−アミノ−1,3−プロパン−3−オール・
スクシナート誘導化CPG』と訂正します。
(誤訳訂正3) 第64頁最下行の「1−O−ジメトキシトリチル−2−N−F
MOC−アミノブタン−1−オール」を『1−O−ジメトキシトリチル−2−N
−FMOC−2−アミノブタン−4−オール』と訂正します。
(誤訳訂正4) 第65頁第3−4行の「4−O−ジメトキシトリチル−2−N
−FMOC−2−アミノブタン−4−O−スクシナート」を『1−O−ジメトキ
シトリチル−2−N−FMOC−2−アミノブタン−4−O−スクシナート』と
訂正します。
(誤訳訂正5) 同第20行の「チミン−2−酢酸」を『N−1−チミン−2−
酢酸』と訂正します。
(誤訳訂正6) 第70頁下から1−3行の「この方法・・・脱保護される。」
を『この方法を用いて、実施例61の固体支持体に結合したN−FMOC−5−
ジメトキシトリチルオキシメチルピロリジンのFMOC保護主鎖セグメント・ア
ミノコンビナトリアル部位は、脱保護される。』と訂正します。
(誤訳訂正7) 第72頁第11−12行の「以下に・・・示している。」を『以
下に説明する一般法は、ホスホルアミデートコンビナトリアルライブラリの調製
のための方法の概略を示している。』と訂正します。
(誤訳訂正8) 同第21−22行の「簡単に言えば・・・含んでいる。」を『簡
単に言えば、これらの方法は、ユニークな試薬を同じ数の固体支持体の別々の分
割部分に付加することを含んでいる。』と訂正します。
(誤訳訂正9) 同第25−26行の「この方法で・・・創られる。」を『この
方法で、化合物の混合物にユニークな試薬を付加させて、異なる試薬の全ての可
能な組合せが創られる。』と訂正します。
(誤訳訂正10) 第73頁下から3行の「5)希望の官能基数を有するアミノ
基の官能化。」を『5)希望の官能基でのアミノ基の官能化。』と訂正します。
(誤訳訂正11) 第74頁第14−19行の「ただ・・・確かめられる。」を
『ただし、四塩化炭素と適した共溶媒中のアミン文字が混合物として、望ましく
は相対的反応性を考慮して規準化された混合物として、加えられる。アミン文字
の混合物からのアミン文字のランダム分布は、アミン文字の混合物で予め処理し
、後処理して精製したオリゴマーを、10%ギ酸水溶液で50−70℃で処理し
てそのアミン文字を放すことにより実験的に確かめられる。』と訂正します。
(誤訳訂正12) 第77頁第15行の「トリクロロ酢酸の3%ジクロロメタン」
を『ジクロロメタン中3%トリクロロ酢酸』と訂正します。
(誤訳訂正13) 第80頁第12行、第16行、第19行および第24行の「
ポスホルチオエート」をそれぞれ『ホスホルチオエート』と訂正します。
(誤訳訂正14) 第81頁第13−15行の「ホスホジエステル・・・から判
別される。」を『ホスホジエステルおよびホスホルチオエートオリゴマー化合物
は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動で、物質長(material leng
th)について判別される。』と訂正します。
(誤訳訂正15) 同第20行および第27行の「TTG CTT CAA T
CT TCC TCG TC」をそれぞれ『TTG CTT CCA TCT
TCC TCG TC』と訂正します。
(誤訳訂正16) 第82頁第5行の「モルホリノホスオルアミデート」を『モ
ルホリノホスホルアミデート』と訂正します。
(誤訳訂正17) 同第7−9行の「チミジン・・・合成した。」を『チミジン
の3’−5’−ホスホジエステル連結二量体で誘導化した調整多孔性ガラス樹脂
[5’−DMT−O−T−O−P(=O)−O−T−CPG]を標準法で合成し
た。』と訂正します。
(誤訳訂正18) 第82頁最下行−第83頁第2行の「ジエチルアミン/四塩
化炭素を用いて、ホスホジエステル三量体またはホスホルアミデート三量体に酸
化された。」を『結合した樹脂は、ジエチルアミン/四塩化炭素を用いて、ホス
ホジエステル三量体またはホスホルアミデート三量体に酸化された。』と訂正し
ます。
(誤訳訂正19) 第83頁第18行の「Na2CO3」を『Na2CO3(1.3
当量)』と訂正します。
(誤訳訂正20) 第85頁第13−15行の「(2S)−カルボキシエチル−
ピロリジン−5−カルボン酸−4−メチルフェニルチオエステルととNa2CO3
(1.3当量)をH2/ジオキサン(1:1)(0.1M)中に懸濁させる。」
を『(2S)−カルボキシエチル−ピロリジン−5−カルボン酸−4−メチルフ
ェニルチオエステルとNa2CO3(1.3当量)をH2O/ジオキサン(1:1
)(0.1M)中に懸濁させる。』と訂正します。
(誤訳訂正21) 第94頁第5行の「N−CBZ−シス−4−アミノ−2−シ
クロヘキサン−1−オール」および同第10行の「N−CBZ−シス−4−アミ
ノシクロヘキサン−1−オール」をそれぞれ『N−CBZ−シス−4−アミノ−
2−シクロヘキセン−1−オール』と訂正します。
(誤訳訂正22) 第97頁第9行の「オリガマー」を『オリゴマー』と訂正し
ます。
(誤訳訂正23) 第110頁第8行、第117頁第12−13行、第118頁
第3−4行、第119頁第5−6行、および同第17−18行の「アミノジオー
ル」をそれぞれ『アミノジオールモノマー』と訂正します。
(誤訳訂正24) 第112頁第15行の「(N,N−ジエチルアミノ)プロピ
オン酸塩酸塩」を『3−(N,N−ジエチルアミノ)プロピオン酸塩酸塩』と訂
正します。
(誤訳訂正25) 第114頁最下行の「3−インダニル酢酸」を『2−インダ
ニル酢酸』と訂正します。
(誤訳訂正26) 第120頁下から3−2行の「そしてその反応混合物を手で
3分間振る。」を『次にアダマントイルクロリド/ピリジン−CH3CNの溶液
を加え、そしてその反応混合物を手で3分間振る。』と訂正します。
(誤訳訂正27) 第123頁第14−16行の「メチル−3−O−TBDMS
−6−(TBDMS)−オキシメチル−8−BOC−8−アザビシクロ[3.2
.
1]オクタ−2,6−ジエン−2−カルボキシレート」を『メチル−3−O−T
BDMS−6−(O−TBDMS)−オキシメチル−8−BOC−8−アザビシ
クロ[3.2.1]オクタ−2,6−ジエン−2−カルボキシレート』と訂正し
ます。
(誤訳訂正28) 同下から6行の「25mmoL」を『20mmoL』と訂正
します。
(誤訳訂正29) 第124頁第1−2行の「メチル−3−O−TBDMS−6
−(TBDMS)−オキシメチル−8−BOC−8−アザビシクロ[3.2.1
]オクタ−2−エン−2−カルボキシレート」を『メチル−3−O−TBDMS
−6−(O−TBDMS)−オキシメチル−8−BOC−8−アザビシクロ[3
.2.1]オクタ−2−エン−2−カルボキシレート』と訂正します。
(誤訳訂正30) 第125頁第12−13行の「3−オキソ−6−O−DMT
−オキシメチル−8−FMOC−8−アザビシクロ[3.2.1]オクタン」を
『3−ヒドロキシ−6−O−DMT−オキシメチル−8−FMOC−8−アザビ
シクロ[3.2.1]オクタン』と訂正します。
(誤訳訂正31) 第133頁第5行の「−2’−Oのスクシニル」を『−2’
−O−スクシニル』と訂正します。
(誤訳訂正32) 同第7−8行の「ビペリジンの10%DMF溶液」を『DM
F中10%ピペリジン』と訂正します。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L
U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF
,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,
SN,TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,S
Z,UG),UA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD
,RU,TJ,TM),AL,AM,AT,AU,AZ
,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,CZ,
DE,DK,EE,ES,FI,GB,GE,HU,I
L,IS,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LK
,LR,LS,LT,LU,LV,MD,MG,MK,
MN,MW,MX,NO,NZ,PL,PT,RO,R
U,SD,SE,SG,SI,SK,TJ,TM,TR
,TT,UA,UG,US,UZ,VN
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1. 連結基により結合した複数のアミノジオールモノマーサブユニットを含む オリゴマー性化合物であって、前記アミノジオールモノマーサブユニットのそれ ぞれは次のいずれかの構造I、II、III、IV、V、VI、VII、VII I、IX、X、またはXI: [式中、 それぞれのxは、独立して、0から5であり; na、nbおよびncは、それぞれ独立して、0から2であり、na、nbおよ びncの合計は1から5であり; R1は、−T−Lまたは塩基不安定性保護基であり; Tは、単結合、メチレン基または次式を有する基であり: {[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q− 式中、 R10は、=O、=S、または=NR11であり; R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH、C≡C、O、S、NR11、ま たはC6−C14アリールであり; それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル、2から約10個の 炭素原子を有するアルケニル、2から約10個の炭素原子を有するアルキニル、 または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり; mおよびnは、独立して、0から5であり; pは、0または1であり; qは、1から約10であり; Lは、H、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10 アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換の C4−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニル、 置換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6−C1 4 アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子 を有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、金属 配位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(SH )、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、アミ ジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13) 、グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニトレー ト(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル(C F3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、NH −アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−アラル キル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(N HNH2)、ヒドロキシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン (SO2)、スルフィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオ シド性塩基、アミノ酸側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結 合しうる基であり、ここで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アル コール、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、 アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニル基から選択され; R2は、水素またはC1−C10アルキルであり; R3およびR4は、独立して、水素、酸不安定性ヒドロキシル保護基、連結基また はコンジュゲート基であり、前記連結基は次の式を有する: 式中、 J1は、=Oまたは=Sであり; J2は、OHまたはN(Y0)T0であり; Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり; T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し ; Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキル、C4−C7炭素環式アルケニル、複 素環、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有す るエーテル、ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり; jおよびkは、独立して、0または1であり; Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、C2 −C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、C H=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12 R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C(= O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素 含有複素環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポ リエチレングリコール基であり; ただし、前記オリゴマー性化合物中の前記アミノジオールモノマーサブユニット の少なくとも1つは構造IIIを有しない] を有することを特徴とする化合物。 2. 前記J1が=Oまたは=Sであり、前記J2がOHである、請求項1記載の オリゴマー性化合物。 3. 前記J1が=Oであり、前記J2がN(Y0)T0であり、前記 N(Y0)T0の少なくとも2つが同一である、請求項1記載のオリゴマー性化合 物。 4. 前記J1が=Oであり、前記J2がN(Y0)T0であり、前記 N(Y0)T0の少なくとも2つが異なる、請求項1記載のオリゴマー性化合物。 5. 前記R1のそれぞれが同一である、請求項1記載のオリゴマー性化合物。 6. 前記R1の少なくとも2つが異なる、請求項1記載のオリゴマー性化合物 。 7. 前記アミノジオールモノマーサブユニットのそれぞれが同一である、請求 項1記載のオリゴマー性化合物。 8. 前記アミノジオールモノマーサブユニットの少なくとも2つが異なる、請 求項1記載のオリゴマー性化合物。 9. オリゴマーのライブラリであって、前記オリゴマーのそれぞれは連結基に より結合した複数のアミノジオールモノマーサブユニットを含み、前記アミノジ オールモノマーサブユニットのそれぞれは、構造I、II、III,IV、V、 VI、VII、VIII、IX、X、またはXI: [式中、 それぞれのxは、独立して、0から5であり; na、nbおよびncは、それぞれ独立して、0から2であり、na、nbおよ びncの合計は1から5であり; R1は、−T−Lまたは塩基不安定性保護基であり; Tは、単結合、メチレン基または次式を有する基であり: {[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q− 式中、 R10は、=O、=S、または=NR11であり; R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH、C≡C、O、S、NR11、ま たはC6−C14アリールであり; それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル、2から約10個の 炭素原子を有するアルケニル、2から約10個の炭素原子を有するアルキニル、 または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり; mおよびnは、独立して、0から5であり; pは、0または1であり; qは、1から約10であり; Lは、H、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10 アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換の C4−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニル、 置換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6−C1 4 アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子 を有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、金属 配位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(SH )、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、アミ ジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13) 、グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニトレー ト(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル(C F3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、NH −アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−アラル キル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)、ヒドロキ シルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)、スルフィ ド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオシド性塩基、アミノ酸 側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結合しうる基であり、こ こで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、ベンジル、フ ェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、 アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニル基から選択され; R2は、水素またはC1−C10アルキルであり; R3およびR4は、独立して、水素、酸不安定性ヒドロキシル保護基、連結基また はコンジュゲート基であり、ここで前記連結基は次の式を有し: 式中、 J1は、=Oまたは=Sであり; J2は、OHまたはN(Y0)T0であり; Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり; T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し ; Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキル、C4−C7炭素環式アルケニル、複 素環、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有す るエーテル、ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり; jおよびkは、独立して、0または1であり; Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、C2 −C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、C H=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12 R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C(= O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素含有複素 環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレ ングリコール基であり; ただし、前記ライブラリの各オリゴマー性化合物中の前記アミノジオールモノマ ーサブユニットの少なくとも1つは構造IIIを有しない] を有することを特徴とするライブラリ。 10. 前記J1が=Oまたは=Sであり、前記J2がOHである、請求項9記載 のライブラリ。 11. 前記J1が=Oであり、前記J2がN(Y0)T0であり、前記N(Y0) T0の少なくとも2つが同一である、請求項9記載のライブラリ。 12. 前記J1が=Oであり、前記J2がN(Y0)T0であり、前記N(Y0) T0の少なくとも2つが異なる、請求項9記載のライブラリ。 13. 前記R1のそれぞれが同一である、請求項9記載のライブラリ。 14. 前記R1の少なくとも2つが異なる、請求項9記載のライブラリ。 15. オリゴマーを製造する方法であって、 (a) 構造I、II,III、IV、V、VI、VII、VIII、IX、X 、またはXI: [式中、 それぞれのxは、独立して、0から5であり; na、nbおよびncは、それぞれ独立して、0から2であり、na、nbおよ びncの合計は1から5であり; R1は、塩基不安定性アミノ保護基であり; R2は、水素またはC1−C10アルキルであり; R3またはR4の一方は水素または活性化ホスファイト基であり、R3またはR4の 他方は酸不安定性ヒドロキシル保護基である] を有するアミノジオールモノマーサブユニットを選択し; (b) 前記アミノジオールモノマーサブユニットを固体支持体に結合させて、 固体支持体に結合したアミノジオールモノマーサブユニットを形成し; (c) 前記酸不安定性ヒドロキシル保護基を希酸で処理して遊離ヒドロキシル 基を形成し; (d) 前記遊離ヒドロキシル基を構造I、II、III、IV、V、VI、ま たはVII、VIII、IX、X、またはXIを有する別のアミノジオールモノ マーサブユニットと反応させ、このことにより前記固体支持体に結合したオリゴ マー性化合物を形成し、前記オリゴマー性化合物はホスファイト結合を含み; (e) 随意に、工程(c)および(d)を繰り返して前記固体支持体に結合し たオリゴマー性化合物の長さを増加させ; (f) 随意に、工程(c)の前または工程(d)の後に、前記ホスファイト結 合を酸化してホスフェート連結基を形成し、ここで前記連結基は次の式: [式中、 J1は、=Oまたは=Sであり; J2は、OHまたはN(Y0)T0であり; Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり; T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し ; Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキル、C4−C7炭素環式アルケニル、複 素環、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有す るエーテル、ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり; jおよびkは、独立して、0または1であり; Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、 C2−C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、 CH=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12 R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C( =O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素含有複 素環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチ レングリコール基である] を有するように選択され; (g) 工程(e)の前または工程(f)の後に、前記固体支持体に結合したア ミノジオールモノマーサブユニットまたは前記支持体に結合したオリゴマー性化 合物を塩基と反応させて前記塩基不安定性アミノ保護基を除去して、遊離アミン を有する固体支持体に結合したアミノジオールモノマーサブユニットまたは支持 体に結合したオリゴマー性化合物を形成し、そして前記遊離アミンを次の式: −T−L [式中、 Tは、単結合、メチレン基または次式を有する基であり: {[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q− 式中、 R10は、=O、=S、または=NR11であり; R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH,C≡C、O、S、NR11、ま たはC6−C14アリールであり; それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル、2から約10個の 炭素原子を有するアルケニル、2から約10個の炭素原子を有するアルキニル、 または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり; mおよびnは、独立して、0から5であり; pは、0または1であり; qは、1から約10であり; Lは、H、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10 アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換 のC4−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニル 、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6− C14アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原 子を有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、金 属配位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(S H)、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、ア ミジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13 )、グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニトレ ート(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル( CF3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、N H−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−アラ ルキル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)、ヒドロ キシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)、スルフ ィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオシド性塩基、アミノ 酸側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結合しうる基であり、 ここで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、ベンジル、 フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール 、アルケニル、およびアルキニル基から選択される] の基で誘導化し; (h) 随意に、工程(c)および(d)、続いて工程(g)を繰り返して、前 記固体支持体に結合したオリゴマー性化合物の長さを増加させ; (i) 前記固体支持体に結合した前記オリゴマー性化合物を酸で処理して任意 の保護基を脱保護し;そして (j) 前記オリゴマー性化合物を前記固体支持体から切断する、 の各工程を含む方法。 16. 前記工程(g)が前記工程(b)の後に実施される、請求項15記載の 方法。 17. 前記工程(g)が工程(d)の前に実施されて、少なくとも1つのモノ マー性サブユニットが前記オリゴマー性化合物に付加される、請求項15記載の 方法。 18. 前記工程(g)が前記工程(d)のそれぞれの繰返しの前に実施される 、請求項15記載の方法。 19. 前記工程(g)が、前記工程(e)の少なくとも1回の繰返しの後にの み実施される、請求項15記載の方法。 20. 前記工程(g)が前記工程(f)の前に実施されて、少なくとも1つの モノマー性サブユニットが前記オリゴマー性化合物に付加される、請求項15記 載の方法。 21. コンビナトリアルライブラリを製造する方法であって、 (a) 構造I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、IX、X 、またはXI: [式中、 それぞれのxは、独立して、0から5であり; na、nbおよびncは、それぞれ独立して、0から2であり、na、nbおよ びncの合計は1から5であり; R1は、塩基不安定性アミノ保護基であり; R2は、水素またはC1−C10アルキルであり; R3またはR4の一方は、水素または活性化ホスファイト基であり、R3またはR4 の他方は酸不安定性ヒドロキシル保護基である] を有する複数のアミノジオールモノマーサブユニットを選択し; (b) 前記アミノジオールモノマーサブユニットを固体支持体に結合させて、 固体支持体に結合したアミノジオールモノマーサブユニットを形成し; (c) 前記酸不安定性ヒドロキシル保護基を希酸で処理して遊離ヒドロキシル 基を形成し; (d) 前記遊離ヒドロキシル基を構造I、II、III、IV、V、VI、V II、VIII、IX、X、またはXIを有する別のアミノジオールモノマーサ ブユニットと反応させ、このことにより前記固体支持体に結合したオリゴマー性 化合物を形成し、前記オリゴマー性化合物はホスファイト結合を含み; (e) 随意に、工程(c)および(d)を繰り返して前記固体支持体に結合し たオリゴマー性化合物の長さを増加させ; (f) 随意に、工程(c)の前または工程(d)の後に、前記ホスファイト結 合を酸化して、次の式: [式中、 J1は、=Oまたは=Sであり; J2は、OHまたはN(Y0)T0であり; Y0は、Hまたは[Q2]j−Z2であり; T0は、[Q1]k−Z1であり、またはY0およびT0は一緒に窒素複素環を形成し ; Q1およびQ2は、独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキル、C4−C7炭素環式アルケニル、複 素環、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原子を有す るエーテル、ポリアルキルグリコール、またはC7−C14アラルキルであり; jおよびkは、独立して、0または1であり; Z1およびZ2は、独立して、H、C1−C20アルキル、C2−C20アルケニル、 C2−C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、 CH=O、OR12、SR12、NR12R13、C(=NH)NR12R13、CH(NR12 R13)、NHC(=NH)NR12R13、CH(NH2)C(=O)OH、C( =O)NR12R13、C(=O)OR12、金属配位基、レポーター基、窒素含有複 素環、プリン、ピリミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチ レングリコール基である] を有するホスフェート連結基を形成し; (g) 工程(e)の前または工程(f)の後に、前記固体支持体に結合したア ミノジオールモノマーサブユニットまたは前記支持体に結合したオリゴマー性化 合物を塩基と接触させて前記塩基不安定性アミノ保護基を除去して、遊離アミン を有する固体支持体に結合したアミノジオールモノマーサブユニットまたは支持 体に結合したオリゴマー性化合物を形成し、そして前記遊離アミンを次の式: −T−L [式中、 Tは、単結合、メチレン基または次式を有する基であり: {[CR6R7]m−(R5)−[CR8R9]n−[C(R10)]p−(E)−}q− 式中、 R10は、=O、=S、または=NR11であり; R5およびEは、独立して、単結合、CH=CH、C≡C、O、S、NR11、ま たはC6−C14アリールであり; それぞれのR6、R7、R8、R9、R11、R12およびR13は、独立して、H、1か ら約10個の炭素原子を有するアルキルまたはハロアルキル、2から約10個の 炭素原子を有するアルケニル、2から約10個の炭素原子を有するアルキニル、 または7から約14個の炭素原子を有するアリールであり; mおよびnは、独立して、0から5であり; pは、0または1であり; qは、1から約10であり; Lは、H、置換または非置換のC2−C10アルキル、置換または非置換のC2−C10 アルケニル、置換または非置換のC2−C10アルキニル、置換または非置換 のC4−C7炭素環式アルキル、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルケニル 、置換または非置換のC4−C7炭素環式アルキニル、置換または非置換のC6− C14アリール、2から10個の炭素原子および1から4個の酸素またはイオウ原 子を有するエーテル、窒素含有複素環、イオウ含有複素環、酸素含有複素環、金 属配位基、コンジュゲート基、ハロゲン、ヒドロキシル(OH)、チオール(S H)、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、アミド(CONR12)、ア ミジン(C(=NH)NR12R13)、グアニジン(NHC(=NH)NR12R13 )、グルタミル(R12OOCCH(NR12R13)(CH2)2C(=O)、ニトレ ート(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル( CF3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、N H−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−アラ ルキル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)、ヒドロ キシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)、スルフ ィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、ヌクレオシド性塩基、アミノ 酸側鎖、炭水化物、生物薬学的に活性な成分、または水素結合しうる基であり、 ここで置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、アルコール、ベンジル、 フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール 、アルケニル、およびアルキニル基から選択される] の基で誘導化し; (h) 随意に、工程(c)および(d)、続いて工程(g)を繰り返して、前 記固体支持体に結合したオリゴマー性化合物の長さを増加させ; (h) 前記固体支持体に結合した前記オリゴマー性化合物を酸で処理して、任 意の保護基を脱保護し;そして (i) 前記オリゴマー性化合物を前記固体支持体から切断する、 の各工程を含む方法。 22. 前記工程(g)が前記工程(b)の後に実施される、請求項21記載の 方法。 23. 前記工程(g)が工程(e)の前に実施されて、少なくとも1つのモノ マー性サブユニットが前記オリゴマー性化合物のそれぞれに付加される、請求項 21記載の方法。 24. 前記工程(g)が前記工程(e)のそれぞれの繰返しの前に実施される 、請求項21記載の方法。 25. 前記工程(g)が、前記工程(e)の少なくとも1回の繰返しの後にの み実施される、請求項21記載の方法。 26. 前記工程(g)が前記工程(f)の前に実施されて、少なくとも1つの モノマー性サブユニットが前記オリゴマー性化合物のそれぞれに付加される、請 求項21記載の方法。
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