JPH11506904A - Rage腫瘍拒絶抗原 - Google Patents

Rage腫瘍拒絶抗原

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JPH11506904A JP8528658A JP52865896A JPH11506904A JP H11506904 A JPH11506904 A JP H11506904A JP 8528658 A JP8528658 A JP 8528658A JP 52865896 A JP52865896 A JP 52865896A JP H11506904 A JPH11506904 A JP H11506904A
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ヴェン・デン・エインデ,ブノア
シュリール,ペーター
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ブン−ファレール,ティエリー
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ルートヴィヒ・インスティチュート・フォー・キャンサー・リサーチ
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、RAGE腫瘍拒絶抗原前駆体族、それらの腫瘍拒絶抗原前駆体をコードする核酸、腫瘍拒絶抗原ペプチドまたはその前駆体、およびそれに関連する抗体を記載する。RAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とする状態を診断および処置する方法および生成物も提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 RAGE腫瘍拒絶抗原 発明の分野 本発明は、腫瘍拒絶抗原およびその前駆体をコードする核酸分子に関する。腫 瘍拒絶抗原前駆体はプロセシングされて、特にHLA分子が提示する少なくとも 1種類の腫瘍拒絶抗原となる。これらの核酸分子、それらの分子がコードするタ ンパク質、およびそれに由来するペプチド、ならびに関連の抗体および細胞毒性 リンパ球は、特に診断および療法用として有用である。 発明の背景 哺乳動物の免疫系が異質または異種の物質を認識して反応する過程は複雑であ る。この系の重要な1面はT細胞の応答である。T細胞は、他の細胞上にある、 ペプチドとヒト白血球抗原(“HLA”)または主要組織適合性遺伝子複合体( “MHC”)と呼ばれる分子との細胞表面複合体を介して他の細胞を認識し、そ れらと相互作用することができる。これらのペプチドは、HLA/MHC分子を も提示する細胞によりプロセシングされた、さらに大型の分子に由来する。Male et al.,Advanced Immunology(J.P.リピンコット・カンパニー、1987)、特に6- 10章参照。T細胞とHLA/ペプチド複合体との相互作用には制限があり、HL A分子とペプチドの特定の複合体には特異的T細胞が要求される。特異的T細胞 が存在しない場合、その相手である複合体が存在してもT細胞応答はない。T細 胞は存在するが特定の複合体が存在しない場合にも、応答はない。この機構は、 異物に対する免疫系の応答、自己免疫病理、および細胞異常に対する応答に関与 する。 T細胞が異物を認識する機構は癌にも関与すると指摘されている。自己由来の 黒色腫に指向性である多数の細胞溶解性Tリンパ球(CTL)クローンについて の記載がある。幾つかの例では、これらのクローンが認識する抗原が解明されて いる。国際特許出願第PCT/US92/04354号(1992年11月26 日公開)には、“MAGE”族、すなわち腫瘍特異性遺伝子族が開示される。こ れらの遺伝子の発現生成物はプロセシングされてペプチドとなり、これらが細胞 表面に発現する。これが特異的CTLによる腫瘍細胞溶解をもたらすことができ る。これらの遺伝子は“腫瘍拒絶抗原前駆体”、すなわち“TRAP”分子をコ ードするといわれ、それに由来するペプチドは“腫瘍拒絶抗原”、すなわち“T RA”と呼ばれる。この遺伝子族のより詳細な情報については、Traversari et al.,Immunogenetics 35:145(1992);van der Bruggen et al.,Science 254:1643 (1991)を参照されたい。米国特許第5,342,774号も参照されたい。 米国特許第5,405,940号には、HLA−A1分子が提示するMAGE ノナペプチドが教示される。特定のHLA分子に対して特定のペプチドが特異性 をもつことが知られているとすれば、ある特定のペプチドは一つのHLA分子に 結合し、他には結合しないと予想するはずである。異なる個体は異なるHLA表 現型をもつので、このことは重要である。その結果、特定のペプチドを特定のH LA分子の相手として確認することは診断および療法に関連はあるが、これらは その特定のHLA表現型をもつ個体に関係があるにすぎない。細胞異常は1つの 特定のHLA表現型に限定されず、ターゲティング療法には問題となる異常細胞 の表現型についてある程度の知識が要求されるので、この領域ではさらに研究の 必要がある。 MAGE発現生成物がプロセシングされて第2のTRAになることも見出され た。この第2のTRAはHLA−Cクローン10の分子により提示される。した がって、あるTRAPが複数のTRAを生成する可能性がある。 国際特許出願公開第WO94/14459号(1994年7月7日公開)には 、チロシナーゼが腫瘍拒絶抗原前駆体として記載される。この参考文献には、あ る正常細胞(たとえばメラニン細胞)により産生された分子が腫瘍細胞中でプロ セシングされて、HLA−A2分子が提示する腫瘍拒絶抗原を生じることが開示 される。 国際特許出願公開第WO94/21126号(1994年9月29日公開)に は、チロシナーゼ由来でない第2のTRAをHLA−A2分子が提示すると教示 される。このTRAはTRAPに由来するが、非MAGE遺伝子によりコードさ れる。この開示は、特定のHLA分子が異なる供給源に由来するTRAを提示す る可能性のあることを示す。 国際特許出願公開第WO95/00159号(1995年1月5日公開)には 、非関連腫瘍拒絶抗原前駆体であるいわゆる“BAGE”前駆体が記載される。 このTRAPから誘導されるTRAも記載される。それらはMHC分子であるH LA−Cクローン10と複合体を形成する。 国際特許出願公開第WO95/03422号(1995年2月2日公開)には 、他の非関連腫瘍拒絶抗原前駆体であるいわゆる“GAGE”前駆体が記載され る。GAGE前駆体はBAGEまたはMAGE族とは関連がない。 前記の報文、特許および特許出願明細書により示される研究は、大部分がMA GE族遺伝子、BAGE遺伝子およびGAGE遺伝子に関する。これらの遺伝子 は多数の腫瘍に発現するが、精巣以外の正常組織中では完全に沈黙している。腎 臓がんには全く発現しない。 他の遺伝子族である“RAGE”遺伝子が他の腫瘍拒絶抗原およびその前駆体 をコードすることが今回見出された。RAGE遺伝子は、MAGE族遺伝子、B AGE遺伝子またはGAGE遺伝子との相同性を示さない。RAGE遺伝子は腎 腫瘍細胞中に発現するが、正常な腎細胞中には発現しない。RAGE遺伝子は特 定の他の腫瘍細胞タイプにも発現する。 本発明を以下に詳細に開示する。 発明の概要 本発明は、単離した核酸分子、それらの分子を含む発現ベクター、それらの分 子でトランスフェクションした宿主細胞を提供する。本発明は単離したタンパク 質およびペプチド、ならびにそれらのタンパク質およびペプチドに対する抗体を も提供する。前記の分子を含むキットもさらに提供される。RAGE TRAま たはTRAPの発現を特色とする状態の診断または処置にこれらを使用できる。 本発明の1態様によれば、単離したポリペプチドが提供される。これは少なく とも配列番号:40のアミノ酸配列を含み、RAGE TRAである。好ましい 態様においては、単離したポリペプチドは少なくとも配列番号:43のアミノ酸 配列を含む。他の態様においては、単離したポリペプチドは本質的に配列番号: 40もしくは配列番号:43のアミノ酸配列からなるか、またはその配列のみで あってもよい。 本発明の他の態様によれば、単離した核酸分子が提供される。この分子は配列 番号:40および配列番号:43よりなる群から選択されるポリペプチドをコー ドする。単離した核酸は配列番号:44を含むことができ、好ましくは配列番号: 45を含む。他の態様においては、単離した核酸は本質的に配列番号:44もし くは配列番号:45からなるか、またはその配列のみであってもよい。 本発明の他の態様によれば、単離した核酸分子であって、配列番号:1、配列 番号:4、配列番号:6、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:13、 配列番号:14、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:23および/ま たは配列番号:35の核酸配列からなる分子に緊縮条件下でハイブリダイズし、 かつRAGE TRAまたはTRAPをコードする核酸分子が提供される。ただ し単離した核酸分子はMAGE、GAGEまたはBAGE TRAまたはTRA Pをコードしない。好ましい態様においては、単離した核酸分子はmRNA分子 またはcDNA分子である。1態様においては、単離した核酸分子は配列番号: 1の204〜326、配列番号:1の313〜399、配列番号:1の444〜 665、配列番号:12の273〜449、配列番号:12の217〜276、 配列番号:13の185〜247、および配列番号:14の269〜832より なる群から選択されるヌクレオチドに相補的である。他の態様においては、単離 した核酸は本質的に配列番号:1、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:1 0、配列番号:12、配列番号:13、配列番号:14、配列番号:15、配列 番号:17、配列番号:23、配列番号:35、配列番号:44および/または 配列番号:45からなる。 本発明の他の態様によれば、発現ベクター、およびそれらの発現ベクターを含 む宿主細胞が提供される。これらの発現ベクターは、前記の単離した核酸分子の いずれか1つまたはそれ以上を含む。1態様においては、発現ベクターは配列番 号:44または45の単離した核酸を含む。本発明による他の発現ベクターは、 前記の単離した核酸、および本発明のTRAを細胞溶解性T細胞に提示しうるH LA分子をコードする核酸を含む。1例はHLA−B7である。宿主細胞はHL A分子、たとえばHLA−B7を、内因性発現することができる。 本発明の他の態様によれば、配列番号:1、配列番号:12、配列番号:13 もしくは配列番号:14のユニークフラグメントである単離した核酸分子、また はそれらの相補体が提供される。これらのユニークフラグメントは、前記核酸を 確認し、または選択的に増幅するために用いられる。前記核酸の発現を確認する ためにこれらのユニークフラグメントを用いる場合、これらのユニークフラグメ ントは好ましくは200〜1310ヌクレオチドの長さ、200〜1234ヌク レオチドの長さ、200〜2050ヌクレオチドの長さ、または200〜116 7ヌクレオチドの長さである。前記核酸分子を増幅するためにこれらのユニーク フラグメントを用いる場合、ユニークフラグメントは12〜32ヌクレオチドの 長さである。増幅方法が核酸分子を同定するために用いる方法を除外しないこと は自明であろう。 本発明の他の態様によれば、TRAまたはTRAPの発現の存在を検出するた めのキットが提供される。これらのキットは、別個の容器中に単離し、かつ単一 パッケージに包装した、2以上の前記分子を用いる。このようなキットの1つに は一対の増幅プライマーが供給され、その一対のそれぞれは、本質的に配列番号 :1もしくはその相補体、配列番号:12もしくはその相補体、配列番号:13 もしくはその相補体、または配列番号:14もしくはその相補体の12〜32ヌ クレオチドの長さの連続セグメントからなり、それらの連続セグメントはオーバ ーラップしない。好ましくは増幅プライマーはPCRプライマーであり、その際 一方のプライマーはワトソン鎖の連続セグメントであり、他方のプライマーはク リック鎖の連続セグメントの相補体である。特定の態様においては、RAGE族 の1つのみ、たとえばRAGE1のみ、またはRAGE1のみの一部などを選択 的に増幅および/または同定するようにプライマーを構築および調整する。たと えば対の一方はRAGE1遺伝子およびその対立変異体中では連続するが、RA GE2、3または4遺伝子中では連続しない。より詳細には一例として、第1プ ライマーは本質的に配列番号:50〜57のいずれか一つよりなる核酸であり、 第2プライマーは第1プライマーの選択に応じて本質的に配列番号:1またはそ の相補体の12〜32ヌクレオチドの長さの連続セグメントからなる。 本発明による他のキットは、RAGE TRAPまたはRAGE TRAを含 む分子、およびそのTRAと複合体を形成しかつ細胞溶解性T細胞応答を刺激す るHLA提示分子をコードする、単離した別個の核酸分子部分を含む発現キット である。このようなキットの1つは、配列番号:40または配列番号:43のペ プチドをコードする核酸、およびHLA−B7をコードする核酸分子を含む。本 発明による他のキットは、配列番号:1、配列番号:4、配列番号:6、配列番 号:10、配列番号:12、配列番号:13、配列番号:14、配列番号:15 、配列番号:17、配列番号:23および/または配列番号:35の核酸配列か らなる分子に緊縮条件下でハイブリダイズし、かつRAGE TRAPをコード する単離した核酸分子の別個の部分、ならびにHLA−B7をコードする核酸分 子を含む発現キットである。 本発明の他の態様によれば、前記分子およびその有用なフラグメントによりコ ードされる単離したTRAPが提供される。それらの分子に対する、およびHL AとRAGE TRAの複合体に対する抗体も提供される。 本発明の他の態様によれば、RAGE TRAPの発現を特色とする障害の診 断方法が提供される。1方法はRAGE TRAPがプロセシングされて、HL A分子と複合体を形成するRAGE由来TRAになることに関係する。この方法 は、対象から単離した生物学的試料を、上記複合体を結合する物質と接触させ、 次いで複合体と物質の結合をその障害の決定因子として測定することを含む。1 態様においては、この方法はRAGE TRAとHLA−B7の複合体への上記 物質の結合を測定する。この態様においては、RAGE TRAを配列番号:4 0のペプチドおよび配列番号:43のペプチドよりなる群から選択できる。他の 方法は、対象から単離した生物学的試料をRAGE核酸またはその発現生成物に 特異的な物質と接触させることを含む。次いでこの物質と核酸またはその発現生 成物との相互作用を測定するが、この相互作用は障害を指示するものである。こ の物質は、配列番号:1、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:10、配列 番号:12、配列番号:13、配列番号:14、配列番号:15、配列番号:1 7、配列番号:23および配列番号:35よりなる群から選択される核酸配列か らなる分子に緊縮条件下でハイブリダイズし、かつTRAPをコードする核酸で あってもよい。ただし単離した核酸分子はMAGE、GAGEまたはBAGE TRAPをコードしない。他の方法は、対象から単離した生物学的試料をRAG E腫瘍拒絶抗原性ペプチドに特異的な物質と接触させ、次いでこのペプチドと物 質の相互作用を障害の決定因子として測定することを含む。1態様においては、 ペプチドは配列番号:40および配列番号:43よりなる群から選択される。 本発明の他の態様によれば、単離した生物学的調製物が提供される。この調製 物は、HLA分子とRAGE TRAとの複合体に特異的な、細胞溶解性T細胞 から本質的になる。1態様においては、細胞溶解性T細胞はHLA−B7分子と TRAの複合体に特異的である。この態様においては、抗原は配列番号:40の ペプチドおよび配列番号:43のペプチドよりなる群から選択されるペプチドで もよい。 したがって本発明の他の態様は、T細胞集団をHLA分子とRAGE TRA との複合体に特異的な細胞溶解性T細胞で選択的に富化する方法を含む。この方 法は、細胞溶解性T細胞前駆体を含む単離したT細胞集団を、この単離したT細 胞集団を細胞溶解性T細胞で選択的に富化するのに十分な量の、RAGE TR AとHLA提示分子との複合体を提示する物質と接触させることを含む。好まし い1態様においては、HLA分子はHLA−B7であり、RAGE TRAは配 列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸から なるペプチドよりなる群から選択される。 本発明のさらに他の態様は、RAGE TRAまたはTRAPの発現を特色と する障害を伴う対象を処置する方法である。このような1方法は、この処置を必 要とする対象に、対象においてHLAとRAGE TRAの複合体の存在を選択 的に高めるのに有効な量の物質を投与して、障害を軽減するのに十分な、前記複 合体と反応性である細胞溶解性T細胞の応答を生じるさせることを含む。このよ うな物質には、RAGE TRAP、およびHLAとRAGE TRAの複合体 を発現する組換え細胞が含まれる。1態様においては、このような物質にはHL A−B7と配列番号:40のペプチドおよび配列番号:43のペプチドからなる ペプチドとの複合体を発現する細胞が含まれる。他の方法は、この処置を必要と する対象に、障害を軽減するのに十分な量の自己由来の細胞溶解性T細胞を投与 するものであり、その際、自己由来の細胞溶解性T細胞はHLA分子とRAGE TRAの複合体に特異的である。 前記のTRAPまたはTRAをコードする単離した核酸に関して、本発明はコ ドン配列が遺伝子コードの縮重のみによって単離核酸と異なる縮重核酸、または 前記核酸の相補体をも包含する。 本発明は、前記分子すべての機能性変異体および均等物をも包含する。 本発明はまた、腫瘍細胞中、特に腎腫瘍細胞中で発現するが、正常な腎細胞中 では発現しないTRAPおよびTRAを見出し、単離するものである。他の多数 の細胞タイプついて他のTRAPおよびTRAが知られかつ確認されているにも かかわらず、本発明以前には本明細書に記載するタイプのTRAPおよび/また はTRAは腎癌について知られておらず、確認されてもいない。意外にも、本発 明のRAGE−1遺伝子は57例中1例の腎癌で発現したにすぎず、特定の細胞 毒性T細胞クローンに対する最良の抗原性ペプチドは、通常のノナマーペプチド ではなくデカマーであることが見出された。したがって本発明の他の態様によれ ば、本発明はTRAP、TRA、ならびにTRAPおよびTRAをコードする核 酸であって、MAGE、BAGEおよびGAGEのTRAP、TRAおよび核酸 でなく、腫瘍細胞中、特に腎腫瘍細胞中で発現するが、正常な腎細胞中では発現 せず、かつ以下の方法で得られ得るものを提供する: 患者から腎腫瘍細胞を単離し、 患者からリンパ球を単離し、 インビボで腎腫瘍細胞をリンパ球と接触させ、 腎腫瘍細胞と反応性であるリンパ球のうちから細胞毒性T細胞クローンを単離 し、 腎腫瘍細胞のmRNAから発現ライブラリーを調製し、 細胞毒性T細胞クローンを用いて、細胞毒性T細胞クローンと反応性であるラ イブラリー構成員子につき発現ライブラリーをスクリーニングし、 細胞毒性T細胞クローンと反応性であるライブラリー構成員子を単離し、そし て 該ライブラリー構成員子中の腎細胞核酸であって、TRAを含めたTRAP( またはその一部)をコードする腎細胞核酸を配列決定する。本発明は、これらの 核酸と相同でありかつ腎付随TRAPおよびTRAをコードする配列、緊縮条 件下でこれらの核酸とハイブリダイズし、かつ腎付随TRAPおよびTRAをコ ードする配列、以上の配列の相補体、ユニークフラグメントおよび“縮重体”、 TRAPおよびTRA自身、ならびに以上の配列のいずれかの機能性変異体およ び均等物をも提供し、これらはすべてRAGE核酸、TRAPおよびTRAであ ると考えることができる。 本発明は、対象において薬剤として用いるHLA/RAGE TRA複合体の 存在を選択的に高める物質をも提供する。このような物質には、RAGE TR Aおよび/またはRAGE TRAP;RAGE TRAおよび/またはRAG E TRAPを発現し、かつ適切なHLA分子(組換え体、またはそうでないも の)をも発現する組換え細胞;ならびに以上に記載したものの機能性変異体およ び均等物が含まれるが、これらに限定されない。具体例には、配列番号:43の RAGE TRA;配列番号:43のTRAを含む、配列番号:5のRAGE TRAPのフラグメント;配列番号:5のRAGE TRAP;配列番号:43 のTRAおよびHLA−B7を発現する組換え細胞;および/または他のいずれ かのRAGE TRA、RAGE TRAPもしくはその機能性フラグメント、 および/またはそれらの分子を発現する細胞が含まれる。 本発明は、対象において癌の処置に用いる薬剤の製造に際して、HLA/RA GE TRA複合体の存在を選択的に高める物質をも提供する。このような物質 には、RAGE TRAおよび/またはRAGE TRAP;RAGE TRA および/またはRAGE TRAPを発現し、かつ適切なHLA分子(組換え体 またはそうでないもの)を発現する組換え細胞;ならびに以上に記載したものの 機能性変異体および均等物が含まれるが、これらに限定されない。具体例には、 配列番号:43のRAGE TRA;配列番号:43のTRAを含む、配列番号 :5のRAGE TRAPのフラグメント;配列番号:5のRAGE TRAP ;配列番号:43のTRAおよびHLA−B7を発現する組換え細胞;および/ または他のいずれかのRAGE TRA、RAGE TRAPもしくはその機能 性フラグメント、および/またはそれらの分子を発現する細胞が含まれる。 本発明は、薬剤として用いる、HLAとRAGE TRAの複合体に特異的な 細胞毒性T細胞をも提供する。限定ではない一例は、HLA−B7とRAGE TRAの複合体を発現する腫瘍細胞に特異的な自己細胞毒性T細胞である。 本発明は、癌治療用の薬剤の製造における、HLAとRAGE TRAの複合 体に特異的な細胞毒性T細胞をも提供する。限定ではない一例は、HLA−B7 とRAGE TRAの複合体を発現する腫瘍細胞に特異的な自己細胞毒性T細胞 である。 本発明は、前記または本明細書全体に記載した1またはそれ以上の薬剤を含有 する薬剤調製物をも提供する。それらの薬剤調製物は薬剤学的に許容しうる希釈 剤、キャリヤーまたは賦形剤を含有することができる。 これらおよび他の本発明の目的を、本発明の詳細な記述と関連してさらに詳細 に述べる。 図面の簡単な説明 図1は、CTLクローン263/17がHLA−B7 cDNAおよびRAG E TRAPをコードするcDNAでトランスフェクションしたCOS細胞と組 み合わせられた場合に産生する腫瘍壊死因子の濃度を示すグラフである。 図2は、RAGE−1、2、3および4 cDNAの模式図である。閉じた黒 色ボックスは3種類それぞれのリーディングフレーム中の異なるORFを示す。 RAGE2、3および4 cDNAのシェーディングした領域はRAGE−1配 列と無関係の配列を表し、2つの挿入配列がこれに含まれる。PCRにより得た 5′末端配列を点線のボックスで示す。このPCR配列の3′末端はRAGE2 、3および4 cDNAのオーバーラップ5′末端配列と等しい。RAGE−1 がコードする抗原性ペプチドを示す。 図3は、CTLクローン263/17がHLA−B7 cDNAおよびRAG E TRAPをコードするcDNAまたはRAGE TRAPのORF2をコー ドするミニジーンでトランスフェクションしたCOS細胞と組み合わせられた場 合に産生する腫瘍壊死因子の濃度を示すグラフである。 図4は、CTLクローン263/17を、RAGE遺伝子のORF2がコード するTRAPのペプチドフラグメント、およびHLA−B7でトランスフェクシ ョンしたCOS細胞と組み合わせた場合に産生される腫瘍壊死因子の濃度を詳細 に示すグラフである。 図5は、RAGE TRAを含む漸増する濃度のペプチドで間欠的に処理した HLA−B7-LB23−EBVBに対するCTLクローン267/17の細胞 溶解活性を示すグラフである。 配列の簡単な記載 配列番号:1は、RAGE−1 cDNAのヌクレオチド配列である。 配列番号:2は、配列番号:1のcDNAのオープンリーディングフレーム1 (ORF1)である。 配列番号:3は、配列番号:2の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:4は、配列番号:1のcDNAのオープンリーディングフレーム2 (ORF2)である。 配列番号:5は、配列番号:4の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:6は、配列番号:1のcDNAのオープンリーディングフレーム3 (ORF3)である。 配列番号:7は、配列番号:6の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:8は、配列番号:1のcDNAのオープンリーディングフレーム4 (ORF4)である。 配列番号:9は、配列番号:8の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:10は、配列番号:1のcDNAのオープンリーディングフレーム 5(ORF5)である。 配列番号:11は、配列番号:10の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:12は、RAGE−2 cDNAのヌクレオチド配列である。 配列番号:13は、RAGE−3 cDNAのヌクレオチド配列である。 配列番号:14は、RAGE−4 cDNAのヌクレオチド配列である。 配列番号:15は、配列番号:12のcDNAのオープンリーディングフレー ム2′(ORF2′)である。 配列番号:16は、配列番号:15の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:17は、配列番号:12のcDNAのオープンリーディングフレー ム3′(ORF3′)である。 配列番号:18は、配列番号:17の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:19は、配列番号:12のcDNAのオープンリーディングフレー ム4(ORF4)である。 配列番号:20は、配列番号:19の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:21は、配列番号:12のcDNAのオープンリーディングフレー ム5(ORF5)である。 配列番号:22は、配列番号:21の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:23は、配列番号:13のcDNAのオープンリーディングフレー ム6(ORF6)である。 配列番号:24は、配列番号:23の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:25は、配列番号:13のcDNAのオープンリーディングフレー ム2′(ORF2′)である。 配列番号:26は、配列番号:25の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:27は、配列番号:13のcDNAのオープンリーディングフレー ム3′(ORF3′)である。 配列番号:28は、配列番号:27の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:29は、配列番号:13のcDNAのオープンリーディングフレー ム4(ORF4)である。 配列番号:30は、配列番号:29の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:31は、配列番号:13のcDNAのオープンリーディングフレー ム5(ORF5)である。 配列番号:32は、配列番号:31の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:33は、配列番号:14のcDNAのオープンリーディングフレー ム2′(ORF2′)である。 配列番号:34は、配列番号:33の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:35は、配列番号:14のcDNAのオープンリーディングフレー ム3′(ORF3′)である。 配列番号:36は、配列番号:35の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:37は、配列番号:14のcDNAのオープンリーディングフレー ム4′(ORF4′)である。 配列番号:38は、配列番号:37の翻訳されたアミノ酸配列である。 配列番号:39は、図4に関して述べたRAGE腫瘍拒絶抗原を含むドデカマ ーペプチドである。 配列番号:40は、配列番号:39に記載したペプチドのノナマーフラグメン ト(アミノ酸1〜9)である。 配列番号:41は、配列番号:39に記載したペプチドのノナマーフラグメン ト(アミノ酸2〜10)である。 配列番号:42は、配列番号:39に記載したペプチドのノナマーフラグメン ト(アミノ酸3〜11)である。 配列番号:43は、配列番号:39に記載したペプチドのデカマーフラグメン ト(アミノ酸1〜10)である。 配列番号:44は、配列番号:40のペプチドをコードするDNAのヌクレオ チド配列である。 配列番号:45は、配列番号:43のペプチドをコードするDNAのヌクレオ チド配列である。 配列番号:46は、RAGE TRAPの発現を調べるPCR試験に用いるセ ンスプライマーである。 配列番号:47は、RAGE TRAPの発現を調べるPCR試験に用いるア ンチセンスプライマーであり、試験したすべてのRAGE遺伝子に共通である。 配列番号:48は、RAGE−1 TRAP遺伝子の発現を調べるPCR試験 に用いる、RAGE−1に特異的なアンチセンスプライマーである。 配列番号:49は、RAGE遺伝子のORF2挿入地点に隣接する領域を示し 、挿入配列をNで表示する。 配列番号:50〜57は、RAGE−1の同定に有用なPCRプライマーであ る。 発明の詳細な記述 腎細胞癌においてHLA−B7により限定された自己CTLが認識する抗原は 、これまで知られていない遺伝子によりコードされる。この遺伝子は、網膜以外 のすべての正常組織(精巣を含む)中では沈黙しており、数種類の腫瘍試料中に 発 現する。 実施例1:患者LE9211の抗腎細胞癌CTLクローンに関する記述 腫瘍系LE9211−RCCはLE9211と命名した女性患者の腫瘍試料に 由来する腎細胞癌である。非増殖性にするため、その試料を照射した。次いでこ れらの照射細胞をそれに特異的な細胞溶解性T細胞クローン(“CTL”)の単 離に用いた。 末梢血単核細胞(“PBMC”)の試料を患者LE9211から採取し、照射 した癌細胞と接触させた。14日後にこの混合物を癌細胞の溶解につき観察した ところ、癌細胞が提示するペプチドとHLA分子との複合体に特異的なCTLが 試料中に存在することが示された。 用いた細胞溶解アッセイ法はHerin et al.,Int.J.Cancer 39:390-396(1987)に よるクロム放出アッセイ法であった。このアッセイ法につきここに簡単に説明す る。標的癌細胞をインビトロで増殖させ、次いで30%のウシ胎児血清を補充し たダルベッコの改変イーグル培地(DMEM)に107細胞/mlに再懸濁し、 37℃で45分間、200μCi/mlのNa(51Cr)O4と共にインキュベ ートした。標識細胞をDMEMで3回洗浄した。次いで10mMのHepesお よび10%のウシ胎児血清(FCS)を補充したDMEMにこれらを再懸濁した のち、103細胞を含有する100μlずつを96ウェルミクロプレートに分配 した。リンパ球の試料を同一培地100μlに添加し、二重試験法でアッセイを 行った。プレートを100gで4分間遠心し、37℃で4時間、8%CO2雰囲 気でインキュベートした。 プレートを再度遠心し、上清100μlずつを採取して計数した。51Cr放出 率を下記により計算した: 式中、ERは観察された51Cr放出量実験値であり、SRは103個の標識細胞 を培地のみ200μl中でインキュベートすることにより測定した自発放出量で あり、MRは100μlの0.3%トリトンX−100を標的細胞に添加するこ とにより得られた最大放出量である。 高いCTL活性を示した単核細胞血液試料を増殖させ、限界希釈法によりクロ ーン化し、同じ方法で再度スクリーニングした。こうして第1のCTLクローン を単離した。このクローンを以下、263/17と呼ぶ。同様に同実験で第2の CTLクローン361A/17を得て、後記に詳述するようにCTL263/1 7が無限に増殖しえなかった場合にこれを用いた。 CTLクローン263/17および361A/17は自己由来腫瘍細胞を特異 的に溶解することができ、NK−標的K562細胞ではなかった。NK−標的K 562細胞はATCC(メリーランド州ロックビル)から入手できる。 CTLクローン263/17は自己由来腫瘍細胞で刺激した場合にTNFを産 生した。CTLクローン263/17に対する抗原を提示するHLA分子を同定 するために、阻害実験を行ったが、この実験ではHLA分子またはCD4/CD 8補助分子に対し指向性のモノクローナル抗体の存在下で、TNFの産生を調べ た。4種類のモノクローナル抗体がCTL 263/17によるTNF産生を阻 害することが認められた:(1)モノクローナル抗体W6/32、これはHLA クラスI分子指向性であった(Parham et al.,1979,J.Immunol.,123:342);( 2)抗体B1.23.2、これはHLA−BおよびC分子を認識する(Rebai et a l.,1983,Tissue Antigens,22:107);(3)抗体ME−1、これはHLA−B7 を特異的に認識する(Ellis et al.,1982,Hum.Immunol.,5:49);(4)CD8 に対する抗体B9.4.1。HLAクラスII DR分子指向性の抗体(L243 ;Lampson et al.,1980,J.Immunol.,125:293)、HLA−A3指向性の抗体(G APA 3;Berger et al.,1982,Hybridoma,1:87)またはCD4指向性の抗体 (13B.8.82)を用いた場合に阻害はみられなかった。結論は、CTL 2 63/17はCD8タイプのものであり、HLA−B7が提示する抗原を認識す るというものであった。 このCTLクローンの腫瘍特異性を判定するために、他の患者に由来する、同 様にHLA−B7である正常な腎細胞(PTEC−HLA−B7細胞)について も試験した。これらの細胞は腎細胞癌の起源部位である近位尿細管上皮に由来す る。PTEC−HLA−B7細胞はCTLにより溶解せず、この抗原が腫瘍上に 特異的に発現することを示唆する。 他のHLA−B7患者に由来する腎細胞癌系MZ−1851も、CTLにより 溶解したが、これはこの抗原が独立した腫瘍に共有されることを示す。 実施例2:CTL 263/17が認識する抗原の発現を指令する cDNAクローンの単離 A.cDNAライブラリー RNAをLE−9211−RCCから単離し、ポリ−A+RNAをオリゴ−d T結合により精製した。NotI部位を含むオリゴ−dTプライーを用いる逆転 写、次いで第2鎖の合成によりcDNAを調製した(スーパースクリプト・チョ イス・システム(Superscript Choice System)、BRL.ライフ・テクノロジ ーズ)。次いでこのcDNAをBstXIアダプターに連結させ、NotIで消 化し、サイズ分画し(セファクリル(Sephacryl)S−500 HRカ ラム、BRL.ライフ・テクノロジーズ)、そしてpcDNA−I−Amp(イ ンビトローゲン)のBstXIおよびNotI部位に1方向にクローン化した。 次いでこの組換えプラスミドを電気穿孔法によりDH5α大腸菌(E.coli )中へ導入した。100個の組換え大腸菌1500プールを増幅し、各プールの プラスミドDNAをアルカリ溶解、酢酸カリウム沈殿およびフェノール抽出によ り抽出した。 B.COS細胞のトランスフェクション 種々のプールから得たプラスミドDNAを、60ngのHLA−B7 cDN A(他のHLA−B7患者のcDNAからPCRによりクローン化し、プラスミ ドベクターpcDSRα中へ挿入したもの)と共に、COS細胞中へ同時トラン スフェクションした。トランスフェクションは2個ずつのウェル内で行われた。 要約すると、10%のウシ胎児血清を補充したDMEM中において、COS−7 細胞を15,000個/ウェルで組織培養用平底ミクロウェルに接種した。細胞 を37℃で一夜インキュベートし、培地を除去し、次いで10%のNu−Ser um(コラボレイティブ・リサーチ、メリーランド州ベッドフォード)、400 μg/mlのDEAEデキストランおよび100μMのクロロキンを含有するD MEM培地50μl/ウェルならびに100ngの上記プラスミドで交換した。 37℃で4時間のインキュベーション後に培地を除去し、10%のジメチルスル ホキシド(DMSO)を含有するPBS 50μlで交換した。この培地を2分 後に除去し、10%のFCSを補充したDMEM 200μlで交換した。 この培地交換後にCOS細胞を37℃で24〜48時間インキュベートした。 次いでトランスフェクション体をCTL 263/17でスクリーニングした。 まず培地を除去したのち、25U/mlのIL−2を含有する培地100μl中 において3000個のCTL 263/17細胞を各ウェルに添加した。次いで 上清中に存在するTNFの量をWEHI 164.13細胞に対する細胞毒性試 験により測定した。大部分のプールはTNF濃度10pg/ml未満であった。 2プール(1157および1319)が2個のウェルの両方において、より高い 濃度を示した(24〜37pg/ml)。プール1319の細菌をクローン化し 、1200クローンを得た。それらのプラスミドDNAを抽出し、HLA−B7 と共にCOS細胞中へトランスフェクションした。トランスフェクション体をC TL 263/17でスクリーニングした。1つのcDNAクローン(9H3) はCTL 263/17によって高いTNF産生を示した。図1はこのcDNA (60ng)をHLA−B7 cDNA(60ng)と共にCOS細胞中へトラ ンスフェクションし、CTL 263/17でスクリーニングした場合に得られ た結果を示す。 このcDNAは、HLA−B7肉腫系のLB23−SAR細胞にも安定にトラ ンスフェクションされた。次いで、CTLクローン263/17と同一の抗原を 認識するCTLクローン361A/17を用いて細胞溶解試験を行った。これら の安定にトランスフェクションされた細胞はCOS−HLA−B7−cDNA9 H3細胞と同様に認識された。 実施例3:cDNA 9H3の配列 cDNAクローン9H3は1130bpの長さである。このcDNAはそのサ イズがノーザンブロットでみられたmRNAの長さ(1.6kb)より短いので 、完全ではなかった。このcDNAの5′末端をRACE−PCRによりクロー ン化し、全配列を確認した。この全配列を配列番号:1として示す。データバン ク に報告された配列と比較して、3′末端においてはその機能が分かっていない“ 発現した配列tag”と呼ばれる235bpの短い配列との高い相同性を示し( 1)、5′末端においてはRTLV−H2およびRGH2と呼ばれる2つのヒト 内因性レトロウイルスのアンチセンス鎖と限られた相同性(95塩基の範囲で7 5%)を示した(2,3)。 この遺伝子はRAGE(renal tumor antiGEn)と呼ばれた。 この配列は5つのオープンリーディングフレーム、ORF1:32残基のタン パク質をコードする99塩基対;ORF2:40残基のタンパク質をコードする 123塩基対;ORF3:28残基のタンパク質をコードする87塩基対;OR F4:95残基のタンパク質をコードする288塩基対;およびORF5:73 残基のタンパク質をコードする222塩基対(それぞれ配列番号:2、4、6、 8および10)を含む。配列番号:4は、CTL 263/17と反応性である 抗原性ペプチド(HLA−B7ペプチド複合体として)が誘導されるTRAPを コードする。 実施例4:他のRAGE遺伝子の同定 この実施例は他の3種類のRAGE遺伝子を同定し、前記の実施例で同定した 現在RAGE−1と表示されるRAGE遺伝子のみが、CTL 263/17と 反応性のRAGE TRAをコードすると判定されたことにつき記載する。 RAGE−1 cDNAからプローブを調製し、他のRAGE遺伝子に対する LE9211−RCC cDNAライブラリーのスクリーニングに用いた。RA GEに相同な3種類のcDNA、すなわちRAGE−2(配列番号:12)、R AGE−3(配列番号:13)およびRAGE−4(配列番号:14)と表示さ れるものが単離された。RAGE−2、RAGE−3およびRAGE−4遺伝子 を標準法により配列決定した。これらのRAGE cDNAのヌクレオチド配列 をRAGE−1 cDNAと比較して、新たに同定されたこれらのRAGE c DNAにはトランケートした新規なオープンリーディングフレーム(ORF)が 存在ことが示された。RAGE−2、RAGE−3およびRAGE−4はRAG E−1の位置249(RAGE−1のORF2(配列番号:4)に対応する配列 内)に37bpのインサートを含む。RAGE−2 cDNAについては、コス ミド配列との比較によりこの挿入はエキソンの初めの部分に対応することが示さ れた。これがRAGE−1 cDNAに存在しないのは、別の下流受容体部位を 用いることによると思われる。さらに、RAGE−2、3および4はRAGE− 1の位置192のヌクレオチドを欠如する点でRAGE−1と異なる。これらの 変化により、RAGE−1のORF2および3と相同なRAGE−2、3および 4のORFが有意に修飾される。さらに、RAGE−3は5′末端に他の47b pの挿入配列をもつ。これらの相異以外はRAGE−1、2および3配列は等し い。 RAGE−4は他のRAGE cDNAより約800bp長い。その5′側配 列はRAGE−2のものと等しいが、位置434からポリーAテイルまではRA GE−4の配列は他のRAGE cDNAと全く異なる。RAGE−4 cDN Aはキメラではないことが示された。3′側の無関係な配列の開始位置はRAG Eゲノム配列のエキソン−イントロン境界に対応し、3′側の無関係な配列はR AGE遺伝子の3′末端に存在した。したがってRAGE−4 cDNAはRA GE−2遺伝子のディフェレンシャル(differential)スプライシングの結果生 じたと思われる。4種類のcDNAを整列させた模式図を図2に示す。4種類の RAGE cDNAには17のORFがある。これら17中10が異なる。これ らのORFは以下のとおりである: RAGE−2、RAGE−3およびRAGE−4 cDNAを当技術分野で標 準的な方法により発現プラスミド中へクローン化し、HLA−B7につき記載し たと同様にCOS−7細胞中へトランスフェクションして、これらのcDNAも CTL263/17が認識する抗原をコードするか否かを判定した。RAGE cDNA(ここではRAGE−1と呼ぶ)およびLE9211−RCC細胞を用 いた平行な対照実験も行った。 LE9211−RCC細胞、またはRAGE−1とHLA−B7で同時トラン スフェクションされたCOS−7細胞をCTL 263/17と共にインキュベ ートすると、CTL 263/17によるTNFの放出が強く誘導された。RA GE−2、RAGE−3またはRAGE−4とHLA−B7との同時トランスフ ェクションでは、TNF放出は誘導されなかった。したがってRAGE−1のみ がCTL 263/17が認識しうる抗原の発現を伝達できた。 実施例5:RAGE腫瘍拒絶抗原を含むORFの確認 RAGE−2、3および4中の37bpの挿入はこれら3遺伝子においてOR F2を早期に終止させた。したがってCTL 263/17が認識した抗原性ペ プチドはORF2の3′末端によりコードされたと推論した。この仮説を調べる ために、RAGE−1のORF2ならびにRAGE−2およびRAGE−3のO RF2′に対応するDNA配列を前記に従って発現ベクター中へクローン化し、 HLA−B7と共にCOS−7細胞中へトランスフェクションした。陽性対照と して、COS−7細胞中へRAGE−1 cDNAをHLA−B7と同時トラン スフェクションし、またはLE2911−RCC細胞を用いた。これらのトラン スフェクション体またはLE2911−RCC細胞を用いて、CTL 263/ 17細胞からのTNFの放出を誘導した。ORFトランスフェクション体のうち RAGE−1由来のORF2のみが、CTL 263/17細胞からのTNFの 放出を効果的に刺激した(図3)。この実験で、CTL 263/17細胞が認 識するRAGE抗原性ペプチドはRAGE−1のORF2の3′末端によりコー ドされることが確認された。 実施例6:RAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドの確認 RAGE−1 ORF2の3′末端に対応する合成ペプチドを合成し、CTL 263/17細胞からのTNF放出の刺激につき試験した。COS−7細胞を前 記に従ってHLA−B7でトランスフェクションし、培養物にORF2の3′部 分に対応する合成ペプチドを添加した。CTL 263/17細胞を添加し、1 8時間後にTNFの産生を測定した(図4)。ペプチドSPSSNRIRNTS T(配列番号:39)がCTL263/17からのTNF放出を効果的に刺激し た。HLAクラスI分子が提示するペプチドは通常は9アミノ酸の長さであるの で、予めCTL263/17細胞からのTNF放出の刺激に用いたドデカマーペ プチド(配列番号:39)由来のノナマーペプチド(配列番号:40、41およ び42)を調べた。これらの実験結果を図4に示す。これらのペプチドのうちの 1つ(SPSSNRIRN、配列番号:40)はCTL 263/17により認 識されたが、ドデカマーペプチドよりはるかに低い程度であった。これはノ ナマー(配列番号:40)が最適ペプチドでないことを示唆した。デカマーペプ チド(SPSSNRIRNT、配列番号:43)はCTL263/17によりき わめて効果的に認識された。 実施例7:RAGE腫瘍拒絶抗原ノナマーおよびデカマーペプチドの活性 この実施例は、RAGE TRAペプチドがHLA−B7発現細胞の溶解を誘 導する効力、ならびにノナマーおよびデカマーペプチドの相対効力を示す。 ノナマーおよびデカマーRAGEペプチド(それぞれ配列番号:40および4 3)を、CTL 263/17細胞によるHLA−B7-LB23−EBV B 細胞の細胞溶解誘導効力につき用量応答アッセイ法により調べた。凍結乾燥ペプ チドを20mg/mlでDMSOに溶解し、次いで10mM酢酸に2mg/ml に希釈し、−80℃に保存した。標的細胞であるHLA−B7-EBV形質転換 したリンパ芽球(LB23−EBV細胞)を前記に従って51Crで37℃におい て1時間標識し、次いで取り込まれていない標識を除去するために十分に洗浄し た。次いでLB23−EBV細胞を96ウェルミクロプレート中で種々の濃度の ペプチドの存在下に37℃で30分間インキュベートした。次いで等容量の培地 中のCTL 263/17をエフェクター:標的の比率10:1で添加した。4 時間後にクロム−51の放出を測定した。図5は用量応答アッセイの結果を示す 。LB23−EBV細胞の半最大溶解が濃度30ng/mlのSPSSNRIR NTペプチド(配列番号:43)で誘導された。 実施例8:RAGE−1遺伝子の発現 RAGEの発現を、以下のプライマーを用いるPCRにより調べた: まず全RNAを当技術分野で認められた方法により特定の試料から採取した。 このRNAを用いてcDNAを調製した。cDNAを調製するのに用いたプロト コールは、下記による:4μlの5×逆転写酵素用緩衝液、各1μlのdNTP (10mM)、2μlのジチオトレイトール(100mM)、2μlのdT−1 5プライマー(20μM)、0.5μlのRNasin(40単位/μl)およ び1μlのM−MLV逆転写酵素(200単位/μl)を混和した。次いで6. 5μlの鋳型RNA(1μg/3.25μlの水、または2μgの全鋳型RNA )を添加した。混合物の全容量は20μlであった。これを混合し、42℃で6 0分間インキュベートしたのち、氷上で冷却した。次いで合計80μlの水を添 加して合計100μlにした。この混合物をPCRに用いるまで−20℃に保存 した。 PCR用試薬は以下のものを含有していた: − 5μlの10×ダイナ・ザイム(Dyna Zyme)用緩衝液 − 各20pmolのプライマー − 各50nmolのdNTP − 1単位の重合酵素“ダイナザイム(Dynazyme)”(2単位/μl) − 5μlのcDNA(100ngの全RNAに相当) − 最終容量50μlとなる量の水 混合物を混和し、1滴の鉱油を積層した。混合物を94℃に予熱したサーモサ イクラーブロックに移し、94℃で15分の1サイクル、次いで以下の33サイ クルの増幅を行った: − 94℃で1分 − 56℃または60℃で2分(後記参照) − 72℃で3分 次いで72℃で15分の最終延長工程を行った。pan−RAGEセンスプライ マー(配列番号:46)およびアンチセンスプライマー(配列番号:47)を用 い、60℃で2分のアニーリング工程によるPCR増幅により、すべてのRAG E遺伝子の発現を調べた。RAGE−1遺伝子の発現のみは、pan−RAGE センスプライマー(配列番号:46)およびRAGE−1特異的アンチセンスプ ライマー(配列番号:48)を用い、56℃で2分のアニーリング工程によるP CR増幅により調べた。194bp(試験したすべてのRAGE遺伝子に一般的 )および239bp(RAGE−1遺伝子に特異的)のPCR生成物が、臭化エ チジウム含有アガロースゲル(1.5%)上で視覚化された。 この遺伝子は腫瘍特異的であることが見出された。この遺伝子は網膜以外は試 験したすべての正常組織で沈黙していた。特にこの遺伝子は副腎、膀胱、骨髄、 脳、乳房、小脳、結腸、心臓、腎臓、肝臓、肺、メラニン形成細胞、筋肉、神経 、卵巣、胎盤、前立腺、皮膚、脾細胞、胃、精巣、胸腺細胞、子宮および治癒し つつある創傷においては沈黙していた。しかしこの遺伝子は多様な腫瘍細胞系お よび腫瘍組織試料中で発現することが見出された(表1)。これは、ここに挙げ たもの以外の幾つかの腫瘍においても、頻度は低いが発現した。 以上の実施例はTRAPをコードする核酸分子の単離を示す。しかしこのTR APコード分子は前掲の参考文献に記載される、これまでに示されたコード配列 の何れのものとも相同ではない。したがって本発明の1態様は、配列番号:1、 配列番号:4、配列番号:6または配列番号:10に示したヌクレオチド配列の 全部またはユニーク部分を含む単離された核酸分子である。配列番号:12、1 3および14がコードする他のRAGE ORF由来の抗原がCTL 263/ 17以外の細胞溶解性Tリンパ球クローンにより認識されることも予想される。 したがって本発明の他の態様は、単離されたユニーク部分、たとえばTRAPお よびTRAをコードする部分を含むRAGE族遺伝子のうち1またはそれ以上、 それに由来するRAGE TRAPおよびTRA、ならびにそれに関連するすべ ての診断および療法の様式を包含する。以上の配列は、それらを参考文献に記載 されたMAGE、BAGEまたはGAGE配列と比較することにより分かるよう に、MAGE、BAGEまたはGAGE配列ではない。 同様に非MAGE、非BAGEおよび非GAGE腫瘍拒絶抗原前駆体をコード し、ただし前記ヌクレオチド配列からなる核酸分子に緊縮条件下でハイブリダイ ズする核酸配列も本発明の一部である。本明細書中で用いる“緊縮条件”という 用語は、当技術分野で一般的なパラメーターを意味する。より詳細には、本明細 書中で用いる緊縮条件は65℃でハイブリダイゼーション緩衝液(3.5×SS C、0.02%ファイコル(Ficoll)、0.02%ポリビニルピロリドン、0.02 %ウシ血清アルブミン、25mM NaH2PO4(pH7)、0.5%SDS、 2mM EDTA)中でのハイブリダイゼーションを意味する。SSCは0.1 5M塩化ナトリウム/0.15Mクエン酸ナトリウム(pH7)であり、SDS はドデシル硫酸ナトリウムであり、EDTAはエチレンジアミン四酢酸である。 ハイブリダイゼーション後に、DNAが伝達された膜を室温の2×SSC、次い で65℃の0.1×SSC/0.1×SDSで洗浄する。 同程度の緊縮を得るのに使用しうる他の条件、試薬などがある。当業者にはそ のような条件が周知であるので、本明細書には示さない。細胞、好ましくは癌細 胞を前記分子の発現につきスクリーニングし、これらの分子を常法により単離し 、次いで関連核酸を単離する方法も当業者には周知である。 RAGE族員子をスクリーニングする際には、上記の条件を32Pプローブと共 に用いてサザンブロット法を行うことができる。DNAが最終的に伝達された膜 を洗浄したのち、膜をX線フィルムに向けて配置し、放射活性シグナルを検出す る。 したがって本発明は、配列番号:1の単離したユニークフラグメントまたはそ の相補体を提供する。ユニークフラグメントは、RAGE遺伝子の“シグネチャ ー”であるフラグメントである。それはたとえば、請求項23に定めるようにそ の配列そのものがRAGE族以外の分子中に見られないことを保証するのに十分 な長さである。好ましいユニークフラグメントはORF2中のみに見られるもの 、またはその相補体である。ユニークフラグメントはORF2を発現するものを 含めたRAGE族員子を同定するためのサザンブロットアッセイ法においてプロ ーブとして使用でき、またはPCRに用いるような増幅アッセイ法に使用できる 。当業者に知られるとおり、特定の用途、たとえばサザンブロット法にはたとえ ば200bp以上の大型プローブが好ましいが、PCRなどの用途にはより小型 のフラグメントが好ましいであろう。当業者に自明のとおり、ユニークフラグメ ントの大きさは遺伝子コード中での保存性に依存するであろう。たとえば配列番 号:1、配列番号:12、配列番号:13および配列番号:14の若干の領域は ユニークであるためには比較的長いセグメントを必要とするが、他は短いセグメ ント、一般に12〜32bp(たとえば12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、 24、25、26、27、28、29、30、31および/または32塩基の長さ)を必要とするにすぎな いであろう。配列番号:1の18ヌクレオチド以上の長さのセグメントは実質的 にいずれもユニークであろう。一般にユニークフラグメントが族以外の員子から のインサートの配列を選択的に区別しうることに基づいて当該配列を選択する方 法は、当業者に周知である。一般にそのフラグメントの配列を既知のデータに基 づく配列と比較しさえすればよいが、ただしインビトロで確認のためのハイブリ ダイゼーションおよび配列分析を行ってもよい。 RAGE−1を選択的に増幅するように構築および調整されるPCRプライマ ー対のいずれにも、RAGE−1特異性プライマーを使用できる。このようなプ ライマーは、他のRAGE遺伝子において付加的なヌクレオチドの挿入により変 化したORF2の挿入地点の両側にハイブリダイズするRAGE−1の連続範囲 である。このような特異的プライマーはRAGE−1中のヌクレオチドの連続範 囲にのみ完全にハイブリダイズするが、ORF2を共有しないRAGE遺伝子に も部分的にはハイブリダイズするであろう。効果的なPCR開始およびRAGE −1同定のためには、その3′末端でRAGE−1以外のRAGE遺伝子に効率 的にハイブリダイズしないようにRAGE−1特異性プライマーを構築および調 整すべきである。これを達成するためには、プライマーは以下の2末端をもつも のとして記載できる:挿入地点の一方側と連続的かつ相補的である5′末端、こ れは挿入地点の反対側と連続的かつ相補的である3′末端に直接に結合している 。プライマーの5′末端を3′末端より実質的に長く作成し、かつ3′末端を短 く作成することにより(すなわち1〜4ヌクレオチド)、ハイブリダイゼーショ ンの反応速度は5′末端の方が大きくなるであろう。この場合、3′側で開始す るPCR延長は、5′末端と3′末端の両方が核酸にハイブリダイズする場合に のみ、すなわちインサートを含まないORF2が存在する場合にのみ起こるであ ろう。 上記のRAGE−1特異性プライマーは、本明細書中でワトソン鎖およびクリ ック鎖と記載するDNAらせんのいずれの鎖上でもDNA合成が開始するように 設計できる。RAGE−1において挿入地点に隣接する配列は5′−CAAAC ANGGATCA−3′(配列番号:49;ワトソン鎖、Nはヌクレオチドイン サート)である。RAGE−1のワトソン鎖を優先的に増幅するように設計され たRAGE−1特異性プライマーは、一般に挿入地点の3′側のワトソン鎖のヌ クレオチドに対し相補的な12以上、好ましくは15以上のヌクレオチドを含む 。プライマーの残りの部分は1〜4ヌクレオチドの長さのものであり、挿入地点 の5′側の配列に対して相補的である。このようなプライマーはRAGE−1中 のその相補体と完全に相補的かつ連続的である。このプライマーの3′末端はワ トソン鎖中のそれの相補体にハイブリダイズし、延長を開始する。RAGE−1 以外のRAGE遺伝子では、ORF2の挿入地点にある非相補的ヌクレオチドの 挿入のため、RAGE−1特異性プライマーの3′末端はインサートの5′側の ワトソン鎖にハイブリダイゼーションしないであろう。RAGE−1以外のRA GE 遺伝子にハイブリダイズした場合にプライマーの3′末端に生じるミス対合は、 それらの遺伝子が効果的に増幅するのを妨げるであろう。プライマーの一例は、 本質的に以下の配列からなる。配列中のNは適切なワトソン鎖またはクリック鎖 上の0、1またはそれ以上の連続ヌクレオチドである: RAGE−1の発現は、挿入地点の向き合った側で延長を開始するプライマー を用いるPCRにより検出することもできる。増幅生成物を分析すると、増幅生 成物の長さによりRAGE−1増幅生成物を非RAGE−1増幅生成物と区別で きる。RAGE−1遺伝子は他のRAGE遺伝子にあるインサートを含まないの で、RAGE−1由来の増幅生成物は他のRAGE遺伝子に由来する増幅生成物 より短いであろう(約37塩基対だけ)。この相異は当技術分野の標準法によっ て容易に区別できる。実質的に相同なヌクレオチド配列を区別できる他の方法、 たとえばリガーゼ連鎖反応(“LCR”)その他の方法が当業者に自明であろう 。RAGE−2、3および4特異性プライマーを同様に調製してもよい。 本発明はRAGE遺伝子がコードするものと同一のアミノ酸残基をコードする 別個のコドンを含む核酸配列の使用も包含する。たとえば先に実施例7に記載し たように、デカマーペプチドSPSSNRIRNT(配列番号:43)はRAG E腫瘍拒絶抗原である。たとえばセリン残基(配列番号:40のアミノ酸番号1 、3および4)はそれぞれTCA、AGTおよびTCAによりコードされる。セ リンアミノ酸残基はTCAおよびAGTのほか、TCC、TCG、TCTおよび A GCによってもコードできる。これら6種類のコドンの各々はセリン残基をコー ドする目的に関して均等である。したがって、セリン残基を取り込むようにイン ビトロまたはインビボでのタンパク質合成装置を指令するためにセリンコーディ ングヌクレオチドトリプレットのいずれも使用できることは、当業者に自明であ ろう。同様にRAGE腫瘍拒絶抗原を含む他のアミノ酸残基をコードするヌクレ オチド配列トリプレットには以下のものが含まれる:CCA、CCC、CCGお よびCCT(プロリンコドン);CGA、CGC、CGG、CGT、AGAおよ びAGG(アルギニンコドン);ACA、ACC、ACGおよびACT(トレオ ニンコドン);AACおよびAAT(アスパラギンコドン);ならびにATA、 ATCおよびATT(イソロイシンコドン)。他のアミノ酸残基も多数のヌクレ オチド配列によりコードできる。したがって本発明は、遺伝子コードの縮重のた めコドン配列が生物学的に単離された核酸と異なる縮重核酸を包含する。 前記の各実施例はRAGE TRAであるペプチドの単離も示す。これらの例 示ペプチドは配列番号:1の核酸のプロセシングされた翻訳生成物である。した がってプロセシングされてRAGE TRAが提示のための最終形態となる翻訳 生成物はRAGE TRAを含む限りいかなる長さまたは配列であってもよいこ とは、当業者に自明であろう。前記の各実施例に示したように、9、10または 12アミノ酸ほどの小型のペプチドまたはタンパク質、およびORF1がコード するほどの大型のアミノ酸配列が適切にプロセシングされ、HLA−B7により 提示され、そしてCTL 263/17により認識される。配列番号:23のペ プチドに1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のアミノ酸 が一方または両方の末端に付加されてもよい。そのようなペプチドの抗原部分が 生理学的条件下で開裂して、HLAクラスI分子により提示される。 RAGE TRAをもたらすタンパク質およびペプチドのアミノ酸配列は、天 然または非天然のいずれに由来するものであってもよい。すなわちそれらは天然 RAGE TRAP分子であってもよく、または細胞表面に提示された場合にC TLが認識する腫瘍拒絶抗原配列をアミノ酸配列が保持する限り、修飾配列を含 んでもよい。たとえばこれに関連するRAGE腫瘍拒絶抗原は、RAGE腫瘍拒 絶抗原と非関連アミノ酸配列との融合タンパク質、RAGE−1遺伝子のORF 2の翻訳ポリペプチド、配列番号:39、40および43に示したアミノ酸配列 の合成ペプチド、標識ペプチド、腎細胞癌患者から単離したペプチド、RAGE −1を発現する培養細胞から単離したペプチド、たとえば特定の薬物送達システ ムにおいて非ペプチド分子に結合したペプチド、ならびに配列番号:40のアミ ノ酸配列を含む他の分子であってもよい。 本発明が前記配列を発現ベクター中に、また宿主細胞および細胞系をトランス フェクションするために使用することを包含することも、実施例から認められる であろう。これらの細胞は原核細胞(たとえば大腸菌)、または真核細胞(たと えばCHO細胞、COS細胞、酵母発現系、および昆虫細胞中での組換えバキュ ロウイルス発現)のいずれであってもよい。発現ベクターは、関連配列、すなわ ち前記の配列がプロモーターに作動性結合していることを必要とする。ヒトHL A−B7がこれらの遺伝子に由来するTRAを提示することが見出されたので、 発現ベクターはHLA−B7をコードする核酸配列を含んでもよい。ベクターが 両コード配列を含む場合、いずれか一方を正常には発現しない細胞をトランスフ ェクションするためにこれを使用できる。TRAPまたはTRAコード配列は、 たとえば宿主細胞が既にHLA−B7を発現する場合には単独で使用できる。も ちろん使用できる個々の宿主細胞に制限はない。上記の2コード配列を含むベク ターを所望によりHLA−B7提示細胞に用いてもよく、HLA−B7を発現し ない宿主細胞中にTRAPまたはTRAをコードする核酸を用いてもよい。 本発明は、当業者が目的とする発現ベクターを調製できるいわゆる発現キット をも包含する。このような発現キットは、前記に述べた少なくとも2種類の物質 の少なくとも別個の部分を含む。所望により他の成分を添加してもよい。 本発明の核酸分子およびTRAPを従来記載されているMAGE族、BAGE 遺伝子およびGAGE遺伝子と区別するために、本発明のものはRAGE族の遺 伝子およびTRAPと呼ぶべきである。したがって本明細書中で“RAGE”を 用いる場合は常に、MAGE、BAGEおよびGAGE族の遺伝子、遺伝子生成 物、TRAPおよびTRAは特に除外される。 本明細書に記載する本発明は多数の用途をもち、そのうちの若干をここに記載 する。まず本発明は、当業者がTRAPの発現を特色とする障害を診断するのを 可能にする。これらの方法は、TRAP遺伝子の発現、および/またはそれに由 来するTRA、たとえばHLA−B7が提示するTRAを測定することを含む。 前者の場合、この測定はポリメラーゼ連鎖反応、または標識ハイブリダイゼーシ ョンプローブを用いるアッセイを含めたいずれかの標準核酸測定アッセイ法によ り実施できる。後者の場合、TRAと5HLAの複合体の結合相手、たとえば抗 体を用いるアッセイ法が特に好ましい。測定のための別法は前記の種類のTNF 放出アッセイである。 TRAP遺伝子を単離すると、TRAP分子自体、および/またはそれに由来 するTRA、特に配列番号:1または4がコードするアミノ酸配列を含むTRA Pおよび/またはTRA分子を単離することができる。配列番号:1、12、1 3および14がコードし、かつ他のCTLクローンが認識し、および/または他 のHLA分子が提示する他のTRAPまたはTRAは、本明細書に詳述する方法 で単離できる。(多数のHLA分子が当業者には知られており、これにはHLA −A、HLA−B、HLA−C、HLA−E、HLA−FおよびHLA−G遺伝 子がコードするものが含まれるが、これらに限定されない。)単離したTRAP 分子および/またはそれに由来するTRAを得るためには、当業者に周知の多様 な方法を用いることができる。タンパク質は天然にこのタンパク質を産生する細 胞から精製できる。あるいは発現ベクターを細胞に導入して、そのタンパク質を 産生させることもできる。他の方法では、mRNA転写物をマイクロインジェク ションその他の方法で細胞に導入して、そのコードするタンパク質を産生させて もよい。無細胞抽出液、たとえば網状赤血球溶解液系中でのmRNAの翻訳もタ ンパク質の産生に使用できる。本発明のTRAを含むペプチドはインビトロで合 成することもできる。当業者は、単離したTRAPおよび/またはそれに由来す るTRAを得るために、タンパク質単離のための既知の方法を容易に実施できる 。これには免疫クロマトグラフィー、HPLC、サイズ排除クロマトグラフィー 、イオン交換クロマトグラフィーおよび免疫アフィニティクロマトグラフィーが 含まれるが、これらに限定されない。これらの単離した分子がプロセシングされ てTRAとして、またはTRAとHLA、たとえばHLA−B7との複合体とし て提示されている場合、アジュバントなどの物質と合わせて、TRAP分子の発 現 を特色とする障害の処置に有用なワクチンを製造することができる。さらに、表 面にTRA/HLA複合体を提示する細胞、たとえば非増殖性癌細胞、非増殖性 トランスフェクション体などからワクチンを製造することもできる。細胞をワク チンとして用いるすべての場合、これらはCTL応答を起こすのに必要な成分の 一方もしくは両方をコードする配列でトランスフェクションした細胞、またはト ランスフェクションの必要なしに既に両分子を発現する細胞であってもよい。ワ クチンにはRAGE TRAまたはその前駆体をコードする裸のDNAまたはR NAも包含され、これらをインビトロで製造し、注射、粒子衝撃、経鼻吸入その 他の方法で投与してもよい。“裸の核酸”型のワクチンは、裸の核酸がコードす るペプチドに特異的なCTLの生成を含めた免疫応答を起こすことが証明されて いる(Science 259:1745-1748,1993)。 TRAP分子、それに伴うTRA、およびTRAとHLAの複合体を当技術分 野で周知の標準法により抗体の産生に用いることができる。抗体産生の一般原理 につき述べた標準的参考文献には以下のものが含まれる:Catty,D.,Antibodies. A Practical Approach ,Vol.1,IRL プレス、ワシントン DC(1988);Klein,J.,Immu nology:The Science of Cell-Non-Cell Discrimination ,ジョン・ワイリー・ア ンド・サンズ、ニューヨーク(1982);Kennett,R.et al.,Monoclonal Antibodies ,Hybridoma.A New Dimension In Biological Analyses ,プレナム・プレス、ニュ ーヨーク(1980);Campbell,A.,Monoclonal Antibody TechnologyLaboratory T echniques and Biochemistry and Molecular Biology ,Vol.13(Burdon,Rら編)、 エルゼビル、アムステルダム(1984);Eisen,H.N.,Microbiology,3版,Davis,B.D. ら編(ハーパー・アンド・ローウェ、フィラデルフィア,1980)。 したがって本発明の抗体は、タンパク質、タンパク質フラグメント、タンパク 質またはそのフラグメントを発現する細胞などを動物に投与してポリクローナル 抗体を誘導することを含めた多様な方法で製造される。モノクローナル抗体の製 造は当技術分野で周知の方法による。本明細書に詳述したように、それらの抗体 を用いて、たとえばタンパク質を発現する組織を確認し、またはタンパク質を精 製することができる。抗体を画像形成のための特定の標識試薬または抗腫瘍薬に 結合させてもよく、これにはメトトレキセート、放射性ヨウ素化合物、リシン (ricin)などの毒素、または静細胞薬もしくは細胞溶解薬などが含まれる が、これらに限定されない。本発明により製造される抗体は、好ましくは本明細 書に記載するTRA/HLA複合体に特異的である。 本明細書中で“障害”を用いる場合、それは腫瘍拒絶抗原前駆体を発現するい かなる病理的状態をも意味する。そのような障害の一例は癌、特に腎細胞癌であ る。 本発明に基づく幾つかの療法は、TRA提示細胞、たとえばHLA−B7細胞 の溶解をもたらす対象の免疫系による応答を前提とする。そのような方法のひと つは、前記複合体に特異的な自己由来CTLを、問題の表現型が異常な細胞を伴 う対象に投与するものである。そのようなCTLをインビトロで発現させるのは 当業者が容易になしうる。一般に、対象から採取した細胞、たとえば血球の試料 を、上記複合体を提示しかつCTLを刺激して増殖させうる細胞と接触させる。 標的細胞はトランスフェクション体、たとえば前記のタイプのCOS細胞であっ てもよい。これらのトランスフェクション体はその表面に目的複合体を提示し、 当該CTLと結合するとその増殖を刺激する。本明細書中で用いるCOS細胞は 、他の好適な宿主細胞と同様に広く入手できる。CTLクローンの特異的産生に ついては前記に述べた。次いでクローンとして増殖させた自己由来CTLを対象 に投与する。RAGE−1に特異的な他のCTL、およびRAGE−2、3また は4がコードするRAGE TRAに特異的なCTLを単離し、同様な方法で投 与することができる。 養子移入と呼ばれる療法につき詳述すると(Greenberg,J.Immunol.136(5):191 7(1986);Riddle et al.,Science 257:238(7-10-92);Lynch et al.,Eur.J.Immu nol.21:1403-1410(1991);Kast et al.,Cell 59:603-614(11-17-89))、目的複 合体を提示する細胞をCTLと混和し、それに特異的なCTLを増殖させる。次 いで増殖したCTLを、特定の複合体を提示する一定の異常な細胞を特色とする 細胞異常を伴う対象に投与する。次いでCTLが異常細胞を溶解し、これにより 希望する療法目標を達成する。 上記の療法では、対象の異常細胞のうち少なくとも若干は関連のHLA/TR A複合体を提示すると仮定する。特定のHLA分子を提示する細胞を同定する方 法、および関連配列(この場合はRAGE配列)のDNAを発現する細胞を同定 する方法は当技術分野で周知であるので、複合体は容易に測定できる。関連複合 体を提示する細胞が上記スクリーニング法により同定されると、それらを患者か ら得た試料と混和するが、その際、試料はCTLを含有している。複合体提示細 胞が混合CTL試料により溶解された場合にはRAGE由来TRAが存在すると 推定でき、その対象は上記の療法に適した候補である。 養子移入法が本発明により利用できる唯一の療法形態ではない。CTLをイン ビボで、多数の方法により刺激することもできる。1方法、すなわち複合体を発 現する非増殖性細胞の使用については前記に詳述した。この方法に用いる細胞は 、複合体を正常に発現する細胞、たとえば照射した腫瘍細胞、または複合体の提 示に必要な遺伝子の一方または両方でトランスフェクションした細胞であっても よい。Chen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:110-114(1991年1月)にこの方法 が例示され、HPVE7ペプチドを発現するトランスフェクション細胞を療法に 使用することを示した。種々の細胞タイプを使用できる。当該遺伝子の一方また は両方を保有するベクターも使用できる。ウイルス又は細菌のベクターが特に好 ましい。たとえばRAGE TRAをコードする核酸を、特定の組織または細胞 タイプ中でRAGE TRAの発現を指令するプロモーター配列およびエンハン サー配列に作動性結合させることができる。この核酸を発現ベクターに取り込ま せる。発現ベクターは、修飾されていない染色体外核酸、外因性核酸、たとえば RAGE TRAをコードするものを挿入しうるように構築または修飾したプラ スミドまたはウイルスゲノムであってもよい。RAGE TRAをコードする核 酸をレトロウイルスゲノムに挿入し、これにより標的組織または細胞タイプのゲ ノム中への核酸の組込みを促進することもできる。これらの系では、当該遺伝子 を微生物、たとえばVacciniaウイルス、レトロウイルスまたは細菌BC Gに保有させ、これらの材料を実際に宿主細胞に“感染”させる。得られた細胞 は当該複合体を提示し、自己由来CTLにより認識され、次いでこれが増殖する 。 TRAPまたはその刺激性フラグメントをアジュバントと混和して、インビボ でのHLA−B7提示細胞中への取込みを促進することにより、同様な効果を達 成できる。TRAPはプロセシングされてHLA分子の相手ペプチドを生成し、 一方TRAはそれ以上のプロセシングの必要なしに提示される。一般に、対象に 有効量のRAGE TRAPおよび/またはそれに由来するTRAを皮内注入す る。当技術分野で標準的な免疫化プロトコールに従って、初回量に続いて追加免 疫量を投与できる。 免疫化プロトコールの一部として、免疫応答を増強する物質を、癌ワクチンの 核酸またはペプチド成分と共に投与してもよい。このような免疫応答増強化合物 をアジュバントまたはサイトカインとして分類できる。アジュバントは抗原の溜 めを提供し(細胞外、またはマクロファージ内に)、マクロファージを活性化し 、一組の特異的リンパ球を刺激することにより、免疫応答を高めることができる 。種々のアジュバントが当技術分野で周知であり、具体例にはMPL(スミスク ライン・ビーチャム)、Salmonella minnesota Re 5 95リポ多糖類の精製および酸加水分解後に得られる同族体、QS21(スミス クライン・ビーチャム)、Quillja saponaria抽出液から精製 した純粋なQA−21サポニン、および生分解性油、たとえばスクアレンおよび /またはトコフェロールから調製した種々の油中水型エマルションが含まれる。 サイトカインはリンパ球刺激性の結果として、ワクチン接種プロトコールにも有 用である。この目的に有用な多数のサイトカインが当業者に周知であり、ワクチ ンの防御効果を高めることが示されたインターロイキン−12(IL−12)が 含まれる(Science 268:1432-1434,1995)。 投与する際、薬剤学的に許容しうる製剤の形態で本発明の療法用組成物を投与 する。このような製剤は一般に薬剤学的に許容しうる濃度の塩類、緩衝剤、防腐 剤、相容性キャリヤー、補助免疫増強剤、たとえばアジュバントおよびサイトカ イン、ならびに所望により他の療法薬を含有してもよい。 本発明の製剤を有効量投与する。有効量は、単独で、または他の投与物質と一 緒に、目的とする応答を刺激する医薬製剤量である。癌の治療の場合、目的とす る応答は癌進行の阻止である。これは疾病の進行速度を一時的に低下させるもの であってもよいが、より好ましくは疾病の進行を永久的に停止するものである。 これは常用される方法で監視するか、または本明細書に述べた本発明の診断法に より監視できる。 本発明の療法用組成物を用いて免疫応答を刺激することを目的とする場合、こ れは体液性抗体反応を刺激し、その結果、血清中の抗体力価の上昇、細胞毒性リ ンパ球のクローン増加、その他の望ましい免疫応答をもたらすことを含む。投与 様式に応じて1ng/kgから100mg/kgまでの量の免疫原の投与量が有 効であると考えられる。好ましい範囲は500ng〜500μg/kgであると 考えられる。絶対量は多様な要因に依存し、投与のために選択する物質、投与が 1回量または多数回量のいずれであるか、ならびに年齢、身体的条件、体格、体 重、および疾病の段階を含めた個々の患者のパラメーターがこれに含まれるであ ろう。これらの要因は当業者に周知であり、常用試験以上のものを行わずに対処 できる。 本発明の他の態様は当業者に自明であり、ここで繰返す必要はないであろう。 用いた用語および表現は説明のためのものであり、限定ではなく、それらの用 語および表現を用いる際に図示もしくは記載したものの均等物またはその一部を 除外することはなく、本発明の範囲内で種々の変更が可能であると解される。 参考文献 1) Gleser,L.,and Swaroop,A.,1992.サブトラクトした網膜色素上皮ライブラ リー由来のcDNAクローンの配列タグの発現および染色体内局在. Genomics 13. 873-876. 2) Mager,D.,and Freeman,J.D.1987. ヒトT細胞リンパ親和性ウイルス関連 のタイプC pol配列およびgag配列を含むヒト内因性レトロウイルス様ゲノム. J.Virol.61.4060-4066. 3) Hirose,Y.,Takamatsu,M.,Harada,F..1993. RTLV-H族の員子中におけるヒ ト内因性レトロウイルス様要素のenv遺伝子の存在. Virology 192.52-61.
【手続補正書】特許法第184条の8第1項 【提出日】1997年3月23日 【補正内容】 請求の範囲 1.配列番号:40のアミノ酸配列またはその機能的変異体を含む単離したポ リペプチド。 2.単離したポリペプチドが配列番号:43のアミノ酸配列を含む、請求項1 記載の単離したポリペプチド。 3.単離したポリペプチドが配列番号:40および配列番号:43よりなる群 から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の単離したポリペプチド。 4.単離したポリペプチドが配列番号:40および配列番号:43よりなる群 から選択されるアミノ酸配列からなる、請求項1記載の単離したポリペプチド。 5.請求項1記載のポリペプチド、請求項2記載のポリペプチド、請求項3記 載のポリペプチド、および請求項4記載のポリペプチドよりなる群から選択され るポリペプチドをコードする、単離した核酸。 6.核酸が配列番号:44を含む、請求項5記載の単離した核酸。 7.プロモーターに作動性結合した請求項5記載の単離した核酸を含む発現ベ クター。 8.核酸が配列番号:44を含む、請求項7記載の発現ベクター。 9.さらに、HLA−B7をコードする核酸を含む、請求項7または8記載の 発現ベクター。 10.請求項7記載の発現ベクター、請求項8記載の発現ベクターおよび請求 項9記載の発現ベクターよりなる群から選択される発現ベクターでトランスフェ クションまたは形質転換した宿主細胞。 11.請求項7記載の発現ベクターおよび請求項8記載の発現ベクターよりな る群から選択される発現ベクターでトランスフェクションまたは形質転換した宿 主細胞であって、HLA−B7を発現する宿主細胞。 12.配列番号:50〜57のいずれか1つからなる核酸よりなる群から選択 される第1プライマー、および RAGE1遺伝子のみに特徴的なORF2の部分を第1プライマーと一 緒に選択的に増幅すべく構築および調整した第2プライマー を含む、腫瘍拒絶抗原前駆体の発現の存在を検出するためのキット。 13.T細胞集団を、RAGE腫瘍拒絶抗原に特異的な細胞溶解性T細胞で選 択的に富化する方法であって、 単離したT細胞集団を、この単離したT細胞集団を細胞溶解性T細胞で選択的 に富化するのに十分な量の、RAGE腫瘍拒絶抗原とHLA提示分子の複合体を 提示する物質と接触させる ことを含む方法。 14.HLA提示分子がHLA−B7であり、かつRAGE腫瘍拒絶抗原が 配列番号:40のアミノ酸配列からなるペプチドおよび配列番号:43のアミ ノ酸配列からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項13記載の方法。 15.RAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドの発現を特色とする障害の診断方法であ って、 対象から単離した生物学的試料をRAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドに特異的な物 質と接触させ、そして 該物質とRAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドの相互作用をその障害の決定因子とし て測定する ことを含む方法。 16.ペプチドが 配列番号:40のアミノ酸配列からなるペプチドおよび配列番号:43のアミ ノ酸配列からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項15記載の方法。 17.HLA−B7分子との複合体を形成するRAGE腫瘍拒絶抗原ペプチド の発現を特色とする障害の診断方法であって、 対象から単離した生物学的試料を、前記複合体を結合する物質と接触させ、そ して 前記の複合体と物質の結合をその障害の決定因子として測定する ことを含む方法。 18.ペプチドが 配列番号:40のアミノ酸配列からなるペプチドおよび配列番号:43のアミ ノ酸配列からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項17記載の方法。 19.医薬の製造における、HLA−B7とRAGE腫瘍拒絶抗原の複合体の 存在を対象において選択的に高める物質の使用。 20.RAGE腫瘍拒絶抗原が 配列番号:40のアミノ酸配列からなるペプチドおよび配列番号:43のアミ ノ酸配列からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項19記載の使用。 21.医薬の製造における、HLA−B7分子とRAGE腫瘍拒絶抗原の複合 体に特異的な自己由来の細胞溶解性T細胞を含む組成物の使用。 22.RAGE腫瘍拒絶抗原が 配列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸 からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項21記載の使用。 23.(a)配列番号:1;配列番号:4;配列番号:6;配列番号:10; 配列番号:12;配列番号:13;配列番号:14;配列番号:15;配列番号 :17;配列番号:23および/または配列番号:35よりなる群から選択され る核酸配列からなる分子に緊縮条件下でハイブリダイズし、かつ腫瘍拒絶抗原前 駆体をコードする単離した核酸分子であって、ただしMAGE、GAGE、BA GE腫瘍拒絶抗原前駆体をコードしない単離した核酸分子;(b)遺伝子コード の縮重のためコドン配列が(a)の核酸分子と異なる核酸分子;並びに(c)( a)および(b)の相補体。 24.単離した核酸分子がcDNA分子またはmRNA分子である、請求項2 3記載の単離した核酸分子。 25.単離した核酸分子が、配列番号:1、配列番号:12、配列番号:13 および/または配列番号:14よりなる群から選択される配列を有する分子によ りコードされる腫瘍拒絶抗原前駆体をコードする、請求項23記載の単離した核 酸分子。 26.単離した核酸分子が、配列番号:1のヌクレオチド204〜326、配 列番号:1のヌクレオチド313〜399、配列番号:1のヌクレオチド444 〜665、配列番号:12のヌクレオチド273〜449、配列番号:12のヌ クレオチド217〜276、配列番号:13のヌクレオチド185〜247、お よび/または配列番号:14のヌクレオチド269〜832よりなる群から選択 される核酸分子に相補的である核酸分子を含む、請求項23記載の単離した核酸 分子。 27.配列番号:1、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:10、配列番 号:12、配列番号:13、配列番号:14、配列番号:15、配列番号:17 、配列番号:23、配列番号:35、および/または配列番号:45よりなる群 から選択されるヌクレオチド配列からなる、単離した核酸分子。 28.プロモーターに作動性結合した、請求項23、24、25、26または 27記載の単離した核酸分子を含む発現ベクター。 29.請求項28記載の発現ベクターでトランスフェクションまたは形質転換 した宿主細胞。 30.配列番号:1;配列番号:12;配列番号:13;配列番号:14;配 列番号:1の相補体;配列番号:12の相補体;配列番号:13の相補体;およ び/または配列番号:14の相補体よりなる群から選択される配列のユニークフ ラグメントからなる単離した核酸であって、ユニークフラグメントが12、13 、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25 、26、27、28、29、30、31および/または32のヌクレオチドの長 さであり、但し、上記の単離した核酸がEMBLデータベースアクセッション番 号M91400からなる配列を除外する、上記の単離した核酸。 31.配列番号:1;配列番号:12;配列番号:13;配列番号:14;配 列番号:1の相補体;配列番号:12の相補体;配列番号:13の相補体;およ び/または配列番号:14の相補体よりなる群から選択される配列のユニークフ ラグメントからなる単離した核酸であって、フラグメントが200から2050 のヌクレオチドの長さである、上記の単離した核酸。 32.ユニークフラグメントが20、21、22、23、24、25、26、 27、28、29、30、31および/または32ヌクレオチドの長さである、 請求項30記載の単離した核酸。 33.請求項23記載の単離した核酸分子を選択的に増幅すべく構築および調 整した一対の単離した核酸分子を含む、腫瘍拒絶抗原前駆体の発現の存在を検出 するためのキット。 34.一対の単離した核酸分子がPCRプライマーである、請求項33記載の キット。 35.請求項23、24、25、26または27記載の核酸分子によりコード される、単離した腫瘍拒絶抗原前駆体。 36.プロセシングされてHLA分子と複合体を形成するRAGE由来の腫瘍 拒絶抗原になるRAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とする障害の診断方法 であって、 対象から単離した生物学的試料を、前記複合体を結合する物質と接触させ、そ して 前記の複合体と物質の結合をその障害の決定因子として測定する ことを含む方法。 37.核酸によりコードされるRAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とす る障害の診断方法であって、 対象から単離した生物学的試料を前記の核酸またはその発現生成物に特異的な 物質と接触させ、その際、核酸は請求項23に記載の核酸であり、そして 前記の物質と核酸またはその発現生成物との相互作用をその障害の決定因子と して測定する ことを含む方法。 38.物質が、配列番号:1;配列番号:12;配列番号:13;配列番号: 14;配列番号:1のユニークフラグメント;配列番号:12のユニークフラグ メント;配列番号:13のユニークフラグメント;および配列番号:14のユニ ークフラグメントよりなる分子の群から選択される核酸分子を含み、ユニークフ ラグメントが、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21 、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31および/また は 32のヌクレオチドの長さである、請求項37記載の方法。 39.医薬の製造における、HLAと請求項23、24、25、26または2 7記載の分子によりコードされる腫瘍拒絶抗原前駆体に由来する腫瘍拒絶抗原と の複合体の存在を対象において選択的に高める物質の使用。 40.医薬の製造における、自己由来の細胞溶解性T細胞を含む組成物の使用 であって、上記細胞溶解性T細胞が、HLA分子と請求項23、24、25、2 6または27記載の分子によりコードされる腫瘍拒絶抗原前駆体に由来する腫瘍 拒絶抗原との複合体に特異的である、上記の使用。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI C12N 5/10 G01N 33/53 Y C12P 21/02 D G01N 33/53 C12N 5/00 B A61K 37/02 ADU //(C12N 15/09 ZNA C12R 1:91) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),AU,CA,CN,J P,NO,NZ (72)発明者 ゴーグレ,ベアトリッス ベルギー王国ベー−1200 ブリュッセル, ユセーエル 7459,アヴニュ・イポクラッ ト 74,アンスティテュ・ルートヴィヒ・ プール・ルシェルシュ・スュール・ル・カ ンセール (72)発明者 ヴェン・デン・エインデ,ブノア ベルギー王国ベー−1200 ブリュッセル, ユセーエル 7459,アヴニュ・イポクラッ ト 74,アンスティテュ・ルートヴィヒ・ プール・ルシェルシュ・スュール・ル・カ ンセール (72)発明者 シュリール,ペーター オランダ国エヌエル−2312 アーヴェー ライデン,スターションズヴェーク 46 (72)発明者 ブロアーンストリン,ナタリー オランダ国エヌエル−2312 アーヴェー ライデン,スターションズヴェーク 46 (72)発明者 ブン−ファレール,ティエリー オランダ国エヌエル−1200 ブリュッセ ル,ユセーエル 7459,アヴニュ・イポク ラット 74,アンスティテュ・ルートヴィ ヒ・プール・ルシェルシュ・スュール・ ル・カンセール

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.配列番号:40のアミノ酸配列を含む単離したポリペプチド。 2.単離したポリペプチドが配列番号:43のアミノ酸配列を含む、請求項1 記載の単離したポリペプチド。 3.単離したポリペプチドが本質的に配列番号:40および配列番号:43よ りなる群から選択されるアミノ酸配列からなる、請求項1記載の単離したポリペ プチド。 4.単離したポリペプチドが配列番号:40および配列番号:43よりなる群 から選択されるアミノ酸配列からなる、請求項1記載の単離したポリペプチド。 5.請求項1記載のポリペプチド、請求項2記載のポリペプチド、請求項3記 載のポリペプチド、および請求項4記載のポリペプチドよりなる群から選択され るポリペプチドをコードする、単離した核酸。 6.核酸が配列番号:44を含む、請求項5記載の単離した核酸。 7.プロモーターに作動性結合した請求項5記載の単離した核酸を含む発現ベ クター。 8.核酸が配列番号:44を含む、請求項7記載の発現ベクター。 9.さらに、HLA−B7をコードする核酸を含む、請求項7または8記載の 発現ベクター。 10.請求項7記載の発現ベクター、請求項8記載の発現ベクターおよび請求 項9記載の発現ベクターよりなる群から選択される発現ベクターでトランスフェ クションまたは形質転換した宿主細胞。 11.請求項7記載の発現ベクターおよび請求項8記載の発現ベクターよりな る群から選択される発現ベクターでトランスフェクションまたは形質転換した宿 主細胞であって、HLA−B7を発現する宿主細胞。 12.本質的に配列番号:50〜57のいずれか1つからなる核酸よりなる群 から選択される第1プライマー、および RAGE1遺伝子のみに特徴的なORF2の部分を第1プライマーと一 緒に選択的に増幅すべく構築および調整した第2プライマー を含む、腫瘍拒絶抗原前駆体の発現の存在を検出するためのキット。 13.T細胞集団を、RAGE腫瘍拒絶抗原に特異的な細胞溶解性T細胞で選 択的に富化する方法であって、 単離したT細胞集団を、この単離したT細胞集団を細胞溶解性T細胞で選択的 に富化するのに十分な量の、RAGE腫瘍拒絶抗原とHLA提示分子の複合体を 提示する物質と接触させる ことを含む方法。 14.HLA提示分子がHLA−B7であり、かつRAGE腫瘍拒絶抗原が 配列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸 からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項13記載の方法。 15.RAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドの発現を特色とする障害の診断方法であ って、 対象から単離した生物学的試料をRAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドに特異的な物 質と接触させ、そして 該物質とRAGE腫瘍拒絶抗原ペプチドの相互作用をその障害の決定因子とし て測定する ことを含む方法。 16.ペプチドが 配列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸 からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項15記載の方法。 17.HLA−B7分子との複合体を形成するRAGE腫瘍拒絶抗原ペプチド の発現を特色とする障害の診断方法であって、 対象から単離した生物学的試料を、前記複合体を結合する物質と接触させ、そ して 前記の複合体と物質の結合をその障害の決定因子として測定する ことを含む方法。 18.ペプチドが 配列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸 からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項17記載の方法。 19.RAGE腫瘍拒絶抗原の発現を特色とする障害を伴う対象を処置する方 法であって、 該対象に、対象においてHLA−B7とRAGE腫瘍拒絶抗原の複合体の存在 を選択的に高める物質を、障害の軽減に十分な量投与する ことを含む方法。 20.RAGE腫瘍拒絶抗原が 配列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸 からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項19記載の方法。 21.RAGE腫瘍拒絶抗原の発現を特色とする障害を伴う対象を処置する方 法であって、 該対象に、HLA−B7分子とRAGE腫瘍拒絶抗原の複合体に特異的な自己 由来の細胞溶解性T細胞を、障害の軽減に十分な量投与する ことを含む方法。 22.RAGE腫瘍拒絶抗原が 配列番号:40のアミノ酸からなるペプチドおよび配列番号:43のアミノ酸 からなるペプチド よりなる群から選択される、請求項21記載の方法。 23.(a)配列番号:1;配列番号:4;配列番号:6;配列番号:10;配 列番号:12;配列番号:13;配列番号:14;配列番号:15;配列番号: 17;配列番号:23および/または配列番号:35よりなる群から選択される 核酸配列からなる分子に緊縮条件下でハイブリダイズし、かつ腫瘍拒絶抗原前駆 体をコードする単離した核酸分子であって、ただしMAGE、GAGEまたはB AGE腫瘍拒絶抗原前駆体をコードしない単離した核酸分子;ならびに(b)遺 伝子コードの縮重のためコドン配列が(a)の核酸分子と異なる核酸分子。 24.単離した核酸分子がcDNA分子またはmRNA分子である、請求項2 3記載の単離した核酸分子。 25.単離した核酸分子が、配列番号:1、配列番号:12、配列番号:13 および/または配列番号:14よりなる群から選択される配列を有する分子によ りコードされる腫瘍拒絶抗原前駆体をコードする、請求項23記載の単離した核 酸分子。 26.単離した核酸分子が、配列番号:1の204〜326、配列番号:1の 313〜399、配列番号:1の444〜665、配列番号:12の273〜4 49、配列番号:12の217〜276、配列番号:13の185〜247、お よび/または配列番号:14の269〜832よりなる群から選択されるヌクレ オチドに相補的である核酸分子を含む、請求項23記載の単離した核酸分子。 27.本質的に配列番号:1、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:10 、配列番号:12、配列番号:13、配列番号:14、配列番号:15、配列番 号:17、配列番号:23、配列番号:35、および/または配列番号:45よ りなる群から選択されるヌクレオチド配列からなる、単離した核酸分子。 28.プロモーターに作動性結合した、請求項23、24、25、26または 27記載の単離した核酸分子を含む発現ベクター。 29.請求項28記載の発現ベクターでトランスフェクションまたは形質転換 した宿主細胞。 30.本質的に、配列番号:1;配列番号:12;配列番号:13;配列番号 :14;配列番号:1の相補体;配列番号:12の相補体;配列番号:13の相 補体;および/または配列番号:14の相補体よりなる群から選択される配列の ユニークフラグメントからなる、単離した核酸。 31.フラグメントが200〜2050ヌクレオチドの長さである、請求項3 0記載の単離した核酸。 32.フラグメントが12、13、14、15、16、17、18、19、2 0、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31およ び/または32ヌクレオチドの長さである、請求項30記載の単離した核酸。 33.請求項23記載の単離した核酸分子を選択的に増幅すべく構築および調 整した一対の単離した核酸分子を含む、腫瘍拒絶抗原前駆体の発現の存在を検出 するためのキット。 34.一対の単離した核酸分子がPCRプライマーである、請求項33記載の キット。 35.請求項23、24、25、26または27記載の核酸分子によりコード される、単離した腫瘍拒絶抗原前駆体。 36.プロセシングされてHLA分子と複合体を形成するRAGE由来の腫瘍 拒絶抗原になるRAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とする障害の診断方法 であって、 対象から単離した生物学的試料を、前記複合体を結合する物質と接触させ、そ して 前記の複合体と物質の結合をその障害の決定因子として測定する ことを含む方法。 37.核酸によりコードされるRAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とす る障害の診断方法であって、 対象から単離した生物学的試料を前記の核酸またはその発現生成物に特異的な 物質と接触させ、その際、核酸は配列番号:1;配列番号:4;配列番号:6; 配列番号:10;配列番号:12;配列番号:13;配列番号:14;配列番号 :15;配列番号:17;配列番号:23および/または配列番号:35よりな る群から選択される核酸配列からなる分子に緊縮条件下でハイブリダイズし、か つ腫瘍拒絶抗原前駆体をコードし、ただし単離した核酸分子はMAGE、GAG EまたはBAGE腫瘍拒絶抗原前駆体をコードせず、そして 前記の物質と核酸またはその発現生成物との相互作用をその障害の決定因子と して測定する ことを含む方法。 38.物質が、配列番号:1;配列番号:12;配列番号:13;配列番号: 14;配列番号:1のユニークフラグメント;配列番号:12のユニークフラグ メント;配列番号:13のユニークフラグメント;および配列番号:14のユニ ークフラグメントよりなる分子の群から選択される核酸分子を含む、請求項37 記載の方法。 39.RAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とする障害を伴う対象を処置 する方法であって、 該対象に、対象においてHLAと請求項23、24、25、26または27記 載の分子によりコードされる腫瘍拒絶抗原前駆体に由来する腫瘍拒絶抗原との複 合体の存在を選択的に高める物質を、障害の軽減に十分な量投与する ことを含む方法。 40.RAGE腫瘍拒絶抗原前駆体の発現を特色とする障害を伴う対象を処置 する方法であって、 該対象に、HLA分子と請求項23、24、25、26または27記載の分子 によりコードされる腫瘍拒絶抗原前駆体に由来する腫瘍拒絶抗原との複合体に特 異的な自己由来の細胞溶解性T細胞を、障害の軽減に十分な量投与する ことを含む方法。
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