KR20200044013A - 아포지단백질 C-III (APOC3)의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제 및 조성물 - Google Patents

아포지단백질 C-III (APOC3)의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제 및 조성물 Download PDF

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Abstract

본 개시내용은 아포지단백질 C-III (또한 APOC3, apoC-III, APOC-III, 및 APO C-III으로도 불림) 유전자 발현을 억제할 수 있는 RNAi 작용제, 예를 들어, 이중 가닥 RNAi 작용제, 및 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물에 관한 것이다. 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 간세포를 포함한 세포로의 전달을 용이하게 하기 위해, N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 리간드를 포함한 표적화 리간드에 접합될 수 있다. 임의로 1종 이상의 추가의 치료제와 함께 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물이 또한 기재된다. APOC3 RNAi 작용제의 생체내 전달은 APOC3 유전자 발현의 억제를 제공하고, 대상체에서 보다 낮은 트리글리세리드 및/또는 콜레스테롤 수준을 발생시킬 수 있다. APOC3 RNAi 작용제는 고트리글리세리드혈증, 심혈관 질환을 포함한 APOC3-관련 질환 및 장애, 및 다른 대사-관련 장애 및 질환의 치료 방법에 사용될 수 있다.

Description

아포지단백질 C-III (APOC3)의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제 및 조성물
관련 출원에 대한 상호 참조
본 출원은 2018년 8월 21일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 62/720,434, 2018년 3월 16일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 62/643,927, 및 2017년 9월 11일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 62/556,818을 우선권 주장하며, 이들 각각의 내용은 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.
서열 목록
본 출원은 ASCII 포맷으로 제출된 서열 목록을 함유하며, 이는 그 전문이 본원에 참조로 포함된다. ASCII 카피는 30655_SeqList로 명명되고, 195 kb 크기이다.
발명의 분야
본 개시내용은 아포지단백질 C-III 유전자 발현의 억제를 위한 RNA 간섭 (RNAi) 작용제, 예를 들어, 이중 가닥 RNAi 작용제, 아포지단백질 C-III RNAi 작용제를 포함하는 조성물, 및 그의 사용 방법에 관한 것이다.
인간 아포지단백질 C-III 유전자에 의해 코딩된 아포지단백질 C-III (또한 APOC3, apoC-III, APOC-III, 및 APO C-III으로도 불림)은 최근 고트리글리세리드혈증과 연관된 질환의 치료를 위한 유망한 표적으로 대두되었다. 상승된 혈청 트리글리세리드 (TG) 수준은 심혈관 질환에 대한 독립적인 위험 인자로서, 그리고 아테롬성동맥경화증 발생의 기여 인자로서 확인되었다. 중증 고트리글리세리드혈증 (종종 > 1000 mg/dL)을 갖는 개체는 또한 재발성 췌장염의 위험이 있다. 트리글리세리드는 주로 TG-풍부 지단백질로서 공지된 초저밀도 지단백질 (VLDL) 및 킬로마이크론 입자의 주요 성분으로서 혈액 내에서 수송된다. 지단백질은 소수성 트리아실글리세롤 및 콜레스테릴 에스테르 코어, 및 인지질, 콜레스테롤, 및 아포지단백질의 친수성 외부 층으로 구성된다. APOC3은 이들 아포단백질 중 하나이다.
APOC3은 주로 간에서 합성되고, 혈장으로부터 TG-풍부 지단백질의 생산, 대사, 및 클리어런스에서 중요한 역할을 한다. 고트리글리세리드혈증 발생의 기여 인자인 것으로 상정되는, APOC3 유전자의 프로모터 영역에서 여러 기능-획득 다형성이 확인되었다 (예를 들어, 문헌 [Wang, Y., et al., Association of Apolipoprotein C3 Genetic Polymorphisms with the Risk of Ischemic Stroke in the Northern Chinese Han Population, 11 PLoS One e0163910 (2016); Li, Y., et al., Apolipoprotein C3 gene variants and the risk of coronary heart disease: A meta-analysis 9 Meta Gene 104-109 (2016)] 참조). 간에서의 증가된 APOC3 합성은 TG-풍부 VLDL의 분비를 촉진한다. 또한, APOC3의 지나친-풍부화는 지단백질 리파제 및 간 리파제의 활성을 억제하여, TG-풍부 지단백질의 이화작용을 지연시킴으로써 혈청 TG 수준을 추가로 증가시킨다. 또한, 상승된 APOC3은 또한 TG-풍부 지단백질 및 그의 잔여 입자의 간 수용체에 대한 결합을 방해함으로써 그의 간 클리어런스를 지연시킨다. 여러 대형 유전 분석 연구는 APOC3의 기능-상실 돌연변이를 갖는 개체가 낮은 트리글리세리드 수준 및 감소된 심혈관 질환 발생률을 나타낸다고 보고하였다 (예를 들어, 문헌 [Bernelot Moens, S. J., et al., Inhibition of ApoCIII: the next PCSK9? 25 Curr Opin Lipidol 418-422 (2014); Saleheen, D., et al., Human knockouts and phenotypic analysis in a cohort with a high rate of consanguinity, 544 Nature 235-239 (2017)] 참조).
현재, 고트리글리세리드혈증은 종종 중등도의 경우에 피브레이트로 치료되거나 스타틴과 조합되어 치료되지만; 대부분의 경우에 혈청 TG의 감소는 크지 않다. 추가적으로, 이용가능한 치료는 종종 매우 중증의 고트리글리세리드혈증의 단일유전자 원인을 갖는 환자 (예컨대 가족성 킬로마이크론혈증 증후군을 갖는 환자)에서 비효과적인데, 이는 질환-유발 돌연변이가 기능장애 지단백질 리파제를 초래하고, 기능성 지단백질 리파제는 표준 요법에 대한 최적 반응을 위해 필요하기 때문이다. APOC3이 소정의 역할을 할 수 있는 질환, 예컨대 고트리글리세리드혈증 유도된 췌장염, 대사 증후군, 제II형 당뇨병, 가족성 킬로마이크론혈증 증후군, 가족성 부분 지방이영양증, 비만, 고지혈증, 고트리글리세리드혈증, 비정상적 지질 및/또는 콜레스테롤 대사, 아테롬성동맥경화증, 심혈관 질환, 관상 동맥 질환, 및 다른 대사-관련 장애 및 질환의 치료를 위해 실질적인 TG 저하 효과를 제공할 수 있는 효과적인 치료제에 대한 필요가 존재한다. 특정의 다른 APOC3-특이적 RNA 간섭 (RNAi) 작용제가, 예를 들어 그 전문이 본원에 참조로 포함되는 국제 특허 출원 공개 번호 WO 2016/011123 A1 (Weiler et al.)에서, APOC3 유전자의 발현을 억제하는 것으로 제시되었다. 그러나, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 이전에 개시되거나 공지되지 않았고, 이는 APOC3 유전자의 발현의 매우 강력하고 효율적인 억제를 제공한다.
APOC3 유전자의 발현을 선택적으로 및 효율적으로 억제할 수 있는 신규 APOC3 RNA 간섭 (RNAi) 작용제 (또한 본원에서 RNAi 작용제, RNAi 촉발제, 또는 촉발제로도 명명됨)에 대한 필요가 존재한다. 추가로, 특히 상승된 트리글리세리드 (TG) 수준과 연관된 질환의 치료를 위한 신규 APOC3-특이적 RNAi 작용제를 포함하는 조성물에 대한 필요가 존재한다.
일반적으로, 본 개시내용은 APOC3 유전자-특이적 RNAi 작용제, APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물, 및 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제 및 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물을 사용하여 시험관내 및/또는 생체내에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법을 특색으로 한다. 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자의 발현을 선택적으로 및 효율적으로 감소시키거나 억제할 수 있고, 그에 의해 대상체, 예를 들어, 인간 또는 동물 대상체에서 TG 수준 및/또는 콜레스테롤 수준을 감소시킬 수 있다.
기재된 APOC3 RNAi 작용제는 비만, 고지혈증, 고트리글리세리드혈증, 비정상적 지질 및/또는 콜레스테롤 대사, 아테롬성동맥경화증, 심혈관 질환, 관상 동맥 질환, 고트리글리세리드혈증 유도된 췌장염, 대사 증후군, 제II형 당뇨병, 가족성 킬로마이크론혈증 증후군, 가족성 부분 지방이영양증, 및 다른 대사-관련 장애 및 질환을 포함하나 이에 제한되지는 않는, 상승된 TG 수준 및/또는 상승된 콜레스테롤 수준과 연관된 증상 및 질환의 치유적 치료 (예방적 및 방지적 치료 포함)를 위한 방법에 사용될 수 있다. 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 대상체에서 APOC3 유전자 발현을 선택적으로 감소시킬 수 있고, 이는 특히 TG 수준 및/또는 콜레스테롤 수준의 감소로 이어질 수 있다. 본원에 개시된 방법은 관련 기술분야에 공지된 임의의 적합한 방법, 예컨대 피하 주사 또는 정맥내 투여를 사용하여 대상체, 예를 들어 인간 또는 동물 대상체에게 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 투여하는 것을 포함한다.
한 측면에서, 개시내용은 인간 APOC3 유전자의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제를 특색으로 하며, 여기서 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥을 포함한다. 또한 APOC3 유전자의 발현을 억제할 수 있는 RNAi 작용제를 포함하거나 그로 이루어진 조성물이 본원에 기재되며, 여기서 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥을 포함하거나 그로 이루어지고, 조성물은 적어도 1종의 제약상 허용되는 부형제를 추가로 포함한다. 개시된 APOC3 RNAi 작용제 중 1종 이상을 포함하는 본원에 기재된 조성물은 APOC3 유전자의 발현을 선택적으로 및 효율적으로 감소시킬 수 있다. 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물은 상승된 TG 수준, 상승된 콜레스테롤, 및/또는 증진된 APOC3 발현과 연관된 증상 및 질환의 치료 (예방적 치료 또는 억제 포함)를 위해 대상체, 예컨대 인간 또는 동물 대상체에게 투여될 수 있다.
본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥 (또한 패신저 가닥으로도 지칭됨), 및 안티센스 가닥 (또한 가이드 가닥으로도 지칭됨)을 포함한다. 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 서로 부분적으로, 실질적으로, 또는 완전히 상보적일 수 있다. 본원에 기재된 RNAi 작용제 센스 및 안티센스 가닥의 길이는 각각 16 내지 30개 뉴클레오티드 길이일 수 있다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 독립적으로 17 내지 26개 뉴클레오티드 길이이다. 센스 및 안티센스 가닥은 동일한 길이 또는 상이한 길이일 수 있다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 독립적으로 21 내지 26개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 독립적으로 21 내지 24개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥 둘 다는 21개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 및/또는 안티센스 가닥은 독립적으로 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 또는 30개 뉴클레오티드 길이이다. 본원에 기재된 RNAi 작용제는, APOC3을 발현하는 세포로의 전달 시, 생체내 또는 시험관내에서 1종 이상의 APOC3 유전자의 발현을 억제한다.
본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥은 APOC3 mRNA의 동일한 수의 뉴클레오티드의 코어 스트레치 서열 (또한 본원에서 "코어 스트레치" 또는 "코어 서열"로도 지칭됨)에 대해 적어도 85% 동일성을 갖는 적어도 16개의 인접 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 mRNA의 서열에 대해 적어도 85% 동일성을 갖는 센스 가닥 코어 스트레치는 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 또는 23개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, APOC3 mRNA의 서열에 대해 적어도 85% 동일성을 갖는 센스 가닥 코어 스트레치는 19개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 이러한 센스 가닥 코어 스트레치는 17개 뉴클레오티드 길이이다.
APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 APOC3 mRNA의 동일한 수의 뉴클레오티드의 코어 스트레치 및 상응하는 센스 가닥의 동일한 수의 뉴클레오티드의 코어 스트레치에 대해 적어도 85% 상보성을 갖는 적어도 16개의 인접 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 mRNA 또는 상응하는 센스 가닥의 서열에 대해 적어도 85% 상보성을 갖는 안티센스 가닥 코어 스트레치는 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 또는 23개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 이러한 안티센스 가닥 코어 스트레치는 19개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 이러한 안티센스 가닥 코어 스트레치는 17개 뉴클레오티드 길이이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 표 1에 개시된 서열 중 임의의 것의 서열을 갖는 APOC3 유전자의 부분을 표적화한다.
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제에 포함될 수 있는 APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥 및 안티센스 가닥의 예가 표 3, 4, 및 5에 제공된다. APOC3 RNAi 작용제 듀플렉스의 예가 표 3 및 6에 제공된다. 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥 및 안티센스 가닥으로 이루어질 수 있거나 그에 포함될 수 있는 19-뉴클레오티드 코어 스트레치 서열의 예가 표 2에 제공된다.
또 다른 측면에서, 개시내용은 APOC3 RNAi 작용제를 대상체, 예컨대 포유동물 내의 간 세포로 생체내 전달하는 방법을 특색으로 한다. 이러한 방법에 사용하기 위한 조성물이 또한 본원에 기재된다. 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제가 관련 분야에 공지되어 있는 임의의 올리고뉴클레오티드 전달 기술을 사용하여 표적 세포 또는 조직으로 전달될 수 있다. 핵산 전달 방법은 리포솜 내 캡슐화에 의한 것, 이온영동에 의한 것, 또는 다른 비히클, 예컨대 히드로겔, 시클로덱스트린, 생분해성 나노캡슐 및 생체접착성 마이크로구체, 단백질성 벡터, 또는 다이나믹 폴리컨쥬게이츠(Dynamic Polyconjugates)™ (DPC) 내로의 혼입에 의한 것을 포함하나 이에 제한되지는 않는다 (예를 들어 WO 2000/053722, WO 2008/0022309, WO 2011/104169, 및 WO 2012/083185 참조, 이들 각각은 본원에 참조로 포함됨).
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표적화 기, 예컨대 아시알로당단백질 수용체 리간드에 RNAi 작용제를 공유 연결 또는 접합시킴으로써 표적 세포 또는 조직으로 전달된다. 일부 실시양태에서, 아시알로당단백질 수용체 리간드는 갈락토스 또는 갈락토스 유도체 클러스터를 포함하거나, 그로 이루어지거나, 또는 그로 본질적으로 이루어진다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 갈락토스 유도체 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 표적화 리간드에 연결된다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 N-아세틸-갈락토사민 삼량체 또는 N-아세틸-갈락토사민 사량체를 포함한다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 N-아세틸-갈락토사민 삼량체 또는 N-아세틸-갈락토사민 사량체이다. 일부 실시양태에서, N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제는 간 세포 및 간세포에 의해, 특히 수용체-매개 세포내이입을 통해 또는 다른 수단에 의해 선택적으로 내재화된다. RNAi 작용제를 전달하는데 유용한 예시적인 표적화 기는 예를 들어 국제 특허 출원 공개 번호 WO 2018/044350 및 WO 2017/156012에 개시되어 있고, 이는 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.
표적화 기는 APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 3' 또는 5' 단부에 연결될 수 있다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 센스 가닥의 3' 또는 5' 단부에 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 센스 가닥의 5' 단부에 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 RNAi 작용제의 센스 가닥 및/또는 안티센스 가닥의 뉴클레오티드에 내부에서 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 링커를 통해 RNAi 작용제에 연결된다.
표적화 기는, 링커와 함께 또는 링커 없이, 표 2, 3, 4 및 5에 개시된 센스 및/또는 안티센스 가닥 중 임의의 것의 5' 또는 3' 단부에 연결될 수 있다. 링커는, 표적화 기와 함께 또는 표적화 기 없이, 표 2, 3, 4 및 5에 개시된 센스 및/또는 안티센스 가닥 중 임의의 것의 5' 또는 3' 단부에 부착될 수 있다.
일부 실시양태에서, 표 6에 개시된 듀플렉스 서열을 갖는 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물이 본원에 기재된다.
추가 측면에서, 1종 이상의 추가의 (즉, 제2, 제3 등) 치료제와 임의로 조합된, 1종 이상의 기재된 APOC3 RNAi 작용제(들)를 포함하는 제약 조성물이 본원에 기재된다. 일부 실시양태에서, 1종 이상의 추가의 (즉, 제2, 제3 등) 치료제와 임의로 조합된, 1종 이상의 기재된 APOC3 RNAi 작용제(들)를 포함하는 제약 조성물은 제약상 허용되는 담체 또는 희석제 중에 제제화될 수 있다. 일부 실시양태에서, 이들 조성물은 대상체, 예컨대 포유동물에게 투여될 수 있다. 일부 실시양태에서는, 포유동물은 인간이다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 조성물은 상이한 뉴클레오티드 서열을 갖는 적어도 2종의 APOC3 RNAi 작용제의 조합물 또는 칵테일을 포함한다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 상이한 APOC3 RNAi 작용제는 각각 개별적으로 및 독립적으로 표적화 기에 연결된다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 상이한 APOC3 RNAi 작용제는 각각 아시알로당단백질 수용체를 표적화하는 1개 이상의 모이어티를 포함하는 표적화 리간드를 포함하거나 그로 이루어진 표적화 기에 연결된다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 상이한 APOC3 RNAi 작용제는 각각 1개 이상의 갈락토스 유도체를 포함하는 표적화 리간드를 포함하거나 그로 이루어진 표적화 기에 연결된다. 일부 실시양태에서, 2종 이상의 상이한 APOC3 RNAi 작용제는 각각 1개 이상의 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 표적화 리간드를 포함하거나 그로 이루어진 표적화 기에 연결된다.
또 다른 측면에서, 개시내용은 APOC3 유전자의 발현을 억제할 수 있는 APOC3 RNAi 작용제의 양을 대상체 또는 대상체의 세포에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 APOC3 유전자 발현을 억제하는 방법을 특색으로 하며, 여기서 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥을 포함하고, 여기서 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4의 안티센스 가닥 뉴클레오티드 서열 중 어느 하나의 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포, 특히 간세포로 생체내 전달하기 위한, 표적화 기에 접합된 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물이 기재된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 아시알로당단백질 수용체 리간드이다.
일부 실시양태에서, APOC3 유전자의 발현을 억제할 수 있는 APOC3 RNAi 작용제의 양을 대상체 또는 대상체의 세포에 투여하는 것을 포함하는, APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시되며, 여기서 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥을 포함하고, 여기서 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 5의 센스 가닥 뉴클레오티드 서열 중 어느 하나의 서열을 포함한다. 또한, 이러한 방법에 사용하기 위한 조성물이 본원에 기재된다.
추가 측면에서, 개시내용은 표 2, 3, 또는 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 갖는 APOC3 RNAi 작용제를 그를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 상승된 TG 수준 및/또는 상승된 콜레스테롤 수준에 의해 유발되는 질환 또는 증상의 치료 (방지적 또는 예방적 치료 포함) 방법을 특색으로 한다. 일부 실시양태에서, 표 2, 3, 또는 5의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 센스 가닥을 갖는 APOC3 RNAi 작용제를 그를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 상승된 TG 수준 및/또는 상승된 콜레스테롤 수준에 의해 유발되는 질환 또는 증상의 치료 (방지적 또는 예방적 치료 포함) 방법이 본원에 기재된다. 또한, 이러한 방법에 사용하기 위한 조성물이 본원에 기재된다.
또한, APOC3 RNAi 작용제 및/또는 APOC3 RNAi 작용제-함유 조성물의 치료 유효량을 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는, 적어도 부분적으로 APOC3 유전자 발현에 의해 매개되는 병리학적 상태 (예컨대 상태 또는 질환)를 갖거나 또는 병리학적 상태가 발생할 위험이 있는 인간 대상체를 치료하는 방법이 기재된다. APOC3 RNAi 작용제 및/또는 APOC3 RNAi 작용제-함유 조성물로 대상체를 치료하는 방법은 임의로 1종 이상의 추가의 (즉, 제2, 제3 등) 치료제 또는 치료를 투여하는 1개 이상의 단계와 조합될 수 있다. APOC3 RNAi 작용제 및 추가의 치료제는 단일 조성물로 투여될 수 있거나, 또는 이들은 개별적으로 투여될 수 있다. 추가의 치료제는 또 다른 APOC3 RNAi 작용제 (예를 들어, APOC3 유전자 내의 상이한 서열을 표적화하는 APOC3 RNAi 작용제)일 수 있다. 추가의 치료제는 또한 소분자 약물, 항체, 항체 단편, 및/또는 압타머일 수 있다. 일부 실시양태에서, 1종 이상의 추가의 치료제는 스타틴, 예컨대 아토르바스타틴, 플루바스타틴, 프라바스타틴, 피타바스타틴, 로수바스타틴, 또는 심바스타틴이다.
일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제(들)는 임의로 1종 이상의 추가의 치료제와 조합되며, 여기서 1종 이상의 추가의 치료제는 RNAi 작용제와 개별 투여 형태로 개별적으로 투여된다 (예를 들어, APOC3 RNAi 작용제는 피하 주사에 의해 투여되는 한편, 치료 투여 요법의 방법에 수반되는 추가의 치료제는 경구로 투여됨). 일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제(들)는 피하 주사를 통해 그를 필요로 하는 대상체에게 투여되고, 1종 이상의 임의의 추가의 치료제는 경구로 투여되며, 이는 함께, 상승된 TG 및/또는 콜레스테롤 수준과 연관된 질환 및 상태에 대한 치료 요법을 제공한다. 일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제(들)는 피하 주사를 통해 그를 필요로 하는 대상체에게 투여되고, 1종 이상의 임의의 추가의 치료제는 개별 피하 주사를 통해 투여된다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 및 1종 이상의 추가의 치료제는 단일 투여 형태 (예를 들어, 피하 주사를 위해 단일 조성물로 제제화된 "칵테일")로 조합된다. APOC3 RNAi 작용제는, 1종 이상의 추가의 치료제와 함께 또는 1종 이상의 추가의 치료제 없이, 1종 이상의 부형제와 조합되어 제약 조성물을 형성할 수 있다.
일부 실시양태에서, 표 2, 3, 또는 5의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하거나, 그로 이루어지거나, 또는 그로 본질적으로 이루어진 센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 세포 또는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 표 5의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 센스 가닥, 및 표 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하거나, 그로 이루어지거나, 또는 그로 본질적으로 이루어진 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 투여하는 것을 포함하는, APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다.
일부 실시양태에서, 표 5의 서열 중 임의의 것의 핵염기 서열을 포함하는 센스 가닥, 및 표 4의 서열 중 임의의 것의 핵염기 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 세포 또는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 세포 또는 대상체에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다. 다른 실시양태에서, 표 5의 변형 서열 중 임의의 것의 변형 서열로 이루어진 센스 가닥, 및 표 4의 변형 서열 중 임의의 것의 변형 서열로 이루어진 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포, 특히 간세포로 생체내 전달하기 위한, 표적화 기에 접합된 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물이 기재된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 아시알로당단백질 수용체 리간드 (즉, 아시알로당단백질 수용체에 대해 친화도를 갖는 화합물을 포함하는 리간드)이다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 표 6에 제시된 듀플렉스의 듀플렉스 구조를 갖는 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 투여하는 것을 포함하는, 세포에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다.
일부 실시양태에서, 표 1의 서열을 갖는 APOC3 mRNA의 부분에 적어도 부분적으로 상보적인 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제의 치료 유효량을 그를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 상승된 TG 수준 및/또는 상승된 콜레스테롤 수준에 의해 유발되는 질환, 장애, 또는 증상의 치료 (예방적 또는 방지적 치료 포함) 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 표 2, 3, 또는 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 안티센스 가닥, 및 안티센스 가닥에 적어도 부분적으로 상보적인 표 2, 3, 또는 5의 서열 중 임의의 것을 포함하는 센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제의 치료 유효량을 그를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 상승된 TG 수준 및/또는 상승된 콜레스테롤 수준에 의해 유발되는 질환 또는 증상의 치료 (예방적 또는 방지적 치료 포함) 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 표 2, 3, 또는 5의 서열 중 임의의 것을 포함하는 센스 가닥, 및 센스 가닥에 적어도 부분적으로 상보적인 표 2, 3, 또는 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제의 치료 유효량을 그를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 상승된 TG 수준 및/또는 상승된 콜레스테롤 수준에 의해 유발되는 질환 또는 증상의 치료 (예방적 또는 방지적 치료 포함) 방법이 본원에 개시된다.
일부 실시양태에서, 표 1의 서열을 갖는 APOC3 mRNA의 부분에 적어도 부분적으로 상보적인 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 세포에 투여하는 것을 포함하는, 세포에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 표 2, 3, 또는 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 안티센스 가닥, 및 안티센스 가닥에 적어도 부분적으로 상보적인 표 2, 3, 또는 5의 서열 중 임의의 것을 포함하는 센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 세포에 투여하는 것을 포함하는, 세포에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 표 2, 3, 또는 5의 서열 중 임의의 것을 포함하는 센스 가닥, 및 센스 가닥에 적어도 부분적으로 상보적인 표 2, 3, 또는 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 포함하는 APOC3 RNAi 작용제를 투여하는 것을 포함하는, 세포에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 개시된다.
일부 실시양태에서, 세포에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하기 위한 조성물이 본원에 개시되며, 방법은 표 6에 제시된 듀플렉스의 듀플렉스 구조를 갖는 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함한다.
일부 실시양태에서, 표적화 기에 접합되거나 연결된 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포로 생체내 전달하기 위한 조성물이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 아시알로당단백질 수용체 리간드이다. 일부 실시양태에서, N-아세틸-갈락토사민 표적화 리간드에 연결된 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포로 생체내 전달하기 위한 조성물이 기재된다.
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자 (서열식별번호(SEQ ID NO): 1) 상의 특정 위치를 표적화하도록 설계된다. 본원에 정의된 바와 같이, 안티센스 가닥의 5' 말단 핵염기가 APOC3 유전자와 염기 쌍을 형성할 때 유전자 상의 위치로부터 (3' 단부를 향해) 19개 뉴클레오티드 하류인 위치와 정렬될 경우, 안티센스 가닥 서열은 APOC3 유전자를 유전자 상의 주어진 위치에서 표적화하도록 설계된다. 예를 들어, 본원의 표 1 및 2에 예시된 바와 같이, APOC3 유전자를 위치 438에서 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열은 유전자와 염기 쌍을 형성할 때 안티센스 가닥의 5' 말단 핵염기가 APOC3 유전자의 위치 456과 정렬되는 것을 필요로 한다.
본원에 제공된 바와 같이, 적어도 16개의 인접 뉴클레오티드의 코어 스트레치 서열에 걸쳐 안티센스 가닥 및 유전자의 적어도 85% 상보성 (예를 들어, 적어도 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 또는 100% 상보성)이 존재하는 한, APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 (5' → 3')의 위치 1의 핵염기가 유전자에 대해 상보적일 것을 필요로 하지 않는다. 예를 들어, APOC3 유전자의 위치 438을 표적화하도록 설계된 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 경우, APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥의 5' 말단 핵염기는 유전자의 위치 456과 정렬되어야 하지만; 적어도 16개의 인접 뉴클레오티드의 코어 스트레치 서열에 걸쳐 안티센스 가닥 및 유전자의 적어도 85% 상보성 (예를 들어, 적어도 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 또는 100% 상보성)이 존재하는 한, 안티센스 가닥의 5' 말단 핵염기는 APOC3 유전자의 위치 456에 대해 상보적일 수는 있지만, 그러할 필요는 없다. 특히, 본원에 개시된 다양한 실시예에 의해 제시되는 바와 같이, APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥이 유전자에 결합하는 특정 부위 (예를 들어, APOC3 RNAi 작용제가 APOC3 유전자를 위치 438, 위치 506, 위치 432, 또는 일부 다른 위치에서 표적화하도록 설계되는지 여부)는 APOC3 RNAi 작용제에 의해 달성되는 억제의 수준에 중요하다.
APOC3 RNAi 작용제의 사용은 상승된 TG 및/또는 콜레스테롤 수준 및/또는 증진되거나 상승된 APOC3 발현과 연관된 질환/장애의 치유적 (예방적 포함) 치료를 위한 방법을 제공한다. 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 RNA 간섭을 매개하여 APOC3의 생산에 필요한 1종 이상의 유전자의 발현을 억제한다. APOC3 RNAi 작용제는 또한 비만, 고지혈증, 고트리글리세리드혈증, 비정상적 지질 및/또는 콜레스테롤 대사, 아테롬성동맥경화증, 심혈관 질환, 관상 동맥 질환, 고트리글리세리드혈증 매개된 췌장염, 대사 증후군, 제II형 당뇨병, 가족성 킬로마이크론혈증 증후군, 가족성 부분 지방이영양증, 및 다른 대사-관련 장애 및 질환을 포함한 다양한 질환 또는 장애를 치료 또는 예방하기 위해 사용될 수 있다. 또한, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포로 생체내 전달하기 위한 조성물이 기재된다.
1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물은 국부 또는 전신 치료를 목적으로 하는지에 따라 다양한 방식으로 투여될 수 있다. 투여는 정맥내, 동맥내, 피하, 복강내, 피부하 (예를 들어, 이식된 장치를 통함), 및 실질내 투여일 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 제약 조성물은 피하 주사에 의해 투여된다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포로 생체내 전달하기 위한 조성물이 본원에 개시되며, 여기서 조성물은 표적화 기에 접합되거나 연결된 APOC3 RNAi 작용제를 포함한다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 아시알로당단백질 수용체 리간드이다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제를 간 세포로 생체내 전달하기 위한 조성물이 기재되며, 여기서 조성물은 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 표적화 리간드에 연결된 APOC3 RNAi 작용제를 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 각각 본원의 표 7에 정의된 바와 같은 (NAG25), (NAG25)s, (NAG26), (NAG26)s, (NAG27), (NAG27)s, (NAG28), (NAG28)s, (NAG29), (NAG29)s, (NAG30), (NAG30)s, (NAG31), (NAG31)s, (NAG32), (NAG32)s, (NAG33), (NAG33)s, (NAG34), (NAG34)s, (NAG35), (NAG35)s, (NAG36), (NAG36)s, (NAG37), (NAG37)s, (NAG38), (NAG38)s, (NAG39), (NAG39)s의 구조를 갖는 1개 이상의 표적화 기를 포함할 수 있다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 단부에 각각 본원의 표 7에 정의된 바와 같은 (NAG25), (NAG25)s, (NAG26), (NAG26)s, (NAG27), (NAG27)s, (NAG28), (NAG28)s, (NAG29), (NAG29)s, (NAG30), (NAG30)s, (NAG31), (NAG31)s, (NAG32), (NAG32)s, (NAG33), (NAG33)s, (NAG34), (NAG34)s, (NAG35), (NAG35)s, (NAG36), (NAG36)s, (NAG37), (NAG37)s, (NAG38), (NAG38)s, (NAG39), (NAG39)s의 구조를 갖는 1개의 표적화 기를 포함한다.
기재된 APOC3 RNAi 작용제 및/또는 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물은 상승된 TG 수준에 의해 유발되는 질환 또는 상태의 치유적 치료 방법에 사용될 수 있다. 이러한 방법은 본원에 기재된 바와 같은 APOC3 RNAi 작용제를 대상체, 예를 들어, 인간 또는 동물 대상체에 투여하는 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제 중 1종 이상은 제약상 허용되는 담체 또는 희석제 중에서 대상체, 예컨대 포유동물에게 투여된다. 일부 실시양태에서, 포유동물은 인간이다.
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 1종 이상의 개시된 APOC3 RNAi 작용제 및 적어도 1종의 제약상 허용되는 부형제를 포함하는 조성물 내로 혼입될 수 있다. 일부 실시양태에서, 개시된 APOC3 RNAi 작용제 중 1종 이상 및 적어도 1종의 제약상 허용되는 부형제를 포함하는 본원에 개시된 조성물은 제약 조성물이다.
일부 실시양태에서, 1종 이상의 개시된 APOC3 RNAi 작용제 및 적어도 1종의 제약상 허용되는 부형제를 포함하는 조성물은 1종 이상의 추가의 치료제 또는 치료를 추가로 포함할 수 있다.
일부 실시양태에서, 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 본원에 기재된 조성물은 키트, 용기, 팩, 분배기, 사전-충전된 시린지, 또는 바이알 내에 포장된다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 조성물은 비경구로 투여된다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 서열식별번호: 3은 안티센스 가닥의 위치 1-21 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 2)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 관련 기술분야의 통상의 기술자가 분명하게 이해할 바와 같이, 본원에 개시된 변형 뉴클레오티드 서열에 제시된 바와 같은 포스포로티오에이트 연결의 포함은 올리고뉴클레오티드에 전형적으로 존재하는 포스포디에스테르 연결을 대체한다 (예를 들어, 모든 뉴클레오시드간 연결을 보여주는 도 1a 내지 1i 참조). 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 2)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCGU (서열식별번호: 5)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCGU (서열식별번호: 5)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCGU (서열식별번호: 5)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 서열식별번호: 5는 안티센스 가닥의 위치 1-21 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcGfsu (서열식별번호: 4)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 관련 기술분야의 통상의 기술자가 분명하게 이해할 바와 같이, 본원에 개시된 변형 뉴클레오티드 서열에 제시된 바와 같은 포스포로티오에이트 연결의 포함은 올리고뉴클레오티드에 전형적으로 존재하는 포스포디에스테르 연결을 대체한다 (예를 들어, 모든 뉴클레오시드간 연결을 보여주는 도 1a 내지 1i 참조). 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcGfsu (서열식별번호: 4)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsascugagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 6)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 관련 기술분야의 통상의 기술자가 분명하게 이해할 바와 같이, 본원에 개시된 변형 뉴클레오티드 서열에 제시된 바와 같은 포스포로티오에이트 연결의 포함은 올리고뉴클레오티드에 전형적으로 존재하는 포스포디에스테르 연결을 대체한다 (예를 들어, 모든 뉴클레오시드간 연결을 보여주는 도 1a 내지 1i 참조). 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsascugagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 6)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 서열식별번호: 8은 안티센스 가닥의 위치 1-21 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usUfscsUfuGfuCfcAfgCfuUfuAfuUfgGfsc (서열식별번호: 7)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usUfscsUfuGfuCfcAfgCfuUfuAfuUfgGfsc (서열식별번호: 7)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAGGG (서열식별번호: 10)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAGGG (서열식별번호: 10)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAGGG (서열식별번호: 10)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 서열식별번호: 10은 안티센스 가닥의 위치 1-21 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfgGfsg (서열식별번호: 9)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfgGfsg (서열식별번호: 9)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAAGC (서열식별번호: 12)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAAGC (서열식별번호: 12)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAAGC (서열식별번호: 12)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 서열식별번호: 12는 안티센스 가닥의 위치 1-21 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfaGfsc (서열식별번호: 11)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfaGfsc (서열식별번호: 11)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UGAGAAUACUGUCCCUUUGCC (서열식별번호: 14)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UGAGAAUACUGUCCCUUUGCC (서열식별번호: 14)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UGAGAAUACUGUCCCUUUGCC (서열식별번호: 14)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 서열식별번호: 14는 안티센스 가닥의 위치 1-21 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usGfsasGfaAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfgcsc (서열식별번호: 13)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usGfsasGfaAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfgcsc (서열식별번호: 13)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, 여기서 센스 가닥은 안티센스 가닥에 적어도 실질적으로 상보적이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GAGGGACAGUAUUCUCAGUIA (서열식별번호: 16)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. (I는 이노신 뉴클레오티드를 나타냄.) 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GAGGGACAGUAUUCUCAGUIA (서열식별번호: 16) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCGU (서열식별번호: 5)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') ACGGGACAGUAUUCUCAGUIA (서열식별번호: 18)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. (I는 이노신 뉴클레오티드를 나타냄.) 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCGU (서열식별번호: 5) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') ACGGGACAGUAUUCUCAGUIA (서열식별번호: 18) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GAGGGACAGUAUUCUCAGUGA (서열식별번호: 21)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UCACUGAGAAUACUGUCCCUC (서열식별번호: 3) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GAGGGACAGUAUUCUCAGUGA (서열식별번호: 21) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GCCAAUAAAGCUGGACAAGAA (서열식별번호: 23)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GCCAAUAAAGCUGGACAAGAA (서열식별번호: 23) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GCCAAUAAAICUGGACAAGAA (서열식별번호: 25)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UUCUUGUCCAGCUUUAUUGGC (서열식별번호: 8) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GCCAAUAAAICUGGACAAGAA (서열식별번호: 25) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAGGG (서열식별번호: 10)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') CCCUAAAAGGGACAGUAUUCU (서열식별번호: 27)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAGGG (서열식별번호: 10) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') CCCUAAAAGGGACAGUAUUCU (서열식별번호: 27) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAAGC (서열식별번호: 12)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GCUUAAAAGGGACAGUAUUCU (서열식별번호: 29)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') AGAAUACUGUCCCUUUUAAGC (서열식별번호: 12) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GCUUAAAAGGGACAGUAUUCU (서열식별번호: 29) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UGAGAAUACUGUCCCUUUGCC (서열식별번호: 14)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GGCAAAGGGACAGUAUUCUCA (서열식별번호: 31)와 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') UGAGAAUACUGUCCCUUUGCC (서열식별번호: 14) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') GGCAAAGGGACAGUAUUCUCA (서열식별번호: 31) (여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드임)와 1개 이하의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 2)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gagggacaGfUfAfuucucaguia (서열식별번호: 15)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, i, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 2)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gagggacaGfUfAfuucucaguia (서열식별번호: 15)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcGfsu (서열식별번호: 4)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') acgggacaGfUfAfuucucaguia (서열식별번호: 17)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, i, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcGfsu (서열식별번호: 4)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') acgggacaGfUfAfuucucaguia (서열식별번호: 17)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsascugagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 6)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gagggacaGfuAfuUfcucaguia (서열식별번호: 19)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, i, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsascugagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 6)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gagggacaGfuAfuUfcucaguia (서열식별번호: 19)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 2)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gagggacaGfUfAfuucucaguga (서열식별번호: 20)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usCfsasCfuGfagaauAfcUfgUfcCfcUfsc (서열식별번호: 2)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gagggacaGfUfAfuucucaguga (서열식별번호: 20)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usUfscsUfuGfuCfcAfgCfuUfuAfuUfgGfsc (서열식별번호: 7)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gccaauaaAfGfCfuggacaagaa (서열식별번호: 22)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usUfscsUfuGfuCfcAfgCfuUfuAfuUfgGfsc (서열식별번호: 7)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gccaauaaAfGfCfuggacaagaa (서열식별번호: 22)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usUfscsUfuGfuCfcAfgCfuUfuAfuUfgGfsc (서열식별번호: 7)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gccaauaaAfIfCfuggacaagaa (서열식별번호: 24)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, If, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usUfscsUfuGfuCfcAfgCfuUfuAfuUfgGfsc (서열식별번호: 7)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gccaauaaAfIfCfuggacaagaa (서열식별번호: 24)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfgGfsg (서열식별번호: 9)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') cccuaaaaGfGfGfacaguauucu (서열식별번호: 26)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfgGfsg (서열식별번호: 9)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') cccuaaaaGfGfGfacaguauucu (서열식별번호: 26)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfaGfsc (서열식별번호: 11)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gcuuaaaaGfGfGfacaguauucu (서열식별번호: 28)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') asGfsasAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfuAfaGfsc (서열식별번호: 11)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') gcuuaaaaGfGfGfacaguauucu (서열식별번호: 28)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usGfsasGfaAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfgcsc (서열식별번호: 13)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') ggcaaaggGfAfCfaguauucuca (서열식별번호: 30)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') usGfsasGfaAfuAfcUfgUfcCfcUfuUfgcsc (서열식별번호: 13)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥, 및 변형 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') ggcaaaggGfAfCfaguauucuca (서열식별번호: 30)로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 센스 가닥을 포함하며, 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00001
여기서 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 센스 가닥을 추가로 포함하고; 여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00002
여기서 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 센스 가닥을 추가로 포함하고; 여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이고; 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00003
여기서 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 센스 가닥을 추가로 포함하고; 여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이고; 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함하고; 여기서 각각의 안티센스 가닥 서열은 안티센스 가닥의 위치 1-21에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하며, 여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥은 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 쌍 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하며:
Figure pct00004
여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하며, 여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥은 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 쌍 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하며:
Figure pct00005
여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이고; 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00006
여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고; 여기서 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 센스 가닥을 추가로 포함하고; 여기서 센스 가닥의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00007
여기서 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 센스 가닥을 추가로 포함하고; 여기서 센스 가닥의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이고; 여기서 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이고; 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 쌍 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00008
여기서 a, c, g, i, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, If, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타낸다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기 뉴클레오티드 서열 쌍 (5' → 3') 중 하나로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00009
여기서 a, c, g, i, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, If, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고; 여기서 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하고, 센스 가닥은 또한 5' 말단 단부에 공유 연결된 표적화 리간드를 포함하고, 여기서 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열 (5' → 3')과 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 포함한다:
Figure pct00010
.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열 (5' → 3')과 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00011
여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열 (5' → 3')과 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열을 포함하는 안티센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00012
여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이고, 여기서 서열식별번호: 49, 서열식별번호: 53, 서열식별번호: 57, 서열식별번호: 58, 또는 서열식별번호: 106은 각각, 안티센스 가닥의 뉴클레오티드 위치 1-19 (5' → 3')에 위치한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 각각이 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열 쌍 (5' → 3')과 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열을 포함하는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함한다:
Figure pct00013
.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 각각이 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열 쌍 (5' → 3')과 0 또는 1개의 핵염기만큼 상이한 핵염기 서열을 포함하는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하며:
Figure pct00014
여기서 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다.
본원에 사용된 용어 "올리고뉴클레오티드" 및 "폴리뉴클레오티드"는 각각 독립적으로 변형되거나 또는 비변형될 수 있는 연결된 뉴클레오시드의 중합체를 의미한다.
본원에 사용된 "RNAi 작용제" (또한 "RNAi 촉발제"로도 지칭됨)는 서열 특이적 방식으로 표적 메신저 RNA (mRNA)인 mRNA의 전사체를 분해하거나 또는 그의 번역을 억제할 수 있는 (예를 들어, 적절한 조건 하에 그를 분해하거나 또는 그의 번역을 억제하는) RNA 또는 RNA-유사 (예를 들어, 화학적으로 변형된 RNA) 올리고뉴클레오티드 분자를 함유하는 조성물을 의미한다. 본원에 사용된 바와 같이, RNAi 작용제는 RNA 간섭 메카니즘 (즉, 포유동물 세포의 RNA 간섭 경로 기구 (RNA-유도 침묵화 복합체 또는 RISC)와의 상호작용을 통해 RNA 간섭을 유도함)을 통해, 또는 임의의 대안적인 메카니즘(들) 또는 경로(들)에 의해 작동할 수 있다. RNAi 작용제가, 이러한 용어가 본원에 사용된 바와 같이, 주로 RNA 간섭 메카니즘을 통해 작동하는 것으로 여겨지지만, 개시된 RNAi 작용제는 임의의 특정 경로 또는 메카니즘에 의해 구속되거나 또는 이에 제한되지는 않는다. 본원에 개시된 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥으로 구성되고, 짧은 (또는 소형) 간섭 RNA (siRNA), 이중 가닥 RNA (dsRNA), 마이크로 RNA (miRNA), 짧은 헤어핀 RNA (shRNA), 및 다이서 기질을 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 본원에 기재된 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 표적화되는 mRNA (즉, APOC3 mRNA)에 대해 적어도 부분적으로 상보적이다. RNAi 작용제는 1개 이상의 변형 뉴클레오티드 및/또는 1개 이상의 비-포스포디에스테르 연결을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 주어진 유전자의 발현을 언급할 때의 용어 "침묵시킨다", "감소시킨다", "억제한다", "하향-조절한다" 또는 "녹다운시킨다"는 유전자가 전사되는 세포, 세포 군, 조직, 기관, 또는 대상체 내의 유전자로부터 전사된 RNA의 수준 또는 mRNA로부터 번역된 폴리펩티드, 단백질 또는 단백질 서브유닛의 수준에 의해 측정된 바와 같은 유전자 발현이 세포, 세포 군, 조직, 기관, 또는 대상체가 본원에 기재된 RNAi 작용제로 처리될 때 이렇게 처리되지 않은 제2 세포, 세포 군, 조직, 기관, 또는 대상체와 비교하여 감소된다는 것을 의미한다.
본원에 사용된 용어 "서열" 및 "뉴클레오티드 서열"은 표준 명명법을 사용하여 일련의 문자로 기재된, 일련의 또는 연속된 핵염기 또는 뉴클레오티드를 의미한다.
본원에 사용된 "염기", "뉴클레오티드 염기", 또는 "핵염기"는 뉴클레오티드의 성분인 헤테로시클릭 피리미딘 또는 퓨린 화합물이고, 1차 퓨린 염기인 아데닌 및 구아닌, 및 1차 피리미딘 염기인 시토신, 티민 및 우라실을 포함한다. 핵염기는, 비제한적으로, 보편적 염기, 소수성 염기, 혼잡 염기, 크기-확장 염기, 및 플루오린화 염기를 포함하도록 추가로 변형될 수 있다. (예를 들어, 문헌 [Modified Nucleosides in Biochemistry, Biotechnology and Medicine, Herdewijn, P. ed. Wiley-VCH, 2008] 참조). 이러한 변형 핵염기 (변형 핵염기를 포함하는 포스포르아미다이트 화합물 포함)의 합성은 관련 기술분야에 공지되어 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 달리 나타내지 않는 한, 용어 "상보적"은, 제1 핵염기 또는 뉴클레오티드 서열 (예를 들어, RNAi 작용제 센스 가닥 또는 표적화된 mRNA)을 제2 핵염기 또는 뉴클레오티드 서열 (예를 들어, RNAi 작용제 안티센스 가닥 또는 단일-가닥 안티센스 올리고뉴클레오티드)과 관련하여 기재하기 위해 사용할 때, 제1 뉴클레오티드 서열을 포함하는 올리고뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드가 특정 표준 조건 하에 제2 뉴클레오티드 서열을 포함하는 올리고뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드와 혼성화하고 (포유동물의 생리학적 조건 (또는 시험관내 유사한 조건) 하에 염기 쌍 수소 결합을 형성하고), 듀플렉스 또는 이중 나선 구조를 형성하는 능력을 의미한다. 적어도 상기 혼성화 요건이 충족되는 한, 상보적 서열은 왓슨-크릭 염기 쌍 또는 비-왓슨-크릭 염기 쌍을 포함하고, 천연 또는 변형 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 모방체를 포함한다. 서열 동일성 또는 상보성은 변형에 독립적이다. 예를 들어, 본원에 정의된 바와 같은 a 및 Af는 U (또는 T)에 대해 상보적이고, 동일성 또는 상보성을 결정하기 위한 목적으로 A와 동일하다.
본원에 사용된 "완벽하게 상보적" 또는 "완전히 상보적"은 핵염기 또는 뉴클레오티드 서열 분자의 혼성화된 쌍에서, 제1 올리고뉴클레오티드의 인접 서열 내의 모든 (100％) 염기가 제2 올리고뉴클레오티드의 인접 서열 내의 동일한 수의 염기와 혼성화할 것임을 의미한다. 인접 서열은 제1 또는 제2 뉴클레오티드 서열 모두 또는 그의 부분을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 "부분적으로 상보적"은 핵염기 또는 뉴클레오티드 서열 분자의 혼성화된 쌍에서, 제1 올리고뉴클레오티드의 인접 서열 내의 염기 모두가 아니라 그의 적어도 70%가 제2 올리고뉴클레오티드의 인접 서열 내의 동일한 수의 염기와 혼성화할 것임을 의미한다. 인접 서열은 제1 또는 제2 뉴클레오티드 서열 모두 또는 그의 부분을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 "실질적으로 상보적"은 핵염기 또는 뉴클레오티드 서열 분자의 혼성화된 쌍에서, 제1 올리고뉴클레오티드의 인접 서열 내의 염기 모두가 아니라 그의 적어도 85%가 제2 올리고뉴클레오티드의 인접 서열 내의 동일한 수의 염기와 혼성화할 것임을 의미한다. 인접 서열은 제1 또는 제2 뉴클레오티드 서열 모두 또는 그의 부분을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 용어 "상보적", "완전히 상보적", "부분적으로 상보적", 및 "실질적으로 상보적"은 RNAi 작용제의 센스 가닥과 안티센스 가닥 사이 또는 RNAi 작용제의 안티센스 가닥과 APOC3 mRNA의 서열 사이의 핵염기 또는 뉴클레오티드 매칭에 관련하여 사용된다.
본원에 사용된 바와 같이, 핵산 서열에 적용된 바와 같은 용어 "실질적으로 동일한" 또는 "실질적 동일성"은 뉴클레오티드 서열 (또는 뉴클레오티드 서열의 부분)이 참조 서열과 비교하여 적어도 약 85% 서열 동일성 또는 그 초과, 예를 들어, 적어도 90%, 적어도 95%, 또는 적어도 99% 동일성을 갖는다는 것을 의미한다. 서열 동일성의 백분율은 2개의 최적으로 정렬된 서열을 비교 윈도우에 걸쳐 비교함으로써 결정된다. 백분율은 동일한 유형의 핵산 염기가 둘 다의 서열에서 발생하는 위치의 수를 결정하여 매칭되는 위치의 수를 산출하고, 매칭되는 위치의 수를 비교 윈도우 내의 위치의 총수로 나누고, 결과에 100을 곱하여 서열 동일성의 백분율을 산출함으로써 계산된다. 본원에 개시된 발명은 본원에 개시된 것과 실질적으로 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
본원에 사용된 용어 "치료하다", "치료" 등은 대상체에서 질환의 1종 이상의 증상의 완화 또는 그의 수, 중증도 및/또는 빈도의 경감을 제공하도록 취해지는 방법 또는 단계를 의미한다. 본원에 사용된 "치료하다" 및 "치료"는 대상체에서의 질환의 1종 이상의 증상의 수, 중증도 및/또는 빈도의 방지적 치료, 관리, 예방적 치료, 및/또는 억제 또는 감소를 포함할 수 있다.
본원에 사용된 어구 "세포 내로 도입하는"은, RNAi 작용제를 언급할 때, RNAi 작용제를 세포 내로 기능적으로 전달하는 것을 의미한다. "기능적 전달"은 RNAi 작용제가 예상되는 생물학적 활성, 예를 들어, 유전자 발현의 서열-특이적 억제를 가질 수 있게 하는 방식으로 RNAi 작용제를 세포로 전달하는 것을 의미한다.
달리 언급되지 않는 한, 본원에 사용된 바와 같은 기호 "
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"의 사용은 본원에 기재된 발명의 범주에 따른 임의의 기 또는 기들이 이에 연결될 수 있다는 것을 의미한다.
본원에 사용된 용어 "이성질체"는 분자식이 동일하지만 그의 원자의 성질 또는 결합 순서 면에서 또는 공간 내에서의 그의 원자의 배열 면에서 상이한 화합물을 지칭한다. 공간 내에서의 그의 원자의 배열 면에서 상이한 이성질체는 "입체이성질체"로 명명된다. 서로 거울상이 아닌 입체이성질체는 "부분입체이성질체"로 명명되고, 비-중첩가능한 거울상인 입체이성질체는 "거울상이성질체", 또는 때때로 광학 이성질체로 명명된다. 4개의 동일하지 않은 치환기에 결합된 탄소 원자는 "키랄 중심"으로 명명된다.
본원에 사용된 바와 같이, 특정한 입체형태를 갖는 것으로 구조 면에서 구체적으로 확인되지 않는 한, 비대칭 중심이 존재하고 따라서 거울상이성질체, 부분입체이성질체, 또는 다른 입체이성질체 형상을 발생시키는 각각의 구조에 대해, 본원에 개시된 각각의 구조는 그의 광학적으로 순수한 형태 및 라세미 형태를 포함하여 모든 이러한 가능한 이성질체를 나타내도록 의도된다. 예를 들어, 본원에 개시된 구조는 부분입체이성질체, 뿐만 아니라 단일 입체이성질체의 혼합물을 포괄하도록 의도된다.
본원의 청구범위에 사용된 바와 같이, 어구 "로 이루어진"은 청구범위에 명시되지 않은 임의의 요소, 단계 또는 성분을 배제한다. 본원의 청구범위에서 사용될 때, 어구 "로 본질적으로 이루어진"은 청구범위의 범주를 명시된 물질 또는 단계 및 청구된 발명의 기본적이고 신규한 특성(들)에 실질적으로 영향을 미치지 않는 것으로 제한한다.
관련 기술분야의 통상의 기술자는 본원에 개시된 화합물 및 조성물이, 화합물 또는 조성물이 놓이는 환경에 따라, 양성자화 또는 탈양성자화 상태의 특정 원자 (예를 들어, N, O, 또는 S 원자)를 가질 수 있다는 것을 쉽게 이해하고 인지할 것이다. 따라서, 본원에 사용된 바와 같이, 본원에 개시된 구조는 특정 관능기, 예컨대 예를 들어, OH, SH, 또는 NH가 양성자화 또는 탈양성자화될 수 있는 것으로 생각된다. 본원의 개시내용은, 관련 기술분야의 통상의 기술자가 쉽게 이해할 바와 같이, 개시된 화합물 및 조성물을 환경 (예컨대 pH)에 기초한 그의 양성자화 상태와 관계 없이 포괄하도록 의도된다.
본원에 사용된 바와 같이, 2개의 화합물 또는 분자 사이의 연결을 언급할 때의 용어 "연결된" 또는 "접합된"은 2개의 화합물 또는 분자가 공유 결합에 의해 연결된다는 것을 의미한다. 언급되지 않는 한, 본원에 사용된 용어 "연결된" 및 "접합된"은 임의의 개재 원자 또는 원자 군의 존재 또는 부재 하의 제1 화합물과 제2 화합물 사이의 연결을 지칭할 수 있다.
본원에 사용된 용어 "포함하는"은 본원에서 어구 "포함하나 이에 제한되지는 않는"을 의미하는 것으로 사용되고, 이와 상호교환가능하게 사용된다. 용어 "또는"은, 문맥이 달리 명백하게 나타내지 않는 한, 본원에서 용어 "및/또는"을 의미하는 것으로 사용되고, 이와 상호교환가능하게 사용된다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술 과학 용어는 관련 기술분야의 통상의 기술자가 통상적으로 이해하는 바와 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기재된 것과 유사하거나 동등한 방법 및 물질이 본 발명의 실시 또는 시험에서 사용될 수 있지만, 적합한 방법 및 물질이 하기에 기재된다. 본원에 언급된 모든 간행물, 특허 출원, 특허 및 다른 참고문헌은 그 전문이 참조로 포함된다. 충돌되는 경우, 정의를 포함하여 본 명세서가 우선한다. 또한, 물질, 방법 및 예는 예시적일 뿐이며, 제한적인 것으로 의도되지 않는다.
본 발명의 다른 목적, 특색, 측면 및 이점이 하기의 상세한 설명, 첨부 도면 및 청구범위로부터 명백할 것이다.
도 1a. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05251의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1a는 서열식별번호: 2 및 501을 개시한다.
하기 약어가 도 1a 내지 1i에 사용된다: a, c, g, i, 및 u는 2'-O-메틸 변형 뉴클레오티드이고 (i의 경우, 핵염기는 하이포크산틴 (즉, 이노신 뉴클레오티드를 위한 염기)임); Af, Cf, Gf, If, 및 Uf는 2'-플루오로 변형 뉴클레오티드이고 (I의 경우, 핵염기는 하이포크산틴 (즉, 이노신 뉴클레오티드를 위한 염기)임); p는 포스포디에스테르 연결이고; s는 포스포로티오에이트 연결이고; invAb는 역전 무염기성 (데옥시리보스) 잔기이고 (표 7 참조); (NAG37)s는 표 7에 도시된 구조를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민 표적화 리간드이다.
도 1b. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05876의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1b는 서열식별번호: 4 및 572를 개시한다.
도 1c. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05769의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1c는 서열식별번호: 6 및 557을 개시한다.
도 1d. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05169의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1d는 서열식별번호: 2 및 482를 개시한다.
도 1e. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05220의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1e는 서열식별번호: 7 및 494를 개시한다.
도 1f. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05547의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1f는 서열식별번호: 7 및 545를 개시한다.
도 1g. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05299의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1g는 서열식별번호: 9 및 521을 개시한다.
도 1h. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05223의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1h는 서열식별번호: 11 및 497을 개시한다.
도 1i. (NAG37)s의 구조 (표 7 참조)를 갖는 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드에 접합된 APOC3 RNAi 작용제 AD05171의 변형 센스 및 안티센스 가닥 (표 4-6 참조)의 개략적 다이어그램. 도 1a는 서열식별번호: 13 및 483을 개시한다.
도 2a 내지 2d. 유리 산으로서 제시된, 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드를 포함하는 ((NAG37)s의 구조를 갖는) APOC3 RNAi 작용제 AD05251의 화학 구조 표현.
도 3a 내지 3d. 나트륨 염으로서 제시된, 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드를 포함하는 ((NAG37)s의 구조를 갖는) APOC3 RNAi 작용제 AD05251의 화학 구조 표현.
도 4a 내지 4d. 유리 산으로서 제시된, 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드를 포함하는 ((NAG37)s의 구조를 갖는) APOC3 RNAi 작용제 AD05876의 화학 구조 표현.
도 5a 내지 5d. 나트륨 염으로서 제시된, 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드를 포함하는 ((NAG37)s의 구조를 갖는) APOC3 RNAi 작용제 AD05876의 화학 구조 표현.
도 6a 내지 6d. 유리 산으로서 제시된, 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드를 포함하는 ((NAG37)s의 구조를 갖는) APOC3 RNAi 작용제 AD05220의 화학 구조 표현.
도 7a 내지 7d. 나트륨 염으로서 제시된, 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민-함유 표적화 리간드를 포함하는 ((NAG37)s의 구조를 갖는) APOC3 RNAi 작용제 AD05220의 화학 구조 표현.
RNAi 작용제
APOC3 유전자의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제 (본원에서 APOC3 RNAi 작용제 또는 APOC3 RNAi 촉발제로 지칭됨)가 본원에 기재된다. 각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥을 포함한다. 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 각각 16 내지 30개 뉴클레오티드 길이일 수 있다. 센스 및 안티센스 가닥은 동일한 길이일 수 있거나, 상이한 길이일 수 있다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 각각 독립적으로 17 내지 27개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 각각 독립적으로 17-21개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 각각 21-26개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥은 각각 21-24개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 약 19개 뉴클레오티드 길이인 한편, 안티센스 가닥은 약 21개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 약 21개 뉴클레오티드 길이인 한편, 안티센스 가닥은 약 23개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 23개 뉴클레오티드 길이이고, 안티센스 가닥은 21개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 및 안티센스 가닥 둘 다는 각각 21개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제 센스 및 안티센스 가닥은 각각 독립적으로 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 또는 26개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 이중-가닥 RNAi 작용제는 뉴클레오티드 약 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 또는 24개의 듀플렉스 길이를 갖는다.
일부 실시양태에서, 센스 가닥과 안티센스 가닥 사이의 완벽한, 실질적 또는 부분적 상보성 영역은 16-26개 (예를 들어, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 또는 26개) 뉴클레오티드 길이이고, 안티센스 가닥의 5' 단부에서 또는 그 부근에서 발생한다 (예를 들어, 이러한 영역은 안티센스 가닥의 5' 단부로부터 완벽하게, 실질적으로 또는 부분적으로 상보적이지 않은 0, 1, 2, 3, 또는 4개 뉴클레오티드만큼 분리될 수 있음).
센스 가닥 및 안티센스 가닥 각각은 16 내지 23개 뉴클레오티드 길이의 코어 스트레치 (또한 본원에서 "코어 서열" 또는 "코어 스트레치 서열"로도 지칭됨)를 함유한다. 안티센스 가닥 코어 스트레치는 APOC3 mRNA 표적 내에 존재하는 뉴클레오티드 서열 (때때로, 예를 들어, 표적 서열로 지칭됨)에 100% (완벽하게) 상보적이거나 또는 적어도 약 85% (실질적으로) 상보적이다. 센스 가닥 코어 스트레치 서열은 안티센스 가닥 내의 코어 스트레치 서열에 100% (완벽하게) 상보적이거나 또는 적어도 약 85% (실질적으로) 상보적이고, 따라서 센스 가닥 코어 스트레치 서열은 APOC3 mRNA 표적 내에 존재하는 뉴클레오티드 서열 (표적 서열)과 전형적으로 완벽하게 동일하거나 또는 적어도 약 85% 동일하다. 센스 가닥 코어 스트레치 서열은 상응하는 안티센스 코어 서열과 길이가 동일할 수 있거나, 또는 길이가 상이할 수 있다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 코어 스트레치 서열은 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 또는 23개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥 코어 스트레치 서열은 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 또는 23개 뉴클레오티드 길이이다.
APOC3 RNAi 작용제를 형성하는데 사용된 센스 및 안티센스 가닥 뉴클레오티드 서열의 예가 표 2, 3, 4, 및 5에 제공된다. 표 2, 4, 및 5의 센스 가닥 및 안티센스 가닥 서열을 포함하는 RNAi 작용제 듀플렉스의 예가 표 6에 제시된다.
APOC3 RNAi 작용제 센스 및 안티센스 가닥은 어닐링되어 듀플렉스를 형성한다. APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 서로 부분적으로, 실질적으로, 또는 완전히 상보적일 수 있다. 상보적 듀플렉스 영역 내에서, 센스 가닥 코어 스트레치 서열은 안티센스 코어 스트레치 서열에 대해 적어도 85% 상보적 또는 100% 상보적이다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥 코어 스트레치 서열은 안티센스 가닥 코어 스트레치 서열의 상응하는 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 또는 23개 뉴클레오티드 서열에 적어도 85% 또는 100% 상보적인 적어도 16개, 적어도 17개, 적어도 18개, 적어도 19개, 적어도 20개, 적어도 21개, 적어도 22개, 또는 적어도 23개 뉴클레오티드의 서열을 함유한다 (즉, APOC3 RNAi 작용제의 센스 및 안티센스 코어 스트레치 서열은 적어도 85%의 염기가 쌍을 이루거나 또는 100%의 염기가 쌍을 이룬 적어도 16개, 적어도 17개, 적어도 18개, 적어도 19개, 적어도 20개, 적어도 21개, 적어도 22개, 또는 적어도 23개 뉴클레오티드의 영역을 갖는다).
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것과 0, 1, 2, 또는 3개의 뉴클레오티드만큼 상이하다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 5의 센스 가닥 서열 중 임의의 것과 0, 1, 2, 또는 3개의 뉴클레오티드만큼 상이하다.
센스 가닥 및/또는 안티센스 가닥은 임의로 및 독립적으로 코어 스트레치 서열의 3' 단부, 5' 단부, 또는 3' 및 5' 단부 둘 다에 추가의 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개 뉴클레오티드 (연장물)를 함유할 수 있다. 안티센스 가닥의 추가의 뉴클레오티드는, 존재하는 경우, APOC3 mRNA 내의 상응하는 서열에 대해 상보적일 수 있거나 또는 그렇지 않을 수 있다. 센스 가닥의 추가의 뉴클레오티드는, 존재하는 경우, APOC3 mRNA 내의 상응하는 서열과 동일할 수 있거나 또는 그렇지 않을 수 있다. 존재하는 경우의 안티센스 가닥의 추가의 뉴클레오티드는 존재하는 경우의 상응하는 센스 가닥의 추가의 뉴클레오티드에 대해 상보적일 수 있거나 또는 그렇지 않을 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 연장물은 센스 가닥 코어 스트레치 서열 및/또는 안티센스 가닥 코어 스트레치 서열의 5' 및/또는 3' 단부에 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개 뉴클레오티드를 포함한다. 센스 가닥 상의 연장물 뉴클레오티드는 상응하는 안티센스 가닥 내의 코어 스트레치 서열 뉴클레오티드 또는 연장물 뉴클레오티드인 뉴클레오티드에 대해 상보적일 수 있거나 또는 그렇지 않을 수 있다. 반대로, 안티센스 가닥 상의 연장물 뉴클레오티드는 상응하는 센스 가닥 내의 코어 스트레치 서열 뉴클레오티드 또는 연장물 뉴클레오티드인 뉴클레오티드에 대해 상보적일 수 있거나 또는 그렇지 않을 수 있다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥 및 안티센스 가닥 둘 다 3' 및 5' 연장물을 함유한다. 일부 실시양태에서, 하나의 가닥의 3' 연장물 뉴클레오티드 중 1개 이상은 다른 가닥의 1개 이상의 5' 연장물과 염기 쌍을 이룬다. 다른 실시양태에서, 하나의 가닥의 3' 연장물 뉴클레오티드 중 1개 이상은 다른 가닥의 1개 이상의 5' 연장물과 염기 쌍을 이루지 않는다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 3' 연장물을 갖는 안티센스 가닥 및 5' 연장물을 갖는 센스 가닥을 갖는다. 일부 실시양태에서, 연장물 뉴클레오티드(들)는 쌍을 이루지 않고, 오버행을 형성한다. 본원에 사용된 "오버행"은 본원에 개시된 RNAi 작용제의 혼성화 또는 듀플렉스화 부분의 일부를 형성하지 않는, 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 말단 단부에 위치하는 1개 이상의 쌍을 이루지 않은 뉴클레오티드의 스트레치를 지칭한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개 뉴클레오티드 길이의 3' 연장물을 갖는 안티센스 가닥을 포함한다. 다른 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 1, 2, 또는 3개 뉴클레오티드 길이의 3' 연장물을 갖는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 연장물 뉴클레오티드 중 1개 이상은 우라실 또는 티미딘 뉴클레오티드 또는 상응하는 APOC3 mRNA 서열에 대해 상보적인 뉴클레오티드를 포함한다.
일부 실시양태에서, 안티센스 가닥의 3' 단부는 무염기성 잔기 (Ab)를 포함할 수 있고, 이는 또한 "무염기성 부위" 또는 "무염기성 뉴클레오티드"를 지칭할 수 있다. 무염기성 잔기 (Ab)는 당 모이어티의 1' 위치에서 핵염기가 결여된 뉴클레오티드 또는 뉴클레오시드이다. (예를 들어, 미국 특허 번호 5,998,203 참조). 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥의 3' 단부에 Ab 또는 AbAb가 부가될 수 있다.
일부 실시양태에서, 센스 가닥 또는 안티센스 가닥은 "말단 캡"을 포함할 수 있고, 이는, 본원에 사용된 바와 같이, 본원에 개시된 RNAi 작용제의 가닥의 1개 이상의 말단에 혼입될 수 있고, 일부 경우에, RNAi 작용제에 특정의 유익한 특성, 예컨대 예를 들어, 엑소뉴클레아제 분해에 대한 보호를 제공할 수 있는 비-뉴클레오티드 화합물 또는 다른 모이어티이다. 일부 실시양태에서, 역전 무염기성 잔기 (invAb)가 말단 캡으로서 부가된다 (표 76 참조). (예를 들어, 문헌 [F. Czauderna, Nucleic Acids Res., 2003, 31(11), 2705-16] 참조). 말단 캡은 일반적으로 관련 분야에 공지되어 있고, 예를 들어 역전 무염기성 잔기, 뿐만 아니라 탄소 쇄 예컨대 말단 C3, C6, 또는 C12 기를 포함한다. 일부 실시양태에서, 말단 캡은 센스 가닥의 5' 말단 단부, 3' 말단 단부, 또는 5' 및 3' 말단 단부 둘 다에 존재한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 1, 2, 3, 4, 또는 5개 뉴클레오티드 길이의 3' 연장물을 갖는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥 연장물 뉴클레오티드 중 1개 이상은 아데노신, 우라실, 또는 티미딘 뉴클레오티드, AT 디뉴클레오티드, 또는 APOC3 mRNA 서열 내의 뉴클레오티드에 상응하는 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 3' 센스 가닥 연장물은 하기 서열 중 하나를 포함하거나 그로 이루어지지만, 이에 제한되지는 않는다: T, UT, TT, UU, UUT, TTT, 또는 TTTT (각각 5' → 3'으로 열거됨).
일부 실시양태에서, 센스 가닥의 3' 단부는 추가의 무염기성 잔기 또는 역전 무염기성 말단 캡을 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, UUAb, UAb, 또는 Ab가 센스 가닥의 3' 단부에 부가된다.
일부 실시양태에서, 1개 이상의 역전 무염기성 잔기 (invAb)가 센스 가닥의 3' 단부에 부가된다. 일부 실시양태에서, 1개 이상의 역전 무염기성 잔기 또는 역전 무염기성 부위가 표적화 리간드와 RNAi 작용제의 센스 가닥의 핵염기 서열 사이에 삽입된다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥의 말단 단부 또는 말단 단부들에서 또는 그 근처에서 1개 이상의 역전 무염기성 잔기 또는 역전 무염기성 부위를 포함하는 것은 RNAi 작용제의 증진된 활성 또는 다른 목적하는 특성을 허용한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개 뉴클레오티드 길이의 5' 연장물을 갖는 센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥 연장물 뉴클레오티드 중 1개 이상은 우라실 또는 아데노신 뉴클레오티드 또는 APOC3 mRNA 서열 내의 뉴클레오티드에 상응하는 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥 5' 연장물은 하기 서열 중 하나이지만, 이에 제한되지는 않는다: CA, AUAGGC, AUAGG, AUAG, AUA, A, AA, AC, GCA, GGCA, GGC, UAUCA, UAUC, UCA, UAU, U, UU (각각 5' → 3'으로 열거됨). 센스 가닥은 3' 연장물 및/또는 5' 연장물을 가질 수 있다.
일부 실시양태에서, 센스 가닥의 5' 단부는 1개 이상의 추가의 무염기성 잔기 (예를 들어, (Ab) 또는 (AbAb))를 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 1개 이상의 역전 무염기성 잔기 (invAb)가 센스 가닥의 5' 단부에 부가된다. 일부 실시양태에서, 1개 이상의 역전 무염기성 잔기가 표적화 리간드와 RNAi 작용제의 센스 가닥의 핵염기 서열 사이에 삽입될 수 있다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥의 말단 단부 또는 말단 단부들에서 또는 그 근처에서 1개 이상의 역전 무염기성 잔기를 포함하는 것은 RNAi 작용제의 증진된 활성 또는 다른 목적하는 특성을 허용할 수 있다. 일부 실시양태에서, 무염기성 (데옥시리보스) 잔기는 리비톨 (무염기성 리보스) 잔기로 대체될 수 있다.
일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 코어 스트레치 서열의 3' 단부, 또는 안티센스 가닥 서열의 3' 단부는 역전 무염기성 잔기 (invAb (표 7 참조))를 포함할 수 있다.
APOC3 RNAi 작용제를 형성하는데 사용된 서열의 예가 표 2, 3, 4, 및 5에 제공된다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2, 3, 또는 4의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함한다. 특정 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 4의 변형 서열 중 어느 하나를 포함하거나 그로 이루어진다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2 또는 표 4의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17, 2-15, 2-17, 1-18, 2-18, 1-19, 2-19, 1-20, 2-20, 1-21, 2-21, 1-22, 2-22, 1-23, 2-23, 1-24, 또는 2-24의 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 2 또는 5의 서열 중 임의의 것의 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 2 또는 5의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-18, 1-19, 1-20, 1-21, 1-22, 1-23, 1-24, 1-25, 1-26, 2-19, 2-20, 2-21, 2-22, 2-23, 2-24, 3-20, 3-21, 3-22, 3-23, 3-24, 4-21, 4-22, 4-23, 4-24, 5-22, 5-23, 또는 5-24의 서열을 포함한다. 특정 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 5의 변형 서열 중 어느 하나의 변형 서열을 포함하거나 그로 이루어진다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 RNAi 작용제의 센스 및 안티센스 가닥은 동일한 수의 뉴클레오티드를 함유한다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 RNAi 작용제의 센스 및 안티센스 가닥은 상이한 수의 뉴클레오티드를 함유한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥 5' 단부 및 안티센스 가닥 3' 단부는 평활 말단을 형성한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥 3' 단부 및 안티센스 가닥 5' 단부는 평활 말단을 형성한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 양쪽 단부는 평활 말단을 형성한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 어느쪽 단부도 평활 말단이 아니다. 본원에 사용된 "평활 말단"은 2개의 어닐링된 가닥의 말단 뉴클레오티드가 상보적인 (상보적 염기 쌍을 형성하는) 이중 가닥 RNAi 작용제의 단부를 지칭한다.
일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥 5' 단부 및 안티센스 가닥 3' 단부는 풀린 단부를 형성한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥 3' 단부 및 안티센스 가닥 5' 단부는 풀린 단부를 형성한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 양쪽 단부는 풀린 단부를 형성한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 어느쪽 단부도 풀린 단부가 아니다. 본원에 사용된 바와 같이, 풀린 단부는 2개의 어닐링된 가닥의 말단 뉴클레오티드가 쌍을 형성하지만 (즉, 오버행을 형성하지 않지만) 상보적이지는 않은 (즉, 비-상보적 쌍을 형성하는) 이중 가닥 RNAi 작용제의 단부를 지칭한다. 일부 실시양태에서, 이중 가닥 RNAi 작용제의 하나의 가닥의 단부의 1개 이상의 쌍을 이루지 않은 뉴클레오티드가 오버행을 형성한다. 쌍을 이루지 않은 뉴클레오티드가 센스 가닥 또는 안티센스 가닥 상에 있어, 3' 또는 5' 오버행을 생성할 수 있다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제는 평활 말단 및 풀린 단부, 평활 말단 및 5' 오버행 단부, 평활 말단 및 3' 오버행 단부, 풀린 단부 및 5' 오버행 단부, 풀린 단부 및 3' 오버행 단부, 2개의 5' 오버행 단부, 2개의 3' 오버행 단부, 5' 오버행 단부 및 3' 오버행 단부, 2개의 풀린 단부, 또는 2개 평활 말단을 함유한다. 전형적으로, 존재하는 경우, 오버행은 센스 가닥, 안티센스 가닥, 또는 센스 가닥 및 안티센스 가닥 둘 다의 3' 말단 단부에 위치한다.
변형 뉴클레오티드는, 다양한 폴리뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 구축물에서 사용될 때, 세포 내에서 화합물의 활성을 보존하면서 동시에 이러한 화합물의 혈청 안정성을 증가시킬 수 있고, 또한 폴리뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 구축물의 투여 시 인간에서 인터페론 활성을 활성화시킬 가능성을 최소화할 수 있다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 염, 혼합 염, 또는 유리 산으로서 제조되거나 제공된다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 나트륨 염으로서 제조된다. 관련 분야에 널리 공지되어 있는 이러한 형태들은 본원에 개시된 발명의 범주 내이다.
변형 뉴클레오티드
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 1개 이상의 변형 뉴클레오티드를 함유한다. 본원에 사용된 "변형 뉴클레오티드"는 리보뉴클레오티드 (2'-히드록실 뉴클레오티드) 이외의 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 뉴클레오티드의 적어도 50% (예를 들어, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99%, 또는 100%)가 변형 뉴클레오티드이다. 본원에 사용된 바와 같이, 변형 뉴클레오티드는 데옥시리보뉴클레오티드, 뉴클레오티드 모방체, 무염기성 뉴클레오티드 (본원에서 Ab로 나타내어짐), 2'-변형 뉴클레오티드, 3' → 3' 연결 (역전) 뉴클레오티드 (본원에서 invdN, invN, invn으로 나타내어짐), 변형 핵염기-포함 뉴클레오티드, 가교 뉴클레오티드, 펩티드 핵산 (PNA), 2',3'-세코 뉴클레오티드 모방체 (비-잠금 핵염기 유사체, 본원에서 NUNA 또는 NUNA로 나타내어짐), 잠금 뉴클레오티드 (본원에서 NLNA 또는 NLNA로 나타내어짐), 3'-O-메톡시 (2' 뉴클레오시드간 연결) 뉴클레오티드 (본원에서 3'-OMen으로 나타내어짐), 2'-F-아라비노 뉴클레오티드 (본원에서 NfANA 또는 NfANA로 나타내어짐), 5'-Me, 2'-플루오로 뉴클레오티드 (본원에서 5Me-Nf로 나타내어짐), 모르폴리노 뉴클레오티드, 비닐 포스포네이트 데옥시리보뉴클레오티드 (본원에서 vpdN으로 나타내어짐), 비닐 포스포네이트를 함유하는 뉴클레오티드, 및 시클로프로필 포스포네이트를 함유하는 뉴클레오티드 (cPrpN)를 포함할 수 있으나 이에 제한되지는 않는다. 2'-변형 뉴클레오티드 (즉, 5-원 당 고리의 2' 위치에 히드록실 기 이외의 기를 갖는 뉴클레오티드)는 2'-O-메틸 뉴클레오티드 (본원에서 뉴클레오티드 서열 내에서 소문자 'n'으로 나타내어짐), 2'-데옥시-2'-플루오로 뉴클레오티드 (또한 본원에서 2'-플루오로 뉴클레오티드로도 지칭되고, 본원에서 Nf로 나타내어짐), 2'-데옥시 뉴클레오티드 (본원에서 dN으로 나타내어짐), 2'-메톡시에틸 (2'-O-2-메톡실에틸) 뉴클레오티드 (또한 본원에서 2'-MOE로도 지칭되고, 본원에서 NM으로 나타내어짐), 2'-아미노 뉴클레오티드, 및 2'-알킬 뉴클레오티드를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 주어진 화합물 내의 모든 위치가 균일하게 변형될 필요는 없다. 반대로, 단일 APOC3 RNAi 작용제에서 또는 심지어 그의 단일 뉴클레오티드에서 하나를 초과하는 변형이 혼입될 수 있다. APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 관련 기술분야에 공지된 방법에 의해 합성되고/거나 변형될 수 있다. 하나의 뉴클레오티드에서의 변형은 또 다른 뉴클레오티드에서의 변형에 독립적이다.
변형 핵염기는 합성 및 천연 핵염기, 예컨대 5-치환된 피리미딘, 6-아자피리미딘 및 N-2, N-6 및 O-6 치환된 퓨린, (예를 들어, 2-아미노프로필아데닌, 5-프로피닐우라실, 또는 5-프로피닐시토신), 5-메틸시토신 (5-me-C), 5-히드록시메틸 시토신, 이노신, 크산틴, 하이포크산틴, 2-아미노아데닌, 아데닌 및 구아닌의 6-알킬 (예를 들어, 6-메틸, 6-에틸, 6-이소프로필, 또는 6-n-부틸) 유도체, 아데닌 및 구아닌의 2-알킬 (예를 들어, 2-메틸, 2-에틸, 2-이소프로필, 또는 2-n-부틸) 및 다른 알킬 유도체, 2-티오우라실, 2-티오티민, 2-티오시토신, 5-할로우라실, 시토신, 5-프로피닐 우라실, 5-프로피닐 시토신, 6-아조 우라실, 6-아조 시토신, 6-아조 티민, 5-우라실 (슈도우라실), 4-티오우라실, 8-할로, 8-아미노, 8-술프히드릴, 8-티오알킬, 8-히드록실 및 다른 8-치환된 아데닌 및 구아닌, 5-할로 (예를 들어, 5-브로모), 5-트리플루오로메틸, 및 다른 5-치환된 우라실 및 시토신, 7-메틸구아닌 및 7-메틸아데닌, 8-아자구아닌 및 8-아자아데닌, 7-데아자구아닌, 7-데아자아데닌, 3-데아자구아닌, 및 3-데아자아데닌을 포함한다.
일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드이다. 본원에 사용된 바와 같이, 실질적으로 모든 뉴클레오티드가 변형 뉴클레오티드를 나타내는 RNAi 작용제는 센스 가닥 및 안티센스 가닥 둘 다의 4개 이하 (즉, 0, 1, 2, 3, 또는 4개)의 뉴클레오티드가 리보뉴클레오티드 (즉, 비변형)인 RNAi 작용제이다. 본원에 사용된 바와 같이, 존재하는 실질적으로 모든 뉴클레오티드가 변형 뉴클레오티드인 센스 가닥은 센스 가닥 내의 2개 이하 (즉, 0, 1, 또는 2개)의 뉴클레오티드가 비변형 리보뉴클레오티드인 센스 가닥이다. 본원에 사용된 바와 같이, 존재하는 실질적으로 모든 뉴클레오티드가 변형 뉴클레오티드인 안티센스 가닥은 센스 가닥 내의 2개 이하 (즉, 0, 1, 또는 2개)의 뉴클레오티드가 비변형 리보뉴클레오티드인 안티센스 가닥이다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 1개 이상의 뉴클레오티드는 비변형 리보뉴클레오티드이다.
변형 뉴클레오시드간 연결
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제의 1개 이상의 뉴클레오티드는 비-표준 연결 또는 백본 (즉, 변형 뉴클레오시드간 연결 또는 변형 백본)에 의해 연결된다. 변형 뉴클레오시드간 연결 또는 백본은 포스포로티오에이트 기 (본원에서 소문자 "s"로 나타내어짐), 키랄 포스포로티오에이트, 티오포스페이트, 포스포로디티오에이트, 포스포트리에스테르, 아미노알킬-포스포트리에스테르, 알킬 포스포네이트 (예를 들어, 메틸 포스포네이트 또는 3'-알킬렌 포스포네이트), 키랄 포스포네이트, 포스피네이트, 포스포르아미데이트 (예를 들어, 3'-아미노 포스포르아미데이트, 아미노알킬포스포르아미데이트, 또는 티오노포스포르아미데이트), 티오노알킬-포스포네이트, 티오노알킬포스포트리에스테르, 모르폴리노 연결, 정상 3'-5' 연결을 갖는 보라노포스페이트, 보라노포스페이트의 2'-5' 연결 유사체, 또는 뉴클레오시드 단위의 인접 쌍이 3'-5' → 5'-3' 또는 2'-5' → 5'-2' 연결된 역극성을 갖는 보라노포스페이트를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 일부 실시양태에서, 변형 뉴클레오시드간 연결 또는 백본은 인 원자가 결여된다. 인 원자가 결여된 변형 뉴클레오시드간 연결은 단쇄 알킬 또는 시클로알킬 당간 연결, 혼합된 헤테로원자 및 알킬 또는 시클로알킬 당간 연결, 또는 1개 이상의 단쇄 헤테로원자 또는 헤테로고리 당간 연결을 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 일부 실시양태에서, 변형 뉴클레오시드간 백본은 실록산 백본, 술피드 백본, 술폭시드 백본, 술폰 백본, 포름아세틸 및 티오포름아세틸 백본, 메틸렌 포름아세틸 및 티오포름아세틸 백본, 알켄-함유 백본, 술파메이트 백본, 메틸렌이미노 및 메틸렌히드라지노 백본, 술포네이트 및 술폰아미드 백본, 아미드 백본, 및 혼합된 N, O, S, 및 CH2 성분을 갖는 다른 백본을 포함하나 이에 제한되지는 않는다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥은 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개의 포스포로티오에이트 연결을 함유할 수 있거나, APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개의 포스포로티오에이트 연결을 함유할 수 있거나, 또는 센스 가닥 및 안티센스 가닥 둘 다는 독립적으로 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개의 포스포로티오에이트 연결을 함유할 수 있다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥은 1, 2, 3, 또는 4개의 포스포로티오에이트 연결을 함유할 수 있거나, APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 1, 2, 3, 또는 4개의 포스포로티오에이트 연결을 함유할 수 있거나, 또는 센스 가닥 및 안티센스 가닥 둘 다는 독립적으로 1, 2, 3, 또는 4개의 포스포로티오에이트 연결을 함유할 수 있다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 적어도 2개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결을 함유한다. 일부 실시양태에서, 적어도 2개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결은 센스 가닥의 3' 단부로부터 위치 1-3의 뉴클레오티드 사이에 있다. 일부 실시양태에서, 1개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결은 센스 가닥의 5' 단부에 있고, 또 다른 포스포로티오에이트 연결은 센스 가닥의 3' 단부에 있다. 일부 실시양태에서, 2개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결은 센스 가닥의 5' 단부에 위치하고, 또 다른 포스포로티오에이트 연결은 센스 가닥의 3' 단부에 있다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 뉴클레오티드 사이에 어떠한 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결도 포함하지 않지만, 5' 및 3' 단부 둘 다의 말단 뉴클레오티드 및 임의로 존재하는 역전 무염기성 잔기 말단 캡 사이에 1, 2, 또는 3개의 포스포로티오에이트 연결을 함유한다. 일부 실시양태에서, 표적화 리간드는 포스포로티오에이트 연결을 통해 센스 가닥에 연결된다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 4개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결을 함유한다. 일부 실시양태에서, 4개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결은 안티센스 가닥의 5' 단부로부터 위치 1-3의 뉴클레오티드 사이 및 5' 단부로부터 위치 19-21, 20-22, 21-23, 22-24, 23-25, 또는 24-26의 뉴클레오티드 사이에 있다. 일부 실시양태에서, 3개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결은 안티센스 가닥의 5' 단부로부터 위치 1-4 사이에 위치하고, 4개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결은 안티센스 가닥의 5' 단부로부터 위치 20-21 사이에 위치한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 내의 적어도 3 또는 4개의 포스포로티오에이트 뉴클레오시드간 연결을 함유한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 1개 이상의 변형 뉴클레오티드 및 1개 이상의 변형 뉴클레오시드간 연결을 함유한다. 일부 실시양태에서, 2'-변형 뉴클레오시드는 변형 뉴클레오시드간 연결과 조합된다.
APOC3 RNAi 작용제
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자를 표 1에 제시된 APOC3 유전자의 위치에서 또는 그 근처에서 표적화한다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 표 1에 개시된 표적 APOC3 19량체 서열에 완전히, 실질적으로 또는 적어도 부분적으로 상보적인 코어 스트레치 서열을 포함한다.
표 1. APOC3 19량체 mRNA 표적 서열 (호모 사피엔스(homo sapiens) 아포지단백질 C3 (APOC3) 전사체, 진뱅크(GenBank) NM_000040.1 (서열식별번호: 1)로부터 취함).
Figure pct00016
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 (5' → 3')의 위치 19가 표 1에 개시된 19량체 표적 서열의 위치 1과 염기 쌍을 형성할 수 있는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 (5' → 3')의 위치 1이 표 1에 개시된 19량체 표적 서열의 위치 19와 염기 쌍을 형성할 수 있는 안티센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 (5' → 3')의 위치 2가 표 1에 개시된 19량체 표적 서열의 위치 18과 염기 쌍을 형성할 수 있는 안티센스 가닥을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥 (5' → 3')의 위치 2 내지 18이 표 1에 개시된 19량체 표적 서열의 위치 18 내지 2에 위치하는 각각의 상보적인 염기 각각과 염기 쌍을 형성할 수 있는 안티센스 가닥을 포함한다.
본원에 개시된 RNAi 작용제에 대해, 안티센스 가닥 (5' 단부에서 → 3' 단부)의 위치 1의 뉴클레오티드는 APOC3 유전자에 완벽하게 상보적일 수 있거나, 또는 APOC3 유전자에 비-상보적일 수 있다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 (5' 단부에서 → 3' 단부)의 위치 1의 뉴클레오티드는 U, A, 또는 dT이다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 (5' 단부에서 → 3' 단부)의 위치 1의 뉴클레오티드는 센스 가닥과 A:U 또는 U:A 염기 쌍을 형성한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 2-18 또는 2-19의 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 5의 센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17, 1-18, 또는 2-18의 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 (i) 표 2, 표 3, 또는 표 4의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 2-18 또는 2-19의 서열을 포함하는 안티센스 가닥, 및 (ii) 표 2, 표 3, 또는 표 5의 센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17 또는 1-18의 서열을 포함하는 센스 가닥으로 구성된다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 하기 표 2에 제시된 코어 19량체 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
표 2. APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥 및 센스 가닥 코어 스트레치 염기 서열 (N = 임의의 핵염기).
Figure pct00017
Figure pct00018
Figure pct00019
표 2의 뉴클레오티드 서열을 포함하거나 그로 이루어지는 APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 변형 뉴클레오티드 또는 비변형 뉴클레오티드일 수 있다. 일부 실시양태에서, 표 2의 뉴클레오티드 서열을 포함하거나 그로 이루어지는 센스 및 안티센스 가닥 서열을 갖는 APOC3 RNAi 작용제는 모두 또는 실질적으로 모두 변형 뉴클레오티드이다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 표 2의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것과 0, 1, 2, 또는 3개의 뉴클레오티드만큼 상이하다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥은 표 2의 센스 가닥 서열 중 임의의 것과 0, 1, 2, 또는 3개의 뉴클레오티드만큼 상이하다.
본원에 사용된 바와 같이, 표 2에 개시된 서열에서 열거된 각각의 N은 임의의 및 모든 핵염기 (변형 및 비변형 뉴클레오티드 둘 다에서 발견되는 것 포함)로부터 독립적으로 선택될 수 있다. 일부 실시양태에서, 표 2에 개시된 서열에서 열거된 N 뉴클레오티드는 다른 가닥 상의 상응하는 위치의 N 뉴클레오티드에 대해 상보적인 핵염기를 갖는다. 일부 실시양태에서, 표 2에 개시된 서열에서 열거된 N 뉴클레오티드는 다른 가닥 상의 상응하는 위치의 N 뉴클레오티드에 대해 상보적이지 않은 핵염기를 갖는다. 일부 실시양태에서, 표 2에 개시된 서열에서 열거된 N 뉴클레오티드는 다른 가닥 상의 상응하는 위치의 N 뉴클레오티드와 동일한 핵염기를 갖는다. 일부 실시양태에서, 표 2에 개시된 서열에서 열거된 N 뉴클레오티드는 다른 가닥 상의 상응하는 위치의 N 뉴클레오티드와 상이한 핵염기를 갖는다.
특정 변형 APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥, 뿐만 아니라 그의 기저 비변형 핵염기 서열이 표 3 및 4에 제공된다. 특정 변형 APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥, 뿐만 아니라 그의 기저 비변형 핵염기 서열이 표 3 및 5에 제공된다. APOC3 RNAi 작용제의 형성에서, 표 3, 4, 및 5, 뿐만 아니라 상기 표 2에 열거된 각각의 기저 염기 서열 내의 각각의 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드일 수 있다.
본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥을 센스 가닥과 어닐링시킴으로써 형성된다. 표 2, 표 3, 또는 표 5에 열거된 서열을 함유하는 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4에 열거된 서열을 함유하는 임의의 안티센스 가닥과 혼성화될 수 있고, 단 2개의 서열은 인접 16, 17, 18, 19, 20, 또는 21개 뉴클레오티드 서열에 걸쳐 적어도 85% 상보성 영역을 갖는다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 표 4, 또는 표 5의 서열 중 임의의 것의 센스 가닥 및 안티센스 가닥의 핵염기 서열을 갖는 듀플렉스를 포함하거나 그로 이루어진다.
변형 뉴클레오티드를 함유하는 안티센스 가닥의 예가 표 4에 제공된다. 변형 뉴클레오티드를 함유하는 센스 가닥의 예가 표 5에 제공된다. 변형 뉴클레오티드를 함유하는 안티센스 가닥 및 센스 가닥의 추가의 예가 표 3에 제공된다.
표 3, 4, 및 5에 사용된 바와 같이, 하기의 표기법이 변형 뉴클레오티드, 표적화 기, 및 연결 기를 나타내는데 사용된다:
A = 아데노신-3'-포스페이트;
C = 시티딘-3'-포스페이트;
G = 구아노신-3'-포스페이트;
U = 우리딘-3'-포스페이트
I = 이노신-3'-포스페이트
n = 임의의 2'-OMe 변형 뉴클레오티드
a = 2'-O-메틸아데노신-3'-포스페이트
as = 2'-O-메틸아데노신-3'-포스포로티오에이트
c = 2'-O-메틸시티딘-3'-포스페이트
cs = 2'-O-메틸시티딘-3'-포스포로티오에이트
g = 2'-O-메틸구아노신-3'-포스페이트
gs = 2'-O-메틸구아노신-3'-포스포로티오에이트
t = 2'-O-메틸-5-메틸우리딘-3'-포스페이트
ts = 2'-O-메틸-5-메틸우리딘-3'-포스포로티오에이트
u = 2'-O-메틸우리딘-3'-포스페이트
us = 2'-O-메틸우리딘-3'-포스포로티오에이트
i = 2'-O-메틸이노신-3'-포스페이트
is = 2'-O-메틸이노신-3'-포스포로티오에이트
Nf = 임의의 2'-플루오로 변형 뉴클레오티드
Af = 2'-플루오로아데노신-3'-포스페이트
Afs = 2'-플루오로아데노신-3'-포스포로티오에이트
Cf = 2'-플루오로시티딘-3'-포스페이트
Cfs = 2'-플루오로시티딘-3'-포스포로티오에이트
Gf = 2'-플루오로구아노신-3'-포스페이트
Gfs = 2'-플루오로구아노신-3'-포스포로티오에이트
If = 2'-플루오로이노신-3'-포스페이트
Ifs = 2'-플루오로이노신-3'-포스포로티오에이트
Tf = 2'-플루오로-5'-메틸우리딘-3'-포스페이트
Tfs = 2'-플루오로-5'-메틸우리딘-3'-포스포로티오에이트
Uf = 2'-플루오로우리딘-3'-포스페이트
Ufs = 2'-플루오로우리딘-3'-포스포로티오에이트
dN = 임의의 2'-데옥시리보뉴클레오티드
dA = 2'-데옥시아데노신-3'-포스페이트
dAs = 2'-데옥시아데노신-3'-포스포로티오에이트
dC = 2'-데옥시시티딘-3'-포스페이트
dCs = 2'-데옥시시티딘-3'-포스포로티오에이트
dG = 2'-데옥시구아노신-3'-포스페이트
dGs = 2'-데옥시구아노신-3'-포스포로티오에이트
dT = 2'-데옥시티미딘-3'-포스페이트
dTs = 2'-데옥시티미딘-3'-포스포로티오에이트
dU = 2'-데옥시우리딘-3'-포스페이트
dUs = 2'-데옥시우리딘-3'-포스포로티오에이트
NUNA = 2',3'-세코 뉴클레오티드 모방체 (비잠금 핵염기 유사체)-3'-포스페이트
NUNAs = 2',3'-세코 뉴클레오티드 모방체 (비잠금 핵염기 유사체)-3'-포스포로티오에이트
AUNA = 2',3'-세코-아데노신-3'-포스페이트
AUNAs = 2',3'-세코-아데노신-3'-포스포로티오에이트
CUNA = 2',3'-세코-시티딘-3'-포스페이트
CUNAs = 2',3'-세코-시티딘-3'-포스포로티오에이트
GUNA = 2',3'-세코-구아노신-3'-포스페이트
GUNAs = 2',3'-세코-구아노신-3'-포스포로티오에이트
UUNA = 2',3'-세코-우리딘-3'-포스페이트
UUNAs = 2',3'-세코-우리딘-3'-포스포로티오에이트
a_2N = 표 7 참조
a_2Ns = 표 7 참조
pu_2N = 표 7 참조
pu_2Ns = 표 7 참조
NLNA = 잠금 뉴클레오티드
NfANA = 2'-F-아라비노 뉴클레오티드
NM = 2'-O-메톡시에틸 뉴클레오티드
AM = 2'-O-메톡시에틸아데노신-3'-포스페이트
AMs = 2'-O-메톡시에틸아데노신-3'-포스포로티오에이트
GM = 2'-O-메톡시에틸구아노신-3'-포스페이트
GMs = 2'-O-메톡시에틸구아노신-3'-포스포로티오에이트
TM = 2'-O-메톡시에틸티미딘-3'-포스페이트
TMs = 2'-O-메톡시에틸티미딘-3'-포스포로티오에이트
mCM = 표 7 참조
mCMs = 표 7 참조
R = 리비톨
(invdN) = 임의의 역전 데옥시리보뉴클레오티드 (3'-3' 연결된 뉴클레오티드)
(invAb) = 역전 (3'-3' 연결된) 무염기성 데옥시리보뉴클레오티드, 표 7 참조
(invAb)s = 역전 (3'-3' 연결된) 무염기성 데옥시리보뉴클레오티드-5'-포스포로티오에이트, 표 7 참조
(invn) = 임의의 역전 2'-OMe 뉴클레오티드 (3'-3' 연결된 뉴클레오티드)
s = 포스포로티오에이트 연결
sp = 표 7 참조
D2u = 표 7 참조
pD2u = 표 7 참조
vpdN = 비닐 포스포네이트 데옥시리보뉴클레오티드
(5Me-Nf) = 5'-Me, 2'-플루오로 뉴클레오티드
cPrp = 시클로프로필 포스포네이트, 표 7 참조
epTcPr = 표 7 참조
epTM = 표 7 참조
관련 분야의 통상의 기술자가 용이하게 이해할 바와 같이, 서열에 의해 (예컨대, 예를 들어, 포스포로티오에이트 연결 "s"에 의해) 달리 나타내지 않는 한, 올리고뉴클레오티드 내에 존재할 때, 뉴클레오티드 단량체는 5'-3'-포스포디에스테르 결합에 의해 상호 연결된다. 관련 기술분야의 통상의 기술자가 분명하게 이해할 바와 같이, 본원에 개시된 변형 뉴클레오티드 서열에 제시된 바와 같은 포스포로티오에이트 연결의 포함은 올리고뉴클레오티드에 전형적으로 존재하는 포스포디에스테르 연결을 대체한다 (예를 들어, 모든 뉴클레오시드간 연결을 보여주는 도 1a 내지 1i 참조). 추가로, 관련 분야의 통상의 기술자는 주어진 올리고뉴클레오티드 서열의 3' 단부의 말단 뉴클레오티드가 주어진 단량체의 각각의 3' 위치에 생체외 포스페이트 모이어티 대신 히드록실 (-OH) 기를 전형적으로 가질 것임을 용이하게 이해할 것이다. 또한, 통상의 기술자가 용이하게 이해하고 인식할 바와 같이, 본원에 도시된 포스포로티오에이트 화학 구조는 전형적으로 황 원자 상에 음이온을 나타내는 한편, 본원에 개시된 발명은 모든 포스포로티오에이트 호변이성질체 및/또는 부분입체이성질체 (예를 들어, 황 원자가 이중-결합을 갖고, 음이온이 산소 원자 상에 있는 경우)를 포괄한다. 본원에서 달리 명백하게 나타내지 않는 한, 관련 분야의 통상의 기술자의 이러한 이해가 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제 및 APOC3 RNAi 작용제의 조성물을 기재할 때 사용된다.
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제와 함께 사용된 표적화 기 및 연결 기의 특정 예가 하기 표 7에 제공된다. 보다 구체적으로, 표적화 기 및 연결 기는 하기를 포함하며, 그의 화학 구조는 하기 표 7에 제공된다: (PAZ), (NAG13), (NAG13)s, (NAG18), (NAG18)s, (NAG24), (NAG24)s, (NAG25), (NAG25)s, (NAG26), (NAG26)s, (NAG27), (NAG27)s, (NAG28), (NAG28)s, (NAG29), (NAG29)s, (NAG30), (NAG30)s, (NAG31), (NAG31)s, (NAG32), (NAG32)s, (NAG33), (NAG33)s, (NAG34), (NAG34)s, (NAG35), (NAG35)s, (NAG36), (NAG36)s, (NAG37), (NAG37)s, (NAG38), (NAG38)s, (NAG39), (NAG39)s. 각각의 센스 가닥 및/또는 안티센스 가닥은 서열의 5' 및/또는 3' 단부에 접합된, 임의의 본원에 열거된 표적화 기 또는 연결 기, 뿐만 아니라 다른 표적화 또는 연결 기를 가질 수 있다.
표 3. APOC3 RNAi 작용제 변형 안티센스 가닥 및 변형 센스 가닥 듀플렉스
Figure pct00020
Figure pct00021
Figure pct00022
표 4. APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥 서열
Figure pct00023
Figure pct00024
Figure pct00025
Figure pct00026
Figure pct00027
표 5. APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥 서열
Figure pct00028
Figure pct00029
Figure pct00030
Figure pct00031
Figure pct00032
Figure pct00033
Figure pct00034
Figure pct00035
(A2N) = 2-아미노아데닌 뉴클레오티드
본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 안티센스 가닥을 센스 가닥과 어닐링시킴으로써 형성된다. 표 2, 표 3, 또는 표 5에 열거된 서열을 함유하는 센스 가닥이 표 2, 표 3, 또는 표 4에 열거된 서열을 함유하는 임의의 안티센스 가닥과 혼성화될 수 있고, 단 2개의 서열은 인접 16, 17, 18, 19, 20, 또는 21개 뉴클레오티드 서열에 걸쳐 적어도 85% 상보성 영역을 갖는다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 안티센스 가닥은 표 4의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것과 0, 1, 2, 또는 3개의 뉴클레오티드만큼 상이하다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 센스 가닥은 표 5의 센스 가닥 서열 중 임의의 것과 0, 1, 2, 또는 3개의 뉴클레오티드만큼 상이하다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17, 2-17, 1-18, 2-18, 1-19, 2-19, 1-20, 2-20, 1-21, 2-21, 1-22, 2-22, 1-23, 2-23, 1-24, 또는 2-24, 1-25, 2-25, 1-16, 또는 2-16의 서열을 포함한다. 특정 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 4의 변형 서열 중 어느 하나의 변형 서열을 포함하거나 그로 이루어진다. 특정 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 3의 변형 서열 중 어느 하나의 변형 서열을 포함하거나 그로 이루어진다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 5의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 5의 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17, 2-17, 3-17, 4-17, 1-18, 2-18, 3-18, 4-18, 1-19, 2-19, 3-19, 4-19, 1-20, 2-20, 3-20, 4-20, 1-21, 2-21, 3-21, 4-21, 1-22, 2-22, 3-22, 4-22, 1-23, 2-23, 3-23, 4-23, 1-24, 2-24, 3-24, 4-24, 1-25, 2-25, 3-25, 4-25, 1-26, 2-26, 3-26, 또는 4-26의 서열을 포함한다. 특정 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 5의 변형 서열 중 어느 하나의 변형 서열을 포함하거나 그로 이루어진다. 특정 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥은 표 3의 변형 서열 중 어느 하나의 변형 서열을 포함하거나 그로 이루어진다.
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제의 경우, 안티센스 가닥 (5' 단부에서 → 3' 단부)의 위치 1의 뉴클레오티드는 APOC3 유전자에 완벽하게 상보적일 수 있거나, 또는 APOC3 유전자에 비-상보적일 수 있다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 (5' 단부에서 → 3' 단부)의 위치 1의 뉴클레오티드는 U, A, 또는 dT (또는 그의 변형 버전)이다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥 (5' 단부에서 → 3' 단부)의 위치 1의 뉴클레오티드는 센스 가닥과 A:U 또는 U:A 염기 쌍을 형성한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제 안티센스 가닥은 표 2 또는 표 4의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 2-18 또는 2-19의 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 센스 가닥은 표 2 또는 표 5의 센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17 또는 1-18의 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 (i) 표 2, 표 3, 또는 표 4의 안티센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 2-18 또는 2-19의 서열을 포함하는 안티센스 가닥, 및 (ii) 표 2, 표 3, 또는 표 5의 센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 (5' 단부에서 → 3' 단부) 1-17 또는 1-18의 서열을 포함하는 센스 가닥을 포함한다.
표 2, 표 3, 또는 표 5에 열거된 서열을 함유하는 센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 4에 열거된 서열을 함유하는 임의의 안티센스 가닥과 혼성화될 수 있고, 단 2개의 서열은 인접 16, 17, 18, 19, 20, 또는 21개 뉴클레오티드 서열에 걸쳐 적어도 85% 상보성 영역을 갖는다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 5의 변형 서열 중 임의의 것의 변형 서열로 이루어진 센스 가닥, 및 표 4의 변형 서열 중 임의의 것의 변형 서열로 이루어진 안티센스 가닥을 갖는다. 대표적인 서열 쌍이 표 3 및 표 6에 제시된 듀플렉스 식별 번호(Duplex ID No.)에 의해 예시된다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 본원에 제시된 듀플렉스 식별 번호 중 임의의 것에 의해 나타내어지는 듀플렉스 중 임의의 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 본원에 제시된 듀플렉스 식별 번호 중 임의의 것에 의해 나타내어지는 듀플렉스 중 임의의 것으로 이루어진다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 본원에 제시된 듀플렉스 식별 번호 중 임의의 것에 의해 나타내어지는 듀플렉스 중 임의의 것의 센스 가닥 및 안티센스 가닥 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 본원에 제시된 듀플렉스 식별 번호 중 임의의 것에 의해 나타내어지는 듀플렉스 중 임의의 것의 센스 가닥 및 안티센스 가닥 뉴클레오티드 서열 및 표적화 기 및/또는 연결 기를 포함하며, 여기서 표적화 기 및/또는 연결 기는 센스 가닥 또는 안티센스 가닥에 공유 연결된다 (즉, 접합된다). 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 본원에 제시된 듀플렉스 식별 번호 중 임의의 것에 의해 나타내어지는 듀플렉스 중 임의의 것의 센스 가닥 및 안티센스 가닥 변형 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 본원에 제시된 듀플렉스 식별 번호 중 임의의 것에 의해 나타내어지는 듀플렉스 중 임의의 것의 센스 가닥 및 안티센스 가닥 변형 뉴클레오티드 서열 및 표적화 기 및/또는 연결 기를 포함하며, 여기서 표적화 기 및/또는 연결 기는 센스 가닥 또는 안티센스 가닥에 공유 연결된다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 또는 표 6의 안티센스 가닥/센스 가닥 듀플렉스 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열을 갖는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하고, 아시알로당단백질 수용체 리간드 표적화 기를 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 또는 표 6의 안티센스 가닥/센스 가닥 듀플렉스 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열을 갖는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하고, (NAG13), (NAG13)s, (NAG18), (NAG18)s, (NAG24), (NAG24)s, (NAG25), (NAG25)s, (NAG26), (NAG26)s, (NAG27), (NAG27)s, (NAG28), (NAG28)s, (NAG29), (NAG29)s, (NAG30), (NAG30)s, (NAG31), (NAG31)s, (NAG32), (NAG32)s, (NAG33), (NAG33)s, (NAG34), (NAG34)s, (NAG35), (NAG35)s, (NAG36), (NAG36)s, (NAG37), (NAG37)s, (NAG38), (NAG38)s, (NAG39), (NAG39)s로 이루어진 군으로부터 선택된 표적화 기를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 표 7에 정의된 바와 같은 (NAG25) 또는 (NAG25)s이다. 다른 실시양태에서, 표적화 기는 표 7에 정의된 바와 같은 (NAG37) 또는 (NAG37)s이다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 또는 표 6의 듀플렉스 중 임의의 것의 안티센스 가닥 및/또는 센스 가닥 뉴클레오티드 서열 중 임의의 것의 변형 뉴클레오티드 서열을 갖는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 또는 표 6의 듀플렉스 중 임의의 것의 안티센스 가닥 및/또는 센스 가닥 뉴클레오티드 서열 중 임의의 것의 변형 뉴클레오티드 서열을 갖는 안티센스 가닥 및 센스 가닥을 포함하고, 아시알로당단백질 수용체 리간드 표적화 기를 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 또는 표 6의 듀플렉스 중 임의의 것을 포함한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표 2, 표 3, 또는 표 6의 듀플렉스 중 임의의 것으로 이루어진다.
표 6. 상응하는 센스 및 안티센스 가닥을 갖는 듀플렉스 식별 번호에 의해 확인되는 APOC3 RNAi 작용제.
Figure pct00036
Figure pct00037
Figure pct00038
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 염, 혼합 염, 또는 유리 산으로서 제조되거나 제공된다. 본원에 기재된 RNAi 작용제는, APOC3 유전자를 발현하는 세포로 전달되면, 생체내 1종 이상의 APOC3 유전자의 발현을 억제하거나 또는 녹다운시킨다.
표적화 기, 연결 기, 및 전달 비히클
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 표적화 기, 연결 기, 전달 중합체, 또는 전달 비히클을 포함하나 이에 제한되지는 않는 1개 이상의 비-뉴클레오티드 기에 접합된다. 비-뉴클레오티드 기는 RNAi 작용제의 표적화, 전달 또는 부착을 증진시킬 수 있다. 표적화 기 및 연결 기의 예가 표 7에 제공된다. 비-뉴클레오티드 기는 센스 가닥 및/또는 안티센스 가닥의 3' 및/또는 5' 단부에 공유 연결될 수 있다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 3' 및/또는 5' 단부에 연결된 비-뉴클레오티드 기를 함유한다. 일부 실시양태에서, 비-뉴클레오티드 기는 APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥의 5' 단부에 연결된다. 비-뉴클레오티드 기는 직접적으로 또는 간접적으로 RNAi 작용제에 링커/연결 기를 통해 연결될 수 있다. 일부 실시양태에서, 비-뉴클레오티드 기는 불안정성, 절단가능, 또는 가역성 결합 또는 링커를 통해 RNAi 작용제에 연결된다.
일부 실시양태에서, 비-뉴클레오티드 기는 그것이 부착된 RNAi 작용제 또는 접합체의 약동학 또는 생체분포 특성을 증진시켜 RNAi 작용제 또는 접합체의 세포- 또는 조직-특이적 분포 및 세포-특이적 흡수를 개선시킨다. 일부 실시양태에서, 비-뉴클레오티드 기는 RNAi 작용제의 세포내이입을 증진시킨다.
표적화 기 또는 표적화 모이어티는 그것이 부착된 접합체 또는 RNAi 작용제의 약동학 또는 생체분포 특성을 증진시켜 접합체 또는 RNAi 작용제의 세포-특이적 분포 및 세포-특이적 흡수를 개선시킬 수 있다. 표적화 기는 지시되는 표적에 대해 1가, 2가, 3가, 4가일 수 있거나, 또는 더 높은 결합가를 가질 수 있다. 대표적인 표적화 기는, 비제한적으로, 세포 표면 분자에 대해 친화도를 갖는 화합물, 세포 수용체 리간드, 합텐, 항체, 모노클로날 항체, 항체 단편, 및 세포 표면 분자에 대해 친화도를 갖는 항체 모방체를 포함한다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 링커, 예컨대 PEG 링커, 또는 일부 경우에 링커로서의 역할을 할 수 있는 1, 2, 또는 3개의 무염기성 및/또는 리비톨 (무염기성 리보스) 잔기를 사용하여 RNAi 작용제에 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 기는 갈락토스-유도체 클러스터를 포함한다.
5'-말단에 반응성 기, 예컨대 아민 기를 갖는 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제가 합성될 수 있다. 반응성 기는 후속해서 관련 기술분야에 전형적인 방법을 사용하여 표적화 기를 부착시키는데 사용될 수 있다.
일부 실시양태에서, 표적화 기는 아시알로당단백질 수용체 리간드를 포함한다. 본원에 사용된 아시알로당단백질 수용체 리간드는 간세포 상에서 고도로 발현되는 아시알로당단백질 수용체에 대해 친화도를 갖는 화합물을 함유하는 리간드이다. 일부 실시양태에서, 아시알로당단백질 수용체 리간드는 1개 이상의 갈락토스 유도체를 포함하거나 그로 이루어진다. 본원에 사용된 용어 갈락토스 유도체는 갈락토스, 및 아시알로당단백질 수용체에 대해 갈락토스의 친화도와 동등하거나 또는 더 큰 친화도를 갖는 갈락토스의 유도체 둘 다를 포함한다. 갈락토스 유도체는 갈락토스, 갈락토사민, N-포르밀갈락토사민, N-아세틸-갈락토사민, N-프로피오닐-갈락토사민, N-n-부타노일-갈락토사민, 및 N-이소-부타노일갈락토사민을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다 (예를 들어: 문헌 [S.T. Iobst and K. Drickamer, J.B.C., 1996, 271, 6686] 참조). 올리고뉴클레오티드 및 다른 분자의 간으로의 생체내 표적화에 유용한 갈락토스 유도체, 및 갈락토스 유도체의 클러스터는 관련 기술분야에 널리 공지되어 있다 (예를 들어, 문헌 [Baenziger and Fiete, 1980, Cell, 22, 611-620; Connolly et al., 1982, J. Biol. Chem., 257, 939-945] 참조).
갈락토스 유도체는 간세포의 표면 상에서 발현되는 아시알로당단백질 수용체에 결합하는 것을 통해 분자를 간세포로 생체내 표적화하는데 사용되어 왔다. 아시알로당단백질 수용체 리간드가 아시알로당단백질 수용체(들)에 결합하는 것은 간세포로의 세포-특이적 표적화 및 분자의 간세포 내로의 세포내이입을 용이하게 한다. 아시알로당단백질 수용체 리간드는 단량체 (예를 들어, 단일 갈락토스 유도체를 가짐) 또는 다량체 (예를 들어, 다중 갈락토스 유도체를 가짐)일 수 있다. 갈락토스 유도체 또는 갈락토스 유도체 클러스터는 관련 기술분야에 공지된 방법을 사용하여 RNAi 작용제의 센스 또는 안티센스 가닥의 3' 또는 5' 단부에 부착될 수 있다. 표적화 기, 예컨대 갈락토스 유도체 클러스터의 제조는, 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 번호 WO 2018/044350 (애로우헤드파마슈티컬스인코포레이티드(Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.)), 및 국제 특허 출원 공개 번호 WO 2017/156012 (애로우헤드파마슈티컬스인코포레이티드)에 기재되어 있고, 둘 다의 내용은 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.
본원에 사용된 갈락토스 유도체 클러스터는 2 내지 4개의 말단 갈락토스 유도체를 갖는 분자를 포함한다. 말단 갈락토스 유도체는 그의 C-1 탄소를 통해 분자에 부착된다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 갈락토스 유도체 삼량체 (또한 3-안테나 갈락토스 유도체 또는 3가 갈락토스 유도체로도 지칭됨)이다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 3개의 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 갈락토스 유도체 사량체 (또한 4-안테나 갈락토스 유도체 또는 4가 갈락토스 유도체로도 지칭됨)이다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 4개의 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다.
본원에 사용된 갈락토스 유도체 삼량체는 각각 중심 분지점에 연결된 3개의 갈락토스 유도체를 함유한다. 본원에 사용된 갈락토스 유도체 사량체는 각각 중심 분지점에 연결된 4개의 갈락토스 유도체를 함유한다. 갈락토스 유도체는 사카라이드의 C-1 탄소를 통해 중심 분지점에 부착될 수 있다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체는 링커 또는 스페이서를 통해 분지점에 연결된다. 일부 실시양태에서, 링커 또는 스페이서는 가요성 친수성 스페이서, 예컨대 PEG 기이다 (예를 들어, 미국 특허 번호 5,885,968; 문헌 [Biessen et al. J. Med. Chem. 1995 Vol. 39 p. 1538-1546] 참조). 일부 실시양태에서, PEG 스페이서는 PEG3 스페이서이다. 분지점은 3개의 갈락토스 유도체의 부착을 허용하고 추가로 RNAi 작용제에 대한 분지점의 부착을 허용하는 임의의 소분자일 수 있다. 분지점 기의 예는 디-리신 또는 디-글루타메이트이다. RNAi 작용제에 대한 분지점의 부착은 링커 또는 스페이서를 통해 발생할 수 있다. 일부 실시양태에서, 링커 또는 스페이서는 비제한적으로 PEG 스페이서와 같은 가요성 친수성 스페이서를 포함한다. 일부 실시양태에서, 링커는 경질 링커, 예컨대 시클릭 기를 포함한다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체는 N-아세틸-갈락토사민을 포함하거나 그로 이루어진다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는 갈락토스 유도체 사량체로 구성되고, 이는 예를 들어 N-아세틸-갈락토사민 사량체일 수 있다.
본 개시내용의 실시양태는 APOC3 RNAi 작용제를 간 세포로 생체내 전달하기 위한 제약 조성물을 포함한다. 이러한 제약 조성물은, 예를 들어, 갈락토스 유도체 클러스터에 접합된 APOC3 RNAi 작용제를 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 갈락토스 유도체 클러스터는, 예를 들어 N-아세틸-갈락토사민 삼량체일 수 있는 갈락토스 유도체 삼량체, 또는 예를 들어 N-아세틸-갈락토사민 사량체일 수 있는 갈락토스 유도체 사량체로 구성된다.
표적화 기는 표 7에 정의된 바와 같은 (PAZ), (NAG13), (NAG13)s, (NAG18), (NAG18)s, (NAG24), (NAG24)s, (NAG25), (NAG25)s, (NAG26), (NAG26)s, (NAG27)¸ (NAG27)s, (NAG28)¸ (NAG28)s, (NAG29)¸ (NAG29)s, (NAG30)¸ (NAG30)s, (NAG31), (NAG31)s, (NAG32), (NAG32)s, (NAG33), (NAG33)s, (NAG34), (NAG34)s, (NAG35), (NAG35)s, (NAG36), (NAG36)s, (NAG37), (NAG37)s, (NAG38), (NAG38)s, (NAG39),, 및 (NAG39)s를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 갈락토스 클러스터 표적화 리간드를 포함한 다른 표적화 기가 관련 기술분야에 공지되어 있다.
일부 실시양태에서, 연결 기가 RNAi 작용제에 접합된다. 연결 기는 작용제가 표적화 기 또는 전달 중합체 또는 전달 비히클에 공유 연결되는 것을 용이하게 한다. 연결 기는 RNAi 작용제 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 3' 또는 5' 단부에 연결될 수 있다. 일부 실시양태에서, 연결 기는 RNAi 작용제 센스 가닥에 연결된다. 일부 실시양태에서, 연결 기는 RNAi 작용제 센스 가닥의 5' 또는 3' 단부에 접합된다. 일부 실시양태에서, 연결 기는 RNAi 작용제 센스 가닥의 5' 단부에 접합된다. 연결 기의 예는 반응성 기 예컨대 1급 아민 및 알킨, 알킬 기, 무염기성 뉴클레오티드, 리비톨 (무염기성 리보스), 및/또는 PEG 기를 포함할 수 있으나 이에 제한되지는 않는다.
링커 또는 연결 기는 하나의 화학적 기 (예컨대 RNAi 작용제) 또는 관심 절편을 또 다른 화학적 기 (예컨대 표적화 기 또는 전달 중합체) 또는 관심 절편에 1개 이상의 공유 결합을 통해 연결하는 2개의 원자 사이의 이음이다. 불안정성 연결은 불안정성 결합을 함유한다. 연결은 2개의 결합된 원자 사이의 거리를 증가시키는 스페이서를 임의로 포함할 수 있다. 스페이서는 연결에 가요성 및/또는 길이를 추가로 부가할 수 있다. 스페이서는 알킬 기, 알케닐 기, 알키닐 기, 아릴 기, 아르알킬 기, 아르알케닐 기, 및 아르알키닐 기를 포함할 수 있으나 이에 제한되지는 않고; 이들 각각은 1개 이상의 헤테로원자, 헤테로사이클, 아미노산, 뉴클레오티드, 및 사카라이드를 함유할 수 있다. 스페이서 기는 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 상기 목록은 설명의 범주를 제한하도록 의도되지 않는다.
표 2, 3, 4, 또는 5에 열거된 APOC3 RNAi 작용제 뉴클레오티드 서열 중 임의의 것은, 변형된 것이든 또는 비변형된 것이든, 3' 또는 5' 표적화 기 또는 연결 기를 함유할 수 있다. 3' 또는 5' 표적화 기 또는 연결 기를 함유하는, 표 4 또는 5에 열거된 APOC3 RNAi 작용제 서열 중 임의의 것은 대안적으로 3' 또는 5' 표적화 기 또는 연결 기를 함유하지 않을 수 있거나, 또는 표 7에 도시된 것을 포함하나 이에 제한되지는 않는 상이한 3' 또는 5' 표적화 기 또는 연결 기를 함유할 수 있다. 표 2, 표 3, 또는 표 6에 열거된 APOC3 RNAi 작용제 듀플렉스 중 임의의 것은, 변형된 것이든 또는 비변형된 것이든, 표 7에 도시된 것을 포함하나 이에 제한되지는 않는 표적화 기 또는 연결 기를 추가로 포함할 수 있고, 표적화 기 또는 연결 기는 APOC3 RNAi 작용제 듀플렉스의 센스 가닥 또는 안티센스 가닥의 3' 또는 5' 말단에 부착될 수 있다.
표적화 기 및 연결 기의 예가 표 7에 제공된다. 표 5는 5' 또는 3' 단부에 연결된 표적화 기 또는 연결 기를 갖는 APOC3 RNAi 작용제 센스 가닥의 여러 실시양태를 제공한다.
표 7. 다양한 변형 뉴클레오티드, 표적화 기, 및 연결 기를 나타내는 구조.
Figure pct00039
Figure pct00040
Figure pct00041
Figure pct00042
Figure pct00043
Figure pct00044
Figure pct00045
Figure pct00046
Figure pct00047
Figure pct00048
Figure pct00049
Figure pct00050
Figure pct00051
Figure pct00052
Figure pct00053
Figure pct00054
Figure pct00055
Figure pct00056
표 7의 상기 구조 각각에서, 상기 구조 및 본원에 제공된 설명의 관점에서 부착에 대해 관련 기술분야의 통상의 기술자가 이해하는 바와 같이, NAG는 N-아세틸-갈락토사민 또는 또 다른 갈락토스 유도체를 포함한다. 예를 들어, 일부 실시양태에서, 표 7에 제공된 구조 내의 NAG는 하기 구조에 의해 나타내어진다:
Figure pct00057
각각의 (NAGx)는 포스페이트 기 ((NAG25), (NAG30), 및 (NAG31)에서와 같음), 또는 포스포로티오에이트 기 ((NAG25)s, (NAG29)s, (NAG30)s, (NAG31)s, 또는 (NAG37)s에서와 같음), 또는 또 다른 연결 기를 통해 APOC3 RNAi 작용제에 부착될 수 있다.
Figure pct00058
관련 기술분야에 공지되어 있는 다른 연결 기가 사용될 수 있다.
일부 실시양태에서, 전달 비히클이 RNAi 작용제를 세포 또는 조직으로 전달하는데 사용될 수 있다. 전달 비히클은 RNAi 작용제를 세포 또는 조직으로 전달하는 것을 개선시키는 화합물이다. 전달 비히클은 중합체, 예컨대 양친매성 중합체, 막 활성 중합체, 펩티드, 멜리틴 펩티드, 멜리틴-유사 펩티드 (MLP), 지질, 가역적 변형 중합체 또는 펩티드, 또는 가역적 변형 막 활성 폴리아민을 포함하거나 그로 이루어질 수 있지만, 이에 제한되지는 않는다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제는 지질, 나노입자, 중합체, 리포솜, 미셀, DPC 또는 관련 기술분야에서 이용가능한 다른 전달 시스템과 조합될 수 있다. RNAi 작용제는 또한 표적화 기, 지질 (콜레스테롤 및 콜레스테릴 유도체를 포함하나 이에 제한되지는 않음), 나노입자, 중합체, 리포솜, 미셀, DPC (예를 들어, WO 2000/053722, WO 2008/0022309, WO 2011/104169, 및 WO 2012/083185, WO 2013/032829, WO 2013/158141 참조, 이는 각각 본원에 참조로 포함됨), 또는 관련 기술분야에서 이용가능한 다른 전달 시스템에 화학적으로 접합될 수도 있다.
제약 조성물 및 제제
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 제약 조성물 또는 제제로서 제조될 수 있다. 일부 실시양태에서, 제약 조성물은 적어도 1종의 APOC3 RNAi 작용제를 포함한다. 이러한 제약 조성물은 표적 세포, 세포 군, 조직 또는 유기체에서의 표적 mRNA의 발현의 억제에서 특히 유용하다. 제약 조성물은 표적 mRNA의 수준의 감소 또는 표적 유전자의 발현의 억제가 이로울 질환 또는 장애를 갖는 대상체를 치료하는데 사용될 수 있다. 제약 조성물은 표적 mRNA의 수준의 감소 또는 표적 유전자의 발현의 억제가 이로울 질환, 장애, 또는 상태가 발생할 위험이 있는 대상체를 치료하는데 사용될 수 있다. 한 실시양태에서, 방법은 본원에 기재된 바와 같은 표적화 리간드에 연결된 APOC3 RNAi 작용제를 치료될 대상체에게 투여하는 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, 1종 이상의 제약상 허용되는 부형제 (비히클, 담체, 희석제, 및/또는 전달 중합체 포함)가 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물에 첨가되고, 그에 의해 인간을 포함하는 대상체로의 생체내 전달에 적합한 제약 제제가 형성된다.
APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물, 및 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제의 치료 유효량을 대상체에게 투여하여 대상체에서 APOC3 mRNA의 발현을 억제하는 것을 포함하는 본원에 개시된 방법은 세포, 세포 군, 세포 군, 조직 또는 대상체에서 표적 mRNA의 수준을 감소시킬 수 있다. 일부 실시양태에서, 대상체는 이전에 표적화된 세포 또는 조직에서 표적 유전자의 병원성 상향조절을 갖는 것으로서 확인되었다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 기재된 제약 조성물은 대상체에서 상승된 TG 수준 및/또는 APOC3 mRNA의 과다발현과 연관된 임상 제시를 치료하거나 관리하기 위해 사용된다. 일부 실시양태에서, 제약 조성물 중 1종 이상의 치료 (예방 포함) 유효량이 이러한 치료 (증상, 질환, 또는 장애의 방지 또는 관리 포함)를 필요로 하는 대상체에게 투여된다. 일부 실시양태에서, 개시된 APOC3 RNAi 작용제 중 임의의 것의 투여는 대상체에서 질환 증상의 수, 중증도 및/또는 빈도를 감소시키는데 사용될 수 있다.
APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 기재된 제약 조성물은 APOC3 mRNA의 발현의 감소 또는 억제가 이로울 질환 또는 장애를 갖는 대상체에서 적어도 1종의 증상을 치료하는데 사용될 수 있다. 일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 1종 이상의 제약 조성물의 치료 유효량을 대상체에게 투여하고, 그에 의해 증상이 치료된다. 다른 실시양태에서, 1종 이상의 APOC3 RNAi 작용제의 예방 유효량을 대상체에게 투여하고, 그에 의해 적어도 1종의 증상이 방지된다.
투여 경로는 APOC3 RNAi 작용제가 신체와 접촉되는 경로이다. 일반적으로, 포유동물의 치료를 위해 약물 및 올리고뉴클레오티드 및 핵산을 투여하는 방법은 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 본원에 기재된 조성물의 투여에 적용될 수 있다. 본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 특정한 경로에 적절하게 맞춰진 제제 중에서 임의의 적절한 경로를 통해 투여될 수 있다. 따라서, 본원에 기재된 제약 조성물은 주사에 의해, 예를 들어, 정맥내로, 근육내로, 피내로, 피하로, 관절내로, 또는 복강내로 투여될 수 있다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 제약 조성물은 피하 주사를 통해 투여된다.
본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물은 관련 기술분야에 공지되어 있는 올리고뉴클레오티드 전달 기술을 사용하여 세포, 세포 군, 조직, 또는 대상체로 전달될 수 있다. 일반적으로, 핵산 분자를 (시험관내 또는 생체내) 전달하기 위해 관련 기술분야에 인지되어 있는 임의의 적합한 방법이 본원에 기재된 조성물과 함께 사용하기 위해 개조될 수 있다. 예를 들어, 전달은 국부 투여 (예를 들어, 직접 주사, 이식, 또는 국소 투여), 전신 투여, 또는 피하, 정맥내, 복강내, 또는 비경구 경로, 예컨대 두개내 (예를 들어, 뇌실내, 실질내 및 척수강내), 근육내, 경피, 기도 (에어로졸), 비강, 경구, 직장 또는 국소 (협측 및 설하 포함) 투여에 의해 이루어질 수 있다. 특정 실시양태에서, 조성물은 피하 또는 정맥내 주입 또는 주사에 의해 투여된다.
따라서, 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 제약 조성물은 1종 이상의 제약상 허용되는 부형제를 포함한다. 본원에 기재된 제약 조성물은 대상체에게 투여하기 위해 제제화된다.
본원에 사용된 바와 같이, 제약 조성물 또는 의약은 약리학상 유효량의 기재된 치료 화합물 중 적어도 1종 및 1종 이상의 제약상 허용되는 부형제를 포함한다. 제약상 허용되는 부형제 (부형제)는 약물 전달 시스템에 의도적으로 포함되는, 활성 제약 성분 (API, 치료 제품, 예를 들어, APOC3 RNAi 작용제) 이외의 물질이다. 부형제는 의도된 투여량에서 치료 효과를 발휘하지 않거나 또는 발휘하도록 의도되지 않는다. 부형제는 a) 제조 동안 약물 전달 시스템의 가공을 돕고/거나, b) API의 안정성, 생체이용률 또는 환자 허용성을 보호, 지지 또는 증진시키고/거나, c) 제품 식별을 보조하고/거나, d) 저장 또는 사용 동안 API의 전반적인 안전성, 유효성 또는 전달의 임의의 다른 속성을 증진시키는 작용을 할 수 있다. 제약상 허용되는 부형제는 불활성 물질일 수 있거나 또는 불활성 물질이 아닐 수 있다.
부형제는 흡수 증진제, 부착방지제, 소포제, 항산화제, 결합제, 완충제, 담체, 코팅제, 색소, 전달 증진제, 전달 중합체, 덱스트란, 덱스트로스, 희석제, 붕해제, 유화제, 증량제, 충전제, 향미제, 활택제, 함습제, 윤활제, 오일, 중합체, 보존제, 염수, 염, 용매, 당, 현탁화제, 지속 방출 매트릭스, 감미제, 증점제, 장성 작용제, 비히클, 발수제, 및 습윤제를 포함하나 이에 제한되지는 않는다.
주사가능한 용도에 적합한 제약 조성물은 멸균 수용액 (수용성인 경우) 또는 분산액 및 멸균 주사가능한 용액 또는 분산액의 즉석 제조를 위한 멸균 분말을 포함한다. 정맥내 투여를 위해, 적합한 담체는 생리 염수, 정박테리아수, 크레모포르(Cremophor)® ELTM (바스프(BASF), 뉴저지주 파시파니) 또는 포스페이트 완충 염수 (PBS)를 포함한다. 적합한 담체는 제조 및 저장 조건 하에 안정적이어야 하고, 미생물 예컨대 박테리아 및 진균의 오염 작용에 대해 보존되어야 한다. 담체는, 예를 들어 물, 에탄올, 폴리올 (예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 및 액체 폴리에틸렌 글리콜), 및 그의 적합한 혼합물을 함유하는 용매 또는 분산 매질일 수 있다. 예를 들어, 코팅 예컨대 레시틴의 사용, 분산액의 경우 필요한 입자 크기의 유지, 및 계면활성제의 사용에 의해, 적절한 유동성이 유지될 수 있다. 다수의 경우에, 등장화제, 예를 들어, 당, 폴리알콜 예컨대 만니톨, 소르비톨 및 염화나트륨을 조성물 내에 포함시키는 것이 바람직할 것이다. 흡수를 지연시키는 작용제, 예를 들어, 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴을 포함시킴으로써, 주사가능한 조성물의 지속 흡수가 이루어질 수 있다.
필요한 양의 활성 화합물을 필요에 따라 상기 열거된 성분 중 하나 또는 그의 조합물과 함께 적절한 용매 중에 혼입시킨 후 여과 멸균함으로써 멸균 주사가능한 용액을 제조할 수 있다. 일반적으로, 활성 화합물을 기본 분산 매질 및 상기 열거된 것들로부터의 필요한 다른 성분을 함유하는 멸균 비히클 내로 혼입시킴으로써 분산액이 제조된다. 멸균 주사가능한 용액의 제조를 위한 멸균 분말의 경우, 제조 방법은 활성 성분 플러스 임의의 추가의 목적하는 성분의 분말이 그의 사전 멸균-여과된 용액으로부터 산출되는 진공 건조 및 동결 건조를 포함한다.
관절내 투여에 적합한 제제는 미세결정질 형태, 예를 들어, 수성 미세결정질 현탁액의 형태일 수 있는 약물의 멸균 수성 제제의 형태일 수 있다. 리포솜 제제 또는 생분해성 중합체 시스템이 관절내 및 안구적 투여 둘 다를 위한 약물을 제시하는데 또한 사용될 수 있다.
활성 화합물은 신체로부터의 급속한 제거로부터 화합물을 보호할 담체, 예컨대 이식물 및 마이크로캡슐화 전달 시스템을 포함하는 제어 방출 제제와 함께 제조될 수 있다. 생분해성, 생체적합성 중합체, 예컨대 에틸렌 비닐 아세테이트, 폴리무수물, 폴리글리콜산, 콜라겐, 폴리오르토에스테르, 및 폴리락트산이 사용될 수 있다. 이러한 제제의 제조 방법은 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 명백할 것이다. 리포솜 현탁액 또한 제약상 허용되는 담체로서 사용될 수 있다. 이들은, 예를 들어, 미국 특허 번호 4,522,811에 기재된 바와 같이, 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지되어 있는 방법에 따라 제조될 수 있다.
APOC3 RNAi 작용제는 투여 용이성 및 투여량 균일성을 위해 투여 단위 형태의 조성물 중에 제제화될 수 있다. 투여 단위 형태는 치료될 대상체에 대한 단위 투여량으로서 적합화된 물리적 이산 단위를 지칭하며; 각각의 단위는 필요한 제약 담체와 함께 목적하는 치료 효과를 일으키도록 계산된 미리 결정된 양의 활성 화합물을 함유한다. 개시내용의 투여 단위 형태에 대한 상세사항은 활성 화합물의 고유한 특징 및 달성될 치료 효과, 및 이러한 활성 화합물을 개체의 치료를 위해 배합하는 분야에 고유한 제한사항에 의해 좌우되고, 이에 직접적으로 의존적이다.
제약 조성물은 제약 조성물에서 통상적으로 발견되는 다른 추가의 성분을 함유할 수 있다. 이러한 추가의 성분은 항소양제, 수렴제, 국부 마취제, 진통제, 항히스타민제 또는 항염증제 (예를 들어, 아세트아미노펜, NSAID, 디펜히드라민 등)를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 본원에 정의된 RNAi 작용제를 발현하거나 또는 포함하는 세포, 조직, 또는 단리된 기관이 "제약 조성물"로서 사용될 수 있는 것으로 또한 구상된다. 본원에 사용된 "약리학상 유효량", "치료 유효량", 또는 간단히 "유효량"은 약리학적, 치료 또는 예방 결과를 일으키는 RNAi 작용제의 양을 지칭한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 방법은 본원에 개시된 RNAi 작용제를 투여하는 것에 더하여 제2 치료제 또는 치료를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 제2 치료제는 또 다른 APOC3 RNAi 작용제 (예를 들어, APOC3 표적 내의 상이한 서열을 표적화하는 APOC3 RNAi 작용제)이다. 다른 실시양태에서, 제2 치료제는 소분자 약물, 항체, 항체 단편, 또는 압타머일 수 있다.
일반적으로, 활성 화합물의 유효량은 약 0.1 내지 약 100 mg/kg 체중/일, 예를 들어, 약 1.0 내지 약 50 mg/kg 체중/일의 범위일 것이다. 일부 실시양태에서, 활성 화합물의 유효량은 용량당 약 0.25 내지 약 5 mg/kg 체중의 범위일 것이다. 일부 실시양태에서, 활성 성분의 유효량은 용량당 약 0.5 내지 약 4 mg/kg 체중의 범위일 것이다. 투여되는 양은 또한 환자의 전반적 건강 상태, 전달되는 화합물의 상대 생물학적 효능, 약물의 제제, 제제 내의 부형제의 존재 및 유형, 및 투여 경로와 같은 변수에 의존적일 수 있다. 또한, 일부 경우에 목적하는 혈액 수준 또는 조직 수준을 신속하게 달성하기 위해 상기의 상위 수준 너머로 증가될 수 있거나, 또는, 일부 경우에 초기 투여량이 최적값보다 더 적을 수 있다는 것을 이해하여야 한다.
질환 치료를 위해, 또는 질환 치료를 위한 의약 또는 조성물의 형성을 위해, APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 본원에 기재된 제약 조성물은 부형제와, 또는 제2 또는 다른 RNAi 작용제, 소분자 약물, 항체, 항체 단편, 펩티드 및/또는 압타머를 포함하나 이에 제한되지는 않는 제2 치료제 또는 치료와 조합될 수 있다.
기재된 APOC3 RNAi 작용제는, 제약상 허용되는 부형제 또는 아주반트에 첨가되는 경우, 키트, 용기, 팩 또는 분배기 내로 포장될 수 있다. 본원에 기재된 제약 조성물은 사전-충전된 주사기 또는 바이알에 포장될 수 있다.
치료 방법 및 발현 억제
본원에 개시된 APOC3 RNAi 작용제는 화합물의 투여가 이로울 질환 또는 장애를 갖는 대상체 (예를 들어, 인간 또는 다른 포유동물)를 치료하는데 사용될 수 있다. 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 RNAi 작용제는 APOC3 mRNA 발현의 감소 및/또는 억제가 이로울 질환 또는 장애를 갖는 대상체 (예를 들어, 인간), 예를 들어 비만, 고지혈증, 고트리글리세리드혈증, 비정상적 지질 및/또는 콜레스테롤 대사, 아테롬성동맥경화증, 심혈관 질환, 관상 동맥 질환, 고트리글리세리드혈증 매개된 췌장염, 대사 증후군, 제II형 당뇨병, 가족성 킬로마이크론혈증 증후군, 가족성 부분 지방이영양증, 및/또는 다른 대사-관련 장애 및 질환을 진단받았거나, 그와 관련된 증상이 발생할 위험이 있는 대상체를 치료하는데 사용될 수 있다.
어느 1종 이상의 RNAi 작용제의 치료 유효량이 대상체에게 투여된다. 대상체는 인간, 환자, 또는 인간 환자일 수 있다. 대상체는 성인, 청소년, 아동 또는 유아일 수 있다. 본원에 기재된 제약 조성물의 투여가 인간 또는 동물에 대해 이루어질 수 있다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3-관련 질환 또는 장애를 갖는 대상체를 치료하기 위해 사용된다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자 발현의 감소 및/또는 억제로부터 이익을 얻을 대상체를 치료하기 위해 사용된다. 일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자 발현에 의해 적어도 부분적으로 매개되는 적어도 1종의 증상 또는 병리학적 상태를 치료하기 위해 (예방상을 포함) 사용된다. 기재된 RNAi 작용제 중 어느 1종 이상의 치료 유효량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시양태에서, 기재된 RNAi 작용제 중 어느 1종 이상의 예방 유효량이 대상체에게 투여되고, 그에 의해 적어도 1종의 증상이 방지된다.
특정 실시양태에서, 본 발명은 적어도 부분적으로 APOC3 발현에 의해 매개되는 질환, 장애, 상태 또는 병리학적 상태의 치료를 필요로 하는 환자에게 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제 중 임의의 것을 투여하는 것을 포함하는, 상기 환자에서 적어도 부분적으로 APOC3 발현에 의해 매개되는 질환, 장애, 상태 또는 병리학적 상태를 치료하는 방법을 제공한다.
일부 실시양태에서, APOC3 RNAi 작용제는 APOC3-관련 질환 또는 장애를 갖는 대상체의 임상 제시를 치료하거나 관리하기 위해 사용된다. 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제 또는 APOC3 RNAi 작용제-함유 조성물 중 1종 이상의 치료 유효량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시양태에서, 방법은 본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제를 포함하는 조성물을 치료될 대상체에게 투여하는 것을 포함한다.
일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제가 투여되는 대상체에서의 APOC3 유전자의 유전자 발현 수준 및/또는 mRNA 수준은 APOC3 RNAi 작용제가 투여되기 전의 대상체 또는 APOC3 RNAi 작용제가 제공되지 않은 대상체에 비해 적어도 약 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 99% 초과만큼 감소된다. 대상체에서의 유전자 발현 수준 및/또는 mRNA 수준은 대상체의 세포, 세포 군, 및/또는 조직에서 감소된다.
일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제가 투여된 대상체에서의 APOC3의 단백질 수준은 APOC3 RNAi 작용제가 투여되기 전의 대상체 또는 APOC3 RNAi 작용제가 제공되지 않은 대상체에 비해 적어도 약 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 99% 초과만큼 감소된다. 대상체에서의 단백질 수준은 대상체의 세포, 세포 군, 조직, 혈액 및/또는 다른 체액에서 감소된다.
일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제가 투여된 대상체에서의 트리글리세리드 (TG) 수준은 APOC3 RNAi 작용제가 투여되기 전의 대상체 또는 APOC3 RNAi 작용제가 제공되지 않은 대상체에 비해 적어도 약 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 99% 초과만큼 감소된다. 대상체에서의 TG 수준은 대상체의 세포, 세포 군, 조직, 혈액 및/또는 다른 체액에서 감소될 수 있다.
일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제가 투여된 대상체에서의 총 콜레스테롤 수준은 APOC3 RNAi 작용제가 투여되기 전의 대상체 또는 APOC3 RNAi 작용제가 제공되지 않은 대상체에 비해 적어도 약 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 99% 초과만큼 감소된다. 일부 실시양태에서, 기재된 APOC3 RNAi 작용제가 투여된 대상체에서의 저밀도 지단백질 (LDL) 콜레스테롤 수준은 APOC3 RNAi 작용제가 투여되기 전의 대상체 또는 APOC3 RNAi 작용제가 제공되지 않은 대상체에 비해 적어도 약 10%, 20%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%,, 또는 99% 초과만큼 감소된다. 대상체에서의 총 콜레스테롤 수준 및/또는 LDL 콜레스테롤 수준은 대상체의 세포, 세포 군, 조직, 혈액 및/또는 다른 체액에서 감소될 수 있다.
유전자 발현, mRNA, APOC3 단백질 수준, TG 수준, 콜레스테롤 수준, 및 LDL 콜레스테롤 수준의 감소는 관련 기술분야에 공지된 임의의 방법에 의해 평가될 수 있다. 본원에 사용된 바와 같이, APOC3 mRNA 수준 및/또는 단백질 수준의 감소 또는 저하는 본원에서 APOC3의 감소 또는 저하 또는 APOC3의 발현을 억제하거나 감소시키거나 또는 녹다운시키는 것을 총괄적으로 지칭된다. 본원에 제시된 실시예는 APOC3 유전자 발현의 억제를 평가하기 위한 공지된 방법을 예시한다.
세포, 조직, 기관 및 비-인간 유기체
본원에 기재된 APOC3 RNAi 작용제 중 적어도 1종을 포함하는 세포, 조직, 기관, 및 비-인간 유기체가 고려된다. 세포, 조직, 기관, 또는 비-인간 유기체는 RNAi 작용제를 세포, 조직, 기관, 또는 비-인간 유기체로 전달함으로써 만들어진다.
상기 제공된 실시양태 및 항목이 이제 하기의 비제한적 예와 함께 예시된다.
실시예
실시예 1. APOC3 RNAi 작용제의 합성.
상기 표 3 및 표 6에 제시된 APOC3 RNAi 작용제 듀플렉스를 하기 일반적 절차에 따라 합성하였다:
A. 합성. APOC3 RNAi 작용제의 센스 및 안티센스 가닥을 올리고뉴클레오티드 합성에 사용되는 고체 상 상에서 포스포르아미다이트 기술에 따라 합성하였다. 규모에 따라, 머메이드96E(MerMade96E)® (바이오오토메이션(Bioautomation)), 머메이드12® (바이오오토메이션), 또는 OP 파일럿 100(OP Pilot 100) (지이 헬스케어(GE Healthcare))을 사용하였다. 제어된 세공 유리 (CPG, 500 Å 또는 600Å, 미국 펜실베니아주 애스톤 소재의 프라임 신테시스(Prime Synthesis)로부터 수득됨)로 제조된 고체 지지체 상에서 합성을 수행하였다. 모든 RNA 및 2'-변형 RNA 포스포르아미다이트는 써모 피셔 사이언티픽(Thermo Fisher Scientific) (미국 위스콘신주 밀워키)에서 구입하였다. 구체적으로, 하기 2'-O-메틸 포스포르아미다이트를 사용하였다: (5'-O-디메톡시트리틸-N6-(벤조일)-2'-O-메틸-아데노신-3'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필아미노) 포스포르아미다이트, 5'-O-디메톡시-트리틸-N4-(아세틸)-2'-O-메틸-시티딘-3'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필-아미노) 포스포르아미다이트, (5'-O-디메톡시트리틸-N2-(이소부티릴)-2'-O-메틸-구아노신-3'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필아미노) 포스포르아미다이트, 및 5'-O-디메톡시트리틸-2'-O-메틸-우리딘-3'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필아미노) 포스포르아미다이트. 2'-데옥시-2'-플루오로-포스포르아미다이트는 2'-O-메틸 아미다이트와 동일한 보호기를 보유하였다. 5'-디메톡시트리틸-2'-O-메틸-이노신-3'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필아미노) 포스포르아미다이트는 글렌 리서치(Glen Research) (버지니아주) 또는 혼진 바이오테크(Hongene Biotech)에서 구입하였다. 역전 무염기성 (3'-O-디메톡시트리틸-2'-데옥시리보스-5'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필아미노) 포스포르아미다이트는 켐진스(ChemGenes) (미국 매사추세츠주 윌밍톤)에서 구입하였다. 5'-(4,4'-디메톡시트리틸)-2',3'-세코-우리딘, 2'-벤조일-3'-[(2- 시아노에틸)-(N,N-디이소프로필)]-포스포르아미다이트를 또한 써모 피셔 사이언티픽 또는 혼진 바이오테크에서 구입하였다. 5'-O-디메톡시트리틸-N2,N6-(페녹시아세테이트)-2'-O-메틸-디아미노퓨린-3'-O-(2-시아노에틸-N,N-디이소프로필아미노) 포스포르아미다이트는 켐진스 또는 혼진 바이오테크에서 입수하였다.
표적화 리간드 함유 포스포르아미다이트를 무수 디클로로메탄 또는 무수 아세토니트릴 (50 mM)에 용해시킨 한편, 모든 다른 아미다이트를 무수 아세토니트릴 (50 mM) 또는 무수 디메틸포름아미드에 용해시키고, 분자체 (3Å)를 첨가하였다. 5-벤질티오-1H-테트라졸 (BTT, 아세토니트릴 중 250 mM) 또는 5-에틸티오-1H-테트라졸 (ETT, 아세토니트릴 중 250 mM)을 활성화제 용액으로서 사용하였다. 커플링 시간은 12분 (RNA), 15분 (표적화 리간드), 90초 (2'OMe), 및 60초 (2'F)였다. 포스포로티오에이트 연결을 도입하기 위해, 무수 아세토니트릴 중 3-페닐 1,2,4-디티아졸린-5-온 (POS, 미국 매사추세츠주 레민스터 소재의 폴리오르그, 인크.(PolyOrg, Inc.)로부터 입수함)의 100 mM 용액을 사용하였다. 어떠한 표적화 리간드도 존재하지 않는 "네이키드" RNAi 작용제로서 구체적으로 확인되지 않는 한, 하기 실시예에서 합성되고 시험된 APOC3 RNAi 작용제 듀플렉스 각각은 표 7에 나타내어진 표적화 리간드 화학 구조의 "NAG"로서 N-아세틸-갈락토사민을 사용하였다.
B. 지지체 결합된 올리고머의 절단 및 탈보호. 고체 상 합성의 종료 후, 건조된 고체 지지체를 40 중량%의 물 중 메틸아민 및 28% 수산화암모늄 용액 (알드리치(Aldrich))의 1:1 부피 용액으로 1.5시간 동안 30℃에서 처리하였다. 용액을 증발시키고, 고체 잔류물을 물 중에 재구성시켰다 (하기 참조).
C. 정제. 조 올리고머를 TSK겔 수퍼Q-5PW 13 μm 칼럼 및 시마즈(Shimadzu) LC-8 시스템을 사용하는 음이온 교환 HPLC에 의해 정제하였다. 완충제 A는 20 mM 트리스, 5 mM EDTA, pH 9.0이었고, 20% 아세토니트릴을 함유하였으며, 완충제 B는 1.5 M 염화나트륨이 첨가된 완충제 A와 동일한 것이었다. 260 nm에서의 UV 트레이스를 기록하였다. 적절한 분획을 풀링한 후, 여과된 DI수 또는 100mM 중탄산암모늄, pH 6.7 및 20% 아세토니트릴의 구동 완충제와 함께 세파덱스 G-25 파인(Sephadex G-25 fine)이 패킹된 지이 헬스케어 XK 26/40 칼럼을 사용하여 크기 배제 HPLC 상에서 실행시켰다.
D. 어닐링. 1x포스페이트 완충 염수 (코닝(Corning), 셀그로(Cellgro)) 중에서 등몰 RNA 용액 (센스 및 안티센스)을 조합함으로써 상보적 가닥을 혼합하여 RNAi 작용제를 형성하였다. 일부 RNAi 작용제를 동결건조시키고, -15 내지 -25℃에서 저장하였다. 1x포스페이트 완충 염수에서 UV-Vis 분광계 상에서 용액 흡광도를 측정함으로써 듀플렉스 농도를 결정하였다. 그 후, 260 nm에서의 용액 흡광도에 전환 인자 및 희석 배율을 곱하여 듀플렉스 농도를 결정하였다. 달리 언급되지 않는 한, 모든 전환 인자는 0.037 mg/(mLㆍcm)이었다. 일부 실험의 경우, 실험적으로 결정된 흡광 계수로부터 전환 인자를 계산하였다.
실시예 2. APOC3 RNAi 작용제의 시험관내 시험.
상기 표 3에 제시된 후보 서열 듀플렉스를 시험관내에서 시험하였다. APOC3 RNAi 작용제를 실시예 1에 제시된 절차에 따라 제조하였다.
인간 간세포성 암종 세포주인 HuH7 세포의 형질감염에 의해 시험관내에서의 APOC3 RNAi 작용제의 평가를 수행하였다. 세포를 96-웰 포맷으로 웰당 ~7,500개의 세포로 플레이팅하고, 표 3에 제시된 65개의 APOC3 RNAi 작용제 듀플렉스 각각을 리포펙타민 RNAiMax (써모 피셔) 형질감염 시약을 사용하여 3종의 농도 (10 nM, 1 nM, 및 0.1 nM)로 형질감염시켰다. 각각의 APOC3 RNAi 작용제의 상대 발현은 qRT-PCR에 의해 APOC3 mRNA의 발현 수준을 내인성 대조군과 비교함으로써 결정하고, 표 8에 제시된 바와 같이 미처리 HuH7 세포에 대해 정규화하였다 (ΔΔCT 분석). 이에 따라, 듀플렉스 식별 번호 56_1의 경우, 1 nM에서 0.126의 평균 상대 발현은 87.4%의 APOC3 유전자 녹다운을 나타낸다.
표 8. APOC3 RNAi 작용제의 시험관내 시험.
Figure pct00059
Figure pct00060
Figure pct00061
실시예 3. APOC3-SEAP 마우스 모델.
6 내지 8주령 암컷 C57BL/6 알비노 마우스를, APOC3 RNAi 작용제 또는 대조군의 투여의 적어도 15일 전에 투여하는, 유체역학적 꼬리 정맥 주사에 의한 플라스미드에 의해 일시적으로 생체내 형질감염시켰다. 플라스미드는 SEAP (분비된 인간 태반 알칼리성 포스파타제) 리포터 유전자의 3' UTR 내로 삽입된 APOC3 cDNA 서열 (진뱅크 NM_000040.1 (서열식별번호: 1))을 함유한다. 동물의 체중의 10%의 총 부피의 링거 용액 중 APOC3 cDNA 서열을 함유하는 플라스미드 50 μg을 마우스에게 꼬리 정맥을 통해 주사하여 APOC3-SEAP 모델 마우스를 생성하였다. 용액을 27-게이지 바늘을 통해 이전에 기재된 바와 같이 (Zhang G et al., "High levels of foreign gene expression in hepatocytes after tail vein injection of naked plasmid DNA." Human Gene Therapy 1999 Vol. 10, p1735-1737) 5-7초 내에 주사하였다. APOC3 RNAi 작용제에 의한 APOC3 발현의 억제는 SEAP 발현의 병행 억제를 초래하였고, 이를 측정하였다. 제-1일에, 혈청 내의 SEAP 발현 수준을 포스파-라이트(Phospha-Light)™ SEAP 리포터 유전자 검정 시스템 (인비트로젠)에 의해 측정하고, 마우스를 평균 SEAP 수준에 따라 그룹화하였다.
분석: SEAP 수준은 다양한 시점에, APOC3 RNAi 작용제의 투여 전 및 후 둘 다에 측정될 수 있다.
i) 혈청 수집: 마우스를 2-3% 이소플루란으로 마취시키고, 혈액 샘플을 하악하 영역으로부터 혈청 분리 튜브 (자르슈테트 아게 & 캄파니(Sarstedt AG & Co.), 독일 뉨브레히트) 내로 수집하였다. 혈액을 주위 온도에서 20분 동안 응고되도록 하였다. 튜브를 8,000 xg에서 3분 동안 원심분리하여 혈청을 분리하고, 4℃에서 저장하였다.
ii) 혈청 SEAP 수준: 혈청을 수집하고, 포스파-라이트™ SEAP 리포터 유전자 검정 시스템 (인비트로젠)에 의해 제조업체의 지침에 따라 측정하였다. 이러한 모델을 사용한 APOC3 발현에서의 비-처리 관련 감소를 설명하기 위해 각각의 동물에 대한 혈청 SEAP 수준을 염수를 주사한 마우스의 대조군에 대해 정규화하였다. 먼저, "처리-전에 대해 정규화된" 발현의 비를 결정하기 위해 한 시점에서의 각각의 동물에 대한 SEAP 수준을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준 (제-1일)으로 나누었다. 이어서, 개별 동물에 대한 "처리-전에 대해 정규화된" 비를 생리 염수 대조군의 모든 마우스의 평균 "처리-전에 대해 정규화된" 비로 나누어 특정 시점에서의 발현을 대조군에 대해 정규화하였다. 대안적으로, 본원에 제시된 일부 실시예에서, 각각의 동물에 대한 혈청 SEAP 수준을 처리-전 수준에 대해서만 정규화하여 평가하였다.
실시예 4. APOC3-SEAP 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험.
상기 실시예 3에 기재된 APOC3-SEAP 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 9에 따라 5 mg/kg (mpk)의 APOC3 RNAi 작용제, 3 mg/kg의 APOC3 RNAi 작용제를 함유하는 200 μl, 또는 대조군으로서 사용하기 위한 APOC3 RNAi 작용제가 없는 포스페이트 완충 염수 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다.
표 9. 실시예 4의 APOC3-SEAP 마우스의 투여 군.
Figure pct00062
각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 말단 단부에서 본원의 듀플렉스 구조에 제시된 바와 같은 변형 서열을 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 기를 포함하는 표적화 리간드 (세자리 리간드)에 접합된 변형 뉴클레오티드를 포함하였다 (APOC3 RNAi 작용제와 관련한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 각각의 군에서 3마리의 마우스를 시험하였다 (n=3). 혈청을 제8일, 제15일, 제22일, 및 제29일에 수집하고, SEAP 발현 수준을 상기 실시예 3에 제시된 절차에 따라 결정하였다. 실험으로부터의 데이터를 하기 표 10에 제시하며, 평균 SEAP는 SEAP의 정규화된 평균 값을 반영한다:
표 10. 실시예 4로부터의 APOC3-SEAP 마우스에서의 처리-전 및 염수 대조군에 대해 정규화된 평균 SEAP.
Figure pct00063
각각의 투여 군 (즉, 군 B 내지 M)에서의 각각의 APOC3 RNAi 작용제는 모든 측정된 시점에 걸쳐 염수 대조군 (군 A)과 비교하여 SEAP에서 실질적인 감소를 나타내었다. 예를 들어, APOC3 RNAi 작용제 AD04815는 단일 5.0 mg/kg 주사 후 제22일에 SEAP에서 대략 97.4% 감소를 나타내었다 (0.026).
실시예 5. APOC3 트랜스제닉 마우스 모델.
특정 다른 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 효과를 평가하고 검토하기 위해, APOC3 트랜스제닉 마우스를 상업적으로 획득하여 사용하였다 (더 잭슨 래보러토리(The Jackson Laboratory), 006907 - B6; CBA-Tg(APOC3)3707Bres/J). APOC3 트랜스제닉 마우스에 대해, 혈청 내의 인간 APOC3 단백질 수준을 코바스(Cobas)® 인테그라 400 (로슈 다이아그노스틱스(Roche Diagnostics)) 상에서 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다.
정규화를 위해, 한 시점에서 각각의 동물에 대한 APOC3 수준을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준으로 나누어 "투여-전에 대해 정규화된" 발현 비를 결정하였다. 본원에 보고된 일부 실시예에서, 이어서 개별 동물에 대한 "투여-전에 대해 정규화된" 비를 비히클 대조군의 모든 마우스의 평균 "투여-전에 대해 정규화된" 비로 나누어 특정 시점에서의 발현을 비히클 대조군에 대해 또한 정규화하였다. 이는 대조군에서의 발현에 대해 정규화된 각 시점에 대한 발현을 산출하였다.
APOC3 수준은 다양한 시점에, APOC3 RNAi 작용제의 투여 전 및 후 둘 다에 측정될 수 있다. 본원에서 달리 나타내지 않는 한, 마우스를 2-3% 이소플루란으로 마취시키고, 혈액 샘플을 하악하 영역으로부터 혈청 분리 튜브 (자르슈테트 아게 & 캄파니, 독일 뉨브레히트) 내로 수집하였다. 혈액을 주위 온도에서 20분 동안 응고되도록 하였다. 튜브를 8,000 xg에서 3분 동안 원심분리하여 혈청을 분리하고, 4℃에서 저장하였다.
실시예 6. APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험.
상기 실시예 5에 기재된 APOC3 트랜스제닉 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 11에 제시된 투여 군을 포함하여, D5W (5% 물 중 덱스트로스) 또는 대조군 (D5W)에 용해된 각각의 RNAi 작용제 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다.
표 11. 실시예 6의 APOC3 트랜스제닉 마우스의 투여 군.
Figure pct00064
각각의 APOC3 RNAi 작용제를 본원에 제시된 바와 같은 변형 서열 및 NAG 구조를 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 (즉, 세자리 NAG 리간드)을 포함하는 표적화 리간드에 접합시켰다 (실시예 6에 사용된 APOC3 RNAi 작용제에 대한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 각각의 군에서 3마리의 마우스를 시험하였다 (n=3). 제-1일 (4시간 금식 하에 투여-전 채혈) 및 제8일, 제15일, 제22일, 및 제29일을 포함하여, 마우스로부터 혈청을 수집하였다. 각각의 수집 전 4시간 동안 마우스를 금식시켰다. APOC3 발현 수준을 상기 실시예 5에 제시된 절차에 따라 결정하였다. 데이터를 하기 표 12에 제시하며, 평균 APOC3은 혈청에서 발현된 APOC3 단백질의 정규화된 평균 값을 반영한다:
표 12. 실시예 6으로부터의 APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질.
Figure pct00065
각각의 투여 군 (즉, 군 B 내지 M)에서의 각각의 APOC3 RNAi 작용제는 측정된 시점에 걸쳐 대조군 (군 A)과 비교하여 APOC3에서 감소를 나타내었다. 예를 들어, 제1일에 단일 2.0 mg/kg 용량 후, APOC3 RNAi 작용제 AD05223은 제15일에 대략 94% 감소 (0.062)를 나타내었다.
실시예 7. APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험.
상기 실시예 5에 기재된 APOC3 트랜스제닉 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 13에 제시된 투여 군에 따라 D5W (5% 물 중 덱스트로스) 또는 대조군 (D5W)에 용해된 각각의 RNAi 작용제 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다.
표 13. 실시예 7의 APOC3 트랜스제닉 마우스의 투여 군.
Figure pct00066
각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 말단 단부에서 본원의 듀플렉스 구조에 제시된 바와 같은 변형 서열을 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 기를 포함하는 표적화 리간드 (세자리 리간드)에 접합된 변형 뉴클레오티드를 포함하였다 (APOC3 RNAi 작용제와 관련한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 각각의 군에서 3마리의 마우스를 시험하였다 (n=3). 제-1일 (4시간 금식 하에 투여-전 채혈) 및 제8일, 제15일, 제22일, 및 제29일을 포함하여, 마우스로부터 혈청을 수집하였다. 각각의 수집 전 4시간 동안 마우스를 금식시켰다. APOC3 발현 수준을 상기 실시예 5에 제시된 절차에 따라 결정하였다. 실험 제8일로부터의 데이터를 하기 표 14에 제시하며, 평균 APOC3은 혈청에서 발현된 APOC3 단백질의 정규화된 평균 값을 반영한다:
표 14. 실시예 7로부터의 APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질.
Figure pct00067
* 군 3, 제8일에 대한 샘플은 장비 고장으로 인해 손실되었다.
각각의 투여 군 (즉, 군 2 내지 11)에서의 각각의 APOC3 RNAi 작용제는 제8일 및 제15일에 대조군 (군 1)과 비교하여 APOC3 단백질 수준에서 감소를 나타내었다. 특히, APOC3 RNAi 작용제 AD05251 및 AD05169 (각각 APOC3 유전자 (즉, 서열식별번호: 1)의 위치 438을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 가짐), 뿐만 아니라 APOC3 RNA 작용제 AD05220 (APOC3 유전자의 위치 506을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 가짐)은 특히 강력한 억제 효과를 나타내었다 (예를 들어, 상기 표 14의 군 4, 7, 및 11 참조).
실시예 8. APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험.
상기 실시예 5에 기재된 APOC3 트랜스제닉 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 13에 제시된 투여 군에 따라 D5W (5% 물 중 덱스트로스) 또는 대조군 (D5W)에 용해된 각각의 RNAi 작용제 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다.
표 15. 실시예 8의 투여 군.
Figure pct00068
각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 말단 단부에서 본원의 듀플렉스 구조에 제시된 바와 같은 변형 서열을 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 기를 포함하는 표적화 리간드 (세자리 리간드)에 접합된 변형 뉴클레오티드를 포함하였다 (APOC3 RNAi 작용제와 관련한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 4마리의 마우스를 시험한 군 1 (D5W 비히클)을 제외하고 (n=4), 각각의 군에서 3마리의 마우스를 시험하였다 (n=3). 제-1일 (4시간 금식 하에 투여-전 채혈) 및 제8일, 및 제15일, 제22일, 및 제29일에 혈청을 수집하였다. 각각의 수집 전 4시간 동안 마우스를 금식시켰다. APOC3 발현 수준을 상기 실시예 5에 제시된 절차에 따라 결정하였다. 또한, 혈청 내의 트리글리세리드, 고밀도 지단백질 (HDL), 저밀도 지단백질 (LDL), 및 총 콜레스테롤을 코바스® 인테그라 400 (로슈 다이아그노스틱스) 상에서 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다.
각각의 동물에 대해 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, HDL 수준, 및 총 콜레스테롤 수준을 정규화하였다. 정규화를 위해, 한 시점에서 각각의 동물에 대한 APOC3 단백질, 트리글리세리드, HDL, LDL, 및 총 콜레스테롤의 수준 각각을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준으로 나누어 (이 경우에 제-1일) "처리-전에 대해 정규화된" 발현 비를 결정하였다. 이어서 개별 동물에 대한 "처리-전에 대해 정규화된" 비를 비히클 대조군의 모든 마우스의 평균 "처리-전에 대해 정규화된" 비로 나누어 특정 시점에서의 발현을 비히클 대조군에 대해 정규화하였다. 이는 대조군에서의 발현에 대해 정규화된 각 시점에 대한 발현을 산출하였다. 실험으로부터의 데이터를 하기 표 16 내지 20에 제시한다:
표 16. 실시예 8로부터의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질.
Figure pct00069
표 17. 실시예 8로부터의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 트리글리세리드.
Figure pct00070
표 18. 실시예 8로부터의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 총 콜레스테롤.
Figure pct00071
표 19. 실시예 8로부터의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 HDL.
Figure pct00072
표 20. 실시예 8로부터의 처리-전 및 비히클 대조군 (D5W)에 대해 정규화된 평균 LDL.
Figure pct00073
각각의 투여 군 (즉, 군 2 내지 16)에서의 각각의 APOC3 RNAi 작용제는 대조군 (군 1)과 비교하여 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, 총 콜레스테롤 수준, 및 LDL 수준에서 감소를 나타내었다. 예를 들어, 단일 0.5 mg/kg 용량의 APOC3 RNAi 작용제 AD05251 (군 7)은 제22일에 APOC3 단백질 수준의 대략 86% 감소 (0.138), 트리글리세리드 수준의 대략 70% 감소 (0.294), 총 콜레스테롤 수준의 대략 47% 감소 (0.533), 및 LDL 수준의 대략 31% 감소 (0.688)를 나타내었다. 추가로, 예상된 바와 같이, 제22일에 AD05251의 투여는 HDL 수준의 증가를 나타내었다 (예를 들어, 상기 표 19 참조).
실시예 9. APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 용량 반응 시험.
상기 실시예 5에 기재된 APOC3 트랜스제닉 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 21에 제시된 투여 군에 따라 D5W (5% 물 중 덱스트로스) 또는 대조군 (D5W)에 용해된 각각의 RNAi 작용제 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다:
표 21. 실시예 9의 투여 군.
Figure pct00074
각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 말단 단부에서 (NAG37)s의 구조를 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 기를 포함하는 표적화 리간드 (세자리 리간드)에 접합된 변형 뉴클레오티드를 포함하였다 (APOC3 RNAi 작용제와 관련한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 각각의 군에서 4마리의 마우스를 시험하였다. 제-1일 (4시간 금식 하에 투여-전 채혈) 및 제8일, 제15일, 제22일, 제29일, 및 제36일에 혈청을 수집하였다. 각각의 수집 전 4시간 동안 마우스를 금식시켰다. 혈청 내의 APOC3 발현 수준, 트리글리세리드, 고밀도 지단백질 (HDL), 저밀도 지단백질 (LDL), 및 총 콜레스테롤을 코바스® 인테그라 400 (로슈 다이아그노스틱스) 상에서 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다.
각각의 동물에 대해 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, HDL 수준, 및 총 콜레스테롤 수준을 정규화하였다. 정규화를 위해, 한 시점에서 각각의 동물에 대한 APOC3 단백질, 트리글리세리드, HDL, LDL, 및 총 콜레스테롤의 수준 각각을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준으로 나누어 (이 경우에 제-1일) "투여-전에 대해 정규화된" 발현 비를 결정하였다. 실험으로부터의 데이터를 하기 표 22 내지 26에 제시한다:
표 22. 실시예 9로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질.
Figure pct00075
표 23. 실시예 9로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 트리글리세리드.
Figure pct00076
표 24. 실시예 9로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 총 콜레스테롤.
Figure pct00077
표 25. 실시예 9로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 HDL.
Figure pct00078
표 26. 실시예 9로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 LDL.
Figure pct00079
시험된 각각의 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, 총 콜레스테롤 수준, 및 LDL 수준의 감소에서 용량 반응을 나타내었다.
실시예 10. APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 용량 반응 시험.
상기 실시예 5에 기재된 APOC3 트랜스제닉 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 27에 제시된 투여 군에 따라 D5W (5% 물 중 덱스트로스) 또는 대조군 비히클 (D5W)에 용해된 각각의 RNAi 작용제 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다:
표 27. 실시예 10의 투여 군.
Figure pct00080
각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 말단 단부에서 본원의 듀플렉스 구조에 제시된 바와 같은 변형 서열을 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 기를 포함하는 표적화 리간드 (세자리 리간드)에 접합된 변형 뉴클레오티드를 포함하였다 (APOC3 RNAi 작용제와 관련한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
실시예 10에서 시험된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자 (즉, 서열식별번호: 1) 상의 상이한 위치를 표적화하도록 설계된 뉴클레오티드 서열을 포함하였다. 보다 구체적으로, 군 2-4 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05891, AD05892, 및 AD05893)는 APOC3 유전자의 위치 248을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 5 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05894)는 APOC3 유전자의 위치 263을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 6-7 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05895 및 AD05896)은 APOC3 유전자의 위치 422를 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 8 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05897)은 APOC3 유전자의 위치 246을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 9-10 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05889 및 AD05890)은 APOC3 유전자의 위치 168을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 11-22 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05876, AD05877, AD05878, AD05878, AD05880, AD05882, AD05884, AD05885, AD05886, AD05887, AD05888, 및 AD05769)는 APOC3 유전자의 위치 438을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하였다.
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 각각의 군에서 3마리의 마우스를 시험하였다 (n=3). 제-1일 (4시간 금식 하에 투여-전 채혈) 및 제8일, 제15일에 혈청을 수집하였다. 상대적으로 높은 억제 활성을 나타내는 특정 RNAi 작용제를 투여한 마우스 및 비히클 대조군을 투여한 마우스에 대해, 제22일 및 제29일에 추가의 혈청 샘플을 수집하였다. 각각의 수집 전 4시간 동안 마우스를 금식시켰다. 혈청 내의 APOC3 발현 수준, 트리글리세리드, 고밀도 지단백질 (HDL), 저밀도 지단백질 (LDL), 및 총 콜레스테롤을 코바스® 인테그라 400 (로슈 다이아그노스틱스) 상에서 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다.
각각의 동물에 대해 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, HDL 수준, 및 총 콜레스테롤 수준을 정규화하였다. 정규화를 위해, 한 시점에서 각각의 동물에 대한 APOC3 단백질, 트리글리세리드, HDL, LDL, 및 총 콜레스테롤의 수준 각각을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준으로 나누어 (이 경우에 제-1일) "투여-전에 대해 정규화된" 발현 비를 결정하였다. 실험으로부터의 데이터를 하기 표 28 내지 32에 제시한다:
표 28. 실시예 10으로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질.
Figure pct00081
Figure pct00082
표 29. 실시예 10으로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 트리글리세리드.
Figure pct00083
Figure pct00084
표 30. 실시예 10으로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 총 콜레스테롤.
Figure pct00085
Figure pct00086
표 31. 실시예 10으로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 HDL.
Figure pct00087
Figure pct00088
표 32. 실시예 10으로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 LDL.
Figure pct00089
Figure pct00090
상기 표 28-32에 제시된 바와 같이, 군 2 내지 10의 RNAi 작용제 (즉, APOC3 유전자를 위치 248, 263, 422, 246, 및 168에서 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥을 갖는 RNAi 작용제)는, 특히 모두 APOC3 유전자의 위치 438을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 뉴클레오티드 서열을 포함하는 군 11 내지 22의 RNAi 작용제와 비교한 경우, 상대적으로 제한된 억제 효과를 나타내었다. 추가로, APOC3 유전자의 위치 438을 표적화하는 서열을 포함하는 RNAi 작용제, 군 11 (AD05876) 및 군 22 (AD05769)는 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드, 및 총 콜레스테롤 수준과 관련하여 최대 수준의 억제 효과를 나타내었다.
실시예 11. APOC3 트랜스제닉 마우스에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험.
상기 실시예 5에 기재된 APOC3 트랜스제닉 마우스 모델을 사용하였다. 제1일에, 각각의 마우스에게 하기 표 33에 제시된 투여 군에 따라 D5W (5% 물 중 덱스트로스) 또는 대조군 비히클 (D5W)에 용해된 각각의 RNAi 작용제 200 μl의 단일 피하 투여를 제공하였다:
표 33. 실시예 11의 투여 군.
Figure pct00091
각각의 APOC3 RNAi 작용제는 센스 가닥의 5' 말단 단부에서 본원의 듀플렉스 구조에 제시된 바와 같은 변형 서열을 갖는 3개의 N-아세틸-갈락토사민 기를 포함하는 표적화 리간드 (세자리 리간드)에 접합된 변형 뉴클레오티드를 포함하였다 (APOC3 RNAi 작용제와 관련한 구체적 변형 및 구조 정보에 대해서는 표 4, 5, 6, 및 7 참조).
실시예 11에서 시험된 APOC3 RNAi 작용제는 APOC3 유전자 (즉, 서열식별번호: 1) 상의 상이한 위치를 표적화하도록 설계된 뉴클레오티드 서열을 포함하였다. 보다 구체적으로, 군 2 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05260)는 APOC3 유전자의 위치 58을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 3 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05221)은 APOC3 유전자의 위치 246을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 4-7 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05223, AD05299, AD05283, 및 AD05284)은 APOC3 유전자의 위치 432를 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 8-12 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05167, AD05168, AD05171, AD05258, 및 AD05259)는 APOC3 유전자의 위치 434를 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 13-15 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05169, AD05239, 및 AD05251)는 APOC3 유전자의 위치 438을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하고; 군 16 (즉, APOC3 RNAi 작용제 AD05220)은 APOC3 유전자의 위치 506을 표적화하도록 설계된 안티센스 가닥 서열을 포함하였다.
주사는 목 및 어깨 영역 위의 느슨한 피부 내로 피부와 근육 사이 (즉, 피하 주사)에 수행하였다. 각각의 군에서 3마리의 마우스를 시험하였다 (n=3). 제-1일 (4시간 금식 하에 투여-전 채혈) 및 제8일, 제15일에 혈청을 수집하였다. 상대적으로 높은 억제 활성을 나타내는 특정 RNAi 작용제를 투여한 마우스 및 비히클 대조군을 투여한 마우스에 대해, 제22일 및 제29일에 추가의 혈청 샘플을 수집하였다. 각각의 수집 전 4시간 동안 마우스를 금식시켰다. 혈청 내의 APOC3 발현 수준, 트리글리세리드, 고밀도 지단백질 (HDL), 저밀도 지단백질 (LDL), 및 총 콜레스테롤을 코바스® 인테그라 400 (로슈 다이아그노스틱스) 상에서 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다.
각각의 동물에 대해 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, HDL 수준, 및 총 콜레스테롤 수준을 정규화하였다. 정규화를 위해, 한 시점에서 각각의 동물에 대한 APOC3 단백질, 트리글리세리드, HDL, LDL, 및 총 콜레스테롤의 수준 각각을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준으로 나누어 (이 경우에 제-1일) "투여-전에 대해 정규화된" 발현 비를 결정하였다. 실험으로부터의 데이터를 하기 표 34 내지 38에 제시한다:
표 34. 실시예 11로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질.
Figure pct00092
표 35. 실시예 11로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 트리글리세리드.
Figure pct00093
표 36. 실시예 11로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 총 콜레스테롤.
Figure pct00094
표 37. 실시예 11로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 HDL.
Figure pct00095
표 38. 실시예 11로부터의 투여-전에 대해 정규화된 평균 LDL.
Figure pct00096
실시예 12. 시노몰구스 원숭이에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험.
APOC3 RNAi 작용제를 시노몰구스 원숭이에서 평가하였다. 제1일에, 시노몰구스 마카크 (마카카 파시쿨라리스(Macaca fascicularis)) 영장류 (또한 본원에서 "시노"로도 지칭됨)에게 염수 중에 제제화된 3.0 mg/kg의 APOC3 RNAi 작용제 AD05876을 함유하는 0.3 mL/kg (대략 2-3 mL 부피, 동물 질량에 좌우됨)의 단일 피하 주사를 투여하였다. APOC3 RNAi 작용제 AD05876은 표 4, 5, 6, 및 7에 제시된 바와 같이, 변형 뉴클레오티드 및 센스 가닥의 5'-말단 단부에 접합된 세자리 N-아세틸-갈락토사민 표적화 리간드 ((NAG37)s)를 포함하였다.
2마리의 원숭이를 시험하였다 (n=2). 제-8일 (투여-전), 제29일 및 제50일에, 간 생검을 채취하였다. 원숭이 중 1마리에 대해, 추가의 간 생검 샘플을 제15일에 채취하였다. 각각의 생검 수집일에, 시노를 마취시키고, 초음파-가이드 간 생검을 수행하여 대략 1 mm x 4 mm 크기의 2 또는 3개의 간 조직 샘플을 추출하였다. 이어서, 생검 샘플을 균질화하고, 시노 간에서 APOC3 mRNA의 수준을 RT-qPCR에 의해 측정하였다. 이어서, 생성된 값을 투여-전 (이 경우, 제-8일) APOC3 mRNA 측정치에 대해 정규화하였다. 생성된 mRNA 데이터를 하기 표 39 및 40에 반영하였다:
표 39. 시노 #1 (cy0713)의 실시예 12로부터의 투여-전에 대해 정규화된 APOC3 mRNA 수준.
Figure pct00097
표 40. 시노 #2 (cy0716)의 실시예 12로부터의 투여-전에 대해 정규화된 APOC3 mRNA 수준.
Figure pct00098
AD05876을 투여한 시노는 둘 다 모든 측정된 시점에서 처리-전 측정치와 비교하여 간-특이적 APOC3 mRNA에서 유의한 감소를 나타내었다. 제29일에, 예를 들어, 제1 시노는 투여-전 수준과 비교하여 대략 87.5% (0.125)의 APOC3 mRNA의 감소를 가졌고, 제2 시노는 대략 88.8% (0.112)의 감소를 가졌다.
실시예 13. 고과당 옥수수 시럽 (HFCS) 식이-섭식 레서스 원숭이에서의 APOC3 RNAi 작용제의 생체내 시험
APOC3 RNAi 작용제 AD05876을 고과당 옥수수 시럽 (HFCS) 식이-섭식 레서스 원숭이에서 추가로 평가하였다. 레서스 원숭이를 투여 37일 전에 HFCS 식이상태에 두었다. 이들 동물은 HFCS 식이 동안 180 mg/dL 초과의 증가된 혈장 트리글리세리드가 발생하는 것으로 공지되었다. 제1일 및 다시 제29일에, 4마리의 레서스 원숭이에게 염수 중에 제제화된 4.0 mg/kg의 APOC3 RNAi 작용제 AD05876을 함유하는 피하 주사를 투여하였다 (n=4). 2마리의 추가의 레서스 원숭이에게는 생리 염수 대조군을 투여하였다. APOC3 RNAi 작용제 AD05876은 표 4, 5, 6, 및 7에 제시된 바와 같이 변형 뉴클레오티드를 함유하였고, 센스 가닥의 5'-말단 단부에 접합된 N-아세틸-갈락토사민 표적화 리간드를 포함하였다.
섭식 및 공복 혈액 샘플 둘 다를 분석을 위해 채취하고, 공복 혈청 샘플을 제-8일(투여전), 제8일, 및 제15일에 분석하였다. 각각의 수집 전에 원숭이를 밤새 금식시켰다. 혈청 내의 APOC3 단백질 수준을 ELISA 검정 (알앤디 시스템즈(R&D Systems))에 의해 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다. 혈청 내의 트리글리세리드, 총 콜레스테롤, 고밀도 지단백질 (HDL), 및 저밀도 지단백질 (LDL)을 코바스® 인테그라 400 (로슈 다이아그노스틱스) 상에서 제조업체의 권장사항에 따라 측정하였다.
각각의 동물에 대해 APOC3 단백질 수준, 트리글리세리드 수준, 총 콜레스테롤 수준, HDL 수준, 및 LDL 수준을 정규화하였다. 정규화를 위해, 한 시점에서 각각의 동물에 대한 APCO3 단백질, 트리글리세리드, HDL 및 총 콜레스테롤의 수준 각각을 그러한 동물에서의 처리-전 발현 수준으로 나누어 (이 경우에 제-8일) "처리-전에 대해 정규화된" 발현 비를 결정하였다.
본 실시예에 제시된 연구로부터의 데이터를 하기 표 41-45에 제시한다:
표 41. 실시예 13으로부터의 처리-전에 대해 정규화된 평균 APOC3 단백질 (공복)
Figure pct00099
표 42. 실시예 13으로부터의 처리-전에 대해 정규화된 평균 TG (공복)
Figure pct00100
표 43. 실시예 13으로부터의 처리-전에 대해 정규화된 평균 총 콜레스테롤 (공복)
Figure pct00101
표 44. 실시예 13으로부터의 처리-전에 대해 정규화된 평균 HDL (공복)
Figure pct00102
표 45. 실시예 13으로부터의 처리-전에 대해 정규화된 평균 LDL (공복)
Figure pct00103
AD05876을 4.0 mg/kg 투여량 수준으로 투여한 레서스 원숭이는 각각의 측정된 시점에 걸쳐 처리-전 측정치와 비교하여 APOC3 단백질의 감소를 나타내었다. 추가로, 트리글리세리드 수준 및 총 콜레스테롤 수준 둘 다의 실질적인 감소가 또한 제시되었다. 예를 들어, 한 동물에서, 트리글리세리드는 제22일에 대략 89%만큼 감소하였고, 상기 표 42에 제시된 바와 같이, 평균 트리글리세리드 수준은 제22일에 대략 60% (0.395)만큼 감소하였다. 추가적으로, 평균 HDL 수준은 제22일에 대략 47%만큼 증가하였고 (표 44 참조 (1.465)), 한 동물은 HDL 수준에서 2.2-배 증가를 가졌다.
다른 실시양태
본 발명이 그의 상세한 설명과 함께 기재되었지만, 상기 기재는 첨부된 청구범위의 범주에 의해 정의되는 본 발명의 범주를 예시하는 것으로 의도되고 제한하는 것으로 의도되지 않는다는 것이 이해되어야 한다. 다른 측면, 이점, 및 변형은 하기 청구범위의 범주 내에 있다.
SEQUENCE LISTING <110> ARROWHEAD PHARMACEUTICALS, INC. <120> RNAi Agents and Compositions for Inhibiting Expression of Apolipoprotein C-III (APOC3) <130> 30655-WO1 <150> 62/720,434 <151> 2018-08-21 <150> 62/643,927 <151> 2018-03-16 <150> 62/556,818 <151> 2017-09-11 <160> 837 <210> 1 <211> 533 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Homo Sapiens apolipoprotein C3 (APOC3) transcript, GenBank NM_000040.1 <400> 1 tgctcagttc atccctagag gcagctgctc caggaacaga ggtgccatgc agccccgggt 60 actccttgtt gttgccctcc tggcgctcct ggcctctgcc cgagcttcag aggccgagga 120 tgcctccctt ctcagcttca tgcagggtta catgaagcac gccaccaaga ccgccaagga 180 tgcactgagc agcgtgcagg agtcccaggt ggcccagcag gccaggggct gggtgaccga 240 tggcttcagt tccctgaaag actactggag caccgttaag gacaagttct ctgagttctg 300 ggatttggac cctgaggtca gaccaacttc agccgtggct gcctgagacc tcaatacccc 360 aagtccacct gcctatccat cctgcgagct ccttgggtcc tgcaatctcc agggctgccc 420 ctgtaggttg cttaaaaggg acagtattct cagtgctctc ctaccccacc tcatgcctgg 480 cccccctcca ggcatgctgg 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underlying base sequence <400> 774 aagggacagu auucucagug a 21 <210> 775 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 775 acgggacagu auucucagug a 21 <210> 776 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 776 cccuguaggu ugcuuaaaag a 21 <210> 777 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 777 ggaaaaggga caguauucuc a 21 <210> 778 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 7 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 778 ggcaaangga caguauucuc a 21 <210> 779 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 10 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 779 gcuuaaaagn gacaguauuc u 21 <210> 780 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 16 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 780 ugaccgaugg cuucanuucc a 21 <210> 781 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 3 <223> n = 2-aminoadenine <400> 781 ggnaaaggga caguauucuc a 21 <210> 782 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 1 <223> n = 2-aminoadenine <400> 782 ngaaaaggga caguauucuc a 21 <210> 783 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 1, 2 <223> n = 2-aminoadenine <400> 783 nnaaaaggga caguauucuc a 21 <210> 784 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 784 cccaauaaag cuggacaaga a 21 <210> 785 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 9 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 785 gcuuaaaang gacaguauuc u 21 <210> 786 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 786 cuucaguucc cugaaagacu a 21 <210> 787 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 787 guucaguucc cugaaagacu a 21 <210> 788 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 9 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 788 aggguacunc uuguuguugc a 21 <210> 789 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 789 gggacaguau ucucagugau u 21 <210> 790 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 1 <223> n = 2-aminoadenine <400> 790 nagggacagu auucucagug a 21 <210> 791 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 18 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 791 gagggacagu auucucanug a 21 <210> 792 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 10 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 792 cuucaguucn cugaaagacu a 21 <210> 793 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 793 cggacaguau ucucagugau u 21 <210> 794 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 8 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 794 ggcaaagnga caguauucuc a 21 <210> 795 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 795 aggguacucc uuguuguugc a 21 <210> 796 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 796 cuucaguucu cugaaagacu a 21 <210> 797 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 797 cuucaguuuc cugaaagacu a 21 <210> 798 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 798 cgucaguucc cugaaagacu a 21 <210> 799 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 799 ccucaguucc cugaaagacu a 21 <210> 800 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 800 cgucaguucu cugaaagacu a 21 <210> 801 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 801 ggucaguucc cugaaagacu a 21 <210> 802 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 802 gcucaguucc cugaaagacu a 21 <210> 803 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 803 gccuaaaagg gacaguauuc u 21 <210> 804 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 804 ccuuaaaagg gacaguauuc u 21 <210> 805 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 11 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 805 gcuuaaaagg nacaguauuc u 21 <210> 806 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 9 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 806 cuucaguunc cugaaagacu a 21 <210> 807 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 19 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 807 aggguacucc uuguuguunc a 21 <210> 808 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 19 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 808 cuucaguucc cugaaaganu a 21 <210> 809 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 20 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 809 gcuuaaaagg gacaguauun u 21 <210> 810 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 20 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 810 ggcaaaggga caguauucun a 21 <210> 811 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 19 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 811 gccaauaaag cuggacaana a 21 <210> 812 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 10 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 812 aggguacucn uuguuguugc a 21 <210> 813 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 11 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 813 cuucaguucc nugaaagacu a 21 <210> 814 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 11 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 814 ggcaaaggga naguauucuc a 21 <210> 815 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 9, 20 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 815 gagggacanu auucucagun a 21 <210> 816 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 11 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 816 gccaauaaag nuggacaaga a 21 <210> 817 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 10 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 817 gcuuaaaagn gacaguauuc u 21 <210> 818 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 11 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 818 gccuaaaagg nacaguauuc u 21 <210> 819 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 819 accuaaaagg gacaguauuc u 21 <210> 820 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 820 gcguaaaagg gacaguauuc u 21 <210> 821 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 821 gucuaaaagg gacaguauuc u 21 <210> 822 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 18 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 822 gggacaguau ucucagunau u 21 <210> 823 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 13 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 823 gccaauaaag cungacaaga a 21 <210> 824 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 9 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 824 gcuuaaaang gacaguauuc u 21 <210> 825 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 825 cagggacagu auucucagug a 21 <210> 826 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 826 aggggacagu auucucagug a 21 <210> 827 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 20 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 827 aggggacagu auucucagun a 21 <210> 828 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 828 agaccgccaa ggaugcacuu u 21 <210> 829 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 15 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 829 agaccgccaa ggauncacuu u 21 <210> 830 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 830 ucaguucccu gaaagacuac u 21 <210> 831 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 831 ucaguucccu gaaagacuac a 21 <210> 832 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 15 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 832 acuacuggag caccnuuaag a 21 <210> 833 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 833 ccuguagguu gcuuaaaagg a 21 <210> 834 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 834 gcuguagguu gcuuaaaagg a 21 <210> 835 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <400> 835 ggucaguucu cugaaagacu a 21 <210> 836 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 14 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 836 gccaauaaag cugnacaaga a 21 <210> 837 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial sequence <220> <223> RNAi agent sense strand underlying base sequence <220> <221> modified_base <222> 20 <223> n = inosine (hypoxanthine) <400> 837 cagggacagu auucucagun a 21

Claims (63)

  1. 표 2, 표 3, 또는 표 4에 제공된 서열 중 어느 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 적어도 17개의 인접 뉴클레오티드를 포함하는 안티센스 가닥; 및
    안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 뉴클레오티드 서열을 포함하는 센스 가닥
    을 포함하는, APOC3 유전자의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제.
  2. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 2, 표 3, 또는 표 4에 제공된 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 2-18을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 센스 가닥이 표 2, 표 3, 또는 표 5에 제공된 센스 가닥 서열 중 어느 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 적어도 17개의 인접 뉴클레오티드의 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 센스 가닥이 안티센스 가닥에 대해 17개의 인접 뉴클레오티드에 걸쳐 적어도 85% 상보성 영역을 갖는 것인 RNAi 작용제.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제의 적어도 1개의 뉴클레오티드가 변형 뉴클레오티드이거나 또는 변형 뉴클레오시드간 연결을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제의 센스 및/또는 안티센스 가닥의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드가 변형 뉴클레오티드인 RNAi 작용제.
  6. 제4항 또는 제5항에 있어서, 변형 뉴클레오티드가 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 2'-플루오로 뉴클레오티드, 2'-데옥시 뉴클레오티드, 2',3'-세코 뉴클레오티드 모방체, 잠금 뉴클레오티드, 2'-F-아라비노 뉴클레오티드, 2'-메톡시에틸 뉴클레오티드, 무염기성 뉴클레오티드, 리비톨, 역전 뉴클레오티드, 역전 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 역전 2'-데옥시 뉴클레오티드, 2'-아미노-변형 뉴클레오티드, 2'-알킬-변형 뉴클레오티드, 모르폴리노 뉴클레오티드, 비닐 포스포네이트 데옥시리보뉴클레오티드, 시클로프로필 포스포네이트 데옥시리보뉴클레오티드, 및 3'-O-메틸 뉴클레오티드로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 RNAi 작용제.
  7. 제5항에 있어서, 모든 또는 실질적으로 모든 변형 뉴클레오티드가 2'-O-메틸 뉴클레오티드 또는 2'-플루오로 뉴클레오티드인 RNAi 작용제.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 3 또는 표 4에 제공된 변형 안티센스 가닥 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  9. 제8항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 4에 제공된 변형 안티센스 가닥 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 표 3 또는 표 5에 제공된 변형 센스 가닥 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  11. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 4에 제공된 변형 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 센스 가닥이 표 5에 제공된 변형 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  12. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 표적화 리간드에 연결된 RNAi 작용제.
  13. 제12항에 있어서, 표적화 리간드가 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  14. 제12항 또는 제13항에 있어서, 표적화 리간드가 (NAG13), (NAG13)s, (NAG18), (NAG18)s, (NAG24), (NAG24)s, (NAG25), (NAG25)s, (NAG26), (NAG26)s, (NAG27), (NAG27)s, (NAG28), (NAG28)s, (NAG29), (NAG29)s, (NAG30), (NAG30)s, (NAG31), (NAG31)s, (NAG32), (NAG32)s, (NAG33), (NAG33)s, (NAG34), (NAG34)s, (NAG35), (NAG35)s, (NAG36), (NAG36)s, (NAG37), (NAG37)s, (NAG38), (NAG38)s, (NAG39), (NAG39)s로 이루어진 군으로부터 선택된 구조를 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  15. 제14항에 있어서, 표적화 리간드가 (NAG37) 또는 (NAG37)s의 구조를 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  16. 제12항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 표적화 리간드가 센스 가닥에 접합된 것인 RNAi 작용제.
  17. 제16항에 있어서, 표적화 리간드가 센스 가닥의 5' 말단 단부에 접합된 것인 RNAi 작용제.
  18. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 18 내지 30개 뉴클레오티드 길이이고, 안티센스 가닥이 18 내지 30개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  19. 제18항에 있어서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥이 각각 18 내지 27개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  20. 제19항에 있어서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥이 각각 18 내지 24개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  21. 제20항에 있어서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥이 각각 21개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  22. 제21항에 있어서, 2개의 평활 말단을 갖는 RNAi 작용제.
  23. 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 1 또는 2개의 말단 캡을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  24. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 1 또는 2개의 역전 무염기성 잔기를 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  25. 제1항에 있어서, 표 3 또는 표 6의 듀플렉스 중 어느 하나의 구조를 갖는 듀플렉스를 형성하는 센스 가닥 및 안티센스 가닥으로 구성된 RNAi 작용제.
  26. 제1항에 있어서, 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 안티센스 가닥을 포함하는 RNAi 작용제:
    Figure pct00104
  27. 제26항에 있어서, 센스 가닥이 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하며:
    Figure pct00105

    여기서 I는 이노신 뉴클레오티드를 나타내는 것인 RNAi 작용제.
  28. 제26항 또는 제27항에 있어서, 안티센스 가닥 및 센스 가닥 둘 다의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드가 변형 뉴클레오티드인 RNAi 작용제.
  29. 제26항 내지 제28항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  30. 제26항 내지 제29항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제의 센스 가닥이 표적화 리간드에 연결된 것인 RNAi 작용제.
  31. 제30항에 있어서, 표적화 리간드가 아시알로당단백질 수용체에 대해 친화도를 갖는 것인 RNAi 작용제.
  32. 제31항에 있어서, 표적화 리간드가 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  33. 제1항에 있어서, 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열을 포함하거나, 그로 이루어지거나, 또는 그로 본질적으로 이루어진 안티센스 가닥을 포함하며:
    Figure pct00106

    여기서 a, c, g, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내고; 여기서 센스 가닥의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형 뉴클레오티드인 RNAi 작용제.
  34. 제33항에 있어서, 센스 가닥이 하기 뉴클레오티드 서열 (5' → 3') 중 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 변형 뉴클레오티드 서열을 포함하거나, 그로 이루어지거나, 또는 그로 본질적으로 이루어지며:
    Figure pct00107

    여기서 a, c, g, i, 및 u는 각각 2'-O-메틸 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신, 또는 우리딘을 나타내고; Af, Cf, Gf, If, 및 Uf는 각각 2'-플루오로 아데노신, 시티딘, 구아노신, 이노신 또는 우리딘을 나타내고; s는 포스포로티오에이트 연결을 나타내는 것인 RNAi 작용제.
  35. 제33항 또는 제34항에 있어서, 센스 가닥이 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부 및/또는 5' 단부에 역전 무염기성 잔기를 추가로 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  36. 제33항 내지 제35항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제의 센스 가닥이 표적화 리간드에 연결된 것인 RNAi 작용제.
  37. 제36항에 있어서, 표적화 리간드가 아시알로당단백질 수용체에 대해 친화도를 갖는 것인 RNAi 작용제.
  38. 제37항에 있어서, 표적화 리간드가 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  39. 제1항에 있어서, AD05251 (서열식별번호: 2 및 501); AD05876 (서열식별번호: 4 및 572); AD05769 (서열식별번호: 6 및 557); AD05169 (서열식별번호: 2 및 482); AD05220 (서열식별번호: 7 및 494); AD05547 (서열식별번호: 7 및 545); AD05299 (서열식별번호: 9 및 521); AD05223 (서열식별번호: 11 및 497); 및 AD05171 (서열식별번호: 13 및 483)로 이루어진 군으로부터 선택된 듀플렉스 구조를 갖는 RNAi 작용제.
  40. 제39항에 있어서, AD05251 (서열식별번호: 2 및 501) 및 AD05876 (서열식별번호: 4 및 572)으로 이루어진 군으로부터 선택된 듀플렉스 구조를 갖는 RNAi 작용제.
  41. 제1항 내지 제40항 중 어느 한 항의 RNAi 작용제를 포함하며, 제약상 허용되는 부형제를 포함하는 조성물.
  42. 제41항에 있어서, RNAi 작용제가 표적화 리간드에 접합된 것인 조성물.
  43. 제42항에 있어서, 표적화 리간드가 n-아세틸-갈락토사민을 포함하는 것인 조성물.
  44. 제43항에 있어서, 표적화 리간드가 표 7의 표적화 리간드로부터 선택된 것인 조성물.
  45. 제41항 내지 제44항 중 어느 한 항에 있어서, APOC3의 발현을 억제하기 위한 제2 RNAi 작용제를 추가로 포함하는 조성물.
  46. 제41항 내지 제44항 중 어느 한 항에 있어서, 1종 이상의 추가의 치료제를 추가로 포함하는 조성물.
  47. 제1항 내지 제40항 중 어느 한 항의 RNAi 작용제 또는 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항의 조성물의 유효량을 세포 내로 도입하는 것을 포함하는, 세포에서 APOC3 유전자의 발현을 억제하는 방법.
  48. 제47항에 있어서, 세포가 대상체 내에 있는 것인 방법.
  49. 제48항에 있어서, 대상체가 인간 대상체인 방법.
  50. 제47항 내지 제49항 중 어느 한 항에 있어서, APOC3 유전자 발현이 적어도 약 30%만큼 억제되는 것인 방법.
  51. 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항의 조성물의 치료 유효량을 APOC3-관련 질환 또는 장애의 치료를 필요로 하는 인간 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, APOC3-관련 질환 또는 장애를 치료하는 방법.
  52. 제51항에 있어서, 질환이 심혈관대사 질환인 방법.
  53. 제52항에 있어서, 질환이 고트리글리세리드혈증, 비만, 고지혈증, 비정상적 지질 및/또는 콜레스테롤 대사, 아테롬성동맥경화증, 심혈관 질환, 관상 동맥 질환, 고트리글리세리드혈증 유도된 췌장염, 대사 증후군, 제II형 당뇨병, 가족성 킬로마이크론혈증 증후군, 또는 가족성 부분 지방이영양증인 방법.
  54. 제51항 내지 제53항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제가 약 0.05 mg/인간 대상체의 체중 kg 내지 약 5.0 mg/인간 대상체의 체중 kg의 용량으로 투여되는 것인 방법.
  55. 제51항 내지 제53항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제가 2회 이상의 용량으로 투여되는 것인 방법.
  56. 제51항 내지 제53항 중 어느 한 항에 있어서, 용량이 피하 주사에 의해 투여되는 것인 방법.
  57. 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항의 조성물의 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 트리글리세리드 수준을 저하시키는 방법.
  58. 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항의 조성물의 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 콜레스테롤 수준을 저하시키는 방법.
  59. 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항의 조성물의 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 저밀도 지단백질 (LDL) 수준을 저하시키는 방법.
  60. 적어도 부분적으로 APOC3 유전자 발현에 의해 매개되는 질환, 장애, 또는 증상을 치료하기 위한, 제1항 내지 제40항 중 어느 한 항에 따른 RNAi 작용제의 용도.
  61. 적어도 부분적으로 APOC3 유전자 발현, 상승된 트리글리세리드 수준, 또는 상승된 콜레스테롤 수준에 의해 매개되는 질환, 장애, 또는 증상을 치료하기 위한, 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항에 따른 조성물의 용도.
  62. 적어도 부분적으로 APOC3 유전자 발현에 의해 매개되는 질환, 장애, 또는 증상을 치료하기 위한 의약의 제조를 위한, 제41항 내지 제46항 중 어느 한 항에 따른 조성물의 용도.
  63. 제60항 내지 제63항 중 어느 한 항에 있어서, 질환이 고트리글리세리드혈증, 비만, 고지혈증, 비정상적 지질 및/또는 콜레스테롤 대사, 아테롬성동맥경화증, 심혈관 질환, 관상 동맥 질환, 고트리글리세리드혈증 유도된 췌장염, 대사 증후군, 제II형 당뇨병, 가족성 킬로마이크론혈증 증후군, 또는 가족성 부분 지방이영양증인 용도.
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