PL186381B1 - Wyizolowana sekwencja DNA kodująca sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka, sekwencja aminokwasowa sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemniaka, wektor oraz sposób otrzymywania transgenicznych ziemniaków - Google Patents
Wyizolowana sekwencja DNA kodująca sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka, sekwencja aminokwasowa sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemniaka, wektor oraz sposób otrzymywania transgenicznych ziemniakówInfo
- Publication number
- PL186381B1 PL186381B1 PL96326975A PL32697596A PL186381B1 PL 186381 B1 PL186381 B1 PL 186381B1 PL 96326975 A PL96326975 A PL 96326975A PL 32697596 A PL32697596 A PL 32697596A PL 186381 B1 PL186381 B1 PL 186381B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- starch
- enzyme
- potato
- vector
- cross
- Prior art date
Links
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 title claims abstract description 55
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 title claims abstract description 52
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 title claims abstract description 51
- 239000008107 starch Substances 0.000 title claims abstract description 51
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 title claims abstract description 48
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 title claims description 53
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 title claims description 53
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 title claims description 51
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 39
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 32
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 32
- 229920000945 Amylopectin Polymers 0.000 claims abstract description 24
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 16
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 claims abstract description 13
- 229920000856 Amylose Polymers 0.000 claims abstract description 11
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims abstract description 7
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract 3
- 102000003925 1,4-alpha-Glucan Branching Enzyme Human genes 0.000 claims abstract 2
- 108090000344 1,4-alpha-Glucan Branching Enzyme Proteins 0.000 claims abstract 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims description 25
- 229920001592 potato starch Polymers 0.000 claims description 17
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 16
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 8
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 8
- 108010039811 Starch synthase Proteins 0.000 claims description 7
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 7
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 claims description 4
- 239000002994 raw material Substances 0.000 claims description 3
- 230000001603 reducing effect Effects 0.000 claims description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims 3
- 229920001503 Glucan Polymers 0.000 claims 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 2
- 108010023236 starch synthase II Proteins 0.000 claims 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims 1
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims 1
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 claims 1
- 239000010985 leather Substances 0.000 claims 1
- 239000000155 melt Substances 0.000 claims 1
- 125000000740 n-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 claims 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims 1
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 30
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 14
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 14
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 13
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 11
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 9
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 8
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 7
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 6
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 6
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 6
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 5
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- OBMZMSLWNNWEJA-XNCRXQDQSA-N C1=CC=2C(C[C@@H]3NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](NC(=O)N(CC#CCN(CCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](CC4=CC=CC=C4)NC3=O)C(=O)N)CC=C)NC(=O)[C@@H](N)C)CC3=CNC4=C3C=CC=C4)C)=CNC=2C=C1 Chemical compound C1=CC=2C(C[C@@H]3NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](NC(=O)N(CC#CCN(CCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](CC4=CC=CC=C4)NC3=O)C(=O)N)CC=C)NC(=O)[C@@H](N)C)CC3=CNC4=C3C=CC=C4)C)=CNC=2C=C1 OBMZMSLWNNWEJA-XNCRXQDQSA-N 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101710176384 Peptide 1 Proteins 0.000 description 3
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000012538 ammonium bicarbonate Nutrition 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- OMSMPWHEGLNQOD-UWVGGRQHSA-N Asn-Phe Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMSMPWHEGLNQOD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- DBWYWXNMZZYIRY-LPEHRKFASA-N Asp-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O DBWYWXNMZZYIRY-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NTISAKGPIGTIJJ-IUCAKERBSA-N Leu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C NTISAKGPIGTIJJ-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- 101710177361 Soluble starch synthase 1, chloroplastic/amyloplastic Proteins 0.000 description 2
- GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 2
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 2
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 2
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 2
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010091871 leucylmethionine Proteins 0.000 description 2
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NTUPOKHATNSWCY-PMPSAXMXSA-N (2s)-2-[[(2s)-1-[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoic acid Chemical compound C([C@@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 NTUPOKHATNSWCY-PMPSAXMXSA-N 0.000 description 1
- VZQHRKZCAZCACO-PYJNHQTQSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]propanoyl]amino]prop-2-enoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N VZQHRKZCAZCACO-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 1
- TVYLLZQTGLZFBW-ZBFHGGJFSA-N (R,R)-tramadol Chemical compound COC1=CC=CC([C@]2(O)[C@H](CCCC2)CN(C)C)=C1 TVYLLZQTGLZFBW-ZBFHGGJFSA-N 0.000 description 1
- YRIZYWQGELRKNT-UHFFFAOYSA-N 1,3,5-trichloro-1,3,5-triazinane-2,4,6-trione Chemical compound ClN1C(=O)N(Cl)C(=O)N(Cl)C1=O YRIZYWQGELRKNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OTEWWRBKGONZBW-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-azaniumylacetyl)amino]-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]acetate Chemical compound NCC(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O OTEWWRBKGONZBW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010043797 4-alpha-glucanotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 1
- PNALXAODQKTNLV-JBDRJPRFSA-N Ala-Ile-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PNALXAODQKTNLV-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 1
- SGFBVLBKDSXGAP-GKCIPKSASA-N Ala-Phe-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)O)N SGFBVLBKDSXGAP-GKCIPKSASA-N 0.000 description 1
- WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N Ala-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YNOCMHZSWJMGBB-GCJQMDKQSA-N Ala-Thr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YNOCMHZSWJMGBB-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- 241000272814 Anser sp. Species 0.000 description 1
- JTKLCCFLSLCCST-SZMVWBNQSA-N Arg-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 JTKLCCFLSLCCST-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- QMQZYILAWUOLPV-JYJNAYRXSA-N Arg-Tyr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QMQZYILAWUOLPV-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- QEYJFBMTSMLPKZ-ZKWXMUAHSA-N Asn-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QEYJFBMTSMLPKZ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N Asn-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- UGXVKHRDGLYFKR-CIUDSAMLSA-N Asn-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O UGXVKHRDGLYFKR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- RLHANKIRBONJBK-IHRRRGAJSA-N Asn-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N RLHANKIRBONJBK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FHCRKXCTKSHNOE-QEJZJMRPSA-N Asn-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N FHCRKXCTKSHNOE-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N Asn-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NSTBNYOKCZKOMI-AVGNSLFASA-N Asn-Tyr-Glu Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O NSTBNYOKCZKOMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- XEDQMTWEYFBOIK-ACZMJKKPSA-N Asp-Ala-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XEDQMTWEYFBOIK-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- XBQSLMACWDXWLJ-GHCJXIJMSA-N Asp-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O XBQSLMACWDXWLJ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- AXXCUABIFZPKPM-BQBZGAKWSA-N Asp-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O AXXCUABIFZPKPM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- VFUXXFVCYZPOQG-WDSKDSINSA-N Asp-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O VFUXXFVCYZPOQG-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- OMMIEVATLAGRCK-BYPYZUCNSA-N Asp-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O OMMIEVATLAGRCK-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N Asp-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- ZXRQJQCXPSMNMR-XIRDDKMYSA-N Asp-Lys-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N ZXRQJQCXPSMNMR-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- RXBGWGRSWXOBGK-KKUMJFAQSA-N Asp-Lys-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O RXBGWGRSWXOBGK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PWAIZUBWHRHYKS-MELADBBJSA-N Asp-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O PWAIZUBWHRHYKS-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- BKOIIURTQAJHAT-GUBZILKMSA-N Asp-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 BKOIIURTQAJHAT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- PDIYGFYAMZZFCW-JIOCBJNQSA-N Asp-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O PDIYGFYAMZZFCW-JIOCBJNQSA-N 0.000 description 1
- HCOQNGIHSXICCB-IHRRRGAJSA-N Asp-Tyr-Arg Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)O HCOQNGIHSXICCB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-M Bromide Chemical compound [Br-] CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- UKVGHFORADMBEN-GUBZILKMSA-N Cys-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O UKVGHFORADMBEN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DSTWKJOBKSMVCV-UWVGGRQHSA-N Cys-Tyr Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 DSTWKJOBKSMVCV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- XMPAXPSENRSOSV-RYUDHWBXSA-N Glu-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O XMPAXPSENRSOSV-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N Glu-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- YRMZCZIRHYCNHX-RYUDHWBXSA-N Glu-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O YRMZCZIRHYCNHX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- XBWMTPAIUQIWKA-BYULHYEWSA-N Gly-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CN XBWMTPAIUQIWKA-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- FIQQRCFQXGLOSZ-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FIQQRCFQXGLOSZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YFGONBOFGGWKKY-VHSXEESVSA-N Gly-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)CN)C(=O)O YFGONBOFGGWKKY-VHSXEESVSA-N 0.000 description 1
- SWQALSGKVLYKDT-UHFFFAOYSA-N Gly-Ile-Ala Natural products NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NC(C)C(O)=O SWQALSGKVLYKDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CVFOYJJOZYYEPE-KBPBESRZSA-N Gly-Lys-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O CVFOYJJOZYYEPE-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- FXLVSYVJDPCIHH-STQMWFEESA-N Gly-Phe-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FXLVSYVJDPCIHH-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N His-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- JIUYRPFQJJRSJB-QWRGUYRKSA-N His-His-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CN=CN1 JIUYRPFQJJRSJB-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- DPQIPEAHIYMUEJ-IHRRRGAJSA-N His-Lys-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N DPQIPEAHIYMUEJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- PYNPBMCLAKTHJL-SRVKXCTJSA-N His-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PYNPBMCLAKTHJL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CCUSLCQWVMWTIS-IXOXFDKPSA-N His-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CCUSLCQWVMWTIS-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- VAXBXNPRXPHGHG-BJDJZHNGSA-N Ile-Ala-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N VAXBXNPRXPHGHG-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- WECYRWOMWSCWNX-XUXIUFHCSA-N Ile-Arg-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WECYRWOMWSCWNX-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- LPFBXFILACZHIB-LAEOZQHASA-N Ile-Gly-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N LPFBXFILACZHIB-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- UASTVUQJMLZWGG-PEXQALLHSA-N Ile-His-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)NCC(=O)O)N UASTVUQJMLZWGG-PEXQALLHSA-N 0.000 description 1
- BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- MDVZJYGNAGLPGJ-KKUMJFAQSA-N Leu-Asn-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MDVZJYGNAGLPGJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- MPSBSKHOWJQHBS-IHRRRGAJSA-N Leu-His-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N MPSBSKHOWJQHBS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- INCJJHQRZGQLFC-KBPBESRZSA-N Leu-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O INCJJHQRZGQLFC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- UHNQRAFSEBGZFZ-YESZJQIVSA-N Leu-Phe-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N UHNQRAFSEBGZFZ-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- RRVCZCNFXIFGRA-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RRVCZCNFXIFGRA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N Leu-Val-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- FSNCEEGOMTYXKY-JTQLQIEISA-N Lycoperodine 1 Natural products N1C2=CC=CC=C2C2=C1CN[C@H](C(=O)O)C2 FSNCEEGOMTYXKY-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- GQUDMNDPQTXZRV-DCAQKATOSA-N Lys-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O GQUDMNDPQTXZRV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XREQQOATSMMAJP-MGHWNKPDSA-N Lys-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O XREQQOATSMMAJP-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 1
- YXPJCVNIDDKGOE-MELADBBJSA-N Lys-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O YXPJCVNIDDKGOE-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N Lys-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- QEVRUYFHWJJUHZ-DCAQKATOSA-N Met-Ala-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C QEVRUYFHWJJUHZ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XMMWDTUFTZMQFD-GMOBBJLQSA-N Met-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCSC XMMWDTUFTZMQFD-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- PESQCPHRXOFIPX-RYUDHWBXSA-N Met-Tyr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710091688 Patatin Proteins 0.000 description 1
- BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N Phe-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N Phe-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N Phe-Pro Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N1[C@@H](CCC1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- BSKMOCNNLNDIMU-CDMKHQONSA-N Phe-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O BSKMOCNNLNDIMU-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- 101001135788 Pinus taeda (+)-alpha-pinene synthase, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- ICTZKEXYDDZZFP-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Pro Chemical compound N([C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 ICTZKEXYDDZZFP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ILMLVTGTUJPQFP-FXQIFTODSA-N Pro-Asp-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ILMLVTGTUJPQFP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VWXGFAIZUQBBBG-UWVGGRQHSA-N Pro-His-Gly Chemical compound C([C@@H](C(=O)NCC(=O)[O-])NC(=O)[C@H]1[NH2+]CCC1)C1=CN=CN1 VWXGFAIZUQBBBG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XYSXOCIWCPFOCG-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XYSXOCIWCPFOCG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RVQDZELMXZRSSI-IUCAKERBSA-N Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 RVQDZELMXZRSSI-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N Pro-Ser-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- AWJGUZSYVIVZGP-YUMQZZPRSA-N Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 AWJGUZSYVIVZGP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 101100463797 Rattus norvegicus Pgrmc1 gene Proteins 0.000 description 1
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N Ser-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XERQKTRGJIKTRB-CIUDSAMLSA-N Ser-His-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)N)CC1=CN=CN1 XERQKTRGJIKTRB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HEUVHBXOVZONPU-BJDJZHNGSA-N Ser-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HEUVHBXOVZONPU-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- LRZLZIUXQBIWTB-KATARQTJSA-N Ser-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRZLZIUXQBIWTB-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N Thr-Ser-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- MZZINWWGSYUHGU-UHFFFAOYSA-J ToTo-1 Chemical compound [I-].[I-].[I-].[I-].C12=CC=CC=C2C(C=C2N(C3=CC=CC=C3S2)C)=CC=[N+]1CCC[N+](C)(C)CCC[N+](C)(C)CCC[N+](C1=CC=CC=C11)=CC=C1C=C1N(C)C2=CC=CC=C2S1 MZZINWWGSYUHGU-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- VZBWRZGNEPBRDE-HZUKXOBISA-N Trp-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N VZBWRZGNEPBRDE-HZUKXOBISA-N 0.000 description 1
- ICNFHVUVCNWUAB-SZMVWBNQSA-N Trp-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N ICNFHVUVCNWUAB-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- PXQPYPMSLBQHJJ-WFBYXXMGSA-N Trp-Asp-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N PXQPYPMSLBQHJJ-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 1
- DYIXEGROAOVQPK-VFAJRCTISA-N Trp-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N)O DYIXEGROAOVQPK-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- NQIHMZLGCZNZBN-PXNSSMCTSA-N Trp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)N)C(O)=O)=CNC2=C1 NQIHMZLGCZNZBN-PXNSSMCTSA-N 0.000 description 1
- FHHYVSCGOMPLLO-IHPCNDPISA-N Trp-Tyr-Asp Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 FHHYVSCGOMPLLO-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- IELISNUVHBKYBX-XDTLVQLUSA-N Tyr-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 IELISNUVHBKYBX-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- JFDGVHXRCKEBAU-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asp-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JFDGVHXRCKEBAU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N Tyr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- OKDNSNWJEXAMSU-IRXDYDNUSA-N Tyr-Phe-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OKDNSNWJEXAMSU-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ISERLACIZUGCDX-ZKWXMUAHSA-N Val-Asp-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ISERLACIZUGCDX-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N Val-Gly-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- ZIGZPYJXIWLQFC-QTKMDUPCSA-N Val-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O ZIGZPYJXIWLQFC-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- JZWZACGUZVCQPS-RNJOBUHISA-N Val-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N JZWZACGUZVCQPS-RNJOBUHISA-N 0.000 description 1
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- HJSLDXZAZGFPDK-ULQDDVLXSA-N Val-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](C(C)C)N HJSLDXZAZGFPDK-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- USXYVSTVPHELAF-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O USXYVSTVPHELAF-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- QPJSIBAOZBVELU-BPNCWPANSA-N Val-Tyr-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N QPJSIBAOZBVELU-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- RLVTVHSDKHBFQP-ULQDDVLXSA-N Val-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)CC1=CC=C(O)C=C1 RLVTVHSDKHBFQP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- NLNCNKIVJPEFBC-DLOVCJGASA-N Val-Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NLNCNKIVJPEFBC-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- CUJRVFIICFDLGR-UHFFFAOYSA-N acetylacetonate Chemical compound CC(=O)[CH-]C(C)=O CUJRVFIICFDLGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 235000011389 fruit/vegetable juice Nutrition 0.000 description 1
- 239000003517 fume Substances 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 108010020688 glycylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 1
- RUCAXVJJQQJZGU-UHFFFAOYSA-M hydron;2-(phosphonatomethylamino)acetate;trimethylsulfanium Chemical compound C[S+](C)C.OP(O)(=O)CNCC([O-])=O RUCAXVJJQQJZGU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 108010078274 isoleucylvaline Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010089198 phenylalanyl-prolyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 1
- 238000000751 protein extraction Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- -1 sodium dithionin Chemical compound 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700004896 tripeptide FEG Proteins 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 108010045269 tryptophyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010021889 valylvaline Proteins 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1048—Glycosyltransferases (2.4)
- C12N9/1051—Hexosyltransferases (2.4.1)
- C12N9/107—1,4-Alpha-glucan branching enzyme (2.4.1.18)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
Abstract
1. Wyizolowana sekwencja DNA kodujaca sieciujacy skrobie enzym II (SBE II) ziemniaka, zawierajaca sekwencje nukleotydowa przedstawiona na sekwencji SEQ ID Nr 1 i warianty tej sekwencji powstale w wyniku degeneracji kodu genetycznego. PL PL PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest wyizolowana sekwencja DNA kodująca sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka, zawierająca sekwencję nukleotydową przedstawioną na sekwencji SEQ ID Nr 1 i warianty tej sekwencji powstałe w wyniku degeneracji kodu genetycznego.
Korzystnie przedmiot wynalazku stanowi fragment tej sekwencji o wielkości od 50 do 3074 par zasad, posiadający sekwencję' nukleotydową przedstawioną na sekwencji SEQ ID Nr 1, oraz jego warianty powstałe w wyniku degeneracji kodu genetycznego, zdolny do powodowania zmian w proporcji amyloza/amylopektyna w skrobi ziemniaczanej, jak również do zmniejszania lub zmiany wzorów usieciowania amyk>pentyny.
Przedmiotem wynalazku jest również sekwencja aminokwasowa sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemmaka posiadająca sekwencję aminokwasów pszedstawioną. ka sekwencji SEQ IDNr 1.
Preedmiot wynalazku stanowi także wektor zawierający całą lub aktywną funkcjonalnie część wyizolow^ej s^eikwencji DNA. prze dstawionej na SEQ ID Nr 1 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemnienu.
Korzystnie zawarta w wektorze sekwencja DNA usytuowana jest w orientacji antysensywnej (odwróconej) względem promotora znajdującego się bezpośrednio w górę od tej sekwencj i DNA.
Krn^stnio ^^Ι^ο' dotyczy wektora, który zawiera całą lub aktywną funkcjonalnie część sekwencji DNA przedstawionej na sekwencji SEw RO Nr 2 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemniaku.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób otrzymywania lrαnsgenicznych ziemniaków o podwyższonym lub obniżonym stopniu usieciowania amylopektyny skrobiowej, polegający na tym, żo do genomu komórki ziemniaka przenosi się i wprowadza wektor zawierający całą lub aktywną malmie część ąyeizolpsnanej sekwencji DNA pyzedrrawiynej na
SEQ ID Nr 1 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemniaku, a następnie regeneruje się z tych transformowanych komórek nienaruszone, całe rośliny.
Korzystnie przedmiot wynalazku stanowi sposób, w którym stosuje się ^ktrn zawierający całą Mb αpryWną frmkcjonalnie część sekwencji DNA przed^wionej na sekwencji. SEQ ID Ną 2 oraz elementy jegulacyjne ektyą^ie w nierąniaku.
Korzystnie stosuje się wektor z zawartą w nim sekwencją DNA usytuowaną w orientacji antysensownej (odytróco net) względem promotora z^jd^ąc ego się bezpośsednyo w górę od ten sekwencji DNA.
Korzystniej stosuje się wektor zawierający również konstrukcję entysensowną dla sieciującego skrobię enzymu I (SBE I).
186 381
Korzystnie stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla związanej z ziarenkami skrobi syntazy skrobiowej II ziemniaka.
Korzystnie stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla rozpuszczalnych syntaz skrobiowych II i III ziemniaka.
Korzystnie stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla enzymu dysproporcjonującego skrobię (enzymu D) ziemniaka.
Korzystnie stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla enzymu de-sieciującego skrobię ziemniaka.
Nowa sekwencja DNA kodująca SBE II, zawierająca 3074 nukleotydów oraz odpowiadająca jej sekwencja aminokwasowa zawierająca 878 aminokwasów, są przedstawione na sekwencji SEQ ID Nr 1. Jeden fragment o długości 1393 nukleotydów z powyższej sekwencji DNA, odpowiadający nukleotydom 1007 do 2399 z sekwencji DNA podanej na SEQ ID Nr 1, jak również odpowiadająca mu sekwencja aminokwasowa zawierająca 464 aminokwasów są przedstawione na sekwencji SEQ ID Nr 2.
Wynalazek jest opisany bardziej szczegółowo w części eksperymentalnej i zilustrowany załączonymi rysunkami, na których:
Figura 1 przedstawia elektroforezę w żelu poliakryloamidowym SDS białek wyekstrahowanych ze skrobi pochodzącej z normalnych ziemniaków (pasmo A) i z ziemniaków transgenicznych (pasmo B). Wycięte pasma białka są oznaczone strzałkami. Pasmo M zawiera białka - markery mas cząsteczkowych (podanych w kDa).
Figura 2 przedstawia cztery sekwencje peptydowe pochodzące z trawionych białek ze skrobi otrzymanej z bulw ziemniaczanych.
Przykłady wykonania
Izolowanie skrobi z bulw ziemniaczanych
Rośliny ziemniaka (Solanum tuberosum) hodowano na polu. Obrane ze skórki ziemniaki, zarówno z odmiany Early Puritan jak i z linii roślin transgenicznych, w zasadzie nie zawierających związanej z ziarnami syntazy skrobi I (Svalóf Weibull AB, publikacja zgłoszenia patentowego międzynarodowego, PCT/SE91/00892) homogenizowano w temperaturze 4°C w sokowirówce. Do „frakcji soku” zawierającej duże ilości skrobi, natychmiast dodano Tris HCl (pH = 7,5) do stężenia 50 mM, dwutionin sodu do stężenia 30 mM i kwas etylenodwuaminoczterooctowy (EDTA) do stężenia 10 mM. Zawiesinę pozostawiono na 30 minut w celu sedymentacji granulek skrobi, następnie przemyto 4 razy buforem do przemywania o składzie: 50 mM Tris HCl (pH = 7,5), 10 mM EDTA, użytym w ilościach odpowiadających 10 objętościom złoża. Skrobię, którą pozostawiano na półce w temperaturze 4°C na 30 minut do sedymentacji pomiędzy każdym przemywaniem ostatecznie przemyto 3 razy ilościami acetonu odpowiadającymi 3 objętościom złoża, wysuszono na powietrzu przez dobę i przechowywano w temperaturze -20°C.
Ekstrakcja białek ze skrobi pochodzącej z bulw
Przechowaną skrobię (20 g) ciągle mieszano z 200 ml buforu do ekstrakcji [2% wagowo-objętościowych 50 mM Tris HCl o pH 7,5, dodecylosiarczan sodowy (SDS), 5 mM EDTA] przez zasysanie pipetą w temperaturze 85°C do czasu żelatynizacji skrobi. Następnie próbki utrzymywano w temperaturze -70°C przez godzinę. Po rozmrożeniu w temperaturze 50°C, próbki wirowano przez 20 minut z prędkością 12000 g w temperaturze 10°C. Supematanty zebrano i powtórnie wirowano z prędkością 3000 g przez 15 minut. Końcowe supematanty przefiltrowano przez filtry o średnicy porów 0,45 μ i dodano 2,25 objętości oziębionego lodem acetonu. Po 30 minutach inkubacji w temperaturze 4°C zebrano osady białka przez wirowanie z prędkością 3000 g w czasie 30 minut w temperaturze 4°C i rozpuszczono w 50 mM Tris HCl (pH = 7,5). Próbki każdego preparatu analizowano metodą elektroforezy w żelu poliakryloamidowym SDS, postępując w sposób opisany przez Laemmli'ego (1970) (fig. 1). Białka znajdujące się w pozostałych porcjach preparatów zatężono przez strącenie 10 procentowym kwasem trójchlorooctowym i rozdzielono je w 8% żelu poliakryloamidowym SDS, w sposób opisany przez Laemmli'ego (1970). Białka w żelu barwiono jaskrawym błękitem kwasowym R-250 (0,2% w roztworze zawierającym 20% metanolu. 0,5°/o kwasu octowego i 79,5% wody)
Trawienie w żelu i sekwencjonowanie peptydów
186 381
Barwione pasma (na fig. 1 oznaczone strzałkami) odpowiadające pozornej masie cząsteczkowej około 100 kDa, wycięto i przemyto dwukrotnie 0,2 M roztworem NH4HCO3 w 50% acetonitrylu w warunkach ciągłego mieszania, w temperaturze 35°C w czasie 20 minut. Po każdym przemyciu usuwano ciecz a kawałki żelu suszono przez odparowanie pod wyciągiem. Całkowicie wysuszone kawałki żelu umieszczano oddzielnie na parafilmie i dodawano po 2 pl roztworu zawierającego 0,2 M NH4HCO3 i 0,02% Tween'u-20. Do kawałków żelu wprowadzano przez zasysanie po 0,25 pg modyfikowanej trypsyny (w 2 pl roztworu) dostarczonej przez firmę Promega, Madison WI (USA) i następnie dodawano 0,2 M roztwór NH4HCO3 w porcjach po 5 pl aż do osiągnięcia pierwotnych rozmiarów. Każdy kawałek żelu dzielono następnie na trzy części i przenoszono do probówek Eppendorfa. Dodano po 200 pl 0,2 M roztworu NH4HCO3 i trawiono białka zawarte w kawałkach żelu w temperaturze 37°C przez dobę (Rosenfeld i wsp. 1992). Po zakończeniu trawienia dodano kwas trójfluorooctowy do stężenia 1%. supernatanty usunięto i zachowano. Kawałki żelu dalej ekstrahowano dwa razy roztworem zawierającym 60% acetonitrylu i 0,1% kwasu trójfluorooctowego (po 200 pl) w warunkach ciągłego wstrząsania, w temperaturze 37°C przez 20 minut. Dwa supernatanty pochodzące z tych ekstrakcji połączono z pierwszym supernatantem. Kawałki żelu ostatecznie przemyto roztworem zawierającym 60% acetonitrylu, 0,1% kwasu trójfluorooctowego
0,02% Tween'u-20 (po 200 pl). Te supernatanty również połączono z poprzednimi i zmniejszono ich objętość do 50 pl przez odparowanie. Ekstrahowane peptydy rozdzielono w zestawie chromatograficznym SMART® (firmy Pharmacia, Upsala, Szwecja) wyposażonym w kolumnę pRPC C2/C18 SC2.1/10. Peptydy eluowano w gradiencie 0 do 60% acetonitrylu w wodnym 0,1% roztworze 0,1% kwasu tróffluorocotowego, w czasie 60 minut, z szybkością przepływu 100 pl/min. Peptydy sekwencjonowano albo w aparacie do sekwencjonowania firmy Applied Biosystems, model 470A, w fazie gazowej, wyposażonym w analizator aminokwasów on-line PTH (120A) albo w modelu 47 6A tej samej firmy, postępując według instrukcji producenta (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA).
Cztery spośród sekwencjonowanych peptydów miały sekwencje łatwe do interpretacji (fig. 2). Poszukiwania w bazie danych ujawniły, że te cztery peptydy wykazują podobieństwo do enzymów sieciujących skrobię i co ciekawe, peptydy te wykazują większe pokrewieństwo z sieciującym skrobię enzymem II z innych gatunków roślin niż z sieciującym skrobię enzymem I z ziemniaka.
Konstruowanie oligonukleotydów kodujących peptyd 1 i peptyd 2.
Syntetyzowano następujące degenerowane oligonukleotydy kodujące peptyd 1 i peptyd oraz odwrócone primery:
Oligonukleotyd 1: 5'-gtaaaacgacggccagt-TTYGGNGTNTGGGARATHTT-3' (reszty 2 do 8 z peptydu 1)
Oligonukleotyd 2: 5'-aattaaccctcactaaaggg-CKRTCRAAYTCYTGIARNCC-3' (reszty 2 do 8 z peptydu 2, nić odwrócona), gdzie H oznacza A, C albo T; I oznacza inozynę; K oznacza G albo T; N oznacza A, C, G albo T; R oznacza A albo G; Y oznacza C albo T; zasady w niższej sekwencji dodano jako sekwencje tag.
Oczyszczanie mRNA z bulw ziemniaczanych, synteza cDNA i amplifikacja w reakcji z udziałem polimerazy (PCR) fragmentu cDNA odpowiadającego sieciującemu skrobię enzymowi II ziemniaka.
Całkowity RNA izolowano z dojrzałych bulw ziemniaczanych (S. tuberosum, odmiana Amanda) w sposób opisany przez Logemann'a i wsp. (1987). Pierwszą nić cDNA syntetyzowano stosując 2 pg całkowitego RNA i 60 pmoli oligo-dT3o jako primer kierunku w dół. Primer ten łączono na gorąco (w temperaturze 60°C) z poli A mRNA w czasie 5 minut. Wydłużanie cDNA prowadzono w zestawie do syntezy cDNA „Riboclone® cDNA Synthesis System M-MLY (H-)” firmy Promega, postępując zgodnie z przepisem podanym w instrukcji producenta.
Amplifikację cDNA kodującego nowy, sieciujący skrobię enzym II według wynalazku, prowadzono w aparacie „GeneAmp® 9600 PGR thermocycler” do amplifikacji w reakcji PCR dostarczonym przez firmę Perkin-Elmer Cetus Instruments (CT, Stany Zjednoczone), stosując te dwa degenerowane primery skonstruowane na podstawie z peptydów 1 i 2 (jak
186 381 wyżej) stosując następujące warunki: 1 mM dNTP, po 1 μΜ każdego primera i ilość cDNA podana powyżej w całkowitej objętości mieszaniny reakcyjnej 20 μΐ. Mieszanina zawierała ponadto bufor 1 x AmpliTaą® i 0,8 jednostki AmpliTaą® (Perkin-Elmer Cetus). Warunki przebiegu poszczególnych cykli były następujące: temperatura 96°C przez minutę, temperatura 80°C w czasie dodawania enzymu inicjującego reakcję (około 15 minut), mimowolny spadek temperatury do 25°C, pięć cykli utrzymywania w temperaturze 94°Ć przez 20 sekund, w temperaturze 45°C przez minutę z następnym wzrostem temperatury do 72°C w ciągu minuty i utrzymywaniem w 72°C przez 2 minuty, następnie 30 cykli w temperaturze 94°C przez 5 sekund, w temperaturze 45°C przez 30 sekund i 72°C przez (2 minuty + 2 sekundy na cykl) i zakończenie reakcji w temperaturze 72°C w czasie 10 minut, po czym schłodzenie do temperatury 4°C.
Próbkę tej mieszaniny reakcyjnej (0,1 μΐ) reamplifikowano stosując następujące warunki w poszczególnych cyklach: temperatura 96°C przez minutę, 80°C w czasie dodawania enzymu (około 5 minut), 5 cykli w temperaturze 94°C przez 20 sekund, 45°C przez minutę i 72°C przez 2 minuty, 25 cykli w temperaturze 94°C przez 5 sekund, 45°C przez 30 sekund i 72°C przez (2 minuty + 2 sekundy na cykl) i zakończenie reakcji w temperaturze 72°C w czasie 10 minut, po czym schłodzenie do temperatury 4°C. Po zakończeniu amplifikacji PCR, mieszaninę reakcyjną naniesiono na 1,5% zel agarozowy Seakem® (FMC Bioproducts, Rockland, ME, Stany Zjednoczone). Po wykonaniu elektroforezy i barwienia bromkiem etidium, wycięto większe pasmo o względnej długości 1500 par zasad i eluowano ten fragment przez wytrząsanie z wodą (200 μΐ) przez godzinę. Ten fragment użyto jako matrycę w reakcjach sekwencjonowania po reamplifikacji, stosując primery odpowiadające sekwencjom taq (w oligonukleotydach 1 i 2), po czym prowadzono oczyszczanie metodą elektroforezy w żelu agarozowym w sposób opisany powyżej i ekstrakcję z żelu w zestawie do ekstrakcji Qiaex®, postępując według instrukcji producenta tego zestawu (DIAGEN GmbH, Hilden, Niemcy). Reakcje sekwencj ono wania prowadzono w zestawach do końcowego cyklicznego sekwencjonowania, „DyeDeoxy® Terminator Cycle Sequencing kits” dostarczanych przez firmę Perkin-Elmer Cetus Instruments), stosując sekwencje taq i primery wewnętrzne. Produkty reakcji sekwencj ono wania analizowano w aparacie do sekwencj ono wania DNA, typ 3 73 A firmy Applied Biosystems, postępując zgodnie z instrukcjami producenta. Edytowana sekwencja zawierała 1393 pary zasad.
W celu uzupełnienia oznaczenia sekwencji dla sieciującego skrobię enzymu II, amplifikowano końce 5' i 3' cDNA o pełnej długości, wychodząc z tego samego całkowitego RNA jak poprzednio, stosując metodologię RACE szybkiej amplifikacji końców cDNA z użyciem specyficznych primerów pochodzących z sekwencji o długości 1393 par zasad. W amplifikacji końca 3' użyto primer oligo-T29G wobec ogona poli A a amplifikację końca 5' prowadzono stosując zestaw 573' RACE dostarczany przez firmę Boehringer Mannheim (Numer katalogowy 1734792). Fragmenty uzyskane z tych amplifikacji sekwencj onowano w ten sam sposób jak poprzednio, stosując primery dla części wewnętrznej i końców. Sekwencje z tych dwóch końców nałożono na sekwencję o długości 1393 par zasad otrzymując złożoną sekwencję cDNA o pełnej długości. Z tej sekwencji wyznaczono primery do amplifikacji całego regionu kodującego w całości. Częściowe sekwencjonowanie amplifikowanej kodującej sekwencji cDNA potwierdziło obecność cDNA odpowiadającego tej złożonej sekwencji. Sekwencja cDNA o pełnej długości składa się z 3074 par zasad a sekwencja podlegająca translacji odpowiada 878 aminokwasom. Dojrzałe białko zawiera 830 aminokwasów.
Porównanie sekwencji consensus z bazami danych EMBL i GenBank wykazało 68 procentową identyczność z sieciującym skrobię enzymem I ziemniaka i około 80 procentową identyczność z sieciującym skrobię enzymem II z innych gatunków roślin. Twórcy niniejszego wynalazku nazwali więc enzym kodowany przez nową sekwencję dla enzymu sieciującego, sieciującym skrobię enzymem II ziemniaka.
Transformowanie roślin ziemniaka
Wyizolowany cDNA o pełnej długości dla sieciującego skrobię enzymu II ziemniaka i inne aktywne funkcyjnie fragmenty o wielkości od 50 do 3074 par zasad sklonowano w odwrotnej orientacji za promotorami aktywnymi w bulwach ziemniaczanych. Określenie „ak8
186 381 tywne funkcyjnie” oznacza fragmenty, które wpływają na proporcję amyloza/amylopektyna w skrobi ziemniaczanej. Sekwencja DNA i sekwencja aminokwasowa SBE II według wynalazku oraz jeden fragment tego DNA i odpowiadająca mu sekwencja aminokwasowa są przedstawione odpowiednio na sekwencjach SEQ ID Nr 1 i 2.
Promotory można wybrać spośród np. promotora patatyny, promotora genu dla związanej z ziarenkami skrobi syntazy skrobi I ziemniaka albo z promotorów wyizolowanych z genów dla sieciujących skrobię enzymów I i II ziemniaka.
Konstrukcje te klonuje się technikami znanymi, albo w binarnym wektorze plazmidowym Ti nadającym się do transformacji ziemniaka za pośrednictwem Agrobacterium tumefaciens albo w wektorze nadającym się do bezpośredniej transformacji techniką bombardowania bądź elektroporacji. Jest oczywiste, że zarówno konstrukcje sensowne (opisane poniżej) jak i antysensowne muszą zawierać wszystkie niezbędne elementy regulacyjne.
W transgenicznych roślinach ziemniaka zachodzi transkrypcja odwrotnej (inwersyjnej) konstrukcji kodującej sieciujący skrobię enzym II, zwłaszcza w bulwach, co prowadzi do antysensownego hamowania tego enzymu. W ten sposób, w skrobi wytwarzanej w bulwach następuje zmniejszenie sieciowania i zmiana wzorów sieciowania amylopektyny a także zmiana proporcji: amyloza/amylopektyna.
W celach uzyskania zmian w stopniu usieciowania amylopektyny i zmian w proporcji: amyloza/amylopektyna, tę antysensowną konstrukcję dla sieciującego skrobię enzymu II ziemniaka stosuje się również do transformowania roślin ziemniaka w kombinacji z antysensownymi konstrukcjami dla sieciującego skrobię enzymu I, dla związanej z ziarenkami skrobi syntazy skrobiowej II ziemniaka, dla rozpuszczalnych syntaz skrobiowych II i III ziemniaka, dla enzymu dysproporcjonującego skrobię (enzymu D) ziemniaka bądź dla enzymu desieciujacego skrobię ziemniaka. Uzyskuje się dzięki temu nowy, cenny surowiec dla przemysłu przetwarzającego skrobię.
Sekwencję cDNA o pełnej długości, kodującą ten enzym klonuje się w różnych konstrukcjach również w orientacji sensownej, za jednym lub większą ilością promotorów wymienionych powyżej i otrzymane konstrukcje przenosi się do odpowiednich wektorów transformujących w sposób opisany powyżej i stosuje się do transformowania roślin ziemniaka. Regenerowane, transformowane rośliny ziemniaka będą wytwarzały w bulwach nadmiar sieciującego skrobię enzymu II, prowadząc do zwiększenia stopnia usieciowania i zmian we wzorach usieciowania amylopektyny albo do hamowania transkrypcji endogennego sieciującego skrobię enzymu II w wyniku ko-supresji, dając w rezultacie obniżony stopień usieciowania amylopektyny.
Piśmiennictwo:
Muller-Rober B., KoBmann J.: Approaches to influence starch quantity and starch quality in transgenic plants (Badania nad wpływem na ilość i jakość skrobi w transgenicznych roślinach), Plant Cell Environm. 17, 601-613 (1994),
Martin C., Smith A. : Starch Biosynthesis (Biosynteza skrobi), Plant Cell, 7, 971-985 (1995),
Laemmli U. K. : Cleavage of structural proteins during assembly of the head of bacteriophage T4 (Rozszczepienie białek strukturalnych podczas instalowania główki bakteriofaga T4) Nature, 227, 680-685 (1979),
Logemann J., Schell J. i Willmitzer L.: Improved method for the isolation of RNA from plant tissues (Ulepszony sposób izolowania RNA z tkanek roślinnych), Anal. Biochem., 163, 16-20(1987),
Rosenfeld J., Capdeville J., Guillemot J. C., Ferrara P.: In-gel digestion of proteins for internal sequence analysis after one- or two-dimensional gel electrophoresis (Trawienie białek w żelu do analizy sekwencji wewnętrznej po jedno- lub dwu-kierunkowej elektroforezie żelowej), Anal. Biochem. 203, 173-179 (1992),
Visser R. G. F., Jacobsen E.: Towards modifying plants for altered starch content and composition (Modyfikowanie roślin w celu zmiany zawartości i składu skrobi), TibTech 11, 63-68(1993).
186 381
Sekwencja SEQ ID Nr. 1
Sekwencjonowana cząsteczka: cDNA
Nazwa: gen beII (dla enzymu sieciującego II) z Solanum tuberosum (ziemniaki)
Długość sekwencji: 3074 par zasad
AAACCTCCTC CACTCAGrCT TTGTTTCTcr CTCTCTCTAC GCTTCTCTTG «CCCCITCSA 60
CTCAGCA^ TCACACTCAC TTACTTACAC TSCNCCCTCA TATCTCACCT TCTATTTTT 120
TCTTAATTCC CCCCCCC TCAATAAAAA CAJAAACCCC TAGCCGCGCA 180
CCCCC CTC (Π TCT CCC CTC TCT CC CTT CCT TT0 CCT CCT CTT CCC 230
Mit Vrl Tyr Tro lewi Ser Hy VaT Crg Phe Pro ThrE Val Pro
-45 -40 -35
TCC CC TAC CCC TCT CCT ICa TTT ACC ACC ?CT CCC <CC CCC! MC ACC 273
Sec Val Tyr Lys Ser Csn dy PPe Ser Sar Asn Gly dp dg Arę Asn
-30 -25 -20
CCT CCT NTT TCT CTC TTC TTC CCC CCC CCC TCT CTC TCC CC CCC CTC 323
C.r Csn Xrr Ser Val Phe Leu Lys Lys HLs Ser Leu Ser Cg Lys Ha
-15 -20 -3 ns CCT CC CCC TCT TCT TCC CCT TCC CCC TCC CCC CCT TCT CCC CTT 373
Lau dr Hu Lys Ser Sar Ty Csn Ser Hu Ser Crg Pro Ser Thr Val
10
CCC CCC TCC CCC CCC CC CTT CTC CCT CC CCC CM CCT CC MC TCC 422
C.r Cr Sar Cy Lys Val Lau Val Pro Cly Thr Cln Sar Csp Ser Ser
00 05 30
TCC TCC TCC CCC CC CCC TTT CTC TT CCT CG ACC TCT COC TCCC, JCT 420
Ser Ser Sar Thr Car Cln Phe Hu Kie TC GCu Thr Ser Pro Hu to.
40 42
TCC CCC CCC TCC CCT CT CTC CT CT TCC CCC CTC CCC CCC CCT CCC 5131
Ser Pro C·! Ser Thr Cp Vil Cup Ser Ser Thr Het Hu H.s Cr Ser
55 60
CCC CTT MC CCT CC CCC CCT CC CTT GCG CCC TCC. CCT CCT CTT CCC 565
Cln Ilr Lys T-.r Clu Cn Csp Cp Val Hu Pro Ser Ser Csp Leu Thr
00 75 <C3C CCT CTC CC CC CTC CCT TCT QCT TCC TCC CTC CCC CEC CM CCC 5141
C.y Ser Val Hu C.u Leu Λορ Phe dr Ser Ser Leu Ha Leu Cln Clu
35 90
HT CT CCC CTC CG CC TCT CC CCC TCC CT CCT TCT CCC CC CCC 562
C.y Hy Lys Leu Hu Clu Ser Lys Thr Leu Csn Thr Ser Hu Hu Thr
100 005 110
CTT CCT CCT CC TCT CT CU CTC .CCC CM MG CC CTC CCT CCC CCT 710
Ile Ile Csp Hu Ser Cp Crg He .Crg Hu Crg Hy Iie Pro Pro Pro
015 000 005
GGA. CTT CC CCC CM CT ę?T CC CCC CCC CTC TCC CCC. CC TCT 718
Hy Leu Hy Cln Lys Ile Tyr Hu He Cp Pro Leu Leu Hm to Tyr
030 035 040
CcT CCC CCC CTT CT TCC CC TCT TCC CM TCC CM CCC CTC MC d 806
Crg Cln H.s Leu Cp Tyr Crg Tyr Ser Cln Tyr Lys Ly3 Leu Cg Hu
145 150 155
186 381
| OTG | ATT | GAC | TAG | CAT | TCA | GGG | GGC | TT? | gca | GGC | TT? | TTC | CCC | CCC | TTG | 854 |
| G.a | Ile | Atp | pys | T?t | GCu | Gly | GCy | Lau | GCl | Ma | PPe | Sau | Aa: | Gly | T?r | |
| 160 | 165 | 170 | ||||||||||||||
| GGG | GAG | AIA | CC | TTT | CAC | CCC | AGC | GGC | AAC | GCG | AGC | AGC | TTA | CCC | GGA | 902 |
| C.u | Lya | Mer. | Gic | P ha | TTr | Mg | Ssr | Ma | T?h | Gly | Ile | TM | Tyr | M-gr | Glu | |
| 175 | 180 | 118 | UO | |||||||||||||
| TCC | CTT | CCC | CCC | TCC | TTA | TCC. | <CT | GGC | CCC | AAT | CCC | GCG | TTT | AGA | AAT | 955 |
| Trp | Ala | Pro | Gic | Ala | GCl | SSr | Ma | Ml | Łlu | Ile | GCy | AGp | PPe | Aci | Aan | |
| 195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
| TGG | GAC | GCG | AAG | TCC | TCA | ATT | ATC | GCT | CCG | GGT | CGG | ttt | CT | GTC | Tli | 999 |
| Trp | Asp | Ala | Ma | Ala | Aap | Ile | fMt | Uh | Jag | Mn | Gi^ | PPh | GCy | Val | Typ | |
| 210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
| GAG | ATT | mer | ck; | CCC. | AAA | AAG | GCT | GGG | CCC | TT? | CCC | GCC | JA? | CTT | CTA | 1004 |
| Glu | He | Phe | Laa | ?:p | ogn | Msn | Vaa | Ago | Gly | Ser | Pro | Ma | Ile | Par | Era | |
| 225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
| GGG | TCC | AiAg | GC | AAG | ca? | <ccc | ATG | <gc | Ad | CCG | KCG | GCC | CTT | AGA | GGG | 1099 |
| CA | A;r | Arg | Val | Lya | Ile | Mg | Met | Gra | TM | Pro | Ser | Gly | Val | Lya | Mo | |
| 240 | 244 | 2S0 | ||||||||||||||
| TOC | ATT | CC | Td | ?GG | cac | GC | TAC | kc; | Ta | CJGC | CTT | CCC | CG | CCA | AG? | 1114 |
| Ser | Ile | Pro | Ma | Tr? | Ile | Aan | r/r | Sse | JL«j | Gln | lasu | Pro | AGp) | Glu | Ile | |
| 255 | 2 00 | 265 | 227 | |||||||||||||
| TTG | TAT | AGC | Td | AlA | -ta; | TAT | CGGT | CG | CCCC | CCGG | CCGG | CCG | AACl | -TG | JGT | 1119 |
| Pro | Tyr | Aso | GlG | Ile | fyr | Ττ | 7Ap | Pro | Pro | GCu | Gilu | Gil | Mg | Tyr | Ha | |
| 275 | 280 | 225 | ||||||||||||||
| ICC | CAG | CCC | CCC | CGG | CCC. | AGC | AGG | CCC. | AAC | TG | CCTl | JACc | -GTG | TG | (CG. | 1123 |
| Phe | Gln | Hrs | ?PO | Agt | Pro | Isy | Lya | Pro | Lya | Siu:: | laeu | Mg | Ile | Tyr | Glu | |
| 290 | 229 | 330 | ||||||||||||||
| ??? | TAT | AAT | GGG | AAG | jgct | ACC | CCC | CCGG | CCT | GGG | AT | jag: | TCA | mc | GGG | 1126 |
| Ser | His | Ile | Gly | Met | Ser | Ser | Piro | Glu | Pro | Lya | Ile | Ms | Sar | -Te | Vaa | |
| 305 | 311 | 335 | ||||||||||||||
| GAC | TTT | ACAc | GGG | CGG | GGT | CCT | CCC | CCC | ATA | AGA | JAGG | CTT | GCC | tta | CAG | 1134 |
| Gsn | Phe | Arę | VGs | Gil | Yal | Ilu | Par | Aag | Ile | Lls | Lls | Lau | Gly | r?r | Agn | |
| 320 | 325 | 330 | ||||||||||||||
| GTC | CTi | CTA | AAT | GCG | GCT | AG? | CCA | GCG | ccac | TTC | TTGC | T?G | GGC | AG? | TTT | 1132 |
| Ma | Val | G!g | He | -Me. | Ma | Ile | Glu | Glu | Hs | Ssr | -?Z | T?y | AGa | SsA | CPh | |
| 335 | 400 | 345 | 350 | |||||||||||||
| GGT | TAI | CAC | CCC | AGA | TGG | r?c | -TT | GGT | CCA | AAC | JAGC | CCC | -j?? | Gil | AAC | 1130 |
| Giy | T/r | Hia | Val | TTs | Mn | Phe | JXa | Ma | Pro | Ssr | Ser | Aa; | PPL | GCr· | TT-r | |
| 355 | 360 | 335 | ||||||||||||||
| ?? | . CAC | cg | CTT | GAC | TCT | TTG | AT? | CAT | AGA | CCT | CG? | (AC | TTA | GGA | AA? | 1473 |
| Pro | As? | Asp | Lau | Las | Ser | Leu | He | Asp | Lya | Mi | His | Glu | Leu | <Cy | Ile | |
| 370 | 337 | 330 | ||||||||||||||
| GTT | GTT | CCT | CC? | CAC | -ATC | CC? | CCG | jac | CG? | CCT | . TCA | JAG | MG | AAC | TTC | 1526 |
| aal | Val | Leu | Ket | Asp | He | vaa | Hiss | Ser | Hm | Ma | Se^ | Aas | Ago | Tch | Lau | |
| 385 | 39<3 | 339 | ||||||||||||||
| GAT | ' GGA | , CCT | ; ca | : atc | CG | : ccc | : aq | . CGT | ' ACC | ' TCT | aa | . Ti? | • CG | . TC? | 11574 | |
| Asp | i Gly | • Leu | ; Gs | i M | Phe | i Gst | i Gly | 1 Asp | - Ser | : Cys | Tyr | PPh | Hm | Sse |
400 405 410
186 381
| OSA GCT COC | GOC TAT CAT TGC ATG GC GG TCC CGG CCC TCC AGA TAI | 1622 | |||||||||
| O-y 415 | Ala | Arg | G-l | Tyr H.s •120 | TrT | Gar | Tt> | AA] | Ser Aig 425 | Leu Pbh Ags Ter 430 | |
| OGA | GAC | COO | SAO | GA CCC | AGA | GC | CTT | CCC | TCC AAG | GOC AGO ICO TTG | 1170 |
| O.y | Asn | Trp | Glu | ViO. Leu 435 | Ata | gyT | Leu | Lei 440 | Ser Asn | AG A_g Ter Tcr 44.4 | |
| CCS | GAT | GAG | CTC | AGA CCC | GAA | CG | Att | AGO | TTT GGG | GAG GGG AGC TCC | 1171 |
| Leu | Ap | Glu | Phe 450 | Lys Phe | Asa Gly | Phe 455 | AAJ | Pbh Asp | GGl Vv1 TCh Tar 460 | ||
| GCG | ATG | TAT | GCT | CAC CAC | GCG | ATCC | GCC | GAT | GAG TCC | AGC GAG AAG TGG | 1176 |
| Mt | Mt | Cyr 465 | Thr | flis H.s | G1a | Leu ulo | Sar | V;V | Gly Phe | Tlc Gly Asis Ter 475 | |
| OGO | GGG | TAC | TTT | OGG CTC | GCG | ACA | TAG | GGT | GAG GAC | GAT GOC TTG· CCC | 1884 |
| Glu | Glu 480 | Tyr | Phe | Gly Leu | A1g 485 | aHc | Asp | W. | Ais AGa 49(9 | Vai VV1 Tc Leu | |
| ATS | CTO | GTC | GAC | GC CTT | GTT | CAT | AAG | ctt | CCC CA | GAC GCG GCC GCC | 1182 |
| Mt 495 | Leu | UaL | Asn | Asp Lau 500 | Ile | His | G.y | Leu | She Pro 505 | Asp Gla He· Thr 551 | |
| ATT | GOT | GAG | GAT | GCC GOC | AAA ATG | CCS | GCG | CCC CNI | GGT ΟΧ GTT CGG | 1191 | |
| Ile | Gly | Glu | Asp | Val Ser 515 | Gly | Het | Pro | mr 552 | Pha Xaa | Ile Pro Val Gn 552 | |
| GAT | GGG | GSG | oce | GAC TTT | GAC | TAT | CGG | CCC | CCG AAG | GOC TGG GOC GGG | 1155 |
| Asp | Gly Gly | Val 530 | Gly Phe | Asp | Tyr | Asg 533 | Leu | Kis Hec. | AG Ile AG Ass 540 | ||
| GAG | TAO | ATT | GAG | CTO CTC | AGG | GAI | CG | CGG | GOG CGG | TTG AGO CTC CGG | 2206 |
| Lya | Crp | Ila 545 | GLu | Leu Leu | Ly3 | Lys Air Aas 550 | CGu Asp Tc? Argr Val CTy 555 | ||||
| GAT | ATT | GIT | CAT | ACA CTG | GCG | AAT | AGA AAA | TAG CCS | GGGG GAG TOT GTT | 2204 | |
| Asp | Ha 560 | Val | His | Thr Leu | Ghr 565 | Gan | Arg Arg Crp Ser 557 | Gilu Lys Cyi Val | |||
| TCG | TAC | GCT | GAA | GOT CGC | GOA | TCG | GOC | CC | cgc <gg | GG JGA AGC AGA | 2212 |
| Sec 575 | Tyr | Ala | Glu | Sir His 580 | Aaj GGl | AGa | Ilu | Val GGy Ago L^s TCr He 55S 559 |
| GCG | CTC | TOG | cto | GCG | AGC | AAG GIT | GGG | TAG | GRC | ccc | GCG | GCT | CTO | GGT | 2LS0 | |
| GLa | Phe | Tzg | Leu | Mt | Asp | Lya | Asp | Mat | Tc | Gsp | Phe | M^lt | GG | Leu | Asp | |
| 595 | 660 | S65 | ||||||||||||||
| AGA | CN | CCG | ACA | TCG | CTG AGA | GAT | Coe | OOO | GCG | GCG | TGG | CAC | AGO | ACO | 2119 | |
| G:g | Pro | Ser | Thr | Ser | Leu | Ile | Gsg | Gg Gly | Ha | G.a | Leu | His | Lya | Mt | ||
| 685 | 665 | 620 | ||||||||||||||
| GTT | AAG | CTC | GIG | GCT | GIG | GGG | TTG | OOA | OOG | GAG | OGO | CGC | CIG | AGC | TCC | 2246 |
| Ile | Grg | Leu | Val | Cis | Met | Gly | Leu | Gy | Aly Olu | GlL | Cyr | Leu | Asn | Phe | ||
| 625 | 530 | 635 | ||||||||||||||
| ATG | GGG AAT | GAG | TCC | GAC | CAC | CCC | OAO | TOG | GCT | GAT | CCC | CCC | GAA | GCT | 2294 | |
| Mt | Aiy | Gan | Olu | 2ha | Gly | His | Pro | Olu | Grp | Ila | Gap | Phe | Pro | Arg | g.. | |
| 640 | 645 | 650 | ||||||||||||||
| GAG | CGG | CGC | TCT | CCI | GAC | GCC | CCG | GIG | ATI | CCC | yoA | AGC | CGG | CTC | GOT | 2342 |
| G-u | AG | His | Leu | Sar | Gsp | Gly | Ser | Vii | Ile | Pro | Oiy | Gan | OG | Phe | Ser | |
| 655 | 660 | 665 | 670 |
186 381
| CTC ga TAA TTG Jaga cct | AGA TTC GC | CTG GOG GAO OCT <GA | TAO T/r 685 | TCT Iuu | 2330 | |||||||||||
| Tyr | Asp | Lys | Ccc | Aa? 675 | ^ta | Arg | ?he | Tsp | Lee 680 | GOy | Asp | ALa | Glu | |||
| AGA | CTC | CTC ^OG | TTT3 | CCA | GTT | ITT | GAC | CGT | <GC | TCT | CTG | TAT | CTC | GTT | 2433 | |
| Arg | Tyr | Arg GOy | Iu»u | GOn | Glu | ?he | Asp | Arg | AAl, | Met | Gln | Ty? | Lou | Glu | ||
| 690 | 695 | 7C0 | ||||||||||||||
| TTC | ATT | TAO | <GA3 | i^TT | ATG | TCT | KOT | GAT | CAC | CCG | TTC | GTA | TCT | CGT | TG | 244ć! |
| Asp | Lys | Tyr | GOu | Phe | Mer. | Thr | Ser | Gilu | His | Gln | Phe | Ile | Sar | Trg· | Łyg | |
| 705 | 710 | 715 | ||||||||||||||
| GAC | GTA | TGT | GAT | AGO | ATT | ATT | GTA | ttt | GAO | AAA | AGA | AAA | CTC | ONG | TTT | 2234 |
| Asp | Glu | Gly | Asp | Arg | Moc. | Ile | VaL | Pho | Glo | uys | Glo | Ast | Leu | Val | ? DP | |
| 720 | 725 | 73C | ||||||||||||||
| GOC | oto | ATT | CCC | CTC | TOG | ACA | TTT | AGO | TAT | CCC | TAG | OAT | TGC | CTA | AGO | 2282 |
| VaJ. | Phe | Asn | Pho | SŁLs | Trp | Thr | Lys | Sar | Tyo | Ser | Asa | Tyr Arę | I la | Glo | ||
| 735 | 744 | 775 | 7S5 | |||||||||||||
| COC | CTG | TAO | CCT | GOT | TAT | TAC | TAG | GTT | GCG | CTG | GAC | CCA | TJO· | TAT | CCC. | 2630 |
| Cys | Lou | Lys | Pry | Gly | Lys | Tyr | Lys | Val | A1a | Leu | uSA | SeS | As. | Asp | p rP | |
| 755 | 760 | 7 5 | ||||||||||||||
| COC | CTC | GOT | GOC | TTC | OOG | AGA | ATT | GTT | CAC | TAT | TCO | CAO. | TAO· | TTC | CCA | 2573 |
| Leu | Phe | Gly Gly | Pho | Gly | Arg | Ile | Tsp | His | Asa | ALa | Glo | Tyr- | Phe | Thr | ||
| 770 | 755 | 73G | ||||||||||||||
| ccc | GTA | GTT | TOG | OAT | GAT | GTT | CGT | CCC | CGO | TOTO | .ATT | TTT | OTG | OAT | SGc | 270. |
| Phe | Glu | Gly | Trp | Tyr | Asp | Asp | Arg | Pro | AtA | geS | Ha | MeM | Val | Tyr | ALa | |
| 785 | 790 | 795 | ||||||||||||||
| CCC | AGO | AGA | TCT | GOT | TTT | GOC | TAT | GOA | CTO | ATS. | GAC | ATT | TAT | GAT | TWA | 2774 |
| Pro | Ser | Arg | Tir | ALa | 1<aL | Val | Cyr | Ala | Leu | Val | Asp | Ly3 | Glo | Glo | Glo | |
| 800 | 805 | 100 | ||||||||||||||
| GAT | GTA | GAT | OAA | GOT | TCT | GTA | GOA | GAA | GAA | ATOO | GTA | GOC | GAOT | GATT | TT | 2822 |
| Olu | Glu | Olu | Olu | lai | Ala | Val | Val | Glu | Glo | Val | Val | VaV | Glo | GlU | Glo | |
| 815 | 820 | 32S | 930 |
CGT ACTTA CCOOCTACCT CTTCTAAAOA CTTOAATGCC TCTITTATCT COCTGTCTTT 2880 « * ★
CCCTTCATCA CTTCACCĄTC (CTOGOOCGTT “TTTCATCGSGA CAAAAGCTTT (GOCOCTTCAT COCO CCACCTCCAG CttcTCTTCG ATATTACGCTG A<^CGTTOIG CTGCACCCTC CTATCTACAC GATT rCGACGA^TC TACGCCTATC COOTGTOOACCOT GC^CTGCAT GTTTTGTCTC GOTCTTGCOT TOTO CATATOGCCA COCO 3074
186 381
Sekwencja SEQ ID Nr. 2
Sekwencjonowana Nazwa: fragment lanum tuberosum cząsteczka: cDNA genu beli (dla enzymu (ziemniaki) sieciującego II) z SoDługość sekwencji: 1393 par zasad
T CTC CCA AAC AAC CCG (CA CCT CCT CCT GCC ATUT CAT CCC TTC MA 49
Leu Pro Asn Asn Val Aso Gly Ser Gls Ala He Pro His Gly Ser Arg
| 1 | 5 | 10 | 11 | ||||||||||||
| CTC | AAC | ATA | CCC | ATC | CAC | ACT | CCA | TCA | CCC | CCT AAC | HT | TCC | ACT | CCT | 97 |
| Val | Lys | Ile | Arg | Met | Asp | Thr | Pro | Ser | ciy | Val Lya | Asp | Ser | Ile | Pro | |
| 22 | 25 | 30 | |||||||||||||
| CCC | TGG | ATC | AAC | TAC | TCT | CMC | CAG | CCCC | CAT | CMC GAA | ACT | CCA | TAC | AAT | 1AC |
| ALa | •rp | Ile | Asn | Tyr | Ser | Teu | Gln | Ilu | Pro | Cmp Glu | Ile | P:u | TH Asn | ||
| 35 | 42 | 45 | |||||||||||||
| CCC | MA | TAT | TAT | CAT | CCA | CCC | CIA | CAC | CAC | ACC TAT | ATC | CTC | CAC | CAC | 110 |
| CLy | Ile | Tyr | Tyr Asp | Pro | Pro | CLu | Clu | Clu | Arg Tyr | Ile | Phe | Hn | Kis | ||
| 52 | 55 | 60 | |||||||||||||
| CCA | CCC | CCA | AAC | AAA | CCA | AAC | TCC | CTC | ACA | ATA TAT | CAI | TCT | CAT | ACT | 229 |
| Pro | Arg | Pro | Lys | Lys | Pro | Lys | Ser | Leu | Arg | Ile Tyr | CLu | Ser | ais | Ile | |
| 65 | 70 | 75 | 82 | ||||||||||||
| CCA | ATC | ACT | ACT | CCC | Cd | CCT | AAA | ATT | AAC | CCA TAC | CTC | AAT | TTT | ACA | 229 |
| Hy | Met | Ser | Ser | Pro | Clu | Pro | Lys | Ile | Asn | Ser T/r | Val | Ara | Phe | Arg | |
| 85 | 90 | 90 | |||||||||||||
| CAC | CCA | CTT | CTT | CCT | CCC | ATA | AAA | AAC | CTT | CCC TAC | AAC | CCC | CTC | CCA | 337 |
| Asp | Hu | V;al | Leu | Pro | Arg | Ile | Lya | Lys | Leu | Cly T/r | Asn | ALa | Val | Gln | |
| 100 | 110 | 111 | |||||||||||||
| ATT | ATC | GCT | ATT | GAC | CAT | TCT | TAT | TAT | CCT ACC | TTT | CCT | TAT | CAT | 338 | |
| Ile | Mer. | ALa | Ile | Hn | CLu | Kis | Ser | Tyr Tyr | M.a Ser | Phe | CLy Tyr | iss | |||
| 115 | 120 | 123 | |||||||||||||
| CTC | ACA | AAT | TTT | TTN | CCA | CCA | ACC | ACC | CCC | TTT CCA | ACN | CCC | CAC | CAC | 4371 |
| vaa | Tu: | Asn | Phe | Xaa | ALa | Pro | Ser | ^r | Arg | Phe Cly | Tur | Pro | Asp | Asp | |
| 132 | 135 | 14ϋ | |||||||||||||
| CTT | AAC | TCT | ttc | ATT | GAI | AAA | CCT | GT | CAC | CTA CCA | ATT | CCT | CTT | CTC | 498 |
| Leu | Lys | Ser | Leu | Ile | Asp | Les | Als | ais | Glu | Leu Cly | Ile | Vsl | Val | Leu | |
| 195 | 150 | 1SS | 152 | ||||||||||||
| ACC | CCC | ATT | CTT | CAC | AAC | CAC | GCA | TCC | AAA | Ad ACT | TCA | gm | CCC | CCT | 522 |
Met Asp Ile Val Kia Ser His Ua Ser Asn JMsi ITh Ilu Ams Gly Ilu
165 170 175
| AAC ATC CTC CAC Asn Met Phe Asp 182 | CCC AAC CLy TTh | GCA Asp | AAC TCC Ser CCS 185 | TTG TTT CCA TCT GGC GCC CCC | 571 | |||||||||||
| Tts | Phh | iii Ser | Gly TA a JMg 190 | |||||||||||||
| CCC | TAT | 'CAT | TGG | ATC | TTG | CCI | «CC | CCCC | CTTC | ttc | JM.C | TTA | (CC | jA£ | T(CJ | 622 |
| Gly Ty: | a.s | Trp | Mm- | Trp JMp | Ser | Hrr | Ilu | Phe | Aa.i | Te | Gly | Asn | Tr? |
195 200 255
| GAC CTA | CTT | ACC | TAT | CTTC | CTC | TCCA | JAT | «X | AAC. | TCCi | «G5 | rac | GC | (CAC | 670 |
| CLu VaL | Leu | Arg | Tyr | Ilu | Ilu | ^e | .Mn | Mn | Trp | Trp | Im | ^Ap | Glu | ||
| 212 | 215 | 222 |
186 381
| TTC AAA TCT gat gga ttt aga ttt gat ggt gtg aca tca atg atg tat | 721 | |||||
| Pha Lys 225 | Pha Aap | Gly | Phe Arg Pha Asp Gly Val Thr Ser Mat Met Tyr | |||
| 230 | 235 | 240 | ||||
| ACT CAC | CAC GGA | TTA | TCG GTG | GGA TTC ACT GGG AAC TAC GAG GAA | TAC | 776 |
| Tir His | His Gly | Leu | Ser Val | G.y Phe Thr Gly Asn Tyr Glu Glu | Tyr | |
| 245 | 250 255 | |||||
| TTT GGA | CTC GCA | ACT | GAT GTG | GAT GCT GTT GTG TAT CTG ATG CTG | GTC | 382 |
| Phe Gly | Leu Ala | Thr | Asp Val | Asp Ala VaL VAL T/r Leu Met Lau | Val | |
| 260 | 265 220 | |||||
| AAC GAT | CTT ATT | CAT | GGG CTT | TTC CCA GAT GCA ATT ACC ATT GGT | GAA | 505 |
| Asn Asp | Leu Ile | His | Gly Leu | Phe Pro Asp Ala Ile Th.r Ile Gly | Glu | |
| 215 | 220 235 | |||||
| GAT GTT | AGC GGA | ATG | CCG ACA | TTT TNT ATT CCC GTT CAA GAT 3GG | GGT | 911 |
| Asp Val | Sar Gly | Mat | Pro Thr | Pha Xaa Ile Pro Vel GL.n Asp Gly | G!v | |
| 290 | 295 | 300 | ||||
| GIT GGC | TTT GAC | TAT | CGG CTG | CAT ATG GCA ATT GCT GAT AAA TGG | ATT | 966 |
| Val Gly | Phe Asp Tyr | Arg Leu | His Met Ala Ile Ala Asp Lys Trp | Ila | ||
| 305 | 310 | 335 | 332 | |||
| GAG TTG | CTC AAG | AAA | CGG GAT | GAG GAT TGG AGA GTG GGT GAT ATT | GTT | 1109 |
| G.'u Leu | Leu Lya | Lys | Arg Asp | Glu A.sp Trp Arg Val Gly Asp Ile | Val | |
| 325 | 330 335 | |||||
| CAT ACA | CTG ACA | AAT | AGA AGA | TGG TCG GAA AAG TGT GTT TCA TAC | GCT | 11551 |
| His Thr | Leu Thr | As.4 | Arg Arg | Trp Ser Glu Lya Cys V&1 Ser Tyr | A.a | |
| 340 | 335 330 | |||||
| GAA AGT | CAT GAT | CAA | GCT CTA | GTC GCT GAT AAA ACT ATA GCA TTC | TGG | 1105 |
| G.u Ser | His Asp | Gin | Ala. Leu | Val Gly Aap Lys Thr Ila ALa Phe | Trp | |
| 355 | 330 365 | |||||
| CTG atg | GAC AAG | GAT | ATG TAT | GAT TTT ATG GCT CTG GAT AGA CCN | TCA | 1153 |
| Leu Met | Aep Lys | Asp | Mat Tyr | Aso Pha Met Ala Leu Asp Arg Pro | Ser | |
| 370 | 375 | 330 | ||||
| ACA TCA | TTA ATA | GAT | CGT GGG | ATA GCA TTG CAC AAG ATG ATT AGG CTT | 1201 | |
| Tur Ser | Leu Ile | Asp | Arg Gly | Ile Ala Leu His Lys Met Ile Arg | Leu | |
| 385 | 390 | 335 | 400 | |||
| GTA ACT | ATG GGA | TTA | GGA GGA | GAA GGG TAC CTA AAT ITC ATG GGA | AAT | 1249 |
| Val Thr | Met Gly | Leu | Gly Gly | Glu Gly Tyr Len Asn Phe M«e Gly | Asn | |
| 405 | 440 115 | |||||
| GAA TTC | GGC CAC | CCT | GAG TGG | ATT GAT TTC CCT AGG GCT GAA CAA | CAC | 1297 |
| Glu Phe | Gly His | Pro | Glu Trp | Ile Asp Phe Pro Arg Aia Glu Gin | His | |
| 420 | 445 430 | |||||
| CTC TCT | GAT GGC | TCA | . GTA ATT | CCC GGA AAC CAA TTC AGT TAT GAT | AAA | 1345 |
| Leu Ser | Asp Gly | Ser | VAL Ile | Pro Glv Asn Gin. Phe Sar Tyr Asp | > Lys | |
| 435 | 440 44δ ' | |||||
| TGC AGA CGG AGA | . TTT | GAC CTG | , GGA GAT GCA GAA TAT TTA AGA TAC | : cgt | 139Ó | |
| Cys Arg Arg Arg | Phe | : Asp Leu | . Gly Asp Aa GTu Tyr Leu Arg Ty- | ' Arg | ||
| 450 | 455 | 450 |
186 381
FIG. 2
Peptjd 1. EFGVWEEFLPN Peptyd 2. HGLQEFDRA Peptyd 3, ENDGIAAKADE Peptyd 4. YEIDPEI/LTN
186 381
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz. Cena 4,00 zł.
Claims (21)
- Zastrzeżenia patentowe1. Wyizolowana sekwencja DNA kodująca sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka, zawierająca sekwencję nukleotydową przedstawioną na sekwencji SEQ ID Nr 1 i warianty tej sekwencji powstałe w wyniku degeneracji kodu genetycznego.
- 2. Sekwencja według zastrz. 1, znamienna tym, że stanowi fragment o wielkości od 50 do 3074 par zasad, posiadający sekwencję nukleotydową przedstawioną na sekwencji SEQ ID Nr 1, oraz jego warianty powstałe w wyniku degeneracji kodu genetycznego, zdolny do powodowania zmian w proporcji amyloza/amylopektyna w skrobi ziemniaczanej, jak również do zmniejszania lub zmiany wzorów usieciowania amylopektyny.
- 3. Sekwencja aminokwasowa sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemniaka posiadająca sekwencję aminokwasów przedstawioną na sekwencji SEQ ID Nr 1.
- 4. Wektor zawierający całą lub aktywną funkcjonalnie część wyizolowanej sekwencji DNA przedstawionej na SEQ ID Nr 1 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemniaku.
- 5. Wektor według zastrz. 4, znamienny tym, że zawarta w nim sekwencja DNA usytuowana jest w orientacji antysensownej (odwróconej) względem promotora znajdującego się bezpośrednio w górę od tej sekwencji DNA.
- 6. Wektor według zastrz. 4, znamienny tym, że zawiera całą lub aktywną funkcjonalnie część sekwencji DNA przedstawionej na sekwencji SEQ ID Nr 2 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemniaku.
- 7. Wektor według zastrz. 6, znamienny tym, że zawarta w nim sekwencja DNA usytuowana jest w orientacji antysensownej (odwróconej) względem promotora znajdującego się bezpośrednio w górę od tej sekwencji DNA.
- 8. Sposób otrzymywania transgenicznych ziemniaków o podwyższonym lub obniżonym stopniu usieciowania amylopektyny skrobiowej, znamienny tym, że do genomu komórki ziemniaka przenosi się i wprowadza wektor zawierający całą lub aktywną funkcjonabiie część wyizolowanej sekwencji DNA przedstawionej na SEQ ID Nr 1 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemniaku, a następnie regeneruje się z tych transformowanych komórek nienaruszone, całe rośliny.
- 9. Sposób według zastrz. 8, znamienny tym, że stosuje się wektor z zawartą w nim sekwencją DNA usytuowaną w orientacji antysensownej (odwróconej) względem promotora znajdującego się bezpośrednio w górę od tej sekwencji DNA.
- 10. Sposób według zastrz. 9, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla sieciującego skrobię enzymu I (SBE I).
- 11. Sposób według zastrz. 9 albo 10, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla związanej z ziarenkami skrobi syntazy skrobiowej II ziemniaka.
- 12. Sposób według zastrz. 9 albo 10, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla rozpuszczalnych syntaz skrobiowych II i III ziemniaka.
- 13. Sposób według zastrz. 9 albo 10, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla enzymu dysproporcjonującego skrobię (enzymu D) ziemniaka.
- 14. Sposób według zastrz. 9 albo 10, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla enzymu de-sieciującego skrobię ziemniaka.186 381
- 15. Sposób według zastrz. 8, znamienny tym, ze stosuje się wektor zawierający całą lub aktywną funkcjonalnie część sekwencji DNA przedstawionej na sekwencji SEQ ID Nr 2 oraz elementy regulacyjne aktywne w ziemniaku.
- 16. Sposób według zastrz. 15, znamienny tym, że stosuje się wektor z zawartą w nim sekwencją DNA usytuowaną w orientacji antysensownej (odwróconej) względem promotora znajdującego się bezpośrednio w górę od tej sekwencji DNA.
- 17. Sposób według zastrz. 16, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla sieciującego skrobię enzymu I (SBE I).
- 18. Sposób według zastrz. 16 albo 17, znamienny tym, ze stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla związanej z ziarenkami skrobi syntazy skrobiowej II ziemniaka.
- 19. Sposób według zastrz. 16 albo 17, znamienny tym, ze stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla rozpuszczalnych syntaz skrobiowych II i III ziemniaka.
- 20. Sposób według zastrz. 16 albo 17, znamienny tym, że stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla enzymu dysproporcjonującego skrobię (enzymu D) ziemniaka.
- 21. Sposób według zastrz. 16 albo 17, znamienny tym, ze stosuje się wektor zawierający również konstrukcję antysensowną dla enzymu de-sieciującego skrobię ziemniaka.Wynalazek dotyczy wyizolowanej sekwencji DNA kodującej sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka oraz fragmentu tej sekwencji a także sekwencji aminokwasowej sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemniaka. Wynalazek dotyczy również wektora zawierającego sekwencje DNA oraz sposobu otrzymywania transgenicznych ziemniaków.Skrobia jest złożoną mieszaniną różnych form cząsteczki, różniących się stopniem polimeryzacji i usieciowaniem łańcuchów glukozowych. Skrobia składa się z amylozy i amylopektyny, przy czym amyloza zawiera w zasadzie liniowy α -1,4-glukan a amylopektyna składa się z reszt α -1,4-glukanu połączonych ze sobą wiązaniami α -1,6, tworząc rozgałęziony poliglukan. Skrobia nie jest więc surowcem jednorodnym.Synteza skrobi przebiega drogą co najmniej trzech reakcji enzymatycznych, w których biorą udział ADP-glukoeofosforylaza (EC 2.7.7.27), cyntaza skrobi (EC 2.4.1.21) i enzym sieciujący skrobię (EC 2.4.1.18). Uważa się, że enzym sieciujący skrobię (SBE, zwany również enzymem Q) posiada dwie różne aktywności enzymatyczne. Katalizuje on mianowicie hydrolizę wiązań α-1,4-glukozydowych oraz powstawanie wiązań α-1,6-glukozydowych podczas syntezy rozgałęzionego komponentu skrobi, to jest, amylopektyny.Skrobia roślinna jest cennym źródłem odnawialnego surowca stosowanego np. w przemyśle chemicznym (Visser and Jacobsen, 1993). Jakość skrobi musi jednakże odpowiadać Wdmaga4i0m przemysłu przetwórczego, dla którego jednorodność struktury jest ważnym kryterium oceny. Do zastosowań przemysłowych potrzebne są rośliny zawierające tylko skro bię tunylozową. bądź rośliny zawierające jedynie skrobię amylopektynową.Opisane są sposoby zmiany proporcji amyloza/amylopektyna w skrobi. Przykładowo, w publfkiuai międzynarodowego zgłoszenia patentowej, W095/04826 opusane są rekw^cje DNA todujące αι/.ymy de-sieciujące, wykazujące właściwości zmniejszania lub zwiększana stopnia usieciowania amdlopektyny w tra4sge4ίcz4dch roślinach, np. w ziemnak.acli.W publikacji międzynarodowego zgłoszenia patentowego, W092/14827 opisane są plazmidy zawierające takie sekwencje DNA, które po insercji do genomu roślinnego powodują zmiany w zawartości węglowodanów i składzie tych węglowodanów w regenerowanych roślinach. Zmiany te można uzyskać dzięki sekwencji dla enzymu sieciującego, znajdującej się w tych plazmidach. Przypuszcza się, ze enzym sieciujący zmieni proporcję: amylo/s./smylopektyns w skrobi znajdującej się w roślinach, zwłaszcza w roślinach stosowanych w przemyśle.186 381W publikacji międzynarodowego zgłoszenia patentowego, W092/14827 opisany został jedynie znany dotychczas enzym sieciujący skrobię w ziemniakach. W stanie techniki nie było wiadomo, czy w syntezie usieciowanej skrobi w ziemniakach biorą udział jeszcze inne enzymy sieciujące skrobię.Visser i wsp. (Mol. Gen. Genet. 1991, 225: 289-296) opisali hamowanie ekspresji genu dla związanej z ziarenkami skrobi syntazy skrobiowej w ziemniakach przez użycie konstrukcji antysensownych. Uzyskano prawie 100 procentowe hamowanie tego enzymu w bulwach ziemniaczanych i w tym przypadku otrzymano skrobię nie zawierającą amylozy.Znane uprzednio sposoby hamowania syntezy amylopektyny nie były tak pomyślne i dlatego ciągle są bardzo potrzebne alternatywne sposoby hamowania wytwarzania amylopektyny (Muller-Rober i KoBmann, 1994; Martin i Smith, 1995).Celem niniejszego wynalazku było umożliwienie dokonywania zmian w stopniu usieciowania amylopektyny i w proporcji: amylopektyna/amyloza w skrobi ziemniaczanej.Zgodnie z wynalazkiem, cel ten osiągnięto dzięki uzyskaniu nowej, wyizolowanej sekwencji DNA kodującej drugi enzym sieciujący skrobię, enzym SBE II, oraz fragmentów tej sekwencji. Sekwencja ta lub jej fragment, po wprowadzeniu do genomu roślinnego powoduje zmiany w stopniu usieciowania i w proporcji: amyloza/amylopektyna w skrobi wytwarzanej w regenerowanych roślinach.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| SE9504272A SE513208C2 (sv) | 1995-11-29 | 1995-11-29 | Förfarande för produktion av transgena potatisar med ökad eller minskad grad av förgrening av amylopektinstärkelse |
| SE9601506A SE513209C2 (sv) | 1995-11-29 | 1996-04-19 | Förfarande för produktion av transgena potatisar med ökad eller minskad grad av förgrening av amylopektinstärkelse |
| PCT/SE1996/001558 WO1997020040A1 (en) | 1995-11-29 | 1996-11-28 | Starch branching enzyme ii of potato |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL326975A1 PL326975A1 (en) | 1998-11-09 |
| PL186381B1 true PL186381B1 (pl) | 2003-12-31 |
Family
ID=26662437
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL96326975A PL186381B1 (pl) | 1995-11-29 | 1996-11-28 | Wyizolowana sekwencja DNA kodująca sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka, sekwencja aminokwasowa sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemniaka, wektor oraz sposób otrzymywania transgenicznych ziemniaków |
Country Status (14)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US6169226B1 (pl) |
| EP (1) | EP0863983A2 (pl) |
| JP (1) | JP2000500978A (pl) |
| KR (1) | KR100540824B1 (pl) |
| CN (1) | CN1112443C (pl) |
| AU (1) | AU7716596A (pl) |
| CA (1) | CA2238948C (pl) |
| CZ (1) | CZ298540B6 (pl) |
| HU (1) | HU222651B1 (pl) |
| NO (1) | NO982443L (pl) |
| PL (1) | PL186381B1 (pl) |
| SE (1) | SE513209C2 (pl) |
| SK (1) | SK284999B6 (pl) |
| WO (1) | WO1997020040A1 (pl) |
Families Citing this family (26)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| PT826061E (pt) | 1995-05-05 | 2007-10-16 | Brunob Ii Bv | ''melhoramentos na composição de amido vegetal ou relacionados com o mesmo'' |
| DE59611362D1 (de) | 1995-09-19 | 2006-08-17 | Bayer Bioscience Gmbh | Pflanzen, die eine modifizierte stärke synthetisieren, verfahren zu ihrer herstellung sowie modifizierte stärke |
| GB9623095D0 (en) * | 1996-11-05 | 1997-01-08 | Nat Starch Chem Invest | Improvements in or relating to starch content of plants |
| NZ503137A (en) | 1997-09-12 | 2000-10-27 | Groupe Limagrain Pacific Pty L | Sequence and promoters for starch branching enzyme I, starch branching enzyme II, soluble starch synthase I and starch debranching enzyme derived from Triticum tauschii to modulate gene expression |
| JP2002518015A (ja) | 1998-06-15 | 2002-06-25 | ナショナル スターチ アンド ケミカル インベストメント ホールディング コーポレイション | 植物および植物製品の改良またはそれらに関する改良 |
| DE19836098A1 (de) | 1998-07-31 | 2000-02-03 | Hoechst Schering Agrevo Gmbh | Pflanzen, die eine modifizierte Stärke synthetisieren, Verfahren zur Herstellung der Pflanzen, ihre Verwendung sowie die modifizierte Stärke |
| AU779814B2 (en) * | 1999-03-29 | 2005-02-10 | Novozymes A/S | Polypeptides having branching enzyme activity and nucleic acids encoding same |
| US7052697B1 (en) | 1999-05-13 | 2006-05-30 | Agriculture Victoria Services Pty Ltd | Lawsonia derived gene and related OmpH polypeptides, peptides and proteins and their uses |
| DE19937643A1 (de) * | 1999-08-12 | 2001-02-22 | Aventis Cropscience Gmbh | Transgene Zellen und Pflanzen mit veränderter Aktivität des GBSSI- und des BE-Proteins |
| GB9921830D0 (en) * | 1999-09-15 | 1999-11-17 | Nat Starch Chem Invest | Plants having reduced activity in two or more starch-modifying enzymes |
| AUPR138100A0 (en) | 2000-11-10 | 2000-12-07 | Agriculture Victoria Services Pty Ltd | Novel therapeutic compositions for treating infection by lawsonia spp |
| WO2002101059A2 (en) * | 2001-06-12 | 2002-12-19 | Bayer Cropscience Gmbh | Transgenic plants synthesising high amylose starch |
| US8022272B2 (en) | 2001-07-13 | 2011-09-20 | Sungene Gmbh & Co. Kgaa | Expression cassettes for transgenic expression of nucleic acids |
| DE60331652D1 (de) | 2002-07-09 | 2010-04-22 | Basf Plant Science Gmbh | Verwendung von mutierten ahas genen als selektionsmarker bei der kartoffeltransformation |
| EP1431393A1 (de) * | 2002-12-19 | 2004-06-23 | Bayer CropScience GmbH | Pflanzen, die eine Stärke mit erhöhter Endviskosität synthetisieren |
| CA2505776C (en) * | 2002-12-19 | 2013-04-02 | Bayer Cropscience Gmbh | Plant cells and plants which synthesize a starch with an increased final viscosity |
| WO2005001098A1 (en) | 2003-06-30 | 2005-01-06 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Wheat with altered branching enzyme activity and starch and starch containing products derived thereform |
| CN1938389A (zh) * | 2004-03-31 | 2007-03-28 | 巴斯福植物科学有限公司 | 羟丙基化高直链淀粉含量马铃薯淀粉实现高抗油脂数的用途 |
| JP2007530809A (ja) * | 2004-04-01 | 2007-11-01 | ビーエーエスエフ プラント サイエンス ゲーエムベーハー | 織物用糸のためのサイジング剤としてのアミロースデンプン生成物 |
| EP2421976B1 (en) | 2009-04-22 | 2015-09-16 | BASF Plant Science Company GmbH | Whole seed specific promoter |
| CN104017829A (zh) * | 2011-12-06 | 2014-09-03 | 中国科学院上海生命科学研究院 | 提高植物直链淀粉含量的方法 |
| DE202012104218U1 (de) | 2012-11-02 | 2014-02-06 | Emsland-Stärke GmbH | Pflanzliches Nahrungsmittelprodukt |
| DE102014107610A1 (de) | 2014-05-28 | 2015-12-03 | Emsland-Stärke GmbH | Verwendung eines Nahrungsmittelprodukts aus stärkehaltigen Pflanzenteilen |
| CN110760532B (zh) * | 2019-11-18 | 2022-08-12 | 南京农业大学 | 一种淀粉分支酶及其基因、含有该基因的工程菌及其应用 |
| CN112391365B (zh) * | 2020-11-30 | 2022-04-15 | 江南大学 | 一种催化活力提高的淀粉分支酶突变体及其应用 |
| CN113151318B (zh) * | 2021-03-17 | 2022-08-16 | 云南中烟工业有限责任公司 | 一种烟草淀粉分支酶基因NtGBE1及其应用 |
Family Cites Families (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| SE467358B (sv) | 1990-12-21 | 1992-07-06 | Amylogene Hb | Genteknisk foeraendring av potatis foer bildning av staerkelse av amylopektintyp |
| SE9004095L (sv) * | 1990-12-21 | 1992-06-01 | Amylogene Hb | Genetisk foeraendring av potatis foer bildning av staerkelse av amylostyp |
| DE4104782B4 (de) * | 1991-02-13 | 2006-05-11 | Bayer Cropscience Gmbh | Neue Plasmide, enthaltend DNA-Sequenzen, die Veränderungen der Karbohydratkonzentration und Karbohydratzusammensetzung in Pflanzen hervorrufen, sowie Pflanzen und Pflanzenzellen enthaltend dieses Plasmide |
| WO1995004826A1 (en) * | 1993-08-09 | 1995-02-16 | Institut Für Genbiologische Forschung Berlin Gmbh | Debranching enzymes and dna sequences coding them, suitable for changing the degree of branching of amylopectin starch in plants |
| WO1995007355A1 (en) | 1993-09-09 | 1995-03-16 | Institut Für Genbiologische Forschung Berlin Gmbh | Combination of dna sequences which enable the formation of modified starch in plant cells and plants, processes for the production of these plants and the modified starch obtainable therefrom |
| PT826061E (pt) | 1995-05-05 | 2007-10-16 | Brunob Ii Bv | ''melhoramentos na composição de amido vegetal ou relacionados com o mesmo'' |
-
1996
- 1996-04-19 SE SE9601506A patent/SE513209C2/sv not_active IP Right Cessation
- 1996-11-28 PL PL96326975A patent/PL186381B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1996-11-28 WO PCT/SE1996/001558 patent/WO1997020040A1/en not_active Ceased
- 1996-11-28 CZ CZ0165698A patent/CZ298540B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1996-11-28 AU AU77165/96A patent/AU7716596A/en not_active Abandoned
- 1996-11-28 JP JP9520417A patent/JP2000500978A/ja not_active Ceased
- 1996-11-28 CN CN96199514A patent/CN1112443C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1996-11-28 EP EP96940226A patent/EP0863983A2/en not_active Withdrawn
- 1996-11-28 HU HU9901306A patent/HU222651B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1996-11-28 KR KR1019980704030A patent/KR100540824B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1996-11-28 CA CA002238948A patent/CA2238948C/en not_active Expired - Fee Related
- 1996-11-28 SK SK726-98A patent/SK284999B6/sk not_active IP Right Cessation
-
1998
- 1998-05-28 NO NO982443A patent/NO982443L/no not_active Application Discontinuation
- 1998-05-29 US US09/087,277 patent/US6169226B1/en not_active Expired - Fee Related
-
2000
- 2000-09-08 US US09/658,499 patent/US6469231B1/en not_active Expired - Fee Related
-
2002
- 2002-09-26 US US10/254,534 patent/US20030046730A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CZ298540B6 (cs) | 2007-10-31 |
| EP0863983A2 (en) | 1998-09-16 |
| SE9601506D0 (sv) | 1996-04-19 |
| SE9601506L (sv) | 1997-05-30 |
| US20030046730A1 (en) | 2003-03-06 |
| NO982443D0 (no) | 1998-05-28 |
| CN1207125A (zh) | 1999-02-03 |
| PL326975A1 (en) | 1998-11-09 |
| WO1997020040A1 (en) | 1997-06-05 |
| AU7716596A (en) | 1997-06-19 |
| CA2238948A1 (en) | 1997-06-05 |
| US6469231B1 (en) | 2002-10-22 |
| CZ165698A3 (cs) | 1999-04-14 |
| JP2000500978A (ja) | 2000-02-02 |
| HUP9901306A3 (en) | 2001-11-28 |
| HUP9901306A1 (hu) | 1999-07-28 |
| HU222651B1 (hu) | 2003-09-29 |
| US6169226B1 (en) | 2001-01-02 |
| KR100540824B1 (ko) | 2006-05-26 |
| NO982443L (no) | 1998-07-24 |
| SE513209C2 (sv) | 2000-07-31 |
| CA2238948C (en) | 2008-11-18 |
| SK284999B6 (sk) | 2006-04-06 |
| SK72698A3 (en) | 1999-06-11 |
| CN1112443C (zh) | 2003-06-25 |
| KR19990071752A (ko) | 1999-09-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| PL186381B1 (pl) | Wyizolowana sekwencja DNA kodująca sieciujący skrobię enzym II (SBE II) ziemniaka, sekwencja aminokwasowa sieciującego skrobię enzymu II (SBE II) ziemniaka, wektor oraz sposób otrzymywania transgenicznych ziemniaków | |
| EP0826061B1 (en) | Improvements in or relating to plant starch composition | |
| US6559356B1 (en) | Nucleic acid molecules which encode proteins having fructosyl transferase activity and methods for producing long-chain inulin | |
| AU713978B2 (en) | DNA molecules that code for enzymes involved in starch synthesis,vectors, bacteria, transgenic plant cells and plants containing these molecules | |
| Cai et al. | Aberrant splicing of intron 1 leads to the heterogeneous 5′ UTR and decreased expression of waxy gene in rice cultivars of intermediate amylose content | |
| AU715944B2 (en) | Plants which synthesize a modified starch, process for the production thereof and modified starch | |
| AU694448B2 (en) | Combination of dna sequences which enable the formation of modified starch in plant cells and plants, processes for theproduction of these plants and the modified starch obtainable therefrom | |
| US20030093834A1 (en) | Nucleic acid molecules encoding wheat enzymes involved in starch synthesis | |
| US20030138927A1 (en) | Nucleic acid molecules encoding enzymes having fructosyl polymerase activity | |
| KR20010043457A (ko) | 전분 합성에 관여하는 밀 유래 효소를 암호화하는 핵산 분자 | |
| AU5729799A (en) | Nucleic acid module coding for alpha glucosidase, plants that synthesize modified starch, methods for the production and use of said plants, and modified starch | |
| WO1995004826A1 (en) | Debranching enzymes and dna sequences coding them, suitable for changing the degree of branching of amylopectin starch in plants | |
| EP0746620A1 (en) | NOVEL $i(EXO)-(1$m(7)4)-$g(b)-D GALACTANASE | |
| CN1809636B (zh) | 耐热化α-葡聚糖磷酸化酶(GP)的方法 | |
| Preiss | Biosynthesis of starch: ADPglucose pyrophosphorylase, the regulatory enzyme of starch synthesis structure-function relationships | |
| AU7535294A (en) | Debranching enzymes and dna sequences coding them, suitable for changing the degree of branching of amylopectin starch in plants | |
| JP3232619B2 (ja) | システイン合成酵素をコードする遺伝子 | |
| AU696436B2 (en) | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, DNA coding for the same, and recombinant vector and transformed plant both containing said DNA | |
| AU2004200536A1 (en) | Nucleic acid molecules | |
| JPH06245773A (ja) | システイン合成酵素をコードする遺伝子 | |
| MXPA00010988A (en) | Nucleic acid molecules which code for enzymes derived from wheat and which are involved in the synthesis of starch |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| LAPS | Decisions on the lapse of the protection rights |
Effective date: 20101128 |