PL206576B1 - Izolowany polinukleotyd, wektor zawierający ten polinukleotyd, komórka gospodarza transfekowana lub transformowana za pomocą tego wektora, sposób wytwarzania polipeptydu kodowanego przez izolowany polinukleotyd, izolowany polipeptyd, chimeryczny polipeptyd, kompozycja do szczepionek zawierająca izolowany polipeptyd lub chimeryczny polipeptyd oraz terapeutyczne zastosowanie tej kompozycji w zakażeniach paciorkowcem - Google Patents

Description

Opis wynalazku

Wynalazek dotyczy antygenów, bardziej szczegółowo białkowych patogennych antygenów paciorkowca zapalenia płuc, które są stosowane do leczenia i/lub profilaktyki jako składniki szczepionek.

S. pneumoniae jest ważnym czynnikiem chorobotwórczym u człowieka, zwłaszcza u niemowląt, ludzi starszych i osób mających obniżoną odporność. Jest to bakteria często izolowana od pacjentów cierpiących na choroby inwazyjne o wysokiej chorobowości i śmiertelności na całym świecie, takie jak: bakteriemia/ posocznica, zapalenie płuc, zapalenie opon. Nawet przy odpowiedniej terapii antybiotykowej, infekcje paciorkowcami nadal prowadzą do wielu zgonów. Pomimo, że rozwój chorób przeciwko drobnoustrojom zmniejszył ogólną śmiertelność w wyniku chorób wywołanych przez paciorkowce, obecność odpornych organizmów paciorkowców stała się obecnie głównym problemem na świecie. Skuteczne szczepionki przeciwko paciorkowcom mogą mieć ogromny wpływ na chorobowość i śmiertelność związaną z chorobami wywołanymi S. pneumoniae. Szczepionki takie mogłyby być również stosowane do zapobiegania zapaleniom ucha środkowego u niemowląt i małych dzieci.

Wysiłki skierowane na opracowanie szczepionki przeciwko paciorkowcom koncentrowały się na tworzeniu odpowiedzi immunologicznej na pneumokokowy polisacharyd otoczkowy. Na podstawie różnic antygenowych zidentyfikowano ponad 80 serotypów pneumokokowych polisacharydów otoczkowych. Dostępne obecnie szczepionki pneumokokowe, zawierające 23 polisacharydy otoczkowe, które najczęściej powodują choroby, mają znaczącą wadę związaną przede wszystkim ze słabą immunogennością niektórych polisacharydów otoczkowych, różnorodnością serotypów i różnic w rozmieszczeniu serotypów w czasie, obszarach geograficznych i grupach wiekowych. W szczególności zawodność w zabezpieczaniu młodych dzieci przeciwko wszystkim serotypom istniejących szczepionek i szczepionek zawierających koniugaty otoczkowe, które są obecnie intensywnie badane zachęca do badania przydatności innych składników S. pneumoniae. Pomimo, że immunogenność polisacharydów otoczkowych może być poprawiona, specyficzność serotypowa nadal jest głównym ograniczeniem szczepionek opartych na polisacharydach. Zastosowanie antygenowo konserwowanych immunogennych pneumokokowych antygenów białkowych zarówno samych jak i w połączeniu z dodatkowymi składnikami, stwarza możliwość do stworzenia szczepionek pneumokokowych opartych na białkach.

Opis patentowy PCT nr publikacji WO 98/18930 opublikowanej 7 maja 1998 zatytułowany „Streptococcus Pneumoniae antigenes i vaccines” opisuje pewne polipeptydy, które zgodnie z zastrzeżeniami są antygenowe. Jednakże, nie stwierdzono żadnej aktywności biologicznej tych polipeptydów.

Dlatego nadal pozostaje niezrealizowana potrzeba opracowania antygenów paciorkowców, które mogłyby być używane jako składniki szczepionki w profilaktyce i/lub leczeniu zakażeń paciorkowcami.

Przedmiotem wynalazku jest izolowany polinukleotyd wybrany spośród (a) izolowanego polinukleotydu kodującego polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasów identyczną w co najmniej 95% z sekwencją aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 73, 74, 77 lub 79, przy czym polipeptyd ten jest zdolny do wytwarzania przeciwciała wykazującego specyficzność wiązania wobec polipeptydu zawierającego sekwencję aminokwasów nr 4 lub 14, oraz polipeptyd ten jest zdolny do wywoływania u osobnika reakcji immunologicznej na paciorkowce;

(b) izolowanego polinukleotydu kodującego polipeptyd zawierający sekwencją aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79;

(c) izolowanego polinukleotydu zawierającego sekwencję nukleotydową identyczną w co najmniej 95% z sekwencją nukleotydową nr 3, 12 lub 13, przy czym polinukleotyd ten koduje polipeptyd zdolny do wytwarzania przeciwciała wykazującego specyficzność wiązania wobec polipeptydu zawierającego sekwencję aminokwasów nr 4 lub 14, oraz ten izolowany polipeptyd jest zdolny do wywoływania u osobnika reakcji immunologicznej na paciorkowce;

(d) izolowanego polinukleotydu zawierającego sekwencję nukleotydową nr 3, 12 lub 13; lub (e) izolowanego polinukleotydu komplementarnego z polinukleotydem określonym w którymkolwiek z punktów (a)-(d) powyżej.

W jednym z korzystnych wariantów realizacji wynalazku polinukleotyd ma postać DNA. W innym korzystnym wariancie realizacji wynalazku polinukleotyd ma postać RNA.

Przedmiotem wynalazku jest także wektor zawierający polinukleotyd według wynalazku funkcjonalnie połączony z regionem kontroli ekspresji.

Ponadto, przedmiotem wynalazku jest komórka gospodarza transfekowana lub transformowana za pomocą wektora według wynalazku.

PL 206 576 B1

Przedmiotem wynalazku jest także sposób wytwarzania polipeptydu kodowanego przez polinukleotyd według wynalazku, przy czym sposób ten obejmuje hodowlę komórek gospodarza według wynalazku w warunkach odpowiednich do uzyskania ekspresji tego polipeptydu. W jednym z korzystnych wariantów realizacji sposób według wynalazku obejmuje ponadto izolowanie polipeptydu z hodowli komórek gospodarza. W innym korzystnym wariancie realizacji sposobu według wynalazku polipeptyd jest polipeptydem rekombinowanym.

Przedmiotem wynalazku jest również izolowany polipeptyd zawierający (a) sekwencję aminokwasów identyczną w co najmniej 95% z sekwencją aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 63, 73, 74, 77 lub 79, przy czym ten izolowany polipeptyd ten jest zdolny do wytwarzania przeciwciała wykazującego specyficzność wiązania wobec polipeptydu zawierającego sekwencję aminokwasów nr 4 lub 14, oraz polipeptyd ten jest zdolny do wywoływania u osobnika reakcji immunologicznej na paciorkowce; lub (b) sekwencję aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79.

W jednym z korzystnych wariantów izolowanego polipeptydu według wynalazku z sekwencji nr 4 lub 14 usunięta jest N-terminalna reszta metioninowa. W innym korzystnym wariancie izolowanego polipeptydu według wynalazku z sekwencji nr 4 lub 14 usunięta jest wydzielnicza sekwencja aminokwasów. W kolejnym korzystnym wariancie izolowany polipeptyd według wynalazku jest przyłączony do sacharydu. W następnym korzystnym wariancie izolowanego polipeptydu według wynalazku paciorkowiec jest wybrany spośród Streptococcus pneumoniae, grupy A Streptococcus (Streptococcus pyogenes), grupy B Streptococcus (Streptococcus agalactiae), Streptococcus dysgalactiae, lub Streptococcus uberis. W szczególnie korzystnym przypadku paciorkowcem jest Streptococcus pneumoniae.

Ponadto, przedmiotem wynalazku jest chimeryczny polipeptyd wybrany spośród (a) chimerycznego polipeptydu zawierającego dwa lub większą liczbę polipeptydów, przy czym sekwencja aminokwasów każdego z dwóch lub większej liczby peptydów zawiera sekwencję aminokwasów wybraną spośród sekwencji nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79, zaś dwa lub większa liczba polipeptydów jest połączona z utworzeniem chimerycznego polipeptydu;

(b) chimerycznego polipeptydu zawierającego dwa lub większą liczbę polipeptydów, przy czym sekwencja aminokwasów każdego z dwóch lub większej liczby peptydów zawiera sekwencję aminokwasów wybraną spośród sekwencji nr 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77, zaś dwa lub większa liczba polipeptydów jest połączona z utworzeniem chimerycznego polipeptydu;

(c) chimerycznego polipeptydu o wzorze (I):

A-(B)m-(C)n-D (I) w którym: m oznacza 0 lub 1, n oznacza 0 lub 1,

A jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79;

B jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79;

C jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79; oraz

D jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79; lub (d) chimerycznego polipeptydu o wzorze (I):

A-(B)m-(C)n-D (I) w którym: m oznacza 0 lub 1, n oznacza 0 lub 1,

A jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77;

B jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77;

C jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77; oraz

D jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77.

W jednym z korzystnych wariantów realizacji chimerycznego polipeptydu według wynalazku izolowany polipeptyd jest przyłączony do sacharydu.

Kolejnym przedmiotem wynalazku jest kompozycja do szczepionek zawierająca (a) skuteczną profilaktycznie lub terapeutycznie ilość izolowanego polipeptydu według wynalazku, oraz farmaceutycznie akceptowalny nośnik lub rozcieńczalnik; lub (b) skuteczną profilaktycznie lub terapeutycznie ilość chimerycznego polipeptydu według wynalazku, oraz farmaceutycznie akceptowalny nośnik lub rozcieńczalnik. W jednym z korzystnych wariantów realizacji kompozycja według wynalazku zawiera ponadto farmaceutycznie akceptowalny adiuwant.

PL 206 576 B1

W innym korzystnym wariancie realizacji kompozycja według wynalazku jest przeznaczona do zastosowania w zapobieganiu lub leczeniu zakażenia osobnika paciorkowcem.

Przedmiotem wynalazku jest także zastosowanie kompozycji według wynalazku do wytwarzania leku do leczenia lub zapobiegania zakażeniu osobnika paciorkowcem. W jednym z korzystnych przypadków zastosowania według wynalazku zakażenie paciorkowcem obejmuje zapalenie opon, zapalenie ucha środkowego, bakteriemię lub zapalenie płuc. W szczególnie korzystnym przypadku zastosowania według wynalazku osobnikiem jest ssak, a zwłaszcza człowiek. W innym korzystnym przypadku zastosowania według wynalazku zakażenie paciorkowcem jest wywołane przez Streptococcus pneumoniae, grupę A paciorkowców (Streptococcus pyogenes), grupę B paciorkowców (Streptococcus agalactiae), Streptococcus dysgalactiae lub Streptococcus uberis, a zwłaszcza - przez Streptococcus pneumoniae.

Przedmiot wynalazku w przykładach wykonania został przedstawiony na rysunku, na którym:

fig. 3 przedstawia sekwencję DNA genu BVH-11; Sekwencja nr 3.

fig. 4 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11; Sekwencja nr 4.

fig. 12 przedstawia porównanie przewidywanej sekwencji aminokwasowej otwartych ramek odczytu BVH-11 ze szczepów S. pneumoniae WU2, Rx1, JNR.7/87, SP64, P4241, A66 i SP63 stosując program Clustal W z oprogramowania do analizy sekwencyjnej MacVector (wersja 6.5). Poniżej wersów zawierających sekwencje, znajduje się wiersz określający zgodność, gdzie symbole* i. oznaczają odpowiednio identyczne i podobne reszty aminokwasowe.

fig. 13 przedstawia porównanie przewidywanej sekwencji aminokwasowej białek BVH-11 z różnych szczepów S. pneumoniae. Stopień identyczności (I) i podobieństwa (S) wyznaczono stosując program Clustal W z oprogramowania do analizy sekwencyjnej MacVector (wersja 6.5).

fig. 15 przedstawia sekwencję DNA zawierającą cały gen BVH-11 (ORF zlokalizowana od nukleotydu 45 do 2567); Sekwencja nr 12.

fig. 16 przedstawia sekwencję DNA zawierającą cały gen BVH-11-2 (ORF zlokalizowana od nukleotydu 114 do 2630); Sekwencja nr 13.

fig. 17 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11-2; Sekwencja nr 14.

fig. 23 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW12; Sekwencja nr 58.

fig. 25 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11M; Sekwencja nr 60.

fig. 26 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11A; Sekwencja nr 61.

fig. 27 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11B (zwanego również New13); Sekwencja nr 62.

fig. 28 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11C; Sekwencja nr 63.

fig. 32 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW4; Sekwencja nr 67.

fig. 33 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW5; Sekwencja nr 68.

fig. 34 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW6; Sekwencja nr 69.

fig. 35 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW7; Sekwencja nr 70.

fig. 36 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW8; Sekwencja nr 71.

fig. 37 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW9; Sekwencja nr 72.

fig. 38 przedstawia sekwencję aminokwasową białka BVH-11-2M; Sekwencja nr 73.

fig. 39 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW10; Sekwencja nr 74.

fig. 40 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW11; Sekwencja nr 75.

fig. 41 przedstawia sekwencję DNA genu NEW12; Sekwencja nr 76.

fig. 42 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW14; Sekwencja nr 77. fig. 44 przedstawia sekwencję aminokwasową białka NEW16; Sekwencja nr 79.

Przeciwciało, które „ma specyficzność wiązania” jest o przeciwciało, które rozpoznaje i wiąże się z wybranym polipeptydem, ale które zasadniczo nie rozpoznaje i nie wiąże się z innymi cząsteczkami w próbce, np. próbce biologicznej, która z natury swojej zawiera wybrany peptyd. Specyficzne wiązanie może być mierzone stosując test ELISA, w którym wybrany polipeptyd jest stosowany jako antygen.

Jeśli nie zdefiniowano inaczej, wszystkie techniczne i naukowe określenia stosowane w niniejszym opisie mają takie samo znaczenie jak ogólnie zrozumiałe dla specjalisty w dziedzinie, do której należy niniejszy wynalazek. Wszystkie publikacje, zgłoszenia patentowe, patenty i inne odnośniki wymienione w opisie są zawarte w całości jako literatura. W przypadku niezgodności niniejszy opis wynalazku włącznie z definicjami będzie wiążący. Ponadto materiały, sposoby i przykłady stanowią jedynie ilustrację i nie mają ograniczać zakresu wynalazku.

PL 206 576 B1

Zgodnie z niniejszym opisem, „fragmenty”, „analogi” lub „pochodne” polipeptydów według wynalazku obejmują te polipeptydy, w których jedna lub większa liczba reszt aminokwasowych jest podstawiona konserwowanymi lub nie-konserwowanymi resztami aminokwasowymi (korzystnie konserwowanymi) i które mogą być naturalne lub nie będące pochodzenia naturalnego. W jednym z wariantów rozwiązania według wynalazku, pochodne i analogi polipeptydów według wynalazku mają mniej niż około 20 podstawień, modyfikacji lub delecji reszt aminokwasowych i korzystniej mniej niż 10. Korzystnymi podstawieniami są te, w które są znane specjalistom w dziedzinie jako konserwowane to jest podstawione reszty wykazują takie same fizyczne lub chemiczne właściwości takie jak hydrofobowość, wielkość, ładunek lub grupy funkcyjne.

Wynalazkiem objęte są również polipeptydy które zostały połączone z innymi związkami, które zmieniają biologiczne lub farmakologiczne właściwości polipeptydów to jest poli(glikolem etylenowym) (PEG), w celu zwiększenia półokresu trwania; aminokwasowymi sekwencjami liderowymi lub wydzielniczymi, w celu ułatwienia oczyszczania, i sekwencjami prepro- i pro-; i (poli)sacharydami.

Ponadto, w tych sytuacjach, w których jak stwierdzono, regiony aminokwasowe są polimorficzne, może być pożądana zmiana jednego lub większej liczby poszczególnych aminokwasów, w celu zwiększenia skuteczności naśladowania różnych epitopów różnych szczepów paciorkowców.

Ponadto, polipeptydy według niniejszego wynalazku mogą być modyfikowane poprzez acylację końca -NH2 (np. przez acetylowanie, lub amidowanie kwasem tioglikolowym, amidowanie końca karboksylowego, np. amoniakiem lub metyloaminą) w celu zapewnienia stabilności, zwiększenia hydrofobowości w wiązaniu lub połączeniu z podłożem lub z inną cząsteczką.

Przedmiotem wynalazku są również hetero- i homo polipeptydowe multimery fragmentów polipeptydowych, analogi i pochodne. Te polimerowe postaci obejmują, na przykład, jeden lub większą liczbę polipeptydów, które zostały usieciowane z cząsteczkami sieciującymi, takimi jak awidyna/biotyna, gluteraldehyd lub dimetylo-superimidan. Takie polimerowe postaci obejmują również polipeptydy zawierające dwa lub większą liczbę tandemowych lub odwróconych przylegających sekwencji, otrzymane z multicistronowych mRNA wytworzonych technikami rekombinacyjnego DNA.

Korzystnie fragment, analog lub pochodna polipeptydu według wynalazku zawiera przynajmniej jeden obszar antygenowy to jest przynajmniej jeden epitop.

W celu uzyskania tworzenia się polimerów antygenowych (to jest multimerów syntetycznych), mogą być wykorzystane polipeptydy mające grupy bishalogenoacetylowe, nitroarylohaloidki, i tym podobne, w których odczynniki są specyficzne dla grup tiolowych. Dlatego połączenie pomiędzy dwoma grupami merkaptolowymi różnych peptydów może być wiązaniem pojedynczym lub może być złożone z grupy wiążącej złożonej zazwyczaj z co najmniej czterech, a nie więcej niż 16, ale zazwyczaj nie więcej niż 14 atomów węgla.

W szczególnym rozwiązaniu, fragmenty polipeptydowe, analogi i pochodne według wynalazku nie zawierają zaczynającej reszty metioninowej (Met). Korzystnie, polipeptydy nie będą zawierały sekwencji liderowej lub wydzielniczej (sekwencji sygnałowej). Część sygnałowa polipeptydu według wynalazku może być określona według ustalonych technik biologii molekularnej. Ogólnie, polipeptyd według wynalazku, może być izolowany z hodowli paciorkowców, a następnie sekwencjonowany w celu określenia reszty początkowej dojrzałego białka i w wyniku tego sekwencji dojrzałego polipeptydu.

Jak wskazano powyżej wynalazek dotyczy również kompozycji do szczepionek zawierającej jeden lub większą liczbę polipeptydów według wynalazku w mieszaninie z farmaceutycznie dopuszczalnym nośnikiem, rozcieńczalnikiem lub adiuwantem. Odpowiednie adiuwanty obejmują oleje takie jak pełny i częściowy adiuwant Freunda; sole to jest AlK(SO4)2, AlNa(SO4)2, AINH4(SO4)2, krzemiany, kaolin, polinukleotydy węglowe to jest poli IC i poli AU. Korzystne adjuwanty obejmują QuilA i Alhydrogel. Szczepionki według wynalazku mogą być podawane pozajelitowo przez iniekcję, szybki wlew, absorpcję nosowo-gardłową, absorpcję skórną, lub policzkową, lub doustną. Nośniki dopuszczalne farmakologicznie obejmują również anatoksynę tężca.

Kompozycje do szczepionek według wynalazku są stosowane do leczenia lub profilaktyki zakażeń paciorkowcami i/lub chorób i zespołów w których uczestniczy zakażenie paciorkowcami, jak opisano w P.R. Murray (Ed, in chief), E.J. Baron, M.A. Pfaller, F.C. Tenover i R.H. Yolken. Manual of Clinical Microbiology, ASM Press, Washington, D.C. szóste wyd., 1995, str. 1482, które są zamieszczone jako odnośniki. Kompozycja do szczepionek według wynalazku może być wykorzystywana m.in. w profilaktyce lub leczeniu zapalenia opon, zapalenia ucha środkowego, bakteriemii lub zapalenia płuc. W szczególnym rozwiązaniu, szczepionki są podawane tym osobnikom które są zagrożone ryzykiem infekcji paciorkowcami takie jak niemowlęta, osoby starsze i osoby o osłabionej odporności.

PL 206 576 B1

Kompozycje do szczepionek są korzystnie w dawce jednostkowej od około 0,001 do 100 μg/kg (antygen/masę ciała) i korzystniej 0,01 do 10 μg/kg i najkorzystniej 0,1 do 1 μg/kg 1 do 3 razy z przerwami około 1 do 6 tygodni pomiędzy immunizacjami.

W jednym rozwiązaniu, polinukleotydy zostały przestawione w Sekwencji nr: 3, 12, 13 i 76, które obejmują otwarte ramki odczytu (ORF), kodujące polipeptydy według wynalazku. Jest jasne, że sekwencje polinukleotydowe przedstawione na rysunku mogą być zmienione przez zdegenerowane kodony, jednak nadal kodując polipeptydy według wynalazku. Zgodnie z powyższym, niniejszy wynalazek obejmuje polinukleotyd, który hybrydyzuje z sekwencjami polinukleotydami jak opisano powyżej (lub całkowitymi sekwencjami tych polinukleotydów).

Niniejszy wynalazek obejmuje również polinukleotydy kodujące polipeptydy według wynalazku, lub fragmenty, analogi lub pochodne tych polipeptydów, które mogą być stosowane w immunizacji DNA. To jest mogą one być włączone do wektora, który ulega replikacji i ekspresji po iniekcji i przez to powoduje produkcję antygenowego polipeptydu in vivo. Na przykład polinukleotydy mogą być włączone do wektora plazmidowego pod kontrolą promotora CMV, który jest funkcjonalny w komórkach eukariotycznych. Korzystnie wektor jest wprowadzany zastrzykiem domięśniowym.

Jak wskazano powyżej, wynalazek dotyczy m.in. sposobu otrzymywania polipeptydu według wynalazku technikami rekombinacyjnymi w wyniku ekspresji polinukleotydu kodującego ten polipeptyd w komórce gospodarza i odzyskiwania produktu polipeptydowego uzyskanego w wyniku ekspresji. W innym rozwiązaniu, polipeptydy mogą być otrzymywane zgodnie z ustalonymi technikami syntezy chemicznej to jest synteza oligopeptydów w fazie płynnej lub stałej, które są ligowane w celu otrzymania całego polipeptydu (ligacja blokowa).

Ogólnie sposoby otrzymywania i oszacowania polinukleotydów i polipeptydów są opisane w następujących odnośnikach: Sambrook i wsp., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, II wyd., Cold Spring Harbor, N.Y., 1989; Current Protocols in Molecular Biology, Edited by Ausubel F.M. i wsp., John Wiley i Sons, Inc. New York; PCR Klonowanie Protocols, from Molecular Klonowanie to Genetic Engineering, Edited by White B.A., Humana Press, Totowa, New Jersey, 1997, strona 490; Białko Oczyszczanie, Principles i Practices, Scopes R.K., Springer-Verlag, New York, III wyd., 1993, strona 380; Current Protocols in Immunology, Edited by Coligan J.E. i wsp., John Wiley & Sons Inc., New York, które są zamieszczone jako odnośniki.

Do produkcji w wyniku rekombinacji, komórki gospodarza są transfekowane wektorami, które kodują polipeptyd, a następnie są one hodowane w pożywce pokarmowej zmodyfikowanej odpowiednio do aktywacji promotorów, selekcji transformantów lub amplifikacji genów. Odpowiednie wektory, które są żywotne i ulegają replikacji w wybranym gospodarzu i obejmują chromosomalnie, nie-chromosomalne i syntetyczne sekwencje DNA np. plazmidy bakteryjne, fagi DNA, bakulowirusy, plazmidy drożdżowe, wektory pochodzące z połączeń plazmidów i fagów DNA. Sekwencje polipeptydowe mogą być włączane do wektora w odpowiednim miejscu stosując enzymy restrykcyjne w taki sposób, że jest on funkcjonalnie połączony z regionem kontroli ekspresji zawierającym promotor, miejsce wiązania rybosomu (region zgodności lub sekwencja Shine-Dalgarno), i ewentualnie operator (element kontroli). Możliwe jest wybranie poszczególnych składników regionu kontroli ekspresji, które są odpowiednie dla danego gospodarza i wektora według ustalonych zasad biologii molekularnej (Sambrook i wsp., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, wyd. II, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989; Current Protocols in Molecular Biology, Edited by Ausubel F.M. i wsp., John Wiley i Sons, Inc. New York załączone w niniejszym opisie jako odnośnik). Odpowiednie promotory obejmują między innymi promotory LTR lub SV40, E.coli lac, tac lub trp i promotory faga lambda PL. Wektory korzystnie zawierają początek replikacji jak i markery selekcyjne to jest gen odporności na ampicylinę. Odpowiednie wektory bakteryjne obejmują pET, pQE70, pQE60, pQE-9, pbs, pD10 phagescript, psiX174, pbluescript SK, pbsks, pNH8A, pNH16a, pNH18A, pNH46A, ptrc99a, pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5 i wektory eukariotyczne pBlueBacIII, pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, pSG, pSVK3, pBPV, pMSG i pSVL. Komórki gospodarza mogą być bakteryjne to jest E.coli, Bacillus subtilis, Streptomyces; grzybowe to jest Aspergillus niger, Aspergillus nidulins; drożdżowe to jest Saccharomyces lub eukariotyczne to jest CHO, COS.

W wyniku ekspresji polipeptydu w hodowli, komórki są zazwyczaj zbierane przez wirowanie następnie rozerwanie środkami fizycznymi lub chemicznymi (jeśli ekspresja polipeptydu prowadzi do otrzymania peptydu, który nie jest wydzielany do pożywki) i otrzymuje się surowy ekstrakt zatrzymany do przeprowadzenia wyodrębnienia żądanego polipeptydu. Oczyszczanie polipeptydu z pożywki hodowlanej lub lizatu może być uzyskany znanymi technikami w zależności od właściwości polipeptydu

PL 206 576 B1 to jest stosując strącanie siarczanem amonowym lub etanolem, ekstrakcję kwasem, chromatografię anionowo- lub kationowo- wymienną, chromatografii na złożu fosfocelulozowym, chromatografii oddziaływań hydrofobowych, chromatografię na hydroksyloapatycie i chromatografii lecytynowej. Końcowe oczyszczanie może być przeprowadzone z wykorzystaniem HPLC.

Polipeptyd może ulegać ekspresji z lub bez sekwencji liderowej lub wydzielniczej. W poprzednim przypadku, lider może być usuwany w trakcie obróbki post-translacyjnej (patrz opisy patentowe US 4,431,739; US 4,425,437; i US 4,338,397 załączone w niniejszym opisie jako odnośniki) lub może być usuwany chemicznie po oczyszczeniu polipeptydu uzyskanego w wyniku ekspresji.

Polipeptydy według wynalazku mogą być stosowane w testach diagnostycznych w zakażeniach paciorkowcami, w szczególności w zakażeniach S. pneumoniae. Możliwe jest zastosowanie kilku sposobów diagnostycznych, na przykład wykrywanie organizmów paciorkowców w próbce biologicznej. W tym celu moż e być wykorzystana procedura opisana poniż ej:

a) uzyskiwanie próbki biologicznej od pacjenta;

b) inkubacja przeciwciała lub jego fragmentu reagującego z polipeptydem paciorkowców według wynalazku z próbką biologiczną do utworzenia mieszaniny; oraz

c) wykrywanie przeciwciała specyficznie związanego lub związanego fragmentu w mieszaninie, co wskazuje na obecność paciorkowców.

W innym rozwiązaniu, sposób wykrywania przeciwciała specyficznego względem antygenu paciorkowców w próbce biologicznej, w której podejrzewa się lub zakłada obecność tego przeciwciała, może być przeprowadzony następująco:

a) uzyskiwanie próbki biologicznej od pacjenta;

b) inkubacja jednego lub większej liczby polipeptydów według wynalazku lub jego fragmentów z próbką biologiczn ą do utworzenia mieszaniny; oraz

c) wykrywanie specyficznie związanego antygenu lub związanego fragmentu w mieszaninie, co wskazuje na obecność przeciwciała specyficznego względem paciorkowców.

Specjalista w dziedzinie zrozumie, że te diagnostyczne testy mogą mieć kilka postaci, włącznie z testami immunologicznymi, takimi jak test immunoabsorpcji enzymozależ nej (ELISA), test radioimmunologiczny (przy użyciu radioaktywnie znakowanych przeciwciał) lub test aglutynacji lateksowej, zasadniczo do określania czy specyficzne przeciwciała przeciwko białkom są obecne w organizmie.

Sekwencje DNA kodujące polipeptydy według wynalazku mogą również być stosowane do projektowania sond DNA do stosowania przy wykrywaniu obecności paciorkowców w próbce biologicznej, które jak się przypuszcza zawierają takie bakterie. Sposób wykrywania według niniejszego wynalazku obejmuje:

a) uzyskiwanie próbki biologicznej od pacjenta;

b) inkubację jednej lub większej liczby sond DNA o sekwencji DNA kodującej polipeptyd według wynalazku lub jego fragmentów z próbką biologiczną do utworzenia mieszaniny; oraz

c) wykrywanie specyficznie związanej sondy DNA w mieszaninie, co wskazuje na obecność bakterii paciorkowców.

Sondy DNA przygotowane z wykorzystaniem niniejszego wynalazku mogą również być stosowane do wykrywania krążących paciorkowców to jest kwasów nukleinowych S. pneumoniae w próbce, na przykład stosując reakcję łańcuchową polimerazy, jako sposobu diagnozowania infekcji paciorkowcami. Sonda może być syntetyzowana stosując tradycyjne techniki i może być unieruchomiona na stałym podłożu, lub może być znakowana znacznikiem, który może być wykryty. Korzystna sonda DNA przygotowana z wykorzystaniem niniejszego wynalazku to oligomer o sekwencji komplementarnej do co najmniej około 6 sąsiadujących nukleotydów kodujących polipeptydy paciorkowców zapalenia płuc według wynalazku.

Inny sposób diagnostyczny wykrywania paciorkowców u pacjenta obejmuje:

a) znakowanie przeciwciała reagujące z polipeptydem według wynalazku lub jego fragmentem za pomocą wykrywalnego znacznika;

b) podawanie znakowanego przeciwciała lub znakowanego fragmentu pacjentowi; oraz

c) wykrywanie specyficznie związanego znakowanego przeciwciała lub znakowanego fragmentu u pacjenta, co wskazuje na obecność paciorkowców.

Kolejny aspekt wykorzystania niniejszego wynalazku stanowi zastosowanie polipeptydów paciorkowców według wynalazku jako immunogenów do otrzymywania specyficznych przeciwciał do diagnostyki i w szczególności do leczenia infekcji paciorkowcami. Odpowiednie przeciwciała mogą być określane przy użyciu odpowiednich sposobów przeszukiwania, na przykład przez pomiar zdolności

PL 206 576 B1 poszczególnego przeciwciała do biernej ochrony przeciwko infekcjom paciorkowcami w modelach testowych. Jednym przykładem modelu zwierzęcego jest model mysi opisany w poniższych przykładach. Przeciwciało może być całym przeciwciałem lub jego fragmentem wiążącym antygen i może należeć do dowolnej klasy immunoglobulin. Przeciwciało lub jego fragment może pochodzić od zwierzęcia, specyficznie od ssaka a bardziej szczegółowo od myszy, szczura lub człowieka. Może to być naturalne przeciwciało lub jego fragment, lub jeśli jest to pożądane, zrekombinowane przeciwciało lub fragment przeciwciała. Określenie zrekombinowane przeciwciało lub fragment przeciwciała oznacza przeciwciało lub fragment przeciwciała, który otrzymano w wyniku zastosowania technik biologii molekularnej. Przeciwciało lub fragment przeciwciała może być poliklonalne, lub korzystnie monoklonalne. Może one być specyficzne ze względu na ilość epitopów związanych z polipeptydami paciorkowców zapalenia płuc, ale korzystnie są one specyficzne względem jednego epitopu.

Jak opisano powyżej, przedmiotem wynalazku są nowe antygeny oznaczone jako BVH-11 i BVH-11-2, obcięte polipeptydy zawierające fragmenty antygenów BVH-11 i BVH-11-2 oraz chimeryczne polipeptydy zawierające fragmenty antygenów BVH-11 i BVH-11-2.

Poniżej przedstawiono tabelę zawierającą odnośniki podsumowującą zależności pomiędzy antygenami według niniejszego wynalazku:

Rodzina	Nr sekwencji nukleotydowej	Nr sekwencji aminokwasowej
BVH-11
BVH-11-1	3, 12	4
BVH-11-2	13	14
BVH-11M		60
BVH-11A		61
BVH-11B również oznaczany jako NEW13		62
BVH-11C		63
New4		67
New5		68
New6		69
New7		70
New8		71
New9		72
BVH-11-2M		73
New10		74
New11		75
New12	76	58
New14		77
New16		79

Treść poniższych przykładów zachowano w zakresie pierwotnego zgłoszenia PCT/CA99/01218. Wprawdzie częściowo treść przykładów odnosi się do rozwiązań stanowiących przedmiot zgłoszeń wydzielonych z niniejszego zgłoszenia (w szczególności w zakresie BVH-3 i BVH-28), ale uznano, że dla zachowania spójności i kompletności informacji korzystniejsze będzie pozostawienie w niniejszym opisie treści przykładów w formie niezmienionej. Znawca w dziedzinie wynalazku będzie w stanie na podstawie tych przykładów zrealizować wynalazek w całym zastrzeganym zakresie.

PL 206 576 B1

P r z y k ł a d 1

Niniejszy przykład przedstawia klonowanie genów S. pneumoniae.

Region kodujący genu S. pneumoniae BVH-3 (Sekwencja nr 1) i region kodujący genu S. pneumoniae BVH-28 (Sekwencja nr 5) amplifikowano metodą PCR (DNA Thermal Cycler GeneAmp PCR system 2400 Perkin Elmer, San Jose, CA) z genomowego DNA z grupy surowiczej 6 Szczepu S. pneumoniae SP64 stosując oligonukleotydy, które zawierały końcówki nici odpowiednie do dodania miejsc restrykcyjnych Bglll (AGATCT) i Xbal (TCTAGA). Produkty PCR oczyszczano z żelu agarozowego stosując zestaw do ekstrakcji z żelu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA), trawiono BglII-XbaI (Pharmacia Canada Inc, Baie d'Urfe, Kanada), ekstrahowano fenolem:chloroformem i wytrącano etanolem. Wektor Superlinker pSL301 (Invitrogen, San Diego, CA) trawiono Bglll i Xbal i oczyszczano z ż elu agarozowego stosują c zestaw do ekstrakcji z ż elu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Fragmenty BglII-XbaI genomowego DNA ligowano z BglII-XbaI wektora pSL301. Zligowanymi produktami transformowano szczep DH5a E. coli [f80 lacZ DM15 koniecA1 recA1 hsdR17 (^rK^{- m}K⁺) supE44 thi-11^- gyrA96 relA1 D(lacZYA-argF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według metody opisanej przez Simanis (Hanahan, D. DNA cloning, 1985, D.M. Glover (wyd), str. 109-135). Zrekombinowane plazmidy pSL301 plazmids (rpSL301) zawierające gen BVH-3 lub BVH-28 oczyszczano stosując zestaw QIAgen (Chatsworth, CA) i Inserty DNA potwierdzono przeprowadzając analizę sekwencji nukleotydów (zestaw do sekwencjonowania Taq Dye Deoxy Terminator Cycle Sequencing, ABI, Foster City, CA). Zrekombinowane rpSL301 (rpSL301) trawiono enzymami restrykcyjnymi Bglll (AGATCT) i XhoI (CTCGAG). Fragmenty DNA BglII-XhoI oczyszczano stosują c zestaw do ekstrakcji z ż elu

QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Wektor ekspresyjny pET-32c(+) (Novagen, Madison, WI) zawierający sekwencję tioredoksyno-HisTag trawiono BamHI (GGATCC) i XhoI i ekstrahowano z żelu stosując zestaw do ekstrakcji z żelu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Fragmenty BglII-XhoI DNA ligowano z BamHI-XhoI wektora pET-32c(+) aby utworzyć sekwencję kodującą dla białka fuzyjnego tioredoksyno-His^Tag-fiyH-3 lub tioredoksyno-His^Tag-BVH-28. Zligowanymi produktami transformowano szczep DH5a E. coli [f80 lacZ DM15 koniecA1 reckA1 hsdR17 (^rK^-mK⁺) supE44 thi-11 gyrA96 relA1 D(lacZYA-argF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według metody opisanej przez Simanis (Hanahan, D. DNA Klonowanie, 1985, D.M. Glover (ed), str. 109-135). Zrekombinowane plazmidy pET-32c(+) oczyszczano stosując zestaw QIAgen (Chatsworth, CA) i sekwencje nukleotydowe w miejscach łączenia tioredoksyno-HisTag i insertu DNA sprawdzano przez sekwencjonowanie DNA (zestaw do sekwencjonowania Taq Dye Deoxy Terminator Cycle Sequencing, ABI, Foster City, CA).

P r z y k ł a d 2

Niniejszy przykład przedstawia klonowanie genów kodujących białka S. pneumoniae w plazmidzie CMV pCMV-GH.

Region DNA kodujący białka S. pneumoniae wprowadzono do genu kodującego ludzki hormon wzrostu (hGH) w fazie downstream, przy czym gen był pod kontrolą transkrypcyjną promotora cytomegalowirusa (CMV) w wektorze plazmidowym pCMV-GH (Tang i wsp., Nature, 1992, 356:152). Promotor (CMV) jest nie funkcjonalnym plazmidem w komórkach E. coli, ale aktyny po podaniu plazmidu do komórek eukariotycznych. Wektor również obejmuje gen oporności na ampicylinę.

Region kodujący genu BVH-3 (Sekwencja nr 1) i BVH-28 (Sekwencja nr 5) otrzymano z rpSL301 (patrz przykład 1) stosując enzymy restrykcyjne Bglll (AGATCT) i Xbal (TCTAGA). Produkty trawienia oczyszczano z żelu agarozowego stosując zestaw do ekstrakcji z żelu QlAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Wektor pCMV-GH (Laboratory of Dr. Stephen A. Johnston, Department of Biochemistry, The University of Texas, Dallas, Texas) zawierający gen kodujący ludzki hormonu wzrostu aby utworzyć białka fuzyjne trawiono Bglll i Xbal i oczyszczano z żelu agarozowego stosując zestaw do ekstrakcji z żelu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Fragmenty BglII-XbaI DNA ligowano z BglII-XbaI wektora pCMV-GH, aby utworzyć białko fuzyjne hGH-BVH-3 lub hGH-BVH-28 pod kontrolą promotora CMV. Zligowanymi produktami transformowano komórki szczepu E. coli DH5a[f80 lacZ DM15 koniecA1 recA1 hsdR17 (^rK^-mK⁺) supE44 thi-11^- gyrA96 relA1 D(lacZYA-argF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według metody opisanej przez Simanis (Hanahan, D. DNA Klonowanie, 1985, D.M. Glover (ed), str. 109-135). Zrekombinowane plazmidy pCMV oczyszczano stosując zestaw QIAgen (QIAgen, Chatsworth, CA).

Region kodujący genu BVH-11 (Sekwencja nr 3) amplifikowano metodą PCR (DNA Thermal Cycler GeneAmp PCR system 2400 Perkin Elmer, San Jose, CA) z genomowego DNA z grupy surowiczej 6 szczepu S. pneumoniae SP64 stosując oligonukleotydy, które zawierały końcówki nici odpowiednie do dodania miejsc restrykcyjnych Bglll (AGATCT) i Hindlll (AAGCTT). Produkt PCR oczyszczano

PL 206 576 B1 z żelu agarozowego stosują c zestaw do ekstrakcji z żelu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA), trawiono enzymami restrykcyjnymi (Pharmacia Canada Inc, Baie d'Urfe, Kanada), ekstrahowano fenolem:chloroformem i wytrącano etanolem. Wektor pCMV-GH (Laboratorium Dr. Stephena A. Johnstona, Departament Biochemii, The University of Texas, Dallas, Texas) trawiono Bg1ll i Hindlll i oczyszczano z żelu agarozowego stosując zestaw do ekstrakcji z żelu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Fragment Bg1ll-HindIII DNA ligowano z Bg1ll-HindlIl wektora pCMV-GH, aby utworzyć białko fuzyjne hGH-BVH-11 pod kontrolą promotora CMV. Zligowanymi produktami transformowano komórki szczepu E. coli DH5a[f80 lacZ DM15 koniecA1 recA1 hsdR17 (^rK^-mK⁺) supE44 thi-11^- gyrA96 relA1 D(lacZYA-arg F)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według metody opisanej przez Simanis (Hanahan, D. DNA Klonowanie, 1985, D.M. Glover (ed), str. 109-135). Zrekombinowany plazmid pCMV oczyszczano stosując zestaw QIAgen (Chatsworth, CA) i sekwencję nukleotydową wstawki DNA was sprawdzano przez sekwencjonowanie DNA.

P r z y k ł a d 3

Niniejszy przykład przedstawia zastosowanie DNA do wywołania odpowiedzi immunologicznej na antygeny S. pneumoniae.

Grupy 8 samic myszy BALB/c (Charles River, St-Constant, Quebec, Kanada) immunizowano przez domięśniowy zastrzyk 50 μl trzy razy w dwu lub trzytygodniowych odstępach 100 μg zrekombinowanego pCMV-GH kodującego gen BVH-3, BVH-11 lub BVH-28 w obecności 50 μg czynnika stymulującego kolonię granulocytów-makrofagów (GM-CSF)- prowadzącego ekspresję plazmidu pCMV-GH-GM-CSF (Laboratory of Dr. Stephen A. Johnston, Department of Biochemistry, The University of Texas, Dallas, Texas). Jako kontrolę, grupie myszy wstrzykiwano 100 μg pCMV-GH w obecności 50 μg pCMV-GH-GM-CSF. Próbki krwi zbierano z oczodołu przed każdą immunizacją i siedem dni po trzecim zastrzyku i odpowiedzi przeciwciał w surowicy wyznaczono testem ELISA stosując białko fuzyjne tioredoksyno-HisTag-S. pneumoniae jako antygen pokrywający. Immunizacja DNA zrekombinowanym plazmidem pCMV-GH kodującym białko S. pneumoniae BVH-3, BVH-11 lub BVH-28 indukowała przeciwciało reagujące przeciwko odpowiedniemu zrekombinowanemu białku. Miana wzajemnych przeciwciał, zdefiniowane jako najwyższe rozcieńczenie surowicy przy którym wartość absorbancji wynosi 0,1 ponad wartości tła, wynosiło powyżej 4x10³.

P r z y k ł a d 4

Niniejszy przykład przedstawia otrzymywanie i oczyszczanie zrekombinowanych białek S. pneumoniae.

Zrekombinowanymi plazmidami pET zawierającymi gen BVH-3, BVH-11 lub BVH-28 odpowiadającymi odpowiednio sekwencjom: Sekwencja nr 1, Sekwencja nr 3 lub Sekwencja nr 5 transformowano przez elektroporację (Gene Pulser II apparatus, BIO-RAD Labs, Mississauga, Canada) komórki szczepu E. coli AD494 (DE3) (Dara^-leu7691 DlacX74 DphoA Pvull phoR DmalF3 F'[lac⁺(lacI^q)pro] trxB::Kan) (Novagen, Madison, WI). W tym szczepie E. coli, promotor T7 kontrolujący ekspresję białka fuzyjnego jest specyficznie rozpoznawany przez polimerazę T7 RNA (obecną w profagu 1DE3), której gen jest pod kontrolą promotora lac, który jest indukowany przez izopropylo-e-d-tio-galaktopyranozyd (IPTG). Transformanty AD494(DE3)/rpET hodowano w temp. 37°C z wytrząsaniem przy 250 rpm w pożywce bulionowej LB (pepton 10 g/L, ekstrakt z drożdży 5 g/L, NaCl 10 g/L) zawierającej 100 μg ampicyliny (Sigma-Aldrich Canada Ltd., Oakville, Kanada) na ml do momentu, gdy A600 osiągnęło wartość 0,6. W celu zaindukowania produkcji białka fuzyjnego tioredoksyno-Hisrfag-BVH-3, tioredoksyno-Hisrfag-BVH-11 lub tioredoksyno-HisTag-BVH-28, komórki inkubowano przez 2 dodatkowe godziny w obecności IPTG o stężeniu końcowym 1 mM. Zaindukowane komórki z hodowli 100 ml osadzano przez wirowanie i zamrażano w temp. -70°C.

Oczyszczanie białek fuzyjnych z rozpuszczalnej frakcji cytoplazmatycznej indukowanego IPTG AD494(DE3)/rpET prowadzono stosując chromatografię powinowactwa opartą na właściwości sekwencji HisTag (6 kolejnych reszt histydynowych) aby związać kationy dwuwartościowe (Ni²+) unieruchomione na żywicy chelatującej metale HisBind. Po krótce, osadzone komórki otrzymane z hodowli 100 mL indukowane IPTG ponownie zawieszono w buforze fosforanowym (PBS):500 mM NaCl pH 7,1, sonikowano i wirowano przy 20,000 X g przez 20 min aby usunąć rozpadnięte szczątki. Supernatant odfiltrowano (błona o rozmiarze oczek 0,22 μm) i naniesiono na kolumnę HiTrap® 1 mL chelatującą, wcześniej upakowaną gotową do użycia (Pharmacia Biotech, Baie d'Urfe, Kanada). Białko fuzyjne tioredoksyno-HisTag-S. pneumoniae wymywano roztworem: 1 M imidazol-500 mM NaClPBS pH 7,1. Usunięcie soli i imidazolu z próbki prowadzono przez dializę w PBS w temp. 4°C. Ilości

PL 206 576 B1 białka fuzyjnego otrzymanego z frakcji rozpuszczalnej E. coli oszacowano stosując MicroBCA (Pierce, Rockford, Illinois).

P r z y k ł a d 5

Niniejszy przykład przedstawia ochronę myszy przeciwko śmiertelnemu zakażeniu paciorkowcami przez immunizację.

Grupy 8 samic myszy BALB/c (Charles River) immunizowano podskórnie trzy razy z trzytygodniowymi przerwami stosując 25 μg oczyszczone przez powinowactwo tioredoksyno-HisTag-BVH-3 białko fuzyjne w obecności 15 μg adiuwanta QuilA (Cedarlane Laboratories Ltd, Hornby, Kanada) lub, jako kontrolę, tylko z samym adiuwantem QuilA w PBS. Próbki krwi zbierano z zatoki oczodołowej dnia 1, 22 i 43 przed każdą immunizacją i siedem dni (dnia 50) po trzecim zastrzyku. Tydzień później myszy prowokowano stosując około 10⁶ CFU typu 3 Szczepu S. pneumoniae WU2. Próbki inokulum S. pneumoniae do prowokacji umieszczono na czekoladowych szalkach agarowych do określania CFU i do sprawdzania dawki do prowokacji. Przypadki śmiertelne zliczano przez 14 dni i 14 dnia po prowokacji, myszy, które przeżyły uśmiercano i próbki krwi badano pod kątem obecności S. pneumoniae. Dane określające przeżywalność przedstawiono w tabeli 1.

Próbki surowicy krwi przed prowokacją analizowano pod kątem obecności przeciwciał reagujących z S. pneumoniae standardowymi testami immunologicznymi. Analizy Elisa i immunoblot wykazały, że immunizacja zrekombinowanym białkiem S. pneumoniae otrzymany w komórkach E. coli wywoływane przeciwciała reagujące zarówno ze zrekombinowanym jak i natywnym białkiem paciorkowców.

T a b e l a 1. Ochrona uzyskana w wyniku zastosowania zrekombinowanego białka BVH-3

Immunogen	Ilość myszy żywych: ilość myszy martwych 14 po teście prowokacji	Średni dzień śmierci
BVH-3	8 : 0	>14
żaden	0 : 8	1

Wszystkie myszy immunizowane zrekombinowanym białkiem BVH-3 przeżyły zakażenie podczas gdy żadna z kontrolnych myszy którym podano sam adiuwant przeżyło. Stwierdzono znaczącą różnicę przeżywalności pomiędzy tymi dwoma grupami myszy (P<0.0001, logarytmiczna analiza rangowa w analizie nieparametrycznej krzywych przeżycia; P=0.0002, Test dokładności Fishera). Wszystkie posiewy krwi pobrane od myszy, które przeżyły były negatywne dnia 14 po prowokacji.

P r z y k ł a d 6

Niniejszy przykład opisuje klonowanie genów BVH-3 i BVH-11 z różnych szczepów S. pneumoniae i konserwacje molekularną tych genów.

Analiza molekularna chromosomowego DNA z różnych izolatów S. pneumoniae sondami DNA obejmującymi różne regiony BVH-3 lub BVH-11 ujawniła obecność jednej kopii genu BVH-3 i dwóch kopii genu BVH-11. Dwie kopie genu BVH-11 nie są identyczne i geny zostały dowolnie oznaczone jako BVH-11 (Sekwencja nr 12; ORF zlokalizowana od nukleotydu 45 do 2567) i BVH-11-2 (Sekwencja nr 13; ORF zlokalizowana od nukleotydu 114 do 2630).

Pierwsze aminokwasy BVH-3 i BVH-11 regionu kodującego mają charakterystykę sekwencji liderowych również znane jako peptydy sygnałowe. Miejsce cięcia peptydazy sygnału zdolności L-X-X-C lipobiałkowego miejsc modyfikacji/obróbki było obecne w tych sekwencjach. Dojrzałe białka BVH-3, BVH-11 i BVH-11-2 z S. pneumoniae SP64 mają odpowiednio 1019, 821 i 819 aminokwasów. Regiony genów S. pneumoniae kodujące dojrzałe BVH-3, zakończone BVH-3M, (nukleotydy 1837 - 4896; Sekw.nr. NO: 11), BVH-11M (nukleotydy 102-2567; Sekw. nr. NO: 12) i BVH-11-2M (nukleotydy 171-2630; Sekw.nr. NO: 13), amplifikowano metodą PCR (DNA Thermal Cycler GeneAmp PCR system 2400 Perkin Elmer, San Jose, CA) z genomowego DNA 6 lub 7 szczepu S. pneumoniae. Kliniczne izolaty z grup surowiczych 6 S. pneumoniae SP64 i grup surowiczych 9 SP63 zostały dostarczone przez laboratorium - laboratoire de la sante publique du Quebec, Sainte-Anne-de-Bellevue; serotype 4 szczep JNR.7/87 został dostarczony przez Andrew Camilli, Tufts University School of Medicine, Boston; Rx1 szczep, nieotorbiona pochodna typu 2 szczepu D39 i typu 3 szczepów A66 i WU2 zostały dostarczone przez Davida E. Brilesa z University of Alabama, Birmingham i izolat kliniczny typu 3 P4241 został dostarczony przez centrum badawcze - centrę de recherche en infectiologie du centre hospitalier de l'universite Laval, Sainte-Foy. Zestawy starterów oligonukleotydowych OCRR479-OCRR480; HAMJ160-OCRR488 i HAMJ160-HAMJ186, które zawierały końcówki nici odpowiednie do dodania

PL 206 576 B1 miejsc restrykcyjnych zastosowano do amplifikacji genu odpowiednio, BVH-3, BVH-11 i BVH-11-2, z wyją tkiem genu BVH-11 ze szczepu SP64, który amplifikowano stosują c zestaw starterów zawierający HAMJ487 i OCRR488. Sekwencje starterów zostały wymienione poniżej (Tabela 2). Produkty

PCR oczyszczano z żelu agarozowego stosując zestaw do ekstrakcji z żelu QIAquick z firmy QIAgen (Chatsworth, CA) i trawiono Bg1II-XbaI lub Bglll-Hindlll (Pharmacia Canada Inc, Baie d'Urfe, Canada). Produkty po trawieniu oczyszczano stosując zestaw do oczyszczania QIAquick PCR z firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Produkty PCR ligowano z Bg1II-XbaI lub Bg1ll-Hindlll wektora pSL301. Zligowanymi produktami transformowano komórki szczepu E. coli DH5n [φ80 lacZ ΔM15 koniecA1 recA1 hsdR17 (^rK^-mK+) st/pE44 thi-1K gyrA96 relA1 Δ(lacZYA-argF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według metody opisanej przez Simanis (Hanahan, D. DNA Klonowanie, 1985, D.M. Glover (ed), str. 109-135). Zrekombinowane plazmidy pSL301 (rpSL301) zawierające BVH-3, BVH-11 lub BVH11-2 oczyszczano stosując zestaw QIAgen (Chatsworth, CA) i inserty DNA sekwencjonowano (zestaw do sekwencjonowania Taq Dye Deoxy Terminator Cycle Sequencing, ABI, Foster City, CA). Fig. 11 i 12 przedstawiają sekwencję zgodności ustaloną na podstawie wyznaczonych sekwencji aminokwasowych, odpowiednio BVH-3, i BVH-11. Porównanie sekwencji białkowych BVH-3 ujawniło 99 do 100% identyczności sekwencji dla wszystkich szczepów z wyjątkiem BVH-3 z grupy surowiczej 9 szczepu SP63 (Sekw.nr. NO: 15 i Sekw.nr. NO: 16) który utracił ciąg 177 aminokwasów odpowiadającym resztom 244 do 420 w sekwencji białkowej BVH-3 S. pneumoniae SP64. Analiza sekwencji dodatkowej grupy surowiczej 9 szczepu ujawniło cząsteczkę BVH-3 mającą taką samą delecję w 3 z 4 szczepów, co sugeruje, że 3 szczepy należą do klonu grupy surowiczej 9 S. pneumoniae.

Porównując 13 BVH-11 sekwencji nukleotydowych otrzymano z 7 szczepów S. pneumoniae, ujawniło że sekwencje nukleotydowe są bardzo podobne. Analiza komputerowa (MacVector, Clustal W 1.4) z wykorzystaniem wielokrotnego przypisania przewidywanych sekwencji białkowych BVH-11 ujawniła, że te sekwencje są w 75% identyczne i 82% homologiczne na długości 834 aminokwasów. Przypisywanie przez parowanie ujawniło 80 do 100% identyczności (fig. 13). Sekwencje wykazały ogromne podobieństwo w całościowej organizacji. Różnorodność pierwszorzędowych sekwencji tych białek jest prawie ograniczone do ostatnich 125 aminokwasów w części C-końcowej białek. Region ten tworzy domenę. Bliższe badanie tej domeny dwie grupy sekwencje, pierwsze 9 sekwencji z fig. 13 należą do jednej grupy podczas gdy ostatnie 4 sekwencje należą do innej grupy. Wartość 39% identyczności otrzymano jeśli zostało porównano sekwencji domen 13 białek (MacVector, Clustal W 1.4). Wartość identyczności zwiększa się do powyżej 92% jeśli porównywane są sekwencje należące do tej samej grupy.

P r z y k ł a d 7

Niniejszy przykład przedstawia homologii części genów BVH-3 i BVH-11.

Analiza molekularna sondami DNA pochodzącymi z genów BVH-3 i BVH-11 wykazała, że BVH-3 i BVH-11 są spokrewnione. W badaniach hybrydyzacji dot blot, sonda DNA zawierająca bądź BVH-3 bądź BVH-11, sekwencja genowa hybrydyzowała z oboma genami, BVH-3 i BVH-11, co wskazuje że geny BVH-3 i BVH-11 mają sekwencje homologiczne. Porównanie sekwencje ujawniło, że otwarte ramki odczytu ORF i białka były odpowiednio, w 43 i 33% identyczne. Dokładniejsze badanie ujawniło że region odpowiadający aminokwasom od 1 do 225 w genie BVH-3 i 1 do 228 w genie BVH-11 wykazywał odpowiednio 73 i 75% identyczności na poziomie DNA i białka. Przeciwnie, regiony 3' odpowiadające aminokwasom od 226 do 1039 z BVH-3 i aminokwasom 229-840 z BVH-11 wykazywały jedynie odpowiednio 34 i 22% identyczności na poziomie DNA i białka. Zatem końce 5' genów BVH-3 i BVH-11 wydają się zawierać wysoce konserwowane sekwencje podczas gdy pozostałe części genów bardzo się różnią. Wyniki te sugerują, że BVH-3 i BVH-11 mogą mieć podobne funkcje w których pośredniczą sekwencje obecne w regionie konserwowanym, podczas gdy specyficzne funkcje BVH-3i BVH-11 mogą być wynikiem sekwencji w regionie zróżnicowanym.

P r z y k ł a d 8

Niniejszy przykład opisuje klonowanie obciętych genów BVH-3, BVH-11 i BVH-11-2 w wyniku reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) i ekspresja obciętych cząsteczek BVH-3 i BVH-11.

Fragmenty genowe amplifikowano metodą PCR stosując pary oligonukleotydów zaprojektowane do prowadzenia amplifikacji fragmentów obejmujących gen BVH-3 (Sekwencja nr 1 i Sekwencja nr 11), BVH-11 (Sekwencja nr 3 i Sekwencja nr 12) lub BVH-11-2 (Sekwencja nr 13) ze szczepu SP64 S. pneumoniae. Każdy ze starterów ma miejsce cięcia endonukleazy na końcu 5', co umożliwia bezpośrednie wklonowanie w ramce amplifikowanego produktu do trawionego wektora plazmidowego (Tabele 2 i 3). Produkty otrzymane w wyniku amplifikacji PCR trawiono endonukleazami restrykcyjnymi

PL 206 576 B1 i ligowano z bądź linearyzowanym plazmidem pSL301 (patrz przykład 1), pCMV-GH (patrz przykład 2) lub pET (Novagen, Madison, WI) wektorem ekspresyjnym trawionym podobnie lub trawionym enzymami, które produkują kompatybilne lepkie końce. Zrekombinowane plazmidy pSL301 i zrekombinowane pCMV-GH trawiono enzymami restrykcyjnymi w celu klonowania w ramce do wektora ekspresyjnego pET. Klony wstępnie stabilizowano w komórkach E. coli DH5D przed wprowadzeniem do E. coli BL21 (DDE3) lub AD494 (DDE3) w celu otrzymania ekspresji obciętych cząsteczek BVH-3 lub BVH11. Każdy z otrzymanych konstruktów plazmidowych potwierdzono przeprowadzając analizę sekwencji nukleotydów. Ekspresję zrekombinowanych białek prowadzono jako fuzję N-końców z tioredoksyną i His-tag lub jako fuzję C-końców z His-tag. Zrekombinowane białka ulegające ekspresji oczyszczano z frakcji supernatantu otrzymanych w wyniku wirowania sonikowanych indukowanych IPTG hodowli E. coli stosując żywicę chelatującą metale His-Bind (QIAgen, Chatsworth, CA). Wytworzone produkty genowe zostały wymienione w tabeli 3. Produkty genowe odpowiadające sekwencjom: region N-końcowy włącznie z sekwencją sygnałową oznaczono jako Lipidowane-białka lub lipobiałka (L-białka). Produkty genowe odpowiadające sekwencjom: region N-końcowy bez sekwencji sygnałowej są określane jako białka bez sekwencji sygnałowej (w/o ss).

T a b e l a 2. Lista starterów oligonukleotydów do PCR

Starter	Sekw. nr.	Sekwencja 5' - 3'	Pozycja nukleotydu	Miejsca restrykcyjne
1	2	3	4	5
OCRR 479	17	cagtagatctgtgcctatgcactaaac	Sekw. nr 1 :61-78	Bg1ll
OCRR 480	18	gatctctagactactgctattccttacgctatg	Sekw. nr 11 :4909-4887	Xbal
OCRR 497	19	atcactcgagcattacctg g ataatcctgt	Sekw. nr 1 :1525-1506	XhoI
OCRR 498	20	ctgctaagcttatgaaagatttagat	Sekw. nr 1 :1534-1548	Hindlll
OCRR 499	21	gatactcgagctgctattccttac	Sekw. nr 11 :4906-4893	XhoI
HAM.I 172	22	gaatctcgagttaagctgctgctaattc	Sekw. nr 1 : 675-661	XhoI
HAMJ 247	23	gacgctcgagcgctatgaaatcagataaattc	Sekw. nr 1 :3117-3096	XhoI
HAMJ 248	24	gacgctcgagggcattacctggataatcctgttcatg	Sekw. nr 1 :1527-1501	XhoI
HAMJ 249	25	cagtagatctcttcatcatttattgaaaagagg	Sekw. nr 11: 1749-1771	Bg1ll
HAMJ 278	26	ttatttcttccatatggacttgacagaagagcaaattaag	Sekw. nr 1 :1414-1437	Ndel
HAMJ 279	27	cgccaagcttcgctatgaaatcagataaattc	Sekw. nr 1 :3117-3096	Hindlll
HAMJ 280	28	cgccaagcttttccacaatataagtcgattgatt	Sekw. nr 1 :2400-2377	Hindlll
HAMJ 281	29	ttatttcttccatatggaagtacctatcttggaaaaagaa	Sekw. nr 1 :2398-2421	Ndel
HAMJ 300	30	ttatttcttccatatggtgcctatgcactaaaccagc	Sekw. nr 1 :62-82	Ndel
HAMJ 313	31	ataagaatgcggccgcttccacaatataagtcgattgatt	Sekw. nr 1 :2400-2377	Notl
OCRR 487	32	cagtagatctgtgcttatgaactaggtttgc	Sekw. nr 3 :58-79	Bg1ll
OCRR 488	33	gatcaagcttgctgctacctttacttactctc	Sekw. nr 12 :2577-2556	Hindlll
HAMJ 171	34	ctgagatatccgttatcgttcaaacc	Sekw. nr 3 :1060-1075	EcoRV
HAMJ 251	35	ctgcaagcttttaaaggggaataatacg	Sekw. nr 3 :1059-1045	Hindlll
HAMJ 264	36	cagtagatctgcagaagccttcctatctg	Sekw. nr 3 :682-700	Bg1ll
HAMJ 282	37	tcgccaagcttcgttatcgttcaaaccattggg	Sekw. nr 3 :1060-1081	Hindlll
HAMJ 283	38	ataagaatgcggccgccttactctcctttaataaagccaa tagtt	Sekw. nr 3 :2520-2492	Ndel
HAMJ 284	39	catgccatgg acattgatagtctcttgaaacagc	Sekw. nr 3 :856-880	Ncol

PL 206 576 B1 cd. tabeli 2

1	2	3	4	5
HAMJ 285	40	cgccaagcttcttactctcctttaataaagccaatag	Sekw. nr 3 :2520-2494	Hindlll
HAMJ 286	41	cgacaagcttaacatggtcgctagcgttacc	Sekw. nr 3 :2139-2119	Hindlll
HAMJ 287	42	cataccatgggcctttatgaggcacctaag	Sekw. nr 3 :2014-2034	Ncol
HAMJ 288	43	cgacaagcttaagtaaatcttcagcctctctcag	Sekw. nr 3 :2376-2353	Hindlll
HAMJ 289	44	gataccatggctagcgaccatgttcaaagaa	Sekw. nr 3 :2125-2146	Ncol
HAMJ 290	45	cgccaagcttatcatccactaacttgactttatcac	Sekw. nr 3 :1533-1508	Hindlll
HAMJ 291	46	cataccatgg atattcttgccttcttagctccg	Sekw. nr 3 :1531-1554	Ncol
HAMJ 301	47	catgccatggtgcttatgaactaggtttgc	Sekw. nr 3 :59-79	Ncol
HAMJ 302	48	cgccaagctttagcgttaccaaaaccattatc	Sekw. nr 3 :2128-2107	Hindlll
HAMJ 160	49	gtattagatctgttcctatgaacttggtcgtcacca	Sekw. nr 13 :172-196	Bg1ll
HAMJ 186	50	cgcctctagactactgtataggagccgg	Sekw. nr 13 :2460-2443	Xbal
HAMJ 292	51	catgccatggaaaacatttcaagccttttacgtg	Sekw. nr 11 :754-778	Ncol
HAMJ 293	52	cgacaagcttctgtataggagccggttgactttc	Sekw. nr 11 :2457-2434	Hindlll
HAMJ 294	53	catgccatggttcgtaaaaataaggcagaccaag	Sekw. nr 11 :2038-2062	Ncol
HAMJ 297	54	catgccatggaagcctattggaatgggaag	Sekw. nr 11 :622-642	Ncol

T a b e l a 3. Listy obciętych produktów genowych BVH-3 i BVH-11 wytworzonych z S. pneumoniae SP64

Zestawy starterów do PCR	Określenie białek	Oznaczenie (kodowane aminokwasy)	Sekw. Nr.	Wektor do klonowania
1	2	3	4	5
OCRR479-OCRR480	BVH-3M	BVH-3 w/o ss (21-1039)	55	pSL301
OCRR479-OCRR497	BVH-3AD	BVH-3 N' koniec w/o ss (21-509)	56	pSL301
HAMJ248-HAMJ249	L-BVH-3AD	BVH-3 N' koniec (1-509)	57	pET-21(+)
OCRR498-OCRR499	BVH-3B	BVH-3 C' koniec (512-1039)	10	pSL301
OCRR479-HAMJ172	BVH-3C	BVH-3 N' koniec w/o ss (21-225)	59	pET-32c(+)
OCRR487-OCRR488	BVH-11M	BVH-11 w/o ss (20-840)	60	pCMV-GH
HAMJ251-OCRR487	BVH-11A	BVH-11 N' koniec w/o ss (20-353)	61	pET-32c(+)
HAMJ171-OCRR488	BVH-11B	BVH-11 C' koniec (354-840)	62	pET-32a(+)
HAMJ264-OCRR488	BVH-11C	BVH-11 C' koniec (228-840)	63	pET-32a(+)
HAMJ278-HAMJ279	NEW1	BVH-3 C' koniec (472-1039)	64	pET-21b(+)
HAMJ278-HAMJ280	NEW2	BVH-3 C' koniec (472-800)	65	pET-21b(+)
HAMJ281-HAMJ279	NEW3	BVH-3 C' koniec (800-1039)	66	pET-21b(+)
HAMJ284-HAMJ285	NEW4	BVH-11 C' koniec (286-840)	67	pET-21d(+)
HAMJ284-HAMJ286	NEW5	BVH-11 wewnętrzny (286-713)	68	pET-21d(+)
HAMJ287-HAMJ288	NEW6	BVH-11 wewnętrzny (672-792)	69	pET-21d(+)
HAMJ285-HAMJ289	NEW7	BVH-11 wewnętrzny (709-840)	70	pET-21d(+)
HAMJ284-HAMJ290	NEW8	BVH-11 wewnętrzny (286-511)	71	pET-21d(+)
HAMJ286-HAMJ291	NEW9	BVH-11 wewnętrzny (511-713)	72	pET-21d(+)

PL 206 576 B1 cd. tabeli 3

1	2	3	4	5
HAMJ160-HAMJ186	BVH-11-2M	BVH-11-2 w/o ss (20-838)	73	pSL301
HAMJ292-HAMJ293	NEW10	BVH-11-2 C' koniec (271-838)	74	pET-21d(+)
HAMJ293-HAMJ294	NEW11	BVH-11-2 C' koniec (699-838)	75	pET-21 d(+)
HAMJ282-HAMJ283	BVH-11B	BVH-11 C' koniec (354-840)	62	pET-21 b(+)
HAMJ286-HAMJ297	NEW14	BVH-11-2 wewnętrzny (227-699)	77	pET-21 d(+)
HAMJ300-HAMJ313	NEW15	BVH-3 N' koniec w/o ss (21-800)	78	pET-21b(+)
HAMJ301-HAMJ302	NEW16	BVH-11 N' koniec w/o ss (20-709)	79	pET-21 d(+)

P r z y k ł a d 9

Niniejszy przykład opisuje izolowanie monoklonalnych przeciwciał (Mabs) i zastosowanie Mabs do charakteryzowania epitopów białkowych BVH-3, BVH-11 i BVH-11-2.

Samice myszy BALB/c (Charles River) immunizowano podskórnie produktami genowymi BVH-3,

BVH-11 lub BVH-11-2 ze szczepu SP64 S. pneumoniae w obecności 15 μg adjuwanta QuilA (Cedarlane Laboratories Ltd, Hornby, Kanada). Jeden zbiór myszy (doświadczenie fuzyjne 1) immunizowano dnia 1 i 14 przy pomocy 25 μg oczyszczonego przez powinowactwo białka fuzyjnego tioredoksyno-HisTag-BVH-3M. Druga grupa myszy (doświadczenie fuzyjne 2) immunizowano trzy razy z trzytygodniowymi przerwami przy pomocy 25 μg oczyszczonego przez powinowactwo tioredoksyno-HisTag-BVH-3M. Trzecia grupa myszy (doświadczenie fuzyjne 3) immunizowano dnia 1 i dnia 15 przy pomocy 25 μg oczyszczonego przez powinowactwo białka fuzyjnego tioredoksyno-His^Tag-BVH-11-2M. Czwarta grupy myszy (doświadczenie fuzyjne 4) immunizowano dnia 1 przy pomocy 25 μg oczyszczonego przez powinowactwo białka fuzyjnego tioredoksyno-HisBVH-11B i zwiększano przez iniekcję dożylną dnia 16 i dnia 37 zrekombinowanego BVH-11B w PBS. Trzy do czterech dni przed fuzją, myszom podawano przez iniekcję dożylną 25 μg odpowiedniego antygeny zawieszone jedynie w PBS. Hybridomy otrzymywano w wyniku fuzji komórek śledziony z niewydzielnicznymi komórkami SP2/0 jak wcześniej opisano w pracy J. Hamel i wsp. [J. Med. Microbiol., 23, pp163-170 (1987)]. Supernatanty kultur hybridom początkowo przeszukiwano stosując test immunologiczny wiązania enzymu według procedury opisanej przez Hamel i wsp. (Supra) stosując szalki powlekane preparatem oczyszczonych zrekombinowanych białek lub zawiesinami komórek S. pneumoniae zabitych ciepłem. Pozytywne hybridomy wybrano na podstawie reagowania w teście ELISA z różnymi antygenami, a następnie zostały sklonowane przez ograniczone rozcieńczenia, zawieszone i zamrożone.

Hybridomy badano testem ELISA lub testem immunoblottingu Westerna przeciwko produktom genowym BVH-3 i BVH-11 w celu scharakteryzowania epitopów rozpoznawanych przez Mabs. BVH-3 i BVH-11 mają wspólne epitopy z 6-ma Mabs (H3-1-F9, H3-1-D4, H3-1-H12, H11-1-E7, H11-1-H10 i H11-1.1-G11) wykazując reaktywność z oboma białkami (Tabela 4). Cząsteczki BVH-11 i BVH-11-2 z S. pneumoniae SP64 mają wspólne epitopy nie obecne na BVH-3 z Mabs (3A1, 13C11, 10H10, 1D8, 10G9, 10A2, 3E8, 10D7, 2H7 i 6H7) reagujące ze zrekombinowanymi białkami zarówno BVH-11 jak i BVH-11-2, (Tabela 5).

T a b e l a 4. Reaktywność BVH-3-immunoreaktywnych Mabs z zespołem produktów genowych BVH-3 i BVH-11

MAbs	Immunoreakcyjność z
BVH-3M 21-1039	BVH-3A 21-509	BVH-3B 512-1039	BVH-3C 21-225	NEW2 472-800	NEW3 800-1039	BVH-11M 20-840
1	2	3	4	5	6	7	8
H3-1-F9	+	+	-	+	-	-	+
H3-1-D4	+	+	-	+	-	-	+
H3-1-H12	+	+	-	+	-	-	+
H3-2-G2	+	+	-	-	-	-	-
H3-3-A1	+	+	-	-	-	-	-

PL 206 576 B1 cd. tabeli 4

1	2	3	4	5	6	7	8
H3-4-D3	+	-	+	-	-	+	-
H11-1-E7	+	+	-	+	-	-	+
H11-1-H10	+	+	-	+	-	-	+
H11-1.1-G11	+	+	-	+	+	-	+

T a b e l a 5. Reaktywność Mabs skierowanych przeciwko białku BVH-11-2 ze szczepu S. pneumoniae SP64 z zespołem produktów genowych BVH-11

Mabsa	Immunoreakcyjność z
Produkty BVH-11	Produkty BVH-11-2
BVH-11M 20-840	NEW8 286-511	NEW9 511-713	BVH-11B 354-840	BVH-11-2 20-838	NEW10 271-838	NEW11 699-838	NEW14 227-699
3A1	+	+	-	+	+	+	-	+
13C11	+	+	+	+	+	+	-	+
10H10	+	+	+	+	+	+	-	+
1D8	+	+	-	+	+	+	-	+
10G9	+	-	-	+	+	+	-	+
10A2	+	-	-	+	+	+	-	+
3E8	+	-	-	+	+	+	-	+
10D7	+	-	-	+	+	+	-	+
2H7	+	-	-	-	+	-	-	-
6H7	+	-	-	-	+	-	-	-
3A4	-	-	-	-	+	+	+	-
14H6	-	-	-	-	+	+	+	-
7G2	-	-	-	-	+	+	-	+
13H10	-	-	-	-	+	-	-	+
7E8	-	-	-	-	+	-	-	-
7H6	-	-	-	-	+	-	-	-

^a Mabs wymienione w tej tabeli nie reagował y ze zrekombinowaną cząsteczką BVH-3

Wyniki otrzymane na podstawie badań immunoreaktywności Mabs (Tabela 4 i Tabela 5) są w zgodzie z sekwencjami białkowymi pochodzącymi od odpowiednich sekwencji genowych. W rzeczywistości Mabs reagujące krzyżowo z cząsteczkami BVH-3 i BVH-11 rozpoznającymi białko BVH-3C odpowiadające sekwencjom: region konserwowany oraz specyficzny Mabs BVH-11 i BVH-11-2 reagowały z epitopami zlokalizowanymi na częściach zmiennych tych cząsteczek. BVH-3 i BVH-11, i BVH-11 i BVH-11-2 mogą być rozpoznawane ze względu na ich reagowanie z Mabs.

P r z y k ł a d 10

Niniejszy przykład przedstawia równoczesną ekspresją produktów genowych BVH-3 i BVH-11 u S. pneumoniae.

Standardową technikę blotu Westerna stosowano do badania czy geny BVH-3 i BVH-11 ulegały ekspresji w S. pneumoniae. Szczepy S. pneumoniae SP64 i SP63 hodowano przez noc w temp. 37°C w 5% CO2 na czekoladowych szalkach agarowych, bakterie zawieszono w PBS i zabito ciepłem w temp. 56°C przez 20 min. Do otrzymywania antygenów, zawiesiny S. pneumoniae poddano działaniu buforu próbki zawierającego SDS i 2-merkaptoetanol przez 5 min w temp. 100°C. białkowe antygeny pneumokokowe rozdzielono stosując elektroforezę SDS-PAGE według metody opisanej przez Laemmli [Nature, 227, str. 680-685 (1970)]. Po SDS-PAGE, białka przenoszono elektroforetycznie z żelu na papier nitrocelulozowy sposobem według Towbina [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 76, str.

PL 206 576 B1

4350-4354 (1979)] i sondowano z mysią surowicą odpornościową lub monoklonalnymi przeciwciałami. Detekcja antygenów reagujących z przeciwciałami prowadzono przez niebezpośredni test enzmymatyczno-immunologiczny stosując koniugowane przeciwko mysie immunoglobuliny i substrat barwiący. Jeśli surowicę odpornościową skierowaną przeciwko zrekombinowanemu BVH-3 badano przeciwko antygenom S. pneumoniae SP64, to wykryto dwa reaktywne prążki mające rzeczywiste masy cząsteczkowe 127 kDa i 99 kDa. Prążki mające takie same rzeczywiste masy cząsteczkowe również wykryto gdy stosowano Mabs H3-1-F9, H3-1-D4, H3-1-H12, H11-1-E7, H11-1-H10 i H11-1.1-G11 indywidualnie jako sondy immunologiczne. Przeciwnie, stosując Mabs specyficzny względem cząsteczki BVH-3 wykryto jedynie prążek 127 kDa a Mabs specyficzny względem BVH-11 wykryto jedynie prążek 99 kDa, potwierdzając w ten sposób identyczność prążków 127 i 99 kDa jako odpowiednio, BVH-3 i BVH-11. Badania te dostarczają dowodów, że białka BVH-3 i BVH-11 są jednocześnie obecne u S. pneumoniae. Ponadto, wyniki są zgodne z naszymi poprzednimi obserwacjami, że BVH-3 i BVH-11 mają epitopy, które są wspólne dla białek i epitopów, które są wyłączne dla któregoś z tych białek.

W S. pneumoniae SP64, dojrzałe BVH-3, BVH-11 i BVH-11-2 są białkami o 1019, 821 i 819 aminokwasach o przewidywanych masach cząsteczkowych odpowiednio 112,5 kDa, 92,4 kDa, i 91,7 kDa. Pomimo, że jest pewna rozbieżność pomiędzy masami cząsteczkowymi przewidzianymi na podstawie sekwencji a masami cząsteczkowymi wyznaczonymi na SDS-PAGE, BVH-3 mogą być rozpoznawane z BVH-11 dzięki jego wyższym masom cząsteczkowym. Ponadto, cząsteczki BVH-3 ze szczepu S. pneumoniae SP63 mają rzeczywiste masy cząsteczkowe 112 kDa w SDS-PAGE w porównaniu do 127 kDa dla BVH-3 ze szczepu SP64. Dane te są zgodne z usunięciem ciągu 177 reszt aminokwasowych w BVH-3 szczepu S. pneumoniae SP63.

P r z y k ł a d 11

Niniejszy przykład opisuje ochronę uzyskaną w przypadku doświadczalnej infekcji myszy szczepionych zrekombinowanymi produktami genowymi BVH-3 lub BVH-11.

Grupy 7 lub 8 samic myszy BALB/c (Charles River) immunizowano podskórnie trzy razy z trzytygodniowymi przerwami stosując oczyszczone przez powinowactwo białko fuzyjne tioredoksyno-HisTag-BVH-3M, oczyszczone przez powinowactwo białko fuzyjne tioredoksyno-HisTag-BVH-77M lub, jako kontrolę, tylko z samym adiuwantem QuilA w PBS. Dwanaście do 14 dni po trzeciej immunizacji, myszy prowokowano dożylnie S. pneumoniae szczep WU2 lub donosowo szczepem P4241. Próbki inokulum S. pneumoniae do prowokacji umieszczono na czekoladowych szalkach agarowych do określania CFU i do sprawdzania dawki do prowokacji. Dawki do prowokacji wynosiły około 10⁶ CFU. Przypadki śmiertelne zliczano przez 14 dni i dnia 14 po prowokacji, myszy, które przeżyły uśmiercano i próbki krwi badano pod kątem obecności organizmów S. pneumoniae. Dane określające przeżywalność przedstawiono w tabelach 6 i 7.

T a b e l a 6. Ochrona w której tworzeniu biorą udział zrekombinowane BVH-3M i BVH-11M białka w przypadku doświadczalnej infekcji wirulentymi S. pneumoniae WU2

Doświadczenie	Immunogen	żywe :	martwea	Średni dzień przeżycia
1	BVH-3M	8	: 0	>14
	żaden	0	: 8	1
2	BVH-11M	8	: 0	>14
	żaden	0	: 8	1

^a Ilość myszy ż ywych : ilość myszy martwe dnia 14 po prowokacji.

T a b e l a 7. Ochrona w której tworzeniu biorą udział zrekombinowane BVH-3M i BVH-11M białka w przypadku doświadczalnej infekcji wirulentymi S. pneumoniae P4241

Doświadczenie	Immunogen	żywe :	martwea	Średni dzień przeżycia
1	BVH-3M	6	: 1	>14
	żaden	1	: 7	4.5
2	BVH-3M	8	: 0	>14
	BVH-11M	8	: 0	>14
	żaden	0	: 8	4

^a Ilość myszy ż ywe : ilość myszy martwe dnia 14 po prowokacji.

PL 206 576 B1

Wszystkie myszy immunizowane zrekombinowanym białkiem BVH-3M lub BVH-11M przeżyły zakażenie WU2, podczas gdy żadna z kontrolnych myszy którym podano sam adiuwant nie przeżyła. Wszystkie z wyjątkiem jednej myszy immunizowanej zrekombinowanym białkiem BVH-3M lub BVH-11M przeżyły zakażenie P4241 podczas gdy tylko jedna mysz kontrolna, z myszy którym podano sam adiuwant przeżyła. Wszystkie posiewy krwi pobrane od myszy, które przeżyły były negatywne dnia 14 po prowokacji. Wyniki te jasno wskazują, że oba, BVH-3M i BVH-11M, wywołują ochronne anty-paciorkowcom odpowiedzi immunologiczne u myszy. Fakt, że te białka są wysoce konserwowane w przypadku izolatów S. pneumoniae podkreśla skuteczność BVH-3 i BVH-11 jako uniwersalnych kandydatów do przygotowywania szczepionek. W rzeczywistości, białka BVH-3 i BVH-11 z grupy surowiczej 6 S. pneumoniae szczepu SP64 powodują ochronę przeciwko zakażeniu paciorkowcami w przypadku szczepów o różnych serotypach otoczkowych.

Idealnie, szczepionka, która może zabezpieczać przeciwko chorobom spowodowanym przez paciorkowce, może chronić przeciwko zapaleniu opon, zapaleniu ucha środkowego, bakteriemii lub, zapaleniu płuc. BVH-3 i BVH-11 miały działanie ochronne przeciwko letalnym ogólnoustrojowym i płucnym modelom infekcji, co sugeruje, że u ludzi, szczepionki oparte na białkach BVH-3- i BVH-11 mogą zmniejszać częstość występowania choroby w szerokim spektrum chorób powodowanych przez zasadniczo wszystkie S. pneumoniae niezależnie od serotypu otoczkowego.

Dane z tabeli 6 i 7 jasno wykazują, że BVH-3 i BVH-11 były obydwa, cząsteczkami z S. pneumoniae wywołującymi ochronę. Jednakże nie było wiadomym, czy w ochronie mogą pośredniczyć specyficzne sekwencje, które nie były obecne w cząsteczkach BVH-3 i BVH-11. Grupy samic myszy BALB/c (Charles River) immunizowano podskórnie trzy razy z trzytygodniowymi przerwami stosując oczyszczane przez powinowactwo białko fuzyjne tioredoksyno-Hisrfag-BVH-3AD, -BVH-3B lub -BVH-3C w obecności 15 μg adiuwanta QuilA (Cedarlane Laboratories Ltd, Hornby, Kanada). Myszy kontrolne immunizowano tylko samym adiuwantem QuilA w PBS lub oczyszczanym przez powinowactwo białkiem fuzyjnym tioredoksyno-Hisrfag lub tioredoksyno-HisTag (His-Tio) w obecności QuilA.

Do określania zdolności ochronnych zestawu obciętych białek, zakończonych NEW4, NEW5, NEW6, NEW7, NEW8, NEW9, NEW10, NEW11, NEW14 i BVH-11B, grupy samic myszy BALB/c (Charles River) immunizowano podskórnie dwa razy z trzytygodniowymi przerwami 25 μg bądź oczyszczonym przez powinowactwo HisTag-białkiem fuzyjnym w obecności 15 μg adiuwanta QuilA. Dziesięć do 14 dni po ostatniej immunizacji, myszy prowokowano wirulentymi S. pneumoniae. Nasze wyniki wskazują, że, BVH-3B, obcięta cząsteczka BVH-3 zawierająca 512-1039 aminokwasów, wywołuje ochronę przeciwko wirulentnych względem myszy szczepów WU2 i P4241. Podobnie, cząsteczki BVH-11B, NEW4 i NEW5, trzy obcięte cząsteczki BVH-11 zawierające 354-840 aminokwasów, 286-840 aminokwasów i 286-713 aminokwasów, odpowiednio, wywoływały ochronę przeciwko doświadczalnym dożylnym prowokacjom WU2 i donosowym prowokacjom P4241. Ponadto, szczepienie NEW10 i NEW14, zawierającym 272-838 aminokwasów i 227-699 aminokwasów z cząsteczki BVH-11-2 również prowadziło do uzyskania ochrony przeciwko śmierci spowodowanej przez szczepy paciorkowców. Wyniki te wskazują, że region zawierający 428 aminokwasów rozciągający się w sekwencjach białkowych odpowiednio, od aminokwasów 286-713 i aminokwasów 272-699 w S. pneumoniae SP64 BVH-11 i BVH-11-2 zawiera epitopy ochronne. Region ten jest wysoce konserwowany przy ogólnej 91% identyczności i 94% homologii pomiędzy trzynastoma sekwencjami białkowymi BVH-11.

T a b e l a 8. Ocena ochrony wywoł ywanej przez szczepienie myszy produktami genowymi BVH-3 i BVH-11

	Prowokacja WU2	Prowokacja P4241
			Średni dzień		Średni dzień
Doświadczenie	Immunogen	żywe : martwea	przeżycia	żywe : martwea	przeżycia
1	2	3	4	5	6
1b	Żaden	0 : 8	1.5	1 : 7	4.5
	NEW4	8 : 0	>14	8 : 0	>14
	NEW5	8 : 0	>14	8 : 0	>14
	NEW7	0 : 8	2	0 : 8	5
	BVH-11M	8 : 0	>14	8 : 0	>14

PL 206 576 B1 cd. tabeli 8

1	2	3	4	5	6
2b	Żaden	0 : 8	1	0 : 8	4
	NEW5	8 : 0	>14	8 : 0	>14
	NEW8	0 : 8	1.5	0 : 8	5.5
	NEW9	3 : 5	3.5	2 : 6	7
	BVH-11M	8 : 0	>14	8 : 0	>14
3b	Żaden	0 : 8	1	0 : 8	4
	NEW6	0 : 8	1	4 : 4	10.5c
	NEW10	8 : 0	>14	8 : 0	>14
	NEW11	0 : 8	1.5	1 : 7	6
	BVH-11M	8 : 0	>14	8 : 0	>14
4b	Żaden	0 : 8	2	0 : 8	4
	BVH-11B	7 : 1	>14	8 : 0	>14
	NEW14	8 : 0	>14	8 : 0	>14
5	His-Tio	0 : 8	2
	BVH-3AD	1 : 7	2.5
	BVH-3B	5 : 3	>14
6	His-Tio	0 : 8	1
	BVH-3C	0 : 8	1

^a Ilość myszy ż ywe : ilość myszy martwe dnia 14 po prowokacji.

^b dawka prowokacji WU2 10⁵ CFU.

^c u myszy, które żyły dłużej niż 14 dni, oznaczano czas przeżycia 14 dni w celu określenia wartości średnich.

P r z y k ł a d 12

Niniejszy przykład przedstawia klonowanie i ekspresję chimerycznego genu kodującego chimeryczny polipeptyd odpowiadający sekwencjom: region końca karboksylowego BVH-3 w połączeniu na końcu C' z regionem końca karboksylowego BVH-11 i dodatkową ochronę obserwowano po szczepieniu chimerycznymi polipeptydem.

Jasne jest z badań przedstawionych powyżej, że BVH-3 i BVH-11 są serologicznie różniącymi się cząsteczkami jednocześnie obecnymi w S. pneumoniae. Wyniki badań immunologicznych myszy wskazują, że oba białka są dobrymi kandydatami do przygotowania szczepionki. Białka te mogą być skuteczne w zapewnianiu ochrony przeciwko wszelkim paciorkowcom, bez względu na serotyp. Pomimo, że dwa białka mają takie same epitopy i sekwencje, mają one różne charakterystyki i mogą służyć różnym funkcjom biologicznym. Zatem, immunizacja przeciwko dwóm białkom może dostarczyć wyższy poziom ochrony niż uzyskiwany przez każde z białek oddzielnie. W celu sprawdzenia tej tezy, kilka dróg może być badanych, BVH-3 i BVH-11 pełnej długości lub obcięte, podawane w połączeniu z lub w sprzężeniu. W niniejszym opisie opisujemy inżynierię genetyczną genu fuzyjnego i białka BVH-3-BVH-11, zakończonego NEW12 (odpowiednio Sekwencja nr 76 i Sekwencja nr 58) i możliwość zastosowania białka NEW12 jako szczepionki.

Fragmenty genowe BVH-3 i BVH-11 odpowiadające sekwencjom: koniec 3' genów amplifikowano metodą PCR stosując pary oligonukleotydów zaprojektowane do prowadzenia amplifikacji fragmentów obejmujących nukleotydy 1414 do 3117 (Sekwencja nr 1) i nukleotydy 1060 do 2520 (Sekwencja nr 3) ze szczepu S. pneumoniae SP64 genów odpowiednio BVH-3 i BVH-11. Stosowane startery, HAMJ278 i HAMJ279; HAMJ282 i HAMJ283 miały miejsca cięcia endonukleaz na końcu 5', co umożliwia bezpośrednie klonowanie w ramce amplifikowanego produktu do trawionego wektora plazmidowego pET21b(+) (Tabela 2). Produkty amplifikacji PCR trawiono endonukleazami restrykcyjnymi i ligowano ze linearyzowanym plazmidem pET21b(+), trawionym podobnie. Otrzymane konstrukty plazmidowe potwierdzono przeprowadzając analizę sekwencji nukleotydów. Zrekombinowane

PL 206 576 B1 plazmidy pET21b(+) zawierające produkt PCR Ndel-Hindlll BVH-3 linearyzowano trawiąc enzymami restrykcyjnymi Hindlll i Notl w celu klonowania w ramce fragmentu Hindlll-Notl DNA otrzymanego ze zrekombinowanego pET21(+) wektora zawierającego fragment genu BVH-11. Klony na wstępnie stabilizowano w E. coli DH5n przed wprowadzeniem do E. coli BL21(dDE3) w celu uzyskania ekspresji chimerycznej cząsteczki białka paciorkowców. Zrekombinowany chimeryczny polipeptyd, zakończony NEW12, ulegał ekspresji jako połączenie C-końcowe z His-tag. Otrzymane w wyniku ekspresji zrekombinowane białko NEW12 oczyszczano z frakcji supernatantu otrzymanej w wyniku wirowania sonikowanej indukowanej IPTG hodowli E. coli stosując żywicę chelatującą metal His-Bind (QIAgen, Chatsworth, CA).

Według tej samej procedury opisanej powyżej, możliwe jest skonstruowanie innych chimerycznych polipeptydów, w wyniku jednoczesnej ekspresji New 1 i New 4, New 1 i New 5, New 1 i New 10, lub New 1 i New 14. Konstrukt może zawierać New 1 upstream lub downstream względem New 4, New 5, New 10, BVH-11B lub New 14. W wyniku jednoczesnej ekspresji więcej niż dwóch fragmentów dowolnego z genów BVH-3, BVH-11 lub BVH-11-2, jest również możliwe skonstruowanie innych chimerycznych polipeptydów.

Grupy 8 samic myszy BALB/c (Charles River) immunizowano podskórnie dwa razy z trzytygodniowymi przerwami 25 μg dowolnym oczyszczonym przez powinowactwo fuzją HisTag z białkiem NEW1, BVH-11B lub NEW12 w obecności 15 μg adiuwanta QuilA dziesięć do 14 dni po ostatniej immunizacji, myszy prowokowano wirulentym S. pneumoniae. Jak wykazano poprzednio, cząsteczki NEW1 i BVH-11B zawierające odpowiednio, aminokwasy 472 do 1039 z białka BVH-3 i aminokwasy 354-840 z białka BVH-11, odpowiadają częściom białka zdolnego do wywołania ochronnej odpowiedzi immunologicznej. W celu określania czy chimeryczny polipeptyd może specyficznie zwiększać ochronę porównano z ochroną obserwowaną dla poszczególnych części, dawki do prowokacji dostosowano w sposób, taki, aby nie spodziewać się ochrony w przypadku cząsteczek NEW1 i BVH-11B. Co ciekawe, chimeryczne białko NEW12, wywołuje odpowiedź przeciwko mysim wirulentmym szczepom WU2 i P4241. Siedem z 8 myszy immunizowanych NEW12 było nadal żywe 10 dni po prowokacji podczas gdy 28 z 32 myszy immunizowanych NEW1, BVH-11B, BVH-3M lub samym adiuwantem było martwych pięć dni po prowokacji. Zatem, szczepienie myszy NEW12 zapewniało najwyższy stopień ochrony przeciwko prowokacji WU2. Wyniki te wskazują, że immunizacja chimerycznym polipeptydem i możliwe połączenia produktów genowych BVH-3 i BVH-11 mogą dostarczyć dodatkowej ochrony do tej jaką otrzymano w wyniku podawania samych antygenów BVH-3 lub BVH-11.

T a b e l a 9. Ocena ochrony wywoływanej przez szczepienie myszy chimeryczną cząsteczką NEW12

	Prowokacja WU2	Prowokacja P4241
Immunogen	żywe : martwea	Średni dzień przeżycia	żywe : martwea	Średni dzień przeżycia
Żaden	0 : 8	1	0 : 8	5
NEW1	2 : 6	2	1 : 7	8
BVH-11B	1 : 7	3.5	8 : 0	>14
NEW12	6 : 2	>14	7 : 1	>14
BVH-3M	1 : 7	3	8 : 1	>14

P r z y k ł a d 13

Niniejszy przykład przedstawia identyfikację dodatkowych pokrewnych sekwencji BVH-3 i BVH-11 u gatunków Streptococcus innych niż S. pneumoniae.

Wykazano uprzednio, że BVH-3, BVH-11 i BVH-11-2 stanowią rodzinę pokrewnych białek mających wspólne sekwencje. Przeprowadzono badania homologii z sekwencją nukleotydową z regionu konserwowanego tych genów i porównano z sekwencjami z GenBank i EMBL stosując technikę FASTA. Najbardziej znaczącą homologię obserwowano z genem kodującym 2.469-kb obliczoną masą 92-kDa białka (Sekwencja nr 81) o nieznanej funkcji u S. agalactiae zwanych również paciorkowce grupy B lub GBS. Gen oznaczono jako BVH-71. Białko wykazujące 99.2% identyczności i 99.5% podobieństwa z GBS było również zidentyfikowano w S. pyogenes zwanym również paciorkowcem grupy A lub GAS (Sekwencja nr 83). Region 5' sekwencji BVH-71 (Sekwencja nr 80 i Sekwencja nr 82), obejmujący

PL 206 576 B1 nukleotydy 1 do 717, wykazano 58 i 60% identyczności z regionami konserwowanymi genów odpowiednio BVH-3 (nukleotydy 1 do 675) i BVH-11 (nukleotydy 1 do 684). Pierwsze 239 aminokwasy sekwencji GBS i GAS BVH-71 otwarte ramki odczytu, które uległy translacji są w 51 i 54% identyczne z pierwszymi 225 i 228 aminokwasami odpowiednio BVH-3 i BVH-11. Oprócz podobieństw strukturalnych, białka pneumokokowe BVH-3, BVH-11 i BVH-71 również mają epitopy antygenowe. Prążek 97-kDa ujawniony w analizie blotu Westerna całych komórek GAS lub GBS, stosując Mab H11-1.1-G11 reagujące z regionami konserwowanymi BVH-3 i BVH-11. Podobnie, zrekombinowane białka BVH-71 GAS i GBS wykryto analizą immunoblotu Westerna.

Wyniki te wskazują, że białka BVH-71, BVH-3 i BVH-11 mogą mieć podobne funkcje. Nasze wyniki również sugerują, że białka BVH-71 mogą być stosowane jako białkowe składniki szczepionek skierowane przeciwko paciorkowcom. Białka BVH-71 mogą być stosowane jako białkowe składniki szczepionek w szczepionkach anti-GAS lub anti-GBS.

PL 206 576 B1

Wykaz sekwencj i <110> BIOCHEM PHARMA INC. hamel, Josee BRODEUR, Bernard R.

PINEAU, Isabelle MARTIN, Denis RIOUX, element <120> Nowe antygeny paciorkowców .

<130> 12806-11PCT <150> US 60/113,800 <151> 1998-12-23 <160> 102 <170> FastSEQ for Windows Version 3.0 <210> 1 <211> 3120 <212> DNA <213> S. pneumoniae <220>

atg

<400> aaa ttt

1 agt

aaa

aaa

tat

ata

gca

gct

gga

tea

gct

gtt

atc

gta

48

tcc

ttg

agt

eta

tgt

gee

tat

gca

eta

aac

cag

cat

cgt

teg

cag

gaa

96

aat

aag

gac

aat

aat

cgt

gtc

tct

tat

gtg

gat

ggc

age

cag

tea

agt

144

cag

aaa

agt

gaa

aac

ttg

aca

cca

gac

cag

gtt

age

cag

aaa

gaa

gga

192

att

cag

gct

gag

caa

att

gta

atc

aaa

att

aca

gat

cag

ggc

tat

gta

240

acg

tea

cac

ggt

gac

cac

tat

cat

tac

tat

aat

ggg

aaa

gtt

cct

tat

288

gat

gee

ctc

ttt

agt

gaa

gaa

ctc

ttg

atg

aag

gat

cca

aac

tat

caa

336

ctt

aaa

gac

gct

gat

att

gtc

aat

gaa

gtc

aag

ggt

ggt

tat

atc

atc

384

aag

gtc

gat

gga

aaa

tat

tat

gtc

tac

ctg

aaa

gat

gca

gct

cat

gct

432

gat

aat

gtt

ega

act

aaa

gat

gaa

atc

aat

cgt

caa

aaa

caa

gaa

cat

480

gtc

aaa

gat

aat

gag

aag

gtt

aac

tct

aat

gtt

gct

gta

gca

agg

tct

528

cag

gga

ega

tat

acg

aca

aat

gat

ggt

tat

gtc

ttt

aat

cca

gct

gat

576

att

atc

gaa

gat

acg

ggt

aat

gct

tat

atc

gtt

cct

cat

gga

ggt

cac

624

tat

cac

tac

att

ccc

aaa

age

gat

tta

tct

gct

agt

gaa

tta

gca

gca

672

gct

aaa

gca

cat

ctg

gct

gga

aaa

aat

atg

caa

ccg

agt

cag

tta

age

720

tat

tct

tea

aca

gct

agt

gac

aat

aac

acg

caa

tct

gta

gca

aaa

gga

768

tea

act

age

aag

cca

gca

aat

aaa

tct

gaa

aat

ctc

cag

agt

ctt

ttg

816

aag

gaa

ctc

tat

gat

tea

cct

age

gee

caa

cgt

tac

agt

gaa

tea

gat

864

ggc

ctg

gtc

ttt

gac

cct

gct

aag

att

atc

agt

cgt

aca

cca

aat

gga

912

gtt

gcg

att

ccg

cat

ggc

gac

cat

tac

cac

ttt

att

cct

tac

age

aag

960

ctt

tct

gct

tta

gaa

gaa

aag

att

gee

aga

atg

gtg

cct

atc

agt

gga

1008

act

ggt

tct

aca

gtt

tct

aca

aat

gca

aaa

cct

aat

gaa

gta

gtg

tct

1056

agt

eta

ggc

agt

ctt

tea

age

aat

cct

tct

tct

tta

acg

aca

agt

aag

1104

gag

ctc

tct

tea

gca

tct

gat

ggt

tat

att

ttt

aat

cca

aaa

gat

atc

1152

gtt

gaa

gaa

acg

gct

aca

gct

tat

att

gta

aga

cat

ggt

gat

cat

ttc

1200

cat

tac

att

cca

aaa

tea

aat

caa

att

ggg

caa

ccg

act

ctt

cca

aac

1248

aat

agt

eta

gca

aca

cct

tct

cca

tct

ctt

cca

atc

aat

cca

gga

act

1296

tea

cat

gag

aaa

cat

gaa

gaa

gat

gga

tac

gga

ttt

gat

gct

aat

cgt

1344

att

atc

gct

gaa

gat

gaa

tea

ggt

ttt

gtc

atg

agt

cac

gga

gac

cac

1392

PL 206 576 B1

aat

cat

tat

ttc

ttc

aag

aag

gac

ttg

aca

gaa

gag

caa

att

aag

gct

1440

gcg

caa

aaa

cat

tta

gag

gaa

gtt

aaa

act

agt

cat

aat

gga

tta

gat

1488

tct

ttg

tca

tct

cat

gaa

cag

gat

tat

cca

ggt

aat

gee

aaa

gaa

atg

1536

aaa

gat

tta

gat

aaa

aaa

atc

gaa

gaa

aaa

att

gct

ggc

att

atg

aaa

1584

caa

tat

ggt

gtc

aaa

cgt

gaa

agt

att

gtc

gtg

aat

aaa

gaa

aaa

aat

1632

gcg

att

att

tat

ccg

cat

gga

gat

cac

cat

cat

gca

gat

ccg

att

gat

1680

gaa

cat

aaa

ccg

gtt

gga

att

ggt

cat

tct

cac

agt

aac

tat

gaa

ctg

1728

ttt

aaa

ccc

gaa

gaa

gga

gtt

gct

aaa

aaa

gaa

ggg

aat

aaa

gtt

tat

1776

act

gga

gaa

gaa

tta

acg

aat

gtt

gtt

aat

ttg

tta

aaa

aat

agt

acg

1824

ttt

aat

aat

caa

aac

ttt

act

eta

gee

aat

ggt

caa

aaa

ege

gtt

tct

1872

ttt

agt

ttt

ccg

cct

gaa

ttg

gag

aaa

aaa

tta

ggt

atc

aat

atg

eta

1920

gta

aaa

tta

ata

aca

cca

gat

gga

aaa

gta

ttg

gag

aaa

gta

tct

ggt

1968

aaa

gta

ttt

gga

gaa

gga

gta

ggg

aat

att

gca

aac

ttt

gaa

tta

gat

2016

caa

cct

tat

tta

cca

gga

caa

aca

ttt

aag

tat

act

atc

gct

tca

aaa

2064

gat

tat

cca

gaa

gta

agt

tat

gat

ggt

aca

ttt

aca

gtt

cca

acc

tct

2112

tta

gct

tac

aaa

atg

gee

agt

caa

acg

att

ttc

tat

cct

ttc

cat

gca

2160

ggg

gat

act

tat

tta

aga

gtg

aac

cct

caa

ttt

gca

gtg

cct

aaa

gga

2208

act

gat

gct

tta

gtc

aga

gtg

ttt

gat

gaa

ttt

cat

gga

aat

gct

tat

2256

tta

gaa

aat

aac

tat

aaa

gtt

ggt

gaa

atc

aaa

tta

ccg

att

ccg

aaa

2304

tta

aac

caa

gga

aca

acc

aga

acg

gee

gga

aat

aaa

att

cct

gta

acc

2352

ttc

atg

gca

aat

gct

tat

ttg

gac

aat

caa

teg

act

tat

att

gtg

gaa

2400

gta

cct

atc

ttg

gaa

aaa

gaa

aat

caa

act

gat

aaa

cca

agt

att

eta

2448

cca

caa

ttt

aaa

agg

aat

aaa

gca

caa

gaa

aac

tca

aaa

ctt

gat

gaa

2496

aag

gta

gaa

gaa

cca

aag

act

agt

gag

aag

gta

gaa

aaa

gaa

aaa

ctt

2544

tct

gaa

act

ggg

aat

agt

act

agt

aat

tca

acg

tta

gaa

gaa

gtt

cct

2592

aca

gtg

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

gta

gca

aaa

ttt

gct

gaa

agt

tat

2640

ggg

atg

aag

eta

gaa

aat

gtc

ttg

ttt

aat

atg

gac

gga

aca

att

gaa

2688

tta

tat

tta

cca

tca

gga

gaa

gtc

att

aaa

aag

aat

atg

gca

gat

ttt

2736

aca

gga

gaa

gca

cct

caa

gga

aat

ggt

gaa

aat

aaa

cca

tct

gaa

aat

2784

gga

aaa

gta

tct

act

gga

aca

gtt

gag

aac

caa

cca

aca

gaa

aat

aaa

2832

cca

gca

gat

tct

tta

cca

gag

gca

cca

aac

gaa

aaa

cct

gta

aaa

cca

2880

gaa

aac

tca

acg

gat

aat

gga

atg

ttg

aat

cca

gaa

ggg

aat

gtg

ggg

2928

agt

gac

cct

atg

tta

gat

cca

gca

tta

gag

gaa

gct

cca

gca

gta

gat

2976

cct

gta

caa

gaa

aaa

tta

gaa

aaa

ttt

aca

gct

agt

tac

gga

tta

ggc

3024

tta

gat

agt

gtt

ata

ttc

aat

atg

gat

gga

acg

att

gaa

tta

aga

ttg

3072

cca

agt

gga

gaa

gtg

ata

aaa

aag

aat

tta

tct

gat

ttc

ata

gcg

3117

taa

3120

<210>

2

<211>

1039

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

2

Met

Lys

Phe

Ser

Lys

Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala

Gly

Ser

Ala

Val

Ile

Val

1

5

10

15

Ser

Leu

Ser

Leu

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

20

25

30

Asn

Lys

Asp

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

35

40

45

Gin

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Gin

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

Leu

Phe

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

PL 206 576 B1

100

105

110

Leu

Lys

Asp

Ala

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

115

120

125

Lys

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

130

135

140

Asp

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

145

150

155

160

Val

Lys

Asp

Asn

Glu

Lys

val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

165

170

175

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180

185

190

Ile

ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

195

200

205

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

210

215

220

Ala

Lys

Ala

His

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

230

235

240

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

255

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Glu

Leu

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

290

295

300

Val

Ala

Ile

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

325

330

335

Thr

Gly

Ser

Thr

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

340

345

350

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

Glu

Leu

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

370

375

380

Val

Glu

Glu

Thr

Ala

Thr

Ala

Tyr

ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

Asn

Ser

Leu

Ala

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

420

425

43 0

Ser

His

Glu

Lys

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

435

440

445

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450

455

460

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

465

470

475

480

Ala

Gin

Lys

His

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

485

490

495

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

500

505

510

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

515

520

525

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

Ser

ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

530

535

540

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

545

550

555

560

PL 206 576 B1

Glu

His

Lys

Pro

Val 565

Gly

Ile Gly His

Ser 570

His

Ser Asn

Tyr

Glu 575

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val Ala Lys

Lys

Glu

Gly Asn

Lys

Val

Tyr

580

585

590

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn Val Val

Asn

Leu

Leu Lys

Asn

Ser

Thr

595

600

605

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr Leu Ala

Asn

Gly

Gin Lys

Arg

Val

Ser

610

615

620

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu Glu Lys

Lys

Leu

Gly Ile

Asn

Met

Leu

625

630

635

640

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp Gly Lys

Val

Leu

Glu Lys

Val

Ser

Gly

645

650

655

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val Gly Asn

Ile

Ala

Asn Phe

Glu

Leu

Asp

660

665

670

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin Thr Phe

Lys

Tyr

Thr Ile

Ala

Ser

Lys

675

680

685

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr Asp Gly

Thr

Phe

Thr Val

Pro

Thr

Ser

690

695

700

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser Gin Thr

Ile

Phe

Tyr Pro

Phe

His

Ala

705

710

715

720

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val Asn Pro

Gin

Phe

Ala Val

Pro

Lys

Gly

725

730

735

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val Phe Asp

Glu

Phe

His Gly

Asn

Ala

Tyr

740

745

750

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val Gly Glu

Ile

Lys

Leu Pro

Ile

Pro

Lys

755

760

765

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg Thr Ala

Gly

Asn

Lys Ile

Pro

val

Thr

770

775

780

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu Asp Asn

Gin

Ser

Thr Tyr

Ile

val

Glu

785

790

795

800

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu Asn Gin

Thr

Asp

Lys Pro

Ser

Ile

Leu

805

810

815

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys Ala Gin

Glu

Asn

Ser Lys

Leu

Asp

Glu

820

825

830

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr Ser Glu

Lys

Val

Glu Lys

Glu

Lys

Leu

835

840

845

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr Ser Asn

Ser

Thr

Leu Glu

Glu

Val

Pro

850

855

860

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu Lys Val

Ala

Lys

Phe Ala

Glu

Ser

Tyr

865

870

875

880

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val Leu Phe

Asn

Met

Asp Gly

Thr

Ile

Glu

885

890

895

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu Val Ile

Lys

Lys

Asn Met

Ala

Asp

Phe

900

905

910

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly Asn Gly

Glu

Asn

Lys Pro

Ser

Glu

Asn

915

920

925

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr Val Glu

Asn

Gin

Pro Thr

Glu

Asn

Lys

930

935

940

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu Ala Pro

Asn

Glu

Lys Pro

Val

Lys

Pro

945

950

955

960

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly Met Leu

Asn

Pro

Glu Gly

Asn

Val

Gly

965

970

975

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro Ala Leu

Glu

Glu

Ala Pro

Ala

Val

Asp

980

985

990

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu Lys Phe

Thr

Ala

Ser Tyr

Gly

Leu

Gly

995

1000

1005

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn Met Asp

Gly

Thr

Ile Glu

Leu

Arg

Leu

PL 206 576 B1

1010

1015

1020

Ile

Ala

Pro Ser 1025

Gly

Glu

Val

Ile Lys 1030

Lys Asn Leu

Ser Asp 1035

Phe

<210>

3

<211>

2523

<212>

DNA

<213>

S. pneumoniae

<220> <221>

CDS

<222>

(1)

. . . (2520)

<223>

Region kodujący

genu BVH-11

<400>

3

atg

aaa

atc

aat

aaa

aaa

tat

eta

gct

ggg

tca

gta

gct

aca

ctt

gtt

48

Met

Lys

Ile

Asn

Lys

Lys

Tyr

Leu

Ala

Gly

Ser

Val

Ala

Thr

Leu

Val

1

5

10

15

tta

agt

gtc

tgt

gct

tat

gaa

eta

ggt

ttg

cat

caa

gct

caa

act

gta

96

Leu

Ser

Val

Cys

Ala

Tyr

Glu

Leu

Gly

Leu

His

Gin

Ala

Gin

Thr

Val

20

25

30

aaa

gaa

aat

aat

cgt

gtt

tcc

tat

ata

gat

gga

aaa

caa

gcg

acg

caa

144

Lys

Glu

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

Gin

Ala

Thr

Gin

35

40

45

aaa

acg

gag

aat

ttg

act

cct

gat

gag

gtt

age

aag

cgt

gaa

gga

atc

192

Lys

Thr

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

50

55

60

aac

gcc

gaa

caa

atc

gtc

atc

aag

att

acg

gat

caa

ggt

tat

gtg

acc

240

Asn

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

65

70

75

80

tct

cat

gga

gac

cat

tat

cat

tac

tat

aat

ggc

aag

gtc

cct

tat

gat

288

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

85

90

95

gcc

atc

atc

agt

gaa

gag

ctc

ctc

atg

aaa

gat

ceg

aat

tat

cag

ttg

336

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

100

105

110

aag

gat

tca

gac

att

gtc

aat

gaa

atc

aag

ggt

ggt

tat

gtc

att

aag

384

Lys

Asp

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

115

120

125

gta

aac

ggt

aaa

tac

tat

gtt

tac

ctt

aag

gat

gca

gct

cat

gcg

gat

432

Val

Asn

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

130

135

140

aat

gtc

cgt

aca

aaa

gaa

gaa

atc

aat

cgg

caa

aaa

caa

gaa

cat

agt

480

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

145

150

155

160

cag

cat

cgt

gaa

gga

ggg

act

tca

gca

aac

gat

ggt

gcg

gta

gcc

ttt

528

Gin

His

Arg

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

PL 206 576 B1

165

170

175

gca

cgt

tca

cag

gga

cgc

tac

acc

aca

gat

gat

ggt

tat

atc

ttc

aat

576

Ala

Arg

Ser

Gin 180

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr 185

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile 190

Phe

Asn

gca

tct

gat

atc

atc

gaa

gat

acg

ggc

gat

gcc

tat

atc

gtt

cct

cat

624

Ala

Ser

Asp 195

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr 200

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile 205

Val

Pro

His

gga

gat

cat

tac

cat

tac

att

cct

aag

aat

gag

tta

tca

gct

agc

gag

672

Gly

Asp 210

His

Tyr

His

Tyr

Ile 215

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu 220

Ser

Ala

Ser

Glu

ttg

gct

gct

gca

gaa

gcc

ttc

eta

tct

ggt

cgg

gaa

aat

ctg

tca

aat

720

Leu 225

Ala

Ala

Ala

Glu

Ala 230

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg 235

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn 240

tta

aga

acc

tat

cgc

ega

caa

aat

agc

gat

aac

act

cca

aga

aca

aac

768

Leu

Arg

Thr

Tyr

Arg 245

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp 250

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr 255

Asn

tgg

gta

cct

tct

gta

agc

aat

cca

gga

act

aca

aat

act

aac

aca

agc

816

Trp

Val

Pro

Ser 260

Val

Ser

Asn

Pro

Gly 265

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn 270

Thr

Ser

aac

aac

agc

aac

act

aac

agt

caa

gca

agt

caa

agt

aat

gac

att

gat

864

Asn

Asn

Ser 275

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin 280

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn 285

Asp

Ile

Asp

agt

ctc

ttg

aaa

cag

ctc

tac

aaa

ctg

cct

ttg

agt

caa

cgc

cat

gta

912

Ser

Leu 290

Leu

Lys

Gin

Leu

Tyr 295

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser 300

Gin

Arg

His

Val

gaa

tct

gat

ggc

ctt

att

ttc

gac

cca

gcg

caa

atc

aca

agt

ega

acc

960

Glu 305

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile 310

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin 315

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr 320

gcc

aga

ggt

gta

gct

gtc

cct

cat

ggt

aac

cat

tac

cac

ttt

atc

cct

1008

Ala

Arg

Gly

Val

Ala 325

Val

Pro

His

Gly

Asn 330

His

Tyr

His

Phe

Ile 335

Pro

tat

gaa

caa

atg

tct

gaa

ttg

gaa

aaa

ega

att

gct

cgt

att

att

ccc

1056

Tyr

Glu

Gin

Met 340

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys 345

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile 350

Ile

Pro

ctt

cgt

tat

cgt

tca

aac

cat

tgg

gta

cca

gat

tca

aga

cca

gaa

gaa

1104

Leu

Arg

Tyr 355

Arg

Ser

Asn

His

Trp 360

Val

Pro

Asp

Ser

Arg 365

Pro

Glu

Glu

cca

agt

cca

caa

ccg

act

cca

gaa

cct

agt

cca

agt

ccg

caa

cct

gca

1152

Pro

Ser 370

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro 375

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser 380

Pro

Gin

Pro

Ala

cca

aat

cct

caa

cca

gct

cca

agc

aat

cca

att

gat

gag

aaa

ttg

gtc

1200

Pro 385

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala 390

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile 395

Asp

Glu

Lys

Leu

Val 400

PL 206 576 B1

aaa Lys

gaa Glu

get Ala

gtt Val

ega aaa

gta ggc

gat Asp

ggt Gly 410

tat Tyr

gtc Val

ttt Phe

gag Glu

gag Glu 415

aat Asn

1248

Arg 405

Lys

Val

Gly

gga

gtt

tet

cgt

tat

atc

cca

gee

aag

aat

ctt

tea

gca

gaa

aca

gca

1296

Gly

Val

Ser

Arg 420

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys 425

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu 430

Thr

Ala

gca

ggc

att

gat

age

aaa

ctg

gee

aag

cag

gaa

agt

tta

tet

cat

aag

1344

Ala

Gly

Ile 435

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala 440

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu 445

Ser

His

Lys

eta

gga

get

aag

aaa

act

gac

etc

cca

tet

agt

gat

ega

gaa

ttt

tac

1392

Leu

Gly 450

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp 455

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp 460

Arg

Glu

Phe

Tyr

aat

aag

get

tat

gac

tta

eta

gca

aga

att

cac

caa

gat

tta

ctt

gat

1440

Asn 465

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu 470

Leu

Ala

Arg

Ile

His 475

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp 480

aat

aaa

ggt

ega

caa

gtt

gat

ttt

gag

get

ttg

gat

aac

ctg

ttg

gaa

1488

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin 485

Val

Asp

Phe

Glu

Ala 490

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu 495

Glu

ega

etc

aag

gat

gtc

tea

agt

gat

aaa

gtc

aag

tta

gtg

gat

gat

att

1536

Arg

Leu

Lys

Asp 500

Val

Ser

Ser

Asp

Lys 505

Val

Lys

Leu

Val

Asp 510

Asp

Ile

ctt

gee

ttc

tta

get

ccg

att

cgt

cat

cca

gaa

cgt

tta

gga

aaa

cca

1584

Leu

Ala

Phe 515

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg 520

His

Pro

Glu

Arg

Leu 525

Gly

Lys

Pro

aat

gcg

caa

att

acc

tac

act

gat

gat

gag

att

caa

gta

gee

aag

ttg

1632

Asn

Ala 530

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr 535

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin 540

Val

Ala

Lys

Leu

gca

ggc

aag

tac

aca

aca

gaa

gac

ggt

tat

atc

ttt

gat

cct

cgt

gat

1680

Ala 545

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr 550

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile 555

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp 560

ata

acc

agt

gat

gag

ggg

gat

gee

tat

gta

act

cca

cat

atg

acc

cat

1728

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu 565

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val 570

Thr

Pro

His

Met

Thr 575

His

age

cac

tgg

att

aaa

aaa

gat

agt

ttg

tet

gaa

get

gag

aga

gcg

gca

1776

Ser

His

Trp

Ile 580

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu 585

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg 590

Ala

Ala

gee

cag

get

tat

get

aaa

gag

aaa

ggt

ttg

acc

cct

cct

teg

aca

gac

1824

Ala

Gin

Ala 595

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys 600

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro 605

Ser

Thr

Asp

cat

cag

gat

tea

gga

aat

act

gag

gca

aaa

gga

gca

gaa

get

atc

tac

1872

His

Gin 610

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr 615

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala 620

Glu

Ala

Ile

Tyr

PL 206 576 B1

aac Asn 625

cgc Arg

gtg Val

aaa Lys

gca Ala

gct Ala 630

aag Lys

aag Lys

gtg Val

cca Pro

ctt Leu 635

gat Asp

cgt Arg

atg Met

cct Pro

tac Tyr 640

1920

aat

ctt

caa

tat

act

gta

gaa

gtc

aaa

aac

ggt

agt

tta

atc

ata

cct

1968

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

645

650

655

cat

tat

gac

cat

tac

cat

aac

atc

aaa

ttt

gag

tgg

ttt

gac

gaa

ggc

2016

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

660

665

670

ctt

tat

gag

gca

cct

aag

ggg

tat

act

ctt

gag

gat

ctt

ttg

gcg

act

2064

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

675

680

685

gtc

aag

tac

tat

gtc

gaa

cat

cca

aac

gaa

cgt

ccg

cat

tca

gat

aat

2112

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

690

695

700

ggt

ttt

ggt

aac

gct

agc

gac

cat

gtt

caa

aga

aac

aaa

aat

ggt

caa

2160

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

705

710

715

720

gct

gat

acc

aat

caa

acg

gaa

aaa

cca

agc

gag

gag

aaa

cct

cag

aca

2208

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

725

730

735

gaa

aaa

cct

gag

gaa

gaa

acc

cct

ega

gaa

gag

aaa

cca

caa

agc

gag

2256

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

740

745

750

aaa

cca

gag

tct

cca

aaa

cca

aca

gag

gaa

cca

gaa

gaa

gaa

tca

cca

2304

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

755

760

765

gag

gaa

tca

gaa

gaa

cct

cag

gtc

gag

act

gaa

aag

gtt

gaa

gaa

aaa

2352

Glu

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

770

775

780

ctg

aga

gag

gct

gaa

gat

tta

ctt

gga

aaa

atc

cag

gat

cca

att

atc

2400

Leu

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

785

790

795

800

aag

tcc

aat

gcc

aaa

gag

act

ctc

aca

gga

tta

aaa

aat

aat

tta

eta

2448

Lys

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

805

810

815

ttt

ggc

acc

cag

gac

aac

aat

act

att

atg

gca

gaa

gct

gaa

aaa

eta

2496

Phe

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

820

825

830

ttg

gct

tta

tta

aag

gag

agt

aag

taa

2523

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

835

840

PL 206 576 B1 <210> 4 <211> 840 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 4

Met

Lys

Ile

Asn

Lys

Lys

Tyr

Leu

Ala

Gly

Ser

Val

Ala

Thr

Leu

Val

1

5

10

15

Leu

Ser

Val

Cys

Ala

Tyr

Glu

Leu

Gly

Leu

His

Gin

Ala

Gin

Thr

Val

20

25

30

Lys

Glu

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

Gin

Ala

Thr

Gin

35

40

45

Lys

Thr

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

50

55

60

Asn

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

65

70

75

80

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

85

90

95

Ala

ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

100

105

110

Lys

Asp

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

115

120

125

Val

Asn

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

130

135

140

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

145

150

155

160

Gin

His

Arg

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

165

170

175

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

180

185

190

Ala

Ser

Asp

Ile

ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

195

200

205

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

210

215

220

Leu

Ala

Ala

Ala

Glu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

225

230

235

240

Leu

Arg

Thr

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

245

250

255

Trp

Val

Pro

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

260

265

270

Asn

Asn

Ser

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

275

280

285

Ser

Leu

Leu

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

290

295

300

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

305

310

315

320

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

325

330

335

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

340

345

350

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

355

360

365

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

370

375

380

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

385

390

395

400

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

PL 206 576 B1

405

410

415

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

420

425

430

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

435

440

445

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

450

455

460

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

465

470

475

480

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

485

490

495

Arg

Leu

Lys Asp Val 500

Ser

Ser

Asp

Lys Val 505

Lys Leu Val Asp 510

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

515

520

525

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

530

535

540

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

545

550

555

560

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

565

570

575

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

ASp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

580

585

590

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

595

600

605

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

610

615

620

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

625

630

635

640

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

645

650

655

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

660

665

670

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

675

680

685

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

690

695

700

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

705

710

715

720

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

725

730

735

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

740

745

750

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

755

760

765

Glu

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

770

775

780

Leu

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

785

790

795

800

Lys

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

805

810

815

Phe

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

820

825

830

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

835

840

<210> 5

PL 206 576 B1 <211> 1581 <212> DNA

<213>

S. pneumoniae

<220>

<221>

CDS

<222>

(1)

...(1578)

<400>

5

atg

gag

aat

ata

gac

atg

ttt

aaa

tca

aat

cat

gag

ega

aga

atg

cgt

48

Met

Glu

Asn

Ile

Asp

Met

Phe

Lys

Ser

Asn

His

Glu

Arg

Arg

Met

Arg

1

5

10

15

tat

tcc

att

cgt

aaa

ttt

agt

gta

gga

gta

gct

age

gta

gct

gtt

gee

96

Tyr

Ser

Ile

Arg

Lys

Phe

Ser

Val

Gly

Val

Ala

Ser

Val

Ala

Val

Ala

20

25

30

agt

ctt

ttt

atg

gga

agt

gtt

gta

cat

gcg

aca

gag

aaa

gag

gga

agt

144

Ser

Leu

Phe

Met

Gly

Ser

val

Val

His

Ala

Thr

Glu

Lys

Glu

Gly

Ser

35

40

45

acc

caa

gca

gee

act

tct

ttt

aat

agg

gga

aat

gga

agt

cag

gca

gaa

192

Thr

Gin

Ala

Ala

Thr

Ser

Phe

Asn

Arg

Gly

Asn

Gly

Ser

Gin

Ala

Glu

50

55

60

caa

cgt

gga

gaa

ctc

gat

tta

gaa

ega

gat

aag

gca

atg

aaa

gcg

gtc

240

Gin

Arg

Gly

Glu

Leu

Asp

Leu

Glu

Arg

Asp

Lys

Ala

Met

Lys

Ala

Val

65

70

75

80

agt

gaa

tat

gta

gga

aaa

atg

gtg

aga

gat

gee

tat

gta

aaa

tca

gat

288

Ser

Glu

Tyr

Val

Gly

Lys

Met

Val

Arg

Asp

Ala

Tyr

Val

Lys

Ser

Asp

85

90

95

aga

aaa

ega

cat

aaa

aat

act

gta

gct

eta

gtt

aac

cag

ttg

gga

aac

336

Arg

Lys

Arg

His

Lys

Asn

Thr

Val

Ala

Leu

Val

Asn

Gin

Leu

Gly

Asn

100

105

110

att

aag

aac

agg

tat

ttg

aat

gaa

ata

gtt

cat

tca

acc

tca

aaa

age

384

Ile

Lys

Asn

Arg

Tyr

Leu

Asn

Glu

Ile

Val

His

Ser

Thr

Ser

Lys

Ser

115

120

125

caa

eta

cag

gaa

ctg

atg

atg

aag

agt

caa

tca

gaa

gta

gat

gaa

gct

432

Gin

Leu

Gin

Glu

Leu

Met

Met

Lys

Ser

Gin

Ser

Glu

Val

Asp

Glu

Ala

130

135

140

gtg

tct

aaa

ttt

gaa

aag

gac

tca

ttt

tct

teg

tca

agt

tca

gga

tcc

480

Val

Ser

Lys

Phe

Glu

Lys

Asp

Ser

Phe

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

Gly

Ser

145

150

155

160

tcc

act

aaa

cca

gaa

act

ccg

cag

ccg

gaa

aat

cca

gag

cat

caa

aaa

528

Ser

Thr

Lys

Pro

Glu

Thr

Pro

Gin

Pro

Glu

Asn

Pro

Glu

His

Gin

Lys

165

170

175

cca

aca

act

cca

tct

ccg

gat

acc

aaa

cca

age

cct

caa

cca

gaa

ggc

576

Pro

Thr

Thr

Pro

Ser

Pro

Asp

Thr

Lys

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Glu

Gly

180

185

190

PL 206 576 B1 aag aaa cca agc gta cca gac att aat cag gaa aaa gaa aaa gct aag 624

Lys Lys Pro Ser Val Pro Asp Ile Asn Gin Glu Lys Glu Lys Ala Lys

195 200 205 ctt gct gta gta acc tac atg agc aag att tta gat gat ata caa aaa 672

Leu Ala Val Val Thr Tyr Met Ser Lys Ile Leu Asp Asp Ile Gin Lys

210 215 220 cat cat ctg cag aaa gaa aaa cat cgt cag att gtt gct ctt att aag 720

His His Leu Gin Lys Glu Lys His Arg Gin Ile Val Ala Leu Ile Lys

225 230 235 240 gag ctt gat gag ctt aaa aag caa gct ctt tct gaa att gat aat gta 768

Glu Leu Asp Glu Leu Lys Lys Gin Ala Leu Ser Glu Ile Asp Asn Val

245 250 255 aat acc aaa gta gaa att gaa aat aca gtc cac aag ata ttt gca gac 816

Asn Thr Lys Val Glu Ile Glu Asn Thr Val His Lys Ile Phe Ala Asp

260 265 270 atg gat gca gtt gtg act aaa ttc aaa aaa ggc tta act cag gac aca 864

Met Asp Ala Val Val Thr Lys Phe Lys Lys Gly Leu Thr Gin Asp Thr

275 280 285 cca aaa gaa cca ggt aac aaa aaa cca tct gct cca aaa cca ggt atg 912

Pro Lys Glu Pro Gly Asn Lys Lys Pro Ser Ala Pro Lys Pro Gly Met

290 295 300 caa cca agt cct caa cca gag gtt aaa ccg cag ctg gaa aaa cca aaa 960

Gin Pro Ser Pro Gin Pro Glu Val Lys Pro Gin Leu Glu Lys Pro Lys

305 310 315 320 cca gag gtt aaa ccg caa cca gaa aaa cca aaa cca gag gtt aaa ccg 1008

Pro Glu Val Lys Pro Gin Pro Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val Lys Pro

325 330 335 cag ccg gaa aaa cca aaa cca gag gtt aaa ccg cag ccg gaa aaa cca 1056

Gin Pro Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val Lys Pro Gin Pro Glu Lys Pro

340 345 350 aaa cca gag gtt aaa ccg cag ccg gaa aaa cca aaa cca gag gtt aaa 1104

Lys Pro Glu Val Lys Pro Gin Pro Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val Lys

355 360 365 ccg cag ccg gaa aaa cca aaa cca gag gtt aaa ccg cag ccg gaa aaa 1152

Pro Gin Pro Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val Lys Pro Gin Pro Glu Lys

370 375 380 cca aaa cca gag gtt aaa ccg cag ccg gaa aaa cca aaa cca gag gtt 1200

Pro Lys Pro Glu Val Lys Pro Gin Pro Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val

385 390 395 400 aaa ccg cag ccg gaa aaa cca aaa cca gag gtt aaa ccg cag ccg gaa 1248

Lys Pro Gin Pro Glu Lys Pro Lys Pro Glu Val Lys Pro Gin Pro Glu

405 410 415 aaa cca aaa cca gag gtt aaa ccg cag ccg gaa aaa cca aaa cca gag 1296

PL 206 576 B1

Lys

Pro

Lys

Pro 420

Glu

Val

Lys

Pro

Gin 425

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys 430

Pro

Glu

gtt

aa a

ccg

caa

cca

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

caa

cca

1344

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

435

440

445

gaa

aa a

cca

aaa

cca

gat

aat

agc

a ag

cca

caa

gca

gat

gat

aag

aag

1392

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Asp

Asn

Ser

Lys

Pro

Gin

Ala

Asp

Asp

Lys

Lys

450

455

460

cca

tca

act

aca

aat

aat

tta

agc

a ag

gac

aag

caa

cct

tct

aac

caa

1440

Pro

Ser

Thr

Thr

Asn

Asn

Leu

Ser

Lys

Asp

Lys

Gin

Pro

Ser

Asn

Gin

465

470

475

480

gct

tca

aca

aac

gaa

aaa

gca

aca

aat

aaa

ccg

aag

aag

tca

ttg

cca

1488

Ala

Ser

Thr

Asn

Glu

Lys

Ala

Thr

Asn

Lys

Pro

Lys

Lys

Ser

Leu

Pro

485

490

495

tca

act

gga

tct

att

tca

aat

eta

gca

ctt

gaa

att

gca

ggt

ctt

ctt

1536

Ser

Thr

Gly

Ser

Ile

Ser

Asn

Leu

Ala

Leu

Glu

Ile

Ala

Gly

Leu

Leu

500

505

510

acc

ttg

gcg

ggg

gca

acc

att

ctt

gct

aag

aaa

aga

atg

aaa

1578

Thr

Leu

Ala

Gly

Ala

Thr

Ile

Leu

Ala

Lys

Lys

Arg

Met

Lys

515

520

525

tag

1581

<210>

6

<211>

526

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

6

Met

Glu

Asn

Ile

Asp

Met

Phe

Lys

Ser

Asn

His

Glu

Arg

Arg

Met

Arg

1

5

10

15

Tyr

Ser

Ile

Arg

Lys

Phe

Ser

Val

Gly

Val

Ala

Ser

Val

Ala

val

Ala

20

25

30

Ser

Leu

Phe

Met

Gly

Ser

Val

val

His

Ala

Thr

Glu

Lys

Glu

Gly

Ser

35

40

45

Thr

Gin

Ala

Ala

Thr

Ser

Phe

Asn

Arg

Gly

Asn

Gly

Ser

Gin

Ala

Glu

50

55

60

Gin

Arg

Gly

Glu

Leu

Asp

Leu

Glu

Arg

Asp

Lys

Ala

Met

Lys

Ala

Val

65

70

75

80

Ser

Glu

Tyr

Val

Gly

Lys

Met

Val

Arg

Asp

Ala

Tyr

Val

Lys

Ser

Asp

85

90

95

Arg

Lys

Arg

His

Lys

Asn

Thr

Val

Ala

Leu

Val

Asn

Gin

Leu

Gly

Asn

100

105

110

Ile

Lys

Asn

Arg

Tyr

Leu

Asn

Glu

Ile

Val

His

Ser

Thr

Ser

Lys

Ser

115

120

125

Gin

Leu

Gin

Glu

Leu

Met

Met

Lys

Ser

Gin

Ser

Glu

Val

Asp

Glu

Ala

130

135

140

Val

Ser

Lys

Phe

Glu

Lys

Asp

Ser

Phe

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

Gly

Ser

145

150

155

160

Ser

Thr

Lys

Pro

Glu

Thr

Pro

Gin

Pro

Glu

Asn

Pro

Glu

His

Gin

Lys

165

170

175

PL 206 576 B1

Pro

Thr

Thr

Pro 180

Ser Pro Asp Thr

Lys 185

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro 190

Glu

Gly

Lys

Lys

Pro

Ser

Val

Pro

Asp

Ile

Asn

Gin

Glu

Lys

Glu

Lys

Ala

Lys

195

200

205

Leu

Ala

Val

Val

Thr

Tyr

Met

Ser

Lys

Ile

Leu

Asp

Asp

Ile

Gin

Lys

210

215

220

His

His

Leu

Gin

Lys

Glu

Lys

His

Arg

Gin

Ile

Val

Ala

Leu

Ile

Lys

225

230

235

240

Glu

Leu

Asp

Glu

Leu

Lys

Lys

Gin

Ala

Leu

Ser

Glu

Ile

Asp

Asn

Val

245

250

255

Asn

Thr

Lys

Val

Glu

Ile

Glu

Asn

Thr

Val

His

Lys

Ile

Phe

Ala

Asp

260

265

270

Met

Asp

Ala

Val

Val

Thr

Lys

Phe

Lys

Lys

Gly

Leu

Thr

Gin

Asp

Thr

275

280

285

Pro

Lys

Glu

Pro

Gly

Asn

Lys

Lys

Pro

Ser

Ala

Pro

Lys

Pro

Gly

Met

290

295

300

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Leu

Glu

Lys

Pro

Lys

305

310

315

320

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

325

330

335

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

340

345

350

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

355

360

365

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

370

375

380

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

385

390

395

400

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

405

410

415

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

420

425

430

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

435

440

445

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Asp

Asn

Ser

Lys

Pro

Gin

Ala

Asp

Asp

Lys

Lys

450

455

460

Pro

Ser

Thr

Thr

Asn

Asn

Leu

Ser

Lys

Asp

Lys

Gin

Pro

Ser

Asn

Gin

465

470

475

480

Ala

Ser

Thr

Asn

Glu

Lys

Ala

Thr

Asn

Lys

Pro

Lys

Lys

Ser

Leu

Pro

485

490

495

Ser

Thr

Gly

Ser

Ile

Ser

Asn

Leu

Ala

Leu

Glu

Ile

Ala

Gly

Leu

Leu

500

505

510

Thr

Leu

Ala

Gly

Ala

Thr

Ile

Leu

Ala

Lys

Lys

Arg

Met

Lys

515 520 525 <210> 7 <211> 1455 <212> DNA <213> S. pneumoniae <220>

<221> CDS

<222>

(1) .

...(1452)

<400>

7

atg

aaa ttt

agt

aaa aaa

tat

ata

gca

get

gga

tea

get

gtt

atc

gta

48

Met

Lys Phe

Ser

Lys Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala

Gly

Ser

Ala

Val

Ile

Val

PL 206 576 B1

1

5

10

15

tcc

ttg

agt

eta

tgt

gcc

tat

gca

eta

aac

cag

cat

cgt

teg

cag

gaa

Ser

Leu

Ser

Leu 20

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu 25

Asn

Gin

His

Arg

Ser 30

Gin

Glu

aat

aag

gac

aat

aat

cgt

gtc

tct

tat

gtg

gat

ggc

agc

cag

tca

agt

Asn

Lys

Asp 35

Asn

Asn

Arg

Val

Ser 40

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser 45

Gin

Ser

Ser

cag

aaa

agt

gaa

aac

ttg

aca

cca

gac

cag

gtt

agc

cag

aaa

gaa

gga

Gin

Lys 50

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr 55

Pro

Asp

Gin

Val

Ser 60

Gin

Lys

Glu

Gly

att

cag

gct

gag

caa

att

gta

atc

aaa

att

aca

gat

cag

ggc

tat

gta

Ile 65

Gin

Ala

Glu

Gin

Ile 70

Val

Ile

Lys

Ile

Thr 75

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val 80

acg

tca

cac

ggt

gac

cac

tat

cat

tac

tat

aat

ggg

aaa

gtt

cct

tat

Thr

Ser

His

Gly

Asp 85

His

Tyr

His

Tyr

Tyr 90

Asn

Gly

Lys

Val

Pro 95

Tyr

gat

gcc

ctc

ttt

agt

gaa

gaa

ctc

ttg

atg

aag

gat

cca

aac

tat

caa

Asp

Ala

Leu

Phe 100

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 105

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 110

Tyr

Gin

ctt

aaa

gac

gct

gat

att

gtc

aat

gaa

gtc

aag

ggt

ggt

tat

atc

atc

Leu

Lys

Asp 115

Ala

Asp

Ile

val

Asn 120

Glu

Val

Lys

Gly

Gly 125

Tyr

Ile

Ile

aag

gtc

gat

gga

aaa

tat

tat

gtc

tac

ctg

aaa

gat

gca

gct

cat

gct

Lys

Val 130

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr 135

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 140

Ala

Ala

His

Ala

gat

aat

gtt

ega

act

aaa

gat

gaa

atc

aat

cgt

caa

aaa

caa

gaa

cat

Asp 145

Asn

Val

Arg

Thr

Lys 150

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg 155

Gin

Lys

Gin

Glu

His 160

gtc

aaa

gat

aat

gag

aag

gtt

aac

tct

aat

gtt

gct

gta

gca

agg

tct

Val

Lys

Asp

Asn

Glu 165

Lys

val

Asn

Ser

Asn 170

Val

Ala

Val

Ala

Arg 175

Ser

cag

gga

ega

tat

acg

aca

aat

gat

ggt

tat

gtc

ttt

aat

cca

gct

gat

Gin

Gly

Arg

Tyr 180

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly 185

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro 190

Ala

Asp

att

atc

gaa

gat

acg

ggt

aat

gct

tat

atc

gtt

cct

cat

gga

ggt

cac

Ile

Ile

Glu 195

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala 200

Tyr

Ile

Val

Pro

His 205

Gly

Gly

His

tat

cac

tac

att

ccc

aaa

agc

gat

tta

tct

gct

agt

gaa

tta

gca

gca

Tyr

His 210

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser 215

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser 220

Glu

Leu

Ala

Ala

gct

aaa

gca

cat

ctg

gct

gga

aaa

aat

atg

caa

ccg

agt

cag

tta

agc

Ala 225

Lys

Ala

His

Leu

Ala 230

Gly

Lys

Asn

Met

Gin 235

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser 240

144

192

240

288

336

384

432

480

528

576

624

672

720

PL 206 576 B1

tat Tyr

tct Ser

tca Ser

aca Thr

gct Ala 245

agt Ser

gac Asp

aat Asn

aac Asn

acg caa

tct Ser

gta Val

gca Ala

aaa Lys 255

gga Gly

768

Thr 250

Gin

tca

act

agc

aag

cca

gca

aat

aaa

tct

gaa

aat

ctc

cag

agt

ctt

ttg

816

Ser

Thr

Ser

Lys 260

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser 265

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser 270

Leu

Leu

aag

gaa

ctc

tat

gat

tca

cct

agc

gcc

caa

cgt

tac

agt

gaa

tca

gat

864

Lys

Glu

Leu 275

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser 280

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser 285

Glu

Ser

Asp

ggc

ctg

gtc

ttt

gac

cct

gct

aag

att

atc

agt

cgt

aca

cca

aat

gga

912

Gly

Leu 290

Val

Phe

Asp

Pro

Ala 295

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg 300

Thr

Pro

Asn

Gly

gtt

gcg

att

ccg

cat

ggc

gac

cat

tac

cac

ttt

att

cct

tac

agc

aag

960

Val 305

Ala

Ile

Pro

His

Gly 310

Asp

His

Tyr

His

Phe 315

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys 320

ctt

tct

gct

tta

gaa

gaa

aag

att

gcc

aga

atg

gtg

cct

atc

agt

gga

1008

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu 325

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg 330

Met

Val

Pro

Ile

Ser 335

Gly

act

ggt

tct

aca

gtt

tct

aca

aat

gca

aaa

cct

aat

gaa

gta

gtg

tct

1056

Thr

Gly

Ser

Thr 340

val

Ser

Thr

Asn

Ala 345

Lys

Pro

Asn

Glu

Val 350

Val

Ser

agt

gta

ggc

agt

ctt

tca

agc

aat

cct

tct

tct

tta

acg

aca

agt

aag

1104

Ser

Leu

Gly 355

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn 360

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr 365

Thr

Ser

Lys

gag

ctc

tct

tca

gca

tct

gat

ggt

tat

att

ttt

aat

cca

aaa

gat

atc

1152

Glu

Leu 370

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp 375

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn 380

Pro

Lys

Asp

Ile

gtt

gaa

gaa

acg

gct

aca

gct

tat

att

gta

aga

cat

ggt

gat

cat

ttc

1200

Val 385

Glu

Glu

Thr

Ala

Thr 390

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg 395

His

Gly

Asp

His

Phe 400

cat

tac

att

cca

aaa

tca

aat

caa

att

ggg

caa

ccg

act

ctt

cca

aac

1248

His

Tyr

Ile

Pro

Lys 405

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly 410

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro 415

Asn

aat

agt

eta

gca

aca

cct

tct

cca

tct

ctt

cca

atc

aat

cca

gga

act

1296

Asn

Ser

Leu

Ala 420

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser 425

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro 430

Gly

Thr

tca

cat

gag

aaa

cat

gaa

gaa

gat

gga

tac

gga

ttt

gat

gct

aat

cgt

1344

Ser

His

Glu 435

Lys

His

Glu

Glu

Asp 440

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp 445

Ala

Asn

Arg

att

atc

gct

gaa

gat

gaa

tca

ggt

ttt

gtc

atg

agt

cac

gga

gac

cac

1392

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450 455 460

PL 206 576 B1

aat Asn 465

cat His

tat Tyr

ttc Phe

ttc Phe

aag Lys 470

aag Lys

gac Asp

ttg Leu

aca Thr

gaa gag caa Glu Glu Gin 475

att Ile

aag gtg

1440

Lys

Val 480

cgc

aaa

aac

att

tag

1455

Arg

Lys

Asn

Ile

<210> 8 <211> 484 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 8

Met 1

Lys

Phe

Ser

Lys 5

Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala Gly Ser Ala Val 10

Ile Val 15

Ser

Leu

Ser

Leu

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

20

25

30

Asn

Lys

Asp

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

35

40

45

Gin

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Gin

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

Leu

Phe

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

100

105

110

Leu

Lys

Asp

Ala

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

115

120

125

Lys

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

130

135

140

Asp

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

145

150

155

160

Val

Lys

Asp

Asn

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

165

170

175

Gin

dy

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180

185

190

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

195

200

205

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

210

215

220

Ala

Lys

Ala

His

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

230

235

240

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

255

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Glu

Leu

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

290

295

300

Val

Ala

Ile

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

325

330

335

PL 206 576 B1

Thr

Gly

Ser Thr 340

val

Ser Thr Asn

Ala Lys 345

Pro

Asn

Glu

Val 350

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

Glu

Leu

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

370

375

380

Val

Glu

Glu

Thr

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

Asn

Ser

Leu

Ala

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

420

425

430

Ser

His

Glu

Lys

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

435

440

445

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450

455

460

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Val

465

470

475

480

Arg

Lys

Asn

Ile

<210> 9 <211> 1587 <212> DNA <213> S pneumoniae

<220> <221>

CDS

<222>

(1)

.,.(1584)

<400>

9

atg

aaa gat

tta

gat

aaa

aaa

atc

gaa

gaa

aaa

att

gct

ggc

att

atg

Met

Lys Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

1

5

10

15

aaa

caa tat

ggt

gtc

aaa

cgt

gaa

agt

att

gtc

gtg

aat

aaa

gaa

aaa

Lys

Gin Tyr

Gly

val

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

20

25

30

aat

gcg att

att

tat

ccg

cat

gga

gat

cac

cat

cat

gca

gat

ccg

att

Asn

Ala Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

ile

35

40

45

gat

gaa cat

aaa

ccg

gtt

gga

att

ggt

cat

tct

cac

agt

aac

tat

gaa

Asp

Glu His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

50

55

60

ctg

ttt aaa

ccc

gaa

gaa

gga

gtt

gct

aaa

aaa

gaa

ggg

aat

aaa

gtt

Leu

Phe Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

65

70

75

80

tat

act gga

gaa

gaa

tta

acg

aat

gtt

gtt

aat

ttg

tta

aaa

aat

agt

Tyr

Thr Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

85

90

95

acg

ttt aat

aat

caa

aac

ttt

act

eta

gee

aat

ggt

caa

aaa

ege

gtt

Thr

Phe Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

PL 206 576 B1

100

105

110

tct

ttt

agt

ttt

ccg

cct

gaa

ttg

gag

aaa

aaa

tta

ggt

atc

aat

atg

384

Ser

Phe

Ser 115

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu 120

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly 125

Ile

Asn

Met

eta

gta

aaa

tta

ata

aca

cca

gat

gga

aaa

gta

ttg

gag

aaa

gta

tct

432

Leu

Val 130

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro 135

Asp

Gly

Lys

Val

Leu 140

Glu

Lys

Val

Ser

ggt

aaa

gta

ttt

gga

gaa

gga

gta

ggg

aat

att

gca

aac

ttt

gaa

tta

480

Gly 145

Lys

Val

Phe

Gly

Glu 150

Gly

Val

Gly

Asn

Ile 155

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu 160

gat

caa

cct

tat

tta

cca

gga

caa

aca

ttt

aag

tat

act

atc

gct

tca

528

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu 165

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe 170

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala 175

Ser

aaa

gat

tat

cca

gaa

gta

agt

tat

gat

ggt

aca

ttt

aca

gtt

cca

acc

576

Lys

Asp

Tyr

Pro 180

Glu

Val

Ser

Tyr

ASp 185

Gly

Thr

Phe

Thr

Val 190

Pro

Thr

tct

tta

gct

tac

aaa

atg

gcc

agt

caa

acg

att

ttc

tat

cct

ttc

cat

624

Ser

Leu

Ala 195

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser 200

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr 205

Pro

Phe

His

gca

ggg

gat

act

tat

tta

aga

gtg

aac

cct

caa

ttt

gca

gtg

cct

aaa

672

Ala

Gly 210

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg 215

Val

Asn

Pro

Gin

Phe 220

Ala

Val

Pro

Lys

gga

act

gat

gct

tta

gtc

aga

gtg

ttt

gat

gaa

ttt

cat

gga

aat

gct

720

Gly 225

Thr

Asp

Ala

Leu

Val 230

Arg

Val

Phe

Asp

Glu 235

Phe

His

Gly

Asn

Ala 240

tat

tta

gaa

aat

aac

tat

aaa

gtt

ggt

gaa

atc

aaa

tta

ccg

att

ccg

768

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn 245

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu 250

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile 255

Pro

aaa

tta

aac

caa

gga

aca

acc

aga

acg

gcc

gga

aat

aaa

att

cct

gta

816

Lys

Leu

Asn

Gin 260

Gly

Thr

Thr

Arg

Thr 265

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile 270

Pro

Val

acc

ttc

atg

gca

aat

gct

tat

ttg

gac

aat

caa

teg

act

tat

att

gtg

864

Thr

Phe

Met 275

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu 280

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr 285

Tyr

Ile

Val

gaa

gta

cct

atc

ttg

gaa

aaa

gaa

aat

caa

act

gat

aaa

cca

agt

att

912

Glu

Val 290

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys 295

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp 300

Lys

Pro

Ser

Ile

eta

cca

caa

ttt

aaa

agg

aat

aaa

gca

caa

gaa

aac

tca

aaa

ctt

gat

960

Leu 305

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg 310

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu 315

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp 320

gaa

aag

gta

gaa

gaa

cca

aag

act

agt

gag

aag

gta

gaa

aaa

gaa

aaa

1008

Glu

Lys

Val

Glu

Glu 325

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu 330

Lys

Val

Glu

Lys

Glu 335

Lys

PL 206 576 B1

ctt Leu

tct Ser

gaa Glu

act Thr 340

ggg Gly

aat Asn

agt Ser

act Thr

agt Ser 345

aat Asn

tca Ser

acg Thr

tta Leu

gaa Glu 350

gaa Glu

gtt Val

1056

cct

aca

gtg

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

gta

gca

aaa

ttt

gct

gaa

agt

1104

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

355

360

365

tat

ggg

atg

aag

eta

gaa

aat

gtc

ttg

ttt

aat

atg

gac

gga

aca

att

1152

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

370

375

380

gaa

tta

tat

tta

cca

tca

gga

gaa

gtc

att

aaa

aag

aat

atg

gca

gat

1200

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

385

390

395

400

ttt

aca

gga

gaa

gca

cct

caa

gga

aat

ggt

gaa

aat

aaa

cca

tct

gaa

1248

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

405

410

415

aat

gga

aaa

gta

tct

act

gga

aca

gtt

gag

aac

caa

cca

aca

gaa

aat

1296

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

420

425

430

aaa

cca

gca

gat

tct

tta

cca

gag

gca

cca

aac

gaa

aaa

cct

gta

aaa

1344

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

435

440

445

cca

gaa

aac

tca

acg

gat

aat

gga

atg

ttg

aat

cca

gaa

ggg

aat

gtg

1392

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

450

455

460

ggg

agt

gac

cct

atg

tta

gat

cca

gca

tta

gag

gaa

gct

cca

gca

gta

1440

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

465

470

475

480

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

tta

gaa

aaa

ttt

aca

gct

agt

tac

gga

tta

1488

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

485

490

495

ggc

tta

gat

agt

gtt

ata

ttc

aat

atg

gat

gga

acg

att

gaa

tta

aga

1536

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

500

505

510

ttg

cca

agt

gga

gaa

gtg

ata

aaa

aag

aat

tta

tct

gat

ttc

ata

gcg

1584

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

515

520

525

taa

1587

<210>

10

<211>

528

<212>

PRT

<213>

S pneumoniae

<400>

10

PL 206 576 B1

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

1

5

10

15

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

val

Asn

Lys

Glu

Lys

20

25

30

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

35

40

45

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

50

55

60

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

65

70

75

80

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

85

90

95

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

100

105

110

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

115

120

125

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

130

135

140

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

145

150

155

160

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

165

170

175

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

180

185

190

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

195

200

205

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

210

215

220

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

225

230

235

240

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

245

250

255

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

260

265

270

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

275

280

285

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

290

295

300

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

305

310

315

320

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

325

330

335

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

340

345

350

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

355

360

365

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

370

375

380

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

385

390

395

400

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

405

410

415

Asn

Gly

Lys

val

Ser

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

420

425

430

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

435

440

445

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

PL 206 576 B1

450

455

460

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

465

470

475

480

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

485

490

495

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

500

505

510

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

515

520

525

<210> 11 <211> 5048 <212> DNA <213> S. pneumoniae <400> 11 aattccttgt cgggtaagtt ccgacccgca cgaaaggcgt aatgatttgg gcactgtctc aacgagagac tcggtgaaat tttagtacct gtgaagatgc aggttacccg cgacaggacg gaaagacccc atggagcttt actgcagttt gatattgagt gtctgtacca catgtacagg ataggtagga gtctaagaga tcgggacgcc agtttcgaag gagacgctgt tgggatacta cccttgtgtt atggccactc taacccagat aggtgatccc tatcggagac agtgtctgac gggcagtttg actggggcgg tcgcctccta aaaggtaacg gaggcgccca aaggttccct cagaatggtt ggaaatcatt cgcagagtgt aaaggtataa gggagcttga ctgcgagagc tacaactcga gcagggacga aagtcgggct tagtgatccg gtggttccgt atggaagggc catcgctcaa cggataaaag ctaccctggg gataacaggc ttatctcccc caagagttca catcgacggg gaggtttggc acctcgatgt cggctcgtcg catcctgggg ctgtagtcgg tcccaagggt tgggctgttc gcccattaaa gcggcacgcg agctgggttc agaacgtcgt gagacagttc ggtccctatc cgtcgcgggc gtaggaaatt tgagaggatc tgctcctagt acgagaggac cagagtggac ttaccgctgg tgtaccagtt gtcttgccaa aggcatcgct gggtagctat gtagggaagg gataaacgct gaaagcatct aagtgtgaaa cccacctcaa gatgagattt cccatgatta tatatcagta agagccctga gagatgatca ggtagatagg ttagaagtgg aagtgtggcg acacatgtag cggactaata ctaatagctc gaggacttat ccaaagtaac tgagaatatg aaagcgaacg gttttcttaa attgaataga tattcaattt tgagtaggta ttactcagag ttaagtgacg atagcctagg agatacacct gtacccatgc cgaacacaga agttaagccc tagaacgccg gaagtagttg ggggttgccc cctgtgagat agggaagtcg cttagctcta gggagtttag ctcagctggg agagcatctg ccttacaagc agagggtcag cggttcgatc ccgttaactc ccaaaggtcc cgtagtgtag cggttatcac gtcgccctgt cacggcgaag atcgcgggtt cgattcccgt cgggaccgtt taaggtaacg caagttattt tagactcgtt agctcagttg gtagagcaat tgacttttaa tcaatgggtc actggttcga gcccagtacg ggtcatatat gcgggtttgg cggaattcta atctctttga aatcatcttc tctcactttc caaaactcta ttacctctta ttataccaca tttcaatctt caacttccca gtaatataag cacctctggc gaaagaagtt tcaatgtcct aaagtaataa gtgaatccaa ttcaggaact ccaagaacaa aagaaacatc tggtgtcaca agtattggat ggcacagagt cacgtggtag tctgacccta gcagaaattt taaatagtaa actatttact ggttaattaa atggttaaat aaccggttta gaaaactatt taataaagta aaagaagttg agaaaaaact tcatcattta ttgaaatgag ggatttatga aatttagtaa aaaatatata gcagctggat cagctgttat cgtatccttg agtctatgtg cctatgcact aaaccagcat cgttcgcagg aaaataagga caataatcgt gtctcttatg tggatggcag ccagtcaagt cagaaaagtg aaaacttgac accagaccag gttagccaga aagaaggaat tcaggctgag caaattgtaa tcaaaattac agatcagggc tatgtaacgt cacacggtga ccactatcat tactataatg ggaaagttcc ttatgatgcc ctctttagtg aagaactctt gatgaaggat ccaaactatc aacttaaaga cgctgatatt gtcaatgaag tcaagggtgg ttatatcatc aaggtcgatg gaaaatatta tgtctacctg aaagatgcag ctcatgctga taatgttcga actaaagatg aaatcaatcg tcaaaaacaa gaacatgtca aagataatga gaaggttaac tctaatgttg ctgtagcaag gtctcaggga cgatatacga caaatgatgg ttatgtcttt aatccagctg atattatcga agatacgggt aatgcttata tcgttcctca tggaggtcac tatcactaca ttcccaaaag cgatttatct gctagtgaat tagcagcagc taaagcacat

120

180

240

300

360

420

480

540

600

660

720

780

840

900

960

1020

1080

1140

1200

1260

1320

1380

1440

1500

1560

1620

1680

1740

1800

1860

1920

1980

2040

2100

2160

2220

2280

2340

2400

2460

PL 206 576 B1 ctggctggaa aaaatatgca accgagtcag ttaagctatt cttcaacagc tagtgacaat 2520 aacacgcaat ctgtagcaaa aggatcaact agcaagccag caaataaatc tgaaaatctc 2580 cagagtcttt tgaaggaact ctatgattca cctagcgccc aacgttacag tgaatcagat 2640 ggcctggtct ttgaccctgc taagattatc agtcgtacac caaatggagt tgcgattccg 2700 catggcgacc attaccactt tattccttac agcaagcttt ctgctttaga agaaaagatt 2760 gccagaatgg tgcctatcag tggaactggt tctacagttt ctacaaatgc aaaacctaat 2820 gaagtagtgt ctagtctagg cagtctttca agcaatcctt cttctttaac gacaagtaag 2880 gagctctctt cagcatctga tggttatatt tttaatccaa aagatatcgt tgaagaaacg 2940 gctacagctt atattgtaag acatggtgat catttccatt acattccaaa atcaaatcaa 3000 attgggcaac cgactcttcc aaacaatagt ctagcaacac cttctccatc tcttccaatc 3060 aatccaggaa cttcacatga gaaacatgaa gaagatggat acggatttga tgctaatcgt 3120 attatcgctg aagatgaatc aggttttgtc atgagtcacg gagaccacaa tcattatttc 3180 ttcaagaagg acttgacaga agagcaaatt aaggctgcgc aaaaacattt agaggaagtt 3240 aaaactagtc ataatggatt agattctttg tcatctcatg aacaggatta tccaggtaat 3300 gccaaagaaa tgaaagattt agataaaaaa atcgaagaaa aaattgctgg cattatgaaa 3360 caatatggtg tcaaacgtga aagtattgtc gtgaataaag aaaaaaatgc gattatttat 3420 ccgcatggag atcaccatca tgcagatccg attgatgaac ataaaccggt tggaattggt 3480 cattctcaca gtaactatga actgtttaaa cccgaagaag gagttgctaa aaaagaaggg 3540 aataaagttt atactggaga agaattaacg aatgttgtta atttgttaaa aaatagtacg 3600 tttaataatc aaaactttac tctagccaat ggtcaaaaac gcgtttcttt tagttttccg 3660 cctgaattgg agaaaaaatt aggtatcaat atgctagtaa aattaataac accagatgga 3720 aaagtattgg agaaagtatc tggtaaagta tttggagaag gagtagggaa tattgcaaac 3780 tttgaattag atcaacctta tttaccagga caaacattta agtatactat cgcttcaaaa 3840 gattatccag aagtaagtta tgatggtaca tttacagttc caacctcttt agcttacaaa 3900 atggccagtc aaacgatttt ctatcctttc catgcagggg atacttattt aagagtgaac 3960 cctcaatttg cagtgcctaa aggaactgat gctttagtca gagtgtttga tgaatttcat 4020 ggaaatgctt atttagaaaa taactataaa gttggtgaaa tcaaattacc gattccgaaa 4080 ttaaaccaag gaacaaccag aacggccgga aataaaattc ctgtaacctt catggcaaat 4140 gcttatttgg acaatcaatc gacttatatt gtggaagtac ctatcttgga aaaagaaaat 4200 caaactgata aaccaagtat tctaccacaa tttaaaagga ataaagcaca agaaaactca 4260 aaacttgatg aaaaggtaga agaaccaaag actagtgaga aggtagaaaa agaaaaactt 4320 tctgaaactg ggaatagtac tagtaattca acgttagaag aagttcctac agtggatcct 4380 gtacaagaaa aagtagcaaa atttgctgaa agttatggga tgaagctaga aaatgtcttg 4440 tttaatatgg acggaacaat tgaattatat ttaccatcag gagaagtcat taaaaagaat 4500 atggcagatt ttacaggaga agcacctcaa ggaaatggtg aaaataaacc atctgaaaat 4560 ggaaaagtat ctactggaac agttgagaac caaccaacag aaaataaacc agcagattct 4620 ttaccagagg caccaaacga aaaacctgta aaaccagaaa actcaacgga taatggaatg 4680 ttgaatccag aagggaatgt ggggagtgac cctatgttag atccagcatt agaggaagct 4740 ccagcagtag atcctgtaca agaaaaatta gaaaaattta cagctagtta cggattaggc 4800 ttagatagtg ttatattcaa tatggatgga acgattgaat taagattgcc aagtggagaa 4860 gtgataaaaa agaatttatc tgatttcata gcgtaaggaa tagcagtaga aaaagtctga 4920 atcaaaaatg aagttctctc aaaagttaga aataaaactc tgactttggg agaatttcat 4980 tttattatta atatataaaa tttcttgaca tacaacttaa aaagaggtgg aatatttact 5040 agttaatt 5048 <210> 12 <211> 2647 <212> DNA <213> Ξ. pneumoniae cagagatctt aatatctagc tgcatcaagc cgacgcaaaa agtgaatcaa tgggtcagta tcaaactgta aacggagaat atatacttaa gctacacttg aaagaaaata ttgactcctg gaaaagagga ttttaagtgt atcgtgtttc atgaggttag aagaatgaaa ctgtgcttat ctatatagat caagcgtgaa atcaataaaa gaactaggtt ggaaaacaag ggaatcaacg

120

180

240

PL 206 576 B1 ccgaacaaat cgtcatcaag attacggatc aaggttatgt gacctctcat ggagaccatt 300 atcattacta taatggcaag gtcccttatg atgccatcat cagtgaagag ctcctcatga 360 aagatccgaa ttatcagttg aaggattcag acattgtcaa tgaaatcaag ggtggttatg 420 tcattaaggt aaacggtaaa tactatgttt accttaagga tgcagctcat gcggataatg 480 tccgtacaaa agaagaaatc aatcggcaaa aacaagaaca tagtcagcat cgtgaaggag 540 ggacttcagc aaacgatggt gcggtagcct ttgcacgttc acagggacgc tacaccacag 600 atgatggtta tatcttcaat gcatctgata tcatcgaaga tacgggcgat gcctatatcg 660 ttcctcatgg agatcattac cattacattc ctaagaatga gttatcagct agcgagttgg 720 ctgctgcaga agccttccta tctggtcggg aaaatctgtc aaatttaaga acctatcgcc 780 gacaaaatag cgataacact ccaagaacaa actgggtacc ttctgtaagc aatccaggaa 840 ctacaaatac taacacaagc aacaacagca acactaacag tcaagcaagt caaagtaatg 900 acattgatag tctcttgaaa cagctctaca aactgccttt gagtcaacgc catgtagaat 960 ctgatggcct tattttcgac ccagcgcaaa tcacaagtcg aaccgccaga ggtgtagctg 1020 tccctcatgg taaccattac cactttatcc cttatgaaca aatgtctgaa ttggaaaaac 1080 gaattgctcg tattattccc cttcgttatc gttcaaacca ttgggtacca gattcaagac 1140 cagaagaacc aagtccacaa ccgactccag aacctagtcc aagtccgcaa cctgcaccaa 1200 atcctcaacc agctccaagc aatccaattg atgagaaatt ggtcaaagaa gctgttcgaa 1260 aagtaggcga tggttatgtc tttgaggaga atggagtttc tcgttatatc ccagccaaga 1320 atctttcagc agaaacagca gcaggcattg atagcaaact ggccaagcag gaaagtttat 1380 ctcataagct aggagctaag aaaactgacc tcccatctag tgatcgagaa ttttacaata 1440 aggcttatga cttactagca agaattcacc aagatttact tgataataaa ggtcgacaag 1500 ttgattttga ggctttggat aacctgttgg aacgactcaa ggatgtctca agtgataaag 1560 tcaagttagt ggatgatatt cttgccttct tagctccgat tcgtcatcca gaacgtttag 1620 gaaaaccaaa tgcgcaaatt acctacactg atgatgagat tcaagtagcc aagttggcag 1680 gcaagtacac aacagaagac ggttatatct ttgatcctcg tgatataacc agtgatgagg 1740 gggatgccta tgtaactcca catatgaccc atagccactg gattaaaaaa gatagtttgt 1800 ctgaagctga gagagcggca gcccaggctt atgctaaaga gaaaggtttg acccctcctt 1860 cgacagacca tcaggattca ggaaatactg aggcaaaagg agcagaagct atctacaacc 1920 gcgtgaaagc agctaagaag gtgccacttg atcgtatgcc ttacaatctt caatatactg 1980 tagaagtcaa aaacggtagt ttaatcatac ctcattatga ccattaccat aacatcaaat 2040 ttgagtggtt tgacgaaggc ctttatgagg cacctaaggg gtatactctt gaggatcttt 2100 tggcgactgt caagtactat gtcgaacatc caaacgaacg tccgcattca gataatggtt 2160 ttggtaacgc tagcgaccat gttcaaagaa acaaaaatgg tcaagctgat accaatcaaa 2220 cggaaaaacc aagcgaggag aaacctcaga cagaaaaacc tgaggaagaa acccctcgag 2280 aagagaaacc acaaagcgag aaaccagagt ctccaaaacc aacagaggaa ccagaagaag 2340 aatcaccaga ggaatcagaa gaacctcagg tcgagactga aaaggttgaa gaaaaactga 2400 gagaggctga agatttactt ggaaaaatcc aggatccaat tatcaagtcc aatgccaaag 2460 agactctcac aggattaaaa aataatttac tatttggcac ccaggacaac aatactatta 2520 tggcagaagc tgaaaaacta ttggctttat taaaggagag taagtaaagg tagcagcatt 2580 ttctaactcc taaaaacagg ataggagaac gggaaaacga aaaatgagag cagaatgtga 2640 gttctag 2647 <210> 13 <211> 2639 <212> DNA <213> S. pneumoniae <220>

<221> CDS <222> (114) ... (2627) <400> 13 gggtcttaaa actctgaatc ctttagaggc agacccacaa aatgacaaga cctatttaga 60 aaatctggaa gaaaatatga gtgttctagc agaagaatta aagtgaggaa aga atg 116

Met

PL 206 576 B1

aaa Lys

atc Ile

aat Asn

aaa Lys 5

aaa Lys

tat Tyr

eta gca

ggt Gly 10

tca Ser

gtg val

gca Ala

gtc Val

ctt Leu 15

gcc Ala

eta Leu

164

Leu

Ala

agt

gtt

tgt

tcc

tat

gaa

ctt

ggt

cgt

cac

caa

gct

ggt

cag

gtt

aag

212

Ser

Val

Cys 20

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly 25

Arg

His

Gin

Ala

Gly 30

Gin

Val

Lys

aaa

gag

tct

aat

ega

gtt

tct

tat

ata

gat

ggt

gat

cag

gct

ggt

caa

260

Lys

Glu 35

Ser

Asn

Arg

Val

Ser 40

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp 45

Gin

Ala

Gly

Gin

aag

gca

gaa

aat

ttg

aca

cca

gat

gaa

gtc

agt

aag

aga

gag

ggg

atc

308

Lys 50

Ala

Glu

Asn

Leu

Thr 55

Pro

Asp

Glu

Val

Ser 60

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile 65

aac

gcc

gaa

caa

att

gtt

atc

aag

att

acg

gat

caa

ggt

tat

gtg

acc

356

Asn

Ala

Glu

Gin

Ile 70

Val

Ile

Lys

Ile

Thr 75

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val 80

Thr

tct

cat

gga

gac

cat

tat

cat

tac

tat

aat

ggc

aag

gtt

cct

tat

gat

404

Ser

His

Gly

Asp 85

His

Tyr

His

Tyr

Tyr 90

Asn

Gly

Lys

Val

Pro 95

Tyr

Asp

gcc

atc

atc

agt

gaa

gaa

ctt

ctc

atg

aaa

gat

ccg

aat

tat

cag

ttg

452

Ala

Ile

Ile 100

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 105

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 110

Tyr

Gin

Leu

aag

gat

tca

gac

att

gtc

aat

gaa

atc

aag

ggt

ggc

tat

gtg

att

aag

500

Lys

Asp 115

Ser

Asp

Ile

Val

Asn 120

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly 125

Tyr

Val

Ile

Lys

gta

gac

gga

aaa

tac

tat

gtt

tac

ctt

aaa

gat

gcg

gcc

cat

gcg

gac

548

Val 130

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr 135

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 140

Ala

Ala

His

Ala

Asp 145

aat

att

cgg

aca

aaa

gaa

gag

att

aaa

cgt

cag

aag

cag

gaa

cac

agt

596

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys 150

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg 155

Gin

Lys

Gin

Glu

His 160

Ser

cat

aat

cat

aac

tca

aga

gca

gat

aat

gct

gtt

gct

gca

gcc

aga

gcc

644

His

Asn

His

Asn 165

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn 170

Ala

Val

Ala

Ala

Ala 175

Arg

Ala

caa

gga

cgt

tat

aca

acg

gat

gat

ggg

tat

atc

ttc

aat

gca

tct

gat

692

Gin

Gly

Arg 180

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp 185

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn 190

Ala

Ser

Asp

atc

att

gag

gac

acg

ggt

gat

gct

tat

atc

gtt

cct

cac

ggc

gac

cat

740

Ile

Ile 195

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp 200

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro 205

His

Gly

Asp

His

tac

cat

tac

att

cct

aag

aat

gag

tta

tca

gct

age

gag

tta

gct

gct

788

Tyr 210

His

Tyr

Ile

Pro

Lys 215

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala 220

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala 225

gca

gaa

gcc

tat

tgg

aat

ggg

aag

cag

gga

tct

cgt

cct

tct

tca

agt

836

PL 206 576 B1

Ala

Glu

Ala

Tyr

Trp 230

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly 235

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser 240

Ser

tct

agt

tat

aat

gca

aat

cca

gtt

caa

cca

aga

ttg

tca

gag

aac

cac

884

Ser

Ser

Tyr

Asn 245

Ala

Asn

Pro

Val

Gin 250

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu 255

Asn

His

aat

ctg

act

gtc

act

cca

act

tat

cat

caa

aat

caa

ggg

gaa

aac

att

932

Asn

Leu

Thr 260

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr 265

His

Gin

Asn

Gin

Gly 270

Glu

Asn

Ile

tca

agc

ctt

tta

cgt

gaa

ttg

tat

gct

aaa

ccc

tta

tca

gaa

cgc

cat

980

Ser

Ser 275

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu 280

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu 285

Ser

Glu

Arg

His

gta

gaa

tct

gat

ggc

ctt

att

ttc

gac

cca

gcg

caa

atc

aca

agt

ega

1028

Val 290

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu 295

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala 300

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg 305

acc

gcc

aga

ggt

gta

gct

gtc

cct

cat

ggt

aac

cat

tac

cac

ttt

atc

1076

Thr

Ala

Arg

Gly

Val 310

Ala

Val

Pro

His

Gly 315

Asn

His

Tyr

His

Phe 320

Ile

cct

tat

gaa

caa

atg

tct

gaa

ttg

gaa

aaa

ega

att

gct

cgt

att

att

1124

Pro

Tyr

Glu

Gin 325

Met

Ser

Glu

Leu

Glu 330

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg 335

Ile

Ile

ccc

ctt

cgt

tat

cgt

tca

aac

cat

tgg

gta

cca

gat

tca

aga

cca

gaa

1172

Pro

Leu

Arg 340

Tyr

Arg

Ser

Asn

His 345

Trp

Val

Pro

Asp

Ser 350

Arg

Pro

Glu

caa

cca

agt

cca

caa

teg

act

ccg

gaa

cct

agt

cca

agt

ctg

caa

cct

1220

Gin

Pro 355

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr 360

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro 365

Ser

Leu

Gin

Pro

gca

cca

aat

cct

caa

cca

gct

cca

agc

aat

cca

att

gat

gag

aaa

ttg

1268

Ala 370

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro 375

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro 380

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu 385

gtc

aaa

gaa

gct

gtt

ega

aaa

gta

ggc

gat

ggt

tat

gtc

ttt

gag

gag

1316

Val

Lys

Glu

Ala

Val 390

Arg

Lys

Val

Gly

Asp 395

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu 400

Glu

aat

gga

gtt

tct

cgt

tat

atc

cca

gcc

aag

gat

ctt

tca

gca

gaa

aca

1364

Asn

Gly

Val

Ser 405

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala 410

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala 415

Glu

Thr

gca

gca

ggc

att

gat

agc

aaa

ctg

gcc

aag

cag

gaa

agt

tta

tct

cat

1412

Ala

Ala

Gly 420

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu 425

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser 430

Leu

Ser

His

aag

eta

gga

gct

aag

aaa

act

gac

ctc

cca

tct

agt

gat

ega

gaa

ttt

1460

Lys

Leu 435

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr 440

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser 445

Asp

Arg

Glu

Phe

tac

aat

aag

gct

tat

gac

tta

eta

gca

aga

att

cac

caa

gat

tta

ctt

1508

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

PL 206 576 B1

450

455

460

465

gat

aat

aaa

ggt

ega

caa

gtt

gat

ttt

gag

gtt

ttg

gat

aac

ctg

ttg

1556

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg 470

Gin

val

Asp

Phe

Glu 475

Val

Leu

Asp

Asn

Leu 480

Leu

gaa

ega

ctc

aag

gat

gtc

tca

agt

gat

aaa

gtc

aag

tta

gtg

gat

gat

1604

Glu

Arg

Leu

Lys 485

Asp

Val

Ser

Ser

Asp 490

Lys

Val

Lys

Leu

vai 495

Asp

Asp

att

ctt

gcc

ttc

tta

gct

ccg

att

cgt

cat

cca

gaa

cgt

tta

gga

aaa

1652

Ile

Leu

Ala 500

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile 505

Arg

His

Pro

Glu

Arg 510

Leu

Gly

Lys

cca

aat

gcg

caa

att

acc

tac

act

gat

gat

gag

att

caa

gta

gcc

aag

1700

Pro

Asn 515

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr 520

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile 525

Gin

Val

Ala

Lys

ttg

gca

ggc

aag

tac

aca

aca

gaa

gac

ggt

tat

atc

ttt

gat

cct

cgt

1748

Leu 530

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr 535

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr 540

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg 545

gat

ata

acc

agt

gat

gag

ggg

gat

gcc

tat

gta

act

cca

cat

atg

acc

1796

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp 550

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr 555

Val

Thr

Pro

His

Met 560

Thr

cat

agc

cac

tgg

att

aaa

aaa

gat

agt

ttg

tct

gaa

gct

gag

aga

gcg

1844

His

Ser

His

Trp 565

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser 570

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu 575

Arg

Ala

gca

gcc

cag

gct

tat

gct

aaa

gag

aaa

ggt

ttg

acc

cct

cct

teg

aca

1892

Ala

Ala

Gin 580

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu 585

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro 590

Pro

Ser

Thr

gac

cac

cag

gat

tca

gga

aat

act

gag

gca

aaa

gga

gca

gaa

gct

atc

1940

Asp

His 595

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn 600

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly 605

Ala

Glu

Ala

Ile

tac

aac

cgc

gtg

aaa

gca

gct

aag

aag

gtg

cca

ctt

gat

cgt

atg

cct

1988

Tyr 610

Asn

Arg

Val

Lys

Ala 615

Ala

Lys

Lys

Val

Pro 620

Leu

Asp

Arg

Met

Pro 625

tac

aat

ctt

caa

tat

act

gta

gaa

gtc

aaa

aac

ggt

agt

tta

atc

ata

2036

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr 630

Thr

Val

Glu

Val

Lys 635

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile 640

Ile

cct

cat

tat

gac

cat

tac

cat

aac

atc

aaa

ttt

gag

tgg

ttt

gac

gaa

2084

Pro

His

Tyr

Asp 645

His

Tyr

His

Asn

Ile 650

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe 655

Asp

Glu

ggc

ctt

tat

gag

gca

cct

aag

ggg

tat

agt

ctt

gag

gat

ctt

ttg

gcg

2132

Gly

Leu

Tyr 660

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly 665

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp 670

Leu

Leu

Ala

act

gtc

aag

tac

tat

gtc

gaa

cat

cca

aac

gaa

cgt

ccg

cat

tca

gat

2180

Thr

Val 675

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu 680

His

Pro

Asn

Glu

Arg 685

Pro

His

Ser

Asp

PL 206 576 B1

aat Asn 690

ggt Gly

ttt Phe

ggt Gly

aac Asn

gct Ala 695

agt Ser

gac Asp

cat His

gtt Val

cgt aaa Arg Lys 700

aat Asn

aag gca

gac Asp 705

2228

Lys

Ala

caa

gat

agt

aaa

cct

gat

gaa

gat

aag

gaa

cat gat

gaa

gta

agt

gag

2276

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His Asp

Glu

Val

Ser

Glu

710

715

720

cca

act

cac

cct

gaa

tct

gat

gaa

aaa

gag

aat cac

gct

ggt

tta

aat

2324

Pro

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn His

Ala

Gly

Leu

Asn

725

730

735

cct

tea

gca

gat

aat

ctt

tat

aaa

cca

age

act gat

acg

gaa

gag

aca

2372

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

740

745

750

gag

gaa

gaa

gct

gaa

gat

acc

aca

gat

gag

gct gaa

att

cct

caa

gta

2420

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala Glu

Ile

Pro

Gin

Val

755

760

765

gag

aat

tct

gtt

att

aac

gct

aag

ata

gca

gat gcg

gag

gee

ttg

eta

2468

Glu

Asn

Ser

val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

770

775

780

785

gaa

aaa

gta

aca

gat

cct

agt

att

aga

caa

aat gct

atg

gag

aca

ttg

2516

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn Ala

Met

Glu

Thr

Leu

790

795

800

act

ggt

eta

aaa

agt

agt

ctt

ctt

ctc

gga

acg aaa

gat

aat

aac

act

2564

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

805

810

815

att

tea

gca

gaa

gta

gat

agt

ctc

ttg

gct

ttg tta

aaa

gaa

agt

caa

2612

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

820

825

830

ccg

gct

cct

ata

cag

tagtaaaatg aa

2639

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

835

<210> <211> <212> <213>

14 838 PRT S. pneumoniae

<400>

14

Met

Lys Ile

Asn

Lys

Lys

Tyr

Leu

Ala

Gly

Ser

Val

Ala

Val

Leu

Ala

1

5

10

15

Leu

Ser Val

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Val

20

25

30

Lys

Lys Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

35

40

45

Gin

Lys Ala

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Asn Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

PL 206 576 B1

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp 85

His

Tyr

His

Tyr

Tyr 90

Asn

Gly

Lys

Val

Pro 95

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile 100

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 105

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 110

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp 115

Ser

Asp

Ile

Val

Asn 120

Glu

ile

Lys

Gly

Gly 125

Tyr

Val

Ile

Lys

Val 130

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr 135

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 140

Ala

Ala

His

Ala

Asp 145

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys 150

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg 155

Gin

Lys

Gin

Glu

His 160

Ser

His

Asn

His

Asn 165

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn 170

Ala

Val

Ala

Ala

Ala 175

Arg

Ala

Gin

Gly

Arg 180

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp 185

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn 190

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile 195

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp 200

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro 205

His

Gly

Asp

His

Tyr 210

His

Tyr

Ile

Pro

Lys 215

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala 220

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala 225

Ala

Glu

Ala

Tyr

Trp 230

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly 235

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser 240

Ser

Ser

Ser

Tyr

Asn 245

Ala

Asn

Pro

Val

Gin 250

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu 255

Asn

His

Asn

Leu

Thr 260

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr 265

His

Gin

Asn

Gin

Gly 270

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser 275

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu 280

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu 285

Ser

Glu

Arg

His

Val 290

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu 295

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala 300

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg 305

Thr

Ala

Arg

Gly

Val 310

Ala

Val

Pro

His

Gly 315

Asn

His

Tyr

His

Phe 320

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin 325

Met

Ser

Glu

Leu

Glu 330

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg 335

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg 340

Tyr

Arg

Ser

Asn

His 345

Trp

Val

Pro

Asp

Ser 350

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro 355

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr 360

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro 365

Ser

Leu

Gin

Pro

Ala 370

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro 375

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro 380

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu 385

Val

Lys

Glu

Ala

Val 390

Arg

Lys

Val

Gly

Asp 395

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu 400

Glu

Asn

Gly

Val

Ser 405

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala 410

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala 415

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly 420

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu 425

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser 430

Leu

Ser

His

Lys

Leu 435

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr 440

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser 445

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr 450

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp 455

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile 460

His

Gin

Asp

Leu

Leu 465

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg 470

Gin

Val

Asp

Phe

Glu 475

Val

Leu

Asp

Asn

Leu 480

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys 485

Asp

Val

Ser

Ser

Asp 490

Lys

Val

Lys

Leu

Val 495

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala 500

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile 505

Arg

His

Pro

Glu

Arg 510

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn 515

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr 520

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile 525

Gin

Val

Ala

PL 206 576 B1

Lys Leu Ala Gly

Lys Tyr Thr Thr Glu Asp Gly Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

530

535

540

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

545

550

555

560

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

565

570

575

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

580

585

590

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

595

600

605

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

610

615

620

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

625

630

635

640

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

645

650

655

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

660

665

670

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

675

680

685

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

690

695

700

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

705

710

715

720

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

725

730

735

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

740

745

750

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

755

760

765

Val

Glu

Asn

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

770

775

780

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

785

790

795

800

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

805

810

815

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

ASp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

820

825

830

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

835 <210> 15 <211> 2528 <212> DNA <213> S. pneumoniae <220>

<221> CDS

<222>

(1)

...(2520)

<400>

15

tgt

gcc tat

gca

eta aac

cag

cat

cgt

tog

cag

gaa

aat

aag

gac

aat

Cys

Ala Tyr

Ala

Leu Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

aat

cgt gtc

tct

tat gtg

gat

ggc

age

cag

tca

agt

cag

aaa

agt

gaa

Asn

Arg Val

Ser

Tyr val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

PL 206 576 B1

20

25

30

aac

ttg

aca

cca

gac

cag

gtt

agc

cag

aaa

gaa

gga

att

cag

gct

gag

144

Asn

Leu

Thr 35

Pro

Asp

Gin

Val

Ser 40

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile 45

Gin

Ala

Glu

caa

att

gta

atc

aaa

att

aca

gat

cag

ggc

tat

gta

acg

tca

cac

ggt

192

Gin

Ile 50

Val

Ile

Lys

Ile

Thr 55

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val 60

Thr

Ser

His

Gly

gat

cac

tat

cat

tac

tat

aat

ggg

aaa

gtt

cct

tat

gat

gcc

ctc

ttt

240

Asp 65

His

Tyr

His

Tyr

Tyr 70

Asn

Gly

Lys

Val

Pro 75

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe 80

agt

gaa

gaa

ctc

ttg

atg

aag

gat

cca

aac

tat

caa

ctt

aaa

gac

gct

288

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 85

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 90

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp 95

Ala

gat

att

gtc

aat

gaa

gtc

aag

ggt

ggt

tat

atc

atc

aag

gtc

gat

gga

336

Asp

Ile

Val

Asn 100

Glu

Val

Lys

Gly

Gly 105

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val 110

Asp

Gly

aaa

tat

tat

gtc

tac

ctg

aaa

gat

gca

gct

cat

gct

gat

aat

gtt

ega

384

Lys

Tyr

Tyr 115

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 120

Ala

Ala

His

Ala

Asp 125

Asn

Val

Arg

act

aaa

gat

gaa

atc

aat

cgt

caa

aaa

caa

gaa

cat

gtc

aaa

gat

aat

432

Thr

Lys 130

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg 135

Gin

Lys

Gin

Glu

His 140

Val

Lys

Asp

Asn

gag

aag

gtt

aac

tct

aat

gtt

gct

gta

gca

agg

tct

cag

gga

ega

tat

480

Glu 145

Lys

Val

Asn

Ser

Asn 150

Val

Ala

Val

Ala

Arg 155

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr 160

acg

aca

aat

gat

ggt

tat

gtc

ttt

aat

cca

gct

gat

att

atc

gaa

gat

528

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly 165

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro 170

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu 175

Asp

acg

ggt

aat

gct

tat

atc

gtt

cct

cat

gga

ggt

cac

tat

cac

tac

att

576

Thr

Gly

Asn

Ala 180

Tyr

Ile

Val

Pro

His 185

Gly

Gly

His

Tyr

His 190

Tyr

Ile

ccc

aaa

agc

gat

tta

tct

gct

agt

gaa

tta

gca

gca

gct

aaa

gca

cat

624

Pro

Lys

Ser 195

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser 200

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala 205

Lys

Ala

His

ctg

gct

gga

aaa

aat

atg

caa

ccg

agt

cag

tta

agc

tat

tct

tca

aca

672

Leu

Ala 210

Gly

Lys

Asn

Met

Gin 215

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser 220

Tyr

Ser

Ser

Thr

cct

tct

cca

tct

ctt

cca

atc

aat

cca

gga

act

tca

cat

gag

aaa

cat

720

Pro 225

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro 230

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr 235

Ser

His

Glu

Lys

His 240

gaa

gaa

gat

gga

tac

gga

ttt

gat

gct

aat

cgt

att

atc

gct

gaa

gat

768

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr 245

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn 250

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu 255

Asp

PL 206 576 B1

gaa Glu

tca Ser

ggt Gly

ttt Phe 260

gtc Val

atg Met

agt Ser

cac His

gga Gly 265

gac Asp

cac His

aat Asn

cat His

tat Tyr 270

ttc Phe

ttc Phe

816

aag

aag

gac

ttg

aca

gaa

gag

caa

att

aag

gct

gcg

caa

aaa

cat

tta

864

Lys

Lys

Asp 275

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin 280

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin 285

Lys

His

Leu

gag

gaa

gtt

aaa

act

agt

cat

aat

gga

tta

gat

tct

ttg

tca

tct

cat

912

Glu

Glu 290

Val

Lys

Thr

Ser

His 295

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser 300

Leu

Ser

Ser

His

gaa

cag

gat

tat

cca

agt

aat

gcc

aaa

gaa

atg

aaa

gat

tta

gat

aaa

960

Glu 305

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser 310

Asn

Ala

Lys

Glu

Met 315

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys 320

aaa

atc

gaa

gaa

aaa

att

gct

ggc

att

atg

aaa

caa

tat

ggt

gtc

aaa

1008

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys 325

Ile

Ala

Gly

Ile

Met 330

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val 335

Lys

cgt

gaa

agt

att

gtc

gtg

aat

aaa

gaa

aaa

aat

gcg

att

att

tat

ccg

1056

Arg

Glu

Ser

Ile 340

Val

Val

Asn

Lys

Glu 345

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile 350

Tyr

Pro

cat

gga

gat

cac

cat

cat

gca

gat

ccg

att

gat

gaa

cat

aaa

ccg

gtt

1104

His

Gly

Asp 355

His

His

His

Ala

Asp 360

Pro

Ile

Asp

Glu

His 365

Lys

Pro

Val

gga

att

ggt

cat

tct

cac

agt

aac

tat

gaa

ctg

ttt

aaa

ccc

gaa

gaa

1152

Gly

Ile 370

Gly

His

Ser

His

Ser 375

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe 380

Lys

Pro

Glu

Glu

gga

gtt

gct

aaa

aaa

gaa

ggg

aat

aaa

gtt

tat

act

gga

gaa

gaa

tta

1200

Gly 385

Val

Ala

Lys

Lys

Glu 390

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr 395

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu 400

acg

aat

gtt

gtt

aat

ttg

tta

aaa

aat

agt

acg

ttt

aat

aat

caa

aac

1248

Thr

Asn

Val

Val

Asn 405

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser 410

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin 415

Asn

ttt

act

eta

gcc

aat

ggt

caa

aaa

cgc

gtt

tct

ttt

agt

ttt

ccg

cct

1296

Phe

Thr

Leu

Ala 420

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg 42 5

Val

Ser

Phe

Ser

Phe 430

Pro

Pro

gaa

ttg

gag

aaa

aaa

tta

ggt

atc

aat

atg

eta

gta

aaa

tta

ata

aca

1344

Glu

Leu

Glu 435

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile 440

Asn

Met

Leu

Val

Lys 445

Leu

Ile

Thr

cca

gat

gga

aaa

gta

ttg

gag

aaa

gta

tct

ggt

aaa

gta

ttt

gga

gaa

1392

Pro

Asp 450

Gly

Lys

Val

Leu

Glu 455

Lys

Val

Ser

Gly

Lys 460

Val

Phe

Gly

Glu

gga

gta

ggg

aat

att

gca

aac

ttt

gaa

tta

gat

caa

cct

tat

tta

cca

1440

Gly 465

Val

Gly

Asn

Ile

Ala 470

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp 475

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro 480

PL 206 576 B1

gga caa aca

ttt Phe

aag Lys 485

tat Tyr

act Thr

atc Ile

get Ala

tea aaa gat Ser Lys Asp 490

tat Tyr

cca Pro

gaa Glu 495

gta Val

1488

Gly

Gin

Thr

agt

tat

gat

ggt

aca

ttt

aca

gtt

cca

acc tet tta

get

tac

aaa

atg

1536

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr Ser Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

500

505

510

gcc

agt

caa

acg

att

ttc

tat

cct

ttc

cat gca ggg

gat

act

tat

tta

1584

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His Ala Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

515

520

525

aga

gtg

aac

cct

caa

ttt

gca

gtg

cct

aaa gga act

gat

get

tta

gtc

1632

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys Gly Thr

Asp

Ala

Leu

Val

530

535

540

aga

gtg

ttt

gat

gaa

ttt

cat

gga

aat

get tat tta

gaa

aat

aac

tat

1680

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala Tyr Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

545

550

555

560

aaa

gtt

ggt

gaa

atc

aaa

tta

ccg

att

ccg aaa tta

aac

caa

gga

aca

1728

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro Lys Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

565

570

575

acc

aga

acg

gcc

gga

aat

aaa

att

cct

gta acc ttc

atg

gca

aat

get

1776

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val Thr Phe

Met

Ala

Asn

Ala

580

585

590

tat

ttg

gac

aat

caa

teg

act

tat

att

gtg gaa gta

cct

atc

ttg

gaa

1824

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val Glu Val

Pro

Ile

Leu

Glu

595

600

605

aaa

gaa

aat

caa

act

gat

aaa

cca

agt

att eta cca

caa

ttt

aaa

agg

1872

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile Leu Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

610

615

620

aat

aaa

gca

caa

gaa

aac

tea

aaa

ctt

gat gaa aag

gta

gaa

gaa

cca

1920

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp Glu Lys

Val

Glu

Glu

Pro

625

630

635

640

aag

act

agt

gag

aag

gta

gaa

aaa

gaa

aaa ctt tet

gaa

act

ggg

aat

1968

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

val

Glu

Lys

Glu

Lys Leu Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

645

650

655

agt

act

agt

aat

tea

acg

tta

gaa

gaa

gtt cct aca

gtg

gat

cct

gta

2016

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val Pro Thr

Val

Asp

Pro

Val

660

665

670

caa

gaa

aaa

gta

gca

aaa

ttt

get

gaa

agt tat ggg

atg

aag

eta

gaa

2064

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser Tyr Gly

Met

Lys

Leu

Glu

675

680

685

aat

gtc

ttg

ttt

aat

atg

gac

gga

aca

att gaa tta

tat

tta

cca

teg

2112

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile Glu Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

690

695

700

gga

gaa

gtc

att

aaa

aag

aat

atg

gca

gat ttt aca

gga

gaa

gca

cct

2160

PL 206 576 B1

Gly 705

Glu

Val

Ile

Lys

Lys 710

Asn

Met

Ala Asp

Phe 715

Thr Gly

Glu

Ala

Pro 720

caa

gga

aat

ggt

gaa

aat

aaa

cca

tct

gaa

aat

gga

aaa

gta

tct

act

2208

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

725

730

735

gga

aca

gtt

gag

aac

caa

cca

aca

gaa

aat

aaa

cca

gca

gat

tct

tta

2256

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

740

745

750

cca

gag

gca

cca

aac

gaa

aaa

cct

gta

aaa

cca

gaa

aac

tea

acg

gat

2304

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

755

760

765

aat

gga

atg

ttg

aat

cca

gaa

ggg

aat

gtg

ggg

agt

gac

cct

atg

tta

2352

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

770

775

780

gat

tea

gca

tta

gag

gaa

gct

cca

gca

gta

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

2400

Asp

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

785

790

795

800

tta

gaa

aaa

ttt

aca

gct

agt

tac

gga

tta

ggc

tta

gat

agt

gtt

ata

2448

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

805

810

815

ttc

aat

atg

gat

gga

acg

att

gaa

tta

aga

ttg

cca

agt

gga

gaa

gtg

2496

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

820

825

830

ata

aaa

aag

aat

tta

ttg

atc

tea

tagcgtaa

2528

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Leu

Ile

Ser

835

840

<210> 16 <211> 840 <212> PRT <213> S. i

□neumoniae

<400>

16

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

PL 206 576 B1

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

His

225

230

235

240

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

245

250

255

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

260

265

270

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

Leu

275

280

285

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

290

295

300

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

305

310

315

320

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

325

330

335

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

340

345

350

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

355

360

365

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

370

375

380

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

385

390

395

400

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

405

410

415

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

420

425

430

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

435

440

445

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

450

455

460

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

465

470

475

430

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

485

490

495

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

500

505

510

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

515

520

525

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

530

535

540

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

545

550

555

560

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

565

570

575

PL 206 576 B1

Thr Arg Thr Ala 580

Gly Asn

Lys

Ile

Pro 585

Val

Thr Phe Met Ala 590

Asn

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

595

600

605

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

610

615

620

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

625

630

635

640

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

645

650

655

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

val

660

665

670

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

675

680

685

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

690

695

700

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

705

710

715

720

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

725

730

735

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

740

745

750

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

755

760

765

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

770

775

780

Asp

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

785

790

795

800

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

805

810

815

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

820

825

830

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Leu

Ile

Ser

835

840

<210> 17 <211> 27 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 17 cagtagatct gtgcctatgc actaaac 27 <210> 18 <211> 33 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 18 gatctctaga ctactgctat tccttacgct atg 33

PL 206 576 B1 <210> 19 <211> 30 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 19 atcactcgag cattacctgg ataatcctgt <210> 20 <211> 26 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 20 ctgctaagct tatgaaagat ttagat <210> 21 <211> 24 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 21 gatactcgag ctgctattcc ttac <210> 22 <211> 28 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 22 gaatctcgag ttaagctgct gctaattc <210> 23 <211> 32 <212 > DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 23 gacgctcgag cgctatgaaa tcagataaat tc <210> 24 <211> 37

PL 206 576 B1 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 24 gacgctcgag ggcattacct ggataatcct gttcatg 37 <210> 25 <211> 33 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 25 cagtagatct cttcatcatt tattgaaaag agg 33 <210> 26 <211> 40 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 26 ttatttcttc catatggact tgacagaaga gcaaattaag 40 <210> 27 <211> 32 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 27 cgccaagctt cgctatgaaa tcagataaat tc 32 <210> 28 <211> 34 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 28 cgccaagctt ttccacaata taagtcgatt gatt 34 <210> 29 <211> 40 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana

PL 206 576 B1 <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 29 ttatttcttc catatggaag tacctatctt ggaaaaagaa 40 <210> 30 <211> 37 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 30 ttatttcttc catatggtgc ctatgcacta aaccagc 37 <210> 31 <211> 40 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 31 ataagaatgc ggccgcttcc acaatataag tcgattgatt 40 <210> 32 <211> 31 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 32 cagtagatct gtgcttatga actaggtttg c 31 <210> 33 <211> 32 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 33 gatcaagctt gctgctacct ttacttactc tc 32 <210> 34 <211> 26 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

PL 206 576 B1 <22 3> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 34 ctgagatatc cgttatcgtt caaacc 26 <210> 35 <211> 28 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 35 ctgcaagctt ttaaagggga ataatacg 28 <210> 36 <211> 29 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 36 cagtagatct gcagaagcct tcctatctg 29 <210> 37 <211> 33 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 37 tcgccaagct tcgttatcgt tcaaaccatt ggg 33 <210> 38 <211> 45 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 38 ataagaatgc ggccgcctta ctctccttta ataaagccaa tagtt 45 <210> 39 <211> 34 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR

PL 206 576 B1 <400> 39 catgccatgg acattgatag tctcttgaaa cagc <210> 40 <211> 37 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 40 cgccaagctt cttactctcc tttaataaag ccaatag 37 <210> 41 <211> 31 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 41 cgacaagctt aacatggtcg ctagcgttac c 31 <210> 42 <211> 30 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 42 cataccatgg gcctttatga ggcacctaag <210> 43 <211> 34 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 43 cgacaagctt aagtaaatct tcagcctctc tcag 34 <210> 44 <211> 31 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 44 gataccatgg ctagcgacca tgttcaaaga a

PL 206 576 B1 <210> 45 <211> 36 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 45 cgccaagctt atcatccact aacttgactt tatcac 36 <210> 46 <211> 33 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 46 cataccatgg atattcttgc cttcttagct ccg 33 <210> 47 <211> 30 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 47 catgccatgg tgcttatgaa ctaggtttgc 30 <210> 48 <211> 32 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 48 cgccaagctt tagcgttacc aaaaccatta tc 32 <210> 49 <211> 36 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 49 gtattagatc tgttcctatg aacttggtcg tcacca 36 <210> 50

PL 206 576 B1 <211> 28 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 50 cgcctctaga ctactgtata ggagccgg 28 <210> 51 <211> 34 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 51 catgccatgg aaaacatttc aagcctttta cgtg 34 <210> 52 <211> 34 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 52 cgacaagctt ctgtatagga gccggttgac tttc 34 <210> 53 <211> 34 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 53 catgccatgg ttcgtaaaaa taaggcagac caag 34 <210> 54 <211> 30 <212> DNA <213> Sewkencja sztucznie otrzymana <220>

<223> Starter oligonukleotydowy do PCR <400> 54 catgccatgg aagcctattg gaatgggaag 30 <210> 55 <211> 1019 <212> PRT

PL 206 576 B1 <213> S. pneumoniae <400> 55

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

PL 206 576 B1

Asp Glu Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser His Gly Asp His Asn His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

ASp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

PL 206 576 B1

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

ile

Ala

1010

1015

<210>

56

<211>

489

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

56

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Giy

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

PL 206 576 B1

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

485

<210>

57

<211>

509

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

57

Met

Lys

Phe

Ser

Lys

Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala

Gly

Ser

Ala

Val

Ile

Val

1

5

10

15

Ser

Leu

Ser

Leu

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

20

25

30

Asn

Lys

Asp

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

35

40

45

Gin

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Gin

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

Leu

Phe

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

100

105

110

Leu

Lys

Asp

Ala

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

115

120

125

Lys

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

130

135

140

Asp

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

145

150

155

160

Val

Lys

ASp

Asn

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

PL 206 576 B1

165

170

175

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180

185

190

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

195

200

205

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

210

215

220

Ala

Lys

Ala

His

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

230

235

240

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

255

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Glu

Leu

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

290

295

300

Val

Ala

Ile

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

325

330

335

Thr

Gly

Ser

Thr

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

340

345

350

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

Glu

Leu

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

370

375

380

val

Glu

Glu

Thr

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

Asn

Ser

Leu

Ala

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

420

425

430

Ser

His

Glu

Lys

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

435

440

445

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450

455

460

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

465

470

475

480

Ala

Gin

Lys

His

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

485

490

495

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

500

505

<210> 58 <211> 1057 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 58

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

Leu

Glu

Glu

1

5

10

15

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

20

25

30

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

35

40

45

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

PL 206 576 B1

55 60

Ser

Ile Val Val Asn Lys

Glu Lys Asn Ala

Ile

ile

Tyr

Pro

His

Gly

65

70

75

80

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

85

90

95

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

100

105

110

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

115

120

125

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

130

135

140

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

145

150

155

160

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

165

170

175

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

180

185

190

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

195

200

205

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

210

215

220

ASp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

225

230

235

240

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

245

250

255

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

260

265

270

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

275

280

285

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

290

295

300

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

305

310

315

320

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

325

330

335

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

340

345

350

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

355

360

365

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

370

375

380

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

val

ASp

Pro

Val

Gin

Glu

385

390

395

400

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

405

410

415

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

420

425

430

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

435

440

445

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

450

455

460

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

465

470

475

480

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

485

490

495

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

500

505

510

PL 206 576 B1

Ala Leu Glu Glu Ala

Pro

Ala Val Asp 520

Pro

Val

Gin Glu Lys 525

Leu

Glu

515

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

530

535

540

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

545

550

555

560

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

Lys

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

565

570

575

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

580

585

590

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

595

600

605

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

610

615

620

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

625

630

635

640

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

645

650

655

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

660

665

670

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

675

680

685

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

690

695

700

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

705

710

715

720

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

725

730

735

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

740

745

750

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

755

760

765

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

770

775

780

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

785

790

795

800

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

805

810

815

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

820

825

830

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

835

840

845

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

850

855

860

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

865

870

875

880

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

885

890

895

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

900

905

910

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

915

920

925

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

930

935

940

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

945

950

955

960

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

PL 206 576 B1

	965	970	975
Thr Glu	Glu Pro Glu Glu	Glu Ser Pro Glu Glu Ser	Glu Glu Pro Gin
	980	985	990
Val Glu	Thr Glu Lys Val	Glu Glu Lys Leu Arg Glu	Ala Glu Asp Leu
	995	1000	1005
Leu Gly	Lys Ile Gin Asp	Pro Ile Ile Lys Ser Asn	Ala Lys Glu Thr
1010	1015 1020
Leu Thr	Gly Leu Lys Asn	Asn Leu Leu Phe Gly Thr	Gin Asp Asn Asn
1025	1030 1035	1040
Thr Ile	Met Ala Glu Ala	Glu Lys Leu Leu Ala Leu	Leu Lys Glu Ser
	1045	1050	1055

Lys <210> 59 <211> 205 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 59

Cys Ala Tyr Ala Leu Asn Gin His Arg Ser Gin Glu Asn Lys Asp Asn
1	5	10	15
Asn Arg Val Ser	Tyr Val	Asp Gly Ser Gin	Ser Ser Gin Lys Ser Glu
20		25	30
Asn Leu Thr Pro	Asp Gin	Val Ser Gin Lys	Glu Gly Ile Gin Ala Glu
35		40	45
Gin Ile Val Ile	Lys Ile	Thr Asp Gin Gly	Tyr Val Thr Ser His Gly
50		55	60
Asp His Tyr His	Tyr Tyr	Asn Gly Lys Val	Pro Tyr Asp Ala Leu Phe
65	70		75 80
Ser Glu Glu Leu	Leu Met	Lys Asp Pro Asn	Tyr Gin Leu Lys Asp Ala
	85	90	95
Asp Ile Val Asn	Glu Val	Lys Gly Gly Tyr	Ile Ile Lys Val Asp Gly
100		105	110
Lys Tyr Tyr Val	Tyr Leu	Lys Asp Ala Ala	His Ala Asp Asn Val Arg
115		120	125
Thr Lys Asp Glu	Ile Asn	Arg Gin Lys Gin	Glu His Val Lys Asp Asn
130		135	140
Glu Lys Val Asn	Ser Asn	Val Ala Val Ala	Arg Ser Gin Gly Arg Tyr
145	150		155 160
Thr Thr Asn Asp	Gly Tyr	Val Phe Asn Pro	Ala Asp Ile Ile Glu Asp
	165	170	175
Thr Gly Asn Ala	Tyr Ile	Val Pro His Gly	Gly His Tyr His Tyr Ile
180		185	190
Pro Lys Ser Asp	Leu Ser	Ala Ser Glu Leu	Ala Ala Ala
195		200	205
<210> 60
<211> 821
<212> PRT
<213> S. pneumoniae
<400> 60
Cys Ala Tyr Glu	Leu Gly	Leu His Gin Ala	Gin Thr Val Lys Glu Asn
1	5	10	15
Asn Arg Val Ser	Tyr Ile	Asp Gly Lys Gin	Ala Thr Gin Lys Thr Glu
20		25	30

PL 206 576 B1

Asn Leu Thr

Pro Asp Glu Val

Ser Lys Arg Glu Gly Ile Asn Ala Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ser

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

Gin

His

Arg

130

135

140

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

Ala

Arg

Ser

145

150

155

160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

165

170

175

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

180

185

190

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

195

200

205

Ala

Glu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

Leu

Arg

Thr

210

215

220

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

Trp

Val

Pro

225

230

235

240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn

Ser

245

250

255

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

290

295

300

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

305

310

315

320

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

325

330

335

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

340

345

350

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

355

360

365

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

370

375

380

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

385

390

395

400

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

405

410

415

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

420

425

430

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

435

440

445

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

450

455

460

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

465

470

475

480

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

PL 206 576 B1

	485	490	495
Leu	Ala Pro Ile Arg 500	His Pro Glu Arg Leu Gly Lys 505	Pro Asn Ala Gin 510
Ile	Thr Tyr Thr Asp 515	Asp Glu Ile Gin Val Ala Lys 520	Leu Ala Gly Lys 525
Tyr	Thr Thr Glu Asp 530	Gly Tyr Ile Phe Asp Pro Arg 535 540	Asp Ile Thr Ser
Asp 545	Glu Gly Asp Ala	Tyr Val Thr Pro His Met Thr 550 555	His Ser His Trp 560
Ile	Lys Lys Asp Ser 565	Leu Ser Glu Ala Glu Arg Ala 570	Ala Ala Gin Ala 575
Tyr	Ala Lys Glu Lys 580	Gly Leu Thr Pro Pro Ser Thr 585	Asp His Gin Asp 590
Ser	Gly Asn Thr Glu 595	Ala Lys Gly Ala Glu Ala Ile 600	Tyr Asn Arg Val 605
Lys	Ala Ala Lys Lys 610	Val Pro Leu Asp Arg Met Pro 615 620	Tyr Asn Leu Gin
Tyr 625	Thr Val Glu Val	Lys Asn Gly Ser Leu Ile Ile 630 635	Pro His Tyr Asp 640
His	Tyr His Asn Ile 645	Lys Phe Glu Trp Phe Asp Glu 650	Gly Leu Tyr Glu 655
Ala	Pro Lys Gly Tyr 660	Thr Leu Glu Asp Leu Leu Ala 665	Thr Val Lys Tyr 670
Tyr	Val Glu His Pro 675	Asn Glu Arg Pro His Ser Asp 680	Asn Gly Phe Gly 685
Asn	Ala Ser Asp His 690	Val Gin Arg Asn Lys Asn Gly 695 700	Gin Ala Asp Thr
Asn 705	Gin Thr Glu Lys	Pro Ser Glu Glu Lys Pro Gin 710 715	Thr Glu Lys Pro 720
Glu	Glu Glu Thr Pro 725	Arg Glu Glu Lys Pro Gin Ser 730	Glu Lys Pro Glu 735
Ser	Pro Lys Pro Thr 740	Glu Glu Pro Glu Glu Glu Ser 745	Pro Glu Glu Ser 750
Glu	Glu Pro Gin Val 755	Glu Thr Glu Lys Val Glu Glu 760	Lys Leu Arg Glu 765
Ala	Glu Asp Leu Leu 770	Gly Lys Ile Gin Asp Pro Ile 775 780	Ile Lys Ser Asn
Ala 785	Lys Glu Thr Leu	Thr Gly Leu Lys Asn Asn Leu 790 795	Leu Phe Gly Thr 800
Gin Leu	Asp Asn Asn Thr Ile Met Ala Glu Ala Glu Lys 805 810 Lys Glu Ser Lys 820 <210> 61 <211> 334 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 61	Leu Leu Ala Leu 815
Cys 1	Ala Tyr Glu Leu 5	Gly Leu His Gin Ala Gin Thr 10	Val Lys Glu Asn 15
Asn	Arg Val Ser Tyr 20	Ile Asp Gly Lys Gin Ala Thr 25	Gin Lys Thr Glu 30
Asn	Leu Thr Pro Asp 35	Glu Val Ser Lys Arg Glu Gly 40	Ile Asn Ala Glu 45
Gin	Ile Val Ile Lys	Ile Thr Asp Gin Gly Tyr Val	Thr Ser His Gly

PL 206 576 B1

55 60

Asp	His Tyr His Tyr Tyr Asn Gly Lys	Val	Pro Tyr	Asp	Ala	Ile	Ile
65	70		75				80
Ser	Glu Glu Leu Leu Met Lys Asp Pro	Asn	Tyr Gin	Leu	Lys	Asp	Ser
	85	90				95
Asp	Ile Val Asn Glu Ile Lys Gly Gly	Tyr	Val Ile	Lys	Val	Asn	Gly
	100 105				110
Lys	Tyr Tyr Val Tyr Leu Lys Asp Ala	Ala	His Ala	Asp	Asn	Val	Arg
	115 120			125
Thr	Lys Glu Glu Ile Asn Arg Gin Lys	Gin	Glu His	Ser	Gin	His	Arg
	130 135		140
Glu	Gly Gly Thr Ser Ala Asn Asp Gly	Ala	Val Ala	Phe	Ala	Arg	Ser
145	150		155				160
Gin	Gly Arg Tyr Thr Thr Asp Asp Gly	Tyr	Ile Phe	Asn	Ala	Ser	Asp
	165	170				175
ile	Ile Glu Asp Thr Gly Asp Ala Tyr	Ile	Val Pro	His	Gly	Asp	His
	180 185				190
Tyr	His Tyr Ile Pro Lys Asn Glu Leu	Ser	Ala Ser	Glu	Leu	Ala	Ala
	195 200			205
Ala	Glu Ala Phe Leu Ser Gly Arg Glu	Asn	Leu Ser	Asn	Leu	Arg	Thr
	210 215		220
Tyr	Arg Arg Gin Asn Ser Asp Asn Thr	Pro	Arg Thr	Asn	Trp	Val	Pro
225	230		235				240
Ser	Val Ser Asn Pro Gly Thr Thr Asn	Thr	Asn Thr	Ser	Asn	Asn	Ser
	245	250				255
Asn	Thr Asn Ser Gin Ala Ser Gin Ser	Asn	Asp Ile	Asp	Ser	Leu	Leu
	260 265				270
Lys	Gin Leu Tyr Lys Leu Pro Leu Ser	Gin	Arg His	Val	Glu	Ser	Asp
	275 280			285
Gly	Leu Ile Phe Asp Pro Ala Gin Ile	Thr	Ser Arg	Thr	Ala	Arg	Gly
	290 295		300
Val	Ala Val Pro His Gly Asn His Tyr	His	Phe Ile	Pro	Tyr	Glu	Gin
305	310		315				320
Met	Ser Glu Leu Glu Lys Arg Ile Ala	Arg	Ile Ile	Pro	Leu
	325	330
	<210> 62
	<211> 487
	<212> PRT
	<213> Ξ. pneumoniae
	<400> 62
Arg	Tyr Arg Ser Asn His Trp Val Pro	Asp	Ser Arg	Pro	Glu	Glu	Pro
1	5	10				15
Ser	Pro Gin Pro Thr Pro Glu Pro Ser	Pro	Ser Pro	Gin	Pro	Ala	Pro
	20 25				30
Asn	Pro Gin Pro Ala Pro Ser Asn Pro	Ile	Asp Glu	Lys	Leu	Val	Lys
	35 40			45
Glu	Ala Val Arg Lys Val Gly Asp Gly	Tyr	Val Phe	Glu	Glu	Asn	Gly
	50 55		60
Val	Ser Arg Tyr Ile Pro Ala Lys Asn	Leu	Ser Ala	Glu	Thr	Ala	Ala
65	70		75				80
Gly	Ile Asp Ser Lys Leu Ala Lys Gin	Glu	Ser Leu	Ser	His	Lys	Leu
	85	90				95
Gly	Ala Lys Lys Thr Asp Leu Pro Ser	Ser	Asp Arg	Glu	Phe	Tyr	Asn
	100 105				110
Lys	Ala Tyr Asp Leu Leu Ala Arg Ile	His	Gin Asp	Leu	Leu	Asp	Asn

PL 206 576 B1

115	120	125
Lys Gly Arg Gin Val	Asp Phe Glu Ala	Leu Asp Asn Leu Leu Glu Arg
130	135	140
Leu Lys Asp Val Ser	Ser Asp Lys Val	Lys Leu Val Asp Asp Ile Leu
145	150	155 160
Ala Phe Leu Ala Pro	Ile Arg His Pro	Glu Arg Leu Gly Lys Pro Asn
165		170 175
Ala Gin Ile Thr Tyr	Thr Asp Asp Glu	Ile Gin Val Ala Lys Leu Ala
180	185	190
Gly Lys Tyr Thr Thr	Glu Asp Gly Tyr	Ile Phe Asp Pro Arg Asp Ile
195	200	205
Thr Ser Asp Glu Gly	Asp Ala Tyr Val	Thr Pro His Met Thr His Ser
210	215	220
His Trp Ile Lys Lys	Asp Ser Leu Ser	Glu Ala Glu Arg Ala Ala Ala
225	230	235 240
Gin Ala Tyr Ala Lys	Glu Lys Gly Leu	Thr Pro Pro Ser Thr Asp His
245		250 255
Gin Asp Ser Gly Asn	Thr Glu Ala Lys	Gly Ala Glu Ala Ile Tyr Asn
260	265	270
Arg Val Lys Ala Ala	Lys Lys Val Pro	Leu Asp Arg Met Pro Tyr Asn
275	280	285
Leu Gin Tyr Thr Val	Glu Val Lys Asn	Gly Ser Leu Ile Ile Pro His
290	295	300
Tyr Asp His Tyr His	Asn Ile Lys Phe	Glu Trp Phe Asp Glu Gly Leu
305	310	315 320
Tyr Glu Ala Pro Lys	Gly Tyr Thr Leu	Glu Asp Leu Leu Ala Thr Val
325		330 335
Lys Tyr Tyr Val Glu	His Pro Asn Glu	Arg Pro His Ser Asp Asn Gly
340	345	350
Phe Gly Asn Ala Ser	Asp His Val Gin	Arg Asn Lys Asn Gly Gin Ala
355	360	365
Asp Thr Asn Gin Thr	Glu Lys Pro Ser	Glu Glu Lys Pro Gin Thr Glu
370	375	380
Lys Pro Glu Glu Glu	Thr Pro Arg Glu	Glu Lys Pro Gin Ser Glu Lys
385	390	395 400
Pro Glu Ser Pro Lys	Pro Thr Glu Glu	Pro Glu Glu Glu Ser Pro Glu
405		410 415
Glu Ser Glu Glu Pro	Gin Val Glu Thr	Glu Lys Val Glu Glu Lys Leu
420	425	430
Arg Glu Ala Glu Asp	Leu Leu Gly Lys	Ile Gin Asp Pro Ile Ile Lys
435	440	445
Ser Asn Ala Lys Glu	Thr Leu Thr Gly	Leu Lys Asn Asn Leu Leu Phe
450	455	460
Gly Thr Gin Asp Asn	Asn Thr Ile Met	Ala Glu Ala Glu Lys Leu Leu
465	470	475 480
Ala Leu Leu Lys Glu	Ser Lys
485
<210> 63
<211> 613
<212> PRT
<213> S. pneumoniae
<400> 63
Ala Glu Ala Phe Leu	Ser Gly Arg Glu	Asn Leu Ser Asn Leu Arg Thr
1 5		10 15
Tyr Arg Arg Gin Asn	Ser Asp Asn Thr	Pro Arg Thr Asn Trp Val Pro

PL 206 576 B1

25 30

Ser

Val

Ser 35

Asn

Pro Gly

Thr

Thr Asn Thr Asn Thr Ser Asn Asn

Ser

40

45

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

50

55

60

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

65

70

75

80

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

85

90

95

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

100

105

110

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

115

120

125

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

130

135

140

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

145

150

155

160

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

165

170

175

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

180

185

190

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

195

200

205

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

210

215

220

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

225

230

235

240

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

245

250

255

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

260

265

270

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

275

280

285

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

290

295

300

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

305

310

315

320

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

325

330

335

Asp

Glu

Gly

ASp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

340

345

350

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

355

360

365

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

370

375

380

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

385

390

395

400

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

405

410

415

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

420

425

430

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

435

440

445

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

450

455

460

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

465

470

475

480

PL 206 576 B1

Asn Ala

Ser

Asp His 485

Val

Gin

Arg Asn Lys Asn Gly Gin Ala Asp Thr

490

495

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

500

505

510

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

515

520

525

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

530

535

540

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

545

550

555

560

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

565

570

575

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

580

585

590

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

595

600

605

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

610

<210>

64

<211>

568

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

64

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

Leu

Glu

Glu

1

5

10

15

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

20

25

30

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

35

40

45

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

50

55

60

Ser

ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

65

70

75

80

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

85

90

95

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

100

105

110

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

115

120

125

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

130

135

140

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

145

150

155

160

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

165

170

175

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

180

185

190

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

ASp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

195

200

205

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

210

215

220

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

225

230

235

240

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

245

250

255

PL 206 576 B1

Asn

Pro Gin

Phe 260

Ala

Val

Pro

Lys

Gly Thr Asp Ala Leu Val

Arg

Val

265

270

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

275

280

285

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

290

295

300

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

305

310

315

320

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

325

330

335

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

340

345

350

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

355

360

365

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

370

375

380

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

385

390

395

400

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

405

410

415

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

420

425

430

val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

435

440

445

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

450

455

460

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

465

470

475

480

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

485

490

495

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

500

505

510

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

515

520

525

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

530

535

540

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

545

550

555

560

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

565

<210> 65 <211> 329 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 65

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

Leu

Glu

Glu

1

5

10

15

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

20

25

30

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

35

40

45

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

50

55

60

Ser

ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

65

70

75

80

PL 206 576 B1

Asp His

His

His

Ala 85

ASp

Pro

Ile Asp Glu His Lys 90

Pro

Val

Gly 95

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

100

105

110

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

115

120

125

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

130

135

140

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

145

150

155

160

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

165

170

175

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

180

185

190

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

195

200

205

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

210

215

220

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

225

230

235

240

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

245

250

255

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

260

265

270

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

275

280

285

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

290

295

300

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

305

310

315

320

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

325

<210> 66 <211> 240 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 66

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

1

5

10

15

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

20

25

30

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

35

40

45

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

50

55

60

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

65

70

75

80

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

85

90

95

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

100

105

110

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

115

120

125

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

130

135

140

PL 206 576 B1

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

145

150

155

160

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

165

170

175

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

180

185

190

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

195

200

205

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

210

215

220

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

225

230

235

240

<210> 67 <211> 555 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 67

Asp 1

Ile

Asp Ser

Leu Leu Lys Gin Leu Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser 15

Gin

5

10

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

20

25

30

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

35

40

45

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

50

55

60

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

65

70

75

80

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

85

90

95

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

100

105

110

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

115

120

125

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

130

135

140

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

145

150

155

160

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

165

170

175

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

180

185

190

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

195

200

205

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

210

215

220

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

225

230

235

240

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

245

250

255

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

260

265

270

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

275

280

285

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

290

295

300

PL 206 576 B1

Arg 305	Ala	Ala	Ala	Gin	Ala 310	Tyr
Ser	Thr	Asp	His	Gin 325	Asp	Ser
Ala	Ile	Tyr	Asn 340	Arg	Val	Lys
Met	Pro	Tyr 355	Asn	Leu	Gin	Tyr
Ile	Ile 370	Pro	His	Tyr	Asp	His 375
Asp 385	Glu	Gly	Leu	Tyr	Glu 390	Ala
Leu	Ala	Thr	Val	Lys 405	Tyr	Tyr
Ser	Asp	Asn	Gly 420	Phe	Gly	Asn
Asn	Gly	Gin 435	Ala	Asp	Thr	Asn
Pro	Gin 450	Thr	Glu	Lys	Pro	Glu 455
Gin 465	Ser	Glu	Lys	Pro	Glu 470	Ser
Glu	Ser	Pro	Glu	Glu 485	Ser	Glu
Glu	Glu	Lys	Leu 500	Arg	Glu	Ala
Pro	Ile	Ile 515	Lys	Ser	Asn	Ala
Asn	Leu 530	Leu	Phe	Gly	Thr	Gin 535
Glu	Lys	Leu	Leu	Ala	Leu	Leu

Ala	Lys	Glu	Lys 315	Gly	Leu	Thr	Pro
Gly	Asn	Thr 330	Glu	Ala	Lys	Gly	Ala 335
Ala	Ala 345	Lys	Lys	Val	Pro	Leu 350	Asp
Thr 360	Val	Glu	Val	Lys	Asn 365	Gly	Ser
Tyr	His	Asn	Ile	Lys 380	Phe	Glu	Trp
Pro	Lys	Gly	Tyr 395	Thr	Leu	Glu	Asp
Val	Glu	His 410	Pro	Asn	Glu	Arg	Pro 415
Ala	Ser 425	Asp	His	Val	Gin	Arg 430	Asn
Gin 440	Thr	Glu	Lys	Pro	Ser 445	Glu	Glu
Glu	Glu	Thr	Pro	Arg 460	Glu	Glu	Lys
Pro	Lys	Pro	Thr 475	Glu	Glu	Pro	Glu
Glu	Pro	Gin 490	Val	Glu	Thr	Glu	Lys 495
Glu	Asp 505	Leu	Leu	Gly	Lys	Ile 510	Gin
Lys 520	Glu	Thr	Leu	Thr	Gly 525	Leu	Lys
Asp Lys	Asn Glu	Asn Ser	Thr Lys 555	Ile 540	Met	Ala	Glu

Pro

320

Glu

Arg

Leu

Phe

Leu

400

His

Lys

Lys

Pro

Glu

480

Val

Asp

Asn

Ala

545 550 <210> 68 <211> 428 <212> PRT <213> S. pneumoniae

	<400>	68
Asp 1	Ile	Asp	Ser	Leu 5	Leu	Lys
Arg	His	Val	Glu 20	Ser	Asp	Gly
Ser	Arg	Thr 35	Ala	Arg	Gly	Val
Phe	Ile 50	Pro	Tyr	Glu	Gin	Met 55
Ile 65	Ile	Pro	Leu	Arg	Tyr 70	Arg
Pro	Glu	Glu	Pro	Ser 85	Pro	Gin
Gin	Pro	Ala	Pro 100	Asn	Pro	Gin
Lys	Leu	Val 115	Lys	Glu	Ala	Val
Glu	Glu 130	Asn	Gly	Val	Ser	Arg 135

Gin Leu Tyr	Lys	Leu	Pro	Leu	Ser 15
	10
Leu	Ile	Phe	Asp	Pro	Ala	Gin	Ile
	25					30
Ala	Val	Pro	His	Gly	Asn	His	Tyr

45

Ser Glu Leu Glu Lys Arg Ile Ala 60

Ser	Asn	His	Trp 75	Val	Pro	Asp	Ser
Pro	Thr	Pro 90	Glu	Pro	Ser	Pro	Ser 95
Pro	Ala 105	Pro	Ser	Asn	Pro	Ile 110	Asp
Arg 120	Lys	Val	Gly	Asp	Gly 125	Tyr	Val
Tyr	Ile	Pro	Ala	Lys 140	Asn	Leu	Ser

Gin

Thr

His

Arg

Arg

Pro

Glu

Phe

Ala

PL 206 576 B1

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

145

150

155

160

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

165

170

175

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

180

185

190

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

195

200

205

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

210

215

220

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

225

230

235

240

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

245

250

255

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

260

265

270

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

275

280

285

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

290

295

300

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

305

310

315

320

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

325

330

335

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

340

345

350

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

355

360

365

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

370

375

380

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

385

390

395

400

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

405

410

415

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

420 425 <210> 69 <211> 121 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 69

Gly Leu Tyr 1

Glu Ala 5

Pro

Lys

Gly

Tyr Thr Leu Glu Asp Leu Leu Ala

10

15

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

20

25

30

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

35

40

45

Gin

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

50

55

60

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

65

70

75

80

Glu

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

85

90

95

Pro

Glu

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

100

105

110

PL 206 576 B1

Lys Leu Arg Glu Ala Glu Asp Leu Leu 115 120 <210> 70 <211> 132 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 70

Ala Ser

Asp

His Val

Gin Arg Asn Lys Asn Gly Gin Ala Asp Thr Asn

1

5

10

15

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

20

25

30

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

Ser

35

40

45

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

Glu

50

55

60

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

Ala

65

70

75

80

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

85

90

95

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

Gin

100

105

110

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

115

120

125

Lys

Glu

Ser

Lys

130

<210> 71 <211> 226 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 71

Asp 1

Ile

Asp

Ser

Leu 5

Leu

Lys

Gin

Leu

Tyr 10

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser 15

Gin

Arg

His

Val

Glu 20

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile 25

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin 30

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr 35

Ala

Arg

Gly

Val

Ala 40

Val

Pro

His

Gly

Asn 45

His

Tyr

His

Phe

Ile 50

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met 55

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys 60

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile 65

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr 70

Arg

Ser

Asn

His

Trp 75

Val

Pro

Asp

Ser

Arg 80

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser 85

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro 90

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser 95

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro 100

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala 105

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile 110

Asp

Glu

Lys

Leu

Val 115

Lys

Glu

Ala

Val

Arg 120

Lys

Val

Gly

Asp

Gly 125

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu 130

Asn

Gly

Val

Ser

Arg 135

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys 140

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu 145

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile 150

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala 155

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu 160

Ser

His

Lys

Leu

Gly 165

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp 170

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp 175

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

PL 206 576 B1

	180	185	190
Leu	Leu Asp Asn Lys Gly Arg Gin 195 200	Val Asp Phe Glu Ala 205	Leu Asp Asn
Leu Asp 225	Leu Glu Arg Leu Lys Asp Val 210 215 Asp <210> 72 <211> 203 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 72	Ser Ser Asp Lys Val 220	Lys Leu Val
Asp 1	Ile Leu Ala Phe Leu Ala Pro 5	Ile Arg His Pro Glu 10	Arg Leu Gly 15
Lys	Pro Asn Ala Gin Ile Thr Tyr 20	Thr Asp Asp Glu Ile 25	Gin Val Ala 30
Lys	Leu Ala Gly Lys Tyr Thr Thr 35 40	Glu Asp Gly Tyr Ile 45	Phe Asp Pro
Arg	Asp Ile Thr Ser Asp Glu Gly 50 55	Asp Ala Tyr Val Thr 60	Pro His Met
Thr 65	His Ser His Trp Ile Lys Lys 70	Asp Ser Leu Ser Glu 75	Ala Glu Arg 80
Ala	Ala Ala Gin Ala Tyr Ala Lys 85	Glu Lys Gly Leu Thr 90	Pro Pro Ser 95
Thr	Asp His Gin Asp Ser Gly Asn 100	Thr Glu Ala Lys Gly 105	Ala Glu Ala 110
Ile	Tyr Asn Arg Val Lys Ala Ala 115 120	Lys Lys Val Pro Leu 125	Asp Arg Met
Pro	Tyr Asn Leu Gin Tyr Thr Val 130 135	Glu Val Lys Asn Gly 140	Ser Leu Ile
Ile 145	Pro His Tyr Asp His Tyr His 150	Asn Ile Lys Phe Glu 155	Trp Phe Asp 160
Glu	Gly Leu Tyr Glu Ala Pro Lys 165	Gly Tyr Thr Leu Glu 170	Asp Leu Leu 175
Ala Asp	Thr Val Lys Tyr Tyr Val Glu 180 Asn Gly Phe Gly Asn Ala Ser 195 200 <210> 73 <211> 819 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 73	His Pro Asn Glu Arg 185 Asp His Val	Pro His Ser 190
Cys 1	Ser Tyr Glu Leu Gly Arg His 5	Gin Ala Gly Gin Val 10	Lys Lys Glu 15
Ser	Asn Arg Val Ser Tyr Ile Asp 20	Gly Asp Gin Ala Gly 25	Gin Lys Ala 30
Glu	Asn Leu Thr Pro Asp Glu Val 35 40	Ser Lys Arg Glu Gly 45	Ile Asn Ala
Glu	Gin Ile Val Ile Lys Ile Thr 50 55	Asp Gin Gly Tyr Val 60	Thr Ser His
Gly 65	Asp His Tyr His Tyr Tyr Asn 70	Gly Lys Val Pro Tyr 75	Asp Ala Ile 80

PL 206 576 B1

Ile

Ser

Glu Glu

Leu Leu Met Lys Asp Pro Asn Tyr Gin Leu Lys Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly

145

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

180

185

190

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Glu

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

370

375

380

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

PL 206 576 B1

530 535 540

His

Trp

ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

675

680

685

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

690

695

700

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

705

710

715

720

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

725

730

735

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

Asn

740

745

750

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

755

760

765

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

770

775

780

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

785

790

795

800

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

Ala

805

810

815

Pro

Ile

Gin

<210>

74

<211>

568

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

74

Glu

Asn Ile

Ser

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

1

5

10

15

Glu

Arg His

Val

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

20

25

30

Thr

Ser Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

35

40

45

His

Phe Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

50

55

60

Arg

Ile Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

65

70

75

80

Arg

Pro Glu

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

85

90

95

Leu

Gin Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

PL 206 576 B1

100

105

110

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

115

120

125

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

130

135

140

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

145

150

155

160

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

165

170

175

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

180

185

190

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

195

200

205

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

210

215

220

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

225

230

235

240

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

245

250

255

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

275

280

285

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

290

295

300

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

305

310

315

320

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

325

330

335

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

340

345

350

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

355

360

365

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

370

375

380

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

385

390

395

400

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

405

410

415

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

435

440

445

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

450

455

460

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

465

470

475

480

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

485

490

495

Pro

Gin

Val

Glu

Asn

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

500

505

510

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

515

520

525

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

530

535

540

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

545

550

555

560

PL 206 576 B1

Glu Ser Gin Pro Ala Pro Ile Gin 565 <210> 75 <211> 140 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 75

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

1

5

10

15

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

20

25

30

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

35

40

45

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

50

55

60

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

Asn

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

65

70

75

80

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

85

90

95

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

100

105

110

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

115

120

125

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

130

135

140

<210> 76 <211> 3171 <212> DNA <213> S. pneumoniae <400:

gacttgacag cataatggat atgaaagatt gtcaaacgtg gatcaccatc agtaactatg tatactggag caaaacttta gagaaaaaat gagaaagtat gatcaacctt gaagtaagtt caaacgattt gcagtgccta tatttagaaa ggaacaacca gacaatcaat aaaccaagta gaaaaggtag gggaatagta aaagtagcaa gacggaacaa tttacaggag aagagcaaat tagattcttt tagataaaaa aaagtattgt atgcagatcc aactgtttaa aagaattaac ctctagccaa taggtatcaa ctggtaaagt atttaccagg atgatggtac tctatccttt aaggaactga ataactataa gaacggccgg cgacttatat ttctaccaca aagaaccaaa ctagtaattc aatttgctga ttgaattata aagcacctca taaggctgcg gtcatctcat aatcgaagaa cgtgaataaa gattgatgaa acccgaagaa gaatgttgtt tggtcaaaaa tatgctagta atttggagaa acaaacattt atttacagtt ccatgcaggg tgctttagtc agttggtgaa aaataaaatt tgtggaagta atttaaaagg gactagtgag aacgttagaa aagttatggg tttaccatca aggaaatggt caaaaacatt gaacaggatt aaaattgctg gaaaaaaatg cataaaccgg ggagttgcta aatttgttaa cgcgtttctt aaattaataa ggagtaggga aagtatacta ccaacctctt gatacttatt agagtgtttg atcaaattac cctgtaacct cctatcttgg aataaagcac aaggtagaaa gaagttccta atgaagctag ggagaagtca gaaaataaac tagaggaagt atccaggtaa gcattatgaa cgattattta ttggaattgg aaaaagaagg aaaatagtac ttagttttcc caccagatgg atattgcaaa tcgcttcaaa tagcttacaa taagagtgaa atgaatttca cgattccgaa tcatggcaaa aaaaagaaaa aagaaaactc aagaaaaact cagtggatcc aaaatgtctt ttaaaaagaa catctgaaaa taaaactagt tgccaaagaa aoaatatggt tccgcatgga tcattctcac gaataaagtt gtttaataat gcctgaattg aaaagtattg ctttgaatta agattatcca aatggccagt ccctcaattt tggaaatgct attaaaccaa tgcttatttg tcaaactgat aaaacttgat ttctgaaact tgtacaagaa gtttaatatg tatggcagat tggaaaagta

120

180

240

300

360

420

480

540

600

660

720

780

840

900

960

1020

1080

1140

1200

1260

1320

1380

PL 206 576 B1 tctactggaa cagttgagaa ccaaccaaca gaaaataaac cagcagattc tttaccagag 1440 gcaccaaacg aaaaacctgt aaaaccagaa aactcaacgg ataatggaat gttgaatcca 1500 gaagggaatg tggggagtga ccctatgtta gatccagcat tagaggaagc tccagcagta 1560 gatcctgtac aagaaaaatt agaaaaattt acagctagtt acggattagg cttagatagt 1620 gttatattca atatggatgg aacgattgaa ttaagattgc caagtggaga agtgataaaa 1680 aagaatttat ctgatttcat agcgaagctt cgttatcgtt caaaccattg ggtaccagat 1740 tcaagaccag aagaaccaag tccacaaccg actccagaac ctagtccaag tccgcaacct 1800 gcaccaaatc ctcaaccagc tccaagcaat ccaattgatg agaaattggt caaagaagct 1860 gttcgaaaag taggcgatgg ttatgtcttt gaggagaatg gagtttctcg ttatatccca 1920 gccaagaatc tttcagcaga aacagcagca ggcattgata gcaaactggc caagcaggaa 1980 agtttatctc ataagctagg agctaagaaa actgacctcc catctagtga tcgagaattt 2040 tacaataagg cttatgactt actagcaaga attcaccaag atttacttga taataaaggt 2100 cgacaagttg attttgaggc tttggataac ctgttggaac gactcaagga tgtctcaagt 2160 gataaagtca agttagtgga tgatattctt gccttcttag ctccgattcg tcatccagaa 2220 cgtttaggaa aaccaaatgc gcaaattacc tacactgatg atgagattca agtagccaag 2280 ttggcaggca agtacacaac agaagacggt tatatctttg atcctcgtga tataaccagt 2340 gatgaggggg atgcctatgt aactccacat atgacccata gccactggat taaaaaagat 2400 agtttgtctg aagctgagag agcggcagcc caggcttatg ctaaagagaa aggtttgacc 2460 cctccttcga cagaccatca ggattcagga aatactgagg caaaaggagc agaagctatc 2520 tacaaccgcg tgaaagcagc taagaaggtg ccacttgatc gtatgcctta caatcttcaa 2580 tatactgtag aagtcaaaaa cggtagttta atcatacctc attatgacca ttaccataac 2640 atcaaatttg agtggtttga cgaaggcctt tatgaggcac ctaaggggta tactcttgag 2700 gatcttttgg cgactgtcaa gtactatgtc gaacatccaa acgaacgtcc gcattcagat 2760 aatggttttg gtaacgctag cgaccatgtt caaagaaaca aaaatggtca agctgatacc 2820 aatcaaacgg aaaaaccaag cgaggagaaa cctcagacag aaaaacctga ggaagaaacc 2880 cctcgagaag agaaaccaca aagcgagaaa ccagagtctc caaaaccaac agaggaacca 2940 gaagaagaat caccagagga atcagaagaa cctcaggtcg agactgaaaa ggttgaagaa 3000 aaactgagag aggctgaaga tttacttgga aaaatccagg atccaattat caagtccaat 3060 gccaaagaga ctctcacagg attaaaaaat aatttactat ttggcaccca ggacaacaat 3120 actattatgg cagaagctga aaaactattg gctttattaa aggagagtaa g 3171 <210> 77 <211> 473 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 77

Glu 1

Ala Tyr

Trp Asn Gly Lys Gin Gly Ser Arg

Pro

Ser

Ser

Ser 15

Ser

5

10

Ser

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

20

25

30

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

35

40

45

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

50

55

60

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

65

70

75

80

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

85

90

95

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

100

105

110

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

115

120

125

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

Pro

Ala

130

135

140

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

145

150

155

160

PL 206 576 B1

Lys Glu Ala Val Arg Lys Val Gly Asp Gly	Tyr	Val	Phe	Glu	Glu 175	Asn
	165	170
Gly Val Ser	Arg Tyr	Ile Pro Ala Lys Asp	Leu	Ser	Ala	Glu	Thr	Ala
	180	185				190
Ala Gly Ile	Asp Ser	Lys Leu Ala Lys Gin	Glu	Ser	Leu	Ser	His	Lys
195		200			205
Leu Gly Ala	Lys Lys	Thr Asp Leu Pro Ser	Ser	Asp	Arg	Glu	Phe	Tyr
210		215		220
Asn Lys Ala	Tyr Asp	Leu Leu Ala Arg Ile	His	Gin	Asp	Leu	Leu	Asp
225		230	235					240
Asn Lys Gly	Arg Gin	Val Asp Phe Glu Val	Leu	Asp	Asn	Leu	Leu	Glu
	245	250					255
Arg Leu Lys	Asp Val	Ser Ser Asp Lys Val	Lys	Leu	Val	Asp	Asp	Ile
	260	265				270
Leu Ala Phe	Leu Ala	Pro Ile Arg His Pro	Glu	Arg	Leu	Gly	Lys	Pro
275		280			285
Asn Ala Gin	Ile Thr	Tyr Thr Asp Asp Glu	Ile	Gin	Val	Ala	Lys	Leu
290		295		300
Ala Gly Lys	Tyr Thr	Thr Glu Asp Gly Tyr	Ile	Phe	Asp	Pro	Arg	Asp
305		310	315					320
Ile Thr Ser	Asp Glu	Gly Asp Ala Tyr Val	Thr	Pro	His	Met	Thr	His
	325	330					335
Ser His Trp	Ile Lys	Lys Asp Ser Leu Ser	Glu	Ala	Glu	Arg	Ala	Ala
	340	345				350
Ala Gin Ala	Tyr Ala	Lys Glu Lys Gly Leu	Thr	Pro	Pro	Ser	Thr	Asp
355		360			365
His Gin Asp	Ser Gly	Asn Thr Glu Ala Lys	Gly	Ala	Glu	Ala	Ile	Tyr
370		375		380
Asn Arg val	Lys Ala	Ala Lys Lys Val Pro	Leu	Asp	Arg	Met	Pro	Tyr
385		390	395					400
Asn Leu Gin	Tyr Thr	Val Glu Val Lys Asn	Gly	Ser	Leu	Ile	Ile	Pro
	405	410					415
His Tyr Asp	His Tyr	His Asn Ile Lys Phe	Glu	Trp	Phe	Asp	Glu	Gly
	420	425				430
Leu Tyr Glu	Ala Pro	Lys Gly Tyr Ser Leu	Glu	Asp	Leu	Leu	Ala	Thr
435		440			445
Val Lys Tyr	Tyr Val	Glu His Pro Asn Glu	Arg	Pro	His	Ser	Asp	Asn
450		455		460
Gly Phe Gly	Asn Ala	Ser Asp His Val
465		470
<210>	78
<211>	780
<212>	PRT
<213>	S. pneumoniae
<400>	78
Cys Ala Tyr	Ala Leu	Asn Gin His Arg Ser	Gin	Glu	Asn	Lys	Asp	Asn
1	5	10					15
Asn Arg Val	Ser Tyr	Val Asp Gly Ser Gin	Ser	Ser	Gin	Lys	Ser	Glu
	20	25				30
Asn Leu Thr	Pro Asp	Gin Val Ser Gin Lys	Glu	Gly	Ile	Gin	Ala	Glu
35		40			45
Gin Ile Val	Ile Lys	Ile Thr Asp Gin Gly	Tyr	Val	Thr	Ser	His	Gly
50		55		60
Asp His Tyr	His Tyr	Tyr Asn Gly Lys Val	Pro	Tyr	Asp	Ala	Leu	Phe

70 75 80

PL 206 576 B1

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 85

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 90

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp 95

Ala

Asp

Ile

Val

Asn 100

Glu

Val

Lys

Gly

Gly 105

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val 110

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr 115

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 120

Ala

Ala

His

Ala

Asp 125

Asn

Val

Arg

Thr

Lys 130

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg 135

Gin

Lys

Gin

Glu

His 140

Val

Lys

Asp

Asn

Glu 145

Lys

Val

Asn

Ser

Asn 150

Val

Ala

Val

Ala

Arg 155

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr 160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly 165

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro 170

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu 175

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala 180

Tyr

Ile

Val

Pro

His 185

Gly

Gly

His

Tyr

His 190

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser 195

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser 200

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala 205

Lys

Ala

His

Leu

Ala 210

Gly

Lys

Asn

Met

Gin 215

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser 220

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala 225

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr 230

Gin

Ser

Val

Ala

Lys 235

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys 240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser 245

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser 250

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu 255

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser 260

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser 265

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu 270

Val

Phe

Asp

Pro

Ala 275

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg 280

Thr

Pro

Asn

Gly

Val 285

Ala

Ile

Pro

His

Gly 290

Asp

His

Tyr

His

Phe 295

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys 300

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu 305

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg 310

Met

Val

Pro

Ile

Ser 315

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr 320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala 325

Lys

Pro

Asn

Glu

Val 330

Val

Ser

Ser

Leu

Gly 335

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn 340

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr 345

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu 350

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp 355

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn 360

Pro

Lys

Asp

Ile

Val 365

Glu

Glu

Thr

Ala

Thr 370

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg 375

His

Gly

Asp

His

Phe 380

His

Tyr

Ile

Pro

Lys 385

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly 390

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro 395

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala 400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser 405

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro 410

Gly

Thr

Ser

His

Glu 415

Lys

His

Glu

Glu

Asp 420

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp 425

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile 430

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser 435

Gly

Phe

Val

Met

Ser 440

His

Gly

Asp

His

Asn 445

His

Tyr

Phe

Phe

Lys 450

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu 455

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala 460

Ala

Gin

Lys

His

Leu 465

Glu

Glu

Val

Lys

Thr 470

Ser

His

Asn

Gly

Leu 475

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser 480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr 485

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys 490

Glu

Met

Lys

Asp

Leu 495

Asp

Lys

Lys

Ile

Glu 500

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly 505

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr 510

Gly

Val

Lys

Arg

Glu 515

Ser

Ile

val

Val

Asn 520

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala 525

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

PL 206 576 B1

530 535 540

Val Gly Ile	Gly	His	Ser His	Ser	Asn	Tyr Glu Leu	Phe	Lys	Pro	Glu
545			550			555				560
Glu Gly Val	Ala	Lys	Lys Glu	Gly	Asn	Lys Val Tyr	Thr	Gly	Glu	Glu
		565				570			575
Leu Thr Asn	Val	Val	Asn Leu	Leu	Lys	Asn Ser Thr	Phe	Asn	Asn	Gin
	580				585			590
Asn Phe Thr	Leu	Ala	Asn Gly	Gin	Lys	Arg Val Ser	Phe	Ser	Phe	Pro
595				600			605
Pro Glu Leu	Glu	Lys	Lys Leu	Gly	Ile	Asn Met Leu	Val	Lys	Leu	Ile
610			615			620
Thr Pro Asp	Gly	Lys	Val Leu	Glu	Lys	Val Ser Gly	Lys	Val	Phe	Gly
625			630			635				640
Glu Gly Val	Gly	Asn	Ile Ala	Asn	Phe	Glu Leu Asp	Gin	Pro	Tyr	Leu
		645				650			655
Pro Gly Gin	Thr	Phe	Lys Tyr	Thr	Ile	Ala Ser Lys	Asp	Tyr	Pro	Glu
	660				665			670
Val Ser Tyr	Asp	Gly	Thr Phe	Thr	Val	Pro Thr Ser	Leu	Ala	Tyr	Lys
675				680			685
Met Ala Ser	Gin	Thr	Ile Phe	Tyr	Pro	Phe His Ala	Gly	Asp	Thr	Tyr
690			695			700
Leu Arg Val	Asn	Pro	Gin Phe	Ala	Val	Pro Lys Gly	Thr	Asp	Ala	Leu
705			710			715				720
Val Arg Val	Phe	Asp	Glu Phe	His	Gly	Asn Ala Tyr	Leu	Glu	Asn	Asn
		725				730			735
Tyr Lys Val	Gly	Glu	Ile Lys	Leu	Pro	Ile Pro Lys	Leu	Asn	Gin	Gly
	740				745			750
Thr Thr Arg	Thr	Ala	Gly Asn	Lys	Ile	Pro Val Thr	Phe	Met	Ala	Asn
755				760			765
Ala Tyr Leu	Asp	Asn	Gin Ser	Thr	Tyr	Ile Val Glu
770			775			780
<210>	79
<211>	690
<212>	PRT
<213>	S. pneumoniae
<400>	79
Cys Ala Tyr	Glu	Leu	Gly Leu	His	Gin	Ala Gin Thr	Val	Lys	Glu	Asn
1		5				10			15
Asn Arg Val	Ser	Tyr	Ile Asp	Gly	Lys	Gin Ala Thr	Gin	Lys	Thr	Glu
	20				25			30
Asn Leu Thr	Pro	Asp	Glu Val	Ser	Lys	Arg Glu Gly	Ile	Asn	Ala	Glu
35				40			45
Gin Ile Val	Ile	Lys	Ile Thr	Asp	Gin	Gly Tyr Val	Thr	Ser	His	Gly
50			55			60
Asp His Tyr	His	Tyr	Tyr Asn	Gly	Lys	Val Pro Tyr	Asp	Ala	Ile	Ile
65			70			75				80
Ser Glu Glu	Leu	Leu	Met Lys	Asp	Pro	Asn Tyr Gin	Leu	Lys	Asp	Ser
		85				90			95
Asp Ile Val	Asn	Glu	Ile Lys	Gly	Gly	Tyr Val Ile	Lys	Val	Asn	Gly
	100				105			110
Lys Tyr Tyr	Val	Tyr	Leu Lys	Asp	Ala	Ala His Ala	Asp	Asn	Val	Arg
115				120			125
Thr Lys Glu	Glu	Ile	Asn Arg	Gin	Lys	Gin Glu His	Ser	Gin	His	Arg
130			135			140
Glu Gly Gly	Thr	Ser	Ala Asn	Asp	Gly	Ala Val Ala	Phe	Ala	Arg	Ser

PL 206 576 B1

145

150

155

160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr 165

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr 170

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser 175

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp 180

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr 185

Ile

Val

Pro

His

Gly 190

Asp

His

Tyr

His

Tyr 195

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu 200

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu 205

Leu

Ala

Ala

Ala

Glu 210

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly 215

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser 220

Asn

Leu

Arg

Thr

Tyr 225

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser 230

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg 235

Thr

Asn

Trp

Val

Pro 240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro 245

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr 250

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn 255

Ser

Asn

Thr

Asn

Ser 260

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser 265

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser 270

Leu

Leu

Lys

Gin

Leu 275

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu 280

Ser

Gin

Arg

His

Val 285

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu 290

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala 295

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg 300

Thr

Ala

Arg

Gly

Val 305

Ala

Val

Pro

His

Gly 310

Asn

His

Tyr

His

Phe 315

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin 320

Met

Ser

Glu

Leu

Glu 325

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg 330

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg 335

Tyr

Arg

Ser

Asn

His 340

Trp

Val

Pro

Asp

Ser 345

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro 350

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr 355

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro 360

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala 365

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro 370

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro 375

ile

Asp

Glu

Lys

Leu 380

Val

Lys

Glu

Ala

Val 385

Arg

Lys

Val

Gly

Asp 390

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu 395

Glu

Asn

Gly

Val

Ser 400

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala 405

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala 410

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly 415

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu 420

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser 425

Leu

Ser

His

Lys

Leu 430

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr 435

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser 440

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr 445

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp 450

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile 455

His

Gin

Asp

Leu

Leu 460

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg 465

Gin

Val

Asp

Phe

Glu 470

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu 475

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys 480

Asp

Val

Ser

Ser

Asp 485

Lys

Val

Lys

Leu

Val 490

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala 495

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile 500

Arg

His

Pro

Glu

Arg 505

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn 510

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr 515

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile 520

Gin

Val

Ala

Lys

Leu 525

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr 53 0

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr 535

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg 540

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp 545

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr 550

Val

Thr

Pro

His

Met 555

Thr

His

Ser

His

Trp 560

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser 565

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu 570

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin 575

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu 580

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro 585

Pro

Ser

Thr

Asp

His 590

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn 595

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly 600

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr 605

Asn

Arg

Val

PL 206 576 B1

Lys

Ala 610

Ala

Lys

Lys

Val

Pro 615

Leu

Asp

Arg

Met

Pro 620

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr 625

Thr

Val

Glu

Val

Lys 630

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile 635

Ile

Pro

His

Tyr

Asp 640

His

Tyr

His

Asn

Ile 645

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe 650

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr 655

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly 660

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp 665

Leu

Leu

Ala

Thr

Val 670

Lys

Tyr

Tyr Asn

Val Ala 690

Glu 675

His

Pro

Asn

Glu

Arg 680

Pro

His

Ser

Asp

Asn 685

Gly

Phe

Gly

<210> 80 <211> 2469 <212> DNA <213> S. pneumoniae <400> 80 gtgaagaaaa catatggtta tatcggctca gttgctgcca ttttactagc tactcatatt 60 ggaagttacc aacttggtaa gcatcatatg ggtctagcaa caaaggacaa tcagattgcc 120 tatattgatg acagcaaagg taaggcaaaa gcccctaaaa caaacaaaac gatggatcaa 180 atcagtgctg aagaaggcat ctctgctgaa cagatcgtag tcaaaattac tgaccaaggc 240 tatgtgacct cacacggtga ccattatcat ttttacaatg ggaaagttcc ttatgatgcg 300 attattagtg aagagttgtt gatgacggat cctaattacc gttttaaaca atcagacgtt 360 atcaatgaaa tcttagacgg ttacgttatt aaagtcaatg gcaactatta tgtttacctc 420 aagccaggta gtaagcgcaa aaacattcga accaaacaac aaattgctga gcaagtagcc 480 aaaggaacta aagaagctaa agaaaaaggt ttagctcaag tggcccatct cagtaaagaa 540 gaagttgcgg cagtcaatga agcaaaaaga caaggacgct atactacaga cgatggctat 600 atttttagtc cgacagatat cattgatgat ttaggagatg cttatttagt acctcatggt 660 aatcactatc attatattcc taaaaaggat ttgtctccaa gtgagctagc tgctgcacaa 720 gcctactgga gtcaaaaaca aggtcgaggt gctagaccgt ctgafctaccg cccgacacca 780 gccccaggtc gtaggaaagc cccaattcct gatgtgacgc ctaaccctgg acaaggtcat 840 cagccagata acggtggcta tcatccagcg cctcctaggc caaatgatgc gtcacaaaac 900 aaacaccaaa gagatgagtt taaaggaaaa acctttaagg aacttttaga tcaactacac 960 cgtcttgatt tgaaataccg tcatgtggaa gaagatgggt tgatttttga accgactcaa 1020 gtgatcaaat caaacgcttt tgggtatgtg gtgcctcatg gagatcatta tcatattatc 1080 ccaagaagtc agttatcacc tcttgaaatg gaattagcag atcgatactt agctggccaa 1140 actgaggaca atgactcagg ttcagagcac tcaaaaccat cagataaaga agtgacacat 1200 acctttcttg gtcatcgcat caaagcttac ggaaaaggct tagatggtaa accatatgat 1260 acgagtgatg cttatgtttt tagtaaagaa tccattcatt cagtggataa atcaggagtt 1320 acagctaaac acggagatca tttccactat ataggatttg gagaacttga acaatatgag 1380 ttggatgagg tcgctaactg ggtgaaagca aaaggtcaag ctgatgagct tgctgctgct 1440 ttggatcagg aacaaggcaa agaaaaacca ctctttgaca ctaaaaaagt gagtcgcaaa 1500 gtaacaaaag atggtaaagt gggctatatg atgccaaaag atggtaagga ctatttctat 1560 gctcgtgatc aacttgattt gactcagatt gcctttgccg aacaagaact aatgcttaaa 1620 gataagaagc attaccgtta tgacattgtt gacacaggta ttgagccacg acttgctgta 1680 gatgtgtcaa gtctgccgat gcatgctggt aatgctactt acgatactgg aagttcgttt 1740 gttatcccac atattgatca tatccatgtc gttccgtatt catggttgac gcgcgatcag 1800 attgcaacag tcaagtatgt gatgcaacac cccgaagttc gtccggatgt atggtctaag 1860 ccagggcatg aagagtcagg ttcggtcatt ccaaatgtta cgcctcttga taaacgtgct 1920 ggtatgccaa actggcaaat tatccattct gctgaagaag ttcaaaaagc cctagcagaa 1980 ggtcgttttg caacaccaga cggctatatt ttcgatccac gagatgtttt ggccaaagaa 2040 acttttgtat ggaaagatgg ctcctttagc atcccaagag cagatggcag ttcattgaga 2100 accattaata aatctgatct atcccaagct gagtggcaac aagctcaaga gttattggca 2160 aagaaaaata ctggtgatgc tactgatacg gataaaccca aagaaaagca acaggcagat 2220 aagagcaatg aaaaccaaca gccaagtgaa gccagtaaag aagaaaaaga atcagatgac 2280

PL 206 576 B1 tttatagaca gtttaccaga ctatggtcta gatagagcaa ccctagaaga tcatatcaat caattagcac aaaaagctaa tatcgatcct aagtatctca ttttccaacc agaaggtgtc caattttata ataaaaatgg tgaattggta acttatgata tcaagacact tcaacaaata aacccttaa <210> 81 <211> 823 <212> PRT <213> S. pneumoniae

2340

2400

2460

2469 <400> 81

Val 1

Lys

Lys

Thr Tyr 5

Gly Tyr

Ile

Gly

Ser Val 10

Ala

Ala

Ile

Leu 15

Leu

Ala

Thr

His

Ile

Gly

Ser

Tyr

Gin

Leu

Gly

Lys

His

His

Met

Gly

Leu

20

25

30

Ala

Thr

Lys

Asp

Asn

Gin

Ile

Ala

Tyr

Ile

Asp

Asp

Ser

Lys

Gly

Lys

35

40

45

Ala

Lys

Ala

Pro

Lys

Thr

Asn

Lys

Thr

Met

Asp

Gin

Ile

Ser

Ala

Glu

50

55

60

Glu

Gly

Ile

Ser

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Val

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

65

70

75

80

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

85

90

95

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Thr

Asp

Pro

Asn

100

105

110

Tyr

Arg

Phe

Lys

Gin

Ser

Asp

Val

Ile

Asn

Glu

Ile

Leu

Asp

Gly

Tyr

115

120

125

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

Asn

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Pro

Gly

Ser

130

135

140

Lys

Arg

Lys

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Gin

Gin

Ile

Ala

Glu

Gin

Val

Ala

145

150

155

160

Lys

Gly

Thr

Lys

Glu

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Ala

Gin

val

Ala

His

165

170

175

Leu

Ser

Lys

Glu

Glu

Val

Ala

Ala

Val

Asn

Glu

Ala

Lys

Arg

Gin

Gly

180

185

190

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

dy

Tyr

Ile

Phe

Ser

Pro

Thr

ASp

Ile

Ile

195

200

205

Asp

Asp

Leu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Leu

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

210

215

220

Tyr

Ile

Pro

Lys

Lys

Asp

Leu

Ser

Pro

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gin

225

230

235

240

Ala

Tyr

Trp

Ser

Gin

Lys

Gin

Gly

Arg

Gly

Ala

Arg

Pro

Ser

Asp

Tyr

245

250

255

Arg

Pro

Thr

Pro

Ala

Pro

Gly

Arg

Arg

Lys

Ala

Pro

ile

Pro

Asp

Val

260

265

270

Thr

Pro

Asn

Pro

Gly

Gin

Gly

His

Gin

Pro

Asp

Asn

Gly

Gly

Tyr

His

275

280

285

Pro

Ala

Pro

Pro

Arg

Pro

Asn

Asp

Ala

Ser

Gin

Asn

Lys

His

Gin

Arg

290

295

300

Asp

Glu

Phe

Lys

Gly

Lys

Thr

Phe

Lys

Glu

Leu

Leu

Asp

Gin

Leu

His

305

310

315

320

Arg

Leu

Asp

Leu

Lys

Tyr

Arg

His

Val

Glu

Glu

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

325

330

335

Glu

Pro

Thr

Gin

Val

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

Phe

Gly

Tyr

Val

Val

Pro

340

345

350

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Ile

Ile

Pro

Arg

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

355

360

365

PL 206 576 B1

Glu

Met 370

Glu

Leu

Ala

Asp Arg Tyr 375

Leu Ala Gly Gin Thr Glu Asp 380

Asn

Asp

Ser

Gly

Ser

Glu

His

Ser

Lys

Pro

Ser

Asp

Lys

Glu

Val

Thr

His

385

390

395

400

Thr

Phe

Leu

Gly

His

Arg

Ile

Lys

Ala

Tyr

Gly

Lys

Gly

Leu

Asp

Gly

405

410

415

Lys

Pro

Tyr

Asp

Thr

Ser

Asp

Ala

Tyr

Val

Phe

Ser

Lys

Glu

Ser

Ile

420

425

430

His

Ser

Val

Asp

Lys

Ser

Gly

Val

Thr

Ala

Lys

His

Gly

Asp

His

Phe

435

440

445

His

Tyr

Ile

Gly

Phe

Gly

Glu

Leu

Glu

Gin

Tyr

Glu

Leu

Asp

Glu

Val

450

455

460

Ala

Asn

Trp

Val

Lys

Ala

Lys

Gly

Gin

Ala

Asp

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

465

470

475

480

Leu

Asp

Gin

Glu

Gin

Gly

Lys

Glu

Lys

Pro

Leu

Phe

Asp

Thr

Lys

Lys

485

490

495

Val

Ser

Arg

Lys

Val

Thr

Lys

Asp

Gly

Lys

Val

Gly

Tyr

Met

Met

Pro

500

505

510

Lys

Asp

Gly

Lys

Asp

Tyr

Phe

Tyr

Ala

Arg

Asp

Gin

Leu

Asp

Leu

Thr

515

520

525

Gin

Ile

Ala

Phe

Ala

Glu

Gin

Glu

Leu

Met

Leu

Lys

ASp

Lys

Lys

His

530

535

540

Tyr

Arg

Tyr

Asp

Ile

Val

Asp

Thr

Gly

Ile

Glu

Pro

Arg

Leu

Ala

Val

545

550

555

560

Asp

Val

Ser

Ser

Leu

Pro

Met

His

Ala

Gly

Asn

Ala

Thr

Tyr

Asp

Thr

565

570

575

Gly

Ser

Ser

Phe

Val

Ile

Pro

His

Ile

Asp

His

Ile

His

Val

Val

Pro

580

585

590

Tyr

Ser

Trp

Leu

Thr

Arg

Asp

Gin

Ile

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Val

Met

595

600

605

Gin

His

Pro

Glu

Val

Arg

Pro

Asp

Val

Trp

Ser

Lys

Pro

Gly

His

Glu

610

615

620

Glu

Ser

Gly

Ser

Val

Ile

Pro

Asn

Val

Thr

Pro

Leu

Asp

Lys

Arg

Ala

625

630

635

640

Gly

Met

Pro

Asn

Trp

Gin

Ile

Ile

His

Ser

Ala

Glu

Glu

Val

Gin

Lys

645

650

655

Ala

Leu

Ala

Glu

Gly

Arg

Phe

Ala

Thr

Pro

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

660

665

670

Pro

Arg

Asp

Val

Leu

Ala

Lys

Glu

Thr

Phe

Val

Trp

Lys

Asp

Gly

Ser

675

680

685

Phe

Ser

Ile

Pro

Arg

Ala

Asp

Gly

Ser

Ser

Leu

Arg

Thr

Ile

Asn

Lys

690

695

700

Ser

Asp

Leu

Ser

Gin

Ala

Glu

Trp

Gin

Gin

Ala

Gin

Glu

Leu

Leu

Ala

705

710

715

720

Lys

Lys

Asn

Thr

Gly

Asp

Ala

Thr

Asp

Thr

Asp

Lys

Pro

Lys

Glu

Lys

725

730

735

Gin

Gin

Ala

Asp

Lys

Ser

Asn

Glu

Asn

Gin

Gin

Pro

Ser

Glu

Ala

Ser

740

745

750

Lys

Glu

Glu

Lys

Glu

Ser

Asp

Asp

Phe

Ile

Asp

Ser

Leu

Pro

Asp

Tyr

755

760

765

Gly

Leu

Asp

Arg

Ala

Thr

Leu

Glu

Asp

His

Ile

Asn

Gin

Leu

Ala

Gin

770

775

780

Lys

Ala

Asn

Ile

Asp

Pro

Lys

Tyr

Leu

Ile

Phe

Gin

Pro

Glu

Gly

Val

785

790

795

800

Gin

Phe

Tyr

Asn

Lys

Asn

Gly

Glu

Leu

Val

Thr

Tyr

Asp

Ile

Lys

Thr

805

810

815

Leu

Gin

Gin

Ile

Asn

Pro

Pro

PL 206 576 B1

820 <210> 82 <211> 2472 <212> DNA <213> S. pneumoniae <400> 82 gtgaagaaaa catatggtta tatcggctca gttgctgcca ttttactagc tactcatatt ggaagttacc aacttggtaa gcatcatatg ggtctagcaa caaaggacaa tcagattgcc tatattgatg atagcaaagg taaggcaaaa gcccctaaaa caaacaaaac gatggatcaa atcagtgctg aagaaggcat ctctgctgaa cagatcgtag tcaaaattac tgaccaaggt tatgtgacct cacacggtga ccattatcat ttttacaatg ggaaagttcc ttatgatgcg attattagtg aagagttgtt gatgacggat cctaattacc attttaaaca atcagacgtt atcaatgaaa tcttagacgg ttacgttatt aaagtcaatg gcaactatta tgtttacctc aagccaggta gtaagcgcaa aaacattcga accaaacaac aaattgctga gcaagtagcc aaaggaacta aagaagctaa agaaaaaggt ttagctcaag tggcccatct cagtaaagaa gaagttgcgg cagtcaatga agcaaaaaga caaggacgct atactacaga cgatggctat atttttagtc cgacagatat cattgatgat ttaggagacg cttatttagt acctcatggt aatcactatc attatattcc taaaaaagat ttgtctccaa gtgagctagc tgctgcacaa gcttactgga gtcaaaaaca aggtcgaggt gctagaccgt ctgattaccg cccgacacca gccccaggtc gtaggaaagc tccaattcct gatgtgacgc ctaaccctgg acaaggtcat cagccagata acggtggcta tcatccagcg cctcctaggc caaatgatgc gtcacaaaac aaacaccaaa gagatgagtt taaaggaaaa acctttaagg aacttttaga tcaactacac cgtcttgatt tgaaataccg tcatgtggaa gaagatgggt tgatttttga accgactcaa gtgatcaaat caaacgcttt tgggtatgtg gtgcctcatg gagatcatta tcatattatc ccaagaagtc agttatcacc tcttgaaatg gaattagcag atcgatactt agccggtcaa actgaggaca atgattcagg ttcagatcac tcaaaaccat cagataaaga agtgacacat acctttcttg gtcatcgcat caaagcttac ggaaaaggct tagatggtaa accatatgat acgagtgatg cttatgtttt tagtaaagaa tccattcatt cagtggataa atcaggagtt acagctaaac acggagatca tttccactat ataggatttg gagaacttga acaatatgag ttggatgagg tcgctaactg ggtgaaagca aaaggtcaag ctgatgagct tgctgctgct ttggatcagg aacaaggcaa agaaaaacca ctctttgaca ctaaaaaagt gagtcgcaaa gtaacaaaag atggtaaagt gggctatatt atgccaaaag atggcaagga ctatttctat gctcgtgatc aacttgattt gactcagatt gcctttgccg aacaagaact aatgcttaaa gataagaacc attaccgtta tgacattgtt gacacaggta ttgagccacg acttgctgta gatgtgtcaa gtctgccgat gcatgctggt aatgctactt acgatactgg aagttcgttt gttatccctc atattgatca tatccatgtc gttccgtatt catggttgac gcgcgatcag attgcaacaa tcaagtatgt gatgcaacac cccgaagttc gtccagatgt atggtctaag ccagggcatg aagagtcagg ttcggtcatt ccaaatgtta cgcctcttga taaacgtgct ggtatgccaa attggcaaat catccattct gctgaagaag ttcaaaaagc cctagcagaa ggtcgttttg caacaccaga cggctatatt ttcgatccac gagatgtttt ggccaaagaa acttttgtat ggaaagatgg ctcctttagc atcccaagag cagatggcag ttcattgaga accattaata aatctgatct atcccaagct gagtggcaac aagctcaaga gttattggca aagaaaaacg ctggtgatgc tactgatacg gataaaccca aagaaaagca acaggcagat aagagcaatg aaaaccaaca gccaagtgaa gccagtaaag aagaagaaaa agaatcagat gactttatag acagtttacc agactatggt ctagatagag caaccctaga agatcatatc aatcaattag cacaaaaagc taatatcgat cctaagtatc tcattttcca accagaaggt gtccaatttt ataataaaaa tggtgaatta gtaacttatg atatcaagac gcttcaacaa ataaaccctt aa <210> 83 <211> 824 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 83

120

180

240

300

360

420

480

540

600

660

720

780

840

900

960

1020

1080

1140

1200

1260

1320

1380

1440

1500

1560

1620

1680

1740

1800

1860

1920

1980

2040

2100

2160

2220

2280

2340

2400

2460

2472

PL 206 576 B1

Val

Lys

Lys

Thr

Tyr

Gly

Tyr

Ile

Gly

Ser

Val

Ala

Ala

Ile

Leu

Leu

1

5

10

15

Ala

Thr

His

Ile

Gly

Ser

Tyr

Gin

Leu

Gly

Lys

His

His

Met

Gly

Leu

20

25

30

Ala

Thr

Lys

Asp

Asn

Gin

Ile

Ala

Tyr

Ile

Asp

Asp

Ser

Lys

Gly

Lys

35

40

45

Ala

Lys

Ala

Pro

Lys

Thr

Asn

Lys

Thr

Met

Asp

Gin

Ile

Ser

Ala

Glu

50

55

60

Glu

Gly

Ile

Ser

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

val

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

65

70

75

80

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

85

90

95

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Thr

Asp

Pro

Asn

100

105

110

Tyr

His

Phe

Lys

Gin

Ser

Asp

Val

Ile

Asn

Glu

Ile

Leu

Asp

Gly

Tyr

115

120

125

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

Asn

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Pro

Gly

Ser

130

135

140

Lys

Arg

Lys

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Gin

Gin

Ile

Ala

Glu

Gin

Val

Ala

145

150

155

160

Lys

Gly

Thr

Lys

Glu

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Ala

Gin

Val

Ala

His

165

170

175

Leu

Ser

Lys

Glu

Glu

Val

Ala

Ala

Val

Asn

Glu

Ala

Lys

Arg

Gin

Gly

180

185

190

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Ser

Pro

Thr

Asp

Ile

Ile

195

200

205

Asp

Asp

Leu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Leu

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

210

215

220

Tyr

ile

Pro

Lys

Lys

Asp

Leu

Ser

Pro

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gin

225

230

235

240

Ala

Tyr

Trp

Ser

Gin

Lys

Gin

Gly

Arg

Gly

Ala

Arg

Pro

Ser

Asp

Tyr

245

250

255

Arg

Pro

Thr

Pro

Ala

Pro

Gly

Arg

Arg

Lys

Ala

Pro

Ile

Pro

Asp

Val

260

265

270

Thr

Pro

Asn

Pro

Gly

Gin

Gly

His

Gin

Pro

Asp

Asn

Gly

Gly

Tyr

His

275

280

285

Pro

Ala

Pro

Pro

Arg

Pro

Asn

Asp

Ala

Ser

Gin

Asn

Lys

His

Gin

Arg

290

295

300

Asp

Glu

Phe

Lys

Gly

Lys

Thr

Phe

Lys

Glu

Leu

Leu

Asp

Gin

Leu

His

305

310

315

320

Arg

Leu

Asp

Leu

Lys

Tyr

Arg

His

Val

Glu

Glu

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

325

330

335

Glu

Pro

Thr

Gin

Val

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

Phe

Gly

Tyr

Val

Val

Pro

340

345

350

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Ile

Ile

Pro

Arg

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

355

360

365

Glu

Met

Glu

Leu

Ala

Asp

Arg

Tyr

Leu

Ala

Gly

Gin

Thr

Glu

Asp

Asn

370

375

380

Asp

Ser

Gly

Ser

Asp

His

Ser

Lys

Pro

Ser

Asp

Lys

Glu

Val

Thr

His

385

390

395

400

Thr

Phe

Leu

Gly

His

Arg

Ile

Lys

Ala

Tyr

Gly

Lys

Gly

Leu

Asp

Gly

405

410

415

Lys

Pro

Tyr

Asp

Thr

Ser

Asp

Ala

Tyr

Val

Phe

Ser

Lys

Glu

Ser

Ile

420

425

430

His

Ser

Val

Asp

Lys

Ser

Gly

Val

Thr

Ala

Lys

His

Gly

Asp

His

Phe

435

440

445

His

Tyr

Ile

Gly

Phe

Gly

Glu

Leu

Glu

Gin

Tyr

Glu

Leu

Asp

Glu

Val

100

PL 206 576 B1

450

455

460

Ala

Asn

Trp

Val

Lys

Ala

Lys

Gly

Gin

Ala

Asp

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

465

470

475

480

Leu.

Asp

Gin

Glu

Gin

Gly

Lys

Glu

Lys

Pro

Leu

Phe

Asp

Thr

Lys

Lys

485

490

495

Val

Ser

Arg

Lys

Val

Thr

Lys

Asp

Gly

Lys

Val

Gly

Tyr

Ile

Met

Pro

500

505

510

Lys

Asp

Gly

Lys

Asp

Tyr

Phe

Tyr

Ala

Arg

Asp

Gin

Leu

ASp

Leu

Thr

515

520

525

Gin

Ile

Ala

Phe

Ala

Glu

Gin

Glu

Leu

Met

Leu

Lys

Asp

Lys

Asn

His

530

535

540

Tyr

Arg

Tyr

Asp

Ile

Val

Asp

Thr

Gly

Ile

Glu

Pro

Arg

Leu

Ala

Val

545

550

555

560

Asp

Val

Ser

Ser

Leu

Pro

Met

His

Ala

Gly

Asn

Ala

Thr

Tyr

Asp

Thr

565

570

575

Gly

Ser

Ser

Phe

Val

Ile

Pro

His

Ile

Asp

His

Ile

His

Val

Val

Pro

580

585

590

Tyr

Ser

Trp

Leu

Thr

Arg

Asp

Gin

Ile

Ala

Thr

Ile

Lys

Tyr

Val

Met

595

600

605

Gin

His

Pro

Glu

Val

Arg

Pro

Asp

Val

Trp

Ser

Lys

Pro

Gly

His

Glu

610

615

620

Glu

Ser

Gly

Ser

Val

Ile

Pro

Asn

Val

Thr

Pro

Leu

Asp

Lys

Arg

Ala

625

630

635

640

Gly

Met

Pro

Asn

Trp

Gin

Ile

Ile

His

Ser

Ala

Glu

Glu

Val

Gin

Lys

645

650

655

Ala

Leu

Ala

Glu

Gly

Arg

Phe

Ala

Thr

Pro

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

660

665

670

Pro

Arg

Asp

Val

Leu

Ala

Lys

Glu

Thr

Phe

Val

Trp

Lys

Asp

Gly

Ser

675

680

685

Phe

Ser

Ile

Pro

Arg

Ala

Asp

Gly

Ser

Ser

Leu

Arg

Thr

Ile

Asn

Lys

690

695

700

Ser

Asp

Leu

Ser

Gin

Ala

Glu

Trp

Gin

Gin

Ala

Gin

Glu

Leu

Leu

Ala

705

710

715

720

Lys

Lys

Asn

Ala

Gly

Asp

Ala

Thr

Asp

Thr

Asp

Lys

Pro

Lys

Glu

Lys

725

730

735

Gin

Gin

Ala

Asp

Lys

Ser

Asn

Glu

Asn

Gin

Gin

Pro

Ser

Glu

Ala

Ser

740

745

750

Lys

Glu

Glu

Glu

Lys

Glu

Ser

Asp

Asp

Phe

Ile

Asp

Ser

Leu

Pro

Asp

755

760

765

Tyr

Gly

Leu

Asp

Arg

Ala

Thr

Leu

Glu

Asp

His

Ile

Asn

Gin

Leu

Ala

770

775

780

Gin

Lys

Ala

Asn

Ile

Asp

Pro

Lys

Tyr

Leu

Ile

Phe

Gin

Pro

Glu

Gly

785

790

795

800

Val

Gin

Phe

Tyr

Asn

Lys

Asn

Gly

Glu

Leu

Val

Thr

Tyr

Asp

Ile

Lys

805

810

815

Thr

Leu

Gin

Gin

Ile

Asn

Pro

Pro

820

<210>

84

<211>

1019

<212>

PRT

<213>

S. pneumoniae

<400>

84

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

PL 206 576 B1

101

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

ASp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Arg

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

102

PL 206 576 B1

His Glu Gin Asp Tyr

Pro

Ser Asn Ala

Lys Glu Met Lys Asp Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Phe

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

PL 206 576 B1

103

	930	935	940
Asp 945	Asn Gly Met Leu Asn 950	Pro Glu Gly Asn	Val Gly Ser Asp Pro Met 955 960
Leu	Asp Pro Ala Leu Glu 965	Glu Ala Pro Ala 970	Val Asp Pro Val Gin Glu 975
Lys	Leu Glu Lys Phe Thr 980	Ala Ser Tyr Gly 985	Leu Gly Leu Asp Ser Val 990
Ile Val	Phe Asn Met Asp Gly Thr Ile Glu Leu 995 1000 Ile Lys Lys Asn Leu Ser Asp Leu Ile 1010 1015 <210> 85 <211> 1019 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 85	Arg Leu Pro Ser Gly Glu 1005 Ala
Cys 1	Ala Tyr Ala Leu Asn 5	Gin His Arg Ser 10	Gin Glu Asn Lys Asp Asn 15
Asn	Arg Val Ser Tyr Val 20	Asp Gly Ser Gin 25	Ser Ser Gin Lys Ser Glu 30
Asn	Leu Thr Pro Asp Gin 35	Val Ser Gin Lys 40	Glu Gly Ile Gin Ala Glu 45
Gin	Ile Val Ile Lys Ile 50	Thr Asp Gin Gly 55	Tyr Val Thr Ser His Gly 60
Asp 65	His Tyr His Tyr Tyr 70	Asn Gly Lys Val	Pro Tyr Asp Ala Leu Phe 75 80
Ser	Glu Glu Leu Leu Met 85	Lys Asp Pro Asn 90	Tyr Gin Leu Lys Asp Ala 95
Asp	Ile Val Asn Glu Val 100	Lys Gly Gly Tyr 105	Ile Ile Lys Val Asp Gly 110
Lys	Tyr Tyr Val Tyr Leu 115	Lys Asp Ala Ala 120	His Ala Asp Asn Val Arg 125
Thr	Lys Asp Glu Ile Asn 130	Arg Gin Lys Gin 135	Glu His Val Lys Asp Asn 140
Glu 145	Lys Val Asn Ser Asn 150	Val Ala Val Ala	Arg Ser Gin Gly Arg Tyr 155 160
Thr	Thr Asn Asp Gly Tyr 165	Val Phe Asn Pro 170	Ala Asp Ile Ile Glu Asp 175
Thr	Gly Asn Ala Tyr Ile 180	Val Pro His Gly 185	Gly His Tyr His Tyr Ile 190
Pro	Lys Ser Asp Leu Ser 195	Ala Ser Glu Leu 200	Ala Ala Ala Lys Ala His 205
Leu	Ala Gly Lys Asn Met 210	Gin Pro Ser Gin 215	Leu Ser Tyr Ser Ser Thr 220
Ala 225	Ser Asp Asn Asn Thr 230	Gin Ser Val Ala	Lys Gly Ser Thr Ser Lys 235 240
Pro	Ala Asn Lys Ser Glu 245	Asn Leu Gin Ser 250	Leu Leu Lys Glu Leu Tyr 255
Asp	Ser Pro Ser Ala Gin 260	Arg Tyr Ser Glu 265	Ser Asp Gly Leu Val Phe 270
Asp	Pro Ala Lys Ile Ile 275	Ser Arg Thr Pro 280	Asn Gly Val Ala Ile Pro 285
His	Gly Asp His Tyr His 290	Phe Ile Pro Tyr 295	Ser Lys Leu Ser Ala Leu 300
Glu	Glu Lys Ile Ala Arg	Arg Val Pro Ile	Ser Gly Thr Gly Ser Thr

104

PL 206 576 B1

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Ile

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Ile

Met

Ser

His

Gly

Asn

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

PL 206 576 B1

105

Ala	Tyr Leu 770	Asp Asn	Gin Ser Thr 775	Tyr	Ile	Val Glu Val 780	Pro	Ile Leu
Glu	Lys Glu	Asn Gin	Thr Asp Lys	Pro	Ser	Ile Leu Pro	Gin	Phe Lys
785			790			795		800
Arg	Asn Lys	Ala Gin	Glu Asn Ser	Lys	Leu	Asp Glu Lys	Val	Glu Glu
		805			810			815
Pro	Lys Thr	Ser Glu	Lys Val Glu	Lys	Glu	Lys Leu Ser	Glu	Thr Gly
		820		825			830
Asn	Ser Thr	Ser Asn	Ser Thr Leu	Glu	Glu	Val Pro Thr	Val	Asp Pro
	835		840			845
Val	Gin Glu	Lys Val	Ala Lys Phe	Ala	Glu	Ser Tyr Gly	Met	Lys Leu
	850		855			860
Glu	Asn Val	Leu Phe	Asn Met Asp	Gly	Thr	Ile Glu Leu	Tyr	Leu Pro
865			870			875		880
Ser	Gly Glu	Val Ile	Lys Lys Asn	Met	Ala	Asp Phe Thr	Gly	Glu Ala
		885			890			895
Pro	Gin Gly	Asn Gly	Glu Asn Lys	Pro	Ser	Glu Asn Gly	Lys	Val Ser
		900		905			910
Thr	Gly Thr	Val Glu	Asn Gin Pro	Thr	Glu	Asn Lys Pro	Ala	Asp Ser
	915		920			925
Leu	Pro Glu	Ala Pro	Asn Glu Lys	Pro	Val	Lys Pro Glu	Asn	Ser Thr
	930		935			940
Asp	Asn Gly	Met Leu	Asn Pro Glu	Gly	Asn	Val Gly Ser	Asp	Pro Met
945			950			955		960
Leu	Asp Pro	Ala Leu	Glu Glu Ala	Pro	Ala	Val Asp Pro	Val	Gin Glu
		965			970			975
Lys	Leu Glu	Lys Phe	Thr Ala Ser	Tyr	Gly	Leu Gly Leu	Asp	Ser Val
		980		985			990
Ile	Phe Asn	Met Asp	Gly Thr Ile	Glu	Leu	Arg Leu Pro	Ser	Gly Glu
	995		1000		1005
val	Ile Lys	Lys Asn	Leu Ser Asp	Leu	Ile	Ala
	1010		1015
	<210>	86
	<211>	1019
	<212>	PRT
	<213>	S. pneumoniae
	<400>	86
Cys	Ala Tyr	Ala Leu	Asn Gin His	Arg	Ser	Gin Glu Asn	Lys	Asp Asn
1		5			10			15
Asn	Arg Val	Ser Tyr	Val Asp Gly	Ser	Gin	Ser Ser Gin	Lys	Ser Glu
		20		25			30
Asn	Leu Thr	Pro Asp	Gin Val Ser	Gin	Lys	Glu Gly Ile	Gin	Ala Glu
	35		40			45
Gin	Ile Val	Ile Lys	Ile Thr Asp	Gin	Gly	Tyr Val Thr	Ser	His Gly
	50		55			60
Asp	His Tyr	His Tyr	Tyr Asn Gly	Lys	Val	Pro Tyr Asp	Ala	Leu Phe
65			70			75		80
Ser	Glu Glu	Leu Leu	Met Lys Asp	Pro	Asn	Tyr Gin Leu	Lys	Asp Ala
		85			90			95
Asp	Ile Val	Asn Glu	Val Lys Gly	Gly	Tyr	Ile Ile Lys	Val	Asp Gly
		100		105			110
Lys	Tyr Tyr	Val Tyr	Leu Lys Asp	Ala	Ala	His Ala Asp	Asn	Val Arg
	115		120			125
Thr	Lys Asp	Glu Ile	Asn Arg Gin	Lys	Gin	Glu His Val	Lys	Asp Asn

130 135 140

106

PL 206 576 B1

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

ASp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

PL 206 576 B1

107

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Leu

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Leu

Ile

Ala

1010 1015 <210> 87 <211> 1019 <212> PRT

108

PL 206 576 B1 <213> S. pneumoniae <400> 87

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

PL 206 576 B1

109

Asp Glu Ser Gly

Phe Val

Met

Ser His Gly Asp His Asn His Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

He

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Qiy

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

110

PL 206 576 B1

	885	890	895
Pro Gin	Gly Asn Gly Glu Asn Lys 900	Pro Ser Glu Asn Gly Lys 905 910	Val Ser
Thr Gly	Thr Val Glu Asn Gin Pro 915 920	Thr Glu Asn Lys Pro Ala 925	Asp Ser
Leu Pro 930	Glu Ala Pro Asn Glu Lys 935	Pro Val Lys Pro Glu Asn 940	Ser Thr
Asp Asn 945	Gly Met Leu Asn Pro Glu 950	Gly Asn Val Gly Ser Asp 955	Pro Met 960
Leu Asp	Pro Ala Leu Glu Glu Ala 965	Pro Ala Val Asp Pro Val 970	Gin Glu 975
Lys Leu	Glu Lys Phe Thr Ala Ser 980	Tyr Gly Leu Gly Leu Asp 985 990	Ser Val
Ile Phe Asn Met Asp Gly Thr Ile Glu Leu Arg Leu Pro Ser 995 1000 1005 Val Ile Lys Lys Asn Leu Ser Asp Phe Ile Ala 1010 1015 <210> 88 <211> 1019 <212> PRT <213> Ξ. pneumoniae <400> 88	Gly Glu
Cys Ala 1	Tyr Ala Leu Asn Gin His 5	Arg Ser Gin Glu Asn Lys 10	Asp Asn 15
Asn Arg	Val Ser Tyr Val Asp Gly 20	Ser Gin Ser Ser Gin Lys 25 30	Ser Glu
Asn Leu	Thr Pro Asp Gin Val Ser 35 40	Gin Lys Glu Gly Ile Gin 45	Ala Glu
Gin Ile 50	Val Ile Lys Ile Thr Asp 55	Gin Gly Tyr Val Thr Ser 60	His Gly
Asp His 65	Tyr His Tyr Tyr Asn Gly 70	Lys Val Pro Tyr Asp Ala 75	Leu Phe 80
Ser Glu	Glu Leu Leu Met Lys Asp 85	Pro Asn Tyr Gin Leu Lys 90	Asp Ala 95
Asp Ile	Val Asn Glu Val Lys Gly 100	Gly Tyr Ile Ile Lys Val 105 110	Asp Gly
Lys Tyr	Tyr Val Tyr Leu Lys Asp 115 120	Ala Ala His Ala Asp Asn 125	Val Arg
Thr Lys 130	Asp Glu Ile Asn Arg Gin 135	Lys Gin Glu His Val Lys 140	Asp Asn
Glu Lys 145	Val Asn Ser Asn Val Ala 150	Val Ala Arg Ser Gin Gly 155	Arg Tyr 160
Thr Thr	Asn Asp Gly Tyr Val Phe 165	Asn Pro Ala Asp Ile Ile 170	Glu Asp 175
Thr Gly	Asn Ala Tyr Ile Val Pro 180	His Arg Gly His Tyr His 185 190	Tyr Ile
Pro Lys	Ser Asp Leu Ser Ala Ser 195 200	Glu Leu Ala Ala Ala Lys 205	Ala His
Leu Ala 210	Gly Lys Asn Met Gin Pro 215	Ser Gin Leu Ser Tyr Ser 220	Ser Thr
Ala Ser 225	Asp Asn Asn Thr Gin Ser 230	Val Ala Lys Gly Ser Thr 235	Ser Lys 240
Pro Ala	Asn Lys Ser Glu Asn Leu 245	Gin Ser Leu Leu Lys Glu 250	Leu Tyr 255
Asp Ser	Pro Ser Ala Gin Arg Tyr	Ser Glu Ser Asp Gly Leu	Val Phe

PL 206 576 B1

111

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

ASp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

112

PL 206 576 B1

Val

Arg

Val

Phe Asp Glu 725

Phe

His

Gly Asn Ala 730

Tyr

Leu

Glu

Asn 735

Asn

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Phe

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Leu

Ile

Ala

1010

1015

<210> 89 <211> 1019 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 89

Cys Ala Tyr Ala Leu Asn Gin His Arg Ser Gin Glu Asn Lys Asp Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

PL 206 576 B1

113

Asp

Ile Val

Asn Glu Val Lys 100

Gly

Gly Tyr 105

Ile

Ile Lys Val Asp Gly 110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Arg

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

He

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

114

PL 206 576 B1

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Phe

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

PL 206 576 B1

115

Val	Ile Lys 1010	Lys	Asn Leu Ser Asp Leu 1015	Ile	Ala
	<210> <211> <212> <213> <400>	90 819 PRT S. pneumoniae 90
Cys 1	Ser Tyr	Glu	Leu Gly Arg His Gin 5	Ala 10	Gly Gin Val Lys Lys Glu 15
Ser	Asn Arg	Val 20	Ser Tyr Ile Asp Gly 25	Asp	Gin Ala Gly Gin Lys Ala 30
Glu	Asn Leu 35	Thr	Pro Asp Glu Val Ser 40	Lys	Arg Glu Gly Ile Asn Ala 45
Glu	Gin Ile 50	Val	Ile Lys Ile Thr Asp 55	Gin	Gly Tyr Val Thr Ser His 60
Gly 65	Asp His	Tyr	His Tyr Tyr Asn Gly 70	Lys	Val Pro Tyr Asp Ala Ile 75 80
Ile	Ser Glu	Glu	Leu Leu Met Lys Asp 85	Pro 90	Asn Tyr Gin Leu Lys Asp 95
Ser	Asp Ile	Val 100	Asn Glu Ile Lys Gly 105	Gly	Tyr Val Ile Lys Val Asp 110
Gly	Lys Tyr 115	Tyr	Val Tyr Leu Lys Asp 120	Ala	Ala His Ala Asp Asn Ile 125
Arg	Thr Lys 130	Glu	Glu Ile Lys Arg Gin 135	Lys	Gin Glu His Ser His Asn 140
His 145	Asn Ser	Arg	Ala Asp Asn Ala Val 150	Ala	Ala Ala Arg Ala Gin Gly 155 160
Arg	Tyr Thr	Thr	Asp Asp Gly Tyr Ile 165	Phe 170	Asn Ala Ser Asp Ile Ile 175
Glu	Asp Thr	Gly 180	Asp Ala Tyr Ile Val 185	Pro	His Gly Asp His Tyr His 190
Tyr	Ile Pro 195	Lys	Asn Glu Leu Ser Ala 200	Ser	Glu Leu Ala Ala Ala Glu 205
Ala	Tyr Trp 210	Asn	Gly Lys Gin Gly Ser 215	Arg	Pro Ser Ser Ser Ser Ser 220
Tyr 225	Asn Ala	Asn	Pro Val Gin Pro Arg 230	Leu	Ser Glu Asn His Asn Leu 235 240
Thr	Val Thr	Pro	Thr Tyr His Gin Asn 245	Gin 250	Gly Glu Asn Ile Ser Ser 255
Leu	Leu Arg	Glu 260	Leu Tyr Ala Lys Pro 265	Leu	Ser Glu Arg His Val Glu 270
Ser	Asp Gly 275	Leu	Ile Phe Asp Pro Ala 280	Gin	Ile Thr Ser Arg Thr Ala 285
Arg	Gly Val 290	Ala	Val Pro His Gly Asn 295	His	Tyr His Phe Ile Pro Tyr 300
Glu 305	Gin Met	Ser	Glu Leu Glu Lys Arg 310	Ile	Ala Arg Ile Ile Pro Leu 315 320
Arg	Tyr Arg	Ser	Asn His Trp Val Pro 325	Asp 330	Ser Arg Pro Glu Gin Pro 335
Ser	Pro Gin	Ser 340	Thr Pro Glu Pro Ser 345	Pro	Ser Leu Gin Pro Ala Pro 350
Asn	Pro Gin 355	Pro	Ala Pro Ser Asn Pro 360	Ile	Asp Glu Lys Leu Val Lys 365
Glu	Ala Val 370	Arg	Lys Val Gly Asp Gly 375	Tyr	Val Phe Glu Glu Asn Gly 380

116

PL 206 576 B1

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

675

680

685

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

690

695

700

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

705

710

715

720

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

725

730

735

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

Asn

740

745

750

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

755

760

765

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

770

775

780

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

785

790

795

800

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

Ala

805

810

815

Pro

Ile

Gin

PL 206 576 B1

117 <210> 91 <211> 820 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 91

Cys 1

Ser

Tyr

Glu

Leu 5

Gly Arg His Gin

Ala 10

Gly Gin Val

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Glu

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

340

345

350

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

355

360

365

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

370

375

380

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

385

390

395

400

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

118

PL 206 576 B1

405

410

415

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

420

425

430

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

435

440

445

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

450

455

460

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Pro

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

465

470

475

480

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

485

490

495

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

500

505

510

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

515

520

525

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

530

535

540

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

545

550

555

560

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

565

570

575

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

580

585

590

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

595

600

605

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

610

615

620

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

625

630

635

640

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

645

650

655

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

660

665

670

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Val

Asp

Gin

675

680

685

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

690

695

700

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

705

710

715

720

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

725

730

735

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

740

745

750

Asn

Ser

val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

755

760

765

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

770

775

780

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

785

790

795

800

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

805

810

815

Ala Pro Ile Gin

820 <210> 92 <211> 816 <212> PRT

PL 206 576 B1

119 <213> S. pneumoniae <400> 92

Cys 1

Ser

Tyr

Glu Leu 5

Gly

Arg

His

Gin Ala Gly 10

Gin

Asp

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

120

PL 206 576 B1

ASP

Leu

Leu 435

Ala

Arg

Ile

His

Gin 440

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn 445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val 450

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu 455

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu 460

Arg

Leu

Lys

Asp

Val 465

Ser

Ser

Asp

Lys

Val 470

Lys

Leu

Val

Glu

Asp 475

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu 480

Ala

Pro

Ile

Arg

His 485

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly 490

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin 495

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp 500

Asp

Glu

Ile

Gin

Val 505

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly 510

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu 515

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe 520

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile 525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly 530

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr 535

Pro

His

Met

Thr

His 540

Ser

His

Trp

Ile

Lys 545

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser 550

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala 555

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr 560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly 565

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser 570

Thr

Asp

His

Arg

Asp 575

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu 580

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu 585

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg 590

Val

Lys

Ala

Ala

Lys 595

Lys

Val

Pro

Leu

Asp 600

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn 605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val 610

Glu

Val

Lys

Asn

Gly 615

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro 620

His

Tyr

Asp

His

Tyr 625

His

Asn

Ile

Lys

Phe 630

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu 635

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala 640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr 645

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu 650

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr 655

Tyr

Val

Glu

His

Pro 660

Asn

Glu

Arg

Pro

His 665

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe 670

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp 675

His

Val

Arg

Lys

Asn 680

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp 685

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu 690

Asp

Lys

Gly

His

Asp 695

Glu

Val

Ser

Glu

Pro 700

Thr

His

Pro

Glu

Ser 705

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn 710

His

Ala

Gly

Leu

Asn 715

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn 720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser 725

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu 730

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala 735

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp 740

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro 745

Gin

Val

Glu

His

Ser 750

Val

Ile

Asn

Ala

Lys 755

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu 760

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys 765

Val

Thr

Asp

Pro

Ser 770

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala 775

Met

Glu

Thr

Leu

Thr 780

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser 785

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr 790

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr 795

Ile

Ser

Ala

Glu

Val 800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala 805

Leu

Leu

Lys

Lys

Ser 810

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile 815

Gin

<210> 93 <211> 816 <212> PRT <213> s. pneumoniae <400> 93

Cys Ser Tyr Glu Leu Gly Arg His Gin Ala Gly Gin Asp Lys Lys Glu 15 10 15

PL 206 576 B1

121

Ser

Asn

Arg

Val 20

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly 25

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin 30

Lys

Ala

Glu

Asn

Leu 35

Thr

Pro

Asp

Glu

Val 40

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly 45

Ile

Asn

Ala

Glu

Gin 50

Ile

Val

Ile

Lys

Ile 55

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr 60

Val

Thr

Ser

His

Gly 65

Asp

His

Tyr

His

Tyr 70

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val 75

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile 80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu 85

Leu

Met

Lys

Asp

Pro 90

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys 95

Asp

Ser

Asp

Ile

Val 100

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly 105

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys 110

Val

Asn

Gly

Lys

Tyr 115

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys 120

Asp

Ala

Ala

His

Ala 125

Asp

Asn

Ile

Arg

Thr 130

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys 135

Arg

Gin

Arg

Gin

Glu 140

His

Ser

His

Asn

His 145

Giy

Gly

Gly

Ser

Asn 150

Asp

Gin

Ala

Val

Val 155

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin 160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr 165

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile 170

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp 175

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr 180

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile 185

Val

Pro

His

Gly

Asn 190

His

Phe

His

Tyr

Ile 195

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu 200

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu 205

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala 210

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys 215

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro 220

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser 225

His

Asn

Ala

Asn

Pro 230

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu 235

Ser

Glu

Asn

His

Asn 240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro 245

Thr

Tyr

His

Gin

Asn 250

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile 255

Ser

Ser

Leu

Leu

Arg 260

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys 265

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg 270

His

Val

Glu

Ser

Asp 275

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp 280

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr 285

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg 290

Gly

Val

Ala

Val

Pro 295

His

Gly

Asn

His

Tyr 300

His

Phe

Ile

Pro

Tyr 305

Glu

Gin

Met

Ser

Glu 310

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile 315

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro 320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser 325

Asn

His

Trp

Val

Pro 330

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu 335

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin 340

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro 345

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn 350

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro 355

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp 360

Glu

Lys

Leu

Val

Lys 365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys 370

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr 375

Val

Phe

Glu

Glu

Asn 380

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr 385

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp 390

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr 395

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp 400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys 405

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser 410

His

Lys

Leu

Gly

Thr 415

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu 420

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg 425

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys 430

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu 435

Ala

Arg

Ile

His

Gin 440

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn 445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450 455 460

122

PL 206 576 B1

Val	Ser Ser Asp	Lys Val	Lys	Leu	Val Glu Asp	Ile	Leu	Ala	Phe	Leu
465		470			475					480
Ala	Pro Ile Arg	His Pro 485	Glu	Arg	Leu Gly Lys 490	Pro	Asn	Ser	Gin 495	Ile
Thr	Tyr Thr Asp 500	Asp Glu	Ile	Gin	Val Ala Lys 505	Leu	Ala	Gly 510	Lys	Tyr
Thr	Thr Glu Asp 515	Gly Tyr	Ile	Phe 520	Asp Pro Arg	Asp	Ile 525	Thr	Ser	Asp
Glu	Gly Asp Ala 530	Tyr Val	Thr 535	Pro	His Met Thr	His 540	Ser	His	Trp	Ile
Lys 545	Lys Asp Ser	Leu Ser 550	Glu	Ala	Glu Arg Ala 555	Ala	Ala	Gin	Ala	Tyr 560
Ala	Lys Glu Lys	Gly Leu 565	Thr	Pro	Pro Ser Thr 570	Asp	His	Gin	Asp 575	Ser
Gly	Asn Thr Glu 580	Ala Lys	Gly	Ala	Glu Ala Ile 585	Tyr	Asn	Arg 590	Val	Lys
Ala	Ala Lys Lys 595	Val Pro	Leu	Asp 600	Arg Met Pro	Tyr	Asn 605	Leu	Gin	Tyr
Thr	Val Glu Val 610	Lys Asn	Gly 615	Ser	Leu Ile Ile	Pro 620	His	Tyr	Asp	His
Tyr 625	His Asn Ile	Lys Phe 630	Glu	Trp	Phe Asp Glu 635	Gly	Leu	Tyr	Glu	Ala 640
Pro	Lys Gly Tyr	Thr Leu 645	Glu	Asp	Leu Leu Ala 650	Thr	Val	Lys	Tyr 655	Tyr
Val	Glu His Pro 660	Asn Glu	Arg	Pro	His Ser Asp 665	Asn	Gly	Phe 670	Gly	Asn
Ala	Ser Asp His 675	Val Arg	Lys	Asn 680	Lys Ala Asp	Gin	Asp 685	Ser	Lys	Pro
Asp	Glu Asp Lys 690	Gly His	Asp 695	Glu	Val Ser Glu	Pro 700	Thr	His	Pro	Glu
Ser 705	Asp Glu Lys	Glu Asn 710	His	Ala	Gly Leu Asn 715	Pro	Ser	Ala	Asp	Asn 720
Leu	Tyr Lys Pro	Ser Thr 725	Asp	Thr	Glu Glu Thr 730	Glu	Glu	Glu	Ala 735	Glu
Asp	Thr Thr Asp 740	Glu Ala	Glu	Ile	Pro Gin Val 745	Glu	His	Ser 750	Val	Ile
Asn	Ala Lys Ile 755	Ala Asp	Ala	Glu 760	Ala Leu Leu	Glu	Lys 765	Val	Thr	Asp
Pro	Ser Ile Arg 770	Gin Asn	Ala 775	Met	Glu Thr Leu	Thr 780	Gly	Leu	Lys	Ser
Ser 785	Leu Leu Leu	Gly Thr 790	Lys	Asp	Asn Asn Thr 795	Ile	Ser	Ala	Glu	Val 800
Asp	Ser Leu Leu Ala Leu Leu 805 <210> 94 <211> 816 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 94	Lys	Lys Ser Gin 810	Pro	Ala	Pro	Ile 815	Gin
Cys 1	Ser Tyr Glu	Leu Gly 5	Arg	His	Gin Ala Gly 10	Gin	Asp	Lys	Lys 15	Glu
Ser	Asn Arg Val 20	Ala Tyr	Ile	Asp	Gly Asp Gin 25	Ala	Gly	Gin 30	Lys	Ala
Glu	Asn Leu Thr 35	Pro Asp	Glu	Val 40	Ser Lys Arg	Glu	Gly 45	Ile	Asn	Ala

PL 206 576 B1

123

Glu

Gin 50

Ile Val

Ile Lys

Ile Thr Asp Gin Gly Tyr Val

Thr

Ser His

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

Arg

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

Arg

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

490

495

124

PL 206 576 B1

Thr

Tyr

Thr

Asp 500

Asp

Glu

Ile

Gin

Val 505

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly 510

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu 515

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe 520

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile 525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly 530

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr 535

Pro

His

Met

Thr

His 540

Ser

His

Trp

Ile

Lys 545

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser 550

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala 555

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr 560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly 565

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser 570

Thr

Asp

His

Gin

Asp 575

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu 580

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu 585

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg 590

Val

Lys

Ala

Ala

Lys 595

Lys

Val

Pro

Leu

Asp 600

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn 605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val 610

Glu

Val

Lys

Asn

Gly 615

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro 620

His

Tyr

Asp

His

Tyr 625

His

Asn

Ile

Lys

Phe 630

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu 635

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala 640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr 645

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu 650

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr 655

Tyr

Val

Glu

His

Pro 660

Asn

Glu

Arg

Pro

His 665

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe 670

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp 675

His

Val

Arg

Lys

Asn 680

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp 685

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu 690

Asp

Lys

Gly

His

Asp 695

Glu

Val

Ser

Glu

Pro 700

Thr

His

Pro

Glu

Ser 705

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn 710

His

Ala

Gly

Leu

Asn 715

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn 720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser 725

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu 730

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala 735

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp 740

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro 745

Gin

Val

Glu

His

Ser 750

Val

Ile

Asn

Ala

Lys 755

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu 760

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys 765

Val

Thr

Asp

Pro

Ser 770

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala 775

Met

Glu

Thr

Leu

Thr 780

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser 785

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr 790

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr 795

Ile

Ser

Ala

Glu

Val 800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala 805

Leu

Leu

Lys

Lys

Ser 810

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile 815

Gin

<210> 95 <211> 834 <212> PRT <213> Ξ. pneumoniae <400> 95

Cys 1

Ser

Tyr

Glu

Leu 5

Gly

Arg

His

Gin

Ala 10

Gly

Gin

Val

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val 20

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly 25

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin 30

Lys

Ala

Glu

Asn

Leu 35

Thr

Pro

Asp

Glu

Val 40

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly 45

Ile

Asn

Ala

Glu

Gin 50

Ile

Val

Ile

Lys

Ile 55

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr 60

Val

Thr

Ser

His

Gly 65

Asp

His

Tyr

His

Tyr 70

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val 75

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile 80

PL 206 576 B1

125

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu Leu Met 85

Lys

Asp

Pro Asn Tyr Gin Leu Lys Asp

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

Arg

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly

145

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

180

185

190

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gin

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Asn

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

Glu

Glu

Lys

Leu

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

370

375

380

Val

Pro

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

126

PL 206 576 B1

Thr Ser 530

Asp Glu Gly

Asp Ala 535

Tyr

Val

Thr

Pro

His 540

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

675

680

685

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Asn

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

690

695

700

Lys

Pro

Glu

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

705

710

715

720

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Val

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

725

730

735

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

740

745

750

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

ile

Pro

Gin

Val

Glu

Tyr

Ser

755

760

765

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Glu

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

770

775

780

Thr

Asp

Ser

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Val

Glu

Thr

Leu

Thr

Giy

Leu

785

790

795

800

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

805

810

815

Glu

val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

Ala

Pro

820

825

830

Ile

Gin

<210> 96 <211> 811 <212> PRT

<213>

S. i

pneumoniae

<400>

96

Cys

Ser Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Asp

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

70 75 80

PL 206 576 B1

127

Ile

Ser Glu

Glu Leu Leu 85

Met

Lys Asp

Pro Asn Tyr Gin Leu Lys

Asp

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

hys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

490

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

128

PL 206 576 B1

Glu Gly Asp 530

Ala

Tyr

Val

Thr Pro His Met Thr His

Ser

His

Trp

Ile

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

ASP

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

He

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Ile

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

810

<210> 97 <211> 811 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 97

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Asp

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

PL 206 576 B1

129

Gly

Lys

Tyr Tyr 115

Gly

Tyr Leu Lys 120

Asp Ala Ala

His

Ala 125

Asp

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

490

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545 550 555 560

130

PL 206 576 B1

Ala Lys

Glu

Lys

Gly 565

Leu

Thr Pro Pro

Ser Thr 570

Asp

His

Gin

Asp 575

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Ile

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

810

<210> 98 <211> 811 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 98

Cys 1

Ser Tyr Glu Leu 5

Gly Arg

His Gin

Ala Gly Gin Asp Lys 10

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

PL 206 576 B1

131

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

490

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580 585 590

132

PL 206 576 B1

Ala	Ala Lys Lys Val 595	Pro	Leu	Asp Arg Met 600	Pro Tyr Asn Leu Gin 605	Tyr
Thr	Val Glu Val Lys	Asn	Gly	Ser Leu Ile	Ile Pro His Tyr Asp	His
	610		615		620
Tyr	His Asn Ile Lys	Phe	Glu	Trp Phe Asp	Glu Gly Leu Tyr Glu	Ala
625		630			635	640
Pro	Lys Gly Tyr Thr	Leu	Glu	Asp Leu Leu	Ala Thr Val Lys Tyr	Tyr
	645			650	655
Val	Glu His Pro Asn	Glu	Arg	Pro His Ser	Asp Asn Gly Phe Gly	Asn
	660			665	670
Ala	Ser Asp His Val	Arg	Lys	Asn Lys Ala	Asp Gin Asp Ser Lys	Pro
	675			680	685
Asp	Glu Asp Lys Gly	His	Asp	Glu Val Ser	Glu Pro Thr His Pro	Glu
	690		695		700
Ser	Asp Glu Lys Glu	Asn	His	Ala Gly Leu	Asn Pro Ser Ala Asp	Asn
705		710			715	720
Leu	Tyr Lys Pro Ser	Thr	Asp	Thr Glu Glu	Thr Glu Glu Glu Ala	Glu
	725			730	735
Asp	Thr Thr Asp Glu	Ala	Glu	Ile Pro Gin	Val Glu His Ser Val	Ile
	740			745	750
Asn	Ala Lys Ile Ala	Asp	Ala	Glu Ala Leu	Leu Glu Lys Val Thr	Asp
	755			760	765
Pro	Ser Ile Arg Gin	Asn	Ala	Met Glu Thr	Leu Thr Gly Leu Lys	Ser
	770		775		780
Ser	Leu Leu Leu Gly	Thr	Lys	Asp Asn Asn	Thr Ile Ser Ala Glu	Val
785		790			795	800
Asp	Ser Leu Leu Ala	Leu	Leu	Lys Glu Ser	Lys
	805			810
	<210> 99
	<211> 811
	<212> PRT
	<213> S. pneumoniae
	<400> 99
Cys	Ser Tyr Glu Leu	Gly	Arg	His Gin Ala	Gly Gin Val Lys Lys	Glu
1	5			10	15
Ser	Asn Arg Val Ser	Tyr	Ile	Asp Gly Asp	Gin Ala Gly Gin Lys	Ala
	20			25	30
Glu	Asn Leu Thr Pro	Asp	Glu	Val Ser Lys	Arg Glu Gly Ile Asn	Ala
	35			40	45
Glu	Gin Ile Val Ile	Lys	Ile	Thr Asp Gin	Gly Tyr Val Thr Ser	His
	50		55		60
Gly	Asp His Tyr His	Tyr	Tyr	Asn Gly Lys	Val Pro Tyr Asp Ala	Ile
65		70			75	80
Ile	Ser Glu Glu Leu	Leu	Met	Lys Asp Pro	Asn Tyr Gin Leu Lys	Asp
	85			90	95
Ser	Asp Ile Val Asn	Glu	Ile	Lys Gly Gly	Tyr Val Ile Lys Val	Asp
	100			105	110
Gly	Lys Tyr Tyr Val	Tyr	Leu	Lys Asp Ala	Ala His Ala Asp Asn	Ile
	115			120	125
Arg	Thr Lys Glu Glu	Ile	Lys	Arg Gin Lys	Gin Glu Arg Ser His	Asn
	130		135		140
His	Asn Ser Arg Ala	Asp	Asn	Ala Val Ala	Ala Ala Arg Ala Gin	Gly
145		150			155	160
Arg	Tyr Thr Thr Asp	Asp	Gly	Tyr Ile Phe	Asn Ala Ser Asp Ile	Ile

165 170 175

PL 206 576 B1

133

Glu Asp Thr Gly Asp

Ala Tyr

Ile

Val 185

Pro His Gly Asp His 190

Tyr

His

180

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gin

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Asn

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

Glu

Glu

Lys

Leu

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

370

375

380

Val

Pro

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

610

615

620

134

PL 206 576 B1

Tyr	Asp His Tyr His Asn Ile Lys	Phe Glu Trp	Phe Asp Glu Gly Leu
625	630	635	640
Tyr	Glu Ala Pro Lys Gly Tyr Ser	Leu Glu Asp	Leu Leu Ala Thr Val
	645	650	655
Lys	Tyr Tyr Val Glu His Pro Asn	Glu Arg Pro	His Ser Asp Asn Gly
	660	665	670
Phe	Gly Asn Ala Ser Asp His Val	Gin Arg Asn	Lys Asn Gly Gin Ala
	675 680		685
Asp	Thr Asn Gin Thr Glu Lys Pro	Asn Glu Glu	Lys Pro Gin Thr Glu
	690 695		700
Lys	Pro Glu Glu Glu Thr Pro Arg	Glu Glu Lys	Pro Gin Ser Glu Lys
705	710	715	720
Pro	Glu Ser Pro Lys Pro Thr Glu	Glu Pro Glu	Glu Glu Ser Pro Glu
	725	730	735
Glu	Ser Pro Glu Glu Ser Glu Glu	Pro Gin Val	Glu Thr Glu Lys Val
	740	745	750
Lys	Glu Lys Leu Arg Glu Ala Glu	Asp Leu Leu	Gly Lys Ile Gin Asn
	755 760		765
Pro	Ile Ile Lys Ser Asn Ala Lys	Glu Thr Leu	Thr Gly Leu Lys Asn
	770 775		780
Asn	Leu Leu Phe Gly Thr Gin Asp	Asn Asn Thr	Ile Met Ala Glu Ala
785	790	795	800
Glu	Lys Leu Leu Ala Leu Leu Lys	Glu Ser Lys
	805	810
	<210> 100
	<211> 805
	<212> PRT
	<213> S. pneumoniae
	<400> 100
Cys	Ser Tyr Glu Leu Gly Arg His	Gin Ala Gly	Gin Asp Lys Lys Glu
1	5	10	15
Ser	Asn Arg Val Ala Tyr Ile Asp	Gly Asp Gin	Ala Gly Gin Lys Ala
	20	25	30
Glu	Asn Leu Thr Pro Asp Glu Val	Ser Lys Arg	Glu Gly Ile Asn Ala
	35 40		45
Glu	Gin Ile Val Ile Lys Ile Thr	Asp Gin Gly	Tyr Val Thr Ser His
	50 55		60
Gly	Asp His Tyr His Tyr Tyr Asn	Gly Lys Val	Pro Tyr Asp Ala Ile
65	70	75	80
Ile	Ser Glu Glu Leu Leu Met Lys	Asp Pro Asn	Tyr Gin Leu Lys Asp
	85	90	95
Ser	Asp Ile Val Asn Glu Ile Lys	Gly Gly Tyr	Val Ile Lys Val Asn
	100	105	110
Gly	Lys Tyr Tyr Val Tyr Leu Lys	Asp Ala Ala	His Ala Asp Asn Ile
	115 120		125
Arg	Thr Lys Glu Glu Ile Lys Arg	Gin Lys Gin	Glu Arg Ser His Asn
	130 135		140
His	Asn Ser Arg Ala Asp Asn Ala	Val Ala Ala	Ala Arg Ala Gin Gly
145	150	155	160
Arg	Tyr Thr Thr Asp Asp Gly Tyr	Ile Phe Asn	Ala Ser Asp Ile Ile
	165	170	175
Glu	Asp Thr Gly Asp Ala Tyr Ile	Val Pro His	Gly Asp His Tyr His
	180	185	190
Tyr	Ile Pro Lys Asn Glu Leu Ser	Ala Ser Glu	Leu Ala Ala Ala Glu
	195 200		205

PL 206 576 B1

135

Ala Tyr Trp Asn Gly Lys Gin Gly Ser

Arg

Pro

Ser 220

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

355

360

365

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

385

390

395

400

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

405

410

415

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

420

425

430

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

435

440

445

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

450

455

460

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

465

470

475

480

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

485

490

495

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

500

505

510

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

515

520

525

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

530

535

540

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

545

550

555

560

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

565

570

575

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

580

585

590

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

595

600

605

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

610

615

620

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

625

630

635

640

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

645 650 655

136

PL 206 576 B1

Pro

Asn Glu

Arg 660

Pro

His

Ser Asp Asn 665

Gly

Phe Gly Asn Ala 670

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

675

680

685

Lys

Pro

Asn

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

690

695

700

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

705

710

715

720

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

725

730

735

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Lys

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

740

745

750

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asn

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

755

760

765

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

770

775

780

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

785

790

795

800

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

<210> 101 <211> 807 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 101

Cys 1

Ser

Tyr

Glu

Leu 5

Gly

Arg

His

Gin

Ala 10

Gly

Gin

Val

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val 20

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly 25

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin 30

Lys

Ala

Glu

Asn

Leu 35

Thr

Pro

Asp

Glu

Val 40

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly 45

Ile

Asn

Ala

Glu

Gin 50

Ile

Val

Ile

Lys

Ile 55

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr 60

Val

Thr

Ser

His

Gly 65

Asp

His

Tyr

His

Tyr 70

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val 75

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile 80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu 85

Leu

Met

Lys

Asp

Pro 90

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys 95

Asp

Ser

Asp

Ile

Val 100

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly 105

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys 110

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr 115

Tyr

val

Tyr

Leu

Lys 120

Asp

Ala

Ala

His

Ala 125

Asp

Asn

Ile

Arg

Thr 130

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys 135

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu 140

Arg

Ser

His

Asn

His 145

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp 150

Asn

Ala

Val

Ala

Ala 155

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly 160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp 165

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe 170

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile 175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly 180

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val 185

Pro

His

Gly

Asn

His 190

Phe

His

Tyr

Ile

Pro 195

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser 200

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala 205

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr 210

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin 215

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser 220

Ser

Ser

Ser

Ser

His 225

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala 230

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser 235

Glu

Asn

His

Asn

Leu 240

PL 206 576 B1

137

Thr

Val

Thr

Pro

Thr 245

Tyr

His Gin Asn Gin Gly Glu Asn 250

Ile

Ser 255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Ser

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Val

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Lys

Asn

Gly

370

375

380

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Glu

Asp

Val

Pro

Ser

Asp

Lys

val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

He

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

675

680

685

138

PL 206 576 B1

Asp

Thr 690

Asn

Gin

Thr Glu Lys 695

Pro

Ser Glu Glu

Lys 700

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

705

710

715

720

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

725

730

735

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

740

745

750

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

755

760

765

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

770

775

780

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

785

790

795

800

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

<210> 102 <211> 821 <212> PRT <213> S. pneumoniae <400> 102

Cys 1

Ala

Tyr

Glu

Leu 5

Gly

Leu

His

Gin

Ala 10

Gin

Thr

Val

Lys

Glu 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser 20

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys 25

Gin

Ala

Thr

Gin

Lys 30

Thr

Glu

Asn

Leu

Thr 35

Pro

Asp

Glu

Val

Ser 40

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile 45

Asn

Ala

Glu

Gin

Ile 50

Val

Ile

Lys

Ile

Thr 55

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val 60

Thr

Ser

His

Gly

Asp 65

His

Tyr

His

Tyr

Tyr 70

Asn

Gly

Lys

Val

Pro 75

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile 80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 85

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 90

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp 95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn 100

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly 105

Tyr

Val

ile

Lys

Val 110

Asn

Gly

Lys

Tyr

Tyr 115

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 120

Ala

Ala

His

Ala

Asp 125

Asn

Val

Arg

Thr

Lys 130

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg 135

Gin

Lys

Gin

Glu

His 140

Ser

Gin

His

Arg

Glu 145

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala 150

Asn

Asp

Gly

Ala

Val 155

Ala

Phe

Ala

Arg

Ser 160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr 165

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr 170

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser 175

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp 180

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr 185

Ile

Val

Pro

His

Gly 190

Asp

His

Tyr

His

Tyr 195

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu 200

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu 205

Leu

Ala

Ala

Ala

Glu 210

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly 215

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser 220

Asn

Leu

Arg

Thr

Tyr 225

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser 230

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg 235

Thr

Asn

Trp

Val

Pro 240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro 245

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr 250

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn 255

Ser

Asn

Thr

Asn

Ser 260

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser 265

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser 270

Leu

Leu

PL 206 576 B1

139

Lys Gin Leu Tyr

Lys

Leu Pro Leu Ser Gin Arg His Val

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

290

295

300

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

305

310

315

320

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

325

330

335

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

340

345

350

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

355

360

365

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

370

375

380

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

385

390

395

400

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

405

410

415

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

420

425

430

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

435

440

445

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

450

455

460

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

465

470

475

480

Asp

Val

Ser

Ser

Asp 485

Lys

Val

Lys

Leu

Val 490

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala 495

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile 500

Arg

His

Pro

Glu

Arg 505

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn 510

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr 515

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile 520

Gin

Val

Ala

Lys

Leu 525

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr 530

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr 535

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg 540

Asp

ile

Thr

Ser

Asp 545

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr 550

Val

Thr

Pro

His

Met 555

Thr

His

Ser

His

Trp 560

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser 565

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu 570

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin 575

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu 580

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro 585

Pro

Ser

Thr

Asp

His 590

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn 595

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly 600

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr 605

Asn

Arg

Val

Lys

Ala 610

Ala

Lys

Lys

Val

Pro 615

Leu

Asp

Arg

Met

Pro 620

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr 625

Thr

Val

Glu

Val

Lys 630

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile 635

Ile

Pro

His

Tyr

Asp 640

His

Tyr

His

Asn

Ile 645

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe 650

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr 655

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly 660

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp 665

Leu

Leu

Ala

Thr

Val 670

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu 675

His

Pro

Asn

Glu

Arg 680

Pro

His

Ser

Asp

Asn 685

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala 690

Ser

Asp

His

Val

Gin 695

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly 700

Gin

Ala

Asp

Thr

Asn 705

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro 710

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro 715

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro 720

140

PL 206 576 B1

Glu Glu Glu Thr Pro

Arg Glu

Glu Lys

Pro Gin Ser Glu 730

Lys

Pro 735

Glu

725

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

740

745

750

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

755

760

765

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

770

775

780

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

785

790

795

800

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

805

810

815

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

820

Zastrzeżenia patentowe

Claims (25)

1. Izolowany polinukleotyd wybrany spośród (a) izolowanego polinukleotydu kodującego polipeptyd zawierają cy sekwencję aminokwasów identyczną w co najmniej 95% z sekwencją aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 73, 74, 77 lub 79, przy czym polipeptyd ten jest zdolny do wytwarzania przeciwciała wykazującego specyficzność wiązania wobec polipeptydu zawierającego sekwencję aminokwasów nr 4 lub 14, oraz polipeptyd ten jest zdolny do wywoływania u osobnika reakcji immunologicznej na paciorkowce;

(b) izolowanego polinukleotydu kodującego polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79;

(c) izolowanego polinukleotydu zawierają cego sekwencję nukleotydową identyczną w co najmniej 95% z sekwencją nukleotydową nr 3, 12 lub 13, przy czym polinukleotyd ten koduje polipeptyd zdolny do wytwarzania przeciwciała wykazującego specyficzność wiązania wobec polipeptydu zawierającego sekwencję aminokwasów nr 4 lub 14, oraz ten izolowany polipeptyd jest zdolny do wywoływania u osobnika reakcji immunologicznej na paciorkowce;

(d) izolowanego polinukleotydu zawierają cego sekwencję nukleotydową nr 3, 12 lub 13; lub (e) izolowanego polinukleotydu komplementarnego z polinukleotydem określonym w którymkolwiek z punktów (a)-(d) powyżej.

2. Polinukleotyd według zastrzeżenia 1, znamienny tym, że ma postać DNA.

3. Polinukleotyd według zastrzeżenia 1, znamienny tym, że ma postać RNA.

4. Wektor zawierający polinukleotyd określony w zastrzeżeniu 1, znamienny tym, że ten polinukleotyd jest funkcjonalnie połączony z regionem kontroli ekspresji.

5. Komórka gospodarza transfekowana lub transformowana za pomocą wektora okreś lonego w zastrzeż eniu 4.

6. Sposób wytwarzania polipeptydu kodowanego przez polinukleotyd określony w zastrzeżeniu 1, znamienny tym, że obejmuje hodowlę komórek gospodarza określonych w zastrzeżeniu 5 w warunkach odpowiednich do uzyskania ekspresji tego polipeptydu.

7. Sposób według zastrzeżenia 6, znamienny tym, że ponadto obejmuje izolowanie polipeptydu z hodowli komórek gospodarza.

8. Sposób według zastrzeżenia 6, znamienny tym, że polipeptyd jest polipeptydem rekombinowanym.

9. Izolowany polipeptyd zawierają cy (a) sekwencję aminokwasów identyczną w co najmniej 95% z sekwencją aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 63, 73, 74, 77 lub 79, przy czym ten izolowany polipeptyd jest zdolny do wytwarzania przeciwciała wykazującego specyficzność wiązania wobec polipeptydu zawierającego sekwencję aminokwasów nr 4 lub 14, oraz polipeptyd ten jest zdolny do wywoływania u osobnika reakcji immunologicznej na paciorkowce; lub (b) sekwencję aminokwasów nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79.

10. Izolowany polipeptyd według zastrzeżenia 9, znamienny tym, że z sekwencji nr 4 lub 14 usunięta jest N-terminalna reszta metioninowa.

11. Izolowany polipeptyd według zastrzeżenia 9, znamienny tym, że z sekwencji nr 4 lub 14 usunięta jest wydzielnicza sekwencja aminokwasów.

PL 206 576 B1

141

12. Izolowany polipeptyd według zastrzeżenia 9 albo 10, albo 11, znamienny tym, że izolowany polipeptyd jest przyłączony do sacharydu.

13. Izolowany polipeptyd według zastrzeżenia 9, znamienny tym, że paciorkowiec jest wybrany spośród Streptococcus pneumoniae, grupy A Streptococcus (Streptococcus pyogenes), grupy B Streptococcus (Streptococcus agalactiae), Streptococcus dysgalactiae, lub Streptococcus uberis.

14. Izolowany polipeptyd według zastrzeżenia 9, znamienny tym, że paciorkowcem jest Streptococcus pneumoniae.

15. Chimeryczny polipeptyd wybrany spośród (a) chimerycznego polipeptydu zawierającego dwa lub większą liczbę polipeptydów, przy czym sekwencja aminokwasów każdego z dwóch lub większej liczby peptydów zawiera sekwencję aminokwasów wybraną spośród sekwencji nr 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79, zaś dwa lub większa liczba polipeptydów jest połączona z utworzeniem chimerycznego polipeptydu;

(b) chimerycznego polipeptydu zawierającego dwa lub większą liczbę polipeptydów, przy czym sekwencja aminokwasów każdego z dwóch lub większej liczby peptydów zawiera sekwencję aminokwasów wybraną spośród sekwencji nr 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77, zaś dwa lub większa liczba polipeptydów jest połączona z utworzeniem chimerycznego polipeptydu;

(c) chimerycznego polipeptydu o wzorze (I):

A-(B)m-(C)n-D (I) w którym: m oznacza 0 lub 1, n oznacza 0 lub 1,

A jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79;

B jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79;

C jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79; oraz

D jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 72, 73, 74, 77 lub 79; lub (d) chimerycznego polipeptydu o wzorze (I):

A-(B)m-(C)n-D (I) w którym: m oznacza 0 lub 1, n oznacza 0 lub 1,

A jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77;

B jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77;

C jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77; oraz

D jest wybrane spoś ród sekwencji nr: 58, 60, 62, 67, 68, 72, 74 lub 77.

16. Chimeryczny polipeptyd według zastrzeżenia 15, znamienny tym, że izolowany polipeptyd jest przyłączony do sacharydu.

17. Kompozycja do szczepionek, znamienna tym, że zawiera (a) skuteczną profilaktycznie lub terapeutycznie ilość polipeptydu określonego w którymkolwiek z zastrzeż eń 9-14, oraz farmaceutycznie akceptowalny nośnik lub rozcieńczalnik; lub (b) skuteczną profilaktycznie lub terapeutycznie ilość chimerycznego polipeptydu określonego w zastrzeżeniu 15 lub 16, oraz farmaceutycznie akceptowalny nośnik lub rozcieńczalnik.

18. Kompozycja do szczepionek według zastrzeżenia 17, znamienna tym, że zawiera ponadto farmaceutycznie akceptowalny adiuwant.

19. Kompozycja do szczepionek według zastrzeżenia 17 albo 18 do zastosowania w zapobieganiu lub leczeniu zakażenia osobnika paciorkowcem.

20. Zastosowanie kompozycji określonej w zastrzeżeniu 17 albo 18 do wytwarzania leku do leczenia lub zapobiegania zakażeniu osobnika paciorkowcem.

21. Zastosowanie według zastrzeżenia 20, znamienne tym, że zakażenie paciorkowcem obejmuje zapalenie opon, zapalenie ucha środkowego, bakteriemię lub zapalenie płuc.

22. Zastosowanie według zastrzeżenia 20, znamienne tym, że osobnikiem jest ssak.

23. Zastosowanie według zastrzeżenia 20, znamienne tym, że osobnikiem jest człowiek.

24. Zastosowanie według zastrzeżenia 20, znamienne tym, że zakażenie paciorkowcem jest wywołane przez Streptococcus pneumoniae, grupę A paciorkowców (Streptococcus pyogenes), grupę B paciorkowców (Streptococcus agalactiae), Streptococcus dysgalactiae lub Streptococcus uberis.

25. Zastosowanie według zastrzeżenia 20, znamienne tym, że zakażenie paciorkowcem jest wywołane przez Streptococcus pneumoniae.