CZ303675B6 - Izolovaný polynukleotid, vektor, hostitelská bunka, zpusob produkce, izolovaný polypeptid, chimérový polypeptid, vakcinacní prostredek a pouzití - Google Patents

Abstract

Popisují se streptokokové proteiny a polynukleotidy, které je kódují. Uvedené proteiny jsou antigenní, a proto jsou pouzitelnými vakcinacními komponenty pri profylaxi nebo terapii streptokokové infekce. Také se popisují rekombinantní zpusoby produkce proteinových antigenu stejne jako zpusoby diagnózy detekující streptokokovou bakteriální infekci.

Description

Izolovaný polynukleotid, vektor, hostitelská buňka, způsob produkce, izolovaný polypeptid, chimérový polypeptid, vakcinační prostředek a použití

Oblast techniky

Popisují se antigeny, zvláště pak proteinové antigeny patogenu Streptococcus pneumoniae, kleré se používají jako vakcinační komponenty při terapii a/nebo profylaxi.

Dosavadní stav techniky

Mikroorganizmus 5.pneumoniae je důležité agens onemocnění u lidí, zvláště mezi novorozenci, u přestárlých a u imunokompromitovaných osob. Je to bakterie, často izolovaná po celém světě u is pacientů s invazivním onemocněním, jako je bakteriémie/septikémie, pneumoniae, meningitida, vykazující vysokou morbiditu a mortalitu. Dokonce i přes vhodnou léčbu antibiotiky vede pneumokokové infekce k řadě úmrtí. Ačkoli příchod antimikrobiálních léků snížil celkovou úmrtnost při pneumokokovém onemocnění, hlavním problémem v dnešní době je existence rezistentních pneumokoků. Účinné pneumokokové vakcíny by mohly mít hlavní dopad na morbiditu a morta20 litu spojenou s onemocněním způsobeným mikroorganizmem S.pneumoniae. Takové vakcíny se mohou také potencionálně použít při prevenci zánětu středního ucha u kojenců a malých dětí.

Úsilí spojené s vývojem pneumokokové vakcíny se obecně koncentrovalo na vytvoření imunitních odezev na pneumokokový kapsulámí polysacharid. Identifikovalo se více než 80 pneumoko25 kových kapsulámích sérotypů na bázi antigenních rozdílů. V současné době dostupná pneumokoková vakcína obsahující 23 kapsulámích polysacharidu, které nejčastěji způsobují onemocnění, vykazuje podstatné nedostatky spojené primárně s nízkou imonogenností některých kapsulámích polysacharidů, rozmanitost sérotypů a rozdíly při distribuci sérotypů v čase, v geografických oblastech a ve věkových skupinách. Selhání existujících vakcín a kapsulámích konjugovaných vakcín, kteréjsou v současné době ve vývoji, za účelem ochrany malých dětí proti všem sérotypům mikroorganizmu S.pneumoniae podporuje hodnoceni jiných komponentů uvedeného mikroorganizmu. Ačkoli imunogennost kapsulámích polysacharidů se může zlepšit, specifita sérotypů bude stále představovat hlavní omezení vakcín založených na polysacharidech. Použití antigenně konzervativního imunogenního pneumokokového proteinového antigenu buď samotné35 ho nebo v kombinaci s dalšími komponenty nabízí možnost pneumokokové vakcíny založené na proteinu.

Přihláška WO98/18930 zveřejněná 7. 5. 1998 nazvaná „Steptococcus Pneumoniae antigens and vaccines“ popisuje jisté polypeptidy, kteréjsou antigenní. Avšak nepopisuje se žádná biologická aktivita těchto polypeptidů.

Proto existuje nutnost najít streptokokové antigeny, které se mohou použít jako vakcinační komponenty pro profylaxi a/nebo terapii streptokokové infekce.

Podstata vynálezu

Vynález se týká izolovaného polynukleotidu, který kóduje polypeptid vybraný z

a) polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 95 % se sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 58, 60, 63, 73, 74, nebo 79

b) polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 99% se sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 63, 73, 74 nebo 79, a

c) polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID č. 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79,

- H přičemž kódovaný polypeptid je schopný u jedince vyvolat imunitní odpověď na Streptokoka.

Vynález dále popisuje vektory obsahující výše uvedený polynukleotid operativně spojený 5 s oblastí řídící expresi, stejně jako hostitelské buňky transfekované uvedenými vektory a metody produkující polypeptidy, které zahrnují kultivaci uvedených hostitelských buněk za podmínek vhodných pro expresi.

Dále vynález popisuje nové polypeptidy kódované polynukleotidy podle vynálezu.

Dále vynález popisuje izolovaný polypeptid vybraný z

a) izolovaného polypeptidů zahrnujícího aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 95 % s aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 58, 60, 63, 73, 74 nebo 79,

b) izolovaného polypeptidů zahrnujícího aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z

99 % s aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 73, 74 nebo 79, nebo

c) izolovaného polypeptídu zahrnujícího aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79, přičemž izolovaný polypeptid je schopný u jedince vyvolat imunitní odpověď na Streptokoka.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid, který vykazuje alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem vykazujícím sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81, 83 nebo s jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid, který má alespoň 95% shodu s druhým polypeptidem, který obsahuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81, 83 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 4, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81,83 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s dru35 hým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 4, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81,83 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 4, 8, 10, 14, 16, 55 až

75, 77 až 79 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 8, 10, 16, 55, 56, 57, 58, 59, 64, 65, 66, 78 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 8, 10, 16, 55, 56, 57, 59, 64, 65, 66, 78 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 4, 14, 58, 60, 61, 62, 63,

67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 77, 79 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

-2CZ 303675 B6

Příklad 12:

Tento příklad popisuje klonování a expresi chimérového genu kódujícího chiméro vý polypeptid odpovídající karboxy koncové oblasti BVH-3 ve fúzi na C-konci s karboxy-terminální oblastí

BVH-11 a dodatečné ochrany pozorované po vakcinaci chimérovým polypeptidem.

Ze studie popsané shora v textuje zřejmé, že BVH-3 a BVH-11 jsou serologicky odlišné molekuly, kteréjsou současně přítomny na mikroorganizmu S.pneumoniae. Výsledky imunologických studií myší ukazují, že oba proteiny jsou dobrými kandidáty na vakcínu. Tyto proteiny mají io potenciál poskytovat ochranu proti všem pneumokokům bez ohledu na sérotyp. Přestože tyto dva proteiny sdílí epitopy a sekvence, vykazují různé charakteristiky a mohou sloužit k různým biologickým funkcím. Tudíž imunizace proti dvěma proteinům může poskytnout lepší ochranu než, když probíhá každá jednotlivě. Aby se toto dalo testovat, může se zkoumat několik cest, kde se aplikuje BVH-3 a BVH-11 v plné délce nebo ve zkrácené formě v kombinaci nebo v konjugaci, is Popisuje se genetické inženýrství fúzního genu BVH-3-BVH-11 a protein nazvaný NEW12 (SEQ ID NO: 76 a SEQ ID NO: 58) a potencionální použití proteinu NEW 12 jako vakcíny.

Genové fragmenty BVH-3 a BVH-11 odpovídající 3'konci genů, které se amplifikovaly pomocí

PCR za použití párů oligonukleotidů připravených tak, aby se amplifikovaly fragmenty překrý20 vající nukleotidy 1414 až 3117 (SEQ ID NO: 1) a nukleotidy 1060 až 2520 (SEQ ID NO: 3) z mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP64 genů BVH-3 a BVH-11. Používané primery

HAMJ278 a HAMJ279, HAMJ282 a HAMJ283 měly na 5'konci místo rozeznávané restrikční endonukleázou, což umožňuje přímé klonování amplifikováného produktu do rámce štěpeného plazmidového vektoru pET21b(+) (tabulka č. 2). Produkty amplifikované PCR se štěpily restrikčními endonukleázami a ligovaly se do linearizovaného plazmidového vektoru pET21b( ·) štěpeného podobným způsobem. Výsledné plazmidové konstrukce se potvrdily analýzou nukleotidové sekvence, Rekombinantní plazmid pET21b(+) obsahující PCR produkt Ndel-HindlII BVH-3 se linearizoval štěpením restrikčními enzymy HindlII a Notl pro klonování do rámce HindlII-Notl fragmentu DNA získaného z rekombinantního vektoru pET21(+), který obsahuje fragment genu BVH-11. Klony se nejdříve stabilizovaly v mikroorganizmu E. coli DH5a a pak se zavedly do mikroorganizmu A. coli BL21(XDE3) za účelem exprese chimérové molekuly pneumokokového proteinu. Rekombinantní chimérový polypeptid nazvaný NEW 12 se exprimoval jako C-terminální fúze s His-tag. Exprimovaný rekombinantní protein NEW 13 se čistil z frakcí supematantů získaných z centrifugace sonikovaných kultur mikroorganizmu E. coli indukovaných 1PTG za použití pryskyřice His-Bind s cheláty kovů (QIAgen, Chatsworth, CA).

Podle stejného postupu popsaného shora v textuje možné zkonstruovat jiné chimérové polypeptidy, jako výsledek současné exprese New 1 a New 4, New 1 a New 5, New 1 a New 10 nebo New 1 a New 14. Konstrukce se může provést tak, že New 1 leží proti směru exprese nebo po směru exprese New 4, New 5, New 10, BVH-11B nebo New 14. Je také možné zkonstruovat jiné chimérové poíypeptidy, jako výsledek současné exprese více jak dvou fragmentů libovolného BVH-3, BVH-11 nebo BVH-11-2.

Skupiny 8 samic myší BALB/c (Charles River) se imunizovaly podkožně dvakrát v tří týdenních intervalech s 25 pg buď His«Tag-fúze NEW1 čištěného na základě afinity BVH-1 IB nebo proteinu NEW 12 v přítomnosti 15 pg adjuvans QuilA. Deset až čtrnáct dní po poslední imunizaci se myším aplikovala zesilovací dávka virulentního S.pneumoniae. Jak se ukázalo dříve, molekuly NEW1 a BVH-1 IB obsahující aminokyseliny 472 až 1039 z proteinu BVH-3 a aminokyseliny 354 a 840 z proteinu BVH-11, odpovídají částem proteinů schopným vyvolat ochrannou imunit50 ní odezvu. Aby se stanovilo, zda chimérový polypeptid podstatně zlepší ochranu ve srovnání s proteiny tvořící jednotlivé části, zesilovací dávka se provedla způsobem, kdy se neočekávaná ochrana s molekulami NEW1 a BVH-1 B. Je zajímavé, že chimérový protein NEW12 vyvolal ochranu proti myším virulentním kmenům WU2 a P4201. Sedm z osmi myší imunizovaných sNEW12 jsou stále živé 10 dní po zesilovací dávce, zatímco 28 myší z 32 imunizovaných

-34CZ 303675 B6

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 60 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 62 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

io Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 64 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s dru15 hým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 67 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 68 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 69 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 72 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 74 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s dru35 hým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 77 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále je popsán izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vykazující alespoň 70% shodu s druhým polypeptidem, který vykazuje sekvenci vybranou z SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10 nebo jeho fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81,83 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sek50 věnci SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81, 83 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

-4CZ 303675 R6

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 2, 4, 10, 14, 16 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 2 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 4 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

io

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 10 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci 15 SEQ ID NO: 14 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 16 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 55 až 75, 77, 78, 79 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 72, 74, 77 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 58 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 62 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 64 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci 45 SEQ ID NO: 67 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvencí SEQ ID NO: 68 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci SEQ ID NO: 74 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí obsahující sekvenci

SEQ ID NO: 77 nebojejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

-5CZ 303675 B6

V dalším provedení vynálezu se také popisují chimémí polypeptidy, které obsahují jeden nebo více polypeptidu nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

Vjíném provedení vynálezu se také popisují chimémí polypeptidy, které obsahují jeden nebo více polypeptidů nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty, jako je uvedeno na obrázcích.

V dalším provedení vynálezu se popisuje chimémí polypeptid zahrnující dva nebo více polypeptidů, kde aminokyselinová sekvence každého ze dvou nebo více polypeptidů zahrnuje aminokyselinovou sekvenci vybranou z aminokyselinové sekvence uvedené v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79, kde dva nebo více polypeptidů jsou spojené za vzniku chimérního polypeptidu, přičemž kódovaný polypeptid je schopný u jedince vyvolat imunitní odpověď na Streptokoka.

Vynález dále popisuje chimémí polypeptid uvedený výše, kde chimémí polypeptid obsahuje dva nebo více polypeptidů, kde aminokyselinová sekvence každého ze dvou nebo více polypeptidů zahrnuje aminokyselinovou sekvenci vybranou z aminokyselinové sekvence uvedené v SEQ ID ě. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77, kde dva nebo více polypeptidů jsou spojené za vzniku chimémího polypeptidu.

Dále jsou popsány chimémí polypeptidy, které obsahují dva nebo více polypeptidů vybraných ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 2„ 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81, 83 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty jsou spojeny a tvoří chimémí polypeptid.

Dále je popsán chimérní polypeptid obsahující dva nebo více polypeptidů vybraných z SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty, přičemž polypeptidy nebo fragmenty, analogy nebo deriváty jsou spojeny a tvoří chimérní polypeptid.

Dále je popsán chimémí polypeptid obsahující dva nebo více polypeptidů vybraných z SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 74, 77 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty, přičemž polypeptidy nebo fragmenty, analogy nebo deriváty jsou spojeny a tvoří chimémí polypeptid.

V dalším provedení chimémí polypeptid obsahuje dva nebo více polypeptidů vybraných z SEQ ID NO: 10, 62, 64, 67, 68, 74, 77 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty, přičemž polypeptidy nebo fragmenty, analogy nebo deriváty jsou spojeny a tvoří chimémí polypeptid.

V dalším provedení chimémí polypeptid obsahuje mezi 2 a 5 polypeptidy,

V dalším provedení vynálezu chimémí polypeptid obsahuje mezi 2 až 4 polypeptidy.

V dalším provedení vynálezu chimémí polypeptid obsahuje mezi 2 až 3 polypeptidy,

V dalším provedení vynálezu chimérní polypeptid obsahuje 2 polypeptidy.

V dalším provedení vynálezu se popisuje chimémí polypeptid výše uvedený, obecného vzorce (I):

A-(B)_m-(C)_n-D (I) kde m je 0 nebo 1, n je 0 nebo 1,

Aje vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79;

-6CZ 303675 B6

B je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79;

C je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79; a

D je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14. 58, 60, 62. 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79.

V dalším provedení vynálezu je výše uvedený chimérní polypeptid obecného vzorce (I);

A-CBj^O-D (I) kde m je 0 nebo 1, n je 0 nebo 1,

A je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77;

B je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77;

C je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77; a

D je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77.

V dalším provedení vynálezu je popsán výše uvedený chimémí polypeptid, kde chimérní polypeptid je fúzovaný se sacharidem.

Dále je popsán chimérní polypeptid kde symbol A vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů, symbol B vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů, symbol C vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů a symbol D vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 72, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů.

V dalším provedení se symbol Λ vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů, symbol B vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů, symbol C vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 74, 77 nebo jejich fragmentů, analogů nebo derivátů a symbol D vybral ze sekvencí SEQ ID NO: 10, 58, 60, 62, 64, 67, 68, 69, 74, 77 nebo jejich frag50 mentů, analogů nebo derivátů.

V jiném provedení vynálezu chimérové polypeptidy podle vynálezu obsahují ty polypeptidy, kde jsou přítomny následující provedení buď nezávisle nebo v kombinaci.

-7 CZ 303675 B6

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 10, 58, 62, 64, 67, 68, 74, 77 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 10 nebo její fragmenty, analogy nebo 5 deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 58 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 58 nebo její fragmenty, analogy nebo io deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 62 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 64 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 67 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 68 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO: 74 nebo její fragmenty, analogy nebo 25 deriváty.

V dalším provedení symbol A je sekvence SEQ ID NO deriváty.

nebo její fragmenty, analogy nebo

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: 10, 58, 62, 64, 67, 68, 74, 77 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: 10 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: 58 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: deriváty.

nebo její fragmenty, analogy nebo

V dalším provedení symbol deriváty.

B je sekvence SEQ ID NO:

nebo její fragmenty, analogy nebo

V dalším provedení symbol deriváty.

B je sekvence SEQ ID NO:

nebo její fragmenty, analogy nebo

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: 68 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: 74 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol B je sekvence SEQ ID NO: 77 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

-8C7. 303675 B6

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 10, 58, 62, 64, 67, 68, 74, 77 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 10 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 58 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

io

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 62 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 64 nebo její fragmenty, analogy nebo 15 deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 67 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 68 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 74 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol C je sekvence SEQ ID NO: 77 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 10, 58, 62, 64, 67, 68, 74, 77 nebo její 30 fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 10 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 58 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 62 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 64 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 67 nebo její fragmenty, analogy nebo 45 deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 68 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 74 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

V dalším provedení symbol D je sekvence SEQ ID NO: 77 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

-9CZ 303675 B6

V dalším provedení vynálezu symbol m je 0.

V dalším provedení vynálezu symbol n je 0.

V dalším provedení vynálezu symbol m a n jsou 0.

V dalším provedení vynálezu symbol man jsou 0, symbol A je sekvence SEQ ID NO: 64 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty, symbol B je sekvence SEQ ID NO: 62 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty. V jiném provedení vynálezu symbol man jsou 0, symbol A je io sekvence SEQ ID NO: 62 nebo její fragmenty, analogy nebo deriváty.

Dále jsou popsány všechny nukleotidy kódující polypeptidy a chimérové polypeptidy.

V dalším provedení vynálezu polypeptidy nebo chimérové polypeptidy v souladu s vynálezem is jsou antigenní.

V dalším provedení vynálezu polypeptidy nebo chimérové polypeptidy se mohou vyvolat imunitní odpověď u jedince.

V dalším provedení vynálezu se také popisují polypeptidy, které jsou schopny vyvolat protilátky, které mají vazebnou specifitu pro polypeptidy nebo chimérové polypeptidy podle vynálezu, jak se definuje shora v textu.

Protilátky, které „vykazují vazebnou specifitu“ jsou protilátky, které rozeznávají a váží se na vybraný polypeptid, ale které v podstatě nerozeznávají a neváží se najiné molekuly ve vzorku, které přirozeně zahrnují vybraný peptid. Specifické navázání se může stanovit za použití testu ELISA, kde se vybraný polypeptid používá jako antigen.

Pokud není definováno jinak, všechny zde používané technické a vědecké termíny mají stejný význam, který je běžný v oboru, do kterého vynález spadá. Všechny publikace, patentové přihlášky, patenty a jiné zde uvedené reference jsou zahrnuty jako celek. V případě konfliktu se budou kontrolovat přítomné specifikace zahrnující definice. Navíc materiály, metody a příklady jsou pouze ilustrativní nejsou omezující.

Termín „fragmenty“, „deriváty“ nebo „analogy“ popsaných póly peptidů zahrnují ty polypeptidy, kde jeden nebo více aminokyselinových zbytků se nahradily konzervativním nebo nekonzervativním aminokyselinovým zbytkem (výhodně konzervativním) a který může být přirozený nebo nepřirozený. V jednom provedení deriváty a analogy polypeptidů podle vynálezu budou vykazovat přibližně 70% shodu se sekvencemi uvedenými na obrázcích nebo s jejich fragmenty. To znamená, že 70 % zbytků je stejných. V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homologii vyšší než 75 %. V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homologii vyšší než 80 %.

V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homologii vyšší než 80 %. V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homologii vyšší než 85 %. V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homologii vyšší než 90 %. V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homolo45 gií vyšší než 95 %. V dalším provedení polypeptidy budou vykazovat homologii vyšší než 99 %.

V dalším provedení deriváty a analogy polypeptidů podle vynálezu budou vykazovat méně než přibližně 20 substitucí, úprav nebo delecí aminokyselinových zbytků, výhodné je méně než 10. Preferované substituce jsou ty, co jsou v oboru známé jako konzervované, to znamená, že substituované zbytky sdílí fyzikální nebo chemické vlastnosti, jako je hydrofóbnost, velikost, náboj nebo funkční skupiny.

Vynález popisuje polypeptidy, které zahrnují polypeptidy a chimérové polypeptidy.

Vynález dále popisuje polypeptidy, které fúzují sjinými sloučeninami, které mění biologické nebo farmakologické vlastnosti polypeptidů. To je polyethylenglykol (PEG), který zvyšuje polo- 10 CZ 303675 B6 čas rozpadu, vedoucí nebo sekreční aminokyselinové sekvence, které zjednodušují čištění, prepro- a prosekvence a (poly)sacharidy.

Dále v těchto situacích, kde se zjistilo, že aminokyselinové oblasti jsou polymorfní, může být nutné změnit jednu nebo více určitých aminokyselin, aby se účinněji napodobily různé epitopy různých streptokokových kmenů.

Polypeptidy podle vynálezu se však mohou upravovat terminál ní -NH₂ acylací (například acetylací nebo amidací thioglykolovou kyselinou, terminální karboxyamidací, například amoniakem nebo methylaminem), což způsobuje vyšší stabilitu, zvýšení hydrofóbnosti pro spojení nebo navázání na podklad nebo na jinou molekulu.

Vynález dále popisuje hetero- a homopolypeptidové multiméry polypeptidových fragmentů, analogů a derivátů. Tyto polymemí formy zahrnují například jeden nebo více polypeptidů, které se síťují například jeden nebo více polypeptidů, které se síťují pomocí síťovacích činidel, jako je avidin/biotik, gluteraldehyd nebo dimethylsuperimidát. Takové polymemí formy také zahrnují polypeptidy obsahující dva nebo více tandemových nebo obrácených kontinuálních sekvencí, které vznikají z multicistronní mRNA vytvořené technologií rekombinace DNA. Je výhodné, aby fragment, analog nebo derivát polypeptidů podle vynálezu obsahoval alespoň jednu antigenní oblast, to je alespoň jeden epitop.

Aby se dosáhlo vytvoření antigenních polymerů (to je syntetických multímérů), mohou se využívat polypeptidy, které mají bishaloacetylové skupiny, nitroarylhalidy nebo podobně, kde činidla jsou specifická pro thioskupiny.

Proto vazba mezi dvěma merkaptoskupinami různých peptidů může být jednoduchá nebo může obsahovat spojovací skupinu alespoň dvou v typickém případě alespoň čtyř a ne více než 16, ale obvykle ne více než přibližně 14 atomů uhlíku.

V určitém provedení, polypeptidové fragmenty, analogy a deriváty podle vynálezu neobsahují počáteční zbytek methionin. Je výhodné, aby polypeptidy nezahrnovaly vedoucí nebo sekreční sekvence (signální sekvence). Signální Část polypeptidů podle vynálezu se může stanovit podle metod molekulární biologie. V obecném případě polypeptid se může izolovat ze streptokokové kultury a následně sekvenovat, aby se stanovil počáteční zbytek zralého proteinu a tak sekvence zralého polypeptidů.

Existují vakcinační kompozice obsahující jeden nebo více streptokokových polypeptidů podle vynálezu ve směsi s farmaceuticky přijatelným nosičovým ředidlem nebo adjuvans. Vhodná adjuvans zahrnují oleje, to znamená Freundovo úplné nebo neúplné adjuvans, sole, to je

AlK(SO₄)₂, AlNa(SO₄)₂, A1NH₄(SO₄)₂, oxid křemičitý, kaolin, karbonové polynukleotidy, to znamená póly IC a póly AU. Preferované adjuvans zahrnují QuilA a Alhydrogel. Vakcíny podle vynálezu se mohou aplikovat parenterálně injekcí, rychlou infúzí, nasofaryngeální absorpcí, dermatoabsorpcí nebo bukálně nebo orálně. Farmaceuticky přijatelné nosiče také zahrnují toxoid tetanu.

Vakcinační kompozice podle vynálezu se mohou použít při léčbě nebo profylaxi streptokokové infekce a/nebo onemocnění a symptomů zprostředkovaných streptokokovou infekcí, jak se popisuje v publikaci P. R. Murray (Ed.), E. J. Baron, M. A. Pfaller, F, C. Tenover and R. H. Yolken. Manual of Clinical Microbiology, ASM Press, Washington, D.C., šesté vydání, 1995, 1482p.

V jednom provedení vynálezu vakcinační kompozice podle vynálezu se používají pří léčbě nebo profylaxi meningitidy, zánětu středního ucha, bakteriémie nebo pneumoníe. V jednom provedení vynálezu vakcinační kompozice podle vynálezu se používají při léčbě nebo profylaxi streptokokové infekce a/nebo onemocnění a symptomů spojených se streptokokovou infekcí, zvláště s mikroorganizmy S.pneumoniae, streptokoky skupiny A (S.pyogenes), streptokoky skupiny B (GBSneboS. agalactiae), S. dysgalactiae, S. uberis, S. nocardia stej nějako Staphylococus auře us.

-II CZ 303675 B6

V dalším provedení vynálezu streptokoková infekce je spojená s mikroorganizmem S. pmeumoniae.

V určitém provedení vynálezu se vakcíny aplikují tem jedincům, pro něž jsou streptokokové infekce nebezpečné, jako jsou kojenci, přestárlí a i munokompromito vání jedinci.

Termín Jedinec“ zahrnuje savce. V dalším provedení vynálezu je savec člověk.

Vakcinační kompozice se výhodně vyskytují v jednotkové dávkové formě. Ta obsahuje přibližně

0,001 až 100 pg/kg (antigen/tělesná hmotnost) a výhodnější je 0,01 až 10 pg/kg a nejvýhodnější je 0,1 až 1 pg/kg 1 až 3 krát s intervalem přibližně 1 až 6 týdnů mezi jednotlivými imunizacemi.

Dále jsou popsány polynukleotidy kódující polypeptidy charakterizované aminokyselinovou sekvencí vybranou ze sekvencí SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 55 až 75, 77 až 79, 81, 83 nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty.

V jednom provedení se polynukleotidy zobrazily v sekvenci SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 12, 13, 15, 76, 80, 82, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF), kódující polypeptidy podle vynálezu. Bude vhodné, aby se polynukleotidové sekvence ilustrované na obrázcích mohly upra20 vit degenerativními kodony, které ještě stále kódují polypeptidy podle vynálezu. Dále se popisují polynukleotidy, které hybridizují s polynukleotidovými sekvencemi, které se popisují shora v textu) (nebo sjejich komplementární sekvencí) vykazující 50% shodu mezi sekvencemi.

V jednom provedení vynálezu existuje mezi sekvencemi alespoň 70% shoda. V jednom provedení vynálezu existuje mezi sekvencemi alespoň 75% shoda. V jednom provedení vynálezu existuje mezi sekvencemi alespoň 80% shoda. V jednom provedení vynálezu existuje mezi sekvencemi alespoň 85% shoda. V jednom provedení vynálezu existuje mezi sekvencemi alespoň 90% shoda.

V dalším provedení polynukleotidy mohou hybridizovat za přísných podmínek, to znamená, že vykazují alespoň 95% shodu. V dalším provedení existuje více jak 97% shoda.

V dalším popsaném provedení polynukleotidy jsou ty, kteréjsou zobrazeny v sekvenci SEQ ID NO: 1,3, 7, 9, 11, 12, 13, 15, 76, 80, 82 kódující polypeptidy podle vynálezu.

V jiném provedení polynukleotidy jsou ty zobrazené v sekvenci SEQ ID NO: 1, 3, 7, 9, 1 1, 12, 13, 15, 76, 80, 82, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF) kódující polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 1, 3, 7, 9, 11, 12, 13, 15, 76, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF) kódující polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty ilustrované v sekvenci SEQ ID NO: 1, 3, 7, 9, 11, 12, 13, 15, 76, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF), které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty ilustrované v sekvenci SEQ ID NO: 1, 7, 9, 11, 15,

76, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF), které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 1, 9, 11, 15, 76, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF), které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 1, 7, 9, 11, které mohou zahrnovat otevřené čtecí rámce (ORF), které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 1, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

- 12 CZ 303675 B6

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 7, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 9, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedeni polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 11, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

ίο V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 15, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 3, 12, 13, 76, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvencí SEQ ID NO: 3, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 12, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 13, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

V dalším provedení polynukleotidy jsou ty uvedené v sekvenci SEQ ID NO: 76, které kódují polypeptidy podle vynálezu.

Pro odborníky bude výhodné, aby nukleotidy zahrnovaly jak DNA tak RNA.

Vynález také zahrnuje polynukleotidy komplementární s polynukleotidy popsanými v tomto dokumentu.

Polynukleotidy kódující polypeptidy podle vynálezu nebo jejich fragmenty, analogy nebo deriváty se mohou použít při metodě imunizace pomocí DNA. To znamená, že se DNA může začle35 nit do vektoru, který se po zavedení injekcí replikuje a exprimuje, čímž se produkuje antigenní polypeptid in vivo. Například polynukleotidy se mohou začlenit do plazmidového vektoru, kde jsou řízeny promotorem CMV, který je funkční v eukaryontních buňkách. Je výhodné, když se vektor zavede injekcí do svalu.

Vynález dále popisuje způsob produkce polypeptidu kódovaného polynukleotidem podle vynálezu, kdy se hostitelská buňka kultivuje za podmínek vhodných pro expresi polypeptidu, polypeptid z hostitelské buněčné kultury dále izoluje. Polypeptid je rekombinantní polypeptid.

Způsob produkce polypeptidů podle vynálezu rekombinantními technikami tak, že polynukleotid kódující uvedený polypeptid se exprimuje v hostitelské buňce a získá se exprimovaný póly peptidový produkt. V jiném případě se polypeptidy mohou produkovat zavedenými syntetickými chemickými technikami. To znamená syntézou oligopeptidů v roztoku nebo na pevné fázi, které se ligují za vzniku celého polypeptidu (bloková ligace).

Obecné metody získání a hodnocení polynukleotidů a polypeptidů se popisují v následujících publikacích: Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2^nd ed., Cold Spring Harbor, N. Y., 1989, Current Protocols in Molecular Biology, Edited by Ausubel F. M. et al., John Wiley and Sons, lne. New York, PCR Cloning Protocols, z Molecular Cloning to Genetíc Engineering, ed. White B. A., Humana Press, Totowa, New Jersey, 1997, 490 p., Protein Purifi55 cation, Principles and Practices, Scopes R. K., Springer-Verlag, New York, 3^rd Edition, 1993,

- 13 CZ 303675 B6

380 p., Current Protocols in Immunology, Edited by Colígan J. E. et at, John Wiley and Sons lne., New York.

V případě rekombinantní produkce se hostitelské buňky transfekovaly vektory, které kódují ⁵ polypeptíd a pak se kultivovaly v nutričním médiu, které se upravilo, aby bylo vhodné pro aktivační promotory, selekční transformanty nebo amplifikaci genů. Vhodné vektory jsou ty, které přežijí a replikují se ve vybraném hostiteli a zahrnují chromozomální, nechromozomální a syntetické sekvence DNA, například bakteriální plazmidy, fágovou DNA, bakuloviry, kvasinkové plazmidy, vektory získané z kombinací plazmidu a fágové DNA. Polypeptidová sekvence se io může začlenit do vektoru do vhodného místa za použití restrikčních enzymů, jako je operativní spojení s expresívní řídící oblastí, která obsahuje promotor, místo pro navázání ribozómu (oblast shody nebo Shine-Dalgamova sekvence) a operátor (řídící element). Mohou se vybrat jednotlivé komponenty expresívní řídící oblasti, které jsou vhodné pro daného hostitele a vektor podle zavedených principů molekulární biologie (popisuje se v publikaci Sambrook et al., Molecular

Cloning: a Laboratory Manual, 2^nd ed., Cold Spring Harbor, N.Y., 1989, Current Protocols in Molecular Biology, Edited by Ausubel F. M. et al., John Wiley and Sons, lne. New York). Vhodné promotory zahrnují, ale nejsou omezeny na promotor LTR nebo SV40, E.coli lac, tac nebo trp a promotor fága lambda P_L. Vektory s výhodou začleňují počátek replikace stejně jako selekční markéry. To znamená gen rezistence na ampicilin. Vhodné bakteriální vektory zahrnují pET, pQE70, pQE60, pQE-9, pbs, pDlO phagescript, psiX174, pbluescript SK, pbsks, pNH8A, pNHlóa, pNH18A, pNH46A, ptrc99a, pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5 a eukaryontní vektory pBlueBacIII, pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXTl, pSG, pSVK3, pBPV, pMSG a pSVL. Hostitelské buňky mohou být bakteriální, to znamená E. coli, Bacillus subtilis, Streptomyces, houbové to znamená Aspergillus niger, Aspergillus nidulans, kvasinky, to znamená Saccharo25 myces nebo eukaryontní, to znamená CHO a COS.

Po expresi polypeptidu v kultuře se buňky v typickém případě sklidily centrifugací, pak se porušily fyzikálním nebo chemickým způsobem (jestliže exprimovaný polypeptíd se nevylučuje do média) a získal se výsledný surový extrakt, z něhož se izoluje polypeptíd. Čištění polypeptidu z kultivačního média nebo lyzátu se může dosáhnout zavedenou metodou závislou na vlastnostech polypeptidu. To znamená precipitací síranem amonným nebo ethanolem, kyselou extrakcí, chromatografií s výměnou iontů, chromatografií na fosfocelulóze, chromatografií s hydrofóbními interakcemi, hydroxy lapat ito vou chromatografií a lektinovou chromatografií. Konečného Čištění se může dosáhnout za použití HPLC.

Polypeptíd se může exprimovat s nebo bez vedoucí a sekreční sekvence. V tomto případě se může vedoucí sekvence odstranit za použití posttranslačního zpracování (popisuje se v publikaci US 4 431 739, US 4 425 437 a US 4 338 397) nebo se může odstranit následně chemickou cestou, aby se izoloval exprimovaný polypeptíd.

Streptokovové polypeptídy podle vynálezu se mohou použít při diagnostickém testu vhodném pro zjištění streptokokové infekce, zvláště infekce mikroorganizmem S.pneumoniae. Je možné použít několik diagnostických metod, které například detekují mikroorganizmus Streptococcus v biologickém vzorku. Postupy jsou následující:

a) získání biologického vzorku od pacienta

b) inkubace protilátky nebo jejího fragmentu, který reaguje se streptokokovým polypeptidem podle vynálezu, s biologickým vzorkem za vzniku směsi a

c) detekce specificky vázaného antigenu nebo vázaného fragmentu ve směsi, která indikuje přítomnost protilátky specifické pro streptokok.

Odborníkovi je zřejmé, že tento diagnostický test může mít několik forem, které zahrnují imunologický test, jako je ELISA, radioimunologický test nebo test latexovou aglutínací, podstatný pro stanovení, zda protilátky specifické pro protein jsou v organizmu přítomny.

- 14CZ 303675 B6

Sekvence DNA kódující polypeptidy podle vynálezu se mohou také použít k navržení sond DNA vhodných pro použití při detekci přítomnosti streptokoka v biologickém vzorku, kde se očekává přítomnost takových bakterií. Detekční metoda podle vynálezu zahrnuje:

a) získání biologického vzorku od pacienta,

b) inkubace jedné nebo více sond DNA, které mají sekvenci DNA kódující polypeptid podle vynálezu nebo její fragmenty s biologickým vzorkem, přičemž vzniká směs a

c) detekce specificky vázané sondy DNA ve směsi, což indikuje přítomnost streptokokové bakterie.

io Sondy DNA se také mohou použít při detekci cirkulujících streptokoků, to znamená nukleové kyseliny mikroorganizmu S.pneumoniae, ve vzorku, například použitím polymerázové řetězcové reakce, jako metody pro diagnostiku streptokokové infekce. Sonda se může syntetizovat za použití běžné metody a může se mobilizovat na pevné fázi nebo se může značit deteko vatě lnou značkou. Preferovaná sonda DNA pro tuto aplikaci je oligomer, který má sekvenci komplemen15 tární alespoň přibližně s šesti spojitými nukleotidy polypeptidů mikroorganizmu S.pneumoniae podle vynálezu.

Jinou diagnostickou metodou vhodnou pro detekci streptokoka u pacienta je:

a) značení protilátky, která reaguje s polypeptidem podle vynálezu, nebo jejího fragmentu dete20 kovanou značkou,

b) aplikace značené protilátky nebo značeného fragmentu pacientovi a

c) detekce specificky vázané značené protilátky nebo značeného fragmentu u pacienta, což indikuje přítomnost streptokoka.

Dále vynález popisuje použití streptokokových polypeptidů podle vynálezu jako imunogenů vhodných pro produkci specifických protilátek pro diagnostiku a zvláště při léčbě streptokokové infekce. Vhodné protilátky se mohou stanovit za použití vhodných testovacích metod, například měřením schopnosti určité protilátky pasivně chránit testovací model proti streptokokové infekci. Jedním příkladem zvířecího modelu je myší model popsaný v příkladech. Protilátkou může být celá protilátka nebo její fragment vázající antigen a může patřit k libovolné třídě imunoglobulinů.

Protilátka nebo její fragment může pocházet ze zvířete, specificky ze savce a více specificky z myši, krysy nebo člověka. Může to být přirozená protilátka nebo její fragment nebo je-1 í to nutné rekombinantní protilátka nebo fragment protilátky. Termín rekombinantní protilátka nebo fragment protilátky znamená protilátku nebo protilátkový fragment, který se produkoval za pou35 žití techniky molekulární biologie. Protilátka nebo fragment protilátky může být polyklonální nebo s výhodou monoklonální. Může být specifický pro řadu epitopů spojených s polypeptidy mikroorganizmu S.pneumoniae, aleje výhodné, kdyžje specifický pouze projeden polypeptid.

Vynález dále popisuje bez omezení nové antigeny označené BVH-3, BVH-11, BVH-11-2,

BVH-28 a BVH-71. Vynález dále popisuje zkrácené polypeptidy obsahující fragmenty nových antigenů označených BVH—3, BVH-11, BVH—11—2, BVH-28 a BVH-71. Vynález dále popisuje chimérové polypeptidy obsahující fragmenty nových antigenů označených BVH-3, BVH-11, BVH-11-2, BVH-28 a BVH-71. Následuje tabulka shrnující vztah mezí antigeny podle vynálezu:

Rodina	nukleotid SEQ ID NO:	polypeptid SEQ ID NO:
BVH-3
BVH-3	1/11	2

BVH-3A	7	8
BVH-3B	9	10
BVH-3 SP63	15	16
BVH-3M		55
BVH-3AD		56
L-BVH-3AD		57
Newl2	76	58
BVH-3C		59
Newl		64
New2		65
New3		66
Newl 5		78
BVH-11
BVH-11	3, 12	4
BVH-11-2	13	14
BVH-11M		60
BVH-11A		61
BVH-11B také známý jako NBW13		62
BVH-11C		63
New4
News
New6		69
New7		70
New8		71
New9		72
BVH-11-2M		73
NewlO		74
Newll		75
Newl 2	76	58
Newl 4		77
Newl 6		79
BVH-28

- 16CZ 303675 B6

BVH-28	5	6
BVH-71
GBS	80	81
GAS	82	83

Přehled obrázků na výkresech

Na obrázku č. 1 je zobrazena sekvence genu BVH-3 SEQ ID NO: 1.

Na obrázku č. 2 je zobrazena aminokyselinová sekvence proteinu BVH-3 SEQ ID NO: 2.

io Na obrázku č. 3 je zobrazena sekvence DNA genu BVH-11 SEQ ID NO: 3.

Na obrázku č. 4 je aminokyselinová sekvence proteinu BVH-11 SEQ ID NO: 4.

Na obrázku č. 5 je sekvence DNA genu BVH-28 SEQ ID NO: 5.

Na obrázku č. 6 je aminokyselinová sekvence proteinu BVH-28 SEQ ID NO: 6.

Na obrázku č. 7 je sekvence DNA genu BVH-3A, která odpovídá 5'konci BVH-3 SEQ ID NO: 7.

Na obrázku č. 8 je aminokyselinová sekvence proteinu BVH-3 A SEQ ID NO: 8.

Na obrázku č. 9 je sekvence DNA genu BVH-3 B, který odpovídá 3'konci SEQ ID NO: 9.

Na obrázku č. 10 je aminokyselinová sekvence proteinu BVH-3B SEQ ID NO: 10.

Na obrázku č. 11 je znázorněno porovnání předpovězených aminokyselinových sekvencí otevřeného čtecího rámce BVH-3 z WU2, RX1, JNR.7/87, SP64, P4241 a A66 kmenů S.pneumoniae za použití programu Clustal W ze softwaru pro analýzu sekvencí Mac Vector (verze 6.5). Pod uspořádáním sekvence existuje znázornění shody, kde symboly * a . indikují shodné a podobné aminokyselinové zbytky.

Na obrázku č. 12 je znázorněno porovnání předpovězených aminokyselinových sekvencí otevřených čtecích rámců z kmenů WU2, Rxl, JNR.7/87, SP64, P4241, 166 a SP63 mikroorganizmu

S.pneumoniae za použití programu Clustal W pocházejícího ze softwaru pro analýzu sekvencí MacVector (verze 6.5). Pod uspořádáním je znázorněna shoda, kde symboly * a . indikují shodné a podobné aminokyselinové zbytky.

Na obrázku č. 13 jsou znázorněny předpovězené aminokyselinové sekvence proteinu BVH-11, které pochází z různých kmenů S.pneumoniae. Stupeň shody (Ϊ) a podobnosti (S) se stanovily za použití programu Clustal W ze softwaru pro analýzu sekvence (verze 6.5).

Na obrázku ě. 14 je sekvence DNA obsahující celý gen BVH-3 (otevřený čtecí rámec s nukleotidy 1777 až 4 896), SEQ ID NO: 11.

Na obrázku č. 15 je sekvence DNA obsahující úplný gen BVH-11 (ORF s nukleotidy 45 až 2567) SEQ ID NO: 12.

- ÍTCZ 303675 B6

Na obrázku č. 16 je znázorněna sekvence DNA obsahující úplný gen BVH-11-2 (ORF znukleotidy 1 Maž2630), SEQIDNO: 13.

Na obrázku č. 17 je aminokyselinová sekvence proteinu BVH-11-2 SEQ ID NO: 14.

Na obrázku č. 18 je sekvence DNA genu SP63 BVH-3 SEQ ID NO: 15.

Na obrázku ě. 19 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu SP63 BVH-3 SEQ ID NO: 16.

io

Na obrázku č. 20 je aminokyselinová sekvence proteinu BVH-3M SEQ ID NO: 55.

Na obrázku č. 21 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH—3AD SEQ ID NO: 56.

Na obrázku č. 22 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu L-BVH-3-AD SEQ ID NO: 57.

Na obrázku č. 23 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW12 SEQ ID NO: 58.

Na obrázku č. 24 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH-3C SEQ ID NO: 59.

Na obrázku č. 25 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH-1 lm SEQ ID NO: 60.

Na obrázku č. 26 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH-11A SEQ ID NO: 61.

Na obrázku č. 27 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH-11B (také nazvaná Newl3) SEQIDNO: 62.

Na obrázku č. 28 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH-11C SEQ ID NO: 63.

Na obrázku č. 29 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW1 SEQ ID NO: 64.

Na obrázku č. 30 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW2 SEQ ID NO: 65.

Na obrázku č. 31 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW3 SEQ ID NO: 66.

Na obrázku č. 32 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW4 SEQ ID NO: 67.

Na obrázku č. 33 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW5 SEQ ID NO: 68.

Na obrázku č. 34 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW6 SEQ ID NO: 69.

Na obrázku č. 35 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW7 SEQ ID NO: 70.

Na obrázku č. 36 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW8 SEQ ID NO: 71.

Na obrázku č. 37 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW9 SEQ ID NO: 72.

Na obrázku č. 38 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu BVH-11-2M SEQ ID 50 NO: 73.

Na obrázku č. 39 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW 10 SEQ ID NO: 74.

Na obrázku č. 40 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW11 SEQ ID NO: 75.

- 18CZ 303675 B6

Na obrázku č. 41 je znázorněna sekvence DNA NEW12 SEQ ID NO: 76.

Na obrázku č. 42 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW 14 SEQ ID NO: 77.

Na obrázku č. 43 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW 15 SEQ ÍD NO; 78.

Na obrázku č. 44 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu NEW 16 SEQ ID NO: 79.

Na obrázku č. 45 je znázorněna sekvence DNA genu GBS BVH-71 SEQ ID NO: 80.

Na obrázku Č. 46 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu GBS BVH-71 SEQ ID NO: 81.

Na obrázku č. 47 je znázorněna sekvence DNA genu GAS BVH-71 SEQ ID NO: 82.

Na obrázku č. 48 je znázorněna aminokyselinová sekvence proteinu GAS BVH-71 SEQ ID NO: 83.

Příklady provedení vynálezu

Příklad 1:

Tento příklad ilustruje klonování genů S.pneumoniae.

Kódující oblast genu S.pneumoniae BVH-3 (SEQ ID NO: 1) a kódující oblast genu

S.pneumoniae BVH-28 (SEQ ID NO: 5) se amplifikovaly pomocí PCR. (systém DNA Thermal Cycler GeneAmp PCR, 2400 Perkin Elmer, San Jose, CA) z genomové DNA séroskupiny 6 mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP64 za použití oligonukleotidů, které obsahovaly extenze bází, přičemž se začlenilo restrikční místo rozeznávané restrikčním enzymem Bglll (AGATCT) a Xbal (TCTAGA). Produkty PCR se izolovaly z agarózového gelu za použití extrakčního kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA), štěpeného restrikčními enzymy Bglll-Xbal (Pharmacia Canada lne., Baie ďUrfé, Canada), extrahovaného směsí chloroform:fenol a srážené35 ho ethanolem. Superlinkerový vektor pSL301 (lnvitrogen, San Diego, CA) se štěpil restrikčním enzymem Bglll a Xbal a čistil se z agarózového gelu za použití extrakčního kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Fragmenty genomové DNA Bglll-Xbal se ligovaly do vektoru pSL30 štěpeného Bglíl-Xba. Ligované produkty se transformovaly do mikroorganizmu E. coli kmen DH5a [f80 lacZ DM15 endAA, recM ksdRAl (^rK“^mK⁺ sw/?E44-///Z-l 1 gvrAóó rtVAl D (Zť7cZYA-č7rgF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) podle Simanisovy metody (Hanahan, D, DNA Clonning, 1985, D. M. Glover (ed), pp. 109-135). Rekombinantní plazmidy pSL301 (rpSL301) obsahující buď BVH-3 nebo BVH-28 se čistily za použití kitu QIAgen (Chatsworth, CA) a inzerty DNA se potvrdily analýzou nukleotidových sekvencí (Taq Dye Deoxy Terminátor Cycle Sequencing kit, ABI, Foster City, CA). Rekombinantní rpSL301 (rpSL301), se štěpil restrikčními enzymy Bglll (AGATCT) a Xhol (CTCGAG). Fragmenty DNA BglII-Xhol se čistily za použití extrakčního kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Expresívní vektor pET-32c(+) (Novagen, Madison, Wl) obsahující sekvenci thioredoxin-His-Tag se štěpil restrikčním enzymem BamHI (CGATCC) a Xhol a gel se extrahoval za použití extrakčního kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Fragmenty DNA BglII-Xhol se ligovaly do vek50 toru BamHI-XhoI pET-32c(+) za vzniku kódující sekvence pro fúzní protein thioredoxinHis.Tag-BVH-3 nebo thioredoxin-His.Tag-BVH-28. Ligované produkty se transformovaly do mikroorganizmu E. coli kmen DH5a [f80 lacZ DM15 enďAl, recAl hsdR!7 (^rK'^mK⁺) 5w/?E44 thi\ i^gyrA$6 relM D (/í7cZYA-czrgF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) podle Simansovy metody (Hanahan, D. DNA Clonning, 1985, D. M. Glover (ed), pp. 109-135). Rekombinantní plazmidy pET-32c(+) se čistily za použití kitu QIAgen (Chatsworth, CA) a nukleotidových sek• · -19CZ 303675 B6 věnci ve fúzních místech thioredoxin-His.Tag a inzert DNA se ověřil sekvenováním DNA (Taq Dye Deoxy Terminátor Cycle Sequencing kit, ABI, Foster City, CA).

Příklad 2:

Tento příklad ilustruje klonování genů proteinu mikroorganizmu S.pneumoniae do CMV plazmídu pCMV-GH.

ío Kódující oblast DNA proteinu mikroorganizmu S.pneumoniae se začlenila do fáze po směru exprese genu lidského růstového hormonu (hGH), jehož transkripci řídí cytomegalovirový promotor (CMV) v plazmidovém vektoru pCMV-GH (popisuje se v publikaci Tang et al., Nátuře, 1992, 356: 152). Promotor CMV není v plazmídu v buňkách organizmu E. coli funkční, aleje aktivní po aplikaci plazmídu do eukaryontních buněk. Do vektoru se také začlenil gen rezistence na ampicilin.

Kódující oblast genu BVH-3 (SEQ ID NO: 1) a BVH-28 (SEQ ID NO: 5) se získal z plazmídu rpS1301 (popisuje se v příkladu 1) za použití restrikčních enzymů BglII (AGATCT) a Xbal (TCTAGA). Štěpené produkty se čistily z agarózového gelu za použití extrakčního kitu

QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Vektor pCMV-GH (získal se z laboratoře Dr. Stephen A. Johnston, Department of Biochemistry, The University of Texas, Dallas, Texas) obsahující lidský růstový hormon se štěpil restrikěnímí enzymy BglII a Xbal za vzniku fúzních proteinů a čistil se z agarózového gelu za použití extrakčního kitu QIAquick od firmy Qiagen (Chatsworth, CA). Fragmenty DNA BglII-Xhol se ligo vály do vektoru pCMV-GH štěpeného restrikčními BglII-Xbal za vzniku fúzního proteinu hGH-BVH-3 nebo hGH-BVH-28 za řízení promotoru CMV. Ligované produkty se transformovaly do mikroorganizmu E. coli kmen DH5A [fSO lacZ DM15 í?«í/A1, recAl Asó/R.17 (^rK^mK⁺) s«pE44 thi-\ l~°gyrA96 re/Al D (ZófcZYAíwgF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) Simansovou metodou (popisuje se v publikaci Hanahan, D. DNA Clonning, 1985, D. M. Glover (ed), pp. 109-135). Rekombinantní plazmidy pCMV se čistily za použití kitu QIAgen (QIAgen, Chatsworth, CA).

Kódující oblast genu BVH-11 (SEQ ID NO: 3) se amplifikovala pomocí PCR (DNA Therman Cycler GeneAmp PCR systém 2400 Perkin Elmer, San Jose, CA) z genomové DNA séroskupiny 6 organizmu S.pneumoniae, kmen SP64 za použití oligonukleotidů, které obsahovaly extenze bází, přičemž se přidaly restrikční místa BglII (AGATCT) a HindiII (AAGCTT). Produkt PCR se čistil z agarózového gelu za použiti extrakčního kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA) štěpeného restrikčními enzymy (Pharmacia Canada lne., Baie ďUrfe, Canada) a extrahoval se směsí fenolu a chloroformu a srážel se ethanolem. Vektor pCMV-GH (získal se z laboratoře Dr. Stephen A. Johnston, Department of Biochemistry, The University of Texas, Dallas, Texas) se štěpil restrikčními enzymy BglII a Hind III a čistil se z agarózového gelu za použití extrakčního kitu od firmy Qiagen (Chatsworth, CA). Fragment DNA BglII-Hind III za vzniku fúzního proteinu hGH-BVH-11, který řídí promotor CMV. Ligované produkty se transformovaly do mikroorganizmu E. coli kmen DH5A [fSO lacZ DM15 ew/Al, m-Al A.$y/R17 (^rK'^mK⁺) s«/?E44 thi—\ 1 °gyrA96 re/Al D (/acZYA-argF)U169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) podle Simanso45 vy metody (popisuje se v publikaci Hanahan, D. DNA Clonning, 1985, D. M. Glover (ed), pp. 109-135). Rekombinantní plazmid pCMV se čistil za použití sady QIAgen (Chatsworth, CA) a nukleotidová sekvence inzertu DNA se ověřila sekvenováním DNA.

Příklad 3:

Tento příklad ilustruje použití DNA za účelem vyvolání imunitní odpovědi antigenů S.pneumoniae.

-20( 7 303675 B6

Skupina 8 myší samic BALB/c (Charles River, St-Constant, Quebec, Canada) se imunizovala intramuskulámí injekcí o objemu 50 μΐ třikrát ve dvou nebo třítýdenních intervalech pomocí 100 pg rekombinantní ho pCMV-GH, který kóduje gen BVH-3, BVH-11 nebo Β V H-2 8 v přítomnosti 50 pg plazmidů pCMV-GH-GM-CSF exprimujícího stimulační faktor granulo5 cyt-makrofágových kolonií (GM-CSF) (získal se z laboratoře Dr. Stephen A. Johnstona, Department of Biochemistry, The university of Texas, Dallas, Texas). Jako kontrola se skupině myší injekcí zavedlo 100 pg pCMV-GH v přítomnosti 50 pg pCMV GH-GM CSF. Krevní vzorky se získaly před každou imunizací a sedm dní po třetí injekci a odezva na sérové protilátky se stanovila pomocí testu ELISA za použití potahovacího antigenu thioredoxin-His.Tag-fúzního io proteinu S.pneumoniae. DNA imunizace s rekombinantním plazmidem pCMV-GH kódujícím BVH-3, BVH-11 nebo BVH-28 protein S.pneumoniae vyvolala protilátky proti rekombinantnímu proteinu. Reciproční titr protilátek definovaný jako nej vyšší ředění séra, při kterém hodnoty absorbance byly 0,1 nad hodnotu pozadí, je nad 4xl0³.

Příklad 4:

Tento příklad ilustruje produkci a čištění rekombinantních proteinů mikroorganizmu S.pneumoniae. Rekombinantní plazmidy pET obsahující gen BVH-3, BVH-11 nebo BVH-28 odpovídající SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 nebo SEQ ID NO: 5 se transformovaly elektroporací (zařízení Gene Pusler II, BIO-RAD Labs, Mississauga, Canada) do mikroorganizmu E. coli kmen AD494 (DE3) (Dara leul(&~] DlacYJ4 DphoA. PvuII phoR DmalF3 F’[lac (lacf^!)pro] trxb::Kan) (Novagen, Madison, WI). V tomto kmenu mikroorganizmu E. coli promotor T7 řídící expresi fúzního proteinu je specificky rozeznáván T7 RNA polymerázou (přítomnou na profágu

1DE3), jejíž gen je řízen promotorem lac, který je indukovatelný isopropyl-p-D-thiogalaktopyranosidem (IPTG). Transformant AD494(DE3)/rpET se kultivoval při teplotě 37 °C za stálého míchání při 250 ot./min. v půdě LB (pepton 10g/l, kvasinkový extrakt 5g/l, NaCI 10g/I) obsahující 100 pg ampicilinu (Sigma-Aldrich Canada Ltd., Oakville, Canada vjednom mililitru až hodnota A_ĎOo dosáhla hodnoty 0,6. Za účelem indukovat produkci fúzního proteinu thioredoxin30 His.Taq-BVH-3, thioredoxin-His.Tag-BVH-11 nebo thtoredoxÍn-His.Tag-BVH-28 se buňky inkubovaly po dobu dalších 2 hodin v přítomnosti IPTG v konečné koncentraci lmM. Indukované buňky ze 100 ml kultuiy se shromáždily centrifugací a zmrazily se při teplotě -70 °C.

Čištění fúzních proteinů z rozpustné cytoplazmatické frakce AD494(DE3)/rpET indukované

IPTG se provedlo afinitní chromatografií založenou na schopnosti sekvence His.Tag (6 konsekutivních histidinových zbytků) vázat se na dvoj mocné kationty (Ni²⁺) i mobilizované na His. vazné chelatační pryskyřici. Shromážděné buňky získané ze 100 ml kultury indukované IPTG se resuspendovaly v PBS pufrovaném fosforečnanem: 500mM NaCI pH7,l, sonikovaly se a centrifugovaly se při 20 000 x g po dobu 20 minut, aby se odstranil odpad. Supematant se filtroval (použila se membrána s velikostí pórů 0,22 pm) a umístila se na předem naplněnou chelatační kolonu H i Trap® (Pharmacia Biotech, Baie ďUrfé, Canada). Thioredoxin-His.Tag-fúzní protein S.pneumoniae se eluoval 1M imidazol-500mM NaCl-PBS pH7,l. Odstranění sole a imidazolu ze vzorku se provedlo dialýzou proti PBS při teplotě 4 °C. Množství fúzního proteinu získaného z rozpustné frakce mikroorganizmu E. coli se stanovilo pomocí MicroBca (Pierce, Rockford,

Illinois).

Příklad 5:

Tento příklad ilustruje ochranu myší proti fatální pneumokokové infekci imunizací.

Skupiny 8 samic myší BALB/c (Charles River) se imunizovaly podkožně třikrát ve třítýdenních intervalech buď 25 pg fúzního proteinu thioredoxin-His.Tag-BVH-3 v přítomnosti 15 pg adjuvans QuilA (Cedarline Laboratories Ltd., Homby, Canada) nebo jako kontrola sc samotným

-2Τ~ adjuvans QuilA v PBS. Krevní vzorky se sebraly z orbitálního sinusu v den 1, 22 a 43 před každou imunizací a sedm dní (den 50) následující po třetí injekci. O jeden týden později se myším opětně aplikovalo přibližně 10⁶ jednotek tvořících kolonie mikroorganizmu S.pneumoniae kmen WU2. Vzorky inokula pro posilovači injekci mikroorganizmem S.pneumoniae se nanesly na plotnu na čokoládový agar, aby se stanovily jednotky tvořící kolonie a ověřila se zesilující dávka. Úmrtí se zaznamenávaly v období 14 dní a čtrnáctý den po zesilovací injekci se myš, která přežila, usmrtila a v krevních vzorcích se testovala přítomnost organizmů S.pneumoniae. Data jsou uvedena v tabulce č. 1.

io Předem čelendžovaná séra se analyzovala za účelem zjištění přítomnosti protilátek, které reagují s mikroorganizmem S.pneumoniae pomocí standardních imunologických testů. Test ELISA a imunoblot indikují, že imunizace s rekombinantním proteinem mikroorganizmu S.pneumoniae produkovaném v mikroorganizmu E. coli vyvolalo protilátky reaktivní s rekombinantním a přirozeným pneumokokovým proteinem.

Tabulka č. 1: Ochrana zprostředkovaná rekombinantním proteinem BVH-3

imunogen	počet živých myší:počtu zemřelých myši 14 dní po zesilovací injekci	střední hodnota dní usmrcení
BVH-3	8:0	déle jak 14
žádný	0:8	1

Všechny myši imunizované rekombinantním proteinem BVH-3 přežily infekci, zatímco žádná z kontrolních myší, které se aplikovalo samotné adjuvans nepřežila. Existuje podstatný rozdíl v počtu myší, které přežily ve dvou skupinách myší (P<0,0001, test „log rank“ pro neparametrickou analýzu křivky přežití, P=0,0002, Fisherův exaktní test). Všechny krevní kultury získané z myší, které přežily jsou negativní 14. den po zesilovací injekci.

Příklad 6:

Tento příklad popisuje klonování genů BVH-3 a BVH-11 z různých kmenů mikroorganizmu S.pneumoniae a molekulovou konzervaci těchto genů.

Molekulové analýza chromozomální DNA z různých izolátů S.pneumoniae se sondami DNA, které překlenou různé oblasti BVH-3 nebo BVH-11 ukázaly přítomnost jedné kopie genu. Kopie dvou genů BVH-11 nejsou identické a geny se libovolně označily BVH-11 (SEQ ID NO: 12, ORF obsahující nukleotidy 45 až 2567) a BVH-11-2 (SEQ ID NO: 13, ORF obsahující nukleotidy 1 Maž 2630).

První aminokyseliny kódujících oblastí BVH-3 a BVH-11 mají charakteristiky vedoucích sek40 věnci, které jsou také známy jako signální peptidy. Signální štěpící místo peptidázy L-X-X-C z lipoproteinových modifikačních/zpracovatelských míst bylo přítomné v sekvencích. Zralé proteiny BVH-3, BVH-11 a BVH-11-2 z mikroorganizmu S.pneumoniae SP64 mají 1019, 821 a 819 aminokyselin. Oblasti genů mikroorganizmu S.pneumoniae kódující zralý BVH-3 nazývaný BVH-3M (nukleotidy 1837-4896., SEQ ID NO: 11), BVH-11M (nukleotidy 102-2567, SEQ ID

NO: 12) a BVH-11-2M (nukleotidy 171-2630, SEQ ID NO: 13) se amplifikovaly pomocí PCR (DNA Thermal Cycler GeneAmp PCR systém 2400 Perkin Elmer, San Jose, CA) z genomové

-22C/. 303675 B6

DNA 6 nebo 7 kmenů organizmu S.pneumoniae. Klinické izoláty mikroorganizmu S.pneumoniae SP64 séroskupina 6 a SP63 séroskupina 9 se získaly z laboratoře „de la santé publique du Québec, sainte-Anne-de-Bellevue“. Sérotyp 4 kmen JNR.7/78 se získal od Andrew Camilli. Tufts University School of Medicine, Boston. Kmen Rxl nekapsulámí derivát kmene D39 typ 2 a kmen A66 typ 3 a WU2 se získal od Dr. Davida E. Brilese z instituce University of Alabama, Birmingham a klinický izolát P4241 typ 3 se získal z instituce „centre de recherche en infectiologie du centre hospitalier de 1'universitě Laval, Sainte-Foy“. Sada nukleotidových primerů OCRR479-OCRR480, HAMJ160-OCRR488 a HAMJ 160-HAMJ186, které obsahovaly extenzi bází pro další restrikční místa, se použila při amplifikací genu BVH-3, BVH11 a BVH-11-2 io s výjimkou genu BVHI1 z kmene SP64, který se amplifikoval za použití sady primerů, který obsahuje HAMJ487 a OCRR488. Příměrové sekvence jsou uvedeny dále v textu (tabulka č. 2). Produkty PCR se čistily z agarózového gelu za použití extrakčního kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA) a štěpily se restrikčními enzymy BglII-Xbal nebo BglII-HindiII (Pharmacia Canada lne., Baie ďUrfé, Canada). Produkty štěpící reakce se čistily za použití PCR čistícího kitu QIAquick od firmy QIAgen (Chatsworth, CA). Produkty PCR se ligovaly do vektoru pSL301 štěpeného restrikčními enzymy BglII-Hindlíl. Ligované produkty se transformovaly do mikroorganizmu E. coli kmen DH5a [φ80 lacZ, ΔΜ15 <?WA1 recAl Z/.sc/Rl7 (^rK*^mK‘) snpE44 thi-Yk gyrA96 re/Al A(/ť3cZYA-argF)U 169] (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) Simanisovy metody (Hanahan, D. DNA Cloning, 1985, D. M. Glover (ed), pp. 109-135). Rekombinantní plazmidy pSL301 (rpSL301) obsahující BVH-3, BVH-11 nebo BVH-11-2 se čistily za použití sady QIAgen (Chatsworth, CA) a inzerty DNA se sekvenovaly (Taq Dye Deoxy Terminátor Cycle Sequencing kit, Abi, Foster City, CA). Obrázky č. 11 a 12 znázorňují sekvenci získanou z dedukovaných aminokyselinových sekvencí BVH-3 a BVH-11. Porovnání sekvencí proteinu BVH-3 ukázalo 99 až 100% shodu se sekvencemi pro všechny kmeny s tou výjimkou, že BVH25 3 ze séroskupiny 9 kmene SP69 (SEQ ID NO: 15 a SEQ ID NO: 16) postrádá 177 aminokyselin odpovídajících zbytkům 244 až 420 v sekvenci proteinu BVH-3 mikroorganizmu S.pneumoniae SP64. Analýza sekvencí dalších kmenů séroskupiny 9 ukázala molekulu BVH-3, která má stejnou deleci ve třech ze čtyř kmenů. To naznačuje, že 3 kmeny jsou členy klonu mikroorganizmu S.pneumoniae séroskupina 9.

Porovnání 13—ti nukleotidových sekvencí BVH-11 získaných ze sedmi kmenů mikroorganizmu S.pneumoniae, ukázalo, že nukleotidové sekvence jsou velmi podobné. Počítačová analýza (MacVector, Clustal W 1.4) za použití vícenásobného uspořádání předpokládaných proteinových sekvencí BVH-11 ukázala, že tyto sekvence jsou ze 75 % shodné a z 82 % homologní v délce

834 aminokyselin. Párové uspořádání ukázalo 80 % až 100 % shody (obrázek č. 13). Sekvence vykazují vysokou podobnost v celkové organizaci. Různorodost primární sekvence těchto proteinů je skoro omezena na posledních 125 aminokyselin v C-terminální části proteinů. Tato oblast obsahuje doménu. Testování této domény ukázalo dvě skupiny sekvencí. Prvních devět sekvencí z obrázku č. 13 patří do jedné skupiny, zatímco poslední 4 sekvence patří do jiné skupiny. Hod40 nota 39 % shody se získala, když se porovnaly sekvence domény 13 proteinů (MacVector, Clustal W 1.4). Hodnota shody se zvýšila na více jak 92 %, když se porovnaly sekvence spadající do stejné skupiny.

Příklad 7:

Tento příklad ilustruje homologii částí genů BVH-3 a BVH-11.

Molekulární analýza sondami DNA získaná z genů BVH-3 a BVH-11 indikovala, že BVH-3 a

BVH-11 jsou příbuzné. Při studii hybridizace dot blot sonda DNA obsahuje buď BVH-3 nebo BVH-11. Sekvence genu hybridizovala s oběma geny BVH-3 a BVH-i 1, což indikuje, že geny BVH-3 a BVH-11 sdílejí homologní sekvence. Porovnání sekvencí ukázalo, že ORF a proteiny byly ze 43 a 33 % shodné. Bližší testování ukázalo, že oblast odpovídající aminokyselinám 1 až 225 v BVH-3 a 1 až 228 v BVH-11 byly ze 73 a 75 % shodné na úrovni DNA a proteinu. Nao55 pak 3'oblasti odpovídající aminokyselinám 226 až 1003 z BVH-3 a aminokyselinám 229 až 840

z BVH-11 byly pouze ze 34 a 22 % shodné na úrovni DNA a proteinu. Tak 5'konce genů BVH3 a BVH-11 se jeví, že obsahují vysoce konzervativní sekvence, zatímco zbývající části genů jsou vysoce divergentní. Tyto výsledky naznačují, že BVH-3 a BVH-11 mohou sdílet podobné funkce zprostředkované sekvencí přítomnou v konzervativní oblasti, zatímco funkce specifické pro BVH-3 a BVH-11 mohou být zprostředkovány sekvencemi v divergentní oblasti.

Příklad 8:

io Tento příklad popisuje klonování zkrácených genů BVH-3, BVH-11 a BVH-11-2 polymerázovou řetězcovou reakcí (PCR) a expresi zkrácených molekul BVH-3 a BVH-11.

Genové fragmenty se amplifikovaly pomocí PCR za použití párů oligonukleotidů, které se vytvořily za účelem amplífikace fragmentů, které překlenou gen BVH-3 (SEQ ID NO: 1 a SEQ ID

NO: 11), BVH-11 (SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 12) nebo BVH-11-2 (SEQ ID NO: 13), který pochází z mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP64. Každý z primerů měl na svém 5'konci místo, které rozeznává restrikční enzym, čímž umožnil přímé klonování amplifikovaného produktu do rámce štěpeného plazmídového vektoru (tabulka č. 2 a 3). Produkty amplifikované PCR se štěpily restrikčními endonukleázami a ligovaly se do linearizovaného plazmidu pSL301 (popi20 suje se v příkladu 1), pCMV-GH (popisuje se v příkladu 2 nebo expresívní vektor pET (Novagen, Madison, WI) štěpený podobně nebo enzymem, který produkuje kompatibilní kohezivní konce. Rekombinantní pSL301 a rekombinantní plazmidy pCMV-GH se štěpily restrikčními enzymy za účelem klonování do expresívního vektoru pET. Klony se nejdříve stabilizovaly v mikroorganizmu E. coli DH5a a pak se zavedly do mikroorganizmu E. coli BL21(XDE3) nebo

AD494 (XDE3) za účelem exprese zkrácené formy molekul BVH-3 nebo BVH-11. Každá z výsledných plazmidových konstrukcí se potvrdila analýzou nukleotidové sekvence. Rekombinantní proteiny se exprimovaly jako N-terminální fúze s thioredoxinem a His-Tag nebo jako Cterminální fúze s His-tag. Exprimované rekombinantní proteiny se čistily z frakcí supematantu získaných z centrifugace sonikovaných kultur mikroorganizmu E. coli indukovaných IPTG za použití His-Bind kovové chelatační pryskyřice (QIAgen, Chatsworth, CA). Vytvořené genové produkty se popisují v tabulce č. 3. Genové produkty odpovídající N-terminální oblasti zahrnující signální sekvenci se označily jako lipidované proteiny nebo lipoproteiny (L-proteiny). Genové produkty odpovídající N-terminální oblasti postrádající signální sekvenci se identifikovaly jako protein bez signální sekvence (w/o ss).

Tabulka č. 2: Seznam oligonukleotidových primerů pro PCR

Primer	SEQ. ID.	sekvence 5'-3'	poloha nukleotidu	restřik. místa
OCRR479	17	cagtagatctgtgcctatgcactaaac	SEQ ID 1:6178	BglH
OCRR480	18	gatctctagactactgctattccttacgctatg	SEQ ID 11 :49094887	Xbal
OCRR497	19	atcactcgagcattacctggataatcctgt	SEQ ID 1 :15251506	Xhol
OCRR498	20	ctgctaagcttatgaaagatttagat	SEQ ED 1:15341548	HindlD

-24 CZ 303675 B6

OCRR 499	21	gatac tcgagc Igctattc c ttac	SEQ ID 11 :49064893	Xhol
HAMJ 172	22	gaatctcgagttaagctgctgctaattc	SEQ ID 1 : 675-661	Xhol
HAMJ 247	23	gacgctcgagcgctatgaaatcagataaattc	SEQ ID 1:3117-3096	Xhol
HAMJ 248	24	gacgctcgagggcattacctggataatcctgttcatg	SEQ ID 1 :1527-1501	Xhol
HAMJ 249	25	cagtagatctcttcatcatttattgaaaagagg	SEQ ID 11 : 1749-1771	BglII
HAMJ 278	26	ttatttcttccatatggacttgacagaagagcaaattaag	SEQ ID 1 :1414-1437	Ndel
HAMJ 279	27	cgccaagcttcgctatgaaatcagataaattc	SEQ ID 1 :3117-3096	HindHI
HAMJ 280	28	cgccaagcttttccacaatataagtcgattgatt	SEQ ID 1 :2400-2377	Hindm
HAMJ 281	29	ttatttcttccatatggaagtacctatcttggaaaaagaa	SEQ ID 1 :2398-2421	Ndel
HAMJ 300	30	ttatttcttccatatggtgcctatgcactaaaccagc	SEQ ID 1 :6282	Ndel
HAMJ 313	31	ataagaatgcggccgcttccacaatataagtcgattgatt	SEQ ID 1 :2400-2377	Notl
OCRR 487	32	cagtagatctgtgcttatgaactaggtttgc	SEQ ID 3:5879	BglII
OCRR 488	33	gatcaagcttgctgctacctttacttactctc	SEQ ID 12 :2577-2556	HindHI
HAMJ 171	34	ctgagatatccgttatcgttc aaacc	SEQ ID 3 :1060-1075	EcoRV
HAMJ 251	35	ctgcaagcttítaaaggggaataatacg	SEQ ID 3:1059-1045	Hindm
HAMJ 264	36	cagtagatctgcagaagccttcctatctg	SEQ ID 3 :682700	BglII
HAMJ 282	37	tcgcc aagcttcgttatcgttcaaaccattggg	SEQ ID 3:10601081	HindHI
HAMJ 283	38	ataagaatgcggccgccttactctcctttaataaagccaat agtt	SEQ ID 3 :2520-2492	Ndel
HAMJ 284	39	catgccatggacattgatagtctcttgaaacagc	SEQ ID 3 :856880	Ncol
HAMJ 285	40	cgccaagcttcttactctcctttaataaagccaatag	SEQ ID 3 :2520-2494	HindHI
HAMJ 286	41	cgacaagcttaacatggtcgctagcgttacc	SEQ ID 3:2139-2119	Hindm
HAMJ 287	42	cataccatgggcctttatgaggcacctaag	SEQ ID 3 :2014-2034	Ncol
HAMJ 288	43	cgacaagcttaagtaaatcítcagcctctctcag	SEQ ID 3 :2376-2353	Hindm

-25-CZ 303675 B6

HAMJ289	44	gataccatggctagcgaccatgttcaaagaa	SEQ ID 3 :2125-2146	Ncol
HAMJ 290	45	cgccaagcttatcatccactaacttgactttateac	SEQ ID 3:1533-1508	Hindm
HAMJ 291	46	cataccatggatattcttgccttcttagctccg	SEQ ID 3:1531-1554	Ncol
HAMJ 301	47	catgccatggtgcttatgaactaggtttgc	SEQ ID 3:5979	Ncol
HAMJ 302	48	cgccaagctttagcgttaccaaaaccattatc	SEQ ID 3 :2128-2107	HindlII
HAMJ 160	49	gtattagatctgttcctatgaacttggtcgtcacca	SEQ ID 13: 172-196	BglH
HAMJ 186	50	cgcctctagactactgtataggagccgg	SEQ ID 13: 2460-2443	Xbal
HAMJ 292	51	catgccatggaaaacatttcaagccttttacgtg	SEQ ID 11: 754-778	Ncol
HAMJ 293	52	cgacaagcttctgtataggagccggttgactttc	SEQ ID 11: 2457-2434	HindUI
HAMJ 294	53	catgccatggttcgtaaaaataaggcagaccaag	SEQ ID 11 : 2038-2062	Ncol
HAMJ 297	54	catgccatggaagcctattggaatgggaag	SEQ ID 11 : 622-642	Ncol

-26CZ 303675 B6

Tabulka č. 3: Seznam zkrácených genových produktů 3VH-3 a BVH-11 vytvořených z mikroorganizmu pneumoniae SP64

klonovací vektor

*··« O □ u

d-4 o □ u

$ CM

3 a

£ u 1

X O f o ct

£ u CM TO í

£ íM <? Ě O.

'ΐβ CM co 4

✓“S +, jí CM É £t

JO CM É Cl

i J3 CM É Cc

T CM Í3 ťX

£ o CM Ě Ct

+ 'w' XJ CM £

£ Ό 1—» έ ct

+ O CM É3 ct

dt · w Q

in

KO

r-

o

cn

o

rd

CM

co

V

ID

KO

X

CT*

o .

id

W H

m

in

TO

tH

in

KO

KjO

CO

KO

KO

KO

KO

KO

K0

Ό

Γ- *

t-

CO

íTí

LO

LO

o

CN

CO

LO

CN

1

1 rd

i—1

O ' CM

___l

___

._.

___

co

CM

o

i—1

CN

cn

CN

___

____

—-

O

o

co

—

ΟΊ

o

I—1

cn

TO |

LO |

Ή

co

(Tt

O

v

v

CO

O

co

v

r-

r-J Φ

o

co

'kt

>P

oa

co

o

o

o

co

l KO

1

ch

»P

cn

1—1

>d

o

OO

-TO

1

i

i—!

OO

i—1

1

CM

o

00

co d-

-r—l

o

1

-l—l

1—1

1

v

co

1

1

1

KO

00

Γ-

f\|

i J

LO

CN

1

O

O

LO

CM

CN

CN

o

X

CM

KO

,Χ

0

1

<—1

0

i—1

CM

co

CM

r—

Γ-

o

CN

—*

'—'

o

,—I

LO

CM

—

-

co

-—

\ř-j

kH

C H J o Εί

£

>d

>d —1

. C

d

C

d

-H d >d

Ή C >d

d >P 1 i

C 4-J

O ít}[

d

C

d

d

O

0

O

C

d

d

o

P

P

-I—' r-l

-H

(0 ;

o

o

o

O

O

44

44

44

O

o

o

44

v—1

4

’ 1 r-*

r·

44 'O!

pí

44

-V

44

o

44

44

44

•

c

d

1-d >

t-i >

•h d

v

s

N.

£

x

U

u

-

u

>

>

Md (U1

' X

X

o

X

45

O

CJ

o

,—1

-a > ί • P Ol C Tt

CO t 1

CO I

(O I

CO , 1

o

i—1 i—I

I—1 i—1 1 i

rH l—1 I

(—1 ϊ—1 I

co 1

co i

co I

1-1 τ—1 i

rH rH l

τ—3 rH 1

i—L 1

i—1 1

ω Ό' Ό -XI 'Ή -I

1 , X

1 x

1 X

I X

1 X

1

1 X

rr:

X

X

X

X

X

X

X

X > X

X > X

1 >

>

>

í>

>

>

>

>

>

>

>

>

>

>

>

ί m

PO

X

X

X

X

X

X

X

X

X

X

X

CQ

X

Ή 3

§

d c &) -d >U cu (0 P

Q

co

£

X

CJ

£

l

fa

CJ

t—1

lH

i-4

c—1

co I

co I

§

co 1,

co |

τ—1 * f

H j

r4 j

r4

rd

CM

CO

v*

m

KO

p.

00

d o

1

1

X I

s

S

s

5 :

5

5

fe

N S-l

Ě>

s

E>

Ě*

£>

CJ

ζ

X

W

w

X

W

M

Ci]

íd

o tr

m

X

X

ta

X

X

ffl

X

X

£

£

£

£

E

£

o

Γ-

cn

cn

CM

OO

Γ-

X

co

cn

o

σ>

LD

KD

TO

o

co

cn

v

cn

ΙΟ-

OO

ΟΟ

TO

co

o

co

r·

00

TO

TO

co

cn

v

V»

cm

v<

Ι—1

V

V

V

v

CN

ÍN

CM

CN

CM

CN

CM

CM

o4

04

dí

04

Ό

X

X

X

X

1“3

Ϊ2

•Ό

d)

dj

dj

•d ί Γ

&

(ň

04

X

X

X

X

£

Ξ

£

£

£

£

£

£

M <D ε

o O

O o

tc

8 I co

X

o o

O O

o o I

CJ O

X

1

X 1

X

X i

X

X 1

X 1

Ή

i ao

1 CT\

1 co

1 Cn

Γ-

i—1

1 <d

v

co

OO

v

v

Γ-

TO

v

d ÍX

Γ

r-

cn

r~

ΟΟ

TO

£-

CO

[>

Γ-

X

X

co

ΟΟ

TO

TO

v

T?

Ol

V

V

v s

CM

rd

ΓΜ

CM

η

CM

CM

CM

CM

CM

CM

fti Ό Ct 15 <J « CL,

04 04

K P4

dJ

04 04

04 o4

5

t) £

di

di

d)

d?

b

d) £

d)

d) §

B

O O

O O

hL(

O O

o o

o o

X

«c X

X

i

X

X

X

< X

X

X

X

27CZ 303675 B6

*O w 04 É cu	o 3 CO cu	£ x> 04 í	$ Ό 04 í	2 X» »—1 04 t	*5^ 04 t	z**\ : JD ·-* CM É CU	$ X) 1
Ol	co	xř	Lf)	OJ	o-	X	cn
	r	O-	r-	LO	o-	f* .	r*
		OO	co		_____ on an	o o □o )	cn o θ' 1 O
co	OO	co	co	----	LQ	r-H	OJ
r“1	co	OO	co	o	1	CM
ο-	OO	I	t	xr	o-	'—
ι	1	*H	cn	00	OJ		•
i—1	o	O	on	1	OJ		>L-i
i—1	OJ	CM	LQ	v7	'—’		TO
m	>ÍM			m ro	£	-ro O	0
Ή	ro	c	c		>n		£
		o	o	•	+J	S
>H	O		λ;	C	•rl	•	q
+->		>.		O		c	o
-H	£	O	o	x	>	o
a >	OJ	04	04	ó	CM		3 .
r~4	1 H	1 i—t	1 1—í	(—1	f τ—1		rH
,—1	r-t	1-1	,—! I	i—I 1	1—1 1	CO I	rH
1 X	1 X	1 X	1 X	1 X	I X	X	1 X
>	>	>	>	>	>	>	>
x	x	X	X	X	X .	X 1	X
	S ÍM í r-1 t-i	o	t-4	X r-f r4	xř	LO	LO
cn	,	t-4	t-4	1	r-J	»—í	i-M
3	X	w 3	1	Š	s X 3	£ §	3
	lo	co	xf	co	ο-	CO	Ol
cn	co	cn	on	00	χ	i—1	o
ÍM	r-1	Ol	04	OJ	04	co	ro
g	b	b	b	b	b	b	b
1	X	$	X	X	X	X	X
]	1	I	t	1	1	1	t
lo	o	OJ	co	04	LQ	O	r~i
00	lo	on	on	00	OO	O	O
OJ	t-1	Ol	OJ	OJ	CM	CO	ΓΟ
b	b X		b	b	b	b	b
X	< X	X	X	X	X	X	X

C7 303675 Β6

Příklad 9:

Tento příklad popisuje izolaci monoklonálních protilátek (Mab) a použití Mab za účelem charakterizace proteinových epitopů BVH-3, BVH-11 a BVH-112.

Samice myší BALB/c (Charles River) se imunizovaly podkožně genovými produkty BVH-3, BVH-l I nebo BVH-11-2, které pochází z mikroorganizmu E. coli kmen SP64 v přítomnosti 15 μg adjuvans QuilA (Cedarlane Laboratories Ltd, Homby, Canada). Jedna sada myší se imunizovala (fúzní experiment 1) v den 1 a 14 25 gg fúzního proteinu thioredoxin-His»Tag-BVH-3M io čištěného na základě afinity. Druhá skupina myší se imunizovala třikrát ve třítýdenních intervalech 25 gg thioredoxin-His»Tag-BVH-l 1M. Třetí skupina myší (fúzní experiment 3) se imunizovala v den 1 a 15 25 μg fúzního proteinu thioredoxin-HÍs»Tag-BVH-l 1-2M. Čtvrtá skupina myší (fúzní experiment 4) se imunizovala v den 1 25 μβ fúzního proteinu thioredoxin-His»TagBVH-11B čištěného na základě afinity a zesilovací dávka se aplikovala intravenózní injekcí v den 16 a 37 rekombinantním BVH-11B v PBS. Tři až čtyři dni před fúzí se myším aplikovala intravenózně injekce s 25 μβ antigenu suspendovaného v samotném PBS. Hybridomy se produkovaly fúzí buněk sleziny spolu s nesekrečními buňkami myelomu SP2/0, jak se popisuje v publikaci J. Hamel et al. J. Med. Microbiol., 23, pp 163-170 (1987)). Supematanty kultur hybridomů se zpočátku sledovaly testem ELISA podle postupu popsaného v publikaci J. Hamel et al.

J. Med. Microbiol., 23, pp 163-170 (1987)) za použití destiček potažených přípravkem čištěním rekombinantních proteinů nebo suspenzí buněk mikroorganizmu S.pnuemoniae usmrcených teplem. Pozitivní hybridomy se vybraly na základě reaktivity v testu ELISA s radou antigenů, pak se klonovaly pomocí omezeného ředění, pomnožily se a zamrazily se.

Hybridomy se pak testovaly v testu ELISA nebo westernovým imunoblotem proti genovým produktům BVH-3 a BVH-11 za účelem charakterizovat epitopy rozeznávané pomocí monoklonálních protilátek. Genové produkty BVH-3 a BVH-11 sdílí běžné epitopy s šesti druhy monoklonálních protilátek (H3-I-F9, H3-1-D4, H3-1-H12, H11-1-E7, H11-1-H10 a HI 1-1.1-Gl 1), které vykazují reaktivitu s oběma proteiny (tabulka č. 4). Molekuly BVH-11 a BVH-11-2 z mikroorganizmu S.pneumoniae SP64 sdílí běžné epitopy, které nejsou přítomny na BVH-3 s monoklonálními protilátkami (3A1, 13C11, 10H10, 1D8, 10G9, 10A2, 3E8, 10D7, 2H7 a 6H7), a reagují s oběma rekombinantnímí proteiny BVH-11 a BVH-11-2 (tabulka č. 5).

Tabulka č. 4: Reaktivita imunoreaktivních monoklonálních protilátek s řadou genových produktů BVH-3 a BVH-1 L

MAb	a* imunoreaktivita s
BVH-3M 21-1039	BVH-3A 21-509	BVH-3B 512-1039	BVH-3C 21-225	HEW2 472-800	NEW3 800-1039	BVH-11M 20-840
H3-1-F9	+	+	-	+	-	-	+
H3-1-D4	+	+	-	+	-	-	+
H3-1-HI2	+	+		+	-	-	+
H3-2-G2	+	+	-	-	-	-	-
H3-3-A1	+	+	-	-	-	-	-
H3-4-D3	+	-	+	-	-		-
H11-1-E7	+	+	-	+	-	-	+
H10	+	+		+			+
Hll- 1.1-G11	+ 1	+		+			+

QZ 303675 B6

Tabulka č. 5: Reaktivita monoklonálních protilátek vytvořených proti proteinu BVH-11-2 z mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP64 s řadou genových produktů BVH-11.

Mab. *	b.imunoreaktivita s·
c. BVH-11 produkt	d.BVH-U-2 produkt
BVK-llM 20-840	NEWS 286-511	NEW9 511-713	BVH-11B 354-840	BVH-ll-2 20-838	NEW10 271-838	NEW11 699-838	NEW14 227-699
3A1	+	+	-	+	+	+	-	+
13C1	+	+	+	+	+	+	-	+
10H10	+	+	+	+	+	+	-	+
1D8	+	+	-	+	+	+	-	+
10G9	+	-	-	+	4-	+	-	+
10A2	+	-	-	+	+	+	-	+
3E8	+	-	-	+	+	+	-	+
10D7	+	-	-	+	+	+	-	+
2H7	+	-	-	-	+	-	-	-
6H7	+	-	-	-	+	-	-	-
3A4	-	-	-	-	+	+	+	-
14H6	-	-	-	-	+	+	+	-
7G2	-	-	-	-	+	+	-	+
13H10	-	-	-	-	+	-	-	+
7E8	-	-	-	-	+	-	-	-
7H6	-	-	-	-	+	-	-	-

^a Monoklonální protilátky v této tabulce nejsou reaktivní s rekombinantní molekulou BVH-3

Výsledky získané z imunoreaktivních studií monoklonálních protilátek (tabulka č. 4 a 5) jsou v souladu s proteinovými sekvencemi získanými z genových sekvencí. Monoklonální protilátky zkříženě reagující s molekulami BVH-3 a BVH-11 rozeznávaly protein BVH-3C odpovídající io konzervativní oblasti a specifické monoklonální protilátky proti BVH-11 a BVH-11-2 reagovaly s epitopy umístěnými v různých částech těchto molekul. BVH-3 a BVH-11 a BVH-11 a BVH11-2 se mohou odlišit na základě jejich reaktivity s monoklonálními protilátkami.

Příklad 10:

Tento příklad ilustruje současnou expresi genových produktů BVH-3 a BVH-11 pomocí S.pneumoniae.

Standardní metoda westernová blotu se použila pro zkoumání, zda se geny BVH-3 a BVH-11 exprimovaly v mikroorganizmu S.pneumoniae. Mikroorganizmus S.pneumoniae kmen SP64 a SP63 se nechaly růst přes noc při teplotě 37 °C v atmosféře 5% CO₂ na plotnách s čokoládovým agarem. Bakterie se resuspendovaly v PBS a usmrtily se teplem při teplotě 56 °C po dobu 20 minut. Při přípravě antigenů se suspenze mikroorganizmu S.pneumoniae ošetřila vzorkovým pufrem, který obsahuje SDS a 2-merkaptoethanol po dobu 5 minut pri teplotě 100 °C, Pneumokokové proteinové antigeny se rozdělily elektroforézou SDS-PAGE způsobem popsaným v publikaci Laemmli, Nátuře, 227, pp. 680-685 (1970). Po SDS-PAGE se proteiny přenesly elektroforeticky z gelu na nitrocelulózovou membránu způsobem Towbin, Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 76, pp. 4350-4354 (1979)) a testovaly se s myším sérem nebo monoklonálními protilátkami.

Detekce antigenů, které reagují s protilátkami, se uskutečnila nepřímým testem ELISA za použití konjugovaných imunoglobulinů proti myším a barevného substrátu. Když se antisérum vytvořené

-30CZ 303675 B6 proti rekombinantnímu BVH-3 testovalo proti antigenům mikroorganizmu S.pneumoniae SP64. detekovaly se dva reaktivní pruhy, které mají zjevnou molekulovou hmotnost 127 kDa a 99 kDa. Když se použily monoklonální protilátky H3-1-F9, H3-1D4, H3-1-H12, Hl 1-1-E7, Η11-1.1G11 jednotlivě jako imunologické sondy, detekovaly se také pruhy, které mají stejnou zjevnou molekulovou hmotnost. Naopak monoklonální protilátky specifické pro molekulu BVH-3 detekovaly pouze pruh o molekulové hmotnosti 127 kDa a monoklonální protilátky specifické pro BVH-1 l detekovaly pouze pruh o molekulové hmotnosti 99 kDa, tak potvrdily identitu pruhů o molekulové hmotnosti 127 a 33 kDa jako pruhy odpovídající BVH-3 a BVH-11. Tyto studie poskytují důkaz, že proteiny BVH-3 a BVH-11 jsou současně přítomny v mikroorganizmu io S.pneumoniae. Avšak výsledky jsou konzistentní s předešlým pozorováním, že BVH-3 a BVH11 vykazují epitopy, které jsou běžné pro oba proteiny a epitopy, které jsou exkluzivní pro každý uvedený protein.

U mikroorganizmu S.pneumoniae SP64 zralé proteiny BVH-3, BVH-11 a BVH-11-2 jsou pro15 teiny obsahující 1019, 821 a 819 aminokyselin s předpovídanou molekulovou hmotností 112,5 kDa, 92,4 kDa a 91,7 kDa. Ačkoli zde existuje rozdíl mezi molekulovou hmotností předpovězenou ze sekvence a vypočítanou molekulovou hmotností na základě SDS-PAGE, BVH-3 se může lišit od BVH-11 vyšší molekulovou hmotností. Molekuly BVH-3 pocházející z mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP63 a mají zjevnou molekulovou hmotnost 112 kDa na SDS-PAGE ve srovnání se 127 kDa v případě BVH-3 kmene SP64. Tyto data jsou konzistentní s delecí 177 aminokyselinových zbytků BVH-3 mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP63.

Příklad 11:

Tento příklad popisuje ochranu potvrzenou v experimentální infekci myší vakcinovaných rekombinantními genovými produkty BVH-3 nebo BVH-11.

Skupiny 7 nebo 8 samic myší BALB/c (Charles River) se imunizovaly třikrát podkožně v interva30 lech tří týdnů bud’ fúzním proteinem thioredoxin-His.Taq-BVH-3M čištěným na základě afinity, fúzním proteinem thioredoxin-His.Tag-BVH-1 ÍM čištěným na základě afinity nebo samotným adjuvans QuilA v PBS, což slouží jako kontrola. 12 až 14 dní po třetí imunizaci se myším aplikovala intravenózně posilující dávka mikroorganizmu S.pneumoniae kmen WU2 nebo intranasálně s kmenem P4241. Vzorky posilující aplikace mikroorganizmu S.pneumoniae se nanesly na plotny s čokoládovým agarem, aby se stanovil počet jednotek tvořících kolonie a aby se ověřila dávka zesilující injekce. Posilující dávka byla přibližně 10⁶ jednotek tvořících kolonie. Úmrtí se zaznamenávalo po dobu 14 dní a čtrnáctý den po posilující dávce se myši usmrtily a vzorky krve se testovaly v přítomnosti organizmů S.pneumoniae. Data o přežití jsou uvedeny v tabulce č. 6 a 7.

Tabulka ě. 6: Ochrana zprostředkovaná rekombinantní mi proteiny BVH-3M a BVH-1 ÍM při experimentální infekci virulentním mikroorganizmem S.pneumoniae WU2.

experiment	imunogen	živý : mrtvý3	střední počet dnů přežití
1	BVH-3M	8 : 0	víc jak 14
	žádný	0 : 8	1
2	BVH-11M	8 : 0	víc jak 14
	žádný	0 : 8	1

^a Počet živých myší : počtu mrtvých myší čtrnáctý den po posilující injekci

Tabulka č. 7: Ochrana zprostředkovaná rekombinantním i proteiny BVH-3 M a BVH-1 ÍM v experimentálním zánětu plic virulentním mikroorganizmem S.pneumoniae P4241

experiment	imunogen	živý : mrtvý*	střední počet dnů přežití
1	BVH-3M	6 : 1	víc jak 14
	žádný	1 ; 7	4,5
2	BVH-3M	8 : 0	víc jak 14
	BVH-1Ím	8 : 0	víc jak 14
	žádný	0 : 8	4

^a Počet živých myší: počtu mrtvých myší čtrnáctý den po posilující injekci

Všechny myši imunizované rekombinantním proteinem BVH-3M nebo BVH-1 ÍM přežily infekci kmenem WU2, zatímco žádná z kontrolních myší, které se aplikovalo samotné adjuvans nepřežila. Všechny myši mimo jedné imunizované rekombinantním proteinem BVH-3 M nebo BVH-1 ÍM přežily infekci P4241, zatímco přežila pouze jedna kontrolní myš, které se aplikovalo samotné adjuvans. Všechny herno kultury z myší, které přežily jsou negativní čtrnáctý den po zesilovací injekci. Tyto výsledky jasně ukazují, že oba produkty BVH-3M a BVH-1 ÍM vyvolávají ochrannou imunitní odezvu proti pneumokokům u myší. Skutečnost, že tyto proteiny jsou vysoce konzervativní mezi izoláty S.pneumoniae zdůrazňují potenciál BVH-3 a BVH-11 jako kandidátů univerzální vakcíny. Proteiny BVH-3 a BVH-11 ze séroskupiny 6 mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP64 vyvolaly ochranu proti pneumokokovým infekcím kmeny různých kapsulámích sérotypů.

V ideálním případě vakcína, která by mohla chránit proti pneumokokovému onemocnění by mohla zajistit ochranu proti meningitidě, zánětu středního ucha, bakteriémii a zápalu plic. BVH3 a BVH-11 chrání experimentální modely proti letální systémové infekci nebo zápalu plic, což naznačuje, že u lidí vakcíny založené na proteinu BVH-3 a BVH-11 by mohly redukovat výskyt širokého spektra onemocnění způsobeného všemi druhy S.pneumoniae nezávisle na kapsulámímu sérotypů.

Data z tabulky č. 6 a 7 jasně naznačují, že BVH-3 a BVH-11 jsou molekuly vyvolávající ochranu proti mikroorganizmu S.pneumoniae. Není však známo, zda ochrana může být zprostředkována specifickými sekvencemi, které nejsou sdíleny molekulami BVH-3 a BVH-11.

Skupiny samic myší BALB/c (Charles River) se imunizovaly podkožně třikrát v třítýdenních intervalech buď fúzním proteinem thioredoxin-His.Tag-BVH-3AD, -BVH-3B nebo -BVH-3C v přítomnosti 15 pg adjuvans QuilA (Cederlane Laboratories Ltd, Homby, Canada). Kontrolní myši se imunizovaly samotným adjuvans QuilA v PBS nebo fúzním proteinem thioredoxinHis.Tag nebo thioredoxin-His.Tag-fúzní protein (His-Thio) v přítomnosti QuilA.

Aby se stanovila schopnost ochrany sady zkrácených proteinů značených NEW4, NEWS, NEW6, NEW7, NEW8, NEW9, NEW10, NEW11, NEW14 a BVH-11B, skupina samic myší BALB/c (Charles River) se imunizovala podkožně dvakrát v tří týdenních intervalech 25 pg His.Tag-fúzní protein čištěným na základě afinity v přítomnosti 15 pg adjuvans QuilA. Deset až čtrnáct dní po poslední imunizaci se myším aplikovala zesilující injekce virulentním mikroorganizmem

S.pneumoniae. Výsledky indikují, že BVH-3B, zkrácená molekula BVH-3 obsahující aminokyseliny 512 až 1039 vyvolala ochranu proti kmenům, WU2 a P4241, kteréjsou virulentní pro myši. Podobně molekuly BVH-11, NEW4 a NEWS, zkrácené molekuly BVH-11 obsahující aminokyseliny 354 až 840, 286 až 840 a 286 až 713 vyvolaly ochranu proti experimentální zesi-32CZ 303675 B6 lovací dávce zavedené intravenózní injekcí obsahující WU2 a intranasální zesilovací dávce obsahující P4241. Vakcinace pomocí NEW 10 a NEW 14 obsahující aminokyseliny 272 až 838 a 227 až 699 z molekuly BVH-11-2 také vedou k ochraně proti usmrcení kmeny pneumokoků. Tylo výsledky indikují, že oblast obsahující 428 aminokyselin skládající se z aminokyselin 286 až 713 a 272 až 699 proteinů BVH-11 a BVH-11-2 mikroorganizmu S.pneumoniae SP64 obsahovala ochranné epitopy. Tato oblast je vysoce konzervativní vykazující celkovou 91% shodu a 94% homologii mezi třinácti sekvencemi proteinu BVH-11.

Tabulka č. 8: Hodnocení ochrany vyvolané vakcinaci myší genovými produkty BVH-3 a BVH-11

		posiluj ící s WU2	dávka	posiluj ící P4241	dávka
Experiment	Imunogen	Živý : mrtvý'*	střední počet dni přežiti	ž i vý : mrtvý'	střední počet dní přežití
	žádný	0 : 8	1,5	1 : 7	4,5

	NEW4 NEW5 NEW7 BVH-11M	8 : 8 : 0 : 8 :	: 0 : 0 : 8 : 0	>14 >14 2 >14	8 : 8 : 0 : 8 :	O 00 o o	>14 >14 5 >14
T	žádný	0 :	: 8	1	0 :	: 8	4
	NEWS	8 :	: 0	>14	8 :	: 0	>14
	NEW8	0 :	; 8	1,5	0 :	: 8	5, 5
	NEW9	3 :	: 5	3,5	2 :	; 6	7
	BVH-11M	8 :	: 0	>14	8 :	: 0	>14
3b	žádný	0 :	; 8	1	0	8	4
	NEW6	0 :	: 8	1	4	4	10,5C
	NEW10	8 :	; 0	>14	8	0	>14
	NEW11	0 :	; 8	1,5	1	7	6
	BVH-11M	8 :	: 0	>14	8	0	>14
ř	žádný	0 :	: 8	2	0 :	: 8	4
	BVH-11M	7 :	: 1	>14	8 :	; 0	>14
	NEW14	8 :	: 0	>14	8 :	: 0	>14
5	H i s - T h i o	0 :	: 8	2
	BVH-3AD	1 :	: 7	2,5
	BVH-3B	5 :	: 3	>14
6	His-Thio	0 :	: 8	1
	BVH-3C	0 :	: 8	1

³ Počet živých myší: počet mrtvých myší čtrnáctý den po zesilovací dávce ^b zesilovací dávka v případě WU2 byla 10⁵ jednotek tvořících kolonie ^c myši žijící déle než 14 dní sc pro stanovení střední hodnoty započítal čas přežití 14 dní.

Příklad 12:

Tento příklad popisuje klonování a expresi chimérového genu kódujícího ch i měrový polypeptid odpovídající karboxykoncové oblasti BVH-3 ve fúzi na C-konci s karboxy-terminální oblastí

BVH-11 a dodatečné ochrany pozorované po vakcinaci chimérovým polypeptidem.

Ze studie popsané shora v textuje zřejmé, že BVH—3 a BVH—11 jsou serologicky odlišné molekuly, které jsou současně přítomny na mikroorganizmu S.pneumoniae. Výsledky imunologických studií myší ukazují, že oba proteiny jsou dobrými kandidáty na vakcínu. Tyto proteiny mají io potenciál poskytovat ochranu proti všem pneumokokům bez ohledu na sérotyp. Přestože tyto dva proteiny sdílí epítopy a sekvence, vykazují různé charakteristiky a mohou sloužit k různým biologickým funkcím. Tudíž imunizace proti dvěma proteinům může poskytnout lepší ochranu než, když probíhá každá jednotlivě. Aby se toto dalo testovat, může se zkoumat několik cest, kde se aplikuje BVH—3 a BVH-11 v plné délce nebo ve zkrácené formě v kombinaci nebo v konjugaci.

Popisuje se genetické inženýrství fúzního genu BVH-3-BVH-11 a protein nazvaný NEW12 (SEQ ID NO: 76 a SEQ ID NO: 58) a potencionální použití proteinu NEW 12 jako vakcíny.

Genové fragmenty BVH-3 a BVH-11 odpovídající 3'konci genů, které se amp li fíková ly pomocí PCR za použití párů oligonukleotidů připravených tak, aby se amplifikovaly fragmenty překrý20 vající nukleotidy 1414 až 3117 (SEQ ID NO: 1) a nukleotidy 1060 až 2520 (SEQ ID NO: 3) z mikroorganizmu S.pneumoniae kmen SP64 genů BVH-3 a BVH-11. Používané příměry HAMJ278 a HAMJ279, HAMJ282 a HAMJ283 měly na 5'konci místo rozeznávané restrikční endonukleázou, což umožňuje přímé klonování amplifikovaného produktu do rámce štěpeného plazmidového vektoru pET21b(+) (tabulka č. 2). Produkty amplifikované PCR se štěpily restrikčními endonukleázami a ligovaly se do linearizovaného plazmidového vektoru pET21b(+) štěpeného podobným způsobem. Výsledné plazmidové konstrukce se potvrdily analýzou nukleotidové sekvence. Rekombinantní plazmid pET21b(+) obsahující PCR produkt Ndel-HindlII BVH-3 se linearizoval štěpením restrikčními enzymy HindlII a Notl pro klonování do rámce HindlII-Notl fragmentu DNA získaného z rekombinantního vektoru pET21(+), který obsahuje fragment genu BVH-11. Klony se nejdříve stabilizovaly v mikroorganizmu E. coli DH5a a pak se zavedly do mikroorganizmu E. coli BL21(ÁDE3) za účelem exprese chimérové molekuly pneumokokového proteinu. Rekombinantní chimérový polypeptid nazvaný NEW 12 se exprimoval jako C-terminální fúze s His-tag. Exprimovaný rekombinantní protein NEW 13 se čistil z frakcí supernatantů získaných z centrifugace sonikovaných kultur mikroorganizmu E. coli indukovaných IPTG za použití pryskyřice His-Bind s cheláty kovů (QIAgen, Chatsworth, CA).

Podle stejného postupu popsaného shora v textuje možné zkonstruovat jiné chimérové polypeptidy, jako výsledek současné exprese New 1 a New 4, New 1 a New 5, New 1 a New 10 nebo New 1 a New 14. Konstrukce se může provést tak, že New 1 leží proti směru exprese nebo po směru exprese New 4, New 5, New 10, BVH-11B nebo New 14. Je také možné zkonstruovat jiné chimérové polypeptidy, jako výsledek současné exprese více jak dvou fragmentů libovolného BVH-3, BVH-11 nebo BVH-11-2.

Skupiny 8 samic myší BALB/c (Charles River) se imunizovaly podkožně dvakrát v tří týdenních intervalech s 25 pg bud’ His«Tag-fúze NEW1 čištěného na základě afinity BVH-11B nebo proteinu NEW12 v přítomnosti 15 pg adjuvans QuilA. Deset až čtrnáct dní po poslední imunizaci se myším aplikovala zesilovací dávka virulentního S.pneumoniae. Jak se ukázalo dříve, molekuly NEW1 a BVH-11B obsahující aminokyseliny 472 až 1039 z proteinu BVH-3 a aminokyseliny 354 a 840 z proteinu BVH-11, odpovídají částem proteinů schopným vyvolat ochrannou imunit50 ní odezvu. Aby se stanovilo, zda chimérový polypeptid podstatně zlepší ochranu ve srovnání s proteiny tvořící jednotlivé části, zesilovací dávka se provedla způsobem, kdy se neočekávaná ochrana s molekulami NEW1 a BVH-1B. Je zajímavé, že chimérový protein NEW12 vyvolal ochranu proti myším virulentním kmenům WU2 a P4201. Sedm z osmi myší imunizovaných s NEW 12 jsou stále živé 10 dní po zesilovací dávce, zatímco 28 myší z 32 imunizovaných

-34C7 303675 B6

NEW1, BVH-11B, BVH-3M nebo samotným adjuvans zemřelo pět dní po zesilující dávce. Tudíž vakcinace myší pomocí NEW 12 poskytuje nejvyšší stupen ochrany proti celendži WIJ2. Tyto výsledky indikují, že imunizace chimérovým polypeptidem a pravděpodobně kombinace genových produktů BVH- 3 a BVH-11 mohou poskytovat další ochranu vedle té, která se získala aplikací samotných antigenu BVH-3 nebo BVH-11.

Tabulka č. 9: Hodnocení ochrany vyvolané vakcinaci myší chimérovou molekulou NEW 12

	Čelendž WU2	Čelendž P4241
imunogen	živé	: mrtvé’	střední přežít i	hodnota	živé : mrtvé’	střední přežiti	hodnota
žádný	0 :	8	1		0 : 8	5
NEW1	2 :	6	2		1 : 7	8
BVH-11B	1 :	7	3,5		8 : 0	více	jak 14
NEW12	6 :	2	více	jak 14	7 : 1	více	jak 14
BVH-3M	1 :	7	3		8 : 1	ví ce	jak 14

Příklad 13:

V příkladu se popisuje identifikace dalších sekvencí příbuzných BVH-3 a BVH-11 u druhu Streptococcus jiného než je S.pneumoniae.

Drive se ukázalo, že BVH-3, BVH-11 a BVH-11-2 je rodina příbuzných proteinů, které sdílejí běžné sekvence. Provedl se průzkum homologie s nukleotidovou sekvencí z konzervativní oblasti těchto genů a porovnáním se sekvencemi z GenBank a EMBL za použití FASTA. Nejvíce podstatná homologie se pozorovala při srovnání s genem 2,469 kb, který kóduje protein s vypočítanou molekulovou hmotností 92 kDa (SEQ ID NO: 81) neznámé funkce v mikroorganizmu S. agalactiae. také se nazývá streptokokus skupiny B nebo GBS. Gen se označil jak BVH—71. Protein vykazující 99,2% identitu a 99,5 % podobnost s proteinem GBS se také identifikoval v mikroorganizmu S.pyogenes. který se také nazývá streptokokus skupiny A nebo GAS (SEQ ID NO: 83. 5'oblast sekvencí BVH-71 (SEQ ID NO: 80 a SEQ ID NO: 82), která pokrývá nukleotidy 1 až 717 demonstruje 58 a 60% shodu s konzervativními oblastmi genů BVH-3 (nukleotidy 1 až 675) a BVH-11 (nukleotidy 1 až 684). Prvních 239 aminokyselin přeložených sekvencí otevřeného čtecího rámce BVH-71 GBS a GAS jsou 51 a 54 % shodných s prvními 225 a 228 aminokyselinami BVH-3 a BVH-11.Navíc k podobnosti struktury streptokokové proteiny BVH-3, BVH-11 a BVH-71 také sdílí antigenní epitopy. Pruh o molekulové hmotnosti 97 kDa se projevil na westernových biotech celých buněk GBS a GAS za použití monoklonálních protilátek Hl 1—1.1—Gl 1 reaktivních s konzervativními oblastmi BVH-3 a BVH-11. Podobně rekombinantní proteiny BVH-71 GAS a GBS se detekovaly analýzou westernovým imunoblotem.

Tyto výsledky indikují, že proteiny BVH-71, BVH-3 a BVH-11 mohou sdílet podobné funkce. Výsledky také naznačují, že proteiny BVH-71 se mohou použít jako komponenty proteinových vakcín proti streptokokům. V dalším provedení podle vynálezu se mohou použít proteiny BVH40 71 jako komponenty proteinové vakcíny proti GAS a GBS.

-35=7-— CZ 303675 B6

Seznam sekvencí <210> 1 <211> 3120 párů bází <212> DNA <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 1 atg aaa ttt agt aaa aaa tat ata gca get gga tca get gtt atc gta 48 tcc ttg agt cta tgt gcc tat gca cta aac cag cat cgt tcg cag gaa 96 aat aag gac aat aat cgt gtc tet tat gtg gat ggc age cag tca agt 144 cag aaa agt gaa aac ttg aca cca gac cag gtt age cag aaa gaa gga 192 att cag get gag caa att gta atc aaa att aca gat cag ggc tat gta 240 acg tca cac ggt gac cac tat cat tac tat aat ggg aaa gtt cct tat 288 gat gcc ctc ttt agt gaa gaa ctc ttg atg aag gat cca aac tat caa 336 ctt aaa gac get gat att gtc aat gaa gtc aag ggt ggt tat atc atc 384 aag gtc gat gga aaa tat tat gtc tac ctg aaa gat gca get cat get 432 gat aat gtt ega act aaa gat gaa atc aat cgt caa aaa caa gaa cat 480 gtc aaa gat aat gag aag gtt aac tet aat gtt get gta gca agg tet 528 cag gga ega tat acg aca aat gat ggt tat gtc ttt aat cca get gat 576 att atc gaa gat acg ggt aat get tat atc gtt cct cat gga ggt cac 624 tat cac tac att ccc aaa age gat tta tet. get agt gaa tta gca gca 672 get aaa gca cat ctg get gga aaa aat atg caa ccg agt cag tta age 720 tat LeL Lea aca get agt gac aat aac acg caa tet gta gca aaa gga 768 tca act age aag cca gca aat aaa tet gaa aat ctc cag agt ctt ttg 816 aag gaa ctc tat gat tca cct age gcc caa cgt tac agt gaa tca gat 864 ggc ctg gtc ttt gac cct get aag att atc agt cgt aca cca aat gga 912 gtt qcg att ccg cat ggc gac cat tac cac ttt att cct tac age aag 960 ctt tet get tta gaa gaa aag att gcc aga atg gtg cct atc agt gga 1008 act ggt tet aca gtt tet aca aat gca aaa cct aat gaa gta gtg tet 1056 agt cta ggc agt ctt tca age aat cct tet tet tta acg aca agt aag 1104 gag ctc tet tca gca tet gat ggt tat att ttt aat cca aaa gat atc 1152 gtt gaa gaa acg get aca get tat att gta aga cat ggt gat cat ttc 1200 cat tac att cca aaa tca aat caa att ggg caa ccg act ctt cca aac 1248 aat agt cta gca aca cct tet cca tet ctt cca atc aat cca gga act 1296 tca cat gag aaa cat gaa gaa gat gga tac gga ttt gat get aat cgt 1344 att atc get gaa gat gaa tca ggt ttt gtc atg agt cac gga gac cac 1392 aat cat tat ttc ttc aag aag gac ttg aca gaa gag caa att aag get 1440 gcg caa aaa cat tta gag gaa gtt aaa act agt cat aat gga tta gat 1488 tet ttg tca tet cat gaa cag gat tat cca ggt aat gcc aaa gaa atg 1536 aaa gat tta gat aaa aaa atc gaa gaa aaa att get ggc att atg aaa 1584 caa tat ggt gtc aaa cgt gaa agt att gtc gtg aat aaa gaa aaa aat 1632 gcg att att tat ccg cat gga gat cac cat cat gca gat ccg att gat 1680 gaa cat aaa ccg gtt gga att ggt cat tet cac agt aac tat gaa ctg 1728 ttt. aaa CCC gaa gaa gga gtt get aaa aaa gaa ggg aat aaa gtt tat 1776 act gga gaa gaa tta acg aat gtt gtt aat ttg tta aaa aat agt acg 1824 ttt aat aat caa aac ttt act cta gcc aat ggt caa aaa ege gtt tet 1872 ttt agt ttt ccg cct gaa ttg gag aaa aaa tta ggt atc aat atg cta 1920 gta aaa tta ata aca cca gat gga aaa gta ttg gag aaa gta tet ggt 1968 aaa gta ttt gga gaa gga gta ggg aat att gca aac ttt gaa tta gat 2016 caa cct tat tta cca gga caa aca ttt aag tat act atc get tca aaa 2064 gat tat cca gaa gta agt tat gat ggt aca ttt aca gtt cca acc tet 2112 tta get tac aaa atg gcc agt caa acg att ttc tat cct ttc cat gca 2160 qgg gat act tat tta aga gtg aac cct caa ttt gca gtg cct aaa gga 2208 act gat get tta gtc aga gtg ttt gat gaa ttt cat gga aat get tat 2256 tta gaa aat aac tat aaa gtt ggt gaa atc aaa tta ccg att ccg aaa 2304 tta aac caa gga aca acc aga acg gcc gga aat aaa att cct gta acc 2352

36CZ 303675 B6

ttc

atg

gca

a a t

gct

tat

ttg

gac

aat

caa

tcg

act

tat

att

gtg

gaa

gta

cct

atc

ttg

gaa

aaa

gaa

aat.

caa

act

gat

aaa

cca

agt

att

cta

cca

caa

ttt

aaa

agg

aat

aaa

gca

caa

gaa

aac

tea

aaa

ctt

gat

gaa

aag

gta

gaa

gaa

cca

aag

act

agt

gag

aag

gta

gaa

aaa

gaa

aaa

ctt

tet

gaa

act

ggg

aat

agt.

act

agt

aat

tea

acg

tta

gaa

gaa

gtt

cct

aca

gtg

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

gta

gca

cl cl ci

ttt

gct

gaa

agt

tat

ggg

atg

aaq

cta

gaa

aat

gtc

ttg

ttt

aat

atg

gac

gga

aca

att

gaa

tta

tat

tta

cca

tea

gga

gaa

gtc

att

aaa

aag

aat

atg

gca

gat

ttt

aca

gga

gaa

gca

cct

caa

gga

aat

ggt

gaa

aat

aaa

cca

tet

gaa

aat

gga

aaa

gta

tet

act

gga

aca

gt t

gag

aac

caa

cca

aca

gaa

aat

aaa

cca

gca

gat

tet

tta

cca

gag

gca

cca

aac

gaa

aaa

cct

gta

aaa

cca

gaa

aac

tea

acg

gat

aat

gga

atg

ttg

aat

cca

gaa

ggg

aat

gtg

ggg

agt

gac

cct

atg

tta

gat

cca

gca

tta

gag

gaa

gct

cca

gca

gta

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

tta

gaa

aaa

ttt

aca

gct

agt

tac

gga

tta

ggc

tta

gat

agt

gtt

ata

ttc

aat

atg

gat

gga

acg

att

gaa

tta

aga

ttg

cca

agt

gga

gaa

gtg

ata

aaa

aag

aat

tta

tet

gat

ttc

ata

gcg

taa

2400 24 48 24 96 2 54 4 2592 2640 2688 2736 27 8 4 2832 2880 2928 2 97 6 3024 307 2 3117 3120 <210> 2 <211> 1039 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 2

Met 1

Lys

Phe

Ser

Lys 5

Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala 10

Gly

Ser

Ala

Val

Ile 15

Val

Ser

Leu

Ser

Leu

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

20

25

30

Asn

Lys

Asp

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

35

40

45

Gin

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Gin

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

lle

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

Leu

Phe

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

100

105

110

Leu

Lys

Asp

Ala

Asp

Ile

Val·

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

lle

Ile

115

120

125

Lys

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

130

135

140

Asp

Asn

Val.

Arg

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

145

150

155

160

Val

Lys

Asp

Asn

Glu

Lys

V a 1

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

165

170

17 5

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180

185

190

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

195

200

205

Tyr

His

Tyr

lle

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Al a

Ser

Glu

Leu

Ala

Al a

210

215

220

Ala

Lys

Ala

His

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

230

235

240

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

255

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

C.lu

Leu

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

260

265

270

Lys

Glu

Leu

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

2 90

295

300

Val

Ala

Ile

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

325

330

335

Thr

Gly

Ser

Thr

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

340

345

350

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

Glu

Leu

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

370

375

380

Val

Glu

Glu

Thr

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

Asn

Ser

Leu

Ala

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

420

425

430

Ser

His

Glu

Lys

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

435

440

445

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450

455

4 60

Asn

Hi s

Tyr

Phe

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Val

465

470

4 75

480

Arg

Lys

Asn

Ile

<210> 9 <211 > 1587 párů bází <212> DNA

<213> mikroorganizmus S. pneumoniae <221> CDS <222> (1)...(1584)

<400> 9

aaa Lys

atc Ile

gaa Glu

gaa Glu 10

aaa Lys

att Ile

gct Ala

ggc Gly

att Ile 15

atg Met

atg Met 1

aaa Lys

gat Asp

tta Leu

gat Asp 5

aaa Lys

aaa

caa

tat

ggt

gtc

aaa

cgt

gaa

agt

att

gtc

gtg

aat

aaa

gaa

aaa

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

20

25

30

aat

gcg

att

att.

tat

ccg

cat

gga

gat

cac

cat

cat

gca

gat

ccg

att

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

35

40

45

gat

gaa

cat

aaa

ccg

gtt

gqa

att

ggt

cat

tet

cac

agt

aac

tat

gaa

Asp

G1 u

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

50

5 5

60

ctg

ttt

aaa

ccc

gaa

gaa

gga

gtt

gct

aaa

aaa

gaa

ggg

aat

aaa

gtt

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

65

70

75

80

tat

act

gga

gaa

gaa

tta

acg

aat

gtt

gtt

aat

ttg

tta

aaa

aat

agt

144

192

240

238

- 52 C7 303675 B6

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu 85

Leu

Thr

Asn

Val

Val 90

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn 95

Ser

acg

ttt

aat

aa t

caa

aac

ttt

act

cta

gcc

aat

ggt

caa

aaa

cgc

gtt

336

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

100

105

110

tet

ttt

agt

ttt

ccg

cct

gaa

ttg

gag

aaa

aaa

tta

ggt

atc

aat

atg

384

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

115

120

125

cta

gta

aaa

tta

ata

aca

cca

gat

gga

aaa

gta

ttg

gag

aaa

gta

tet

432

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

130

135

140

ggt

aaa

gta

ttt

gga

gaa

gga

gta

ggg

aat

att

gca

aac

ttt

gaa

tta

480

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

145

150

155

160

gat

caa

cct

tat

tta

cca

gga

caa

aca

ttt

aag

tat

act

atc

gct

tea

528

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

165

170

175

aaa

gat

tat

cca

gaa

gta

agt

tat

gat

ggt

aca

ttt

aca

gtt

cca

acc

57 6

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

ISO

185

190

tet

tta

gct

tac

aaa

atg

gcc

agt

caa

acg

att

ttc

tat

cct

ttc

cat

624

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

195

200

205

gca

ggg

gat

act

tat

tta

aga

gtg

aac

cct

caa

ttt

gca

gtg

cct

aaa

672

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

210

215

220

gga

act

gat

gct

tta

g t c

aga

gtg

ttt

gat

gaa

1.11

cat

gga

aat

gct

72 0

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

225

230

235

240

tat

tta

gaa

aat

aac

tat

aaa

gtt

ggt

gaa

atc

aaa

tta

ccg

att

ccg

768

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

245

2 50

255

aaa

tta

aac

caa

gga

aca

acc

aga

acg

gcc

gga

aat

aaa

att

cct

gta

816

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

260

265

270

acc

ttc

atg

gca

aat

gct

tat

ttg

gac

aat

caa

tcg

act

tat

att

gtg

864

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

275

280

285

gaa

gta

cct

atc

ttg

gaa

aaa

gaa

aat

caa

act

gat

aaa

cca

agt

att

912

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

290

295

300

cta

cca

caa

ttt

s aa

agg

aat

aaa

gca

caa

gaa

aac

tea

aaa

ct t

gat

960

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

305

310

315

320

5?

gaa Glu

aag Lys

gta Val

gaa Glu

gaa Glu 325

cca Pro

aag Lys

act Thr

agt Ser

gag Glu 330

aag Lys

gta Val

gaa Glu

aaa Lys

gaa Glu 335

aaa 1008 Lys

ctt

tct

gaa

act

ggg

aat

agt

act

agt

aat

tca

acg

tta

gaa

gaa

gtt

1056

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

340

345

350

cct

aca

gtg

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

gt a

gca

aaa

ttt

get

gaa

agt

1104

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

355

360

365

tat

ggg

atg

aag

cta

gaa

aat

gtc

ttg

ttt

aat

atg

gac

gga

aca

att

1152

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

lle

370

375

380

gaa

tta

tat

tta

cca

tca

gga

gaa

gtc

att

aaa

aag

aat

atg

gca

gat

1200

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

lle

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

335

390

395

400

ttt

aca

gga

gaa

gca

cct

caa

gga

aat

ggt

gaa

aat

aaa

cca

tet

gaa

1248

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

4 05

410

415

aat

gga

aaa

gta

tet

act

gga

aca

gtt

gag

aac

caa

cca

aca

gaa

aat

1296

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

4 20

425

430

aaa

cca

gca

gat

tet

tta

cca

gag

gca

cca

aac

gaa

aaa

cct

gta

aaa

1.34 4

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

435

440

445

cca

gaa

aac

tca

acg

gat

aat

gga

atg

ttg

aat

cca

gaa

ggg

aat

gtg

1392

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

450

455

460

ggg

agt

gac

cct

atg

tta

gat

cca

gca

tta

gag

gaa

get

cca

gca

gta

1440

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

465

470

475

480

gat

cct

gta

caa

gaa

aaa

tta

gaa

aaa

ttt

aca

get

agt

tac

gga

tta

1488

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

4 85

4 90

495

ggc

tta

gat

agt

gtt

ata

ttc

aat

atg

gat

gga

acg

att

gaa

tta

aga

1536

Gl.y

Leu

Asp

Ser

Val

lle

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

lle

Glu

Leu

Arg

500

505

510

ttg

cca

agt

gqa

gaa

gtg

ata

aaa

aag

aat

tta

tet

gat

ttc

ata

gcg

1584

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Tle

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

lle

Ala

51 5

520

525

taa

1587

<210>

10

<211>

528 aminokyselin

<212>

protein

<213>

m

ikroorganizmus

S.pneumoniae

<400>

10

54C7 303675 B6

Ťlet

Lys

Asp

Leu

Asp 5

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu 10

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile 15

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Va L

Asn

Lys

Glu

Lys

20

25

30

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

35

40

45

Asp

Glu

HÍS

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

50

55

60

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

65

70

75

80

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

85

90

95

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

100

105

110

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

115

120

125

Leu

Val

Lys

Leu

I le

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

130

135

140

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

145

150

155

160

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

165

170

175

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

As p

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

180

185

190

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

195

200

205

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

210

215

220

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

225

230

235

240

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

245

250

255

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

ile

Pro

Val

260

265

270

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

275

280

285

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

ile

290

295

300

Leu

Pro

Cin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

305

310

315

320

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Gl u

Lys

325

330

335

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

340

345

350

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Val.

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

355

360

365

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

370

375

380

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

385

390

395

400

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

405

410

415

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

420

425

430

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Gl u

Lys

Pro

Val·

Lys

435

440

445

Pro Glu Asn Ser Thr Asp Asn Gly Met Leu Asn Pro Glu Gly Asn Val 450 455 460

Gly Ser Asp Pro Met Leu Asp Pro Ala Leu Glu Glu Ala Pro Ala Val

465 470 475 480

Asp Pro Val Gin Glu Lys Leu Glu Lys Phe Thr Ala Ser Tyr Gly Leu

485 450 455

Gly Leu Asp Ser Val Ile Phe Asn Met Asp Gly Thr Ile Glu Leu Arg

500 505 510

Leu Pro Ser Gly Glu Val Ile Lys Lys Asn Leu Ser Asp Phe Ile Ala

515 520 525 <210> 11 <211> 5048 párů bází <212> DNA <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 11 aattccttgt cgggtaagtt ccgacccgca cgaaaggcgt aatgatttgg gcactgtctc 60 aacgagagac tcggtgaaat tttagtacct gtgaagatgc aggttacccg cgacaggacg 120 gaaagacccc atggagcttt actgcagttt gatattgagt gtctgtacca catgtacagg 180 ataggtagga gtctaagaga tcgggacgcc agtttcgaag gagacgctgt tgggatacta 240 cccttgtgtr atggccactc taacccagat aggtgatccc tatcggagac agtgtctgac 300 gggcagtttg aotggggcag tcgcctccta aaaggtaacg gaggcgccca aaggttccct 360 cagaatggtt ggaaatcatt cgcagagtgt aaaggtataa gggagcttga ctgcgagagc 420 tacaactcga gcagggacga aagtcgggct tagtgatccg gtggttccgt atggaagggc 480 catcgctcaa cggataaaag ctaccctggg gataacaggc ttatctcccc caagagttca 540 catcgacggg gaggtttggc acctcgatgt cggctcgtcg catcctgggg ctgtagtcgg 600 tcccaagggt tgggctgttc gcccattaaa gcggcacgcg agctgggttc agaacgtcgt 660 gagacagttc ggtccctatc cgtcgcgggc gtaggaaatt tgagaggatc tgctoctagt 720 acgagagqac cagagtggac ttaccgctgg tgtaccagtt gtcttgccaa aggcatcgct 780 gggtagctat gtagggaagg gataaacgct gaaagcatct aagtgtgaaa cccacctcaa 840 gatgagattt cccatgatta tatatcagta agagccctga gagatgatca ggtagatagg 900

LLagaagLyg aagLgtggcg acacatgtag cggactaata ctaatagctc gaggacttat 960 ccaaagtaac tgagaatatg aaagcgaacg gttttcttaa attgaataga tattcaattt 1020 tgagtaggta ttactcagag ttaagtgacg atagcctagg agatacacct gtacccatgc 1080 cgaacacaga agttaagccc tagaacqccg gaagtagttg ggggttgccc cctgtgagat 1140 agggaagtcg cttagctcta gggagtttag ctcagctggg agagcatctg ccttacaagc 1200 agagggtcag cggttcgatc ccgttaactc ccaaaggtcc cgtagtgtag cggttatcac 1260 gtcgcccLgt cacggcgaag atcgcgggtt cgattcccgt cgggaccgtt taaggtaacg 1320 caagttattt tagactcgtt agctcagttg gtagagcaat tgacttttaa tcaatgggtc 1380 actggttcga gcccagtacg ggtcatatat gcgggtttgg cggaattcta atctctttga 1440 aatcatcttc tctcaccttc caaaactcta ttacct.ctta ttataccaca tttcaatcrt 1500 caacttccca gtaatataag cacctctggc qaaaaaagtt tcaatgtcct aaagtaataa 1560 gtgaatccaa ttcaggaact ccaagaacaa aagaaacatc tggtgtcaca agtattggat 1620 ggcacagagt cacgtggtag tctgacccta gcagaaattt taaatagtaa actatttact 1680 ggttaattaa atggttaaat aaccggttta qaaaactatt. taataaagta aaagaagttg 1740 agaaaaaact tcatcattta ttgaaatgag ggatttatga aatttagtaa aaaatatata 1800 gcagctggat cagctgttat cgtatccttg agtctatgtg cctatgcact aaaccagcat 1860 egttcgcagg aaaataagga caataatcgt qtctcttatg tggatggcag ccagtcaagt 1920 cagaaaagtg aaaacttgac accagaccag gttagccaga aagaaggaat tcaggctgag 1580 caaattgtaa tcaaaattac agatcagggc tatgtaacgt cacacggtga ccactatcat 2040 íactataatg ggaaagttcc ttatgatgcc ctctttagtg aagaactctt gatgaaggat 2100 ccaaactatc aacttaaaga cgetgatatt gtcaatgaag tcaagggtgg ttatatcatc 2160 aaggtcgatg gaaaatatta tgtctacctg aaagatgcag ctcatgctga taatgttcga 2220 actaaagatg aaatcaatcg tcaaaaacaa gaacatgtca aagataatga gaaggttaac 2280 tctaatgttg ctgtagcaag gtcLcaggga cgatatacga caaatgatgg ttatgtcttt 2340 aatccagctg aLattatcga agatacgggt aatgcttata tcgttcctca tggaggtcac 2400 tatcactaca tícccaaaag cgatttatct qctagtgaat tagcagcagc taaagcacat 2460 ctggctggaa aaaatatgea accgagtcag ttaagctatt uttcaacagc tagtgacaat 2520

-56Q7. 303675 B6 aacacgc.aat ctgtagcaaa aggatcaact- agcaagccag caaat.aaatc tqaaaatctc 2bS0 cagaqtcttt tqaaggaact ctatgattca cctagcgccc aacgttacag tgaalcagat 2640 gqcctggtct t Lgaccctgc taagattatc agtcgtacac caaatggagt tgcgattccg 27 00 catqgcgacc attaccactt tattccttac aqcaagcttt ctgctttaga agaaaagatt 2/60 qccaqaatgg tgcctatcag tggaactggt tctacagttt ctacaaatgc aaaacctaat 2820 gaagtagtat ctaatctagg cagtctttca agcaatcctt cttctttaac gacaagtaaq 2880 gagcLctcLL cagcatctga tggttatatt tttaatccaa aagatatcgt tgaagaaacg 2940 gctacagctt atattgraag acatggtgat catttccatt acattccaaa atcaaatcaa 3000 attgggcaac cgactcttcc aaacaatagt ctagcaacac cttctccatc tcttccaatc 3060 aatccaggaa cttcacatga gaaacatgaa gaagatggat acggatttga tgctaatcgt 3120 attatcgctg aagatgaatc aggttttgtc atgagtcacg gagaccacaa tcattatttc 3180 ttcaagaagg acttgacaga agagcaaatt aaggctgcgc aaaaacattt agaggaagtt 3240 aaaactagtc ataatggatt agattctttg tcatctcatg aacaggatta tccaggtaat 3300 gccaaagaaa tgaaagattt agataaaaaa atcgaagaaa aaattgctgg cattatgaaa 3360 caatatggtg tcaaacgtga aagtattgtc gtgaataaag aaaaaaatgc gattattt.at 3420 ccgcatggag atcaccatca tgcagatccg attgatgaac ataaaccggt tggaattggt 3480 cattctcaca gtaactatga actgtttaaa cccgaagaag gagttgctaa aaaagaaggg 3540 aataaagttt atactggaga agaattaacg aatgttgtta atttgttaaa aaatagtacg 3600 tttaataatc aaaactttac tctagccaat ggtcaaaaac gcgtttcttt tagttttccg 3660 cctgaattgg sgaaaaaatt aggtatcaat atgctagtaa aattaataac accagatgga 3720 aaagtattgg agaaagtatc tggtaaagta tttggagaag gagtagggaa tattgcaaac 3780 tttgaattag atcaacctta tttaccagga caaacattta agtatactat cgcttcaaaa 3840 gattatccag aagtaagtta tgatggtaca tttacagttc caacetcttt agcttacaaa 3900 atggccagtc aaacgatttt ctatcctttc catgcagggg atacttattt aagagtgaac 3960 cctcaatttg cagtgcctaa aggaactgat gctttaqtca gagtgtttga lgaatttcal 4020 ggaaatgctt atttagaaaa taactataaa gttggtgaaa tcaaattacc gattccgaaa 4080 ttaaaccaag gaacaaccag aacggccgga aataaaattc ctgtaacctt catggcaaat 4140 gcttatttgg acaatcaatc gacttatatt gtggaagtac ctatcttgga aaaagaaaat 4200 caaactgata aaccaagtat tctaccacaa tttaaaagga ataaagcaca agaaaactca 4260 aaacttgatg aaaaggtaga agaaccaaag actagtgaga aggtagaaaa agaaaaactt 4320 tctgaaactg ggaatagtac tagtaattca acgttagaag aagttcctac agtggatcct 4380 gtacaagaaa aagtagcaaa atttgctgaa agttatggga tgaagctaga aaatgtcttg 4440 cttaatatgg acggaacaat tgaattatat ttaccatcag gagaagtcat taaaaagaat 4500 atggcagatt ttacaggaga agcacctcaa ggaaatggtg aaaataaacc atctgaaaat 4560 ggaaaagtat ctactggaac agttgagaac caaccaacag aaaataaacc agcagattct 4620 ttaccagagg caccaaacga aaaacctgta aaaccagaaa actcaacgga taatggaatg 4680 ttgaatccag aagggaatgt qgggagtgac cctatgttag atccagcatt agaggaagct 4740 ccagcagtag atcctgtaca agaaaaatta gaaaaattta cagctagtta cggattaggc 4800 ttagatagtg ttatattcaa tatggatgga acgattgaat taagattgce aagtggagaa 4860 gtgataaaaa agaatttatc tgatttcata gcgtaaggaa tagcagtaga aaaagtctga 4920 atcaaaaatg aagttctctc aaaagttaga aataaaactc tgactttggg agaatttcat 4980 tttattatta atatataaaa tttcttgaca tacaacttaa aaagaggtgg aatatttact 5040 agttaatt 5048 <210> 12 <211> 2647 párů bází <212> DNA <213> mikroorgan izmus 5.pneumoniae <400> 12 cagagatctt agtgaatcaa atatacttaa gaaaagagga aagaatgaaa atcaataaaa 60 aatatctagc tgggtcagta gctacacttg ttttaagtgt ctgtgcttat gaactaggtt 120 tqcatcaagc tcaaactgta aaagaaaata atcgtgtttc ctatatagat ggaaaacaag 180 cgacgcaaaa aacggagaat ttgactcctg atgaggttag caagcgtgaa ggaatcaacg 240 ccgaacaaat cgtcatcaaa attacggatc aaggttatgt gacctctcat ggagaccatt 300 atcattacta taatggcaag gtcccttatg atgccatcat cagtgaagag ctcctcatga 360 aagatccgaa ttatcagttg aaggattcag acattgtcaa tgaaatcaag ggtggttatg 420 tcattaaggt aaacggtaaa tactatgttt accttaagga tgcagctcat gcggataatg 480 tccgtacaaa agaagaaatc aatcgqcaaa aacaagaaca tagtcageat cgtgaaggag 540 ggacttcagc aaacgatggt gcggtagcct ttgcacgttc acagggacgc tacaccacag 600 atgatggtta tatcttcaat gcatctgata tcategaaga tacgggcgat gcctatatcg 660 ttcctcatgg agatcattac cattacattc ctaagaatga gttafceaget agcgagttgg 720 ctgctgcaga agccttccta tctggtcggg aaaatctgtc aaatttaaga acctatcgcc 780 gacaaaatag cgataacact ccaagaacaa actgggtacc ttctgtaagc aatccaggaa 840 ctacaaatac taacacaagc aacaacagca acactaacag tcaagcaagt caaagtaatg 900 acattgatag tctcttgaaa cagctctaca aactgccttt gagtcaacgc catgtagaat 960 ctgatggcct tattttcgac ccagcgcaaa tcacaagtcg aaccgccaga ggtgtagctg 1020 tccctcatgg taaccattac cactttatcc cttatgaaca aatgtctgaa ttggaaaaac 1080 gaattgctcg tattattccc cttcgttatc gttcaaacca ttgggtacca gattcaagac 1140 cagaagaacc aagtccacaa ccgactccag aacctagtcc aagtccgcaa cctgcaccaa 1200 atcctcaacc agctccaagc aatccaattq atgagaaatt ggtcaaagaa gctgttcgaa 1260 aagtaggcga tggttatgtc tttgaggaga atggagtttc tcgttatatc ccagccaaga 1320 atctttcagc agaaacagca gcaggcattg atagcaaact ggccaagcag gaaagtttat 1380 ctcaLaagct aggagctaag aaaactgacc tcccatctag tgatcgagaa ttttacaata 1440 aggcttatga cttactagca agaattcacc aagatttact tgataataaa ggtcgacaag 1500 ttgattttga ggctttggat aacctgttgg aacgactcaa ggatgtctca agtgataaag 1560 tcaagttagt ggatgatatt cttgccttct tagctccgat tcgtcatcca gaacgtttag 1620 gaaaaccaaa tgcgcaaatt acctacactg atgatgagat tcaagtagcc aagttggcag 1680 gcaagtacac aacagaagac ggttatatct ttgatcctcg tgatataacc agtgatgagg 1740 gggatgccta tgtaactcca catatgaccc atagccactg gattaaaaaa gatagtttgt 1800 ctgaagctga gagagcggca gcccaggctt atgctaaaga gaaaggtttg acccctcctt 1860 cgacagacca teaggattea ggaaatactg aggcaaaagg ageagaaget atctacaacc 1920 gcgtgaaagc agctaagaag gtgccacttg atcgtatgcc ttacaatctt caatatactg 1980 tagaagtcaa aaacggtagt ttaatcatac ctcattatga ccattaccat aacatcaaat 2040 ttgagtggtt tgacgaaggc ctttatgagg cacctaaggg gtatactctt gaggatcttt 2100 tggcgactgt caaatactat gtcgaacatc caaacgaacg tccgcattca gataatggtt 2160 ttggtaacgc tagcgaccat gttcaaagaa acaaaaatgg tcaagctgat accaatcaaa 2220 cggaaaaacc aagcgaggag aaacctcaga cagaaaaacc tgaggaagaa acccctcgag 2280 aagagaaacc acaaagcgag aaaccagagt ctccaaaacc aacagaggaa ccagaagaag 2340 aatcaccaga ggaatcagaa gaacctcagg tcgagactga aaaggttgaa gaaaaactga 2400 gagaggctga agatttactt gcaaaaatcc aggatccaat tatcaagtcc aatgccaaag 2460 agactctcac aggattaaaa aataatttac tatttggcac ccaggacaac aatactatta 2520 tggcagaagc tgaaaaacta ttggctttat taaaggagag taagtaaagg tageageatt 2580 ttctaactcc taaaaacagg ataggagaac gggaaaacga aaaatgagag cagaatgtga 2640 gttctag 2647

<210>	13
<211>	2639 párů bází
<212>	DNA
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<221>	CDS
<222>	(114)...(2627)
<400>	13

gggtcttaaa actctgaatc ctttagaggc agacccacaa aatgacaaga cctatttaga aaatctggaa gaaaatatga gtgttctagc agaagaatta aagtgaggaa aga atg

Met

116

aaa Lys	atc Ile	aat Asn	aaa Lys 5	a a a Lys	tat Tyr	cta Leu	gca Ala	ggt Gly 10
agt	gtt	tgt	tcc	tat	gaa	ctt	ggt	cgt
Ser	Val	Cys	Ser	Tyr	Glu	Leu	Gly	Arg
		20					25

tea Ser	gtg Val	gca Al a	gtc Val	ctt Leu 15	gcc Ala	cta Leu	164
cac	caa	gct	ggt	cag	gtt	aag	212
His	Gin	Ala	Gly 30	Gin	Val	Lys

-58C7. 303675 R6

260

aaa

gag

tet

aat

ega

gtt

tet

tat

ata

gat

ggt

gat

cag

get

ggt

caa

Lys

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gln

Ala

Gly

Gln

35

40

45

aag

gca

gaa

aat

ttg

aca

cca

gat

gaa

gtc

agt

aag

aga

gag

ggg

atc

Lys

Ala

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

50

55

60

65

aac

gcc

gaa

caa

att

gtt

atc

aag

att

acg

gat

caa

ggt

tat

gtg

acc

Asn

Ala

Glu

Gln

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gln

Gly

Tyr

Val

Thr

70

7 5

80

tet

cat

gga

gac

cat

tat

cat

tac

tat

aat

ggc

aag

gtt

cct

tat

gat

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

85

90

95

gcc

atc

atc

agt

gaa

gaa

ctt

ctc

atg

aaa

gat

ccg

aat

tat

cag

ttg

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

100

105

110

aag

gat

tea

gac

att

gtc

aat

gaa

atc

aag

ggt

ggc

tat

gtg

att

aag

Lys

Asp

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

115

120

125

gta

gac

gga

aaa

tac

tat

gtt

tac

ctt

aaa

gat

gcg

gcc

cat

gcg

gac

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

130

135

140

145

aat

att

cgg

aca

aaa

gaa

gag

att

aaa

cgt

cag

aag

cag

gaa

cac

agt

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gln

Lys

Gln

Glu

His

Ser

150

155

160

cat

aat

cat

aac

t ca

aga

gca

gat

aat

get

gtt

get

gca

gcc

aga

gcc

His

Asn

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Al a

Ala

Ala

Arg

Ala

165

170

175

caa

gga

cgt

tat

aca

acg

gat

gat

ggg

tat

atc

ttc

aat

gca

tet

gat

Gln

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

180

185

190

atc

att

gag

gac

acg

ggt

gat

get

tat

atc

gtt

cct

cac

ggc

gac

cat

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

195

200

205

tac

cat

tac

att

cct

aag

aat

gag

t ta

tea

get

age

gag

tta

get

get

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

210

215

220

225

gca

gaa

gcc

tat

tgg

aat

ggg

aag

cag

gga

tet

cgt

cct

tet

tea

agt

Ala

Glu

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gln

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

230

235

240

tet

agt

tat

aat

gca

aat

cca

gtt

caa

cca

aga

ttg

tea

gag

aac

cac

Ser

Ser

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gln

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

24 5

250

255

aat

ctg

act

gtc

act

cca

act

tat

cat

caa

aat

caa

ggg

gaa

aac

att

308

356

404

452

500

548

596

644

692

740

788

836

884

932

Asn

Leu

Thr 260

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr 265

His

Gin

Asn

Gin

Gly 270

Glu

Asn

Ile

tea

age

ctt

tta

cgt

gaa

ttg

tat

get

aaa

ccc

tta

tea

gaa

ego

cat

980

Ser

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

275

280

285

gta

gaa

tet

gat

ggc

ctt

att

ttc

gac

cca

gcg

caa

atc

aca

agt

ega

1028

Va 1

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Tle

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

290

295

300

305

acc

gcc

aga

ggt

gta

get

gtc

cct

cat

ggt

aac

cat

tac

cac

ttt

atc

1076

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

310

315

320

cct

tat

gaa

caa

atg

tet

gaa

ttg

gaa

aaa

ega

att

get

cgt

att

att

1124

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

He

Ala

Arg

Ile

Ile

325

330

335

ccc

ctt

cgt

tat

cgt

tea

aac

ca t

tgg

gta

cca

gat

tea

aga

cca

gaa

1172

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

340

345

350

caa

cca

agt

cca

caa

tcg

act

ccg

gaa

cct

agt

cca

agt

ctg

caa

cct

1220

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

Pro

355

360

365

gca

cca

aat.

cct

caa

cca

get

cca

age

aat

cca

att

gat

gag

aaa

ttg

1268

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

370

375

380

385

gtc

aaa

gaa

get

gtt

ega

aaa

gta

ggc

gat

ggt

tat

gtc

ttt

gag

gag

1316

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

390

395

400

aat

gga

gtt

tet

cgt

tat

atc

cca

gcc

aag

gat

ctt

tea

gca

gaa

aca

1364

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

405

410

415

gca

qca

ggc

att

gat

age

aaa

ctg

gcc

aag

cag

gaa

agt

tta

tet

cat

1412

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

420

425

430

aag

cta

gga

get

aag

aaa

act

gac

ctc

cca

tet

agt

gat

ega

gaa

ttt

1460

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

435

440

445

tec

aat

aag

get

tat

gac

tta

cta

gca

aga

att

cac

caa

gat

tta

ctt

1508

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Al a

Arg

Tle

His

Gin

Asp

Leu

Leu

4 50

455

460

465

gat

aat

aaa

ggt

ega

caa

gtt

gat

ttt

gag

gtt

ttg

gat

aac

ctg

ttg

1556

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

470

475

480

gaa

ega

ctc

aag

gat

gtc

tea

agt

gat

aaa

gtc

aag

tta

gtg

gat

gat

1604

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

4 85

4 90

495

60CZ 303675 R6

att Ile

ctt Leu

gcc Ala 500

ttc Phe

tta Leu

gct Ala

ccg Pro

att Ile 50 5

cgt Arg

cat H i s

cca Pro

gaa Glu

cgt Arg 510

tta Leu

gga Gly

aaa Lys

16 52

cca

aat

gcg

caa

att

acc

tac

act

ga t.

gat

gag

att

caa

gta

qcc

aag

1700

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Al a

Lys

515

5 20

525

ttg

gca

ggc

aag

tac

aca

aca

gaa

gac

ggt

tat

atc

ttt

gat

cct

cgt

1748

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

530

535

540

545

gat

ata

acc

agt

gat

gag

ggg

gat

gcc

tat

gta

act

cca

cat

atg

acc

1796

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

550

555

560

cat

age

cac

tgg

att

aaa

aaa

gat

agt

ttg

tet

gaa

gct

gag

aga

gcg

1844

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

565

570

575

gca

gcc

cag

gct

tat

gct

aaa

gag

aaa

ggt

ttg

acc

cct

cct

t cg

aca

1892

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

580

585

590

gac

cac

cag

gat

tca

gga

aat

act

gag

gca

aaa

gga

gca

gaa

gct

atc

1940

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

595

600

605

tac

aac

cqc

gtg

éi či cJ

gca

gct

aag

aag

gtg

cca

ctt

gat

cgt

atg

cct

1988

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

610

615

620

625

tac

aat

ct t

caa

tat

act

gta

gaa

gtc

aaa

aac

ggt

agt

tta

atc

ata

2036

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

630

635

640

cct

cat

tat

gac

cat

tac

cat

aac

atc

aaa

ttt

gag

tgg

ttt

gac

gaa

2084

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

645

650

655

ggc

ctt

tat

gag

gca

cct

aag

ggg

tat

agt

ctt

gag

gat

ctt

ttg

gcg

2132

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

660

665

670

act

gtc

aag

tac

tat

gtc

gaa

cat

cca

33C

gaa

cgt

ccg

cat

tca

gat

2180

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

67 5

680

685

aat

ggt

ttt

ggt

aac

gct

agt

gac

cat

gtt

cgt

aaa

aat

aag

gca

gac

2228

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

690

695

700

705

caa

gat

agt

aaa

cct

gat

gaa

gat

aag

gaa

cat

gat

gaa

gta

agt

gag

2276

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

710

715

7 20

cca

act

cac

cct

gaa

tet

gat

gaa

aaa

gag

aat

cac

gct

ggt

tta

aat

2324

Pro

Thr

His

Pro 725

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys 730

Glu

Asn

His

Ala

Gly 735

Leu

Asn

cct

tea

gca

gat

aat

ctt

tat

aaa

cca

age

act

gat

acg

gaa

gag

aca

2372

Pro

Ser

Al a

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

740

745

750

gag

gaa

gaa

gct

gaa

gat

acc

aca

gat

gag

gct

gaa

att

cct

caa

gta

2420

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

755

760

765

gag

aat

tet

gtt

att

aac

gct

aag

ata

gca

gat

gcg

gag

gcc

ttg

cta

2468

Glu

Asn

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

770

7 75

780

785

gaa

aaa

gta

aca

gat

cct

agt

att

aga

caa

aat

gct

atg

gag

aca

ttg

2516

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

790

795

800

act

ggt

cta

aaa

agt

agt

ctt

ctt

ctc

gga

acg

aaa

gat

aat

aac

act

2564

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

805

810

815

att

tea

gca

gaa

gta

gat

agt

ctc

ttg

gct

ttg

tta

aaa

gaa

agt

caa

2612

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

820

825

830

ccg gct cct ata cag tagtaaaatg aa 2639

Pro Ala Pro Ile Gin

835 <210> <211>

<212>

<213> <400>

848 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 14

Met 1

Lys

Ile

Asn

Lys 5

Lys

Tyr

Leu

Ala

Gly 10

Ser

Val

Ala

Val

Leu 15

Ala

Leu

Ser

Val

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Val

20

25

30

Lys

Lys

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

3 5

40

45

Gin

Lys

Ala

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Asn

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

ll.e

1 le

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

100

105

110

Leu

Lys

A s p

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

1 15

120

125

Lys

V a 1

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

1 3 U

135

140

Asp

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

I le

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

Hi s

145

150

155

160

Ser

His

Asn

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

165

170

175

Ala

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

lle

Phe

Asn

Ala

Ser

180

185

190

Asp

lle

lle

G.1 u

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

1 95

200

205

His

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

210

215

220

Ala

Ala

Glu

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

225

230

235

240

Ser

Ser

Ser

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

245

250

255

His

Asn

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

260

265

270

T 1 e

Ser

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

275

280

285

His

Val

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Al a

Gin

Tle

Thr

Ser

290

295

300

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

305

310

315

320

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

325

330

335

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

340

345

350

Glu

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

355

360

365

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

370

37 5

380

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gl y

Tyr

Val

Phe

Glu

385

390

395

400

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Al a

T.ys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

405

410

415

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

420

425

430

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

435

440

445

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

450

455

460

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

465

470

475

480

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

485

490

495

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

lle

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

500

505

510

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

515

520

525

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

530

535

540

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

545

550

555

560

Thr

His

Ser

His

Trp

11 e

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

565

570

575

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

580

585

590

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

595

600

605

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

610

615

620

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Μ

625

630

635

640

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

645

650

655

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

660

665

670

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

675

680

685

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

690

695

700

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

705

710

715

720

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

725

730

735

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

740

745

750

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

755

760

765

Val

GlU

Asn

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

770

775

780

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

7 85

790

795

800

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

805

810

815

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

820

825

830

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

835 <210> 15 <211> 2528 párů bází <212> DNA <213> mikroorganizmus Xpneumoniae <221 > CDS <222> (1)...(2520) <400> 15

tgt Cys 1

gcc Ala

tat Tyr

gca Ala

cta Leu 5

aac Asn

cag Gin

cat His

cgt Arg

tcg Ser 10

cag Gin

gaa Glu

aat Asn

aag Lys

gac Asp 15

aat Asn

aat

cgt

gtc

tet

tat

gtg

gat

ggc

age

cag

tea

agt

cag

aaa

agt

gaa

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

aac

ttg

aca

cca

gac

cag

gtt

age

cag

aaa

gaa

gga

att

cag

gct

gag

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

caa

att

gta

atc

aaa

att

aca

gat

cag

ggc

tat

gta

acg

tea

cac

ggt

G1. n

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

gat

cac

tat

cat

tac

tat

aat

ggg

aaa

gtt

cct

tat

gat

gcc

ctc

ttt

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

agt

gaa

gaa

ctc?

ttg

atg

aag

gat

cca

aac

tat

caa

ct t

aaa

gac

gct

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

144

192

240

288

-64CZ 303675 R6

gat Asp

att Ile

gtc Val

aat Asn 100

gaa Glu

gtc Val

aag Lys

ggt Gly

ggt Gly 105

tv Tyr

atc Ile

atc Ile

aag Lys

gtc Val 110

gat Asp

gga Gly

336

aaa

tat

tat

gtc

tac

ctg

aaa

gat

gca

gct

cat

gct

gat

aat

gtt

ega

38 4

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

AJ a

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

act

aaa

gat

gaa

atc

aat

cgt

caa

aaa

caa

gaa

cat

gt c

aaa

gat

aat

4 3?

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

gag

aag

gtt

aac

tet

aat

gtt

gct

gta

gca

agg

tet

cag

gga

ega

tat

480

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Al a

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

1 60

acg

aca

aat

gat

ggt

tat

gtc

ttt

aat

cca

gct

gat

att

atc

gaa

gat

52 8

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

acg

ggt

aat

gct

tat

atc

gtt

cct

cat

gga

ggt

cac

tat

cac

tac

att

576

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Tle

180

185

190

CCC

aaa

agc

gat

tta

tet

gct

agt

gaa

tta

gca

gca

gct

aaa

gca

cat

624

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

c t. g

gct

gga

aaa

aat

atg

caa

ccg

agt

cag

tta

agc

tat

tet

tea

aca

67 2

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

cct

tet

cca

tet

ctt

cca

atc

aat

cca

gga

act

tea

cat

gag

aaa

cat

720

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

His

225

230

235

240

gaa

gaa

gat

gga

tac

qga

ttt

gat

gct

aat

cgt

att

atc

gct

gaa

gat

768

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

245

250

255

gaa

tea

ggt

ttt

gtc

atg

agt

cac

gga

gac

cac

aat

cat

tat

ttc

ttc

816

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

Hi.s

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

260

265

270

aag

aag

gac

ttg

aca

gaa

gag

caa

att

aag

gct

gcg

caa

aaa

cat

tta

864

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

Leu

275

280

285

gag

gaa

gtt

aaa

act

agt

cat

aat

gga

tta

gat

tet

ttg

tea

tet

cat

912

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

Sis

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

290

295

300

gaa

cag

gat

tat

cca

agt

aat

gcc

aaa

gaa

atg

aaa

gat

tta

gat

aaa

960

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

305

310

315

320

aaa

ale

gaa

gaa

aaa

att

gct

gg^

at t.

atg

ddd

caa

tat

ggt

gtc

aaa

1008

A*

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Tle

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

325

330

3 35

cgt

gaa

agt

att

gtc

gtg

aat

aaa

gaa

aaa

aat

gcg

att

att

tat

ccg

1056

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

34 0

345

350

cat

gga

gat

cac

cat

cat

gca

gat

ccg

att

gat

gaa

cat

aaa

ccg

gtt

1104

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

355

360

365

gga

att

ggt

cat

tet

cac

agt

aac

tat

gaa

ctg

ttt

aaa

ccc

gaa

gaa

1152

Gly

Ile

Gly

His

Ser

Hi s

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

37 0

375

380

gga

gtt

gct

aaa

aaa

gaa

ggg

aat

aaa

gtt

tat

act

gga

gaa

gaa

tta

1200

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

385

390

395

400

acg

aat

gtt

gtt

aat

ttg

tta

aaa

aat

agt

acg

ttt

aat

aat

caa

aac

1248

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

405

410

415

ttt

act

cta

gcc

aat

ggt

caa

aaa

cgc

gtt

tet

ttt

agt

ttt

ccg

cct

1296

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

420

425

430

gaa

ttg

gag

aaa

aaa

tta

ggt

atc

aat

atg

cta

gta

aaa

tta

ata

aca

1344

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

435

440

445

cca

gat

gga

aaa

gta

ttg

gag

aaa

gta

tet

ggt

aaa

gta

ttt

gga

gaa

13 92

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

450

455

460

gga

gta

ggg

aat

att

gca

aac

ttt

gaa

tta

gat

caa

cct

tat

tta

cca

1440

Gly

Val

Gl y

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

465

470

475

480

gga

caa

aca

ttt

aag

tat

act

atc

gct

tea

aaa

gat

tat

cca

gaa

gta

1488

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

485

490

495

agt

tat

gat

ggt

aca

ttt

aca

gtt

cca

acc

tet

tta

gct

tac

aaa

atg

1536

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

500

505

510

gcc

agt.

caa

acg

att

ttc

tat

cct

ttc

cat

gca

ggg

gat

act

tat

tta

1584

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

515

520

525

aga

gtg

aac

cct

caa

ttt

gca

gtg

cct

aaa

gga

act

gat

gct

tta

gtc

1632

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

530

535

540

aga

gtg

ttt

gat

gaa

ttt

cat

gga

a a t

gct

tat

tta

gaa

aat

aac

tat

1680

Arg

va 1

Phe

Asp

G1 u

Phe

His

G1 y

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

545 550 555 560

-66C7 303675 B6 aaa gtt ggt gaa atc aaa tta ccg att ccg aaa tta aac caa gga aca 1728

Lys Val Gly Glu lle Lys Leu Pro lle Pro Lys Leu Asn Gin Gly Thr

565 570 575 acc aga acg gcc gga aat aaa att cct gta acc ttc atg gca aat get. 1776

Thr Arg Thr Ala Gly Asn Lys lle Pro Val Thr Phe Met. Ada Asn Ala

580 585 590 tat ttg gac aat caa tcg act tat att gtg gaa gta cct atc ttg gaa 1824

Tyr Leu Asp Asn Gin Ser Thr Tyr lle Val Glu Val Pro lle Leu Glu

595 600 605 aaa gaa aat caa act gat aaa cca agt att cta cca caa ttt aaa agg 1872

Lys Glu Asn Gin Thr Asp Lys Pro Ser lle Leu Pro Gin Phe Lys Arg

610 615 620 aat aaa gca caa gaa aac tca aaa ctt gat gaa aag gta gaa gaa cca 1920

Asn Lys Ala Gin Glu Asn Ser Lys Leu Asp Glu Lys Val Glu Glu Pro

625 630 635 640 aag act agt gag aag gta gaa aaa gaa aaa ctt tet gaa act ggg aat 1968

Lys Thr Ser Glu Lys Val Glu Lys Glu Lys Leu Ser Glu Thr Gly Asn

645 650 655 agt act agt aat tca acg tta gaa gaa gtt cct aca gtg gat cct gta 2016

Ser Thr Ser Asn Ser Thr Leu Glu Glu Val Pro Thr Val Asp Pro Val

660 665 670 caa gaa aaa gta gca aaa ttt get gaa agt tat ggg atg aag cta gaa 2064

Gin Glu Lys Val Ala Lys Phe Ala Glu Ser Tyr Gly Met Lys Leu Glu

675 680 685 aat gtc ttg ttt aat atg gac gga aca att gaa tta tat tta cca tcg 2112

Asn Val Leu Phe Asn Met Asp Gly Thr lle Glu Len Tyr Leu Pro Ser

690 695 700 gga gaa gtc att aaa aag aat atg gca gat ttt aca gga gaa gca cct 2160

Gly Glu Val lle Lys Lys Asn Met Ala Asp Phe Thr Giy Glu Ala Pro

705 710 715 720 caa gga aat ggt gaa aat aaa cca tet gaa aat gga aaa gta tet act 2208

Gin Gly Asn Gly Glu Asn Lys Pro Ser Glu Asn Gly Lys Val Ser Thr

725 730 735 gga aca gtt gag aac caa cca aca gaa aat aaa cca gca gat tet tta 2256

Gly Thr Val Glu Asn Gin Pro Thr Glu Asn Lys Pro Ala Asp Ser Leu

740 745 750 cca gag gca cca aac gaa aaa cct gta aaa cca gaa aac tca acg gat 2304

Pro Glu Ala Pro Asn Glu Lys Pro Val Lys Pro Glu Asn Ser Thr Asp

755 760 765 aat gga atg ttg aat cca gaa ggg aat gtg ggg agt gac cct atg tta 2352

Asn Gly Met Leu Asn Pro Glu Gly Asn Val Gly Ser Asp Pro Met Leu

7 0 7 7 5 7 8 0 gat. tca gca tta gag gaa get cca gca gta gat cct gta caa gaa aaa 2400

O

Asp 785

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu 790

Ala

Pro

Ala

Val

Asp 795

Pro

Val

Gin

Glu

Lys 800

tta

gaa

aaa

ttt

aca

get

agt

tac

gga

tta

ggc

tta

gat

agt

gtt

ata

2448

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

805

810

815

ttc

aat

atg

gat

gga

acg

att

gaa

tta

aga

ttg

cca

agt

gga

gaa

gtg

2496

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

820

825

830

ata

aaa

aag

aat

tta

ttg

atc

tca

tagcgtaa

2528

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Leu

Ile

Ser

835

840

<210> <211>

<212>

<213> <400>

840 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 16

Cys 1

Ala

Tyr

Ala

Leu 5

Asn

Gin

His

Arg

Ser 10

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

Hi s

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val.

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gl y

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

His

225

230

235

240

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

245

250

255

G1 u

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

260

265

270

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

Leu

27 5

280

285

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

-68 C7 303675 B6

290

295

300

Glu

Gln

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

305

310

315

32 0

Lys

Tle

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gln

Tyr

Gly

Val

Lys

325

330

335

Arg

G.1 u

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

340

345

350

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

355

360

365

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

370

375

380

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

385

390

395

400

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gln

Asn

405

410

415

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gln

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

420

425

430

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

435

440

445

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Giy

Glu

450

455

460

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gln

Pro

Tyr

Leu

Pro

465

470

475

480

Gly

Gln

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

485

4 90

495

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

500

505

510

Ala

Ser

Gln

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

515

520

525

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

530

535

540

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

545

550

555

560

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gln

Gly

Thr

5 65

570

575

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

580

585

590

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gln

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

595

600

605

Lys

Glu

Asn

Gln

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gln

Phe

Lys

Arg

610

615

620

Asn

Lys

Ala

Gln

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

625

630

635

640

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

645

650

655

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

660

665

670

Gln

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

675

680

685

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

690

695

700

Gly

Glu

Val

Tle

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

705

710

715

720

Gln

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

725

730

735

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gln

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

740

745

7 50

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

----CZ 303675 B6

755

760

765

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

770

775

780

Asp

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

785

790

795

800

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

805

810

815

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

820

825

830

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Leu

Ile

Ser

835

840

<210>	17
<211>	27 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	17

cagtagatct gtgcctatgc actaaac 27

<210>	18
<211>	33 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	18

gatctctaga ctactgctat tccttacgct atg

<210>	19
<211>	30 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	19
atcac	tcgag cattacctgg ataatcct
<210>	20
<211>	26 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	20

ctgctaagct tatgaaagat ttagat

<210>	21
<211>	24 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	21

<210> 22 <211> 28 párů bází gatactcgag ctgctattcc ttac

-70C7 303675 R6

5	<212> DNA <213> umělá sekvence <223> oligonukleotidový primer PCR <400> 22 gaatctcgag ttaagctgct gctaattc
	<210>	23
	<211>	32 párů bází
	<212>	DNA
10	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	23
	gacgctcgag cgctatgaaa tcagataaat
15	<210>	24
	<211>	37 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
20	<400>	24
	gacgctcgag ggcattacct ggataatcct
	<210>	25
	<211>	33 párů bází
25	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	25
	cagtagatct cttcatcatt tattgaaaag
30
	<210>	26
	<211>	40 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
35	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	26
	ttatttcttc catatggact tgacagaaga
	<210>	27
40	<211>	32 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	27
45	cgccaa	gctt cgctatgaaa tcagataaat
	<210>	28
	<211>	34 párů bází
	<212>	DNA
50	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	28

cgccaagctt ttccacaata taagtcgatt gatt

	<210>	29
	<211>	40 párů bází
5	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	29
	ttatttcttc catatggaag tacctatctt
10
	<210>	30
	<211>	37 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
15	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	30
	ttatttcttc catatqgtgc ctatgcacta
	<210>	31
20	<211>	40 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	31
	ataagaatgc ggccgcttcc acaatataag
25
	<210>	32
	<211>	31 párů bází
	<212>	DNA
30	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	32
	cagtagatct gtgcttatga actaggtttg
35	<210>	33
	<211>	32 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
40	<400>	33
	gatcaagctt gctgctacct ttacttactc
	<210>	34
	<211>	26 párů bází
45	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	34

ctgagatatc cgttatcgtt caaacc

-72C? 303675 R6

<210>	35
<211>	28 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
5 <223>	oligonukleotidový primer PCR

<400> 35 ctgcaagctt ttaaagggga ataatacg

	<210>	36
10	<211>	29 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	36
15	cagtagatct gcagaagcct tcctatctg
	<210>	37
	<211>	33 párů bází
	<212>	DNA
20	<213>	umělá sekvence

<223> oligonukleotidový primer PCR <400> 37 tcgccaagct tcgttatcgt tcaaaccatt ggg

25 <210>	38
<211>	45 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
30 <400>	38

ataagaatgc ggccgcctta ctctccttta ataaagccaa tagtt

	<210> <211>	39 34 párů bází
35	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	39
	catgccatgg acattgatag tctcttgaaa
40
	<210>	40
	<211>	37 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
45	<223>	oligonukleotidový primer PCR

<400> 40 cgccaagctt cttactctcc tttaataaag ccaatag

	<210>	41
50	<211>	31 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence

7?

<223> oligonukleotidový primer PCR <400> 41 cgacaagctt aacatggtcg ctagcgttac c

<210>	42
<211>	30 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	42

cat accatgg gcctttatga ggcacctaag

<210>	43
<211>	34 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	43

cgacaagctt aagtaaatct tcagcctctc tcag <210> 44 <211> 31 párů bází <212> DNA <213> umělá sekvence <223> oligonukleotidový primer PCR <400> 44 gataccatgg ctagcgacca tgttcaaaga a <210> 45 <211> 36 párů bází <212> DNA <213> umělá sekvence <223> oligonukleotidový primer PCR <400> 45 cgccaagctt atcatccact aacttgactt tatcac <210> 46 <211> 33 párů bází <212> DNA <213> umělá sekvence <223> oligonukleotidový primer PCR <400> 46 cataccatgg atattcttgc cttcttagct ccg <210> 47 <211> 30 párů bází <212> DNA <213> umělá sekvence <223> oligonukleotidový primer PCR <400> 47 catgccatgg tgcttatgaa ctaggtttgc

-74C7 303675 R6

<210>	48
<211>	32 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
<400>	48

cgccaagctt tagcgttacc aaaaccatta tc <210> 49 <211> 36 párů bází <212> DNA <213> umělá sekvence <223> oligonukleotidový primer PCR <400> 49 gtattagatc tgttcctatg aacttggtcg tcacca

	<210>	50
	<211>	28 párů bází
	<212>	DNA
20	<213>	umělá sekvence

<223> oligonukleotidový primer PCR <400> 50 cgcctctaga ctactgtata ggagccgg

25 <210>	51
<211>	34 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR
30 <400>	51

catgccatgg aaaacatttc aagcctttta cgtg

	<210> <211>	52 34 párů bází
35	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	52
	cgacaagctt ctgtatagga gccggttgac
40
	<210>	53
	<211>	34 párů bází
	<212>	DNA
	<213>	umělá sekvence
45	<223>	oligonukleotidový primer PCR
	<400>	53

catgccatgg ttcgtaaaaa taaggcagac caag

<210>	54
<211>	30 párů bází
<212>	DNA
<213>	umělá sekvence
<223>	oligonukleotidový primer PCR

<400> 54 catgccatgg aagcctattg gaatgggaag <210> 55 <211> 1019 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 55

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val.

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Va 1

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

lle

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

14 5

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

1 95

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

-76C7, 303675 B6

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

G i u

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

Hi s

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Gl u

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

4 90

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gl y

Asp

His

His

Hi s

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

V a 1

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

57 0

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Tle

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Al a

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr-

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

7?

	675	680	685
Met Ala 690	Ser Gin	Thr Ile Phe Tyr Pro Phe 695	His Ala Gly Asp Thr Tyr 700
Leu Arg 705	Val Asn	Pro Gin Phe Ala Val Pro 710	Lys Gly Thr Asp Ala Leu 715 720
Val Arg	Val Phe	Asp Glu Phe His Gly Asn 725 730	Ala Tyr Leu Glu Asn Asn 735
Tyr Lys	Val Gly 740	Glu Ile Lys Leu Pro Ile 745	Pro Lys Leu Asn Gin Gly 750
Thr Thr	Arg Thr 755	Ala Gly Asn Lys Ile Pro 760	Val Thr Phe Met Ala Asn 765
Ala Tyr 770	Leu Asp	Asn Gin Ser Thr Tyr Ile 775	Val Glu Val Pro Ile Leu 780
Glu Lys 785	Glu Asn	Gin Thr Asp Lys Pro Ser 790	Ile Leu Pro Gin Phe Lys 795 800
Arg Asn	Lys Ala	Gin Glu Asn Ser Lys Leu 805 810	Asp Glu Lys Val Glu Glu 815
Pro Lys	Thr Ser 820	Glu Lys Val Glu Lys Glu 825	Lys Leu Ser Glu Thr Gly 830
Asn Ser	Thr Ser 835	Asn Ser Thr Leu Glu Glu 840	Val Pro Thr Val Asp Pro 845
Val Gin 850	Glu Lys	Val Ala Lys Phe Ala Glu 855	Ser Tyr Gly Met Lys Leu 860
Glu Asn 865	Val Leu	Phe Asn Met Asp Gly Thr 870	Ile Glu Leu Tyr Leu Pro 875 880
Ser Gly	Glu Val	Ile Lys Lys Asn Met Ala 885 890	Asp Phe Thr Gly Glu Ala 895
Pro Gin	Gly Asn 900	Gly Glu Asn Lys Pro Ser 905	Glu Asn Gly Lys Val Ser 910
Thr Gly	Thr Val 915	Glu Asn Gin Pro Thr Glu 920	Asn Lys Pro Ala Asp Ser 925
Leu Pro 930	Glu Ala	Pro Asn Glu Lys Pro Val 935	Lys Pro Glu Asn Ser Thr 940
Asp Asn 945	Gly Met	Leu Asn Pro Glu Gly Asn 950	Val Gly Ser Asp Pro Met 955 960
Leu Asp	Pro Ala	Leu Glu Glu Ala Pro Ala 965 970	Val Asp Pro Val Gin Glu 975
Lys Leu	Glu Lys 980	Phe Thr Ala Ser Tyr Gly 985	Leu Gly Leu Asp Ser Val 990
Ile Phe Asn Met Asp Gly Thr Ile Glu Leu 995 1000 Val Ile Lys Lys Asn Leu Ser Asp Phe Ile 1010 1015 <210> 56 <211> 489 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 56	Arg Leu Pro Ser Gly Glu 1005 Ala
Cys Ala i	Tyr Ala	Leu Asn Gin His Arg Ser 5 10	Gin Glu Asn Lys Asp Asn 15
Asn Arg	Val Ser 20	Tyr Val Asp Gly Ser Gin 25	Ser Ser Gin Lys Ser Glu 30
Asn Leu	Thr Pro 35	Asp Gin Val Ser Gin Lys 40	Glu Gly Ile Gin Ala Glu 45
Gin Ile 50	Val Tle	Lys Ile Thr Asp Gin Gly 55	Tyr Val Thr Ser His Gly 60
Asp His	Tyr His	Tyr Tyr Asn Gly Lys Val	Pro Tyr Asp Ala Leu Phe

-78 CZ 303675 B6

65

70

75

30

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Gl u

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

ILe

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gl y

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val·

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyi

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

HiS

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

I le

Ala

Glu

420

42 5

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

430

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

485

<210>	57
<211>	509 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	57

Met

Lys

Phe

Ser

Lys Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala

Gly

Ser

Ala

Val

Ile

Val

1

5

10

15

Ser

Leu

Ser

Leu

Cys Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

20

25

30

Asn

Lys

Asp

Asn

Asn Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

35

40

45

Gin

Lys

Ser

Glu

Asn Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Gin

Ala

Glu

Gin Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

Leu

Phe

Ser Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

100

105

110

Leu

Lys

Asp

Ala

Asp Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

115

120

125

Lys

Val

Asp

Gly

Lys Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

130

] 35

140

Asp

Asn

Val

Arg

Thr Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

145

150

155

160

Val

Lys

Asp

Asn

Glu Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

165

170

175

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180

185

190

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

195

200

205

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

210

215

220

Ala

Lys

Ala

His

Leu Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

230

235

240

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

255

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Glu

Leu

Tyr

Asp Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Val

Phe

Asp Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

290

295

300

Val

Ala

Ile

Pro

His Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

325

330

335

Thr

Gly

Ser

Thr

Val Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

340

345

350

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

Gl u

Leu

Ser

Ser

Ala Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

370

375

380

Va 1

Glu

Glu

Thr

Ala Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

His

Tyr

Ile

Pro

Lys Ser

Asn

Gin

Ile

Gl y

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

Asn

Ser

Leu

Ala

Thr Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

420

4 25

430

Ser

His

Gl u

Lys

His Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

4 35

440

445

Ile

ile

Ala

Glu

Asp Glu

Ser

Gl y

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

- 80C.7. 303675 B6

Lys Ala

480

Leu Asp

495

	4 50
Asn	His
465
Ala	Gln
Ser	Leu

Tyr	Phe
Lys	His
Ser	Ser 500

Phe	Lys 470
Leu	Glu
485
His	Glu

55

Lys Asp

Glu Val

Gln Asp

Leu	Thr
Lys	Thr
	490
Tyr	Pro
505

	4 60
Glu	Glu
475
Ser	His
Gly	Asn

Gln Ile

Asn Gly

Ala <210> <211>

<212>

<213> <400>

1057 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 58

Asp 1

Leu

Thr

Glu

Glu 5

Gln

Ile

Lys

Ala

Ala 10

Gln

Lys

His

Leu

Glu 15

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gln

20

25

30

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

35

40

45

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gln

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

50

55

60

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

65

70

75

80

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

85

90

95

G1 y

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

100

105

110

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

115

120

125

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gln

Asn

Phe

Thr

130

135

140

Leu

Ala

Asn

Gly

Gln

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

145

150

155

160

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

165

170

175

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

180

185

190

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gln

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gln

195

200

205

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

210

215

220

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

225

230

235

240

Gln

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

245

250

255

Asn

Pro

Gln

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

260

265

270

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

275

280

285

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gln

Gly

Thr

Thr

Arg

290

295

300

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

305

310

315

320

Asp

Asn

Gln

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

325

330

335

Asn

Gln

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gln

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

340

345

350

Ala

Gln

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

355

360

365

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

370

375

380

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

385

390

395

400

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

405

410

415

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

420

425

430

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

435

440

445

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

450

455

460

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

465

470

475

480

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

485

490

4 95

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

500

505

510

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

515

520

525

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

530

535

540

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

I le

Lys

545

550

555

560

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

Lys

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

565

570

575

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

580

585

590

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

595

600

605

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

610

615

620

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

62 5

630

635

640

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

645

650

655

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

660

665

670

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

675

680

685

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

690

695

700

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

705

710

715

720

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

7 25

730

735

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

740

745

750

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

7 55

760

765

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

770

775

780

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Tle

Lys

Lys

Asp

785

790

795

800

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

805

810

815

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

-82C7. 303675 B6

	820	825	830
Glu Ala	Lys Gly 835	Ala Glu Ala Ile Tyr 840	Asn Arg Val Lys Ala Ala Lys 845
Lys Val 850	Pro Leu	Asp Arg Met Pro Tyr 855	Asn Leu Gin Tyr Thr Val Glu 860
Val Lys 865	Asn Gly	Ser Leu Ile Ile Pro 870	His Tyr Asp His Tyr His Asn 875 880
Ile Lys	Phe Glu	Trp Phe Asp Glu Gly 885	Leu Tyr Glu Ala Pro Lys Gly 890 895
Tyr Thr	Leu Glu 900	Asp Leu Leu Ala Thr 905	Val Lys Tyr Tyr Val Glu His 910
Pro Asn	Glu Arg 915	Pro His Ser Asp Asn 920	Gly Phe Gly Asn Ala Ser Asp 925
His Val 930	Gin Arg	Asn Lys Asn Gly Gin 935	Ala Asp Thr Asn Gin Thr Glu 940
Lys Pro 945	Ser Glu	Glu Lys Pro Gin Thr 950	Glu Lys Pro Glu Glu Glu Thr 955 960
Pro Arg	Glu Glu	Lys Pro Gin Ser Glu 965	Lys Pro Glu Ser Pro Lys Pro 970 975
Thr Glu	Glu Pro 980	Glu Glu Glu Ser Pro 985	Glu Glu Ser Glu Glu Pro Gin 990
Val Glu	Thr Glu 995	Lys Val Glu Glu Lys 1000	Leu Arg Glu Ala Glu Asp Leu 1005
Leu Gly 101C	Lys Ile 1	Gin Asp Pro Ile Ile 1015	Lys Ser Asn Ala Lys Glu Thr 1020
Leu Thr 1025	Gly Leu	Lys Asn Asn Leu Leu 1030	Phe Gly Thr Gin Asp Asn Asn 1035 1040
Thr Ile Lys	Met Ala	Glu Ala Glu Lys Leu 1045	Leu Ala Leu Leu Lys Glu Ser 1050 1055

<210> <211>

<212>

<213> <400>

205 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

dy

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Va 1

Al a

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

1 60

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

<210> <211>

<212>

<213> <400>

821 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 60

Cys 1

Ala

Tyr

Gl u

Leu 5

Gly

Leu

His

Gin

Ala 10

Gin

Thr

Val

Lys

Glu 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

Gin

Ala

Thr

Gin

Lys

Thr

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ser

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gl y

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

Gin

His

Arg

130

135

140

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

Ala

Arg

Ser

145

150

155

160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

165

170

175

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

180

185

190

Tyr

His

Tyr

Tle

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

195

200

205

Ala

Giu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

Leu

Arg

Thr

210

215

220

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

Trp

Val

Pro

225

230

235

240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn

Ser

245

250

255

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

290

295

300

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

30 5

310

315

320

Met

Ser

Glu

Leu

Clu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

I le

Pro

Leu

Arg

Tyr

325

330

335

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

340

34 5

350

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

355

360

365

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

- 84 CZ 303675 B6

370

37 5

380

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

385

390

395

400

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

405

410

415

Asp

Ser

Τ.νς

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Π o VJ j. y

Ala

420

425

430

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

435

440

445

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

450

455

460

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

465

4 70

475

480

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

485

4 90

4 95

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

500

505

510

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Al a

Gl y

Lys

515

520

525

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

530

535

540

Asp

Glu

Gl y

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

545

550

555

560

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

565

570

575

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

580

585

590

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Al a

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

595

600

605

Lys

Al a

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

610

615

620

Tyr

Thr

Val

Gl u

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

62 5

630

635

640

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

645

650

655

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

660

665

670

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

dy

Phe

Gly

675

680

685

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

690

695

700

Asn

Gl n

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

705

710

715

720

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

725

730

735

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

740

745

750

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

755

760

765

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

770

775

780

Al a

Tys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

785

790

7 95

800

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

805

810

815

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

820

<210> 61 <211> 334 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 61

Cys 1

Ala

Tyr

Glu

Leu 5

Gly

Leu

His

Gin

Ala 10

Gin

Thr

Val

Lys

Glu 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

Gin

Ala

Thr

Gin

Lys

Thr

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

lle

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ser

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Tle

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

Gin

His

Arg

130

135

140

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

Ala

Arg

Ser

145

150

155

160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

lle

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

165

170

175

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

180

185

190

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

195

200

205

Ala

Glu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

Leu

Arg

Thr

210

215

220

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

Trp

Val

Pro

225

230

235

240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn

Ser

245

250

255

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

290

295

300

Val

Ala

Val.

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

305

310

315

320

Mel

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

325

330

io <210> 62 <211> 487 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 62

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

H i s

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

1

5

10

15

Ser

Pro

Gl.n

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

20

25

30

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

-86CZ 303675 B6

35

40

45

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

GJy

50

55

60

Val

Ser

Arg

Tyr

lle

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

65

70

75

80

Gly

lle

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

T Ί 4-'t7 L4

85

90

95

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

100

105

110

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

lle

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

115

120

125

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

130

135

140

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

lle

Leu

145

150

155

160

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

lle

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

165

170

175

Ala

Gin

lle

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

lle

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

180

185

190

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Tle

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Tle

195

200

205

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

210

215

220

His

Trp

lle

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

225

2 30

235

240

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

245

250

255

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

lle

Tyr

Asn

260

265

270

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

275

280

285

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

lle

lle

Pro

His

290

295

300

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

I ie

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

305

310

315

320

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

325

330

335

Lys

TyL

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

340

34 5

350

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

H ls

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Giy

Gin

Ala

35 5

360

365

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

370

375

38 0

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

385

390

395

400

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Gl u

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

405

410

415

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

420

425

430

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

lle

Gin

Asp

Pro

lle

lle

Lys

435

440

445

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

450

455

460

Giy

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

lle

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

465

470

475

480

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

485

<210> <211> <212>

<213>

<400>

613 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 63

Ala 1

Glu

Ala

Phe

Leu 5

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn 10

Leu

Ser

Asn

Leu

Arg 15

Thr

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

Trp

Val

Pro

20

25

30

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn

Ser

35

40

45

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

50

55

60

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

65

70

75

80

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

85

90

95

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

100

105

110

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

115

120

125

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

130

135

140

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

145

150

155

160

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

165

170

175

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

180

185

190

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

'Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

195

200

205

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

210

215

220

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

225

230

235

240

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

245

250

255

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

260

265

270

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

275

280

285

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

290

295

300

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Al a

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

305

310

315

320

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

325

330

335

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

340

345

350

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

355

360

365

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

370

375

380

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

335

390

395

400

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

405

410

415

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

- 88 CZ 303675 B6

420

425

430

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

435

440

445

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

450

455

4 60

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

4 65

470

475

480

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

485

490

495

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

500

505

510

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

515

520

525

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

530

535

540

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

545

550

555

560

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

ile

Gin

Asp

Pro

Tle

Ile

Lys

Ser

Asn

565

570

575

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

580

585

590

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Tle

Met

Ala

Gl u

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

595

600

605

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

610 <210> <211>

<212>

<213> <400>

568 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 64

Asp 1

Leu

Thr

Glu

Glu 5

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala 10

Gin

Lys

His

Leu

Glu 15

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

20

25

30

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

35

40

45

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

50

55

60

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Gl u

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

65

7 0

75

80

Asp

Hís

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

85

90

95

Gly

Hís

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

100

105

110

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

115

120

125

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

130

135

140

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

145

150

155

160

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

Thr

Pro

Asp

165

170

175

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

180

185

1 90

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

195

200

205

Thr

Phe

I.ys

Tyr

Thr

Ile

Al a

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

210

215

220

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

225

230

235

240

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

245

250

255

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

260

265

270

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

Tyr

Lys

Val

275

280

285

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

Thr

Thr

Arg

290

295

300

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

Ala

Tyr

Leu

305

310

315

320

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

Glu

Lys

Glu

325

330

335

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

Arg

Asn

Lys

340

345

350

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Pro

Lys

Thr

355

360

365

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

Asn

Ser

Thr

370

375

380

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

385

390

395

400

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

Glu

Asn

Val

405

410

415

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

420

425

430

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

Pro

Gin

Gly

435

440

445

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

Thr

Gly

Thr

450

455

4 60

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

465

470

475

480

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

485

4 90

495

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

500

505

510

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

515

520

525

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

530

535

540

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

545

550

555

560

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

565

<210> <211>

<212>

<213> <400>

329 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 65

Asp 1

Leu

Thr

Glu

Glu 5

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala 10

Gin

Lys

His

Leu

Glu 15

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

20

2 5

30

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

3 5

40

45

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

-90C7. 303675 Bó

50	55	60
Ser Ile Val Val Asn Lys	Glu Lys Asn Ala	Ile Ile Tyr Pro His Gly
65 70		7 5 80
Asp His His His Ala Asp	Pro Ile Asp Glu	His Lys Pro Val Gly Ile
85	90	95
Gly His Ser His Ser Asn	Tyr Glu Leu Phe	Lys Pro Glu Glu Gly Val
10 0	105	110
Ala Lys Lys Glu Gly Asn	Lys Val Tyr Thr	Gly Glu Glu Leu Thr Asn
115	120	125
Val Val Asn Leu Leu Lys	Asn Ser Thr Phe	Asn Asn Gin Asn Phe Thr
130	135	140
Leu Ala Asn Gly Gin Lys	Arg Val Ser Phe	Ser Phe Pro Pro Glu Leu
145 150		155 160
Glu Lys Lys Leu Gly Ile	Asn Met Leu Val	Lys Leu Ile Thr Pro Asp
165	170	175
Gly Lys Val Leu Glu Lys	Val Ser Gly Lys	Val Phe Gly Glu Gly Val
180	185	190
Gly Asn Ile Ala Asn Phe	Glu Leu Asp Gin	Pro Tyr Leu Pro Gly Gin
195	200	205
Thr Phe Lys Tyr Thr Ile	Ala Ser Lys Asp	Tyr Pro Glu Val Ser Tyr
210	215	220
Asp Gly Thr Phe Thr Val	Pro Thr Ser Leu	Ala Tyr Lys Met Ala Ser
225 230		235 240
Gin Thr Ile Phe Tyr Pro	Phe His Ala Gly	Asp Thr Tyr Leu Arg Val
245	250	255
Asn Pro Gin Phe Ala Val	Pro Lys Gly Thr	Asp Ala Leu Val Arg Val
260	265	270
Phe Asp Glu Phe His Gly	Asn Ala Tyr Leu	Glu Asn Asn Tyr Lys Val
275	280	285
Gly Glu Ile Lys Leu Pro	Ile Pro Lys Leu	Asn Gin Gly Thr Thr Arq
290	295	300
Thr Ala Gly Asn Lys Ile	Pro Val Thr Phe	Met Ala Asn Ala Tyr Leu
305 310		315 320
Asp Asn Gin Ser Thr Tyr	Ile Val Glu
325
<210> 66
<211> 240 aminokyselin
<212> protein
<213> mi kroorganizmus S.pneumoniae
<400> 66
Glu Val Pro Ile Leu Glu	Lys Glu Asn Gin	Thr Asp Lys Pro Ser Ile
1 5	10	15
Leu Pro Gin Phe Lys Arg	Asn Lys Ala Gin	Glu Asn Ser Lys Leu Asp
20	25	30
Glu Lys Val Glu Glu Pro	Lys Thr Ser Glu	Lys Val Glu Lys Glu Lys
35	40	45
Leu Ser Glu Thr Gly Asn	Ser Thr Ser Asn	Ser Thr Leu Glu Glu Val
50	55	60
Pro Thr Val Asp Pro Val	Gin Glu Lys Val	Ala I.ys Phe Ala Glu Ser
65 70		75 80
Tyr Gly Met Lys Leu Glu	Asn Val Leu Phe	Asn Met Asp Gly Thr Ile
85	90	95
Glu Leu Tyr Leu Pro Ser	Gly Glu Val Ile	Lys Lys Asn Met Ala Asp
100	105	110
Phe Thr Gly Glu Ala Pro	Gin Gly Asn Gly	Glu Asn Lys Pro Ser Glu
] 15	120	125
Asn Gly Lys Val Ser Thr	Gly Thr Val Glu	Asn Gin Pro Thr Glu Asn

-to

130

1,35

140

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

145

150

155

160

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

165

170

175

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

180

185

190

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

195

200

205

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

210

215

220

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

225

230

235

240

<210> <211>

<212>

<213> <400

555 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 67

Asp Ile Asp Ser Leu Leu Lys Gin Leu Tyr Lys Leu Pro Leu Ser Gin

1

5

10

15

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

20

25

30

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

35

40

45

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

50

55

60

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

65

70

75

80

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

85

90

95

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

100

105

HO

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

115

120

125

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

130

135

140

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

145

150

155

160

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

165

170

175

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

180

185

190

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

195

200

205

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

210

215

220

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

225

230

235

240

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

245

250

255

Ala

Lys

Lo u

Ala

Gl y

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

260

265

270

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

275

280

285

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

290

295

30 0

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

-92CZ 303675 B6

305

310

315

320

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

325

330

335

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

340

34 5

350

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gl y

Ser

Leu

355

360

365

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

370

375

380

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Al a

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

385

390

395

400

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

405

4 10

415

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

420

425

430

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

435

440

445

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

450

455

460

Gl n

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

465

470

475

480

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

485

4 90

4 95

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

500

505

510

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

515

520

525

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

530

535

540

Gl u

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

545 550 555 <210> 68 <211> 428 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 68

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

1

5

10

15

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

I le

Thr

20

25

30

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

35

40

45

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

50

55

60

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

65

70

75

80

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

85

90

95

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

100

105

110

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

115

120

125

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

130

135

140

Glu

Thr

Zkla

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

145

150

155

160

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

IOCZ 303675 B6

	165	170	175
Glu	Phe Tyr Asn Lys Ala Tyr Asp Leu	Leu Ala Arg	Ile His Gin Asp
	180 185		190
Leu	Leu Asp Asn Lys Gly Arg Gin Val	Asp Phe Glu	Ala Leu Asp Asn
	195 200		205
Leu	Leu Glu Arg Leu Lys Asp Val Ser	Ser Asp Lys	Val Lys Leu Val
	210 215	220
Asp	Asp Ile Leu Ala Phe Leu Ala Pro	Ile Arg His	Pro Glu Arg Leu
225	230	235	240
Gly	Lys Pro Asn Ala Gin Ile Thr Tyr	Thr Asp Asp	Glu Ile Gin Val
	245	250	255
Ala	Lys Leu Ala Gly Lys Tyr Thr Thr	Glu Asp Gly	Tyr Ile Phe Asp
	260 265		270
Pro	Arg Asp Ile Thr Ser Asp Glu Gly	Asp Ala Tyr	Val Thr Pro His
	275 280		285
Met	Thr His Ser His Trp Ile Lys Lys	Asp Ser Leu	Ser Glu Ala Glu
	290 295	300
Arg	Ala Ala Ala Gin Ala Tyr Ala Lys	Glu Lys Gly	Leu Thr Pro Pro
305	310	315	320
Ser	Thr Asp His Gin Asp Ser Gly Asn	Thr Glu Ala	Lys Gly Ala Glu
	325	330	335
Ala	Ile Tyr Asn Arg Val Lys Ala Ala	Lys Lys Val	Pro Leu Asp Arg
	340 345		350
Met	Pro Tyr Asn Leu Gin Tyr Thr Val	Glu Val Lys	Asn Gly Ser Leu
	355 360		365
Ile	Ile Pro His Tyr Asp His Tyr His	Asn Ile Lys	Phe Glu Trp Phe
	370 375	380
Asp	Glu Gly Leu Tyr Glu Ala Pro Lys	Gly Tyr Thr	Leu Glu Asp Leu
385	390	395	400
Leu	Ala Thr Val Lys Tyr Tyr Val Glu	His Pro Asn	Glu Arg Pro His
	405	410	415
Ser	Asp Asn Gly Phe Gly Asn Ala Ser	Asp His Val
	420 425
<210>	69
<211>	121 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	69
Gly	Leu Tyr Glu Ala Pro Lys Gly Tyr	Thr Leu Glu	Asp Leu Leu Ala
1	5	10	15
Thr	Val Lvs Tyr Tyr Val Glu His Pro	Asn Glu Arg	Pro His Ser Asp
	20 25		30
Asn	Gly Phe Gly Asn Ala Ser Asp His	Val Gin Arg	Asn Lys Asn Gly
	35 40		45
Gin	Ala Asp Thr Asn Gin Thr Glu Lys	Pro Ser Glu	Glu Lys Pro Gin
	50 55	60
Thr	Glu Lys Pro Glu Glu Glu Thr Pro	Arg Glu Glu	Lys Pro Gin Ser
65	70	75	80
Glu	Lys Pro Glu Ser Pro Lys Pro Thr	Glu Glu Pro	Glu Glu Glu Ser
	85	90	95
Pro	Glu Glu Ser Glu Glu Pro Gin Val	Glu Thr Glu	Lys Val Glu Glu
	100 105		110
Lys	Leu Arg Glu Ala Glu Asp Leu Leu
	115 120
<210>	70
<211>	132 aminokyselin

-94CZ 303675 Βό <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 70

Ala 1	Ser	Asp	His	Val 5	Gln	Arg	Asn
Gln	Thr	Glu	Lys 20	Pro	Ser	Glu	Glu
Glu	Glu	Thr 35	Pro	Arg	Glu	Glu	Lys 40
Pro	Lys 50	Pro	Thr	Glu	Glu	Pro 55	Glu
Glu 65	Pro	Gln	Val	Glu	Thr 70	Glu	Lys
Glu	Asp	Leu	Leu	Gly 85	Lys	Ile	Gln
Lys	GJu	Thr	Leu 100	Thr	Gly	Leu	Lys
Asp Lys	Asn Glu 130	Asn 115 Ser	Thr Lys	Ile	Met	Ala	Glu 120

Lys	Asn 10	Gly	Gln	Ala	Asp	Thr 15	Asn
Lys 25	Pro	Gln	Thr	Glu	Lys 30	Pro	Glu
Pro	Gln	Ser	Glu	Lys 45	Pro	Glu	Ser
Glu	Glu	Ser	Pro 60	Glu	Glu	Ser	Glu
Val	Glu	Glu 75	Lys	Leu	Arg	Glu	Ala 80
Asp	Pro 90	Ile	Ile	Lys	Ser	Asn 95	Ala
Asn 105	Asn	Leu	Leu	Phe	Gly 110	Thr	Gln
Ala	Glu	Lys	Leu	Leu 125	Ala	Leu	Leu

<210> 71 <211 > 226 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus & pneumoniae <400> 71

Asp 1	Ile	Asp	Ser	Leu 5	Leu	Lys	Gln
Arg	His	Val	Glu 20	Ser	Asp	dy	Leu
Ser	Arg	Thr 35	Ala	Arg	Gly	Val	Ala 40
Phe	Ile 50	Pro	Tyr	Glu	Gln	Met 55	Ser
Ile 65	Ile	Pro	Leu	Arg	Tyr 70	Arg	Ser
Pro	Glu	Glu	Pro	Ser 85	Pro	Gln	Pro
Gln	Pro	Ala	Pro 100	Asn	Pro	Gln	Pro
Lys	Leu	Val 115	Lys	Glu	Ala	Val	Arg 120
Glu	Glu 130	Asn	Gly	Val	Ser	Arg 135	Tyr
Glu 145	Thr	Ala	Ala	Gly	Ile 150	Asp	Ser
Ser	His	Lys	Leu	Gly 165	Ala	Lys	Lys
Glu	Phe	Tyr	Asn 180	Lys	Ala	Tyr	Asp
Leu	Leu	Asp 195	Asn	Lys	Gly	Arg	Gln 200
Leu Asp	Leu 210 Asp	Glu	Arg	Leu	Lys	Asp 215	Val

Leu	Tyr 10	Lys	Leu	Pro	Leu	Ser 15	Gln
Ile 25	Phe	Asp	Pro	Ala	Gln 30	Ile	Thr
Val	Pro	His	Gly	Asn 45	His	Tyr	His
Glu	Leu	Glu	Lys 60	Arg	Ile	Ala	Arg
Asn	His	Trp 75	Val	Pro	Asp	Ser	Arg 80
Thr	Pro 90	Glu	Pro	Ser	Pro	Ser 95	Pro
Ala 105	Pro	Ser	Asn	Pro	Ile 110	Asp	Glu
Lys	Val	Gly	Asp	Gly 125	Tyr	Val	Phe
Ile	Pro	Ala	Lys 140	Asn	Leu	Ser	Ala
Lys	Leu	Ala 155	Lys	Gln	Glu	Ser	Leu 160
Thr	Asp 170	Leu	Pro	Ser	Ser	Asp 175	Arg
Leu 185	Leu	Ala	Arg	Tle	His 190	Gln	Asp
Val	Asp	Phe	Glu	Ala 205	Leu	Asp	Asn
Ser	Ser	Asp	Lys 220	Val	Lys	Leu	Val

225 <210> 72 <211> 203 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 72

Asp 1

Ile

Leu

Ala

Phe 5

Leu Ala

Pro

Ile

Arg 10

His

Pro

Glu

Arg

Leu 15

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

20

25

30

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

35

40

45

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

50

55

60

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

65

70

75

80

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

85

90

95

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

100

105

110

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

115

120

125

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

130

135

140

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

145

150

155

160

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

165

170

175

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

180

185

190

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

195

200

<210> 73 <211 > 819 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 73

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Val

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Va 1

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ai a

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

1 40

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

G1 y

14 5

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Al a

Ser

Asp

Ile

Ile

-96CZ 303675 B6

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

180

185

190

Tyr

Tle

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Gl u

Leu

Ala

Ala

Ala

Giu

195

200

205

A_l a

Tyr

Trp

Asn

j. y

Τ , Λ

Gin

Gly

r* ~ oči

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

o „

210

215

220

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Arg

Gly

Va L

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

32 5

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Giy

370

375

380

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

38 5

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp)

Leu

Leu

Ala

Arg

Tle

Hn s

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

4 35

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

4 70

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Al a

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

I le

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Tle

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Tle

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

H7

625	630	635	640
Tyr Glu	Ala Pro Lys Gly	Tyr Ser Leu Glu Asp Leu	Leu Ala Thr Val
	645	650	655
Lys Tyr	Tyr Val Glu His	Pro Asn Glu Arg Pro His	Ser Asp Asn Gly
	660	665	670
Phe Gly	Asn Ala Ser Asp	His Val Arg Lys Asn Lys	Ala Asp Gin Asp
	675	680	685
Ser Lys	Pro Asp Glu Asp	Lys Glu His Asp Glu Val	Ser Glu Pro Thr
690		695 700
His Pro	Glu Ser Asp Glu	Lys Glu Asn His Ala Gly	Leu Asn Pro Ser
705	710	715	720
Ala Asp	Asn Leu Tyr Lys	Pro Ser Thr Asp Thr Glu	Glu Thr Glu Glu
	725	730	735
Glu Ala	Glu Asp Thr Thr	Asp Glu Ala Glu Ile Pro	Gin Val Glu Asn
	740	745	750
Ser Val	Ile Asn Ala Lys	Ile Ala Asp Ala Glu Ala	Leu Leu Glu Lys
	755	760	765
Val Thr	Asp Pro Ser Ile	Arg Gin Asn Ala Met Glu	Thr Leu Thr Gly
770		775 780
Leu Lys	Ser Ser Leu Leu	Leu Gly Thr Lys Asp Asn	Asn Thr Ile Ser
785	790	795	800
Ala Glu	Val Asp Ser Leu	Leu Ala Leu Leu Lys Glu	Ser Gin Pro Ala
	805	810	815
Pro Ile	Gin
<210> 74
<211> 568 aminokyselin
<212> protein
<213> mikroorganizmus S.pneumoniae
<400> 74

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

1

5

10

15

Glu

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

20

25

30

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

35

40

45

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

50

55

60

Arg

lle

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

65

70

75

80

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

85

90

95

Leu

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

100

105

110

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

115

120

125

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

130

135

140

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

145

1 50

155

160

Leu

Ser

H i s

Lys

Leu

Gly

Al a

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

165

170

175

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

180

185

190

Asp

Leu

Le u

Asp

Asn

T.ys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

195

200

205

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

-98 Q7. 303675 B6

	210					215
Val 225	Asp	Asp	Ile	Leu	Ala 230	Phe	Leu
Leu	Gly	Lys	Pro	Asn 245	Ala	Gin	Ile
Val	Ala	Lys	Leu 260	Ala	Gly	Lys	Tyr
Asp	Pro	Arg 275	Asp	Ile	Thr	Ser	Asp 280
His	Met 290	Thr	His	Ser	His	Trp 295	Ile
Glu 305	Arg	Ala	Ala	Ala	Gin 310	Ala	Tyr
Pro	Ser	Thr	Asp	His 325	Gin	Asp	Ser
Glu	Ala	Ile	Tyr 340	Asn	Arg	Val	Lys
Arg	Met	Pro 355	Tyr	Asn	Leu	Gin	Tyr 360
Leu	Ile 370	Ile	Pro	His	Tyr	Asp 375	His
Phe 385	Asp	Glu	Gly	Leu	Tyr 390	Glu	Ala
Leu	Leu	Ala	Thr	Val 405	Lys	Tyr	Tyr
His	Ser	Asp	Asn 420	Gly	Phe	Gly	Asn
Lys	Ala	Asp 435	Gin	Asp	Ser	Lys	Pro 440
Val	Ser 450	Glu	Pro	Thr	His	Pro 455	Glu
Gly 465	Leu	Asn	Pro	Ser	Ala 470	Asp	Asn
Glu	Glu	Thr	Glu	Glu 4 85	Glu	Ala	Glu
Pro	Gin	Val	Glu 500	Asn	Ser	Val	Ile
Ala	Leu	Leu 515	Glu	Lys	Val	Thr	Asp 520
Glu	Thr 530	Leu	Thr	Gly	Leu	Lys 535	Ser
Asn 545	Asn	Thr	Ile	Ser	Ala 550	Glu	Val
Glu	Ser	Gin	Pro	Ala 565	Pro	ile	Gin

220
Ala	Pro	Ile 235	Arg	His	Pro	Glu	Arg 240
Thr	Tyr 250	Thr	Asp	Asp	Glu	Ile 255	Gin
Thr 265	Thr	Glu	Asp	Gly	Tyr 270	Ile	Phe
Glu	GJ y	Asp	Ala	Tyr 285	Val	Thr	Pro
Lys	Lys	Asp	Ser 300	Leu	Ser	Glu	Ala
Ala	Lys	Glu 315	Lys	Gly	Leu	Thr	Pro 320
Gly	Asn 330	Thr	Glu	Ala	Lys	Gly 335	Ala
Ala 345	Ala	Lys	Lys	Val	Pro 350	Leu	Asp
Thr	Val	Glu	Val	Lys 365	Asn	Gly	Ser
Tyr	His	Asn	Ile 380	Lys	Phe	Glu	Trp
Pro	Lys	Gly 395	Tyr	Ser	Leu	Glu	Asp 400
Val	Glu 410	His	Pro	Asn	Glu	Arg 415	Pro
Ala 425	Ser	Asp	His	Val	Arg 430	Lys	Asn
Asp	Glu	Asp	Lys	Glu 445	His	Asp	Glu
Ser	Asp	Glu	Lys 460	Glu	Asn	His	Ala
Leu	Tyr	Lys 475	Pro	Ser	Thr	Asp	Thr 480
Asp	Thr 490	Thr	Asp	Glu	Ala	Glu 495	Ile
Asn 505	Ala	Lys	Ile	Ala	Asp 510	Ala	Glu
Pro	Ser	Ile	Arg	Gin 525	Asn	Ala	Met
Ser	Leu	Leu	Leu 540	Gly	Thr	Lys	Asp
Asp	Ser	Leu 555	Leu	Ala	Leu	Leu	Lys 560

<210>	75
5 <211>	140 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pnewnoniae
<400>	75

Val	Arg	Lys	Asn	Lys	Ala	Asp	Gin
1				5
Glu	His	Asp	Glu	Val	Ser	Glu	Pro
			20
Glu	Asn	His	Ala	Gly	Leu	Asn	Pro
		35					40
Ser	Thr	As o	Thr	Glu	Glu	Thr	Glu

Asp	Ser 10	Lys	Pro	Asp	Glu	Asp 15	Lys
Thr 25	His	Pro	Glu	Ser	Asp 30	Glu	Lys
Ser	Ala	Asp	Asn	Leu 45	Tyr	Lys	Pro
Glu	Glu	Ala	Glu	Asp	Thr	Thr	Asp

1344

Asn

Ser

Leu

Ala 420

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser 425

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro 430

Gly

Thr

tca

cat

gag

aaa

cat

gaa

gaa

gat

gga

tac

gga

ttt

gat

get

aat

cgt

Ser

His

Glu

Lys

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

435

440

445

att

atc

get

gaa

gat

gaa

tca

ggt

ttt

gtc

atg

agt

cac

gga

gac

cac

Ile

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450

455

460

aat

cat

tat

ttc

ttc

aag

aag

gac

ttg

aca

gaa

gag

caa

att

aag

gtg

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Val

465

470

475

480

1392

1440

1455 cgc aaa aac att tag

' Arg Lys Asn Ile
<210>	8
<211>	484 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	8

Met 1

Lys

Phe Ser

Lys 5

Lys Tyr Ile Ala

Ala 10

Gly Ser

Ala

Val

Ue 15

Val

Ser

Leu

Ser

Leu

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

20

25

30

Asn

Lys

Asp

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

35

40

45

Gin

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

50

55

60

Ile

Gin

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Ue

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

65

70

75

80

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

85

90

95

Asp

Ala

Leu

Phe

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

100

105

110

Leu

Lys

Asp

Ala

Asp

Ue

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ue

Ile

115

120

125

Lys

Val

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

130

135

140

Asp

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Asp

Glu

Ue

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

145

150

155

160

Val

Lys

Asp

Asn

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

165

170

175

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180

185

190

I Le

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

195

200

205

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Al a

Ala

210

215

220

Ala

Lys

Ala

His

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

230

235

24 0

Tyr

Ser

Ser

Thr

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

255

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

att Ile

atc Ile

gaa Glu ±95

gat Asp

acg Thr

ggt Gly

aat Asn

gct Ala 2 00

tat Tyr

atc Ile

gtt Val

cct Pro

cat His 203

gga Gly

ggt G.ly

cac His

624

tat

cac

tac

att

CCC

aaa

age

gat

tta

tet

gct

agt

gaa

tta

gca

gca

672

Tyr

lira

Ti , -v- 1 yr

Tle

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

AJ a

210

215

220

gct

aaa

gca

cat

ctg

gct

gga

aaa

aat

atg

caa

ccg

agt

cag

tta

age

720

Ala

Lys

Ala

His

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

225

2 30

235

240

t a 1.

tet

t ca

aca

gct

agt

gac

aat

aac

acg

caa

tet

gta

gca

aaa

gga

768

Tyr

Ser

Ser

Thr

AI a

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

245

250

2 55

tea

act

age

aag

cca

gca

aat

3 3 a

tet

gaa

aat

ctc

cag

agt

ctt

ttg

816

Ser

Thr

Ser

Lys

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

260

265

270

aag

gaa

ctc

tat

gat

tea

cct

age

gcc

caa

cgt

tac

agt

gaa

tea

gat

864

Lys

Glu

Leu

Tyr

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

275

280

285

ggc

ctg

gtc

ttt

gac

cct

gct

aag

att

atc

aqt

cgt

aca

cca

aat

gga

912

Gly

Leu

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

290

295

300

ytt

gcg

att

ccg

cat

ggc

gac

cat

tac

cac

ttt

att

cct

tac

age

aag

960

Val

Ala

Ile

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

ctt

tet

gct

tta

gaa

gaa

aag

att

gcc

aga

atg

gtg

cct

atc

agt

gga

1008

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

32 5

330

335

aut

ggt

tet

aca

gtt

tet

aca

aat

gca

aaa

cct

aat

gaa

gta

gtg

tet

1056

Thr

Gly

Ser

Thr

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

340

345

350

agt

cta

ggc

agt

ctt

tea

age

aat

cct

tet

Let

tta

acg

aca

agt

aag

1104

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

gag

ctc

tet

tea

gca

tet

gat

ggt

tat

att

ttt

aat

cca

aaa

gat

atc

1152

Glu

Leu

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Tle

3V0

375

380

gtt

gaa

gaa

acg

gct

aca

gct

tat

att

gta

aga

cat

ggt

gat

cat

ttc

1200

Val

Gl u

Gl u

Thr

Al a

Thr

Ala

Tyr

ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

cat

tac

att

cca

aaa

tea

aat

caa

att

ggg

caa

ccg

act;

ctt

cca

aac

1248

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asn

Gl n

ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

a a t

agt

cta

gca

aca

cct

tet

cca

tet

ctt

cca

atc

aat

cca

gga

act

1296

500

505

510

Thr Leu Ala Gly Ala Thr Ile Leu Ala Lys Lys Arg Met Lys 515 520 525 <210> <211>

<212>

<213> <221> <222> <400>

1455 párů bází

DNA mikroorganizmus S.pneumoniae CDS (1)-.(1452)

atg

aaa

ttt

agt

aaa

aaa

tat

ata

gca

gct

gga

tea

gct

gtt

atc

gta

Met 1

Lys

Phe

Ser

Lys 5

Lys

Tyr

Ile

Ala

Ala 10

Gly

Ser

Ala

Val

Ile 15

Val

tcc

ttg

agt

cta

tgt

gcc

tat

gca

cta

aac

cag

cat

cgt

tcg

cag

gaa

Ser

Leu

Ser

Leu 20

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu 25

Asn

Gin

His

Arg

Ser 30

Gin

Glu

aat

aag

gac

aat

aat

cgt

gtc

tet

tat

gtg

gat

ggc

agc

cag

tea

agt

Asn

Lys

Asp 35

Asn

Asn

Arg

Val

Ser 40

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser 45

Gin

Ser

Ser

cag

aaa

agt

gaa

aac

ttg

aca

cca

gac

cag

gtt

agc

cag

aaa

gaa

gga

Gin

Lys 50

Ser

Glu

Asn

Leu

Thr 55

Pro

Asp

Gin

val

Ser 60

Gin

Lys

Glu

Gly

att

cag

gct

gag

caa

att

gta

atc

aaa

att

aca

gat

cag

ggc

tat

gta

Ile 65

Gin

Ala

Giu

Gin

Ile 70

Val.

Ile

Lys

Ile

Thr 75

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val 80

acg

tea

cac

ggt

gac

cac

tat

cat

tac

tat

aat

ggg

aaa

gtt

cct

tat

Thr

Ser

His

Gly

Asp 85

His

Tyr

His

Tyr

Tyr 90

Asn

Gly

Lys

Val

Pro 95

Tyr

gat

gcc

ctc

ttt

agt

gaa

gaa

ctc

ttg

atg

aag

gat

cca

aac

tat

caa

Asp

Ala

Leu

Phe 100

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu 105

Met

Lys

Asp

Pro

Asn 110

Tyr

Gin

ctt

aaa

gac

gct

gat

att

gtc

aat

gaa

gtc

aag

ggt

ggt

tat

atc

atc

I.eu

Lys

Asp 115

Ala

Asp

Ile

Val

Asn 120

Glu

Val

Lys

Gly

Gly 125

Tyr

Ile

Ile

aag

gtc

gat

gga

aaa

tat

tat

gtc

tac

ctg

aaa

gat

gca

gct

cat

gct

Lys

Val 130

Asp

Gly

Lys

Tyr

Tyr 135

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp 140

Ala

Ala

His

Ala

gat

aat

gtt

ega

act

aaa

gat

gaa

atc

aat

cgt

caa

aaa

caa

gaa

cat

Asp 145

Asn

Val

Arg

Thr

Lys 150

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg 155

Gin

Lys

Gin

Glu

His 1 60

gtc

aaa

gat

aat

gaq

aag

gtt

aac

tet

aat

gtt

gct

gta

gca

agg

t ct

Val

Lys

Asp

Asn

Glu 165

Lys

Val

Asn

Ser

Asn 170

Val

Ala

Val

Ala

Arg 175

Ser

cag

gga

ega

tal

acg

aca

aat

gat

ggt

tat

gtc

ttt

aat

cca

gct

gat

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

180 185 190

4

192

240

288

336

384

432

480

528

576

-49CZ 303675 B6

35

40

45

Thr

Gin

Ala

Ala

Thr

Ser

Phe

Asn

Arg

Gly

Asn

Gly

Ser

Gin

Ala

Glu

50

55

60

Gl n

Arg

Gly

Glu

Leu

Asp

Leu

Glu

Arg

Asp

Lys

Ala

Met

Lys

Ala

Val

65

70

7 5

80

Ser

Glu

Tyr

Val

Gly

Lys

Met

Val

Arg

Asp

Ala

Tyr

Val

Lys

Ser

Asp

85

90

95

Arg

Lys

Arg

His

Lys

Asn

Thr

Val

Ala

Leu

Val

Asn

Gin

Leu

Gly

Asn

100

105

110

Ile

Lys

Asn

Arg

Tyr

Leu

Asn

Glu

Ile

Val

His

Ser

Thr

Ser

Lys

Ser

115

120

125

Gin

Leu

Gin

Glu

Leu

Mel

Met

Lys

Ser

Gin

Ser

Glu

Val

Asp

Glu

Ala

130

135

140

Val

Ser

Lys

Phe

Gl u

Lys

Asp

Ser

Phe

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

Gly

Ser

145

150

155

160

Ser

Thr

Lys

Pro

Glu

Thr

Pro

Gin

Pro

Glu

Asn

Pro

Glu

His

Gin

Lys

165

170

175

Pro

Thr

Thr

Pro

Ser

Pro

Asp

Thr

Lys

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Glu

Gly

180

185

190

T,ys

Lys

Pro

Ser

Val

Pro

Asp

Ile

Asn

Gin

Glu

Lys

Glu

Lys

Ala

Lys

195

200

205

Leu

Ala

Val

Val

Thr

Tyr

Met

Ser

Lys

Ile

Leu

Asp

Asp

Ile

Gin

Lys

210

215

220

His

His

Leu

Gin

Lys

Glu

Lys

His

Arq

Gin

Ile

Val

Ala

Leu

Ile

Lys

225

230

235

240

Glu

Len

Asp

Glu

Leu

Lys

Lys

Gin

Ala

Leu

Ser

Glu

Ile

Asp

Asn

Val

24 5

250

255

Asn

Thr

Lys

Val

Glu

Ile

Glu

Asn

Thr

Val

His

Lys

Ile

Phe

Ala

Asp

260

265

270

Met

Asp

Ala

Val

Val

Thr

Lys

Phe

Lys

Lys

Gly

Leu

Thr

Gin

Asp

Thr

275

280

285

Pro

Lys

Glu

Pro

Gly

Asn

Lys

Lys

Pro

Ser

Ala

Pro

Lys

Pro

Gly

Met

290

295

300

Gin

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Leu

Glu

Lys

Pro

Lys

305

310

315

320

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val·

Lys

Pro

325

330

335

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

340

345

350

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

355

360

365

Pro

Gin

Pro

Clu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

370

375

380

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

385

390

395

400

Ly s

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Gl u

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

405

410

415

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

420

425

430

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

435

440

445

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Asp

Asn

Ser

Lys

Pro

Gin

Ala

Asp

Asp

Lys

Lys

450

455

4 60

Pro

Ser

Thr

Thr

Asn

Asn

Leu

Ser

Lys

Asp

Lys

Gin

Pro

Ser

Asn

Gin

465

470

475

480

Ala

Ser

Thr

Asn

Glu

Lys

Ala

Thr

Asn

Lys

Pro

Lys

Lys

Ser

Leu

Pro

4 85

490

4 95

Ser

Thr

Gl y

Ser

Ile

Ser

Asn

Leu

Ala

Leu

Glu

Ile

Ala

Gly

Leu

Leu

340

345

350

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

1104

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

355

360

365

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

1152

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

370

375

380

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

1200

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

385

390

395

400

aaa

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

cag

ccg

gaa

1248

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

405

410

415

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

1296

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

420

425

430

gtt

aaa

ccg

caa

cca

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

caa

cca

1344

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

435

440

445

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gat

aat

agc

aag

cca

caa

gca

gat

gat

aag

aag

1392

Glu

Lys

Pro

Lys

Pro

Asp

Asn

Ser

Lys

Pro

Gin

Ala

Asp

Asp

Lys

Lys

450

455

460

cca

tca

act

aca

aat

aat

tta

agc

aag

gac

aag

caa

cct

tet

aac

caa

1440

Pro

Ser

Thr

Thr

Asn

Asn

Leu

Ser

Lys

Asp

Lys

Gin

Pro

Ser

Asn

Gin

465

470

475

480

get

tca

aca

aac

gaa

aaa

gca

aca

aat

aaa

ccg

aag

aag

tca

ttg

cca

1488

Ala

Ser

Thr

Asn

Glu

Lys

Ala

Thr

Asn

Lys

Pro

Lys

LYS

Ser

Leu

Pro

485

490

495

tca

act

gga

tet

att

tca

aat

cta

gca

ctt

gaa

att

gca

ggt

ctt

ctt

1536

Ser

Thr

Gly

Ser

lle

Ser

Asn

Leu

Ala

Leu

Glu

lle

Ala

Cly

Leu

Leu

500

505

510

acc

ttg

gcg

ggg

gca

acc

att

ctt

get

aag

aaa

aga

atg

aaa

1578

Thr

Leu

Ala

Gly

Ala

Thr

lle

Leu

Ala

Lys

Lys

Arg

Met

Lys

515

520

525

tag

1581

<210>

6

<211>

526 aminokyselin

<212>

protein

<213>

m

i ikroorganizmus S.pneumoniae

<400> 6

Met

Glu

Asn

lle

Asp

Met

Phe

Lys

Ser

Asn

His

Glu

Arg

Arg

Met

Arg

1

5

10

15

Tyr

Ser

lle

Arg

Lys

Phe

Ser

Val

Gly

Val

Ala

Ser

Val

Ala

Val

Al a

20

25

30

Ser

Leu

Phe

Met

Gly

Ser

Val

Val

His

Al a

Thr

Glu

Lys

Glu

Gly

Ser

-47CZ 303675 B6

att

aag

aac

agg

tat

ttg

aat

gaa

ata gtt

cat

tea

acc

tea

aaa

agc

384

T 1 e

Lys

Asn

Arg

Tyr

i .eu

Asn

Glu

Ile Val

His

Ser

Thr

Ser

Lys

Ser

115

12 0

125

caa

cta

cag

gaa

ctg

atg

atg

aag

agt caa

tea

gaa

gta

gat

gaa

gct

432

Cln

Leu

Gin

Glu

Leu

Met

Met

Lys

Ser Gin

Stu

Glu

Va i

Asp

Glu

Ala

130

135

140

ytg

tet

aaa

ttt

gaa

aag

gac

tea

ttt tet

tcg

tea

agt

tea

gga

tcc

430

Val

Ser

Lys

Phe

Glu

Lys

Asp

Ser

Phe Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

Gly

Ser

145

1 50

155

160

tcc

act

aaa

cca

gaa

act

ccg

cag

ccg gaa

aat

cca

gag

cat

caa

aaa

528

Ser

Thr

Lys

Pro

Glu

Thr

Pro

Gin

Pro Glu

Asn

Pro

Glu

His

Gin

Lys

1 65

170

1 75

cca

aca

act

cca

tet

ccg

gat

acc

aaa cca

agc

cct

caa

cca

gaa

ggc

576

Pro

Thr

Thr

Pro

Ser

Pro

Asp

Thr

Lys Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Glu

Gly

180

185

190

aag

aaa

cca

agc

gta

cca

gac

att

aat cag

gaa

aaa

gaa

aaa

gct

aag

624

Lys

Lys

Pro

Ser

Val

Pro

Asp

Ile

Asn Gin

Glu

Lys

Glu

Lys

Ala

Lys

195

200

205

ctt

gct.

gta

gta

acc

tac

atg

agc

aag att

tta

gat

gat

ata

caa

aaa

672

Leu

Ala

Val

Val

Thr

Tvr

Met

Ser

Lys Tle

I.,eu

Asp

Asp

Ile

Gin

Lys

210

215

220

cat

cat

ctg

cag

aaa

gaa

aaa

cat

cgt cag

att

gtt

gct

ctt

att

aag

720

His

His

Leu

Gin

Lys

Glu

Lys

His

Arg Gin

Ile

Val

Al a

Leu

Ile

Lys

225

230

235

240

gag

ctt

gat

gag

ctt

aaa

aag

caa

gct ctt

tet

gaa

att

gat

aat

gta

768

Glu

Leu

Asp

Glu

Leu

Lys

Lys

Gin

Ala Leu

Ser

Glu

Ile

Asp

Asn

Val

245

250

255

aat

acc

aaa

gta

gaa

att

gaa

aat

aca gtc

cac

aag

ata

ttt

gca

gac

816

Asn

Thr

Lys

Val

Glu

Ile

Glu

Asn

Thr Val

His

Lys

Tle

Phe

Ala

Asp

260

265

270

atg

gat

gca

gtt

gtg

act

aaa

ttc

aaa aaa

ggc

tta

act

cag

gac

aca

864

Met

Asp

Ala

Val

Val

Thr

Lys

Phe

Lys Lys

Gly

Leu

Thr

Gin

Asp

Thr

275

280

285

cca

aaa

gaa

cca

ggt

aac

aaa

aaa

cca tet.

gct

cca

aaa

cca

ggt

atg

912

Pro

Lys

Glu

Pro

Glv

Asn

Lys

Lys

Pro Ser

Ala

Pro

Lys

Pro

Gly

Met

290

295

300

caa

cca

agt

cct

caa

cca

gag

gtt

aaa ccg

cag

ctg

gaa

aaa

cca

aaa

960

Gin

Pro

Se r

Pro

Gin

Pro

Glu

Val

Lys Pro

Gin

Leu

Glu

Lys

Pro

Lys

305

310

315

320

cca

gag

gtt

aaa

ccg

caa

cca

gaa

aaa cca

aaa

cca

gag

gtt

aaa

ccg

1008

Pro

Gin

Val

Lys

Pro

Gin

Pro

Glu

Lys Pro

Lys

Pro

Glu

Val

Lys

Pro

32 5

330

335

cag

ccg

gaa

aaa

cca

aaa

cca

gag

gtt. aaa

ccg

cag

ccg

gaa

aaa

cca

1 056

Gin

Pro

Gl u

Lys

Pro

Lys

Pro

Clu

Val Lys

Pro

Gl π

Pro

Gl u

Lys

Pro

to

Leu Tyr Glu Ala

Pro

Lys Gly Tyr Thr Leu Glu Asp Leu

Leu

Ala

Thr

675

680

685

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

690

695

700

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

705

710

715

720

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

725

730

735

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

740

745

750

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

GlU

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

755

760

7 65

Glu

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

770

775

780

Leu

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

785

790

795

800

Lys

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

805

810

815

Phe

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Al a

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

820

825

830

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

835

840

<210> 5 <211> 1581 párů bází <212> DNA <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <221> CDS <222> (1)...(1578) <400> 5

atg

gag

aat

ata

gac

atg

ttt

aaa

tca

aat

cat

gag

ega

aga

atg

cgt

Met 1

Glu

Asn

Ile

Asp 5

Met

Phe

Lys

Ser

Asn 10

His

Glu

Arg

Arg

Met 15

Arg

tat

tcc

att

cgt

aaa

ttt

agt

gta

gga

gta

gct

age

gta

gct

gtt

gcc

Tyr

Ser

Ile

Arg 20

Lys

Phe

Ser

Val

Gly 25

Val

Ala

Ser

Val

Ala 30

Val

Ala

agt

ctt

ttt

atg

gga

agt

gtt

gta

cat

gcg

aca

gag

aaa

gag

gga

agt

Ser

Leu

Phe 35

Met

Gly

Ser

Val

Val 40

His

Ala

Thr

Glu

Lys 45

Glu

Gly

Ser

acc

caa

gca

gcc

act

tet

ttt

aat

agg

gga

aat

gga

agt

cag

gca

gaa

Thr

Gin 50

Ala

Ala

Thr

Ser

Phe 55

Asn

Arg

Gly

Asn

Gly 60

Ser

Gin

Ala

Glu

caa

cgt

gga

gaa

ctc

gat

tta

gaa

ega

gat

aag

gca

atg

aaa

gcg

gtc

Gin 65

Arg

Gly

Glu

Leu

Asp 70

Leu

Glu

Arg

Asp

Lys 7 5

Ala

Met

Lys

Ala

Val 80

agt

gaa

tat

gta

gga

aaa

atg

gtg

aga

gat

gcc

tat

gta

3 £2 £1

tca

gat

Ser

Glu

Tyr

Val

Gly 85

Lys

Met

Val

Arg

Asp 90

Ala

Tyr

Val

Lys

Ser 95

Asp

aga

aaa

ega

cat

aaa

aat

act

gta

gct

cta

gtt

aac

cag

ttg

gga

aac

Arg

Lys

Arg

His 100

Lys

Asn

Thr

Val

Ala 105

Leu

Val

Asn

Gin

Leu 110

Gly

Asn

144

192

240

288

36

-45CZ 303675 B6

Gl.y

Asp 210

His

Tyr

His

Tyr

Ile 215

Pro

Lys Asn

Glu Leu 220

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Al a

Ala

Glu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

225

2 30

235

240

Leu

Arg

Thr

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

245

250

255

Trp

Val

Pro

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

260

265

270

Asn

Asn

Ser

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

275

280

285

Ser

Leu

Leu

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

290

295

300

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

305

310

315

320

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

325

330

335

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

340

345

350

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

3 55

360

365

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

370

375

380

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

385

390

395

400

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

405

410

415

Gly

val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

420

42 5

4 30

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

435

440

445

Leu

G1 y

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

450

455

460

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

4 65

470

475

480

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

485

490

4 95

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

500

505

510

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

515

520

525

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

530

535

540

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

o4 5

550

555

560

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

565

570

575

Ser

His

Trp

Tle

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

580

585

590

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

5 95

600

605

H is

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Al a

Glu

Ala

Ile

Tyr

610

615

620

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

625

630

635

640

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

645

650

655

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

I.le

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

660

665

670

740 745 750

aaa	cca	gaq	tet	cca	aaa	cca	aca	gag
Lys	Pro	Glu 755	Ser	Pro	Lys	Pro	Thr 760	Glu
gag	gaa	tea	gaa	gaa	cct	cag	gtc	gag
Glu	Glu 770	Ser	Glu	Glu	Pro	Gln 775	Val	Glu
ctg	aga	gag	get	gaa	gat	tta	ctt	gga
Leu 785	Arg	Glu	Ala	Glu	Asp 790	Leu	Leu	Gly
aag	tcc	aat	gcc	aaa	gag	act	ctc	aca
Lys	Ser	Asn	Ala	Lys 805	Glu	Thr	Leu	Thr
ttt	ggc	acc	cag	gac	aac	aat	act	att
Phe	Gly	Thr	Gln 820	Asp	Asn	Asn	Thr	Ile 825
ttg	get	tta	tta	aag	gag	agt	aag	taa
Leu	Ala	Leu 835	Leu	Lys	Glu	Ser	Lys 840

gaa Glu	cca Pro	gaa Glu	gaa Glu 765	gaa Glu	tea Ser	cca Pro	2304
act	gaa	aag	gtt	gaa	gaa	aaa	2352
Thr	Glu	Lys 780	Val	Glu	Glu	Lys
aaa	atc	cag	gat	cca	att	atc	2400
Lys	Ile 795	Gln	Asp	Prc	Ile	Ile 800
gga	tta	aaa	aat	aat	tta	cta	2448
Gly 810	Leu	Lys	Asn	Asn	Leu 815	Leu
atg	gca	gaa	get	gaa	aaa	cta	2496
Met	Ala	Glu	Ala	Glu 830	Lys	Leu

2523 <210> <211>

<212>

<213> <400>

840 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 4

Met

Lys

Ile

Asn

Lys

Lys

Tyr

Leu

Ala

Gly

Ser

Val

Ala

Thr

Leu

Val

1

5

10

15

Leu

Ser

Val

Cys

Ala

Tyr

Glu

Leu

Gly

Leu

His

Gln

Ala

Gln

Thr

Val

20

25

30

Lys

Glu

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

Gln

Ala

Thr

Gln

35

40

45

Lys

Thr

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

50

55

60

Asn

Ala

Glu

Gln

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gln

Gly

Tyr

Val

Thr

65

70

75

80

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

85

90

95

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gln

Leu

100

105

110

Lys

Asp

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

115

120

125

Val

Asn

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

130

135

140

Asn

Val

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gln

Lys

Gln

Glu

His

Ser

145

150

155

160

Gln

His

Arg

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

165

170

175

Ala

Arg

Ser

Gln

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

180

185

190

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

195

200

205

-43CZ 303675 B6

ctt

gcc

ttc

tta gct

ccg

att

cgt

cat

cca

gaa

cgt

tta

gga

aaa

cca

1584

Leu

Ala

Phe

Leu Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

515

520

525

aat

gcg

caa

att acc

tac

act

gat

gat

gag

att

caa

gta

gcc

aag

ttg

1632

Asn

Ala

Gin

Ile Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

530

535

540

gca

ggc

aag

tac aca

aca

gaa

gac

ggt

tat

atc

ttt

gat

cct

cgt

gat

1680

Ala

Gly

Lys

Tyr Thr

Thr

Glu

Asp

Gl y

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

545

550

555

560

ata

acc

aqt

gat gag

ggg

gat

gcc

tat

gta

act

cca

cat

atg

acc

cat

1728

ile

Thr

Ser

Asp Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Va 1

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

565

570

5/5

agc

cac

tgg

att aaa

aaa

gat

agt

ttg

tet

gaa

gct

gag

aga

gcg

gca

1776

Ser

His

Trp

Ile Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Al a

580

585

590

gcc

cag

gc.L

tat gct

aaa

gag

aaa

ggt

ttg

acc

cct

cct

tcg

aca

gac

1824

Ala

Gin

Ala

Tyr Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

595

600

605

cat

cag

gat

tea gga

aat

act

gag

gca

aaa

gga

gca

gaa

gct

atc

tac

1872

His

Gin

Asp

Ser Gly

Asn

Thr

Glu

Al a

Lys

Gly

Ala

Gl u

Ala

Ile

Tyr

610

615

620

aac

cgc

gtg

aaa gca

gct

aag

aag

gtg

cca

ctt

gat

cgt

atg

cct

tac

1920

Asn

Arg

Val

Lys Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

625

630

635

640

aat

ctt

caa

tat act

gta

gaa

gtc

aaa

aac

ggt

agt

tta

atc

ata

cct

1968

Asn

Leu

Gin

Tyr Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

645

650

65 5

cat

tat

gac

cat tac

cat

aac

atc

aaa

ttt

gag

tgg

ttt

gac

gaa

ggc

2016

His

Tyr

Asp

His Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

660

665

670

ctt

tat

gag

gca cct

aag

ggg

tat

a ct

ctt

gag

gat

Ctt

ttg

gcg

act

2064

Leu

, - x- 1 yr

Glu

Ala Pro

Lys

G.1 y

Tyr

Thr

Leu

Gl u

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

675

680

685

gtc

aag

tac

t.at gtc

gaa

cat

cca

aac

gaa

cgt

ccg

cat

tea

gat

aat

2112

Val

Lys

Tyr

Tyr Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

690

695

700

ggt

ttt

ggt

aac gct

agc

gac

cat

gtt

caa

aga

aac

aaa

aat

ggt

caa

2160

Gly

Phe

Gly

Asn Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

705

710

715

72 0

gct

gat

acc

aat caa

acg

gaa

aaa

cca

agc

gag

gag

aaa

cct

cag

aca

2208

Ala

Asp

Thr

Asn Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

725

730

735

gaa

aaa

cct

gag gaa

gaa

acc

cct

ega

gaa

gag

aaa

cca

caa

agc

gag

2256

Glu

Lys

Pro

Glu Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

275 280 285

agt Ser

ctc Leu 290

ttg Leu

aaa Lys

cag Gin

ctc Leu

tac Tyr 295

aaa Lys

ctg Leu

cct Pro

ttg Leu

agt Ser 300

caa Gin

ege Arg

cat His

gta Val

912

gaa

tet

gat

ggc

ctt

att

ttc

gac

cca

gcg

caa

atc

aca

agt

ega

acc

960

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

I le

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

305

310

315

320

gcc

aga

ggt

gta

get

gtc

cct

cat

ggt

aac

cat

tac

cac

ttt

atc

cct

1008

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

325

330

335

tat

gaa

caa

atg

tet

gaa

ttg

gaa

aaa

ega

att

get

cgt

att

att

ccc

1056

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Al a

Arg

Ile

Ile

Pro

340

345

350

ctt

cgt

tat

cgt

tea

aac

cat

tgg

gta

cca

gat

tea

aga

cca

gaa

gaa

1104

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

355

360

365

cca

agt

cca

caa

ccg

act

cca

gaa

cct

agt

cca

agt

ccg

caa

cct

gca

1152

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

37 0

375

380

cca

aat

cct

caa

cca

get

cca

age

aat

cca

att

gat

gag

aaa

ttg

gtc

1200

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

385

390

395

400

aaa

gaa

get

gtt

ega

aaa

gta

ggc

gat

ggt

tat

gtc

ttt

gag

gag

aat

1248

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

405

410

415

gga

gtt

tet

cgt

tat

atc

cca

gcc

aag

aat

ctt

tea

gca

gaa

aca

gca

1296

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

AJ a

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

420

425

430

gca

ggc

att

gat

age

aaa

ctg

gcc

aag

cag

gaa

agt

tta

tet

cat

aag

1344

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

435

440

445

cta

gga

get

aag

aaa

act

gac

ctc

cca

tet

agt

gat

ega

gaa

ttt

tac

1 392

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

450

455

460

aac

aag

get

tat

gac

tta

cta

gca

aga

att

cac

caa

gat

tta

ctt

gat

1440

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

4 65

470

475

480

aat

aaa

ggt

ega

caa

gtt

gat

ttt

gag

get

ttg

gat

aac

ctg

ttg

gaa

1488

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

485

490

495

ega

ctc

aag

gat

gtc

tea

agt

gat

aaa

gtc

aag

tta

gtg

gat

gat

att

1536

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

500

505

510

C7 303675 Bó aaa acq gag aat ttg act cct gat gag gtt agc aag cgt gaa gga atc 192

Lys Thr Glu Asn Leu Thr Pro Asp Glu Val Ser Lys Arg Glu Gly Tle

55 60 aac gcc gaa caa atc gtc atc aag att acg gat caa ggt tat gtg acc 240

Asn Ala Glu Gin Ile Val Ile Lys Ile Thr Asp Gin Gly Tyr Val Thr

70 75 80 tet cat gga gac cat tat cat tac tat aat ggc aag gtc cct tat gat 288

Ser His Gly Asp His Tyr His Tyr Tyr Asn Gly Lys Val Pro Tyr Asp

90 95 gcc atc atc agt gaa gag ctc ctc atg aaa gat ccg aat tat cag ttg 336

Ala Ile Ile Ser Glu Glu Leu Leu Met Lys Asp Pro Asn Tyr Gin Leu

100 105 110 aag gat tea gac att gtc aat gaa atc aag ggt ggt tat gtc att aag 384

Lys Asp Ser Asp Ile Val Asn Glu Ile Lys Gly Gly Tyr Val Ile Lys

115 120 125 gta aac ggt aaa tac tat gtt tac ctt aag gat gca gct cat gcg gat 432

Val Asn Gly Lys Tyr Tyr Val Tyr Len Lys Asp Ala Ala His Ala Asp

130 135 140 aat gtc cgt aca aaa gaa gaa atc aat cgg caa aaa caa gaa cat agt 480

Asn Val Arg Thr Lys Glu Glu Ile Asn Arg Gin Lys Gin Glu His Ser

145 150 155 160 cag cat cgt gaa gga ggg act tea gca aac gat ggt gcg gta gcc ttt 528

Gin His Arg Glu Gly Gly Thr Ser Ala Asn Asp Gly Ala Val Ala Phe

165 170 175 gca cgt tea cag gga cgc tac acc aca gat gat ggt tat atc ttc aat 576

Ala Arg Ser Gin Gly Arg Tyr Thr Thr Asp Asp Gly Tyr Ile Phe Asn

180 185 190 gca tet gat atc atc gaa gat acg ggc gat gcc tat atc gtt cct cat 624

Ala Ser Asp Ile Ile Glu Asp Thr Gly Asp Ala Tyr Ile Val Pro His

195 200 205 gga gat cat tac cat tac att cct aag aat gag tta tea gct agc gaq 672

Gly Asp His Tyr His Tyr Ile Pro Lys Asn Glu Leu Ser Ala Ser Glu

210 215 220 ttg gct gct gca gaa gcc ttc cta tet ggt cgg gaa aat ctg tea aat 720

Leu Ala Ala Ala Glu Ala Phe Leu Ser Gly Arq Glu Asn Leu Ser Asn

225 230 235 240 tta aga acc tat cgc ega caa aat agc gat aac act cca aga aca aac 768

Leu Arg Thr Tyr Arg Arg Gin Asn Ser Asp Asn Thr Pro Arg Thr Asn

245 250 255 tgg gta cct tet gta agc aat cca gga act aca aat act aac aca agc 816

Trp Val Pro Ser Val Ser Asn Pro Gly Thr Thr Asn Thr Asn Thr Ser

260 265 270 aac aac aqc aac act aac agt caa gca agt caa agt aat gac att gat 864

Asn Asn Ser Asn Thr Asn Ser Gin Ala Ser Gin Ser Asn Asp Ile Asp

	740	745	7 50
Leu	Glu Asn Asn Tyr Lys	Val Gly Glu Ile Lys Leu Pro	Ile Pro Lys
	755	760 765
Leu	Asn Gin Gly Thr Thr	Arg Thr Ala Gly Asn Lys Ile	Pro Val Thr
	770	775 780
Phe	Met Ala Asn Ala Tyr	Leu Asp Asn Gin Ser Thr Tyr	Ile Val Glu
785	790	795	800
Val	Pro Ile Leu Glu Lys	Glu Asn Gin Thr Asp Lys Pro	Ser Ile Leu
	805	810	815
Pro	Gin Phe Lys Arg Asn	Lys Ala Gin Glu Asn Ser Lys	Leu Asp Glu
	820	825	830
Lys	Val Glu Glu Pro Lys	Thr Ser Glu Lys Val Glu Lys	Glu Lys Leu
	835	840 845
Ser	Glu Thr Gly Asn Ser	Thr Ser Asn Ser Thr Leu Glu	Glu Val Pro
	850	855 860
Thr	Val Asp Pro Val Gin	Glu Lys Val Ala Lys Phe Ala	Glu Ser Tyr
8 65	870	875	880
Gly	Met Lys Leu Glu Asn	Val Leu Phe Asn Met Asp Gly	Thr Ile Glu
	885	890	895
Leu	Tyr Leu Pro Ser Gly	Glu Val Ile Lys Lys Asn Met	Ala Asp Phe
	900	905	910
Thr	Gly Glu Ala Pro Gin	Gly Asn Gly Glu Asn Lys Pro	Ser Glu Asn
	915	920 925
Gly	Lys Val Ser Thr Gly	Thr Val Glu Asn Gin Pro Thr	Glu Asn Lys
	930	935 940
Pro	Ala Asp Ser Leu Pro	Glu Ala Pro Asn Glu Lys Pro	Val Lys Pro
945	950	955	960
Glu	Asn Ser Thr Asp Asn	Gly Met Leu Asn Pro Glu Gly	Asn Val Gly
	965	970	97 5
Ser	Asp Pro Met Leu Asp	Pro Ala Leu Glu Glu Ala Pro	Ala Val Asp
	980	985	990
Pro	Val Gin Glu Lys Leu	Glu Lys Phe Thr Ala Ser Tyr	Gly Leu Gly
	995	1000 1005
Leu	Asp Ser Val Ile Phe	Asn Met Asp Gly Thr Ile Glu	Leu Arg Leu
	1010	1015 1020
Pro	Ser Gly Glu Val Ile	Lys Lys Asn Leu Ser Asp Phe	Ile Ala
1025	, 103C	) 1035

<210> 3 <211> 2523 párů bází <212> DNA <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <221> CDS <222> (1)...(2520) <223> kódující oblast genu BVH-11 <400> 3

atg Met 1

aaa Lys

atc Ile

aat Asn

aaa Lys 5

aaa Lys

tat Tyr

cta Leu

gct Al a

ggg Gly 10

tca Ser

gt a Val

gct Al a

aca Thr

ctt Leu 15

gtt Val

tta

agt

gtc

tgt

gct

tat

gaa

cta

ggt.

ttg

cat

caa

gct

caa

act

gta

Leu

Ser

Val

Cys

Ala

Tyr

Glu

Leu

Gl y

Leu

His

Gin

Ala

Gin

Thr

Val

20

25

30

aaa

gaa

aat

aat

cgt

gtt

t cc

tat

ata

ga t

gga

aaa

caa

gcg

acg

caa

Lys

Glu

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

G.l.n

Ala

Thr

Gin

35

40

45

144

-39CZ 303675 BC

275

280

285

Gly

Leu

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Tle

Ue

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

290

295

300

Val

Ala

Ue

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

305

310

315

320

Leu

Ser

Ala

Leu

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

325

330

335

Thr

Cly

Ser

Thr

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

340

345

350

Ser

Leu

Gly

Ser

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

355

360

365

Glu

Leu

Ser

Ser

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ue

37 0

37 5

380

Val

Gl u

Glu

Thr

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

385

390

395

400

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asn

Gin

Tle

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

405

410

415

Asn

Ser

Leu

Ala

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

420

425

430

Ser

His

Glu

Lys

Hi s

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

A.sp

Ala

Asn

Arg

435

440

445

Ue

Ile

Ala

Glu

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

450

455

4 60

Asn

His

Tyr

Phe

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

465

470

4 75

480

Ala

Gin

Lys

His

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

Hi s

Asn

Gly

Leu

Asp

485

490

495

Ser

Leu

Ser

Ser

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

500

505

510

Lys

Asp

Leu

Asp

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Tle

Ala

Gly

Ue

Met

Lys

515

520

525

Gin

Tyr

Gly

Val

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

530

535

540

Ala

Ile

Ile

Tyr

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ue

Asp

545

550

555

560

Glu

His

Lys

Pro

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

5 65

570

575

Phe

Lys

Pro

Glu

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

580

585

590

Thr

Gly

Glu

Glu

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

5 95

600

605

Phe

Asn

Asn

Gin

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

610

615

620

Phe

Ser

Phe

Pro

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

625

630

635

640

Val

Lys

Leu

I le

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

645

650

655

Lys

Val

Phe

Gly

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

660

665

670

Gin

Pro

Tyr

Leu

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ue

Ala

Ser

Lys

67 5

680

685

Asp

Tyr

Pro

Glu

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

690

6 95

700

Leu

Ala

Tyr

Lys

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

705

710

715

720

Gly

Asp

Thr

Tyr

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

725

730

735

Thr

Asp

Ala

Leu

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

50

55

60

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

Asn

Ser

Val

Tle

Asn

Ala

Lys

Ile

65

70

75

80

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

85

90

95

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

100

105

110

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

115

120

125

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

130

135

140

<210>	76
<211>	3171 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	76

gacttgacag aagagcaaat taaggctgcg caaaaacatt tagaggaagt taaaactagt 60 cataatggat tagattcttt gtcatctcat gaacaggatt atccaggtaa tgccaaagaa 120 atgaaagatt tagataaaaa aatcgaagaa aaaattgctg gcattatgaa acaatatggt 180 gtcaaacgtg aaagtattgt cgtgaataaa gaaaaaaatg cgattattta tccgcatgga 240 gat:caccatc atgcagatcc gattgatgaa cataaaccgg ttggaattgg tcattctcac 300 agtaaccatg aactgtttaa acccgaagaa ggagttgcta aaaaagaagg gaataaagtt 360 tatactggag aagaattaac gaatgttgtt aatttgttaa aaaatagtac gtttaataat 420 caaaacttta ctctagccaa tggtcaaaaa cgcgtttctt ttagttttcc gcctgaattg 480 gagaaaaaat taggtatcaa tatgctagta aaattaataa caccagatgg aaaagtattg 540 gagaaagtat ctggtaaagt atttggagaa ggagtaggga atattgcaaa ctttgaatta 600 gatcaacctt atttaccagg acaaacattt aagtatacta tcgcttcaaa agattatcca 660 gaagtaagtt atgatggtac atttacagtt ccaacctctt tagcttacaa aatggccagt 720 caaacgattt tetatccttt ccatgcaggg gatacttatt taagagtgaa ccctcaattt 780 gcagtgccta aagqaactga tgctttagtc agagtgtttg atgaatttca tggaaatgct 840 tatttagaaa ataactat.aa agttgqtgaa atcaaattac cgattccgaa attaaaccaa 900 ggaacaacca gaacggccgg aaataaaatt cctgtaacct tcatggcaaa tgcttatttg 960 gacaatcaat egaettatat tgtggaagta cctatcttgg aaaaagaaaa tcaaactgat 1020 aaaccaagta ttctaccaca atttaaaagg aataaagcac aagaaaactc aaaacttgat 1080 gaaaaggtag aagaaccaaa gactagtgag aaggtagaaa aagaaaaact ttctgaaact 1140 gggaatagta ctagtaattc aacgttagaa gaagttccta cagtggatcc tgtacaagaa 1200 aaagtagcaa aatttgctga aagttatggg atgaagctag aaaatgtctt gtttaatatg 1260 gacggaacaa tLgaattata tttaccatca ggagaagtca ttaaaaagaa tatggcagat 1320 tttacaggag aagcacctca aggaaatggt gaaaataaac catctgaaaa tggaaaagta 1380 tctactggaa cagttgagaa ccaaccaaca gaaaataaac cagcagattc tttaccagag 1440 gcaccaaacg aaaaacctgt aaaaccagaa aactcaacgg ataatggaat gttgaatcca 1500 gaagggaatg tggggagtga ccctatgtta gatccagcat tagaggaagc tccagcagta 1560 gatcctgtac aagaaaaatt agaaaaattt acagctagtt acggattagg cttagatagt 1620 gttatattea atatggatgg aacgattgaa ttaagattgc caagtggaga agtgataaaa 1680 aagaatttat ctgatttcat agcgaagctt cgttatcgtt caaaccattg ggtaccagat 1740 teaagaccag aagaaccaag tccacaaccg actccagaac ctagtccaag tccgcaacct 1800 gcaccaaatc ctcaaccagc tccaagcaat ccaattgatg agaaattggt caaagaagct 1860 gttcgaaaag taggcgatgg ttatgtcttt gaggagaatg gagtttctcg ttatatccca 1920 gccaaqaa^c ttteageaga aacagcagca ggeattgata gcaaactggc caagcaggaa 1980 agtttatctc ataagctagg agctaagaaa actgacctcc catctagtga tcgagaattt 2040 tacaataagg cttatgactt actagcaaga attcaccaag atttacttga taataaaggt 2100 egaeaagttg attttgaggc tttggataac ctgttggaac gactcaagga tgtctcaagt 2160 gataaagtca agttagt.gga tgatattett gccttcttag ctccgattcg tcatccagaa 2220 cgtttaggaa aaccaaatgc gcaaattacc tacactgatg atgagattea agtagccaag 2280 ILggcaggca agtacacaac agaagacggt tatatctttg atcctcgtga tataaccagt 2340 gatgaggggg at.gcctatqt aactccacat atgacccata qccactggat taaaaaagat 2400 agtttgtctg aagctqaqag agcggcagcc caggcttatg ctaaagagaa aggtttgacc 2460

- 100C7. 303675 B6 cctccttcga tacaaccgcg tatactgtag atcaaat 11g gatcttttgg aatggttttg aatcaaacgg cctcgagaag gaagaagaat aaactgagag gccaaagaga actattatgg cagaccat ca tgaaagcagc aagtcaaaaa agtggtttga cgactgtcaa gtaaogctag aaaaaccaag agaaaccaca caccagagga aggctgaaga ctctcacagg cagaagctga ggattcagga taagaaggtg cggtagttta cgaaggcct t gtact atgtc cgaccatgtt cgaqgagaaa aagcgagaaa atcagaagaa tttacttgga attaaaaaat aatactgagg ccacttgatc atcatacctc tatgaqgcac gaacatccaa caaagaaaca cctcagacag ccagagtctc cctcaggtcg aaaatccagg aatttactat aaaactattg gctttattaa caaaaggagc gtatgcct ta attatgacca ctaaggggta acgaacgtcc aaaatggtca aaaaacctga caaaaccaac agactgaaaa atccaattat ttggcaccca aggagagtaa agaagctatc caatct.tcaa ttaccataac tactcttgag gcattcagat agctga Lacc ggaagaaacc agaggaacca ggttgaagaa caagtccaat ggacaacaat g

5 20 2580 2640 2700 2760 2820 2880 294 0 30 00 3060 3120 3171 <210> 77 <211> 473 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 77

Glu 1

Ala

Tyr

Trp

Asn 5

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser 10

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser 15

Ser

Ser

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

20

25

30

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Cin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

35

40

4 5

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

50

55

60

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Tle

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

65

70

75

80

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

85

90

95

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

100

105

110

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

115

120

125

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

Pro

Ala

130

135

140

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

145

150

155

160

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

165

170

175

Gly

Val

Ser

Ar g

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

180

185

190

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

195

200

205

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

210

215

220

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

225

230

235

240

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

245

250

255

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

260

265

270

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

275

280

285

Asn

Ala

Gin

I le

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

290

295

300

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

305

310

315

320

lle

Thr

Ser

Asp

Glu Gly Asp 325

Ala

Tyr

Val 330

Thr

Pro

His

Met

Thr 335

His

Ser

His

Trp

Tle

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

340

345

350

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

355

360

365

His

Gin

Asp

Ser

Giy

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

lle

Tyr

370

375

380

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

385

390

395

400

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

lle

lle

Pro

405

410

415

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

lle

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

420

425

430

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

435

440

445

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

450

455

460

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

465

4 70

<210> <211>

<212>

<213> <400>

780 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 78

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gin

His

Arg

Ser

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

dy

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

lle

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

lle

Val

lle

Lys

lle

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

lle

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

lle

lle

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

lle

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

GJ. u

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Al a

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Tle

lle

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

lle

Val

Pro

His

Gly

Gl y

His

Tyr

His

Tyr

lle

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

1 95

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

- 102 C7. 303675 B6

Asp

Ser

Pro

Ser 260

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser 265

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu 270

Val

Phe

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Giy

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Al a

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

4 60

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Va L

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

67 5

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Ť0?

Val Arg

Val

Phe Asp 725

Glu

Phe

His Gly Asn Ala Tyr Leu Glu Asn Asn

7 30

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

770

775

780

<210> <211>

<212>

<213> <400>

690 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 79

Cys 1

Ala Tyr

Glu Leu 5

Gly Leu His Gin Ala 10

Gin Thr Val

Lys

Glu 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

Gin

Ala

Thr

Gin

Lys

Thr

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ser

8 5

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

Gin

His

Arg

130

'135

140

Glu

Giv

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

Ala

Arg

Ser

145

150

155

160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

165

170

175

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

180

185

190

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

195

200

205

Ala

Glu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

Leu

Arg

Thr

210

215

220

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

Trp

Val

Pro

225

230

235

240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn

Ser

245

250

255

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

Hj 5

Val

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

290

295

300

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

305

310

315

320

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

325

330

335

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

34 0

345

350

- 104CZ 303675 B6

Gin

Pro

Thr 355

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro 360

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala 365

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

370

375

380

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

385

390

395

400

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Al a

Ala

Gly

Ile

405

410

4 15

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

420

425

4 30

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

435

440

445

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

450

455

460

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

465

470

475

480

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

485

490

495

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

500

505

510

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

515

520

525

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

530

535

540

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

545

550

555

560

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

565

570

575

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

580

585

590

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

595

600

605

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

610

615

620

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

625

630

635

640

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

645

650

655

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

660

665

670

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

675

680

685

Asn

Ala

690

<210>	80
<211>	2469 párů bází
<212>	DNA
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	80

gtgaagaaaa catatggtta tatcggctca gttgctgcca ttttactagc tactcatatt 60 ggaagttacc aacttggtaa gcatcatatg ggtctagcaa caaaggacaa tcagattgcc 120 tatattgatg acagcaaagg taaggcaaaa gcccctaaaa caaacaaaac gatggatcaa 180 atcagtgctg aagaaggcat ctctgctgaa cagatcgtag tcaaaattac tgaccaaygc 240 tatgtgacct cacacggtga ccattatcat ttttacaatg ggaaagttcc ttatgatgcg 300 attattagtg aagagttgtt gatgacggat cctaattacc gttttaaaca atcagacgtt 360 atcaatgaaa tcttagacgg ttacgttatt aaagtcaatg gcaactatta tgtttacetc 420 aagccaggta gtaagcgcaa aaacattcga accaaacaac aaattgctga gcaagtagcc 480 aaaggaacta aagaagctaa agaaaaaggt ttagctcaag tggcccatct cagtaaagaa 540 gaagttgcgg atttttagtc aatcactatc gcctactgga gccccaggtc cagccagata aaacaccaaa cgtcttgatt gtqatcaaat ccaagaagtc actgaggaca acctttcttg acgagtgatg acagctaaac ttggatgagg ttggatcagg gtaacaaaag gctcgtgatc gataagaagc gatgtgt.caa gttatcccac attgcaacag ccagggcatg ggtatgccaa ggtcgttttg acttttgtat accattaata aagaaaaata aagagcaatg tttatagaca caattagcac caattttata aacccttaa cagtcaatga cgacagatat attatattcc gtcaaaaaca gtaggaaagc acggtggcta gagatgagtt tgaaataccg caaacgcttt agt tatcacc atgactcagg gtcatcgcat cttatgtttt acggagatca tcgctaactg aacaaggcaa atggtaaagt aacttgattt attaccgtta gtctgccgat atattgatca tcasgtatgt aagagtcagg actggcaaat caacaccaga ggaaagatgg aatctgatct ctggtgatgc aaaaccaaca gtttaccaga aaaaaqctaa ataaaaatgg agcaaaaaga cattgatgat taaaaaggat aggtcgaggt cccaattcct tcatccagcg taaaggaaaa tcatgtggaa tgggtatgtg tcttgaaatg ttcagagcac caaagcttac tagtaaagaa tttccactat ggtgaaagca agaaaaacca gggctatatg gactcagatt tgacattgtt gcatgctggt tatccatgtc gatgcaacac ttcggtcatt tatccattet cggctatatt ctcctttagc atcccaagct tactgatacg gccaagtgaa ctatggtcta tatcgatcct tgaattggta caaggacgct ttaggagatg ttgtctccaa gctagaccgt gatgtgacgc cctcctaggc acctttaagg gaagatgggt gtgcctcatg gaattagcag tcaaaaccat ggaaaaggct tccattcatt ataggatttg aaaggtcaag ctctttgaca atgccaaaag gcctttgccg gacacaggta aatgctactt gttccgtatt cccgaagttc ccaaatgtta gctgaagaag ttcgatccac atcccaagag gagtggcaac gataaaccca gccagtaaag gatagageaa aagtatctca acttatgata atactacaga cttatttagt gtgagctagc ctgattaccg ctaaccctgg caaatgatgc aacttttaga tgatttttga gagateatta atcgatactt cagataaaga tagatggtaa cagtggataa gagaacttga ctgatgagct ctaaaaaagt atggtaagga aacaagaact ttgagccacg acgatactgg catggttgac gtccggatgt cgcctcttga ttcaaaaagc gagatgtttt cagatggcag aagctcaaga aagaaaagca aagaaaaaga ccctagaaga ttttccaacc tcaagacact cgatggctat acctcatggt tgctgcacaa cccgacacca acaaggtcat gtcacaaaac tcaactacac accgactcaa teatattate agctggccaa agtgacacat accatatgat atcaggagtt acaatatgag tgctgctgct gagtcgcaaa etatttetat aatgcttaaa acttgctgta aagttcgttt gcgcgatcag atggtctaag taaacgtgct cctagcagaa ggccaaagaa tteattgaga gttattggca acaggcagat ateagatgac tcatatcaat agaaggtgtc tcaacaaata

600

660

720

780

840

900

960

1020

1080

1140

1200

1260

1320

1380

1440

1500

1560

1620

1680

1740

1800

1860

1920

1980

2040

2100

2160

2220

2280

2340

2400

2460

2469 <210 <211>

<212>

<213> <400>

Sl

823 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 81

Val

Lys

Lys

Thr

Tyr

Gly

Tyr

I le

Gly

Ser

Val

Ala

Ala

Ile

Leu

Leu

1

5

10

15

Ala

Thr

His

Ile

Gly

Ser

Tyr

Gin

Leu

Gly

Lys

His

His

Met

Gly

Leu

20

25

30

Ala

Thr

Lys

Asp

Asn

Gin

ile

Ala

Tyr

Ile

Asp

Asp

Ser

Lys

Gly

Lys

35

40

45

Ala

Lys

Ala

Pro

Lys

Thr

Asn

Lys

Thr

Met

Asp

Gin

Ile

Ser

Ala

Glu

5 0

55

60

Glu

Gly

Ile

Ser

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Val

Lys

lle

Thr

Asp

Gin

Gly

65

70

7 5

80

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

85

90

95

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Thr

Asp

Pro

Asn

100

105

110

Tyr

Arg

Phe

Lys

Gin

Ser

Asp

Val

Ile

Asn

Glu

Ile

Leu

Asp

Gly

Tyr

115

120

125

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

Asn

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Pro

Gly

Ser

13C

135

140

Tys

Arg

Lys

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Gin

Gin

Ile

Ala

Glu

Gin

Val

Ala

- 106CZ 303675 B6

145

150

155

160

Lys

Gly

Thr

Lys

Glu

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Ala

Gln

Val

Ala

His

165

170

17 5

Leu

Ser

Lys

G1 u

Glu

Val

Ala

Ala

Val

Asn

Glu

Ala

Lys

Arg

Gln

G1 y

180

185

190

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Sor

Pro

Thr

Asp

Ile

Ile

195

200

205

Asp

Asp

Leu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Leu

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

210

215

220

Tyr

Ile

Pro

Lys

Lys

Asp

Leu

Ser

Pro

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gln

225

230

235

240

Ala

Tyr

Trp

Ser

Gln

Lys

Gln

Gly

Arg

Gly

Ala

Arg

Pro

Ser

Asp

Tyr

245

250

255

Arg

Pro

Thr

Pro

Ala

Pro

Gly

Arg

Arg

Lys

Ala

Pro

Ile

Pro

Asp

Val

260

265

270

Thr

Pro

Asn

Pro

Gly

Gln

Gly

His

Gln

Pro

Asp

Asn

Gly

Gly

Tyr

His

275

280

285

Pro

Ala

Pro

Pro

Arg

Pro

Asn

Asp

Ala

Ser

Gln

Asn

Lys

His

Gln

Arg

290

295

300

Asp

Glu

Phe

Lys

Gly

Lys

Thr

Phe

Lys

Glu

Leu

Leu

Asp

Gln

Leu

His

305

310

315

320

Arg

Leu

Asp

Leu

Lys

Tyr

Arg

His

Val

Glu

Glu

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

325

330

335

Glu

Pro

Thr

Gin

Val

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

Phe

Giy

Tyr

Val

Val

Pro

340

345

350

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Ile

Ile

Pro

Arg

Ser

Gln

Leu

Ser

Pro

Leu

355

360

365

Glu

Met

Glu

Leu

Ala

Asp

Arg

Tyr

Leu

Ala

Gly

Gln

Thr

Glu

Asp

Asn

370

375

380

Asp

Ser

Gly

Ser

Glu

His

Ser

Lys

Pro

Ser

Asp

Lys

Glu

Val

Thr

His

385

390

395

400

Thr

Phe

Leu

Gly

His

Arg

Ile

Lys

Ala

Tyr

Gly

Lys

Gly

Leu

Asp

Gly

405

410

415

Lys

Pro

Tyr

Asp

Thr

Ser

Asp

Ala

Tyr

Val

Phe

Ser

Lys

Glu

Ser

Ile

420

425

430

His

Ser

Val

Asp

Lys

Ser

Gly

Val

Thr

Ala

Lys

His

Giy

Asp

His

Phe

4 35

440

445

His

Tyr

Ile

Gly

Phe

Gly

Glu

Leu

Glu

Gln

Tyr

Glu

Leu

Asp

Glu

Val

450

455

460

Ala

Asn

Trp

Val

Lys

Al a

Lys

Gly

Gln

Ala

Asp

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

465

470

475

480

Leu

Asp

Gln

Glu

Gln

Gly

Lys

Glu

Lys

Pro

Leu

Phe

Asp

Thr

Lys

Lys

485

490

495

Val

Ser

Arg

Lys

Val

Thr

Lys

Asp

Giy

Lys

Val

Gly

Tyr

Met

Met

Pro

500

505

510

Lys

Asp

Gly

Lys

Asp

Tyr

Phe

Tyr

Ala

Arg

Asp

Gln

Leu

Asp

Leu

Thr

515

520

525

Gln

Ile

Ala

Phe

Ala

Glu

Gln

Glu

Leu

Met

Leu

Lys

Asp

Lys

Lys

His

530

535

540

Tyr

Arg

Tyr

Asp

Ile

Val

Asp

Thr

Gly

Ile

Glu

Pro

Arg

Leu

Ala

Val

545

550

555

560

Asp

Va 1

Ser

Ser

Leu

Pro

Met

His

Ala

Gly

Asn

Ala

Thr

Tyr

Asp

Thr

565

570

575

Gly

Ser

Ser

Phe

Val

Ile

Pro

His

Ile

Asp

His

Ile

His

Val

Val

Pro

580

585

590

Tyr

Ser

Trp

Leu

Thr

Arg

Asp

Gln

Ile

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Val

Met

595

600

605

Gln

His

Pro

Glu

Val

Arg

Pro

Asp

Val

Trp

Ser

Lys

Pro

Gly

His

Glu

610

615

620

Glu

Ser

Gly

Ser

Val

Ile

Pro

Asn

Val

Thr

Pro

Leu

Asp

Lys

Arg

Ala

625

630

635

640

Gl y

Met

Pro

Asn

Trp

Gin

Ile

Ile

His

Ser

Ala

Glu

Glu

Val

Gin

Lys

645

650

655

Ala

Leu

Ala

Glu

Gly

Arg

Phe

Ala

Thr

Pro

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

660

665

670

Pro

Arg

Asp

Val

Leu

Ala

Lys

Glu

Thr

Phe

Val

Trp

Lys

Asp

Gly

Ser

675

680

685

Phe

Ser

Ile

Pro

Arg

Ala

Asp

Gly

Ser

Ser

Leu

Arg

Thr

Ile

Asn

Lys

690

695

700

Ser

Asp

Leu

Ser

Gin

Ala

Glu

Trp

Gin

Gin

Ala

Gin

Glu

Leu

Leu

Ala

705

710

715

720

Lys

Lys

Asn

Thr

Gly

Asp

Ala

Thr

Asp

Thr

Asp

Lys

Pro

Lys

Glu

Lys

725

730

735

Gin

Gin

Ala

Asp

Lys

Ser

Asn

Glu

Asn

Gin

Gin

Pro

Ser

Glu

Ala

Ser

740

745

750

Lys

Glu

Glu

Lys

Glu

Ser

Asp

Asp

Phe

Ile

Asp

Ser

Leu

Pro

Asp

Tyr

755

760

765

Gly

Leu

Asp

Arg

Ala

Thr

Leu

Glu

Asp

His

Ile

Asn

Gin

Leu

Ala

Gin

770

775

780

Lys

Ala

Asn

Ile

Asp

Pro

Lys

Tyr

Leu

Ile

Phe

Gin

Pro

Glu

Gly

Val

785

7 90

795

800

Gin

Phe

Tyr

Asn

Lys

Asn

Gly

Glu

Leu

Val

Thr

Tyr

Asp

Ile

Lys

Thr

805

810

815

Leu

Gin

Gin

Ile

Asn

Pro

Pro

820

<210>	82
<211>	2472 párů bází
<212>	DNA
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	82

gtgaagaaaa catatggtta tatcggctca gttgctgcca ttttactagc tactcatatt 60 ggaagttacc aacttggtaa gcatcatatg ggtctagcaa caaaggacaa tcagattgcc 120 tatattgatg atagcaaagg taaggcaaaa gcccctaaaa caaacaaaac gatggatcaa 180 atcagtgctg aagaaggcat ctctgctgaa cagatcgtag tcaaaattac tgaccaaggt 240 tatqtgacct cacacggtga ccattatcat ttttacaatg ggaaagttcc ttatgatgcg 300 attattagtg aagagttgtt gatgacggat cctaattacc attttaaaca atcagacgtt 360 atcaatgaaa tcttagacgg ttacgttatt aaagtcaatg gcaactatta tgtttacctc 420 aagccaggta gtaagcgcaa aaacattega accaaacaac aaattgctga gcaagtagcc 480 aaaggaacta aagaagctaa agaaaaaggt ttagctcaag tggcccatct cagtaaagaa 540 gaagttgcgg cagtcaatga agcaaaaaga caaggacgct atactacaga cgatggctat 600 atttttagtc cgacagatat cattgatgat ttaggagacg cttatttagt acctcatggt 660 aatcactatc attatattcc taaaaaagat ttgtctccaa gtgagctagc tgctgcacaa 720 gcttactgga gtcaaaaaca aggtcgaggt gctagaccgt ctgattaccg cccgacacca 780 gccccaggtc gtaggaaagc tccaattcct gatgtgacgc ctaaccctgg acaaggtcat 840 cagccagata acggtggcta tcatccagcg cctcctaggc caaatgatgc gtcacaaaac 900 aaacaccaaa gagatgagtt taaaggaaaa acctttaagg aacttttaga tcaactacac 960 cgtcttgatt tqaaataccg tcatgtggaa gaagatgggt tgatttttga accgactcaa 1020 gtqatcaaat. aaaacgcttt. tgggtatgtg gtgcctcatg gagateatta teatattate 108 0 ccaagaagtc agttatcacc tcttgaaatg gaattagcag atcgatactt agccggtcaa 1140 actgaggaca atgattcagg ttcagatcac tcaaaaccat cagataaaga agtgacacat 1200 acctttcrtg gtcatcgcat caaagcttac ggaaaaggct tagatggtaa accatatgat 1260 acgagtgatg cttatgtttt tagtaaagaa tccattcatt cagtggataa atcaggagtt 1320 acagctaaac aogqagatca tttccactat ataggatttg gagaacttga acaatatgag 1380 ttggatgagg tcgctaacLg ggtgaaagca aaaggtcaag ctgatgagct tgctgctgct 1440 Ltggatcagg aacaaggcaa agaaaaacca ctctttgaca ctaaaaaagt gagtcgcaaa 1500

- 108 C.7 303675 Bó gtaacaaaag atggtaaagt gggctatatt atgccaaaag atggcaagga ctaLttctat 1560 gctcgtgatc aacttgattt gactcagatt qcctttgccg aacaagaact. aaígclt.aaa 1620 gataagaacc attaccgtta tqacattgtt gacacaggta ttgagccacg acttgctgt.a 1680 gatqtqtcaa gtctgccgat gcatgctggt aatgctactt acqatactqg aagttcgttt 1740 gttatccctc atat l.gatca tatccatgtc gttccgtatt catggttgac gcgcgatcag 1800 attgcaacaa tcaagtatgt gatgcaacac cccgaagttc gtccagatgt atggtctaag 1860 ccagggcatg aagagtcagg ttcggtcatt ccaaatgtta cgcctcttga taaacgtgct 1920 qgtatgccaa attggcaaat catccattct gctgaagaag ttcaaaaagc cctagcagaa 1980 ggtcgttttg caacaccaga cggctatatt ttcgatccac gagatgtttt ggccaaagaa 2040 acttttytat ggaaagatgg ctcctttagc atcccaagag cagatggcag ttcattgaga 2100 accattaata aatctgatcl at.cccaagct gagtggcaac aagctcaaga gttatlggca 2160 aagaaaaacg ctggtgatgc tactgatacg gataaaccca aagaaaagca acaggcagat 2220 aagagcaatg aaaaccaaca gccaagtgaa gccagtaaag aagaagaaaa agaatcagat 2280 gactttatag acagtttacc agactatggt ctagatagag caaccctaga agatcatatc 2340 aatcaattag cacaaaaagc taatatcgat cctaagt.at c tcalt tLcca accagaaggt 2400 gtccaattt.t. ataataaaaa tggtgaaLta gtaacttatg atatcaagac gcLtcaacaa 2460 ataaacccttaa 2472 <210> 83 <211> 824 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 83

Val 1

Lys

Lys

Thr

Tyr 5

Gly Tyr

Ile Gly

Ser 10

Val

Ala

Ala

Ile

Leu 15

Leu

Ala

Thr

His

Ile

Gly

Ser

Tyr

Gin

Leu

Gly

Lys

His

His

Met

Gly

Leu

20

25

30

Ala

Thr

Lys

Asp

Asn

Gin

Ile

Ala

Tyr

Ile

Asp

Asp

Ser

Lys

Gly

Lys

35

40

45

Ala

Lys

Ala

Pro

Lys

Thr

Asn

Lys

Thr

Met

Asp

Gin

Ile

Ser

Ala

Glu

50

55

60

Glu

Gly

Ile

Ser

Ala

Glu

Gin

Ile

Val

Val

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

65

70

7 5

80

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

85

90

95

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Thr

Asp

Pro

Asn

100

105

110

Tyr

His

Phe

Lys

Gin

Ser

Asp

Val

Ile

Asn

Glu

Ile

Leu

Asp

Gly

Tyr

115

120

125

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

Asn

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Pro

Gly

Ser

130

135

140

Lys

Arg

Lys

Asn

Ile

Arg

Thr

Lys

Gin

Gin

Ile

Ala

Glu

Gin

Val

Ala

145

150

155

160

Lys

Gly

Thr

Lys

Glu

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Ala

Gin

Val

Ala

His

165

170

175

Leu

Ser

Lys

Glu

Glu

Val

Ala

Ala

Val

Asn

Glu

Ala

Lys

Arg

Gin

Gly

180

185

190

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Ser

Pro

Thr

Asp

Ile

Ile

195

200

205

Asp

Asp

Leu

Gly

Asp

Al a

Tyr

Leu

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

210

215

220

Tyr

Ile

Pro

Lys

Lys

Asp

Leu

Ser

Pro

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gin

225

230

235

240

Ala

Tyr

Trp

Ser

Gin

Lys

Gin

Gly

Arg

Gly

Ala

Arg

Pro

Ser

Asp

Tyr

245

250

255

Arg

Prc

Thr

Pro

Ala

Pro

Gly

Arg

Arg

Lys

Ala

Pro

Ile

Pro

Asp

Val

260

2 65

270

Tor

Prc

Asn

Pro

Gl y

Gin

Gly

His

Gin

Pro

Asp

Asn

Cly

Gly

Tyr

His

TO

2 75

280

285

Pro

Ala

Pro

Pro

Arg

Pro

Asn

Asp

Ala

Ser

Gin

Asn

Lys

His

Gin

Arg

290

295

300

Asp

Glu

Phe

1 .ys

Gly

Lys

Thr

Phe

Lys

Glu

Leu

Leu

Asp

Gin

Leu

His

305

310

315

320

Arg

Leu

Asp

Leu

Lys

Tyr

Arg

His

Val

Glu

Glu

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

325

330

335

Glu

Pro

Thr

Gin

Val

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

Phe

Gly

Tyr

Val

Val

Pro

340

345

350

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Ile

Ile

Pro

Arg

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

355

360

365

Glu

Met

Glu

Leu

Ala

Asp

Arg

Tyr

Leu

Ala

Gly

Gin

Thr

Glu

Asp

Asn

370

375

380

Asp

Ser

Gly

Ser

Asp

His

Ser

Lys

Pro

Ser

Asp

Lys

Glu

Val

Thr

His

385

390

395

400

Thr

Phe

Leu

Gly

His

Arg

Ile

Lys

Ala

Tyr

Gly

Lys

Gly

Leu

Asp

Gly

4 05

410

415

Tys

Pro

Tyr

Asp

Thr

Ser

Asp

Ala

Tyr

Val

Phe

Ser

Lys

Glu

Ser

Ile

420

425

430

His

Ser

Val

Asp

Lys

Ser

Gly

Val

Thr

Ala

Lys

His

Gly

Asp

His

Phe

435

440

445

His

Tyr

Ile

Gly

Phe

Gly

Glu

Leu

Glu

Gin

Tyr

Glu

Leu

Asp

Glu

Val

450

455

460

Ala

Asn

Trp

Val

Lys

Ala

Lys

Gly

Gin

Ala

Asp

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

465

470

475

480

Leu

Asp

Gin

Glu

Gin

Gly

Lys

Glu

Lys

Pro

Leu

Phe

Asp

Thr

Lys

Lys

485

490

495

Val

Ser

Arg

Lys

Val

Thr

Lys

Asp

Gly

Lys

Val

Gly

Tyr

Ile

Met

Pro

500

505

510

Lys

Asp

Gly

Lys

Asp

Tyr

Phe

Tyr

Ala

Arg

Asp

Gin

Leu

Asp

Leu

Thr

515

520

525

Gin

Ile

Ala

Phe

Ala

Glu

Gin

Glu

Leu

Met

Leu

Lys

Asp

Lys

Asn

His

530

535

540

Tyr

Arg

Tyr

Asp

Ile

Val

Asp

Thr

Gly

Ile

Glu

Pro

Arg

Leu

Ala

Val

545

550

555

560

Asp

Val

Ser

Ser

Leu

Pro

Met

His

Ala

Gly

Asn

Ala

Thr

Tyr

Asp

Thr

565

570

575

Gly

Ser

Ser

Phe

Val

Ile

Pro

His

Ile

Asp

His

Ile

His

Val

Val

Pro

580

585

590

Tyr

Ser

Trp

Leu

Thr

Arg

Asp

Gin

Ile

Ala

Thr

Ile

Lys

Tyr

Val

Met

595

600

605

Gin

His

Pro

Glu

Val

Arg

Pro

Asp

Val

Trp

Ser

Lys

Pro

Gly

His

Glu

610

615

620

Glu

Ser

Gly

Ser

Val

Ile

Pro

Asn

Val

Thr

Pro

Leu

Asp

Lys

Arg

Ala

625

630

635

640

Gly

Met

Pro

Asn

Trp

Gin

Ile

Ile

His

Ser

Ala

Glu

Glu

Val

Gin

Lys

645

650

655

Ala

Leu

Ala

Glu

Gly

Arg

Phe

Ala

Thr

Pro

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

660

665

670

Pro

Arg

Asp

Val

Leu

Ala

Lys

Glu

Thr

Phe

Val

Trp

Lys

Asp

Gly

Ser

675

680

685

Phe

Ser

Ile

Pro

Arg

Ala

Asp

Gly

Ser

Ser

Leu

Arg

Thr

Ile

Asn

Lys

690

695

700

Ser

Asp

Leu

Ser

Gin

Ala

Glu

Trp

Gin

Gin

Ala

Gin

Glu

Leu

Leu

Ala

7 05

710

715

720

Lys

Lys

Asn

Al a

Gly

Asp

Ala

Thr

Asp

Thr

Asp

Lys

Pro

Lys

Glu

Lys

725

730

735

CG n

Gl n

Ala

Asp

Lys

Ser

Asn

Glu

Asn

Gin

Gin

Pro

Ser

Glu

AJ a

Ser

-110CZ 303675 B6

740

745

750

I,ys

Glu

Glu

Glu

Lys

Glu

Ser

Asp

Asp

Phe

Ile

Asp

Ser

Leu

Pro

Asp

755

760

765

Tyr

Gly

Leu

Asp

Arg

Ala

Thr

Leu

Glu

Asp

His

Ile

Asn

Gin

Leu

Ala

770

775

780

Gin

Lys

Ala

Asn

Ile

Asp

Pro

Lys

Tyr

Leu

Ile

Phe

Gin

Pro

Glu

Gly

785

790

795

800

Val

Gin

Phe

Tyr

Asn

Lys

Asn

Gly

Glu

Leu

Val

Thr

Tyr

Asp

Ile

Lys

805

810

815

Thr

Leu

Gin

Gin

Ile

Asn

Pro

Pro

820

<210> 84 <211 > 1019 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 84

Cys 1

Ala

Tyr

Ala

Leu Asn Gin His 5

Arg

Ser 10

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Arg

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Al a

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

2 65

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

.Ile

Pro

275

280

285

His

Giy

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

i— - -CZ 303675 B6

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

4 30

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val.

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

G.ln

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Giy

Asn

Lys

I le

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

7 80

Glu

Lvs

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

- 112CZ 303675 B6

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Phe

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

8 30

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Tle

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Leu

Ile

Ala

1010

1015

<210> 85 <211> 1019 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 85

Cys Ala 1

Tyr

A] a

Leu 5

Asn Gin

His

Arg

Ser Gin Glu Asn Lys Asp

Asn

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

7 5

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Tle

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gl y

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ue

Ue

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ue

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ue

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ue

Ala

Arg

Arg

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ue

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ue

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ue

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ue

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ue

Asn

Pro

Gly

Ile

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ue

Ue

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Ue

Met

Ser

His

Gly

Asn

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ue

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

4 60

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gl n

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ue

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ue

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ue

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ue

Ue

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gl y

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ue

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ue

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ue

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ue

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gl y

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ue

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

-114CZ 303675 B6

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Tle

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Sor

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

lle

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

G ly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

lle

Lys

Leu

Pro

lle

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

lle

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

7 55

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Tle

Val

Glu

Val

Pro

lle

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

lle

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Sor

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Tle

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

8 75

880

Ser

Gly

Glu

Val

lle

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Cly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

97 0

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Tle

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Tle

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gl y

Glu

995

1000

1005

Val

lle

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Leu

lle

Ala

1010

1015

<210> 86 <211> 1019 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumomcte <400> 86

Cys 1

Ala

Tyr

Ala

Leu 5

Asn Gin

His

Arg

Ser 10

Gin Glu

Asn

Lys Asp Asn 15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

lle

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Al a

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val·

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Al a

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

4 35

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

4 60

Leu

Glu

Glu

Vči±

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

4 75

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Clu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

-116CZ 303675 B6

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Tle

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

7 90

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Leu

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

625

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Al a

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Gl u

444

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Leu

Ile

Ala

1010 1015

<210=

► 87

<211> 1019 aminokyselin

<212> protein

<213> m

likroorganizmus S.pneumoniae

<400> 87

Cys

Ala

Tyr

Ala

Leu

Asn

Gln

His

Arg

Ser

Gln

Glu

Asn

Lys

Asp

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gln

Ser

Ser

Gln

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gln

Val

Ser

Gln

Lys

Glu

Gly

Ile

Gln

Ala

Glu

35

40

45

Gln

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gln

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gln

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gln

Lys

Gln

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gln

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Giy

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gln

Pro

Ser

Gln

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gln

Ser

Val

Ala

Lys

G1 y

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gln

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gln

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

Hi s

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Al a

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

-118C7. 303675 B6

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Giy

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Giu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

TJ e

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

4 50

455

460

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Gly

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

4 90

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Tle

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Al a

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Va 1

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val·

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Tle

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

7 65

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

77 5

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

7 95

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Leu

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

94 5

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Phe

Ile

Ala

1010

1015

<210> 88 <211> 1019 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 88

Cys 1

Ala

Tyr

Ala

Leu Asn Gin 5

His

Arg

Ser 10

Gin

Glu

Asn

Lys

Asp 15

Asn

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Val

Asp

Gly

Ser

Gin

Ser

Ser

Gin

Lys

Ser

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Gin

Val

Ser

Gin

Lys

Glu

Gly

Ile

Gin

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Leu

Phe

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

As n

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Arg

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Se ι-

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

Ι 95

200

205

Leu

Ala

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

- 120C7 303675 R6

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

245

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Tle

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Tle

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Tle

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

Leu

Ala

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

1 le

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val·

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

4 35

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

4 60

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

4 65

470

4 75

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

490

495

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

50 0

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

Ile

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

530

535

540

Val

Gly

Ile

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

T.eu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

4-24

67 5

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

765

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

780

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Phe

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

I le

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

995

1000

1005

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Leu

Ser

Asp

Leu

Ile

Ala

1010

1015

<210> 89 <211> 1019 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 89

Cys Ala Tyr Ala Leu Asn Gin His Arg Ser Gin Glu Asn Lys Asp Asn 15 10 15

Asn Arg Val Ser Tyr Val Asp Gly Ser Gin Ser Ser Gin Lys Ser Glu 20 25 30

Asn Leu Thr Pro Asp Gin Val Ser Gin Lys Glu Gly Ile Gin Ala Glu 35 40 45

Gin Ile Val Ile Lys Ile Thr Asp Gin Gly Tyr Val Thr Ser His Gly 50 55 60

Asp His Tyr His Tyr Tyr Asn Gly Lys Val Pro Tyr Asp Ala Leu Phe

- 122

C7 303675 R6

65

70

75

8 0

Ser

Glu

G 1 u

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ala

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Val

Lys

Gly

Gly

Tyr

Ile

Ile

Lys

Val

Asp

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Asp

Glu

Ile

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Val

Lys

Asp

Asn

130

135

140

Glu

Lys

Val

Asn

Ser

Asn

Val

Ala

Val

Ala

Arg

Ser

Gin

Gly

Arg

Tyr

145

150

155

160

Thr

Thr

Asn

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Asn

Pro

Ala

Asp

Ile

Ile

Glu

Asp

165

170

175

Thr

Gly

Asn

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Arg

Gly

His

Tyr

His

Tyr

Ile

180

185

190

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Lys

Ala

His

195

200

205

Leu

Al a

Gly

Lys

Asn

Met

Gin

Pro

Ser

Gin

Leu

Ser

Tyr

Ser

Ser

Thr

210

215

220

Ala

Ser

Asp

Asn

Asn

Thr

Gin

Ser

Val

Ala

Lys

Gly

Ser

Thr

Ser

Lys

225

230

235

240

Pro

Ala

Asn

Lys

Ser

Glu

Asn

Leu

Gin

Ser

Leu

Leu

Lys

Glu

Leu

Tyr

24 5

250

255

Asp

Ser

Pro

Ser

Ala

Gin

Arg

Tyr

Ser

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Val

Phe

260

265

270

Asp

Pro

Ala

Lys

Ile

Ile

Ser

Arg

Thr

Pro

Asn

Gly

Val

Ala

Ile

Pro

275

280

285

His

Gl y

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Ser

Lys

Leu

Ser

Ala

Leu

290

295

300

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Arg

Met

Val

Pro

Ile

Ser

Gly

Thr

Gly

Ser

Thr

305

310

315

320

Val

Ser

Thr

Asn

Ala

Lys

Pro

Asn

Glu

Val

Val

Ser

Ser

Leu

Gly

Ser

325

330

335

Leu

Ser

Ser

Asn

Pro

Ser

Ser

Leu

Thr

Thr

Ser

Lys

Glu

Leu

Ser

Ser

340

345

350

Ala

Ser

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Pro

Lys

Asp

Ile

Val

Glu

Glu

Thr

355

360

365

Ala

Thr

Ala

Tyr

Ile

Val

Arg

His

Gly

Asp

His

Phe

His

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Lys

Ser

Asn

Gin

Ile

Gly

Gin

Pro

Thr

Leu

Pro

Asn

Asn

Ser

T.eu

Al a

385

390

395

400

Thr

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Pro

Ile

Asn

Pro

Gly

Thr

Ser

His

Glu

Lys

405

410

415

His

Glu

Glu

Asp

Gly

Tyr

Gly

Phe

Asp

Ala

Asn

Arg

Ile

Ile

Ala

Glu

420

425

430

Asp

Glu

Ser

Gly

Phe

Val

Met

Ser

His

Gly

Asp

His

Asn

His

Tyr

Phe

435

440

445

Phe

Lys

Lys

Asp

Leu

Thr

Glu

Glu

Gin

Ile

Lys

Ala

Ala

Gin

Lys

His

450

455

4 60

Leu

Glu

Glu

Val

Lys

Thr

Ser

His

Asn

Gly

Leu

Asp

Ser

Leu

Ser

Ser

465

470

475

480

His

Glu

Gin

Asp

Tyr

Pro

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Met

Lys

Asp

Leu

Asp

485

4 90

4 9 5

Lys

Lys

Ile

Glu

Glu

Lys

Ile

Ala

Gly

Ile

Met

Lys

Gin

Tyr

Gly

Val

500

505

510

Lys

Arg

Glu

Ser

Ile

Val·

Val

Asn

Lys

Glu

Lys

Asn

Ala

1 le

Ile

Tyr

515

520

525

Pro

His

Gly

Asp

His

His

His

Ala

Asp

Pro

Ile

Asp

Glu

His

Lys

Pro

Í3?

530

535

540

Val

Gly

I le

Gly

His

Ser

His

Ser

Asn

Tyr

Glu

Leu

Phe

Lys

Pro

Glu

545

550

555

560

Glu

Gly

Val

Ala

Lys

Lys

Glu

Gly

Asn

Lys

Val

Tyr

Thr

Gly

Glu

Glu

565

570

575

Leu

Thr

Asn

Val

Val

Asn

Leu

Leu

Lys

Asn

Ser

Thr

Phe

Asn

Asn

Gin

580

585

590

Asn

Phe

Thr

Leu

Ala

Asn

Gly

Gin

Lys

Arg

Val

Ser

Phe

Ser

Phe

Pro

595

600

605

Pro

Glu

Leu

Glu

Lys

Lys

Leu

Gly

Ile

Asn

Met

Leu

Val

Lys

Leu

Ile

610

615

620

Thr

Pro

Asp

Gly

Lys

Val

Leu

Glu

Lys

Val

Ser

Gly

Lys

Val

Phe

Gly

625

630

635

640

Glu

Gly

Val

Gly

Asn

Ile

Ala

Asn

Phe

Glu

Leu

Asp

Gin

Pro

Tyr

Leu

645

650

655

Pro

Gly

Gin

Thr

Phe

Lys

Tyr

Thr

Ile

Ala

Ser

Lys

Asp

Tyr

Pro

Glu

660

665

670

Val

Ser

Tyr

Asp

Gly

Thr

Phe

Thr

Val

Pro

Thr

Ser

Leu

Ala

Tyr

Lys

675

680

685

Met

Ala

Ser

Gin

Thr

Ile

Phe

Tyr

Pro

Phe

His

Ala

Gly

Asp

Thr

Tyr

690

695

700

Leu

Arg

Val

Asn

Pro

Gin

Phe

Ala

Val

Pro

Lys

Gly

Thr

Asp

Ala

Leu

705

710

715

720

Val

Arg

Val

Phe

Asp

Glu

Phe

His

Gly

Asn

Ala

Tyr

Leu

Glu

Asn

Asn

725

730

735

Tyr

Lys

Val

Gly

Glu

Ile

Lys

Leu

Pro

Ile

Pro

Lys

Leu

Asn

Gin

Gly

740

745

750

Thr

Thr

Arg

Thr

Ala

Gly

Asn

Lys

Ile

Pro

Val

Thr

Phe

Met

Ala

Asn

755

760

7 65

Ala

Tyr

Leu

Asp

Asn

Gin

Ser

Thr

Tyr

Ile

Val

Glu

Val

Pro

Ile

Leu

770

775

7 80

Glu

Lys

Glu

Asn

Gin

Thr

Asp

Lys

Pro

Ser

Ile

Leu

Pro

Gin

Phe

Lys

785

790

795

800

Arg

Asn

Lys

Ala

Gin

Glu

Asn

Ser

Lys

Phe

Asp

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

805

810

815

Pro

Lys

Thr

Ser

Glu

Lys

Val

Glu

Lys

Glu

Lys

Leu

Ser

Glu

Thr

Gly

820

825

830

Asn

Ser

Thr

Ser

Asn

Ser

Thr

Leu

Glu

Glu

Val

Pro

Thr

Val

Asp

Pro

835

840

845

Val

Gin

Glu

Lys

Val

Ala

Lys

Phe

Ala

Glu

Ser

Tyr

Gly

Met

Lys

Leu

850

855

860

Glu

Asn

Val

Leu

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

Ile

Glu

Leu

Tyr

Leu

Pro

865

870

875

880

Ser

Gly

Glu

Val

Ile

Lys

Lys

Asn

Met

Ala

Asp

Phe

Thr

Gly

Glu

Ala

885

890

895

Pro

Gin

Gly

Asn

Gly

Glu

Asn

Lys

Pro

Ser

Glu

Asn

Gly

Lys

Val

Ser

900

905

910

Thr

Gly

Thr

Val

Glu

Asn

Gin

Pro

Thr

Glu

Asn

Lys

Pro

Ala

Asp

Ser

915

920

925

Leu

Pro

Glu

Ala

Pro

Asn

Glu

Lys

Pro

Val

Lys

Pro

Glu

Asn

Ser

Thr

930

935

940

Asp

Asn

Gly

Met

Leu

Asn

Pro

Glu

Gly

Asn

Val

Gly

Ser

Asp

Pro

Met

945

950

955

960

Leu

Asp

Pro

Ala

Leu

Glu

Glu

Ala

Pro

Ala

Val

Asp

Pro

Val

Gin

Glu

965

970

975

Lys

Leu

Glu

Lys

Phe

Thr

Ala

Ser

Tyr

Gly

Leu

Gly

Leu

Asp

Ser

Val

980

985

990

Ile

Phe

Asn

Met

Asp

Gly

Thr

I le

Glu

Leu

Arg

Leu

Pro

Ser

Gly

Glu

- 124C7 303675 R6

995 1000

Val Ile Lys Lys Asn Leu Ser Asp Leu Ue Ala

1010 1015

1005 <210> 90 <211 > 819 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 90

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Val

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ue

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ue

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ue

Val

Ue

Lys

Ue

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ue

65

70

75

80

Ue

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ue

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ue

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ue

1 15

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ue

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly

145

150

155

160

Arq

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ue

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ue

Ue

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ue

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

180

185

190

Tyr

Ue

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Glu

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Val

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ue

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ue

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ue

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ue

Pro

Tyr

290

295

300

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ue

Ala

Arg

Ue

Ue

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Leu

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ue

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

370

375

380

Val

Ser

Arg

Tyr

Ue

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

lle

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

lle

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Val

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

lle

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

lle

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

lle

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

lle

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

lle

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

lle

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

lle

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

lle

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

lle

lle

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

lle

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Giy

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

67 5

680

685

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

690

695

700

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

705

710

715

720

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

725

730

735

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

lle

Pro

Gin

Val

Glu

Asn

740

745

750

Ser

Val

lle

Asn

Ala

Lys

lle

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

755

760

765

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

lle

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

77 0

775

780

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

lle

Ser

785

790

795

800

/Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

Ala

805

810

815

Pro

lle

Gin

- 126C7 303675 R6 <210> 91 <211> 820 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumomae <400> 91

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Val

Lys

Lys

Glu

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

17 5

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Glu

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Le u

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

340

345

350

Pro

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

355

360

365

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

370

375

380

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

385

390

395

400

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

405

410

415

Leu

Gly Ala Lys 420

Lys

Thr Asp Leu Pro Ser Ser Asp 425

Arg

Glu 430

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

ne

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

435

440

445

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

450

455

460

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Pro

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

465

470

475

480

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

485

4 90

4 95

Asn

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

500

505

510

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

515

520

525

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

530

535

540

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

545

550

555

560

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

565

570

575

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

580

585

590

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

595

600

605

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

610

615

620

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

625

630

635

640

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

645

650

655

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

660

665

670

Gl y

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

I.ys

Asn

Lys

Val

Asp

Gin

675

680

685

Asp

Ser

Lys

Pro

Asp

Glu

Asp

Lys

Glu

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

690

695

700

Thr

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

705

710

715

720

Ser

Ala

Asp

Asn

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

725

730

735

Glu

Glu

Ala

Glu

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

740

745

750

Asn

Ser

Val

Ile

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

755

760

765

Lys

Val

Thr

Asp

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

770

775

780

Gly

Leu

Lys

Ser

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

785

790

795

800

Ser

Ala

Glu

Val

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Gin

Pro

805

810

815

Ala

Pro

Ile

Gin

820

x

<210>	92
<211>	816 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	92

- 128

C7. 303675 B6

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gln

Ala

Gly

Gln

Asp

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gln

Ala

Gly

Gln

Lys

A.1 a

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gln

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gln

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gln

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

GlU

Ile

Lys

Arg

Gln

Lys

Gln

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gln

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gln

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gln

Al a

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gln

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gln

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gln

Asn

Gln

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gln

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gln

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

I le

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gln

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gln

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gln

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gln

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Giy

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gln

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

4 25

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gln

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gln

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Clu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

WCZ 303675 B6

Val 465

Ser

Ser

Asp

Lys

Val 470

Lys

Leu

Val

Glu

Asp 475

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu 480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

490

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Tle

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Arg

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Ile

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Giy

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Lys

Ser

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

805 810 815 <210> <211>

<212>

<213> <400>

816 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 93

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Giy

Gin

Asp

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Giy

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Giu

Gin

Ile

Val

TI e

Lys

Ile

Thr

Asp

Glu

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

5 5

60

- 130 C7 303675 R6

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Ί 00

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Arg

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

I 60

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Cly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Al a

Asn

Pro

Al a

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

T.eu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

4 90

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

I3e

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

+34

Glu

Gly 530

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr 535

Pro

His

Met

Thr

His 540

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gl y

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Ile

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Aia

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Lys

Ser

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

805

810

815

<210> <211>

<212>

<213> <400>

816 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 94

Cys 1

Ser

Tyr Glu

Leu 5

Gly

Arg

His Gin Ala 10

Gly Gin Asp Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val·

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

- 132 CZ 303675 B6

Arg

Thr 130

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys 135

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu 140

His

Ser

His

Asn

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

cly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

Arg

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Giy

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

Hi s

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Giy

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

Arg

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

4 25

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gl n

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

490

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gl y

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala Ala

Lys 5 95

Lys

Val

Pro

Leu

Asp Arg Met 600

Pro

Tyr

Asn 605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

dy

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Tle

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Tle

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Lys

Ser

Gin

Pro

Ala

Pro

Ile

Gin

805 810 815 <210> <211>

<212>

<213> <400>

834 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 95

Cys 1

Ser

Tyr Glu

Leu Gly 5

Arg

His

Gin

Ala 10

Gly

Gin

Val

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

Arg

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly

145

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

Hi s

180 185 190

- 134CZ 303675 B6

Tyr

Ile

Pro 195

Lys

Ser Asp Leu

Ser 200

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala 205

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Asn

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

Glu

Glu

Lys

Leu

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

370

375

380

Val

Pro

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

4 60

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys	Tyr	Tyr	Val 660	Glu	His	Pro	Asn
Phe	Gly	Asn 675	Ala	Ser	Asp	His	Val 680
Asp	Thr 690	Asn	Gin	Thr	Glu	Lys 695	Pro
Lys 705	Pro	Glu	Glu	Asp	Lys 710	Glu	His
Pro	Glu	Ser	Asp	Glu 725	Lys	Glu	Asn
Asp	Asn	Leu	Tyr 740	Lys	Pro	Ser	Thr
Ala	Glu	Asp 755	Thr	Thr	Asp	Glu	Ala 760
Val	Ile 770	Asn	Ala	Lys	Ile	Ala 775	Glu
Thr 785	Asp	Ser	Ser	Ile	Arg 790	Gin	Asn
Lys	Ser	Ser	Leu	Leu 805	Leu	Gly	Thr
Glu Ile	Val Gin	Asp	Ser 820	Leu	Leu	Ala	Leu

Glu	Arg	Pro	His	Ser	Asp	Asn	Gly
665					670
Gin	Arg	Asn	Lys	Asn 685	Gly	Gin	Ala
Asn	Glu	Glu	Lys 700	Pro	Gin	Thr	Glu
Asp	Glu	Val 715	Ser	Glu	Pro	Thr	His 720
His	Val 730	Gly	Leu	Asn	Pro	Ser 735	Ala
Asp 745	Thr	Glu	Glu	Thr	Glu 750	Glu	Glu
Glu	Ile	Pro	Gin	Val 765	Glu	Tyr	Ser
Ala	Glu	Ala	Leu 780	Leu	Glu	Lys	Val
Ala	Val	Glu 795	Thr	Leu	Thr	Gly	Leu 800
Lys	Asp 810	Asn	Asn	Thr	Ile	Ser 815	Ala
Leu 825	Lys	Glu	Ser	Gin	Pro 830	Ala	Pro

<210> 96 <211 > 811 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 96

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Asp

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

14 5

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210 215 220

- 136CZ 303675 B6

Ser 225

His

Asn

Ala

Asn

Pro 230

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu 2 35

Ser

Glu

Asn

His

Asn 240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

290

295

300

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Al a

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

4 90

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Tle

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp Glu 690

Asp

Lys

dy

His

Asp Glu Val 695

Ser

Glu Pro Thr 700

His

Pro

Glu

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

i

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Ile

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Ile

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

Ile

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

810

<210> 5 <211>

<212>

<213>

<400>

811 aminokyselin protein m i kroorgan izm u s X pneumoniae 97

Cys Ser Tyr Glu Leu Gly Arg His Gin Ala Gly Gin Asp Lys Lys Glu 15 10 15

Ser Asn Arg Val Ala Tyr Ile Asp Gly Asp Gin Ala Gly Gin Lys Ala 20 25 30

Glu Asn Leu Thr Pro Asp Glu Val Ser Lys Arg Glu Gly Ile Asn Ala 35 40 45

Glu Gin Ile Val Ile Lys Ile Thr Asp Gin Gly Tyr Val Thr Ser His

55 60

Gly Asp His Tyr His Tyr Tyr Asn Gly Lys Val Pro Tyr Asp Ala Ile

70 75 80

Ile Ser Glu Glu Leu Leu Met Lys Asp Pro Asn Tyr Gin Leu Lys Asp

90 95

Ser Asp Ile Val Asn Glu Ile Lys Gly Gly Tyr Val Ile Lys Val Asn

100 105 110

Gly Lys Tyr Tyr Gly Tyr Leu Lys Asp Ala Ala His Ala Asp Asn Ile

115 120 125

Arg Thr Lys Glu Glu Ile Lys Arg Gin Lys Gin Glu His Ser His Asn

130 135 140

His Gly Gly Gly Ser Asn Asp Gin Ala Val Val Ala Ala Arg Ala Gin

145 150 155 160

Gly Arg Tyr Thr Thr Asp Asp Gly Tyr Ile Phe Asn Ala Ser Asp Ile

165 170 175

Ile Glu Asp Thr Gly Asp Ala Tyr Ile Val Pro His Gly Asn His Phe

180 185 190

His Tyr Ile Pro Lys Ser Asp Leu Ser Ala Ser Glu Leu Ala Ala Ala

195 200 205

Gin Ala Tyr Trp Asn Gly Lys Gin Gly Ser Arg Pro Ser Ser Ser Ser

210 215 220

Ser His Asn Ala Asn Pro Ala Gin Pro Arg Leu Ser Glu Asn His Asn

225 230 235 240

Leu Thr Val Thr Pro Thr Tyr His Gin Asn Gin Gly Glu Asn Ile Ser

245 250 255

Ser Leu Leu Arg Glu Leu Tyr Ala Lys Pro Leu Ser Glu Arg His Val

260 265 270

Glu Ser Asp Gly Leu Ile Phe Asp Pro Ala Gin Ile Thr Ser Arg Thr

275 280 285

- 138C7 303675 R6

Ala

Arg 290

Gly Val

Ala

Val

Pro 295

His

Gly

Asn His

Tyr 300

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

355

360

365

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

460

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

Ile

485

4 90

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Xle

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

lle

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

Hi s

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

Ile

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

Ile

740

745

750

Asn	Ala	Lys 755	Ile	Ala	Asp	Ala	Glu 760
Pro	Ser 770	Ile	Arg	Gin	Asn	Ala 775	Met
Ser 785	Leu	Leu	Leu	Gly	Thr 790	Lys	Asp
Asp	Ser	Leu	Leu	Ala 805	Leu	Leu	Lys

Ala	Leu	Leu	Glu	Lys 765	Val	Thr	Asp
Glu	Thr	Leu	Thr	Gly	Leu	Lys	Ser
			780
Asn	Asn	Thr	Ile	Ser	Ala	Glu	Val
		7 95					800
Glu	Ser	Lys

810 <210> <211>

<212>

<213> <400>

811 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 98

Cys 1

Ser

Tyr

Glu

Leu 5

Gly

Arg

His

Gin

Ala 10

Gly

Gin

Asp

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ue

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ue

Val

Ue

Lys

Ue

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ue

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ue

Val

Asn

Glu

Ue

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ue

Lys

Val

Asn

100

105

110

GJ γ

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ue

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Gly

Gly

Gly

Ser

Asn

Asp

Gin

Ala

Val

Val

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

145

150

155

160

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

1 le

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

165

170

175

Ue

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ue

Val

PrG

His

Gly

Asn

His

Phe

180

185

190

His

Tyr

Ue

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

195

200

205

Gin

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Ser

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

225

230

235

240

Leu

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ue

Ser

245

250

255

Ser

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

260

265

270

Glu

Ser

Asp

Gly

Leu

1 le

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ue

Thr

Ser

Arg

Thr

275

280

285

Ala

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ue

Pro

290

295

300

Tyr

Clu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Al a

Arg

Ue

Ue

Pro

305

310

315

320

Leu

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

325

330

335

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

Gin

340

345

350

- 140C7 303675 R6

Pro

Ala

Pro 355

Ser

Asn

Pro

lle Asp 360

Glu Lys

Leu

Val

Lys 365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gl.y

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

370

375

380

Tyr

lle

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Al a

Gly

lle

Asp

385

390

395

400

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Thr

Lys

405

410

415

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

420

425

430

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Tle

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

435

440

445

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

450

455

4 60

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Glu

Asp

lle

Leu

Ala

Phe

Leu

465

470

475

480

Ala

Pro

lle

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ser

Gin

lle

485

490

495

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

lle

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

500

505

510

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

lle

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

lle

Thr

Ser

Asp

515

520

525

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

lle

530

535

540

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

545

550

555

560

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

565

570

575

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

lle

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

580

585

590

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

595

600

605

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

lle

lle

Pro

His

Tyr

Asp

His

610

615

620

Tyr

His

Asn

lle

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

625

630

635

640

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

645

650

655

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

660

665

670

Ala

Ser

Asp

His

Val

Arg

Lys

Asn

Lys

Ala

Asp

Gin

Asp

Ser

Lys

Pro

675

680

685

Asp

Glu

Asp

Lys

Gly

His

Asp

Glu

Val

Ser

Glu

Pro

Thr

His

Pro

Glu

690

695

700

Ser

Asp

Glu

Lys

Glu

Asn

His

Ala

Gly

Leu

Asn

Pro

Ser

Ala

Asp

Asn

705

710

715

720

Leu

Tyr

Lys

Pro

Ser

Thr

Asp

Thr

Glu

Glu

Thr

Glu

Glu

Glu

Ala

Glu

725

730

735

Asp

Thr

Thr

Asp

Glu

Ala

Glu

lle

Pro

Gin

Val

Glu

His

Ser

Val

lle

740

745

750

Asn

Ala

Lys

Tle

Ala

Asp

Ala

Glu

Ala

Leu

Leu

Glu

Lys

Val

Thr

Asp

755

760

765

Pro

Ser

lle

Arg

Gin

Asn

Ala

Met

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Ser

770

775

780

Ser

Leu

Leu

Leu

Gly

Thr

Lys

Asp

Asn

Asn

Thr

Tle

Ser

Ala

Glu

Val

785

790

795

800

Asp

Ser

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

810

<210> <211> <212> <213>

<400>

811 aminokyselin protein mikroorganizmus S.pneumoniae 99

Cys

Ser

Tyr

Glu

Leu

Gly

Arg

His

Gin

Ala

Gly

Gin

Val

Lys

Lys

Glu

1

5

10

15

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

Hi s

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

Arg

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly

145

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

180

185

190

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gin

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

22 5

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Asn

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Ser

Gin

Leu

Ser

Pro

Leu

Glu

Glu

Lys

Leu

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gin

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

370

375

380

Val

Pro

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

GJ y

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

- 142C7 303675 B6

Gly Ala

Lys

Lys 420

Thr Asp Leu

Pro

Ser Ser Asp Arg Glu 425

Phe 430

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

Hi s

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

460

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

4 65

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

4 90

495

Ala

Gin

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

iys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

515

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

570

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Al a

Ile

Tyr

Asn

580

585

590

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Giy

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

675

680

685

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Asn

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

690

695

700

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

705

710

715

720

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

725

730

735

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

740

745

750

Lys

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asn

755

760

765

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

770

775

780

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

785

790

795

800

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

810

<210>	100
<211>	805 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400>	100

Cys 1

Ser Tyr

Glu Leu Gly Arg 5

His

Gin

Ala 10

Gly

Gin

Asp

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ala

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

85

90

95

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

He

Lys

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

Arg

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gin

Gly

145

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

Tyr

His

180

185

190

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Glu

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gin

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

Tyr

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gin

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gin

Asn

Gin

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Leu

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Al a

275

280

285

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Glu

Gin

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

340

345

350

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

Val

Arg

Lys

Val

355

360

365

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

370

375

380

Al a

Lys

Asp

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

385

390

395

400

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

405

410

415

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

420

425

430

A.1 a

Arg

Ile

H is

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

Arg

Gin

Val

Asp

435

440

445

Phe

G.l u

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

Asp

Val

Ser

Ser

4 50

455

460

As ρ

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

465

470

475

480

- 144Q7 303675 R6

Arg

His

Pro

Glu

Arg 485

Leu

Gly

Lys

Pro Asn Ala 490

Gin

Ile

Thr

Tyr 495

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

500

505

510

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

515

520

525

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

530

535

540

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

545

550

555

560

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

565

570

575

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

580

585

590

Lys

Val

Pro

Leu

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

595

600

605

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

610

615

620

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

625

630

635

640

Tyr

Ser

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

64 5

650

655

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

660

665

670

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

675

680

685

Lys

Pro

Asn

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

690

695

700

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

705

710

715

720

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

725

730

735

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Gl u

Lys

Val

Lys

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

740

745

750

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asn

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

7 55

760

7 65

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

770

77 5

780

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

785

7 90

795

800

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

<210>	101
<211>	807 aminokyselin
<212>	protein
<213>	mikroorganizmus S.pneumoniae
<400	101

Cys 1

Ser

Tyr

Glu

Leu 5

Gly Arg

His

Gin

Ala 10

Gly

Gin

Val

Lys

Lys 15

Glu

Ser

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Asp

Gin

Ala

Gly

Gin

Lys

Ala

20

25

30

Glu

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

35

40

45

Glu

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

50

55

60

Gly

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

65

70

75

80

Ile

Ser

Glu

Glu

Leu 85

Leu

Met

Lys

Asp

Pro 90

Asn

Tyr

Gln

Leu

Lys 95

Asp

Ser

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asp

100

105

110

Gly

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Ile

115

120

125

Arg

Thr

Lys

Glu

Glu

Ile

Lys

Arg

Gln

Lys

Gln

Glu

Arg

Ser

His

Asn

130

135

140

His

Asn

Ser

Arg

Ala

Asp

Asn

Ala

Val

Ala

Ala

Ala

Arg

Ala

Gln

Gly

145

150

155

160

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

Ile

Ile

165

170

175

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Phe

His

180

185

190

Tyr

Ile

Pro

Lys

Ser

Asp

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

Ala

Gln

195

200

205

Ala

Tyr

Trp

Asn

Gly

Lys

Gln

Gly

Ser

Arg

Pro

Ser

Ser

Ser

Ser

Ser

210

215

220

His

Asn

Ala

Asn

Pro

Ala

Gln

Pro

Arg

Leu

Ser

Glu

Asn

His

Asn

Leu

225

230

235

240

Thr

Val

Thr

Pro

Thr

Tyr

His

Gln

Asn

Gln

Gly

Glu

Asn

Ile

Ser

Ser

245

250

255

Leu

Leu

Arg

Glu

Leu

Tyr

Ala

Lys

Pro

Le u

Ser

Glu

Arg

His

Val

Glu

260

265

270

Ser

Asp

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gln

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

275

280

285

Arg

Gly

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

290

295

300

Ser

Gln

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Glu

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

305

310

315

320

Arg

Tyr

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Gln

Pro

325

330

335

Ser

Pro

Gln

Ser

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gln

Ser

Ala

Pro

340

345

350

Asn

Pro

Gln

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

355

360

365

Glu

Val

Val

Arg

Lys

Val

G1 y

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Lys

Asn

Gly

370

375

380

Val

Ser

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

385

390

395

400

Gly

Ile

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gln

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

405

410

415

Gly

Ala

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

420

425

430

Lys

Ala

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gln

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

435

440

445

Lys

Gly

Arg

Gln

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

450

455

4 60

Leu

Glu

Asp

Val

Pro

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

465

470

475

480

Ala

Phe

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

485

490

495

Ala

Gln

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gln

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

500

505

510

Gly

Lys

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ile

51 5

520

525

Thr

Ser

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

530

535

540

- 146C7. 303675 B6

His

Trp

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

545

550

555

560

Gin

Ala

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

565

57 0

575

Gin

Asp

Ser

Gly

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

580

585

5 90

Ara

Val

Lys

Ala

Ala

Lys

Lys

Val

Pro

Leví

Asp

Arg

Met

Pro

Tyr

Asn

595

600

605

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

1 le

Ile

Pro

His

610

615

620

Tyr

Asp

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

625

630

635

640

Tyr

Glu

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

645

650

655

Lys

Tyr

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

Hi s

Ser

Asp

Asn

Gly

660

665

670

Phe

Gly

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

675

680

685

Asp

Thr

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

690

695

700

Lys

Pro

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

705

710

715

720

Pro

Glu

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

725

730

735

Glu

Ser

Glu

G1 u

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

740

745

750

Arg

Glu

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

755

760

765

Ser

Asn

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

770

7 75

780

Gly

Thr

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

785

790

795

800

Ala

Leu

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

805

<210> 102 <211> 821 aminokyselin <212> protein <213> mikroorganizmus S.pneumoniae <400> 102

Cys

Ala

Tyr

Glu

Leu

Gly

Leu

His

Gin

Ala

Gin

Thr

Val

Lys

Glu

Asn

1

5

10

15

Asn

Arg

Val

Ser

Tyr

Ile

Asp

Gly

Lys

G.l.n

Ala

Thr

Gin

Lys

Thr

Glu

20

25

30

Asn

Leu

Thr

Pro

Asp

Glu

Val

Ser

Lys

Arg

Glu

Gly

Ile

Asn

Ala

Glu

35

40

45

Gin

Ile

Val

Ile

Lys

Ile

Thr

Asp

Gin

Gly

Tyr

Val

Thr

Ser

His

Gly

50

55

60

Asp

His

Tyr

His

Tyr

Tyr

Asn

Gly

Lys

Val

Pro

Tyr

Asp

Ala

Ile

Ile

65

70

75

80

Ser

Glu

Glu

Leu

Leu

Met

Lys

Asp

Pro

Asn

Tyr

Gin

Leu

Lys

Asp

Ser

85

90

95

Asp

Ile

Val

Asn

Glu

Ile

Lys

Gly

Gly

Tyr

Val

Ile

Lys

Val

Asn

Gly

100

105

110

Lys

Tyr

Tyr

Val

Tyr

Leu

Lys

Asp

Ala

Ala

His

Ala

Asp

Asn

Val

Arg

115

120

125

Thr

Lys

Glu

Glu

Tle

Asn

Arg

Gin

Lys

Gin

Glu

His

Ser

Gin

His

Arg

130

135

140

Glu

Gly

Gly

Thr

Ser

Ala

Asn

Asp

Gly

Ala

Val

Ala

Phe

Ala

Arg

Ser

145

150

155

160

Gin

Gly

Arg

Tyr

Thr

Thr

Asp

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asn

Ala

Ser

Asp

165

170

175

Ile

Ile

Glu

Asp

Thr

Gly

Asp

Ala

Tyr

Ile

Val

Pro

His

Gly

Asp

His

180

185

190

Tyr

His

Tyr

Ile

Pro

Lys

Asn

Glu

Leu

Ser

Ala

Ser

Glu

Leu

Ala

Ala

195

200

205

Ala

Glu

Ala

Phe

Leu

Ser

Gly

Arg

Glu

Asn

Leu

Ser

Asn

Leu

Arg

Thr

210

215

220

Tyr

Arg

Arg

Gin

Asn

Ser

Asp

Asn

Thr

Pro

Arg

Thr

Asn

Trp

Val

Pro

225

230

235

240

Ser

Val

Ser

Asn

Pro

Gly

Thr

Thr

Asn

Thr

Asn

Thr

Ser

Asn

Asn

Ser

245

250

255

Asn

Thr

Asn

Ser

Gin

Ala

Ser

Gin

Ser

Asn

Asp

Ile

Asp

Ser

Leu

Leu

260

265

270

Lys

Gin

Leu

Tyr

Lys

Leu

Pro

Leu

Ser

Gin

Arg

His

Val

Glu

Ser

Asp

275

280

285

Gly

Leu

Ile

Phe

Asp

Pro

Ala

Gin

Ile

Thr

Ser

Arg

Thr

Ala

Arg

Gly

290

295

300

Val

Ala

Val

Pro

His

Gly

Asn

His

Tyr

His

Phe

Ile

Pro

Tyr

Glu

Gin

305

310

315

320

Met

Ser

Glu

Leu

Glu

Lys

Arg

Ile

Ala

Arg

Ile

Ile

Pro

Leu

Arg

Tyr

325

330

335

Arg

Ser

Asn

His

Trp

Val

Pro

Asp

Ser

Arg

Pro

Glu

Glu

Pro

Ser

Pro

340

345

350

Gin

Pro

Thr

Pro

Glu

Pro

Ser

Pro

Ser

Pro

Gin

Pro

Ala

Pro

Asn

Pro

355

360

365

Gin

Pro

Ala

Pro

Ser

Asn

Pro

Ile

Asp

Glu

Lys

Leu

Val

Lys

Glu

Ala

370

375

380

Val

Arg

Lys

Val

Gly

Asp

Gly

Tyr

Val

Phe

Glu

Glu

Asn

Gly

Val

Ser

385

390

395

400

Arg

Tyr

Ile

Pro

Ala

Lys

Asn

Leu

Ser

Ala

Glu

Thr

Ala

Ala

Gly

Ile

405

410

415

Asp

Ser

Lys

Leu

Ala

Lys

Gin

Glu

Ser

Leu

Ser

His

Lys

Leu

Gly

Ala

420

425

430

Lys

Lys

Thr

Asp

Leu

Pro

Ser

Ser

Asp

Arg

Glu

Phe

Tyr

Asn

Lys

Ala

435

440

445

Tyr

Asp

Leu

Leu

Ala

Arg

Ile

His

Gin

Asp

Leu

Leu

Asp

Asn

Lys

Gly

450

455

460

Arg

Gin

Val

Asp

Phe

Glu

Ala

Leu

Asp

Asn

Leu

Leu

Glu

Arg

Leu

Lys

465

470

475

480

Asp

Val

Ser

Ser

Asp

Lys

Val

Lys

Leu

Val

Asp

Asp

Ile

Leu

Ala

Phe

485

490

4 95

Leu

Ala

Pro

Ile

Arg

His

Pro

Glu

Arg

Leu

Gly

Lys

Pro

Asn

Ala

Gin

500

505

510

Ile

Thr

Tyr

Thr

Asp

Asp

Glu

Ile

Gin

Val

Ala

Lys

Leu

Ala

Gly

Lys

515

520

525

Tyr

Thr

Thr

Glu

Asp

Gly

Tyr

Ile

Phe

Asp

Pro

Arg

Asp

Ue

Thr

Ser

530

535

540

Asp

Glu

Gly

Asp

Ala

Tyr

Val

Thr

Pro

His

Met

Thr

His

Ser

His

Trp

54 5

550

555

560

Ile

Lys

Lys

Asp

Ser

Leu

Ser

Glu

Ala

Glu

Arg

Ala

Ala

Ala

Gin

Ala

565

57 0

57 5

Tyr

Ala

Lys

Glu

Lys

Gly

Leu

Thr

Pro

Pro

Ser

Thr

Asp

His

Gin

Asp

580

585

590

Ser

Gl y

Asn

Thr

Glu

Ala

Lys

Gly

Ala

Glu

Ala

Ile

Tyr

Asn

Arg

Val

595

600

605

- 148C7 303675 B6

Lys Ala Ala 610

Lys

Lys

Val

Pro 615

Leu

Asp Arg

Met

Pro 620

Tyr

Asn

Leu

Gin

Tyr

Thr

Val

Glu

Val

Lys

Asn

Gly

Ser

Leu

Ile

Ile

Pro

His

Tyr

Asp

625

630

635

640

His

Tyr

His

Asn

Ile

Lys

Phe

Glu

Trp

Phe

Asp

Glu

Gly

Leu

Tyr

Glu

645

650

655

Ala

Pro

Lys

Gly

Tyr

Thr

Leu

Glu

Asp

Leu

Leu

Ala

Thr

Val

Lys

Tyr

660

665

670

Tyr

Val

Glu

His

Pro

Asn

Glu

Arg

Pro

His

Ser

Asp

Asn

Gly

Phe

Gly

675

680

685

Asn

Ala

Ser

Asp

His

Val

Gin

Arg

Asn

Lys

Asn

Gly

Gin

Ala

Asp

Thr

690

695

700

Asn

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

Ser

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Thr

Glu

Lys

Pro

705

710

715

720

Glu

Glu

Glu

Thr

Pro

Arg

Glu

Glu

Lys

Pro

Gin

Ser

Glu

Lys

Pro

Glu

725

730

735

Ser

Pro

Lys

Pro

Thr

Glu

Glu

Pro

Glu

Glu

Glu

Ser

Pro

Glu

Glu

Ser

740

745

750

Glu

Glu

Pro

Gin

Val

Glu

Thr

Glu

Lys

Val

Glu

Glu

Lys

Leu

Arg

Glu

755

760

765

Ala

Glu

Asp

Leu

Leu

Gly

Lys

Ile

Gin

Asp

Pro

Ile

Ile

Lys

Ser

Asn

770

775

780

Ala

Lys

Glu

Thr

Leu

Thr

Gly

Leu

Lys

Asn

Asn

Leu

Leu

Phe

Gly

Thr

785

790

795

800

Gin

Asp

Asn

Asn

Thr

Ile

Met

Ala

Glu

Ala

Glu

Lys

Leu

Leu

Ala

Leu

805

810

815

Leu

Lys

Glu

Ser

Lys

820

PATENTOVÉ NÁROKY

Claims (38)

1. Izolovaný polynukleotid kódující polypeptid vybraný z

10 a) polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 95 % se sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 58, 60, 63, 73, 74, nebo 79

b) polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 99 % se sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 63, 73, 74 nebo 79, a

c) polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID č. 14, 58, 60, 62, 63,

15 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79, přičemž kódovaný polypeptid je schopný u jedince vyvolat imunitní odpověď na Streptokoka.

2. Izolovaný polynukleotid podle nároku 1, kde polynukleotid zahrnuje nukleotidovou sekvenci identickou nejméně z 95 % s nukleotidovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 3, 12 nebo 13.

3. Izolovaný polynukleotid podle nároku 2, zahrnující nukleotidovou sekvenci uvedenou v SEQ ID č. 3, 12 nebo 13.

4. Izolovaný polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 3, kde kódovaný 25 polypeptid je schopný generovat protilátky, které se specificky vážou na polypeptid skládající se z aminokyselinové sekvence uvedené v SEQ ID č. 4 nebo SEQ ID č. 14.

5. Izolovaný polynukleotid, který je komplementární k polynukleotidů podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 4.

Í4?

6. Izolovaný polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 4, kde polynukleotid je DNA.

5

7. Izolovaný polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 4, kde polynukleotid je RNA.

8. Vektor zahrnující izolovaný polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 4, kde polynukleotid je operativně spojen s oblastí kontrolující expresi.

9. Hostitelská buňka transfektovaná nebo transformovaná vektorem podle nároku 8.

10. Způsob produkce polypeptidů kódovaného polynukleotidem podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 4, vyznačující se tím, že se hostitelská buňka podle nároku 9 kulti15 vuje za podmínek vhodných pro expresi polypeptidů.

11. Způsob podle nároku 10, vyznačující se tím, že se polypeptid z hostitelské buněčné kultury dále izoluje.

20

12. Způsob podle nároku 10, vyznačující se tím, že polypeptid je rekombinantní polypeptid.

13. Izolovaný polypeptid vybraný z

a) izolovaný polypeptid zahrnující aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 95 % 25 s aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č, 4, 58, 60, 63, 73, 74 nebo 79,

b) izolovaný polypeptid zahrnující aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 99 % s aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 73, 74 nebo 79, nebo

c) izolovaný polypeptid zahrnující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID č. 4, 14,

30 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79, přičemž izolovaný polypeptid je schopný u jedince vyvolat imunitní odpověď na Streptokoka.

14. Izolovaný polypeptid podle nároku 13, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 99% s aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 14.

15. Izolovaný polypeptid podle nároku 13, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci identickou nejméně z 99% s aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID č. 73.

16. Izolovaný polypeptid podle nároku 13, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci uvedenou 40 v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79.

17. Izolovaný polypeptid podle nároku 13, kde N-terminální methioninový zbytek ze SEQ ID č. 4 nebo SEQ ID č. 14 je vynechán.

45

18. Izolovaný polypeptid podle nároku 13, kde sekreční aminokyselinová sekvence ze SEQ ID

č. 4 nebo SEQ ID č. 14 je vynechána.

19. Izolovaný polypeptid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 13 až 18, kde izolovaný polypeptid je fúzovaný se sacharidem.

20. Izolovaný polypeptid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 13 až 19, kde izolovaný polypeptid je schopný generovat protilátky, které se specificky vážou na polypeptid zahrnující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID č. 4 nebo SEQ ID č. 14.

- 150CZ 303675 B6

21. Izolovaný polypeptid podle nároku 13, kde Streptococcus je vybraný ze Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Streptococcus dysgalactiae nebo Streptococcus uberis.

5

22. Izolovaný polypeptid podle nároků 13. kde Streptococcus je Streptococcus pneumoniae.

23. Chimémí polypeptid zahrnující dva nebo více polypeptidů, kde aminokyselinová sekvence každého ze dvou nebo více polypeptidů zahrnuje aminokyselinovou sekvenci vybranou z aminokyselinové sekvence uvedené v SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 nebo 79, kde io dva nebo více polypeptidů jsou spojené za vzniku chimérního polypeptidů, přičemž kódovaný polypeptid je schopný u jedince vyvolat imunitní odpověď na Streptokoka.

24. Chimémí polypeptid podle nároku 23, kde chimémí polypeptid obsahuje dva nebo více polypeptidů, kde aminokyselinová sekvence každého ze dvou nebo více polypeptidů zahrnuje

15 aminokyselinovou sekvenci vybranou z aminokyselinové sekvence uvedené v SEQ ID ě. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77, kde dva nebo více polypeptidů jsou spojené za vzniku chimérního polypeptidu.

25. Chimémí polypeptid podle nároku 23, obecného vzorce (I):

A—(B)_m-(C)_n-D (I) kde m je 0 nebo 1,

25 n je 0 nebo 1,

A je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79;

B je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79;

C je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79; a D je vybrán ze SEQ ID č. 4, 14, 58, 60, 62, 63, 67, 68, 73, 74, 77 a 79.

35

26. Chimémí polypeptid podle nároku 23 obecného vzorce (I):

A-(B)_m-(C)„-D (I) kde m je 0 nebo 1, n je 0 nebo 1,

A je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77;

45 B je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77;

C je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77; a D je vybrán ze SEQ ID č. 58, 60, 62, 67, 68, 74 a 77.

27. Chimémí polypeptid podle kteréhokoliv z předchozích nároků 23 až 26, kde chimérní polypeptid je fúzovaný se sacharidem.

ŤřF

28. Vakcína, vyznačující se tím, že obsahuje profylakticky nebo terapeuticky účinné množství izolovaného polypeptidu podle kteréhokoliv z předchozích nároků 13 až 22 a farmaceuticky přijatelný nosič nebo rozpouštědlo.

5

29. Vakcína podle nároku 28, vyznačující se tím, že dále obsahuje farmaceuticky přijatelné adjuvans.

30. Vakcína, vyznačující se tím, že obsahuje profylakticky nebo terapeuticky účinné množství chimémího polypeptidu podle kteréhokoliv z předchozích nároků 23 až 27, a farmaio ceuticky přijatelný nosič nebo rozpouštědlo.

31. Vakcína podle nároku 30, vyznačující se tím, že dále obsahuje farmaceuticky přijatelné adjuvans.

15

32. Použití izolovaného polypeptidu podle kteréhokoliv z předchozích nároků 13 až 22 pro výrobu léčiva pro terapeutické nebo profylaktické léčení streptokokové infekce u jedince.

33. Použití chimémího polypeptidu podle kteréhokoliv z předchozích nároků 23 až 27 pro výrobu léčiva pro terapeutické nebo profylaktické léčení streptokokové infekce u jedince.

34. Použití podle nároků 32 nebo 33, kde streptokoková infekce zahrnuje meningitidu, zánět středního ucha, bakteriem» nebo pneumonii.

35. Použití podle nároků 32 a 33, kde jedinec je savec.

36. Použití podle nároků 32 a 33, kde jedinec je člověk.

37. Použití podle nároků 32 a 33, kde streptokoková infekce je způsobená Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Streptococcus dysgalactiae nebo

30 Streptococcus uberis.

38. Použití podle nároků 32 a 33, kde streptokoková infekce je způsobená Streptococcus pneumoniae.