PL207850B1 - Sposób wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych - Google Patents
Sposób wytwarzania bicyklicznych związków peptydowychInfo
- Publication number
- PL207850B1 PL207850B1 PL377635A PL37763503A PL207850B1 PL 207850 B1 PL207850 B1 PL 207850B1 PL 377635 A PL377635 A PL 377635A PL 37763503 A PL37763503 A PL 37763503A PL 207850 B1 PL207850 B1 PL 207850B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- formula
- compound
- group
- dpr
- leu
- Prior art date
Links
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 title claims abstract description 89
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 80
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims abstract description 28
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 27
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 title claims abstract description 15
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 96
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 60
- -1 succinimidyl Chemical group 0.000 claims description 43
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims description 37
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 33
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 claims description 23
- 230000008878 coupling Effects 0.000 claims description 18
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 claims description 18
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 claims description 16
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 claims description 14
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 13
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 claims description 13
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 12
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 11
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 11
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 10
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims description 10
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 claims description 9
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 claims description 9
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 8
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 claims description 8
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 125000004453 alkoxycarbonyl group Chemical group 0.000 claims description 7
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 7
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 7
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 7
- 229910001868 water Inorganic materials 0.000 claims description 7
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 6
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 claims description 6
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 6
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 102000002068 Glycopeptides Human genes 0.000 claims description 5
- 108010015899 Glycopeptides Proteins 0.000 claims description 5
- 229930182470 glycoside Natural products 0.000 claims description 5
- 238000005984 hydrogenation reaction Methods 0.000 claims description 5
- 238000003402 intramolecular cyclocondensation reaction Methods 0.000 claims description 5
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 5
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- YOETUEMZNOLGDB-UHFFFAOYSA-N 2-methylpropyl carbonochloridate Chemical compound CC(C)COC(Cl)=O YOETUEMZNOLGDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000002585 base Substances 0.000 claims description 4
- 239000012964 benzotriazole Chemical group 0.000 claims description 4
- 125000003354 benzotriazolyl group Chemical group N1N=NC2=C1C=CC=C2* 0.000 claims description 4
- 125000000051 benzyloxy group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])O* 0.000 claims description 4
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 4
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 4
- 150000002338 glycosides Chemical class 0.000 claims description 4
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 claims description 4
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- FPIRBHDGWMWJEP-UHFFFAOYSA-N 1-hydroxy-7-azabenzotriazole Chemical compound C1=CN=C2N(O)N=NC2=C1 FPIRBHDGWMWJEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 claims description 3
- BNEIONMRSYCOPM-UHFFFAOYSA-N carbamimidoyl(oxido)azanium Chemical class NC(=N)[NH2+][O-] BNEIONMRSYCOPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 claims description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 3
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 3
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 3
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 claims description 3
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 claims description 3
- 150000004714 phosphonium salts Chemical class 0.000 claims description 3
- 150000003512 tertiary amines Chemical class 0.000 claims description 3
- 125000005500 uronium group Chemical group 0.000 claims description 3
- LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 1-Ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide Substances CCN=C=NCCCN(C)C LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 1-Hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 3-(dimethylamino)propyliminomethylidene-ethylazanium;chloride Chemical compound Cl.CCN=C=NCCCN(C)C FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- TZCYLJGNWDVJRA-UHFFFAOYSA-N 6-chloro-1-hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=C(Cl)C=C2N(O)N=NC2=C1 TZCYLJGNWDVJRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229910000272 alkali metal oxide Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 150000001340 alkali metals Chemical class 0.000 claims description 2
- 229910001860 alkaline earth metal hydroxide Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 150000003862 amino acid derivatives Chemical class 0.000 claims description 2
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 claims description 2
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims description 2
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 claims description 2
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 claims description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 claims description 2
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 claims description 2
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 claims description 2
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 2
- 239000002574 poison Substances 0.000 claims description 2
- 231100000614 poison Toxicity 0.000 claims description 2
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 claims 3
- 125000004178 (C1-C4) alkyl group Chemical group 0.000 claims 2
- 101100295741 Gallus gallus COR4 gene Proteins 0.000 claims 1
- AVQQQNCBBIEMEU-UHFFFAOYSA-O [dimethylamino(hydroxy)methylidene]-dimethylazanium Chemical compound CN(C)C(O)=[N+](C)C AVQQQNCBBIEMEU-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims 1
- 150000007514 bases Chemical class 0.000 claims 1
- WGNZRLMOMHJUSP-UHFFFAOYSA-N benzotriazol-1-yloxy(tripyrrolidin-1-yl)phosphanium Chemical compound C1CCCN1[P+](N1CCCC1)(N1CCCC1)ON1C2=CC=CC=C2N=N1 WGNZRLMOMHJUSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 125000003754 ethoxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC)* 0.000 claims 1
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-O pyridinium Chemical compound C1=CC=[NH+]C=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims 1
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 abstract description 5
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 abstract description 2
- IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N Dimethyl sulfoxide Chemical compound [2H]C([2H])([2H])S(=O)C([2H])([2H])[2H] IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N 0.000 description 28
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 24
- XYXYXSKSTZAEJW-VIFPVBQESA-N (2s)-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanedioic acid Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)OCC1=CC=CC=C1 XYXYXSKSTZAEJW-VIFPVBQESA-N 0.000 description 17
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 16
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 16
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 14
- 125000004213 tert-butoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C(O*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 12
- 239000000047 product Substances 0.000 description 11
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 10
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 9
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 9
- PECYZEOJVXMISF-UHFFFAOYSA-N 3-aminoalanine Chemical compound [NH3+]CC(N)C([O-])=O PECYZEOJVXMISF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 8
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 7
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 7
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 7
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 7
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 7
- 239000007821 HATU Substances 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 5
- KGAJCJXBEWLQDZ-UBHSHLNASA-N Asp-Asp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N KGAJCJXBEWLQDZ-UBHSHLNASA-N 0.000 description 4
- CXEFNHOVIIDHFU-IHPCNDPISA-N Asp-Trp-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N CXEFNHOVIIDHFU-IHPCNDPISA-N 0.000 description 4
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000003141 Tachykinin Human genes 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 4
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 4
- 108060008037 tachykinin Proteins 0.000 description 4
- DQJCDTNMLBYVAY-ZXXIYAEKSA-N (2S,5R,10R,13R)-16-{[(2R,3S,4R,5R)-3-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-5-(ethylamino)-6-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-5-(4-aminobutyl)-10-carbamoyl-2,13-dimethyl-4,7,12,15-tetraoxo-3,6,11,14-tetraazaheptadecan-1-oic acid Chemical class NCCCC[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@@H](C)NC(=O)C(C)O[C@@H]1[C@@H](NCC)C(O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 DQJCDTNMLBYVAY-ZXXIYAEKSA-N 0.000 description 3
- JUMSBOKRGDETHL-AWEZNQCLSA-N 4-o-tert-butyl 1-o-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) (2s)-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanedioate Chemical compound N([C@@H](CC(=O)OC(C)(C)C)C(=O)ON1C(CCC1=O)=O)C(=O)OCC1=CC=CC=C1 JUMSBOKRGDETHL-AWEZNQCLSA-N 0.000 description 3
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010040722 Neurokinin-2 Receptors Proteins 0.000 description 3
- 102100037342 Substance-K receptor Human genes 0.000 description 3
- 239000012317 TBTU Substances 0.000 description 3
- CLZISMQKJZCZDN-UHFFFAOYSA-N [benzotriazol-1-yloxy(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium Chemical compound C1=CC=C2N(OC(N(C)C)=[N+](C)C)N=NC2=C1 CLZISMQKJZCZDN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 3
- 238000009903 catalytic hydrogenation reaction Methods 0.000 description 3
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 3
- 150000002367 halogens Chemical group 0.000 description 3
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 3
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- KHWYSUBVXWWBRB-UHFFFAOYSA-N (+/-)-n-ethyl-1-phenyl-2-butylamine Chemical compound CCNC(CC)CC1=CC=CC=C1 KHWYSUBVXWWBRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NPSVXOVMLVOMDD-SXRVEDALSA-N (2s)-2-[[(3s,6s,9s,12s)-12-[[(2s)-4-[[(2r,3r,4r,5s,6r)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]amino]-2-amino-4-oxobutanoyl]amino]-6-benzyl-9-(1h-indol-3-ylmethyl)-5,8,11,14-tetraoxo-1,4,7,10-tetrazacyclotetradecane-3-carbonyl]amino]-4-methyl Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@H]1CC(=O)NC[C@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@H](CC=2C3=CC=CC=C3NC=2)NC1=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1NC(C)=O NPSVXOVMLVOMDD-SXRVEDALSA-N 0.000 description 2
- AHYFYYVVAXRMKB-KRWDZBQOSA-N (2s)-3-(1h-indol-3-yl)-2-(phenylmethoxycarbonylamino)propanoic acid Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)O)C(=O)OCC1=CC=CC=C1 AHYFYYVVAXRMKB-KRWDZBQOSA-N 0.000 description 2
- 108010092101 MEN 11420 Proteins 0.000 description 2
- WQDUMFSSJAZKTM-UHFFFAOYSA-N Sodium methoxide Chemical compound [Na+].[O-]C WQDUMFSSJAZKTM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N Trichloro(2H)methane Chemical compound [2H]C(Cl)(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N 0.000 description 2
- IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N Trp-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 2
- FPQVGDGSRVMNMR-JCTPKUEWSA-N [[(z)-(1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidene)amino]oxy-(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium;tetrafluoroborate Chemical compound F[B-](F)(F)F.CCOC(=O)C(\C#N)=N/OC(N(C)C)=[N+](C)C FPQVGDGSRVMNMR-JCTPKUEWSA-N 0.000 description 2
- 125000000738 acetamido group Chemical group [H]C([H])([H])C(=O)N([H])[*] 0.000 description 2
- PBCJIPOGFJYBJE-UHFFFAOYSA-N acetonitrile;hydrate Chemical compound O.CC#N PBCJIPOGFJYBJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 2
- UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N beta-alanine Chemical compound NCCC(O)=O UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 150000004702 methyl esters Chemical class 0.000 description 2
- 229950000640 nepadutant Drugs 0.000 description 2
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- PLMKYGHASWACNG-IBGZPJMESA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) (2s)-3-(1h-indol-3-yl)-2-(phenylmethoxycarbonylamino)propanoate Chemical compound O=C([C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)ON1C(=O)CCC1=O PLMKYGHASWACNG-IBGZPJMESA-N 0.000 description 1
- RRONHWAVOYADJL-HNNXBMFYSA-N (2s)-3-phenyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)propanoic acid Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 RRONHWAVOYADJL-HNNXBMFYSA-N 0.000 description 1
- PTOWLMLOPOFEIW-UHFFFAOYSA-N 1-[(4-chlorophenyl)methyl]-3-[(4-hydroxy-3-iodo-5-methoxyphenyl)methyl]thiourea Chemical compound IC1=C(O)C(OC)=CC(CNC(=S)NCC=2C=CC(Cl)=CC=2)=C1 PTOWLMLOPOFEIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ZIHQZQOJTUSPHK-XUTVFYLZSA-N N-[(2R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]acetamide Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 ZIHQZQOJTUSPHK-XUTVFYLZSA-N 0.000 description 1
- VORIUEAZEKLUSJ-UHFFFAOYSA-M [(6-chlorobenzotriazol-1-yl)oxy-(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium;trifluoroborane;fluoride Chemical compound [F-].FB(F)F.C1=C(Cl)C=C2N(OC(N(C)C)=[N+](C)C)N=NC2=C1 VORIUEAZEKLUSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- KFTDPOJLGIWVEI-UHFFFAOYSA-N [benzotriazol-1-yl(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium Chemical compound C1=CC=C2N(C(N(C)C)=[N+](C)C)N=NC2=C1 KFTDPOJLGIWVEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DWZNQQMVUFPQMQ-UHFFFAOYSA-N acetonitrile;2-methoxy-2-methylpropane Chemical compound CC#N.COC(C)(C)C DWZNQQMVUFPQMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 238000010306 acid treatment Methods 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical group 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 229920001429 chelating resin Polymers 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002147 dimethylamino group Chemical group [H]C([H])([H])N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 230000006806 disease prevention Effects 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000000921 elemental analysis Methods 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N hydroxybenzotriazole Substances O=C1C=CC=C2NNN=C12 NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 1
- DODCBMODXGJOKD-RGMNGODLSA-N methyl (2s)-2-amino-4-methylpentanoate;hydrochloride Chemical compound Cl.COC(=O)[C@@H](N)CC(C)C DODCBMODXGJOKD-RGMNGODLSA-N 0.000 description 1
- XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N methyl 1-acetylthieno[3,2-c]pyrazole-5-carboxylate Chemical compound CC(=O)N1N=CC2=C1C=C(C(=O)OC)S2 XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VSDUZFOSJDMAFZ-VIFPVBQESA-N methyl L-phenylalaninate Chemical compound COC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 VSDUZFOSJDMAFZ-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 125000000325 methylidene group Chemical group [H]C([H])=* 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- WHQSYGRFZMUQGQ-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylformamide;hydrate Chemical compound O.CN(C)C=O WHQSYGRFZMUQGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 239000002464 receptor antagonist Substances 0.000 description 1
- 229940044551 receptor antagonist Drugs 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000003746 solid phase reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/50—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link
- C07K7/54—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link with at least one abnormal peptide link in the ring
- C07K7/56—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link with at least one abnormal peptide link in the ring the cyclisation not occurring through 2,4-diamino-butanoic acid
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/06—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length using protecting groups or activating agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/22—Tachykinins, e.g. Eledoisins, Substance P; Related peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K9/00—Peptides having up to 20 amino acids, containing saccharide radicals and having a fully defined sequence; Derivatives thereof
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Description
Opis wynalazku
Wynalazek dotyczy nowego sposobu wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych o wzorze (I), przydatnych jako związki pośrednie do wytwarzania związków farmaceutycznie czynnych, a w szczególnoś ci do wytwarzania bicyklicznych glikopeptydów o wzorze (I-A), o dział aniu antagonistów receptora NK2 tachykininy.
Związki o wzorze (I-A), a zwłaszcza związek [N-4-(2-acetyloamino-2-deoksy-p-D-glukopiranozylo)-L-asparaginylo-L-a-aspartylo-L-tryptofylo-L-fenyloalanylo-L-2,3-diaminopropionylo-L-leucylo]-C-4,2-N-3,5-laktamo-C-1,6-N-2,1-laktam (związek o wzorze (I-A), w którym R1=R2=R3=H, znany pod nazwą handlową „nepadutant) są związkami o silnym działaniu jako antagoniści receptora NK2 tachykininy i w związku z tym mogą być stosowane do wytwarzania środków farmaceutycznych do leczenia chorób i są przydatne w leczeniu i profilaktyce chorób, w których tachykininy odgrywają rolę, jako neuromodulatory.
Związek ten i pewne związki pośrednie opisano w EP nr 815126 B1, zwłaszcza w przykładzie 4. W dokumencie tym, na stronach 4 i 5 opisano sposoby, znane z literatury, syntezy w roztworze lub w fazie stałej liniowych peptydów na drodze sekwencyjnego sprzęgania odpowiednio zabezpieczonych aminokwasów, a następnie ich końcową cyklizację, w celu otrzymania związków o ogólnym wzorze (I).
Sposoby te opisano bardzo ogólnie, a więcej szczegółów podano w opisie wytwarzania związków w przykładach 1 i 2. W przykładach tych jako syntezę zastosowano sprzęganie Fmoc-aminokwasów w fazie stałej do otrzymania liniowego peptydu, który po odłączeniu od żywicy cyklizuje się, oczyszcza metodą HPLC i cyklizuje ponownie. Należy podkreślić, że w tym sposobie syntezy boczną, grupę glikozydową wprowadza się na etapie syntezy w fazie stałej liniowego peptydu na żywicy, jako boczny łańcuch odpowiednio zabezpieczonej asparaginy.
Nieoczekiwanie odkryto nowy i bardziej wydajny sposób wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych o wzorze (I), przydatnych jako związki pośrednie do wytwarzania związków o działaniu farmakologicznym.
Nowy sposób prowadzi się całkowicie w roztworze, a nie w fazie stałej, przy czym umożliwia on wytwarzanie produktów o wysokiej czystości i z wysoką wydajnością.
Wynalazek dotyczy sposobu wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych o wzorze (I) (SEQ. ID. 1)
w fazie ciekłej, obejmującego następujące etapy:
1) odbezpieczanie liniowego pentapeptydu o wzorze (II) (SEQ. ID. 2) w obecności rozpuszczalnika z wytworzeniem związku o wzorze (III):
PL 207 850 B1
gdzie A1 i A2 oznaczają dwie różne grupy zabezpieczające atom azotu, a R5 i R6 są różne i oznaczają benzyloksyl lub niższy alkoksyl, w którym część alkilowa oznacza liniową lub rozgałęzioną grupę C1-C4;
2) wewnątrzcząsteczkową cyklizację związku o wzorze (III) z etapu 1) w obecności rozpuszczalnika i odpowiedniego środka sprzęgającego, z wytworzeniem związku o wzorze (IV) (SEQ. ID. 3):
gdzie R5 ma znaczenie podane wyżej;
3) odbezpieczanie związku o wzorze (IV) z etapu 2) w obecności rozpuszczalnika, z wytworze-
PL 207 850 B1
4) sprzęganie związku o wzorze (V) z etapu 3) z zabezpieczonym aminokwasem o wzorze (VIa) w obecnoś ci rozpuszczalnika, z wytworzeniem zwią zków o wzorze (VII) (SEQ.ID.4):
gdzie A3 oznacza grupę zabezpieczającą atom azotu; R7 oznacza benzyloksyl lub niższy alkoksyl, w którym część alkilowa oznacza liniową lub rozgałęzioną grupę C1-C4; R8 oznacza resztkową grupę pochodzącą z procedury aktywacji grupy karboksylowej;
5) odbezpieczanie związku o wzorze (VII) z etapu 4) w obecności rozpuszczalnika, z wytworzeniem związku o wzorze (VIII)
gdzie R7 ma znaczenie podane wyżej;
6) wewnątrzcząsteczkową cyklizację, w obecności rozpuszczalnika i odpowiedniego środka sprzęgającego, związku o wzorze (VIII) z etapu 5), z wytworzeniem bicyklicznego związku o wzorze (IX)
PL 207 850 B1
7) odbezpieczanie bicyklicznego związku o wzorze (IX) z etapu 6) w obecności rozpuszczalnika, z wytworzeniem związku o wzorze (I)
gdzie R7 ma znaczenie podane wyżej.
Związek o wzorze (III) jest przedstawiony SEQ. ID.2.
Związki o wzorze (I) można stosować np. do wytwarzania bicyklicznych związków glikopeptydowych o wzorze (I-A), które wykazują silne działanie antagonistyczne w stosunku do receptora NK2 tachykininy; w nowym sposobie wytwarzania, w którym boczną grupę glikozydową wprowadza się do związków o wzorze (I) w reakcji prowadzonej w roztworze, oczyszczanie w końcowym etapie na drodze HPLC nie jest konieczne, tak że produkcję tych związków w dużej skali można prowadzić przy kosztach zdecydowanie niższych niż w przypadku znanego sposobu.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest sposób wytwarzania bicyklicznego związku glikopeptydowego o wzorze (I-A) (SEQ. ID. 5)
PL 207 850 B1 w którym R1, R2 i R3, które są takie same lub różne, mogą oznaczać atom wodoru lub grupę zabezpieczającą atom tlenu, obejmujący następujące etapy:
1A) aktywację bicyklicznych związków peptydowych o wzorze (I) odpowiednim środkiem sprzęgającym, z wytworzeniem pochodnej o wzorze (II-A)
w którym R oznacza benzotriazol, ewentualnie podstawiony atomem chlorowca, azabenzotriazol lub sukcynoimidyl;
2A) reakcję związku o wzorze (II-A) z etapu 1A) w obecności rozpuszczalnika z pochodną glikozydową o wzorze (III-A)
gdzie R, R1, R2 i R3 mają znaczenie podane wyżej, w którym stosuje się bicykliczny związek peptydowy o wzorze (I) otrzymany sposobem będącym przedmiotem wynalazku.
PL 207 850 B1
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest sposób wytwarzania związku o wzorze (I-A) ze związków o wzorze (II) i o wzorze (III), z pośrednim wytwarzaniem związku o wzorze (I), jak to opisano w dwóch wyżej wspomnianych sposobach.
Sposoby według wynalazku, prowadzone wyłącznie jako reakcje w roztworze, a nie w fazie stałej, wykazują nieoczekiwanie wysokie wydajności i nie wymagają stosowania oczyszczania metodą HPLC, co umożliwia znaczące zmniejszenie kosztów produkcji i prowadzenie syntezy w dużej skali.
Grupy zabezpieczające atom azotu stosowane w sposobach według wynalazku można wybrać spośród dowolnych grup zabezpieczających, które można stosować w syntezie peptydów, takiej jak to opisano w M. Bodansky, Peptide Chemistry, Springer Verlag 1988 lub w J. Jones, „The Chemical Synthesis of Peptides, Clarendon Press, Oxford 1994.
Według wynalazku grupy zabezpieczające atom azotu korzystnie są wybrane spośród benzyloksykarbonylu i alkoksykarbonylu, w którym część alkilową stanowi liniowa lub rozgałęziona grupa C1-C4; korzystniej są one wybrane spośród t-butoksykarbonylu (Boc) i benzyloksykarbonylu (Z).
R8 oznacza resztkową grupę pochodzącą z procedury aktywacji, korzystnie wybraną z grupy obejmującej benzyloksykarbonyl, alkoksykarbonyl, w którym część alkilową stanowi liniowa lub rozgałęziona grupa, sukcynoimidyl, benzotriazol ewentualnie podstawiony atomem chlorowca i azabenzotriazol.
Liniowe peptydy o wzorze (II) można otrzymać z zastosowaniem jednej z następujących strategii:
a) Strategia stopniowa: W przypadku tej strategii aminokwasy niezbędne do otrzymania peptydu o wzorze (II) sprzęga się kolejno wychodząc z pochodnej aminokwasu Dpr o wzorze (X), zabezpieczonej przy atomie azotu i otrzymanej osobno lub wytworzonej in situ
gdzie:
A2 i A4, oznaczają różne grupy zabezpieczające atom azotu, tak to podano powyżej;
R9 oznacza resztkową grupę pochodzącą z procedury aktywacji, korzystnie wybraną z grupy obejmującej benzyloksykarbonyl, alkoksykarbonyl, w którym część alkilową stanowi liniowa lub rozgałęziona grupa i sukcynoimidyl;
pochodną o powyższym wzorze (X) poddaje się reakcji z estrem Leu (XI) w obecności rozpuszczalnika
w którym R5 ma znaczenie podane wyż ej, z wytworzeniem dipeptydu A4-Dpr (A2)-Leu-R5, który nastę pnie odbezpiecza si ę w odpowiedni sposób, zależny od grupy zabezpieczającej atom azotu, która ma być usunięta i kompatybilny z grupą zabezpieczającą, która ma być utrzymana.
Odbezpieczony w ten sposób dipeptyd następnie sprzęga się z uaktywnionym estrem aminokwasu Phe, a następnie kolejno z Trp i Asp, aż do otrzymania związków o wzorze (II).
b) Strategia 2+2+1: strategia ta obejmuje sprzęganie mono-odbezpieczonego dipeptydu H-Dpr(A2)-Leu-R5, otrzymanego w sposób opisany powyżej w strategii a), z uaktywnioną pochodną dipeptydu o wzorze (XII)
As-Trp-Phe-OH (XII) przy czym A2 i A5, oznaczają różne grupy zabezpieczające atom azotu, jak to określono powyżej; otrzymaną osobno lub wytworzoną in situ przez sprzęganie uaktywnionego estru Trp, zabezpieczonego przy atomie azotu, otrzymanego osobno lub wytworzonego in situ, z estrem Phe, a następnie hydrolizę grupy estrowej.
Otrzymany tetrapeptyd As-Trp-Phe-Dpr (A2)-Leu-R5 dogodnie odbezpiecza się przez usunięcie grupy przyłączonej do atomu azotu w Trp i sprzęga się ze związkiem o wzorze (VIb)
PL 207 850 B1
Α-,-ΗΝ COOR8 (VI b) w którym A1, R6 i R8 mają znaczenie podane wyżej.
c) Strategia 3+2: zgodnie z tą strategią tripeptyd A1-Asp(R6)-Trp-Phe-OH, otrzymany przez usunięcie grupy zabezpieczającej atom azotu ze związków o powyższym wzorze (XII), a następnie sprzęganie ze związkiem o powyższym wzorze (VIb), sprzęga się z mono-odbezpieczonym dipeptydem H-Dpr-(A2)-Leu-R5 otrzymanym w sposób opisany zgodnie z procedurą według strategii a).
W opisie określenie „niższy alkoksyl dotyczy grup alkoksylowych, w których część alkilowa oznacza liniową lub rozgałęzioną grupę C1-C4, korzystnie wybraną z grupy obejmującej metyl, etyl, propyl, butyl, izopropyl i t-butyl. Odnosi się to również do grup alkiloksykarbonylowych, w których część alkilową stanowi liniowa lub rozgałęziona grupa C1-C4, korzystnie wybrana z grupy obejmującej metyl, etyl, propyl, butyl, izopropyl i t-butyl.
Środek sprzęgający można wybrać spośród środków powszechnie stosowanych w syntezie peptydów, tak aby otrzymać uaktywnioną pochodną aminokwasu, przy czym środki te opisano np. w M. Bodansky, „Peptide Chemistry, Springer Verlag 1988 lub w J. Jones, „The Chemical Synthesis of Peptides, Clarendon Press, Oxford 1994.
Uaktywnione pochodne, jeśli nie są dostępne w handlu, można otrzymać osobno lub in situ w reakcji aminokwasu lub peptydu i z jednym lub większą liczbą rozlicznych znanych środków sprzęgających, takich jak chloromrówczan izobutylu (IBCF), karbodiimid wybrany spośród dicykloheksylokarbodiimidu (DCC) i chlorowodorku 1-etylo-3-(3-dimetyloaminopropylo)-karbodiimidu (EDAC-HC1), ewentualnie w połączeniu z pochodną hydroksylową wybraną spośród 1-hydroksybenzotriazolu (HOBt), 1-hydroksy-7-azabenzotriazolu (HOAt), 6-chloro-1-hydroksybenzotriazolu (Cl-HOBt) i hydroksysukcynoimidu (HOSu); sól fosfoniowa, sól N-tlenku guanidyny lub sól uroniowa, np. heksafluorofosforan (benzotriazol-1-iloksy)tri(dimetyloamino)fosfoniowy(BOP), heksafluorofosforan (benzotriazol-1-iloksy)-tripirolidynofosfoniowy (PyBOP), heksafluorofosforan 3-tlenku 1[bis(dimetyloamino)metyleno]-1H-benzotriazoliowego(HBTU), heksafluorofosforan 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-5-chloro-1H-benzotriazoliowego (HCTU), heksafluorofosforan 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-1H-benzotriazoliowego (TBTU), heksafluorofosforan 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridyniowego (HATU), heksafluorofosforan 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-5-chloro-1H-benzotriazoliowego (TCTU), tetrafluoroboran O-[(etoksykarbonylo)cyjanometylenoamino]-N,N,N',N'-tetrametylouroniowy (TOTU), tetrafluoroboran O-(bicyklo[2.2.1]-hept-5-eno-2,3-dicarboksyimido)-N,N,N',N'-tetrametyluroniowy (TNTU) lub tetrafluoroboran O-(N-sukcynoimidylo)-N,N,N',N'-tetrametyluroniowy (TSTU).
Gdy pochodną wytwarza się in situ, reakcję sprzęgania przeprowadza się bezpośrednio potem przez dodanie innego reagenta, który oczywiście, w przypadku wewnątrzcząsteczkowych cyklizacji, odpowiada wolnemu końcowi aminowemu obecnemu w samej cząsteczce.
Reakcję sprzęgania prowadzi się zazwyczaj w obecności trzeciorzędowej aminy, takiej jak N-metylomorfolina (NMM), trietyloamina (TEA) lub diizopropyloetyloamina (DIPEA) w rozpuszczalniku organicznym wybranym spośród rozpuszczalników zazwyczaj stosowanych w syntezie peptydów. Do korzystnych rozpuszczalników w reakcji sprzęgania należy octan etylu (AcOEt), dimetyloformamid (DMF) i N-metylopirolidon (NMP).
Reakcje sprzęgania można prowadzić w temperaturze, która nie powinna powodować degradacji lub zbyt powolnego przebiegu reakcji, przy czym korzystnie temperatura wynosi od -20 do +50°C.
Odbezpieczanie w sposobach według wynalazku przeprowadza się sposobami odpowiednimi dla usuwanych grup i kompatybilnymi z grupami, które mają być zachowane; zwykle reakcje odbezpieczania w sposobach według wynalazku prowadzi się jako katalityczne uwodornienie lub potraktowanie kwasem albo zasadą.
PL 207 850 B1
W przypadku uwodornienia katalizator można wybrać spośród różnych katalizatorów dostępnych i przydatnych w danym celu; korzystnie stosuje się 5% lub 10% pallad. Rozpuszczalnik w reakcjach odbezpieczania na drodze katalitycznego uwodornienia można wybrać spośród tych rozpuszczalników, które rozpuszczają związki w reakcji, z wyłączeniem ketonów, takich jak aceton, rozpuszczalników, które zatruwają katalizator i tych, które reagują ze składnikami reakcji. Do korzystnych rozpuszczalników w reakcji należy DMF, NMP, kwasy organiczne, takie jak kwas octowy i kwas p-toluenosulfonowy (PTSA) oraz alkohole, takie jak metanol, etanol i izopropanol lub ich mieszaniny. Temperatura reakcji uwodornienia wynosi od -20 do +50°C.
W przypadku odbezpieczania na drodze traktowania kwasem, korzystnie stosuje się kwasy mineralne, takie jak kwas chlorowodorowy lub kwasy organiczne, taki jak kwas trifluorooctowy lub kwas mrówkowy, które można stosować same lub w mieszaninie z innymi rozpuszczalnikami. Temperatura wynosi od -20 do +50°C.
W przypadku odbezpieczania na drodze traktowania zasadą , korzystnie stosuje się wodorotlenki metali alkalicznych i metali ziem alkalicznych, w obecności rozpuszczalnika, takiego jak woda, dioksan, acetonitryl, metanol, etanol, izopropanol lub ich mieszaniny; temperatura wynosi od -20 do +50°C.
Użyte w opisie określenie „grupa zabezpieczająca atom tlenu dotyczy grup zabezpieczających wybranych spośród grup powszechnie stosowanych do zabezpieczania grup -OH, dobrze znanych specjalistom, przy czym są one wybrane np. spośród grup -COR4, gdzie R4 oznacza liniową lub rozgałęzioną grupę alkilową o 1-4 atomach węgla, fenyl ewentualnie podstawiony atomem chlorowca, benzyl lub benzoil; grupę zabezpieczającą atom tlenu korzystnie stanowi acetyl.
Według wynalazku związki glikopeptydowe o wzorze (I-A) można otrzymać w reakcji pochodnej glikozydowej o wzorze (III-A) z uaktywnioną pochodną peptydu o wzorze (II-A), otrzymaną w reakcji aktywowania lub wytworzoną in situ ze związku o wzorze (I). W związku z tym w sposobie wytwarzania bicyklicznych związków glikopeptydowych o wzorze (I-A), grupę glikozydową wprowadza się nie do liniowego peptydu, ale do bicyklicznego związku peptydowego.
Gdy poddaje się reakcji związki o wzorze (III-A), w 30 którym R1, R2 i R3 mają znaczenie inne niż atom wodoru, otrzymane związki o wzorze (I-A) można przeprowadzić w odpowiednie związki, w których R1=R2=R3=H, drogą katalitycznego uwodornienia lub przez potraktowanie kwasem albo zasadą, w zależności od charakteru grup zabezpieczających R1, R2 i R3.
Związki glikozydowe o wzorze (III-A) korzystnie stosowane w sposobie według wynalazku, są wybrane z grupy obejmującej 2-acetamido-2-deoksy-(3-D-glukopiranozyloaminę i 2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetylo-2-deoksy-e-D-glukopiranozyloaminę, związki znane z literatury, które można otrzymać np. w sposób opisany odpowiednio w I. Shin i inni, Tetrahedron Letters, 42 (2001), 1325-1328 oraz D. Macmillan i inni. Organic Letters, tom 4, nr 9, 2002.
Poniższe przykłady i schematy syntezy podano w celu zilustrowania wynalazku bez ograniczania jego zakresu.
Na schemacie 1 przedstawiono szlak syntezy, w którym wychodząc ze związków o wzorze (II) dochodzi się do związków o wzorze (I-A), podczas gdy schematy 2-4 przedstawiają 3 różne strategie wytwarzania związków o wzorze (II).
Jako przykładowe grupy zabezpieczające pokazano t-butoksykarbonyl (BOC) i benzyloksykarbonyl (Z) w przypadku aminowych grup końcowych oraz ester metylowy i ester t-butylowy w przypadku karboksylowych grup końcowych.
Liczby podane za każdym związkiem na poszczególnych schematach odpowiadają liczbom przypisanym związkom w przykładach.
Otrzymane związki identyfikowano i ich czystość oznaczano na podstawie analizy elementarnej, HPLC, 1H-NMR, IR i analizy masowej.
PL 207 850 B1
Schemat 1: Synteza związków o wzorze (I-A)
NFk-Gk-NHAc
NH^GkOriOAcj-NHAc
IBTU, NMM, DMF
HATU, NMM, DMF
Cyklo- [Asp- Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
Gk( tnO Ac )NHAc
Sposób A
Sposob B
MeONa. MeOH
Cykk>[Asp-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
Gk
NHAc
Z-Asp(OtBu)-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe | HCOOH
Z-Asp(OH)-Trp-Phe-Dpr(H)-Leu-OMe
PyBOP, NMM, DMF Z- Asp-Τιp-Phe-Dpr-Leu-OMe
NaOH, dioksan - HoO
Z-Asp-Trp-Plie-Dpr-Leu-OH
1) H2, Pd/C 10%, NMM, DMF
2) HATU, DEPEA, DMF
Z-Asp(OIBu)-Asp-Tip-Phe-Dpr-Leu-OH
1) H2, Pd/C 10%, NMM, DMF
2) HATU, DIPEA, DMF
Cyklo[Asp(OTBu)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
HCOOH
Cykk>[Asp(OH)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
PL 207 850 B1
Schemat 2: Synteza związków o wzorze (II) według strategii a) (strategia stopniowa)
Z-Dpr(BOC)-OH + H-Leu-OMe-HCl
1) HOSu, DCC, DMF I 2) NMM, DMF
Z-Dpr(BOC)-Leu-OMe
H7, Pd/C 10%, MeOH, PTSA r
[H-Dpr(BOC)-Leu-OMe]
Z-Phe-OSu, NMM, DMF
Z-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe 11
H7, Pd/C 10%, DMF ▼
(H-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe] 12
Z-Trp-OSu, NMM, DMF ▼
Z-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe 13 | H2, Pd/C 10%, NMP
[H-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe] 14 j Z-Asp(OtBu)-Osu I DEPEA, NMP-CH3CN
Z-Asp(OtBu)-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe 15
PL 207 850 B1
Schemat 3: Synteza związków o wzorze (II) według strategii b) (strategia, 2+2+1)
PL 207 850 B1
Schemat 4: Synteza związków o wzorze (II) według strategii c) (strategia 3+2)
P r z y k ł a d 1
Wytwarzanie Z-Asp(OH)-Trp-Phe-Dpr(H)-Leu-OMe (SEQ. ID.1)
Roztwór Z-Asp(OtBu)-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe o stężeniu 72 mmole/l, otrzymany w sposób opisany w przykładzie 15, w 95% kwasie mrówkowym ogrzewano w 40°C pod próżnią przez 4 godziny.
Mieszaninę reakcyjną odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem i pozostałość rozpuszczono w mieszaninie 8:2 CH3CN-H2O.
Zawiesinę ochłodzono do 15-20°C i wartość pH doprowadzono do 6 przez dodanie 20% wodnego roztworu NMM.
Acetonitryl odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem i otrzymaną zawiesinę przesączono.
Otrzymaną białawą substancję stałą przemyto H2O i wysuszono pod próżnią w 30-40°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 96,4%.
1H-NMR dimetylosulfotlenek-d6 (DMSO-d6) δ:
0,86 (2d; 6H); 1,47-1,75 (m; 3H); 2,32-2,68 (m; 2H); 2,79-3, 55 (m; 6H); 3,63 (s; 3H); 4,25-4,65 (m; 5H); 4,99 (układ AB; 2H); 6,91-7,43 (m; 14H); 7,48-7,60 (2d; 2H); 7,82 (b; 2H); 8,03-8,43 (4d; 4H); 10,83 (s; 1H); 12,35 (b; 1H).
PL 207 850 B1
P r z y k ł a d 2
Z-Asp-Trp-Phc-Dpr-Leu-Ome
Wytwarzanie ' (SEQ. ID 2)
NMM (2,2 równoważnika) dodano do roztworu 24 mmole/l Z-Asp (OH)-Trp-Phe-Dpr (NH2)-LeuOme w DMF i po 5-10 minutach dodano 1,2 równoważnika PyBOP.
Po mieszaniu przez 2-3 godziny w temperaturze pokojowej roztwór odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem aż do otrzymania płynnej pozostałości, którą wkroplono do 0,5 M wodnego roztworu NaHCO3.
Otrzymaną zawiesinę przesączono i otrzymaną substancję stałą przemyto mieszaniną 4:6 DMF-H2O, a następnie H2O do osiągnięcia obojętnego odczynu pH i wysuszono pod próżnią w 3050°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 84,2%.
1H-NMR (DMSO d6) δ:
0,83 (2d; 6H); 1,34-1,69 (m; 3H); 2,31-2,92 (m; 4H); 3,03-3,91 (m; 4H); 3,61 (s; 3H); 4,17-4,63 (m; 5H); 5,01 (układ AB; 2H); 6,84-7,48 (m; 16H); 7,60 (d; 1H); 7,87 (d; 2H); 8,01 (t; 1H); 8,27 (d; 1H); 10,81 (s; 1H).
P r z y k ł a d 3_
Wytwarzanie
Mętny roztwór zawierający 77 mmoli/l _(SEQ. ID 3)
Z-Asp-Trp-Phe-D[?r-LeihOme w mieszaninie 8:2 dioksanH2O ogrzano w 35°C i utrzymywano wartość pH 12,0-12,5 przez powolne i ciągłe dodawanie 1,5N NaOH. Po zakończeniu reakcji mętny roztwór doprowadzono do pH 9 przez dodanie 6N HCl, wyklarowano przez przesączenie przez złoże pomocniczego materiału filtracyjnego i zakwaszono do pH 3 przez ponowne dodanie 6N HCl.
Roztwór zatężono pod zmniejszonym ciśnieniem do otrzymania dającego się sączyć roztworu. Odsączoną białawą substancję stałą przemyto mieszaniną 1:1 dioksan-H2O, a następnie H2O i wysuszono pod próżnią w 30-40°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 97,7%.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,84 (2d; 6H); 1,42-1,76 (m; 3H); 2,29-3,48 (m; 7H); 3,85 (m; 1H); 4,10-4,65 (m; 5H); 5,00 (układ AB; 2H); 6,86-7,47 (m; 16H); 7,55-8,36 (4d+m; 5H); 10,80 (d; 1H); 12,65 (b; 1H).
P r z y k ł a d 4
Z-Asp(OtBu)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu-OH
Wytwarzanie _1----------- —l_ (SEQ. ID 4)
Z-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu-OH
Roztwór 66 mmoli/l w obecności 1 równoważnika NMM i katalitycznej ilości 10% Pd/C o zawartości wilgoci 50%.
Po prowadzeniu reakcji przez 6 godzin zawiesinę przesączono w celu usunięcia katalizatora, H-As p-T rp-Phe-Dpr-Leu-OH
DMF uwodorniano w temperaturze pokojowej a przesącz rozcieńczono DMF, tak że otrzymano roztwór o stężeniu 53 mmole/l, do którego dodano 4 równoważniki NMM i 1,05 równoważnika Z-Asp(OtBu)Osu.
Po mieszaniu przez 5 godzin w temperaturze pokojowej mieszaninę odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem, a otrzymaną pozostałość wkroplono do 0,05 NH2SO4.
Otrzymaną zawiesinę przesączono, a otrzymaną substancję stałą przemyto mieszaniną 1:1
DMF-H2O, a następnie H2O i wysuszono pod próżnią w 30-40°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 93,7%.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,84 (2d; 6H), 1,35 (s; 9H); 1,40-1,70 (m; 3H); 2,20-3,94 (m; 10H); 4,10-4,81 (m; 6H); 4,92-5,12 (układ AB; 2H); 6,74-7,57 (m; 17H); 7,71-8,35 (4d+1t; 5H); 10,70 (s; 1H); 12,70 (b; 1H).
P r z y k ł a d 5
C yklo[ Asp{ OtBu )-Asp-T rp-Phe-Dpr-Leu]
Wytwarzanie_L____i (SEQ. ID 5)
Z-Asp(OtBu)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu-OH
Roztwór_l —1_o stężeniu 47 mmoli/l w DMF uwodorniano w temperaturze pokojowej, w obecności 1 równoważnika DIPEA i katalitycznej ilości 10% Pd/C o zawartości wilgoci 50%.
PL 207 850 B1
Po prowadzeniu reakcji przez około 2 godziny zawiesinę przesączono w celu usunięcia kataliH-Asp(OtBu)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu-OH zatora i rozcieńczono DMF do osiągnięcia stężenia 19 mmoli/l 1-1 , po czym dodano 1,4 równoważnika DIPEA i 1,2 równoważnika HATU.
Po mieszaniu przez 30-60 minut w temperaturze pokojowej roztwór odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem, a otrzymaną pozostałość wkroplono do 0,5 M wodnego roztworu NaHCO3.
Otrzymaną zawiesinę przesączono, a otrzymaną substancję stałą przemyto obficie H2O do obojętnego odczynu pH i wysuszono pod próżnią w 30-50°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 94,1%.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,88 (2d; 6H); 1,38 (s; 9H); 1,31-1,72 (m; 3H); 2,33-2,99 (m; 6H); 3,20-3,63 (m; 3H); 3,87-4,62 (m; 7H); 6,75-7,50 (m; 13H); 8,04 (b; 1H); 8,56 (d; 1H); 8,76 (d; 1H); 9,18 (b; 1H); 10,84 (s; 1H).
P r z y k ł a d 6_
Wytwarzanie
Cyklo [ Asp( OH)- Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
I-Ϊ (SEQ. ID 6)
C yklo[ Asp( OtBu)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
Roztwór o stężeniu 83 mmole/l w 90% kwasie mrówkowym ogrzewano w 40°C pod próżnią przez 2 godziny.
Mieszaninę reakcyjną odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem, a otrzymaną ciężką pozostałość rozpuszczono w H2O.
Otrzymaną zawiesinę przesączono, a otrzymaną substancję stałą przemyto H2O, wysuszono pod próżnią w 30-40°C i na koniec oczyszczono na kolumnie Sephadex LH-20, z elucją metanolem.
Otrzymano 314 g białej substancji stałej (czystość 95,2%, wydajność 82,0%).
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0, 88 (2d; 6H); 1,31-1,77 (m; 3H); 2,32-3,73 (m; 9H); 3,80-4,65 (m; 7H); 6,82-7,51 (m; 13H); 7,94-9,19 (2d; 2b; 4H); 10,85 (s; 1H); 12,20 (s; 1H).
P r z y k ł a d 7
Cyklo[ As p-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
Wytwarzanie 3 równoważniki
GJc(tnOAc)NHAc (SEQ. ID 7)
NMM, 1,2 równoważnika HATU i 2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetylo-2-deoksy-eC’ykło[Asp( OH)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu]
I-—--Ϊ W DMF
-D-glukopiranozyloaminę dodano do roztworu 0,24 mola/l w odstępach 10 minutowych.
Po mieszaniu przez 1 godzinę w 0-4°C mieszaninę reakcyjną odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem, a otrzymaną płynną pozostałość wkroplono do 1% wodnego roztworu NaHCO3.
Otrzymaną zawiesinę przesączono, a otrzymaną substancję stałą przemyto H2O, wysuszono pod próżnią w 30-40°C i oczyszczono na drodze krystalizacji z mieszaniny EtOH-H2O.
Otrzymano 117 g białej substancji stałej (czystość 96,0%, wydajność 87,0%).
1H-NMR (DMSO- d6) δ:
10,80 (d; 1H); 8,90 (b; 1H); 8,72 (d; 1H); 8,47 (d; 1H); 8,46 (d; 1H); 8,08 (b; 1H); 7,84 (d; 1H); 7,43 (dd; 1H); 7,33 (dd; 1H); 7,24 (b; 1H); 7,23 (m; 2H); 7,16 (m; 3H); 7,14 (d; 1H); 7,06 (dt; 1H); 7,00 (d; 1H); 6,98 (dt; 1H); 6,90 (t; 1H); 5,18 (dd; 1H); 5,12 (dd; 1H); 4,82 (dd; 1H); 4,18 (dd; 1H); 3,96 (dd; 1H); 3,85 (ddd; 1H); 3,80 (ddd; 1H); 4,53 (m, 1H); 4,47 (m; 1H); 4,43 (m; 1H); 4,39 (m; 1H); 4,16 (m; 1H); 4,08 (m; 1H), 3,58 (m; 1H); 3,30 (m; 1H); 2,98 (m; 1H); 2,88 (m; 1H); 2,86 (m; 1H); 2,70 (m; 1H); 2,65 (m; 1H); 2,60 (m; 1H); 2,19 (m; 1H); 2,00 (s, 3H); 1,96 (s; 3H); 1,90 (s; 3H), 1,73 (s; 3H); 1,65 (m; 1H); 1,52 (m; 1H); 1,37 (m; 1H); 0,92 (d; 3H); 0,85 (d; 3H).
P r z y k ł a d 8
Cvklo[ As p-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu] | I_I (Nepadutantu) (SEQ. ID. 8)
Wytwarzanie
Metoda a) równoważniki NMM i 1,3 równoważnika TBTU oraz 2-acetamido-2-deoksy-e-D-glukopiranozyloaminę dodano w 10 minutowych odstępach do roztworu 83 mmole/l w DMF
CykIo[Asp(OtBu)-Asp-Trp-Phe-Dpr-Leu] (otrzymanego w sposób opisany w przykładzie 6).
PL 207 850 B1
Po mieszaniu przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej, mieszaninę reakcyjną odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem, a otrzymaną pozostałość w postaci gęstego oleju rozpuszczono w mieszaninie 2:8 acetonitryl-t-butoksymetan (TBME).
Otrzymaną zawiesinę energicznie mieszano przez 30 minut w temperaturze pokojowej, po czym przesączono ją.
Otrzymaną substancję stałą przemyto TBME, wysuszono pod próżnią w 25-30°C i na koniec oczyszczono metodą preparatywnej HPLC z użyciem jako eluentu mieszanin acetonitrylu i wody.
Otrzymano 151 g białej substancji stałej (czystość 93,0%, wydajność 89,3%).
1H-NMR (DMSO- d6) δ:
0,85 (d; 3H); 0,92 (d; 3H); 1,36 (m; 1H); 1,51 (m; 1H); 1,65 (m; 1H); 1,76 (s; 3H); 2,16 (dd; 1H); 2,57 (dd; 1H); 2,63 (dd; 1H); 2,67 (dd; 1H); 2,83 (dd; 1H); 2,88 (dd; 1H); 2,93 (m; 1H); 3,04-3,09 (m; 2H); 3,27-3,32 (m; 2H); 3,42 (m; 1H); 3,50 (ddd + b; 2H); 3,65 (dd; 1H); 3,96 (b; 1H); 4,09 (m; 1H); 4,12 (m; 1H); 4,35 (m; 1H); 4,43 (m; 1H); 4,50 (m; 1H); 4,53 (m + t; 2H); 4,81 (dd; 1H); 4,94 (d; 1H); 4,98 (d; 1H); 6,91 (b; 1H); 6,98 (t + b; 2H); 7,06 (t; 1H); 7,14-7,17 (m; 4H); 7,24 (t; 2H); 7,27 (b; 1H); 7,33 (d; 1H); 7,42 (d; 1H); 7,77 (d; 1H); 8,05 (b; 1H); 8,10 (d; 1H); 8,51 (d; 1H); 8,77 (d; 1H); 9,00 (b; 1H); 10,84 (d; 1H).
Metoda b)
0,1N NaOMe w MeOH (0,04 równoważnika) dodano do roztworu 0,89 mola/l
Cyklo[ Asp-Asp-Τι p-Phe-Dpr-Leu] _<jlc(tnQAc)NHAc_w MeOH, otrzymanego w sposób opisany w przykładzie 7.
Po mieszaniu przez 3 godziny w temperaturze pokojowej wartość pH doprowadzono do 6,5-7 i dodano żywicy Amberlyst® 15. Po usunięciu żywicy roztwór zatężono pod zmniejszonym ciśnieniem i otrzymano pozostałość, którą rozcieńczono TBME.
Otrzymaną zawiesinę przesączono i otrzymaną białą substancję stałą przemyto TBME i wysuszono pod próżnią w 35-40°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 94,8%.
P r z y k ł a d 9
Wytwarzanie Z-Dpr(BOC)-Leu-OMe
Sposób a)
NMM (1,2 równoważnika) dodano do roztworu 0,66 mola/l Z-Dpr(BOC)-OH w DMF. Roztwór ochłodzono do -25°C i wkroplono 1 równoważnik IBCF, utrzymując temperaturę poniżej -20°C.
Po około 10 minutach wkroplono uprzednio ochłodzono roztwór o stężeniu 0,78 mola/l zawierający 1 równoważnik H-Leu-OME*HCl i NMM w DMF, utrzymując przez cały czas temperaturę poniżej -15°C.
Po mieszaniu przez 1 godzinę mieszaninę reakcyjną wkroplono do 0,5 M wodnego roztworu NaHCO3.
Otrzymaną zawiesinę przesączono i otrzymaną substancję stałą przemyto kolejno H2O, 0,05 NH2SO4 i H2O do obojętnego odczynu pH i wysuszono pod próżnią w 30-50°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 89,0%.
temperatura topnienia 122-125°C;
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,85 (2d; 6H); 1,37 (s; 9H); 1,40-1,71 (m; 3H); 3,01-3,36 (m; 2H); 3,61 (s; 3H); 4,06-4,37 (m; 2H); 5,03 (s; 2H); 7,35 (s; 5H); 6,66 (t; 1H); 7,20 (d; 1H); 8,29 (d; 1H).
Sposób b)
DCC (1 równoważnik) dodano do roztworu 0,35 mola/l Z-Dpr(BOC)-OH w DMF zawierającym 1 równoważnik HOSu, ochłodzonym do 0-5°C. Mieszaninę doprowadzono do temperatury pokojowej i mieszano przez 1 godzinę. DCC odsączono i do klarownego przesączu dodano 1,2 równoważnika H-Leu-Ome*HCl i 2,6 równoważnika NMM. Po mieszaniu przez 2-3 godziny w temperaturze pokojowej mieszaninę rozcieńczono 0,5 N NaHCO3, a następnie ochłodzono do -5°C.
Otrzymaną zawiesinę przesączono i otrzymaną substancję stałą przemyto kolejno 0,5 N NaHCO3, mieszaniną 2:1 H2O-DMF i wodą, po czym wysuszono pod próżnią w 30-40°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 93%.
P r z y k ł a d 10
Wytwarzanie H-Dpr(BOC)-Leu-OMe
Roztwór 0,14 mola/l Z-Dpr(BOC)-Leu-OMe w MeOH zawierającym 1 równoważnik PTSA uwodorniano w temperaturze pokojowej w obecności katalitycznej ilości 10% Pd/C, 50% wilgoci.
PL 207 850 B1
Po prowadzeniu reakcji przez około 2 godziny zawiesinę przesączono w celu usunięcia katalizatora i przesącz rozcieńczono DMF.
MeOH i H2O całkowicie odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem, a pozostałość w postaci roztworu DMF zawierającego dipeptyd zastosowano do prowadzonego następnie sprzęgania.
P r z y k ł a d 11
Wytwarzanie Z-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe
Związek ten otrzymano z dipeptydu H-Dpr(BOC)-Leu-OMe z przykładu 10, w sposób opisany w przykładzie 9, z użyciem Z-Phe-OH.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,86 (2d; 6H); 1,38 (s; 9H); 1,40-1,74 (m; 3H); 2,73-3,02 (m; 2H); 3,10-3,41 (m; 2H); 3,62 (s; 3H); 4,17-4,46 (m; 3H); 4,94 (układ AB; 2H); 7,18-7,39 (m; 10H); 6,52 (t; 1H); 7,52 (d; 1H); 8,13 (d; 1H); 8,25 (d, 1H).
P r z y k ł a d 12
Wytwarzanie H-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe
Związek otrzymano z zabezpieczonej pochodnej z przykładu 11, sposobem według przykładu 10, z użyciem DMF jako rozpuszczalnika.
P r z y k ł a d 13
Wytwarzanie Z-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe (SEQ. ID. 9)
Związek otrzymano sposobem według przykładu 9 z tripeptydu z przykładu 12, z użyciem Z-Trp-OH lub przez sprzęganie dwóch dipeptydów, Z-Trp-Phe-OH i H-Dpr(BOC)-Leu-OMe, otrzymanych w sposób opisany odpowiednio w przykładach 17 i 10.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,86 (2d; 6H); 1,37 (s; 9H); 1,40-1,76 (m; 3H); 2,73-3,41 (m; 6H); 3,62 (s; 3H), 4,16-4,67 (m; 4H); 4,93 (układ AB; 2H); 6,89-7,65 (m; 16H); 6,55 (t; 1H); 8,07 (d; 1H); 8,11 (d; 1H); 8,29 (d; 1H); 10,79 (s; 1H).
P r z y k ł a d 14
Wytwarzanie H-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe (SEQ. ID. 10) Związek otrzymano z zabezpieczonej pochodnej z przykładu 13, sposobem podanym w przykładzie 10, z użyciem NMP jako rozpuszczalnika.
P r z y k ł a d 15
Wytwarzanie Z-Asp(OtBu)-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe (SEQ. ID. 11)
Sposób a)
CH3CN (1 objętość), 1,5 równoważnika DIPEA i 1,15 równoważnika Z-Asp(OtBu)-OSu dodano do roztworu 0,16 mola/l H-Trp-Phe-Dpr(BOC)-Leu-OMe w NMP, pochodzącego z reakcji uwodornienia. Po mieszaniu przez 3-4 godziny w temperaturze pokojowej mieszaninę reakcyjną ochłodzono do 5°C i rozcieńczono H2O. Otrzymaną zawiesinę przesączono i substancję stałą przemyto mieszaniną 3:7 CH3CN-H2O oraz H2O, a następnie wysuszono pod próżnią w 30-50°C, w wyniku czego otrzymano produkt z wydajnością 90%.
Sposób b)
DIPEA (1 równoważnik), 1,1 równoważnika TBTU oraz, po 5 minutach, 1 równoważnik roztworu 0,25 mola/l H-Dpr(BOC)-Leu-OMe w DMF, pochodzącego z reakcji uwodornienia (przykład 10), dodano do roztworu 0,22 mola/l Z-Asp-(OtBu)-Trp-Phe-OH w DMF, ochłodzonego do -5°C, utrzymując temperaturę poniżej -5°C.
Po mieszaniu przez około 2 godziny mieszaninę reakcyjną rozcieńczono 0,5 M wodnym roztworem NaHCO3.
Otrzymaną zawiesinę przesączono, a otrzymaną substancję stałą przemyto kolejno H2O, mieszaniną 3:4 DMF-0,5M NaHCO3 w H2O oraz H2O, po czym wysuszono pod próżnią w 30-40°C i otrzymano produkt z wydajnoś cią 84,4%.
temperatura topnienia 215-218°C;
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
0,86 (2d; 6H); 1,34 (s; 9H); 1,37 (s; 9H), 1,40-1,72 (m; 3H); 2,23-2,67 (m; 2H); 2,71-3,39 (m; 6H); 3,62 (s; 3H); 4,23-4,58 (m; 5H); 5,01 (układ AB, 2H); 6,89-7,58 (m; 16H); 6,50 (t; 1H); 7,87-8,29 (4d; 4H); 10,78 (s; 1H).
P r z y k ł a d 16
Wytwarzanie Z-Trp-Phe-OMe
PL 207 850 B1
Związek otrzymano sposobem z przykładu 9, przez sprzęganie dwóch aminokwasów, Z-Trp-OH i H-Phe-OMe.
1H-NMR (CDCI3) δ:
2,88-2, 98 (m; 2H); 3,11 (dd; 1H); 3,32 (dd; 1H); 3,62 (s; 3H); 4,40-4,58 (m; 1H); 4,16-4,30 (m; 1H); 5,11 (s; 2H); 5,45 (d; 1H), 6,11 (d; 1H); 6,72-4,85 (m; 2H), 6,92-7,46 (m; 12H); 7,67 (d; 1H); 8,03 (s; 1H).
P r z y k ł a d 17
Wytwarzanie Z-Trp-Phe-OH
Związek otrzymano z estru metylowego z przykładu 16, w sposób opisany w przykładzie 3.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
2,70-3,15 (m; 4H); 4,20-4,36 (m; 1H); 4,38-4,55 (m; 1H); 4,92 (s; 2H); 4,85-7,42 (m; 15H); 7,63 (d; 1H); 8,26 (d; 1H); 10,81 (s; 1H); 12,30 (b; 1H).
P r z y k ł a d 18
Wytwarzanie H-Trp-Phe-OH
Związek otrzymano z zabezpieczonej pochodnej z przykładu 17, sposobem z przykładu 10, z użyciem kwasu octowego jako rozpuszczalnika.
P r z y k ł a d 19
Wytwarzanie Z-Asp(OtBu)-Trp-Phe-OH
Związek otrzymano sposobem z przykładu 15 (sposób a) z dipeptydu z przykładu 18.
1H-NMR (DMSO-d6) δ:
1,35 (s; 3H); 2,21-2,67 (m; 2H); 2,71-3,18 (m; 4H); 4,22-4,58 (m; 3H); 5,00 (układ AB; 2H); 6,877,43 (m; 14H); 7,55 (m; 2H); 7,94 (d; 1H); 8,17 (d; 1H); 10,80 (s; 1H); 12,25 (b; 1H).
PL 207 850 B1
LISTA SEKWENCJI <110> Menarini Ricerche S.p.A.
<120> Sposób wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych
| <130> | 3874PTWO | |
| <150> | FI2002A000239 | |
| <151> | 12.06.2002 | |
| <160> | 11 | |
| <170> | Patentln wersja 3.2 | |
| <210> | i | |
| <211> | 5 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | pentapeptyd | |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (1) .. (i) | |
| <223> | Asp jest związany z grupą | benzyloksykarbonylową |
| <220> | ||
| <221> | MISC FEATURE | |
| <222> | (4).. (4) | |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas | 2,3-diaminopropionowy) |
| <220> | ||
| <221> | MOD RES | |
| <222> | (5) . . (5) | |
| <223> | METYLOWANIE | |
| <400> | 1 | |
| Asp Trp | Phe Xaa Leu | |
| 1 | 5 | |
| <210> | 2 | |
| <211> | 5 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sztuczna sekwencja | |
| <220> | ||
| <223> | cykliczny pentapeptyd | |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (1) · · (i) | |
| <223> | Asp jest związany z grupą | benzyloksykarbonylową |
PL 207 850 B1
| <220> <221> <222> <223> | SITE (1) · . (4) Asp ί Dpr są połączone ze sobą i | tworzą pierścień |
| <220> | ||
| <221> | MISC FEATURE | |
| <222> | (4) . , (4) | |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas 2,3-diaminopropionowy) | |
| <220> | ||
| <221> | MOD kES | |
| <222> | (5).,(5) | |
| <223> | METYLOWANIE | |
| <400> | 2 | |
| Asp Trp | Phe Xaa Leu | |
| 1 | 5 | |
| <210> | 3 | |
| <211> | 5 | |
| <91 9> | PRT | |
| <213> | Sztuczna sekwencja | |
| <220> | ||
| <223> | cykliczny pentapeptyd | |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (1) ·. (i) | |
| <223> | Asp jest związany z grupą benzyloksykarbonylową | |
| <220> | ||
| <221> | SitE | |
| <222> | (1)..(4) | |
| <223> | Asp i Dpr są połączone ze sobą i | tworzą pierścień |
| <220> | ||
| <221> | MISC FEATURE | |
| <222> | (4)..(4) | |
| <223> | X O2h3C23 (czyli Icwcs 2^3 d-4. | ąminopropionowy) |
| <400> | 3 | |
| Asp Trp | Phe Xaa Leu | |
| 1 | 5 | |
| <210> | 4 | |
| <211> | 6 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sztuczna sekwencja | |
| <220> |
PL 207 850 B1
| <223> | cykliczny heksapeptyd |
| <220> | |
| <221> | BINDING |
| <222> | (1) .. (i) |
| <223> | Asp jest związany z grupą benzyioksykarbonylową i grupą t-butylową |
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (2) . . (5) |
| <223> | Asp i Dpr są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
| <220> | |
| <221> | MISC FEATURE |
| <222> | (5) . . (5) |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas 2,3-aminopropionowy) |
| <400> | 4 |
| Asp Asp | Trp Phe Xaa Leu |
| 1 | b |
| <210> | 5 |
| <211> | 6 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sztuczna sekwencja |
| <220> | |
| <223> | Blcykliczny heksapeptyd |
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (1).. (6) |
| <223> | Asp i Leu są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
| <220> | |
| <221> | BINDING |
| <222> | (1) .. (1) |
| <223> | Asp jest związany z grupą t-butyiową |
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (2) .. (4) |
| <223> | Asp i Dpr są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
| <220> | |
| <221> | MISC FEATURE |
| <222> | (5) . . (5) |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas 2,3-diaminopropionowy) |
| <400> | 5 |
| Asp Asp | Trp Phe Xaa Leu |
| 1 | 5 |
PL 207 850 B1
| <2iu> <211> <212> <213> | 6 6 PRT Sztuczna sekwencja |
| <220> | |
| <223> | bicykliczny heksapeptyd |
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (1) (6) |
| <22 3> | Asp i Leu są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (2)..(5) |
| <223> | Asp i Dpr są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
| <220> | |
| <221> | MISC FEATURE |
| <222> | (5) . . (5) |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas 2,3-diaminopropionowy) |
| <400> | 6 |
| Asp Asp | Trp Phe Xaa Leu |
| 1 | 5 |
| <2i0> | 7 |
| <211> | 6 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sztuczna sekwencja |
| <220> | |
| <223> | bicykliczny głikopeptyd |
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (1)--(6) |
| <223> | Asp i Leu są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
<220>
<221> CARBOHYD <222> (1)..(1) <223> Asp jest związany z 2-acetamido-3,4, 6-tri-0 acetyło-2-deoksy-p-D-głukopiranozyioaminą
| <220> | ||
| <22i> | SITE | |
| <222> | (2) . . | (5) |
| <223> | Asp i | Dpr są połączone ze sobą i tworzą pierścień |
| <220> |
PL 207 850 B1 <221> MISC_FEATURE <222> (5)..(5) <223> X oznacza Dpr {czyli kwas 2,3-diaminopropionowy) <400> Asp Asp 1
Trp rae xaa ueu 5 <210> 8 <211> 6 <212> PRT <213> Sztuczna sekwencja <220>
<223>
bicykiiczny glikopeptyd <220>
<221>
<222>
<223>
<220>
<221>
<222>
<223>
SITE (i) .· (6)
Asp i Leu są połączone ze sobą i tworzą pierścień
CARBOHYD (i) . . (1)
Asp jest związany z 2-acetamido-2-deoksy-p-D-glukopiranozyloaminą
| <220> | |
| <221> | SITE |
| <222> | (2).. (5) |
| <223> | Asp i Dpr są połączone ze |
| <220> | |
| <221> | MISC EEATURE |
| <222> | (5) . . (5! |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas |
| <400> | 9 |
| Asp Asp | Trp Phe Xaa Leu |
| 1 | 5 |
| <210> | 9 |
| <211> | 4 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sztuczna sekwencja |
| <220> | |
| <223> | tetrapeptyd |
| <220> | |
| <221> | BINDING |
| <222> | (1) . . (1) |
| <223> | Trp jest związany z grupą |
PL 207 850 B1
| <220> <221> <222> <223> | MISC FEATURE (3) . . (3) X oznacza Dpr (czyli kwas | 2,3-diaminopropionowy) |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (3) . . (3) | |
| <223> | Dpr jest związany z grupą | t-butoksykarbonylową |
| <220> | ||
| <221> | MOD RES | |
| <222> | (4).. (4) | |
| <223> | METYLOWANIE | |
| <400> | 9 | |
| Trp Phe | Xaa Leu | |
| 1 | ||
| <210> | 10 | |
| <211> | 4 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sztuczna sekwencja | |
| <220> | ||
| <223> | tetrapeptyd | |
| <220> | ||
| <221> | MISC FEATURE | |
| <222> | (3) . . (3) | |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas | 2,3-diaminopropionowy) |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (3) . . (3) | |
| <223> | Dpr jest związany z grupą | t-butoksykarbonylową |
| <220> | ||
| <221> | MOD RES | |
| <222> | (3).. (3) | |
| <223> | METYLOWANIE | |
| <400> | 10 | |
| Trp Phe | Xaa Le.u | |
| 1 | ||
| <210> | 11 | |
| <211> | 5 | |
| <2±2> | PRT | |
| <213> | Sztuczna sekwencja | |
| <220> |
PL 207 850 B1
| <223> | pentapeptyd | |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (i).. (i) | |
| <223> | Asp jest związany z grupą | t-butoksylową i z grupą |
| benzyloksykarbonyiową | ||
| <220> | ||
| <221> | MISC FEATURE | |
| <222> | (4) (4) | |
| <223> | X oznacza Dpr (czyli kwas | 2,3-diaminopropionowy) |
| <220> | ||
| <221> | BINDING | |
| <222> | (4) . . (4) | |
| <223> | Dpr jest związany z grupą | t-butoksykarbonylową |
| <220> | ||
| <221> | MOD RES | |
| <222> | (4) . . (4) | |
| <223> | METYLOWANIE | |
| <400> | ii | |
| Asp Trp | Phe Xaa Leu | |
| 1 | 5 |
Zastrzeżenia patentowe
Claims (24)
1) odbezpieczanie liniowego pentapeptydu o wzorze (II) w obecności rozpuszczalnika z wytworzeniem związku o wzorze (III):
PL 207 850 B1 gdzie A1 i A2 oznaczają dwie różne grupy zabezpieczające atom azotu, a R5 i R6 są różne i oznaczają benzyloksyl lub niższy alkoksyl, w którym część alkilowa oznacza liniową lub rozgałęzioną grupę C1-C4;
1. Sposób wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych o wzorze (I), w fazie ciekł ej, obejmują cy nastę pują ce etapy:
2. Sposób według zastrz. 1, w którym liniowe peptydy o wzorze (II) wytwarza się według strategii kolejnego sprzęgania odpowiednich aminokwasów, wychodząc z pochodnej aminokwasu Dpr o wzorze (X), zabezpieczonej przy atomie azotu i otrzymanej osobno lub wytworzonej in situ gdzie:
A2 i A4, oznaczają różne grupy zabezpieczające atomy azotu; R9 oznacza resztkową grupę pochodzącą z procedury aktywacji, korzystnie wybraną z grupy obejmującej benzyloksykarbonyl, alkoksykarbonyl, w którym część alkilową stanowi liniowa lub rozgałęziona grupa i sukcynoimidyl; sposobem obejmującym następujące etapy:
- reakcję pochodnej o powyż szym wzorze (X) w obecnoś ci rozpuszczalnika, z estrem Leu o wzorze (XI) w którym R5 ma znaczenie podane w zastrz. 1, z wytworzeniem dipeptydu A4-Dpr (A2)-Leu-R5,
- odbezpieczanie dipeptydu A4-Dpr (A2)-Leu-R5, z wytworzeniem mono-odbezpieczonego dipeptydu H-Dpr (A2)-Leu-R5;
- sprzęganie mono-odbezpieczonego dipeptydu H-Dpr (A2)-Leu-R5 z uaktywnionym estrem następnego aminokwasu Phe, a następnie kolejno z Trp i Asp, aż do wytworzenia związków o wzorze (II).
2) wewnątrzcząsteczkową cyklizację związku o wzorze (III) z etapu 1) w obecności rozpuszczalnika i odpowiedniego środka sprzęgającego, z wytworzeniem związku o wzorze (IV):
3. Sposób według zastrz. 1, w którym liniowe peptydy o wzorze (II) wytwarza się według strategii syntezy obejmującej następujące etapy:
- sprzęganie mono-odbezpieczonego dipeptydu H-Dpr(A2)-Leu-R5, otrzymanego w sposób opisany w zastrz. 2, z uaktywnioną pochodną dipeptydu o wzorze (XII)
As-Trp-Phe-OH (XII) gdzie A2 i A5, oznaczają różne grupy zabezpieczające atom azotu, przy czym pochodna o wzorze (XII) została otrzymana osobno lub wytworzona in situ przez sprzęganie uaktywnionego estru Trp
PL 207 850 B1 zabezpieczonego przy atomie azotu, otrzymanego osobno lub wytworzonego in situ, z estrem Phe, a następnie hydrolizę grupy estrowej, z wytworzeniem tetrapeptydu A5-Trp-Phe-Dpr (A2)-Leu-R5;
- odpowiednie odbezpieczanie tetrapeptydu A5-Trp-Phe-Dpr (A2)-Leu-R5 przez usunięcie grupy przyłączonej do atomu azotu Trp;
- sprzęganie odbezpieczonego tetrapeptydu ze związkiem o wzorze (VIb) w którym A1, R6 i R8 mają znaczenie podane w zastrz. 1.
3) odbezpieczanie związku o wzorze (IV) z etapu 2) w obecności rozpuszczalnika, z wytworzeniem związku o wzorze (V) gdzie R5 ma znaczenie podane wyżej;
PL 207 850 B1
4. Sposób według zastrz. 1, w którym liniowe peptydy o wzorze (II) wytwarza się według strategii syntezy typu 3+2, obejmującej sprzęganie tripeptydu A1-Asp (R6)-Trp-Phe-OH, otrzymanego przez usunięcie grupy zabezpieczającej atom azotu ze związków o wyżej podanym wzorze (XII), a następnie sprzęganie ze związkiem o wyżej podanym wzorze (VIb), a potem dodatkowe sprzęganie z monoodbezpieczonym dipeptydem H-Dpr-(A2)-Leu-R5 otrzymanym w sposób opisany w zastrz. 2.
4) sprzęganie związku o wzorze (V) z etapu 3) z zabezpieczonym aminokwasem o wzorze (VIa) w obecności rozpuszczalnika, z wytworzeniem związków o wzorze (VII):
gdzie A3 oznacza grupę zabezpieczającą atom azotu; R7 oznacza benzyloksyl lub niższy alkoksyl, w którym część alkilowa oznacza liniową lub rozgałęzioną grupę C1-C4; R8 oznacza resztkową grupę pochodzącą z procedury aktywacji grupy karboksylowej;
5. Sposób według zastrz. 1, w którym grupy zabezpieczające atom azotu są wybrane z grupy obejmującej benzyloksykarbonyl i alkoksykarbonyle, w których część alkilową stanowi liniowa lub rozgałęziona grupa C1-C4.
5) odbezpieczanie związku o wzorze (VII) z etapu 4) w obecności rozpuszczalnika, z wytworzeniem związku o wzorze (VIII)
6. Sposób według zastrz. 5, w którym grupy zabezpieczające atom azotu są wybrane spośród t-butoksykarbonylu i benzyloksykarbonylu.
6) wewnątrzcząsteczkową cyklizację, w obecności rozpuszczalnika i odpowiedniego środka sprzęgającego, związku o wzorze (VIII) z etapu 5), z wytworzeniem bicyklicznego związku o wzorze (IX) gdzie R7 ma znaczenie podane wyżej;
PL 207 850 B1
7. Sposób według zastrz. 1, w którym R8 jest wybrany z grupy obejmującej benzyloksykarbonyl, alkiloksykarbonyl zawierający liniową lub rozgałęzioną grupę C1-C4 w części alkilowej, sukcynoimidyl, benzotriazol ewentualnie podstawiony atomem chlorowca i azabenzotriazol.
7) odbezpieczanie bicyklicznego związku o wzorze (IX) etapu 6) w obecności rozpuszczalnika, z wytworzeniem zwią zku wzorze (I)
8. Sposób według zastrz. 1-7, w którym liniowa lub rozgałęziona grupa C1-C4 jest wybrana z grupy obejmującej metyl, etyl, propyl, butyl, izopropyl i t-butyl.
9. Sposób wytwarzania bicyklicznego związku glikopeptydowego o wzorze (I-A) w którym R1, R2 i R3, które są takie same lub różne, mogą oznaczać atom wodoru lub grupę zabezpieczającą atom tlenu, obejmujący następujące etapy:
1A) aktywację bicyklicznych związków peptydowych o wzorze (I) odpowiednim środkiem sprzęgającym, z wytworzeniem pochodnej o wzorze (II-A) w którym R oznacza benzotriazol, ewentualnie podstawiony atomem chlorowca, azabenzotriazol lub sukcynoimidyl;
PL 207 850 B1
2A) reakcję związku o wzorze (II-A) z etapu lA) w obecności rozpuszczalnika z pochodną glikozydową o wzorze (III-A) gdzie R, R1, R2 i R3 mają znaczenie podane wyżej, znamienny tym, że stosuje się bicykliczny związek peptydowy o wzorze (I) otrzymany sposobem określonym w zastrzeżeniu nr 1.
10. Sposób według zastrz. 9, w którym związki o wzorze (I-A), w którym R1, R2 i R3 mają znaczenie inne niż H, przeprowadza się w odpowiednie związki o wzorze (I-A), w którym R1=R2=R3=H, w reakcji odbezpieczania w obecności rozpuszczalnika.
11. Sposób według zastrz. 9, w którym grupy zabezpieczające atom tlenu są wybrane z grupy obejmującej - COR4, gdzie R4 oznacza liniowy lub rozgałęziony C1-C4 alkil, fenyl ewentualnie podstawiony atomem chlorowca, benzyl lub benzoil.
12. Sposób według zastrz. 11, w którym C1-C4 alkil jest wybrany z grupy obejmującej metyl, etyl, propyl, butyl, izopropyl i t-butyl.
13. Sposób według zastrz. 12, w którym C1-C4 alkil stanowi metyl.
14. Sposób według zastrz. 9, w którym pochodne glikozydowe o wzorze (III-A) są wybrane z grupy obejmującej 2-acetamido-2-deoksy-e-D-glukopiranozyloaminę i 2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetylo-2-deoksy-e-D-glukopiranozyloaminę.
15. Sposób według zastrz. 1 albo 9, w którym stosuje się środek sprzęgający wybrany z grupy obejmującej chloromrówczan izobutylu, karbodiimid ewentualnie w połączeniu z pochodną hydroksylową, sole fosfoniowe, sole N-tlenku guanidyny i sole uroniowe.
16. Sposób według zastrz. 15, znamienny tym, że karbodiimidy są wybrane spośród dicykloheksylokarbodiimidu i chlorowodorku 1-etylo-3-(3-dimetyloaminopropylo)karbodiimidu; pochodne hydroksylowe są wybrane spośród 1-hydroksybenzotriazolu, 6-chloro-1-hydroksybenzotriazolu, hydroksysukcynoimidu i 1-hydroksy-7-azabenzotriazolu; sole fosfoniowe, sole N-tlenku guanidyny i sole uroniowe są wybrane spośród heksafluorofosforanu (benzotriazol-1-iloksy) tri(dimetyloamino)fosfoniowego, heksafluorofosforanu (benzotriazol-1-iloksy)tripirolidynofosfoniowego, heksafluorofosforanu 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-1H-benzotriazoliowego, heksafluorofosforanu 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-5-chloro-1H-benzotriazoliowego, tetrafluoroboranu 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)-metyleno]-1H-benzotriazoliowego, heksafluorofosforanu 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]PL 207 850 B1
-1H-1,2,3-triazolo [4,5-b]pirydyniowego, tetrafluoroboranu 3-tlenku 1-[bis(dimetyloamino)metyleno]-5-chloro-1H-benzotriazoliowego, tetrafluoroboranu O-[(etoksykarbonylo)cyjanometylenoamino]-N,N,N',N'-tetrametylouroniowego, tetrafluoroboranu O(bicyklo[2.2.1]hept-5-eno-2,3-dikarboksyimido)N,N,N',N'-tetrametyluroniowego i tetrafluoroboranu O-(N-sukcynoimidylo)-N,N,N',N'-tetrametylouroniowego.
17. Sposób według zastrz. 1 albo 9, w którym reakcje sprzęgania prowadzi się w obecności trzeciorzędowej aminy w organicznym rozpuszczalniku w temperaturze od -20 do +50°C.
18. Sposób według zastrz. 17, znamienny tym, że trzeciorzędowa amina jest wybrana z grupy obejmującej N-metylomorfolinę, trietyloaminę i diizopropyloetyloaminę, a rozpuszczalnik organiczny jest wybrany z grupy obejmującej octan etylu, dimetyloformamid i N-metylopirolidon.
19. Sposób według zastrz. 1 albo 10, znamienny tym, że reakcję odbezpieczania prowadzi się na drodze uwodornienia, w obecności katalizatora, w rozpuszczalniku wybranym spośród tych rozpuszczalników, które rozpuszczają składniki reakcji bez reagowania z nimi, z wyłączeniem ketonów i rozpuszczalników, które zatruwają katalizator, w temperaturze od -20 do +50°C.
20. Sposób według zastrz. 19, znamienny tym, że stosuje się katalizator wybrany spośród 5% i 10% palladu oraz rozpuszczalnik wybrany spoś ród dimetyloformamidu, N-metylopirolidonu, kwasu octowego, kwasu p-toluenosulfonowego, metanolu, etanolu, izopropanolu i ich mieszanin.
21. Sposób według zastrz. 1 albo 10, w którym reakcje odbezpieczania prowadzi się przez potraktowanie kwasem z użyciem samych kwasów lub kwasów zmieszanych z innymi rozpuszczalnikami, w temperaturze od -20 do +50°C.
22. Sposób według zastrz. 21, znamienny tym, że stosuje się kwas wybrany z kwasu chlorowodorowego, kwasu trifluorooctowego i kwasu mrówkowego.
23. Sposób według zastrz. 1 albo 10, znamienny tym, że reakcje odbezpieczania prowadzi się przez potraktowanie związkiem zasadowym w obecności rozpuszczalnika, w temperaturze od -20 do + 50°C.
24. Sposób według zastrz. 23, znamienny tym, że stosuje się zasady wybrane spośród wodorotlenków metali alkalicznych i metali ziem alkalicznych, oraz rozpuszczalnik wybrany z grupy obejmującej wodę, dioksan, acetonitryl, metanol, etanol, izopropanol i ich mieszaniny.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| IT000239A ITFI20020239A1 (it) | 2002-12-06 | 2002-12-06 | Processo per la preparazione di composti peptidici biciclici. |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL377635A1 PL377635A1 (pl) | 2006-02-06 |
| PL207850B1 true PL207850B1 (pl) | 2011-02-28 |
Family
ID=32500550
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL377635A PL207850B1 (pl) | 2002-12-06 | 2003-12-04 | Sposób wytwarzania bicyklicznych związków peptydowych |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US7999068B2 (pl) |
| EP (1) | EP1576000B1 (pl) |
| JP (1) | JP4593284B2 (pl) |
| KR (1) | KR101081256B1 (pl) |
| CN (1) | CN1318445C (pl) |
| AT (1) | ATE440105T1 (pl) |
| AU (1) | AU2003289958A1 (pl) |
| BR (1) | BR0317029A (pl) |
| CA (1) | CA2508696C (pl) |
| DE (1) | DE60328915D1 (pl) |
| ES (1) | ES2330102T3 (pl) |
| IT (1) | ITFI20020239A1 (pl) |
| MX (1) | MXPA05005969A (pl) |
| PL (1) | PL207850B1 (pl) |
| RU (1) | RU2330045C9 (pl) |
| WO (1) | WO2004052923A2 (pl) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2007111952A2 (en) * | 2006-03-22 | 2007-10-04 | The Scripps Research Institute | Method of preparing glycopeptides |
| CN103864901B (zh) * | 2012-12-17 | 2017-02-08 | 深圳翰宇药业股份有限公司 | 一种制备奈帕坦特及其中间体的方法及所述中间体 |
| CN109503698B (zh) * | 2018-12-13 | 2021-01-01 | 无限极(中国)有限公司 | 一种多肽及其制备方法与应用 |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| IT1277835B1 (it) * | 1995-03-13 | 1997-11-12 | Menarini Farma Ind | Composti biciclici, loro preparazione ed uso in composizioni farmaceutiche |
-
2002
- 2002-12-06 IT IT000239A patent/ITFI20020239A1/it unknown
-
2003
- 2003-12-04 DE DE60328915T patent/DE60328915D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2003-12-04 KR KR1020057009808A patent/KR101081256B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2003-12-04 ES ES03782304T patent/ES2330102T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2003-12-04 WO PCT/EP2003/013696 patent/WO2004052923A2/en not_active Ceased
- 2003-12-04 AT AT03782304T patent/ATE440105T1/de not_active IP Right Cessation
- 2003-12-04 EP EP03782304A patent/EP1576000B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2003-12-04 PL PL377635A patent/PL207850B1/pl unknown
- 2003-12-04 RU RU2005117345/04A patent/RU2330045C9/ru not_active IP Right Cessation
- 2003-12-04 JP JP2004557990A patent/JP4593284B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2003-12-04 BR BR0317029-2A patent/BR0317029A/pt unknown
- 2003-12-04 CN CNB200380105180XA patent/CN1318445C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2003-12-04 MX MXPA05005969A patent/MXPA05005969A/es unknown
- 2003-12-04 CA CA2508696A patent/CA2508696C/en not_active Expired - Fee Related
- 2003-12-04 AU AU2003289958A patent/AU2003289958A1/en not_active Abandoned
- 2003-12-04 US US10/537,731 patent/US7999068B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| ES2330102T3 (es) | 2009-12-04 |
| CN1720260A (zh) | 2006-01-11 |
| KR101081256B1 (ko) | 2011-11-08 |
| BR0317029A (pt) | 2005-10-25 |
| DE60328915D1 (de) | 2009-10-01 |
| ITFI20020239A1 (it) | 2004-06-07 |
| CA2508696C (en) | 2014-05-06 |
| JP4593284B2 (ja) | 2010-12-08 |
| WO2004052923A2 (en) | 2004-06-24 |
| ATE440105T1 (de) | 2009-09-15 |
| MXPA05005969A (es) | 2005-11-17 |
| US7999068B2 (en) | 2011-08-16 |
| CN1318445C (zh) | 2007-05-30 |
| CA2508696A1 (en) | 2004-06-24 |
| AU2003289958A1 (en) | 2004-06-30 |
| US20090163695A1 (en) | 2009-06-25 |
| PL377635A1 (pl) | 2006-02-06 |
| EP1576000B1 (en) | 2009-08-19 |
| RU2330045C9 (ru) | 2008-11-20 |
| WO2004052923A3 (en) | 2005-02-24 |
| EP1576000A2 (en) | 2005-09-21 |
| RU2005117345A (ru) | 2006-02-27 |
| KR20050089966A (ko) | 2005-09-09 |
| RU2330045C2 (ru) | 2008-07-27 |
| AU2003289958A8 (en) | 2004-06-30 |
| JP2006520743A (ja) | 2006-09-14 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CA3017926C (en) | Methods for synthesizing .alpha.4.beta.7 peptide antagonists | |
| AU2011322618B2 (en) | Process for the manufacture of degarelix and its intermediates | |
| CN101918429B (zh) | 肽的生产和纯化方法 | |
| US5079341A (en) | Cyclosporins | |
| US5977302A (en) | Liquid phase process for the preparation of GnRH peptides | |
| CA2466430A1 (en) | Process for the preparation of cyclic peptides | |
| EP0300784B1 (en) | Peptides | |
| HK1231495A1 (zh) | 用於制备催产素类似物的方法 | |
| GB2216529A (en) | Peptides useful as tachykinin antagonists | |
| JPH0354957B2 (pl) | ||
| CN103842373A (zh) | 模板-固定的肽模拟物作为fpr1的抑制物 | |
| WO2013014527A1 (en) | Processes for preparing eptifibatide | |
| KR20220059479A (ko) | 트로피네타이드의 조성물 | |
| EP1576000B1 (en) | Process for the preparation of bicyclic hexa-peptide nepadutant | |
| US4491541A (en) | Peptides | |
| GB1587427A (en) | Polypeptide derivatives | |
| TW201730203A (zh) | 製備rada-16的方法 | |
| AU2004201899A1 (en) | Process for the preparation of clyclic peptides |