RU2012129362A - Обнаружение мишени tsg праймером - Google Patents
Обнаружение мишени tsg праймером Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012129362A RU2012129362A RU2012129362/10A RU2012129362A RU2012129362A RU 2012129362 A RU2012129362 A RU 2012129362A RU 2012129362/10 A RU2012129362/10 A RU 2012129362/10A RU 2012129362 A RU2012129362 A RU 2012129362A RU 2012129362 A RU2012129362 A RU 2012129362A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- acid sequence
- target nucleic
- primer
- molecule
- Prior art date
Links
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims abstract 68
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract 39
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract 28
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract 28
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims abstract 19
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 18
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract 9
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract 9
- 238000010791 quenching Methods 0.000 claims abstract 8
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract 7
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims abstract 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract 6
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 13
- 108010037497 3'-nucleotidase Proteins 0.000 claims 6
- 108010010677 Phosphodiesterase I Proteins 0.000 claims 4
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims 2
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 claims 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 claims 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени (TSG-праймера), включающий стадии:(a) гибридизации нуклеиновокислотной последовательности-мишени с TSG-праймером; при этом TSG-праймер содержит (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;(b) приведения в контакт продукта со стадии (а) с матричной полимеразой нуклеиновых кислот в условиях удлинения праймера, так что реакция 3'-удлинения индуцируется по 3'-концу TSG-праймера; и(c) детекции сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, тем самым данный сигнал указывает на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени в ДНК или смеси нуклеиновых кислот.2. Способ по п.1, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот
Claims (21)
1. Способ детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени (TSG-праймера), включающий стадии:
(a) гибридизации нуклеиновокислотной последовательности-мишени с TSG-праймером; при этом TSG-праймер содержит (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;
(b) приведения в контакт продукта со стадии (а) с матричной полимеразой нуклеиновых кислот в условиях удлинения праймера, так что реакция 3'-удлинения индуцируется по 3'-концу TSG-праймера; и
(c) детекции сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, тем самым данный сигнал указывает на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени в ДНК или смеси нуклеиновых кислот.
2. Способ по п.1, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 5'→3'-нуклеазной активностью, и TSG-праймер удлиняется по своему 3'-концу под действием полимеразной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот и расщепляется на своем 5'-конце под действием 5'→3'-нуклеазной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот, в результате чего из TSG-праймера высвобождается либо репортерная молекула, либо молекула-гаситель, генерируя сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
3. Способ по п.2, дополнительно включающий повторение по меньшей мере дважды стадий (а)-(b) или (а)-(с) вместе со стадией денатурации между повторяющимися циклами с целью усиления сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
4. Способ по п.1 или 2, где репортерная молекула или молекула-гаситель на TSG-праймере расположена на его 5'-конце или на расстоянии 1-5 нуклеотидов от его 5'-конца.
5. Способ по п.1, где молекула-гаситель представляет собой флуоресцентную молекулу и где сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, детектируемый на стадии (с), представляет собой сигнал от флуоресцентной молекулы-гасителя.
6. Способ по п.1, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 3'→5'-экзонуклеазной активностью.
7. Способ по п.6, где TSG-праймер содержит по меньшей мере один ошибочно спаренный нуклеотид, имеющий остов, устойчивый в отношении 3'→5'-экзонуклеазной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот на своем 3'-концевом участке.
8. Способ по п.1, который осуществляют на твердой фазе и где TSG-праймер иммобилизован через свой 5'-конец на поверхности твердой подложки.
9. Способ по п.1 или 8, где нуклеиновокислотная последовательность-мишень включает по меньшей мере два типа нуклеиновокислотных последовательностей, и TSG-праймеры включают по меньшей мере два типа праймеров.
10. Способ по п.1 или 8, где нуклеиновокислотная последовательность-мишень имеет вариабельность нуклеотидов.
11. Способ детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени, (TSG-праймера) в реакции амплификации, включающий стадии:
(а) гибридизации нуклеиновокислотной последовательности-мишени с использованием пары праймеров, состоящей из двух праймеров в качестве прямого праймера и обратного праймера, способных амплифицировать нуклеиновокислотную последовательность-мишень; при этом по меньшей мере один из этих двух праймеров представляет собой TSG-праймер; при этом TSG-праймер содержит (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;
(b) приведения в контакт продукта со стадии (а) с матричной полимеразой нуклеиновых кислот в условиях удлинения праймера, так что реакция 3'-удлинения индуцируется по 3'-концам этих двух праймеров;
(c) денатурации продукта со стадии (b);
(d) повторение стадий (а)-(с) по меньшей мере дважды с целью как амплификации нуклеиновокислотной последовательности-мишени, так и усиления сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени; и
(e) детекции сигнала, указывающего на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, при этом детекцию осуществляют для каждого цикла повторного проведения стадии (d), в конце повторного проведения стадии (d) или в каждый из предварительно заданных интервалов времени в процессе повторного проведения, тем самым данный сигнал указывает на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
12. Способ по п.11, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 5'→3'-нуклеазной активностью, и TSG-праймер удлиняется по своему 3'-концу под действием полимеразной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот и расщепляется на своем 5'-конце под действием 5'→3'-нуклеазной активности матричной полимеразы нуклеиновых кислот, в результате чего из TSG-праймера высвобождается либо репортерная молекула, либо молекула-гаситель, генерируя сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
13. Способ по п.11 или 12, где репортерная молекула или молекула-гаситель на TSG-праймере расположена на его 5'-конце или на расстоянии 1-5 нуклеотидов от его 5'-конца.
14. Способ по п.11, где молекула-гаситель представляет собой флуоресцентную молекулу и где сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени, детектируемый на стадии (е), представляет собой сигнал от флуоресцентной молекулы-гасителя.
15. Способ по п.11, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 3'→5'-экзонуклеазной активностью.
16. Способ по п.11, который осуществляют на твердой фазе, где по меньшей мере один из этих двух праймеров иммобилизован через свой 5'-конец на поверхности твердой подложки и где иммобилизованный праймер представляет собой TSG-праймер.
17. Набор для детекции нуклеиновокислотной последовательности-мишени из ДНК или смеси нуклеиновых кислот с использованием праймера, генерирующего сигнал от мишени, (TSG-праймера), содержащий:
(a) TSG-праймер, содержащий (1) гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеиновокислотной последовательности-мишени, и (2) репортерную молекулу и молекулу-гаситель; при этом если TSG-праймер не гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно располагаются близко друг к другу, что позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы; при этом если TSG-праймер гибридизуется с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью, то репортерная молекула и молекула-гаситель пространственно разделяются, что не позволяет молекуле-гасителю гасить сигнал от репортерной молекулы, в результате чего генерируется и выявляется сигнал, указывающий на присутствие нуклеиновокислотной последовательности-мишени;
(b) матричную полимеразу нуклеиновых кислот, способную индуцировать реакцию 3'-удлинения по 3'-концу TSG-праймера в результате действия на продукт гибридизации TSG-праймера и нуклеиновокислотной последовательности-мишени.
18. Набор по п.17, содержащий пару праймеров, состоящую из двух праймеров в качестве прямого праймера и обратного праймера, способных амплифицировать нуклеиновокислотную последовательность-мишень; при этом по меньшей мере один из этих двух праймеров представляет собой TSG-праймер.
19. Набор по п.17 или 18, где матричная полимераза нуклеиновых кислот обладает 5'→3'-нуклеазной активностью для индукции как реакции 3'-удлинения по 3'-концу TSG-праймера в результате проявления ее полимеразной активности, так и реакции 5'-расщепления на 5'-конце TSG-праймера в результате проявления ее 5'→3'-нуклеазной активности.
20. Набор по любому из пп.17 и 18, где репортерная молекула или молекула-гаситель на TSG-праймере расположена на его 5'-конце или на расстоянии 1-5 нуклеотидов от его 5'-конца.
21. Набор по п.17 или 18, где матричная полимераза нуклеиновых кислот представляет собой матричную полимеразу нуклеиновых кислот, обладающую 3'→5'-экзонуклеазной активностью.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR10-2009-0127880 | 2009-12-21 | ||
| KR20090127880 | 2009-12-21 | ||
| PCT/KR2010/001873 WO2011078441A1 (en) | 2009-12-21 | 2010-03-26 | Tsg primer target detection |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012129362A true RU2012129362A (ru) | 2014-01-27 |
| RU2551321C2 RU2551321C2 (ru) | 2015-05-20 |
Family
ID=44195946
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012129362/10A RU2551321C2 (ru) | 2009-12-21 | 2010-03-26 | Обнаружение мишени tsg-праймером |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US9845492B2 (ru) |
| EP (1) | EP2516679B1 (ru) |
| JP (1) | JP5822843B2 (ru) |
| KR (1) | KR101569476B1 (ru) |
| CN (1) | CN102762744B (ru) |
| AU (1) | AU2010336137B2 (ru) |
| BR (1) | BR112012018394B8 (ru) |
| CA (1) | CA2784344C (ru) |
| IL (1) | IL220478A (ru) |
| RU (1) | RU2551321C2 (ru) |
| WO (1) | WO2011078441A1 (ru) |
Families Citing this family (35)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2012024642A1 (en) * | 2010-08-20 | 2012-02-23 | Life Technologies Corporation | Quantitative real-time pcr assay using fret dual-labeled primers |
| MX352460B (es) | 2011-01-11 | 2017-11-24 | Seegene Inc | Detección de secuencias de ácido nucleico objetivo mediante ensayo de escisión y extensión del pto. |
| US11078525B2 (en) | 2011-03-29 | 2021-08-03 | Seegene, Inc. | Detection of target nucleic acid sequence by PTO cleavage and extension-dependent cleavage |
| WO2012150749A1 (en) | 2011-05-04 | 2012-11-08 | Seegene, Inc. | Detection of target nucleic acid sequences by po cleavage and hybridization |
| KR20130101952A (ko) * | 2012-02-02 | 2013-09-16 | 주식회사 씨젠 | Ｐｔｏ 절단과 연장-의존적 혼성화를 이용한 타겟 핵산서열의 검출 |
| NO2817421T3 (ru) * | 2012-02-20 | 2018-05-12 | ||
| CA2865163A1 (en) * | 2012-02-23 | 2013-08-29 | Qiagen Mansfield, Inc. | Multimodal pcr target detection |
| CA2864523C (en) | 2012-03-05 | 2019-02-05 | Seegene, Inc. | Detection of nucleotide variation on target nucleic acid sequence by pto cleavage and extension assay |
| JP6096885B2 (ja) * | 2012-04-19 | 2017-03-15 | シージーン アイエヌシー | ＰＴＯ切断及び伸長依存的なシグナリングオリゴヌクレオチド切断を用いたターゲット核酸配列の検出｛ＤｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆＴａｒｇｅｔＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄＳｅｑｕｅｎｃｅｂｙＰＴＯＣｌｅａｖａｇｅａｎｄＥｘｔｅｎｓｉｏｎ−ＤｅｐｅｎｄｅｎｔＳｉｇｎａｌｉｎｇＯｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅＣｌｅａｖａｇｅ｝ |
| US9074249B2 (en) | 2012-06-04 | 2015-07-07 | New England Biolabs, Inc. | Detection of amplification products |
| US9074243B2 (en) | 2012-07-27 | 2015-07-07 | New England Biolabs, Inc. | Detection of amplification products |
| EP2948566B1 (en) * | 2013-01-24 | 2025-03-26 | California Institute of Technology | Chromophore-based characterization and detection methods |
| US10077475B2 (en) | 2013-01-24 | 2018-09-18 | California Institute Of Technology | FRET-based analytes detection and related methods and systems |
| JP6544861B2 (ja) * | 2013-02-07 | 2019-07-17 | ラトガース，ザ ステート ユニバーシティ オブ ニュー ジャージー | 高い選択性の核酸増幅プライマー |
| JP2016512041A (ja) * | 2013-03-15 | 2016-04-25 | アボツト・モレキユラー・インコーポレイテツド | 多重対立遺伝子の検出 |
| WO2015147370A1 (en) | 2014-03-28 | 2015-10-01 | Seegene, Inc. | Detection of target nucleic acid sequences using different detection temperatures |
| CN106661616A (zh) * | 2014-04-23 | 2017-05-10 | 儿童医学中心公司 | 使用核酸卡尺的高通量结构测定 |
| KR101742681B1 (ko) * | 2015-01-30 | 2017-06-01 | 에스디 바이오센서 주식회사 | 상보적 염기서열 내지는 미스-매치된 염기를 포함하는 상보적인 염기서열과 연결된 pcr 프라이머 및 이를 이용한 핵산 증폭 방법 |
| KR101756875B1 (ko) * | 2015-05-28 | 2017-07-11 | 에스디 바이오센서 주식회사 | 상보적 염기서열과 미스-매치된 염기서열 그리고 reporter와 quencher를 포함하는 이중 기능성 올리고뉴클레오타이드 및 이를 이용한 핵산 증폭 및 측정 방법 |
| CN105256055B (zh) * | 2015-11-13 | 2019-02-05 | 中华人民共和国汕头出入境检验检疫局 | 基于dpo引物的实时荧光pcr检测植物乳杆菌的方法、引物及试剂盒 |
| CN108368547B (zh) | 2015-12-15 | 2022-04-05 | Seegene株式会社 | 与靶核酸序列有关的信号提取 |
| CN110475871B (zh) | 2017-03-28 | 2024-04-12 | Seegene株式会社 | 用于确定靶核酸序列的存在的分析信号 |
| CN107091834B (zh) * | 2017-05-24 | 2019-07-02 | 青岛科技大学 | 一种基于发卡错配循环放大技术检测dna的方法 |
| US11591645B2 (en) | 2017-08-31 | 2023-02-28 | Seegene, Inc. | Evaluation of performance of components using a pair of dimer-forming primers |
| JP7012151B2 (ja) | 2017-09-28 | 2022-01-27 | シージーン アイエヌシー | 試料内ターゲット分析物を分析する方法及び装置 |
| WO2019066461A2 (en) | 2017-09-29 | 2019-04-04 | Seegene, Inc. | DETECTION OF TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCES BY CLEAVAGE ANALYSIS AND EXTENSION OF PTO |
| CN107760764B (zh) * | 2017-10-23 | 2023-04-07 | 上海阅尔基因技术有限公司 | 一种基于引物荧光和淬灭标记的靶核酸检测方法和试剂盒 |
| KR102369388B1 (ko) | 2018-01-05 | 2022-03-02 | 주식회사 씨젠 | 시료에서 M. tuberculosis, M. bovis 및 M. bovis BCG의 존재 또는 부존재를 결정하는 방법 |
| JP7077992B2 (ja) * | 2019-02-22 | 2022-05-31 | 横河電機株式会社 | 核酸配列計測用デバイス、核酸配列計測方法、および核酸配列計測装置 |
| CN112111566A (zh) | 2020-09-23 | 2020-12-22 | 迈克生物股份有限公司 | 多重核酸检测方法、组合及试剂盒 |
| WO2022061593A1 (zh) | 2020-09-23 | 2022-03-31 | 迈克生物股份有限公司 | 检测核酸的组合、方法及试剂盒 |
| KR102894467B1 (ko) | 2021-03-05 | 2025-12-03 | 주식회사 씨젠 | SARS-CoV-2 변이를 검출하는 방법 |
| EP4403645A4 (en) | 2021-09-17 | 2025-10-08 | Seegene Inc | DETECTION OF A TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCE USING A MARKER OLIGONUCLEOTIDE CARRYING A SYNTHETIC NON-NATURAL BASE |
| EP4603593A1 (en) | 2022-10-14 | 2025-08-20 | Seegene, Inc. | Method for detecting target nucleic acid in sample using two probes with different tm values |
| EP4621068A1 (en) | 2022-11-16 | 2025-09-24 | Seegene, Inc. | Detection of target nucleic acid by quenching-pto cleavage and extension (q-ptoce) assay |
Family Cites Families (40)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US3996345A (en) | 1974-08-12 | 1976-12-07 | Syva Company | Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays |
| US4351760A (en) | 1979-09-07 | 1982-09-28 | Syva Company | Novel alkyl substituted fluorescent compounds and polyamino acid conjugates |
| US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| US4800159A (en) | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
| IL86724A (en) | 1987-06-19 | 1995-01-24 | Siska Diagnostics Inc | Methods and kits for amplification and testing of nucleic acid sequences |
| EP0359789B1 (en) | 1988-01-21 | 1993-08-04 | Genentech, Inc. | Amplification and detection of nucleic acid sequences |
| US5210015A (en) | 1990-08-06 | 1993-05-11 | Hoffman-La Roche Inc. | Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
| US5538848A (en) | 1994-11-16 | 1996-07-23 | Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. | Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe |
| US6117635A (en) * | 1996-07-16 | 2000-09-12 | Intergen Company | Nucleic acid amplification oligonucleotides with molecular energy transfer labels and methods based thereon |
| US6485901B1 (en) * | 1997-10-27 | 2002-11-26 | Boston Probes, Inc. | Methods, kits and compositions pertaining to linear beacons |
| ES2290979T3 (es) | 1997-12-15 | 2008-02-16 | Csl Behring Gmbh | Cebador marcado para uso en la deteccion de acidos nucleicos diana. |
| GB9812768D0 (en) | 1998-06-13 | 1998-08-12 | Zeneca Ltd | Methods |
| US6383752B1 (en) * | 1999-03-31 | 2002-05-07 | Hybridon, Inc. | Pseudo-cyclic oligonucleobases |
| US6322980B1 (en) | 1999-04-30 | 2001-11-27 | Aclara Biosciences, Inc. | Single nucleotide detection using degradation of a fluorescent sequence |
| US6277607B1 (en) * | 1999-05-24 | 2001-08-21 | Sanjay Tyagi | High specificity primers, amplification methods and kits |
| US7537886B1 (en) | 1999-06-22 | 2009-05-26 | Life Technologies Corporation | Primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids |
| US7205105B2 (en) * | 1999-12-08 | 2007-04-17 | Epoch Biosciences, Inc. | Real-time linear detection probes: sensitive 5′-minor groove binder-containing probes for PCR analysis |
| US7344830B2 (en) | 2000-09-26 | 2008-03-18 | Health Research Inc. | Heteroduplex tracking assay |
| AU2002305941A1 (en) * | 2001-03-01 | 2002-09-19 | The Johns Hopkins University | Quantitative assay for the simultaneous detection and speciation of bacterial infections |
| US20060057561A1 (en) * | 2001-06-14 | 2006-03-16 | Hart Keith W | Virus detection method, primers therefor and screening kit |
| US7205112B2 (en) * | 2001-06-27 | 2007-04-17 | University Of South Florida | Materials and methods for detection of enterovirus and norovirus |
| US20040076994A1 (en) | 2001-10-26 | 2004-04-22 | Hidenobu Yaku | Method of detecting target nucleic acid and nucleic acid probe |
| US6818420B2 (en) | 2002-02-27 | 2004-11-16 | Biosource International, Inc. | Methods of using FET labeled oligonucleotides that include a 3′-5′ exonuclease resistant quencher domain and compositions for practicing the same |
| WO2003102239A2 (en) * | 2002-05-31 | 2003-12-11 | Secretary, Department Of Atomic Energy | Met/fret based method of target nucleic acid detection whereby the donor/acceptor moieties are on complementary strands |
| JP3923917B2 (ja) | 2003-03-26 | 2007-06-06 | 株式会社東芝 | ターゲットの製造方法、標的配列検出方法、ターゲットおよび標的配列検出用アッセイキット |
| EP1616028A1 (en) * | 2003-04-18 | 2006-01-18 | Warnex Research Inc. | Polynucleotides for the detection of listeria monocytogenes |
| DK1687609T3 (en) * | 2003-10-28 | 2015-01-12 | Epoch Biosciences Inc | Fluorescent probes for DNA detection by hybridization with improved sensitivity and low background |
| US7667024B2 (en) * | 2003-11-19 | 2010-02-23 | Allelogic Biosciences Corp. | Oligonucleotides labeled with a plurality of fluorophores |
| GB0423552D0 (en) * | 2004-10-22 | 2004-11-24 | Hepcgen Ltd | Methods |
| RU2400538C2 (ru) | 2005-03-05 | 2010-09-27 | Сиджен, Инк. | Олигонуклеотид с двойственной специфичностью и способы, в которых он используется |
| US20070048758A1 (en) * | 2005-06-09 | 2007-03-01 | Epoch Biosciences, Inc. | Improved primer-based amplification methods |
| US7919244B2 (en) * | 2005-06-16 | 2011-04-05 | Biotools Biotechnological & Medical Laboratories, S.A. | Nucleic acid detection method involving the direct generation of a measurable signal |
| JP2009501532A (ja) | 2005-07-15 | 2009-01-22 | アプレラ コーポレーション | 核酸増幅物の検出 |
| EP2829615B1 (en) | 2005-07-25 | 2018-05-09 | Alere San Diego, Inc. | Kit for multiplexing recombinase polymerase amplification |
| US20090068643A1 (en) * | 2005-11-23 | 2009-03-12 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Dual Function Primers for Amplifying DNA and Methods of Use |
| US20070254284A1 (en) * | 2006-05-01 | 2007-11-01 | Biwei Zhao | A nucleic acid detection method |
| GB0609498D0 (en) * | 2006-05-12 | 2006-06-21 | Oncomethylome Sciences S A | Novel methylation marker |
| GB0703997D0 (en) * | 2007-03-01 | 2007-04-11 | Oxitec Ltd | Methods for detecting nucleic sequences |
| KR20110050327A (ko) * | 2009-11-07 | 2011-05-13 | 주식회사 씨젠 | Ｔｈｄ 프라이머 타겟 검출 |
-
2010
- 2010-03-26 US US13/515,975 patent/US9845492B2/en active Active
- 2010-03-26 AU AU2010336137A patent/AU2010336137B2/en active Active
- 2010-03-26 CN CN201080064263.9A patent/CN102762744B/zh active Active
- 2010-03-26 CA CA2784344A patent/CA2784344C/en active Active
- 2010-03-26 EP EP10839638.3A patent/EP2516679B1/en active Active
- 2010-03-26 BR BR112012018394A patent/BR112012018394B8/pt active IP Right Grant
- 2010-03-26 JP JP2012545829A patent/JP5822843B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2010-03-26 WO PCT/KR2010/001873 patent/WO2011078441A1/en not_active Ceased
- 2010-03-26 RU RU2012129362/10A patent/RU2551321C2/ru active
- 2010-03-26 KR KR1020127017999A patent/KR101569476B1/ko active Active
-
2012
- 2012-06-18 IL IL220478A patent/IL220478A/en active IP Right Grant
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2010336137A1 (en) | 2012-07-12 |
| JP5822843B2 (ja) | 2015-11-24 |
| AU2010336137B2 (en) | 2015-08-06 |
| IL220478A0 (en) | 2012-08-30 |
| EP2516679A4 (en) | 2013-05-22 |
| WO2011078441A1 (en) | 2011-06-30 |
| US20120264643A1 (en) | 2012-10-18 |
| IL220478A (en) | 2016-09-29 |
| BR112012018394B8 (pt) | 2021-07-27 |
| EP2516679A1 (en) | 2012-10-31 |
| BR112012018394A2 (pt) | 2017-01-10 |
| KR20120107488A (ko) | 2012-10-02 |
| CA2784344C (en) | 2018-01-02 |
| US9845492B2 (en) | 2017-12-19 |
| CN102762744A (zh) | 2012-10-31 |
| JP2013514803A (ja) | 2013-05-02 |
| KR101569476B1 (ko) | 2015-11-16 |
| CA2784344A1 (en) | 2011-06-30 |
| BR112012018394B1 (pt) | 2021-02-23 |
| CN102762744B (zh) | 2017-07-25 |
| RU2551321C2 (ru) | 2015-05-20 |
| EP2516679B1 (en) | 2017-08-23 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US8329394B2 (en) | Methods and substances for isolation and detection of small polynucleotides | |
| JP2019528726A5 (ru) | ||
| RU2012109893A (ru) | Зонд td и его применения | |
| JP2009521223A5 (ru) | ||
| JP2015156872A5 (ru) | ||
| GB2595076A (en) | Methods for targeted nucleic acid library formation | |
| JP2013509871A5 (ru) | ||
| RU2012142160A (ru) | Детекция нуклеиновокислотных последовательностей-мишеней в анализе с расщеплением и удлинением рто | |
| US20110117559A1 (en) | Small rna detection assays | |
| EP1456416A4 (en) | MULTIPLEX OLIGONUCLEOTIDE ADDITION AND TARGET AMPLIFICATION | |
| WO2005089508A3 (en) | Dna sequence detection by limited primer extension | |
| RU2010116772A (ru) | Полинуклеотидные праймеры | |
| CA2532160A1 (en) | Methods of genotyping using differences in melting temperature | |
| NZ594155A (en) | Methods for amplifying hepatitis c virus nucleic acids | |
| RU2014138951A (ru) | Детекция нуклеотидной вариации в нуклеиновокислотной последовательности-мишени в анализе с расщеплением и удлинением зондирующего и метящего олигонуклеотида (рто) | |
| WO2008013462A2 (en) | Isothermal detection methods and uses thereof | |
| JP2019508043A5 (ru) | ||
| RU2016104218A (ru) | Определение целевых нуклеиновокислотных последовательностей путем расщепления зондирующего олигонуклеотида и гибридизации | |
| CN108368557A (zh) | 包含用于核酸等温扩增的报告染料、猝灭剂的基于等温的双功能性寡聚核苷酸及利用其的核酸扩增和测定方法 | |
| RU2018113750A (ru) | Улучшенное выявление коротких гомополимерных повторов | |
| CN115948604A (zh) | 一种基于DNAzyme与PER扩增的病毒检测试剂盒 | |
| CN105063190A (zh) | 微小rna的固相芯片恒温检测方法 | |
| KR20140123858A (ko) | 폴리뉴클레오티드 및 그의 용도 | |
| JP2014003946A5 (ru) | ||
| JP2019502374A5 (ru) |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HE9A | Changing address for correspondence with an applicant |