RU2015120663A

RU2015120663A - Связывающие белки, содержащие, по меньшей мере, две повторяющиеся области-антагонисты HER2

Info

Publication number: RU2015120663A
Application number: RU2015120663A
Authority: RU
Inventors: Ульрике ФИДЛЕР; Игансио ДОЛАДО; Хайке Штробель
Original assignee: Молекуляр Партнерс Аг
Priority date: 2012-11-30
Filing date: 2013-12-02
Publication date: 2017-01-10
Also published as: EP2925784A1; CN104918959A; WO2014083208A1; EP2925784B1; JP6410724B2; RU2664464C9; KR20150091138A; WO2014083208A8; US10370414B2; RU2664464C2; KR102290592B1; CA2892747A1; MX366223B; MX2015006548A; US20150299265A1; AU2013351096C9; AU2018256592A1; AU2013351096A1; WO2014083208A9; CA2892747C

Claims

1. Рекомбинантный связывающий белок, содержащий, по меньшей мере, первую и вторую повторяющиеся области, каждая из которых связывает внеклеточную область HER2, при этом две повторяющиеся области ковалентно связаны.

2. Связывающий белок по п. 1, в котором первая повторяющаяся область связывает область II HER2, а вторая повторяющаяся область связывает область IV HER2.

3. Связывающий белок по п. 2, в котором первая и вторая повторяющиеся области находятся в одном и том же полипептиде, при этом первая повторяющаяся область, связывающая область II HER2, находится на N-конце второй повторяющейся области, связывающей область IV HER2.

4. Связывающий белок по п. 2, в котором первая повторяющаяся область, связывающая область II HER2, не конкурирует с пертузумабом за связывание HER2.

5. Связывающий белок по п. 2, в котором вторая повторяющаяся область, связывающая область IV HER2, не конкурирует с трастузумабом за связывание HER2.

6. Связывающий белок по п. 1, в котором первой повторяющейся областью является область анкиринового повтора, и второй повторяющейся областью, является область анкиринового повтора.

7. Связывающий белок по п. 1, в котором первая повторяющаяся область связывает внеклеточную область HER2 в PBS с Kd менее 10^-7М, а вторая повторяющаяся область связывает внеклеточную область HER2 в PBS с Kd менее 10^-7М.

8. Связывающий белок по п. 1, который ингибирует стимулированную пролиферацию клеток ВТ474 при показателе IC₅₀ менее 100 нМ.

9. Связывающий белок по п. 1, который индуцирует апоптоз в клетках ВТ474 при показателе ЕС₅₀ менее 100 нМ.

10. Связывающий белок по п. 1, в котором первая и вторая повторяющиеся области соединены полипептидным линкером.

11. Связывающий белок по п. 1, в котором

a) первая повторяющаяся область содержит аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 70% идентична одной области анкиринового повтора, выбранной из группы, включающей SEQ ID 62-68, 72 и 114-121, и/или

b) вторая повторяющаяся область содержит аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 70% идентична одной области анкиринового повтора, выбранной из группы, включающей SEQ ID 74-82.

12. Связывающий белок по п. 1, в котором

a) первая повторяющаяся область конкурирует за связывание HER2 с областью анкиринового повтора, выбранной из группы, включающей SEQ ID 62-68, 72 и 114-121, и/или

b) вторая повторяющаяся область конкурирует за связывание HER2 с областью анкиринового повтора, выбранной из группы, включающей SEQ ID 74-82.

13. Связывающий белок по п. 11, в котором, по меньшей мере, одна аминокислота изменена следующим образом:

a) G в положении 1 и/или S в положении 2 упомянутой области анкиринового повтора отсутствует; или

b) L в предпоследнем положении и/или N в последнем положении упомянутой области анкиринового повтора заменены А.

14. Связывающий белок по п. 11, в котором

a) первая повторяющаяся область выбрана из группы области анкириновых повторов, состоящей из SEQ ID 62-68, 72 и 114-121, и/или

b) вторая повторяющаяся область выбрана из группы области анкириновых повторов, состоящей из SEQ ID 74-82,

в котором дополнительно

a) G в положении 1 и/или S в положении 2 упомянутой области анкиринового повтора необязательно отсутствует; и

b) L в предпоследнем положении и/или N в последнем положении упомянутой области анкиринового повтора необязательно заменены А.

15. Связывающий белок по п. 1, в котором

a) первая повторяющаяся область содержит модуль анкиринового повтора, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID 15-18, 21-23, 37, 38, 125, 126, 129,130, 133 и 134 и последовательности, в которых до 9 аминокислотных остатков в SEQ ID 15-18, 21-23, 37, 38, 125, 126,129, 130,133 и 134 заменены любыми другими аминокислотными остатками, и/или

b) вторая повторяющаяся область содержит модуль анкиринового повтора, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей SEQ ID 46, 47, 51, 52, 55 и 56 и последовательности, в которых до 9 аминокислотных остатков в SEQ ID 46, 47, 51, 52, 55 и 56 заменены любыми другими аминокислотными остатками.

16. Связывающий белок по п. 15, в котором модуль анкиринового повтора имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей KDFQGITPLHIAATSGHLEIVEVLLKAGADVNA (SEQ ID16) и последовательности, в которых до 9 аминокислотных остатков в SEQ ID 16 заменены любыми другими аминокислотными остатками, и, по меньшей мере, один аминокислотный остаток изменен следующим образом:

a) F в положении 3 заменена А

b) Q в положении 4 необязательно заменена Е;

c) G в положении 5 необязательно заменена S;

d) I в положении 6 необязательно заменена V;

e) I в положении 11 необязательно заменена L;

f) Τ в положении 14 необязательно заменена Q; и/или

g) S в положении 15 заменена аминокислотой, выбранной из группы, включающей N и W.

17. Связывающий белок по п. 16, в котором S в положении 15 заменена N.

18. Связывающий белок по п. 15, в котором модуль анкиринового повтора имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей KDITGETPLHHAADSGHLEIVEVLLKAGADVNA (SEQ ID 18) и последовательности, в которых до 9 аминокислотных остатков SEQ ID 18 заменены любыми другими аминокислотными остатками, и в котором

а) I в положении 3 заменена V;

b) Ε в положении 6 заменена D;

c) Η в положении 11 заменена L;

d) D в положении 14 заменена Q;

e) S в положении 15 заменена Н; и/или

f) Ε в положении 19 заменена V.

19. Связывающий белок по п. 1, содержащий полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 70%, идентичную полипептиду, выбранному из группы, включающей SEQ ID 83-98, 102, 103, 122, 123 и 136-141.

20. Связывающий белок по п. 1, содержащий полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 90%, идентичную полипептиду, выбранному из группы, включающей SEQ ID 83-98, 102, 103, 122, 123 и 136-141.

21. Фармацевтический состав, содержащий связывающий белок по. п. 1 и фармацевтически приемлемый носитель.

22. Способ лечения пациента, который заключается во введении пациенту эффективного количества фармацевтической композиции по п. 21 для лечения рака.

23. Способ по п. 22, при этом рак отличается, по меньшей мере, одним признаком, выбранным из группы, включающей

a) амплификацию кодирующего HER2 гена

b) сверхэкспрессию кодирующего HER2 гена,

c) экспрессию мутантного кодирующего HER2 гена, и

d) сверхэкспрессию кодирующего HER3 гена в резистентных к трастузумабу опухолях.

24. Способ по п. 22, при этом рак выбран из группы, включающей

рак молочной железы,

рак яичников,

рак желудочно-кишечного тракта,

рак желудка,

рак матки, и

колоректальный рак.