TWI277652B - Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens - Google Patents

Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens Download PDF

Info

Publication number
TWI277652B
TWI277652B TW089127378A TW89127378A TWI277652B TW I277652 B TWI277652 B TW I277652B TW 089127378 A TW089127378 A TW 089127378A TW 89127378 A TW89127378 A TW 89127378A TW I277652 B TWI277652 B TW I277652B
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
sample
rna
solution
minutes
chromatography
Prior art date
Application number
TW089127378A
Other languages
English (en)
Inventor
Kathleen Danenberg
Peter Danenberg
Steven Swenson
Original Assignee
Univ Southern California
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Univ Southern California filed Critical Univ Southern California
Application granted granted Critical
Publication of TWI277652B publication Critical patent/TWI277652B/zh

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1003Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Description

1277652 五、發明說明(1) 政府補助 政府對屬於國立健康部之國立癌症局計劃編號R 0 1 C A 7 1 7 1 6的本發明具有某些權利。 發明範疇 本發明係關於自生物組織樣品中純化RNA,DNA及蛋白質 之方法。 背景 測定 要的, 可測定 法。 例如 酵素, 苷磷酸 的路徑 酶為化 組織中基因表現程度對精確診斷人體疾病是相當重 且逐漸-地用於決定病患治療過程。藥學基因學方法 出病患似有反應之特定藥劑,並開發出新治療方 ,胸脊酸合成酶 其可將去氧尿苷 (dTMP ),並且 (強斯頓(John 學治療藥劑的標 5-氟尿嘧啶(5-FU), 單一噤劑,其主 乳癌的 胸嘴σ定 在原 ,1 995 曼(Le 含量減少,最後 發性腫瘤(強斯 )及移轉(福祿 ichmann)等人 (TS )為DNA生合成時不可或缺的 磷酸(dUMP )還原曱基化成去氧胸 是細胞内哺°定核脊酸唯一重新合成 ston)等人·,1 9 95 )。胸脊酸合成 的物,最常使用者為抗葉酸藥劑 5 - F U為最有效治療結腸,頭及頸與 要作用是抑制T S活性,致使細胞内 導致細胞死亡。 頓等人,1 9 9 5 ;林吉(Lenz )等人 吉(Farrugia)等人,1997 ;林許 ,1 9 9 7 )之臨床腫瘤樣品發現T S的
第4頁 1277652 ____________ 五、發明I兒日月⑵ 表現相當的不同,例如,在結直腸癌中,腫瘤組織@ 與正常腸胃黏膜組織之TS表現比例範圍自2至1 0 (阿德蘭 (Ardalan)及蔡格(Zang) ,1 9 96 ) ° 胸苔酸合成酶在腫瘤抗性的發展過程中亦有臨床上的重 要性,研究證明贅生細胞暴露於5 _ F u後’顯示T s蛋白急速 的誘發,且TS酵素含量增加(絲皮爾(Spears )等人’
1 9 8 2 ;絲瓦恩(Swa i η )等人,1 9 8 9 )。腫瘤對細胞毒性 藥劑(例如5 _ F U )反應後急速過度表現TS在氟尿嘧啶抗性 發展過程可能扮演重要的角色。先前的研究已證明TSf白 的含量與5-FU療效成正比,換言之,蛋白質與RNA表現成 正比(捷克曼(Jackman)等人,1985),且TS的表現在 結直腸癌與乳癌是個強而有利的預測標記(捷克曼等人, 1985 ;何立可許(Horikoshi )等人,1992 )。 在進展性移轉疾病中,可預期具高含量TS mRNA (以 RT-PCR定量)及高度TS蛋白表現之結直腸癌(強斯頓等人 ,1995 ;福祿吉等人,1997,Lei chm a η 等人,1 9 9 7 ),胃 癌(Lenz等人,1995 ;亞歷山大等人,1995),及頭與頸 癌(強斯頓等人’1997)患者對以氣哺咬為基礎之療法呈 現較差的反應。當TS表現低時,可能是對藥劑有反應者或 無反應者,f但若TS含量高於平均值之病患則通常係為無反 應者,假若與其他分子特性(諸如二氫嘴淀去氫酶(DPD) 及胸苷磷酸酶(TP )表現,複製錯誤正向(RER+ )狀態 (奇晴司(Kitchens)及貝格(Berger)1997),及p 53 狀態(Lenz等人,1997 ) —起評斷,則可進一步增強以過
1277652 五、發明說明(3) 〜 度表現的預測價值。目前自人體腫瘤表現TS研究推滴丨, 測人體腫瘤中TS表現反應及結果可於將來提供病患^Ts = 關療法的優點。 ~ # 直至目前,包括這些TS表現之定量組織基因表現研 限於自冷凍組織中萃取出RNA之反轉錄聚合酶鏈結反廉 w (R T - P C R ) ’然而’大多數病理樣品並非為冷;東組織,
是以福馬林固定,及以石臘包埋(FFPE ),以便作為組镞 分析及原樣保存之用◊利用免疫組織化學染色法監^ ^白 表現程度可半定量,並間接方式監視此類固定化及包埋樣 品中之基因表現程度。因為石臘包埋樣品是廣泛使用之·方 式,故快速及可靠的自此類樣品中分離核酸(特別是rna) 之方法是必須的。 目前有一些自生物樣品中純化RNA的技術,但這些技術 均非為自FFPE樣品中分離RNA的可靠技術,例如周姆塞斯 基((:11〇11^271131^).(美國專利申請案5,346,994號)揭示 利用酚及異硫氰酸胍之液相分離技術自組織中純化R N A的 方法,生物樣品置於酚及異硫氰酸胍之液態溶液中均質化 ’而後將均質物與氣仿混合,經過離心作用後,均質物分 散至有機相’雙相界面及水相中,蛋白質在有機相, 在雙相界面f,而R N A在水相,自水相中將R N A沉殿出來,此 方法並不是自福馬林固定石服包埋組織樣品分離r N A之可 靠方法。 其他已知分離RNA的技術主要是利用胍鹽或酚萃取作用 ’例如山姆布魯克(Sambrook),J·等人,(1989)7.3-
第6頁 1277652 五、發明說明(4) 一 7· 24及歐斯貝爾(Ausubel ),F 4·4·7中所述。然而,這些已知方 ( 1 9 9 4 ) 4.0.3 - 中分離RNA時,並不能產生重 石臘包埋組織樣品 對研究腫瘤組織中基因表現而/ ^的結果。 離技術特別是有需要的,某/、/_自石臘包埋組織中分 可顯示^特定治療的成功與否'二文體或酵素的表現程度 、正疋罝TS基因表現研究偈限於 經由免疫組織化學染色方法可丰j =凍組織之RT-PCR,而 樣病理物質中之TS蛋白表現,因1置監測固定於玻璃片原 分離RNA的技術,測定此樣品 為雙限於原樣病理物質—中 未可行。 —_ I因表現量的定量技術尚 摘要 本發明一個主旨是提供自生物 DNA或蛋白質之可靠·方法,本發物明且亦織樣品中分離出MA, 組織中分離出R N A,D N A或蛋白曾砧^ 供自包埋於石蠟之 方法。 、'簡單’有效及重複性之 本發明所提供自生物組織樣品 樣品置於約50至約100。(:含有效濃产fNA的方法,係將 agent )溶劑中,約5至約12〇分鐘,壞劑(chaotropic ,該破壞劑為胍鹽化合物,而後自中一個具體實例中 如可以氣仿萃取作用回收RNA而後自該溶液中回收RNA,例 在^ Ϊ ΐ明一個方法中,RNA係自原樣病理樣品中分離, 體實例中’石蠟包埋樣品首先要進行去石蠟作用
第7頁 1277652 五、發明說明(5) ------: 佳:壤化的樣品樣較 脫水,合適的低碳數醇類包括甲醇,乙醇,丙J,及丁醇 。在:個ί體實例中,以濃度漸減之低碳數醇類溶液連續 清洗去石蠟化樣品,以進行脫水,在另一= 中嘖 樣品可同時進行去石蠟化及脫水。 /、 利用5械化,:”均質方法,將去石蠟化樣品均 質化爸i:,具體m ’脫水樣品置於含有破壞劑諸如 硫代氰酸脈(亦以異硫氰酸胍之名販售)之溶液中均質 化0 〜 均質化樣品-於破壞性溶液(内含有效
Ki:50;:1 二νΛ—個具體實例中,破壞^ 鹽化合物,較佳的破壞劑為硫代氰酸胍。 而後,例如,利用酚氣仿萃取作用, /刀子大小筛選層析法自溶液中回收rna離交換層析法或 而後’利用萃取作用,電泳,爲祕 適工之,術進_步純化RNA /層析法,沉殿作用或其他 術 庫 ,包括:ί ί : ί ί 應用於一些分子生物學的技 。,用逢機引子進仃之反轉錄作用,以提供。^ 矛j用反轉餘 RNa可剛定福彔作用聚合酶鏈結反應(RT_pcr ),純化之 。利用適當馬林固定石蠟包埋組織樣品中基因表現程度 現程度,a Mr引子’以本發明方法可測定任何a表 疋量RT-PCR技術可比較在相同樣品中,石喂包埋
$ 8頁 1277652 五、發明說明(6) (經由免疫組織化學)組織中蛋白質表現程度及基因表現 程度(利用RT-PCR )。 … 本發明方法可廣泛應用於組織及腫瘤類型與標的基因上 ,因此可用以評估治療方法,以作為各式癌症的診斷工具 ,包括乳癌,頭與頸部癌症,食道癌,結直腸癌,及其他 癌症。本發明方法特別佳的基因為胸苷酸合成酶基因。本 發明方法可重複性定量在FFPE組織中TS基因表現(與冷凍 組織比較)。 圖形簡要說明 圖1顯示不-同加熱時間時冷-肌動蛋白及TS表現程度,這 些數據顯示沒有加熱步驟時,自石臘中萃取的RNA量最 〇 圖2顯示利用95 °C處理0至40分鐘萃取之RNA進行定量PCR ,在正常組織(N ) ·或結直腸癌病患的腫瘤組織(T )中所 測定之/5 -肌動蛋白及T S表現程度,這些數據推測3 0分鐘 為最佳的加熱時間。 圖3顯示溫度與時間對/3-肌動蛋白RNA的產量及分離DNA 的效果,這些數據顯示較長的加熱時間(介於6 0至1 2 0分 鐘間)時,RNA會進行分解作用,同時會使產生DNA PCR訊 號之污染D N A含量增加。柱狀圖為所示的不同時間點及溫 度時三次的實驗的數值。 圖4顯示不同加熱溶液對分離R N A產量的效果,這些數據 顯示溶液中的破壞成分(此例為異硫氰酸胍(G I T C ))為
第9頁 1277652 五、發明說明(7) RNA萃取溶液中所必要的成分,缺乏該成分,則萃取RNA的 產量至少低1 〇倍。 圖5比較在不同6種細胞株經石臘包埋(白色柱狀圖)及 冷凍細胞沉澱物(黑色柱狀圖)的相對TS基因表現程度’ 這些數據顯示石臘萃取RNA分析法$可靠地反應出新鮮冷 凍組織中基因表現數值。 圖6係比較福馬林因定及石臘包埋或冷凍之正常或腫瘤 結直腸及腫瘤食道癌組織中TS基因表現量。 圖7測定對5-FU/LV有反應病患(先前與以基因表現考關 者)之石臘組織中TS/召-肌動蛋白比例。
圖8顯示在-同一病患中,原發性結腸癌及一年後復發肝 移轉之FFPE樣品中,四種惡性標滤基因的表現程度(TS ; 胸苷磷酸酶(TP );環氧酶-2(C0X_2);及血管内皮生長 因子(VEGF)),這些數據顯示一如預測,四種惡性標諸 中的三種在移轉腫瘤組織中有上升的趨勢。 詳細說明 本發明方法係關於自生物樣品中純tRNA,在一個具體 實例中’樣品為石蠟包埋樣品,且該方法涉及包埋樣品的 去石堪作用?,去石蠟組織在破壞溶液(含有有效含量之胍 鹽化合物)中岣質,及在溫度約5 〇至i 〇 〇 t間,加埶均質 組織約5分鐘至約12〇分鐘。與未加熱的樣品比較起'來,此馨 加熱步驟可使自樣品所增幅CJ)NAi增加至丨〇〇〇倍。 因為冷凍腫瘤組織並不廣泛的適用,通常在手術後,各
第10頁 1277652 五、發明說明(8) 種類型的腫瘤均是以石蠟包埋,因而必須採取大量事後研 究TS表現及化學療法措施。 除此之外,該技術可應用於任何廣泛各式腫瘤且沒有標 的基因的限制,此意指未來可製備族群腫瘤的“基因表現 圖譜”,藉此測定個人病患樣品中各式會影響臨床症狀及 對各式化學療劑有反應基因之表現程度。FFPE樣品所測得 自動真正-時間PCR可作為個人腫瘤之治療標的。 組織樣品 利用本發明方法可自任何生物樣品中分離出Μα,生物 樣品常以固定—劑固定之,主要使用者為醛類固定劑,諸如_ 福馬林(甲醛)及戊二醛。亦可利用其他固定技術諸如醇 類ί心入法(貝替福羅(Battifora)及可皮斯其(K〇pinski) ,J •組織化學細胞化學(1 9 8 6 ) 3 4 : 1 0 9 5 ) ^定組織樣品 ,所用的樣品亦可包埋於石臘中,利用本發明方法亦可從 石臘包埋生物樣品中分離RNA,在一個具體實例中/ ,樣品 經福馬林固定,並以石臘包埋。 樣品的去石臘作用 去石臘作嘀係將石臘包埋樣品上的石臘塊去除,已知有 些去石服作用的技術’本發明可使用任何適^的技術, 本發明較佳的方法是利用有機溶劑清洗以溶解石臘,此種_ 溶劑可有效去除組織樣品上的石臘而不會影孿 合適的溶劑選自苯,甲苯,乙基苯,二甲笨:R:A/合離物,
第11頁 I277652 五、發明說明(9) ί ^明方法所用較佳者為二甲笨溶劑,本發明方法所用的 檀溶劑或組合溶劑較佳為高純度,通常大於9 9%。 石=有機,劑強力混合清洗後,再以離心方法處理可去除 ,’樣品離心的速度為足以使組織沉澱於試管底部為限 劑的ί ί丨、0,〇 〇 〇至約2 〇,0 0 0 g。離心作用後,丟棄有機溶 ,並可$液’熟知組織學技藝者知曉所用有機溶劑的體積 去除較夕據樣品大小及欲除石峨量所需清洗之次數,若需 約1 〇次t的石峨’則需要清洗較多次,通常樣品清洗1至 言,所田而較佳是介於約2至約4次,以10微米組織樣品而 本發^的有機溶劑體積通常約5 0 〇微升。 —
,此種j ί ΐ亦可使用其他技藝者所熟知的去除石蠟方法 1995)。、包括直接溶解法(貝娜吉(Banerjee)等人, 壤後樣品較佳進 度之低碳數醇類 是較佳的低碳數 包括甲醇,異丙 方式是將樣品強 具體實例中,醇 清'洗約3至5次, (例如,依序為1 具體實例中,利 因公司,山羅曼 以漸減濃 言,乙醇 的醇類, 〇 另一藉 個較佳的 水溶液, 於約1 0 % 在另一個 (生物基 水作用。 行脫水作用,較佳脫水的方法係 水溶液進行逐步清洗,以脫水而 ^類’本發明亦可使用其他適當 醇及C1-C5範圍之其他相似醇類 力混以醇類溶液,並離心。在一 類濃度逐步自約100%減至70%的 其。中每步溶液濃度的改變通常少 0 0 % ’ 9 5 %,9 0 %,8 0 %,7 0 % )。 用一種化學藥劑,諸如EZ-DEWAX 恩’CA)可同時進行去石蠟及脫
第12頁 1277652 五、發明說明(10) 均質作用 _ 利用任何標準機械化,音波或其他適當的技術可將去石 壤脫水的樣品均質化,組織均質化作用較佳係根據標準步 驟以機械化組織均質器完成,本發明可使用一些市售的均 質器’包括Ultra-Turrax均質器(IKA-瓦克斯公司,威明 頓 ’NC) ;Tissumizer (Tekmar-Dohrmann ,辛辛那提, 0H);及Polytron (Brinkmann ,Westbury ,NY) 〇 在 個具體實例中,樣品於破壞劑下進行均質化,選用 破壞劑可使石蠟包埋中所純化之RNA有效濃度约為不含'破 壞劑時所分離-時1 〇倍,破壞劑包括:胍鹽化合物,脲,甲 酿胺’碘化鉀,異氰酸鉀,及相似的化合物,本發明較佳 的破壞劑為胍鹽化合物,諸如異硫氰酸胍(亦以硫代氣酸 脈之名販售)及脈氣化氫。可使用許多陰離子反離子,熟 知技藝者利用此種適當陰離子可製備許多胍鹽,本發明戶^ 用的脈鹽溶液通常的濃度範圍為約i至約5M,較佳者 ,假若RNA已存於溶液中,胍鹽溶液為較高的濃度,: 樣品中最終的濃度約1至約5 Μ,胍溶液較佳以適當此 緩衝劑(諸如Tr i s-Cl )緩衝至pH約3至約6,較&者生化 破壞溶液中%亦寸含有還原劑,諸如二硫蘇糖醇(D 約4, 召一巯醇(BME),破壞溶液中亦可含有RNAse抑生h)及 1剌劑。 將樣品置於破壞溶液中 加熱 ,於溫度約6 0。(:至約1 〇 Q。 0 下,
第13頁 1277652 五、發明說明(11) 加 中 , 理 樣
熱約5分鐘至約2小時,另一種方式是樣品置於破壞溶液 ,於溫度約50 °C至約lOOt:下,加熱約5分鐘至約2小時 選用加熱時間主要係所純化的RNA含量至少為未埶處 樣品所純化含量約10…在一個較佳的以:列; σ口在溫度約7 5至約1 〇 〇 C下,加熱約2 〇分鐘,更佳者, 品於約9 5 °C下加熱3 0至6 0分鐘。 RNA回收 藉由可產生RNA至少為破壞溶液一個成分之適當技術, 於力:熱,於破壞溶液中回收RNA。以有機溶劑的萃取作一用 ,氯仿萃取作—用,酚-氯仿萃取作用,乙醇,異丙醇或任 何其他低碳數醇類之沉澱作用,層析法(包括離子交換層 析法、,分子大小篩選層析法,矽膠層析法及逆相層析法) 或電泳法(包括聚丙醯胺膠電泳法及瓊脂膠電泳法)等所 熟知之技藝自破壞溶液中回收RNA,較佳係以酚-氯仿萃取 作用自破壞溶液回收RNA。 在回收RNA後,可視情況進一步純化㈣人,進一步純化作 用所產生的RNA實質上沒有DNA或蛋白質的污染,前述用以 回收RNA的任何技術均可用以進一步的純化,較佳係以低 碳數醇類(轉別是乙醇或異丙醇)進行沉澱作用,以進行 RNA的純化,沉澱作用較佳係於載劑(諸如肝糖)存在下 進行,以助沉澱作用。 DNA及蛋白質回收
第14頁 1277652 五、發明說明(12) 本發明方法亦可自組織樣品中純化DNA或蛋白質,將樣 品與有機溶劑(諸如氣仿)混合之後,並經離心作用後, 溶液可分三相,分別為下層的有機相,雙相界面,及上層 的水相。利用適當之破壞藥劑(特別是胍鹽化合物),樣 品中的生物成分會分散至此三相中,上層的水相含有RNA ,而界面相含有DNA,而有機相則含有蛋白質。熟知技藝 者會了解本發明方法適合用以回收DNA及蛋白質^目' 與含^ RNA的相,本發明方法可增進dnA的回收率。
純化RNA
利用本發明-方法純化之RN A適合各式目的及分子生物步 驟,包括(但不侷限於):反轉錄作用製成cDNA ;製備放 射性,螢光性或其他用於分析基因片段與寡核苷酸及相似 物之標記cDNA ;以丙醯胺或瓊脂膠電泳;利用層析法(例 如離子交換,矽膠i逆相,或分手大小篩選層析法)純化 作用;以核酸探針之雜交作用;及利用機械化,音波或其 他方法之片段作用。 實例 / 物質及方法 這些物質及方法為下列實例所通用。 樣品製備。人類細胞株SKI,H157,A431,HT29, HCC298及HH30已於前文說明。利用胰蛋白酶作用處理單層 細胞以收集細胞,並以3 0 0 0 r pm的離心速度離心5分鐘沉
第15頁 1277652 五、發明說明(13) 澱細胞,細胞沉殿物冷凍於-7 〇 °c下,或以、-小時,而後以石臘包埋。 一偈馬林固定24 所獲取之代表腫瘤組織係於手術時取下,、 病理實驗室常用之步驟將其固定於福馬林並包二二2=f ,利用microtome切取截面組織(5微米)。 々、石臘中 RNA分離。自石臘包埋組織中分離RNA的步 個5微米石臘化組織切片置於小離心管中,哪-如下。將一 1 5分鐘兩次,進行去石臘作用◊用梯度漸一甲笨清洗 (100%,95%,80%及70%)連續清洗組織進杆辰度之醇類 之沉澱物懸浮於含有〇 · 5 %肌胺酸及2 〇 m μ二访― ’所J导 之4Μ異硫氰酸孤中,將懸浮液均質化,醇(DTT) 約9 5 °C達0至6 0分鐘;〇加熱時間點為每個樣α : ^約5 0至 加入醋酸納(ΡΗ4.0 )至〇·2Μ,用酚/氣仿萃111 取制組° 以異丙醇及10毫克肝糖進行沉澱作用,離心取用1液,並 ( 1 3 0 0 0 rpm,4°C Μ5分鐘),用1毫升75%之乙醇清洗 RNA沉澱物兩次,而後將沉澱物懸浮於不含RNase之水中。 反轉錄作用(RT )。加熱後,利用逢機六核苷引子將所 有的RNA轉化成cDNA,冷凍組織的RT條件已於先文說明 (合立可許等人’1992)。每個樣品的控制组盔反轉錄酶 (No-RT )- ..... 利用Perkin Elmer Cetus 7700 PCR 機器(Taqman)測 定ts及冷一肌動蛋白基因表現的真正一時間pwCR定量作用。 利用前述(Heid等人,1996 ;Eads等人,1999)所述之螢 光偵測方法為基礎,以真正-時間PCR進行訊息RNA的定量
第16頁 1277652 五、發明說明(14) 實驗。以前述的方法製備cDNA。以帶有5’-螢光報告染劑 (6FAM )及3’ -終止染劑(TAMRA )之探針分別增幅有意之 cDNA及參考cDNA,TAQ聚合酶的5’-外核酸酶活性會切割探 針,並釋放出報告分子,利用ABI Prism Sequence Detection System (Taqman)偵測螢光。當其超越螢光偵 測閾值時,PCR增幅作用產生的螢光訊息與所產生的PCR產 物成正比,當螢光訊息超越PCR反應對數相的閾值時之循、 環數值為初期模板之濃度,以有意基因及參考基因的閾值 循環數為基礎測定相對之基因表現,參考基因的應用係避 免直接定量RNA,因其為主要的錯誤來源。 引子及探針序列如下:TS ·· SEQ ID NO : 1 : GGC CTC φ GGT GTG CCT ΤΤ ; SEQ ID NO : 2 : AAC ATC GCC AGC TAC GCC CTG C ; SEQ ID NO : 3 : GAT GTG CGC AAT CAT GTA CGT。yS-肌動蛋白:SEQ ID NO :4 :TGA GCG CGG CTA CAG CTT ; SEQ ID NO : 5 : ACC ACC ACG GCC GAG CGG ; SEQ ID NO :6 :TCC TTA ATG TCA CGC ACG ATT T 。以真 正-時間PCR實驗而言,如前討論,報告寡核苷(SEq ID NOS : 2及5 )以6FAM標記5,端,以TAMRA標記3,端。 進行每次PCR時’均需包括“無反轉錄酶,,(NRT或 No-RT )的控制組,此反應的目的係為修正任何源自殘餘 基因體DNA污染所導致之背景增幅作用,因此,丁3及泠-肌 動蛋白的整體含量計算為rT數值減數值(RT-NRT)。Λ 統計分析。以無母數平均值比較法測定分別以冷凍組織 及FFPE處理之腫瘤樣品之TS差異是否有意義或無意義。
第17頁 1277652 五、發明說明(15) 實例1 . 一般RNA分離步驟 利用下列的一般步驟萃取石臘包埋組織中的R N A。 A.切片的去石臘作用及脫水作用 (1 ) 將大約為1 0微米的切片置於1 . 5毫升塑膠離心試管 中
升二曱苯,室溫下(大約20至25 °C 強 (2)加入6 0 0 1 力混搖約1 0分鐘。 _ (3 ) 室溫下,以桌上型離心機最大轉速(約logo , 0 0 0 g ) 將樣品 離心約 7 分鐘。 (4) 重複步驟2及3,直至大部分的石臘溶解,通常視原 樣品中所含石1含量需2次或多次。 (5 ) 與低碳數醇類強力混搖,較佳為1 0 0 %乙醇(約6 0 0 微升),混搖3分鐘·,以去除二曱苯溶液。 (6) 將離心管以步驟(3 )方式離心約7分鐘,將上清液 移入另一試管並丟棄,沉澱物為白色。 (7) 以更多稀釋乙醇溶液連續重複步驟5及6,首先約 95%乙醇,而後約80%,最後為約70%乙醇。 (8 ) 室溫下,將離心管以步驟(3 )方式離心約7分鐘, 丟棄上清液,讓沉澱物於室溫下乾燥約5分鐘。
B.以酚-氯仿分離RNA (1) 加入包括0.5 %肌胺酸之400微升異硫氰酸胍溶液及8 微升1 Μ二硫蘇醇。
第18頁 1277652 五、發明說明(16) (2) 而後以組織均質器(ultra-Turrax ,IKA-Works公 司,威名頓,N C )均質樣品約2至3分鐘,期間均質速度由 低速(速度1)轉至高速(速度5)。 (3) 而後將樣品置於約9 5 °C下加熱約5 - 2 0分鐘,在加熱 之前,最好以細針將含有樣品的試管蓋戳洞,另一種方式 是可用塑膠夾或實驗室石臘膜將試管蓋固定。 (4) 而後以pH 4·〇的2M醋酸鈉50微升及600微升酚/氯 仿/異戊醇(1 0 : 1 · 9 3 : 〇 · 〇 3 6 )(新鮮配製,將1 8毫升 酚與3 · 6毫升1 : 4 9異戊醇:氯仿溶液混合而成),強;^混 搖約1 0秒鐘’而後置於冰上約1 5分鐘。
(5 ) 以最-高速度離心該溶液約7分鐘,將上清液(水相) 移入另一個新的試管。 (6)加入1〇微升肝糖及400微升異丙醇,置於—2〇 °C下3〇 分鐘’將R N A >儿;殿出來。 (7 )以桌上型最高速度離心約7分鐘將R N A沉殿;上清液 移入另一容器並丟棄,以約5 0 0微升之70至7 5%乙醇清洗沉 澱物。 (8 )再以最高速離心樣品約7分鐘,上清液丟棄,乾燥 沉澱物,而後將沉澱物溶解於適當的緩衝液,以備進一步 實驗用(例如50 微升5 Tris chloride,pH 8.0)。
實例2 加熱時間 此實例說明加熱時間對RNA產量的效果。
第19頁 1277652 五、發明說明(Π) 如圖1說明’在沉搬作用及反轉錄作用之前,於9 5 °C下 加熱破^溶f I明顯増加Ts及召-肌動蛋白標的物的偵測 效率’备不執行加熱步驟時,並未偵測到TS或沒—肌動蛋 白(0分知時間點),在95加熱2〇分鐘後此兩種轉錄產 物均可摘測到;若持續將加熱時間增加至6 0分鐘,則TS偵 測感度增加3倍’而万―肌動蛋白增加45倍(NRT=無反轉 錄酶控制組’ RT-NRT=相對基因表現總量,即反轉錄酶減 去無反轉錄酶者)3
圖2 "兒明正常(N )及腫瘤(T )組織中/3 -肌動蛋白基因 的RNA表&現程度’樣品置於95下〇至4〇分鐘,對大部务的 樣品而言,,較-佳的加熱時間約3 〇分鐘。 圖3說明當加熱時間長於60分鐘時,RNA的萃取量開始減 少’此f測RNA的熱分解效應,此時DNA的萃取量開始增加 ’這不是我們所要的結果,因為在某些情況下DNA的存在 會產生不必要的PC R·訊號。 實例3 加熱溶液 此實例說明R N A溶液中存有破壞劑對獲取高產量r n A是重 要的’此為利用偵測yS -肌動蛋白基因表現相對測定於各 式溶液中所分離RNA含量之RT-PCR實驗。 根據前述方法處理臨床食道癌F F P E組織樣品,除了開始 時進行去石臘作用後所得之沉澱物溶解或懸浮於4M異硫氰 酸胍(GITC) ,4M異硫氰酸胍+1〇〇 召-巯醇
第20頁 1277652 五、發明說明(18) (GITC + BME) ,4M異硫氰酸胍+20 βΜ二硫蘇糖醇 (GITC + DTT)或 Tris-Cl 緩衝液(10 mM pH 7.5)或 Tris-Cl 緩衝液+20 二硫蘇醇(Tris/Cl+DTT)。而後
將樣品置於95 °C下加熱30分鐘,或不加熱(〇分鐘,95 °C) 。而後T r i s / C 1樣品以4 Μ異硫氰酸胍處理,以R T - P C R測定 R Ν Α量,而以真正時間P C R偵測yS -肌動蛋白。如圖4所示, 當加熱時,含有破壞劑異硫氰酸胍對RNA高回收率非常重 要,而還原劑(諸如DTT或BME)對高回收RNA並非必要。4M 異硫氰酸胍溶液中含有50 mM Tris-HCl (pH 7·5),25 ιηΜ £0丁八及0.5%肌胺酸。 一 實例4 相同來源的F F Ρ Ε及冷凍組織中基因表現數值之比較 此實例顯示本發明方法提供福馬林固定石蠟包埋樣品的 基因表現數值與冷珠組織所得之數值等同。
六種細胞株樣品經FFPE處理,利用本發明方法(包括於 95 C下加熱30分鐘)進行TS定量。所得之相對TS數值(圖 5 )與利用已知方法自冷凍細胞沉澱物所得之數值比較, 相對TS表現量在冷凍細胞為3·〇-ΐ9·5 (平均= 8·5),而 FFPE樣品數值為3· 0-25· 0 (平均=9.〇),統計分析此二 均值差異的Ρ值為0·726 ’此表示以原始rt-PCR方法自冷康 細胞沉澱物所得之TS數值與利用本發明方法自FFΡΕ細^ 澱物所得者並無明顯差異。 ' /JL 不論為福馬林固定及石蠟包埋或為冷凍之腫瘤組織樣品
1277652 五、發明說明(19) 及正常組織樣品,其R N A表現程度亦相同。比較五個正常 組織及6個腫瘤結腸癌組織及4個食道癌腫瘤組織(如前述 石蠟及冷凍組織(FT ))中相對TS基因表現程度,結果如 圖6所示。結果發現冷凍組織樣品之TS量與相同組織經 FFPE處理之樣品所得之TS數值並無明顯差異,此對結腸及 食道組織均為相同的結果(平均F T樣品結腸=3 · 4 6 ,平均 FFPE樣品結腸= 3·06,ρ = 0·395 ;平均FT樣品食道=13.9, 平均 FFPE 樣品食道=15·93,ρ = 0·21)。 比較-反應者及無反應者腫瘤組織中T S量 比較對5-FU/硫克凡靈(Leucovorin) (LV)有反應之 第iv期結腸癌患者之冷凍組織及同質性FFPE樣品的TS含量 。士 RT-PCR數據為基礎,先前的報告顯示在腫瘤冷束組織 為高含量之TS (相對基因表現^4· 0 ),表示其對TS治療 為較差的反應,具有反應腫瘤的特徵是其TS表現程度^氏、。 測定17位病患石蠟切片中TS/点一肌動蛋白比值,經 樣品分析(圖7 ),該等病患對5 — fu/lv的反應與;某 因表現有關。在1 7位病患中,6位已知對TS有反應,而】广 ΐ ίίΓίϊϊ差的反應者。咸已知發現,在同質石蠓纟且織 中之TS結果與亦可預期其對此治療的反 本織 =8 7,平均反應者FFPE = 2.37,ρ = 〇 641丨平^者 者FT = 7· 66,平均無反應者FFPE = 7· 84,ρ = 〇· 537 了反應 冷凍組織中所得之TS量與同質性FFPE組織所得者。之門並
1277652 五、發明說明(20) 無明顯差異。 實例6 , 原發性結腸癌與肝癌移轉之TS基因表現程度 此實例顯示在相同病患中原發性結腸癌及復發肝癌移轉 之TS分析,及其他基因表現的情況。 圖8顯示相同病患中原發性結腸癌及一年後復發肝癌移 轉(met)之四種基因的表現:TS ;TP ;環氧酶-2(COX - 2) ;及血管内皮生長因子(V E G F ),結果推測原發性腫瘤對 5 -FU療法具有感度(TS = 2. 32 ),移轉腫瘤則較難治療— (TS met 11.58) ,COX-2及VEGF表現程度與已發表的文 獻相關,其在侵略性疾病的表現會增加,且相互調節 (COX-2 原發性=1.35 ;COX-2 met = 5.4 ;VEGF 原發性 =5. 02 ; VEGF met = 14· 4 )。自原發性直腸癌的5微米FFPE 切片及乾燥移轉之FFPE切片中分離RNA,在反應原發性腫 瘤的相對TS基因表現為2 . 3 2,而在移轉疾病則為1 1. 5 8 (圖8 ),此利用本發明之RT-PCR方法測定增加5倍TS表現 量表示次發性疾病對5-FU並無反應,推測另一種治療方法 可能較為適當,諸如CPT-11。 本專利說明書中所列的所有文獻一并併入發明實體參 考。
第23頁 1277652
第24頁

Claims (1)

  1. 1277652 案號89127378 丨華^^‘嗜 六、申請專利範圍 1 . 一種自石臘包埋生物組織樣品中回收RNA的方法,其 中該樣品不是體液的液態樣品’其包括: 將樣品去石胤; 將樣品置於包括有效濃度之胍鹽化合物之破壞溶液 中,於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍下,加熱約1 0至約1 2 0分鐘 之時間;及 利用選自萃取、電泳、層析法、沈澱法及其組合所組 成之群之回收技術自該破壞溶液中回收該R N A。 2 ·根據申請專利範圍第1項之方法,另包括於加熱前將 該樣品脫水。 3 ·根據申請專利範圍第1或2項之方法,另包括於加熱前 將該樣品均質化。 4.根據申請專利範圍第3項之方法,其中該RNA之回收係 藉以水不溶性有機溶劑自該破壞溶液中萃取。 5 .根據申請專利範圍第4項之方法,其中該不溶於水有 機溶劑必須含有氯仿。 6 ·根據申請專利範圍第5項之方法,另包括純化該RNA。 7.根據申請專利範圍第6項之方法,其中係以乙醇沉澱 作用純化RNA。 8 ·根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該時間期間 係自約1 0至約6 0鐘。 9 ·根據申請專利範圍第8項之方法,其中該時間期間係 自約3 0至約6 0分鐘。 1 0 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中溫度係在
    O:\68\68394-951102.ptc 第25頁 1277052案號89127378 年月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 約7 5至約9 5 °C之範圍。 1 1 ·根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中溫度係在 約8 5至約1 0 0 °C之範圍。 1 2 ·根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該時間期 間係自約3 0至約6 0分鐘。 1 3.根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中胍鹽化合 物為脈氫氣酸。 1 4.根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中胍鹽化合 物為異硫氰酸脈。 1 5 ·根據申請專利範圍第1 4項之方法,其中異硫氰酸胍 存在的濃度為約2至約5 Μ。 1 6 ·根據申請專利範圍第1 5項之方法,其中異硫氰酸胍 存在的濃度為約4 Μ。 1 7.根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該破壞溶 液的pH為約3-6。 1 8.根據申請專利範圍第1 7項之方法,其中該破壞溶液 的pH為約4。 1 9.根據申請專利範圍第1 2項之方法,其中該破壞溶液 另包括還原劑。 2 0 .根據申請專利範圍第1 9項之方法,其中該還原劑為 /3 -酼醇。 2 1 .根據申請專利範圍第1 9項之方法,其中該還原劑為 二硫蘇糖醇。 2 2 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中RN A係自破
    O:\68\68394-951102.ptc 第26頁 1277052案號89127378 年丨丨月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 壞溶液中回收。 23.根據申請專利範圍第22項之方法,其中該RNA係用以 測定基因表現程度。 2 4 ·根據申請專利範圍第2 2項之方法,其中該R N A進一步 進行選自反轉錄、電泳、層析法、與核酸探針雜交及片段 作用所組成之群之步驟。 2 5.根據申請專利範圍第24項之方法,其中該RNA進行反 轉錄,且所製得之c D N A係被標記者。 2 6.根據申請專利範圍第25項之方法,其中該標記cDNA 係用於基因晶片或微陣列分析。 2 7.根據申請專利範圍第22項之方法,其中該RNA進行反 轉錄,且所製得之cDNA係經聚合酶鏈反應放大者。 2 8 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該樣品於 約7 5至約1 0 0 °C之溫度範圍下,加熱約3 0至約6 0分鐘之時 間,且RNA係自破壞溶液中回收。 2 9 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該樣品於 約7 5至約9 5 °C之溫度範圍下,加熱約3 0至約1 2 0分鐘之時 間。 3 0 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該樣品於 約9 5 °C之溫度範圍下,加熱約3 0至約6 0分鐘之時間。 3 1 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該樣品於 約9 5 °C之溫度範圍下,加熱約1 0至約6 0分鐘之時間。 3 2 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該樣品於 約9 5 °C之温度範圍下,加熱約6 0分鐘之時間。
    O:\68\68394-951102.ptc 第27頁 1277052案號89127378 年π月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 3 3 .根據申請專利範圍第1或2項之方法,其中該樣品於 約9 5 °C之溫度範圍下,加熱約3 0至約4 0分鐘之時間。 3 4. —種定量測定標的基因表現之方法,其包括: 將經固定石臘包埋生物組織樣品去石臘; 將去石臘樣品脫水; 將脫水樣品與包含異硫氰酸胍及還原劑且pH約為5之 破壞溶液混合; 均質化該樣品,並將樣品與破壞溶液混合物於溫度約 9 5 °C下加熱約3 0分鐘; 利用不溶於水有機溶劑之萃取作用自破壞溶液中萃回 收樣品R N A ; 純化回收的RNA ; 利用反轉錄反應將純化RNA轉化成cDNA ; 在聚合酶鏈結反應溶液進行cDNA之PCR反應,該聚合 酶鏈結反應溶液包括適合增幅至少一段特定序列之募核苷 探針,聚合酶及螢光發光源; 測定PCR反應後螢光強度的變化;及 以螢光強度為基礎,測定存於樣品中特定序列核酸的 含量。 3 5 .根據申請專利範圍第3 4項之方法,其中在破壞溶液 中異硫氰酸胍濃度為3 Μ。 3 6 .根據申請專利範圍第3 5項之方法,其中還原劑包括 二硫蘇糖醇。 3 7.根據申請專利範圍第3 6項之方法,其中不溶於水有
    O:\68\68394-951102.ptc 第28頁 1277052案號89127378 今广年U 月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 機溶劑包括氯仿。 3 8 ·根據申請專利範圍第3 7項之方法,其中係利用乙醇 沉澱作用純化回收的Μ A。 3 9 · —種自生物組織樣品中回收R N A之方法,其中該樣品 不是體液的液態樣品,其包括: 將樣品置於包括有效濃度之胍鹽化合物之破壞溶液 中,於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍下,加熱約1 0至約1 2 0分鐘 之時間;及 利用選自萃取、電泳法、層析法、沈澱法及其組合所 組成之群之回收技術自該破壞溶液中回收該R N A。 4 0 ·根據申請專利範圍第3 9項之方法,其另包括於加熱 前將該樣品脫水。 4 1 ·根據申請專利範圍第4 0項之方法’其另包括於加熱 前將該樣品均質化。 42.根據申請專利範圍第41項之方法,其中談RNA之回收 係藉以水不溶性有機溶劑自該破壞溶液中萃取。 4 3 .根據申請專利範圍第4 2項之方法,其中該不溶於水 有機溶劑實質上係由氯仿組成。 4 4.根據申請專利範圍第4 3項之方法,其另包括純化該 RNA ° 4 5 ·根據申請專利範圍第4 4項之方法,其中係以乙醇沉 澱作用純化RNA。 46.根據申請專利範圍第39項回收RNA之方法,其中該時 間期間係自約1 0至約6 0鐘。
    O:\68\68394-951102.ptc 第29頁 1277052案號89127378 年il月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 4 7.根據申請專利範圍第46項之方法,其中一該時間期 間係自約3 0至約6 0分鐘。 4 8 ·根據申請專利範圍第3 9項之方法,其中溫度係在約 8 5至約1 0 0 °C之範圍。 4 9.根據申請專利範圍第48項之方法,其中一該時間期 間係自約3 0至約6 0分鐘。 5 0 .根據申請專利範圍第3 9項回收R N A之方法,其中胍鹽 化合物為脈氫氯酸。 5 1 .根據申請專利範圍第3 9項回收R N A之方法,其中胍鹽 化合物為異硫氰酸胍。 5 2.根據申請專利範圍第5 1項之方法,其中異硫氰酸胍 存在的濃度為約2至約5 Μ。 5 3.根據申請專利範圍第5 2項之方法,其中異硫氰酸胍 存在的濃度為約4 Μ。 5 4.根據申請專利範圍第5 1項之方法,其中該破壞溶液 的pH為約3 - 6。 5 5 .根據申請專利範圍第5 4項之方法,其中該破壞溶液 的p Η為約4。 56.根據申請專利範圍第39項回收RNA之方法,其中該破 壞溶液另包括還原劑。 5 7.根據申請專利範圍第56項回收RNA之方法,其中該還 原劑為/3 -巯醇。 58.根據申請專利範圍第56項回收RNA之方法,其中該還 原劑為二硫鍊糖醉。
    O:\68\68394-951102.ptc 第30頁 1277052案號89127378 年U月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 5 9.根據申請專利範圍第39項之方法,其中該RNA係用以 測定基因表現程度。 6 0 .根據申請專利範圍第3 9項之方法,其中該沉澱法係 以醇進行。 6 1 ·根據申請專利範圍第6 0項之方法,其中該醇係為乙 醇、異丙醇或其混合物。 6 2 ·根據申請專利範圍第3 9項之方法,其中該層析法係 為離子交換層析法、分子大小篩選層析法、>5夕膠層析法、 逆相層析法或其組合。 6 3.根據申請專利範圍第3 9項之方法,其中該電泳法係 為聚丙醯胺電泳法、瓊脂電泳法或其組合。 6 4 . —種自生物組織樣品中回收Μ A之方法,其中該樣品 不是體液的液態樣品5其包括: 將樣品置於包括有效濃度之胍鹽化合物之破壞溶液 中,於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍下,加熱約1 0至約1 2 0分鐘 之時間;及 自該破壞溶液中回收該R N A,其中自該破壞溶液中回 收之該RNA適用於利用反轉錄聚合酶鏈結合反應(RT-PCR) 放大偵測基因之表現程度。 6 5 .根據申請專利範圍第1項之方法,其中該沉澱法係以 醇進行。 6 6 .根據申請專利範圍第6 5項之方法,其中該醇係為乙 醇、異丙醇或其混合物。 6 7.根據申請專利範圍第1項之方法,其中該層析法係為
    O:\68\68394-951102.ptc 第31頁 1277052案號89127378 〇yc年月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 離子交換層析法、分子大小篩選層析法、矽膠層析法、逆 相層析法或其組合。 6 8 .根據申請專利範圍第1項之方法,其中該電泳法係為 聚丙醯胺電泳法、瓊脂電泳法或其組合。 6 9. —種自經固定石臘包埋生物組織樣品中回收RNA之方 法,其中該樣品不是體液的液態樣品,其包括: 將樣品去石胤; 將樣品置於包括有效濃度之胍鹽化合物之破壞溶液 中,於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍下,加熱約1 0至約1 2 0分鐘 之時間;及 自該破壞溶液中回收該R N A,其中自該破壞溶液中回 收之該RNA適用於利用反轉錄聚合酶鏈結合反應(RT-PCR) 放大偵測基因之表現程度。 7 0 . —種自經固定石臘包埋生物組織樣品中測定胸苷酸 合成酶(TS)表現之方法,其包括: (a )將組織樣品去石臘以獲得去石臘樣品; (b )自去石脱樣品中獲得經分離之in R N A ’其言先將組 織樣品於包括有效濃度之胍鹽化合物之破壞溶液中,於溫 度約7 5至約1 0 0 °C範圍下,加熱約1 0至約1 2 0分鐘,並自該 破壞溶液中回收該m R N A ; (c) 利用可放大TS基因區域之一對募核苷酸引子放大 經分離之mRNA以獲得將放大之樣品;及 (d) 相對於内對照組基因mRNA之量,測定TS mRNA之 量 °
    O:\68\68394-951102.ptc 第32頁 1277652 案號 89127378 修正 六、申請專利範圍 其中該内對照組 7 1 .根據申請專利範圍第70項之方法 基因係為yS -肌動蛋白。 7 2 .根據申請專利範圍第7 0項之方法,其中該組織樣品 係為腫瘤組織。 7 3.根據申請專利範圍第7 2項之方法,其中該腫瘤組織 係獲自結腸癌腫瘤。 7 4.根據申請專利範圍第7 2項之方法,其中該腫瘤組織 係獲自肝臟移轉。 7 5 . —種自經固定石臘包埋生物組織樣品中測定胸苷酸 合成酶(TS)表現程度之方法,其包括: (a )將組織樣品去石臘以獲得去石臘樣品; (b) 自去石臘樣品中獲得經分離之mRNA,其首先將去 石臘組織樣品於包括有效濃度之胍鹽化合物之破壞溶液 中,於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍下加熱,並自該溶液中回 收該mRNA ;及 (c) 相對於内對照組基因mRNA之量,測定TS mRNA之 量 ° 其中該加熱係為 其中該募核苷酸 其中該募核苷酸 其中該加熱係發 7 6 .根據申請專利範圍第7 5項之方法 進行1 0至1 2 0分鐘。 7 7.根據申請專利範圍第75項之方法 引子之一係為SEQ ID NO: 1。 7 8 .根據申請專利範圍第7 5項之方法 引子之一係為SEQ ID NO: 3。 7 9 .根據申請專利範圍第75項之方法
    O:\68\68394-951102.ptc 第33頁 1277052案號89127378 年q 月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 生於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍下,進行約1 0至約1 2 0分鐘之 時間。 8 0.根據申請專利範圍第70項之方法,其中該回收mRNA 之方法包括選自以水不溶性有機溶劑萃取法、氯仿萃取 法、酚-氯仿萃取法、醇沉澱法、層析法、分子大小篩選 層析法、石夕膠層析法、逆相層析法及電泳法、聚丙酷胺電 泳法、瓊脂電泳法及其組合所組成之群之方法。 81. 根據申請專利範圍第70項之方法,其中該RNA之回收 係藉以水不溶性有機溶劑自該破壞溶液中萃取。 82. 根據申請專利範圍第70項之方法,其中該TS mRNA量 之測定包括R T - P C R。 8 3.根據申請專利範圍第75項之方法,其中該回收mRN A 之方法包括選自以水不溶性有機溶劑萃取法、氯仿萃取 法、紛-氯仿萃取法、醇沉殿法、層析法、分子大小篩選 層析法、碎膠層析法、逆相層析法及電泳法、聚丙酸胺電 泳法、瓊脂電泳法及其組合所組成之群之方法。 84.根據申請專利範圍第75項之方法,其中該RNA之回收 係藉以水不溶性有機溶劑自該破壞溶液中萃取。 8 5.根據申請專利範圍第75項之方法,其中該TS mRNA量 之測定包括RT-PCR。 8 6 . —種自石臘包埋生物組織樣品中回收R N A的方法,其 中該樣品不是體液的液態樣品,其包括: 將樣品去石臘; 將樣品置於包括有效濃度之破壞溶液’該破壞溶液係
    O:\68\68394-951102.ptc 第34頁 1277052案號89127378 年η月 曰 修正_ 六、申請專利範圍 選自由胍鹽化合物,脲,甲醯胺,碘化鉀,異氰酸鉀,及 相似的化合物所組成之群,於溫度約7 5至約1 0 0 °C範圍 下,加熱約1 0至約1 2 0分鐘之時間;及 利用選自萃取、電泳、層析法、沈殿法及其組合所組 成之群之回收技術自該破壞溶液中回收該R N A。
    O:\68\68394-951102.ptc 第35頁
TW089127378A 1999-12-20 2000-12-20 Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens TWI277652B (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US09/469,338 US6248535B1 (en) 1999-12-20 1999-12-20 Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TWI277652B true TWI277652B (en) 2007-04-01

Family

ID=23863395

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW089127378A TWI277652B (en) 1999-12-20 2000-12-20 Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens

Country Status (19)

Country Link
US (8) US6248535B1 (zh)
EP (3) EP2363477A3 (zh)
JP (1) JP2003525033A (zh)
KR (1) KR100723328B1 (zh)
CN (2) CN1891836B (zh)
AR (1) AR027036A1 (zh)
AT (2) ATE523590T1 (zh)
AU (2) AU784565C (zh)
BR (1) BR0016569A (zh)
CA (1) CA2394618C (zh)
DE (1) DE60032634T2 (zh)
DK (1) DK1743939T3 (zh)
EA (2) EA006827B1 (zh)
ES (1) ES2373149T3 (zh)
IL (2) IL150116A0 (zh)
MX (1) MXPA02006145A (zh)
NO (1) NO330802B1 (zh)
TW (1) TWI277652B (zh)
WO (1) WO2001046402A1 (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8574868B2 (en) 2010-11-24 2013-11-05 Industrial Technology Research Institute Method for deparaffinizing formalin-fixed paraffin-embedded tissue

Families Citing this family (248)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5854033A (en) 1995-11-21 1998-12-29 Yale University Rolling circle replication reporter systems
KR20010023070A (ko) * 1997-08-20 2001-03-26 더 유니버시티 오브 마이애미 고품질의 연속적인 재료 처리, 조직 고정-탈수-지방제거-함침 방법
US6793890B2 (en) 1997-08-20 2004-09-21 The University Of Miami Rapid tissue processor
US6960439B2 (en) 1999-06-28 2005-11-01 Source Precision Medicine, Inc. Identification, monitoring and treatment of disease and characterization of biological condition using gene expression profiles
US6248535B1 (en) * 1999-12-20 2001-06-19 University Of Southern California Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens
US20060166227A1 (en) * 2000-06-20 2006-07-27 Stephen Kingsmore Protein expression profiling
US6602670B2 (en) * 2000-12-01 2003-08-05 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on ERCC1 expression
NZ546252A (en) * 2000-12-01 2008-03-28 Response Genetics Inc Method of determining HER2-neu gene expression in paraffin embedded tissue samples
US7049059B2 (en) * 2000-12-01 2006-05-23 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on ERCC1 and TS expression
US20020142328A1 (en) * 2000-12-01 2002-10-03 Danenberg Kathleen D. Method of determining a chemotherapeutic regimen by assaying gene expression in primary tumors
US6582919B2 (en) 2001-06-11 2003-06-24 Response Genetics, Inc. Method of determining epidermal growth factor receptor and HER2-neu gene expression and correlation of levels thereof with survival rates
US6518416B1 (en) 2000-12-01 2003-02-11 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on ERCC1 expression
US6956111B2 (en) * 2001-03-02 2005-10-18 Response Genetics, Inc. Method of determining dihydropyrimidine dehydrogenase gene expression
US6686155B2 (en) * 2001-06-14 2004-02-03 Response Genetics, Inc. Method of determining a chemotherapeutic regimen based on glutathione-S-transferase pi expression
US20040091857A1 (en) * 2001-07-20 2004-05-13 Nallur Girish N. Gene expression profiling
EP1450952B1 (en) * 2001-10-12 2016-09-21 Becton, Dickinson and Company Apparatus for storing biological samples
JP4303592B2 (ja) * 2001-10-12 2009-07-29 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー 生体試料を輸送する方法及びバスケット装置
US6964850B2 (en) 2001-11-09 2005-11-15 Source Precision Medicine, Inc. Identification, monitoring and treatment of disease and characterization of biological condition using gene expression profiles
US7553619B2 (en) * 2002-02-08 2009-06-30 Qiagen Gmbh Detection method using dissociated rolling circle amplification
ES2374311T3 (es) 2002-03-13 2012-02-15 Genomic Health, Inc. Obtención de perfil de expresión génica en tejidos tumorales biopsiados.
CA2494262A1 (en) 2002-07-31 2004-02-05 University Of Southern California Polymorphisms for predicting disease and treatment outcome
CN100374576C (zh) * 2002-10-11 2008-03-12 阿克丘勒斯生物科学股份有限公司 来自ffpe样品的基因表达分布图
US7364846B2 (en) 2002-10-11 2008-04-29 Molecular Devices Corporation Gene expression profiling from FFPE samples
US8039218B2 (en) * 2002-11-14 2011-10-18 John Wayne Cancer Institute Detection of cancer cells in body fluids
EP1572105B1 (en) * 2002-11-14 2011-08-31 John Wayne Cancer Institute Detection of micro metastasis of melanoma and breast cancer in paraffin-embedded tumor draining lymph nodes by multimaker quantitative rt-pcr
WO2004046386A1 (en) 2002-11-15 2004-06-03 Genomic Health, Inc. Gene expression profiling of egfr positive cancer
US9487823B2 (en) 2002-12-20 2016-11-08 Qiagen Gmbh Nucleic acid amplification
US6977153B2 (en) 2002-12-31 2005-12-20 Qiagen Gmbh Rolling circle amplification of RNA
US20040231909A1 (en) 2003-01-15 2004-11-25 Tai-Yang Luh Motorized vehicle having forward and backward differential structure
WO2004074518A1 (en) * 2003-02-20 2004-09-02 Genomic Health, Inc. Use of intronic rna to measure gene expression
DK1601450T3 (da) 2003-03-10 2013-09-08 Expression Pathology Inc Flydende vævspræparat ud fra histopatologisk bearbejdede biologiske prøver, væv og celler
US8043834B2 (en) 2003-03-31 2011-10-25 Qiagen Gmbh Universal reagents for rolling circle amplification and methods of use
US7267950B2 (en) * 2003-05-01 2007-09-11 Veridex, Lcc Rapid extraction of RNA from cells and tissues
AU2004248140A1 (en) * 2003-05-30 2004-12-23 Cedars-Sinai Medical Center Gene expression markers for response to EGFR inhibitor drugs
US20040248103A1 (en) * 2003-06-04 2004-12-09 Feaver William John Proximity-mediated rolling circle amplification
HUE050365T2 (hu) * 2003-06-24 2022-09-28 Genomic Health Inc Rákkiújulás valószínûségének elõrejelzése
AU2004258085B2 (en) * 2003-07-10 2010-05-27 Genomic Health, Inc. Expression profile algorithm and test for cancer prognosis
US8062897B2 (en) 2003-07-21 2011-11-22 Aureon Laboratories, Inc. Diagnostic histopathology using multiplex gene expression FISH
WO2005054466A2 (en) * 2003-07-25 2005-06-16 Ambion, Inc. Methods and compositions for preparing rna from a fixed sample
US20050059024A1 (en) * 2003-07-25 2005-03-17 Ambion, Inc. Methods and compositions for isolating small RNA molecules
US20050042660A1 (en) * 2003-07-31 2005-02-24 Hall Gerald Edward Devices and methods for isolating RNA
EP2216415B2 (en) * 2003-08-01 2017-01-04 Life Technologies Corporation Methods for preparing short RNA molecules
CA2542656A1 (en) * 2003-10-16 2005-05-06 Genomic Health, Inc. Qrt-pcr assay system for gene expression profiling
ATE442576T1 (de) * 2003-10-24 2009-09-15 Univ Miami Vereinfachte gewebeverarbeitung
WO2005049794A2 (en) 2003-11-13 2005-06-02 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Methods of characterizing infectious bursal disease virus
AU2004309396B2 (en) * 2003-12-23 2010-05-13 Genomic Health, Inc. Universal amplification of fragmented RNA
ES2636470T3 (es) * 2004-04-09 2017-10-05 Genomic Health, Inc. Marcadores de expresión génica para predecir la respuesta a la quimioterapia
US7794932B2 (en) * 2004-04-16 2010-09-14 Piotr Chomczynski Reagents and methods for isolation of purified RNA
US7588890B2 (en) * 2004-04-16 2009-09-15 Wei-Sing Chu Device for extracting biological molecules from tissue specimens and methods for preparing the same
US20050239055A1 (en) * 2004-04-22 2005-10-27 Mariani Brian D Enterovirus primers and probes
US7332597B2 (en) * 2004-06-28 2008-02-19 University Of Kentucky Research Foundation Primers and probe to identify mycobacterium tuberculosis complex
US20060115827A1 (en) * 2004-07-01 2006-06-01 University Of Southern California Genetic markers for predicting disease and treatment outcome
US20060099605A1 (en) * 2004-11-11 2006-05-11 Hall Gerald E Jr Devices and methods for isolating RNA
ES2787454T3 (es) * 2004-09-30 2020-10-16 Epigenomics Ag Método para proveer fragmentos de ADN derivados de una muestra archivada
DE102004047772B4 (de) * 2004-09-30 2018-12-13 Infineon Technologies Ag Lateraler Halbleitertransistor
JP4939425B2 (ja) * 2004-11-05 2012-05-23 ジェノミック ヘルス, インコーポレイテッド 乳癌の治療反応の予後および予測の分子指標
CA2585571C (en) * 2004-11-05 2020-01-21 Genomic Health, Inc. Predicting response to chemotherapy using gene expression markers
US20060141481A1 (en) * 2004-12-27 2006-06-29 Mariani Brian D HSV-1 and HSV-2 primers and probes
US7541144B2 (en) * 2005-01-31 2009-06-02 Agilent Technologies, Inc. RNA labeling method
US8309303B2 (en) 2005-04-01 2012-11-13 Qiagen Gmbh Reverse transcription and amplification of RNA with simultaneous degradation of DNA
US7449297B2 (en) * 2005-04-14 2008-11-11 Euclid Diagnostics Llc Methods of copying the methylation pattern of DNA during isothermal amplification and microarrays
EP1877569A4 (en) * 2005-05-04 2009-07-15 Univ South Florida PREDICTING THE RESPONSE TO TREATMENT OF CANCER PATIENTS
US20060270843A1 (en) * 2005-05-26 2006-11-30 Hall Gerald E Jr Methods for isolation of nucleic acids
US20060269929A1 (en) * 2005-05-26 2006-11-30 Hall Gerald E Jr Methods and kits for DNA purification on polymeric membranes at low ionic strength
US7544471B2 (en) * 2005-07-30 2009-06-09 Agilent Technologies, Inc. Preparing RNA from a wax-embedded tissue specimen
US20070054168A1 (en) * 2005-09-06 2007-03-08 Hao Chang Zinc/air cell
EP1762627A1 (de) 2005-09-09 2007-03-14 Qiagen GmbH Verfahren zur Aktivierung einer Nukleinsäure für eine Polymerase-Reaktion
EP1777291A1 (en) * 2005-10-20 2007-04-25 Fundacion para la Investigacion Clinica y Molecular del Cancer de Pulmon Method for the isolation of mRNA from formalin fixed, paraffin-embedded tissue
US20070092883A1 (en) * 2005-10-26 2007-04-26 De Luwe Hoek Octrooien B.V. Methylation specific multiplex ligation-dependent probe amplification (MS-MLPA)
DE102005060738A1 (de) * 2005-12-16 2007-06-21 Qiagen Gmbh Verfahren zur Extraktion von Biomolekülen aus fixierten Geweben
CN100366632C (zh) * 2005-12-28 2008-02-06 南方医科大学 一种石蜡包埋组织提取蛋白质的方法
KR20090086415A (ko) * 2006-10-27 2009-08-12 조지 매이슨 인털렉춸 프로퍼티즈, 인코퍼레이티드 전이성 결장직장 암에 대한 검정
EP2147119B1 (en) * 2007-05-03 2011-05-25 Roche Diagnostics GmbH SINGLE-CELL mRNA QUANTIFICATION WITH REAL-TIME RT-PCR
WO2008157316A1 (en) * 2007-06-14 2008-12-24 Creighton University Improved method for rna isolation
CN101815793A (zh) * 2007-06-15 2010-08-25 南佛罗里达大学 诊断和治疗癌症的方法
KR20100012056A (ko) 2007-06-22 2010-02-04 리스판스 지네틱스, 인크. 고정 표본에서 긴 단편 rna를 분리하는 방법
CN101910414B (zh) 2007-11-07 2016-01-13 健泰科生物技术公司 用于评估b细胞淋巴瘤对抗cd40抗体治疗的响应性的方法和组合物
WO2009127350A1 (en) * 2008-04-15 2009-10-22 Universität Bern Method for optimized isolation of rna from fixed tissue
US20090298172A1 (en) * 2008-05-28 2009-12-03 Steven Paul Wheeler Histological specimen treatment apparatus and method
DE102008029356A1 (de) * 2008-06-20 2009-12-24 Siemens Healthcare Diagnostics Gmbh Verfahren zur Aufreinigung von Nukleinsäuren, insbesondere aus fixiertem Gewebe
ES2539856T3 (es) * 2008-08-01 2015-07-06 F. Hoffmann-La Roche Ag Lisis mejorada y transcripción reversa para la cuantificación de mRNA
EP2370803A2 (en) 2008-12-03 2011-10-05 The United States Government As Represented By The Department Of Veterans Affairs Pressure-assisted molecular recovery (pamr) of biomolecules, pressure-assisted antigen retrieval (paar), and pressure-assisted tissue histology (path)
EP2193831A1 (de) * 2008-12-05 2010-06-09 Qiagen GmbH Parallel-Extraktion von unterschiedlichen Biomolekülen aus Formalin-fixiertem Gewebe
DE102008061714A1 (de) 2008-12-12 2010-06-17 Siemens Healthcare Diagnostics Inc., Deerfield Verfahren zur Aufreinigung von Nukleinsäuren, inbesondere aus fixiertem Gewebe
US8846878B1 (en) 2009-01-23 2014-09-30 Cubrc Corporation Method and device for isolating a protein sample
EP2210936A1 (en) * 2009-01-27 2010-07-28 Curetis AG Processing and analysis of viscous liquid biological samples
CN102459639A (zh) * 2009-04-18 2012-05-16 健泰科生物技术公司 用于评估b细胞淋巴瘤对抗cd40抗体治疗的响应性的方法
WO2010123626A1 (en) 2009-04-24 2010-10-28 University Of Southern California Cd133 polymorphisms and expression predict clinical outcome in patients with cancer
DE202009018981U1 (de) * 2009-07-01 2015-03-11 Axagarius Gmbh & Co. Kg Verwendung eines Kits für die Isolierung von Biomolekülen aus biologischen Proben sowie Kit dafür
MX353237B (es) 2009-09-23 2018-01-08 Danisco Us Inc Enzimas de glicosil hidrolasa novedosas y usos de las mismas.
US8329360B2 (en) 2009-12-04 2012-12-11 Taiwan Semiconductor Manufacturing Company, Ltd. Method and apparatus of providing overlay
RU2012131405A (ru) 2009-12-23 2014-01-27 ДАНИСКО ЮЭс ИНК. Способы улучшения эффективности одновременно протекающих реакций осахаривания и ферментации
AU2011203450B2 (en) * 2010-01-04 2016-01-07 Qiagen Gaithersburg, Inc. Methods, compositions, and kits for recovery of nucleic acids or proteins from fixed tissue samples
WO2011104032A1 (en) 2010-02-26 2011-09-01 Qiagen Gmbh Method for isolating rna from a rna and dna containing sample
US10787701B2 (en) 2010-04-05 2020-09-29 Prognosys Biosciences, Inc. Spatially encoded biological assays
US20190300945A1 (en) 2010-04-05 2019-10-03 Prognosys Biosciences, Inc. Spatially Encoded Biological Assays
EP2556158B1 (en) 2010-04-08 2019-12-18 Qiagen GmbH Chromatographic device and method for isolating and purifying nucleic acids
JP2013523143A (ja) 2010-04-08 2013-06-17 キアゲン ゲーエムベーハー 核酸を単離および精製するための方法
MX342055B (es) 2010-04-12 2016-09-12 Response Genetics Inc Iniciadores y sondas de kras.
EP2388324A1 (de) * 2010-05-20 2011-11-23 Siemens Healthcare Diagnostics Inc. Kontrollmaterial für Nukleinsäureteste
EP2395082A1 (en) 2010-06-14 2011-12-14 QIAGEN GmbH Extraction of nucleic acids from wax-embedded samples
EP2627984B1 (en) 2010-10-12 2017-08-16 Life Technologies Corporation Method of preparing quality control material for ffpe
KR101420094B1 (ko) * 2010-10-27 2014-07-17 (주)바이오니아 다양한 생체시료분석을 위한 전자동실시간정량증폭장비, 다양한 생체시료분석을 위한 자동정제 및 반응준비 장치, 전자동 핵산정제 및 실시간 정량 유전자증폭 방법, 전자동 핵산정제방법, 실시간정량pcr을 이용한 병원균의 전자동 생균수검사방법, 정량면역pcr을 이용한 전자동 항원농도획득방법 및 타겟항원에 라벨링된 부착용 타겟핵산의 정제방법
EP2468862A1 (en) * 2010-12-23 2012-06-27 Qiagen GmbH Method and kit for processing wax-embedded biological samples
CN102146112B (zh) * 2011-01-25 2013-07-10 天根生化科技(北京)有限公司 从福尔马林固定石蜡包埋组织中提取脱氧核糖核酸的方法
CN107255584B (zh) * 2011-02-28 2021-04-13 安捷伦科技有限公司 用于预处理包埋的生物样本的不混溶两相系统
CN102181431B (zh) * 2011-03-11 2012-12-26 大连医科大学 从石蜡包埋组织中提取总rna的方法
US20140134677A1 (en) 2011-03-17 2014-05-15 Danisco Us Inc. Method for reducing viscosity in saccharification process
ES2656958T3 (es) 2011-03-28 2018-03-01 Geron Corporation Medición de la longitud de telómeros en muestras fijadas en formalina, embebidas en parafina (FFPE) por PCR cuantitativa
GB201106254D0 (en) 2011-04-13 2011-05-25 Frisen Jonas Method and product
EP3587573A1 (en) 2011-06-16 2020-01-01 The Regents of The University of California Synthetic gene clusters
WO2013010074A1 (en) 2011-07-13 2013-01-17 Primeradx, Inc. Multimodal methods for simultaneous detection and quantification of multiple nucleic acids in a sample
FR2982278A1 (fr) 2011-11-03 2013-05-10 Assist Publ Hopitaux De Paris Procede de classification d'echantillons de tissus fixes et inclus en paraffine
US9416357B2 (en) 2011-11-16 2016-08-16 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Method for isolating total RNA from cells
EP2780453B1 (en) 2011-11-17 2017-03-29 Rheonix, Inc. Microfluidic apparatus, method, and applications
CN103571824B (zh) 2012-08-09 2016-04-13 财团法人工业技术研究院 用于分离核酸的组合物及方法
AU2013323586B2 (en) * 2012-09-28 2019-07-11 Cepheid Methods for DNA and RNA extraction from fixed paraffin-embedded tissue samples
CN104884625A (zh) 2012-10-15 2015-09-02 先锋国际良种公司 增强cry内毒素的活性的方法和组合物
EP4592400A3 (en) 2012-10-17 2025-10-29 10x Genomics Sweden AB Methods and product for optimising localised or spatial detection of gene expression in a tissue sample
WO2014071182A1 (en) 2012-11-01 2014-05-08 Massachusetts Institute Of Technology Directed evolution of synthetic gene cluster
EP2730653A1 (en) 2012-11-07 2014-05-14 QIAGEN GmbH Method for lysing a fixed biological sample
US9200327B2 (en) 2012-11-30 2015-12-01 Geron Corporation Diagnostic markers for treating cell proliferative disorders with telomerase inhibitors
WO2014153254A2 (en) 2013-03-14 2014-09-25 Pioneer Hi-Bred International Inc. Compositions and methods to control insect pests
CA2901316A1 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Phi-4 polypeptides and methods for their use
KR101748867B1 (ko) * 2013-04-19 2017-06-20 주식회사 젠큐릭스 조기 유방암 예후 예측 진단용 자동화 시스템
CA2916662C (en) 2013-06-25 2022-03-08 Prognosys Biosciences, Inc. Methods and systems for determining spatial patterns of biological targets in a sample
BR112016003225B1 (pt) 2013-08-16 2022-10-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Polipeptídeo pip-47, polipeptídeo pip-47 quimérico, composição, proteína de fusão, método para controlar uma população de inseto-praga, método para inibir o crescimento ou matar um inseto-praga, construto de dna, polinucleotídeo isolado, cassete de expressão, método de obtenção de uma planta transgênica e método para controlar infestação de inseto
BR122020001770B1 (pt) 2013-09-13 2022-11-29 Pioneer Hi-Bred International, Inc Construto de dna, método de obtenção de planta transgênica, proteína de fusão, método para controlar uma população de praga de inseto, método para inibir o crescimento ou matar uma praga de inseto
BR112016018103B1 (pt) 2014-02-07 2024-01-16 E.I. Du Pont De Nemours And Company Polipeptídeo e seu uso, polinucleotídeo, composição, proteína de fusão, método para controlar uma população, método para inibir o crescimento, método para controlar a infestação, método para obtenção de uma planta ou célula vegetal, construto
CN106536545B (zh) 2014-02-07 2026-03-03 先锋国际良种公司 杀昆虫蛋白及其使用方法
WO2016000237A1 (en) 2014-07-03 2016-01-07 Pioneer Overseas Corporation Plants having enhanced tolerance to insect pests and related constructs and methods involving insect tolerance genes
WO2016044092A1 (en) 2014-09-17 2016-03-24 Pioneer Hi Bred International Inc Compositions and methods to control insect pests
CN113372421B (zh) 2014-10-16 2024-08-06 先锋国际良种公司 杀昆虫蛋白及其使用方法
DE102014118532B4 (de) 2014-12-12 2017-03-23 Axagarius Gmbh & Co. Kg Vorrichtung mit einer Filterschicht und Verfahren zur Gewinnung von Nukleinsäuren aus Formalin-fixierten und in Paraffin eingebetteten Proben
US10968443B2 (en) * 2014-12-31 2021-04-06 The Rockefeller University Method of RNA isolation from clinical samples
CN114075267B (zh) 2015-01-15 2025-03-18 先锋国际良种公司 杀昆虫蛋白及其使用方法
CA2977026A1 (en) 2015-03-11 2016-09-15 E.I. Du Pont De Nemours And Company Insecticidal combinations of pip-72 and methods of use
EP3901282B1 (en) 2015-04-10 2023-06-28 Spatial Transcriptomics AB Spatially distinguished, multiplex nucleic acid analysis of biological specimens
US10365189B2 (en) 2015-05-07 2019-07-30 Steven Wheeler Histological specimen treatment
CA2985198A1 (en) 2015-05-19 2016-11-24 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
EA033170B1 (ru) * 2015-05-21 2019-09-30 Государственное Учреждение Образования "Белорусская Медицинская Академия Последипломного Образования" (Гуо "Белмапо") Способ определения экспрессии гена gstm1 в образцах из парафин-фиксированных срезов опухолевой ткани молочной железы
EP3310803A1 (en) 2015-06-16 2018-04-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
KR102804055B1 (ko) 2015-07-13 2025-05-08 피벗 바이오, 인크. 식물 형질 개선을 위한 방법 및 조성물
WO2017019293A1 (en) 2015-07-24 2017-02-02 Cepheid Compositions and methods for dna and rna extraction from tissue samples
BR112018002535A2 (pt) 2015-08-06 2018-09-25 Du Pont polipeptídeo inseticida recombinante, polinucleotídeo recombinante, construto de dna, planta transgênica ou célula de planta, composição, proteína de fusão, método para controlar uma praga, método para inibir crescimento ou para exterminar uma população de pragas ou uma praga e uso do polipeptídeo
DK3341483T3 (da) 2015-08-28 2020-03-16 Pioneer Hi Bred Int Ochrobactrum-medieret transformation af planter
CA3001001A1 (en) 2015-10-05 2017-04-13 Massachusetts Institute Of Technology Nitrogen fixation using refactored nif clusters
KR101749419B1 (ko) 2015-10-15 2017-07-03 주식회사 어큐진 파라핀포매된 샘플로부터 dna를 추출하는 방법
EP3371594A1 (en) 2015-11-06 2018-09-12 Ventana Medical Systems, Inc. Representative diagnostics
CN108575091A (zh) 2015-12-18 2018-09-25 先锋国际良种公司 杀昆虫蛋白及其使用方法
RU2018137045A (ru) 2016-04-14 2020-05-14 Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. Инсектицидные полипептиды, обладающие улучшенным спектром активности, и пути их применения
EP3445861B1 (en) 2016-04-19 2021-12-08 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal combinations of polypeptides having improved activity spectrum and uses thereof
CA3018384A1 (en) 2016-05-04 2017-11-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
CA3022858A1 (en) 2016-06-16 2017-12-21 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
UA127388C2 (uk) 2016-06-24 2023-08-09 Піонір Хай-Бред Інтернешнл, Інк. Регуляторний елемент рослини і спосіб його застосування
EP3478052B1 (en) 2016-07-01 2021-08-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins from plants and methods for their use
WO2018013333A1 (en) 2016-07-12 2018-01-18 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
EP3535285B1 (en) 2016-11-01 2022-04-06 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
BR112019012339A2 (pt) 2016-12-14 2019-11-26 Pioneer Hi Bred Int polipeptídeo inseticida recombinante, composição, construto de dna, célula hospedeira, planta transgênica, método para inibir o crescimento ou extermínio de uma praga de inseto ou população de praga, polipeptídeo ipd093 quimérico e proteína de fusão
US11213028B2 (en) 2016-12-22 2022-01-04 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
WO2018119295A1 (en) 2016-12-22 2018-06-28 Ventana Medical Systems, Inc. Fully automated nucleic acid extraction method for tissue samples
CN116904333A (zh) 2017-01-12 2023-10-20 皮沃特生物公司 用于改良植物性状的方法及组合物
WO2018140214A1 (en) 2017-01-24 2018-08-02 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Nematicidal protein from pseudomonas
WO2018148001A1 (en) 2017-02-08 2018-08-16 Pioneer Hi-Bred International Inc Insecticidal combinations of plant derived insecticidal proteins and methods for their use
CN110914438A (zh) 2017-05-26 2020-03-24 先锋国际良种公司 具有改善的活性谱的杀昆虫多肽及其用途
CN107271239A (zh) * 2017-07-06 2017-10-20 浙江大学 一种溶解石蜡组织切片的方法及应用
US20200165626A1 (en) 2017-10-13 2020-05-28 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Virus-induced gene silencing technology for insect control in maize
CN111527057A (zh) 2017-10-25 2020-08-11 皮沃特生物股份有限公司 靶向改良植物性状的固氮的基因靶标
MX2020004343A (es) 2017-10-25 2021-01-08 Pivot Bio Inc Métodos y composiciones para mejorar microbios modificados que fijan nitrógeno.
KR20200123144A (ko) 2018-02-22 2020-10-28 지머젠 인코포레이티드 바실러스가 농축된 게놈 라이브러리를 생성하고 새로운 cry 독소를 동정하기 위한 방법
EP3759489A1 (en) 2018-03-02 2021-01-06 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Plant health assay
CA3088011A1 (en) 2018-03-02 2019-09-06 Zymergen Inc. Insecticidal protein discovery platform and insecticidal proteins discovered therefrom
CA3092078A1 (en) 2018-03-14 2019-09-19 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins from plants and methods for their use
AU2019234562B2 (en) 2018-03-14 2024-08-01 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins from plants and methods for their use
WO2019226508A1 (en) 2018-05-22 2019-11-28 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Plant regulatory elements and methods of use thereof
WO2020006064A2 (en) 2018-06-27 2020-01-02 Pivot Bio, Inc. Agricultural compositions comprising remodeled nitrogen fixing microbes
EP3813511A4 (en) 2018-06-27 2022-08-03 Pivot Bio, Inc. GUIDED MICROBIAL REMODELING, PLATFORM FOR RATIONAL IMPROVEMENT OF MICROBIAL SPECIES FOR AGRICULTURE
KR20210060434A (ko) 2018-07-11 2021-05-26 피벗 바이오, 인크. 리모델링된 미생물에 의한 시간적 및 공간적 표적화 동적 질소 전달
US11519033B2 (en) 2018-08-28 2022-12-06 10X Genomics, Inc. Method for transposase-mediated spatial tagging and analyzing genomic DNA in a biological sample
WO2020046701A1 (en) 2018-08-29 2020-03-05 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
WO2020123316A2 (en) 2018-12-10 2020-06-18 10X Genomics, Inc. Methods for determining a location of a biological analyte in a biological sample
US12529094B2 (en) 2018-12-10 2026-01-20 10X Genomics, Inc. Imaging system hardware
US11649485B2 (en) 2019-01-06 2023-05-16 10X Genomics, Inc. Generating capture probes for spatial analysis
US11926867B2 (en) 2019-01-06 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Generating capture probes for spatial analysis
WO2020190363A1 (en) 2019-03-19 2020-09-24 Massachusetts Institute Of Technology Control of nitrogen fixation in rhizobia that associate with cereals
CA3129539A1 (en) 2019-04-25 2020-10-29 Min-Hyung RYU High-throughput methods for isolating and characterizing ammonium-excreting mutant libraries generated by chemical mutagenesis
WO2020243579A1 (en) 2019-05-30 2020-12-03 10X Genomics, Inc. Methods of detecting spatial heterogeneity of a biological sample
CN110376036A (zh) * 2019-07-30 2019-10-25 河南赛诺特生物技术有限公司 一种肿瘤细胞系免疫组化对照品的制备方法及肿瘤细胞系免疫组化对照品
CN110361242B (zh) * 2019-08-14 2022-01-18 武汉赛维尔生物科技有限公司 一种用于眼球组织的固定液以及眼球组织制片的预处理方法
WO2021076346A1 (en) 2019-10-18 2021-04-22 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Maize event dp-202216-6 and dp-023211-2 stack
WO2021092433A2 (en) 2019-11-08 2021-05-14 10X Genomics, Inc. Enhancing specificity of analyte binding
CN115135984B (zh) 2019-12-23 2025-12-23 10X基因组学有限公司 可逆固定试剂及其使用方法
ES2982420T3 (es) 2019-12-23 2024-10-16 10X Genomics Inc Métodos para el análisis espacial mediante el uso de la ligazón con plantilla de ARN
EP4081656A1 (en) 2019-12-23 2022-11-02 10X Genomics, Inc. Compositions and methods for using fixed biological samples in partition-based assays
US12365942B2 (en) 2020-01-13 2025-07-22 10X Genomics, Inc. Methods of decreasing background on a spatial array
US12405264B2 (en) 2020-01-17 2025-09-02 10X Genomics, Inc. Electrophoretic system and method for analyte capture
US11702693B2 (en) 2020-01-21 2023-07-18 10X Genomics, Inc. Methods for printing cells and generating arrays of barcoded cells
US11732299B2 (en) 2020-01-21 2023-08-22 10X Genomics, Inc. Spatial assays with perturbed cells
US20210230681A1 (en) 2020-01-24 2021-07-29 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using proximity ligation
US12076701B2 (en) 2020-01-31 2024-09-03 10X Genomics, Inc. Capturing oligonucleotides in spatial transcriptomics
US11898205B2 (en) 2020-02-03 2024-02-13 10X Genomics, Inc. Increasing capture efficiency of spatial assays
US12110541B2 (en) 2020-02-03 2024-10-08 10X Genomics, Inc. Methods for preparing high-resolution spatial arrays
TWI906251B (zh) 2020-02-04 2025-12-01 美商科迪華農業科技有限責任公司 具有殺有害生物效用之組成物及與其相關之方法
US11732300B2 (en) 2020-02-05 2023-08-22 10X Genomics, Inc. Increasing efficiency of spatial analysis in a biological sample
WO2021158925A1 (en) 2020-02-07 2021-08-12 10X Genomics, Inc. Quantitative and automated permeabilization performance evaluation for spatial transcriptomics
US12281357B1 (en) 2020-02-14 2025-04-22 10X Genomics, Inc. In situ spatial barcoding
US11891654B2 (en) 2020-02-24 2024-02-06 10X Genomics, Inc. Methods of making gene expression libraries
EP4127164A1 (en) 2020-03-31 2023-02-08 QIAGEN GmbH Nucleic acid purification from fixed biological samples
WO2021207610A1 (en) 2020-04-10 2021-10-14 10X Genomics, Inc. Cold protease treatment method for preparing biological samples
CN115916972A (zh) 2020-04-16 2023-04-04 10X基因组学有限公司 用于被固定样品的组合物和方法
EP4139485B1 (en) 2020-04-22 2023-09-06 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using targeted rna depletion
AU2020445067A1 (en) 2020-05-01 2022-12-01 Pivot Bio, Inc. Measurement of nitrogen fixation and incorporation
EP4414459B1 (en) 2020-05-22 2025-09-03 10X Genomics, Inc. Simultaneous spatio-temporal measurement of gene expression and cellular activity
EP4153776B1 (en) 2020-05-22 2025-03-05 10X Genomics, Inc. Spatial analysis to detect sequence variants
US12031177B1 (en) 2020-06-04 2024-07-09 10X Genomics, Inc. Methods of enhancing spatial resolution of transcripts
EP4421186B1 (en) 2020-06-08 2025-08-13 10X Genomics, Inc. Methods of determining a surgical margin and methods of use thereof
ES2994976T3 (en) 2020-06-25 2025-02-05 10X Genomics Inc Spatial analysis of dna methylation
US11981960B1 (en) 2020-07-06 2024-05-14 10X Genomics, Inc. Spatial analysis utilizing degradable hydrogels
US11761038B1 (en) 2020-07-06 2023-09-19 10X Genomics, Inc. Methods for identifying a location of an RNA in a biological sample
US12209280B1 (en) 2020-07-06 2025-01-28 10X Genomics, Inc. Methods of identifying abundance and location of an analyte in a biological sample using second strand synthesis
BR112022027035A2 (pt) 2020-07-14 2023-04-11 Pioneer Hi Bred Int Proteínas inseticidas e métodos para uso das mesmas
CN116323968A (zh) 2020-07-31 2023-06-23 10X基因组学有限公司 用于空间分析的去交联化合物和使用方法
CN116096903A (zh) 2020-08-10 2023-05-09 先锋国际良种公司 植物调节元件及其使用方法
US11981958B1 (en) 2020-08-20 2024-05-14 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using DNA capture
US11926822B1 (en) 2020-09-23 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Three-dimensional spatial analysis
WO2022103712A1 (en) 2020-11-13 2022-05-19 10X Genomics, Inc. Nano-partitions (encapsulated nucleic acid processing enzymes) for cell-lysis and multiple reactions in partition-based assays
US11827935B1 (en) 2020-11-19 2023-11-28 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using rolling circle amplification and detection probes
EP4729631A2 (en) 2020-12-21 2026-04-22 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and systems for capturing probes and/or barcodes
CN114854824A (zh) * 2021-02-03 2022-08-05 深圳华大基因股份有限公司 建库方法及应用
EP4305196B1 (en) 2021-04-14 2025-04-02 10X Genomics, Inc. Methods of measuring mislocalization of an analyte
EP4320271B1 (en) 2021-05-06 2025-03-19 10X Genomics, Inc. Methods for increasing resolution of spatial analysis
WO2022256503A1 (en) 2021-06-03 2022-12-08 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, kits, and systems for enhancing analyte capture for spatial analysis
US12611645B2 (en) * 2021-08-25 2026-04-28 Matchstick Technologies, Inc. Microplate cycling thermo sonicator with programmable ultrasound, heating, and cooling for multi-analytical applications
WO2023034489A1 (en) 2021-09-01 2023-03-09 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and kits for blocking a capture probe on a spatial array
WO2023086880A1 (en) 2021-11-10 2023-05-19 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and kits for determining the location of an analyte in a biological sample
WO2023102118A2 (en) 2021-12-01 2023-06-08 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and systems for improved in situ detection of analytes and spatial analysis
TW202345696A (zh) 2022-05-18 2023-12-01 美商科迪華農業科技有限責任公司 具有殺有害生物效用之組成物及與其相關的方法
EP4540607A1 (en) 2022-06-17 2025-04-23 10X Genomics, Inc. Catalytic de-crosslinking of samples for in situ analysis
EP4482979B1 (en) 2022-11-09 2025-10-01 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and kits for determining the location of multiple analytes in a biological sample
WO2025178772A1 (en) 2024-02-23 2025-08-28 Genective Sa Insecticidal proteins compositions and methods of use
WO2025193453A1 (en) 2024-03-14 2025-09-18 Genective Sa Insecticidal proteins compositions and methods of use
WO2025235220A1 (en) 2024-05-08 2025-11-13 Genective Sa Insecticidal proteins compositions and methods of use
WO2025264577A1 (en) 2024-06-20 2025-12-26 Genective Sa Insecticidal proteins, compositions and methods of use
WO2025264584A1 (en) 2024-06-20 2025-12-26 Genective Sa Insecticidal proteins, compositions and methods of use
WO2026006045A1 (en) 2024-06-25 2026-01-02 Genective Sa Insecticidal proteins, compositions and methods of use
WO2026043743A1 (en) 2024-08-21 2026-02-26 Genective Sa Insecticidal proteins compositions and methods of use
WO2026055006A2 (en) 2024-09-03 2026-03-12 Genective Sa Insecticidal proteins compositions and methods of use
WO2026076007A1 (en) 2024-10-04 2026-04-09 Genective Sa Insecticidal proteins compositions and methods of use

Family Cites Families (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4830969A (en) 1981-08-31 1989-05-16 The Research Foundation Of State University Of New York Process for the rapid and simple isolation of nucleic acids
US4843155A (en) 1987-11-19 1989-06-27 Piotr Chomczynski Product and process for isolating RNA
US5128247A (en) 1989-08-14 1992-07-07 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods for isolation of nucleic acids from eukaryotic and prokaryotic sources
US5654179A (en) * 1990-11-14 1997-08-05 Hri Research, Inc. Nucleic acid preparation methods
US5284940A (en) 1990-11-14 1994-02-08 Hri Research, Inc. Preparation for nucleic acid samples
US5620852A (en) 1990-11-14 1997-04-15 Hri Research, Inc. Nucleic acid preparation methods
US5346994A (en) * 1992-01-28 1994-09-13 Piotr Chomczynski Shelf-stable product and process for isolating RNA, DNA and proteins
US5502166A (en) 1992-02-26 1996-03-26 Mitsubishi Chemical Corporation NMDH receptor proteins and genes encoding the same
AU6230594A (en) 1993-02-01 1994-08-29 University Of Iowa Research Foundation, The Quartenary amine surfactants and methods of using same in isolation of rna
US5876978A (en) * 1993-04-06 1999-03-02 Medical College Of Ohio Method for quantitative measurement of gene expression using multiplex competitive reverse transcriptase-polymerase chain reaction
US5637687A (en) 1993-08-31 1997-06-10 Wiggins; James C. Methods and compositions for isolating nucleic acids
US5643767A (en) 1994-05-02 1997-07-01 The Rockefeller University Process for isolating cellular components
US5942391A (en) * 1994-06-22 1999-08-24 Mount Sinai School Of Medicine Nucleic acid amplification method: ramification-extension amplification method (RAM)
US5876924A (en) * 1994-06-22 1999-03-02 Mount Sinai School Of Medicine Nucleic acid amplification method hybridization signal amplification method (HSAM)
CA2153215A1 (en) 1994-07-06 1996-01-07 Lu Wang Treatment of paraffin embedded tissue for gene analysis
US5763169A (en) * 1995-01-13 1998-06-09 Chiron Diagnostics Corporation Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi
US5707802A (en) * 1995-01-13 1998-01-13 Ciba Corning Diagnostics Corp. Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi
US5777099A (en) 1995-02-24 1998-07-07 Biotecx Laboratories, Inc. RNA separation
US5945515A (en) 1995-07-31 1999-08-31 Chomczynski; Piotr Product and process for isolating DNA, RNA and proteins
US5998151A (en) 1995-12-01 1999-12-07 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Methods for predicting the efficacy of a chemotherapeutic regimen for gastrointestinal cancers using antibodies specific for thymidylate synthase
US20020090642A1 (en) * 1995-12-11 2002-07-11 Patrick G. Johnston Methods for determining the prognosis of breast cancer using antibodies specific for thymidylate synthase
DE29601618U1 (de) 1996-01-31 1996-07-04 InViTek GmbH, 13125 Berlin Vorrichtung zur gleichzeitigen multiplen Isolierung
EP0791654A1 (en) 1996-02-21 1997-08-27 Jürgen A. Dr. Richt Polypeptides corresponding to the amino acid sequences of proteins p57 or p9.5 of Borna disease virus, nucleic acid fragments coding therefore and their use for diagnostic and immunization purposes
CA2253937A1 (en) * 1996-05-10 1997-11-20 Phylomed Corporation Methods for oxidizing disulfide bonds using ozone
EP0973944A1 (en) * 1997-03-31 2000-01-26 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for detecting diseases of the gastrointestinal tract
DE60025172T2 (de) * 1999-03-18 2006-09-21 Exiqon A/S Einstufige probezubereitung und bestimmung von nukleinsäure in biologischen proben
US6248535B1 (en) * 1999-12-20 2001-06-19 University Of Southern California Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8574868B2 (en) 2010-11-24 2013-11-05 Industrial Technology Research Institute Method for deparaffinizing formalin-fixed paraffin-embedded tissue

Also Published As

Publication number Publication date
DK1743939T3 (da) 2011-12-12
EP1743939B1 (en) 2011-09-07
CA2394618A1 (en) 2001-06-28
CN1891836A (zh) 2007-01-10
HK1055446A1 (zh) 2004-01-09
IL150116A0 (en) 2002-12-01
NO330802B1 (no) 2011-07-18
NO20022945L (no) 2002-08-06
EP2363477A2 (en) 2011-09-07
KR20030027878A (ko) 2003-04-07
US20010029018A1 (en) 2001-10-11
CN1269959C (zh) 2006-08-16
AU784565B2 (en) 2006-05-04
MXPA02006145A (es) 2004-08-23
US20090035761A1 (en) 2009-02-05
US7960147B2 (en) 2011-06-14
CN1420927A (zh) 2003-05-28
EA006827B1 (ru) 2006-04-28
WO2001046402A1 (en) 2001-06-28
EP2363477A3 (en) 2013-07-31
EP1743939A3 (en) 2007-05-09
ATE523590T1 (de) 2011-09-15
ATE349518T1 (de) 2007-01-15
JP2003525033A (ja) 2003-08-26
US20020009795A1 (en) 2002-01-24
US7919280B2 (en) 2011-04-05
EA200501772A1 (ru) 2006-10-27
US20040018551A1 (en) 2004-01-29
EP1743939A2 (en) 2007-01-17
US6610488B2 (en) 2003-08-26
US20060199197A1 (en) 2006-09-07
US7998707B2 (en) 2011-08-16
US6428963B2 (en) 2002-08-06
US6613518B2 (en) 2003-09-02
ES2373149T3 (es) 2012-01-31
HK1098178A1 (zh) 2007-07-13
DE60032634T2 (de) 2007-10-04
DE60032634D1 (de) 2007-02-08
EP1242594A1 (en) 2002-09-25
US6248535B1 (en) 2001-06-19
AR027036A1 (es) 2003-03-12
EA200200698A1 (ru) 2003-12-25
US20020009794A1 (en) 2002-01-24
CA2394618C (en) 2013-05-07
IL150116A (en) 2012-01-31
AU2006202986B2 (en) 2008-12-04
EA008832B1 (ru) 2007-08-31
CN1891836B (zh) 2010-04-21
US20040091910A1 (en) 2004-05-13
EP1242594B1 (en) 2006-12-27
NO20022945D0 (no) 2002-06-19
BR0016569A (pt) 2003-07-15
KR100723328B1 (ko) 2007-05-31
AU1578501A (en) 2001-07-03
AU2006202986A1 (en) 2006-08-10
AU784565C (en) 2007-02-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI277652B (en) Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens
US11193120B2 (en) RNA isolation from soluble urine fractions
US20200354712A1 (en) Diagnosis of prostate cancer
TWI338049B (en) Method of determining a chemotherapeutic regimen based on glutathione-s-transferase pi expression
HK1098178B (zh) 定量測量固定的石蠟包埋的組織樣品中靶基因表達的方法

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Annulment or lapse of patent due to non-payment of fees