WO2006080409A1 - 5-置換ヒダントインラセマーゼ、これをコードするdna、組換えdna、形質転換された細胞、および、光学活性n-カルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法 - Google Patents

5-置換ヒダントインラセマーゼ、これをコードするdna、組換えdna、形質転換された細胞、および、光学活性n-カルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法 Download PDF

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amino acid
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Kenichi Nishi
Satohiro Yanagisawa
Hirokazu Nanba
Makoto Ueda
Naoto Noro
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Kaneka Corp
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    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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    • C12P41/00Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture
    • C12P41/006Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture by reactions involving C-N bonds, e.g. nitriles, amides, hydantoins, carbamates, lactames, transamination reactions, or keto group formation from racemic mixtures
    • C12P41/009Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture by reactions involving C-N bonds, e.g. nitriles, amides, hydantoins, carbamates, lactames, transamination reactions, or keto group formation from racemic mixtures by reactions involving hydantoins or carbamoylamino compounds

Definitions

  • the present invention is a polypeptide having a novel hydantoin racemase activity from a microorganism, DN A encoding the same, and microorganisms or transformant having an ability to produce hydantoin racemase, and the hydantoin racemase using them
  • the present invention also relates to a production method and an efficient production method of optically active N-streptylamylamino acid or optically active amino acid using hydantoin racemase.
  • Hydantoin racemase is an enzyme that acts on optically active 5-substituted hydantoin compounds, that is, D- or L5-substituted hydantoin compounds, and catalyzes the racemization reaction of the compound. It can be used to produce optically active N-force rubamyl amino acids or optically active amino acids, which are important as raw materials for chemical industrial products and food additives, from 5-substituted hydantoin compounds.
  • a 5-substituted hydantoin compound power, an optically active N-power, and a hydantoinase having stereoselectivity can be used simultaneously to produce a ruvamil amino acid.
  • hydantoin racemase and a hydantoinase having stereoselectivity are used at the same time. —Power Use Lubamil amino acid amide hydrase.
  • hydantoinase and N-strength amino acid amide hydride can be performed separately in two stages, or the two reactions can be mixed and reacted in one stage. It can also be carried out as a reaction.
  • the weak rubamyly reaction after the reaction using hydantoinase is not only the method using the enzyme as described above, but also the weak rubamyly method using a chemical reaction well known from the past. Monkey.
  • 5-substituted hydantoin compounds that are chemically racemized in the above reaction system are also known, but their types are limited, and many 5-substituted hydantoin compounds are known.
  • the chemical racemization rate of is slow or does not progress substantially. For this reason, when hydantoin racemase is not used effectively, there is a problem that the yield is lowered, and it is very useful to use hydantoin racemase in this reaction system. Therefore, a search for hydantoin racemase has been made for the purpose of promoting racemization of optically active 5-substituted hydantoin compounds having a slow racemization rate.
  • Examples of microorganisms that produce hydantoin racemase include, for example, the genus Arthroba cter (Patent Document 1, Non-Patent Document 1), the genus Pseudomonas (Patent Document 2, Non-Patent Document 2), and Agrobacterium.
  • Non-patent document 3 Non-patent document 4, Patent document 3
  • Sinorhizobium genus Non-patent document 5
  • Microbacterium genus Patent document 4
  • Flavobata teri Microorganisms belonging to the genus Flavobacterium Patent Document 5
  • the Pasteurella genus Patent Document 6
  • the Candida genus Patent Document 7
  • Patent Document 1 Japanese Patent Laid-Open No. 62-122591
  • Patent Document 2 Japanese Patent Laid-Open No. 4-271784
  • Patent Document 3 International Publication No. WO03 / 100050
  • Patent Document 4 Japanese Patent Laid-Open No. 2002-330784
  • Patent Document 5 Japanese Unexamined Patent Publication No. 2003-210176
  • Patent Document 6 Japanese Unexamined Patent Publication No. 2003-210177
  • Patent Document 7 JP-A-61-47194
  • Non-Patent Document 1 J. BiotechnoL, vol.80, 217 (2000)
  • Non-Patent Document 2 J. BacterioL, vol.174, 7989 (1992)
  • Non-Patent Document 3 Appl. Microbiol. BiotechnoL, 57, 680 (2001)
  • Non-Patent Document 4 Biotechnol. Prog., 18, 1201 (2002), Biochem. Biophys. Res. Commun. 303, 541 (2003)
  • Non-Patent Document 5 Appl. Microbiol, 70, 625 (2004) Disclosure of the invention
  • One object of the present invention is to provide a novel hydantoin racemase. Another object of the present invention is to clarify the amino acid sequence of the hydantoin racemase, the DNA sequence of the gene, a microorganism or transformant capable of producing the enzyme, and the hydantoin racemase using them. It is to provide a manufacturing method. Furthermore, another object of the present invention is to provide an efficient optically active N-force rubamyl amino acid or optically active amino acid production method using the hydantoin racemase.
  • the present inventors have extensively searched for microorganisms having hydantoin racemase activity from soil, and as a result, newly isolated bacteria belonging to the genus Bacillus that produce hydantoin racemase having excellent properties. did.
  • the microorganism was also isolated and purified from hydantoin racemase, and the hydantoin racemase gene was isolated and expressed in the host microorganism.
  • the hydantoin racemase obtained in the present invention also acts on 5-substituted hydantoin compounds corresponding to the aforementioned non-natural amino acids.
  • one feature of the present invention is a polypeptide having the following properties and having hydantoin racemase activity:
  • Another feature of the present invention is a polypeptide comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.
  • Another feature of the present invention is DNA encoding the above-described polypeptide.
  • Another feature of the present invention is a recombinant plasmid containing the above DNA.
  • Another feature of the present invention is a transformant obtained by transforming a host microorganism with the above recombinant plasmid.
  • Another feature of the present invention is the ability to produce the above-described polypeptide
  • Another feature of the present invention is a method for producing a hydantoin racemase, characterized by culturing a microorganism having the ability to produce the above polypeptide, accumulating the polypeptide in the culture, and collecting it. is there.
  • Another feature of the present invention is that the above-mentioned polypeptide having hydantoin racemase activity, the above-mentioned transformant, or the above-mentioned microorganism is caused to act on an optically active 5-substituted hydantoin compound. This is a method for racemization of optically active 5-substituted hydantoins.
  • polypeptide having the hydantoin racemase activity, the transformant, or the microorganism described above is represented by the general formula (1).
  • R is an optionally substituted alkyl group having 1 to 20 carbon atoms, V having a substituent, and may be a aralkyl group having 7 to 20 carbon atoms, or a substituted group.
  • An optically active 5-substituted compound characterized in that it is made to act on an optically active 5-substituted hydantoin compound having a group, which may be an aryl group having 6 to 20 carbon atoms. This is a method of racemizing hydantoin.
  • Another feature of the present invention is that the above polypeptide, the above transformant, or the above microorganism and the hydantoinase are allowed to act on a 5-substituted hydantoin compound. This is a method for producing active N-strength rubamil amino acids.
  • polypeptide, the transformant, or the microorganism described above and hydantoinase are allowed to act on the 5-substituted hydantoin compound represented by the formula (1).
  • Another feature of the present invention is that the above-mentioned polypeptide, the above-mentioned transformant, or the above-mentioned microorganism, hydantoinase and N-force rubamyl amino acid amide hydrolase are combined with a 5-substituted hydantoin. It is a method for producing an optically active amino acid characterized by acting on a product
  • Another feature of the present invention is that the above polypeptide, the above transformant, or the above microorganism. And a hydantoinase, N-strength rubamyl amino acid amidino, and idolase are allowed to act on the 5-substituted hydantoin compound represented by the above formula (1). 9]
  • the hydantoin racemase of the present invention is an enzyme that can efficiently act on a 5-substituted hydantoin compound corresponding to an unnatural amino acid.
  • Substituted hydantoin compounds, particularly 5-substituted hydantoin compounds corresponding to non-natural amino acids, are allowed to react with hydantoinase, N carminyl amino acid amidino, or idolase to react with optically active N-strength
  • the reaction yield can be improved by allowing the hydantoin racemase of the present invention to be present at the same time when producing a mill amino acid or an optically active amino acid.
  • novel hydantoin racemase can be efficiently produced by the microorganism and the transformant of the present invention. Furthermore, by using the hydantoin racemase of the present invention or a microorganism that produces the hydantoin racemase, an optically active N-force rubamyl amino acid or an optically active amino acid can be efficiently produced.
  • FIG. 1 is a diagram showing a restriction enzyme map of a recombinant plasmid pBHROOl containing a hydantoin racemase gene as an embodiment of the present invention.
  • FIG. 2 is a graph showing Km values of hydantoin racemase for L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin as an embodiment of the present invention.
  • FIG. 3 is a graph showing the working temperature range and optimum temperature of hydantoin racemase as an embodiment of the present invention.
  • FIG. 5 is a graph showing the temperature stability of hydantoin racemase as an embodiment of the present invention.
  • FIG. 6 is a graph showing the pH stability of hydantoin racemase as an embodiment of the present invention.
  • FIG. 7 is a graph showing the substrate inhibitory effect of hydantoin racemase as an embodiment of the present invention.
  • the polypeptide of the present invention is a polypeptide having hydantoin racemase activity and has the following physicochemical properties.
  • the hydantoin racemase activity of the polypeptide is, for example, 50 mM.
  • the hydantoin racemase of the embodiment (hereinafter referred to as "the present enzyme” or “the present hydantoin racemase” as appropriate) is an item of background art in terms of origin, enzyme properties, etc., as exemplified below. It is a novel hydantoin racemase that is clearly different from the other known hydantoin racemases described in (1).
  • This enzyme has 50% amino acid sequence homology compared to hydantoin racemase derived from Agrobacterium radiobacter (International Publication No. WO03 / 100050), Both are different sequences. In addition, this enzyme is subject to substrate inhibition, whereas hydantoin racemase derived from Agrobataterium radiopactor differs in that it is not subject to substrate inhibition.
  • This enzyme has 48% amino acid sequence homology compared to the hydantoin racemase of Microbacterium liquefaciens (JP 2002-330784 A). Are different sequences.
  • the optimum temperature of this enzyme is about 40 ° C, whereas the hydantoin racemase of microbacterium liquifaciens differs in that the optimum temperature is 50-60 ° C.
  • This enzyme has 3 amino acids as compared with Pseudomonas sp. Hydantoin racemase (JP-A-4-271784, J. BacterioL, vol.174, 7989 (1992)). Residues are different. This enzyme has an optimum temperature of 40 ° C and an optimum pH of 8-9. On the other hand, Syudomonas sp. Hydantoin racemase is different in that it has an optimum temperature power of S45 ° C and an optimum pH of 9.5. Syudomonas sp.
  • Hydantoin racemase exhibits high racemization activity against L-5- (1 methylpropyl) hydantoin, similar to L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin. Specifically, when the relative activity when L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin is used as a substrate is 100 and the relative activity when L-5- (1 methylpropyl) hydantoin is used as a substrate is calculated, 132 (refer to the ratio of D-form at a reaction time of 10 minutes in Table 1 of JP-A-4-271784).
  • this enzyme is based on L-5- (1-methylpropyl) hydantoin when the activity against L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin, which exhibits high racemization activity, is defined as 100.
  • the relative activity is 2 (see Table 2 in Example 2). Therefore, this enzyme and Pseudomonas species hydantoin racemase differ greatly in terms of substrate specificity as well as the optimum temperature and pH described above, and the properties of both enzymes are clearly different.
  • the hydantoin racemase of the embodiment obtained by the inventor of the present application is a novel enzyme derived from a microorganism belonging to the genus Bacillus, which is known for the presence or absence of hydantoin racemase activity.
  • the present inventor of the present application is that the present hydantoin racemase is an enzyme having different properties from the known hydantoin racemase as described above, and also acts on 5-substituted hydantoin compounds corresponding to unnatural amino acids. (See Table 2 in Example 2).
  • the polypeptide as an embodiment of the present invention can be preferably obtained from a microorganism belonging to the genus Bacillus, more preferably from a Bacillus sp. KNK519HR strain.
  • the Bacillus sp. KNK519HR strain which was isolated and obtained by the inventors in the present invention, is an independent administration dated December 12, 2005 as the accession number FERM BP-10477.
  • the mycological properties of Bacillus sp. KNK519HR are shown below.
  • the microorganism that produces the polypeptide of the present invention may be a wild strain of the above-described microorganism, or may be a mutant strain with improved mutation.
  • the mutant strain is a method well known to those skilled in the art, such as UV irradiation, treatment with drugs such as N-methinole N, 1-tro-N-trosoguanidine (NTG), ethyl methane sulfonate (EMS). It can be obtained by performing.
  • the medium for culturing the microorganism producing the polypeptide of the present invention is not particularly limited as long as the microorganism can grow.
  • a carbon source carbohydrates such as glucose and sucrose, alcohols such as ethanol and glycerol, fatty acids such as oleic acid and stearic acid, and esters thereof, oils such as rapeseed oil and soybean oil, and nitrogen sources Ammonium sulfate, sodium nitrate, peptone, casamino acid, corn steep liquor, bran, yeast extract, and other inorganic salts such as magnesium sulfate, sodium chloride salt, calcium carbonate, dipotassium hydrogen phosphate, phosphorus
  • other nutrient sources such as potassium dihydrogen acid, a normal liquid medium containing malt extract, meat extract and the like can be used.
  • hydantoin compounds can be added to enhance hydantoin racemase production.
  • concentration in the medium is selected from the range of 0.001 to 10% by weight, preferably 0.01 to 1% by weight.
  • the culture is usually performed in a temperature range of 20 ° C or higher and 40 ° C or lower, preferably 25 ° C or higher and 35 ° C or lower, and pH is usually 6 or higher, 8 or lower, preferably 6.5 or higher. 7. Can be done aerobically in the range of 5 or less.
  • the culture time is usually 1 day or more and 5 days or less. Further, either a batch or continuous culture method may be used.
  • hydantoin racemase Separation and purification of hydantoin racemase can be performed as follows. First, after completion of the above culture, the cells are disrupted by culture fluid force centrifugation or the like, and the cells are disrupted by means such as an ultrasonic crusher to obtain a crude enzyme solution. Purified hydantoin racemase can be obtained by purifying the crude enzyme solution by a salting-out method, a column chromatography method or the like.
  • the polypeptide of the present invention is obtained by culturing a microorganism having an ability to produce hydantoin racemase, accumulating hydantoin racemase, and collecting it. Obtained by.
  • the polypeptide of the present invention may be an enzyme that can also acquire the above-mentioned microbial power, and may be an enzyme that is produced from a transformant obtained by using a gene recombination technique as described later.
  • Examples of the enzyme of the embodiment include a polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.
  • the DNA of the present invention is not limited as long as it encodes a polypeptide having hydantoin racemase activity as described above, and is preferably a DNA encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 in the sequence listing, for example, SEQ ID NO: 2 in the sequence listing. Examples include DNA having the base sequence shown.
  • DNA having another base sequence that codes the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 is also different from the base sequence shown in SEQ ID NO: 2. It is equivalent and included in the DNA of the present invention.
  • the range of “equivalent base sequence” to a specific base sequence includes, for example, a base sequence different from the base sequence encoding an amino acid sequence corresponding to the specific base sequence.
  • the “equivalent base sequence” has a base sequence in which one or several bases are substituted, inserted, deleted and Z or added in the base sequence, and is encoded by the base sequence.
  • a nucleotide sequence having polypeptide activity eg, hydantoin racemase activity
  • “Several bases” is preferably 10 bases or less, more preferably 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, or 2 bases or less.
  • the DNA containing the hydantoin racemase gene as an embodiment of the present invention can be obtained from, for example, the Bacillus sp. KNK519HR strain, but may of course be chemically synthesized. .
  • An example of obtaining the target DNA is shown below.
  • the N-terminal amino acid sequence of hydantoin racemase purified from a microorganism having hydantoin racemase activity is determined using a gas phase protein sequencer or the like.
  • a DNA primer designed based on the N-terminal amino acid sequence thus obtained and the homologous sequence site of a known hydantoin racemase is synthesized.
  • chromosomal DNA is isolated from the microorganism that is the source of hydantoin racemase.
  • Dyeing The chromophoric DNA is obtained from the cultured cells using the UltraClean Microbial DNA Isolation Kit (manufactured by MO BIO Laboratories, Inc.).
  • DNA fragments encoding the N-terminal side and C-terminal side of the already obtained partial gene can be obtained by inverse PCR (see, for example, Nucleic Acids Res. 16, 8186 (1988)). ).
  • a DNA primer is prepared based on the base sequence of the part presumed to be upstream from the N-terminal of the enzyme and the part presumed to be downstream from the C-terminal.
  • a DNA fragment containing the full length of the desired hydantoin racemase gene can be obtained by performing PCR using the previously obtained chromosomal DNA as a cage.
  • a recombinant plasmid can be obtained by ligating the obtained DNA fragment containing the hydantoin racemase gene with vector DNA and T4 DNA ligase or the like.
  • the base sequence of the DNA fragment containing the hydantoin racemase gene inserted into the vector was analyzed, and it was confirmed that there was a base encoding the N-terminal amino acid sequence of the hydantoin racemase enzyme.
  • the open reading frame is determined by confirming the site and stop codon.
  • a host microorganism By using the DNA thus obtained or a recombinant plasmid obtained by incorporating the DNA into a vector, a host microorganism can be transformed to obtain a transformant.
  • the host-vector system described in “Guidelines for Recombinant DNA Experiments” (Science and Technology Agency, Research and Development Bureau, Life Science Division, revised on March 22, 1996) can be used.
  • the hosts include the genus Escherichia, the genus Pseudomonas, the genus Flavobacterium, the genus Bacillus, the Serratia, the genus Corynebacterium, the Brevi Brevibacterium, Agrobacterium, Acetobacter, Gluconobacter, Lactobacillus, Streptococcus It is possible to use microorganisms belonging to the genus Streptococcus or Streptomyces.
  • a plasmid, phage or derivative thereof derived from a microorganism capable of autonomous replication in the above host can be used.
  • Escherichia coli as a host microorganism and a vector capable of autonomous replication in the microorganism as a vector.
  • examples of such vectors include PUC18 (Takara Bio Inc.), pUC19 (Takara Bio Inc.), pBR3 22 (Takara Bio Inc.), pACYC184, which are readily available to those skilled in the art or are commercially available.
  • pUCNT (Tubon Gene Co., Ltd.), pSClOl (Funakoshi Co., Ltd.), pT7Blue (Takara Bio Co., Ltd.), or pUCNT that can be produced by those skilled in the art based on the description of International Publication No. WO94Z03 613, or their Derivatives can be mentioned.
  • a vector modified so as to have a strong structural promoter can be used to increase the production amount of the enzyme.
  • Escherichia coli HB101 was transformed with a recombinant plasmid pBHROOl (see Fig. 1) in which the DNA obtained as described above was incorporated into pUCNT, and the transformant Escherichia coli ( Escherichia coli) HB 101 (pB HR001) can be obtained.
  • Plasmid pBHROOl is identified in the restriction map of Figure 1.
  • Transformant Escherichia coli HB101 obtained by the above method (pBH ROOD is under the accession number FERM BP-10476, and is incorporated by the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology as of December 12, 2005 Patent Biology Deposited at the Deposit Center (IPOD: 305-8566 Ibaraki Prefecture Tsukuba Rokuto 1-1-1 Chuo No. 6), the domestic deposits of the original deposit date of 15 December 2004 Transferred to the deposit).
  • the recombinant DNA technology used in the present invention is well known in the art, and includes, for example, Molecular 2nd Edition (Cold bpnng Harbor Laboratory Press, 1989), Current Protocols in Molecular Biology (Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience).
  • the transformant may be cultured using a normal medium.
  • a normal medium containing nutrients such as a carbon source, a nitrogen source, and inorganic salts may be used. Addition of organic micronutrients such as vitamins and amino acids to these often gives favorable results.
  • a carbon source carbohydrates such as glucose sucrose, organic acids such as acetic acid, alcohols and the like are appropriately used.
  • the nitrogen source ammonia salt, aqueous ammonia, ammonia gas, urea, yeast extract, peptone, corn's tip liquor, etc. are used.
  • inorganic salts include phosphates, magnesium salts, potassium salts, sodium salts, calcium salts, iron salts, sulfate salts, chlorine, and the like.
  • the culture is particularly preferably performed at a temperature of 25 ° C to 37 ° C which can be carried out at a temperature of 25 ° C in the normal temperature range of 40 ° C.
  • the pH can usually be cultured at 4 to 8, but 5 to 7.5 is preferable.
  • either a batch or continuous culture method may be used. If necessary, treatment for enzyme induction such as addition of isopropyl 1-thio j8-D-galatatoside (IPTG), ratatoose, etc. can be performed.
  • IPTG isopropyl 1-thio j8-D-galatatoside
  • ratatoose etc.
  • the optically active N-strength rubamyl amino acid as an embodiment is converted into a N-strength rubamyl amino acid by hydrolysis by reacting hydantoinase from a 5-substituted hydantoin compound by the method shown in the reaction formula (I). Can be converted.
  • the produced N 2 rubamyl amino acid can be hydrolyzed and converted into an amino acid by the action of force rubamyl amino acid amide hydride mouth by the method shown in the above reaction formula (I).
  • optically active N force rubamyl amino acid or optically active amino acid can be efficiently and quantitatively produced from a 5-substituted hydantoin compound having a slow chemical racemization rate.
  • the present invention it is important to simultaneously use the hydantoin racemase of the present invention and the hydantoinase having stereoselectivity in order to produce an optically active N-strength rubamyl amino acid.
  • the hydantoin racemase of the present invention and the hydantoinase having stereoselectivity are simultaneously used to make an optically active N-force rubamyl amino acid, and then an N-force rubamyl amino acid amide hydride.
  • hydantoin racemase of the present invention hydantoinase
  • N-force rubamil amino acid amide hydride mouthase may be used simultaneously.
  • hydantoinase, N-strength rubamyl amino acid amidino, and idolase are used at the same time, an optically active amino acid can be obtained if any of the enzymes has stereoselectivity.
  • hydantoinase is an enzyme having an activity of hydrolyzing a 5-substituted hydantoin derivative to produce an N-force rubamyl amino acid derivative.
  • hydantoinase used in the present invention those derived from animals, plants and microorganisms can be used, but those derived from microorganisms are preferred for industrial use.
  • the microorganism can be used as long as it has the ability to produce the enzyme. For example, the following known microorganisms having the ability to produce the enzyme can be mentioned.
  • Hydantoinases that catalyze D-form selective hydrolysis include bacteria belonging to the genus Acetobacter, Achromobacter, Aerobacter, and Agrobatateru. Genus Agrobacterium, Alcal igenes, Arthrobacter, Bacillus, Brevibacterium, Corynebacterium, Enterobacter, Erwinia Genus (Erwinia), Escherichia, Klebsiella, Microbacterium, Microco ecus, Protaminobacter, Proteus, Syudomo Eggplant (Pseudomonas), Sanoretina (Sartina), Serratia (Serratia), Xanthomonas (X anthomonas, Aeromonas, Flavobacteri um, Rhizobium, and other actinomycetes belonging to Actinomyces, Mycobacterium, Nocanoletya ( Nocardia, Streptomyces, Actinoplanes, Rhodo coccus
  • yeasts that belong to the genus Candida, Phichia, Rhodotorula or Toruguchi Examples include hydantoinases derived from microorganisms belonging to the genus Torulopsis.
  • hydantoinase derived from a microorganism belonging to the genus Agrobacterium, Bacillus, Pseudomonas, or Rhizobium.
  • Agrobacterium sp. KNK71 2 (FERM BP— 1900), Bacillus sp. KNK245 (FERM BP— 4863), Pseudomonas putida IFO 12996 And hydantoinase derived from Pseudomonas sp. KNK003A (FERM BP-3181) or Rhizobium sp. KNK1415 (FERM BP-4419).
  • Hydantoinases that catalyze L-selective hydrolysis include Bacillus, Flavobacterium, Arthrobacter, Pseudomonas, or Nocardia. And hydantoinase derived from microorganisms belonging to).
  • a D-form selective hydantoinase with high production is described as a hydantoinase derived from Bacillus sp. KN K245 (FERM BP-4863) described in International Publication No. WO96Z20275 Escherichia coli containing the gene HB 101 pTH104 (FERM BP— 4864), Agrobacterium sp. KNK712 (FERM BP— 1900) Escherichia coli HB101 containing the hydantoinase gene pAHIO 43 (FERM BP— 4865) or Pseudomonas sp.
  • N-force Lubamil amino acid amide hydride is an enzyme having an activity of hydrolyzing an N-force Lubamil amino acid derivative to generate an amino acid derivative.
  • N-force rubamyl amino acid amidono and idolase used in the present invention, any of those derived from animals, plants or microorganisms can be used as in the case of the hydantoinase described above. preferable.
  • the microorganism that becomes the enzyme source any microorganism that has the ability to produce the enzyme can be used.
  • genus Agrobacterium preferably, genus Agrobacterium, Blastobacter J3 ⁇ 4, genus Comamonas, Pseudomonas J3 ⁇ 4, or Rhizobium Examples include enzymes derived from microorganisms belonging to the genus.
  • Agrobacterium sp. KNK712 (FERM BP— 1900), Rhizobium sp. KNK1415 (FER M BP— 4419), or Pseudomonas sp. KNK003 A (FERM BP— 3181) N-power rubamil amino acid amide hydrolase Can be mentioned.
  • the known N-force rubamyl amino acid amide hydrase catalyzing L-selective hydrolysis belongs to the genus Arthrobacter, Microbacterium or Pseudomonas. Mention may be made of microorganism-derived N-force luminoylamino acid amide hydride.
  • the microorganism may be a wild strain, or may be a mutant strain in which N-force rubamyl amino acid amide hydrase activity is increased by a mutation treatment. Furthermore, it may be a transformed microorganism prepared so as to produce a high yield of the above-mentioned microorganism-derived N-power rubamyl amino acid amidino or idolase using a method such as gene recombination.
  • Transformed microorganisms that efficiently produce N-streptylamino acid amidino and idolase are strains that exhibit N-streptylamino acid amidoridase activity as described in, for example, International Publication No. WO92Z10579 It can be obtained by cloning the N-strength Lubamil amino acid amide hydrase gene, creating a string-replacement plasmid with an appropriate vector, and transforming an appropriate host fungus with it. .
  • Agrobacterium sp. As a transformed microorganism capable of highly producing the D-selective N-strength amino acid amide hydride mouth obtained in this way, Agrobacterium sp. (Agrobacterium sp.) Described in International Publication No. WO92Z10579 KNK712 (FERM BP— 1900) derived from N-strength Lumamyl amino acid amidino, Escherichia coli jM109 (pAD108) (FERM BP— 3184), Pseudomonas sp.
  • Escherichia coli j M109 (pPD304) (FERM BP-3183) containing the N-carbamylamino acid amide hydride mouth gene derived from KNK003A (FERM BP-3181) and the genetic modification described in International Publication No. WO94Z03613 N-force Lubamil amino acid amide hydrodrora derived from Agrobacterium sp. KNK712 (FERM BP— 1900) with improved heat resistance Escherichia coli HB101 (pNT4553), which contains the zease gene ) (FERM BP— 4368).
  • N-strength rubamyl amino acid amide hydride can be performed by culturing the above-mentioned microorganism exhibiting N-strength rubamyl amino acid amide hydrase activity or a transformed microorganism by a conventional method. Culturing can also be performed by force solid surface culture, which is usually performed in a liquid nutrient medium.
  • the culture medium contains carbon sources, nitrogen sources, and inorganic salt nutrients essential for the growth of various microorganisms.
  • amino acids such as 4-hydroxyphenyldaricin and phenylglycine; N-powered rubamil mono-alpha-amino acids such as N-powered rubymilmethionine and N-powered ruvamil ferulanan; 5— (4-hydroxyphenyl) hydantoin, 5 —5-substituted hydantoins such as ferrohydantoins; pyrimidine metabolites such as uracil, dihydrouracil, j8-ureidopropionic acid; urea; Fe 2+ , Fe 3+ , Be 2+ , Co 2+ , Al 3+ Add a small amount of metal ions such as Li +, Mn 2+ , Mg 2+ , Cs +, or enzyme inducers such as isopropyl 1-thio ⁇ D galatatoside (IPTG), ratatose, etc.
  • IPTG isopropyl 1-thio ⁇ D galatatoside
  • the concentration of these substances in the medium of carminylamino acid amide hydrase production enhancer is selected from the range of 0.1 ImM or more and 10 mM or less for metal ions and 0.01 to 1% by weight or less for other substances. It is.
  • the culture is usually performed at a temperature in the range of 20 ° C or higher and 85 ° C or lower, preferably in the range of 25 ° C or higher and 60 ° C or lower, and in the pH range of 4 or higher and 11 or lower, preferably pH 5 or higher.
  • the range of 9 or less is used, and the growth of microorganisms can be promoted by aeration stirring.
  • the above-mentioned hydantoin racemase, hydantoinase and N-strength amino acid amide hydride can be used as the enzyme itself, and also as a microorganism having the enzyme activity or a processed product thereof.
  • the treated product of microorganisms means, for example, a crude extract, cultured cell freeze-dried organisms, acetone-dried organisms, or disrupted products of these cells.
  • immobilized enzyme obtained by immobilizing the enzyme itself or cells with known means.
  • the immobilization can be carried out by a cross-linking method, a covalent bonding method, a physical adsorption method, an entrapment method, etc., which are well known to those skilled in the art.
  • phenol formaldehyde anion exchange resin such as Duolite A-568 or DS-17186 (Rohm 'and' Haas: registered trademark), Amberlite IRA935, I RA945, IRA901 (Rohm 'and' Haas: registered Trademarks), Lewatit OC1037 (Bayer: registered trademark), Diaion EX-05 (Mitsubishi Chemical: registered trademark), and other amines such as polystyrene resins and diethanolamine type functionalities.
  • Various anion exchange resins with groups are suitable.
  • the enzyme reaction as an embodiment of the present invention can be performed by the following method.
  • the 5-substituted hydantoin compound used as a substrate for the enzyme reaction is D-form, L-form, racemate, or a mixture of D-form and L-form in any ratio. Can also be used.
  • a 5-substituted hydantoin compound can be used as a substrate for the enzyme reaction, and preferably, a 5-substituted hydantoin compound represented by the general formula (1) is used.
  • R has a substituent! /, May! /, An alkyl group having 1 to 20 carbon atoms, or has a substituent !, and may have 7 to 20 carbon atoms.
  • the aralkyl group or the substituent may be an aryl group having 6 to 20 carbon atoms.
  • the alkyl group having 1 to 20 carbon atoms may have a substituent in the above R, and is not particularly limited, for example, a methyl group, an isopropyl group, an isobutyl group, a 1 methylpropyl group, a strong rubamoylmethyl group.
  • 2-force rubermoylethyl group hydroxymethyl group, 1-hydroxyethyl group, mercaptomethyl group, 2-methylthioethyl group, (1 mercapto 1-methyl) ethyl group, carboxymethyl group, 2-carbochetyl group, 4-amino Butyl group, 3-guanodinopropyl group, 4 (5) -imidazole methyl group, ethyl group, n-propyl group, n-butyl group, methoxymethyl group, 2-hydroxyethyl group, 3-aminopropyl group, 2-cyanoethyl group Group, 3 cyanopropyl group, 4 (benzoylamino) butyl group, or 2-methoxycarbonylethyl group.
  • the aralkyl group having 7 to 20 carbon atoms may have a substituent, and is not particularly limited.
  • examples include a tylenedibenzyl group.
  • examples of the aryl group having 6 to 20 carbon atoms include a phenol group and a 4-hydroxyphenol group.
  • the above hydantoin racemase is allowed to coexist with the above stereoselective hydantoinase, or the hydantoinase and the N force luminol amino acid amide hydrolase, and the reaction is carried out in an aqueous medium.
  • the reaction temperature is adjusted to an appropriate temperature of 10 ° C or higher and 80 ° C or lower, preferably 20 ° C or higher and 60 ° C or lower, pH 4 or higher, 9 or lower, preferably pH 5 or higher, 8 It may be left for a while or stirred while maintaining the following. Also, the substrate can be added continuously.
  • the reaction can be performed in a notched manner or in a continuous manner.
  • the reaction of the present invention can also be carried out using an immobilized enzyme, a membrane reactor or the like.
  • aqueous medium examples include water, a buffer solution, an aqueous medium containing a water-soluble organic solvent such as ethanol, or an organic solvent that is difficult to dissolve in water, for example, ethyl acetate, butylacetate, toluene, A suitable solvent such as a two-layer system with an aqueous medium containing an organic solvent such as black mouth form and n-xane can be used. Further, if necessary, an antioxidant, a surfactant, a coenzyme, a metal, etc. can be added.
  • the 5-substituted hydantoin compound is racemized with the hydantoin racemase of the present invention
  • the 5-substituted hydantoin compound is hydrolyzed only by one of the optically active forms by the stereoselective hydantoinase.
  • N Converted to force Lubamil amino acid.
  • the optically active N-force rubamyl amino acid is further converted into an optically active amino acid by using N-force rubamyl amino acid amidino and idolase together.
  • the optically active amino acid may be obtained by subjecting it to a chemical weakening ruvalylation reaction without using N-force ruvamil amino acid amidono or idolase.
  • Isolation of the optically active N-force rubamyl amino acids and optically active amino acids produced can be carried out by conventional separation methods, for example, separation methods such as extraction, concentration, crystallization, column chromatography, etc. It can be separated and purified by combination.
  • the optically active N-strength amino acid obtained by the production method according to the embodiment of the present invention is, for example, represented by the above general formula (2).
  • Mill D Mouth Ishin N Force Lubamil D—Isoleucine
  • N Force Lubamil D Bari N-force Lubamil—D-norleucine
  • N-force Lubamil—D-norparin N-force Lubamil D—methionine
  • N-force Lubamil D—cystine N-force Lubamil—D penicillamine
  • N-force Lubamil D—fe-lualanine N
  • strong Lubamil D-phenolglycine or N-Carnomil-D-4-hydroxyphenolglycine.
  • optically active amino acid obtained by the production method of the above embodiment is, for example, represented by the general formula (3), and specifically, D-mouth isine, D-isoleucine, D-valine. D-norleucine, D-norparin, D-methionine, D-cysteine, D-pecilamine, D-phenylalanine, D-phenol glycine, or D-4-hydroxyphenol glycine.
  • Bacillus sp. KNK519HR strain (FERM BP-10477) was inoculated into a medium (500 ml volume—Sakaguchi flask) with the composition shown in Table 1 and cultured aerobically at 30 ° C for 17 hours. .
  • the medium was adjusted to pH 7 and autoclaved before use. However, glucose Sterilized separately from other medium components and added after sterilization.
  • the liquid volume in the flask was 300 ml.
  • This precipitate was dissolved in 50 mM potassium phosphate buffer (pH 7.0) containing 1 mM DTT, dialyzed with the same buffer, and subjected to column chromatography using TSKgel DEAE Toyopearl 650M (manufactured by Tosohichi Corporation). ImM The active fractions were collected by eluting with a 50 mM potassium phosphate buffer (pH 7.0) containing 0 to 0.6 M NaCl gradient.
  • Example 1 The properties of the purified hydantoin racemase obtained in Example 1 were examined as follows.
  • N-terminal amino acid sequence Use a hydantoin racemase that was dispensed during the HPLC analysis of Example 1, Te, and analyzed the N-terminal amino acid sequence in protein Shikuensa one p roc i se 492 (Applied Biosystems). As a result, the 40 amino acid sequence of the N-terminal chain was determined. The sequence is shown in SEQ ID NO: 3 in the sequence listing.
  • the activity of the purified hydantoin racemase obtained is generated in 30 mM at 30 ° C in 50 mM Tris—HC1 buffer (pH 7.5) containing 50 mM L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin. —5— The increase in (2-methylthioethyl) hydantoin was determined by HPLC.
  • column: Chirobiotic T (4.6 mm x 250 mm, manufactured by A STEC), eluent: 0.01% (v / v) Triethylamine acetate (pH 6.8) / methanol 9 Zl, flow rate: 0.
  • the Km value for L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin was determined by the Rheinauberk plot. As shown in Figure 2, the Km value for L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin was 0.304 mM.
  • Figure 3 shows the relative activity at each temperature when the activity at 40 ° C is defined as 100%.
  • the optimum temperature of this enzyme was 40 ° C, and it worked well in the range of 25 to 65 ° C studied.
  • Figure 4 shows the relative activity at each pH when the activity at pH 8.9 is 100%.
  • the enzyme acted in the range of pH 6-10, and the optimum pH was 8-9.
  • the pH stability was investigated.
  • the residual activity after treating this enzyme at 30 ° C. for 16 hours at each pH is shown in FIG. 6 with the activity of the untreated enzyme solution as 100%.
  • the enzyme was relatively stable between pH 4.5 and 8.0.
  • the substrate specificity of purified hydantoin racemase was examined. 50 mM L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin, 50 mM D-5- (2-methylthioethyl) hydantoin, 13 mM D-5- (1-mercapto-1-methyl) ethylhydantoin, 8 mM, respectively In Example 1 in 0.9 ml of 50 mM Tris—HC1 buffer ( PH 7.5) containing L 5 isobutylhydantoin, 50 mM L-5- (1 methylpropyl) hydantoin, or 4 mM L-5 benzylhydantoin.
  • the centrifuged supernatant was diluted 2-fold with ion-exchanged water, and the D-5-substituted hydantoin compound produced in the reaction solution was quantified by HPLC.
  • the mixture is between 90 minutes at room temperature, by measuring the absorbance of 55 5 nm, formed in the reaction solution The amount of D-alanine was quantified.
  • the results are shown in Table 3 as relative activity values when the activity for L-5-isoptylhydantoin is defined as 100.
  • the substrate inhibitory effect of hydantoin racemase produced by Bacillus sp. Strain KNK519HR was examined using the crude enzyme solution prepared in Example 1. 5, 10, 50, or 80 mM 50 ml Tris HC1 buffer solution (pH 7.5) containing L-5- (2-methylthioethyl) hydantoin (pH 7.5) and 0.1 ml of the above crude enzyme solution in a mixed reaction solution 30 After reacting at ° C for 10, 20, 30, or 40 minutes, add 0.1 ml of IN HC1 to inactivate hydantoin racemase, and dilute the centrifugation supernatant twice with ion-exchanged water.
  • a DNA primer (Primer-3: SEQ ID NO: 6 in the sequence listing) directed toward the outside of the partial gene based on the nucleotide sequence corresponding to each of the N-terminal side and C-terminal side of the enzyme.
  • Primer-4 SEQ ID NO: 7 in the sequence listing were synthesized.
  • inverse PCR was carried out using the DNA obtained by digesting the previously obtained chromosomal DNA with restriction enzymes Kpnl and Spel using ⁇ 4 DNA ligase in a cocoon shape. As a result, a DNA fragment containing a gene portion further outside the already obtained partial gene was obtained.
  • a DNA primer having a sequence in which the cleavage site of the restriction enzyme Ndel is bound to a portion presumed to be upstream from the N-terminus of the enzyme (Primer-5: SEQ ID NO: 8 in the Sequence Listing)
  • a DNA fragment (SEQ ID NO: 10 in the sequence listing) containing the full length of the hydantoin racemase gene was obtained by amplifying the previously obtained chromosomal DNA by PCR using a cage type. The nucleotide sequence of the obtained DNA fragment was analyzed, and it was confirmed that it contained the full length of the hydantoin racemase gene (SEQ ID NO: 2 in the sequence listing).
  • a primer having a sequence in which the cleavage sites of restriction enzymes Ndel and EcoRI are bound to the N-terminal and C-terminal parts of the hydantoin racemase gene obtained in Example 5 (Primer-7: SEQ ID NO: 11, Using Primer-8: SEQ ID NO: 12) in the sequence listing, the open readings shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing are amplified by PCR using the chromosomal DNA obtained in Example 5 in a cocoon-shaped PCR. A DNA fragment of the frame was obtained.
  • Example 7 Production of a transformed body using a recombinant DNA containing hydantoin racemase gene Transformation was performed by mixing the plasmid pBHROOl obtained in Example 6 with a competent cell of Escherichia coli HB101, and agar medium (trypton 10 g, first extract 5 g, salted sodium 10 g, agar 15 g, ampicillin 100 mg, made up to 11 with deionized water, pH 7.0 before sterilization (but ampicillin is added after sterilization) and transformation containing the recombinant DNA containing the hydantoin racemase gene Escherichia coli HB101 (pBHROOl) was obtained as a colony.
  • agar medium trypton 10 g, first extract 5 g, salted sodium 10 g, agar 15 g, ampicillin 100 mg, made up to 11 with deionized water, pH 7.0 before sterilization (but ampicillin is added after sterilization
  • the obtained transformant colonies were inoculated into 6 ml of medium sterilized in a test tube (the above-mentioned medium strength also excludes agar) and then shaken at 37 ° C for 23 hours. Cultured aerobically. The resulting culture broth is centrifuged by centrifuging, suspended in 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5), disrupted by sonication, and centrifuged to obtain microbial cells derived from the microbial cells. The insoluble matter was removed, and a transformant hydantoin racemase enzyme solution was obtained. When hydantoin racemase activity was measured by the same method as in Example 2 using 0.1 ml of the obtained enzyme solution, hydantoin racemase activity was confirmed.
  • Escherichia coli HB 101 (pTH104) (FERM BP— 4864), which is a recombinant Escherichia coli having D-selective hydantoinase activity shown in Example 3, and D-selective N-force Luba Recombinant large intestine with mil amino acid amide hydride mouth activity Escherichia coli HB101 (pNT4553) (FERM BP-43 68), which is a bacterium, was simultaneously cultured with the culture solution of Bacillus sp. KNK519HR strain having hydantoin racemase activity cultured in Example 1. The corresponding D-amino acid was synthesized by acting on DL-5- (2-methylthioethyl) hydantoin or DL-5-methylhydantoin.
  • the amino acid was quantified by HPLC analysis under the following conditions. Column: CROWNPAK CR + (4.6 mm XI 50 mm, manufactured by Daicel), eluent: HCIO (pHl. 5), flow rate: lmlZmin., Column temperature : 25 ° C, detection: 210 nm.
  • the suspension was suspended in 2 ml of HEPES-NaOH buffer (pH 7.0), and the reaction was carried out at 40 ° C.
  • the substrate was reacted with DL-5 benzylhydantoin under the same conditions as described in “1.” above.
  • a reaction was performed without adding the hydantoin racemase-active recombinant bacterial crush solution.
  • 98. l% ee D phenylalanine was produced with a conversion rate of 83% in 9 hours of reaction.
  • the hydantoin racemase activity recombinant bacterium which is a comparative example In the reaction without adding the crushed liquid, the conversion rate was 40%.

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Abstract

 本発明は、新規なヒダントインラセマーゼ、及びそれを用いた光学活性N-カルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法を提供する。本発明の特徴として、バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株から単離・精製された新規ヒダントインラセマーゼ、当該ヒダントインラセマーゼをコードする遺伝子、当該遺伝子を含む組換えプラスミド、及び当該ヒダントインラセマーゼ遺伝子を導入された形質転換体が挙げられる。本発明の別の特徴として、5-置換ヒダントイン化合物にヒダントイナーゼやN-カルバミルアミノ酸アミドハイドロラーゼと同時に当該ヒダントインラセマーゼを存在させることによる、光学活性N-カルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法が挙げられる。

Description

5 _置換ヒダントインラセマーゼ、これをコードする DNA、組換え DNA、 形質転換された細胞、および、光学活性 N_力ルバミルアミノ酸または光学活性 アミノ酸の製造方法
技術分野
[0001] 本発明は、微生物由来の新規なヒダントインラセマーゼ活性を有するポリペプチド、 これをコードする DNA、及びヒダントインラセマーゼを生産する能力を有する微生物 あるいは形質転換体、及びそれらを用いたヒダントインラセマーゼの製造方法、また、 ヒダントインラセマーゼを用いた効率的な光学活性 N 力ルバミルアミノ酸または光 学活性アミノ酸の製造方法に関するものである。
関連出願の相互参照
[0002] 曰本国特許 2005— 022802号(2005年 1月 31曰出願)の明細書、請求の範囲、 図面および要約を含む全開示内容は、これら全開示内容を参照することによって本 出願に合体される。
背景技術
[0003] ヒダントインラセマーゼは、光学活性 5 置換ヒダントインィ匕合物、すなわち D—また は L 5—置換ヒダントインィ匕合物に作用し、当該化合物のラセミ化反応を触媒する 酵素であり、医薬品、化学工業品、食品添加物などの原料として重要な光学活性 N —力ルバミルアミノ酸、又は光学活性アミノ酸を、 5—置換ヒダントインィ匕合物から製造 するのに利用できる。
[0004] [化 6] N—力ルバミル- n
ヒダントイナ一ゼ R\^COOH Dハ;:Jイ ドロラ一ゼド R^^COOH H -. - -- '
HN-^ NHCONH2 NHj
O
D— 5詈换ヒダントイン N—力ルバミル一 D—アミノ酸 D—アミノ酸 ヒダントインラセマーゼ OOH
Figure imgf000003_0001
L— 5 S換ヒダントイン N—力ルバミル一 L一アミノ酸 L一アミノ酸 反応式 ( I )
[0005] すなわち反応式 (I)に示すように、 5—置換ヒダントインィ匕合物力 光学活性 N—力 ルバミルアミノ酸を製造するためには、ヒダントインラセマーゼと立体選択性を有する ヒダントイナーゼを同時に用いればよい。また、 5—置換ヒダントインィ匕合物から光学 活性アミノ酸を製造するためには、ヒダントインラセマーゼと、立体選択性を有するヒ ダントイナーゼとを同時に用いて、さらに立体選択性を有するか又は有さない N—力 ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼを用いればょ ヽ。
[0006] ここで、ヒダントイナーゼと N—力ルノ ミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼの両酵素反応 は別々に 2段階で行なうことができ、または、両酵素を混合して反応することで 2つの 反応を一段階の反応として行なうこともできる。
[0007] ヒダントイナーゼを用いた反応の後の脱力ルバミルィ匕反応は、上記のように酵素を 用いた方法のほか、従来から良く知られている化学反応による脱力ルバミルィ匕法を採 用することちでさる。
[0008] このように、ヒダントイナーゼと N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼを用いる 反応方法において、原料である 5—置換ヒダントインィ匕合物のラセミ化を、ヒダントイン ラセマーゼを用いることによりヒダントイナーゼ反応と同時に進行すれば、光学活性 N —力ルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸へ定量的に変換することができ、高い 収率が得られる。
[0009] 一方、上記反応系中でィ匕学的にラセミ化する 5—置換ヒダントインィ匕合物も知られ ているがその種類は限られており、多くの 5—置換ヒダントインィ匕合物の化学的ラセミ 化速度は遅いか、実質的には進行しない。このため、ヒダントインラセマーゼを使用し な力つた場合、収率が低くなるという問題があり、本反応系にヒダントインラセマーゼ を使用することは非常に有用である。そこで、ラセミ化速度の遅い光学活性 5—置換 ヒダントインィ匕合物のラセミ化促進を目的としてヒダントインラセマーゼの探索がなされ ている。
[0010] ヒダントインラセマーゼを生産する微生物として、例えばアースロバクタ一(Arthroba cter)属(特許文献 1、非特許文献 1)、シユードモナス (Pseudomonas)属(特許文献 2 、非特許文献 2)、ァグロパクテリゥム (Agrobacterium)属(非特許文献 3、非特許文献 4、特許文献 3)、シノリゾビゥム (Sinorhizobium)属(非特許文献 5)、マイクロバクテリウ ム(Microbacterium)属(特許文献 4)、フラボバタテリゥム(Flavobacterium)属(特許文 献 5)、パスッレラ (Pasteurella)属(特許文献 6)、キャンディダ (Candida)属(特許文献 7)に属する微生物が知られている。
特許文献 1 :特開昭 62— 122591号公報
特許文献 2:特開平 4 - 271784号公報
特許文献 3:国際公開第 WO03/100050号公報
特許文献 4:特開 2002— 330784号公報
特許文献 5 :特開 2003— 210176号公報
特許文献 6 :特開 2003— 210177号公報
特許文献 7:特開昭 61— 47194号公報
非特許文献 1 :J. BiotechnoL, vol.80, 217 (2000)
非特許文献 2 : J. BacterioL, vol.174, 7989 (1992)
非特許文献 3 :Appl. Microbiol. BiotechnoL, 57, 680 (2001)
非特許文献 4 : Biotechnol. Prog., 18, 1201 (2002)、 Biochem. Biophys. Res. Commun . 303, 541 (2003)
非特許文献 5 :Appl. Microbiol, 70, 625 (2004) 発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0011] しかし、上記いずれの文献においても、例えば非天然のアミノ酸である D—ノルバリ ン、 D—ノルロイシン、 D—ぺ-シラミン、 D— O—メチルセリン、 D—ホモセリンなどの 製造において、対応する 5—置換ヒダントインのラセミ化活性を有する酵素は報告さ れていない。
[0012] また、バチルス(Bacillus)属の細菌について、ヒダントインラセマーゼ活性があること はまったく知られておらず、また、ヒダントインラセマーゼを精製、単離し、性質を調べ た報告、ヒダントインラセマーゼ遺伝子の単離にっ 、ての報告はこれまでになされて いない。
[0013] 本発明の一つの目的は新規のヒダントインラセマーゼを提供することにある。また、 本発明の別の目的は、当該ヒダントインラセマーゼのアミノ酸配列、その遺伝子の D NA配列を明らかにし、当該酵素を生産する能力を有する微生物あるいは形質転換 体、及びそれらを用いた当該ヒダントインラセマーゼの製造方法を提供することにある 。さらに本発明の別の目的は、当該ヒダントインラセマーゼを利用した効率的な光学 活性 N—力ルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法を提供することにあ る。
課題を解決するための手段
[0014] 本発明者らは上記課題に鑑み、広く土壌よりヒダントインラセマーゼ活性を有する微 生物を探索した結果、優れた性質を有するヒダントインラセマーゼを高生産するバチ ルス (Bacillus)属細菌を新たに分離した。そして、当該微生物カもヒダントインラセマ 一ゼを単離、精製し、ヒダントインラセマーゼ遺伝子の単離、ならびに宿主微生物で の発現を達成した。さらに、本発明で得たヒダントインラセマーゼは前述の非天然型 アミノ酸に対応する 5—置換ヒダントイン化合物にも作用することが明らかとなった。こ のようにして得られたヒダントインラセマーゼを、ヒダントイナーゼや N—力ルバミルアミ ノ酸アミドハイド口ラーゼと同時に 5—置換ヒダントインィ匕合物に作用させることにより、 光学活性 N—力ルバミルアミノ酸及び光学活性アミノ酸の反応収率を向上させること が可能となり、本発明を完成するに至った。 [0015] 即ち、本発明の一つの特徴は、下記の性質を有し、ヒダントインラセマーゼ活性を 有するポリペプチドである:
1.分子量:約 139, 000、
2. L— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインに対する Km値:約 0. 304mM、
3.作用温度の範囲: 25°C〜65°C、 至適温度 40°C
4.作用 pHの範囲: 6〜10、 至適 pH8〜9、
5.温度安定性: 30°C以下、
6. pH安定性: 4. 5〜8. 0。
[0016] また、本発明の別の特徴は、配列表の配列番号 1に示されるアミノ酸配列からなる ポリペプチドである。
[0017] 本発明の別の特徴は、上記のポリペプチドをコードする DNAである。
[0018] 本発明の別の特徴は、上記の DNAを含む組換えプラスミドである。
[0019] 本発明の別の特徴は、上記の組換えプラスミドで宿主微生物を形質転換して得ら れる形質転換体である。
[0020] 本発明の別の特徴は、上記のポリペプチドを生産する能力を有し、かつ、バチルス
(Bacillus)属に属する微生物である。
本発明の別の特徴は、上記のポリペプチドを生産する能力を有する微生物を培養し 、培養物中に当該ポリペプチドを蓄積せしめ、これを採取することを特徴とするヒダン トインラセマーゼの製造方法である。
本発明の別の特徴は、上記のヒダントインラセマーゼ活性を有するポリペプチド、上 記の形質転換体、又は上記の微生物を、光学活性 5—置換ヒダントインィ匕合物に作 用させることを特徴とする光学活性 5 -置換ヒダントインのラセミ化方法である。
[0021] 本発明の別の特徴は、上記のヒダントインラセマーゼ活性を有するポリペプチド、上 記の形質転換体、又は上記の微生物を、一般式(1)
[0022] [化 7]
Figure imgf000007_0001
[0023] (式中、 Rは置換基を有していてもよい炭素数 1〜20のアルキル基、置換基を有して V、てもよ 、炭素数 7〜20のァラルキル基、もしくは置換基を有して 、てもよ 、炭素数 6〜20のァリール基を表す。)で表される光学活性 5—置換ヒダントインィ匕合物に作 用させることを特徴とする光学活性 5 -置換ヒダントインのラセミ化方法である。
[0024] 本発明の別の特徴は、上記のポリペプチド、上記の形質転換体、又は上記の微生 物と、ヒダントイナーゼを、 5—置換ヒダントインィ匕合物に作用させることを特徴とする 光学活性 N—力ルバミルアミノ酸の製造方法である。
本発明の別の特徴は、上記のポリペプチド、上記の形質転換体、又は上記の微生物 と、ヒダントイナーゼを、前記式(1)で表される 5—置換ヒダントインィ匕合物に作用させ ることを特徴とする、一般式 (2) :
[0025] [化 8]
Figure imgf000007_0002
[0026] (式中、 Rは前記と同じ。 )で表される光学活性 N—力ルバミルアミノ酸の製造方法で ある。
[0027] 本発明の別の特徴は、上記のポリペプチド、上記の形質転換体、又は上記の微生 物と、ヒダントイナーゼおよび N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼを、 5—置換 ヒダントインィ匕合物に作用させることを特徴とする光学活性アミノ酸の製造方法である
[0028] 本発明の別の特徴は、上記のポリペプチド、上記の形質転換体、又は上記の微生 物と、ヒダントイナーゼおよび N 力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼを、前記式( 1)で表される 5 置換ヒダントインィ匕合物に作用させることを特徴とする、一般式 (3): [化 9]
Figure imgf000008_0001
[0030] (式中、 Rは前記と同じ。 )で表される光学活性アミノ酸の製造方法である。
発明の効果
[0031] 本発明のヒダントインラセマーゼは、非天然型アミノ酸に対応する 5 置換ヒダントイ ン化合物にも効率よく作用しうる酵素である。 5—置換ヒダントインィ匕合物、特に非天 然型のアミノ酸に対応する 5 置換ヒダントインィ匕合物にヒダントイナーゼや N カル ノ ミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼを作用させて、光学活性 N—力ルバミルアミノ酸や 光学活性アミノ酸を製造する際に本発明のヒダントインラセマーゼを同時に存在させ ることにより、反応収率を向上させることができる。また、本発明の微生物及び形質転 換体によって、上記の新規なヒダントインラセマーゼを効率よく製造することができる。 さらに、本発明のヒダントインラセマーゼ、または、ヒダントインラセマーゼを生産する 微生物を利用することで、効率良く光学活性 N 力ルバミルアミノ酸または光学活性 アミノ酸を製造することができる。
図面の簡単な説明
[0032] [図 1]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼ遺伝子を含む組換えプラスミ ド pBHROOlの制限酵素地図を示す図である。
[図 2]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼの L— 5— (2—メチルチオェ チル)ヒダントインに対する Km値を示すグラフである。
[図 3]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼの作用温度の範囲と至適温 度を示すグラフである。
[図 4]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼの作用 pHの範囲と至適 pH を示すグラフである。
[図 5]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼの温度安定性を示すグラフで ある。
[図 6]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼの pH安定性を示すグラフで ある。
[図 7]本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼの基質阻害効果を示すダラ フである。
発明を実施するための最良の形態
[0033] 以下、本発明を実施形態に基づいて詳細に説明する。
[0034] 1.ポリペプチド
まず、本発明の実施形態としてのポリペプチドについて説明する。本発明のポリべ プチドは、ヒダントインラセマーゼ活性を有するポリペプチドであって、以下のような理 化学的性質を有することを特徴とする。
1)作用
光学活性 5—置換ヒダントインィ匕合物のラセミ化反応を触媒する。
2)分子量
約 139, 000
3) L— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインに対する Km値
約 0. 304mM
4)作用温度の範囲
温度範囲 25°C〜65°C、 至適温度 40°C
5)作用 pHの範囲
pH範囲 6〜10、 至適 pH8〜9
6)温度安定性
30°C以下
7) pH安定性
pH4. 5〜8. 0
さらには、以下の理ィ匕学的性質も有する。 8)比活性 (後述の測定法において、 1分間に 1 μ molの D— 5—(2—メチルチオェチ ル)ヒダントインを生成する酵素量を lunitと定義する)
純粋酵素 lmgあたり 24. 2unit
9)基質阻害
50〜80mM L— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインを基質としたときに基 質阻害を受ける。
[0035] 実施形態にお!、て、ポリペプチドのヒダントインラセマーゼ活性は、例えば、 50mM
L- 5- (2—メチルチオェチル)ヒダントインを含む 50mM Tris (トリス(ヒドロキシメ チル)ァミノメタン)一 HC1緩衝液 (pH7. 5)中における、 30°C、 30分間での D— 5— (2—メチルチオェチル)ヒダントインの生成を高速液体クロマトグラフィー (HPLC)等 を用いて定量することにより測定することができる。
[0036] 実施形態のヒダントインラセマーゼ(以下、適宜「本酵素」または「本ヒダントインラセ マーゼ」とする。)は、以下に例示するように、由来や酵素の性質等の点で、背景技術 の項目で説明した他の公知のヒダントインラセマーゼとは明らかに異なる新規なヒダ ントインラセマーゼである。
[0037] (i)本酵素は、ァグロバタテリゥム ラジオパクター(Agrobacterium radiobacter)由来 のヒダントインラセマーゼ(国際公開第 WO03/100050号)と比較してアミノ酸配列の相 同性は 50%であり、両者は異なる配列である。また、本酵素は基質阻害を受けるの に対して、ァグロバタテリゥム ラジオパクター由来のヒダントインラセマーゼは基質阻 害を受けな ヽ点で相違する。
[0038] (ii)本酵素は、マイクロバタテリゥム リクエファシエンス(Microbacterium liquefacien s) (特開 2002— 330784号公報)のヒダントインラセマーゼと比較してアミノ酸配列の 相同性は 48%であり、両者は異なる配列である。また、本酵素は至適温度が約 40°C であるのに対して、マイクロバタテリゥム リクエファシエンスのヒダントインラセマーゼ は至適温度が 50〜60°Cである点で相違する。
[0039] (iii)本酵素は、シユードモナス スピーシーズ(Pseudomonas sp.)のヒダントインラセ マーゼ(特開平 4— 271784号公報、 J. BacterioL, vol.174, 7989 (1992))と比較して アミノ酸が 3残基異なる。また、本酵素は至適温度が 40°C、至適 pH8〜9であるのに 対して、シユードモナス スピーシーズのヒダントインラセマーゼは至適温度力 S45°C、 至適 pHが 9. 5である点で相違する。シユードモナス スピーシーズのヒダントインラセ マーゼは、 L- 5- (2—メチルチオェチル)ヒダントインと同様に、 L— 5—(1 メチル プロピル)ヒダントインに対して高いラセミ化活性を示す。具体的には、 L— 5— (2—メ チルチオェチル)ヒダントインを基質とした場合の相対活性を 100として、 L— 5— (1 メチルプロピル)ヒダントインを基質とした場合の相対活性を求めると、 132である( 特開平 4— 271784号公報の表 1の反応時間 10分における D体の割合を参照)。
[0040] 一方、本酵素は、高いラセミ化活性を示す L— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダント インに対する活性を 100としたときの、 L— 5— (1—メチルプロピル)ヒダントインを基 質とした場合の相対活性は 2である(実施例 2の表 2参照)。したがって、本酵素とシュ ードモナス スピーシーズのヒダントインラセマーゼとは、上記至適温度および pHの ほか基質特異性の点でも大きく異なっており、両酵素の性質は明らかに異なる。
[0041] ここで、従来、バチルス(Bacillus)属に属する微生物がヒダントインラセマーゼ活性 を有する力否かは知られていな力つた。この点、本出願の発明者によって取得された 実施形態のヒダントインラセマーゼは、ヒダントインラセマーゼ活性の有無が知られて V、な力つたバチルス (Bacillus)属に属する微生物に由来する新規な酵素である。さら に、本ヒダントインラセマーゼが上記のような公知のヒダントインラセマーゼとは性質が 異なる酵素であり、非天然型アミノ酸に対応する 5 置換ヒダントインィ匕合物にも作用 する点は、本出願の発明者によって初めて明らかにされた事項である(実施例 2の表 2参照)。
[0042] 2.微生物
本発明の実施形態としてのポリペプチドは、好適には、バチルス (Bacillus)属に属 する微生物から取得することが出来、より好ましくは、バチルス スピーシーズ (Bacillu s sp.)KNK519HR株から取得できる。
[0043] 上記のバチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株は、本発明において 発明者らが分離、取得した菌株であり、受託番号 FERM BP— 10477として、 200 5年 12月 12日付けで独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター( IPOD:〒 305-8566 茨城県つくば巿東 1 1 1 中央第 6)に寄託されている (原 寄託日 2004年 12月 15日の国内寄託株を、ブダペスト条約に基づく国際寄託に移 管)。以下に、バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株の菌学的性質 を示す。
1.形態
1)直径 1. 0- 1. 1 μ ηι Χ 2. 0—4. 程度の桿菌
2)グラム染色:陽性
3)運動性:有り
4)胞子の有無:有り
5)寒天平板培地培養でのコロニー形態:円形、周縁波状、凸状、光沢あり、黄色
2.培養的性質
1)生育温度試験: 37°C ( + )、 45°C (―)
3.生理学的性質
1)カタラーゼ: +
2)ォキシダーゼ:
3)グルコース力 の酸 Zガス産生 (酸産生 Zガス産生): Z—
4) OZFテスト (酸化 Z発酵)
5)発酵性試験
グリセローノレ: +
エリスリトール:
D ァラビノース:
Lーァラビノース:
リボース: +
D キシロース: +
Lーキシロース:
アド二トール:
β—メチノレ一 D キシロース:一
ガラクトース: +
グノレコース: + フラクトース: +
マンノース:一
ソノレボース:一
ラムノース:一
ズルシトーノレ:一
イノシトール:一
マンニトール: +
ソルビトール:一
aーメチルー D—マンノース:一 aーメチルー D—グルコース:一
N—ァセチルダルコサミン: + アミグダリン:一
アルブチン: +
エスクリン: +
サリシン: +
セロビオース: +
マルトース: +
乳糖: - メリビオース:一
白糖: +
トレノヽロース: + ィヌリン:一
メレチトース:一
ラフィノース: +
澱粉: +
グリコーゲン: +
キシリトーノレ:一
ゲンチオビオース:一 D ッラノース:一
D リキソース:
D タガトース:
D フコース:
Lーフコース:
D ァラビトーノレ:
Lーァラビトール:
ダルコネート::
2—ケトグノレコン酸:一
5—ケトグルコン酸:—
)生化学試験
β ガラクトシダーゼ:
アルギニンジヒドロラーゼ:
リシンデカルボキシラーゼ:
オル-チンデカルボキシラーセ:
クェン酸の利用性:
H S産生:
2
ゥレアーゼ:
トリプトファンデァミナーゼ:
インドール産生:
ァセトイン産生 (VP) :—
ゼラチナーゼ:+
硝酸塩還元:
7)嫌気での生育性:
8) 10%NaClでの生育性: +
9)馬尿酸塩加水分解性:
10)カゼイン加水分解性: +
上記の菌学的性質、及び、 16SrDNA配列解析から、 KNK519HR株はバチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)と同定された。
[0046] なお、本発明のポリペプチドを生産する微生物は、上述した微生物の野生株であつ ても良いし、変異改良された変異株であってもよい。変異株は、上記 KNK519HR株 に、 UV照射や、 N—メチノレ N,一-トロ一 N -トロソグァ-ジン(NTG)、ェチルメ タンスルフォネート (EMS)等の薬剤による処理といった当業者に周知の方法を行な うことで取得できる。
[0047] 本発明のポリペプチドを生産する微生物を培養する培地としては、その微生物が増 殖し得るものである限り特に限定されない。例えば、炭素源として、グルコース、シュ 一クロース等の糖質、エタノール、グリセロール等のアルコール類、ォレイン酸、ステ アリン酸等の脂肪酸及びそのエステル類、菜種油、大豆油等の油類、窒素源として、 硫酸アンモ-ゥム、硝酸ナトリウム、ペプトン、カザミノ酸、コーンスティープリカ一、ふ すま、酵母エキスなど、無機塩類として、硫酸マグネシウム、塩ィ匕ナトリウム、炭酸カル シゥム、リン酸水素二カリウム、リン酸二水素カリウムなど、他の栄養源として、麦芽ェ キス、肉エキス等を含有する通常の液体培地が使用され得る。更に、ヒダントインラセ マーゼの生産を増強させるために、 5—置換ヒダントイン化合物を少量添加することも できる。その培地中濃度は、 0. 001重量%以上、 10重量%以下、好ましくは 0. 01 重量%以上、 1重量%以下の範囲から選ばれる。
[0048] 培養は、温度として通常 20°C以上、 40°C以下、好ましくは 25°C以上、 35°C以下の 範囲、 pHとしては通常 6以上、 8以下、好ましくは 6. 5以上、 7. 5以下の範囲で好気 的に行い得る。培養時間は通常 1日以上、 5日間以下程度で行い得る。また、回分 式、連続式のいずれの培養方法でもよい。
[0049] 3.酵素の精製
ヒダントインラセマーゼの分離精製は、次のようにして行ない得る。まず、上記培養 終了後に培養液力 遠心分離などにより菌体^^め、超音波破砕機などの手段によ り菌体を破砕して、粗酵素液を得る。この粗酵素液を、塩析法、カラムクロマトグラフィ 一法などにより精製することで精製ヒダントインラセマーゼを得ることができる。
[0050] 本発明のポリペプチドは、上記のようにして、ヒダントインラセマーゼを生産する能力 を有する微生物を培養し、ヒダントインラセマーゼを蓄積させて、これを採取すること によって得られる。本発明のポリペプチドは上述した微生物力も取得される酵素であ つてもょ ヽし、後述するように遺伝子組換え技術を利用して得られた形質転換体から 生産される酵素であってもよい。実施形態の酵素としては、配列表の配列番号 1に示 されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをあげることができる。
[0051] 4. DNA
次に本発明の DNAについて説明する。本発明の DNAは上記のようなヒダントイン ラセマーゼ活性を有するポリペプチドをコードする DNAであればよぐ好ましくは配 列表の配列番号 1のアミノ酸配列をコードする DNA、例えば、配列表の配列番号 2 で示される塩基配列を有する DNAを挙げることができる。なお、通常 1つのアミノ酸 に複数の塩基コドンが対応していることから、配列番号 1で示されるアミノ酸配列をコ ードするほかの塩基配列を持つ DNAも、配列番号 2で示される塩基配列と等価であ り、本発明の DNAに含まれる。
[0052] 特定の塩基配列と「等価の塩基配列」の範囲には、例えば、その特定の塩基配列 に対応するアミノ酸配列をコードする、その塩基配列とは別の塩基配列が含まれる。 その他、「等価の塩基配列」には、その塩基配列において、 1若しくは数個の塩基が 置換、挿入、欠失および Zまたは付加された塩基配列を有し、かつその塩基配列に よってコードされるポリペプチドの活性 (例えばヒダントインラセマーゼ活性)を有する 塩基配列を含む。「数個の塩基」とは、好ましくは 10塩基以下であり、より好ましくは 9 、 8、 7、 6、 5、 4、 3、または 2個以下である。
[0053] 本発明の実施形態としてのヒダントインラセマーゼ遺伝子を含む DNAは、例えば、 バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株から取得することができるが、 もちろん化学的に合成したものであっても構わない。 目的の DNAを取得する一例を 以下に示す。
[0054] まず、ヒダントインラセマーゼ活性を有する微生物より精製されたヒダントインラセマ ーゼの N末端のアミノ酸配列を、気相プロテイン 'シークェンサ一などで決定する。こ のようにして得られた N末端アミノ酸配列、及び、既知ヒダントインラセマーゼの相同 配列部位にもとづいて設計した DNAプライマーを合成する。
[0055] 次に、ヒダントインラセマーゼの起源となる微生物より、染色体 DNAを単離する。染 色体の DNAは、培養された細胞から、 UltraClean Microbial DNA Isolation Kit (MO BIO Laboratories, Inc.社製)を用いて得られる。
[0056] この染色体 DNAを铸型に、上記の DNAプライマーを用いて PCRを行うことで、目 的の遺伝子の一部を取得できる。
[0057] 次に、既に取得した部分遺伝子のさらに N末側と C末側をコードする DNA断片をィ ンバース PCR法により取得することができる(例えば Nucleic Acids Res.16,8186(1988 )を参照)。この DNA断片の塩基配列を決定後、酵素の N末端より上流と推定される 部分、及び、 C末端より下流と推定される部分のそれぞれの塩基配列にもとづき DN Aプライマーを作成する。この DNAプライマーを用いて、先に得た染色体 DNAを铸 型とした PCRを行なうことで、目的とするヒダントインラセマーゼ遺伝子の全長を含む DNA断片を取得できる。
[0058] 次いで、得られたヒダントインラセマーゼ遺伝子を含む DNA断片をベクター DNAと T4 DNAリガーゼなどを用いて結合させることにより組換えプラスミドを得ることがで きる。このプラスミドを用いて、ベクターに挿入したヒダントインラセマーゼ遺伝子を含 む DNA断片部分の塩基配列を解析、ヒダントインラセマーゼ酵素の N末端アミノ酸 配列をコードする塩基があることを確認し、また、これより翻訳開始部位と終止コドン を確認することでオープンリーディングフレームを決定する。
[0059] このようにして取得した DNA、または該 DNAをベクターに組み込んで得られる組 換えプラスミドを用いることにより、宿主微生物を形質転換し形質転換体を得ることが できる。
[0060] 5.宿主およびベクター
宿主、ベクターとしては、「組換え DNA実験指針」(科学技術庁研究開発局ライフ サイエンス課編:平成 8年 3月 22日改定)に記載の宿主一ベクター系を用いることが できる。例えば、宿主としては、ェシエリヒア(Escherichia)属、シユードモナス(Pseudo monas)属、フラボバタテリゥム(Flavobacterium)属、バチノレス(Bacillus)属、セラチア( Serratia)属、コリネバタテリゥム(Corynebacterium)属、ブレビバタテリゥム(Brevibacte rium)属、ァグロノくクテリゥム (Agrobacterium)属、ァセトノ クタ一 (Acetobacter)属、グ ルコノバクタ一(Gluconobacter)属、ラクトバチルス (Lactobacillus)属、ストレプトコッカ ス(Streptococcus)属またはストレプトマイセス(Streptomyces)属に属する微生物を用 いることがでさる。
[0061] ベクターは上記の宿主内で自律複製できる微生物由来のプラスミド、ファージまた はその誘導体が使用できる。なかでも、宿主微生物としてェシエリヒア コリ(Escherich ia coli)、ベクターとして当該微生物中で自律複製できるベクターを用いるのが好まし い。このようなベクターとしては、例えば、当業者が容易に入手可能、あるいは巿販さ れている PUC18 (タカラバイオ株式会社)、 pUC19 (タカラバイオ株式会社)、 pBR3 22 (タカラバイオ株式会社)、 pACYC184 (株式会社-ツボンジーン)、 pSClOl (フ ナコシ株式会社)、 pT7Blue (タカラバイオ株式会社)、又は国際公開第 WO94Z03 613号公報の明細書の記載に基づいて当業者が製造しうる pUCNT、またはそれら の誘導体を挙げることができる。また、酵素の生産量を上昇させるために強力な構造 プロモーターをもつように改質したベクターを使用することもできる。
[0062] 6.形皙転橼体
形質転換体の一例として、上記のようにして取得した DNAを pUCNTに組み込ん だ組換えプラスミド pBHROOl (図 1参照)を用いてェシエリヒア コリ(Escherichia coli ) HB101を形質転換し、形質転換体ェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB 101 (pB HR001)を得ることができる。プラスミド pBHROOlは、図 1の制限酵素地図にて特定 される。
[0063] 上記方法で得られた形質転換体ェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pBH ROODは受託番号 FERM BP— 10476として、 2005年 12月 12日付けで独立行 政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター (IPOD :干 305-8566 茨城県 つくば巿東 1 - 1 - 1 中央第 6)に寄託されて 、る(原寄託日 2004年 12月 15日の 国内寄託株を、ブダペスト条約に基づく国際寄託に移管)。
[0064] なお、本発明で用いた組換え DNA技術は当該分野にぉ 、て周知であり、例えば、 Molecularし loning 2nd Edition (Cold bpnng Harbor Laboratory Press, 1989)、 Curren t Protocols in Molecular Biology (Greene Publishing Associates and Wiley- Interscie nce)に記載されている。
[0065] 形質転換体の培養は、通常の培地を用いて行えば良 、。培養に使用する培地とし ては、炭素源、窒素源および無機塩類などの栄養素を含む通常の培地で良い。これ に、ビタミン、アミノ酸などの有機微量栄養素を添加すると、好ましい結果が得られる 場合が多い。炭素源としては、グルコースゃシユークロースのような炭水化物、酢酸 のような有機酸、アルコール類などが適宜使用される。窒素源としては、アンモ-ゥム 塩、アンモニア水、アンモニアガス、尿素、酵母エキス、ペプトン、コーンス 'ティープ' リカーなどが用いられる。無機塩類としてはリン酸塩、マグネシウム塩、カリウム塩、ナ トリウム塩、カルシウム塩、鉄塩、硫酸塩、塩素などが用いられる。
[0066] 培養は通常温度範囲 25°C力も 40°Cで行える力 25°Cから 37°Cが特に好ましい。
また、 pHは通常 4から 8で培養できるが 5から 7. 5が好ましい。また、回分式、連続式 のいずれの培養方法でもよい。必要に応じてイソプロピル 1 チォー j8— D—ガラ タトサイド (IPTG)、ラタトース等を添加する等の酵素誘導のための処理を行うこともで きる。
[0067] 7. 光学活件 N 力ルバミルアミノ酸または光学活件アミノ酸の ¾告方法
次に、本発明のヒダントインラセマーゼを使用する、効率的な光学活性 N—カルバミ ルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法にっ 、て説明する。実施形態としての 光学活性 N—力ルバミルアミノ酸は、前記反応式 (I)に示す方法で、 5—置換ヒダント インィ匕合物から、ヒダントイナーゼを作用させることによる加水分解で N—力ルバミル アミノ酸に変換することができる。また、生成した N 力ルバミルアミノ酸は、前記反応 式 (I)に示す方法で、力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼを作用させることにより加 水分解されてアミノ酸に変換することができる。このとき、ヒダントインラセマーゼを同 時に用いることで、化学的ラセミ化速度が遅い 5—置換ヒダントインィ匕合物から、効率 良く定量的に光学活性 N 力ルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸を製造できる
[0068] 本発明において、光学活性 N—力ルバミルアミノ酸を製造するためには、本発明の ヒダントインラセマーゼと、立体選択性を有するヒダントイナーゼとを同時に用いること が重要である。また、光学活性アミノ酸を製造するためには、本発明のヒダントインラ セマーゼと、立体選択性を有するヒダントイナーゼとを同時に用いて光学活性 N—力 ルバミルアミノ酸としたのちに、 N 力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼを使用する か化学的な脱力ルバミルィ匕を行ってもよいし、本発明のヒダントインラセマーゼと、ヒダ ントイナーゼと、 N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼとを同時に使用してもよい 。ヒダントイナーゼ及び N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼを同時に用いる場 合、いずれかの酵素が立体選択性を有すれば、光学活性アミノ酸を得ることが出来 る。
[0069] 8.ヒダントイナーゼ
ここでヒダントイナーゼとは、 5—置換ヒダントイン誘導体を加水分解して N—力ルバ ミルアミノ酸誘導体を生成する活性を有する酵素である。本発明で用いるヒダントイナ ーゼとしては、動物、植物、微生物由来のものが使用できるが、工業的な利用には微 生物由来のものが好ましい。微生物としては、当該酵素の生産能力を有する微生物 であればいずれも利用できる力 例えば、以下の公知の、当該酵素の生産能力を有 する微生物を挙げることがでさる。
[0070] D体選択的な加水分解を触媒するヒダントイナーゼとしては、細菌に属するものとし てァセトパクター属 (Acetobacter)、ァクロモノくクター属 (Achromobacter)、ァェロノくク ター属(Aerobacter)、ァグロバタテリゥム属(Agrobacterium)、アルカリゲネス属(Alcal igenes)、ァルスロパクター属(Arthrobacter)、バチルス属(Bacillus)、ブレビバタテリ ゥム属 (Brevibacterium)、コリネノ クテリゥム属 (Corynebacterium)、ェンテロノくクタ一 属(Enterobacter)、エルウイニァ属 (Erwinia)、ェシエリヒア属 (Escherichia)、クレブシ エラ属 (Klebsiella)、ミクロノくクテリゥム属 (Microbacterium)、ミクロコッカス属 (Microco ecus)、プロタミノバクター属 (Protaminobacter)、プロテウス属 (Proteus)、シユードモ ナス属(Pseudomonas)、サノレチナ属(Sartina)、セラチア属(Serratia)、キサントモナス 属 (Xanthomonas)、ァエロモナス属 (Aeromonas)、フラポバクテリゥム属 (Flavobacteri um)、リゾピウム属(Rhizobium)など、放線菌に属するものとしてァクチノミセス属 (Acti nomyces)、ミコノ クテリゥム属 (Mycobacterium)、ノカノレティア属 (Nocardia)、ストレプ トミセス属(Streptomyces)、ァクチノプラネス属 (Actinoplanes)、ロドコッカス属 (Rhodo coccus)など、かびに属するものとしてァスペルギルス属(Aspergillus)、パェシロミセ ス属(Paecilomyces)、ぺ -シリウム属(Penicillium)など、酵母に属するものとしてはキ ヤンディダ属(Candida)、ピヒア属(Phichia)、ロードトルラ属(Rhodotorula)又はトル口 プシス属(Torulopsis)などに属する微生物由来のヒダントイナーゼが挙げられる。
[0071] その中でも好ましくは、ァグロバタテリゥム属(Agrobacterium)、バチルス属(Bacillu s)、シユードモナス属(Pseudomonas)又はリゾビゥム属(Rhizobium)に属する微生物 由来のヒダントイナーゼが挙げられる。
[0072] さらに好ましくは、ァグロバタテリゥム スピーシーズ (Agrobacterium sp.) KNK71 2 (FERM BP— 1900)、バチノレス スピーシーズ(Bacillus sp.) KNK245 (FERM BP— 4863)、シユードモナス プチダ(Pseudomonas putida) IFO 12996、シユード モナス スピーシーズ(Pseudomonas sp.) KNK003A (FERM BP— 3181)又はリ ゾビゥム スピーシーズ(Rhizobium sp.) KNK1415 (FERM BP— 4419)由来のヒ ダントイナーゼが挙げられる。
[0073] L体選択的な加水分解を触媒するヒダントイナーゼとしては、バチルス属(Bacillus )、フラボバタテリゥム属(Flavobacterium)、ァルスロパクター属(Arthrobacter)、シュ ードモナス属(Pseudomonas)又はノカルディア属(Nocardia)に属する微生物由来の ヒダントイナーゼを挙げることができる。
[0074] ヒダントイナーゼを効率良く高生産する高活性菌を得るためには、周知のとおり、 形質転換微生物を作成することが有効である。作成方法としては、例えば国際公開 第 WO96Z20275号記載のように、ヒダントイナーゼ活性を示す菌株カもヒダントイ ナーゼ遺伝子をクローユングした後、適当なベクターとの組換えプラスミドを作成して 、これを用いて適当な宿主菌を形質転換することで得られる。なお、組換え DNA技 術については当該分野において周知である。
[0075] このようにして得られた D体選択的ヒダントイナーゼを高生産する形質転換体として は国際公開第 WO96Z20275号記載の、バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.) KN K245 (FERM BP— 4863)由来のヒダントイナーゼ遺伝子を含有するェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB 101 pTH104 (FERM BP— 4864)、ァグロバクテリウ ム スピーシーズ (Agrobacterium sp.) KNK712 (FERM BP— 1900)由来のヒダ ントイナーゼ遺伝子を含有するェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 pAHIO 43 (FERM BP— 4865)、又はシユードモナス スピーシーズ(Pseudomonas sp.) K NK003A (FERM BP— 3181)由来のヒダントイナーゼ遺伝子を含有するェシエリ ヒア コリ(Escherichia coli) HB101 pPHD301 (FERM BP— 4866)を挙げること ができる。
[0076] これら形質転換体によるヒダントイナーゼの生産、ある 、は、前述のヒダントイナーゼ 活性を示す菌株によるヒダントイナーゼの生産は、例えば、国際公開第 WO96Z20 275号記載の、通常の栄養培地を用いて培養を行えば良ぐ必用に応じて、酵素誘 導のための処理を行うこともできる。
[0077] 9. N—力ルノミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ
N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼは、 N—力ルバミルアミノ酸誘導体をカロ 水分解してアミノ酸誘導体を生成する活性を有する酵素である。本発明で用いる N —力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼとしては、前述のヒダントイナーゼと同様に、 動物、植物、又は微生物由来のいずれでも使用できるが、工業的な利用には微生物 由来のものが好ましい。酵素源となる微生物としては、当該酵素の生産能力を有する 微生物であれば!/、ずれも利用できる。
[0078] 例えば公知の D体選択的 N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼとして、特公 昭 57— 18793号、特公昭 63— 20520号、特公平 1—48758号および特開平 6— 2 33690号に開示されたァクロモパクター(Achromobacter)属、ァエロパクター(Aerob acter)属、ァエロモナス (Aeromonas)属、ァグロノくクテリゥム (Agrobacterium)属、ァノレ カリゲネス (Alcaligenes)属、ァルスロパクター(Arthrobacter)属、バチノレス (Bacillus) 属、ブラストパクター(Blastobacter)属、ブラディリゾビゥム(Bradyrhizobium)属、ブレ ビバクテリウム(Brevibacterium)属、コマモナス(Comamonas)属、フラボバクテリウム( Flavobacterium)属、モラキセラ(Moraxellaリ属、ノヽラコッカス (Paracoccus)属、シユー ドモナス(Pseudomonas)属、リゾビゥム(Rhizobium)属、セラチア(Serratia)属、又はス ポロサルシナ(Sporosarcina)属に属する微生物由来の N—力ルノ ミルアミノ酸アミド ハイド口ラーゼが挙げられる。
[0079] そのなかでも好ましくは、ァグロバタテリゥム(Agrobacterium)属、ブラストパクター(B lastobacter) J¾、コマモナス (Comamonas)属、ンュ' ~~トモナス (Pseudomonas) J¾、又 はリゾビゥム(Rhizobium)属に属する微生物由来の酵素が挙げられる。
[0080] さらに好ましくは、ァグロバタテリゥム スピーシーズ (Agrobacterium sp.) KNK712 (FERM BP— 1900)、リゾビゥム スピーシーズ(Rhizobium sp.)KNK1415 (FER M BP— 4419)、又はシユードモナス スピーシーズ(Pseudomonas sp.)KNK003 A (FERM BP— 3181)由来の N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼが挙げら れる。
[0081] 公知の L体選択的な加水分解を触媒する N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラー ゼとしては、ァルスロパクター属(Arthrobacter)、ミクロバタテリゥム属(Microbacterium )又はシユードモナス属(Pseudomonas)に属する微生物由来の N—力ルノ ミルアミノ 酸アミドハイド口ラーゼを挙げることができる。
[0082] 上記微生物は野生株であってもよぐまた、変異処理によって N—力ルバミルアミノ 酸アミドハイド口ラーゼ活性が高められた変異株であってもよい。さらに、遺伝子組換 え等の方法を用いて、上記微生物由来の N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼ を高生産するように作成された形質転換微生物であってもよ ヽ。
[0083] N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼを効率良く高生産する形質転換微生物 は、例えば国際公開第 WO92Z10579号記載のように、 N—力ルバミルアミノ酸アミ ドハイド口ラーゼ活性を示す菌株カも N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ遺伝 子をクロー-ングした後、適当なベクターとの糸且換えプラスミドを作成して、これを用い て適当な宿主菌を形質転換することで得られる。
[0084] このようにして得られた、 D体選択的な N—力ルノ ミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼを 高生産する形質転換微生物としては、国際公開第 WO92Z10579号記載のァグロ バタテリゥム スピーシーズ (Agrobacterium sp.)KNK712 (FERM BP— 1900)由 来の N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼ遺伝子を含有するェシエリヒア コリ( Escherichia coli)jM109 (pAD108) (FERM BP— 3184)、シユードモナス スピ 一シーズ(Pseudomonas sp.) KNK003A (FERM BP— 3181)由来の N—カルバミ ルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ遺伝子を含有するェシエリヒア コリ(Escherichia coli)j M109 (pPD304) (FERM BP— 3183)および国際公開第 WO94Z03613号記 載の遺伝子改変により耐熱性の向上したァグロバタテリゥム スピーシーズ (Agrobact erium sp.)KNK712 (FERM BP— 1900)由来の N—力ルバミルアミノ酸アミドハィ ドロラーゼ遺伝子を含有するェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pNT4553 ) (FERM BP— 4368)などを挙げることができる。
[0085] N 力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼの生産は、前述の N 力ルバミルアミノ 酸アミドハイド口ラーゼ活性を示す微生物、或 、は形質転換微生物を通常の方法で 培養することにより行い得る。培養は、通常液体栄養培地で行われる力 固体表面培 養によっても行うことができる。培地には、通常資化し得る炭素源、窒素源、各種微生 物の生育に必須の無機塩栄養素を含有させる。更に 4—ヒドロキシフエニルダリシン、 フエ-ルグリシン等のアミノ酸; N 力ルバミル メチォニン、 N 力ルバミル フエ- ルァラニンなどの N 力ルバミル一 α—アミノ酸; 5— (4—ヒドロキシフエ-ル)ヒダント イン、 5—フエ-ルヒダントイン等の 5—置換ヒダントイン類;ゥラシル、ジヒドロウラシル 、 j8—ウレイドプロピオン酸等のピリミジン代謝物;尿素; Fe2+、 Fe3+、 Be2+、 Co2+、 Al3+、 Li+、 Mn2+、 Mg2+、 Cs+等の金属イオン類、またはイソプロピル 1 チォー β D ガラタトサイド (IPTG)、ラタトース等の酵素誘導剤を少量添加して Ν カル ノ ミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼを増強蓄積させることが好まし 、。これら Ν カル ノ ミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ生産増強物質の培地中濃度は、金属イオン類で 0 . ImM以上、 10mM以下、その他の物質で 0. 01重量%以上、 1重量%以下の範 囲力 選ばれる。
[0086] 培養は通常、温度として 20°C以上、 85°C以下の範囲、好ましくは 25°C以上、 60°C 以下の範囲、 pHとしては 4以上、 11以下の範囲、好ましくは pH5以上、 9以下の範 囲が用いられ、通気攪拌によって微生物の生育を促進することもできる。
[0087] 10.酵素
本発明において、上記ヒダントインラセマーゼ、ヒダントイナーゼおよび N—力ルバミ ルアミノ酸アミドハイド口ラーゼは、酵素自体として用いることができるほか、本酵素活 性を有する微生物もしくはその処理物としても用いることができる。ここで、微生物の 処理物とは、例えば、粗抽出液、培養菌体凍結乾燥生物体、アセトン乾燥生物体、 またはそれらの菌体の破砕物を意味する。
[0088] 更にそれらは、酵素自体あるいは菌体のまま公知の手段で固定ィ匕して得た固定ィ匕 酵素としても用いられ得る。固定ィ匕は当業者に周知の方法である架橋法、共有結合 法、物理的吸着法、包括法などで行い得る。酵素の固定ィヒに使用される支持体とし ては、例えば、 Duolite A— 568または DS— 17186 (ローム 'アンド'ハース社:登録 商標)などのフエノールホルムアルデヒド陰イオン交換榭脂、 Amberlite IRA935、 I RA945、 IRA901 (ローム 'アンド'ハース社:登録商標)、 Lewatit OC1037 (バイ エル社:登録商標)、 Diaion EX— 05 (三菱ィ匕学:登録商標)などのポリスチレン榭 脂のような各種アミンゃアンモ-ゥム塩あるいはジエタノールァミン型の官能基を持つ 各種の陰イオン交換樹脂が適している。その他、 DEAE セルロースなどの支持体 ち使用することがでさる。
[0089] 11.酵素反応
本発明の実施形態としての酵素反応は以下の方法で行うことができる。本発明に おいて、酵素反応の基質として用いられる 5—置換ヒダントインィ匕合物は、 D体、 L体 、ラセミ体、または、 D体と L体とが任意の割合で混合したものの、いずれを用いること もできる。酵素反応の基質として、 5—置換ヒダントインィ匕合物を用いることができ、好 ましくは、前記一般式(1)で表される 5 置換ヒダントインィ匕合物が用いられる。
[0090] ここで、 Rは置換基を有して!/、てもよ!/、炭素数 1〜20のアルキル基、置換基を有し て!、てもよ 、炭素数 7〜20のァラルキル基、もしくは置換基を有して 、てもよ 、炭素 数 6〜20のァリール基を表す。上記 Rにおける置換基を有して 、てもよ 、炭素数 1〜 20のアルキル基としては、特に限定されず、例えば、メチル基、イソプロピル基、イソ ブチル基、 1 メチルプロピル基、力ルバモイルメチル基、 2—力ルバモイルェチル基 、ヒドロキシメチル基、 1ーヒドロキシェチル基、メルカプトメチル基、 2—メチルチオェ チル基、(1 メルカプト 1ーメチル)ェチル基、カルボキシメチル基、 2—カルボキ シェチル基、 4—アミノブチル基、 3—グァ -ジノプロピル基、 4 (5)—イミダゾールメチ ル基、ェチル基、 n—プロピル基、 n—ブチル基、メトキシメチル基、 2—ヒドロキシェ チル基、 3 ァミノプロピル基、 2 シァノエチル基、 3 シァノプロピル基、 4 (ベン ゾィルァミノ)ブチル基、または、 2—メトキシカルボニルェチル基などが挙げられる。 置換基を有して 、てもよ 、炭素数 7〜20のァラルキル基としては、特に限定されず、 例えば、ベンジル基、インドリルメチル基、 4ーヒドロキシベンジル基、又は、 3, 4—メ チレンジォキシベンジル基等が挙げられる。置換基を有して 、てもよ 、炭素数 6〜20 のァリール基としては、フエ-ル基、または 4ーヒドロキシフエ-ル基などが挙げられる [0091] 上記の基質を用いて、上記のヒダントインラセマーゼを、上記立体選択的ヒダントイ ナーゼ、またはヒダントイナーゼ及び N 力ルノ ミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼと、 同時に存在させ、水性媒体中で反応を行う。基質の仕込み濃度は 0. 1% (WZV)以 上、 90% (w/v)以下、好ましくは 1% (w/v)以上、 60% (w/v)以下で溶解または 懸濁した状態で反応を行い、反応温度は 10°C以上、 80°C以下、好ましくは 20°C以 上、 60°C以下の適当な温度で調節し、 pH4以上、 9以下、好ましくは pH5以上、 8以 下に保ちつつ暫時静置または攪拌すればよい。また、基質を連続的に添加しうる。 反応は、ノ ツチ法または連続方式で行い得る。本発明の反応は、固定化酵素、膜リ アクターなどを利用して行うことも可能である。
[0092] 水性媒体としては、水、緩衝液、これらにエタノールのような水溶性有機溶媒を含 む水性媒体、あるいは、水に溶解しにくい有機溶媒、たとえば、酢酸ェチル、酢酸ブ チル、トルエン、クロ口ホルム、 n キサンなどの有機溶媒を含む水性媒体との 2層 系などの適当な溶媒を用いることができる。さらに必要に応じて、抗酸化剤、界面活 性剤、補酵素、金属などを添加することもできる。
[0093] 力べして、本発明のヒダントインラセマーゼにて 5 置換ヒダントインィ匕合物をラセミ 化しつつ、該 5—置換ヒダントイン化合物は立体選択的ヒダントイナーゼにより一方の 光学活性体のみが加水分解され光学活性な N—力ルバミルアミノ酸に変換される。 更に、必要に応じて、 N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼも併用することにより 光学活性 N—力ルバミルアミノ酸はさらに光学活性アミノ酸へ変換される。または、 N —力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼを用いず、化学的な脱力ルバミル化反応に 供して光学活性アミノ酸を得ても良 ヽ。
[0094] 生成した光学活性 N—力ルバミルアミノ酸類及び光学活性アミノ酸類の単離は、常 套分離方法、例えば、抽出、濃縮、晶析、またはカラムクロマトグラフィーなどの分離 方法や、それらの組み合わせにより分離、精製することができる。
[0095] 上記本発明の実施形態としての製造方法によって得られる光学活性 N—力ルバミ ルアミノ酸は、例えば、上記一般式(2)で表されるものであり、具体的には、 N カル ノ ミル D 口イシン、 N 力ルバミル D—イソロイシン、 N 力ルバミル D—バリ ン、 N 力ルバミル— D ノルロイシン、 N 力ルバミル— D ノルパリン、 N 力ルバ ミル D—メチォニン、 N 力ルバミル D—システィン、 N 力ルバミル—D ぺニ シラミン、 N 力ルバミル D—フエ-ルァラニン、 N 力ルバミル D—フエ-ルグリ シン、又は、 N カルノ ミル— D— 4—ヒドロキシフエ-ルグリシン等が挙げられる。ま た、上記実施形態の製造方法によって得られる光学活性アミノ酸は、例えば、上記一 般式(3)で表されるものであり、具体的には、 D 口イシン、 D—イソロイシン、 D バ リン、 D ノルロイシン、 D ノルパリン、 D—メチォニン、 D システィン、 D ぺ-シ ラミン、 D フエ二ルァラニン、 D フエ-ルグリシン、又は、 D— 4—ヒドロキシフエ- ルグリシン等が挙げられる。
実施例
[0096] 以下に本発明の具体的な実施例を示す。しかし、本発明はこれらの実施例により限 定されるものではない。
[0097] (実施例 1)ヒダントインラセマーゼの精製
バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株(FERM BP— 10477)を、 表 1の組成の培地(500ml容—坂口フラスコ)に植菌して 30°Cで 17時間、好気的に 振とう培養した。
[0098] [表 1]
Figure imgf000027_0001
[0099] 上記培地は、 pH7に調整、オートクレープ殺菌して使用した。ただし、グルコースは 他の培地成分と別に殺菌し、殺菌後に添加した。フラスコ中の液量は 300mlとした。
[0100] 培養終了後、遠心分離により菌体を集菌し、 ImMのジチオスレィトール (DTT)を 含む 50mMリン酸カリウムノ ッファー (pH7. 0)に懸濁後、超音波により破砕した後 に遠心し、上清を粗酵素液として取得した。粗酵素液に硫酸アンモニゥムを 60〜90 %飽和になるように添加して塩祈した沈殿を遠心分離により取得した。この沈殿を 1 mMの DTTを含む 50mMリン酸カリウムバッファー(pH7. 0)〖こ溶解、同バッファー で透析後、 TSKgel DEAEトヨパール 650M (東ソ一社製)を用いてカラムクロマトグ ラフィーを行い、 ImMの DTTを含む 50mMリン酸カリウムバッファー(pH7. 0)で 0 〜0. 6M NaClのグラジェントをかけて溶出して、活性のあるフラクションを集めた。 このフラクションに、 1. 5Mとなるように硫酸アンモ-ゥムをカ卩えた後、 TSKgel Phe nylトヨパール 650M (東ソ一社製)を用いてカラムクロマトグラフィーを行 、、 ImMの DTTを含む 50mMリン酸カリウムバッファー(pH7. 0)で 1. 5〜0Mの硫酸アンモ- ゥムのグラジェントをかけて溶出した。得られた活性画分を ImMの DTTを含む 50m Mリン酸カリウムバッファー(pH7. 0)で透析した後、 1. 5Mとなるように硫酸アンモ- ゥムを加え、 RESOURCE ISO 1ml (アマシャムフアルマシア社製)を用いてカラ ムクロマトグラフィーを行 、、 ImMの DTTを含む 50mMリン酸カリウムバッファー(p H7. 0)で 1. 5〜0Mの硫酸アンモ-ゥムのグラジェントをかけて溶出した。得られた 活性画分を ImMの DTTを含む 50mMリン酸カリウムバッファー(pH7. 0)で透析し 、精製ヒダントインラセマーゼを得た。
[0101] この精製ヒダントインラセマーゼを SDS—ポリアクリルアミド電気泳動によって分析し たところ、ヒダントインラセマーゼはほぼ単一バンドとして検出された。これを HPLC ( カラム: YMC— Pack PROTEIN— RP (YMC社製)、溶離液: 20%ァセトニトリル 水溶液〜 80%ァセトニトリル水溶液のグラジェント、流速: lmlZmin.、カラム温度: 25°C、検出: 230nm)で分析したところ、精製ヒダントインラセマーゼの純度は約 93 %であった。
[0102] (実施例 2)ヒダントインラセマーゼの性質
実施例 1で得られた精製ヒダントインラセマーゼの性質を以下のように調べた。
[0103] [N末端アミノ酸配列] 実施例 1の HPLC分析の際に分取したヒダントインラセマーゼを用 、て、プロテイン シークェンサ一 procise492 (アプライドバイオシステムズ社製)で N末端アミノ酸配列 を解析した。その結果、 N末端カゝら 40アミノ酸の配列を決定できた。その配列を、配 列表の配列番号 3に示した。
[0104] [比活性]
得られた精製ヒダントインラセマーゼの活性は、 L— 5— (2—メチルチオェチル)ヒ ダントイン 50mMを含む 50mM Tris— HC1緩衝液(pH7. 5)中で、 30°C、 30分間 に生成する D—5— (2—メチルチオェチル)ヒダントインの増加量を HPLCで定量す ることにより求めた。 HPLC分析は、カラム: Chirobiotic T(4. 6mm X 250mm, A STEC社製)、溶離液: 0. 01 % (v/v) Triethylamine acetate (pH6. 8) /meth anol=9Zl、流速: 0. 7ml/min.、カラム温度: 35°C、検出: 210nmで行なった。 このとき 1分間に 1 μ molの D— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインを生成する酵 素量を lunitと定義した。また、タンパク質の定量は、 BSAを標準タンパク質として Lo wry法で行った。その結果、精製したヒダントインラセマーゼの比活性は 24. 2unit/ mgタンパク質であった。
[0105] [Km値の測定]
L- 5- (2—メチルチオェチル)ヒダントインに対する Km値を、ラインゥエーバ バークのプロットにより求めた。図 2に示したように、 L- 5- (2—メチルチオェチル)ヒ ダントインに対する Km値は 0. 304mMであった。
[0106] [作用温度の範囲'至適温度]
作用温度の範囲と至適温度を調べた。 40°Cでの活性を 100%とした場合の各温度 での相対活性を図 3に示した。本酵素の至適温度は 40°Cで、検討した 25〜65°Cの 範囲でよく作用した。
[0107] [作用 pHの範囲]
作用 pHの範囲と至適 pHを調べた。 pH8. 9での活性を 100%とした場合の各 pH での相対活性を図 4に示した。本酵素は pH6〜10の範囲で作用し、至適 pHは 8〜9 であった。
[0108] [温度安定性] 本酵素の温度安定性を、各温度で 30分間処理した後の残活性で調べたところ、図 5に示すように 30°Cで 80%の残存活性を示し、 70°Cではほぼ失活した。
[0109] [PH安定'性]
pH安定性について調べた。本酵素を 30°C、 16時間、各 pHで処理した後の残活 性を、未処理酵素液の活性を 100%として図 6に示した。本酵素は pH4. 5〜8. 0の 間で比較的安定であった。
[0110] [分子量の測定]
ゲルろ過クロマトグラフィー法 (カラム: TSKgel G3000SW (東ソ一社製))により 標準タンパク質の溶出時間と比較して分子量を測定したところ、約 139,000であった 。また、 SDS ポリアクリルアミド電気泳動により標準タンパク質との移動度と比較し てサブユニット分子量を測定したところ、約 31, 000であった。
[0111] [基質特異性]
精製ヒダントインラセマーゼの基質特異性を調べた。それぞれ、 50mM L— 5— ( 2—メチルチオェチル)ヒダントイン、 50mM D— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダン トイン、 13mM D— 5— (1—メルカプト一 1—メチル)ェチルヒダントイン、 8mM L 5 イソブチルヒダントイン、 50mM L- 5- (1 メチルプロピル)ヒダントイン、ま たは、 4mM L— 5 ベンジルヒダントインを含む 0. 9mlの 50mM Tris— HC1緩衝 液 (PH7. 5)に実施例 1で得た精製ヒダントインラセマーゼ 0. 1mlを添加して 30°Cで 反応させた後、 IN HC1 0. lmlを添カ卩して反応を停止した。 D— 5— (1—メルカプ ト 1ーメチル)ェチルヒダントイン以外の基質を用いた反応の分析は、反応液の遠 心上清をイオン交換水で 2倍希釈し、反応液中に生成した D— 5 置換ヒダントイン 化合物を HPLCで定量することで行なった。 HPLC分析は前記の条件で行なった。 また、 D— 5—(1 メルカプト 1ーメチル)ェチルヒダントインを基質として用いた反 応の分析は、反応液を lmlの酢酸ェチルで抽出して得た試料を、次の条件で HPL C分析により定量することで行なった。カラム: CHIRALPAK AD— H (ダイセル社 製)、溶離液:へキサン Zイソプロパノール = 9Zl、流速: lmlZmin. 、カラム温度: 25°C、検出: 210nm。その結果を表 2に、 L—5—(2—メチルチオェチル)ヒダントイ ンに対する活性を 100としたときの相対活性値で示した。 [0112] [表 2]
Figure imgf000031_0001
[0113] (実施例 3)バチルス スピーシーズ(Bacillus SD.) KNK519HR株の牛.産するヒダン トインラセマーゼの某皙特異件
実施例 1と同様に調製したバチルス スピーシーズ(Bacillus sp.) KNK519HR株 の粗酵素液を用いて、バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.) KNK519HR株の生産 するヒダントインラセマーゼの基質特異性を調べた。それぞれ、 4mM L— 5—ベン ジルヒダントイン、 50mM L- 5 - (2—メチルチオェチル)ヒダントイン、または、 8m M L—5—イソブチルヒダントインを含む 0. 9mlの 50mM Tris— HC1緩衝液(pH 7. 5)に上記粗酵素液 0. 1mlを添カ卩して、 30°Cで反応させた後、 IN HC1 0. lml を添加して反応を停止した。その遠心上清をイオン交換水で 2倍希釈し、反応液中 に生成した D— 5—置換ヒダントインィ匕合物を HPLCで定量した。 HPLC分析は、力 ラム: Chirobiotic T (4. 6mm X 250mm、 ASTEC社製)、溶離液: 0. 01% (v/v ) Triethylamme acetate Η6. 8) / methanol = 9/ 1、流速: 0. 7ml/ mm.、 カラム温度: 35°C、検出: 210nmで行なった。また、 50mM 5—メチルヒダントインを 含む 50mM Tris— HC1緩衝液(pH7. 5) 0. 9ml〖こ上記バチルス スピーシーズ(B acillus sp.) KNK519HR株の粗酵素液 0. lml、後述の培養液 lml分の D体選択的 ヒダントイナーゼ活性を有する組換え大腸菌および培養液 lml分の D体選択的 N— 力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ活性を有する組換え大腸菌を同時に添加して 、 30°Cで反応させた後、 IN HC1 0. lmlを添カ卩して反応を停止した。 IN NaOH を添加して中和した後、遠心分離し、上清中に生成した D ァラニンを D—アミノ酸 ォキシダーゼとペルォキシダーゼを用 V、た酵素法で定量した。
[0114] 酵素法による D ァラニンの定量は次のように実施した。反応液上清をイオン交換 水で 5倍希釈し、 1. 3mM 4 ァミノアンチピリン、 2. 2mM N ェチル N— (2 —ヒドロキシ一 3—スルフォプロピル)一 m—トルイジン、 0. 8U/ml ペルォキシダー ゼ(CALZYME Lavoratories, Inc.社製、製品番号 100A0600)、 1. 2U/ml D—アミノ酸ォキシダーゼ(SIGMA社製、製品番号 A5222)、および、 40mM リン 酸カリウム緩衝液 (PH7. 9)からなる発色液と 1 : 1で混合し、室温で 90分間させ、 55 5nmの吸光度を測定して、反応液中に生成した D ァラニン量を定量した。その結 果を表 3に、 L— 5—イソプチルヒダントインに対する活性を 100としたときの相対活性 値で示した。
[0115] 本実施例で使用する、 D体選択的ヒダントイナーゼ活性を有する組換え大腸菌およ び D体選択的 N -力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼ活性を有する組換え大腸 菌の培養液は次のようにして得た。 D体選択的ヒダントイナーゼ活性を有する組換え 大腸菌であるェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB 101 (pTH 104) (FERM BP 4864)を 500ml坂口フラスコ内で滅菌した 50mlの培地(トリプトン 16g、イーストェ キス 10g、塩化ナトリウム 5g、水 11、塩化マンガン 400ppm、滅菌前 pH7、別途ろ過 滅菌したアンピシリンナトリウム lOOppm)に接種して、 37°Cで 24時間振とう培養した 。また、 D体選択的 N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イド口ラーゼ活性を有する組換え 大腸菌であるェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pNT4553) (FERM BP —4368)を 500ml坂口フラスコ内で滅菌した 350mlの培地(トリプトン 16g、イースト エキス 10g、塩ィ匕ナトリウム 5g、水 11、滅菌前 pH7、別途ろ過滅菌したアンピシリンナ トリウム lOOppm)に接種して、 37°Cで 36時間振とう培養した。
[0116] [表 3] 基質
L-5一イソブチルヒダントイン 100
し一 5一(2—メチルチオェチル)ヒダントイン 61
L-5一ベンジルヒダントイン 35
L-5ーメチルヒダン卜イン 20
[0117] なお、上記ェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB 101 (pTH 104) (FERM BP— 4864)は、 1994年 11月 2日付けで、ェシエリヒア コリ (Escherichia coli) HB101 (p NT4553) (FERM BP— 4368)は 1993年 7月 22日付けで、それぞれ記載の受託 番号にて、独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター (IPOD :〒3 05-8566 茨城県つくば巿東 1 1 1 中央第 6)に寄託されている。
[0118] (実施例 4)バチルス スピーシーズ(Bacillus SD.) KNK519HR株の生産するヒダン トインラセマーゼの某晳阻害
バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株の生産するヒダントインラセ マーゼの基質阻害効果を実施例 1で調製した粗酵素液を用いて調べた。 5、 10、 50 、または、 80mM L— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインを含む 50mM Tris HC1緩衝液 (pH7. 5) 0. 9mlと上記粗酵素液 0. 1mlの混合反応液中 30°Cで、 1 0、 20、 30、ないし、 40分間反応させた後、 IN HC1 0. 1mlを添カ卩してヒダントイン ラセマーゼを失活させ、遠心上清をイオン交換水で 2倍希釈し、反応液中に生成した D- 5- (2—メチルチオェチル)ヒダントインを HPLCで定量した。 HPLC分析は実 施例 3と同じ条件で実施した。それぞれの初発基質濃度について反応初速度を求め 、初発基質濃度との関係を図 7に示した。その結果、バチルス スピーシーズ (Bacillu s sp.)KNK519HR株の生産するヒダントインラセマーゼは、 50、ないし、 80mM L 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインを基質としたときに基質阻害を受けることが 明らかになった。
[0119] ( 施例 5)ヒダントインラセマーゼ遣伝早の単離
バチノレス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株のコロニーを、培地 10ml (l 6g トリプトン ペプトン(DIFCO社製)、 10g バクトイーストエキス(Becton Dickin son and Company社製)、 5g NaClに水をカ卩えて 1Lとして pH7に調製、オートク レーブ殺菌して使用)に植菌して 30°Cで 12時間、好気的に振とう培養した。
[0120] 培養終了後、遠心分離で菌体を集菌して、 UltraClean Microbial DNA Isolation Kit
(MO BIO Laboratories, Inc.社製)を用いて DNA溶液を取得した後、エタノールで析 出させ、遠心分離で得られた沈殿を 10mM Tris— HC1緩衝液(pH8. 0、 ImM エチレンジァミン四酢酸)へ溶解させることで染色体 DNAを調製した。次いで、実施 例 2で得た N末端アミノ酸配列にもとづ 、て設計した DNAプライマー(Primer— 1: 配列表の配列番号 4)と、既知のヒダントインラセマーゼの配列相同部位にもとづいて 設計した DNAプライマー(Primer— 2:配列表の配列番号 5)を用いて、先に得た染 色体 DNAを铸型に PCRを行った。その結果、 目的のヒダントインラセマーゼ遺伝子 の一部 (部分遺伝子と称す)を取得した。
[0121] 次に、目的遺伝子の全長を取得するために以下の操作を行った。上記部分遺伝子 において、酵素の N末端側、 C末端側それぞれの部分に相当する塩基配列にもとづ き、部分遺伝子の外側方向へ向けた DNAプライマー(Primer— 3:配列表の配列番 号 6、及び、 Primer— 4 :配列表の配列番号 7)を合成した。このプライマーを用い、 先に得た染色体 DNAを制限酵素 Kpnl、 Spelで分解したものを Τ4 DNAリガーゼ を用いて環化させて得た DNAを铸型に、インバース PCRを行った。これにより、既に 取得した部分遺伝子のさらに外側の遺伝子部分を含む DNA断片を取得した。この DNA断片の塩基配列を決定後、酵素の N末端より上流と推定される部分に制限酵 素 Ndelの切断部位を結合させた配列をもつ DNAプライマー(Primer— 5:配列表 の配列番号 8)と、 C末端より下流と推定される部分に制限酵素 EcoRI切断部位を結 合させた配列をもつ DNAプライマー(Primer— 6:配列表の配列番号 9)を用いて、 この配列の間の DNAを先に得た染色体 DNAを铸型にした PCRにより増幅すること でヒダントインラセマーゼ遺伝子の全長を含む DNA断片(配列表の配列番号 10)を 取得した。得られた DNA断片の塩基配列を解析し、ヒダントインラセマーゼ遺伝子の 全長 (配列表の配列番号 2)が含まれて ヽることを確認した。
[0122] 施例 6)ヒダントインラセマーゼ遣伝早 発現する鉬. ¾ プラスミドの作成
実施例 5で得られたヒダントインラセマーゼ遺伝子の N末端、 C末端部分にそれぞ れ制限酵素 Ndel及び EcoRIの切断部位を結合させた配列を持つプライマー(Prim er— 7 :配列表の配列番号 11、 Primer— 8 :配列表の配列番号 12)を用いて、この 間の DNAを実施例 5で得た染色体 DNAを铸型にした PCRにより増幅することで配 列表の配列番号 2に示されるオープンリーディングフレームの DNA断片を取得した。
[0123] この DNA断片を制限酵素 Ndelと EcoRIで切断し、同酵素で切断したベクタープラ スミド pUCNT (国際公開第 WO94Z03613号参照)と T4 DNAリガーゼを用いて 結合することで、図 1の制限酵素地図で表され、ヒダントインラセマーゼ遺伝子を大量 に発現できるように設計された pBHROO 1を取得した。
[0124] (実施例 7)ヒダントインラセマーゼ遺伝子を含む組椽ぇ体 DNAを用いた形皙転椽 体の作成 実施例 6で得られたプラスミド pBHROOlをェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB1 01のコンビテントセルと混合することで形質転換を行い、寒天培地(トリプトン 10g、ィ 一ストエキス 5g、塩ィ匕ナトリウム 10g、寒天 15g、アンピシリン 100mg、脱イオン水に て 11にメスアップ、滅菌前 pH7. 0、ただしアンピシリンは滅菌後に添加する)にプレ 一ティングして、ヒダントインラセマーゼ遺伝子を含む組換え体 DNAを含有する形質 転換体ェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pBHROOl)をコロニーとして取 得した。
[0125] 得られた形質転換体のコロニーを、試験管内にて滅菌した 6mlの培地 (前記の培 地力も寒天を除いたもの)に植菌後、 37°Cで 23時間、振とうして好気的に培養した。 得られた培養液カゝら遠心分離により菌体魏菌し、 50mM Tris—塩酸緩衝液 (pH 7. 5)に懸濁して超音波により菌体を破砕した後、遠心分離により菌体由来の不溶物 を除去して、形質転換体のヒダントインラセマーゼ酵素液を取得した。得られた酵素 液 0. 1mlを用いて、実施例 2と同じ方法でヒダントインラセマーゼ活性を測定したとこ ろ、ヒダントインラセマーゼ活性が確認された。
[0126] ( 施例 8)形皙転橼体のヒダントインラセマーゼの 特虽件
実施例 7で得た形質転換体のヒダントインラセマーゼ酵素液を用いて、実施例 2と 同じ方法で基質特異性を調べた。その結果を表 4に、 L- 5- (2—メチルチオェチル )ヒダントインに対する活性を 100としたときの相対活性値で示した。
[0127] [表 4] 基質
L-5- - (2—メチルチオェチル)ヒダントイン 100
D-5- - (2—メチルチオェチル)ヒダントイン 52
D-5- - ( 1—メルカプト一 1ーメチル)ェチルヒダントイン 9
L-5-イソプチルヒダントイン 174
L-5- ( 1一メチルプロピル)ヒダントイン 2
L-5-ベンジルヒダントイン 35
[0128] 施例 9)ヒダントインラセマーゼ活件菌 禾 II用した光学活件アミノ酸の合成
実施例 3に示した D体選択的ヒダントイナーゼ活性を有する組換え大腸菌であるェ シエリヒア コリ(Escherichia coli) HB 101 (pTH104) (FERM BP— 4864)、およ び、 D体選択的 N -力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ活性を有する組換え大腸 菌であるェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pNT4553) (FERM BP— 43 68)を、実施例 1で培養したヒダントインラセマーゼ活性を有するバチルス スピーシ ーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株の培養液と同時に、 DL— 5— (2—メチルチオェ チル)ヒダントイン、または、 DL— 5—メチルヒダントインのそれぞれに作用せしめ、対 応する D アミノ酸を合成した。
[0129] 1. DL— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインから D メチォニンの合成
実施例 1のバチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株の培養液 lml分 の菌体と、実施例 3の D体選択的ヒダントイナーゼ活性を有する組換え大腸菌の培養 液 lml分の菌体、および、実施例 3の D体選択的 N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド 口ラーゼ活性を有する組換え大腸菌の培養液 lml分の菌体を、 2% (w/v) DL- 5 — (2—メチルチオェチル)ヒダントインを含む 50mM Tris— HC1緩衝液(pH7. 5) 0. 5mlに懸濁し、 30°Cで反応を行った。 19時間後に反応液に IN HC1 0. 05ml を添加して反応を停止し、反応上清をイオン交換水で 50倍希釈して HPLCで分析し た。 HPLC分析は実施例 3に示した条件で行なった。その結果、モル収率 80%で D メチォニンが生成し、光学純度は 86. 0%eeであった。それと比較して、 KNK519 HR株培養菌体を添カ卩しなかった場合、モル収率 39%で D—メチォニンが生成し、 3 8mol%の L 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインが残存した。
[0130] 2. DL— 5—メチルヒダントインから D ァラニンの合成
実施例 1のバチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株の培養液 lml分 の菌体と、実施例 3の D体選択的ヒダントイナーゼ活性を有する組換え大腸菌の培養 液 lml分の菌体、および、実施例 3の D体選択的 N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド 口ラーゼ活性を有する組換え大腸菌の培養液 lml分の菌体を、 2% (w/v) DL- 5 —メチルヒダントインを含む 50mM Tris— HC1緩衝液(pH7. 5) 0. 5mlに懸濁し、 30°Cで反応した。 18時間後に反応液に IN HC1 0. 05mlを添カ卩して反応を停止 し、イオン交換水で 20倍希釈した後、遠心分離し、上清を HPLCで分析した。
[0131] HPLC分析は次に示す条件で実施した。カラム: CROWNPAK CR+ (4. 6mm
X 150mm,ダイセル社製)、溶離液: HCIO (pHl. 5)、流速: 0. 4ml/min.、力
4
ラム温度: 4°C、検出: 210nm。その結果、 KNK519HR株培養菌体を添カ卩しなかつ た場合の DL— 5—メチルヒダントインの残存率が 32%であったのに対して、残存率 は 3. 6%であり D ァラニン生成量が増加した。
[0132] (実施例 10)形皙転椽体を刺用した光学活件 N—力ルバミルアミノ酸及び光学活件 アミノ酸の合成
実施例 7で得たヒダントインラセマーゼ活性を有する形質転換体、実施例 3で得た D 体選択的ヒダントイナーゼ活性を有する組換え大腸菌ェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pTH104)、および実施例 3で得た D体選択的 N—力ルノ ミルアミノ酸 アミドハイド口ラーゼ活性を有する組換え大腸菌ェシエリヒア コリ(Escherichia coli) H B101 (pNT4553)のそれぞれを培養後の培養液力も遠心分離により集菌し、 50m M Tris— HC1緩衝液 (pH7. 5)に懸濁して超音波により菌体を破砕して各酵素液 を取得した。それらの酵素液を、 DL— 5—イソブチルヒダントイン、 DL— 5— (2—メ チルチオェチル)ヒダントイン、 DL— 5—(1 メルカプト 1ーメチル)ェチルヒダント イン、または、 DL— 5—ベンジルヒダントインに作用させて、対応する D— N 力ルバ ミルアミノ酸又は D -アミノ酸を合成した。
[0133] 1. DL— 5 イソブチルヒダントインから D 口イシンの合成
前記のヒダントインラセマーゼ活性を有する形質転換体の培養液 2ml分、前記の D 体選択的ヒダントイナーゼ活性組換え菌の培養液 2ml分、および、前記の D体選択 的 N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ活性組換え菌の培養液 10ml分の菌体 破砕液を、 5% (wZv) DL— 5—イソブチルヒダントインを含む 0. 83M 2— [4— (2 ― hydroxyetnyl)― 1— piperazmyl]etnanesulfonic acid (HEPES)— NaOH 緩衝液 (pH7. 0) 2mlに懸濁し、 30°Cで反応を行った。また、比較例としてヒダントイ ンラセマーゼ活性組換え菌破砕液を添加しな 、反応も行なった。 2時間後に反応液 を 0. 01 % (v/v) Triethylamine acetate (pH6. 8) /methanol= 9/lで 50倍 希釈して、遠心上清を HPLCで分析した。その結果、変換率 99%で 100%eeの D— ロイシンが生成した (L体 n. d. ) 0また、比較例であるヒダントインラセマーゼ活性組 換え菌破砕液を添加しな 、反応では変換率 26%であった。 HPLC分析によるアミノ 酸の定量は次に示す条件で実施した。カラム: CROWNPAK CR+ (4. 6mm X I 50mm、ダイセル社製)、溶離液: HCIO (pHl. 5)、流速: lmlZmin. 、カラム温度 : 25°C、検出: 210nm。
[0134] 2. DL— 5—イソブチルヒダントインから D—N—力ルバミルロイシンの合成
前記のヒダントインラセマーゼ活性を有する形質転換体の培養液 2ml分、前記の D 体選択的ヒダントイナーゼ活性組換え菌の培養液 2ml分の菌体破砕液を、 5% (w/ v) DL— 5—イソブチルヒダントインを含む 0. 2M Tris— HC1緩衝液(pH8. 5) 2ml に懸濁し、 30°Cで反応を行った。また、比較例としてヒダントインラセマーゼ活性組換 ぇ菌破砕液を添加しない反応も行なった。 6時間後に反応液を 0. 01% (v/v)Triet hylamine acetate (pH6. 8) Zmethanol= 9Zlで 50倍希釈して、遠心上清を H PLCで分析した。その結果、変換率 74%で 100%eeの D— N—力ルノ ミルロイシン が生成した (L体 n. d. ) 0また、比較例であるヒダントインラセマーゼ活性組換え菌破 砕液を添加しない反応では、変換率 49%であった。 HPLC分析による定量は次に 示す条件で実施した。カラム: Chirobiotic T(4. 6mmX 250mm、 ASTEC社製) を 2本連結、溶離液:0. 01% (v/v) Triethylamine acetate (pH6. 8) /metha nol= 9Zl、流速: 0. 7ml/min.、カラム温度: 35°C、検出: 210nm。
[0135] 3. L— 5—イソブチルヒダントインから D—口イシンの合成
前記のヒダントインラセマーゼ活性を有する形質転換体の培養液 2ml分、前記の D 体選択的ヒダントイナーゼ活性組換え菌の培養液 2ml分、および、前記の D体選択 的 N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ活性組換え菌の培養液 8ml分の菌体 破砕液を、 5% (wZv) L— 5—イソブチルヒダントインを含む 0. 63M HEPES— Na OH緩衝液 (pH7. 0) 2mlに懸濁し、 40°Cで反応を行った。 2. 5時間後に反応液を 10mMリン酸カリウム緩衝液 (pH2. 0) /ァセトニトリル = 95/5で 50倍希釈して、 遠心上清を HPLCで分析した。その結果、変換率 99%で 100%eeの D—ロイシンが 生成した (L体 n. d. ) 0 HPLC分析によるアミノ酸の定量は、上述の「1.」で説明した 条件と同じ条件で実施した。
[0136] 4. DL— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインから D—メチォニンの合成
前記のヒダントインラセマーゼ活性組換え菌、前記の D体選択的ヒダントイナーゼ活 性組換え菌、および、前記の D体選択的 N—力ルバミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ 活性組換え菌の、それぞれの培養液 2ml分の菌体破砕液を、 l% (w/v) DL- 5- (2—メチルチオェチル)ヒダントインを含む lOOmMリン酸カリウム緩衝液 (pH7. 0) 2 mlに懸濁し、 40°Cで反応を行った。また、比較例としてヒダントインラセマーゼ活性 組換え菌破砕液を添加しな 、反応も行なった。 2時間後に反応液を 10mMリン酸力 リウム緩衝液 (PH2. 0) /ァセトニトリル = 95/5で 20倍希釈して、遠心上清を HPL Cで分析した。その結果、変換率 93%で D—メチォニンが生成し、この時、比較例で あるヒダントインラセマーゼ活性組換え菌破砕液を添加しな ヽ反応では、変換率 47 %であった。 HPLC分析によるアミノ酸の定量は次に示す条件で実施した。カラム: D evelosil ODS HG 5 (4. 6mm X 150mm、ノムラケミカル社製)、溶離液: 60m Mリン酸カリウム緩衝液(5mMデカンスルホン酸ナトリウム) Zメタノール = 3Zl、流 速: lmlZmin.、カラム温度: 40°C、検出: 210nm。
[0137] 5. DL— 5— (1—メルカプト一 1—メチル)ェチルヒダントインから D ぺ-シラミン の合成
前記のヒダントインラセマーゼ活性組換え菌の培養液 2ml分、前記の D体選択的ヒ ダントイナーゼ活性組換え菌の培養液 2ml分、および、前記の D体選択的 N—カル ノ ミルアミノ酸アミドハイド口ラーゼ活性組換え菌の培養液 4ml分の菌体破砕液を、 1 % (w/v) DL— 5— ( 1—メルカプト 1—メチル)ェチルヒダントインを含む lOOmM
HEPES- NaOH緩衝液 (pH7. 0) 2mlに懸濁し、 40°Cで反応を行った。また、比 較例としてヒダントインラセマーゼ活性組換え菌破砕液を添加しない反応も行なった 。 2. 5時間後に反応液を 10mMリン酸カリウム緩衝液 (pH2. 0) /ァセトニトリル = 9 5Z5で 20倍希釈して、遠心上清を HPLCで分析した。その結果、変換率 86%で 10 0%eeの D ぺ-シラミンが生成した (L体 n. d. ) 0また、比較例であるヒダントインラ セマーゼ活性組換え菌破砕液を添加しない反応では、変換率 52%であった。 HPL C分析は上述の「4.」で説明した条件と同じ条件で行なった。
[0138] 6. DL— 5 ベンジルヒダントインから D フエ-ルァラニンの合成
上述の「1.」で説明した条件と同じ条件で、基質を DL— 5 ベンジルヒダントインと して反応した。また、比較例としてヒダントインラセマーゼ活性組換え菌破砕液を添カロ しない反応も行なった。その結果、反応 9時間で変換率 83%で 98. l%eeの D フ ェニルァラニンが生成した。また、比較例であるヒダントインラセマーゼ活性組換え菌 破砕液を添加しない反応では変換率 40%であった。
7. DL- 5-ベンジルヒダントインから D -N-力ルバミルフエ-ルァラニンの合成 上述の「2.」で説明した条件と同じ条件で、基質を DL— 5—ベンジルヒダントインと して反応した。また、比較例としてヒダントインラセマーゼ活性組換え菌破砕液を添加 しない反応も行なった。その結果、反応 20時間で変換率 84%で D—N—力ルバミル フエ-ルァラニンが生成した。また、比較例であるヒダントインラセマーゼ活性組換え 菌破砕液を添加しな!、反応では、変換率 48%であった。
ラフである。

Claims

請求の範囲 [I] 下記の性質を有し、ヒダントインラセマーゼ活性を有するポリペプチド。
1.分子量
約 139, 000
2. L— 5—(2—メチルチオェチル)ヒダントインに対する Km値
約 0. 304mM
3.作用温度の範囲
温度範囲 25°C〜65°C、 至適温度 約 40°C
4.作用 pHの範囲
pH範囲 6〜10、 至適 pH8〜9
5.温度安定性
30°C以下
6. pH安定性
pH4. 5〜8. 0
[2] バチルス (Bacillus)属に属する微生物に由来する請求項 1記載のポリペプチド。
[3] 前記微生物が、バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株(FERM BP
10477)である請求項 2記載のポリペプチド。
[4] 配列表の配列番号 1に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチド。
[5] 請求項 1から 4のいずれ力 1項に記載のポリペプチドをコードする DNA。
[6] 配列表の配列番号 1のアミノ酸配列をコードする DNA。
[7] 配列表の配列番号 2に示す塩基配列もしくはこれと等価の塩基配列を有し、ヒダント インラセマーゼの遺伝子を含む DNA。
[8] 請求項 5から 7の 、ずれか 1項に記載の DNAを含む組換えプラスミド。
[9] 前記組換えプラスミド力 プラスミド pBHROOlである請求項 8記載の組換えプラスミド
[10] 請求項 8または 9に記載の組換えプラスミドで宿主微生物を形質転換して得られる形 質転換体。
[II] 前記宿主微生物がェシエリヒア コリ(Escherichia coli)である請求項 10に記載の形 質転換体。
[12] 前記形質転換体がェシエリヒア コリ(Escherichia coli) HB101 (pBHROOl) (FER
M BP- 10476)である請求項 10に記載の形質転換体。
[13] 請求項 1または 4に記載のポリペプチドを生産する能力を有し、かつ、バチルス (Bacil lus)属に属する微生物。
[14] バチルス スピーシーズ(Bacillus sp.)KNK519HR株(FERM BP— 10477)、又 はその変異株である請求項 13記載の微生物。
[15] 請求項 1から 4のいずれか 1項に記載のポリペプチドを生産する能力を有する微生物 を培養し、培養物中に当該ポリペプチドを蓄積せしめ、これを採取することを特徴と するヒダントインラセマーゼの製造方法。
[16] 前記微生物が請求項 10から 12のいずれか 1項に記載の形質転換体、又は、請求項
13もしくは 14記載の微生物である、請求項 15に記載のヒダントインラセマーゼの製 造方法。
[17] 前記ヒダントインラセマーゼの生産能を有する微生物力 バチルス スピーシーズ (Ba cillus sp.)KNK519HR株(FERM BP— 10477)である請求項 16に記載のヒダン トインラセマーゼの製造方法。
[18] 前記ヒダントインラセマーゼの生産能を有する形質転換体力 ェシエリヒア コリ(Esch erichia coli) HB101 (pBHROOl) (FERM BP— 10476)である請求項 16に記載 のヒダントインラセマーゼの製造方法。
[19] 請求項 1から 4のいずれか 1項に記載のヒダントインラセマーゼ活性を有するポリぺプ チド、請求項 10から 12のいずれか 1項に記載の形質転換体、又は請求項 13もしくは
14に記載の微生物を、光学活性 5—置換ヒダントイン化合物に作用させることを特徴 とする光学活性 5—置換ヒダントインのラセミ化方法。
[20] 前記光学活性 5—置換ヒダントイン化合物が一般式(1)
[化 1]
Figure imgf000043_0001
(式中、 Rは置換基を有していてもよい炭素数 1〜20のアルキル基、置換基を有して V、てもよ 、炭素数 7〜20のァラルキル基、もしくは置換基を有して 、てもよ 、炭素数 6〜20のァリール基を表す。)で表される光学活性 5—置換ヒダントインである、請求 項 19記載の光学活性 5 -置換ヒダントインのラセミ化方法。
[21] 請求項 1から 4のいずれか 1項に記載のヒダントインラセマーゼ活性を有するポリぺプ チド、請求項 10から 12のいずれか 1項に記載の形質転換体、又は請求項 13もしくは 14に記載の微生物と、ヒダントイナーゼを、 5—置換ヒダントインィ匕合物に作用させる ことを特徴とする光学活性 N—力ルバミルアミノ酸の製造方法。
[22] 前記光学活性 5—置換ヒダントイン化合物が一般式(1)
[化 2]
Figure imgf000043_0002
(式中、 Rは置換基を有していてもよい炭素数 1〜20のアルキル基、置換基を有して V、てもよ 、炭素数 7〜20のァラルキル基、もしくは置換基を有して 、てもよ 、炭素数 6〜20のァリール基を表す。)で表される 5—置換ヒダントインであり、前記光学活性 N—力ルバミルアミノ酸が一般式(2)
[化 3]
Figure imgf000044_0001
(式中、 Rは前記と同じ)で表される光学活性 N—力ルバミルアミノ酸である、請求項 2 1記載の光学活性 N—力ルバミルアミノ酸の製造方法。
[23] 前記光学活性 N 力ルバミルアミノ酸が、 N 力ルバミル D ロイシン、 N 力ルバ ミル—D—イソロイシン、 N 力ルバミル D パリン、 N 力ルバミル D ノルロイ シン、 N カノレバミノレー D ノノレバリン、 N カノレバミノレー D—メチォニン、 N 力ノレ ノ ミル D—システィン、 N 力ルバミル D ぺニシラミン、 N 力ルバミル D— フエ-ルァラニン、 N 力ルバミル— D フエ-ルグリシン、又は、 N 力ルバミル— D 4ーヒドロキシフエ-ルグリシンである請求項 22に記載の製造方法。
[24] 請求項 1から 4のいずれか 1項に記載のヒダントインラセマーゼ活性を有するポリぺプ チド、請求項 10から 12のいずれか 1項に記載の形質転換体、又は請求項 13もしくは 14に記載の微生物と、ヒダントイナーゼおよび N—力ルバミルアミノ酸アミドノ、イドロラ ーゼを、 5 -置換ヒダントインィ匕合物に作用させることを特徴とする光学活性アミノ酸 の製造方法。
[25] 前記 5 置換ヒダントイン化合物が一般式(1)
[化 4]
Figure imgf000044_0002
(式中、 Rは置換基を有していてもよい炭素数 1 20のアルキル基、置換基を有して V、てもよ 、炭素数 7 20のァラルキル基、もしくは置換基を有して 、てもよ 、炭素数 6 20のァリール基を表す。)で表される 5 置換ヒダントインであり、前記光学活性 アミノ酸が一般式 (3)
[化 5]
Figure imgf000045_0001
(式中、 Rは前記と同じ。)で表される光学活性アミノ酸である、請求項 24記載の光学 活性アミノ酸の製造方法。
光学活性アミノ酸力 D—ロイシン、 D—イソロイシン、 D—パリン、 D—ノルロイシン、 D—ノルパリン、 D—メチォニン、 D—システィン、 D—ぺ-シラミン、 D—フエ二ルァラ ニン、 D—フエ-ルグリシン、又は、 D— 4—ヒドロキシフエ-ルグリシンである請求項 2 5に記載の製造方法。
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