CZ199995A3 - Dna sequence encoding novel insulin biosynthetic precursors and insulin preparation process - Google Patents
Dna sequence encoding novel insulin biosynthetic precursors and insulin preparation process Download PDFInfo
- Publication number
- CZ199995A3 CZ199995A3 CZ951999A CZ199995A CZ199995A3 CZ 199995 A3 CZ199995 A3 CZ 199995A3 CZ 951999 A CZ951999 A CZ 951999A CZ 199995 A CZ199995 A CZ 199995A CZ 199995 A3 CZ199995 A3 CZ 199995A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- dna sequence
- insulin
- transformed
- site
- dna
- Prior art date
Links
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 73
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 title claims abstract description 36
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 title claims abstract description 36
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 title claims abstract description 36
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 title claims abstract description 32
- 239000002243 precursor Substances 0.000 title claims abstract description 16
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title abstract description 4
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 title description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 28
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 claims abstract description 21
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 20
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 17
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 17
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 11
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 claims abstract description 9
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 8
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims abstract description 6
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 claims abstract description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 15
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 12
- 108010075254 C-Peptide Proteins 0.000 claims description 8
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 8
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 8
- 101000976075 Homo sapiens Insulin Proteins 0.000 claims description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 7
- PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N insulin (human) Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H]2C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3NC=NC=3)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC1=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=O)CSSC[C@@H](C(N2)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C1=CN=CN1 PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N 0.000 claims description 6
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 4
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 claims description 4
- 241000228257 Aspergillus sp. Species 0.000 claims description 3
- 101500025353 Homo sapiens Insulin A chain Proteins 0.000 claims 1
- VOUAQYXWVJDEQY-QENPJCQMSA-N 33017-11-7 Chemical class OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)CCC1 VOUAQYXWVJDEQY-QENPJCQMSA-N 0.000 abstract description 9
- 238000000034 method Methods 0.000 abstract description 9
- 230000028327 secretion Effects 0.000 abstract description 7
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 abstract description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 abstract description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 44
- 108010076181 Proinsulin Proteins 0.000 description 37
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 28
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 20
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 17
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 14
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 14
- 241000228245 Aspergillus niger Species 0.000 description 12
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 description 12
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 10
- 101150108358 GLAA gene Proteins 0.000 description 9
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 9
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 9
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 9
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 8
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 7
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 7
- 102100022624 Glucoamylase Human genes 0.000 description 6
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 6
- 239000000047 product Substances 0.000 description 6
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 5
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 5
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 5
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 4
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 4
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 3
- 239000002933 immunoreactive insulin Substances 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 3
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N Acetamide Chemical compound CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- 108090000783 Renin Proteins 0.000 description 2
- 102100028255 Renin Human genes 0.000 description 2
- AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N Riboflavin Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N 0.000 description 2
- 241000473945 Theria <moth genus> Species 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 108010066381 preproinsulin Proteins 0.000 description 2
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 2
- LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N pyridoxine Chemical compound CC1=NC=C(CO)C(CO)=C1O LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 108010017640 Aspartic Acid Proteases Proteins 0.000 description 1
- 102000004580 Aspartic Acid Proteases Human genes 0.000 description 1
- 241001513093 Aspergillus awamori Species 0.000 description 1
- 241000351920 Aspergillus nidulans Species 0.000 description 1
- 101000914103 Bos taurus Chymosin Proteins 0.000 description 1
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N C1CCCCC1 Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 0 CC(C(C)([C@@]1*2C)C=CCC2=C2C=C(C)CC12[N+](C)[O-])N=C Chemical compound CC(C(C)([C@@]1*2C)C=CCC2=C2C=C(C)CC12[N+](C)[O-])N=C 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000087 Carboxypeptidase B Proteins 0.000 description 1
- 102000003670 Carboxypeptidase B Human genes 0.000 description 1
- 108090000746 Chymosin Proteins 0.000 description 1
- AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N D-Lyxoflavin Natural products OCC(O)C(O)C(O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 description 1
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 description 1
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 1
- 108010054218 Factor VIII Proteins 0.000 description 1
- 102000001690 Factor VIII Human genes 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 101800001707 Spacer peptide Proteins 0.000 description 1
- JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N Thiamine Natural products CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- DFPAKSUCGFBDDF-ZQBYOMGUSA-N [14c]-nicotinamide Chemical compound N[14C](=O)C1=CC=CN=C1 DFPAKSUCGFBDDF-ZQBYOMGUSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 108010048241 acetamidase Proteins 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001507 asparagine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 229940080701 chymosin Drugs 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 229960000301 factor viii Drugs 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 101150021022 galA gene Proteins 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 1
- 101150073906 gpdA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150095733 gpsA gene Proteins 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 230000003914 insulin secretion Effects 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- GNOLWGAJQVLBSM-UHFFFAOYSA-N n,n,5,7-tetramethyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-amine Chemical compound C1=C(C)C=C2C(N(C)C)CCCC2=C1C GNOLWGAJQVLBSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 108010064037 prorennin Proteins 0.000 description 1
- 230000020978 protein processing Effects 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 235000008160 pyridoxine Nutrition 0.000 description 1
- 239000011677 pyridoxine Substances 0.000 description 1
- 229960002477 riboflavin Drugs 0.000 description 1
- 235000019192 riboflavin Nutrition 0.000 description 1
- 239000002151 riboflavin Substances 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 235000019157 thiamine Nutrition 0.000 description 1
- KYMBYSLLVAOCFI-UHFFFAOYSA-N thiamine Chemical compound CC1=C(CCO)SCN1CC1=CN=C(C)N=C1N KYMBYSLLVAOCFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003495 thiamine Drugs 0.000 description 1
- 239000011721 thiamine Substances 0.000 description 1
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 1
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 1
- 101150016309 trpC gene Proteins 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 230000001810 trypsinlike Effects 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- 229940011671 vitamin b6 Drugs 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
- C07K14/62—Insulins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
Tento vynález se týká DNA sekvencí kódujících nové biosyntetické prekursory insulinu a přípravy insulinu kultivací transformovaných buněk obsahujících takovéto DNA sekvence.
Dosavadní stav techniky
Insulin je hormon, jehož primární rolí je řízení transportu glukosy z krevního oběhu do buněk, kde je metabolizována.
Insulin sestává z dvou řetězců aminokyselin: Řetězce A, obsahujícího 21 aminokyselin a řetězce B, obsahujícího 30 aminokyselin, přičemž tyto řetězce jsou vázány jeden k druhému dvěma disulfidovými můstky. Třetí disulfidový můstek se nalézá v řetězci A.
Primární forma insulinové molekuly je syntetizována jako nascentní polypeptidový řetězec nazývaný preproinsulin, jenž sestává ze signálního peptidu a proinsulinu. Signální peptid směruje nascentní řetězec skrz endoplasmatické retikulum. Proinsulin se tvoří z preproinsulinu v oblasti lumenu endoplasmatického retikula, když polypeptidový řetězec prochází membránou. Proinsulin zahrnuje polypeptidový řetězec obsahující 35 aminokyselin, jenž není přítomný v insulinu. Tento spojovací peptid neboli C-peptid spojuje karboxy- konec řetězce B s aminokoncem řetězce A budoucí molekuly insulinu. Z lumenu endoplasmatického retikula je proinsulin směrován ke Golgiho aparátu, kde začíná proteolysa spojovacího peptidu. Spojovací neboli C-peptid je odštěpen enzymovým systémem podobným systému trypsin / karboxypeptidasa B, jenž působí u sekvence dvou následujících basických aminokyselin, a tvoří se insulin (Steiner et al. , J. Cell Biol. 24, (1984). 121-130).
Význam C-peptidu spočívá v tom, že spojuje řetězce A a B tak, aby se umožnila správná tvorba disulfidových můstků v molekule insulinu (Bell et al., Nátuře 284, (1980) 26-32) nebo v tom, že řídí trypsinu podobný konvertující enzym ke zpracování proinsulinu v místě se dvěma basickými aminokyselinami (Thim et al., PNAS, 83 (1986) 6766-6770).
Produkce biosyntetického lidského insulinu byla zveřejněna hlavně v bakteriích Escherichia coli a Saccharomyces cerevisiae. Pro všechny je společné, že DNA sekvence kóduje buď celý proinsulin, modifikovanou část proinsulinu nebo zvlášt řetězce A a B.
V bakterii E. coli byl insulin prostřednictvím oddělených řetězců A a al., Diabetes Care 4 (1982) 147-154) nebo produkován buď B (Chance et jako proinsulin,
EP 55945.
V kvasinkách S. cerevisiae byl insulin produkován prostřednictvím proinsulinu, avšak s velmi nízkým výtěžkem, EP-A-121 884. Různé modifikace C-peptidu zlepšují výtěžek a správnou tvorbu insulinové molekuly v kvasinkách.
Insulinové prekursory vzorce B-X-A, kde B a A representují řetězce B a A a kde X representuje peptid obsahující od 2 do 35 aminokyselin, jsou popsány v DK-A-5284/87.
Insulinové prekursory vzorce B-X-Y-A, kde B a A representují řetězce B a A a kde X a Y každý representuje lysin nebo arginin jsou zveřejněny v EP-A-347 845.
V EP-A-163 529 jsou popsány insulinové prekursory obsahující peptidový řetězec B(1-29)-A(1-21) spojený s krátkým peptidem majícím 2 až 8 aminokyselin. Modifikace prekursorů des-B(30) insulinu se vzorcem B(1-29)-X1-X2-Y2-Y1~A(1-21) jsou popsány v EP-A-347 845.
V EP-A-249 350 jsou popsány glukoamylasový promotor a signální sekvence pro sekreci bílkovin v plísních jako hostiteli. Jako příklad byl exprimovaný trimer proinsulinu též zařazen do takovéhoto vektoru exprese.
Mnohé polypeptidy pro léčebné nebo diagnostické účele, např. erythropoietin, tPA a faktor VIII, byly N-glykosylovány (Parekh et al., TIBTECH 7 (1989) 117-121). Zde byl též popsán trojnásobně zvýšený výtěžek bovinního chymosinu (glykochymosinu) v plísni A. niger var. awamori dosažený zavedením N-glykosylačního konsensus místa do kódující sekvence. Fúzí prochymosinového a glukoamylasového genu byl dosažen ještě vyšší výtěžek, ale fúzí glykochymosinu ke glukoamylase nebylo dosaženo žádného dalšího zvýšení výtěžku (Berka et al., Biochem. Soc. Trans. 19 (1991) 681-685).
V případě aspartátové proteinasy (reninu), jež je mikrobiálního původu a slouží jako náhražka chymosinu, bylo pozorováno, že hyperglykosylace může snižovat enzymovou aktivitu, když nastává v kritickém místě molekuly (Berka et al., Biochem. Soc. Trans. 19 (1991) 681-685; Aikawa et al., J. Biol. Chem. 265 (1991) 13955-13959).
Mutace glykosylovaného asparaginu v kódující oblasti reninu vedla k významnému snížení sekrece v buňkách kvasinek (Aikawa et al., J. Biol. Chem. 265 (1991) 13955-13959).
Podstata vynálezu
Předmětem vynálezu jsou DNA sekvence kódující nové biosyntetické prekursory insulinu a použití eukaryotických buněk, zvláště buněk plísní, k preparaci insulinu.
Cíle se dosahuje sekvencí DNA zahrnující kódující sekvenci pro insulinový prekursor vzorce B-Pg-A, kde B a A representují řetězec B resp. řetězec A a kde Pg representuje modifikovaný C-peptid nebo jakýkoli počet aminokyselin obsahující přinejmenším jedno konsensus místo N-glykosylace.
řetězce Ba A signály proteolytického zpracování specifického chemického štěpení.
Výhodné je modifikovat proinsulinový gen vytvořením glykosylačního místa AsnXSer. Toho lze dosáhnout v sekvenci
Pg spojuje nebo místy
C-peptidu např. změnou kodonu GCC pro aminokyselinu Ala-C-20 na kodon AAC pro Asn.
Stejného principu lze použít u des-B(30)-proinsulinu.
Vynález je založen na zjištění, že výtěžek imunoreaktivního insulinu, měřený metodou RIA, je mnohem vyšší u transformantů obsahujících DNA sekvence vzorce B-Pg-A ve fúzi k chránící bílkovině než u transformantů obsahujících nemodifikované DNA sekvence proinsulinu ve fúzi k chránící bílkovině. Buňky transformované vektorem obsahujícím DNA sekvence proinsulinu bez fuze nebo proinsulinu modifikovaného N-glykosylačním konsensus místem bez fuze dávají velmi nízké nebo žádné výtěžky imunoreaktivního insulinu, měřené metodou RIA.
Zavedení N-glykosylačního konsensus místa do oblasti odstupu mezi řetězci [spacer}, jenž není součástí molekuly maturního insulinu, znamenitě zvyšuje expresi v buňkách plísní, jež jsou transformovány DNA sekvencemi kódujícími takovéto fúzované prekursory insulinu. Bílkovina fúzovaná s proinsulinem může být buď zpracována v hostitelském organismu samotném anebo odstraněna pozdějším enzymatickým nebo chemickým štěpením.
DNA sekvence kódující řečený modifikovaný prekursor insulinu může být připravena oligonukleotidovou syntézou celé DNA sekvence v kombinaci s PCR nebo in vitro mutagenesou. Kodony DNA sekvence mohou být též optimalizovány pro expresi ve vhodném organismu, s výhodu v kmeni plísně.
Vynález se též týká postupu přípravy insulinu kultivací vhodných buněk ve vhodném kultivačním médiu, s výhodou buněk plísní, transformovaných vektorem obsahujícím DNA sekvenci kódující insulinový prekursor vzorce B-Pg-A.
Exprese a sekrece peptidu shora uvedeného vzorce lze dosáhnout použitím vektoru, v němž je kódující sekvence regulována promotorem, signální sekvencí a terminátorem funkčním ve vhodném organismu. Mohou být jimi například Pgja^ a signální sekvence galA genu nebo jejich části, vhodné pro expresi v Aspergillus sp. (Cullen et al., Biotechnology, 5 (1987) 369-376). Exprese a sekrece tohoto peptidu lze též dosáhnout použitím vektoru exprese, v němž je DNA sekvence kódující insulinový prekursor shora uvedeného vzorce fúzovaná ke genu chránící bílkoviny prostřednictvím signálu pro zpracování (Ward et al., Biotechnology, 8 (1990) 435-440; Broekhuijsen et al.,
J. Biotech. 31 (1993) 135-145) nebo místa chemického štěpení.
Vynález se dále týká DNA sekvencí kódujících farmaceutické do nichž se pro vyšší expresi nebo N-glykosylační konsensus místo do jímž není peptidy nebo bílkoviny, sekreci proteinu zavádí neesenciálního místa jakékoli oblasti odstupu, kódována maturní bílkovina.
Stručný popis obrázků
Obr. 1 ukazuje nukleotidovou sekvenci jak přirozeného tak kodonové optimalizovaného proinsulinového genu a odpovídající aminokyselinovou sekvenci, s použitím konvenčních zkratek pro nukleotidy a aminokyseliny.
Obr. 2 popisuje dva typy kazet pro expresi lidského proinsulinového genu a schematicky ukazuje lidský proinsulinový gen a mutantní gen, obsahující N-glykosylační konsensus místo.
Obr. 3 vysvětluje strategii konstrukce lidského proinsulinového genu a mutantního genu, obsahujícího N-glykosylační konsensus místo pro dva typy kazet exprese prostřednictvím fragmentů syntetizovaných separátně pomocí překrývajících se oligonukleotidů v kombinaci s PCR.
Obr. 4 ukazuje 14 oligonukleotidů navržených pro syntézu lidského proinsulinového genu a mutantního genu, obsahujícího N-glykosylační konsensus místo.
Obr. 5 vysvětluje na příkladu syntézy fragmentu I nový přístup, jenž byl použit k syntéze lidského proinsulinového genu využitím překrývajících se, komplementárních oligonukleotidů v kombinaci s PCR.
Obr. 6 schematicky ukazuje syntézu fragmentu IV (oligonukleotidy jsou vyznačeny jen šipkami).
Obr. 7 schematicky ukazuje syntézu fragmentu II, fragmentu III a fragmentu V (oligonukleotidy jsou vyznačeny jen šipkami).
Obr. 8 ukazuje konstrukci plasmidů pPZG301, pPZG302, pPZG303, pPZG304, pPZG302.
Obr. 9 ukazuje konstrukci plasmidů pPZG311, pPZG302.
Obr. 10 ukazuje konstrukci vektoru exprese pro filamentární plísně a kazetu exprese typu I.
Obr. 11 ukazuje konstrukci vektoru exprese pro filamentární plísně a kazetu exprese typu II.
Obr. 12 ukazuje sekvenci u spojení GlaG2 genu glaA.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Syntéza lidského proinsulinového genu a mutantního genu, obsahujícího N-glykosylační konsensus místo pomocí překrývajících se oligonukleotidů v kombinaci s polymerasovou řetězovou reakcí (PCR).
a) Metody
Všechny pokusy v manipulaci DNA byly provedeny s použitím standardních metod, jak jsou popsány v Maniatis T., et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, U.S.A. (1982).
Všechny chemikálie, enzymy a plasmidy jsou dostupné z různých komerčních zdrojů, pokud se neuvádí jinak. Pufry a reakční podmínky pro digesce restrikčními endonukleasami se použily podle doporučení výrobců, pokud není vyznačeno jinak.
Chemická syntéza oligonukleotidů byla provedena na zakázku u fy. ISOGEN Bioscience, Amsterdam, Nizozemí. Vzorky DNA byly dodávány v lyofilizované formě jako sodné sole s volnými hydroxylovými skupinami na 5' a 3' konci. Takováto DNA byla rozpouštěna ve sterilní MQ H20. Koncentrace jednovláknových DNA oligonukleotidů byla stanovována měřením absorbance Α260· Vzorky rozpuštěných DNA oligonukleotidů byly skladovány při -20°C.
Polymerasová řetězová reakce, dále označována jako PCR, byla prováděna s přístrojem fy. Perkin Elmer Cetus (761 Main Ave., Norwalk CT 06859), soupravou GeneAmp™ DNA Amplification Reagent Kit a enzymem AmpliTaq™ Recombinant Taq DNA Polymerase. Koncentrované roztoky a reakční směsi byly připravovány podle Perkin Elmer Cetus Protocol for DNA Amplification jak je doporučováno výrobcem s tou výjimkou, že v reakční směsi nebyla žádná templátová DNA, ale jen oligonukleotidy v koncentraci 100 pmol na jednu reakci (100 μΐ). Profil teplotního cyklu pro každou PCR byl: Teplota tání 94°C / 1 min, teplota navázání oligonukleotidů [annealing] 40°C / 1 min (pro fragmenty I a IV) nebo 50°C / 1 min (pro fragmenty II, III a V), polymerizační teplota 72°C / 1 min. Cyklů bylo 25. Po posledním cyklu byla doba polymerizace prodloužena na 7 minut k dokončení polymerizace všech řetězců. Vzorek byl pak ochlazen na 4°C. Produkty PCR byly izolovány z reakční směsi dvěma kroky chloroformové extrakce. DNA pak byla sražena isopropanolem, vysušena ve vakuu a rozpuštěna v 50 μΐ TE pufru.
V pokusech s transformací a s amplifikací plasmidů byla použita bakterie E. coli K12 (Yanisch-Perron et al., Gene 21 (1985) 103-119).
Návrhy oligonukleotidů
Syntetický lidský proinsulinový gen byl odvozen z publikované sekvence lidského insulinového genu (Bell et al., Nátuře 284 (1980) 26-32). Mělo by být uvedeno, že když se gen syntetizuje, lze provádět určité modifikace: Je možné používat různé, ve většině případů preferované, kodony, zavádět dodatečné funkční DNA sekvence a restrikční místa k umožnění ligace do vektoru exprese, měnit jeden nebo více kodonů kódující oblasti k produkci strukturně modifikovaného polypeptidu s v podstatě stejnou aktivitou nebo použitím.
V předkládaném vynálezu byl syntetický lidský proinsulinový gen pro expresi v plísni modifikován. Byly použity kodony, jež jsou nejčastěji využívány v glukoamylasovém G 1 genu filamentární plísně A. niger, jenž je exprimován ve vysokém množství (Boel et al., EMBO J., 2 (1984) 1097-1102; Nunberg et al., Mol. Cell. Biol., 4_ (1984) 2306-2315); ve většině případů jsou stejné jako lidské kodony s výjimkou určitých oblastí, kde by se výběrem preferovaných kodonu stal oligonukleotid velice bohatým na CG nukleotidy, což by mohlo způsobovat problémy v sekvenování a možná dokonce v PCR. Proto byly některé, většinou Gly kodony, změněny z GGC na GGT, což je druhý preferovaný Gly kodon v glukoamylasovém genu filamentární plísně A. niger (Obr. 1).
K 5' konci syntetického proinsulinového genu byly zavedeny dodatečné DNA sekvence kódující buď 18 aminokyselin signálního peptidu glukoamylasového (GlaA) genu anebo 6 aminokyselin propeptidu genu GlaA, obsahující Lys-Arg místo proteolytického štěpení, aby bylo možno zkonstruovat dva typy kazet exprese. V prvním případě (I) byl syntetický lidský proinsulinový gen regulován glukoamylasovým promotorem (PgiaA^ a signální sekvencí (sSglaA) glukoamylasového genu, zatímco ve druhém případě (II) byl pod řízením PgiaA proinsulinový gen fúzován s úplným genem glaA filamentární plísně A. niger prostřednictvím odstupového peptidu, obsahujícího signál zpracování proteinu podobný KEX-2 (Obr. 2).
Připraven byl též mutant syntetického lidského proinsulinového genu nesoucí konsensus místo N-glykosylace pro studium vlivu na úroveň exprese a sekrece. Jelikož C-peptid není esenciální pro funkci insulinu, protože je odštěpen v procesu sekrece, mutace byla zavedena do kódující oblasti C-peptidu lidského proinsulinového genu (BCA). Mutant (BPgA) nesoucí konsensus místo N-glykosylace AsnXSer byl připraven změnou kodonu GCC pro aminokyselinu Ala-C20 na kodon AAC pro aminokyselinu Asn (Obr. 2).
Pro syntézu lidského proinsulinového genu byl zaveden nový přístup, v němž se použily překrývající se, komplementární oligonukleotidy v kombinaci s PCR. Principem metody bylo použít během PCR dva střední, překrývající se, komplementární oligonukleotidy současně jako templáty a primery a takto umožnit
Taq DNA polymerase zvětšit je, t.j. prodloužit je během prvního cyklu.
oligonukleotidy oligonukleotidy
Ve druhém překrýváj í a umožňují cyklu se takovéto zvětšené se sousedícími 3' nebo 5' tím Taq DNA polymerase dále zvětšovat již zvětšené střední oligonukleotidy. Takto Taq DNA polymerasa ve skutečnosti vyplňuje mezery mezi chemicky syntetizovanými, překrývajícími se nukleotidy a vytváří dvoušroubovíci DNA. Syntéza lidského proinsulinového genu a jeho mutantu obsahujícího konsensus místo N-glykosylace byla provedena ve fragmentech, jež byly separátně syntetizovány pomocí PCR. Štěpení genu na fragmenty bylo umožněno přítomností dvou štěpících míst pro restrikční enzym Pstl v kódující oblasti C-peptidu (Obr. 3). Bylo navrženo čtrnáct oligonukleotidů: Deset oligonukleotidů (B3, B4, B5, B6, Cl, C2, C3, Al, A2, a A3) bylo odvozeno z DNA sekvence kódující lidský proinsulin s kodony preferovanými pro expresi ve filamentární plísni A. niger, dva oligonukleotidy (B1 a B2) byly navrženy pro zavedení signální sekvence glaA genu a dodatečných restrikčních míst k umožnění ligace do vektoru exprese typu I, jeden oligonukleotid (B7) byl navržen pro zavedení oblasti odstupu sekvence glaA(G2) genu a dodatečných restrikčních míst k umožnění ligace do vektoru exprese typu II, a jeden oligonukleotid (C4) byl navržen k zavedení mutace nesoucí konsensus místo N-glykosylace (Obr. 4).
b) PCR syntéza fragmentů I - V
Fragmenty I a IV
Fragmenty I a IV byly V prvním kroku PCR byla reakce B4, a vedla k produktu B3/B4.
syntetizovány krok za krokem. provedena s oligonukleotidy B3 a V následujícím kroku byl 1 μΐ produktu B3/B4 smíchán v reakční směsi PCR s: a) oligonukleotidy B2 a B5 pro fragment I, a b) oligonukleotidy B7 a B5 pro fragment XV. Byly získány produkty B2/B3/B4/B5 a B7/B3/B4/B5. Ve třetím kroku byl 1 μΐ produktu B2/B3/B4/B5 použit pro PCR s oligonukleotidy B1 a B6 pro fragment I a 1 μΐ produktu B7/B3/B4/B5 byl smíchán v reakční směsi PCR s oligonukleotidy B7 a B6 pro fragment IV. Byly získány produkty B1/B2/B3/B4/B5/B6 a B7/B3/B4/B5/B6. Jejich velikosti odpovídaly očekávaným, a produkty byly digerovány příslušnými restrikčními enzymy na fragment I a na fragment IV (Obr. 5 a 6).
Fragmenty II, III a V
Fragmenty II, III a V byly syntetizovány v jednom kroku. PCR byla provedena s oligonukleotidy: a) Cl, C2, C3; b) Al, A2, A3; a c) C2, C4, C5. PCR produkty C1/C2/C3, A1/A2/A3 a C2/C4/C5 měly očekávanou velikost a byly digerovány příslušnými restrikčními enzymy na fragment II, na fragment III a na fragment V (Obr. 7).
Klonování PCR-syntetizovaných fragmentů do vektoru pUC19 a analýza sekvence DNA
Plasmid pUC19 byl digerován: a) Pstl, b) Pstl/EcoRI, a c) Pstl/Sall a ligován s patřičným fragmentem I-V za vzniku plasmidů pPZG301, pPZG302, pPZG303, pPZG304 a pPZG305 (Obr. 8). Těmito plasmidy byla transformována bakterie E. coli JM109. Ze získaných transformantů byla pDNA izolována mini-preparací a analyzována restrikčními enzymy. Transformanty E. coli obsahující správné plasmidy byly rozrůstány, jejich pDNA izolována pomocí kolony QIAGEN typ 20 a sekvenována pomocí soupravy SEQUENASER Version 2.0 kit. Vektory obsahující správně syntetizovanou a vloženou sekvenci byly použity pro další konstrukce.
PPZG311 a pPZG312
Vektory obsahující úplný lidský proinsulinový gen a mutantní gen s konsensus místem N-glykosylace se signální sekvencí glaA genu byly konstruovány jak následuje: pPZG311 byl konstruován ligací 173 bp EcoRI-Pstl fragmentu izolovaného z pPZG301, 75 bp Pstl-Pstl fragmentu izolovaného z pPZG302 a 74 bp Pstl-Sall fragmentu izolovaného z pPZG303 do EcoRI/SalI digerovaného pUC19 vektoru. pPZG312 byl konstruován ligací 173 bp EcoRI-Pstl fragmentu izolovaného z pPZG301, 75 bp Pstl-Pstl fragmentu izolovaného z pPZG305 a 74 bp Pstl-Sall fragmentu izolovaného z pPZG303 do EcoRI/SalI digerovaného pUC19 vektoru (Obr. 9).
Příklad 2
Konstrukce vektoru exprese pro filamentární plíseň
I. Kazeta exprese typu I pAN52-7NotBCA a pAN52-7NotBPgA pAN52-7NouiďA (Verdoes et al., Gene (1994) v tisku) byl digerován parciálně Ncol a Sáli. 7,55 kb Sall-Ncol fragment nesoucí promotor glaA a terminační oblast trpC genu byl izolován a ligován s 317 bp Ncol-Sall fragmentem plasmidu pPZG311 za vzniku plasmidu pAN52-7NotBCA a s 317 bp Ncol-Sall fragmentem plasmidu pPZG312 za vzniku plasmidu pAN52-7NotBPgA (Obr. 10).
pAN52-7BCAamdS a pAN52-7BPgAamdS
5,0 kb Notl fragment nesoucí gen acetamidasy (amdS) z A. nidulans byl zaligován do Notl místa plasmidů pAN52-7NotBCA a pAN52-7NotBPgA za vzniku plasmidů pAN52-7BCAamdS a pAN52-7BPgAamdS (Obr. 10).
I. Kazeta exprese typu II pAN56-7BCAamdS a pAN56-7BPgAamdS
Vektory pro fúzované bílkoviny glukoamylasa-proinsulin a glukoamylasa-proinsulinový mutant s konsensus místem N-glykosylace byly konstruovány jak následuje: Plasmid pPZG304 byl digerován EcoRV a AlwNI. Fragment EcoRV-AlwNI o 25 bp, nesoucí sekvenci šesti aminokyselin oblasti odstupu, byl ligován s 3,07 kb Sall-EcoRV fragmentem z pAN56-7 nesoucím glaA(G2) gen za vzniku fragmentu SalI-AlwNI. Vektor pAN56-7 byl získán z vektoru pAN56-4 (Broekhuijsen et al., J. Biotech. 31 (1993) 135-145), v němž byl gpdA promotor nahrazen 4,2 kb Notl-Ncol fragmentem z pAN52-7, nesoucím glaA promotor, a v něž byl odstraněn interleukinový gen odstraněn, s ponecháním EcoRV místa nahoru od GlaG2. Fragment AlwNI-SalI byl pak ligován s 10, 6 kb HindlII-SalI fragmentem z pABl-6S (Den Herder et al., Mol. Gen. Genet. 233 (1992) 404-410), jenž měl promotor glaA a gen amdS as a) 1,06 kb AlwNI-HindlII fragmentem z pAN52-7BCA za vzniku plasmidu pAN56-7BCAamdS a b) 1,06 kb AlwNI-HindlII fragmentem z pAN52-7BPgA za vzniku vektoru pAN56-7BPgAamdS (Obr. 11). V oblasti odstupu bylo dibazické místo zpracování Lys-Arg. Sekvence kolem míst fuze glukoamylasového genu s lidským proinsulinovým genem (BCA) a proinsulinovým mutantem (BPgA) pomocí oblasti odstupu je ukázána v Obr. 12.
Příklad 3
Transformace filamentární plísně Aspergillus niger
Transformace filamentární plísně Aspergillus niger byla provedena podle již popsaných metod (Goosen et al., Curr. Genet. 11 (1987) 499-503; Kelly a Hyneš, EMBO J. 4 (1985) 475-479; Van Hartingsvelt et al., Mol. Gen. Genet. 206 (1987) 71-75).
Filamentární plíseň Λ. niger N402 (Bos, C. J. et al., Curr. Genet. 14 (1988) 437-443) byla transformována vektory exprese pAN52-7BCAamdS, pAN52-7BPgAamdS, pAN56-7BCAamdS a pAN56-7BPgAamdS. Kolonie byly selektovány na kultivačním médiu s acetamidem nebo akrylamidem jako jedinými zdroji uhlíku a dusíku. Provedla se další analýza transformantů vycházející z jednotlivých spor.
Příklad 4
Sekrece lidského insulinu do kultivačního média
1. Kultivace transformantů A. niger nesoucích lidský proinsulinový gen a mutantní gen s konsensus místem N-glykosylace
Kolem 108 spor selektovaných transformantů bylo naočkováno do 500 ml Erlenmeyerových baněk obsahujících 100 ml tekutého kultivačního média obsahujícího: 70 mM NaN03, 7 mM KCl, 11 mM KH2PO4, 2 mM MgSO4, 4 % dextran, stopové prvky (1 : 1000; 76 mM ZnSO4, 178 mM H3BO3, 25 mM MnCl2, 18 mM FeSO4, 7,1 mM CoCl2, 6,4 mM CuSO4, 6,2 mM Na2Mo04, 174 mM EDTA) a vitaminy (1 : 1000; 100 mg/1 thiamin, 100 mg/1 riboflavin, 100 mg/1 nikotinamid, 50 mg/1 pyridoxin, 10 mg/1 kyselina panthotenová, 0,2 mg/ml biotin). Transformanty rostly při 32°C po 36 hodin. Vzorky byly analyzovány na přítomnost insulinu.
2. Exprese insulinu
Exprese imunoreaktivního lidského insulinu byla demonstrována soupravou Pharmacia INSULIN RIA 100 fy. Kabi Pharmacia Diagnostics. Vzorky transformantů kultivovaných fermentací byly filtrovány, filtráty neutralizovány, ředěny pokud to bylo potřebné a pak podrobeny stanovení RIA (radioimunotestu) (Livessy et al., Clin. Biochem. 13 (1980)
151-155). Hladina exprese imunoreaktivního lidského insulinu (mU/1) v A. niger je ukázána v Tabulce 1.
Tabulka 1
Hladina exprese imunoreaktivního lidského insulinu v různých transofrmantech A. niger-.
Transformant
Plasmid
Imunoreaktivní insulin (mU/1)
| A. | niger | 7650 | [NCAIM | (P) | F | 00215] | PAN52-7BCAamďS | 0 |
| A. | niger | 7651 | [NCAIM | (P) | F | 00216] | Ρ AN5 2-7 BPg AamdS | 2 |
| A. | niger | 7649 | [NCAIM | (P) | F | 00214] | PAN56-7BCAamdS | 56 |
| A. | niger | 7638 | [NCAIM | (P) | F | 00213] | PAN56-7BPgAamdS | 776 |
Transformanty A. niger 7650, A. niger 7651, A. niger 7649 a A. niger 7638 byly uloženy v Národní sbírce zemědělských a průmyslových mikroorganismů, H-1502 Budapest, P.O.B. 53,
Maďarsko dne 8. NCAIM (P) F 00215, a NCAIM (P) F 00213 července 1994 pod přístupovými čísly NCAIM (P) F 00216, NCAIM (P) F 00214, a v souladu s Budapešťskou dohodou o mezinárodním uznávání uložení mikroorganismů pro účele patentovacího postupu, Prohlášením v případě původního uložení, podle Pravidla 6.1.
Z Tabulky je zřejmé, že existuje značný rozdíl v expresi transformantů obsahujících různé vektory. Daleko nej lepší výsledky se ukazují u transformanta získaného transformací vektorem, jenž má lidský proinsulinový gen, nesoucí konsensus místo N-glykosylace, fúzovaný s glukoamylasovou bílkovinou.
Claims (13)
-
P A Τ Ε N T 0 V É N Á R 0 K Y 1. DNA sekvence v y z n ačující se tím, že obsahuje sekvenci kódující insulinové prekursory vzorce - B-Pg-A, kde B a A representují řetězec B respektive A lidského insulinu a kde Pg representuje modifikovaný - C-peptid nebo libovolný počet aminokyselin, zahrnující přinejmenším jedno konsensus místo N-glykosylace, a Pg spojuje řetězce Ba A prostřednictvím signálu proteolytického zpracování nebo místa chemického štěpení. - 2. DNA sekvence vyznačující se tím, že obsahuje sekvenci kódující insulinové prekursory vzorce B(29)-Pg-A, kde B(29) representuje B(l-29), A representuje řetězec A lidského insulinu a kde Pg representuje modifikovaný C-peptid nebo libovolný počet aminokyselin, zahrnující přinejmenším jedno konsensus místo N-glykosylace, a Pg spojuje řetězce B a A prostřednictvím signálu proteolytického zpracování nebo místa chemického štěpení.
- 3. DNA sekvence podle nároků 1 až 2 vyznačující se tím, že obsahuje kodony preferované pro expresi v určitém hostiteli.
- 4. DNA sekvence podle nároků 1 až 3 vyznačující se tím, že je fúzovaná s genem chránící bílkoviny prostřednictví oblasti odstupu, nesoucí signál proteolytického zpracování nebo místo chemického štěpení.
- 5. DNA sekvence vyznačující se tím, že obsahuje sekvenci kódující farmaceutický peptid nebo protein, jenž má zavedeno konsensus místo N-glykosylace v neesenciálním místě kterékoli oblasti odstupu.
- 6. Transformované buňky vyznačující se tím, ž e obsahují DNA sekvenci podle nároků 1 až 5.
- 7. Transformované buňky plísně vyznačující se tím, že obsahují DNA sekvenci podle nároků 1 až 5.
- 8. Transformované buňky plísně Aspergillus sp.vyznačující se tím, že obsahují DNA sekvenci podle nároků 1 až 5.
- 9. Transformované buňky vyznačující se tím, ž e obsahují segment DNA podle nároků 1 až 5.
- 10. Transformované buňky plísně vyznačující se tím, že obsahují segment DNA podle nároků 1 až 5.
- 11. Transformované buňky plísně Aspergillus sp.vyznačující se tím, že obsahují segment DNA podle nároků 1 až 5.
- 12. Postup pro přípravu insulinu vyznačující se kultivací vhodných buněk, s výhodou buněk plísně, transformovaných vektorem obsahujícím sekvenci DNA podle nároků 1 až 4.
- 13. Postup pro přípravu farmaceutických peptidů nebo proteinů vyznačující se kultivací vhodných buněk, s výhodou buněk plísně, transformovaných vektorem obsahujícím sekvenci DNA podle nároku 5.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| HR940432A HRP940432B1 (en) | 1994-08-05 | 1994-08-05 | Dna sequences encoding biosynthetic insulin precursors and process for preparation of insulin |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ199995A3 true CZ199995A3 (en) | 1996-02-14 |
Family
ID=10946142
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ951999A CZ199995A3 (en) | 1994-08-05 | 1995-08-03 | Dna sequence encoding novel insulin biosynthetic precursors and insulin preparation process |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0704527B1 (cs) |
| CN (1) | CN1126761A (cs) |
| AT (1) | ATE239791T1 (cs) |
| BG (1) | BG62336B1 (cs) |
| CA (1) | CA2155451A1 (cs) |
| CZ (1) | CZ199995A3 (cs) |
| DE (1) | DE69530647T2 (cs) |
| ES (1) | ES2198428T3 (cs) |
| HR (1) | HRP940432B1 (cs) |
| PL (1) | PL309882A1 (cs) |
| PT (1) | PT704527E (cs) |
| SI (1) | SI9500250A (cs) |
| SK (1) | SK97195A3 (cs) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB9513967D0 (en) * | 1995-07-08 | 1995-09-06 | Univ Leicester | Insulin |
| AU5504999A (en) * | 1998-07-20 | 2000-02-14 | Frenken, Leon Gerardus Joseph | Production of proteins |
| CA2356109C (en) | 1999-01-06 | 2008-04-22 | Genentech, Inc. | Insulin-like growth factor (igf) i mutant variants |
| JP3406244B2 (ja) * | 1999-04-30 | 2003-05-12 | 伊藤ハム株式会社 | 新規な融合蛋白質からの組み換えインスリンの製造方法 |
| DE19947456A1 (de) * | 1999-10-02 | 2001-04-05 | Aventis Pharma Gmbh | C-Peptid zur verbesserten Herstellung von Insulin und Insulinanaloga |
| DK1265630T3 (da) | 2000-03-24 | 2006-10-09 | Genentech Inc | Anvendelse af insulin til behandling af brusksygdomme |
| WO2002100887A2 (en) * | 2001-06-08 | 2002-12-19 | Novo Nordisk A/S | Method for making insulin precursors and insulin precursor analogs |
| US9074015B2 (en) * | 2010-07-28 | 2015-07-07 | Smartcells, Inc. | Recombinantly expressed insulin polypeptides and uses thereof |
| AR087433A1 (es) * | 2011-08-08 | 2014-03-26 | Merck Sharp & Dohme | Analogos de insulina n-glicosilados |
| WO2020071551A1 (ja) | 2018-10-05 | 2020-04-09 | 株式会社癌免疫研究所 | 良性腫瘍の予防または治療薬 |
Family Cites Families (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA1260858A (en) * | 1985-03-28 | 1989-09-26 | Lawrence S. Cousens | Expression using fused genes providing for protein product |
| FI872102L (fi) * | 1986-06-06 | 1987-12-07 | Panlabs Inc | Expressionssystem hos filamentala fungi. |
| CA1340772C (en) * | 1987-12-30 | 1999-09-28 | Patricia Tekamp-Olson | Expression and secretion of heterologous protiens in yeast employing truncated alpha-factor leader sequences |
| DK300090D0 (da) * | 1990-12-19 | 1990-12-19 | Novo Nordisk As | Fremgangsmaade til fremstilling af leadersekvenser |
| BR9400600A (pt) * | 1994-02-17 | 1995-10-24 | Finep Financiadora De Estudos | Processos para produção de uma protéina recombinante e/ou de glicosilfosfatidilinositol (GPI) em células de microorganismos eucariontes e para a obtenção de leveduras de S. cerevisae; célula de levedura sequência de nucleotídios; meio de cultura; medicamento ou vacina; e produto dos ditos processos |
-
1994
- 1994-08-05 HR HR940432A patent/HRP940432B1/xx not_active IP Right Cessation
-
1995
- 1995-08-01 SK SK971-95A patent/SK97195A3/sk unknown
- 1995-08-03 BG BG99844A patent/BG62336B1/bg unknown
- 1995-08-03 ES ES95112210T patent/ES2198428T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-08-03 PT PT95112210T patent/PT704527E/pt unknown
- 1995-08-03 CZ CZ951999A patent/CZ199995A3/cs unknown
- 1995-08-03 AT AT95112210T patent/ATE239791T1/de active
- 1995-08-03 EP EP95112210A patent/EP0704527B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-08-03 DE DE69530647T patent/DE69530647T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-08-04 PL PL95309882A patent/PL309882A1/xx unknown
- 1995-08-04 SI SI9500250A patent/SI9500250A/sl unknown
- 1995-08-04 CA CA002155451A patent/CA2155451A1/en not_active Abandoned
- 1995-08-04 CN CN95115064A patent/CN1126761A/zh active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CA2155451A1 (en) | 1996-02-06 |
| HRP940432B1 (en) | 2003-10-31 |
| PT704527E (pt) | 2003-09-30 |
| ES2198428T3 (es) | 2004-02-01 |
| EP0704527B1 (en) | 2003-05-07 |
| BG62336B1 (bg) | 1999-08-31 |
| DE69530647T2 (de) | 2004-03-11 |
| HRP940432A2 (en) | 1997-08-31 |
| SI9500250A (en) | 1996-02-29 |
| EP0704527A2 (en) | 1996-04-03 |
| SK97195A3 (en) | 1996-02-07 |
| EP0704527A3 (en) | 1997-08-27 |
| BG99844A (bg) | 1996-02-28 |
| ATE239791T1 (de) | 2003-05-15 |
| CN1126761A (zh) | 1996-07-17 |
| PL309882A1 (en) | 1996-02-19 |
| DE69530647D1 (de) | 2003-06-12 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP3017962B2 (ja) | ヘマトクリット値を上昇させるための医薬組成物の製造方法 | |
| US4661454A (en) | GAL1 yeast promoter linked to non galactokinase gene | |
| JP3577311B2 (ja) | インスリン様成長因子結合タンパク質の製造 | |
| CA1340772C (en) | Expression and secretion of heterologous protiens in yeast employing truncated alpha-factor leader sequences | |
| EP0228449B1 (en) | Fibroblast growth factor | |
| JP5503968B2 (ja) | 成熟インスリンポリペプチドの作製方法 | |
| JP2634193B2 (ja) | ヒトプロアポリポタンパク質a−1の発現 | |
| US7166446B2 (en) | Method for expression of heterologous proteins in yeast | |
| JP4597668B2 (ja) | 遺伝子およびポリペプチド配列 | |
| JPH0217156B2 (cs) | ||
| CN105308067B (zh) | 制备成熟胰岛素多肽的方法 | |
| JP2001512684A (ja) | 新規のpichiapastoris遺伝子配列およびそれらの使用方法 | |
| ES2198428T3 (es) | Secuencias de adn codificantes de precursores de insulina biosinteticos y procedimiento para la preparacion de insulina. | |
| US6861237B2 (en) | Production of heterologous polypeptides in yeast | |
| KR20010020482A (ko) | 개량된 단백질 발현균주 | |
| EP0409098B1 (en) | The expression and secretion of mature human beta interleukin-1 in bacillus subtilis and means and methods for its achievement | |
| CN101243190B (zh) | 制备成熟胰岛素多肽的方法 | |
| EP1211314A2 (en) | Expression of a human insulin precursor in p. pastoris | |
| JP2002538757A (ja) | 食欲制御活性を有するポリペプチド | |
| CN115947864A (zh) | 一种融合蛋白、生长激素及其制备方法 | |
| HUT72848A (en) | Dna sequences encoding novel biosynthetic insulin precursors and process for preparation of insulin | |
| US7638618B2 (en) | Nucleic acids encoding a hirudin and pro-insulin as superscretable peptides and for parallel improvement of the exported forms of one or more polypeptides of interest | |
| KR100284036B1 (ko) | 재조합 인간 형질전환 성장인자-베타 유전자, 그의 발현벡터 및 인간 형질전환 성장인자-베타의 제조방법 | |
| BG60508B2 (bg) | Днк последователности кодиращи еритропоетин | |
| HU210608A9 (hu) | Inzulinszerű növekedési faktort kötő protein, valamint a proteint tartalmazó gyógyszerkészítmények Az átmeneti oltalom az 1-7. igénypontokra vonatkozik. |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |