ES2216010T3 - Biosintesis de riboflavina en hongos. - Google Patents
Biosintesis de riboflavina en hongos.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION TRATA DE LOS GENES PARA LA BIOSINTESIS DE LA RIBOFLAVINA EN EL HONGO ASHBYA GOSSYPII ASI COMO DEL PROCEDIMIETNO DE INGENIERIA GENETICA PARA LA OBTENCION DE RIBOFLAVINA UTILIZANDO ESTOS GENES Y PRODUCTOS GENETICOS.
Description
Biosíntesis de riboflavina en hongos.
La presente invención se refiere a los genes para
la biosíntesis de riboflavina en hongos, a las proteínas
codificadas por ellos, así como a los procedimientos
genético-técnicos para la producción de riboflavina
utilizando estos genes y productos genéticos.
Se conoce la producción de riboflavina por medio
de la fermentación de hongos, tales como Eremothecium
ashbyii o Ashbya gossypii (The Merck Index, Windholz
et al., editoriales Merck & Co., página 1183, 1983).
En el documento EP 405370 se describen cepas de
bacterias superproductoras de riboflavina, que se obtuvieron por
transformación de los genes de biosíntesis de riboflavina de
Bacillus subtilis
Puesto que la genética de la biosíntesis de
riboflavina es diferente en bacterias y eucariotas, los genes
mencionados anteriormente de Bacillus subtilis no son
adecuados para un procedimiento recombinante de producción de
riboflavina con organismos de producción eucariotas, tales como
Ashbya gossypii.
En una solicitud de patente presentada el
19.11.1992 en la Oficina Alemana de Patentes, se describe la
clonación de los genes de biosíntesis de riboflavina de la levadura
Saccharomyces cerevisiae.
Sin embargo, no se logró la clonación de los
genes de biosíntesis de riboflavina de Ashbya gossypii
utilizando los genes RIB de S. cerevisiae, con métodos
habituales de hibridación; evidentemente, la homología de los genes
RIB de S. cerevisiae y A. gossypii no era lo
suficientemente grande para una hibridación.
Por tanto se planteó la tarea de aislar los genes
de biosíntesis de riboflavina de un eucariota, para proporcionar un
procedimiento recombinante de producción de riboflavina en un
organismo eucariota de producción.
De manera correspondiente, se encontraron y
aislaron en el ascomiceto Ashbya gossypii seis genes (genes
rib), que codifican para las enzimas de la biosíntesis de
riboflavina partiendo de GTP.
La invención se refiere a las siguientes
secuencias de ADN:
Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 2, o un análogo o un derivado del polipéptido según SEQ ID NO:
2, con lo que uno o varios aminoácidos han sido delecionados,
adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin reducir
esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la condición
de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del polipéptido
sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO: 1.
Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 4, o un análogo o un derivado del polipéptido según SEQ ID NO:
4, con lo que uno o varios aminoácidos han sido delecionados,
adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin reducir
esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la condición
de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del polipéptido
sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO: 3.
Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 6, o un análogo o un derivado del polipéptido según SEQ ID NO:
6, con lo que uno o varios aminoácidos han sido delecionados,
adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin reducir
esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la condición
de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del polipéptido
sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO: 5.
Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 8, o un análogo o un derivado del polipéptido según SEQ ID NO:
8, con lo que uno o varios aminoácidos han sido delecionados,
adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin reducir
esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la condición
de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del polipéptido
sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO: 7.
Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 10, o un análogo o un derivado del polipéptido según SEQ ID NO:
10, con lo que uno o varios aminoácidos han sido delecionados,
adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin reducir
esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la condición
de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del polipéptido
sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO: 9.
Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 12, o un análogo o un derivado del polipéptido según SEQ ID NO:
12, con lo que uno o varios aminoácidos han sido delecionados,
adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin reducir
esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la condición
de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del polipéptido
sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO: 11.
Los genes y sus productos genéticos
(polipéptidos) están representados en el protocolo de secuencias
con su estructura primaria y tienen las siguientes
asignaciones:
SEQ ID NO: 1 : gen rib1
SEQ ID NO: 2 : producto del gen rib1 (GTP
ciclohidrolasa II)
SEQ ID NO: 3 : gen rib2
SEQ ID NO: 4 : producto del gen rib2 (DRAP
desaminasa)
SEQ ID NO: 5 : gen rib3
SEQ ID NO: 6 : producto del gen rib3 (DBP
sintasa)
SEQ ID NO: 7 : gen rib4
SEQ ID NO: 8 : producto del gen rib4 (DMRL
sintasa)
SEQ ID NO: 9 : gen rib5
SEQ ID NO: 10 : producto del gen rib5
(riboflavina sintasa)
SEQ ID NO: 11 : gen rib7
SEQ ID NO: 12 : producto del gen rib7 (HTP
reductasa)
La guanosina trifosfato (GTP) se transforma por
medio de la GTP ciclohidrolasa II (producto del gen rib1) para dar
2,5-diamino-6-ribosilamino-4-(3H)-pirimidinon-5-fosfato.
Este compuesto se reduce a continuación por medio del producto del
gen rib7 para dar
2,5-diamino-ribitilamino-2,4
(1H,3H)-pirimidin-5-fosfato
y después se desamina por medio del producto del gen rib2 para dar
5-amino-6-ribitilamino-2,4
(1H,3H)-pirimidindiona. A continuación, en una
reacción catalizada por el producto del gen rib4 se adiciona el
compuesto C4, DBP, y se forma
6,7-dimetil-8-ribitillumazina
(DMRL), a partir de la cual se forma riboflavina en la reacción
catalizada por el producto del gen rib5. El compuesto C4, DBP
(L-3,4-dihidroxi-2-butanon-4-fosfato),
se forma a partir de
D-ribulosa-5-fosfato
en una reacción catalizada por el producto del gen rib3.
Las secuencias de ADN descritas en SEQ ID NO: 1,
3, 5, 7, 9, 11, codifican para los polipéptidos descritos en SEQ ID
NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12.
Además de las secuencias de ADN mencionadas en el
protocolo de secuencias, también son adecuadas aquellas que tienen
otra secuencia de ADN a causa de la degeneración del código
genético, pero que, sin embargo, codifican para los mismos
polipéptidos.
Además, también son objeto de la invención
aquellas secuencias de ADN que codifican para un producto genético
(polipéptido) con otra estructura primaria que la representada en
el protocolo de secuencias, siempre que el producto genético
presente esencialmente las mismas propiedades biológicas que el
producto genético mencionado en el protocolo de secuencias. Por
propiedades biológicas se entienden, ante todo, las actividades
enzimáticas que provocan la biosíntesis de riboflavina.
Dichos productos genéticos modificados, con
esencialmente las mismas propiedades biológicas, pueden obtenerse
por deleción o adición de uno o varios aminoácidos o péptidos o por
intercambio de aminoácidos por otros aminoácidos o pueden aislarse
a partir de otros organismos distintos de Ashbya
gossypii.
Generalmente, las secuencias de ADN que codifican
para los productos genéticos modificados son homólogas en un 80 o
más por ciento con las secuencias de ADN según el protocolo de
secuencias. Dichas secuencias de ADN pueden aislarse de otros
eucariotas distintos de Ashbya gossypii, partiendo de las
secuencias de ADN descritas en SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, con
procedimientos de hibridación habituales o con la técnica PCR.
Estas secuencias de ADN se hibridan en condiciones estándar con las
secuencias de ADN descritas en SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11.
Por condiciones estándar se entienden, por
ejemplo, temperaturas de entre 42 y 58ºC, en una solución tampón
acuosa con una concentración de entre 0,1 y 1 x SSC (1 x SSC: NaCl
0,15 M, citrato de sodio 15 mM pH 7,2). Las condiciones
experimentales para la hibridación de ADN están descritas en los
libros de texto de la ingeniería genética, por ejemplo, en Sambrook
et al., "Moleuclar Cloning", Cold Spring Harbor
Laboratory, 1989.
Otro objeto de la invención son las secuencias de
regulación, especialmente secuencias de promotores, que, en
dirección 5', se encuentran antes de las secuencias de ADN que
codifican para los polipéptidos correspondientes. Las secuencias de
regulación están representadas en el protocolo de secuencias y se
explican detalladamente a continuación.
Secuencia de regulación para el gen rib1:
SEQ ID NO: 1 Nucleótido 1-242
Secuencia de regulación para el gen rib2:
SEQ ID NO: 3 Nucleótido 1-450
Secuencia de regulación para el gen rib3:
SEQ ID NO: 5 Nucleótido 1-314
Secuencia de regulación para el gen rib4:
SEQ ID NO: 7 Nucleótido 1-270
Secuencia de regulación para el gen rib5:
SEQ ID NO: 9 Nucleótido 1-524
Secuencia de regulación para el gen rib7:
SEQ ID NO: 11 Nucleótido
1-352
Las secuencias de regulación pueden acortarse
también en dirección 5' y/o 3', sin que su función disminuya
esencialmente.
Generalmente, para el efecto de regulación son
esenciales fragmentos de 30 a 100, preferiblemente de 40 a 70
nucleótidos, de las zonas de secuencia indicadas anteriormente.
Estas secuencias de regulación también pueden
optimarse en su función por medio de la mutagénesis dirigida en
comparación con las secuencias naturales.
Las secuencias de regulación según la invención
son adecuadas para la sobreexpresión de los genes en Ashbya,
especialmente de los genes que son responsables de la biosíntesis
de riboflavina.
Además, son objeto de la invención los vectores
de expresión que contienen una o varias secuencias de ADN según la
invención. Dichos vectores de expresión se obtienen dotando a las
secuencias de ADN según la invención de señales funcionales
adecuadas de regulación. Dichas señales de regulación son secuencias
de ADN que son responsables de la expresión, por ejemplo,
promotores, operadores, potenciadores, puntos de unión ribosomales,
y que son reconocidos y manejados por el organismo huésped.
Dado el caso, otras señales de regulación, que
controlan, por ejemplo, la replicación o recombinación del ADN
recombinante en el organismo huésped, pueden ser componentes del
vector de expresión.
También pertenecen al objeto de la invención los
organismos huésped transformados con las secuencias de ADN o los
vectores de expresión según la invención. Preferiblemente se
emplean como organismos huésped los organismos eucariotas,
prefiriéndose especialmente aquellos de los géneros
Saccharomyces, Candida, Pichia,
Eremothecium o Ashbya. Las especies especialmente
preferidas son Saccharomyces cerevisiae, Candida
flaveri, Candida famata, Eremothecium ashbyii y
Ashbya gossypii.
Además pertenece a la invención un procedimiento
recombinante de producción de riboflavina, en el que los organismos
huésped según la invención se cultivan de manera conocida por
fermentación y la riboflavina formada durante la fermentación se
aísla del medio de fermentación y, dado el caso, se purifica.
Los genes rib y los productos de los genes rib
pueden aislarse y caracterizarse como se describe en el ejemplo y
en el protocolo de secuencias.
Se extrajo todo el ARN del micelio de la cepa
superproductora de riboflavina Ashbya gossypii ATCC 10195,
después del cultivo sobre medio YEPD (Sherman et al.,
"Methods in yeast genetics", Cold Spring Harbor, Nueva York,
1989), en la fase logarítmica tardía de crecimiento.
El Poli (A)^{+} ARN se purificó
realizando dos veces una adsorción y elución en oligo
(dT)-celulosa (Aviv y Leder, Proc. Natl. Acad. Sci.
EE.UU. 69, 1972, 1408-1412). El ADNc se aisló según
el método general de Gubler y Hoffmann (Gene 25, 1983, 263) y se
adicionaron adaptadores EcoRI sintéticos en los extremos de las
moléculas romas (blunt end) de ADNc. A continuación, los fragmentos
de ADNc recortados por EcoRI se fosforilaron mediante T4
polinucleótido quinasa y se clonaron en el vector pYEura3
desfosforilado, cortado por EcoRI, (figura 1). pYEura3 (Clonetech
Laboratories, Inc., California) es un vector de expresión de la
levadura, que contiene los promotores GAL1 y GAL10, que pueden
inducirse con galactosa, y URA, CEN4 y ARS1. Estos elementos de la
levadura permiten la transformación y expresión de los fragmentos
de ADN clonados en las células de levadura.
Se utilizaron porciones alícuotas de la reacción
de ligación, para transformar el E. coli
XL1-Blue (Bullock et al., Biotechniques 5
(1987) 376- 378) altamente competente (Hanahan, DNA Cloning, ed.
D.M. Glover; IRL Press, Oxford 1985, 109) y los transformantes se
seleccionaron basándose en su resistencia a la ampicilina.
Se unieron y amplificaron aproximadamente 3 x
10^{5} células resistentes a la ampicilina y, a partir de ello,
se aisló ADN de plásmido (Birnboim y Doly, Nucleic Acids Res. 7,
1979, 1513).
Se aislaron clones de ADNc de Ashbya
gossypii que codifican para enzimas de producción de
riboflavina, por medio de la complementación funcional de mutantes
de Saccharomyces cerevisiae que están implicados en la
biosíntesis de riboflavina.
Las cepas AJ88 (Mata leu2 his3 rib1::URA3
ura3-52), AJ115 (Mata1pha leu2 inos1 rib2::URA3
ura3-52), AJ71 (Mata1pha leu2 inos1 rib3::URA3
ura3-52), AJ106 (Mata1pha leu2 inos1 rib4::URA3
ura3-52), AJ66 (Mata canR inos1 rib5::URA3
ura3-52) y AJ121 (Mata1pha leu2 inos1 rib7::URA3
ura3-52) son cepas mutadas, que se obtienen por
destrucción de uno de los seis genes (RIB1 a RIB5 y RIB7), que
están implicados en la biosíntesis de riboflavina con
Saccharomyces cerevisiae.
Estas cepas se transformaron en cada caso con 25
\mug de ADNc del banco de ADNc de Ashbya gossypii y se
prepararon cultivos en placas sobre un medio consistente con
galactosa sin riboflavina. Después de aproximadamente una semana de
crecimiento se aislaron los transformantes Rib+ de las placas de
cultivo.
Se analizó en cada caso un transformante de cada
mutante transformado (Rib1+, Rib2+, Rib3+, Rib4+, Rib5+ y Rib7+) y
en todos los casos se halló que el fenotipo Rib+ únicamente se
expresó en el medio de galactosa pero, sin embargo, no se expresó
en el medio de glucosa.
Estos resultados prueban que el fenotipo Rib+ se
expresó bajo el control del promotor GAL10 contenido en el
plásmido, que puede inducirse con galactosa.
Se aisló ADN de los plásmidos de los
transformantes Rib1+, Rib2+, Rib3+, Rib4+, Rib5+ y Rib7+ por
transformación de E. coli y se denominaron pJR715, pJR669,
pJR788, pJR733, pJR681 y pJR827.
La secuenciación parcial de las inserciones de
ADNc contenidas en estos plásmidos confirmó que codifican para
proteínas que son análogas a las proteínas de los productos de los
genes rib de Saccharomyces.
Para aislar las copias genómicas de los genes de
producción de riboflavina de Ashbya gossypii se creó un
banco genómico de Ashbya gossypii ATCC 10195 en el cósmido
superCos1 (Stratagene Cloning Systems, California) y se detectó con
muestras marcadas con ^{32}P, derivadas de las copias de ADNc de
los genes RIB1, RIB2, RIB3, RIB4, RIB5 y RIB7 de Ashbya
gossypii.
Se aislaron los clones del cósmido con ADN de
RIB1, RIB2, RIB3, RIB4, RIB5 y RIB7 por medio de hibridación de
colonias (Grunstein y Hogness, Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU. 72,
1975, 3961-3965). Otro análisis de ADN del cósmido
desdoblado enzimáticamente, mediante la técnica de Southern,
utilizando las mismas muestras de ADNc, específicas en cuanto al
RIB, permitió la identificación de fragmentos definidos de
restricción, que contenían los genes RIB1, RIB2, RIB3, RIB4, RIB5 y
RIB7 de Ashbya gossypii.
Se encontró un fragmento de ADN de
BamHI-ClaI de 3,1 kb de largo, que contenía el gen
RIB1 completo de Ashbya gossypii, que codifica para la GTP
ciclohidrolasa II. Este fragmento se aisló de un gel de agarosa y se
clonó en el fagomidio pBluescript KS (+) (Stratagene Cloning
Systems) cortado por BamHI y ClaI y, de esta manera, proporcionó el
plásmido pJR765 (figura 2).
Se obtuvo una secuencia de ADN de 1329 pb de
largo (SEQ ID NO:1), que contenía el marco de lectura abierto de
RIB1 de 906 pb, 242 pb de la región no codificadora 5' y 181 pb de
la región no codificadora 3'.
Todo el gen RIB2 de Ashbya gossypii, que
codifica para la DRAP desaminasa, se encontró en un fragmento
EcoRI-PstI de 3,0 kb de largo, que, clonado en
pBluescript KS (+), dio como resultado el plásmido PJR758 (figura
3).
Una región de 2627 pb de largo de la inserción
EcoRI-PstI con el marco de lectura abierto de RIB2
de 1830 pb, 450 pb de la región 5' no traducida y 347 pb de la
región 3' no traducida, se secuenció (SEQ ID NO:3).
El gen completo RIB3 de Ashbya gossypii,
que codifica para la DNP sintasa, se encontró en un fragmento
PstI-HindIII de 1,5 kb de largo, que, clonado en
pBluescript KS (+), dio como resultado el plásmido PJR790 (figura
4).
Una región de 1082 pb de largo de la inserción
PstI-HindIII con el marco de lectura abierto de
RIB3 con 639 pb, 314 pb de la región 5' no traducida y 129 pb de la
región 3' no traducida, se secuenció (SEQ ID NO:5).
El gen RIB4 de Ashbya gossypii, que
codifica para la DMRL sintasa, se encontró en un fragmento
PstI-PstI de 3,2 kb de largo, que, clonado en
pBluescript KS (+), dio como resultado el plásmido PJR762 (figura
5).
Una región de 996 pb de largo de la inserción
PstI-PstI con el marco de lectura abierto de RIB4
con 519 pb, 270 pb de la región 5' no traducida y 207 pb de la
región 3' no traducida, se secuenció (SEQ ID NO:7).
El gen completo RIB5 de Ashbya gossypii,
que codifica para la riboflavina sintasa, se encontró en un
fragmento PstI-PstI de 2,5 kb de largo, que, clonado
en pBluescript KS (+), dio como resultado el plásmido PJR739
(figura 6).
Una región de 1511 pb de largo de la inserción
PstI-PstI con el marco de lectura abierto de RIB5
con 708 pb, 524 pb de la región 5' no traducida y 279 pb de la
región 3' no traducida, se secuenció (SEQ ID NO:9).
Finalmente, el gen RIB7 de Ashbya
gossypii, que codifica para la HTP reductasa, se encontró en un
fragmento EcoRI-EcoRI de 4,1 kb de largo, que,
clonado en pBluescript KS (+), dio como resultado el plásmido PJR845
(figura 7).
Una región de 1596 pb de largo de la inserción
EcoRI-EcoRI con el marco de lectura abierto de RIB7
con 741 pb, 352 pb de la región 5' no traducida y 503 pb de la
región 3' no traducida, se secuenció (SEQ ID NO:11).
Para identificar los transcritos específicos en
cuanto a RIB se realizaron análisis Northern. Se aisló el ARN
completo de la cepa Ashbya gossypii ATCC 10195, como se
describió en el ejemplo 1. Las muestras de ARN de la cepa (5
\mug) se separaron mediante electroforesis sobre geles al 0,8% de
agarosa-formaldehído, junto con marcadores de tamaño
de ARN, y se transfirieron, a vacío, a membranas de nylon (Thomas,
Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 77, 1980,
5201-5205).
Las membranas de nylon se hibridaron
independientemente unas de la otras con muestras de ADN específicas
en cuanto a RIB, marcadas con ^{32}P, a 42ºC en 5xSSC y en
presencia de un 50% de formamida. El gen RIB1 de Ashbya
gossypii se expresa como unique message de aproximadamente 1150
nucleótidos, lo que se detectó en las dos cepas por medio de una
muestra SmaI-SacI de 0,7 kpb de largo del plásmido
pJR765 (figura 8).
De manera análoga, los transcritos unique de RIB2
de 1900 nucleótidos de largo, de RIB3 de 900 nucleótidos de largo,
de RIB4 de 800 nucleótidos de largo, de RIB5 de 1050 nucleótidos de
largo y de RIB7 de 1000 nucleótidos de largo se detectaron en las
manchas con ayuda de un fragmento SmaI-SmaI de
pJR758 de 0,5 kpb de largo, un fragmento
HindIII-KpnI de pJR790 de 0,6 kpb de largo, un
fragmento ScaI-HindIII de pJR739 de 0,5 kpb de largo
y un fragmento PstI-PstI de pJR845 de 0,3 kpb de
largo, como muestra específica.
Como se ha descrito en el ejemplo 1, los mutantes
bien estudiados de Saccharomyces cerevisiae, que tienen un
defecto en una etapa de la biosíntesis de riboflavina, pueden
crecer sobre un medio de cultivo sin riboflavina si llevan un
plásmido que codifica para las enzimas complementarias de
Ashbya. Para comprobar la función de los productos de los
genes RIB de Ashbya gossypii se midieron las actividades
enzimáticas de producción de flavina en extractos sin células de
mutantes de S. cerevisiae que llevaban uno de los plásmidos
de expresión pJR715, pJR669, pJR788, pJR733, pJR681 y pJR827.
Estos plásmidos derivados de pYEura3, descritos
en el ejemplo 1, contienen fragmentos de ADNc específico en cuanto
a RIB de Ashbya gossypii bajo el control del promotor GAL10,
que puede inducirse con galactosa.
Se obtuvieron extractos de proteínas de
Saccharomyces cerevisiae sin células a partir de cultivos
que habían crecido en medio líquido hasta una densidad óptica de
aproximadamente 2 OD.
Se recogieron las células, se lavaron con Tris
HCl frío 20 mM, pH 7,5 y se resuspendieron en el mismo tampón, que
estaba suplementado con fluoruro de feniletilsulfonilo 1 mM.
Los lisados de células se produjeron mediante
tratamiento en un vortex en presencia de bolas de vidrio y
centrifugación a 3000 g durante 20 minutos a 4ºC.
Se determinaron las actividades enzimáticas de
GTP ciclohidrolasa II, DRAP desaminasa, DBP sintasa, DMRL sintasa,
riboflavina sintasa y HTP reductasa tal como se describe en la
bibliografía (Shavlovsky et al., Arch. Microbiol. 124, 1980,
255-259; Richter et al., J. Baceriol. 175,
1993, 4045-4051; Klein y Bacher, Z. Naturforsch.
35b, 1980, 482-484; Richter et al., J.
Bacteriol. 174, 1992, 4050-4056; Nielsen et
al., Biol. Chem. 261, 1986, 3661; Plaut y Harvey, Methods
Enzymol. 18B, 1971, 515-538; Hollander y Brown,
Biochem. Biophys. Res. Commun. 89, 1979, 759-763;
Shavlovski et al., Biochim. Biophys. Acta, 428, 1976,
611-618).
La proteína se cuantificó según el método de
Peterson (Anal. Biochem. 83, 1977, 346-356). Como
muestra la tabla 1, el plásmido pJR715 provoca la expresión de la
actividad de la GTP ciclohidrolasa II en el mutante AJ88 de S.
cerevisiae. Además, esta actividad únicamente está presente en
células que han crecido en un medio de galactosa, lo que indica que
la expresión de ADNc RIB1 de Ashbya gossypii tiene lugar
bajo el control del promotor GAL10, que puede inducirse con
galactosa.
Por tanto, estos resultados prueban que RIB1
codifica para la GTP ciclohidrolasa II en Ashbya gossypii.
De manera análoga se ha mostrado que RIB2 codifica para la DRAP
desaminasa, RIB3 para la DBP sintasa, RIB4 para la DMRL sintasa,
RIB5 para la riboflavina sintasa y RIB7 para la HTP reductasa en
este hongo.
(1) Información general:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Registrante:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre: BASF Aktiengesellschaft
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Calle: Carl-Bosch-Strasse 38
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Lugar: Ludwigshafen
\vskip0.333000\baselineskip
- (E)
- País: República Federal de Alemania
\vskip0.333000\baselineskip
- (F)
- Código postal: D-67056
\vskip0.333000\baselineskip
- (G)
- Teléfono: 0621/6048526
\vskip0.333000\baselineskip
- (H)
- Telefax: 0621/6043123
\vskip0.333000\baselineskip
- (I)
- Telex: 1762175170
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Título del registro: Biosíntesis de riboflavina en hongos
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Número de secuencias: 12
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- Formato de lectura por ordenador:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Soporte de datos: disquete
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Ordenador: compatible con IBM PC
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Sistema operativo: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Software: PatentIn Release #1.0, versión #1.25 (EPA)
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 1329 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Forma de la cadena: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: ADNc a ARNm
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Hipotético: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Antisentido: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- Procedencia originaria:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Organismo: Ashbya gossypii
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 5'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1..242
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 243..1148
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 3'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1149..1329
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 1:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 301 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 2627 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Forma de la cadena: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: ADNc a ARNm
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Hipotético: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Antisentido: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- Procedencia original:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Organismo: Ashbya gossypii
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 5'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1..450
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 451..2280
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 3'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 2281..2627
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 609 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 1082 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Forma de la cadena: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: ADNc a ARNm
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Hipotético: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Antisentido: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- Procedencia original:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Organismo: Ashbya gossypii
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 5'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1..314
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 315..953
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 3'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 954..1082
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 212 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 7:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 996 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Forma de la cadena: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: ADNc a ARNm
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Hipotético: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Antisentido: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- Procedencia original:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Organismo: Ashbya gossypii
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 5'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1..270
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 271..789
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 3'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 790..996
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 7:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 172 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 9:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 1511 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Forma de la cadena: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: ADNc a ARNm
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Hipotético: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Antisentido: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- Procedencia original:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Organismo: Ashbya gossypii
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 5'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1..524
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 525..1232
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 3'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1233..1511
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 9:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 235 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 11:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 1596 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- Forma de la cadena: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: ADNc a ARNm
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Hipotético: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- Antisentido: no
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- Procedencia original:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Organismo: Ashbya gossypii
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 5'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1..352
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 353..1093
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- Características:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Código: 3'UTR
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Posición: 1094..1596
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 11:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) Información sobre SEQ ID NO: 12:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- Características de la secuencia:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- Largo: 246 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- Tipo de molécula: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID NO: 12:
Claims (9)
1. Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 2 (GTP ciclohidrolasa II) o para un análogo o derivado del
polipéptido según SEQ ID NO: 2, en la que uno o varios aminoácidos
han sido delecionados, adicionados o sustituidos por otros
aminoácidos, sin reducir esencialmente el efecto enzimático del
polipéptido, con la condición de que las secuencias de ADN del
análogo o derivado del polipéptido sean al menos en un 80%
homólogas respecto a SEQ ID NO: 1.
2. Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 4 (DRAP desaminasa), o un análogo o un derivado del polipéptido
según SEQ ID NO: 4, en la que uno o varios aminoácidos han sido
delecionados, adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin
reducir esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la
condición de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del
polipéptido sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO:
3.
3. Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 6 (DBP sintasa), o un análogo o un derivado del polipéptido
según SEQ ID NO: 6, en la que uno o varios aminoácidos han sido
delecionados, adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin
reducir esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la
condición de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del
polipéptido sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO:
5.
4. Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 8 (DMRL sintasa), o un análogo o un derivado del polipéptido
según SEQ ID NO: 8, en la que uno o varios aminoácidos han sido
delecionados, adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin
reducir esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la
condición de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del
polipéptido sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO:
7.
5. Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 10 (riboflavina sintasa), o un análogo o un derivado del
polipéptido según SEQ ID NO: 10, en la que uno o varios aminoácidos
han sido delecionados, adicionados o sustituidos por otros
aminoácidos, sin reducir esencialmente el efecto enzimático del
polipéptido, con la condición de que las secuencias de ADN del
análogo o derivado del polipéptido sean al menos en un 80%
homólogas respecto a SEQ ID NO: 9.
6. Secuencias de ADN que codifican para un
polipéptido con la secuencia de aminoácidos representada en SEQ ID
NO: 12 (HTP reductasa), o un análogo o un derivado del polipéptido
según SEQ ID NO: 12, en la que uno o varios aminoácidos han sido
delecionados, adicionados o sustituidos por otros aminoácidos, sin
reducir esencialmente el efecto enzimático del polipéptido, con la
condición de que las secuencias de ADN del análogo o derivado del
polipéptido sean al menos en un 80% homólogas respecto a SEQ ID NO:
11.
7. Vector de expresión que contiene uno o varias
secuencias de ADN según las reivindicaciones 1 a 6.
8. Organismo huésped no humano, que ha sido
transformado con un sistema de expresión según la reivindicación
7.
9. Procedimiento recombinante de producción de
riboflavina, caracterizado porque se utiliza un organismo
huésped según la reivindicación 8.
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| DE4410382 | 1994-03-25 | ||
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ID=25935071
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