ES2220933T3 - Conjugados constituidos por complejos metalicos y oligonucleotidos. - Google Patents
Conjugados constituidos por complejos metalicos y oligonucleotidos.Info
- Publication number
- ES2220933T3 ES2220933T3 ES95925792T ES95925792T ES2220933T3 ES 2220933 T3 ES2220933 T3 ES 2220933T3 ES 95925792 T ES95925792 T ES 95925792T ES 95925792 T ES95925792 T ES 95925792T ES 2220933 T3 ES2220933 T3 ES 2220933T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- groups
- oligonucleotide
- group
- acid
- oligonucleotides
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K41/00—Medicinal preparations obtained by treating materials with wave energy or particle radiation ; Therapies using these preparations
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K51/00—Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
- A61K51/02—Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
- A61K51/04—Organic compounds
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Compounds Of Unknown Constitution (AREA)
- Solid-Sorbent Or Filter-Aiding Compositions (AREA)
Abstract
ESTA INVENCION SE REFIERE A CONJUGADOS DE OLIGONUCLEOTIDOS MODIFICADOS QUIMICAMENTE QUE CONTIENEN UN AGENTE DE COMPLEJO O UN COMPLEJO QUE SE UNE POR UN ELEMENTO DE CONEXION A LOS OLIGONUCLEOTIDOS. EN ESTE CASO, LOS OLIGONUCLEOTIDOS SE MODIFICAN EN UNA FORMA QUE EVITA O AL MENOS INHIBE DE FORMA SIGNIFICATIVA LA DEGRADACION POR LAS NUCLEASAS QUE SE PRODUCEN NATURALMENTE. EL RADICAL OLIGONUCLEOTIDO PUEDE UNIRSE ESPECIFICAMENTE Y CON ALTA AFINIDAD DE ENLACE A ESTRUCTURAS DE DESTINO Y POR TANTO PUEDE PRODUCIR UN EFECTO DIAGNOSTICO O TERAPEUTICO ESPECIFICO MEDIANTE EL AGENTE DE COMPLEJO DE UNION O COMPLEJO DE UNION.
Description
Conjugados constituidos por complejos metálicos y
oligonucleótidos.
Esta invención se refiere al objeto descrito en
las reivindicaciones, es decir, conjugados oligonucleotídicos, que
contienen un agente complejante o un complejo. Estos conjugados se
utilizan en los campos de diagnóstico y tratamiento.
El diagnóstico por imagen ha alcanzado gran
progreso en las últimas décadas, y está desarrollándose más
continuamente. Actualmente es posible visualizar el sistema
vascular, la mayoría de los órganos y muchos tejidos en el cuerpo
vivo sin intervención de mayor importancia. Las enfermedades se
diagnostican en muchos casos, debido a que conducen a cambios
evidentes de forma, tamaño y posición de las estructuras anatómicas
en el cuerpo. Tales datos anatómicos procedentes del interior del
cuerpo pueden obtenerse por tecnología de rayos X, diagnóstico por
ultrasonidos y tomografía de resonancia magnética. La eficiencia de
cada una de las tecnologías mencionadas puede mejorarse por el uso
de agentes farmacéuticos para mejora de los contrastes naturales de
los tejidos y fluidos corporales en la imagen resultante. Los
agentes farmacéuticos en cuestión se introducen en las cavidades del
cuerpo o se inyectan en los vasos sanguíneos, con el propósito de
cambiar el contraste de las cavidades o vasos. Adicionalmente,
aquéllos se extienden por el torrente sanguíneo en el organismo y
pueden cambiar la visibilidad de órganos y tejidos. En caos
excepcionales, tales sustancias se fijan a ciertas estructuras en el
cuerpo y/o son transportadas y/o excretadas activamente por el
último. De este modo, pueden hacer visibles también funciones en
casos individuales y utilizarse para diagnosticar enfermedades.
En contraste con ello, el diagnóstico nuclear
está basado en sustancias que pueden hacerse visibles en sí mismas.
En este caso, se introduce en el cuerpo isótopos radiactivos que
emiten radiación de largo alcance. La extensión de estas sustancias
en el organismo puede rastrearse por medio de detectores adecuados.
La ventaja del proceso médico nuclear es la alta eficacia a dosis
baja de las sustancias radiactivas transmisoras de las señales
designadas como agentes radiofarmacéuticos.
Si se utilizan isótopos, que liberan radiación
\alpha o \beta u otros productos tóxicos de descomposición
eficaces en el tejido, pueden utilizarse también agentes
radiofarmacéuticos para propósitos terapéuticos, v.g., para la
destrucción de tumores. La misma finalidad puede conseguirse
también, introduciendo en el cuerpo isótopos o sustancias no nocivos
que se convierten solamente en el mismo mediante, v.g., radiación de
neutrones o rayos X, ultrasonidos o radioondas, en una forma
terapéuticamente eficaz.
Un problema general es el diagnóstico y la
localización de cambios patológicos en un momento en el que no está
disponible cambio alguno de forma, estructura y circulación de los
órganos y tejidos en cuestión. Un diagnóstico y seguimiento de este
tipo tiene importancia decisiva, v.g., en el caso de enfermedades
tumorales, con inclusión de la búsqueda de metástasis, evaluación de
un suministro deficiente de oxígeno a los tejidos, y en el caso de
ciertas infecciones y enfermedades metabólicas.
Los métodos terapéuticos y de diagnóstico por
imagen ahora disponibles dependen considerablemente de la
disponibilidad de preparaciones farmacéuticas, que se acumulan en
sitios de cambios patológicos indetectables por otros medios.
Los medios de contraste disponibles
comercialmente en este momento son, muy predominantemente, las
denominadas preparaciones inespecíficas. Las mismas se extienden
pasivamente en los espacios en los que se introducen, v.g., por
inyección.
En el pasado, se han identificado muchas
sustancias y clases de sustancias que pueden detectarse o puede
esperarse que tengan especificidad con respecto a su extensión en el
organismo vivo. Ejemplos a este respecto son, además de los
anticuerpos, lectinas, todos los tipos de sustancias fijadas a
receptores, células, membranas y componentes de membrana, ácidos
nucleicos, metabolitos naturales y sus derivados, así como
incontables sustancias farmacéuticas. Se han estudiado y están
estudiándose también péptidos con atención especial.
La patente U.S. No. 4.707.352 se refiere a un
proceso especial para marcar moléculas formadoras de complejos con
isótopos radiactivos, pero no se describe ningún agente complejante
adecuado para la fijación de iones metálicos.
El documento
EP-A-0 285 057 describe conjugados
nucleótido-agente complejante, que no son adecuados,
entre otras cosas, debido a la inestabilidad in vivo de los
nucleótidos utilizados, para uso como agentes de diagnóstico o
agentes terapéuticos in vivo y cumplen apenas también los
otros requisitos de compatibilidad y farmacocinética.
Muchas patentes de los Estados Unidos, tales
como, por ejemplo, la patente U.S. No. 4.707.440, se refieren a
polímeros modificados, que contienen un grupo químico detectable.
Los polímeros pueden ser polinucleótidos y oligonucleótidos, pero no
están estabilizados contra la degradación por las nucleasas
existentes naturalmente ni seleccionados por un proceso especial, de
tal modo que se fijen específicamente con afinidad de fijación alta
a estructuras diana. Realizaciones especiales de estas moléculas
detectables se mencionan en las patentes U.S. No. 4.843.122 y
4.943.523. Un nucleótido individual, modificado de este modo, se
reivindica en la patente U.S. No. 4.952.685. El uso de estos agentes
en procesos de formación de imagen se describe en la patente U.S.
No. 4.849.208.
El objeto de esta invención es la preparación de
agentes de diagnóstico que se fijan específicamente para la
detección de estructuras diana, por los cuales, por ejemplo, se hace
posible la visualización de órganos, tejidos y sus cambios
patológicos in vitro e in vivo.
Se ha encontrado ahora que este objeto es
alcanzado por conjugados oligonucleotídicos que, además de un
radical oligonucleotídico, exhiben un agente complejante, fijado por
un enlace directo o un componente de conexión, y cuyo radical
oligonucleotídico está modificado de tal modo que se previene la
degradación por las nucleasas existentes naturalmente o se inhibe al
menos significativamente.
El objeto de esta invención está constituido
por:
Conjugados oligonucleotídicos constituidos por un
radical oligonucleotídico N y n sustituyentes (B-K),
en los cuales el compuesto exhibe la fórmula general (I)
(I)N-(B-K)_{n}
en la cual N es un oligonucleótido
con 15 a 100 nucleótidos, que se fija específicamente con afinidad
de fijación alta a otras estructuras diana y exhibe modificaciones
que impiden o al menos reducen significativamente la degradación por
las nucleasas existentes
naturalmente,
B es un enlace químico o un componente de
conexión al radical oligonucleotídico, que produce la conexión entre
N y K, y K significa un agente complejante o complejo de isótopos de
metales radiactivos, o isótopos estables, que
- se convierten en isótopos
radiactivos por radiación procedente del exterior,
- convierten la radiación procedente
del exterior en radiación de calidad diferente, contenido de energía
diferente, y/o diferente longitud de onda, de los elementos de
números atómicos 5, 21-29, 31, 39,
42-44, 49, 57-83 u 85,
n es un número entre 1 y 10,
en los cuales
a) la posición 2' de la unidad azúcar,
independientemente unas de otras, está ocupada por los grupos
siguientes:
un grupo OR, en el cual
R es un radical alquilo con 1 a 20 átomos de
carbono, que contiene opcionalmente hasta 2 grupos hidroxilo y que
está interrumpido opcionalmente por 1-5 átomos de
oxígeno,
un átomo de hidrógeno,
un grupo hidroxilo,
un átomo de flúor,
un radical amina,
un grupo amino,
y los grupos hidroxilo presentes en las
posiciones terminales 3' y 5', independientemente unos de otros,
están eterificados opcionalmente con el radical R y/o
b) los fosfodiésteres, que se utilizan
opcionalmente como el enlace internucleotídico, independientemente
unos de otros, están reemplazados por fosforotioatos,
fosforoditioatos o alquilfosfonatos, preferiblemente
metil-fosfonato, y/o
c) los radicales terminales en las posiciones 3'
y 5' están enlazados de una manera intramolecular unos con otros por
un enlace internucleotídico como se describe en b) y/o
d) contiene un enlace internucleotídico como se
describe en b), que enlaza las posiciones 3'-3' o
5'-5', y/o
e) contiene un enlace fosfodiéster como se
describe en b), que conecta, de modo análogo a un éster, dos
timidinas por un radical hidroxialquilo
C_{2}-C_{10} respectivamente en posición 3 o
conecta un radical timidina sustituido análogamente, de modo análogo
a un éster, con un grupo hidroxilo de otro azúcar en posición 2' o
3' o 5' y/o
f) los radicales terminales en las posiciones 3'
y 5' contienen enlaces internucleotídicos modificados opcionalmente
como se describe en b).
Se prefieren aquellos compuestos de la invención
en los cuales N es un oligonucleótido, que se fija específicamente
con afinidad de fijación alta a otras estructuras diana y que puede
obtenerse de tal manera que una mezcla de oligonucleótidos que
contienen secuencias aleatorias se pone en contacto con la
estructura diana, y ciertos oligonucleótidos exhiben una afinidad
incrementada para la estructura diana con relación a la mezcla de
los oligonucleótidos, se separan los últimos del resto de la mezcla
de oligonucleótidos, y se multiplican luego los oligonucleótidos que
tienen afinidad incrementada para la estructura diana a fin de
obtener una mezcla de oligonucleótidos que exhibe una porción
incrementada de oligonucleótidos que se fijan a las estructuras
diana.
Son especialmente preferidos los compuestos de la
invención en los cuales N es un oligonucleótido, que se fija
específicamente con afinidad de fijación alta a otras estructuras
diana, y que puede obtenerse, de tal modo que
a) en primer lugar, se produce una cadena de DNA
por síntesis química, de tal modo que en el extremo 3', esta cadena
de DNA exhibe una secuencia definida, que es complementaria a un
promotor para una RNA-polimerasa y al mismo tiempo
complementaria para un iniciador de la reacción en cadena de la
polimerasa (PCR), y de tal modo que esta cadena de DNA exhibe una
secuencia definida en el extremo 5', que es complementaria para una
secuencia iniciadora para la reacción en cadena de la polimerasa, y
la secuencia entre las secuencias definidas contiene una secuencia
aleatoria, y de tal manera que
b) esta cadena de DNA se transcribe en una cadena
de RNA complementario con ayuda de una
RNA-polimerasa, y se ofrecen a la polimerasa
nucleótidos que están modificados en la posición 2' de la unidad
ribosa, y de tal manera que
c) los nucleótidos de RNA, producidos de este
modo, se ponen en contacto con la estructura diana a la cual debe
fijarse específicamente el oligonucleótido, y de tal manera que
d) aquellos oligonucleótidos que se han fijado a
la estructura diana se separan primeramente junto con la estructura
diana de los oligonucleótidos que no se fijan, y después de ello los
oligonucleótidos fijados se separan de nuevo de la estructura diana,
y de tal manera que
e) estos oligonucleótidos de RNA específicos de
la estructura diana se transcriben con ayuda de transcriptasa
inversa en una cadena de DNA complementario, y de tal manera que
f) estas cadenas de DNA se multiplican por la
reacción en cadena de la polimerasa con el uso de las secuencias
iniciadoras definidas, y de tal manera que
g) los oligonucleótidos de DNA multiplicados de
esta manera se transcriben luego nuevamente con ayuda de la
RNA-polimerasa y con nucleótidos modificados en
oligonucleótidos de RNA, y de tal manera que
h) los pasos de selección c) a g) arriba
mencionados se repiten opcionalmente muchas veces hasta que los
oligonucleótidos, que se caracterizan por una afinidad de fijación
alta a la estructura diana, se seleccionan suficientemente, y
después de ello las secuencias del oligonucleótido así obtenido
pueden ser determinadas opcionalmente.
Son especialmente preferidos los compuestos de la
invención en los cuales la estructura de diana se selecciona entre
macromoléculas, estructuras tisulares de organismos superiores,
tales como animales o humanos, órganos o partes de órganos de un
animal o humano, células, células tumorales o tumores.
En esta Solicitud se consideran especialmente
aquellas sustancias en las cuales el o los componentes de conexión B
se fija(n)
*a) al extremo 4' del radical oligonucleotídico N
reducido en posición 4' por el grupo CH_{2}-OH
y/o
*b) al extremo 3' del radical oligonucleotídico N
reducido en posición 3' por un átomo de hidrógeno y/o
*c) al puente o puentes fosfodiéster,
reducido(s) por el o los grupos OH, entre dos nucleótidos
cada uno y/o
*d) a 1 a 10 nucleobases, que está(n)
reducida(s) por un átomo de hidrógeno respectivamente en la o
las posiciones 5, 8 y/o el o los grupos amino en la o las posiciones
2, 4 y 6.
Son especialmente preferidos los compuestos de la
invención, descritos anteriormente en *a) o *b) en los cuales B
tiene la fórmula general
X-Y-Z^{1}, que está conectada al
lado X con el agente complejante o complejo y en el lado Z con el
oligonucleótido, en la cual
X representa un enlace directo, un grupo
-NH o -S,
Y representa una cadena de alquileno
C_{1}-C_{20} de cadena lineal, de cadena
ramificada, saturada o insaturada, que contiene opcionalmente
1-2 grupos ciclohexileno,
1-5 grupos imino, 1-3 grupos
fenileno, 1-3 grupos fenilenimino,
1-3 grupos fenil-enoxi,
1-3 grupos hidroxifenileno, 1-5
grupos amido, 1-2 grupos hidrazido,
1-5 grupos carbonilo, 1-5 grupos
etil-enoxi, 1 grupo ureido, 1 grupo tioureido,
1-2 grupos carboxialquilimino, 1-2
grupos éster, 1-3 grupos Ar, en los cuales Ar
representa un anillo de 5 ó 6 miembros saturado o insaturado, que
contiene opcionalmente 1-2 heteroátomos
seleccionados de nitrógeno, oxígeno y azufre y/o 1-2
grupos carbonilo; 1-10 átomos de oxígeno,
1-5 átomos de nitrógeno y/o 1-5
átomos de azufre, y/o está sustituida opcionalmente con
1-5 grupos hidroxi, 1-2 grupos
mercapto, 1-5 grupos oxo, 1-5 grupos
tioxo, 1-3 grupos carboxi, 1-5
grupos carboxi-alquilo
C_{1}-C_{4}, 1-5 grupos éster,
1-3 grupos amino, 1-3 grupos
hidroxi-alquilo C_{1}-C_{4},
1-3 grupos alcoxi C_{1}-C_{7},
y
Z^{1} representa
-CONH-CH_{2}-4',
-NH-CO-4',
-O-P(O)R^{1}-NH-CH_{2}-4',
-O-P(O)R^{1}-O-CH_{2}-4',
-O-P(S)R^{1}-O-3'
o
-O-P(O)R^{1}-O-3',
en cuyas fórmulas 4' o 3' indica el enlace a la o las unidades
azúcar terminales y R^{1} representa O^{-}, S^{-}, un grupo
alquilo C_{1}-C_{4} o NR^{2}R^{3},
significando R^{2} y R^{3} hidrógeno y radicales alquilo
C_{1}-C_{4}.
Como estructuras cíclicas (Ar), son adecuadas
especialmente alquilenos cíclicos saturados o insaturados con 3 a 6,
especialmente 5 ó 6 átomos C, que contienen opcionalmente
heteroátomos, tales como N, S u O. Como ejemplos, se pueden
mencionar: grupos ciclopentileno, pirrolileno, furanileno,
tiofenileno, imidazolileno, oxazolilideno, tiazolileno,
pirazolileno, pirrolidileno, piridileno, pirimidileno,
maleinimidileno y ftalimidileno.
Adicionalmente deben considerarse los compuestos
arriba descritos en *c) en los cuales B tiene la fórmula general
X-Y-Z^{2}, que está conectado en
el sitio X con el agente complejante o complejo y en el sitio Z con
el oligonucleótido. En este caso
Z^{2}, en el puente que enlaza dos unidades
azúcar adyacentes,
Z^{2}---
\melm{\delm{\para}{\delm{O}{\delm{\para}{3'}}}}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---5'
\hskip1cmy/o
\hskip1cmZ^{2}---
\melm{\delm{\para}{\delm{O}{\delm{\para}{3'}}}}{P}{\uelm{\dpara}{S}}---O---5'
representa el grupo
-NR^{2}-, -O- o -S-, y X representa un
enlace directo, un grupo -NH o grupo
-S,
Y representa una cadena alquileno
C_{1}-C_{20} de cadena lineal, cadena
ramificada, saturada o insaturada, que contiene opcionalmente
1-2 grupos ciclohexileno,
1-5 grupos imino, 1-3 grupos
fenileno, 1-3 grupos fenilenimino,
1-3 grupos fenil-enoxi,
1-3 grupos hidroxifenileno, 1-5
grupos amido, 1-2 grupos hidrazido,
1-5 grupos carbonilo, 1-5 grupos
etil-enoxi, 1 grupo ureido, 1 grupo tioureido,
1-2 grupos carboxialquilimino, 1-2
grupos éster, 1-3 grupos Ar, en los cuales Ar
representa un anillo de 5 ó 6 miembros saturado o insaturado, que
contiene opcionalmente 1-2 heteroátomos
seleccionados de nitrógeno, oxígeno y azufre y/o 1-2
grupos carbonilo; 1-10 átomos de oxígeno,
1-5 átomos de nitrógeno y/o 1-5
átomos de azufre, y/o está sustituida opcionalmente con
1-5 grupos hidroxi, 1-2 grupos
mercapto, 1-5 grupos oxo, 1-5 grupos
tioxo, 1-3 grupos carboxi, 1-5
grupos carboxi-alquilo
C_{1}-C_{4}, 1-5 grupos éster,
1-3 grupos amino, 1-3 grupos
hidroxi-alquilo C_{1}-C_{4},
1-3 grupos alcoxi C_{1}-C_{7},
y
R^{2} significa hidrógeno o radicales alquilo
C_{1}-C_{4}.
Como radicales Y del componente de conexión
Z^{1}-Y-X (de acuerdo con el punto
6) o Z^{2}-Y-X (de acuerdo con el
punto 7), se pueden mencionar como ejemplos los radicales
Son especialmente preferidos los compuestos de la
invención descritos anteriormente en *d) en los cuales B tiene la
fórmula general X-Y-Z^{3}, en la
cual Z^{3} representa un grupo -NH o un enlace directo
a la nucleobase y X representa un enlace directo, un grupo
-NH o -S,
Y representa una cadena de alquileno
C_{1}-C_{20} de cadena lineal, cadena
ramificada, saturada o insaturada, que contiene opcionalmente
1-2 grupos ciclohexileno,
1-5 grupos imino, 1-3 grupos
fenileno, 1-3 grupos fenilenimino,
1-3 grupos fenil-enoxi,
1-3 grupos hidroxifenileno, 1-5
grupos amido, 1-2 grupos hidrazido,
1-5 grupos carbonilo, 1-5 grupos
etil-enoxi, 1 grupo ureido, 1 grupo tioureido,
1-2 grupos carboxialquilimino, 1-2
grupos éster, 1-3 grupos Ar, en los cuales Ar
representa un anillo de 5 ó 6 miembros saturado o insaturado, que
contiene opcionalmente 1-2 heteroátomos
seleccionados de nitrógeno, oxígeno y azufre y/o 1-2
grupos carbonilo; 1-10 átomos de oxígeno,
1-5 átomos de nitrógeno y/o 1-5
átomos de azufre, y/o está sustituida opcionalmente con
1-5 grupos hidroxi, 1-2 grupos
mercapto, 1-5 grupos oxo, 1-5 grupos
tioxo, 1-3 grupos carboxi, 1-5
grupos carboxi-alquilo
C_{1}-C_{4}, 1-5 grupos éster,
1-3 grupos amino, 1-3 grupos
hidroxi-alquilo C_{1}-C_{4},
1-3 grupos alcoxi
C_{1}-C_{7}.
Como ejemplos se pueden mencionar los
radicales
-CH_{2}-CO-NH-CH_{2}-CH(OH)-CH_{2}-,
NH-CO-CH_{2}-CO-NH-CH_{2}-CH(OH)-CH_{2},
-CO-NH-CH_{2}-CH_{2}-NH-,
-CH_{2}-S-CH_{2}-CH_{2}-NH-,
-CH_{2}-S-CH_{2}-CH_{2}-,
-(CH_{2})_{4}-S-CH_{2}-CH_{2}-NH-,
-CO-CH_{2}-S-CH_{2}-CH_{2}-NH-,
-CO-CH_{2}-S-(CH_{2})_{6}-NH-,
-CH=CH-CO-NH-CH_{2}-CH_{2}-NH-,
-CH=CH-CH_{2}-NH-,
-C\equivC-CH_{2}-NH-
ó
-CO-CH_{2}-CH_{2}-NH-CH_{2}-CH_{2}-NH-.
Como sitios de fijación en el caso de las bases
púricas, es especialmente adecuada la posición 8, y en el caso de
las bases pirimidínicas, es adecuada la posición 5. De modo
exclusivamente formal, en este caso, un átomo de hidrógeno de la
base respectiva se sustituye por el radical B-K. No
obstante, puede tener lugar también un enlace por grupos amino
contenidos opcionalmente en posición 2, 4 ó 6, así, v.g., por el
grupo 2-amino en la guanina, por el grupo
6-amino en la adenina o por el grupo
4-amino en la citosina. En este caso, un átomo de
hidrógeno del grupo amino respectivo está sustituido respectivamente
por el radical B-K.
Los compuestos de acuerdo con uno de los puntos
anteriores, en los cuales el complejo metálico, como elemento
formador de imagen, contiene un isótopo radiactivo, seleccionado de
los elementos cobre, bismuto, tecnecio, renio o indio están
considerados en esta Solicitud.
La invención comprende también un proceso para
detectar una estructura diana, en el cual uno o más de los
compuestos de acuerdo con uno de los puntos anteriores se ponen en
contacto in vivo o in vitro con la muestra a estudiar
y, basándose en la señal, se detecta si la estructura diana, a la
cual se fija específicamente y con afinidad de fijación alta el
oligonucleótido N, está presente en la muestra.
Un proceso para diagnóstico no invasivo de
enfermedades forma parte de la invención, en el cual uno o más de
los compuestos de la invención mencionados se ponen en contacto con
la estructura diana a estudiar in vivo y, basándose en la
señal, se detecta si la estructura diana, a la cual se fija
específicamente el oligonucleótido N, está presente en el organismo
a estudiar.
El objeto de la invención es también el uso de un
compuesto arriba descrito para la producción de un medicamento útil
en radiodiagnóstico y/o en radioterapia.
Adicionalmente, es objeto de la invención el uso
de un estuche de diagnóstico para detección in vivo y/o in
vitro de estructuras diana, en el cual el estuche de diagnóstico
contiene al menos un compuesto de acuerdo con la descripción.
Son especialmente preferidos compuestos, en los
cuales N es un ligando oligonucleotídico no existente naturalmente
que tiene una afinidad de fijación específica para una molécula
diana, siendo dicha molécula diana una estructura química
tridimensional distinta de un polinucleótido que está unido a dicho
ligando oligonucleotídico a través de un mecanismo que depende
predominantemente del apareamiento de bases de Watson/Crick o
fijación de la triple hélice, en los cuales dicho ligando
oligonucleotídico no es un ácido nucleico que tenga la función
fisiológica conocida de fijarse a la molécula diana.
Si los conjugados de acuerdo con la invención
deben utilizarse como agentes de diagnóstico, el o los agentes
complejantes contiene(n) un isótopo radiactivo formador de
imagen de los elementos de números atómicos 21,
26-27, 29, 31, 43 ó 49, preferiblemente 43 ó 49. Si
los conjugados de acuerdo con la invención deben utilizarse como
agente terapéutico, además de los arriba mencionados, son también
adecuados isótopos de los elementos de números atómicos 5,
22-25, 28, 42, 44, 57-83 y 85. Más
allá de los isótopos radiactivos de los elementos arriba
mencionados, especialmente también isótopos estables, que
a) se convierten por radiación procedente del
exterior en isótopos radiactivos,
b) convierten la radiación del exterior en
radiación de calidad diferente, contenido de energía diferente y/o
longitud de onda diferente,
son adecuados en el intervalo de
tratamiento.
El número de sustituyentes de formación de imagen
o terapéuticamente eficaces B-K enlazados con el
radical oligonucleotídico está, por una parte, limitado por el valor
del oligonucleótido, pero nunca es mayor que 10. De acuerdo con la
invención, se prefieren uno o dos sustituyentes
B-K.
El valor del radical oligonucleotídico N en esta
invención está limitado a 15 hasta 100 nucleótidos.
Los oligonucleótidos utilizables de acuerdo con
la invención están estabilizados contra la degradación por las
nucleasas que tiene lugar in vivo.
Los oligonucleótidos o polinucleótidos no
modificados son escindidos in vivo por endonucleasas y
exonucleasas. La reacción de degradación en la serie del RNA
comienza con una activación del grupo 2'-hidroxi.
Otras enzimas catabólicas son, v.g. ribozimas, que escinden el
enlace fosfodiéster RNS (véase Science 261, 709 (1993)). La
estabilidad in vivo de los derivados de RNS puede aumentarse
por sustitución parcial o completa del grupo
2'-hidroxilo por otros sustituyentes. Tales
sustituyentes son, v.g., grupos alcoxi, especialmente el grupo
metoxi (véase, v.g., Chem. Pharm. Bull. 13, 1273 (1965),
Biochemistry 10, 2581, (1971)), un átomo de hidrógeno, un
átomo de flúor (véase, v.g., Can. J. Chem. 46, 1131 (1968)) o
un grupo amino (véase, v.g., J. Org. Chem. 42, 714 (1977)).
Varios de estos sustituyentes, así como otros, pueden introducirse
también en la posición 2' utilizando los métodos descritos en la
Solicitud U.S. No. Ser. 08/264.029, presentada el 22 de junio de
1994. Otras posibilidades para estabilizar el enlace
internucleotídico son el reemplazamiento de uno o dos átomos de
oxígeno en el puente fosfodiéster al mismo tiempo que se forman
fosforotioatos (Trends Biochem. Sci. 14, 97 (1989)) o
fosforoditioatos (J. Chem. Soc., Chem. Commun. 591 (1983) y Nucleic
Acids Res. 12, 9095 (1984)) y el uso de alquilfosfonatos en
lugar de fosfodiésteres (Ann. Rep. N.Y. Acad. Sci. 507, 220
(1988)).
La estabilización puede realizarse de tal modo
que los grupos hidroxilo en la posición 2' de las unidades ribosa,
independientemente unos de otros, se modifiquen. Una modificación de
este tipo puede realizarse por reemplazamiento de este grupo
hidroxilo por un grupo OR, un átomo de halógeno, especialmente un
átomo de flúor, un átomo de hidrógeno o un radical amina,
especialmente por un grupo amino. El radical R del grupo alcoxi
representa, en este caso, un radical alquilo de cadena lineal o
cadena ramificada con 1 a 20 átomos C, tal como metilo, etilo,
propilo, isopropilo, butilo, terc-butilo, pentilo o
hexilo o un radical alquilo cíclico insustituido o sustituido con 4
a 20 átomos C, tal como ciclopentilo o ciclohexilo, que contiene
opcionalmente 1-2 grupos hidroxi, y que está
interrumpido opcionalmente por 1-5 átomos de
oxígeno. La estabilización se incrementa también debido a que los
presentes grupos hidroxilo en posiciones 3' y 5' están opcionalmente
eterificados.
Otra estabilización del polinucleótido tiene
lugar en el sentido de que los fosfodiésteres que se utilizan como
enlace internucleotídico están reemplazados parcial o completamente,
y con independencia unos de otros, por fosforotioatos,
fosforoditioatos o alquilfosfonatos, de modo especialmente
preferible por alquilfosfonatos inferiores, tales como, v.g.,
metil-fosfonato. Estos enlaces internucleotídicos
pueden unirse también a los radicales terminales en las posiciones
3' y 5' o bien conectar también las posiciones 3'-3'
o 5'-5'. El enlace fosfodiéster hace posible uniones
ulteriores por radicales hidroxialquilo, que están presentes en los
átomos de nitrógeno o carbono de las nucleobases; así, por ejemplo,
dos timidinas pueden unirse por las cadenas hidroxialquilo presentes
en posición 3, o dos bases púricas por los radicales presentes en
posiciones 8. Puede tener lugar también la unión a los grupos
hidroxilo en posición 2', 3' o 5'.
Los enlaces internucleotídicos modificados pueden
tener lugar opcionalmente de modo preferible en los extremos del
polinucleótido, y estar unidos de modo especialmente preferible a la
timidina.
De acuerdo con la invención, los radicales
oligonucleotídicos utilizados N no están limitados a secuencias
oligonucleotídicas específicas. No obstante, se prefieren aquellos
oligonucleótidos que están enlazados específicamente con afinidad de
fijación alta a estructuras diana con la excepción del ácido
nucleico.
Un proceso para identificar oligonucleótidos
adecuados, que se requieren como sustancias de partida para los
conjugados de acuerdo con la invención, se describe en la patente
U.S. 5.270.163. Este proceso, denominado SELEX, puede utilizarse
para producir un ligando de ácido nucleico para cualquier molécula
diana deseada.
El método SELEX significa la selección de una
mezcla de oligonucleótidos candidato e iteraciones escalonadas de
fijación, partición y multiplicación, utilizando el mismo esquema de
selección general, para cumplir virtualmente cualquier criterio
descrito de afinidad de fijación y selectividad. Partiendo de una
mezcla de ácidos nucleicos, que comprende preferiblemente un
segmento de secuencia aleatorizada, el método SELEX incluye pasos de
poner en contacto la mezcla con la diana en condiciones favorables
para la fijación, separación de los ácidos nucleicos no fijados de
aquellos ácidos nucleicos que se han fijado específicamente a
moléculas diana, disociación de los complejos ácido
nucleico-diana, multiplicación de los ácidos
nucleicos disociados de los complejos ácidos
nucleico-diana para proporcionar una mezcla de
ácidos nucleicos enriquecida en ligandos, seguido por reiteración de
los pasos de fijación, partición, disociación y multiplicación a lo
largo de tantos ciclos como se desee para obtener ligandos de ácido
nucleico altamente específicos, y de afinidad alta para la molécula
diana.
El método SELEX básico se ha modificado para
conseguir varios objetivos específicos. Por ejemplo, la Solicitud de
Patente U.S. No. Ser. 07/960.093, presentada el 14 de octubre de
1992, describe el uso de SELEX en asociación con electroforesis en
gel para seleccionar moléculas de ácido nucleico con características
estructurales específicas, tales como DNA plegado. La Solicitud de
Patente U.S. No. Ser. 08/123.935, presentada el 17 de septiembre de
1993, describe un método basado en SELEX para seleccionar ligandos
de ácido nucleico que contienen grupos fotorreactivos capaces de
fijación y/o fotorreticulación y/o fotodesactivación de una molécula
diana. La Solicitud de Patente U.S. No. Ser. 08/134.028, presentada
el 7 de octubre de 1993, describe un método para identificar
ligandos de ácido nucleico altamente específicos capaces de
discriminar entre moléculas estrechamente relacionadas, denominado
Counter-SELEX. La Solicitud de Patente U.S. No. Ser.
08/143.564, presentada el 25 de octubre de 1993, describe un método
basado en SELEX que consigue una partición altamente eficiente entre
oligonucleótidos que tienen afinidad alta y baja para una molécula
diana. La Solicitud de Patente U.S. No. Ser. 07/964.624, presentada
el 21 de octubre de 1992, describe métodos para la obtención de
ligandos de ácido nucleico mejorados después que se ha realizado el
método SELEX. La Solicitud de Patente U.S. No. Ser. 08/400.440,
presentada el 8 de marzo de 1995, describe métodos para unir
covalentemente un ligando a su diana.
El método SELEX abarca la identificación de
ligandos de ácido nucleico de afinidad alta que contienen
nucleótidos modificados que confieren características mejoradas al
ligando, tales como estabilidad in vivo mejorada o
características de suministro mejoradas. Ejemplos de tales
modificaciones incluyen sustituciones químicas en la ribosa y/o el
fosfato y/o sustituciones de bases. Ligandos de ácido nucleico
identificados por SELEX que contienen nucleótidos modificados se
describen en la Solicitud de Patente U.S. No. Ser. 08/117.991,
presentada el 8 de septiembre de 1993, que describe oligonucleótidos
que contienen derivados de nucleótidos modificados químicamente en
las posiciones 5 y 2' de las pirimidinas. La Solicitud de Patente
U.S. No. Ser. 08/134.028, citada anteriormente, describe ligandos de
ácido nucleico altamente específicos que contienen uno o más
nucleótidos modificados con
2'-amino-(2'-NH_{2}),
2'-fluoro(2'-F), y/o
2'-O-metil(2'-OMe).
La Solicitud de Patente U.S. No. Ser. 08/264.029, presentada el 22
de junio de 1994, describe oligonucleótidos que contienen varias
pirimidinas modificadas en la posición 2.
El método SELEX abarca la combinación de
oligonucleótidos seleccionados con otros oligonucleótidos
seleccionados y unidades funcionales que no son oligonucleótidos
como se describe en las Solicitudes de Patente U.S. No. Ser.
08/284.063, presentada el 2 de agosto de 1994, y No. Ser.
08/234.997, presentada el 28 de abril de 1994, respectivamente.
Estas Solicitudes permiten la combinación de la extensa serie de
formas y otras propiedades, y las propiedades de multiplicación y
replicación eficientes, de oligonucleótidos con las propiedades
deseables de otras moléculas.
En su forma más básica, el proceso SELEX puede
definirse por la serie de pasos siguiente:
1) Se prepara una mezcla candidato de ácidos
nucleicos de secuencia diferente. La mezcla candidato incluye
generalmente regiones de secuencias fijas (es decir, cada uno de los
miembros de la mezcla candidato contiene las mismas secuencias en la
misma localización) y regiones de secuencias aleatorizadas. Las
regiones de secuencias fijas se seleccionan para: (a) colaborar en
los pasos de multiplicación descritos más adelante, o (b) mimetizar
una secuencia conocida que se fija a la diana, o (c) mejorar la
concentración de una configuración estructural dada de los ácidos
nucleicos en la mezcla candidato. Las secuencias aleatorizadas
pueden estar aleatorizadas totalmente (es decir, tales que la
probabilidad de encontrar una base en cualquier posición es de uno
en cuatro) o sólo parcialmente aleatorizadas (v.g., tales que la
probabilidad de encontrar una base en una localización dada puede
seleccionarse en cualquier nivel comprendido entre 0 y 100 por
ciento).
2) La mezcla candidato se pone en contacto con la
diana seleccionada en condiciones favorables para fijación entre la
diana y los miembros de la mezcla candidato. En estas
circunstancias, puede considerarse que la interacción entre la diana
y los ácidos nucleicos de la mezcla candidato forma pares ácido
nucleico-diana entre la diana y aquellos ácidos
nucleicos que tengan la afinidad más fuerte para la diana.
3) Los ácidos nucleicos con afinidad máxima para
la diana se separan por partición de aquellos ácidos nucleicos que
tienen menor afinidad para la diana. Dado que sólo un número
extremadamente pequeño de secuencias (y posiblemente una sola
molécula de ácido nucleico) correspondiente(s) a los ácidos
nucleicos de afinidad máxima existe(n) en la mezcla
candidato, generalmente es deseable establecer los criterios de
partición de tal manera que una cantidad significativa de los ácidos
nucleicos en la mezcla candidato (aproximadamente
5-50%) queden retenidos durante la partición.
4) Aquellos ácidos nucleicos seleccionados
durante la partición por tener la afinidad relativamente más alta
para la diana se multiplican luego para crear una nueva mezcla
candidato que está enriquecida en ácidos nucleicos que tienen una
afinidad relativamente mayor para la diana.
5) Por repetición de los pasos de partición y
multiplicación anteriores, la mezcla candidato nuevamente formada
contiene cada vez menos secuencias singulares, y el grado medio de
afinidad de los ácidos nucleicos para la diana aumentará por regla
general. Llegado a este extremo, el proceso SELEX producirá una
mezcla candidato que contiene solamente uno o un pequeño número de
ácidos nucleicos singulares que representan aquellos ácidos
nucleicos de la mezcla candidato original que tienen la afinidad
máxima para la molécula diana.
Las patentes y solicitudes SELEX se describen y
elaboran en este proceso con gran detalle. Se incluyen dianas que
pueden utilizarse en el proceso; métodos para la partición de los
ácidos nucleicos dentro de una mezcla candidato; y métodos para
multiplicar los ácidos nucleicos obtenidos por partición a fin de
generar una mezcla candidato enriquecida. Las patentes y solicitudes
SELEX describen también los ligandos obtenidos para cierto número de
especies diana, que incluyen tanto dianas proteínicas en las cuales
la proteína es y no es una proteína de fijación de ácido nucleico.
Por esta razón, el proceso SELEX puede utilizarse para proporcionar
ligandos de afinidad alta de una molécula diana.
Las moléculas diana son preferiblemente
proteínas, pero pueden incluir también, entre otros, carbohidratos,
peptidoglicanos y una diversidad de pequeñas moléculas. Como en el
caso de los anticuerpos proteináceos convencionales, los anticuerpos
de ácido nucleico (ligandos oligonucleotídicos) pueden emplearse
para direccionamiento a estructuras biológicas, tales como
superficies celulares o virus, por interacción específica con una
molécula que es una parte integral de dicha estructura biológica.
Los ligandos oligonucleotídicos son ventajosos en el sentido de que
no están limitados por auto-tolerancia, como ocurre
con los anticuerpos convencionales. Asimismo, los anticuerpos de
ácido nucleico no requieren animales o cultivos de células para
síntesis o producción, dado que SELEX es un proceso totalmente in
vitro. Como es bien conocido, los ácidos nucleicos pueden
fijarse a secuencias de ácido nucleico complementarias. Esta
propiedad de los ácidos nucleicos ha sido extensamente utilizada
para la detección, cuantificación y aislamiento de ácidos nucleicos.
Así pues, los métodos de la presente invención no tienen por objeto
abarcar estas capacidades de fijación bien conocidas entre los
ácidos nucleicos. Específicamente, los métodos de la presente
invención relacionados con el uso de anticuerpos de ácido nucleico
no tienen por objeto abarcar afinidades de fijación conocidas entre
moléculas de ácido nucleico. Se conocen cierto número de proteínas
que funcionan por fijación a secuencias nucleicas, tales como
proteínas reguladoras que se fijan a secuencias operadoras de ácido
nucleico. La capacidad conocida de ciertas proteínas de fijación de
ácido nucleico para fijarse a sus sitios naturales, por ejemplo, se
ha empleado en la detección, cuantificación, aislamiento y
purificación de tales proteínas. Los métodos de la presente
invención relacionados con el uso de ligandos oligonucleotídicos no
tienen por objeto abarcar la afinidad de fijación conocida entre
moléculas de fijación de ácido nucleico y secuencias de ácido
nucleico a las cuales se sabe que se fijan aquéllas. Sin embargo,
utilizando SELEX pueden desarrollarse nuevas secuencias, no
existentes naturalmente, que se fijan a las mismas proteínas de
fijación de ácido nucleico. En particular, los ligandos
oligonucleotídicos de la presente invención se fijan a tales
moléculas diana que comprenden una estructura química
tridimensional, distinta de un polinucleótido que se fija a dicho
ligando oligonucleotídico a través de un mecanismo que depende
predominantemente del apareamiento de bases Watson/Crick o fijación
de la triple hélice, en el cual dicho ligando oligonucleotídico no
es un ácido nucleico que tenga la función fisiológica conocida de
ser fijado por la molécula diana.
Debe indicarse que SELEX permite una
determinación muy rápida de las secuencias de ácido nucleico que se
fijarán a alguna proteína y, por tanto, puede emplearse fácilmente
para determinar la estructura de secuencias operadoras y sitios de
fijación desconocidos, secuencias que pueden emplearse luego para
aplicaciones como las descritas en esta memoria. SELEX es por
consiguiente un método general para uso de moléculas de ácido
nucleico para la detección, cuantificación, aislamiento y
purificación de proteínas que no son conocidas por su fijación a
ácidos nucleicos. Adicionalmente, ciertos anticuerpos de ácido
nucleico que pueden ser aislados por SELEX pueden emplearse también
para afectar a la función, por ejemplo, inhibir, mejorar o activar
la función de moléculas o estructuras diana específicas.
Específicamente, pueden emplearse anticuerpos de ácido nucleico para
inhibir, mejorar o activar la función de proteínas.
Los oligonucleótidos utilizados en los conjugados
de acuerdo con la invención se obtienen en una realización preferida
de acuerdo con el proceso descrito a continuación.
Así, pueden obtenerse oligonucleótidos adecuados
de tal manera que una mezcla de oligonucleótidos que contiene
secuencias aleatorias se pone en contacto con la estructura diana, y
ciertos oligonucleótidos exhiben una afinidad incrementada para la
estructura diana con relación a la mezcla de los oligonucleótidos,
se separan los últimos del resto de la mezcla de oligonucleótidos, y
los oligonucleótidos con afinidad incrementada para la estructura
diana se multiplican luego a fin de obtener una mezcla de
oligonucleótidos que exhibe una porción incrementada de
oligonucleótidos que se fijan a las estructuras diana.
En el proceso, primeramente se produce una cadena
de DNA de un modo preferido por síntesis química. En el extremo 3',
esta cadena de DNA tiene una secuencia conocida, que se utiliza como
promotor para una RNA-polimerasa y al mismo tiempo
es complementaria para una secuencia iniciadora para la reacción en
cadena de la polimerasa (PCR). En una realización especialmente
preferida, en este caso, está implicado el promotor para la
RNA-polimerasa T7. A continuación, se sintetiza una
secuencia aleatoria en el promotor. La secuencia aleatoria puede
obtenerse de tal manera que las cuatro bases adecuadas se alimentan
en la misma relación a la máquina de síntesis. Así, resultan
secuencias de DNA completamente aleatorias. En una realización
preferida, la longitud de la secuencia aleatoria es aproximadamente
15 a 100 nucleótidos. Otra secuencia de DNA, que puede utilizarse
para la realización en cadena de la polimerasa (PCR), se sintetiza
sobre esta pieza de DNA con la secuencia aleatoria.
Después de la síntesis de esta cadena de DNA, se
transcribe la última en una cadena de RNA complementaria con ayuda
de una RNA-polimerasa. En una realización preferida,
se utiliza en este caso la RNA-polimerasa T7. En la
transcripción, se ofrecen a la RNA-polimerasa los
nucleótidos que están modificados. En una realización especialmente
preferida, la ribosa se modifica en la posición 2'. En este caso,
puede estar implicada una sustitución del átomo de hidrógeno o el
grupo hidroxilo por un grupo alcoxi, preferiblemente metoxi, amino o
flúor. Los oligonucleótidos de RNA producidos de esta manera se
introducen luego en el proceso de selección.
En el proceso de selección, los oligonucleótidos
de RNA se ponen en contacto con la estructura diana. Debe entenderse
que la estructura diana significa una estructura a la cual el
oligonucleótido debe unirse específicamente y con afinidad alta.
Tales estructuras son, v.g., macromoléculas,
estructuras tisulares de organismos superiores, tales como animales
o humanos, órganos o partes de órganos, células, especialmente
células tumorales o tumores.
En este contexto, la estructura diana no tiene
que encontrarse absolutamente en forma pura, sino que puede estar
presente también en un órgano existente naturalmente o en una
superficie celular. Puede aplicarse severidad al proceso de
selección por la adición de poliamino (tRNA, heparina), plasma o
sangre entera a la reacción de SELEX.
Si está involucrada en este caso una proteína
aislada, la última puede estar fijada a una fase sólida, por
ejemplo, un filtro. En la selección, se utiliza un exceso de la
estructura diana con relación a la mezcla de RNA. En la incubación,
las moléculas oligonucleotídicas específicas se unen a las
estructuras diana, mientras que los oligonucleótidos no fijados se
separan de la mezcla, por ejemplo por lavado.
A continuación, las moléculas oligonucleotídicas
se separan de las moléculas diana o se eliminan por lavado con
tampones o disolventes adecuados.
Con ayuda de la transcriptasa inversa, el
oligonucleótido de RNA encontrado se transcribe en la cadena de DNA
complementario.
Dado que la cadena de DNA obtenida exhibe
secuencias iniciadoras (o secuencias promotoras) en ambos extremos,
una multiplicación de las secuencias de DNA encontradas puede
realizarse simplemente con ayuda de la reacción en cadena de la
polimerasa.
Los oligonucleótidos de DNA multiplicados de este
modo se transcriben luego nuevamente con ayuda de la
RNA-polimerasa en oligonucleótidos de RNA, y los
oligonucleótidos de RNA así obtenidos pueden utilizarse en un paso
de selección ulterior (como se ha descrito arriba).
Después de separar los oligonucleótidos de RNA
que se fijan, obtenidos en el segundo paso de selección, de las
moléculas diana, las últimas se transcriben nuevamente en DNA con
ayuda de la transcriptasa inversa, los oligonucleótidos de DNA
complementarios así obtenidos se multiplican con ayuda de la
reacción en cadena de la polimerasa y se transcriben luego
nuevamente con ayuda de la RNA-polimerasa a los
oligonucleótidos de RNA, que están disponibles para un paso de
selección ulterior.
Se ha encontrado que las altas especificidades
deseadas y las altas afinidades de fijación pueden obtenerse si los
pasos de selección se repiten varias veces. En raras ocasiones se
obtendrá la secuencia oligonucleotídica deseada tan pronto como
después de uno o dos pasos de selección. Tan pronto como se obtiene
la especificidad y afinidad de fijación deseada entre la estructura
diana y el oligonucleótido, el o los oligonucleótidos pueden
secuenciarse y, como resultado, se puede determinar la secuencia de
los oligonucleótidos que se fijan específicamente.
Es especialmente ventajoso en este proceso el
hecho de que el mismo puede utilizarse no sólo con proteínas
adecuadas, sino también in vivo. No obstante, el proceso de
selección arriba mencionado puede realizarse también sobre
estructuras diana purificadas. Sin embargo, es esencial,
especialmente para el diagnóstico in vivo, que la
especificidad de los oligonucleótidos se proporcione para la
estructura diana in vivo. Por esta razón, los procesos de
selección pueden realizarse también sobre células o cultivos
celulares, sobre tejidos o secciones de tejidos, sobre órganos
sometidos a perfusión e incluso sobre organismos vivos.
En este caso, es ventajoso que los
oligonucleótidos modificados puedan resistir la degradación por los
RNAs prácticamente omnipresentes. Como resultado, las secuencias
oligonucleotídicas deseadas se acumulan por sí mismas en los
procesos de selección en organismos vivos, dado que los
oligonucleótidos correspondientes existentes naturalmente serían
degradados por los RNAs.
El radical oligonucleotídico N puede exhibir uno
o más componentes de conexión B, o sustituyentes
B-K, que pueden seleccionarse independientemente
unos de otros. Se reivindican conjugados oligonucleotídicos, que
contienen 1 a 10 componentes de conexión B idénticos o 2 a 10
componentes de conexión B diferentes. Son especialmente preferidos
los conjugados oligonucleotídicos con 1 ó 2 componentes de conexión
B.
El componente de conexión B conecta el radical
oligonucleotídico N con un agente complejante o complejo K.
Ventajosamente, pueden utilizarse como átomos
donantes ligandos polidentados complejantes de cadena abierta o
cíclicos con O, S y N.
Como ejemplos para radicales de agentes
complejantes K, se pueden mencionar los ácidos
poliaminopolicarboxílicos reducidos por un átomo de hidrógeno, un
grupo hidroxi y/o un grupo ácido acético, ácido
etilenodiaminatetraacético, ácido dietilenotriaminapentaacético,
ácido
trans-1,2-ciclohexanodiaminatetraacético,
ácido
1,4,7,10-tetra-azaciclododecanotetraacético,
ácido
1,4,7-triazaciclo-nonanotriacético,
ácido
1,4,8,11-tetraazatetradecano-tetraacético,
ácido 1,5,9-triazaciclododecanodiacético, ácido
1,4,7,10-tetraazaciclododecanotriacético y ácido
3,6,9,15-tetraazabiciclo-[9,3,1]-pentadeca-1(15),11,13-trienotriacético.
Agentes complejantes adecuados se describen,
v.g., en los documentos EP 0 485 045, EP 0 071 564 y EP 0 588 229,
en DE 43 10 999 y DE 43 11 023, así como US 4.965.392.
Para ilustrar las diversas posibilidades para los
agentes complejantes K de acuerdo con esta invención, se hace
referencia a las figuras 1 a 3, en las cuales se recogen algunas
estructuras ventajosas. Estas figuras deben entenderse como una
selección y no limitan esta invención en modo alguno a los agentes
complejantes representados.
El agente complejante K puede contener todos los
isótopos radiactivos, utilizados habitualmente en medicina nuclear
para propósitos diagnósticos y terapéuticos, en la forma de sus
iones metálicos. Pueden utilizarse también isótopos estables, que
son excitados por radiación externa para emitir radiación
diagnóstica o terapéutica, o isótopos que se convierten por
radiación procedente del exterior en isótopos radiactivos.
Isótopos adecuados de acuerdo con la invención se
seleccionan de los elementos de los números atómicos 5,
21-29, 31, 39, 42-44, 49,
57-83 u 85.
Para uso del compuesto de acuerdo con la
invención como agente radiofarmacéutico, el agente complejante
contiene un elemento radiactivo. Dos elementos radiactivos que son
capaces de producir un efecto terapéutico o
diag-nóstico in vivo o in vitro son
adecuados para este propósito. Se prefieren isótopos radiactivos de
los elementos cobre, bismuto, tecnecio, renio o indio. Son
especialmente preferidos los complejos de ^{99m}Tc.
Si los compuestos de fórmula general I de acuerdo
con la invención contienen isótopos emisores de positrones, tales
como, v.g., Sc-43, Sc-44,
Fe-52, Co-55, Ga-68
o Cu-61, los últimos pueden utilizarse en tomografía
de emisión de positrones (PET).
Si los compuestos de fórmula general I de acuerdo
con la invención contienen isótopos emisores de radiación gamma,
tales como, v.g., Tc-99m o In-111,
los mismos pueden utilizarse en tomografía de emisión de fotones
simple (SPECT).
Los compuestos de acuerdo con la invención pueden
utilizarse también en radioterapia en forma de sus complejos con
radioisótopos, tales como, v.g., Ir-192.
Los compuestos de acuerdo con la invención pueden
utilizarse también en radioinmunoterapia o terapia de radiación. Los
últimos se distinguen del diagnóstico correspondiente solamente por
la cantidad y tipo de isótopo utilizado. En este caso, el propósito
es la destrucción de células tumorales por radiación de onda corta
de alta energía con una gama lo más pequeña posible. Iones emisores
\beta adecuados son, por ejemplo, Sc-46,
Sc-47, Sc-48, Ga-72,
Ga-73, Y-90, Re-186
o Re-188. Iones emisores \alpha adecuados que
exhiben semi-vidas breves son, por ejemplo,
At-209, At-211,
Bi-211, Bi-212,
Bi-213 y Bi-214, prefiriéndose
Bi-212. Un ion emisor de fotones y electrones
adecuado es ^{158}Gd, que puede obtenerse a partir de ^{157}Gd
por captura de neutrones.
Si el agente de acuerdo con la invención tiene
por objeto ser utilizado en la variante de terapia de radiación
propuesta por R.L. Mills et al. (Nature 336, 787 (1988)), el
ion central tiene que derivarse de un isótopo de Mössbauer, tal
como, por ejemplo, ^{57}Fe o ^{151}Eu.
Aquellos grupos de ácido carboxílico que no se
requieren para la formación de complejos con los iones metálicos de
los elementos de números atómicos 21 a 29, 31, 39, 42 a 44, 49, 57 a
83 u 85 pueden estar presentes opcionalmente como sales de una base
inorgánica u orgánica, tal como hidróxidos y carbonatos de metal
alcalino o alcalinotérreo, especialmente hidróxido de sodio y
potasio, o amoníaco y alquilaminas, o aminoácido o como un éster o
amida.
Adicionalmente, pueden utilizarse compuestos que
son excitados por neutrones para emitir partículas y/o radiación. Es
especialmente efectivo en este caso el gadolinio. Ventajosamente,
pueden utilizarse aquellos compuestos que contienen el isótopo
boro-10. En tales casos, K puede tener la
estructura
en la cual x representa un número
entero de 1 a
10.
La invención se refiere adicionalmente a procesos
para la producción de los conjugados de acuerdo con la
invención.
Así, conjugados en los cuales el componente de
conexión B está fijado en el extremo 5' del oligonucleótido pueden
obtenerse por reacción del oligonucleótido con un derivado de
fosforamidito (Tetrahedron 49, 1925-1963
(1993)). A este fin, el grupo 5' hidroxi del oligonucleótido se hace
reaccionar con un fosforamidito de fórmula general
PR'(NR_{2}'')OR'''. En este caso, R' representa un grupo alquilo,
alcoxi o arilalcoxi, que contiene opcionalmente N, NO_{2}, Si, o
SO_{2}, con 1 a 20 átomos C, tal como metilo, etilo, propilo,
butilo, pentilo, hexilo, metoxi, etoxi, propiloxi, butiloxi,
benciloxi o feniletiloxi, que puede estar sustituido opcionalmente.
Como sustituyentes se utilizan especialmente grupos ciano y nitro.
Ventajosamente, por ejemplo, pueden utilizarse grupos metoxi,
\beta-cianoetoxi o nitrofeniletoxi. Son
especialmente preferidos los grupos
\beta-cianoetoxi. R'' es un radical
C_{1}-C_{4} alquilo, y son especialmente
adecuados etilo y propilo. Se prefieren radicales isopropilo. R'''
es un grupo alquilo o arilalquilo, que contiene opcionalmente S, O,
N, CN, NO_{2} o halógeno, con 1 a 20 átomos C. Preferiblemente, se
utilizan radicales amino y tioalquilo protegidos, así como radicales
amino y tiooxaalquilo protegidos. Son especialmente preferidos
6-amino-hexilo,
6-tiohexilo,
3,6,9-trioxa-11-amino-undecilo
y
3,6-dioxa-8-amino-octanilo.
Como grupos protectores se pueden utilizar grupos protectores de N o
S habituales. Por ejemplo, son adecuados grupos trifluoroacetilo,
ftalimido y monometoxitritilo.
En una realización especialmente preferida de
esta invención, se utiliza como derivado de fosforamidito
\beta-cianoetil-N,N-diisopropil-6-(trifluoroacetamido)-1-hexil-fosforamidito.
En otra realización preferida de esta invención,
se utiliza como derivado de fosforamidito
\beta-cianoetil-N,N-diisopropilamino-(3,6,9-trioxa-11-ftalimido-1-undecil)-fosforamidito.
En otra realización de la invención, el
componente de conexión B está fijado en el extremo 3' del
oligonucleótido N de una manera análoga a la descrita arriba por un
grupo que contiene fósforo.
La reacción arriba descrita entre oligonucleótido
y fosforamidito puede tener lugar como reacción en fase sólida,
encontrándose el oligonucleótido todavía en la columna de un
sintetizador automático. Después que se ha obtenido un
oligonucleótido de la secuencia deseada y ha tenido lugar la
exposición del grupo 5'-hidroxi del oligonucleótido,
v.g., con ácido tricloroacético, se hace reaccionar el mismo con el
fosforamidito y el producto de reacción se oxida y se desprende. A
continuación, el derivado de oligonucleótido así obtenido se acopla
en el grupo amino o tiol terminal con el agente complejante o
complejo K opcionalmente por otro grupo enlazador. El radical fijado
en el primer paso por el grupo que contiene fósforo en el
oligonucleótido forma luego, junto con el grupo enlazador adicional
opcionalmente presente, el componente de conexión B.
El enlace entre el oligonucleótido y el agente
complejante puede tener lugar también de tal manera que el grupo
5'-hidroxilo libre del oligonucleótido se hace
reaccionar con un agente complejante o complejo, que lleva en
posición terminal un radical fósforo susceptible de fijación. Un
compuesto de este tipo puede describirse por la fórmula
a)
\newpage
en la
cual
R^{a} representa un radical alquilo
C_{1}-C_{6}, que lleva opcionalmente un grupo
ciano en posición \beta,
R^{b} representa un grupo amino secundario
y
K y B tienen el significado indicado
o la fórmula
b)
K---B---
\melm{\delm{\para}{H}}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---R^{c}
en la
cual
R^{c} representa un catión trialquilamonio y K
y B tienen el significado mencionado,
O la fórmula
c)
K---B---
\melm{\delm{\para}{\delm{O}{\delm{\para}{R ^{d} }}}}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---R^{c}
\hskip1cmo
\hskip1cmK---B---
\melm{\delm{\para}{\delm{O}{\delm{\para}{R ^{d} }}}}{P}{\uelm{\dpara}{S}}---O---R^{c}
en la
cual
R^{d} representa un radical arilo, sustituido
opcionalmente con uno o más átomos de halógeno y/o uno o más grupos
nitro, o un radical alquilo C_{1}-C_{6}, que
está sustituido opcionalmente en posición \beta con un grupo
ciano, y K, B y R^{c} tienen el significado mencionado, y cuando
se utiliza un radical de fórmula a), tiene lugar un paso de
oxidación a fosfato después que se ha completado la reacción de
acoplamiento. En ambos casos, el radical -OR^{a} o
-OR^{c} puede escindirse opcionalmente por
hidrólisis.
El enlace del derivado oligonucleótido por el
enlazador con el agente complejante o complejo K puede tener lugar
también como una reacción en fase sólida en la columna de un
sintetizador automático. El compuesto de acuerdo con la invención
puede aislarse luego del vehículo sólido por desprendimiento.
El enlace del oligonucleótido con el enlazador
puede tener lugar no sólo por el grupo 5'-OH del
azúcar del nucleótido terminal, sino también por otros grupos
funcionales, que pueden generarse a partir del grupo
5'-OH, tales como, v.g., un grupo amino o carboxi.
Tales nucleótidos que llevan grupos amino o carboxi son conocidos y
pueden producirse fácilmente. La síntesis de una
5'-desoxi-5'-aminouridina
se describe en J. Med. Chem. 22, 1273 (1979) y en Chem. Lett. 6, 601
(1976). La
4'-carboxi-5'-desoxiuridina
está disponible como se describe en J. Med. Chem. 21, 1141
(1978) o Nucleic Acids Symp. Ser. 9, 95 (1981).
El enlace con el agente complejante tiene lugar
luego por medio de un enlazador que lleva un grupo ácido carboxílico
o amino de una manera conocida por los expertos en la técnica. El
enlazador forma luego el componente B de conexión junto con el
grupo-NH-CH_{2}-4'
o el grupo -CO-4'.
Puede subrayarse que la distribución de los
conjugados de acuerdo con la invención en un radical nucleotídico,
un componente de conexión y un agente complejante o complejo tiene
lugar de modo puramente formal, y por tanto independientemente de la
estructura de síntesis actual. Así, v.g., en el caso arriba
mencionado, se considera el grupo
-NH-CH_{2}-4' o
-CO-4' como perteneciente al componente de conexión
B, mientras que el oligonucleótido reducido en la posición 4' por un
grupo CH_{2}-OH se designa como radical
oligonucleotídico N.
Un proceso para la producción de conjugados, en
el cual tiene lugar el componente de conexión a los puentes
fosfodiéster o fosforotioato reducidos por los grupos OH, consiste
en que primeramente se unen dos unidades azúcar a un dinucleótido
(véase, v.g., Chem. Lett. 1305 (1993)). En este caso, resulta
primeramente un triéster de fórmula
3'---O---
\melm{\delm{\para}{O---U---V}}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---5'
en la cual U representa un radical
alquileno correspondiente y V representa un grupo amino o azufre
protegido. Después de la escisión, v.g., del grupo protector de
amino, el agente complejante puede enlazarse opcionalmente, de una
manera conocida por los expertos en la técnica, por medio de un
enlazador con el grupo amino - v.g., en la forma de un
enlace amida. El enlazador forma luego el componente de conexión B
junto con el grupo O-U-V' (en el
cual V' representa un grupo
-NH).
Un proceso alternativo consiste en que el
fosfodiéster que se forma y pasa durante el mismo (v.g., por
reacción con 1,5-diaminopentano) se somete a una
aminólisis (véase Biochemistry 27, 7237 (1988) o J. Am. Chem.
Soc. 110, 4470 (1988)).
Los compuestos así obtenidos de fórmula
3'---O---
\melm{\delm{\para}{NH---U---NH _{2} }}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---5'
pueden enlazarse como se describe
arriba con el agente complejante, opcionalmente por medio de un
enlazador.
Para propósitos de acoplamiento, son también
adecuados los
dinucleósido-fosfato-monotiotriésteres
(véase J. Am. Chem. Soc. 111, 9117 (1983) y Nucl. Acids Res.
20, 5205 (1992)).
Las nucleobases ofrecen una variedad
especialmente grande para enlazar los agentes complejantes con los
nucleótidos. Un eslabonamiento por grupos amino en posición 2 en las
purinas y en posición 4 en las pirimidinas puede tener lugar
directamente. Pero, en muchos casos, es más ventajoso modificar
primeramente las purinas o pirimidinas y enlazar estas bases
derivatizadas con los agentes complejantes (opcionalmente por medio
de enlazadores adicionales). Nucleobases derivatizadas convenientes
se describen, v.g., en Biochemie [Biochemistry] 71, 319
(1989), Nucl. Acids Res. 16, 4937 (1988) o Nucleosides
Nucleotides 10, 633 (1991).
Un proceso alternativo para enlace por las
nucleobases consiste en el acoplamiento catalizado por paladio de
nucleobases de bromo o yodo con radicales funcionalizados (Biogenic
and Medical Chemistry Letter V, 361 (1994)). Por estos radicales
funcionalizados, el agente complejante puede enlazarse luego
opcionalmente con la nucleobase por otro enlazador de acuerdo con
métodos conocidos. Como radicales funcionalizados en posición 5 de
la pirimidina y en posición 8 de la purina, pueden mencionarse como
ejemplos un éster acrílico o una alquilamina (véase Nucl. Acids Res.
14, 6115 (1986) y Nucl. Acids Res. 16, 4077 (1988)).
Otro proceso alternativo para preparar pirimidinas modificadas en
posición 5, especialmente para introducir grupos funcionales tales
como carbonilo, alquenilo o arilo en la posición 5, y un catalizador
de paladio mejorado capaz de acoplar grupos modificadores en la
posición 5 de las pirimidinas se describe en la Solicitud de Patente
U.S. No. Ser. 08/076.735, presentada el 14 de junio de 1993. Los
derivados de halógenos utilizados como precursor pueden obtenerse
como se describe, v.g., en Biophys. J. 44, 201 (1983), J. Am.
Chem. Soc. 86, 1242 (1964) o Chem. Commun. 17 (1967).
La producción de los complejos metálicos de
acuerdo con la invención a partir de los conjugados
oligonucleotídicos exentos de metales tiene lugar como se describe
en el documento DE 34 01 052, por el óxido metálico o una sal
metálica (por ejemplo, el nitrato, acetato, carbonato, cloruro o
sulfato) del isótopo metálico deseado que se disuelve o se suspende
en agua y/o un alcohol inferior (tal como metanol, etanol o
isopropanol) y se hace reaccionar con la solución o suspensión de la
cantidad equivalente del conjugado oligonucleotídico que contiene el
agente complejante y posteriormente, en caso deseado, los átomos de
hidrógeno ácido presentes se sustituyen por cationes de bases
inorgánicas y/u orgánicas o aminoácidos o grupos de ácido
carboxílico libres que se convierten en aminas de aminoácidos.
La neutralización de los grupos ácido libres
todavía posiblemente presentes tiene lugar con ayuda de bases
inorgánicas (por ejemplo, hidróxidos, carbonatos o bicarbonatos) de,
por ejemplo, sodio, potasio, litio, magnesio o calcio y/o bases
orgánicas tales como, entre otras, aminas primarias, secundarias y
terciarias, tales como, por ejemplo, etanolamina, morfolina,
glucamina, N-metil- y
N,N-dimetil-glucamina, así como
aminoácidos básicos, tales como, por ejemplo, lisina, arginina y
ornitina, o de amidas de aminoácidos originalmente neutros o
ácidos.
La producción de los agentes farmacéuticos de
acuerdo con la invención tiene lugar también de una manera conocida
en la técnica, suspendiendo o disolviendo los conjugados
oligonucleotídicos de acuerdo con la invención
-opcionalmente por adición de los aditivos habituales en preparaciones galénicas- en medio acuoso y esterilizándose luego opcionalmente la suspensión o solución, o esterilizándose por filtración. Aditivos adecuados son, por ejemplo, tampones fisiológicamente inocuos (tales como, por ejemplo, trometamina), aditivos de agentes complejantes (tales como, por ejemplo, ácido dietilenotriaminapentaacético) o -en caso necesario- electrólitos, tales como, por ejemplo, cloruro de sodio o -en caso necesario- antioxidantes, tales como, por ejemplo, ácido ascórbico, o especialmente para formas de administración oral, manitol u otras sustancias osmóticamente activas.
-opcionalmente por adición de los aditivos habituales en preparaciones galénicas- en medio acuoso y esterilizándose luego opcionalmente la suspensión o solución, o esterilizándose por filtración. Aditivos adecuados son, por ejemplo, tampones fisiológicamente inocuos (tales como, por ejemplo, trometamina), aditivos de agentes complejantes (tales como, por ejemplo, ácido dietilenotriaminapentaacético) o -en caso necesario- electrólitos, tales como, por ejemplo, cloruro de sodio o -en caso necesario- antioxidantes, tales como, por ejemplo, ácido ascórbico, o especialmente para formas de administración oral, manitol u otras sustancias osmóticamente activas.
Si se desean suspensiones o soluciones de los
agentes de acuerdo con la invención en agua o solución salina
fisiológica para administración enteral o para otros propósitos, las
mismas pueden mezclarse con uno o más adyuvantes usuales en la
preparación de formulaciones galénicas (por ejemplo,
metil-celulosa, lactosa, manitol) y/o agentes
tensioactivos (por ejemplo, lecitinas, Tween^{TR},
Myrj^{TR}).
Los agentes farmacéuticos de acuerdo con la
invención contienen preferiblemente 0,1 \mumol/l a 3 mmol/l de los
conjugados oligonucleotídicos de acuerdo con la invención y
generalmente se dosifican en cantidades de 0,01
nmol/kg-60 \mumol/kg. Aquéllos están destinados a
administración enteral o parenteral.
En el uso médico-nuclear in
vivo, los compuestos marcados se dosifican generalmente en
cantidades menores que 10^{-10} mol/kg de peso corporal, y la
dosis exacta puede variar notablemente en función de la región
corporal estudiada, pero especialmente también en función del método
de estudio seleccionado respectivamente. Partiendo de un peso
corporal medio de 70 kg, la cantidad de radiactividad para usos de
diagnóstico está comprendida entre 40 y 1100 MBq, preferiblemente
200-800 MBq, para usos terapéuticos
1-500 MBq, preferiblemente 10-100
MBq por administración. La administración tiene lugar normalmente
por vía intravenosa, intra-arterial, intersticial,
peritoneal o intratumoral, y se prefiere la administración
intravenosa. En general, se administran 0,1 a 20 ml del agente en
cuestión por estudio.
Esta invención se refiere adicionalmente a un
proceso para detectar estructuras diana. En este caso, uno o más de
los compuestos arriba descritos se ponen en contacto con la muestra
a estudiar in vivo o in vitro. En este caso, el
radical oligonucleotídico N se fija específicamente y con afinidad
de fijación alta a la estructura diana a detectar.
Si la estructura diana está presente en la
muestra, puede detectarse en ella basándose en la señal. El proceso
es especialmente adecuado para un diagnóstico de enfermedades no
invasivo. En este caso, se administra in vivo uno o más de
los compuestos arriba descritos y puede detectarse por la señal si
la estructura diana, a la cual se fija específicamente y con
afinidad alta el radical oligonucleotídico N, está presente en el
organismo a estudiar.
No obstante, además de la mera detección de
estructuras diana en las muestras a estudiar, las últimas pueden
destruirse también específicamente. A este respecto, los compuestos
de la presente invención son especialmente adecuados en
radioterapia, v.g., en terapia del cáncer.
Otra realización de esta invención comprende un
estuche (kit) de diagnóstico para detección in vivo de
estructuras diana, que contiene uno o más de los compuestos arriba
mencionados.
Los conjugados y agentes de acuerdo con la
invención satisfacen los muchos requerimientos que deben ser
cumplidos por un agente farmacéutico para radioterapia y
diagnóstico. Aquéllos se distinguen especialmente por una alta
especificidad o afinidad con relación a la estructura diana en
cuestión. Con relación a los conjugados oligonucleotídicos
conocidos, los conjugados de acuerdo con la invención exhiben una
estabilidad in vivo especialmente alta. Esto se ha conseguido
por una sustitución del grupo 2'-hidroxilo y la
incorporación de secuencias de timidina modificadas en los grupos
hidroxilo terminales de los nucleótidos. Sorprendentemente, la
especificidad del oligonucleótido no se deteriora significativamente
por esta modificación ni por el acoplamiento con el agente
complejante. Otras ventajas son la farmacocinética controlable así
como la necesaria compatibilidad.
Diversos otros objetos, características y
ventajas concomitantes de la presente invención se apreciarán más
plenamente a medida que la misma llegue a comprenderse mejor cuando
se considera en asociación con los dibujos que se adjuntan, en los
cuales:
La Figura 1 muestra una selección de agentes
complejantes cíclicos K, que pueden ser utilizados ventajosamente
para esta invención. "b" marca el sitio de fijación en el
componente de conexión B.
Las Figuras 2 y 3 muestran una selección de
agentes complejantes K de cadena abierta, que pueden ser utilizados
ventajosamente para esta invención.
Los ejemplos siguientes tienen por objeto
ilustrar esta invención con mayor detalle.
Los polinucleótidos descritos en los ejemplos
contienen compuestos modificados.
Los mismos significan:
A, U, C, G los nucleótidos contienen un grupo
2'-OCH_{3}
*: el enlace internucleotídico es un
metil-fosfonato
**: el enlace internucleotídico es un
tiofosfonato
***: el enlace internucleotídico es un
ditiofosfonato.
Sin mayor elaboración, se cree que un experto en
la técnica puede, utilizando la descripción que antecede, emplear la
presente invención en su máxima extensión. Las realizaciones
específicas preferidas siguientes deben interpretarse, por
consiguiente, como meramente ilustrativas y no limitantes del resto
de la descripción en modo alguno, cualquiera que sea.
En lo que antecede y en los ejemplos siguientes,
todas las temperaturas se exponen en grados Celsius sin corregir; y,
a no ser que se indique otra cosa, todas las partes y porcentajes se
expresan en peso.
El oligonucleótido 30mero
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUA-3',
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia T*T*T*T*T-3' situada aguas arriba se
produce de la manera usual en un sintetizador automático de la
compañía Pharmacia (véase Oligonucleotides and Analogues, A
Practical Approach, compilador F. Eckstein, Oxford University Press,
Oxford, Nueva York, Tokyo, 1991), y el oligonucleótido está presente
también en la columna del vehículo sólido. Por reacción con solución
de ácido tricloroacético en diclorometano, se abre el grupo
5'-hidroxi. La carga de la columna es
aproximadamente 10 mg de oligonucleótido 35mero. Para unir el
enlazador, la columna se hace reaccionar con una solución en
acetonitrilo de 50 \mumol de
\beta-cianoetil-N,N-diisopropilamino-6-(trifluoroacetamido)-1-hexil-fosforamidito
(producido de acuerdo con Nucl. Acids Res. 16,
2659-2669 (1988)) en presencia de tetrazol. La
oxidación del fosfito formado al fosfotriéster completamente
protegido tiene lugar con yodo en tetrahidrofurano. A continuación,
la columna se lava sucesivamente con metanol y agua. Para separar el
oligonucleótido modificado del vehículo sólido, el contenido de la
columna se transporta en un multivial, se mezcla con 5 ml de
solución de amoníaco al 30%, se cierra herméticamente el recipiente
y se agita durante una noche mediante sacudidas a 55ºC. Se enfría
luego a 0ºC, se centrifuga, se lava el vehículo con 5 ml de agua y
las fases acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para purificación, el material sólido se recoge
en 2 ml de agua, se mezcla con 2 ml de solución de acetato de amonio
0,5 M y se mezcla con 10 ml de etanol, se deja en reposo durante una
noche a -20ºC, se centrifuga, se lava el residuo con 1
ml de etanol (-20ºC) y finalmente se seca a vacío a la temperatura
ambiente. Se obtienen 8 mg del compuesto del título como polvo
incoloro.
Se disuelven 50 g (144,3 mmol) de
1,4,7-tris(carboxi-metil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano
(D03A) en 250 ml de agua y se ajusta el pH a 13 con solución 5N de
hidróxido de sodio. A continuación, se añade gota a gota en el
transcurso de una hora una solución de 38,12 g (187,6 mmol) de
N-(2,3-epoxipropil)-ftalimida en 100
ml de dioxano, se agita durante 24 horas a 50ºC y el pH se mantiene
en 13 por adición de solución 5N de hidróxido de sodio. La solución
se ajusta a pH 2 con ácido clorhídrico al 10% y se evapora a
sequedad a vacío. El residuo se disuelve en algo de agua y se
purifica en una columna de intercambio iónico (Reillex® =
poli-(4-vinil)-piridina, se eluye
con agua). Las fracciones principales se concentran por evaporación
a vacío, y se somete el residuo a una purificación final por
cromatografía sobre RP-18 (LiChroPrep®/disolvente
móvil: gradiente de tetrahidrofurano/metanol/agua). Después de
concentración por evaporación de las fracciones principales, se
obtienen 63,57 g (71% de la teoría)) de un sólido amorfo.
Contenido de agua: 8,5%
Análisis elemental (referido a la sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 52,90 | H 6,57 | N 12,34 |
| Enc.: | C 52,65 | H 6,68 | N 12,15 |
50 g (88,1 mmol) del compuesto del título del
Ejemplo 1b se calientan a reflujo en 300 ml de ácido clorhídrico
concentrado durante 24 horas. Se evapora a sequedad, se disuelve el
residuo en algo de agua y se purifica en una columna de intercambio
iónico (Reillex® =
poli-(4-vinil)-piridina (se eluye
con agua)). Las fracciones principales se evaporan a sequedad.
Rendimiento: 39 g (95% de la teoría) de un sólido
vítreo.
Contenido de agua: 10,3%
Análisis elemental (referido a la sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 48,68 | H 7,93 | N 16,70 |
| Enc.: | C 48,47 | H 8,09 | N 16,55 |
9,84 g (41,8 mmol) de anhídrido
3-(4-nitrofenil)-glutárico (J. Org.
Chem. 26, 3856 (1961)) se añaden a 14,62 g (34,86 mmol) del
compuesto del título del Ejemplo 1c) en 200 ml de
dimetilformamida/20 ml de trietilamina y se agita durante una noche
a la temperatura ambiente. Se evapora a sequedad a vacío. El residuo
se recristaliza en isopropanol/ácido acético 95:5.
Rendimiento: 21,68 g (95% de la teoría) de un
sólido amarillento)
Contenido de agua: 0,9%
Análisis elemental (referido a la sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 51,37 | H 6,47 | N 12,84 |
| Enc.: | C 51,18 | H 6,58 | N 12,67 |
21,0 g (32,07 mmol) del compuesto del título del
Ejemplo 1d) se disuelven en 250 ml de metanol y se añaden 5 g de
catalizador de paladio (10% Pd sobre C). Se hidrogena durante una
noche a la temperatura ambiente. El catalizador se separa por
filtración y el filtrado se evapora a sequedad a vacío.
Rendimiento: 19,63 g (98% de la teoría) de un
sólido de color crema)
Contenido de agua: 0,8%
Análisis elemental (referido a la sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 53,84 | H 6,35 | N 12,60 |
| Enc.: | C 53,73 | H 6,45 | N 12,51 |
Se disuelven 12,4 g (19,27 mmol) del compuesto
del título del Ejemplo 1e) en 200 ml de agua y se añaden 6,64 g
(57,8 mmol) de tiofosgeno en 50 ml de cloroformo. Se agita durante 1
hora a 50ºC. Se enfría a la temperatura ambiente, se separa la fase
orgánica y se agita dos veces la fase acuosa mediante sacudidas con
100 ml de cloroformo. La fase acuosa se evapora a sequedad y el
residuo se precipita absortivamente en 100 ml de isopropanol a la
temperatura ambiente. Se separa el sólido por filtración y se lava
con éter. Después de secado durante una noche a vacío (40ºC), se
obtienen 12,74 g (97% de la teoría) de un sólido de color crema.
Contenido de agua: 3,1%
Análisis elemental (referido a sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 52,24 | H 6,35 | N 12,60 | S 4,81 |
| Enc.: | C 52,37 | H 6,44 | N 12,48 | S 4,83 |
8 mg del oligonucleótido obtenido en el Ejemplo
1a) se disuelven en 2,5 ml de un tampón NaHCO_{3}/Na_{2}CO_{3}
(pH 8,0) y se mezclan con 1 mg de
10-[7-(4-isotiocianatofenil)-2-hidroxi-5-oxo-7-(carboximetil)-4-aza-heptil]-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano
(compuesto del título del Ejemplo 1f). Se agita durante 5 horas a la
temperatura ambiente, se ajusta el pH a 7,2 por adición de ácido
clorhídrico 0,01 M y la solución se somete a ultrafiltración a
través de una membrana con límite de exclusión 3.000 (Amicon YM3)
seguido por liofilización. Se obtienen 7 mg del conjugado
deseado.
15 \mul de una solución de acetato de
^{111}indio(III) (350 \muCi), (producido a partir de
cloruro de ^{111}indio(III) en solución 2 M de acetato de
sodio y ajuste del pH a 4,0 con ácido clorhídrico 0,1 M) se añaden a
135 \mul de una solución de 1 mg del compuesto del título del
Ejemplo 1g) en tampón MES, pH 6,2 (MES = ácido
2-(N-morfolino)etilsulfónico). Se lleva el pH
a 4,2 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M. Se agita durante una
hora a 37ºC a pH 4,2. Se lleva a pH 6 con solución 2 M de acetato de
sodio y se añaden 10 \mul de una solución 0,1 M de Na_{2}EDTA =
sal disódica del ácido etilenodiamina-tetraacético,
para complejar el exceso de ^{111}indio. La purificación final del
conjugado marcado así obtenido (1 h) tiene lugar por HPLC
(cromatografía de exclusión: TSK-400/tampón MES).
Las fracciones que contienen el conjugado marcado se diluyen con
solución fisiológica de sal común, se ajustan a pH 7,2 con solución
0,01 M de hidróxido de sodio y se filtran. La solución así producida
representa entonces una preparación adecuada para
radiodiagnóstico.
8 mg del oligonucleótido obtenido en el Ejemplo
1a) se disuelven en 2,5 ml de un tampón NaHCO_{3}/Na_{2}CO_{3}
(pH 8,0) y se añade 1 mg de ácido
N-(2-amino-3-(p-isotiocianato-fenil)propil]-trans-ciclohexano-1,2-diamina-N,N',N',N'',N''-pentaacético
(producido de acuerdo con Bioconjugate Chem. 1, 59 (1990)).
Se agita durante 5 horas a la temperatura ambiente, se ajusta luego
a pH 7,2 con ácido clorhídrico 0,1 M y la solución se somete a
ultrafiltración a través de una membrana con el límite de exclusión
3.000 (Amicon YM3). Después de liofilización, se obtienen 6 mg del
conjugado de tiourea 2a).
Una solución de tetrayoduro de ^{212}bismuto en
ácido yodhídrico 0,1 M se lleva a pH 4 con ácido acético 2 M. Una
parte alícuota de esta solución con actividad de aproximadamente 3
mCi se añade a 1 mg del compuesto del título del Ejemplo 2a),
disuelto en 0,5 ml de tampón MES 0,02 M y se añaden 0,5 ml de
solución 0,15 M de cloruro de sodio. Se agita durante 20 minutos a
la temperatura ambiente. Se lleva a pH 6 con solución 2M de acetato
de sodio y se añaden 20 \mul de una solución 0,01 M de
Na_{2}EDTA. Se agita durante 20 minutos. La purificación del
complejo tiene lugar por HPLC (cromatografía de exclusión:
TSK-400/tampón MES). Las fracciones de conjugado
radiactivo se reúnen, se diluyen con solución fisiológica de sal
común, y se ajustan a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido de
sodio. Después de filtración, se obtiene una preparación adecuada
para radioterapia.
15 ml de una solución de 15 \mul de acetato de
^{111}indio(III) (350 \muCi) (producido a partir de
cloruro de ^{111}indio(III) en solución 2 M de acetato de
sodio y ajuste del pH a 4,0 con ácido clorhídrico 0,1 M) se añaden a
0,5 ml de una solución de 1 mg del compuesto del título del Ejemplo
2a) en tampón MES, pH 6,2 (MES = ácido
2-(N-morfolino)etilsulfónico). El pH se lleva
a 5,0 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M. Se agita durante 1
hora a 37ºC a pH 5,0. Se lleva a pH 6 con solución 2M de acetato de
sodio y se añaden 10 \mul de una solución 0,1 M de Na_{2}EDTA
=
sal disódica del ácido etilenodiamina-tetraacético, para complejar el exceso de ^{111}indio. La purificación final del conjugado marcado así obtenido (1 h) tiene lugar por HPLC (cromatografía de exclusión: TSK-400/tampón MES). Las fracciones que contienen el conjugado marcado se diluyen con solución fisiológica de sal común, se ajustan a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido de sodio y se filtran. La solución así producida representa entonces una preparación adecuada para radiodiagnóstico.
sal disódica del ácido etilenodiamina-tetraacético, para complejar el exceso de ^{111}indio. La purificación final del conjugado marcado así obtenido (1 h) tiene lugar por HPLC (cromatografía de exclusión: TSK-400/tampón MES). Las fracciones que contienen el conjugado marcado se diluyen con solución fisiológica de sal común, se ajustan a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido de sodio y se filtran. La solución así producida representa entonces una preparación adecuada para radiodiagnóstico.
8 mg del oligonucleótido obtenido en el Ejemplo
1a) se disuelven en 2,5 ml de un tampón NaHCO_{3}/Na_{2}CO_{3}
(pH 8,0) y se añade 1 mg de ácido
2-(4-isotiocianato-bencil)-dietilenotriamina-N,N',N',N'',N''-pentaacético
(producido de acuerdo con: Bioconjugate Chem. 2, 187
(1991)). Se agita durante 5 horas a la temperatura ambiente, se
ajusta luego a pH 7,2 con ácido clorhídrico 0,01 M y la solución se
somete a ultrafiltración a través de una membrana con el límite de
exclusión 3.000 (Amicon YM3). Después de liofilización, se obtienen
6 mg del conjugado de tiourea.
Una solución de ^{90}itrio, disuelto en
solución 0,05 M de acetato de amonio (aproximadamente 380 mCi), se
añade a 1 mg del derivado de tiourea del Ejemplo 4a) en 0,5 ml de
solución 0,05 M de acetato de amonio de pH 6, se ajusta a pH 5,2 con
ácido acético 3 M y se agita durante una hora a la temperatura
ambiente. Se ajusta a pH 7,0 con solución 0,01 M de hidróxido de
sodio y el conjugado se purifica por HPLC
(TSK-400/tampón MES). Se reúnen las fracciones
principales, se diluyen con solución fisiológica de sal común y se
llevan a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido de sodio. Después
de filtración, se obtiene una preparación adecuada para la
radioterapia.
El oligonucleótido 30mero
5'-AGGAGGAGGAGGGAGAGCGCAAAUGAGAUU-3'
(seq.no. 13 de la Patente U.S. No. 5.270.163) identificado de
acuerdo con el proceso SELEX, modificado en las unidades azúcar y
por una secuencia enlazada en 5' de 5 timidinas, se produce de la
manera usual en un sintetizador automático de la compañía Pharmacia
(véase Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach,
compilador F. Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York,
Tokyo, 1991), y el oligonucleótido está presente también en la
columna del vehículo sólido. Por reacción con solución de ácido
tricloroacético en diclorometano, se abre el grupo
5'-hidroxi. La carga de la columna es
aproximadamente 10 mg de oligonucleótido 35mero. Para unir el
enlazador, se hace reaccionar la columna con una solución de 50
\mumol de
\beta-cianoetil-N,N-diisopropilamino-S-tritil-6-mercapto)-fosforamidito
en acetonitrilo en presencia de tetrazol. La oxidación del fosfito
formado para dar el fosfotriéster completamente protegido tiene
lugar con yodo en tetrahidrofurano. A continuación, se lava la
columna sucesivamente con metanol y agua. Para separar el
oligonucleótido modificado del vehículo sólido, el contenido de la
columna se transfiere a un multivial, se mezcla con 5 ml de solución
de amoníaco al 30%, se cierra herméticamente el recipiente y se
agita mediante sacudidas durante una noche a 55ºC. Se enfría luego a
0ºC, se centrifuga, se lava el vehículo con 5 ml de agua y las fases
acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para la purificación, el material sólido se
recoge en 2 ml de agua, se mezcla con 2 ml de solución 0,5 M de
acetato de amonio y se mezcla con 10 ml de etanol, se deja en reposo
durante una noche a -20ºC, se centrifuga, se lava el
residuo con 1 ml de etanol (-20ºC) y se seca finalmente a vacío a la
temperatura ambiente.
Se obtienen 9 mg del compuesto del título
tritilado en S. Para escindir el grupo protector tritilo, se
disuelve el producto en 0,5 ml de agua, se seca con 0,1 ml de
solución 1 M de nitrato de plata y se agita durante 1 hora a la
temperatura ambiente. A continuación, se mezcla con 0,1 ml de
solución 1 M de ditiotreitol. Después de 15 minutos, se centrifuga,
y la solución sobrenadante se extrae varias veces con acetato de
etilo. Después de la liofilización, se obtienen 8 mg del compuesto
del título deseado a partir de la solución acuosa.
Se añaden gota a gota 19,58 g de cloruro del
ácido metanosulfónico en 50 g de hidrocloruro del éster metílico de
4-benciloxi-fenilalanina en 300 ml
de piridina a 0ºC y se agita durante 3 horas a 0ºC. Se evapora a
sequedad a vacío y el residuo se disuelve en 500 ml de
diclorometano. Se agita 2 veces mediante sacudidas con 300 ml de
ácido clorhídrico 5 N cada vez, se seca sobre sulfato de magnesio y
se concentra por evaporación a vacío. El residuo se recristaliza en
150 ml de metanol.
Rendimiento: 53,64 g de un polvo cristalino
incoloro.
37,2 g de éster metílico de
4-benciloxi-N-metano-sulfonil)fenilalanina
y 1,2 l de 1,2-diaminoetano se agitan durante 3
horas a 80ºC. El residuo se evapora a sequedad y se precipita
absortivamente con 200 ml de agua; el precipitado se filtra con
succión, se lava hasta neutralidad con agua y se seca durante una
noche a 60ºC.
Rendimiento: 37,68 g de un polvo amorfo de color
crema.
Una solución de 16,23 g de
2-(4-benciloxibencil)-1-metanosulfonil-1,4,7-triazaheptan-3-ona
y 4,76 g de tri-etilamina en 200 ml de cloroformo
se mezcla a 0ºC con una solución de 10,27 g de dicarbonato de
di-terc-butilo en 50 ml de
cloroformo. Se agita durante 5 horas a la temperatura ambiente, se
agita mediante sacudidas con solución de carbonato de sodio al 5% y
agua, se seca sobre sulfato de magnesio y se concentra por
evaporación a vacío. El residuo se recristaliza en 100 ml de
metanol.
Rendimiento: 20,19 g de un sólido alveolar.
20 g de
2-(4-benciloxibencil)-1-metanosulfonil-7-(terc-butiloxicarbonil)-1,4,7-triazaheptan-3-ona,
disueltos en 300 ml de diclorometano, se agitan con 4 g de
paladio-carbono (al 10%) durante una noche en
atmósfera de hidrógeno. Se filtra y la solución se concentra por
evaporación a vacío.
Rendimiento: 16,17 g de una espuma vítrea, que
solidifica después de unos cuantos minutos.
15 g de
2-(4-hidroxibencil)-1-metanosulfonil-7-(terc-butiloxicarbonil)-1,4,7-triazaheptan-3-ona,
8,56 g de éster bencílico del ácido bromoacético y 13,18 g de
carbonato de potasio se calientan a reflujo en 300 ml de
acetonitrilo durante 24 horas. Se filtra y se evapora a sequedad a
vacío. El residuo se disuelve en 200 ml de diclorometano, y se agita
2 veces mediante sacudidas con 50 ml de agua cada vez. La fase
orgánica se seca sobre sulfato de magnesio y se concentra por
evaporación a vacío. El residuo se cromatografía con
diclorometano-hexano-acetona
(20/10/1) como eluyente.
Rendimiento: 10,06 g de un sólido alveolar.
10 g de 2-[4-(éster bencílico del ácido
3-oxapropiónico)-bencil]-1-metanosulfonil-7-(terc-butiloxi-carbonil)-1,4,7-triazaheptan-3-ona
se agitan durante una hora a la temperatura ambiente con 100 ml de
ácido trifluoroacético. Se evapora a sequedad a vacío.
Rendimiento: 9,2 g de una espuma vítrea, que
solidifica al dejarla en reposo.
9 g de 2-[4-(éster bencílico del ácido
3-oxa-propiónico)-bencil]-1-metanosulfonil-1,4,7-triazaheptan-3-ona
y 1,78 g de trietilamina se disuelven en 200 ml de cloroformo. A
0ºC, se añaden gota a gota 1,98 g de cloruro de cloroacetilo,
disueltos en 20 ml de cloroformo, en el transcurso de 30 minutos y
se agita luego durante 2 horas a 0ºC. Se lava con 100 ml de ácido
clorhídrico al 5%, 2 veces con 50 ml de agua cada vez, se seca sobre
sulfato de magnesio y se evapora a sequedad a vacío. El residuo se
cromatografía sobre gel de sílice con
diclorometano-acetato de etilo (20/1) como
diluyente.
Rendimiento: 6,97 g de un sólido céreo.
6,5 g de
9-cloro-1-metanosulfonil-2-[4-(éster
bencílico del ácido
3-oxapropiónico)-bencil]-1,4,7-triaza-3,8-diona,
disueltos en 150 ml de diclorometano, se agitan con 2 g de
paladio-carbono (al 10%) durante una noche en
atmósfera de hidrógeno. Se filtra y la solución se concentra por
evaporación a vacío.
Rendimiento: 5,33 g de un sólido vítreo.
5 g de
9-cloro-1-metanosulfonil-2-[4-(éster
bencílico del ácido
3-oxapropiónico)-bencil]-1,4,7-triaza-3,8-diona,
disueltos en 80 ml de cloroformo, se calientan a reflujo con 1,98 g
de trietilamina y 0,74 g de ácido tioacético durante 10 minutos. La
solución se vierte en 200 ml de ácido clorhídrico al 5% enfriado en
hielo, se separa la fase orgánica, se seca sobre sulfato de magnesio
y se concentra por evaporación a vacío. Después de cromatografía
sobre gel de sílice con hexano-acetato de etilo
(3/1), se obtienen 4,64 g del compuesto deseado como un sólido
ví-
treo.
treo.
4 g de
10-acetil-2-[4-ácido
3-oxapropiónico)-bencil]-1-(metanosulfonil)-10-tia-1,4,7-triazadecano-3,8-diona,
1,91 g de diciclohexilcarbodiimida, 4 g de
N-hidroxi-succinimida y 30 mg de
4-dimetilaminopiridina se agitan durante 24 horas en
20 ml de cloroformo a la temperatura ambiente. Se mezcla luego con
20 ml de dietil-éter, se filtra, y el residuo se concentra por
evaporación a vacío. El residuo se cromatografía sobre gel de sílice
con diclorometano-dioxano (10/1) como eluyente.
Rendimiento: 3,47 g de un sólido de color
crema.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 46,15 | H 4,93 | N 9,78 | S 11,20 |
| Enc.: | C 46,03 | H 4,83 | N 9,64 | S 11,05 |
3 g de
10-acetil-2-[4-(ácido
3-oxapropiónico-(2,5-dioxo-pirrolidin-1-il)-éster)-bencil]-1-(metanosulfonil)-10-tia-1,4,7-triazadecano-3,8-diona
y 1,17 g de hidrazida del ácido 6-maleimidocaproico
(Science 261, 212 (1993)) se agitan en 40 ml de
dimetilformamida durante 5 horas a 60ºC. Con agitación enérgica, se
añaden gota a gota 100 ml de agua y se separan por filtración del
precipitado producido. Se seca a vacío y el residuo se purifica por
cromatografía súbita en una columna de gel de sílice con
diclorometano/dioxano (10/1) como eluyente. Se obtienen 2,8 g del
compuesto del título como un sólido blanco.
Análisis elemental (referido a sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 49,25 | H 5,61 | N 12,30 | S 9,39 |
| Enc.: | C 49,33 | H 5,95 | N 12,43 | S 1,11 |
5 mg del oligonucleótido que contiene tiol
producido de acuerdo con el Ejemplo 5a) se mezclan en 2 ml de tampón
de fosfato (pH 7,4) con 1 mg del derivado de maleimida, producido de
acuerdo con el Ejemplo 5l), disuelto en 0,2 ml de dimetilformamida.
Se deja en reposo durante 2 horas a la temperatura ambiente, y la
solución se somete a ultrafiltración a través de una membrana con el
límite de exclusión 3.000 (Amicon YM3) seguido por liofilización. Se
obtienen 5 mg del conjugado deseado.
1 ml de una solución de
D-glucarato de potasio (12 mg/ml) y cloruro de
estaño(II) (100 \mug/ml) en NaHCO_{3} 0,2 M se liofilizan
en un vial y se mezclan luego con solución de
[Tc-99m]pertecnetato de sodio (1 ml, 1 mCi)
procedente de un generador de
Mo-99/Tc-99m. Después de dejar en
reposo a la temperatura ambiente durante 15 minutos, se retira una
parte alícuota y se mezcla con el mismo volumen del conjugado del
Ejemplo 5m) (1 mg/ml) disuelto en solución 0,2 M de NaHCO_{3}.
Después de 15 minutos, tanto la cromatografía en capa fina como la
HPLC demostraron que más del 98% de la radiactividad había sido
retenida por el conjugado.
3 mg de
S-benzoil-MAG_{3}-2,3,5,6-tetrafluorofeniléster
(producido de acuerdo con el documento US 4.965.392), disueltos en
0,2 ml de dimetilformamida, se añaden a 8 mg del compuesto del
título del Ejemplo 1a), disueltos en 0,5 ml de tampón de fosfato 0,1
M (pH 7), y se agita durante 3 horas a la temperatura ambiente. Se
diluye con agua y la solución se somete a ultrafiltración (Amicon
YM3, límite de exclusión 3.000). Después de liofilización, se
obtienen 5 mg del conjugado 6a).
1 mg del compuesto del título del Ejemplo 6a) se
disuelve en 200 \mul de agua y se mezcla con 1 ml de tampón de
fosfato 0,1 M de pH 8,5. Se añaden a esta mezcla 200 \mul de
solución de gluconato de ^{99m}tecnecio-(V) (aproximadamente 15
mCi) y se deja en reposo durante 15 minutos a la temperatura
ambiente. El rendimiento de trazador (determinado por HPLC) es
aproximadamente 95%.
Se añaden 3 mg del compuesto del título del
Ejemplo 1a), disueltos en 0,6 ml de tampón de fosfato, al complejo
con ^{99m}tecnecio del éster del ácido
2,3,5,6-tetrafluorofenil-4,5-bis(mercaptoacetamido)-pentanoico
(producido de acuerdo con: J. Nucl. Med. 32, 1445 (1991))
aproximadamente 100 mCi, disueltos en 2 ml de tampón de fosfato, pH
7,2. Se ajusta a pH 10 con tampón 1,0 M de carbonato de potasio y se
agita durante 20 minutos a la temperatura ambiente. Para la
purificación final, se añade la solución a una columna Sephadex
(Pharmacia) y se eluye con 75 mmol de solución de cloruro de sodio.
Se reúnen las fracciones principales, se diluyen con solución
fisiológica de sal común y se filtran. La solución así obtenida
puede utilizarse para estudios de radiodiagnóstico.
5 mg del oligonucleótido que contiene el grupo
tio producido de acuerdo con el Ejemplo 5a) se mezclan bajo N_{2}
en 2 ml de tampón de fosfato (pH 7,4) con 1 mg de
5-(N-maleimido)-3-oxapentil-{2-[3-carboxi-benzoil)-tio]-acetil}-glicilglicilglicinato
(producido de acuerdo con Bioconj. Chem. 1, 431 (1990)),
disuelto en 0,2 ml de dimetilformamida. Se deja en agitación durante
2 horas a la temperatura ambiente y la solución se somete a
ultrafiltración a través de una membrana (Amicon YM3) seguido por
liofilización. Se obtienen 5,5 mg del conjugado deseado.
1 ml de una solución de
D-glucarato de potasio (12 mg/ml) y cloruro de
estaño(II) (100 \mug/ml) en NaHCO_{3} 0,2 M se liofiliza
en un vial y se mezcla luego con solución de
[Tc-99m]-pertecnetato de sodio (1
ml, 1 mCi) procedente de un generador de
Mo-99/Tc-99m. Después de permanecer
en reposo a la temperatura ambiente durante 15 minutos, se retira
una parte alícuota y se mezcla con el mismo volumen del conjugado
del Ejemplo 8a) (1 mg/ml) disuelto en solución 0,2 M de NaHCO_{3}.
La sustancia puede aislarse por liofilización. El rendimiento de
trazador determinado por HPLC es mayor que 96%.
Una solución de 4 mg del oligonucleótido que
contiene el grupo tio, producido de acuerdo con el Ejemplo 5a), en 2
ml de tampón de fosfato (pH 7,4) se mezcla bajo N_{2} con 1 mg de
1-[6-(2-vinil-6-hexil-oximetil)-piridina]-1,4,8,11-tetraazaciclotetradecano
(producido de acuerdo con el documento EP 0 588 229), disuelto en
0,5 ml de dimetilformamida. Se deja en agitación durante 4 horas a
35ºC, se mezcla con 10 ml de etanol y el producto se aisla por
centrifugación. La purificación tiene lugar por cromatografía en
fase inversa en una columna de 1 x 25 cm con un gradiente de 50 mmol
de acetato de trietilamonio (pH 7)/acetonitrilo. Las fracciones
reunidas se liofilizan, se disuelven en 1 ml de agua y se desalan en
una columna Sephadex G-10. El compuesto del título
(aproximadamente 4 mg) se aisla por liofilización.
El procedimiento se lleva a cabo como se describe
en el Ejemplo 8b). El rendimiento de trazador, determinado por HPLC,
es 92%.
Una solución de 6,5 mg del oligonucleótido que
contiene el grupo tiol, producido de acuerdo con el Ejemplo 5a), en
2 ml de tampón de fosfato (pH 8,0) se mezcla con 1,2 mg de
N-[4-hidroxi-3-(1,4,8,11-tetraaza-ciclotetra-dec-5-il)-bencil-2-(6-vinil-piridin-2-ilmetoxi)-acetamida
(producida de acuerdo con J. Chem. Soc., Chem. Commun. 156 (1988)),
disuelta en 0,1 ml de dimetilformamida. Se agita durante 4 horas
bajo N_{2} a 35ºC, se mezcla con 10 ml de etanol y el producto se
aisla por centrifugación. La purificación tiene lugar por
cromatografía en fase inversa en una columna de 1 x 25 cm con un
gradiente de 50 mmol acetato de trietilamonio (pH 7)/acetonitrilo).
Las fracciones reunidas se desalan en una columna Sephadex
G-10. Por liofilización, se obtienen 5 mg del
compuesto del título como un polvo blanco.
1 mg del conjugado obtenido de acuerdo con 10a)
se incuba en un 1 ml de tampón de fosfato (pH 8) con
^{64}CuCl_{2} (0,2 mCi). El rendimiento de trazador, determinado
después de 1 hora por HPLC, es > 98%. El producto se aisla por
liofilización.
1 mg de ácido
1,4,7,10-tetraazaciclododecano-2-[(5-aza-8-maleimido-6-oxo)-octano]-1,4,7,10-tetraacético
(producido de acuerdo con J. Chem. Soc., Chem. Commun. 796, (1989))
se añade a una solución de 5 mg del oligonucleótido que contiene
grupo tiol, producido de acuerdo con el Ejemplo 5a), en 2 ml de
tampón de fosfato (pH 8) bajo N_{2}. Se agita durante 3 horas a
35ºC, se mezcla con 10 ml de alcohol isopropílico y el producto se
aisla por centrifugación. La purificación tiene lugar por
cromatografía en fase inversa en una columna de 1 x 25 cm con un
gradiente de 25 mmol de acetato de trietilamonio (pH
7)/acetonitrilo). Las fracciones reunidas se concentran
cuidadosamente por evaporación a vacío, se disuelven en un poco de
agua y se desalan con ayuda de una columna Sephadex
G-10. Por liofilización, se obtienen 4 mg del
compuesto del título en forma de un polvo blanco.
Se mezcla acetato de ^{90}Y (1 mCi), disuelto
en 1 ml de solución 0,05 M de acetato de amonio, con 1 mg del
conjugado producido de acuerdo con el Ejemplo 11a) y se calienta
durante 1 hora a 85ºC. El rendimiento de trazador, determinado por
HPLC, es > 95%. El producto se aisla por liofilización.
1 mg de ácido
1,4,7,10-triazaciclononano-2-[(5-aza-8-maleimido-6-oxo)-octano]-1,4,7-triacético
(producido de acuerdo con J. Chem. Soc., Chem. Commun. 794, (1989))
se añade a una solución de 5 mg del oligonucleótido que contiene
grupo tiol, producido de acuerdo con el Ejemplo 5a), en 2 ml de
tampón de fosfato (pH 8) bajo N_{2}. Se agita durante 6 horas a
35ºC, se mezcla con 10 ml de isopropanol y el producto se aisla por
centrifugación. La purificación tiene lugar por cromatografía en
fase inversa en una columna de 1 x 25 cm con un gradiente de 25 mmol
de acetato de trietilamonio (pH 7)/acetonitrilo. Las fracciones
reunidas se concentran cuidadosamente por evaporación a vacío, se
disuelven en un poco de agua y se desalan con ayuda de una columna
Sephadex G-10. Por liofilización, se obtienen 3 mg
del compuesto del título como un polvo blanco.
20 mg del conjugado producido de acuerdo con el
Ejemplo 12a) se disuelven en 0,5 ml de tampón de citrato 0,1 M de pH
4,5 y se mezclan con 0,1 ml de una solución de citrato de
galio-67 (0,2 mCi). Se deja en reposo durante 2
horas a la temperatura ambiente y el producto se desala en una
columna Sephadex G-10. Después de liofilización, se
obtienen 17 mg del compuesto del título como un polvo blanco.
50 mg de 4-dimetilaminopiridina,
3 ml de diisopropil-etilamina y 962 \mul (4,31
mmol) de
2-cianoetil-N,N-diisopropilclorofosforamidito
se añaden sucesivamente a una solución agitada de 2,1 g (3,59 mmol)
de
5'-0-(4,4'-dimetoxitritil)-5-(prop-2-en-1-ona)-2'-desoxiuridina
(producida de acuerdo con Nucleosides & Nucleotides 13,
939-944, (1994)) en 50 ml de tetrahidrofurano.
Después de aproximadamente 30 min, se forma un precipitado blanco.
Se filtra, se concentra la solución por evaporación a vacío y el
residuo se reparte entre diclorometano y solución de bicarbonato de
sodio al 5%. La fase de diclorometano se seca sobre sulfato de
magnesio y se concentra por evaporación a vacío. El residuo se
purifica por cromatografía rápida en gel de sílice, y se eluye con
diclorometano/hexano/diisopropiletilamina (80:18:2). Se obtienen 1,8
g del compuesto deseado como una espuma blanca.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 64,28 | H 6,29 | N 7,14 | P 3,95 |
| Enc.: | C 64,02 | H 6,60 | N 7,21 | P 4,09 |
U^{*}:
5-(prop-2-en-1-ona)-2'-desoxiuridina
Se produce el oligonucleótido 30mero identificado
de acuerdo con el proceso SELEX con la modificación de una secuencia
enlazada en 5' 5'-T*T*T*T*T de la manera usual en un
sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo, 1991),
y el oligonucleótido está presente también en la columna del
vehículo sólido. Por reacción con solución de ácido tricloroacético
en diclorometano, se abre el grupo 5'-hidroxi. La
carga en la columna es aproximadamente 10 mg del oligonucleótido
35mero. El grupo 5'-hidroxi se hace reaccionar en
presencia de tetrazol con el fosforamidito obtenido de acuerdo con
el Ejemplo 13a). A continuación, el fosfito se convierte en el
fosfotriéster por tratamiento con solución de yodo, y el radical DMT
terminal se escinde por reacción con solución de ácido
tricloroacético en diclorometano. Para la adición de un grupo tiol
al sistema de carbonilo \alpha,\beta-insaturado
presente en la 2'-desoxiuridina terminal, se hace
reaccionar la misma con una solución de
10-(4-aza-2-hidroxi-5-imino-8-mercapto-octano)-1,4,7-tris(carboximetil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano*)
en tetrahidrofurano y se lava sucesivamente con metanol y agua. Para
separar el oligonucleótido modificado del vehículo sólido, se
transfiere el contenido de la columna a un multivial, se mezcla con
5 ml de solución de amoníaco al 30%, se cierra herméticamente el
recipiente y se agita mediante sacudidas durante una noche a 55ºC.
Se enfría luego a 0ºC, se centrifuga, se lava el vehículo con 5 ml
de agua y las fases acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para purificación, el material sólido se recoge
en 2 ml de agua, se mezcla con 2 ml de solución 0,5 M de acetato de
amonio y se mezcla con 10 ml de etanol, se deja en reposo durante
una noche a -20ºC, se centrifuga, se lava el residuo con
1 ml de etanol (-20ºC) y se seca finalmente a vacío a la temperatura
ambiente.
Se obtienen 6 mg del compuesto del título como un
polvo incoloro.
*) El
10-(4-aza-2-hidroxi-5-imino-8-mercapto-octano)-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano
se obtiene como se describe a continuación:
Se añaden 15,7 ml de solución 1 N de hidróxido de
sodio y 480 mg (3,49 mmol) de hidrocloruro de
2-iminotetrahidrotiofeno a una solución de 1,46 g
(3,49 mmol) de
10-(3-amino-2-hidroxi-propil)-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano
(véase Ejemplo 1c) en una mezcla de 50 ml de agua y 50 ml de metanol
y se agita durante 3 horas a la temperatura ambiente, se concentra
por evaporación a vacío hasta aproximadamente 1/4 del volumen
inicial y se mezcla por agitación con un cambiador de aniones (IRA
410) hasta que se alcanza un pH de 11. Se filtra la solución y se
mezcla con agitación en pequeñas porciones con cantidad suficiente
del cambiador de cationes IRC 50 hasta que se alcanza un pH de 3,5.
Después de filtrar, se liofiliza la solución. Se obtienen 1,39 g de
la sustancia deseada como un polvo blanco que tiene un contenido de
agua de 4,9%.
Análisis elemental (referido a la sustancia
anhidra):
| Calc.: | C 48,45 | H 7,74 | N 16,14 | S 6,16 |
| Enc.: | C 48,30 | H 7,98 | N 16,05 | S 6,44 |
U^{*}:
5-(prop-2-en-1-ona)-2'-desoxiuridina
Se añade una solución de ^{90}itrio, disuelto
en solución 0,05 M de acetato de amonio (aproximadamente 380 mCi), a
1 mg del tio-derivado del Ejemplo 13b) en 0,5 ml de
solución 0,05 M de acetato de amonio de pH 6, se ajusta a pH 5,2 con
ácido acético 3 M y se agita durante 1 hora a la temperatura
ambiente. Se ajusta a pH 7,0 con solución 0,01 M de hidróxido de
sodio y el conjugado se purifica por HPLC
(TSK-400/tampón MES). Las fracciones principales se
reúnen, se diluyen con solución fisiológica de sal común y se llevan
a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido de sodio. Después de
filtración, se obtiene una preparación adecuada para
radioterapia.
3,34 g (10 mmol) de ácido
S-trifenilmetil-mercaptoacético y
1,83 g (10 mmol) de hidrocloruro del éster metílico de glicilglicina
se suspenden en 250 ml de diclorometano absoluto. Después de añadir
1,01 g (10 mmol) de trietilamina, se añaden gota a gota 2,06 g (10
mmol) de diciclohexilcarbodiimida, disueltos en 50 ml de
diclorometano absoluto enfriando con hielo. Se agita durante 1 hora
a 0ºC y durante 18 horas a la temperatura ambiente. Se filtra, se
concentra por evaporación y se cromatografía sobre gel de sílice
(eluyente: CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 10%-30%).
Rendimiento: 3,56 g (77,0% de la teoría)), polvo
blanco
Análisis elemental:
| Calc.: | C 67,51 | H 5,67 | N 6,06 | O 13,84 | S 11,20 |
| Enc.: | C 67,37 | H 6,02 | N 5,91 | S 6,73 |
4,63 g (10 mmol) de éster metílico de
S-(trifenil-metil-mercaptoacetil)-glicil-glicina,
producido de acuerdo con el Ejemplo 14a), se calientan a 100ºC en
11,72 g (100 mmol) de 6-aminohexanol/50 ml de
1,4-dioxano en atmósfera de argón durante 2 horas. A
continuación, la carga de reacción se vierte sobre una mezcla de 100
ml de diclorometano y 100 ml de agua. Con agitación y enfriamiento
con hielo, se ajusta un pH de 6 con ácido clorhídrico 10 M, se
separa la fase orgánica y se seca sobre sulfato de sodio. Después de
evaporación del disolvente, el producto bruto se purifica sobre gel
de sílice (eluyente: CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 10%-50%).
Rendimiento: 2,97 g (54,2% de la teoría)), polvo
blanco
Análisis elemental:
| Calc.: | C 67,98 | H 6,81 | N 7,67 | O 11,68 | S 5,85 |
| Enc.: | C 67,72 | H 6,93 | N 7,93 | S 5,64 |
5,48 g (10 mmol) del
[S-(trifenilmetil-mercapto-acetil)-glicil-glicinamidil]-6-hexanol
producido de acuerdo con el Ejemplo 14b) se disuelven en 100 ml de
diclorometano absoluto. Se añaden 5,17 g (40 mmol) de
diisopropiletilamina en atmósfera de argón y se añaden gota a gota a
0ºC 3,95 g (20 mmol) de cloruro de diisopropilamida de éster
monometílico de ácido fosforoso, disueltos en 50 ml de diclorometano
absoluto. Se agita durante 0,5 horas a 0ºC y luego durante 2 horas a
la temperatura ambiente. Para el tratamiento de acabado, se mezcla
bajo enfriamiento en hielo con 320 mg (10 mmol) de metanol absoluto,
y después de concentración, se cromatografía sobre gel de sílice
(eluyente: CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 95%:5/5% trietilamina).
Rendimiento: 1,98 g (27,9% de la teoría)), aceite
incoloro.
Se produce un oligonucleótido 30mero,
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia enlazada en 5'-T*T*T*T*T con ayuda de
un sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo,
(1991)), y el oligonucleótido está presente también en forma
protegida en la columna del vehículo sólido. La carga en la columna
es aproximadamente 15 mg de oligonucleótido 35mero. Después de
escisión del grupo protector 5'-DMT (ácido
tricloroacético/diclorometano), se acopla de acuerdo con los métodos
estándar con el fosforamidito descrito en el Ejemplo 14c). Después
de oxidación con yodo en tetrahidrofurano, el conjugado se escinde
del vehículo. En este caso, el material se mezcla con 10 ml de
solución de amoniaco al 30%, se cierra herméticamente el recipiente
y se agita mediante sacudidas durante una noche a 55ºC. Se enfría a
0ºC, se centrifuga, se lava el vehículo con 10 ml de agua y las
fases acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para purificación, el material se recoge en 5 ml
de agua, se mezcla con 4 ml de solución 0,5 M de acetato de amonio y
se mezcla con 20 ml de etanol. Para completar la precipitación, se
enfría durante una noche (-20ºC), se centrifuga, se lava el residuo
con 1 ml de etanol (-20ºC) y se seca a vacío. Se obtienen 9 mg de un
polvo blanco.
Para escisión de grupo protector
S-tritilo, el material se recoge en 5 ml de solución
50 milimolar de acetato de trietilamonio (pH 7,0) y se incuba con
500 \mul de solución 0,1 M de nitrato de plata durante 30 minutos.
A continuación, se añaden 500 \mul de solución 0,14 M de
ditiotreitol y se incuba durante otros 30 minutos. Después de
centrifugar, el sobrenadante claro se desala sobre Sephadex
G-10. Las fracciones que contienen el producto se
liofilizan. Se obtienen 4 mg del conjugado como un polvo blanco.
1 mg del conjugado 14d) se disuelve en 1 ml de
tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH = 9,5). Después de
añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con solución de
pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 ml de solución de
cloruro de estaño(II) (5 mg de SnCl_{2}/1 ml de HCl 0,01
M). El rendimiento de trazador (aproximadamente 93%) se determina
por HPLC.
Se disuelven 5,48 g (10 mmol) del
[S-(trifenilmetil-mercaptoacetil)-glicil-glicinamidil]-6-hexanol
producido de acuerdo con el Ejemplo 14b) en 100 ml de diclorometano
absoluto. Se añaden 1,01 g (10 mmol) de trietilamina y 1,91 g (10
mmol) de cloruro del ácido p-toluenosulfónico y se
agita durante 24 horas a la temperatura ambiente. A continuación, se
concentra y se cromatografía sobre gel de sílice (eluyente:
CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 95:5).
Rendimiento: 4,32 g (61,5% de la teoría)), aceite
incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 65,03 | H 6,18 | N 5,99 | O 13,68 | S 9,14 |
| Enc.: | C 64,93 | H 6,32 | N 5,78 | S 8,87 |
Se produce un oligonucleótido 30mero,
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia en 5'-T*T*T*T*T con ayuda de un
sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo,
(1991)), y el oligonucleótido está presente también en forma
protegida en la columna del vehículo sólido. La carga de la columna
es aproximadamente 15 mg de oligonucleótido 35mero. Después de
escisión del grupo protector 5'-DMT (ácido
tricloroacético/diclorometano), se acopla de acuerdo con los métodos
estándar con
S-tritil-6-mercapto-hexil-fosforamidito.
Después de oxidación con yodo en tetrahidrofurano, el compuesto
protegido con tritilo se escinde del vehículo, se aisla y se
purifica (véase Ejemplo 14d).
La escisión del grupo protector
S-tritilo, el aislamiento del oligonucleótido que
lleva el grupo SH y la purificación tienen lugar como se describe en
el Ejemplo 14d) (6 mg).
Para el acoplamiento, el oligonucleótido 35mero
que lleva el grupo SH (6 mg) en 500 \mul de solución 0,1 M de
carbonato de sodio se mezcla en atmósfera de argón con 100 mg de
éster del ácido toluenosulfónico 15a), disuelto en 500 \mul de
dimetilformamida. Después de 30 minutos, se neutraliza y se diluye
con agua hasta un volumen de 5 ml. Después de la centrifugación, el
sobrenadante claro se liofiliza.
Para escisión de los grupos
S-tritilo, el procedimiento se realiza como se ha
descrito en 14d). Después de purificación, se obtienen 4 mg del
conjugado.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 15b) se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
9,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg de SnCl_{2}/1 ml de
HCl 0,01 M). El rendimiento de trazador (aproximadamente 95%) se
determina por HPLC.
2,69 g (10 mmol) de éster metílico de
N-[3-tia-5-(trifenilmetilmercapto)-1-oxo-pent-1-il]-S-trifenilmetil-cisteína
(producción de acuerdo con el documento DE 43 10 999) se disuelven
junto con 5,58 g (20 mmol) de cloruro de trifenilmetilo en 100 ml de
diclorometano absoluto. Después de añadir 2,02 g (20 mmol) de
trietilamina, se deja en agitación durante una noche en atmósfera de
argón a la temperatura ambiente. Para el tratamiento de acabado, la
fase orgánica se lava tres veces en cada caso con solución de ácido
cítrico al 1%, solución saturada de bicarbonato de sodio y con agua.
Después de secar sobre sulfato de sodio, se concentra por
evaporación y se purifica sobre gel de sílice (eluyente:
CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 95:5).
Rendimiento: 4,53 g (60,1% de la teoría)) de
aceite incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 73,27 | H 5,75 | N 1,86 | O 6,37 | S 12,76 |
| Enc.: | C 73,31 | H 5,48 | N 1,63 | S 12,49 |
7,54 g (10 mmol) del éster metílico de
N-[3-tia-5-(trifenilmetilmercapto)-1-oxo-pent-1-il]-S-cisteína
descrito en el Ejemplo 16a) se calientan a 100ºC en 11,72 g (100
mmol) de 6-aminohexanol/50 ml de
1,4-dioxano en atmósfera de argón durante 2 horas. A
continuación, la carga de reacción se vierte sobre una mezcla de 100
ml de diclorometano y 100 ml de agua. Con agitación y enfriamiento
en hielo, se ajusta a un pH de 6 con ácido clorhídrico 10 M, se
separa la fase orgánica y se seca sobre sulfato de sodio. Después de
evaporación del disolvente, el producto bruto se purifica sobre gel
de sílice (eluyente: CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 5%-50%).
Análisis elemental:
| Calc.: | C 72,99 | H 6,49 | N 3,34 | O 5,72 | S 11,46 |
| Enc.: | C 72,73 | H 6,62 | N 3,11 | S 11,17 |
8,39 g (10 mmol) de la
N-[3-tia-5-(trifenilmetil-mercapto)-1-oxo-pent-1-il]-S-trifenilmetil-N'-(6-hidroxi-hex-1-il)cisteinamida
producida según el Ejemplo 16b), se disuelven en 200 ml de
diclorometano absoluto. Se añaden 5,17 g (40 mmol) de
diisopropiletilamina en atmósfera de argón y se añaden gota a gota a
0ºC 3,95 g (20 mmol) de cloruro de éster monometílico del ácido
fosforoso-diisopropilamida, disueltos en 50 ml de
diclorometano absoluto. Se agita durante 0,5 horas a 0ºC y luego
durante 1,5 horas a la temperatura ambiente. Para el tratamiento de
acabado, se mezcla, enfriando con hielo, con 320 mg (10 mmol) de
metanol absoluto y, después de concentración, se somete a
cromatografía sobre gel de sílice (eluyente: CH_{2}Cl_{2}/MeOH:
95:5/5% (trietilamina)).
Rendimiento: 5,37 g (53,7% de la teoría)) de
aceite amarillento.
Se produce un oligonucleótido 30mero,
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia T*T*T*T*T-3' situada aguas arriba con
ayuda de un sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo,
(1991)), y el oligonucleótido está presente también en forma
protegida en la columna del vehículo sólido. La carga en la columna
es aproximadamente 15 mg de oligonucleótido 35mero. Después de
escisión del grupo protector 5'-DMT (ácido
tricloroacético/diclorometano), se acopla de acuerdo con los métodos
estándar con fosforamidito (16c) y se oxida luego.
La escisión del vehículo de los grupos
protectores básicos y la purificación del conjugado protegido con
bis-S-tritilo tienen lugar como se
describe en 14d) (aproximadamente 12 mg).
Para escisión de los grupos protectores
S-tritilo, el material se recoge en 5 ml de solución
50 milimolar de acetato de trietilamonio (pH = 7,0) y se incuba con
500 \mul de solución 0,1 M de nitrato de plata durante 30 minutos.
A continuación, se añaden 500 \mul de solución 0,14 M de
ditiotreitol y se incuba durante otros 30 minutos. Después de
centrifugar, el sobrenadante claro se desala sobre Sephadex G10. Las
fracciones que contienen el producto se liofilizan. Se obtienen 5 mg
de un polvo blanco.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 16d) se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
9,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 ml de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg de SnCl_{2}/1 ml de
HCl 0,01 M). El rendimiento de trazador (aproximadamente 96%) se
determina por HPLC.
8,39 g (10 mmol) de la
N-[3-tia-5-(trifenilmetil-mercapto)-1-oxo-pent-1-il]-S-trifenilmetil-N'-(6-hidroxi-hex-1-il)cisteinamida,
producida en el Ejemplo 16b, se disuelven en 200 ml de diclorometano
absoluto. Se añaden 1,01 g (10 mmol) de trietilamina y 1,91 g (10
mmol) de cloruro del ácido p-toluenosulfónico, y se
agita durante 20 horas a la temperatura ambiente. A continuación, se
concentra y se somete a cromatografía sobre gel de sílice.
(Eluyente: CH_{2}Cl_{2}/MeOH: 97:3).
Rendimiento: 6,44 g (67,0% de la teoría)) de un
aceite amarillento.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 72,47 | H 6,29 | N 2,91 | O 8,32 | S 10,01 |
| Enc.: | C 72,19 | H 6,47 | N 2,68 | S 9,83 |
Se produce un oligonucleótido 30mero,
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia T*T*T*T*T-3' situada aguas arriba con
ayuda de un sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo,
(1991)), y el oligonucleótido está presente también en forma
protegida en la columna del vehículo sólido. La carga en la columna
es aproximadamente 15 mg de oligonucleótido 35mero. Después de
escisión del grupo protector 5'-DMT (ácido
tricloroacético/diclorometano) se acopla de acuerdo con los métodos
estándar con
S-tritil-6-mercaptohexil-fosforamidito.
Después de oxidación con yodo en
tetrahidrofurano, el compuesto protegido con tritilo se escinde del
vehículo, se aisla y se purifica (véase Ejemplo 14d).
La escisión del grupo protector
S-tritilo, el aislamiento del oligonucleótido que
lleva el grupo SH y la purificación tienen lugar como se describe en
el Ejemplo 14d) (7,5 mg).
Para el acoplamiento, se mezcla el
oligonucleótido 30mero que lleva el grupo SH (7 mg) en 550 \mul de
solución 0,1 M de carbonato de sodio en atmósfera de argón con 180
mg de éster del ácido toluenosulfónico 17a), disuelto en 500 \mul
de dimetilformamida. Después de 30 minutos, se neutraliza y se
diluye con agua hasta un volumen de 5 ml. Después de la
centrifugación, se liofiliza el sobrenadante claro. Para escisión de
los grupos S-tritilo, el procedimiento se realiza
como se describe en 14d). Después de purificación, se obtienen 4,3
mg de conjugado.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 17b) se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
9,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de tecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg de SnCl_{2}/1 ml de
HCl 0,01 M). El rendimiento de trazador (aproximadamente 93%) se
determina por HPLC.
Se produce un oligonucleótido 30mero,
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia T*T*T*T*T-3' situada aguas arriba con
ayuda de un sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo,
(1991)), y el oligonucleótido está presente también en forma
protegida en la columna del vehículo sólido. La carga en la columna
es aproximadamente 15 mg de oligonucleótido 35mero. Después de
escisión del grupo protector 5'-DMT (ácido
tricloroacético/diclorometano), se acopla de acuerdo con los métodos
estándar con
N-trifluoroacetilaminohexilfosforamidito.
Después de oxidación con yodo en
tetrahidrofurano, el oligonucleótido que lleva el grupo amino se
escinde del vehículo y se aisla y purifica como se describe en 1b)
(9,3 mg).
Para acoplamiento con la monoamida del ácido
N-(tetrahidro-2-oxo-tiofen-3-il)-tiodiglicólico
(documento DE 43 11 023), se disuelven 5 mg del oligonucleótido que
lleva el grupo amino en 1 ml de solución 2 M de carbonato de sodio.
Después de añadir 100 mg del derivado tiolactona, se incuba durante
4 horas a la temperatura ambiente. A continuación, se neutraliza y
se realiza el desalado por ultrafiltración a través de una membrana
con un límite de exclusión de 3.000 (Amicon YM3). Después de
liofilización, se liofiliza una vez más. Se obtienen 6,3 mg del
conjugado deseado.
1 mg del conjugado que lleva el grupo SH descrito
en el Ejemplo 18a) se disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de
hidrogenofosfato disódico (pH = 9,5). Después de añadir 10 mg de
tartrato disódico, se mezcla con solución de pertecnetato de sodio
(1 mCi) y luego con 10 \mul de solución de cloruro de
estaño(II) (5 mg de SnCl_{2}/1 ml de HCl 0,01 M). El
rendimiento de trazador (94%) se determina por HPLC.
El oligonucleótido 30mero
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUA-3',
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia de
timidina-T^{3'-3'}T-5',
situada aguas arriba, que está unida por la posición 5' al vehículo,
se produce de la manera usual en un sintetizador automático de la
compañía Pharmacia (véase Oligonucleotides and Analogues, A
Practical Approach, compilador F. Eckstein, Oxford University Press,
Oxford, Nueva York, Tokyo, (1991)), y el oligonucleótido está
presente también en la columna del vehículo sólido. Por reacción con
solución de ácido tricloroacético en diclorometano, se abre el grupo
5'-hidroxi. La carga en la columna es
aproximadamente 10 mg del oligonucleótido 32mero. Para unir el
enlazador, la columna se hace reaccionar con una solución en
acetonitrilo de 50 \mumol de
\beta-cianoetil-N,N-diisopropilamino-6-(trifluoroacetamido)-1-hexil-fosforamidito
(producido de acuerdo con Nucl. Acids Res. 16,
2659-2669 (1988)) en presencia de tetrazol. La
oxidación del fosfito formado al fosfotriéster completamente
protegido tiene lugar con yodo en tetrahidrofurano. A continuación,
la columna se lava sucesivamente con metanol y agua. Para separar el
oligonucleótido modificado del vehículo sólido, el contenido de la
columna se transfiere a un multivial, se mezcla con 5 ml de solución
de amoniaco al 30%, se cierra herméticamente el recipiente y se
agita mediante sacudidas durante una noche a 55ºC. Se enfría luego a
0ºC, se centrifuga, se lava el vehículo con 5 ml de agua y las fases
acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para la purificación, el material sólido se
recoge en 2 ml de agua, se mezcla con 2 ml de solución 0,5 M de
acetato de amonio y se mezcla con 10 ml de etanol, se deja en reposo
durante una noche a -20ºC, se centrifuga, se lava el
residuo con 1 ml de etanol (-20ºC) y finalmente se seca a vacío a la
temperatura ambiente.
Se obtienen 8 mg del compuesto del título como un
polvo incoloro.
8 mg del oligonucleótido obtenido en el Ejemplo
19a) se disuelven en 2,5 ml de un tampón
NaHCO_{3}/Na_{2}CO_{3} (pH =
8,0) y se mezclan con 1 mg de 10-[7-(4-isotiocianatofenil)-2-hidroxi-5-oxo-7-(carboximetil)-4-aza-heptil]-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraaza-ciclododecano (compuesto del título del Ejemplo 1f). Se agita durante 5 horas a la temperatura ambiente, se ajusta el pH a 7,2 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M y la solución se somete a ultrafiltración a través de una membrana con el límite de exclusión 3.000 (Amicon YM3) seguido por liofilización. Se obtienen 7 mg del conjugado deseado.
8,0) y se mezclan con 1 mg de 10-[7-(4-isotiocianatofenil)-2-hidroxi-5-oxo-7-(carboximetil)-4-aza-heptil]-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraaza-ciclododecano (compuesto del título del Ejemplo 1f). Se agita durante 5 horas a la temperatura ambiente, se ajusta el pH a 7,2 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M y la solución se somete a ultrafiltración a través de una membrana con el límite de exclusión 3.000 (Amicon YM3) seguido por liofilización. Se obtienen 7 mg del conjugado deseado.
Se añaden 15 \mul de una solución de acetato de
^{111}indio(III) (350 \muCi), (producida a partir de
cloruro de ^{111}indio(III) en solución 2 M de acetato de
sodio y ajuste del pH a 4,0 con ácido clorhídrico 0,1 M) a 135
\mul de una solución de 1 mg del compuesto del título del Ejemplo
19b) en tampón MES, pH 6,2 (MES = ácido
2-(N-morfolino)etilsulfónico). El pH se lleva
a 4,2 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M. Se agita durante 1
hora a 37ºC a pH 4,2. Se lleva a pH 6 con solución 2 M de acetato de
sodio y se añaden 10 \mul de una solución 0,1 M de Na_{2}EDTA
(Na_{2}EDTA = sal disódica del ácido etilenodiaminatetraacético)
para complejar el exceso de ^{111}indio. La purificación final del
conjugado marcado así obtenido (1 h) tiene lugar por HPLC
(cromatografía de exclusión: TSK-400/tampón MES).
Las fracciones que contienen el conjugado marcado se diluyen con
solución fisiológica de sal común, se ajusta a pH 7,2 con solución
0,01 M de hidróxido de sodio y se filtra. Una solución así preparada
representa entonces una preparación adecuada para
radiodiagnóstico.
Se produce el oligonucleótido 30mero
5'-TAGGAGGAGGAGGGAGAGCGCAAAUGAGAUU-3'
(seq.no. 13 de la Patente U.S. No. 5.270.163), identificado de
acuerdo con el proceso SELEX, de la manera usual en un sintetizador
automático de la compañía Pharmacia (véase Oligonucleotides and
Analogues, A Practical Approach, compilador F. Eckstein, Oxford
University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo, (1991)), y el
oligonucleótido está presente también en la columna del vehículo
sólido. Las cuatro timidinas finales se fijan por fosforoditioatos a
la timidina presente en el extremo 5' de acuerdo con la técnica
descrita por G. Blaton et al. en "Oligonucleotides and
Analogues", pp. 109-135. Para este propósito, se
abre primeramente el grupo 5'-hidroxi por
tratamiento con ácido tricloroacético. A continuación, el grupo
3'-hidroxi de una
5'-DMTO-tiridina se convierte con
tris-pirrolidinofosfina y tetrazol en el diamidito,
que se convierte en el fosforotioamidito por adición de
2,4-diclorobencil-mercaptano. Este
compuesto se activa con tetrazol y se hace reaccionar con el grupo
5'-hidroxi del oligonucleótido a tiofosfatotriéster.
La oxidación a fosforoditioato tiene lugar con azufre elemental en
una solución de disulfuro de carbono, piridina y trietilamina
95:95:10. Los grupos bencilo no se eliminan todavía. De manera
análoga, se fijan también 3 timidinas adicionales. La carga en la
columna es aproximadamente 10 mg del oligonucleótido 35mero. A
continuación, se abre de nuevo un grupo
5'-hidroxi.
Para unir el enlazador, la columna se hace
reaccionar con una solución en acetonitrilo de 50 \mumol de
2-cianoetil-N,N'-diisopropilamino-6-(trifluoroacetamido)-1-hexil-fosforamidito
(lit. en el ejemplo en presencia de tetrazol. La oxidación del
fosfito formado al fosfotriéster tiene lugar con yodo en
tetrahidrofurano. A continuación, la columna se lava sucesivamente
con metanol y agua. Después de ello, los grupos protectores de los
enlaces ditionato se eliminan por una solución de
tiofenol/trietilamina/dioxano 1:2:2, lo que tiene lugar en 2 horas.
Después de ello, la columna se lava en cada caso con 3 veces su
volumen de metanol, se lava luego con éter y se seca. Para separar
el oligonucleótido modificado del vehículo sólido, el contenido de
la columna se transfiere a un multivial, se mezcla con 5 ml de
solución de amoniaco al 30%, se cierra herméticamente el recipiente
y se agita mediante sacudidas durante una noche a 55ºC. Se enfría
luego a 0ºC, se centrifuga, se lava luego el vehículo con 5 ml de
agua y las fases acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para la purificación, el material sólido se
recoge en 2 ml de agua, se mezcla con 2 ml de solución 0,5 M de
acetato de amonio y se mezcla con 10 ml de etanol, se deja en reposo
durante una noche a -20ºC, se centrifuga, se lava el
residuo con 1 ml de etanol (-20ºC), y finalmente se seca a vacío a
la temperatura ambiente.
Se obtienen 8 mg del compuesto del título como un
polvo incoloro.
Se disuelven 8 mg del oligonucleótido obtenido en
el Ejemplo 20a) en 2,5 ml de un tampón NaHCO_{3}/Na_{2}CO_{3}
(pH 8,0) y se mezclan con 1 mg de
10-[7-(4-isotiocianatofenil)-2-hidroxi-5-oxo-7-(carboximetil)-4-aza-heptil]-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano
(compuesto del título del Ejemplo 1f). Se agita durante 5 horas a la
temperatura ambiente, se ajusta el pH a 7,2 por adición de ácido
clorhídrico 0,01 M y la solución se somete a ultrafiltración a
través de una membrana con el límite de exclusión 3.000 (Amicon YM3)
seguido por liofilización.
Se obtienen 7 mg del conjugado deseado.
Se añaden 15 \mul de una solución de acetato de
^{111}indio(III) (350 \muCi), (producida a partir de
cloruro de ^{111}indio(III) en solución 2 M de acetato de
sodio y ajuste del pH a 4,0 con ácido clorhídrico 0,1 M) a 135
\mul de una solución de 1 mg del compuesto del título del Ejemplo
20b) en tampón MES, pH 6,2 (MES = ácido
2-(N-morfolino)etilsulfónico). El pH se lleva
a 4,2 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M. Se agita durante 1
hora a 37ºC a pH 4,2. Se lleva a pH 6 con solución 2M de acetato de
sodio y se añaden 10 \mul de una solución 0,1 M de Na_{2}EDTA =
sal disódica del ácido etilenodiamina-tetraacético,
para complejar el exceso de ^{111}indio. La purificación final del
conjugado así obtenido (1 h) tiene lugar por HPLC (cromatografía de
exclusión: TSK-400/tampón MES). Las fracciones que
contienen el conjugado marcado se diluyen con solución fisiológica
de sal común, se ajustan a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido
de sodio y se filtran. Una solución así producida representa
entonces una preparación adecuada para radiodiagnóstico.
Se obtiene el oligonucleótido 30mero
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUA-3',
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia T**T**T**T**T-3' situada aguas arriba,
primeramente por una secuencia de 5 timidinas conectada por grupos
cianoetilfosfato que se producen en el vehículo por 3'. Por reacción
de este compuesto con una solución 0,5 M de disulfuro de
tetraetiltiuram en acetonitrilo, la sulfonación al fosfonotioato
tiene lugar en el transcurso de 15 minutos que, posteriormente, con
el grupo 5'-hidroxilo libre es el material de
partida para el oligonucleótido 35mero. La síntesis total tiene
lugar de la manera usual en un sintetizador automático de la
compañía Pharmacia (véase Oligonucleotides and Analogues, A
Practical Approach, compilador F. Eckstein, Oxford University Press,
Oxford, Nueva York, Tokyo, (1991)), y el oligonucleótido está
presente todavía en la columna del vehículo sólido. Por reacción con
solución de ácido tricloroacético en diclorometano, se abre el grupo
5'-hidroxi. La carga en la columna es
aproximadamente 10 mg del oligonucleótido 35mero. Para unir el
enlazador, la columna se hace reaccionar con una solución en
acetonitrilo de 50 \mumol de
\beta-cianoetil-N,N-diisopropilamino-6-(trifluoroacetamido)-1-hexilfosforamidito
(producido de acuerdo con Nucl. Acids Res. 16,
2659-2669 (1988)) en presencia de tetrazol. La
oxidación del fosfito formado de este modo para dar el fosfotriéster
totalmente protegido tiene lugar con yodo en tetrahidrofurano. A
continuación, la columna se lava sucesivamente con metanol y agua.
Para separar el oligonucleótido modificado del vehículo sólido y
escindir los grupos cianoetilo, el contenido de la columna se
transfiere a un multivial, se mezcla con 5 ml de solución de
amoniaco al 30%, se cierra herméticamente el recipiente y se agita
mediante sacudidas durante una noche a 55ºC. Se enfría luego a 0ºC,
se centrifuga, se lava el vehículo con 5 ml de agua y las fases
acuosas reunidas se someten a liofilización.
Para la purificación, el material sólido se
recoge en 2 ml de agua, se mezcla con 2 ml de solución 0,5 M de
acetato de amonio y se mezcla con 10 ml de etanol, se deja en reposo
durante una noche a -20ºC, se centrifuga, se lava el
residuo con 1 ml de etanol (-20ºC) y finalmente se seca a vacío a la
temperatura ambiente.
Se obtienen 8 mg del compuesto del título como
polvo incoloro.
8 mg del oligonucleótido obtenido en el ejemplo
20a) se disuelven en 2,5 ml de un tampón
NaHCO_{3}/Na_{2}CO_{3} (pH 8,0) y se mezclan con 1 mg de
10-[7-(4-isotiocianatofenil)-2-hidroxi-5-oxo-7-(carboximetil)-4-aza-heptil]-1,4,7-tris-(carboximetil)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano
(compuesto del título del Ejemplo 1f). Se agita durante 5 horas a la
temperatura ambiente, se ajusta el pH a 7,2 por adición de ácido
clorhídrico 0,01 M y la solución se somete a ultrafiltración a
través de una membrana con el límite de exclusión 3.000 (Amicon YM3)
seguido por liofilización.
Se obtienen 7 mg del conjugado deseado.
15 \mul de una solución de acetato de
^{111}indio(III) (350 \muCi), (producida a partir de
cloruro de ^{111}indio(III) en solución 2 M de acetato de
sodio y ajuste del pH a 4,0 con ácido clorhídrico 0,1 M) se añaden a
135 \mul de una solución de 1 mg del compuesto del título del
Ejemplo 21b) en tampón MES, pH 6,2 (MES = ácido
2-(N-morfolino)etilsulfónico). El pH se lleva
a 4,2 por adición de ácido clorhídrico 0,01 M. Se agita durante 1
hora a 37ºC a pH 4,2. Se lleva a pH 6 con solución 2 M de acetato de
sodio y se añaden 10 \mul de una solución 0,1 M de Na_{2}EDTA =
sal disódica del ácido etilenodiamina-tetraacético
para complejar el exceso de ^{111}indio. La purificación final del
conjugado así obtenido (1 h) tiene lugar por HPLC (cromatografía de
exclusión: TSK-400/tampón MES). Las fracciones que
contienen el conjugado marcado se diluyen con solución fisiológica
de sal común, se ajustan a pH 7,2 con solución 0,01 M de hidróxido
de sodio y se filtran. Una solución así producida representa
entonces una preparación adecuada para radiodiagnóstico.
12,56 g (0,1 mol) de hidrocloruro del éster
metílico de glicina, 13,42 g (0,1 mol) de
2,5-ditia-ciclohexanona y 10,12 g
(0,1 mol) de trietilamina se disuelven en atmósfera de argón en 500
ml de diclorometano absoluto. Se agita durante 24 horas a la
temperatura ambiente, y la carga se vierte luego sobre 250 ml de
ácido cítrico acuoso al 5%. Se agita bien, se separa la fase
orgánica y se seca sobre sulfato de sodio. Después de evaporación
del disolvente a vacío, el residuo aceitoso se cromatografía sobre
gel de sílice (disolvente móvil: diclorometano/metanol, metanol
0-10%).
Rendimiento: 18,9 g (84,6%), aceite incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 37,65 | H 5,87 | N 6,27 | O 21,49 | S 28,71 |
| Enc.: | C 37,43 | H 6,02 | N 6,12 | S 28,48 |
11,17 g (50 mmol) de éster metílico de
N-(5-mercapto-3-tia-1-oxo-pent-1-il)-glicina
(Ejemplo 22a), 13,94 g (50 mmol) de cloruro de trifenilmetilo y 5,06
g (50 mmol) de trietilamina se disuelven en atmósfera de argón en
500 ml de diclorometano absoluto. Se agita durante 16 horas a la
temperatura ambiente y la carga se vierte luego sobre 150 ml de
ácido cítrico acuoso al 5%. Se agita bien, se separa la fase
orgánica y se seca sobre sulfato de sodio. Después de evaporación
del disolvente a vacío, el residuo aceitoso se somete a
cromatografía sobre gel de sílice (disolvente móvil:
diclorometano/metanol, 95:5).
Rendimiento: 15,7 g (67,4%), aceite incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 67,07 | H 5,85 | N 3,01 | O 10,31 | S 13,77 |
| Enc.: | C 67,01 | H 6,11 | N 2,93 | S 13,49 |
11,64 g (25 mmol) de éster metílico de
N-[5-(trifenilmetilmercapto)-3-tia-1-oxo-pent-1-il]-glicina
(Ejemplo 22b) y 29,3 g (250 mmol) de 6-aminohexanol
se funden juntos en atmósfera de argón durante 16 horas a 100ºC.
Después de enfriar la carga de reacción, se recoge la misma en 500
ml de diclorometano y se vierte sobre 250 ml de ácido cítrico acuoso
al 5%. Bajo enfriamiento con hielo y agitación, se ajusta a un pH de
6,5 con ácido clorhídrico concentrado. La fase orgánica se separa y
se seca sobre sulfato de sodio. Después de evaporación del
disolvente a vacío, el residuo aceitoso se somete a cromatografía
sobre gel de sílice (disolvente móvil: diclorometano/metanol,
0-10% metanol).
Rendimiento: 7,7 g (56,0%), aceite incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 67,60 | H 6,96 | N 5,09 | O 8,72 | S 11,64 |
| Enc.: | C 67,48 | H 7,03 | N 4,92 | S 11,43 |
5,51 g (10 mmol) de
N-[5-(trifenilmetilmercapto)-3-tia-1-oxo-pent-1-il]-glicina-N'-(6-hidroxihexil)-amida
(Ejemplo 22c) se disuelven en 50 ml de diclorometano absoluto y 50
ml de piridina absoluta. Se añaden gota a gota a la carga 4,73 g
(20 mmol) de cloruro del ácido
diisopropilamino-O-cianoetil-fosforoso,
disueltos en 50 ml de diclorometano absoluto, a la temperatura
ambiente. Después de 4 horas, se vierte sobre 250 ml de solución
acuosa saturada de bicarbonato de sodio, se agita y la fase orgánica
se seca sobre sulfato de magnesio. Después de evaporación del
disolvente, el residuo aceitoso se cromatografía sobre gel de sílice
(diclorometano/etanol/trietilamina 98:1:1).
Rendimiento: 4,32 g (57,5%), aceite espumoso
incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 63,97 | H 7,38 | N 7,46 | O 8,52 | P 4,12 | S 8,54 |
| Enc.: | C 63,81 | H 7,41 | N 7,22 | P 3,97 | S 8,31 |
Se produce un oligonucleótido 30mero
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUA-3',
identificado de acuerdo con el proceso SELEX, con la modificación de
una secuencia T*T*T*T*T*-3' situada aguas arriba, con ayuda de un
sintetizador automático de la compañía Pharmacia (véase
Oligonucleotides and Analogues, A Practical Approach, compilador F.
Eckstein, Oxford University Press, Oxford, Nueva York, Tokyo, 1931),
y el oligonucleótido en forma protegida está presente todavía en la
columna del vehículo sólido. La carga en la columna es
aproximadamente 15 mg del oligonucleótido 35mero. Después de
escisión del grupo protector 5'-DMT, se acopla de
acuerdo con los métodos estándar con el fosforamidito descrito en el
ejemplo 22d. Después de oxidación con yodo en tetrahidrofurano, el
conjugado se escinde del vehículo. Para este propósito, el material
se mezcla con 10 ml de solución de amoniaco al 30% y se agita luego
mediante sacudidas durante una noche a 55ºC. Se enfría a 0ºC, se
centrifuga, se lava el vehículo con 10 ml de agua y las fases
acuosas reunidas se someten a liofilización. Para la purificación,
el material se recoge en 5 ml de agua, se añaden 4 ml de acetato de
amonio 0,5 mol y se mezcla con 20 ml de etanol. Para completar la
precipitación, se enfría durante una noche (-20ºC), se centrifuga,
se lava el residuo con 1 ml de etanol (-20ºC) y se seca a vacío. Se
obtienen 9,5 mg de un polvo blanco. Para escisión del grupo
protector S-tritilo, el material se recoge en 5 ml
de solución 50 milimolar de acetato de trietilamonio (pH = 7) y se
incuba con 500 \mul de solución 0,1 M de nitrato de plata durante
30 minutos. A continuación, se añaden 500 \mul de solución 0,14 M
de ditiotreitol y se incuba durante otros 30 minutos. Después de
centrifugar, el sobrenadante claro se desala sobre Sephadex G10. Las
fracciones que contienen el producto se liofilizan. Se obtienen 3,5
mg de un polvo blanco.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 22e) se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
8,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg/1 ml de HCl 0,01 M).
El rendimiento de trazador (aproximadamente 95%) se determina por
HPLC.
Se produce primeramente una solución del éster de
N-hidroxisuccinimida de la monoamida del ácido
N-(2-oxo-tetrahidrotiofen-3-il)-tiodiglicólico
(documento DE 43 11 023) en 500 \mul de DMF absoluta. Para este
propósito, 24,9 mg (0,1 mmol) de monoamida del ácido
N-(2-oxo-tetrahidrotiofen-3-il)-tiodiglicólico
y 11,5 mg (0,1 mmol) de N-hidroxisuccinimida se
disuelven en 500 \mul de DMF absoluta. A 0ºC, se añaden a la carga
19,2 mg (0,1 mmol) de EDC. Se agita durante 30 minutos a 0ºC.
10 mg del 5'-(éster del ácido
6-amino-hexilfosfórico) de
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUAT*
T*T*T*T*-3' producido en el Ejemplo 1 se disuelven en 1 ml de un tampón bicarbonato de sodio/carbonato de sodio (pH = 8,0). Se añade la solución en DMF del éster de NHS preparado previamente y se incuba durante 16 horas a la temperatura ambiente en atmósfera de argón. A continuación, se centrifuga, se concentra a un volumen de 500 \mul y se somete a cromatografía sobre Sephadex G-25. Después de liofilización, se obtienen 2 mg del conjugado como un polvo blanco.
T*T*T*T*-3' producido en el Ejemplo 1 se disuelven en 1 ml de un tampón bicarbonato de sodio/carbonato de sodio (pH = 8,0). Se añade la solución en DMF del éster de NHS preparado previamente y se incuba durante 16 horas a la temperatura ambiente en atmósfera de argón. A continuación, se centrifuga, se concentra a un volumen de 500 \mul y se somete a cromatografía sobre Sephadex G-25. Después de liofilización, se obtienen 2 mg del conjugado como un polvo blanco.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 23a) se
disuelve en 1 ml de tampón de hidrogenofosfato disódico 0,1 M.
Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con solución
de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de solución
de cloruro de estaño(II) (5 mg/1 ml de HCl 0,01 M). El
rendimiento de trazador se determina por HPLC (aproximadamente
92%).
10 mg del 5'-(éster del ácido
6-amino-hexil-fosfórico)
de
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUAT*T*T*T*T-3'
producido de acuerdo con el Ejemplo 1 se disuelven en 1 ml de un
tampón de bicarbonato de sodio/carbonato de sodio (pH = 8,0). A
continuación, se añaden a la carga 23,1 mg (0,1 mmol) de éster de
NHS del ácido S-acetilmercaptoacético, disueltos en
500 \mul de DMF absoluta, y se incuba durante 17 horas a la
temperatura ambiente en atmósfera de argón. A continuación, se
centrifuga, se concentra a un volumen de 500 \mul y se somete a
cromatografía sobre Sephadex G-25. Después de
liofilización, se obtienen 3 mg del conjugado como un polvo
blanco.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 24a) se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
8,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg/1 ml de HCl 0,01 M).
El rendimiento de trazador (aproximadamente 97%) se determina por
HPLC.
31,9 g (0,1 mol) de
2-(trifenilmetilmercapto)-etilamina y 10,1 g (0,1
mol) de trietilamina se introducen en 500 ml de diclorometano
absoluto. A 0ºC, se añade gota a gota una solución de 13,2 g (0,1
mol) de anhídrido del ácido tiodiglicólico, se agita durante 1 hora
a 0ºC y durante 16 horas a la temperatura ambiente. A continuación,
se vierte sobre 250 ml de ácido cítrico acuoso al 5%, se agita bien,
se separa la fase orgánica y se seca sobre sulfato de sodio. Después
de evaporación del disolvente a vacío, el residuo se somete a
cromatografía sobre gel de sílice (disolvente móvil:
diclorometano/metanol, 0-20% metanol).
Rendimiento: 20,32 g (45,0%), aceite
incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 66,49 | H 5,58 | N 3,10 | O 10,63 | S 14,20 |
| Enc.: | C 66,21 | H 5,73 | N 2,98 | S 14,02 |
Primeramente, se produce el éster de NHS de la
monoamida del ácido
N-[2-(trifenilmetilmercapto)-et-1-il]-tiodiglicólico
(Ejemplo 25a). Para este propósito, se disuelven 45,2 mg (0,1 mmol)
del ácido mencionado previamente en 500 \mul de DMF absoluta (0,1
mmol) y se mezcla con 11,5 mg (0,1 mmol) de NHS. Después de enfriar
a 0ºC, se añaden 19,2 mg (0,1 mmol) de EDC y se incuba durante 30
minutos a 0ºC.
Una solución de 10 mg del 5-(éster del ácido
6-aminohexil-fosfórico) de
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACG
AAUAGCUACAUAT*T*T*T*T*-3' en 1 ml de un tampón de bicarbonato de sodio/carbonato de sodio (pH = 8,0), descrito en el Ejemplo 1, se mezcla con 500 \mul de la solución del éster de NHS producida previamente. Se incuba durante 16 horas a la temperatura ambiente. A continuación, se concentra por evaporación en 500 \mul y se somete a cromatografía sobre Sephadex G-25. Se obtienen 6 mg del compuesto protegido con S-tritilo. La escisión del grupo protector S-tritilo, el aislamiento del oligonucleótido que lleva grupos SH y la purificación tienen lugar como se describe en el ejemplo 22e. Se obtienen 4 mg de liofilizado blanco.
AAUAGCUACAUAT*T*T*T*T*-3' en 1 ml de un tampón de bicarbonato de sodio/carbonato de sodio (pH = 8,0), descrito en el Ejemplo 1, se mezcla con 500 \mul de la solución del éster de NHS producida previamente. Se incuba durante 16 horas a la temperatura ambiente. A continuación, se concentra por evaporación en 500 \mul y se somete a cromatografía sobre Sephadex G-25. Se obtienen 6 mg del compuesto protegido con S-tritilo. La escisión del grupo protector S-tritilo, el aislamiento del oligonucleótido que lleva grupos SH y la purificación tienen lugar como se describe en el ejemplo 22e. Se obtienen 4 mg de liofilizado blanco.
1 mg del conjugado producido en el Ejemplo 25b se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
8,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg/1 ml de HCl 0,01 M).
El rendimiento de trazador se determina por HPLC (91%).
Se disuelven 3,32 g (20 mmol) de éster metílico
del ácido 3,4-diaminobenzoico y 13,38 g (40 mmol) de
ácido
S-trifenilmetil-mercaptoacético en
200 ml de diclorometano absoluto. A 0ºC, se añaden gota a gota a la
carga 8,25 g (40 mmol) de diciclohexilcarbodiimida, disuelta en 100
ml de diclorometano absoluto. Se agita durante 1 hora más a 0ºC y
finalmente durante 16 horas más a la temperatura ambiente. Se
filtra, se agita mediante sacudidas contra ácido cítrico acuoso al
1%, se seca la fase orgánica sobre sulfato de sodio y se evapora el
disolvente a vacío. El residuo se somete a cromatografía sobre gel
de sílice (disolvente móvil: diclorometano/metanol,
0-10% metanol).
Rendimiento: 10,2 g (63,8%), aceite incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 75,16 | H 5,30 | N 3,51 | O 8,01 | S 8,02 |
| Enc.: | C 75,01 | H 5,58 | N 3,30 | S 7,89 |
7,99 g (10 mmol) de éster metílico del ácido
N,N'-bis-[2-(trifenilmetilmercapto)-1-oxo-et-1-il]-3,4-diaminobenzoico
(Ejemplo 26a) se mezclan en 200 ml de dioxano, 20 ml de agua y 20
ml de metanol con 4 g (100 mmol) de hidróxido de sodio. Se agita
durante 5 horas a la temperatura ambiente y la carga se vierte sobre
300 ml de ácido acético acuoso al 5%. Se extrae exhaustivamente con
diclorometano, y se seca la fase orgánica sobre sulfato de sodio.
Después de evaporación del disolvente, el residuo se somete a
cromatografía sobre gel de sílice (disolvente móvil:
diclorometano/metanol, metanol 0-40%).
Rendimiento: 3,56 g (45,4%), aceite incoloro.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 74,97 | H 5,14 | N 3,57 | O 8,15 | S 8,17 |
| Enc.: | C 74,71 | H 5,32 | N 3,31 | S 7,88 |
Primeramente, se produce el éster de NHS del
ácido
N,N'-bis-[2-(trifenilmetilmercapto)-1-oxo-et-1-il]-3,4-diaminobenzoico
(Ejemplo 26b). Para este propósito, se disuelven 78,5 mg (0,1 mmol)
del ácido en 500 \mul de DMF absoluta y se mezclan con 11,5 mg
(0,1 mmol) de NHS. Después de enfriar a 0ºC, se añaden 19,2 mg (0,1
mmol) de EDC y se incuba durante 30 minutos a 0ºC. Una solución de
10 mg del 5'-(éster del ácido
6-aminohexil-fosfórico) de
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUAT*T*T*T*T*-3' en 1
ml de tampón de bicarbonato de sodio/carbonato de sodio (pH = 8,0),
descrito en el Ejemplo 1, se mezcla con 500 \mul de la solución
del éster de NHS producida previamente. Se incuba durante 17 horas a
la temperatura ambiente. A continuación, se concentra por
evaporación a 500 \mul y se somete a cromatografía sobre Sephadex
G-25. Se obtienen 7 mg del compuesto protegido con
S-tritilo.
La escisión del grupo protector
S-tritilo, el aislamiento del oligonucleótido que
lleva grupos SH y la purificación tienen lugar como se describe en
el Ejemplo 22e. Se obtienen 3 mg de liofilizado blanco.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 26c) se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
9,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg/1 ml de HCl 0,01 M).
El rendimiento de trazador (aproximadamente 91%) se determinó por
HPLC.
24,5 g (0,1 mol) de éster
terc-butílico de
glicil-glicil-glicina y 11,8 g (0,1
mol) de ácido O-acetil-glicólico se
añaden juntos a 0ºC a 500 ml de dimetilformamida absoluta. Se añade
gota a gota a la carga una solución de 20,6 g (0,1 mol) de
diciclohexilcarbodiimida en 500 ml de dimetilformamida absoluta, se
agita durante 1 hora a 0ºC y finalmente durante una noche a la
temperatura ambiente. Se filtra, y el filtrado se concentra por
evaporación en la bomba de aceite. Se cristaliza repetidamente en
acetato de etilo/n-pentano.
Rendimiento: 12,5 g (36,2%), polvo blanco.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 48,69 | H 6,71 | N 12,17 | O 32,43 |
| Enc.: | C 48,43 | H 7,01 | N 11,93 |
3,45 g (10 mmol) de éster
terc-butílico de
N-[O-acetil-hidroxiacetil]-glicil-glicil-glicina
se agitan en 50 ml de ácido trifluoroacético durante 15 minutos. A
continuación, se vierte sobre 500 ml de dietil-éster absoluto y el
producto se separa por filtración, y se recristaliza repetidamente
en acetato de etilo/n-pentano.
Rendimiento: 1,23 g (42,5%), polvo blanco.
Análisis elemental:
| Calc.: | C 41,53 | H 5,23 | N 14,53 | O 38,72 |
| Enc.: | C 41,31 | H 5,51 | N 14,32 |
Primeramente, se produce el éster de NHS de
N-[O-acetilhidroxiacetil]-glicil-glicil-glicina
(ejemplo 27b). Para este propósito, se disuelven 28,9 mg (0,1 mmol)
del ácido en 500 \mul de DMF absoluta y se mezcla con 11,5 mg (0,1
mmol) de NHS. Después de enfriar a 0ºC, se añaden 19,2 mg (0,1 mmol)
de EDC y se incuba durante 30 minutos a 0ºC. Una solución de 10 mg
del (éster del ácido 6-aminohexilfosfórico) de
5'-CUCAUGGAGCGCAAGACGAAUAGCUACAUAT*T*T*T*T*-3' en 1
ml de solución 1M de carbonato de sodio, descrita en el Ejemplo 1,
se mezcla con 500 \mul de la solución del éster de NHS producida
previamente. Se incuba durante 18 horas a la temperatura ambiente. A
continuación, se concentra por evaporación a 500 \mul y se somete
a cromatografía sobre Sephadex G-25. Después de
liofilización, se obtienen 3 mg del compuesto del título.
1 mg del conjugado descrito en el Ejemplo 27c se
disuelve en 1 ml de tampón 0,1 M de hidrogenofosfato disódico (pH =
10,5). Después de añadir 10 mg de tartrato disódico, se mezcla con
solución de pertecnetato de sodio (1 mCi) y luego con 10 \mul de
solución de cloruro de estaño(II) (5 mg/1 ml de HCl 0,01 M).
El rendimiento de trazador se determina por HPLC (95%).
Los ejemplos que anteceden pueden repetirse con
éxito similar empleando las sustancias reaccionantes y/o las
condiciones de operación de esta invención descritas genérica o
específicamente en sustitución de las utilizadas en los ejemplos que
anteceden.
Claims (14)
1. Conjugados oligonucleotídicos constituidos por
un radical oligonucleotídico N y n sustituyentes
(B-K), en los cuales el compuesto exhibe la fórmula
general I)
(I)N-(B-K)_{n}
en la cual N es un oligonucleótido
con 15 a 100 nucleótidos, que se fija específicamente con afinidad
de fijación alta a estructuras diana y exhibe modificaciones que
impiden o al menos reducen significativamente la degradación por las
nucleasas existentes
naturalmente,
B es un enlace químico o un componente de
conexión, que produce la conexión entre N y K, y K significa un
agente complejante o complejo de isótopos de metales radiactivos, o
isótopos estables, que
- se convierten en isótopos
radiactivos por radiación procedente del exterior,
- convierten la radiación procedente
del exterior en radiación de calidad diferente, contenido de energía
diferente, y/o diferente longitud de onda, de los elementos de
números atómicos 5, 21-29, 31, 39,
42-44, 49, 57-83 u 85,
n es un número entre 1 y 10,
en los cuales
a) la posición 2' de la unidad azúcar,
independientemente unas de otras, está ocupada por los grupos
siguientes:
un grupo -OR, en el cual
R es un radical alquilo con 1 a 20 átomos de
carbono, que contiene opcionalmente hasta 2 grupos hidroxilo y que
está interrumpido opcionalmente por 1-5 átomos de
oxígeno,
un átomo de hidrógeno,
un grupo hidroxilo,
un átomo de flúor,
un radical amina,
un grupo amino,
y los grupos hidroxilo presentes en las
posiciones terminales 3' y 5', independientemente unos de otros,
están eterificados opcionalmente con el radical R y/o
b) los fosfodiésteres, que se utilizan
opcionalmente como enlace internucleotídico, independientemente unos
de otros, están reemplazados por fosforotioatos, fosforoditioatos o
alquilfosfonatos, preferiblemente metil-fosfonato,
y/o
c) los radicales terminales en las posiciones 3'
y 5' están enlazados de una manera intramolecular unos con otros por
un enlace internucleotídico como se describe en b) y/o
d) contiene un enlace internucleotídico como se
describe en b), que enlaza las posiciones 3'-3' o
5'-5', y/o
e) contiene un enlace fosfodiéster como se
describe en b), que conecta, de modo análogo a un éster, dos
timidinas respectivamente por un radical hidroxialquilo
C_{2}-C_{10} en posición 3 o conecta un radical
timidina sustituido análogamente, de modo análogo a un éster, con un
grupo hidroxilo de otro azúcar en posición 2' o 3' o 5' y/o
f) los radicales terminales en las posiciones 3'
y 5' contienen enlaces internucleotídicos modificados opcionalmente
como se describe en b).
2. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación
1, en el cual N es un oligonucleótido, que se fija específicamente
con afinidad de fijación alta a otras estructuras diana y que puede
obtenerse de tal manera que una mezcla de oligonucleótidos que
contienen secuencias aleatorias se pone en contacto con la
estructura diana, y en la que ciertos oligonucleótidos exhiben una
afinidad incrementada para la estructura diana con relación a la
mezcla de los oligonucleótidos, se separan los últimos del resto de
la mezcla de oligonucleótidos, y se multiplican luego los
oligonucleótidos que tienen afinidad incrementada para la estructura
diana a fin de obtener una mezcla de oligonucleótidos que exhibe una
porción incrementada de oligonucleótidos que se fijan a las
estructuras diana.
3. Un compuesto de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 2, en el cual N es un oligonucleótido, que se
fija específicamente con afinidad de fijación alta a otras
estructuras diana, y que puede obtenerse de tal manera que
a) en primer lugar, se produce una cadena de DNA
por síntesis química, de tal modo que esta cadena de DNA exhibe una
secuencia definida en el extremo 3', que es complementaria a un
promotor para una RNA-polimerasa y al mismo tiempo
complementaria para un iniciador de la reacción en cadena de la
polimerasa (PCR), y de tal modo que esta cadena de DNA exhibe una
secuencia definida en el extremo 5', que es complementaria para una
secuencia iniciadora para la reacción en cadena de la polimerasa, y
la secuencia entre las secuencias definidas contiene una secuencia
aleatoria, y de tal manera que
b) esta cadena de DNA se transcribe en una cadena
de RNA complementario con ayuda de una
RNA-polimerasa, y se ofrecen a la polimerasa
nucleótidos que están modificados en la posición 2' de la unidad
ribosa, y de tal manera que
c) los nucleótidos de RNA, producidos de este
modo, se ponen en contacto con la estructura diana a la cual debe
fijarse específicamente el oligonucleótido, y de tal manera que
d) aquellos oligonucleótidos que se han fijado a
la estructura diana se separan primeramente junto con la estructura
diana de los oligonucleótidos que no se fijan, y después de ello los
oligonucleótidos fijados se separan de nuevo de la estructura diana,
y de tal manera que
e) estos oligonucleótidos de RNA específicos de
la estructura diana se transcriben con ayuda de transcriptasa
inversa en una cadena de DNA complementario, y de tal manera que
f) estas cadenas de DNA se multiplican utilizando
las secuencias iniciadoras definidas por la reacción en cadena de la
polimerasa, y de tal manera que
g) los oligonucleótidos de DNA multiplicados de
esta manera se transcriben luego nuevamente con ayuda de la
RNA-polimerasa y con nucleótidos modificados en
oligonucleótidos de RNA, y de tal manera que
h) los pasos de selección c) a g) arriba
mencionados se repiten opcionalmente muchas veces hasta que los
oligonucleótidos, que se caracterizan por una afinidad de
fijación alta a la estructura diana, se seleccionan suficientemente,
y después de ello las secuencias del oligonucleótido así obtenido
pueden ser determinadas opcionalmente.
4. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación
3, en el cual la estructura diana se selecciona de entre
macromoléculas, estructuras tisulares de organismos superiores,
tales como animales o humanos, órganos o partes de órganos de un
animal o humano, células, células tumorales o tumores.
5. Un compuesto de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 4, en el cual el o los componentes de conexión
B se fija(n)
a) al extremo 4' del radical oligonucleotídico N
reducido en posición 4' por el grupo CH_{2}-OH
y/o
b) al extremo 3' del radical oligonucleotídico N
reducido en posición 3' por un átomo de hidrógeno y/o
c) al puente o puentes fosfodiéster,
reducido(s) por el grupo o grupos OH, entre dos nucleótidos
cada uno y/o
d) a 1 a 10 nucleobases, que está(n)
reducida(s) por un átomo de hidrógeno respectivamente en las
posiciones 5, 8 y/o el o los grupos amino en la o las posiciones 2,
4 y 6.
6. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación
5, párrafo a) o b), en el cual B tiene la fórmula general
X-Y-Z^{1}, que está conectada en
el lado X con el agente complejante o complejo y en el lado Z con el
oligonucleótido, en el cual
X es un enlace directo, un grupo -NH
o -S,
Y representa una cadena de alquileno
C_{1}-C_{20} de cadena lineal, de cadena
ramificada, saturada o insaturada, que contiene opcionalmente
1-2 grupos ciclohexileno, 1-5 grupos
imino, 1-3 grupos fenileno, 1-3
grupos fenilenimino, 1-3 grupos fenilenoxi,
1-3 grupos hidroxifenileno, 1-5
grupos amido, 1-2 grupos hidrazido,
1-5 grupos carbonilo, 1-5 grupos
etilenoxi, 1 grupo ureido, 1 grupo tioureido, 1-2
grupos carboxialquilimino, 1-2 grupos éster,
1-3 grupos Ar, en los cuales Ar representa un anillo
de 5 ó 6 miembros saturado o insaturado, que contiene opcionalmente
1-2 heteroátomos seleccionados de nitrógeno, oxígeno
y azufre y/o 1-2 grupos carbonilo;
1-10 átomos de oxígeno, 1-5 átomos
de nitrógeno y/o 1-5 átomos de azufre, y/o está
sustituida opcionalmente con 1-5 grupos hidroxi,
1-2 grupos mercapto, 1-5 grupos oxo,
1-5 grupos tioxo, 1-3 grupos
carboxi, 1-5 grupos carboxi-alquilo
C_{1}-C_{4}, 1-5 grupos éster,
1-3 grupos amino, 1-3 grupos
hidroxi-alquilo C_{1}-C_{4},
1-3 grupos alcoxi C_{1}-C_{7},
y
Z^{1} es
-CONH-CH_{2}-4',
-NH-CO-4',
-O-P(O)R^{1}-NH-CH_{2}-4',
-O-P(O)R^{1}-O-CH_{2}-4',
-O-P(S)R^{1}-O-3'
o
-O-P(O)R^{1}-O-3',
en cuyas fórmulas 4' o 3' indica el enlace a la o las unidades
azúcar terminales y R^{1} es O^{-}, S^{-}, un grupo alquilo
C_{1}-C_{4} o NR^{2}R^{3}, significando
R^{2} y R^{3} hidrógeno o radicales alquilo
C_{1}-C_{4}.
7. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación
5, párrafo c), en el cual B tiene la fórmula general
X-Y-Z^{2}, que está conectada en
el lado X con el agente complejante o complejo y en el lado Z con el
oligonucleótido, en el cual
Z^{2}, en el puente que enlaza dos unidades
azúcar adyacentes,
Z^{2}---
\melm{\delm{\para}{\delm{O}{\delm{\para}{3'}}}}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---5'
\hskip1cmy/o
\hskip1cmZ^{2}---
\melm{\delm{\para}{\delm{O}{\delm{\para}{3'}}}}{P}{\uelm{\dpara}{O}}---O---5'es el grupo -NR^{2}-,
-O- o
-S-,
X es un enlace directo, un grupo -NH
o grupo -S,
Y es una cadena alquileno
C_{1}-C_{20} de cadena lineal, cadena
ramificada, saturada o insaturada, que contiene opcionalmente
1-2 grupos ciclohexileno, 1-5 grupos
imino, 1-3 grupos fenileno, 1-3
grupos fenilenimino, 1-3 grupos fenilenoxi,
1-3 grupos hidroxifenileno, 1-5
grupos amido, 1-2 grupos hidrazido,
1-5 grupos carbonilo, 1-5 grupos
etilenoxi, 1 grupo ureido, 1 grupo tioureido, 1-2
grupos carboxialquilimino, 1-2 grupos éster,
1-3 grupos Ar, en los cuales Ar representa un anillo
de 5 ó 6 miembros saturado o insaturado, que contiene opcionalmente
1-2 heteroátomos seleccionados de nitrógeno, oxígeno
y azufre y/o 1-2 grupos carbonilo;
1-10 átomos de oxígeno, 1-5 átomos
de nitrógeno y/o 1-5 átomos de azufre, y/o está
sustituida opcionalmente con 1-5 grupos hidroxi,
1-2 grupos mercapto, 1-5 grupos oxo,
1-5 grupos tioxo, 1-3 grupos
carboxi, 1-5 grupos carboxi-alquilo
C_{1}-C_{4}, 1-5 grupos éster,
1-3 grupos amino, 1-3 grupos
hidroxi-alquilo C_{1}-C_{4},
1-3 grupos alcoxi C_{1}-C_{7},
y
R^{2} es hidrógeno o radicales alquilo
C_{1}-C_{4}.
8. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación
5d, en el cual B tiene la fórmula general
X-Y-Z^{3}, en la cual Z^{3}
representa un grupo -NH o un enlace directo a la
nucleobase,
X es un enlace directo, un grupo -NH
o grupo -S, e
Y es una cadena de alquileno
C_{1}-C_{20} de cadena lineal, cadena
ramificada, saturada o insaturada, que contiene opcionalmente
1-2 grupos ciclohexileno, 1-5 grupos
imino, 1-3 grupos fenileno, 1-3
grupos fenilenimino, 1-3 grupos fenilenoxi,
1-3 grupos hidroxifenileno, 1-5
grupos amido, 1-2 grupos hidrazido,
1-5 grupos carbonilo, 1-5 grupos
etilenoxi, 1 grupo ureido, 1 grupo tioureido, 1-2
grupos carboxialquilimino, 1-2 grupos éster,
1-3 grupos Ar, en los cuales Ar representa un anillo
de 5 ó 6 miembros saturado o insaturado, que contiene opcionalmente
1-2 heteroátomos seleccionados de nitrógeno, oxígeno
y azufre y/o 1-2 grupos carbonilo;
1-10 átomos de oxígeno, 1-5 átomos
de nitrógeno y/o 1-5 átomos de azufre, y/o está
sustituida opcionalmente con 1-5 grupos hidroxi,
1-2 grupos mercapto, 1-5 grupos oxo,
1-5 grupos tioxo, 1-3 grupos
carboxi, 1-5 grupos carboxi-alquilo
C_{1}-C_{4}, 1-5 grupos éster,
1-3 grupos amino, 1-3 grupos
hidroxi-alquilo C_{1}-C_{4}, y
1-3 grupos alcoxi
C_{1}-C_{7}.
9. Compuestos de acuerdo con una de las
reivindicaciones anteriores, en los cuales el complejo metálico,
como elemento formador de imagen, contiene un isótopo radiactivo,
seleccionado de los elementos cobre, bismuto, tecnecio, renio o
indio.
10. Un proceso para detectar una estructura
diana, en el cual uno o más de los compuestos de acuerdo con una de
las reivindicaciones anteriores se ponen en contacto con la muestra
a estudiar in vivo o in vitro y, basándose en la
señal, se detecta si la estructura diana, a la cual se fija
específicamente y con afinidad de fijación alta el oligonucleótido
N, está presente en la muestra.
11. Compuestos de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1-9 para diagnóstico no invasivo de
enfermedades.
12. Uso de un compuesto de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 9 para la producción de un medicamento útil en
radiodiagnóstico y/o en radioterapia.
13. Estuche de diagnóstico para detección in
vivo y/o in vitro de estructuras diana, en el cual el
estuche de diagnóstico contiene al menos un compuesto de acuerdo con
una de las reivindicaciones 1 a 9.
14. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación
1, en el cual N es un ligando oligonucleotídico no existente
naturalmente, que tiene una afinidad de fijación específica para una
molécula diana, siendo dicha molécula diana una estructura química
tridimensional distinta de un polinucleótido que se fija a dicho
ligando oligonucleotídico por un mecanismo que depende
predominantemente del apareamiento de bases de Watson/Crick o
fijación de la triple hélice, en el cual dicho ligando
oligonucleotídico no es un ácido nucleico que tiene la función
fisiológica conocida de ser fijado por la molécula diana.
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE4424922 | 1994-07-14 | ||
| DE4424922A DE4424922A1 (de) | 1994-07-14 | 1994-07-14 | Konjugate aus Metallkomplexen und Oligonucleotiden, die spezifisch an bestimmte Zielstrukturen binden |
| DE19944445078 DE4445078A1 (de) | 1994-12-05 | 1994-12-05 | Konjugate aus Metallkomplexen und Oligonucleotiden, diese enthaltende Mittel, deren Verwendung in der Radiodiagnostik sowie Verfahren zu deren Herstellung |
| DE4445078 | 1994-12-05 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2220933T3 true ES2220933T3 (es) | 2004-12-16 |
Family
ID=25938359
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES95925792T Expired - Lifetime ES2220933T3 (es) | 1994-07-14 | 1995-06-30 | Conjugados constituidos por complejos metalicos y oligonucleotidos. |
Country Status (23)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0777498B1 (es) |
| JP (2) | JPH10503182A (es) |
| KR (1) | KR100366525B1 (es) |
| CN (1) | CN1219551C (es) |
| AT (1) | ATE265229T1 (es) |
| AU (1) | AU2979195A (es) |
| CA (1) | CA2194558A1 (es) |
| CZ (1) | CZ295930B6 (es) |
| DE (1) | DE69532958T2 (es) |
| DK (1) | DK0777498T3 (es) |
| ES (1) | ES2220933T3 (es) |
| HU (1) | HU220859B1 (es) |
| IL (1) | IL114237A (es) |
| MX (1) | MX9606443A (es) |
| NO (1) | NO318585B1 (es) |
| NZ (1) | NZ289831A (es) |
| PL (1) | PL318147A1 (es) |
| PT (1) | PT777498E (es) |
| RU (1) | RU2165771C2 (es) |
| SK (1) | SK284598B6 (es) |
| TW (1) | TW502040B (es) |
| UA (1) | UA48140C2 (es) |
| WO (1) | WO1996002274A1 (es) |
Families Citing this family (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1998000435A2 (en) * | 1996-07-03 | 1998-01-08 | President And Fellows Of Harvard College | Oligonucleotide linker and techniques involving immobilized and linked oligonucleotides |
| US6335437B1 (en) * | 1998-09-07 | 2002-01-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for the preparation of conjugated oligomers |
| RU2244572C1 (ru) * | 2003-04-24 | 2005-01-20 | Медицинский радиологический научный центр РАМН | Способ внутритканевой лучевой терапии злокачественных опухолей |
| CN101437943A (zh) * | 2006-05-03 | 2009-05-20 | 波罗的科技发展有限公司 | 牢固结合的碱基-修饰的寡核苷酸和人工核酸酶组合的反义药剂 |
| GB201012418D0 (en) * | 2010-07-23 | 2010-09-08 | Santaris Pharma As | Process |
| KR101948404B1 (ko) * | 2014-05-13 | 2019-02-14 | 폴 슈레 앙스띠뛰 | 양전자 방출 단층촬영에 사용하기 위한 43sc 방사성핵종 및 그의 방사성제약의 제조 |
Family Cites Families (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5013831A (en) * | 1984-01-30 | 1991-05-07 | Enzo Biochem, Inc. | Detectable molecules, method of preparation and use |
| ATE132350T1 (de) * | 1985-03-19 | 1996-01-15 | Randell L Mills | Verfahren und system zur erzielung einer lokalen mössbauer-absorption in einem organischen medium |
| US5057302A (en) * | 1987-02-13 | 1991-10-15 | Abbott Laboratories | Bifunctional chelating agents |
| WO1989000062A1 (en) * | 1987-07-07 | 1989-01-12 | The Cancer Institute Board | Radiotherapy |
| US5457183A (en) * | 1989-03-06 | 1995-10-10 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Hydroxylated texaphyrins |
| ES2259800T3 (es) * | 1990-06-11 | 2006-10-16 | Gilead Sciences, Inc. | Procedimientos de uso de ligandos de acido nucleico. |
| US5270163A (en) * | 1990-06-11 | 1993-12-14 | University Research Corporation | Methods for identifying nucleic acid ligands |
| IE914220A1 (en) * | 1990-12-10 | 1992-06-17 | Akzo Nv | Labelled, modified oligonucleotides |
| EP0588229A3 (en) * | 1992-09-12 | 1994-06-15 | Hoechst Ag | Macrocyclic chelating agents for the preparation of technetium or rhenium complexes |
-
1995
- 1995-06-20 IL IL11423795A patent/IL114237A/xx not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 PL PL95318147A patent/PL318147A1/xx unknown
- 1995-06-30 UA UA97020642A patent/UA48140C2/uk unknown
- 1995-06-30 CA CA002194558A patent/CA2194558A1/en not_active Abandoned
- 1995-06-30 RU RU97102039/14A patent/RU2165771C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 PT PT95925792T patent/PT777498E/pt unknown
- 1995-06-30 CZ CZ1997114A patent/CZ295930B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 EP EP95925792A patent/EP0777498B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-30 SK SK28-97A patent/SK284598B6/sk not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 KR KR1019970700223A patent/KR100366525B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1995-06-30 NZ NZ289831A patent/NZ289831A/xx not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 ES ES95925792T patent/ES2220933T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-30 AT AT95925792T patent/ATE265229T1/de not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 AU AU29791/95A patent/AU2979195A/en not_active Abandoned
- 1995-06-30 HU HU9700100A patent/HU220859B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1995-06-30 CN CNB951940007A patent/CN1219551C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1995-06-30 DE DE69532958T patent/DE69532958T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1995-06-30 JP JP8504630A patent/JPH10503182A/ja not_active Withdrawn
- 1995-06-30 WO PCT/EP1995/002539 patent/WO1996002274A1/en not_active Ceased
- 1995-06-30 DK DK95925792T patent/DK0777498T3/da active
- 1995-06-30 MX MX9606443A patent/MX9606443A/es not_active IP Right Cessation
- 1995-10-14 TW TW084110812A patent/TW502040B/zh not_active IP Right Cessation
-
1997
- 1997-01-13 NO NO19970141A patent/NO318585B1/no not_active IP Right Cessation
-
2009
- 2009-06-04 JP JP2009134684A patent/JP2009197024A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0777498A1 (en) | 1997-06-11 |
| NO970141D0 (no) | 1997-01-13 |
| SK2897A3 (en) | 1997-09-10 |
| NO970141L (no) | 1997-03-14 |
| CN1152879A (zh) | 1997-06-25 |
| MX9606443A (es) | 1997-12-31 |
| NZ289831A (en) | 1999-01-28 |
| IL114237A (en) | 2000-08-31 |
| RU2165771C2 (ru) | 2001-04-27 |
| IL114237A0 (en) | 1995-10-31 |
| ATE265229T1 (de) | 2004-05-15 |
| PT777498E (pt) | 2004-09-30 |
| JPH10503182A (ja) | 1998-03-24 |
| DE69532958D1 (de) | 2004-06-03 |
| DK0777498T3 (da) | 2004-08-16 |
| CZ11497A3 (cs) | 1998-08-12 |
| HU220859B1 (en) | 2002-06-29 |
| CZ295930B6 (cs) | 2005-12-14 |
| SK284598B6 (sk) | 2005-07-01 |
| HU9700100D0 (en) | 1997-02-28 |
| KR100366525B1 (ko) | 2003-03-15 |
| NO318585B1 (no) | 2005-04-11 |
| PL318147A1 (en) | 1997-05-12 |
| JP2009197024A (ja) | 2009-09-03 |
| AU2979195A (en) | 1996-02-16 |
| HUT76329A (en) | 1997-08-28 |
| CN1219551C (zh) | 2005-09-21 |
| WO1996002274A1 (en) | 1996-02-01 |
| UA48140C2 (uk) | 2002-08-15 |
| KR970704471A (ko) | 1997-09-06 |
| EP0777498B1 (en) | 2004-04-28 |
| TW502040B (en) | 2002-09-11 |
| DE69532958T2 (de) | 2009-04-09 |
| CA2194558A1 (en) | 1996-02-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP0646019B1 (en) | Biotin-DOTA conjugates and their use in pretargeting methods | |
| CA2451650A1 (en) | Ligands to enhance cellular uptake of biomolecules | |
| WO1995006633A1 (en) | Hydrazino-type n2s2 chelators | |
| KR20040030826A (ko) | 마크로시클릭 금속 착물, 및 생체분자와의 콘쥬게이트를제조하기 위한 이의 용도 | |
| JP2009197024A (ja) | 金属複合体及びオリゴヌクレオチドから作られた接合体、該接合体を含む薬剤、放射線診断におけるそれらの使用並びにそれらの製造のための方法 | |
| US20020077306A1 (en) | Conjugates made of metal complexes and oligonucleotides, agents containing the conjugates, their use in radiodiagnosis as well as process for their production | |
| US20090068103A1 (en) | Aptamers labeled with 68ga | |
| US8158782B2 (en) | Biomolecule labeling reactants based on azacycloalkanes and conjugates derived thereof | |
| CA2157902A1 (en) | Tumour targeting with l-enantiomeric oligonucleotide conjugates of immunoreagents and of chelated radionuclides | |
| ITRM20010079A1 (it) | Amminoderivati della biotina e loro coniugati con chelanti macrociclici. | |
| AU721330B2 (en) | Conjugates made of metal complexes and oligonucleotides | |
| DE4424922A1 (de) | Konjugate aus Metallkomplexen und Oligonucleotiden, die spezifisch an bestimmte Zielstrukturen binden | |
| WO1996002669A1 (en) | Conjugates of metal complexes and oligonucleotides, which specifically bond to specific target structures, agents containing these conjugates, their use in nmr diagnosis as well as process for their production | |
| DE4445078A1 (de) | Konjugate aus Metallkomplexen und Oligonucleotiden, diese enthaltende Mittel, deren Verwendung in der Radiodiagnostik sowie Verfahren zu deren Herstellung | |
| WO1996040273A2 (en) | Conjugates of ferrites and oligonucleotides, which bond specifically to certain target structures | |
| DE4424923A1 (de) | Konjugate aus Metallkomplexen und Oligonucleotiden, die spezifisch an bestimmte Zielstrukturen binden für MRI | |
| ES2250143T3 (es) | Prolongacion de la duracion de vida de aptameros de oligodesoxinucleotidos anticoagulantes en sangre. | |
| DE4445076A1 (de) | Konjugate aus Metallkomplexen und Oligonucleotiden, die spezifisch an bestimmte Zielstrukturen binden, diese Konjugate enthaltende Mittel, deren Verwendung in der NMR-Diagnostik sowie Verfahren zu deren Herstellung | |
| US20070167615A1 (en) | Macrocyclic oligonucleotide labeling reactants and conjugates derived thereof |