ES2297913T3 - Transformacion microbiana usando microorganismos del genero monosporium o thamostylum. - Google Patents

Transformacion microbiana usando microorganismos del genero monosporium o thamostylum. Download PDF

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Abstract

La presente invención se refiere a la utilización de microorganismos del género Monosporium y Thamostylum para O-demetilación diasteroselectiva de intermedios farmacéuticos, para producir compuestos de fórmula: *fórmulas *.

Description

Transformación microbiana usando microorganismos del género monosporium o thamostylum.
Antecedentes de la invención
La presente invención está dirigida al uso de la biotransformación microbiana para O-desmetilar ciertos compuestos farmacéuticos intermedios. Más específicamente, está dirigida al uso de ciertos microorganismos para O-desmetilar ciertos compuestos farmacéuticos intermedios.
Un artículo en Analytica Chimica Acta (1990) 233, 191-198 se refiere al uso de Cunninghamella elegans para desmetilar ciertos compuestos de n-propilnoraporfina.
Un artículo en Biomedical and Enviromental Mass Spectrometry (1986) 13, 223-229 se refiere al uso de Cunninghamella elegans para producir metabolitos potenciales de N-n-propil norapomorfina.
Un artículo de revisión publicado en Enzime and Microbial Technology (1984) 6.242-6.253 en las páginas 250-252 resume ampliamente el uso de ciertos microorganismos, por ejemplo especies fúngicas tales como Cunninghamella, Aspergillus, Thamnostylum, Penicillium y Sepedonium para O-desalquilar ciertos compuestos.
El capítulo 5.5 de Biotransformations in Organic Chemistry de H.G. Davies y col. se refiere al uso de Sepedonium chrysospermum y Cunninghamella elegans para desmetilar ciertos compuestos, que incluyen vindolina y 10,11-dimetoxiaporfina.
Un artículo en Phytochemistry (1997) 44 (8), 1479-1482, se refiere al uso de Aspergillus niger para producir
(-)-pinoresinol a través de la O-desmetilación de (+/-)-eudesmina.
La patente de Estados Unidos número 5.618.707 concedida el 18 de abril de 1997 se refiere al uso de Zygosaccharomyces bailii ATCC 38924 para reducir estereoselectivamente un compuesto de ácido pentanoico en un producto de feniloxazolidinona.
La patente de Estados Unidos número 5.580.764 se refiere al uso de óxido/reductasas de Lactobacillus plantarum, Pichia haplophila, Candida utilis, Lactobacillus buchmans, Aspergillus flavus y de Neuroespora crassa para reducir compuestos intermedios en la síntesis de inhibidores de la anhidrasa carbónica.
Breve descripción de los dibujos
Las Figuras 1-4 ilustran los perfiles de Cromatografía Líquida de Alta Presión generados usando biotransformación microbiana por medio de 3 cultivos fúngicos.
Resumen de la invención
En una forma de realización, la presente invención está dirigida a un procedimiento para la producción de un compuesto de la fórmula:
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a partir de un compuesto de la fórmula:
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que comprende desmetilar selectivamente un compuesto de fórmula II en presencia de una enzima derivada de un cultivo de un microorganismo del género Monosporium.
Resulta de preferencia el procedimiento en el que dicho microorganismo es Monosporium olivaceum.
Resulta también de preferencia el procedimiento en el que dicho Monosporium olivaceum es Monosporium olivaceum ATCC 36300.
En otra forma de realización, la presente invención está dirigida a un procedimiento para la preparación de un compuesto de la fórmula:
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a partir de un compuesto de la fórmula:
4
que comprende desmetilar selectivamente un compuesto de fórmula II en presencia de una enzima derivada de un microorganismo del género Thamnostylum.
Resulta de preferencia el procedimiento en el que dicho microorganismo es Thamnostylum piriforme.
Resulta también de preferencia el procedimiento en el que dicho Thamnostylum piriforme es Thamnostylum piriforme ATCC 8992.
También está descrito el uso de un compuesto de la fórmula:
5
para producir un compuesto de la fórmula:
6
También está descrito el uso en el que se desmetila no selectivamente un compuesto de fórmula II.
Descripción detallada de la invención
Esta invención comprende el uso de microorganismos para llevar a cabo la O-desmetilación de un compuesto intermedio en la síntesis de CP-336.156 (agonista de estrógeno/osteoporosis). El uso de microbios elimina la etapa química que produce bromuro de metilo, un gas de invernadero que es difícil y caro de atrapar, como un subproducto.
La biotransformación puede llevarse a cabo usando cultivos celulares completos de los microorganismos, extractos celulares de los microorganismos, o enzimas purificadas de los microorganismos.
El material de partida para esta biotransformación microbiana es CP-324.098, que es una mezcla de los diastereómeros cis. Se han encontrado tres hongos que realizan esta reacción con diferentes estereoselectividades. Cunninghamella echinulata O-desmetila ambos diastereómeros para formar la mezcla racémica denominada CP-319.609, que comprende los diastereómeros CP-336.156 y CP-335.992. Monosporium olivaceum y Thamnostylum piriforme sólo actúan sobre uno de los diastereómeros en CP-324.098 y dan un único producto de diastereómeros como se indica a continuación.
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El material de partida y los productos obtenidos por estos tres organismos se determinaron por medio de HPLC quiral como se muestran en las Figuras 1-4. Los productos finales de las reacciones de los tres microorganismos se aislaron del cultivo de fermentación y se caracterizaron por medio de RNM EM, y HPLC quiral para confirmar su identidad.
Habiendo descrito la invención en términos generales, a continuación se hace referencia a ejemplos específicos. Debe entenderse que estos ejemplos no tienen la intención de limitar la presente invención, cuyo alcance está determinado por las reivindicaciones.
Monosporium olivaceum ATCC 36300 y Thamnostylum piriforme ATCC 8992 pueden obtenerse de la American Type Culture Collection. Se añade un cultivo obtenido de esa manera a un medio de cultivo adecuado y se incuba con agitación hasta que se produzca el crecimiento. Los cultivos preparados de esta manera se usan para inocular biseles de medio de cultivo. Se congelan porciones de estos biseles como cultivos patrón. Los microorganismos respectivos se inoculan a partir de los biseles en dos matraces que contienen un medio de cultivo cuya composición se muestra a continuación. La fermentación se lleva a cabo a temperaturas que varían desde aproximadamente 22ºC hasta aproximadamente 32ºC; sin embargo, para obtener resultados óptimos resulta de preferencia realizar la fermentación aproximadamente a 28ºC. El pH del medio se controla en aproximadamente pH 6-7 por medio del uso de tampones orgánicos o inorgánicos adecuados incorporados en el medio de fermentación o mediante la adición periódica de una base. Se obtiene un buen crecimiento del microorganismo dentro de las 48 a 72 horas. Se transfiere el contenido de los matraces a un frasco de Fernbach que contiene medio de cultivo fresco con la misma composición que el medio de cultivo usado previamente. La variación del medio alterará el rendimiento del compuesto y su tasa de producción. La composición de preferencia del medio se establece en la sección del ejemplo. Tras agitar durante otro día, se adiciona una solución esterilizada por filtración de rapamicina en un disolvente adecuado tal como sulfóxido de dimetilo o dimetilformamida. La fermentación continúa durante uno a seis días. Resulta de preferencia continuar la fermentación durante aproximadamente dos días.
Un medio de cultivo adecuado para uso en el procedimiento de esta invención contendrá una fuente o fuentes de carbono asimilable, nitrógeno asimilable y sales inorgánicas que contengan minerales esenciales. En general, pueden usarse muchos carbohidratos tales como glucosa, maltosa, manosa, sacarosa, almidón, glicerol, jalea de mijo, melazas, soja y similares como fuentes de carbono asimilable. Las fuentes de nitrógeno asimilable incluyen materiales tales como levaduras e hidrolizados de caseína, levadura primaria, extractos de levadura, harina de semilla de algodón, sólidos de soja, germen del trigo, extractos de carne, peptona, licor de maceración de maíz, y sales de amonio. Los nutrientes de sales inorgánicas que pueden incorporarse en el medio de cultivo son las sales habituales que dan sodio, hierro, magnesio, potasio, cobalto, fosfato y similares. En general, por supuesto, las técnicas usadas no pretenden ser limitantes.
Los medios de cultivo adecuados incluyen (a) dextrosa (20 g), extracto de levadura (5 g), harina de soja (5 g), NaCl (5 g), K_{2}HPO_{4} (5 g) y agua destilada (1000 mililitros) en el que el pH se ajusta hasta 7,0 con HCI acuoso; (b) dextrina (10 g), extracto de carne de vaca (3 g), ardamine pH (5 g), N-Z amina tipo E (5 g), MgSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,5 g), KH_{2}PO_{4} (0,37 g), CaCO_{3} (0,5 g), agua destilada (1000 mililitros) en el que el pH se ajusta hasta 7,1 con HCI acuoso seguido por una segunda etapa de glucosa (10 g), Hy-Case SF (2 g), extracto de carne de vaca (1 g), licor de maceración de maíz (3 g), agua destilada (1000 mililitros) en la que el pH se ajusta hasta 7,0; (c) glucosa (10 g), licor de maceración de maíz (6 g), KH_{2}PO_{4} (3 g), CaCO_{3} (3,5 g), aceite de soja (bruto, 2,2 mililitros), extracto de levadura (2,5 g), agua destilada (1000 mililitros) en el que el pH se ajusta hasta 7,0 - 7,3 con HCI acuoso; (d) jarabe de la malta (20 g), medio de soja (5 g), caseína (1 g), levadura seca (1 g), NaCl (5 g), agua destilada (1000 mililitros); (e) lactosa (75 g), Pharmamedia (sustituto de extracto de levadura, 40 g), CaCO_{3} (10 g), Na_{2}SO_{3} (4 g), agua destilada (1000 mililitros); (f) ISP #3; (h) ISP #4; (i) ISP #5 y similares.
Procedimientos
Cultivos: Cunninghamella Echinulata ATCC 9244 y ATCC 36190; Monosporium Olivaceum ATCC 36300 y Thamnostylum piriforme ATCC 8992.
Biotransformación Medio de cultivo (etapas de inóculo y biotransformación)
glucosa
20 g/l hasta pH 7,0
harina de soja o alimento de soja
5
extracto de levadura
5
NaCl
5
K_{2}HPO_{4}
5
25 ml por matraz de Erlenmeyer de 125 ml para inóculo y biotransformación.
Inocular a partir de biseles o cultivos patrón congelados en 25 ml del medio anterior en un matraz de Erlenmeyer de 125 ml e incubar con agitación a 28ºC durante 2-3 días. Transferir 2,5 ml en 25 ml de caldo fresco en un matraz de Erlenmeyer y agitar durante otro día. Añadir CP-324.098 disuelto en DMSO y esterilizado por filtración hasta una concentración final de 0,2 mg/ml. Se puede añadir más substrato en intervalos de 1 día. Continuar la incubación con agitación durante 1-6 días.
Extracción y purificación
Se extrajo el caldo con dos veces su volumen de acetato de etilo en un embudo de separación. Se separaron las fases por centrifugación a 1000 x g durante 5 minutos tras lo cual se retiró cuidadosamente la fase superior de acetato de etilo y se evaporó hasta sequedad. El metanol funciona también adecuadamente como un disolvente de extracción. El producto puede purificarse usando extracción en fase sólida y HPLC preparativa.
Ensayo de HPLC Quiral
Columna
Chiral OD, 4,6 x 250 mm (Daicel, Chiral Technologies)
Caudal
0,7 ml/min
Tamaño de la muestra
20 \mul
Concentración
0,1 mg/ml
Temperatura
30ºC
Detección
UV a 220 nm
Fase móvil
100 ml de alcohol etílico (USP, deshidratado, 200 proof) más 900 ml de hexano más 1 ml de N'N'-dietilamina.
Las muestras se disuelven en etanol.

Claims (6)

1. Un procedimiento para la producción de un compuesto de la fórmula:
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a partir de un compuesto de la fórmula:
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que comprende desmetilar selectivamente un compuesto de fórmula II en presencia de una enzima derivada de un cultivo de un microorganismo del género Monosporium.
2. Un procedimiento según la reivindicación 1 en el que dicho microorganismo es Monosporium olivaceum.
3. Un procedimiento según la reivindicación 2 en el que dicho Monosporium olivaceum es Monosporium olivaceum ATCC36300.
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4. Un procedimiento para la producción de un compuesto de la fórmula:
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a partir de un compuesto de la fórmula:
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11
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que comprende desmetilar selectivamente un compuesto de fórmula II en presencia de una enzima derivada de un microorganismo del género Thamnostylum.
5. Un procedimiento según la reivindicación 4 en el que dicho microorganismo es Thamnostylum piriforme.
6. Un procedimiento según la reivindicación 5 en el que dicho Thamnostylum es Thamnostylum piriforme ATCC
8992.
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