ES2841902T3

ES2841902T3 - Composiciones que comprenden cepas bacterianas

Info

Publication number: ES2841902T3
Application number: ES18731444T
Authority: ES
Inventors: Imke Elisabeth MULDER; Anna Ettorre; Suaad Ahmed; Parthena Fotiadou; Samantha Yuille; Helene Savignac
Original assignee: 4D Pharma Research Ltd
Current assignee: 4D Pharma Research Ltd
Priority date: 2017-06-14
Filing date: 2018-06-14
Publication date: 2021-07-12
Anticipated expiration: 2038-06-14
Also published as: US20220096565A1; WO2018229188A1; JP2020523341A; JP6884889B2; MD3638271T2; EP3638271B1; EP3638271A1; DK3638271T3; US11123379B2; CY1123890T1; TW201919670A; PT3638271T; LT3638271T; SMT202000695T1; HRP20202033T1; HUE052319T2; PL3638271T3; MA49373A; SI3638271T1; US20200179459A1

Abstract

Una composición que comprende una cepa bacteriana del género Roseburia, para su uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson, incluida la parálisis supranuclear progresiva, parálisis supranuclear progresiva, síndrome de Steele-Richardson-Olszewski, hidrocefalia de presión normal, parkinsonismo vascular o arterioesclerótico y parkinsonismo inducido por fármacos; enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson; enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia, incluida la demencia con cuerpos de Lewy, vascular y frontotemporal; afasia progresiva primaria; deterioro cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH; o degeneración corticobasal.

Description

DESCRIPCIÓN

Composiciones que comprenden cepas bacterianas

CAMPO TÉCNICO

[0001] Esta invención está en el campo de las composiciones que comprenden cepas bacterianas aisladas del tracto digestivo de los mamíferos y el uso de tales composiciones en el tratamiento de la enfermedad.

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN

[0002] Se cree que el intestino humano es estéril en el útero, pero está expuesto a una gran variedad de microbios maternos y ambientales inmediatamente después del nacimiento. A partir de entonces, se produce un período dinámico de colonización y sucesión microbiana, que está influenciado por factores como el modo de administración, el medio ambiente, la dieta y el genotipo del hospedador, todos los cuales afectan la composición de la microbiota intestinal, particularmente durante la vida temprana. Posteriormente, la microbiota se estabiliza y se vuelve adulta [1]. La microbiota intestinal humana contiene más de 500-1000 filotipos diferentes que pertenecen esencialmente a dos divisiones bacterianas principales, los Bacteroidetes y Firmicutes [2]. Las relaciones simbióticas exitosas que surgen de la colonización bacteriana del intestino humano han producido una amplia variedad de funciones metabólicas, estructurales, protectoras y otras funciones beneficiosas. Las actividades metabólicas mejoradas del intestino colonizado aseguran que los componentes de la dieta que de otro modo no serían digeribles se degraden con la liberación de subproductos que proporcionan una importante fuente de nutrientes para el huésped. De manera similar, la importancia inmunológica de la microbiota intestinal está bien reconocida y se ejemplifica en animales libres de gérmenes que tienen un sistema inmunológico deteriorado que se reconstituye funcionalmente después de la introducción de bacterias comensales [3-5].

[0003] Los cambios dramáticos en la composición de la microbiota se han documentado en los trastornos gastrointestinales tales como enfermedad inflamatoria intestinal (IBD). P. ej., los niveles de las bacterias Clostridium cluster XIVa se reducen en pacientes con EII mientras que el número de E. coli aumenta, lo que sugiere un cambio en el equilibrio de simbiontes y patobiontes dentro del intestino [6-9].

[0004] En reconocimiento del efecto positivo potencial que pueden tener ciertas cepas bacterianas en el intestino animal, se han propuesto varias cepas para uso en el tratamiento de diversas enfermedades (véase, p. ej., [10-13]). Además, se han propuesto ciertas cepas, incluidas principalmente cepas de Lactobacillus y Bifidobacterium, para su uso en el tratamiento de diversas enfermedades inflamatorias y autoinmunes que no están directamente relacionadas con los intestinos (ver [14] y [15] para revisiones). La capacidad de Roseburia hominis para regular el sistema inmunológico se ha sugerido en [16]. Sin embargo, la relación entre diferentes enfermedades y diferentes cepas bacterianas, y los efectos precisos de cepas bacterianas particulares sobre el intestino y a nivel sistémico y sobre cualquier tipo particular de enfermedad, están pobremente caracterizados, particularmente para los trastornos neurodegenerativos.

[0005] Recientemente, ha habido un creciente interés en la técnica con respecto a las alteraciones en el microbioma intestinal que puede desempeñar un papel fisiopatológico en las enfermedades cerebrales humanas [17]. La evidencia preclínica y clínica sugiere fuertemente un vínculo entre el desarrollo del cerebro y la microbiota [18]. Un creciente cuerpo de literatura preclínica ha demostrado la señalización bidireccional entre el cerebro y el microbioma intestinal, que involucra múltiples sistemas de señalización neurocrina y endocrina. De hecho, los niveles elevados de especies de Clostridium en el microbioma se han relacionado con trastornos cerebrales [19], y un desequilibrio de los filos de Bacteroidetes y Firmicutes también se ha relacionado con trastornos del desarrollo cerebral [20]. Las sugerencias de que los niveles alterados de comensales intestinales, incluidos los de los géneros Bifidobacterium, Lactobacillus, Sutterella, Prevotella y Ruminococcus y de la familia Alcaligenaceae están involucrados en trastornos del sistema nervioso central (SNC) inmunomediados, son cuestionados por estudios que sugieren una falta de alteración en la microbiota entre pacientes y sujetos sanos [10]. Se ha propuesto Roseburia hominis para tratar una variedad de trastornos que incluyen asma, artritis reumatoide y esclerosis múltiple [21].

[0006] Como el asma y la artritis reumatoide, la esclerosis múltiple está mediada principalmente por el sistema inmunológico. El sistema inmunológico ataca los axones mielinizados en el sistema nervioso central, destruyendo la mielina llamada placas o lesiones. La desmielinización ocurre en particular en los nervios ópticos, médula espinal subpial, tronco encefálico, cerebelo y regiones de la sustancia blanca yuxtacortical y periventricular.

[0007] Como tal, la esclerosis múltiple tiene una patología diferente a otras enfermedades neurodegenerativas, tales como la de Parkinson, la enfermedad de Alzheimer o demencia. P. ej., la esclerosis múltiple se diagnostica comúnmente en pacientes de entre 20 y 30 años, mientras que muchas otras enfermedades neurodegenerativas, como la enfermedad de Parkinson, el Alzheimer y la demencia, se diagnostican predominantemente en pacientes mayores de 65 años.

[0008] La enfermedad de Parkinson, como muchas enfermedades neurodegenerativas, está mediada principalmente por la acumulación de proteína mal plegada. La enfermedad de Parkinson es una sinucleinopatología que implica la acumulación de a-sinucleína, que se agrega como fibrillas insolubles en cuerpos de Lewy dentro del citoplasma del cuerpo neuronal. La acumulación de a-sinucleína es tóxica y altera las funciones de mitocondrias, lisosomas y retículo endoplásmico e interfiere con el transporte de microtúbulos.

[0009] Fármacos antiinflamatorios no esteroideos (AINE) tales como ibuprofeno, han sido probados por su eficacia en el tratamiento de una variedad de enfermedades neurológicas, pero el impacto clínico de los AINE en enfermedades neurodegenerativas como la enfermedad de Parkinson sigue sin estar claro. Si bien algunos estudios mostraron que el uso crónico de AINE protege contra la enfermedad de Parkinson, otros estudios no pudieron confirmar la existencia de una relación significativa. Un metaanálisis reciente indicó que el uso de AINE sin aspirina, en particular ibuprofeno, reduce el riesgo de EP en un 15%, mientras que el uso de aspirina no mostró ningún efecto [22].

[0010] Esto indica que, en la actualidad, el efecto práctico de la relación entre el microbioma y enfermedades cerebrales humanas está mal caracterizado. En consecuencia, se requieren estudios analíticos más directos para identificar el impacto terapéutico de la alteración del microbioma en los trastornos neurodegenerativos.

[0011] No es un requisito en la técnica de nuevos métodos de tratamiento de trastornos neurodegenerativos. También existe la necesidad de caracterizar los efectos potenciales de las bacterias intestinales para poder desarrollar nuevas terapias que utilicen bacterias intestinales.

[0012] El documento US2015/132264 describe el uso de Roseburia hominis en el tratamiento de trastornos inmunitarios, homeostasis inmunitaria y trastornos intestinales. El documento US 2015/071957 describe el uso de especies de Roseburia en el tratamiento de trastornos autoinmunitarios o antiinflamatorios. El documento WO 2016/203221 describe el uso de una cepa bacteriana del género Roseburia para el tratamiento y la prevención de trastornos inflamatorios y autoinmunitarios caracterizados principalmente por una señalización anómala de la vía Th17/IL17. Keshavarzian y col. (Movement Disorders 2015; 30 (10) 1351-1360) describen la composición bacteriana del colon en pacientes con enfermedad de Parkinson. Jai Yin y col. (J Am Heart Assoc 2015; 4 (11), página e002699) describen la microbiota intestinal en pacientes con accidente cerebrovascular y ataque isquémico.

SUMARIO DE LA INVENCIÓN

[0013] Los inventores han desarrollado nuevas terapias para el tratamiento y prevención de trastornos neurodegenerativos. Los inventores han identificado que las cepas bacterianas del género Roseburia pueden ser eficaces para tratar enfermedades neurodegenerativas. Como se describe en los ejemplos, la administración de composiciones que comprenden Roseburia hominis puede proteger contra especies reactivas de oxígeno y prevenir la inflamación, actuando así como neuroprotector. Los inventores también han identificado que el tratamiento con Roseburia hominis puede reducir la activación de moléculas proinflamatorias, tales como NTkB e IL-6, por LPS y asinucleína A53T mutante. Los inventores han identificado que el tratamiento con Roseburia hominis puede reducir la actividad de desacetilación de histonas y la peroxidación de lípidos in vitro, lo que puede ayudar a reducir la muerte celular y la apoptosis. Los inventores también han identificado que Roseburia hominis puede producir indol que puede atenuar la inflamación y el estrés oxidativo. Además, los inventores han demostrado que el tratamiento con Roseburia hominis puede aumentar los niveles de quinurenina.

[0014] La invención proporciona una composición que comprende una cepa bacteriana del género Roseburia, para uso en un método de tratamiento o prevención de una enfermedad o condición seleccionada del grupo que consiste en: enfermedad de Parkinson, incluyendo parálisis supranuclear progresiva, parálisis supranuclear progresiva, Steele -Síndrome de Richardson-Olszewski, hidrocefalia de presión normal, parkinsonismo vascular o arterioesclerótico y parkinsonismo inducido por fármacos; Enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson; Enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; Enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia, incluida la demencia con cuerpos de Lewy, vascular y frontotemporal; afasia progresiva primaria; defecto cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH y degeneración corticobasal.

[0015] En realizaciones preferidas, la invención proporciona una composición que comprende una cepa bacteriana del género Roseburia, para uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson, tales como el medio ambiente, familiar o el Parkinson asociado con el estado inflamatorio general. Los inventores han identificado que el tratamiento con Roseburia cepas puede reducir la activación de moléculas proinflamatorias, tales como NTkB e IL-6, por LPS y mutante a-sinucleína A53T en modelos in vitro de Parkinson ambiental y familiar. En realizaciones preferidas, la invención proporciona una composición que comprende una cepa bacteriana de la especie Roseburia hominis, para uso en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson. Las composiciones que usan Roseburia hominis pueden ser particularmente efectivas para tratar la enfermedad de Parkinson.

[0016] En formas de realización preferidas de la invención, la cepa bacteriana en la composición es de Roseburia hominis. También se pueden usar cepas estrechamente relacionadas, como las cepas bacterianas que tienen una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a la secuencia de rARN 16S de una cepa bacteriana de Roseburia hominis. Preferiblemente, la cepa bacteriana tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a SEQ ID NO: 1, 2 o 3, Preferiblemente, la secuencia la identidad es la SEQ ID NO: 3, Preferiblemente, la cepa bacteriana para su uso en la invención tiene la secuencia de rARN 16S representada por SEQ ID NO: 3.

[0017] En ciertas realizaciones, la composición de la invención es para administración oral. La administración oral de las cepas de la invención puede ser eficaz para los trastornos neurodegenerativos. Además, la administración oral es conveniente para pacientes y médicos y permite el suministro y/o la colonización parcial o total del intestino.

[0018] En ciertas realizaciones, la composición de la invención comprende uno o más excipientes o vehículos portadores farmacéuticamente aceptables.

[0019] En ciertas realizaciones, la composición de la invención comprende una cepa bacteriana que ha sido liofilizada. La liofilización es una técnica eficaz y conveniente para preparar composiciones estables que permitan la liberación de bacterias.

[0020] En determinadas realizaciones, la invención proporciona un producto alimenticio que comprende la composición descrita anteriormente.

[0021] En ciertas realizaciones, la invención proporciona una composición de vacuna que comprende la composición como se ha descrito anteriormente.

[0022] En ciertas realizaciones de la invención, la composición es para uso en el tratamiento de lesión cerebral. La actividad neuroprotectora de las composiciones de la invención y su capacidad para reducir los niveles de actividad de la histona desacetilasa (HDAC) puede hacerlas útiles para el tratamiento de lesiones cerebrales. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de un accidente cerebrovascular, como el tratamiento de una lesión cerebral resultante de un accidente cerebrovascular.

BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS

[0023]

Figura 1: Regulación a la baja de la secreción de IL-6

Figura 2: Inhibición de la activación promotora NFkB inducida por a-sinucleína

Figura 3: La inhibición de activación promotora NFkB inducida por LPS

Figura 4: Cambio en la capacidad antioxidante

Figura 5: Cambio en la capacidad antioxidante total (oxidación de lípidos)

Figura 6: Cambio en la actividad de histona desacetilatasa (HDAC)

Figura 7: Nivel de producción de indol

Figura 8: Nivel de producción de cirunenina

Figura 9: Regulación a la baja de la secreción de IL-6 por MRX001

Figura 10: Regulación a la baja de la secreción de IL-6 por la cepa A

Figura 11: A) Inhibición de la activación del promotor de NFkB inducida por a-sinucleína y B) Inhibición de la activación del promotor de NFkB inducida por LPS por la cepa A

Figura 12: Regulación a la baja de secreción de IL-6 por la cepa B

Figura 13: A) Inhibición de la activación promotora NFkB inducida por a-sinucleína B) Inhibición de activación promotora NTkB inducida por LPS por la cepa B

DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN

Cepas bacterianas

[0024] Las composiciones de la invención comprenden una cepa bacteriana del género Roseburia. Los ejemplos demuestran que las bacterias de este género son útiles para tratar o prevenir trastornos neurodegenerativos. Las cepas bacterianas preferidas son de las especies Roseburia hominis, Roseburia faecis y Roseburia intestinalis.

[0025] Los ejemplos de especies de Roseburia para usar en la invención incluyen Roseburia hominis, Roseburia cecicola, Roseburia faecis, Roseburia intestinalis y Roseburia inulinivorans. La bacterias Roseburia son células en forma de bastoncillo ligeramente curvadas que son estrictamente anaeróbicas y autóctonas del intestino de los mamíferos. Son del grupo filogenético XIVa dentro del filo Firmicutes. Las bacterias son productoras de butirato y se mueven activamente a través de múltiples flagelos presentes a lo largo del lado cóncavo y en un grupo en un extremo [23]. Roseburia hominis y Roseburia intestinalis son ejemplos descritos recientemente.

[0026] Un ejemplo de Roseburia hominis es la cepa depositada bajo los términos del Tratado de Budapest en el National Collections of Industrial, Food and Marine Bacteria (NCIMB) en NCIMB Ltd., Ferguson Building, Craibstone Estate, Bucksburn, Aberdeen, Reino Unido, AB21 9YA, el 21 de octubre de 2004 por el Rowett Research Institute con el número de acceso NCIMB 14029T Roseburia hominis A2-183T (DSM = 16839T). Otras cepas ejemplares de Roseburia hominis se describen en [24]. Los números de acceso de GenBank/EMBL/DDBJ para la secuencia del gen 16S rARN de cepas de Roseburia hominis son AY804148 y AJ270482 (descritos en el presente documento como SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2).

[0027] Un ejemplo de Roseburia intestinalis es la cepa depositada bajo el número de acceso NCIMB 13810 Roseburia intestinalis L1-82T (DSM = 14610T). Otro ejemplo es la cepa Roseburia intestinalis como se describe en [24]. La referencia [24] también describe cepas ejemplares de Roseburia faecis y Roseburia inulinivorans.

[0028] La bacteria Roseburia hominis depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 fue probada en los ejemplos y también se denomina en este documento como la cepa 433. Una secuencia 16S rARN para la cepa 433 que fue probada se proporciona en la SEQ ID NO: 3. La cepa 433 fue depositada en la autoridad depositaria internacional NCIMB, Ltd. (Ferguson Building, Aberdeen, AB21 9YA, Escocia) por GT Biologics Ltd. (Life Sciences Innovation Building, Aberdeen, AB25 2ZS, Escocia) el 12 de marzo de 2015 como "Roseburia hominis 433" y se le asignó el número de acceso NCIMB 42383. GT Biologics Ltd. posteriormente cambió su nombre a 4D Pharma Research Limited.

[0029] El documento WO 2016/203221 describe la administración de la cepa 433 a ratones y muestra que puede afectar los procesos patológicos fuera del intestino (como el asma y la artritis). La cepa 433 también afecta a los procesos patológicos fuera del intestino en el tratamiento de los trastornos neurodegenerativos descritos en este documento.

[0030] Una secuencia del genoma de la cepa 433 se proporciona en WO2018/229188 como SEQ ID NO: 4. Esta secuencia se generó utilizando la plataforma PacBio RS II.

[0031] La bacteria Roseburia intestinalis depositada bajo el número de acceso NCIMB 43043 fue probada en los ejemplos y también se denomina en este documento como cepa A. Una secuencia de 16S rARN para la cepa A que fue probada se proporciona en SEQ ID NO: 5. La cepa A fue depositada en la autoridad depositaria internacional NCIMB, Ltd. (Ferguson Building, Aberdeen, AB21 9YA, Escocia) por 4D Pharma Research Limited (Life Sciences Innovation Building, Aberdeen, AB252ZS, Escocia) el 3 de mayo de 2018 como "Roseburia intestinalis" y se le asignó el número de acceso NCIMB 43043.

[0032] Los ejemplos también describen una bacteria Roseburia faecis que fue probada y se denomina cepa B. Una secuencia de 16S rARN para la cepa B que fue probada se proporciona en SEQ ID NO: 6.

[0033] En ciertas realizaciones, la cepa bacteriana para uso en la invención es Roseburia hominis. En determinadas realizaciones, la cepa bacteriana para uso en la invención es Roseburia intestinalis. En determinadas realizaciones, la cepa bacteriana para usar en la invención es Roseburia faecis.

[0034] Las cepas bacterianas estrechamente relacionadas con la cepa probada en los ejemplos también se espera que sean eficaces para el tratamiento o prevención de enfermedades de enfermedades neurodegenerativas y afecciones mediadas por IL-17 o la vía Th17. En ciertas realizaciones, la cepa bacteriana para uso en la invención tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a la secuencia de rARN 16S de una cepa bacteriana de Roseburia hominis. Preferiblemente, la cepa bacteriana para usar en la invención tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a SEQ ID NO: 1, 2 o 3. Preferiblemente, la identidad de secuencia es la SEQ ID NO: 3. Preferiblemente, la cepa bacteriana para su uso en la invención tiene la secuencia de rARN 16S representada por SEQ ID NO: 3.

[0035] En otras formas de realización, la cepa bacteriana para uso en la invención tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a la secuencia de 16S rARN de una cepa bacteriana de Roseburia intestinalis. Preferiblemente, la cepa bacteriana para uso en la invención tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a SEQ ID NO: 5. Preferiblemente, la cepa bacteriana para usar en la invención tiene la secuencia de rARN 16S representada por SEQ ID NO: 5.

[0036] En otras formas de realización, la cepa bacteriana para uso en la invención tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a la secuencia de 16S rARN de una cepa bacteriana de Roseburia faecis. Preferiblemente, la cepa bacteriana para uso en la invención tiene una secuencia de rARN 16S que es al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a SEQ ID NO: 6. Preferiblemente, la cepa bacteriana para su uso en la invención tiene la secuencia de rARN 16S representada por SEQ ID NO: 6.

[0037] Las cepas bacterianas que son biotipos de la bacteria depositada bajo el número de acceso 42383 o NCIMB 43043 también se espera que sean eficaces para el tratamiento o la prevención de trastornos neurodegenerativos. Un biotipo es una cepa estrechamente relacionada que tiene las mismas características fisiológicas y bioquímicas o muy similares.

[0038] Las cepas que son biotipos de la bacteria depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043 y que son adecuadas para uso en la invención pueden identificarse por secuenciación de otras secuencias de nucleótidos para la bacteria depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043. P. ej., sustancialmente se puede secuenciar todo el genoma y una cepa de biotipo para uso en la invención puede tener al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% de identidad de secuencia en al menos 80% de todo su genoma (p. ej., en al menos 85%, 90%, 95% o 99%, o en todo su genoma). Otras secuencias adecuadas para su uso en la identificación de cepas de biotipo pueden incluir hsp60 o secuencias repetitivas como BOX, ERIC, (GTG) 5 o REP o [25]. Las cepas de biotipo pueden tener secuencias con al menos 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% de identidad de secuencia con la secuencia correspondiente de la bacteria depositada con el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043.

[0039] En determinadas realizaciones, la cepa bacteriana para su uso en la invención tiene un genoma con identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188. En realizaciones preferidas, la cepa bacteriana para uso en la invención tiene un genoma con al menos el 90% de identidad de secuencia (p. ej., al menos el 92%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% de secuencia identidad) a SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 en al menos 60% (p. ej., al menos 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100%) de la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188. P. ej., la cepa bacteriana para usar en la invención puede tener un genoma con al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 70% de la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 90% de identidad de secuencia con SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 80% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 90% de identidad de secuencia con SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 en 90% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 100% de la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos un 95% de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 70% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 95% de identidad de secuencia a SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 80% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos un 95% de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 en el 90% de la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos un 95% de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 en 100% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 98% de identidad de secuencia con SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 70% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 98% de identidad de secuencia a SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 a través del 80% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 98% de identidad de secuencia con SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 en el 90% de SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188, o al menos 98% de identidad de secuencia con SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188 en el 100% de la SEQ ID NO: 4 de WO2018/229188.

[0040] Alternativamente, cepas que son biotipos de la bacteria depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043 y que son adecuados para uso en la invención pueden identificarse usando el número de acceso NCIMB 42383 o depósito NCIMB 43043 y análisis de fragmentos de restricción y/o análisis de PCR, por ejemplo usando polimorfismo de longitud de fragmento amplificado fluorescente (FAFLP) y huella digital repetitiva de elemento de ADN(Rep)-PCR, o perfil de proteínas, o secuenciación parcial de rADN 16S o 23S. En realizaciones preferidas, tales técnicas se pueden usar para identificar otras cepas de Roseburia hominis, Roseburia faecis y Roseburia intestinalis.

[0041] En ciertas realizaciones, cepas que son biotipos de la bacteria depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043 y que son adecuados para uso en la invención son cepas que proporcionan el mismo patrón que la bacteria depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043 cuando se analiza mediante análisis de restricción de ADN ribosómico amplificado (ARDRA), p. ej., cuando se usa la enzima de restricción Sau3AI (para métodos ejemplares y orientación, ver, p. ej., [26]). Alternativamente, las cepas de biotipo se identifican como cepas que tienen los mismos carbohidratos patrones de fermentación como la bacteria depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043.

[0042] Otras cepas Roseburia que son útiles en las composiciones y métodos de la invención, tales como biotipos de las bacterias depositadas con el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043, pueden identificarse usando cualquier método o estrategia apropiados, incluidos los ensayos descritos en los ejemplos. P. ej., las cepas para uso en la invención pueden identificarse cultivando con células de neuroblastoma y luego evaluando los niveles de citocinas y los niveles de neuroprotección o neuroproliferación. En particular, las cepas bacterianas que tienen patrones de crecimiento, tipo metabólico y/o antígenos de superficie similares a la bacteria depositada con el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043 pueden ser útiles en la invención. Una cepa útil tendrá una actividad inmunomoduladora comparable a la cepa NCIMB 42383 o NCIMB 43043. En particular, una cepa de biotipo provocará efectos comparables sobre los modelos de enfermedades neurodegenerativas y efectos comparables sobre los niveles de citoquinas a los efectos mostrados en los Ejemplos, que pueden identificarse usando los protocolos de cultivo y administración descritos en los Ejemplos.

[0043] Una cepa particularmente preferida de la invención es la cepa Roseburia hominis depositada bajo el número de acceso NCIMB 42383. Esta es la cepa 433 ejemplar probada en los ejemplos y que se ha demostrado que es eficaz para tratar enfermedades. Por tanto, la divulgación proporciona una célula, tal como una célula aislada, de la cepa Roseburia hominis depositada con el número de acceso NCIMB 42383, o un derivado de la misma. La divulgación también proporciona una composición que comprende una célula de la cepa Roseburia hominis depositada con el número de acceso NCIMB 42383, o un derivado de la misma. La invención también proporciona un cultivo biológicamente puro de la cepa Roseburia hominis depositada con el número de acceso NCIMB 42383. La divulgación también proporciona una célula de la cepa Roseburia hominis depositada con el número de acceso NCIMB 42383, o un derivado de la misma, para uso en terapia, en particular para las enfermedades descritas en este documento.

[0044] Una cepa particularmente preferida de la invención es la cepa Roseburia intestinalis depositada bajo el número NCIMB 43043. Esta es la cepa ejemplar A probada en los ejemplos y demostrada a ser eficaz para el tratamiento de la enfermedad. Por tanto, la divulgación proporciona una célula, tal como una célula aislada, de la cepa Roseburia intestinalis depositada con el número de acceso NCIMB 43043, o un derivado de la misma. La divulgación también proporciona una composición que comprende una célula de la cepa Roseburia intestinalis depositada con el número de acceso NCIMB 43043, o un derivado de la misma. La divulgación también proporciona un cultivo biológicamente puro de la cepa Roseburia intestinalis depositada con el número de acceso NCIMb 43043. La divulgación también proporciona una célula de la cepa Roseburia intestinalis depositada con el número de acceso NCIMB 43043, o un derivado de la misma, para uso en terapia, en particular para las enfermedades descritas en este documento. Un derivado de la cepa depositada con el número de acceso NCIMB 42383 o NCIMB 43043 puede ser una cepa hija (progenie) o una cepa cultivada (subclonada) del original. Un derivado de una cepa de la invención puede modificarse, p. ej., a nivel genético, sin eliminar la actividad biológica. En particular, una cepa derivada de la invención es terapéuticamente activa. Una cepa derivada tendrá una actividad inmunomoduladora comparable a la cepa NCIMB 42383 o NCIMB 43043 original. En particular, una cepa derivada provocará efectos comparables en los modelos de enfermedades neurodegenerativas y efectos comparables sobre los niveles de citocinas a los efectos mostrados en los Ejemplos, que pueden identificarse utilizando los protocolos de cultivo y administración descritos en los Ejemplos. Un derivado de la cepa NCIMB 42383 o NCIMB 43043 será generalmente un biotipo de la cepa NCIMB 42383 o NCIMB 43043.

[0045] Las referencias a células de la cepa de Roseburia hominis depositadas con el número de acceso NCIMB 42383 abarcan cualquier célula que tenga las mismas características de seguridad y eficacia terapéutica que las cepas depositadas con el número de acceso NCIMB 42383, y tales células están incluidas en la invención.

[0046] Las referencias a células de la cepa Roseburia intestinalis depositadas con el número de acceso NCIMB 43043 abarcan cualquier célula que tenga las mismas características de seguridad y eficacia terapéutica que las cepas depositadas con el número de acceso NCIMB 43043, y tales células están incluidas en la invención.

[0047] En realizaciones preferidas, las cepas bacterianas en las composiciones de la invención son viables y capaces de colonizar parcial o totalmente el intestino.

[0048] La divulgación también proporciona un cultivo biológicamente puro de la cepa Roseburia intestinalis depositada bajo el número de acceso NCIMB 43043. La divulgación también proporciona una célula de la cepa Roseburia intestinalis depositada bajo el número de acceso NCIMB 43043, o un derivado del mismo, para uso en terapia, en particular para las enfermedades descritas en este documento. Un derivado de la cepa depositada con el número de acceso NCIMB 43043 puede ser una cepa hija (progenie) o una cepa cultivada (subclonada) de la original.

[0049] Un derivado de una cepa de la invención se puede modificar, por ejemplo a nivel genético, sin ablación de la actividad biológica. En particular, una cepa derivada de la invención es terapéuticamente activa. Una cepa derivada tendrá una actividad inmunomoduladora comparable a la cepa NCIMB 42761 original. En particular, una cepa derivada provocará efectos comparables en los modelos de enfermedad neurodegenerativa a los efectos mostrados en los Ejemplos, que pueden identificarse usando los protocolos de cultivo y administración descritos en los Ejemplos. Un derivado de la cepa NCIMB 43043 será generalmente un biotipo de la cepa NCIMB 43043.

[0050] Las referencias a células de la cepa Roseburia intestinalis depositadas con el número de acceso NCIMB 43043 abarcan cualquier célula que tenga las mismas características de seguridad y eficacia terapéutica que la cepa depositada con el número de acceso NCIMB 43043, y tales células están incluidas en la invención. Por lo tanto, en algunas realizaciones, la referencia a las células de la cepa Roseburia intestinalis depositada con el número de acceso NCIMB 43043 se refiere sólo a la cepa A depositada con el NCIMB 43043 y no se refiere a una cepa bacteriana que no se depositó bajo NCIMB 43043.

[0051] En realizaciones preferidas, la cepa bacteriana en las composiciones de la invención es viable y capaz de colonizar parcial o totalmente el intestino.

Usos terapéuticos

[0052] Como se demuestra en los ejemplos, las composiciones bacterianas de la invención son eficaces para el tratamiento de trastornos neurodegenerativos. En particular, el tratamiento con composiciones de la invención aumenta la neuroproliferación y actúa como neuroprotector contra agentes que destruyen las neuronas dopaminérgicas. Por tanto, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir trastornos neurodegenerativos que son el resultado de la muerte neuronal.

[0053] Las composiciones de la invención pueden disminuir la activación del promotor NTkB, que activa la producción de citocinas, por ejemplo IL-1p, IL-1 a, IL-18, TNFa e IL-6. El tratamiento de células con a-sinucleína mutante es un modelo para el Parkinson familiar. Una mutación puntual en la posición 53 de adenina a treonina conduce a un plegamiento incorrecto de la a-sinucleína. La a-sinucleína plegada incorrectamente se agrega posteriormente en fibrillas insolubles que forman cuerpos de Lewy. Por tanto, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir trastornos neurodegenerativos que son el resultado de neuroinflamación, plegamiento incorrecto de proteínas y/o exposición ambiental. Las composiciones de la invención pueden usarse para el tratamiento del Parkinson familiar. La activación del promotor NFkB está mediada por el ligando TLR4. Se sabe que TL4 media la muerte celular en el modelo de ratón MPTP, que simula la enfermedad de Parkinson. Las composiciones de la invención pueden usarse para inhibir la capacidad de la señalización de TLR4 para activar el promotor NFkB. De particular relevancia para la EP, se encontró que tanto TLR2 como TLR4 estaban regulados positivamente en los cerebros de los pacientes con EP [27]. Además, a-syn se ha descrito como un ligando para TLR2 [28] y hemos demostrado que a-syn es también un ligando para TLR4 usando células HEK-TLR4.

[0054] Las composiciones de la invención disminuyen la secreción de citocinas proinflamatorias tales como IL-6, que pueden ser inducidas por lipopolisacáridos (LPS). El tratamiento de las células con LPS simula el Parkinson causado por factores ambientales. Las composiciones de la invención pueden usarse para disminuir la secreción de IL-6, Las composiciones de la invención pueden usarse para el tratamiento del Parkinson ambiental.

[0055] Los ejemplos de enfermedades neurodegenerativas a tratar mediante composiciones de la invención incluyen: enfermedad de Parkinson, que incluye parálisis supranuclear progresiva, parálisis supranuclear progresiva, síndrome de Steele-Richardson-Olszewski, hidrocefalia de presión normal, parkinsonismo vascular o arteriosclerótico y parkinsonismo inducido por fármacos; Enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson; Enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; Enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia, incluida la demencia con cuerpos de Lewy, vascular y frontotemporal; afasia progresiva primaria; defecto cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH y degeneración corticobasal. Otra enfermedad neurodegenerativa que se va a tratar con las composiciones descritas en el documento en este documento es la neuropatía inflamatoria progresiva.

[0056] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención pueden ser eficaces para el tratamiento de trastornos neurodegenerativos que se producen en pacientes de edad avanzada. Los ejemplos muestran que las composiciones de la invención pueden tratar la enfermedad de Parkinson que se diagnostica predominantemente en pacientes mayores de 65 años. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención son para el tratamiento de pacientes de 65 años o más. En otras determinadas realizaciones, los pacientes tienen entre 40 y 65 años. En otras realizaciones, los pacientes tienen más de 40 años. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una enfermedad asociada con la vejez, p. ej., una enfermedad diagnosticada después de los 50 años.

[0057] En ciertas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento son para uso en el tratamiento de un trastorno neurodegenerativo mediado o caracterizado por la acumulación de proteínas, en particular proteínas mal plegadas.

[0058] En ciertas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento son para uso en el tratamiento de un trastorno neurodegenerativo asociado con la pérdida neuronal de la materia gris. En ciertas realizaciones, las composiciones descritas en este documento son para tratar un trastorno neurodegenerativo que no está asociado con lesiones de la sustancia blanca.

[0059] En ciertas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento son para uso en el tratamiento de un trastorno neurodegenerativo asociado con síntomas permanentes.

[0060] En ciertas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento son para uso en el tratamiento de un trastorno neurodegenerativo que no es un trastorno auto-inmune. En determinadas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento se utilizan en el tratamiento de un trastorno neurodegenerativo que no es la esclerosis múltiple.

[0061] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención son para su uso en la reducción de la muerte neuronal, en particular, en el tratamiento de trastornos neurodegenerativos. En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan para proteger neuronas, en particular en el tratamiento de trastornos neurodegenerativos.

[0062] Las propiedades neuroprotectoras de las composiciones de la invención, como se muestra en los ejemplos, significan que las composiciones pueden ser particularmente eficaces para prevenir o retrasar la aparición o la progresión de trastornos neurodegenerativos. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan para retrasar la aparición o progresión de trastornos neurodegenerativos.

Modulación del eje microbiota-intestino-cerebro

[0063] La comunicación entre el intestino y el cerebro (el eje microbiota-intestino-cerebro) se produce mediante un sistema de comunicación neurohumoral bidireccional. La evidencia reciente muestra que la microbiota que reside en el intestino puede modular el desarrollo del cerebro y producir fenotipos de comportamiento a través del eje microbiotaintestino-cerebro. De hecho, una serie de revisiones sugieren un papel del eje microbiota-intestino-cerebro en el mantenimiento de la funcionalidad del sistema nervioso central e implican la disfunción del eje microbiota-intestinocerebro en el desarrollo de trastornos y afecciones del sistema nervioso central [17], [20], [29].

[0064] La comunicación bidireccional entre el cerebro y el intestino (es decir, el eje intestino-cerebro) incluye el sistema nervioso central, neuroendocrino y sistemas neuroinmunes, incluyendo el hipotálamo-pituitaria-adrenal (HPA), simpático y los brazos parasimpáticos del sistema nervioso autónomo (SNA), que incluye el sistema nervioso entérico (SEN) y el nervio vago, y la microbiota intestinal.

[0065] Como se demuestra en los ejemplos, las composiciones de la presente invención pueden modular el eje microbiota-intestino-cerebro y reducir la muerte celular asociada con trastornos neurodegenerativos. Por consiguiente, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir trastornos neurodegenerativos, en particular aquellos trastornos y afecciones asociadas con la disfunción del eje microbiota-intestino-cerebro.

[0066] En realizaciones particulares, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir una enfermedad o afección seleccionada del grupo constituido por: enfermedad de Parkinson, incluyendo parálisis supranuclear progresiva, parálisis cerebral supranuclear progresiva, síndrome de Steele-Richardson-Olszewski, hidrocefalia normal por presión, parkinsonismo vascular o arterioesclerótico y parkinsonismo inducido por fármacos; enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson; enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; Enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia; incluido el cuerpo de Lewy; demencia vascular y frontotemporal; primaria afasia progresiva; defecto cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH y degeneración corticobasal.

[0067] Las composiciones de la invención pueden ser particularmente útiles para tratar o prevenir las enfermedades crónicas, el tratamiento o la prevención de la enfermedad en pacientes que no han respondido a otras terapias (tales como el tratamiento con levodopa, agonistas de dopamina, inhibidores de la MAO-B, inhibidores de la COMT, antagonistas de glutamato y/o anticolinérgicos), y/o tratar o prevenir el daño tisular y los síntomas asociados con la disfunción del eje microbiota-intestino-cerebro.

[0068] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el SNC. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el sistema nervioso autónomo (SNA). En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el sistema nervioso entérico (SNE). En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el eje hipotalámico, pituitario, suprarrenal (HPA). En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la ruta neuroendocrina. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la vía neuroinmune. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el SNC, el SNA, el SNE, el eje HPA y/o las vías neuroendocrinas y neuroinmunes. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modifican los niveles de metabolitos comensales y/o la permeabilidad gastrointestinal de un sujeto. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el sistema dopaminérgico.

[0069] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro es modulada por los sistemas neuronales. Por consiguiente, en algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la señalización en los sistemas neurales. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la señalización del sistema nervioso central. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la señalización en neuronas sensoriales. En otras realizaciones, las composiciones de la invención modulan la señalización en las neuronas motoras. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la señalización en el SNA. En algunas realizaciones, el SNA es el sistema nervioso parasimpático. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención modulan la señalización del nervio vago. En otras realizaciones, el SNA es el sistema nervioso simpático. En otras realizaciones, las composiciones de la invención modulan la señalización en el sistema nervioso entérico. En determinadas realizaciones, la señalización de las neuronas SNA y SNE responde directamente al contenido luminal del tracto gastrointestinal. En otras realizaciones, la señalización de neuronas SNA y SNE responde indirectamente a neuroquímicos producidos por bacterias luminales. En otras realizaciones, la señalización de neuronas SNA y SNE responde a neuroquímicos producidos por bacterias luminales o células enteroendocrinas. En ciertas realizaciones preferidas, las neuronas del SNE activan aferentes vagales que influyen en las funciones del SNC. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención regulan la actividad de las células enterocromafines.

Enfermedades neurodegenerativas

[0070] Tauopatías son enfermedades neurodegenerativas asociadas con la agregación patológica de la proteína tau en los ovillos neurofibrilares o gliofibrilares en el cerebro humano. La enfermedad de Alzheimer es un ejemplo de tauopatología. Las sinucleinopatías (también llamadas a-sinucleinopatías) son enfermedades neurodegenerativas caracterizadas por la acumulación anormal de agregados de a-sinucleína en neuronas, fibras nerviosas o células gliales. La enfermedad de Parkinson es un ejemplo de sinucleinopatología.

[0071] Existe una superposición clínica y patológica entre estas dos patologías. Los pacientes con enfermedad de Parkinson con frecuencia tienen demencia y los pacientes con enfermedad de Alzheimer a menudo manifiestan parkinsonismo [30]. P. ej., la parálisis supranuclear progresiva (también conocida como síndrome de Steele-Richardson-Olszewski) tiene una tauopatología, pero también conduce a un parkinsonismo prominente [31]. Las mutaciones en LRRK2 que se sabe que causan parkinsonismo están asociadas con la acumulación de sinucleína, tau, ninguna o ambas proteínas [32].

[0072] La enfermedad con cuerpos de Lewy (LBD) es una enfermedad neurodegenerativa que es una de las causas más comunes de demencia en los ancianos. LBD ejemplifica la existencia de un continuo entre patologías de tau y sinucleína. El LBD comparte características clínicas y patológicas con la enfermedad de Parkinson, la demencia de la enfermedad de Parkinson y la enfermedad de Alzheimer [30].

[0073] En realizaciones particulares, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir tauopatías y/o sinucleinopatías. En realizaciones particulares, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir tauopatías. En realizaciones particulares, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir sinucleinopatías. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir una enfermedad o afección seleccionada del grupo que consiste en: enfermedad de Parkinson, que incluye parálisis supranuclear progresiva, parálisis supranuclear progresiva, síndrome de Steele-Richardson-Olszewski, hidrocefalia de presión normal, parkinsonismo vascular o arterioesclerótico y parkinsonismo inducido por fármacos; enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson; y demencia; incluido el cuerpo de Lewy; demencia vascular y frontotemporal.

[0074] En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir la enfermedad de Parkinson, incluyendo la parálisis supranuclear progresiva, parálisis cerebral supranuclear progresiva, síndrome de Steele-Richardson-Olszewski, hidrocefalia de presión normal, parkinsonismo vascular o arteriosclerótico e parkinsonismo inducio por fármacos. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir la enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson. En realizaciones preferidas adicionales, las composiciones de la invención pueden ser útiles para tratar o prevenir la demencia; incluido el cuerpo de Lewy; demencia vascular y frontotemporal.

Enfermedad de Parkinson

[0075] La enfermedad de Parkinson es una enfermedad neurodegenerativa común neuropatológicamente caracterizada por la degeneración de poblaciones heterogéneas de células neuronales (células productoras de dopamina). El diagnóstico clínico de la enfermedad de Parkinson requiere bradicinesia y al menos uno de los siguientes síntomas centrales: temblor en reposo; rigidez muscular y deterioro de los reflejos posturales. Otros signos y síntomas que pueden estar presentes o desarrollarse durante la progresión de la enfermedad son alteraciones autonómicas (sialorrea, seborrea, estreñimiento, alteraciones de la micción, funcionamiento sexual, hipotensión ortostática, hiperhidrosis), alteraciones del sueño y alteraciones en el sentido del olfato o del sentido del sueño de temperatura. La enfermedad de Parkinson es una enfermedad neurodegenerativa que puede desarrollarse o persistir debido a una disfunción del eje microbiota-intestino-cerebro. Por tanto, en realizaciones preferidas, las composiciones de la invención se utilizan para tratar o prevenir la enfermedad de Parkinson en un sujeto.

[0076] En otras realizaciones preferidas, la invención proporciona una composición que comprende una cepa bacteriana del género Roseburia, para uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson. Las composiciones que comprenden una cepa bacteriana del género Roseburia pueden mejorar las funciones motoras y cognitivas en modelos de la enfermedad de Parkinson. El tratamiento con cepas de Roseburia puede modular la señalización en los sistemas nerviosos central, autónomo y entérico; puede modular la actividad de la vía del eje HPA; puede modular las vías neuroendocrinas y/o neuroinmunes; y puede modular los niveles de metabolitos comensales, marcadores inflamatorios y/o permeabilidad gastrointestinal de un sujeto, todos los cuales están implicados en la neuropatología de la enfermedad de Parkinson. En realizaciones preferidas, la invención proporciona una composición que comprende una cepa bacteriana de la especie Roseburia hominis para su uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson. Las composiciones que usan Roseburia hominis pueden ser particularmente efectivas para tratar la enfermedad de Parkinson.

[0077] En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian uno o más de los síntomas de enfermedad de Parkinson en un sujeto. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian uno o más síntomas centrales de la enfermedad de Parkinson en un sujeto. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la bradicinesia en un sujeto. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian el temblor en reposo; rigidez muscular y/o deterioro del reflejo postural en un sujeto. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian uno o más síntomas asociados con la progresión de la enfermedad de Parkinson seleccionados entre alteraciones autonómicas (sialorrea, seborrea, estreñimiento, alteraciones de la micción, funcionamiento sexual, hipotensión ortostática, hiperhidrosis), alteraciones del sueño y alteraciones en el sentido del olfato o del sentido de la temperatura.

[0078] En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian los síntomas de depresión comórbida con la enfermedad de Parkinson. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la memoria verbal y/o las funciones ejecutivas. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la atención, la memoria de trabajo, la fluidez verbal y/o la ansiedad.

[0079] En otras realizaciones preferidas, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian disfunciones cognitivas comórbidas con la enfermedad de Parkinson.

[0080] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la progresión de la enfermedad de Parkinson. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian las complicaciones motoras posteriores. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian las fluctuaciones motoras tardías. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la pérdida neuronal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran los síntomas de la demencia de la enfermedad de Parkinson (PDD). En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian el deterioro de la función ejecutiva, la atención y/o la memoria de trabajo. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la neurotransmisión dopaminérgica. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la neurotransmisión dopaminérgica alterada.

[0081] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran los síntomas de la enfermedad de Parkinson de acuerdo con una escala sintomática o de diagnóstico. En determinadas realizaciones, las pruebas para evaluar la mejora sintomática de la función motora en la enfermedad de Parkinson es la Escala Unificada de Valoración de la Enfermedad de Parkinson. En particular, UPDRS II considera la actividad de la vida diaria y UPDRS III considera el examen motor.

[0082] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran los síntomas asociados al PDD de acuerdo a una prueba y/o la escala sintomática o de diagnóstico. En determinadas realizaciones, la prueba o escala se selecciona de la prueba de aprendizaje verbal de Hopkins - Revisada (HVLT-R); la prueba de interferencia de palabras y colores del sistema de funciones ejecutivas Delis-Kaplan (D-KEFS); la Escala de Calificación de Depresión de Hamilton (HAM-D 17; depresión); la Escala de Calificación de Ansiedad de Hamilton (HAMA; ansiedad) y la Escala de Calificación de la Enfermedad de Parkinson Unificada (UPDRS; severidad de los síntomas de la EP).

[0083] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la escala de impresión clínica global -Mejora Global (CGI-I) para la evaluación de trastornos psiquiátricos y neurológicos. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención muestran un efecto positivo sobre el deterioro social y ocupacional global del sujeto con la enfermedad de Parkinson.

Enfermedad de Alzheimer y demencia

[0084] En el DSM-5, el término demencia se reemplazó con los términos trastorno neurocognitivo mayor y trastorno neurocognitivo leve. El trastorno neurocognitivo es una clase heterogénea de enfermedades psiquiátricas. El trastorno neurocognitivo más común es la enfermedad de Alzheimer, seguida de demencias vasculares o formas mixtas de las dos. Otras formas de trastornos neurodegenerativos (p. ej., enfermedad con cuerpos de Lewy, demencia frontotemporal, demencia de Parkinson, enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, enfermedad de Huntington y síndrome de Wernicke-Korsakoff) se acompañan de demencia.

[0085] La enfermedad de Alzheimer y la demencia también se caracterizan por la pérdida neuronal, por lo que los efectos neuroprotectores y neuroproliferativos mostrados en los ejemplos de las composiciones de la invención indican que pueden ser útiles para tratar o prevenir estas afecciones.

[0086] Los criterios sintomáticos para la demencia según el DSM-5 son evidencia de un deterioro cognitivo significativo de un nivel previo de desempeño en uno o más dominios cognitivos seleccionados de: aprendizaje y memoria; idioma; función ejecutiva; atención compleja; cognición perceptivo-motora y social. Los déficits cognitivos deben interferir con la independencia en las actividades cotidianas. Además, los déficits cognitivos no ocurren exclusivamente en el contexto de un delirio y no se explican mejor por otro trastorno mental (p. ej., TDM o esquizofrenia).

[0087] Además del síntoma primario, los sujetos con trastornos neurodegenerativos muestran síntomas conductuales y psiquiátricos incluyendo agitación, agresión, depresión, ansiedad, apatía, psicosis y trastornos del ciclo sueño-vigilia.

[0088] Los trastornos neurodegenerativos pueden desarrollarse o persistir debido a la disfunción del eje microbiotaintestino-cerebro. Por tanto, en realizaciones preferidas, las composiciones de la invención se utilizan para tratar o prevenir trastornos neurodegenerativos en un sujeto. En realizaciones preferidas, el trastorno neurodegenerativo es la enfermedad de Alzheimer. En otras realizaciones, el trastorno neurodegenerativo se selecciona de demencias vasculares; enfermedad de Alzheimer de forma mixta y demencia vascular; enfermedad con cuerpos de Lewy; demencia frontotemporal; Demencia de Parkinson; Enfermedad de Creutzfeldt-Jakob; Enfermedad de Huntington; y síndrome de Wernicke-Korsakoff.

[0089] En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian uno o más de los síntomas de trastornos neurodegenerativos en un sujeto. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la aparición de deterioro cognitivo en un sujeto. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran el nivel de rendimiento de un sujeto con trastornos neurodegenerativos en uno o más dominios cognitivos seleccionados entre: aprendizaje y memoria; idioma; función ejecutiva; atención compleja; cognición perceptivo-motora y social. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la aparición de uno o más síntomas conductuales y psiquiátricos asociados con trastornos neurodegenerativos seleccionados entre agitación, agresión, depresión, ansiedad, apatía, psicosis y alteraciones del ciclo sueño-vigilia.

[0090] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención previenen, reducen o alivian la enfermedad sintomática por la intervención en los mecanismos patógenos sospechosos en una etapa preclínica. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la modificación de la enfermedad, con ralentización o detención de la progresión de los síntomas. En algunas realizaciones, la ralentización o la detención de la progresión de los síntomas se correlaciona con la evidencia del retraso del proceso neuropatológico subyacente. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención mejoran los síntomas de los trastornos neurodegenerativos que comprenden una mejora cognitiva y funcional mejorada. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención mejoran los síntomas conductuales y psiquiátricos de la demencia (BPSD). En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención mejoran la capacidad de un sujeto con trastorno neurodegenerativo para realizar actividades cotidianas.

[0091] En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención mejoran la cognición y el funcionamiento en un sujeto con la enfermedad de Alzheimer. En algunas realizaciones, la composición de la invención mejora el criterio de valoración cognitivo en un sujeto con enfermedad de Alzheimer. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran el punto final funcional en un sujeto con enfermedad de Alzheimer. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención mejoran el punto final cognitivo y funcional en un sujeto con enfermedad de Alzheimer. En otras realizaciones preferidas, las composiciones de la invención mejoran la respuesta clínica global (el criterio de valoración global) en un sujeto con enfermedad de Alzheimer.

[0092] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran los síntomas de trastornos neurodegenerativos según una prueba sintomática o de diagnóstico. En ciertas realizaciones, las pruebas para evaluar la mejoría sintomática de la enfermedad de Alzheimer (y otros trastornos neurodegenerativos) se seleccionan de pruebas cognitivas objetivas, actividades de la vida diaria, evaluación global del cambio, pruebas de calidad de vida relacionadas con la salud y pruebas que evalúan síntomas conductuales y psiquiátricos de trastornos neurodegenerativos.

[0093] En ciertas realizaciones, las pruebas cognitivas objetivas para la evaluación del uso de la mejoría sintomática de la enfermedad de la Escala de Evaluación subescala cognitiva (ADAS-cog) de Alzheimer y la escala ADAS clásica. En determinadas realizaciones, la mejora sintomática de la cognición se evalúa utilizando la batería de pruebas neurofisiológicas para su uso en la enfermedad de Alzheimer (NTB).

[0094] En algunas realizaciones, la evaluación global de la prueba de cambio utiliza la escala de Impresión Clínica Global - Mejora Global (CGI-I) para evaluar los trastornos psiquiátricos y neurológicos. En algunas realizaciones, la escala global es la Impresión de cambio más basada en entrevistas del médico (CIBIC-plus). En algunas realizaciones, la escala global es la Impresión Global del Cambio del Médico de la Unidad de Estudio Cooperativo de la Enfermedad de Alzheimer (ADCS-c G iC).

[0095] En ciertas realizaciones, la calidad devida relacionada con la salud de las medidas de la calidad de vida son la QOL relacionada con enfermedad de Alzheimer (ADRQL) y la enfermedad de QOL-Alzheimer (QOL-AD).

[0096] En ciertas realizaciones, las pruebas de evaluación de los síntomas conductuales y psiquiátricos de los trastornos neurodegenerativos se seleccionan de la patología conductual en la Escala de Calificación de Enfermedad de Alzheimer (BEHAVE-AD); la Escala de Evaluación del Comportamiento para la Demencia (BRSD); el Inventario Neuropsiquiátrico (NPI); y el Inventario de Agitación Cohen-Mansfield (CMAI).

[0097] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención son particularmente eficaces en la prevención, la reducción o el alivio de trastornos neurodegenerativos cuando se utilizan en combinación con otra terapia para el tratamiento de trastornos neurodegenerativos. En determinadas realizaciones, tales terapias incluyen inhibidores de acetilcolinesterasa que incluyen donepezil (Aricept®), galantamina (Razadyne®) y rivastigmina (Exelon®) y memantina.

Factores neuroquímicos, neuropéptidos y neurotransmisores y el eje microbiota-intestino-cerebro

[0098] Como se indica anteriormente, el eje microbiota-intestino-cerebro es modulado por un número de diferentes sistemas fisiológicos. El eje microbiota-intestino-cerebro está modulado por una serie de moléculas de señalización. Las alteraciones en los niveles de estas moléculas de señalización dan como resultado enfermedades neurodegenerativas. Los experimentos realizados por los inventores indican que la administración de especies de Roseburia, y en particular Roseburia hominis, puede modular los niveles de indol y quinurenina. La desregulación de estos metabolitos puede provocar enfermedades neurodegenerativas, como la enfermedad de Parkinson.

[0099] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles de monoaminas cerebrales y metabolitos de los mismos. En realizaciones preferidas, el metabolito es quinurenina. En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la quinurenina, que es la ruta principal del metabolismo del triptófano, que sirve como ruta para la producción de dinucleótidos de nicotinamida y adenina (NAD+). La quinurenina se puede metabolizar a compuestos neuroactivos como el ácido quinurénico (KYNA) y 3-hidroxi-1-quinurenina (3-OH-1-KYN), y en etapas posteriores a ácido quinolínico (QUIN). La desregulación de la vía de la quinurenina puede provocar la activación del sistema inmunológico y la acumulación de compuestos potencialmente neurotóxicos. Las alteraciones en el metabolismo de la quinurenina pueden estar involucradas en el desarrollo de la enfermedad de Parkinson. Se ha demostrado que los niveles de quinurenina están disminuidos en la corteza frontal, el putamen y la substantia nigra pars compacta de los pacientes con EP [33]. Por tanto, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan para aumentar los niveles de quinurenina en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson.

[0100] En ciertas realizaciones de la invención, las composiciones de la invención pueden aumentar los niveles de quinurenina. Se ha demostrado que niveles elevados de quinurenina atenúan la muerte de células neuronales inducida por MPP+ in vitro en una línea celular de neuroblastoma dopaminérgico humano [34]. En determinadas realizaciones, la quinurenina y el ácido quinurénico pueden activar el receptor de hidrocarburo de arilo GI (Ahr) y los receptores GPR35. La activación del receptor Ahr induce la producción de IL-22, que puede inhibir la inflamación local. Activación de GPR35 induciendo la producción de trifosfato de inositol y movilización de Ca2+.

[0101] En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles de indol. En realizaciones preferidas, el metabolito es quinurenina. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la quinurenina, que es la ruta principal del metabolismo del triptófano.

[0102] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro está modulada por niveles de factores neuroquímicos, neuropéptidos y neurotransmisores. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles de factores neuroquímicos, neuropéptidos y neurotransmisores. Por consiguiente, en ciertas realizaciones preferidas, las composiciones de la invención alteran directamente la bioquímica del SNC.

[0103] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro es modulada por los niveles de ácido Y-aminobutírico (GABA). Por consiguiente, en realizaciones preferidas, las composiciones de la invención modulan los niveles de GABA. GABA es un neurotransmisor inhibidor que reduce la excitabilidad neuronal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención aumentan los niveles de GABA. En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención disminuyen los niveles de GABA. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención alteran la neurotransmisión GABAérgica. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el nivel de transcripción de GABA en diferentes regiones del sistema nervioso central. En determinadas realizaciones, el GABA derivado de comensal cruza la barrera hematoencefálica y afecta directamente a la neurotransmisión. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención conducen a una reducción de GABA en el hipocampo, la amígdala y/o el locus coeruleus. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención conducen a un aumento de GABA en las regiones corticales.

Respuesta inmune

[0104] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro está modulada por alteraciones en la respuesta inmune y factores y marcadores inflamatorios. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención pueden modular la respuesta inmunitaria. En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles sistémicos de moléculas de señalización neuroinmunes circulantes. En ciertas realizaciones preferidas, las composiciones de la invención modulan la producción e inflamación de citocinas proinflamatorias. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan el estado inflamatorio. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención reducen la producción y secreción de IL-6, En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención disminuyen la activación del promotor NFkB. En determinadas formas de realización, las composiciones de la invención pueden modular la activación de la producción de IL-6 por el potente lipopolisacárido de endotoxina proinflamatorio (LPS). En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención son capaces de modular la activación del promotor NFkB por proteínas mutantes LPS y alfa-sinucleína tales como A53T. El aumento de los niveles circulantes de citocinas está estrechamente asociado con varios trastornos neurodegenerativos, como el Parkinson, la demencia y el Alzheimer. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan para reducir los niveles de IL-6 y/o NFkB en el tratamiento de un trastorno neurodegenerativo.

[0105] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro está modulada por niveles de metabolitos comensales. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles sistémicos de metabolitos de la microbiota. En ciertas realizaciones preferidas, las composiciones de la invención modulan el nivel de ácidos grasos de cadena corta (SCFA). En ciertas realizaciones, el nivel de SCFA aumenta o disminuye. En algunas realizaciones, el SCFA es ácido butírico (BA) (o butirato). En algunas realizaciones, el SCFA es ácido propiónico (PPA). En algunas realizaciones, el SCFA es ácido acético. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la capacidad de los AGCC para cruzar la barrera hematoencefálica.

[0106] Acetilación de histonas y la desacetilación son importantes reguladores epigenéticos de la expresión génica. Un desequilibrio en la acetilación y desacetilación de histonas puede resultar en apoptosis. La desregulación de tales histonas acetiltransferasas se ha implicado en la patogénesis asociada con enfermedades neurodegenerativas asociadas a la edad, como la enfermedad de Parkinson, la enfermedad de Huntington, la enfermedad de Alzheimer, la esclerosis lateral amiotrófica y el deterioro cognitivo [35]. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención pueden modular la actividad de la histona desacetilatasa. En determinadas formas de realización, las composiciones de la invención pueden reducir la actividad de la histona desacetilatasa. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención pueden reducir la actividad histona acetilatasa.

[0107] Los pacientes con enfermedades neurodegenerativas, incluyendo la enfermedad de Parkinson, enfermedad de Huntington, enfermedad de Alzheimer y esclerosis lateral amiotrófica, exhiben altos niveles de peroxidación lipídica. Los lípidos son vulnerables a la oxidación por especies reactivas de oxígeno y el cerebro es rico en ácidos grasos poliinsaturados. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención pueden modular la peroxidación lipídica. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención pueden reducir la peroxidación lipídica. La reducción del daño oxidativo causado por las especies reactivas del oxígeno puede usarse para atacar las etapas tempranas de las enfermedades neurodegenerativas. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de la neurodegeneración en estadio temprano. También en consecuencia, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan para prevenir el desarrollo de un trastorno neurodegenerativo. En tales realizaciones, las composiciones de la invención pueden usarse en un paciente que ha sido identificado como en riesgo de desarrollar un trastorno neurodegenerativo.

[0108] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro está modulada por niveles de permeabilidad gastrointestinal. Por consiguiente, en algunas realizaciones, las composiciones de la invención alteran la integridad del epitelio del tracto gastrointestinal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la permeabilidad del tracto gastrointestinal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la función de barrera y la integridad del tracto gastrointestinal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la motilidad del tracto gastrointestinal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la translocación de metabolitos comensales y moléculas de señalización inflamatoria al torrente sanguíneo desde el lumen del tracto gastrointestinal.

[0109] La señalización del eje microbiota-intestino-cerebro está modulada por la composición del microbioma en el tracto gastrointestinal. Por consiguiente, en determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la composición del microbioma del tracto gastrointestinal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen la disbiosis del microbioma y los aumentos asociados de metabolitos tóxicos (p. ej., LPS). En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles de Clostridium en el tracto gastrointestinal. En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención reducen el nivel de Clostridium en el tracto gastrointestinal. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención reducen los niveles de Campylobacter jejuni. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan la proliferación de bacterias anaerobias dañinas y la producción de neurotoxinas producidas por estas bacterias. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles de microbioma de Lactobacillus y/o Bifidobacterium. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención modulan los niveles de microbioma de los géneros Sutterella, Prevotella, Ruminococcucs y/o la familia Alcaligenaceae. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención aumentan el nivel de Lactobacillus plantarum y/o Saccharomyces boulardii.

Lesión cerebral

[0110] Los ejemplos demuestran que las composiciones de la invención son neuroprotectoras y tienen actividad inhibidora de HDAc . HDAC2 es una diana crucial para la recuperación funcional de un accidente cerebrovascular [36] y la inhibición de HDAC puede prevenir la lesión de la sustancia blanca [37], por lo que las composiciones descritas en este documento pueden ser útiles en el tratamiento de la lesión cerebral.

[0111] En determinadas formas de realización, las composiciones descritas en el presente documento se utilizan en el tratamiento de lesiones cerebrales. En algunas realizaciones, la lesión cerebral es una lesión cerebral traumática. En algunas realizaciones, la lesión cerebral es una lesión cerebral adquirida. En algunas realizaciones, las composiciones descritas en este documento son para uso en el tratamiento de lesiones cerebrales resultantes de un trauma. En algunas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento se utilizan en el tratamiento de una lesión cerebral resultante de un tumor. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una lesión cerebral resultante de un accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento se utilizan en el tratamiento de lesiones cerebrales que resultan de una hemorragia cerebral. En algunas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento son para uso en el tratamiento de lesiones cerebrales resultantes de encefalitis. En algunas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento se utilizan en el tratamiento de la lesión cerebral resultante de la hipoxia cerebral. En algunas realizaciones, las composiciones descritas en el presente documento son para uso en el tratamiento de lesiones cerebrales resultantes de anoxia cerebral.

[0112] En realizaciones preferidas, las composiciones de la invención son para su uso en el tratamiento de accidente cerebrovascular. Los efectos que se muestran en los ejemplos son particularmente relevantes para el tratamiento del accidente cerebrovascular. El accidente cerebrovascular ocurre cuando se interrumpe el flujo de sangre a al menos una parte del cerebro. Sin un suministro adecuado de sangre para proporcionar oxígeno y nutrientes al tejido cerebral y para eliminar los productos de desecho del tejido cerebral, las células cerebrales comienzan a morir rápidamente. Los síntomas del accidente cerebrovascular dependen de la región del cerebro afectada por el flujo sanguíneo inadecuado. Los síntomas incluyen parálisis, entumecimiento o debilidad de los músculos, pérdida del equilibrio, mareos, dolores de cabeza repentinos e intensos, problemas del habla, pérdida de la memoria, pérdida de la capacidad de razonamiento, confusión repentina, deterioro de la visión, coma o incluso la muerte. Un derrame cerebral también se conoce como un ataque cerebral o un accidente cerebrovascular (ACV). Los síntomas de un accidente cerebrovascular pueden ser breves si se restablece el flujo sanguíneo adecuado en un período corto de tiempo. Sin embargo, si el flujo sanguíneo inadecuado continúa durante un período de tiempo significativo, los síntomas pueden ser permanentes.

[0113] En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular es isquemia cerebral. La isquemia cerebral se produce cuando hay un flujo sanguíneo insuficiente a los tejidos del cerebro para satisfacer la demanda metabólica. En algunas realizaciones, la isquemia cerebral es una isquemia cerebral focal, es decir, confinada a una región específica del cerebro. En algunas realizaciones, la isquemia cerebral es una isquemia cerebral global, es decir, que abarca un área amplia del tejido cerebral. La isquemia cerebral focal ocurre comúnmente cuando un vaso cerebral se ha bloqueado, ya sea parcial o completamente, reduciendo el flujo de sangre a una región específica del cerebro. En algunas realizaciones, la isquemia cerebral focal es un accidente cerebrovascular isquémico. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular isquémico es trombótico, es decir, causado por un trombo o coágulo de sangre, que se desarrolla en un vaso cerebral y restringe o bloquea el flujo sanguíneo. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular isquémico es un accidente cerebrovascular trombótico. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular isquémico es embólico, es decir, causado por un émbolo o una masa no adherida que viaja a través del torrente sanguíneo y restringe o bloquea el flujo sanguíneo en un sitio distante de su punto de origen. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular isquémico es un accidente cerebrovascular embólico. La isquemia cerebral global ocurre comúnmente cuando el flujo sanguíneo al cerebro en su conjunto se bloquea o se reduce. En algunas realizaciones, la isquemia cerebral global está causada por hipoperfusión, es decir, debido a un choque. En algunas realizaciones, la isquemia cerebral global es el resultado de un paro cardíaco.

[0114] En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido isquemia cerebral. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido isquemia cerebral focal. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un accidente cerebrovascular isquémico. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un accidente cerebrovascular trombótico. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un accidente cerebrovascular embólico. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido isquemia cerebral global. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido hipoperfusión. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un paro cardíaco.

[0115] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención son para uso en el tratamiento de la isquemia cerebral. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de la isquemia cerebral focal. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan para tratar el accidente cerebrovascular isquémico. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de accidentes cerebrovasculares trombóticos. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de la apoplejía embólica. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de la isquemia cerebral global. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de la hipoperfusión.

[0116] En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular es un accidente cerebrovascular hemorrágico. El accidente cerebrovascular hemorrágico es causado por una hemorragia en el cerebro o alrededor de él, lo que provoca hinchazón, presión y daño a las células y tejidos del cerebro. El accidente cerebrovascular hemorrágico es comúnmente el resultado de un vaso sanguíneo debilitado que se rompe y sangra en el cerebro circundante. En algunas realizaciones, la apoplejía hemorrágica es una hemorragia intracerebral, es decir, causada por hemorragia dentro del propio tejido cerebral. En algunas realizaciones, la hemorragia intracerebral está provocada por una hemorragia intraparenquimatosa. En algunas realizaciones, la hemorragia intracerebral es causada por una hemorragia intraventricular. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular hemorrágico es una hemorragia subaracnoidea, es decir, una hemorragia que se produce fuera del tejido cerebral pero todavía dentro del cráneo. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular hemorrágico es el resultado de una angiopatía amiloide cerebral. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular hemorrágico es el resultado de un aneurisma cerebral. En algunas realizaciones, el accidente cerebrovascular hemorrágico es el resultado de una malformación arteriovenosa cerebral (MAV).

[0117] En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un accidente cerebrovascular hemorrágico. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido una hemorragia intracerebral. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido una hemorragia intraparenquimatosa. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido una hemorragia intraventricular. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido una hemorragia subaracnoidea. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido angiopatía amiloide cerebral. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un aneurisma cerebral. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido AVM cerebrales.

[0118] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención son para uso en el tratamiento de apoplejía hemorrágica. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una hemorragia intracerebral. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una hemorragia intraparenquimatosa. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una hemorragia intraventricular. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención son para uso en el tratamiento de una hemorragia subaracnoidea. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una angiopatía amiloide cerebral. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de un aneurisma cerebral. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de MAV cerebrales.

[0119] La restauración del flujo sanguíneo adecuado al cerebro después de un período de interrupción, aunque es eficaz para aliviar los síntomas asociados con el accidente cerebrovascular, paradójicamente puede resultar en un daño adicional al tejido cerebral. Durante el período de interrupción, el tejido afectado sufre de falta de oxígeno y nutrientes, y la restauración repentina del flujo sanguíneo puede resultar en inflamación y daño oxidativo a través de la inducción de estrés oxidativo. Esto se conoce como lesión por reperfusión y está bien documentado no solo después de un accidente cerebrovascular, sino también después de un ataque cardíaco u otro daño tisular cuando el suministro de sangre regresa al tejido después de un período de isquemia o falta de oxígeno. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido una lesión por reperfusión como resultado de un accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de la lesión por reperfusión como resultado de un accidente cerebrovascular.

[0120] Un ataque isquémico transitorio (AIT), a menudo referido como un mini-accidente cerebrovascular, es una señal de advertencia reconocida por una más grave accidente cerebrovascular. Por tanto, los sujetos que han sufrido uno o más AIT tienen un mayor riesgo de sufrir un accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto diagnosticado con lesión cerebral ha sufrido un AIT. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de un TIA. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de una lesión cerebral en un sujeto que ha sufrido un AIT.

[0121] La presión arterial alta, colesterol alto en la sangre, una historia familiar de accidente cerebrovascular, enfermedad cardíaca, diabetes, aneurismas cerebrales, malformaciones arteriovenosas, enfermedad de células falciformes, vasculitis, trastornos, uso de fármacos anti-inflamatorios no esteroideos (AINE) de sangrado, el tabaco de fumar, beber grandes cantidades de alcohol, consumo de drogas ilegales, obesidad, falta de actividad y una dieta poco saludable se consideran factores de riesgo de accidente cerebrovascular. En particular, se ha demostrado de manera concluyente que la disminución de la presión arterial previene los accidentes cerebrovasculares tanto isquémicos como hemorrágicos [38, 39]. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en el tratamiento de lesiones cerebrales en un sujeto que tiene al menos un factor de riesgo de accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto tiene dos factores de riesgo de accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto tiene tres factores de riesgo de accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto tiene cuatro factores de riesgo de accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto tiene más de cuatro factores de riesgo de accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto tiene presión arterial alta. En algunas realizaciones, el sujeto tiene colesterol en sangre alto. En algunas realizaciones, el sujeto tiene antecedentes familiares de accidente cerebrovascular. En algunas realizaciones, el sujeto tiene una enfermedad cardíaca. En algunas realizaciones, el sujeto tiene diabetes. En algunas realizaciones, el sujeto tiene un aneurisma cerebral. En algunas realizaciones, el sujeto tiene malformaciones arteriovenosas. En algunas realizaciones, el sujeto tiene vasculitis. En algunas realizaciones, el sujeto tiene anemia de células falciformes. En algunas realizaciones, el sujeto tiene un trastorno hemorrágico. En algunas realizaciones, el sujeto tiene un historial de uso de fármacos antiinflamatorios no esteroideos (AINE). En algunas realizaciones, el sujeto fuma tabaco. En algunas realizaciones, el sujeto bebe grandes cantidades de alcohol. En algunas realizaciones, el sujeto usa drogas ilegales. En algunas realizaciones, el sujeto es obeso. En algunas realizaciones, el sujeto tiene sobrepeso. En algunas realizaciones, el sujeto carece de actividad física. En algunas formas de realización, el sujeto tiene una dieta poco saludable.

[0122] Los ejemplos indican que las composiciones de la invención pueden ser útiles para el tratamiento de la lesión cerebral y ayudar a la recuperación cuando se administra antes de que ocurra el evento de lesión. Por lo tanto, las composiciones de la invención pueden ser particularmente útiles para tratar lesiones cerebrales cuando se administran a sujetos con riesgo de lesión cerebral, como apoplejía.

[0123] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención son para su uso en la reducción de los daños causados por una lesión cerebral potencial, preferiblemente un accidente cerebrovascular. Las composiciones pueden reducir el daño causado cuando se administran antes de que ocurra la posible lesión cerebral, en particular cuando se administran a un paciente identificado con riesgo de lesión cerebral.

[0124] Los ejemplos indican que las composiciones de la invención pueden ser útiles para el tratamiento de la lesión cerebral y ayudar a la recuperación cuando se administran después de que ocurre el evento de lesión. Por lo tanto, las composiciones de la invención pueden ser particularmente útiles para tratar lesiones cerebrales cuando se administran a sujetos después de una lesión cerebral, como un accidente cerebrovascular.

[0125] En algunas formas de realización, las composiciones de la invención tratan la lesión cerebral reduciendo la lesión motora. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención tratan la lesión cerebral mejorando la función motora. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención tratan la lesión cerebral mejorando la fuerza muscular. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención tratan la lesión cerebral mejorando la memoria. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención tratan la lesión cerebral mejorando el reconocimiento social. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención tratan la lesión cerebral mejorando la función neurológica.

[0126] El tratamiento de la lesión cerebral puede referirse, p. ej., a un alivio de la gravedad de los síntomas. El tratamiento de la lesión cerebral también puede referirse a la reducción de las alteraciones neurológicas que siguen a un accidente cerebrovascular. Las composiciones de la invención para su uso en el tratamiento de un accidente cerebrovascular se pueden proporcionar al sujeto antes del inicio del accidente cerebrovascular, p. ej., en un paciente identificado con riesgo de accidente cerebrovascular. Las composiciones de la invención para su uso en el tratamiento de un accidente cerebrovascular se pueden proporcionar después de que ha ocurrido un accidente cerebrovascular, p. ej., durante la recuperación. Las composiciones de la invención para su uso en el tratamiento de un accidente cerebrovascular se pueden proporcionar durante la fase aguda de recuperación (es decir, hasta una semana después del accidente cerebrovascular). Las composiciones de la invención para su uso en el tratamiento de un accidente cerebrovascular se pueden proporcionar durante la fase subaguda de recuperación (es decir, desde una semana hasta tres meses después del accidente cerebrovascular). Las composiciones de la invención para su uso en el tratamiento de un accidente cerebrovascular se pueden proporcionar durante la fase crónica de recuperación (a partir de tres meses después del accidente cerebrovascular).

[0127] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención son para su uso en combinación con un agente activo secundario. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención se utilizan en combinación con aspirina o activador de plasminógeno tisular (tPA). Otros agentes secundarios incluyen otros antiagregantes plaquetarios (como clopidogrel), anticoagulantes (como heparinas, warfarina, apixaban, dabigatrán, edoxabán o rivaroxabán), antihipertensivos (como diuréticos, inhibidores de la ECA, bloqueadores de los canales de calcio, betabloqueantes o alfabloqueantes) o estatinas. Las composiciones de la invención pueden mejorar la respuesta del paciente al agente activo secundario.

[0128] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención reducen el efecto de la isquemia en los tejidos. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención reducen la cantidad de daño a los tejidos causado por la isquemia. En determinadas realizaciones, los tejidos dañados por isquemia son los tejidos cerebrales. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención reducen la necrosis o el número de células necróticas. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención reducen la apoptosis o el número de células apoptóticas. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención reducen el número de células necróticas y apoptóticas. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen la muerte celular por necrosis y/o apoptosis. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención previenen la muerte celular por necrosis y/o apoptosis provocada por isquemia. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la recuperación del tejido dañado por isquemia. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la velocidad de eliminación de células necróticas y/o apoptóticas. En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la eficacia del aclaramiento de células necróticas y/o células apoptóticas. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran el reemplazo y/o regeneración de células dentro de los tejidos. En determinadas realizaciones, las composiciones de la invención mejoran la sustitución y/o regeneración de células dentro de tejidos dañados por isquemia. En determinadas formas de realización, las composiciones de la invención mejoran la histología global del tejido (p. ej., tras una biopsia).

Modos de administración

[0129] Preferiblemente, las composiciones de la invención son para ser administradas al tracto gastrointestinal con el fin de permitir la entrega a y/o colonización parcial o total del intestino con la cepa bacteriana de la invención. Generalmente, las composiciones de la invención se administran por vía oral, pero pueden administrarse por vía rectal, intranasal o por vía bucal o sublingual.

[0130] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención se pueden administrar en forma de espuma, como una pulverización o un gel.

[0131] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención pueden administrarse como un supositorio, tal como un supositorio rectal, por ejemplo en forma de un aceite de Theobroma (manteca de cacao), grasa dura sintética (por ejemplo Suppocire, Witepsol), glicero-gelatina, polietilenglicol o composición de glicerina de jabón.

[0132] En ciertas realizaciones, la composición de la invención se administra en el tracto gastrointestinal a través de un tubo, tal como un tubo nasogástrico, sonda orogástrica, tubo gástrico, tubo de yeyunostomía (tubo J), gastrostomía endoscópica percutánea (PEG), o un puerto, como un puerto de pared torácica que proporciona acceso al estómago, yeyuno y otros puertos de acceso adecuados.

[0133] Las composiciones de la invención pueden administrarse una vez, o se pueden administrar de forma secuencial como parte de un régimen de tratamiento. En determinadas formas de realización, las composiciones de la invención deben administrarse diariamente.

[0134] En determinadas formas de realización de la invención, el tratamiento según la invención se acompaña de la evaluación de la microbiota intestinal del paciente. El tratamiento puede repetirse si no se logra la liberación y/o la colonización parcial o total con la cepa de la invención de manera que no se observe la eficacia, o el tratamiento puede interrumpirse si la administración y/o la colonización parcial o total es exitosa y se observa la eficacia.

[0135] En ciertas realizaciones, la composición de la invención se puede administrar a un animal preñado, por ejemplo un mamífero tal como un ser humano con el fin de prevenir una enfermedad inflamatoria o autoinmune en desarrollo en su hijo en el útero y/o después de su nacimiento.

[0136] Las composiciones de la invención se pueden administrar a un paciente que ha sido diagnosticado con una enfermedad neurodegenerativa, o que ha sido identificado como en riesgo de una enfermedad neurodegenerativa. Las composiciones también pueden administrarse como medida profiláctica para prevenir el desarrollo de enfermedades neurodegenerativas en un paciente sano.

[0137] Las composiciones de la invención se pueden administrar a un paciente que ha sido identificado como teniendo una microbiota intestinal anormal. P. ej., el paciente puede tener una colonización reducida o ausente por Roseburia, y en particular por Roseburia hominis.

[0138] Las composiciones de la invención se pueden administrar como un producto alimenticio, como un suplemento nutricional.

[0139] Generalmente, las composiciones de la invención son para el tratamiento de los seres humanos, a pesar de que se pueden utilizar para los animales a tratar incluyendo mamíferos monogástricos tales como aves de corral, cerdos, gatos, perros, caballos o conejos. Las composiciones de la invención pueden ser útiles para mejorar el crecimiento y el rendimiento de los animales. Si se administra a animales, se puede usar sonda oral.

Composiciones

[0140] Generalmente, la composición de la invención comprende bacterias. En realizaciones preferidas de la invención, la composición se formula en forma liofilizada. P. ej., la composición de la invención puede comprender gránulos o cápsulas de gelatina, por ejemplo cápsulas de gelatina dura, que comprenden una cepa bacteriana de la invención.

[0141] Preferiblemente, la composición de la invención comprende bacterias liofilizadas. La liofilización de bacterias es un procedimiento bien establecido y la orientación pertinente está disponible, p. ej., en las referencias [40-42].

[0142] Alternativamente, la composición de la invención puede comprender un cultivo bacteriano vivo activo.

[0143] En algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención no ha sido inactivada, p. ej., no ha sido inactivada por calor. En algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención no ha sido destruida, p. ej., no ha sido destruida por calor. En algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención no se ha atenuado, p. ej., no se ha atenuado por calor. P. ej., en algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención no ha sido destruida, inactivada y/o atenuada. P. ej., en algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención está viva. P. ej., en algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención es viable. P. ej., en algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención es capaz de colonizar parcial o totalmente el intestino. P. ej., en algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición de la invención es viable y capaz de colonizar parcial o totalmente el intestino.

[0144] En algunas realizaciones, la composición comprende una mezcla de cepas bacterianas vivas y cepas bacterianas que han sido destruidas.

[0145] En realizaciones preferidas, la composición de la invención está encapsulada para permitir la entrega de la cepa bacteriana al intestino. La encapsulación protege la composición de la degradación hasta el suministro en la ubicación diana a través de, p. ej., ruptura con estímulos químicos o físicos como presión, actividad enzimática o desintegración física, que pueden desencadenarse por cambios en el pH. Puede usarse cualquier método de encapsulación apropiado. Las técnicas de encapsulación ejemplares incluyen atrapamiento dentro de una matriz porosa, unión o adsorción sobre superficies sólidas del portador, autoagregación por floculación o con agentes reticulantes y contención mecánica detrás de una membrana microporosa o microcápsula. La guía sobre encapsulación que puede ser útil para preparar composiciones de la invención está disponible, p. ej., en las referencias [43] y [44].

[0146] La composición se puede administrar por vía oral y puede estar en la forma de un comprimido, cápsula o polvo. Se prefieren los productos encapsulados porque Roseburia son anaerobios. Se pueden incluir otros ingredientes (tales como vitamina C, por ejemplo) como captadores de oxígeno y sustratos prebióticos para mejorar el suministro y/o la colonización parcial o total y la supervivencia in vivo. Alternativamente, la composición probiótica de la invención se puede administrar por vía oral como alimento o producto nutricional, tal como leche o producto lácteo fermentado a base de suero, o como producto farmacéutico.

[0147] La composición se puede formular como probiótico.

[0148] Una composición de la invención incluye una cantidad terapéuticamente eficaz de una cepa bacteriana de la invención. Una cantidad terapéuticamente eficaz de una cepa bacteriana es suficiente para ejercer un efecto beneficioso sobre un paciente. Una cantidad terapéuticamente eficaz de una cepa bacteriana puede ser suficiente para dar como resultado el suministro y/o la colonización parcial o total del intestino del paciente.

[0149] Una dosis diaria adecuada de las bacterias, por ejemplo para un ser humano adulto, puede ser de aproximadamente 1 x 103 a aproximadamente 1 x 1011 unidades formadoras de colonias (UFC); p. ej., de aproximadamente 1 x 107 a aproximadamente 1 x 1010 UFC; en otro ejemplo, de aproximadamente 1 x 106 a aproximadamente 1 x 1010 UFC.

[0150] En ciertas realizaciones, la composición contiene la cepa bacteriana en una cantidad de aproximadamente 1 x 106 a aproximadamente 1 x 1011 UFC/g, respecto al peso de la composición; p. ej., de aproximadamente 1 x 108 a aproximadamente 1 x 1010 UFC/g. La dosis puede ser, p. ej., 1 g, 3 g, 5 g y 10 g.

[0151] Típicamente, un probiótico, tal como la composición de la invención, se combina opcionalmente con al menos un compuesto prebiótico adecuado. Un compuesto prebiótico suele ser un carbohidrato no digerible, como un oligo o polisacárido, o un alcohol de azúcar, que no se degrada ni se absorbe en el tracto digestivo superior. Los prebióticos conocidos incluyen productos comerciales tales como inulina y transgalactooligosacáridos.

[0152] En ciertas realizaciones, la composición probiótica de la presente invención incluye un compuesto prebiótico en una cantidad de aproximadamente 1 a aproximadamente 30% en peso, respecto a la composición peso total, (por ejemplo de 5 a 20% en peso). Los carbohidratos pueden seleccionarse del grupo que consiste en: fructo-oligosacáridos (o FOS), fructo-oligosacáridos de cadena corta, inulina, isomalt-oligosacáridos, pectinas, xilo-oligosacáridos (o XOS), quitosano-oligosacáridos (o COS), beta-glucanos, almidones resistentes y modificados con goma de cultivo, polidextrosa, D-tagatosa, fibras de acacia, algarroba, avena y fibras de cítricos. En un aspecto, los prebióticos son los fructooligosacáridos de cadena corta (por simplicidad mostrados a continuación en el presente documento como FOSs-c.c); dichos FOSs-c.c. no son carbohidratos digeribles, generalmente obtenidos por conversión del azúcar de remolacha e incluyen una molécula de sacarosa a la que se unen tres moléculas de glucosa.

[0153] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención se usan en combinación con otro compuesto terapéutico para tratar o prevenir el trastorno neurodegenerativo. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se administran con suplementos nutricionales que modulan la neuroprotección o la neuroproliferación. En realizaciones preferidas, los suplementos nutricionales comprenden o consisten en vitaminas nutricionales. En determinadas formas de realización, las vitaminas son vitamina B6, magnesio, dimetilglicina (vitamina B16) y vitamina C. En determinadas formas de realización, las composiciones de la invención se administran en combinación con otro probiótico.

[0154] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención son para uso en la potenciación del efecto de un segundo agente en una enfermedad neurodegenerativa. Los efectos inmunomoduladores de las composiciones de la invención pueden hacer que el cerebro sea más susceptible a terapias convencionales tales como levodopa, agonistas de dopamina, inhibidores de MAO-B, inhibidores de COMT, antagonistas de glutamato o anticolinérgicos, que son agentes secundarios ejemplares para administrar en combinación (secuencial o contemporáneamente) con las composiciones de la invención.

[0155] Las composiciones de la invención pueden comprender excipientes farmacéuticamente o portadores aceptables. Se pueden encontrar ejemplos de tales excipientes adecuados en la referencia [45]. Los vehículos o diluyentes aceptables para uso terapéutico son bien conocidos en la técnica farmacéutica y se describen, p. ej., en la referencia [46]. Los ejemplos de vehículos adecuados incluyen lactosa, almidón, glucosa, metilcelulosa, estearato de magnesio, manitol, sorbitol y similares. Los ejemplos de diluyentes adecuados incluyen etanol, glicerol y agua. La elección del vehículo, excipiente o diluyente farmacéutico se puede seleccionar con respecto a la vía de administración prevista y la práctica farmacéutica estándar. Las composiciones farmacéuticas pueden comprender como, o además de, el vehículo, excipiente o diluyente, cualquier aglutinante, lubricante, agente(s) de suspensión, agente(s) de revestimiento, agente(s) solubilizante(s) adecuado(s). Ejemplos de aglutinantes adecuados incluyen almidón, gelatina, azúcares naturales tales como glucosa, lactosa anhidra, lactosa de flujo libre, beta-lactosa, edulcorantes de maíz, gomas naturales y sintéticas, tales como acacia, tragacanto o alginato de sodio, carboximetilcelulosa y polietilenglicol. Los ejemplos de lubricantes adecuados incluyen oleato de sodio, estearato de sodio, estearato de magnesio, benzoato de sodio, acetato de sodio, cloruro de sodio y similares. En la composición farmacéutica se pueden proporcionar conservantes, estabilizadores, colorantes e incluso agentes aromatizantes. Los ejemplos de conservantes incluyen benzoato de sodio, ácido sórbico y ésteres de ácido p-hidroxibenzoico. También se pueden usar antioxidantes y agentes de suspensión.

[0156] Las composiciones de la invención pueden formularse como un producto alimenticio. P. ej., un producto alimenticio puede proporcionar un beneficio nutricional además del efecto terapéutico de la invención, como en un suplemento nutricional. De manera similar, se puede formular un producto alimenticio para mejorar el sabor de la composición de la invención o para hacer que la composición sea más atractiva para consumir al ser más similar a un artículo alimenticio común, en lugar de a una composición farmacéutica. En determinadas realizaciones, la composición de la invención se formula como un producto a base de leche. El término "producto a base de leche" significa cualquier producto a base de leche o suero líquido o semisólido que tenga un contenido de grasa variable. El producto a base de leche puede ser, p. ej., leche de vaca, leche de cabra, leche de oveja, leche desnatada, leche entera, leche recombinada de leche en polvo y suero sin ningún procesamiento, o un producto procesado, como yogur, leche cuajada, cuajada, leche agria., leche entera agria, leche de mantequilla y otros productos lácteos agrios. Otro grupo importante incluye las bebidas lácteas, como las bebidas de suero, leches fermentadas, leches condensadas, leches para lactantes o bebés; leches aromatizadas, helados; alimentos que contienen leche, como dulces.

[0157] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden una o más cepas bacterianas del género Roseburia y no contienen bacterias de cualesquiera otros géneros, o que se compongan únicamente de minimis o biológicamente irrelevantes cantidades de bacterias de otros géneros. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas del género Roseburia, que no contiene bacterias de ningún otro género o que comprende solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otro género, para su uso en terapia.

[0158] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia hominis y no contienen bacterias de cualquier otra especie, o que se compongan únicamente de minimis o cantidades biológicamente irrelevantes de las bacterias de otras especies. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia hominis, que no contiene bacterias de ninguna otra especie o que comprende solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie, para su uso en terapia.

[0159] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia intestinalis y no contienen bacterias de ninguna otra especie, o que comprenden solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia intestinalis, que no contiene bacterias de ninguna otra especie o que comprende únicamente cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie, para su uso en terapia.

[0160] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia faecis y no contienen bacterias de cualquier otra especie, o que se compongan únicamente de minimis o cantidades biológicamente irrelevantes de las bacterias de otras especies. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia faecis, que no contiene bacterias de ninguna otra especie o que comprende solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie, para su uso en terapia.

[0161] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden uno o más cepas más bacterianas de la especie Roseburia hominis y no contienen bacterias de cualquier otra especie Roseburia, o que comprenden solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie de Roseburia. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia hominis, que no contiene bacterias de ninguna otra especie de Roseburia o que comprende solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie de Roseburia, para uso en terapia.

[0162] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden una o más cepas más bacterianas de la especie Roseburia intestinalis y no contienen bacterias de cualquier otra especie Roseburia, o que se compongan únicamente de minimis o cantidades biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie Roseburia. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia intestinalis, que no contiene bacterias de ninguna otra especie de Roseburia o que comprende solo cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie de Roseburia, para uso en terapia.

[0163] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden una o más cepas más bacterianas de la especie Roseburia faecis y no contienen bacterias de cualquier otra especie Roseburia, o que se compongan únicamente de minimis o cantidades biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie Roseburia. Por tanto, en algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una o más cepas bacterianas de la especie Roseburia faecis, que no contiene bacterias de ninguna otra especie de Roseburia o que comprende únicamente cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra especie de Roseburia, para uso en terapia.

[0164] En ciertas realizaciones, las composiciones de la invención contienen una sola cepa o especie bacteriana y no contienen otras cepas bacterianas o especies. Tales composiciones pueden comprender únicamente cantidades de minimis o biológicamente irrelevantes de otras cepas o especies bacterianas. Dichas composiciones pueden ser un cultivo sustancialmente exento de otras especies de organismos.

[0165] En algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una única cepa bacteriana del género Roseburia, que no contiene bacterias de cualesquiera otras cepas o que comprende cantidades sólo de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra cepa para uso en terapia.

[0166] En algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una única cepa bacteriana de las especies Roseburia hominis, que no contiene bacterias de cualesquiera otras cepas o que comprende cantidades sólo de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra cepa para su uso en terapia.

[0167] En algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una única cepa bacteriana de las especies Roseburia intestinalis, que no contiene bacterias de cualesquiera otras cepas o que comprende cantidades sólo de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra cepa para su uso en terapia.

[0168] En algunas realizaciones, la invención proporciona una composición que comprende una única cepa bacteriana de las especies Roseburia faecis, que no contienen bacterias de cualesquiera otras cepas o que comprende cantidades sólo de minimis o biológicamente irrelevantes de bacterias de otra cepa para su uso en terapia.

[0169] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden más de una cepa bacteriana. P. ej., en algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden más de una cepa de la misma especie (p. ej., más de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40 o 45 cepas) y, opcionalmente, no contienen bacterias de ninguna otra especie. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden menos de 50 cepas de la misma especie (p. ej., menos de 45, 40, 35, 30, 25, 20, 15, 12, 10, 9, 8, 7, 6, 5), 4 o 3 cepas) y, opcionalmente, no contienen bacterias de ninguna otra especie. En algunas realizaciones, las composiciones de la invención comprenden 1-40, 1-30, 1-20, 1-19, 1-18, 1-15, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3, 1-2, 2-50, 2-40, 2-30, 2-20, 2-15, 2-10, 2-5, 6- 30, 6-15, 16-25 o 31-50 cepas de la misma especie y, opcionalmente, no contienen bacterias de ninguna otra especie. La invención comprende cualquier combinación de los anteriores.

[0170] En algunas realizaciones, la composición comprende un consorcio microbiano. P. ej., en algunas realizaciones, la composición comprende la cepa bacteriana Roseburia como parte de un consorcio microbiano. P. ej., en algunas realizaciones, la cepa bacteriana Roseburia está presente en combinación con una o más (p. ej., al menos 2, 3, 4,5, 10, 15 o 20) otras cepas bacterianas de otros géneros con las que puede vivir simbióticamente in vivo en el intestino. P. ej., en algunas realizaciones, la composición comprende una cepa bacteriana de Roseburia en combinación con una cepa bacteriana de un género diferente. En algunas realizaciones, el consorcio microbiano comprende dos o más cepas bacterianas obtenidas de una muestra de heces de un solo organismo, p. ej., un ser humano. En algunas realizaciones, el consorcio microbiano no se encuentra en la naturaleza. P. ej., en algunas realizaciones, el consorcio microbiano comprende cepas bacterianas obtenidas de muestras de heces de al menos dos organismos diferentes. En algunas realizaciones, los dos organismos diferentes son de la misma especie, p. ej., dos seres humanos diferentes. En algunas realizaciones, los dos organismos diferentes son un ser humano infantil y un ser humano adulto. En algunas realizaciones, los dos organismos diferentes son un mamífero humano y otro no humano.

[0171] En algunas realizaciones, la composición de la invención comprende, además, una cepa bacteriana que tiene la misma seguridad y las características de eficacia terapéutica como la cepa MRx0001, pero que no es MRx0001, o que no es una Roseburia hominis.

[0172] En algunas realizaciones, la composición de la invención comprende adicionalmente una cepa bacteriana que tiene las mismas características de seguridad y eficacia terapéutica que la cepa A, pero que no es la cepa A, o que no es una Roseburia intestinalis.

[0173] En algunas realizaciones en las que la composición de la invención comprende más de una cepa, especie o género bacteriano, las cepas, especies o géneros bacterianos individuales pueden ser para administración separada, simultánea o secuencial. P. ej., la composición puede comprender todas las más de una cepa, especie o género bacteriano, o las cepas, especies o géneros bacterianos pueden almacenarse por separado y administrarse por separado, simultánea o secuencialmente. En algunas realizaciones, las más de una cepa, especie o género bacteriano se almacenan por separado pero se mezclan antes de su uso.

[0174] En algunas realizaciones, la cepa bacteriana para uso en la invención se obtiene a partir de heces de adultos humanos. En algunas realizaciones en las que la composición de la invención comprende más de una cepa bacteriana, todas las cepas bacterianas se obtienen a partir de heces humanas adultas o si están presentes otras cepas bacterianas, están presentes sólo en cantidades de minimis. Las bacterias pueden haber sido cultivadas después de haberlas obtenido de las heces humanas adultas y haber sido utilizadas en una composición de la invención.

[0175] En algunas realizaciones, la cepa bacteriana para uso en la invención se obtiene a partir de heces infantiles humanos. En algunas realizaciones en las que la composición de la invención comprende más de una cepa bacteriana, todas las cepas bacterianas se obtienen a partir de heces de lactantes humanos o, si están presentes otras cepas bacterianas, sólo lo están en cantidades de minimis. Las bacterias pueden haber sido cultivadas después de ser obtenidas de las heces de bebés humanos y de ser utilizadas en una composición de la invención.

[0176] Como se mencionó anteriormente, en algunas realizaciones, la una o más cepas bacterianas Roseburia es/son el (los) único(s) agente(s) terapéuticamente activo(s) en una composición de la invención. En algunas realizaciones, la cepa bacteriana en la composición es el único agente o agentes terapéuticamente activos en una composición de la invención.

[0177] Las composiciones para uso de acuerdo con la invención pueden o pueden no requerir la aprobación de comercialización.

[0178] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde dicha cepa bacteriana se liofiliza. En determinadas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde dicha cepa bacteriana se seca por pulverización. En determinadas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde la cepa bacteriana se liofiliza o se seca por pulverización y en donde está viva. En determinadas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde la cepa bacteriana se liofiliza o se seca por pulverización y es viable. En determinadas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde la cepa bacteriana se liofiliza o se seca por pulverización y en donde es capaz de colonizar parcial o totalmente el intestino. En determinadas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde la cepa bacteriana se liofiliza o se seca por pulverización y en donde es viable y capaz de colonizar parcial o totalmente el intestino.

[0179] En algunos casos, la cepa bacteriana liofilizada se reconstituye antes de la administración. En algunos casos, la reconstitución se realiza mediante el uso de un diluyente descrito en este documento.

[0180] Las composiciones de la invención pueden comprender excipientes farmacéuticamente aceptables, diluyentes o vehículos.

[0181] En determinadas realizaciones, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende: una cepa bacteriana de la invención; y un excipiente, portador o diluyente farmacéuticamente aceptable; en donde la cepa bacteriana está en una cantidad suficiente para tratar un trastorno neurodegenerativo cuando se administra a un sujeto que lo necesita.

[0182] En ciertas realizaciones, la invención proporciona composición farmacéutica que comprende: una cepa bacteriana de la invención; y un excipiente, portador o diluyente farmacéuticamente aceptable; en donde la cepa bacteriana está en una cantidad suficiente para tratar o prevenir un trastorno neurodegenerativo.

[0183] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde la cantidad de la cepa bacteriana es de aproximadamente 1 x 103 a aproximadamente 1 x 1011 unidades formadoras de colonias por gramo de formación con respecto a un peso de la composición.

[0184] En determinadas formas de realización, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde la composición se administra en una dosis de 1 g, 3 g, 5 g o 10 g.

[0185] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, donde la composición se administra mediante un método seleccionado del grupo que consiste en administración oral, rectal, subcutánea, nasal, bucal, y sublingual.

[0186] En ciertas realizaciones, la invención proporciona el composición farmacéutica anterior, que comprende un vehículo seleccionado del grupo que consiste en lactosa, almidón, glucosa, metilcelulosa, estearato de magnesio, manitol y sorbitol.

[0187] En ciertas realizaciones, la invención proporciona el composición farmacéutica anterior, que comprende un diluyente seleccionado del grupo que consiste en etanol, glicerol y agua.

[0188] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, que comprende un excipiente seleccionado del grupo que consiste en almidón, gelatina, glucosa, lactosa anhidra, lactosa de flujo libre, beta-lactosa, maíz edulcorante, acacia, tragacanto, sodio alginato, carboximetilcelulosa, polietilenglicol, oleato de sodio, estearato de sodio, estearato de magnesio, benzoato de sodio, acetato de sodio y cloruro de sodio.

[0189] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, que comprende además al menos uno de un conservante, un antioxidante y un estabilizador.

[0190] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, que comprende un conservante seleccionado del grupo que consiste en benzoato de sodio, ácido sórbico y ésteres de ácido p-hidroxibenzoico.

[0191] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde dicha cepa bacteriana se liofiliza.

[0192] En ciertas realizaciones, la invención proporciona la composición farmacéutica anterior, en donde cuando la composición se almacena en un recipiente sellado a aproximadamente 4°C o aproximadamente 25°C y el recipiente se coloca en una atmósfera que tiene 50% de humedad relativa, en al menos el 80% de la cepa bacteriana, medida en unidades formadoras de colonias, permanece después de un período de al menos aproximadamente: 1 mes, 3 meses, 6 meses, 1 año, 1,5 años, 2 años, 2,5 años o 3 años.

[0193] En algunas realizaciones, la composición de la invención se proporciona en un recipiente sellado que comprende una composición como se describe en el presente documento. En algunas realizaciones, el recipiente sellado es una bolsita o una botella. En algunas realizaciones, la composición de la invención se proporciona en una jeringa que comprende una composición como se describe en este documento.

[0194] La composición de la presente invención puede, en algunas realizaciones, proporcionarse como una formulación farmacéutica. P. ej., la composición se puede proporcionar en forma de tableta o cápsula. En algunas realizaciones, la cápsula es una cápsula de gelatina ("cápsula de gel").

[0195] En algunas realizaciones, las composiciones de la invención se administran por vía oral. La administración oral puede implicar la deglución, de modo que el compuesto ingrese al tracto gastrointestinal y/o la administración bucal, lingual o sublingual mediante la cual el compuesto ingresa al torrente sanguíneo directamente desde la boca.

[0196] Las formulaciones farmacéuticas adecuadas para la administración oral incluyen tapones sólidos, micropartículas sólidas, semisólidas y líquidas (incluyendo múltiples fases o sistemas dispersos), tales como comprimidos; cápsulas blandas o duras que contienen nanopartículas múltiples, líquidos (p. ej., soluciones acuosas), emulsiones o polvos; pastillas para chupar (incluso rellenas de líquido); mastica geles formas de dosificación de rápida dispersión; películas; óvulos; aerosoles y parches bucales/mucoadhesivos.

[0197] En algunas realizaciones, la formulación farmacéutica es una formulación entérica, es decir, una formulación gastro-resistente (p. ej., resistente al pH gástrico) que es adecuado para la entrega de la composición de la invención en el intestino por la administración oral. Las formulaciones entéricas pueden ser particularmente útiles cuando las bacterias u otro componente de la composición es sensible a los ácidos, p. ej., propenso a degradarse en condiciones gástricas.

[0198] En algunas realizaciones, la formulación entérica comprende un recubrimiento entérico. En algunas realizaciones, la formulación es una forma de dosificación con recubrimiento entérico. P. ej., la formulación puede ser una tableta con recubrimiento entérico o una cápsula con recubrimiento entérico o similares. El recubrimiento entérico puede ser un recubrimiento entérico convencional, p. ej., un recubrimiento convencional para una tableta, cápsula o similar para administración oral. La formulación puede comprender un revestimiento de película, p. ej., una capa de película delgada de un polímero entérico, p. ej., un polímero insoluble en ácido.

[0199] En algunas realizaciones, la formulación entérica es intrínsecamente entérica, p. ej., gastrorresistente sin la necesidad de un recubrimiento entérico. Por tanto, en algunas realizaciones, la formulación es una formulación entérica que no comprende un recubrimiento entérico. En algunas realizaciones, la formulación es una cápsula hecha de un material termogelificante. En algunas realizaciones, el material termogelificante es un material celulósico, como metilcelulosa, hidroximetilcelulosa o hidroxipropilmetilcelulosa (HPMC). En algunas realizaciones, la cápsula comprende una cubierta que no contiene ningún polímero formador de película. En algunas realizaciones, la cápsula comprende una cubierta y la cubierta comprende hidroxipropilmetilcelulosa y no comprende ningún polímero formador de película (p. ej., véase [47]). En algunas realizaciones, la formulación es una cápsula intrínsecamente entérica (p. ej., Vcaps® de Capsugel).

[0200] En algunas realizaciones, la formulación es una cápsula blanda. Las cápsulas blandas son cápsulas que, debido a la adición de suavizantes, tales como, p. ej., glicerol, sorbitol, maltitol y polietilenglicoles, presentes en la cubierta de la cápsula, pueden tener una cierta elasticidad y suavidad. Las cápsulas blandas se pueden producir, p. ej., a base de gelatina o almidón. Las cápsulas blandas a base de gelatina están disponibles comercialmente de varios proveedores. Dependiendo del método de administración, como por ejemplo por vía oral o rectal, las cápsulas blandas pueden tener varias formas, pueden ser, p. ej., redondas, ovaladas, oblongas o en forma de torpedo. Las cápsulas blandas se pueden producir mediante procesos convencionales, tales como, p. ej., mediante el proceso de Scherer, el proceso Accogel o el proceso de gotitas o soplado.

Métodos de cultivo

[0201] Las cepas bacterianas para uso en la presente invención pueden ser cultivadas utilizando técnicas estándar de microbiología como se detalla en, p. ej., las referencias [48-50].

[0202] El medio sólido o líquido usado para el cultivo puede ser agar YCFA o medio YCFA. El medio YCFA puede incluir (por 100 ml, valores aproximados): Casitone (1,0 g), extracto de levadura (0,25 g), NaHCO3 (0,4 g), cisteína (0,1 g), K2HPO4 (0,045 g), KH2PO4 (0,045 g), NaCl (0,09 g), (NH4)2SO4 (0,09 g), MgSO4'7H2O (0,009 g), CaCh (0,009 g), resazurina (0,1 mg), hemina (1 mg), biotina (1 |jg), cobalamina (1 |jg), ácido p-aminobenzoico (3 jg), ácido fólico (5 jg ) y piridoxamina (15 jg).

Cepas bacterianas para uso en composiciones de vacunas

[0203] Los inventores han identificado que las cepas bacterianas de la invención son útiles para tratar o prevenir trastornos neurodegenerativos. Es probable que esto sea el resultado del efecto que las cepas bacterianas de la invención tienen sobre el sistema inmunológico del huésped. Por lo tanto, las composiciones de la invención también pueden ser útiles para prevenir trastornos neurodegenerativos cuando se administran como composiciones de vacuna. En ciertas de tales realizaciones, las cepas bacterianas de la invención se pueden matar, inactivar o atenuar. En ciertas de tales realizaciones, las composiciones pueden comprender un adyuvante de vacuna. En determinadas realizaciones, las composiciones se administran mediante inyección, tal como mediante inyección subcutánea.

General

[0204] La práctica de la presente invención empleará, a menos que se indique lo contrario, métodos convencionales de química, bioquímica, biología molecular, inmunología y farmacología, dentro de los conocimientos de la técnica. Estas técnicas se explican completamente en la literatura. Véanse, p. ej., las referencias [51] y [52-58], etc.

[0205] El término "que comprende" abarca "que incluye" así como "que consiste", por ejemplo, una composición "que comprende" X puede consistir exclusivamente en X o puede incluir algo adicional, por ejemplo. X Y.

[0206] El término "aproximadamente" en relación con un valor numérico x es opcional y significa, p. ej., x 10%.

[0207] La palabra "sustancialmente" no excluye "completamente", por ejemplo. una composición que está "sustancialmente libre" de Y puede estar completamente libre de Y. Cuando sea necesario, la palabra "sustancialmente" puede omitirse de la definición de la invención.

[0208] Las referencias a un porcentaje de identidad de secuencia entre dos secuencias de nucleótidos significan que, cuando se alinean, ese porcentaje de nucleótidos es el mismo al comparar las dos secuencias. Este alineamiento y el porcentaje de homología o identidad de secuencia se pueden determinar usando programas de software conocidos en la técnica, p. ej., los descritos en la sección 7.7.18 de la ref. [59]. Una alineación preferida se determina mediante el algoritmo de búsqueda de homología de Smith-Waterman usando una búsqueda de huecos afines con una penalización de apertura de hueco de 12 y una penalización de extensión de hueco de 2, matriz BLOSUM de 62. El algoritmo de búsqueda de homología de SmithWaterman se describe en la ref. [60].

[0209] A menos que se indique específicamente, un proceso o método que comprende numerosos pasos puede comprender pasos adicionales al principio o al final del método, o puede comprender pasos intermedios adicionales. Además, los pasos se pueden combinar, omitir o realizar en un orden alternativo, si es apropiado.

[0210] En el presente documento se describen diversas realizaciones de la invención. Se apreciará que las características especificadas en cada realización se pueden combinar con otras características especificadas para proporcionar realizaciones adicionales. En particular, las realizaciones destacadas en el presente documento como adecuadas, típicas o preferidas pueden combinarse entre sí (excepto cuando son mutuamente excluyentes).

MODOS DE REALIZAR LA INVENCIÓN

Ejemplo 1 - Eficacia de los inóculos bacterianos para reducir la secreción de IL-6.

Resumen

[0211] La activación de citoquinas proinflamatorias se ha asociado con daño neuronal en enfermedades neurodegenerativas. El lipopolisacárido (LPS) es un estimulador conocido de la citoquina proinflamatoria IL-6. Se trataron células de astrocitoma de glioblastoma humano con composiciones que comprenden cepas bacterianas de acuerdo con la invención en combinación con LPS para observar su capacidad para modular los niveles de IL-6. Material y Métodos

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

Línea celular

[0212] MG U373 es un astrocitoma de glioblastoma humano derivado de un tumor maligno y se adquirieron de Sigma-Aldrich (cat n° 08061901-1VL). Se cultivaron células de astrocitoma de glioblastoma humano Mg U373 en MEM (Sigma Aldrich, cat n° M-2279) suplementado con FBS al 10%, Pen Strep al 1%, L-Glut 4 mM, solución de aminoácidos no esenciales IX MEM y piruvato sódico IX.

Método

[0213] Una vez cultivadas, las células MG U373 se sembraron en placa de 24 pocillos a 100.000 células/pocillo. Las células se trataron con LPS (1 ug/ml) solo o con un 10% de sobrenadante de bacterias de MRx0001 durante 24 h. También se realizó un control en donde las células se incubaron en medio sin tratar. Las células se trataron con un 10% de sobrenadante de bacterias de MRx0001 o YCFA solo durante 24 h. También se realizó un control en donde las células se incubaron en medio sin tratar. Posteriormente, se recogieron los sobrenadantes libres de células, se centrifugaron a 10.000 g durante 3 min a 4°C. La IL-6 se midió utilizando el kit ELISA de IL-6 humana de Peprotech (n° de cat. 900-K16) de acuerdo con las instrucciones del fabricante.

Resultados

[0214] Los resultados de estos experimentos se muestran en la Figura 1 y la Figura 9. El tratamiento de células de neuroblastoma con LPS y la cepa bacteriana condujo a una disminución en el nivel de IL-6 secretada al mismo nivel que las células de control que eran sin tratar con LPS (Figura 1). El tratamiento de células de neuroblastoma con Roseburia hominis condujo a una disminución en el nivel de IL-6 secretado por debajo de los niveles observados con las células tratadas con el control (Figura 9).

Ejemplo 2 - Eficacia de los inóculos bacterianos para reducir la activación de NFkB

Resumen

[0215] La activación del promotor NFkB conduce a la producción de citocinas proinflamatorias que incluyen IL-1p, IL-1a, IL-18, TNFa e IL-6, El promotor NFkB puede ser activado por a-sinucleína y LPS estimulando el ligando TLR4. Las mutaciones en la a-sinucleína, como la a-sinucleína A53T, están implicadas en el Parkinson familiar. El tratamiento de las células neuronales con LPS simula el Parkinson causado por factores ambientales. Se investigó la capacidad de las composiciones que comprenden cepas bacterianas según la invención para inhibir la activación del promotor NFkB.

Material y Métodos

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

Línea celular

[0216] TLR4 azul de Hek humano se adquirieron de InvivoGen (cat n° HKB-hTLR4). Se cultivaron TLR4 azul de Hek humano en DMEM con alto contenido de glucosa (Sigma Aldrich, cat n° D-6171) suplementado con FBS al 10%, Pen Strep al 1%, L-Glut 4 mM, Normocina y solución de selección HEK Blue 1X.

Método

[0217] Una vez cultivadas, se sembraron las células azules Hek Humano en placa de 96 pocillos a 25.000 células/pocillo en 4 repeticiones. Un conjunto de células se trató con a-sinucleína a 53T (1 pg/ml) solo o con un 10% de sobrenadante de bacterias de MRx0001 durante 22 h. El segundo conjunto de células se trató con LPS (10 ng/ml, de Salmonella enterica serotipo Typhimurium, Sigma Aldrich, cat n° L6143) solo o con 10% de sobrenadante de bacterias de MRx0001 durante 22 h. Las células se centrifugaron posteriormente y se mezclaron 20 pl del sobrenadante con 200 pl de reactivo Quanti Blue (InvivoGen, n° de cat. Rep-qb2), se incubaron durante 2 h y se leyó la absorbancia a 655 nm.

Resultados

[0218] Los resultados de estos experimentos se muestran en la Figura 2 y 3. La Figura 2 muestra que la activación del promotor NFkB por a-sinucleína es inhibida por MRx0001. La Figura 3 muestra que la activación del promotor de NTkB por LPS es inhibida por MRx0001.

Ejemplo 3 - Eficacia de inóculos bacterianos para alterar la capacidad antioxidante

Resumen

[0219] La capacidad de las composiciones que comprenden cepas bacterianas de acuerdo con la invención para alterar la capacidad antioxidante. La capacidad antioxidante de la cepa bacteriana se estableció utilizando el conocido ensayo ABTS (ácido 2,2'-azino-bis(3-etilbenzotiazolina-6-sulfónico)).

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

Método

[0220] Las células bacterianas (106 o mayores) se recogieron y se centrifugaron. Se resuspendieron en tampón de ensayo (usando tres veces el volumen del sedimento). La suspensión se sonicó en hielo durante 5 minutos y luego se centrifugó a 12,000 x g durante 10 minutos. El sobrenadante se eliminó y se midió usando el kit de ensayo ABTS producido por Sigma Aldrich (código Cs0790), de acuerdo con las instrucciones del fabricante.

Resultados

[0221] Los resultados de estos experimentos se muestran en la Figura 4. La Figura 4 muestra que MRx0001 tiene una capacidad antioxidante de aproximadamente 1 mM en comparación con Trolox.

Ejemplo 4 - Eficacia de inóculos bacterianos para alterar los niveles de peroxidación de lípidos Resumen

[0222] Se investigó la capacidad de las composiciones que comprenden cepas bacterianas de acuerdo con la invención a la peroxidación de lípidos alter niveles. Se utilizó el ensayo de sustancias reactivas tiobarbitúricas (TBAR) para medir los subproductos de la peroxidación lipídica.

Material y Métodos

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

Método

[0223] Las células bacterianas (106 o más) se recogieron y se centrifugaron, una etapa de lavado se realizó con solución salina isotónica antes de resuspenderse el sedimento en tampón de ensayo de cloruro de potasio. La suspensión se sonicó en hielo durante 10 minutos y luego se centrifugó a 10.000 x g durante 10 minutos. Se eliminó el sobrenadante y se evaluó el nivel de peroxidación lipídica utilizando el ensayo de sustancias reactivas tiobarbitúricas.

Resultados

[0224] Los resultados de los experimentos se muestran en la Figura 5. La Figura 5 muestra que MRx0001 es capaz de inhibir peroxidación de lípidos en aproximadamente un 18%, que es una capacidad antioxidante más alta que el control positivo, hidroxitolueno butilado (1% p/v).

Ejemplo 5 - Eficacia de inóculos bacterianos sobre la actividad de histona deacetilatasa

Resumen

[0225] Se investigó la capacidad de las composiciones que comprenden cepas bacterianas de acuerdo con la invención para alterar la actividad de histona deacetilatasa. La desregulación de la histona desacetilatasa se ha implicado en la patogénesis asociada con las enfermedades neurodegenerativas asociadas a la edad.

Material y Métodos

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

Línea celular

[0226] La línea celular se utilizó HT-29 porque la histona desacetilasa está presente.

Método

[0227] Sobrenadantes libres de células de cultivos de bacterias de fase estacionaria se aislaron por centrifugación y el filtrado en un filtro 0,22 uM. Las células HT-29 se utilizaron 3 días después de la confluencia y se redujeron en 1 ml de DTS 24 horas antes del comienzo del experimento. Las células HT-29 se desafiaron con sobrenadante libre de células al 10% diluido en DTS y este se dejó incubar durante 48 horas. A continuación, se extrajeron las proteínas nucleasa usando el kit de extracción Sigma Aldrich Nuclease y las muestras se congelaron rápidamente antes de la medición de la actividad HDAC. La actividad de HDAC se evaluó fluorométricamente usando el kit Sigma Aldrich (Reino Unido).

Resultados

[0228] Los resultados de los experimentos se muestran en la Figura 6. La Figura 6 muestra que MRx0001 es capaz de reducir los niveles de actividad de histona desacetilasa.

Ejemplo 6 - Nivel de producción de indol en bacterias

Resumen

[0229] Se investigó la capacidad de las bacterias de la invención para producir indol. El indol se ha relacionado con la atenuación de la inflamación y el estrés oxidativo.

Material y métodos

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

[0230] La ATCC 11775 es una cepa bacteriana de referencia que se sabe que produce indol.

Método

[0231] Células bacterianas intactas en fase estacionaria se incubaron con 6 mM triptófano durante 48 horas. Las especies bacterianas que poseen la enzima triptofanasa utilizarán triptófano como sustrato para producir indol. Después del período de incubación de 48 horas, se eliminó el sobrenadante y se añadió al reactivo de Kovac para la cuantificación del indol. Los estándares, las soluciones madre y los reactivos se prepararon utilizando métodos estandarizados validados internamente.

Resultados

[0232] Los resultados de los experimentos se muestran en la Figura 7. La Figura 7 muestra que MRx0001 tiene la capacidad de producir indol a partir de triptófano, a concentraciones de aproximadamente 0,25 mM.

Ejemplo 7 - Nivel de producción de quinurenina en bacterias

Resumen

[0233] La capacidad de las bacterias de la invención para producir quinurenina. La desregulación de la vía de la quinurenina puede provocar la activación del sistema inmunológico y la acumulación de compuestos potencialmente neurotóxicos. Las alteraciones en el metabolismo de la quinurenina pueden estar involucradas en el desarrollo de la enfermedad de Parkinson.

Cepa bacteriana

Roseburia hominis MRx0001

[0234] DSM 17136 es una cepa de Bacteroides copricola que se sabe que produce quinurenina.

Método

[0235] Se aislaron los sobrenadantes libres de células de cultivos bacterianos en fase estacionaria mediante centrifugación y filtración en un filtro de 0,22 pM y se congelaron hasta su uso. Los estándares de quinurenina, las soluciones madre y los reactivos se prepararon utilizando métodos estandarizados validados internamente. Las muestras se trataron con ácido tricloroacético y se centrifugaron a 10.000 x g durante 10 minutos a 4°C. Se recogió el sobrenadante y se dispensó en una placa de 96 pocillos. Se utilizó reactivo de Ehrlich para la detección de quinurenina y se añadió en una proporción de 1:1.

Resultados

[0236] Los resultados de los experimentos se muestran en la Figura 8. La Figura 8 muestra que MRx0001 tiene la capacidad de producir quinurenina a una concentración de aproximadamente 50 pm.

Ejemplo 8 - Prueba de estabilidad

[0237] Una composición descrita en este documento que contiene al menos una cepa bacteriana descrita en este documento se almacena en un recipiente sellado a 25°C o 4°C y el recipiente se coloca en una atmósfera que tenga 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90% o 95% de humedad relativa. Después de 1 mes, 2 meses, 3 meses, 6 meses, 1 año, 1,5 años, 2 años, 2,5 años o 3 años, quedará al menos el 50%, 60%, 70%, 80% o 90% de la cepa bacteriana medida en unidades formadoras de colonias determinadas por protocolos estándar.

Ejemplo 9 - Eficacia de inóculos bacterianos para reducir la secreción de IL-6.

Resumen

[0238] La activación de citoquinas proinflamatorias se ha asociado con daño neuronal en enfermedades neurodegenerativas. El lipopolisacárido (LPS) es un estimulador conocido de la citoquina proinflamatoria IL-6. Se trataron células de astrocitoma de glioblastoma humano con composiciones que comprenden cepas bacterianas de acuerdo con la invención en combinación con LPS para observar su capacidad para modular los niveles de IL-6. Material y métodos

Cepa bacteriana

Roseburia intestinalis Cepa A

Roseburia faecis Cepa B

Línea celular

[0239] MG U373 es un astrocitoma de glioblastoma humano derivado de un tumor maligno y se adquirió de Sigma-Aldrich (n° de cat. 08061901-1VL). Se cultivaron células de astrocitoma de glioblastoma humano MG U373 en MEM (Sigma Aldrich, cat n° M-2279) suplementado con FBS al 10%, Pen Strep al 1%, L-Glut 4 mM, solución de aminoácidos no esenciales 1X MEM y piruvato de sodio 1X.

Método

[0240] Una vez cultivadas, las células MG U373 se sembraron en placa de 24 pocillos a 100.000 células/pocillo. Las células se trataron con las siguientes condiciones durante 24 h:

LPS (1ug/mL)

LPS con 10% de sobrenadante de bacterias de la cepa A

LPS con 10% de sobrenadante de bacterias de la cepa B

LPS con medio YCFA

YCFA

[0241] También se realizó un control en donde las células se incubaron en medio sin tratar.

[0242] A continuación, se recogieron los sobrenadantes libres de células, se centrifugaron a 10.000 g durante 3 min a 4°C. La IL-6 se midió usando el kit ELISA de IL-6 humana de Peprotech (n° de cat. 900-K16) de acuerdo con las instrucciones del fabricante.

Resultados

[0243] Los resultados de estos experimentos se muestran en la Figura 10 y 12. Tratamiento de células de neuroblastoma con LPS y las bacterias de la cepa A y B condujeron a una disminución en el nivel de IL-6 secretada al mismo nivel que las células de control que no fueron tratadas con LPS (Figura 10A y 12A).

[0244] El tratamiento de células de neuroblastoma con Roseburia intestinalis y Roseburia faecis condujo a una disminución en el nivel de IL-6 secretado por debajo de los niveles observados con las células tratadas con el control (Figura 10B y 12B).

Ejemplo 10 - Eficacia de inóculos bacterianos para reducir la activación de NFkB

Resumen

[0245] La activación del promotor de NFkB conduce a la producción de citocinas proinflamatorias que incluyen IL-1p, IL-1a, IL-18, TNFa e IL-6. El promotor NFkB puede ser activado por a-sinucleína y LPS estimulando el ligando TLR4. Las mutaciones en la a-sinucleína, como la a-sinucleína A53T, están implicadas en el Parkinson familiar. El tratamiento de las células neuronales con LPS simula el Parkinson causado por factores ambientales. Se investigó la capacidad de las composiciones que comprenden cepas bacterianas según la invención para inhibir la activación del promotor NFkB.

Material y Métodos

Cepa bacteriana

Roseburia intestinalis cepa A

Roseburia faecis Cepa B

Línea celular

[0246] TLR4 azul de Hek humano se adquirieron de InvivoGen (cat n° HKB-hTLR4). Se cultivaron TLR4 azul de Hek humano en DMEM con alto contenido de glucosa (Sigma Aldrich, cat n° D-6171) suplementado con FBS al 10%, Pen Strep al 1%, L-Glut 4 mM, Normocina y solución de selección de azul IX HEK.

Método

[0247] Una vez cultivadas, se sembraron las células azules de Hek humano en placa de 96 pocillos a 25.000 células/pocillo en 4 repeticiones. Un conjunto de células se trató con a-sinucleína A53t (1 pg/ml) solo o con un 10% de sobrenadante de bacterias de la cepa A o la cepa B durante 22 h. El segundo conjunto de células se trató con LPS (10 ng/ml, de Salmonella enterica serotipo Typhimurium, Sigma Aldrich, cat n° L6143) solo o con un 10% de sobrenadante de bacterias de la cepa A o la cepa B durante 22 h. Las células se centrifugaron posteriormente y se mezclaron 20 pl del sobrenadante con 200 pl de reactivo Quanti Blue (InvivoGen, n° de cat. Rep-qb2), se incubaron durante 2 h y se leyó la absorbancia a 655 nm.

Resultados

[0248] Los resultados de estos experimentos se muestran en las Figuras 11 y 13.

Secuencias

[0249]

SEQ ID NO:1 (Roseburia hominis cepa A2-181 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial - AY804148)

1 taaaggttga tcctggctca ggatgaacgc tggaggcgtg cttaacacat gcaagtcgaa 61 cgaagcactt taattgattt cttcggaatg aagtttttgt gactgagtgg cggacgggtg 121 agtaacgcgt gggtaacctc gctcatacag ggggataaca gttggaaacg actgctaata 181 ccgcataagc gcacaggatt gcatgatcca gtgtgaaaaa ctccggtggt atgagatgga 241 cccgcgtctg attagccagt tggcggggta acggcccacc aaagcgacga tcagtagccg 301 acctgagagg gtgaccggcc acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc 361 agcagtgggt aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agcgacgccg agtgagcgaa 421 gaagtatttc ggtatgtaaa gctctatcag caggaagaag aatgacggta cctgactaaa 481 aagcaccggc taaatacgtg ccagcagccg cggtaatacg tatggtgcaa gcgttatccg 541 gatttactgg gtgtaaaggg agcgcaggcg gtacggcaag tctgatgtga aatcccgggg 601 ctcaaccccg gtactgcatt ggaaactgtc ggactagggt gtctgagggg taagtggaat 661 tcctagtgta gcggtgaaat gcgtagatat taggaggaac accagtggcg aaggcggctt 721 actggacgat tactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc 781 tggtagtcca cgccgtaaac gatgaatact aggtgtcggg gagcattgct cttcggtgcc 841 gcagcaaacg caataagtat tccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg 901 aattgacggg gacccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga 961 accttaccaa gtcttgacat cccactgaca aagtatgtaa tgtactttct cttcggagca 1021 gtggtgacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc 1081 cgcaacgagc gcaaccccta ttcttagtag ccagcggttt ggccgggcac tctagggaga 1141 ctgccaggga taacctggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac 1201 ttgggctaca cacgtgctac aatggcgtaa acaaagggaa gcaatcccgc gagggggagc 1261 aaatctcaaa aataacgtct cagttcggac tgtagtctgc aactcgacta cacgaagctg 1321 gaatcgctag taatcgcgaa tcagaatgtc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac 1381 accgcccgtc acaccatggg agttggtaat gcccgaagtc agtgacccaa ccgcaaggag 1441 ggagctgccg aagcaggact gataactggg gtgaagtcgt aacaagt

SEQ ID NO:2 (Roseburia hominis A2-183 16S gen de ARN, tipo cepa A2-183T - AJ270482)

1 gatcctggct caggatgaac gctggcggcg tgcttaacac atgcaagtcg aacgaagcac 61 tttaattgat ttcttcggaa tgaagttttt gtgactgagt ggcggacggg tgagtaacgc 121 gtgggtaacc tgcctcatac agggggataa cagttggaaa cgactgctaa taccgcataa 181 gcgcacagga ttgcatgatc cagtgtgaaa aactccggtg gtatgagatg gacccgcgtc 241 tgattagcca gttggcgggg taacggccca ccaaagcgac gatcagtagc cgacctgaga 301 gggtgaccgg ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtgg 361 ggaatattgc acaatggggg aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgagcg aagaagtatt 421 tcggtatgta aagctctatc agcagggaag aagaatgcgg tacctgacta agaagcaccg 481 gctaaatacg tgccagcagc cgcggtaata cgtatggtgc aagcgttatc cggatttact 541 gggtgtaaag ggagcgcagg cggtacggca agtctgatgt gaaatcccgg ggctcaaccc 601 cggtactgca ttggaaactg tcggactaga gtgtcggagg ggtaagtgga attcctagtg 661 tagcggtgaa atgcgtagat attaggagga acaccagtgg cgaaggcggc ttactggacg 721 attactgacg ctgaggctcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc 781 cacgccgtaa acgatgaata ctaggtgtcg gggagcattg ctcttcggtg ccgcagcaaa 841 cgcaataagt attccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg 901 gggacccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc 961 aagtcttgac atcccactga cagagtatgt aatgtacttt ctcttcggag cagtggtgac 1021 aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga 1081 gcgcaacccc tattcttagt agccagcggt tcggccgggc actctaggga gactgccagg 1141 gataacctgg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcat gccccttatg acttgggcta 1201 cacacgtgct acaatggcgt aaacaaaggg aagcaatccc gcgaggggga gcaaatctca 1261 aaaataacgt ctcagttcgg actgtagtct gcaactcgac tacacgaagc tggaatcgct 1321 agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg 1381 tcacaccatg ggagttggta atgcccgaag tcagtgaccc aaccgcaagg agggagctgc 1441 cgaaggcagg actgataact ggggtgaagt cgtaacaagg gtacg

SEQ ID NO:3 (consenso 16S secuencia rARN para Roseburia hominis cepa 433)

AAGAGTTTGGGHCAGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGAAGCACTTTAATTGA

TTTCTTCGGAATGAAGTTTTTGTGACTGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACCTGCCTCATACAGGGGG

ATAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGCATAAGCGCACAGGATTGCATGATCCAGTGTGAAAAACTCCGGTGGTA

TGAGATGGACCCGCGTCTGATTAGCCAGTTGGCGGGGTAACGGCCCACCAAAGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGA

GGGTGACCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGG

GGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGCGAAGAAGTATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAGA

ATGACGGTACCTGACTAAGAAGCACCGGCTAAATACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGGTGCAAGCGTTATC

CGGATTTACTGGGTGTAAAGGGAGCGCAGGCGGTACGGCAAGTCTGATGTGAAATCCCGGGGCTCAACCCCGGTACT

GCATTGGAAACTGTCGGACTAGAGTGTCGGAGGGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTA

GGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTACTGGACGATTACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGG

ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTCGGGGAGCATTGCTCTTCGGTGCCGCAGCA

AACGCAATAAGTATNCCACCTGGGGAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGC

GGTGGAGCNTGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCCACTGACAGAGTATGTAA

TGTACTTTCTCTTCGGAGCAGTGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAG

TCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTCTTAGTAGCCAGCGGTTTGGCCGGGCACTCTAGGGAGACTGCCAGGGATAAC

CTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTAAA

CAAAGGGAAGCAATCCCGCGAGGGGGAGCAAATCTCAAAAATAACGTCTCAGTTCGGACTGTAGTCTGCAACTCGAC

TACACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGC

CCGTCACACCATGGGAGTTGGTAATGCCCGAAGTCAGTGACCCAACCGCAAGGAGGGAGCTGCCGAAGGCAGGACTG

ATAACTGGGGTGAAGTCTACRSAGGGTAGCCGTRMMC.

SEQ ID NO:5 (Consenso 16S secuencia rARN, Roseburia intestinalis cepa A)

gctccctcct tgcggttggg tcactgactt cgggcattac caactcccat ggtgtgacgg 60 gcggtgtgta caagacccgg gaacgtattc accgcgacat tctgattcgc gattactagc 120 gattccagct tcgtgcagtc gagttgcaga ctgcagtccg aactgagacg ttatttttga 180 gatttgctcc ccctcgcagg ctcgcttccc tttgtttacg ccattgtagc acgtgtgtag 240 cccaagtcat aaggggcatg atgatttgac gtcatcccca ccttcctcca ggttatccct 300 ggcagtctcc ctagagtgcc cggcttaccc gctggctact aagaataggg gttgcgctcg 360 ttgcgggact taacccaaca tctcacgaca cgagctgacg acaaccatgc accacctgtc 420 accgatgctc cgaagagaaa acacattaca tgttctgtca tcgggatgtc aagacttggt 480 aaggttcttc gcgttgcttc gaattaaacc acatgctcca ccgcttgtgc gggtccccgt 540 caattccttt gagtttcatt cttgcgaacg tactccccag gtggaatact tattgcgttt 600 gctgcggcac cgaagagcaa tgctccccga cacctagtat tcatcgttta cggcgtggac 660 taccagggta tctaatcctg tttgctcccc acgctttcga gcctcagcgt cagtaatcgt 720 ccagtaagcc gccttcgcca ctggtgttcc tcctaatatc tacgcatttc accgctacac 780 taggaattcc acttacccct ccgacactct agtccgacag tttccaatgc agtaccgggg 840 ttgagccccg ggctttcaca tcagacttgc cgtaccgcct gcgctccctt tacacccagt 900 aaatccggat aacgcttgca ccatacgtat taccgcggct gctggcacgt atttagccgg 960 tgcttcttag tcaggtaccg tcatttcttc ttccctgnct gatagagctt tacataccga 1020 aatacttctt cgctcacgcg gcgtcgctgc atcagggttt cccccattgt gcaatattcc 1080 ccactgctgc ctcccgtagg agtttgggcc gtgtctcagt cccaatgtgg ccggtcaccc 1140 tctcaggtcg gctactgatc gtcgctttgg taggccgtta ccccaccaac tggctaatca 1200 gacgcgggtc catctcatac caccggagtt tttcacacca ggtcatgcga ccctgtgcgc 1260 ttatgcggta ttagcagtcg tttccaactg ttatccccct gtatgaggca ggttacccac 1320 gcgttactca cccgtccgcc actcagtcac aaaatcttca ttccgaagaa atcaaataaa 1380 gtgcttcgtt cgactgca 1398 SEQ ID NO:6 (Consenso 16S secuencia rARN, Roseburia faecis cepa B)

cactgctgcc tcccgtagga gtttgggccg tgtctcagtc ccaatgtggc cggtcaccct 1140 ctcaggtcgg ctactgatcg tcgctttggt aggccgttac cctgccaact ggctaatcag 1200 acgcgggtcc atctcatacc accggagttt ttcacaccgg atcatgcgat cctgtgcgct 1260 tatgcggtat tagcagtcgt ttccaactgt tatccccctg tatgaggcag gttacccacg 1320 cgttactcac ccgtccgcca ctcagtcaca aaatcttcat ttccgaagaa aatcaaatag 1380 agtgcttcgt ccgactgcag 1400

REFERENCIAS

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Claims

REIVINDICACIONES

1. Una composición que comprende una cepa bacteriana del género Roseburia, para su uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson, incluida la parálisis supranuclear progresiva, parálisis supranuclear progresiva, síndrome de Steele-Richardson-Olszewski, hidrocefalia de presión normal, parkinsonismo vascular o arterioesclerótico y parkinsonismo inducido por fármacos; enfermedad de Alzheimer, incluido el síndrome de Benson; enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia, incluida la demencia con cuerpos de Lewy, vascular y frontotemporal; afasia progresiva primaria; deterioro cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH; o degeneración corticobasal.

2. La composición para uso según la reivindicación 1, en donde la composición es para uso en un método para tratar o prevenir la enfermedad de Parkinson.

3. La composición para su uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 ó 2, en donde (a) la enfermedad de Parkinson; enfermedad de Alzheimer; enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia; afasia progresiva primaria; deterioro cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH; o degeneración corticobasal; es de inicio temprano; y/o en donde (b) la composición se utiliza en un método para prevenir o retrasar la aparición o progresión de la enfermedad de Parkinson; enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Huntington; la esclerosis lateral amiotrófica; enfermedad de Lou Gehrig; enfermedad de la neurona motora; enfermedad por priones; ataxia espinocerebelosa; atrofia muscular en la columna; demencia; afasia progresiva primaria; defecto cognitivo leve; deterioro cognitivo relacionado con el VIH; o degeneración corticobasal.

4. Una composición que comprende una cepa bacteriana del género Roseburia, para su uso en un método de tratamiento de un accidente cerebrovascular, tal como isquemia cerebral, isquemia cerebral focal, accidente cerebrovascular isquémico o accidente cerebrovascular hemorrágico.

5. La composición para su uso según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde la cepa bacteriana es de Roseburia hominis, opcionalmente en donde la cepa bacteriana tiene una secuencia de rARN 16s que es al menos 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a SEQ ID NO: 3, o en donde la cepa bacteriana tiene la secuencia de rARN 16s representada por SEQ ID NO: 3.

6. La composición para su uso según la reivindicación 1, en donde la composición comprende una cepa bacteriana de la especie Roseburia hominis, para su uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson.

7. La composición para uso de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 5-6, en donde la cepa bacteriana es la cepa Roseburia hominis depositada con el número de acceso NCIMB 42383.

8. La composición para uso de acuerdo con las reivindicaciones 1-4, en donde la cepa bacteriana es de la especie Roseburia intestinalis, en donde opcionalmente la cepa bacteriana tiene una secuencia de rARN 16s que es al menos 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a la SEQ ID NO: 5.

9. La composición para su uso según las reivindicaciones 1-3, en donde la composición comprende una cepa bacteriana de la especie Roseburia intestinalis, para usar en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson.

10. La composición para su uso según cualquiera de las reivindicaciones 8 o 9, en donde la cepa bacteriana es la cepa Roseburia intestinalis depositada con el número de acceso NCIMB 43043.

11. La composición para su uso según las reivindicaciones 1-4, en donde la cepa bacteriana es de la especie Roseburia faecis, en donde opcionalmente la cepa bacteriana tiene una secuencia de rARN 16s que es al menos 99%, 99,5% o 99,9% idéntica a la SEQ ID NO: 6.

12. La composición para su uso según las reivindicaciones 1-3, en donde la composición comprende una cepa bacteriana de la especie Roseburia faecis, para su uso en un método de tratamiento o prevención de la enfermedad de Parkinson.

13. La composición para uso según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde la composición es para administración oral; y en donde la composición comprende uno o más excipientes o portadores farmacéuticamente aceptables.

14. La composición para su uso según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde la cepa bacteriana está liofilizada.

15. Un producto alimenticio que comprende la composición de cualquier reivindicación precedente, para el uso de cualquier reivindicación anterior.

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