JP2022515744A5 - - Google Patents
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本発明は、その具体的な実施形態と関連して記載されているが、本発明はさらなる修正が可能であり、この出願は、一般に本発明の原理に従い、既知または慣行に含まれ、本発明が関係する技術の範囲内であり、前述の本質的な特徴に適用することができ、特許請求される範囲に従う本開示からのそのような逸脱を含む、本発明のあらゆる変形、使用、または適応を範囲に含むことを意図していることを理解されたい。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
配列番号3526に対して少なくとも90%同一である配列を含む転写産物の少なくとも10個の連続する核酸塩基に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列、または配列番号3526の連続する15から50個の核酸塩基部分を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドを含む、化合物。
(項目2)
配列番号3526に対して少なくとも90%同一である配列を含む転写産物の少なくとも10個の連続する核酸塩基に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列、または配列番号3526の連続する15から50個の核酸塩基部分を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチド。
(項目3)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、項目1に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目2に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目4)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する11、12、13、14、15、16、または17個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2もしくは3に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目5)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~116のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2もしくは3に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目6)
前記オリゴヌクレオチドが、1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドである、項目1もしくは3に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2もしくは3に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目7)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3~6のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~6の
いずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目8)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する11、12、13、14、15、16、または17個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目9)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する11、12、13、14、15、16、または17個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3~8のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~8のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目10)
配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも10個の連続する核酸塩基配列を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目11)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも10個の連続する核酸塩基配列を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチド。
(項目12)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目10に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目11に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目13)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1338、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、項目10に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目11に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目14)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18,または19個の連続する核酸塩基を含む、項目13に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目13に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目15)
配列番号3526の位置374、661、655~680、765、837、1347、1340~1370、1629、1760、1752、1795、1775、1740~1815、2879、3008、3168、または3110~3171のうちのいずれか1つの10個の核酸塩基の範囲内の等しい長さの部分に対して少なくとも90%相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目16)
配列番号3526の位置374、661、655~680、765、837、1347、1340~1370、1629、1760、1752、1795、1775、1740~1815、2879、3008、3168、または3110~3171のうちの10個の核酸塩基の範囲内の等しい長さの部分に対して少なくとも90%相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチド。
(項目17)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~680、1340~137、1740~1815、または3110~3175のいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さ部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目15に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目16に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目18)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~665、660~670、665~675、または670~680のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目19)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置1340~1350、1345~1355、1350~1360、1355~1365、または1360~1370のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目20)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置1740~1750、1745~1755、1750~1760、1755~1765、1760~1770、1765~1775、1770~1780、1775~1785、1780~1790、1785~1795、1790~1800、1795~1805、1800~1810、または1805~1815のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目21)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置3110~3120、3115~3125、3120~3130、3125~3135、3130~3140、3135~3145、3140~3150、3145~3155、3150~3160、3155~3165、3160~3170、3165~3175、3170~3180のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目22)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置374、661、765、837、1347、1629、2879、3008、3168、1760、1752、1795、1775、655~680、1340~1370、1740~1815、または3110~3171のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、項目15に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目16に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目23)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~680、1340~137、1740~1815、または3110~3175のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、項目15に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目16に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目24)
前記オリゴヌクレオチドが12~40個の核酸塩基の長さである、項目1もしくは3~23のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~23のいずれか1項に記載のいずれかのオリゴヌクレオチド。
(項目25)
前記オリゴヌクレオチドが、
a.連結したデオキシリボヌクレオシド、2’-フルオロアラビノ核酸(FANA)、及びフルオロシクロヘキセン核酸(F-CeNA)のうちの1つ以上を含むギャップセグメント、
b.連結したヌクレオシドを含む5’ウィングセグメント、
c.連結したヌクレオシドを含む3’ウィングセグメントを含み、
d.前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に配置された配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも80%の同一性を有する少なくとも8つの連続する核酸塩基の領域を含み、前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントがそれぞれ、少なくとも2つの連結したヌクレオシドを含み、各々のウィングセグメントの少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む、項目1、10、または15のいずれか1項に記載の化合物。
(項目26)
a.連結したデオキシリボヌクレオシド、2’-フルオロアラビノ核酸(FANA)、及びフルオロシクロヘキセン核酸(F-CeNA)のうちの1つ以上を含むギャップセグメント;
b.連結したヌクレオシドを含む5’ウィングセグメント;
c.連結したヌクレオシドを含む3’ウィングセグメントを含み、
d.前記ギャップセグメントが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも80%の同一性を有する少なくとも8つの連続する核酸塩基の領域を含み、前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントがそれぞれ、少なくとも2つの連結したヌクレオシドを含み、各々のウィングセグメントの少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む、項目2、11、または16のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目27)
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも13、14、15、16、17、18、19、または20個の連結したヌクレオシドを含む、項目25に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目28)
前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、2’-アルコキシ結合、アルキルリン酸エステル結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロジチオエート結合、ホスホトリエステル結合、アルキルホスホネート結合、メチルホスホネート結合、ジメチルホスホネート結合、アミノアルキルホスホトリエステル結合、アルキレンホスホネート結合、ホスフィネート結合、ホスホルアミデート結合、ホスホロジアミデート結合、アミノアルキルホスホルアミデート結合、チオホスホルアミデート結合、チオノアルキルホスホネート結合、チオノアルキルホスホトリエステル結合、チオホスフェート結合、セレノホスフェート結合、及びボラノホスフェート結合からなる群から選択される、項目1、もしくは3~27のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~17のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目29)
前記5’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を介して連結され、前記3’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を介して連結され、前記ギャップセグメントのヌクレオシド間結合のうちの少なくとも1つが、修飾ヌクレオシド間結合である、項目25もしくは27に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26もしくは27に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目30)
前記核酸塩基配列の少なくとも2つ、3つ、または4つのヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、項目25もしくは27~29のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~29のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目31)
前記ギャップセグメントのヌクレオシド塩基間の少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、項目25もしくは27~30のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~30のいずれか1項に記載のいずれかのオリゴヌクレオチド。
(項目32)
前記核酸塩基配列の少なくとも2つのヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、項目1、3~25もしくは27~31のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~31のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目33)
前記核酸塩基配列の修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である、項目32に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目32に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目34)
前記核酸塩基配列の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合である、項目32もしくは33に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目32もしくは33に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目35)
前記5’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、修飾ヌクレオシド間結合を介して連結されている、項目25、27~28、もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目36)
前記3’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、修飾ヌクレオシド間結合を介して連結されている、項目25、27~28、もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目37)
前記5’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記3’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記ギャップセグメントのヌクレオシド間結合のうちの少なくとも1つが、修飾ヌクレオシド間結合である、項目25、27~28、もしくは32~36のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~36のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目38)
前記核酸塩基配列の少なくとも2つ、3つ、または4つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、項目25、27~28、もしくは32~37のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~37のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目39)
前記ギャップセグメントのヌクレオシド塩基間の少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、項目25、27~28、もしくは32~38のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~38のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目40)
前記ホスホロチオエートヌクレオシド間結合がRp配置、SP配置、またはRpとSp配置の任意の組み合わせである、項目25、27~28、もしくは32~39のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~39のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目41)
前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾核酸塩基を含む、項目1、3~25もしくは27~40のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~40のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目42)
前記少なくとも1つの修飾核酸塩基が、5’-メチルシトシン、シュードウリジン、または5-メトキシウリジンである、項目41に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目41に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目43)
前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾糖部分を含む、項目1、3~25もしくは27~42のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~42のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目44)
前記少なくとも1つの修飾糖が二環式糖である、項目43に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目43に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目45)
前記二環式糖が、4’-CH(R)-O-2’ブリッジを含み、式中、Rが独立して、H、C 1 -C 12 アルキル、または保護基である、項目44に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目44に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目46)
Rがメチルである、項目45に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目45に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目47)
RがHである、項目45に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目45に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目48)
前記修飾糖部分が、2’-OMe修飾糖部分、二環式糖部分、2’-O-メトキシエチル(MOE)、2’-デオキシ-2’-フルオロヌクレオシド、2’-フルオロ-β-D-アラビノヌクレオシド、ロックド核酸(LNA)、拘束エチル2’-4’-架橋核酸(cEt)、S-cEt、tcDNA、ヘキシトール核酸(HNA)、及び三環類似体(例えば、tcDNA)のうちの1つである、項目43に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目43に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目49)
前記オリゴヌクレオチドがホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結している1つ以上の2’-O-メトキシエチルヌクレオシドを含む、項目1、3~25、もしくは27~48のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~48のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目50)
前記オリゴヌクレオチドが、5’末端にホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された3つの連続するヌクレオシド塩基を含み、3’末端にホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された3つの連続するヌクレオシド塩基を含む、項目1、3~25、もしくは27~49のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~49のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目51)
前記オリゴヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された5つの連続するヌクレオシド塩基を含む、項目50に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目50に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目52)
前記5つの連続するヌクレオシド塩基のそれぞれが2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、項目50もしくは51に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目50もしくは51に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目53)
前記オリゴヌクレオチドのヌクレオシド塩基のそれぞれが2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目54)
前記ギャップセグメントが1つ以上の2’-O-メトキシエチルヌクレオシドを含む、項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目55)
前記ギャップセグメントが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、前記5’ウィングセグメントが、ホスホジエステルヌクレオシド結合を介して連結される2つの連続するヌクレオシド塩基を含み、前記3’ウィングセグメントが、ホスホジエステルヌクレオシド結合を介して連結される2つの連続するヌクレオシド塩基を含む、項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目56)
前記ギャップセグメントの5つの連続するヌクレオシド塩基が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記5’ウィングセグメントが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、前記3’ウィングセグメントが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目57)
1つ以上のキラル中心及び/または二重結合を含む、項目1、3~25、もしくは27~56のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~57のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目58)
前記オリゴヌクレオチドが、幾何異性体、エナンチオマー、及びジアステレオマーから選択される立体異性体として存在する、項目57に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目57に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目59)
前記オリゴヌクレオチドが、eeeee-d10-eeeee、d20、eeeee-d12-eeeee、eeeee-d8-eeeee、及びeekk-d8-kkeeeのパターンのうちのいずれかの糖修飾を含み、式中、e=2’-O-メトキシエチルヌクレオシド;d=2’-デオキシヌクレオシド;k=ロックド核酸(LNA)、拘束メトキシエチル(cMOE)ヌクレオシド、拘束エチル(cET)ヌクレオシド、またはペプチド核酸(PNA)である、項目1、3~25、もしくは27のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~27のいずれかのオリゴヌクレオチド。
(項目60)
前記オリゴヌクレオチドが、sssssssssssssssssss、sssssssssssssssssssss、sooosssssssssooss、及びsoosssssssssoossのうちのいずれかのヌクレオシド間結合を含み、式中、s=ホスホロチオエート結合、及びo=ホスホジエステル結合である、項目1、3~25、27、もしくは59のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、26、27、もしくは59のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目61)
前記オリゴヌクレオチドが、それぞれ以下のパターンのうちのいずれかの糖修飾とヌクレオシド間結合の組み合わせを含む、項目1、3~25、27、59、もしくは60のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、26、27、59、もしくは60のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド:
a)d20とsssssssssssssssssss、
b)eeeee-d10-eeeeeとsssssssssssssssssss、
c)eeeee-d12-eeeeeとsssssssssssssssssssss、d)eeeee-d8-eeeeeとsooosssssssssooss、及び
e)eekk-d8-kkeeeとsoosssssssssooss。
(項目62)
前記オリゴヌクレオチドが修飾シトシンを含む、項目1、3~25、27、もしくは59~61のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、26、27、もしくは59~61のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目63)
前記修飾シトシンが5-メチル-dCである、項目62に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目62に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目64)
前記オリゴヌクレオチドが、eeeee-d10-eeeeeとssssssssssssssssssの糖修飾及びヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、前記シトシンが、5-メチル-dCとして修飾されている、項目63に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目63に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目65)
前記オリゴヌクレオチドが、それぞれ以下のパターンのうちのいずれかにおける糖修飾とヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、前記オリゴヌクレオチド中のシトシンが未修飾のシトシンである、項目60もしくは61に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目60もしくは61に記載のオリゴヌクレオチド:
a)d20とsssssssssssssssssss、
b)eeeee-d12-eeeeeとsssssssssssssssssssss、c)eeeee-d8-eeeeeとsooosssssssssooss、及び
d)eekk-d8-kkeee及びsoosssssssssooss。
(項目66)
標的核酸配列の標的領域の核酸塩基配列と相補的であり、前記標的核酸の前記標的領域の核酸塩基配列が、少なくとも1つの非標的核酸配列の核酸塩基配列と1~3個の異なる核酸塩基によって異なり、前記非標的核酸が配列番号3526の配列を含む、項目1、3~25、もしくは27~56のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、もしくは26~65のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドによる、化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目67)
前記1~3個の異なる核酸塩基が一塩基多型(SNP)を含む、項目66に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目68)
前記標的領域に存在するSNPが、配列番号3526の等しい長さの部分と比較されるSNPである、項目67に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目69)
前記一塩基多型が、rs397515403、rs397515402、rs587777264、rs397515404、rs866242631、rs886043455、rs397515407、及びrs397515406からなる群から選択される、項目66に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目70)
前記一塩基多型が、、配列番号3526に示される配列の1112位のCからG、配列番号3526に示される配列の2845位のCからT、及び配列番号3526に示される配列の885位のGからTからなる群から選択される、項目66に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目71)
先行項目のいずれか1項に記載の化合物またはオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容される担体または賦形剤と、を含む、医薬組成物。
(項目72)
前記医薬組成物が、局所、髄腔内、嚢内、非経口、経口、肺、気管内、鼻腔内、経皮、直腸、頬側、舌下、膣、または十二指腸内投与に適している、項目71に記載の医薬組成物。
(項目73)
先行項目のいずれか1項に記載の化合物またはオリゴヌクレオチドと、脂質ナノ粒子、ポリプレックスナノ粒子、リポプレックスナノ粒子、またはリポソームと、を含む組成物。
(項目74)
KCNT1関連障害を有する対象の細胞におけるKCNT1のレベル及び/または活性を低下させる方法であって、項目1、3~25、もしくは27~70のいずれか1項に記載の化合物、項目2~24、もしくは26~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、または項目71もしくは72に記載の医薬組成物を、細胞におけるKCNT1のレベル及び/または活性を下げるのに十分な量及び期間で細胞と接触させることを含む、前記方法。
(項目75)
前記細胞が中枢神経系の細胞である、項目74に記載の方法。
(項目76)
神経疾患を治療することを、それを必要とする対象において行う方法であって、前記患者へ転写産物の阻害剤を投与することを含み、前記転写産物は、配列番号3526と少なくとも90%の同一性を共有する、前記方法。
(項目77)
前記阻害剤が、項目1、3~25、もしくは27~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、または項目71もしくは72に記載の医薬組成物を含む、項目76に記載の方法。
(項目78)
KCNT1関連障害を治療、予防、またはその進行を遅延させることを、それを必要とする対象において行う方法であって、項目1、3~25、もしくは70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、項目2~24もしくは26~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、または項目71もしくは72に記載の医薬組成物を、KCNT1関連障害を治療、予防、またはその進行を遅延させるのに十分な量及び期間で前記対象に投与することを含む、前記方法。
(項目79)
前記KCNT1関連障害が、移動性焦点発作を伴う乳児期てんかん、常染色体優性夜間前頭葉てんかん、ウエスト症候群、点頭てんかん、てんかん性脳症、部分発作、大田原症候群、発達性てんかん性脳症、及びレノックス・ガストー症候群からなる群から選択される、項目74~78のいずれか1項に記載の方法。
(項目80)
前記対象が、KCNT1に機能獲得型変異を有する、項目74~79のいずれか1項に記載の方法。
(項目81)
前記機能獲得型変異が、V271F、L274I、G288S、F346L、R398Q、R428Q、R474H、F502V、M516V、K629N、I760M、Y796H、E893K、M896I、M896K、P924L、R928C、F932I、A934T、A966T、H257D、R262Q、Q270E、V340M、C377S、P409S、L437F、R474C、A477T、R565H、K629E、G652V、I760F、Q906H、R933G、A934T、R950Q、R961H、R1106Q、K1154Q、R474Q、Y1903C、H469L、M896R、K946E、及びR950Lからなる群から選択される、項目80に記載の方法。
(項目82)
前記機能獲得型変異が、G288S、R398Q、R428Q、R928C、またはA934Tである、項目80または81に記載の方法。
(項目83)
前記方法が、前記KCNT1関連障害の1つ以上の症状を軽減する、項目74~82のいずれか1項に記載の方法。
(項目84)
前記KCNT1関連障害の1つ以上の症状が、長期の発作、頻繁な発作、行動及び発達の遅延、運動及びバランスの問題、整形外科的状態、言語遅延及び発声の問題、成長及び栄養の問題、睡眠困難、慢性感染症、感覚統合障害、自律神経系の乱れ、ならびに発汗からなる群から選択される、項目83に記載の方法。
(項目85)
前記オリゴヌクレオチドまたは医薬組成物が、局所的、非経口的、髄腔内、嚢内、経口、直腸、頬側、舌下、膣内、肺内、気管内、鼻腔内、経皮、または十二指腸内に投与される、項目74~84のいずれか1項に記載の方法。
(項目86)
前記患者がヒトである、項目74~85のいずれか1項に記載の方法。
(項目87)
18~22個の連結したヌクレオシドの長さであって、H.sapiensのKCNT1及びM.musculusのKCNT1転写産物の等しい長さの部分に対して少なくとも85%の配列相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目88)
18~22個の連結したヌクレオシドの長さであって、H.sapiensのKCNT1及びM.fascicularisのKCNT1転写産物の等しい長さの部分に対して少なくとも85%の配列相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目89)
18~22個の連結したヌクレオシドの長さであって、H.sapiensのKCNT1、M.musculusのKCNT1、及び/またはM.fascicularisのKCNT1転写産物の等しい長さの部分に対して少なくとも85%の配列相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む、化合物。
(項目90)
前記オリゴヌクレオチドが、40%~70%のGC含量を含む、項目87~89のいずれか1項に記載の化合物。
(項目91)
前記オリゴヌクレオチドが、H.sapiensのKCNT1転写産物に対して2つ以下のミスマッチを含む、項目87~90のいずれか1項に記載の化合物。
(項目92)
前記オリゴヌクレオチドが、任意の非KCNT1転写産物に対して少なくとも3つのミスマッチを含む、項目87~91のいずれか1項に記載の化合物。
(項目93)
前記オリゴヌクレオチドがGGGGの4塩基組を欠いている、項目87~92のいずれか1項に記載の化合物。
(項目94)
前記オリゴヌクレオチドが配列番号3512~3525のいずれでもない、項目74~86のいずれか1項に記載の方法。
(項目95)
前記オリゴヌクレオチドが配列番号3512~3525のいずれでもない、項目71または72に記載の医薬組成物。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
配列番号3526に対して少なくとも90%同一である配列を含む転写産物の少なくとも10個の連続する核酸塩基に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列、または配列番号3526の連続する15から50個の核酸塩基部分を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドを含む、化合物。
(項目2)
配列番号3526に対して少なくとも90%同一である配列を含む転写産物の少なくとも10個の連続する核酸塩基に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列、または配列番号3526の連続する15から50個の核酸塩基部分を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチド。
(項目3)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、項目1に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目2に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目4)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する11、12、13、14、15、16、または17個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2もしくは3に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目5)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~116のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2もしくは3に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目6)
前記オリゴヌクレオチドが、1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドである、項目1もしくは3に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2もしくは3に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目7)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3~6のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~6の
いずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目8)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する11、12、13、14、15、16、または17個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目9)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する11、12、13、14、15、16、または17個の核酸塩基配列を含む、項目1もしくは3~8のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~8のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目10)
配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも10個の連続する核酸塩基配列を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目11)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも10個の連続する核酸塩基配列を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチド。
(項目12)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目10に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目11に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目13)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1071、1195~1224、1338、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、項目10に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目11に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目14)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18,または19個の連続する核酸塩基を含む、項目13に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目13に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目15)
配列番号3526の位置374、661、655~680、765、837、1347、1340~1370、1629、1760、1752、1795、1775、1740~1815、2879、3008、3168、または3110~3171のうちのいずれか1つの10個の核酸塩基の範囲内の等しい長さの部分に対して少なくとも90%相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目16)
配列番号3526の位置374、661、655~680、765、837、1347、1340~1370、1629、1760、1752、1795、1775、1740~1815、2879、3008、3168、または3110~3171のうちの10個の核酸塩基の範囲内の等しい長さの部分に対して少なくとも90%相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチド。
(項目17)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~680、1340~137、1740~1815、または3110~3175のいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さ部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目15に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目16に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目18)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~665、660~670、665~675、または670~680のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目19)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置1340~1350、1345~1355、1350~1360、1355~1365、または1360~1370のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目20)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置1740~1750、1745~1755、1750~1760、1755~1765、1760~1770、1765~1775、1770~1780、1775~1785、1780~1790、1785~1795、1790~1800、1795~1805、1800~1810、または1805~1815のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目21)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置3110~3120、3115~3125、3120~3130、3125~3135、3130~3140、3135~3145、3140~3150、3145~3155、3150~3160、3155~3165、3160~3170、3165~3175、3170~3180のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、項目17に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目17に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目22)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置374、661、765、837、1347、1629、2879、3008、3168、1760、1752、1795、1775、655~680、1340~1370、1740~1815、または3110~3171のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、項目15に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目16に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目23)
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~680、1340~137、1740~1815、または3110~3175のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、項目15に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目16に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目24)
前記オリゴヌクレオチドが12~40個の核酸塩基の長さである、項目1もしくは3~23のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~23のいずれか1項に記載のいずれかのオリゴヌクレオチド。
(項目25)
前記オリゴヌクレオチドが、
a.連結したデオキシリボヌクレオシド、2’-フルオロアラビノ核酸(FANA)、及びフルオロシクロヘキセン核酸(F-CeNA)のうちの1つ以上を含むギャップセグメント、
b.連結したヌクレオシドを含む5’ウィングセグメント、
c.連結したヌクレオシドを含む3’ウィングセグメントを含み、
d.前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に配置された配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも80%の同一性を有する少なくとも8つの連続する核酸塩基の領域を含み、前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントがそれぞれ、少なくとも2つの連結したヌクレオシドを含み、各々のウィングセグメントの少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む、項目1、10、または15のいずれか1項に記載の化合物。
(項目26)
a.連結したデオキシリボヌクレオシド、2’-フルオロアラビノ核酸(FANA)、及びフルオロシクロヘキセン核酸(F-CeNA)のうちの1つ以上を含むギャップセグメント;
b.連結したヌクレオシドを含む5’ウィングセグメント;
c.連結したヌクレオシドを含む3’ウィングセグメントを含み、
d.前記ギャップセグメントが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも80%の同一性を有する少なくとも8つの連続する核酸塩基の領域を含み、前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントがそれぞれ、少なくとも2つの連結したヌクレオシドを含み、各々のウィングセグメントの少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む、項目2、11、または16のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目27)
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも13、14、15、16、17、18、19、または20個の連結したヌクレオシドを含む、項目25に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目28)
前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、2’-アルコキシ結合、アルキルリン酸エステル結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロジチオエート結合、ホスホトリエステル結合、アルキルホスホネート結合、メチルホスホネート結合、ジメチルホスホネート結合、アミノアルキルホスホトリエステル結合、アルキレンホスホネート結合、ホスフィネート結合、ホスホルアミデート結合、ホスホロジアミデート結合、アミノアルキルホスホルアミデート結合、チオホスホルアミデート結合、チオノアルキルホスホネート結合、チオノアルキルホスホトリエステル結合、チオホスフェート結合、セレノホスフェート結合、及びボラノホスフェート結合からなる群から選択される、項目1、もしくは3~27のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~17のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目29)
前記5’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を介して連結され、前記3’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を介して連結され、前記ギャップセグメントのヌクレオシド間結合のうちの少なくとも1つが、修飾ヌクレオシド間結合である、項目25もしくは27に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26もしくは27に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目30)
前記核酸塩基配列の少なくとも2つ、3つ、または4つのヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、項目25もしくは27~29のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~29のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目31)
前記ギャップセグメントのヌクレオシド塩基間の少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、項目25もしくは27~30のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~30のいずれか1項に記載のいずれかのオリゴヌクレオチド。
(項目32)
前記核酸塩基配列の少なくとも2つのヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、項目1、3~25もしくは27~31のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~31のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目33)
前記核酸塩基配列の修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である、項目32に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目32に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目34)
前記核酸塩基配列の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合である、項目32もしくは33に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目32もしくは33に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目35)
前記5’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、修飾ヌクレオシド間結合を介して連結されている、項目25、27~28、もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目36)
前記3’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、修飾ヌクレオシド間結合を介して連結されている、項目25、27~28、もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~34のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目37)
前記5’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記3’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記ギャップセグメントのヌクレオシド間結合のうちの少なくとも1つが、修飾ヌクレオシド間結合である、項目25、27~28、もしくは32~36のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~36のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目38)
前記核酸塩基配列の少なくとも2つ、3つ、または4つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、項目25、27~28、もしくは32~37のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~37のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目39)
前記ギャップセグメントのヌクレオシド塩基間の少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、項目25、27~28、もしくは32~38のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~38のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目40)
前記ホスホロチオエートヌクレオシド間結合がRp配置、SP配置、またはRpとSp配置の任意の組み合わせである、項目25、27~28、もしくは32~39のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目26~28もしくは32~39のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目41)
前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾核酸塩基を含む、項目1、3~25もしくは27~40のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~40のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目42)
前記少なくとも1つの修飾核酸塩基が、5’-メチルシトシン、シュードウリジン、または5-メトキシウリジンである、項目41に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目41に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目43)
前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾糖部分を含む、項目1、3~25もしくは27~42のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~42のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目44)
前記少なくとも1つの修飾糖が二環式糖である、項目43に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目43に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目45)
前記二環式糖が、4’-CH(R)-O-2’ブリッジを含み、式中、Rが独立して、H、C 1 -C 12 アルキル、または保護基である、項目44に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目44に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目46)
Rがメチルである、項目45に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目45に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目47)
RがHである、項目45に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目45に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目48)
前記修飾糖部分が、2’-OMe修飾糖部分、二環式糖部分、2’-O-メトキシエチル(MOE)、2’-デオキシ-2’-フルオロヌクレオシド、2’-フルオロ-β-D-アラビノヌクレオシド、ロックド核酸(LNA)、拘束エチル2’-4’-架橋核酸(cEt)、S-cEt、tcDNA、ヘキシトール核酸(HNA)、及び三環類似体(例えば、tcDNA)のうちの1つである、項目43に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目43に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目49)
前記オリゴヌクレオチドがホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結している1つ以上の2’-O-メトキシエチルヌクレオシドを含む、項目1、3~25、もしくは27~48のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~48のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目50)
前記オリゴヌクレオチドが、5’末端にホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された3つの連続するヌクレオシド塩基を含み、3’末端にホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された3つの連続するヌクレオシド塩基を含む、項目1、3~25、もしくは27~49のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~49のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目51)
前記オリゴヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された5つの連続するヌクレオシド塩基を含む、項目50に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目50に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目52)
前記5つの連続するヌクレオシド塩基のそれぞれが2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、項目50もしくは51に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目50もしくは51に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目53)
前記オリゴヌクレオチドのヌクレオシド塩基のそれぞれが2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目54)
前記ギャップセグメントが1つ以上の2’-O-メトキシエチルヌクレオシドを含む、項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~52のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目55)
前記ギャップセグメントが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、前記5’ウィングセグメントが、ホスホジエステルヌクレオシド結合を介して連結される2つの連続するヌクレオシド塩基を含み、前記3’ウィングセグメントが、ホスホジエステルヌクレオシド結合を介して連結される2つの連続するヌクレオシド塩基を含む、項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目56)
前記ギャップセグメントの5つの連続するヌクレオシド塩基が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記5’ウィングセグメントが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、前記3’ウィングセグメントが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目43~54のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目57)
1つ以上のキラル中心及び/または二重結合を含む、項目1、3~25、もしくは27~56のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~57のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目58)
前記オリゴヌクレオチドが、幾何異性体、エナンチオマー、及びジアステレオマーから選択される立体異性体として存在する、項目57に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目57に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目59)
前記オリゴヌクレオチドが、eeeee-d10-eeeee、d20、eeeee-d12-eeeee、eeeee-d8-eeeee、及びeekk-d8-kkeeeのパターンのうちのいずれかの糖修飾を含み、式中、e=2’-O-メトキシエチルヌクレオシド;d=2’-デオキシヌクレオシド;k=ロックド核酸(LNA)、拘束メトキシエチル(cMOE)ヌクレオシド、拘束エチル(cET)ヌクレオシド、またはペプチド核酸(PNA)である、項目1、3~25、もしくは27のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~27のいずれかのオリゴヌクレオチド。
(項目60)
前記オリゴヌクレオチドが、sssssssssssssssssss、sssssssssssssssssssss、sooosssssssssooss、及びsoosssssssssoossのうちのいずれかのヌクレオシド間結合を含み、式中、s=ホスホロチオエート結合、及びo=ホスホジエステル結合である、項目1、3~25、27、もしくは59のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、26、27、もしくは59のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目61)
前記オリゴヌクレオチドが、それぞれ以下のパターンのうちのいずれかの糖修飾とヌクレオシド間結合の組み合わせを含む、項目1、3~25、27、59、もしくは60のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、26、27、59、もしくは60のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド:
a)d20とsssssssssssssssssss、
b)eeeee-d10-eeeeeとsssssssssssssssssss、
c)eeeee-d12-eeeeeとsssssssssssssssssssss、d)eeeee-d8-eeeeeとsooosssssssssooss、及び
e)eekk-d8-kkeeeとsoosssssssssooss。
(項目62)
前記オリゴヌクレオチドが修飾シトシンを含む、項目1、3~25、27、もしくは59~61のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、26、27、もしくは59~61のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目63)
前記修飾シトシンが5-メチル-dCである、項目62に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目62に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目64)
前記オリゴヌクレオチドが、eeeee-d10-eeeeeとssssssssssssssssssの糖修飾及びヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、前記シトシンが、5-メチル-dCとして修飾されている、項目63に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物または項目63に記載のオリゴヌクレオチド。
(項目65)
前記オリゴヌクレオチドが、それぞれ以下のパターンのうちのいずれかにおける糖修飾とヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、前記オリゴヌクレオチド中のシトシンが未修飾のシトシンである、項目60もしくは61に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目60もしくは61に記載のオリゴヌクレオチド:
a)d20とsssssssssssssssssss、
b)eeeee-d12-eeeeeとsssssssssssssssssssss、c)eeeee-d8-eeeeeとsooosssssssssooss、及び
d)eekk-d8-kkeee及びsoosssssssssooss。
(項目66)
標的核酸配列の標的領域の核酸塩基配列と相補的であり、前記標的核酸の前記標的領域の核酸塩基配列が、少なくとも1つの非標的核酸配列の核酸塩基配列と1~3個の異なる核酸塩基によって異なり、前記非標的核酸が配列番号3526の配列を含む、項目1、3~25、もしくは27~56のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24、もしくは26~65のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドによる、化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目67)
前記1~3個の異なる核酸塩基が一塩基多型(SNP)を含む、項目66に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目68)
前記標的領域に存在するSNPが、配列番号3526の等しい長さの部分と比較されるSNPである、項目67に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目69)
前記一塩基多型が、rs397515403、rs397515402、rs587777264、rs397515404、rs866242631、rs886043455、rs397515407、及びrs397515406からなる群から選択される、項目66に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目70)
前記一塩基多型が、、配列番号3526に示される配列の1112位のCからG、配列番号3526に示される配列の2845位のCからT、及び配列番号3526に示される配列の885位のGからTからなる群から選択される、項目66に記載の化合物またはオリゴヌクレオチド。
(項目71)
先行項目のいずれか1項に記載の化合物またはオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容される担体または賦形剤と、を含む、医薬組成物。
(項目72)
前記医薬組成物が、局所、髄腔内、嚢内、非経口、経口、肺、気管内、鼻腔内、経皮、直腸、頬側、舌下、膣、または十二指腸内投与に適している、項目71に記載の医薬組成物。
(項目73)
先行項目のいずれか1項に記載の化合物またはオリゴヌクレオチドと、脂質ナノ粒子、ポリプレックスナノ粒子、リポプレックスナノ粒子、またはリポソームと、を含む組成物。
(項目74)
KCNT1関連障害を有する対象の細胞におけるKCNT1のレベル及び/または活性を低下させる方法であって、項目1、3~25、もしくは27~70のいずれか1項に記載の化合物、項目2~24、もしくは26~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、または項目71もしくは72に記載の医薬組成物を、細胞におけるKCNT1のレベル及び/または活性を下げるのに十分な量及び期間で細胞と接触させることを含む、前記方法。
(項目75)
前記細胞が中枢神経系の細胞である、項目74に記載の方法。
(項目76)
神経疾患を治療することを、それを必要とする対象において行う方法であって、前記患者へ転写産物の阻害剤を投与することを含み、前記転写産物は、配列番号3526と少なくとも90%の同一性を共有する、前記方法。
(項目77)
前記阻害剤が、項目1、3~25、もしくは27~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、または項目2~24もしくは26~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、または項目71もしくは72に記載の医薬組成物を含む、項目76に記載の方法。
(項目78)
KCNT1関連障害を治療、予防、またはその進行を遅延させることを、それを必要とする対象において行う方法であって、項目1、3~25、もしくは70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含む化合物、項目2~24もしくは26~70のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、または項目71もしくは72に記載の医薬組成物を、KCNT1関連障害を治療、予防、またはその進行を遅延させるのに十分な量及び期間で前記対象に投与することを含む、前記方法。
(項目79)
前記KCNT1関連障害が、移動性焦点発作を伴う乳児期てんかん、常染色体優性夜間前頭葉てんかん、ウエスト症候群、点頭てんかん、てんかん性脳症、部分発作、大田原症候群、発達性てんかん性脳症、及びレノックス・ガストー症候群からなる群から選択される、項目74~78のいずれか1項に記載の方法。
(項目80)
前記対象が、KCNT1に機能獲得型変異を有する、項目74~79のいずれか1項に記載の方法。
(項目81)
前記機能獲得型変異が、V271F、L274I、G288S、F346L、R398Q、R428Q、R474H、F502V、M516V、K629N、I760M、Y796H、E893K、M896I、M896K、P924L、R928C、F932I、A934T、A966T、H257D、R262Q、Q270E、V340M、C377S、P409S、L437F、R474C、A477T、R565H、K629E、G652V、I760F、Q906H、R933G、A934T、R950Q、R961H、R1106Q、K1154Q、R474Q、Y1903C、H469L、M896R、K946E、及びR950Lからなる群から選択される、項目80に記載の方法。
(項目82)
前記機能獲得型変異が、G288S、R398Q、R428Q、R928C、またはA934Tである、項目80または81に記載の方法。
(項目83)
前記方法が、前記KCNT1関連障害の1つ以上の症状を軽減する、項目74~82のいずれか1項に記載の方法。
(項目84)
前記KCNT1関連障害の1つ以上の症状が、長期の発作、頻繁な発作、行動及び発達の遅延、運動及びバランスの問題、整形外科的状態、言語遅延及び発声の問題、成長及び栄養の問題、睡眠困難、慢性感染症、感覚統合障害、自律神経系の乱れ、ならびに発汗からなる群から選択される、項目83に記載の方法。
(項目85)
前記オリゴヌクレオチドまたは医薬組成物が、局所的、非経口的、髄腔内、嚢内、経口、直腸、頬側、舌下、膣内、肺内、気管内、鼻腔内、経皮、または十二指腸内に投与される、項目74~84のいずれか1項に記載の方法。
(項目86)
前記患者がヒトである、項目74~85のいずれか1項に記載の方法。
(項目87)
18~22個の連結したヌクレオシドの長さであって、H.sapiensのKCNT1及びM.musculusのKCNT1転写産物の等しい長さの部分に対して少なくとも85%の配列相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目88)
18~22個の連結したヌクレオシドの長さであって、H.sapiensのKCNT1及びM.fascicularisのKCNT1転写産物の等しい長さの部分に対して少なくとも85%の配列相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
(項目89)
18~22個の連結したヌクレオシドの長さであって、H.sapiensのKCNT1、M.musculusのKCNT1、及び/またはM.fascicularisのKCNT1転写産物の等しい長さの部分に対して少なくとも85%の配列相補性を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む、化合物。
(項目90)
前記オリゴヌクレオチドが、40%~70%のGC含量を含む、項目87~89のいずれか1項に記載の化合物。
(項目91)
前記オリゴヌクレオチドが、H.sapiensのKCNT1転写産物に対して2つ以下のミスマッチを含む、項目87~90のいずれか1項に記載の化合物。
(項目92)
前記オリゴヌクレオチドが、任意の非KCNT1転写産物に対して少なくとも3つのミスマッチを含む、項目87~91のいずれか1項に記載の化合物。
(項目93)
前記オリゴヌクレオチドがGGGGの4塩基組を欠いている、項目87~92のいずれか1項に記載の化合物。
(項目94)
前記オリゴヌクレオチドが配列番号3512~3525のいずれでもない、項目74~86のいずれか1項に記載の方法。
(項目95)
前記オリゴヌクレオチドが配列番号3512~3525のいずれでもない、項目71または72に記載の医薬組成物。
Claims (46)
- オリゴヌクレオチドまたは前記オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526に対して少なくとも90%同一である配列を含む転写産物の少なくとも10個の連続する核酸塩基に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列、または配列番号3526の連続する15から50個の核酸塩基部分を含み、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、請求項1に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1~116のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、請求項2に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、1、4、5、6、8、10、12、13、15、17、28、29、62、625~649、1046、1047、1071、1195~1224、1388、1496~1567、2591~2631、または3395~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、請求項2に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、5、1046、1047、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも90%の同一性を共有する少なくとも連続する10個の核酸塩基配列を含む、請求項4に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号4、1046、1071、1388、1551、1546、または2595のうちのいずれか1つの少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18,または19個の連続する核酸塩基を含む、請求項5に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- オリゴヌクレオチドまたは前記オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置374、655~680、765、837、1340~1370、1629、1740~1815、2879、3008、または3110~3175のうちのいずれか1つの10個の核酸塩基の範囲内の等しい長さの部分に対して少なくとも90%相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、あるいは
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置374、661、765、837、1149、1150、1176、1347、1598、1629、1760、1752、1795、1775、1793、1799、2879、3008、3114、または3168のうちのいずれか1つの10個の核酸塩基の範囲内の等しい長さの部分に対して少なくとも90%相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含み;かつ、前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が修飾ヌクレオシド間結合である、オリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~680、1340~137、1740~1815、または3110~3175のいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さ部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~665、660~670、665~675、または670~680のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置1340~1350、1345~1355、1350~1360、1355~1365、または1360~1370のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置1740~1750、1745~1755、1750~1760、1755~1765、1760~1770、1765~1775、1770~1780、1775~1785、1780~1790、1785~1795、1790~1800、1795~1805、1800~1810、または1805~1815のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置3110~3120、3115~3125、3120~3130、3125~3135、3130~3140、3135~3145、3140~3150、3145~3155、3150~3160、3155~3165、3160~3170、3165~3175、3170~3180のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも10個の連続する核酸塩基を含む、
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置374、661、765、837、1347、1629、2879、3008、3168、1760、1752、1795、1775、655~680、1340~1370、1740~1815、または3110~3171のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、あるいは
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号3526の位置655~680、1340~137、1740~1815、または3110~3175のうちのいずれか1つ内の核酸塩基の等しい長さの部分に相補的である少なくとも11、12、13、14、15、16、17、18、または19個の連続する核酸塩基を含む、
請求項7に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 前記オリゴヌクレオチドが12~40個の核酸塩基の長さである、請求項7または8に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、
a.連結したデオキシリボヌクレオシド、2’-フルオロアラビノ核酸(FANA)、及びフルオロシクロヘキセン核酸(F-CeNA)のうちの1つ以上を含むギャップセグメント、
b.連結したヌクレオシドを含む5’ウィングセグメント、及び
c.連結したヌクレオシドを含む3’ウィングセグメントを含み、
前記ギャップセグメントが、前記5’ウィングセグメントと前記3’ウィングセグメントとの間に配置された配列番号1~3525のうちのいずれか1つの等しい長さの部分と少なくとも80%の同一性を有する少なくとも8つの連続する核酸塩基の領域を含み、前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントがそれぞれ、少なくとも2つの連結したヌクレオシドを含み、各々のウィングセグメントの少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む、請求項1、4、7、または8のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも13、14、15、16、17、18、19、または20個の連結したヌクレオシドを含む、請求項10に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記核酸塩基配列の少なくとも1つのヌクレオシド結合が、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合、2’-アルコキシ結合、アルキルリン酸エステル結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロジチオエート結合、ホスホトリエステル結合、アルキルホスホネート結合、メチルホスホネート結合、ジメチルホスホネート結合、アミノアルキルホスホトリエステル結合、アルキレンホスホネート結合、ホスフィネート結合、ホスホルアミデート結合、ホスホロジアミデート結合、アミノアルキルホスホルアミデート結合、チオホスホルアミデート結合、チオノアルキルホスホネート結合、チオノアルキルホスホトリエステル結合、チオホスフェート結合、セレノホスフェート結合、及びボラノホスフェート結合からなる群から選択される、請求項1~8及び11のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- a)前記5’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を介して連結され、前記3’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を介して連結され、前記ギャップセグメントのヌクレオシド間結合のうちの少なくとも1つが、修飾ヌクレオシド間結合である、または
b)前記5’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記3’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結され、前記ギャップセグメントのヌクレオシド間結合のうちの少なくとも1つが、修飾ヌクレオシド間結合である、
請求項11に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - a)前記核酸塩基配列の少なくとも2つ、3つ、または4つのヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、あるいは
b)前記核酸塩基配列の少なくとも2つ、3つ、または4つのヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、
請求項10に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - a)前記ギャップセグメントのヌクレオシド塩基間の少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、
b)前記ギャップセグメントのヌクレオシド塩基間の少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、かつ/あるいは
c)前記核酸塩基配列の少なくとも2つのヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、
請求項10に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - a)前記核酸塩基配列の修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である、かつ/または
b)前記核酸塩基配列の全てのヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合である、
請求項15に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - a)前記5’ウィングセグメントの少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、修飾ヌクレオシド間結合を介して連結されている、または
b)前記3’ウィングセグメントの前記少なくとも2つの連結したヌクレオシドが、修飾ヌクレオシド間結合を介して連結されている、
請求項10に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 前記ホスホロチオエートヌクレオシド間結合がRp配置、SP配置、またはRpとSp配置の任意の組み合わせである、請求項12に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾核酸塩基、少なくとも1つの修飾糖部分、またはその両方を含む、請求項1~8、11、及び13~18のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記少なくとも1つの修飾核酸塩基が、5’-メチルシトシン、シュードウリジン、または5-メトキシウリジンである、かつ/または前記少なくとも1つの修飾糖が二環式糖である、請求項19に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記二環式糖が、4’-CH(R)-O-2’ブリッジを含み、式中、Rが独立して、H、C1-C12アルキル、または保護基である、請求項20に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- RがHまたはメチルである、請求項21に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記修飾糖部分が、2’-OMe修飾糖部分、二環式糖部分、2’-O-メトキシエチル(MOE)、2’-デオキシ-2’-フルオロヌクレオシド、2’-フルオロ-β-D-アラビノヌクレオシド、ロックド核酸(LNA)、拘束エチル2’-4’-架橋核酸(cEt)、S-cEt、tcDNA、ヘキシトール核酸(HNA)、及び三環類似体のうちの1つである、請求項19に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドがホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結している1つ以上の2’-O-メトキシエチルヌクレオシドを含む、
前記オリゴヌクレオチドが、5’末端にホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された3つの連続するヌクレオシド塩基を含み、3’末端にホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された3つの連続するヌクレオシド塩基を含む、または
前記オリゴヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された5つの連続するヌクレオシド塩基を含み、前記5つの連続するヌクレオシド塩基のそれぞれが2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、
請求項1~8、11、13~18、及び20~23のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 前記オリゴヌクレオチドのヌクレオシド塩基のそれぞれが2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、請求項19に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記ギャップセグメントが1つ以上の2’-O-メトキシエチルヌクレオシドを含む、請求項19に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- a)前記ギャップセグメントが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、前記5’ウィングセグメントが、ホスホジエステルヌクレオシド結合を介して連結される2つの連続するヌクレオシド塩基を含み、前記3’ウィングセグメントが、ホスホジエステルヌクレオシド結合を介して連結される2つの連続するヌクレオシド塩基を含む、または
b)前記ギャップセグメントが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を介して連結された5つの連続するヌクレオシド塩基を含み、前記5’ウィングセグメントが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、前記3’ウィングセグメントが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、
請求項19に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 1つ以上のキラル中心及び/または二重結合を含む、請求項1~8、11、13~18、20~23、及び25~27のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、幾何異性体、エナンチオマー、及びジアステレオマーから選択される立体異性体として存在する、請求項28に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、eeeee-d10-eeeee、d20、eeeee-d12-eeeee、eeeee-d8-eeeee、及びeekk-d8-kkeeeのパターンのうちのいずれかの糖修飾を含み、式中、e=2’-O-メトキシエチルヌクレオシド;d=2’-デオキシヌクレオシド;k=ロックド核酸(LNA)、拘束メトキシエチル(cMOE)ヌクレオシド、拘束エチル(cET)ヌクレオシド、またはペプチド核酸(PNA)である、
前記オリゴヌクレオチドが、sssssssssssssssssss、sssssssssssssssssssss、sooosssssssssooss、及びsoosssssssssoossのうちのいずれかのヌクレオシド間結合を含み、式中、s=ホスホロチオエート結合、及びo=ホスホジエステル結合である、または
前記オリゴヌクレオチドが、それぞれ以下のパターン
a)d20とsssssssssssssssssss、
b)eeeee-d10-eeeeeとsssssssssssssssssss、
c)eeeee-d12-eeeeeとsssssssssssssssssssss、d)eeeee-d8-eeeeeとsooosssssssssooss、及び
e)eekk-d8-kkeeeとsoosssssssssooss
のうちのいずれかの糖修飾とヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、式中、s=ホスホロチオエート結合、o=ホスホジエステル結合、e=2’-O-メトキシエチルヌクレオシド;d=2’-デオキシヌクレオシド;k=ロックド核酸(LNA)である、
請求項1~8及び11のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 前記オリゴヌクレオチドが修飾シトシンを含む、請求項1~8及び11のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記修飾シトシンが5-メチル-dCである、請求項31に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、eeeee-d10-eeeeeとssssssssssssssssssの糖修飾及びヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、前記シトシンが、5-メチル-dCとして修飾されており、式中、s=ホスホロチオエート結合、及びe=2’-O-メトキシエチルヌクレオシドである、請求項32に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記オリゴヌクレオチドが、それぞれ以下のパターンのうちのいずれかにおける糖修飾とヌクレオシド間結合の組み合わせを含み、式中、s=ホスホロチオエート結合、o=ホスホジエステル結合、e=2’-O-メトキシエチルヌクレオシド;d=2’-デオキシヌクレオシド;k=ロックド核酸(LNA)であり、前記オリゴヌクレオチド中のシトシンが未修飾のシトシンである、請求項1~8及び11のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物:
a)d20とsssssssssssssssssss、
b)eeeee-d12-eeeeeとsssssssssssssssssssss、c)eeeee-d8-eeeeeとsooosssssssssooss、
d)eekk-d8-kkeee及びsoosssssssssooss、及び
e)eekk-d8-kkeee及びsoosssssssssooss。 - 前記オリゴヌクレオチドが、標的核酸配列の標的領域の核酸塩基配列と相補的であり、前記標的核酸の前記標的領域の核酸塩基配列が、少なくとも1つの非標的核酸配列の核酸塩基配列と1~3個の異なる核酸塩基によって異なり、前記非標的核酸が配列番号3526の配列を含む、請求項1~8、11、13~18、20~23、25~27、29、32、及び33のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記1~3個の異なる核酸塩基が一塩基多型(SNP)を含む、請求項35に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。
- 前記一塩基多型が、rs397515403、rs397515402、rs587777264、rs397515404、rs866242631、rs886043455、rs397515407、及びrs397515406からなる群から選択される、または
前記一塩基多型が、、配列番号3526に示される配列の1112位のCからG、配列番号3526に示される配列の2845位のCからT、及び配列番号3526に示される配列の885位のGからTからなる群から選択される、
請求項36に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物。 - 請求項1~8、11、13~18、20~23、25~27、29、32、及び35~37のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物と、薬学的に許容される担体または賦形剤と、を含む、医薬組成物。
- 請求項1~8、11、13~18、20~23、25~27、29、32、及び35~37のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドまたは化合物と、脂質ナノ粒子、ポリプレックスナノ粒子、リポプレックスナノ粒子、またはリポソームと、を含む、医薬組成物。
- KCNT1関連障害を有する対象の細胞におけるKCNT1のレベル及び/または活性を低下させることにおいて使用するための請求項38に記載の医薬組成物であって、前記細胞が、請求項38に記載の医薬組成物と、細胞におけるKCNT1のレベル及び/または活性を下げるのに十分な量及び期間で接触される、医薬組成物。
- 前記細胞が中枢神経系の細胞である、請求項40に記載の医薬組成物。
- KCNT1関連障害を治療、予防、またはその進行を遅延させることを、それを必要とする対象において行うことにおいて使用するための、請求項38に記載の医薬組成物。
- 前記KCNT1関連障害が、移動性焦点発作を伴う乳児期てんかん、常染色体優性夜間前頭葉てんかん、ウエスト症候群、点頭てんかん、てんかん性脳症、部分発作、大田原症候群、発達性てんかん性脳症、及びレノックス・ガストー症候群からなる群から選択される、請求項40~42のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 前記対象が、KCNT1に機能獲得型変異を有する、請求項40~42のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- KCNT1の前記機能獲得型変異が、V271F、L274I、G288S、F346L、R398Q、R428Q、R474H、F502V、M516V、K629N、I760M、Y796H、E893K、M896I、M896K、P924L、R928C、F932I、A934T、A966T、H257D、R262Q、Q270E、V340M、C377S、P409S、L437F、R474C、A477T、R565H、K629E、G652V、I760F、Q906H、R933G、A934T、R950Q、R961H、R1106Q、K1154Q、R474Q、Y1903C、H469L、M896R、K946E、及びR950Lからなる群から選択される、請求項44に記載の医薬組成物。
- 前記対象がヒトである、請求項40~42のいずれか1項に記載の医薬組成物。
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