JPH03501383A - オリゴヌクレオチド官能化試薬及び方法 - Google Patents
オリゴヌクレオチド官能化試薬及び方法Info
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
オリゴヌクレオチド官能化試薬及び方法孜歪圀互
本発明は一般にオリゴヌクレオチド官能化試薬に関し、そしてさらに詳しくは合
成オリゴヌクレオチドにスルヒドリル基、アミノ基及びヒドロキシル基を導入す
るための新規な試薬に関する。
非−アイソトープ性標識合成りNA断片は分子生物学において、・・・例えば、
DNAの配列決定の分野、D N Aプローブに基く診断等の分野において広範
な用途を有することが見出されている。本明細書に開示される試薬は、任意の位
置、典型的には5′−末端においてオリゴヌクレオチドに1又は複数のユニーク
な修飾可能なスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル基を導入することにより特
定の基によりオリゴヌクレオチドの標識化を促進する。
幾つかの参考文献が、合成オリゴヌクレオチドの5′−末端にスルヒドリル又は
アミノ基を導入する方法を開示している。例えば、Connolly、 Nuc
、Ac1ds Res、 13(12) : 4485−4502(1985)
及びNuc、Ac1ds Res、 15(7) : 3131−3139(1
987)は、2−メルカプトエタノール、3−メルカプトプロパン−1−オール
及び6−メルカブトヘキサンー1−オールのS−)リチルーO−メトキシーモル
ホリノホスフィン誘導体、すなわち、(式中、Xは2,3又は6である)
で表わされる試薬を用いて合成りNAにスルヒドリル成分を導入する方法を記載
している。
Cou l l ら、Tetrahedron Lett、 27(34) :
3991−3994(1986)は、次の式:
で表わされるN−保護脂肪族アミノホスホアミダイトを官能化試薬として用いて
オリゴヌクレオナトの5′−末端に脂肪族−級アミノ基を導入する反応を記載し
ておりH5proatら、Nuc、Ac1ds Res、 15(15) :
6181−6196(1987)は同様な方法を記載している。Smi th
ら、Nuc、Ac1ds Res、 13(7) : 2399−2411(1
985)もまた、オリゴヌクレオチドと5′−アミノ−5′−デオキシチミジン
の保護されたホスホラミダイト誘導体との直接反応による、5′−脂肪族アミノ
基を含有するオリゴヌクレオチドの合成方法を記載している。5′−末端に一級
アミノ基を導入するだめの他の官能化試薬はアプライド・バイオシステムス社(
Applied Biosystems、 Inc、)により商標「八m1no
linkJのもとで販売されておりそして次の式:で示されるものである。この
試薬は使用前に活性化剤ジメチルアミノピリジンで処理することを必要とし、そ
してさらに鋭敏な悪臭のある試薬であるチオフェノールによる脱保護を必要とす
る。
これらの及び他の従来技術の方法は下記の欠点の1つ又は複数を有する。
(1)オリゴヌクレオチドの5′−末端をスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシ
基に連結する短いスペーサー鎖が誘導体化された構造の不安定性をもらたす・・
・、すなわち、オリゴヌクレオチドへの固体支持体又は嵩ばった標識種の接近が
構造的障害を惹起し、そしてそれ故にプローブに暴く用途における誘導体化され
たオリゴヌクレオチドの使用を妨害する;(2)オリゴヌクレオチドの5′−末
端をスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシ基に連結する疎水性スペーサー鎖が、
DNAプローブに基礎を置く方法において一般に使用される水性溶剤での溶解性
の問題をもたらす;(3)常用されている官能化試薬はしばしば、−iに使用さ
れるDNA合成法と適合せず、その主たる理由は、官能化試薬が試薬及びそれと
−緒に典型的に使用される溶剤と適合しないためである;
(4)常用されている官能化試薬は高収率で合成することがしばしば困難であり
、複雑な多段階反応である;(5) Am1nolinkの場合に前記したよう
に、ある種の既知試薬は使用直前に複数の活性化剤により処理する必要がある;
(6)常用されている官能化試薬は、末端スルヒドリル、アミノ又はヒドロキシ
成分とオリゴヌクレオチド鎖との距離を増加するための複数のスペーサー鎖の「
接ぎ合わせ」を許容しないのみならず、一般にそれらはオリゴヌクレオチド鎖に
そっての複数官能化を許容しない;
(7)常用されている官能化試薬は一般に5′−ヒドロキシル末端以外の位置で
の官能化を許容しない;及び(8)常用されている官能化試薬と時として、激し
い条件下での脱保護を必要とし、この脱保護反応はしばしば容易に検出できない
。
従って、上記の点を考慮したオリゴヌクレオチド官能化剤の必要性が当業界にお
いて存在する。
主里至M玉
従って、本発明の第一の目的は従来技術の上記の欠点を克服するオリゴヌクレオ
チド官能化試薬を提供することである。
特に、本発明の1つの目的はカップリングの後に安定な水溶性の誘導体化された
オリゴヌクレオチドを提供するオリゴヌクレオチド官能化試薬を提供することで
ある。
本発明の他の目的は、オリゴヌクレオチド鎖の5′−末端での多官能化を許容す
る・・・、すなわち、連結された複数のスペーサー鎖の逐次付加を可能にするオ
リゴヌクレオチド官能化試薬を提供することである。
本発明の他の目的は、標準的なりNA合成試薬及びプロトコールと組合わせて使
用することができるオリゴヌクレオチド官能化試薬を提供することである。
本発明の他の目的は、簡単な方法で高収率で合成することができるオリゴヌクレ
オチド官能化試薬を提供することである。
本発明の他の目的は、使用に先立って標準的活性化剤のみによる処理を必要とし
、そしてカップリング反応が分光分析的手段により容易にモニターすることがで
きるような態様でオリゴヌクレオチド鎖にカップリングすることができるオリゴ
ヌクレオチド官能化試薬を提供することである。
本発明の他の目的は、オリゴヌクレオチド鎖に、典型的には5′−末端において
1又は複数のスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシ成分を導入するために前記の
オリゴヌクレオチド官能化試薬を用いてオリゴヌクレオチド鎖を官能化する方法
を提供することである。
本発明の他の目的は、スルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル基を介してオリゴ
ヌクレオチド鎖に結合する検出可能な種によりオリゴヌクレオチド鎖を誘導体化
する方法を提供することである。
本発明の1つの最終目的は前記のオリゴヌクレオチド官能化試薬を合成する方法
を提供することである。
本発明の他の目的、利点及び新規な特徴は部分的には以後の記載において示され
、そして部分的には以後の試験に基いて、又は本発明の実施により当業者に知ら
れるであろう。本発明の目的及び利点は添付された請求の範囲中に特に指摘され
る手段及び組合せにより実現されそして達成されるであろう。
本発明の1つの観点において、構造が実質的に線状であり、一端にオリゴヌクレ
オチド鎖上のヒドロキシル基と反応するホスホラミダイト成分を有し、他端にス
ルヒドリル基、アミノ基又はヒドロキシル基を有し、これら2端が比較的長い親
水性鎖により連結されているオリゴヌクレオチド官能化試薬が提供される。好ま
しい態様において、前記親水性鎖は少なくとも8個の炭素原子をその中に存する
ポリエーテルスペーサーである。好ましい特定の構造は後に記載されよう。
本発明の他の観点において、これらの試薬が、脱保護の後に、少なくとも1個の
スルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル基を導入するためにオリゴヌクレオチド
を官能化するのに使用される。このカップリング反応は、ホスホラミダイトをオ
リゴヌクレオチドの末端端ヒドロキシル基にカップリングするための標準的技法
を用いて行われる。官能化の後、オリゴヌクレオチドは、導入されたスルヒドリ
ン、アミノ又はヒドロキシ成分において検出可能な種により誘導体化され得る。
官能化試薬への種々の新規な合成ルートが後に記載されよう。これらのルートの
それぞれは非常に簡単であり、関与する合成段階の数を最少にし、そして高収率
での生成物の回収を可能にする。
主ユ■失隻q履櫃
1、定義
「官能化J (functionalizing)は、本明細書において使用す
る場合、保護されているか又は保護されていないスルヒドリル成分(−3H)又
はアミノ成分(−NH−α、ここでαは水素又は低級アルキルである)をオリゴ
ヌクレオチド鎖に導入することを意味する。官能化により導入されるスルヒドリ
ル、アミノ又はヒドロキシ基は典型・的には本明細書に記載するようにスペーサ
ー鎖によりオリゴヌクレオチドから離れて配置される。従って、[オリゴヌクレ
オチド官能化試薬jはスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル基をオリゴヌクレ
オチド鎖に導入して「官能化されたオリゴヌクレオチド鎖」を生成する試薬であ
る。
「誘導体化」は、本明細書において使用する場合、官能化されたオリゴヌクレオ
チドが、付加されたスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル成分において、検出
可能な種、すなわちプローブに基礎を置く用途における標識として役立つ種と反
応することを意味する。従って「誘導体化された」オリゴヌクレオチドは、「誘
導体化」種により検出可能なものであ[オリゴヌクレオチド」は本明細書におい
て使用する場合、ヌクレオチド、典型的にはデオキシリボヌクレオチドモノマー
ユニットの一本鎖又は二本鎖、典型的には1本鎖である。
本発明の試薬及び方法は単一ヌクレオチドモノマー又は全長DNAtJfと組み
合わせて使用することができるが、本発明における「オリゴヌクレオチドは典型
的には、約2〜約400モノマーユニツト、そしてさらに典型的には、はとんど
のプローブに基礎を置く用途のために、約2〜約100モノマーユニツトの一本
鎖である。
[プローブに基礎を置く」用途における誘導体化されたオリゴヌクレオチドの使
用は、検体中のオリゴヌクレオチドセグメント又は配列を検出又は定量するため
の標識された鎖の使用を意味することが意図される。
「保護される」スルヒドリル又はアミノ基は、生ずる保護された基が、保護基が
存在する1又は複数の合成段階の間のあらゆる種類の化学反応に対して感受性で
ないように、保護成分と反応する基である。
官能化され又は誘導体化されたオリゴヌクレオチド鎖の「安定」とは、立体的障
害の実質的な不存在、及びほとんどのプローブに基礎を置く用途での化学的安定
性を意味する。
「低級アルキル」又は「低級アルコキシ」は、約1〜6個、より典型的には約1
〜3個の炭素原子を有するアルキル置換基及びアルコキシ置換基をそれぞれ意味
する。
芳香族置換基が示される場合、各個々の芳香族環が1又は複数の炭素原子におい
て機能又は反応性に実質的に影響を与えない成分によに置換されていてもよいと
理解すべきである。
2、 な′ f巧の ゛告
前記のごとく、新規化合物は、一端にホスホラミダイト成分を有し、該成分が親
水性のスペーサーを介して、保護されているか又は保護されていないスルヒドリ
ル、アミノ又はヒドロキシ成分を有する他端に連結されている、実質的に線状の
官能化試薬である。これらの官能化試薬は一般に次の構造式:
Rは保護されているか又は保護されていないアミノ、スルヒドリル又はヒドロキ
シ成分であり;
R”は水素、−cuton 、又は次の式:(式中、XI 、Xz、X:1.X
’、X’ 及びX’ は同一でも又は異っていてもよく、そして水素、低級アル
キル及び低級アルコキシから成る群から選択される)で表わされる置換基であり
;
R1及びR2は独立に水素及び低級アルキル基から成る群から選択され;
R3はβ−シアノエチル又はメチルであり;Q成分は次の式:
%式%
から成る群から選択され、そして同一でも異っていてもよ(;n’、n”及びn
″′は2〜loの範囲(2及び10を含む)、さらに典型的には2〜6の範囲(
2及び6を含む)の整数であり;そして
nは30より大でもよく、しかし典形的には2〜3oの範囲(2及び30を含む
)、そしてさらに典型的には2〜1oの範囲(2及び10を含む)の整数である
〕
により表わされる。
構造式(6):
(式中、R,R”、R’、R”、R3及びnは前記の通りである)は特に好まし
い態様の一例である。親水性スペーサー鎖は、上に示す場合においては、例えば
ポリエチレングリコールから形成されるポリエーテル連結である。〔一般構造式
(4)に含まれる他の態様において、スペーサー鎖はポリエチレングリコール等
、又はテキサコ・ケミカル社(Texaco ChemicalCo、)により
販売されているJeffanineのごときポリ(オキシアルアルキレンアミン
)から形成することもできる。
官能化試薬を任意の位置でオリゴヌクレオチド鎖にカップリングすることが望ま
れる場合、一般に、ヌクレオシドホスホラミダイトを該鎖にカップリングするこ
とができ、R成分は保護されたスルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル成分であ
る。保護基は、スルヒドリル、アミノ又はヒドロキシル成分が、スルホラミダイ
トカップリング段階のあいだに、すなわち試薬のホスホラミダイト基がオリゴヌ
クレオチド鎖上のヒドロキシル成分と反応する間に、無傷であるように選択され
る。この反応のための条件は、例えばBeaucage及びCaruthers
。
Tetrahedron Lett、 22 : 1859−1862(198
1)に記載されているいわゆる「ホスホラミダイト」ルートを介してDNAを合
成する常法において使用されるものである。
官能化試薬がスルヒドリル官能化試薬である場合の特に好ましい保護基の例は、
次のR二
で表わされる。
官能化試薬がアミン官能化試薬である場合の特に好ましい保護基の例は、次のR
:
で表わされる。
上に例示した保護基は単なる例に過ぎず、上記の「保護」の基準に合致する限り
任意のスルヒドリル保護基及びアミノ保護基を用いることができると理解すべき
である。
ヒドロキシ官能化試薬の場合、多数のヒドロキシ保護基が利用可能であり、そし
て当業者によ(知られている。しかしながら、Roはほとんどの態様においてD
MTのごとき酸感受性保護基により保護されたヒドロキシ成分〔構造式(5)を
参照のこと〕であり、Rが保8Wされたヒドロキシ成分である場合、保護基はR
”におけるそれから官能的に区別できること、すなわち酸怒受性のもの以外のも
のであることが好ましい。従って、「R」のための典型的なヒドロキシ保護基は
塩基感受性成分、例えばフルオレニルメチルクロロホルメート(FMOC)のご
ときエステルである。
ホスホラミダイト基:
により定義される官能化試薬の他端は、はとんどの場合に成長しつつある又は完
成したオリゴヌクレオチド鎖の末端5′−ヒドロキシル基である遊離ヒドロキシ
ル成分にカップリングするように選択される。前記のように、R1及びR2は水
素又は低級アルキルであり、そして同一でも異っていてもよく、特に好ましい態
様においてはR1及びR”の両者がイソプロピルである。R3はメチル又はβ−
シアンエチルであり、特に好ましい態様においてはR3はβ−シアノエチルであ
る。
カップリング手段としてのホスホラミダイトの使用はDNA合成の分野において
よく知られており、さらに詳細な記載のためにはBeaucage及びCaru
thers (1981) (前掲)に言及しなければならないであろう。
スペーサー鎖:
は親水性鎖であり、ここでn・n′ ・n”及びn″′は前記0値を有する整数
である。
式(6)で表わされる好ましい態様において、スペーサー鎖は、ポリエーテル成
分:
であり、ここでnは典型的には2〜30、さらに典型的には2〜20であり、し
かしながらある場合、すなわち誘導体化成分とオリゴヌクレオチド鎖との間の増
加した距離が望まれる場合には30より大であることができる。
nの最適値は、スペーサー鎖の長さにそって約8個以上の合計炭素原子を有する
スペーサー鎖を提供する。スペーサー鎖の長さは本発明の試薬の有効性に非常に
関連しており、スルヒドリル、アミノ又はヒドロキシ基とオリゴヌクレオチド鎖
との間の距離が大きくなれば、(1)DNAへの試験のカップリングを促進し、
(2)ハイブリダイゼーション妨害しそして官能化又は誘導体化されたオリゴヌ
クレオチド鎖を不安定化するであろう立体障害を回避し、そして(3)誘導体化
されたスルヒドリル又はアミン成分の運動の自由度を増強するように「溶液jタ
イプの環境を刺激する。スペーサー鎖が親水性であるという事実はまた水性媒体
中での官能化又は誘導体化されたオリゴヌクレオチド鎖の溶解性を増強する。
R“は水素、−CH201(、又は(5)により示される芳香族置換基である。
R1が(5)である場合、これは、クロモゲン陽イオン:
が放出後にモニターできるように選択される。すなわち、DNAへの官能化試薬
のカップリングの後、脱保護が溶液中に陽イオン(5a)をもたらすであろう、
特に好ましい置換基の例はジメトキシトリチル(DMT) 、すなわちR1が−
CHz−0−DMTである。
好ましい態様においては、構造式(6)により示されるように、R′″がホスホ
ラミダイト基に隣接した炭素原子に結合しているが、式(4)に示されるように
、R”がスペーサー鎖にそっての1又は複数の他の炭素原子に結合していてもよ
い。
3、 第1ゴヌクレオチパ′ −た の、 なi工゛戸の一般に、新規な官能化
試薬とヒドロキシ基含有化合物との間のカップリング反応は次のス゛キーム:に
より表わされる。スキームIにおいてXは典型的にはオリゴヌクレオチド鎖であ
る。反応条件は、前に記載されるように、そして特にBeaucage及びCa
ru thers (1981) (前掲)により記載されているような、DN
A合成へのホスホラミダイトルートにおいて使用されるものと同じである。
化合物(14)は次の様にして脱保護される。R”が式(5)で表わされる場合
、非保護ヒドロキシへの転換は酸で処理することにより行われる。「R」におけ
る保護されたアミノ又はヒドロキシ置換基は一般に塩基で処理することにより脱
保護される。例えば、NH,OHによる処理はオリゴヌクレオチド鎖を脱保護す
るのみならず、Rがアミノ又はヒドロキシである場合には該R1換基も同様に脱
保護する。Rが保護されたスルヒドリル成分である場合、脱保護は例えば硝酸塩
によって行うことができる。
オリゴヌクレオチドの多官能化は複数のR′″部位〔R”は式(5)で表わされ
る〕を使用することにより可能である。
酸膜保護の後、脱保護されたヒドロキシル部位での反応によりさらに官能化する
ことができる。すなわち、官能化されたオリゴヌクレオチド(15) :
の場合、例えばR“の脱保護、及び標準的ホスホラミダイトカップリング法を用
いての該脱保護により生じたー〇〇成分におけるさらなる官能化が次の式(16
) :で表わされる化合物をもたらす。
オリゴヌクレオチド鎖にそっての複数のヒドロキシル基における多数官能化もま
た同じ化学的方法を用いて可能である。
4、i反に1見企威
本発明者らは新規試薬への種々のルートを開発した。簡単のため、官能化試薬の
合成を一般構造式(4)によってではなく例示構造式(6)により検討しよう、
しかしながら、記載される合成方法は一般に、(4)により表わされる化合物に
実質的に同様に通用されることが理解されるべきである。
合成されるべき官能化試薬がアミン官能化試薬である第一の態様において、スキ
ーム■は次の通りである。
ス土二左工
HO−CH!−(H,(0−(H,−(H2)、0−CH!−CH,−oH”段
階(1)は、当業界においてよく知られているMi tsunobu反応を示す
。要約すれば、この反応は化合物(17)、 (18)。
(19)及び(20)の混合物を用い、極性有機溶剤中で少なくとも数時間、好
ましくは一夜行われる(実施例1を参照のこと)。
化合物(21)が単離され、そして次のようにしてホスホラミダイト(ここで、
Xはハロゲン、好ましくは塩素である)にカップリングされる0モル過剰のホス
ホラミダイトが化合物(21)に、適当な溶剤、やはり好ましくは極性有機溶剤
中で、不活性雰囲気下で添加される。化合物(22)は、例えばカラムクロマト
グラフィーにより単離される。
アミン官能化試薬を合成するための他の方法であって、スルヒドリル官能化試薬
を得るためにも使用できるものは次のスキーム■により表わされる。
スキーム■において、段階1a−1c及びla’−1b’は中間体(25)への
代替できるルートを示す。段階1a−10において、保護されたジオール(25
)は、ポリエチレングリコールとアリルブロマイドとの反応(この反応は室温に
おいて、少なくとも約数時間、好ましくは一夜行われる)による(23)の生成
;常用の既知の条件下での(23)と四酸化オスミウムとの反応によるジオール
(24)の生成;及び2゜2−ジメトキシプロパンとの反応による該ジオールの
保護、により生成される0段階1al 1 b Iはトシル化グリコールとツル
ケタール陰イオンとの反応を介して(25)をもたらす0段階2はスキーム■に
示したMitsunobu反応を示し、ここでRは前に定義した通りであり、他
方段階3の酸処理はジオールを脱保護する0段階4−1はクロモゲン成分(14
)〔ここでR′″は(5)により表わされる(そしてR′″が水素である場合に
は略すことができる〕を導入し、そして段階4−2はホスホラミデー) (12
)を導入する0両段階4−1及び4−2におけるrXuはハロゲン脱離基、好ま
しくは塩素である。
スルヒドリル官能試薬の製造のために特異的な第三の合成法はスキーム■により
示される。
スキーム■
HO−OH宜−CH!(O−CH,−CH占Q−CH,−CHt−OHスキーム
■において、段階1番1低温、好ましくは0°C以下において行われ、そしてト
リフェニルホスフィン、ジイソプロピルアゾジカルボキシレート及びs−トリチ
ルメルカプタンを一夜反応せしめる。ホスホラミデートが段階(2)において添
加され、そして(29)が高収率で得られる。ここで、構造式(4)のI’ R
Jは−5−Cφ、(常にφ−フェニル)として示されるが、実際に任意の保護さ
れたスルヒドリル成分であることができる。
5、−ベル れた による悸。
新規な試薬を用いて製造される官能化されたオリゴヌクレオチド鎖はプローブを
基礎とする用途において主として有用である。すなわち、オリゴヌクレオチドに
スルヒドリル、ア部位において、標識された種による誘導体化を可能にすること
である。はとんど共通のタイプの標識された種は、蛍光物質(fluoroph
ore) 、発色物質(chroo+ophore) 、放射性同位元素及び酵
素である。
例えば、官能化されたオリゴヌクレオチド鎖と西洋ワサビパーオキシダーゼ(H
RP )との共有結合接合体である誘導体化されたオリゴヌクレオチドを製造す
ることができ、この接合体は次の構造式(28) :
(式中、R* 、 Q 、 n 、 n I 、 n ′を及びn″′は構造式
(4)について前に定義した通りであり、そしてXはオリゴヌクレオチド鎖であ
る)
により表わされる。
オリゴヌクレオチド鎖の長さは典型的には2〜100モノマーユニツトの範囲で
ある。接合体が対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド(^SO)として使用され
る場合、鎖中のモノマーユニットの数は好ましくは約13〜21である。
1つの具体例において、この様な接合体は次の構造式(29) :(式中、R”
、X及びnは前記の通りである)により表わされる0式(29)の接合体はオリ
ゴマーXへのスルヒドリル官能化試薬(4)のカップリングにより生ずる。
式(28)により示される共有結合接合体(28)はスキーム■により例示され
る方法により製造される。
スキーム■(続き)
(2日)
mal −5ac−HNSA%すなわち4−ヒドロキシ−3−二トロベンゼンス
ルホン酸ナトリウム塩(HNSA)のN−マレイミド−6−アミノカプロイル(
Illal−sac)誘導体、及び対応するmal −5ac−HNSA HR
P複合体(30)は実施例6及び7に後記する。
チオール化オリゴヌクレオチド(31)は前記のようにして製造される。典型的
には、トリチルチオオリゴヌクレオチドをスキーム■の反応において使用する直
前に試薬(19)に誘導体化する。
mal sac FIRP複合体(30)を単純な混合により、好ましくは室温
以下でチオール化オリゴヌクレオチド(31)にカップリングさせる。反応混合
物を室温において、例えば約0℃において、少なくとも一夜、そして好ましくは
少なくとも数日間保持し、この時点で共有結合HRP接合体(28)を単離し、
そして好ましくはクロマトグラフィーにより精製する。
プローブに基礎を置く用途において使用する前に、接合体を、約5.5〜約7.
5、好ましくは約6.0のpHに維持されたリン酸緩衝液(場合によっては酸を
添加する)に、約−10°C〜約30°C(但し溶液が凍結しないようにする)
、最適には約4°Cの温度にて保持する。
ハイブリダイゼーションにおいて使用するため、接合体溶液は通常、ハイブリダ
イゼーション緩衝液により稀釈され(最終濃度は用途に依存する)、そして標準
的ハイブリダイゼーション技法(例えば、Maniatisら、Mo1ecul
ar C1onin 。
ニューヨーク、Co1d Spring Harbor Laboratory
+ 1982)に従って使用される。一般的方法は当業界においてよく知られて
おり、そして典型的には、(1)注目の分析対象のヌクレオチド配列に対して実
質的に相補的な、すなわちハイブリダイゼーションを可能にするために十分なだ
け相補的な共存結合接合体を用意し; (2)溶液中で注目の分析対象を共有結
合接合体と接触せしめ;そして(3)生成する核酸複合体の存在を、HRP活性
を測定することにより検出する、ことを含む。
一般に、共有結合複合体は固体支持体に結合した分析対象にハイブリダイズし、
そして次にその上で検出される。
本発明をその好ましい特定の態様と関連させて記載したが、前記の記載及び実施
例は例示的なものであり、本発明の範囲を限定するものではないと理解される。
他の観点、利点、及び本発明の範囲での変更は当業者に明らかであろう。
実施■玉
(a)テトラエチレングリコールとフタリミドとの反応〔スキーム■、段階(1
)を参照のこと〕
テトラエチレングリコール(38,85g 、 200mmole)及びトリフ
ェニルホスフィン(52,46g 、 ”200mmole)を200mK!の
乾燥THFに?理解し、そしてフタリミド(29,43g 、 200mmol
e)を加えた。loomj!の乾燥THF中ジエチルアゾジカルボキシレー ト
(DEAD)の溶液を、凍却及び撹拌しながら反応混合物に滴加した。反応混合
物を室温にて一夜撹拌した。次に、溶剤を減圧下で除去し、そして残渣を25M
の水と250dのジエチルエーテルとの間で分配した。水性層を2007のジエ
チルエーテルにより5回洗浄し、そして真空乾燥した。残渣を、トルエンの共沸
蒸留(3X100ml)により乾燥した。次に、得られた25.89 g 5i
Ozカラム上で溶離剤として酢酸エチルを用いて精製した。生成物画分を集め、
そしてシロップ状(11,75g ; 36.3mmole ; 18.2%)
に濃縮し、これを−夜結晶化させた。
(a)において得られた生成物の構造は、’)l−NMRにより、であると石育
認された。
(b)アリル誘導体の合成〔スキーム■、段階(1b)を参照のこと〕
100dの乾燥THF中段階(a)で得られたアルコール(4,67g 、 1
4.4mmole)のン容液にNa)I(520mg、 21.67mmole
)を加えた。この混合物を1時間撹拌し、そして次にアリルブロマイド(1,9
mi!、 2.61 g 、 21.67nonole)を加えた。この懸濁液
を一夜撹拌し、この時点で濾過し、そして溶剤を減圧下で除去した。残渣をSi
0gカラム上で溶離剤として酢酸エチルとヘキサンとの混合物(70: 30)
を用いて精製した。目的の生成物を含有する画分をプールし、そして2.84
g (7,82mmole。
54.3%)のシロップ状に濃縮した。元素分析は次の通りであった。
計算値: C62,80; H6,93;N 3.85測定値: C62,49
;H6,99;N 3.82゜得られた生成物の提案される構造は、
(c)対応するジオールの合成〔スキーム■、段階(1b)を参照のこと〕
180dのDMF/水(8:1)中段階(b)で得られたアリルエーテル(2,
84g 、 7.82mmol )及びN−メチルモルホリンN−オキサイド(
1,83g、 15.63mmole)の溶液に四酸化オスミウム(t−ブタノ
ール中25■/−の溶液8.13戚;800μmole)を加えた。生ずるコハ
ク色の溶液を室温にて撹拌した。48時間後、水(10mf)中ナトリウムハイ
ドロサルファイド(2,13g)の溶液を反応混合物に加えた。形成される黒色
沈澱及び懸濁液を1時間撹拌した。この混合物を濾過し、そして減圧下で濃縮し
た。残渣をSi0gカラム上で溶離剤として塩化メチレンとメタノールとの混合
物を用いて精製した。元素分析は次の通りであった。
生成物の提案される構造は、
(d)DMTによる標識
前記(C)において得られたジオール(1g 、 2.25mmole)を無水
ピリジン(2x15d)と共蒸発せしめた0次に、乾燥残渣を25mの無水ピリ
ジンに溶解した。この溶液にDMT−Cffi(0,92g、 2.75mmo
le)を加えた。反応を室温にて行い、そして生成物の出現までT L C(C
HsCf : MeOH約97:3)によりモニターした。
1時間後、10m1のメタノールを添加し、そして反応混合物をさらに10分間
撹拌した。次に、10m1の氷水により反応を停止せしめ、そして酢酸エチル(
2X75d)で抽出した。
有機層を5%NaHCOs (50ml)で1回、及び飽和NaCl溶液で2回
洗浄し、そしてNa25O,で乾燥した。生成物を減圧下で油状残渣になるまで
蒸発させた。
残渣を上記の溶剤系を用いてクロマトグラフ処理した。最終生成物をさらに精製
することな(段階ce>において使用した。収率:理論量の86.3%(実際量
1.51 g /理論量1.75g)。
この段階で得られた提案される構造は、(e)ホスホラミダイトの製造
段階(d)において得られた生成物(1,0g + 1.4auaole)を1
0m1の酸不含有クロロホルムに溶解し、そして乾燥アルゴンによりレフレッシ
ュされた250IIrl丸底フラスコに入れた。
この溶液に、0.72 g (5,6++uaole)の((CH3)g Cl
) z N−Etを加えた。次に、ホスホラミダイト:
0.66 g (2,8mmole)を注射器を用いて2分間にわたって加えた
。反応を室温にてそしてアルゴンのもとで行った。1時間後、混合物を50m1
の酢酸エチルと共に250mj!の分液漏斗に移し、そして飽和NaCl溶液に
より4回抽出した。有機層をNa、SO。
で乾燥し、そして真空下で油状残渣まで蒸発せしめた。この残渣を酢酸エチル中
1%Et3Nによりクロマトグラフ処理した。収率:理論量の48.4%(実際
量0.61 g /理論11.26g)。
1施班久
実施例1に記載したのと実質的に同じ方法に従ったが、しかしこの場合テトラエ
チレングリコール出発物質を最初にフタリミドと反応させなかった。
(a)ペンタエチレングリコールのアリル誘R体の合成100mff1の乾燥’
r HF中ペンタエチレングリコール(5,65g 。
20a+mole)の溶液にL−ブタノールのカリウム塩(2,24g、 20
mmole)を添加した。この混合物を30分間撹拌し、そして18−クラウン
−6(53■、 0.2+++a+ole)を添加した。混合物をさらに30分
間撹拌し、そして次にアリルブロマイド(2,42g、 1.73m1.2Qm
mole)を加えた。臭化カリウムと考えられる白色沈澱が認められ、そして撹
拌を一夜続けた。反応混合物をワットマンGFBフィルターを通して濾過し、8
gの5i02に吸着せしめ、そして溶剤として塩化メチレンとアセトンとの混合
物(1;1)を用いて5iO1カラム上で分画した。プールされた画分が4.2
8 g (13,28mn+ole、 66.4%)の生成物をもたらした。
元素分析は次の通りであった。
計算値: C55,8B、 H9,83測定値: C55,56; H9,76
゜生成物の提案される構造は、
8゜2ハしイー(Δヘッo/(〃−リスへンであった。
(b)対応するジオールの合成
アセトンと水との混合物(8: 1)270d中段階(a)において調製したア
リルエーテル(4,28g 、 13.28mmole)の溶液にN−メチルモ
ルホリン(3,11g 、 4.6 rnfl、 26.55mmole、 2
当量)及びこれに続いて四酸化オスミウム(L−ブタノール中25■/d ;
33B■; 13.5mi!; 1.33mmole(0,1当量)を加えた。
この反応混合物を一夜撹拌した0次の朝、15dの水中ナトリウムハイドロサル
ファイド(3,62g )の溶液を加えた。
45分間の撹拌の後、懸濁液をワットマンGFBフィルターを通して濾過した。
溶剤を蒸発せしめ、残渣をメタノール中に入れ、そして懸濁液を濾過した。濾液
をコハク色のシロップ状に濃縮し、このシロップを次にSiO□上で溶離剤とし
て塩化メチレン、メタノール及び酢酸の混合物(80:20:5)を用いて精製
した。生成物を含有する両分を濃縮して3.3 g (9,26a++++ol
e 、収率69.7%)の生成物を得た。
この生成物の提案される構造は、
(c)段階(b)において調製したトリオール(3,3g。
9.26+am+ole)を60jd!のアセトンに入れ、そして硫酸第二銅(
45g 、 28.20mmole)を加えた。生ずる青味がかった懸濁液に6
0−〇HtSO,を添加し、この時点で溶液が黄色に変った。フラスコに栓をし
、そして−週末にわたって撹拌した0次に、懸濁液をワットマンGFBフィルタ
ーを通して濾過し、そして濾液を2.58のCa (OH) z中で1時間処理
した。懸濁液を再び濾過し、そして濾液を濃縮しそしてSi0gカラム上で精製
した。
カラムにクロロホルム/メタール(97: 3 ”)を通し、そして次に再びク
ロロホルム/メタノール(8:1)を用いた。カラム画分をプールし、3.03
g (7,64+uaole、 82.5%)の生成物生成物の提案される構造
は、
1旅1
の合成を次の様にして行った。
(a)へキサエチレングリコール(10,0g、 35.40wamole)を
無水ピリジン(3X25aN)と共に共蒸発せしめ、そして次に100m1!の
それに溶解した。この溶液にDMT−CI! (13,17g 。
38.94mm+ole)を加えた。反応を室温にて行い、そして生成物が出現
するまでT L C(CHCl s : MeOH約8:1)によりモニターし
た。2時間後、25dのメタノールを添加し、そして反応混合物をさらに15分
間撹拌した0次に、この反応を50jdの氷水により停止せしめ、そして酢酸エ
チル(3X150m1りにより抽出した。有機層を5%NaHCOz (2X
100m )及び飽和NaC1,(2X looml)により洗浄し、Na25
O,により乾燥し、そして次に油状残渣(黄味がかった色)にまで蒸発せしめた
。
この油状残渣をシリカゲルカラム(400g )上でクロマトグラフ処理した。
カラムをまずClIC(13/ MeOH(約97:3)により、次にCHCl
3 / MeOH(約90 : 10)により溶出した。両分を一緒にし、そ
して蒸発乾燥して油状残渣を得た。得られた物質は次の構造:
を有するものと予想され、そしてさらに精製することなく、対応するホスホラミ
ダイトの合成において使用した。
(b ) 2.0 g (3,40mmole)の(a)において得た化合物、
1、6 g (6,80mmole)のホスホラミダイト:及び1.76 g
(13,60mmole)の((Clh)z Cl) N Elを用いて実施例
1(e)の方法を反復した。生成物の元素分析は、C4□1161N201゜P
xHzOについて予想した通りであった。
計算値: C63,49; H7,93; N 3.52測定値: C63,3
6、II7.95 ; N 4.11゜収率:理論量の85.4%(2,28g
/2.67 g )。
某JL[汁L
(a)化合物:
〔化合物(26) 、スキーム■、ステップ(1)を参照のこと]の合成を次の
様にして行った。75m!の乾燥THFHFジトリフェニルホスフィン、87
g 、 30monole)のO″Cの溶液に撹拌しながらアゾジカルボキシレ
ート(NCOOCH(Ct(:+))z (6,07g 、 30mmole)
を加えた。1時間後、10 mflの乾燥THFHF中子トラエチレングリコー
ル、83 g 、 30mmole)の溶液を加えた。溶解したすべての物質が
淡黄色溶液を与えた。1時間の後、20dの乾燥THF中メルカプタンφ、C−
SHの溶液を、冷去及び撹拌しながら滴加した。反応混合物を一夜撹拌し、そし
て溶剤を減圧下に除去した。残渣をSiO□カラムに適用し、そし°ζ塩化メチ
レン及びこれに続き塩化メチレンとC)1.cNとの混合物(2:1)を用いて
分画した。物質をSin、上で溶離剤としてCH,CNを用いて再クロマトグラ
フィー処理し、そして生成物をφP=0から、小(約15d)画分を取ることに
より取り出した。
両分をプールし、5.22 g (11,53mmole、 38.4%全体収
率、理論量の77%)を得た。元素分析の結果は次の通りであった。
計算値: C71,65; H7,12; S 7.08測定値: C71,3
2; H7,21; S 7.15゜(b)次に、対応するホスホラミダイト:
の合成を、実施例1 (e)に記載した方法に従って、段階(a)の反応生成物
(4,22g 、 9.30mmole)、ホスホラミダイト :
(4,40g、 18.6(lImmole) 、及び((CH3)2CH)
zN−Et (4,81g 。
37.20+rmo1e)を用いて行った。収率:理論量の75.3%(4,5
7g /6.07 g )。
実JJ江乳
(a)化合物:
の合成を次の様にして行った。15dの乾燥THFHFジトリフェニルホスフィ
ン、87 g 、 30mmole)の0°Cの溶液に、撹拌しながらジイソプ
ロピルアゾジカルボキシレート(NCOOCH(CH3))2(6,07g 、
30mmole)を加えた。1時間後、10dの乾燥THFHF中子トラエチ
レングリコール、83 g 、 30mmole)の溶液を加えた。溶解したす
べての物質が淡黄色溶液を与えた。1時間後、20dの乾燥T l−I F中メ
ルカプタンφ、C−511の溶液を、冷却及び撹拌しながら滴加した。反応混合
物を一夜撹拌し、そして溶剤を減圧下で除去した。残渣をSiO□カラムに適用
し、そして塩化メチレン及びそれに続き塩化メチレンとCH3CNとの混合物(
271)を用いて分画した。物質を5iOt上で溶離剤としてCH3CNを用い
て再クロマトグラフ処理し、そして生成物をφ3P=0から、小(約15mjり
画分を取ることにより取り出した。画分をプールし、5.22g (11,53
mmole ;全体収率38.4%;理論量の77%)を得た。元素分析は次の
通りであった。
計算値: C71,65: H7,12; S 7.08測定値: C71,3
2; H7,21; S 115゜(b)ホスホラミダイト:
段階(a)で得られた生成物(4,22g 、 9.30mmole)を10戚
の酸不含有クロロホルムに溶解し、そしてアルゴンによりレフレッシュされた2
50m1丸底フラスコに入れた。この溶液に0.72 g (5,6mmole
)の((CH3) zCH) 2NEtを加えた。次に、ホスホラミダイト:
(0,66g 、 2.8mmole)を注射器を用いて2分間にわたり加えた
。室温にてアルゴンのもとて反応を行った。1時間後、混合物を50dの酢酸エ
チルと共に250Jdの分液漏斗に移し、そして飽和NaCl溶液により4回抽
出した。有機層をNazSOnで乾燥し、そして真空下で油状残渣にまで蒸発せ
しめた。この残渣を酢酸エチル中1%EtJによりクロマトグラフ処理した。
i n+al−sac−HNSAエスールの11゛告1モル当量(2,24g
)の4−ヒドロキシ−3−二トロベンゼンスルホン酸ナトリウム塩(II N
S A )を1モル当量(2,06g )のジシクロヘキシルカルボジイミド
のN−マレイミド−6−アミノカプロン酸と25affiのジメチルホルムアミ
ド中で室温にて混合した.ジシクロヘキシル尿素の白色沈澱が生成した.この沈
澱を濾去し、そして母液に300dのジエチルエーテルを加えた。約10分間〜
4時間後、母液からゴム状の固体が沈澱した。この固体は58%の活性HNSA
エステル及び42%の遊1@HNSAを含有していることが見出された。
少量の沈澱を10mMリン酸緩衝液(pH7.0)に溶解し、そして406nn
+での吸光を測定することにより分析を行った.この読みが未反応の遊離HNS
Aの量を与え、これが粗HNSAエステル中の挾雑物質である。非常に少量の濃
強塩基(5 N NaOII)の添加がこのエステルを加水分解した.第二の続
みを取った。
第二の読みから第一の読みを差引いた差がもとの物質中のエステルの量を与えた
.生成目的のため、前記固体をDMFに溶解し、LH20セファデックスカラム
上に置き、そしてDMFで溶出することによりエステルを挟雑遊離HNSAから
分離した。
精製の進行を、溶出溶剤としてクロロホルム、アセトン及び酢酸(6:3:1=
v:v:v)を用いる薄層クロマトグラフィーによりモニターした.生成物は、
アミンと反応するその活性によりmal −sac HNSAとしてポジティブ
に同定された。
生成した粗エステルの量は理論量の約30%であると算定され、生成された物質
は99%のエステルから成っていた。
こうして得られたエステルは水に十分に溶解することが見出され、そして親核物
質が添加されなければ数時間にわたり水中で安定であることが見出された.精製
されたエステルは乾燥状態で貯蔵されれば長期間安定であることが見出された。
M mal−sacHNsAエスールと ′ サビパーオキシ゛−ゼ()!RP
との 八 の″
mal −sac HNSAエステルとHRSとのアミドを次の様にして製造し
た。
合計40mg ( 1. 0 μo+ole)のHRP (シグマ・ケミカル社
)を0. 5 Jlll!の0. 1 Mリン酸緩衝液(pH7.0)に溶解し
、全アミン濃度を3. 7 XIO−’Mとした.次に、実施例6Aのデーター
から計算して51ng ( 1. I X 10−’mole)の実施例5Aの
mal −sac HNSAエステルを0. 5 dのHRP溶液に溶解した.
この混合物を室温にて撹拌し、そしてHRP画分(2.8m)をファルマシアG
ー25カラム上に集め溶剤として0. 1 Mリン酸緩衝液(pH6.0)を使
用した。
n HRP−オiゴヌクレオチド 八 の1′告バイオサーチ8630 DNA
シンセサイザーで合成した次の19−mar : d(TGTTTGCCTGT
TCTCAGAC)を用いてチオール−官能化オリゴマーを調製した。
実施例1(b)で得られたスルヒドリル官能化試薬をオリゴマーの溶液と混合し
、そして標準的ホスホラミダイトカップリング条件〔例えば、Beaucage
及びCaruthers(1981) 、前掲〕下でそれにカップリングさせた
。
トリチルチオ・オリゴマーを、分取用PRPーカラム、及び次の溶剤系〔ここで
、溶剤「A」はCHsCNであり、そしてr13Jは0. 1 M TEAA(
pH 7. 2 )中5%CH3CNである):(1)A:10%→40%、1
5分間;(2)A:40%→100%、15分間;及び(3)A:100%、5
分間、を用いて精製した.トリチルチオ・オリゴマーは約20分後に溶出した。
こうして得られた精製トリチルチオ・オリゴマーを、硝酸銀及びジチオスレイト
ール(0. 1 M TEAA(pH6. 5 )中それぞれ0. 1 M及び
0.15M)を用いて脱トリチル化した。次に、ジトリチル化オリゴマーをG
− 25 (NAP−10)カラムに通し、真空濃縮して約100i11とし、
そして次の接合反応においてすぐに使用した。
実施例7において調製したmal −sac HRP複合体(700m)をチオ
オリゴマーに分配して最終容量800Iとした。個々の反応容器を室温にて約1
時間、そして次に約4℃にて約2日間保持し、そしてこの時点で4種類の接合体
を取り出し、そしてDEAE Nucleogenカラム上で次の溶剤勾配(「
B」は20s+MNatPOa (pH6 ) ; ’CJは20mM Nat
PO4+ I M NaCI2 (pH6 )を意味する): (1)B:O→
100%、30分間;(2)C:100%、10分間;及び(3)C:100%
→0%、5分間、を用いて精製した。残りの未接合HRP及びオリゴマーはそれ
ぞれ約2分間後及び約15〜40分間後(オリゴマーのサイズに依存する)に溶
出し、他方接合体は同様に約15〜40分間後(やはりオリゴマーのサイズに依
存する)に溶出した.生成物の同一性は、オリゴマー(260nm )及びHR
Pのヘム基(402nm)のピーク吸光をモニターして紫外線分光法により確認
した。
手続補正書く方式)
平成3年 1月 10日
Claims (20)
- 1.次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ (式中、 Rは保護されているか又は保護されていないアミノ、スルヒドリル又はヒドロキ シル成分であり;R*は水素、−CH2OH、又は次の式:▲数式、化学式、表 等があります▼ (式中、X1,X2,X3,X4,X5及びX6は同一でも異っていてもよく、 そして水素、低級アルキル及び低級アルコキシから成る群から選択される) により表わされる置換基であり; R1及びR2は独立に水素及び低級アルキルから成る群から選択され; R3はβ−シアノエチル又はメチルであり;Q成分は次の基: −O−,−NH−,−S−,▲数式、化学式、表等があります▼,▲数式、化学 式、表等があります▼及び▲数式、化学式、表等があります▼から成る群から選 択され、そして同一でも異っていてもよく;n′,n′′及びn′′′は2と1 0(2及び10を含む)の範囲の整数であり;そして nは2と30(2及び30を含む)の範囲の整数である〕を有するオリゴヌクレ オチド官能化試薬。
- 2.Rが−OH,−SH、又は−NH−αであり、ここでαが水素又は低級アル キルである、請求項1に記載の試薬。
- 3.Rが保護されたアミノ成分である請求項1に記載の試薬。
- 4.Rが次の基: ▲数式、化学式、表等があります▼及び▲数式、化学式、表等があります▼から 成る群から選択されたものである請求項3に記載の試薬。
- 5.Rが保護されたスルヒドリル成分である請求項1に記載の試薬。
- 6.Rが次の基: ▲数式、化学式、表等があります▼▲数式、化学式、表等があります▼及び▲数 式、化学式、表等があります▼から成る群から選択されたものである請求項5に 記載の試薬。
- 7.R*が−O−DMTである請求項1に記載の試薬。
- 8.R1及びR2が低級アルキルである請求項1に記載の試薬。
- 9.R1及びR2がイソプロピルである請求項8に記載の試薬。
- 10.R3がβ−シアノエチルである請求項1に記載の試薬。
- 11.次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼
- 12.アミン成分を導するためにオリゴヌクレオチド鎖のヒドロキシル基を官能 化する方法であって、請求項3の官能化試薬をカップリング条件下で遊離ヒドロ キシル基を有するオリゴヌクレオチド鎖と反応せしめ、該オリゴヌクレオチド鎖 が保護されたアミン成分を有するようにする段階を含んで成る方法。
- 13.複数のヒドロキシル基を官能化する請求項12に記載の方法。
- 14.末端5′−ヒドロキシル基を官能化する請求項12に記載の方法。
- 15.スルヒドリル成分を導入するためにオリゴヌクレオチド鎖のヒドロキシル 基を官能化する方法であって、請求項5に記載の官能化試薬を遊離ヒドロキシル 基を有するオリゴヌクレオチド鎖と反応せしめ、該オリゴヌクレオチド鎖が保護 されたスルヒドリル成分を有するようにする段階を含んで成る方法。
- 16.複数のヒドロキシル基を官能化する請求項15に記載の方法。
- 17.末端5′−ヒドロキシル基を官能化する請求項15に記載の方法。
- 18.次の構造式: ▲数式、化学式、表等があります▼ 〔式中、 Rは保護されているか又は保護されていないアミノ、スルヒドリル又はヒドロキ シル成分であり;R■は水素、−CH2OH、又は次の式:▲数式、化学式、表 等があります▼ (式中、X1,X2,X3,X4,X5及びX6は同一でも異っていてもよく、 そして水素、低級アルキル、及び低級アルコキシから成る群から選択される) により表わされる置換基であり; R1及びR2は独立に水素及び低級アルキルから成る群から選択され; R3はメチル又はβ−シアノエチルであり;そしてnは2と10(2及び10を 含む)の範囲の整数である〕により表わされるオリゴヌクレオチド官能化剤の合 成方法であって、 式HO−CH2−CH2−(O−CH2−CH2)n−CH2−CH2−OHの ジオールを式R−Hの化合物とカップリングさせることにより式R−CH2−C H2−(O−CH2−CH2)n−CH2−CH2−OHのアルコールを生成せ しめ;そして こうして得られたアルコールを、次の構造式:▲数式、化学式、表等があります ▼ (式中、Xはハロゲン脱離基である) で表わされるホスホラミダイトと、ホスホラミダイトカップリング条件下で反応 せしめる; 段階を含んで成る方法。
- 19.次の式: ▲数式、化学式、表等があります▼ 〔式中、 Rは保護されているか又は保護されていないアミノ、スルヒドリル又はヒドロキ シル成分であり;R*は水素、−CH2OH、又は次の式:▲数式、化学式、表 等があります▼ (式中、X1,X2,X3,X4,X5及びX6は同一であっても異っていても よく、そして水素、低級アルキル及び低級アルコキシから成る群から選択される ) により表わされる置換基であり; R1及びR2は独立に水素及び低級アルキルから成る群から選択され; R3はメチル又はβ−シアノエチルであり;そしてnは2と10(2及び10を 含む)の範囲の整数である〕により表わされるオリゴヌクレオチド官能化試薬の 合成方法であって、 トシル化ポリエチレングリコールをソルケタール陰イオンにカップリングさせて 次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ を有するケタールを生成せしめ; こうして得られたケタールをトリフェニルホスフィンの存在下で式R−Hの化合 物と反応せしめることにより該ケタールの末端ヒドロキシル基を−Rで置き換え ;該R−置換ケタールを脱保護して、次の構造式:▲数式、化学式、表等があり ます▼ により表わされるジオールを生成せしめ;該R*−置換ジオールを次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ を有するホスホラミダイトに、ホスホラミダイトカップリング条件下でカップリ ングせしめる; 段階を含んで成る方法。
- 20.次の構造式: ▲数式、化学式、表等があります▼ (式中、R1及びR2は独立に水素及び低級アルキルから成る群から選択され; そして R3はメチル又はβ−シアノエチルである)で表わされるオリゴヌクレオチド官 能化試薬の合成方法であって、 次の構造式: ▲数式、化学式、表等があります▼ で表わされるジオールを、トリフェニルホスフィン及び▲数式、化学式、表等が あります▼ の存在下でφ3C−SHにカップリングさせて、置換されたアルコール: ▲数式、化学式、表等があります▼ を生成せしめ;そして こうして得られた置換されたアルコールを次の構造式:▲数式、化学式、表等が あります▼ (式中、Xはハロゲン脱離基である) で表わされるホスホラミダイトと、ホスホラミダイトカップリング条件下で反応 せしめる; ことを含んで成る方法。
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