JPH04131084A - 熱安定性シトシンデアミナーゼ - Google Patents

熱安定性シトシンデアミナーゼ

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JPH04131084A
JPH04131084A JP2153799A JP15379990A JPH04131084A JP H04131084 A JPH04131084 A JP H04131084A JP 2153799 A JP2153799 A JP 2153799A JP 15379990 A JP15379990 A JP 15379990A JP H04131084 A JPH04131084 A JP H04131084A
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cdase
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thermostable
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Peter Chong-Dug Su
ピーター チョン―ダグ スー
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ハンス マークワート
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マーサ エス.ヘイデン
Peter Linsley
ピーター リンズレー
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    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 (産業上の利用分野) 本発明は、一般的に酵素シトシンデアミナーゼに関する
。さらに特定すれば9本発明は、 5acchanシ1
竪cerevisiaeに由来する熱安定性シトシンデ
アミナーゼの精製および組換え産生に関する。
(従来の技術) シトシンデアミナーゼ(CDアーゼ、 EC3,5,4
,1)−’は2次の反応により、シトシンからウラシル
への加水分解を触媒する。
微生物のピリミジン代謝で重要な役割をはだすこの酵素
は(0’ DonovanおよびNeuhard、 1
970)+ いくつかの異なった微生物から単離された
。しかし。
哺乳類細胞には存在しないようである(NiNhiya
w+aら、 1985)。
様々な微生物由来のCDアーゼの物性は1分子量。
安定性、およびサブユニット組成の点で大きく異なるこ
とが示されてきた。例えば、 SaJmonellaシ
11!■エリ−由来のCDアーゼが、 5DS−PAG
Eにより均一になるように精製されたところ、それぞれ
が54キロダルトン(kDa)の4つのサブユニットか
ら構成されていた01estら、 1982) 、一方
、 Escheri仕」 い旦由来の該酵素は、 20
0kDaの分子量を有し、 35kDaおよび46kD
aのサブユニットから構成される(Ka tsurag
iら、 1986) 。これらの酵素の両方とも非常に
熱安定であり、55℃において高い活性を維持している
パンf1m<s犯匹加■μリシ埼 cerevisia
e)もまた。
CDアーゼの供給源として使用されてきた。以前にパン
酵母から得られたCDアーゼは、ゲル濾過により決定さ
れたところ分子量34kDaを有しており (Ipat
a ら、 197L 1978)、 5O3−PAGE
およびアミノ酸分析により決定されたところ32〜33
kDaを有していた(Yergatianら、 197
7) 、それゆえ、以前にパン酵母から単離されたCD
アーゼ酵素は、単一のタンパクであるようである。
以前に単離されたパン酵母CDアーゼの溶液は。
4°C,pH5〜90間で保存された場合、少なくとも
48時間活性を維持した(lpataら、 1971.
1978)。
しかし、37°Cでは、パン酵母CDアーゼの粗試料は
1時間でその活性の半分が消失することが示され(Kr
eamおよびChargaff、 1952)、  該
酵素の精製された形態では、30分の半減期を有してい
た(Katsuragi、 1988) 、 37°C
における半減期は、該酵素をエポキシ−アクリルビーズ
上に固定することにより28日まで増大され得る(Ka
tsuragiら、 1987)。
このように、パン酵母由来のCDアーゼの熱安定性は、
それが低分子量であることとともに、上記細菌の酵素と
は異なっている。
CDアーゼは、治療用としてプロドラッグ5−フルオロ
シトシン(5−PC)を制ガン剤5−フルオロウラシル
(5−FC)に変換するために使用されてきた(Kat
suragiら+ 1987; NiN15hiya 
ら、 1985; 5akai  ら。
1985; 5enterら、 19B?) 、  し
かし、 CDアーゼの細菌の供給源は、充分な活性を得
るために大量の培養を必要とし、そのような使用のため
には実質的ではない(Sakaiら、 1985)。加
えて、微生物の抽出物は、その受容体に望ましくない副
作用をひきおこし得る。
これらの問題を克服するために、酵母がCDアーゼの供
給源として使用され得る。しかし、以前の酵母由来の生
成物の熱不安定性のため、酵素をその使用前に固定化す
ることが必要であるCKatsuragjら、 198
7)。したがって、熱安定性の酵母CDアーゼの単離・
精製により、制ガン治療に使用される改善された酵素が
提供される。同様に、酵母からの熱安定性CDアーゼの
遺伝子をクローニングすることにより、遺伝子自身に限
定された変性あるいは付加、遺伝子の発現を制御する配
列、および遺伝子と他の分子との間で作製される遺伝子
融合を導入することができる。そのような新しい構築物
は、制ガン治療における該酵素の効率または有用性を増
大させる。
(発明の要旨) 本発明は、パン酵母由来の熱安定性CDアーゼの予期せ
ぬ発見に基づく。この酵素のアミノ酸配列分析によれば
、公知の他のタンパクの配列と有意な相同性が見られな
い。
本発明は、熱安定性CDアーゼまたはそれと機能上等価
なタンパクをコードする。単離されたヌクレオチド配列
を提供し、そして、この配列を含有し、そして該配列の
発現において効果的である組換え発現ベクター、それに
より形質転換された宿主細胞、および組換えにより熱安
定性CDアーゼまたはその機能的等個物を産生ずる方法
を提供する。
上記産生方法は、上記形質転換された宿主細胞を増殖さ
せることを包含する。
好ましい実施態様では、上記ヌクレオチドは。
第1O図に示される配列と実質的に同一である。
好ましい実施態様では、上記組換え発現ベクターは、前
記ヌクレオチド配列が、宿主細胞と適合性の制御配列と
作動可能に連結している。
本発明は、単離された。熱安定性CDアーゼ、またはそ
れと機能的に等価なタンパクをも提供する。
好ましい実施態様では、上記CDアーゼは、第6図また
は第10図に示されるアミノ酸配列、またはそれと実質
的に相同でありかつ機能的に等価なアミノ酸配列を包含
する。
本発明の好ましい実施態様では、 CDアーゼは酵母か
ら単離される。特に好ましい実施態様では。
単離される。
本発明の別の局面、利益および用途は、当業者がこの開
示を見れば、容品に明らがとなるであろう。
(以下余白) (発明の構成) 本発明を実施する場合、特にことわりがないがぎり、タ
ンパク化学1分子生物学、微生物学および組換えDNA
技術の通常の技術が用いられ得る。
これらの技術は、当業者の範囲内である。このような技
術は2文献で充分説明されている〔例えば。
5copes、R,に、+Protein Purif
ication Pr1nciplesand Pra
ctice+第2版、 Springer−Verla
g、 1987年;Methods in Enzym
ology、S、ColowickおよびN。
Kaplan編集、^cademic  Pr@ss、
Inc、;Maniatis、Fr1tschおよびS
ambrook、Mo1ecular Cloning
:A Laboratory ManuaL第2版、 
1989年;O1igonucleotideSynt
hesis+ MJ、Ga1tW集、 1984年参照
〕。
A、定1 本発明を説明する際に2次の用語が用いられ得るが、こ
こで使用された場合、以下に示されるように定義される
ことを意図している。
r熱に安定なシトシンデアミナーゼ」は、遊離した非固
定化状態で、37℃で12時間より長く、好ましくは3
7°Cで1日以上より長く、最も好ましくは37°Cで
8日より長く、少なくとも50%の活性を有するCDア
ーゼをいう (この活性は、以下で充分に説明されるア
ッセイにより、単離された上記酵素の存在下で5FCか
ら5PUへの交換をモニターすることにより決定される
)。
アミノ酸配列またはタンパクは、アミノ酸の少なくとも
約50%、好ましくは少なくとも約85%。
および最も好ましくは少なくとも約90〜95%が。
その分子の所定の長さにわたって一致する場合。
他のアミノ酸配列またはタンパクと「実質的に相同」で
ある。さらに、そのアミノ酸の変異は、置換、欠失また
は付加を包含し得る。
「機能上等価な」という用語は、そのようなアミノ酸配
列またはタンパクが5−FCを5−FUに変換し得る(
実施例で述べられる)上記熱に安定な酵素を産生じ得る
鎖であることを明確にすることを意図する。熱に安定な
CDアーゼと機能上等価なタンパクが1本発明の図面に
示されるアミノ酸配列と正確に−・致した配列またはそ
の全体の配列を持つ必要はない、むしろ、そのタンパク
は、アミノ酸配列の生物学的活性のある断片で構成され
得る(その活性は上で定義された)。さらに、生物学的
に活性を有するかぎり、このタンパクは9図示される配
列に対する付加、欠失または置換を包含し得る。
「精製されたタンパク」は、他の物質を実質的に含有し
ていないタンパクである。例えば、タンパクAは、Bが
他の細胞成分およびタンパクの混合物であり、存在する
A+Bの合計の少なくとも約50重量%、より好ましく
は少なくとも75重量%。
および最も好ましくは90〜95重量%、または、さら
に99重量%がAの場合、Bを実質的に含有していない
。しかし「精製された」という用語は、精製されたタン
パクが誘導される方法には関係しない。したがって、精
製されたタンパクは1組換え技術により製造されたタン
パク、合成により製造され生物から直接単離されたタン
パクであり得る。
「ポリペプチド」および「タンパク」という用語は、最
も広い意味で用いられる。すなわち、「ペプチド」およ
び「タンパク」は、ペプチド結合によって連結されたあ
らゆるアミノ酸のポリマー(ジペプチドまたはこれより
大きいペプチド)である。従って、この用語には、オリ
ゴペプチド。
タンパク断片、類似体、ミューティン(変異タンパク)
、融合タンパクなどが包含される。この用語には、天然
および組換えタンパクが包含される。
「組換え」タンパクまたはポリペプチドは9組換えヌク
レオチド配列から発現されるタンパク。
すなわち、所望のポリペプチドをコードする外因性DN
Aの構築物により形質転換された細胞から産性されるタ
ンパクをいう。
C[1アーゼをコードするヌクレオチド配列を特徴づけ
るためにここで用いられる「組換え」という用語は、ゲ
ノム、 cDNA+半合成または合成起源の核酸配列の
以下のようなものをいう;すなわち。
その核酸配列は、起源または操作によって、天然には生
じないヌクレオチド配列、または、それが天然に連結さ
れている核酸配列以外の核酸配列に連結されたヌクレオ
チド配列である。
「レプリコン」は、細胞内で、ポリヌクレオチド複製の
自律単位として挙動する。すなわち、それ自身の制御下
で複製し得る9あらゆる遺伝要素(例えば、プラスミド
、染色体、ウィルス)である。
「ベクター」は、他のポリヌクレオチドのセグメントが
結合されて、結合されたセグメントの複製および/また
は発現を起こすレプリコンである。
「発現ベクター」は、自律性の複製または組込みを行い
得るベクターをいい、適切な宿主内で所望のヌクレオチ
ド配列の転写と翻訳を行う制御配列を持っている。
「コード配列」は、ポリペプチドに転写および/または
翻訳されるポリヌクレオチド配列である。
「プロモーター配列」は、 RNAポリメラーゼを結合
させて、下流の(すなわち3′方向の)コード配列の転
写を開始させることができるDNA iji!f5領域
である。
コード配列の転写がRNAポリメラーゼのプロモーター
配列への結合によって起こる場合、コード配列は、細胞
内でプロモーター配列の「制御下jにある。次いで、得
られた1lRNAの翻訳によって。
コード配列内にコードされたポリペプチドが性成する。
「作動可能に連結された」という用語は、その構成要素
が、その通常の機能を発揮するような配置に並置されて
いることをいう。したがって、コド配列に作動可能に連
結された制御配列は、コード配列を発現することができ
る。
「制御配列」は、コード配列の転写および/または翻訳
を制御する配列をいう;この配列には。
限定されないが、プロモーター配列、転写の開始および
終止の配列、および翻訳の開始および終止の配列が包含
され得る。さらに「制御配列」は。
コード配列内にコードされたポリペプチドのプロセッシ
ングを制御する配列をいう。これらの配列には、限定さ
れないが9分泌、プロテアーゼの切断、およびポリペプ
チドのグリコジル化を制御する配列が包含される。
「シグナル配列」は、コード配列の前部に位置して得る
。この配列はシグナルペプチド、すなわち、ポリペプチ
ドに対するN末端をコードし、このシグナルペプチドは
宿主細胞と連絡し、ポリペプチドを細胞表面に向けるか
、またはポリペプチドを培地中に分泌させる。このシグ
ナルタンパクは、タンパクが細胞から離れる前に宿主細
胞により切離される。シグナル配列は、原核生物および
真核生物に天然に存在する各種のタンパクと結合したも
のが見つけられ得る。例えば2 α因子、すなわち、天
然酵母のタンパクは酵母から分泌され。
そのシグナル配列は、培地中に分泌される非相同のタン
パクに連結され得る(米国特許第4,546,082号
参照)。さらに、α因子とその類僚体は、サツカロミセ
ス(Saccharomyces)およびタルイベロミ
セス(Kluyverosyces)のような各種の酵
母から非相同タンパクを分泌させることが見出されてい
る[例えば、ヨーロッパ特許出願公開箱0.301,6
69号(公開日1989年2月1日)参照]。
「形質転換」は、外因性のポリヌクレオチドを宿主細胞
に挿入することである。この外因性ポリヌクレオチドは
、プラスミドとして維持され得るか、または宿主ゲノム
内に組込まれ得る。
「組換え宿主細胞」、「宿主細胞」、「細胞jなどの微
生物を表す用語は、交換可能な同意語として用いられ1
組換えベクターまたは転移されるDNAの受容体として
用いられ得る。または用いられてきた細胞をいい、トラ
ンスフェクトされたもとの細胞の後代が含まれる。単一
の親細胞の後代は、偶然または計画的な変異のために9
元の親と。
ゲノムまたは全DNA補体が、必ずしも完全に同一でな
くてもよいことが理解される。したがって。
この用語は、関連する性質(例えば、所望の遺伝子産物
をコードする構造遺伝子に連結されたクローン化遺伝子
による。必須酵素をコードする天然遺伝子の置換)によ
って特徴づけられる親に充分類似した親細胞の後代を意
味する。
CDアーゼの「治療に有効な量」は、 CDアーゼが作
用する基質とともに投与された時に、基質を。
腫瘍細胞の成長を阻害し得る活性のある細胞毒性薬剤に
変換するのに充分な量である。
B、二股敗星亙汰 本発明は、熱安定性を示す、酵母から単離されたCDア
ーゼに向けられる。このCDアーゼは、以前に酵母から
単離されたCDアーゼ酵素とは異なる特性を有している
。新規に単動された酵母CDアーゼは、ゲル濾過クロマ
トグラフィーで決定したところ、約32kDaである。
5O5−PAGEでは、 17kDaの位置に主要バン
ドを示し、このことは2本発明のCDアーゼは二量体で
構成され、各サブユニットは約17kDaの分子量を有
することを示している。さらに、以前に単離された酵母
CDアーゼ酵素は、37℃では著しい不耐熱性を示した
が1本発明の精製された酵素は、この温度で安定である
。さらに、この新しいCDアーゼのアミノ酸配列は、配
列が決定された他の公知のタンパクと、有意な配列相同
性を全く示さない、この独特のCDアーゼをコードする
遺伝子のクローニングと発現によって、約474塩基対
の長さのコード配列が得られ、予想分子量が約17,5
06ダルトンの158アミノ酸のタンパクを指定する。
熱に安定なCDアーゼは、有子嚢胞子酵母、有担子胞子
酵母および不完全酵母のメンバーを含む酵母から単離さ
れ得る。CDアーゼは、好ましくは、サツカロミセトイ
デエ(Saccharomycetoideae)のメ
ンバーから単離され、サツカロミセス(Sacchar
os+yces)の種が好ましく、特にサツカロミセス
セレビシェ(Saccharow+yces 5ere
visiae) (パン酵母)が好ましい。フライシュ
マン圧搾酵母(Fleishmann’s Compr
essed Yeast)が熱に安定なCDアーゼの優
れた起源であることがわかったが。
これはパン類製造業者と食料品店から容易に入手できる
本発明のCDアーゼ精製法は、すでに報告されている方
法(例えば、 Katsuragi ら、 1987年
;ifatsuragi  ら、 1986年5Ipa
taら、 1978年;Ipataら。
1971年の各文献参照)およびKatsuragi 
(19B8年)の方法とは異なる方法である。具体的に
述べると。
この方法は、異なる精製工程を用いており、アニオン交
換クロマトグラフィーと疎水性クロマトグラフィーとの
工程の間にゲル浸透カラムによる精製法を追加(以下に
述べる)するとともに、異なる精製条件(異なる緩衝液
、 pH,およびEDTAやDTTのような緩衝液の成
分を包含する)を用いていることを含む。その上、以前
の方法では熱に安定な酵素は得られない。
(以下余白) 酵母から熱に安定なCDアーゼを精製する第1工程は、
 CDアーゼを含有する自己分解物にするために酵母細
胞を破裂させることを包含する。自己分解は、公知のい
くつかの方法のどれを用いても行うことができる。例え
ば、酵母細胞は、クニンツの方法(1947年)に従っ
て、トルエンで原形質を分離され得る。特に有用なのは
、酵母を酢酸エチルのような有機溶媒に暴露し2次いで
緩衝液を添加して、溶液のpHを約7に維持することで
ある。
適切な緩衝液には、リン酸カリウム緩衝液、リン酸緩衝
食塩水、トリス緩衝液、および当該分野で公知のその他
いくつかの緩衝液が包含される。緩衝液は、 CDアー
ゼを安定化させるために、1〜25%の範囲にある。好
ましくは15%の濃度の硫酸アンモニムをEDTAおよ
びDTT  (ジチオトレイトール)とともに含有する
ことが好ましい。あるいは。
EDTAおよびDTTは、この緩衝液および後で使用さ
れる緩衝液から除くことができる。EDTAを用いる場
合、その濃度は、 Q、1mM〜1101IIの範囲に
あり。
5mMが好ましく、またDTTは、 O,01111M
〜10mMの濃度で、好ましくは0.1wMで用いられ
得る。この混合物は敞日間撹拌され、 pHは約7に維
持される。
細胞の破片は遠心分離により除去され得る。
自己分解に続いて、硫酸アンモニウムを用いて。
自己分解物から全タンパクを沈澱させる。硫酸アンモニ
ウムは、タンパクに対するCDアーゼのより高い比を得
るのに充分な濃度で添加される。例えば、硫酸アンモニ
ウムは、最初60〜80%の飽和度。
好ましくは70%の飽和度に達するように添加される。
 EDTAは1反応混合物中に、好ましくは1〜3g/
lの濃度、より好ましくは1.5〜2.0g/lで含有
され9反応は数時間実施され、遠心分離した後、沈澱が
回収される。ベレットを、適切な緩衝液(例えば、 p
itが約7のPBS 、緩衝液は、上記のようにEDT
AおよびDTTを含有することが好ましい)に溶解させ
9次いで、溶液を同じ緩衝液に対して透析する。透析物
は、硫酸アンモニウムを加え約50%の濃度にして、2
回目の処理が行われ得る。この場合も上記のようにED
T^を含有させる。
沈澱は遠心分離により再び回収され、上清液に硫酸アン
モニウムを添加して、約73%飽和度にする。沈澱は回
収され、 pHが約5.6〜8.5の適切な緩衝液に溶
解される。この緩衝液としては、 DTTを上記の濃度
で含有するpH8,0のトリス緩衝液が好ましい。再構
成させた沈澱は1次にこの緩衝液に対して数時間透析さ
れる。透析物から得られたCDアーゼば、さらに1例え
ば、架橋アガロースまたはセルロースバッキング材を用
いるアニオン交換クロマトグラフィーにより精製される
。ファーマシア社から入手可能なQセファロースおよび
DEAEセファロースのようなアニオン交換体が特に適
切である。適切な平衡化緩衝液には2例えば、トリス緩
衝液またはリン酸緩衝液が包含され、溶離は。
線形勾配を用いて行われる。0.1s+MのDTTを含
有するpH8,0の20mMトリス緩衝液を、同緩衝液
にO〜0.3MのKCIを含有させた線形勾配とともに
用いるのが特に適切である。
アニオン交換クロマトグラフィーに続いて、 CDアー
ゼ活性(以下に述べられるようにしてアッセイされる)
を有する画分がプールされ1次いで。
例えば約30.000ダルトン(Da)以下の分子量カ
ントオフを行うフィルターを用いる限外濾過法によりS
縮される。
次に、得られたCDアーゼ含有溶液は、ゲル浸透カラム
に通される。特に有用なのは、架橋されたデキストラン
、アガロース、またはデキストラン/ビスアクリルアミ
ドのゲルがあり、セファデックスG−75,G−100
またはセファクリルS−100が好ましい。溶離液は、
 pHが約7の当該分野で公知の通常の緩衝液でよ(、
先に述べたDTTを含有するPBSが好ましい。CDア
ーゼ活性を有する画分はプールされ、リン酸カリウムの
ような緩衝液に対して透析される。この緩衝液は、自己
分解物用緩衝液について先の述べたように、約1〜2?
Iの硫酸アンモニウムとEDTAとDTTとを含有する
ことが好ましい。所望するのであれは、2回目のゲル浸
透カラムを這され得2次いで、活性画分は2例えば。
5000Daの分子量カントオフを行うフィルターを用
いる限外濾過法で濃縮され得る。
得られたCDアーゼ含有物質は1次に、疎水性に基づい
て物質を分離するカラムに適用され9例えば、リン酸カ
リウム緩衝液に硫酸アンモニウムを含有させた逆勾配を
用いて溶離される。CDアーゼ活性を有する画分を合わ
せ、 50000aの分子量カットオフのフィルターを
用いる限外濾過法で濃縮する。:a縮物は、その後の使
用のために凍結して保存され得る。しかし、2回目のゲ
ル浸透カラム処理が行われない場合、および/またはC
Dアーゼの比活性が低い場合は、上で述べた他のゲル浸
透カラムが使用され得る。このようにして精製されたC
Dアーゼは、熱に安定であり、それゆえ、自由な形に凍
結または凍結乾燥して保存され得る。
CDアーゼの活性は、精製中に、当該分野で公知のいく
つかの方法によりモニターされ得る。例えば、 CDア
ーゼ存在下でのシトシンからウラシルまたはその誘導体
への変換は、この変換に伴う2860mにおける吸光度
の低下から、直接分光光度ア・ンセイによってモニター
され得る(例えば、 IpataおよびCercign
ani、 1978年の文献参照)。あるいは、 Ni
N15hiyaら(1985年)により記載された5F
Cから5FUへの変換を分光光度測定法でモニターする
ことによって、活性が測定され得る。なお。
この文献は本発明に援用される。
上記の方法で精製された熱に安定なCDアーゼは。
本発明の試験のセクションで述べられたように配列が決
定され、その部分的なアミノ酸配列が第6図に示され得
た。その配列は、配列が決定された他の公知のタンパク
とは、実質的な相同性を全く示さない。この情報に基づ
いて、熱に安定なCDアーゼは組換え技術で製造され得
る。例えば、 CDアーゼをコードするDNA配列は、
得られたアミノ酸配列に基づいて、適切なコドンを用い
て合成により製造され得る。一般に、 CDアーゼの発
現に用いられる宿主に対して好ましいコドンが選択され
得る。完全配列は、標準法で製造されたオリゴヌクレオ
チドをオーバーラツプして組み立てられる(例えば+ 
Edge、 Nature、292巻、756頁、 1
981年;Nambajr ら、 5cience、2
23巻、 1299頁、 1984年;Jayら、  
J、Biol、CheIll、259巻、 6311頁
、 1984年参照)。
あるいは1組換えの熱に安定なCDアーゼは、以下の方
法により製造され得る。決定されたアミノ酸配列の一部
分に対するコドンを含有するオリゴヌクレオチドプロー
ブが製造され得、 CDアーゼをコードする遺伝子のゲ
ノムまたはcDNAのライブラリーをスクリーニングす
るために使用される。オリゴヌクレオチドツブローフ゛
およびDNパライフ゛ラリ−の製造、および核酸ハイブ
リダイゼーションによるそれらのスクリーニングの基本
的な方法は。
当業者には公知である(例えば、 Oligonucl
eotideSynthesis、  上記文献; T
、Maniatisら、上記文献参照)。陽性のハイブ
リダイゼーションによってスクリーニングされたライブ
ラリー由来のクローンが同定されたならば、制限酵素分
析およびDNA配列決定が行われ得、特定のライブラリ
ーの挿入断片が、 CDアーゼをコードする遺伝子を含
有することを確認する。さらに、ポリメラーゼ連鎖反応
(PCR)が増幅のために用いられ得9次いで、 CD
アーゼをコードするヌクレオチド配列を検出する。
この方法は、 5aiki ら、  1986年の文献
、および米国特許第4.683,1.95号および第4
,683,202号に記載されており、その開示事項は
本発明に援用されるものである。PCRで増幅された産
物のヌクレオチド配列の分析は、 5aiki ら(1
988年)の文献に記載された直接配列分析法により行
われ得る。
あるいは、増幅された標的配列は、配列分析の前にクロ
ーン化され得る。酵素によって増幅されたゲノムセグメ
ントの直接のクローン化および直接配列分析の方法は、
 5charfら(1986年)の文献に記載されてい
る。この方法では、 PCR技術に用いられるプライマ
ーは、その5°末端の近くが修飾され1例えば、H13
配列決定ベクター中で直接クローン化するために好都合
な制限部位を生成される。
増幅後、 PCR産物は適切な制限酵素によって切断さ
れる。その制限断片はM13ベクターに連結され。
例えば、 J?1103宿主に形質転換され、プレート
され3次いで得られたプラークは、標識されたオリゴヌ
クレオチドのプローブを用いてハイブリダイゼーション
によりスクリーニングされる。クローン化および配列分
析のその他の方法は、当該分野では公知である。
本発明で用いられる特に好ましい方法では、2つのオリ
ゴヌクレオチドのプライマーを1部分的なアミノ酸配列
とDNA配列の[ゲスマーJ  (guessllle
r)配列を設計する際のガイドとしてニス・セレフシエ
(S、 cerevisiae)由来のコドン使用パタ
ーン(GuthrieおよびAbelson (198
2年)の文献)とを用いて合成した。これらのプライマ
ーを、クローン化された酵母ゲノムライブラリーIIN
Aが鋳型として存在するPCHに用いた。アミノ酸が、
著しいコドン使用のかたよりを示すCDアーゼの領域お
よび/または縮重をほとんど示さないCDアーゼの領域
から、オリゴヌクレオチドを合成した。第1プライマー
のCDA4R1は、アミノ末端のアミノ酸配列に対応す
る33のヌクレオチドを含有する42号体であった。一
方、第2プライマーのCDA4R1は。
そのタンパクのカルボキシ末端の近くに位置する配列に
相補的なヌクレオチドを含有していた。これらのオリゴ
ヌクレオチドの配列を第7図に示す。
2つゲノムライブラリーをPCR反応における鋳型DN
Aとして用い1両者が、長さが約350塩基対の単一の
特異的断片を生成することがわかった(大きさは、入手
可能な対応するアミノ酸配列がら予測した)。PCRブ
ライマーをその5”末端のEcoRI制限部位で設計し
、 PCRで生成する断片のクローン化を容易にした。
350塩基対のPCR由来の断片をゲル電気泳動法で精
製し、適切なベクターでサブクローン化してI)NAの
配列を決定した。
(以下余白) PCR由来の断片もまた。コロニーフィルターハイブリ
ダイゼーション法によって酵母ライブラリーをスクリー
ニングするだめのCDアーゼ特異的プローブとして用い
た。ゲスマーオリゴヌクレオチドをプローブとして用い
る最初の試みは、ハイブリダイゼーション後のシグナル
/ノイズ比が低いために失敗した。可能性があるすべて
のクローンを取り圧し、2回再度スクリーニングを行い
、正のハイブリダイゼーションシグナルを確認した。
プラスミドを個々のクローンから精製し、一連の制限酵
素を個々に用いて、そして、複数個を用いて消化を行う
ことにより、制限地図を作成した。
クローン化されたPCR断片と、 CDアーセをコード
するゲノムクローンとの両方のDNA配列分析を行った
。反応条件を変えることによって2ブライマーに直接隣
接する配列から数百塩基対離れた配列までの分析が可能
であった。得られたDNA配列を第8図に示す。図から
明らかなように、この配列は93%相同で23個がミス
マツチであり、330個がマツチしていた。この配列内
に見出されたORPを第9図に示す。第10図は、 0
RF2のヌクレオチド配列および推定アミノ酸配列を示
す。このことにより先に決定されたアミノ酸配列が確認
され、そして、精製タンパクの分析により得られる部分
配列のいずれの端部にも、僅かに少数のアミノ酸が付加
していることが予想される。
このDNA配列のデータは次に、 CDアーゼをコード
する。増幅されたDNAカセットを生成させるための新
しいP[Rブライマーを設計するのに、用いられる。こ
のようなカセットは、真核もしくは原核細胞中に高レベ
ルの遺伝子発現を行い、かつ。
癌抗原を標的にした免疫グロブリン分子を含む(これに
は限定されない)生物学的に重要な他の分子とロDアー
ゼ間の遺伝子融合を起こすよう設計された遺伝子構築物
に用いることができる。
CDアーゼをコードする配列は、当該技術分野で公知の
適切ないずれのベクターもしくはレプリコンにもクロー
ン化することができる。クローン化用組換え体DA’A
ベクター、およびこれらが形質転換し得る宿主細胞(大
括弧内に示す)の例とじては次のようなものがある:λ
バクテリオファージ〔イヘ・コリ (E、  coli
)  ”J 、  pBR322Cイー・]リコ。
pAcYc177 Cイー −コリコ、 pKT230
 Cグラム陰性菌コ。
pGV1106  [グー)ム陰性菌] 、 pLAF
Rl 〔グア’AII性菌〕、 pME290 Cイー
・コリ以外のグラム陰性菌〕。
pH〜114〔イー・コリ;バシラス・サチリス(Ba
sillussubtilis) :] 、 pBD9
 Cバシラス〕、 plJ61  Cストレプトミセス
) 、 pUc6 CストレプトミセスE 、  YI
p5〔サツカロミセス) 、 YCp19  [サツカ
ロミセス〕およびウシ乳頭腫ウィルス(哺乳類細胞〕。
CDアーゼタンパクのコード配列は、プロモータリポソ
ーム結合部位(細菌発現用)および必要に応じてオペレ
ーターの制御下に配置することができ(本明細書ではこ
れらをまと杓てパ制御′”要素と呼ぶ)、その結果、 
CDアーゼタンパクをコードするDNA配列は、この発
現構築物を有するベクターで形質転換された宿主細胞中
でRNAに転写される。このコード配列は、シグナルペ
プチドもしくはリーダー配列を有していてもいなくても
よい。リーダー配列は、!!l訳後のプロセッシングに
より細菌宿主で除去され得る(例えば、米国特許第4.
431.739号、第4.425.437号および第4
.338゜397号参照)。
制御配列に加えて、宿主細胞の生育に関連して発現CD
アーゼ配列の調節ができる調節配列を加えることが望ま
しい。調節配列は、当業者にとって公知のものであり、
その例には、化学的もしくは物理的刺激に対して反応し
、遺伝子の発現を開始もしくは停止させる配列が含まれ
、それには調節化合物の存在が含まれる。他の種類の調
節要素。
例えばエンハンサ−配列もベクター中に存在し得る。
発現ベクターは、 CDアーゼコード配列が、適切な調
節配列とともにベクター中に配置されることにより構築
される。上記ベクター中での制御配列に関しての、コー
ド配列の位置および方向は、コード配列が制御配列の“
制御下で転写されるような位置および配列である(つま
り制御配列の位置においてDNA分子に結合するRNA
ポリメラーゼがコード配列を転写する)。CDアーゼを
コードする配列を修飾することは、この目的を達成する
のに望ましいことである。例えば、ある場合においては
、この配列を、該配列が適切な方向で制御配列に連結す
るように修飾すること、つまり、読み枠を維持するよう
に修飾することが必要である。
制御配列および、別の調節配列は、上記のクローニング
ベクターのようなベクターに挿入する前にコード配列に
連結してもよい。あるいは、コード配列は、すでに制御
配列と適切な制限部位を有する発現ベクターに直接クロ
ーン化してもよい。
多くの原核発現ベクターが当該技術分野で知られている
。例えば、米国特許第4.440.859号、第4、4
36.815号、第4.431.740号、第4.43
1.739号、第4.428.941号、第4.425
.437号、第4.418.149号、第4.411.
994号、第4.366、246号、第4,342、8
32号;英国特許出願GB2.121.054号、 G
B2,008.123号、 2.007,675号;お
よびヨーロッパ特許出願第103.395号を参照され
たい。酵母発現ベクターも当該技術分野で公知である。
例えば、米国特許第4.446.235号、第4.44
3.539号、第4.430428号;ヨーロッパ特許
出願第103.409号、第100,561号および9
6.491号を参照されたい。哺乳類発現ベクターもま
た。公知である。
選択される発現系および宿主に依存して、 CDアーゼ
は、上記発現ベクターで形質転換された宿主細胞を、 
CDアーゼが発現される条件下で増殖させることによっ
て製造される。次いでこのタンパクは宿主細胞から単離
され精製される。発現系がタンパクを増殖培地内に分泌
する場合には、このタンパクは培地から直接精製され得
る。タンパクが分泌されない場合には、それは細胞溶解
物から単離される。適切な増殖条件および回収法の選択
は。
当業者の技術範囲内にある。
酵母中でCDアーゼ配列を制御して誘発させる構築物の
1例は、[Dアーゼカセットを、″フユージョネーター
” (fusionator)と呼ばれる酵母ベクター
に挿入したものである。このベクターは、米国、ワシン
トン州、シアトルのワシントン大学。
遺伝学BおよびNIHから人手可能である。このような
構築物を第11図に示す。この構築物において。
CDアーゼは、その発現を、酵母由来の9高度に発現さ
れ厳密に調節されたGALIOプロモーターの制御下に
置くポリリンカーに挿入される(Johnston。
M、 1987年)。GALIOプロモーターはガラク
トースに反応し、遺伝子の高レベルの発現をその制御下
で誘発する。このベクターはまた。 DNA配列を適当
に変化させることによってCDアーゼ−1acZ融合体
を創製するのに使用され得る。生成した融合タンパクに
より、誘発の定量、精製、および生物学的分析が容易に
なる。これらの構築物は、 Hovlandら(198
9年)の文献に記載されているような適切な酵母株に形
質転換するこよができる。この酵母株には、上記のよう
な構築物とともに用いるのが望ましいいくつかの変異体
が含まれている。特に。
gall変異体が存在し、これはガラクトース利用の第
1段階を触媒する酵素を減少させ、その結果。
培地中の誘発物質(ガラクトース)を枯渇するのを防止
する。reg]−5旧変異体もまた存在し、これは、ガ
ラクトース遺伝子発現のグルコースによる抑制を排除し
、培養物を増殖および生存度に最適な条件下に置くこと
を可能にする。誘発は、ガラクトースを添加して、グル
コースをベースとする培地をガラクトース富化させるこ
とによって容易に行われ得る。最後に、この酵母株には
プロテアーゼが不足した変異体がいくつか存在し、増殖
中に生成した非相同タンパクもしくはその断片の安定性
を増大化する。このような発現構築物は、内因性遺伝子
で得られる発現レベルを用いて、従来不可能であった量
で、 CDアーゼを酵母から単離および精製するのを促
進するに違いない。
その他の構築物が哺乳類細胞の培養系に用いるために創
製され得る。本発明の好ましい態様において、 CDア
ーゼをコードするカセットは、 PCR技術を用いて、
オンコスタチンM (Malikら、 1989年)の
分泌シグナルペプチドに連結され9次に、@乳類での発
現に適切なエンハンサ−プロモーター終止およびプロセ
ッシングのシグナルを有する哺乳類発現ベクターpH3
MPy (Stamenkovicら、 1990年)
に挿入される。この構築物は、 C[IS細胞にトラン
スフェクトされ(Aruffoi6よび5eed、 1
987年)血清を含有しない培養培地が集められ、そし
て内因性酵素活性を欠いた系内でCDアーゼ活性が分析
される。同様に、 CDアーゼおよび他の関連分子との
遺伝子融合を行うためのcDNA構築物が標準法で構築
され、 COS細胞にトランスフェクトされ1次に細胞
抽出物もしくは上澄液が、タンパクとその活性について
分析される。
他の遺伝子融合体もまた。CDアーゼの組換えによる生
産に用いられる。例えば、 CDアーゼをコードするヌ
クレオチド配列もしくは機能性変異体もしくはその断片
は、 cDNAがコードし、癌抗原を標的とする免疫グ
ロブリン分子に融合され得、抗体酵素融合タンパクが形
成され得る。腫瘍細胞上で優先的に発現する決定因子を
認識するモノクローナル抗体が得られている(Hel 
Istromら、 1984年)従って1選択された腫
瘍細胞を特異的に標的とする融合タンパクが創生され得
る。例えば、米国特許第4.906.562号およびH
ellstrom、 1985年の文献を参照されたい
。次にこの酵素は、腫瘍細胞部位に直接作用して、前駆
薬剤5FCを抗腫瘍剤5FIIに変換することができる
。目的とする酵素をコードする遺伝子と、癌細胞を標的
にした抗体とのゲノム融合体によって、2つのタンパク
の化学的結合が不要となる。同様に、目的とする2つの
分子間のcDNA構築物は、非相同発現系内でのこのよ
うな構築物のフレキシビリティを増大することができる
ある系においては、癌抗体のH鎮のcDNAは、この抗
体を産生ずる細胞系から得られる。二のcDNAの全部
または一部をコードするPCRフラグメントは、当業者
に公知の方法により得ることができる。
2つのカセットの枠内融合は、いくつかの位置における
標準的技術により可能であり、得られた融合遺伝子は、
望ましい生物学的活性についてタンパクの産生を試験し
た。この抗体分子のし鎖部分をコードするcDNAを有
する2番目のプラスミドのコトランスフェクションによ
り、活性型CD了−ゼ酵素に融合した生物学的に活性な
抗体フラグメントを単離できる。このようにして、望ま
しい位置に対するこの酵素の標的化が達成される。
機能的には同等の熱安定性CDアーゼの変異体または類
似体を作ることも望ましい。変異体または類似体は、 
CDアーゼをコードする配列部分の欠失。
配列の挿入、および/またはこの配列内の1個またはそ
れ以上の核酸の置換により、調製され得る。
ヌクレオチド配列を修飾する手法9例えば1部位特異的
変異法またはPCRオリゴヌクレオチド変異法は、当業
者に公知である。例えば、■、マニアナイスらを参照さ
れたい。
本発明のCDアーゼは、既知のアミノ酸配列または目的
とする遺伝子のDNA配列から得たアミノ酸配列を用い
た固相ペプチド合成法のような化学的合成によっても生
産される。このような方法は当業者に既知である。
熱安定性CD了−ゼは、化学療法剤として用いることが
できる。特に、この酵素は、インビボにおいて、プロド
ラッグである5FCを抗癌剤である5FUに変換し得る
。従って江Dアーゼは、 5F[l:と共投与すること
ができる。例えば、腫瘍部位または近傍に外科的にCD
アーゼを置き、 5FCを経口投与する(例えば、 K
atsuragi ら、 1987.が記載している)
ことにより共投与することが可能である。上記文献は、
参考文献として、ここに引用する。あるいは、この酵素
は、これらの腫瘍に特異的な抗体を用いて腫瘍に対して
江りアーゼ/抗体複合体を標的移送することにより、腫
瘍部位へ運ぶことができる。この複合体は、化学的方法
によっても。
または、上記のように、適当な免疫グロブリンとCDア
ーゼ遺伝子との遺伝子融合物を構築することにより遺伝
子操作的にも生産することができる。
(実施例) 本発明を実施するための特定の実施例を以下に示す。こ
の実施例は9例示を目的としたものであり9本発明の範
囲を制限することを意図していない。
実施例1 酵素精製、活性測定、およびCDアーゼ特徴づけCDア
ーゼは、以下の方法を用いて、フレイシュマンの圧搾パ
ン酵母から精製した。精製の全工程は、4℃で行われた
。酵素活性は、5フルオロシトシン(5F[:)の3m
Mリン酸緩衝生理食塩水(PBS)溶液を用いて、37
℃で測定されたにシャ7ら。
1985)。この文献の開示内容は、すべて参考文献と
してここに含まれている。酵素溶液を加え、その反応経
過を、 0.1N HCIで消光したアリクオツドにつ
いて分光光度計でモニターした。255/290の吸光
度比を用いて、5−フルオロウラシル(5FU)の生成
量を算出した。酵素活性の1単位は、37℃において、
1分間に1μmolの5FIlが生成される活性と定義
される。タンパク濃度は、ピアース(ロックフォード、
イリノイ)から入手したBCAアッセイを用いて測定さ
れた。各精製工程後、 5O3−PAGEを用いてタン
パク組成を調べた。
(以下余白) 工】、   ″の パン酵母(2,25kg)にエチルアセテート(225
紙)を加え、30分間撹拌した。これに、15%硫酸ア
ンモニウム 5mM EDTA、および0.1曽門ジチ
オスレイトール(DTT)を含有する501リン酸カリ
ウム緩衝液pH7,2を2.254加えた。この混合物
を3日間攪拌し、固形のトリヒドロキシメチルアミノメ
タン(Tris)を用いて毎日pH7,2に調整した。
細胞残層は、 10.OOOrpm 15分間の遠心分
離により取り除いた。
工 2.   アンモニウム ECT八(1,8g/f)および硫酸アンモニウム(3
71g/ l )を加えて、工程1の上清から、すべて
のタンパクを沈澱させ、そして、硫酸アンモニウムの最
終濃度を、70%飽和とした。この溶液を4°Cで約1
6時間置き、その後沈澱物を遠心分離で採集した。この
ペレツトを 5+MEDTAおよび0.1+nM DT
Tを含有する50mMリン酸カリウム緩衝液pH7,2
に溶解させ この緩衝液に対する透析を約12〜16時
間行なった。
二の透析物にECT八(1,8g/l)を加え、50%
飽和となるよう硫酸アンモニウムを加えた(3148 
g酸アンモニウム/!透析物)。1時間後、沈澱物を遠
心分離し、さらに、最終g酸アンモニウム濃度が73%
飽和となるように硫酸アンモニウムを上清に加えた。沈
澱物を採集し、 O,l+M DTTを含有する20m
M Tris緩衝液pH8,0のIfに溶解させ、この
緩衝液を用いて約12〜16時間よく透析した。
工 3.  イオン−りロマトグーフィー工程2の透析
物を、 0.1mM DTTを含有する20mMTri
s緩衝液p)18.0で平衡化した4、8 X25CI
IQ−セファロース(ファーマシア)カラムに付した。
カラムを洗浄後、酵素を、上記緩衝液中0−0.3?I
 KCIの線型勾配によって溶出した。CDアーゼ活性
を有する画分をプールし、限外濾過(アミコン、 PM
30フィルター)により約15IIlに′a縮した。
工 4. ゲル゛ クロマトグラフィー工程3のCDア
ーゼを含む溶液をG−75セフアデツクスカラム(2,
5X100 Ca+)に付し、 0.1a+M DTT
を含有するPBSで溶出した。CDアーゼ活性を有する
画分をプールし3次いで、 1.8M硫酸アンモニウム
5mM EDTA、 0.1 mM DTTを含む10
0mMリン酸カリウム緩衝液pH7,0の4fに対し透
析した。
工 5.疎      クロマトグーフィー工程4の物
質を、 1.8M硫酸アンモニウム、51EDTAおよ
び0.1+M DTTを含有する100mM リン酸カ
リウム緩衝液p)17.0で平衡化した2、5 X15
C1mオクチル−セファロース(ファーマシア)カラム
に付した。カラムをこの緩衝液で洗浄し、酵素を、上記
リン酸緩衝液中1.8〜OM硫酸アンモニウムの線型勾
配で溶出し、た。CDアーゼ活性を有する画分を集めて
、限外濾過(アミコン、YM5フィルター)で濃縮した
工 6. ゲル′3 クロマトグラフィー工程5の物質
の、?容出液としてPBSを用いたG75セファデック
ス上の最終的ゲル濾過は、工程4に示したようにして行
なわれた。精製酵素は、限外I#、過で濃縮され、−7
0°Cで保存された。
工程毎の精製結果を1表1に示す。各精製工程毎にタン
パク組成を調べるために用いられた5DSPAGEプロ
フイールを、第1図に示す。最終酵素調製物は、約17
kDaの大きなハンドと約19kDaの小さなバンドか
らなる。
表1 2.25  パン  からCDアーゼの工程   総タ
ンパク 総活性 比活性 精製倍率(N)14)2SO
4 36,000 0,035 2,5 セファロース 4 、200 0.16 11.4 75セフアテフクス 3.5 オクチル セファ0−ス 1 、800 75セフ7テフクス 4.800 1゜ CA (ピアース) を用いて測定したタンパク濃度 2 酵素活性1単位は、37°Cにおいて、1分間に1
μ■of 5FUが生成される活性とする。
CDアーゼの分子量は、この精製酵素をリボヌクレアー
ゼA (13,7kDa) 、  キモトリプシノーゲ
ンA(25kDa) 、卵白アルブミン(43kDa)
 とともにG−50セフアデツクスカラムにかけること
により測定された。
画分は、総タンパクを測定するために280nmの吸光
度をモニターされ、基質として5FCを用いて。
CDアーゼ活性をモニターされた。CDアーゼ酵素活性
は、約32kDaに中心があった(第2図A)。この酵
素は、キャリブレーションスタンダードなしでカラムに
付した場合全く同じ容量で溶出した(第2図B)。
精製CDアーゼの37°C’Jン酸緩衝生理食塩水中p
H7,2での安定性は、基質として5FCを用いて測定
された。酵素活性のゆっ(つとした減少が、インキュベ
ーションの延長と共にみられた(第3図)。
これらの条件下では、5.2日後に酵素活性の半分が失
われた。インキュベーションの最初の4時間では9酵素
活性の明らかな低下はなかった。(第3図挿入図)。
実施例2 CDアーゼのアミノ 配I CDアーゼの配列解析に用いた試薬は、アプライド バ
イオシステム社から入手した。逆相RPLCに用いた溶
媒は、プルデイックアンドジャクソンかう入手した。4
−ビニルピリジンは、アルドリッチケミカル社から、 
CNBrはコダックから人手し、他のすべての化学物質
は試薬用であった。黄色ブドウ球菌由来のエンドプロテ
イナーゼGlu−Cは、マイルズ ラボラトリ−から入
手した。Pseudomonas几…辷のエンドプロテ
イナーゼAsp−NおよびエンドプロテイナーゼLys
−Cは、ベーリンガーマンハイムから入手した。
自動配列分析は、 RUN470−LまたはPRO47
0−Lプログラムを用いて、モデル475Aアミノ酸シ
ークエンサー(ABI)により行なわれた。全部で1.
5■のBi。
Brene (ABI)を分析し、試料を分析する前に
、エドマン分解を2,3回行なった。チアゾリノン誘導
体の、フェニルチオヒダントインアミノ酸への変換は、
61°Cにおいて、25%TFAを用いて行なわれた。
フェニルチオヒダントインアミノ酸誘導体は、開始緩衝
液として5%(v/v)テトラヒドロフランを含有する
酢酸ナトリウム緩衝液を用いたPTI(C18カラム(
2,lX220 m、ABI)の逆相HPLCにより。
そして、制限緩衝液として500nMジメチルフェニル
チオウレア(ABI)を含有するアセトニトリル緩衝液
を用い、モデル120A PTH分析機(ABI)で分
離した。
CDアーゼおよびペプチドを、モデル130A分離シス
テム(アプライドバイオシステム社)による逆相HPL
Cを用いて精製した。分離は、 RP−300カラム(
2,I X 30m ;ABI)上で40°Cにおいて
行なった。タンパクおよびペプチドフラグメントの溶出
のために、 0.1 d/分で2時間に渡る。0.1%
トリフルオロ酢酸(TFA)水溶液中のアセントニトリ
ル0〜60%の線型勾配を用いた。CNBrペプチド、
エンドブロテイナーゼLys−Cペプチド、エンドブロ
テイナーゼGlu−C,およびエンドブロテイナーゼA
sp−Nべ′プチドは、それ以上に精製しないで、配列
分析に用いた。
CDアーゼの4−ビニルピリジンとの 実施例1の工程6から得たCDアーゼを、以下の方法に
従い、4−ビニルピリジンを加えることにりよ変性させ
た。CDアーゼを、 6Fグアニジン−HCl。
0.1%Na2EDTAを含有する0、4M Tris
−HCI緩衝液pus、sの0.1 d中の20+nM
ジチオスレイトールにより、50°Cで2時間還元した
後、 100mMの4−ビニルピリジンで室温にて一晩
反応させた。この反応混合液を、20%TFAを用いて
pH2,0に酸性化し、上記の逆相HPLCにより、脱
塩および精製を行った。
得られた産物の)IPLC分析により、2つの異なるピ
ークが認められ(第4図)、これらは5DS−PAGE
により分離され、再度分析された(第5図)。小さい方
ピーク(プールA)は、第1図の19kDaのハンドに
対応し、大きい方のピークは、 17kDaのハンドに
対応した。
アミノ酸フェニルチオヒダントインに1体の同定法によ
り、プールA(第4図)のタンパクのアミノ末端アミノ
酸配列が、27残基まで得られた。この配列は、パン酵
母スーパーオキサイドジスムターゼ(EC1,15,1
,1,スタインマン、 1980)のN末端配列と同一
であることが見出された。このことは、精製CDアーゼ
のゲル中でみられた小さなバンド(第1図、第5図)の
同一性を立証した。
第4図の大きなピーク(ブールB)のエドマン分解から
アミノ酸配列を得ることができなかったことから、 C
Dアーゼのアミノ末端がブロックされていることが示唆
される。そのため、 CDアーゼの部分的アミノ酸配列
を、以下に示す通り、酵素的にあるいは臭化シアノゲン
分解による選択されたフラグメントの配列解析により得
た。
CDアーゼの   および    ” 4−ビニルピリジンで変性されたCDアーゼのエンドプ
ロティナーゼLys−CおよびエンドフロティナーゼG
lu−Cによる分解を、 O,]M Tris fh酸
緩衝液(pH8,0) 40 μ!中中子7°C約12
〜16時間行った。
酵素/基質比は、それぞれ1 : 10 (ht/wt
)であった。エンドプロティナーゼAsp−N分解は、
酵素/基質比1 : 100.37°C1約12〜16
時間で同様の方法で行われた。酵素的消化物は、20%
TFAでpH2,0に酸性化され、逆相HPLCで分離
された。
臭化シアノゲン(CNBr)は、 CDアーゼをメチオ
ニン残基で切断するために用いた。4−ビニルピリジン
で変性されたCDアーゼ(2,25nwoりは、70%
ギ酸40μ!で再構成され、200倍モルを越えるCN
Brを含有する70%ギ酸を加えた。反応を、35°C
で2時間進行させた後、室温で約12〜16時間行った
この消化物を水で希釈し、減圧乾燥により過剰のCNB
rを取り除いた。逆相HPLC分析のための溶液は。
1%TFA中で調製された。
第6図に、臭化シアノゲン分解、およびエンドブロティ
ナーゼGlu−C,エンドプロテイナーゼt、ys−C
およびエンドプロテイナーゼAsp−Nの酵素を用いた
タンパク分解から得られたフラグメントに基づいた。 
CDアーゼの部分的アミノ酸配列を示す。
154個にわたるアミノ酸が、このタンパクの大部分を
含有することが確認、された。アミノ酸残基の番号付け
は、未だ同定されていないアミノ末端付近のアミノ酸を
含んでいない。この部分的CDアーゼ配列を、マウスの
アデノシンデアミナーゼ(ユングら、 1985)およ
びパン酵母dCMPデアミナーゼ(マンキントンシュと
ハイネス、 1986)を含む他の既知の配列と比較す
ると1本質的な相同性はみられなかった。
(以下余白) 実施例3 CDアーゼ遺伝子のクローニングと発現口Dアーゼをコ
ードする遺伝子をS、cerevisiae (パン酵
母)の実験室株から単離し、以下の方法を用いて、r@
乳類細胞系で発現させた。
工程1:PCRを用いたCDアーゼ特異的プローブの作
製 オリゴヌクレオチドブライマーは1部分的アミノ酸配列
と、 DNA配列の「ゲスマー(guessmer) 
Jセグメントを設計するガイドとしてS、cerevi
siae(グスリーとアベルソン、  1982)由来
のコドン使用パターンを用い、自動[]NA合成装置に
より合成された。これらのオリゴヌクレオチドは、 P
CRのブライマーとして用いられ、クローニングした酵
母ゲノムライブラIJ−DNAが鋳型として存在した。
[:DA4R1および[:DA5^Sと呼ばれるブライ
マーは。
共に33ヌクレオチド配列を含む42量体であり、それ
ぞれCDアーゼのセンス鎮およびアンチセンス釦に対応
する。各オリゴヌクレオチドの残基は、 Ec。
R1の制限酵素切断部位をコードした。この2つのプラ
イマーを配列を、第7図に示す。
両プライマーは、1回の反応あたり50または1001
00p存在した。PCR反応の訪型DNAとして用いた
2つの遺伝子ライブラリーは、 5au3Aの部分的制
限酵素分解の後、 [’V13またはYCp50シャト
ルベクターのいずれかのBamHI部位へ導入すること
によって酵母ゲノムDN^から構築された。これら2つ
のベクターおよびそのゲノムライブラリーは。
船釣に当該技術分野で入手可能であり、ワシントン大学
の遺伝子学部から入手した。両ライブラリーは、既に細
菌ホストに形質転換されたものを人手した。ライブラリ
ー〇)IAは、アルカリ溶解プラスミド調製法により単
離され、セシウムタライドエチジウムブロマイド密度勾
配の遠心分離によりその後精製された。PCR反応は、
 CsCl精製の酵母由来Cν13またはYCp50ゲ
ノムライブラIJ−ONAI 、czg 、各プライマ
ー50または100100p、 10xP(:R反応緩
衝液(ストラタジーン)の1/10容量、1.25mM
 dNTP (^、 G、 T、 C)の16/100
容量、 PCR用蒸用水留水よびTaq DNAポリメ
ラーゼ0.5 μii  (51/μmストラタジーン
)を用いて調製され、最終容量100μ矛、とされた。
反応は、滅菌した微量遠沈管内にて、蒸発を防ぐための
75μにの精製鉱油層の下で行われた。P(1,R反応
を、パーキンーエルマーシータス温度周期変換器の中で
、以下の温度変化を包含する30周期グラグラムにおい
て進行させた。すなわち、変性のために94℃30秒間
、アニリングのために55℃の45秒間、伸展させるた
めに72℃を1.5分間(90秒間)の工程周期である
PCR反応液の一部をアガロースゲルで分析し。
CDアーゼのほとんどをコードする。予想された350
塩基対フラグメントを確認した。350塩基対フラグメ
ントは1次に、予備的アガロースゲル電気泳動の後に、
プライマーと、調製物と異なるフラグメントとを除くた
めに、シーンクリーンキット (BIOIOI)のプロ
トコルおよび試薬を用いて溶出することにより精製され
た。
工程1によるPCRプライマーは4作製したフラグメン
トのすべてのクローニングを促進するために、 EC0
RI制限部位の5°末端を操作した。PCRによるフラ
グメントの精製350塩基対の一部は、制限酵素Eco
RIで消化し、 EcoRI切断したファージシトベク
ターpBsII−3K”  (ストラタジーン)に連結
した。制限酵素は、ベリーンガーマンハイムバイオケミ
カルズ(BMB)から入手した。消化には。
37℃で2時間インキユベートシ、続いてフェノール:
クロロホルム:イソアミルアルコールノ等量混合液で抽
出後、エタノール沈澱を行った。フラグメントを、再度
TE (10mM Tris−HCI、pH8,0,1
mMEDTA pH8,0)に懸濁し、T4DNA リ
ガーゼ(BMB)を用いてともに連結した。コンピテン
トJM109細菌は、結合反応の175を形質転換し、
その適当な希釈液を、 XGa1 (ジメチルポルノア
ミド中の2%保存液(50μM )およびIPTG (
100mM保存液の10μl)を補足したLB+アンピ
シリン(100μg/−)プレートにプレート化した。
白色コロニーを取り出し、サムプルツクら(1989)
に示されたプロトコルに従って、小規模プラスミド調製
を行った。
プラスミドは、 EcoRIで消化することにより、3
50塩基対挿入物についてスクリーニングされた。いく
つかの異なる単離物を取り比し、プラスミドDNAを単
離精製し、さらにON^配列分析に付した。
工程1で得られたPCRフグメントは、遺伝子を含むク
ローンに対してゲノムライブラリーをスクリーニングす
る際に、CDアーゼをコードする配列を検出するための
プローブとしても用いられた。
精製フラグメントを、α−32P−dcTPおよびベー
リンガーマンハイムバイオケミカルズ製のプライマー 
DNA無作為ラベリングキットを用いて標識した。
酵母ライブラリーを、 18士アンピシリン培地で一晩
増殖させ、その希釈液をLB+アンピシリン培地プレー
ト上にプレート化し、プレートあたり250〜2000
コロニーノ密度ノコロニーヲ得り。コロニーの取り上げ
は、シュリーシャーアンドシュエル製の0.45μmニ
トロセルロース円形または正方形フィルターを用いて行
った。フィルターは、フィルターのコロニー側を、ファ
ツトマン3MM紙の上に乗せ、固定するため10%SO
3に6分間、変性させるために1.5M NaOH,1
,5M NaC1に5分間、中和するために0.5M 
NaC]、 0.5M Tris−HCI  pH7,
4に5分間浸し、そして、2XSSCに5分間浸した後
スタータリンカ−(ストラタジーン)を用いて説胡書の
指示通りにtlV架橋を行って処理された。次に、フィ
ルターを2 xSSCl: 5分間浸し、5XSS[:
0.5%SO3,1mM EDTA中50℃で予備洗浄
を行った。
プレハイブリダイセーションは、12フィルター入りの
パック毎に20mf溶液が入る。ヒートシール可能なプ
ラスチックバッグの中で行った。プレハイブリダイゼー
ション溶液は50%ホルムアップヒト、  6 xss
c、  0.01M NaP  pH6,8,1mM 
EDT^ (pH8,0)、 0.5%SDS、 11
00A1/−の変性サケ精子DNA。
および5×デンハート溶液を含有した。プラスチックバ
ックを、42℃の水浴中に浸し、12〜16時間インキ
ュベートした。ラベルしたプローブは、ブツシュ−カラ
ム(ストラタジーン)からの溶出により、導入されてい
ないヌクレオチドから精製された。プローブを、約11
06cp/−液体となるように加え、ハイブリダイゼー
ションのだbに42℃で12〜16時間インキュベート
した。
フィルターを、室温で2 X SSC,0,1%SO3
中で数回洗浄した後、55℃で1時間I X5SC,Q
、1%SO3中で洗浄した。フィルターを風乾し、サラ
ンラップで包み、−70℃で一晩1強化スクリーンと共
に。
X線フィルムにさらした。オートラジオグラフは。
ハイブリダイゼーションの陽性信号を示すクローンを選
別するために、フィルターとマスタープレートとを並べ
て行った。陽性クローンは、プラスミドを単離するまで
に、上記方法で2回以上再スクリーニングされた。プラ
スミドDNAは、タロラムフェニコール増幅されたしB
+アンピシリン培養物500祿の増殖により単離され、
その後、サムプルツクら (1989年)の示したアル
カリ溶解法を用いて精製された。セシウムクロライドエ
チジウムブロマイド平衡遠心分離により精製されるプラ
スミドもあるが、その他は、 PZ253カラム(5゛
→3“)から溶出された後、ポリエチレングリコール沈
澱。
フェノール:クロロホルム抽出、そしてエタノール沈澱
が行われた。
オリゴヌクレオチド18量子体のいくつかを1合成する
か、あるいは、 PCRとゲノムCDアーゼクローン出
来のDNAの配列決定のために用いた。一部のプライマ
ーは、コード鎖から配列を作製し、その他は、相補的D
NA釦から配列を得た。配列決定反応は、シークエナー
ゼハージョン2,0キット(ユナイテッドステイツバイ
オケミカル)が提供するプロトコルと試薬に従って行っ
た。DNAは。
配列決定反応の前に、 0.2N NaD)I中でアル
カリ変性により変性された。ラベルした反応混合液の希
釈と1反応時間は、目的とする配列の領域に依存して変
化された。大部分の反応は、1つの反応当り、  1〜
1.5pmolの鋳型DNAとプライマーを、10〜1
5μC1のα−35S−dATPと共に用いた。試料を
8%ポリアクリルアミド−尿素シーフェンシングゲルに
担持し、解析されるべき配列に応じて、1〜7時間実施
した。ゲルを、10%メタノール、10%酢酸にて30
分間固定させ、減圧ポンプに接続したスラブ−ゲル乾燥
器を用いて、80℃45分間乾燥させた。乾燥したゲル
を、室温で18〜72時間コダックXAR−5フィルム
にさらした。配列は9手動で読まれた。配列データの整
合と分析は、シーンプロソフト (リバーサイドサイエ
ンティフィック。
シアトル、ワシントン州)を用いたコンピュータにより
行われた。第8図は、ゲノム(’Dアーゼをコードする
クローンの核酸配列を示す。第10図は。
予測されるアミノ酸配列を示す。図に見られるように、
コード配列は、約474塩基対からなり、158アミノ
酸のタンパクを特定する。そのため、 CDアーゼの予
測される分子量は、約17.506ダルトンとなる。
工程4で得られたDNA配列を用いて、CDアーゼをコ
ードするPCRで作製されたカセットのためのオリゴヌ
クレオチドプライマーを設計した。これらのオリゴヌク
レオチドの一部は1分泌シグナルペプチドおよびクロー
ニングまたは発現において用いられる制限酵素切断部位
等の追加配列を有していた。オリゴヌクレオチドプライ
マーは、適当な配列を末端に追加してPCRフラグメン
トを作製するために、2つひと組で用いられた。
特に1CDアーゼをコードするカセットは、  CDア
ーゼ特異的配列とクローニングのための制限酵素切断部
位をコードする追加配列の両方を含む2つのプライマー
を用いて、 PARにより構築された。
5゛プライマーは、45塩基の相同配列を含む65量体
であり、制限酵素HindIII、 5all、および
Ncolの切断部位を含む5”末端に結合した。CDア
ーゼのゲノムコピーの5゛末端とは完全に同一ではなか
った。
3′プライマーは、39量子体で、5′末端にXbal
末端が結合した。 (1,0了−ゼのC末端のアンチセ
ンス釦と同一であった。用いられた銃撃は、1反応あた
り約1ngのCDアーゼのゲノムクローンであった。
各プライマーは、 75μmol濃度存在した。PCR
反応は、工程1に示すように行われた。
PCR反応産物は、クロロホルムによる抽圧およびエタ
ノール沈澱により精製された。その後DNAは、制限酵
素旧ndIIIおよびXbalにより消化され。
ゲル電気泳動にかけられ、シーンクリーン(BIolo
l)を説明書に従って用いて溶出することにより精製さ
れた。
工程6:哺乳類系におけるCDアーゼの発現工程5で精
製されたフラグメントを、 HinclI[l −Xb
alで消化したC0M8またはpH3Mプラスミドベク
ターに連結し、宿主細菌であるMC1061の中に形質
転換させた(アルフォおよびシード、 1987)。p
 H3!+!ベクターの遺伝子地図を第12図に示す。
その構造を!3.Uするた約に、 20の形質転換体を
取り圧し。
プラスミド調製物の小規模アルカリ溶解を行いその一部
を旧ndIII + Xbalで消化した。3つの調製
物のうち残るプラスミドは、 DEAE−デキストラン
トランスフェクション法(アウスベルラ編9分子生物学
の最新プロトコル)により、 [O3細胞のトランスフ
ェクションに用いた。
簡潔に説明すると、 3.5 X105CO3細胞を[
1MEM/10%ウシ胎仔血清(FBS)の6cm@i
養皿にプレート化し、6%[02中37℃で一部インキ
ユベートした。
この小調製物から得たDNAには、最終容量が100μ
βとなるように、 PBSおよび50mg/mfDEA
E−デキストランを、以下に示した量で加えた。
対照 擬似(sham)対照0μf   80μ!  20p
RBBI       4μf   76μm  20
μmCDアーゼトランスフェクタント 1−1      13μl   67μA   20
μ!1−4      13μl167μ!  20μ
に2−6      13μm  67μ!  20μ
m各トランスフェクションは、2試料ずつ行われた。1
日経た培養培地を、培養皿から吸引し、1回の洗浄あた
り2rIf!のPBSで、細胞を3回洗浄した。DME
M−10ロキントランスフエクシヨン培地を、1.7m
f/プレート加え、 DNAカクテルを培地中に滴下し
た。トランスフェクション インキュベートし、培地を取り除き、細胞にFBS/1
0%DMSOで2分間ショックを与えた後、血清を含ま
ない培地で3回洗浄し、1プレートあたり3.5dのD
MEM/10%PBS中で3日間インキュベートした。
(以下余白) 1、ラジオイムノ沈降反応ニ ラジオイムノ沈降反応(RIPS)に用いる工程6で得
られたプレートは、  200 μci/mf35S−
メチオニンを含む片時調製した0μ!M/10%FBS
中で約12〜16時間インキュベートした。
RIPSil、 37℃約12〜16時間のインキュベ
ーションの後、ラベルした培地を吸引し、各培養皿に1
%DG−PO4RJPAE緩衝液(50mM NaJP
04.1%デオキシコール酸ナトリウム、1% トリト
ンX−100,0゜%SDS、  150mM NaC
1,5mM EDTA、  5mM EGTA、 2m
MPMSF、およびIμg/mfアプロチニン−1%オ
クトグルコシドを加えたPO4−RIPAE)を加え、
水冷中で10分間インキ−ベートした。分解物を1(7
オークリツジ遠沈管に写し、 40,000rpm、 
4℃で40分間遠心分離した。上清を水冷下2本の微量
遠沈管に移した(0.4mf/チューブ)。BBI  
)ランスフェクタントは、2μgの抗体と共にインキュ
ベートしたが、他のトランスフエクタントには、17.
5μ!または31.5μgのウサギ抗CDアーゼポリク
ローナル抗血清を加えた。RIPSを、氷冷下1時間イ
ンキュベートした。BBIチューブには2番目の抗体と
してヒツジ抗マウス抗体を加え、水冷下20分間インキ
コベートした。
黄色ブドウ球菌(カルビオケム)を、0.5%NP−4
0/TBS緩衝液(700μf)で洗浄後、0.05%
NF−40/TBS緩衝液で洗浄し、最終的には1mg
/ml卵白アルブミンを含むPO4−RIPAE M#
r液(TBS、即ち50mM Tris−t(CI、 
pl(7,4,1mMEDTA、 150mM NaC
I)に再度懸濁した。洗浄した黄色ブドウ球菌の50μ
mをRIP物質に加え、水冷下10分間インキュベート
した。RIPSは、微量遠沈管内でペレット化され。
0.5 mj!TNEN(20mM Tris−HCI
 p)18.0.100mM Na[:]。
11mMEDTA、 0.5%NF−40)で3回洗浄
された。元の400μlの2試料から得た最終ベレット
は、35μ矛還元または35μ!非還元5O5−PAG
E用緩衝液に再度懸濁させた。試料をバイオ−ラッドの
低分子量タンパクマーカーとともに10−20%5O3
−PAGE勾配ゲルに担持させ、300ボルト約2時間
の電気泳動を行った。ゲルは、クマシーブルーで1時間
染色し、 10%メタノール、5%酢酸で約12〜16
時間脱色し、30分間発色を強めるためにさらした後。
水で3回洗浄し、60℃で1時間乾燥した。ゲルを4時
間X線フィルムにさらすと、擬似対照に17.000ダ
ルトンのバンドが認められ、 BBI試料では、 17
,000ダルトンのバンドは5忍められなかったが、 
45,000ダルトン付近に特異的なバンドがみられた
。3つのトランスフエクタントにはすべて、約17.0
00ダルトンに特異的なバンドが認められた。
2、ウェスタン分析: 工程6でえられた2重のトランスフェクションプレート
は、ラベルしないまま1こしておき、3日間のインキ;
ベーション後に回収した。培地を吸引して捨て、細胞を
PBSで洗浄した後、1μg/−アプロチニンおよび3
0μg /mfPMsFを含む10mMTr 1s−H
CI (pH8,0) 0.5rnl中に懸濁した。細
胞は、滅菌スクレーパを用いて培養皿から取り除き、水
冷下で滅菌微量遠沈管に移した。各懸濁液を、水冷下2
〜15秒間最強で超音波処理した。この分解物を氷玲微
量遠沈管で20分間遠心分離することにより細胞残渣を
取り除き、上清を新しいチューブに移した。酵素アッセ
イは、以下の通りに行った。
これらの分解物の一部を、精製CDアーゼに対して生じ
たポリクローナルウサギ抗血清を用いたウェスタンプロ
ットにも用いた。希釈していないトランスフエクタント
分解物の25μ矛を、 RIPSに示したように5O3
−PAGE電気泳動に付した。ただし。
濃度標準として、精製CDアーゼ酵素の一連の希釈物を
ゲルに担持させた。500ng /レーンの濃縮したC
Oアーゼは、  1100n、 20ng、 4%g、
 0.8%g /レーンと5倍ずつ希釈された。その後
このゲルを、 C3Hクローニングマニユアル(サムプ
ルツクら、 1989)のプロトコルに従って、ニトロ
セルロールフィルターに電気プロットした。
フ゛ロットは、プロット−(Blotto、すなわちp
es十1%脱脂乳十0.5%NP−40)中1時間でブ
ロックされた。2.5μg/rn1.ポリクローナルウ
サギ抗c()アーゼ血清を含む片時調製したプロア)−
を、このフィルターに加え、室温で1時間インキュベー
トした。フィルターは、プロット−中で5分間3回洗浄
した後、アルカリホスファターゼ接合体(ベーリンガー
マンハイムバイオケミカル)を1:1000でプロット
−中に希釈したものの中でインキュベートした。過剰な
抗体接合体をプロット−中で3回洗浄することにより取
り除き、最後にアルカリホスファターゼ基質緩衝液(1
00mM Tris−)ICI pH9,5,100m
M Na[:]、 55mMMgC1□)で洗浄した。
その後フィルターを発色させるために、 12mgブロ
モコリンドリルリン酸と7mgニトロブルーテトラゾリ
ウムを加えた40rnlの基質緩衝液中に15分間イン
キュベートした。反応は、フィルターを蒸留水で洗浄す
ることにより停止した。
発色を行うと、3つのトランスフェクションすべてに約
17.000ダルトンのバンドがみられ、その強度は、
精製CDアーゼの濃度標準の0.8ngより大きく4n
gより小さかった。
3、組換えで発現したCDアーゼの活性測定上記形質転
換されたCO8細胞からの抽出物について、5−フルオ
ロシトシン(5−FC)かう5−フルオロウラシル(5
−FIJ)の変換を測定した。CDアーゼ(1−1゜1
−4.2−6)を含むトランスフェクタント(3X10
’細胞)、 擬似トランスフェクション、または対照プ
ラスミドトランスフェクション(881)を、 IOm
MTrjs緩衝液0.5ml中で超音波処理し、遠心分
離した。各上清100μmと1μg/−のCDアーゼ溶
液を、170μβのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)と
30mM 5−FC溶液30μmとに加えた。これによ
り。
3mM5−FCの反応混合液300μmを得た。対照反
応として、酵素を入れない反応も行った。
これらの試験管を、37℃で24時間インキュベートし
た後、各溶液50μlを取り、 0.IN ILcI 
1−で反応をクエンチングした。これらの試料を、25
5および290nmでUv分光光度計を用いて測定した
(0,1191X 0D2=o O,02485X 0
Lss) X 20=mAl 5−FCおよび (0,1849X DD25s 0.04907x 0
D2=o) X 20=mM 5−F2O式を用いて、
 5−FCから5−FUに変換した量を算出した。次い
で9元の細胞抽出物中の活性単位数を計算した(1単位
−5−FCから5−FIJへ1 μmol /分変換)
。擬似およびBBI )ランスフェクション。
および酵素なしの反応では、活性が認められず。
CDアーゼの3つのトランスフェクタントはすべて活性
であった。トランスフェクタント1−1は、0.41X
 10−3単位、1−4は0.54X 10−’単位、
そして、2−6は0.26X10−3単位であった。C
Oアーゼ1/Jg/mfの対照アッセイでは、 5−F
Cすべてが5−Fllに変換した。精製CDアーゼの活
性を40[J/mgとすると、10ng(1−1)、 
13.5ng(1−4)、および7.3ng (2−6
)の活性型CDアーゼが発現したことになる。
同じ試料について、別のアッセイ法も行った。
上清50μmまたはCDアーゼ1μg /mli、 1
30μ1PBS、 20 μm 30mM 5−FC,
および、 1 μci [3H]5〜FCを各アッセイ
試験管に入れた。これらの反応は24時間インキユベー
トシ、蒸発乾固後残渣を20μβメタノールに溶解し、
シリカゲル薄層クロマトフラフィ−(TLC)板上にス
ポットして行った。
薄層板は、 96:4アセトン/水で展開された。この
とき、  5−FCおよび5−FCのRfはそれぞれ0
.2および0.8であった。TLC板の適当な部分を切
り取り。
シンナレーションカウンターでカウントし、各試料中の
5−FCおよび5−FUの相対量を測定した。擬似およ
びBBIアッセイでは、 5−FCが得られず、トラン
スフェクシントすべてで、 5−F[’の14%が5−
Fllに変換していた。これは、試料あたり0.6 X
l0−’単位ということになり、 [、lV実験で算出
した量を立証している。CDアーゼ1μg/−の対照反
応では。
5−FCすべてが5−F[Iに変換した。
実験は、 CDアーゼトランスフェクタントが、実際に
活性型酵素を発現していることを示している。
このことは、ウェスタンプロット分析と考え合わせて1
組換え酵素の比活性が酵母から単離したそれと同等であ
ることを示している。
このように、熱安定性CDアーゼならびにその精製方法
と組換え製造方法を開示した。本発明の好ましい実施態
様をある程度詳細に示したが、これは例示であって、制
限するものではなく、特許請求の範囲に定義された本発
明の意図および範囲から離れるこさなしに明らかな変更
をなし得るこ出は理解されている。
(以下余白) (発明の要約) 熱安定性シトシンデアミナーゼ(CDア〜ゼ)、および
それをコードする遺伝子、ならびに、それを単離し、精
製し、そして組換えにより産生ずる方法が開示される。
熱安定性CDアーゼは、 5acchar。
離された酵素は、約32kDaの分子量を有しくゲル濾
過クロマトグラフィーにより決定された)、それぞれが
約17kDaの分子量を有する。2つのサブユニットか
ら構成されている。よく精製された熱安定性酵母口Dア
ーゼは、他の公知の配列決定されたタンパクと有意な配
列の相同性を示さない。
参照文献 Aruffo、八、および5eed、 B、 、 PN
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【図面の簡単な説明】
以下の図面は1本発明の開示内容の一部を構成する。 第1図は、 CDアーゼの5DS−PAGE分析(非還
元条件下、14%ポリアクリルアミド)を示す図である
。 各レーンに示される物質は1次のものである。レーン1
および9.マーカータンパク;レーン2゜実施例1の工
程からの自己分解上清;レーン3゜実施例1の工程2の
(NH,) 2SO,沈澱(70%)後の生成物;レー
ン4.実施例1の工程2の(Ni14) 2So。 沈# (50〜73%)後の生成物;レーン5.実施例
1の工程3のΩ〜セファロースクロマトグラフィー後誘
導された生成物;レーン6、実施例1の工程4の6−7
5カラム後の生成物;レーン7、実施例1の工程5のオ
クチル−セファロース精製後の生成物;レーン8.実施
例1の工程6の2回目の6−75カラム後得られる最終
精製物。 第2図は、 G−50セフアデツクスカラム(1,5X
 100cm)からのCDアーゼの溶離プロフィールを
示す図である。(A)精製されたロアーゼ2711は、
リボヌクレアーゼ゛A (2mg)、  卵白アルブミ
ン(2mg)、およびキモトリプシノーゲンA (1m
g)と混合され、 PBSで溶離された。両分は、全タ
ンパク含量を決定するため280nmでモニターされ、
 CDアーゼ活性を決定するため基質として5FCを使
用しながら290nmでモニターされた。(B)キャリ
ブレーションスタンダードを用いない、上記G−50セ
ファデックスカラムからのCDアーゼの溶離。 第3図は、37℃におけるCDアーゼの安定性を示す図
である。PBS (プロテアーゼを含有しないBSA(
1mg/ml)を含有)中のCDアーゼ(72Ll/m
g)は。 ポリプロピレンチューブ中で37℃でインキュベートさ
れた。様々な期間において、 CDアーゼ活性が。 酵素溶液10μβを使用して決定された。 第4図は、 HPLCで精製されたCDアーゼのプロフ
ィールを示す図である。水平なバーは、アミノ酸配列分
析のためにプールされた画分を示す。 第5図は、 HPLC精製後のCDアーゼの5O5−P
AGE分析(還元条件下、15%ポリアクリルアミド)
を示す図である。レーン1.プールA;レーン2.プー
ルB0 第6図は、 CDアーゼの部分的なアミノ酸配列を示す
図である。口NBr (Mシリーズ)、 エンドブロテ
イナーゼGlu−C(Eシリーズ)、 エンドプロテイ
ナゼLys、[: (Kシリーズ)、およびエンドプロ
テイナーゼAsp−N (Dシリーズ)による開裂から
得られたペプチドを示す。 第7図は、ブライマーCDA4R1およびCDA3八S
のヌクレオチド配列、それに対応するアミノ酸配列。 およびCDアーゼアミノ酸配列中におけるこれらのプラ
イマーの相対的な位置を示す図である。CDA4R1は
センス鋼上の5°から3゛に向かい、一方CDA5AS
はアンチセンス如上の5′から3′に向かう。 !8図1t、[:Dアーゼをコードするゲノムクローン
由来のDNAのヌクレオチド配列を示す図である。 第9図は、 CDアーゼのゲノム配列中に見られるオー
ブンリーディングフレーム(ORFs)を示す図である
。 第10図は、 0RF2のヌクレオチド配列およびそれ
に対応するアミノ酸配列を示す図である。ヌクレオチド
配列から予言されたが、ペプチド配列上に見畠されなか
った。さらに別のアミノ酸が、太字で強調され、開始お
よび停止コドンが四角で囲まれている。 第11図は、COアーゼ遺伝子を含有するプラスミド発
現ベクター「フユージョネータ−(fusionato
r) Jを示す図である。 第12図は。 pH3Mベクターの制限地図を示す図である。 以 上

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、熱安定性シトシンデアミナーゼ、またはそれと機能
    的に等価なタンパクをコードする、単離れたヌクレオチ
    ド配列。 2、前記配列が、第10図に示される配列と実質的に同
    じである、請求項1に記載のヌクレオチド配列。 3、請求項1または2のヌクレオチド配列を含有し、そ
    して該配列の発現において効果的である、組換え発現ベ
    クター。 4、前記ヌクレオチド配列が、宿主細胞と適合性の制御
    配列と作動可能に連結している、請求項3に記載の組換
    え発現ベクター。 5、請求項4の組換え発現ベクターで形質転換された宿
    主細胞。 6、請求項5の宿主細胞を増殖させることを包含する、
    組換え熱安定性シトシンデアミナーゼ、またはそれと機
    能上等価なタンパクを産生する方法。 7、単離された、熱安定性シトシンデアミナーゼ、また
    はそれと機能的に等価なタンパク。 8、第6図または第10図に示されるアミノ酸配列、ま
    たはそれと実質的に相同でありかつ機能的に等価なアミ
    ノ酸配列を包含する、請求項7に記載のシトシンデアミ
    ナーゼ。 9、酵母から単離される、請求項7に記載のシトシンデ
    アミナーゼ。 10、¥Saccharomyces¥¥cerevi
    siae¥から単離される、熱安定性シトシンデアミナ
    ーゼ。
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