JPH01180900A - 細胞接着活性ポリペプチド - Google Patents
細胞接着活性ポリペプチドInfo
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- JPH01180900A JPH01180900A JP63000148A JP14888A JPH01180900A JP H01180900 A JPH01180900 A JP H01180900A JP 63000148 A JP63000148 A JP 63000148A JP 14888 A JP14888 A JP 14888A JP H01180900 A JPH01180900 A JP H01180900A
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- C07—ORGANIC CHEMISTRY
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- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔産業上の利用分野〕
本発明は、フィブロネクチン様の細胞接着活性タンパク
質に関し、更に詳しくは、ヒトフィブロネクチンの細胞
接着活性を有するポリペプチド及びその製造方法に関す
る。
質に関し、更に詳しくは、ヒトフィブロネクチンの細胞
接着活性を有するポリペプチド及びその製造方法に関す
る。
〔従来の技術]
フィブロネクチンは、動物の種々の組織や体液中、また
、培養細胞表面などに広く分布する多機能糖タンパク質
であり、細胞の接着、伸展、移動、分化、増殖、償食作
用などの生理作用を示し、組織修復、組織構築、生体防
御などに関与していることが知られている。
、培養細胞表面などに広く分布する多機能糖タンパク質
であり、細胞の接着、伸展、移動、分化、増殖、償食作
用などの生理作用を示し、組織修復、組織構築、生体防
御などに関与していることが知られている。
フィブロネクチンは、分子量約25万のポリペプチドが
C末端付近でS−S結合で2量体を形成している。分子
内アミノ酸配列に、繰返し構造を有し、■、■、■型に
分けちれる。更に、種々の機能を有するドメイン構造を
有し、細胞接着、コラーゲン、ヘパリン及びフィブリン
等に対する結合活性を示す。これらのドメインのうち、
細胞接着ドメインについては、その生物活性から産業上
の利用が考えられており、例えば、培養基質のコーティ
ング剤として、細胞が付着する基質の調製に使用するこ
とができる。
C末端付近でS−S結合で2量体を形成している。分子
内アミノ酸配列に、繰返し構造を有し、■、■、■型に
分けちれる。更に、種々の機能を有するドメイン構造を
有し、細胞接着、コラーゲン、ヘパリン及びフィブリン
等に対する結合活性を示す。これらのドメインのうち、
細胞接着ドメインについては、その生物活性から産業上
の利用が考えられており、例えば、培養基質のコーティ
ング剤として、細胞が付着する基質の調製に使用するこ
とができる。
また、細胞付着の促進剤として、点眼液、ローション、
外傷治療薬等に使用することができる。
外傷治療薬等に使用することができる。
フィブロネクチンの細胞接着ドメインの基本構造につい
て汀、その最小必要単位としてR−G−D−8配列が明
らかにされており〔ネーチャー(Nature )第3
09巻、第60〜56頁(1984)]、この配列を含
む108アミノ酸残基からなる分−Fil、15万のポ
リペプチドが、細胞接着活性ペプチドとして特表昭59
−501548号公報に記載されている。
て汀、その最小必要単位としてR−G−D−8配列が明
らかにされており〔ネーチャー(Nature )第3
09巻、第60〜56頁(1984)]、この配列を含
む108アミノ酸残基からなる分−Fil、15万のポ
リペプチドが、細胞接着活性ペプチドとして特表昭59
−501548号公報に記載されている。
しかしながら、この分子量1.15万のポリペプチドの
細胞接着活性は、天然のフィブロネクチンに比べて非常
に弱く、前記の用途として用いるには必ずしも実用的と
はいい難い。このことについては、例えばジャーナル
オン バイオロジカル ケミストリー(J、 Biol
、、 Ohem、 )第260巻、第13256〜15
260頁(1985)に記載されている。また、本発明
者らは、前記分子i1.j5万のポリペプチドを遺伝子
工学的に製造し、そのNRK細1@(ラット腎細胞)に
対する細胞接着活性を、天然のフィブロネクチンと比較
した。その結果、フィブロネクチンは[11〜1μ?/
ウエルで活性がみられたのに対し、公刊[,15万のポ
リペプチドでに40μm/ウェルでも活性は認めらiな
かった。
細胞接着活性は、天然のフィブロネクチンに比べて非常
に弱く、前記の用途として用いるには必ずしも実用的と
はいい難い。このことについては、例えばジャーナル
オン バイオロジカル ケミストリー(J、 Biol
、、 Ohem、 )第260巻、第13256〜15
260頁(1985)に記載されている。また、本発明
者らは、前記分子i1.j5万のポリペプチドを遺伝子
工学的に製造し、そのNRK細1@(ラット腎細胞)に
対する細胞接着活性を、天然のフィブロネクチンと比較
した。その結果、フィブロネクチンは[11〜1μ?/
ウエルで活性がみられたのに対し、公刊[,15万のポ
リペプチドでに40μm/ウェルでも活性は認めらiな
かった。
本発明の目的は、フィブロネクチンの細胞結合ドメイン
ペプチドとして、実質的に細胞接着活性を有するアミノ
酸配列を明らかにし、その製造方法を提供することにあ
る。
ペプチドとして、実質的に細胞接着活性を有するアミノ
酸配列を明らかにし、その製造方法を提供することにあ
る。
本発明を概説すれば、本発明の第1の発明はポリペプチ
ドに関する発明であって、フィブロネクチンと実質上同
等の細胞接着活性を有していることを特徴とする。
ドに関する発明であって、フィブロネクチンと実質上同
等の細胞接着活性を有していることを特徴とする。
また、本発明の第2の発明はDNAに関する発明であっ
て、上記第1の発明のポリペプチドをコードすることを
特徴とする。
て、上記第1の発明のポリペプチドをコードすることを
特徴とする。
更に、本発明の第3の発明にポリペプチドの製造方法に
関する発明であって、上記第2の発明のDNA配列が組
込まれたベクターが導入された大腸菌を培養し、培養物
より前記第1の発明のポリペプチドを採取することを特
徴とする。
関する発明であって、上記第2の発明のDNA配列が組
込まれたベクターが導入された大腸菌を培養し、培養物
より前記第1の発明のポリペプチドを採取することを特
徴とする。
前記課題を解決する手段としては、フィブロネクチンの
細胞結合ドメインに相当する種々の鎖長のポリペプチド
全コードするDNA配列を発現ベクターに接続し、宿主
細胞に導入して、目的とするポリペプチドを生産させ、
それぞれを単離して、細胞接着活性を測定することによ
り解決される。実際、そのような手段により、公刊[1
5万のポリペプチドには、細胞接着活性がほとんどない
こと、しかし、そのN末側を延長した283アミノ酸残
基から成るポリペプチドには天然のフィブロネクチンと
ほぼ同等の細胞接着活性があることなどが、本発明者ら
によって見出された。本発明は、これらの知見に基づい
て達成された。
細胞結合ドメインに相当する種々の鎖長のポリペプチド
全コードするDNA配列を発現ベクターに接続し、宿主
細胞に導入して、目的とするポリペプチドを生産させ、
それぞれを単離して、細胞接着活性を測定することによ
り解決される。実際、そのような手段により、公刊[1
5万のポリペプチドには、細胞接着活性がほとんどない
こと、しかし、そのN末側を延長した283アミノ酸残
基から成るポリペプチドには天然のフィブロネクチンと
ほぼ同等の細胞接着活性があることなどが、本発明者ら
によって見出された。本発明は、これらの知見に基づい
て達成された。
以下、l1ji ’に追って、本発明を具体的に説明す
る。
る。
ヒトフィブロネクチンの全アミノ酸配列及びソノCDN
A 配列ID、ジ エムボ ジャーナル(The EM
BOJournal )第4巻、第1755〜1759
頁(1985)に記載されている。その細胞接着ドメイ
ンのアミノ酸配列から、対応するcDNA kクローニ
ングする手段は公知であり、例えばヒト肝臓からポリA
を含むRNA画分を調製し、岡山−バーブ法あるいは、
ガブラーーホフマン(Gubler −Hoffman
n ’)法等によりcDNAライブラリーを作製するこ
とができる。
A 配列ID、ジ エムボ ジャーナル(The EM
BOJournal )第4巻、第1755〜1759
頁(1985)に記載されている。その細胞接着ドメイ
ンのアミノ酸配列から、対応するcDNA kクローニ
ングする手段は公知であり、例えばヒト肝臓からポリA
を含むRNA画分を調製し、岡山−バーブ法あるいは、
ガブラーーホフマン(Gubler −Hoffman
n ’)法等によりcDNAライブラリーを作製するこ
とができる。
一方、その様なcDNAライブラIJ −U市販されて
お沙、例えばクローンチック社より購入することができ
る。cDNAライブラリーから目的のcDNAクローン
ケ得る方法としては、アミノ酸配列に対応しfcDNA
’iプローブとするコロニーハイブリダイゼーションあ
るいはブラークツ1イブリダイゼーシヨンが用いられる
。プローブとハイブリダイズするクローンを選択し、培
養菌体あるいはファージ溶菌液からDNA’i抽出し、
制限酵素で切断する。電気泳動にかけてインサートの確
認を行う。必要とあれば、サザンプロツテイングにより
、インサートが、プローブとハイブリダイズすることの
確認を行う。最終的にはインサートの塩基配列をダイデ
オキシ(dideoxy )法等の方法で調べることに
より、目的のクローンを同定することができる。
お沙、例えばクローンチック社より購入することができ
る。cDNAライブラリーから目的のcDNAクローン
ケ得る方法としては、アミノ酸配列に対応しfcDNA
’iプローブとするコロニーハイブリダイゼーションあ
るいはブラークツ1イブリダイゼーシヨンが用いられる
。プローブとハイブリダイズするクローンを選択し、培
養菌体あるいはファージ溶菌液からDNA’i抽出し、
制限酵素で切断する。電気泳動にかけてインサートの確
認を行う。必要とあれば、サザンプロツテイングにより
、インサートが、プローブとハイブリダイズすることの
確認を行う。最終的にはインサートの塩基配列をダイデ
オキシ(dideoxy )法等の方法で調べることに
より、目的のクローンを同定することができる。
フィブロネクチンの細胞接着ドメインをコードするcD
llA fi(組込んだベクターは必要に応じて宿主内
で増幅され、精製され、更に、制限酵素による切断によ
りcDliA部分を切出し、電気泳動によりcDNA断
片を精製することができる。
llA fi(組込んだベクターは必要に応じて宿主内
で増幅され、精製され、更に、制限酵素による切断によ
りcDliA部分を切出し、電気泳動によりcDNA断
片を精製することができる。
このcDNA断片を、発現が可能なベクターに読取り)
V−ムが合うようにDNAリガーゼで接続し、宿主細胞
に導入することにより、cDNAの発現が可能となる。
V−ムが合うようにDNAリガーゼで接続し、宿主細胞
に導入することにより、cDNAの発現が可能となる。
大腸菌?宿主とする発現ベクターとしては、既存のすべ
てのベクターが使用可能であるが、好ましくは、プロモ
ーター活性が強く、誘導発現が可能な宿主−ベクター系
を用いる。そのようなベクターとしては、例えば、λP
Lプロモーターを組込んだベクター、1ac7’c+モ
ーターを組込んだベクター、trpプ0モーターに組込
んだベクター、pstsプロモーターを組込んだベクタ
ー、1acとtrpの両プロモーターヲ組込んだベクタ
ー、1ppブロモ−ターを組込んだベクター、1ppと
lacの両プロモーターを組込んだベクター等が知られ
ている(榊 佳之著「ベクターDNA」、講談社すイエ
ンテイフィク、1986年)。
てのベクターが使用可能であるが、好ましくは、プロモ
ーター活性が強く、誘導発現が可能な宿主−ベクター系
を用いる。そのようなベクターとしては、例えば、λP
Lプロモーターを組込んだベクター、1ac7’c+モ
ーターを組込んだベクター、trpプ0モーターに組込
んだベクター、pstsプロモーターを組込んだベクタ
ー、1acとtrpの両プロモーターヲ組込んだベクタ
ー、1ppブロモ−ターを組込んだベクター、1ppと
lacの両プロモーターを組込んだベクター等が知られ
ている(榊 佳之著「ベクターDNA」、講談社すイエ
ンテイフィク、1986年)。
また、発現されたペプチドが分泌可能なように、シグナ
ルペプチド遺伝子の下流に外来遺伝子を挿入できるベク
ターを利用することもできる。
ルペプチド遺伝子の下流に外来遺伝子を挿入できるベク
ターを利用することもできる。
目的のポリペプチドの遺伝子をシグナルペプチド遺伝子
の下流に接続できるような発現ベクター%6るいUi接
発現ベクターを用いてペプチドを発現させる場合、ベク
ターとの接続において、目的ポリペプチドのN末にベク
ター由来の数個のアミノ酸配列が含まれる場合がある。
の下流に接続できるような発現ベクター%6るいUi接
発現ベクターを用いてペプチドを発現させる場合、ベク
ターとの接続において、目的ポリペプチドのN末にベク
ター由来の数個のアミノ酸配列が含まれる場合がある。
これらの配列が付加することによって、ポリペプチドの
細胞接着活性が本質的に変化することはなく、そのまま
使用することができる。しかし、これらの配列を必要に
応じて遺伝子工学的に除去することもできる。これに、
部位特異的変位導入と呼ばれ、確立された技術である。
細胞接着活性が本質的に変化することはなく、そのまま
使用することができる。しかし、これらの配列を必要に
応じて遺伝子工学的に除去することもできる。これに、
部位特異的変位導入と呼ばれ、確立された技術である。
一般的には、異種のペプチドが大腸菌で発現した場合、
異種ペプチドが宿主の生育に有害となることが多いので
、あらかじめ、プロモーター’) プVツサ一の存在下
に生育させたのち、リプレッサー全不活化するか、イン
デューサーを添加することにより、異種ペプチドの発現
を誘導する方法がとられるが、異種ペプチドが宿主大腸
菌に有害でない場合は、この限りでにない。
異種ペプチドが宿主の生育に有害となることが多いので
、あらかじめ、プロモーター’) プVツサ一の存在下
に生育させたのち、リプレッサー全不活化するか、イン
デューサーを添加することにより、異種ペプチドの発現
を誘導する方法がとられるが、異種ペプチドが宿主大腸
菌に有害でない場合は、この限りでにない。
本発明で発現させるポリペプチドは、宿主大腸菌に有害
とはいえないので、必ずしも誘導発現に限定する必要は
ない。
とはいえないので、必ずしも誘導発現に限定する必要は
ない。
細胞接着ポリペプチドの遺伝子を組込んだベクターを常
法によ)大腸菌に導入し、形質転換大腸菌を、発現に適
した条件下に培養し、目的ポリペプチドを発現させるこ
とができる。目的ポリペプチドの発現の確認には、イム
ノブロッティングの手法を用いることができ、例えば培
養菌体に、19DI9を含むバッファーを加えて加熱し
、全タンパク質を可溶化した後、ポリアクリルアミド電
気泳動にかける。泳動パターンをニトロセルロースやナ
イロンのメンプランに移し取り、フィブロネクチンの細
胞接着ドメインに特異的なモノクローナル抗体を作用さ
せ、更に酵素標識第2抗体を結合させる。結合した第2
抗体の酵素活性を、発色基質で発色させることにより、
目的のポリペプチドのバンドを確認することができる。
法によ)大腸菌に導入し、形質転換大腸菌を、発現に適
した条件下に培養し、目的ポリペプチドを発現させるこ
とができる。目的ポリペプチドの発現の確認には、イム
ノブロッティングの手法を用いることができ、例えば培
養菌体に、19DI9を含むバッファーを加えて加熱し
、全タンパク質を可溶化した後、ポリアクリルアミド電
気泳動にかける。泳動パターンをニトロセルロースやナ
イロンのメンプランに移し取り、フィブロネクチンの細
胞接着ドメインに特異的なモノクローナル抗体を作用さ
せ、更に酵素標識第2抗体を結合させる。結合した第2
抗体の酵素活性を、発色基質で発色させることにより、
目的のポリペプチドのバンドを確認することができる。
大腸菌からの細胞接着ポリペプチドの精製は、例えば次
のようにする。集菌した菌体ベレツトをバッファーに懸
濁し、超音波処理により可溶性画分と不溶性画分に分け
、後者は、更に7M尿素を含むバッファーで可溶化する
。可溶性画分ヲ集めて、イムノブロッティングで用いた
抗体を結合させたモアロース4Eカラムにかけ、アフイ
ニテイ精製を行う。溶出に1jpH2付近のパンファー
を用いる。イムノブロッティングにより、目的ポリペプ
チド画分を集めることにより、電気泳動的にほぼ単一の
ポリペプチドを得ることができる。必要とちれば、FP
L(1!又はHPL(!で更に精製することができる。
のようにする。集菌した菌体ベレツトをバッファーに懸
濁し、超音波処理により可溶性画分と不溶性画分に分け
、後者は、更に7M尿素を含むバッファーで可溶化する
。可溶性画分ヲ集めて、イムノブロッティングで用いた
抗体を結合させたモアロース4Eカラムにかけ、アフイ
ニテイ精製を行う。溶出に1jpH2付近のパンファー
を用いる。イムノブロッティングにより、目的ポリペプ
チド画分を集めることにより、電気泳動的にほぼ単一の
ポリペプチドを得ることができる。必要とちれば、FP
L(1!又はHPL(!で更に精製することができる。
このようにして得られたポリペプチドが細胞接着活性を
有するか否かに例えば次のようにして調べる。
有するか否かに例えば次のようにして調べる。
パンファーに溶かしたサンプルを、マイクロタイタープ
レートに吸看させた後、IIIRK細胞(正常ラント腎
a3胞)の懸濁液を添加し、37℃で1時間培養後、細
胞の形態変化により接着活性の有無を観察する。接着活
性を発現するウェル当りの最少ffi’?天然のフィブ
ロネクチンと比較することにより、接着活性の強さを表
すことができる。
レートに吸看させた後、IIIRK細胞(正常ラント腎
a3胞)の懸濁液を添加し、37℃で1時間培養後、細
胞の形態変化により接着活性の有無を観察する。接着活
性を発現するウェル当りの最少ffi’?天然のフィブ
ロネクチンと比較することにより、接着活性の強さを表
すことができる。
このようにして、フィブロネクチンの細胞接着ドメイン
に相当するいくつかのポリペプチドを遺伝子工学的に製
造し、その生物活性を調べることにより、接着活性発現
に必要かつ十分なポリペプチド配列が明らかとなった。
に相当するいくつかのポリペプチドを遺伝子工学的に製
造し、その生物活性を調べることにより、接着活性発現
に必要かつ十分なポリペプチド配列が明らかとなった。
後記表1に得られたポリペプチドの細胞接着活性をフィ
ブロネクチンと比較して示した。この結果からA1a1
235 M θ1,1517−2含むポリペプチドは
、実質的にフィブロネクチンと同等の強い細胞接着活性
を有することが明らかとなった。細胞接着活性を有する
ポリペプチドは、そのまま、あるいは、三官能架橋剤を
介して他のペプチドと結合させて使用することができる
。他のペプチドと結合させる方法としては、例えば、ペ
プチドのC末端にCys残基を付加しておき、Oys残
基全基金架橋剤えば3−(2−ピリジルジチオ)プロピ
オン酸−N−ヒドロキシスクシンイミドエステルを介し
て、他のペプチドのアミノ基と結合させる方法がとられ
る。ペプチドのC末端にCys残基全基金付加ことは遺
伝子工学的に容易に達成することができ、例えば、目的
のポリペプチド?コードする遺伝子をクローニングする
際に6′末端を07日に対応するコドンを付加した合成
りNAで置き換えればよい。
ブロネクチンと比較して示した。この結果からA1a1
235 M θ1,1517−2含むポリペプチドは
、実質的にフィブロネクチンと同等の強い細胞接着活性
を有することが明らかとなった。細胞接着活性を有する
ポリペプチドは、そのまま、あるいは、三官能架橋剤を
介して他のペプチドと結合させて使用することができる
。他のペプチドと結合させる方法としては、例えば、ペ
プチドのC末端にCys残基を付加しておき、Oys残
基全基金架橋剤えば3−(2−ピリジルジチオ)プロピ
オン酸−N−ヒドロキシスクシンイミドエステルを介し
て、他のペプチドのアミノ基と結合させる方法がとられ
る。ペプチドのC末端にCys残基全基金付加ことは遺
伝子工学的に容易に達成することができ、例えば、目的
のポリペプチド?コードする遺伝子をクローニングする
際に6′末端を07日に対応するコドンを付加した合成
りNAで置き換えればよい。
本発明のポリペプチドの列としては下記のものが挙げら
れる。
れる。
すなわち、少なくとも下記一般式■で表されるアミノ酸
配列を含むものがある: −・・〔■〕 また、上記一般式!で表されるアミノ酸配列のC末端に
Cy8残基が付加したものがある。
配列を含むものがある: −・・〔■〕 また、上記一般式!で表されるアミノ酸配列のC末端に
Cy8残基が付加したものがある。
以下、本発明を実施列により更に具体的に説明するが、
本発明はこれら実施例に限定されない。
本発明はこれら実施例に限定されない。
実施例1
フィブロネクチンの工1e”0−Met1517(10
8アミノ酸残基)をコードするcDNA断片のクローニ
ング(第1図参照) なお、第1図は、フィブロネクチンの工1e141G−
Mθt1517 f含むポリペプチドをコードするDN
A配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す図
である。
8アミノ酸残基)をコードするcDNA断片のクローニ
ング(第1図参照) なお、第1図は、フィブロネクチンの工1e141G−
Mθt1517 f含むポリペプチドをコードするDN
A配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す図
である。
(1−1) cDNA断片の調製
フィブロネクチンの細胞接着ドメインをコードするcD
NA配列を含む4.1kbのプラスミドpLF 5 [
バイオケミストリー(Biochemistry )第
25巻、第4936〜4941頁(1986)]10[
]μりを、制限酵素Bad I用バッファー及び100
−1=ツトのBad l f含む200 plの反応液
中、37℃、2時間インキュベートした。
NA配列を含む4.1kbのプラスミドpLF 5 [
バイオケミストリー(Biochemistry )第
25巻、第4936〜4941頁(1986)]10[
]μりを、制限酵素Bad I用バッファー及び100
−1=ツトのBad l f含む200 plの反応液
中、37℃、2時間インキュベートした。
反応液を、ニュクレオジエン(nucleogen )
社製HPLOカラムDEAE−4000(6X 12
5 wm )にかけ、5M尿素を含む30 mM リ
ン酸カリウムパンファー(pH&5)中でKCtの濃度
勾配で溶出し、イソプロピルアルコール沈殿により、Q
、 75 kb の断片Z5μ??得た。次に、この断
片を30ユニツトのFok Iで37℃、1時間処理し
、同様の精製方法で92 bpと205 bpの断片を
それぞれ60 +1及び140 nf得た。
社製HPLOカラムDEAE−4000(6X 12
5 wm )にかけ、5M尿素を含む30 mM リ
ン酸カリウムパンファー(pH&5)中でKCtの濃度
勾配で溶出し、イソプロピルアルコール沈殿により、Q
、 75 kb の断片Z5μ??得た。次に、この断
片を30ユニツトのFok Iで37℃、1時間処理し
、同様の精製方法で92 bpと205 bpの断片を
それぞれ60 +1及び140 nf得た。
(1−2) 合成りNAリンカ−の調製cDNA断片
をベクターに接続するための5′側及び6′側リンカ−
を、次の方法により化学合成した。塩基配列は、第1図
に示しである。5′側リンカ−の上のストランド(鎖長
11 )i5U。
をベクターに接続するための5′側及び6′側リンカ−
を、次の方法により化学合成した。塩基配列は、第1図
に示しである。5′側リンカ−の上のストランド(鎖長
11 )i5U。
下のストランド(鎖長7)ft5IJ、また5′側リン
カ−の上のストランド(鎖長5o)Isa。
カ−の上のストランド(鎖長5o)Isa。
下のストランド(鎖長5o)I3hと名付けてそれぞれ
アプライドバイオシステムズ社のDNA合成機を用いて
合成した。脱保護の後、5U及び5 Lij(オン交換
HPLO(T8’にゲルDEAE−2000)で精製ち
、5epPak (ウォーターズ社)で脱塩し、それ
ぞれ60μ?、40μ?を得た。3U及び5Lに7M尿
素を含む12%ポリアクリルアミドゲル電気泳動で分離
し、ゲル片から抽出後、同様に脱塩して、それぞれ32
μ?、26μVを得た。塩基配列は、固相マキサム・ギ
ルバート法で確認した。各ストランドは次の方法により
5′末端k +)ン酸化し念。すなわち、25μmのD
NA110μtの蒸留水に溶かし、PNK(ポリヌクレ
オチドキナーゼ)用バッファー(50mMl−リス(T
rie ) HCl。
アプライドバイオシステムズ社のDNA合成機を用いて
合成した。脱保護の後、5U及び5 Lij(オン交換
HPLO(T8’にゲルDEAE−2000)で精製ち
、5epPak (ウォーターズ社)で脱塩し、それ
ぞれ60μ?、40μ?を得た。3U及び5Lに7M尿
素を含む12%ポリアクリルアミドゲル電気泳動で分離
し、ゲル片から抽出後、同様に脱塩して、それぞれ32
μ?、26μVを得た。塩基配列は、固相マキサム・ギ
ルバート法で確認した。各ストランドは次の方法により
5′末端k +)ン酸化し念。すなわち、25μmのD
NA110μtの蒸留水に溶かし、PNK(ポリヌクレ
オチドキナーゼ)用バッファー(50mMl−リス(T
rie ) HCl。
pH7,6,10mM Mg0L、、 10mMDTT
]、1mMATP及び5ユニツトのPNKケ含む20μ
tの溶液中で37℃、1時間インキュベートし、65℃
、10分の処理で反応を停止した。リン酸化の後5Uと
5L、3Uと31.z−それぞれアニーリング操作によ
り、2重鎖とした。
]、1mMATP及び5ユニツトのPNKケ含む20μ
tの溶液中で37℃、1時間インキュベートし、65℃
、10分の処理で反応を停止した。リン酸化の後5Uと
5L、3Uと31.z−それぞれアニーリング操作によ
り、2重鎖とした。
すなわち、5Uと5Lを等量混ぜて、60℃に10分間
保持した後徐々に室温に戻し、更に15℃まで冷却した
。3Uと6Lについても同様に処理した。
保持した後徐々に室温に戻し、更に15℃まで冷却した
。3Uと6Lについても同様に処理した。
(1−3) cDNA断片とリンカ−の結合(1−2
)で調製した2種のリンカ−及び(1−1)で調製した
2種のIINA断片(92bp及び2o3bp)k用い
て、ライゲーション反応に供した。すなわちcDNA断
片各115 pmole、!J y yb −各5 p
moleを、ライゲーションバッファ −(66mM
ト リ ス HCl、 pH7,6、6,6m
MMgOL、 )、α5mM ATP、10mM DT
T及ヒ2.8ユニツトのT4DNAリガーゼを含む20
μtの溶液中で16℃、−夜インキユベートした。反応
液を65℃、10分処理した後2倍量の冷エタノールを
加えて、−70℃に30分保持した後遠心によりDNA
’i沈殿として回収した。これk、EcoRエバツファ
ー、7.5ユニツトのEcoR工f含む20μtの反応
液中、37℃、30分インキュベートした後、ポリアク
リルアミド電気泳動にかけて536 ’bpの断片を切
出シ、ゲル溶出バッファー(15M酢酸アンモニウム、
[lL01M酢酸マグネシウム、1mMEDTA )で
37℃、10時間抽出しエタノール沈殿により、DNA
1回収した。これヲ20μtのTE(10mMトリスH
C6,1mMEDTム、pHao)に溶かした。
)で調製した2種のリンカ−及び(1−1)で調製した
2種のIINA断片(92bp及び2o3bp)k用い
て、ライゲーション反応に供した。すなわちcDNA断
片各115 pmole、!J y yb −各5 p
moleを、ライゲーションバッファ −(66mM
ト リ ス HCl、 pH7,6、6,6m
MMgOL、 )、α5mM ATP、10mM DT
T及ヒ2.8ユニツトのT4DNAリガーゼを含む20
μtの溶液中で16℃、−夜インキユベートした。反応
液を65℃、10分処理した後2倍量の冷エタノールを
加えて、−70℃に30分保持した後遠心によりDNA
’i沈殿として回収した。これk、EcoRエバツファ
ー、7.5ユニツトのEcoR工f含む20μtの反応
液中、37℃、30分インキュベートした後、ポリアク
リルアミド電気泳動にかけて536 ’bpの断片を切
出シ、ゲル溶出バッファー(15M酢酸アンモニウム、
[lL01M酢酸マグネシウム、1mMEDTA )で
37℃、10時間抽出しエタノール沈殿により、DNA
1回収した。これヲ20μtのTE(10mMトリスH
C6,1mMEDTム、pHao)に溶かした。
(1−4) リンカ−を結合したcDNA断片とベク
ターの結合 1μmの分泌型発現ベクターpIN Ill−ompA
l〔ジ エムボ ジャーナル、第6巻、第2437〜2
442頁(1984)〕?制限酵素EcoRI用パンフ
ァー中5ユニットのEcoR工と共に57℃、1時間イ
ンキユベートシ、次いテ0.5ユニットのアルカリホス
ファターゼを加え、更に1時間インキユベートシ念。反
応液をフェノール処理(2回)した後、エタノール沈殿
により、Q、5μ7のDNA’i回収した。EcoR工
で切断し、脱リン酸したpIN ill omp A1
ベクター0.1p? と(1−s’)で得たDN
A断片の10μtをT4DNAリガーゼ用パンファー、
α5mMATP。
ターの結合 1μmの分泌型発現ベクターpIN Ill−ompA
l〔ジ エムボ ジャーナル、第6巻、第2437〜2
442頁(1984)〕?制限酵素EcoRI用パンフ
ァー中5ユニットのEcoR工と共に57℃、1時間イ
ンキユベートシ、次いテ0.5ユニットのアルカリホス
ファターゼを加え、更に1時間インキユベートシ念。反
応液をフェノール処理(2回)した後、エタノール沈殿
により、Q、5μ7のDNA’i回収した。EcoR工
で切断し、脱リン酸したpIN ill omp A1
ベクター0.1p? と(1−s’)で得たDN
A断片の10μtをT4DNAリガーゼ用パンファー、
α5mMATP。
10mMDTT及び2.8−L二7トのT4DNAリガ
〜ゼを含む60μtの反応液中、16℃、−夜インキユ
ペートした。この反応液15μtを大腸菌の形質転換に
使用した。
〜ゼを含む60μtの反応液中、16℃、−夜インキユ
ペートした。この反応液15μtを大腸菌の形質転換に
使用した。
(1−5) 大腸菌の形質転換
大腸菌S B 221 [ジ ェムボ ジャーナル、第
3巻、第2437〜2442頁(1984)]を5+d
(DL−グロス(バクトドリプトン、1゜1/1.酵母
エキス5 ? / L、 1Nac!t5 ? / L
。
3巻、第2437〜2442頁(1984)]を5+d
(DL−グロス(バクトドリプトン、1゜1/1.酵母
エキス5 ? / L、 1Nac!t5 ? / L
。
pH7,2)を含む20m容試験管で37℃、−夜振と
う培養した。その[105sa/i5w/の新しいL−
グロスに接種し、600 nmの吸光度が0.6になる
まで振とり培養した。これを氷冷し、4℃、5 D 0
0 rpmで5分間遠心し、上清を除去した。これにあ
らかじめ氷冷したQ、1MM g OL、を2.5d加
え混合した後、同様に遠心分離して上清を除去した。更
に、氷冷した0、1MCa Ol、を1.25−加え、
穏やかに混合し氷水中に30分間保持した。遠心分離に
より上清を除去した後、氷冷したCL I M 0a
C4f O,1−加え穏やかに懸濁した。これに、(1
−4)で得た反応液10μt’(加え、氷水中に30分
間保持した。次に、42℃で2分間加熱処理を行った。
う培養した。その[105sa/i5w/の新しいL−
グロスに接種し、600 nmの吸光度が0.6になる
まで振とり培養した。これを氷冷し、4℃、5 D 0
0 rpmで5分間遠心し、上清を除去した。これにあ
らかじめ氷冷したQ、1MM g OL、を2.5d加
え混合した後、同様に遠心分離して上清を除去した。更
に、氷冷した0、1MCa Ol、を1.25−加え、
穏やかに混合し氷水中に30分間保持した。遠心分離に
より上清を除去した後、氷冷したCL I M 0a
C4f O,1−加え穏やかに懸濁した。これに、(1
−4)で得た反応液10μt’(加え、氷水中に30分
間保持した。次に、42℃で2分間加熱処理を行った。
更に、37℃に加温したL培地を1−加え、37℃で3
0分間インキュベートした。更に 37℃で1時間振と
り培養した。培養液を、50μ22場のアンピシリンを
含むL寒天培地に塗布し、67℃で一夜培養し生育する
コロニーを分離した。その結果、約200のコロニーが
得られ、そのうちの14コロニーにつき、ブラスミドの
分析を行った。
0分間インキュベートした。更に 37℃で1時間振と
り培養した。培養液を、50μ22場のアンピシリンを
含むL寒天培地に塗布し、67℃で一夜培養し生育する
コロニーを分離した。その結果、約200のコロニーが
得られ、そのうちの14コロニーにつき、ブラスミドの
分析を行った。
(1−6) プラスミドの分析(ラピッド法)14糧
の形質転換体を50μf/−のアンピンリンを含むi、
5 Ntの一−ブロスで一夜振とり培養した後、遠心
分離により菌体ペレット全回収した。菌体を100μt
の溶液A (50mMグルコース、10mM EDT
A、25mM トリスHC4%pHao、2mI/−
リゾチーム)で懸濁し、室温に5分保持した後、200
μtの溶液B(α2 N NaOH,1%SDS )
e加え、容器を5回穏やかに転倒させ、0℃に10分保
持した、150μtの5M酢酸カリウム(pH5,0)
を加えた後、2倍量の冷エタノールを加え、−70℃で
30分保持した後、遠心分離によりDNA’i回収した
。これを80%エタノールで洗浄し、真空ポンプでエタ
ノール水を除去し、少量のTEに溶かした。その一部(
a1μ1)iEcoR工用バッファーと5ユニツトのB
e oRIを含む10μtの反応液中37℃で1時間反
応させた後、アガロース電気泳動で分離し、エチジラム
ブロマイド染色で予想されるDBIAのバンド(cL3
3kb) の生成を調べた。その結果、9クローンに
目的のバンドが認められた。これら9クローンについて
更にPvu IIとHlndIll(Z)2重消化を行
い、挿入断片の方向性?調べたところ、8クローンが正
しい方向に挿入されていた。これらのうちの5クローン
についてプラスミドからXba IとFind m
の2重消化で挿入断片を含むDNA;jz切出し、ファ
ージM13mp18及びmp19に組込んで、ダイデオ
キシ法による塩基配列分析を行ったところ、3クローン
が目的の配列を含むことを確認した。このようにして得
られた組換え体プラスミドf pTFlolと命名した
。
の形質転換体を50μf/−のアンピンリンを含むi、
5 Ntの一−ブロスで一夜振とり培養した後、遠心
分離により菌体ペレット全回収した。菌体を100μt
の溶液A (50mMグルコース、10mM EDT
A、25mM トリスHC4%pHao、2mI/−
リゾチーム)で懸濁し、室温に5分保持した後、200
μtの溶液B(α2 N NaOH,1%SDS )
e加え、容器を5回穏やかに転倒させ、0℃に10分保
持した、150μtの5M酢酸カリウム(pH5,0)
を加えた後、2倍量の冷エタノールを加え、−70℃で
30分保持した後、遠心分離によりDNA’i回収した
。これを80%エタノールで洗浄し、真空ポンプでエタ
ノール水を除去し、少量のTEに溶かした。その一部(
a1μ1)iEcoR工用バッファーと5ユニツトのB
e oRIを含む10μtの反応液中37℃で1時間反
応させた後、アガロース電気泳動で分離し、エチジラム
ブロマイド染色で予想されるDBIAのバンド(cL3
3kb) の生成を調べた。その結果、9クローンに
目的のバンドが認められた。これら9クローンについて
更にPvu IIとHlndIll(Z)2重消化を行
い、挿入断片の方向性?調べたところ、8クローンが正
しい方向に挿入されていた。これらのうちの5クローン
についてプラスミドからXba IとFind m
の2重消化で挿入断片を含むDNA;jz切出し、ファ
ージM13mp18及びmp19に組込んで、ダイデオ
キシ法による塩基配列分析を行ったところ、3クローン
が目的の配列を含むことを確認した。このようにして得
られた組換え体プラスミドf pTFlolと命名した
。
(1−7) プラスミドの精製
前記(1−6)で得られたpTF 101を導入した大
腸菌(SB 221 / pTF 101 ) を5
dのL−グロスに接種し、37℃、−夜振とう培養した
。
腸菌(SB 221 / pTF 101 ) を5
dのL−グロスに接種し、37℃、−夜振とう培養した
。
これを、500dの同培地に移して培養を続け、660
nmの吸光度がα6になった時点で170μm/ゴの
クロラムフエニコールヲ添加し、更に10〜12時間培
養した。5000rpm、10分間遠心し、菌体2sT
E(10mM トリスHC!t、 pH8,100m
M Na1l、 1 mM EDTA )で洗浄し
、同様に遠心分離でペレット’1回収した。10mの溶
液AK懸濁し、室温に5分保持し、史に20−の溶液P
を加え穏やかにかくはんし、0℃に5分間保持した。1
5N1.の3M酢酸カリウムを加え穏やかにかくはんし
た後、0℃に10分保持した。8DOOrpm、60分
遠心して45−の上清を得、これに27−(α6倍量)
のイノプロピルアルコールを加えて室温に15分保持し
た。遠心分離で沈殿を回収し、80%エタノールで洗浄
した。残存エタノール水を真空ポンプで除いて乾燥した
。これを、4−のTEに溶かし、4.751の塩化セシ
ウムを加え、更に5■/−のエチジウムブロマイドを4
20μを加え0℃に60分保持した。8000rpm、
10分間遠心し、不溶物を除去した上清をペックマン社
クイックシールチューブに入れ、55000回転で一夜
超遠心分離を行った。紫外線照射下にプラスミドのバン
ドを注射器で抜取った。等量のイソプロピルアルコール
で7回抽出してエチジウムブロマイドを除去した後、エ
タノール沈殿を2回、更111c80%エタノールで洗
浄して、真空乾燥後、適量のTRに溶かした(収量76
0μ?)。
nmの吸光度がα6になった時点で170μm/ゴの
クロラムフエニコールヲ添加し、更に10〜12時間培
養した。5000rpm、10分間遠心し、菌体2sT
E(10mM トリスHC!t、 pH8,100m
M Na1l、 1 mM EDTA )で洗浄し
、同様に遠心分離でペレット’1回収した。10mの溶
液AK懸濁し、室温に5分保持し、史に20−の溶液P
を加え穏やかにかくはんし、0℃に5分間保持した。1
5N1.の3M酢酸カリウムを加え穏やかにかくはんし
た後、0℃に10分保持した。8DOOrpm、60分
遠心して45−の上清を得、これに27−(α6倍量)
のイノプロピルアルコールを加えて室温に15分保持し
た。遠心分離で沈殿を回収し、80%エタノールで洗浄
した。残存エタノール水を真空ポンプで除いて乾燥した
。これを、4−のTEに溶かし、4.751の塩化セシ
ウムを加え、更に5■/−のエチジウムブロマイドを4
20μを加え0℃に60分保持した。8000rpm、
10分間遠心し、不溶物を除去した上清をペックマン社
クイックシールチューブに入れ、55000回転で一夜
超遠心分離を行った。紫外線照射下にプラスミドのバン
ドを注射器で抜取った。等量のイソプロピルアルコール
で7回抽出してエチジウムブロマイドを除去した後、エ
タノール沈殿を2回、更111c80%エタノールで洗
浄して、真空乾燥後、適量のTRに溶かした(収量76
0μ?)。
実施例2
フィブロネクチンのAla”s−Met15’ (2
B 5アミノ酸残基)をコードするcDNAのクローニ
ング(第2図参照) なお、第2図に、フィブロネクチンのA 1 a 12
35− M et1517 を含むポリペプチドをコ
ードするDNA配列を組込んだ発現プラスミドの構築の
工程を示す図である。
B 5アミノ酸残基)をコードするcDNAのクローニ
ング(第2図参照) なお、第2図に、フィブロネクチンのA 1 a 12
35− M et1517 を含むポリペプチドをコ
ードするDNA配列を組込んだ発現プラスミドの構築の
工程を示す図である。
50μノのプラスミドpLF 5 Q BcoRエメチ
ラーゼバソファ−(100mM トリスHOt、1)
”8012mM DTT、10mM EDTA、8
0μMS−アデノシルメチオニン)及び200ユニツト
のEcoRエメチラーゼを含む反応液200μを中で、
67℃、60分インキュベートしEcoRエサイトに保
護した。65℃、20分の処理で反応を停止した後、P
vu 11パンフアー及び96ユニツトのpvu nを
加え、反応液600μtとして67℃、60分間インキ
ュベートした。
ラーゼバソファ−(100mM トリスHOt、1)
”8012mM DTT、10mM EDTA、8
0μMS−アデノシルメチオニン)及び200ユニツト
のEcoRエメチラーゼを含む反応液200μを中で、
67℃、60分インキュベートしEcoRエサイトに保
護した。65℃、20分の処理で反応を停止した後、P
vu 11パンフアー及び96ユニツトのpvu nを
加え、反応液600μtとして67℃、60分間インキ
ュベートした。
これを、アガロース電気泳動にかけ、0.60kbの断
片を切出した。これを溶出バッファー(5mMトリス酢
酸バッファー、pHaOll mMEDTA)を含む透
析チューブに入れ、同ノくソファ−中で電気泳動溶出を
行ってDNA’i抽出した。抽出液に対し2回のフェノ
ール抽出を行った後、i/1o容量の6M酢酸ナトIJ
ウムを加え、史に、2倍量のエタノールを加えて、エタ
ノール沈殿を2回行った。80%エタノールで洗浄後乾
燥し、少量のTEに溶かした(収量1.2μ7)。
片を切出した。これを溶出バッファー(5mMトリス酢
酸バッファー、pHaOll mMEDTA)を含む透
析チューブに入れ、同ノくソファ−中で電気泳動溶出を
行ってDNA’i抽出した。抽出液に対し2回のフェノ
ール抽出を行った後、i/1o容量の6M酢酸ナトIJ
ウムを加え、史に、2倍量のエタノールを加えて、エタ
ノール沈殿を2回行った。80%エタノールで洗浄後乾
燥し、少量のTEに溶かした(収量1.2μ7)。
一方、実施例1で得たプラスミドpTF 101の14
01’k、144ユ=ツトのPvu I[k含む200
μtの反応液で37℃、60分インキュベートした後、
150ユニツトの1coR工を加えて、240μtの反
応液とし、37℃、60分インキュベートした。ポリア
クリルアミド電気泳動にかけ、0.25 kb の断片
を切出した。ゲル片から前述の方法でDNA’!i抽出
し、エタノール沈殿によfiDNA+i回収した(収量
cL4μ?)。先に得たa 6 kbの断片1.25μ
m とα25 k’b の断片Q、4μ? を2.8ユ
ニツトのT4 DNAリガーゼ、0.5mMATP及
び10mMDTT’i含む50μtのリガーゼバッファ
ー中で、16℃、60分インキュベートした。
01’k、144ユ=ツトのPvu I[k含む200
μtの反応液で37℃、60分インキュベートした後、
150ユニツトの1coR工を加えて、240μtの反
応液とし、37℃、60分インキュベートした。ポリア
クリルアミド電気泳動にかけ、0.25 kb の断片
を切出した。ゲル片から前述の方法でDNA’!i抽出
し、エタノール沈殿によfiDNA+i回収した(収量
cL4μ?)。先に得たa 6 kbの断片1.25μ
m とα25 k’b の断片Q、4μ? を2.8ユ
ニツトのT4 DNAリガーゼ、0.5mMATP及
び10mMDTT’i含む50μtのリガーゼバッファ
ー中で、16℃、60分インキュベートした。
反応液に92 pmoleのリン酸化リンカ−(I)C
OGAATTGG )及び1.4ユニツトのT4 DN
Aリガーゼを加え、液量70μt として10℃で一夜
インキユベートした。65℃、10分の処理で反応を止
め、バッファーf EcoR工至適条件KL、30ユニ
ツトのEc oR工を加工て、37℃、60分間反応さ
せた。反応液をアガロース電気泳動にかけ、186 k
l)のバンドを切出し、前述の方法でDIJAを回収し
た(約2 s tl )。
OGAATTGG )及び1.4ユニツトのT4 DN
Aリガーゼを加え、液量70μt として10℃で一夜
インキユベートした。65℃、10分の処理で反応を止
め、バッファーf EcoR工至適条件KL、30ユニ
ツトのEc oR工を加工て、37℃、60分間反応さ
せた。反応液をアガロース電気泳動にかけ、186 k
l)のバンドを切出し、前述の方法でDIJAを回収し
た(約2 s tl )。
[186kb 断片20nPと、EcoR工で切断し、
脱リン酸したベクターp工N−m−ompA1 の0
.1μFヲ2.8ユニツトのT4DNAリガーゼ、15
mMATP及び10mMDTTi含む20μtのリガー
ゼバッファー中、16℃、10時間インキュベートした
後、反応液の捧ヲ用いて、前述の方法で大腸菌5B22
1を形質転換させた。得られた形質転換体のうちの48
クローンについて前述の方法でプラスミド分析を行い、
6クローンに目的断片を含むプラスミドが検出された。
脱リン酸したベクターp工N−m−ompA1 の0
.1μFヲ2.8ユニツトのT4DNAリガーゼ、15
mMATP及び10mMDTTi含む20μtのリガー
ゼバッファー中、16℃、10時間インキュベートした
後、反応液の捧ヲ用いて、前述の方法で大腸菌5B22
1を形質転換させた。得られた形質転換体のうちの48
クローンについて前述の方法でプラスミド分析を行い、
6クローンに目的断片を含むプラスミドが検出された。
更に、これらのプラスミドf Bam H1消化して、
生成する断片を分析した結果、5クローンが正方向に挿
入された目的断片を含んでいた。更に、そのうちの3ク
ローンについて塩基配列を調べたところ、1つのクロー
ンが正しい塩基配列を持つことを確認した。この組換体
プラスミドを、pTF 301と命名し、このプラスミ
ドを保持する大腸菌5B221’i、エシェリヒア・コ
ーリ5B221 / pTF 301と命名した。次に
、pTF 301 isら、t 8 kb のEco
RニーSal l断片を切出し、これ1ipUc18
のBc oRニーSad Iサイトに接続して得られ
た組換え体プラスミドをpTli 1409と命名し、
そのプラスミドを保持する大腸菌HB 101 f
Escherichia coliHB 101 /
pTF1409 と命名して、表示し、工業技術院微
生物工業技術研究所に寄託した〔微工研菌寄第9716
号(FERM P 9716)]。
生成する断片を分析した結果、5クローンが正方向に挿
入された目的断片を含んでいた。更に、そのうちの3ク
ローンについて塩基配列を調べたところ、1つのクロー
ンが正しい塩基配列を持つことを確認した。この組換体
プラスミドを、pTF 301と命名し、このプラスミ
ドを保持する大腸菌5B221’i、エシェリヒア・コ
ーリ5B221 / pTF 301と命名した。次に
、pTF 301 isら、t 8 kb のEco
RニーSal l断片を切出し、これ1ipUc18
のBc oRニーSad Iサイトに接続して得られ
た組換え体プラスミドをpTli 1409と命名し、
そのプラスミドを保持する大腸菌HB 101 f
Escherichia coliHB 101 /
pTF1409 と命名して、表示し、工業技術院微
生物工業技術研究所に寄託した〔微工研菌寄第9716
号(FERM P 9716)]。
実施例6
フイプロネクチ7 cD Gay””−Met”17(
504アミノ酸残基)?コードするcDNAのクローニ
ング(第3図参照) なお、第3図は、フィブロネクチンの(31y 101
4M e t1517 2含むポリペプチドをコードす
るDNA配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を
示す図である。
504アミノ酸残基)?コードするcDNAのクローニ
ング(第3図参照) なお、第3図は、フィブロネクチンの(31y 101
4M e t1517 2含むポリペプチドをコードす
るDNA配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を
示す図である。
(3−1) ブライマー伸長法によるCDNA合成フ
ィブロネクチンmRNAに相補的な配列を有する17塩
基合成ブライマー(” pGTCTcccACTGAA
GTGC6′) +i前述の方法に従って調製した。
ィブロネクチンmRNAに相補的な配列を有する17塩
基合成ブライマー(” pGTCTcccACTGAA
GTGC6′) +i前述の方法に従って調製した。
この合成プライマーを用いてヒト肝臓由来ポリ(4)+
RNA (クローンチック社)から、cDNAを合成
した。
RNA (クローンチック社)から、cDNAを合成
した。
cDNA合成には、アマジャム社1”’ CDNA合成
システム」に含まれる試薬を用いた。すなわち、5×フ
ア一ストストランド合成パンファー4μt、 ピロリン
酸ナトリウム溶液1μt1 リボヌクレアーゼインピヒ
タ−1μt (20ユニツト)、デオキシ三リン酸混液
(10mll)2μt5 合成りNAプライマー1μt
(l11μ?)、〔α−”2p〕clcTP 5μO
1及びポリ(A)RNA 1μt(1μ?)ヲ水冷下エ
ツペシドルフチューブに順次加え、静かに混和した。2
0ユニツト(1μ?)の逆転写酵素と蒸留水を加えて全
量を20μtとし静かに混和した後、42℃で50分間
インキュベートした。これを水浴に戻し、セカンドスト
ランド合成用バッファー37.5μm、 [α−”p
、] acTP 50μC1(5μt)、 大腸菌リボ
ヌクンアーゼH(1,8ユニツト(1μt)、大腸菌D
NAポリメラーゼ1の23ユニツト(3,5μt)及び
水63μtを順次加え静かに混和した。12℃、60分
、次いで22℃、60分、史に70℃、10分インキュ
ベートし、水浴に戻し、2.0ユニツト([15μt)
のT4DNAポリメラーゼを加えた。静かに混和後、3
7℃、10分間インキュベートした。10μtノ[L2
5M EDTA (pHan )及び1optの10
%5DSi加えて反応を停止させた。フェノール抽出を
2回行った後、等量の4M酢酸アンモニウムを加え、更
に、2倍量の冷エタノールを加えてドライアイス中に1
5分保持後、室温に戻して、10分間遠心し上清を除い
た。
システム」に含まれる試薬を用いた。すなわち、5×フ
ア一ストストランド合成パンファー4μt、 ピロリン
酸ナトリウム溶液1μt1 リボヌクレアーゼインピヒ
タ−1μt (20ユニツト)、デオキシ三リン酸混液
(10mll)2μt5 合成りNAプライマー1μt
(l11μ?)、〔α−”2p〕clcTP 5μO
1及びポリ(A)RNA 1μt(1μ?)ヲ水冷下エ
ツペシドルフチューブに順次加え、静かに混和した。2
0ユニツト(1μ?)の逆転写酵素と蒸留水を加えて全
量を20μtとし静かに混和した後、42℃で50分間
インキュベートした。これを水浴に戻し、セカンドスト
ランド合成用バッファー37.5μm、 [α−”p
、] acTP 50μC1(5μt)、 大腸菌リボ
ヌクンアーゼH(1,8ユニツト(1μt)、大腸菌D
NAポリメラーゼ1の23ユニツト(3,5μt)及び
水63μtを順次加え静かに混和した。12℃、60分
、次いで22℃、60分、史に70℃、10分インキュ
ベートし、水浴に戻し、2.0ユニツト([15μt)
のT4DNAポリメラーゼを加えた。静かに混和後、3
7℃、10分間インキュベートした。10μtノ[L2
5M EDTA (pHan )及び1optの10
%5DSi加えて反応を停止させた。フェノール抽出を
2回行った後、等量の4M酢酸アンモニウムを加え、更
に、2倍量の冷エタノールを加えてドライアイス中に1
5分保持後、室温に戻して、10分間遠心し上清を除い
た。
ペンットを50μtのTEに溶かし、もう−度エタノー
ル沈殿を行い、更に沈殿を200μtの冷エタノールで
洗浄し、乾燥した後、少!のTEに溶かした。
ル沈殿を行い、更に沈殿を200μtの冷エタノールで
洗浄し、乾燥した後、少!のTEに溶かした。
i−2’) (!DNAのλgt10 ファージベ
クターへの接続と、インヒドロパンケージ ング 前項(s−1’)で得られたcDNA 、 [15f
i? のEcoRニリンカー(d[pGGAATTC!
(!、] ) リガーゼバッファー及び2.8ユニツ
トのT4 IINAリガ−ゼを含む反応液16.6μ
t il 5℃−夜インキユペートした後、70℃、1
0分の処理で反応を停止させた。パンファー’f(Ec
oRIの至適条件にした後、50ユニツトのEc oR
Iを加え、液量’1100μtとして37℃、2時間イ
ンキュベートした後、70℃、10分の処理で反応を止
めた。この全jtkセファデンクスG−50のカラム(
1i)にかけてSTBバッファー(100mMNaC2
、10mM ) リ ス HCl 、1mME
DTA、1)Hao )で溶出し、遊離のリンカ−に除
去した後、cDNAフラクションを、10mM ト
リ ス HC!t (pHELO) 、 11
1 mM EDTAに対して透析し、凍結乾燥し
た。これに363mM NaO4,10mM MgC4
f加えて4.5plとし、2μ? 10 / EcoR
I アーム(アマジャム社)[15μt (IllL2
5μ?)を加え、更に、5μtのDNAライゲーション
キット(宝酒造)Biを加え、26℃、10分インキユ
ベートシ、70℃、10分で反応を停止した。これを、
インビトロパンケージング反応に供した。すなわち、反
応液4μt2.2種のパンケージングエキストラクト(
ストラテジーン社)と静かに混和し、22℃、2時間イ
ンキュベートしてファージ粒子を形成させ、500μt
の8Mバッファー(100mM Na0t、 8 mM
Mg5O,,50mM)リスHC!t、 pH7,5
,0,01%ゼラチン)及び20μtのクロロホルムを
加え、4℃に保存した。
クターへの接続と、インヒドロパンケージ ング 前項(s−1’)で得られたcDNA 、 [15f
i? のEcoRニリンカー(d[pGGAATTC!
(!、] ) リガーゼバッファー及び2.8ユニツ
トのT4 IINAリガ−ゼを含む反応液16.6μ
t il 5℃−夜インキユペートした後、70℃、1
0分の処理で反応を停止させた。パンファー’f(Ec
oRIの至適条件にした後、50ユニツトのEc oR
Iを加え、液量’1100μtとして37℃、2時間イ
ンキュベートした後、70℃、10分の処理で反応を止
めた。この全jtkセファデンクスG−50のカラム(
1i)にかけてSTBバッファー(100mMNaC2
、10mM ) リ ス HCl 、1mME
DTA、1)Hao )で溶出し、遊離のリンカ−に除
去した後、cDNAフラクションを、10mM ト
リ ス HC!t (pHELO) 、 11
1 mM EDTAに対して透析し、凍結乾燥し
た。これに363mM NaO4,10mM MgC4
f加えて4.5plとし、2μ? 10 / EcoR
I アーム(アマジャム社)[15μt (IllL2
5μ?)を加え、更に、5μtのDNAライゲーション
キット(宝酒造)Biを加え、26℃、10分インキユ
ベートシ、70℃、10分で反応を停止した。これを、
インビトロパンケージング反応に供した。すなわち、反
応液4μt2.2種のパンケージングエキストラクト(
ストラテジーン社)と静かに混和し、22℃、2時間イ
ンキュベートしてファージ粒子を形成させ、500μt
の8Mバッファー(100mM Na0t、 8 mM
Mg5O,,50mM)リスHC!t、 pH7,5
,0,01%ゼラチン)及び20μtのクロロホルムを
加え、4℃に保存した。
(5−5) プラークハイブリダイゼー7ヨンファー
ジ液の100μtkあらかじめL−グロス+[14%マ
ルトースの培地で一夜培養し&大腸菌N M 514の
200μtに加え、37℃、15分インキュベートし、
42℃に加温した4−OL−軟寒天培地(L−グロス+
[18%寒天)に加え、あらかじめ調製した2O−OL
−寒天プレート上に重層した。37℃で一夜インキユベ
ートして得られ念プレート上にナイロンフィルター(ア
マジャム社、ハイボンドN)i50秒接触させた後、変
性溶液([15M RACl、1.5M Na06’)
で飽和した厚手の戸紙上に5分間量き、更に中和溶
液(0,5MトリスHC6,pH7,0。
ジ液の100μtkあらかじめL−グロス+[14%マ
ルトースの培地で一夜培養し&大腸菌N M 514の
200μtに加え、37℃、15分インキュベートし、
42℃に加温した4−OL−軟寒天培地(L−グロス+
[18%寒天)に加え、あらかじめ調製した2O−OL
−寒天プレート上に重層した。37℃で一夜インキユベ
ートして得られ念プレート上にナイロンフィルター(ア
マジャム社、ハイボンドN)i50秒接触させた後、変
性溶液([15M RACl、1.5M Na06’)
で飽和した厚手の戸紙上に5分間量き、更に中和溶
液(0,5MトリスHC6,pH7,0。
15 M Na06) で飽和した戸紙上に5分間静
置した。次に、2 X 88C(cL3 M NaC!
t、30 mMクエン酸ナトリウム、pH7,0)でフ
ィルターを洗浄し風乾した後、500 nmのUV照射
(5分間)により固定し、レプリカフィルターとした。
置した。次に、2 X 88C(cL3 M NaC!
t、30 mMクエン酸ナトリウム、pH7,0)でフ
ィルターを洗浄し風乾した後、500 nmのUV照射
(5分間)により固定し、レプリカフィルターとした。
一方、ハイブリダイゼーションニ用いるプローブを調製
した。すなわち、プラスミドpLF5の4μ?を、12
ユニツトのPvu II、次いで15ユニツトのEco
RIで分解し、アガロース電気泳動で0.43 kb
の断片100n? を回収した。これを、アマジャム社
[マルチプライムDNAラベリングシステム、」ヲ用い
て32pでラベルした。方法は添付のプロトコールに従
った。
した。すなわち、プラスミドpLF5の4μ?を、12
ユニツトのPvu II、次いで15ユニツトのEco
RIで分解し、アガロース電気泳動で0.43 kb
の断片100n? を回収した。これを、アマジャム社
[マルチプライムDNAラベリングシステム、」ヲ用い
て32pでラベルした。方法は添付のプロトコールに従
った。
得られた標識プローブは、60μtで5.5X10’c
pmであった。前述のレプリカフィルターを、6×5S
C15×デンハルト(Denharat )(BSA、
ポリビニルピロリドン、フィコール各Q、1%)、[1
1,5%SDS、80μ?/−サケ精子DB+Ai含む
15mjの溶液中で65℃、4時間インキュベートシ、
フレハイブリダイゼーションを行った。次に熱変性処理
した標識プローブ(2,75X10’ cpm)((加
え、同条件で一夜ハイブリダイゼーションを行った。フ
ィルター’1i2Xssc、cL1%SDSの洗液で6
5℃、15分のインキュベートを2回、次いでQ、 2
X SSO。
pmであった。前述のレプリカフィルターを、6×5S
C15×デンハルト(Denharat )(BSA、
ポリビニルピロリドン、フィコール各Q、1%)、[1
1,5%SDS、80μ?/−サケ精子DB+Ai含む
15mjの溶液中で65℃、4時間インキュベートシ、
フレハイブリダイゼーションを行った。次に熱変性処理
した標識プローブ(2,75X10’ cpm)((加
え、同条件で一夜ハイブリダイゼーションを行った。フ
ィルター’1i2Xssc、cL1%SDSの洗液で6
5℃、15分のインキュベートを2回、次いでQ、 2
X SSO。
CL1%SD8の洗液で65℃、15分のインキュベー
トを2回行った後2 X SSOで軽くリンスし、オー
トラジオグラフィーを行った。その結果、4X10”の
プラーク中に250のポジティブシグナルが認められた
。
トを2回行った後2 X SSOで軽くリンスし、オー
トラジオグラフィーを行った。その結果、4X10”の
プラーク中に250のポジティブシグナルが認められた
。
(3−4) ファージDNAの調製と挿入断片の分析
ポジティブシグナルを与えたファージクローンを1−0
8Mパンファーに懸濁し、その250μt2、あら力)
しめ−夜培養した大腸菌NM514の0.5tfに加え
、37℃、15分インキュベートして、ファージを吸着
させ、10mMMg、C! 4を含むL−グロス5dを
加え、37℃、4.5時間振とう培養した。50μtの
クロロホルムを加え、更に10分損色うした後、遠心分
離により上清(ファージ溶菌液)を得た。溶菌液に20
μmのDNase I 、 10 p? のRNaee
Aを加え、37℃、30分インキュベートした。
8Mパンファーに懸濁し、その250μt2、あら力)
しめ−夜培養した大腸菌NM514の0.5tfに加え
、37℃、15分インキュベートして、ファージを吸着
させ、10mMMg、C! 4を含むL−グロス5dを
加え、37℃、4.5時間振とう培養した。50μtの
クロロホルムを加え、更に10分損色うした後、遠心分
離により上清(ファージ溶菌液)を得た。溶菌液に20
μmのDNase I 、 10 p? のRNaee
Aを加え、37℃、30分インキュベートした。
更に0.29 ?のRhC1,[L55rのPFiG
6000を加えて、水中で2時間インキュベートした。
6000を加えて、水中で2時間インキュベートした。
遠心でべVットヲ回収し、4C1OμtのTEに懸濁し
た。フェノール抽出を2回、フェノール/クロロホルム
抽出を1回、クロロホルム抽1fi−1回行った後、エ
タノール沈殿により、ファージDNAを回収した。これ
を20μtのTEに溶かし、20ユニツトのEcoRI
ヲ含む60μtの反応液中で67℃、2時間インキュベ
ートし、アガロース電気泳動により、挿入断片の分析を
行った。その結果、24クローン中、1クローンに1.
1kbの挿入断片が認められた。この1.1kl)断片
をプラスミドpUC!118にサブクローニングし、得
られた組換え体プラスミドをpUFN 74と命名した
。これを用いて挿入断片の塩基配列をダイデオキシ法で
決定したところ、この断片はフィブロネクチンCD1i
A Cジ エムボ ジャーナル、第4巻、第1755〜
1759頁(1985)]の22990番のGから、4
105番目のAまでを含むことが判明した。
た。フェノール抽出を2回、フェノール/クロロホルム
抽出を1回、クロロホルム抽1fi−1回行った後、エ
タノール沈殿により、ファージDNAを回収した。これ
を20μtのTEに溶かし、20ユニツトのEcoRI
ヲ含む60μtの反応液中で67℃、2時間インキュベ
ートし、アガロース電気泳動により、挿入断片の分析を
行った。その結果、24クローン中、1クローンに1.
1kbの挿入断片が認められた。この1.1kl)断片
をプラスミドpUC!118にサブクローニングし、得
られた組換え体プラスミドをpUFN 74と命名した
。これを用いて挿入断片の塩基配列をダイデオキシ法で
決定したところ、この断片はフィブロネクチンCD1i
A Cジ エムボ ジャーナル、第4巻、第1755〜
1759頁(1985)]の22990番のGから、4
105番目のAまでを含むことが判明した。
但し、5018018番目、5065065番目321
6番目のCにそれぞれA、A、Tに置換していたが、ア
ミノ酸コードに変化になかった。
6番目のCにそれぞれA、A、Tに置換していたが、ア
ミノ酸コードに変化になかった。
(3−5) pUFN 74のEcoO109−Ba
mHl 断片の調製 40μiのpUFN 74に対し、200ユニツトのE
coo 109 を加え、400μtの反応液中、6
7℃、2時間インキュベートした。エタノール沈殿によ
り、DNAを回収し、そのVtを7mMトリ、z、HC
I、pH7,5,1mMEDTA。
mHl 断片の調製 40μiのpUFN 74に対し、200ユニツトのE
coo 109 を加え、400μtの反応液中、6
7℃、2時間インキュベートした。エタノール沈殿によ
り、DNAを回収し、そのVtを7mMトリ、z、HC
I、pH7,5,1mMEDTA。
20 mM NaC1,7mM Mg、C1l 2
0 μM dATP。
0 μM dATP。
cLGTP、 dc!TP、 dTTP 及び2ユニ
ツトのりVノウ酵素を含む200μtの反応液中、室温
、20分インキュベートした。65℃、10分で反応を
止め、反応液をライゲーションバッファーの組成とし、
2.5 nmoleのEc oRニリンカー(a[pc
caAATTOGa] ) 及び2.8ユニツトのT
4DNAリガーゼを加え、13℃、−夜インキユベート
した。加熱により反応を止め、6oユニツトのBamH
l、50ユニツトのEcoRTを含む400μt の反
応液中、37℃、2時間インキュベー トした。アガロ
ース電気泳動により1. Okbの断片0.2μmを得
た。
ツトのりVノウ酵素を含む200μtの反応液中、室温
、20分インキュベートした。65℃、10分で反応を
止め、反応液をライゲーションバッファーの組成とし、
2.5 nmoleのEc oRニリンカー(a[pc
caAATTOGa] ) 及び2.8ユニツトのT
4DNAリガーゼを加え、13℃、−夜インキユベート
した。加熱により反応を止め、6oユニツトのBamH
l、50ユニツトのEcoRTを含む400μt の反
応液中、37℃、2時間インキュベー トした。アガロ
ース電気泳動により1. Okbの断片0.2μmを得
た。
(3−6) pTF 301のEamHl −H1n
d in 断片の調製 50μ?のpTF 301に200ユニントのEcoR
エメチラーゼを加え、200μtの反応液とし、37℃
、1時間インキュベートした。
d in 断片の調製 50μ?のpTF 301に200ユニントのEcoR
エメチラーゼを加え、200μtの反応液とし、37℃
、1時間インキュベートした。
65℃、20分の処理後、6oユニツトのBanHl、
6O−L−::、/トのH1ncll’Th含む400
μtの反応液とし、37℃、2時間インキユベートシた
。アガロース電気泳動によりa 5 kbの断片0.1
μi を得た。
6O−L−::、/トのH1ncll’Th含む400
μtの反応液とし、37℃、2時間インキユベートシた
。アガロース電気泳動によりa 5 kbの断片0.1
μi を得た。
(3−7) G1ylO14−Met15’? (5
04アミノ酸残基)?コードするcDNA断片の構築 とクローニング (3−5)で得た1、Okb断片[L2μ?、(5−6
)で得た0、 5 k’b 断片α1μノ を100μ
1(D−yイゲー7ヨンバノファー中、2.8ユニツト
のT4DNAリガーゼを加え、16℃、−夜インキユベ
ートし、70℃、10分の処理で反応を止めた。反応液
f H1nd Ill 用バッファーとし、12ユニ
ツトのH1ndlll’に含む100μtの反応液を3
7℃、2時間インキュベートした。気に、パンファー1
EcoRI用の組成とし、10ユニツトのEcoR工f
加えて、37℃、2時間インキュベートし、加熱により
反応を止めた。
04アミノ酸残基)?コードするcDNA断片の構築 とクローニング (3−5)で得た1、Okb断片[L2μ?、(5−6
)で得た0、 5 k’b 断片α1μノ を100μ
1(D−yイゲー7ヨンバノファー中、2.8ユニツト
のT4DNAリガーゼを加え、16℃、−夜インキユベ
ートし、70℃、10分の処理で反応を止めた。反応液
f H1nd Ill 用バッファーとし、12ユニ
ツトのH1ndlll’に含む100μtの反応液を3
7℃、2時間インキュベートした。気に、パンファー1
EcoRI用の組成とし、10ユニツトのEcoR工f
加えて、37℃、2時間インキュベートし、加熱により
反応を止めた。
この反応液20μtをあらかじめEcoRニーH1nd
Ill処理して脱リン酸したプラスミドル工N m
−ompAlの[116μ?を2.8ユニツトのT4D
NAリガーゼ全含む60μtの反応液中、16℃、−夜
インキユベートした。反応液のA量を用いて大腸菌HE
101 を形質転換した。得らf′した形質転換体の
12クローンにつき挿入断片を調べたところ、5クロー
ンに1.5 kb の断片が認められた。その塩基配列
をダイチオキン法で決定し、フィブロネクチンノG1y
’°14からMfljt15”t ”−ドするCD11
A ’i含むプラスミドを得た。このプラスミドf p
TF 1101 と命名した。
Ill処理して脱リン酸したプラスミドル工N m
−ompAlの[116μ?を2.8ユニツトのT4D
NAリガーゼ全含む60μtの反応液中、16℃、−夜
インキユベートした。反応液のA量を用いて大腸菌HE
101 を形質転換した。得らf′した形質転換体の
12クローンにつき挿入断片を調べたところ、5クロー
ンに1.5 kb の断片が認められた。その塩基配列
をダイチオキン法で決定し、フィブロネクチンノG1y
’°14からMfljt15”t ”−ドするCD11
A ’i含むプラスミドを得た。このプラスミドf p
TF 1101 と命名した。
実施例4
部位特異的変異による付加配列の除去(第4図参照)
なお、第4−1図に、pTF 101における不要DN
A配列及びアミノ酸配列と、それを除去した後のDNA
配列及びアミノ酸配列を示す図であり、第4−2図μ、
部位特異的変異によるpTF 101 力>らの不要D
NA配列の除去の工程を示す図である。
A配列及びアミノ酸配列と、それを除去した後のDNA
配列及びアミノ酸配列を示す図であり、第4−2図μ、
部位特異的変異によるpTF 101 力>らの不要D
NA配列の除去の工程を示す図である。
pTF 101やpTF 301に挿入されているcD
NA断片を発現させると、シグナルペプチド以外にN末
にベクター由来の6アミノ酸が付加したペプチドが生成
される。シグナルペプチドは、宿主のシグナルペプチダ
ーゼにより除去されうるが、N末側に付加したアミノ酸
はそのままでに除去されない。そこで、この余分の3ア
ミノ酸?−一ドする9 bp の配列を部位特異的変異
により除去すること?試みた。方法は井上らの方法〔ゾ
ロシーデイングス オン ナショナルアカデミ−オン
サイエンス オン ザU、 S、A、 (Procee
dings of National Academy
of 5cience of the U、 S、 A
、 )第79巻、第6468〜3441頁(1982)
]に準じて行った(第4−1図、第4−2図)。
NA断片を発現させると、シグナルペプチド以外にN末
にベクター由来の6アミノ酸が付加したペプチドが生成
される。シグナルペプチドは、宿主のシグナルペプチダ
ーゼにより除去されうるが、N末側に付加したアミノ酸
はそのままでに除去されない。そこで、この余分の3ア
ミノ酸?−一ドする9 bp の配列を部位特異的変異
により除去すること?試みた。方法は井上らの方法〔ゾ
ロシーデイングス オン ナショナルアカデミ−オン
サイエンス オン ザU、 S、A、 (Procee
dings of National Academy
of 5cience of the U、 S、 A
、 )第79巻、第6468〜3441頁(1982)
]に準じて行った(第4−1図、第4−2図)。
5μ? のpTFIDlを、P日tlで切断した後、ク
ンノウ酵素を作用させ、粘着末端を平滑末端とし念。こ
れをエタノール沈殿により回収して40μtのTEに溶
かした(フラグメント1)。
ンノウ酵素を作用させ、粘着末端を平滑末端とし念。こ
れをエタノール沈殿により回収して40μtのTEに溶
かした(フラグメント1)。
一方、5 p? のpTF 101 f Xba l
−Hlnd Ill で切断し、挿入断片を含む領域を
除去し念断片を5%アクリルアミド電気泳動により回収
し、40μtのTEに溶かした(フラグメント2)。
−Hlnd Ill で切断し、挿入断片を含む領域を
除去し念断片を5%アクリルアミド電気泳動により回収
し、40μtのTEに溶かした(フラグメント2)。
更に、変異導入用オリゴヌクレオチドブライマー (d
GTAGOGcAGGcic!ATTG([0AAC!
AA )を合成し、20 pmo’le / μmのT
E浴溶液した。その25μt 2.5ユニツトのPNK
とα03mMATPを含む50μtのキナーゼバッファ
ー中、37℃、60分インキュベートし5′末端をリン
酸化した。α3μ?の7ラグメント1.0.28μ?の
7ラグメント2及び75 pmoleのオリゴヌクレオ
チドブライマーを、ポリメラーゼ−リガーゼバッファ=
(100mMNact、 &5mM トリス180
t、 pH7,5,8mM MgC1,,1mMメルカ
プトエタノール)を含む65μtの反応液中で3分間煮
沸した後、30℃で30分インキユヘートシ、更に4℃
で30分インキユペートシた。一部をアガロース電気泳
動にかけ、ペテロ二重鎖が形成されたことを確認した。
GTAGOGcAGGcic!ATTG([0AAC!
AA )を合成し、20 pmo’le / μmのT
E浴溶液した。その25μt 2.5ユニツトのPNK
とα03mMATPを含む50μtのキナーゼバッファ
ー中、37℃、60分インキュベートし5′末端をリン
酸化した。α3μ?の7ラグメント1.0.28μ?の
7ラグメント2及び75 pmoleのオリゴヌクレオ
チドブライマーを、ポリメラーゼ−リガーゼバッファ=
(100mMNact、 &5mM トリス180
t、 pH7,5,8mM MgC1,,1mMメルカ
プトエタノール)を含む65μtの反応液中で3分間煮
沸した後、30℃で30分インキユヘートシ、更に4℃
で30分インキユペートシた。一部をアガロース電気泳
動にかけ、ペテロ二重鎖が形成されたことを確認した。
次に反応液の1opt’x、各々l 5 mMのaAT
P、 dGTP。
P、 dGTP。
dcTPXdTTP、 1 mM ATP、フレノ
ウ酵素2ユニット及び1ユニツトのT4DNAリガーゼ
を含む20μtの溶液中で12℃、−夜インキユベート
した。反応液を用いて大腸菌IHB101 を形質転
換した。得られfC200コロニーのうち、100コロ
ニーにつき、ラピッド法でプラスミドを調製し、Pst
ニーEcoRI 断片の生成を調べ、2つのEc o
RIサイトのうちの一方のサイトt4つているクローン
を選択した。その結果、5クローンが目的のクローンで
あつ友。そのうちの1クローンについて、プラスミド1
XbaニーHimd l[l で切断し、M13mp
18及びMl 3mp19に組込んでダイデオキシ法で
塩基配列分析を行い、ベクター由来の9 bp が除去
されていることを確認した。このようにして得られたプ
ラスミドを、pTF 201と命名した。pTF 30
1についても全く同様にして、ベクター由来の9bp’
i除去し、得られたプラスミドf pTF 901と命
名した。
ウ酵素2ユニット及び1ユニツトのT4DNAリガーゼ
を含む20μtの溶液中で12℃、−夜インキユベート
した。反応液を用いて大腸菌IHB101 を形質転
換した。得られfC200コロニーのうち、100コロ
ニーにつき、ラピッド法でプラスミドを調製し、Pst
ニーEcoRI 断片の生成を調べ、2つのEc o
RIサイトのうちの一方のサイトt4つているクローン
を選択した。その結果、5クローンが目的のクローンで
あつ友。そのうちの1クローンについて、プラスミド1
XbaニーHimd l[l で切断し、M13mp
18及びMl 3mp19に組込んでダイデオキシ法で
塩基配列分析を行い、ベクター由来の9 bp が除去
されていることを確認した。このようにして得られたプ
ラスミドを、pTF 201と命名した。pTF 30
1についても全く同様にして、ベクター由来の9bp’
i除去し、得られたプラスミドf pTF 901と命
名した。
実施例5
フィブロネクチンの工1e141G Be上1615
(1Q 13アミノ酸残基ポリペプチド)の生産と精
製プラスミドpTF 201 f組込んだ大腸菌HE1
01/ pTF 201ケ50μm/−のアンピシリン
を添加した5−のL−グロスを含む試験管2本に接種し
、37℃、−夜振とう培養した。これを、500−の同
培地を含む2tの三角フラスコにそれぞれ接種して、培
養を続け、66 D nm の吸光度がα6となったと
ころで2 mMの工PTG(イソプロピルβ−チオガラ
クトシド)を添加し、2時間後に集菌した。菌体の一部
を用いて、イムノプロッティングを行った。すなわち、
全菌体タンパク質を、BDS−PAGE (EIDE
−ポリアクアルアミド電気泳動)で分離し、泳動パター
ンをニトロセルロースメンプランに転写した後、フィブ
ロネクチンの細胞接着ドメインを特異的に認識する抗フ
ィブロネクチンモノクローナル抗体FN−no(宝酒造
)を作用させ、次いで、パーオキシダーゼ標識第2抗体
を作用させた。結合した標識第2抗体?、過酸化水素と
Q〜フェニンンジアミンの存在下で発色させることによ
り、目的のポリペプチドが生産されていることを確認し
た。次に、全菌体ペレットi、10mM) リ ス
’Hct (pH7,5) 、 5 mM
EDTA 。
(1Q 13アミノ酸残基ポリペプチド)の生産と精
製プラスミドpTF 201 f組込んだ大腸菌HE1
01/ pTF 201ケ50μm/−のアンピシリン
を添加した5−のL−グロスを含む試験管2本に接種し
、37℃、−夜振とう培養した。これを、500−の同
培地を含む2tの三角フラスコにそれぞれ接種して、培
養を続け、66 D nm の吸光度がα6となったと
ころで2 mMの工PTG(イソプロピルβ−チオガラ
クトシド)を添加し、2時間後に集菌した。菌体の一部
を用いて、イムノプロッティングを行った。すなわち、
全菌体タンパク質を、BDS−PAGE (EIDE
−ポリアクアルアミド電気泳動)で分離し、泳動パター
ンをニトロセルロースメンプランに転写した後、フィブ
ロネクチンの細胞接着ドメインを特異的に認識する抗フ
ィブロネクチンモノクローナル抗体FN−no(宝酒造
)を作用させ、次いで、パーオキシダーゼ標識第2抗体
を作用させた。結合した標識第2抗体?、過酸化水素と
Q〜フェニンンジアミンの存在下で発色させることによ
り、目的のポリペプチドが生産されていることを確認し
た。次に、全菌体ペレットi、10mM) リ ス
’Hct (pH7,5) 、 5 mM
EDTA 。
5mMメルカプトエタノールを含む溶液に懸濁して、超
音波処理を行って、12000rpm。
音波処理を行って、12000rpm。
30分遠心して、上清20−を得た。これを、20mM
トリスHC4(pH7,5)バッファーに対シて透析
し、抗フィブロネクチンモノクロ−ス4Eのカラム(8
IIE7りに通した。カラムを洗浄バッファーA(20
mM トリスHO6,pH&0、l 15 M KC
l)で洗浄し、史に洗浄バッファーB(20mM ト
リスHO4,pH&4、o、1sMxcz)で洗浄した
。最後に溶出パンファー(50mM グリシン−’HC
6,pH2,3,0、20M Kct )で溶出した。
トリスHC4(pH7,5)バッファーに対シて透析
し、抗フィブロネクチンモノクロ−ス4Eのカラム(8
IIE7りに通した。カラムを洗浄バッファーA(20
mM トリスHO6,pH&0、l 15 M KC
l)で洗浄し、史に洗浄バッファーB(20mM ト
リスHO4,pH&4、o、1sMxcz)で洗浄した
。最後に溶出パンファー(50mM グリシン−’HC
6,pH2,3,0、20M Kct )で溶出した。
溶出液のイムノブロッティングを行い、目的ポリペプチ
ドの画分を集めた。更にモノ(Mono)S HR51
5(ファルマシア)カラムにかけて20 mM酢酸バッ
ファー(pH4,0)中のNa06 の濃度勾配によ
り溶出し、電気泳動的にほぼ単一なポリペプチド4m9
に得た。得られたポリペプチドのN末端側の10アミノ
酸残基の配列を決定したところ、フィブロネクチンの工
1e1410からVal 1419の配列に一致した。
ドの画分を集めた。更にモノ(Mono)S HR51
5(ファルマシア)カラムにかけて20 mM酢酸バッ
ファー(pH4,0)中のNa06 の濃度勾配によ
り溶出し、電気泳動的にほぼ単一なポリペプチド4m9
に得た。得られたポリペプチドのN末端側の10アミノ
酸残基の配列を決定したところ、フィブロネクチンの工
1e1410からVal 1419の配列に一致した。
また、アミノ酸組成の分析結果も理論値に一致した。但
し、SDS −PAGE では、目的のバンドは分子
量約14kD付近に検出され、予想される分子量11.
5 kD よりも高い値を示した。これば、ペプチド
中のプロリン(pro )の含量が高い(108残基中
9残基)ためであると推定される。事実、タンパク室中
のプロリンの含量が多い場合には、SDS −PAGE
での分子量に予想よりも高い値を示すことが知られ
ている〔モレキュラー アンド セルラー バイオロジ
ー(Mo1ecular and Ce1lular
Eiology )第4巻、第2486頁<1984)
、:l。
し、SDS −PAGE では、目的のバンドは分子
量約14kD付近に検出され、予想される分子量11.
5 kD よりも高い値を示した。これば、ペプチド
中のプロリン(pro )の含量が高い(108残基中
9残基)ためであると推定される。事実、タンパク室中
のプロリンの含量が多い場合には、SDS −PAGE
での分子量に予想よりも高い値を示すことが知られ
ている〔モレキュラー アンド セルラー バイオロジ
ー(Mo1ecular and Ce1lular
Eiology )第4巻、第2486頁<1984)
、:l。
実施例6
フィブロネクチン(D Aha”5−Met” (28
ろアミノ酸残基ポリペプチド)を含むペプチドの生産と
精製 プラスミドpTF 901 f導入した大腸菌HE1o
1/ 1)TF 901を実施例5と同様の方法で培養
し、同様の方法で精製して2tの培養液から、電気泳動
的にほぼ単一なペプチドとして約400μ′?ヲ得た。
ろアミノ酸残基ポリペプチド)を含むペプチドの生産と
精製 プラスミドpTF 901 f導入した大腸菌HE1o
1/ 1)TF 901を実施例5と同様の方法で培養
し、同様の方法で精製して2tの培養液から、電気泳動
的にほぼ単一なペプチドとして約400μ′?ヲ得た。
本ポリペプチドのN末側アミノ酸配列を調べたところ、
目的のポリペプチドのN末にベクター由来のシグナルペ
プチドの一部(Ala−Gly−Phe−Ala−Va
l−Ala−Gun−Ala )が付加した構造を有す
ることが分った。
目的のポリペプチドのN末にベクター由来のシグナルペ
プチドの一部(Ala−Gly−Phe−Ala−Va
l−Ala−Gun−Ala )が付加した構造を有す
ることが分った。
次に、プラスミドpTF 1409 f導入した大腸
菌HB 101 / pTF 1409も同様に培養、
精製し、2tの培養液から、約600μ?■ポリペプチ
ドを得た。本ポリペプチドのR末側のアミノ酸配列を調
べたところ、目的ポリペプチドのN末にベクター由来の
アミノ酸配列(Met−Thr−Met−工1e−Th
r−Asn−8θr)が付加した構造を有することが分
った。
菌HB 101 / pTF 1409も同様に培養、
精製し、2tの培養液から、約600μ?■ポリペプチ
ドを得た。本ポリペプチドのR末側のアミノ酸配列を調
べたところ、目的ポリペプチドのN末にベクター由来の
アミノ酸配列(Met−Thr−Met−工1e−Th
r−Asn−8θr)が付加した構造を有することが分
った。
実施例7
フィブロネクチンのGly101’−Met1517(
504アミノ酸残基ポリペプチド)?含むポリペプチド
の生産と精製 プラスミドpTF 1101 f導入した大腸菌HE
101 / pTF 1101 を用いて、実施例5
と同様な方法で16の培養を行い、菌体を超音波破砕し
た後、透析後、抗体を結合したセファロース4Bのカラ
ムにかけ、電気泳動的に単一なポリペプチドを600μ
?得た。本ポリペプチドのN末側アミノ酸配列?調べた
ところ、目的ポリペプチドのb末にベクター由来のシグ
ナルペプチド配列とAla−Asn−eer配列が付加
した構造を有することがわかった。
504アミノ酸残基ポリペプチド)?含むポリペプチド
の生産と精製 プラスミドpTF 1101 f導入した大腸菌HE
101 / pTF 1101 を用いて、実施例5
と同様な方法で16の培養を行い、菌体を超音波破砕し
た後、透析後、抗体を結合したセファロース4Bのカラ
ムにかけ、電気泳動的に単一なポリペプチドを600μ
?得た。本ポリペプチドのN末側アミノ酸配列?調べた
ところ、目的ポリペプチドのb末にベクター由来のシグ
ナルペプチド配列とAla−Asn−eer配列が付加
した構造を有することがわかった。
実施例8
細胞接着活性の測定
前記実施例5〜7で得られた各ポリペプチドを用いて、
細胞接着活性を測定した。方法は、ルオスラーテイ(R
uos’1ahti ’)らの方法〔メンツズ イン
エンジモロシ(Methodθ1nKnZ7mOIOg
7 ’)第82巻、第803〜831頁(1981)〕
に準じて行った。また、ポジティブコントロールとして
は、ヒトのフィブロネクチンを用いた。すなわち、試料
を、Q、IMNaHOO,で段階的に希釈し、その50
μtを96穴マイクロプレートに分注し、37’C11
時間インキュベートして、試料をプレートに付着させた
。次にP B S (IJン酸緩衝化生理食塩水)でプ
レートを2回洗浄し、1%ESA’1100μを加え、
37℃、1時間インキュベートして、プレートをブロッ
クした。プレートをPBSで2回洗浄した後、あらかじ
め、イーグルの最小培地(MEM)に106細胞/WI
lとなるように懸濁させたラット腎細胞(NHK−49
F)を100μt/ウエルO割合で分注し、37℃で2
〜3時間インキュベートした。顕微fi下で細胞の形態
変化を観察し、細胞接着活性を示す最少量を決定した。
細胞接着活性を測定した。方法は、ルオスラーテイ(R
uos’1ahti ’)らの方法〔メンツズ イン
エンジモロシ(Methodθ1nKnZ7mOIOg
7 ’)第82巻、第803〜831頁(1981)〕
に準じて行った。また、ポジティブコントロールとして
は、ヒトのフィブロネクチンを用いた。すなわち、試料
を、Q、IMNaHOO,で段階的に希釈し、その50
μtを96穴マイクロプレートに分注し、37’C11
時間インキュベートして、試料をプレートに付着させた
。次にP B S (IJン酸緩衝化生理食塩水)でプ
レートを2回洗浄し、1%ESA’1100μを加え、
37℃、1時間インキュベートして、プレートをブロッ
クした。プレートをPBSで2回洗浄した後、あらかじ
め、イーグルの最小培地(MEM)に106細胞/WI
lとなるように懸濁させたラット腎細胞(NHK−49
F)を100μt/ウエルO割合で分注し、37℃で2
〜3時間インキュベートした。顕微fi下で細胞の形態
変化を観察し、細胞接着活性を示す最少量を決定した。
その結果を下記表1に示す。
表 1
工le”10−Met15’ )5004400)A
−La1236 Mo上1517 α19(&1’
)Gly””−Met”’ CL16
(2,8)フィブロネクチン 1.50
(!175)実施例9 C末にCys残基を付加したポリペプチドをコードする
cDNAのクローニングと発現(第5図参照) なお、第5図は、C末にCy8残基全基金付加ポリペプ
チドをコードするDNA配列を組込んだ発現プラスミド
の構築の工程を示す図である。
−La1236 Mo上1517 α19(&1’
)Gly””−Met”’ CL16
(2,8)フィブロネクチン 1.50
(!175)実施例9 C末にCys残基を付加したポリペプチドをコードする
cDNAのクローニングと発現(第5図参照) なお、第5図は、C末にCy8残基全基金付加ポリペプ
チドをコードするDNA配列を組込んだ発現プラスミド
の構築の工程を示す図である。
実施例4で得られたプラスミドpTF 201からXb
aニーH1nd m断片(α44kb )ft切出し、
これf Fok工 で切断して、XbaニーFok工断
片(175bp ) とFokニーFok工断片(’
203bp)e得た。
aニーH1nd m断片(α44kb )ft切出し、
これf Fok工 で切断して、XbaニーFok工断
片(175bp ) とFokニーFok工断片(’
203bp)e得た。
一方、C末側のFokニーEcoR工 断片のストップ
コドンの前にCysのコドン(TG (! )i付加し
た合成りNAi調裏し、リン酸化後二重鎖とした。この
ようにして得られた、XbaニーFok工断片、Fok
ニーFokI断片及びFokニーEcoR工 断片を、
あらかじめpTF 201からXbaニーEcoR工
断片を除いたベクターとDNA!Jガーゼで接続し、大
腸菌HB 101 ’z 形質転換した。得られた形質
転換体から、プラスミドを精製し、Ml 3mp18に
サブクローニングして、ダイデオキシ法で塩基配列を調
べ、3′末端にOysに対応するTqCの配列が付加し
ていることを確認した。このようにして工1e1410
−M e t 1517のC末にCys残基が付加した
ポリペプチドをコードするcDNAを組込んだプラスミ
ドを得、pTF 1201 と命名した。
コドンの前にCysのコドン(TG (! )i付加し
た合成りNAi調裏し、リン酸化後二重鎖とした。この
ようにして得られた、XbaニーFok工断片、Fok
ニーFokI断片及びFokニーEcoR工 断片を、
あらかじめpTF 201からXbaニーEcoR工
断片を除いたベクターとDNA!Jガーゼで接続し、大
腸菌HB 101 ’z 形質転換した。得られた形質
転換体から、プラスミドを精製し、Ml 3mp18に
サブクローニングして、ダイデオキシ法で塩基配列を調
べ、3′末端にOysに対応するTqCの配列が付加し
ていることを確認した。このようにして工1e1410
−M e t 1517のC末にCys残基が付加した
ポリペプチドをコードするcDNAを組込んだプラスミ
ドを得、pTF 1201 と命名した。
次に、pTF 1201 からPvun−Hindl
l[断片を、また、実施例4で得られたpTF 901
からXbaニーPvun 断片をそれぞれ切出して、
精製した。これらを、あらかじめ、pTF 901から
XbaI−HindlI[@片を除いたベクターと、D
NAリガーゼで連結し、大腸菌HB101(r形質転換
した。得られた形質転換体からプラスミドを抽出し、挿
入断片f Ml 3mp18にサブクローニングして、
ダイデオキシ法により、塩基配列を調べ、3′末端にC
ySに対応するTGC配列が付加していることを確認し
た。このようにしてAl a1235− Me t t
st’rOC末iCC!ys残基が付加したポリペプチ
ドをコードするcDNA f組込んだプラスミドを得、
pTF1501 と命名した。pTF 1501
f実施例5と同様の方法で培養、精製を行って、1tの
培養液から、500μ?の精製ポリペプチドを得た。
l[断片を、また、実施例4で得られたpTF 901
からXbaニーPvun 断片をそれぞれ切出して、
精製した。これらを、あらかじめ、pTF 901から
XbaI−HindlI[@片を除いたベクターと、D
NAリガーゼで連結し、大腸菌HB101(r形質転換
した。得られた形質転換体からプラスミドを抽出し、挿
入断片f Ml 3mp18にサブクローニングして、
ダイデオキシ法により、塩基配列を調べ、3′末端にC
ySに対応するTGC配列が付加していることを確認し
た。このようにしてAl a1235− Me t t
st’rOC末iCC!ys残基が付加したポリペプチ
ドをコードするcDNA f組込んだプラスミドを得、
pTF1501 と命名した。pTF 1501
f実施例5と同様の方法で培養、精製を行って、1tの
培養液から、500μ?の精製ポリペプチドを得た。
本ポリペプチドのアミノ酸組成分析を行った結果、分子
中のCy8残基の数に1と計算され、理論値と一致した
。
中のCy8残基の数に1と計算され、理論値と一致した
。
以上詳細に説明したように、本発明により、フィブロネ
クチンと実質上同等の細胞接着活性を有するポリペプチ
ド、及びその遺伝子工学的な製造方法が提供された。
クチンと実質上同等の細胞接着活性を有するポリペプチ
ド、及びその遺伝子工学的な製造方法が提供された。
第1図はフィブロネクチンの工1θ141G −Me
t 1517を含むポリペプチドをコードするDlIA
配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す図、
第2図にフイブロネクチy C) A]−a ”5−
Met ls’ f含むポリペプチドをコードするDN
A配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す図
、第3図iフィブロネクチンの(31y 1o14−M
e t 1517 f含むポリペプチドをコードするD
BiA配列?組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示
す図、第4−1図IQ pTF 101 icおける不
要I)NA配列及びアミノ酸配列とそnl除去した後の
DNA配列及びアミノ酸配列を示す図、第4−211i
部位特異的変異によるpTF 101からの不用D11
1A配列の除去の工程を示す図、第5図はC末にCys
残基を付加したポリペプチドをコードするDIIIA配
列l!i−組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す
図である。
t 1517を含むポリペプチドをコードするDlIA
配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す図、
第2図にフイブロネクチy C) A]−a ”5−
Met ls’ f含むポリペプチドをコードするDN
A配列を組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す図
、第3図iフィブロネクチンの(31y 1o14−M
e t 1517 f含むポリペプチドをコードするD
BiA配列?組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示
す図、第4−1図IQ pTF 101 icおける不
要I)NA配列及びアミノ酸配列とそnl除去した後の
DNA配列及びアミノ酸配列を示す図、第4−211i
部位特異的変異によるpTF 101からの不用D11
1A配列の除去の工程を示す図、第5図はC末にCys
残基を付加したポリペプチドをコードするDIIIA配
列l!i−組込んだ発現プラスミドの構築の工程を示す
図である。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、フィブロネクチンと実質上同等の細胞接着活性を有
していることを特徴とするポリペプチド。 2、該ポリペプチドが、少なくとも下記一般式 I で表
されるアミノ酸配列を含むものである請求項1記載のポ
リペプチド。 【遺伝子配列があります】・・・〔 I 〕 3、該ポリペプチドが、請求項2記載の一般式 I で表
されるアミノ酸配列のC末端にCys残基が付加したも
のである請求項1又は2記載のポリペプチド。 4、請求項1記載のポリペプチドをコードすることを特
徴とするDNA。 5、請求項4記載のDNA配列が組込まれたベクターが
導入された大腸菌を培養し、培養物より請求項1記載の
ポリペプチドを採取することを特徴とするポリペプチド
の製造方法。 6、該大腸菌がエシエリヒアコーリHB101/pTF
1409である請求項5記載のポリペプチドの製造方法
。
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP63000148A JPH0829098B2 (ja) | 1988-01-05 | 1988-01-05 | 細胞接着活性ポリペプチド |
| US07/291,894 US5049658A (en) | 1988-01-05 | 1988-12-29 | Polypeptide with cell-spreading activity |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
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