JPH07508410A - 酵母人工染色体を有するトランスジェニック非ヒト動物の製造方法 - Google Patents
酵母人工染色体を有するトランスジェニック非ヒト動物の製造方法Info
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
酵母人工染色体を有するトランスジェニック非ヒト動物の製造方法
技術分野
本発明は、異種のポリペプチドを発現できるトランスジェニック非ヒト動物、こ
のようなトランスジェニック動物の製造のために用いられるトランスジーン、異
種のポリペプチドを発現できるトランスジーン、ヒトタンパク質例えばヒト免疫
グロブリン又はアミロイド前駆タンパク質(APP)をエンコードするポリヌク
レオチド配列を含む酵母人工染色体(yeast artificial ch
romosomes ) 、大きなポリヌクレオチド配列を細胞内へ移入させる
ための方法及びトランスジーン、及び細胞内へ不連続ポリヌクレオチド配列をコ
リボフエクション(co−1ipofection)するための方法に関する。
発明の背景
細胞内へ異種の遺伝物質を移入させることは、現代の分子生物学の基礎である。
移入方法の効率、特異性、及び/又は大きさの限界を改善するための新しい方法
の絶え間ない開発が、従来は構築することが現実的でなく又は不可能であったポ
リヌクレオチドクローン及び組換え生物の製造を可能にして、研究及び生産開発
の範囲を拡げてきた。特に、リン酸カルシウム沈降法、エレクトロポレーション
、リポフエクション、弾道移入(ballistic transfer) 、
DEAE−デキストラントランスフェクション、マイクロインジェクション及び
ウィルスに基づいた移入法が、異質のDNAフラグメントを哺乳動物細胞に導入
するために報告されている。
また、大きな(50〜1000キロベースを越える)クローン化された異種遺伝
子の挿入物(米国特許第4889806号明細書)を増殖させることができる酵
母人口染色体(“YAC”)クローニングベクターも開発された。YACクロー
ンライブラリーは、哺乳類動物のゲノムDNAの大きなフラグメントを、同定し
、マツピングし、そして増殖するために用いられてきた。YACクローニングは
、無傷の遺伝子、特に数十キロベース以上にわたるエキソンを有する大きな遺伝
子、及びエキソン配列から数十キロベース以上上流或いは下流に配置された遠位
調節因子を有する遺伝子を単離するのに特に有用である。YACクローニングは
、大きな複合遺伝子座例えば再配置されていない免疫グロブリン遺伝子座、及び
ほぼ正しい染色体領域に厳密でなくマツピングされた遺伝子(例えば、ハンチン
トン舞踏病遺伝子)を単離するのに特に有利である。YACは、相同な標的ベク
ターにおいて組換相同領域として有用な大きな近接した配列のクローニングを可
能にするので、YACクローニングはまた、哺乳動物細胞中で標的とされた相同
組換を起こすためのベクターを作成するのに適している。更にYACは、酵母宿
主細胞中で標的とされた相同組換を行うための系を与えて、YAC構築物中に新
しい大きなトランスジーン(例えば、大きなミニジーン、直列の遺伝子配列等)
を創造でき、該YAC構築物は次いで哺乳動物宿主細胞中に移入されることがで
きる。
不運にも、大きなポリヌクレオチドの操作は問題が多い。
大きなポリヌクレオチドは、剪断力によって破壊を受けやすく、そして比較的薄
い濃度ですら高粘度溶液を形成しやすい。そのことはインヒドロの操作を非常に
困難にしている。これらの理由及びその他のために、大きなトランスジーン構築
物或いは相同組換え構築物を構築する方法において、操作されるYACクローン
及び他の大きなりNAフラグメントの量を減少させることが望まれている。
更なる問題は、大きな無傷のポリヌクレオチドの哺乳動物細胞中への移入は、一
般的に非能率的であるか又は移入されるポリヌクレオチドの大きさが制限される
という事実である。例えば、5chedlら、1992年、Nucleic A
c1ds Res、、第20巻、第3073頁は、マウス胚の前核インジェクシ
ヨンによる35キロベースのYACクローンのマウスゲノムへの移入を開示して
いる。しかしながら、インジェクションマイクロピペット中に生じる剪断力は、
無傷の状態での、著しく大きなYACの効率的な移入をほぼ確実に不可能にする
。
現在のマイクロインジェクション法では、多くの大きな遺伝子は、哺乳動物細胞
中へ効率よ(移入されることができないようである。
スフェロプラスト融合が、YACDNAを線維芽細胞、胚芽腫細胞、及びCHO
細胞中への導入に用いられている( Pachnieら、1990年、Proc
、Natl、Acad、Sci、(U、S、A、)。
第87巻、第5409頁、Payan ら、1990年、1lo1. Ce11
. Biol。
第10巻、第4163頁、Chirke ら、1991年、EMBOJ、、第1
0巻、第1629頁、Daviesら、1992年、Nucleic Ac1d
s Res、、第20巻、第2693頁)。別の、トランスフェクション法例え
ばリン酸カルシウム沈降法及びリポフエクション法が、哺乳動物細胞中へYAC
DNAを移入するために用いられている( Eticciriら、1991年、
Proc、 Natl、 Acad、 Sci。
このように、本技術分野においては、最小の操作及びクローニング手順で、トラ
ンスジェニック動物を作るために、大きなりNA上セグメントえば大きなYAC
クローンを哺乳動物細胞例えば胚幹細胞中に移入する効率的な方法が必要とされ
ている。特に、もし、大きなりローン化された哺乳動物ゲノムフラグメントがY
ACライブラリーから単離でき(YAC酵母配列に連結されているか又はYAC
酵母配列から精製されている)、そして、それを無傷で、第2のポリヌクレオチ
ド配列(例えば、選択マーカー例えばneo発現カセット)とともに、追加のク
ローニング或いは操作(例えば、配列を互いに連結)なしに嘩乳動物宿主細胞(
例えば、ES細胞)中へ移入できれば、それは非常に有利である。このような方
法は、トランスジェニック細胞、トランスジェニック動物及び相同的に標的とさ
れる細胞及び動物を効率よく構築することを可能にする。これらのトランスジェ
ニック/相同的に標的とされる細胞及び動物は、例えばヒト遺伝病特にハンチン
トン舞踏病及びアルツハイマー病等の有用なモデルを提供することができる。
アルツハイマー病
現在、アルツハイマー病(AD)の様々な形態のための治療法は知られていない
。しかしながら、有効な処置が可能な、アルツハイマー病に関連する痴呆に酷似
している進行性の知能低下を引き起こすいくつかの病状がある。
アルツハイマー病は、一般に老人性痴呆として知られている進行性の病気である
。大雑把に言えば、その病気は2つのカテゴリー、すなわち晩期の発病と、早期
の発病に分けることができる。晩期発病(すなわち、老齢(65才以上)で発病
)は、通常よりも早い速度でそしてより厳しい程度で起こる脳の自然の委縮によ
って引き起こされる。早期発病アルツハイマー病は、はるかにまれであるが、老
年期前(すなわち、35〜60才の間)によく発生する脳の委縮を伴った病理学
的にまったく同じ痴呆を示す。このタイプのアルツハイマー病の一つの形態は、
遺伝しそしてそれ故、家族性アルツハイマー病(FAD)として知られていると
いうことが証明されている。
アルツハイマー病のどちらのタイプにおいても病状は同じであるが、その異常は
より若い年齢で発病した場合に、より厳しくそしてより広範囲に及ぶ傾向がある
。その病気は、脳における4つのタイプの病変により特徴付けられる。
これらは、ニューロン周辺のアミロイド斑(老人斑)、大脳血管周辺のアミロイ
ド沈積物、ニューロン内側の神経細線維のもつれ及びニューロン細胞の死である
。老人斑は、中心に細胞外アミロイド沈積物がある、直径が150μmにも及ぶ
組織が破壊され神経網の領域である。脳血管性アミロイド沈積物は、大脳血管を
とり囲むアミロイド物質である。神経細線維のもつれは、2つ1組になって互い
に巻きついている2つのフィラメントから成るアミロイドタンパク質の細胞内沈
積物である。
主要なタンパク質サブユニットであるアミロイドβタンパク質は、神経細線維の
もつれ及び老人斑の両者のアミロイドフィラメント中に見られ、そして約4.0
00の相対分子質量の高度に凝集する小さなポリペプチドである。このタンパク
質は、アミロイド前駆タンパク質(APP)と呼ばれるはるかに大きな前駆タン
パク質の切断生成物である。
APP遺伝子は、ヒト染色体21番上に配置されていると知られている。家族性
アルツハイマー病を隔離する遺伝子座は、APP遺伝子の近傍の染色体21番に
マツピングされる( St、 George HysIop ら、1987年、
5cience 1第235巻、第885頁)。APP遺伝子とAD遺伝子座の
間での組み換え体は、既に報告されている( 5chel lenbergら、
1988年、5cience 、第241巻、第1507頁、Schellen
bergら、1991年、4m、J、Bun、Genetics、、第48巻、
第563頁、5chel Ienbergら、1991年、Am、J、Hum、
Genetics、第49巻、第511頁、これらは引用することにより本明細
書の一部である)。ADの病因に含まれる根底にある生化学的現象を更に明らか
にするために用いることができる、アルツハイマー病の実験モデルの開発が非常
に望まれている。このようなモデルは、アルツハイマー病における退化過程を変
える薬剤をスクリーニングするために、ある用途において、恐らく用いることが
できる。例えば、アルツハイマー病のモデル系は、ADの病因を引き起こす又は
促進する環境要因をスクリーニングするために用いることができる。対照的に、
ADの進行を阻害し、防ぎ、又は逆行させる薬剤のスクリーニングのために実験
モデルを用いることもできる。
恐らく、このようなモデアルは、ADを防ぎ、その進行を止め、又は逆行させる
のに有効な製薬の開発のために用いられることができる。
不運にも、ヒト及び老齢な非ヒト霊長類のみがADの病理学的な特徴を示す。即
ち、霊長類を用いることは高価で困難であり、そしてADの病状を表すまでに要
求される時間が長いので、このような動物を用いた広範囲の研究は禁止されてい
る。層線類動物は、極度に高齢となってもADを発現しない。β−アミロイドタ
ンパク質(βAP)又は細胞毒性のβAPフラグメントを、層線類動物の脳に注
入すると、細胞の損失を起こし神経細繊維のからみ成分に対する抗原性マーカー
を誘引することが報告されている(Kovallら、1991年、Proc、N
atl、^cad、、Sci、(U、S、A )、第88巻、第7247頁)。
染色体第16番の部分的三染色体性の結果として、APP遺伝子の余分のコピー
を有するマウスは、生まれる前に死ぬ(Coyle ら、1988年、Tren
ds 1nNeurosci、第11巻、第390頁)。APP遺伝子のクロー
ニング以来、APP遺伝子の全て又は一部を含むトランスジーンを用いたADの
ためのマウスモデルを作成する試みが成されてきたが、不運にも、それらのマウ
スは成育できなかったかAD様の病状を示さなかったので、その研究の多くは発
表されずにいる。2つ発表された報告は、その報告された結果が不規則なので取
り下げられた( Marx J%5cience、第255巻、第1200頁)
。
従って、本技術分野においては、無傷なヒ1−APP遺伝子、即ち野生型の対立
遺伝子、病気に付随した対立遺伝子或いはこれらの組み合わせのいずれか、又は
ヒトAPP配列に対応する配列修飾を含む変異した層線動物(例えばマウス)対
立遺伝子を有するトランスジェニック非ヒト動物が必要とされている。このよう
なトランスジェニック動物由来の細胞株及び細胞系統(例えば、アストログリア
細胞)はまた、AD療法を開発するための実験モデルとして、本技術分野におい
て広い用途がある。
所定の抗原に結合するヒトモノクローナル抗体を作成することは、選択した抗原
で免疫されたかつ免疫源に対し十分な体液性免疫応答を示すヒトからの生存可能
なリンパ球の供給源を要求するので、困難である。特に、ヒトは一般的には、ヒ
ト(自己)抗原の攻撃に応答する十分な抗体を作れない。不運にも多くのこのよ
うなヒト抗原は、ヒトモノクローナル抗体を含む治療方法の目標物となる見込み
がある。所定のヒト抗原に特異的に反応するヒト抗体を作成する一つのアプロー
チは、再配列されていないヒト免疫グロブリントランスジーンを有し、そして内
在性免疫グロブリン遺伝子が機能的に破壊されているトランスジェニックマウス
を製造することを含む(LonbergとKay、 To 92103918゜
KuCherlapati と Jakobovits、 To 91/107
41)。しかしながら、大きなりNA上セグメントえばヒト免疫グロブリンの軽
鎖又は重鎮の遺伝子座の相当な部分に及ぶDNAセグメントを効率よく移入する
ことは、潜在的な障害を与え及び/又はトランスジェニック動物の作成方法の効
率を減少させる。
前記のことより、1以上の大きな無傷のトランスジーン、特にヒトAPP遺伝子
又はヒト免疫グロブリントランスジーンを有する非ヒト細胞及び非ヒト動物が必
要であることが明らかである。従って、本発明の目的は、大きなトランスジーン
及び大きな相同組み換え構築物(通常はYACとしてクローン化されている)を
哺乳動物細胞特に胚幹細胞中に移入するための方法及び組成物を提供することで
ある。
本発明の目的はまた、1以上の本発明のAPP トランスジーンを有するトラン
スジェニック非ヒト細胞及びトランスジェニック非ヒト動物を提供することであ
る。
本明細書中で述べた文献は、本出願の出願日量前の開示のためにのろ提供される
ものである。本明細書は、先の発明に基づいて、このような開示よりも日付が先
であるとする権利が発明者にはないということを認めるものであると解釈される
ものではない。すべての引用文献は引用することにより、本明細書の一部である
。
発明の概要
前記目的に従って、本発明の一つの観点において、大きなトランスジーン及び大
きな相同標的構築物(典型的には、YACとして増殖され、そして好ましくは少
なくとも一つの完全な転写複合体にまで及ぶ)を哺乳動物細胞例えばES細胞中
へ移入する方法が提供される。一つの観点において、上記方法は、大きなトラン
スジーン及び大きな相同標的構築物を、リボフエクンラン法例えばコリボフエク
ションにより動物細胞中に移入することを提供し、そこでは、第2の連結されて
いないポリヌクレオチドが大きなトランスーン及び/又は大きな相同標的構築物
とともに哺乳動物細胞中に移入される。好ましくは、第2のポリヌクレオチドは
、選択表現型(例えば、6418選択に対する耐性)を、該ポリヌクレオチド配
列を受け取りそして組み込んでいる細胞に与える。通常、大きなトランスジーン
又は相同標的構築物は、ポリヌクレオチド結合に酵母由来のYAC配列とともに
移入されうる。しかし、酵母由来のYAC配列は、制限酵素消化及び分離(例え
ば、パルスゲル電気泳動)により取り除かれる。大きなトランスジーン及び/又
は相同標的構築物は、一般に、連結されていない第2のポリヌクレオチド(例え
ば、選択表現型を与えるneoR発現カセット)と混合され、そして、カチオン
性脂質(例えば、DOGS。
DOTMA 、 DOTAP )に接触されて、カチオン性脂質−DNA複合体
を形成する。複合体は、細胞中へのDNAの取り込みに適した条件(例えば、培
養液、生理的リン酸塩緩衝食塩溶液、無血清ES培地)で、哺乳動物細胞(例え
ば、ES細胞)と接触させられる。一般に大きなトランスジーン又は大きな相同
標的構築物を有する細胞は付随的に第2のポリヌクレオチドの少なくとも1つの
コピーを有し、その結果、第2のポリヌクレオチドを有する細胞を選択すること
は、一般的には、大きなトランスジーン又は大きな相同標的構築物の少なくとも
1つのコピーを、内在性染色体遺伝子座の組み込まれたか又は相同的に組み換え
られたセグメントとして有するかなりの可能性を有する。従って、第2のポリヌ
クレオチド(例えば、neoR発現カセット)の選択はまた、一般的に、リボフ
ェクンヨンに先立つ大きなトランスジーン又は大きな相同標的構築物の第2のポ
リヌクレオチドへの面倒なポリヌクレオチド結合(例えば、連結反応)をするこ
となしに、大きなトランスジーン又は大きな相同標的構築物を有する細胞を選択
することとなる。本発明のコリボフエクション法に従って、選択マーカー遺伝子
の結合及びそれに続くクローニングを要求することなし、異種DNAの大きなセ
グメントが、素早(そして効率良く哺乳動物細胞(例えばネズミES細胞)中に
移入される。
本発明はまた、組み込まれた又は相同的に組み換えられた、酵母由来のYAC配
列に連結された異種(好ましくは、非相同)哺乳動物ゲノムDNA配列の少なく
とも1つのコピーを有する哺乳動物細胞、好ましくはES細胞を提供する。大き
な異種(好ましくは非相同)#乳動物ゲノムDNA配列は、好ましくは完全な構
造遺伝子、更に好ましくは完全な転写単位、及び一つの例としては完全なヒトA
PP遺伝子を含む。典型的には、得られたトランスジェニック哺乳動物細胞はま
た、連結されていない第2のポリヌクレオチド(例えば、選択マーカー)の少な
くとも一つの組み込まれたコピーを含み、該第二のポリヌクレオチドは、非相同
的に、通常は少な(とも一つの染色体遺伝子座中に、時々は大きなトランスジー
ン又は大きな相同標的構築物が組み込まれているところとは異なった染色体座(
−カ所又は複数箇所)中に組み込まれる。トランスフェクション工程の間及びそ
の直後に、大きな外来DNA配列、連結されていない選択マーカー遺伝子及び適
当なカチオン性脂質を有する新しい哺乳動物細胞例えばES細胞が形成される。
このような新しい哺乳動物細胞は、本発明の一つの観点である。
本発明はまた、組み込まれた又は相同的に組み換えられた、酵母由来のYAC配
列に連結された大きな異種(好ましくは、非相同)gfR乳動物ゲノムDNA配
列の少なくとも1つのコピーを有するゲノムを含むトランスジェニック非ヒト動
物を提供する。大きな異種(好ましくは非相同)l’ii乳動物ゲノムDNA配
列は、好ましくは完全な構造遺伝子、更に好ましくは完全な転写単位、及び一つ
の例としては完全なヒトAPP遺伝子を含む。典型的には、得られたトランスジ
ェニック非ヒト晴乳動物はまた、連結されていない第2のポリヌクレオチド(例
えば、選択マーカー)の少なくとも一つの組み込まれたコピーを有するゲノムを
含み、該第二のポリヌクレオチドは、非相同的に、通常は少なくとも一つの染色
体遺伝子座中に、時々は大きなトランスジーン又は大きな相同標的構築物が組み
込まれているところとは異なった染色体座(−カ所又は複数箇所)中に組み込ま
れる。好ましくは、非ヒト動物の染色体遺伝子座(−カ所又は複数箇所)中に組
み込まれている大きなトランスジーン又は大きな相同標的構築物が発現され、更
に好ましくは、非ヒト動物種の自然存在する相同遺伝子と同様に発現される(例
えば、同様な組織特異的様式及び/又は発生様式で)。 本発明はまた、コリポ
フエクションのための組成物、即ち、少なくとも一つの組み込まれている大きな
外来トランスジーンの少なくとも一つのコピーを有する及び/又は少なくとも一
つの相同的に標的とされる構築物をそのゲノム中に有するトランスジェニック非
ヒト動物を作るために、異種の、典型的には非相同の大きな(例えば50kb以
上)ポリヌクレオチドを哺乳動物細胞例えばES細胞中に移入するためのトラン
スジエネシス(transgenesis)組成物及び相同標的組成物を提供す
る。トランスジエネシス組成物は、(1)少なくとも一つの大きなトランスジー
ン種、(2)少くとも一つの連結されていない第二のポリヌクレオチド種(例え
ば、選択マーカー遺伝子neoRを含む発現カセット)及び(3)少なくとも一
つの適当なカチオン性脂質種を含む。相同標的組成物は、(1)少なくとも一つ
の大きな標的構築物種、(2)少なくとも一つの連結されていない第二のポリヌ
クレオチド種(例えば、選択マーカー遺伝子neoRを含む発現カセット)及び
(3)少なくとも一つの適当なカチオン性脂質種を含む。好ましくは、大きなト
ランスジーン又は大きな相同標的構築物は、無傷な転写単位に及ぶ。コリポフエ
クション組成物の一つの好ましい実施例は、(1)酵母由来のYAC配列に連結
されたヒトAPP遺伝子配列(又は、ヒトAPP配列に対応する非自然発生的に
生じた配列を有する修飾されたマウス又はラットAPP遺伝子) 、(2)選択
マーカーをエンコードする発現カセット及び(3)適なカチオン性脂質を含む。
コリポフエクション組成物の他の好ましい実施例は、(1)酵母由来のYAC配
列に連結されたヒト非再配列免疫グロブリン遺伝子配列(少なくとも二つのV遺
伝子の完全なセグメント、少なくとも一つの完全なりセグメント(もし、重鎮遺
伝子であれば)、少な(とも一つの完全なJセグメント及び少なくとも一つの定
常領域遺伝子を含む重鎮及び軽鎖遺伝子配列)、(2)選択マーカーをエンコー
ドする発現カセット及び(3)適当なカチオン性脂質を含む。
本発明の一つの観点において、連結されていないポリヌクレオチド配列の複数種
が、ネズミ胚幹細胞及び/又は他の哺乳動物細胞中にコリボフエクションされ、
そこでは、少なくとも一つの連結されていないポリヌクレオチド配列の種は、そ
れを取り込んでいる細胞に選択表現型を与える選択マーカーを含む。得られた細
胞は、選択マーカーの存在により選択される。このように選択された細胞は、細
胞中に導入されたポリヌクレオチド配列の他の種の少なくとも一つの組み込まれ
たコピーを含んでいる可能性が非常に高い。
図面の簡単な説明
図に本発明のコリボフェクション複合体を形成するための代表的なカチオン性脂
質の化学構造。
図2.ヒトAPPhランスジーンでコリボフェクションされたESクローンのP
CR分析。陰をつけた円は、用いなかったウェルを示す。横列のプール(A−P
)は、それぞれ18クローン(A−El)又は16クローン(I−P)を含んで
いた。
縦列の一ル(PI−PI8)は、それぞれ16クローン(PL−PI2)又は8
クローン(PI3−PI8)を含んでいた。
図3 ヒトAPPトランスジーンでコリボフエクションされたESクローンのP
CR分析。プールP3.P4.P9、PLO,pH及びPI2、及びプールG、
H,K。
M、N、O及びPは、プロモーター配列及びエキラン1フ配列を共に含んでいる
クローンの候補であった。
図4=ヒトAPPトランスジーンでコリボフエクションされたESクローンのP
CR分析。
図5:ヒヒトlu配列プローブを用いたYACクローンDNAのサザンプロット
分析。
図6:ヒトAPP YACの部分的制限消化マツピング。
図7・組み込まれたヒトAPP トランスジーンから発現されたRNA転写物の
PCR分析。
図8=ヒトAPP)ランスジーンからのAPP RNA転写物を検出するための
定量的RNase防護検定。
定義
特に断りのない限り、本明細書中で用いた全ての技術及び科学用語は、本発明が
属する技術分野の当業者によって通常理解されているのと同じ意味である。本明
細書中に記した方法及び物質と類似か又は等しいものが、本発明の実施及び試験
において用いることができるが、好ましい方法及び物質を記す。本発明の目的に
そって、用語を以下のように定義する。
”一致する”又は“対応する”という用語は、本明細書中で、ポリヌクレオチド
配列が、参照するポリヌクレオチド配列の全て或いは一部に対して相同である(
即ち、厳密に進化的には関係していないが同一である)、又はポリヌクレオチド
配列が参照するポリヌクレオチド配列と同一であることを意味するものとして用
いられる。対照的に、”相補的”という用語は、本明細書中で、相補的配列が、
参照するポリヌクレオチド配列の全て或いは一部に対して相同であるということ
を意味するものとして用いられる。例えば、ヌクレオチド配列” TATAC”
は、参照配列”TATAC”と一致し、そして参照配列”GTATA”と相補的
である。
本明細書中で用いた”実質的に一致”、”実質的に相同”又は”実質的に同一”
とは、核酸配列が参照配列と比べて少な(とも70%の配列同一性、典型的には
少なくとも85%の配列同一性、そして好ましくは核酸配列が参照配列と比べて
少なくとも95%の配列同一性を有するところの核酸配列の特徴を示す。配列同
一性の%は、全部合わせても参照配列の25%未満の、小さな欠失又は付加を除
外して計算する。参照配列は、大きな配列のサブセット、例えば遺伝子或いはフ
ランキング配列の一部又は染色体の反復部分でありうる。しかしながら、参照配
列は、少なくとも18ヌクレオチド長、典型的には少な(とも30ヌクレオチド
長、そして好ましくは少なくとも50〜100ヌクレオチド長である。本明細書
中で用いる”実質的に相補的”とは、参照配列に実質的に一致する配列に相補的
である配列を意味する。
特異的ハイブリダイゼーションとは、本明細書中では、標的トランスジーン配列
(例えば、置換、欠失及び/又は付加を含みうる本発明のポリヌクレオチド)と
特定の標的DNA配列(例えば、ヒトAPP遺伝子配列又はヒト免疫グロブリン
遺伝子配列)との間のハイブリッドの形成と定義され、そこでは、標識された標
的トランスジーン配列は、標的と優先的に対合して、例えば遺伝子の制限フラグ
メントに一致する単一バンドが、プローブである該標識標的トランスジーン配列
を用いて、細胞より調製されたDNAのサザンプロットで同定されうる。最適の
ハイブリダイゼーション条件は、標的トランスジーン及び内在性標的の配列組成
及び長さ、及び実験者によって選択された実験方法に依存して変化する。種々の
ガイドラインが、適当なハイブリダイゼーション条件を選択するために用いられ
つる(Maniatis ら、Mo1ecular Cloning: A L
aboratory Manual、1989年、第2版、Co1d Spri
ng Harbor、 N、Y、、及びBergerとKimmel、 Met
hod in Enzymology、第152巻、Guide t。
Mo1ecular Craning Techniques 、 1987年
、Academic Press、 Inc、 、San Diego、 CA
を参照、これらは引用することにより本明細書の一部でる)。
目的物に対して用いる、明細書中で用いる”自然存在する”とは、目的物が自然
に見いだされうるという事実を意味する。例えば、自然の供給源から単離されう
る及び実験室でヒトによって意図的に修飾されていない生物(ウィルスを含む)
中に存在するポリペプチド又はポリヌクレオチド配列は、自然存在する、である
。本明細書中においては、古典的な遺伝学に従って選択的に生育されうる層線動
物の実験室系統は、自然存在する動物とみなされる。
本明細書中で用いる”同族”とは、種間で進化的及び機能的に関係している遺伝
子配列を意味する。例えば、これには限定されないが、ヒトゲノムにおいてはヒ
ト免疫グロブリン重鎮遺伝子座はマウス免疫グロブリン重鎮遺伝子座に対して同
族遺伝子である。なぜならこれら二つの遺伝子の配列及び構造は、それらが非常
に相同であり、かつ両方の遺伝子が共に特異的に抗原に結合するために機能する
タンパク質をエンコードする遺伝子であるということを示しているからである。
本明細書中で用いる”異種の”は、宿種哺乳動物宿主細胞又は非ヒト動物との関
係で定義され、アミノ酸配列又はポリヌクレオチド配列が、それぞれ宿種哺乳動
物宿主細胞又は非ヒト動物の自然存在するゲノムによってエンコードされない又
はゲノム中に存在しないことを意味する。異種DNA配列は外来DNA配列であ
る。即ち、例えばヒトAPP遺伝子又は免疫グロブリン遺伝子は、ネズミES細
胞にとっては異種であり、また、例えばヒトすい嚢胞性繊維症関連CFTR対立
遺伝子は、野生型(正常)CFTR対立遺伝子のホモ接合体であるヒト細胞系統
にとっては異種である。従って、(例えば、特定部位の突然変異誘発により)変
異を受けているクローン化されたネズミ核酸配列は、もし変異した配列がネズミ
ゲノム中で自然に発生したものでなければ、該配列がそれから由来したところの
ネズミゲノムにとっては異種である。
本明細書中で用いる”非相同遺伝子”又は”非相同ポリヌクレオチド配列”は、
そのような遺伝子生成物を作るトランスジェニック非ヒト生物との関係で定義さ
れる。非相同ポリペプチド(これはまた、異種ポリペプチドとしても表される)
は、該トランスジェニック非ヒト動物ではない生物中に見られる同族遺伝子のそ
れと一致するアミノ酸配列又はエンコードするDNA配列を有するポリヌクレオ
チドとして定義される。従って、ヒトAPP遺伝子を有するトランスジェニック
マウスは、非相同APP遺伝子を有すると記述されうる。ヒト免疫グロブリン遺
伝子を有するトランスジェニックマウスは、非相同免疫グロブリン遺伝子を有す
ると記述されつる。非相同タンパク質配列をエンコードする種々の遺伝子セグメ
ントを含むトランスジーンは、例えば、ハイブリダイゼーション又はDNA配列
決定により、トランスジェニック動物以外の生物種由来として、容易に同定され
つる。例えば、ヒトAPPアミノ酸配列の発現は、ヒトAP遺伝子セグメントに
よってエンコードされたヒトAPPエピトープに特異的な抗体を用いて、本発明
のトランスジェニック非ヒト動物中で容易に検出されつる。
同族非相同遺伝子は、他の種からの一致する遺伝子として表される。従って、も
しネズミAPPが参照されれば、ヒトAPPは同族非相同遺伝子である(他の種
からのAP遺伝子に加えて、ブタ、ヒツジ又はラットのAPPも同様である)。
本明細書中で用いる”標的構築物”なる用語は、(1)宿主細胞内在性遺伝子座
中に存在する配列に対して実質的に同−又は実質的に相補的である配列を有する
少なくとも一つの相同領域、及び(2)標的構築物相同領域及び該内在性遺伝子
座配列の間での相同組み換えによって、宿主細胞内在性遺伝子座中に組み込まれ
ることになる標的領域、を含むポリヌクレオチドを表す。もし標的構築物が”ヒ
ツトアンド ラン”又は”イン アンド アウト”タイプ構築らは引用すること
により本細書の一部である)であれば、標的領域は内在性遺伝子座中にほんの一
時的に取り込まれ、そして選択により宿主ゲノムから除去される。標的領域は、
内在性遺伝子配列に対して実質的に相同である配列を含みことができ、及び/又
は非相同配列例えば選択マーカー(例えば、neo Stk、 gpt )を含
むことができる。”標的構築物”なる用語は、必ずしも、ポリヌクレオチドが宿
主ゲノム中に組み込まれることになる遺伝子を含むことを表すとは限らず、また
ポリヌクレオチドが完全な構造遺伝子配列を含むことを表すとも限らない。本技
術分野で用いている”標的構築物”なる用語は、本明細書で用いている”標的ト
ランスジーン”なる用語と同義である。
本明細書中で用いる”相同領域”及び”相同クランプ”は、その遺伝子に隣接す
る配列を含みうる所定の内在性遺伝子配列に、実質的に一致するか又は実質的に
相補的である配列を有する標的構築物のセグメント(即ち、一部)である。相同
領域は、一般に、少なくとも約100ヌクレオチド長、好ましくは少なくとも約
250〜500ヌクレオチド長、典型的には少なくとも約1000ヌクレオチド
長或いはれ以上である。相同組み換えを仲介する相同クランプのための理論的な
最小の長さは示されていないが、相同組み換えの効率は、一般に相同クランプの
長さに伴って増加すると信じられている。同様に、相同組み換え効率は、標的構
築物相同領域及び内在性標的配列間の配列相同の程度に伴い増加し、相同クラン
プが内在性標的配列と同質であるときに最適組み換え効率となる。”相同クラン
プ”及び”相同領域”なる用語とは、本明細書中で互換的に用いられ、そして本
技術分野における似ている言葉の一貫性のない使用を考慮して、明快にすべく代
替的は用語法が提案される。相同クランプは、必ずしも内在性配列と塩基が対合
した7%イブリッド構造の形成を意味するとは限らない。トランスジーン相同領
域に実質的に一致するか又は実質的に相補的である内在性遺伝子配列は、本明細
書中では、”交差標的配列”又は”内在性標的配列”と表される。
本明細書中で用いる、” ミニジーン”又は” ミニ遺伝子座”なる用語は、遺
伝子の1以上の必須でない遺伝子のセグメントが自然存在する遺伝子との関係で
欠失されているところの非相同遺伝子構築物を意味する。典型的には、欠失され
たセグメントは、少なくとも約100塩基対から数キロベースのイントロン配列
であり、数十キロベース以上にまで及びうる。大きな(即ち、約50キロベース
以上)の標的構築物の単離及び操作は、しばしば困難であり、標的構築物の宿主
細胞中への移入の効率を減少しうる。従って、しばしば、遺伝子の1以上の必須
でない部分を欠失させることによって標的構築物の大きさを減少させることが望
ましい。典型的には、必須の調節因子を含まないイントロン配列が欠失されうる
。例えば、ヒト免疫グロブリン重鎮ミニジーンは、ヒト重鎮免疫グロブリン遺伝
子遺伝子座のJ遺伝子セグメント及びμ定常領域エキソン間のイントロンセグメ
ントの欠失を含みうる。もし慣用の制限部位がクローン化された遺伝子配列の必
須でないイントロン配列に結合していれば、しばしば、イントロン配列の欠失は
、(1)クローン化されたDNAを適当な制限酵素で消化する、(2)制限フラ
グメントを(例えば、電気泳動により)分離する、(3)必須のエキラン及び調
節因子を含む制限フラグメントを単離する、及び(4)単離された制限フラグメ
ントを連結して、エキランが、自然存在する遺伝子の生殖細胞系列のコピー中に
存在するのと同じ直線配列であるところのミニジーンを形成する、ことにより製
造されうる。ミニジーンを製造するための別の方法は、本発明の技術分野の当業
者にとって明白である(例えば、必須のエキランを含むがイントロン配列のいく
つかの部分を欠いている部分的ゲノムクローンの連結)。更に典型的には、ミニ
ジーンを含む遺伝子セグメントは、生殖細胞系列遺伝子中に存在するのと同じ直
線配列で配列される。しかしながら、常にそうだと言う訳ではない。いくつかの
望まし調節因子(例えば、エンハンサ−、サイレンサー)は、比較的位置非感受
性である。従って、調節因子は、対応する生殖細胞系列の遺伝子中における場合
と異なってミニジーン中に位置された場合でさえ正しく機能する。例えば、エン
ハンサ−はプロモ−ターから異なった距離で、異なった方向に、及び/又は異な
った直線配列で配置されつる。例えば、生殖細胞系列の立体配置においてプロモ
ーターに対して3′に配置されているエンハンサ−は、ミニジーンにおいてプロ
モーターに対して5°に配置されつる。同様に、いくつかの遺伝子は、RNAレ
ベルにおいて交互的に(alternatively)スプライスされるエキラ
ンを含みうる。従って、ミニジーンは、対応する生殖細胞系列の遺伝子より少な
いエキラン及び/又は異なった直線配列のエキランを含むことができ、依然とし
て、機能的遺伝子生成物をエンコードできうる。遺伝子生成物をエンコードする
c DNAはまたミニジーンを構築するために用いられうる。しかしながら、一
般には、非相同ミニジーンが同族の自然存在する非ヒト遺伝子と同様に発現され
るのが望ましいので、c DNAミニジーンの転写は、典型的には、自然存在す
る遺伝子からの連結された遺伝子プロモーター及びエンハンサ−によって誘導さ
れる。
本明細書中で用いる”大きいトランスジーン”又は7大きい相同標的構築物”と
は、一般に50kbより大きい、通常は100kbより大きい、しばしば260
kbより大きい、場合により500kb程度の大きさの、時々は1000kb以
上の大きさのポリヌクレオチドを意味する。
本明細書中で用いる、”転写単位”又は”転写複合体”なる用語とは、構造遺伝
子(エキラン)、シス作用する連結されたプロモーター及び構造遺伝子の効率的
な転写のために必須の他のシス作用配列、構造配列の適当な組織特異的及び発生
的な転写のために必須の遠位調節因子、及び効率的な転写及び翻訳のために重要
な付加的シス配列(例えば、ポリアデニル化部位、mRNA安定性制御配列)を
含むポリヌクレオチド配列を意味する。
本明細書中で用いる1連結された2とは、ポリヌクレオチド連結(すなわち、ホ
スホジエステル連結)を意味する。
”連結されていない”とは、他のポリヌクレオチド配列に連結されていないこと
を意味する。従って、もしそれぞれの配列が遊離の5゛末端及び遊離の3゛末端
を有すれば、2つの配列は連結されいない。
本発明の詳細な説明
一般に、以下で用いた命名法、細胞培養、分子遺伝学及び核酸化学の実験方法及
び以下に記したハイブリダイゼーションは、本技術分野において当業者に公知の
ものでありかつ通常用いられるものである。核酸組み換え法、ポリヌクレオチド
合成、細胞培養及びトランスジーンの取り込み(例えば、リポフエクション法)
のために、標準方法を用いた。一般に、酵素反応、オリゴヌクレオチド合成及び
精製工程は、製品仕様書に従って行った。方法及び手順は、一般に、本技術分野
における慣用の方法及び本明細書を通して示された種々の一般の引用に従って行
った。そこに示された手順は、本技術分野においてよく知られており、そして読
者の利便のために示されるものであると信じられる。
そこに含まれる全ての情報は、引用することにより本明細書の一部である。
キメラ標的マウスは、Boganら、Manipulatin the Mou
se Embryo: A Laboratory Manual 、Co1d
Spring HarborLaboratory、 1988年 及び T
eratocarcinomas and Embryonjc 5telIC
ells:^Practical Approach 、 E、J、 Robe
rtson編、IRL Press、Washington、 D、C,,19
87年(これらは引用することにより本明細書の一部である)に従って作製され
た。
胚幹細胞は、発表された方法(Teratocarcinomas and E
Ilbryonic Stem Ce1ls: A Practical Ap
proach 、 E、J、 Robertson編、IRL Press、f
ashington、D、C,,1987年、Zjilstraら、Natur
e、 第342巻、第435−438頁、1998年、Schvartzber
gら、5cience s第246巻、第799〜803頁、1989年(これ
らは引用することによ明細書の一部である)に従って操作された。
オリゴヌクレオチドは、Applied Bio System社のオリゴヌク
レオチドシンセサイザーにより、製品仕様書に従い合成されうる。
c D N Aに基ついたトランスジーンは、発現が悪く又は不適当に調節され
るということがしばしば観察された。自然存在する遺伝子座の成分及び編成を実
質的に残しているゲノムDNAに基づいたトランスジーン(即ち、クローン化さ
れたゲノムDNA配列から構築された)は、正確に発現される可能性がより高い
が、バクテリオファージ及びプラスミド/コスミドベクターのクローニング容量
によって大きさが限定される。酵母人工染色体(YAC)は、約2メガベース(
輩B)の容量を持つ最近開発されたクローニング伝達体である( Burkeら
、1987年、5cience 、第236巻、806頁)。再現性よくかつ効
率的にYACをトランスジェニックマウス中に導入する能力は、最近のトランス
ジーンの大きさの制限を著しく凌ぐことができる。
概して、本発明は、大きな(即ち、約50kbより大きい)クローン化されたポ
リヌクレオチドが効率的に哺乳動物細胞例えばES細胞中に移入されることがで
き、かつ少なくとも一つの染色体の位置中に取り込まれることができそして染色
体のセグメントとして安定に複製されることができるという予期されない発見に
基づいたものである。更に、完全な転写単位を含む大きなりローン化されたポリ
ヌクレオチドは、哺乳動物細胞(例えば、ES細胞)中に移入され、染色体の位
置中に取り込まれそして転写されて、検出できる濃度の構造遺伝子配列のRN、
A転写物を製造できることが判った。YAC中にクローン化された再配列されて
いない免疫グロブリン遺伝子が、ES細胞中に導入され、有効なVDJ再配列が
起こりかつ免疫グロブリン鎖の発現もまた起こるところのトランスジェニック動
物を形成するために発生分化されつるといことも判った。大きなトランスジーン
はYAC中にクローン化されることができ、そして宿主酵母細胞から単離後に、
所望のトランスジーン配列を酵母由来YAC配列から前もって分離することなく
哺乳動物細胞(例えば、ES細胞)中に効率的に移入されうるということ、及び
、このような酵母由来YAC配列の存在は、不干渉でありうる(即ち、効果的な
トランスジーンの組み込み及びトランスジーン転写単位の転写と共存できる)と
いうことも判った。意外なことに、大きなトランスジーンは、連結された酵母由
来のYAC配列と共に又はなしで、効率的に哺乳動物細胞(例えば、ES細胞)
中に、選択マーカー例えばneoR発現カセットを含む連結されていないポリヌ
クレオチドと共にコトランスフエクトされることができ、そして選択マーカー遺
伝子を有し選択マーカーを発現している細胞を選択することは、コトランスフエ
クトされた大きなトランスジーン種をも有する可能性が高く、従って選択マーカ
ー遺伝子を前もって連結(及びクローニング)する必要なしに大きなトランスジ
ーンDNA配列を効率的に選択できる、ということがまた判った。大きなりNA
上セグメント例えばYACクローンとして)を選択マーカー遺伝子と共に効率的
にコリボフエクシ3ンできるという発見は、典型的に操作が困難であった大きな
異種DNAセグメントを有するトランスジェニック補乳動物細胞及びトランスジ
ェニック非ヒト動物の構築を初めて可能とした。従って、大きなポリヌクレオチ
ド、典型的には50〜100kbの大きさ、しばしば250kbを超える大きさ
、場合により約500kbを超える大きさ、時々1000kb以上の大きさのポ
リヌクレオチドが、哺乳動物細胞中に効率的に導入されうる。哺乳動物細胞は、
ES細胞、例えばネズミES細胞(例えば、AB−1系統)でありうる。従って
得られたトランスジェニック細胞は胚盤胞中に注入されることができ、好ましく
は非ヒトトランスジェニック動物中で発現される大きなりNAトランスジーンを
有するトランスジェニック非ヒト動物例えばトランスジェニックマウス又はトラ
ンスジェニックラットを作りうる。本発明の方法はまた、体細胞例えば上皮細胞
(例えばケラチン細胞)、内皮細胞、造血細胞及びミオサイトでも行われつる。
胚幹細胞
胚幹(ES)細胞をトランスジーン宿主として用いれば、組み込まれた標的とさ
れたトランスジーンを含む標的とされた遺伝子を有するトランスジェニック動物
を発生させることが可能である。要約すれば、この技術は、非相同組み込み又は
相同組み換えによって、遺伝子を生殖細胞組織に分化できる多能性細胞系列(例
えば、ネズミES細胞系統)中に導入することを含む。
大きなトランスジーンは、宿主ゲノムの染色体の位置中に非相同的に組み込まれ
うる。或いは、生殖細胞系列遺伝子又は異種同族遺伝子(非相同遺伝子を含む)
の一部の少な(とも一つの変化したコピーを含む相同標的構築物(これはトラン
スジーンを含みうる)は、胚幹細胞のゲノム中に導入されうる。細胞の一部にお
いて、導入されたDNAは、非相同的に染色体の位置中に組み込まれるか又はマ
ウス遺伝子の内在性(即ち、自然存在する)コピーと相同組み換えをおこして、
それを変化した構築物で置き換える。
新しく設計された遺伝子配列を含む細胞を宿主マウス胚盤胞中に注入し、該胚盤
胞を宿主雌牛に再着床させる。これらの胚のいくつかは、部分的に変異細胞系統
由来である生殖細胞の集団を有するキメラマウスへと発生する。それ故、キメラ
マウスを繁殖することにより、導入された遺伝的損傷を含むマウスの新しい系統
を得ることができる( Capecchl ら、1989年、5cience
%第244巻、第1288頁によってレビューされている。この文献は引用する
ことにより本明細書の一部である)。
相同標的構築物のための標的効率は、一般に、標的DNA(即ち交差標的配列)
中に存在する参照配列に実質的に相補的な標的トランスジーン部分(即ち、相同
領域)の長さに伴って増加する。あるES細胞クローン中でのリコンビナーゼの
存在は効率的な組み換えに要求される配列の同一性の程度を減少しうると認識さ
れているが、一般には、標的効率は同質DNAの相同領域を用いることで最適化
される。
本発明はまた、非ヒト宿主種に対して異種(例えば、非相同)である遺伝子生成
物をエンコードするトランスジーンを提供する。このようなトランスジーンは典
型的には、構造遺伝子配列発現カセット(そこでは、連結されたプロモーター及
び好ましくはエンハンサ−が異種(例えば、非相同)タンパク質をエンコードす
る構造配列の発現を誘導する)を含む。例えば、本発明は、哺乳動物エンハンサ
−及びヒ1−APPタンパク質をエンコードする構造配列に連結された少なくと
も一つのヒトAPPプロモーターを含むトランスジーンを提供する。このような
トランスジーンを有するトランスジェニックマウスは、ヒトAPPのmRNAを
発現する。好ましくは、異種(例えば、非相同)タンパク質をエンコードするポ
リヌクレオチド配列は、シス作用転写調節領域(例えば、プロモーター、エンハ
ンサ−)に作動可能に連結されて、非相同タンパク質が自然存在する非ヒト動物
中の同族内在性遺伝子の発現と同様の様式で発現される。従って、一般に、トラ
ンスジーンの構成的なエンコードする配列を、同族内在性遺伝子中或いは近くに
自然に存在する転写調節因子に作動可能に連結するのが好ましい。しかしながら
、非相同タンパク質をエンコードするトランスジーンは、内在性転写調節配列に
隣接する標的とされる相同遺伝子標的構築物を用いることにより標的とされるこ
とができ、調節配列への作動可能な連結は、ES細胞の標的とされる内在性染色
体の位置中へのトランスジーンの組み込み後に起きる。
選択マーカー遺伝子
選択マーカー遺伝子発現カセットは、典型的には、標的とされる宿主細胞に選択
表現型を与えるタンパク質又はポリペプチドをエンコードする構造配列に連結し
た標的とされる宿主細胞(例えば、ES細胞)中で作動できるプロモーター、及
びポリアデニル化シグナルを含む。発現カセット中に含まれるプロモーターは、
構成要素であり、細胞タイプ特異的であり、段階特異的であり、及び/又は調節
できる(例えば、ホルモン例えばグルココルチコイドによる、即ち、MMTVプ
ロモーター)ものでありうるが、選択に先だって及び/又は選択中に発現される
。発現カセットは、場合により1以上のエンハンサ−(典型的には、プロモータ
ーの上流の約3〜10キロベース以内に連結される)を含みうる。しかしながら
、選択マーカーが相同標的構築物中に含まれる場合は、標的とされる内在性部位
の相同組み換えは、機能的内在性プロモーターの下流に選択マーカー構造配列を
置くように選ばれうる。そして標的構築物置換領域は、選択マーカーをエンコー
ドするたった一つの構造配列を含み、転写を導く内在性プロモーターを当てにす
るこより本明細書の一部である)。同様に、標的とされる内在性部位の近くに配
置されている内在性エンハンサ−を、エンハンサ−のない構築物中の選択マーカ
ー遺伝子配列の転写を増強させるために当てにすることができる。好ましい本発
明の発現カセットは、選択薬剤耐性マーカー及び/又はH3Vチミジンキナーゼ
酵素をエンコードしかつ発現する。適当な薬剤耐性遺伝子は、例えば、gpt
(キサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ、これはマイコフェ
ノール酸で選択されうる)、neo(ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ、
これはG418、ヒグロマイシン、又はビューロマイシンで選択されつる)、及
びDFHR(ジヒドロ葉酸レダクターゼ、これはメトトレキセートにより選択さ
れうる(MulliganとBerg、 1981年、肱旦−Nat1. Ac
ad、Sci、(U、S、^、)、第78巻、第2072頁、5outher頁
、これらは引用することより本明細書の一部である)を含む。他の適当な選択マ
ーカーも本技術分野において明らかである。
正しくコリボフエクションされた組み換え体の選択は、一般に、選択マーカー遺
伝子発現カセットが、内在的に組み込まれた発現カセットを有する標的とされた
細胞に選択表現型を与える機能的タンパク質(例えば、neo又はgpt )を
エンコードし、発現するところの、少なくとも正の選択を用い、従って、選択剤
(たとえばG 418、ビューロマイシンまたはマイコフェノール酸)を添加す
ることにより、このような標的とされた細胞は組み込まれた発現カセットを有し
ない細胞に比べ有利に成長し又は生存できる。選択マーカー遺伝子に関する更な
る案内は、Smj、thとBerg、 1984年、Co1d Spring
Harbor Symp、 Quant、 Biol、 、第49巻、第171
頁、3edivyと5harp 、 1989年、Proc 、Natl、Ac
ad。
Sci、 (U、S、^、)、第86巻、第227頁、ThomasとCape
cchiS1987年、既に引用(これらは引用することにより本明細書の一部
である)を含むい(つかの文献により可能である。
大きな異種ポリヌクレオチド
大きなポリヌクレオチドは、通常、YACベクター中にクローン化される。例え
ば、YACクローニングベクター中のヒトゲノムDNAライブラリーが、目的の
完全な遺伝子(例えば、ヒトAPP遺伝子、ヒト免疫グロブリン重鎮遺伝子座又
は軽鎖遺伝子座)又は完全な転写単位を含むこのような遺伝子の大部分に及ぶY
ACクローンを単離するために(例えば、PCR又は標識ポリヌクレオチドプロ
ーブハイブリダイゼーションによって)スクリーニングされつる。YACライブ
ラリーを作り、所望のYACを単離し、モしてYACDNAを精製するための方
法は、技術文献(米国特許第4889806号明細書、Burkeら、1987
年、5cie二、第236巻、第806頁、1urryら、1986年、囲、第
45巻、第529頁、これらは引用することにより本明細書の一部である)に記
載されている。
いったん所望のYACクローンが単離され及び好ましくは脱タンパク質化されれ
ば、酵母由来のYAC配列は、場合により、所望のクローン化された大きなトラ
ンスジーン配列の外側で切断する1以上の制限酵素で消化することによって完全
に又は部分的に除かれうる。つまり、酵母由来の配列は、例えば、パルスゲル電
気泳動によりクローン化された挿入配列から分離される。好ましくは、本発明の
方法において、完全な再配列されていないYACクローンが大きなトランスシー
ン又は大きな相同標的構築物として用いられる。
一つの観点において、好ましいYACクローンは、ヒトAPP遺伝子、ヒト免疫
グロブリン重鎮遺伝子座、ヒト免疫グロブリン軽鎖遺伝子座、ヒトα1抗トリプ
シン遺伝子、デュシエンヌ筋ジストロフィー遺伝子、ハンチントン舞踏症関連遺
伝子、及び他の大きな構造遺伝子好ましくはヒト遺伝子からなる群より選ばれる
構造遺伝子配列に完全に又は部分的に及ぶクローンである。
好ましいYACクローニングベクターは、修飾されたpY^C3ベクター(Bu
rkeら、1987年、既に引用、これは引用することにより本明細書の一部で
ある) 、pYACneo (Traverら、1989年、Proc、Nat
l、Acad、 Sci、(U、S、^、)、第86巻、第5898頁、これは
引用することにより本明細書の一部であにより本明細書の一部である)である。
カチオン性脂質
リボフエクション及びその基礎方法論での種々の変法は、公知の技術文献(米国
特許第5049386.4946787及び4897355号明細書)に記載さ
れており、リポフエション剤は、現在市販されている(例えば、”Transf
ectam″及び”Lipofectin“)。
DNAの効率的リボフエクシタンに適したカチオン性及び中性脂質は、技術文献
に記載されている。リボフエクションは、Felgner (Y091/174
24、これは引用することにより本明細書の一部である)及び/又はカチオン性
脂質化(、1091/16024、これは引用することにより本明細書の一部で
ある)に従って作られたDNAとの脂質複合体を形成することにより達成されつ
る。技術文献に記載されている種々のりボフエクション方法は、本発明に従った
コリポフェクションに適用されうる。例えば(限定されるものではないが)、一
般的なりポフェクション方法は以下の文献に記載されている: Behrら(1
989) Proc、 Natl、 Acad、 Sci、 (U。
S、A、) 86: 6982; Demeneixら(1991) Int、
J、Dev、Biol。
35+ 481; Loefflerら(1990) J、Neurochem
、54; 1812; Bennettら(1992)Mo1. Pharma
col、41: 1023; Bertlingら(1991) Biotec
hnol、^pp1. Biochei、13: 390; Felgnerら
(1987) Proc、 Natl、 Acad、 Sci、 (U、S、A
、) 84: 7413; FelgnerとRingold(1989) N
ature 331: 387; Gareisら(1991) Ce11、M
o1. Biol、37.: 191; Jarnaginら(1992) N
ucleic Ac1ds」胚、翻: 4205; Jiaoら(1992)塾
上エエ駐μ■1月、5: 400;Limら(1991) C1rculati
on 83: 2007; Maloneら(1989) Pr。
本明細書の一部である。
最近判ったポリカチオン性リポスペルミン化合物は、広範囲の細胞に見られ(B
ehrら、1989年、既に引用)、DNAはこれらの化合物によって覆われて
いる。更に、中性及びカチオン性脂質の組み合わせは、動物細胞のトランスフェ
クションにおいて高い効率であることが示され、そして多くの細胞系統において
広範囲の効果が示されている(R。
seら、1991年、BioTechniques 、第10巻、第520頁)
。
リポフエクション複合体(又は、カチオン性の脂質化されたDNA複合体)は、
適当なカチオン性脂質組成物を1以上のポリヌクレオチド種例えば大きなトラン
スジーン及び選択マーカー遺伝子発現カセットと混合することによって作られる
生成物と定義される。このようなコリポフエクション複合体は、適当な条件(例
えば、生理食塩緩衝液又は血清の入っている或いは入っていないES細胞培地、
20〜45℃)下で哺乳動物細胞と接触させたときに哺乳動物細胞(好ましくは
哺乳動物細胞は、ES細胞例えばネズミES細胞である)中へのポリヌクレオチ
ドの取り込みを引き起こすコリボフエクション複合体の形成をもたらす、ポリヌ
クレオチドと脂質成分の相互作用によって特徴づけられる。
種々の適当なカチオン性脂質は、単独で又は1以上の他のカチオン性脂質種或い
は中性脂質種と組み合わせて用いられうる。一般に、適当なカチオン性脂質は正
に荷電した頭部基(1以上の荷電)及び共有結合的に結合された脂肪酸尾からな
る。適当なカチオン性脂質組成物は、カチオン性脂質−ポリアミンジオクタデシ
ルアミドグリシルスペルミジン(DOGS)を含む”Transfectam”
(ProMega、 Madison。
TI)である。DOTMAは、N−(2,3−ジ(9−(Z)−オクタデセニル
オキシ))−プロブ−1−N、N、N−トリメチルアンモニウムクロライドとし
て知られている好ましい脂質である。D N A −DOTMA複合体は、本質
的にはDOTMA及DNAから作られる。好ましいカチオン性脂質の他の具体例
は、ジオレオイルフォスファチジルエタノールアミン(PtdEtn、 DOP
E) 、ジオクタデシルアミドグリシル、N−トリメチルアンモニウムクロライ
ド、N−トリメチルアンモニウムメチルサルフェート、DORI及びDORI−
エーテル(DORIE )である。DORIは、N−[1−(2,3−ジオレオ
イル)プロピル]−N、N−ジメチル−N−ヒドロキシエチルアンモニウムアセ
テートであり、DORIEはN−[1−(2,3−ジオレイルオキシ)プロピル
]−N、N−ジメチル−N−ヒドロキシエチルアンモニウムアセテートである。
DOTAPはN−[1−(2,3−ジオレオイルオキシ)プロピル]−N、N、
N−トリメチルアンモニウムメチルサルフェートであり、この脂質はエーテル結
合ではなくエステル結合を有し、細胞によって代謝されつる。
場合により、1以上のコリビド(co−1ipid)を適当なカチオン性脂質と
組み合わせることができる。場合により用いるコリビドとは、単独でも或いは他
の脂質成分と組み合わせてDNAと安定なりNA−脂質複合体を作りうる構造体
として理解されるべきであり、それは正にも負にも荷電されつるが、好ましくは
中性である。場合により用いられるコリピドの具体例は、ホスホリピド関連物質
例えばレシチン、ホスファチジルエタノールアミン、リゾレシチン、リゾホスフ
ァチジンエタノールアミン、ホスファチジルセリン、フォスファチジルイノシト
ール、スフィンゴミエリン、セファリン、カルシオリピン、ホスファチジル酸、
セレブロシド、ジセチルホスフエート、ジオレオイルフォスファチジルコリン(
DOPC) 、ジパルミトイルホスファチジルコリン(DPPC) 、ジオレオ
イルフォスファチジルグリセロール(DOPG)、ジパルミトイルフォスファチ
ジルグリセロール(DPPG)、ジオレイルフオスファチジルエタノールアミン
(DOPE)、パルミトイルオレオイルフォスファチジルコリン(POPC)、
パルミトイルオレオイルフオスファチジルエタノールアミン(POPE)及びジ
オレオイルフオスファチジルエタノールアミン4−・(N−マレイミドメチル)
−シクロヘキサン−1−カルボキシレーt−(DOPE−11al)である。追
加的なリンを含まない脂質は、例えば、ステアリルアミン、ドデシルアミン、ヘ
キサデシルアミン、アセチルパルミテート、グリセロールリシノーレート、ヘキ
サデシルステアレート、イソプロピルミリステート、両性アクリルポリマー、ト
リエタノールアミンラウリルスルフェート、アルキルアリールスルフェートポリ
エチルオキシル化脂肪酸アミド、ジオクタデシルジメチル臭化アンモニウムなど
である。
一般に、リボフエクション複合体を形成するために、−又は複数のポリヌクレオ
チドを、文献及び本明細書の技術に従って、適当なカチオン性脂質と、1以上の
コリピドの存在下又は不存在下で、約pn7.4〜?、8.20〜30℃で、組
み合わせる。2以上のポリヌクレオチド種をリボフエクション複合体中に組み入
れる場合は、本明細書中ではコリボフエクション複合体と呼ばれる。一般に、コ
リボフエクション複合体は、大きなポリヌクレオチド(トランスジーン又は相同
標的構築物)及び選択マーカー遺伝子発現カセットを含む。コリボフエクション
複合体は、技術文献又は本明細書に記したりボフエクション条件下で、細胞培養
物、好ましくはES細胞に投与される。
一般的方法
本発明の好ましい方法は、大きな非相同トランスジーンを含む実質的に無傷のY
ACクローンを、トランスジェニック非ヒト動物を作るために用いられうる多能
性幹細胞系統中に移入し、次に宿主杯盤中に注入することである。本発明の特に
好ましい実施例は、連結されていない正の(例えば、neo )選択発現カセッ
トと共にコリボフエクションされたヒトAPP遺伝子標的構築物である。ヒトA
PPトランスジーンは、コリボフエクションされたES細胞が引き続き生存する
のに適した条件下でマウスES細胞中に移入される(例えば、neoと共にコリ
ポフエクションにより)0リポフエクシヨンされたES細胞は、正の選択の選択
条件(例えば、G418の選択濃度)下で培養される。次いで、選択された細胞
は、本技術分野で公知の標準PCHに従ったPCR分析又はサザンプロテイング
法(米国特許第4683202号明細書、Er1ichら、1991年、5ci
ence 、第252、第1643頁、これらは引用することにより本明細書の
一部である)により、正しく標的されたトランスジーン組み換えを有しているこ
とが確かめられる。
次いで、正しく標的されたES細胞は、本技術分野で公知の方法(Capecc
hi、 M、 、1989年、丁IG 、第5巻、第70頁、Capecchi
、 M、、1989年、5cience 、第244巻、第1288頁、これら
は引用することにより本明細書の一部である)に従いキメラトランスジェニック
動物を作製するために適当な胚盤胞宿主へと移入される。いくつかの研究は既に
、所望のトランスフェクションされた細胞系統を成功裡に同定するためにPCR
を用いている( ZiimerとGruss 、 198988巻、第4294
頁、これらは引用することにより本明細書の一部である)。この方法は、外来性
の標的トランスジーンを受け取った細胞数が大きいとき(即ち、エレクトロポレ
ーシヨン又はリボフエクションを用いたとき)及び処理された細胞集団が大きく
なれる場合は、非常に効果的である( Capecchi、 M、、1989年
、既に引用、これは引用することにより本明細書の一部である)。
トランスジェニック非ヒト動物(これは、相同的に標的とされる非ヒト動物を含
む)を作るためには、胚幹細胞(ES細胞)が好ましい。有糸分裂できない5N
L76/7細胞の支持細胞層(McMahonとBradley 、 Ce1l
、第62巻、第1073〜1085頁、1990年)上で生育されたネズミES
細胞例えばAB−1系統(実質的には(Robertson、 E、J、、19
8eSS s第71〜112頁)に述べらている)は、相同遺伝子標的のために
用いられうる。他の適当なES系統は、814頁、D3系統(DoetslAn
anら、1985年、1. Embryol、 Ex 。
含むが、これには限定されない。う・ノド、)\ムスター、ウシ及びブタのES
細胞も、ヒトAPP遺伝子配列を有する非相同トランスジーン・ンク非ヒト動物
を製造するための技術分野において入手可能である。大きなトランスジーン又は
特に標的とされた遺伝的交代を有するES細胞力)らのマウス系統の作製の成功
は、ES細胞の多能性(即ち、宿主胚盤胞に注入された後に、胚形成に参加し、
得られる動物の生殖細胞系統に対する寄与する、それらの能力)lこ依存する。
注入されたES細胞を含む胚盤胞は、擬妊娠lμヒト雌の子宮中で発生を許され
、そしてキメラマウスとして生まれる。得られたトランスジーン・ンクマウス(
ヨ、大きなトランスジーン/相同標的構築物を有する細胞]こつ0てキメラであ
り、そして戻し交雑され、子孫の尾の生検でのDNAのPCR又はサザンプロテ
イング分析(こよってトランスジーン及び/又はYAC配列の存在lこつ(1て
スフ1ノーニングされて、トランスジーン/相同標的構築物lこつ(旭てのトラ
ンスジェニックマウスへテロ接合体を同定する。適当な交雑を行うことにより、
複数の大きなトランスジーン/相同組み換え構築物、及び場合により異なったI
D相同タンパク質をエンコードするトランスジーン1こつ(1てトランスジェニ
ック非ヒト動物ホモ接合体力(製造できる。このようなトランスジェニックヒト
動物は、移入されたトランスジーンと関連した種々の疾患の満足できる実験モデ
ルである。
ある種の研究を行うためには、ヒトAPP配列を有しかつ発現するトランスジェ
ニックラットが好ましいであろう。
毒性レベル、最適DNA :脂質比等を決定するための試行実験を、pUC中の
2kb PGKneoカセットを用いて、及びpYPPN (無動原体腕中の5
V40−neoカセットの代りにP G K n e○カセ・ノドを含んで0る
修飾されたpYACneo)を用いて行なった。
これらの検量実験に用いたYACは、85kbのヒトTgH遺伝子フラグメント
が、修飾されたpYACneoベクター(クローニング部位をEcoRI −>
No tlに変更)中にクローン化されたものであった。従って、YACli、
ベクター腕を含む100kb長であった。
D OT MA (LipofectinSB RL、 BethesdaSM
D)及びD OG S (Transfectam、 ProMega、 )l
adison、 W I )をカチオン性脂質としてテストした。図1に、コリ
ポフエクション複合体を形成するために用いることができる代表的な、カチオン
性脂質の化学構造を示す。ES細胞毒性カーブ1よ、それぞれについて行なわれ
た。毒性効果は、DOTMAでは、30gg/mlのレベルで見られた。DOG
Sは、60jg/mlのレベルで毒性効果を示さなかった。
最適DNA :脂質比は、受容体としてpGKneoを用いて両方の脂質につい
て決定した。DOTMA及びDOGSの最適値は、それぞれ1:10及び1:5
0(DNA:脂質、重量二重量)であった。
それぞれの脂質について最適ES細胞数を決定した。最適温置時間及び条件を決
定した(どれ位の長さ及びいかなる緩衝液中が、両方のDNA :脂質複合体に
ついて最高のトランスフェクションを与えるか)。試行実験によると、無血清D
MEM中に、37℃にて、3〜4時間DNA : D。
GSの1:50の混合液とともに、温室した3〜5XIQ6のES細胞が、トラ
ンスフェクシントの最大数を生じることが示された。これらの条件を、日常実験
的に、YACリボフエクション実験のために用いた。
コリボフエクション手順において、PGKneoカセット、eem又はpYPN
Nのいずれかを有する連結されていないプラスミドにより、neo が提供され
た。DNA ニブラスミドモル比は、14〜1:20の間を変化した。キャリア
ーDNA (剪断されたニシン精子)の等重量をまた添加した。
酵母ブロックを、0.67%低融点アガロース中にて、3,5×109細胞/m
lに調製した。YACをPFGEによって単離した。外側のレーンをEtBrを
用いて染色し、染色されていない部分と並べた。YACを含む薄い切片を、プレ
イン(brain)ナイフを用いて分離した。約1pgのYACが、約10m1
のゲルから回収された。ゲルを、多量のゲラーゼ緩衝液(40℃1M bis4
ris pH6,0,1@麗EDT^、40mM NaC1)中で洗い、70℃
で溶融し、40℃に冷却し、そして、IOUのゲラーゼ(Epicentre
Technologies、 Madison、 WI)とともに1晩温置した
。
消化後、pYPNN又はピセンター(picenter)を、典型的なモル比1
:4(YACニブラスミド)で加えた。当重量の剪断されたニシン精子DNAを
キャリアーとして添加した。約1100IIのYACを含んでいるアガロース消
化混合物を、すぐに、Transfectamを用いて、最適DNA :脂質比
にて、30分間、室温で温室した。ポリアミンは、添加しなかった。
ES細胞を洗浄し、トリプシン処理し、そして無血清DMEM中に再懸濁した。
3X106のES細胞(及び約105の支持細胞)を含んでいる9mMの細胞懸
濁液を、60nmペトリ皿(組織培養プラスチックではない)上に塗布した。約
1mlのDNA−脂質混合物をDMEM中の細胞に加えて、37℃で3〜4時間
温置した。次いで細胞をDMEM+FBS中に集め、100mm組織培養皿当た
り106で塗布した。0418選択を24時間後に行い、約10日後にコロニー
をつった。
典型的には、1〜211gのYACを実験毎に用いた。従って、約10〜20の
別々のりボフエクションを、1回の日程で行った。一般に、数百の6418耐性
クローンがつりあげられ、それらの少なくとも1〜2%は特定のYAC由未配列
を含んでいた。これらのうち、約10%が、全YAC挿入をカバーしているプロ
ーブを用いた微細構造サザンブロツティング、PFGEサザン分析及びPCR分
析によると、無傷のYACを有していた。
実施例2
ヒトアミロイド前駆タンパク質をエンコードするYACを有するマウスの製造
APP YACDNAの調製、完全な長さのAPP遺伝子を含む650kbのヒ
トゲノムフラグメントを、Yashingt。
n University Y A Cライブライ−(Center for
Geneticsin Medicine Librarian、 Yashi
r+gton Llniversity 5choolof Medicine
、 St、 Louis、 Missouriから入手)から酵母宿主株(クロ
ーン#B142F9)中の酵母人工染色体(YAC)として単離した。酵母株を
、AHC培地中で後期対数期まで生育し、0.67%の低融点アガロース(Se
aPlaque、 FMCCorp、 )中に3.5x 10” cells/
ill: テ懸15L、ソシテ、フロック形成器(Bio−Rad)中にて冷却
した。無傷の酵母染色体DNAを以下のようにして調製した。30の25hlの
B142F9細胞のブロックを、50m1のY S S (Y S S ; 4
mg/ml Novozyme 234(Novo Nordisk)、I M
ソルビトール、100m1l EDTA、 50mM リン酸カリウム、pH1
5,5)を含む150m1のペトリ皿中で、37℃で、30分間ぐるぐるかき混
ぜた。ブロックを、T E (IOM Tris pH7,5,1mM EDT
A)中で1回洗い、50m1のLDS (LDS・1%リチウムドデシルスルフ
ェート、1%サルコンル、100mM EDTA)中で、30〜60分間、37
℃でぐるぐるかき混ぜた。LDSを50m1の滅菌ピペットで除き、そしてブロ
ックを、新鮮な、LDS50111中で、1晩ぐるぐるかき混ぜた。ブロックを
数回501M EDTA中でさっと洗い、50mM EDTA中に4℃で保存し
た。調製したブロックの100μlの部分を、0.25倍のTBE中の1%低融
点アガロースの各ウェル(14X 25cmCHE Fゲル、10ウエルゲル櫛
、Bio・[i。
d)にのせた。酵母染色体をパルス場ゲル電気泳動(CHE F −D RI
LSBioRad)によってスイッチ時間60分、200V、 14℃、48時
間の条件にて、分離した。ゲルの先端のレーンを除き、0.5pg/mlの臭化
エチジウム中にて2時間染色し、UVl−ランスミツターで分離された染色体を
見えるようにした。これらの条件下で、650kbのYACが、最も近い内在性
酵母染色体から3〜5+Inの距離で分離された。
ゲルの部分に刻み目をつけて、650kbのYACの位置を示し、そして、それ
らの部分をゲルの残りと再び並べた。650kbのYACを含んでいるゲルの2
mM巾のスライスを、プレインナイフ(Roboz Surgical In5
truinet Co)を用いて単離し、50n+jl EDTA中にて4℃に
て保存した。約5μgのYACDNAが、約10+alのゲル中に単離された。
YACDNAを含むアガローススライスを、ゲラーゼ緩衝液(40mM bis
−Tris pH6,0,1mM EDTA、 4(lnM NaC1)中にて
平衡化し、完全に溶液となるまで70℃で20分間溶融し、そして45℃まで冷
却した。ゲラーゼ(25U 5Epicentre Technologies
、 Madison、 III )を加え、溶融されたアガロース混合液を45
℃で90分間温温置て、DNA−アガロース混合物を液化した。
APP YACのES細胞中への導入
胚幹細胞(AB−1)をPBSで洗浄し、トリプシン処理し、そして無血清ES
培地(DMEM、 1倍量のグルタミン、ペニシリン/ストレプトマイシン、1
11M2−メルカプトエタノール、1倍量のNEAA)中に懸濁した。9mlの
無血清ES細胞懸濁液中の約5X106細胞を60%mのペトリ(組織培養処理
をしていない)皿のそれぞれに塗布した。選択マーカー (P(JneoA+R
、ネオマイシン耐性遺伝子に融合したP(Jプロモーターを含む、Rudnic
kiら、1988年、Mo1. Ce11. Biol、、第8巻、第406頁
、Rudnickiら、1989年、Biochem。
Ce11. Biol、、第67巻、第590頁、これらは引用することにより
本明細書の一部である)を含む直線化したプラスミドを、1mlのゲラーゼ処理
したYACDNAに、2.1(プラスミド・YAC)のモルにて加えた。カチオ
ン性脂質(丁ransfectan、 ProMega、 Madison、
TI )を、50:1 (Transfectam : D N A )の重量
1重量比にて加え、混合液を穏やかに一回ひっくり返して混合し、そして室温に
て約30分間温室した。次いでDNA :脂質混合液のll1lを、それぞれE
S細胞の60mmの皿に加え、37℃の002インキユベーター中にて4時間温
室した。次いで、細胞を滅菌した250111のボトルに移し、等体積のES培
地(上記と同じ、但し15%のウシ胎児血清を含んでいる)を加えた。細胞を穏
やかなピペッティングで皿から取り出し、15%のウシ胎児血清を含む等体積の
ES培地と合わせた。この細胞懸濁液を、15111ずつ、有糸分裂活性を有さ
ない5NL76/7繊維芽細胞の支持細胞(llcMahon (!: Bra
dley 、1990年、囲、第62巻、第1073頁、これは引用することに
より本明細書の一部である)を含んだ100■の組織培養プレートに移し、そし
て組織培養インキュベーターに戻し24時間装いた。24時間後、培地を、10
%ウシ胎児血清及び400μg/mlのG418を含むES培地に代えた。48
時間ごとに培地を代えた。
7日後に、全部で366の0418耐性コロニーが測定された。240コロニー
のそれぞれを、別々に、0.25%のトリプシンの入った、カルシウム無し一マ
グネシウム無しPBSの50μlを含む96ウエルマイクロタイターデイシユの
ウェルに移した。15分後、血清を含む培地を50μl加え、粉砕によりコロニ
ーを解離した。そして、細胞懸濁液を、培地及び支持細胞(上記)を含む96ウ
エルプレートに重複して移した。4〜5日後、1連のディシュを慣用の方法に従
って凍結した( Ram1rez−3oi lisら、Guide to Te
chniques in Mouse Developenent 、 199
2年、Methods j、n Enzymology。
これは引用することによ本明細書の一部である)。細胞を、50μlのトリプシ
ン中で解離し、50μlの凍培地(20%DMSo、 20%ウシ飴児血清を含
むDMEM)と混合した。100μmの滅菌シリコーン油を、それぞれのウェル
中の細胞懸濁液の上に重層し、そしてプレートを、5tyrofoanコンテナ
中に置き、−80℃で凍結した。
APP配列を含むESクローンの同定
リボフェクタントESクローンを含む他の一連のマイクロタイターディシュを、
PCR分析のためのDNAを調製するために用いた。50μlの溶解緩衝液(5
0mM Tris pH8゜0、200mM NaC1,25mM EDTA、
0.2%SDS、1mg/ml プロティンキナーゼK)をそれぞれのウェル
に加えた( Ram1rez−3゜lis ら、1992年、Anal、 Bi
ochem、、第201巻、第331頁、これは引用することにより本明細書の
一部である)。−晩55℃で温室後、それぞれのウェルに5μlの2.5M N
aC1及び95μmの100%エタノールを加えた。ディシュを穏やかに室温で
60分間ぐるぐると回してDNAを沈降させた。次いで、ウェルを5回、70%
エタノールでさっと洗い、そして37℃で乾燥させた。DNAを、加湿インキュ
ベーター中で、37℃にて、100 μmのH20に、−晩かけて、再び懸濁し
た。
個々のDNA試料を、PCRのために、縦及び横について集め(図2)、そして
集めたもの(プール)を、以下のプライマーを用いてPCRによりAPP配列に
ついて分析した( Fidaniら、Human Mo1ecular Gen
etics、第1巻、第165〜168頁、1992年の方法を改変した)。
AP P−PA : 5’−GCT TTT GACGTT GGG GGT
TA−3’APP−PB2・ 5°−TTCGTG AACAGT GGG A
GG GA−3’APP−17A: 5°−ATA ACCTCA TCCAA
A TGT CCCC−3′
APP−178: 5’−GTA ACCCAA GCA TCA TGG A
AG C−3゜
APP−PA/PB2は、ヒトAPP遺伝子のプロモーター領域に特異的なプラ
イマーを表し、APP7A/7Bは、エキラン7に特異的であり、APP17A
/17Bはエキラン17に特異的である。
−j−ルのPcR分析は、42クローンがプロモーター及びエキフン1フ配列を
共に有している可能性を示した(図3)。42クロ一ン個々のPCR分析により
、6クローン(番号23.24.176、213.219.230 )がプロモ
ーター及びエキフン1フ配列を共に有していることが示された(図4)。
これらのクローンは培養により増やされ、そしてバイアル中にて液体窒素中で凍
結された。これらの細胞を、PFGE分析のためにアガロースブロック中に充填
し、そしてRNA単離のために収集した。
APP配列を含むESクローンの構造分析ESクローンにより運ばれたAPP
YACの組み込み率は、まず以下に示すレアカッター(rare cutter
)フィンガープリント技術を用いて推定された。ヒトDNAを鍼灸に切断しな
い制限酵素をヒトaluフラグメントプローブに対合するフラグメントのパター
ンを決定するために用いた。レアカッターは、しばしば、ジヌクレオチドCpG
を含んでおり、哺乳動物細胞はしばしばCpGジヌクレオチドをメチル化するこ
とにより、それらを含む殆どの制限部位を消化に対して耐性にする。しかしなが
ら、酵母細胞は、CpGをメチル化できない。従って、所与のフラグメント中の
CpGを含む制限部位のパターンは、酵母中又は哺乳動物細胞中のいずれかでフ
ラグメントがYACとして増殖されるかに依存する。従って、認識配列中にCp
Gがないレアカッターのみが、YACからのalu含有フラグメントの消化パタ
ーンを作るために用いられる。
B142F9アガロースブロツクを、制限酵素Sfi I 、Pac I、Sv
a I 、 Pie I及びApa Iを用いて完全に消化し、Aluフラグメ
ントに対するプローブとして全ヒトDNAを用いてPFGEサザンブロッティン
グにより分析した(図5)。
Sfi I消化によって生じたバンドのパターンは、30kb〜220kbの間
に均一に分布するバンドを生じるので、参照パターンとして用いた。もしYAC
が、ES細胞中に無傷で組み込まれていれば、Sfi I消化は、末端フラグメ
ントを除いて、同様のバンドのパターンを生じると期待される。末端フラグメン
トは、Sfi I消化物をpBR322をプローブとして再び調べることにより
容易に同定されつる。この場合は、フラグメントの完全なセットが部分的消化マ
ツピングにより配列される。要約すれば、B142F9ブロツクは、一連の範囲
のSfi I濃度で消化され、PFGEで分離され、そしてpBR322の2.
5kb (trp腕特異的)又は1.6kb (ura腕特異的) BamE
I−Pvunラグメントでプローブして探査される。
従って、部分的消化の特定のレベルにおいて、バンドの梯子が生じた。それぞれ
のバンドは、隣接するSfi I部位への距離により、最近傍のものと異なる。
6のES細胞系統を、Sfi Iにより完全に消化し、非常に厳しい条件下で、
全ヒトDNAをプローブとして探査した。6の系統の内、たった3つ(24,1
76,230)が、APP YACからの参照パターンに一致するバンドのパタ
ーンを示した。レアカッターフィンガープリント方法は、YAC中にクローン化
されたフラグメントの配列が判らな(とも良いので、ヒトDNAを含むいずれの
YACの分析にも適用できる。更に、標的哺乳動物細胞系統中に見いだされない
他の種からの繰り返し因子を探査するのであれば、この方法は他の哺乳動物細胞
系統中に他の外来DNAを含んだYACの構造を分析するために用いられうる。
APP YACを含んだESクローンの転写分析6のES系統を、PCHにより
転写について分析した。
全RNAを標準グアニジンイソチオシアネート/塩化リチウム法(5anbrO
Okら、Mo1ecular Cloning )により、それぞれの細胞系統
から調製した。相補的DNAをオリゴ−dTプライマーを用いて調製し、そして
c DNAを、PCRにより、以下に描いたエキタン6及びエキラン9由来のP
CRプライマーを用いてヒトAPP遺伝子のスプライス生成物について分析した
(Goldeら、Neuron、第4巻、第253〜267頁、1990を改変
)。マウスAPP cDNAの不適当な増幅を排除するために、それぞれのオリ
ゴマーの3′末端ヌクレオチドを、ヒトcDNA配列に特異的であるが、マウス
のcDNA配列には一致しないように選択した。マウスAPP cDNAに特異
的なPCRオリゴマーもまた、調製した。
ヒトAPP特異的オリゴマー
APP−HASI・ 5’ −CAG GAA TTCCACCACAGA G
TCTGT GGA A−3゜
APP−HAS2: 5°−CAG GAT CCG TGT CTCGAG
ATA CTT GTCA−3’
マウスAPP特異的オリゴマー
APP−MASI・ 5’ −CAG GAA TTCCACCACTGA G
TCCGT GGA G−3゜
APP−MAS2・ 5’ −CAG GAT CCG TGT CTCCAG
GTA CTT GTCG−3’
クローン24.176及び230においては、タン/<り質の770.751及
び695アミノ酸の形をエンコードする交互的;こスプライスされたヒトAPP
転写物を示す予期されたPCR/<ンドを示した(図7)。クローン23.21
3及び219(よ、PCRで検出できる転写物を含んでいなかったので、ヒトA
PP特異的オリゴマーがES細胞系統に対して内在性のマウスAPP転写物から
のバンドを増幅しな(1ことを示す負の対照として用いられる。更に、RT−P
CR分析(よ、クローン24.176及び230が無傷のYACを含んでおり一
方クローン23.213及び219が含まないと予測したレア力・ツタ−フィン
ガープリント分析の結果を確認し、証明した。
ES細胞中のAPP転写物の定量分析
RT−PCR分析は定量的であるので、RNase防護は分析がES系統中の交
互的にスプライスされたヒトAPP転写物の定量のために用いられる。RNas
eプローブは、ベクターpsP72中に310kbRT −P CR生成物をE
coRl −BamB Iフラメントとしてクローニングすること(こよって作
られた(図8)。得られたプラスミド、pH1APP it、UpaI部位で直
線化され、そしてアンチセンス転写物力<SP6ブモーターから作られた。RN
ase防護分析は、標準方法(Sambrookら、Mo1ecular Cl
oning)に従って行われた。
或いは、S1ヌクレア一ゼ防護分析を、転写物の定量のために用いた。pH1A
PPは、Xho I及び1lpa Iで消化され、446t)pのフラグメント
を遊離する。二本鎖ラグメントはフレノウを用いて末端標識され、変性され、ヒ
トAPP配列を有するES系統からのRNA試料に対合され、そして81分析を
標準方法(Sambrookら、Mo1ecular Cloning )に従
って行われた。
更に、ヒトAPPタンパク質の発現は、ES細胞系統及びトランスジェニック動
物の組織からのヒトAPPタンパク質に特異的な抗体を用いたヒトAPPの免疫
沈降により決定されつる。このような抗体は、標準的な組織切片の免疫組織化学
分析により直接にヒトAPPを検出できる。
トランスジェニックマウス中でのヒトAPP発現の分析上記の定量及び定性分析
はまた、これらのES系統由来のトランスジェニックマウスの組織中のヒトAP
P遺伝子の分析にも適用できる。
クローン23.213及び219は、(Robertson編、Teratoc
arcinomas and Embryonic Stem Ce1ls)に
記載の通りにしてキメラ始祖を作るために胚盤胞中へ注入された。始祖は、野生
型マウスへと繁殖され、APP YACを有するF1動物を生み出す。
アルツハイマー病のマウスモデル
野生型ヒト(又はマウス)APPタンパク質の過発現は、神経細繊維の絡み形成
、斑形成及び神経系の機能不全を含むアルツハイマー病の表現型の特徴をもたら
しつる。その目的に向かって、APP YACを発現する種々のマウス系統が、
ヒトAPP遺伝子の数及びその結果の発現を増やすために交配される。
或いは、家族制アルツハイマー病(コドン 717:V−I、F又はG)及び/
又は遺伝性のアミロイド−シスに伴う脳出血、Dutchタイプ(ncnv^−
D1コドン 693:glu −gin )に関連すると同定された変異は、標
準の酵母分子遺伝学技術例えば変異を含むAPP遺伝子のサブクローン化された
フラグメントを有するプラスミドの挿入/取り出しを用いて、又は酵母のオリゴ
ヌクレオチド指揮形質転換(GuthrieとFinkSGuide to Y
east Mo1ecular Genetics and 1iolecul
a Biology)により、YAC上に含まれるヒトAPP遺伝子に導入され
つる。これらの変異したAPP遺伝子を有するYACは、上記の方法を用いてト
ランスジェニックマウス中に導入されつる。他の自然存在するヒトAPP病の対
立遺伝子配列もまた用いられつる。これらは、コドン692 (Ala →Gl
y ) 、:Iトン692 (Glu →Gln又はGly ) 、及びコドン
713 (Ala −Val )及び頁、ilu l Lanら、1992年、
Nature Genet、 、第1巻、第505頁、Levyら、1990年
、5cience、第248巻、第1124頁、これらは引用することにより本
明細書の一部である)に記載されているその他を含むが、これらには限定されな
い。
実施例3
酵母人工染色体中にクローン化されたヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するトラ
ンスジェニックマウスヒト重鎮免疫グロブリン遺伝子の85kbフラグメントが
、YACとしてクローン化され、実質的に無傷の組込まれたYACを有する胚幹
細胞系列がYAC及び連結されていない選択マーカーのコリボフエクションによ
り誘導された。
キメラ祖先動物は、胚盤胞インジェクションにより作られ、YACクローンにつ
いてトランスジェニックな子孫が得られた。これら子孫からの血清の、ヒト重鎮
の存在についての分析は、YACに運ばれる免疫プロプリン遺伝子フラグメント
の発現を示した。酵母スフェロプラストと哺乳動物細胞との融合と違って、酵母
染色体DNAは、コリボフエクンヨン法によって導入される必要がない。なぜな
ら、YACは典型的にはまず、パルス場(フィールド)ゲル電気泳動(P F
G E)のような分離法により酵母染色体から分離されるからである。YACは
、連結されていない選択マーカープラスミドと共にコボリフエクションによりE
S細胞中に導入された。このコボリフエクション戦略は、レトロフイテイング(
retrofitting)ベクターが再構築される又はYAC中に組み換えら
れる必要がなく、組み換え欠陥宿主中に有されるYACを用いつる点で、修飾さ
れたYACのリポフェクトンと異なる。マイクロインジェクションによるアプロ
ーチと対照的に、無傷のYACDNAの精製における技術的ハードの故に及びマ
イクロインジェクションの間にDNAに与えられる高剪断力の故に、マイクロイ
ンジェクションに比べてコリポフエクションによって、より大きなYACを導入
できる。更に、酵母スフェロプラストと哺乳動物細胞の融合(そこでは酵母染色
体のいくつかがYAC5°6と一体化する)と違って、酵母染色体DNAはコリ
ボフエクション中で導入されない。なぜなら、YACは初めに、パルス場ゲル電
気泳動により単離されるからである。
無傷のYACを有するES細胞の胚盤胞インジェクションにより、トランスジェ
ニックマウスが作られた。YACは、生殖細胞系列を通して無傷のまま保たれ、
ヒト重鎖抗体サブユニットがトランスジェニック子孫の血清中で検出再配置され
ていないヒト免疫グロブリン重鎮座の85kbSpe!フラグメントが単離され
た。ヒト重鎮免疫グロブリン(H)鎖遺伝子の85kbSpe Iフラグメント
は、ヒトIgM重鎖分子の正しい再配置及び発現のために必要な各因子の少なヒ
ト重鎮免疫グロブリン遺伝子の85kbSpel制限フラグメントは、v6、機
能多様性(D)セグメント、6つすべての結合(J)セグメント、及びCμ定常
領域セグメントを5hinら(1991)EMBOJ、第10巻第3641頁)
。新鮮なヒト精液を採取し、ゲノムDNAが5traussら(1992)Ma
im、 Genome第2巻第150頁)に記載されるようにアガロースブロッ
ク中に調製された。サイズ選択された(50〜100kb) 5pel完全消化
物YACライブラリーが、クローニング部位として動原体近くのSpe 1部位
を用いて、酵母宿主株AB1380において、pYACneOR中に調製された
。サイズ選択された(50〜100kb) 5pel完全消化物YACライブラ
リーが、YACベクターpYACneoR中に作られ、ヒトCμに対し特異的な
プローブとのコロニーハイブリダイゼーション(コロニ一対合)によりスクリー
ンされた( Traverら(1989)Proc、Natl、Acad、Sc
i、(U、S、A))第86巻第5898頁)。
約18.000の主たる形質転換体のうち、1つの陽性クローン(Jl)が同定
された。酵母ミトコンドリアDNAがしばしば、パルス場ゲル電気泳動において
YACをおおいに隠すので、ミトコンドリアDNAを欠(r’ ブチシト突然変
異体がEtBr処理により選択され、Jl、3Pと名付けられた。1つのサブク
ローン、Jl、3Pが3.5X109細胞/1でアガロースブロック中に乗せら
れ、無傷の酵母染色体DNAが調製された( Sm1thら(1990)Pro
c、 Natl、人cad、 Sci。
(U、 S、 A、 )第87巻第8242頁)。YACDNAが、低融点の準
備したCHEFゲル(Biorad)から3〜4 mu輻幅ゲルスライス中単離
された。ゲルスライスは、b−アガロース緩衝液中で平衡化され、70℃で20
分間溶融され、45℃に冷却され、10単位のアガラーゼにより45℃で一夜消
化された。
YACJl、3Pの特性づけ
Jl、3Pインサートの信憑性が、制限マツピング及びサザン分析により決定さ
れた。pYACneoの動原体及び無動原体腕(アーム)におけるバクテリア選
択マーカーを用いて、インサートの端をサブクーロン化した。末端フラグメント
の微細構造制限分析は、領域の発表されているマツプ及び配列と完全に一致しく
Faxら、酵母ミトコンドリア遺伝子の分析と操作、酵母遺伝学及び分子生物
学へのガイド(1991)Guthrie CとFink G編、Academ
ic Press、サンジエゴ、カリフォールニアHTordら(1989)
Int、 I+i+aunol。
第1巻第296頁)、ベクターアームに対するインサートのオリエンテーション
を定義した。該オリエンテーションは更に、vFi6配列のための無動原体イン
サートのPCR分析、及び動原体インサートのCμプローブとのハイブリダイゼ
ーシヨン(対合)によって検証された。Cμ領領域サザン分析は、発表されてい
るマツプ及び制限分析と一致した( Hofkerら、(1989)ProC,
Natl、Acad、Sci、(U、S、A、)第86巻第5587頁)。ヒト
重鎮の機能多様性セグメントは、Dセグメントの4倍の多形繰返しを含む35k
bスパン中に含まれている。Jl、3PYACのサザン分析は、D領域の「制限
フラグメント指紋」を作り、その中でYAC中のD特異的バンドのすべてがヒト
ゲノムDNA中に存在した。
ES細胞中へのJl、3P YACのコリポフエクションJ1.3P YACが
、マウスPGKプロモーターにより作動されるneor遺伝子を有する連結され
て0なl、1線形化されたプラスミドと共にコリポフエクションされた(Sor
ianoら(1991)Cell第64巻第893頁)。
選択マーカープラスミド
プラスミドは、マウスホスホグリセラードキナーゼ−1プロモーター、及びPG
K−1ポリ(A)部位の転写コントロール下のneo遺伝子より成る発現カセ・
シトを含む5kbプラスミドである(Tybulewiczら(1991)Ce
11第40巻第271頁)。プラスミドpYPNNは、SV40プロモーター−
neorカセットの代りにPGKn e oカセ・シトを含むpYACneoの
突然変異体であり、YACn e oの4.5kb Sa11Apa17ラグメ
ントを、PGKプロモーター、ne。
コーディング領域及びP G K p (A)シグナルを含む1.5kbsal
1人palフラグメントで交換して構築される。プラスミドは、5ail(a)
又はNotl(pYPNN)により線形化された。
ES細胞中へのYACDNAのリボフエクション消化されたアガロース/DNA
混合物は、ポリスチレン管(Falcon)中の1m1(約10100n部分へ
と分けられ、1100n又は20ngのpYPNN、及び1μgの剪断されたニ
シン精子D N A(Sigma)を容管に加え、次にカチオン性月旨質(Tr
ansfectam、 ProMega)を10.1の比(重量比)で加え、お
たやかにDNA溶液中に混合した。混合物を室温で30分間温買置てD N A
−脂質複合体の形成を許した。分裂的薯こ不活性化されたS N L 76/7
線維芽支持細胞層上のAB−1胚幹(E S)細胞の迅速に成長する密集する培
養物をト1ノブシン処理して、単一の細胞懸物を得て、血清含有培地で洗い、そ
して無血清D M E M (Gibco)中に再懸濁した。
各リポフェクションに対して、3 X 106E S細胞及び約1×105支持
細胞を含む細胞懸濁物9mlをDNA−脂質混合物1a+1と60mrAペトリ
皿(Falcon 1007; Becton Dickinson)中で混合
し、加湿した5%Co2雰囲気中で37℃で4時間温室した。細胞付着を最小に
するために、部属の間、皿をゆっくりと回転させた。温室の後、細胞を血清含有
ES細胞培地で希釈し、ゆっくりと分散させ、そして支持層を含む100mm培
養皿上に1×106で塗布した。細胞を、塗布の24時間後から始めて9〜12
日間、G 418 (400ag/mlパワー、Gibco)中で選択した。2
つの異なるプラスミド、すなわちpYPNN (SV40− n e oカセッ
トの代りにPGKneOカセットを有するpYACneoの12kb突然変異体
)及び1ckensian (同じPGKneoカセットを有する5kbプラス
ミド)をテストした。YACニブラスミドのモル比は、pYPNNの場合には1
8.1ckensianの場合には1:4であった。2つのカチオン性脂質処方
、すなわちDOGS (Transfectam、 ProMega)及びD
OT M A (Lipofectin。
BRL)をテストした。類似のトランスフェクション効率が、線形化プラスミド
を用いてDOGS及びDOTMAに対して得られたが、結局はDOGSがYAC
実験のために選択された。これは、そのカチオン性部はスペルミンであり、DN
A保護体としてスペルミンを外から加える必要性をなくすこと、及びDOGSは
用いられた濃度でES細胞に対して毒性でないことの故である。トランスフェク
ション効率に対してDNA:脂質比が重要であると見い出され、そしてYACD
NA濃度の正確な測定が困難である故に、DNAの基本濃度を与えるために各リ
ポフェクシジンは、推定10倍過剰(1μg)の剪断されたニシン精子キャリア
ーDNAを含んだ。
ESクローンの分析
G418耐性クローンがトリプシンにより分散され、各クローンからの細胞が9
6ウエル(くぼみ)のプレートの一つのウェルに分けられ凍結され、第2の96
ウエル又は24ウエルのプレートがサザン分析によるスクリーニングのためのD
NAの調製のためのために用いられた。陽性のクローンが解凍され、皿なる分析
のために増殖された。
サザンブロットハイプリダイゼーション及びPCRゲノムDNAが、ES細胞及
び迅速調製法(Lairdら(1991)Nucleic Ac1ds Res
、第19巻第4293頁)による尾生体組織鏡検から調製され、標孕法によるサ
ザン分析に付された。
パルス場ゲル電気泳動のために、ES細胞が107細胞/mlでアガロースブロ
ック中に埋め込まれ、制限消化のために準備され、そして5pelにより1夜消
化された。パルス場ゲルのサザン分析のために、DNAは酸−ニックされ、次に
変性化溶液(0,4N NaOH,1,5M NaCI)中のGeneScre
en Plus(Du Pont)に移された。vB6領域のPCR増幅に適す
るオリゴヌクレオチドは、発表されている配列から調製された。用いられたプラ
イマーは、5’ CAGGTACAGCTGCAGCAGTCA3′及び
5’ TCCGGAGTCACAGAGTTCAGC3’であり、これらは診断
の275b生成物を増幅した。
トランスジェニックマウスの製造及び分析キメラ祖先動物を作るために無傷のY
AC配列を含むクローンが胚盤胞中にインジェクトされ、これはC57BL/6
野生タイプマウス及びJ「マウス(マウス重鎮遺伝子の両コピーの標的とされる
不活性化を有する)で繁殖された。トランスジェニック子孫からの胸腺細胞が、
無傷のYACの伝達を確認するために、パルス場ゲル電気泳動及びサザン分析の
ためにアガロースブロック中に置かれた。
ELISA分析
ヒトμ鎖が、2部位ELISAアッセイにより検出された。ポリ塩化ビニルマイ
クロタイタープレートが100jlPBS中の1.25μg/11のマウスモノ
クローナル抗ヒトIgMクローンCH6(The Binding 5ite、
サンジエゴ、カリフォールニア)により、4℃での1夜温置によって被覆された
。プレートを、PBS中5%チキン血ff1(JRH,レキサナ、カンサス)と
の1時間温置によりブロックした。PBSで6回洗った後、0.5%Tveen
20s血清サンプル及ヒ標準ヲ、110plPBS、0.5%Tweem20s
5%チキン血清(PTC3)中に希釈し、ウェル中で室温で1時間温置した。
標準として、精製されたヒトミニローマ由来IgMfi度(Calbioche
m。
ラ ジヨウ、カリフォールニア)を用いた。次にプレートを、PBS、0.5%
Twee12oテロ回洗い、100IIIP T CS ’T:1000倍希釈
された、ベルオキシダーゼとコンジュゲートされたラビット抗ヒトIgM、 F
c5uフラグメント特異性抗体を加えた。室温でさらに1時間温置の後、ウェル
を6回洗い、100111ABTS基質(Sigma)で0.5時間発育した。
アッセイプレートを、v m aX ?イクロプレートリーダー上(Molec
ular Devices、メン口 パーク、カリフォールニア)で415〜4
90nmで読み、IgMfi度は標準値の4パラメ一タロジステイタ曲線適合か
ら決定された。血清サンプル中の4.89ng/mlのレベルがこのアッセイい
において、ルーチン的に検出され、少な(とも3標準偏差により背景とは区別さ
れる。
結果
約8μgのJl、3PYACDNAが、8つの別々の実験においてリポフエクト
された(表1)。スクリーンされた1221のG418耐性クローンのうち、1
5が2つの診断のEcoRI Cμフラグメントを含んだ(表2)。クローンの
2つの(# 195及び553)が2つのCμバンドの1つのみを含み、これは
失われたEcoRIフラグメント中におけるYACのフラグメント化から生じた
かもしれない(表2)。
2つの選択マーカプラスミド(pYPNNとace)は夫々、10の被トランス
フェクション細胞当り0.5及び13.5のG418耐性クローンの頻度を作っ
た。pYPNN選択の効率は、それがaCeの2倍のモル1度で用いられたにも
がかわらず、はるかに低かった。なぜプラスミドは異なったのか不明である。な
ぜなら、それらは共に、同じneo’カセットを含んでいたからである。しかし
、それは、プラスミドとベクターアームとの間の配列相同性の程度又は2つのプ
ラスミドからのneo 発現の効率の違いの結果であるかも知れない。
表IJ1.3PYACリボフエクションのまとめ実験番号 選択 YAC:ne
o リボフェクンヨン G418r aCe クローノ番号プラス、ド モル比
の番号 クローン# 陽 性1 pYPNN 1:8 8 24 3 14,
18.212 pYPNN 1:8 9 19 1 123 pYPNN 1:
8 9 12 04 pYPNN 1:8 9 8 0
5 pYPNN 1:8 9 10 06 mpt 1:4 4 44 0
7 at 1:4 16 480 3 86,266.4808 at 1:4
18 624 10 25.35.164゜表1.J1.3PYACDNAの
、選択マーカープラスミドとのコリボフエクション。約1100nのYACJl
、3がPGKn e o含有プラスミドpYPNN又はat及びキャリアーDN
Aと一緒にされた。各実験は、DNA/脂質複合体の同じ溶液を用いて、夫々1
0100n A CD N Aの4〜18回の別々のりポフエクションより成っ
た。ヒトCaプローブが、クローンの初めのスクリーニングのために用いられた
。
マ c81:+I:I:
表2において、Cμプローブに対し陽性であったESクローンが、v■6配列に
ついてPCRで、D領域組込みについてサザンプロットで、そして3′末端組込
みについてサザンプロットにより分析された。vH6分析における「+」は、v
B6特異性プライマーを用いる、診断の275bpP CR生成物の増幅を示す
。D領域フィンガープリントにおける「+」は、完全に親のバンドパターンを示
す。Cμ分析における「+」は、プローブとハイブリッドされたとき、2つの診
断のバンドが存在したことを示し、一方、「−」は単一のバンドの存在を示す。
3′末端分析における「+」は、Xhol/5pel二重消化物におけるフラン
キングXho lバンドのサイズの4. lkbへの減少ならびに画情化物にお
ける4、5kb内部Xho lバンドの存在を示す。パルス場ゲル電気泳動分析
における「+」は、D領域プローブで調べられたとき、単一の85kbSpel
バンドの存在を示す。rndJは測定されなかったことを示す。無傷のYACイ
ンサートを有するクローンは、太線で印される。 クローン12.14.18及
び21は、プローブとして275kbP CR生成物DNAを用いてApal及
びEcoRl消化物を調べることによってVn6について分析された。クローン
18のみが、診断のvB6バンドについて陽性であった。
ES細胞中のYAC構造の分析
pYPNNコポリフエクションからの4つのCμ クローン(番号12.14.
18.21)を、上記の制限フラグメント指紋アッセイによりD領域構造につい
て分析した。クローンのうち、クロン18のみが親YACの指紋を保持した。ク
ローン14と21は、親よりも少ないバンドを含んだ。これは、YAC配列が失
われたことを示唆する。一方、クローン12は、い(つかの追加バンドを含み、
このES系列におけるYACの1より多いコピーの組込みと符合rる。
4つのES系列におけるインサート領域の3′末端の組込みは、プローブとして
ベクター再環化により単離された10.5kb NdeiSpel末端フラグメ
ントを用いるサザン分析により評価された。3つのバンドが、親YACのXho
l消化物から予期される。すなわち、非常に大きいD−J−Cμバンド(>
30kb) 、4.5kbCμmCδバンド、及び8.9kbCδ−ベクターバ
ンドである。Xhol及びSpe Iによる二重消化は、8、9kbバンドのサ
イズを4. lkbに減少すると予期される。4゜5kb及び8.9kbバント
がXho l消化物中に存在し、一方、4,5kb及び4.1kbバントが親Y
ACのXho l Spe l消化物中に存在する。4つのES系列のうち、系
列18のみが、無傷の3′末端の指標である親YACバンドパターンを含んだ。
8,9kbバンドの存在は、ES系列におけるベクターアームXho 1部位の
保持と符号し、テロマー領域の非常に少しがこのクローンにおいて失われている
ことを示唆する。YAC末端配列の喪失は、異常なXho lバンドを結果する
と予期されるであろう。他の3つのES系列のうち、クローン14は4,5kb
Xho lバンドを欠き、一方、クローン12及び21は異常に短いXho l
バンドを含み、これらESクローンにおける再配置された又は除去された3′末
端領域を示している。5′末端組込みの同様な分析は、領域における繰返す因子
の故に可能でなかった。しかし、PCR分析及びプローブとしてVB6PCR生
成物を用いるサザン分析は、クローン18がvH6配列を含み、一方、クローン
14.12及び21は含まないことを示した(表2)。
dコリポフエクションからの13のCμ ES細胞系列のうち、1つがクローン
増大の間に失われ、1つ(#266)がvH6配列を欠く故に除去された。残り
は、D領域構造、3′末端組込み及び/またはV n 5配列について分析され
た(表2)。D領域指紋について分析された11系列のうち、6つ(番号86.
191.220.371.463.567)が無傷のD領域を示し、5つが異常
なパターンを有した。無傷のD領域を持つ6つの系列のうち5つの3′末端分析
は、1つ(番号22o)を除くすべてが無傷の3′末端を含んだことを示した。
PCR分析は、無傷のD領域を持つ6つの系列のうち5つ(番号86.220.
371.463.567)がvH6配列を含み、無傷(7)D領域を持たない5
系列のうち1つのみ(番号55)がvH6配列を持ったことを示した。
10のES細胞系列が、D領域又はCμプローブを用いるパルス場すザン分析に
より、全長インサートについて調べられた(表2)。クローン18.371及び
463のみが、全長インサートを示す85kb 5pelフラグメントを含んだ
。他のクローンのすべては、より小さいSpe Iフラグメントを持った。
クローン18のSpe l消化物は、D及びCμプローブ、及びV■6のための
プローブによりスクリーンされた。3つのすべてのプローブが、85kbの単一
バンドにハイブリダイズした。
パルス場すザン分析をD領域、3′末端及びV86詳細構造分析と併せ考えると
、YACインサートが3つの系列、番号18.371及び463において無傷で
移入されたことを示している。高程度の内部再配置、除去又はフラグメント化が
、破壊されたYAC配列を有するES系列において一般に見られ、しかし構造の
わずかの変化もまた検出された(たとえば番号567)。総じて、無傷のYAC
移入の頻度は低く、400の6418クローンのうち1つ(3/1221)であ
る。しかし、クローンDNAの単離及びCμ配列のための一次的スクリーン(1
221のクローンのうち1206を更なる分析から除く)は、方法論に記載され
るマイクロタイタープレートプロトコールを用いて迅速に行われた。すなわち、
ゎずが15のクローンが、徹底的分析を必要とした(表2)。
ES細胞中のYAC構造の分子分析は、YACの小さい、好ましくは単一のコピ
ーにより大いに容易にされる。ES系列のD領域、パルス場ゲル分析及び3′末
端分析は、YACの少ない又は単一コピ1組込みと符合する。診断の3′末端フ
ランキングバンドについてのクローン18.371及び463の分析は、クロー
ン18及び371がYACインサートの単一コピーを有し、一方、463は追加
の無傷の又は部分的に無傷のコピーを有するかも知れないことを示した。
キメラの製造及びYACの生殖細胞系列伝達胚盤胞が、ES系統18.371及
び463を用いてインジエク浄誓(内容に変更なし)
トされた。色を覆うために10〜95%のES細胞寄与の範囲であるキメラ先祖
動物が、3つすべての系統から導かれた。
最も高齢の動物(ES系統18から導かれた40%キメラオス)は、73の子の
うち20にES細胞遺伝子型を伝達した。20のアゲ−ティの子のうち11が無
傷り領域指紋について陽性であり、これは単価接合体YAChランスジーン対立
遺伝子のメンプリアン分離と符合する。加えて、D領域プローブを用いたパルス
場すザン分析は、トランスジェニック子における単一の85kbSpelバンド
を示し、これはYACが生殖細胞系列を通して安定に維持されたことを示す。す
なわち、ES細胞中へのYACのコリボフエクンヨンは、ES細胞の全型発育能
を駄目にしない。
コリポフェクンヨンされた選択マーカーについての組込み部位のサザン分析は、
2〜10のプラスミドコピーの組込みを示した。マーカープラスミドが複数座で
インサートされたなら、それらは突然変異の原因でありうるので、プラスミドの
組込み部位が、プラスミド配列のサザン分析により追跡された。pYPNN及び
YACベクターアームはEcoRI部位を欠き、p B R322配列を含むの
で、PBR322プローブにハイブリダイズされた夫々のEcoRIバンドは、
pYPNN又はYACベクターアームの別々の無傷の又はフラグメント化された
コピーの組込みを示す。ES細胞クローン18D N Aの分析は、5.5〜2
0KBの大きさの8つのEcoRIバンドを現し、非トランスジェニック配偶体
で繁殖された単価接合体トランスジェニック動物の子は、浄書(内容に変更なし
)
EcoRIバンドの分離について分析された。14の子のうチスべて8のEco
RIバンドが9つのトランスジェニック子の尾DNA中で検出され、5つの非ト
ランスジェニック子の尾DNAでは何も検出されなかった。すなわち、すべての
検出しうるマーカープラスミドがYACを用いて分離され、このことは、それら
がYAC組込み部位に又は近傍に挿入されたことを示す。種々のD N Aのコ
リボフエクンヨンが、接合子のマイクロインジェクションにより作られたトラン
スジェニックマウスにおいて観察され、プラスミドDNAの共組込みは、接合子
マイクロインジェクションよりもコリボフエクションについて、より突然変異源
性であることはないことが予期される。ニシン精子キャリアDNAもまたYAC
と共組込みされた。おそらくサザン分析におけるEcoRI部位の源でありうる
。共組込みされたキャリアーDNAは、YACI−ランスシーン機能に潜在的に
悪影響しうるので、キャリアーDNAを排除することがしばしば望ましい。65
0kbY A Cを用いる予備実験は、ES細胞中への無傷のYACの効率的リ
ボフエクションのためにキャリアーDNAは必要でないことを示す。この予備的
実験はまた、ES細胞中に成功裡にコリボフエクンヨンされることができるYA
Cのサイズの制限は、少なくとも650kbであることを示唆する。
系統18のトランスジェニックマウスが、血清中における浄書(内容に変更ない
ヒトμ鎖についてELISAにより検定された。ヒトμ重鎖は、トランスジェニ
ックな子の血清中で検出された(表3)。トランスジェニック体におけるヒトμ
血清レベルは、検出範囲内に明らかにあったが、それらは内在性マウスIgMの
血清レベルに比べて非常に低かった。トランスジーン発現の低いレベルは、内在
性重鎮遺伝子からの競争に部分的に起因する。トランスジーンが、内在性重鎮対
立遺伝子が不活性化されているパックグララウンド中に導入され、そしてこのマ
ウスにおいてヒトμ血清レベルは約10倍高められた(表3)。
浄書(内容に変更なし)
表3 ELISAによる血清ヒトIgMの検出ゲッタイブ 性 検定時の齢(週
) ヒトIgMYAC18+ F 3,9.20 <5 ng/m1YAC18
+ M 1? 12.2ng/m1YAC18十 F 10 27.0ng/m
1YAC18+ F 6.17 <5 ng/m1YAC18+ F 4 5.
8ng/m1YAC18+ F 6 10.5ng/m1YAC18+M6 1
0.4ng/m1YAC18+/JH−M 5,8 165 ng/ml野生タ
イプ F 6 <5 ng/m1野生タイプ F 6 <5 ng/ml野生タ
イプ F 6 <5 ng/@l野生タイプ M 6 <5ng/ml
野生タイプ F 34 <5 ng/ml野生タイプ F 34 <5 ng/
ml野生タイプ M 34 <5ng/al野生タイプ M 34 <5ng/
m1表3.トランスジェニック動物及び対照からの血サンプルを、表示した齢に
おいてヒトIgMについてELISAにより分析した。トランスジェニック動物
のすべては、単一クローン18の祖先キメラに由来し、YACについて単価接合
体であった(YAC1B+)。野生タイプノ<・ツクグランド浄IF(内容に変
更なし)
における7つの動物のうち5つは、その血清中に検出しつるヒトIgMを有した
。ELISAの検出のレベルは、5ngヒトIg)l/ml血清であった。YA
Cトランスジーンが、機能的内在性マウス重鎮遺伝子を欠くバックグラウンド(
YAは約10倍高められた。
蛍光活性化された細胞のソーティング(FAC3)分析が、85kb重鎖遺伝子
フラグメントを含むYACについて陽性であり、かつ相同遺伝子標的(ターゲテ
ィング)によるJn領域の破壊によって機能的に破壊された(ノックアウトされ
た)内在性マウス免疫グロブリン重鎮遺伝子について同型接合であるマウスにお
いて実施された。マウスは、YACトランスジーンの単一コピーを有し、機能的
マウス重鎮対立遺伝子を欠いた。FAC3分析は、とりわけヒトU @を検出す
るための抗体を使用し、マウスからの合計10゜000の末梢リンパ細胞当り約
60の細胞がヒトμ鎖免疫グロブリンを発現したことを示した。このレベルは、
野生タイプ(非トランスジェニック/非ノツクアウト)マウス牌臓においてマウ
スμ鎖を発現する細胞の数の約1〜2%である。
FAC3は、YAC+/J −マウスの牌臓及び腹膜腔か■
ら得られた細胞におけるヒトμ鎖発現を検出した。
上述の本発明は、理解の明瞭のために例示及び実施例により詳しく説明されてい
るが、本発明の請求の範囲内にお浄書(内容に変更なし)
いて変更及び修飾が行われうろこと(よ明白であろう。
IG l
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○○○○0000 00000000
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FIG 8゜
手続補正書
平成7年2月2日
Claims (31)
- 1.カチオン性脂質、第一のポリヌクレオチド、及び選択マーカー遺伝子発現カ セットを含む連結されていない第二のポリヌクレオチドを含むコリポフェクショ ン複合体を形成する工程、 該第一のポリヌクレオチド及び咳第二のポリヌクレオチドが同一の細胞中に導入 されそしてゲノム中に組み込まれる条件下で、哺乳動物細胞を該コリボフェクシ ョン複合体と接触させる工程、 を含む、取り込まれた複数の非相同DNA種を有するコリポフェクションされた 哺乳動物細胞を製造する方法。
- 2.該カチオン性脂質が、N[1−(2、3−ジオレオイルオキシル)プロピル ]−N、N、N−トリメチルアンモニウムクロライド、N[1−(2、3−ジオ レオイルオキシル)プロピル]−N、N、N−トリメチルアンモニウムメチルス ルフェート、N−(2、3−ジ(9−(Z)−オクタデセニルオキシ))−プロ プ−1−N、N、N−トリメチルァンモニウムクロライド、ジオレオイルフォス ファチジルエタノールアミン(PtdEtn、DOPE)及びジオクタデシルア ミドグリシルスペルミジンからなる群より選ばれる請求の範囲第1項の方法。
- 3.第一のポリヌクレオチドが、少なくとも500kbである請求の範囲第1項 の方法。
- 4.該選択マーカーの少なくとも一つが薬剤耐性遺伝子である請求の範囲第1項 の方法。
- 5.咳選択マーカーがネオマイシン耐性をエンコードする遺伝子である請求の範 囲第4項の方法。
- 6.咳選択性マーカーを有する細胞の選択工程を更に含む請求の範囲第1項の方 法。
- 7.該哺乳動物細胞が非ヒト肺幹細胞である請求の範囲第1項の方法。
- 8.該非ヒト胚幹細胞がマウスES細胞である請求の範囲第7項の方法。
- 9.該カチオン性脂質がジオクタデシルアミドグリシルスペルミジン(DOGS )であり、該第一のポリヌクレオチドがヒトAPP遺伝子配列を含み、かつ咳連 結されていない第二のポリヌクレオチドがネオマイシン耐性遺伝子を含む、請求 の範囲第8項の方法。
- 10.咳第一のポリヌクレオチドが酵母由来YAC配列を含む、請求の範囲第1 項の方法。
- 11.YACクローンDNAを含む第一のDNA及び選択マーカーをエンコード する遺伝子を含む第二のDNAに、非共有結合的に結合されたカチオン性脂質を 含むコリポフェクション複合体。
- 12.カチオン性脂質が、N[1−(2、3−ジオレオイルオキシル)プロピル ]−N、N、N−トリメチルアンモニウムクロライド、N[1−(2、3−ジオ レオイルオキシル)プロピル]−N、N、N−トリメチルアンモニウムメチルス ルフェート及びジオクタデシルアミドグリシルスペルミジンからなる群より選ば れる、請求の範囲第11項のコリポフェクション複合体。
- 13.YACDNAがヒトAPP遺伝子配列又はヒト免疫グロブリン遺伝子配列 を含む、請求の範囲第11項のコリポフェクション複合体。
- 14.該カチオン性脂質がジオクタデシルアミドグリシルスペルミジンである、 請求の範囲第13項のコリポフェクション複合体。 R
- 15.該選択マーカー選任子がneoRである請求の範囲第14項のコリポフェ クション複合体。
- 16.少なくとも50kbのポリヌクレオチド、連結されていない選択マーカー 遺伝子発現カセット、及びN[1−(2、3−ジオレオイルオキシル)プロピル ]−N、N、N−トリメチルァンモニウムクロライド、N[1−(2、3−ジオ レオイルオキシル)プロピル]−N、N、N−トリメチルアンモニウムメチルス ルフェート及びジオクタデシルアミドグリシルスペルミジンからなる群より選ば れるカチオン性脂質を含むコリポフェクション複合体。
- 17.哺乳動物細胞及び請求の範囲第16項のコリポフェクション複合体を含む 組成物。
- 18.哺乳動物細胞が非ヒト胚幹細胞である請求の範囲第17項の組成物。
- 19.非ヒト胚幹細胞がマウスES細胞である請求の範囲第17項の組成物。
- 20.請求の範囲第1項の方法によって製造されたコトランスフェクトされた置 市乳動物細胞。
- 21.請求の範囲第10項の方法によって製造されたコトランスフェクトされた 哺乳動物細胞。
- 22.請求の範囲第1項の方法によって製造されたキメラトランスジェニック非 ヒト動物。
- 23.請求の範囲第9項の方法によって製造されたトランスジェニック非ヒト動 物。
- 24.酵母由来YAC配列に連結された少なくとも50kbの異種ポリヌクレオ チド配列を含む生殖細胞系列ゲノムを含むトランスジェニックマウス。
- 25.異種ポリヌクレオチドが少なくとも約500kbである、請求の範囲第2 4項のトランスジェニックマウス。
- 26.異種ポリヌクレオチド配列がヒトAPPタンパク質又はヒト免疫グロブリ ンをエンコードする、請求の範囲第25項のトランスジェニックマウス。
- 27.更にneoR遺伝子発現カセットを含む請求の範囲第26項のトランスジ ェニックマウス。
- 28.85kbのSpeIフラグメントを含む再配列されていないヒト免疫グロ ブリン遺伝子、選択マーカー及びカチオン性脂質を含むYACを含むコリポフェ クション複合体。
- 29.少なくとも一つのV領域遺伝子、少なくとも一つのJ領域遺伝子及び少な くとも一つの定常領域遺伝子を有する再配列されていないヒト免疫グロブリン遺 伝子を含むYACを含むトランスジェニックマウス。
- 30.トランスジェニックマウスがヒト免疫グロブリン鎖を発現する、請求の範 囲第29項のトランスジェニックマウス。
- 31.YACがヒト重鎖の遺伝子座の85kbのSpeIフラグメントを含む、 請求の範囲第29項のトランスジェニックマウス。
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