JPH09508105A - モノマージオールおよびそれらから形成されるホスフェート結合オリゴマー - Google Patents

モノマージオールおよびそれらから形成されるホスフェート結合オリゴマー

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Abstract

(57)【要約】 種々の官能基を有する新規なエチレングリコール化合物を用いて、オリゴマー構造を製造する。エチレングリコールモノマーは、ホスホロチオエート、ホスホジエステル、およびホスホルアミデート連結を含む標準的なホスフェート連結を介して結合させることができる。有用な官能基には、核塩基ならびに極性基、疎水基、イオン性基、芳香族性基、および/または水素結合を形成する基が含まれる。

Description

【発明の詳細な説明】 モノマージオールおよびそれらから形成されるホスフェート結合オリゴマー関連出願 本出願は1994年1月11日に出願された米国特許出願第08/179,9 70号の一部継続出願であり、その内容はすべてここに引例として含まれる。発明の分野 本発明はアルキレングリコールモノマーユニットおよびこれらのユニットから 構築されたオリゴマーに関する。オリゴマーはモノマーユニットをランダムなま たは前もって決められた配列を持つように合成でき、ホスホロチオエート、ホス ホジエステルおよびホスホルアミダイト結合を含むホスフェート結合を通して連 結できる。モノマーユニットの各々は蛋白質、核酸および他の生物学的標的へオ リゴマー構造を結合させるための化学基をその上に持つことができる。好適な実 施態様において、本発明の化合物はホスホリパーゼA2のような酵素の阻害剤と して働き、アトピー性皮膚炎および炎症性腸疾患を含む炎症性の疾患の処置に使 用される。背景技術 ホスホリパーゼA2(PLA2)は膜リン脂質のsn−2エステル結合を加水分 解する酵素のファミリーであり、遊離脂肪酸およびリゾリン脂質の放出を起こす (Dennis,E.A.,The Enzymes,Vol.16,pp307-353,Boyer,P.D.,ed.,Academic Press ,New york,1983参照)。タイプIIPLA2レベルの上昇は多くのヒト炎症性疾患 と関連している。PLA2触媒反応は多くのプロ炎症性仲介物の放出の律速段階 である。アラキドン酸(sn−2位に共通して結合されている脂肪酸)はロイコ トリエン、プロスタグランジン、リポキシンおよびトロンボキサンの前駆体とし て働いている。リゾリン脂質は血小板活性化因子の前駆体でありうる。PLA2 はプロ炎症性サイトカインにより制御されており、炎症カスケードの中心的位置 を占めている(例えば、Dennis,上記文献;Glaser,et al.,Tips Reviews 1992,14 ,9 2;およびPruzanski,et al.,Inflammation 1992,16,451を参照されたい)。 これまで評価されたすべての哺乳類組織はPLA2活性を示した。少なくとも 三つの異なった型のPLA2がヒトにおいて観察されている:膵臓性(タイプI )、滑液性(タイプII)および細胞質性。さらなるイソ酵素が存在していること が研究により示唆されている。タイプIおよびタイプII(PLA2の分泌型)は 蛇毒から単離されたホスホリパーゼと強い類似性を共有している。PLA2酵素 は消化、細胞膜リモデリングおよび修復、および炎症性応答の仲介を含む正常な 機能のために重要である。細胞質性およびタイプII酵素の両方とも治療的標的と して興味をひかれる。タイプIIPLA2レベルの上昇は慢性関節リュウマチ、骨 関節炎、炎症性腸疾患および敗血病性ショックを含む種々の炎症性障害と関連し ており、この酵素の阻害剤は治療的有用性を持っているようであることを示唆し ている。ある種の慢性炎症性障害で病理生理学的に観察されたPLA2の役割を さらに支持する観察とは、ラットの足しょ内へ(Vishwanath,et al.,Inflammati on 1988,12,549)またはウサギの関節空間へ(Bomalaski,et al.,J.Immunol.199 1,146,3904)タイプIIPLA2を注射すると炎症性応答が得られたことである。 注射前に蛋白質を変性させた場合は炎症性応答は得られなかった。 滑液からのタイプIIPLA2酵素は比較的小さな分子であり(約14kD)、 配列およびそのジスルフィド結合のパターンによりタイプI酵素(例えば膵臓性 )と区別できる。酵素の両方の型とも活性にカルシウムを必要とする。蛇毒およ び膵臓性PLA2からの分泌PLA2酵素の結晶構造(阻害剤とおよび阻害剤なし で)が報告されている(Scott,et al.,Science 1990,250,1541)。最近、ヒト滑 液からのPLA2の結晶構造が解読された(Wery,et al.,Nature 1991,352,79) 。その構造は触媒におけるカルシウムおよびアミノ酸残基の役割を明らかにした 。カルシウムはルイス酸として働いて切れ易いエステルカルボニルを活性化し、 脂質を結合し、His−Asp側鎖の二個群が一般塩基触媒として働いて水分子 求核試薬を活性化する。このことはアシル酵素中間体が存在しないことと一致し 、セリンプロテアーゼの触媒機構にも匹敵する。触媒残基およびカルシウムイオ ンは酵素中の深い裂け目(約14Å)の末端に存在する。この裂け目の壁はリン 脂質の炭化水素と接触し、疎水性および芳香族性残基からなっている。正に荷電 した アミノ末端ヘリックスは疎水性裂け目の開口部に位置している。いくつかの証拠 の系列はN−末端部分は界面結合部位であることを示唆している(例えば、Acha ri,et al.,Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.1987,52,441;Cho,et al.,J.Bi ol.Chem .1988,263,11237;Yang,et al.,Biochem.J.1989,262,855;およびNoelet a l.,J.Am.Chem.Soc.1990,112,3704を参照されたい)。 近年、PLA2触媒によるリン脂質の加水分解の機構および特性の研究につい て多くの仕事が報告されている。インビトロアッセイにおいて、PLA2は遅延 状態を示し、この間に酵素は基質二重層に吸着し、界面活性化と称される過程が 起こる。この活性化には酵素/脂質の界面の脱溶媒和、または裂け目開口部の周 辺の脂質の物理的状態の変化が関与しているのであろう。この仮説を裏付ける証 拠はPLA2活性の急速な変化が膜プローブの蛍光の変化と同時に起こることを 明らかにした研究からきている(Burack,et al.,Biochemistry 1993,32,583)。 このことは界面活性化過程の間に脂質の再配置が起こっていることを示唆してい る。PLA2活性は脂質の融解温度周辺(ゲルおよび液晶脂質が共存している領 域)で最大である。このことはまたPLA2活性が温度および基質の組成(両方 とも境界領域により分離されている構造的に明瞭な脂質配置を導く)に感受性が あることとも矛盾しない。触媒反応中の脂質の物理的状態および酵素の位置を同 時に同定するために蛍光顕微鏡が使用された(Grainger,et al.,FEBS Lett.1989 ,252,73)。これらの研究はPLA2は液相および固相脂質の間の境界領域のみに 結合していることを明瞭に示している。 酵素により触媒される1,2−ジアシルグリセロリン脂質の二級エステル結合 の加水分解が比較的単純である一方、機構的および動力学的な様子は酵素−基質 相互作用が複雑であるためはっきりしない。PLA2の顕著な特徴は、最大の触 媒活性は凝集している基質(すなわち、その臨界ミセル濃度より高い濃度のリン 脂質)に対して観察され、一方、モノマー基質に対しては低いレベルの活性しか 観察されないことである。その結果、PLA2の競合阻害剤は酵素が基質二重層 に結合するまたは膜内へ分配される前に酵素の活性部位に対する高い親和性を持 ち、およびリン脂質と活性部位を競合している。多くの阻害剤が生化学的アッセ イにおいてPLA2の阻害を約束しているようにみえるが(例えば、Yuan,et al. , J.Am.Chem.Soc .1987,109,8071;Lombardo,et al.,J.Biol.Chem.1985,260,7234;Ca mpbell,et al.,J.Chem.Soc.,Chem.Commun.1988,1560;およびDavidson,et al.,Bi oche.Biophys.Res.Commun .1986,137,587参照)、インビボ活性を記載している報 告は少ない(例えば、Miyake,et al.,J.Pharmacol.Exp.Ther.1992,263,1302参照 )。 伝統的な構造活性相関薬剤開発は明白な生成物を与えるが、多くの個々の試験 候補の製造が必要とされる。各々の構造の製造には著しく多くの時間と物質が必 要とされる。別の薬剤開発法、酵素構造の高度な解析に基づいて初めから活性化 合物を設計することは一般的に成功していない。さらに別の方法では所望の生物 学的活性について複雑な発酵ブロスおよび植物抽出物がスクリーニングされる。 生物起源の混合物をスクリーニングする利点は多量の化合物を同時にスクリーニ ングできることであり、ある場合には予期できなかった活性を持つ新規で複雑な 天然の生成物の発見を導くことがある。一つの欠点は多くの異なった試料をスク リーニングせねばならないこと、およびしばしば痕跡量しか存在しない活性化合 物の同定に多くの精製過程を実施しなければならないことである。 各々の古典的方法の利点を最大にするために、いくつかのグループにより組み 合わせ非ランダム化のための新しい方法を開発された。選択技術がペプチド(例 えば、Geysen,et al.,J.Immun.Meth.1987,102,259;Houghten,et al.,Nature 199 1,354,84;およびOwens,et al.,Biochem.Biophys.Res.Commun.1991,181,402参照 )および核酸(例えば、Wyatt,et al.,(印刷中)Proc.Natl.Acad.Sci.USA;お よびEcker,et al.,Nucleic Acids Res.1993,21,1853)のライブラリーに使用さ れた。これらの選択技術は反復合成およびだんだん単純化されたオリゴマーのサ ブセットのスクリーニングを含む。これらの選択技術を用いると、細胞ベースの アッセイ、または精製された蛋白質標的との結合または阻害に対してサブセット の活性がアッセイされる。 SURF(ランダム化された断片の合成的非ランダム化)と称される一つの技 術(例えば、Ecker,et al.,上記文献を参照)では、一つの固定されたモノマー 位置に既知の残基を含み、かつすべての他の位置に等モルの残基の混合物を含む オリゴマーのサブセットが合成される。三つのモノマーを含む(A、B、C)四 残基長のオリゴマーのライブラリーに対して、三つのサブセットが合成されるで あろう(NNAN、NNBN、NNCN)式中Nは三つのモノマーの各々の等し い取り込みを表している)。各々のサブセットは次に機能性アッセイでスクリー ニングされ、最良のサブセットが同定される(例えば、NNAN)。ライブラリ ーの第二の組が合成されスクリーニングされるが、ここで各々は前ラウンドから の固定化残基および第二の固定化残基を含んでいる(例えば、ANAN、BNA N、CNAN)。スクリーニングおよび合成の連続的ラウンドを通して、アッセ イで活性を持つ特異的配列が同定できる。発明の目的 新規なアルカングリコールモノマーユニットを提供するのが本発明の目的であ る。 新規なオリゴマー構造内へ取り込ませることができる新規なアルカングリコー ルモノマーユニットを提供するのが本発明の別の目的である。 リン含有主鎖を通して一緒に結合できる新規なアルカングリコールモノマーユ ニットを提供するのが本発明の別の目的である。 問題とする生物学的部位への結合のために、多様な機能的部分を含むオリゴマ ーに基づく新規なアルカングリコールを提供するのが本発明の別の目的である。発明の簡単な説明 本発明の化合物は構造Iのモノマー化合物を含む: [式中: XはH、ホスフェート基、活性化ホスフェート基、活性化ホスファイト基、ま たは固体支持体であり; YはHまたはヒドロキシル保護基であり; ZはL1、L1−G1、L2、L2−G2、NR34、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; L1は1から約20の炭素原子を持つアルキル、2から約20の炭素原子を持 つアルケニル、または2から約20の炭素原子を持つアルキニルであり; L2は6から約14の炭素原子を持つアリールまたは7から約15の炭素原子 を持つアラルキルであり; G1はハロゲン、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、NHC( =NH)NR34、CH=O、C(=O)OR5、CH(NR34)(C(=O )OR5)、C(=O)NR34、金属配位基、またはホスフェート基であり; G2はハロゲン、OH、SH、SCH3、またはNR34であり; R1はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはヒドロキシル保護基 であり; R2はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはチオール保護基であ り; R3およびR4は独立してH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはア ミン保護基であり; R5はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、または酸保護基であり; QはL1、G3、L1−G3、またはG3−L1−G3であり; G3はNR3、C(=O)、C(=S)、C(O)−O、C(O)−NH、C( S)−O、C(S)−NHまたはS(O)2、NR3C(=O)、NR3C(=S )、NR3C(O)−O、NR3C(O)−NH、NR3C(S)−O、NR3C( S)−NHまたはNR3S(O)2であり; nは0または1であり;および jは1から6であり; ただし、nが0でありかつZがNH2、アデニン、グアニン、シトシン、ウラ シルまたはチミンであり、XまたはYの一つが5Hである場合、XまたはYの他 方はHではなく;および nが0でありかつQがアルキル−NHである場合、Zはビオチンまたはホスホ チロシニルではない]。 好適な実施態様において、Yはトリチル、メトキシトリチル、ジメトキシトリ チルまたはトリメトキシトリチルのような酸不安定性ヒドロキシル保護基である 。Xは好適にはH、ホスホルアミダイトのような活性化ホスファイト基または活 性化ホスフェートまたは固体支持体である。ある好適な実施態様において、nは 1であり、Qはアシル連結基、アルキル連結基、アミノ連結基または二官能性連 結基である。好適なアシル基にはカルボニル、チオカルボニル、カルボキシ、ア セチル、アミド、スクシニル、カルバモイル、チオカルバモイル、ウレイド、チ オウレイド、およびスルホンアミド基が含まれる。 一つの好適な化合物の群において、Zはイミダゾールまたはカルバゾール環の ような窒素含有複素環を含んでいる。さらに好適な基において、Zはプリンまた はピリミジン核塩基を含んでいる。特に好適であるのは、Xが活性化ホスファイ トであり、Yが酸不安定性ヒドロキシル保護基であり、およびZがアデニン、グ アニン、シトシン、ウリジンまたはチミンである化合物である。 別の好適な化合物の群において、Zは2から約20の炭素原子を持つ非置換ま たはアミノ置換アルキル基、6から約20の炭素原子を持つアリール基、または 7から約15の炭素原子を持つアラルキル基を含んでいる。さらに別の化合物の 群において、Zはフルオレニルメチル、フェニル、ベンジル、ポリエチレングリ コール、グルタミル、またはNR12基を含んでいる。 本発明の別の化合物は構造IIのオリゴマー化合物を含んでいる: 式中: XはH、ホスフェート基、活性化ホスフェート基、活性化ホスファイト基、固 体支持体、コンジュゲート基またはオリゴヌクレオチドであり; YはH、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基またはオリゴヌクレオチドで あり; EはOまたはSであり; EEはO-またはN(Y0)T0であり; Y0はHまたは[Q2jj−Z2であり; T0は[Q1kk−Z1であるかまたはY0およびT0は一緒に窒素複素環内に連 結されており; Q1およびQ2は独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキルまたはアルケニル、複素環、2から 10の炭素原子および1から4の酸素または硫黄原子を持つエーテル、ポリアル キルグリコールまたはC7−C14アラルキルであり; jjおよびkkは独立して0または1であり; Z1およびZ2は独立して、H、C1−C2アルキル、C2−C20アルケニル、C2 −C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、CH =O、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、CH(NR34)、N HC(=NH)NR34、CH(NH2)C(=O)OH、C(=O)NR34 、C(=O)OR5、金属配位基、レポーター基、窒素含有複素環、プリン、ピ リ ミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基で あり; ZはL1、L1−G1、L2、L2−G2、NR34、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; L1は1から約20の炭素原子を持つアルキル、2から約20の炭素原子を持 つアルケニル、または2から約20の炭素原子を持つアルキニルであり; L2は6から約14の炭素原子を持つアリールまたは7から約15の炭素原子 を持つアラルキルであり; G1はハロゲン、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、NHC( =NH)NR34、CH=O、C(=O)OR5、CH(NR34)(C(=O )OR5)、C(=O)NR34、金属配位基、またはホスフェート基であり; G2はハロゲン、OH、SH、SCH3、またはNR34であり; R1はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはヒドロキシル保護基 であり; R2はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはチオール保護基であ り; R3およびR4は独立してH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはア ミン保護基であり; R5はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、または酸保護基であり; QはL1、G3、L1−G3、またはG3−L1−G3であり; G3はNR3、C(=O)、C(=S)、C(O)−O、C(O)−NH、C( S)−O、C(S)−NHまたはS(O)2、NR3C(=O)、NR3C(=S )、NR3C(O)−O、NR3C(O)−NH、NR3C(S)−O、NR3C( S)−NHまたはNR3S(O)2であり; nは0または1であり; jは1から6であり;および mは1から50である。 オリゴマー化合物において、X、Y、Z、Q、R1、R2、jおよびnは上に定義 した通りであり、およびmは1から約25である。 本発明の別の化合物は上記モノマーまたはオリゴマー構造を含む隣接領域間の 空間に置かれたホスホジエステルまたはホスホロチオエートオリゴデオキシヌク レオチドからなる中心領域を持つキメラオリゴマー化合物を含んでいる。 本発明はさらに上記のようなモノマーの群を選択し、前記群のモノマーの少な くとも二つを共有結合で結合する工程を含むランダム化されたオリゴマー化合物 を製造する工程を含んでいる。好適な方法において、前記群の少なくとも一つの モノマーのZ部分は前記群の他のモノマーのZ部分と異なっている。この方法に より製造された化合物は、好適には2から50のモノマー、より好適には2から 約25のモノマーを持つランダム化されたオリゴマー化合物である。 本発明の化合物はホスホリパーゼA2酵素を含む種々の酵素の阻害剤として使 用できる。ホスホリパーゼA2の阻害剤として、本化合物はアトピー性皮膚炎お よび炎症性腸疾患を含む炎症性疾患の処置に有用である。本発明のオリゴマー化 合物は、疾患の病因論において興味をひく核酸へ特異的にハイブリッド形成でき るので、診断にも使用できる。本発明の化合物はまた、特に酵素生化学および蛋 白−核酸相互作用の研究のための研究プローブおよびプライマーとしても使用で きる。図面の簡単な説明 本発明の多くの目的および利点は付随する図を参照することにより当業者には より良く理解されるであろう: 図1−4は本発明による活性化モノマーの合成方法を記載している。発明の詳細な説明 本発明のモノマー化合物は同定の目的のためには、アルカン部分が2から7の 炭素原子を持つ置換アルカングリコール(即ち、置換アルカンジオール)である と考えられる。好適な実施態様において、アルカングリコールのヒドロキシル基 は隣接するモノマーを連結し、オリゴマー構造を形成するのに使用される。オリ ゴマー合成の間、グリコールヒドロキシル基の一つは典型的には保護基によりブ ロックされており、他のヒドロキシル基をβ−シアノエチルホスホルアミダイト 基のような活性化ホスフェート基と反応させる。本明細書で使用する場合、術語 活性化ホスフェート基とはその求核試薬との反応性を促進させるための化学的修 飾を持つホスフェート基を表していることを意味している。同様に、術語活性化 ホスファイト基とはその求核試薬との反応性を促進させるための化学的修飾を持 つホスファイト基を表している。多くのそのような修飾が本分野で知られている 。 本発明のモノマー化合物は好適にはホスフェート結合を通して共有結合で結合 されている。このことは、液相かまたは固相化学による結合を可能にする。代表 的液相技術は1993年5月11日に開示され、本発明と共通して譲渡されてい る米国特許第5,210,264号に記載されている。代表的固相技術は標準ホ スホルアミダイト化学(例えば、Protocols For Oligonucleotides And Analogs ,Agrawal,S.,ed.,Humana Press,Totowa,NJ,1993参照)を利用したDNAおよび RNA合成に用いられるようなものである。好適な固相合成は活性化ホスフェー トとしてホスホルアミダイトを利用する。ホスホルアミダイトはP(III)化学 を利用している。中間体ホスファイト化合物は続いて既知の方法によりP(V) 状態に酸化される。このことにより選択された酸化状態に依存して好適なホスホ ジエステルまたはホスホロチオエートホスフェート結合の合成が可能である。他 のホスフェート結合を発生させることも可能である。これらには、ホスホロジチ オエート、ホスホトリエステル、アルキルホスホネート、ホスホロセレネート、 およびホスホアミデートが含まれる。 アルカングリコール部分は種々の官能基により置換できる。モノマー化合物が 互いに連結された時、これらの官能基は生じるオリゴマー化合物に多様な性質( ”多様性”)を提供できる。官能基には水素結合供与体および受容体、イオン性 部分、極性部分、疎水性部分、芳香族中心および電子供与体および受容体が含ま れる。個々のモノマーの性質は一緒になって、それらが見いだされるオリゴマー の特性に寄与する。従って、そのようなオリゴマーのライブラリーは無数の性質 を持っているであろう(即ち、”多様性”)。一緒になってオリゴマーを形成 する個々のモノマーの性質は集合的にそのようなオリゴマーの特異性に寄与し、 細胞、酵素または核酸標的部位と相互作用するためのある種の特性を与える。官 能基はモノマーユニットのアルカングリコール”コア”または”主鎖”に直接的 に結合できるし、または適当なつなぎ基(テザー)を通して連結することもでき る。認識されるように、モノマーユニットのコア部分はエチレングリコール部分 のようなアルカングリコール部分から形成されている。そのため、本発明のオリ ゴマー化合物は官能基を持つ多数のアルカングリコールユニット(例えば、エチ レングリコールユニット)から形成され、ホスフェート結合を通して一緒に連結 される。 本発明の化合物を合成するための好適な方法において、アルカングリコールコ アはエポキシド化合物の環開裂により発生される。好適な化合物は上記構造Iに おいて変数jが1であるものである。好適であるのは、j=1である立体特異的 モノマー化合物が製造でき、オリゴマー構造に取り込まれた場合、それらの立体 特異性を維持しているという事実による。これらの系統の他のもの(例えば、j =2から6)はj=1である化合物を製造するために使用された方法と類似の方 法により製造される。より大きな同族体は一般的により不安定であるので、それ らは好適にはその場で製造され使用される。そのような製造および使用はKo,et al.,J.Org.Chem.1986,51,413;Ko,etal.,J.Org.Chem.1987,52,667;およびKlun der,et al.,J.Org.Chem.1989,54,1295の方法により一般的に達成される。従っ て、3,4−エポキシ−1−ブタノール、4,5−エポキシ−1−ペンタノール 、5,6−エポキシ−1−ヘキサノール、6,7−エポキシ−1−ヘプタノール 、および7,8−エポキシ−1−オクタノールが各々j=2、3、4、5および 6の構造Iの化合物を提供するためにその場で製造および使用できる。グリシド ール(2,3−エポキシ−1−プロパノールまたはオキシランメタノール)はj =1である化合物の製造に特に適しており、それは環開裂により本発明のオリゴ マー化合物中のホスフェート結合に含ませることができる第1ヒドロキシル基お よび第2ヒドロキシル基の両方を供給できるからである。第1ヒドロキシル基は グリシドールのアルカノール(即ち、−CH2OH)部分から誘導され、一方第 2ヒドロキシル基はグリシドールのエポキシド環の開裂により発生する。 本発明のモノマー化合物はエポキシド環含有出発物質への官能基(またはその ような官能基のつなぎ基)の求核的付加により製造できる。一般的に、この付加 は、図1に示したように、適当な溶媒中、触媒存在下で達成される。必要な場合 には、反応性官能基を保護するために一時的保護基が使用される。 エポキシド環への求核付加はSn2反応であり、独占的にC−1炭素上に起き る。j=1である構造Iの化合物においてはラセミ体または非ラセミ体グリシド ールが出発原料として使用できる。非ラセミ体(即ち、キラル)グリシドールが 使用された場合、生成物もまた非ラセミ体である(Hanson,ChemicalReviews,199 1,91,437参照)。この方法は光学活性モノマーならびにそのようなモノマーを取 り込んだオリゴマーを得る簡単な方法である。 名称を割り当てる目的のためには、本発明の構造Iの化合物は置換アルカン化 合物と考えられる。例えば、j=1の場合、得られる化合物は置換プロパン化合 物と考えることができる。官能基またはつなぎ基の求核付加によるエポキシド環 の開裂によりアルカン部分のC1炭素に結合された官能基またはつなぎ基を持つ 置換ジオール化合物、例えば1−置換−2,3−ジオールプロパンが得られる。 1−置換プロパン 2,3−ジオールは第1ヒドロキシル基(即ち、C3炭素に 結合されたヒドロキシル基、グリシドール部分のヒドロキシメチル基)および第 2ヒドロキシル基(グリシドールのエポキシド環の開裂により生じたC2炭素に 結合されたヒドロキシル基)の両方を持っている。 j=1の構造IIを持つ本発明の化合物はモノマーレベルではプロパン化合物と 考えられるが、モノマープロパンユニットの三つの炭素原子の二つのみがオリゴ マー主鎖に含まれているのでオリゴマーレベルでは置換エチレングリコール化合 物と考えられる。拡張すると、ブタノールモノマー化合物(j=2)は置換プロ ピレングリコールオリゴマー化合物となり、より長い類似体でも同様である。従 って、プロパンジオールモノマーが本発明のオリゴマー化合物に取り込まれると 、プロパンジオール部分のC2およびC3炭素はオリゴマーエチレングリコール コアの一部となり、一方、プロパン部分のC1炭素はコアから伸びるつなぎまた は官能基の一部に組み込まれた部分となる。 本発明のホスフェート連結オリゴマー化合物内への組み込みを容易にするため 、 官能基を持つアルカンジオール含有モノマーは活性化ホスファイトかまたは活性 ホスフェートで活性化される。第2ヒドロキシル基(例えば、j=1の場合、C 2プロパンジオールヒドロキシル基)のホスフィチル化(phosphityl ation)に先だって、第1ヒドロキシル基(例えば、j=1の場合、C3プ ロパンジオールヒドロキシル基)が保護される。第1ヒドロキシルの保護はエポ キシド環の環開裂の前または後に実施される。グリシドールのメチルヒドロキシ ル基への保護基の付加はそのエポキシド環の無触媒求核付加に対する反応性を低 くするので、そのような環開裂後の保護において問題がなければ、第1ヒドロキ シル基の保護は通常開環後に達成されるであろう。第1ヒドロキシル基と反応し うる求核剤を用いる場合、環開裂前に(”前環開裂”)ヒドロキシル基の保護が 達成される。そのような前環開裂保護は例えば、グリニャール試薬および他の類 似の試薬の付加に利用される。 トリチルファミリーの一員のような酸不安定性保護基が、環開裂前または後に 第1ヒドロキシル基の保護に好適に使用できる。トリチルファミリーには少なく ともトリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチルおよびトリメトキシ トリチルが含まれる。ジメトキシトリチル基が好適であり、第1ヒドロキシル基 と4,4’−ジメトキシトリチルクロリドを反応させることにより付加できる。 Beaucage et al.,Tetrahedron 1992,48,2223に記載されているような他のヒドロ キシル保護基も使用できる。 本発明の別の態様においては、BOC−型保護基のような、DMT除去に使用 されるトリクロロ酢酸処理に安定な酸不安定性基が使用される。それらは拡張T CA処理に安定であるが、トリフルオロ酢酸溶液(例えば、5%CH2Cl2溶液 )により除去される。この方法論に合致する別の保護基の群はアリルである。こ れらの保護基は、遷移金属触媒を用いて切断する。この型の保護基は、オリゴマ ーが依然として固体支持体に結合されている間に、特定の官能基の選択的脱保護 が望まれ、新しい反応部位が覆われていないようにする場合に特に有用である。 別の保護基を用いる戦略も可能である:例えば、光不安定性保護基もまたこの方 法論に合致する。 第1ヒドロキシル基の保護および環開裂(順序はどちらでも良い)に続いて、 第2ヒドロキシル基が活性化リン部分基、好適には活性化ホスファイト部分に変 換される。ホスフィチル化はクロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロ ピルアミノホスフィンのような適当な試薬により達成される。ホスフィチル化に より活性化ホスファイト部分かまたは活性化ホスフェート部分を持ち、本発明の ホスフェート結合オリゴマー化合物内への組み込みに適した保護されたモノマー が得られる。 本発明のオリゴマー化合物は図1−4に示した方法により合成できる。示され た合成法は固定された中間体上に広範囲に異なった官能基を簡単に取り込ませる ことができることに重点を置いている。活性化ホスフエートまたは活性化ホスフ ァイトとしてのモノマーは、例えばDNA合成機による標準オリゴヌクレオチド 型合成法を用いての前もって計画された配列か、または例えば上記のSURF技 術のような組み合わせ技術を用いるランダム配列でオリゴマー化される。 保護または非保護官能基を持つモノマーユニットは以下の実施例に記載されて いるように製造できる。もし官能基がホスフィチル化またはオリゴマー化の間に 他の部分または試薬と反応するようであれば、官能基は保護基、好適にはオリゴ マー合成の完了後に除去される塩基不安定性保護基で保護できる。 本発明の好適なモノマー化合物の第一の群は、グリシドールへの活性窒素含有 複素環の求核付加により製造される。本特許出願の目的のためには、窒素含有複 素環は少なくとも一つの窒素原子を含む単または多環式化合物である。複素環は 窒素原子以外の複素原子を含むことができる。そのような他の複素原子には酸素 および硫黄が含まれるがそれらに制限されるわけではない。特に好適な複素環の 群は合成および天然のプリンおよびピリミジン核塩基、例えば、アデニン、グア ニン、シトシン、ウリジン、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、2−アミノ アデニン、アデニンおよびグアニンの6−メチルおよび他のアルキル誘導体、ア デニンおよびグアニンの2−プロピルおよび他のアルキル誘導体、5−ハロウラ シルおよびシトシン、6−アザウラシル、シトシンおよびチミン、5−ウラシル (プソイドウラシル)、4−チオウラシル、8−ハロ、アミノ、チオール、チオ アルキル、ヒドロキシルおよび他の8置換アデニンおよびグアニン、5−トリフ ルオロメチルおよび他の5置換ウラシルおよびシトシンおよび7−メチルグアニ ンである。米国特許第3,687,808号、Concise Encyclopedia of Polyme r Science And Engineering ,J.I.Kroschwitz,Ed.John Wiley & Sons,1990,858 -859およびEnglisch,et al.,Angewandte Chemie,International Edition 1991,30 ,613に記載されているような他のプリンおよびピリミジンも含まれる。 そのような窒素含有複素環は図2に示したように、適した溶媒中、炭酸カリウ ムのような触媒の存在下グリシドールかまたはR−(+)−グリシドールに付加 できる。必要な場合、窒素複素環上の環外官能基は一時的保護により保護される 。特に有用な核塩基環外官能基のための一時的保護基はクロロトリメチルシラン 、塩化ベンゾイルおよび塩化イソブチリルである。保護化合物は次にその第1ヒ ドロキシル基を保護するためにピリジン中、4,4’−ジメトキシトリチルクロ リドでトリチル化される。テトラヒドロフラン(THF)中、クロロ−β−シア ノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンおよびジイソプロピルエ チルアミンによるホスフィチル化で対応するホスホルアミダイトモノマーが得ら れ、それは本発明のオリゴマー化合物内へ組み込むことができる。 官能基として使用できる他の窒素含有複素環にはイミダゾール、ピロール、イ ミダゾリル、ピラゾール、インドール、1H−インダゾール、β−カルボリン、 カルバゾール、フェノチアジンおよびフェノキサジンが含まれる。窒素複素環の より好適な群にはイミダゾール、ピロールまたはカルバゾールが含まれる。イミ ダゾールが特に好適である。 そのような複素環を含むモノマー化合物の製造において、塩基不安定性保護基 による環外官能基の保護は上記のような核塩基で達成され、得られた化合物は4 ,4’−ジメトキシトリチルクロリドでトリチル化され、クロロ−β−シアノエ トキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンによりホスフィチル化されて 所望のモノマー化合物が得られる。 本発明の別の好適なモノマー化合物は、エポキシド環含有出発物質へ(例えば グリシドールの2,3−エポキシ環へ)アルキル、アルケニルまたはアリール有 機金属を添加することにより製造できる。このことは図3に示されている。その ような化合物の製造のためには、出発物質の第1ヒドロキシル基(例えば、グリ シドールのメチルヒドロキシル基)がエポキシド環の開環に先だって酸不安定性 保護基で保護される。上記のように、保護基として適しているものはトリチルフ ァミリー保護基の一つである。従って、例えば適当な溶媒中、ジリチウムテトラ クロロ銅酸の存在下に1−O−ジメトキシトリチルグリシドールへ有機マグネシ ウム試薬を添加することにより達成できる。続いてクロロ−β−シアノエトキシ −N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンによるホスフィチル化によりモノマ ー化合物がホスホルアミダイトとして得られる。 本発明のさらに別の好適なモノマー化合物はグリシドールへのアンモニアの求 核的付加により製造できる。このことは図4に示されている。この反応の生成物 、1−アミノ−2,3−プロパンジオールは塩化ベンゾイルで保護でき、保護さ れた化合物はオリゴマーへの取り込みのためにDMT−ホスホルアミダイトへ変 換される。もしくは、1−アミノ−2,3−プロパンジオールのアミノ基はさら に官能化できる。アルキル化かまたはアシル化により官能基を窒素へ直接的にま たはつなぎ基を通して結合できる。官能化後、4,4’−ジメトキシトリチルク ロリドで保護し、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノ ホスフィンによりホスフィチル化を実施して、本発明のオリゴマー化合物内への 取り込みのためのホスホルアミダイトモノマーが得られる。 アルカンジオールへつなぎ基を連結するための点として上記の1−アミノアル カンジオール化合物のアミノ基を用いる場合、アシル化かまたはアルキル化によ りアミノ基を反応させることができる。そのような反応の一つにおいて、アミノ 基は二官能性連結基、即ち、アルカングリコールモノマー化合物への結合のため の第一の反応性基およびアルカングリコールモノマー化合物へ結合されている官 能基へ結合するための第二の反応性基を持つ化合物と反応させる。特に好適な二 官能性連結基またはつなぎ基の一つの群は無水コハク酸、無水マレイン酸、無水 グルタール酸を含む環状無水物である。従って、例えば上記の1−アミノ−2, 3−プロパンジオールを無水コハク酸と反応させてプロパンジオールおよびコハ ク酸つなぎ基の間でアミド結合を形成することができる。コハク酸つなぎ基の他 の末端は続いて例えば所望の官能基を持つものとのエステルまたはアミド結合の 形成により官能化できる。続いて、4,4’−ジメトキシトリチルクロリド、次 にクロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンと反 応させ、本発明のオリゴマー化合物内への取り込みのためのホスホルアミダイト モノマーが得られる。 上記1−アミノ−2,3−プロパンジオールへのつなぎの基を結合するために はアミドアシル基に加えて他のアシル基も使用できる。そのような他の基による 1−アミノ基のアシル化により、カルバモイル、チオカルバモイル、ウレイド、 チオウレイドおよびスルホンアミド結合が形成される。カルバメートおよびチオ カルバメートは適当なクロロホルメートまたはチオクロロホルメート化合物と1 −アミノ−2,3−プロパンジオールのアミノ基との反応により形成される。ウ レアはアミノ−2,3−プロパンジオールとイソシアネートまたはチオイソシア ネートとの反応により形成され、スルホンアミドは1−アミノ−2,3−プロパ ンジオールと塩化スルホニルとの反応により形成される。つなぎ基の他の末端( 即ち、アミンへのつなぎ基の結合に使用されなかった末端)はモノマーユニット へ結合されている官能基と反応するように選択される。エステル、アミド、カル バメート、ウレアなどを含むアシル結合はこの結合にもまた有用である。 特に有用な二官能性結合基またはつなぎ基の別の群はPierce(Rock ford II)から入手可能なある種のヘテロ二官能性またはホモ二官能性連 結基である。これらには種々のジ−イミデート、N−ヒドロキシスクシンイミド エステルおよびスルホ−N−ヒドロキシスクシンイミドエステルが含まれる。代 表的なジ−イミデートには、ジメチル アジピミデート、ジメチル ピメリミデ ート、ジメチル スベリミデートなどが含まれる。代表的なN−ヒドロキシスク シンイミドエステルおよびスルホ−N−ヒドロキシスクシンイミドエステルには ジスクシンイミジルスベレート、ビス(スルホスクシンイミジル)スベレートな どが含まれる。 つなぎ化合物の別の好適な基にはアルキル、アルケニルおよびアリール化合物 が含まれる。これらは1−アミノアルカンジオール化合物のアミノ基をアルキル 化するのに使用できる。もしくは、これらは、例えば適当な出発物質のエポキシ ド環へアルキル、アルケニルまたはアリール有機金属試薬を添加することにより 直接アルカンジオール化合物に付加することができる。つなぎ基は次に官能基で さらに官能化できる。 好適な官能基は:随意に一つまたはそれ以上のハロゲン、OR1、SR1、NR12、C(=NH)NR12、NHC(=NH)NR12、CH=O、C(=O )OH、C(=O)NR12、CH(NH2)(C(=O)OH)で置換された アルキル、アルケニルおよびアルキニル基;随意に一つまたはそれ以上のハロゲ ン、OH、SH、SCH3、NR12で置換されたアリールまたはアラルキル基 ;アダマンチル;NR12;複素環;プリン;ピリミジン;ホスフェート;ポリ エーテル;ポリエチレングリコールまたは金属配位基である。 本発明に従ったアルキル、アルケニルおよびアルキニル基には、メチル、エチ ル、プロピル、ブチル、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、デ シル、ウンデシル、ドデシル、トリデシル、テトラデシル、ペンタデシル、ヘキ サデシル、ヘプタデシル、オクタデシル、ノナデシル、エイコシルおよび他の高 級炭素アルキル基を含む置換および無置換直鎖、分岐鎖および脂環式炭化水素が 含まれるがそれらに制限されるわけではない。さらなる例としては2−メチルプ ロピル、2−メチル−4−エチルブチル、2,4−ジエチルプロピル、3−プロ ピルブチル、2,8−ジブチルデシル、6,6−ジメチルオクチル、6−プロピ ル−6−ブチルオクチル、2−メチルブチル、2−メチルペンチル、3−メチル ペンチル、2−エチルヘキシルおよび他の分岐鎖基、アリル、クロチル、プロパ ルギル、2−ペンテニルおよびその他の不飽和基、シクロヘキサン、シクロペン タン、アダマンタンならびに他の脂環式基、3−ペンテン−2−オン、3−メチ ル−2−ブタノール、2−シアノオクチル、3−メトキシ−4−ヘプタナール、 3−ニトロブチル、4−イソプロポキシドデシル、4−アジド−2−ニトロデシ ル、5−メルカプトノニル、4−アミノ−1−ペンテニルならびに他の置換基が 挙げられる。 本発明に従ったアリール基にはフェニルおよびナフチル基のような置換および 無置換芳香族炭化水素基が含まれるがそれらに制限されるわけではない。アラル キル基にはベンジルおよびキシリル基のようなアリールおよびアルキル官能性の 両方を持った基が含まれるがそれらに制限されるわけではない。 本発明に従った金属配位基にはヒドロキサム酸、カテコールアミド、アセチル アセトン、2,2’−ビピリジン、1,10−フェナントロリン、二酢酸、ピリ ジン−2−カルボキサミド、イソアルキルジアミン、チオカルバメート、オキザ レート、グリシル、ヒスチジルおよびテルピリジルが含まれるがそれらに制限さ れるわけではない。他の金属配位基も知られている;例えば、Mellor,D.P.,Chem istry of Chelation and Chelating Agents in International Encyclopedia of Pharmacology and Therapeutics ,Section 70,The Chelation of Heavy Metals, Levine,W.G.Ed.,Pergamon Press,Elmford,N.Y.,1979を参照されたい。 本発明に従った固体支持体には制御孔ガラス(CPG)、オキザリル制御孔ガ ラス(例えば、Alul,et al.,Nucleic Acids Research 1991,19,1527を参照され たい)、TentaGel支持体−−アミノポリエチレングリコール誘導化支持 体(例えば、Wright,et al.,Tetrahedron Letters 1993,34,3373を参照されたい )またはPoros−−ポリスチレン/ジビニルベンゼンの共重合体が含まれる 。 多くの置換基が本発明の化合物内へ保護された(ブロックされた)形で導入で き、後で脱保護されて最終的な所望の化合物を生成する。一般に、保護基は特定 の反応条件に対して化学官能性を不活性にし、分子の残りの部分には実質的に損 傷を与えることなく付加でき、除去できる。例えば、Green and Wuts,Protectiv e Groups in Organic Synthesis,2d edition,John Wiley & Sons,New York,1991 を参照されたい。例えば、アミノ基はフタルイミド基としてまたは9−フルオレ ニルメトキシカルボニル(FMOC)基として保護でき、カルボキシル基はフル オレニルメチル基として保護できる。代表的ヒドロキシル保護基はBeaucage,et al.,Tetrahedron 1992,48,2223に記載されている。 本発明に従った置換基にはハロゲン(Cl、Br、F)、ヒドロキシル(OH )、チオール(SH)、ケト(C=O)、カルボキシル(COOH)、エーテル 、チオエーテル、アミジン(C(=NH)NR34)、グアニジン(NHC(= NH)NR34)、グルタミル(CH(NR34)(C(=O)OR5)、ニト レート(ONO2)、ニトロ(NO2)、ニトリル(CN)、トリフルオロメチル (CF3)、トリフルオロメトキシ(OCF3)、O−アルキル、S−アルキル、 NH−アルキル、N−ジアルキル、O−アラルキル、S−アラルキル、NH−ア ラルキル、アミノ(NH2)、アジド(N3)、ヒドラジノ(NHNH2)、ヒド ロキシルアミノ(ONH2)、スルホキシド(SO)、スルホン(SO2)スルフ ィド(S−)、ジスルフィド(S−S)、シリル、複素環式、脂環式および炭素 環式基が含まれるがそれらに制限されるわけではない。好適な置換基にはハロゲ ン、アルコールおよびエーテル(OR1)、チオールおよびチオエーテル(SR2 )、アミン(NR34)、アミジン(C(=NH)NR34)、グアニジン(N HC(=NH)NR34)、アルデヒド(CH=O)、酸(C(=O)OH)、 エステル(C(=O)OR5)、アミド(C(=O)NR34)およびグリシン (CH(NH2)(C(=O)OH))が含まれる。 本発明に従った特に好適な官能基には少なくとも以下の特定の官能部分を持つ モノマーユニットを含んでいる:チミン、ウラシル、アデニン、グアニン、シト シン、イミダゾール、カルバゾール、アミノエチル、カルボキシエチル、フェニ ル、短鎖および長鎖アルキルおよびグリシン。他の好適な官能基にはアミノ、ベ ンジルおよびテトラエチレングリコール基が含まれる。 本発明の化合物は第1または第2ヒドロキシル基に共有結合で結合されたコン ジュゲート基を含むことができる。本発明のコンジュゲート基には、インターカ レーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ポリエチレングリコール 、ポリエーテル、オリゴマーの薬動学特性を促進する基およびオリゴマーの薬力 学特性を促進する基が含まれる。典型的なコンジュゲート基にはコレステロール 、リン脂質、ビオチン、フェナントロリン、フェナジン、フェナントリジン、ア ントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリンおよび色素 が含まれる。本発明の文脈において薬動学的特性を促進する基には、オリゴマー 取り込みを促進し、オリゴマーの分解に対する耐性を改良しおよび/またはRN Aとの配列特異的ハイブリッド形成を強化する基が含まれる。本発明の文脈にお いて薬力学的特性を促進する基には、オリゴマー取り込み、分布、代謝または排 泄を改良する基が含まれる。代表的コンジュゲート基は1992年10月23日 に出願された国際特許出願PCT/US92/09196、1993年9月3日 に出願された米国特許出願第116,801号および米国特許第5,218,1 05号に開示されている。上記の各々は本出願と共通して譲渡されている。各々 の全開示はここに引例として含まれている。 本発明のモノマー化合物は前もって選択された配列かまたは組み合わせ法によ り決定される配列のいずれかをもつオリゴマー化合物の製造に使用できる。一つ の有用な組み合わせ法は上述のSURF法であり、それは1991年8月23日 に出願された米国特許出願第749,000号、1992年8月21日に出願さ れたPCT出願US/07121、1994年12月16日に出願された米国特 許出願第357,396号(これらのすべては本出願と共通して譲渡されている )に開示および特許請求されている。各々の全開示はここに引例として含まれて いる。 広い範囲の化学的多様性を持つ組み合わせライブラリーを合成することが本発 明の重要な観点である。一つのレベルでは、化学的多様性はリン結合の性質を変 化させることにより導入される。本発明に従うリン結合にはホスホジエステル( OPO)、ホスホロチオエート(OPS)、ホスホルアミデート(OPN)、ホ スホロチオアミデート(SPN)およびアルキルホスホネート(OPC)が含ま れる。組み合わせライブラリーは単一の型のリン結合でも、またはオリゴマーの 各々の位置で異なった結合でも製造できる。例えば、単一OPS結合はOPOオ リゴマーの任意の位置に選択的に導入できる。実際、OPO、OPS、OPN、 SPNおよびOPC結合のすべての可能な組み合わせがオリゴマー内に選択的に 導入できる。オリゴマーの特定の位置での結合の型の存在または不在は分子の性 質に絶大な影響を持っているであろう。 ホスホルアミデート結合ライブラリーの場合、OPN結合の窒素原子上に置換 基を持つことができるためさらなるレベルの多様性が可能である。従って、オリ ゴマーにOPNが存在するそれぞれに広範囲のアミンを導入することが可能であ る。各々のOPN結合に同一のアミン置換基または各々の位置に異なったアミン を持つことが可能である。 前に議論したように、SURFライブラリーにいくつかのレベルで化学的多様 性を発生させることができる。前に多くのモノマーの製造について説明した。こ れらのモノマーは化学的多様性の二つの特色を研究するために製造された:第一 に化学的性質の範囲をカバーする多くの官能基が利用できる。第二に、これらの 官能基は、異なった結合位置で提示されるようにまたは異なった様式での間隔で 存在するように結合させ、柔軟性を変えることが可能である。以下の節では多様 性の第三のレベル、残基間結合それ自体について説明する。結合型の導入に使用 されるいかなる方法も両立することは理解されなければならない。特に、適当な 条件を使用することにより、オリゴマーの配列に関係なく随意にオリゴマーの任 意の位置にOPO、OPS、OPN、SPNおよびOPC結合を含むホスフェー ト結合を導入することが可能である。このことは、結合の性質を決定する化学反 応は固体支持体上の反応性基(連結基にせよまたは前のモノマーにせよ)へのモ ノマーの結合とは別であるために可能である。特に、ホスホルアミダイトモノマ ーがテトラゾールで処理され、遊離ヒドロキシル基を持つ固体支持体へ加えられ た場合、ホスファイトトリエステルが得られる。このホスファイトトリエステル は次にヨウ素(自動化合成機でのDNA合成と同様な方法で処方された)で処理 でき、アンモニア脱保護後にホスホジエステルが得られる。もしくは、ホスファ イトトリエステルをベンゾジチオール−3−オン−1,1−ジオキシドで処理し て対応するホスホロチオエートを得ることができる。 水素ホスホネート化学はオリゴマー内へ導入されるべきさらなる化学修飾を可 能にする利点を持っている。オリゴヌクレオチドホスホジエステルおよびホスホ ロチオエートはこの方法を用いて製造され(Froehler,B.C.,Matteucci,M.D.Tetr ahedron Lett .1986,27,469-472参照)、同様にオリゴヌクレオチド ホスホルア ミデートはFroehler,B.C.Tetrahedron Lett.1986,27,5575-5579、Letsinger,R.L .,Sigman,C.N.,Histand,G.,Salunkhe,M.J.Am.Chem.Soc.1988,110,4470-4471を参 照されたい。ホスホジエステルおよびホスホルアミデートの両方を含むオリゴマ ーの合成、並びにホスホルアミダイトの合成に関係したホスホルアミダイト化学 の使用は報告されている(Jung,P.M.,Histand,G.,Letsinger,R.L.Nucleosides & Nucleotides ,1994,13,1597-1605参照)。この後者の研究では、交互にホスホジ エステルおよびホスホルアミデートを持つオリゴマーが、オリゴマーの伸長にホ スホルアミダイトおよびH−ホスホネートを結合させ、続いての適当な酸化工程 により製造されている。しかしながら、一般に記載したすべての例において、オ リゴマーのすべてのホスホルアミデート結合に同一のアミン置換基が取り込まれ ている。これらの研究は多様な官能基の取り込みのための追加的部位としてのホ スホルアミデート結合の使用の可能性を示している。広範囲のアミンが酸化工程 で使用でき、本発明のモノマーは必要な化学的性質を支持する。従って、ホスホ ルアミデート結合を取り込む組み合わせライブラリーの製造には、本発明のモノ マーは対応するH−ホスホネートモノエステルに変換される。本発明の一つの態 様では、このことはホスフィチル化剤としてPCl3およびイミダゾールを使用 することにより達成された(Garegg,P.J.,Regberg,T.,Stawinski,J.Stromberg,R .Chem.Scr.1986,26,59-62参照)。これらのH−ホスホネートモノマーは塩化ピ バロイル、塩化アダマントイルまたは他の適当な活性化剤で活性化することによ り固体支持体上でオリゴマー化される。中間体H−ホスホネートジエステルは水 性ピリジン中でのヨウ素を用いて高収率でホスフェートジエステルに酸化される 。これによりH−ホスホネートとホスホルアミダイト法のカップリング効率を比 較することが可能である。本質的には両方の方法論で同じカップリング効率が達 成された。H−ホスホネートジエステルはピリジン/CCl4(1:1)中、適 当なアミンの10%溶液を用いることによりホスホルアミデートへ変換された。 これらの条件下、H−ホスホネートジエステルはArbuzov反応を経て塩化 ホスホリルにより酸化され、続いて第1または第2アミンにより塩素が置換され た。第二の工程は非常に一般的であることが証明されており、広範囲のアミンで 満足すべき収率が得られる。さらに、ホスホルアミデートの収率はホスホジエス テルの収率と同程度であった。 いくつかの型のライブラリーがこの方法論により得られた。最も単純な種類の ライブラリーは、リンが単一のアミンで置換されている2から10またはそれ以 上のモノマーユニットの長さの本発明の一組のモノマー(4から16またはそれ 以上のモノマーの組が典型的には使用された)から作製されるライブラリーであ る。これらのライブラリーは、ホスホルアミダイト化学ではなくH−ホスホネー ト合成プロトコールにしたがって、スプリットビーズ合成により製造される。中 間体H−ホスホネートジエステルは最終工程までそのまま残される。その時点で オリゴマーライブラリープールは適当な第1または第2アミンを10%含むCC l4/ピリジンで酸化される。これによりすべての残基間結合がホスホルアミデ ートへ変換される。従って、このライブラリーは一定のホスホルアミデート結合 によって一緒に結合され、固定された位置のユニークなサブセットに分離された モノマーのすべての可能な配列から構成されている。ライブラリーの最終的性質 は酸化工程で使用されたアミンの選択により決定されるであろうことは明かであ る。従って、ライブラリー成分の水溶解性、薬力学、薬動学をアミンの選択によ り変えることができる。中間の酸化工程を行うことにより混合された結合を持つ オリゴマーライブラリーを製造することも可能である(Gryaznov,S.M.,Sokolova ,N.I.Tetrahedron Lett.1990,31,3205-3208;Gryaznov,S.M.,Potapov,V.K.Tetrah edron Lett .1991,32,3715-3718;Farooqui,F.,Sarin,P.S.,Sun,D.,Letsinger,R.L .Bioconjugate Chem.,1991,2,422-426;Iso,Y.,Yoneda,F.,Ikeda,H.,Tanaka,K.,F uji,K.Tetrahedron Lett.1992,33,503-506参照)。従って、オリゴマーライブラ リーの一部はH−ホスホネート化学により合成され、それはR2NH、CCl4/ PyまたはS8、CS2/TEAまたはH2O、CCl4/Pyで酸化でき、およ びライブラリーの第二の部分が合成され、試薬の第二の組で酸化される。これに よりキメラライブラリーが創造され、ここでは各々のサブセット中のランダムオ リゴマーの区分は分子の残りの部分と異なった結合を持っている。この方法論を 拡張し、各々のモノマー結合後に異なった酸化工程を行うことによりオリゴマー ライブラリーの各々の位置に異なった結合を取り込ませることが可能である。H −ホスホネートジエステル結合固体支持体の一部へ別々の酸化を実施し、続いて モノマー位置がランダム化されるように同様の方法でサブセットをプールする事 により結合が組み合わせ化できる。従って、各々のモノマーおよびそれらの間の 結合はスプリット合成法によりランダム化できる。 SURF法の例は下記の表Iに示されている2’−O−メチルオリゴヌクレオ チドライブラリーである(Ecker et.al.、上記文献)。表IはRNAヘアピンに 対する結合での2’−O−メチルオリゴヌクレオチドの選択を記載する。KD’ すなわち結合定数はゲルシフトにより決定された。”X”は変化させた位置を示 すのに用いられ、下線はSURF法の連続的な反復の間に固定された位置を示す のに用いられる。 このSURF法はモノマーユニットとして天然に存在するヌクレオチドをホスホ ジエステルまたはホスホロチオエートとして用いるライブラリーを除いて、ライ ブラリーに対しては用いられていない。他の組み合わせ法はモノマーユニットと してアミノ酸を用いるライブラリーについてのみ用いられてきた。 本発明の一つの態様は上記SURF法に構造Iを持つモノマー化合物を包含さ せることである。自動化ホスホルアミダイトオリゴマー合成の利点を保持しなが らこれらのモノマー化合物に付加された官能基をライブラリー内へ取り込ませる ことができる。これらの官能基は以下の型の相互作用に影響を及ぼすことができ る:水素結合供与体および受容体、イオン性、極性、疎水性、芳香族および電子 供与体および受容体。好適な官能基にはアミノエチル、カルボキシエチル、アデ ニルメチル、チミニルメチル、イミダゾリルメチル、ベンジル、ミリスチル、イ ソプロピルおよびテトラエチレングリコール基が含まれる。 本発明の一つの利点は、本発明のモノマー化合物の簡単な設計が合理的薬剤設 計と何千もの化合物に対するスクリーニング機構との組み合わせを可能にするこ とである。このことは本発明の化合物をSURF法のような組み合わせ技術で使 用することにより達成できる。 一つの好適な実施態様において、本発明のモノマー化合物に付加された官能基 は酵素PLA2との相互作用の能力(好適には阻害)で選択される。従って、本 発明の化合物はアトピー性皮膚炎および炎症性腸疾患を含む炎症性疾患の局所的 および/または全身的処置に使用できる。官能基の選択において、PLA2が両 性イオンベシクルより陰性イオンベシクルを好むことが利用できる。これらの官 能基を持つ主鎖の選択においては、PLA2の天然の基質がホスフェート基を含 んでいるという事実がさらに利用できる。従って、ホスホジエステルまたはホス ホロチオエートおよび他のホスフェート結合オリゴマーが好適に選択され、PL A2の正に荷電した界面結合部位と結合するための負に荷電した化合物が提供さ れる。 本発明のある種の化合物はPLA2酵素の裂け目への結合を容易にするために 芳香族官能基を含んでいる(Oinuma,et al.,J.Med.Chem.1991,34,2260;Marki,et al.,Agents Actions 1993,38,202;およびTanaka,et al.,J.Antibiotics 1992,4 5 ,1071参照)。ベンジルおよび4−ヘキシルベンジル基が好適な芳香族基である 。本発明の化合物はさらにテトラエチレングリコール基のような疎水性官能基を 含むことができる。PLA2酵素は疎水性チャンネルを持っているので、疎水性 はこの酵素の阻害剤の重要な性質と信じられている。 本発明のある実施態様では、構造Iを持つホスホルアミダイトモノマー化合物 がオリゴマー化合物のライブラリー内へ組み込まれ、連続的スクリーニングによ り上記SURF技術のような組み合わせスクリーニング技術でオリゴマーのより 複雑でないサブセットが同定される。一つの好適な実施態様において、アミノエ チル、カルボキシエチル、アデニルメチル、チミニルメチル、テトラエチレング リコール、イミダゾリルメチル、ベンジル、イソプロピル、ミリスチル、または 4−ヘキシルベンジル基で官能化されたオリゴマー化合物のライブラリーが製造 され、PLA2活性の阻害がアッセイされた。PLA2アッセイはSURF法のよ うな組み合わせスクリーニング法を用いて実施できる。このアッセイでは、オリ ゴマーライブラリーはヒトII型PLA2酵素活性の阻害でスクリーニングされた 。典型的には、これらのライブラリーは約8000の異なった化合物を含んでい る。SURF技術の連続的反復がライブラリーからユニークなオリゴマーを選択 するために行われる。ライブラリーは阻害のさらなる機構を決定するために他の インビトロアッセイでもさらにスクリーニングできる。 スクリーニングの第一段階でのオリゴマーの同定後、オリゴマーライブラリー の内容物にさらなる修飾がなされる。例えば、もし第一のスクリーニングの反復 でベンジル基を含む活性化合物が得られたら、続いてのスクリーニングの連続的 反復ではこの芳香族残基を変更して置換ベンジル基を用いることができる。この 方法で段階的に構造活性が同定され、酵素活性の強力な阻害剤が決定される。 組み合わせ法によるPLA2の強い結合オリゴマー阻害剤の同定を最大にする ため、典型的にはランダムライブラリーは官能基のアレイを含む。正常ヌクレオ チド構造がより多様な化学基により置き換えられているモノマー、ホスホルアミ デートユニットをカップリングさせることによりヌクレオチド合成と類似の方法 でオリゴマーを組み立てる。モノマーユニットのいくつかにおいて、ヌクレオチ ドの核塩基は保持されている。他のものでは、核塩基は、核塩基により提供され る相互作用とは異なったリガンドーリガンド相互作用を提供するように選択され た他の官能基で置き換えられている。正常ヌクレオチドの糖部分は、例えばエチ レングリコールのようなアルキレングリコールユニットにより置き換えられてお り、特異的主鎖が形成されている。この方法論は多くの種類の官能基を持つたく さんのモノマーの収斂的製造を供給する。必要な場合には、合成完了後のオリゴ マーの一工程脱保護を可能にするように、官能基は塩基不安定性保護基で保護さ れる。 前に示したように、構造Iを持つモノマー化合物は互いに連結できてホモポリ マー構造を形成でき、またはヌクレオチドおよび/または他の部分と連結できて ヘテロポリマー構造を形成できる。例えば、天然に存在するまたは合成オリゴヌ クレオチドの一つまたはそれ以上の領域または”ストレッチ”またはペプチド、 ペプトイド、ペプチド核酸、オリゴおよび/またはポリサッカライドのような他 の合成または天然オリゴマー化合物へ連結された本発明のモノマーユニットの一 つまたはそれ以上の領域または”ストレッチ”を含むキメラ構造が形成できる。 さらに、構造IIを持つオリゴマー化合物は、代理人ドケットISIS−1014 が付けられ”窒素含有結合を持つオリゴヌクレオチド模倣物”と題された特許出 願および代理人ドケットISIS−1237が付けられ”ピロリジン含有モノマ ーおよびオリゴマー”と題された特許出願に開示されている化合物と共にキメラ 構造の中へ取り込ませることができる。前記特許出願はこの出願と同時に出願さ れ、共通して譲渡されており、ここに引例として包含されている。 本発明のオリゴマー化合物の組み合わせ合成において、モノマーはライブラリ ー(PLA2阻害のスクリーニングに適したライブラリーを含む)内へ組み込ま れる。本ライブラリーは興味深い他の標的に対してのスクリーニングにも有用で ある。本発明のオリゴマー化合物の非組み合わせ合成においては、モノマーユニ ットはオリゴヌクレオチド合成に使用される標準条件を用いて前もって決定され ている配列に結合される。 組み合わせ技術により発生された活性配列を検出するため、選択されたアッセ イの感度内で分子が検出できるように十分大きく活性分子の濃度が選択される。 認識されるように、組み合わせ技術により生成されるサブセット内のユニークな オリゴマーの数は、オリゴマーの長さおよび使用された異なったモノマーの数に 依存している。配列の数は、モノマーの数をランダムな位置の数に等しい大きさ まで高めることにより決定できる。このことは表IIに示されている。表IIはまた 、サブセット濃度が100μM(典型的な高試験濃度)である場合の各々の配列 の濃度も示している。モノマーの数およびその長さが、最終的なオリゴマー化合 物に望まれる予測IC50(すなわち、50%の酵素活性が阻害される濃度)の見 積に基づくことができることが見いだされた。100nMの予測IC50に対して は、 表IIに示された複雑さは受容可能であり、すなわち、表IIに示されたライブラリ ーは約100nMまたはそれ未満のIC50の特異的配列の検出を可能とする複雑 さを持っている。 ライブラリーのために5モノマーが選択されたら、ライブラリーは5モノマー ユニット、XNNNN(式中、Nはモノマーユニットの等モル混合物であり、X は5サブセット各々の異なったモノマーユニットである)の長さをもつであろう 。 合成を容易にするため、固定位置を分子の右端に選択できる。下記のようにPL A2活性をアッセイした後、位置Xを最も大きな阻害を与える残基で固定し、続 いて次のサブセットを合成しスクリーニングする。非ランダム化法のように、固 定位置を左端に向かって移行させる。ユニークな阻害剤を決定するには5回の合 成およびスクリーニングが必要とされる。 本発明のモノマーユニットはオリゴヌクレオチドの標準合成に使用される標準 ホスホルアミダイト化学を用いて連結されオリゴマー化合物を形成する。官能化 アルキレングリコールモノマーのカップリング速度は異なっているが、個々のモ ノマーの反応性を各々のランダム化された位置での各々のモノマーの取り込みが 等モルになるように調整できる。モノマーの反応性の調整は下記の実施例のよう に達成できる。そのような調整を達成する別の技術は、代理人ドケットISIS −1009が付けられた”ランダムオリゴヌクレオチドライブラリーおよびこれ を作製する方法”と題された米国特許出願に開示されている。前記特許出願はこ の出願と同時に出願され、共通して譲渡されており、ここに引例として包含され ている。 SURFスクリーニング法において、オリゴマーの量は最初の回のスクリーニ ングでの各々のサブセットの濃度が比較的高くなるように(約100μM)選択 される。現在のところDNA合成機を使用してオリゴマーを合成するのが好適で ある。そのような合成機では、オリゴマーは1から4μmolのスケールで最も 都合よく合成される。ライブラリーのサブセットの濃度を約100μMとすると 、アッセイは約200μL未満の少容量で好適に実施される。 本発明の化合物の例を以下の実施例に示すが、本発明はこれらに限定されるも のではない。 実施例1 1−(1−チミン)−2,3−プロパンジオール 乾燥ジメチルホルムアミド(DMF,30ml)中のチミン(4.2g,33 mmol)の撹拌溶液に、R−(+)−グリシドール(2.2g,30mmol )および炭酸カリウム(50mg,0.36mmol)を加えた。懸濁液を80 ℃に5時間加熱し、次に蒸発させた。生成物をメタノール(25ml)で希釈し 、濾過した。濾液を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによ り精製した。酢酸エチル:メタノール(9:1,v/v)で溶出し、適当な画分 をプールし、蒸発させて、N(1),N(3)二置換物質を含まないN(1)置 換物質3.08g(60%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6):δ,1. 8(s,3,CH3);3.35(bm,3,COHC 2OH);3.7およ び3.9(2m,2,NCH2);4.7(bs,1,CH2,D2Oと交換 );5.0(bs,1,CHO,D2Oと交換);7.4(s,1,H−6) ;11.2(bs,1,NH,D2Oと交換)。元素分析:計算値C81224 (200.193):47.99% C,6.04% H,13.99% N; 実測値:47.35% C,6.10% H,13.67% N。 実施例2 1−(1−チミン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール 乾燥ピリジン(30ml)中の1−(1−チミン)−2,3−プロパンジオー ル(2.079g,12.4mmol)の撹拌溶液に、塩化4,4’−ジメトキ シトリチル(4.4g,13mmol)を加えた。懸濁液を室温で4時間撹拌し た。反応混合物を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより 精製した。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(3/2/1,v/v/% )で溶出して、適当な画分をプールし、蒸発させて、3.39g(54%)を得 た。1H−NMR(DMSO−d6):δ,1.8(s,3,CH3);2.9( m, 2,CH2ODMT);3.8(s,6,OCH3);3.9(m,2,NCH2 );5.3(d,1,OH,D2Oと交換);6.9(m,4,トリチル);7 .3(m,9,トリチル);11.2(s,1,NH,D2Oと交換)。 実施例3 1−(1−チミン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイ ソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 乾燥THF(35ml)中の1−(1−チミン)−3−O−ジメトキシトリチ ル−2−プロパノール(3.39g,6.7mmol)およびN,N−ジイソプ ロピルエチルアミン(2.4ml,14mmol)の撹拌溶液を氷浴中で10℃ に冷却した。クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホス フィン(1.5ml,6.7mmol)を加えた。室温で4時間撹拌した後、反 応混合物を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し た。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(1:1:1,v/v/%)で溶 出し、適当な画分をプールし、蒸発させて、2.78g(61%)を得た。1H −NMR(CD3CN):δ,1.2(m,12,6CH3);1.75(d,3 ,CH3);2.45および2.6(2t,2,CH2ODMT);3.8(d, 6,OCH3);6.9および7.3(2m,14,トリチル);9.3(bs ,1,NH,D2Oと交換)。31P−NMR(CD3CN);δ,150.19お よび150.66。元素分析:計算値C384747P(702.786):6 4.94% C,6.74% H,7.97% N;実測値:64.60% C ,6.91% H,7.80% N。 実施例4 1−(1−イミダゾール)−2,3−プロパンジオール DMF(250mL)中の速く撹拌したイミダゾール(13.6g,0.2m ole)の溶液を、粉末炭酸カリウム(12g)で処理し、70℃に30分間加 熱した。この溶液に、グリシドール(14.8g,0.2mole)を一度に加 え、混合物をこの温度で36時間撹拌した。得られた黄色懸濁液を濾過し、濾液 を回転蒸留して、透明赤色シロップを得た。シロップをアセトニトリル(100 mL)とともに共蒸発させ、次に10.5×10cmシリカゲルカラム上でフラ ッシュクロマトグラフィーを行った。酢酸エチル−メタノール(9:1,2L、 次に4:1,2L)で段階的勾配溶出して、イミダゾール生成物を非晶質固体と して得た。16g(56%)。1H−NMR(DMSO−d6):δ,7.55, 7.10および6.84(3s,3,イミダゾール);5.08(d,1,CH O,D2Oと交換);4.85(t,1,CH2,D2Oと交換);4.0 5および3.83(2dd,2,CH2);3.55(m,1,メチン);3. 30および3.18(2m,2,C 2OH)。元素分析:計算値C61022 (142.157):50.69% C,7.09% H,19.71% N; 実測値:50.59% C,7.07% H,19.59% N。 実施例5 1−(1−イミダゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール 乾燥ピリジン(15ml)および乾燥DMF(15ml)中の1−(1−イミ ダゾール)−2,3−プロパンジオール(1.0g,7.0mmol)の撹拌溶 液に、塩化4,4’−ジメトキシトリチル(2.61g,7.7mmol)を加 えた。懸濁液を室温で4時間撹拌した。追加の等量のトリチル化合物(2.61 g,7.7mmol)を加えた。さらに23時間撹拌を継続し、混合物を蒸発さ せた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。メタノール :酢酸エチル:トリエチルアミン(1/19/1,v/v/%)で溶出し、適当 な画分をプールし、蒸発させて、432mg(14%)を得た。1H−NMR( DMSO−d6):δ,2.78,2.95(2m,1,CH2ODMT);3. 7(s,6,20CH3);3.85(bm,1,COH);3.95および 4.1(2m,2,NCH2);5.25(d,1,OH,D2Oと交換);6. 7から7.5(m,13/3,DMT/イミダゾール)。 実施例6 1−(1−イミダゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[N,N− ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 乾燥DMF(35ml)中の1−(1−イミダゾール)−3−O−ジメトキシ トリチル−2−プロパノール(432mg,0.97mmol)およびN−N− ジイソプロピルエチルアミン(252mg,3.5mmol)の溶液を氷浴中で 5℃に冷却した。クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノ ホスフィン(233mg,1.1mmol)を加え、反応混合物を室温で30分 間撹拌した。反応混合物を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィ ーにより精製した。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(7/3/1,v /v/%)で溶出し、適当な画分をプールし、蒸発させて、498mg(80% )を得た。1H−NMR(CD3CN);δ,0.9から1.2(m,12,CH3 );3.8(d,6,OCH3);6.75から7.5(M,13/3,ODM T/イミダゾール)。31P−NMR(CD3CN);δ,149.83および1 50.68。 実施例7 1−(1−カルバゾール)−2,3−プロパンジオール 無水DMF(300mL)中のカルバゾール(14g,83mole)および R−(+)−グリシドール(6.20g/83mmol)の速く撹拌した溶液を 、粉末炭酸カリウム(2.3g)で処理し、混合物を70℃で18時間加熱した 。得られた黄色懸濁液を濾過し、次に回転蒸留させて、黄色シロップを得た。シ ロップをアセトニトリル(100mL)とともに共蒸発させ、次に10.5×1 0cmシリカゲルカラム上でフラッシュクロマトグラフィーを行った。酢酸エチ ルで溶出して、カルバゾール生成物を非晶質固体として得た。8.25g(41 %)。1H−NMR(DMSO−d6):δ,8.13,7.60,7.23およ び7.10(4m,8,カルバゾール);5.03および4.90(2s,2, ヒドロキシル,D2Oと交換);4.47および4.27(2dd,2,CH2) ;3.90(m,1,メチン);3.40(m,2,C 2OH)。元素分析: 計算値C1515NO2(241.289):74.66% C,6.27% H ,5.80% N;実測値:74.32% C,6.25% H,5.76% N。 実施例8 1−(1−カルバゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール 乾燥ピリジン(40ml)中の1−(1−カルバゾール)−2,3−プロパン ジオール(1.1g,4.5mmol)の溶液に、塩化4,4’−ジメトキシト リチル(1.54g,4.5mmol)を加えた。反応混合物を室温で3時間撹 拌し、蒸発させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した 。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(1/9/1,v/v/%)で溶出 し、適当な画分をプールし、蒸発させて、976mg(39%)を得た。1H− NMR(DMSO−d6);δ,2.9から3.1(2m,2,CH2ODMT) ;3.7(s,6,2OCH3);4.1(m,1,COH);4.3から4 .5(2m,2,NCH2);5.2(d,1,OH,D2Oと交換);6.8か ら8.2(m,21,カルバゾールおよびトリチル)。元素分析:計算値C3633 NO4(543.661):79.53% C,6.12% H,2.58% N;実測値:79.28% C,6.34% H,2.70% N。 実施例9 1−(1−カルバゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N −ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(4 03mg,1.7mmol)を、5℃において、乾燥THF(40ml)中の1 −(1−カルバゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール(9 16mg,1.7mmol)およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン(44 5mg,3.4mmol)の溶液に加えた。4時間後、反応混合物を蒸発させ、 残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。酢酸エチル:ヘキ サン:トリエチルアミン(1/19/1,v/v/%)で溶出し、適当な画分を プールし、蒸発させて、850mg(68%)を得た。1H−NMR(CD3CN );δ,0.7から1.05(3d,12,CH3);3.75(d,6,OC H3);6.7から8.1(m,21,カルバゾールおよびトリチル)。31P− NMR (CD3CN);δ,149.1および149.5。元素分析:計算値C4550 35P(743.881):72.66% C,6.77% H,5.65% N;実測値:72.62% C,6.76% H,5.61% N。 実施例10 1−(1−ウラシル)−2,3−プロパンジオール ウラシル(21.56g,192mmol)を加熱しながら乾燥DMF(50 0ml)に溶解し、R−(+)−グリシドール(15.1g,203mmol) を加えた。懸濁液を70℃に加熱した。4時間後、反応液を蒸発させ、残渣をシ リカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。酢酸エチル:メタノール( 19/1,v/v)で溶出し、適当な分画をプールし、蒸発させて、15.62 g(44%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6);δ,3.35(m,3, COHC 2OH);3.7および3.9(2m,2,NCH2);5.5(m ,1,H−5);7.5(d,1,H−6);11.2(bs,1,NH)。 実施例11 1−(1−ウラシル)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール 塩化ジメトキシトリチル(29.8g,88mmol)を、乾燥ピリジン(1 50ml)中の1−(1−ウラシル)−2,3−プロパンジオール(15.62 g,84mmol)の溶液に加えた。反応混合物を室温で22時間撹拌し、蒸発 させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。酢酸エチ ル:ヘキサン:トリエチルアミン(3/2/1,v/v/%)で溶出し、適当な 画分をプールし、蒸発させて、1.1g(4%)を得た。1H−NMR(DMS O−d6);δ,2.8から3.0(2m,2,CH2ODMT);3.7(s, 6,2OCH3);3.85(m,1,COH);3.95(m,2,NCH2 );5.3(d,1,CHO,D2Oと交換);5.41(d,1,H−5) ;6.85(d,4,トリチル);7.3および7.4(2m,10,H−6お よびトリチル);11.2(s,1,NH,D2Oと交換)。 実施例12 1−(1−ウラシル)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジ イソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 乾燥THF(35ml)中の1−(1−ウラシル)−3−O−ジメトキシトリ チル−2−プロパノール(598mg,1.2mmol)およびN,N−ジイソ プロピルエチルアミン(158mg,1.2mmol)を氷浴中で10℃に冷却 した。クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン (286mg,1.2mmol)を加えた。室温で4時間撹拌した後、反応混合 物を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。酢 酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(1:1:1,v/v/%)で溶出し、 適当な画分をプールし、蒸発させて、368mg(42%)を得た。1H−NM R(CD3CN);δ,1.2(m,12,CH3);2.45および2.6(2 t,2,CH2ODMT);3.8(d,6,OCH3);6.9および7.3( 2m,15,トリチルおよびH−6);9.3(bs,1,NH,D2Oと交換 )。31P−NMR(CD3CN);δ,154.88および155.2。 実施例13 1−[9−(N6−ベンゾイル)アデニン]−2,3−プロパンジオール 乾燥DMF(500ml)中のアデニン(30.0g,0.22mol)の撹 拌溶液に、R−(+)−グリシドール(22.0ml,0.33mol)および 炭酸カリウム(7.6g,55mmol)を加えた。懸濁液を85℃で20時間 加熱し、次に濃縮した。残渣をメタノールからの結晶化により精製して、18. 1g(39%)の中間体1−(9−アデニン)−2,3−プロパンジオールを得 た。1H−NMR(DMSO−d6);δ,3.3から3.4(m,2,C 2O H);3.8から3.9(m,1,COH);3.9から4.1および4.3 から4.4(2m,2,NCH2);4.8から4.9(t,1,CH2,D2 Oと交換);5.1から5.2(d,1,CHO,D2Oと交換);7.3( s,2,NH2,D2Oと交換);8.0および8.1(2s,2,C(2)−H ,C(8)−H)。元素分析:計算値C81152(209.207):4 5.93% C,5.30% H,33.48% N;実測値:45.81% C,5.42% H,32.93% N。 1−(9−アデニン)−2,3−プロパンジオール(18.0g,86.0m mol)の懸濁液に、0℃でクロロトリメチルシラン(32.7ml,257m mol)を加えた。15分後、塩化ベンゾイル(30.0ml,259mmol )を加え、混合物を室温で3時間撹拌した。混合物を0℃に冷却し、冷水100 mlを加えた。15分後、冷濃水酸化アンモニウム100mlを加えた。室温で 1時間撹拌した後、混合物を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフ ィーにより精製した。メタノール:酢酸エチル(1/10,v/v)で溶出し、 適当な画分をプールし、蒸発させて、4.1g(14.8%)を得た。1H−N MR(DMSO−d6):δ,3.3から3.5(m,2,C 2OH);3.8 から4.0(m,1,COH);4.1から4.2および4.4から4.5( 2m,2,NCH2);4.9から5.0(t,1,CH2,D2Oと交換) ;5.2から5.3(d,1,CHO,D2Oと交換);7.4から8.2( 2m,5,ベンゾイル);8.4から8.8(2s,2,C(2)−H,C(8 )−H);11.2(bs,1,NH,D2Oと交換)。元素分析:計算値C15 1553(313.315):57.50% C,4.82% H,22.3 5% N;実測値:57.24% C,4.81% H,21.97% N。 実施例14 1−[9−(N6−ベンゾイル)アデニン]−3−O−ジメトキシトリチル−2 −プロパノール 無水ピリジン(50ml)中の1−[9−(N6−ベンゾイル)アデニン]− 2,3−プロパンジオール(4.0g,13mmol)の溶液に、塩化4,4’ −ジメトキシトリチル(4.7g,14mmol)を加えた。混合物を室温で4 時間撹拌した。メタノール(5ml)を加え、混合物を蒸発させた。残渣をシリ カゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。ヘキサン/酢酸エチル/トリ エチルアミン(2/8/1,v/v/v)で溶出し、適当な画分をプールし、蒸 発させて、4.2g(53%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6):δ, 2.9から3.1(2m,2,CH2ODMT);3.7から3.8(s,6, OCH3);4.1から4.6(m,3,NCH2CHOH);5.4から5.5 (d,1,CHOH,D2Oと交換);6.8から8.2(4m,18,トリチ ル,ベンゾイル);8.3から8.8(2s,2,C(2)−H,C(8)−H );11.2(bs,1,NH,D2Oと交換)。 実施例15 1−[9−(N6−ベンゾイル)アデニン]−3−O−ジメトキシトリチル−2 −O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト ]プロパン 無水THF(50ml)中の1−[9−(N6−ベンゾイル)アデニン]−3 −O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール(4.2g,6.8mmol)の 溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(2.9ml)およびクロロ−β−シアノ エトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(1.5ml,6.7mm ol)を加えた。混合物を室温で20時間撹拌した。残渣を蒸発させ、シリカゲ ルカラムクロマトグラフィーにより精製した。ヘキサン/酢酸エチル/トリエチ ルアミン(2/8/.1,v/v/v)で溶出し、適当な分画をプールし、蒸発 させて、4.54g(82%)を得た。1H−NMR(CD3CN);δ,0.9 −1.1(m,12,CH3);2.4から2.6(m,2,CH2CN);3か ら3.2(m,2,CH2ODMT);3.4から3.7(m,3,OC 2CH2 CN,(CH32);3.7から3.8(d,6,OCH3);4.3から 4.6(m,3,NC 2OH);6.8から7.7(3m,18,トリチ ル,ベンゾイル);7.9から8.8(2d,2,C(2)−H,C(8)−H )。31P−NMR(CD3CN);δ,149.80および150.75。 実施例16 1−[9−(2−アミノ−6−クロロ)プリン]−2,3−プロパンジオール 無水THF200ml中の2−アミノ−6−クロロプリン(21.3g,12 5mmol)の溶液に、R−(+)−グリシドール(14.0g,187mmo l)および炭酸カリウム(3.5g,25mmol)を加えた。反応液を85℃ で3時間撹拌した。反応混合物を濾過した。濾液を蒸発させ、残渣をシリカゲル カラムクロマトグラフィーにより精製した。酢酸エチル/メタノール(9/1, v/v)で溶出し、適当な分画をプールし、蒸発させて、11.74g(38% )を得た。1H−NMR(DMSO−d6);δ,3.2から3.5(m,2,C 2 OH);3.7から5.3(2m,3,NC 2OH);4.8から4. 9(t,1,CH2,D2Oと交換);5.2から5.3(d,1,CHOH ,D2Oと交換);6.8から6.9(s,2,NH2,D2Oと交換)8.0( s,1,C(8)H)。元素分析:計算値C81052Cl(243.652 ):39.44% C,4.14% H,28.74% N;実測値:39.4 1% C,4.12% H,28.45% N。 実施例17 1−(9−グアニン)−2,3−プロパンジオール 1−[9−(2−アミノ−6−クロロ)プリン]−2,3−プロパンジオール (2.62g,11mmol)を1N HCl(aq,100ml)中で85℃ で3時間撹拌した。反応混合物を氷浴中で冷却し、濃縮水酸化アンモニウムでp H10の塩基性とした。生成物を結晶質固体として濾別した。収量2.04g( 84%)。1H−NMR(DMSO−d6);δ,3.2から3.4(m,2,C 2 OH);3.7から4.2(M,3,NC 2OH);4.7から4.9 (t,1,CH2,D2Oと交換);5.1から5.2(d,1,CHO, D2Oと交換);6.6(s,2,NH2,D2Oと交換);7.7(s,1,C (8)−H);10.7(s,1,NH,D2Oと交換)。元素分析:計算値C8 1153(225.207):42.67% C,4.92% H,31.1 0% N;実測値:42.28% C,4.88% H,30.85% N。 実施例18 1−[9−(N2−イソブチリル)グアニン]−2,3−プロパンジオール ピリジン(400ml)中の1−(9−グアニン)−2,3−プロパンジオー ル(17.0g,75.5mmol)の溶液に、0℃においてクロロトリメチル シラン(28.6ml,225mmol)を加えた。反応混合物を0℃で15分 間撹拌し、次に室温で30分間撹拌した。混合物を再び0℃に冷却し、塩化イソ ブチリル(23.7ml,226mmol)を加えた。混合物を室温で2時間撹 拌した。反応液を0℃に冷却し、氷冷水100mlを加え、15分後に氷冷水酸 化アンモニウム100mlを加えた。反応液を室温で30分間撹拌し、ほぼ乾燥 するまで蒸発させ、メタノールを加えて、不要の副生成物を析出させて濾過した 。濾液を蒸発させ、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した 。酢酸エチル/メタノール(9/1,v/v)で溶出し、適当な画分をプールし 、蒸発させて、13.8g(62%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6); δ,1から1.2(d,6,CH3);2.7から2.9(m,1,COCH) ;3.3から3.5(m,2,C 2OH);3.8から3.9(m,1,C OH);3.9から4.3(2m,2,NCH2);4.8から4.9(t,1 ,CH2OH,D2Oと交換);5.1から5.2(d,1,CHO,D2Oと 交換);7.9(s,1,C(8)−H);11.6から12.2(2s,2, NH,CONH,いずれもD2Oと交換)。元素分析:計算値C121754( 295.297):48.81% C,5.80% H,23.72% N;実 測値:48.36% C,5.62% H,23.10% N。 実施例19 1−[9−(N2−イソブチリル)グアニン−3−O−ジメトキシトリチル−2 −プロパノール ピリジン(100ml)中の1−[9−(N2−イソブチリル)グアニン]− 2,3−プロパンジオール(5.3g,18mmol)の溶液に、塩化4,4’ −ジメトキシトリチル(6.69g,20mmol)を加えた。反応混合物を室 温で4時間撹拌した。メタノールで急冷した後、混合物を蒸発させた。残渣をシ リカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。メタノール:酢酸エチル: トリエチルアミン(5/95/1,%/%/%)で溶出し、適当な画分をプール し、蒸発させて、4.9g(45%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6); δ,1.1から1.2(d,6,CH3);2.7から3.1(m,3,CH2O DMT,COCH);3.7から3.9(s,6,OCH3);4.1から4. 3(m,3,NC 2OH);5.4から5.5(d,1,CHO,D2O と交換);6.7から8.0(m,14,トリチル,C(8)−H);11.5 から12(2bs,2,NH,CONH,いずれもD2Oと交換)。 実施例20 1−[9−(N−イソブチリル)グアニン]−3−O−ジメトキシトリチル−2 −O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト ]プロパン THF(200ml)中の1−[9−(N2−イソブチリル)グアニン]−3 −O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール(13.12g,22mmol) およびジイソプロピルエチルアミン(10ml)の溶液に、0℃においてクロロ −β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(5.6ml ,25mmol)を加えた。反応混合物を室温で20時間撹拌した。反応液を濃 縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。1%トリエ チルアミンを含む酢酸エチルで溶出し、適当な画分をプールし、蒸発させて、8 .62g(49%)を得た。1H−NMR(CD3CN);δ,1.0から1.2 (m,18,CH3);2.4から2.8(m,2,CH2CN);2.8から3 .0(m,1,COCH);3.1から3.3(m,2,CH2ODMT);3 .4から3.8(m,9,OC 2CH2CN,(CH32CH,OCH3);4 .2から4.4(m,3,NCH2O);6.7から7.7(m,14,ト リチル,C(8)−H);12.3(BS,2,NH,CONH,いずれもD2 Oと交換)。31P−NMR(CD3CN);d,150.15および150.4 8。 実施例21 1−(1−シトシン)−2,3−プロパンジオール シトシン(11.0g,99mmol),R−(+)−グリシドール(8.9 g,120mmol),および炭酸カリウム(6.9g,50mmol)の溶液 をDMF(300ml)中で85℃で22時間撹拌した。粗反応混合物を濾過し 、濾液を蒸発させた。この残渣をメタノールから結晶化させて、10.5g(5 7%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6);δ,3.2から3.5(m,3 ,COHC 2OH);3.6から3.7(m,1,NCH2);3.8から4 .0(dd,1,NCH2);4.7から4.8(t,1,CH2,D2Oと 交換);4.9から5.1(d,1,CHO,D2Oと交換);5.6から5 .7(d,1,C(5)−H);7.0から7.1(bs,2,NH2,D2Oと 交換);7.4から7.5(d,1,C(6)−H)。 実施例22 1−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]−2,3−プロパンジオール ピリジン(400ml)中の1−(1−シトシン)−2,3−プロパンジオー ル(11.11g,60mmol)の氷冷懸濁液に、クロロトリメチルシランを 加えた。この混合物を氷浴温度で30分間撹拌した。塩化ベンゾイルを加え、混 合物を室温で2時間撹拌した。混合物を0℃に冷却し、氷冷水(100ml)を 加えた。15分間撹拌した後、氷冷水酸化アンモニウム(100ml)を加えた 。反応混合物を15分間撹拌し、濃縮した。水(400ml)を加え、混合物を ほぼ沸騰するまで加熱した。所望の生成物を固体として濾過した。乾燥後、収量 は15.31g(88%)であった。1H−NMR(DMSO−d6);δ,3. 3から3.6(m,3,COHC 2OH);3.7から3.9(bs,1, NCH2);4.1から4.3(d,1,NC 2);4.7から4.9(t,1 ,CH2,D2Oと交換);5.1(d,1,CHO,D2Oと交換);7 .2から7.3(d,1,C(5)−H);7.5から7.7(m,3,ベンゾ イル);8.0から8.1(d,3,C(6)−H,ベンゾイル);10.5か ら11(bs,1,NH,D2Oと交換)。 実施例23 1−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]−3−O−ジメトキシトリチル−2 −プロパノール ピリジン(100ml)中の1−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]−2 ,3−プロパンジオール(7.0g,24mmol)および塩化4,4’−ジメ トキシトリチル(9.84g,29mmol)の溶液を室温で24時間撹拌した 。反応混合物を濾過し、濾液を蒸発させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグ ラフィーにより精製した。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(6/4/ 1,v/v/%)で溶出し、適当な画分をプールし、蒸発させて、52%の収率 を得た。1H−NMR(DMSO−d6);δ,2.9から3.1(m,2,C 2 ODMT);3.6から3.9(m,7,OCH3,COH);4から4.3 (2m,2,NCH2);5.3から5.4(d,1,OH,D2Oと交換);6 .8から8.2(3m,20,トリチル,ベンゾイル,C(5)−H,C(6) −H);11.2(s,1,NH,D2Oと交換)。 実施例24 1−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]−3−O−ジメトキシトリチル−2 −O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト ]プロパン THF(50ml)中の1−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]−3−O −ジメトキシトリチル−2−プロパノール(7.48g,13mmol)および ジイソプロピルエチルアミン(5.5ml)の溶液に、クロロ−β−シアノエト キシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(3.2ml,14mmol) を加えた。混合物を室温で2時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液をシリカゲル カラムクロマトグラフィーにより精製した。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチル アミン(1/1/1,v/v/%)で溶出し、適当な画分をプールし、蒸発させ て、5.7g(57%)を得た。1H−NMR(CD3CN);δ,1から1.2 (m,12,CH3);2.4から2.7(2t,2,CH2CN);3.1から 3.3(m,2,C 2ODMT);3.5から4.0(m,11,OC 2CH2 CN,CCH32,OCH3,NCH2);4.1から4.4(m,2, NCH2);6.6から8.0(m,20,トリチル,ベンゾイル,C(5)− H,C(6)−H)。31P−NMR(CD3CN);δ,154.5および15 5.1。 実施例25 1−O−ジメトキシトリチルグリシドール グリシドール(4.4ml,67mmol)およびトリエチルアミン(19m l,136mmol)を無水ジクロロメタン120ml中で撹拌した。塩化ジメ トキシトリチル(22.7g,67mmol)を加え、混合物を室温で8時間撹 拌した。混合物を濾過し、濾液を蒸発させた。残渣をジクロロメタンに溶解し、 水、つづいてブラインで洗浄した。粗粒シリカゲルを加え、この物質を蒸発させ た。この物質をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。ヘキサン :酢酸エチル:トリエチルアミン(19/1/1,v/v/%)で溶出し、適当 な分画をプールし、蒸発させて、16.6g(65%)を得た。1H−NMR( DMSO−d6);δ,2.6から2.9(2t,2,環CH2);3.1から3 .2(m,1,CH);3.2から3.4(2m,2,CH2);3.7(s, 1,OCH3);6.8から7.4(3m,13,トリチル)。 実施例26 1−O−ジメトキシトリチル−4−フェニル−2−ブタノール 塩化ベンジルマグネシウム(55ml,2M溶液,110mmol)を−78 ℃に冷却し、THF(200ml)中のジリチウムテトラクロロ銅酸塩(11m l,0.1M溶液,12mmol)の溶液に−78℃で加えた。この混合物に、 THF(20ml)中の1−O−ジメトキシトリチルグリシドール(8.28g ,22mmol)を−78℃で加えた。混合物を室温で18時間撹拌した。混合 物を0℃に冷却し、濃塩化アンモニウム(10ml)をゆっくり加えた。混合物 を水で希釈し、酢酸エチルで抽出した。酢酸エチル抽出物を硫酸マグネシウムで 乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製 した。酢酸エチル:ヘキサン(1:9,v/v)で溶出し、適当な画分をプール し、濃縮して、1.37g(17%)を得た。1H−NMR(CDCl3);δ, 1.6から1.8(m,2,C65CH2);2.3から2.4(d,1,OH ,D2 Oと交換);2.5から2.8(m,2,C 2CHOH);3.0から3.2 (m,2,CH2ODMT);3.8(s,6,OCH3);6.8から7.5( m,18,トリチルおよびフェニル)。 実施例27 1−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)− 2−シアノエトキシホスファイト]−4−フェニルブタン 1−O−ジメトキシトリチル−4−フェニル−2−ブタノール(1.37g, 2.9mmol)およびジイソプロピルエチルアミン(1.5ml,8.6mm ol)をTHF(35ml)中で撹拌し、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N −ジイソプロピルアミノホスフィン(0.65ml,2.9mmol)を加えた 。混合物を室温で10時間撹拌し、濾過した。この物質をシリカ粗粒ゲル上に濃 縮し、乾燥した。この物質をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し た。酢酸エチル:ヘキサン:トリエチルアミン(1:9:1,v/v/%)で溶 出し、適当な画分をプールし、蒸発させて、0.94g(49%)を得た。1H −NMR(CDCl3);δ,1.0から1.3(m,12,CH3);1.8か ら2.1(m,2,C65 2);2.3から2.8(2m,4,CH2CN, C65CH2 2);3.0から3.3(2m,2,CH2ODMT);3.5 から3.9(m,10,C(CH32,POCH2,OCH3);3.9から4 .2(m,1,CH2)6.8から7.5(3m,18,フェニルおよびト リチル)。31P−NMR(CDCl3);δ,148.48および148.69 。 実施例28 1−ジメトキシトリチル−2−ウンデカノール 塩化オクチルマグネシウム(9.4ml,2M溶液,18.8mmol)を、 無水THF(15ml)中のジリチウムテトラクロロ銅酸塩(1.9ml,0. 1M溶液,0.11mmol)の溶液に−78℃において加えた。1−O−ジメ トキシトリチルグリシドールを加え、混合物を室温まで暖まらせ、2時間撹拌し た。混合物を0℃に冷却し、飽和塩化アンモニウムを加えた。水を加え、混合物 を酢酸エチルで抽出した。酢酸エチル抽出物を合わせ、硫酸マグネシウムで乾燥 した。この物質を濾過し、濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィ ーにより精製した。酢酸エチル/ヘキサン/トリエチルアミン(5/95/1, v/v/%)で溶出し、適当な画分をプールし、蒸発させて、1.1g(60% )を得た。1H−NMR(CDCl3);δ,0.8から0.9(t,3,CH3 );1.2から1.4(m,16,(CH27CH2);2.3から2.4(d ,1,OH,D2Oと交換);3.0から3.2(m,2,CH2ODMT);3 .7から3.9(s,7,OCH3,COH);6.8から7.5(m,14 ,DMT)。 実施例29 1−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2− シアノエトキシホスファイト]ウンデカン THF(50ml)中のHPLC精製1−ジメトキシトリチル−2−ウンデカ ノール(1.06g,2.2mmol)、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N −ジイソプロピルアミノホスフィン(0.5ml,2.2mmol)およびトリ エチルアミン(1.0ml,5.7mmol)の混合物を室温で20時間撹拌し た。混合物を濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。酢 酸エチル/ヘキサン/トリエチルアミン(1/9/1,v/v/%)で溶出し、 適当な画分をプールし、蒸発させて、表題化合物を得た。 実施例30 フルオレニルコハク酸半エステル ジクロロメタン(25ml)中の9−フルオレニルメタノール(3.92g, 20mmol)、無水コハク酸(2.20g,22mmol),および4−ジメ チルアミノピリジン(0.25g,2mmol)の溶液に、トリエチルアミン( 3ml)を加えた。混合物を室温で4時間撹拌した。反応液をジクロロメタン( 50ml)で希釈し、飽和炭酸水素ナトリウムで抽出した(3×50ml)。合 わせた抽出物を酢酸エチルで逆抽出した。得られた炭酸水素ナトリウム溶液を 3N HClで酸性とし、冷蔵した。溶液から析出物が沈殿し、乾燥後、表題化 合物3.05g(56%)を得た。 実施例31 フルオレニル−[N−(アミノ−2,3−プロパンジオール)]スクシンイミド 半エステル DMF(50ml)中のフルオレニルコハク酸半エステル(3.05g,11 .24mmol)の懸濁液に、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(2.28g ,16.86mmol)および1−(3−ジメチルアミノプロピル)−3−エチ ルカルボジイミド−HCl(3.23g,16.84mmol)を順番に加えた 。混合物を室温で2時間撹拌し、カニューレを通して1−アミノ−2,3−プロ パンジオール(1.02g,11.24mmol)を含むフラスコに移した。反 応液を室温で3時間撹拌した。混合物を濃縮し、酢酸エチル(100ml)と水 (50ml)との間に分配した。層を分離し、水性層を酢酸エチル(3×50m l)で抽出した。酢酸エチル抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し 、濃縮した。1H−NMR:(CDCl3,200MHz);δ,7.8−7.2 6(8H,m,ArH),4.43(2H,d,J=6.5Hz,CHC 2O CO),4.23(1H,t,J=6.5Hz,CCH2OCO),2.70 (4H,s,OCOC 2 2COO)。 実施例32 フルオレニル−[N−(1−アミノ−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパ ノール)スクシンイミド]半エステル ピリジン(20ml)中のフルオレニル−[N−(2,3−プロパンジオール )]スクシンイミド半エステル(0.74g,2.0mmol)の溶液を塩化4 ,4’−ジメトキシトリチル(0.68g,2.0mmol)で処理した。混合 物を室温で一夜撹拌した。精製物の薄層クロマトグラフィー(TLC)分析は、 より高い移動スポットに完全に変換したことを示した。これはメタノール中10 %硫酸でスプレーして加熱したときに特徴的な赤色を与える。 実施例33 フルオレニル−N−{3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイ ソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン}スクシンイ ミドエステル 表題ホスホルアミダイトは、フルオレニル−[N−(3−O−ジメトキシトリ チル−2−プロパノール)]スクシンイミド半エステルから、実施例27の方法 を用いて製造した。 実施例34 1−[(N−ベンゾイル)アミノ]−2,3−プロパンジオール R−(+)−グリシドール(10ml,0.15mol)およびアンモニアで 飽和したイソプロピルアルコール(70ml)をボンベ中に密封し、室温で5日 間撹拌した。ボンベを冷却し、開封した。溶液を蒸発させ、残渣をピリジン(1 00ml)に溶解した。この溶液を塩化ベンゾイル(47ml,0.4mol) で30分間処理し、濾過した。濾液を蒸発させ、メタノール(400ml)に溶 解し、次に水酸化アンモニウム(100ml)で処理した。混合物を4時間撹拌 し、蒸発させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製した。 酢酸エチル:メタノール(19/1,v/v)で溶出し、適当な画分をプールし 、蒸発させて、9.9g(34%)を得た。1H−NMR(DMSO−d6);δ ,3.1から3.5(m,4,C 2CHOHC 2OH);3.6から3.7( m,1,COH);4.6から4.7(t,1,CH2,D2Oと交換); 4.8から4.9(d,1,CHO,D2Oと交換);7.4から7.6およ び7.8から7.9(m,5,ベンゾイル);8.4から8.5(t,1,NH )。 実施例35 1−[(N−ベンゾイル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[ (N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパ ン 1−[(N−ベンゾイル)アミノ]−2,3−プロパンジオールを、実施例5 の方法にしたがってピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して、1−[( N−ベンゾイル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを 得た。得られた1−[(N−ベンゾイル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチ ル−2−プロパノールを、さらに実施例6にしたがってクロロ−β−シアノエト キシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して、表題化 合物を得た。 実施例36 1−(1−ピロール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジ イソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン ピロールを、実施例4にしたがって炭酸カリウムの存在下でグリシドールで処 理して、1−(1H−ピロール)−2,3−プロパンジオールを得た。得られた 1−(1−ピロール)−2,3−プロパンジオールを、さらに実施例5の方法に したがってピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して、1−(1−ピロ− ル)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得た。得られた1−( 1−ピロール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを、さらに実 施例6にしたがってクロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミ ノホスフィンでホスフィチル化して、表題化合物を得た。 実施例37 1−(10−フェノキサジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N ,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン フェノキサジンを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシド ールで処理して1−(1−フェノキサジン)−2,3−プロパンジオールを得る 。得られた1−(1−フェノキサジン)−2,3−プロパンジオールを、実施例 5の手順に従い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(1−フ ェノキサジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。得ら れた1−(1−フェノキサジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノ ールを、実施例6の手順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソ プロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例38 1−(1−ピラゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N− ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン ピラゾールを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシドール で処理して1−(1−ピラゾール)−2,3−プロパンジオールを得る。得られ た1−(1−ピラゾール)−2,3−プロパンジオールを、実施例5の手順に従 い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(1−ピラゾール)− 3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。得られた1−(1−ピ ラゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを、実施例6の手 順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフ ィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例39 1−(1−インドール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N− ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン インドールを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシドール で処理して1−(1−インドール)−2,3−プロパンジオールを得る。得られ た1−(1−インドール)−2,3−プロパンジオールを、実施例5の手順に従 い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(1−インドール)− 3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。得られた1−(1−イ ンドール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを、実施例6の手 順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフ ィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例40 1−(1−インダゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N −ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 1H−インダゾールを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリ シドールで処理して1−(1H−インダゾール)−2,3−プロパンジオールを 得る。得られた1−(1H−インダゾール)−2,3−プロパンジオールを、実 施例5の手順に従い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(1 −インダゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。得 られた1−(1−インダゾール)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノ ールを、実施例6の手順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソ プロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例41 1−(9−プリン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイ ソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン プリンを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシドールで処 理して1−(9−プリン)−2,3−プロパンジオールを得る。得られた1−( 9−プリン)−2,3−プロパンジオールを、実施例5の手順に従い、ピリジン 中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(9−プリン)−3−O−ジメトキ シトリチル−2−プロパノールを得る。得られた1−(9−プリン)−3−O− ジメトキシトリチル−2−プロパノールを、実施例6の手順に従い、クロロ−β −シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル 化して表題化合物を得る。 実施例42 1−(10−フェノチアジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N ,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン フェノチアジンを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシド ールで処理して1−(10−フェノチアジン)−2,3−プロパンジオールを得 る。得られた1−(10−フェノチアジン)−2,3−プロパンジオールを、実 施例5の手順に従い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(1 0−フェノチアジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る 。得られた1−(10−フェノチアジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2− プロパノールを、実施例6の手順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N −ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例43 1−(9−β−カルボリン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N, N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン β−カルボリンを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシド ールで処理して1−(9−β−カルボリン)−2,3−プロパンジオールを得る 。得られた1−(9−β−カルボリン)−2,3−プロパンジオールを、実施例 5の手順に従い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(9−β −カルボリン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。得ら れた1−(9−β−カルボリン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノ ールを、実施例6の手順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソ プロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例44 1−(10−フェノチアジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N ,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン フェノチアジンを、実施例4の手順に従い、炭酸カリウムの存在下、グリシド ールで処理して1−(10−フェノチアジン)−2,3−プロパンジオールを得 る。得られた1−(10−フェノチアジン)−2,3−プロパンジオールを、実 施例5の手順に従い、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(1 0−フェノチアジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る 。得られた1−(10−フェノチアジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2− プロパノールを、実施例6の手順に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N −ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例45 1−[1−(5−プロピニル)ウラシル−3−O−ジメトキシトリチル−2−O −[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プ ロパン 5−プロピニルウラシルを、実施例9の手順のように、炭酸カリウムの存在下 、グリシドールで処理して1−[1−(5−プロピニル)ウラシル]−2,3− プロパンジオールを得る。得られた1−[1−(5−プロピニル)ウラシル]− 2,3−プロパンジオールを、実施例10のように、ピリジン中の塩化ジメトキ シトリチルで処理して1−[1−(5−プロピニル)ウラシル]−3−O−ジメ トキシトリチル−2−プロパノールを得る。得られた1−[1−(5−プロピニ ル)ウラシル]−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを、実施例1 1に従って、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホス フィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例46 1−[1−(6−アザ)チミン]−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[( N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 6−アザチミンを、実施例1の手順のように、炭酸カリウムの存在下、グリシ ドールで処理して1−[1−(6−アザ)チミン]−2,3−プロパンジオール を得る。得られた1−[1−(6−アザ)チミン]−2,3−プロパンジオール を、実施例2のように、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−[ 1−(6−アザ)チミン]−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを 得る。得られた1−[1−(6−アザ)チミン]−3−O−ジメトキシトリチル −2−プロパノールを、実施例3に従って、クロロ−β−シアノエトキシ−N, N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例47 1−(9−ヒポキサンチン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N, N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン ヒポキサンチンを、実施例1の手順のように、炭酸カリウムの存在下、グリシ ドールで処理して1−(ヒポキサンチン−9−イル)−2,3−プロパンジオー ルを得る。得られた1−(9−ヒポキサンチン)−2,3−プロパンジオールを 、実施例2のように、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−(9 −ヒポキサンチン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。 得られた1−(9−ヒポキサンチン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロ パノールを、実施例3に従って、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソ プロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例48 1−[9−(2,6−ジアミノ)プリン]−3−O−ジメトキシトリチル−2− O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト] プロパン 2,6−ジアミノプリンを、実施例16の手順のように、炭酸カリウムの存在 下、グリシドールで処理して1−[9−(2,6−ジアミノ)プリン]−2,3 −プロパンジオールを得る。得られた1−[9−(2,6−ジアミノ)プリン] −2,3−プロパンジオールを、実施例18のように、クロロトリメチルシラン および塩化イソブチリルで処理して1−[9−(N2,N6−ジイソブチリル− 2,6−ジアミノ)プリン]−2,3−プロパンジオールを得る。得られた1− [9−(N2,N6−ジイソブチリル−2,6−ジアミノ)プリン]−2,3− プロパンジオールを、実施例19のように、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチ ルで処理して1−[9−(N2,N6−ジイソブチリル−2,6−ジアミノ)プ リン]−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを得る。次に、得られ た1−[9−(N2,N6−ジイソブチリル−2,6−ジアミノ)プリン]−3 −O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールを、実施例24に従って、クロロ −β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチ ル化して表題化合物を得る。 実施例49 1−[9−(7−メチルグアニン)]−3−O−ジメトキシトリチル−2−O− [(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロ パン 7−メチルグアニンを、実施例16の手順のように、炭酸カリウムの存在下、 グリシドールで処理して1−[9−(7−メチルグアニン)]−2,3−プロパ ンジオールを得る。得られた1−[9−(7−メチルグアニン)]−2,3−プ ロパンジオールを、実施例18のように、クロロトリメチルシランおよび塩化イ ソブチリルで処理して1−[9−(N2−ジイソブチリル)−(7−メチルグア ニン)]−2,3−プロパンジオールを得る。得られた1−[9−(N2−ジイ ソブチリル)−(7−メチルグアニン)]−2,3−プロパンジオールを、実施 例19のように、ピリジン中の塩化ジメトキシトリチルで処理して1−[9−( N2−ジイソブチリル)−(7−メチルグアニン)]−3−O−ジメトキシトリ チル−2−プロパノールを得る。次に、得られた1−[9−(N2−ジイソブチ リル)−(7−メチルグアニン)]−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパ ノールを、実施例20に従って、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソ プロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例50 N−(α−Fmoc)−N’−(アミノ−2,3−プロパンジオール)グリシン アミド N−α−Fmoc−グリシン−ペンタフルオロフェニルエステル(4.0g、 8.6mmol)を含む乾燥ジメチルフォルムアミドの溶液を、アルゴン雰囲気下、 1−アミノ−2,3−プロパンジオール(0.78g、8.6mmol)で処理した 。混合物を室温で6時間撹拌し、溶媒を減圧下で蒸発させた。得られたシロップ を一晩真空下に保ち、次に、40mlの熱酢酸エチルに溶解した。熱溶液を濾過 し、濾液を−20℃に冷却し、氷の中に一晩保った。結晶化した物質を濾過し、 冷酢酸エチルで洗浄し、濾液をできるだけ少ない体積に蒸発させた。この温度で の第2のインキュベーションで結晶の第2の回収物を得た。得られた白色結晶は 2.2g(69%)である。1H NMR(ジメチルスルホキシド−d6):8. 0−7.2(m,8,芳香族);5.0−4.5(m,4,N−HおよびOH, D2Oで交換可能);4.3(m,3,Fmoc);3.7(m,2,グリシン );3.5−3.0(m,5,プロパン)。 実施例51 N−(α−Fmoc)−N’−{3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N ,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]アミノプロ パン}グリシンアミド N−(α−Fmoc)−N’−(アミノ−2,3−プロパンジオール)グリシ ンアミド(2.0mmol)を含むピリジン(20ml)の溶液を、実施例32の手 順に従い、塩化4,4’−ジメトキシトリチル(0.68g、2.0mmol)で処 理する。混合物を一晩室温で撹拌して、N−(α−Fmoc)−N’−(1−ア ミノ−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール)グリシンアミドを得、 これをシリカゲルクロマトグラフィーによって単離する。得られたN−(α−F moc)−N’−(1−アミノ−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノー ル)グリシンアミドを実施例27の手順に従って処理して表題化合物を得る。 実施例52 1−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2− シアノエトキシホスファイト]ヘプタデカン 臭化ドデシルをエチルエーテル中の金属マグネシウムと反応させて、臭化ドデ シルマグネシウムを得る。臭化ドデシルマグネシウムを、テトラクロロ銅酸ジリ チウムの存在下、THF中の1−O−ジメトキシトリチルグリシドール(実施例 25参照)と反応させて1−ジメトキシトリチル−2−ヘプタデカノールを得る 。得られた1−ジメトキシトリチル−2−ヘプタデカノールを、THF中のジイ ソプロピルエチルアミンの存在下、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイ ソプロピルアミノホスフィンと反応させて表題化合物を得る。 実施例53 1−アミノ−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール 1−O−ジメトキシトリチルグリシドール(実施例25から、10ml、0. 15mol)およびアンモニアで飽和したイソプロピルアルコール(70ml)を ボンベに密閉し、室温で5日間撹拌した。ボンベを冷却し、開き、溶液を蒸発さ せて粗生成物を得る。 実施例54 1−[(N−パルミトイル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル−2 −O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト ]プロパン 1−アミノ−3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノール(実施例53か ら)を5mlの乾燥ピリジンに溶解し、クロロトリメチルシラン(0.227m l、194mg、1.79mmol)を加え、1時間撹拌した。パルミチン酸(35 9mg、1.40mmol)、ヒドロキシベンゾチアゾール(209mg、1.55 mmol)およびジメチルアミノプロピルエチルカルボジイミド(EDC)(281 mg、1.80mmol)を5mlのDMFに溶解し(必要ならば、5mlのCH2 Cl2補助溶媒を加える)、1時間撹拌する。次に、この溶液を粗1−アミノ− 3−O−ジメトキシトリチル−2−プロパノールのピリジン溶液に加え、出発物 質が完全になくなるまで溶液を撹拌する。5mlの飽和NaHCO3を加えるこ とによって反応を停止し、15分後に溶液を水(100ml)で希釈し、酢酸エ チル(2×75ml)で抽出し、NaHCO3、ブラインで洗浄し、乾燥、蒸発 させる。残留物をシリカゲルクロマトグラフィーで精製して1−[(N1−パル ミトイル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル−2−プロパンジオー ルを得る。得られた1−[(N1−パルミトイル)アミノ]−3−O−ジメトキ シトリチルメチル−2−プロパンジオールをクロロ−β−シアノエトキシ−N, N−ジイソプロピルアミノホスフィンで実施例20に従ってホスフィチル化して 表題化合物を得る。 実施例55 1−[(N−イソブチロイル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル− 2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイ ト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従って、イソ酪酸をカルボン酸成分として用 いることによって製造する。 実施例56 1−[(N−フェニルアセチル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル −2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファ イト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従って、フェニル酢酸をカルボン酸成分とし て用いることによって製造する。 実施例57 グルタル酸モノフルオレニルメチルエステル フルオレニルメタノール(0.90g、4.5mmol)およびジメチルアミノピ リジン(50mg)を10mlの乾燥ピリジンに溶解する。無水グルタル酸(5 .0mmol)を加え、溶液を一晩撹拌する。溶媒を減圧下で除去し、炭酸水素ナト リウム(50ml)を加え、溶液を酢酸エチル(50ml)で抽出し、有機層を 廃 棄する。水性層はpH2の酸性にし、酢酸エチル(2×100ml)で抽出し、 ブラインで洗浄し、溶媒を減圧下で除去する。残留物をフラッシュクロマトグラ フィーで精製して生成物を得る。 実施例58 1−[(N−フルオレニルメチルグルタロイル)アミノ]−3−O−ジメトキシ トリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエ トキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い、グルタル酸モノフルオレニルメチルエ ステル(実施例57)をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例59 2−(1−チミン)酢酸 ブロモ酢酸メチル(25.5g、15.2ml、160mmol)を、K2CO3( 44.2g、320mmol)およびチミジン(20.2g、160mmol)を500 mlの乾燥DMFに懸濁させた懸濁液に加え、一晩撹拌した。懸濁液を濾過し、 溶媒を減圧下で除去した。残留物を120mlのH2Oおよび30mlの4N HClに懸濁させ、30分間撹拌し、再び濾過した。固体を250mlのH2O に懸濁させ、これに100mlの2.5M NaOHを加えた。溶液を加熱して 沸騰させ、冷却し、濃HClでpH1の酸性にした。沈殿物を真空中で乾燥して 、13.6g(73.6mmol、46%)の純粋な生成物を得た。1H NMR: (DMSO−d6、200MHz)δ7.48(s,1H,H6),4.37( s,2H,CH2)、1.76(s,3H,CH3)。 実施例60 1−{N−[2−(1−チミジン)アセチル]アミノ}−3−O−ジメトキシト リチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエト キシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,チミジン−2−酢酸をカルボン酸成分 として用いて製造する。 実施例61 N−Fmoc−3−アミノプロピオン酸 炭酸水素ナトリウム(2.52g、30mmol)および3−アミノプロピオン酸 (1.00g、11.2mmol)を50mlの水に溶解し、50mlのジオキサン を加えた。クロロギ酸フルオレニルメチル(3.10g、12.0mmol)を含む 50mlのジオキサンの溶液を撹拌しながら滴加した。6時間後、溶液を水(1 00ml)および飽和炭酸塩溶液(50ml)で希釈し、ジエチルエーテルで1 回抽出し、水性層を濃HClでpH2の酸性にした。曇った溶液を酢酸エチル( 2×100ml)で抽出し、ブラインで洗浄し、MgSO4で乾燥した。蒸発さ せた後、表題生成物およびペプチド2量体の混合物を得た。純粋な生成物はフラ ッシュクロマトグラフィーによって得た。1H NMR:(CDCl3、200M Hz)δ7.95−7.26(8H,m,ArH),7.40−7.15(3H ,m,C 2O),3.20(2H,t,J=8Hz,C 2N),2.40 (2H,t,J=8Hz,HOOCC 2)。 実施例62 1−[N−(N−Fmoc−3−アミノプロピオノイル)アミノ]−3−O−ジ メトキシトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2− シアノエトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,N−Fmoc−3−アミノプロピオン 酸をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例63 2−(N−イミダゾリル)酢酸 イミダゾール(3.7g、54mmol)を、水素化ナトリウム(油中の60%懸 濁液2.6g、60mmol)を50mlの乾燥THFに懸濁させた懸濁液に加えた 。次に、ブロモ酢酸(3.4g、24mmol)を加え、混合物を一晩撹拌した。次 に、 水(1ml)を加え、溶媒を減圧下で除去した。残留物を水(50ml、pH> 10)に取り、エーテルで抽出し、有機層を廃棄した。水性層を濃HClでpH 1の酸性にし、再びエーテルで抽出した。水性層を蒸発させて乾燥した。油状残 留物を無水エタノール(EtOH)に溶解して、NaClを沈殿させ、アセトン /メタノールから再結晶して、1.22g(7.5mmol、30%)の純粋な生成 物を塩酸塩として得た。1H NMR:(DMSO−d6、200MHz)δ9. 20(s,H2),7.76(d,J=1.5Hz),7.69(d,J=1. 5Hz),5.20(s,CH2)。0 実施例64 1−{N−[2−(N−イミダゾリル)アセチル]アミノ}−3−O−ジメトキ シトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノ エトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,N−イミダゾリル−2−酢酸をカルボ ン酸成分として用いて製造する。 実施例65 2−(9−アデニン)酢酸エチルエステル 水素化ナトリウム(油中60%8.20g、205mmol)を、アデニン(25 .0、185mmol)を500mlのDMFに懸濁させた懸濁液に加えた。激しい 機械撹拌を2時間行った後、H2の発生は止み、粘稠なスラリーが得られた。ブ ロモ酢酸エチル(55.6g、36.9ml、333mmol)を3時間にわたって 滴加し、さらに1時間撹拌を続けた。水(10ml)およびH2SO4を加えてp H4にした。溶媒を蒸発させ、残留物を500mlのH2Oに懸濁させ、濾過し 、水で洗浄した。残留物を400mlのエタノールから再結晶して、23.8g (108mmol、58%)の純粋な生成物を得た。 実施例66 2−[9−(N2−ベンゾイル)アデニン]酢酸 2−(9−アデニン)酢酸エチルエステル(6.06g、27.4mmol)を懸 濁させた250mlの乾燥ピリジンに、塩化ベンゾイル(9.60ml、11. 6g、82mmol)を加え、溶液を4時間、室温で撹拌した。メタノール(25m l)を加え、溶媒を蒸発させた。残留物を酢酸エチル(2×250ml)に溶解 し、0.1N HCl、飽和NaHCO3、ブラインで洗浄し、Na2SO4で乾 燥した。有機抽出物を蒸発させ、固体残留物を0℃の250mlのTHFに再溶 解し、これに100mlの1M NaOHを加えた。溶液を0℃で1時間撹拌し 、濃HClでpH1の酸性にし、水性部分をエーテルで1回抽出した。ほとんど ただちに結晶化し始める生成物を濾過によって集め、4.96g(61%)を得 た。1H NMR:(DMSO−d6、200MHz)δ8.86、8.84(d ,H2,H8)、8.1(d,2H,J=7.0Hz,ArH),7.69−7 .58(m,3H,Ar−H),5.22(s,2H,CH2)。 実施例67 1−{{N−{2−[9−(N2−ベンゾイル)アデニン]アセチル}アミノ} }−3−O−ジメトキシトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピル アミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,2−[9−(N2−ベンゾイル)アデ ニン]酢酸をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例68 2−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]酢酸 シトシン0.5水和物(12.0g、100mmol)をピリジンとの同時蒸発に よって乾燥し、乾燥ピリジン(250ml)に再溶解し、塩化ベンゾイル(70 .3g、500mmol)を冷却しながら滴加した。溶液を一晩撹拌し、水を加え、 そして溶媒を真空中で除去した。残留物を、55gのNaOHを含有する700 mlのH2Oに溶解した。完全に溶解したら、撹拌を1時間続けた。次に、溶液 をpH4の酸性にし、白色沈殿物を集め、1リットルのエタノール中で沸騰させ 、再び濾過して16.1gのベンゾイルシトシンを得た。この15gを、9.7 g (70mmol)のK2CO3およびブロモ酢酸メチル(10.7g、70mmol)を含 む500mlのDMFに懸濁させた。懸濁液を3日間撹拌し、濾過し、溶媒を除 去した。水(100ml)および10mlの4N HClを加えた。懸濁液を1 5分間撹拌し、濾過した。固体を、4.8gのNaOHを含有する200mlの H2Oに再懸濁させた。全ての固体が溶解するまで、懸濁液を45分撹拌した。 次に、溶液をpH2の酸性にし、固体を濾過によって集め、乾燥して10.6g (43%)の生成物を得た。生成物はNMRで確認した。 実施例69 1−{{N−{2−[1−(N4−ベンゾイル)シトシン]アセチル}アミノ} }−3−O−ジメトキシトリチルメチル−1−アミノ−2−O−[(N,N−ジ イソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,2−[1−(N4−ベンゾイル)シト シン]酢酸をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例70 2−[9−(N2−イソプチロイル)グアニン]酢酸 2−アミノ−6−クロロプリン(10mmol)およびK2CO3(15mmol)を懸 濁させたDMF(25ml)の懸濁液に、ブロモ酢酸エチル(10mmol)を加え る。混合物を24時間激しく撹拌し、濾過し、溶媒を蒸発させる。残留物を25 mlのピリジンに再懸濁させ、塩化イソブチロイル(20mmol)を加える。18 時間撹拌した後、水を加え、溶媒を除去する。残留物を1NのHClに懸濁させ て、1時間還流加熱する。次に、懸濁液を0℃に冷却し、NaOHを加えてpH 12にし、懸濁液を1時間撹拌する。溶液をpH3の酸性にし、生成物を濾過に よって集める。 実施例71 1−{{N−{2−[9−(N2−イソブチロイル)グアニン]アセチル}アミ ノ}}−3−O−ジメトキシトリチルメチル−1−アミノ−2−O−[(N,N −ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,2−[9−(N2−イソブチロイル) グアニン]酢酸をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例72 3,6,9,12−テトラオキサトリデカン酸ベンジル トリエチレングリコールモノメチルエーテル(10mmol)およびブロモ酢酸ベ ンジル(11mmol)を、無水K2CO3(15mmol)を懸濁させた50mlの無水 DMFの懸濁液に加える。懸濁液を室温で一晩撹拌する。水を加え、そしてエマ ルジョンを酢酸エチル(3×200ml)で抽出し、水、ブラインで洗浄し、M gSO4で乾燥する。溶媒を蒸発させ、残留油をフラッシュクロマトグラフィー で精製して表題化合物を得る。 実施例73 3,6,9,12−テトラオキサトリデカン酸 3,6,9,12−テトラオキサトリデカン酸ベンジル(5mmol)をメタノー ル(50ml)に溶解し、10%パラジウム担持炭素(100mg触媒/mmol) を加える。出発物質がなくなるまで、懸濁液を30psiのH2下で振盪する。 懸濁液をセライトの短いパッドに通して濾過し、メタノールで十分に洗浄し、溶 媒を蒸発させる。生成物は精製することなく、直接使用する。 実施例74 1−[N−(3,6,9,12−テトラオキサトリデカノイル)アミノ]−3− O−ジメトキシトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ) −2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,3,6,9,12−テトラオキサトリ デカン酸をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例75 ビス−[(2−ピリジル)−2−エチル]アミノ酢酸ベンジル K2CO3(15mmol)を懸濁させた25mlのDMFの懸濁液に、2,2’− ビス(2−ピリジルエチル)アミン(10mmol)、次いでブロモ酢酸ベンジル( 12mmol)を加えた。懸濁液を4時間室温で撹拌した。次に、水を加え、懸濁液 を酢酸エチル(2×100ml)で抽出し、5%Na2CO3、水、ブラインで洗 浄し、MgSO4で乾燥し、溶媒を除去した。生成物は油として定量的収量で得 られた。生成物はNMRで確認した。 実施例76 ビス−(2−(2−ピリジル)エチル)アミノ酢酸 ビス−[(2−ピリジル)−2−エチル]アミノ酢酸ベンジル(5mmol)をメ タノール(50ml)に溶解し、10%パラジウム担持炭素(10mg触媒/mm ol)を加える。出発物質がなくなるまで、懸濁液を30psiのH2下で振盪す る。懸濁液をセライトの短いパッドに通して濾過し、メタノールで十分に洗浄し 、溶媒を蒸発させる。生成物は精製することなく、直接使用する。 実施例77 1−{{N−{ビス−[2−(2−ピリジル)エチル]アミノアセチル}アミノ }}−3−O−ジメトキシトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピ ルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン この化合物は実施例54の手順に従い,ビス−(2−(2−ピリジル)エチル )アミノ酢酸をカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例78 1−[N−(トルエンスルホニル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチ ル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスフ ァイト]プロパン クロロトリメチルシラン(6.0mmol)を、1−アミノ−3−O−ジメトキシ トリチル−2−プロパノール(5.0mmol)を含む25mlの乾燥ピリジンの溶 液に滴加する。1時間撹拌した後、塩化トルエンスルホニル(6.0mmol)を分 けて加え、撹拌を2時間続ける。反応を飽和水性NaHCO3で急冷し、シリル エーテルが加水分解するまで、混合物を撹拌する。溶媒を真空中で除去し、残留 物を水と酢酸エチルとの間で分配する。有機層をNaHCO3、水、ブラインで 洗浄し、Na2SO4乾燥する。溶媒を除去し、得られた油を、CHCl3中のメ タノールの勾配を用いて、フラッシュクロマトグラフィーにより精製する。得ら れる1−[N−(トルエンスルホニル)アミノ}−3−O−ジメトキシトリチル メチル−2−プロパノールを、実施例20に従って、クロロ−β−シアノエトキ シ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物 を得る。 実施例79 1−[N−(トリフルオロメタンスルホニル)アミノ]−3−O−ジメトキシト リチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエト キシホスファイト]プロパン クロロトリメチルシラン(6.0mmol)を、1−アミノ−3−O−ジメトキシ トリチル−2−プロパノール(5.0mmol)およびトリエチルアミン(15mmol )を含む50mlの乾燥CH2Cl2の溶液に滴加する。1時間後、溶液を−78 ℃に冷却し、無水トリフルオロメタンスルホン酸(5.5mmol)を滴加する。冷 却浴を取り除き、混合物を室温に温める。粗生成物をピリジンに溶解し、NaH CO3溶液を加えて、TMSエーテルを加水分解する。溶媒を蒸発させ、残留物 を酢酸エチルと水との間で分配し、NaHCO3、ブラインで洗浄し、MgSO4 で乾燥する。残留物を、CHCl3中のメタノールの勾配を用いて、フラッシュ クロマトグラフィーにより精製する。得られる1−[N−(トリフルオロメタン スルホニル)アミノ}−3−O−ジメトキシトリチルメチル−1−アミノ−2− プロパノールを、実施例20に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジ イソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る。 実施例80 1−[N−(ベンジル)アミノ}−3−O−ジメトキシトリチルメチル−2−O −[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プ ロパン クロロトリメチルシラン(6.0mmol)を、1−アミノ−3−O−ジメトキシ トリチル−2−プロパノール(5.0mmol)、イミダゾール(5mmol)およびト リエチルアミン(15mmol)を含む25mlの乾燥DMFの溶液に滴加する。1 時間撹拌した後、溶媒を真空中で除去し、残留物をアセトニトリル(25ml) およびトリエチルアミン(10mmol)に再溶解する。臭化ベンジル(6.0mmol )を加え、撹拌を一晩続ける。反応を飽和水性NaHCO3で急冷し、シリルエ ーテルが加水分解するまで、混合物を撹拌する。溶媒を真空中で除去し、残留物 を水と酢酸エチルとの間で分配する。有機層をNaHCO3、水、ブラインで洗 浄し、Na2SO4で乾燥する。溶媒を除去し、得られる残留油を、CHCl3中 のメタノールの勾配を用いて、フラッシュクロマトグラフィーにより精製する。 得られる1−[N−(ベンジル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル −1−アミノ−2−プロパノールを、実施例20に従い、クロロ−β−シアノエ トキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化 合物を得る。 実施例81 1−[N−(アミノカルボニル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル −2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファ イト]プロパン クロロトリメチルシラン(6.0mmol)を、1−アミノ−3−O−ジメトキシ トリチル−2−プロパノール(5.0mmol)およびトリエチルアミン(15mmol )を含む50mlの乾燥CH2Cl2の溶液に滴加する。1時間後、ジメチルアミ ノピリジン(1mmol)、次いでトリメチルシリルイソシアネート(5.5mmol) を加える。出発物質がなくなるまで、溶液を撹拌する。溶媒を真空中で除去し、 粗生成物をピリジンおよびNaHCO3溶液に再溶解して、TMSエーテルを加 水分解する。溶媒を蒸発させ、残留物を酢酸エチルと水との間で分配し、NaH C O3、ブラインで洗浄し、MgSO4で乾燥する。残留物を、CHCl3中のメタ ノールの勾配を用いて、フラッシュクロマトグラフィーにより精製する。得られ る1−[N−(アミノカルボニル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチ ル−2−プロパノールを、実施例20に従い、クロロ−β−シアノエトキシ−N ,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題化合物を得る 。 実施例82 1−[N−(メチルアミノチオカルボニル)アミノ]−3−O−ジメトキシトリ チルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキ シホスファイト]プロパン クロロトリメチルシラン(6.0mmol)を、1−アミノ−3−O−ジメトキシ トリチル−2−プロパノール(5.0mmol)およびトリエチルアミン(15mmol )を含む50mlの乾燥CH2Cl2の溶液に滴加する。1時間後、ジメチルアミ ノピリジン(1mmol)、次いでメチルイソチオシアネート(5.5mmol)を加え る。出発物質がなくなるまで、溶液を撹拌する。溶媒を真空中で除去し、そして 粗生成物をピリジンおよびNaHCO3溶液に再溶解して、TMSエーテルを加 水分解する。溶媒を蒸発させ、残留物を酢酸エチルと水との間で分配し、NaH CO3、ブラインで洗浄し、MgSO4で乾燥する。残留物を、CHCl3中のメ タノールの勾配を用いて、フラッシュクロマトグラフィーにより精製する。得ら れる1−[N−(メチルアミノチオカルボニル)アミノ]−3−O−ジメトキシ トリチルメチル−2−プロパノールを、実施例20に従い、クロロ−β−シアノ エトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンでホスフィチル化して表題 化合物を得る。 実施例83 N−α−(FMOC)−グルタミン酸γ−ベンジルエステル グルタミン酸γ−ベンジル(10mmol)を含む50mlのジオキサンおよび5 0mlの水の溶液に、トリエチルアミン(25mmol)、次いでクロロギ酸フルオ レニルメチル(11mmol)を含む50mlのジオキサンの溶液を加える。出発物 質がなくなるまで、混合物を激しく撹拌する。溶液を濃HClでpH2の酸性に し、酢酸エチル(2×250ml)で抽出し、ブラインで洗浄し、MgSO4で 乾燥し、蒸発させる。生成物は精製することなく使用する。 実施例84 N−α−(FMOC)−γ−ベンジル−L−グルタミン酸フルオレニルメチルエ ステル N−α−(FMOC)−グルタミン酸γ−ベンジルエステル(5mmol)、フル オレニルメタノール(5.5mmol)およびジメチルアミノピリジン(0.5mmol )を、50mlのCH2Cl2に溶解する。ジメチルアミノプロピルエチルカルボ ジイミド(EDC)6.0mmol)を加え、溶液を室温で撹拌する。出発物質が完 全になくなった後、溶液をCH2Cl2で希釈し、1%HCl、水およびブライン で洗浄し、MgSO4で乾燥し、蒸発させる。残留物は酢酸エチルおよびヘキサ ンを溶離剤として用いるフラッシュクロマトグラフィーによって精製する。 実施例85 N−α−(FMOC)−L−グルタミン酸α−フルオレニルメチルエステル N−α−(FMOC)−γ−ベンジル−L−グルタミン酸フルオレニルメチル エステル(5mmol)を、メタノール(50ml)に溶解し、10%パラジウム担 持炭素(100mg触媒/mmol)を加える。出発物質がなくなるまで、懸濁液を 30psiのH2下で振盪する。懸濁液をセライトの短いパッドに通して濾過し 、メタノールで十分に洗浄し、溶媒を蒸発させる。生成物は精製することなく、 直接使用する。 実施例86 1−[N−(N−α−Fmoc−α−フルオレニルメチル−γ−グルタミル)ア ミノ]−3−O−ジメトキシトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロ ピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,N−α−(FMOC)−L−グルタミ ン酸α−フルオレニルメチルエステルをカルボン酸成分として用いて製造する。 実施例87 2−(N−カルバゾリル)酢酸 表題化合物は実施例63の手順に従い,カルバゾールを出発複素環として用い て製造する。 実施例88 1−{N−[2−(N−カルバゾリル)アセチル]アミノ}−3−O−ジメトキ シトリチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノ エトキシホスファイト]プロパン 表題化合物は実施例54の手順に従い,N−カルバゾリル−2−酢酸をカルボ ン酸成分として用いて製造する。 実施例89 N−ピロリル−2−酢酸 表題化合物は実施例63の手順に従い,ピロールを出発複素環として用いて製 造する。 実施例90 1−{N−[2−(N−ピロリル)アセチル]アミノ}−3−O−ジメトキシト リチルメチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエト キシホスファイト]プロパン 化合物は実施例54の手順に従い,N−ピロリル−2−酢酸をカルボン酸成分 として用いて製造する。 実施例91 1−(1−イミダゾール)−5−ジメトキシトリチル−2−ペンタノール 1−ブテン−4−オールをKlunder等、J.Org.Chem.198 6、51、3710の手順に従って処理して、4,5−エポキシ−1−ペンタノ ールを得る。グリコールは単離しないが、その場で乾燥DMF中で粉末炭酸カリ ウムおよびイミダゾールで実施例4の手順に従って処理し、次いで塩化ジメトキ シトリチルで実施例5の手順に従って処理して、表題化合物を得る。 実施例92 1−(1−イミダゾール)−5−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N −ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]ペンタン 1−(1−イミダゾール)−4−ジメトキシトリチル−2−ペンタノールを実 施例6の手順に従って処理して表題化合物を得る。 実施例93 1−(1−カルバゾール)−8−ジメトキシトリチル−2−オクタノール 1−オクテン−8−オールをKlunder等、J.Org.Chem.19 86、51、3710の手順に従って処理して、4,5−エポキシ−1−オクタ ノールを得る。グリコールは単離しないが、その場で乾燥DMF中で粉末炭酸カ リウムおよびイミダゾールで実施例4の手順に従って処理し、次いで塩化ジメト キシトリチルで実施例5の手順に従って処理して、表題化合物を得る。 実施例94 1−(1−カルバゾール)−8−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N −ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]オクタン 1−(1−カルバゾール)−4−ジメトキシトリチル−2−ペンタノールを実 施例6の手順に従って処理して表題化合物を得る。 実施例95 1−(N−モルホリノ)−2,3−プロパンジオール 再蒸留したモルホリン(4.3g、50mmol)およびR−(+)−グリシドー ル(3.7g、50mmol)を含む無水メチルアルコール(50ml)の急速撹拌 溶液を18時間還流加熱した。得られた溶液を冷却し、回転蒸発させて、淡黄色 シロップを得た。このシロップを真空下に3時間保って、定量的収量のプロパン ジオール(8.0g)を得た。1H NMR(DMSO−d6):d,4.5(m ,2,ヒドロキシル);3.5−3.3(m,7);2.4−2.1(m,6) 。 実施例96 1−(N−モルホリノ)−3−O−ジメトキシトリチル−2,3−プロパンジオ ール 1−(N−モルホリノ)−2,3−プロパンジオール(8.0g、50mmol) を含む無水ピリジン(150ml)およびトリエチルアミン(10ml)の氷冷 溶液に、粉末塩化ジメトキシトリチル(17g、50mmol)を5分間かけて加え た。無水状態に維持しながら、この混合物を室温で一晩撹拌した。得られた溶液 を回転蒸発させ、次に、酢酸エチル/メチルアルコール/トリエチルアミン(9 0/9.5/0.5)を溶離剤として用い、7.5×5cmカラムでクロマトグ ラフィーを行った。こはく色の固体フォーム16g(69%)を得た。1H N MR(DMSO−d6):d,7.5−6.8(m,13,芳香族);3.9( s,6,メトキシ);10.4および5.7(2m,1,ヒドロキシル);4. 2−2.8(3m,13,脂肪族)。 実施例97 1−(N−モルホリノ)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N− ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]−2,3−プロパ ンジオール クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(2 .4g、1mmol)を、1−(N−モルホリノ)−3−O−ジメトキシトリチル− 2,3−プロパンジオール(4.3g、1mmol)を含む無水テトラヒドロフラン (50ml)およびジイソプロピルエチルアミン(5ml)の氷冷溶液に加えた 。溶液を室温で3時間撹拌し、次に、回転蒸発させた。得られたガムを、酢酸エ チル/メチルアルコール/トリエチルアミン(95/4.5/0.5)を溶離剤 とし て用い、5.5×10cmシリカゲルカラムでクロマトグラフィーを行った。適 当なフラクションを蒸発させてアミダイトを得た。 実施例98 1−(N−ピペリジン)−2,3−プロパンジオール ピペリジン(4.3g、50mmol)およびR−(+)−グリシドールを含む無 水メタノール(50ml)の急速撹拌溶液を18時間還流加熱した。混合物を回 転蒸発させて、透明なシロップを得、これを真空下に3時間保って、定量的収量 のプロパンジオール(8g)を得た。1H NMR(DMSO−d6):d,4. 6および4.3(2m,2,ヒドロキシル);3.6(m,1,メチン);3. 3および2.3(2m,4,プロパン);1.4(m,10)ピペリジン)。 実施例99 1−(N−ピペリジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2,3−プロパンジオ ール 1−(N−ピペリジン)−2,3−プロパンジオール(6.8g、43mmol) を含むピリジン(75ml)およびトリエチルアミン(15ml)の氷冷溶液に 、塩化ジメトキシトリチル(14.4g、43mmol)を5分間かけて加えた。無 水状態に維持しながら、この混合物を室温で一晩撹拌した。得られた溶液を回転 蒸発させ、酢酸エチル、次いで酢酸エチル/メチルアルコール/トリエチルアミ ン(90/9.5/0.5)を溶離剤として用い、11.5×5cmカラムでク ロマトグラフィーを行った。黄色の固体フォーム11g(56%)を得た。1H NMR(DMSO−d6):d,7.4−6.8(m,13,芳香族);4. 5(m,1,ヒドロキシル);3.8(s,6,メトキシ);2.9(d,1, ヒドロキシル);2.2および1.4(2m,14,プロパンおよびピペリジン )。 実施例100 1−(N−ピペリジン)−3−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N− ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホスファイト]−2,3−プロパ ンジオール クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(2 .4g、1mmol)を、1−(N−ピペリジン)−3−O−ジメトキシトリチル− 2,3−プロパンジオール(4.6g、1mmol)およびジイソプロピル−エチル アミン(5ml)の氷冷溶液に加えた。反応混合物を室温で3時間撹拌し、次に 、回転蒸発させて、無色のシロップを得た。このシロップを酢酸エチル/メチル アルコール/トリエチルアミン(95/4.5/0.5)を溶離剤として用い、 5.5×10cmカラムでクロマトグラフィーを行ってアミダイトを得た。 実施例101 1−O−ジメトキシトリチル−5−ヘキセン−1,2−ジオール 室温の、3−O−ジメトキシトリチル−R−(+)−グリシドール(8.0g 、 21mmol)を含む無水テトラヒドロフラン(80ml)の溶液に、テトラクロロ 銅酸リチウム(50ml、THF中の0.1M溶液、アルドリッチ社)、すぐ後 に臭化アリルマグネシウム(70ml、THF中の0.1M溶液、アルドリッチ 社)を加えた。混合物をアルゴンガス雰囲気下で一晩撹拌し、次に、塩化アンモ ニウムの飽和水溶液(約20ml)をゆっくりと加えて急冷した。さらに、混合 物を30分間撹拌し、次に、セライトに通して濾過した。フィルター床を追加の THFで洗浄し、濾液を蒸発させた。得られた黒ずんだ油をヘキサン/酢酸エチ ル/トリエチルアミン(90/9.5/0.5)、次いで(80/19.5/0 .5)を溶離剤として用い、5.5×10cmシリカゲルカラムでクロマトグラ フィーを行った。適当なフラクションを蒸発させて、ジオールを無色の油(8. 0g、90%)として得た。1H NMR(DMSO−d6):d、7.5−6. 8(m,13,芳香族);5.8および5.0(2m,3,アルケン);4.7 (d,1,ヒドロキシル);3.7(s,6,メトキシ);3.6(m,1,メ チン);2.9(m,2,アリル);2.1および1.6(2m,4,メチレン )。 実施例102 1−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)− 2−シアノエトキシホスファイト]−5−ヘキセン−1,2−ジオール クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィン(2 .4g、1mmol)を、1−O−ジメトキシトリチル−5−ヘキセン−1,2−ジ オール(4.2g、1mmol)を含むテトラヒドロフラン(80ml)およびジイ ソプロピル−エチルアミン(5ml)の氷冷溶液に加えた。混合物を室温で3時 間撹拌し、次に、回転蒸発させた。得られた油をヘキサン/酢酸エチル/トリエ チルアミンを溶離剤として用い、5.5×10cmシリカゲルカラムでクロマト グラフィーを行った。適当なフラクションを蒸発させてアミダイトを得た。 実施例103 2−O−ベンジル−1−O−ジメトキシトリチル−5−ヘキセン−1,2−ジオ ール 1−O−ジメトキシトリチル−5−ヘキセン−1,2−ジオール(2.0g、 4.8mmol)を含む無水ジメチルホルムアミド(15ml)の溶液に、60%水 素化ナトリウム(0.28g、ヘキサンで洗浄した)、すぐ後に臭化ベンジル( 0.82g、4.8mmol)を加えた。混合物をアルゴン雰囲気下、室温で1時間 撹拌し、次に回転蒸発させた。得られた油をジクロロメタン(150ml)と冷 飽和炭酸水素ナトリウム溶液(50ml)との間で分配した。有機層をさらに水 、ブラインで洗浄し、次に硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、回転蒸発させて透 明な黄色油を得た。この物質を酢酸エチル/ヘキサン(4/1)を用いて焼結ガ ラス漏斗上のシリカゲルの短い床に通して濾過して、無色の油2.0g(82% )を得た。1H NMR(DMSO−d6):d,7.5−6.8(m,18,芳 香族);5.8および4.9(2m,3,アルケン);4.6(q,2,ベンジ ル);3.8(s,6,メトキシ);3.5(m,1,メチン);3.1,2. 0および1.6(3m,6,メチレン)。 実施例104 2−O−ベンジル−1−O−ジメトキシトリチル−5−ヘキサン−1,2,6− トリオール 2−O−ベンジル−1−O−ジメトキシトリチル−5−ヘキセン−1,2−ジ オール(1.6g、3.1mmol)を含む無水テトラヒドロフラン(25ml)の 溶液を、室温でジボラン/THF複合体(THF中の1M溶液6.3ml)で処 理した。泡立ちが鎮まった(ジボランの添加から10分)後に、混合物をさらに アルゴン下で15分間撹拌した。混合物をメタノール(10ml)で処理し、3 0分間室温で撹拌し、次にNaOH溶液(10ml、1N)で処理し、さらに3 0分間撹拌した。混合物を回転蒸発させてできるだけ少ない体積にし、得られた 残留物をテトラヒドロフラン(50ml)に再溶解し、次に30%過酸化水素( 6ml)で処理した。30分後、2層溶液をジクロロメタン(100ml)で希 釈し、有機層を冷水、冷飽和炭酸水素ナトリウム溶液およびブラインで洗浄した 。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、蒸発させた。この物質をヘキサ ン/酢酸エチル/トリエチルアミン(60/39.5/0.5)を溶離剤として 用いて、3.5×15cmシリカゲルカラムでクロマトグラフィーした。適当な フラクションを回転蒸発させて、無色の油0.7g(42%)を得た。1H N MR(DMSO−d6):d,7.5−6.8(m,18,芳香族);4.6( q,2,ベンジル);4.3(t,1,ヒドロキシル);3.8(s,6,メト キシ);3.5(m,1,メチン);3.3,3.1および1.3(3m,10 ,メチレン)。 実施例105 6−O−ベンゾイル−2−O−ベンジル−1−O−ジメトキシトリチル−1,2 ,6−ヘキサントリオール 2−O−ベンジル−1−O−ジメトキシトリチル−1,2,6−ヘキサントリ オール(0.60g、1.14mmol)を含む無水ピリジンの溶液を塩化ベンゾイ ル(0.24g、1.71mmol)で処理し、混合物をアルゴン雰囲気下、一晩撹 拌した。反応混合物を数ミリリットルのメチルアルコールで処理し、回転蒸発さ せた。得られた油をジクロロメタン(50ml)と冷飽和炭酸水素ナトリウム溶 液(25ml)との間で分配した。有機層をさらに冷水およびブラインで洗浄し 、次に硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、回転蒸発させた。得られた物質をヘキ サン/酢酸エチル/トリエチルアミン(80/19.5/0.5)を溶離剤とし て用いて、3.5×15cmシリカゲルカラムでクロマトグラフィーした。適当 なフラクションを蒸発させて、無色の油0.57g(80%)を得た。1H N MR(DMSO−d6):d,8.1−6.7(3m,23H,芳香族);4. 6(q,2,ベンジル);4.3(t,2,メチレン);3.8(s,6,メト キシ);3.6(m,1,メチン);3.2(m,2,メチレン);1.7(m ,6,メチレン)。 実施例106 6−O−ベンゾイル−1−O−ジメトキシトリチル−1,2,6−ヘキサントリ オール 6−O−ベンゾイル−2−O−ベンジル−1−O−ジメトキシトリチル−1, 2,6−ヘキサントリオール(0.5g、0.8mmol)を含むテトラヒドロフラ ンの溶液に10%Pd/C触媒(0.15g)を加え、混合物を水素ガス(2〜 3ボンド/インチ2)のバルーン下に3日間置いた。バルーンを再び満たし、当 量部の触媒を1日目および2日目の終わりに合計約0.5g加えた。混合物をセ ライトに通して濾過し、床を追加のTHFで洗浄し、回転蒸発させた。得られた 残留物をヘキサン/酢酸エチル/トリエチルアミン(80/19.5/0.5) を溶離剤として用いて、3.5×15cmシリカゲルカラムでクロマトグラフィ ーした。適当なフラクションを蒸発させて、無色のガラスとしてトリオールを0 .4g(32%)を得た。1H NMR(CDCl3):d,8.1(d,2,芳 香族);7.6−6.2(m,12,芳香族);6.8(d,4,芳香族);4 .3(t,2,bz−O−CH2−);3.8(s,6,メトキシ);3.2( ddd,2,C 2−O−DMT);2.4(d,1,ヒドロキシル);1.9 −1.4(m,6,CH2)。 実施例107 6−O−ベンゾイル−1−O−ジメトキシトリチル−1,2,6−ヘキサントリ オール−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−シアノエトキシホ スファイト]−1,2,6−ヘキサントリオール クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンを、 6−O−ベンゾイル−1−O−ジメトキシトリチル−1,2,6−ヘキサントリ オールを含むテトラヒドロフランおよびジイソプロピルエチルアミンの氷冷溶液 に加えた。混合物を室温で3時間撹拌し、次に、回転蒸発させた。得られた油を ヘキサン/酢酸エチル/トリエチルアミンを溶離剤として用い、5.5×10c mシリカゲルカラムでクロマトグラフィーを行った。適当なフラクションを蒸発 させてアミダイトを得た。 実施例108 1−O−ジメトキシトリチル−4−メチルペンタン−1,2−ジオール 臭化イソプロピルマグネシウム(THF中の2M溶液50ml、アルドリッチ 社)およびテトラクロロ銅酸ジリチウム(THF中の0.1M溶液10ml、ア ルドリッチ社)の混合物をアルゴン雰囲気下、−68℃に冷却した。この温度に 維持するように、混合物を3−O−ジメトキシトリチル−R−(+)−グリシド ール(7.3g、20mmol、30mlのTHF中)の溶液で滴加処理した。こは く色の溶液を室温に温め、次に一晩撹拌した。混合物を冷飽和塩化アンモニウム 溶液(約30ml)で処理し、セライトに通して濾過した。セライト床を追加の テトラヒドロフランで数回洗浄し、濾液を回転蒸発させた。得られた黄色シロッ プをヘキサン/酢酸エチル/トリエチルアミンを溶離剤として用い、5.5×1 5cmシリカゲルカラムでクロマトグラフィーを行った。適当なフラクションを 蒸発させて、5.2g( )のジオールを無色のガムとして得た。1H NMR (DMSO−d6):d,7.5−6.8(m,13,芳香族);4.6(d, 1,ヒドロキシル);3.7(s,6,メトキシ);3.7(m,1,C−2メ チン);2.9(2m,2,メチレン);1.7(m,1,C−4 メチン); 1.2(t,2,メチレン);1.9(2d,6,メチル)。 実施例109 1−O−ジメトキシトリチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)− 2−O−シアノエトキシホスファイト]−4−メチルペンタン−1,2−ジオー ル N,N,N’,N’−テトライソプロピル−2−シアノエチルジホスホアミダ イト(3.3g、10.8mmol)を、1−O−ジメトキシトリチル−4−メチル ペンタン−1,2−ジオール(3.8g、9mmol)およびジイソプロピルアンモ ニウムテトラゾリド(1.2g、4.5mmol)を含む無水アセトニトリル(40 ml)の氷冷溶液に加えた。この混合物をアルゴン雰囲気下、室温で一晩撹拌し た。反応混合物をできるだけ少ない体積に蒸発させ、残留物をジクロロメタン( 100ml)と冷飽和炭酸水素ナトリウム溶液(50ml)との間で分配した。 有機層はさらに冷水およびブラインで洗浄し、次に硫酸ナトリウムで乾燥し、濾 過し、回転蒸発させた。得られたシロップをヘキサン/酢酸エチル/トリエチル アミン(80:19.5:0.5)を溶離剤として用い、5.5×15cmシリ カゲルカラムでクロマトグラフィーを行った。適当なフラクションを回転蒸発さ せて、無色ガラスとしてアミダイト5.4g(80%)を得た。31P NMR( CD3OD):153.3、152.9ppm。 実施例110 1−(N,N−ビス−シアノエチルアミノ)−2,3−プロパンジオール R−(+)−グリシドール(0.5g、6.7mmol)を含む無水アセトニトリ ル(30ml)およびトリエチルアミン(0.5ml)の溶液を、3,3’−イ ミノジプロピオニトリル(0.825g、6.7mmol)で処理した。混合物を5 0℃に加熱し、アルゴン雰囲気下で18時間撹拌した。混合物を真空ポンプの下 で回転蒸発させて、1.0g(76%)の明るい無色の油を得た。1H NMR (DMSO−d6):d,4.9(t,1,1°ヒドロキシル);4.7(d, 1,2°ヒドロキシル);3.7−3.2(m,5,プロパン);2.7および 2.6(2t,8,エチレン)。 実施例111 1−([N,N−ビス−シアノエチル]アミノ)−3−O−ジメトキシトリチル −プロパン−2,3−ジオール 1−([N,N−ビス−シアノエチル]アミノ)−2,3−プロパンジオール を含む無水ピリジンの溶液を、塩化ジメトキシトリチルで処理し、混合物を無水 条件下で18時間撹拌した。混合物を数ミリリットルの無水メタノールで処理し 、次に回転蒸発させた。得られた油をトルエンと同時蒸発させ、そしてシリカゲ ルカラムでクロマトグラフィーしてトリチル化化合物を得た。 実施例112 1−([N,N−ビス−シアノエチル]アミノ)−3−O−ジメトキシトリチル −2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−O−シアノエトキシホス ファイト]−プロパン−2,3−ジオール クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンを、 1−([N,N−ビス−シアノエチル]アミノ)−3−O−ジメトキシトリチル −プロパン−2,3−ジオールおよびジイソプロピルエチルアミンを含む無水テ トラヒドロフランの氷冷溶液に加えた。反応混合物を室温でアルゴン雰囲気下、 3時間撹拌し、次に、回転蒸発させた。得られた混合物をシリカゲルカラムでク ロマトグラフィーを行い、適当なフラクションを集め、回転蒸発させてホスホア ミダイトを得た。 実施例113 1−(N,N’−ビス−カルボキサミドエチルアミノ)−3−O−ジメトキシト リチル−プロパン−2,3−ジオール テトラヒドロフラン中の1−([N,N−ビス−シアノエチル]アミノ)−3 −O−ジメトキシトリチル−プロパン−2,3−ジオールの溶液を、室温で水性 1M水酸化ナトリウム溶液で処理した。2相混合物に30%過酸化水素を加え、 次に室温で一夜撹拌した。得られた混合物をジクロロメタンで希釈し、さらに有 機層を冷飽和炭酸水素ナトリウム溶液、水およびブラインで洗浄した。有機層を 回転蒸発させ、得られた油状物を焼結ガラス漏斗上で短ベッドシリカゲルを通し て濾過し、ビス−カルボキサミドを得た。 実施例114 1−([N,N’−ビス−カルボキサミドエチル]アミノ)−3−O−ジメトキ シトリチル−2−O−[(N,N−ジイソプロピルアミノ)−2−O−シアノエ トキシホスファイト]−プロパン−2,3−ジオール クロロ−β−シアノエトキシ−N,N−ジイソプロピルアミノホスフィンを無 水テトラヒドロフランおよびジイソプロピルエチルアミン中の1−([N,N’ −ビス−カルボキサミドエチル]アミノ)−3−O−ジメトキシトリチル−プロ パン−2,3−ジオールの氷冷溶液に加えた。得られた混合物を室温でアルゴン 雰囲気下で3時間撹拌し、次に回転蒸発させた。得られた混合物をシリカゲルカ ラム上でクロマトグラフィーを行い、適当な画分を回収し、回転蒸発させて、ホ スホルアミダイトを得た。 実施例115 標準的DNA合成プロトコールを用いる標準オリゴマーカップリングサイクル 本発明のオリゴマー性高分子は、標準的オリゴヌクレオチドと同様に、自動化 DNA合成機(Applied Biosystems model 380B )で、標準的ホスホルアミデート化学を用いて、ヨウ素で酸化して合成した(O ligonucleotide synthesis,a practical approach,M.J.Gait.Ed.,Oxford Univers ity Press,New York,New York,1990 を参照 のこと)。ホスホロチオエートオリゴマーについては、ホスファイト結合の段階 的チオ化のために、標準的な酸化ボトルをアセトニトリル中の3H−1,2−ベ ンゾジチオール−3−オン1,1−ジオキシドの0.2M溶液で置き換えた。チ オ化の待機時間を68秒に増加し、続いてキャッピング段階を実施した。CPG カラムからの切断および水酸化アンモニウム中55℃における脱ブロッキング( 18時間)の後、オリゴマーを2.5容量のエタノールで0.5MNaCl溶液 から2回析出させて精製した。分析ゲル電気泳動は、20%アクリルアミド、8 M尿素、454mMトリスホウ酸緩衝液(pH=7.0)で実施した。ホスホジ エステルおよびホスホロチオエートオリゴマーは、ポリアクリルアミドゲル電気 泳動でその長さを判定した。 実施例116 ホスホジエステル結合を有する配列特異的エチレングリコールオリゴマーの合成 ”Aforvirsen”は、次の核塩基配列を有する抗パピローマ剤である : TTG CTT CCA TCT TCC TCG TC あらかじめ選択されたこの配列のエチレングリコールホスホジエステル結合オリ ゴマーを、それぞれ実施例3、15、24および20からのT、A、CおよびG 試薬を用いて、酸化試薬としてヨウ素を用いて、実施例115の方法により製造 し、”Aforvirsen”配列を有するホスホジエステル結合オリゴマー性 化合物を得た。 実施例117 ホスホロチオエート結合を有する配列特異的エチレングリコールオリゴマーの合 成 ”Aforvirsen”は、次の核塩基配列を有する抗パピローマ剤である : TTG CTT CCA TCT TCC TCG TC あらかじめ選択されたこの配列のエチレングリコールホスホロチオエート結合オ リゴマーを、それぞれ実施例3、15、24および20からのT、A、Cおよび G試薬を用いて、酸化試薬として3H−1,2−ベンゾジチオール−3−オン1 ,1−ジオキシドを用いて、実施例115の方法により製造し、ホスホロチオエ ート結合オリゴマー性化合物を得た。 実施例118 水素ホスホネートカップリング:一般的方法(Froehler,B.C.,M ethods in Molecular Biology,vol20:Pr otocols for Oligonucleotides and Ana logs.Agrawal,S.Ed.;Humana Press:Toto wa,1993,63−80) コハク酸リンカー(1μmol)を介して結合したDMT保護アルコールで誘 導化した固体支持体(CPGまたは他のポリマー性支持体、例えばTentaG el)の一部をDNA合成カラムに充填し、次の機能を実施するようにプログラ ムされた自動化DNA合成機に取り付けた。 1) ジクロロメタンで洗浄 2) ジクロロメタン中3%トリクロロ酢酸でDMT基を除去 3) ジクロロメタンおよびCH3CN/ピリジン(1:1)で洗浄 4) カップリング:CH3CN/Py(1:1)中の0.2M塩化アダマント イルまたは塩化ピバロイル、およびCH3CN/Py(1:1)中の0.05M H−ホスホネートモノマーを1分間で交互に添加 5) CH3CN/ピリジン(1:1)で洗浄 6) 完全な配列が完成するまで、工程1から5を繰り返す。 この一連の反応の生成物は、H−ホスホネートジエステルであり、これを以下 に記載するものを含むいくつかの方法の1つにより酸化する。 酸化方法1:ホスホジエステル 固体支持体結合−H−ホスホネートジエステルを、等容量の溶液A(0.2M I2/THF)および溶液B(N−メチルモルホリン/H2O/THF 1:1: 8)で5分間処理(手動または自動)し、次に、等容量の溶液Aおよび溶液C( TEA/H2O/THF 1:1:8)で5分間処理し、次にCH3CN/Py( 1:1)で洗浄する。 酸化方法2:ホスホロチオエート 固体支持体結合−H−ホスホネートジエステルを、CS2/ルチジン中のS8の 溶液で30分間処理(手動または自動)する。次に、固体支持体をCH3CN/ Py(1:1)で洗浄する。 酸化方法3:ホスホルアミデート 固体支持体結合−H−ホスホネートジエステルを、CCl4/ピリジン(1: 1)中の所望のアミンの溶液(10%V/V)で15−30分間処理(手動また は自動)する。次に、固体支持体をCH3CN/Py(1:1)で洗浄する。 均一なPN置換を有するホスホルアミデートライブラリの合成;XPN(NPNn N ライブラリは、エチレングリコールCPGまたはユニバーサル支持体CPG( Zeneca,Cambridge,UK)上で、自動化DNA合成機を用いて 合成した。固体支持体を、用いたモノマーの数と等しい数の部分に分離した。そ れぞれのモノマーをHホスホネートカップリングの一般的方法を用いて、支持体 にカップリングさせた。部分を混合し、次のカップリングのために再び分割した 。このようにして、ランダムオリゴマーを、固定した位置に達するまで合成した 。再び支持体を部分に分割し、それぞれのモノマーをカップリングさせた。個々 のプールにカップリングを行うことにより、固定位置の後に追加のモノマーを付 加することができる。さらにそれぞれのプールを分割し、カップリング後に再び 合わせることにより、追加のランダム位置をオリゴマーに付加することができる 。ただし、異なる固定位置のプールを混合しないように注意する。オリゴマー の組み立てが完了した後、一般方法3にしたがって、個々のサブセット中のH− ホスホネート結合を酸化する必要がある。この結果、ライブラリ中のそれぞれの 残基の間に同一のホスホルアミデート結合が形成される。あるいは、酸化の一般 方法1または2にしたがうと、全ホスホジエステルまたは全ホスホロチオエート ライブラリが生成する。次にライブラリのプールを固体支持体から切断し、精製 し、先に記載したように活性についてアッセイする。 固定したPN置換を有するホスホルアミデートライブラリの合成;XPN1−NPN2 −(NpNnm−N 2−置換−DMT−エチレングリコール−H−ホスホネートモノマー(P−ア ミデート:EGP,種々のアミン、XpN1−NpN2−(NpNnm−N)を用いるホ スホルアミデートライブラリの合成。ライブラリは、エチレングリコールCPG またはユニバーサル支持体CPG(Zeneca,Cambridge,UK) 上で、自動化DNA合成機を用いて合成した。固体支持体を、用いたモノマーの 数(X)と等しい数の部分に分割した。それぞれのモノマーを、H−ホスホネー トカップリングの一般方法を用いて支持体にカップリングさせた。部分を再び合 わせ、酸化方法3を用いて、H−ホスホネートジエステル結合をホスホルアミデ ートに変換した。これらの工程(分割、カップリング、合体)を繰り返し、続い て、オリゴマーのそれぞれのランダム化位置について異なるアミンを用いて酸化 方法3を実施した。固定位置において、支持体を分割し、モノマーをカップリン グさせた。ただしサブセットは酸化工程のために分離したままにした。切断およ び後処理の後、ランダム化モノマーおよびそれぞれのホスホルアミデート結合に おいて異なる置換基を有するライブラリが得られる。適当な酸化方法に置き換え ることにより、ホスホジエステルおよびホスホロチオエート結合をオリゴマーラ イブラリ中の任意の位置に導入することも可能である。 種々のPN置換を有するホスホルアミデートライブラリの合成;XpNn−(NpNn m−N ライブラリは、エチレングリコールCPGまたはユニバーサル支持体CPG (Zeneca,Cambridge,UK)上で、自動化DNA合成機を用い て合成した。固体支持体を、用いたモノマーの数に等しい数の部分に分離した。 H−ホスホネートカップリングの一般方法を用いて、それぞれのモノマーを支持 体にカップリングさせた。部分を再び合わせ、混合し、部分に分離した。酸化方 法3にしたがってそれぞれの部分を異なるアミンで酸化し、次に支持体を合わせ て混合した。これらの工程(分割、カップリング、混合、分割、酸化、混合)を 固定位置まで繰り返した。次に支持体を部分に分割し、モノマーをカップリング させ、樹脂部分を再び分割して、方法3にしたがって酸化した。後処理の後、そ れぞれのサブセットは、ユニークなモノマー残基およびホスホルアミデート結合 、およびランダムな位置に等モル量のそれぞれのモノマーおよびアミンを有する 。方法1または2にしたがってそれぞれのH−ホスホネートジエステルの部分を 酸化することにより、ホスホジエステルおよびホスホルアミデート結合をオリゴ マー中にランダムに導入することも可能である。 実施例119 3−オクチル−プロパン−1,2−ジオール−ホスホジエステル−チミジン−ホ スホジエステル−チミジントリマーの製造 チミジンの3’−5’ホスホジエステル結合ダイマーで誘導化した制御孔ガラ ス樹脂[5’−Dmt−O−T−O−P(=O)−O−T−CPG]を、標準的 方法により合成した。ジクロロメタン中の3%トリクロロ酢酸を用いて樹脂(2 5.6mg,47.5mmole/g樹脂)を脱トリチル化し、次に、無水アセ トニトリルおよびピリジンで順番に洗浄した。樹脂を塩化アダマントイル(50 mM)およびピリジン中の3−オクチル−1−O−ジメトキシトリチルプロパン ジオール−2−H−ホスホネート(25mM)の溶液とともに5分間激しく撹拌 した。次に、樹脂を無水ピリジンで繰り返し洗浄し、アルゴンガスでブロー乾燥 した。カラムに1mLのヨウ素/ピリジン/水(2/90/8)溶液を加え、カ ラムを激しく撹拌した。カラムをピリジンおよびアセトニトリルで順番に洗浄し 、次にアルゴンガスでブロー乾燥した。生成物は、1mLの濃水酸化アンモニウ ムで30分間処理することによりCPGから切断した。アンモニア溶液を蒸発さ せ て乾固させ、次に80%酢酸/水で30分間処理してトリチル基を除去した。溶 液のアリコートは、HPLC分析(Vyadec C−18カラム,260nm でモニター,酢酸アンモニウム緩衝液(pH7)−アセトニトリル,0−75% アセトニトリルの直線勾配、52分間)により、26.3分に単一ピークを示し 、これはホスホジエステルトリマーに対応する。 実施例120 3−オクチル−プロパン−1,2−ジオール−モルホリノホスホルアミデート− チミジン−ホスホジエステル−チミジントリマーの製造 実施例118および119に記載のようにして製造した1−O−ジメトキシト リチル−3−オクチル−プロパンジオール−2−O−P(H)−O−T−O−P (=O)−O−T−CPG樹脂を、モルホリン/四塩化炭素/ピリジン(1/5 /5)の溶液1mlとともに30分間激しく振盪した。樹脂を、ピリジン、続い てアセトニトリルで順番に洗浄し、アルゴンガスでブロー乾燥した。生成物は、 濃水酸化アンモニウム1mlで30分間処理することによりCPGから切断した 。アンモニア溶液を蒸発して乾固させ、次に、80%酢酸/水で30分間処理す ることによりトリチル基を除去した。この溶液のアリコートを、得られたモルホ リノホスホルアミデートトリマーのHPLC分析に用いた。 実施例121 3−(N−ピペリジン)−プロパン−1,2−ジオール−ホスホジエステル−チ ミジン−ホスホジエステル−チミジントリマーの製造 チミジンの3’−5’ホスホジエステル結合ダイマーで誘導化した制御孔ガラ ス樹脂[5’−Dmt−O−T−O−P(=O)−O−T−CPG]を、標準的 方法により合成した。ジクロロメタン中の3%トリクロロ酢酸を用いて樹脂(2 4.6mg,47.5mmole/g樹脂)を脱トリチル化し、次に無水アセト ニトリルおよびピリジンで順番に洗浄した。樹脂を塩化アダマントイル(50m M)およびピリジン中の1−(N−ピペリジン)−3−O−ジメトキシトリチル プロパンジオール−2−H−ホスホネート(25mM)の溶液1mlとともに5 分間激しく撹拌した。次に、樹脂を無水ピリジンで繰り返し洗浄し、アルゴンガ スでブロー乾燥した。カラムにヨウ素/ピリジン/水(2/90/8)溶液1m lを加え、激しく撹拌した。次に、カラムをピリジンおよびアセトニトリルで洗 浄し、次にアルゴンガスでブロー乾燥した。生成物は、濃水酸化アンモニウム1 mlで30分間処理することによりCPGから切断した。アンモニア溶液を蒸発 して乾固させ、次に80%酢酸/水で30分間処理してトリチル基を除去した。 溶液のアリコートは、上述の条件下でのHPLC分析により、12.4minに 単一ピークを示した。 実施例122 1−N−ピペリジン−3−O−ジメトキシトリチル−プロパンジオール−2−モ ルホリノホスホルアミデート−チミジン−ホスホジエステル−チミジントリマー の製造 実施例118および119に記載のようにして製造した3−O−ジメトキシト リチル−1−N−ピペリジン−プロパンジオール−2−O−P(H)−O−T− O−P(=O)−O−T−CPG樹脂を、モルホリン/四塩化炭素/ピリジン( 1/5/5)の溶液1mlとともに30分間激しく振盪した。樹脂を、ピリジン 、続いてアセトニトリルで順番に洗浄し、アルゴンガスでブロー乾燥した。生成 物を濃水酸化アンモニウム1mlで30分間処理することによりCPGから切断 した。アンモニア溶液を蒸発させて乾固させ、次に、80%酢酸/水で30分間 処理することによりトリチル基を除去した。この溶液のアリコートを得られたモ ルホリノホスホルアミデートトリマーのHPLC分析に用いた。 実施例123 組み合わせ技術を用いるオリゴマー性構造中へのモノマー単位の取り込み−一般 的方法 固体支持体(ユニバーサル支持体、Cambridge Research Bilchemicals)を等重量の部分に分離した。部分の数は、組み合わ せライブラリ中のモノマーの数と等しい。それぞれの部分を、触媒としてテトラ ゾールを用いて所望のアミダイトの1つと反応させ、次に、実施例115の標準 的カップリングサイクルにしたがってホスファイトトリエステルを酸化してホス フェートとした。CH2Cl2中のトリクロロ酢酸を用いてDMTエーテルを切断 し、延長されたオリゴマーの末端にヒドロキシル基を生成した。アミダイト濃度 および総等量およびカップリング時間を変更することにより、カップリング反応 の程度を最適化して90%以上とした。カップリング後、個々のカップリング反 応からの支持体を十分に混合し、次に等量に分割し、再びアミダイトを個々に支 持体の部分と反応させた。このサイクルを、「固定」位置に達するまで、それぞ れのランダム位置について繰り返した。 オリゴマーの「固定」位置においては、それぞれのアミダイトを支持体の部分 と個々に反応させるが、部分は混合しない。そのかわり、それぞれのサブセット をさらにモノマーの数に対応する数の部分に分割する。次に、支持体のそれぞれ の部分を異なるアミダイトと反応させ、上述のように混合した。支持体の異なる サブセットのそれぞれについてこのサイクルを繰り返し、配列中の固定位置の後 の位置をランダム化した。得られるサブセットは、固定位置においてのみユニー クである。 オリゴマー合成が完了したとき、濃アンモニア中で室温で1−2時間インキュ ベートすることにより、オリゴマーを固体支持体から切断し、ホスフェート保護 基を除去した。次に、オリゴマーを含む上清をシリカから取り除き、55℃で6 −16時間インキュベートして残基から保護基を切断した。オリゴマーを脱塩し 、HPLCサイズ排除クロマトグラフィーにより保護基を除去した。 実施例124 ホスホルアミダイトモノマーのカップリング効率の評価 以下の方法を用いて、エチレングリコールホスホルアミダイトまたは他のホス ホルアミダイトについて、ランダム配列固相オリゴマー合成において用いるため の適合性を評価した。内部対照を含む固相合成支持体を用いてカップリング効率 を決定して、消光計数を見積もり、試験ホスホルアミダイトモノマーのカップリ ング生成物の質を以下のようにして評価した。 試験モノマー−支持体を内部標準として選択した。チミジンについてはdT, デオキシシチジンについてはdCの略記を用い、他の略号は以下に記載する。示 される試験システムにおいては、試験モノマー−支持体としてCPGに結合した チミジン(dT−CPG)を用い、CPGに結合した5’−O−アセチルキャッ プ化シトシン(5’−Ac−dC−CPG)を内部標準として用いた。 反応性dT−CPGを、より少ないモル等量の非反応性5’−Ac−dC−C PGと混合した。非反応性5’−Ac−dC−CPG内部標準により、カップリ ング反応の前および後に存在する未反応dTを正確に決定することができる。 dTのピーク面積をATと表し、dCのピーク面積をAcと表すことができる。 dTとdCのピーク面積の初期比、すなわち(AT/ACOは、CPG混合物の アリコートの切断、脱保護およびHPLC分析により決定した。測定は波長26 0nmで実施した。dCの相対モルはCと表し、dTの相対モルはTと表すこと ができる。これらは、既知の消光計数:C=AC/εCおよびT=AT/εTを用い て、それぞれピーク面積ACおよびATから計算した。すなわち、初期に存在した dTの相対ピーク面積またはモル量は、常にdCのピーク面積から計算すること ができる。 ATO =(AC)[(AT/ACO] =(C)[(T/C)O] また、 (C)(T/C) =(AC/εC)[(AT/εT)/(AC/εC)] =(AC/εC)(AT/AC))(εC/εT) したがって、 (C)[(T/C)O]=(AC/εC)[(AT/ACO](εC/εT) =(AC/εT)[(AT/ACO] 所望のアミダイトモノマー(Xとして表される)をCPG混合物のアリコート と反応させた。反応したCPGをアンモニアで切断および脱保護し、次にHPL Cで分析して、以下のものを決定した:dCのピークの下の面積,AC;未反応 dTのピークの下の面積,ATur;およびX−Tダイマーのピークの下の面積, AXT。これらの値を用いて、カップリング効率C.E.およびX−Tダイマーの 消光計数εXTを計算した。 カップリング効率C.E.は、総dT(TO)に対する反応したdT(Tr)の 比率により定義される。したがって、C.E.=Tr/TOである。カップリング 効率は、Xとのカップリングの前(TO)および後(Tur)に存在した未反応d Tの相対モルから決定することができる。これらの3つの値は次の式の関係を有 する: TO=Tr+Tur C.E.は無単位値であるため、相対的モル量のかわりにHPLCピーク面積 を用いて計算を行うことができる: C.E. = (Tr/TO) = (TO/TO)−(Tur/TO) = 1−(Tur/TO) = 1−(ATur/εT)/(ATO/εT) = 1−(ATur/ATO) = 1−(ATur)/[(AC)[(AT/ACO]] 上述はすべて測定可能な量である。 XについてのC.E.およびHPLCピークの相対的面積から、あるHPLC 溶媒系におけるXについての消光計数ε、すなわちεX-Tを決定した。X−Tの 量は、反応したTの量と等しい。ダイマーX−Tについてのεは、ピーク面積AXT を存在するダイマーX−Tのモル数XTで割ったものとして定義され、以下の ように計算される: XT = Tr = (C.E.)(TO) εXT = (AXT/XT) = (AXT)/(C.E.)(TO) = (AXT)/(C.E.)(C)[(T/C)O] = (AXT)/(C.E.)(AC/εT)[(AT/ACO] 上述はすべて測定可能な量である。 最後に、HPLCクロマトグラムの出現からカップリング生成物X−Tの質を 評価することができる。予期されたもの以外の顕著なピーク(生成物ピーク面積 の10%を越える積算を有するもの)も処理する。これらはしばしば保護基を保 持する所望のX−Tダイマーである。これらのピークが延長したアンモニア処理 により消滅すれば、モノマーが標準的な時間を越える延長したアンモニア脱保護 を必要とすることが確認される。他の場合には、追加のピークは望まれない副生 成物として同定される可能性があり、または場合によってはこれらは同定するこ とができない。一般に、約90%より低いカップリング効率、数日を越える時間 を要するアンモニア脱保護時間、または10%を越える量の(UV吸収により) 副生成物の生成は、ランダムオリゴマー性化合物の生成において用いられる特定 のアミダイトのセットにおける使用についての考慮からアミダイトを排除する可 能性を判定する初期ガイドラインとして選択することができる。 実施例125 例示的エチレングリコールホスホルアミダイトモノマーのカップリング効率の評 価 エチレングリコールホスホルアミダイトをdT−CPG固相合成支持体にカッ プリングさせて、ダイマーおよびトリマーを形成した。カップリングは、実施例 124の一般的方法にしたがって実施した。ダイマーおよびトリマーの合成は、 ABI394 DNA合成機(Applied Biosystems,Fos ter City,CA)で、標準的DNA合成試薬および合成プロトコールを 用いて実施した。ただし、合成サイクルに延長した(5分間)カップリング時間 を追加した。濃アンモニアで4℃で3日間処理することにより、オリゴマーを固 体支持体から切断した。支持体から上清を除去し、密封バイアル中で55℃で8 時間加熱した。この溶液を冷却し、蒸発によりアンモニアを除去した。オリゴマ ーは、逆相HPLCカラム(Waters Nova−Pak Phenyl, Cat.#10656;Millipore Corp.,Milford,M A))で、0.1M酢酸アンモニウム(pH7)中の1%から75%アセトニト リルの50分間の勾配を用いて直接分析した。HPLC系は、991検出機、6 25LCポンプおよび714WISP自動注入器を備えたWatersである。 計算は、260nmで収集したデータを用いて実施した。 実施例126 エチレングリコールホスフェートオリゴマーライブラリの合成 エチレングリコールホスフェートオリゴマー(EGP)は、標準的なDNAホ スホルアミダイト化学を用いて合成した。次の6つのEGPホスホルアミダイト をオリゴマーライブラリに取り込ませた:アデニン、グアニン、シトシン、チミ ン、カルバゾールおよびイミダゾール。EGPホスホルアミダイトを無水アセト ニトリル(CH3CN)に溶解して0.2Mとした。ただし、EGPグアニン( ”egG”)は、最初に無水ジメチルホルムアミド(DMF)に溶解して2Mと し、次にCH3CNで0.2Mに希釈した。ABI394 DNA合成機で、1 μmolスケールのシアノエチルホスホルアミダイト合成の標準的ABIサイク ルを用いて、カップリング待機時間を5分間に増加して、EGPホスホルアミダ イトを1−2μmolの制御孔ガラス(CPG)支持体にカップリングさせた。 ヨウ素酸化溶液をアセトニトリル中のH−1,2−ベンゾジチオール−3−オン 1,1−ジオキシド(Beaucage)の0.1M溶液で置き換えることによ り、ホスホロチオエートオリゴマーも合成した。5’EGP残基で終わるオリゴ マーの5’ジメトキシトリチル基(DMT)は、オリゴマーをCPG支持体から 切断する前には除去しなかった。水酸化アンモニウム(NH4OH)中での切断 の前に5’ヒドロキシルを脱トリチル化すると、5’EGPは加水分解されて環 ホスフェートとなる。 1mlの30%NH4OHで室温で1時間、EGPオリゴマーをCPGから切 断した。切断したオリゴマーを、NH4OH中で55℃で一夜(典型的には12 −18時間)脱保護した。次に、Savantスピードバック中で蒸発させるこ とにより、NH4OHをオリゴマーから除去した。1mlの80%酢酸(HOA c)中で1時間、オリゴマーからDMTを切断することにより5’ヒドロキシル を脱保護した。次に、スピードバック中で蒸発させることにより、HOAcをオ リゴマーから除去した。 オリゴマーをH2Oに再懸濁し、実施例127の3つの方法の1つまたはそれ 以上によりさらに精製した。 実施例127 一般的オリゴマー精製方法 方法A−逆相HPLCクロマトグラフィー 逆相クロマトグラフィーによりオリゴマーを脱塩するために、オリゴマーを約 100mMの酢酸アンモニウム(NH4OAc)または酢酸ナトリウム(NaO Ac)中で逆相カラムに負荷した。カラムをカラム容量の数倍(10−20)の H2Oで洗浄して脱塩した。オリゴマーは、0%から100%のメタノールの勾 配で溶出した。 方法B−サイズ排除クロマトグラフィー サイズ排除により脱塩するために、オリゴマーをHPLCに接続したサイズ排 除カラム(典型的にはSephadexG10またはG25 1.6×50cm )に負荷し、H2Oで流速0.5ml/minで溶出した。オリゴマーは、約2 −3時間でカラムから溶出し、次に塩および保護基が溶出した。 方法C−酢酸エチル抽出 オリゴマーはまた、酢酸エチル抽出により保護基から精製することができる。 しかし、この方法はオリゴマーを脱塩しない。HOAcでDMTを切断した後、 乾燥オリゴマーを1−2mlのH2Oに再懸濁した。酢酸エチル(1ml)をオ リゴマーに加え、ボルテックスして層を混合した。H2Oおよび酢酸エチル層が 分離した後、上の層(DMTおよびベンズアミド保護基を含む酢酸エチル層)を 、オリゴマーを含むH2O層から除去した。酢酸エチルによる3回の抽出が、オ リゴマーからDMTおよびベンズアミドを除去するのに十分であった。 クロマトグラフィーまたは抽出による精製の後、スピードバック中で蒸発させ ることによりオリゴマーを乾燥した。オリゴマーをH2Oに再懸濁し(典型的に は0.5−2mM)、−20℃以下で保存した。 実施例128 (dG)4(egCB)4(dG)4および(dG)4(egIM)4(dG)4ホス ホジエステルオリゴマーの合成 EGPカルバゾールホスホルアミダイト(egCB)およびEGPイミダゾー ルホスホルアミダイト(egIM)をデオキシグアノシン(dG)ホスホルアミ ダイト(ABI Cat#400327)とともに取り込ませることにより、2 つの合成を実施した。オリゴマー(dG)4(egCB)4(dG)4および(d G)4(egIM)4(dG)4は、2つの1μmol 500Å G−CPG合 成カラム(Cruchachem,Cat#19−7821−80)上で合成し た。アミダイトを無水アセトニトリル(AldrichCat#27,100− 4)で0.2Mに希釈した。アミダイトdG、egCBおよびegIMを、AB 1394 DNA合成機のアミダイト位置(位置1−8)の3つに配置した。用 いた合成サイクルは、カップリング待機時間を5分間に増加するように変更した ABI標準1μmolスケールサイクルであった。それぞれの合成ラウンドの後 、5’DMTを除去した。 デュアルシリンジ法を用いて、オリゴマーを1mlの30%NH4OH中で1 時間切断した。それぞれのカラムについて、1mlの30%NH4OHを3ml スリップ先端ポリプロピレンシリンジ中に入れた。満たしたシリンジの先端を合 成カラムの一端に配置し、第2の空のシリンジを他の端に配置した。シリンジを 用いてNH4OHをカラムを通して押し出し、1時間反応させた。NH4OH中の 切断されたオリゴマーをカラムから除き、Wheatonの4mlガラスネジ蓋 バイアルに入れ、Wheatonテフロンライニングキャップできつく蓋した。 オリゴマーをVWR55℃加熱ブロック中に16時間おいて、塩基から保護基を 除去した。バイアルを氷浴中に約15分間おいて冷却した。バイアルを注意深く 開封してNH4OHを流し出した後、オリゴマーを1.5mlのBiostor ネジ蓋ポリプロピレンマイクロチューブに移した。バイアルをSavantスピ ードバック中に置き、オリゴマーから過剰のNH4OHを蒸発させた。 オリゴマーを約500μlのH2Oに再懸濁し、ボルテックスした。Delt a−Pakカートリッジ5μm C18 300Å 3.9×150mm逆相カ ラム(Millipore,Cat#011793)でそれぞれのオリゴマーを 別々に精製して脱塩した。カラムを125mM NH4OAcで1ml/min で20分間平衡化した。オリゴマーをカラムに注入した。カラムを125mM NH4OAcで5分間洗浄した。次にカラムをH2Oで36分間洗浄してオリゴマ ーを脱塩し、ベンズアミドを除去した。オリゴマーを75%メタノールで6分間 溶出し、続いて100%メタノールで6分間洗浄した。75%−100%メタノ ール洗浄の間に溶出した画分をポリプロピレン遠心管にプールした。スピードバ ックで過剰の溶媒をオリゴマーから蒸発させた。オリゴマーをH2Oに再懸濁し て約1mM濃度とし、−20℃で凍結保存した。 実施例129 ホスホジエステルライブラリG4XN34の合成 2つのEGPホスホルアミダイト(カルバゾール(egCB)およびイミダゾ ール(egIM))を、4つのDNA(dA,dC,dG,およびdT)ホスホ ルアミダイトとともに取り込ませて、オリゴマーのライブラリを製造した。ライ ブラリは配列G4XN34の6つのサブセットからなる。6つのサブセットのそ れぞれについて、位置XをdA,dC,dG,dT,egCB,またはegIM として固定した。Nは、dA,dC,dG,dT,egCB,およびegIMを 等しく取り込んだランダム化位置である。このライブラリを2μmolスケール で合成した。6つの空の1μmolスケールのSnap合成カラム(ABI)に 2μmolのdG−CPG(CPG Inc.Cat#DG200503)(2 μmol=45mgの44.5μmol/g G−cpg)を充填した。アミダ イトを無水アセトニトリル(Aldrich,Cat#27,100−4)で0 .2Mに希釈した。アミダイトdA,dG,dC,dT,egCBおよびegI MをそれぞれABI394 DNA合成機のボトル位置1−6に配置した。 異なるアミダイトのカップリング速度はさまざまである。それぞれのランダム 化位置Nが6つの残基すべてを等しく取り込むことを確実にするために、混合C PG合成スキームを用いた。それぞれのランダム化位置において、それぞれのホ スホルアミダイトをCPGの等しい部分に個々にカップリングさせ、脱トリチル した。次にCPGをカラムからテフロンライニングキャップを有する4mlガラ スネジ蓋バイアルに移し、倒立させることにより15分間混合し、次のカップリ ングのために6つのカラムに再分配した。固定位置Xをカップリングさせた後は 、ライブラリの6つのサブセットを別々に保持した。用いた合成サイクルは、カ ップリング待機時間を5分間に増加させるように変更したABI標準1μmol スケールサイクルである。それぞれの合成ラウンドの後、5’DMTを除去した 。 デュアルシリンジ法を用いて、オリゴマーを1mlの30%NH4OH中で1 時間切断した。オリゴマーを55℃で16時間保持し、塩基を脱保護した。次に 、オリゴマーをSavantスピードバック中に置き、過剰のNH4OHを蒸発 させた。 オリゴマーを約500μlのH2Oに再懸濁し、ボルテックスした。Radi al−Paktmカートリッジ8×100mm Delta−PaktmC18 3 00Å 15μm逆相カラム(Waters,Cat#WAT025845)で それぞれのオリゴマーを別々に精製し脱塩した。カラムを125mM NH4O Acで3ml/minで20分間平衡化した。オリゴマーをカラムに注入した。 カラムを125mM NH4OAcで5分間洗浄した。次にカラムをH2Oで35 分間洗浄してオリゴマーを脱塩し、ベンズアミドを除去した。オリゴマーを75 %メタノールで10分間溶出し、続いて100%メタノールで10分間洗浄した 。75%メタノール洗浄の間に溶出した画分をポリプロピレン遠心管にプールし 、スピードバックで過剰の溶媒をオリゴマーから蒸発させた。オリゴマーを1m lのH2Oに再懸濁して1.5mlのBiostorネジ蓋マイクロチューブに 移し、スピードバックで蒸発させることにより乾燥した。オリゴマーをH2Oに 再懸濁して約2mM濃度とし、−20℃で凍結保存した。 ライブラリは、Southern Research Institute( SRI)において、急性HIVアッセイでスクリーニングした。XがegCBに 固定されたオリゴマーのサブセット(すなわちG4(egCB)N34)は、3 μMのIC50を有し、6つのサブセットの中で最も活性が高かった。 このライブラリについての次の合成ラウンド(G4(egCB)XN24)を 、上述した混合CPG法を用いて2μmolスケールで合成した。用いた合成サ イクルは、カップリング待機時間を5分間に増加させるように変更したABI標 準1μmolスケールサイクルである。それぞれの合成ラウンドの後、5’DM Tを除去した。 デュアルシリンジ法を用いて、オリゴマーを1mlの30%NH4OH中で1 時間切断し、55℃で16時間加熱して、塩基から保護基を除去した。オリゴマ ーをSavantスピードバック中に置き、過剰のNH4OHをオリゴマーから 蒸発させた。 オリゴマーを約500μlのH2Oに再懸濁し、ボルテックスした。Seph adexG25樹脂(Cat#17−0572−01)を充填したPharma cia16/50HRカラム(Cat#18−1460−01)でそれぞれのオ リゴマーを別々に精製し脱塩した。カラムを充填し、H2Oで1−2ml/mi nで平衡化した。オリゴマーをカラムに注入し、流速を0.5ml/minに低 下させた。オリゴマーはカラムから2時間で溶出された。次に流速を1−2ml /minに上昇させて、塩および保護基を速やかに溶出させ、カラムを再び平衡 化した。オリゴマーを含む画分をポリプロピレン遠心管にプールし、スピードバ ックで過剰のH2Oをオリゴマーから蒸発させた。オリゴマーを1mlのH2Oに 再懸濁して1.5mlのBiostorネジ蓋マイクロチューブに移し、スピー ドバック中で蒸発させることにより乾燥した。オリゴマーをH2Oに再懸濁して 約1−2mM濃度とし、−20℃で凍結保存した。 実施例130 G4XN34ホスホロチオエートライブラリの合成 ホスホロチオエートでの同一のライブラリG4XN34を、上述の混合モード 法および合成スキームを用いて、2μmolスケールで合成した。それぞれの合 成ラウンドの後に5’−DMTを除去した。用いた合成サイクルは、カップリン グ待機時間を5分間に増加させることにより変更したABI標準1μmolスケ ールサイクルである。さらに、ヨウ素およびH2Oの溶液を用いる酸化工程を、 硫化工程で置き換えた。アセトニトリル中の0.1M Beaucage溶液を 合成機の位置#10に配置した。カップリング工程の後にBeaucage溶液 をカラムに送達するようにサイクルを変更した。30秒の待機時間の後に、カラ ムをアセトニトリルですすぎ、次にキャッピング工程を実施した。 オリゴマーは、デュアルシリンジ方法を用いて1mlの30%NH4OH中で 1時間切断し、55℃で16時間加熱して、塩基から保護基を除去した。オリゴ マーは、上述のように、G−25サイズ排除クロマトグラフィーで脱塩し、H2 O中1mMで冷凍保存した。 実施例131 XN5Tホスホジエステルライブラリの合成 6つのEGPホスホルアミダイト:アデニン(egA),グアニン(egG) ,シトシン(egC),チミン(egT),カルバゾール(egCB)およびイ ミダゾール(egIM)ホスホルアミダイトを取り込んだオリゴマーのライブラ リを製造した。ライブラリは、配列XN5Tの6つのサブセットからなる。6つ のサブセットのそれぞれについて、位置XをegA,egC,egG,egT, egCB,またはegIMで固定した。NはegA,egC,egG,egT, egCBおよびegIMを等しく取り込んだランダム化位置である。このライブ ラリを2μmolスケールで合成した。6つの空の1μmolスケールのSna p合成カラム(ABI)に2μmolのdT−CPG(CPG Inc.Cat #DT06H012)(2μmol=51mgの39.2μmol/g dT− CPG)を充填した。アミダイトを無水アセトニトリル(Aldrich,Ca t#27,100−4)で0.2Mに希釈した。ただし、egGは最初に無水D MFに溶解して2μMとし、次にCH3CNで0.2μMに希釈した。アミダイ トegA,egG,egC,egT,egCBおよびegIMをそれぞれABI 394 DNA合成機のボトル位置1−6に配置した。このライブラリは、カ ップリング待機時間を5分間に増加させることにより変更したABI標準1μm olスケールサイクルを用いて、上述の混合CPG方法により合成した。合成セ グメント1−5の後に、5’−DMTを除去した。合成セグメント6の後には5 ’−DMTを除去しなかった。NH4OH中での切断の間に5’−EGP残基が 加水分解するためである。 オリゴマーを、デュアルシリンジ法を用いて1mlの30%NH4OH中で1 時間切断し、55℃で16時間加熱して塩基から保護基を除去した。オリゴマー を6mlポリプロピレン試験管に移し、Savantスピードバック中に置いて 過剰のNH4OHをオリゴマーから蒸発させた。800μlの80%HOAcを 乾燥オリゴマーに1時間加えて、5’−ヒドロキシルからDMT保護基を切断し た。スピードバック中で蒸発させることにより酸を除去した。 オリゴマーを1mlのH2O中でボルテックスして再懸濁させ、酢酸エチル抽 出により、ベンズアミドおよびDMT保護基を粗合成物から除去した。酢酸エチ ル1mlを粗オリゴマー中にピペットで入れた。試験官をボルテックスして、H2 Oと酢酸エチルとをよく混合した。層の形成後、これらの間に透明な溶媒フロ ントが現れ、上の酢酸エチル層をポリプロピレンピペットを用いて除去した。H2 O層を2×1mlの酢酸エチルでさらに2回抽出した。オリゴマーを含むH2O 層を蒸発乾固させて残りの酢酸エチルを除去した。 オリゴマーをH2Oに再懸濁して約1−2mM濃度とし、−20℃で凍結保存 した。 実施例132 PLA2アッセイ ホスホリパーゼA2(PLA2)酵素は、膜リン脂質のsn−2結合の加水分 解を行う。PLA2触媒反応は、多くのプロ炎症媒介物の放出の律速段階であり 、タイプIIPLA2は、いくつかのヒト炎症性疾患の病因に関与する。タイプII PLA2の活性の阻害についてライブラリサブセットをスクリーニングし、ユニ ークな阻害剤を同定した。 3H−オレイン酸で標識したE.coli細胞を基質として用いるアッセイに おいて、PLA2の阻害についてオリゴマーライブラリをスクリーニングした( Franson et al.,J.Lipid Res.1974,15,3 80;およびDavidson et al.,J.Biol.Chem.19 87,262,1698)。バキュロウイルス系で発現させ、部分精製したタイ プIIPLA2(もともとは滑液から単離された)を、酵素の源として用いた。 それぞれのオリゴマーのプールの希釈列(水中)を作成した。10μlのそれぞ れのオリゴマーを、10μlのPLA2、20μlの5×PLA2緩衝液(500 mM Tris,pH7.0−7.5,5mM CaCl2)および50μlの 水の混合物とともに室温で5分間インキュベートした。それぞれのオリゴマー試 料は2重に試験した。この時点において、3H−標識E.coli細胞10μl を加えた。この混合物を37℃で15分間インキュベートした。酵素反応は、5 0μlの2M HClおよび50μlの脂肪酸フリーBSA(20mg/mL PBS)を加えることにより停止させ、5秒間ボルテックスし、高速で5分間遠 心分離した。次に、それぞれの上清の165μl部分を、6mlのシンチラント (Scintiverse)を含むシンチレーションバイアル中に入れ、Bec kman液体シンチレーションカウンターでcpmを測定した。対照として、オ リゴマーを含まない反応ならびにオリゴマーもPLA2酵素も含まないベースラ イン反応を他の反応の横に流した。それぞれの反応データポイントからベースラ インを差し引くことにより、cpmを補正した。結果を表III、IVおよびVに示 す。 最初のラウンドにより、G4(egCB)NNNG4が25μMのIC50を有す る最良のオリゴマーとして同定された。次の位置は、2倍の活性の向上および1 2μMのIC50を有するegCBであると判定された。その結果、2ラウンドの 選択の後、G4(egCB)2NNG4がPLA2アッセイにおいて最良のオリゴマ ーであると同定された。 最初の2ラウンドは、オリゴマーの最初の2つのモノマー単位、すなわちno Cの決定に有用であった。次の2つの位置は、順番にdGおよびdTであると判 定され、最も高い活性を有するユニークなオリゴマーは2μMのIC50を有する (noC)(noC)(dG)(dT)(dT)であると同定された。 第1のラウンドでは、最も活性の高いサブセットとして、40μMのIC50を 有する(egOC)NNNNdTが選択された。次のラウンドにより、活性の8 倍の向上および5μMのIC50を有するオリゴマーの第2の位置におけるモノマ ー単位、すなわちegoCが決定された。合成および選択の第3のラウンドによ り、さらに改良された1.5μMのIC50を有する(egOC)(egOC)( egOC)NNdTが最も活性の高いサブセットとして同定された。さらなるラ ウンドを用いて、PLA2アッセイにおいて最も高い活性を有するユニークなオ リゴマーを同定することができる。 実施例133 アッセイの検証 グアノシンヌクレオチドの1またはそれ以上のストリング(1ストリングあた り少なくとも3個)を有するホスホロチオエートオリゴヌクレオチドを用いて、 実施例132のPLA2試験系を検証した。SURFのスクリーニング方法を用 いてこれらのオリゴヌクレオチドのライブラリを解離(deconvolute )し、PLA2酵素に対して阻害効果を有することが示された。ホスホロチオエ ートオリゴヌクレオチドがいくぶんかの配列特異性をもってPLA2を阻害する ことが知られているため、4個の天然塩基からなる8ヌクレオチドのホスホロチ オエートライブラリを用いて、SURFスクリーニングとしての適合性について アッセイ系を試験した。このライブラリは、他の系のために合成されたものであ り、すべてのサブセットが入手可能ではなかった(以下の表IIIにおいてダッシ ュで示される)。SURF法を用いて、グアノシンのストレッチがホスホロチオ エートオリゴヌクレオチドによるPLA2活性の阻害に必要でることが確認され た(以下の表VI)。 アッセイは、オリゴマーのサブセットの間を区別するのに十分に感度が高く正 確であったため、阻害配列を選択することができた。選択の最初の3ラウンドの それぞれにおいて、最も活性の高いサブセットが容易に決定された。5ラウンド の後、1つの列で少なくとも5つのGを有するサブセットの活性にはほとんど相 違がなく、このことから、末端位置は阻害活性には重要ではないことが示唆され た。より多くの位置が固定されるほど、「勝者」のIC50は改良された(酵素活 性は減少した)。アッセイの再現性の試験として、単一の配列(TTGGGGT T)を有する8ヌクレオチドのホスホロチオエートオリゴヌクレオチドを試験の それぞれのラウンドでアッセイした。このオリゴヌクレオチドは、アッセイの正 確性の内部対照として作用した。それぞれのアッセイにおいてIC50は8μMで あった。 実施例134 エチレングリコールオリゴマー性化合物のライブラリのPLA2に対するアッセ イ エチレングリコールモノマーを含むライブラリを、タイプIIPLA2の阻害剤 の同定のために、PLA2アッセイにおいて試験した。「勝者」の確認を行って 、オリゴマーが基質ではなく酵素に結合し、選択された任意のオリゴマーの阻害 が タイプIIPLA2に特異的であることを確認した。E.coli膜ではなく14C −ホスファチジルエタノールアミン(14C−PE)を基質として用いるアッセイ を用いて、基質ではなく酵素の特異性を確認した。14C−PEとデオキシコール 酸とのミセルを酵素およびオリゴマーとともにインキュベートした。PLA2に 触媒される加水分解の結果として放出された14C−標識アラキドン酸を薄層クロ マトグラフィーにより基質から分離し、放射活性生成物を定量化した。「勝者」 をヒトタイプIIPLA2の好ましい基質であるホスファチジルエタノールアミン と比較して、その活性を確認した。他の源からのPLA2(ヘビ毒、膵臓、蜂毒 )およびホスホリパーゼC,ホスホリパーゼDおよびリソホスホリパーゼを用い て、阻害がヒトタイプIIPLA2に特異的であることをさらに確認することがで きる。 組成:GGGGXNNNGGGG [式中、それぞれのXおよびN位置は、上述のエチレングリコールモノマーであ る]のホスホジエステルライブラリを用いたとき、最も協力な化合物は、Xモノ マーがカルバゾール官能基を有する化合物である。この化合物は25μMのIC50 を有する。次に強力な化合物では、Xモノマーはアデニン官能基を有する。 同一の組成のホスホロチオエートライブラリを用いたときも、最も強力な化合 物は、Xモノマーがカルバゾール官能基を有する化合物である。しかし、このラ イブラリにおいては、次に最も強力な化合物では、Xモノマーはシトシン官能基 を有する。 実施例135 PLA2に対するエチレングリコールおよびヌクレオチドオリゴマー性化合物の 混合ライブラリの製造 それぞれのN位置が本発明の新規なエチレングリコールモノマーまたはヌクレ オチドである組成”NNNNT”の5merホスホジエステルライブラリを製造 した。合計12個のモノマー(すべてオリゴマー化に適当なホスホルアミデート として)およびゼロ(null)位置をライブラリの製造に用いた。モノマー性 単位は、それぞれ上述の実施例6および9のイミダゾールおよびカルバゾール− エチレングリコールモノマー性ホスホルアミデート、グアノシンおよびシチジン −デオキシヌクレオチドホスホルアミデート,2’−O−メチルアデノシンおよ びウリジンヌクレオチドホスホルアミデート,2’−O−ノニルシチジンヌクレ オチドホスホルアミデート,2’−O−ペンチルグアノシンヌクレオチドホスホ ルアミデート,N2,2’−O−ジメチルウリジンヌクレオチドホスホルアミデ ート,1−アミノ−プロパングリコールホスホルアミデート(実施例35の1− [N−ベンゾイルアミノ]プロパングリコールホスホルアミデートから、オリゴ マー合成の完了後、アミノ基を塩基で脱ブロックした後の生成物)およびベンゾ トリアゾールデオキシヌクレオチドホスホルアミデートを含んでいた。 実施例136 生物学的試料中の特異的mRNAの検出のためのハイブリダイゼーションプロー ブ 他の細胞成分からmRNAを精製することなく生物学的試料中の多種のmRN Aの、信頼性のある、迅速な、同時定量化を行うために、適当な生物学的試料か らの問題のmRNA(血液運搬性微生物、ならびに便、尿および同様の生物学的 試料中の細菌性病因生成物からのmRNA)を標準的な微生物技術を用いて同定 する。このmRNAの核酸配列に相補的な本発明のオリゴマー性化合物を、上述 の実施例にしたがって製造する。Pon,R.T.,Protocols fo r oligonucleotide and Analogs,Agrawa l,S.,Ed.,HumanaPress,Totowa,NJ,1993, p465−496の方法を用いて、オリゴマー性化合物を不溶性CPG固体支持 体上に固定化する。PCT出願WO93/15221の方法を用いて、調査すべ き既知の生物学的試料のアリコートを、オリゴマーを有する不溶性CPG支持体 とともに、mRNAがオリゴマーとハイブリダイズし、したがってmRNAがオ リゴマーを介して固体支持体に結合するのに十分な時間インキュベートする。こ のことにより、試料中に存在するmRNAはCPG支持体に固定化される。次に CPG支持体を、生物学的試料とともに用いるのに適した洗浄媒体で洗浄して他 の非固定化物質および成分を洗い流す。支持体上のmRNAを、臭化エチジウム 、 ビオチンまたは市販の放射性ヌクレオチドで標識し、CPG支持体に固定化され た標識の量を測定して、生物学的試料中に存在するmRNAの量を示す。 当業者は、本発明の好ましい態様に多くの変更および改変を行うことが可能で あること、およびそのような変更および改変は本発明の精神から逸脱することな くなしうることを理解するであろう。したがって、そのような等価変更物のすべ ては、本発明の真の精神および範囲に含まれるものとして特許請求の範囲に含ま れることを意図するものである。 実施例137 ロイコトリエンB4アッセイ ロイコトリエンB4(LTB4)は、種々のヒト炎症性疾患に関与することが示 されており、その薬理学的効果は、その特異的表面細胞レセプターとの相互作用 に媒介される。ライブラリのサブセットを、放射性標識したLTB4のレセプタ ー調製物への結合の競合的阻害についてスクリーニングした。 NenquestTM Drug Discovery System Kit (NEN Research Products,Boston,MA)を用い て、ロイコトリエンB4(LTB4)とモルモット脾臓膜調製物上のレセプターと の相互作用の阻害剤を選択した。放射性リガンド0.25mlにリガンド希釈剤 (NaCl,MgCl2,EDTAおよびバシトラシンを含むリン酸緩衝液,p H7.2)5mlを加えることにより、[3H]ロイコトリエンB4試薬を調製し た。レセプター調製物は、濃縮物を融解し、レセプターを均一に再懸濁するため にリガンド希釈剤35mlを加えて穏やかに渦巻かせることにより作製した。実 験の間、試薬は氷上に保持し、残りの部分は−20℃に保存した。 ライブラリのサブセットを、リン酸緩衝液(1×PBS,0.1%アジドおよ び0.1%BSA,pH7.2)中で5μM,50μMおよび500μMに希釈 し、それぞれ最終試験濃度0.5μM,5μMおよび50μMを得た。試料は2 重にアッセイした。[3H]LTB4(25μL)を、25μLの適当に希釈した 標準(未標識LTB4)またはライブラリサブセットのいずれかに加えた。それ ぞれのチューブにレセプター懸濁液(0.2mL)を加えた。試料を4℃で2時 間インキュベートした。対照は、レセプター懸濁液を含まない[3H]LTB4( 総カウントバイアル)およびライブラリ分子を含まないリガンドおよびレセプタ ーの試料(標準)であった。 インキュベーション時間の後、あらかじめ冷食塩水ですすいだGF/B濾紙を 通して試料を濾過した。それぞれのチューブの内容物を濾紙上に吸引して、未結 合リガンドを膜調製物から除去し、チューブを冷食塩水(2×4ml)で洗浄し た。濾過ユニットから濾紙を取り除き、フィルターディスクをシンチレーション 計数のために適当なバイアル中に入れた。Fluorを加え、バイアルを振盪し 、計数の前に2−3時間室温においた。それぞれの試料から得られたカウント/ 分(cpm)を、総カウントバイアルから得られたcpmから差し引き、それぞ れの試料の正味cpmを決定した。それぞれのライブラリのサブセットについて の結合の阻害の程度を、標準(ライブラリ分子を含まないリガンドおよびレセプ ターの試料)に対して決定した。結果を表VII、VIIIおよびIXに示す。 スクリーニングの最初のラウンドにおいては、egCBを第1の位置に有する サブセット、すなわち(egCB)NNNNNdTが最も高い活性を示した。第 2ラウンドにおいては、サブセット(egCB)(egCB)NNNNdTが最 も活性が高く、活性はラウンド1の11μMのIC50から、ラウンド2の2μM に、約6倍増加した。ラウンド3のサブセットのアッセイにより、改良された活 性および0.7μMのIC50を有する(egCB)(egCB)(egCB)N NNdTが同定された。さらなるラウンドのサブセットの合成およびアッセイに より、LTB4アッセイにおいて最高の活性を示すユニークなオリゴマーを同定 することができる。 スクリーニングの最初のラウンドにおいては、第1の位置にegCBを有する サブセット、すなわち(egCB)NNNdTが最も高い活性を示した。第2の ラウンドにおいては、サブセット(egCB)(egCB)NNdTが最も活性 が高く、活性は、ラウンド1の40μMのIC50からラウンド2の6μMに増加 し、約7倍の向上を示した。ラウンド3および4からのサブセットのアッセイに より、最も低い0.7μMのIC50を有する最も活性の高いオリゴマー(egC B)(egCB)(BTI)(egCB)dTが得られた。 合成および選択の最初の2つのラウンドは、オリゴマーの最初の2つのモノマ ーユニット、すなわち7μMのIC50を有する(egOC)(egOC)NNN dTを決定するのに有用であった。次のラウンドにより、改良された2μmのI C50を有するオリゴマーが選択された。さらなるラウンドを実施して、最高の活 性を有するユニークなオリゴマーを同定することができる。 実施例138 ヒト免疫不全ウイルスの阻害の検出のためのアッセイ インビトロHIV感染アッセイを用いて、組み合わせライブラリからHIV複 製の阻害剤を選択した(Buckheit et al.,Antiviral Res.1993,21,247)。ヒトT−リンパ芽球CEM細胞株を10 %ウシ胎児血清、グルタミンおよび抗生物質を含むRPMI1640中で対数増 殖期に維持した。アッセイの日、細胞を洗浄し、トリパンブルー排除により計数 した。これらの細胞(CEM−IIIB)を、96ウエルマイクロタイタープレ ートのそれぞれのウエルに、ウエルあたり5×103個で播種した。それぞれの ウエルに細胞を加えた後、ライブラリのサブセットを示された濃度および半対数 希釈系列で加えた。感染性HIV−1IIIBを、感染後6日において完全な細胞殺 傷を与えるように決定した感染多重度でそれぞれのウエルに速やかに加えた。3 7℃で6日間インキュベートした後、それぞれのウエルから上清のアリコートを 除去し、それぞれのウエルにテトラゾリウム染料XTTを加えた。XTTは、生 きた細胞では代謝されてホルマザンブルー生成物となり、これをMolecul ar Devices Vmaxプレートリーダーで分光光度として定量的に測 定した。XTTアッセイは、試験化合物の添加の結果としてのHIV誘導性細胞 殺傷からの保護を測定する。上清アリコートを用いて、XTTアッセイにより決 定された活性を確認した。逆転写酵素アッセイおよびp24ELISAアッセイ を実施して、感染細胞から放出されたHIVの量を測定した。殺傷からの保護に より、XTTアッセイにおける光学密度が増加し、ウイルス性逆転写酵素および p24コア蛋白質のレベルが減少する。結果を表Xに示す。 2ラウンドの合成および選択により、サブセットG4(egCB)(egCB )NNG4が2μMのIC50を有する最良のサブセットであることが決定された 。追加のラウンドを実施して、さらに増加した活性を有するユニークなオリゴマ ーを同定することができる。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C07C 325/00 7106−4H C07C 325/00 327/20 7106−4H 327/20 327/38 7106−4H 327/38 333/02 7106−4H 333/02 C07D 207/325 9159−4C C07D 207/325 209/08 9159−4C 209/08 233/60 103 9551−4C 233/60 103 239/26 8615−4C 239/26 239/42 8615−4C 239/42 Z 239/54 9283−4C 279/18 279/18 9283−4C 295/08 Z 295/08 9283−4C 471/04 103A 471/04 103 9450−4H C07F 9/141 C07F 9/141 9450−4H 9/143 9/143 9450−4H 9/572 Z 9/572 9450−4H A 9450−4H 9/6503 9/6503 9450−4H 9/6509 Z 9/6509 9450−4H 9/6561 Z 9/6561 8615−4C C07H 21/00 C07H 21/00 8619−4J C08G 79/04 NUP C08G 79/04 NUP A61K 31/40 // A61K 31/40 31/70 ABE 31/70 ABE ACJ ACJ ADA ADA 9051−4C AED AED 9271−4C C07D 473/18 C07D 473/18 9271−4C 473/34 473/34 8615−4C 239/54 Z (72)発明者 デイヴィス,ピーター・ダブリュー アメリカ合衆国カリフォルニア州92008, カールズバッド,ハイランド・ドライブ 2202 (72)発明者 エッカー,デヴィッド・ジェイ アメリカ合衆国カリフォルニア州92024, ルーカディア,サキソニー・ロード 1041 (72)発明者 ハーバート,ノーマンド アメリカ合衆国カリフォルニア州92007, カーディフ,モンゴメリー・アベニュー 1861

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.構造I: [式中: XはH、ホスフェート基、活性化ホスフェート基、活性化ホスファイト基、ま たは固体支持体であり; YはHまたはヒドロキシル保護基であり; ZはL1、L1−G1、L2、L2−G2、NR34、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; L1は1から約20の炭素原子を持つアルキル、2から約20の炭素原子を持 つアルケニル、または2から約20の炭素原子を持つアルキニルであり; L2は6から約14の炭素原子を持つアリールまたは7から約15の炭素原子 を持つアラルキルであり; G1はハロゲン、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、NHC( =NH)NR34、CH=O、C(=O)OR5、CH(NR34)(C(=O )OR5)、C(=O)NR34、金属配位基、またはホスフェート基であり; G2はハロゲン、OH、SH、SCH3、またはNR34であり; R1はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはヒドロキシル保護基 であり; R2はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはチオール保護基であ り; R3およびR4は独立してH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはア ミン保護基であり; R5はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、または酸保護基であり; QはL1、G3、L1−G3、またはG3−L1−G3であり; G3はNR3、C(=O)、C(=S)、C(O)−O、C(O)−NH、 C (S)−O、C(S)−NHまたはS(O)2、NR3C(=O)、NR3C(= S)、NR3C(O)−O、NR3C(O)−NH、NR3C(S)−O、NR3C (S)−NHまたはNR3S(O)2であり; nは0または1であり;および jは1から6であり; ただし、nが0でありかつZがNH2、アデニン、グアニン、シトシン、ウラ シルまたはチミンであり、XまたはYの一つが5Hである場合、XまたはYの他 方はHではなく;および nが0でありかつQがアルキル−NHである場合、Zはビオチンまたはホスホ チロシニルではない] を有する化合物。 2.Yがヒドロキシル保護基である、請求項1記載の化合物。 3.Yがトリチル、メトキシトリチル、ジメトキシトリチルまたはトリメトキシ トリチルである、請求項2記載の化合物。 4.XがH、活性化ホスファイト基または固体支持体である、請求項1記載の化 合物。 5.Xがホスホルアミダイトである、請求項4記載の化合物。 6.nが1であり、Qがカルボニル、チオカルボニル、カルボキシ、アセチル、 アミド、スクシニル、カルバモイル、チオカルバモイル、ウレイド、チオウレイ ド、またはスルホンアミドアシル基である、請求項1記載の化合物。 7.Zが窒素含有複素環である、請求項1記載の化合物。 8.前記窒素含有複素環がイミダゾール、ピロールまたはカルバゾールである、 請求項7記載の化合物。 9.Zがイミダゾールまたはカルバゾールである、請求項8記載の化合物。 10.Zがプリンまたはピリミジンである、請求項1記載の化合物。 11.Xが活性化ホスファイト基であり、Yがヒドロキシル保護基であり、およ びZがアデニン、グアニン、シトシン、ウリジンまたはチミンである、請求項1 0記載の化合物。 12.Zがポリエチレングリコールである、請求項1記載の化合物。 13.Zが1から約20の炭素原子を持つアルキルである、請求項1記載の化合 物。 14.ZがC1−C6アルキル−NH2である、請求項1記載の化合物。 15.Zが6から約14の炭素原子を持つアリール、または7から約15の炭素 原子を持つアラルキルである、請求項1記載の化合物。 16.Zがフルオレニルメチル、フェニルまたはベンジルである、請求項15記 載の化合物。 17.Zがグルタミルである、請求項1記載の化合物。 18.構造II: 式中: XはH、ホスフェート基、活性化ホスフェート基、活性化ホスファイト基、固 体支持体、コンジュゲート基またはオリゴヌクレオチドであり; YはH、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基またはオリゴヌクレオチドで あり; EはOまたはSであり; EEはO-またはN(Y0)T0であり; Y0はHまたは[Q2jj−Z2であり; T0は[Q1kk−Z1であるかまたはY0およびT0は一緒に窒素複素環内に連 結されており; Q1およびQ2は独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキルまたはアルケニル、複素環、2から 10の炭素原子および1から4の酸素または硫黄原子を持つエーテル、ポリアル キルグリコールまたはC7−C14アラルキルであり; jjおよびkkは独立して0または1であり; Z1およびZ2は独立して、H、C1−C2アルキル、C2−C20アルケニル、C2 −C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、CH =O、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、CH(NR34)、N HC(=NH)NR34、CH(NH2)C(=O)OH、C(=O)NR34 、C(=O)OR5、金属配位基、レポーター基、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; ZはL1、L1−G1、L2、L2−G2、NR34、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; L1は1から約20の炭素原子を持つアルキル、2から約20の炭素原子を持 つアルケニル、または2から約20の炭素原子を持つアルキニルであり; L2は6から約14の炭素原子を持つアリールまたは7から約15の炭素原子 を持つアラルキルであり; G1はハロゲン、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、NHC( =NH)NR34、CH=O、C(=O)OR5、CH(NR34)(C(=O )OR5)、C(=O)NR34、金属配位基、またはホスフェート基であり; G2はハロゲン、OH、SH、SCH3、またはNR34であり; R1はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはヒドロキシル保護基 であり; R2はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはチオール保護基であ り; R3およびR4は独立してH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはア ミン保護基であり; R5はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、または酸保護基であり; QはL1、G3、L1−G3、またはG3−L1−G3であり; G3はNR3、C(=O)、C(=S)、C(O)−O、C(O)−NH、C( S)−O、C(S)−NHまたはS(O)2、NR3C(=O)、NR3C(=S )、NR3C(O)−O、NR3C(O)−NH、NR3C(S)−O、NR3C( S)−NHまたはNR3S(O)2であり; nは0または1であり; jは1から6であり;および mは1から50である] を有する化合物。 19.Yがヒドロキシル保護基である、請求項18記載の化合物。 20.Yがトリチル、メトキシトリチル、ジメトキシトリチルまたはトリメトキ シトリチルである、請求項19記載の化合物。 21.XがH、活性化ホスファイト基または固体支持体である、請求項18記載 の化合物。 22.Xがホスホルアミダイトである、請求項21記載の化合物。 23.nが1であり、Qがカルボニル、チオカルボニル、カルボキシ、アセチル 、アミド、スクシニル、カルバモイル、チオカルバモイル、ウレイド、チオウレ イド、またはスルホンアミドアシル基である、請求項18記載の化合物。 24.Zが窒素含有複素環である、請求項18記載の化合物。 25.前記窒素含有複素環がイミダゾール、ピロールまたはカルバゾールである 、請求項24記載の化合物。 26.Zがイミダゾールまたはカルバゾールである、請求項25記載の化合物。 27.Zがプリンまたはピリミジンである、請求項18記載の化合物。 28.Zがアデニン、グアニン、シトシン、ウリジンまたはチミンである、請求 項27記載の化合物。 29.nが0である、請求項28記載の化合物。 30.Zが1から約20の炭素原子を持つアルキルである、請求項18記載の化 合物。 31.ZがC1−C6アルキル−NH2である、請求項18記載の化合物。 32.Zが6から約14の炭素原子を持つアリール、または7から約15の炭素 原子を持つアラルキルである、請求項18記載の化合物。 33.Zがカルバゾール、フェニルまたはベンジルである、請求項32記載の化 合物。 34.Zがグルタミルである、請求項18記載の化合物。 35.mが1から約25である、請求項18記載の化合物。 36.EがOである、請求項18記載の化合物。 37.EがSである、請求項18記載の化合物。 38.前記モノマーのそれぞれのZ基が、あらかじめ定められた配列にある、請 求項18記載の化合物。 39.前記モノマーのそれぞれのZ基が、ランダム化配列にある、請求項18記 載の化合物。 40.ランダム化オリゴマー化合物を製造する方法であって、構造I: [式中: XはH、ホスフェート基、活性化ホスフェート基、活性化ホスファイト基、ま たは固体支持体であり; YはHまたはヒドロキシル保護基であり; ZはL1、L1−G1、L2、L2−G2、NR34、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; L1は1から約20の炭素原子を持つアルキル、2から約20の炭素原子を持 つアルケニル、または2から約20の炭素原子を持つアルキニルであり; L2は6から約14の炭素原子を持つアリールまたは7から約15の炭素原子 を持つアラルキルであり; G1はハロゲン、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、NHC( =NH)NR34、CH=O、C(=O)OR5、CH(NR34)(C(=O )OR5)、C(=O)NR34、金属配位基、またはホスフェート基であり; G2はハロゲン、OH、SH、SCH3、またはNR34であり; R1はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはヒドロキシル保護基 であり; R2はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはチオール保護基であ り; R3およびR4は独立してH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはア ミン保護基であり; R5はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、または酸保護基であり; QはL1、G3、L1−G3、またはG3−L1−G3であり; G3はNR3、C(=O)、C(=S)、C(O)−O、C(O)−NH、C( S)−O、C(S)−NHまたはS(O)2、NR3C(=O)、NR3C(=S )、NR3C(O)−O、NR3C(O)−NH、NR3C(S)−O、NR3C( S)−NHまたはNR3S(O)2であり; nは0または1であり;および jは1から6である] を有するモノマーの群を選択し;そして 前記群の少なくとも2つのモノマーを共有結合させて、前記化合物を形成する; ことを含む方法。 41.前記群の少なくとも1つのモノマーのZ成分が、前記群の他のモノマーの Z成分と異なる、請求項40記載の方法。 42.前記ランダム化オリゴマー化合物が、2から50個の前記モノマーを含む 、請求項40記載の方法。 43.請求項40記載の方法により製造されたオリゴマー化合物であって、2か ら25個の前記モノマーを含む化合物。 44.構造II: 式中: Xは、ホスフェート基、活性化ホスフェート基、活性化ホスファイト基、固体 支持体、コンジュゲート基またはオリゴヌクレオチドであり; YはH、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基またはオリゴヌクレオチドで あり; EはOまたはSであり; EEはO-またはN(Y0)T0であり; Y0はHまたは[Q2jj−Z2であり; T0は[Q1kk−Z1であるかまたはY0およびT0は一緒に窒素複素環内に連 結されており; Q1およびQ2は独立して、C2−C10アルキル、C2−C10アルケニル、C2− C10アルキニル、C4−C7炭素環式アルキルまたはアルケニル、複素環、2から 10の炭素原子および1から4の酸素または硫黄原子を持つエーテル、ポリアル キルグリコールまたはC7−C14アラルキルであり; jjおよびkkは独立して0または1であり; Z1およびZ2は独立して、H、C1−C2アルキル、C2−C20アルケニル、C2 −C20アルキニル、C6−C14アリール、C7−C15アラルキル、ハロゲン、CH =O、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、CH(NR34)、N HC(=NH)NR34、CH(NH2)C(=O)OH、C(=O)NR34 、C(=O)OR5、金属配位基、レポーター基、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; ZはL1、L1−G1、L2、L2−G2、NR34、窒素含有複素環、プリン、ピ リミジン、ホスフェート基、ポリエーテル基、またはポリエチレングリコール基 であり; L1は1から約20の炭素原子を持つアルキル、2から約20の炭素原子を持 つアルケニル、または2から約20の炭素原子を持つアルキニルであり; L2は6から約14の炭素原子を持つアリールまたは7から約15の炭素原子 を持つアラルキルであり; G1はハロゲン、OR1、SR2、NR34、C(=NH)NR34、NHC( =NH)NR34、CH=O、C(=O)OR5、CH(NR34)(C(=O )OR5)、C(=O)NR34、金属配位基、またはホスフェート基であり; G2はハロゲン、OH、SH、SCH3、またはNR34であり; R1はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはヒドロキシル保護基 であり; R2はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはチオール保護基であ り; R3およびR4は独立してH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、またはア ミン保護基であり; R5はH、1から約6の炭素原子を持つアルキル、または酸保護基であり; QはL1、G3、L1−G3、またはG3−L1−G3であり; G3はNR3、C(=O)、C(=S)、C(O)−O、C(O)−NH、C( S)−O、C(S)−NHまたはS(O)2、NR3C(=O)、NR3C(=S )、NR3C(O)−O、NR3C(O)−NH、NR3C(S)−O、NR3C( S)−NHまたはNR3S(O)2であり; nは0または1であり; jは1から6であり;および mは1から50である] を有するフランク領域の間におかれた、ホスホジエステルまたはホスホロチオエ ートオリゴヌクレオチドを含む中心領域を有する、キメラオリゴマー化合物。
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