JPH10507361A - 線虫から抽出されるセリンプロテアーゼ阻害剤および抗凝固性タンパク質 - Google Patents

線虫から抽出されるセリンプロテアーゼ阻害剤および抗凝固性タンパク質

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JPH10507361A JP8513399A JP51339996A JPH10507361A JP H10507361 A JPH10507361 A JP H10507361A JP 8513399 A JP8513399 A JP 8513399A JP 51339996 A JP51339996 A JP 51339996A JP H10507361 A JPH10507361 A JP H10507361A
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Abstract

(57)【要約】 抗凝固剤および/またはセリンプロテアーゼ阻害剤として有用であり、少なくとも1のNAPドメインを有するタンパク質を開示する。本発明のタンパク質のうちのあるものは第Xa因子阻害活性を有しており、他のもの第VIIa因子/TF阻害剤としての活性を有する。本発明のタンパク質は線虫のごとき天然源から、化学合成によって、または様々なDNA発現系を用いるリコンビナント法によって単離することができる。

Description

【発明の詳細な説明】 線虫から抽出されるセリンプロテアーゼ 阻害剤および抗凝固性タンパク質 関連出願の相互参照 この出願は、1995年10月18日に出願された米国特許出願第08/32 6,110号の一部継続出願である下記の米国特許出願(出願日はいずれも19 95年6月5日である)の一部継続出願である:第08/461,965号、第 08/465,380号、第08/486,397号および第08/486,39 9号。これらの特許出願の開示内容も本明細書の一部を成すものである。 発明の分野 この発明は特異的タンパク質およびセリンプロテアーゼ阻害剤であるこれらの タンパク質の組換え体(ヒト血漿の強力な抗凝固剤を含む)に関する。これらの タンパク質には線虫から抽出される特定のタンパク質が含まれる。別の観点によ れば、本発明は、生体外および生体内における血液凝固酵素の強力な特異的阻害 剤として有用なこれらのタンパク質を含有する組成物並びに血液凝固を防止する ための生体外診断剤または生体内治療剤としての該組成物の使用法に関する。さ らに別の観点によれば、本発明はmRNAおよびDNAを含みタンパク質をコー ドする核酸配列並びにベクター内において宿主細胞をトランスフェクトするか、 または形質転換させるための該配列の使用および他の種や生物において特定の関 連遺伝子を単離するプローブとしての該配列の使用に関する。 発明の背景と序論 正常な止血はクロットの形成過程(血液凝固)とクロットの溶解過程(線維素 溶解)の間の複雑なバランスの結果もたらされる。血球、特異的血漿タンパク質 および血管表面の間の複雑な相互作用によって、けががおこらない限り血液の流 動性は保持される。血液壁を裏打ちする内皮壁が損傷を受けると、その下部組織 はこれらの血液成分にさらされる。これが引き金となって、血液凝固を優先させ る止血バランスを変化させる一連の生化学反応が誘発され、該生化学反応によっ て出血を止める望ましい血栓形成または損傷器官への血液の低減もしくは停止を もたらす望ましくない血管内での閉塞性血栓形成がもたらされる。 血液凝固反応は、血漿中のセリンプロテアーゼの数種の特異的酵素前駆体が限 定的なタンパク質分解によって活性化される一連の増幅反応の完結である。この 一連の反応により、初期の止血栓もしくは血栓の安定化に必要なフィブリンと細 胞成分から成る不溶性マトリックスの形成がもたらされる。タンパク質分解活性 反応の開始と伝搬は、血管損傷部位の膜状表面に局在化された一連の増幅経路を 経ておこなわれる[マン(Mann、K.G.)、ネスハイム(Nesheim、M.E.)、チャ ーチ(Church、W.R.)、ハレイ(Haley、P.)およびクリシュナスワミイ(Kr ishnaswamy、S.)、Blood、第76巻、第1頁〜第16頁(1990年);ロウ ソン(Lawson、J.H.)、カラファチス(Kalafatis、M.)、ストラム(Stram, S.)およびマン(Mann、K.G.)、J.Biol.Chem.、第269巻、第233 57頁〜第23366頁(1994年)]。 血管損傷に対する血液凝固反応の開始後、セリンプロテアーゼ第VIIa因子およ び非酵素補因子である組織因子(TF)から成る触媒複合体が形成される[ラッ パポルト(Rappaport、S.I.)およびラオ(Rao、L.V.M.)、Arterioscle rosis and Thrombosis、第12巻、第1112頁〜第1121頁(1992年 )]。血管の局部的損傷後、この反応は循環する微量の第VIIa因子とそのチモー ゲン第VII因子に内皮下TFがさらされることによってもっぱら調節されると考 えられる。自己賦活によって、セリンプロテアーゼ第Xa因子の形成の原因とな る第VIIa/TF複合体の数が増加する。第VIIa因子/TF複合体のほかに、生成 する少量の第Xa因子が第IX因子の第IXα因子へのタンパク質分解性修飾によっ て凝固反応を開始させ、第IXα因子は第VIIa因子/TF複合体によって活性セリ ンプロテアーゼ第IXaβに変換されると考えられている[マン、クリシュナスワミ イおよびロウソン、Sem.Hematology.第29巻、第213頁〜第226頁( 1992 年)]。第Xa因子を多量に生成させる原因と考えられるのは活性化第VIIIa因子 と複合した第IXaβであり、該第Xa因子は次いで血液凝固カスケードの最後から 2番目のステップ(セリンプロテアーゼトロンビンの生成ステップ)を触媒する 。 第Xa因子はプロトロンビナーゼ複合体の形成後にトロンビンの形成を触媒す る(該複合体は、大抵の場合は損傷部位に付着する活性化血小板の表面上に形成 される基質プロトロンビン(第II因子)、非酵素補因子Vaおよび第Xa因子から成 る)[フスター(Fuster、V.)、バジモン(Badimon、L.)、バジモン(Badimon 、J.J.)およびケセブロ(Chesebro、J.H.)、New Engl.J.Med.、第 326巻、第310頁〜第318頁(1992年)]。動脈管構造においては、 プロトロンビナーゼによって触媒されたトロンビンの突発的な増幅的生成に起因 してこのプロテアーゼが局部的に高濃度で生成し、これによってフィブリンの生 成と付加的な血小板の漸増およびトランスグルタミナーゼチモーゲン第XIII因子 の活性化によるクロットの共有結合的安定化がもたらされる。さらに、凝固反応 はトロンビンによって仲介される非酵素補因子VとVIIIのタンパク質分解性フィ ードバック活性によって伝播され、これによってプロトロンビナーゼの生成とそ の後のトロンビン生成が促進される[ヘムカー(Hemker、H.C.)およびケッセ ルズ(Kessels、H.)、Haemostasis、第21巻、第189頁〜第196頁(1 991年)]。 血液凝固過程を妨げる物質(抗凝固剤)は血栓性障害の治療と予防における重 要な治療剤になることが明らかにされている[ケスラー(Kessler、C.M.)、Ch est、第99巻、第97頁〜第112頁(1991年);ケイルンス(Cairns、 J.A.)、ヒルシュ(Hirsh、J.)、ルイス(Lewis、H.D.)、レスネコフ(Res nekov、L.)およびセロー(Theroux、P.)、Chest、第102巻、第456頁 〜第481頁(1992年)]。現在、臨床的な使用が承認されている抗凝固剤 は血液凝固カスケードに対する作用効果が相対的に非特異的であるために多くの 副作用をもたらしている[レビン(Levine、M.N.)、ヒルシュ(Hirsh、J.) 、ランデフェルト(Landefeld、S.)およびラスコブ(Raskob、G.)、C hest、第102巻、第352頁〜第363頁(1992年)]。このため、抗凝 固治療の合併症を低減させる正の効果をもたらすこのプロセスにおける特異的反 応による選択的阻害によって凝固カスケードの活性をより効果的に調節できるよ り有効な抗凝固剤の開発が要請されるようになっている[ヴァイツ(Weitz、J.) およびヒルシュ、J.Lab.Clin.Med.、第122巻、第364頁〜第373 頁(1993年)]。別の観点によれば、このような開発研究は、血液凝固カス ケードの活性調節において内因性抗凝固剤として作用する正常なヒトタンパク質 に注目している。さらに、種々の食血性生物についての研究がなされている。こ れは、この種の生物が宿主に依存して生存している間およびその後で血液食を有 効に凝固させる能力を有するからであり、このことは、この種の生物が治療剤と して有用な有効な抗凝固剤成分を保有していることを示唆する。 血漿タンパク質である組織因子経路阻害剤(TFPI)は3つの連続したクニ ッッドメイン(Kunitz domain)を有しており、該阻害剤は第Xa因子の酵素活性 を直接的に阻害し、また、第Xa因子に依存して第VIIa因子−組織因子複合体の 酵素活性を阻害することが報告されている[サルベンセン(Salvensen、G.)お よびピッツォ(Pizzo、S.V.)著、「プロテイナーゼ阻害剤:α−マクログロ ブリン、セルピンおよびクニス」、「止血と血栓症」、第3版、第251頁〜第 253頁、J.B.リッピンコット社(J.B.Lippincott Company)1994 年発行、コルマン(R.W.Colman)ら編]。TFPIをコードするcDNA配列 が報告されており、また、31,950ダルトンの分子量と276個のアミノ酸 を有するクローン化タンパク質が報告されている[ブロツェ(Broze,,G.J. )およびギラード(Girad、T.J.)、米国特許第5,106,833号明細書、第 1欄(1992年)]。TFPIから誘導された種々のリコンビナントタンパク 質が報告されている[ギラードおよびブロツェ、ヨーロッパ特許第439,442 号明細書(1991年);ラスムッセン(Rasmussen、J.S.)およびノルトフ ァント(Nordfand、O.J.)、WO91/02753号(1991年);ブロツ ェおよびギラード、米国特許第5,106,833号明細書、第1欄(1992 年)]。 メキシコヒル(Haementeria officinalis)の唾液腺から抽出された119個 のアミノ酸から成るタンパク質であるアンチスタシンが第Xa因子の酵素活性を 阻害することが報告されている[ツスジンスキー(Tuszynski)ら、J.Biol.C hem.、第262巻、第9718頁(1987年);ヌッツ(Nutt)ら、J.Bi ol.Chem.、第263巻、第10162頁(1988年)]。アンチスタシンの アミノ末端のアミノ酸1〜58に対して高度の相同性を示す58個のアミノ酸と 6,000ダルトンの分子量を有するリコンビナントタンパク質が第Xa因子の酵 素活性を阻害することが報告されている[ツング(Tung、J.)ら、ヨーロッパ 特許第454,372号明細書(1991年10月30日);ツングら、米国特 許第5,189,019号明細書(1993年2月23日)]。 ヒメダニ(Ornithodoros moubata)から単離された60個のアミノ酸から成 るタンパク質であるマダニ(Tick)抗凝固ペプチド(TAP)が第Xa因子の酵 素活性は阻害するが、第VIIa因子の酵素活性は阻害しないことが報告されている [ワックスマン(Waxman、L.)ら、Science、第248巻、第593頁(199 0年)]。リコンビナント法によって調製されたTAPも報告されている[ブラウ スク(Vlausk、G.P.)ら、ヨーロッパ特許第419,099号明細書(1991 年);ブラウスクら、米国特許第5,239,058号明細書(1993年)]。 ヒトにも感染するイヌの鉤虫(Ancylostoma caninum)が生体外で血液凝固を 阻害する強力な抗凝固性物質を保有していることが報告されている[ロエブ(Lo eb、L.)およびスミス(Smith、A.J.)、Proc.Pathol.Soc.Philadelp hia、第7巻、第173頁〜第187頁(1904年)]。該鉤虫の抽出物がヒト 血漿中のプロトロンビン時間と部分トロンボプラスチン時間を延長し、その抗凝 固効果がトロンビンではなくて第Xa因子の阻害に起因することが報告されてい る[スペルマン(Spellman、Jr.J.J.)およびノッセル(Nossel、H.L.)、Am .J.Physiol.、第220頁、第922頁〜第927頁(1971年)]。比較的 最近になって、該鉤虫の可溶性タンパク質抽出物が生体外のヒト血漿中のプ ロトロンビン時間と部分トロンボプラスチン時間を延長することが報告されてお り、また、この抗凝固効果はトロンビンではなくてヒト第Xa因子の阻害[キャ ッペロ(Cappello、M.)ら、J.Infect.Diseases、第167巻、1474 頁〜第1477頁(1993年)]および第Xa因子と第VIIa因子の阻害[WO 94/25000号;米国特許第5,427,937号]に起因するとされている 。 ヒト鉤虫(Ancylostoma ceylanicum)も抗凝固性成分を保有することが報告 されている。該鉤虫の抽出物が生体外のイヌとヒトの血漿中のプロトロンビン時 間と部分トロンボプラスチン時間を延長することが報告されている[キャロル( Carroll、S.M.)ら、Thromb.Haemostas.(スツットガルト)、第51巻、 第222頁〜第227頁(1984年)]。 非食血性寄生虫アスカリス・スウム(Ascaris suum)の可溶性抽出物が抗凝 固性成分を含有することが報告されている。この種の抽出物は全血の凝固を遅延 させ、また、カオリン活性化部分トロンボプラスチン時間テストにおける凝血時 間を延長させるが、プロトロンビン時間テストにおける凝血時間は延長させない ことが報告されている[クロウフォード(Crawford、G.P.M.)ら、J.Paras itol.、第68巻、第1044頁〜第1047頁(1982年)]。 アスカリス・スウムから単離されたキモトロプシン/エラスターゼ阻害剤−1 とその主要なイソ型トリプシン阻害剤−1およびキモトリプシン/エラスターゼ 阻害剤−4がセリンプロテアーゼ阻害剤であって、5つのジスルフィド架橋を共 通のパターンとして有していることが報告されている[ベルナード(Bernard、V .D.)およびピーナスキー(Peanasky、R.J.)、Arch.Biochem.Biophys. 、第303巻、第367頁〜第376頁(1993年);ファング(Huang、K .)ら、Structure、第2巻、第679頁〜第689頁(1994年);グラスベ ルガー(Grasberger、B.L.)ら、Structure、第2巻、第669頁〜第67 8頁(1994年)]。しかしながら、報告されていいるセリンプロテアーゼ阻 害剤が抗凝固活性を有するという教示はなされていない。 アメリカ鉤虫の分泌物がヒト血漿の凝血時間を延長させ、蛍光性(fluorogeni c)成分によりヒトFXaのアミド分解活性を阻害し、マルチプルアゴニスト(mu ltiple agonist)で誘発される血小板の濃密顆粒(dense granule)放出を阻害 し、また、フィブリノーゲンを分解させることが報告されている[プリチャード (Pritchard、D.J.)およびファーミッジ(Furmidge、B.)、Thromb.Hae most.、第73巻、第546頁(1995年);WO95/12615号]。 発明の概要 本発明はセリンプロテアーゼ阻害活性および/または抗凝固活性を有しており 、少なくとも一つのNAPドメインを含有する単離されたタンパク質に関する。 本明細書においてかかるタンパク質を、線虫抽出抗凝固タンパク質(Nematode-ex tracted Anticoagulant Proteins)またはNAPと呼ぶことにする。「NAPド メイン」とは単離されたタンパク質またはNAPの配列であって、阻害活性を有 すると考えられる部分をいい、これについては以下に説明する。かかるタンパク 質の抗凝固活性は、プロトロンビン時間(PT)および活性化部分トロンボプラ スチン時間(aPTT)アッセイによって示されるヒト血漿凝血時間の増加によ って評価され、また同様に当該物質の血液凝固第Xa因子または第VIIa因子 /TF因子に対する阻害活性によっても評価される。NAPドメインはこれらの タンパク質に認められる抗凝固活性を担っていると考えられている。これらのタ ンパク質のいくつかはは少なくとも1のNAPドメインを有しており、このドメ インは約120アミノ酸残基より短いアミノ酸配列であり、10個のシステイン 残基を有している。 他に、本発明は抗凝固活性を示し、NAPドメインを有するタンパク質をコー ド化するcDNA分子を調製、単離する方法、およびこの方法により得られるリ コンビナントcDNA分子に関する。この方法は以下の工程: (a)cDNAライブラリーを線虫から構築する; (b)該cDNAライブラリーを適当なクローニングベクターへ連結させる;( c)該cDNAライブラリーを含有する該クローニングベクターを適当な宿主細 胞内へ導入する; (d)該宿主細胞のcDNA分子を、AAR GCi TAY CCi GAR TGY GGi GAR AAY GA R TGG[配列番号94](式中RはAまたはGであり、YはTまたはC、そしてiはイノシン である)の核酸配列のハイブリダイゼーションプローブを含有する溶液と接触さ せる; (e)該プローブとハイブリダイズするリコンビナントcDNA分子を検出する ;そして (f)該リコンビナントcDNA分子を単離する、 を有する。 他に、本発明は該cDNAによってコード化されるリコンビナントタンパク質 であって、抗凝固活性を有し、NAPドメインを含有しているものの製法、およ び該製法によって製造されるリコンビナントタンパク質に関する。この方法には 以下の工程: (a)cDNAライブラリーを線虫から構築する; (b)該cDNAライブラリーを適当なクローニングベクターへ連結させる;( c)該cDNAライブラリーを含有する該クローニングベクターを適当な宿主細 胞内へ導入する; (d)該宿主細胞のcDNA分子を、AAR GCi TAY CCi GAR TGY GGi GAR AAY GA R TGG[配列番号94]の核酸配列のハイブリダイゼーションプローブを含有する溶 液と接触させる; (e)該プローブとハイブリダイズするリコンビナントcDNA分子を検出する ; (f)該リコンビナントcDNA分子を単離する; (g)該リコンビナントタンパク質をコード化する該cDNA分子の核酸配列を 、適当な発現クローニングベクター内に連結する; (h)第2の宿主細胞を、該リコンビナントタンパク質をコード化する該核酸配 列を含有する発現クローニングベクターにて形質転換する; (i)形質転換された第2の宿主細胞を培養する;そして (j)第2の宿主細胞にて発現された該リコンビナントタンパク質を単離する、 を含有する。本明細書において、リコンビナントタンパク質の、COS細胞のご とき適当な発現系における産生について述べる際、「トランスフェクション」と いう用語は通常「形質転換」の語に代えて(時には交換可能に)使用するものと する。 他に本発明は、抗凝固活性を有し、NAPドメインを有しているリコンビナン トタンパク質をコード化するリコンビナントcDNAの調製方法であって、以下 の工程: (a)線虫からcDNAライブラリーを単離する; (b)該cDNAライブラリーをクローニングベクターに連結させる; (c)該cDNAライブラリーを含有する該クローニングベクターを宿主細胞内 へ導入する; (d)該宿主細胞のcDNA分子を第1および第2ハイブリダイゼーションプロ ーブを含有する溶液と接触させる、ここで第1ハイブリダイゼーションプローブ は以下の核酸配列: 第2ハイブリダイゼーションプローブは以下の核酸配列 を有する; (e)該プローブの混合物とハイブリダイズするリコンビナントcDNA分子を 検出する;そして (f)該リコンビナントcDNA分子を単離する; からなる方法を提供する。 さらにその他には本発明は抗凝固活性を有し、NAPドメインを含有するタン パク質をコード化するリコンビナントcDNAを製造する、以下の工程: (a)線虫からcDNAライブラリーを単離する; (b)該cDNAラィブラリーを適当なファージミド発現クローニングベクター へ連結する; (c)宿主細胞を該cDNAライブラリーを含有する該ベクターにて形質転換す る; (d)該宿主細胞を培養する; (e)該宿主細胞をヘルパーファージにて感染させる; (f)該cDNAライブラリーを含有するファージを、該宿主細胞から分離する ; (g)該cDNAライブラリーを含有する該ファージとビオチニル化ヒト第Xa 因子の溶液を合わせる; (h)ストレプトアビジンで被覆した固相を、該cDNAライブラリーを含有す る該ファージ、および該ビオチニル化したヒト第Xa因子を含有する該溶液へ接 触させる; (i)該ストレプトアビジン−被覆固相へ結合したファージを単離する;そして (j)リコンビナントcDNA分子を該ストレプトアビジン−被覆固相結合ファ ージから単離する; を含有する方法に関する。 好ましい態様において本発明は、図1、図3、図7Aから7F、図9、図13 Aから図13Hおよび図14に示した核酸配列から選択した核酸配列を有するリ コンビナントcDNAに関する。 本発明はまた、第Xa因子の触媒活性を阻害するNAP、第VIIa因子/T F因子複合体の触媒活性を阻害するNAPおよびセリンプロテアーゼの触媒活性 を阻害するNAPに関し、さらに該NAPをコード化する核酸およびその使用法 に関する。 定義 「アミノ酸」は天然のL-アミノ酸を示す;D-アミノ酸は、かかるD−アミノ 酸を含有するタンパク質が生理活性を保持している場合にのみこの語に含まれる ものとする。天然のL−アミノ酸には、アラニン(Ala)、アルギニン(Arg) 、アスパラギン(Asn)、アスパラギン酸(Asp)、システイン(Cys)、グル タミン(Gln)、グルタミン酸(Glu)、グリシン(Gly)、ヒスチジン(Hi s)、イソロイシン(Ile)、ロイシン(Leu)、リジン(Lys)、メチオニン( Mety)、フェニルアラニン(Phe)、プロリン(Pro)、セリン(Ser)、 トレオニン(Thr)、トリプトファン(Trp)、チロシン(Tyr)およびバリン (Val)を含む。 「アミノ酸残基」は以下の構造:(1)-NH-CH(R)-C(=O)-(式中、Rは L-プロリン以外のL-アミノ酸のα炭素側鎖基を示す);または(2)L-プロリン の場合には を有する基である。 「ペプチド」はアミノ酸がそのαアミノおよびカルボキシレート基がペプチド 結合を生成して結合している配列をいう。本明細書においてペプチド配列は、左 から右へアミノ基からカルボキシ方向に向かうよう記載する。 「タンパク質」は1またはそれ以上のペプチドを有する分子を示す。 「cDNA」はコンプリメンタリーDNAを示す。 「核酸」は塩基(すなわちプリンまたはピリミジン類)が糖リン酸骨格に結合 しているポリマーを示す。核酸にはDNAおよびRNAを含む。 「核酸配列」は核酸を含有するヌクレオシドの配列を示す。本明細書では核酸 配列は左から右へ、5’から3’に向かって記載する。 「リコンビナントDNA分子」は、天然には隣接しないDNAの断片を連結さ せて創造されるDNA分子をいう。 「mRNA」はメッセンジャーリボ核酸を示す。 「ホモロジー」はDNAまたはペプチド配列の類似の程度を示す。 「第Xa因子またはfXaもしくはFXa」は全て同じ意味であり、通常血液 凝固カスケード内の酵素であって、プロトロンビナーゼ複合体の一部として機能 して酵素トロンビンを生成させるセリンプロテアーゼを示すことが知られている 。 「第Xa因子阻害活性」の表現は、第Xa因子のその基質に対する触媒活性を 阻害する活性を示す。 「第Xa因子選択的阻害活性」の表現は、他のセリンプロテアーゼなどの他の 関連酵素と比して第Xa因子に選択的な阻害活性を意味する。 「第Xa因子阻害剤」という表現は、第Xa因子阻害活性を有する化合物を示 す。 「第VIIa因子/組織因子」または「第VIIa因子/TF」は同じ意味で あり、通常触媒的に活性なセリンプロテアーゼ凝固因子VIIa(第VIIa因 子)と非酵素タンパク質組織因子(TF)の複合体であり、該複合体が定義され た組成物のリン脂質膜上で組み立てられているものをいう。 「第VIIa因子/TF阻害活性」の表現は第Xa因子または触媒不活性な第 Xa因子誘導体の存在下における、第VIIa因子/TFの触媒活性を阻害する 活性を意味する。 「第VIIa因子/TF選択的阻害活性」の表現は、第VIIa因子および第 Xa因子を含む他のセリンプロテアーゼなどの他の関連酵素と比して第VIIa 因子/TFに対して選択的である阻害活性を意味する。 「第VIIa因子/TF阻害剤」という表現は、第Xa因子または触媒不活性 な第Xa因子誘導体の存在下における、第VIIa因子/TFの触媒活性を阻害 する活性を有する化合物である。 「セリンプロテアーゼ」は通常、ヒスチジン、アスパラギン酸およびセリンの 三つ組み(triad)アミノ酸を有し、触媒的にアミド結合を切断する、この三つ組 み内のセリン残基は触媒による切断において共有結合的に含まれる。セリンプロ テアーゼは触媒性三つ組み内のセリン残基へ共有結合的な修飾がジイソプロピル フルオロホスフェート(DFP)によりなされた場合には不活性化される。 「セリンプロテアーゼ阻害活性」はセリンプロテアーゼの触媒活性を阻害する 活性を意味する。 「セリンプロテアーゼ選択的阻害活性」は一つのセリンプロテアーゼに対して 、他のセリンプロテアーゼと比して選択的に示される阻害活性を意味する。 「セリンプロテアーゼ阻害剤」はセリンプロテアーゼ阻害活性を有する化合物 である。 「プロトロンビナーゼ」は、セリンプロテアーゼ凝固因子Xaと非酵素タンパ ク質第Va因子の触媒活性複合体を意味すると一般に知られている語であり、複 合体は規定された組成物のリン脂質膜上で組み立てられる。 「抗凝固活性」は血液の凝固を阻害する活性を意味し、これには血漿の凝血も 含まれる。 「選択的」、「選択的に」およびこれらと置換し得る語は、特定の酵素に対す るNAP活性の場合には、NAPが特定の酵素を、他の関連酵素の阻害より少な くとも10倍の強度で阻害することを意味する。この場合に、NAP活性はこの 特定の酵素に対して選択的である。 「実質的に同一」の語はタンパク質、アミノ酸配列、cDNA、ヌクレオチド 配列等に用いる場合には、少なくとも約90%のホモロジーを他のタンパク質、 cDNAまたは配列に対して示すことを意味する。 「NAP」または「NAPタンパク質」は少なくとも1のNAPドメインを含 有しており、セリンプロテアーゼ阻害活性をおよび/または抗凝固活性を有する 単離されたタンパク質を意味する。 図面の簡単な説明 図1はAcaNAP5 cDNA[配列番号3]のヌクレオチド配列を示す。 番号付はcDNAの最初のヌクレオチドから始めている。翻訳の開始は最初のA TGコドン(第14位);第2枠内ATGは20位に存在する。 図2は成熟AcaNAP5[配列番号4]のアミノ酸配列を示す。 図3はAcaNAP6 cDNA[配列番号5]のヌクレオチド配列を示す。 番号付はcDNAの最初のヌクレオチドから始めている。翻訳は最初のATGコ ドン(第14位)から開始する;第2枠内ATGは20位に存在する。 図4は成熟AcaNAP6のアミノ酸配列[配列番号6]を示す。AcaNA P5と異なるアミノ酸には下線を付している。かかるアミノ酸の置換に加えて、 AcaNAP6はAcaNAP5と比較した場合に2つのアミノ酸の欠失(プロ −プロ)を含む。 図5はプロ−AcaNAP5のアミノ酸配列[配列番号7]を示す。 図6はプロ−AcaNAP6のアミノ酸配列[配列番号8]を示す。プロ−A caNAP5と異なるアミノ酸に下線を付した。かかるアミノ酸の置換に加えて 、プロ−AcaNAP6はプロ−AcaNAP5と比較した場合に2つのアミノ 酸の欠失(プロ−プロ)を含む。 図7Aから図7Fはアンサイロストマ セイラニカム(Ancylostoma ceylanicu m )、アンサイロストマ デュオデナール(Ancylostoma duodenale)およびヘリグ モソモイデスポリギルス(Heligmosomoides polygyrus)から単離された特定のN APタンパク質cDNAのヌクレオチド配列および演鐸されるアミノ酸配列を示 す。図7Aは、アンサイロストマ セイラニカムから単離されたAcaNAP4 のリコンビナントcDNA分子[配列番号9]を示す。図7Bは、アンサイロス トマ セイラニカムから単離されたAcaNAP5のリコンビナントcDNA分 子[配列番号10]を示す。図7Cは、アンサイロストマ セイラニカムから単 離されたAcaNAP6のリコンビナントcDNA分子[配列番号11]を示す 。図7Dは、アンサイロストマ デュオデナールから単離されたAduNAP 4のリコンビナントcDNA分子[配列番号12]を示す。図7Eは、アンサイ ロストマ デュオデナールから単離されたAduNAP7のリコンビナントcD NA分子[配列番号13]を示す。図7Fは、ヘリグモソモイデス ポリギルス から単離されたHpoNAP5のリコンビナントcDNA分子[配列番号14] を示す。リコンビナントcDNA分子の5'−末端に対応するEcoRI部位は すべての配列において同一である(下線)。各配列の番号付けはこのEcoRI 部位より開始している。AceNAP4およびAduNAP7はそれぞれ2つの NAPドメインを有するタンパク質をコードする;この図に示した他のすべての クローンは1個のNAPドメインを有するタンパク質をコードする。AduNA P4cDNAクローンは全長ではない、というのは他のアイソフォームにはある 、コード領域の5’−末端部分をこのリコンビナントcDNAは欠いている。 図8Aから図8CはそれぞれベクターpDONG61(図8A)[配列番号1 5]、pDONG62(図8B)[配列番号16]、およびpDONG63(図 8C)[配列番号17]のヌクレオチド配列を示す。図示されているHindII I−BamHIフラグメントはpUC119のHindIII部位とBamHI部位 の間に存在している。これらのベクターはcDNAをSfiI−NotIフラグ メントとして、糸状ファージ遺伝子6の下流の3つの異なるリーディングフレー ム内へとクローニングすることができる。すべての関連制限部位を示している。 373〜375位にあるAAAのLysをコードするトリプレットが遺伝子6の 最後のコドンである。遺伝子6にコードされるタンパク質にはGly−Gly− Gly−Ser−Gly−Gly[配列番号18]リンカー配列が続いている。 図9はリコンビナントcDNAのヌクレオチド配列、AcaNAPc2 cD NA[配列番号19]を示す。cDNAの5'−末端に対応するEcoRI部位 を示した(下線部分)。番号付けはこのEcoRI部位から開始している。演繹 されたアミノ酸配列もまた示した;翻訳リーディングフレームは遺伝子6融合パ ートナーにより決定された。AcaNAPc2 cDNAはコーディング領域の 5’末端部分を欠いている;AcaNAP5およびAcaNAP6とのホモロジ ーにより最初の7つのアミノ酸残基が分泌シグナルに属することが示唆される。 図10Aおよび10Bは特定のNAPタンパク質がクエン酸化正常ヒト血漿の プロトロンビン時間(PT)(図10A)および活性化部分トロンボプラスチン 時間(aPTT)(図10B)の測定値に及ぼす影響を調べたものである。黒丸 (●)はPro−AcaNAP5を;白抜き三角(△)はAcaNAP5を(表 2のAcaNAP5a);白抜き丸(○)は天然のAcaNAP5の値を示す。 図11は様々な線虫から単離されたNAP cDNAによりコードされる一連 のアミノ酸配列を示す。AcaNAP5[配列番号20]、AcaNAP6[配 列番号21]、およびAcaNAPc2[配列番号128]はアンサイロストマ カニナム(Ancylostoma caninum)から単離されたものである。AceNAP 5[配列番号22]、AceNAP7[配列番号23]、およびAceNAP4 (AceNAP4d1[配列番号24]およびAceNAP4d2[配列番号2 5])はアンサイロトマ セイラニカムから単離されたものである。AduNA P4[配列番号26]およびAduNAP7(AduNAP7d1[配列番号2 7]およびAduNAP7d2(配列番号28])はアンサイロストマ デュオ デナールから単離されたものである。HpoNAP5[配列番号29]はヘリグ モソモイデス ポリギルスから単離されたものである。この図に示されたアミノ 酸配列は、図1、3、7Aから7Fおよび9に開示されたものである。成熟Ac aNAP5[配列番号4]およびAcaNAP6[配列番号6](図2及び図4 参照)は、10個のシステイン残基(1から10まで番号を付し、太字で記載し ている)によってその性質の一部が決定されている。この図のすべてのアミノ酸 配列には少なくとも1のNAPドメインを含有する。AceNAP4 cDNA は2つの隣接領域、AceNAP4d1[配列番号24]とAceNAP4d2 [配列番号25]からなり、これらは第1(d1)および第2(d2)NAPド メインをコードする;同様に、AduNAP cDNAも2つの隣接領域Adu NAP7d1[配列番号27]およびAduNAP7d2[配列番号28]から なり、それぞれ第1(d1)および第2(d2)のNAPドメインをコードする 。 すべてのNAP−ドメインの一連のアミノ酸配列をシステインによって整理する ;システインの列を保持するために特定の部位へダッシュ(---)を導入してい るが、この記号は当該部位にアミノ酸が無いことを示している。cDNAがコー ドするタンパク質のカルボキシ末端の残基の後に「end」という語を付した。 図12Aおよび12BはPパストリス(P.pastoris)pYAM7SP8発現/分 泌ベクター(図12A)の地図およびこのベクター内に含まれる配列(図12B )を示す[配列番号30]。図12Aに示されるように、このプラスミドは以下 の要素が、メタノール誘導性AOX1プロモーター(5'AOX非翻訳領域内の 濃矢印)およびAOX1転写終結シグナル(3'T)の間に挿入されている:酸 ホスファターゼ分泌シグナル(S)をコードする合成DNAフラグメント、Ly s−Argプロセシング部位とともにKEX2プロテアーゼおよびマルチクロー ニング部位をコードする合成19−アミノ酸プロ配列(P)。GS115形質転 換において選択マーカーとなるHIS4遺伝子は部位特異的変位誘発によって tu 1認識配列(HIS4*)が除去されるよう、修飾されている。pBR32 2配列にはBla遺伝子およびE.coli内で増幅するための起点(Ori) を含有しており、これは一本線として示されている。図12BはpYAM7SP 8内に導入される以下の連続的なDNA配列を示している:酸ホスファターゼ(PH01 )分泌シグナル配列、プロ配列およびマルチクローニング部位(MCS )配列。PH01分泌シグナルのATG開始コドンに下線を付した。 図13Aから図13Hはアンサイロストマ カニナムから単離された特定のN APタンパク質のcDNAのヌクレオチド配列および演繹アミノ酸配列を示す。 図13AはリコンビナントcDNA分子AcaNAP23[配列番号31]を示 す。図13BはリコンビナントcDNA分子AcaNAP24[配列番号32] を示す。図13CはリコンビナントcDNA分子AcaNAP25[配列番号3 3]を示す。図13DはリコンビナントcDNA分子AcaNAP31、Aca NAP42およびAcaNAP46を示し、これらのすべては同一である[配列 番号34]。図13EはリコンビナントcDNA分子AcaNAP44[配列番 号35]を示す。図13FはリコンビナントcDNA分子AcaNAP45[配 列番号36]を示す。図13GはリコンビナントcDNA分子AcaNAP47 [配列番号37]を示す。図13HはリコンビナントcDNAAcaNAP48 [配列番号38]を示す。EcoRI部位はリコンビナントcDNA分子の5’ −末端に対応するが、すべての配列において下線をひいて示している。各配列の 番号付はこのEcoRI部位から始めた。AcaNAP45およびAcaNAP 47はそれぞれ2つのNAPドメインを含有するタンパク質をコードする;この 図における他のすべてのクローンは一個のNAPドメインのみをコードする。 図14はリコンビナントcDNA分子NamNAPのヌクレオチドおよび演繹 アミノ酸配列を示す[配列番号39]。 図15はAcaNAP5および低分子量ヘパリン(LMWH;エノキサパリン (登録商標))の抗血栓活性活性を、FeCl3人工血栓モデルによって調べた 結果を示す。活性のデータは頚動脈における閉塞性血栓生成の発生率(%)によ って示す(白丸)。血栓生成は被験剤の皮下投与(s.c.)の150分後から 認められた。深部傷出血をFeCl3を加える以外は同様に処理した別のグルー プの動物において調べた(四角)。首の深部手術傷における血液の消失は、化合 物の皮下投与から210分の間の合計として定量した。 図16は以下の方法により単離された成熟NAP一連のアミノ酸配列を示す: 即ちAcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41]、Ac aNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、AcaN AP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、AcaNAP 44[配列番号46]、AcaNAP31、42、46[配列番号47]、Ac eNAP4d1[配列番号48]、AceNAP4d2[配列番号49]、Ac eNAP45d1[配列番号50]、AceNAP47d1[配列番号51]、 AduNAP7d1[配列番号52]、AcaNAP45d2[配列番号53] 、AcaNAP47d2[配列番号54]、AduNAP4[配列番号55]、 AduNAP7d2[配列番号56]、AceNAP5[配列番号57]、Ac e NAP7[配列番号58]、AcaNAPc2[配列番号59]、HpoNAP 5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号61]である。各NAPドメ インには10個のシステイン残基を含み、これらの基準に配列を一列に並べてお り、そしてシステインの間のアミノ酸を規定している。A1からA10はシステ イン残基の間のアミノ酸配列を示す。 図17は2つのNAPドメインを有する成熟AceNAP4[配列番号62] のアミノ酸配列を示す。 図18は2つのNAPドメインを有する成熟AcaNAP45[配列番号63 ]のアミノ酸配列を示す。 図19は2つのNAPドメインを有する成熟AcaNAP47[配列番号64 ]のアミノ酸配列を示す。 図20は2つのNAPドメインを有する成熟AduNAP7[配列番号65] のアミノ酸配列を示す。発明の詳細な説明 本発明はタンパク質のファミリーに関する。正確には線虫抽出抗凝固タンパク 質(Nematode-extracted Anticoagulant Proteins:NAP)に関する。これらの タンパク質は最初に単離された成分が線虫である犬鉤虫(canine hookworm)アン サイロストマ カニナムから抽出されたことからこう呼ばれるようになった。し かしながらNAPまたはNAPドメインの名前から本発明のタンパク質が、この 源または他の天然の源に限定されるものと考えるべきではない。 各NAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメインを有し、そしてセリンプ ロテアーゼ阻害および/または抗凝固活性を有していることにより特徴付けられ る。かかる抗凝固活性は、第Xa因子または第VIIa因子/TF活性の阻害に よる本明細書にて述べるPTおよびaPTTアッセイの両方において凝血時間の 増加によって、またはインビボによる活性により評価される。好ましくは、かか るアッセイにおいて用いられる血液または血漿は線虫に感染することが知られて いる種、例えば豚、ヒト、霊長類等のものを用いる。NAPドメインは、アミノ 酸配列である。このNAPドメインが観察される阻害および/または抗凝固活性 に関与していると考えられている。代表的なNAPドメインは図11および16 に記載のアミノ酸配列を有しており、特にこれらの図においてシスティン1とシ ステイン10と名付けられているシステイン残基の間のアミノ酸配列、およびシ ステイン10の後に続く配列を有している。このタンパク質のファミリーの性質 を大まかに規定する性質、さらにかかるタンパク質をコードするmRNA配列お よびDNA配列を含む核酸分子を提供する。これらのタンパク質の調製方法およ びかかるタンパク質をコードする核酸分子の調製方法もまた提供する。特定の実 施例においては、例示のためのみ、タンパク質の他のNAPファミリーおよびそ れをコードする核酸配列が、実施例および以下に概略した方法にて得られる。 本発明のタンパク質には単離されたNAPを含み、これららは抗凝固活性を有 し少なくとも1のNAPドメインを含むタンパク質を含む。 「抗凝固活性」については、本発明の精製タンパク質は抗凝固剤として有用で あり、抗凝固剤は血漿の凝固を含む、血液の凝固阻害活性により特徴付けられる 。ある観点においては、好ましい本発明の単離されたタンパク質には、プロトロ ンビン時間(PT)および活性化部分トロンボプラスチン時間(aPTT)の両 方により示されるヒト血漿の凝固時間を増加させるものを含む。 PTアッセイにおいて、凝固は一定量の組織因子−ホスフォリピドミセル複合 体(トロンボプラスチン)をヒト血漿に添加することにより開始される。抗凝固 剤はこの複合体表面における特定の相互作用を妨害し、抗凝固剤を含有しない系 で認められる凝血に対して、凝血に達するために必要とされる時間が増加する。 PTの測定は特にNAP抗凝固活性の評価に適している、というのはこのアッセ イにおいて凝血に必要な一連の特定の生化学的事象は、天然において鉤虫が栄養 摂取を容易にするための機構と同一だからである。従って、このアッセイにおい てNAPが阻害剤として作用する能力は天然におけるその作用とパラレルであり 得、これはインビボにおける抗凝固活性を示唆するものとなる。両方のアッセイ および天然において、凝固反応はセリンプロテアーゼである第VIIa因子、組 織因子(TF)のバイナリー複合体(第VIIa因子/TF)の形成により開始 され、第Xa因子を生成する。続く第Xa因子のプロトロンビナーゼ複合体への 組み込みがトロンビンの形成を導くキーとなる事象であり、そしてこれにより凝 血が導かれる。 aPTTアッセイにおいて、凝血は特定量の負にチャージしたリン脂質ミセル (活性化剤)のヒト血漿への添加により開始する。抗凝固剤として作用する物質 は、複合体の表面上の特定の相互作用を妨害し、そして一定量の凝血が生じるま での時間を、該剤が無い場合と比して増加させる。実施例BはPTおよびaPT Tアッセイを示す。これらのアッセイは本発明の単離されたNAPの抗凝固活性 を評価するのに用いることができる。 本発明の好ましい単離NAPには、PTアッセイにおけるヒト血漿の凝血時間 を、約1から約500ナノモルの濃度で2倍とし、aPTTアッセイにおけるヒ ト血漿凝血時間を、約1から約500ナノモルの濃度で2倍とするものである。 特に好ましいのは、PTアッセイにおいてヒト血漿凝血時間を約5から約100 ナノモルの濃度で2倍とし、aTPPアッセイにおいてヒト血漿凝血時間を約5 から約200ナノモルの濃度にて2倍とするタンパク質である。特により好まし いものはPTアッセイにおけるヒト血漿凝血時間を、約10から約50ナノモル の濃度にて2倍とし、aPTTアッセイにおけるヒト血漿凝血時間を約10ナノ モルから約100ナノモルの濃度にて2倍とするタンパク質である。 本発明のNAPの抗凝固または抗血栓活性は実施例Fに示したインビボモデル を用いて評価することができる。実施例のパートAに開示したラットFeCl3 モデルは、血小板依存性動脈血栓モデルで、通常抗血栓性化合物の評価に用いら れているモデルである。このモデルは被験化合物がラット頸動脈の切片において FeCl3が誘導する閉塞性血栓の生成を抑制する能力を調べるものである。本 発明のNAPは、静脈内または皮下に投与した場合、このモデルにおいて有効な 抗凝固剤であった。実施例FのパートBに示した深部傷出血アッセイは抗凝固性 化合物の投与後の血液の損失を測定するものである。抗凝固剤の所望の抗凝固活 性は、血液凝固または血栓生成を阻害するが、凝固を完全に抑制して出血を促進 するほど強くはないようにするものである。すなわち、深部傷出血アッセイは抗 凝固剤の投与後3.5時間の間の血液の消失を測定する。図15に示されたデー タは本発明のNAPが、過剰な出血を生じさせない濃度において有効な抗血栓化 合物であることを示す。これに対して、低分子量ヘパリン(LMWH)の、閉塞 を0%とする濃度では、NAPの有効濃度投与時の約3倍の出血をもたらした。一般的NAPドメイン[式I] 「NAPドメイン」に関して、本発明の単離されたタンパク質(またはNAP )には少なくとも1のNAPドメインをそのアミノ酸配列に含んでいる。特定の NAPドメインは分子量約5.0から10.0キロダルトン、好ましくは約7. 0から10.0キロダルトンであり、10個のシステイン残基を含有するアミノ 酸配列を有する。 本発明の特定の好ましい単離NAPには少なくとも1のNAPドメインを含み 、各NAPドメインはさらにアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A9−Cys(式I) (式中:(a)A1は7から8アミノ酸残基を有するアミノ酸配列;(b)A2は 2から5のアミノ酸残基を有するアミノ酸配列;(c)A3は3アミノ酸残基を 有するアミノ酸配列;(d)A4は6から17アミノ酸残基を有するアミノ酸配 列;(e)A5は3から4アミノ酸残基を有するアミノ酸配列;(f)A6は3 から5アミノ酸残基を含有するアミノ酸配列;(g)A7は1のアミノ酸残基; (h)A8は10から12アミノ酸残基を有するアミノ酸配列;および(i)A9 は5から6アミノ酸残基を有するアミノ酸配列である。) を含む。これとほんの少し異なる他のNAPドメインを含有するNAP(式II から式V参照)もまた本発明の範囲内である。 特に好ましいNAPドメインはA2が4から5アミノ酸残基を含有するアミノ 酸配列であり、A4が6から16アミノ酸残基を含有するアミノ酸配列であるも のを含む。より好ましくは、NAPドメインのうち(a)A1の4番目のアミノ 酸残基がGluである;(b)A2の第1アミノ酸残基がGlyである;(c) A8の3番目のアミノ酸残基がGlyであり、6番目がArgである;そして8 d)A9の第1アミノ酸残基がValであるものである。より好ましくは、A3の 第1アミノ酸残基がAspまたはGluであり、3番目のアミノ酸残基がLys またはArgであり、A7がValまたはGlnであるものである。さらに、よ り好ましくはA8がLeuまたはPheをその4番目のアミノ酸残基として有し ており、LysまたはTyrをその5番目のアミノ酸残基として有する。また、 好ましいNAPドメインにはA8が11または12アミノ酸残基を有し、Asp またはGlyがその最後から2番目のアミノ酸残基であり、A8が10アミノ酸 を含有してGlyがその10番目のアミノ酸残基であるものもまた含まれる。リ コンビナントタンパク質を特定の発現系において発現させるため、リコンビナン トNAPにはさらに適当な分泌シグナルのアミノ酸配列を含んでいてもよい。特 定の代表的なNAPドメインは図11及び図16に示した配列を含み、特にシス テイン1およびシステイン10と名付けられたシステインの間(そしてこれを含 む)およびシステイン10の後の配列が挙げられる。 本発明の好ましい態様において、少なくとも1の式IのNAPドメイン(式中 、NAPドメインにはアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A9−Cys−A10(式 中:(a)Cys−A1は配列番号66および129から選択される;(b)C ys−A2−Cysは配列番号130から133までから選択される;(c)A 3−Cys−A4は配列番号134から135までから選択される;(d)Cy s−A5は配列番号146および147から選択される;(e)Cys−A6は 配列番号148から配列番号150までから選択される;(f)Cys−A7− Cys−A8は配列番号151から153までから選択されるおよび、(g)C ys−A9−Cysは配列番号154および配列番号155から選択される。ま た、Cys−A2−Cysで示される、配列番号130および131から選択さ れるタンパク質、A3−Cys−A4で示される、配列番号135から145ま でのうちから選択されるタンパク質もまた好ましい。より好ましくは、配列番号 66および129の5位にGluを有する;配列番号130および131の2位 にGlyを含有する;配列番号151から153の、6位にGlyを、そして9 位にArgを含有する;および配列番号154および155の、2位にValを 含有するNAPドメインを含有するタンパク質が挙げられる。より好ましくは配 列番号151から153の2位にValまたはGluを有し、7位にLeuまた はPheを有しおよび/または8位にLysまたはTyrを含有するものである 。よりさらに好ましいのは、配列番号151の14位にAspまたはGlyを有 するもの;配列番号152の13位にAspまたはGlyを有するもの;および 配列番号153の13位にGlyを有するものが挙げられる。 本発明の特定のNAPは、凝固カスケードにおける特定の成分、例えば第Xa 因子または第VIIa因子/TF複合体のごとき成分の特異的な阻害を示す。N APの阻害活性の凝血カスケードにおける1成分への特異性は実施例Dのプロト コールにて評価される。NAPの、凝固カスケードに含まれるさまざまなセリン プロテアーゼ類への作用は実施例Dに示したプロトコールによって評価すること ができる。実施例Dでは、凝固に含まれる様々なセリンプロテアーゼの活性を阻 害するNAPの活性を測定し、比較した。NAPの第VIIa因子/TF複合体 の活性に対する阻害作用についても実施例Eのプロトコールにより評価すること ができ、これはNAPが第Xa因子へ阻害的または非阻害的な態様で結合する能 力を測定し、そして第VIIa因子がTFと複合体を形成する際に阻害する能力 を測定するものである。AcaNAP5およびAcaNAP6はNAPドメイン を有し、特異的に第Xa因子を阻害するタンパク質の例である。AcaNAPc 2はNAPドメインを有し、第VIIa因子/TF複合体を、第Xa因子または その触媒的に活性もしくは非活性の誘導体の存在下において選択的な阻害を示す タンパク質である。抗凝固活性を有するNAP、第Xa因子阻害活性を有するNAPも含む(式II) 本発明のNAPにはさらに、抗凝固活性を有する単離されたタンパク質を含み 、これには第Xa因子阻害活性を有し、1または複数のNAPドメインを有し、 それぞれのNAPドメインが以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−CyS−A5− Cys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A9−Cys−A10( 式II) (式中、 (a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1のアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; A2、A4、A6およびA10はそれぞれ独立して選択される数の、独立して選 択されるアミノ酸残基であり、各配列は各NAPドメインが全部で約120アミ ノ酸残基を有するように選択される。) を有する単離タンパク質を含む。 本発明のNAPタンパク質を含有する医薬組成物、およびNAPタンパク質を 投与することを含む血液凝固の阻害方法もまた、本発明の範囲に含まれる。 この観点における本発明のNAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメイン を有する。好ましくはNAPは1または2のNAPドメインを有する。NAPタ ンパク質AcaNAP5[配列番号4および40]およびAcaNAP6[配列 番号6および41]は1のNapドメインを有し、本発明のNAPとして好まし い。 本発明のある態様において好ましいNAPタンパク質は、A2が3から5アミ ノ酸残基のアミノ酸配列であり、A4が6から19アミノ酸残基のアミノ酸配列 であり、A6が3から5アミノ酸残基のアミノ酸配列であり、そしてA10が5 から25アミノ酸残基のアミノ酸配列であるものである。 すなわち、好ましい態様によれば、本発明は抗凝固活性を有する単離されたタ ンパク質を提供し、これには第Xa因子阻害剤としての活性を有するタンパク質 であって、少なくとも1の式IIのNAPドメイン: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5− Cys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A9−Cys−A10 (式中、 (a)Cys−A1は配列番号67および156から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号157から159までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号160から173までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号174および175から選択される; (e)Cys−A6は配列番号176から178までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号179および180から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号181から183までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号184から204までから選択される を含有するものが含まれる。 本発明の他の好ましい態様においては、A3はGlu−A3a−A3bの配列 を有する(式中、A3aおよびA3bは独立して選択されるアミノ酸残基である) 。より好ましくはA3aはAla、Arg、Pro、Lys、Ile、His、 Leu、およびThrからなる群から選択され、A3bはLys、Thrおよび Argからなる群から選択される。特に好ましいA3の配列はGlu−Ala− Lys、Glu−Arg−Lys、Glu−Pro−Lys、Glu−Lys− Lys、Glu−Ile−Thr、Glu−His−Arg、Glu−Leu− LysおよびGlu−Thr−Lysからなる群から選択される。 本発明の付加的に好ましい態様においては、A4は全体として負電荷を有する アミノ酸配列である。 本発明のこの観点からは、好ましいA7アミノ酸残基はValまたはIleで ある。 本発明の他の好ましい具体例は、A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c −A8d−A8e−A8f−A8g (式中、(a)A8aはA8の第1アミノ酸残基である; (b)少なくともA8aおよびA8bの少なくとも1方はGluまたはAspで ある;そして (c)A8cからA8gはそれぞれ独立して選択されるアミノ酸残基である) で示されるものを含む[配列番号68]。 好ましくはA8cはGlyであり、A8dはPhe、TyrおよびLeuから なる群から選択され、A8eはTyrであり、A8fはArgであり、A8gは AspおよびAsnから選択される。特に好ましいA8c−A8d−A8e−A 8f−A8g配列としては、以下の群Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp [配列番号69]、Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70] 、Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、Gly−Tyr −Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、およびGly−Leu−Tyr− Arg−Asp[配列番号73]である。 その他の好ましい態様は、A10がGlu−Ile−Ile−His−Val [配列番号74]、Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75] 、Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]およびM et−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ばれ るものである。 NAPタンパク質AcaNAP5およびAcaNAP6はアミノ酸配列Glu −Ile−Ile−His−Val[配列番号74]をA10に有しており、こ れは本発明のこの態様において好ましいNAPである。 本発明のこの観点のある態様においては、好ましいNAP分子は (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立して選 択されるアミノ酸残基である)である; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValおよびIleからなる群から選択される; (d)A8がGly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、Gl y−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、Gly−Tyr−Ty r−Arg−Asp[配列番号71]、Gly−Tyr−Tyr−Arg−As n[配列番号72]、およびGly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番 号73]からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、そして (e)A10がGlu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、A sp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、Phe−Ile−T hr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]およびMet−Glu−Ile −Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ばれるアミノ酸配列を含有 する; ものである。 この態様のNAPタンパク質を含有する医薬組成物およびこの態様のNAPタ ンパク質を投与することを含む血液凝固阻害方法もまた、本発明の範囲内である 。この態様のNAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメインを有する。好ま しくはNAPは1または2のNAPドメインを有する。AcaNAP5およびN caNAP6のNAPタンパク質は1のNAPドメインを有しており、本発明の この態様において好ましいNAPである。 他の好ましい態様においては、NAP分子は (a)A3がGlu−Ala−Lys、Glu−Arg−Lys、Glu−Pr o−Lys、Glu−Lys−Lys、Glu−Ile−Thr、Glu−Hi s−Arg、Glu−Leu−LysおよびGlu−Thr−Lysからなる群 から選択される; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8が、A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配 列番号78]、A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配 列番号79]、A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配 列番号80]、A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配 列番号81]、およびA8a−A8b−Gly−Leu−Tyr−Arg−As p[配列番号82](式中、A8aおよびA8bのうちの少なくとも1つはGl uまたはAspである); (e)A9がアミノ酸残基5のアミノ酸配列である; (f)A10がGlu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、A sp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、Phe−Ile−T hr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]およびMet−Glu−Ile −Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ばれる、 ものである。この態様において、NAPタンパク質を含有する医薬組成物および この態様のNAPタンパク質を投与することを含む血液凝固阻害方法もまた、本 発明の範囲内である。この態様のNAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメ インを含有する。好ましくはNAPは1または2のNAPドメインを有する。好 ましいものは少なくとも1のNAPドメインを有し、これが実質的にAcaNA P5[配列番号40]またはAcaNAP6[配列番号41]のものいずれかと 同一であるものである。NAPタンパク質AcaNAP5[配列番号4および4 0]およびAcaNAP6[配列番号6および41]は1のNAPドメインを有 し、本発明のこの態様において特に有用である。 抗凝固活性を有する好ましいNAPタンパク質は、第Xa因子阻害活性を有す るものを含み、本発明の態様のうち、上記すべての態様において線虫から単離さ れる。好ましい線虫の種はアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セ イラニカム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスお よびヘリゴモソモイド ポリギラスからなる群から選択される。特に好ましいの はアンサイロストマ カニナムから誘導されるAcaNAP5およびAcaNA P6のNAPタンパク質である。 この観点において本発明の範囲にはさらに、抗凝固および/または第Xa因子 阻害活性を有するタンパク質をコード化する単離されたリコンビナントcDNA 分子を含み、このタンパク質は、抗凝固および/または第Xa因子阻害活性を有 する単離されたNAPタンパク質を示す各態様において規定されるものである。 本発明のこの態様において好ましいcDNAはAcaNAP5およびAcaNA P6をコード化するものである。 本発明のこの観点における、NAPの第Xa因子阻害活性は本明細書に記載し たプロトコールにより測定することができる。実施例Aはかかる方法のひとつを 示す。簡単に述べると、NAPを第Xa因子とともにある一定時間インキュベー トし、その後第Xa因子の基質を添加する。基質の加水分解速度を測定し、NA P非存在下における速度と比した場合のその速度の低下によりNAPが第Xa因 子を阻害したことがわかる。実施例Cは他のNAPの第Xa因子阻害活性測定方 法のうちのプロトロンビナーゼ複合体に組み込まれた際の測定方法であって、第 Xa因子がインビボで作用する際の機能をより正確に反映するものとなっている 。記載してあるように、第Xa因子がプロトロンビナーゼ複合体内に組み込まれ たものをNAPと共にインキュベートし、その後基質を添加する。プロトロンビ ナーゼ複合体による第Xa因子媒介性トロンビン生成をこの混合物からのトロン ビンの生成速度により測定できる。抗凝固活性を有するNAP、第VIIa因子/TF阻害活性を有するNAPを含 む(式III) 他の観点において、本発明のNAPはまた、第VIIa/TF阻害活性を有し 、 1または複数のNAPドメインを有する抗凝固活性を有する単離されたタンパク 質もまた含まれる。ここにおいて各NAPドメインは以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式III) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列は各NAPドメインが全部で約120アミノ酸 残基を有するように選択される。) を含有する。 この発明によるNAPタンパク質を含有する医薬組成物および、この発明のN APタンパク質を投与することを含む血液凝固抑制方法も本発明の範囲内である 。本発明のこの観点にかかわるNAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメイ ンを有する。好ましいのは1または2のNAPドメインを含有するタンパク質で ある。好ましいのは少くとも1のNAPドメインが実質的にAcaNAPc2[ 配列番号59]のNAPドメインと同一であるタンパク質である。NAPタンパ ク質AcaNAPc2[配列番号59]は1のNAPドメインを有し、本発明の この観点においては特に好ましいものである。 本発明のこの観点から好ましいNAPタンパク質としては、A2が3から5ア ミノ酸残基のアミノ酸配列であり、A4が6から19アミノ酸残基のアミノ酸配 列であり、A6が3から5アミノ酸残基のアミノ酸配列であり、A10が5から 25アミノ酸残基のアミノ酸配列であるタンパク質である。 したがって、好ましい態様としては、第VIIa因子/TF阻害活性を含む抗 凝固活性を有し、式IIIのNAPドメインを少くとも1つ有し、かかるNAPド メインが以下のアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号83および205から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号206から208までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号209から222までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号223および224から選択される; (e)Cys−A6は配列番号225から227までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号228および229から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号230から232までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号233から253までから選択される、 を有するものが挙げられる。 本発明の他の好ましい態様においては、A3はGlu−A3a−A3bの配列 を有する(式中、A3aおよびA3bは独立して選択されるアミノ酸残基である) 。より好ましくはA3aはAsp−Lys−Lysである。 付加的に好ましい態様においては、A4は全体として負電荷を有するアミノ酸 配列である。 本発明のこの観点におけるその他の好ましい態様においては。A5がA5a− A5b−A5c−A5d[配列番号84](式中、A5aからA5dは独立して 選択されるアミノ酸残基である。好ましくはA5aがLeuでありA5cがAr gである。 本発明のこの観点によれば、好ましいA7アミノ酸残基はValまたはIle であり、より好ましくはValである。 本発明のこの観点によるさらに好ましい態様は、A8がアミノ酸配列A8a− A8b−A8c−A8d−A8e−A8f−A8g[配列番号68]を含有する タンパク質である(式中、 (a)A8aはA8の最初のアミノ酸残基である、 (b)少くともA8aとA8bのうちのひとつがGluまたはAspから選択さ れる、 (c)A8cからA8gは独立して選択されるアミノ酸残基である。 好ましくは、A8cがGlyであり、A8dがPhe、TyrおよびLeuか らなる群から選択され、A8eがTyrであり、A8fがArgでありA8gが AspおよびAsnから選択される。好ましいA8c−A8d−A8e−A9f −A8g配列はGly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]であ る。 ある具体例において、好ましいNAP分子は (a)A3がAsp−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立して選 択されるアミノ酸残基である); (b)A4は全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5はA5a−A5b−A5c−A5dの配列を有するアミノ酸配列であ り、A5aからA5dまでは独立して選択されるアミノ酸残基である;そして (d)A7はValおよびIleからなる群から選択される)。 この態様のNAPタンパク質を有する医薬組成物、およびこの態様のNAPタン パク質を投与することを含む、血液凝固抑制方法もまた本発明の範囲内である。 この態様のNAPタンパク質は少くとも1のNAPドメインを有する。好ましい NAPは1または2のNAPドメインを含有する。1のNAPドメインを有する NAPタンパク質AcaNAPc2が本発明のこの態様において好ましい。 他の好ましい態様において、 (a)A3はAsp−Lys−Lysである; (b)A4は全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5はA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85]の配列であり、 A5aからA5dは独立して選択されるアミノ酸残基である; (d)A7はValである;および (e)A8はアミノ酸配列A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg− Asn[配列番号79](式中、A8aとA8bの少くとも一方はGluまたは Aspである)であるNAP分子が提供される。この態様のNAPタンパク質を 含有する医薬組成物および、この態様のNAPタンパク質を投与することを含む 血液凝固を抑制する方法もまた、本発明の範囲内である。本発明のこの態様のN APタンパク質はすくなくとも1のNAPドメインを有する。好ましいNAPは 1または2のNAPドメインを有するものである。NAPタンパク質AcaNA Pc2[配列番号59]は1のNAPドメインを有し、本発明のこの態様におい て好ましいNAPである。 抗凝固活性を有する好ましいNAPタンパク質は、第VIIa因子/TF阻害 活性を有するものを含む。本発明のこの観点からの上記すべての態様によれば、 線虫の種から誘導し得る。好ましい線虫の種としてはアンサイロストマ カニナ ム、アンサイロストマ セイラニカム、アンサイロストマ デュオデナール、ネ カトール アメリカヌスおよびヘリゴモソモイデス ポリギルスからなる群から 選択される。特に好ましいのはアンサイロストマ カニナムより単離されるNA Pタンパク質AcaNAPc2である。本発明のこの観点には、抗凝固および/ または第VIIa因子/TF阻害活性を有するタンパク質をコードする単離され たリコンビナントcDNA分子も含まれるが、このタンパク質は上記の単離され た抗凝固および/または第VIIa因子/TF阻害活性を有するNAPタンパク 質の態様のそれぞれに沿って規定されるものである。この観点による好ましいc DNAは配列番号19の核酸配列を有し、これは配列番号59のAcaNAPc 2タンパク質をコードするものである。 本発明のこの観点におけるNAPの第VIIa因子/TF阻害活性は本明細書 に示すプロトコルにより測定することができる。実施例Eは第VIIa因子/T Fアッセイを開示する。放射線標識したヒト第IX因子(3H−FIX)からの 3つ組活性化タンパク質の第VIIa因子/TFが媒介する切断または、色素生 成性ペプチジル基質のアミド分解性加水分解により測定する。興味深いことに、 本発明のNAP第VIIa因子/TF阻害剤は、活性な第VIIa/TF阻害剤 となるために第Xa因子の存在を必要とする。しかしながら、NAP第VIIa 因子/TF阻害剤は、第Xa因子の活性部位が非可逆的にペプチジルクロロメチ ルケトン、H−Glu−Gly−Arg−CMK(EGR)で占められており、 これによって触媒的に第Xa因子が非活性であると考えられるものである場合に も(EGR−FXa)同様に有効である。この理由を一の説明に帰するつもりは ないが、第VIIa因子/TF阻害活性を有するNAPが第Xa因子と2成分複 合体を形成し、その形成は酵素上の特定の認識部位であって、酵素の触媒中心の P4−P1のプライマリー認識部位とは異なる部位を介して行われることは明ら かである。これは次いで第VIIa因子/TF複合体と共に、4成分阻害複合体 を形成する。第Xa因子の触媒中心にあるプライマリー認識部位(P4−P1) が共有結合的にトリペプチジルクロロメチルケトン(EGR−CMK)により占 められているにもかかわらず、EGR−fXaが完全にNAPによる第VIIa 因子/TFの阻害をサポートし得ることは、この仮説を支持する。 NAPの第VIIa因子/TF阻害活性はまた、実施例Dのプロトコルによっ て測定することもでき、同様に実施例AおよびCに開示した第Xa因子アッセイ によって測定してもよい。この方法は、NAPが様々の酵素の触媒活性を阻害す る能力を測定し、これを第VIIa因子/TF複合体に対する阻害活性と比較す るものである。第VIIa因子/TFのNAPによる特異的阻害は、ある適用に おいて所望されている性質である。 本発明のさらなる観点に従って、抗凝固活性を有する単離されたタンパク質お よびそのタンパク質をコードするcDNAが提供されるが、当該タンパク質は特 異的に第VIIa因子/TF複合体を第Xa因子の存在下、または触媒的に非活 性な第Xa因子誘導体の存在下にて阻害するが、TFの非存在下においては第V IIa因子の活性を特異的に阻害せず、またプロトロンビナーゼの活性を特異的 に阻害することもないタンパク質を提供する。本発明のこの観点において好まし いタンパク質は第VIIa因子/TF阻害活性を有する単離されたタンパク質に ついて上記に説明したような性質を有し、1または複数のNAPドメインを有す る。本発明のこの態様において好ましいタンパク質はAcaNAPc2である。 本発明のこの観点にあてはまるNAPは、第Xa因子または第Xa因子誘導体 の存在下において、該誘導体が触媒的に活性であろうがなかろうが第VIIa因 子/TF阻害活性を有するものであるとして同定される。実施例B、CおよびF のプロトコルはかかるNAPの抗凝固活性を測定するのに有用である。実施例A のプロトコルは第Xa因子またはプロトロンビナーゼの無い場合のNAPの不活 性性を調べることができる。実施例Eのプロトコルを用いて得たデータは、触媒 的に活性または不活性である第Xa因子の存在を第VIIa因子/TF複合体の 阻害の際に必要とする同定するものである。セリンプロテアーゼ阻害活性を有するNAP(式IV) さらなる観点において、本発明のNAPにはセリンプロテアーゼ阻害活性を有 し、1または複数のNAPドメインを有する単離されたタンパク質を含む。かか るタンパク質の各NAPドメインは以下の配列を有する: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式IV) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4アミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列は各NAPドメインが全部で約120未満のア ミノ酸残基を有するように選択される。) この発明によるNAPタンパク質を含有する医薬組成物および、この発明のN APタンパク質を投与することを含む血液凝固抑制方法も本発明の範囲内である 。本発明のこの観点にかかわるNAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメイ ンを有する。好ましいのは1または2のNAPドメインを含有するタンパク質で ある。好ましいのはNAPドメインが実質的にHpoNAP5[配列番号60] またはNamNAP[配列番号61]のものと同一であるタンパク質である。N APタンパク質HpoNAP5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号 61]は1のNAPドメインを有し、本発明のこの観点においては特に好ましい NAPタンパク質である。 本発明のこの観点から好ましいNAPタンパク質としては、A2が3から5ア ミノ酸残基のアミノ酸配列であり、A4が6から19アミノ酸残基のアミノ酸配 列であり、A6が3から5アミノ酸残基のアミノ酸配列であり、A10が1から 25アミノ酸残基のアミノ酸配列であるタンパク質である。 したがって、好ましい態様としては、セリンプロテアーゼ阻害活性を示し少な くとも1つの式IVのNAPドメインを有するNAPタンパク質には、以下のア ミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号86および254から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号255から257までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号258から271までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号272および273から選択される; (e)Cys−A6は配列番号274から276までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号277および279から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号280から282までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号283から307までから選択される。 本発明の他の好ましい態様においては、A3はGlu−A3a−A3bの配列 を有する(式中、A3aおよびA3bは独立して選択されるアミノ酸残基である )。より好ましくはA3aはGlu−Pro−Lysである。 その他の好ましい態様においては、A4は全体として負電荷を有するアミノ酸 配列である。 本発明のこの観点におけるその他の好ましい態様においては。A5がA5a− A5b−A5c(式中、A5aからA5cは独立して選択されるアミノ酸残基で ある。好ましくはA5aがThrでありA5cがAsnである。特に好ましいA 5の配列にはThr−Leu−AsnまたはThr−Met−Asnが含まれる 。 本発明のこの観点によれば、好ましいA7アミノ酸残基はGlnである。 本発明のこの観点によれば、好ましいNAP分子の一態様は、 (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立して選 択されるアミノ酸残基である)であり; (b)A4は全体として負電荷を有するアミノ酸配列であり; (c)A5はA5a−A5b−A5cの配列を有するアミノ酸配列で、A5aか らA5cまでは独立して選択されるアミノ酸残基であり;そして (d)A7はGlnである。この態様のNAPタンパク質を有する医薬組成物お よびこの態様のNAPタンパク質を投与することを含む、血液凝固抑制方法もま た本発明の範囲内である。この態様のNAPタンパク質は少くとも1のNAPド メインを有する。好ましいNAPは1または2のNAPドメインを含有する。1 のNAPドメインを有するNAPタンパク質HpoNAP5[配列番号60]お よびNamNAP[配列番号61]が本発明のこの態様において好ましい。 他の好ましい態様において、 (a)A3がGlu−Pro−Lysであり; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列であり; (c)A5がThr−Leu−AsnおよびThr−Met−Asnから選択さ れ; (d)A7がGlnである。この態様のNAPタンパク質を有する医薬組成物お よびこの態様のNAPタンパク質を投与することを含む、血液凝固抑制方法もま た本発明の範囲内である。この態様のNAPタンパク質は少くとも1のNAPド メインを有する。好ましいNAPは1または2のNAPドメインを含有する。1 のNAPドメインを有するNAPタンパク質HpoNAP5[配列番号60]お よびNamNAP[配列番号61]が本発明のこの態様において好ましい。 本発明のこの観点からの上記すべての態様において好ましいNAPタンパク質 は、線虫から誘導し得る。好ましい線虫の種としてはアンサイロストマ カニナ ム、アンサイロストマ セイラニカム、アンサイロストマ デュオデネール、ネ カトール アメリカヌスおよびヘリゴモソモイデス ポリギルスからなる群から 選択される。特に好ましいのはヘリゴモソモイデス ポリギルスおよびネカトー ル アメリカヌスからそれぞれ単離されるNAPタンパク質HpoNAP5およ びNamNAPである。 本発明のこの観点にはまた、セリンプロテアーゼ阻害活性を有するタンパク質 をコード化するcDNAを含むが、このタンパク質には上記のセリンプロテアー ゼ阻害活性を有する単離されたタンパク質の態様のそれぞれに沿って規定される ものも含む。本発明のこの観点において好ましいcDNAは配列番号14の核酸 配列(HpoNAP5)および配列番号39の核酸配列(NamNAP)を有す るものであり、これらはそれぞれHpoNAP5[配列番号60]およびNam NAP[配列番号61]のタンパク質をコードする。 セリンプロテアーゼ阻害活性は実施例AからFのいずれに記載されたアッセイ によって測定しても、あるいは一般的に使用されるセリンプロテアーゼ活性阻害 の測定のための酵素アッセイによって測定してもよい。多くの酵素アッセイ方法 についてはメソッズ・オブ・エンザイモロジーの各巻または他の同様の文献より 読み取ることができる。好ましいNAPはセリンプロテアーゼ阻害活性を有し、 血液凝固カスケードの酵素を指向するか、またはトリプシン/エラスターゼを指 向する活性を有しているものである。抗凝固活性を有するNAP(式V) 本発明の他の観点において、本発明のNAPにはさらに抗凝固活性を有し、1 または複数のNAPドメインを含有する単離されたタンパク質であって、各NA Pドメインが以下の配列を有する: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式V) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列はNAPドメインが全部で約120未満のアミ ノ酸残基を有するように選択される。)ものを含む。この発明によるNAPタン パク質を含有する医薬組成物および、この発明のNAPタンパク質を投与するこ とを含む血液凝固抑制方法も本発明の範囲内である。本発明のこの観点にかかわ るNAPタンパク質は少なくとも1のNAPドメインを有する。好ましいのは1 または2のNAPドメインを含有するタンパク質である。好ましいのはNAPド メインが実質的に配列番号40から58のいずれかと同一のものである。NAP タンパク質AcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41] 、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、A caNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、Aca NAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、AduNA P4[配列番号55]、AceNAP5[配列番号57]およびAceNAP7 [配列番号58]は1のNAPドメインを有する、本発明のこの観点において好 ましいタンパク質である。AceNAP4[配列番号62]、AcaNAP45 [配列番号63]、AcaNAP47[配列番号64]およびAduNAP7[ 配列番号65]は2つのNAPドメインを有し、本発明のこの観点において有用 である。 本発明のこの観点から好ましいNAPタンパク質としては、A2が3から5ア ミノ酸残基のアミノ酸配列であり、A4が6から19アミノ酸残基のアミノ酸配 列であり、A6が3から5アミノ酸残基のアミノ酸配列であり、A10が5から 25アミノ酸残基のアミノ酸配列であるタンパク質である。 したがって、好ましい態様としては、抗凝固活性を有し少なくとも1つの式V のNAPドメインを有するNAPタンパク質には、以下のアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号87および308から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号309から311までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号312から325までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号326および327から選択される; (e)Cys−A6は配列番号328から330までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号331および332から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号333から335までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号336から356までから選択される。 本発明の他の好ましい態様においては、A3はGlu−A3a−A3bの配列 を有する(式中、A3aおよびA3bは独立して選択されるアミノ酸残基である) 。より好ましくはA3aはAla、Arg、Pro、Lys、Ile、His、 Leu、およびThrからなる群より選択され、A3bはLys、Thrおよび Argからなる群から選択される。特に好ましいA3配列はGlu−Ala−L ys、Glu−Arg−Lys、Glu−Pro−Lys、Glu−Lys−L ys、Glu−Ilr−Thr、Glu−His−Arg、Glu−Leu−L ysおよびGln−Thr−Lysからなる群から選択される。 その他の好ましい態様においては、A4は全体として負電荷を有するアミノ酸 配列である。 本発明のこの観点において、好ましいA7アミノ酸残基はValまたはIle である。 本発明のこの観点において、他の好ましい態様においてはA8がアミノ酸配列 A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8f−A8g[配列番号68]で あるタンパク質も含む;(式中、 (a)A8aはA8の最初のアミノ酸残基である、 (b)少くともA8aとA8bのうちのひとつがGluおよびAspからなる群 から選択される、 (c)A8cからA8gは独立して選択されるアミノ酸残基である。)。 好ましくは、A8cがGlyであり、A8dがPhe、TyrおよびLeuか らなる群から選択され、A8eがTyrであり、A8fがArgでありA8gが AspおよびAsnから選択される。好ましいA8c−A8d−A8e−A8f −A8g配列はGly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、G ly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、Gly−Tyr−T yr−Arg−Asp[配列番号71]、Gly−Tyr−Tyr−Arg−A sn[配列番号72]および、Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列 番号73]である。 他の好ましい態様は、A10がGlu−Ile−Ile−His−Val[配 列番号74]、Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、P he−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および[M et−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選択さ れるアミノ酸配列を有するタンパク質である。AcaNAP5[配列番号4およ び40]およびAcaNAP6[配列番号6および41]はA10内にGlu− Ile−Ile−His−Val[配列番号74]のアミノ酸配列を有し、本発 明のこの態様に好ましい。NAPタンパク質AcaNAP23[配列番号43] 、AcaNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、A caNAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、および AceNAP4[配列番号48、49および62]はアミノ酸配列Phe−Il e−Thr−Ala−Pro[配列番号76]を含有し、本発明のこの態様にお いて好ましい。AcaNAP45[配列番号50、53および63]、AcaN AP47[配列番号51、54および64]、AduNAP7[配列番号52、 56および65]、AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番 号57]およびAceNAP7[配列番号58]はアミノ酸配列Met−Glu −Ile−Ile−Thr[配列番号77]を含有し、本発明のこの態様におい て好ましいNAPタンパク質である。 ある態様において、好ましいNAPタンパク質は、 (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立して選 択されるアミノ酸残基である)である; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7はValおよびIleからなる群から選択される; (d)A8はGly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、Gl y−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、Gly−Tyr−Ty r−Arg−Asp[配列番号71]、Gly−Tyr−Tyr−Arg−As n[配列番号72]および、Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番 号73]からなる群から選択されるアミノ酸配列である;および (e)A10はGlu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、A sp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、Phe−Ile−T hr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および[Met−Glu−I le−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選択されるアミノ酸配列 を有する; ものである。この態様のNAPタンパク質を有する医薬組成物およびこの態様の NAPタンパク質を投与することを含む、血液凝固抑制方法もまた本発明の範囲 内である。この態様のNAPタンパク質は少くとも1のNAPドメインを有する 。好ましいNAPは1または2のNAPドメインを含有する。NAPタンパク質 AcaNAP5[配列番号4および40]およびAcaNAP6[配列番号6お よび41]、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号 43]、AcaNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45 ]、AcaNAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、 AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番号57]およびAc eNAP7[配列番号58]は1のNAPドメインを有し、本発明のこの態様に おいて好ましいアミノ酸配列である。NAPタンパク質AceNAP4[配列番 号62]、AcaNAP45[配列番号63]、AcaNAP47[配列番号6 4]、およびAduNAP7[配列番号65]は2つのNAPドメインを有し、 本発明のこの態様において好ましいNAPタンパク質である。 他の好ましい態様において、 (a)A3はGlu−Ala−Lys、Glu−Arg−Lys、Glu−Pr o−Lys、Glu−Lys−Lys、Glu−Ile−Thr、Glu−Hi s−Arg、Glu−Leu−LysおよびGlu−Thr−Lysからなる群 から選択される; (b)A4は全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7はValまたはIleである; (d)A8はA8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列 番号78]、A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列 番号79]、A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列 番号80]、A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列 番号81]およびA8a−A8b−Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[ 配列番号82](式中、A8aおよびA8bはGluまたはAspである)から なる群から選択されるアミノ酸配列を含有する; (e)A9が5つのアミノ酸残基からなるアミノ酸配列である; (f)A10がGlu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、A sp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、Phe−Ile−T hr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、およびMet−Glu−Il e−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選択される、 化合物も含まれる。この態様のNAPタンパク質を有する医薬組成物およびこの 態様のNAPタンパク質を投与することを含む、血液凝固抑制方法もまた本発明 の範囲内である。この態様のNAPタンパク質は少くとも1のNAPドメインを 有する。好ましいNAPは1または2のNAPドメインを含有する。NAPタン パク質のうち、AcaNAP5[配列番号4および40]およびAcaNAP6 [配列番号6および41]、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP 23[配列番号43]、AcaNAP24[配列番号44]、AcaNAP25 [配列番号45]、AcaNAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配 列番号47]、AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番号5 7]およびAceNAP7[配列番号58]は1のNAPドメインを含み、本発 明のこの態様において好ましいNAPタンパク質である。NAPタンパク質Ac eNAP4[配列番号62]、AceNAP45[配列番号63]、AcaNA P47[配列番号64]およびAduNAP7[配列番号65]は2つのNAP ドメインを有し、本発明のこの態様において好ましいNAPである。 本発明のこの観点における上記すべての態様に基づく抗凝固活性を有する好ま しいNAPタンパク質は、ある種類の線虫から誘導し得る。好ましい線虫の種と してはアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム、アンサ イロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴモソモイ デス ポリギルスからなる群から選択される。特に好ましいのはアンサイロスト マ カニナムより誘導されるAcaNAP5[配列番号4および40]およびA caNAP6[配列番号6および41]、AcaNAP48[配列番号42]、 AcaNAP23[配列番号43]、AcaNAP24[配列番号44]、Ac aNAP25[配列番号45]、AcaNAP44[配列番号46];アンサイ ロストマ セイラニカムから誘導されるAceNAP45[配列番号63]、A caNAP47[配列番号64]およびAcaNAP31[配列番号47];ア ンサイロストマ デュオデナールから誘導されるAduNAP7[配列番号65 ]およびAduNAP4[配列番号55]が挙げられる。 本発明のこの観点にはまた、抗凝固活性を有するタンパク質をコード化するc DNAを含むが、このタンパク質には上記の抗凝固活性を有する単離されたタン パク質の態様のそれぞれに沿って規定されるものが含まれる。本発明のこの観点 において好ましいcDNAはAcaNAP5[配列番号3]、AcaNAP6[ 配列番号5]、AcaNAP48[配列番号38]、AcaNAP23[配列番 号31]、AcaNAP24[配列番号32]、AcaNAP25[配列番号3 3]、AcaNAP44[配列番号35]、AcaNAP31[配列番号34] 、AduNAP4[配列番号12]、AceNAP5[配列番号10]、Ace NAP7[配列番号11]、AceNAP4[配列番号9]、AcaNAP45 [配列番号36]、AcaNAP47[配列番号37]、およびAduNAP7 [配列番号13]の核酸配列を含む。 本発明のこの観点の抗凝固活性は本明細書に記載の方法にて測定すればよい。 実施例BおよびFにはNAPの抗凝固活性を評価するのに特に有用な方法を開示 する。第Xa因子阻害活性を有するNAPを検出する方法(実施例AおよびC) および第VIIa因子/TF阻害活性を有するNAPを検出する方法(実施例E )として記載された方法もまた、NAPの抗凝固活性を評価するのに有用である 。オリゴヌクレオチド 本発明の別の観点においては、本発明は YG109: TCAGACATGT-ATAATCTCAT-GTTGG[配列番号88]、 YG103: AAGGCATACC-CGGAGTGTGG-TG[配列番号89]、 NAP−1: AAR-CCN-TGY-GAR-MGG-AAR-TGY[配列番号90]、および NAP−4.RC: TW-RWA-NCC-NTC-YTT-RCA-NAC-RCA[配列番号91] からなる群から選択される配列を有するオリゴヌクレオチドを提供する。 これらのオリゴヌクレオチド配列はNAPタンパク質をコードする核酸配列に ハイブリダイズする。 本発明の単離されたNAPには、説明したアミノ酸配列のバリエーションも含 まれている。このバリエーションには、フラグメント、天然に生じた変異体、ア レル変異体、ランダムに生成した人工的変異体、および目的に沿って生成させた 人工変異体であって、抗凝固活性を保持しているものを含む。「フラグメント」 の語は、全タンパク質より少ないアミノ酸より構成される配列のいずれかの部分 を意味し、例えばアミノ末端、カルボキシ末端を含んでいない部分配列やまたは 、完全タンパク質のアミノ末端とカルボキシ末端の間の配列をいう。 本発明の単離されたNAPにはまた、NAPドメインのアミノ酸配列の抗凝固 活性を保持しているリコンビナントアミノ酸配列を有するタンパク質も含む。し たがって、本明細書においては、「NAPタンパク質」または「タンパク質」と いう語をNAPドメインを含有するタンパク質について使用する場合には、特に 指定しなければ天然のNAPタンパク質およびリコンビナント方法により調製し たNAPタンパク質の両方を意味するものとする。これらのリコンビナントタン パク質は融合タンパク質のごときハイブリッドタンパク質、さまざまな遺伝子を 発現ベクター内へ発現させて得られるタンパク質、さまざまな遺伝子を宿主細胞 のクロモソーム内へ発現させて得られるタンパク質、さらには開示したタンパク 質の抗凝固活性を有するポリペプチドであって、第2のポリペプチドとペプチド 結合にて結合しているものも含まれる。リコンビナントタンパク質にもまた、本 発明のNAPドメインアミノ酸配列のバリアントであって、保存的アミノ酸置換 のみを含むバリアントを含む。保存的アミノ酸置換はテイラー(Taylor,W.R.) のジェイ・モル・バイオル(J.Mol.Biol)、188:233(1986)の表1に「セット」とし て記載されている。リコンビナントタンパク質にはまた、本発明の単離されたN APドメインアミノ酸配列からアミノ酸の置換または欠失があり、これによって 単離されたNAPドメインの配列の抗凝固活性を保存しているものも含む。 本発明のある好ましい態様は、線虫、アンサイロストマ カニナムから実施例 1に記載のごとき生化学的方法を用いて単離したタンパク質である。このタンパ ク質はヒト血漿の凝血時間をPTおよびaPTTアッセイの両方において延長し 、1のNAPドメインを含有し、そしてN−末端にアミノ酸配列Lys−Ala −Tyr−Pro−Glu−Cys−Gly−Glu−Asn−Glu−Trp −Leu−Asp[配列番号92]を有し、マススペクトロメトリーで測定した 分子量が約8.7キロダルトンから8.8キロダルトンであるものである。 本発明の他の好ましい態様には、この線虫、アンサイロストマ カニナムのc DNAライブラリーよりリコンビナント方法によって作成された抗凝固活性を有 するタンパク質を含む。例えばAcaNAP5[配列番号4または40]、Ac aNAP6[配列番号6または41]、Pro−AcaNAP5[配列番号7] 、Pro−AcaNAP6[配列番号8]、AcaNAP48[配列番号42] 、AcaNAP23[配列番号43]、AcaNAP24[配列番号44]、A caNAP25[配列番号45]、AcaNAP44[配列番号46]、Aca NAP31[配列番号47],AcaNAP45[配列番号63]、AcaNA P47[配列番号64]およびAcaNAPc2[配列番号59];線虫、アン サ イロストマ セイラニウムから単離されたものには、例えばAceNAP4[配 列番号62]、AceNAP5[配列番号57]およびAceNAP7[配列番 号59];線虫、アンサイロストマ デュオデナールから単離されたものには例 えば、AduNAP4[配列番号55]およびAduNAP7[配列番号65] ;線虫、ヘリゴモスモイデス ポリギルスから単離されたものは例えばHpoN AP5[配列番号60];および線虫ネカトール アメリカヌスより単離された ものには例えばNamNAP[配列番号61]が例示される。かかるタンパク質 のアミノ酸配列は図11及び16および他の図面に記載している。これらの好ま しい具体例はそれぞれヒト血漿の凝血時間をPTおよびaPTTアッセイの両方 において延長し、少なくとも1のNAPドメインを含有するものである。 「単離されたタンパク質」に関しては、本発明のタンパク質はタンパク質精製 の方法として当業者によりよく知られている方法または以下に記載の方法によっ て単離されたものである。これらは天然物より単離しても、固相上もしくは液体 内にて、例えば固相自動ペプチド合成法によって化学合成したものであっても、 リコンビナント方法によりタンパク質を産生させた際の細胞培養物より単離した ものであってもよい。 以下に詳しく述べるように、本発明にはNAPを含有する医薬組成物およびN APを使用して血液凝固の過程および関連する血栓を抑制する方法も含む。試料 中のNAP核酸の存在を同定するために有用なオリゴヌクレオチドプローブもま た、本発明の範囲内であり、以下により詳しく説明する。1.天然物より単離されたNAP 本発明の好ましい単離タンパク質(NAP)は、天然物から単離、精製したも のであってよい。好ましい天然物は線虫である;適当な線虫には腸線虫、例えば アンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム、アンサイロス トマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴモソモイデス ポリギルスなどが例示される。天然物として特に好ましいのは吸血性線虫、鉤虫 のアンサイロストマ カニナムである。 本発明の好ましいタンパク質は天然物より生化学分野でよく知られた方法によ り単離、精製すればよい。単離、精製方法には可溶性抽出物の調製、抽出物の、 異なる固体支持物質を用いたクロマトグラフ法による濃縮を含む。精製の好まし い方法は線虫の可溶性抽出物を、さまざまなプロテアーゼ阻害剤を含有する0. 02Mトリス−塩酸、pH7.4バッファー内にて調製し、次いで抽出物をコン カナバリン−Aセファロースマトリックス、ポーラス20HQ(poros20 HQ)陽イ オン交換マトリックス、スーパーデックス30ゲル濾過マトリックスおよびC1 8逆相マトリックスを含むクロマトグラフィーへ連続的に通すことを含む。クロ マトグラフィーのカラムから各フラクションを集め、これをPTおよびaPTT アッセイによって凝血時間を延長する能力の有無、または精製酵素を用いてアミ ド分解を比色定量するアッセイによるまたは実施例AからFに開示された他の方 法による第Xa因子アミド分解活性に対する阻害能の有無により選択すればよい 。本発明の単離されたタンパク質を精製する好ましい精製方法の例には実施例1 に記載した方法を含む。 本発明の好ましいタンパク質は、天然物、例えばアンサイロストマ カニナム から説明したように単離される場合、アミノ酸配列Lys−Ala−Tyr−P ro−Glu−Cys−Gly−Glu−Asn−Glu−Trp−Leu−A sp[配列番号92]を含有する。特に好ましいのはこのアミノ酸配列をアミノ 末端に有する精製タンパク質であり、図2(AcaNAP5[配列番号4])ま たは図4(AcaNAP6[配列番号6])が例示される。本発明の好ましいタ ンパク質の一つはアミノ酸配列Lys−Ala−Tyr−Pro−Glu−Cy s−Gly−Glu−Asn−Glu−Trp−Leu−Asp[配列番号92 ]をそのアミノ末端に含有し、マススペクトロメトリーにより測定される分子量 が8.7から8.8キロダルトンであるタンパク質である。2.化学合成により調製されるNAP 本発明の好ましい単離NAPは化学業界において知られている標準的な方法に よって合成してもよい。 本発明の単離されたタンパク質は固相合成、例えばメリフィールド(Merrifiel d)ジェイ・アム・ケム・ソク(J.Amer.Chem.Soc.)85:2149(1964)に記載の方法、また は他の化学業界で知られている等価な方法、例えばホーテン(Houghten)らの方法 プロシーデイングス・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエ スエー82:5132(1985)によって調製してもよい。 固相合成はペプチドのC−末端から、保護したアミノ酸またはペプチドを適当 な不溶性樹脂へカップリングさせることにより開始する。適当な樹脂にはクロロ メチル、ブロモメチル、ヒドロキシルメチル、アミノメチル、ベンズヒドリルお よびt−アルキルオキシカルボニルヒドラジド基を含むものを含み、これらの基 にはアミノ酸が直接カップリングし得る。 この固相合成において、αアミノ基と必要に応じて反応性側鎖を適当に保護し たカルボキシ末端のアミノ酸を、最初にこの不溶性樹脂へカップリングさせる。 αアミノ保護基を、適当な溶媒内のトリフルオロ酢酸処理のごとき適当な処理方 法で処理した後、αアミノ酸および必要に応じて各反応性側鎖を保護した次のア ミノ酸またはペプチドを、樹脂へカップリングしたアミノ酸の遊離のアミノ基へ とカップリングさせる。続いて適当な保護アミノ酸もしくはペプチドを同様の方 法にてカップリングさせ、ペプチド鎖を所望のアミノ酸配列を得るまで伸長させ る。合成はマニュアルで行っても、あるいは自動化されたペプチド合成装置で行 っても、あるいはこれらを組み合わせて行ってもよい。 適当に保護されたアミノ酸もしくはペプチドの、樹脂に結合したフリーのアミ ノ基へのカップリングは、従来のカップリング方法、例えばアジド法、混合無水 物法、DCC(ジサイクロヘキシルカルボジイミド)法、活性化エステル法(p-ニ トロフェニルエステルまたはN-ヒドロキシスクシンイミドエステル)、BOP( ベンゾトリアゾル−1−イル−オキシ−トリス(ジアミノ)ホスホニウムヘキサフ ルオロホスフェート法またはウッドワード試薬K法などによって行えばよい。ペ プチド合成において、不溶性樹脂に結合している成長ペプチド鎖へカップリング させるアミノ酸またはペプチドのαアミノ基の保護基を、側鎖の保護基が除去さ れないような条件にて除去することは通常行われている。合成完了時、ペプチド は通常不溶性樹脂と分離され、そして分離時または分離後に側鎖の保護基を除去 することもまた、通常行われることである。 すべてのアミノ酸αアミノ基およびリジンのオメガアミノ基のために適した保 護基としてはベンジルオキシカルボニル、イソニコチニルオキシカルボニル、o −クロロベンジルオキシカルボニル、p−ニトロフェニルオキシカルボニル、p −メトキシフェニルオキシカルボニル、t−ブトキシカルボニル、t−アミロキ シカルボニル、アダマンチルオキシカルボニル、2−(4−ビフェニル)−2− プロピルオキシカルボニル、9−フルオレニルメトキシカルボニル、メチルスル ホニルエトキシカルボニル、トリフルオロアセチル、フタリル、ホルミル、2− ニトロフェニルスルフフェニル、ジフェニルホスフィノチオイル、ジメチルフォ スフィノチオイルなどが例示される。 アスパラギン酸およびグルタミン酸のカルボキシ基の好ましい保護基にはベン ジルエステル、シクロヘキシルエステル、4−ニトロベンジルエステル、t−ブ チルエステル、4−ピリジルメチルエステルなどが例示される。 アルギニンのグアニジノ基のための好ましい保護基にはニトロ、p−トルエン スルホニル、ベンジルオキシカルボニル、アダマンチルオキシカルボニル、p− メトキシベンゼンスルホニル、4−メトキシ−2,6−ジメチルベンゼンスルホ ニル、1,3,5−トリメチルフェニルスルホニルなどが挙げられる。 システインのチオール基のための好ましい保護基には、p−メトキシベンジル 、トリフェニルメチル、アセチウアミノメチル、エチルカルバモイル、4−メチ ルベンジル、2,4,6−トリメチルベンジルなどが挙げられる。 セリンのヒドロキシ基のための好ましい保護基にはベンジル、t−ブチル、ア セチル、テトラヒドロピラニルなどが挙げられる。 完成されたペプチドを樹脂から分離するには、1または複数のチオ含有スカベ ンジャーを含有する液体フッ化水素酸で低温で処理すればよい。かかる処理によ る樹脂からのペプチドの分割により、側鎖保護基もまたペプチドからはずれる。 分離したペプチドは希酢酸に溶解させて濾過し、次いで再び折畳み、適当なジ スルフィド結合が形成するよう、ペプチド濃度が約0.5mMから2mMとなる よう、0.1Mの酢酸溶液とする。この溶液のpH値を水酸化アンモニウムを用 いて約8.0に調整し、溶液を開放下で約24時間から約72時間の間撹拌する 。 再び折畳まれたペプチドをクロマトグラフィー、好ましくは逆相カラム高圧液 体クロマトグラフィーにて、アセトニトリル/水のグラジエント(さらに0.1 %のトリフルオロ酢酸を含有する)により精製する。好ましいグラジエントは水 中のアセトニトリル濃度を0から80%とするものである。精製ペプチドを含有 するフラクションの回収にあたっては、フラクションを集め、凍結乾燥して固体 のペプチドを得た。3.リコンビナント方法により調製されるNAP その他には、本発明の好ましい単離NAPは本明細書に記載した、生物学の当 業者にはよく知られているリコンビナントDNA法により調製してもよい。サム ブルック(Sambrook,J)、フィリッシュ(Fritsch,E.F.)およびマニアチスの(M aniatis,T.)のモレキュラー・クローニング、ア・ラボラトリー・マニュアル、 第2版、第1〜3巻、コールドスプリングハーバーラボラトリープレス(1989)。 リコンビナントDNA法は、遺伝情報の断片であるDNAのうち、異なる生物 から得たDNAを、該DNAを得た生物外で結合することができ、このハイブリ ッドDNAを細胞内へ取り込ませることができ、そして最初のDNAがコードす るタンパク質を産生させることができるという方法である。 本発明のタンパク質をコード化する遺伝情報は生物のゲノムDNAまたはmR NAより、当業者によく知られた方法にて得ることができる。この遺伝情報を得 るための好ましい方法にはmRNAを生物より単離し、これを相補的DNA(c DNA)へ転換し、このcDNAを適当なクローニングベクターへ導入し、所望 のタンパク質をコードするリコンビナントcDNAを含有するクローンを、該タ ンパク質の既知の配列により構築されている、適当なオリゴヌクレオチドプロー ブによるハイブリダイゼーションによって同定する工程を含む。 本発明のタンパク質をコードするリコンビナントDNA内の遺伝情報は発現ベ クターに連結させ、該ベクターを宿主細胞内へ導入して、遺伝情報をそれがコー ドするタンパク質として発現させればよい。(A)cDNAライブラリーの調製 cDNAライブラリーを構築するための好ましい天然のmRNA源は線虫であ り、これには腸線虫、アンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラ ニカム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよび ヘリゴモソモイデス ポリギルスが例示される。天然のmRNA源として特に好 ましいのは線虫のうちでも鉤虫、アンサイロストマ カニナムである。 本発明のタンパク質をコードするmRNAを、他のmRNAと共にある生物か ら単離する好ましい方法には、ポリUまたはポリTアフィニティーゲル上でのク ロマトグラフィー法を含む。mRNAを線虫から単離するのに特に好ましい方法 は、クイックプレプ(QuickPrep)mRNA精製キット(ファルマシア )の操作および試薬を用いることである。 二本鎖cDNAを単離したmRNAから得る好ましい方法は、1本鎖cDNA をmRNA鋳型上で逆転写酵素を用いて合成し、cDNA鎖にハイブリダイズし たRNAをリボヌクレアーゼ(RNアーゼ)にて分解し、そして相補的DNA鎖 をDNAポリメラーゼを用いて合成して二本鎖cDNAを得る操作を含む。特に 好ましい方法においては、線虫から単離した約3マイクログラムのmRNAを2 本鎖cDNAに転換する際に、鳥類ミエロブラストシス・ウイルス(Avian Myelo blastosis Virus)逆転写酵素、RNアーゼHおよび大腸菌DNAポリメラーゼI およびT4DNAポリメラーゼを用いて行う。 本発明のタンパク質をコードするcDNAは、上記のようにして構築されたラ イブラリー内の他のタンパク質と共に、クローニングベクターへと連結する。ク ローニングベクターにはcDNAライブラリーから得たcDNAを擁するDNA 配列を含む。cDNAライブラリーを含有するベクターを宿主細胞に導入し、こ れは安定に存在でき、クローニングベクターが複製される環境を提供する。適当 なクローニングベクターにはプラスミド、バクテリオファージ、ウイルスおよび コスミドが含まれる。好ましいクローニングベクターにはバクテリオファージを 含む。特に好ましいクローニングベクターには、バクテリオファージラムダgt 11 SfiNotベクターを含む。 cDNAライブラリーおよびコントロール配列を含む適当なクローニングベク ターの構築には標準的な連結および制限手法が用いられ、これは当業者にはよく 知られている。単離されたプラスミド、DNA配列または合成されたオリゴヌク レオチドを切断し、仕立て、そして所望の形態に再連結する。 制限手法、cDNAの部位特異的切断は、当業者に一般的に理解されている条 件下にて適当な制限酵素を作用させることによって行うことができ、詳細には市 販の制限酵素の製造者が決定した条件を用いればよい。例えば、ニュー・イング ランド・バイオラブス、プロメガおよびストラタジェン・クローニング・システ ムスの製品カタログを参照されたい。 一般に、約1ミクログラムのcDNAが、20ミクロリットルの緩衝液中の約 1単位の制限酵素により切断される。典型的には過剰な制限酵素を、cDNAの 切断を完全に行うために用いる。約37℃、約1から2時間のインキュベーショ ンという条件が通常用いられているが、これ以外の条件下で行う場合もある。切 断反応の後、タンパク質をフェノール/クロロホルムにより抽出すればよく、任 意にセファデックス(登録商標)G50のごときゲル濾過カラムを用いたクロマ トグラフィーにかけてもよい。または、切断されたcDNAフラグメントをその 大きさに基づきポリアクリルアミドまたはアガロースゲル上の電気泳動により分 離し、そして標準的な方法により単離してもよい。大きさによる分離の一般的な 事項についてはメソッズ・オブ・エンザイモロジー65:499−560(19 80)に記載されている。 制限酵素により切断されたcDNAフラグメントを、次いでクローニングベク ターへ連結する。 ライゲーション手法に関しては、ブラント末端ライゲーションは一般に約15 から約30マイクロリットルの約1mM ATP、約0.3から0.6単位(ウエ イス(Weiss))のT4DNAリガーゼを含有するバッファー(pH7.5)内で 、約14℃にて行われる。分子内粘着末端ライゲーションは、約5から100ナ ノモルの全末端DNA濃度にて行われる。分子内ブラント末端ライゲーション( 通常、約10から30倍モル過剰のリンカーを用いる)は約1マイクロモルの全 末端DNA濃度内にて行われる。(B)NAPをコードするcDNAの調製 上記のように調製された、cDNAライブラリーを含有するクローニングベク ターを宿主細胞内に導入し、宿主細胞を培養し、プレート上に撒き、そしてハイ ブリダイゼーションプローブにて本発明のタンパク質をコードするリコンビナン トcDNAを含有するクローンを同定する。好ましい宿主細胞は、ファージクロ ーニングベクターを用いる場合は、細菌である。特に好ましい宿主細胞は大腸菌 のY1090株のごとき菌株である。 または、本発明のタンパク質をコードするリコンビナントcDNAを、かかる タンパク質を糸状ファージの外表面上へ発現させ、次いでこのファージを血液凝 固に含まれる標的タンパク質へ結合させることによって単離して、得てもよい。 遺伝コードの重要でそしてよく知られた性質は、その重複性−2以上のトリプ レットヌクレオチド配列が1のアミノ酸をコードする−である。したがって、多 くの異なるヌクレオチド配列が、本発明のNAPの特定のアミノ酸配列をコード するリコンビナントcDNA分子となり得る。かかるヌクレオチド配列は機能的 には等価であると考えられる、というのはこれらはすべての生物内で結果的に同 じアミノ酸配列を産生するからである。場合によっては、プリンもしくはピリミ ジンのメチル化された変異体がヌクレオチド配列内に含まれていてもよい。しか しながら、かかるメチル化はいずれにせよコードの関係に影響は及ぼさない。(1)オリゴヌクレオチドプローブの使用 ハイブリダイゼーションプローブおよびプライマーは所望のリコンビナントc DNAの全体もしくは一部に相補的であるオリゴヌクレオチド配列である。これ らは適当な方法にて調製すればよく、例えばホスホトリエステル方法およびホス ホジエステル方法(それぞれナラン(Narang,S.A.)ら、メソッズ・イン・エンザイモ ロジー(Methods in Enzymology)68:90(1979)およびブラウン(Brown) ら、メソッズ・イン・エンザイモロジー68:109(1979)に開示されてい る)を用いても、またはこれらを自動化した方法を用いてもよい。ある態様にお いては、ジエチルホスホルアミダイトを出発物質として用い、ビーケージ(Beauc age)らのテトラヘドロン・レターズ(Tetrahedron Letters)22:1859−1 862に記載の方法により合成する。オリゴヌクレオチドを修飾した固体支持体 上に合成する方法のひとつは、米国特許第4,458,066号に記載されている 。プローブは、ホースラディッシュ・パーオキシダーゼのごとき酵素や放射性原 子、例えば32Pなどによってラベルして検出を容易にする点において、プライマ ーとは異なる。合成されたプローブは大腸菌DNAポリメラーゼIを用いたニッ クトランスレーションにより放射線ラベルするかまたは、アルカリ性ホスファタ ーゼとT4バクテリオファージポリヌクレオチドキナーゼを用いて末端をラベル する。 好ましいハイブリダイゼーションプローブには鉤虫、アンサイロストマ カニ ナムのごとき線虫から精製されたNAPのアミノ酸配列の一部をコードする一本 鎖cDNAのある範囲に対して相補的なオリゴヌクレオチド配列を含む。例えば 、図2(AcaNAP5)[配列番号4]または図4(AcaNAP6)[配列 番号6]のアミノ酸配列の一部を用いることができる。特に好ましいハイブリダ イゼーションプローブには、オリゴヌクレオチド配列が以下のアミノ酸配列:L ys−Ala−Tyr−Pro−Glu−Cys−Gly−Glu−Asn−G lu−Trp[配列番号93]をコードする範囲の一本鎖cDNAと相補的であ るものを含む。かかるハイブリダイゼーションプローブには以下のオリゴヌクレ オチド配列:AAR GCi TAY CCi GAR TGY GGi GAR AAY GAR TGG[配列番号94] (式中、RはAまたはGであり、YはTまたはCであり、iはイノシンである) を含む。本発明のタンパク質をコードする好ましいリコンビナントcDNA分子 は、 このプローブにハイブリダイズする能力により同定される。 好ましいハイブリダイゼーションプローブはまた、NAP−1[配列番号90 ]とNAP−4.RC[配列番号91]の対、およびYG109[配列番号88 ]とYG103[配列番号89]の対を含んでいてもよく、両者はそれぞれ実施 例13および12にて説明している。 所望のcDNAを含有するクローンを同定する際に、本発明のタンパク質をコ ードする遺伝子をリコンビナントcDNAの形態にて大量に産生するために増幅 を行ってもよい。 好ましい増幅方法にはポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用することを含み 、これは例えばPCRテクノロジー、ダブリュウ・エイチ・フリーマン・アンド ・カンパニー、ニューヨーク(エーリッヒ、エイチ・エー編集、1992)を参 照されたい。PCRは特定のDNA配列を合成するためのインビトロ増幅方法で ある。PCRにおいては、反対側の鎖、クローンのcDNAの目的とする領域に 隣接する領域にハイブリダイズする2つのオリゴヌクレオチドプライマーが用い られる。一連の反復操作には、cDNAを1本鎖へ変性する、プライマーを1本 鎖cDNAへアニールさせる、アニールさせたプライマーをDNAポリメラーゼ により伸長させて、数多くのcDNAのコピーを生成させる。得られるcDNA の末端はプライマーの5’末端により規定され、1回のサイクルにより数が約2 倍となる。同、第1頁。PCR増幅によって、単離しようとすうリコンビナント cDNA分子のコーディング領域、および制限部位または翻訳シグナル(シグナ ル配列、スタートコドン、および/またはストップコドン)のごとき情報をコー ドするさらなるプライマーが得られる。 cDNAの増幅のための好ましい条件にはTaqポリメラーゼを用い、30の 温度サイクル:95℃にて1分;50℃にて1分;72℃にて1.5分;を行う ことを含む。好ましいプライマーには、プロメガ・コーポレイションより入手さ れるオリゴ(dT)−NotIプライマー、AATTCGCGGC CGC(T)15[配列番号9 5]を(i)オリゴヌクレオチド配列:AAR GCi TAY CCi GAR TGY GGi GAR AAY GAR TGG[配列番号94](式中、RはAまたはGであり、YはTまたはCであ り、iはイノシンである、または(ii)ニュー・イングランド・バイオラブスより 入手されるラムダgt11プライマー#1218、GGTGGCGACG ACTCCTGGAG CCC G[配列番号96]のいずれかの分解プライマーと共に用いることを含む。 記載したように調製されるリコンビナントcDNA分子の核酸配列は、サンガ ー(Sanger,F)らのジデオキシ法(プロシーデイングス・オブ・ザ・ナショナル・ アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエスエー74:5463(1977))に基 づいて決定すればよく、この方法はさらにメッシング(Messing)らのヌクレイッ ク・アシッズ・リサーチ:309(1981)にも記載されている。 上記のごとく調製された好ましいリコンビナントcDNA分子は図1、3、7 、9、13および14の核酸配列を有している。(2)NAPcDNAをプローブとして用いる ハイブリダイゼーションプローブとして特に好ましいものとしてはその他に、 線虫、鉤虫アンサイロストマ カニナムより精製されたNAPの実質的に全アミ ノ酸配列をコードするオリゴヌクレオチド配列がある。特に好ましいプローブに はAcaNAP5およびAcaNAP6遺伝子から誘導されるものが含まれ、こ れらは以下の核酸配列を含む(AcaNAP5遺伝子): 好ましいハイブリダイゼーションプローブにはまた、NAPのアミノ酸配列の 実質的な部分をコードする配列を含み、これには例えばプライマーの組NAP− 1[配列番号90]およびNAP−4.RC[配列番号91]を用いて得たPC Rフラグメントが例示される(実施例13参照)。(3)ファージディスプレイの使用 ここに記載するのは本発明のタンパク質をコードするcDNAを全体のcDN Aライブラリーから選択する、糸状ファージ上のディスプレーを用いる方法であ る。現在の糸状ファージ上へのディスプレー方法は、目的とするコーディング領 域を、ファージの付着タンパク質および被覆タンパク質をそれぞれコードする遺 伝子3または遺伝子8内へのインフレーム挿入させるものである。未知の配列の cDNAの大量の混合物に対してこの方法を行うには、本来的にさまざまな問題 があること、および機能的なcDNA生成物のディスプレイを得るための最も実 際的な方法はcDNAをその5’末端で融合させることであるということは、当 業者には理解されるであろう。実際、十分な大きさのcDNAライブラリーには 同じmRNAから誘導されたいくつかのcDNAを含有していてもよいが、これ らのうちのいくつかが融合生成物として発現するよう、さまざまな部位において 5’末端となるよう切断されている。この線に沿った戦略であって、JunとF osのロイシンジッパーのヘテロダイマーを形成する能力に基づく方法が近年、 開示されている(カラメリ(Crameri,R)とスーター(Suter,M)ジーン137:6 9−75(1993)。 我々はこれに代わり得る新規な、直接的にcDNA生成物をファージの表面へ 共有結合させる方法を見いだした;この発見はファージ被覆タンパク質6ののC −末端へ融合したタンパク質が機能的にディスプレイされるという知見に基づく ものである。この知見は本明細書に記載したファージミド系、これは機能的にデ ィスプレイされたcDNA産生物の発現を可能にする方法であり、このDNAを 次いでディスプレイされたcDNA産生物の産生の為に必要とされるcDNAを 含有するファージ粒子を親和性により選択することが可能となる。この系は本発 明 のタンパク質をコードするcDNAの単離の基礎となる。いったん単離すれば、 かかるcDNAを含有するリコンビナントcDNA分子を、本発明のタンパク質 を他の発現系において発現させるのに用いることができる。こうして調製される リコンビナントcDNA分子もまた本発明の範囲内である。 本発明のリコンビナントcDNA分子はcDNAライブラリーを天然物(例と しては、鉤虫のごとき線虫)から調製し、このcDNAライブラリーを適当なフ ァージミドベクターへ連結し、宿主細胞をかかるcDNAを含有するベクターに より形質転換し、該宿主細胞を培養し、形質転換した細胞を適当なヘルパーファ ージに感染させ、宿主細胞培養物よりファージを分離し、その表面上に本発明の タンパク質を発現しているものを分け、これらのファージを単離し、そしてリコ ンビナントcDNA分子をかかるファージより単離して得る。 ファージミドベクターはpUC119発現ベクター(ビーエイラ(Vieira,J.) とメッシング(Messing,J.)メソッズ・イン・エンザイモロジー153:3−11 (1987))を用いて構築される。糸状ファージの表面タンパク質をコードす る遺伝子6の5’および3’末端にそれぞれHindIIIおよびSfiI制限 部位を付加する修飾をし、3つの前向きプライマーおよび1つの後向きプライマ ーとともにPCR法を行う。これによって3つのDNAフラグメントが得られる が、これらをさらにその3’および5’末端にNotIおよびBamHIフラグ メントが付加されるよう、PCRによって修飾する。3つのDNAフラグメント をHindIIIおよびBamHIにて別々に消化した後、3つのDNAフラグ メントをpUC119へライゲートしてpDONG61、pDONG62および pDONG63発現ベクターを得る。これらのベクターはcDNAをSfiI−Not Iフラグメントとして内部に取り込むことができる。 cDNAライブラリーは天然物、例えば線虫より、実施例2、9、および13 に記載されたごとく調製される。かかるライブラリーを作成するために好ましい 線虫には、アンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ デュオデナール、 ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴモソモイデス ポリギルスのごとき腸線 虫を含む。 SfiI−NotIフラグメントとしてのcDNAライブラリーは直接ファー ジミドベクターpDONG61、pDONG62およびpDONG63に連結さ せることができる。または、実施例2に記載したごとくラムダgt11ファージ ベクターに連結させたcDNAライブラリーをPCRにて回収し、電気泳動にて 単離し、次いでこれらのベクターに部位特異的に連結させてもよい。後のアプロ ーチにおいて、Taqポリメラーゼを用いるPCRのための好ましい条件は;プ ライマー、ラムダgt11プライマー#1218、GGTGGCGACG ACTCCTGGAG CCCG (ニュー・イングランド・バイオラブス、ビバリー、MA、USA)[配列番号 96]の配列を有する、およびオリゴ(dT)−NotI プライマー、AATTCG CGGC CGC(T)15の配列を有する(プロメガ・コーポレイション)[配列番号95 ]と共に、95℃1分間、50℃1分間、72℃3分間、の温度サイクル20回 、その後65℃で10分間おく、というものである。 宿主細胞をcDNAライブラリーを含有するpDONG発現ベクターにて形質 転換させる。好ましい宿主細胞には大腸菌の菌株が含まれ、TG1株が特に好ま しい。大腸菌宿主細胞形質転換の好ましい方法には電気穿孔法が含まれる。 形質転換された細胞を37℃で1%グルコースと100マイクログラム/ml のカルベニシリンを添加したLB培地内にて、600nmの光学吸収が0.5の 値に達するまで培養し、次いでVCSM13ヘルパーファージ(ストラタジェン )にて感染させる。感染倍率(moi)は20である。 ファージを培養物から遠心分離により分離し、次いでポリエチレングリコール /塩化ナトリウムによる沈殿によって精製する。 本発明のNAPをその表面に発現するファージはNAPが血液凝固系に含まれ る標的タンパク質、例えば第Xa因子、に結合する能力を利用して単離すること ができる。 かかるファージを単離する好ましい方法には以下のステップ: (1)ビオチンラベルした第Xa因子とファージ溶液とを合わせる; (2)この混合物をインキュベートする; (3)ストレプトアビジンでラベルした固相とこの混合物とを接触させる; (4)固相を混合物と共に培養する; (5)固相を混合物と分離し、該固相をバッファーに浸けて未結合ファージを除 く; (6)固相を第2のバッファーに接触させ、結合ファージを固相から切り離す; (7)該ファージを単離する; (8)宿主細胞を該ファージで形質転換する; (9)形質転換した宿主細胞を培養する; (10)形質転換した宿主細胞をVCSM13ヘルパーファージに感染させる; (11)ファージを宿主細胞培養物から単離する; (12)(1)から(11)のステップをさらに4回繰り返す、 を含むものである。 かかるファージを単離する特に好ましい方法には、実施例10に詳細に説明し た方法を含む。 一本鎖DNAを単離したファージから調製し、糸状ファージ遺伝子6の3'挿 入物の配列を決定した。 図9にはファージディスプレイ方法によって単離したリコンビナントcDNA 分子AcaNAPc2を示す。AcaNAPc2によりコードされる、本発明の このタンパク質の演繹されたアミノ酸配列もまた、この図に示した。(C)リコンビナントNAPの調製 上記のごとく単離された本発明のリコンビナントcDNA分子は、本発明のN APを発現するのに利用される。一般に、本発明のリコンビナントcDNA分子 は発現ベクターに導入され、この発現ベクターは適当な宿主細胞内へ導入され、 宿主細胞が培養され、そして発現されたタンパク質が単離される。 発現ベクターは、適当な宿主においてクローンされた遺伝子コピーの転写およ びそのmRNAの翻訳に必要なDNA配列である。これらのベクターは原核生物 の遺伝子または真核生物の遺伝子のいずれかを、細菌、酵母、哺乳類、植物およ び昆虫の細胞のごとき様々な細胞内に発現させることができる。タンパク質もま た様々なウイルス系において発現させることができる。 好ましく構築された発現ベクターは、宿主細胞内における自己複製のための複 製起点を含有するか、または宿主細胞のクロモソーム内へ挿入し得るものである 。かかるベクターには、選択マーカー、限定された数の有用な制限酵素部位、高 いコピー数および強いプロモーターもまた含有する。プロモーターはRNAポリ メラーゼを調整してDNAと結合させ、RNA合成を開始させるためのDNA配 列であり;強いプロモーターによりかかる開始が高頻度で生じる。本発明の好ま しい発現ベクターは、本発明のリコンビナントcDNAへ操作可能に連結したも のであり、すなわち結合したリコンビナントcDNA分子の複製および該リコン ビナントcDNA分子によりコードされるタンパク質の発現の両方を支配し得る 。発現ベクターはクローニングベクター、修飾クローニングベクターおよび特別 にデザインされたプラスミドまたはウイルスを含んでもよいが、これらに限定さ れない。 本発明のタンパク質の発現のために適当な宿主細胞としては、細菌、酵母、哺 乳類、植物および昆虫細胞が例示される。それぞれのタイプの細胞および株にお いて、特定の発現ベクターが適当であることは以下に示す通りである。 原核生物を本発明のタンパク質の発現に用いてもよい。適当な細菌宿主細胞に は大腸菌、バチラス ズブチリスの様々な株およびシュードモナスの様々な株を 含む。これらの系においては、宿主細胞と共存性の種から誘導された複製部位お よび調節配列を含有するプラスミドベクターが利用される。大腸菌に対して適当 なベクターには、大腸菌のある株より誘導されたプラスミドであるpBR322 (ボリバー(Bolivar)、ジーン:95(1977))の誘導体である。一般的 な原核細胞の調節配列、本明細書では調節配列は転写プロモーター、開始部位、 任意にオペレーターをリボソーム結合部位の配列と共に含有しているものと定義 する、にはベータラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系を含んでおり( チ ャン(Chang)ら、ネイチャー198:1056(1977))、トリプトファン プロモーター系を含んでおり(ジョーデル(Goeddel)ら、ヌクレイック・アシッ ズ・リサーチ:4057(1980))およびラムダ由来PLプロモーターお よびN−遺伝子リボソーム結合部位を含んでいる(シマタカら、ネイチャー29 :128(1981))。しかしながら、原核生物と共存性であるプロモータ ー系であればいずれも使用することができる。好ましい原核生物の発現系には大 腸菌およびその発現ベクターを含む。 真核生物を本発明のタンパク質の発現のために使用してもよい。真核生物は通 常酵母および哺乳類細胞にて代表される。適当な酵母宿主にはサッカロミセス セレビジュー(Saccharomyces cerevisiae)およびピチア パストリス(Pichia pastoris )を含む。哺乳類宿主細胞にはCOSおよびCHO(チャイニーズハム スターの卵母細胞)細胞が例示される。 真核生物のための発現ベクターは適当な真核生物の遺伝子から誘導したプロモ ーターを含む。酵母細胞発現ベクターのための適当なプロモーターにはグリコリ ティック酵素の合成のためのプロモーターを含み、これにはサッカロミセス セ レビジューの3−ホスホグリセレートキナーゼ遺伝子(ヒッズマン(Hitzman) ら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー255:2073(19 80))およびメタノールをアルコールピチア パシトリス内のオキシダーゼ遺 伝子のごとく、メタノールの代謝のための酵素(ストローマン(Stroman)ら、 米国特許第4808537号および4855231号)が含まれる。他の適当な プロモーターにはエノラーゼ遺伝子(オランド(Holland,M.J.)、ジャーナル・ オブ・バイオロジカル・ケミストリー256:1385(1981))またはY Ep13から得られるLeu2遺伝子(ブローチ(Broach,J.)ら、ジーン:1 21(1978))が挙げられる。 好ましい酵母発現系にはピチア パストリスおよびその発現ベクターが含まれ る。ピチア パストリス内に発現されたNAPをコードするcDNAは所望によ りC末端にプロリン残基が導入されたNAPタンパク質へと変異させてもよい。 しばしばかかるNAPタンパク質は高いレベルで発現され、そして望ましくない タンパク質分解に対してより耐性がある。かかるcDNAのひとつ、およびその ピチア パストリス内への発現を実施例17に示した。 哺乳類細胞発現ベクターのために適当なプロモーターにはSV40からの初期 および後期プロモーター(フィアス(Fiers)ら、ネイチャー237:113(1 978))または他のウイルスプロモーター、例えばポリオーマ、アデノウイル スII、ウシパピローマウイルスまたは鳥類サルコーマウイルス、から誘導され たものが含まれる。 昆虫細胞発現ベクターのための適当なプロモーターには、スミスらにより米国 特許第4745051に開示された系に手を加えたバージョンが挙げられる。こ の発現ベクターはバキュロウイルスのポリヘドリンプロモーターを含有し、その 制御下にあるタンパク質をコードするcDNA分子をおくことができる。 宿主細胞内へ本発明の発現ベクターを導入して、形質転換を行う。形質転換は 各種細胞に適した標準的な方法によって行えばよい。塩化カルシウムを用いるカ ルシウム処理(コーエン(Cohen,S.N.)のプロシーデイングス・オブ・ザ・ナショ ナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエスエー69:2110(1972)に 記載)またはRbCl法(マニアチスら、モレキュラー・クローニング:ア・ラ ボラトリー・マニュアル第254頁、コールド・スプリング・ハーバー・プレス (1982)に記載)を原核生物および実質的な細胞壁バリアを含有する他の細 胞に用いる。酵母の形質転換はファン・ゾリンゲン(Van Solingen,P.)ら、ジ ェイ・バクテール(J.Bacter)130:946(1977)およびシオ(Hsiao,C.L .)らのプロシーデイングス・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ ユーエスエー76:546(1978)に記載されているように行えばよい。多 くの細胞壁を有していない哺乳類の細胞はグラハム(Graham)とファン・デル・イ ーブ(Van der Eb)バイロロジー(Virology)52:546(1978)に記載のカ ルシウムホスフェート法を用いて形質転換すればよい。植物細胞はアグロバクテ リウム・ツメファシエンスの感染により、ショウ(Shaw,C.)ら、ジーン23: 315(1983)に記載されたごとき方法にて形質転換すればよい。大腸菌お よびピチア・パストリスを発現ベクターにより形質転換させる好ましい方法には 電気穿孔法を含む。 形質転換された宿主細胞を培養するが、培地の種類、温度;酸素濃度、液の状 態等の条件は、生物学分野の当業者によく知られている。 本発明のリコンビナントタンパク質は宿主細胞または培地から、生化学分野の 当業者によく知られた標準的な方法にて単離する。かかる方法にはクロマトグラ フ法を利用する方法を含む。好ましい精製方法には抽出物をポーラス20HQ(P oros20HQ)陰イオン交換性マトリックスまたはポーラス20HS(Poros20HS)陽イ オン交換性マトリックス、セファデックス30ゲル濾過マトリックスおよびC1 8逆相マトリックスを通す連続クロマトグラフ法を含む。かかるクロマトグラフ ィーの1のカラムを通した後に集められたフラクションは、ヒト血漿の凝結時間 を増加させる作用を有するか否かを、PTおよびaPTTアッセイにより調べる か、あるいは比色アッセイにより第Xaアミド分割活性の阻害能を調べて、これ らによって選択すればよい。本発明のリコンビナントタンパク質の精製のための 好ましい方法の例を実施例3、4、6、8、14および15に示した。4.NAPを使用する方法 本発明には、哺乳類の血漿を、該血漿が凝固しないよう採取する方法を含み、 この方法には血液採取管内へ本発明のタンパク質を、血液を該管内へ流入させた 場合に凝血生成を抑制するのに十分な量添加すること、該管内へ哺乳類の血液を 吸入すること、赤血球と哺乳類の血漿とを分離することおよび哺乳類の血漿を回 収することを含む。 血液採取管には、静脈穿刺によって得られる血液を吸引するための手段として 内部が真空である試験管に、ストッパーを付したものを含む。これらを含む好ま しい試験管ははボロシリケートガラス製のもので、大きさが例えば10.25×47mm 、10.25×50mm、10.25×64mm、10.25×82mm、13×75mm、13×100mm、16×75mm、 16×100mm、または16×125mmのものが挙げられる。好ましいストッパーは血液採 取針により容 易に孔を明けることができ、試験管上に設置した場合に、空気の管内への侵入す るを阻止するのに十分な密閉性を付与するものである。 本発明のタンパク質の血液採取管へ添加する際の態様としては、当業者によく 知られたさまざまなものとして添加することができ、例えばその液体組成物、そ の固体組成物、または試験管内で凍結乾燥される液体組成物が挙げられる。管内 へ添加する量は、哺乳類の血液が管内へ導入された場合に血液凝固が生じるのを 防止するのに十分な量とする。本発明のタンパク質は以下のごとき量を採血管内 へ添加する:2から10mlの哺乳類の血液と混合した場合に、このタンパク質 の量が凝血塊生成を阻止するのに十分な濃度となる量。典型的には、このような 有用な濃度としては約1から約10000nMであり、10から1000nMが 好ましい。または、本発明のタンパク質は他の凝血抑制添加剤、例えばヘパリン 塩、EDTA塩、クエン酸塩またはオキサレート塩等とともに管内へ添加しても よい。 哺乳類血液を、本発明のタンパク質または該タンパク質と他の凝血抑制添加剤 と共に含む血液採取管内へ吸引した後、赤血球を遠心分離により哺乳類の血漿よ り分離する。遠心分離は医療分野の当業者によく知られた重力、温度および時間 条件にて行えばよい。赤血球から血漿を分離するための典型的な条件は遠心力が 約100×gから約1500×gであり、温度が約5から約25℃であり、そし て約10分から約60分の時間行うというものである。 哺乳類の血漿を別の容器へ注ぐには、ピペットにて吸い上げるまたはその他の 医療の当業者によく知られている方法によって集めればよい。 他の観点において、本発明には哺乳類における血栓(凝血塊生成)または血液 凝固を予防または抑制する方法を含み、この方法には該哺乳類に治療有効量の本 発明のタンパク質または医薬組成物を投与することを含む。 本発明のタンパク質または医薬組成物は、通常哺乳類、特にヒトにインビボに て投与する。本発明のこれらをインビボにて用いる際には、このタンパク質また は医薬組成物を様々な経路で投与し得、例えば経口、非経口、静脈内、皮下、筋 肉内、結腸内、直腸内、鼻孔内または腹腔内などの経路を含む。投与は好ましく は非経口投与、例えば静脈内投与とし、毎日投与することが好ましい。または、 投与は好ましくは経口で行い、例えば錠剤、カプセル、エリキシルにより毎日飲 むのが好適である。 本発明の方法を実施するに際して、本発明のタンパク質または医薬組成物は単 独で投与しても、互いに混合しても、または他の治療またはインビボ診断用剤と 共に投与してもよい。 医療分野の当業者には明らかなように、本発明のタンパク質または医薬組成物 の治療有効量は年齢、体重および処置する哺乳類の種類、用いる特定のタンパク 質、用いる投与方法および所望の効果と治療上指針などによって変わるものであ る。これらの要因およびその相互関係によって、治療有効用量レベルの決定、血 栓を阻止する所望の結果に到達するのに必要な量の決定は、当業者の業務範囲で ある。 典型的には、本発明のタンパク質または医薬組成物の投与は低い用量レベルに て始め、用量レベルを上げながらインビボ血栓の阻害という所望の効果が得られ るようにするのがよく、その時の濃度が治療有効量となる。本発明のタンパク質 は、単独であっても医薬組成物の成分としてであっても、その用量は体重1kg あたり0.01から100mg、より好ましくは体重の約0.01から10mg/ kgである。5.有用性 本発明のタンパク質を上述の通り調製し、選択したものは、インビトロおよび インビボの両方において血液凝固の強い阻害剤として有用である。このように、 かかるタンパク質は血液の凝血を防止するためのインビトロ診断試薬として有用 であり、また哺乳類のインビボにおける血栓生成または血液凝固を防止するため の医薬組成物としても有用である。 本発明のタンパク質は、血液吸引管内の凝血を抑制するためのインビボ診断用 試薬として有用である。静脈穿刺により得られる血液を吸引する手段として内部 を真空にしてある、ストッパーを付した試験管を用いることは医療業界において よく知られている。キャステン(Kasten,B.L.)「スペシメン・コレクション」ラボ ラトリー・テスト・ハンドブック第2版、レキシ−コンプ・インコーポレイテッ ド、クリーブランドpp16−17(ヤコブス(Jacobs,D.S.)ら編集、1990)。か かる真空試験管は凝血阻害用の添加剤を有していないものであってもよく、その ような場合には、このようなチューブは哺乳類の血清を血液から単離するのに有 用となる。または凝血阻止添加剤(ヘパリン塩、EDTA塩、クエン酸塩または オキサレート塩等)を含有していてもよく、かかる場合には血液より哺乳類の血 漿を単離するのに有用である。本発明のタンパク質は強い血液凝固阻害剤であり 、したがって血液採取管内へ、その管内へ吸引される哺乳類の血液が凝固するの を防ぐために添加するのに有用である。 本発明のタンパク質は単独で、本発明の他のタンパク質と共に、あるいは他の 既知の凝固防止剤、例えばヘパリン塩、EDTA塩、クエン酸塩、オキサレート 塩と共に、血液採取管内にて用いられる。 血液採取管内へ添加すべき量、即ち有効量は、哺乳類の血液が管内へ導入され た場合に血液凝固の形成を阻害するのに十分な量である。本発明のタンパク質は 2から10mlの哺乳類血液と混合した場合に血餅が生成するのを阻止するのに 十分な濃度となるような量を添加すればよい。典型的にはこの有効量は血液中に おける最終濃度が約1から10000nM、好ましくは10から100nMとな る量である。 本発明のタンパク質はまた診断用組成物を製造するために用いてもよい。ひと つの態様において、診断用組成物は本発明のタンパク質を診断用に用い得る担体 に溶解する。担体としては、リン酸緩衝生理的食塩水(0.01Mのリン酸ナト リウム+0.15Mの塩化ナトリウム、pH7.2)またはトリス緩衝生理的食塩 水(0.05Mのトリス−HCl+0.15Mの塩化ナトリウム、pH8.0)が 例示される。他の態様においては、本発明のタンパク質は他の診断において許容 される固形担体と、固形診断用組成物の製造方法として当業者によく知られてい る方法にて混合して調製してもよい。かかる担体としてはバッファー塩が含まれ る。 本発明のタンパク質の血液採取管への添加は、当業者によく知られている方法 にて遂行すればよく、かかる方法には該タンパク質の液体診断組成物として、該 タンパク質の固形診断組成物として、または該タンパク質の液体組成物を血液採 取管内で凍結乾燥して、固形診断用組成物の固形塊を生成したものとして添加す る方法が含まれる。 本発明の診断用組成物を含有する血液採取管の使用には、有効量のこの診断用 組成物と該管内へ誘導される哺乳類の血液とを接触させること含む。典型的には 、2から10mlの哺乳類の血液を血液採取管に採取し、血液採取管内で診断用 組成物と接触させた場合;有用な量は診断用組成物として処方されているタンパ ク質の血液試料内の濃度が、凝血塊の生成を阻止するのに十分である濃度となる 量である。好ましい有効濃度は約1から10000nM、好ましくは10から1 000nMである。 本発明の別の観点からは、本発明のタンパク質は哺乳類の血栓症もしくは血液 凝固生成の抑制のための医薬としても有用である。この血栓症もしくは血液凝固 の抑制もしくは阻害には、異常な血栓の防止または抑制を含む。 異常な血栓により特徴付けられる症状については医療分野においてよく知られ ており、哺乳類の動脈および静脈血管系の両方を含む。冠動脈血管系に関しては 、異常な血栓症(血栓生成)は確立されたアテローム性動脈硬化性プラークの破 裂に認められ、これは急性心筋梗塞および不安定アンギナの主原因となっている 。そして、血栓溶解治療または経皮トランスルミナル冠動脈アンギオプラスティ ー(PTCA)による治療の結果の閉塞性冠動脈血栓生成にもまた認められる。 静脈血管系に関しては、異常な血栓症は下肢や腹部に大手術をされた患者にしば しば血栓生成が静脈血管内に認められ、これは治療した下肢への血流量の減少を もたらし、また肺動脈塞栓症体質となる。異常な血栓症はさらに、通常敗血症シ ョック、ある種のウイルス感染、および癌にかかっている患者の両方の血管系に 認め られる、播種性血管内凝血異常についても特徴付け、この症状は凝固因子の迅速 な消費と全身性の凝血を起こすものであり、その結果、毛細血管中に生命にかか わるような血栓が生成して広く臓器不全を引き起こすものである。 本発明のNAPタンパク質はまた、抗体を生成するための免疫原としても有用 である。NAPに対するモノクローナル抗体およびポリクローナル抗体の両方の 抗体は診断方法において、およびNAPのさまざまな生物的液体中の濃度の測定 において、有用である。かかる抗体を利用するイムノアッセイを、例えば哺乳類 の宿主に寄生虫が感染したかどうかを検出するため、または哺乳類宿主の組織内 の寄生虫からNAP検出するために用いることができる。また、このようなイム ノアッセイをNAPを組織ホモゲネート、クローン細胞等から検出、単離するの に用いてもよい。 NAPを適当なアジュバントと共に、哺乳類における寄生虫感染に対するワク チンとして用いることもできる。NAPワクチンによる免疫は、寄生虫感染の予 防および治療の両方に用いることができる。寄生虫に起因する疾患症状を、かか る寄生虫に感染した動物にたいして抗NAP抗体を投与することによって治療で きる。 セリンプロテアーゼ阻害活性を有する本発明のNAPタンパク質はまた、セリ ンプロテアーゼの阻害が所望される症状またはアッセイにおいて有用である。例 えば、セリンプロテアーゼトリプシンまたはエラスターゼを阻害するNAPタン パク質は、それぞれ白血球に媒介される急性膵炎または急性炎症性応答の治療に 有用である。 本発明のタンパク質をコードするリコンビナントcDNA分子は、ある態様に おいては他のcDNA分子であって本発明のタンパク質をコードするものを単離 するのにも有用である。他の観点においては、これらは本発明のタンパク質を宿 主細胞上に発現させるのにも有用である。 本発明のヌクレオチドプローブは線虫および他の生物からNAPをコードする 核酸を同定、単離するのに有用である。さらに、本発明のヌクレオチドプローブ は線虫をコード化する核酸の存在を試料、例えば線虫に感染した疑いのある哺乳 類の体液または組織から検出するために有用である。プローブは線虫核酸の存在 の検出のために直接使用しても、適当な検出のための標識をつけて用いてもよく 、またはより間接的な方法、たとえばPCR型反応を用いて、検出のための試料 に存在するかもしれない線虫の核酸を増幅してもよい。かかる方法の条件および 診断アッセイの条件は当業者は容易に入手することができる。 理解の補助のため、本発明を以下の実施例に基づいてさらに詳細に説明する。 かかる本発明に関連する実施例は本発明を特別なものに限定するためのものでは ない。また、本発明の現在および将来的に開発される発明のバリエーションは当 業者が本明細書に記載し、クレイムに記載した本発明の範囲内に入ると考える場 合には本発明の範囲に入る。実施例 実施例1 アンサイロストマ カニナム(Ancylostoma caninum)由来の新規抗凝固タンパ ク質(NAP)の単離 (A)アンサイロストマ カニナム溶解液の調製 凍結アンサイロストマ カ(Ancylostoma caninum)をAntibody System(テキ サス州ベッドフォード)から入手した。鉤虫をホモジネートに使用するまで−80 ℃で保存した。 鉤虫を液体窒素中で凍結し、乳鉢で粉砕した後、テフロンピストンを付けたPo tterSホモジナイザー(B.Braun Melsungen AG,ドイツ)を用いて、ホモジナイ ゼーション緩衝液中氷上でホモジナイズした。ホモジナイゼーション緩衝液は0. 02M Tris-HCl(pH7.4)、0.05M NaCl、0.001M MgCl2、0.001M CaCl2、1.0×10-5 M E-64プロテアーゼ阻害剤(Boehringer Mannheim,ドイツ)、1.0×10-5Mペプ スタチンA(イソバレリル-Val-Val-4-アミノ-3-ヒドロキシ-6-メチル-ヘプタノ イル-Ala-4-アミノ-3-ヒドロキシ-6-メチルヘプタン酸,ICN Biomedicals,カリ フォルニア州)、1.0×10-5Mキモスタチン(Boehringer)、1.0×10-5Mロイペプ チン(ICN)、5×10-5M AEBSF(フッ化4-(2-アミノエチル)-ベンゼンスルホニ ル,ICN)および5%(v/v)グリセロールを含有した。約4mlのホモジナイゼーシ ョン緩衝液を用いて各1gの凍結虫(約500匹)をホモジナイズした。不溶物質を2 回の連続的遠心分離段階(4℃,19,000×gmaxで30分間の後、4℃,110,000×gma x で40分間)によってペレット化した。その上清溶液を0.45マイクロメーター酢 酸セルロースフィルター(Corning,ニューヨーク州)に通して清浄化すること によりアンサイロストマ カニナム溶解液を得た。(B)コンカナバリンA−Sepharoseクロマトグラフィー アンサイロストマ カニナム溶解液(100ml)を、ConA緩衝液(0.02M Tris-HC l,pH7.4,1M NaCl,0.002M CaCl2)で予め平衡化しておいた22mlのコンカナバ リンA−Sepharose(Pharmacia,スウェーデン)に吸着させた。これは該ゲルの1 .6×11cmカラムに3ml/分(90cm/時)の流速で該溶解液を流すことによって行 った。カラムは周囲温度であったが、溶解液の受器はこの操作の間ずっと氷槽温 度に維持した。次にこのカラムを2カラム体積のConA緩衝液で洗浄した。そのカ ラム通過液と洗浄液を集め(約150ml)、さらなる加工を行うまで−80℃で保存 した。(C)陰イオン交換クロマトグラフィー 最終濃度12.5mMとなるように固形酢酸ナトリウムを加えることによって、コン カナバリンA−Sepharoseカラムの通過液と洗浄液を緩衝化した。ミリQ水で希釈 することによってその導電率を下げ、pHをHClでpH5.3に調節した。pH調節の間に 生成した沈殿を15,000×gmax,4℃,15分の遠心分離によってペレット化した。 その上清溶液を0.2マイクロメーター酢酸セルロースフィルター(Corning,ニュ ーヨーク州)に通すことによって清浄化した。 この清浄化した溶液(総体積約600ml)を、陰イオン緩衝液(0.05M酢酸ナトリ ウム,pH5.3,0.1M NaCl)で予め平衡化しておいたPoros20 HQ(Perseptive Bio systems,マサチューセッツ州)1×2cmカラムに10ml/分(800cm/時)の流速で 流した。このカラムと加えた溶液はこの精製段階中ずっと周囲温度であった。次 にそのカラムを10カラム体積の陰イオン緩衝液で洗浄した。 第Xa因子アミド分解検定において阻害因子活性を持つ物質(後述の方法に従 って検出する)を、流速5ml/分(400cm/時)の0.55M NaClを含有する陽イオン 緩衝液で溶出させた。溶液の試料を第Xa因子アミド分解検定で次のように試験 した。検定緩衝液(100mM Tris-HCl pH7.4;140mM NaCl;0.1% BSA)中に第X a因子と試料の様々な希釈液を含む反応混合物(150マイクロリットル)を96穴 プレート中に調製した。ヒト第X因子はEnzyme Research Laboratories(米国イ ンディアナ州サウスベント)から購入し、Bock,P.E.,Craig,P.A.,Olson, S.T.およびSingh P.,Arch.Biochem.Biophys.,273: 375-388(1988)の方法 を用いてラッセルクサリヘビ毒で活性化した。周囲温度で30分間インキュベート した後、50マイクロリットルの1mM基質水溶液(p-ニトロアニリド-ジヒドロ-塩 化N-アルファ-ベンジルオキシカルボニル-D-アルギニル-L-グリシル-L-アルギニ ン;S-2765;Chromogenix,スウェーデン国メルンダル)を加え、最終濃度0.2nM 第Xa因子および0.25mM S-2765にすることによって酵素反応を開始させた。基 質の加水分解をVmax速度プレート測定器(Molecular Devices,米国カリフォル ニア州メンロパーク)を用いて405nmで吸光度を連続的に測定することにより監 視した。(D)熱処理 陰イオン交換クロマトグラフィーから得た0.55M NaCl溶出液の半分(3ml)に1 M Tris-HCl pH7.5を最終濃度50mMになるように加えて中和し、ガラス管中90℃で 5分間インキュベートした後、氷上で急速に冷却した。不溶物質を19,000×gmax, 4℃で20分間の遠心分離によってペレット化した。その上清は第Xa因子アミド 分解検定で第Xa因子を阻害する物質を含有していた。この熱処理後、希釈を考 慮して、第Xa因子阻害活性の約89%がその上清中に回収された。(E)Superdex30を用いる分子篩クロマトグラフィー(熱処理段階の代替法) 陰イオン交換クロマトグラフィーから得た0.55M NaCl溶出液の半分(3ml)を2 4℃の0.01Mリン酸ナトリウムpH7.4,0.15M NaClで予め平衡化しておいたSuperde x30 PG(Pharmacia,スウェーデン)1.6×66cmカラムにのせた。このクロマトグ ラフィーを2ml/分の流速で行った。第Xa因子阻害活性(第Xa因子アミド分 解検定で決定した)は56〜64mlに溶出した(Kav=0.207)。この溶出体積は分子 質量14,000ダルトンの球状タンパク質に予期されるものである。(F)逆相クロマトグラフィー コンカナバリンA-Sepharose、陰イオン交換およびSuperdex30(または代替熱 処理段階)でのクロマトグラフィーによって分画した鉤虫溶解液を0.46×25cm C 18カラム(218TP54 Vydac;カリフォルニア州ヘスペリア)にのせ、それを0.1% (v/v)トリフルオロ酢酸中の10〜35%アセトニトリルの直線的勾配(流速1ml/ 分,変化速度0.625%アセトニトリル/分)で展開した。FXa阻害活性(第Xa因 子アミド分解検定で決定した)は約30%アセトニトリルで溶出した。このHPLC溶 出は215nmのPolychrom 9600検出器セットに接続したVista 5500(Varian,カリ フォルニア州)で行った。検出器の信号を同じ企業の4290インテグレーターで積 分した。第Xa因子阻害活性を含有する画分を真空乾燥し、PBS(0.01Mリン酸ナ トリウムpH7.4,0.15M NaCl)中に再溶解した。 これらの画分を集め、それを0.46×25cm C18カラム(218TP54 Vydac;カリフ ォルニア州ヘスペリア)にのせ、0.1%トリフルオロ酢酸中の10〜35%アセトニ トリルの直線的勾配(流速1ml/分,先ほどより遅い変化速度0.4%アセトニトリ ル/分)で展開した。第Xa因子阻害活性を含有する画分を集め、真空乾燥した 。(G)アンサイロストマ カニナム由来のNAPの分子量決定 この実施例に記述したように単離したNAPの推定質量をエレクトロスプレイイ オン化質量スペクトル測定法を用いて決定した。 真空乾燥したNAPペレットを50%(v/v)アセトニトリル,1%(v/v)ギ酸に溶 解した。質量分析をVG Bio-Q(Fisons Instruments,英国マンチェスター)を用 いて行った。 NAP試料をポンプでキャピラリーに通し、その先端で4kVの高電圧をかけた。高 電場の影響下で、試料をタンパク質分子を含む小滴状に噴霧した。60℃の中性ガ ス(N2)の乾燥効果によって、すべての溶媒が蒸発してタンパク質種のみが気状 で残るまで小滴の体積をさらに減じた。1回の投入で互いに異なるタンパク質種 の群が生じた。四極子分析器で、異なるDa/e(質量/電荷)値を検出した。装 置の較正はウマ心臓ミオグロビン(Sigma,ミズーリ州)を用いて行った。 この実施例のA、B、C、DおよびF項に記述したように単離したNAPの推定質量は 8734.60ダルトンである。A、B、C、EおよびF項に記述したように単離した天然NA Pの推定質量は8735.67ダルトンである。(H)アンサイロストマ カニナム由来のNAPのアミノ酸配列決定 On Board Microgradient PTH AnalyzerとModel 610A Analysis Systemを装着 した476-A Protein/Peptide Sequencer(Applied Biosystems,カリフォルニア 州)でアミノ酸決定を行った。残基の定量はシステムコンピューター(Applied Biosystems,カリフォルニア州)でのオンライン分析によって行い、残基の同定 はHPLCクロマトグラムの目視分析によって行った。天然NAPのアミノ末端の最初 の20アミノ酸を次のように決定した。 試料を還元せず、続いてアルキル化したので、システイン残基はこの分析では直 接的には検出されなかった。特定のアミノ酸が同定されなかった位置にシステイ ンを割り当てた。実施例2 アンサイロストマ カニナム由来のNAPのクローンニングと配列決定 (A)ハイブリッド形成プローブの調製 線虫(アンサイロストマ カニナム)から単離したmRNAから調製したcDNAライ ブラリーを、アンサイロストマ カニナム由来のNAPのアミノ末端の最初の11ア ミノ酸:Lys Ala Tyr Pro Gln Cys Gly Glu Asn Gln Trp[配列番号93]に基 づく配列を持つ放射性標識変性オリゴヌクレオチドを用いてスクリーニングする ことにより、NAPをコードする全長cDNAクローンを単離した。YG99と命名したこ の33マー・オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは次の配列を持つ:AA R GCi TAY CCi GAR TGY GGi GAR AAY GAR TGG[配列番号94]。(ここに「R」は AまたはGを表し、「Y」はTまたはCを表し、「i」はイノシンを表す)ガンマ-32P -ATP(比活性>7000Ci/mmol;ICN,米国カリフォルニア州コスタメサ)を用いる 酵素的5'末端リン酸化(5'末端標識キット;Amersham,英国バッキンガムシャー )によってYG99を放射性標識した後、これをNAPTM10カラム(Pharmacia,スウェ ーデン国ウプサラ)に通した。(B)cDNAライブラリーの調製 記述された方法(Promega Protocols and Applications Guide第2版;Promega Corp.,米国ウィスコンシン州マジソン)を用いてcDNAライブラリーを構築した 。 成体鉤虫(アンサイロストマ カニナム)をAntibody Systems(テキサス州ベ ッドフォード)から購入した。ポリ(A+)RNAをQuick Prep mRNA Purification Kit(Pharmacia)を用いて調製した。オリゴ(dT)-Not Iプライマー/アダプタ ー:AATTCGCGGCCGC(T)15[配列番号95](Promega Corp.)とAMV(ニワトリ骨 髄芽球症ウイルス)逆転写酵素(Boehringer Mannheim,ドイツ)を用いて、約3 マイクログラムのmRNAを逆転写した。二本鎖cDNA合成に使用した酵素は、Life T echnologies(米国メリーランド州ガイサースブルク)製の大腸菌DNAポリメラー ゼIとRNaseHおよびPharmacia製のT4 DNAポリメラーゼである。 Eco RIメチラーゼで処理した後、得られたcDNAにEco RIリンカー(pCGGAATTCC G)[配列番号98]を連結した(RiboClone Eco RI Linker Ligation System;Pr omega)。 このcDNAをNot IとEco RIで消化し、1.5%アガロースゲルに通し(Geneclean 法(BIO101 Inc.,カリフォルニア州ラジョラ)を用いて大きい物質をすべて溶 出させた)、ラムダgt11 Sfi−Not Iベクター(Promega)のEco RI−Not I腕中 に同一方向に連結した。インビトロパッケージング(GigapackII-Gold,Stratag ene,カリフォルニア州ラジョラ)の後、株Y1090(Promega)を感染させること により組換えファージを得た。 いくつかの無作為に拾ったクローンを、配列:GGTGGCGACG ACTCCTGGAG CCCGを 持つラムダgt11プライマー#1218(New England Biolabs,米国マサチューセッ ツ州ベバリー)[配列番号96](cDNA挿入物の上流に位置する配列を標的とする )を上述のオリゴ(dT)-Not Iプライマー/アダプターと組み合わせて用いるPC R分析にかけることにより(Boehringer製のTaqポリメラーゼ;30温度サイクル: 95℃で1分、50℃で1分、72℃で3分)、このcDNAライブラリーの有用性を立証し た。そのクローンの大半は様々なサイズのcDNA挿入物を含有することがわかった 。(C)クローンの同定 約1×106cDNAクローン(HybondTM-N(Amersham)を用いて複製プラーク採取フ ィルターを調製した)を、次の予備ハイブリッド形成およびハイブリッド形成条 件を用いて、放射性標識YG99オリゴヌクレオチドでスクリーニングした:5×SSC (SSC:150mM NaCl,15mMクエン酸三ナトリウム)、5×デンハルト溶液、0.5% SDS,100マイクログラム/ml超音波処理魚精子DNA(Boehringer)、42℃で終夜。 そのフィルターを37℃の2×SSC,0.1% SDS中で4回洗浄した。X線フィルムに暴 露(約72時間)した後、合計350〜500のハイブリッド形成スポットを同定した。 NAP1〜NAP24と命名した24個の陽性クローンを、より低いプラーク密度での第2回 ハイブリッド形成にかけた。NAP24以外では、ラムダファージの均一な集団を含 有する単一のプラークが同定された。オリゴ(dT)-Not Iプライマー(AATTCGCG GC CGC(T)15)[配列番号95]を(i)YG99または(ii)ラムダgt11プライマー #1218と組み合わせて用いるPCR増幅によって、保持したクローンを分析した(B oehringer製のTaqポリメラーゼ;30温度サイクル:95℃で1分、50℃で1分、72℃ で1.5分)。そのクローンの大半(23個中20個)は、オリゴ(dT)-Not I/YG99 プライマーセットを使用した場合に約400bpの断片を与え、オリゴ(dT)-Not I /#1218プライマー対を使用した場合には約520bpの断片を与えた。全長であろ うと思 われるこれらのクローン19個をさらに特徴づけた。 5つのクローンのcDNA挿入物をpGEM-5Zf(−)およびpGEM-9Zf(−)(Promega )上のSfi I−Not I断片としてサブクローニングした。ラムダgt11とpGEM-5Zf( −)のSfi I部位は互いに適合しないので、このベクター上でのクローニングに は、2つの5'末端リン酸化オリゴヌクレオチド:pTGGCCTAGCG TCAGGAGT[配列番 号99]とpCCTGACGCTA GGCCATGG[配列番号100]をアニーリングさせた後に得ら れる小さなアダプター断片を使用する必要があった。一本鎖DNAの調製後、配列 :AGCGGATAAC AATTTCACAC AGGA[配列番号101]を持つプライマー#1233(New E ngland Biolabs)を用いるジデオキシ連鎖終結法で、これらのcDNAの配列を決定 した。5つのクローンすべてが完全な分泌シグナルを含む全長であることがわか った。クローンNAP5、NAP7およびNAP22は同一のコード領域を持つことがわかっ た。クローンNAP6とNAP11も同一であるが、NAP5型のコード領域とは異なる。図1 はNAP5遺伝子のヌクレオチド配列を表し、図2はコード化されているタンパク質A caNAP5のアミノ酸配列を表す。同様に、図3はNAP6[配列番号5]遺伝子のヌクレ オチド配列を表し、図4はコード化されているタンパク質AcaNAP6[配列番号6] のアミノ酸配列を表す。 全長であろうと思われる他のクローン14個を制限分析にかけた。YG99/オリゴ (dT)-Not Iプライマー対で得られる上述の400bp PCR産物を、クローンのNAP5 型とNAP6型を識別しうる4つの異なる酵素:Sau 96I、Sau 3AI、Dde IおよびHpa IIで消化した。その結果は14クローン中10クローンがNAP5型(例:NAP4、NAP8、 NAP9、NAP15、NAP16、NAP17、NAP18、NAP20、NAP21およびNAP23)であり、残り の4クローンがNAP6型(例:NAP10、NAP12、NAP14およびNAP19)であることを示 した。 これらのクローンを、NAP名の直前にAcaという文字を置くことによってアンサ イロストマ カニナムからの起源を反映するように再命名した。例えばNAP5はAc aNAP5となり、NAP6はAcaNAP6になるといったふうである。実施例3 P .pastorisにおける組換えAcaNAP5の生産と精製 (A)発現ベクター構築 大腸菌/P.pastorisシャトルベクターpHILD2を含むPichia pastoris酵母発現 系はいくつかの米国特許に記述されている。例えば米国特許第5330901号、第526 8273号、第5204261号、第5166329号、第5135868号、第5122465号、第5032516号 、第5004688号、第5002876号、第4895800号、第4885242号、第4882279号、第487 9231号、第4857467号、第4855231号、第4837148号、第4818700号、第4812405号 、第4808537号、第4777242号および第4683293号を参照のこと。 P.pastorisにおける組換えAcaNAP5の直接発現と分泌に使用したpYAM7SP8ベク ターは、同じ一般構造を持つpHILD2プラスミド(Despreaux,C.W.およびMannin g,R.F.,Gene 131: 35-41(1993))の誘導体である。P.pastorisにおける発 現と染色体組込みに必要なpHILD2の転写要素および組換え要素(Stroman,D.W. ら,米国特許第4855231号を参照のこと)に加えて、このベクターはアルコール オキシダーゼ(AOX1)プロモーターの下流に挿入されたキメラプレプロリーダー 配列を含有する。そのプレプロリーダーは、合成19アミノ酸プロ配列に融合した P.pastoris酸性ホスファターゼ(PHO1)分泌シグナルからなる。このプロ配列 は、サッカロミセス・セレビシェ(Saccharomyces cerevisiae)アルファ因子リ ーダー配列に基づいてClementsら(Gene 106: 267-272(1991))によって設計 された2つの19-aaプロ配列の1つである。そのプレプロリーダー配列のすぐ下流 に、酵素Stu I、Sac II、Eco RI、Bg1 II、Not I、Xho I、Spe IおよびBam HIの 認識配列を持つ合成マルチクローニング部位を作成して、外来遺伝子のクローニ ングを容易にした。Pichia pastoris内でpYAM7SP8から発現されるNAPは最初にプ レプロ産物として翻訳され、続いてその宿主細胞によるプロセシングを受けてプ レおよびプロ配列が除去される。 このベクターの構造を図12に示す。シグナル配列(S)は次の核酸配列を持つ :ATG TTC TCT CCA ATT TTG TCC TTG GAA ATT ATT TTA GCT TTG GCT ACT TTG CA A TCT GTC TTC GCT[配列番号102]。プロ配列(P)は次の核酸配列を持つ:CAG CCA GGT ATC TCC ACT ACC GTT GGT TCC GCT GCC GAG GGT TCT TTG GAC AAG AGG [配列番号103]。マルチクローニング部位(MCS)は次の核酸配列を持つ:CCT ATC CGC GGA ATT CAG ATC TGA ATG CGG CCG CTC GAG ACT AGT GGA TCC[配列番 号104]。 AcaNAP5 cDNAを含有するpGEM-9Zf(−)ベクター(Promega)を用い、増幅( 「PCRレスキュー」)によって、成熟AcaNAP5タンパク質をコードする領域を単離 した(New England Biolabs(マサチューセッツ州ベバリー)製のVentポリメラ ーゼを使用;20温度サイクル:94℃で1分間、50℃で1分間、72℃で1.5分間)。 次のオリゴヌクレオチドプライマーを用いた: C末端配列を標的とするYG101プライマーはXba IおよびHin dIII制限部位(下線 部)を含む非アニーリング伸長部を含有する。 Xba I酵素による消化後、予期されるサイズを持つ増幅産物をゲルから単離し 、続いて酵素的にリン酸化した(New England Biolabs(マサチューセッツ州ベ バリー)製のT4ポリヌクレオチドキナーゼ)。キナーゼの熱不活化(70℃で10分 )後、平滑末端/Xba I断片を発現用のベクターpYAM7SP8中に指向的にクローニ ングした。pYAM7SP8由来の受容ベクター断片をStu I−Spe I制限によって調製し 、アガロースゲルから精製した。その連結混合物で大腸菌株WK6(Zell,R.およ びFritz,H.-J.,EMBO J.,6: 1809-1815(1987))を形質転換し、アンピシリ ン耐性クローンを選択した。 制限分析に基づいて、予期されるサイズの挿入物を含有するプラスミドクロー ン(pYAM7SP-NAP5と命名)をさらなる特徴づけのために保持した。クローンpYAM 7SP-NAP5の配列決定によって、プレプロリーダーシグナルと融合した成熟AcaNAP 5コード領域の正確な挿入が、構築法によって予想される通りに、そしてコード 領域中に望ましくない突然変異を伴うことなく、確認された。(B)P.pastorisにおける組換えAcaNAP5の発現 Pichia pastoris株GTS115(his4)はStroman,D.W.ら,米国特許第4855231号 に記述されている。すべてのP.pastoris操作を基本的にStroman,D.W.ら,米 国特許第4855231号に記述されているように行った。 約1マイクログラムのpYAM7SP-NAP5プラスミドベクターDNAを標準的な電気穿 孔法(エレクトロポレーション)を用いて株GTS115中にエレクトロポレートした 。そのプラスミドは予めSal I消化によって直鎖化しておいたもので、これによ りプラスミドのhis4染色体遺伝子座への標的と組込みが理論的に促進される。 AcaNAP5高発現株の選択は基本的に下記のように行った。His+形質転換体をMD プレート(アミノ酸非含有Yeast Nitrgen Base(DIFCO),13.4g/l;ビオチン, 400マイクログラム/L;D-グルコース,20g/1;寒天,15g/1)上で回収した。 エレクトロポレーションに由来する単一コロニー(n=60)を96穴プレートのウ ェル中のFM22−グリセロール−PTM1培地100マイクロリットルに接種し、プレー ト攪拌器上30℃で24時間生育させた。FM22−グリセロール−PTM1培地1リットル はKH2PO4 42.87g、(NH42SO4 5g、CaSO4・2H2O 1g、K2SO4 14.28g、MgSO4・7H2O 11.7g、100ml溶液として滅菌したグリセロール50gおよびフィルター滅菌したPT M1微量ミネラル混合物1mlを含有する。その培地のFM22部分は、KOHでpH4.9に調 節しフィルター滅菌した900ml溶液として調製した。PTM1混合物1リットルはCuSO4・ 5H2O 6g、KI 0.8g、MnSO4・H2O 3g、NaMoO4・2H2O 0.2g、H3BO3 0.02g、CoCl2・6 H2O 0.5g、ZnCl2 20g、H2SO4 5ml、FeSO4・7H2O 65g、ビオチン0.2gを含有する 。 次に細胞をペレット化し、新鮮なFM22−メタノール−PTM1培地(AOX1プロモー ターの発現を誘導するためにグリセロール50gを0.5%(v/v)メタノールに置き 換えた点以外は上と同じ組成)に再懸濁した。30℃でさらに24時間インキュベー トした後、その微量培養の上清を分泌されたAcaNAP5の存在について試験した。A caNAP5を高レベルに合成および分泌する(実施例1に記述したアミド分解第Xa 因子検定で測定した時に、培養培地中に高い第Xa因子阻害活性が出現すること によって示される)2つのクローンを選択した。同じ手法を用いるが今度は振と うフラスコレベルで行う2回目のスクリーニングの後、1つの単離宿主細胞を選 択し、それをP.pastoris GTS115/7SP-NAP5と命名した。 宿主細胞GTS115/7SP-NAP5は野生型メタノール資化表現型(Mut+)を持つこと が示された。これはGTS115染色体への発現カセットの組込みがゲノムAOX 1遺伝 子の機能性を変化させなかったことを立証している。 これに続く組換えAcaNAP5物質の生産をStroman,D.W.ら,米国特許第4855231 号に記述されているように振とうフラスコ培養で行った。その組換え産物を下記 のようにPichia pastoris細胞上清から精製した。(C)組換えAcaNAP5の精製 (1)陽イオン交換クロマトグラフィー 発現後、GTS115/75SP−NAP5の培養上清(100ml)を16000r.p.m.(約30,000× g)で20分間遠心分離し、次いでpHを1N HClでpH3に調節した。ミリQ水を添加す ることによってその上清の導電率を10mS/cm未満に下げた。その希釈上清を0.22 マイクロメーター酢酸セルロースフィルター(Corning Inc.,米国ニューヨーク 州コーニング)に通すことによって清浄化した。上清の全量(約500ml)を、陽 イオン緩衝液(0.05Mクエン酸ナトリウム,pH3)で予め平衡化しておいたPoros2 0 HS(Perseptive Biosystems,マサチューセッツ州)1×2cmカラムに5ml/分(4 00cm/時)の流速でのせた。カラムと試料はこの精製段階中ずっと周囲温度であ った。次にそのカラムを50カラム体積の陽イオン緩衝液で洗浄した。第Xa因子 アミド分解検定で阻害活性を持つ物質を1M NaClを含む陽イオン緩衝液で溶出さ せた(流速2ml/分)。(2)Superdex30を用いる分子篩クロマトグラフィー 陽イオン交換カラムから得た阻害物質を含む1M NaCl溶出液(3ml)を、0.01M リン酸ナトリウム(pH7.4),0.15M NaClで予め平衡化した周囲温度のSuperdex3 0 PG(Pharmacia,スウェーデン)1.6×66cmカラムにのせた。そのクロマトグラ フィーを2ml/分の流速で行った。第Xa因子阻害活性は56〜64mlに溶出した(Ka v=0.207)。これは天然分子について決定したのと同じ溶出体積である(実施例 1E項)。(3)逆相クロマトグラフィー ゲルろ過クロマトグラフィーで得た画分1mlを0.46×25cm C18カラム(218TP54 Vydac;カリフォルニア州ヘスペリア)にのせ、次に0.1%(v/v)トリフルオロ 酢酸中の10〜35%アセトニトリルの直線的勾配(流速1ml/分,変化速度0.4%ア セトニトリル/分)で展開した。実施例1のように検定した第Xa因子阻害活性 は30〜35%アセトニトリル付近に溶出し、いくつかの画分中に存在した。HPLC溶 出を実施例1と同じ系で行った。このカラムでの数回の溶出から得られる第Xa 因子阻害活性含有画分を集め、真空乾燥した。(4)組換えAcaNAP5の分子量決定 この実施例の(1)項から(3)項に記述したように単離した主要成分の推定質 量を、実施例1と同じエレクトロスプレイイオン化質量スペクトル測定系を用い て決定した。 組換えAcaNAP5の推定質量は8735.69ダルトンであった。(5)組換えAcaNAP5のアミノ酸配列決定 この実施例の(1)項から(3)項による精製後、Pichia pastorisから得た組 換えAcaNAP5を実施例1に記載のアミノ酸配列分析にかけた。AcaNAP5のアミノ末 端の最初の5アミノ酸はLys-Ala-Tyr-Pro-Gln[配列番号106]と決定された。こ の配列は天然NAPタンパク質と同一であった(実施例1参照)。実施例4 P .pastorisにおける組換えAcaNAP6の生産と精製 (A)発現ベクター構築 発現ベクターpYAM7SP-NAP6を実施例3のpYAM7SP-NAP5と同じ方法で作成した。(B)P.pastorisにおける組換えAcaNAP6の発現 ベクターpYAM7SP-NAP6を用いてPichia株GTS115(his4)を実施例3に記述のご とく形質転換した。(C)AcaNAP6の精製 発現ベクターpYAM7SP-NAP6で形質転換したPichia株GTS115(his4)から発現さ れる組換えAcaNAP6を実施例3のAcaNAP5と同様に精製した。 実施例3に記述のごとく決定した組換えAcaNAP6の推定質量は8393.84ダルトン であった。 AcaNAP6調製物の主成分は次のアミノ末端を持っていた:Lys-Ala-Tyr-Pro-Glu [配列番号106]。実施例5 COS 細胞における組換えプロAcaNAP5の発現 (A)発現ベクター構築 AcaNAP5 cDNAをサブクローニングしたpGEM-9Zf(−)ベクター(Promega Corp oration,米国ウィスコンシン州マジソン)を、天然の分泌シグナルを含む全Aca NAP5コード領域のPCRレスキュー用の標的とした(New England Biolabs(米国マ サチューセッツ州ベバリー)製のVentポリメラーゼを使用;20温度サイクル;95 ℃で1分、50℃で1分、72℃で1.5分)。使用したオリゴヌクレオチドプライマー は次の通りである:(1)YG101(NAPをコードする遺伝子の3'末端を標的とし、 配列GCTCGCTCTAGAAGCTTCAG ACATGTATAA TCTCATGTTG G[配列番号105]を持つ) および(2)YG102(NAPをコードする遺伝子の5'末端を標的とし、配列GACCAGTCT A GACAATGAAG ATGCTTTACG CTATCG[配列番号107]を持っ)。これらのプライマ ーはXba I制限部位(下線部)を含む非アニーリング伸長部を含有する。 Xba I酵素での消化後、予期されるサイズを持つ増幅産物をアガロースゲルか ら単離し、次いで発現用pEF-BOSベクター(Mizushima,S.およびNo.gata,S.,N ucl.Acids Res.,18: 5322(1990))の約450塩基対Xba Iスタッファー断片と 置換した。この受容ベクター断片はXba I消化によって調製し、アガロースゲル から精製した。 大腸菌株WK6(Zell,R.およびFritz,H.-J.,EMBO J.,6: 1809-1815(1987) )を連結混合物で形質転換した。無作為に拾い上げたアンピシリン耐性形質転換 体30個をPCR分析にかけた(Lif e Technologies Inc.(米国メリーランド州ガイ サースブルク)製のTaqポリメラーゼ;次の温度プログラムによる30増幅サイク ル :95℃で1分、50℃で1分、72℃で1分)。使用したオリゴヌクレオチドプライマ ーは次の通りである:(i)YG103(配列:AAGGCATACC CGGAGTGTGG TG[配列番号 89]を持ち、成熟NAPをコードする領域のアミノ末端と合致する)および(ii)Y G60(配列:GTGGGAGACC TGATACTCTC AAG[配列番号108]を持ち、挿入部位の下 流(すなわちpEF-BOS発現カセットの3'非翻訳領域中)のベクター配列を標的と する)。所望の方向に挿入物を保持するクローンのみが予期される長さ(約250 塩基対)のPCR断片を与えることができる。そのようなクローン2つを配列決定に よってさらに特徴づけたところ、所望のXba I挿入物を含むことがわかった。そ のクローンの1つ(pEF-BOS-NAP5と命名した)を用いてCOS細胞をトランスフェク トした。(B)COS細胞のトランスフェクション COS-7細胞(ATCC CRL 1651)を、DEAEデキストランを用いて、pEF-BOS-NAP5、 無関係な挿入物を含有するpEF-BOSあるいはDNAなし(擬似トランスフェクション )でトランスフェクトした。DEAEデキストラン法では次の培地とストック溶液を 用いた: (1)COS培地:DMEM;10% FBS(56℃で30分間インキュベートしたもの);0.03 % L-グルタミン;ペニシリン(50I.U./ml)およびストレプトマイシン(50マイ クログラム/ml)(すべてLife Technologies製)。 (2)MEM-HEPES:製造者の指示に従って再構成したLife Technologies Inc.製の MEM培地;最終濃度25mMのHEPESを含有する;ろ過(0.22マイクロメーター)前に pH7.1に調節。 (3)DNA溶液:MEM-HEPES 3mlあたり6マイクログラムのDNA。 (4)DEAEデキストラン溶液:MEM-HEPES 3mlあたり30マイクロリットルのDEAEデ キストラン貯蔵液(Pharmacia(スウェーデン国ウプサラ);H20中100mg/ml)。 (5)トランスフェクション混合物:3mlのDEAEデキストラン溶液をDNA溶液3mlに 加え、その混合物を周囲温度で30分間静置する。 (6)クロロキノン溶液:クロロキノン貯蔵液(Sigma(米国ミズーリ州セントル イス);水中10mM;0.22マイクロメーター膜を通したもの)の1:100希釈液(COS 培地中)。 COS細胞の一時的トランスフェクションを次のように行った。175cm2 Nunc TC- フラスコ(Life Technologies Inc.)中で培養したCOS細胞(約3.5×106)をMEM -HEPESで1回洗浄した。6mlのトランスフェクション混合物を洗浄した細胞にピペ ットで加えた。周囲温度で30分間のインキュベーション後、48mlのクロロキノン 溶液を加え、細胞を37℃でさらに4時間インキュベートした。細胞を新鮮なCOS培 地で1回洗浄し、最後に50mlの同培地中37℃でインキュベートした。(C)トランスフェクトしたCOS細胞の培養 トランスフェクションの3、4および5日後に、培養上清の試料を、実施例1の 方法に従って第Xa因子アミド分解検定で試験した。その結果は、pEF-BOS-NAP5 でトランスフェクトした細胞の培養上清中に第Xa因子阻害活性が蓄積しつつあ ることを明白に立証した。 トランスフェクションの5日後にCOS細胞培養上清を収集し、NAPタンパク質を 実施例6のように精製した。実施例6 組換えプロAcaNAP5の精製 (A)陰イオン交換クロマトグラフィー プロAcaNAP5を含有するCOS培養上清を1500r.p.m.(約500×g)で10分間遠心分 離した後、固形酢酸ナトリウムを最終濃度50mMになるよう加えた。次のプロテア ーゼ阻害剤を加えた(プロテアーゼ阻害剤はすべてICN Biochemcals Inc.(米国 カリフォルニア州コスタメサ)製):1.0×10-5MペプスタチンA(イソバレリル- Val-Val-4-アミノ-3-ヒドロキシ-6-メチル-ヘプタノイル-Ala-4-アミノ-3-ヒド ロキシ-6-メチルヘプタン酸)、1.0×10-5Mロイペプチン、5×10-5M AEBSF(フ ッ化4-(2-アミノエチル)-ベンゼンスフホニル)。pHをHClでpH5.3に調節した 。その上清を0.2マイクロメーター酢酸セルロースフィルター(Corning Inc., 米国ニューヨーク州コーニング)に通すことによって清浄化した。 清浄化した上清(総体積約300ml)を、陰イオン緩衝液(0.05M酢酸ナトリウム ,pH5.3、0.1M NaCl)で予め平衡化しておいたPoros20 HQ(Perseptive Biosyst ems,マサチューセッツ州)1×2cmカラムに10ml/分(800cm/時)の流速でのせた 。カラムと試料はこの精製段階中ずっと周囲温度であった。次にそのカラムを少 なくとも10カラム体積の陰イオン緩衝液で洗浄した。第Xa因子アミド分解検定 で阻害活性を持つ物質を0.55M NaClを含有する陰イオン緩衝液で溶出させ(流速 5ml/分(400cm/時))、それを集めた。(B)Superdex30を用いる分子篩クロマトグラフィー 陰イオン交換クロマトグラフィーで得た0.55M NaCl溶出液(3ml)を、24℃の0 .01Mリン酸ナトリウム(pH7.4),0.15M NaClで予め平衡化しておいたSuperdex3 0 PG(Pharmacia,スウェーデン)1.6×66cmカラムにのせた。クロマトグラフィ ーを2ml/分の流速で行った。第Xa因子アミド分解検定で阻害的な物質は56〜64 mlに溶出した(Kav=0.207)。これは天然分子について決定した溶出体積と全く 同じであった。(C)熱処理 第Xa因子阻害活性を持つ画分の全量をガラス管中90℃で5分間インキュベー トした後、氷上で急速に冷却した。不溶物質を19,000×gmax,4℃で20分の遠心 分離によってペレット化した。その上清は第Xa因子阻害活性のすべてを含有し た。(D)逆相HPLCクロマトグラフィー 熱処理した試料の上清を0.46×25cm C18カラム(218TP54 Vydac;カリフォル ニア州ヘスペリア)にのせ、それを0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸中の10〜35% アセトニトリルの直線的勾配(流速1ml/分,変化速度0.4%アセトニトリル/分) で展開した。第Xa因子阻害活性は約30%アセトニトリルで溶出した。HPLC溶出 は実施例1と同じ系で行った。第Xa因子阻害活性含有画分を真空乾燥した。(E)分子量決定 この実施例のA〜D項に記述のごとく単離した組換えプロAcaNAP5の推定質量を 実施例1と同じエレクトロスプレイイオン化質量スペクトル測定法で決定した。 組換えプロAcaNAP5の推定質量は9248.4ダルトンであった。(F)アミノ酸配列決定 精製後、COS細胞から得た組換えプロAcaNAP5をアミノ酸分析にかけて、実施例 1に記述の如くそのアミノ末端配列を決定した。プロAcaNAP5のアミノ末端の最初 の9アミノ酸は:Arg Thr Val Arg Lys Ala Tyr Pro Gln[配列番号109]である と決定された。天然のAcaNAP5タンパク質(実施例1参照)と比較すると、プロAc aNAP5はそのN末端に4つの追加アミノ酸を保持している。プロAcaNAP5のアミノ酸 配列を図5に示す。実施例7 COS 細胞における組換えプロAcaNAP6の発現 実施例5に記述したプロAcaNAP5の場合と基本的に同様にして、プロAcaNAP6をC OS細胞中で一時的に生産した。 分泌シグナルを含むAcaNAP6コード領域のPCRレスキューに、AcaNAP5に用いた ものと同一の2つのオリゴヌクレオチドプライマーを使用した:(1)YG101(該 遺伝子の3'末端を標的とし、配列GCTCGCTCTA GAAGCTTCAG ACATGTATAA TCTCATGTT GG[配列番号105]を持つ)および(2)YG102(該遺伝子の5'末端を標的とし、 配列GACCAGTCTA GACAATGAAG ATGCTTTACG CTATCG[配列番号107]を持っ)。YG10 1プライマーはAcaNAP6を標的として用いた時に非合致ヌクレオチドを含有する( 下線を付したT残基;図1と図3を比較のこと)。このミスマッチはATA Ileコドン によるATT Ileコドンの置換をもたらす。このミスマッチは増幅効率に著しい影 響を与えなかった。 実施例5に次の変更を加えた:COS細胞のトランスフェクションの24時間後(こ れは実施例5のB項に記述されている)、10% FBSを含有するCOS培地をDMEMとNut rient Mixture Ham's F-12(Life Technologies)の1:1混合物からなる50mlの培 地で置き換える。次に細胞を37℃でさらにインキュベートして、第Xa因子阻害 活性の生産を実施例5のように検出した。実施例8 組換えプロAcaNAP6の精製 (A)陰イオン交換クロマトグラフィー プロAcaNAP6を含有するCOS培養上清を1500r.p.m.で10分間遠心分離した後、固 形酢酸ナトリウムを最終濃度50mMになるよう加えた。次のプロテアーゼ阻害剤を 加えた(プロテアーゼ阻害剤はすべてICN Biochemcals Inc.(米国カリフォルニ ア州コスタメサ)製):1.0×10-5MペプスタチンA(イソバレリル-Val-Val-4-ア ミノ-3-ヒドロキシ-6-メチル-ヘプタノイル-Ala-4-アミノ-3-ヒドロキシ-6-メチ ルヘプタン酸)、1.0×10-5Mロイペプチン、5×10-5M AEBSF(フッ化4-(2-アミ ノエチル)-ベンゼンスフホニル)。pHをHClでpH5.3に調節した。その上清を0.2 マイクロメーター酢酸セルロースフィルター(Corning Inc.,米国ニューヨーク 州コーニング)に通すことによって清浄化した。 清浄化した上清(総体積約450ml)を、陰イオン緩衝液(0.05M酢酸ナトリウム ,pH5.3、0.1M NaCl)で予め平衡化しておいたPoros20 HQ(Perseptive Biosyst ems,マサチューセッツ州)1×2cmカラムに10ml/分(800cm/時)の流速でのせた 。カラムと試料はこの精製段階中ずっと周囲温度であった。次にそのカラムを少 なくとも10カラム体積の陰イオン緩衝液で洗浄した。第Xa因子アミド分解検定 で阻害活性を持つ物質を0.55M NaClを含有する陰イオン緩衝液で溶出させ(流速 5ml/分(400cm/時))、それを集めた。(B)Superdex30を用いる分子篩クロマトグラフィー 陰イオン交換クロマトグラフィーで得た0.55M NaCl溶出液(3ml)を、24℃の0 .01Mリン酸ナトリウム(pH7.4),0.15M NaClで予め平衡化しておいたSuperdex3 0 PG(Pharmacia,スウェーデン)1.6×66cmカラムにのせた。クロマトグラフィ ーを2ml/分の流速で行った。第Xa因子アミド分解検定で阻害的な物質は56〜64 mlに溶出した(Kav=0.207)。これは天然NAPについて決定した溶出体積と全く同 じであった。(C)逆相HPLCクロマトグラフィー ゲルろ過で得た画分を0.46×25cm C18カラム(218TP54 Vydac;カリフォルニ ア州ヘスペリア)にのせ、それを0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸中の10〜35%ア セトニトリルの直線的勾配(流速1ml/分,変化速度0.4%アセトニトリル/分)で 展開した。実施例1に従って検定した第Xa因子阻害活性は約30%アセトニトリ ルで溶出した。HPLC溶出は実施例1と同じ系で行った。第Xa因子阻害活性含有 画分を真空乾燥した。(D)分子量決定 この実施例のA〜C項に記述のごとく単離した組換えプロAcaNAP6の推定質量を 実施例1と同じエレクトロスプレイイオン化質量スペクトル測定系で決定した。 組換えプロAcaNAP6の推定質量は8906.9ダルトンであった。(E)アミノ酸配列決定 精製後、COS細胞から得た組換えプロAcaNAP6を実施例1に記載のアミノ酸配列 分析にかけた。プロAcaNAP6のアミノ末端の最初の5アミノ酸は:Arg Thr Val Ar g Lys[配列番号110]であると決定された。天然のNAPタンパク質(実施例1参照 )と比較すると、プロAcaNAP6はそのアミノ末端に4つの追加アミノ酸を保持して いる。プロAcaNAP6のアミノ酸配列を図6に示す[配列番号8]。実施例9 他のNAPタンパク質をコードする遺伝子を単離するためのNAP DNA配列の使用 実施例2で得たAcaNAP5およびAcaNAP6 cDNA配列を用い、交差ハイブリッド形成 によって他の寄生虫種から関連する分子を単離した。 AcaNAP5およびAcaNAP6 cDNAを含有するpGEM-9Zf(−)ベクター(Promega)を 、成熟NAPタンパク質をコードする領域のPCRレスキューに用いた(Life Technol ogies製のTaqポリメラーゼ;20温度サイクル:95℃で1分間、50℃で1分間、72℃ で1.5分間)。使用したオリゴヌクレオチドプライマーは次の通りである: (1)YG109(NAPをコードするcDNAのC末端配列を標的とし、配列:TCAGACATGT-A TAATCTCAT-GTTGG[配列番号88]を持つ)および(2)YG103(配列:AAGGCATACC- CGGAGTGTGG-TG[配列番号89]を持つ)。YG109プライマーはAcaNAP6を標的とし て用いたときに1つのヌクレオチドミスマッチを含有する(下線を引いたT残基; 図1と図3に示した配列を比較のこと)。これは増幅効率に著しい影響を与えなか った。正しい大きさのPCR産物(約230塩基対)を共に1.5%アガロースゲルから 単離した。等モル混合物をランダムプライマー伸長(T7 QuickPrimeキット;Pha rmacia)によって放射性標識した後、Bio-Spin 30カラム(Bio-Rad,米国カリフ ォルニア州リッチモンド)に通した。 アンサイロストマ セイラニカム(Ancylostoma ceylanicum;Ace)、アンサ イロストマ デュオデナール(Ancylostoma duodenale;Adu)およびヘリグモソ モイデス ポリギルス(Heligmosomoides polygyrus;Hpo)cDNAライブラリーを 、実施例2のアンサイロストマ カニナムの場合と基本的に同様にして調製した 。 アンサイロストマ セイラニカムとヘリグモソモイデス ポリギルスはD.I. Pritchard博士(ノッチンガム大学生命科学部(英国ノッチンガム))から購入した 。アンサイロストマ デュオデナールはG.A.Schad博士(ペンシルバニア大学 病理学部獣医学校(米国ペンシルバニア州フィラデルフィア))から購入した。 いずれの場合も、cDNAをラムダgt11中のEco RI−Not I断片として指向的にク ローン化した。各ライブラリーから得られる約2×105cDNAクローン(複製プラー ク採取フィルターをHybondTM-N(Amersham)を用いて調製した)を、放射性標識 したAcaNAP5およびAcaNAP6断片で、次の予備ハイブリッド形成およびハイブリッ ド形成条件を用いてスクリーニングした:5×SSC(SSC:150mM NaCl,15mMクエ ン酸三ナトリウム)、5×デンハルト溶液、0.5% SDS、20%ホルムアミド、100 マイクログラム/ml超音波処理魚精子DNA(Boehringer)、42℃で終夜。フィルタ ーを37℃の2×SSC,0.1% SDS中で30分間、4回洗浄した。X線フィルムに暴露し た後(約60時間)、AceとAduの場合は、合計100〜200のハイブリッド形成スポッ トが同定された。Hpo cDNAライブラリーの場合は極めてかすかなスポットが少数 見えた。各ライブラリーについて8つの陽性物を、単一プラークが単離できるよ うにより低いプラーク密度での第2ハイブリッド形成にかけた。 保持したクローンを、オリゴ(dT)-Not Iプライマー(Promega;これは第1鎖 cDNAを調製する際に使用したものと同じプライマーである;実施例2参照)[配 列番号95]を配列:GGTGGCGACG ACTCCTGGAG CCCG[配列番号96]を持つラムダgt 11プライマー#1218(New England Biolabs;プライマー#1218はcDNA挿入部位 の上流に位置するラムダ配列を標的とする)と組み合わせて用いるcDNA挿入物の PCR増幅によって、さらに特徴づけた。PCR増幅は次のように行った:Boehringer 製のTaqポリメラーゼ;30温度サイクル:95℃で1分、50℃で1分、72℃で1.5分。 PCR産物のゲル電気泳動分析は、AcaNAP5 cDNAと大体同じサイズのcDNA(例:400 〜500bp)が各種について得られることを明白に立証した。これらのAcaNAP5サイ ズのcDNAに加えて、いくつかのAceおよびAdu cDNAは約700bp長と見積もられた。 500bpまたは800bp挿入物を含有するいくつかのクローンを配列決定のために選 択した。この目的のため、cDNA挿入物をpGEM型ファージミド(Promega;詳細に ついては実施例2を参照のこと;これは一本鎖DNAの調製を可能にする)中にSfi I−Not I断片としてサブクローニングした。配列決定の結果、6つの異なる新し いNAP様タンパク質が同定され、これらを次のように命名した:AceNAP4、AceNAP 5、AceNAP7、AduNAP4、AduNAP7およびHpoNAP5。これらcDNAのヌクレオチド配列 とコード化されているタンパク質の推定アミノ酸配列を図7A(AceNAP4[配列番 号9])、図7B(AceNAP5[配列番号10])、図7C(AceNAP7[配列番号11])、 図7D(AduNAP4[配列番号12])、図7E(AduNAP7[配列番号13])および図7F( HpoNAP5[配列番号14])に示す。それぞれ約700bp長のAceNAP4[配列番号9]お よびAduNAP7[配列番号13]cDNAは、それぞれ2つのNAPドメインを組込んだタン パク質をコード化しており、他の単離cDNAは単一のNAPドメインを持つタンパク 質をコードしていた。AduNAP4 cDNAクローン[配列番号12]は全長ではなかった (すなわちコード領域の5'末端部分を欠くクローンであった)。しかしNAP関連 物質ファミリーとのアミノ酸配列相同性に基づいて正しい読み枠を割り当てるこ とができた。 同定したcDNA配列を用いることにより、実施例3、4、5および7に開示したよう に、同じ(あるいは別の)適当な発現系を用いて、コード化されたタンパク質を 生産することができる。使用する系に応じて調整培地か細胞溶解液をそのままで 、あるいは分画した後に、実施例3、4、6および8に概論したような方法を用いて 、プロテアーゼ阻害活性と抗凝固活性について試験することができる。AcaNAP5 遺伝子(図1;配列番号3)および/またはAcaNAP6遺伝子(図3;配列番号5)の 断片から誘導したプローブにハイブリッド形成するcDNAによってコード化されて おり、セリンプロテアーゼ阻害特性および/または抗凝固特性を持つタンパク質 は、NAP関連物質ファミリーに属すると見なされる。実施例10 cDNA によってコード化されるタンパク質の機能的表現によるNAPの同定 (A)pDONGベクター系列 pUC119(Vieira,J.およびMessing,J.,Methods in Enzymology,153: 3-11 (1987))の誘導体であるpDONGベクターpDONG61[配列番号15]、pDONG62[配 列番号16]およびpDONG63[配列番号17]のヌクレオチド配列をそれぞれ図8A〜8 Cに示す。 これら3つのベクターを構築するため、G6BACKHIND後方プライマーと前方プラ イマーとしてのG6FORSFI61、G6FORSFI62またはG6FORSFI63を用いるM13K07一本鎖 DNA(Vieira,J.およびMessing,J.,同上)のPCR増幅によって、Hin dIIIおよ びSfi I制限部位を繊維状ファージ遺伝子6の5'末端と3'末端に加えた。第2のPCR では、得られた3つの断片を前方プライマーとしてのG6FORNOTBAMHとG6BACKHIND で再増幅することにより、該断片の3'末端にNot IおよびBam HI部位を付加した 。上記PCRプライマーの配列は次の通りである(制限部位に下線を付す): 最後に、PCR産物をゲル精製し、個別にHin dIIIとBam HIで消化し、pUC119の対 応する部位間に挿入した。配列決定により、pDONG61、pDONG62およびpDONG63の すべてが意図した挿入物を含有することが確認された。 pDONGベクター系列はSfi I−Not I断片としてのcDNAのクローニングを可能に する。このクローニングは、cDNAを3つの読み(翻訳)枠のそれぞれで、ファー ジ外殻タンパク質の1つをコードする繊維状ファージ遺伝子6の3'末端に融合させ る。pDONG誘導体を保持する雄性特異的大腸菌株のVCSM13ヘルパーファージ(Str atagene,カリフォルニア州ラジョラ)による感染は、pDONG誘導体の1つの特異 的一本鎖を包膜し、また組換えタンパク質6(p6)融合タンパク質をその外殻に 組込みうる偽ウイルス粒子の回収をもたらす。コード化されているタンパク質が ファージ表面上に組換えp6融合タンパク質として機能的に表現されるようなcDNA は、下記の選別実験を利用して同定できるようになる。(B)ラムダgt11アンサイロストマ カニナムcDNAライブラリーのpDONGベクター 系列への移転 配列:GGTGGCGACG ACTCCTGGAG CCCG[配列番号96]を持つラムダgt11プライマ ー#1218(New England Biolabs,米国マサチューセッツ州ベバリー;cDNA挿入 物の上流に位置する配列を標的とする)を第1鎖cDNA合成に用いたオリゴ(dT)- Not Iプライマー/アダプター(Promega)と組み合わせて用いるcDNA挿入物のPC Rレスキュー(Life Technologies(米国メリーランド州ガイサースブルク)製の Taqポリメラーゼ;20温度サイクル:95℃で1分、50℃で1分、72℃で3分の後、65 ℃で10分)に、集めたアンサイロストマ カニナムcDNAクローンのファージラム ダ調製物(約1×106プラーク,実施例2参照)を使用した。制限酵素Sfi IとNot Iで消化した後、完全サイズ範囲の増幅産物をアガロースゲルから回収した。 すべての断片をpDONG61、pDONG62およびpDONG63ベクター中に指向的にクロー ニングした。受容ベクター断片を、CsCl精製したベクターのSfi IおよびNot Iに よる消化と「WizardTM PCR Preps DNA Purification System」(Promega Corp, 米国ウィスコンシン州マジソン)での精製によって調製した。 電気穿孔法により、大腸菌株TG1(Sambrook,J.,Fritsch,E.F.およびMania tis,T.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,第2版,第1〜3巻,Cold S pring Harbor Laboratory Press(1989))をpDONG/cDNA連結混合物で形質転換 した。電気形質転換した細胞をSOC培地(Sambrook,J.ら,同上)中37℃で1時間 インキュベートし、0.1%グルコースと100マイクログラム/mlカルベニシリンを 含有するLBプレート(245×245×25mmプレート;Nunc)に接種した。pDONG61、p DONG62およびpDONG63でそれぞれ2.2×106、1.6×106および1.4×106カルベニシ リン耐性形質転換体を得た。20L、21Lおよび22Lと命名した各ライブラリーのそ れぞれから無作為に拾い上げたいくつかの形質転換体を、pUC119のマルチクロー ニング部位に隣接する配列に合致する2つのプライマー(配列:CGCCAGGGTT TTCC CAGTCA CGAC[配列番号116]を持つプライマー#1224と配列:A GCGGATAAC AATT TCACAC AGGA[配列番号101]を持つプライマー#1233;New England Biolabs) を用いるPCR分析にかけた(Life Technologies製のTaqポリメラーゼ;次の温度 プログラムによる30増幅サイクル:95℃で1分、50℃で1分、72℃で1〜3分)。そ の結果はそのクローンの大半が様々なサイズのcDNA挿入物を含有することを示し た。(C)NAPタンパク質をコードするcDNAクローンの第Xa因子に基づくアフィニティ 選択 20L、21Lおよび22Lライブラリーから得られるファージ粒子を次のように回収 した:各ライブラリーをプレートから掻き取り、1%グルコースと100マイクログ ラム/mlカルベニシリンを加えたLB培地100ml中37℃で、600nmの吸光度が0.5に達 するまで生育させた。感染多重度(moi)20のVCSM13ヘルパーファージ(Stratag ene)を添加した後、培養を37℃で30分間放置し、次いでさらに30分間ゆっくり と振とうした。遠心分離によって細胞をペレット化し、100マイクログラム/mlカ ルベニシリンと50マイクログラム/mlカナマイシンを添加したLB培地250mlに再懸 濁した。これらの培養を激しく攪拌しながら30℃で終夜生育させた。得られたフ ァージ粒子をポリエチレングリコール/NaClによる2回の連続的沈殿によって精 製し、TRIS緩衝化食塩水(0.05M Tris、0.15M塩化ナトリウム、pH7.4)(TBS)1 mlあたり1×1013ウイルス粒子の密度に再懸濁した。次いで20L、21Lおよび22Lか ら得た等量のファージ粒子を互いに混合した。 ヒト第Xa因子(調製については実施例1を参照)を製造者(Pierce)の指示に 従ってビオチン-XX-NHSでビオチン化した。このプロテアーゼのアミド分解活性 はこの修飾によって影響されないことが、発色原性基質S-2765(Chromogenix; 実施例1参照)を用いる酵素検定で示された。ストレプタビジン被覆磁気ビーズ (Dynal;選別1回あたり1mg)をTBSで3回洗浄し、2%スキムミルク(Difco)を 添加した周囲温度のTBS中で遮断した。1時間後、磁気ビーズを使用前にTBSで2回 洗浄した。 第1回の選別のため、貯蔵ライブラリーから得た1×1013ファージを、250nMビ オチン化第Xa因子、5mM CaCl2および2%スキムミルクを添加したTBS緩衝液200マ イクロリットル中4℃で75分間インキュベートした。この時間の後、ファージ溶 液に1mgの遮断したストレプタビジン被覆磁気ビーズ(5mM CaCl2と2%スキムミ ルクを含有するTBS 200マイクロリットルに再懸濁したもの)を加え、穏やかに 攪拌しながら4℃で1時間インキュベートした。次に磁石(Dynal)を用い、0.1% Tween-20を含有するTBS 500マイクロリットルで磁気ビーズを10回すすいだ。500 マイクロリットルの0.1Mグリシン-HCl緩衝液(pH2.0)と共に磁気ビーズを10分 間インキュベートすることによって、結合したファージを磁気ビーズから溶離さ せた。その上清を1M Tris-HCl緩衝液(pH8.0)150マイクロリットルで中和した。 ファージ増殖のため、大腸菌株TG1(Sambrook,J.,Fritsch,E.F.およびMan iatis,T.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,第2版,第1〜3巻,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989))を10mlのLB培地中で600nmの吸光度 が0.5に達するまで生育させた。その培養を磁気ビーズから溶離させたファージ6 50マイクロリットルで感染し、振とうすることなく37℃で短時間インキュベート した。遠心分離後、感染細胞を2mlのLB培地に再懸濁し、1%グルコースと100マ イクログラム/mlカルベニシリンを含有するLB寒天で満たした245×245×25mmプ レートに接種した。37℃で終夜インキュベートした後、細胞をプレートから掻き 取り、1%グルコースと100マイクログラム/mlカルベニシリンを添加したLB培地4 0mlに再懸濁した。次に、600nmで15光学密度に相当する細胞の一部を1%グルコ ースと100マイクログラム/mlカルベニシリンを含有するLB培地100mlに接種した 。次の選別工程用のファージ回収を上に概論したように行った。 第2回の選別のため、6×1012ファージを1mgの遮断したストレプタビジン被覆 磁気ビーズと共に、2.5mM Ca2+と2%スキムミルクを含有するTBS 200マイクロリ ットル中で90分間インキュベートした(この段階はストレプタビジン結合クロー ンの選択を避けるための手法として導入した)。ビーズを除去した後、第1回と 同じ手順を踏んだ。第3、第4および第5回を、ファージ投入量を2×1012ファージ に下げた点以外は第2回と同様に行った。 次に、ビオチン化第Xa因子に対する5回の選別後に単離された24個の個々のカ ルベニシリン耐性クローンをELISAで分析した。ストレプタビジン被覆96穴プレ ート(Pierce)を、2%スキムミルクを含有するTBS 200マイクロリットル/ウェ ルで1時間遮断した後、TBS中の20nMビオチン化第Xa因子 100マイクロリットル/ ウェルと共に1時間インキュベートした。各クローンについて、2%スキムミルク と0.1%Tween-20を含有するTBS 100マイクロリットルに希釈した約1010ファージ をウェルに加えた。2時間のインキュベーション後、そのウェルを0.1%Tween-20 を含有するTBS 200マイクロリットルで4回すすいだ。ウサギ抗M13抗血清(実施 例11参照)、アルカリ性フォスファターゼ結合抗ウサギ血清(Sigma)および基 質としてのp-ニトロフェニルホスフェート(Sigma)と順番にインキュベートす ることによって、結合したファージを可視化した。20分後、405nmで吸光度を測 定した。24クローンのうち5つが第Xa因子に強固に結合した。同じELISAでビオチ ン化第Xa因子を除いて試験したところ、これらのファージでは有意な非特異的結 合が観測されなかった。 次に5つの陽性クローンから一本鎖DNAを調製し、遺伝子6の3'側の挿入物を、 配列:CGCCAGGGTT TTCCCAGTCA CGAC[配列番号116]を持つプライマー#1224(N ew England Biolabs)を用いる自動化DNA配列決定にかけた。5つのクローンすべ てがpDONG63内の遺伝子6に枠内融合した同じ470bpの5'先端欠失cDNAを含有する ことがわかった。このcDNAのヌクレオチド配列と推定アミノ酸配列を図9[配列 番号19]に示す。AcaNAPc2と命名したこのcDNAはNAPイソ型c2と命名したタンパ ク質をコードし、このタンパク質はNAP関連タンパク質ファミリーに属する。実施例11 M13 ファージに対する抗血清の調製 PBS(0.01Mリン酸ナトリウム,pH7.4+0.15M塩化ナトリウム)500マイクロリ ットル中の約1013M13K07ファージ(等量のアジュバントと混合したもの)を皮下 注射することによってM13ファージに対する抗血清をウサギ内で調製した。Glase r-Wuttke,G.,Keppner,J.およびRasched,I.,Biochim.Biophys.Acta.,985 :239-247(1989)の記述と基本的に同様にしてM13K07ファージをCsCl精製した。 最初の注射を第0日に完全フロインドアジュバントで行った後、第7日、第14日お よび第35日に不完全フロインドアジュバントで皮下注射した。抗血清を第42日に 収集した。 当該機術分野周知の条件を用いてプロテインA-Sepharoseカラムに通すことに より、その抗血清のIgG画分を濃縮した。実施例12 アンサイロストマ カニナム由来のさらなるNAPコード化配列を単離するためのA caNAP5およびAcaNAP6 DNA配列の使用 AcaNAP5およびAcaNAP6 DNA配列(実施例2で得たもの)を用い、交差ハイブリ ッド形成によって同じ寄生虫種から関連分子を単離した。 AcaNAP5およびAcaNAP6 cDNAを含有するpGEM-9Zf(−)ベクター(Promega;ウ ィスコンシン州マジソン)を、成熟NAPタンパク質をコード化する領域のPCRレス キュ ーに用いた(Life Technologies(メリーランド州ガイサースブルク)製のTaqポ リメラーゼ;20温度サイクル:95℃で1分、50℃で1分、72℃で1.5分)。使用し たオリゴヌクレオチドプライマーは次の通りである:(1)YG109(AcaNAP5およ びAcaNAP6をコードするcDNAのC末端コード配列を標的とし、配列:TCAGACATGT-A TAATCTCAT-GTTGG[配列番号88]を持つ)および(2)YG103(成熟AcaNAP5および AcaNAP6のN末端コード配列を標的とし、配列:AAGGCATACC-CGGAGTGTGG-TG[配列 番号89]を持つ)。YG109プライマーはAcaNAP6を標的として用いた場合に1つの ヌクレオチドミスマッチを含有する(下線を引いたT残基;図3[配列番号5]に 示す配列と比較のこと)。このミスマッチは増幅効率に著しい影響を与えなかっ た。AcaNAP5とAcaNAP6について正しいサイズのPCR産物(約230塩基対)を共に1. 5%アガロースゲルから単離した。等モル混合物をランダムプライマー伸長(T7 QickPrimeキット;Pharmacia(スウェーデン))で放射性標識した後、Bio-Spin 30カラム(Bio-Rad,米国カリフォルニア州リッチモンド)に通した。 約750,000のアンサイロストマ カニナム(Aca)cDNAクローン(実施例2(B) を参照;複製プラーク採取フィルターをHybondTM-N(Amersham,英国バッキンガ ムシャー)を用い調製した)を、次の予備ハイブリッド形成およびハイブリッド 形成条件を用い、放射性標識したAcaNAP5およびAcaNAP6 cDNA断片でスクリーニ ングした:5×SSC(SSC:150mM NaCl,15mMクエン酸三ナトリウム)、5×デンハ ルト溶液、0.5% SDS、20%ホルミアミド、100マイクログラム/ml超音波処理魚 精子DNA(Boehringer)、42℃で終夜。フィルターを37℃の2×SSC,0.1% SDS中 で30分間、4回洗浄した。X線フィルムに暴露した後、合計約300の陽性体を同定 した。 300の陽性体のうち48を、AcaNAP5およびAcaNAP6 cDNAのC末端コード配列に特 異的な上述のYG109プライマーとcDNA挿入部位の上流に位置するラムダgt11配列 を標的とするプライマー#1218(New England Biolabs(マサチューセッツ州ベ バリー);GGTGGCGACG ACTCCTGGAG CCCG[配列番号96])とを用いるPCR増幅に かけた(Boehringer Mannheim(ドイツ)製のTaqポリメラーゼ;30温度サイクル :95℃で1分、50℃で1分、72℃で1.5分)。48の陽性体のうち31がAcaNAP5/6型c DNAに予期されるサイズと類似するサイズのPCR産物を与えた。 残りの17陽性体を、プライマー#1218とAcaNAPc2特異的プライマー(例:AcaN APc2のC末端を標的とし、配列:GTTTCGAGTT CCGGGATATA TAAAGTCC[配列番号117 ]を持つLJ189;実施例10と図9を参照のこと)による増幅の鋳型として用いた。 いずれのクローンもPCR産物を与えなかった。次に17の陽性体すべてをより低い プラーク密度での第2回ハイブリッド形成にかけた。単一の単離クローンがすべ ての場合に同定された。17の単離したcDNAクローンを、プライマー対#1218/YG 109および#1218/LJ189を用いるPCRで再分析した。17クローンのうち3クローン が#1218/YG109プライマーで増幅産物を与えた。 残りの14クローンを、プライマー#1218とオリゴ(dT)-Not(Promega(ウィ スコンシン州マジソン);これは第1鎖cDNAを調製する際に使用したものと同じ プライマーである;実施例2参照)によるPCR増幅でさらに分析した。14クローン すべてがPCR産物を与えた。そのPCR産物のゲル電気泳動分析はいくつかのcDNAが AcaNAP5 cDNA挿入物よりかなり長いことを示した。 最大のcDNAを持つものを含む10クローンを配列決定のために選択した。この目 的のため、実施例2に記述のごとく、cDNA挿入物をSfi I-Not I断片としてpGEM型 ファージミド(Promega,ウィスコンシン州マジソン)上にサブクローニングし た。この配列決定により8つのさらなるNAPタンパク質配列が同定された。これら をAcaNAP23、AcaNAP24、AcaNAP25、AcaNAP31、AcaNAP44、AcaNAP45、AcaNAP47お よびAcaNAP48と命名した。AcaNAP42およびAcaNAP46と命名した2つのさらなるcDN AはAcaNAP31によってコードされているものと同じタンパク質をコードしていた [配列番号34]。これらcDNAのヌクレオチド配列とコード化されているタンパク 質の推定アミノ酸配列を図13A(AcaNAP23[配列番号31])、図13B(AcaNAP24[ 配列番号32])、図13C(AcaNAP25[配列番号33])、図13D(AcaNAP31[配列番 号34])、図13E(AcaNAP44[配列番号35])、図13F(AcaNAP45[配列番号36] )、図13G(AcaNAP47[配列番号37])、図13H(AcaNAP48[配列番号38])に示 す。 すべてのクローンは全長で、完全な分泌シグナルを含んだ。AcaNAP45[配列番号 36]とAcaNAP47[配列番号37]cDNAはそれぞれ2つのNAPドメインを組込んだタン パク質をコードしており、他のcDNAは1つのNAPドメインを持つタンパク質をコー ドしている。実施例13 ネカトール アメリカヌス(Necator americanus)由来のNAPタンパク質をコー ド化する配列を単離するためのNAP DNA配列の使用 AcaNAP5[配列番号3]、AcaNAP6[配列番号5]、AcaNAPc2[配列番号19]、Ac aNAP23[配列番号31]、AcaNAP24[配列番号32]、AcaNAP25[配列番号33]、Ac aNAP31[配列番号34]、AcaNAP44[配列番号35]、AcaNAP45[配列番号36]、Ac aNAP47[配列番号37]、AcaNAP48[配列番号38]、AceNAP4[配列番号9]、AceN AP5[配列番号10]、AceNAP7[配列番号11]、AduNAP4[配列番号12]、AduNAP7 [配列番号13]およびHpoNAP5[配列番号14]の配列(図1、3、7および13参照) を用いて、PCRクローニングにより、吸血性寄生虫ネカトール アメリカヌス由 来の関連分子を単離した。 NAPタンパク質間の相同領域から共通アミノ酸配列を作成した。次にこれらの 共通配列を用いて、次の変性PCRプライマーを設計した:NAP-1,アミノ酸配列NH 2-Lys-Pro-Cys-Gln-(Arg/Pro/Lys)-Lys-Cys[配列番号118]に対応する5'-AAR -CCN-TGY-GAR-MGG-AAR-TGY-3'[配列番号90];NAP-4.RC,配列NH2-Cys-(Val/I le/Gln)-Cys-(Lys/Asp/Gln/Gln)-(Asp/Gln)-Gly-(Phe/Tyr)-Tyr[配列番 号119]に対応する5'-TW-RWA-NCC-NTC-YTT-RCA-NAC-RCA-3'[配列番号91]。こ れらのプライマーを1対にし、ネカトール アメリカヌスcDNAを鋳型として用い るPCRによってNAP特異的プローブを作成した。 成虫ネカトール アメリカヌスをDavid Pritchard博士(ノッチンガム大学) から購入した。Quick Prep mRNA Purification Kit(Pharmacia,ニュージャー ジー州ピスキャタウェイ)を用いてポリ(A+)RNAを調製した。1マイクログラム のmRNAをAMV逆転写酵素とランダムヘキサマープライマー(Amersham,イリノイ 州 アーリントンヒルズ)を用いて逆転写した。Perkin-Elmer DNAサーマルサイクラ ー上でPCR GeneAmp(Perkin Elmer,コネチカット州ノルウォーク)試薬と共に 、一本鎖cDNA反応産物の50分の1を各〜400pmolのNAP-1およびNAP-4.RCの鋳型と して用いた。PCR条件は次の通りとした:第1〜3サイクル,96℃で2分間の変性、 37℃で1分間のアニーリング、72℃で3分間の伸長(37℃と72℃の間の傾斜時間は 2分間とした);第4〜5サイクル,94℃で1分間の変性、37℃で1分間のアニーリ ング、72℃で2分間の伸長(37℃と72℃の間の傾斜時間は2分間とした);第6〜4 5サイクル,94℃で1分間の変性、37℃で1分間のアニーリング、72℃で2分間の伸 長。第6〜45サイクルについては伸長時間を3秒/サイクルづつ増やした。 NAP-1とNAP-4.RCによるネカトール アメリカヌスcDNAのPCR増幅は約100bpの 増幅産物をもたらした。ランダムプライマーラベリング(Stratagene,カリフォ ルニア州ラジョラ)を用いてそのPCR産物を[a-32P]-dCTP(Amersham)で標識 し、標識されたDNAをChromaspin-10カラム(CloneTech,カリフォルニア州ポロ アルト)を用いて組込まれなかったヌクレオチドから分離した。 次の手法を用いてcDNAライブラリーを構築した。二本鎖cDNAを1μgのネカトー ル アメリカヌスポリ(A+)RNAからAMV逆転写酵素とランダムヘキサマープライ マー(Amersham,イリノイ州アーリントンヒルズ)を用いて合成した。約300bp より大きいcDNA断片を6%ポリアクリルアミドゲルで精製し、Eco RIリンカー(S tratagene,カリフォルニア州サンディエゴ)に標準的な手法で連結した。連結 したcDNAをEco RI切断脱リン酸化ラムダgt10(Stratagene,カリフォルニア州サ ンディエゴ)中に連結し、Gigapack Gold IIパッケージングキット(Stratagene ,カリフォルニア州サンディエゴ)を用いてパッケージング(ゲノム詰め込み) した。 予備ハイブリッド形成とハイブリッド形成の条件は6×SSC(SSC:150mM NaCl ,15mMクエン酸三ナトリウム,pH7.0)、0.02Mリン酸ナトリウム(pH6.5)、5 ×デンハルト溶液、100μg/mlせん断変性サケ精子DNA、0.23%硫酸デキストラン とした。予備ハイブリッド形成とハイブリッド形成を42℃で行い、フィルターを 2 ×SSCで20分間予備洗浄した後、45℃の2×SSCで30分間洗浄した。2つの増強スク リーンを使ってフィルターをX線フィルムに−70℃で終夜暴露した。 ランダムプラィムドネカトール アメリカヌスライブラリー(非増幅)の約40 0,000組換えファージをNAP-1/NAP-4.RC PCR断片でスクリーニングした。約11の 組換えファージがこのプローブにハイブリッド形成し、そのうちの4つをヌクレ オチド配列決定分析のために単離した。これらのファージ単離物に含まれるEco RI cDNA断片をpBluescript II KS+ベクター(Stratagene,カリフォルニア州サ ンディエゴ)中にサブクローニングすることにより、二本鎖配列決定を行った。 Sequenaseバージョン2.0キット(Amersham,イリノイ州アーリントンヒルズ)と M13オリゴヌクレオチドプライマー(Stratagene,カリフォルニア州サンディエ ゴ)を用いてDNAを配列決定した。 これら4つのラムダ単離物は、Ancylostoma種およびH.polygyrus由来のNAP配 列に似た単一の79アミノ酸NAPポリペプチドをコードするDNAを含有した。ネカト ール アメリカヌス由来のNAPポリペプチドは8859.6ダルトンの計算分子量を持 つ。そのヌクレオチド配列と推定アミノ酸配列を図14に示す。実施例14 COS 細胞における組換えAceNAP4の発現 A .発現 実施例5のプロAcaNAP5および実施例7のプロAcaNAP6と基本的に同様にして、Ac eNAP4をCOS細胞中で一時的に生産した。 実施例9のAceNAP4 cDNAを保持するpGEM型ファージミドを、分泌シグナルを含 む全AceNAP4コード領域のPCRレスキューにおける標的とした。このPCRレスキュ ーには2つのXba I追加オリゴヌクレオチドプライマーを用いたが、そのプライマ ーは次の通りである:(1)SHPCR4(該遺伝子の5'末端を標的とし、配列:GACCA GTCTA GACCACCATG GCGGTGCTTT ATTCAGTAGC AATA[配列番号120]を持つ)および (2)SHPCR5(該遺伝子の3'末端を標的とし、配列:GCTCGCTCTA GATTATCGTG AGG TTTCTGG TGCAAAAGTG[配列番号121]を持つ)。これらのプライマーに含まれるX ba I制限部位に下線を付す。実施例5に記載の条件に従い、上記のプライマーを 用いてAceNAP4配列を増幅した。 Xba I酵素で消化した後、予期されるサイズを持つ増幅産物をアガロースゲル から単離し、次いでpEF-BOSベクター[Mizushima,S.およびNagata,S.,Nucl. Acids Res.,18: 5322(1990)]の約450塩基対のXba Iスタッファー断片と置換 した。実施例5に記載の手順に従ってクローンpEF-BOS-AceNAP4を得た。このクロ ーンは、まずSHPCR4とYG60を用いるPCRによって所望の向きにXba I挿入物を持つ ことが示され、次いで配列決定によって確認されたものである。実施例5の方法 に従い、このクローンを用いてCOS細胞をトランスフェクトした。 COS細胞のトランスフェクションの24時間後(実施例5のB項参照)、10% FBS を含有するCOS培地をDMEMとNutrient Mixture Ham's F-12(Life Technologies ,メリーランド州ガイサースブルク)の1:1混合物からなる培地50mlで置換した。 次に細胞を37℃でさらにインキュベートし、EGR-第Xa因子依存性TF/第VIIa因子 阻害活性の生産を実施例Eに記述のごとく検出した。B .AceNAP4の精製 1.陰イオン交換クロマトグラフィー AceNAP4発現細胞から得られるCOS培養上清を1500r.p.m.(約500×g)で10分間 遠心分離した後、次のプロテアーゼ阻害剤(ICN Biomedicals Inc.,カリフォル ニア州コスタメサ)を加えた(1.0×10-5MペプスタチンA(イソバレリル-Val-Va l-4-アミノ-3-ヒドロキシ-6-メチル-ヘプタノイル-Ala-4-アミノ-3-ヒドロキシ- 6-メチルヘプタン酸)、1.0×10-5M AEBSF(フッ化4-(2-アミノエチル)-ベン ゼンスフホニル))。固形酢酸ナトリウムを最終濃度50mMになるよう添加した後 、pHを1N HClでpH5.3に調節した。その上清を0.22マイクロメーター酢酸セルロ ースフィルター(Corning Inc.,米国ニューヨーク州コーニング)に通すことに より清浄化した。 清浄化した上清(総体積約450ml)を、陰イオン緩衝液(0.05M酢酸ナトリウム 、0.1M NaCl、pH5.3)で予め平衡化しておいたPoros20 HQ(Perseptive Biosyst ems,マサチューセッツ州)1×2cmカラムに5ml/分の流速でのせた。カラムと試 料はこの精製段階中ずっと周囲温度であった。次にカラムを10カラム体積の陰イ オン緩衝液と10カラム体積の50mM酢酸ナトリウム,0.37M NaCl(pH5.3)で洗浄 した。 EGR-FXa依存性fVIIa/TFアミド分解阻害活性(実施例E参照)を持つ物質を流 速2ml/分の50mM酢酸ナトリウム,1M NaCl(pH5.3)で溶出させた。 2.逆相クロマトグラフィー 陰イオン交換クロマトグラフィー後に集めた画分の一部を0.46×25cm C18カラ ム(218TP54 Vydac;カリフォルニア州ヘスペリア)にのせ、次いで0.1%(v/v) トリフルオロ酢酸中の10〜35%アセトニトリルの直線的勾配(流速1ml/分,変化 速度0.4%アセトニトリル/分)で展開した。EGR-FXa依存性TF/FVIIaアミド分解 阻害活性(実施例E参照)を監視し、この阻害活性を含有する画分を単離し、真 空乾燥した。 3.組換えAceNAP4の特徴づけ AceNAP4化合物は4〜20%ゲル上でcDNA配列から予測されるサイズに合ったSDS- PAGE移動度を示した(RPクロマトグラフィー後の物質のクマシー染色ゲル)。実施例15 P .pastorisにおける組換えAcaNAPc2の生産と精製 A .発現ベクター構築 P.pastorisにおけるAcaNAPc2遺伝子の発現を、AcaNAP5の発現について実施例 3に詳述した方法に次の変更を加えて行った。 AcaNAPc2 cDNAを含有する実施例10に記載のpDONG63ベクターを用い、増幅(「P CRレスキュー」)によって、成熟AcaNAPc2タンパク質をコードする領域を単離し た(New England Biolabs(マサチューセッツ州ベバリー)製のVentポリメラー ゼを使用;20温度サイクル:94℃で1分間、50℃で1分間、72℃で1.5分間)。次 のオリゴヌクレオチドプライマーを使用した: C末端配列を標的とするLJ191プライマーはXba IおよびHin dIII制限部位(下 線部)を含む非アニーリング伸長部を含有した。 Xba I酵素による消化の後、予期されるサイズの増幅産物をゲルから単離し、 次いで酵素的にリン酸化した(New England Biolabs(マサチューセッツ州ベバ リー)製のT4ポリヌクレオチドキナーゼ)。キナーゼの熱不活化(70℃で10分間 )後、平滑末端/Xba I断片を発現用のベクターpYAM7SP8中に指向的にクローニ ングした。pYAM7SP8由来の受容ベクター断片をsut I-Spe I制限によって調製し 、アガロースゲルから精製した。大腸菌株WK6[Zell,R.およびFritz,H.-J.,E MBO J.,6: 1809-1815(1987)]を連結混合物で形質転換し、アンピシリン耐性 クローンを選択した。 制限分析に基づいて、予期されるサイズの挿入物を含有するプラスミドクロー ン(pYAM7SP-NAPC2と命名)をさらなる特徴づけのために保持した。クローンpYA M7SP-NAPC2の配列決定により、構築法から予期される通り、プレプロリーダーシ グナルに融合した成熟AcaNAPc2コード領域の正確な挿入と、コード領域中に望ま しくない突然変異の存在しないことが確認された。B .P.pastorisにおける組換えAcaNAPc2の発現 Pichia株GTS115(his4)はStroman,D.W.ら,米国特許第4855231号に記述さ れている。すべてのP.pastoris操作をStroman,D.W.ら,米国特許第4855231号 の記載に基本的に従って行った。 約1マイクログラムのpYAM7SP-NAPC2プラスミドDNAを標準的な電気穿孔法で株G TS115中にエレクトポレートした。理論的にhis4染色体遺伝子座への組込みを標 的として、プラスミドを予めSal I消化によって直鎖化しておいた。 AcaNAPc2高発現株の選択をNAPイソ型5(AcaNAP5)について実施例3に記述した ように微量培養スクリーニングを用いて行った。fVIIa/TF-EGR-fXa検定(実施 例E)を用いて、微量培養を分泌されたAcaNAPc2の存在について試験したところ 、2つのクローンが選択された。同じ手法であるが、今度は振とうフラスコレベ ルで行う第2回のスクリーニング後、1つの単離された宿主細胞を選択し、P.pas toris GTS115/7SP-NAPc2と命名した。 宿主細胞GTS115/7SP-NAPc2は野生型メタノール資化表現型(Mut+)を持つこ とが示された。このことはGTS115の染色体への発現カセットの組込みがゲノムAO X 1遺伝子の機能性を変化させなかったことを立証している。 これに続く組換えAcaNAPc2物質の生産は、Stroman,D.W.ら,米国特許第4855 231号に記述されているように、振とうフラスコ培養で行った。組換え産物を下 記のようにPichia pastoris細胞上清から精製した。C .組換えAcaNAP2の精製 1.陽イオン交換クロマトグラフィー 培養上清(100ml)を16000rpm(約30,000×g)で20分間遠心分離した後、1N H ClでpH3に調節した。上清の導電率をミリQ水の添加によって10mS/cm未満に下げ た。希釈した上清を0.22マイクロメーター酢酸セルロースフィルター(Corning Inc.,米国ニューヨーク州コーニング)に通すことによって清浄化した。 その上清の全量(約500ml)を、陽イオン緩衝液(50mMクエン酸ナトリウム,p H3)で予め平衡化しておいたPoros20HS(Perseptive Biosystems,マサチューセ ッツ州)1×2cmカラムに5ml/分の流速でのせた。カラムと希釈した醗酵上清はこ の精製段階中ずっと室温であった。次にカラムを50カラム体積の陽イオン緩衝液 と10カラム体積の0.1M NaClを含む陽イオン緩衝液で洗浄した。プロトロンビナ ーゼ検定で阻害活性を持つ物質を1M NaClを含む陽イオン緩衝液(流速2ml/分) で溶出させた。 2.Superdex30を用いる分子篩クロマトグラフィー 陽イオン交換カラムから得たEGR-fXa-fVIIa/TF阻害物質を含有する1M NaCl溶 出液(3ml;実施例C参照)を、周囲温度の0.1Mリン酸ナトリウム(pH7.4),0.1 5M NaClで予め平衡化しておいたSuperdex30 PG(Pharmacia,スウェーデン)1.6 ×60cmカラムにのせた。クロマトグラフィーを2ml/分の流速で行った。プロトロ ンビナーゼ阻害活性(実施例C)は56〜64mlに溶出し、それを集めた。 3.逆相クロマトグラフィー ゲルろ過クロマトグラフィーで得た集めた画分1mlを0.46×25cm C18カラム(2 18TP54 Vydac;カリフォルニア州ヘスペリア)にのせ、それを0.1%(v/v)トリ フルオロ酢酸中の直線的勾配10〜30%アセトニトリル(変化速度0.5%アセトニ トリル/分)で展開した。20〜25%アセトニトリル付近に溶出した主要ピークを 手動で集めた。これはプロトロンビナーゼ阻害活性を発揮した。 4.分子質量決定 この実施例の(1)〜(3)項に記述のごとく単離した主要成分の推定質量をエ レクトロスプレイイオン化質量スペクトル測定法を用いて決定した。組換えAcaN APc2の推定質量は9640ダルトンで、cDNA配列から導かれるこの分子の計算分子質 量と完全に一致した。実施例16 P .pastorisにおけるAcaNAP42の発現 AcaNAP42 cDNA(実施例12)を含有するpGEM-9zf(−)ベクター(Promega)を 用い、PCR増幅によって成熟AcaNAP42タンパク質をコード化する領域を単離した (Perkin Elmer(ニュージャジー州ブランチブルク)製のTaqポリメラーゼを使 用;25温度サイクル:94℃で1分間、50℃で1分間、72℃で1分間)。次のオリゴ ヌクレオチドプライマーを使用した: N末端配列を標的とするオリゴ3プライマーはDra I制限部位(下線部)を含む 非アニーリング伸長部を含有した。C末端配列を標的とするオリゴ2プライマーは Spe I制限部位を含有した。 予期される約250bpのサイズを持つNAP増幅産物をDra IおよびSpe I酵素で消化 し、フェノール:クロロホルム:イソアミルアルコール(25:24:1,体積/体積) での抽出によって精製し、エチルアルコール中で沈殿させた。pYAM7SP8(実施例 3)由来の受容ベクター断片をStu I-Spe I制限によって調製し、フェノール:ク ロロホルム:イソアミルアルコール(25:24:1,体積/体積)での抽出によって精 製し、エチルアルコール中で沈殿させた。大腸菌株XL1-Blue[Bullock,W.O., Fernande,J.M.およびShort,J.M.,Biotechniques 5: 376-379(1987)]を 、上述のDNA断片を含有する連結混合物で形質転換し、アンピシリン耐性クロー ンを選択した。 制限分析に基づいて、予期されるサイズの挿入物を含有するプラスミドクロー ン(pYAM7SP8-NAP42と命名)をさらなる特徴づけのために保持した。このクロー ンの配列決定により、構築法から予想される通りに、PHO1/アルファ因子プレプ ロリーダーシグナルに融合した成熟コード領域の正しい挿入と、そのコード領域 内に望ましくない突然変異の存在しないことが確認された。 約10マイクログラムのpYAM7SP-NAP42プラスミドを実施例3に記述のごとくPich ia株GTS115(his4)中にエレクトロポレートした。AOX1染色体遺伝子座での組込 みを標的として、プラスミドはNot I酵素で予め消化しておいた。 His+形質転換体を実施例3のように選択した。エレクトロポレーションから得 た単一コロニー(n=90)を室温で、グリセロール最小培地100マイクロリットル を含むプレート振とう器上の96穴プレートのウェル内で24時間生育させた。グリ セロール最小培地1リットルはアミノ酸非含有Yeast Nitrgen Base(DIFCO)13.4 g、ビオチン400マイクログラム、グリセロール10ml、10mMリン酸カリウム(pH6. 0)を含有する。 細胞をペレット化し、新鮮なメタノール最小培地(グリセロール10mlをメタノ ール5mlに置き換えた以外は上記と同じ組成)中に再懸濁してAOX1プロモーター を誘導した。室温で攪拌しながらさらに24時間インキュベートした後、10マイク ロリットルの培養上清をプロトロンビン時間検定(実施例B)で試験した。分泌 されたAcaNAP42をヒト血漿の凝固時間の延長によって検出した。実施例17 P .pastorisにおけるAcaNAPc2/プロリンの発現 AcaNAPc2の発現レベルと安定性を増大させるため、タンパク質のC末端に追加 のプロリン残基をコードする突然変異cDNAを構築した(AcaNAPc2/プロリンまた は「AcaNAPc2P」)。実施例16と同じ方法で発現ベクターpYAM7SP8-NAPc2/プロ リンを作成した。オリゴ8プライマーはDra I制限部位を持つN末端プライマーで あり、オリゴ9プライマーはXba I部位と天然型AcaNAPc2のC末端に1つのプロリン 残基を付加するためのアミノ酸コドンTGGとを含有するC末端プライマーである。 増幅産物(約270bp)をDra IとXba Iで消化した後、Stu I-Spe I制限によって 調製したpYAM7SP8由来のベクター断片に増幅産物を連結した。AcaNAPc2/プロリ ン挿入物を含有するプラスミドクローンをDNA配列決定によって確認し、それをp YAM7SP8-NAPc2/プロリンと命名した。 ベクターpYAM7SP8-NAPc2/プロリンを用いて、実施例16に記述のごとく株GTS1 15(his)を形質転換した。形質転換体を実施例16に従って選択し、生育させた 。分泌されたAcaNAPc2/プロリンが生育培地中に存在することをヒト血漿の凝固 時間の延長によって検出した(実施例B参照)。実施例18 AcaNAP5 、AcaNAPc2およびAcaNAPc2P精製の別法 (A)AcaNAp5 醗酵培地からAcaNAP5を精製するための別法は次の通りである。AcaNAP5を発現 するPichia pastoris株の醗酵液から細胞を除去し、培地を凍結した。この精製 法は凍結した培地を4℃で終夜融解し、次に約4体積のミリQ水でそれを希釈する ことによって導電率を8mS未満に低下させることから開始した。pHを3.5に調節し 、0.22μm酢酸セルロースフィルター(Corning Inc.,ニューヨーク州コーニン グ)を用いて培地をろ過した。 精製の最初と各段階で実施例Bに記述の方法を用いて、NAP含有物質の活性をプ ロトロンビン時間凝固検定で決定した。 ろ過した培地を周囲温度のPharmacia SP-Fast Flowカラムに60ml/分の流速で のせ、そのカラムを10カラム体積の50mMクエン酸/リン酸(pH3.5)で洗浄した 。50mMクエン酸/リン酸(pH3.5)中の100mM NaCl、250mM NaCl、1000mM NaClで 段階的溶出を行った。PT活性を250mM NaCl溶出液中に検出した。その全溶出液を 導電率が8mS未満になるまで透析した。 この物質のpHを酢酸で4.5に調節した後、周囲温度のスルホエチルアスパルタ ミドカラムにのせた。約10カラム体積の50mM酢酸アンモニウム(pH4.5)/40% アセトニトリルを用いてカラムを洗浄した。そのカラムを50mM酢酸アンモニウム (pH4.5)/40%アセトニトリル/200mM NaClで溶出させ、その溶出液を上述の ように透析またはダイアフィルトレーションした。 溶出液を0.1% TFAに調節し、それを周囲温度のVydac C18タンパク質/ペプチ ド逆相カラムにのせ、0.1% TFA/19%アセトニトリルとそれに続く0.1% TFA/ 25%アセトニトリルを用いて7ml/分の流速で溶出させた。0.1% TFA/25%アセ トニトリル溶出液中にNAPを検出し、そこから回収した。(B)AcaNAPc2およびAcaNAPc2P 上述の方法に次の変更を加えてAcaNAPc2またはAcaNAPc2Pを精製することがで きる。培地の融解と希釈によって8mS未満の導電率にした後、AcaNAPc2含有培地 のpHをNaOHでpH5.0に調節した。ろ過した培地を周囲温度でPharmacia Q Fast Fl owカラムに60ml/分の流速でのせ、そのカラムを10カラム体積の50mM酢酸(pH5.0 )で洗浄した。50mM酢酸(pH5.0)中の100mM NaCl、250mM NaCl、1000mM NaClで 段階的溶出を行った。250mM NaCl溶出液中にPT活性を検出した。その全溶出液を 導電率が8mS未満になるまで透析し、スルホエチルアスパルタミドおよびRP-HPLC クロマトグラフィーを用いて上に概論した方法を繰り返した。 実施例A 第Xa因子のアミド分解アッセイ 第Xa因子の触媒活性の阻害剤として作用する本発明によるNAPの作用能は ヒト酵素によって触媒されるアミド分解活性のNAP−誘発阻害[Ki値で表示 される]の決定によって評価した。 全てのアッセイに用いた緩衝液はHBSA(10mM HEPES、pH7.5、 150mM 塩化ナトリウム、0.1%牛血清アルブミン)である。全ての試薬は 特に言及しない限り、シグマ・ケミカル社(セントルイス、ミズリー)の製品であ る。 このアッセイはコーニング(Corning)のマイクロタイタープレートの適当なウ ェル内に次の試料を入れておこなった: HBSA 50μl、HBSAで希釈し た試験NAP化合物(0.025〜25nM)[非阻害速度測定の場合にはHBSA のみ)50μl、およびHBSAで希釈した因子Xa酵素[次の文献に記載した方法 に従い、エンザイム・リサーチ・ラボラトリーズ社(サウスベンド、インディア ナ)から入手した精製ヒト第X因子から調製した: ボック(Bock、P.E.)ら、A rchives of Biochem.Biophys.、第273巻、第375頁(1989年)]50 μl(この酵素は最終濃度が0.5nMになるようにアッセイ前にHBSAを用いて 希釈した)。周囲温度で50分間インキュベートした後、基質S2765[カビ・ ジアグノスチカ社またはカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、オハイ オ)から入手したN−α−ベンジルオキシカルボニル−D−アルギニニル−L− グリシル−L−アルギニン−p−ニトロアニリドジヒドロクロリドを脱イオン水 と配合した後、アッセイ前にHBSAを用いて希釈した試料]50μlを上記のウ ェル内に添加し、最終全体積を200μlとし、また、最終濃度を250μM(約 5倍のKm)とした。色素原基質の加水分解の初期速度を「サーモマックス(Therm o Max)」(登録商標)カイネティックマイクロプレートリーダー[モレキュラー・ デバイス社製; パロアルト、カリフォルニア]を用いて405nmにおける吸光度 の変化を測定することによって求めた(5分間で添加した基質の5%以下が利用 された)。 NAPを含有する試料の阻害された前平衡定常状態での速度(Vi)と遊離のfX aのみを含有する試料の非阻害速度(Vo)の比をNAPの対応する濃度に対して プロットした。これらのデータを密着結合阻害剤に関する方程式に直接あてはめ ることによって、見掛け解離阻害定数Kiを計算した[モリソン(Marrison、J .F.)およびワルシュ(Walsh、C.T.)、Adv.Enzymol.、第61巻、第20 1頁〜第300頁(1988年)]。 以下の表1に、実施例3、4および15においてそれぞれ調製した試験化合物 AcaNAP5(配列番号4)、AcaNAP6(配列番号6)およびAcaNAPc2(配 列番号59)に関するKi値を示す。これらのデータは、AcaNAP5とAcaN AP6がヒトFXaの強力な阻害剤として有用なことを示す。これに対して、Ac aNAc2はFXaアミド分解活性を効果的に阻害しなかったが、このことは該化 合物が遊離のfXaの触媒活性に影響を及ぼさないことを示す。 表1において、NIaは阻害効果がなかったことを示す(1μMまでは最大で1 5%までの阻害効果がみられた)。 実施例B プロトロンビン時間(PT)および活性化部分トロンボプラスチン時間(aPTT )アッセイ 本発明によるNAPのヒト血漿中における生体外抗凝固効果を、各々の阻害剤 の幅広い濃度範囲にわたるプロトロンビン時間(PT)と活性化部分トロンボプラ スチン時間(aPTT)の延長を測定することによって評価した。 凍結貯留した正常なクエン酸塩加ヒト血漿をジョージ・キング・バイオメディ カル社(オーバーランドパーク、カンザス)から入手した。aPTTおよびPTの 各々の測定は、凝血開始剤としてそれぞれ自動化aPTT「プレイトリン(Platel in)」(登録商標)L試薬[オルガノン・テクニカ社製; ダーラム、ノースカロライ ナ]および「シムプラスチン(Simplastin)」(登録商標)エクセル[オルガノン・テ クニカ社製]を使用し、測定装置として「Coag−A−Mate RA4自動化凝固計」 [ジェネラル・ジアグノスチックス、オルガノン・テクニカ社製; オクラホマシ ティー、オクラホマ]を用い、これらのメーカーの使用説明書に従っておこなっ た。 これらのアッセイは、急解凍した血漿で各々の試験NAPを希釈した一連の希 釈液をaPTTおよびPTを測定するためのアッセイカルーセルのウェル内に入 れ、これにそれぞれ上記の標準試薬を200μlまたは100μl添加することに よっておこなった。あるいは該アッセイは、NAPをHBSAで希釈した一連の 希釈液を、Coag−A−Mateアッセイカルーセルのウェル内に入れた正常なヒト 血漿100μlに添加した後、上記試薬をさらに添加しておこなった。 NAPの濃度を凝血時間に対してプロットし、倍加時間濃度、即ち、PTまた はaPTTの対照凝血時間を2倍にするNAPの特定の濃度を計算した。NAP の不存在下でのPTおよびaPTTにおける対照凝血時間はそれぞれ12.1秒間 および28.5秒間であった。 以下の表2はAcaNAP5(配列番号4)、AcaNAP6(配列番号6)および AcaNAPc2(配列番号59)の生体外抗凝固効果を示すもので、該抗凝固効果 は、これらのNAPが存在しない対照アッセイに対して各々のPT凝血アッセイ およびaPTT凝血アッセイにおける正常なヒト血漿の対照凝血時間を2倍にす る濃度(倍加濃度)で表示する。これらのデータは、これらの化合物がヒト血漿の 凝固に対する強力な抗凝固剤として有用なことを示す。これらのデータはまた、 未変性NAPとリコンビナントNAPが等価であることも示す。 図10Aおよび図10BはNAPで誘発されるPT(図10A)およびaPTT( 図10B)が用量に依存した延長されることを示す。 実施例C プロトロンビナーゼ阻害アッセイ 生理的プロトロンビナーゼ複合体に組み込まれた第Xa因子によるプロトロン ビンの活性化の阻害剤として作用する本発明によるNAPの効能は各々の阻害定 数Kiの決定によって評価した。 プロトロンビナーゼ活性は共役アミド分解アッセイによって測定した。このア ッセイにおいては、ヒトFXa、ヒト第Va因子(FVa)およびリン脂質ベシクル か ら前もって形成された複合体が先ず第一にヒトプロトロンビンをトロンビンに活 性化させる。生成するトロンビンのアミド分解活性は色素原基質を用いて同時に 測定される。精製されたヒトFVaはヘマトロジック・テクノロジーズ社(エセッ クスジャンクション、ヴェルモント)から入手した。精製されたヒトプロトロン ビンはセルサス・ラボラトリーズ社(シンシナティ、オハイヨ)から入手した。ペ ンタファーム社(バーゼル、スイス)製の色素原基質「ペファクロム t−PA」(C H3SO2−D−ヘキサヒドロチロシン−グリシル−L−アルギニン−p−ニトロ アニリド)はセンターケム社(タリタウン、ニューヨーク)から入手した。この基 質は使用前に脱イオン水中において再形成させた。フォスフォチジルコリン(6 7%、w/v)、フォスファチジルグリセロール(16%、w/v)、フォスファチジ ルエタノールアミン(10%、w/v)およびフォスファチジルセリン(7%、w/v) から成るリン脂質ベシクルは次の文献に記載の方法に従って界面活性剤の存在下 で調製した: ルフ(Ruf、W.)、マイルズ(Miles、D.J.)、レヘムツラ(Rehe mtulla、A.)およびエジングトン(Edgington、T.S.)、Methods in Enzymo logy、第222巻、第209頁〜第224頁(1993年)。リン脂質はアバンチ ・ポーラー・リピズ社(アラバスター、アラバマ)から入手した。 プロトロンビナーゼ複合体はポリプロピレン製試験管内において、3mM Ca Cl2含有HBSA中でFVa、FXaおよびリン脂質ベシクル(PLV)を10分間 結合させることによって調製した。マイクロタイタープレートの適当なウェル内 において、該複合体50μlをHBSAで希釈したNAPまたはHBSAのみ[非 阻害速度Voを測定する場合]50μlと混合した。室温で30分間インキュベー トした後、ヒトプロトロンビンおよびトロンビンな対する色素源基質ペファクロ ムtPAを含有する基質溶液の添加によってトリプリケイト(triplicate)の反応 を開始させた。HBSAの全体積(150μl)中の反応成分の最終濃度は次の通 りである: NAP(0.025〜25nM)、FXa(250fM)、PLM(5μM)、 プロトロンビン(250nM)、ペファクロムtPA(250μM、5X Km)およ びCaCl2(3mM)。 FXaのプロトロンビナーゼ活性は実施例Aに記載のようにして、定常状態の 条件下での405nmにおける吸光度の10分間の増加(速度)として測定した。吸 光度は経時的にS字状に増加した。このことはFXa含有プロトロンビナーゼ複 合体によるプロトロンビン活性化の共役反応の後、生成するトロンビンによって ベファクロムtPAが加水分解されたことを示す。トリプリケイトの各々のウェ ルから得られたデータを一緒にし、次の文献に記載の方法に従い、吸光度対(時 間)2の関数として反復線形最小二乗回帰分析により処理することによってプロト ロンビン活性の初期速度(Vi)を決定した: [カーソン(Carson、S.D.)、Comp ut.Prog.Biomed.、第19巻、第151頁〜第157頁(1985年)]。N AP含有試料についての阻害された定常状態での初期速度(Vi)とプロトロンビ ナーゼFXaのみを含有する試料についての非阻害速度(Vo)の比を対応するNA Pの濃度に対してプロットした。これらのデータを前記実施例Aの場合のような 密着結合阻害剤に対する方程式に直接適用することによって、見掛け平衡の解離 阻害定数Kiを計算した。 以下の表3に、プロトロンビナーゼ複合体に組み込まれたヒトFXaによるプ ロトロンビン活性に対するリコンビナントAcaNAP5(配列番号4)、AcaNA P6(配列番号6)およびAcaNAPc2(配列番号59)(いずれの化合物も前述の ようにしてピキア・パストリス中で調製した)の解離阻害定数(Ki)を示す。こ れらのデータは、これらの化合物が、プロトロンビナーゼ複合体に組み込まれた ヒトFXaの阻害剤として有用であることを示す。 実施例A、BおよびCに記載のデータはAcaNAP5とAcaNAP6がFXa 類似の相互作用することを示す。この相互作用には酵素の触媒中心へのペプチド と高分子基質(プロトロンビン)の接近を直接的に制限する作用が含まれる。これ に対し、AcaNAPc2とFXaとの相互作用は、この酵素と基質および/または 補因子(第Va因子)との高分子相互作用を摂動させるだけであって、ペプチド基 質の触媒回転を直接的に阻害しない(表1参照)。 実施例D 活性特異性決定のための生体外酵素アッセイ FXa触媒活性またはTF/VIIa活性の選択的阻害剤として作用する本発明に よるNAPの効能は、試験NAPが次の関連するセリンプロテアーゼの濃度より も100倍高い濃度でのアッセイにおいて他の酵素を阻害するかどうかを決定す ることによって評価した:トロンビン、第Xa因子、第XIa因子、第XIIa因子、 カリクレイン、活性タンパク質C、プラスミン、リコンビナント組織プラスミノ ーゲン活性化因子(rt−PA)、ウロキナーゼ、キモトリプシンおよびトリプシ ン。これらのアッセイはセリンプロテアーゼ阻害活性を有するNAPの特異性の 決定にも利用した。 (1)酵素阻害アッセイの一般的プロトコル 全てのアッセイにはHBSA(実施例A参照)を緩衝液として使用した。全ての 基質は脱イオン水中で再構成させ、アッセイの前にHBSAを用いて希釈した。 セリンプロテアーゼ阻害の特異性を決定するためのアミド分解アッセイはコーニ ングマイクロタイタープレートの適当なウェル内に次の試料を入れておこなった :HBSA 50μl、HBSAで所定濃度に希釈したNAP溶液またはHBS Aのみ(非阻害対照速度Voを測定する場合)50μlおよび特定の酵素溶液(以下 の特異性酵素参照)50μl。周囲温度で30分間インキュベートした後、基質溶 液50μlをトリプリケイトウェルに添加した。HBSAの全体積(200μl)中 の反応成分の最終濃度は次の通りである: NAP(75nM)、酵素(750pM) および色素原基質(後述の濃度)。色素原基質の加水分解の初期速度は405nmに おける吸光度の5分間の変化(添加した基質の5%以下が加水分解される)とし て測 定した。NAPを含有する試験試料の速度(Vi)は各々の酵素に関する非阻害対 照速度(Vo)に対する%[(Vi/Vo)×100]として表示した。 (2)特異性酵素アッセイ (a)トロンビンアッセイ トロンビン触媒活性はペンタファーム社(バーゼル、スイス)から入手した色素 原基次ペファクロムt−PA(CH3SO2−D−ヘキサヒドロチロシン−グリシル −L−アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決定した。ペファクロムt−P Aの最終濃度は250μMとした(約5倍のKm)。精製したヒトα−トロンビン はエンザイム・リサーチ・ラボラトリーズ社(サウスベンド、インディアナ)から 入手した。 (b)第Xa因子アッセイ 第Xa因子の触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、オハイ オ)から入手した色素原基質S−2765を用いて決定した。全ての基質は使用 前に脱イオン水中で再構成させた。S−2765の最終濃度は250μMとした (約5倍のKm)。精製したヒト第X因子はエンザイム・リサーチ・ラボラトリー ズ社(サウスベンド、インディアナ)から入手した。第Xa因子(FXa)は次の文献 に記載した方法により第X因子から活性化させた調製した: ボック(Bock、P. E.)、クレイク(Craig、P.A.)、オルソン(Olson、S.T.)およびシング(Si ngh)、P.Arch.Biochem.Biophys.、第273巻、第375頁〜第388頁 (1989年)。 (c)第XIa因子アッセイ FXIaの触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、オハイオ )から入手した色素原基質S−2366(L−ピログルタミル−L−プロリル−L −アルギニン−p-ニトロアニリン)を用いて決定した。S−2366の最終濃度 は750μMとした。精製したヒトFXIaはエンザイム・リサーチ・ラボラト リーズ社(サウスベンド、インディアナ)から入手した。 (d)第XIIa因子アッセイ FXIIaの触媒活性はアメリカン・ジアグノスチカ社(グレニッチ、コネティカ ット)から入手した色素原基質スペクトロザイムFXIIa(H−D−CHT−L− グリシル−L−アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決定した。スペクトロ ザイムFXIIaの最終濃度は100μMとした。精製したヒトFXIIaはエンザイ ム・リサーチ・ラボラトリーズ社(サウスベンド、インディアナ)から入手した。 (e)カリクレインアッセイ カリクレインの触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、オ ハイオ)から入手した色素原基質S−2302(H−D−プロリン−L−フェニル アラニル−L−アルギニン−p-ニトロアニリン)を用いて決定した。S−230 2の最終濃度は400μMとした。精製したヒトカリクレインはエンザイム・リ サーチ・ラボラトリーズ社(サウスベンド、インディアナ)から入手した。 (f)活性化タンパク質C(aPC) 活性化タンパク質Cの触媒活性はアメリカン・ジアグノスチカ社(グレニッチ 、コネティカット)から入手した色素原基質スペクトロザイムPCa(H−D−リ シル(−Cbo)−L−プロリル−L−アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決 定した。スペクトロザイムPCaの最終濃度は300μMとした(約4倍のKm)。 精製したヒトaPCはヘマトロジック・テクノロジーズ社(エセックスジャンクシ ョン、ベルモント)から入手した。 (g)プラスミンアッセイ プラスミンの触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、オハ イオ)から入手した色素原基質S−2366(L−ピログルタミル−L−プロリル −L−アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決定した。S−2366の最終 濃度は300μM(約4倍のKm)とした。精製したヒトプラスミンはエンザイム ・リサーチ・ラボラトリーズ社(サウスベンド、インディアナ)から入手した。 (h)リコンビナイト組織プラスミノーゲン活性化因子(rt−PA) rt−PAの触媒活性はペンタファーム社(バーゼル、スイス)から入手した基質 ペファクロムt−PA(CH3SO2−D−ヘキサヒドロチロシン−グリシル−L− アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決定した。ペファクロムt−PAの最 終濃度は500μMとした(約3倍のKm)。ヒトrt−PA[「アクチベイス(Activ ase)」(登録商標)]はジェネンテク社(サウスサンフランシスコ、カリフォルニア) から入手した。 (i)ウロキナーゼ ウロキナーゼの触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、オ ハイオ)から入手した基質S−2444(L−ピログルタミル−L−グリシル−L −アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決定した。S−2444の最終濃度 は150μMとした(約7倍のKm)、ヒトの培養腎細胞から調製したヒトの精製 ウロキナーゼ[「アブボキナーゼ(Abbokinase)」(登録商標)]はアブボット・ラボ ラトリーズ社(ノースシカゴ、イリノイ)から入手した。 (j)キモトリプシン キモトリプシンの触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランクリン、 オハイオ)から入手した色素原基質S−2586(メトキシ−スクシニル−L−ア ルギニニル−L−プロリル−L−チロシン−p−ニトロアニリン)を用いて決定し た。S−2586の最終濃度は100μMとした(約8倍のKm)。精製した(3回 の結晶化; CDI)ウシの膵キモトリプシンはワージントン・バイオケミカル社( フリーホルド、ニュージャーシー)から入手した。 (k)トリプシン トリプシンの触媒活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フリーホルド、オハ イオ)から入手した色素原基質S−2222(N−ベンゾイル−L−イソロイシル −L−グルタミル[−メチルエステル]−L−アルギニン−p−ニトロアニリン)を 用いて決定した。S−2222の最終濃度は300μMとした(約3倍のKm)。 精製したヒト膵トリプシンはスクリップス・ラボラトリーズ社(サンジエゴ、カ リフォルニア)から入手した。 以下の表4に、FXaおよび10種のセリンプロテアーゼのアミド分解活性に 対するリコンビナントAcaNAP5(配列番号4)またはリコンビナントAcaNA P6(配列番号6)(いずれの化合物も前述のピキア・パストリス中で発現させた) の阻害効果を示す(該阻害効果は対照速度に対する%で表示する)。これらのNA Pは他の関連するセリンプロテアーゼに比べてFXaの阻害に関して高度の特異 性を示す。 以下の表5には、11種の選択したセリンプロテアーゼのアミド分解活性に対 するリコンビナントAcaNAPc2(配列番号59)およびリコンビナントAcaN AP4(配列番号62)(いずれの化合物も前述のようにピキア・パストリア中に おいて発現させた)の阻害効果を示す(該阻害効果は対照速度に対する%で表示す る)。これらのデータは、これらのNAPが表5に示すセリンプロテアーゼに対 して高度の特異性を示すことを例証する。 実施例E FVIIa/TF複合体に対するNAPの阻害能を測定するためのアッセイ (1)FVIIa/TFによるFIXの活性化アッセイ この実施例においては、生体外でのプロトロンビンのタイムアッセイ(実施例 B参照)での凝固反応の開始において主要な役割を果たす触媒複合体FVIIa/T Fの阻害剤として作用する本発明によるNAPの効能を測定する。トリチウム標 識した第IX因子のrFVIIa/rTF/PLV複合体による活性化は固有阻 害定数Kiの決定によって評価した。 凍結乾燥した精製リコンビナントヒトVIIa因子はバイオスパシフィック社(エ メリーヴィル、カリフォルニア)から入手し、使用前にHBS(10mM HEP ES、pH7.5、150mM 塩化ナトリウム)中で再構成させた。精製ヒト因子 Xはエンザイム・リサーチ・ラボラトリーズ社(サウスベンド、インディアナ)か ら入手した。第Xa因子(遊離FXa)は次の文献に記載の方法によって第X因子を 活性化して調製した:ボック、クレイク、オルソンおよびシング、P.Arch.Bi ochem.Biophys.、第273巻、第375頁〜第388頁(1989年)。L− グルタミル−L−グリシル−L−アルギニルクロロメチルケトンで不可逆的に不 活性化された活性部位ブロック化ヒト因子Xa(EGR−FXa)はヘマトロジッ ク−テクノロジーズ社(エセックスジャンクション、ベルモント)から入手した。 リコンビナントヒト組織因子(rTF)はバキュロウイルス(baculovirus)−発現系 によって調製し、モノクローナル抗体アフィニティークロマトグラフィー(コル バス・インターナショナル社製:サンジエゴ、カリフォルニア)によって同種性(h omogeneity)まで精製した。 精製したrTFアポタンパク質は次の文献に記載の方法により、ホスホチジル コリン(75%、w/v)とホスホチジルセリン(25%、w/v)から成るリン脂質ベ シクルに界面活性剤の存在下で組み込んだ(rTF/PLV):ハフ(Ruf、w.)、 マイルズ(Miles、D.J.)、レヘムツラ(Rehemtulla、A.)およびエジングト ン(Edgington、T.S.)、Method in Enzymology、第222巻、第209頁 〜第224頁(1993年)。リン脂質はアバンチ・ポーラー・リピズ社(アラバ スター、アラバマ)から入手した。全てのアッセイにおける緩衝液としてはHB SA(牛血清アルブミンを0.1%w/v含有するHBS)を使用した。全ての試薬 は特に言及しない限り、シグマ・ケミカル社(セントルイス、ミネソタ)から入手 した。 rFVIIa/rTF複合体によるヒト3H−因子IX(FIX)の活性化は放射能標識活 性ペプチドの放出を監視することによって測定した。精製したヒトFIXはヘマ トロジック・テクノロジーズ社(エセックスジャンクション、ベルモント)から入 手し、これを次の文献に記載の方法により、還元トリチウム化によって放射能標 識した:ファンレンテン(Van Lenten)およびアッシュヴェル(Ashwell)、JB C、第246巻、第1889頁〜第1894頁(1971年)。得られたトリチウ ム化FIXの免疫喪失FIX欠損血漿[オルソ(Ortho)]中で測定した比活性は19 4凝固単位/mgであり、また、この活性の97%が保持された。放射性比活性は 2.7×108dpm/mgであった。rFVIIa/rTF/PLVによる3H−FIXの活 性化に対するKmは25nMであり、この値は未処理(非標識化)FIXに対して得ら れた値に等しかった。 Kiを決定するためのアッセイは次の様にしておこなった。rFVIIaとrTF /PLVは5mM CaCl2を含有するHBSAを保有するポリプロピレン製試験 管内において結合させ、10分間放置することによって複合体を形成させた。r FVIIa/rTF/PLVのアリコートを適当なポリプロピレン製マイクロ遠心分 離管内においてEGR−FXaもしくは遊離FXa(存在する場合)およびHBSA で種々の濃度に希釈したNAP試験化合物溶液もしくはHBSAのみ[非阻害対 照速度Voを測定する場合]と混合した。この混合物を周囲温度で60分間インキ ュベートした後、3H−FIXの添加によって反応を開始させた。HBSA420 μl中の反応成分の最終濃度は次の通りである:rFVIIa(50pM)、rTF(2.7n M)、PLV(6.4μM)、EGR−FXaもしくは遊離FXa(300pM)、リコ ンビナントNAP(5〜1,500pM)、3H−FIX(200nM)およびCaCl2(5 mM)。さらに、バックグラウンド対照反応は、rFVIIa以外の前記の全ての成分 を含む系においておこなった。 所定の時間(8分間、16分間、24分間、32分間および40分間)経過後、 等容量の50mM EDTA(溶媒:HBS)と0.5%BSAを保有するエッペン ドルフ管内に反応混合物80μlを加えて反応を停止させ、次いで6%(w/v)ト リクロロ酢酸160μlを添加し、沈殿したタンパク質を40℃での遠心分離処 理(16,000g)に6分間付すことによって上澄みから分離させた。得られた上 澄み中の放射能は、シンチバースBD(フィッシャー・サイエンティフィック社製 ;フェアローン、ニュージャーシー)に添加したトリプリケイトアリコートを除去 することによって測定し、次いで液体シンチレーション計数管を用いて定量した 。対照活性化速度は定常状態条件下で放出された溶性カウント成分の線形回帰分 析によって決定した(3H−FIXの5%以下が消費された)。バックグラウンド対 照(対照速度の1%以下)は全ての試料についての測定値から差し引いた。NAP の存 在下での阻害定常状態速度(Vi)とrFVIIa/TFのみのときの非阻害対照速度( Vo)との比を対応するNAPの濃度に対してプロットした。これらのデータを密 着結合性阻害剤に関する方程式に直接代入することによって、見掛けの平衡解離 阻害定数Kiを計算した:モリソン(Morrison、J.F.)およびワルシュ(Walsh 、C.T.)、Adv.Enzymol.、第61巻、第201頁〜第300頁(1988年 )。 前述のようにして調製したリコンビナントAcaNAP5、AcaNAP6、Aca NAPc2およびAcaNAP4に関するデータを以下の表6に示す。 (2)FAIIa/TFのアミド分解アッセイ FVIIa/TF複合体のアミド分解活性の阻害剤として作用する本発明による NAPの効能を、活性部位がブロックされたヒトFXa(EGR−FXa)の存在下 および不存在下での阻害定数Kiを決定することによって評価した。 rFVIIa/rTFのアミド分解活性はカビ・ファーマシア・ヘパル社(フランク リン、オハイオ)から入手した色素原基質S−2288(H−D−イソロイシル− L−プロリル−L−アルギニン−p−ニトロアニリン)を用いて決定した。この基 質は使用前に脱イオン水中で再構成させた。3mM CaCl2含有HBSAを保有 するポリプロピレン製試験管内においてrFVIIaとrTF/PLVを混合し、1 0分間放置することによって複合体を形成させた。Kiを決定するためのアッ セイは、コーニング・マイクロタイタープレートの適当なウエルに次の試料を入 れておこなった:rFVIIa/rTF/PLV複合体50μl、EGR−FXa50μ lおよびHBSAで種々の濃度に希釈したNAP試験化合物またはHBSAのみ[ 非阻害速度Voを測定する場合]50μl。周囲温度で30分間インキュベートし た後、S−2288 50μlの添加によってトリプリケイト反応を開始させた 。HBSAの全体積(200μl)中の反応成分の最終濃度は次の通りである:リコ ンビナントNAP(0.025〜25nM)、rFVIIa(750pM)、rTF(3.0n M)、PLV(6.4μM)、EGR−FXa(2.5nM)およびS−2288(3.0m M、3×Km)。 rFVIIa/rTF/PLVのアミド分解活性は、定数状態条件下において、「サ ーモ・マックス(登録商標)カイネティック・マイクロプレート・リーダー(モレ キュラー・デバイシィズ社製;パロアルト、カリフォルニア)を用いて405nmで の吸光度の10分間の一次増加として測定した(基質の5%以下が消費された)。 NAPの存在下で阻害された前平衡定常状態速度(Vi)と遊離FXaのみの存在下 での非阻害速度(Vo)との比をNAPの対応する濃度に対してプロットした。こ れらのデータを密着結合性阻害剤に関する方程式(実施例E参照)に直接代入する ことによって、見掛けの平衡遊離阻害定数Kiを計算した。 rFVIIa/rTF活性の阻害アッセイにおけるリコンビナントAcaNAPc2( 配列番号59)、AceNAP4(配列番号62)、AcaNAP5(配列番号4)およ びAcaNAP6(配列番号6)(前述のようにピキア・パストリス中で調製した試 料)のKi値を以下の表6に示す。これらのデータは、遊離FXaもしくは活性 部位がブロックされたFXaの存在下または不存在下においてAcaNAPc2およ びAceNAP4がヒトrFVIIa/rTF/PLV複合体の強力な阻害剤として有 用であることを示す。AcaNAPc2P(実施例17参照)の生体外活性はAcaN APc2の場合と実質的に同一であった。 実施例F NAP活性の生体内モデル (1)FeCl3で誘発された血小板依存性動脈血栓症のラットモデルにおける NAPの抗血栓性活性の評価 NAPの抗血栓性特性(血栓の形成を阻害する特性は、急性血管血栓症の確立 された実験用ラットモデルを用いて評価した。 ラット−FeCl3モデルは強力な抗血栓性化合物の評価に使用されている血小 板依存性動脈血栓症によって十分に特徴づけられるモデルである:クルツ(Kurz 、K.D.)、マイン(Main、B.W.)およびサンドゥスキー(Sandusky、G.E.) 、Thromb.Res.、第60巻、第269頁〜第280頁(1990年)。このモ デルにおいては、濾紙片に吸収させた調製直後のFeCl3溶液を用いて局部的に 処理したラットの頚動脈のセグメント内に血小板に富む閉塞性血栓が形成される 。FeCl3は処理した動脈セグメント内へ拡散し、冒された血管表面の脱内皮化 をもたらすと考えられている。この結果、血液が内皮下構造内へ流入し、これに よって血小板付着、トロンビン形成および血小板凝集がもたらされる。最終的な 効果は閉塞性血栓形成である。FeCl3の塗布後にもたらされる閉塞性血栓形成 の発生率に対する試験化合物の効果は超音波フロートメトリー(flowtometry)に よって監視し、主要な最終的結果として利用する。頚動脈の血流測定にフロート メトリーを利用する手法は、クロットの形成を熱的に検知するオリジナルな方法 [クルツ、マインおよびサンドゥスキー、Thromb.Res.、第60巻、第269 頁〜第280頁(1990年)]の変法である。 (a)静脈内投与 雄のハーラン・スプレーク・ドーリーラット(420〜450g)を実験に供す る前少なくとも72時間環境に順応させ、処置の12時間前は水を自由に与える 以外は絶食させた。これらのラットをネンブタール(Nembutal)を用いて麻酔さ せ、次いで血圧の監視および薬剤と麻酔薬の投与のためにカテーテルを挿入した 。正中線の頚部を切開した後、鈍器解剖と拡大によって左側の頚動脈を取り出し 、頚部鞘から2cmの血管セグメントを分離させた。分離させた血管の隣接遠位端 の下に絹の縫合糸を挿入することによって、血管の隣接端の周囲に超音波のフロ ー プローブ[トランソニック(Transonic)]を装着させるための間隙を形成させた。 固定アームを用いて該プローブを該間隙内に固定した。 上記の手術後、ラットを無作為に生理食塩水を投与する対照群とリコンビナン トAcaNAP5を投与する処置群に分類した。実施例3に記載の方法によってペ キア・パストリス中で調製した試験化合物を単一の静脈用ボラス(bolus)として 、該フロープローブの設置後、血栓を誘発させる5分前に表7に示す投与量で投 与した。t=0のとき、調製直後のFeCl3の35%水溶液10μlを吸収させた 直径3mmの濾紙片(ワットマン#3)をフロープローブに接する分離頚動脈末端セ グメントと接触させた。血圧、血流量、心拍数および呼吸を60分間監視した。 閉塞の発生率(血流量がゼロになるとき)を主要な最終結果として記録した。 この生体内モデルでの血栓形成を阻害する抗血栓症剤としてのAcaNAP5( 配列番号4)の効力は、以下の表7に示すように、血栓閉塞の発生率が投与量に 応じて低減することによって例証された。 このモデルにおける血栓閉塞の50%を阻害する有効投与量(ED50)は上記の データに基づき、閉塞の発生率を投与量に対してプロットすることによって決定 することができる。この値を用いることによって、前述のモデルにおいて評価し た他の抗血栓症剤とAcaNAP5の抗血栓症効能を直接的に比較することができ る。 以下の表8に、周知の抗凝固剤とAcaNAP5のこのモデルにおけるED50値 を示す。 表8において、「ED50」は被験動物の完全血栓閉塞の発生率を50%阻害する 投与量として定義され、また、「rTAP」はリコンビナントマダニ抗凝固ペプチ ド[ブラスク(Vlask)ら、Thromb.Haemostas.、第70巻、第212頁〜第2 16頁(1993年)参照]を示す。 (b)皮下投与 ラット/FeCl3モデルにおいて、皮下投与後のAcaNAP5と低分子量ヘパ リン[エノキサパリン;ラブノックス(Lovenox)、ローン−ポーレンク・ローラー (Rhone−Poulenc Rorer)]の抗血栓症効果を比較した。このモデル実験は、 試験化合物を皮下投与してその効力を投与から30分間および150分間経過後 に測定する以外は前述のモデル実験に準拠しておこなった。皮下投与は両方の頚 動脈に対して逐次的におこなった。これらの実験結果により、AcaNAP5(配 列番号4)が皮下投与後の生体内において有効な抗血栓症剤となることが明らか となった。実験結果を以下の表9に示す(表中のED50は表8の場合と同意義で ある)。 (2)深部創傷出血の測定 深部創傷出血に対するNAPと低分子量ヘパリンの効果を比較した。 雄のラットに麻酔をかけた後、前記のFeCl3モデルの場合と同様の器具を装 着させた(但し、FeCl3は頚動脈に投与しなかった)。頚動脈に達する傷をラッ トの首に外科的につけ、出血量を経時的測定した。即ち、AcaNAP5または低 分子量ヘパリンを皮下投与してから3.5時間にわたって出血量を測定した。外 科用スポンジを創傷部に詰め、該スポンジを30分毎に取り出し、ドラプキン( Drabkin)試薬[シグマ・ケミカル社製;セントルイス、ミズリー]中に浸漬した。 該試薬は赤血球を溶解させ、ヘモグロビンと反応して変色する。変色した試料は 550nmでの吸光度の測定によって定量し、該定量値からスポンジに含浸した血 液量を決定した。 両方の試験化合物に関する投与応答特性を、該化合物の効力データと共に図1 5に示す。このモデルにおける閉塞性動脈血栓形成の阻害能の点ではAcaNAP 5(配列番号4)は低分子量ヘパリンよりも強力であった。さらに、NAPを投与 したラットの出血量は、低分子量ヘパリンを投与したラットの出血量よりも少な かった。 表7、表9および図15に示すデータから明らかなように、NAPはこの実験 モデルにおける閉塞性血栓形成を効果的に阻害する。ヒトの血栓症も阻害すると いうこのデータの妥当性は、表8に示す他の抗凝固剤のデータと比較すれば明ら かである。次の文献に記載のように、これらの抗凝固剤は上記と同じ実験モデル において、該モデルにおけるNAPの場合と同じ方法によって評価されており、 該抗凝固剤の抗血栓症に対する効力は臨床的に証明されている:「ヘパリン」・・ ・ ヒルシュ(Hirsh、J.N.)、Engl.J.Med.、第324巻、第1565頁〜第1 574頁(1992年)、ケイルンス(Cairns、J.A.)ら、Chest、第102巻 、第456頁〜第481頁(1992年);「アルガトロバン」・・・ゴールド(Gol d、H.K.)ら、J.Am.Coll.Cardiol.、第21巻、第1039頁〜第104 7頁(1993年);「ヒルログ(商標)」・・・シャルマ(Sharma、G.V.R.K.)ら 、Am.J.Cardiol.、第72巻、第1357頁〜第1360頁(1993年)、 リドン(Lidon、R.M.)ら、Circulation、第88巻、第1495頁〜第150 1頁(1993年)。 実施例G ブタにおける急性冠動脈血栓症 この実験モデルにおいて用いたプロトコルは次の文献に記載の血栓症モデルの 場合を修正したものである:ルッケシ(Lucchesi、B.R.)ら、Brit.J.Pharma col.、第113巻、第1333頁〜第1343頁(1994年)。 実験動物に麻酔をかけ、動脈カテーテルおよび静脈カテーテルをそれぞれ左側 の全身頚動脈および外部頚動脈に装着した。第4肋間の胸部を開口して心臓を露 出させた。左前方下行(LAD)頚動脈を重層結合組織から分離させ、これにドッ プラーフロープローブ(Doppler flow probe)および17ゲージの結紮狭窄具 を装着した。該動脈の内部には陽極電極を挿入した。 ベースライン測定をおこなった後、試験に供されるNAPまたはプラセボを外 部頚動脈から投与した。投与から5分後、刺激電極に直流(300μA、DC)を 印加して冠動脈内皮の内膜を損傷させることによって血栓形成を開始させた。電 流は3時間流し続けた。実験動物の観察は、電流停止から1時間後または致死時 までおこなった。 以下の表10には、実験動物にAcaNAP5またはAcaNAPc2P(実施例1 7参照)を漸増的に所定量投与したときの閉塞の発生率を例証するデータを示す 。プラセボを投与した実験動物における閉塞の発生率は8/8(100%)であっ た。プラセボ処理した実験動物における閉塞までの時間は66.6±7.5分間( 平均 値±sem)であった。4時間の観察中に閉塞の認められなかったAcaNAP処理動 物の血管の閉塞までの時間は統計的な比較を容易にするために任意の時間(24 0分間)を割り当てた。 表10のデータから明らかなように、AcaNAP5およびAcaNAPc2Pは この実験モデルにおいては同等の効能を示し、いずれも投与量に応じて冠動脈の 閉塞時間を遅延させた。さらに、両方の分子は投与量が0.03mg/kg i.v.の ときでも、出血量を著しく増大させることなく閉塞時間を著しく遅延させる。 上記のデータが示すように、AcaNAP5とAcaNAPc2Pは好ましい治療 指数を有する。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (31)優先権主張番号 08/465,380 (32)優先日 1995年6月5日 (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 08/486,397 (32)優先日 1995年6月5日 (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 08/486,399 (32)優先日 1995年6月3日 (33)優先権主張国 米国(US) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,MW,SD,SZ,UG), AM,AT,AU,BB,BG,BR,BY,CA,C H,CN,CZ,DE,DK,EE,ES,FI,GB ,GE,HU,IS,JP,KE,KG,KP,KR, KZ,LK,LR,LT,LU,LV,MD,MG,M N,MW,MX,NO,NZ,PL,PT,RO,RU ,SD,SE,SG,SI,SK,TJ,TM,TT, UA,UG,US,UZ,VN (72)発明者 スタンセンス,パトリック・エリック・フ ーゴ ベルギー、ベー−9830シント−マルテンス −ラテム、コンスタント・ペルメケラーン 48番 (72)発明者 メセンス,ヨーレス・ヒルダ・リーヴェン ベルギー、ベー−2018アントウェルペン、 デスギンレイ234番 (72)発明者 ローウェレイス,マルク・ヨーゼフ ベルギー、ベー−9450ハールテルト、ウィ ルヘンストラート2番 (72)発明者 ラロシュ,イヴ・ルネ ベルギー、ベー−1150ブリュッセル、リ ュ・ベメル115番 (72)発明者 イェスペルス、ローレント・ステファン ベルギー、ベー−3080テルフレン、カーレ ル、ファン・ローレイネンラーン4番 (72)発明者 ガンセマンス,ヤニック・ジョールジェ・ ヨーゼフ ベルギー、ベー−8450ブレデネ、ニーウス トラート89番 (72)発明者 モイル,マシュー アメリカ合衆国92029カリフォルニア州 エスコンディド、ピュアラー・ロード3215 番 (72)発明者 バーガム,ピーター・ダブリュー アメリカ合衆国92130カリフォルニア州 サンディエゴ、カーメル・クリーク・ロー ド・ナンバー6、12906番

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 抗凝固作用を有し、1または複数のNAPドメインを有し、NAPドメイ ンがそれぞれ以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A9−Cys−A10(式 II)(式中、 (a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1のアミノ酸である: (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10の各配列はそれぞれ独立して選択される数の 、独立して選択されるアミノ酸残基を有するものであり、各配列はNAPドメイ ンそれぞれが約120未満のアミノ酸残基を有するように選択される。) を有する、単離されたタンパク質。 2. A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立して選 択されるアミノ酸残基である)の配列を有する、第1項記載のタンパク質。 3. A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aはAla、Arg、Pro 、Lys、Ile、His、LeuおよびThrからなる群から選択され、A3 bはLys、ThrおよびArgからなる群から選択されるアミノ酸残基である )の配列を有する、第2項記載のタンパク質。 4. A3がアミノ酸配列: Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ile−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lysおよび Glu−Thr−Lys からなる群から選択される、第3項記載のタンパク質。 5. A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である、第1項記載のタン パク質。 6. A7がValである、第1項記載のタンパク質。 7. A7がIleである、第1項記載のタンパク質。 8. A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8f− A8g[配列番号68]: (式中、(a)A8aはA8の第1アミノ酸残基である; (b)A8aおよびA8bの少なくとも1方はGluおよびAspからなる群か ら選択される;そして (c)A8cからA8gはそれぞれ独立して選択されるアミノ酸残基である) を含む、第1項記載のタンパク質。 9. (a)A8aがGluまたはAspである、 (b)A8bが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第8項記載のタンパク質。 10. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが以下: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第9項記載のタンパク質。 11. (a)A8aが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (b)A8bがGluまたはAspである、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第8項記載のタンパク質。 12. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが以下: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第11項記載のタンパク質。 13. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが以下: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第8項記載のタンパク質。 14. A10がアミノ酸配列: Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ば れる、第1項記載のタンパク質。 15. A10がアミノ酸配列:Glu−Ile−Ile−His−Val[配 列番号74]を含む、第14項記載のタンパク質。 16. NAPタンパク質AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP 6[配列41]のNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列のNAPドメイ ンを有する、第15項記載のタンパク質。 17. A10がアミノ酸配列:Asp−Ile−Ile−Met−Val[配 列番号75]を含む、第14項記載のタンパク質。 18. A10がアミノ酸配列:Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−P ro[配列番号76]を含む、第14項記載のタンパク質。 19. A10がアミノ酸配列:Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配 列番号77]を含む、第14項記載のタンパク質。 20. 線虫から誘導される第1項記載のタンパク質。 21. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第20項記載のタンパク 質。 22. (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独 立して選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8が、アミノ酸配列: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、および (e)A10が、アミノ酸配列: Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ば れる、 第1項記載のタンパク質。 23. AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP6[配列番号41 ]のからなる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のNAPドメイン を有する、第22項記載のタンパク質。 24. 線虫から誘導される、第23項記載のタンパク質。 25. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第24項記載のタンパク 質。 26. (a)A3がアミノ酸配列: Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ile−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lysおよび Glu−Thr−Lys からなる群から選択される; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8が以下の A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号78]、 A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号79]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号80]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号81]、 およびA8a−A8b−Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号8 2](式中、A8aおよびA8bのうちの少なくとも1つはGluまたはAsp である)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む; (e)A9がアミノ酸残基5のアミノ酸配列である; (f)A10が以下の Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76] およびMet−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群か ら選択される、 第1項記載のタンパク質。 27. AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP6[配列番号41 ]のからなる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のNAPドメイン を有する、第26項記載のタンパク質。 28. 線虫から誘導される、第26項記載のタンパク質。 29. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第28項記載のタンパク 質。 30. AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP6[配列番号41 ]のからなる群から選択される、第Xa因子阻害活性を有する単離されたタンパ ク質。 31. 第Xa因子阻害活性を有し、および1または複数のNAPドメインを有 し、NAPドメインがそれぞれ以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A9−Cys−A10(式 II)(式中、 (a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1のアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10の各配列はそれぞれ独立して選択される数の 、独立して選択されるアミノ酸残基を有するものであり、各配列はNAPドメイ ンそれぞれが約120未満のアミノ酸残基を有するように選択される。) を有するタンパク質をコード化する、単離されたリコンビナントcDNA分子。 32. A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立して 選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する、第31項記載のcDNA分子 。 33. A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aはAla、Arg、Pr o、Lys、Ile、His、LeuおよびThrからなる群から選択され、A 3bはLys、ThrおよびArgからなる群から選択されるアミノ酸残基であ る)の配列を有する、第32項記載のcDNA分子。 34. A3がアミノ酸配列: Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ile−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lysおよび Glu−Thr−Lys からなる群から選択される、第33項記載のcDNA分子。 第3項記載のcDNA分子。 35. A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である、第31項記載の cDNA分子。 36. A7がValである、第31項記載のcDNA分子。 37. A7がIleである、第31項記載のcDNA分子。 38. A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8f −A8g[配列番号68]: (式中、(a)A8aはA8の第1アミノ酸残基である; (b)A8aおよびA8bの少なくとも1方はGluおよびAspからなる群か ら選択される;そして (c)A8cからA8gはそれぞれ独立して選択されるアミノ酸残基である) を含む、第31項記載のcDNA分子。 39. (a)A8aはGluまたはAspである、 (b)A8bは独立して選択されるアミノ酸残基である、 (c)A8cはGlyである、 (d)A8dはPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eはTyrである、 (f)A8fはArgである、 (g)A8gはAspおよびAsnから選択される、 第38項記載のcDNA分子。 40. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが以下: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第39項記載のcDNA分子。 41. (a)A8aが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (b)A8bがGluまたはAspである、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第38項記載のcDNA分子。 42. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが以下: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第41項記載のcDNA分子。 43. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが以下: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第38項記載のcDNA分子。 44. A10がアミノ酸配列: Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ば れる、第31項記載のcDNA分子。 45. A10がアミノ酸配列:Glu−Ile−Ile−His−Val[配 列番号74]を含む、第44項記載のcDNA分子。 46. NAPタンパク質AcaNAP5[配列番号3]およびAcaNAP6 [配列番号5]をコードする核酸配列と実質的に同一の核酸配列を有する、第4 5項記載のcDNA分子。 47. A10がアミノ酸配列:Asp−Ile−Ile−Met−Val[配 列番号75]を含む、第44項記載のcDNA分子。 48. A10がアミノ酸配列:Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−P ro[配列番号76]を含む、第44項記載のcDNA分子。 49. A10がアミノ酸配列:Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配 列番号77]を含む、第44項記載のcDNA分子。 50. 線虫から誘導される第31項記載のcDNA分子。 51. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第50項記載のcDNA 分子。 52. (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独 立して選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8がアミノ酸配列: Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]、および Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、および (e)A10がアミノ酸配列: Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選ば れる、 第31項記載のcDNA分子。 53. NAPタンパク質AcaNAP5[配列番号3]およびAcaNAP6 [配列番号5]をコードするcDNAと実質的に同一のcDNAから選択される 、第52項記載のcDNA分子。 54. 線虫から誘導される、第53項記載のcDNA分子。 55. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第54項記載のcDNA 分子。 56. (a)A3がアミノ酸配列: Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ile−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lysおよび Glu−Thr−Lys からなる群から選択される、 (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8が以下の A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号78]、 A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号79]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号80]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号81]、 およびA8a−A8b−Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号8 2](式中、A8aおよびA8bのうちの少なくとも1つはGluまたはAsp である)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む; (e)A9がアミノ酸残基5のアミノ酸配列である; (f)A10が以下の Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76] およびMet−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群か ら選択されるアミノ酸配列を含む、 第31項記載のcDNA分子。 57. AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP6[配列番号41 ]のからなる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のNAPドメイン をコードするcDNAから選択される、第56項記載のcDNA分子。 58. 線虫から誘導される、第56項記載のcDNA分子。 59. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第58項記載のcDNA 分子。 60. AcaNAP5[配列番号40]またはAcaNAP6[配列番号41 ]のNAPドメインと実質的に同一のNAPドメインを有するタンパク質からな る群から選択され、第Xa因子阻害活性を有するタンパク質をコード化するcD NA分子。 61. 第1項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 62. 第22項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 63. 第26項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 64. AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP6[配列番号41 ]のからなる群から選択されるタンパク質を含有する、医薬組成物。 65. 第1項記載のタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与すること を含む、血液凝」を抑制する方法。 66. 第22項記載のタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与するこ とを含む、血液凝固を抑制する方法。 67. 第26項記載のタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与するこ とを含む、血液凝固を抑制する方法。 68. AcaNAP5[配列番号40]およびAcaNAP6[配列番号41 ]のからなる群から選択されるタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与 することを含む、血液凝固を抑制する方法。 69. 2つのNAPドメインを含有する、第1項記載のタンパク質。 70. 2つのNAPドメインを含有する、第22項記載のタンパク質。 71. 2つのNAPドメインを含有する、第26項記載のタンパク質。 72. NAPドメインが以下のアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号67および156から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号157から159までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号160から173までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号174および175から選択される; (e)Cys−A6は配列番号176から178までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号179および180から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号181から183までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号184から204までから選択される) を含有する、第1項記載のタンパク質。 73. 抗凝固活性を有し、および1または複数のNAPドメインを有し、各N APドメインが以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式III) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である;および (j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列は各NAPドメインが全部で約120アミノ酸 残基を有するように選択される。) を有する、単離されたタンパク質。 74. A3がGlu−A3a−A3bの配列を有する(式中、A3aおよびA 3bは独立して選択されるアミノ酸残基である)、第73項記載のタンパク質。 75. A3がAsp−Lys−Lysである、第73項記載のタンパク質。 76. A4が全体として負電荷を有する、第73項記載のタンパク質。 77. A5がA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85](式中、A5 aからA5dは独立して選択されるアミノ酸残基である)のアミノ酸配列を有す る第73項記載のタンパク質。 78. A5aがLeuでありA5cがArgである、第77項記載のタンパク 質。 79. A7がValおよびIleからなる群から選択される、第73項記載の タンパク質。 80. A7がValである、第79項記載のタンパク質。 81. A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8f −A8g[配列番号68]:(式中、 (a)A8aはA8の最初のアミノ酸残基である、 (b)少くともA8aとA8bのうちのひとつがGluまたはAspから選択さ れる、 (c)A8cからA8gは独立して選択されるアミノ酸残基である) を含有する、第73項記載のタンパク質。 82. (a)A8aがGluまたはAspである、 (b)A8bが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第81項記載のタンパク質。 83. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gがGly−Phe−Tyr− Arg−Asn[配列番号70]である、第82項記載のタンパク質。 84. (a)A8aが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (b)A8bがGluまたはAspである、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第81項記載のタンパク質。 85. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gがGly−Phe−Tyr− Arg−Asn[配列番号70]である、第84項記載のタンパク質。 86. 線虫から誘導される第73項記載のタンパク質。 87. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モ ソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第86項記載のタンパク質 。 88. (a)A3がAsp−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独 立して選択されるアミノ酸残基である); (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85](式中、A5a からA5dまでは独立して選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する;そ して (d)A7はValおよびIleからなる群から選択される、 第73項記載のタンパク質。 89. AcaNAPc2[配列番号59]のNAPドメインと実質的に同一の アミノ酸配列を有するNAPドメインを有する第88項記載のタンパク質。 90. 線虫から誘導される、第89項記載のタンパク質。 91. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第90項記載のタンパク 質。 92. (a)A3がAsp−Lys−Lysである; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85](式中、A5a からA5dは独立して選択されるアミノ酸残基である9の配列を有する; (d)A7がValである;および (e)A8がA8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列 番号79](式中、A8aとA8bの少くとも一方はGluまたはAspである )のアミノ酸配列を有する、 第73項記載のタンパク質。 93. AcaNAPc2[配列番号59]のNAPドメインと実質的に同一の アミノ酸配列であるNAPドメインを有する、第92項記載のタンパク質。 94. 線虫から誘導される、第92項記載のタンパク質。 95. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカム 、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリゴ モソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第94項記載のタンパク 質。 96. 第VIIa因子/組織因子阻害活性を有し、AcaNAPc2[配列番 号59]のNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列であるNAPドメイン を有する単離されたタンパク質。 97. 抗凝固活性を有し、および1または複数のNAPドメインを有し、各N APドメインが以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式III) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である;および (j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列は各NAPドメインが全部で約120アミノ酸 残基を有するように選択される。) を有するタンパク質をコード化する、単離されたcDNA分子。 98. A3がGlu−A3a−A3bの配列を有する(式中、A3aおよびA 3bは独立して選択されるアミノ酸残基である)、第97項記載のcDNA分子 。 99. A3がAsp−Lys−Lysである、第97項記載のcDNA分子。 100. A4が全体として負電荷を有する、第97項記載のcDNA分子。 101. A5がA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85](式中、A 5aからA5dは独立して選択されるアミノ酸残基である)のアミノ酸配列を有 する第97項記載のcDNA分子。 102. A5aがLeuでありA5cがArgである、第101項記載のcD NA分子。 103. A7がValおよびIleからなる群から選択される、第97項記載 のcDNA分子。 104. A7がValである、第103項記載のcDNA分子。 105. A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8 f−A8g[配列番号68](式中、 (a)A8aはA8の最初のアミノ酸残基である、 (b)少くともA8aとA8bのうちのひとつがGluまたはAspから選択さ れる、 (c)A8cからA8gは独立して選択されるアミノ酸残基である) を含有する、第97項記載のcDNA分子。 106. (a)A8aがGluまたはAspである、 (b)A8bが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第105項記載のcDNA分子。 107. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gがGly−Phe−Tyr −Arg−Asn[配列番号70]である、第106項記載のcDNA分子。 108. (a)A8aが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (b)A8bがGluまたはAspである、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第105項記載のcDNA分子。 109. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gがGly−Phe−Tyr −Arg−Asn[配列番号70]である、第108項記載のcDNA分子。 110. 線虫から誘導される第97項記載のcDNA分子。 111. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第110項記載のcD NA分子。 112. (a)A3がAsp−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは 独立して選択されるアミノ酸残基である); (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85](式中、A5a からA5dまでは独立して選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する;そ して (d)A7はValおよびIleからなる群から選択される、 第97項記載のcDNA分子。 113. AcaNAPc2[配列番号59]のNAPドメインと実質的に同一 のアミノ酸配列をコード化する核酸分子を有する、第112項記載のcDNA分 子。 114. 線虫から誘導される、第112項記載のcDNA分子。 115. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第114項記載のcD NA分子。 116. (a)A3がAsp−Lys−Lysである; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がA5a−A5b−A5c−A5d[配列番号85](式中、A5a はLeuであり、A5cはArgであり、A5bとA5dは独立して選択される アミノ酸残基である); (d)A7がValである;および (e)A8がA8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列 番号79](式中、A8aとA8bの少くとも一方はGluまたはAspである )のアミノ酸配列を有する、 第97項記載のcDNA分子。 117. AcaNAPc2[配列番号59]と実質的に同一のアミノ酸配列を コードするヌクレオチド配列を有する、第116項記載のcDNA分子。 118. 線虫から誘導される、第116項記載のcDNA分子。 119. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第118項記載のcD NA分子。 120. 第VIIa因子/組織因子阻害活性を有し、AcaNAPc2[配列 番号59]のNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列であるNAPドメイ ンを有するタンパク質をコード化する単離されたcDNA分子。 121. 第73項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 122. 第88項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 123. 第92項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 124. AcaNAPc2[配列番号59]タンパク質を含有する、医薬組成 物。 125. 第73項記載のタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与する ことを含む、血液凝固を抑制する方法。 126. 第88項記載のタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与する ことを含む、血液凝固を抑制する方法。 127. 第92項記載のタンパク質を薬学上許容される担体とともに投与する ことを含む、血液凝固を抑制する方法。 128. AcaNAPc2[配列番号59]タンパク質を薬学上許容される担 体とともに投与することを含む、血液凝固を抑制する方法。 129. 2つのNAPドメインを含有する、第73項記載のタンパク質。 130. 2つのNAPドメインを含有する、第88項記載のタンパク質。 131. 2つのNAPドメインを含有する、第92項記載のタンパク質。 132. 抗凝固活性を有するタンパク質であって、第VIIa因子/組織因子 複合体の触媒活性を第Xa因子または触媒的に不活性な第Xa因子誘導体の存在 下において特異的に阻害するが、組織因子非存在下では第VIIa因子の活性を 特異的に阻害せず、またプロトロンビナーゼ活性を特異的に阻害しない、単離さ れたタンパク質。 133. タンパク質がAcaNAP2[配列番号59]である、第132項記 載のタンパク質。 134. 抗凝固活性を有するタンパク質であって、第VIIa因子/組織因子 複合体の触媒活性を第Xa因子または触媒的に不活性な第Xa因子の存在下にお いて特異的に阻害し、組織因子非存在下では第VIIa因子の活性を特異的に阻 害せず、またプロトロンビナーゼ活性を特異的に阻害しないタンパク質をコード 化する単離されたリコンビナントcDNA分子。 135. cDNA分子がタンパク質がAcaNAPc2[配列番号59]をコ ード化するものである、第134項記載のcDNA分子。 136. AcaNAPc2[配列番号19]と実質的に同一のヌクレオチド配 列を有する単離されたcDNA分子。 137. 実質的にAcaNAPc2[配列番号59]と同一のアミノ酸配列を 有する、タンパク質。 138. NAPドメインがアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号83および205から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号206から208までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号209から222までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号223および224から選択される; (e)Cys−A6は配列番号225から227までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号228および229から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号230から232までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号233から253までから選択される) を有する、第1項記載のタンパク質。 139. セリンプロテアーゼ阻害活性を有し、および1または複数のNAPド メインを有し、各NAPドメインが以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式IV) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基10から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列は各NAPドメインが全部で約120未満のア ミノ酸残基を有するように選択される。) を有する、単離されたタンパク質。 140. A3がGlu−A3a−A3bの配列を有する(式中、A3aおよび A3bは独立して選択されるアミノ酸残基である)、第139項記載のタンパク 質。 141. A3がGlu−Pro−Lysである、第139項記載のタンパク質 。 142. A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である、第139項記 載のタンパク質。 143. A5がA5a−A5b−A5c(式中、A5aからA5cは独立して 選択されるアミノ酸残基である)のアミノ酸配列を有する第139項記載のタン パク質。 144. A5aがThrでありA5cがAsnである、第143項記載のタン パク質。 145. A5がThr−Leu−AsnおよびThr−Met−Asnからな る群から選択される、第144項記載のタンパク質。 146. A7がGlnである、第139項記載のタンパク質。 147. 線虫から誘導される、第139項記載のタンパク質。 148. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第147項記載のタン パク質。 149. (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは 独立して選択されるアミノ酸残基である)である; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がA5a−A5b−A5cの配列を有するアミノ酸配列である(式中 、A5aからA5cまでは独立して選択されるアミノ酸残基である);そして (d)A7がGlnである、 第139項記載のタンパク質。 150. HpoNAP5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号61 ]からなる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列であ るNAPドメインを含有する、第149項記載のタンパク質。 151. 線虫から誘導される、第149項記載のタンパク質。 152. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第151項記載のタン パク質。 153. (a)A3がGlu−Pro−Lysである; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がThr−Leu−AsnおよびThr−Met−Asnから選択さ れる; (d)A7がGlnである 第139項記載のタンパク質。 154. HpoNAP5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号61 ]からなる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列であ るNAPドメインを含有する、第153項記載のタンパク質。 155. 線虫から誘導される、第154項記載のタンパク質。 156. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第155項記載のタン パク質。 157. セリンプロテアーゼ阻害活性を有し、HpoNAP5[配列番号60 ]およびNamNAP[配列番号61]からなる群から選択されるNAPドメイ ンと実質的に同一のアミノ酸配列であるNAPドメインを含有する単離されたタ ンパク質。 158. セリンプロテアーゼ阻害活性を有し、および1または複数のNAPド メインを有し、各NAPドメインが以下の配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式IV) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基10から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列は各NAPドメインが全部で約120未満のア ミノ酸残基を有するように選択される。) を有するタンパク質をコード化する単離されたリコンビナントcDNA分子。 159. A3がGlu−A3a−A3bの配列を有する(式中、A3aおよび A3bは独立して選択されるアミノ酸残基である)、第158項記載のcDNA 分子。 160. A3がGlu−Pro−Lysである、第158項記載のcDNA分 子。 161. A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である、第158項記 載のcDNA分子。 162. A5がA5a−A5b−A5c(式中、A5aからA5cは独立して 選択されるアミノ酸残基である)のアミノ酸配列を有する第158項記載のcD NA分子。 163. A5aがThrでありA5cがAsnである、第162項記載のcD NA分子。 164. A5がThr−Leu−AsnおよびThr−Met−Asnからな る群から選択される、第163項記載のcDNA分子。 165. A7がGlnである、第158項記載のcDNA分子。 166. 線虫から誘導される、第158項記載のcDNA分子。 167. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第166項記載のcD NA分子。 168. (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは 独立して選択されるアミノ酸残基である)である; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がA5a−A5b−A5cの配列を有するアミノ酸配列である(式中 、A5aからA5cまでは独立して選択されるアミノ酸残基である);そして (d)A7がGlnである 第158項記載のcDNA分子。 169. HpoNAP5[配列番号14]およびNamNAP[配列番号39 ]をコードするcDNAから選択される配列と実質的に同一のヌクレオチド配列 を有する、第168項記載のcDNA分子。 170. 線虫から誘導される、第168項記載のcDNA分子。 171. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第170項記載のcD NA分子。 172. (a)A3がGlu−Pro−Lysである; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A5がThr−Leu−AsnおよびThr−Met−Asnから選択さ れる; (d)A7がGlnである 第158項記載のcDNA分子。 173. HpoNAP5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号61 ]のNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列であるNAPドメインを含有 するタンパク質をコードするcDNA分子から選択される、第172項記載のc DNA分子。 174. 線虫から誘導される、第172項記載のcDNA分子。 175. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第174項記載のcD NA分子。 176. セリンプロテアーゼ阻害活性を有し、HpoNAP5[配列番号60 ]およびNamNAP[配列番号61]からなる群から選択されるNAPドメイ ンと実質的に同一のアミノ酸配列であるNAPドメインを含有するタンパク質を コード化するcDNA分子。 177. 第139項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 178. 第149項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 179. 第153項記載のタンパク質を含有する、医薬組成物。 180. HpoNAP5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号61 ] からなる群から選択されるタンパク質を含有する、医薬組成物。 181. 第139項記載のタンパク質を、薬学上許容され得る担体と共に投与 することを含む、血液凝固を抑制する方法。 182. 第149項記載のタンパク質を薬学上許容され得る担体と共に投与す ることを含む、血液凝固を抑制する方法。 183. 第153項記載のタンパク質を薬学上許容され得る担体と共に投与す ることを含む、血液凝固を抑制する方法。 184. HpoNAP5[配列番号60]およびNamNAP[配列番号61 ]からなる群から選択されるタンパク質を投与することを含む、血液凝固を抑制 する方法。 185. タンパク質が2つのNAPドメインを有する、第139項記載のタン パク質。 186. タンパク質が2つのNAPドメインを有する、第149項記載のタン パク質。 187. タンパク質が2つのNAPドメインを有する、第153項記載のタン パク質。 188. NAPドメインが以下のアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号86および254から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号255から257までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号258から271までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号272および273から選択される; (e)Cys−A6は配列番号274から276までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号277および279から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号280から282までから選択される;および( h )Cys−A10は配列番号283から307までから選択される) を含有する、第139項記載のタンパク質。 189. 抗凝固活性を有し、1または複数のNAPドメインを有し、各NAP ドメインが配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式V) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列はNAPドメインが全部で約120未満のアミ ノ酸残基を有するように選択される。) を含有する、単離されたタンパク質。 190. A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立し て選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する、第189項記載のタンパク 質。 191. A3がGlu−A3a−A3bの配列を有し、A3aがAla、Ar g、pro、Lys、Ile、His、Leu、およびThrからなる群より選 択され、A3bはLys、ThrおよびArgからなる群から選択される、第1 89項記載のタンパク質。 192. A3が Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ilr−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lys、および Gln−Thr−Lys からなる群から選択される、第191項記載のタンパク質。 193. A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である、第189項記 載のタンパク質。 194. A7がValである第189項記載のタンパク質。 195. A7がIleである第189項記載のタンパク質。 196. A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8 f−A8g[配列番号68](式中、 (a)A8aはA8の最初のアミノ酸残基である、 (b)少くともA8aとA8bのうちのひとつがGluおよびAspからなる群 から選択される、 (c)A8cからA8gは独立して選択されるアミノ酸残基である) であるものを含む、第189項記載のタンパク質。 197. (a)A8aがGluまたはAspである、 (b)A8bが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第196項記載のタンパク質。 198. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第197項記載のタンパク質。 199. (a)A8aが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (b)A8bがGluまたはAspである、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第196項記載のタンパク質。 200. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第199項記載のタンパク質。 201. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第196項記載のタンパク質。 202. A10が Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選択 されるアミノ酸配列を有する、第189項記載のタンパク質。 203. A10がアミノ酸配列Glu−Ile−Ile−His−Val[配 列番号74]を含有する、第202項記載のタンパク質。 204. AcaNAP5[配列番号40]またはAcaNAP6[配列番号4 1]のNAPドメインと実質的に同一のアミノ酸配列のNAPドメインを有する 、第203項記載のタンパク質。 205. A10がアミノ酸配列Asp−Ile−Ile−Met−Val[配 列番号75]を含有する、第202項記載のタンパク質。 206. AcaNAP48[配列番号42]のNAPドメインと実質的に同一 のアミノ酸配列のNAPドメインを有する、第205項記載のタンパク質。 207. A10がアミノ酸配列Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−P ro[配列番号76]を含有する、第202項記載のタンパク質。 208. AcaNAP23[配列番号43]、AcaNAP24[配列番号4 4]、AcaNAP25[配列番号45]、AcaNAP44[配列番号46] 、AcaNAP31[配列番号47]、AceNAP4[配列番号48または4 9]のNAPドメインからなる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一 のアミノ酸配列を有する、第207項記載のタンパク質。 209. A10がアミノ酸配列Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配 列番号77]を含有する、第202項記載のタンパク質。 210. AcaNAP45[配列番号50または53]、AcaNAP47[ 配列番号51または54]、AduNAP7[配列番号52または56]、Ad uNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番号57]およびAceN AP7[配列番号58]のNAPドメインからなる群から選択されるNAPドメ インと実質的に同一であるアミノ酸配列のNAPドメインを有する、第209項 記載のタンパク質。 211. 線虫から誘導される、第189項記載のタンパク質。 212. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第211項記載のタン パク質。 213. (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは 独立して選択されるアミノ酸残基である)である; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValおよびIleからなる群から選択される; (d)A8が Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73] からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む;および (e)A10が Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、 および[Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77] からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、 第189項記載のタンパク質。 214. AcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41] 、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、A caNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、Aca NAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、AceNA P4[配列番号48または49]、AcaNAP45[配列番号50または53 ]、AcaNAP47[配列番号51または54]、AduNAP7[配列番号 52または56]、AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番 号57]およびAceNAP7[配列番号58]からなる群から選択されるNA Pドメインと実質的に同一のNAPドメインを有する第213項記載のタンパク 質。 215. 線虫から誘導される、第213項記載のタンパク質。 216. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第215項記載のタン パク質。 217. (a)A3が Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ile−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lysおよび Glu−Thr−Lysからなる群から選択される; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8が A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号78]、 A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号79]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号80]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号81]お よびA8a−A8b−Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号82 ](式中、A8aおよびA8bはGluまたはAspである) からなる群から選択されるアミノ酸配列を含有する; (e)A9が5つのアミノ酸残基からなるアミノ酸配列である;および (f)A10が Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77] からなる群から選択されるアミノ酸配列を含有する、 第189項記載のタンパク質。 218. AcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41] 、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、A caNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、Aca NAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、AceNA P4[配列番号48または49]、AcaNAP45[配列番号50または53 ]、AcaNAP47[配列番号51または54]、AduNAP7[配列番号 52または56]、AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番 号57]およびAceNAP7[配列番号58]からなる群から選択されるNA Pドメインと実質的に同一のNAPドメインを有する第217項記載のタンパク 質。 219. 線虫から誘導される、第217項記載のタンパク質。 220. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第219項記載のタン パク質。 221. AcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41] 、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、A caNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、Aca NAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、AceNA P4[配列番号62]、AcaNAP45[配列番号63]、AcaNAP47 [配列番号64]、AduNAP7[配列番号65]、AduNAP4[配列番 号55]、AceNAP5[配列番号57]、AduNAP4[配列番号55] 、AceNAP5[配列番号57]およびAceNAP7[配列番号58]から なる群から選択される、抗凝固活性を有する単離されたタンパク質。 222. 抗凝固活性を有し、1または複数のNAPドメインを有し、各NAP ドメインが配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10(式V) (式中、(a)A1はアミノ酸残基7から8のアミノ酸配列である; (b)A2はアミノ酸配列である; (c)A3はアミノ酸残基3のアミノ酸配列である; (d)A4はアミノ酸配列である; (e)A5はアミノ酸残基3から4のアミノ酸配列である; (f)A6はアミノ酸配列である; (g)A7は1つのアミノ酸である; (h)A8はアミノ酸残基11から12のアミノ酸配列である; (i)A9はアミノ酸残基5から7のアミノ酸配列である; および(j)A10はアミノ酸配列である; 上記A2、A4、A6およびA10は独立して選択される数の、独立して選択さ れるアミノ酸残基を有し、各配列はNAPドメインが全部で約120未満のアミ ノ酸残基を有するように選択される。) を含有するタンパク質をコード化する単離されたリコンビナントcDNA分子。 223. A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは独立し て選択されるアミノ酸残基である)の配列を有する、第222項記載のcDNA 分子。 224. A3がGlu−A3a−A3bの配列を有し、A3aがAla、Ar g、Pro、Lys、Ile、His、Leu、およびThrからなる群より選 択され、A3bはLys、ThrおよびArgからなる群から選択される、第2 23項記載のcDNA分子。 225. A3が Glu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ilr−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lys、および Gln−Thr−Lys からなる群から選択される、第224項記載のcDNA分子。 226. A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である、第222項記 載のcDNA分子。 227. A7がValである第222項記載のcDNA分子。 228. A7がIleである第222項記載のcDNA分子。 229. A8がアミノ酸配列A8a−A8b−A8c−A8d−A8e−A8 f−A8g[配列番号68](式中、 (a)A8aはA8の最初のアミノ酸残基である、 (b)少くともA8aとA8bのうちのひとつがGluおよびAspからなる群 から選択される、 (c)A8cからA8gは独立して選択されるアミノ酸残基である) であるものを含む、第222項記載のcDNA分子。 230. (a)A8aがGluまたはAspである、 (b)A8bが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第229項記載のcDNA分子。 231. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第230項記載のcDNA分子。 232. (a)A8aが独立して選択されるアミノ酸残基である、 (b)A8bがGluまたはAspである、 (c)A8cがGlyである、 (d)A8dがPhe、TyrおよびLeuからなる群から選択される、 (e)A8eがTyrである、 (f)A8fがArgである、 (g)A8gがAspおよびAsnから選択される、 第229項記載のcDNA分子。 233. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第232項記載のcDNA分子。 234. A8c−A8d−A8e−A8f−A8gが、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73]からなる群から選択 される、第229項記載のcDNA分子。 235. A10が Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77]からなる群から選択 されるアミノ酸配列を有する、第222項記載のcDNA分子。 236. A10がアミノ酸配列Glu−Ile−Ile−His−Val[配 列番号74]を含有する、第235項記載のcDNA分子。 237. AcaNAP5[配列番号3]またはAcaNAP6[配列番号5] をコードするcDNA分子と実質的に同一のヌクレオチド配列を有する、第23 6項記載のcDNA分子。 238. A10がアミノ酸配列Asp−Ile−Ile−Met−Val[配 列番号75]を含有する、第236項記載のcDNA分子。 239. AcaNAP48[配列番号38]をコードするcDNAと実質的に 同一のヌクレオチド配列を有する、第238項記載のcDNA分子。 240. A10がアミノ酸配列Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−P ro[配列番号76]を含有する、第235項記載のcDNA分子。 241. AcaNAP23[配列番号31]、AcaNAP24[配列番号3 2]、AcaNAP25[配列番号33]、AcaNAP44[配列番号35] 、AcaNAP31[配列番号34]、およびAceNAP4[配列番号9]を コードするcDNAからなる群から選択されるcDNAと実質的に同一のヌクレ オチド配列を有する、第240項記載のcDNA分子。 242 A10がアミノ酸配列Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配 列番号77]を含有する、第235項記載のcDNA分子。 243. AcaNAP45[配列番号36]、AcaNAP47[配列番号3 7]、AduNAP7[配列番号13]、AduNAP4[配列番号12]、A ceNAP5[配列番号10]およびAceNAP7[配列番号11]をコード するcDNAからなる群から選択されるcDNAと実質的に同一のヌクレオチド 配列を有する、第242項記載のcDNA分子。 244. 線虫から誘導される、第222項記載のcDNA分子。 245. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第244項記載のcD NA分子。 246. (a)A3がGlu−A3a−A3b(式中、A3aおよびA3bは 独立して選択されるアミノ酸残基である)である; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValおよびIleからなる群から選択される; (d)A8が Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号69]、 Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号70]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号71]、 Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号72]および、 Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号73] からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む;および (e)A10が Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、 およびMet−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77] からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、 第222項記載のcDNA分子。 247. AcaNAP5[配列番号3]、AcaNAP6[配列番号5]、A caNAP48[配列番号38]、AcaNAP23[配列番号31]、Aca NAP24[配列番号32]、AcaNAP25[配列番号33]、AcaNA P44[配列番号35]、AcaNAP31[配列番号34]、AceNAP4 [配列番号9]、AcaNAP45[配列番号36]、AcaNAP47[配列 番号37]、AduNAP7[配列番号13]、AduNAP4[配列番号12 ]、AceNAP5[配列番号10]およびAceNAP7[配列番号11]を コードするcDNAからなる群から選択されるcDNAと実質的に同一のヌクレ オチド配列を有する第246項記載のcDNA分子。 248. 線虫から誘導される、第246項記載のcDNA分子。 249. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第248項記載のcD NA分子。 250. (a)A3がGlu−Ala−Lys、 Glu−Arg−Lys、 Glu−Pro−Lys、 Glu−Lys−Lys、 Glu−Ile−Thr、 Glu−His−Arg、 Glu−Leu−Lysおよび Glu−Thr−Lysからなる群から選択される; (b)A4が全体として負電荷を有するアミノ酸配列である; (c)A7がValまたはIleである; (d)A8が A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asp[配列番号78]、 A8a−A8b−Gly−Phe−Tyr−Arg−Asn[配列番号79]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asp[配列番号80]、 A8a−A8b−Gly−Tyr−Tyr−Arg−Asn[配列番号81]お よびA8a−A8b−Gly−Leu−Tyr−Arg−Asp[配列番号82 ](式中、A8aおよびA8bはGluまたはAspである) からなる群から選択されるアミノ酸配列を含有する; (e)A9が5つのアミノ酸残基からなるアミノ酸配列である;および (f)A10が Glu−Ile−Ile−His−Val[配列番号74]、 Asp−Ile−Ile−Met−Val[配列番号75]、 Phe−Ile−Thr−Phe−Ala−Pro[配列番号76]、および Met−Glu−Ile−Ile−Thr[配列番号77] からなる群から選択されるアミノ酸配列を含有する、 第222項記載のcDNA分子。 251. AcaNAP5[配列番号3]、AcaNAP6[配列番号5]、A caNAP48[配列番号38]、AcaNAP23[配列番号31]、Aca NAP24[配列番号32]、AcaNAP25[配列番号33]、AcaNA P44[配列番号35]、AcaNAP31[配列番号34]、AceNAP4 [配列番号9]、AcaNAP45[配列番号36]、AcaNAP47[配列 番号37]、AduNAP7[配列番号13]、AduNAP4[配列番号12] 、AceNAP5[配列番号10]およびAceNAP7[配列番号11]をコ ードするcDNAからなる群から選択されるcDNAと実質的に同一のヌクレオ チド配列を有する第250項記載のcDNA分子。 252. 線虫から誘導される、第250項記載のcDNA分子。 253. 線虫がアンサイロストマ カニナム、アンサイロストマ セイラニカ ム、アンサイロストマ デュオデナール、ネカトール アメリカヌスおよびヘリ ゴモソモイデス ポリギルスからなる群から選択される、第252項記載のcD NA分子。 254. 抗凝固活性を有するタンパク質を有するタンパク質をコード化する、 AcaNAP5[配列番号3]、AcaNAP6[配列番号5]、AcaNAP 48[配列番号38]、AcaNAP23[配列番号31]、AcaNAP24 [配列番号32]、AcaNAP25[配列番号33]、AcaNAP44[配 列番号35]、AcaNAP31[配列番号34]、AceNAP4[配列番号 9]、AcaNAP45[配列番号36]、AcaNAP47[配列番号37] 、AduNAP7[配列番号13]、AduNAP4[配列番号12]、Ace NAP5[配列番号10]、およびAceNAP7[配列番号11]をコードす るcDNAからなる群から選択されるcDNAと実質的に同一のヌクレオチド配 列を有するcDNA分子。 255. 第189項のタンパク質を含有する、医薬組成物。 256. 第213項のタンパク質を含有する、医薬組成物。 257. 第217項のタンパク質を含有する、医薬組成物。 258. AcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41] 、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、A caNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、Aca NAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、AceNA P4[配列番号48または49]、AcaNAP45[配列番号50または53 ]、AcaNAP47[配列番号51または54]、AduNAP7[配列番号 65]、AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番号57]、 AduNAP7[配列番号52または56]、AduNAP4[配列番号55] 、AceNAP5[配列番号57]およびAceNAP7[配列番号58]から なる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のNAPドメインを有する タンパク質を含有する、医薬組成物。 259. 第189項記載のタンパク質を薬学上許容される担体と共に投与する ことを含む、血液凝固抑制方法。 260. 第213項記載のタンパク質を薬学上許容される担体と共に投与する ことを含む、血液凝固抑制方法。 261. 第217項記載のタンパク質を薬学上許容される担体と共に投与する ことを含む、血液凝固抑制方法。 262. AcaNAP5[配列番号40]、AcaNAP6[配列番号41] 、AcaNAP48[配列番号42]、AcaNAP23[配列番号43]、A caNAP24[配列番号44]、AcaNAP25[配列番号45]、Aca NAP44[配列番号46]、AcaNAP31[配列番号47]、AceNA P4[配列番号48または49]、AcaNAP45[配列番号50または53 ]、AcaNAP47[配列番号51または54]、AduNAP7[配列番号 65]、AduNAP4[配列番号55]、AceNAP5[配列番号57]、 AduNAP7[配列番号52または56]、AduNAP4[配列番号55] 、AceNAP5[配列番号57]およびAceNAP7[配列番号58]から なる群から選択されるNAPドメインと実質的に同一のNAPドメインを有する タンパク 質を投与することを含む、血液凝固抑制方法。 263. 2つのNAPドメインを有する、第189項記載のタンパク質。 264. 2つのNAPドメインを有する、第213項記載のタンパク質。 265. 2つのNAPドメインを有する、第217項記載のタンパク質。 266. AceNAP4[配列番号62]、AcaNAP45[配列番号63] 、AcaNAP47[配列番号64]および、AduNAP7[配列番号65] からなる群から選択される、2つのNAPドメインを有するタンパク質。 267. NAPドメインがアミノ酸配列: Cys−A1−Cys−A2−Cys−A3−Cys−A4−Cys−A5−C ys−A6−Cys−A7−Cys−A8−Cys−A10 (式中、(a)Cys−A1は配列番号87および308から選択される; (b)Cys−A2−Cysは配列番号309から311までから選択される; (c)A3−Cys−A4は配列番号312から325までから選択される;( d)Cys−A5は配列番号326および327から選択される; (e)Cys−A6は配列番号328から330までから選択される; (f)Cys−A7−Cys−A8は配列番号331および332から選択され る; (g)Cys−A9は配列番号333から335までから選択される;および( h)Cys−A10は配列番号336から356までから選択される。 を含有している、第1項記載のタンパク質。 268. 以下の配列: YG109: TCAGACATGT-ATAATCTCAT-GTTGG[配列番号88]、および YG103: AAGGCATACC-CGGAGTGTGG-TG[配列番号89] からなる群から選択されるヌクレオチド配列を有する、オリゴヌクレオチド。 269. 以下の配列: NAP−1: AAR-CCN-TGY-GAR-MGG-AAR-TGY[配列番号90]、および NAP−4.RC: TW-RWA-NCC-NTC-YTT-RCA-NAC-RCA[配列番号91] からなる群から選択されるヌクレオチド配列を有する、オリゴヌクレオチド。
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