JPS61282085A - ビフエニル代謝機能を備えた外来遺伝子bph A−C及びこれを保有する新規な微生物 - Google Patents

ビフエニル代謝機能を備えた外来遺伝子bph A−C及びこれを保有する新規な微生物

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JPS61282085A
JPS61282085A JP60124555A JP12455585A JPS61282085A JP S61282085 A JPS61282085 A JP S61282085A JP 60124555 A JP60124555 A JP 60124555A JP 12455585 A JP12455585 A JP 12455585A JP S61282085 A JPS61282085 A JP S61282085A
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Kensuke Furukawa
謙介 古川
Toshitsugu Miyazaki
寿次 宮崎
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National Institute of Advanced Industrial Science and Technology AIST
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Agency of Industrial Science and Technology
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 (イ)本発明はビフェニル代謝機能を有するシュウトモ
ナス・シュウ、本遺伝子は、例えば増殖能の高いシュウ
トモナス・プチダ(Pseudomonas  put
ida)やシュウトモナス・エルギノーザ(Pseud
omonas  aeruginosa)等に組換え形
質転換させた微生物を用いて化合物■2−ハイドロキシ
−6−オキソ−6−フェニルヘキサ−2,4−ジェノイ
ックアシッド及びその誘導体を製造せしめ、病源菌とし
て知られている例えばスタフィロコッカス属などのグラ
ム陽性菌及び大腸菌などのダラム陰性菌に対する殺菌剤
や生理活性物質の中間体としての生産に寄与できること
が期待されるものである。
(ロ)従来の技術 従来、ビフェニルを資化する細菌については数種類分離
され、その代謝様式も検討されているが、遺伝子単位で
検討された例は知られていない。
また、ビフェニルの特定の中間代謝物については代謝様
式を含めて遺伝子単位で検討された例はない。
そこで、本発明者らはビフェニル代謝機構に関連する遺
伝子について研究を進めた結果、シュウドモナス・シュ
ウドアルカリゲネス由来の遺伝子bph  A−Cをと
り出すことに成功し、本発明を完成するに至った。
(ハ)発明の構成 KF707)  (FERM  P−8297)を例示
できる。
なお、本菌株の菌学的性質は以下のとおりである。
〔菌学的性質〕
ダラム       陰性 桿菌       0.7X1.5〜2.0μ極鞭毛 
      1本 色素産生      なし オキシダーゼ   陽性 スターチ加水分解  陰性 41℃での生育   陽性 最適生育温度    35℃ 資化性        グルコース、こはく酸、乳酸、
ピルビン酸以上の菌学的性質からバージイーズ マニュ
アル オブ システィなお、本菌株は、新規な外来遺伝
子bph  A−Cを保有する点で新規な微性物である
本菌株からの該遺伝子の切出しは、前記菌株を例えばL
培地(バクトリプトン10g、イーストエキス5g、食
塩5g、蒸溜水it)に−晩増殖させ、リゾチーム−3
DS法により溶菌し染色体DNAを調製し、次いで、染
色体DNA (1μg)を制限酵素XhoTで切断する
ことにより、本遺伝子を得ることができる。
本遺伝子の各種制限酵素による切断数は第1表に示すと
おりである。
(>゛AT−酪臼) 第1表 また、本遺伝子の断片の制限酵素地図は第1図に示され
るとおりである。
次に、本遺伝子のビフェニル代謝様式と遺伝子群との関
係は次に示すとおりである。
!        ■        ■      
  ■P  iP& 八    kk6    611
(?上記反応式において、A、B、Cは反応を司る酵素
を示し、Aはビフェニル オキシゲナーゼ、Bはジヒド
ロキシジオール デヒドロゲナー九〇はフェニルカテコ
ール オキシゲナーゼを各々示している。
また、これらの酵素に対応する遺伝子として、bphA
、bphB。
bphCが存在しこれらの遺伝子はオペロンを形成して
いる。またPはプロモーターを示す。
本遺伝子の利用にあたっては、例えば、大腸菌エシェリ
ヒア・コリ’KF637(Escherichia  
coli  KF637)’(FERM  P−829
6)由来のpKF330を常法により該菌株より取り出
した後、制限酵素Xholで切断後T4リガーゼで結合
さく1− マイ°シン耐性遺伝子部位にはXholなどの挿入失活
部位ををしており、またカナマイシンのプロモーターを
利用できる。
次に宿主株として増殖能の高いシュウトモナス・プチダ
KF107(Psaudomonasputida  
KF107)(FERM  P−8294)やシュウト
モナス・エルギノーザKF204 (Pseudomo
nas  aeruginosa  KF204)など
を例示できる。形質転換方法及び形質転換体の選択にあ
たっては、該菌株等を対数増殖期(5X10”  細胞
/ m I! )まで培養し、集菌、洗浄後、冷バッフ
ァー (10mM  MOPS−10mM  RbCf
−100mM  MgC1z 、pH7,0)に懸濁し
、次いで遠心後、冷バッフy−II(100mM  M
OPS−10mM  RbC1−100mM  CaC
1z 、pH6,5)に再懸濁し0℃、30分インキエ
ベートする。次に遠心後、菌株を1/10量の冷バッフ
ァー■に懸濁する。この0. 2mj!コンピテントセ
ルに組換えプラスミド(0,5、′− 地上でpKF330及び組換えプラスミドを保有する形
質転換体を1次スクリーニングする。ビフェニル遺伝子
を保存する目的とする形質i喚体(組換え微生物)は2
.3−ジヒドロキシビフェニル溶液(’4mg/ml)
を−次スクリーニングで生じたコロニーに噴霧すること
により黄変するコロニーを選択する。ビフェニル代謝遺
伝子を含むクローンはビフェニル及びビフェニル関連化
合物より黄色物質を蓄積させ、黄色物質を酸性下(pH
1〜2)で酢酸エチルで抽出後、トリチルシリル化して
GC−MSによる分析を行いこれが化合物■(図4)及
びその誘導体であることを確認する。
(ニ)実施例 実施例1 ビフェニル資化性菌シュウトモナス・シェウドアルカリ
ゲネスKF707株(FERM  P−8297)をL
培地で一晩培養し、集菌、洗浄後、0.1Mトリス(p
H7,9) 、1mM  EDTA  バッファーに懸
濁する0次にリゾチームを最P−濃度2μg / m 
12になるよう(−加え、室温で5分間インキュベート
し、10%SDSを50μ417 m lになるように
加え溶菌した。
次いでプロナーゼ、RNa s e処理をしたのちフェ
ノール抽出を行い、エーテルでフェノールを除去した。
このようにして調製したDNAは10mMトリス、1m
M  EDTA  バッファーに透析した。
一方、プラスミドpKF330を有するエシェリヒア・
コリKF6した。次いで組換えプラスミドを宿主株であ
るシュウトモナス・エルギノーザKF204  (FE
RM  P−8295)に導入した。すなわち、対数増
殖期(約4X10’セル/ m j! )のKF204
株を集菌し、等量の冷バッフy−(10mM  MOP
S、10mM  RbCj!。
100mM  MgC1t 、pH7,0)で洗浄後、
冷バッフy−11(100mM  MOPS、10mM
  RbCj!、100mM  CaC1z。
pH6,5)に再懸濁し、0℃にて30分間放置した。
次に遠心後、1/10量の冷バッファー■に再懸濁し、
その0.2ml細胞懸濁液と精製したpMFBl(0,
5μg)と0℃、1時間インキュベートした。42℃で
2分間、ヒートショックした後、3mlのし培地を加え
30°Cで3時間培養した。ビフェニル代謝遺伝子群(
bph  A−C)の組込まれたpMFBlを保有する
形質転換体はストレプトマイシン(200μg/mf)
を含むL−寒天培地で2,3−ジヒドロキシビフェニル
溶液(1mg/rrl )を噴霧して黄色となすると7
.9kbのbph  A−C遺伝子が切り出された0本
遺伝子は第1図に示す制限酵素切断点を有していた。
・、) 実施例2 ’+1 、′実施例1で調製した組換えプラスミドpMFB1を
用いて、シュウ“ド゛モナス・プチダKF107 (F
ERM  P−8294)を実施例1の方法によって形
質転換した。その結果、lXl0’セル/μgDN炭素
源としてこはく酸(1mg/mj! )i含むBSM寒
天培地に塗布(tFIl) Lヒフェニル粉末をペトリ
皿のふたにおし〕でビニールテープでシールした。KF
257株の増殖とともにビフェニル蒸気をとり込んだ菌
体は、ビフェニルを化合物■に変化せしめ、培地は鮮や
かに黄変した。
上記の反応はpMFBlを保有しない宿主株シュウトモ
ナス・エルギノーザKF204 (FERM  P−8
295>では全く認められなかった。以上の反応はpM
FBlを保存するシュウトモナス・プチダKF138に
おいても同様に認められた。
なお、宿主株及びpMFBlを保有するKF257株に
ついてダラム染色        陰性 鞭毛           1本 、細胞の大きさ       0.5−0.7X2.0
最適生育塩度       37℃ 青色色素(ビオシアニン) 生成 オキシダーゼ       + GC含量         67% 以上の性質等によりKF257株はシュウトモナス・エ
ルギノーザであることを確認した。
また、宿主株及びpMFBTを保有するKF138株に
ついてダラム染色      陰性 鞭毛         〉1 ビオシアニン     生成せず 螢光色素       生成 至適生育温度     25−30℃ オキシダーゼ     + GCC含量       60% でんぷん加水分解   十 以上の性質等によりKF138株はシュウトモナス・プ
チダであるハイドロキシ−6−オキソ−6−フェニルヘ
キサ−2,4−ジェノイックアシッド及びその誘導体を
安価に製造することが可能となる。
【図面の簡単な説明】
第1図は外来遺伝子bph  A−Cの制限酵素切断地
図を示す。 第2図はエシエリヒヤ・コリ由来のプラスミドpKF3
30の構造を示す。 第3図は組換えプラスミドpMFB1の作製手順とその
構造を示す。 特許出願人  工業技術院長     等々力 達q)
[6°L   −一一一一一一一一−−−Pst工 EcoR工 Sac工

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1)シュウドモナス・シュウドアルカリゲネス由来のビ
    フェニル代謝機能を有する外来遺伝子であって、分子量
    が7.9キロベースであり、次の制限酵素において塩基
    の切断数が特徴づけられる外来遺伝子 Pst I ,6個 BglII,1 Xho I  1 EcoR I ,2 BamH I ,1 Xba I  0 Sma I ,1 Sac I ,1 HindIII 0 Sal I ,0 Hpa I ,0 2)シュウドモナス・シュウドアルカリゲネス由来のビ
    フェニル代謝機能を有する外来遺伝子であって、分子量
    が7.9キロベースであり、次の制限酵素において塩基
    の切断数が特徴づけられる外来遺伝子 Pst I ,6個 BglII,1 Xho I  1 EcoR I ,2 BamH I ,1 Xba I  0 Sma I ,1 Sac I ,1 HindIII 0 Sal I ,0 Hpa I ,0 を保有する新規な微生物シュウドモナス・シュウドアル
    カリゲネスKF707株。
JP60124555A 1985-06-08 1985-06-08 ビフエニル代謝機能を備えた外来遺伝子bph A−C及びこれを保有する新規な微生物 Granted JPS61282085A (ja)

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