JPS6237738A - 化学反応情報の記録・検索方法 - Google Patents
化学反応情報の記録・検索方法Info
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- JPS6237738A JPS6237738A JP60177345A JP17734585A JPS6237738A JP S6237738 A JPS6237738 A JP S6237738A JP 60177345 A JP60177345 A JP 60177345A JP 17734585 A JP17734585 A JP 17734585A JP S6237738 A JPS6237738 A JP S6237738A
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Landscapes
- Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
[発明の分野]
本発明は、化学反応情報の記録保存方法に関するもので
あり、さらに詳しくは、化学反応に関テする物質の構造
変化についての情報の記録保存方法に関するものである
。
あり、さらに詳しくは、化学反応に関テする物質の構造
変化についての情報の記録保存方法に関するものである
。
[発明の技術的背景]
近年において、コンピュータの発達に伴ない。
化学物質、特に有機化合物の構造情報の記録方法につい
て各種の方法が提案され、利用されつつある。今日まで
に研究され、解明された有機化合物および有機化学反応
は膨大な量にのぼるが、これらの既知の情報を有効に利
用して公知の化学物質または化学反応を短時間のうちに
検索したり、さらには所望の特性を有する新規物質の合
成方法を見い出すことが望まれている。そのためには、
化学物質および化学反応の表現形態として、技術者にと
ってその構造的特徴を把握することが容易な従来の化学
構造式の代りに、コンピュータが処理できる(すなわち
、コンピュータが論理判断しうる)表現形態を開発し、
利用することが要求されている。
て各種の方法が提案され、利用されつつある。今日まで
に研究され、解明された有機化合物および有機化学反応
は膨大な量にのぼるが、これらの既知の情報を有効に利
用して公知の化学物質または化学反応を短時間のうちに
検索したり、さらには所望の特性を有する新規物質の合
成方法を見い出すことが望まれている。そのためには、
化学物質および化学反応の表現形態として、技術者にと
ってその構造的特徴を把握することが容易な従来の化学
構造式の代りに、コンピュータが処理できる(すなわち
、コンピュータが論理判断しうる)表現形態を開発し、
利用することが要求されている。
化学物質の記録方法としては、W L N (Wisw
esser Linear Notation )など
の線型表記法および結合表による方法が代表的なもので
あり、その、詳細はたとえば、W、T、Wipke、
S、R,He1ler、 R,J、Feldmann、
E、Hyde(Eds) : ”Computer
Representati。
esser Linear Notation )など
の線型表記法および結合表による方法が代表的なもので
あり、その、詳細はたとえば、W、T、Wipke、
S、R,He1ler、 R,J、Feldmann、
E、Hyde(Eds) : ”Computer
Representati。
n and Manipulation of Che
mical Information”(Jobr+
Wiley and 5ons、 New York、
1974)に記載されている。結合表(conne
ction table)は、たとえば化学物質の構造
式における各原子の種類、それに結合する相手の原子お
よび結合の種類などを一覧表にまとめたものであり、1
:記の線型表記法に比べて化学物質を原子単位で検索す
ることができるとの利点がある。
mical Information”(Jobr+
Wiley and 5ons、 New York、
1974)に記載されている。結合表(conne
ction table)は、たとえば化学物質の構造
式における各原子の種類、それに結合する相手の原子お
よび結合の種類などを一覧表にまとめたものであり、1
:記の線型表記法に比べて化学物質を原子単位で検索す
ることができるとの利点がある。
また、化学物質の構造変化(化学反応)に関する情報を
記録する方法についても提案されているが、今までのと
ころ満足できる表現方法は知られていない、たとえば、
化学反応に関する情報を記録する方法として反応コード
による方法があり。
記録する方法についても提案されているが、今までのと
ころ満足できる表現方法は知られていない、たとえば、
化学反応に関する情報を記録する方法として反応コード
による方法があり。
具体的にはJ、Valls、 O,5cheiner:
’C:hemical Information S
ystems″、 E、Ash、 E、 )Iyde(
Eds)、 (Ellls Horwoad Lim1
ted、 1975) p、241−258に記・征さ
れた方法、MJ、l、obeck、 Angew、 C
herB、 Intern。
’C:hemical Information S
ystems″、 E、Ash、 E、 )Iyde(
Eds)、 (Ellls Horwoad Lim1
ted、 1975) p、241−258に記・征さ
れた方法、MJ、l、obeck、 Angew、 C
herB、 Intern。
Ed、 Engl、、 9.578(1970)に記載
された方法、およびHj、Ziegler、 J、 C
hem、Inf、 Comput。
された方法、およびHj、Ziegler、 J、 C
hem、Inf、 Comput。
Sci、、 19.141(+979)に記載された
方法なとがある。この方法では化学反応表現の観点が固
定されているために、新しい化学反応が見い出された場
合に記録できないとの欠点がある。また、化学物質の構
造情報とその変化の情報とが別個の形態で記録されてい
るので自効な情報検索を行なうことができないとの欠点
かある。
方法なとがある。この方法では化学反応表現の観点が固
定されているために、新しい化学反応が見い出された場
合に記録できないとの欠点がある。また、化学物質の構
造情報とその変化の情報とが別個の形態で記録されてい
るので自効な情報検索を行なうことができないとの欠点
かある。
別に、化学物質の合成経路を設計するケ場から案出され
た記録方法も知られている。たとえば、El、Core
y、 R,D、Cramer、 W、J、Howe、
J、 Am、 Chem、 Sac、、 94.440
(1972) 、 1.l1g1. J、Bauer、
J、Braodt、 J、Fr1edrich、 J
、Gasteiger、 Llochum。
た記録方法も知られている。たとえば、El、Core
y、 R,D、Cramer、 W、J、Howe、
J、 Am、 Chem、 Sac、、 94.440
(1972) 、 1.l1g1. J、Bauer、
J、Braodt、 J、Fr1edrich、 J
、Gasteiger、 Llochum。
W、5chubert、 Angew、 Cheva、
Intern、 Ed、 Engl、。
Intern、 Ed、 Engl、。
18、 l1l(1979)に記載された方法がある。
しかしながら、この方法は個々の化学反応を記録するの
には適していない。
には適していない。
[発明の要旨]
本発明は、化学物質の構造変化に関する情報を記録保存
するための新規な方法を提供することをその目的とする
ものである。
するための新規な方法を提供することをその目的とする
ものである。
また本発明は、化学物質の構造変化に関する情報をコン
ピュータ処理が可能な表現形態で記録保存する方法を提
供することもその目的とするものである。
ピュータ処理が可能な表現形態で記録保存する方法を提
供することもその目的とするものである。
さらに本発明は、出発物質、生成物質およびこれらの間
の構造変化に関する情報を統合した化学反応情報を、コ
ンピュータ処理が可能な表現形yi;で記録保存する方
法を提供することもその目的とするものである。
の構造変化に関する情報を統合した化学反応情報を、コ
ンピュータ処理が可能な表現形yi;で記録保存する方
法を提供することもその目的とするものである。
すなわち、本発明は、少なくとも一つの出発物質から少
なくとも一つの生成物質を生ずる化学反応に関する情報
を記録し保存する方法において、トポロジカルに重ね合
わされた。該出発物質の構造と該生成物質の構造との間
で、(1)出発物質および生成物質に共通して存在する
ノード間の結合、(2)出発物質のみに存在するノード
間の結合、および(3)生成物質のみに存在するノード
間の結合をそれぞれ区別して表わすことにより化学反応
を表現することを特徴とする化学反応情報の記録保存方
法を提供するものである。
なくとも一つの生成物質を生ずる化学反応に関する情報
を記録し保存する方法において、トポロジカルに重ね合
わされた。該出発物質の構造と該生成物質の構造との間
で、(1)出発物質および生成物質に共通して存在する
ノード間の結合、(2)出発物質のみに存在するノード
間の結合、および(3)生成物質のみに存在するノード
間の結合をそれぞれ区別して表わすことにより化学反応
を表現することを特徴とする化学反応情報の記録保存方
法を提供するものである。
また、本発明は、
1)少なくとも一つの出発物質から少なくとも一つの生
成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存する
方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発物
質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物質
および生成物質に共通して存在するノード間の結合、(
2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および(
3〕生成物質のみに存在するノード間の結合がそれぞれ
区別して表わされてなる結合情報に基づいて、該化学反
応における物質の構造変化を表現する構造図を作成し、
そして化学反応を構造図の形態で記録保存することを特
徴とする化学反応情報の記録保存方法、および 2)少なくとも一つの出発物質から少なくとも−・つの
生成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存す
る方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発
物質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物
質および生成物質に共通して存在するメート間の結合、
(2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および
(3)生成物質のみに存在するノード間の結合がそれぞ
れ区別して表わされてなる結合情報に基づいて、各ノー
ド、該/−ドに結合する結合相手のノードおよび該ノー
ド間の結合に関する情報を含む結合表を作成し、そして
化学反応を結合表の形態で記録保存することを特徴とす
る化学反応情報の記録保存方法、 を提供するものである。
成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存する
方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発物
質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物質
および生成物質に共通して存在するノード間の結合、(
2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および(
3〕生成物質のみに存在するノード間の結合がそれぞれ
区別して表わされてなる結合情報に基づいて、該化学反
応における物質の構造変化を表現する構造図を作成し、
そして化学反応を構造図の形態で記録保存することを特
徴とする化学反応情報の記録保存方法、および 2)少なくとも一つの出発物質から少なくとも−・つの
生成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存す
る方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発
物質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物
質および生成物質に共通して存在するメート間の結合、
(2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および
(3)生成物質のみに存在するノード間の結合がそれぞ
れ区別して表わされてなる結合情報に基づいて、各ノー
ド、該/−ドに結合する結合相手のノードおよび該ノー
ド間の結合に関する情報を含む結合表を作成し、そして
化学反応を結合表の形態で記録保存することを特徴とす
る化学反応情報の記録保存方法、 を提供するものである。
本発明の方法によれば、化学反応は基本的に原子、原子
団等からなるノード(節、node)とメートとの間の
結合についての簡易な表現で表わされる。そして、反応
系におけるノード間の結合は、出発物質のみに存在する
結合、生成物質のみに存在する結合および両者に共通に
存在する結合からなる三種類に区別して表わされるため
に、化学反応そのものだけではなく、同時に反応に関与
する出発物質、生成物質等の物質についても表現するこ
とができる。すなわち、従来の種々の表現方法と比較し
て、本発明は化学物質情報および化学反応情報の両方を
同時に記録保存することができる点で非常に優れた方法
である。
団等からなるノード(節、node)とメートとの間の
結合についての簡易な表現で表わされる。そして、反応
系におけるノード間の結合は、出発物質のみに存在する
結合、生成物質のみに存在する結合および両者に共通に
存在する結合からなる三種類に区別して表わされるため
に、化学反応そのものだけではなく、同時に反応に関与
する出発物質、生成物質等の物質についても表現するこ
とができる。すなわち、従来の種々の表現方法と比較し
て、本発明は化学物質情報および化学反応情報の両方を
同時に記録保存することができる点で非常に優れた方法
である。
また、化学反応情報を記録保存するに際して未発明にか
かる表現方法を利用することにより、コンピュータによ
る情報の処理が容易となり、かつそれはと大きな記憶容
量をとることもない。そして、記録媒体への化学反応の
)D、録を簡便に行なうことかできるため、これらの情
報の蓄積、管理が容易となる。また、登録された化学反
応情報等に基づいて、化学反応および反応に関かする化
学物質等に関する情報検索を短時間のうちに効率良く行
なうことができるため、技術者の個々の研究において情
報の収集、調査等に要する時間を短縮化し、かつ得られ
る情報の密度を高めることが可能であり、研究を効率的
に進めることができる。さらには、薬品製造等にたずさ
れる技術者にとって要望が友である化学物質の構造解析
、分子設計(molecular modeliB)
、有機合成経路設計(heuristic analy
sis of organic 5yntheSis
)などの応用分野に有効に利用することが可能である。
かる表現方法を利用することにより、コンピュータによ
る情報の処理が容易となり、かつそれはと大きな記憶容
量をとることもない。そして、記録媒体への化学反応の
)D、録を簡便に行なうことかできるため、これらの情
報の蓄積、管理が容易となる。また、登録された化学反
応情報等に基づいて、化学反応および反応に関かする化
学物質等に関する情報検索を短時間のうちに効率良く行
なうことができるため、技術者の個々の研究において情
報の収集、調査等に要する時間を短縮化し、かつ得られ
る情報の密度を高めることが可能であり、研究を効率的
に進めることができる。さらには、薬品製造等にたずさ
れる技術者にとって要望が友である化学物質の構造解析
、分子設計(molecular modeliB)
、有機合成経路設計(heuristic analy
sis of organic 5yntheSis
)などの応用分野に有効に利用することが可能である。
そして、]−記表現方法を用いて化学反応情報を二次元
もしくは三次元の構造図および/または結合表としてコ
ンピュータに記録保存(登録)することができる。本発
明において構造図とは、化学反応に関与する物質の構造
変化をL記表現方法を用いて表わした図形(これをf虚
遷移構造Jと呼ぶ)をいい、化合物についての従来の構
造式および三次元的構造図に準して技術者が視覚的にな
じみやすく、また容易に理解できる形態で化学反応を表
わすことができる。また、結合表は、ノードの種類、該
ノードに結合する相手ノードおよびこれらノード間の結
合の種類などの組合せからなる筒中かつ明瞭な−・賢人
であり、たいして大きな容量を必要とせずに化学反応情
報を記Q媒体に蓄積保存することができる。
もしくは三次元の構造図および/または結合表としてコ
ンピュータに記録保存(登録)することができる。本発
明において構造図とは、化学反応に関与する物質の構造
変化をL記表現方法を用いて表わした図形(これをf虚
遷移構造Jと呼ぶ)をいい、化合物についての従来の構
造式および三次元的構造図に準して技術者が視覚的にな
じみやすく、また容易に理解できる形態で化学反応を表
わすことができる。また、結合表は、ノードの種類、該
ノードに結合する相手ノードおよびこれらノード間の結
合の種類などの組合せからなる筒中かつ明瞭な−・賢人
であり、たいして大きな容量を必要とせずに化学反応情
報を記Q媒体に蓄積保存することができる。
これら構造図および結合表のいずれの登録形態において
も、各ノードを結ぶ結合は出発物質および生成物質に関
連して表わされるから、構造1χおよび結合表は化学反
応以外に反応に関与する物質についての情報をも総合的
に含蓄している。従って、登録された構造図および/ま
たは結合表を利用して化学物質および化学反応を原fl
′J1位で検索1照合することができる。
も、各ノードを結ぶ結合は出発物質および生成物質に関
連して表わされるから、構造1χおよび結合表は化学反
応以外に反応に関与する物質についての情報をも総合的
に含蓄している。従って、登録された構造図および/ま
たは結合表を利用して化学物質および化学反応を原fl
′J1位で検索1照合することができる。
さらに1本発明においては、結合表が各7−ドの空間座
標についての情報をも包含する場合には、L記構造園と
結合表との間で相互に任意に変換することが可能であり
、いずれの形態でも化学反応を表示記録することができ
る。
標についての情報をも包含する場合には、L記構造園と
結合表との間で相互に任意に変換することが可能であり
、いずれの形態でも化学反応を表示記録することができ
る。
ト述の利点に加えて、たとえば各メート間の結合を一対
の数字(a、b)[ただし、aは出発物質における結合
多重度を表わす整数であり、bは化学反応における結合
多重度の変化を表わす整数である]で表わす場合には、
個々の反応のみならず複数の連続する反応(多段階反応
)をも一つの結合表にまとめて表わすことが可能であり
、任意の中間反応および一連の合成反応を簡単に表示す
ることができる。従って、本発明の構造図および/また
は結合表を用いる記録保存方法を利用することにより、
化学物質および化学反応の部分構造検索、構造−活性相
関1分子2(ジ旧、合成経路設計、未知化合物の構造自
動決定、および複雑な化合物をある条件ドで反応させた
場合の反応機構お紅ひ反、応生成物のI’411 (m
echanistic evaluationof o
rganic reaction)などを短時間のうち
に1分実用可能な範囲内で行なうことが可能である。
の数字(a、b)[ただし、aは出発物質における結合
多重度を表わす整数であり、bは化学反応における結合
多重度の変化を表わす整数である]で表わす場合には、
個々の反応のみならず複数の連続する反応(多段階反応
)をも一つの結合表にまとめて表わすことが可能であり
、任意の中間反応および一連の合成反応を簡単に表示す
ることができる。従って、本発明の構造図および/また
は結合表を用いる記録保存方法を利用することにより、
化学物質および化学反応の部分構造検索、構造−活性相
関1分子2(ジ旧、合成経路設計、未知化合物の構造自
動決定、および複雑な化合物をある条件ドで反応させた
場合の反応機構お紅ひ反、応生成物のI’411 (m
echanistic evaluationof o
rganic reaction)などを短時間のうち
に1分実用可能な範囲内で行なうことが可能である。
[発明の構成]
本発明において、化学反応における化学物質の構造変化
は、出発物質の構造と生成物質の構造とをトポロジカル
に重ね合わせた場合に出発物質のみに存在する結合、生
成物質のみに存在する結合および両者に共通に存在する
結合からなる三種類に区別することにより表現される。
は、出発物質の構造と生成物質の構造とをトポロジカル
に重ね合わせた場合に出発物質のみに存在する結合、生
成物質のみに存在する結合および両者に共通に存在する
結合からなる三種類に区別することにより表現される。
本発明の化学反応情報の記録保存方法を、酢酸エチルを
塩酸によって加水分解する反応を例に挙げて説明する。
塩酸によって加水分解する反応を例に挙げて説明する。
この化学反応は、
CH3COOCH2CH3+ H20+ HCD−→C
H,C0OH+CH,CH,,O)l+HCQ(反応式
j) で表わされる。反応に関与する全ての出発物質(原糸)
についてノードを以下のよう番ことって1lll−1に
番号を付ける。
H,C0OH+CH,CH,,O)l+HCQ(反応式
j) で表わされる。反応に関与する全ての出発物質(原糸)
についてノードを以下のよう番ことって1lll−1に
番号を付ける。
厚−系 (6)
CHコーC−0CH2−CHo
+ H−0−H+ H−0文次に、通常の
構造式で表わされた原糸(出発物質群)と生成系(生成
物質群)とをトポロジカルに、すなわち位相を同じくし
て重ね合わせると。
構造式で表わされた原糸(出発物質群)と生成系(生成
物質群)とをトポロジカルに、すなわち位相を同じくし
て重ね合わせると。
(8) (II)
で表わネれる構造か得られる。ここで、l)記号−は、
出発物質および生成物質に共通1゜て1′1在する結合
を表わし、 11)記X′j←は、出発物質にのみ存在する結合を表
わし5、そして 111)記号・・・は、生成物質にのみ存在する結合を
表わしている。
出発物質および生成物質に共通1゜て1′1在する結合
を表わし、 11)記X′j←は、出発物質にのみ存在する結合を表
わし5、そして 111)記号・・・は、生成物質にのみ存在する結合を
表わしている。
本発明において5 F、記の構造1を虚遷移構造(im
aginary transition 5truct
ures 、以ドにおいてITSと略称する)と叶、沁
ことにする。すなわち、虚遷移構造(ITS)とは、出
発物質の構造と生成物質の構凸とをトポロジカルに重ね
合わせて、各ノード間の結合を上記i)〜1ii)の三
種類で区別した二次元もしくは二次元の構造をいう。
aginary transition 5truct
ures 、以ドにおいてITSと略称する)と叶、沁
ことにする。すなわち、虚遷移構造(ITS)とは、出
発物質の構造と生成物質の構凸とをトポロジカルに重ね
合わせて、各ノード間の結合を上記i)〜1ii)の三
種類で区別した二次元もしくは二次元の構造をいう。
加水分解反応の結果として得られた生成系は、原糸のメ
ート番号に対応して次のような構造式で表わされる。
ート番号に対応して次のような構造式で表わされる。
生成系 (6)
C)I、 −C−0−H
+ )l−0−CH,、−1:H3+ H−CΩ(1
0)(3) (4) (5) (U cl
l)換、−Tすれば、本発明においでj゛トポロジカル
重ね合わせる」とは、出発物質の構造に親れる。ノード
と生成物質の構造に現れるノードとを一致させてこれら
の構造を組み合わせることをいう。
0)(3) (4) (5) (U cl
l)換、−Tすれば、本発明においでj゛トポロジカル
重ね合わせる」とは、出発物質の構造に親れる。ノード
と生成物質の構造に現れるノードとを一致させてこれら
の構造を組み合わせることをいう。
本発明において、化学反応に関ケする物質のノードとし
て、原糸および生成系に含まれる全ての原子をとっても
よいし、あるいはメチル基[E記ノー・ド(,1) 、
(5) ] 、 メチレン基[上記ノード(4)]
のような官能基などの原子団をとってもよい。また、化
学反応を表現するに際して、原糸および生成系に現れる
ノードを一部省略して表わすことも可能であり、これも
本発明に含まれる。
て、原糸および生成系に含まれる全ての原子をとっても
よいし、あるいはメチル基[E記ノー・ド(,1) 、
(5) ] 、 メチレン基[上記ノード(4)]
のような官能基などの原子団をとってもよい。また、化
学反応を表現するに際して、原糸および生成系に現れる
ノードを一部省略して表わすことも可能であり、これも
本発明に含まれる。
本発明に係る虚遷移構造(I TS)において。
三種類の結合の区別は上記i)〜1ii)のような記号
による表示に限定されるものではなく、たとえば数字(
1,2,3)4の簡屯な文字による表示、あるいは色彩
(黒色、赤色、緑色)による色分は表示など利用者が五
感により判断でき、かつコンビ、−タ処理が可能であれ
ばいかなる手段を用いて行なってもよい。
による表示に限定されるものではなく、たとえば数字(
1,2,3)4の簡屯な文字による表示、あるいは色彩
(黒色、赤色、緑色)による色分は表示など利用者が五
感により判断でき、かつコンビ、−タ処理が可能であれ
ばいかなる手段を用いて行なってもよい。
以ト本発明において、
])出うり1および生成物質に共通の結合(記号−)を
r無色の結合」と呼び、 11)出発物質にのみ存在する結合(記号十)をr出結
合」と呼び、 1ii)生成物質にのみ存在する結合(記号・・・)を
「入結合Jと呼び、 そして、出結合と入結合とを総称してr有色の結合」と
呼ぶことにする。
r無色の結合」と呼び、 11)出発物質にのみ存在する結合(記号十)をr出結
合」と呼び、 1ii)生成物質にのみ存在する結合(記号・・・)を
「入結合Jと呼び、 そして、出結合と入結合とを総称してr有色の結合」と
呼ぶことにする。
具体的に、本発明の虚遷移構造に現れる結合の種類を第
1表にまとめて示す。なお、第1表において横の数値は
結合の出入の指標を意味する。
1表にまとめて示す。なお、第1表において横の数値は
結合の出入の指標を意味する。
す、下余白
第1表において、たとえば記号r・・・」で表わされた
結合は中入結合(single 1n−bond) テ
あって、一対の数字(0+1)で表わすことができる。
結合は中入結合(single 1n−bond) テ
あって、一対の数字(0+1)で表わすことができる。
ここで、0は反応前の原系において結合か存在しないこ
とを意味し、+1は反応後の生成系において単結合が生
じていることを意味する。同様にして、「−」で表わさ
れた結合は小出結合(single out−bond
) テあって(1−1)で表わし、反応前の原系にお
いて単結合が存在するが反応後の生成系において単結合
が消滅していることを意味する。また、(2−1)で表
わされる結合は卓出の二重結合(double bon
d singly cleaved)であり、f−4−
」で表記される。
とを意味し、+1は反応後の生成系において単結合が生
じていることを意味する。同様にして、「−」で表わさ
れた結合は小出結合(single out−bond
) テあって(1−1)で表わし、反応前の原系にお
いて単結合が存在するが反応後の生成系において単結合
が消滅していることを意味する。また、(2−1)で表
わされる結合は卓出の二重結合(double bon
d singly cleaved)であり、f−4−
」で表記される。
このように結合の種類はまた、一対の数字=(a、b)
[ただし、aは出発物質における結合多重度を表わす整
数であり、bは化学反応における結合多重度の変化を表
わす整数である]で表わすことができ、この場合には結
合多重度が二重上であっても簡潔に表記することができ
る。なお、(a、b)の表記のうちコンマ(1)は省略
してもよい、また、この表記によれば記憶容量をそれほ
ど必要としなく、かつ直接にコンピュータ処理が可能で
ある点で化学反応の記録保存に特に好ましい。
[ただし、aは出発物質における結合多重度を表わす整
数であり、bは化学反応における結合多重度の変化を表
わす整数である]で表わすことができ、この場合には結
合多重度が二重上であっても簡潔に表記することができ
る。なお、(a、b)の表記のうちコンマ(1)は省略
してもよい、また、この表記によれば記憶容量をそれほ
ど必要としなく、かつ直接にコンピュータ処理が可能で
ある点で化学反応の記録保存に特に好ましい。
次に、」二重のノード間の結合に注目した表現方法を用
いて、個々の化学反応はたとえば以下に述べるような方
法により記録保存(登録)される。
いて、個々の化学反応はたとえば以下に述べるような方
法により記録保存(登録)される。
化学反応の記録保存は、上記の虚遷移構造、結合表また
はこれらの組合せの形態で行なわれる。
はこれらの組合せの形態で行なわれる。
まず、上記の塩酸による酢酸エチルの加水分解反応にお
いて、(1)〜(11)の各ノードの種類と各ノード間
の結合を無色または有色の結合および出または入結合の
区別をつけた結合に関する入力情報に基づいて、構造(
ITS)1に示したような二次元の虚遷移構造を作成す
る。三次元の虚遷移構造を作成することも勿論可能であ
る。従って、この結合情報には各ノードの相対的な空間
配首に関する情報(二次元もしくは三次元座標)が含ま
れている必要がある。
いて、(1)〜(11)の各ノードの種類と各ノード間
の結合を無色または有色の結合および出または入結合の
区別をつけた結合に関する入力情報に基づいて、構造(
ITS)1に示したような二次元の虚遷移構造を作成す
る。三次元の虚遷移構造を作成することも勿論可能であ
る。従って、この結合情報には各ノードの相対的な空間
配首に関する情報(二次元もしくは三次元座標)が含ま
れている必要がある。
次いで個々の化学反応は、得られた二次元もしくは三次
元の虚遷移構造(図形)の形態でコンピュータに登録さ
れる。この登録形態は、化学反応情報を利用しようとす
る者が視覚的に直ちに理解し判断できる構造式または三
次元の構造図の形をとっている点で非常に優れている。
元の虚遷移構造(図形)の形態でコンピュータに登録さ
れる。この登録形態は、化学反応情報を利用しようとす
る者が視覚的に直ちに理解し判断できる構造式または三
次元の構造図の形をとっている点で非常に優れている。
たとえば、この登録された虚遷移構造から、入結合のみ
を削除する(無結合とする)ことにより出発物質の構造
が得られ、また出結合のみを削除すれば生成物質の構造
が得られる。すなわち、本発明に係る虚遷移構造は化学
反応情報のみならず化学物質情報をも含んでおり、この
登録形態を利用して反応検索だけではなく化合物の構造
検索をも実施することが可能である。
を削除する(無結合とする)ことにより出発物質の構造
が得られ、また出結合のみを削除すれば生成物質の構造
が得られる。すなわち、本発明に係る虚遷移構造は化学
反応情報のみならず化学物質情報をも含んでおり、この
登録形態を利用して反応検索だけではなく化合物の構造
検索をも実施することが可能である。
また、上記ITSIにおいて無色結合のみを削除すれば
出結合と入結合とが交互に連結した構造[(2) −(
3) +(10)−(11)+(8) −(7) +(
2) Jを得ることができ、これを反応緒(react
ion string )と呼ぶ。なお、ここで−およ
び+はそれぞれ出結合および入結合を意味している。反
応緒は個々の反応型に特有な形として取り出すことがで
き、この場合にはエステルの加水分解反応にIM有の表
現となっている。すなわち、登録された虚遷移構造を利
用して個々の反応型に固有の構造表現である反応路のみ
を抽出することが可能であり、反応検索を一層容易にす
ることができる。このほかに、反応に関与する環構造(
開環もしくは閉環の環)のみを抽出することなども可能
である。
出結合と入結合とが交互に連結した構造[(2) −(
3) +(10)−(11)+(8) −(7) +(
2) Jを得ることができ、これを反応緒(react
ion string )と呼ぶ。なお、ここで−およ
び+はそれぞれ出結合および入結合を意味している。反
応緒は個々の反応型に特有な形として取り出すことがで
き、この場合にはエステルの加水分解反応にIM有の表
現となっている。すなわち、登録された虚遷移構造を利
用して個々の反応型に固有の構造表現である反応路のみ
を抽出することが可能であり、反応検索を一層容易にす
ることができる。このほかに、反応に関与する環構造(
開環もしくは閉環の環)のみを抽出することなども可能
である。
あるいは、石型の塩酸による酢酸エチルの加水分解反応
において、(1)〜(11)の各ノードの種類と各ノー
ド間の結合を無色または有色の結合および出または入結
合の区別をつけた結合に関する入力情報に基づいて、各
ノード、該ノードに結合する結合相手のノードおよび該
ノード間の結合に関する情報を含む結合表(conne
ction table)を作成する。
において、(1)〜(11)の各ノードの種類と各ノー
ド間の結合を無色または有色の結合および出または入結
合の区別をつけた結合に関する入力情報に基づいて、各
ノード、該ノードに結合する結合相手のノードおよび該
ノード間の結合に関する情報を含む結合表(conne
ction table)を作成する。
得られた結合表を第2表に示す。なお、結合表は各ノー
ドの二次元座標(xy座標〕に関する情報をも包含して
いる。
ドの二次元座標(xy座標〕に関する情報をも包含して
いる。
第2表に示すように、結合表は加水分解反応、こ関与す
る原糸(酢酸エチル、水、塩酸)および生成系(酢酸、
エタノール、塩酸)について、全てのノード、その二次
元座標(ノード(1)を原点にとっである)、各ノード
に結合する全てのノードおよびこれらノード間の結合の
種類がノード番号順に記載された一覧表である。
る原糸(酢酸エチル、水、塩酸)および生成系(酢酸、
エタノール、塩酸)について、全てのノード、その二次
元座標(ノード(1)を原点にとっである)、各ノード
に結合する全てのノードおよびこれらノード間の結合の
種類がノード番号順に記載された一覧表である。
結合表はまた、上記において得られた虚遷移構造に基づ
いて作成することもできる。あるいは直接に虚遷移構造
の形で入力された情報から結合表を作成することもでき
る。
いて作成することもできる。あるいは直接に虚遷移構造
の形で入力された情報から結合表を作成することもでき
る。
次いで個々の化学反応は、結合表の形態でコンピュータ
に登録される。この登録形態は、多大な記憶容量を要せ
ず、直接にコンピュータ処理ができる形態とされている
点で優れている。なお、結合表と虚遷移構造とを組み合
わせて登録することも勿論可能であり、本発明において
好ましいものである。
に登録される。この登録形態は、多大な記憶容量を要せ
ず、直接にコンピュータ処理ができる形態とされている
点で優れている。なお、結合表と虚遷移構造とを組み合
わせて登録することも勿論可能であり、本発明において
好ましいものである。
結合表には、上記のように各ノードの空間座標等に関す
る入力情報が併記されていてもよい。更に、虚遷移構造
および/または結合表には所望により、各ノードの電荷
および立体化学等に関する情報:反応に関与する化学物
質の各種の物性値、スペクトル情報;および反応のエン
タルピー、温度、時間、使用する触媒、雰囲気、反応相
、反応の収率、副生成物の有黒等に関する情報を記載し
てもよい、コンピュータに登録された虚遷移構造または
結合表がこれらの付加情報を含蓄している場合には、虚
遷移構造または結合表をデータベースとして化学物質の
構造検索システム、化学反応の検索システム、または有
機合成設計システムなどに広く利用することが可1mで
ある。
る入力情報が併記されていてもよい。更に、虚遷移構造
および/または結合表には所望により、各ノードの電荷
および立体化学等に関する情報:反応に関与する化学物
質の各種の物性値、スペクトル情報;および反応のエン
タルピー、温度、時間、使用する触媒、雰囲気、反応相
、反応の収率、副生成物の有黒等に関する情報を記載し
てもよい、コンピュータに登録された虚遷移構造または
結合表がこれらの付加情報を含蓄している場合には、虚
遷移構造または結合表をデータベースとして化学物質の
構造検索システム、化学反応の検索システム、または有
機合成設計システムなどに広く利用することが可1mで
ある。
上記の虚遷移構造および/または結合表をコンピュータ
に登録するに際して、化学反応情報の蓄積、管理および
検索を容易にするために、虚遷移構造および/または結
合表ごとに反応番号を付してもよいし、あるいはまた、
虚遷移構造および/または結合表ごとに反応名を一緒に
登録してもよい。
に登録するに際して、化学反応情報の蓄積、管理および
検索を容易にするために、虚遷移構造および/または結
合表ごとに反応番号を付してもよいし、あるいはまた、
虚遷移構造および/または結合表ごとに反応名を一緒に
登録してもよい。
登録された結合表に基づいて、出発物質、生成物質およ
び反応式などを表示することが可能であり、また虚遷移
構造の場合と同様に反応績および反応に関与する環を抽
出することも可能である。
び反応式などを表示することが可能であり、また虚遷移
構造の場合と同様に反応績および反応に関与する環を抽
出することも可能である。
さらに、たとえば数字(a、b)の組合せで表わされた
結合について適当な演算処理を施すことにより、多段階
に渡る反応を統合して−の結合表として表示することが
可能である。すなわち、個々の反応のみならず、有機化
合物の合成におけるような複雑な反応全体を簡易に表示
したり、あるいはそのうちの一部の反応のみを抽出して
表示することが可能である。
結合について適当な演算処理を施すことにより、多段階
に渡る反応を統合して−の結合表として表示することが
可能である。すなわち、個々の反応のみならず、有機化
合物の合成におけるような複雑な反応全体を簡易に表示
したり、あるいはそのうちの一部の反応のみを抽出して
表示することが可能である。
従って、物質の特定の性質に注目した分子設計、有機化
合物の合成経路の決定、未知化合物の構造自動決定など
化学におけるコンピュータ利用分野において広範囲に渡
って、この登録された結合表を最適の登録形感として利
用することができる。
合物の合成経路の決定、未知化合物の構造自動決定など
化学におけるコンピュータ利用分野において広範囲に渡
って、この登録された結合表を最適の登録形感として利
用することができる。
また逆に、登録された結合表に基づいて虚遷移構造を作
成することも可能であり、上記の種々の検索システムに
おいて化学反応について結合表と虚遷移構造とを相互に
任意に変換することができる。このことにより、各種の
検索を一層容易にすることが可能であり、検索システム
の汎用性および利用度を高めることが可能である。
成することも可能であり、上記の種々の検索システムに
おいて化学反応について結合表と虚遷移構造とを相互に
任意に変換することができる。このことにより、各種の
検索を一層容易にすることが可能であり、検索システム
の汎用性および利用度を高めることが可能である。
虚遷移構造および/または結合表のコンピュータへの登
録は、コンピュータ内の上記tt装置に記録保存するこ
とにより行なってもよいし、あるいは適当な記録媒体(
磁気ディスク、光ディスク、磁気テープなど)を介して
記録保存してもよい。
録は、コンピュータ内の上記tt装置に記録保存するこ
とにより行なってもよいし、あるいは適当な記録媒体(
磁気ディスク、光ディスク、磁気テープなど)を介して
記録保存してもよい。
登録された虚遷移構造および/または結合表は、適当な
記録装首によりプレインペーパーなど各種の記録材料上
に記録したり、あるいはコンピュータや電子機器に接続
したカラーブラウン管などに表示することができる。
記録装首によりプレインペーパーなど各種の記録材料上
に記録したり、あるいはコンピュータや電子機器に接続
したカラーブラウン管などに表示することができる。
以下に1本発明の化学反応情報の記録保存方法を別の実
施例を用いて更に説明する。
施例を用いて更に説明する。
[実施例1]アセトンにn−ブチルリチウムを付加する
反応 この化学反応は、 H3 →CH3CCH2CH2CH2CH3 OH(反応式2) %式% 反応の虚遷移構造は以下のように表わすことができる。
反応 この化学反応は、 H3 →CH3CCH2CH2CH2CH3 OH(反応式2) %式% 反応の虚遷移構造は以下のように表わすことができる。
H(8) (10) (I
TS 2)また、この虚遷移構造に対応する結合表を
作成した。得られた結合表を第3表に示す、なお、結合
表は各ノードの二次元座標(xy座標)に関する情報を
も包含している。
TS 2)また、この虚遷移構造に対応する結合表を
作成した。得られた結合表を第3表に示す、なお、結合
表は各ノードの二次元座標(xy座標)に関する情報を
も包含している。
[実施例2]フリーデル・クラフッ反応によるアシル化
反応 この化学反応は、 CH,CH。
反応 この化学反応は、 CH,CH。
CHff CH3
で表わされる。
反応の虚遷移構造は以ドのように表わすことができる。
以下余白
OHy (12)(10)
また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第4表に示す。なお、結合表は各ノード
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも包含してい
る。
られた結合表を第4表に示す。なお、結合表は各ノード
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも包含してい
る。
1、゛)下ネ白
[実施例3]ベックマン転位
この化学反応は、 H
(反応式4)
%式%
反応の虚遷移構造は以下のように表わすことができる。
また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第5表に示す、なお、結合表は各ノード
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも包含してい
る。
られた結合表を第5表に示す、なお、結合表は各ノード
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも包含してい
る。
[実施例4]シクロヘプタノンのメチル化反応この化学
反応はA−Cの一連の反応: [Aコ [B] 「C」 (反応式5)%式% (1)A段階の反応の虚遷移構造は以下のように表わす
ことができる。
反応はA−Cの一連の反応: [Aコ [B] 「C」 (反応式5)%式% (1)A段階の反応の虚遷移構造は以下のように表わす
ことができる。
CHコ (11)
1ト
また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第6表番こ示す。なお、結合表は各ノー
ドの二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでl
、Nる。
られた結合表を第6表番こ示す。なお、結合表は各ノー
ドの二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでl
、Nる。
’、 −:’ ;7’:白
(2)B段階の反応の虚遷移構造は以Fのように表わす
ことかでざるう CHz(11> 書 (8) 0 (15) ■(18) 1 〆゛・ (5) C−1:(4) また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第7表に示す。なお、結合表は各ノード
の一次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでいる
。
ことかでざるう CHz(11> 書 (8) 0 (15) ■(18) 1 〆゛・ (5) C−1:(4) また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第7表に示す。なお、結合表は各ノード
の一次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでいる
。
辺、下余白
(3〕C段階の反応の虚遷移構造は以下のように表わす
ことができる。
ことができる。
(5) C−C(4)
また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第8表に示す。なお、結合表は各7−ド
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでいる
。
られた結合表を第8表に示す。なお、結合表は各7−ド
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでいる
。
以下令r1
(4)AおよびB段階の反応、すなわち[A]
〔B] (反応式5“)からなる反
応をまとめた虚遷移構造は以Fのように表わすことがで
きる。
応をまとめた虚遷移構造は以Fのように表わすことがで
きる。
また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第9表に示す。なお、結合表は各メート
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでいる
。
られた結合表を第9表に示す。なお、結合表は各メート
の二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでいる
。
以下余白
(5)A、BおよびC段階の反応、すなわち[A]
[B1 [C] (反応式5′)からなる
反応をまとめた虚遷移構造は以下のように表わすことが
できる。
[B1 [C] (反応式5′)からなる
反応をまとめた虚遷移構造は以下のように表わすことが
できる。
また、この虚遷移構造に対応する結合表を作成した。得
られた結合表を第10表に示す。なお、結合表は各ノー
ドの二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでい
る。
られた結合表を第10表に示す。なお、結合表は各ノー
ドの二次元座標(xy座標)に関する情報をも含んでい
る。
ラF続−?rlj正旦)
昭和60年11月 1日
■(和60年 特許願 第177345号2、発明の名
称 化学反応情報の記録保存方法 3、補IEをする者 事件との関係 特許出願人 名 称 (520)富士写真フィルム株式会社4、代
理人 住 所 東京都新宿区四谷2−14ミツヤ四谷ビル8
階6、補正により増加する発明の数 な し7、補正
の対象 明細書の「発明の詳細な説明」の欄8、補正
の内容 別紙の通り − ・明
細壽の「発明の詳細な説明」の欄を下記の如く補正致し
ます。
称 化学反応情報の記録保存方法 3、補IEをする者 事件との関係 特許出願人 名 称 (520)富士写真フィルム株式会社4、代
理人 住 所 東京都新宿区四谷2−14ミツヤ四谷ビル8
階6、補正により増加する発明の数 な し7、補正
の対象 明細書の「発明の詳細な説明」の欄8、補正
の内容 別紙の通り − ・明
細壽の「発明の詳細な説明」の欄を下記の如く補正致し
ます。
記
(1)第15頁の構造式(構造l)を次のように訂正す
る。
る。
(8) (II)
(2)第31頁の(反応式3)の生成物質を次のように
訂止する。
訂止する。
補正前
補正後
以 七
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、少なくとも一つの出発物質から少なくとも一つの生
成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存する
方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発物
質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物質
および生成物質に共通して存在するノード間の結合、(
2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および(
3)生成物質のみに存在するノード間の結合をそれぞれ
区別して表わすことにより化学反応を表現することを特
徴とする化学反応情報の記録保存方法。 2、上記出発物質および/または生成物質に存在する結
合のノードが、原子もしくは原子団であることを特徴と
する特許請求の範囲第1項記載の化学反応情報の記録保
存方法。 3、上記出発物質および/または生成物質に存在する結
合を、文字、記号、色彩またはこれらの組合せによって
区別して表わすことを特徴とする特許請求の範囲第1項
記載の化学反応情報の記録保存方法。 4、上記出発物質および/または生成物質に存在する結
合を、一対の数字(a、b)[ただし、aは出発物質に
おける結合多重度を表わす整数であり、bは化学反応に
おける結合多重度の変化を表わす整数である]によって
区別して表わすことを特徴とする特許請求の範囲第3項
記載の化学反応情報の記録保存方法。 5、少なくとも一つの出発物質から少なくとも一つの生
成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存する
方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発物
質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物質
および生成物質に共通して存在するノード間の結合、(
2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および(
3)生成物質のみに存在するノード間の結合がそれぞれ
区別して表わされてなる結合情報に基づいて、該化学反
応における物質の構造変化を表現する構造図を作成し、
そして化学反応を構造図の形態で記録保存することを特
徴とする化学反応情報の記録保存方法。 6、上記構造図に化学反応名が付されていることを特徴
とする特許請求の範囲第5項記載の化学反応情報の記録
保存方法。 7、少なくとも一つの出発物質から少なくとも一つの生
成物質を生ずる化学反応に関する情報を記録し保存する
方法において、トポロジカルに重ね合わされた該出発物
質の構造と該生成物質の構造との間で、(1)出発物質
および生成物質に共通して存在するノード間の結合、(
2)出発物質のみに存在するノード間の結合、および(
3)生成物質のみに存在するノード間の結合がそれぞれ
区別して表わされてなる結合情報に基づいて、各ノード
、該ノードに結合する結合相手のノードおよび該ノード
間の結合に関する情報を含む結合表を作成し、そして化
学反応を結合表の形態で記録保存することを特徴とする
化学反応情報の記録保存方法。 8、上記結合表が、各ノードの二次元もしくは三次元座
標に関する情報を含むことを特徴とする特許請求の範囲
第7項記載の化学反応情報の記録保存方法。 9、上記結合表に化学反応名が付されていることを特徴
とする特許請求の範囲第7項記載の化学反応情報の記録
保存方法。 10、上記化学反応を、結合表および化学反応における
物質の構造変化を表現する構造図の形態で記録保存する
ことを特徴とする特許請求の範囲第7項記載の化学反応
情報の記録保存方法。
Priority Applications (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP60177345A JPS6237738A (ja) | 1985-08-12 | 1985-08-12 | 化学反応情報の記録・検索方法 |
| EP86111173A EP0213483B1 (en) | 1985-08-12 | 1986-08-12 | Method for processing information on chemical reactions |
| DE3689965T DE3689965T2 (de) | 1985-08-12 | 1986-08-12 | Verfahren zum Verarbeiten von Informationen bezüglich chemischer Reaktionen. |
| US07/368,919 US4982338A (en) | 1985-08-12 | 1989-06-16 | Method for processing information on chemical reactions |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP60177345A JPS6237738A (ja) | 1985-08-12 | 1985-08-12 | 化学反応情報の記録・検索方法 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS6237738A true JPS6237738A (ja) | 1987-02-18 |
| JPH0564386B2 JPH0564386B2 (ja) | 1993-09-14 |
Family
ID=16029341
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP60177345A Granted JPS6237738A (ja) | 1985-08-12 | 1985-08-12 | 化学反応情報の記録・検索方法 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPS6237738A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPS6429324A (en) * | 1987-07-24 | 1989-01-31 | Fuji Photo Film Co Ltd | Treatment of chemical reaction information |
-
1985
- 1985-08-12 JP JP60177345A patent/JPS6237738A/ja active Granted
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPS6429324A (en) * | 1987-07-24 | 1989-01-31 | Fuji Photo Film Co Ltd | Treatment of chemical reaction information |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JPH0564386B2 (ja) | 1993-09-14 |
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