JPS6239598A - 標識付けした核酸 - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
本発明は、核酸の、同位体(アイソトープ)を用いない
標識付けに関する。
標識付けに関する。
従来の技術
核酸の標識付けは医学および研究の両方における多くの
分析目的のために必須である。例えば、このような標識
付けした分子は、複雑な細菌群の中で、特殊な細菌の遺
伝子の単一コピー(copy)の存在を検出するために
使用することができ、こうして感染の迅速な診断を行な
うことができる。伝統的に、こうした標識付けは、放射
性をもつように傳識付けられたヌクレオチドを、DNA
Jリメラーゼを用いて核酸内に、酵素により組み入れる
ことを包含していた。
分析目的のために必須である。例えば、このような標識
付けした分子は、複雑な細菌群の中で、特殊な細菌の遺
伝子の単一コピー(copy)の存在を検出するために
使用することができ、こうして感染の迅速な診断を行な
うことができる。伝統的に、こうした標識付けは、放射
性をもつように傳識付けられたヌクレオチドを、DNA
Jリメラーゼを用いて核酸内に、酵素により組み入れる
ことを包含していた。
同位体を用いない核酸の標識付は法も存在する。
このような方法の一つは、核酸内へのビオチンで標識付
けたヌクレオチドの組み入れを要する。
けたヌクレオチドの組み入れを要する。
〔ランジャー(Langer)外、プロシーデインダス
・オブーナショナル・アカデミ−・オプeサイエンシー
ズ(PrOceedings of NatiOnal
Aca、demyOf 5ciences)+ 7
8.6633. 1981)。この標識付けした核酸の
、フィルターに結合された標的DNAへのハイブリッド
形成(交IA)後に、これを比色法による検定により検
出することができる(1983年9月2日にランデス(
Landes)が出願し、本出願人と同一人に譲渡され
た、USSNSSN第525芳44 アヒシンとの複合体の形成;下記酵素がアビジン更複合
するための、ビオチンで標識付けした酵素の添加;およ
び比色法基質の添加による酵素の検゛出;を含む。
・オブーナショナル・アカデミ−・オプeサイエンシー
ズ(PrOceedings of NatiOnal
Aca、demyOf 5ciences)+ 7
8.6633. 1981)。この標識付けした核酸の
、フィルターに結合された標的DNAへのハイブリッド
形成(交IA)後に、これを比色法による検定により検
出することができる(1983年9月2日にランデス(
Landes)が出願し、本出願人と同一人に譲渡され
た、USSNSSN第525芳44 アヒシンとの複合体の形成;下記酵素がアビジン更複合
するための、ビオチンで標識付けした酵素の添加;およ
び比色法基質の添加による酵素の検゛出;を含む。
本発明は、アクリジンエステル類または発光ランタニド
で標識付けしたポリヌクレオチドを提供する。これらの
q識付けしたポリヌクレオチドは、相同のポリヌクレオ
チド配列の直接検定の手段を与える。
で標識付けしたポリヌクレオチドを提供する。これらの
q識付けしたポリヌクレオチドは、相同のポリヌクレオ
チド配列の直接検定の手段を与える。
アクリジンエステル類〔キャンプベル(C姐pbell
)外、ヨーロッパ特許第0082636号〕または発光
ランタニド〔ヘミン(Hemmila) 、ヨーロッパ
特許第0064484号〕、最も好ましくはユーロピウ
ム、テルビウムまたはサマリウムをポリヌクレオチドに
くみ入れることにより同位体を用いないで標識づけられ
たポリヌクレオチドを合成する方法は、一般に、官能化
試薬のこのポリヌクレオチト9への組み入れ、およびこ
れに続くアクリジンエステル、発光ランタニド、または
発光ラン。
)外、ヨーロッパ特許第0082636号〕または発光
ランタニド〔ヘミン(Hemmila) 、ヨーロッパ
特許第0064484号〕、最も好ましくはユーロピウ
ム、テルビウムまたはサマリウムをポリヌクレオチドに
くみ入れることにより同位体を用いないで標識づけられ
たポリヌクレオチドを合成する方法は、一般に、官能化
試薬のこのポリヌクレオチト9への組み入れ、およびこ
れに続くアクリジンエステル、発光ランタニド、または
発光ラン。
タニドキレートのこれらの試薬への結合を包含する。こ
れらの官能化試薬は、化学的または酵素的て組み入れる
ことができる。一つの具体化では、シトシンの同族体が
ポリヌクレオチド9の合成の間に化学的に付加され、別
の具体化では、単一または二重鎖の鋳型(テンプレート
)から合成されるポリヌクレオチド内に、例えば三リン
酸化塩基の同族体を組み入れるのにD N A $ +
)メラーゼが使用される。このような三リン酸化塩基の
例を下に示す: ○HX 式中、XはHまたはOHであり、zくn<−toである
。もう一つの方法には、先に標識付けたヌクレオチドま
たはポリヌクレオチドを、例えばカルボジイミド結合(
coupl工ng)によシ存在するポリヌクレオチドへ
共有結合させる方法が包含される。
れらの官能化試薬は、化学的または酵素的て組み入れる
ことができる。一つの具体化では、シトシンの同族体が
ポリヌクレオチド9の合成の間に化学的に付加され、別
の具体化では、単一または二重鎖の鋳型(テンプレート
)から合成されるポリヌクレオチド内に、例えば三リン
酸化塩基の同族体を組み入れるのにD N A $ +
)メラーゼが使用される。このような三リン酸化塩基の
例を下に示す: ○HX 式中、XはHまたはOHであり、zくn<−toである
。もう一つの方法には、先に標識付けたヌクレオチドま
たはポリヌクレオチドを、例えばカルボジイミド結合(
coupl工ng)によシ存在するポリヌクレオチドへ
共有結合させる方法が包含される。
標識付けしたポリヌクレオチドは、酵素または酵素基質
の添加を必要とすることなく、ニトロセルロースのよう
な適当な媒体上のRNAまたはDNAの相同配列の直接
検出のための標準法に使用することができる。
の添加を必要とすることなく、ニトロセルロースのよう
な適当な媒体上のRNAまたはDNAの相同配列の直接
検出のための標準法に使用することができる。
本発明のその他の特徴および利点は、以下に示すその好
ましい具体化の説明および特許請求の範囲から明らかで
あろう。
ましい具体化の説明および特許請求の範囲から明らかで
あろう。
構造
「ポリヌクレオチド」という語は、2またはそれ以上の
ヌクレオチビ塩基対を含有するヌクレオチド配列を指す
。これらは、鋳型なしで化学的に、または単一または二
重鎖のボ゛リヌクレオチド鋳型を用いて酵素により合成
することができ、あるいは、ゲノム、プラスミL” (
plasmiJ ウィルス、またはその他のベクター中
に遺伝子または遺伝子の部分として存在する天然配列か
ら誘導することができる。本発明に従えば、ポリヌクレ
オチドは1またはそれ以上のアクリジンエステル基また
は発光ランタニド9を用いて標識づけられる。
ヌクレオチビ塩基対を含有するヌクレオチド配列を指す
。これらは、鋳型なしで化学的に、または単一または二
重鎖のボ゛リヌクレオチド鋳型を用いて酵素により合成
することができ、あるいは、ゲノム、プラスミL” (
plasmiJ ウィルス、またはその他のベクター中
に遺伝子または遺伝子の部分として存在する天然配列か
ら誘導することができる。本発明に従えば、ポリヌクレ
オチドは1またはそれ以上のアクリジンエステル基また
は発光ランタニド9を用いて標識づけられる。
アクリジンエステル
アクリジンエステルおよびこれらの合成は、キャンプベ
ル(Campbell)外(前述)、マクカプラ(Mc
Capra) 外の英国特許第1,461,877号お
よびシーハン(Sheehan)の米国特許第3539
574号に記載されておシ、これらは両者ともここで参
照されている。
ル(Campbell)外(前述)、マクカプラ(Mc
Capra) 外の英国特許第1,461,877号お
よびシーハン(Sheehan)の米国特許第3539
574号に記載されておシ、これらは両者ともここで参
照されている。
本発明に有用なアクリジンエステルは、一般式:(式中
、Tは、サルファイド基、アミド基まだは1またはそれ
以上のヒドロキシル基、を含有シテいてもよい飽和また
は不飽和脂肪族鎖である)を有する。Tの長さは、相同
ポリヌクレオチドのハイブリット9形成を有意には妨げ
ないようなものでなくてはならない。好ましくは、Tの
脂肪族鎖中の炭素原子の数は1−10であシ、最も好ま
しくは、2から5までである。Aは離脱基である。好ま
しくは、Aは: である。
、Tは、サルファイド基、アミド基まだは1またはそれ
以上のヒドロキシル基、を含有シテいてもよい飽和また
は不飽和脂肪族鎖である)を有する。Tの長さは、相同
ポリヌクレオチドのハイブリット9形成を有意には妨げ
ないようなものでなくてはならない。好ましくは、Tの
脂肪族鎖中の炭素原子の数は1−10であシ、最も好ま
しくは、2から5までである。Aは離脱基である。好ま
しくは、Aは: である。
発光ランタニド
発光ランタニドは一般に、キレートとして使用される。
ランタニビキレートの例は、ヘミ2(HemmilaX
前述)、ヒント、シュア(Hindshure)外のヨ
ーロッパ特許第0068875号、ソイニ(Soini
) 外の米国特許m4374t2o号;フランク(F
rank) 外の米国特許第4.283382号;フラ
ンク(1’rank)外の米国特許第425Q313号
;ウイーダー(Wieder)外の米国特許第4,35
2,751号;ウイーダ−(wiaer)外の米国特許
第4,432,907号;およびソイニ(Soini)
外のヨーロッパ特許第0103558号;に示され
ており、上記のものはここで参照されている。本発明で
使用されるキレート化剤は、次の性質を有していなくて
はならない:(a)分子の一端は発光ランタニドをキレ
ート化することができなくてはならず、そして(b)分
子の他端は、ポリヌクレオチド配列上のアミン、アミノ
プロピルまたは他の反応基と共有結合することができる
基を有していなくてはならない。一般に、これらのキレ
ート化剤は、下記(A)、 (B)の2構造の1つを有
している; (A) 〔式中、2は、 (a) N=C=8 。
前述)、ヒント、シュア(Hindshure)外のヨ
ーロッパ特許第0068875号、ソイニ(Soini
) 外の米国特許m4374t2o号;フランク(F
rank) 外の米国特許第4.283382号;フラ
ンク(1’rank)外の米国特許第425Q313号
;ウイーダー(Wieder)外の米国特許第4,35
2,751号;ウイーダ−(wiaer)外の米国特許
第4,432,907号;およびソイニ(Soini)
外のヨーロッパ特許第0103558号;に示され
ており、上記のものはここで参照されている。本発明で
使用されるキレート化剤は、次の性質を有していなくて
はならない:(a)分子の一端は発光ランタニドをキレ
ート化することができなくてはならず、そして(b)分
子の他端は、ポリヌクレオチド配列上のアミン、アミノ
プロピルまたは他の反応基と共有結合することができる
基を有していなくてはならない。一般に、これらのキレ
ート化剤は、下記(A)、 (B)の2構造の1つを有
している; (A) 〔式中、2は、 (a) N=C=8 。
(C) ”31
(ここで1<n<10.)
(ここで1≦n<10.)
または
(gJ−CH−C−CH2−W (ここでWはハロゲ
ン、好ましくは臭素である);αD であり、Yはポリアミノカルボキシレート配位子、好ま
しくは、 または (ここでn、mおよびpの各々は別個に、2−4である
) である〕;または (B) 構造 ここで2≦n(10そして2≦rn < 4のDTPA
Ao (勾に示されたキレート化剤は、一般的にヘミラ(He
+nm1la)外、〔アナリテイカル・バイオケミス
ト リ イ (Amalytical Binche
mistry) l 37 :335.1984
)に記載されているように、市販品として入手できる化
合物から合成することができる。DTPAA (上記
Bに示されている)の合成は、エムΦビー・ベイリイ(
M、P、Ba1leY) 外、アナリスト(Anal
yst)、 109.1449.1984に示されてい
る。ポリヌクレオチドヲ、Zが上記式〇〇に示された通
りであるキレートで標識付けしようとするときは、この
ポリヌクレオチドは、キレートが結合できるようにする
ために、まずアミノチオランと反応させねばならない。
ン、好ましくは臭素である);αD であり、Yはポリアミノカルボキシレート配位子、好ま
しくは、 または (ここでn、mおよびpの各々は別個に、2−4である
) である〕;または (B) 構造 ここで2≦n(10そして2≦rn < 4のDTPA
Ao (勾に示されたキレート化剤は、一般的にヘミラ(He
+nm1la)外、〔アナリテイカル・バイオケミス
ト リ イ (Amalytical Binche
mistry) l 37 :335.1984
)に記載されているように、市販品として入手できる化
合物から合成することができる。DTPAA (上記
Bに示されている)の合成は、エムΦビー・ベイリイ(
M、P、Ba1leY) 外、アナリスト(Anal
yst)、 109.1449.1984に示されてい
る。ポリヌクレオチドヲ、Zが上記式〇〇に示された通
りであるキレートで標識付けしようとするときは、この
ポリヌクレオチドは、キレートが結合できるようにする
ために、まずアミノチオランと反応させねばならない。
合成
官能基の導入
標識付けされるべきポリヌクレオチドは、最初に、アク
リジンエステルと反応することができるアミノプロピル
または第一アミン基のような反応基、または発光ランタ
ニドをキレート化することができる成分1またはそれ以
上の導入により官能化しなくてはならない。このような
官能基は、次にポリヌクレオチドの化学的または酵素的
合成に使用されるヌクレオチドに結合させることができ
る。別法として、官能基を、存在するポリヌクレオチド
に化学的に結合させることもできる。
リジンエステルと反応することができるアミノプロピル
または第一アミン基のような反応基、または発光ランタ
ニドをキレート化することができる成分1またはそれ以
上の導入により官能化しなくてはならない。このような
官能基は、次にポリヌクレオチドの化学的または酵素的
合成に使用されるヌクレオチドに結合させることができ
る。別法として、官能基を、存在するポリヌクレオチド
に化学的に結合させることもできる。
モツク(M○ck)により記載された(1985年5月
15日に出願され、本出願人と同一人に■渡された米国
特許出願筒734,323号、これによって参照されて
いる)もののような塩基同族体を、通常の塩基の代りに
、ポリヌクレオチドの合成の間に組み入れることができ
る。これらは、分子の末端に組み入れられ、次に続く塩
基を必要に応じて加え得るものであり、そしてアクリジ
ンエステルまたは発光ランタニドキレート化化合物を結
合させることのできるアミノプロピル基、または発光ラ
ンタニドを直接キレート化するのに使用することができ
る基を導入する役目を果す。このような同族体の一般構
造を下に示す: 式中、Dはあらゆる保護基、好ましくは447−ジメト
キントリチル基であり、Gは他のヌクレオチドへの化学
的結合を可能にする基、例えば:であり、Jはアクリジ
ンエステルまたはランタニドキレート化化合物と反応す
ることができるか、または発光ランタニド9をキレート
化することのできる基である。Jの例は: (a) −HN(CH) NHCOCF’ ここ
で1≦n<10゜2 n 3′ および(c) である。
15日に出願され、本出願人と同一人に■渡された米国
特許出願筒734,323号、これによって参照されて
いる)もののような塩基同族体を、通常の塩基の代りに
、ポリヌクレオチドの合成の間に組み入れることができ
る。これらは、分子の末端に組み入れられ、次に続く塩
基を必要に応じて加え得るものであり、そしてアクリジ
ンエステルまたは発光ランタニドキレート化化合物を結
合させることのできるアミノプロピル基、または発光ラ
ンタニドを直接キレート化するのに使用することができ
る基を導入する役目を果す。このような同族体の一般構
造を下に示す: 式中、Dはあらゆる保護基、好ましくは447−ジメト
キントリチル基であり、Gは他のヌクレオチドへの化学
的結合を可能にする基、例えば:であり、Jはアクリジ
ンエステルまたはランタニドキレート化化合物と反応す
ることができるか、または発光ランタニド9をキレート
化することのできる基である。Jの例は: (a) −HN(CH) NHCOCF’ ここ
で1≦n<10゜2 n 3′ および(c) である。
ホIJヌクレオチビを官能化するには、後の2つの例(
bおよびC)を、合成ポリヌクレオチドへの組み入れ後
に塩基によって加水分解しなくてはならない。このよう
な反応は、結果的に、構造二〇 0−P−0 (ここで、lおよびmばOまたは正の整敬であり、kば OHOH または の、d +)ヌクレオチドを形成することになる。発光
ランタニドは直接、これらの後者の化合物にキレート化
されることができる。
bおよびC)を、合成ポリヌクレオチドへの組み入れ後
に塩基によって加水分解しなくてはならない。このよう
な反応は、結果的に、構造二〇 0−P−0 (ここで、lおよびmばOまたは正の整敬であり、kば OHOH または の、d +)ヌクレオチドを形成することになる。発光
ランタニドは直接、これらの後者の化合物にキレート化
されることができる。
このような化学的に合成された官能化d IJヌクレオ
チビの例は、自動化された亜リン酸塩合成によシ、合成
33塩基対ポリヌクレオチドの両末端にC−4アミノプ
ロピル−変形されたシチジンが組み入れられているもの
である。このようなポリヌクレオチド9は、次式: %式% の構造を有している。
チビの例は、自動化された亜リン酸塩合成によシ、合成
33塩基対ポリヌクレオチドの両末端にC−4アミノプ
ロピル−変形されたシチジンが組み入れられているもの
である。このようなポリヌクレオチド9は、次式: %式% の構造を有している。
酵素によるポリヌクレオチド合成
下に示したもののような、反応性またはアミン官能性を
有する変形されたヌクレオチ)” [o1族体を、単一
または二重鎖の鋳型を利用して、ポリヌクレオチド標識
付けの間に、通常の三すン酸化ヌクンオチド塩基の代り
に組み入れることができる。このような三すン酸化ヌク
レオチビの例は:(ここでXはH(DNA)まだは0H
(RNA)であり、2≦n≦10) である。
有する変形されたヌクレオチ)” [o1族体を、単一
または二重鎖の鋳型を利用して、ポリヌクレオチド標識
付けの間に、通常の三すン酸化ヌクンオチド塩基の代り
に組み入れることができる。このような三すン酸化ヌク
レオチビの例は:(ここでXはH(DNA)まだは0H
(RNA)であり、2≦n≦10) である。
このような酵素法の例には、DNAアーゼIを加えるか
または加えないで、DNAポリメラーゼを用いる二重鎖
DNAのニックトランスレーション(nick tra
nslatiOn) ; D N AポリメラーゼI(
フレノウ断片)を用いる二重鎖領域からの単一鎖DNA
のゾライマ−(primer)伸長;DNAの末端デオ
キシトランスフェラーゼテーリング(taning);
または糖成分上に2′および3′ヒドロキシル基を有す
る同族体および二重鎖領域を滲なう単一鎖DNA祷型に
ついてのRNAポリメラーゼの使用〔マニアテイス(M
aniat、is)外、1982モレキユラー・クロー
ニング(MolecularCunning) 、ア・
ラボラトリイ・マニ二アル ゛(A Labnratn
ry Manual)、コールド・スプリング+1 ハ
ーバ−研究所(Cold SpringHarbarL
abnratnry) 、 ニュー ヨーク州、コール
)”@、Xプリン/拳ハーバー2私書箱100);が含
まれる。
または加えないで、DNAポリメラーゼを用いる二重鎖
DNAのニックトランスレーション(nick tra
nslatiOn) ; D N AポリメラーゼI(
フレノウ断片)を用いる二重鎖領域からの単一鎖DNA
のゾライマ−(primer)伸長;DNAの末端デオ
キシトランスフェラーゼテーリング(taning);
または糖成分上に2′および3′ヒドロキシル基を有す
る同族体および二重鎖領域を滲なう単一鎖DNA祷型に
ついてのRNAポリメラーゼの使用〔マニアテイス(M
aniat、is)外、1982モレキユラー・クロー
ニング(MolecularCunning) 、ア・
ラボラトリイ・マニ二アル ゛(A Labnratn
ry Manual)、コールド・スプリング+1 ハ
ーバ−研究所(Cold SpringHarbarL
abnratnry) 、 ニュー ヨーク州、コール
)”@、Xプリン/拳ハーバー2私書箱100);が含
まれる。
存在するポリヌクレオチドの官能化
ポリヌクレオチドは、例えば、BSPSE (ランデ
ス(Landes ) * 前述〕を用いる、主にアデ
ニンおよびシトシン残基でのアルキル化によって化学的
に変形されることができる。別法として、先に標識付け
したポリヌクレオチドまたはポリリジンは、例えば、カ
ルボジイミド結合〔・・ロラン(Hallnran)外
、ジャーナル・オメ・イムノロシイ(Jr+urnal
nf 工mmunnlogy)、 96 : 373
゜1966) を用いて、第二のポリヌクレオチドに
共有結合により結合させることができる。ポリリジンは
また、ここに参照されているワード’(Ward)のヨ
ーロッパ特許第0063879号によシ記載されている
ように標識付けの前にg IJヌクレオチビの51末端
に結合させることもできる。
ス(Landes ) * 前述〕を用いる、主にアデ
ニンおよびシトシン残基でのアルキル化によって化学的
に変形されることができる。別法として、先に標識付け
したポリヌクレオチドまたはポリリジンは、例えば、カ
ルボジイミド結合〔・・ロラン(Hallnran)外
、ジャーナル・オメ・イムノロシイ(Jr+urnal
nf 工mmunnlogy)、 96 : 373
゜1966) を用いて、第二のポリヌクレオチドに
共有結合により結合させることができる。ポリリジンは
また、ここに参照されているワード’(Ward)のヨ
ーロッパ特許第0063879号によシ記載されている
ように標識付けの前にg IJヌクレオチビの51末端
に結合させることもできる。
アクリジンエステルの付加
1またはそれ以上の反応性第一アミン基を用いて官能化
されたポリヌクレオチド9は、下記の実施例に示すよう
に、アクリジンエステルで容易に標識付けされる: 実施例 ポリヌクレオチドの標識付けの前に、アクリジンエステ
ルのは下に示すようにして合成されるニアクリジン−9
−カルボ/r1!(870rn9)を塩化チオニル(l
OmJ)に加え、混合物を3時間油浴中で還流させる
。この反応混合物を回転蒸発器上で真空蒸発させ、転像
残留物を60℃よシ低温に加熱しながら無水ピリジン(
50m/)中に再溶解させる。この溶液を水浴中でl”
Lぼ20℃に冷却した。p−ヒドロキシフェニルプロピ
オン酸n−ヒドロキシこはく酸イミビエステル(1g)
を無水ピリジン(lO+++/)に溶解させ、かくはん
しながら、上記のアクリジン−9カルボン酸塩化物−ピ
リジン溶液に加える。この反応混合物を15−30℃で
ほぼ30分間かくはんした後、かくはんしながら氷水(
250rd”)中に注ぐ。この混合物を分液ロート中に
移して酢酸エチル(250xt)で抽出する。有機相を
分離し、無水硫酸す) IJウム上で乾燥させ、濾過し
て、真空蒸発させる。残留物を無水トルエン(50r)
)から3回蒸発させて、無水ジメトキシエタン(5OW
l)に再溶解させる。こうして得られる溶液を、光線を
通さない容器で約15時間15−30℃に置く。この保
温中に形成されるすべての沈殿を濾去し、溶液をシリカ
ゲルカラム(300グラム)にかけ、溶離溶媒として酢
酸エチルおよびヘキサン(2:1)の溶液を用いてフラ
ッシュクロマトグラフィー〔ダブリュー・シー・ステイ
ル(W、C,5till)外、ゼネラルφオプ・オーガ
ニック・ケミストリイ(General nf Org
anic Chemistry)(1978) 。
されたポリヌクレオチド9は、下記の実施例に示すよう
に、アクリジンエステルで容易に標識付けされる: 実施例 ポリヌクレオチドの標識付けの前に、アクリジンエステ
ルのは下に示すようにして合成されるニアクリジン−9
−カルボ/r1!(870rn9)を塩化チオニル(l
OmJ)に加え、混合物を3時間油浴中で還流させる
。この反応混合物を回転蒸発器上で真空蒸発させ、転像
残留物を60℃よシ低温に加熱しながら無水ピリジン(
50m/)中に再溶解させる。この溶液を水浴中でl”
Lぼ20℃に冷却した。p−ヒドロキシフェニルプロピ
オン酸n−ヒドロキシこはく酸イミビエステル(1g)
を無水ピリジン(lO+++/)に溶解させ、かくはん
しながら、上記のアクリジン−9カルボン酸塩化物−ピ
リジン溶液に加える。この反応混合物を15−30℃で
ほぼ30分間かくはんした後、かくはんしながら氷水(
250rd”)中に注ぐ。この混合物を分液ロート中に
移して酢酸エチル(250xt)で抽出する。有機相を
分離し、無水硫酸す) IJウム上で乾燥させ、濾過し
て、真空蒸発させる。残留物を無水トルエン(50r)
)から3回蒸発させて、無水ジメトキシエタン(5OW
l)に再溶解させる。こうして得られる溶液を、光線を
通さない容器で約15時間15−30℃に置く。この保
温中に形成されるすべての沈殿を濾去し、溶液をシリカ
ゲルカラム(300グラム)にかけ、溶離溶媒として酢
酸エチルおよびヘキサン(2:1)の溶液を用いてフラ
ッシュクロマトグラフィー〔ダブリュー・シー・ステイ
ル(W、C,5till)外、ゼネラルφオプ・オーガ
ニック・ケミストリイ(General nf Org
anic Chemistry)(1978) 。
第43巻、2923)によシ精製する。純粋な分画を合
わせて、テフロン(Tsflnn) 47 trys
0.45μmフィルターを通して清適し、真空蒸発させ
る。
わせて、テフロン(Tsflnn) 47 trys
0.45μmフィルターを通して清適し、真空蒸発させ
る。
収率はほぼ36%である。これを無水クロロホルム(2
5+、xl )に再溶解させ、混合物にフルオルスルホ
ン酸メチル(1,1m1)を加えて、15−30℃で約
20時間かくはんする。形成される沈殿を濾去し、無水
トルエンで3回すしてジメトキシエタンで2回洗浄する
。乾燥させた結晶を乾燥させ、−20℃で光から保護し
て貯蔵する。最終的な収量は、純粋なアクリジンエステ
ル123 )1ぼ556■である。
5+、xl )に再溶解させ、混合物にフルオルスルホ
ン酸メチル(1,1m1)を加えて、15−30℃で約
20時間かくはんする。形成される沈殿を濾去し、無水
トルエンで3回すしてジメトキシエタンで2回洗浄する
。乾燥させた結晶を乾燥させ、−20℃で光から保護し
て貯蔵する。最終的な収量は、純粋なアクリジンエステ
ル123 )1ぼ556■である。
官能化DNA(構造(22に示されたように両端を第一
アミン基で官能化されだ33塩基対の、l IJヌクレ
オチビ)100μ9を、水(190μl)、NaC1(
5M溶液toμl)およびNaHCO3(5チ溶液25
μl)と混合する。0,10および20分で、アクリジ
ンエステル(2り(ンメチルホルムアミビ中の60μM
原液83μl)を加える。
アミン基で官能化されだ33塩基対の、l IJヌクレ
オチビ)100μ9を、水(190μl)、NaC1(
5M溶液toμl)およびNaHCO3(5チ溶液25
μl)と混合する。0,10および20分で、アクリジ
ンエステル(2り(ンメチルホルムアミビ中の60μM
原液83μl)を加える。
さらに10分後に、Na(J (200mM)を含有す
るクエン酸塩(100mM溶液500A7.pH5,5
)を加える。こうして得られる標識付けしたポリヌクレ
オチドを、Na(J(200mM)を廿有するクエン酸
塩(l OOmM、 pE(5)で平衡させたセファ
デクス(Sephadex)G 25カラム上で精製し
た。
るクエン酸塩(100mM溶液500A7.pH5,5
)を加える。こうして得られる標識付けしたポリヌクレ
オチドを、Na(J(200mM)を廿有するクエン酸
塩(l OOmM、 pE(5)で平衡させたセファ
デクス(Sephadex)G 25カラム上で精製し
た。
1 u
ポリヌクレオチド鎖
のポリヌクレオチドゝが得られる。
■ま光はそれ以上のアミノプロピル基で官能化されたポ
リヌクレオチド〔モツク(Mnck) 外、前述、参照
〕を、発光ランタニドがこのポリヌクレオチげに結合す
ることができるように、発光ランタニドヤレートと混合
する。例えば、ポリヌクレオチド50μ9(構造器に示
されている)を、トリエチルアミン(5μ9)および式
: のユーロピウムキレート(315μ9.硼酸ナトリウム
緩衝液0.2 M、 p)19.5に溶解させたもの
)と混合して、15°−30℃に3時間放置する。
リヌクレオチド〔モツク(Mnck) 外、前述、参照
〕を、発光ランタニドがこのポリヌクレオチげに結合す
ることができるように、発光ランタニドヤレートと混合
する。例えば、ポリヌクレオチド50μ9(構造器に示
されている)を、トリエチルアミン(5μ9)および式
: のユーロピウムキレート(315μ9.硼酸ナトリウム
緩衝液0.2 M、 p)19.5に溶解させたもの
)と混合して、15°−30℃に3時間放置する。
この標識付けしたポリヌクレオチドを、硼酸ナトリウム
(0,1M、pH8,0)で平衡させたセファデクス(
Sephadex) G 50−80カラム上で精製
し、必要があれば、移動相として酢酸トリエチルアンモ
ニウム(0,1M、 pH7,0) およびアセト
ニトリルの混合物を用いる逆相HPLCによシ゛さらに
精製する。この方法によれば、構造:■ のポリヌクレオチドが形成される。別の出発キレートを
使用すると、上記の方法で構造:Q−NH−[(−L または Q−NH−C−L NH (ここでl≦n<i o ) または Q、−NH−C−(CH2)n−L(ここでl
≦n≦10) またば Q−1(H−CH2TCH2−L(ここでQは
ポリヌクレオチドであり、Lば である) (ここでl≦n≦10) CH−Co − (E u3 + ) OH 罰 ■ または 2〈尤<10.) のポリヌクレオチドが形成されることになるであろう。
(0,1M、pH8,0)で平衡させたセファデクス(
Sephadex) G 50−80カラム上で精製
し、必要があれば、移動相として酢酸トリエチルアンモ
ニウム(0,1M、 pH7,0) およびアセト
ニトリルの混合物を用いる逆相HPLCによシ゛さらに
精製する。この方法によれば、構造:■ のポリヌクレオチドが形成される。別の出発キレートを
使用すると、上記の方法で構造:Q−NH−[(−L または Q−NH−C−L NH (ここでl≦n<i o ) または Q、−NH−C−(CH2)n−L(ここでl
≦n≦10) またば Q−1(H−CH2TCH2−L(ここでQは
ポリヌクレオチドであり、Lば である) (ここでl≦n≦10) CH−Co − (E u3 + ) OH 罰 ■ または 2〈尤<10.) のポリヌクレオチドが形成されることになるであろう。
検出
標的ホIJヌクレオチドへの標識付けされたポリヌクレ
オチビプローブのハイブリット9形成は、ポール(Pa
ll)ナイロンフィルターまたはそれらの同等物に関す
る標準方法〔マニアテイス(Mania−tis)外、
前述〕Kより実施した。結合された発光ランタニドで標
識付けしたポリヌクレオチドは、LKB蛍光計による時
間分割蛍光を使用して測定“°これは試料中の標的yN
+)ヌクレオチドの尺つる0シグナルの強化は、標識
付けしたフィーにLKB”強化1溶液を加えることによ
つ1することができる。
オチビプローブのハイブリット9形成は、ポール(Pa
ll)ナイロンフィルターまたはそれらの同等物に関す
る標準方法〔マニアテイス(Mania−tis)外、
前述〕Kより実施した。結合された発光ランタニドで標
識付けしたポリヌクレオチドは、LKB蛍光計による時
間分割蛍光を使用して測定“°これは試料中の標的yN
+)ヌクレオチドの尺つる0シグナルの強化は、標識
付けしたフィーにLKB”強化1溶液を加えることによ
つ1することができる。
アクリジンエステル
1されるべき試料のホIJヌクレオチドは、標二よって
普通にニトロセルロースフィルターボさせられた後、次
のようにハイブリッド形成させられる: これらのフィルターは、フィルタ−1立方センチメート
ルあたり100μlの予備ハイブリッド緩衝液を用いて
、48℃で2時間予備ノ・イズリツ1した後、48℃の
アクリジンエステルで標識付けしたオリゴマープローブ
(1dあたり50℃g)を含む緩衝液中で、遮断剤とし
てメチル硫酸メトキシフェナジンを用いるかまたは用い
ないで、2時間ハイブリッド形成させる。この予備ハイ
ブリッドおよびハイブリッド形成緩衝液は、塩化テトラ
メチルアンモニウム(0,9M)、クエン酸ナトリウム
(50mM)、デフ ハーノ(Denhar ts )
(5X)、5DS(Q、1%)、ピロリン酸ナトリウム
(0,1% )、および大腸菌(E、cnll) tR
NA(50η/罰原液L m、lあたり2μl)より成
っている。次にフィルターを15−30℃で、クエン酸
ナトリウム(l OOrn!J、 pH6,5)を含
有する塩化テトラメチルアンモニウム(0,9M ’)
中で4回5分間洗浄する。次に、ポリヌクレオチドが結
合されている領域を切り取って、12X47++L!n
プリスチレン管に入れた酢酸ナトリウム(10mM。
普通にニトロセルロースフィルターボさせられた後、次
のようにハイブリッド形成させられる: これらのフィルターは、フィルタ−1立方センチメート
ルあたり100μlの予備ハイブリッド緩衝液を用いて
、48℃で2時間予備ノ・イズリツ1した後、48℃の
アクリジンエステルで標識付けしたオリゴマープローブ
(1dあたり50℃g)を含む緩衝液中で、遮断剤とし
てメチル硫酸メトキシフェナジンを用いるかまたは用い
ないで、2時間ハイブリッド形成させる。この予備ハイ
ブリッドおよびハイブリッド形成緩衝液は、塩化テトラ
メチルアンモニウム(0,9M)、クエン酸ナトリウム
(50mM)、デフ ハーノ(Denhar ts )
(5X)、5DS(Q、1%)、ピロリン酸ナトリウム
(0,1% )、および大腸菌(E、cnll) tR
NA(50η/罰原液L m、lあたり2μl)より成
っている。次にフィルターを15−30℃で、クエン酸
ナトリウム(l OOrn!J、 pH6,5)を含
有する塩化テトラメチルアンモニウム(0,9M ’)
中で4回5分間洗浄する。次に、ポリヌクレオチドが結
合されている領域を切り取って、12X47++L!n
プリスチレン管に入れた酢酸ナトリウム(10mM。
pH4,75のもの50−)で処理する。試料を、注入
試薬として過酸化水素(0,1% )を含有するNaO
H(0,l Mのもの10(it/)を用イーC、ベル
トールド(Bertbnld) 9500 T光子計数
装置で、化学発光ングナルについて測定する(ピーク領
域積分型)。得られる形を、ポリヌクレオチドを含まな
かったフィルターから得られたものと比較する。遮断剤
試薬は、非特異結合を消去する。
試薬として過酸化水素(0,1% )を含有するNaO
H(0,l Mのもの10(it/)を用イーC、ベル
トールド(Bertbnld) 9500 T光子計数
装置で、化学発光ングナルについて測定する(ピーク領
域積分型)。得られる形を、ポリヌクレオチドを含まな
かったフィルターから得られたものと比較する。遮断剤
試薬は、非特異結合を消去する。
その他の具体化は前記の特許請求の範囲内にある。
Claims (13)
- (1)ヌクレオチドまたはポリヌクレオチド中にアクリ
ジンエステルまたは発光ランタニドを組み入れることよ
り成る、アイソトープを用いないで標識付けしたヌクレ
オチドまたはポリヌクレオチドを合成する方法。 - (2)アクリジンエステルが構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ (式中、Tは、飽和脂肪族鎖、不飽和脂肪族鎖、サルフ
ァイト基を含有する脂肪族鎖、アミド基を含有する脂肪
族鎖、2つのヒドロキシル基を含有する脂肪族鎖から選
択され、Aは離脱基である) を有する、特許請求の範囲第1項に記載の方法。 - (3)発光ランタニドが、式(1)または(2):▲数
式、化学式、表等があります▼(1) 〔式中、Zは、 (a)N=C=S、 (b)▲数式、化学式、表等があります▼(ここでWは
ハロゲンである)、 (c)▲数式、化学式、表等があります▼ (d)N_3 (e)▲数式、化学式、表等があります▼ (ここでVはアルキル基またはフェニル基であり、1≦
n≦10) (f)▲数式、化学式、表等があります▼(ここで1≦
n≦10)および (g)▲数式、化学式、表等があります▼(ここで1≦
n≦10); から選択され、そしてYは (a) ▲数式、化学式、表等があります▼ および(b) ▲数式、化学式、表等があります▼ (ここでn、mおよびpは各々別個に2−4である) から選択される〕; ▲数式、化学式、表等があります▼(2) (ここで2≦n≦10および2≦m≦4) の化合物でキレート化されているものである、特許請求
の範囲第1項に記載の方法。 - (4)A成分が次式: ▲数式、化学式、表等があります▼ の構造を有している、特許請求の範囲第2項に記載の方
法。 - (5)アクリジンエステルまたは発光ランタニドで標識
付けされた第一ヌクレオチドまたは第一ポリヌクレオチ
ド。 - (6)ランタニドがユーロピウム、テルビウムまたはサ
マリウムである、特許請求の範囲第5項に記載の第一ヌ
クレオチドまたは第一ポリヌクレオチド。 - (7)ユーロピウムをキレート化することができる基で
標識付けされたヌクレオチドまたはポリヌクレオチド。 - (8)キレート団が、 ▲数式、化学式、表等があります▼ または ▲数式、化学式、表等があります▼ または ▲数式、化学式、表等があります▼ または ▲数式、化学式、表等があります▼ (ここでn、mおよびpは各々別個に2−4である) または ▲数式、化学式、表等があります▼ (ここで2≦m≦4) である特許請求の範囲第7項に記載のヌクレオチドまた
はポリヌクレオチド。 - (9)アクリジンエステルが、第一ヌクレオチドまたは
第一ポリヌクレオチド上のアミン基に化学的に結合して
いる、特許請求の範囲第6項に記載の上記第一ヌクレオ
チドまたは第一ポリヌクレオチド。 - (10)下記アミン基を包含する第二ヌクレオチドまた
は第二ポリヌクレオチドを下記第一ヌクレオチドまたは
第一ポリヌクレオチドに化学的にまたは酵素を用いて結
合させることにより、アミン基が第一ヌクレオチドまた
は第一ポリヌクレオチドに導入されたものである、特許
請求の範囲第9項に記載の第一ヌクレオチドまたは第一
ポリヌクレオチド。 - (11)ヌクレオチドまたはポリヌクレオチドがユーロ
ピウム、テルビウムまたはサマリウムにキレート化され
ている、特許請求の範囲第8項に記載のヌクレオチドま
たはポリヌクレオチド。 - (12)ヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを化学的
に変形し、アクリジンエステルまたは発光ランタニドを
この変形されたヌクレオチドまたは変形ポリヌクレオチ
ドに結合させることより成る、特許請求の範囲第1項に
記載の方法。 - (13)上記変形が、上記ヌクレオチドまたはポリヌク
レオチドの塩基のアルキル化である、特許請求の範囲第
12項に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US76603885A | 1985-08-15 | 1985-08-15 | |
| US766038 | 1985-08-15 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS6239598A true JPS6239598A (ja) | 1987-02-20 |
| JP2509574B2 JP2509574B2 (ja) | 1996-06-19 |
Family
ID=25075208
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP61191191A Expired - Lifetime JP2509574B2 (ja) | 1985-08-15 | 1986-08-14 | 標識付けした核酸 |
Country Status (4)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0212951B1 (ja) |
| JP (1) | JP2509574B2 (ja) |
| AT (1) | ATE94557T1 (ja) |
| DE (1) | DE3689019T2 (ja) |
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| US5639604A (en) * | 1987-09-21 | 1997-06-17 | Gen-Probe Incorporated | Homogeneous protection assay |
| ATE220796T1 (de) * | 1987-09-21 | 2002-08-15 | Gen Probe Inc | Schutztest |
| US5283174A (en) * | 1987-09-21 | 1994-02-01 | Gen-Probe, Incorporated | Homogenous protection assay |
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- 1986-08-15 DE DE86306305T patent/DE3689019T2/de not_active Expired - Fee Related
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| JPH04121239U (ja) * | 1991-02-16 | 1992-10-29 | 武内プレス工業株式会社 | 通 箱 |
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Also Published As
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