CZ287620B6 - Způsob produkce lidského erythropoietinu - Google Patents
Způsob produkce lidského erythropoietinu Download PDFInfo
- Publication number
- CZ287620B6 CZ287620B6 CZ19994314A CZ431499A CZ287620B6 CZ 287620 B6 CZ287620 B6 CZ 287620B6 CZ 19994314 A CZ19994314 A CZ 19994314A CZ 431499 A CZ431499 A CZ 431499A CZ 287620 B6 CZ287620 B6 CZ 287620B6
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- epo
- cells
- sequence
- human
- dna
- Prior art date
Links
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 19
- 101000987586 Homo sapiens Eosinophil peroxidase Proteins 0.000 title claims abstract description 17
- 102000044890 human EPO Human genes 0.000 title claims abstract description 17
- 101000920686 Homo sapiens Erythropoietin Proteins 0.000 title claims abstract description 6
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 147
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 26
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 11
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 claims abstract description 4
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 claims abstract description 4
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 claims abstract description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 89
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 47
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 40
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 32
- 239000002609 medium Substances 0.000 claims description 20
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 claims description 13
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 claims description 11
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 9
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 claims description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 4
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 claims description 4
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 claims description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 claims 1
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 claims 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 abstract description 4
- 108010092408 Eosinophil Peroxidase Proteins 0.000 description 147
- 102100031939 Erythropoietin Human genes 0.000 description 147
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 88
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 68
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 67
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 33
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 33
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 25
- 101150002621 EPO gene Proteins 0.000 description 22
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 22
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 18
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 18
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 15
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 14
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 14
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 13
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 13
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 13
- 101100007328 Cocos nucifera COS-1 gene Proteins 0.000 description 11
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 11
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 11
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 11
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 10
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 10
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 10
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 10
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 10
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 9
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 9
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 9
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 9
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 8
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 8
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 8
- 101710182846 Polyhedrin Proteins 0.000 description 8
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 8
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 8
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 7
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 7
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 7
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 7
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 7
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 7
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 7
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 6
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 6
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 6
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 6
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 6
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 6
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 5
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 5
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 description 5
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 5
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 5
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 5
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 5
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 208000032467 Aplastic anaemia Diseases 0.000 description 4
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 4
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 4
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 4
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 208000007502 anemia Diseases 0.000 description 4
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 4
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 4
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 4
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 4
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 4
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 3
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 3
- 101100333654 Homo sapiens EPO gene Proteins 0.000 description 3
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 description 3
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 3
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 3
- 230000004989 O-glycosylation Effects 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 3
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 3
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 3
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 210000003013 erythroid precursor cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 3
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 3
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 3
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 150000002402 hexoses Chemical class 0.000 description 3
- 230000001146 hypoxic effect Effects 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 3
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 3
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 3
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 3
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 3
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 3
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WHTVZRBIWZFKQO-AWEZNQCLSA-N (S)-chloroquine Chemical compound ClC1=CC=C2C(N[C@@H](C)CCCN(CC)CC)=CC=NC2=C1 WHTVZRBIWZFKQO-AWEZNQCLSA-N 0.000 description 2
- 241001367049 Autographa Species 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 101000966481 Mus musculus Dihydrofolate reductase Proteins 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 2
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 2
- 241001460678 Napo <wasp> Species 0.000 description 2
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 description 2
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 229960003677 chloroquine Drugs 0.000 description 2
- WHTVZRBIWZFKQO-UHFFFAOYSA-N chloroquine Natural products ClC1=CC=C2C(NC(C)CCCN(CC)CC)=CC=NC2=C1 WHTVZRBIWZFKQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 2
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 2
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 2
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 2
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 2
- 241000701366 unidentified nuclear polyhedrosis viruses Species 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XPBVBZPVNFIHOA-UVBJJODRSA-N Ala-Trp-Val Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N)=CNC2=C1 XPBVBZPVNFIHOA-UVBJJODRSA-N 0.000 description 1
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000013 Ammonium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 102000016605 B-Cell Activating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010028006 B-Cell Activating Factor Proteins 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 1
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 101000909256 Caldicellulosiruptor bescii (strain ATCC BAA-1888 / DSM 6725 / Z-1320) DNA polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 241000272194 Ciconiiformes Species 0.000 description 1
- 108020004638 Circular DNA Proteins 0.000 description 1
- 101150074155 DHFR gene Proteins 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N L-valyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- OKIZCWYLBDKLSU-UHFFFAOYSA-M N,N,N-Trimethylmethanaminium chloride Chemical compound [Cl-].C[N+](C)(C)C OKIZCWYLBDKLSU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 101800000135 N-terminal protein Proteins 0.000 description 1
- MQUQNUAYKLCRME-INIZCTEOSA-N N-tosyl-L-phenylalanyl chloromethyl ketone Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1S(=O)(=O)N[C@H](C(=O)CCl)CC1=CC=CC=C1 MQUQNUAYKLCRME-INIZCTEOSA-N 0.000 description 1
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 206010058116 Nephrogenic anaemia Diseases 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 101100333663 Ovis aries EPO gene Proteins 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 101800001452 P1 proteinase Proteins 0.000 description 1
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 1
- 208000006513 Progressive osseous heteroplasia Diseases 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 101000902592 Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000035415 Reinfection Diseases 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000473945 Theria <moth genus> Species 0.000 description 1
- 101100002024 Thermus aquaticus pstI gene Proteins 0.000 description 1
- 241000990222 Tometes Species 0.000 description 1
- FBVGQXJIXFZKSQ-GMVOTWDCSA-N Tyr-Ala-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N FBVGQXJIXFZKSQ-GMVOTWDCSA-N 0.000 description 1
- WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N Val-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- ZXYPHBKIZLAQTL-QXEWZRGKSA-N Val-Pro-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ZXYPHBKIZLAQTL-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-KBPBESRZSA-N Val-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N Valylglycine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000003277 amino acid sequence analysis Methods 0.000 description 1
- 235000012538 ammonium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 208000020832 chronic kidney disease Diseases 0.000 description 1
- 208000022831 chronic renal failure syndrome Diseases 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000003750 conditioning effect Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- OZRNSSUDZOLUSN-LBPRGKRZSA-N dihydrofolic acid Chemical compound N=1C=2C(=O)NC(N)=NC=2NCC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OZRNSSUDZOLUSN-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 230000010437 erythropoiesis Effects 0.000 description 1
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000004744 fabric Substances 0.000 description 1
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 108010004609 gamma-carboxyglutamyl-gamma-carboxyglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005462 in vivo assay Methods 0.000 description 1
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 1
- 230000026045 iodination Effects 0.000 description 1
- 238000006192 iodination reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 238000006140 methanolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 210000000865 mononuclear phagocyte system Anatomy 0.000 description 1
- JBPWDTQELHPIPV-UHFFFAOYSA-N n-(3,6-dihydro-2h-pyridin-1-yl)pyridine-4-carboxamide Chemical compound C=1C=NC=CC=1C(=O)NN1CCC=CC1 JBPWDTQELHPIPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000003924 normoblast Anatomy 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 239000006880 nzcym-medium Substances 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 1
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 1
- 235000001954 papillon Nutrition 0.000 description 1
- 244000229285 papillon Species 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- HKOOXMFOFWEVGF-UHFFFAOYSA-N phenylhydrazine Chemical compound NNC1=CC=CC=C1 HKOOXMFOFWEVGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940067157 phenylhydrazine Drugs 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920001469 poly(aryloxy)thionylphosphazene Polymers 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 230000007026 protein scission Effects 0.000 description 1
- 238000000734 protein sequencing Methods 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 239000012465 retentate Substances 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 238000007493 shaping process Methods 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 1
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 239000010409 thin film Substances 0.000 description 1
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000001291 vacuum drying Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
- C07K14/505—Erythropoietin [EPO]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/10—Plasmid DNA
- C12N2800/108—Plasmid DNA episomal vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/001—Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination
- C12N2830/002—Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination inducible enhancer/promoter combination, e.g. hypoxia, iron, transcription factor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/42—Vector systems having a special element relevant for transcription being an intron or intervening sequence for splicing and/or stability of RNA
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/60—Vector systems having a special element relevant for transcription from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
- C12N2830/80—Vector systems having a special element relevant for transcription from vertebrates
- C12N2830/85—Vector systems having a special element relevant for transcription from vertebrates mammalian
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2840/00—Vectors comprising a special translation-regulating system
- C12N2840/44—Vectors comprising a special translation-regulating system being a specific part of the splice mechanism, e.g. donor, acceptor
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Hematology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Steroid Compounds (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Způsob produkce lidského erythropoietinu, při němž se ve vhodném médiu kultivují eukaryontní hostitelské buňky, obsahující DNA sekvenci, znázorněnou v tabulce 3 od sekvence ATG kódující počáteční Met do AGA kódující terminální Arg, operativně připojenou k expresní kontrolní sekvenci, a takto vyrobený erythropoietin se oddělí od buněk a média.ŕ
Description
Způsob produkce lidského erythropoietinu
Oblast techniky
Vynález se týká způsobu produkce lidského erythropoietinu.
Dosavadní stav techniky
Erythropoietin (dále označován jako EPO) je cirkulující glykoprotein, který stimuluje tvorbu eiythrocytů ve vyšších organismech, viz Camot a spol., Compt. Rend., 143:384 (1906). Jako takový je EPO někdy označován jako erythrocyty stimulující faktor.
Doba životnosti lidských erythrocytů je asi 120 dnů. Asi 1/120 celkových erythrocytů je denně odbourána v retikulo-endotheliáním systému. Současně je denně produkován relativně konstantní počet erythrocytů, aby byla stále udržena určitá hladina erythrocytů (Guyton, Textbook of Medical Physiology, str. 56 až 60, W. B. Saunders Co., Philadelphia 1976).
Erythrocyty jsou produkovány zráním a diferenciací erythroblastů v kostní dřeni a EPO je faktor, který působí na méně diferencované buňky a indukuje jejich diferenciaci k erythrocytům (viz výše).
EPO je slibným terapeutickým prostředkem pro klinickou léčbu anémie nebo konkrétně renální anémie. V praktické terapii není používání EPO dosud bohužel běžné pro jeho malou dostupnost.
Pro použití EPO jako terapeutického prostředku je třeba uvážit možné problémy antigenicity a proto je výhodné připravovat EPO ze suroviny lidského původu. Je možno například použít lidskou krev nebo moč pacientů, postižených aplastickou anémií nebo podobnými nemocemi, které způsobují vylučování velkého množství EPO. Tyto suroviny však jsou k dispozici v omezeném množství, viz například White a spol,, Rec. Progr. Horm. Res., 16; 219 (1960), Espada a spol., Biochem. Med., 3; 475 (1970), Fisher, Pharmacol. Rev., 459 (1972) a Gordon, Vitam. Horm. (N. Y.) 31; 105 (1973).
Příprava EPO produktů se obvykle prováděla koncentrací a čištěním moči pacientů, vykazujících vysokou úroveň EPO, například pacientů, postižených aplastickou anémií a podobnými nemocemi, viz například patenty USA 4397840, 4303650 a 3865801. Omezená zásoba takovéto moči je překážkou praktického použití EPO, a tudíž je velmi žádoucí připravovat EPO produkty z moči zdravých osob. Problém použití moči zdravých lidí spočívá v jejím nízkém obsahu EPO ve srovnání s anemickými pacienty. Moč zdravých jedinců obsahuje určité inhibiční faktory, které v dostatečně vysoké koncentraci působí proti erythropoese, takže dostatečný terapeutický účinek může být u EPO, získaného z takové moči, dosažen pouze s použitím následujícího významného postupu čištění.
EPO lze rovněž regenerovat z ovčí krevní plazmy a separace EPO z této krevní plazmy poskytla dostatečně potentní a stabilní vodorozpustné preparáty, viz Goldwasser, Control Cellular Dif. Develop., díl A, str. 487 až 494, Alan R. Liss, lne., N. Y. (1981). Lze však očekávat, že ovčí EPO bude pro lidi antigenní.
Běžné izolační a čisticí metody s použitím přírodních zdrojů EPO tedy nejsou adekvátní masové produkci tohoto žádaného terapeutického prostředku.
Sugimoto a spol. v patentu USA 4377513 popisují jeden ze způsobů masové produkce EPO, zahrnující multiplikace in vivo lidských lymfoblastoidních buněk, zahrnujících Namalwa, BALL-1, NALL-1, TALL-1 a JBL.
-1 CZ 287620 B6
Zprávy o produkci EPO jinými metodami genetického inženýrství se objevily ve standardní literatuře. Nebyl však zatím publikován reprodukovatelný způsob výroby ani chemická charakteristika produktu. Předmět tohoto vynálezu naproti tomu představuje reprodukovatelný způsob masové produkce proteinů, vykazujících biologické vlastnosti lidského EPO. Tímto způsobem je možno rovněž produkovat proteiny, které se mohou chemicky lišit od autentického lidského EPO a současně vykazovat podobné (a v některých případech zlepšené) vlastnosti. Pro jednoduchost jsou zde všechny proteiny, vykazující biologické vlastnosti lidského EPO, označovány jako EPO bez ohledu na to, zda s ním jsou nebo nejsou chemicky identické.
Podstata vynálezu
Předmětem vynálezu je způsob produkce lidského eiythropoietinu, jehož podstata spočívá v tom, že se ve vhodném médiu kultivují eukaryotní hostitelské buňky, obsahující DNA sekvenci, znázorněnou v tabulce 3, od sekvence ATG kódující počáteční Met od AGA kódující terminální Arg, operativně připojenou k expresní kontrolní sekvenci, a takto vyrobený erythropoietin se oddělí od buněk a média.
Ve výhodném provedení obsahuje kultivační médium fetální sérum. Jako hostitelské buňky přicházejí v úvahu zvláště savčí buňky, s výhodou buňky COS, CHO, C127 nebo 3T3 a nejvýhodněji buňky 3T3 nebo buňky vaječníků čínského křečka (CHO).
Ve zvláště výhodném provedení způsobu podle vynálezu je DNA sekvence obsažena ve vektoru, který také obsahuje DNA hovězího papilomaviru.
Předložený vynález se tedy týká exprese DNA, která exprimuje překvapivě vysoké hladiny. lidského EPO, jeho exprese a masové produkce aktivního lidského EPO in vitro. Jsou také λϊ popsány vhodné expresní vektory pro produkci EPO, expresní buňky, schémata čištění a příbuzné *; procesy.
Jak je podrobněji dále popsáno, byl EPO získán v částečně čištěné formě a byl dále čištěn do homogenity a štěpen trypsinem za vzniku specifických fragmentů. Tyto fragmenty byly čištěny a sekvenovány. EPO oligonukleotidy byly navrženy a syntetizovány na základě těchto sekvencí. Tyto oligo byly použity ke screeningu lidské genomické knihovny, ze které byl izolován EPO gen.
EPO gen byl ověřen na základě své DNA sekvence, která odpovídala mnoha ze sekvenovaných tryptických proteinových fragmentů. Část genomického klonu pak byla použita pro demonstraci při hybridizaci, že EPO mRNA by mohla být detekována v lidské fetální mRNA (stáří 20 týdnů). Byla připravena cDNA knihovna jater lidského plodu a byla screenována. Byly získány tři EPO cDNA klony (po screeningu.750 000, rekombinantů). Dva z těchto klonů byly stanoveny jako mající plnou délku podle kompletní kódující sekvence a v podstatě 5-konec a 3-konec netranslatované sekvence. Tyto cDNA byly exprimovány jak v SV-40 virem transformovaných opičích buňkách (COS-1 buněčná linie; Gluzman, Cell 23:175-182 (1981)) a buňkách vaječníků čínských křečků (buněčná linie CHO; Urlaub G. a Chasin L. A. Proč. Nati. Acad. Sci. USA 77:4216—4280 (1980)). EPO produkovaný z COS buňky je biologicky aktivní EPO in vitro a in vivo. EPO produkovaný z CHO buněk je také biologicky aktivní in vitro a in vivo.
EPO cDNA klon má zajímavý otevřený čtecí rámeček 14-15 aminokyselin (aminoacids -aa) s iniciátorem a terminátorem ze 20 až 30 nukleotidů (nt) proti směru kódující oblasti. Reprezentativní vzorek E.coli, transfektované klonovaným EPO genem, byl uložen v Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland, který je dostupný pod přírůstkovým číslem ATCC 40153.
-2CZ 287620 B6
Popis obrázků na připojených výkresech
Tabulka 1 je sekvence 87 párů bází exonu lidského EPO genu;
obr. 1 ilustruje detekci EPO mRNA v lidské fetální jatemí mRNA, tabulka 2 ilustruje aminokyselinovou sekvenci EPO proteinu, odvozenou z nukleotidové sekvence lambda-HEPOFL13;
tabulka 3 ilustruje nukleotidovou sekvenci EPO cDNA v lambda-HEPOFL13 (uvedena schematicky na obr. 2) a z ní odvozenou aminokyselinovou sekvenci;
obr. 3 ilustruje relativní polohy DNA inzertů čtyř nezávislých lidských EPO genomických klonů;
obr. 4 představuje mapu zjevné intronové a exonové struktury lidského EPO genu;
tabulka 4 ilustruje DNA sekvenci EPO genu;
obr. 5A, 5B a 5C ilustrují konstrukci vektoru 910(B);
obr. 6 ilustruje SDS polyakrylamidovou gelovou analýzu EPO, produkovaného v COS-1 buňkách, ve srovnání s nativním EPO, tabulka 6 ilustruje nukleotidovou a aminokyselinovou sekvenci EPO klonu, lambda-HEPOFL8;
tabulka 7 ilustruje nukleotidovou a aminokyselinovou sekvenci EPO klonu, lambda-HEPOFL13;
obr. 7 je schematickou ilustrací plazmidu pRkl—4, a obr. 8 je schematickou ilustrací plazmidu pdBPV-MMTneo(342-12).
Předložený vynález se tedy týká produkce lidského EPO in vitro expresí DNA, která byla popsána výše.
V patentové a vědecké literatuře je uváděno mnoho způsobů, vhodných pro produkci rekombinantních proteinů. Obecně tyto techniky zahrnují izolaci nebo syntézu požadované genové sekvence a expresi takové sekvence buď v prokaryotické nebo eukaryotické buňce za použití technik běžně odborníkům známých. Jakmile byl gen izolován, čištěn a inzertován do transfer vektoru (tj. klonován), je zajištěna dostupnost podstatného množství. Vektor s do něj klonovaným genem je transferován do vhodného mikroorganismu nebo buněčné linie, například bakterie, kvasinky, savčích buněk, jako jsou COS-1 buňky (opičí ledviny), CHO (vaječníky čínského křečka), hmyzí buněčné linie a podobně, kde se vektor replikuje při proliferaci mikroorganismu nebo buněčné linie a ze kterých vektor může být izolován běžnými prostředky. Je tak poskytnut obnovitelný zdroj genu pro další manipulace, modifikace a transfery do jiných vektorů nebo jiných míst v tomtéž vektoru.
Exprese může být často dosažena transferováním klonovaného genu ve správné orientaci a čtecím rámečku do vhodného místa v transfer vektoru tak, že translační čtecí postup z prokaryotického nebo eukaryotického genu vede k syntéze proteinového prekurzoru, obsahujícího aminokyselinovou sekvenci, kódovanou klonovaným genem, připojeného kMet nebo aminokoncové sekvenci z prokaryotického nebo eukaryotického genu. V obou případech mohou být signály pro iniciaci transkripce a translace dodány vhodným genomickým fragmentem klonovaného genu. Mnoho specifických technik štěpení proteinů může být použito pro štěpení proteinového prekurzoru, je-li produkován, v požadovaném bodě tak, aby se uvolnila
-3CZ 287620 B6 požadovaná aminokyselinová sekvence, která může být pak čištěna obvyklými prostředky. V některých případech je protein, obsahující požadovanou aminokyselinovou sekvenci, produkován bez potřeby specifických technik štěpení a může být také uvolněn z buněk do extracelulámího růstového média.
Izolace genomického klonu lidského EPO
Lidský EPO byl čištěn do homogenity z moči pacientů, postižených aplastickou anémií, jak popsáno dále. Úplné štěpení tohoto čištěného EPO proteázovým trypsinem poskytlo fragmenty, které byly odděleny vysokotlakovou kapalinovou chromatografií s reverzní fází, získány z gradientových frakcí a podrobeny mikrosekvenční analýze. Sekvence tiyptických fragmentů jsou podtrženy v tabulkách 2 a 3 a jsou podrobněji diskutovány dále. Dvě aminokyselinové sekvence, Val-Asn-Phe-Tyr-Ala-Trp-Lys a Val-Tyr-Ser-Asn-Phe-Leu-Arg, byly zvoleny pro návrh oligonukleotidových sond (vedoucích k oligonukleotidovém poolu 17 nt dlouhému a 32-krát degenerovanému, a oligonukleotidovému poolu 18 nt dlouhému a 128-krát degenerovanému, ze dřívějšího tryptického fragmentu jakož i dvou poolů 14nt dlouhého, vždy 48-krát degenerovaného, z pozdějšího tryptického fragmentu). 32-krát degenerovaný 17merový pool byl použit pro screening lidské genomické DNA knihovny v Ch4A vektoru (22) za použití modifikace Woo-a a O'Malleye v in šitu amplifikačním postupu (47) pro přípravu filtrů pro screening.
Arabské číslice v závorkách (1) až (60) jsou použity pro označení publikací, které jsou uvedeny podle čísel na konci tohoto popisu.
Fágy, hybridizující k 17meru, byly vybrány, spojeny do malých skupin a sondovány se 14merovými a 18merovými pooly. Fágy, hybridizující k 17merovým, 18merovým a 14merovým poolům, byly plakově čištěny a fragmenty byly subklonovány do Ml3 vektorů pro sekvenacL dideoxy-řetězec ukončující metodou podle
-4CZ 287620 B6
O *-» cs txo
Λ « tfi <5 bí) bc bo d <0 <Q ba
Tabulka
-5CZ 287620 B6
| o | >- | |
| ca | —1 | tň |
| a. | <9 | Ή Λ |
| CO | =0 | |
| >- | UJ | <3 |
| <~í | < |
Tabulka
Val Pro Asp Thr Lya Val Asn Plio Tyr Ala Trp t»ya Arg Met Clu Val Gly Gin Gin Ala
-6CZ 287620 B6
Val títu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu
| o fa o α | O *· ♦» JS | 5 > | «, ~ | 1 |
| S w | —' CQ | »4 «4 | ||
| & | 9 | |||
| O | fa | |||
| > | < | a | ||
| a < | 4 < | O £ a. | c | |
| «5 | 9 | fa | fa | |
| > u | 3 | B | B | |
| r* « < | * 4 | c » | x« 5«i b | |
| c c | a «> ·< | ·* 9 «4 | ||
| fa | vt | |||
| w — | « | £ H | ||
| Leu | >> 6 | © M | 9 O u | |
| c | 9 | fa £ | a >» | |
| C | © U | B | fa> | |
| 9 | C | td h | >. | |
| O ►4 | < | < | <5 | |
| O e fa o Ifa | 2? Ξ < | 130 Leu | e W 2< | |
| 9 | 0 | ·* | ||
| £ | 9 | fa | 5 | |
| C | M | 0« | ||
| c | 9 | tí | © | |
| fa í- | O U | < | Ξ | |
| £ | h £ | a «· | e ® | |
| w c. | B | < | < | |
| h | fa | fa | « fa | |
| £ | Λ | © | v | <s *; |
| O | H | ta | ta | ·-« < |
| fa | ·— | « | fa >« | a. M |
| e ta | ♦4) u | < | B | < |
| Ser | fa o ta | a < | 0 > | >» c |
| cl <1 | ta h < | a <a < | tq < | % B |
| 1 a > | s a u | £ A> | © £ P* | ε < |
| 9 O U | >» 6 | 2 C. | 9 © >4 | > O |
Tabulka 2 (pokrač
-7CZ 287620 B6
Tabulka 3 cccgaagcc gsacccccgc cacegcQCCC nctctgccccg acáccgcgcc
| 00 | O H |
| w | C£ CJ |
| CO | 0. CJ |
| 00 | |
| u | |
| u | |
| v | « H |
| u | > O |
| u | U H |
ca
Cd
CO ca co u
M U CO
CJ o u v eo o 00 u
co u
ca co u u u u co M U U u 4 O u
CO gg s o ω tu u
| M ω | *» o | <-» υ |
| v cj | O t-J | « řl |
| CO < | X < | > <j |
| Q U | MU | α h |
| XCJ | l·· CJ | P |
| CJ H | < < | < CJ |
| CJ | |
| — | O |
| c | H |
| •M | CJ |
| μ | H |
| P | CJ |
| u | O |
| P | CJ < |
| 9 | o |
| 4 | H |
| U | O |
| k | O |
| Cl | a |
| tn | ·< |
-8CZ 287620 B6
| u | u | a | ÍO | 14 | « | CO | a |
| u | w | C3 | Π | U | a | w | 44 |
| a | CO | SJ | o | to | . a | CO | U |
| u | 44 | 63 | w | V | u | co | U |
| 40 | u | 44 | u | a · | eo | tŮ | u |
| <o | Q | u | *3 | u | ca | 00 | 44 |
| u | eo | w | Γ3 | -3 | w | u | a |
| o | ro | o | «3 | 20 | 20 | u | 44 |
| c | o | «4 | 20 | co | c3 | eo | |
| u | u | Π | «4 | C3 | a | u | u |
| u | co | u | 44 | u | u | ti | £0 |
| u | u | ca | u | u | u | eo | u |
| u | CO | a | ca | co | u | 44 | 44 |
| υ | Π | co | a | 44 | ri | 44 | 41 |
| 44 | u | a | u | JJ | a | O | LJ |
| u | 44 | ca | co | so | co | U | CO |
| Q | u | «3 | C3 | 14 | <5 | U | S3 |
| «0 | £3 | o | CO | 4J | CO | U | <3 |
| U | <3 | u | π | 44 | ca | u | U |
| u | U | u | co | a | 44 | co | u |
| a | u | ca | ar | e | o | <5 | 44 |
| u | u | u | Q | «3 | u | ta | CO |
| u | u | u | 44 | <3 | <3 . | a | co |
| 14 | u | a | •44 | U | CO | <3 | co |
| a | co | rt | Λ | 60 | 44 | u | co |
| 44 | co | 20 | u | w | a | ω | 44 |
| C3 | ca | eo | co | υ | 20 | 60 | a |
| O | co | <0 | Q | u | CO | «J | U |
| CO | a | eo | O | u | a | eo | W |
| CO | co | a | CO | <3 | v | co | U |
| 54 | < | ||
| z-* | u < | ϋ o | |
| »o | |||
| O | M | o | |
| ÍH | m | 5 | H |
| >4 | » | U | |
| O | |||
| CL. \_z | o u | 5 | |
| s-. | o | ||
| <n | X | H | |
| «3 | F* | O | |
| >! | < | O | |
| c | f- | ||
| R- | ω | ||
| «3 | < | u | |
| H | P | ||
| c | u | ||
| tn | H | ||
| <3 | U | ||
| O | |||
| O | |||
| o | C3 | ||
| O | |||
| < | u | ||
| c | H | ||
| 01 | < | ||
| < | C | ||
| c | < | ||
| u | u | ||
| A. | ω | ||
| O | H | ||
| L. | o | ||
| e. | u |
| « e | |||||||||
| > «4 | ‘5 | CO | U | U | ca | o | CO | 44 | 44 |
| 44 | u | u | a | ca | CO | 14 | U | ||
| <* | O | ca | co | u | so | CO | U | CO | |
| •H | e | u | o | 20 | to | u | co | U | eo |
| C3 | ϋ | a | u | 03 | s3 | 44 | Q | u | 14 |
| CJ | u | co | ca | Ό | u | 44 | u | ||
| u | o | to | a | <3 | 4J | U | u | ||
| O & | o | 4J | a | u | u | u | 0 | a | u |
| iZl v | o | a | Q | 44 | u | 44 | u | u | Q |
| — -< | a | w | ca | C4 | a | <4 | u | co | CO |
CJ £
| 63 | |||||||
| U | 14 | 44 | co | ca | a | to | 00 |
| to | U | *3 | co | c | 44 | ca | |
| ca | U | U | co | co | U | w | Q |
| a | 44 | CO | a | w | O | a | CO |
| v | U | CO | co | u | CJ | eo | |
| u | 0 | 44 | 44 | u | υ | 20 | co |
| u | CO | 14 | co | to | CO | eo | |
| < | u | a | u | u | u | co | eo |
| o | CO | u | <3 | <3 | 44 | u | 44 |
| ř* | o | ca | a | to | U | a | Q |
| u | «3 | u | <3 | u | u | 00 |
| u | U | u | •3 | 14 | 14 | co |
| u | U | ω | eo | eo | u | a |
| tf | co | ¢0 | eo | u | 44 | o |
| •J | w | eo | co | u | 00 | <0 |
| o | co | a | a | o | ca | eo |
| v | <0 | u | u | a | m | a |
| u | o | <3 | co | 14 | u | a |
| a | u | u | u | u | v | eo |
| u | 44 | •j | <0 | 14 | 14 | M |
| <3 | U | co | u | Π | O | «3 |
| U | <3 | 44 | Q | co | 14 | o |
| u | U | a | CO | u | 14 | u |
| 00 | <3 | eo | Π | ca | U | 43 |
| 44 | CO | ca | 63 | eo | a | 43 |
| 20 | 00 | <3 | C3 | a | 20 | co |
| 44 | w | Π | U | eo | w | CO |
| 14 | 40 | •4 | eo | eo | SO | |
| U | O | u | CO | w | w | 14 |
| CO | u | u | 00 | *4 | w | 00 |
aacctcactg acaagaaclg anaccaccaa aaaaaaaaaaua
Sangera a Coulsona (23)(1977). Sekvence regionu, hybridizujícího ke 32násobně degenerovanému 17meru v jednom z klonů, je uvedena v tabulce 1. DNA sekvence obsahuje v otevřeném čtecím rámečku nukleotidy, které by mohly přesně kódovat tryptický fragment, použitý 5 k odvození 17merového poolu oligonukleotidů. Dále analýza DNA sekvence indikuje, že 17merový hybridizující region byl obsažen v 87bp exonu, navázaném v místech potenciálního sestřihu akceptoru a donoru.
Pozitivní potvrzení, že tyto dva klony (zde označené jako lambda-HEPOl a lambda-HEPO2) ío jsou EPO genomické klony, byly získány sekvenováním dalších exonů, obsahujících jiný tryptický fragment kódující informaci.
Izolace EPO cDNA klonů
Byla provedena Northem analýza (56) lidské fetální (20 týdnů staré) jatemí MRNA za použití 95nt jednořetězcové sondy, připravené zM13 klonu, obsahující část 87bp exonu, popsaného v tabulce 1. Jak je ilustrováno na obr. 1, bylo možno detekovat silný signál ve fetální jaderné MRNA. Přesní identifikace tohoto pásu jako EPO MRNA byla provedena za použití stejné sondy ke screeningu bakteriofágové lambda cDNA knihovny fetální jatemí mRNA (25). Bylo získáno několik hybridizujících klonů při frekvenci přibližně 1 pozitivní na 250 000 rekombinantů. Kompletní nukleotid a odvozené od těchto klonů (lambda-HEPOFL13 a lambda-HEPOFL8) jsou uvedeny v tabulkách 5 a 6. EPO kódující informace je obsažena v 594nt v 5-konec polovině cDNA, zahrnující velmi hydrofobní 27 aminokyselinový leadr a 166 aminokyselinový zralý protein.
Identifikace N-konce zralého proteinu byla založena na N-koncové sekvenci proteinu, sekretovaného do moči osob saplastickou anémií, viz tabulka 1, a jak publikoval Goldwasser (26), Sue a Sytkowski (27) a Yangawa (21). Zda tento N-konec (Ala-Pro-Pro-Arg-) představuje skutečný N-konec, navázaný na EPO v oběhu, nebo zda probíhá nějaké štěpení v ledvinách nebo 30 moči, není v současné době známo.
Aminokyselinové sekvence, které jsou podtrženy v tabulkách 2 a m označují ty typické fragmenty nebo části, ze kterých byla získána proteinová sekvence. Dedukovaná sekvence přesně souhlasí s tryptickými fragmenty, které byly sekvenovány, potvrzuje, že izolovaný gen kóduje 35 lidský EPO.
Struktura a sekvence lidského EPO genu
Relativní polohy DNA inzertů čtyř nezávislých lidských EPO genomických klonů jsou uvedeny 40 na obr. 3. Hybridizační analýza těchto klonů s oligonukleotidovými sondami a s různými sondami, připravenými ze dvou tříd EPO cDNA klonů, umísťuje EPO gen do přibližně 3,3 kb oblasti, znázorněné na obr. 3 tmavou čarou. Kompletní sekvenční analýza této oblasti (viz příklad 4) a porovnání s cDNA klony vede k mapě intronové a exonové struktury EPO genu, uvedené na obr. 4. Epo gen je rozdělen do 5 exonů. Část exonu I, celé exony II, III a IV a část exonu V, 45 obsahují protein kódující informaci. Zbylé exony I a V kódují 5-konec a 3-konec netranslatované sekvence.
Přechodná exprese EPO v COS buňkách
K demonstrování, že biologicky aktivní EPO by mohl být exprimován v in vitro buněčném systému, byla provedena COS buněčná expresní studie (58). Vektor, použitý pro přechodné studie, p91023(B), je popsán v příkladu 5. Tento vektor obsahuje adenovirový hlavní pozdní promotor, SV40 polyadenylační sekvenci, SV40 původ replikace, SV40 enhancer a adenovirový VA gen. cDNA inzert v lambda-HEPOFL13 (viz tabulka 6) byla inzertována do p91023(B)
-10CZ 287620 B6 vektoru po směru od hlavního pozdního promotoru. Tento nový vektor je označen jako PPTFL13.
Dvacetčtyři hodiny po transfekci tohoto konstruktu do M6 kmene COS-1 buněk (Horowitz a spol., J. Mol. Appl. Genet. 2:147-149 (1983)), byly buňky promyty, přemístěny do séra prostého média a buňky byly sklizeny o 48 hodin později. Hladina uvolnění EPO do supematantu kultuiy pak byla hodnocena za použití kvantitativní radioimunozkoušky pro EPO (55). Jak je uvedeno v tabulce 8 (příklad 6), byl exprimován imunologicky reaktivní EPO. Biologická aktivita EPO, produkovaného z COS-1 buněk, byla také hodnocena. V odděleném pokuse byl vektor, obsahující EPO cDNA z lambda-HEPOFL13, transfektován do COS-1 buněk a médium bylo sklizeno, jak popsáno výše. EPO v médiu byl pak kvantifikován buď ve dvou in vitro biologických zkouškách, Ή-thymidinem a CFU-E (12, 29), a buď dvěma in vivo zkouškami, hypoxickou myší a vyhladovělou myší (30, 31) (viz tabulka 9, příklad 7). Tyto výsledky demonstrují, že biologicky aktivní EPO je produkován v COS-1 buňkách. Při Westem-blottingu za použití polyklonální anti-EPO protilátky, EPO, produkovaný COS buňkami, má mobilitu na SDS-polyakrylamidových gelech, která je identická s mobilitou nativního EPO, připraveného z lidské moče (příklad 8). Rozsah glykosylace EPO, produkovaného COS-1, může být podobný jako u nativního EPO.
Různé vektory, obsahující jiné promotoiy, mohou být také použity v COS buňkách nebo v jiných savčích nebo eukaryotických buňkách. Příklady takových jiných promotorů, vhodných při provedení vynálezu, zahrnují SV40 časné a pozdní promotory, promotor myšího metallothioneinového genu, promotor, nalezený v dlouhých terminálních opakováních ptačích nebo savčích retrovirech, promotor bakulovirového polyhedron genu a jiné. Příklady typů jiných buněk, vhodných v praktickém provedení tohoto vynálezu, zahrnují E.coli, kvasinkové, savčí buňky, jako jsou CHO (vaječník čínského křečka), Cl27 (opičí epithel), 3T3 (myší fibroblast), CV-1 (ledviny africké opice - Afričan green monkey kidney) a hmyzí buňky, jako jsou buňky ze Spodoptera frugiperda a Drosophila metanogaster. Tyto alternativní promotory a/nebo buněčné typy mohou umožňovat regulaci načasování nebo hladiny EPO exprese, produkce buněčně specifických typů EPO nebo růstu velkých množství EPO produkujících buněk za méně nákladných, snadněji kontrolovatelných podmínek.
Expresní systém, který si zachovává výhody savčí exprese, ale vyžaduje kratší dobu pro redukci vyšší hladiny exprese buněčné linie, se skládá z hmyzí buněčné linie a DNA viru, který se reprodukuje v této buněčné linii. Virus je virus jaderné polyhedrózy. Má dvojvláknový cirkulámí DNA genom o velikosti 128 kb. Nukleokapsid je tyčkovitě tvarován a nalézá se obalen ve dvou formách, neokludované formě viru, prorůstajícího membránou, a okludované formě, obalené v proteinovém krystalu v jádru infikované buňky. Tyto viry mohou být rutinně propagovány v in vitro hmyzí buněčné kultuře a jsou přizpůsobivé všem rutinním virovým metodám u živočichů. Médium buněčné kultury je typicky živný solný roztok a 10% fetální telecí sérum.
In vitro je růst viru iniciován, jestliže neokludovaný virus (NOV) vstupuje do buňky a přechází do jádra, kde se replikuje. Replikace je jaderná. Během počáteční fáze (8-18 h po infekci) virové aplikace jsou nukleokapsidy shromážděny v jádře a následně prorůstají plazmovou membránou jako NOV, a rozšiřují infekci v buněčné kultuře. Navíc některé nukleokapsidy následně (18+ h po infekci) zůstávají v jádře a jsou okludovány v proteinové matrici a jsou známy jako polyhedrální inkluzní tělísko (PIB). Tato forma není v buněčné kultuře infekční. Matrice je složena z proteinu, známého jako polyhedrin, mol. hmotnost 33 kd. Každý PIB má přibližně 1 mm v průměru a v jádře může být až 100 PIB. V pozdní fázi infekčního cyklu je produkován tak velký podíl polyhedrinu, činící až 25 % celkového buněčného proteinu.
Protože PIB nehraje žádnou roli v in vitro replikačním cyklu, může být polyhedrinový gen deletován z virového chromozomu bez ovlivnění životaschopnosti in vitro. Při použití viru jako expresního vektoru byla nahrazena polyhedrinový gen kódující oblast cizí DNA, která má být
-11CZ 287620 B6 exprimována, a byla tak umístěna pod kontrolou polyhedrinového promotoru. Výsledkem je virový fenotyp, netvořící PIB.
Tento systém byl použit několika výzkumníky, z nichž jsou nejčastěji uváděni Pennock a spol. a 5 Smith a spol. Pennock a spol. (Gregory D. Pennock, Charles Shoemaker a Louis K. Miller,
Molecular and Cell Biology 3:84, str. 399-406) popisují vysokou hladinu exprese bakteriálního proteinu, B-galaktosidázy, jestliže je umístěn pod kontrolou polyhedrinového promotoru.
Jiný expresní vektor, odvozený od jaderného polyhedrozního viru, byl popsán Smithem a spol. ío (Gale E. Smith, Max D. Summers a M. J. Fraser, Molecular and Cell Biology, 16. května 1983, str. 2156-2165). Tito autoři demonstrovali účinnost svého vektoru v expresi lidského Binterferonu. Syntetizovaný produkt byl shledán glykosylovaným a sekretovaným z hmyzích buněk, jak bylo očekáváno. V příkladu 14 jsou popsány modifikace plazmidu, obsahujícího Autographa califomica jaderný polyhedrosis virový (AcNPV) polyhedronový gen, které 15 umožňují snadnou inzerci EPO genu do plazmidu, takže může být pod transkripční kontrolou polyhedrinového promotoru. Výsledná DNA je ko-transfektována intaktní chromozómovou DNA ze standardního typu AcNPV do hmyzích buněk. Genetická rekombinace vede k nahrazení AcNPVC oblasti polyhedrinového genu DNA z plazmidu. Výsledný rekombinantní virus může být identifikován mezi virovým potomstvem tím, že vykazuje DNA sekvence EPO genu. Tento 20 rekombinantní virus má po reinfekci hmyzích buněk produkovat EPO.
Příklady EPO exprese v CHO, Cl 27 a 3T3 a hmyzích buňkách jsou uvedeny v příkladech 10 a 11 (CHO), 13 (C127 a 3T3) a 14 (hmyzí buňky).
Rekombinantní EPO, produkovaný v CHO buňkách, jako v příkladu 11, byl čištěn běžnými metodami sloupcové chromatografie. Relativní množství cukrů, přítomných v glykoproteinu, byla analyzována dvěma nezávislými metodami [(i) Reinold, Methods in Enzymol. 50:244-249 (Methanolysis) a (II) Takemoto H. a spol., Anal. Biochem. 145:245 (1985) (pyridylaminace, spolu s nezávislým stanovením kyseliny sialové)]. Výsledky, získané v každé metodě, byly ve 30 vynikajícím souladu. Bylo provedeno několik stanovení, poskytujících následující průměrné hodnoty, kde N-acetylglukosamin je pro srovnávací účely označen hodnotou 1:
| Cukr | Relativní molámí hladina | |
| N-acetylglukosamin | 1 | |
| hexózy: | 1,4 | |
| galaktóza | 0,9 | |
| mannóza | 0,5 | |
| kyselina N-acetyl- | ||
| uraminová | 1 | |
| fukóza | 0,2 | |
| N-acetylgalaktosam in | 0,1 |
Je třeba uvést, že významné hladiny fiikózy a N-acetylgalaktosaminu byly reprodukovatelně pozorovány za použití obou nezávislých metod analýzy cukrů. Přítomnost N-acetylgalaktosaminu indikuje přítomnost O-napojené glykosylace na proteinu. Přítomnost O-napojené glykosylace byla dále indikována SDS-PAGE analýzou glykoproteinu s následujícím štěpením glykoproteinu s různými kombinacemi glykosidických enzymů. Po enzymatickém odštěpení všech N-napojených karbohydrátů na glykoproteinech za použití enzymu peptid endo F N40 glykosidáza, byla molekulová hmotnost proteinu dále snižována následujícím štěpením s neuraminidázami, jak bylo stanoveno pomocí SDS-PAGE analýzy.
In vitro biologická aktivita čištěného rekombinantního EPO byla zkoušena metodou G. Krystala, Exp. Hematol. 11:649 (1983) (biozkouška proliferace slezinných buněk) s proteinovými ukončeními, vypočtenými na základě údajů o aminokyselinovém složení. Po vícenásobných
-12CZ 287620 B6 ukončeních byla in vitro specifická aktivita čištěného rekombinantního EPO vypočtena jako vyšší než 200 000 jednotek/mg proteinu. Průměrná hodnota byla v rozmezí asi 275 000- 300 000 jednotek/mg proteinu. Navíc byly také pozorovány hodnoty vyšší než 300 000. Poměry in vivo/polycytemická zkouška na myších, Kazal a Erslev, Am. Clinical Lab. Sci., Vel. B, str. 91 (1975)/in vitro aktivity, pozorované pro rekombinantní materiál, byly v rozmezí 0,7 až 1,3.
Je zajímavé porovnat glykoproteinové charakteristiky, uvedené výše pro rekombinantní CHOprodukovaný EPO materiál, dříve uvedený v mezinárodní patentové přihlášce č. WO 85/02610 (publikované 20. června 1985). Odpovídající srovnatelná analýza cukrů, popsaná na str. 65 této přihlášky, udává nulovou hodnotu pro fukózu a pro N-acetylgalaktosamin a poměr hexózy:Nacetylgalaktosamin 15,09:1. Nepřítomnost N-acetylgalaktosaminu indikuje nepřítomnost Onapojené glykosylace ve dříve uváděném glykoproteinu. Na rozdíl od tohoto materiálu, rekombinantní CHO-produkovaný EPO podle tohoto vynálezu, který je charakterizován výše, obsahuje významná a reprodukovatelná pozorovatelná množství jak fukózy, tak Nacetylgalaktosaminu, obsahuje méně než jednu desetinu relativního množství hexóz a je charakterizován přítomností O-napojené glykosylace. Dále může být vysoká specifická aktivita výše popsaného CHO-získaného rekombinantního EPO podle tohoto vynálezu přímo vztažena ke svému charakteristickému glykosylačnímu uspořádání.
Biologicky aktivní lidský erythropoietin, produkovaný podle vynálezu eukaryotickou expresí klonované DNA pro EPO, která byla definována výše, může být použit lékaři a/nebo veterináři pro in vivo léčbu savců. Množství účinné složky bude samozřejmě záviset na intenzitě léčené choroby, zvoleném způsobu podávání a specifické aktivitě aktivního EPO a v konečné podobně bude stanoveno příslušným lékařem nebo veterinářem. Takové množství aktivního EPO, stanovené příslušným lékařem, je zde také označováno jako „léčebně účinné EPO“ množství. Například v léčbě indukované hypoproliferativní anémie, spojené s chronickým selháním ledvin u ovce, bylo účinné denní množství EPO nalezeno 10 jednotek/kg po 15 až 40 dnů. Viz Eschbach a spol., J. Clin. Invest., 74:434 (1984).
Účinný EPO může být podáván jakýmkoliv způsobem, vhodným pro stav, který je léčen. Výhodně je EPO injektován do krevního proudu léčeného savce. Odborníkovi v oboru bude zřejmé, že preferovaný způsob podání se bude měnit podle léčeného stavu.
U účinného EPO je možné, aby byl podáván jak jako čistá, tak v podstatě čistá sloučenina, je výhodná ho podávat ve formě farmaceutické formulace nebo preparátu.
Formulace (tj. kompozice či prostředky) jak pro veterinární, tak humánní použití, obsahují účinný EPO protein, jak je popsán výše, spolu s jedním nebo více jeho farmaceuticky přijatelnými nosiči a popřípadě další terapeutické složky. Nosič(e) musí být přijatelné vtom smyslu, že jsou kompatibilní s jinými složkami formulace a neškodí jejímu příjemci. Je žádoucí, aby formulace neobsahovala oxidační činidla a jiné substance, o kterých je známo, že nejsou speptidy kompatibilní. Formulace může být výhodně ve formě jednotkové dávkové formy a může být připravena jakoukoliv metodou, známou v oboru farmacie. Všechny metody zahrnují stupeň uvedení do spojení účinné složky s nosičem, který tvoří jedna nebo více pomocných složek. Obecně jsou formulace připraveny homogenním a dokonalým spojením účinné složky s kapalnými nosiči nebo jemně dělenými pevnými nosiči nebo oběma typy nosičů, a pak jsou, jeli to nezbytné, tvarovány produkty do požadovaného tvaru.
Formulace, vhodné pro parenterální podání, obvykle zahrnují sterilní vodné roztoky účinné složky s roztoky, které jsou výhodně izotonické s krví příjemce. Takové formulace mohou být výhodně připraveny rozpuštěním pevné účinné složky ve vodě za vzniku vodného roztoku a sterilizací roztoku v jedno nebo vícedávkových nádobkách, například zatavených ampulích nebo lahvičkách.
-13CZ 287620 B6
Výraz „EPO/cDNA“, používaný v tomto textu, zahrnuje zralý EPO/cDNA gen, jemuž předchází ATG kodon, a EPO/cDNA kódující EPO protein, znázorněný v tabulkách 2 a 3. Epo protein zahrnuje 1-methioninový derivát EPO proteinu (Met-EPO). Zralý EPO protein, ilustrovaný sekvencemi v tabulce 2, začíná sekvencí Ala-Pro-Pro-Arg..., jejíž začátek je v tabulce 2 označen číslem „1“. Met-EPO by začínal sekvencí Met-Ala-Pro-Prc-Arg...
Následující příklady slouží lepšímu porozumění vynálezu, jehož rozsah je dán připojenými nároky. Všechny teploty jsou udávány ve stupních Celsia a nejsou korigovány. Symbol mikron nebo mikro, např. mikrolitr, mikromol atd., je „u“, např. ul, um atd.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Izolace genomického klonu EPO
EPO byl čištěn z moči pacientů s aplastickou anémií v podstatě, jak bylo popsáno dříve (Miyake a spol., J. Biol. Chem., 252:5558 (1977)) stím rozdílem, že bylo vynecháno zpracování s fenolem a nahrazeno tepelným zpracováním při 80 stupních po 5 min pro inaktivaci neuraminidázy. Konečný stupeň v čištění byla frakcionace na C-4 Vydac HPLC koloně (The Separation Group) s použitím 0 až 95% acetonového gradientu s 0,1% kyselinou trifluoroctovou (TFA) během 100 minut. Poloha EPO v gradientu byla stanovena gelovou elektroforézou a Nterminální sekvenční analýzou (21, 26, 27) hlavních píků. EPO byl eluován přibližně 53% acetonitrilem a představuje přibližně 40 % proteinu, podrobeného HPLC s reverzní fází. Frakce, obsahující EPO, byly odpařeny na 100 μΐ, upraveny na pH 7,0 hydrogenuhličitanem amonným, dokonale štěpeny 2% TPCK-zpracovaným trypsinem (Worthington) po 18 hodin při 37 stupních. Produkt tryptického štěpení byl pak podoben HPLC s reverzní fází, jak je popsáno výše. Byla sledována optická hustota jak při 280, tak 214 nm. Dobře oddělené píky byly odpařeny téměř dosucha a podrobeny přímo N-terminální aminokyselinové sekvenční analýze (59) za použití Applied Biosystems Model 480Ab sekvenátoru v plynné fázi. Získané sekvence jsou v tabulkách 2 a 3 podtrženy. Jak je zde uvedeno výše, byly dva z těchto tryptických fragmentů zvoleny pro syntézu oligonukleotidových sond. Ze sekvence Val-Asn-Phe-Tyr-Ala-Trp-Lys byly připraveny (aminokyseliny 46 až 52 v tabulkách 2 a 3)
17mer 32násobné degenerace TTCCANGCGTAGAAGTT, a 18 mer 128násobné degenerace CCANGCGTAGAAGTTNAC.
Ze sekvence Val-Tyr-Ser-Asn-Phe-Leu-Arg (aminokyseliny 144 až 150 v tabulkách 2 a 3) byly připraveny dva pooly 14merů, každý 32násobně degenerován
TACACCTAACTTCCT a TACACCTAACTTCTT, které se liší v první poloze připraveného leucinového kodonu. Oligonukleotidy jsou značeny na 5-konec konci pomocí 32P použitím polynukleotid-kinázy (New England Biolabs) a gamma 32PATP (New England Nuclear). Specifická aktivita oligonukleotidů se měnila mezi 1000 a 3000 Ci/mmol oligonukleotidu. Lidská genomická DNA knihovna v bakteriofágu lambda (Laen a spol., 22) byla screenována za použití modifikace in šitu amplifikačního postupu, původně popsaného Woo-em a spol. (47)(1978). Přibližně 3,5 x 105 fágů bylo umístěno v hustotě 6000 fágů na 150 mm Petriho misku (NZCYM médium) a inkubováno při 37 stupních do viditelných plaků, které jsou však malé (přibližně 0,5 mm). Po 1 hodině chlazení při 4 stupních byly duplikátové kopie vzorků plaků přeneseny na nylonové membrány (New England Nuclear) a inkubovány přes noc při 37 stupních na čerstvých NZCYM plotnách. Filtry pak byly denaturovány a neutralizovány lOminutovým pobytem vždy po 10 min na tenkém filmu 0,5N NaOH - 1M NaCl a 0,5M Tris (pH 8) - 1M NaCl. Po vakuovém sušení při 80 stupních po 2 hodiny byly filtry promyty v 5 x SSC, 0,5% SDS po 1 h a buněčné zlomky na povrchu filtru
-14CZ 287620 B6 byly odstraněny mírným škrabáním vlhkou tkaninou. Toto škrabání redukuje podstatnou vazbu sondy k filtrům. Filtry pak byly promyty vodou a prehybridizovány po 4 až 8 hodin při 48 stupních ve 3M tetramethylamoniumchloridu, 10 mM NaPO4 (pH6,8), 5 x Denhardtově roztoku, 0,5% SDS a lOmM EDTA. 32P značený 17mer byl pak přidán v koncentraci 0,1 pmol/ml a hybridizace byla provedena při 48 stupních po 72 h. Po hybridizaci byly filtry intenzivně promyty 2 x SSC (0,3M NaCl- 0,03M Na-citrát, pH 7) při teplotě místnosti a pak 1 h ve 3M TMAC1 - 10 mm NaPO4 (pH 6,8) při teplotě místnosti a od 5 do 15 min při hybridizační teplotě. Přibližně 120 silných duplikátových signálů bylo detekováno 2 dny po autoradiografii za intenzifikačního screeningu. Pozitiva byla vybrána, shromážděna po 8 a znovu třikrát rescreenována za použití jedné poloviny 14merového poolu na každém ze dvou filtrů a 127 meru na třetím filtru. Podmínky a 17mer pro umístění na plotnu jsou popsány výše s výjimkou, že hybridizace pro 14mer byla při 37 stupních. Po autoradiografii byly sondy odstraněny ze 17merového filtru v 50% formamidu po 20 min při teplotě místnosti a filtrát byl rehybridizován při 52 stupních s 18merovou sondou. Dva nezávislé fágy hybridizují ke všem třem sondám. DNA z jednoho z těchto fágů (zde označen lambda HEPO1) byla dokonale štěpena pomocí Sau3A a subklonována do M13 pro DNA sekvenční analýzu za použití dideoxy řetězec terminující metody podle Sangera a Coulsona, (23)(1977). Nukleotidová sekvence a odvozená aminokyselinová sekvence otevřeného čtecího rámečku, kódující pro EPO tryptický fragment (podtržená oblast), jsou zde popsány. Intronové sekvence jsou uvedeny malými písmeny, exonové sekvence (87nt) velkými písmeny. Sekvence, které souhlasí s místy akceptorového (a) a donorového (d) střihu, jsou podtrženy (viz tabulka 4).
Příklad 2
Northem analýza mRNA jater lidského plodu ug mRNA jater lidského plodu (připravené z jater 20týdenního lidského fetu) a mRNA jater dospělého člověka bylo elektroforezováno v 0,8% agarosovém formaldehydovém gelu a transferováno na nitrocelulózu za použití metody Dermana a spol., Cell, 23:731 (1981). Jednořetězcová sonda pak byla připravena z M13 templátu, obsahujícího inzert, ilustrovaný v tabulce 1. Konec byl 20mer, získaný ze stejného tryptického fragmentu, jako původní 17merová sonda. Sonda byla připravena, jak popsal Anderson a spol., PNAS, (50)(1984) s tím rozdílem, že následuje štěpení pomocí Amal (které produkuje požadovanou sondu délky 95nt, obsahující 74nt kódující sekvence), malý fragment byl čištěn z ml3 templátu chromatografií na sloupci sepharosy C14B
-15CZ 287620 B6 agc t tctgggct tccagacccagctact t tgcggaac tcagcaacccaggcatctctgagEctccgcccaagacc BBBatgccccccaggaggtgtccgggagcccagcctEtcccagatngcagcEccgccagEcccaagggtgcgcaa 150
| o | o | a | o | |||||
| o | m | o | ||||||
| m | Ό | r* | ||||||
| o | u | c | u | CJ | 44 | u | ||
| u | ,U | 00 | CJ | CJ | CJ | 44 | o | |
| u | u | a | u | H | < | 00 | u | |
| 00 | u | u | < | CJ | CJ | 44 | <9 | |
| Π | o | u | CJ | CJ | O | « | ||
| u | 00 | 00 | CJ | CJ | c | U | 00 | |
| 03 | u | 00 | u | O | ·< | y | C3 | |
| C | 00 | u | CJ | o | CJ | M | «0 | |
| U | oo | υ | o | H | H | 00 | O | |
| eo | 44 | Q | < | b | CJ | 00 | M | |
| u | u | o | u | u | O | oo | 00 | |
| o | u | u | o | υ | CJ | o | 44 | |
| 44 | u | <0 | υ | a | h | y | 4J | |
| 00 | u | 00 | CJ | a | u | y | O | |
| u | «3 | u | CJ | c | CJ | 00 | «3 | |
| 4 | w | u | H | < | < | u | 00 | |
| u | u | u | CJ | CJ | o | u | U | |
| ta | υ | u | CJ | CJ | u | OO | ||
| u | y | 00 | H | H | CJ | 00 | to | |
| CQ | u | <0 | u | υ | CJ | Q | u | |
| U | 00 | a | (-< | u | u | o | u | |
| «9 | 00 | <Q | CJ | CJ | o | <0 | ||
| u | w | a | CJ | CJ | CJ | 4J | 03 | |
| o | 00 | u | o | H | CJ | u | 00 | |
| u | co | m | CJ | υ | u | 00 | ||
| <9 | 00 | 00 | o | CJ | CJ | u | <0 | |
| eo | u | «3 | υ | CJ | CJ | cO | u | |
| 4J | u | U | υ | CJ | 03 | u | ||
| <0 | u | 03 | u | CJ | 00 | u | ||
| u | u | w | CJ | CJ | < | 4J | eo | |
| u | a | C3 | υ | CJ | CJ | v | to | |
| a | 00 | u | CJ | < | p | 00 | 00 | |
| U | u | OJ | CJ | CJ | u | 00 | 44 | |
| o | u | u | CJ | < | o | to | U | |
| od | 03 | CJ | o | (i | u | 00 | ||
| m | u | <J | CJ | CJ | 00 | CO | ||
| u | co | CO | c | H | H | u | w | |
| 00 | 44 | CJ | cj | CJ | CJ | aj | 00 | |
| ta | Q | «3 | CJ | CJ | CJ | u | 00 | |
| O0 | u | U | CJ | CJ | CJ | C3 | a | |
| 00 | ϋ | 00 | CJ | CJ | CO | |||
| eo | u | O | CJ | CJ | CJ | co | 00 | |
| u | 03 | 00 | CJ | O | CJ | Q | <3 | |
| U | W | u | cj | CJ | CJ | 00 | O | |
| U | u | u | H | CJ | CJ | U | u | |
| 03 03 | y 4U | u to | CJ Cj | CJ <J | u c | 00 O | CJ | OO 00 |
| 63 | CO | o | o | < | O | (0 | 44 | |
| Q | u | u | CJ | CJ | c | < | *4 | U |
| U | 00 | o | <3 | < | ř- | o | to | |
| u | 03 | u | o | CJ | ζ | CJ | AJ | |
| u | <5 | u | CJ | CJ | CJ | H | «3 | U |
| «0 | u | «3 | CJ | CJ | CJ | CJ | > | 00 |
| 03 u | U 0 | u u | O G | δ | o CJ | O CJ | r-< | 00 O |
| 03 | c | u | c | a | a | O | CJ | u |
| <J | <0 | y | u | H | CJ | CJ | 44 | Q |
| U U 44 | u w (j | u X4 u | u 00 00 | CJ δ | fδ | o | a •v· | U 00 U |
| y | u | 00 | CJ | CJ | 03 | |||
| u | 03 | U | u | (J | < | CJ | <3 | |
| (J | <3 | u | u | CJ | CJ | CJ | 44 | |
| u | CO | 00 | u | CJ | CJ | o | U | |
| w | co | ta | u | CJ | CJ | CJ | 44 | |
| □ | u | u | u | CJ | CJ | CJ | <3 | |
| c3 | U | «3 | 00 | u | CJ | CJ | 00 | |
| U | CJ | U | « | CJ | CJ | CJ | 00 | |
| 03 | o | a | 00 | CJ | < | <3 | 00 | |
| w | 00 | u | <3 | < | CJ | CJ | 00 | |
| u | a | 00 | u | CJ | CJ | CJ | u | |
| 03 | u | u | 00 | CJ | (-> | CJ | 00 | |
| 00 | 44 | «3 | u | CJ | CJ | CJ | <3 | |
| u | eC | u | u | CJ | CJ | CJ | eo | |
| u | u | w | 00 | CJ | CJ | CJ |
| o | o | |||||
| o | 1Λ | o | ||||
| o | O | csi | ||||
| 0\ | M | |||||
| 00 | 00 | d | ta | aU M | ||
| « | 00 | <3 | 44 | CJ | >55 2í | |
| <3 | to | <3 | 60 | 0} | H | uy S |
| <3 | OJ | U | 44 | eo | < | |
| oo | U | «3 | to | í | r-U | |
| <3 | 00 | c | 83 | 60 | 00 | O 6U |
| U | 4J | u | 00 | 03 | 83 | 2 |
| 03 | 00 | a | 44 | 44 | u | CJ u |
| O0 | Cl | u | 4J | 00 | U | Q CU |
| 4J | o | 44 | 83 | y | 14 | CJ e |
| <3 | u | 00 | 60 | a | 44 | O »-j |
| 00 | 00 | 44 | 03 | 60 | 60 | CJ < |
| 00 | 44 | u | a | ca | 44 | u |
| 00 | 00 | 44 | u | 00 | U | CJ |
| 00 | u | U | 60 | C3 | U | CJ CJ |
| 44 | CJ | CJ | ta | U | «J | CJ 9 |
| 44 | 00 | oo | O | 00 | 44 | H |
| U | 44 | 4 | 60 | 00 | CJ | 0 u |
| u | u | to | 00 | 00 | 00 | CJ |
| w | 4J | eú | u | to | 03 | H |
| oo | 4J | co | 4 | w | 44 | y |
| «3 | OO | to | y | u | u | < 0 |
| 00 | 03 | 00 | 00 | o | 0 | |
| 00 | co | RJ | u | ca | 00 | Q P* |
| co | oo | OO | 03 | 00 | s | CJ P |
| 03 | 00 | a | 44 | u | u | H « |
| C0 | 00 | Q | 00 | C3 | 44 | U «j |
| w | 44 | U | 44 | 00 | (J | CJ |
| u | 44 | ca | CO | 03 | 44 | CJ |
| CJ | 44 | 44 | co | «3 | u | CJ CJ |
| t3 | 00 | u | eo | a | 0 | CJ 3 |
| eO | to | 44 | 63 | 03 | 00 | |
| 00 | 43 | Q | W | 03 | 44 | CJ 1-* |
| 00 | 83 | 44 | co | a) | a | H 0 |
| 00 | 00 | 44 | 63 | u | y | CJ J- |
| u | 01 | CJ | 00 | <3 | ca | CJ |
| ca | <3 | 83 | 60 | 00 | u | CJ 3 |
| <3 u u 03 | 00 03 03 co | O U <3 U | 00 - 44 O y | eo co 00 u | u u o «4 | Gť Q O |
| Kl | s | U | to | 44 | CJ | Η <Λ |
| co υ | 00 44 | co a | a 44 | 00 00 | y u | CJ 3 |
| <3 | 44 | 00 | eo | 44 | 44 | CJ *4 |
| O | 00 | 00 | 00 | ca | u | CJ D |
| u | 00 | u | 44 | o | 44 | H Cí |
| co | u | C | eo | 44 | CJ »-J | |
| u | 00 | 00 | 00 | 44 | U | CJ M |
| <J | co | y | 44 | M | y | CJ 0 |
| 00 | 44 | 00 | <3 | U | y | H CO |
| Q | 4J | 00 | 60 | 03 | <3 | CJ D |
| O | u | co | 00 | J-» | U | H |
| 00 | 00 | u | 44 | 60 | y | O *» |
| co | a | u | ω | <3 | er* | CJ ZI |
| to | u | u | CJ | 60 | a | h y |
| co | <3 | <3 | ta | 44 | u | CJ |
| w | U | C3 | « | U | C3 | f* 2 |
| 00 | (3 | 44 | <3 | U | u | r* O |
| 00 | 00 | <3 | 60 | a | u | CJ |
| eo | co | CO | 60 | u | 44 | H 2* |
| 00 | 63 | <w | U | 63 | 44 | |
| 03 | 00 | y | y | <3 | u | |
| 03 | <3 | OO | ca | a | u | CJ 3 |
| C5 | ta | <3 | 60 | eo | X4 | H q |
| 00 | 00 | a | 44 | 00 | C3 | 0 |
| 00 | w | 44 | 44 | c | 44 | CJ o* |
| eo | co | «3 | 44 | 60 | y | |
| 00 | u | 00 | 60 | C0 | eo | Η H |
| 00 | CJ | 44 | C | eo | Q | <j e |
| CJ | y | S5 | tz | ca | ||
| «3 | C3 | 00 | 60 | u | 00 | u < |
| 00 | eo | ca | M | u | to | h 2 |
| CO | 44 | c? | 44 | co | ta | CJ ** |
| u | O | to | n | oo | a | CJ CU |
CTCATCTGTGACAGCCGACTCCTGCACAGGTACCTCTTCGAGGCCAAGGACGCCGAGAATATCACGgEgagaccc 1350 Leul 1 cCyaAspSerArgValLeuGl uArgTyrLauLcuGluAlaLysCluAlaGluAsnlleThr cttccccagcncactccacagaactcacgcccagggcjt tcagggaacrcctcccagacccaggaacctggcactt
16CZ 287620 B6
| o | ó | O | a | o | O |
| o | O | V» | o | vn | |
| V» | \O | eo | σ» | •M | <N |
| •«4 | *· | CM |
Tabulka 4(pokrač.
xj u u « XI © CJ U © © © cj u o u 60 co xj « «
CJ W ω 4» C XI O «I co «a © xj a cj © XJ u CJ cj cj u u co υ a 60
CJ u u © ea ta OQ 9 u u u a u ca «a ta «3 o u co CQ 60 90 u u eo xj ca u o a ea o « u a u xi a to a u co © u u CO <9 <0 «3 u oa © co ca to «β cj co co <3 XJ CJ <3 «9 «3 00 CO
CJ CO co eo cj u u u
u X CJ w u
| w | CO | co | to | © | © |
| 00 | a | X» | © | o | co |
| u | «3 | U | a | X» | |
| u | ca | ca | eo | XJ | co |
| u | xi | co | © | <a | © |
| u | co | ta | <9 | u | oů |
| M | co | ca | <a | XI | eo |
| 4 | « | w | © | xj | a |
| eo | υ | xj | 00 | © | CJ |
| w | u | x> | © | CJ | eo |
| u | ca | a | «3 | u | co |
| u | © | «V | «3 | w | 00 |
| 00 | XJ | ca | a | © | 00 |
| u | XI | ca | ej | V | © |
| 44 | a | ta | a | XJ | 00 |
| a | ta | v | o | CJ | XI |
| a | co | u | xi | O | <j |
| 00 | «0 | cj | u | u | 03 |
| «0 | <0 | 00 | XI | XI | Xj |
| eo | ftj | ca | ea | u | CJ |
| eo | «0 | to | xj | © | CO |
| eo | x> | XJ | CJ | u | 03 |
| u | xj | XJ | u | XJ | CO |
| <0 | x> | CJ | CJ | CJ | eo |
| eo | Q | eo | 03 | © | XJ |
| a | u | CJ | 00 | 0 | XJ |
| eo | to | XI | ca | XJ | cj |
| u | ca | as | 00 | u | eo |
| u | © | oa | XI | Q | XJ |
| eo | cj | eo | « | u | eo |
| 00 | <0 | CJ | ca | XI | 00 |
| u | xi | 00 | ca | XJ | XJ |
| a | cj | co | © | © | XJ |
| 00 | xj | 00 | O | 0 | CJ |
| a | CJ | o | €3 | XI | 03 |
| eo | XJ | eo | ca | XI | a |
| 44 | «0 | co | XI | © | u |
| a | CJ | ta | co | u | xj |
| oa | CJ | eo | © | ΙΛ | u |
| 00 | u | XJ | CJ | c | 00 |
| «3 | u | CJ | XI | o | XJ |
| U | cj | ca | CJ | u | XJ |
| <4 | x> | eo | u | XI | XI |
| <4 | «3 | ca | ea | ea | CO |
| 44 | ca | •a | © | u | XJ |
| «3 | <0 | co | a | a | CJ |
| <3 | co | ea | cj | XI | XI |
| 44 | XJ | u | xi | ca | XI |
| <0 | CO | u | Cj | a | u |
| w | to | X* | © | ea | O |
| <4 | XJ | © | u | ea. | © |
| 44 | <0 | XI | eo | 4U | w |
| co | o | <0 | XI | © | © |
| <4 | co | eo | u | XI | V |
| <3 | «3 | to | a | eo | 00 |
| <4 | CJ | CJ | u | XI | XI |
| 44 | ca | u | CJ | U | XJ |
| U | ca | u | «a | eo | c |
| eo | CO | XI | cj | ea | XI |
| co | xi | eo | <3 | eo | U |
| <3 | CJ | ta | CJ | © | CJ |
| eo | u | XJ | XI | co | XI |
| «3 | <a | ca | C3 | XI | 00 |
| O | <0 | co | CO | © | © |
| eo | CJ | u | XI | © | © |
| u | CJ | 00 | ca | w | u |
| eo | <0 | eo | XI | a | © |
| eo | CO | XJ | CJ | © | © |
| eo | <0 | © | ca | © | o |
| 44 | <j | CJ | © | a | XI |
| O | XI | oa | eo | © | XI |
| u | xi | XI | XI | eo | © |
| eo | XJ | eo | eO | © | CJ |
| 44 | ca | eo | a | © | XJ |
| U | « | XJ | u | a | u |
-17CZ 287620 B6
| o | O | o |
| o | m | o θ |
| r-. | CO CM |
| C u | o q | c | υ | P 3* H |
| »-· o | u < | -4 | m | UMO |
| O Q | b. q | o | o | CJ V < |
| CU u | 3 O | 4 | 00 | H w P |
| A P | co | O 41 O | ||
| Η O | o q | π | H r-f H | |
| <-< O | a | o | < »H o | |
| «8 u | k o | to | O β < | |
| > S | H | O | u | CJ -J CJ |
| 3 o | o o | 3 | ca | q < u |
| —· o O o | RJ co | |||
| * o | c řť | <8 | co | u u h |
| β <· | M P | <3 | umo | |
| > o | u q | C | 5 | |
| <3 | M O | 80 | 4J | < <-i o |
| <“· Q | « U | >4 | υ | u < |
| < H | « o | 00 | 18 < | |
| c C | u H | 3 | 4J | U < |
| -4 o | i-· | ti | U | 80 Q |
| O H | V> P | <U | u | CO O |
| £ CJ | 5 U | 3 | w | M Q |
| O H | « | co | W CJ | |
| u 3 | U | co | ° h | |
| >»o | 5 ί- | La | co | « r |
| α y -> *** | P | a a | w H u o | |
| ri 8 | 3 ° | M | co | H < |
| O U | X | <Q | U o | |
| u < | H 4 | CO | ť < U /·> |
TGATGCCACGACACCCTTTGGACCCCATTTACCTCTTTTCGCACCTACCATCAGGGACAGGATGACCTGGAGAAC 3150
TTAGGTCGCAAGCTGTCACTTCTCCACCTCTCACGGGCATCGGCACTCCCTTGCTGGCAACAGCCCCCTTCACAC
CGCGGTCGT^GGAACCATGAAGACACCATGGGGCCTGCCCTCTGGCTCTCATCGGGTCCAACTTTTGTGTATTCT 3300
TCAACCTCATTGACAAGAACTCAAACCACCaatatgacccctggctt:ct:ctgt:cttctgggaacctccaaaCccc ctggctccgtcccactcctggcagca 3400
-18CZ 287620 B6 v O,1N NaOH-0,2M NaCl. Filtr byl hybridizován k přibližně 5xl06 cpm této sondy po 12 hodin při 68 stupních, promyt ve 2 x SSC při 68 stupních a vystaven 8 dnů intenzivnímu screeningu. Jediná markerová mRNA o 1200 nt (označeno šipkou) probíhala v sousední dráze (obr. 1).
Příklad 3 cDNA z jater plodu
Byla připravena sonda, shodná se sondou, popsanou v příkladu 2, a byla použita ke screeningu cDNA knihovny jater plodu, připravené ve vektoru lambda-Ch21A (Toole a spol., Nátuře, (25)(1984) za použití standardního screeningového (Benton Davis, Science, (54)(1978)) postupu. Tři nezávislé pozitivní klony (označené zde lambda-HEPOFL6 (1350bp), lambda-HEPOFL8 (700 bp) a lambda-HEPOFL3 (1400 bp) byly izolovány po screeningu 1 x 106 plaků. Celý inzert lambda-HEPOFL13 a lambda-HEPOFL6 byly sekvenovány po subklonování do Ml3. (Tabulka 7 a 5). Pouze části lambda-HEPOFL8 byly sekvenovány a zbytek byl považován za shodný s ostatními dvěma klony (tabulka 6). 5-konec a 3-konec netranslatované sekvence jsou uváděny malými písmeny. Kódující oblast je zapsána písmeny velkými.
V tabulkách 2 a 3 je dedukovaná aminokyselinová sekvence uvedena pod nukleotidovou sekvencí a je číslována tak, že číslo 1 platí pro první aminokyselinu maturovaného proteinu. Předpokládaný vedoucí peptid (leader peptid) je označen zápisem celých zkratek pro zápis aminokyselin. Cysteinové zbytky ve zralém proteinu jsou dále označeny SH a potenciální Nnapojená glykosylační místa hvězdičkou. Aminokyseliny, které jsou podtrženy, označují ty zbytky, identifikované N-terminálním proteinovým sekvenováním nebo sekvenováním tryptických fragmentů EPO, jak je popsáno v
-19CZ 287620 B6 e
lu crs pro RBanRctccc ctcccacagc caccctcctc cctccccgcc tgactctcaR cecggecacc tgteccagAA TCT CCT
| > o U C3 o o | O «Ν | 0 O 2?5 | O | 55 H *5 | i u o cj Ό .< U | 3 P O a H co »4 CJ | O U H a 33 v —· w < | O u CJ CM O O « w A | O 3 < <· >,< — -J < |
| s t» ω η U o | * Q — u < O | U ** ts | B 52 CJ Q | 13 U ω c u | ,r3 O 55 | 41 E M < | sou U o < υ | ||
| J u > o | 3 £ u o | « | C t 55 | - P o ω | e 2 •M e o | a o r-l-O < o | « O ω < o | ž£ | |
| o * Pí p β. O | 3 P | 22 o o | 48 o o | í8 υ υ | η < >4 < | 25 CJ o | 10 | ||
| 3 P 55 | s υ 55 | a H 55 | •H <J 25 | “8 < u | 0 < ·< o | a O 5*5 | C.O 0 < < o | ||
| 58 o u | £2 t~ H | so 55 | 3 W CJ O | 3 2 α H _l u | •H U S5 | 52 O <J | <3 »— O < O | ||
| P ° S F-t u u | eo O u υ < < | u υ a cj v> < | u £ - b | <H U a F- > u | « H < 3 CJ | « υ r- <J < O | 5 5 H < | ||
| O H et o cu <J | 3 2 •Ί ·< o υ | <a | w O >»p O í- | au 52 | 45 < o | s p u υ | o ϋ | a o = 5 | |
| 3 p ω i— u o | 3 2 a t-4 O | ·« o ·— < 3 O | <n o >. < -4 < | 25 o u | c o —· < C3 U | 3 £ v o H U O | - 5 r* 5$ | ||
| a o Ul p CO H | -- CJ 25 | 35 o u | a. O > P H ί- | M ts t> o W H | •3 P O H — u | a fru < o | C3 < u c < Q | ||
| 3 S? U 5 | O | «< U CJ < o | o r* | a i— x u < 3 | α cj O — CJ ά < e | 3 O O O fr* —· O | o υ O w o O1C. 2 | o eao — u o — < CJ | C = C r 1 H ·* -4 W |
| 3 P | u u u u ta < | ta | 33 tcíč | M íx< F-> t- | 3 O a ř~ u o | 3 3 -i < UJ O | K | 0 < U *J £· U | |
| st υ w u Μ H | ř2 < cj | 48 o o | a υ šř | «3 O « U ·< O | c.u b U t- ί- | 2Š | 2 < 5 | ||
| 3 P « fu CJ | « | o’g | U O JS u H ·< | §5 < < | 3 P 33 h U W | α u te U β, Q | *5 b> < | 45 ·< CJ | |
| §g | «CJ -< tí < | U O F < | > u | >,o -< o o u | e 2 o o | F. U F 2 | w < 3 U 3 H | ||
| !E | 3 P «1 H j δ | w < | 0 < >·< -4 < | c o — < o o | U y a p w t- | 3 P 55 | p < 5 | ||
| o. o « £ Η H | au 58 | a Η 55 | * u X u F < | cuu U U Η H | u ία <j <0 p | u ϋ a U m < | a C •M CJ < s | ||
| 3 O 35 | £<5 a. cj | 3 2 5 <3 | C.CJ W < ·< O | — O <3 H > 3 | 3 U « » < c < | coc? u u < U> | 3f- □ < < c | ||
| ě8 Ir· í- | t> < u CJ cu CJ | 13 o — <j < u | o < Μ u a. u | 25 o o | — U 5 5· | 25 U 3 | 9 < 48 | ||
| < o -1 Cj < CJ | n t> -< o < o | = o — < o a | — P «3 i- > O | — < o r· > O | 3 O 5P | >*P —.3 c u | 3 h M tí c. cj |
-20CZ 287620 B6
Tabulka 5 (pokrač.
| O fl u | 44 | u | a | to | 44 | 60 | eo | o |
| «Ο oM <J | 44 | u | 60 | a | o | re | u | u |
| «* ·< C3 | ea | <0 | u | 00 | eo | 4J | ||
| o | 4J | co | u | u | Q | 00 | u | |
| <a | Q | 44 | O | «3 | CO | eo | u | |
| O | Q | a | u | ca | eo | M | ||
| 3 U | . u | ea | 44 | «1 | 4J | u | a | |
| < | u | <o | « | a | 80 | CO | u | w |
| e u | «3 | o | «0 | u | 60 | co | CQ | ea |
| u | Q | 3 | 4J | <3 | CO | u | o | |
| >»a | ||||||||
| -4 CJ CJ U | 44 | 60 | o | U | U | u | a | ea |
| u | u | 60 | ϋ | u | 4J | ca | u | |
| P < | u | ea | <0 | eo | 00 | u | u | |
| Λ O | u | a | 60 | a | u | m | u | 4J |
| H < | u | u | <3 | u | <3 | Q | u | U |
| u | 4J | 60 | eo | 80 | to | u | ea | |
| o | u | Q | a | u | <0 | u | <a | |
| U O | <9 | eo | O | eo | u | ca | u | |
| >> < | O | a | u | <Q | u | co | u | u |
| Η H | CJ | o | u | ea | <3 | M | ea | CJ |
| 3 U | ||||||||
| « P J u | <3 | u | 60 | a | <3 | U | w | u |
| U | u | 44 | u | <3 | O | 00 | co | |
| o) <5 | U | u | U | u | <3 | <0 | c9 | 60 |
| u | cj | a | u | U | co | a | 00 | |
| <4 < | 3 | ea | a | « | 80 | w | CJ | ca |
| u | co | 00 | u | 14 | «ú | 60 | M | |
| <3 | ea | 60 | ea | U | ca | 60 | <0 | |
| 3 C5 | U | 60 | <0 | <5 | U | 60 | AJ | U |
| V E-< | ea | « | 00 | <3 | O | <0 | ca | 4J |
| »4 υ | ω | CO | a | ea | <3 | u | ca | CJ |
| vi CJ | 64 | u | u | 00 | U | a | u | 4J |
| u | w | o | CJ | 80 | co | w | CJ | |
| >,·< | u | Ď0 | eo | u | 60 | eo | U | 60 |
| Ή CJ | u | υ | eo | eo | <J | C0 | O | eo |
| Q C3 | <9 | cj | eú | «3 | U | CQ | u | w |
| U | ci | co | eo | a | u | 4U | CJ | |
| u | u | <3 | a | <3 | w | Q | 4J | |
| o eec | u | <0 | u | u | CJ | <0 | <0 | CJ |
| «Λ P CJ | 60 | ta | u | U | 44 | CJ | Cl | |
| -« < CJ | 44 | 60 | u | u | O | u | eo | 60 |
| 3 y v H -4 CJ | 60 44 | 4J | u | co | 80 | a | ca | CO |
| 60 | CJ | CJ | ea | «3 | ea | 4J | ||
| <J U | 00 | U | U | eo | 60 | u | u | CJ |
| o u | u | <3 eo | 53 60 | u υ | u <3 | <0 o | 60 ea | |
| u | a | XJ | O | o | u | ea | co | |
| u | <3 | 4J | 60 | co | eo | 00 | ||
| C H | < | u | «3 | υ | U | u | co | ea |
| u H | co u | U 60 | a a | 3 80 | u u | u O | U <Q | |
| P cj | O ea-< | |||||||
| 3 O | OPU | |||||||
| OJ H | —· ·< < | v | <3 | CJ | 0 | u | O | 60 |
| CJ | U | Cl | 6> | u | w | eo | ||
| p U | au | υ | a | 00 | CO | 00 | u | <0 |
| >, | «1 < | u | M | ca | eo | u | M | CJ |
| t- H | < C | u u | u 00 | eo d | co u | u u | eo 60 | <0 ea |
| u | a | u | U | ca | <Q | a | ||
| CJ <9 H | >»e r-t cj | U a | u u | 30 14 | 4J AJ | CJ u | es CO | |
| > CJ | o u | u | M | U | 3 | U | LA | w |
| M< | p < | |||||||
| U O | Λ CJ | |||||||
| < CJ | H < | ca | u | CO | U | m | CJ | a |
| u | 3 | W | U | ea | U | CJ | ||
| 3 O | 00 cj | u | O | a | 60 | Q | U | u |
| p CJ | ca | 3 | co | a | ¢0 | CJ | CO | |
| O, P | •c < | u | eo | ca | 80 | 00 | tí | a |
| ea | ca | <a | a | ca | ca | co | ||
| w | 44 | <7 | u | co | M | CO | ||
| 3 <4 | <0 cj | M | <3 | 4J | 3 | co | ca | co |
| O H | X >>c | CJ | U | CJ | 60 | u | u | M |
| >4 ω | w cj h | CkO | U | M | eo | M | u | 60 |
áacctcattg acaagaactg aaaccaccaa aaaaaaaaaaaa
| ftO | U | u | ||||
| u | U | «0 | o | δ | >· o | |
| u | ω | u | tň | u cj | ||
| 30 | Q | tí> | 00 | u | o o | |
| iO | co | eo | ||||
| u | u | u | ||||
| u | <J | a | ||||
| u | u | <0 | Ι- | s y | ||
| υ | o | >« | Ο | Cd H | ||
| «3 | U | U | H | u o | ||
| CO | eo | u p | ||||
| u | « | a | «< | |||
| u | eo | -j | ||||
| u | <3 | y | O | > O | ||
| u | ea | |||||
| CO | 4J | |||||
| M | •e | tn | cj | O < | ||
| U | eo | 1-4 | < | « O | ||
| w | eo | ss | o | ft. U | ||
| u | eo | |||||
| co | u | e | => o | |||
| Cd t-4 | ||||||
| > | o | -4 O | ||||
| CJ | u | |||||
| u | <j | > O | ||||
| u | 44 | >* | o | |||
| CO | u | >4 | o | J $3 | ||
| u | u | O | o | O O | ||
| CO | eo | |||||
| u u | <3 eo | řs | o | 3 U | ||
| «3 | u | fro | Cd H | |||
| u | u | ) z | < | -1 CJ | ||
| O H | ||||||
| u | eo | eo | Cl O | |||
| CO | u | «0 | O, CJ | |||
| co | u | eo | ||||
| CO | «3 | ca | 3 O | |||
| co | U | u | ||||
| u | eo | eo | u> H | |||
| u | w | u | U O | |||
| 13 | O | ca | ||||
| co | U | eo | O£ O | |||
| co | u | « | ||||
| Cd CJ CO H | ||||||
| u | eo | « | o P | |||
| u | co | u | ||||
| co | *j | co | Cd H | |||
| a* | u | eo | -J U | |||
| co | eo | u | ||||
| SO | co | eo | u | |||
| u | co | u | o 2 | |||
| a} | u | eo | u | Cd H | ||
| a | tj | •3 | U Q | |||
| •M | u | eo | eo | |||
| I—1 5 | S y | |||||
| Λ | u | u | eo | cn H | ||
| <4 | o | u | eo | |||
| ř-4 | 4J | o | « | 3 <3 | ||
| co | eo | eo | ||||
| u | eo | u | «β h | |||
| <J | «0 | u | -j o | |||
| CO | U | eo | ||||
| Q | Q | u | 3 U· | |||
| co | 44 | u | ||||
| Q | U | eo | 35 | |||
| U «3 | u u | eo o | ||||
| U | o | O | ►4 O | |||
| CO | u | U | ||||
| u | u | u | a. o | |||
| cl | u | u | ||||
| CO | u | eo | « y | |||
| u | eo | O | Η H | |||
| CO | o | eo | ||||
| o | o | 3 CO | ||||
| Cd H _1 CJ | ||||||
| u | eo | eo | ||||
| eo | <0 | eo | ||||
| u | u | u | a. o | |||
| co | ts | u | tA O | |||
| u | co | u | t* H | |||
| u | eo | 0 | ||||
| co | 44 | O | 38 | |||
| v w | u u | u eo | ||||
| u | u | co | < co |
| M co O Ck< eo U < | o -T | M f-4 CJ ř* < | « y O < u ό < y | 3 y O 3 H ® u y |
| <3 CJ | a a | s y | 4 y | |
| -4 Cj | »-* r-* | —♦ < | -4 O | |
| < CJ | — < | y y | < y | |
| 3 CO | c H | c y | ||
| ^4 «< | « | »4 <; | —i < | |
| o e | a y | y u | ||
| 3 o | s y | >»y | ||
| <-l r« | rl < y y | r4 y y y | ^4 O y y | |
| 3 CJ « K u y | c t- | -4 U 3 H > y | eo y w y ·< y | |
| h CJ | 3 O | 3 o | ||
| x< Η H | .S5- | »4 < y y | ,3 5 | |
| eoco | u y | m y | oi u | |
| U O < < | n y m < | O Η X < | 58 | |
| 3 O | a y | coy | 4 H | |
| CJ CJ | Čžj | xu U H | d y < < | 38 |
| 3 CJ | a O | m y | □ 5 | |
| V i* | >•3 | |||
| u y | s u | J -< | y y | |
| -4 CJ | 5 | a.y | u y | |
| <3 H | u y | a cj | ||
| > y | y y | Η H | Μ H | |
| eo ·< | <3 H | « U | Λ 5 g | |
| O M CJ | o | R-« CJ | o -4 y | O o H |
| — < O | ΓΊ | < U | <n < y | r* y |
| >4 O | « H | u H | 3 2 | |
| 0 co | xy | >>< | v t* | |
| <Λ < | oi | y H | ř- H | u y |
| e.o | >>y | e> y | <o y | |
| « < | <-< y | — b* | y | |
| < o | y y | O. H | < y | |
| o H | * y | C f4 | 3 2 | |
| s XCJ | x u | 4> H | ||
| WUH | H < | < ·ί | ►j y | |
| a o | w y | r4 (4 | ||
| •Μ Βλ | -* cj | 5> Η | «4 y | |
| ·~· < | f- < | s> y | y y | |
| 3 O | a y | c S2 | ||
| a H | •W »4 | «-4 < | ||
| u o | »-· < | <-> -í | y o | |
| edu | C r4 | M y | C.O | |
| m y | « | 0 < | λ y | |
| < O | < 3 | H ·< | H f4 | |
| o < | 3 y | s.y | ·* 2 | |
| U CJ | *-· ·< | « < | 0 f4 | |
| cu u | u y | < y | > y | |
| <0 < | a y | o < | 3 á | |
| M O | -4 y | «4 O | ||
| c. y | < y | fi« y | O o | |
| 3 a | 3 y | -4 y | ||
| -« CJ | -4 *: | <3 Í4 | <0 *4 | |
| — < a | a y | > y | > o |
-22CZ 287620 B6
| O | O | u | u | ||
| o | a | <\ř | o | o | |
| W | < | -4 W |
U β w.
235
Tabulka 6 pokrač.
| <-l O se | V O | MU U CJ < o |
| « u •m cj < u | n u -M CJ < o | 4) Q |
| ó <e <j < | 25 o o | Μ H P< |
| a.H a < < U | a O 35 | « < <.o |
| •Ί O £5 | s o —t < O O | « H -4 CJ < u |
| s u | a u -1 U < o | 25 H ·< |
| 3 P υ frU U | 35 O <J | u P Ή H »-í -< |
| S 9 CJ U | 3 <3 V H U O | M < X U H < |
| 3 o e řu cj | « H -» U < CJ | M< U CJ < u |
| o cj M U Cm CJ | O MO -· u CJ — < CJ | O 3 O η « H — J u |
| 3 U -· < CJ O | 25 U CJ | 25 0» u |
| 0.0 U CJ Η H | 3 2 25 | η H 58 |
| o u u Q t> u | 25 P < | e H < 3 |
| c Q —4 O U | M CJ — y H ·< | e 5 co H |
| b Q « cj CO H | 3 P 25 | a u rt a ·< u |
| u H o cj CO i- | «§ CO < | « e f-t u < u |
| s u » < < < | MU L. CJ < u | C.H « < < o |
| -Μ ϋ <5 H > CJ | sH | 0 < M U 0. O |
| 3 P * b· -4 H | >»u -4 CJ CJ CJ | 25 cl. u |
Leu Phe Arg Val Tyr Ser Aen Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lya Leu Tyr Thr Cly Clu
CTC TTC CCA GTC TAC TCC AAT TTC CTC CCG CCA AAC CTC AAG CTC TAC ACA CCC CAG
-23CZ 287620 B6 r*· <o
J4 wM 2
Λ cceftijaBCc Cftaecccesc caccgcgcec gccctficcccg' acaccRcccr
| u ea | O H | >· o |
| M | 3 P. | — o |
| tC | 33 O | u u |
| ta u u u | cn ř- | 3 P u μ, |
| <J | > CJ | |
| v | CJ H | 3 o |
| ea | ||
| ta | 5 < | |
| M | -1 o | < r* > Q |
| 44 e | «η o | O < |
| ea | — < | ca p |
| es | s o | CU O |
| ta | ||
| ci | o | p o |
| 0 | 2δ | |
| u | ||
| M | >* e | » 3 |
| U | _S ϋ | u o |
| U €3 | α o | 13 3 |
| a Ofi | ** ř- u | 3 O |
| u | M S H | « H |
| a | 1 X < | <4 O |
| ta | ca | 2δ |
| ci | ta | a. o |
| <j | ea | |
| 4 | co | |
| U | u | s 3 |
| ca | ca | u H |
| 44 | o | u u |
| CJ | as | |
| u | ca | |
| υ | o | 3 3 |
| ta | u | 3 3 W W |
| ea u | & | 38 |
| <1 | ta | — 3 |
| «0 | u | |
| co | CJ | |
| ca ca | CJ CJ | 38 |
| u | <3 | cj |
| aa | ta | |
| a | ca | fiá CJ £8 |
| ci | ca | |
| cj | j· | |
| aa a | aa af | 38 |
| a | u | _i 3 |
| u | ta | |
| CJ | u | |
| 44 | M | s P |
| O | ca | |
| o | ca | -i U R fc |
| M | c | «2 ř* |
| CJ | CJ | *4 3 |
| *4 | u | |
| u | CJ | |
| u | u | O> «3 |
| cj | ca | 3 3 |
| ta | u | b· b· |
| v | ca | |
| u | v | |
| ca | ca | 38 U CJ |
| « | ea | |
| CJ | u | B. 3 |
| «9 | u | 3 3 |
| ca | u | <- f- |
| to | c | |
| 44 | u | |
| CJ u | w «4» | |
| u | s | < 3 |
□ |O O Iři
-· u o o «i = >> (Λ 3 b·
-24·
130 IÓ0
Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arj> Thr llo Tlir Ala Asp Tlir Phe Arg Lvs
1*1*·#» 1*#»A sutu ΑΑΛ MAi . . .l. ' . Σί'ΣΤ 'L' ΤΤΣΞ’ ΣΓΏ -1Γ ~ ί·Α··ιι«ιιι I ,Ηΐιιιι II lil « ..1..,..1.,1 Vf«— · ti
| Q | M | u | c | ej | AJ | Sm | CO | u |
| υ | AI | ai | ec | ·· | <J | *·' « | u | w |
| o | €5 | ta | a | u | ea | rj | za | u |
| O | AJ | CO | w | u | u | za | tr | |
| σ | u | AJ | Cl | a | za | za | •J | |
| 0 | o | u | Q | cj | ea | co | u | |
| ca | ci | cd | AJ | 0 | 0 | u | u | 0 |
| < | ci | •o | CJ | 0 | cd | 10 | o | AI |
| o | Π | o | C | AI | cd | co | « | Cd |
| u | u | 0 | AJ | 0 | 0 | o | AJ |
| c | ||||||||
| u | co | u | w | u | u | 0 | co | |
| u | u | es | u | u | «J | 30 | w | |
| < | u | co | n | co | co | u | AJ | w |
| o | u | 0 | ta | 0 | AJ | g | AJ | AI |
| < | Al | o | <3 | o | c | w | U | w |
| J | u | co | ea | eO | CO | U | Cd | |
| u | u | <3 | a | AJ | 0 | y | 0 | |
| o | 0 | 60 | u | co | U | ca | o | 0 |
| < | u | 0 | u | c | Al | ca | ci | u |
| r· | u | O | u | ea | 0 | AJ | 20 | CJ |
-4
ct q
2$
| 0 | w | ea | 0 | 0 | o | a | LI |
| u | O | u | u | 0 | u | co | eo |
| O | u | u | AI | 0 | 0 | a | eo |
| U | u | «1 | U | u | co | <3 | ea |
| 0 | co | 9 | »<· | ea | AI | u | eo |
| w | eo | ea | u | Al | 0 | eo | Ll |
| 0 | co | co | eo | a | eO | eo | a |
| U | eo | ·>· | <3 | ci | CO | Ll | <j |
| to | <3 | Ξά | a | w | 0 | eo | LI |
| co | co | eo | ·«· | o | ea | U |
| eo | u | u | 30 | o | 0 | AI | AJ | ||
| AJ | Ll | u | a | co | AJ | u | |||
| x< | u | ea | ea | u | co | 3 | y | C3 | |
| ^4 | ca | u | o | eo | eo | y | »* | u | 00 |
| O | c | 0 | u | co | a | AJ | t3 | cj | w |
| y | u | co | ea | u | U | AJ | u | ||
| u | u | W | 3 | 0 | AI | Cl | AJ | ||
| o ed | o | w | 3 | u | O | u | 0 | 0 | u |
| ca | »4 | a | aj | u | AJ | u | Cl | u | |
| —· < | υ | AI | eo | u | ti | u | Cl | ts | to |
| to | |||||||
| AJ | AJ | aj | es | ·» | »· *** | • A | |
| ** | g | 0 | to | «* | AJ | eo | «J |
| 2 | u | G | ta | es | y | w | y |
| π | u | C | ·« | LI | u | 0 | «* |
| u | u | eo | eo | ti | 0 | U | to |
| υ | 0 | u | AJ | ti | o | Cd | |
| CJ | 0 | AJ | ca | 20 | eo | s | |
| < | Cl | Π | O | u | u | eo | *A *·» |
| o | eo | u | JJ | a | AJ | y | W |
| u | co | 0 | ea | AJ | 0 | 0 |
| u | Q | o | eo< | |||||||
| 0 | O | u ’J | ||||||||
| CO | H | < < | <1 | 0 | CJ | « | AJ | Cl | eo | |
| C.O | u | u | u | 0 | AJ | AJ | eo | |||
| w | O | υ | y | eo | ea | es | U | |||
| > | < | 3> < | o | eo | es | so | W | AJ | u | |
| í-· | < o | AJ | AJ | ea | ea | G | ea | |||
| CJ | CO | 0 | AJ | U | ea | 0» | ||||
| xu | u | 0 | Cl | O | 0 | 0 | 0 | |||
| u | CJ | 0 | es | AJ | Cl | 0 | ||||
| 31 | —< c | 0 | G | y | *J | G | eS | |||
| =1 | o | O ΐ | u | AJ | AJ | *· ·« | w | aJ | M | |
| u < | ||||||||||
| <í | o | js o | ||||||||
| o | H < | 0 | υ | ca | □ | U | 4· | |||
| tsb | y | 0 | ·· | u | tJ | AJ | ||||
| 310 | υ | c | ea | *> | y | |||||
| iřš | eO | *7 | 33 | •5 | to | y | ||||
| Zm· | <f< | AJ | *· •a·» | za | eo | 20 | * | 0 | ||
| 1 | CO | G, | e | 0 | •7 | A | eo | |||
| I | L | M | AJ | • | u | •a | 23 | |||
| 3’ | u | W | 0 | • I | Id | 20 | t3 | |||
| 31 | SX | V | y | J | ea | w | w | hJ | ||
| V» | tj íř* | to | y | M | 4 » | tř | ea |
.i.icetcatcp, acaagaactg aaiiccaccaa aaanaanaaau/i •25CZ 287620 B6 příkladu 1. Částečné podtržení označuje zbytky v aminokyselinové sekvenci určitých tryptických fragmentů, které nemohly být stanoveny jednoznačně. cDNA klony lambda-HEPOFL8 a lambda-HEPOFL13 byly screenovány, uloženy a jsou dostupné z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem ATCC 40156, ATCC 40152 a ATCC 40153.
Příklad 4
Genomická struktura EPO genu
Relativní velikosti a polohy čtyř nezávislých genomických klonů (lambda-HEPOl, 2, 3 a 6) z knihovny HaelII/AluI jsou ilustrovány překrývajícími se čarami na obr. 3. Silná čára označuje polohu EPO genu. Je uvedena stupnice (v kb) a polohy známých míst štěpení restrikční endonukleázou. Oblast, obsahující EPO gen, byla kompletně sekvenována zobou řetězců za použití řízené série delecí v této oblasti. Schematické znázorněné pěti exonů, kódujících EPO mRNA, je uvedeno na obr. 4. Přesná 5-konec vazba exonu I je v současnosti neznámá. Protein kódující podíly exonů jsou tmavší. Kompletní nukleotidová sekvence oblasti je uvedena v tabulce 4. Známé hranice každého exonu jsou označeny pomocí silných vertikálních čar. Genomické klony lambda-HEPOl, lambda-HEPO2, lambda-HEPO3 a lambda-HEPO6 byly uloženy a jsou dostupné z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem ATCC 40154, ATCC 40155 a ATCC 40150 a ATCC 40151.
Příklad 5
Konstrukce vektoru p91023(b)
Transformačním vektorem byl pAdD26SVpA(3), popsaný Kaufmanem a spol., Mol. Cell Biol., 2:1304 (1982). Struktura tohoto vektoru je uvedena na obr. 5A. Stručně, tento plazmid obsahuje gen cDNA myší dihydrofolát reduktázy (DFHR), který je pod transkripční kontrolou adenovirus 2 (Ad2) hlavního pozdního promotoru. 5-konec střihové místo je indikováno v adenovirové DNA a 3-konec střihové místo, odvozené od imunoglobulinového genu, je přítomno mezi Ad2 hlavním pozdním promotorem a DFHR kódující sekvencí. SV40 časné polyadenylační místo je přítomnosti za DHFR kódující sekvencí. Prokaryoticky odvozená sekce pAdD26SVpA(3) je z pSVOd (Mellon a spol., Cell, 27:279(1981)) a neobsahuje pBR322 sekvence, o nichž je známé, že inhibují replikaci v savčích buňkách (Lusky a spol., Nátuře, 293:79 (1981)).
pAdD26SVpA(3) byl převeden na plazmid pCVSVL2, jak je ilustrováno na obr. 5A. pAdD26SVpA(3) byl převede na plazmid pAdD26SVpA(3) (d) delecí jednoho ze dvou Pstl míst v pAdD26SVpA(3). Toto bylo provedeno parciálním štěpením pomocí Pstl za použití deficitu enzymu tak, aby byla získána subpopulace linearizovaných plazmidů, ve kterých bylo štěpeno pouze jedno Pstl místo, s následujícím zpracováním Klenowem, ligací pro recirkulaci a screeningem na deleci Pstl místa umístěného 3-konec k SV40 polyadenylační sekvenci.
Adenovirový trojdílný leader a s virem spojené geny (VA genyl) byly inzertovány do pAdD26SVpA(3) (d), jak je ilustrováno na obr. 5A. Nejprve byl pAdD26SVpA(3) (d)) štěpen pomocí PvuII pro získání lineární molekuly, otevřené ve 3-konec části tří elementů, tvořících trojdílný leader. Potom byl pJAW 43 (Zain a spol., Cell, 16:851 (1979)) zpracován s Klenowem, štěpen pomocí PvuII a 140bp fragment, obsahující druhou část třetího leaderu, byl izolován elektroforézou na akrylamidovém gelu (6% ve Tris borátovém pufřu; Maniatis a spol., supra). 140bp fragment byl pak ligován do PvuII štěpeného pAdD26SVpA(3) (d). Ligační produkt byl použit ke transformaci E.coli na tetracyklinovou rezistenci a kolonie byly screenovány za použití Grunstein-Hognessova postupu za použití 32P značené sondy, hybridizující ke 140 bp fragmentu. DNA byla připravena z pozitivně hybridizujících kolonií pro test, zda PvuII rekonstruované místo bylo 5-konec nebo 3-konec inzertované 140bp DNA specifické ke druhému a třetímu
-26CZ 287620 B6 adenovirovému pozdnímu leaderu. Správná orientace PvuII místa je na 5-koncové straně 140bp inzertu. Tento plazmid je označen tTPL na obr. 5A.
Ava II D fragment SV40, obsahující SV40 enhancerovou sekvenci, byl získán štěpením SV40 5 DNA pomocí Ava II, zatupením konců Klenowým fragmentem pol I, ligací Xho 1 linkerů k fragmentům, štěpením s Xho 1 pro otevření Xho 1 místa a izolací čtvrtého největšího (D) fragmentu gelovou elektroforézou. Tento fragment byl pak ligován k Xho 1 štěpenému pTPL za vzniku plazmidu pCVSVL2-TPL. Orientace SV40 D fragmentu v pCVSVL2-TPL byla taková, že SV40 pozdní promotor byl ve stejné orientaci jako adenovirový hlavní pozdní promotor.
Pro zavedení s adenovirem spojených (VA) genů do pCVSVL2-TPL byl nejprve konstruován plazmid pBR322, který obsahuje adenovirus typ 2 Hind III B fragment. Adenovirus typ 2 DNA byla štěpena s Hind III a B fragment byl izolován gelovou elektroforézou. Tento fragment byl inzertován do pBR322, který byl předem štěpen pomocí Hind III. Po transformaci E.coli na 15 ampicilinovou rezistenci byly rekombinanty screenovány na inzerci Hind III B fragmentu a orientace inzertu byla stanovena štěpením restrikčním enzymem. pBR322-Ad Hind III B obsahuje adenovirus typ 2 Hind III B fragment v orientaci, znázorněné na obr. 5B.
Jak je ilustrováno na obr. 5B, jsou VA geny výhodně získány z plazmidu pBR322-Ad Hind III B 20 štěpením s Hpa I, přídavkem EcoRI linkerů a štěpením pomocí EcoRI a následujícím odstraněním 1,4 kb fragmentu. Fragment, mající EcoRI lepivé konce, se pak liguje do EcoRI místa PTL, předem štěpeného s EcoRI. Po transformaci E.coli HB101 a selekci na tetracyklinovou rezistenci, byly kolonie screenovány filtrovou hybridizací k DNA, specifické pro VA geny. DNA byla připravena z pozitivně hybridizujících klonů a charakterizována štěpením 25 restrikční endonukleázou. Výsledný plazmid je označen p91023.
Jak je ilustrováno na obr. 5C, byla dvě EcoRI místa vp91023 odstraněna úplným rozštěpením p91023 pomocí EcoRI za vzniku DNA fragmentů, jeden asi 7kba druhý asi l,3kb. Posledně uváděný fragment obsahuje VA geny. Konce obou fragmentů pak byly vzájemně k sobě 30 ligovány. Plazmid p91023(A), obsahující VA geny, a podobně p91023, ale s delecí dvou EcoRI míst, byly identifikovány pomocí Grunstein-Hognessova screeningu s Va genovým fragmentem a běžnou analýzou restrikčních míst.
Jediné Pstl místo v p91023(A) bylo odstraněno a nahrazeno EcoRI místem. p91023(a) byl úplně 35 rozřezán pomocí Pstl a zpracován s Klenowým fragmentem poli pro vytvoření vyrovnaných konců. EcoRI linkery byly ligovány kzatupenému Pstl místu p91023(A). Lineární p91023(A) s EcoRI linkery, připojenými k zatupenému Pst místu, byly odděleny od neligovaných linkerů a plně rozštěpeny pomocí EcoRI a religovány. Byl získán plazmid p91023(B), jak je znázorněn na obr. 5C, a byl identifikován jako mající strukturu podobnou p91023(A), ale s EcoRI místem 40 místo dřívějšího Pstl místa. Plazmid p91023(B) byl uložen a je dostupný z Američan Type
Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem ATCC 39754.
Příklad 6 cDNA klony (lambda-EPOFLó a lambda-EPOFL13, příklad 3) byly inzertovány do plazmidu p91023(B) za vzniku PPTFL6 a PPTFL13. 8 ug každé z čištěných DNA bylo pak použito k transfektování 5 x 106 COS buněk za použití DEAE-dextranové metody (infra). Po 12 hodinách byly buňky promyty a zpracovány s chloroquinem (0,1 mm) po 2 h, opět promyty a 50 vystaveny 10 ml média, obsahujícího 10 % fetálního telecího séra po 24 hodiny. Médium bylo zaměněno za 4 ml séra prostého média a sklizeno o 48 hodin později.
Produkce imunologicky aktivního EPO byla kvantifikována radioimunozkouškou, jak popsali Sherwood a Goldwasser (55). Protilátka byla poskytnuta Dr. Judith Sherwood. Jodovaný
-27CZ 287620 B6 značkovač byl připraven z homogenního EPO, popsaného v příkladu 1. Citlivost zkoušky je přibližně 1 ng/ml. Výsledky jsou uvedeny dále v tabulce 8,
Tabulka 8
| Vektor | hladina EPO uvolněného do média(ng/ml) |
| pPTFL13 | 330 |
| pPTFLÓ | 31 |
PTFL13 byl uložen a je dostupný z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem ATCC 3990.
Příklad 7
EPO cDNA (lambda-HEPOFL13) byla inzertována do p91023(B) vektoru a byla transfektována do COS-1 buněk a sklizena, jak popsáno výše (příklad 6) s tím rozdílem, že bylo vypuštěno zpracování chloroquinem.
In vitro byl stanoven biologicky aktivní EPO pomocí zkoušky tvorby kolonií s buňkami jater myšího plodu jako zdroje CFU-E, nebo zkoušky příjmu 3H-thymidinu za použití buněk sleziny myší, kterým byla předem podána injekce fenylhydrazinu. Citlivosti těchto zkoušek jsou, přibližně 25 milijednotek/ml. In vivo byl biologicky aktivní EPO měřen použitím metod buď hypoxickou myší nebo vyhladovělou krysou. Citlivost těchto zkoušek je přibližně-, 100 milijednotek/ml. Nebyla detekována žádná aktivita u obou zkoušek ani v kontrolním pokuse. Výsledky EPO, exprimovaného klonem EPOFL13, jsou uvedeny dále v tabulce 9, kde uváděné aktivity jsou vyjádřeny v jednotkách/ml za použití komerčního kvantifikovaného EPO (Toyobo, lne.) jako standardu.
Tabulka 9
EPO exprimovaný z COS buněk transfektovaných EPO cDNA typ I
| Zkouška | Aktivita |
| RIA | 100 ng/ml |
| CFU-E | 20,5j./ml |
| Tl-Thy | 3,1 l,8j./ml |
| hypoxická myš | 1 j./ml |
| vyhladovělá krysa | 2 j./ml |
Příklad 8
Analýza EPO z COS buněk na polyakrylamidovém gelu
180 ng EPO, uvolněného do média COS buněk, transfektovaných EPO (lambda-HEPOFL13) cDNA ve vektoru 91023(B) (viz výše), bylo elektroforezováno na 10% SDS Laemli polyakrylamidovém gelu a elektrotransferováno na nitrocelulózový papír (Towbin a spol., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 76:4350 (1979)). Filtr byl sondován s anti-EPO protilátkou, jak je popsána v tabulce 8, promyt a znovu prohledán pomocí 125I-staph A proteinem. Filtr byl zpracováván autoradiografií po dva dny. Nativní homogenní EPO, popsané v příkladu 1, buď před (dráha B)
-28CZ 287620 B6 nebo po jodaci (dráha C), byly podrobeny elektroforéze (viz obr; 8). Použité markéry zahrnují 35S značený methionin,, sérový albumin (68 000 d) a ovalbumin (450 00 d).
Příklad 9
Konstrukce RK1-4
Bam HI-PvuII fragment z plazmidu PSV2DHFR (Subramani a spol., Mol. Cell. Biol. 1:854-864 (1981)), obsahující oblast časného promotoru SV40, připojeného ke genu myší dihydrofolát reduktázy (DHFR), SV40 enhancer, malý intron t antigenu a SV40 polyadenylační sekvenci, byl izolován (fragment A). Zbývající fragmenty byly získány z vektoru p91023(A) (viz výše) následovně: p91023(A) byl štěpen pomocí Pst I v jediném Pst I místě, blízkém adenovirovému promotoru, pro linearizaci plazmidu a buď ligován k syntetickým Pst I až EcoRI konverterům a recirkulován (vytvoření míst Pst I- EcoRI - Pst I na původním Pst I místě; 91023(B'), nebo zpracován s velkým fragmentem DNA polymerázy I k rozrušení Pst I míst a ligován k syntetickému EcoRI linkeru a recirkularizován (vytvořením EcoRI místa na původním místě Pst I; 91023(B). Každý ze dvou výsledných fragmentů 91023(B) a 91023(B;) byly štěpeny pomocí Xba a EcoRI za vzniku dvou fragmentů (F a G). Spojením F fragmentu z p91023(B) a fragmentu G zp91023(B') a fragmentu G zp91023(B) a fragmentu F zp91023(B') byly vytvořeny dva nové plazmidy, které obsahují buď EcoRI - Pst I místo nebo Pst I - EcoRI místo na původním Pst I místě. Plazmid, obsahující Pst I - Eco RI místo, kde Pst I místo je nejblíže adenovirovému hlavnímu pozdnímu promotoru, byl nazván p91023(C).
Vektor p91023(C) byl kompletně štěpen pomocí Xhol a výsledná linearizovaná DNA s lepivými konci byla zatupena reakcí zaplnění konců s velkým fragmentem E.coli z DNA polymerázy I. K této DNA byl ligován 340 bp Hind III EcoRI fragment, obsahující SV40 enhancer, připravený následovně:
Hind III - Pvu II fragment ze SV40, který obsahuje SV40 počátek replikace, a enhancer byl inzertován do plazmidu c lac (Little a spol., Mol. Biol. Med. 1:473-488 (1983)). c lac vektor byl připraven štěpením c lac DNA pomocí BamHI, zaplněním na lepivých koncích velkým fragmentem DNA polymerázy I a štěpením DNA pomocí Hind III. Výsledný plazmid (c SVHPlaC) regeneroval BamHI místo při ligaci k Pvu II tupému konci. Fragment EcoRI-Hind III byl připraven z c SVHPlac a ligován k EcoRI-Hind III fragmentu pSVOd (Mellon a spol, supra), který obsahuje plazmidový počátek replikace a byl selektován výsledný plazmid PSVHPOd. Pak byl připraven 340 bp EcoRI-Hind III fragment z PSVHPOd, obsahující SV40 počátek/enhancer, zatupen na obou koncích pomocí velkého fragmentu DNA polymerázy I a ligován kXhol štěpenému, zatupenému p91023(c) vektoru, popsanému výše. Výsledný plazmid (p91023(C)/Xho/zatupený plus EcoRI/Hind III/zatupený SV40 počátek plus enhancer), ve kterém byla orientace Hind III - EcoRI fragmentu taková, že BamHI místo v tomto fragmentu bylo co nejblíže VA genu, byl označen pES105. Plazmid Pesl05 byl štěpen pomocí Bam HI a PvuII a také PvuII samotným a byl izolován BamHI-PvuII fragment, obsahující adenovirový hlavní pozdní promotor (fragment B) a PvuII fragment, obsahující plazmid trvání rezistence genu (tetracyklinová rezistence) a jiné sekvence (fragment C). Fragmenty A, B a C byly ligovány a výsledný plazmid je uveden na obr. 7 a byl izolován a nazván RK1-4. Plazmid RK1-4 byl uložen v Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland, kde je dostupný pod přírůstkovým číslem ATCC 399940.
-29CZ 287620 B6
Příklad 10
Exprese EPO v CHO buňkách - metoda I
DNA (20 ug) zplazmidu pPTFL13, popsaného výše (příklad 6), byla štěpena restrikční endonukleázou Cla I k linearizaci plazmidu a byla ligována k Cla I-štěpené DNA z plazmidu pAdD26SVP(A) 1 (2 ug), který obsahuje intaktní dihydrofolát reduktázový (DHFR) gen řízený adenovirovým hlavním pozdním promotorem (Kaufman a Sharp, Mol. and Cell. Biol. 2:1304— 1319 (1982)). Takto ligovaná DNA byla použita k transfektování DHFR-negativních CHO buněk (DUKS-BII, Chasin L. A. a Urlaub G. (1980) PNAS 77 4216-4220) a ponechána růst dva dny, buňky, které inkorporovaly alespoň jeden DHFR gen, byly selektovány v alfa médiu, postrádajícím nukleotidy a doplněném 10 % dialyzovaného fetálního hovězího séra. Po dvou týdnech růstu v selektivním médiu byly kolonie odstraněny z originálních ploten, spojeny do skupin 10-100 kolonií na skupinu, znovu umístěny na plotnu a ponechány růst do slití v médiu, postrádajícím nukleotidy. Supematanty média ze skupin, rostlých před methotrexátovou selekcí, byly zkoušeny na EPO pomocí RIA. Skupiny, které vykazují pozitivní EPO produkci, rostly za přítomnosti methotrexátu (0,02 uM) a pak byly subklonovány a znovu zkoušeny. EPO Cla 4 4.02-7, jediný subklonovaný z EPO Cla 4 4.02 skupiny, uvolňuje 460 ng/ml EPO do média, obsahujícího 0,02 uM MTX (tabulka 10). EPO Cla 4 4.02-7 je buněčná linie volby pro produkci EPO a byla uložena v Američan Type Culture Collection pod přírůstkovým číslem ATCC CRL8695. V současnosti je tento klon podroben postupné selekci ve zvyšujících se koncentracích MTX a bude pravděpodobně poskytovat buňky, které produkují i vyšší hladiny EPO. Pro skupiny, které na základě RIA byly negativní, byly kolonie, rezistentní k metotrexátu, získány z duplikátních kultur, které rostly za přítomnosti metothrexátu (0,02 uM), opět ve skupinách zkoušeny na EPO pomocí RIA. Tyto kultury, které nebyly pozitivní, byly subklonovány a podrobeny růstu v dále se zvyšujících koncentracích methotrexátu.
Postupná methotrexátová selekce (MTX) byla dosažena opakováním cyklů kultivace buněk za přítomnosti zvyšujících se koncentrací methotrexátu a selekcí přežívajících. V každém cyklu byl měřen EPO v kulturách supematantu pomocí RIA a in vitro biologické aktivity. Hladiny methotrexátu, použité v každé postupné amplifikaci, byly 0,02 uM, 0,1 uM a 0.5 uM. Jak je uvedeno v tabulce 10, po jednom cyklu selekce v 0,02 uM MTX byly do kultivačního média uvolněny významně vysoké hladiny EPO.
Tabulka 10
| Hladina EPO, uvolněného do média | |||
| Vzorek | zkouška | získáno z média alfa | 0,02 uM methotrexát v médiu alfa |
| skupina | |||
| 44 | RIA | 17 ng/ml | 50 ng/ml |
| jediná kolonie | |||
| 4 4 klon | |||
| (.02-7) | RIA | 460 mg/ml |
Příklad 11
Exprese EPO v CHO buňkách - metoda II
DNA z klonu lambda HEPOFL13 byla štěpena pomocí EcoRI a malý fragment, obsahující EPO gen, byl subklonován do EcoRI místa plazmidu RK1-4 (viz příklad 10). Tato DNA (RKFL13) pak byla použita ke transfekci DHFR-negativních CHO buněk přímo (bez štěpení) a selekce a amplifíkace byla provedena, jak je popsáno výše v příkladu 10.
-30CZ 287620 B6
RKFL13 DNA byla také inzertována do CHO buněk protoplastovou fúzí a mikroinjekcí. Plazmid RKFL13 byl uložen a je dostupný z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem ATCC 39989.
Tabulka 11
| Hladina EPO, uvolněného do média | |||
| Vzorek | zkouška | získáno z média alfa | 0,02 uM methotrexát v médiu alfa |
| skupina | |||
| kolonií | |||
| A | RIA | 3 ng/ml | 42 ng/ml (skupina) |
| 150 ng/ml (klon) | |||
| 3H-Thy | - | 1,5 j./ml | |
| jediná | RIA | - | 90 ng/ml |
| kolonie | 3H-Thy | - | 5,9j./ml |
| klon(.02C-Z) | |||
| mikroinjektovaná | |||
| skupina | RIA | 60 ng/ml | 160 ng/ml |
| (DEPO-1) | 3H-Thy | l,8j./ml | - |
Preferovaný klon jediné kolonie byl uložen a je dostupný z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem ATCC CRL8695.
Příklad 12
Exprese EPO genomického klonu v COS-1 buňkách
Pro expresi EPO genomického klonu byl použit vektor pSVOd (Mellon a spol., supra). DNA z pSVOD byla úplně štěpena pomocí Hind III a zatupena s velkým fragmentem DNA polymerázy I. EPO genomický klon lambda-HEP3 byl úplně štěpen s EcoRI a HindllI a 4,0 kb fragment, obsahující EPO gen, byl izolován a zatupen jako výše. Nukleotidová sekvence tohoto fragmentu z Hind III místa do oblasti právě za polyadenylačním signálem je uvedena na obr. 4 a v tabulce 4. EPO genový fragment byl inzertován do pSVOd plazmidového fragmentu a správně konstruované rekombinanty v obou orientacích byly izolovány a ověřeny. Plazmid CZ2-1 má EPO gen v orientaci „a“ (tj. 5' konec EPO nejblíže k SV40 počátku) a plazmid CZ1-3 je v opačné orientaci (orientace „b“).
Plazmidy CZ1-3 a CZ2-1 byly transfektovány do COS-1 buněk, jak je popsáno v příkladu 7, a média byla sklizena a zkoušena na imunologicky reaktivní EPO. Přibližně 31 ng/ml EPO bylo defektních v supematantu kultury z CZ2-1 a 16—31 ng/ml CZ1-3.
Genomické klony HEPO1, HEPO2 a HEPO5 mohou být inzertovány do COS buněk pro expresi podobným způsobem.
Příklad 13
Exprese v C127 a v 3T3 buňkách. Konstrukce pBPVEPO
Plazmid, obsahující EPO cDNA sekvenci pod transkripční kontrolou myšího metalothioneinového promotoru a napojený ke kompletní DNA hovězího papillona viru, byl připraven následovně:
-31CZ 287620 B6 pEPO49F
Plazmid SP6/5byl získán od Promega Biotec. Tento plazmid byl štěpen kompletně pomocí EcoRI a 1340 bp EcoRI fragment z lambda-HEPOFL13 byl inzertován DNA ligázou. Výsledný plazmid, ve kterém 5' konec EPO genu byl nejblíže k SP6 promotoru (stanoveno pomocí štěpení BglI a Hind III), byl nazván pEPO49F. V této orientaci je BamHI místo v PSP6/5 polylinkeru přímo připojeno k 5' konci EPO genu.
pMMTneo BPV
Plazmid pdBPV-MMTneo (342-12) (Law a spol., Mol. and Cell Biol., 3:2110-2115 (1983)), ilustrovaný na obr. 8, byl štěpen kompletně pomocí BanHI za vzniku dvou fragmentů - velkého fragmentu asi 8 kg v délce, obsahujícího BPV genom, a menšího fragmentu asi 6,5 kb délky, obsahujícího pML2 počátek replikace a gen ampicilinové rezistence, metallothioneionový promotor, gen rezistence neomycinu a SV40 polyadenylační signál. Štěpená DNA byla recirkularizována DNA ligázou a plazmidy, které obsahují pouze 6,8 kb fragment, byly identifikovány pomocí EcoRI a BamHI restrikčním endonukleázovým štěpením. Jeden z těchto plazmidů byl nazván pMMTneo BPV.
pEPO15a pMMT neo BPV byl kompletně štěpen pomocí BglII. pEPO49f byl štěpen kompletně pomocí BamHI a BglII a přibližně 700 bp fragment byl připraven izolací na gelu. BglII štěpený pMMTneo BPV a 700 bp BamHI/BglII Epo fragment byly ligovány a výsledné plazmidy, obsahující EPO cDNA, byly identifikovány koloniovou hybridizací s olionukleotidovou d(GGTCATCTGTCCCCTGTCC) sondou, která je specifická pro EPO gen. Z plazmidů, které byly pozitivní při hybridizační analýze, byl jeden (pÉPO15a), který měl EPO cDNA v orientaci takové, že 5' konec cDNA byl nejbližší metallothioneinovému promotoru, identifikován štěpením“ pomocí EcoRI a Kpnf.
pBPV-EPO
Plazmid pEPO15A byl štěpen kompletně BamHI pro linearizaci plazmidů. Plazmid pdBPVMMTneo(342-12) byl také štěpen kompletně pomocí BamHI za vzniku dvou fragmentů 6,5 a 8kb. 8kb fragment, který obsahuje celý genom hovězího Papilloma viru, byl izolován na gelu. pEPO15a/BamHI a 8kb BamHI fragment byly spolu ligovány a plazmid (pBPV-EPO), který obsahuje BPV fragment, byly identifikovány koloniovou hybridizací za použití oligonukleotidové sondy d(P-CCACACCCGGTACACA-OH), která je specifická pro BPV genom. Štěpení pBPV-EPO DNA pomocí Hind III indikuje, že směr transkripce BPV genomu byl stejný jako směs transkripce metallothioneinového promotoru (jako v pdBPV-MMMTnec(342-12) viz obr. 8). Plazmid pdBPV-MMTneo(342-12) je dostupný z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem č. ATCC 37224.
Exprese
Následující metody byly použity pro expresi EPO.
Metoda I
DNA pBPV-EPO byla připravena a přibližně 25 ug bylo použito k transfektování asi lx 106 C127 (Lowy a spol., J. of Virol. 26:291-98 (1978)) CHO buněk za použití standardních technik srážení fosforečnanem vápenatým (Grahm a spol., Virology, 52:456-67 (1973)). Pět hodin po transfekci byla transfekční média odstraněna, buňky byly podrobeny glycerinovému šoku, promyty a bylo přidáno čerstvého α-média, obsahujícího 10 % fetálního bovinního séra. Po 48 hodinách byly buňky trypsinizovány a štěpeny v poměru 1:10 v DME médiu, obsahujícím
-32CZ 287620 B6
500ug/ml G418 (Southem a spol., Mol. Appl. Genet. 1:327-41 (1982)), a buňky byly inkubovány dva až tři týdny. G418 rezistentní kolonie pak byly individuálně izolovány do mikrotitračních jamek a ponechány růst do stadia za přítomnosti G418. Buňky pak byly promyty, bylo přidáno čerstvé médium, obsahující 10 % fetálního hovězího séra a média byla sklizena o 48 hodin později. Kondicionované médium bylo testováno a zjištěno jako pozitivní při radioimunoeseji a in vitro biologické eseji.
Metoda II
Cl27 nebo 313 buňky se transfektovaly 25 ug pBPV-EPO a 2ug pSV2neo (Southem a spol., supra), jak je popsáno v metodě I. Je zde přibližně 10-násobný molámí přebytek pBPV-EPO. Po transfekci je postup stejný jako v metodě 1.
Metoda III
C127 buňky byly transfektovány 30 ug pBPV-EPO, jak je popsáno v metodě I. Po transfekci a štěpení (1:10) bylo každé tři dny vyměňováno čerstvé médium. Po asi 2 týdnech byla zřejmá ložiska transformovaných buněk. Jednotlivá ložiska byla odebrána jednotlivě do lem jamek mikrotitrační plotny, ponechána růst do subsouvislé monovrstvy a zkoušena na EPO aktivitu nebo antigenicitu v kondicionovaném médiu.
Příklad 14
Exprese ve hmyzích buňkách. Konstrukce pIVEV EPOFL13
Plazmidový vektor pIVEV byl uložen a je dostupný od Američan Type Culture Collection, Rockville, Maiyland pod přírůstkovým číslem č. ATCC 39991. Vektor byl modifikován následovně:
pIVEVNI pIVEV byl štěpen pomocí EcoRI k linearizaci plazmidu, zatupen použitím velkého fragmentu DNA polymerázy I.a jediného Notl linkeru
GGCGGCCGCC
CCGCCGGCGG byl inzertován ligací k otupeným koncům. Výsledný plazmid je nazván pIVEVNI. pIVEVSI pIVEV byl štěpen pomocí Smál k linearizaci jediného Sfil linkeru GGGCCCCAGGGGCCC
CCCGGGGTCCCCGGG byl inzertován ligací k otupeným koncům. Výsledný plazmid byl nazván pIVEVSI. pIVEVSI BgKp.
Plazmid pIVEVSI byl štěpen pomocí KpnI k linearizaci plazmidu a přibližně 0 až 100 bp bylo získáno z každého konce štěpením dvojřetězcovou exonukleázou Bal 31. Jakékoliv konce, které nebyly perfektně tupé, byly zatupeny pomocí velkého fragmentu DNA polymerázy I a polylinker (__Xho_ I _ _XbaI _BgUII JEcokl klál KpnI
I « I |~ Π ΓΊ 1 —] AGATCTCGAGAATTCTAGATCGATGGTACC TCTAGAGCTCTTAAGATCTAGCTACCATGG
-33CZ 287620 B6 byl inzertován ligací k tupým koncům. Polylinker byl inzertován v obou orientacích. Plazmid, ve kterém je polylinker orientován tak, že BglII místo v polylinkeru je nejbližší k promotoru polyhedron genu, je nazván pIVEVSIBgKp. Plazmid, ve kterém KpnI místo v polylinkeru je nejbližší k promotoru polyhedron genu, je nazván pIVEVSIKpBg. Počet párů bází, které byly deletovány mezi původním KpnI místem v pIVEVSI a polyhedron promotorem, nebyl stanoven. pIEIVSIBgKp byl uložen a je dostupný z Američan Type Culture Collection, Rockville, Maryland pod přírůstkovým číslem č. ATCC 399988.
pIVEVSIBgKpNl pIVEVNI byl štěpen kompletně pomocí KpnI a Pstl za vzniku dvou fragmentů. Větší fragment, kteiý obsahuje plazmidový počátek replikace a 3' konec polyhedron genu, byl připraven izolací na gelu (fragment A). pIVEVSIBgKp byl štěpen kompletně pomocí pstl a Kpn za vzniku dvou fragmentů a menší fragment, který obsahuje polyhedron genový promotor a polylinker, byl připraven izolacemi na gelu (fragment B). Fragment A a B pak byly spojeny DNA ligázou za vzniku nového plazmidu pIVEVSIBgKpNl, který obsahuje částečně deletovaný polyhedron gen, do kterého byl inzertován polylinker, a obsahuje také Notl místo (nahrazení zničeného EcoRI místa) a Sfil místo, které přiléhá k polyhedron genové oblasti.
pIVEPO pIVEVSI BGKpNI byl štěpen kompletně pomocí EcoRI pro linearizaci plazmidu a 1340 bp EcoRI fragment z lambda-HEPOFL13 byl inzertován. Plazmidy, obsahující EPO gen v orientaci takové, že 5' konec EPO genu je nejbližší polyhedron promotoru a 3' konec polyhedronu genu, byly identifikovány štěpením s BglII. Jeden z těchto plazmidů ve výše popsané orientaci byl označen pIVEPO.
Exprese EPO ve hmyzích buňkách
Velká množství pIVEPO plazmidu byla vyrobena transformací E.coli kmene JMIOl-tgl. Plazmidová DNA byla izolována technikou čištění lyzátu (Maniatis a Fritsch, Cold Spring Harbor Manual) a dále čištěna pomocí CsCl odstředění. L-l DNA polyhedrosis viru standardního typu Autographa califomica (AcNPV) byla připravena fenolovou extrakcí částic viru a následným CsCl čištěním virové DNA.
Tyto dvě DNA pak byly kotransfektovány do Spodoptera frugiperda buněk IPLB-SF-21 (Vaughn a spol., In Vitro, díl B, str. 213-17 (1977) za použití transfekčního postupu s fosforečnanem vápenatým (Potter a Millere, 1977). Pro každou plotnu kotransfektovaných buněk byl použit 1 ug DNA standardního typu AcNPV a 10 ug pIVEPO. Plotny byly inkubovány při 27 °C 5 dnů. Supematant pak byl oddělen a EPO exprese v supematantu byla potvrzena radioimunoesejí a in vitro biologickou eseji.
Příklad 15
Čištění EPO
COS-buněčná kondicionovaná média (121) sEPO koncentracemi až 200 ug/litr byla koncentrována na 600 ml za použití ultrafialových membrán se schopností dělení 10 000 mol. hmotnosti, jako je Millipore Pellicans 0,46 m2 na membránu. Eseje byly provedeny pomocí RIA, jak je popsáno v příkladu 6. Retentát z ultrafiltrace byl diafiltrován proti 4 ml 10 mM 10 mM fosforečnanu sodného, pufrovaného na pH 7,0. Koncentrovaná a diafiltrovaná kondiční média obsahují 2,5 mg EPO ve 380 mg celkového proteinu. EPO roztok byl dále koncentrován na 186 ml a vysrážené proteiny byly odstraněny odstředěním při 110 000 x g po 30 minut.
-34CZ 287620 B6
Supematant, který obsahuje EPO (2,0 mg), byl upraven na pH 5,5 s 50% kyselinou octovou, ponechán míchat při 4 °C 30 minut a sraženina byla odstraněna odstřeďováním při 13 000 x g po 30 minut.
Chromatografie na karbonylmethylsepharose
Supematant z odstřeďování (20 ml), obsahující 200 ug EPO (24 mg celkového proteinu), byl nanesen na kolonu, naplněnou CM-Sepharosovou (20 ml), ekvilibrovanou v 10 mM octanu sodného pH 5,5, promytou 40 ml stejného pufru. EPO, který se navázal k CM-Sepharose, byl eluován 100 ml gradientu NaU (0-1) v 10 mM fosforečnanu sodném pH 5,5. Frakce, obsahující EPO (celkem 50 ug ve 2 mg celkových proteinů), byly spojeny a koncentrovány na 2 ml za použití Amicon YM10 ultrafiltrační membrány.
HPLC s reverzní fází
Koncentrované frakce z CM-Sepharosy, obsahující EPO, byly dále čištěny pomocí HPLC s reverzní fází za použití Vydac-Á kolony. EPO byl nanesen na kolonu, ekvilibrovanou v 10% rozpouštědle B (rozpouštědlo A bylo 0,1 % CF3CO2H ve vodě; rozpouštědlo B bylo 0,1 % CF3CO2H v CF3CO2H v CF3CN) při průtokové rychlosti 1 ml/min. Kolona byla promývána 10% B po 10 minut a EPO byl eluován s lineárním gradientem B (10-70 % po 60 minut). Frakce, obsahující EPO, byly spojeny (asi 40 ug EPO ve 120 ug celkových proteinů) a lyofilizovány. Lyofilizovaný EPO byl rekonstituován v 0,lM Tris HC1 při pH 7,5, obsahujícím 0,15M NaCl a rechromatografován pomocí HPLC s reverzní fází. Frakce, obsahující EPO, byly spojeny a analyzovány SDS-polyakrylamidovou (10%) gelovou elektroforézou (Lameli U.K., Nátuře). Spojené frakce EPO obsahují 15,5 ug EPO ve 25 ug celkového proteinu.
-35CZ 287620 B6
1) Jacobson, L. O„ Goldwasser, E. Fried, W., a Pizak, L. F., Trans. Assoc, Am. Physlcians TO:305-317 (1957).
2) Krantz, S. B. a Jacobson, L. O. Chicago: University of Chicago Press 1970, pp. 29-31.
3) Hammond, D a. Winnick, S. Ann. N.Y. Acad. Sci. 23ÓŽ19-227 (1974).
4) Sherwood, J. B. ε Goldwasser, E., Endocrinology 103:866-870 (1978).
5) Fried, W. Blood 40:671-677 (1972).
6) fisher, J. J. Lab. a£_ Clin. Med. 93:695-699 (1979).
7) Naughton, B. A., Kaplan. S. M., Roy, M., Burdowski, A. J., Gordon, A. S., a. Piliero, S. J. Science 196:301-302.
8) Lucarelli, G. P.. Howard, D., a. Stohlman, F., Jr. J. Clin. Invest 43:2195-2203 (1964).
9) Zanjani, E. D., Poster, J., Burlington, H., Mann, L.T.,~a Wasserman, L. R. J. Lab. Clin. Med. 89:640644 (1977).
10) Krantz, S. B., Gallien-Lartigue, O., a> Goldwasser, E. J. Biol Chem. 238:4085-4090 (1963).
11) Dunn, C. D., Jarvis, J. H. a· Greehman, J. M. Exp. Hematoí. 3:65-78 (1975).
12) Krystal, G. Exp. Hematol. 11:649-660 (1983)
13) Iscove, N.N. a* Guilbert, L.J., M.J. Murphy, Jr. (Ed.) New York: Springer-Verlag, pp. 3-7 (1978).
14) Goldwasser. E., ICN UCLA Symposium Control of Cellular Division and Development. A. R. Liss, lne., pp. 487-494 (1981)
15) Cline, M. J. a Golde, D. W. Nátuře 277:177-181 (1979)
16) Metcalf, D., Johnson, G. R., a> Burgess, A. W. Blood 55:138- (1980)
17) Krane, N. Henry Ford Hosp. Med. J. 31:177-181 (1983)
18) Eschbach, J., Madenovic, J., Garda J., Wahl, P., a Adamson, J. J. Clin. Invest. 74;434-441 (1984)
19) Anagnostou, A., Barone, J., Védo, A., at Fried, W. Br. J. Hematol 37:85-91 (1977)
20) Miyake, T., Kung, C., a : Goldwasser, E. J. Bio!. Chem.~252:5558-5564 (1977)
21) Yanagawa, S., Hirade, K., Ohnota, H., Sasaki, R., Chiba, H., Veda, M., ai Goto, M. J. Biol. Chem. 259:2707-2710 (1984)
22) Lawn, R. M., Fritsch, E. F., Parker, R. C., Blake, G., a' Maniatis, T. Cell 15:1157 - (1978)
23) Sanger, F., Nicklen, S., a Coulson, A. R. Proč. Naťl. Acad. Sci., U.SA 74:5463- (1977)
24) Zanjanc, ED., Ascensao, J.L., McGlave, P.B., Banisadre, M., ai Ash, R. C. J. Clin. Invest. 67:1183(1981)
25) Toole, J.J., Knopf, J.L., Wozney, J.M., Sultzman, LA. Buecker, J. L, Pittman, D. D., Kaufman. R. J.,
-36CZ 287620 B6
Brown, E. Shoemaker, C., Orr, E. C., Amphlett, G. W., Foster, W. B., Coe, M. L., Knutson, G. J., Fass, D. N., a. . Hewick, R. M. Nátuře in Press
26) Goldwasser, E Blood Suppí. 1,58, xlii (abstr) (1981)
27) Sue, J. M. ai ’ Šytkowdki, A J. Proč. Naťl Acad. Sci U.SA 80:3651-3855 (1983)
29) Bersch, N. a Golde. D.W., tn Vitro Aspects of Erythropoiesis, M. J. Murphy (Ed.) New York:
Springer-Verlag (1978) ~
30) Cotes, P. M. a> Bangham, D. R. Nátuře 191:1085- (1961)
31) Goldwasser, E a Gross, M. Methods in Enzymol 37:109-121 (1975)
32) Nabeshlma, Y. -i, Fujii-Kuriyama, Y., Muramatsu, M., a Ogata, K. Nátuře 308:333-338 (1984)
33) Young, R. A, Hagencuhle, 0. a Schibler, U. Cell 23:451-558 (1981)
34) Medford, R. M., Nguyen. Η. T., Destree, A ŤTSummers, E a Nadal-Ginard, B . Cell 38:409-421 (1984) “ ---
35) Ziff, E B. Nátuře 287:491 -499 (1980)
36) Early, P. Cell 20:313-319 (1980)
37) Sytkowski, A Bio. Biop. Res. Comm. 96:143-149 (1980)
38) Murphy, M. ai . Miyake, T. Acta. Haematol. Jpn. 46:1380-1396 (1983)
39) Wagh, P. V. a Bahl, O. P. CRC CritlcáTŘeviews in Biochemistry 307-377 (1981)
40) Wang, F. F., Kung, C. K. -H. a ' Goldwasser, E. Fěd. Proč. Feď. Am. Soc. Exp. Biol. 42:1872 (abstr) (1983)
41) Lowy, P., Keighley, G. a- Borsook, H. Nátuře 185:102-103 (1960) *42) VanLenten, L a Ashwell, G. J. Biol. Chem. 247:4633-4640 (1972)
43) Lee-Huang, S. Proč. Naťl Acad. Sci. USA81:2708-2712(1984)
44) Fyhrquist, F., Rosenlof, K., Gronhagen-Riska, C., Hortling, L ar Tikkanen. I. Nátuře 308:649-562 (1984)
45) Ohkubo, H., Kageyama, R., Vjihara. M., Hirose, T., Inayama, S., ar Nakanishi, S. Proč. Naťl Acad. Sci. U.SA 80:2196-2200 (1983)
46) Suggs, S.V., Wallace, R. B., Hirose, T., Kawashima, E. H. ar Itakura, K. Proč. Naťl. Acad. Sci. U.SA -78:6613-6617 (1981)
47) Woo, S. L C., Dugaíczyk, A, Tsai, M. -J„ Lai, E C., Catterall, J. F. ar I 0‘Malley, B. W. Proč. Naťl.Acad. Sci. U.SA 75:3688- (1978)
48) MelchtořTW?B. ar · VonHippel, P. H. Proč. Naťl Acad. Soc. U.S.A. 70:298-302 (1973)
49) Orosz, J. M. a . Wetrnis, J. G. Biopolymers 16;1183-1199 (1977)
50) Anderson, S a Kingston, I. B. Proč. NaťTAcad. Sci.-U.SA. 80:6836-6842 (1983)
51) Ullrich, A, Coussens, L, Hayflick, J. S. ΊοϊιΙΙ, T. J., Gray, A, Tam, A W., Lee, J.. Yarden, Y., Ubermann. T. A, Schlesslnger, J„ Downward, J., Mayes, E. L V., Whittle, H.. Waterfield, M.D. a. ’ Seeburg, P. H. Nátuře 309:418-425 (1984)
52) Fisher, J. Proč. Soc. Exptí. Biol. and Med . 173:289-305 (1983)
53) Kozák, M. Nuc. Acld Res. 12:857-872 (1984)
54) Benton, W.D. e Davís, R.w. Science 196:180-182 (1977)
55) Sherwood, J.B. a Goldwasser, E. Blood 54:885-893 (1979)
56) Derman, E, Krauter, K., Walling, L., Weinberger, C., Ray, M., a Damell, J. T., Cell 23:731- (1981)
57) Gluzman, Y., Cell 23:175-182 (1981)
58) Hewick, R. M., Hunkaplller, Μ. E., Hood, L E., f Dreyer, W. J. J. Biol. Chem. 256:7990-7997 (1981) ~
59) Towbln, H.. Stachelin, T„ a.· Gordon, J„ Proč. Naťl Acad. Sel. 76:4380- (1979)
60) Camott, P., Deflandre, C. C. R. Acad. Sci; Paris 143:432-(1960)
Claims (7)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. Způsob produkce lidského erythropoietinu, vyznačující se tím, že se ve 10 vhodném médiu kultivují eukaryontní hostitelské buňky, obsahující DNA sekvenci, znázorněnou v tabulce 3 od sekvence ATG kódující počáteční Met do AGA kódující terminální Arg, operativně připojenou k expresní kontrolní sekvenci, a takto vyrobený erythropoietin se oddělí od buněk a média.-37CZ 287620 B6
- 2. Způsob podle nároku 1, vyznačující se tím, že kultivační médium obsahuje fetální sérum.5
- 3. Způsob podle některého z předchozích nároků, vyznačující se tím, že hostitelské buňkyjsou savčí buňky.
- 4. Způsob podle nároku 3, vyznačující se tím, že savčí buňky jsou buňky CVi Origin SV 40 (COS), buňky vaječníků čínského křečka (CHO), buňky myší buněčné linie, io pocházející z tkáně mléčné žlázy (Cl27), nebo buňky myší buněčné linie, pocházející z tkáně epithelu (3T3).
- 5. Způsob podle nároku 3, vyznačující se tí m , že savčí buňky jsou buňky 3T3.15
- 6. Způsob podle nároku 3, vy z n ač uj ící se tí m , že savčí buňky jsou buňky CHO.
- 7. Způsob podle nároku 3, vyznačující se tím, že DNA sekvence je obsažena ve vektoru, který také obsahuje DNA hovězího papilomaviru.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US67781384A | 1984-12-04 | 1984-12-04 | |
| US68862285A | 1985-01-03 | 1985-01-03 | |
| US69325885A | 1985-01-22 | 1985-01-22 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ287620B6 true CZ287620B6 (cs) | 2001-01-17 |
Family
ID=27418329
Family Applications (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CS858804A CZ281756B6 (cs) | 1984-12-04 | 1985-12-03 | DNA sekvence, kodující aminokyselinovou sekvenci lidského erythropoietinu, vektory, obsahující takové DNA sekvence, prokaryotické a eukaryotické hostitelské buňky transformované takovým vektorem, způsob přípravy lidského erythropoietinu, rekombinantní lidský erythropoietin a farmaceutický přípravek, obsahující erythropoietin |
| CZ19961274A CZ286557B6 (cs) | 1984-12-04 | 1996-05-02 | Způsob produkce rekombinantního lidského erythropoietinu |
| CZ19994314A CZ287620B6 (cs) | 1984-12-04 | 1999-12-02 | Způsob produkce lidského erythropoietinu |
Family Applications Before (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CS858804A CZ281756B6 (cs) | 1984-12-04 | 1985-12-03 | DNA sekvence, kodující aminokyselinovou sekvenci lidského erythropoietinu, vektory, obsahující takové DNA sekvence, prokaryotické a eukaryotické hostitelské buňky transformované takovým vektorem, způsob přípravy lidského erythropoietinu, rekombinantní lidský erythropoietin a farmaceutický přípravek, obsahující erythropoietin |
| CZ19961274A CZ286557B6 (cs) | 1984-12-04 | 1996-05-02 | Způsob produkce rekombinantního lidského erythropoietinu |
Country Status (24)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (2) | EP0411678B2 (cs) |
| JP (4) | JPH0655144B2 (cs) |
| KR (1) | KR890001011B1 (cs) |
| AT (2) | ATE63137T1 (cs) |
| AU (1) | AU621535B2 (cs) |
| CA (1) | CA1341502C (cs) |
| CZ (3) | CZ281756B6 (cs) |
| DE (3) | DE3585161D1 (cs) |
| DK (4) | DK172953B1 (cs) |
| ES (1) | ES8800049A1 (cs) |
| FI (2) | FI104261B (cs) |
| GE (1) | GEP19970775B (cs) |
| GR (1) | GR852890B (cs) |
| HK (2) | HK105693A (cs) |
| HU (1) | HU216079B (cs) |
| IL (1) | IL77081A (cs) |
| LV (2) | LV10505B (cs) |
| MD (1) | MD1639C2 (cs) |
| NO (1) | NO304469B1 (cs) |
| PL (2) | PL157926B1 (cs) |
| PT (1) | PT81590B (cs) |
| SK (2) | SK880485A3 (cs) |
| UA (1) | UA44882C2 (cs) |
| WO (1) | WO1986003520A1 (cs) |
Families Citing this family (81)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4703008A (en) * | 1983-12-13 | 1987-10-27 | Kiren-Amgen, Inc. | DNA sequences encoding erythropoietin |
| KR850004274A (ko) * | 1983-12-13 | 1985-07-11 | 원본미기재 | 에리트로포이에틴의 제조방법 |
| NZ210501A (en) * | 1983-12-13 | 1991-08-27 | Kirin Amgen Inc | Erythropoietin produced by procaryotic or eucaryotic expression of an exogenous dna sequence |
| US4677195A (en) * | 1985-01-11 | 1987-06-30 | Genetics Institute, Inc. | Method for the purification of erythropoietin and erythropoietin compositions |
| EP0236059B1 (en) * | 1986-02-27 | 1994-04-27 | Snow Brand Milk Products Co. Ltd. | Preparation of erythropoietin-producing cells and production process of erythropoietin using same |
| DK173067B1 (da) * | 1986-06-27 | 1999-12-13 | Univ Washington | Humant erythropoietin-gen, fremgangsmåde til ekspression deraf i transficerede cellelinier, de transficerede cellelinier sa |
| AU613316B2 (en) * | 1986-09-12 | 1991-08-01 | Genentech Inc. | Improved recombinant expression |
| US4954437A (en) * | 1986-09-15 | 1990-09-04 | Integrated Genetics, Inc. | Cell encoding recombinant human erythropoietin |
| US4835260A (en) * | 1987-03-20 | 1989-05-30 | Genetics Institute, Inc. | Erythropoietin composition |
| FR2686899B1 (fr) | 1992-01-31 | 1995-09-01 | Rhone Poulenc Rorer Sa | Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant. |
| US5888774A (en) * | 1994-12-19 | 1999-03-30 | Cangene Corporation | Recombinant DNA molecules and expression vectors for erythropoietin |
| IL160406A0 (en) | 1995-06-15 | 2004-07-25 | Crucell Holland Bv | A cell harbouring nucleic acid encoding adenoritus e1a and e1b gene products |
| EP0752474A1 (en) | 1995-07-07 | 1997-01-08 | Boehringer Mannheim Gmbh | Nucleic acid coding for CMP-N-acetyl-neuraminic acid hydroxylase and its use for the production of modified glycoproteins |
| AU6611896A (en) * | 1995-07-07 | 1997-02-10 | Boehringer Mannheim Gmbh | Nucleic acid coding for cmp-n-acetyl-neuraminic acid hydroxylase and its use for the production of modified glycoproteins |
| DE19535571A1 (de) | 1995-09-14 | 1997-03-20 | Boehringer Mannheim Gmbh | Pharmazeutische Kombinationspräparate und deren Verwendung zur Behandlung von Hämodialysepatienten |
| US5952226A (en) * | 1996-11-05 | 1999-09-14 | Modex Therapeutiques | Hypoxia responsive EPO producing cells |
| IL131959A0 (en) | 1997-03-18 | 2001-03-19 | Roche Diagnostics Gmbh | Pharmaceutical combined preparations containing erythropoietin and iron preparations |
| EP0885613A1 (de) | 1997-06-21 | 1998-12-23 | Roche Diagnostics GmbH | Verwendung von modifizierten Hämoglobinen zur Behandlung von Anämien und Kombinationspräparate umfassend Erythropoietin und modifiziertes Hämoglobin |
| JP4541539B2 (ja) * | 1997-07-23 | 2010-09-08 | ロシュ ダイアグノスティックス ゲーエムベーハー | 内因性遺伝子活性化によるエリスロポエチンの製造 |
| PT986644E (pt) | 1997-07-23 | 2007-01-31 | Roche Diagnostics Gmbh | Preparação de eritropoietina por activação genética endógena com promotores virais |
| US6395484B1 (en) | 1997-07-23 | 2002-05-28 | Roche Diagnostics Gmbh | Identification of human cell lines for the production of human proteins by endogenous gene activation |
| KR100622203B1 (ko) | 1997-07-23 | 2006-09-07 | 로셰 디아그노스틱스 게엠베하 | 내인성 유전자 활성화에 의해 사람 단백질을 생성시키는 사람 세포주를 확인하는 방법 |
| US6548296B1 (en) | 1997-07-23 | 2003-04-15 | Roche Diagnostics Gmbh | Methods for identifying human cell lines useful for endogenous gene activation, isolated human lines identified thereby, and uses thereof |
| ES2208798T3 (es) * | 1997-09-01 | 2004-06-16 | Aventis Pharma Deutschland Gmbh | Eritropoyetina humana recombinante con un perfil de glicosilacion ventajoso. |
| AR019025A1 (es) | 1998-04-09 | 2001-12-26 | Roche Diagnostics Gmbh | Uso de eritropoyetina en bajas dosis para producir un preparado farmaceutico para el tratamiento de hemocromatosis, preparado farmaceutico combinadoutilizado segun dicho uso y envase farmaceutico unitario que contiene al referido preparado farmaceutico combinado |
| US6777205B1 (en) | 1998-11-06 | 2004-08-17 | Sterrenbeld Biotechnologie North America, Inc. | Host cells expressing recombinant human erythropoietin |
| BR9917606A (pt) | 1998-11-06 | 2002-12-31 | Bio Sidus S A | Procedimento para a purificação de eritropoetina humana recombinante a partir de sobrenadantes de cultivo de células e eritropoetina humana recombinante obtida com tal procedimento |
| BR9905867A (pt) * | 1998-11-06 | 2001-01-23 | Bio Sidus S A | Linhagem celular produtora de eritropoietina humana recombinante e a eritropoietina humana recombinante produzida por esta célula |
| BR9905868A (pt) | 1998-11-06 | 2001-01-23 | Bio Sidus S A | Procedimento de cultivo massivo de células de mamìfero para a obtenção de eritropoetina humana, recombinante e a eritropoetina humana recombinante obtida com tal procedimento |
| DE19857609A1 (de) | 1998-12-14 | 2000-06-15 | Hannelore Ehrenreich | Verwendung von Erythropoietin zur Behandlung von cerebralen Ischämien des Menschen |
| US7297680B2 (en) | 1999-04-15 | 2007-11-20 | Crucell Holland B.V. | Compositions of erythropoietin isoforms comprising Lewis-X structures and high sialic acid content |
| US7604960B2 (en) | 1999-04-15 | 2009-10-20 | Crucell Holland B.V. | Transient protein expression methods |
| US8236561B2 (en) | 1999-04-15 | 2012-08-07 | Crucell Holland B.V. | Efficient production of IgA in recombinant mammalian cells |
| US6855544B1 (en) | 1999-04-15 | 2005-02-15 | Crucell Holland B.V. | Recombinant protein production in a human cell |
| US7521220B2 (en) | 1999-11-26 | 2009-04-21 | Crucell Holland B.V. | Production of vaccines |
| US7192759B1 (en) | 1999-11-26 | 2007-03-20 | Crucell Holland B.V. | Production of vaccines |
| US7527961B2 (en) | 1999-11-26 | 2009-05-05 | Crucell Holland B.V. | Production of vaccines |
| EP2213743A1 (en) | 2000-04-12 | 2010-08-04 | Human Genome Sciences, Inc. | Albumin fusion proteins |
| AU2002233230B2 (en) | 2000-12-20 | 2007-02-01 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Erythropoietin conjugates |
| DE10112825A1 (de) | 2001-03-16 | 2002-10-02 | Fresenius Kabi De Gmbh | HESylierung von Wirkstoffen in wässriger Lösung |
| KR100505152B1 (ko) * | 2001-09-10 | 2005-08-03 | (주)가이아진 | 아스코르브산을 이용한 에리트로포이에틴의 생산방법 |
| US6930086B2 (en) | 2001-09-25 | 2005-08-16 | Hoffmann-La Roche Inc. | Diglycosylated erythropoietin |
| PT1465987E (pt) | 2001-12-07 | 2008-04-15 | Crucell Holland Bv | Produção de vírus, isolados virais e vacinas |
| AU2002364586A1 (en) | 2001-12-21 | 2003-07-30 | Delta Biotechnology Limited | Albumin fusion proteins |
| WO2005003296A2 (en) | 2003-01-22 | 2005-01-13 | Human Genome Sciences, Inc. | Albumin fusion proteins |
| DE10209822A1 (de) | 2002-03-06 | 2003-09-25 | Biotechnologie Ges Mittelhesse | Kopplung niedermolekularer Substanzen an ein modifiziertes Polysaccharid |
| DE10209821A1 (de) | 2002-03-06 | 2003-09-25 | Biotechnologie Ges Mittelhesse | Kopplung von Proteinen an ein modifiziertes Polysaccharid |
| RU2245720C2 (ru) * | 2002-07-01 | 2005-02-10 | Государственное учреждение Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии МЗ РФ | Способ восполнения кровопотери при операциях на легких у больных туберкулезом |
| DE10234192B4 (de) | 2002-07-26 | 2009-11-26 | Epoplus Gmbh Co.Kg | Verwendung von Erythropoetin |
| US7459435B2 (en) | 2002-08-29 | 2008-12-02 | Hoffmann-La Roche Inc. | Treatment of disturbances of iron distribution |
| BR0314227A (pt) | 2002-09-11 | 2005-10-25 | Fresenius Kabi De Gmbh | Derivados de amido de hidroxialquila |
| US7538092B2 (en) | 2002-10-08 | 2009-05-26 | Fresenius Kabi Deutschland Gmbh | Pharmaceutically active oligosaccharide conjugates |
| US7459436B2 (en) | 2002-11-22 | 2008-12-02 | Hoffmann-La Roche Inc. | Treatment of disturbances of iron distribution |
| WO2004099396A1 (en) | 2003-05-09 | 2004-11-18 | Crucell Holland B.V. | Cultures of e1-immortalized cells and processes for culturing the same to increase product yields therefrom |
| WO2005014655A2 (en) | 2003-08-08 | 2005-02-17 | Fresenius Kabi Deutschland Gmbh | Conjugates of hydroxyalkyl starch and a protein |
| WO2005032467A2 (en) | 2003-09-29 | 2005-04-14 | Warren Pharmaceuticals, Inc. | Tissue protective cytokines for the treatment and prevention of sepsis and the formation of adhesions |
| ATE469654T1 (de) | 2003-12-30 | 2010-06-15 | Augustinus Bader | Verwendung des erythropoietins zur regeneration von lebergewebe |
| DE102004004509B4 (de) | 2004-01-23 | 2010-07-01 | Epoplus Gmbh Co.Kg | Einsatz von niedrig dosiertem Erythropoietin zur Stimulation endothelialer Vorläuferzellen sowie zur Organregeneration und Progressionsverlangsamung von Endorganschäden |
| JP5191729B2 (ja) | 2004-03-11 | 2013-05-08 | フレゼニウス・カビ・ドイチュラント・ゲゼルシャフト・ミット・ベシュレンクテル・ハフツング | 還元的アミノ化によって製造される、ヒドロキシアルキルデンプンとタンパク質とのコンジュゲート |
| ES2390885T3 (es) | 2004-03-11 | 2012-11-19 | Fresenius Kabi Deutschland Gmbh | Conjugados de hidroxialquilalmidón y una proteína |
| GB0507123D0 (en) * | 2005-04-08 | 2005-05-11 | Isis Innovation | Method |
| EP1762250A1 (en) | 2005-09-12 | 2007-03-14 | Fresenius Kabi Deutschland GmbH | Conjugates of hydroxyalkyl starch and an active substance, prepared by chemical ligation via thiazolidine |
| AR053416A1 (es) | 2005-11-10 | 2007-05-09 | Protech Pharma S A | Combinacion de glicoisoformas para el tratamiento o prevencion de la septicemia, linea celular transgenica productora de glicoformas de eritropoyetina, composicion farmaceutica que comprende a dicha combinacion, procedimientos para obtener la linea celular, procedimiento para producir dicha combinac |
| EP1978030A4 (en) | 2006-01-18 | 2009-12-30 | Chugai Pharmaceutical Co Ltd | PROCESS FOR REMOVING SIALIC ACID AND METHOD FOR PRODUCING ASIALOERYTHROPOIETIN |
| DE102006004008A1 (de) | 2006-01-27 | 2007-08-02 | Hannelore Prof. Dr. Dr. Ehrenreich | Verfahren zur Behandlung und/oder Prophylaxe von Multipler Sklerose, sowie Verwendung von Erythropoietin zur Herstellung eines Arzneimittels zur intermittierenden Behandlung und/oder intermittierenden Prophylaxe von Multipler Sklerose |
| EP1991569A4 (en) * | 2006-03-07 | 2009-12-23 | Regenetech Inc | MAMMALIAN BIOLOGICAL MOLECULES WITH NATURAL GLYCOSYLATION PRODUCED BY ELECTROMAGNETIC STIMULATION OF LIVING MAMMALIAN CELLS |
| JP5553506B2 (ja) | 2006-03-22 | 2014-07-16 | 中外製薬株式会社 | エリスロポエチン溶液製剤 |
| PL2054074T3 (pl) | 2006-08-04 | 2015-03-31 | Prolong Pharmaceuticals Llc | Zmodyfikowana erytropoetyna |
| WO2009010107A1 (en) | 2007-07-19 | 2009-01-22 | Hannelore Ehrenreich | Use of epo receptor activation or stimulation for the improvement of the edss score in patients with multiple sclerosis |
| EP2070950A1 (en) | 2007-12-14 | 2009-06-17 | Fresenius Kabi Deutschland GmbH | Hydroxyalkyl starch derivatives and process for their preparation |
| EP2095829A1 (en) | 2008-02-27 | 2009-09-02 | LEK Pharmaceuticals D.D. | Selenium containing modifying agents and conjugates |
| DE102008002209A1 (de) | 2008-06-04 | 2009-12-10 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur Aufreinigung von Erythropoietin |
| DE102008002210A1 (de) | 2008-06-04 | 2009-12-10 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur fermentativen Herstellung von Erythropoietin |
| CN102164954B (zh) | 2008-09-23 | 2018-04-06 | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 | 促红细胞生成素的纯化 |
| DE102008054716A1 (de) | 2008-12-16 | 2010-06-17 | Evonik Degussa Gmbh | Inprozesskontrolle in einem Verfahren zur Herstellung von EPO |
| US20100272816A1 (en) | 2009-04-27 | 2010-10-28 | Wolfgang Rudinger | Microcapsules comprising liver cells and erythropoietin, methods for preparing said microcapsules and methods for treating a patient comprising applying said microcapsules to the patient |
| EA022396B1 (ru) | 2009-09-23 | 2015-12-30 | Ратиофарм Гмбх | Способ очистки рекомбинантного эритропоэтина человека (epo), эритропоэтин, очищенный данным способом, и фармацевтические композиции, содержащие такой эритропоэтин |
| WO2017068051A1 (en) | 2015-10-21 | 2017-04-27 | Lek Pharmaceuticals D.D. | Peg-based dendron and process for producing the same |
| CN106906359B (zh) | 2015-12-22 | 2018-12-11 | 理查德.亨威克 | 从硅酸盐矿物收取锂 |
| EP3570871B1 (en) | 2017-03-20 | 2020-11-18 | H. Hoffnabb-La Roche Ag | Method for in vitro glycoengineering of an erythropoiesis stimulating protein |
| WO2022159414A1 (en) | 2021-01-22 | 2022-07-28 | University Of Rochester | Erythropoietin for gastroinfestinal dysfunction |
Family Cites Families (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US439780A (en) * | 1890-11-04 | Method of and apparatus for casting ingots | ||
| US3865801A (en) * | 1973-06-15 | 1975-02-11 | Atomic Energy Commission | Stabilization of urinary erythropoietin using sodium p-aminosalicylate and extracting into phenol |
| JPS5455790A (en) * | 1977-10-05 | 1979-05-04 | Tomoyuki Tajima | Production of erythropoetin |
| JPS5653696A (en) * | 1979-10-09 | 1981-05-13 | Ajinomoto Co Inc | Isolation of erythropoietin by adsorption |
| JPS6045849B2 (ja) * | 1980-08-25 | 1985-10-12 | 林原 健 | ヒトエリトロポエチンの製造方法 |
| US4419446A (en) * | 1980-12-31 | 1983-12-06 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Recombinant DNA process utilizing a papilloma virus DNA as a vector |
| JPS6043395A (ja) * | 1983-08-19 | 1985-03-07 | Sumitomo Chem Co Ltd | エリスロポエチンの製造法 |
| NZ210501A (en) * | 1983-12-13 | 1991-08-27 | Kirin Amgen Inc | Erythropoietin produced by procaryotic or eucaryotic expression of an exogenous dna sequence |
| IT1185503B (it) * | 1984-01-11 | 1987-11-12 | Univ New York | Cloni di odna di eritropietina umana |
| JPS60215632A (ja) * | 1984-04-12 | 1985-10-29 | Japan Found Cancer | エリスロポエチンの製造法 |
| US4732889A (en) * | 1985-02-06 | 1988-03-22 | Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha | Pharmaceutical composition for the treatment of the anemia of rheumatoid arthritis |
| JPH062070B2 (ja) * | 1988-07-06 | 1994-01-12 | 農林水産省食品総合研究所長 | ▲o下−▼アシルアミノ酸の製造方法 |
-
1985
- 1985-11-18 IL IL7708185A patent/IL77081A/en not_active IP Right Cessation
- 1985-12-02 PT PT81590A patent/PT81590B/pt unknown
- 1985-12-02 GR GR852890A patent/GR852890B/el unknown
- 1985-12-03 WO PCT/US1985/002405 patent/WO1986003520A1/en not_active Ceased
- 1985-12-03 EP EP90118215A patent/EP0411678B2/en not_active Expired - Lifetime
- 1985-12-03 EP EP86900439A patent/EP0205564B2/en not_active Expired - Lifetime
- 1985-12-03 HU HU553/86A patent/HU216079B/hu unknown
- 1985-12-03 SK SK8804-85A patent/SK880485A3/sk unknown
- 1985-12-03 CA CA000496740A patent/CA1341502C/en not_active Expired - Fee Related
- 1985-12-03 DE DE9090118215T patent/DE3585161D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1985-12-03 PL PL1985287787A patent/PL157926B1/pl unknown
- 1985-12-03 ES ES549539A patent/ES8800049A1/es not_active Expired
- 1985-12-03 AT AT86900439T patent/ATE63137T1/de not_active IP Right Cessation
- 1985-12-03 DE DE8686900439T patent/DE3582732D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1985-12-03 SK SK1687-99A patent/SK168799A3/sk unknown
- 1985-12-03 PL PL1985256589A patent/PL154180B1/pl unknown
- 1985-12-03 AU AU53134/86A patent/AU621535B2/en not_active Withdrawn - After Issue
- 1985-12-03 DE DE199090118215T patent/DE411678T1/de active Pending
- 1985-12-03 AT AT90118215T patent/ATE71408T1/de not_active IP Right Cessation
- 1985-12-03 CZ CS858804A patent/CZ281756B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1985-12-03 GE GEAP19851901A patent/GEP19970775B/en unknown
-
1986
- 1986-07-24 FI FI863044A patent/FI104261B/fi not_active IP Right Cessation
- 1986-07-28 NO NO863050A patent/NO304469B1/no not_active IP Right Cessation
- 1986-08-01 DK DK198603687A patent/DK172953B1/da not_active IP Right Cessation
- 1986-08-04 KR KR8670525A patent/KR890001011B1/ko not_active Expired
-
1988
- 1988-03-18 JP JP63065591A patent/JPH0655144B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1988-03-18 JP JP63065592A patent/JPH02104284A/ja active Pending
- 1988-08-09 JP JP63198766A patent/JPH02442A/ja active Pending
-
1991
- 1991-11-15 UA UA5010104A patent/UA44882C2/uk unknown
-
1992
- 1992-12-02 JP JP4323466A patent/JPH07184681A/ja active Pending
-
1993
- 1993-06-08 LV LVP-93-500A patent/LV10505B/lv unknown
- 1993-06-10 LV LVP-93-623A patent/LV10507B/lv unknown
- 1993-10-07 HK HK1056/93A patent/HK105693A/en not_active IP Right Cessation
- 1993-10-07 HK HK1055/93A patent/HK105593A/en not_active IP Right Cessation
-
1994
- 1994-07-14 MD MD94-0371A patent/MD1639C2/ro not_active IP Right Cessation
-
1996
- 1996-05-02 CZ CZ19961274A patent/CZ286557B6/cs not_active IP Right Cessation
-
1997
- 1997-08-20 DK DK95197A patent/DK173254B1/da not_active IP Right Cessation
-
1999
- 1999-08-20 DK DK199901147A patent/DK173293B1/da not_active IP Right Cessation
- 1999-09-27 FI FI992064A patent/FI105347B/fi not_active IP Right Cessation
- 1999-12-02 CZ CZ19994314A patent/CZ287620B6/cs not_active IP Right Cessation
-
2000
- 2000-03-29 DK DK200000527A patent/DK175826B1/da not_active IP Right Cessation
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CZ287620B6 (cs) | Způsob produkce lidského erythropoietinu | |
| JPH09118695A (ja) | 組換え繊維芽細胞成長因子 | |
| RU2129613C1 (ru) | Способ получения эритропоэтина человека | |
| JPH0144317B2 (cs) | ||
| AU5711199A (en) | Method for the production of erythropoietin | |
| KR930005917B1 (ko) | 에리트로포이에틴의 제조방법 | |
| AU604051B2 (en) | Recombinant human erythropoietin | |
| DD251788A5 (de) | Verfahren zur Herstellung eines menschlichen cDNA-Klons | |
| DD279687A5 (de) | Verfahren zur herstellung von erythropoietin |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MK4A | Patent expired |
Effective date: 20051203 |