JP7082013B2 - 微粒子測定システム、計測装置 - Google Patents
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Description
Is=Vb/Rp …(1)
Vs=r×Is …(2)
式(1)を式(2)に代入すると、式(3)が得られる。
Vs=Vb×r/Rp …(3)
デジタイザ230は、電圧信号VsをデジタルデータDsに変換する。このように計測装置200Rにより、細孔104の抵抗値Rpに反比例する電圧信号Vsを得ることができる。
図3は、実施の形態に係る微粒子測定システム1のブロック図である。微粒子測定システム1は、ナノポアデバイス100、計測装置200、データ処理装置300を備える。
T1=X1/r1
T2=X2/r2
ここでは、T1<T2であるとする。r1、r2は、キャッシュのデータ量の増加の傾きに対応する。
第1データD1、第2データD2を確実にデータ処理装置300に送信することができる。
実施の形態では、アナログ領域で、第1信号V1と第2信号V2を生成し、デジタルデータD1,D2を取得したがその限りでない。たとえば電圧信号Vsを高速かつ高分解能なA/Dコンバータによってデジタル信号Dsに変換し、デジタル信号処理により、第1データD1と第2データD2を生成してもよい。具体的には、デジタルのハイパスフィルタを用いてデジタル信号Dsを処理することで、第1データD1を生成してもよく、デジタルのローパスフィルタを用いてデジタル信号Dsを処理することで、第2データD2を生成してもよい。
実施の形態では、第2データD2の生成に、ローパスフィルタ(アンチエイリアシングフィルタ)を利用したがその限りでなく、ローパスフィルタは省略することもできる。なぜなら、第2データD2は、ナノポアデバイスの状態の監視に利用できる程度の情報、すなわちおおまかな電流レベルが取得できればよく、したがってサンプリングノイズ等が含まれていたとしても大きな影響はないからである。
計測装置200からデータ処理装置300への第1データD1、第2データD2の伝送は以下のように行ってもよい。たとえば、第1データD1と第2データD2それぞれのビット数が、バスのデータ幅より大きい場合には、第1キャッシュ群241からすべての第1データD1を先行して読み出してデータ処理装置300に送信し、続いて第2キャッシュ群242からすべての第2データD2を読み出してデータ処理装置300に送信してもよい。
図7の計測装置200において、同じアドレスに対して書き込みと読み出しが同時に可能なデュアルポートキャッシュを用いてもよい。
本明細書では微粒子計測装置について説明したが本発明の用途はそれに限定されず、DNAシーケンサをはじめとするナノポアデバイスを用いた微小電流計測を伴う計測器に広く用いることができる。
2 電解液
4 粒子
100 ナノポアデバイス
102 ナノポアチップ
104 細孔
106,108 電極
200 計測装置
210 トランスインピーダンスアンプ
220 電圧源
250 ハイパスフィルタ
252 アンチエイリアシングフィルタ
231 第1A/Dコンバータ
232 第2A/Dコンバータ
240 インタフェース
241 第1キャッシュ群
242 第2キャッシュ群
244 キャッシュコントローラ
246 バスコントローラ
300 データ処理装置
V1 第1信号
V2 第2信号
D1 第1データ
D2 第2データ
Claims (8)
- 細孔および電極対を有するナノポアデバイスを用いた微粒子測定システムであって、
前記ナノポアデバイスに流れる電流信号を電圧信号に変換するトランスインピーダンスアンプと、
前記電極対の間に直流のバイアス電圧を印加する電圧源と、
前記電圧信号を受けるハイパスフィルタと、
前記ハイパスフィルタの出力を第1デジタルデータに変換する第1A/Dコンバータと、
前記ハイパスフィルタを通過しない信号を第2デジタルデータに変換する第2A/Dコンバータと、
を備え、
前記電圧信号からDC成分を除去した前記第1デジタルデータと、前記電圧信号からDC成分を除去しない前記第2デジタルデータと、にもとづいて、微粒子を測定するとともに、前記ナノポアデバイスの状態を監視可能であることを特徴とする微粒子測定システム。 - 前記第1A/Dコンバータの分解能は、前記第2A/Dコンバータの分解能より高いことを特徴とする請求項1に記載の微粒子測定システム。
- 前記第1A/Dコンバータのサンプリングレートは、前記第2A/Dコンバータのサンプリングレートより高いことを特徴とする請求項1または2に記載の微粒子測定システム。
- 前記第1デジタルデータにもとづいて、微粒子を検出する処理と、前記第2デジタルデータに応じて、前記ナノポアデバイスの状態を監視する処理と、を実行するプロセッサを含むことを特徴とする情報処理装置をさらに備えることを特徴とする請求項1から3のいずれかに記載の微粒子測定システム。
- 前記情報処理装置は、前記ナノポアデバイスの目詰まりを検出可能であることを特徴とする請求項4に記載の微粒子測定システム。
- 前記情報処理装置は、前記第2デジタルデータが示す電流量が所定時間にわたり、所定値より小さいときに、前記ナノポアデバイスが目詰まり状態であると判定することを特徴とする請求項5に記載の微粒子測定システム。
- 細孔および電極対を有するナノポアデバイスを測定する計測装置であって、
前記ナノポアデバイスに流れる電流信号を電圧信号に変換するトランスインピーダンスアンプと、
前記電極対の間に直流のバイアス電圧を印加する電圧源と、
前記電圧信号からDC成分を除去するハイパスフィルタと、
前記ハイパスフィルタの出力を第1データに変換する第1A/Dコンバータと、
前記ハイパスフィルタを通過する前の前記電圧信号を、第2データに変換する第2A/Dコンバータと、
前記第1データを格納するための第1キャッシュ群と、
前記第2データを格納するための第2キャッシュ群と、
前記第1データおよび前記第2データを、前記第1キャッシュ群および前記第2キャッシュ群に書き込むとともに、前記第1データおよび前記第2データを読み出すキャッシュコントローラと、
前記キャッシュコントローラが読み出した前記第1データおよび前記第2データを、外部の情報処理装置に伝送するバスコントローラと、
を備えることを特徴とする計測装置。 - 前記第1A/Dコンバータのサンプリングレートは、前記第2A/Dコンバータのサンプリングレートよりも高く、
前記キャッシュコントローラは、前記第1キャッシュ群に含まれる複数のキャッシュのいずれかにおいてキャッシュフルが生ずると、前記第1データの読み出しを開始し、前記第2キャッシュ群に含まれる複数のキャッシュのいずれかにおいてキャッシュフルが生ずると、前記第2データの読み出しを開始することを特徴とする請求項7に記載の計測装置。
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