JPH06504441A - アルツハイマー病に関するテストおよびモデル - Google Patents

アルツハイマー病に関するテストおよびモデル

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 アルツハイマー病に関するテストおよびモデル発明の背景 アルツハイマー病は、一般的に老人痴呆として知られている進行性の病気である 。広義にいうと、この病気は、2つのカテゴリー、つまり後年に始まるものと初 期に始まるものとに分かれる。後年に始まるものは、老年(65+数年)で起こ り、正常なものより早い速度でかつより重度に脳の自然の萎縮が起こることによ って生じるものである。
初期に始まるアルツハイマー病は、かなりより頻繁に起こるが、老年期前、つま り35から60才の間で、非常に発達する広範囲な脳の萎縮による病理学的に同 様な痴呆を示す。このタイプのアルツハイマー病の一形態としては血族で起こり やすいものがあることが知られており、このため1、これは家族性アルツハイマ ー病(familial AlzheimCr’5disease) (FAD )として知られている。
両方のタイプのアルツハイマー病において、病理学的には同様であるが、より若 い年齢で始まる場合のほうが、異常性がより重度でかつより広範囲になる傾向が ある。この病気は、2タイプの脳の病変、つまり、老年性局面および神経細線維 のもつれ(neurofibrillary tangle)によって特徴づけ られる。
老人性局面は、中枢の細胞外のアミロイドの沈着による150μmまでの直径の 破壊された神経網の領域である。
神経細線維のもつれ(neurofibrillary tangle)は、そ れぞれが対でねじれている2本のフィラメントからなるアミロイドタンパク質の 細胞内の沈着物である。
老人性局面のアミロイドフィラメントの主要なタンパク質のサブユニットである 、β−アミロイドタンパク質は、相対的な分子量が約4,500の非常に凝集し た小さいポリペプチドである。このタンパク質は、アミロイド前駆体タンパク質 (amyloid precursor protein) (APP)と呼ば れるかなりより大きな前駆体タンパク質の切断生成物である。
現在、様々な形態のアルツハイマー病(AD)に対する効果的な治療は知られて いない。しかしながら、それに対する治療が利用でき、アルツハイマー病に関す る痴呆とよく似た進行性の知能の衰退が生じる様々な他の形態の痴呆は存在する 。
したがって、ADに関する診断テストによって、アルツハイマー病を排除できる ため、これらの他の症状の診断および治療に有用な道具が得られる。また、適当 な治療が利用できる際にも有用である。
ADの病因に含まれる基礎的な生化学的な事項をさらに定義するために用いられ るアルツハイマー病の実験モデルの開発も重要である。このようなモデルは、一 つの適用として、アルツハイマー病の変性の過程を変える物質(agent]を 評価するために用いることができると考えられる。例えば、アルツハイマー病の モデルシステムを、ADの病因を誘発する若しくは促進する環境因子のスクリー ニングに用いられる。一方、実験モデルは、ADの進行を阻害し、防止し、また は転換する物質のスクリーニングに用いることができる。ADを防止し、はばみ 、若しくは転換するのに効果的である薬剤の開発に用いることもできると考えら れる。
発明の要約 本発明は、モデルシステムがAPP770の717番目のアミノ酸残基の位置に 相当するアミノ酸の位置にバリン以外のアミノ酸を有するアミロイド前駆体タン パク質(APP)のイソ型または断片をエンコードするDNA配列からなる、ア ルツハイマー病のモデルシステムを提供するものである。
第一の実施態様においては、本発明は、APP770の717番目のアミノ酸残 基の位置に相当するアミノ酸の位置にバリン以外のアミノ酸を有するアミロイド 前駆体タンパク質(APP)のイソ型または断片をエンコードする単離されたD NA配列を提供するものである。
第二の実施態様においては、本発明は、APP770の717番目のアミノ酸残 基の位置に相当するアミノ酸の位置にバリン以外のアミノ酸を有するアミロイド 前駆体タンパク質(APP)のイソ型または断片をエンコードするヒトのDNA 配列の少なくとも1つの組込まれたコピーを何するヒト以外の形質転換動物を提 供するものである。
第二の実施態様においては、本発明は、ヒト以外の内因性のAPP対立遺伝子の 少なくとも1つがバリンをエンコードしない717番目のコドンを含むすべての 若しくは一部のヒトのAPP遺伝子によって完全に若しくは部分的に置き代った ものである、ヒト以外の形質転換動物を提供するものである。
第四の実施態様においては、本発明は、細胞がAPP770の717番目のアミ ノ酸残基の位置に相当するアミノ酸の位置にバリン以外のアミノ酸を有するアミ ロイド前駆体タンパク質(APP)のイソ型または断片を発現する、異種のDN A配列で形質転換した若しくはトランスフェクションした、またはヒト以外の形 質転換動物由来の、細胞、具体的には哺乳類動物の細胞および好ましくは神経、 神経膠、または星状細胞の系統(l ineage)の哺乳類動物の細胞を提供 するものである。標準的なプロトコルによると、培養されたヒトの細胞は、初代 培養物若しくは不死化した細胞株のいずれにしても、培養されたヒトの細胞が突 然変異APPポリペプチドを発現するよろに、突然変異APP対立遺伝子で、一 時的あるいは安定してトランスフェクションされる。
第五の実施態様においては、本発明は、APP770の717番目のアミノ酸残 基の位置に相当するアミノ酸の位置にバリン以外のアミノ酸を釘するアミロイド 前駆体タンパク質(A P P)のイソ型または断片をエンコードするDNA配 列を含むヒト以外の形質転換動物および形質転換された細胞の製造方法を提供す るものである。
第六の実施態様においては、本発明は、他のヒトのタンパク質を含まない、AP P770の717番目のアミノ酸残基の位置に相当するアミノ酸の位置にバリン 以外のアミノ酸を有するヒトのアミロイド前駆体タンパク質(APP)のイソ型 または断片の製造方法を提供するものである。
第七の実施態様においては、本発明は、APP770の717番目のアミノ酸残 基の位置に相当するアミノ酸の位置にバリン以外のアミノ酸を有し、他のヒトの タンパク質を含まない、ヒトのアミロイド前駆体タンパク質(APP)のイソ型 または断片を提供するものである。
第への実施態様においては、本発明は、対立遺伝子の717番目のコドンがバリ ンをエンコードしないことを決定することによってこのような疾病に特徴的なA PP対立遺伝子を検出するものである、アルツハイマー病、特に初期に始まるA Dの遺伝学的な素因に連結した(linked) (つまり、コセグレケートし た(co+egregaje) ) APP対立遺伝子の検出方法を提供するも のである。好ましくは、717番口のコドンかイソロイシン、グリシン、若しく はフェニルアラニンのいずれかをエンコードすることが決定される際に、疾病に 特徴的なAPP対立遺伝子が検出される。したがって、アルツハイマー病に関連 した遺伝学的な変化の存在を定める方法が得られる。この診断方法を用いて、遺 伝学的なスクリーニングを目的として、発病する前に、この病気の発達を予想す るまたはヒト以外の実験動物若しくは細胞において特異的な突然変異を検出する ことができる。
第九の実施態様においては、本発明は、特にヒト以外の動物の細胞に存在する、 他のヒトのタンパク質を含まないヒトの変異APPポリペプチドを提供するもの である。本発明は、また、717番目の位置(APP770に関して定義される 際の)でのアミノ酸の置換を含む本発明の特別な実施態様に関して上記したよう なこのようなポリペプチドをエンコードする単離された核酸およびこのような核 酸の使用及び適用に関するものである。
本発明の一概念によると、APPに関してコードする遺伝子配列における遺伝学 的な変化を同定することからなる、被験者から除去した核酸または他のサンプル における、アルツハイマー病に対する遺伝子の存在を検出する方法を提供するも のである。
図の簡単な説明 図1は、初期に始まるADが明らかに常染色体優性の無秩序fdisotdet )として受け継がれている第一の家系図を示すものである。この家族における疾 病する平均年齢は57±5才である。黒塗は、疾病した人を意味し、斜線は死亡 した人を示す。女性は丸によって示され、男性は四角によって示される。三角は プライバシーの保護のため現在の世代について用いられる。第二助代においては 、2人の疾病した兄弟の配偶者は姉妹であった。サンプルは、ハブロタイブが示 されている13人、これらの人々の19人の子供及び配偶者、および7人のより 遠い血縁の疾病していない人から用いた。染色体の長腕上の4遺伝子座における 第三世代の各人の2本の第21染色体の文字を家系図の下に示す。この連鎖デー タ(linkage data)によって、黒塗の染色体は疾病した父親から受 け継がれていることが指摘される。
図2は、疾病した人における2149番目の塩基対での1塩基対変化(a si ngle base pair change)を示す図1の家系図の正常なお よび疾病した人におけるAPP遺伝子のエキソン17の一部のシーフェンシング ゲル(sequencingge llのオートラジオグラフである。このCか らTへのトランジションによって717番目のコドンでのバリンからイソロイシ ンへのアミノ酸置換が起こる。
図3は、トランスメンブレンドメイン内のバリンからイソロイシンへの突然変異 (Vから1)および細胞外ドメインにおけるエッチシーエッチダブルニー−ディ  (HCHWA−D)を引き起こす突然変異(EからQ)を示すAPP遺伝子の エキソン16および17によってエンコードされるアミノ酸配列の一部を示すも のである。トランスメンブレンドメインの斜線のはいった領域および細胞外ドメ インの四角で囲っであるアミノ酸は、沈着したβ−アミロイドペプチドの配列を 示している。カング(Kang)ら、(1987年)、ネイチ+ −ntatu re)、325 : 733より用いた。
図4は、初期に始まるAD家族における疾病しないおよび疾病した人からのエキ ソン17のPCR生成物のBclI消化物を示し、制限部位および病気のコセグ レゲーション(co−segregation)を示すものである。
図5は、家族F19の家系図、さらにはD21s21゜のデータを示すものであ る。
図6は、F19の疾病したおよび疾病しない人のAPPのエキラン1フ配列を示 すものである。疾病した人においては、2150番目の位置でG−>T)ランジ ションが存在する。
図7は、APP695の配列を示すものである。
図8は、APP751の配列を示すものである。
図9は、APP770の配列を示すものである。
好ましい実施態様の詳細な説明 特に脳の領域におけるβ−アミロイドタンパク質(A4)の#積は、アルツハイ マー病の主要な病理学的な特徴の一つである。このβ−アミロイドタンパク質は 、内部の切断生成物(internal cleavage produt)と して、より大きなアミロイド前駆体タンパク質(amyloid precur sor protein) (APP)の一つまたはそれ以上のイソ型由来であ る約4kDのタンパク質(39がら42アミノ酸)である。それぞれ、563. 695.714.751、及び770個のアミノ酸を含む、少なくとも5つのA PPの独特なイソ型がある(ライラック(Wirak) ら、(1991年)、 サイエンス(Science) 、253 : 323) 、これらのAPPの イソ型は、ヒトの第21染色体上に位置する、APP遺伝子と称される、単一の 遺伝子の一次転写産物をスプライシングすることによっても生じる。はとんどの APPのイソ型は配糖化された貫層タンパク質であり(ゴールドガバー(Gol dgaber) ら、(1987年)、サイエンス(Science)、235  : 877) 、4つのイソ型、AA56B、APP714、APP751及 びAPP770がクニッッタイプ(Kunitx tYpe)のセリンプロテア ーゼインヒビターと相同性のあるプロテアーゼインヒビタードメインを有するこ とが知られている。β−アミロイド(A4)セグメントは、約 ・半分のトラン スメンブレンドメインおよびAPPのイソ型の細胞外ドメインの最初の約28ア ミノ酸からなる。
in vivoのAPPのタンパク質分解プロセッシング(pro+eoly+ ic processing)は正常な生理学的なプロセスである。カルボキシ ル末端を切り取った形態のAPP695、APP751及びAPP770は、脳 および脳を髄液に存在しくパル7−ト(PalmeNJ ら、(1989年)S ブロック ナショル ア力デ サイ ニーニスニー(Proc、 Natl、A cd、Sci、U、S、A、)、86 : 6338 ;ワイプマン(Weid emann) ら、(1989年)、セル(Cell)、57:115) 、A PPのイソ型のA4ペプチドドメイン内の構成性切断部位(consjijut ive cleavage 5ite)でのAPPのイソ型の切断によって生じ る(ニッシュ(Esch)ら、(1990年)、サイエンス(Science)  、248 : 1122) o構成性切断部位(consjittuive  cleavage s目e)での正常なタンパク質分解による切断によって、イ ソ型によってはプロテアーゼインヒビタードメインを含む大きい(約100kD )の可溶性のN−末端断片、およびほとんどのA4ドメインを含む9〜10kD の膜に結合したC−末端断片が得られる。
病原性のβ−アミロイド(A4)タンパク質の生成は、A4ドメイン内の構成性 部位での正常な切断は起こらず、むしろA4ドメインに隣接する2か所の特異的 な部位で切断が起こる等の、APPの異常な若しくは代わりのタンパク質分解プ ロセッシング(proteolytic proce@stng)の結果である と考えられる。これらの異常な切断部位の1つはトランスメンブレンドメイン中 にあり、他の異常な切断部位は細胞外のドメインの最初の28アミノ酸のN−末 端辺りに位置する(図3を参照)。このような異常なタンパク質分解による切断 によって、タンパク質分解による分解および除去に対して耐性のある高密度のア ミロイド形成性の凝集物(dense am71oidogenic aggr egate)を形成しゃすいβ−アミロイドA4ポリペプチドが生じる。このよ うにして得られたβ−アミロイドの凝集物は、アルツハイマー病の神経病理学的 な証しである多くのアミロイド斑および脳血管のアミロイドの形成に含まれると 考えられる。しかしながら、正確な異常な切断部位は必ずしも明らかではない; ADに罹っている患者の脳から単離されたβ−アミロイド分子はN−およびC− 末端の異質性を示す。したがって、異常な切断経路は、配列に特異的なタンパク 質分解後のエキソペプチダーゼ活性化(末端の異質性を生じる)を含む、または 配列に特異的でない。
APP遺伝子はヒトの第21染色体上に位置することが知られている。家族性ア ルツハイマー病によって分離する遺伝子座は、APP遺伝子の近くの第21染色 体上に位置する(ハイスロップ1yslop)ら、(1987年)、サイエンス (Science) 、235 : 885) o APP遺伝子とAD遺伝子 座との間の組換えはすでに報告されている(シエレンバーグ(Schelleo berg)ら、(1988年)、サイエンス(Sciencel 、241 :  1507) oこれらのデータによって、FADを引き起こす突然変異の部位 としてAPP遺伝子が除外されるように思われる(ファン ブロウクホーヴエン (Van BroekhovenJら、(1987年)、ネイチャー(Natu re)、329:153;タング(Tanzi) ら、(1987年)、ネイチ ャー (Nafurc)、329:156)。
組換えDNA技術によって、可能な突然変異の位置を決めるための様々な遺伝子 の分析技術が害られる。例えば、ポリメラーゼ連鎖反応(polymerase  chain reaction) (ベル、(1989年)、イムノロジー  ツデイ(ImmunologyToday)、10 : :351)は、イント ロンのプライマーを用いた特異的な配列を増幅するのに使用でき、さらに、これ は直接配列決定(direct sequencing)によって分析できる。
ダッチタイプのアミロイド症(「エッチシーエッチダブルニー−ディ」 (HC HWA−D”)による遺伝性の脳出血の分野において作業をしている研究者たち (レヴイ(Lev7)ら、(1990年)、サイエンス(Sc:errce)  、248 :11224)は、これによってこれらの患者の脳血管中にβ−アミ ロイドの蓄積が起こると考えられるAPPにおける618番目の残基(APP6 95のナンバリングシステム(numbering g7gjem)を用いる) でのGluからGinへの置換を発見した。本発明者らは、−塩基置換、つまり 2149149番目対でのCからTへのトランジションが家族性アルツハイマー 病のケースによってはAPP遺伝子配列の一部で発見されることを確認した。こ の塩基対のトランジションによって、β−アミロイドタンパク質のC−末端付近 の、アミノ酸の置換、つまり717番目のアミノ酸(A P P 770 )で のバリンからインロイシンへの置換が起こる(ヨシカイ(Yoshikai)) ら、(1990年)、ジーン(Gene)、87 : 257を参照)。これに よって、アルツハイマー病のケースによってはAPP遺伝子内の突然変異、特に バリン以外のアミノ酸をエンコードする等の717番目のコドンを変える突然変 異によって生じることが指摘される。
さらに、−塩基置換、つまり2150150番目対付近のTからGへのトランジ ションが、家族性アルツハイマー病の他のケースにおいてAPP遺伝子配列の一 部で発見された。この塩基対のトランジションによって、717番目のアミノ酸 で、異なるアミノ酸の置換、つまりバリンからグリシンへの置換が生じ、これに よってアルツハイマー病のケースによっては特に717番目のコドンでの、AP P遺伝子における突然変異によって生じるという論拠が有力になる。
717#目のコドン(APP695では642番目の残基)でのバリンからイン ロイシンへの置換が生じるAPP遺伝子座における突然変異によって、家族によ ってはADが生じることは現在明らかである(ボウティ(Goafe) ら、( 1991年)、ネイチャー(Nature)、349 : 704)。
717番目のコドンでバリンがグリシンに置換される第二のAPP対立遺伝子の 変異体も現在確認され、APP遺伝子の717番目のコドンでの対立遺伝子の変 異体、好ましくはバリン以外のアミノ酸をエンコードするもの、さらに好ましく はイソロイシン、グリシン、若しくはフェニルアラニンをエンコードするものが 病原性のおよび/または疾病に特徴的な対立遺伝子であることが示されるくらい 、ADの表現型によく連接している(linkl (チャーティアー−ハーリン tchartier4a+l1nj ら、(1991年)、ネイチャー (Na ture)、353 : 844)。
APPのβ−アミロイド(A4)領域のいずれの側でのタンパク質分解も、71 7番口のコドンでの特異的な突然変異によって促進または量的に変化し、β−ア ミロイドの沈着および凝集の割合が増す。このような717番口のコドンでの突 然変異は、主要なタンパク質分解経路(構成性部位(conNitujive  5ite)での切断)に対するより悪い基質若しくは(異常な切断部位での)競 合する、代わりの切断経路に対するより良好な基質を提供することによってβ− アミロイドの形成を増加する。
定義 多くの言葉および表現はこの明細書を通して使用され、さらに、明細書の理解を 容易にするために、以下の定義を用いる: ここで用いられるように、「エキソン」は成熟したRNA生成物中で発現する分 断遺伝子のセグメントを意味する。
ここで用いられるように、「イントロン」は成熟したRNA生成物中で発現しな い分断遺伝子のセグメントを意味する。イントロンは、核の一次転写産物の一部 であるが、スプライシングによってmRNAを生産し、さらに、細胞質へ運ばれ る。
ここで用いられるように、「アミロイドタンパク質前駆体に対してコードする遺 伝子配列」という句は、ヨシカイ(Yoshikailら、(1990年)、ジ ーン(Genel、87;257およびカング(KangJら、上記引用文(f oe、cN、)で詳細に記載されているようなりNAおよびcDNAを意味する ものとし、さらに、プロモーターDNA配列はサルバウム(Sllbauml  ら、(1988年)、イーエムビーオー(EMBO) 、7 (9)42807 で詳細の記載されているようなものを意味するものとする。
ここで用いられるように、「標識」または「標識された」という言葉は、検出可 能なマーカーの導入(例えば、放射性同位元素で標識した(radiolabe led)ヌクレオチドの導入による、または末端を放射性同位元素で標識した( radiolabeled)リン酸塩で末端標識することによる)を意味する。
DNA若しくはRNAは、具体的には、放射性同位元素で標識した(radio labeled)ヌクレオチド(H3、C14、S35、P32)、または標識 されたアビジン(例えば、蛍光マーカー若しくは酵素活性を有するアビジン)に よって検出できるビオチン化(biotin71ated)ヌクレオチド、また は標識された特異的な抗体によって検出できるジゴキシゲニン化(dtgox7 genin71ajcd) ヌクレオチドを導入することによって標識される。
ここで用いられるように、「イソ型」、rAPPJ、およびrAPPのイソ型」 は、APP遺伝子の少なくとも1つのエキソンによってエンコードされるポリペ プチドを意味する(キタグチ(にHaguchi) ら、(1988年)、夫イ 回書(i b i d)、ページ525;アールイー タング(R,E、 T! uyage)およびオクテイブ(OHave)、(1989年)、サイエンス( Science) 、245 : 651 ;ゴールド(Golde) ら、( 1990年)、ニューロン(Neuron)、4:253>、APPのイソ型は 、アルツハイマー病の一形態に関連のあるまたはADの病気の表現型に関連のな いAPPの対立遺伝子(若しくはこれのエキソン)によってエンコードされる。
「β−アミロイド遺伝子」という言葉は、β〜ルアミロイドAPP遺伝子の生成 物の翻訳後切断によって生じたタンパク質生成物であるため、ここではAPP遺 伝子の同義語として用いられる。
ここで用いられるように、「断片」は、ポリペプチドが以下のアミノ酸のコア配 列(アミノ−からカルボキシル−末端の方向で並べられている)を含む、少なく とも約9個のアミノ酸、具体的には50から75、またはそれ以上のアミノ酸の ポリペプチドを意味するニ ーl1e−Ala−Thr−val−11e−X−11e−Thr−Leu [ 配列番号:6]ただし、Xはバリン以外の20個の既知のアミノ酸のいずれかで あり、さらに特にXはイソロイシン、グリシン、若しくはフェニルアラニンであ る。断片は、末端を切り取ったAPPのイソ型、修飾されたAPPのイソ型(ア ミノ酸の置換、欠損、またはコア配列の外側での添加による等)、または他の変 異ポリペプチド配列であるが、ADに疾病しているまたは疾病していないにかか わらず、ヒト個人中に存在する自然に生じたAPPのイソ型またはβ−アミロイ ドのポリペプチドではない。必要であれば、この断片は、1から20から、具体 的には50から100、ただし250から500またはそれ以上までの数である 、いずれかの末端で添加アミノ酸(addHional amino acid )に融合される。
ここで用いられるように、rAPP751Jおよび[APP770Jは、ヒトの APP遺伝子によってエンコードされたそれぞれ751および770個のアミノ 酸残基長のポリペプチドを意味する(プロンテ(Pronte)ら、上記引用9  (Ioc、ca+、 ) ;キタグチ(にHxguchi) ら、上記引用文 (1oc、 cit、) ;タング(Tanxi) ら、上記引用文(loc、  cH,) )ここで用いられるように、「717番目のコドン」は、APP7 70の717番目のアミノ酸の位置、またはAPP770の717番目の位置に 相当するAPPのイソ型若しくは断片中のアミノ酸の位置をエンコードするコド ン(つまり、トリヌクレオチド配列)を意味する。例えば、以下に限定されない が、100個のN−末端のアミノ酸を除去することによってAPP770の末端 を切り取ることによって生じた670残基長の断片は、717番目のコドンに相 当する617番目のアミノ酸の位置を有する。事実、ここで用いられるように、 717番目のコドンは、APP751 [配列番号:2]の689番目のアミノ 酸残基およびAPP695 [配列番号:1]の642番目のアミノ酸残基をエ ンコードするコドンを意味する。
ここで用いられるように、「ヒトのAPPのイソ型または断片」は、ヒト個人に おいて自然に生じたヒトのAPP770、APP751、若しくはAPP695 タンパク質における配列と一致する少なくとも9個の保存アミノ酸(Conse rvative amino acid)の配列を含むAPPのイソ型または断 片であり、かつ一致した配列がヒト以外の種において自然に生じたAPPタンパ ク質中雪中存在しないものであることを意味する。
核酸は、他の核酸配列と結合する(placed 1nto ! funcji onal relattonship)際には「操作して連結される(oper ably 1inked) J。例えば、プロモーターまたはエンハンサ−は、 配列の転写に影響を及ぼす際にはコーディング配列に操作して連結される(op erab171inkcd)。転写調節配列(transcription r egulator75equence)に関しては、[操作して連結される(o perab171inksd) Jとは、連結されるDNA配列が隣接している 、さらに必要であれば2つのタンパク質のコーディング領域(coding t egion)を結合する際には、隣接しかつ読み枠内にあることを意味する。
「に相当する」という言葉は、配列が基準配列のすべて若しくは一部と相同性の ある(すなわち、厳密に展開して関連しないが、一致する)という意味で、ここ では使用する。一方、「に相補する」という言葉は、相補的配列が基準配列のす べて若しくは一部と相同性のあるという意味で、ここでは使用する。例えば、ヌ クレオチド配列“TATAC”は、基準配列“TATAC”に相当し、基準配列 “GTATA”に相補する。
「転写促進(transcripjional enhancement) J という言葉は、機能的なプロモーターを有する連結された配列の転写速度が増加 するような機能的な性質という意味でここでは使用する。
「物質(ageni) Jという言葉は、化学的な化合物、化学的な化合物の混 合物、生物学的な高分子、または細菌、植物、菌類、若しくは動物(特に哺乳動 物)細胞若しくは組織等の生物材料から作製された抽出物という意味でここでは 使用する。物質(agenj)は、以下に記載されているスクリーニングアッセ イに含まれる強力な生物学的な活性によって評価される。
ここで用いられるように、「突然変異体」という言葉は、ADを発達させる遺伝 的な素因に対して特徴的であるミスセンス突然変異を有するAPP対立遺伝子を 意味する;詳しくは、717番目のコドンがバリンでない19個のアミノ酸の一 つ(すなわち、グリシン、メチオニン、アラニン、セリン、イソロイシン、ロイ シン、トレオニン、プロリン、ヒスチジン、システィン、チロシン、フェニルア ラニン、グルタミン酸、トリプトファン、アルギニン、アスパラギン酸、アスパ ラギン、リシン、およびグルタミン)、好ましくはイソロイシン、グリシン、フ ェニルアラニンをエンコードする等の、APP遺伝子の717番目のコドン(A PP770におけるアミノ酸配列について)での突然変異。
このように、突然変異APP770のポリペプチドは、バリンではない717番 目の位置のアミノ酸残基を有するAPP770のポリペプチドである。他の突然 変異APPのイソ型は、717番目のコドンに相当する(つまり、717番目の コドンによってエンコードされる)アミノ酸残基の位置がバリンでないアミノ酸 からなる。同様にして、突然変異APPの対立遺伝子または変異体APPの71 7番目のコドンの対立遺伝子は、717番目のコドン(上記の、「717番目の コドン」の定義において記載したように翻訳を誘導したヒトのAPP770につ いて)にバリン以外のアミノ酸、好ましくはインロイシン、グリシン、若しくは フェニルアラニンをエンコードするAPPの対立遺伝子である。したがって、7 17番目のコドンにバリンをエンコードするAPPの対立遺伝子は、「野生型」 のAPPの対立遺伝子である。
ヌクレオチドの置換、欠損、および添加が本発明のポリヌクレオチドに含まれる ことは当業者に明らかである。しかしながら、このようなヌクレオチドの置換、 欠損、および添加は、実質的に、ポリヌクレオチドが特異的なハイブリッドの形 成を生じるのに十分厳しいハイブリッド形成条件下で図5および6に示されるポ リヌクレオチド配列の一つにハイブリッドを形成できなくなるようなものではあ ってはならない。
「特異的なハイブリッド形成」は、例えば、変異体APPの対立遺伝子またはこ の制限断片に相当するバンドはサザンプロット上で同定できるが、野生型のAP Pの対立遺伝子(すなわち、717番目のコドンにバリンをエンコードするもの )は同定されない若しくはシグナル強度を基にすると変異体APPの対立遺伝子 と識別できる等、プローブが特異的なターゲットに対して選択的にハイブリッド を形成する、プローブであるポリヌクレオチド(例えば、置換、欠損、および/ または添加を含む本発明のポリヌクレオチド)および特異的なターゲットである ポリヌクレオチド(例えば、配列を有するポリヌクレオチド)との間のハイブリ ッド形成としてここでは定義される。特異的なハイブリッド形成によって1塩基 のミスマツチ(migmafch)の検出が可能なハイブリッド形成用のプロー ブは、既知の方法にしたがって設計され、これらは、マニアティス(Mania ti2版、(1989年)、コールド スプリング ハーバ−、ニューヨーク( Cold Spring Harbor、N、Y、)およびバーガー(Be+g er)およびキンメル(Kimmel)、メソッズ イン エンザイモロジー、 152巻、ガイド ツー モレキュラーfume 152. Guide to  Mo1ecular Cloning Techniquesl、(1987 年)、アカデミツク プレス、インク(Academic Press、Inc 、)、サン ジエゴ、シーニー(San Diego、CA);ギブス(Gib bs) ら、(1989年)、ヌクレイックアシッズ リサーチ(Nuclei c Ac1ds Res、)、17:2437;コウク(Kowk)ら、(19 90年)、ヌクレイツク アシッズ リサーチ(Nucleic Ac1ds  Res、)、18 : 999 ;ミャダ(Miyada)ら、(1987年) 、メソッズ エンザイモル(MethodSEnzymol、)、154 :  94に記載されており、それぞれを参考としてここに記載した。オリゴヌクレオ チドのT は、標準的な条件下(LM NaC1)で[4℃X (G+C)+2 ℃X (A+T)Eの計算によってめられる。PCHの条件は標準的な条件とは 異なるが、このT。はオリゴヌクレオチドの予想される相対的な安定性の規準と して用いられる。対立遺伝子に特異的なプライマーは、具体的には、13〜15 ヌクレオチド長、場合によっては16〜21ヌクレオチド長、若しくはそれ以上 である;14ヌクレオチド長のプライマー等の、短いプライマーを使用する際に は、44から50℃等の低いアニーリング温度を用い、必要であれば、配列の塩 基組成によってはこれより少し高い若しくは低くなる。
好ましい実施態様の説明 717番目のコドンが突然変異したAPP対立遺伝子の検水発明の実施態様にお いては、方法は、これによって共通のバリン(consensus Vat)が 例えば、他の疎水性の残基に変化する、717番目のアミノ酸での遺伝学的な変 化を同定することを含むものである。上記は、通常、被験者から取った試料につ いて行う。疎水性の残基としては、LeuSAla、11eおよびGlyが挙げ られ、初めの3つは脂肪族の側鎖を有する。Pheもまた、適当な疎水性の残基 を有する。上記したように、好ましい残基としては、11e%Gly、およびP heが挙げられる(マレル(Murre I Il ら、(1991年)、サイ エンス(Science) % 254:97)。
上記したこれらの突然変異が同じコドンで起こるという事実は一致しているが、 このことは統計上の分野ではありえないように思われる。これらのデータを説明 できる可能性が2つある。第一には、717番目のコドンでのバリン残基の置換 によって、APPの代謝における変化によるβ−アミロイドの蓄積が増加するこ とである。第二には、この位置周辺の配列の変異によって、APPのmRNAの 翻訳量が増加し、これによってADがダウン症候群によって引き起こされると考 えられている経路と類似した経路によってADが生じる(タング(Tanzi) およびハイマン(H7man)、(1991年)、ネイチャー (Nature )、350 : 564およびランプル(Rumblelら、(1989年)、 エヌ イングル ジェー メト(N、Engl、J、 Med、)、320:1 446)。in 5itu ハイブリッド形成法の研究によって、APP717 の突然変異体がAPPの発現を変えないことが示された(ハリソン(Barri son)ら、(1991年)、二ニーロレプ(Neurorep、) 、2 :  152)。
V717I(APP717 Val−>l1e)、V717G (APP717  Val−>Gly)およびV717F (APP717 Val−>Phe) の突然変異体は、推定のステムループ構造を不安定化しくdestabilis e) 、2131および2156156番目対の間の可能な鉄応答性の要素(i ron−responsive element)を破壊する(タング(Tta xi)およびハイマン(Hyman) 、上記引用文(foe、 cit、)  )。この構造をも破壊する他の可能性のある突然変異体が様々あり、そのうち多 くがタンパク質レベルでサイレント(Silent)である;しかしながら、こ れらの突然変異は、同様のアミノ酸への変化を含むことを特に意味し、サイレン トな(gilel)変化または他のアミノ酸への変化はここで記載されたものよ り以前では報告されていない。10の他の哺乳動物種からの配列データを調べる (ジョーンストーン(johns jone) ら、(1991年)、モル プ レイン レス(Mof、 Brain Res、) 、10 : 299)こと によって、717番目のコドンでのバリン残基はこれら全てにおいて保存されて いるが、ヒトの配列から仮定された推定のステムループ構造(タング(Tanx i)およびハイマン(Hyman) 、上記引用文(foe、c白、))は畜生 及び羊では起こらないと考えられる;さらに、ブタ及びマウスでは鉄応答性の要 素(iron−responsive element)に対する共通配列は存 在しない。最後に、このようなステムループ構造は、mRNAの安定性を変化さ せることによって遺伝子の翻訳を調節する(modulate)と考えられる( クラウスナ−(Ilausnet)およびハーフオード(Harford) 、 (1989年)、サイエンス(Science) 、246:870);しかし ながら、ハリソン(Harris。
n)やその同僚(ハリソン(Harrigon)ら、上記引用文(foe。
cit、) )は、APPのmRNAがV7171の突然変異体を有する人の脳 においてあまり変化していないことを、in 5itu ハイブリッド形成法に よって示した。これらの理由によって、同定された特異的な突然変異によって起 こるAPPの翻訳速度の変化は病原性への鍵ではないと考えられる。
上記した特異的な突然変異が様々な変化(Val−>11e、Val−>Gly 、およびVal−>Phe)を含むという事実によって、側鎖の疎水性若しくは 側鎖の大きさが決定的な論点ではないことが指摘される。717番目のコドンで バリン以外のアミノ酸をエンコードするAPPの対立遺伝子のすべての例はFA Dとコセグレゲートする(cosegrega+e) ;これによって、野生型 のAPP770若しくはAPP751の717番目の位置であるバリンは非病原 性のAPPのタンパク質分解のプロセッシング(proneo17tic pr ocessing)の(つまり、構成性切断経路(constHlive cl eavage pathway)による)臨界アミノ酸残基であることが示唆さ れる。
APP分子に対する主要な代謝経路としては、β−アミロイド断片内の切断が挙 げられる(ニッシュ(E s c h)ら、上記引用文(10(、cit、)  )。β−アミロイドを得るためには、APPをこの配列の外で切断する第二の経 路が存在しなければならない。このような切断は、膜内に埋め込まれたβ−アミ ロイド断片を含むAPP分子のスタブ(stub)を切り離すと考えられる。恐 らく、第二の経路によって生じたβ−アミロイドを含む断片はペプチダーゼの作 用によって分解される;報告された突然変異体は、これらの含むペプチドが上記 ペプチダーゼの作用に対してより耐性があるため、病原性がある。したがって、 分解特性の変化(通常、減少)を生じるAPP遺伝子の遺伝学的な変化は、本発 明の適用において特に重要である。アルツハイマー病に応答する遺伝学的な突然 変異体を検出し、同定するために使用される組換えDNA技術が利用できる方法 論は様々なものがある。
これらとしては、ダイレクトプロービング(direct probing)1 ポリメラ一ゼ連鎖反応(po17merasechain reaction) (P CR)方法論、制限断片長炎型(restriction rragme nr length po17morphism) (RF L P)分析およ び1重鎖立体配座解析(single 5trand conformajio nxl ina17sis)(SSCA)が挙げられる。
ダイレクトプロービング(ditecj probing)を用いた点突然変異 (point mutation)の検出は、合成でまたはニックトランスレー ションによって調製されるオリゴヌクレオチドのプローブを使用する。このDN Aプローブは、例えば、放射性同位元素標識、酵素標識、蛍光標識、ビオチン− アビジン標識および例えばサザンブロッティングによるハイブリッド形成方法で 肉眼観察できるもの等を用いて適当に標識される。標識されたプローブは、ニト ロセルロース若しくはナイロン66の基質に結合したDNAのサンプルと反応す る。標識されたDNAプローブに相補的であるDNA配列を有する領域は、再ア ニーリング反応の結果、それ自身標識される。さらに、このように標識されたフ ィルターの領域を、例えば、ラジオオートグラフィーによって肉眼観察する。
また、リガーゼ連鎖反応(Iigxgechain teact:on) (L CR)等の、ブロービング技術(probiB Hchnique) は、ミス マツチプローブ、すなわち突然変異の点(paint)以外はターゲラ)・と完 全に相補性を有するプローブを用いる。
さらに、ターゲット配列を、以下の2つのオリゴヌクレオチドを識別できる条件 下で、完全に相補性を有するオリゴヌクレオチドおよびミスマツチ(misma tch)を含むオリゴヌクレオチドの両方とハイブリッド形成させる。反応条件 を操作することによって、完全に相補性を有する場合のみハイブリッド形成を得 ることが可能である。ミスマツチ(mismatch)が存在する際には、非常 にハイブリッド形成が減少する。
ポリメラーゼ連鎖反応(polymerase chain reaction )(PCR)は、かなり効率よく特異的なりNA配列を増幅させる技術である。
熱に安定な酵素であるTaqlポリメラーゼを用いて行われた変性、プライマー のアニーリングおよび拡張(extension)を繰り返し行うことによって 、目的とするDNA配列の濃度が指数的に増加する。
ADのアミロイドタンパク質の前駆体をエンコードするヌクレオチド配列が分か ること(カング(Kang)ら、上記引用文(loc、cij、)およびヨシカ イ(Yashikai)、上記)により、有用なりNAに隣接する配列に相補的 である合成のオリゴヌクレオチドが調製できる。それぞれのオリゴヌクレオチド は2本鎖の一つに相補的である。さらに、DNAを高温(例えば、95℃)で変 性させ、次に、過剰な高いモル濃度のオリゴヌクレオチドの存在下で再アニーリ ングする。それぞれが互いに向いている3′方向の、オリゴヌクレオチドを、タ ーゲット配列の反対の鎖とハイブリッド形成させ、さらに、4つのデオキシリボ ヌクレオチド三リン。
酸の存在下で核酸の鋳型に沿って酵素拡張(enxymatic extens sion)を開始する。次に、末端生成物を他のサイクルのために再変性する。
この3段階のサイクル(three−step aycle)を数回繰り返した 後、百万倍以上によるDNAセグメントの増幅が得られる。さらに、このように して得られたDNAを、遺伝的な変化の位置を決定するために直接配列決定を行 う。または、変化したDNAにのみ結合するオリゴヌクレオチドを調製すること も可能であり、これによって突然変異が存在する際にPCHによってのみDNA が増殖する。PCR後、対立遺伝子に特異的なオリゴヌクレオチドのハイブリッ ド形成(ジヘラ(Dihella) ら、(1988年)、ランセット(Lan ce+)、1:497)を用いて、ADの点突然変異を検出する。または、特異 的な対立遺伝子の増幅と呼ばれるPCR(PASA)を用いることもできる;上 記は、1塩基対が異なる対立遺伝子間を迅速にかつ正確に識別するために分画増 幅(diHerenHal ampl百ica+1on)を用いる。
さらに他の方法においては、PCHの後に、このようにして得られた生成物をさ らに分析する制限エンドヌクレアーゼによる消化を行う。エキラン17の配列決 定の結果で見られるように、2149番目の塩基対でのCからTこのへの置換に よって、BclIの制限部位が生じる。この制限エンドヌクレアーゼの2諏部位 が生じることによって、RFLP分析を用いたADの突然変異の検出または71 7番目のコドンを含むPCRによる生成物における多形性のBclI部位の存在 若しくは欠損の検出が容易になる。
RFLP分析のために、例えば、ADに罹っていると思われる被験者のおよび正 常な被験者の血液からDNAを得、制限エンドヌクレアーゼのBa1lで消化し 、さらに、アガローズゲル電気泳動を用いて大きさによって分離する。
次に、標識されたプローブを用いてハイブリッド形成することによって、エンド ヌクレアーゼで消化された生成物を検圧するために、サザンプロット(Sout hern blot)技術を用いることができる。サザンプロット(Solhe rn blot)により得られたパターンをさらに比較できる。このような方法 を用いて、Bc11部位等の、717番目のコドンでの制限部位を作製するまた は除去するアルツハイマー病の突然変異にまたがるDNAを、検出されたバンド の数をはかり、この数をバリンをエンコードする717番目のコドンの対立遺伝 子を有する規準となる対立遺伝子のものと比較することによって、検出する。
相応じて、2150番目の塩基対でのTからGのへの置換によって、5faNI の制限部位(GCATC)が生じ、これは、必要な変更を加えて(mutati s muHndis)上記の方法と同様にして利用される。717番目のコドン がバリン以外のアミノ酸をエンコードする、717番目のコドン内でのヌクレオ チドの置換によってさらに制限部位が同様にして生じることは、遺伝コードおよ び制限エンドヌクレアーゼによって認識されたヌクレオチド配列のリストを参考 tocols and Applications Guide)、(1991 年)、プロメガ コーポレーション(Promega Corpora目on) 、マディラン、ライスコンシン(Madison Wisconsin) )。
1重鎖立体配座解析(single 5trand confotmajion al analysis) (S S CA) (オリタ(Orija) ら、 (1989年)、ジェノミックス(Genomtcs)、5 : 874および オリタ(OrHa) ら、(1990年)、ジェノミックス(Genomics )、6:271)は、少なくともある例においては好ましい配列の変化を迅速に 検出する方法を提供している。
特異的な対立遺伝子のPCR増幅(PASA)は、1塩基の突然変異あるいは多 形性を素早く検出する方法である64;ソ7− (S omme r)ら、(1 989年)、マヨ クリソ2757 ;およびダットン(Dujton)ら、( 1991年)、バイオテクニックス(Biojechniques) 、よ↓ニ ア00))。
PASA (対立遺伝子の特異的増幅として知られている)は、対立遺伝子に特 異的である等の2本のオリゴヌクレオチドのプライマーによる増幅を含む。対立 遺伝子に特異的なプライマーの3′末端の若しくは付近の塩基とのミスマツチ( mismalch)により他の対立遺伝子はあまり増幅しないが、目的とする対 立遺伝子が効果的に増幅する。このようにして、PASAまたはPAMSAの関 連した方法を用いて、1つ若しくはそれ以上の717番目のコドンが変異したA PPの対立遺伝子を特異的に増幅できる、このような増幅が個体より得られた遺 伝材料(若しくはRNA)上でなされる際には、個体における1つ若しくはそれ 以上の717番目のコドンが変異したAPPの対立遺伝子の存在の検出方法とし て機能できる。
同様にして、リガーゼ連鎖反応(Iigase chain reaction > (LCR)として知られている方法は、錐状赤血球貧血を引き起こすヘモグ ロビンの対立遺伝子における1塩基置換を良好に検出するために用いられる(バ ラニー(Barge)に用いる、または多数の異なる突然変異体を同時にスクリ ーニングするために複合したものを用い(muHiplex)てもよい。したが って、717番目のコドンが変異したAPPの対立遺伝子のスクリーニングの一 方法としては、バリンはエンコードしないがアミノ酸をエンコードする717番 口のコドンを有するAPPの対立遺伝子を検出する少なくとも2つの、好ましく はすべてのLCRのプローブを複合して用いるものがある。普遍遺伝コードによ って、すべてのバリン以外をエンコードしたアミノ酸の同義配列(d e g  e nerate 5equence)が得られるため、特に717番目のコド ンが変異した対立遺伝子を検出するためのLCRのプローブの設計は簡単であり 、LCRのプローブ等の複合して用いられたプール(pool)を特徴とする特 殊な使用に対して従業者の裁量で選択できる。
上記の技術またはこれらの変形のいずれかを用いて診断を行うにあたって、様々 な個体を調べることは好ましい。
上記としては、疾病していない親、疾病している親、疾病している兄第、疾病し ていない兄第が挙げられ、さらにはより遠い血族の人々をも恐らく挙げられる。
モデル動物および細胞株 家族性アルツハイマー病(FAD)の原因としてのβ−アミロイド遺伝子の71 7番目のコドンにおける特異的なと突然変異を同定することによって、遺伝子操 作を用いて、例えば、薬剤をスクリーニングするおよび薬剤の効果を評価するた めのモデルシステムとして使用する突然変異FAD遺伝子(若しくはこの一部) を含む形質転換モデルシステムおよび/または全細胞システムを開発することが できる。さらに、このようなモデルシステムによって、APPおよびβ−アミロ イドの代謝の基礎的な生化学を定義する道具が得られ、これによって合理的な薬 剤の設計の基礎が得られる。
細胞システムの一タイプは自然由来のものである。このタイプでは、例えば、エ プスタイン−パールウィルス(Epstein−Barr virus)を用い てリンパ芽球様細胞株(17phoblas+oid cell 1ineJ中 に永久に形質転換できる必要な細胞を提供するために、疾病した被験者からの血 液サンプルを得なければならない。
確立されたら、このような細胞株を浮遊培養で連続して生育させ、APPの発現 およびプロセッシングを研究するための様々なin vitroの実験に用いる 。
FADの突然変異体は優性であるため、細胞株の構築方法としては、(安定にま たは一時的のいずれかで)確立された選択細胞株中に突然変異遺伝子、若しくは 717番目のコドンを含むこれらの一部を遺伝子操作することも挙げられる。シ ソディア(Sisodia) ((1990年)、サイエンス(Science ) 、248 : 492)は、トランスフェクションよる哺乳動物細胞への正 常なAPP遺伝子の挿入を記載している。オルタースドルフ(ONersdor f)ら((1990年)、ジエー パイオル ケム(J、 Biol、 Che m、 )、265:4492)は、不死化された真核生物の細胞株へのAPPの 挿入について記載している。
バキュロウィルスの発現システムは、真抗生物の細胞における異種遺伝子を高い レベルで発現させるのに有用である。クノブス(Xnops) ら、(1991 年)、ジエー パイオル ケム(J、 Biol、 Cbem、 )、266  (11)ニア285は、このようなシステムを用いたAPPの発現について記載 している。
本発明の方法をさらに使用すると、突然変異遺伝子を有する形質転換動物の作製 に使用できる突然変異遺伝子(すなわち、717番目のコドンが変異したAPP の遺伝子)を除去できる。例えば、ヒトの717番目のコドンが変異したAPP の対立遺伝子全体を、クローニングベクター(例えば、λシャロン35、コスミ ド、若しくは酵母の人工染色体)中に、一部または全体として、クローニングし 、単離する。ヒトの717番目のコドンが変異したAPPの遺伝子を、一部また は全体、マウス等の、ヒト以外の宿主動物に転移する。転移の結果、このように して得られたヒト以外の形質転換動物は、好ましくは1つまたはそれ以上の71 7番目のコドンが変異したAPPのポリペプチドを発現する。最も好ましくは、 本発明のヒト以外の形質転換動物は、ニューロンに特異的な様式で1つまたはそ れ以上の717番目のコドンが変異したAPPのポリペプチドを発現する(ライ ラック(Wirak) ら、(1991年)、イーエムビーオー(EMBO)  、10 : 289)。最初の主要なAPPの転写開始部位の付近および上流に ある4、5キロベースの配列を含むヒトの全APP遺伝子(717番目のコドン が突然変異したものをエンコードする)を実質的に転移することによって上記が 達成される。
または、717番目のコドンが変異したAPPのポリペプチドをエンコードする ミニ遺伝子を設計してもよい。このようなミニ遺伝子は、ポリアデニル化シグナ ル(pokyadeBlajion signal)配列の下流および上流のプ ロモーター(および好ましくはエンハンサ−)に連結した、好ましくは全長の、 717番目のコドンが変異したAPPのポリペプチド、APP遺伝子のエキラン の組み合わせ、若しくはこれらの組み合わせをエンコードするcDNA配列を含 む。
このようなミニ遺伝子の構築物は、適当な形質転換宿主(例えば、マウス若しく はラット)中に導入されると、エンコードされた717番目のコドンが変異した APPのポリペプチド、最も好ましくはAPP770の717番目のコドンまた はAPPのイソ型若しくは断片の相当する位置にイソロイシン、グリシン、若し くはフェニルアラニンのいずれかを含む717番目のコドンが変異したAPPの ポリペプチドを発現する。
形質転換動物を作製する一方法としては、in vitroの胚の幹(embr yonic stem) (ES)細胞株において相同的組換によって目的とす る遺伝子に突然変異を行った後、宿主の未分化胚芽細胞(blasjocygt J中に修飾されたES細胞株をマイクロインジェクションし、さらに養い母中で 培養するものがある(フローマン(Frohman)およびマーティン(Mar tin)、(1989年)、セル(Cell)、56:145を参照)。または 、1細胞の胚への突然変異遺伝子若しくはこれの一部のマイクロインジェクショ ン後に養い母において培養する技術を使用してもよい。形質転換動物、特に野生 型のAPPのイソ型若しくは断片を発現する形質転換動物の様々な使用が、ライ ラック(Wirak) ら、(1991年)、イーエムビーオー(EMBO)  、10 (2): 289;シリング(Schi I l ing) ら、(1 991年)、ジーン(Gene)、98 (2): 225 ;クオン(Quo n)ら、 (1991年)、ネイチャー (Nature)、352 : 23 9 ;ライラック(Wirakl ら、(1991年)、サイエンス(Scie nce) 、2されている。さらなる形質転換動物の作製方法は既知である。
または、部位特異的突然変異誘発および/または遺伝子変換を用いて、突然変異 された対立遺伝子がヒトのAPP遺伝子の(APP770の)717番目のコド ン(この位置はヒトのAPP遺伝子若しくはAPP770タンパク質に対するマ ウスのAPP遺伝子若しくはAPPタンパク質の相同性のマツチングIbomo Iogy matchiB>によって容易に同定される)に相当するマウスのA PP遺伝子におけるコドンの位置にバリンをエンコードしない等の、内因性の若 しくはトランスフェクションされた、マウス(または他のヒト以外の動物)のA PP遺伝子の対立遺伝子を突然変異できる。好ましくは、このような突然変異さ れたマウスの対立遺伝子は、相当するコドンの位置でイソロイシン若しくはグリ シン若しくはフェニルアラニンをエンコードし家族性ADの明白な徴候をまだ示 さない個人においてβ−アミロイドタンパク質に対してう−ドする遺伝子配列中 の遺伝子の突然変異を検出することによって、本発明の方法を用いて、病気の発 達を防止する、遺伝子の移植の形態を有する、遺伝子治療を用いることが可能で ある。
変異APPタンパク質の製造のモジュレーシヨンに対するさらなる実施態様とし ては、変異APP配列、または実施態様によっては野生型のAPP配列のすべて 若しくは一部に相補的である特異的なアンチセンスなポリヌクレオチドを用いる 方法が挙げられる。このように相補的なアンチセンスなポリヌクレオチドとして は、関連したターゲット配列、すなわち717番目のコドンが変異したAPP配 列に対する特異的なハイブリッド形成がポリヌクレオチドの性質として維持され ればよく、具体的には、ヌクレオチドの置換、添加、欠損、または転位が挙げら れる。したがって、アンチセンスなポリヌクレオチドは、野生型のAPP(つま り、717番目のコドンがバリンをエンコードする)と比較した場合、変異AP P (つまり、717番目のコドンがバリンをエンコードしない)配列に選択的 に結合しなければならない。このアンチセンスなポリヌクレオチドは変異対立遺 伝子(若しくは必要であれば野生型の対立遺伝子)のヌクレオチド配列を意味し 、同義性配列(degeneraje 5equence)を意味するものでは ないことは明らかである。
相補的なアンチセンスなポリヌクレオチドとしては、変異APPのMRNA種に 特異的にハイブリッド形成でき、mRNA種の転写および/またはエンコードさ れたポリペプチドの翻訳を防止できる可溶性のアンチセンスなRNAまたはDN Aのオリゴヌクレオチドが挙げられる(チング(Ching) ら、(1989 年)、ブロック ナシミル アカ4;ロロイ(Loreau)ら、(1990年 )、エフイービーニス レターズ(FEBS LeHerg)、274 : 5 3〜56 ;ホルセンベルグ(Holcenberg)ら、W091/1153 5;米国特許番号ニア、530.165号(「ニュー ヒユーマンクリプト ジ ーン(New human CRIPTOgene) J−ダーウエント パブ リケーションズ エルティディ、ロクデイルハウス、128 テオバルズ ロー ド、ロンドン(Derwent Publications Ltd、、 Ro chdals House、128 TheobaldsRoad、 Lond on) 、英国)より出版、WO91109865。
WO91104753、WO90/13641 、およびEP386563号、 それぞれここでは参考として挙げられている)。したがって、このアンチセンス なポリヌクレオチドは変異APPのポリヌクレオチドの製造を阻害する。
アンチセンスなポリヌクレオチドが転写を選択的に阻害するおよび/または変異 (若しくは野生型の)ポリペプチドに相当するmRNAの翻訳がTリンパ球の活 性化を阻害することができる。
アンチセンスなポリヌクレオチドは、好ましくは発現カセットが細胞タイプの特 異的な発現を促進する配列を含むものである、形質転換された神経性の、神経膠 の、若しくは星状細胞等の、トランスフェクションされた細胞または形質転換細 胞若しくは動物において異種の発現カセットより生産される(ライラック(Wi rak) ら、上記引用文(toe。
ciL) )。または、アンチセンスなポリヌクレオチドは、in vitro の培養液若しくは循環系若しくは1nvivoの間質液のいずれかにおける、外 部環境に投与される可溶性のオリゴヌクレオチドからなる。外部環境に存在する 可溶性のアンチセンスなポリヌクレオチドは、細胞質に接近して特異的なmRN A種の翻訳を阻害することが知られている。実施態様によっては、アンチセンス なポリヌクレオチドはメチルホスホネー) (meth71phogphona te)イエ−メルトン(D、 AoMeIton) 、出版、コールド スプリ ング ハーバ−ラボラトリ−(Cold Spring Harbor Lab ora+ory+ 、コールド スプリング ハーバ−(Cold Sprin g Harbor)、ニューヨークを参照。
変異APPの抗原およびモノクローナル抗体本発明の他の概念においては、AP Pに対してコードする遺伝子配列中の遺伝子の変化を検出することによって、同 じ源の変化したβ−アミロイドタンパク質のサンプルが得られる。このタンパク 質は、アルツハイマー病に罹っていると診断された被験者の脳組織由来であり、 または、より好ましくは、このタンパク質は組換DNA方法によって製造される または固体の支持体における直接化学合成(d i tect chemica l 5ynthesis)によって合成される。このようなポリペプチドは、7 17番目のコドンを含むAPPの変異対立遺伝子のアミノ酸配列を含むものであ る。上記配列の例を以下に示す: (a) −11e−Ala−Thr−Val−11e−Gly−11e−Thr −Leu−[配列番号ニア1(b) −11e−Ala−Thr−Val−11 e−Met−11e−Thr−Leu−[配列番号:81(c) −11e−A la−Thr−val−11e−Ala−11e−Tht−Leu−[配列番号 、9J(d) −11e−Ala−Thr4al−11e−5er−11e−T hr−Leu−[配列番号;10](e) −11e−Ala−Thr’Val −11e−11e−11e−Thr−Leu−[配列番号:11][f) −1 1e−Ala−Thr−1al−11e−Leu−11e−Thr−Leu−[ 配MH:12](g) −11e−Ala−Thr4al−11e−Thr−1 1e−Thr−Leu−[配列番号:131(hl −11e−Ala−Thr −Val−11e−Pro−11e−Thr−Leu−[配列番号;14](i ) −11e−Ala−Thr−Val−11e−Hig−11e−Thr−L eu−[配列番号;151(i) −11e−Ala−Thr−Val−11e −Cys−11e−Thr−Leu−[配列番号二16](k) −11e−A la−Thr−Val−11e−Tyr−11e−Thr−Leu−[配列番号 ;171(1) −11e−Ala−Thr−Val−11e−Phe−11e −Thr−Leu−[配列番号;18](m) 1le−Ala−Thr−4a l−11e−Glu−11e−Thr−Leu−[配列番号;19](n) − 11e−Ala−ThrVal−11e−Trp−11e−Thr−Leu−[ 配MH:20](o) −11e−Ala−Thr−Val−11e−Arg− 11e−Thr−Leu−[配列番号;21](p) −11e−Ala−Th r−Val−11e−Agp−11e−Thr−Leu−[配列番号;22]( q) −11e−Ala−Thr−Val−11e−Asn−11e−Thr− Leu−[配列番号;23](r) −11e−Ala−Thr’Val−11 e−Lys−11e−Thr−Leu−[配列番号:241(s) −11e− Ala−Thr−Val−11e−Gln−11e−Tht−Leu−[配列番 号;251さらに、このようなポリペプチド材料を用いて、例えば、コーラ−( Iohler)およびミルスタイン(Milsjein) ((1975年)、 ネイチ−? −(Najure)、256:495)の方法を用いて、抗血清お よびモノクローナル抗体を調製できる。
さらに、このようなモノクローナル抗体は診断テストの基礎を形成するものであ る。
このような変異APPのポリペプチドを用いて、特異的な抗体の製造のために動 物を免疫処理する。これらの抗体は、多クローン性の抗血清からなるまたはハイ ブリドーマ細胞によって製造されるモノクローナル抗体からなる。抗nual)  、(1988年)、イー バーロウ(E、Hartow)およびディ レイン (D、Lane) 、コールド スプリング ノへ−バー ラボラトリ−(Co ld Spring Harbor Laboratory)、コールド スプ リング ハーバ−(Cold Spring )larbor)、ニューヨーク を参照(これはここでは参考として挙げられている)。
例えば、以下に制限されないが、組換によって製造される717番目のコドンが 変異したAPPのポリペプチドの断片を、免疫反応を生じるようにアジュバント と共にマウスに注入することができる。少なくとも1×107M−1の結合親和 性(binding affinit7)を有する組換断片を結合するマウスの 免疫グロブリンを、抗血清として免疫処理されたマウスから集め、さらに、アフ ィニティクロマトグラフィーまたは他の方法によって精製する。さらに、膵臓細 胞をマウスより集め、ミエローマ細胞に融合させ、抗体を分泌するハイブリドー マ細胞のバンクを作製する。ハイブリドーマのバンクから、少なくともlX10 6M−1の親和力を有する組換えで生産された断片を結合する免疫グロブリンを 分泌するクローンをスクリーニングできる。さらに詳しくは、717番目のコド ンが変異したAPPのポリペプチドには結合するが野生型の(すなわち、717 番目のコドンがバリンをエンコードする)APPのポリペプチドとの交差反応性 が限られている免疫グロブリンが、野生型のAPPによる予備吸着(preab gorption)または野生型と比較した場合変異体を選択的に結合する特異 的なイディオタイプのハイブリドーマ細胞株のスクリーニングのいずれかによっ て、選択される。
最終的に目的とする変異APPポリペプチドを発現できる本発明の核酸配列を、 様々な異なるポリヌクレオチド(ゲノム若しくはcDNASRNA、合成オリゴ ヌクレオチド等)から、さらには様々な異なる技術によって、形成できる。
前記したように、DNA配列は、配列を発現調節配列に操作して連結した(op erably 1ink) (つまり、発現調節配列の機能を確保するために位 置づけた)後、宿主において発現する。これらの発現ベクターは、具体的にはエ ピワームとしであるいは宿主の染色体DNAの内在性の一部として宿主生物にお いて複製可能である。一般的には、発現ベクターは、目的とするDNA配列を形 質転換した細胞を検出および/または選択できるような、例えばテトラサイクリ ン耐性またはヒグロマイシン耐性等の、選択マーカーを有する(例えば、米国特 許番号:4,704,362号を参照、これはここでは参考として挙げられてい る)。
717番目のコドンが変異したAPPのポリペプチドをエンコードするポリヌク レオチドは、エンコードされたポリペプチド生成物が生産される等の、コーディ ング配列(Coding 5equence)の転写(発現配列)および翻訳を 容易にする配列を含む。このようなポリペプチドの構築は既知であり、マニアテ ィス(Maniatis)ら、モレキュラー タローng:A Laborat ory Manual) 、2版、(1989年)、コールド スプリング ハ ーバ−、ニューヨーク(Cold Spring1’1arbor、 N、Y、 )に記載されている。例えば、以下に制限されないが、このようなポリペプチド としては、プロモーター、転写終結部位(真核生物の発現宿主においてはポリア デニル化部位(pokyadenylation 5ite)) 、リポソーム 結合部位、および必要であれば、真核生物の発現宿主において使用するエンハン サ−1およびさらに必要であれば、ベクターの複製に必要な配列が挙げられる。
大腸菌(E、coli)は、本発明のDNA配列をクローニングするために特に 有用な一原核生物宿主である。使用するのpecies)が挙げられる。これら の原核生物宿主においては、発現ベクターを作製することも可能であり、具体的 には、これらのベクターは宿主細胞と両立できる発現制御配列(例えば、複製起 点)を含む。さらに、ラクトースのプロモーターシステム、トリプトファン(t rp)のプロモーターシステム、β−ラクタマーゼのプロモーターシステム、ま たはλファージのプロモーターシステム等の、多くの様々な既知のプロモーター が存在する。これらのプロモーターは、具体的には、必要であればオペレーター 配列と共に発現を制御し、さらに、転写及び翻訳を開始し終了させるために、リ ポソーム結合部位配列等を有する。
酵母等の、他の微生物を発現に用いてもよい。3−ホスホグリセリン酸キナーゼ 若しくは他の解糖酵素を含む、プロモーター、および複製起点等の、発現制御配 列、および必要であれば終結配列等を有する適当なベクターを有する、サツカロ マイセス(Saccharomyces)が、好ましい宿主である。
微生物に加えて、哺乳動物の組繊細胞培養物も、本発明のポリペプチドを発現し 、生産するのに使用できる(ウィンナツカ−(Winnacker) ら、「フ ロム ジーン ツー クローンズ(From Gene jo C1ones)  J 、ブイシーエッチ パブリッシャーズ(VCII Publishers )、ニューヨーク、ニューヨーク、(1987年)を参照、これはここでは参考 として挙げられている)。真核生物の細胞が、ヒトのタンパク質をそのまま分泌 できる多くの好ましい宿主細胞株が当該分野において開発されているため、実際 に好ましく、具体的には、CHO細胞株、様々なCO8細胞株、ヒーラ(HeL a)細胞、ミエローマ細胞株、ジャーカット細胞(Jurkaj cell)等 が挙げられる。これらの細胞の発現ベクターは、複製起点、プロモーター、エン ハンサ−等の発現制御配列(1mmuno1. Rev、) 、89 : 49 、これはここでは参考として挙げられている)、およびリポソーム結合部位、R NAスプライス部位、ポリアデニル化部位(pokyxdenylNion 5 He)、及び転写終結配列等の必要なプロセッシング情報部位(process ing information 5ue)を含む。好ましい発現制御配列は、 免疫グロブリン遺伝子、SV40、アデノウィルス、ウシのパピローマウィルス 等由来のプロモーターである。有用なりNA上セグメント例えば、変異APPポ リペプチドをエンコードするポリペプチド)を含むベクターを、細胞宿主のタイ プによって変わる、既知の方法によって宿主細胞に転移することができる。例え ば、塩化カルシウムによるトランスフェクションは一般的に原核生物の細胞に用 いられるが、リン酸カルシウム処理若しくはエレクトロポレーションは他の細胞 宿主に使用される。(通常、oratory Manual) 、コールド ス プリング ハーバ−プレス、(Cold Spring Harbor Pre ss)、(1982年)を参照、これはここでは参考として挙げられている。) または、相同的組換を用いて、特異的な部位、例えば、宿主のAPP遺伝子座に おいて、宿主ゲノム中にAPPの変異配列を挿入してもよい。相同的組換の一つ のタイプでは、1つまたはそれ以上の宿主の配列を置き換える;例えば、宿主の APPの対立遺伝子(若しくはこの一部)を変異APPの対立遺伝子(若しくは この一部)と置換する。
このような遺伝子の置換方法に加えて、相同的組換を用いて、宿主のAPP遺伝 子座以外の特異的な部位に変異APPの対立遺伝子を標的にして(t a r  g e +)もよい。相同的組換を用いて、変異APPの対立遺伝子を導入した ヒト以外の形質転換動物および/または細胞を作製できる。
この方法自身によって、診断において使用できるテストキットを容易に形成でき る。このようなキットは、第一のコンテナー(container)が適当に標 識されたDNAプローブを含む1つまたはそれ以上のコンテナー(colain et)を密に並べて区分されるキャリアー(carrier)からなる。他のコ ンテナーfcontainer)は、酵素基質等の、標識されたプローブの位置 を決定するのに用いる試薬を含む。さらに他のコンテナー(container )には、制限酵素(BclI等)′、バッファーなどが、使用のための指示に従 って入っている。
実験の実施例 以下の実施例によって詳細に説明するが、以下の実施例によって本発明は制限さ れるものではない。
アルツハイマー病を剖検で確認した一家族(図1を参照)おける第21染色体の 長腕に沿ったADおよびマーカーの分離(segregation)を評価した 。6人の疾病した人および33人の疾病していないが疾病する危険を有する人か らのDNAサンプルを用いた。。
疾病した家族員におけるAPP遺伝子を、イントロンのプライマーを用いたポリ メラーゼ連鎖反応(polymerase chain reaction)  (PCR)の直接配列決定(direct sequencing)によって分 析した(ギレンステン(G711ensten)、ニー イン ピーシ−アール  テクノロジー(U、in PCRTechnolog7)、エリツク、エッチ ニー(Erlich、B、A、)著、ストックトン プレス(Sjockjon  Press)、45〜60.1989年;ヨシカイ(Yoshikai)ら、 (1990年)、ジーン(Gene)、87 : 257)。(図2)。このプ ライマーを、ジーン アセンブラ−プラス(Gene As@embler P lus) (ファルマシア エルケービ−(Pharmicia LKB)製) を用いて製造会社のプロトコルにしたがって作製した。
APP遺伝子のエキラン17を増幅するために、PCRヲ以下のイントロンのプ ライマーを用いて行った:[A] 5’ −CCTCATCCAAATGTCC CCGTCATT−3’ [配列番号=26]および[B]5’−GCCTAA TTCTCTCATAGTCTTAATTCCCAC−3’ [配列番号;27 ]PCHの条件は、94℃、10分間で変性:さらに、60℃で1分、72℃で 3分、94℃で1.5分を35サイクル;および72℃で10分を1サイクル。
10mM)リス−塩酸 pH8,3,50mM塩化カリウム、0.01%ゼラチ ン、1.5mM塩化マグネシウム、200μMのdNTPs、50ピコモルのそ れぞれのPCRプライマーおよび1単位のTaqポリメラーゼを用いて、反応を 行った。全体の最終反応容積は25μmであった。
次に、第二のPCR反応を、最終濃度がプライマー[A]が50ピコモルおよび プライマー[B]が0.5ピコモルで行った。PCR生成物を、セントリコン  100 マイクロコンセントレータ−(cenHicon 100 m1cro concenHajor) (アミコン(Amicon)製)上で精製し、製造 会社のプロトコルにしたがってシークエナーゼ(SEQUENASE)キット( バージョン 2.0、ユナイテッド ステーツバイオケミカル コープ(Uni ted 5tates Biochemical Corp、);シークエナー ゼ(SEQUENASE)は商標である)を用いた配列決定のために直接用いた 。
エキラン17はβ−アミロイドペプチドの一部をエンコードし、ダッチタイプの アミロイド症(「エッチシーエッチダブルニー−ディ」 (“HCHWA−D”  ))による遺伝性の脳出血を引き起こす(APP693の)突然変異の部位で あるため、これを最初に配列決定した。
エキラン17の配列分析によって、717番目のアミノ酸でバリンからイソロイ シンへの変化が生じる、2149番目の塩基対でCからTへのトランジションが 明らかになった(図2および図3)。
このCからTへのトランジションによって、PCHの生成物内で検出できるBc lIの制限部位が生じる(図4)。
製造会社によって推奨されているように、Bcllによる消化を50℃で2〜4 時間行い、さらに、3%アガロースで電気泳動した。
100人の関連のない正常な個人および14ケース(9家族)の家族性の後年に 始まる病気のPCRによるスクリーニングでは、この置換が示されなかった。家 族性の初期に始まる病気の11ケース(9家族)のスクリーニングで、関連のな い家族の2人の疾病した個人においてBa1lの制限部位が明らかになった。遺 伝的データによって、病気の遺伝子座がミスセンス突然変異体に連結しているこ とが示される。また、200個の正常な染色体において多形性が検出されなかっ たことによって、これが病原性のある突然変異体であるという主張が支持される 。
バリンからイソロイシンへの置換は、β−アミロイドペプチドのC−末端のトラ ンスメンブランドメインの2残基内で起こる。コンピューター分析によって、置 換によってトランスメンブランがより疎水性になり、これによって膜内により強 力にタンパク質を固定することが予想される。
置換の位置、β−アミロイドペプチドのC−末端から2残基は、沈着したペプチ ドのオリジン(otigin)に重要である。
この知見は、アルツハイマー病のエッチシーエッチダブルニー−ディ (HCH WA−D) 、つまりアミロイドの沈着がβ−アミロイドペプチド内ではなくN −末端により近い突然変異によって起こる病気への関連を示すものである(レヴ イ(levy)ら、上記引用文(loc、ciL) )。
実施例2−欠陥(defective) β−アミロイド(APP)遺10m1 の新鮮な血液を、家族性アルツハイマー病に罹っているそれぞれの個人から集め た。リンパ球をパーコルグラジェント(Percoll gradient)上 で血液から精製し、エプスタイン−パールウィルス(Epstein−Barr  virus) (EBV)と混合した。次に、細胞を10%ウシ胎児血清、抗 生物質、グルタミンおよびTリンパ球を殺すシクロスポリンAを追加した培地中 に撒いた。EBVによって感染したBリンパ球を不死化し、患者のB細胞由来の 永久細胞株を確立した。
リンパ芽球様細胞株(lyphoblagjoid cell 1ine) 、 AC21は、ヨーロッピアン コレクション オブ アニマルセル カルチャー ズ(European Co11ection of Animal Ce1f  CuHures) 、ポートン ダウン(Porton Down)に寄託疾 病年齢が59±4才であるADを剖検で確認した、F19と称され、図5に示さ れた家系を、APP遺伝子の近くに位置する、非常に多形性であるジヌクレオチ ドの反復マーカー(repeat marker) GT 12の対立遺伝子( D21S210)が病気とコセグレゲートする(co−segregate)こ とを観察することによって確認した。連鎖分析(linkage analys is)によって、以下の表に示されるように、組換画分がゼロの際にマーカーと 病気との間のピーク ロッド スコア(peak lod 5core)が3. 02であった:シータ 0 0.01 0.05 0.1 0.2 0.3 0 .40ツド 3.02 2.97 2.75 2.47 1.86 1.22  0.60ソド スコア(Iod 5core)を、リンケージ(L I NKA GE)パッケージ(package)のムリンク(ML INK)を用いて0. 001の表現型模写率および0.001の遺伝子頻度を有する年齢に依存してい る浸透度が0.01から0.95である病気に罹りやすい7クラスを用いて計算 した(ラトロツプfLathropl ら、(1984年)、ブロック ナシコ ル アカデ サイ ニーニスニー(Proc、 Natl。
Acd、Sci、U、S、A、)、81 : 344B)。
F19の疾病したおよび疾病していない個人のAPPのエキラン17の配列を決 定した。疾病した人においては、図6に示されるように、2150番目の位置で G−>Tのトランジションが存在した。
エキラン17の増幅を、以下のように修飾して、上記実施例1およびチャーティ アー−パーリン(Chartier−Harlin)ら、(1991年)、ニュ ーロサイ レッゾ(Neurosci。
Lens、)、129:134に記載されたようにして行った:(a)増幅用の プライマー配列は以下の通りである:ATA−ACC−TCA−TCC−AAA −TGT−CCC−C[配列番号:281 およびGTA−ACC−CAA−G CA−TCA−TGG−AAG−C[配列番号+29] ; さら1ニ(b)P CRの条件ハ、94℃、1o分間した後、60℃で1分、72℃で1分、94℃ で1分を35サイクル、さらに、72℃で5分であった。
50ピコモルの第二のプライマーを用いて、1本鎖の生成物を生産し、さらに、 これを精製した(チャーティアー−パーリン(ChaNier4arlin)ら 、上記引用文(loc、 ci())。精製した生成物を以下の配列のプライマ ーを用いてシークエナーゼ(SEQUENASE) キット(2,0)(商標; ニーエスピー([l5B) )を用いて配列決定した:AAA−TGA−AAT −TCT−TCT−AAT−TGC−G [配列番号: 307T−>Cのトラ ンジションの存在によって、配列決定反応におけるイノシン(シークエナーゼ( SEQUENASE)キット)を含ませることによって溶解するゲルのアーチフ ァクトが得られた。
F19の疾病した個人のエキラン7および16を直接配列決定(direct  sequencing)すること(チャーティアー−パーリン(Charfie r4arlin) ら、上記引用文(Ioc、 ci、))によって、これらは 正常な配列を有することが示され、5SCA(オリタ(OrHa) ら、上記引 用文(Ioc、 ciL) )および(オリタ(Orija) ら)によっては エキラン2.3.7.9.12.13若しくは15における変化を同定できなか った。エキラン17の5SCAによって、標準のスクリーニングの条件下で、A PP693 (レヴイ(levyJら、上記引用文(toe、cif、)および バーディ(Hardy) ら、(1991年)、ランセット(Lancet)、 337 :1342〜1343)およびAPP717 Val−>Ileの両方 が検出され、修飾すると、APP717 Val−>Glyが検出される。
実施例4−変異APP対立遺伝子を有する形質転換動物の非 構築物の生産:ポリリン力−のHindI I I末端がPvu11部位の付近 にくるように、pBR322のPvullおよびEcoRI部位の間にポリリン カーをクローニングすることによって、ベクターブリンク(veNor pli nk)を構築した。連結によって、pBR322のセグメントに関連したEco RIおよびPvulI部位の両方を破壊した。SV40のポリアデニル化シグナ ル(pok7xdenylationsignil)を含むpSV2neo ( サザン(Southern)およびベルブ(B e r g)、(1982年) 、ジエー モル アップルジエネット(J、 Mo1.、 Appl、 Gen eL)、1:327)の700bpのHpaIからEcoRIまでの断片を、プ リンク(pltnk)のHpalからEcoRIの部位にクローニングすること によって、pNo tSVを得た。SV40の16S/1gSのスプライス部位 を含ti’pL2(7)200bpのXhoIからPstlの断片(オカヤ7  (Oka7ama)およ断端を平滑にし、さらに、pNo t SVのHpa1 部位にクローニングすることによって、pspliceを得た。
APPに対するcDNAのコーディング領域(coding region)を 含むpAPP695の2,3kbのNrulから5pelの断片(タング(Ta nxi) ら、(1987年)、サイエンス(Science) 、235 :  880)をpsplice(7)Nrulから5peIの部位にクローニング することによって、pd695を得た。同様のストラテジーを用いて、APP7 51 (タング(Tinxi) ら、(1988年)、ネイチャー(Nitur e)、331 : 528)のcDNAを用いてpd751を得た。様々なプロ モーターを、単一のNru I部位またはHindl I IおよびNruI部 位を用いて、pd695およびpd751ベクターに挿入した。
pshAPP695およびpshAPP751の生成:APPのcDNAの1. 5kbのBamHI断片をpuc19 xHamyのBamHI部位にクローニ ングすることによって、構築物、pAmyproBamを得た。pAmypro Bamの700bpのHindllIからAsp718の断片(サルバウム(S albaum) ら、(1988年)、イーエムビーオー(EMBO)、7 :  2807に記載された700bpのBamHIからAsp718の断片と同じ )をpd695およびpd751のHindlllからAsp718の部位にク ローニングし、pshAPP695およびpshAPP751を得た。
Bamの3.0kbのEcoRIからXholの断片、APP751 cDNA の1.5kbのXholから5peIの断片、およびpd751の5pelから EcoRIの断片の3工程の連結反応(!hree−wa71iga目on)に よって、pAPP695およびpAPP751ベクターを得た。
pNsE751 (+47)の生成: pNSE6 (フォース−ペラターu’ orss−petter)ら、(1990年)、ニューロン(Neuron)、 5:187)のHindlIIからKpnlの断片、pNSE6のKpnlから Bs tYIの断片およびpAPP751の部分的なりamHI (ATGより 一47番目)からHindI I Iの断片の3工程の連結反応(three− way I+gaNon)を用いて、pNsE751 (+47)を構築した。
これによって、pNsE751 (+47)のKpnI部位にクローニングされ たKpnl断片を得た。
BstY1/Bamの融合によって、両方の部位が欠損する。
pNsE751の生成:これによってAPPのコーディング領域(coding  region) ヘのNSEの開始コドンの直接融合(direct fus ion)が生じる、4プライマーの2段階のPCHのプロトコル(4prime r two−step PCRprotocol)(ヒグチ(Biguchi)  ら、(1988年)、ヌクレイックアシッズ レス(Nucleic Ac1 ds Res、)、16 : 7351)を用いて、このベクターを得た。オリ ゴヌクレオチドC2,1072,1073、およびA2(下記のヌクレオチド配 列を参照)を用いて、PCR生成物を得た。制限酵素による消化によってKpn l断片を得た。このKpnl断片を用いて、pNsE751 (+47)中の同 様の断片を置換−の2段階のPCHのプロトコル(4primer two−s tep PCRprotocol)を用いて、バーディ(Hardy) (AP P642APP695のVal−>1ie)およびダッチ(Dutch)(AP P618 APP695のGln−>Glu)の突然変異を導入した。反応のセ ットは両方とも、適当な突然変異を含む「内側のプライv−(inside p rimer) Jを有する同様の「外側のフライ7− (olside pri mer) Jを使用した。これによって、消化後BglIIから5peIの断片 突然変異のいずれかを含んでいた。pNsE751のBgIIIから5pelの 断片を突然変異断片によって置換し、適当なベクターを得た。突然変異の存在を ベクターの配列分析によって確認した。
−の2段階のPCHのプロトコル(4primer tto−step PCR protocol) (ヒグチ(旧guchi) ら、(1988年))を用い て、バーディVl(HardyVI)(APP642 Vから■)、バーディV G(llardy VG) (APP642 VからG)、およびダッチ(Du tch) (APP618 EからQ)の突然変異を導入した。プライマー11 7/738.922.923、および785を用いて、/\−ディV I (H ardy I/I)の突然変異体を得た;プライマー117/738.1105 、G)の突然変異体を得た;プライマー117/738.1010.1011、 および785を用いて、ダ’7チ(Dlch)の突然変異体を得た。これらすべ ての突然変異において、PCR生成物を制限酵素で消化することによって、70 0bpのBgllIから5peIの断片を単離し、さらにpNSE751の同様 の部位にクローニングした。この突然変異は配列分析によって確認した。
pNFH751の生成:ヒトのNFH遺伝子(リーズ(Lees)ら、(198 8年)、イーエムビーオー(EMBO)、7(7):1947)を、プローブと してう・ノドのNFHのcDNAを用いてゲノムライブラリーから単離した(り 一ベルバーグ(Lieberburg)ら、(1989年)、プロ・ノクナショ ル アシツズ レス ニーニスニー(Proc、 Nxtl、 Ac1ds、  Rcs、 U、S、A、)、86 : 2463)、Ss t I断片をpSK ベクターにサブクローニングした。1対のPCRプライマーを作製し、NFH遺 伝子の開始コドンの直ぐ上流の150bl)の増幅した断片の3′末端にNru I部位を置いた。5′末端は、開始コドンから150番目の上流にKpnI部位 を有する。pNFH8,8の5.5bのHindlllからKpn I断片、K pn IからNrulのPCRによって生じた断片、およびpd751のHin dlIIからNrulの断片の3工程の連結反応(three−way 1ig ation)によって、pNFH751の最終的な構築物を得た。開始コドンで のPCRによって生じた融合物周辺の配列を、配列分析によって確認した。pN FH751の同様の断片を配列を確認した突然変異ベクターの600bpのBg lIIから5peIの断片で置換することによって、pNFH751のダッチ( Dutch)およびバーディ(llardy)の変異体を得た。突然変異の存在 は、突然変異したオリゴマーによるハイブリッド形成によってまたは配列分析に よって確認した。
pThy751の生成:以下の3工程の連結反応(three−W!F 1ig a+1on)によって、pT1y751ベクターを得た。
ヒトのゲノムライブラリーから単離したpThy8.2のHindI I Iか らBamHIの断片(チャンク(Chang)ら、(1985年)、ブロック  ナショル アカデ サイニーニスニー(Proc、 Natl、 Acd、Sc i、υ、 S、 A、 )、82:3819)、合成断片’rhyApp、およ びpd751のHindI I IからNru Iの断片。
’rhyAppを以下に示す: CAGACTGAGATCCCAGAACCCTAGGTCTGACTCTAG GGTCTTGG [配列番号:31] p’rhyc1ooの生成:以下の3工程の連結反応(three−way l igation)によって、このp”rhyc1oo構築物を得た。pThy8 .2の3.6kbのHindllIからBamHIの断片、合成断片ThyAP P2、およびpd751またはpNsE751ダッチ(Dutch)若しくはp NSE751バーディ(liardy)のHindI I IからBg]、 I  Iの断片を連結し、p’rhycxooを得た。
ThyAPP2を以下に示す: CAGACTGAGATCCCAGAACCGATCCTAGGTCTGACT CTAGGGTCTTGG [配列番号、321 開始コドン周辺の領域を配列分析によって確認した。
注入用のDNAの調製:Notlによる消化およびゲル電気泳動のために有用な 相当するベクターから注入用のトランスジーン(transgene)を単離し た。このトランスジーン(t:ransgene)をジーン クリーン キット (Gene C1eankil (バイ第101 (Biolol))を用いて 精製し、さらに、エルチップ(Elufip)またはヌクレオゲン 4000  カラム(Nucleogen 4000 column)で精製したHPLCで 精製した。
マイクロインジェクション:このトランスジーン(transgene)を、F VB若しくはB6D2F2の1細胞胚(one−celf embryo)の最 も便利な前核(一般的にはオスの前核)中に2〜20μg/ml量を注入した( マニピュレイティング ザ マウス エンブリオ(Manipulating  the MouseEmbryo) 、ビー ホーガン(B、 Hogan)、 エフ コンスタンチニ(F、 Con5tantini)、イー ラシーfE、  Lacy) 、コールド スプリング ハーバ−(Cold Spring  Harbo「)、(1986年))。注入された胚を一晩培養した。2細胞段階 に分裂した胚を、偽妊娠した(pseudo−pregnan+)メスのCD1 マウス中に移植した。このマウスを約21日で離乳させた(weaned)。尾 の生検により得られたDNAサンプルを、トランスジーン(tranggene )に特異的なプローブ(一般的にはSV40 3=のスプライス(SV403’  gplice)およびポリアデニル化シグナル(pokyadenylati on gignal)配列)を用いたサザンプロットによって分析した。トラン スジーン(1,ranggene)の少なくとも1コピーを有する形質転換マウ スを同定した。
形質転換マウスの使用: hAPP遺伝子またはその変異体を発現するマウスを 用いて、アミロイドの沈着の病因およびアミロイドの沈着を調節する(modu late)ように設計された治療上の関与を試験できる。
形質転換マウスの生化学的な分析によって、β−アミロイドに対する前駆体と考 えられるAPPの異化作用における可能な中間体が明らかになる。この分析は、 動物においてまたは発現する細胞の一次組織培養において行うことができる。
この動物を用いて、強力な治療物質を試験することができる。マウスの試験群を 、一定期間適当な様式で投与される試験化合物によって処理する。試験期間が終 了した際、動物を、試験化合物の可能な効果について、行動学的に、生化学的に 、および組織学的に評価する。このプロトコルは、試験化合物の作用の予想され るメカニズムに依存する。
ADを治療するのに用いられる化合物をこの方法を用いて同定できる。
配列リスト (1) 一般的な情報: (i) 出願人: (A) 名称: インペリアル カレッジ オン サイエンス。
テクノロジー アンド メデイシン (アメリカ合衆国を除く) (B)kmη: エキシビジョン ロード、サーフイールド ビルディング (C) 市(CrrY): ロンドン ■) 国: イギリス国 (F) 郵便番号二 ニスダブル72ニーゼツト(A) 氏名: バーディ、ジ ョーン アンソニー(アメリカ合衆国のみ) し) 新旧η司!η: ドレイクツエル ロード 187(C) 市(crrY ): ロンドン ■) 国: イギリス国 (F′)郵便番号: ニスイー4 (A) 氏名: ゴウテイ、アリラン マリ−(アメリカ合衆国のみ) ■) NErrREET): ハンプトン ウィック、ハイ ストリート l■ (C) 市(CITY): キックストン−オン、テムズ(D) 州(STAT E): サリー ■) 国: イギリス国 (F) 郵便番号二 ケーティ14デイキユー(A) 氏名: マラン、マイケ ル ジョーン(アメリカ合衆国のみ) (B) 街(8TRI!Ji’r): ブルース ビー、ダウンズ ブルヴアー ド エムディジー 50 12901. サンコースト ジェロントロジー セ ンター (C) 市(CrrY): テンバ (D) 州(SrrATE): 7 aリダα) 国: アメリカ合衆国 ■ 郵便番号: 33612 (A> 氏名: チャーテイアー−ハーリン、マリ−、クリステイン(アメリカ 合衆国のみ) (B) MSTRERT): フランシス ロード 田(C) 市(CffY) : ロンドン ■)国: イギリス国 (F) 郵便番号: イー106ビーエヌ(A) 氏名: オウエン、マイケル  ジョーン(アメリカ合衆国のみ) (B) 街(STREET): ランブレシアン、キャッスルヒル、フォーへツ ジェス (C) 市(CrrY): カラブリッジ(D) 州(STATE): サウス  グラモルガンG) 国: イギリス国 (ii) 発明の名称: アルツハイマー病に関するテストおよびモデル(ii i) 配列の数; 楓 (iv) コンピューターの解読可能な形態(COnRREADABIJFOR M):申8青せず (V) 一般的な出願資料: 出願番号: WOPOT/GB92/ (2) 配列番号=1に間する情報: (i) 配列の特性: (if) 分子のタイプ: タンパク質(傾 配列の記載: 配列番号:l: Thr Lys clu Gly 工la Lau Gin Tyr Cys  Gin Glu Val Tyr Pro Glu r、+≠■ Trp Cys Lys )xq Gly Arg Lys Gin CY!!  Lys Thr Hls Pro Hls Pha Va■ l、00 105 1LO 工1a Pro ’ryr Arq cys Lau Val Gly Glu  Pha Val Sar Asp Ala Lau rx■ 115 12α 125 Glu Thr His Lau His Trp Hls Thr Val  入1a Lys Glu Thr Cys Sar Glu工45 工50 1 55 160 LY!I sar Thr Ajin Lau Hls Asp Tyr cx y xat L41u Lau Pro C711GIY工P・ 165 170 1フ5 alu Ala AJIP AJIP A1%P Glu Asp Asp G Lu Asp Gly Asp GLu Val GLu flu 245 25Q 255 GLu Arg Lau Glu Ala r、ys Hls Arg Glu  Arg Mat Sar Gin Val Mat Ar■ コ25 ココ0 コ35 clu Trp Glu Glu Ala Glu Arg Glrx Ala  Lya Asn Lau Pro Lysに1」―pココ0 コ45 コ50 (2)配列番号:2に関する情報: (ii) 分子のタイプ: タンパク質(xi)配列の記載: 配列番号:2: Msat Lau Pr口 Gly Lau Ala Lau Lau Lau  Lau Ala 入1a Trp Thr Ala 入r■ 工 5 10 15 人19n Gay L7!l Ih−p Asp Bar Asp pro S ar GIY Thr Lys Thr CYs 工la `sp Thr Lys Glu Gly工1a rl、au Gin Tyr Cys  Gin Glu Va1Tyr Pro Glu LauTrp Cys L ys Arg Gly Arq Lyg Gin Cys Lys Thr H ls Pro Hls Ph@ ValZoo 105 xl。
Glu Ala Asp Asp Asp Glu Asp Agp Glu  Asp Gly Asp GLu Val Glu GluTyr Gay G 1.y Cys Gly Gly Asn Arq As1n ASn Pha  ASp τhrGユu Glu Ty■ 325 3コ0 ココ5 Mat l1・ Sar Glu Pro Arg l1* 5ar Tyr  Gly Asnλsp Ala Lau Mat Pr。
565 5フ0 575 −Glu Pha Sar L@uAsp Ajp Lau Gin Pro  ’rrp 1Eis 5CPha Gly 紅& jlJp(2)配列番号:3 に関する情報: (i) 配列の特性: (D) )ポロジー: 直線状 (■)分子のタイプ: タンパク質 (xi) 配列の記載; 配列番号二3:Glu Aha Ajp Asp A sp Glu Asp Asp Glu Asp Gly Asp Glu V a工工lu Glu245 250 25! 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DK、ES、PR,GB、GR,IT、LU、MC,NL、SE)、0A(BF 、BJ、CF、CG、CI、CM、GA、GN、ML、MR,SN、TD、TG )、AtJ、 BB、 BG、 BR,CA、 C3,FI、 HU、JP。
KP、KR,LK、MG、MN、MW、No、PL、RO,RU、SD、US (72)発明者 ゴウティ、アリラン マリーイギリス国、サリー ケーティ1 4デイキユー、キックストン、ハンプトン ウィック、ハイ ストリート100 FI (72)発明者 オウエン、マイケル ジョーンイギリス国、サウス グラモル ガン シーエフ77ジエービー、ニア−カウブリ ッジ、ランブレシアン、キャッスルヒル。
フォー へッジェス(番地なし) (72)発明者 マラン、マイケル ジョーンアメリカ合衆国、フロリダ州 3 3612.テンパ、ブルース ビー、ダウンズ ブルヴアード エムディジー  50.12901.ユニバーシティ オン サウス フロリダ、サンコースト  ジエロントロジー センター内

Claims (39)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.ヒトのアミロイド前駆体タンパク質770(APP770)の717番目の コドンが突然変異したもの、または717番目のコドンによってエンコードされ る位置に突然変異したアミノ酸残基を有するAPP770のイソ型若しくは断片 をエンコードする核酸配列からなる単離されたポリヌクレオチド。
  2. 2.717番目のコドンによってエンコードされた位置のアミノ酸がイソロイシ ン、グリシン、またはフェニルアラニンである、請求の範囲1に記載の単離され たポリヌクレオチド。
  3. 3.該核酸配列がcDNAである、請求の範囲1に記載の単離されたポリヌクレ オチド。
  4. 4.717番目のコドンで突然変異を発現するアミロイド前駆体タンパク質77 0(APP770)の対立遺伝子に対して特異的にハイブリッドを形成すること ができるポリヌクレオチドプローブからなる組成物。
  5. 5.該突然変異した対立遺伝子の717番目のコドンがイソロイシン、フェニル アラニン、またはグリシンをエンコードする、請求の範囲4に記載の組成物。
  6. 6.該プローブが標識されている、請求の範囲4に記載の組成物。
  7. 7.該プローブがAPP770の対立遺伝子の717番目のアミノ酸にわたる少 なくとも約10ヌクレオチドからなる、請求の範囲4に記載の組成物。
  8. 8.ヒトのアミロイド前駆体タンパク質770(APP770)の717番目の 位置が突然変異したもの、または突然変異を有するAPP770のイソ型若しく は断片をエンコードする核酸セグメンを有する形質転換宿主。
  9. 9.初代培養の若しくは不死化した真核生物の細胞株である、請求の範囲8に記 載の宿主。
  10. 10.細菌である、請求の範囲8に記載の宿主。
  11. 11.該セグメントが宿主のゲノム中に組込まれた、請求の範囲8に記載の宿主 。
  12. 12.生殖系列中に導入されたDNAセグメントを有するヒト以外の動物であり 、かつ該突然変異APP770タンパク質を発現できる、請求の範囲8に記載の 宿主。
  13. 13.該突然変異APP770タンパク質が動物によって生産される単一のAP P770タンパク質である、請求の範囲12に記載の宿主。
  14. 14.発現した際の遺伝子が動物においてアルツハイマー病の神経病理学的な特 性を促進する、717番自の位置が突然変異したアミロイド前駆体タンパク質7 70(APP770)をエンコードする異種遺伝子からなる生殖細胞若しくは体 細胞を有するヒト以外の形質転換動物。
  15. 15.ヒトのアミロイド前駆体タンパク質770(APP770)の717番目 の位置が突然変異したもの、または突然変異を有するAPP770のイソ型若し くはAPP770の断片をエンコードする核酸セグメントを有する、培養された ヒトの初代培養の若しくは不死化した細胞。
  16. 16.以下よりなる、アルツハイマー病を治療できる物質(agent)のスク リーニング方法:請求の範囲8に記載の宿主に該物質(agent)を接触させ ;さらに、突然変異APP770遺伝子によってエンコードされたタンパク質の 発現またはプロセッシングを検査する。
  17. 17.被験者におけるアミロイド前駆体タンパク質(APP)の対立遺伝子、こ れらのイソ型若しくは断片の存在を検出することからなり、該対立遺伝子がAP P770の717番目のコドンに相当する位置に配列の多形性を有する、被験者 におけるアルツハイマー病の遺伝的な素質を決定するための診断方法。
  18. 18.該配列の多形性がヌクレオチドの置換であり、これによってAPP770 の717番目のコドンでイソロイシンまたはグリシンに置換される、請求の範囲 17に記載の方法。
  19. 19.該配列の多形性が1個のヌクレオチドの置換である、請求の範囲17に記 載の方法。
  20. 20.該検出段階が被験者の第21染色体のゲノムDNAのセグメントを配列決 定することからなる、請求の範囲17に記載の方法。
  21. 21.該検出段階が(i)被験者からの核酸サンプルを反応物中のAPP遺伝子 の対立遺伝子に選択的にハイブリッド形成できる1つまたはそれ以上のポリヌク レオチドプローブと混合し、さらに(ii)反応物を検査してサンプル中の遺伝 子の対立遺伝子の存在を決定し、これによって被験者がアルツハイマー病になる 危険性があるかどうかを判定する、請求の範囲17に記載の方法。
  22. 22.1つのプローブがAPP770の717番目のコドンにわたる少なくとも 約10ヌクレオチドの配列からなるポリヌクレオチドである、請求の範囲20に 記載の方法。
  23. 23.該プローブがポリメラーゼ連鎖反応(polymerase chain  reaction)においてポリヌクレオチドの合成を開始することができる オリゴヌクレオチドであり、反応生成物がAPP遺伝子のエキソン17の少なく とも25個の隣接するヌクレオチド配列を有する、請求の範囲22に記載の方法 。
  24. 24.少なくとも1つのオリゴヌクレオチドがAPP770遺伝子のイントロン またはブランキング領域(flankingregion)中に存在する配列に 特異的にハイブリッドを形成する、請求の範囲21に記載の方法。
  25. 25.該検査段階がPCR反応物のシークエンシングゲル反応生成物(sequ encing gel reaction product)を分析することか らなる、請求の範囲21に記載の方法。
  26. 26.該検査段階がPCR反応物による反応生成物のBclI消化物のオートラ ジオグラフを分抗することからなる、請求の範囲21に記載の方法。
  27. 27.該検査段階が(i)免疫学的なアッセイにおいて被験者からのAPP77 0若しくはイソ型のタンパク質のサンプルを対立遺伝子に特異的な抗体試薬と混 合し、さらに(ii)アッセイを検査して抗体試薬とタンパク質サンプルとの間 の特異的な結合を測定し、これによって被験者がアルツハイマー病になる危険性 があるかどうかを判定する、請求の範囲17に記載の方法。
  28. 28.該抗体試薬が対立遺伝子に特異的な抗原決定基と特異的に反応するモノク ローナル抗体である、請求の範囲27に記載の方法。
  29. 29.被験者におけるアミロイド前駆体タンパク質(APP)遺伝子のAPP7 70遺伝子の717番自のコドンにおける少なくとも1つの多形性の存在または 欠損を検出することからなるヒトの被験者の遺伝学的な分析方法。
  30. 30.被験者からのゲノムDNAを少なくとも1つの制限エンドヌクレアーゼで 消化し、得られた断片を検出用のプローブとハイブリッドを形成させることによ って該多形性を検出する、請求の範囲29に記載の方法。
  31. 31.以下のコア配列を有する、ヒトのタンパク質を含まないポリペプチドから なる組成物; 【配列があります】[配列番号:6] ただし、Xはバリン以外の20個の既知のアミノ酸のいずれかである。
  32. 32.請求の範囲31に記載のポリペプチドを有するヒト以外の形質転換動物。
  33. 33.該ポリペプチドが脳に存在するものである、請求の範囲32に記載のヒト 以外の形質転換動物。
  34. 34.アルツハイマー病の遺伝学的な素質とコセグレゲートする(cosegr egate)突然変異したヒトのAPP対立遺伝子をエンコードする核酸配列か らなる、単離されたポリヌクレオチド。
  35. 35.該突然変異したヒトのAPP対立遺伝子が717番目のコドンが突然変異 したものからなる、請求の範囲34に記載の単離されたポリヌクレオチド。
  36. 36.被験者のDNAにおけるアミロイド前駆体タンパク質(APP)をエンコ ードする遺伝子の対立遺伝子の存在を検出することからなる方法である、アルツ ハイマー病に対する被験者の遺伝学的な素質の決定方法。
  37. 37.該検出の段階が被験者の体から除去された材料(これは戻さない)につい て行われるものである、請求の範囲36に記載の方法。
  38. 38.該遺伝子の対立遺伝子がAPPの置換による突然変異体をエンコードする 、請求の範囲36または37に記載の方法。
  39. 39.1つのアミノ酸を他のアミノ酸に置換するものである、請求の範囲38に 記載の方法。
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