JP5260877B2 - 面に対して両親媒性のポリアリール及びポリアリールアルキニルのポリマー及びオリゴマー並びにそれらの使用 - Google Patents
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Description
ると説明することができる。実際、これらのペプチドの生物学的活性に寄与するのは全体的生理化学的特性であり、詳細な配列ではない(非特許文献11、12、14及び24〜28参照)。特定の配列、二次構造又はキラル構造ではなく、全体的両親媒性がこれらのペプチドの抗微生物活性ともっとも良く相関するために、任意の適切に両親媒性の物質(必ずしもα−ヘリックス又はβ−シートとは限らず)が抗微生物性を有するであろうように見える。
てデザインされた。
R1−[−A1−s−A2−s−]m−R2
(I)
の化合物あるいは許容できるそれらの塩又は溶媒和物であり、式中、R1、R2、A1、A2、s及びmは以下に定義される通りである。本発明の、面に対して両親媒性のポリアリール及びポリアリールアルキニルオリゴマーはまた、式Ia
R1−A1−s−A2−s−A1−R2
(Ia)
の化合物あるいは許容できるそれらの塩又は溶媒和物を包含し、式中R1、R2、A1、A2及びsは以下に定義される通りである。
その塩又は溶媒和物と接触させる方法を含んでなる、微生物を殺す又はその増殖を阻害する方法に関する。本発明の幾つかのアスペクトにおいて、微生物はバクテリアの細胞、カビ・真菌又はウイルスである。
本発明は非ペプチドの、面に対して両親媒性ポリアリール及びポリアリールアルキニルポリマー及びオリゴマー並びに抗微生物物質としての、そしてヘパリン治療に伴う出血性合併症のための解毒剤としての製薬学的適用におけるそれらの使用を包含する、多数の適用におけるポリマー及びオリゴマーの使用法を提供する。本発明はまた、新規の、面に対して両親媒性のポリアリール及びポリアリールアルキニルポリマー及びオリゴマー並びに新規のポリマー及びオリゴマーを含んでなる組成物を提供する。本発明は更に、面に対して両親媒性のポリアリール及びポリアリールアルキニルポリマー及びオリゴマーをデザインし、合成する方法を提供する。
R1−[−A1−s−A2−s−]m−R2
(I)
の化合物又は式Ia、
R1−A1−s−A2−s−A1−R2
(Ia)
の化合物あるいは許容できるそれらの塩又は溶媒和物であり、式中R1、R2、A1、A2、s及びmは下記に定義される通りである。
極性領域の異なる空間領域への分離を許す両親媒性形態を採ることができる。
ほぼ同等な強度及び作用スペクトルの広さをもつ。しかし、本発明の非ペプチドのポリマー及びオリゴマーはヒトの赤血球に対する毒性が著しく低く、調製のための経費がずっと安く、そしてインビボでずっと安定であることが期待される。重要なことには、これらのポリマー及びオリゴマーは宿主防御ペプチドの構造及び生物学的活性を模倣するために、耐性菌株の出現は非常に起りにくいようである。従って本発明の、面に対して両親媒性のポリマー及びオリゴマーは幾つかの重要な、そして新規な利点を提供する。
ない)状態;状態、障害又は疾患の発症の遅延又は進行の遅延;検出可能又は不可能に拘わらず、状態、障害又は疾患状態の緩和又は寛解(部分的又は全体);あるいは状態、障害又は疾患の強化(enhancement)又は改善が包含される。処置は過剰レベルの副作用を伴わずに臨床的に有意な反応を引き出す処置を包含する。処置はまた、処置を受けていない場合に期待される生存率に比較して生存率を延長する処置を包含する。
R1−[−A1−s−A2−s−]m−R2
(I)
[式中、
A1及びA2は独立に、場合により置換されていてもよいアリーレン又は場合により置換されていてもよいヘテロアリーレンであり(ここで
(i)A1及びA2は独立に、場合により、1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよいか、あるいは
(ii)A1又はA2の一方が前記に定義された通りであり、そして場合により、1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよく、そしてA1又はA2の他方が基−C≡C(CH2)pC≡C−(ここでpは0〜8であり、そして−(CH2)p−アルキレン鎖は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよい)である)、
Sは存在しないか又は−CH2−、−CH2−CH2−、−CH=CH−又は−C≡C−を表わし、
R1は
(i)水素、極性の基(PL)又は非極性の基(NPL)であり、そしてR2は−A1−R1(ここでA1は前記に定義の通りであり、そして場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよい)であるか、あるいは
(ii)水素、極性の基(PL)又は非極性の基(NPL)であり、そしてR2が−A1−s−A2−R1(ここでA1及びA2はそれぞれ前記に定義の通りであり、そして場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよい)であるか、あるいは
(iii)A’−s−であり、そしてR2が−A1−s−A’(ここでA’はアリール又はヘテロアリールであり、それらのいずれも場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよい)であるか、あるいは
(iv)A’−s−であり、そしてR2が−A’(ここでA’はアリール又はヘテロアリールであり、それらのいずれも場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよい)であるか、あるいは
(v)R1及びR2が一緒になって単結合を形成し、
NPLは−B(OR4)2又は−(NR3’)qlNPL−UNPL−(CH2)pNPL−(NR3”)q2NPL−R4から独立に選択される非極性基であり(ここで
R3、R3’及びR3”は独立に、水素、アルキル及びアルコキシからなる群から選択され、
R4は水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール及びヘテロアリールからなる群から選択され、それらのいずれも場合により1個又は複数のアルキル又はハロ基で置換されていてもよく、
UNPLは不在であるか又は、O、S、S(=O)、S(=O)2、NR3、−(C=O)−、−(C=O)−N=N−NR3−、−(C=O)−NR3−N=N−、−N=N−NR3−、−C(=N−N(R3)2)−、−C(=NR3)−、−C(=O)O−、−C(=O)S−、−C(=S)−、−O−P(=O)2O−、−R3O−、−R3S−、−S−C=N−及び−(C=O)−NR3−O−からなる群から選択され、ここで2個の化学的に同等でない末端をもつ基は双方の可能な配置を採用することができ、
−(CH2)pNPL−アルキレン鎖は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよいかあるいはアルキレン鎖が不飽和であり、
pNPLは0〜8であり、
q1NPL及びq2NPLは独立に0〜2である)、
PLはハロ、ヒドロキシエトキシメチル、メトキシエトキシメチル、ポリオキシエチレン及び−(NR5’)q1PL−UPL−(CH2)pPL−(NR5’)q2PL−Vからなる群から選択される極性基であり(ここで
R5、R5’及びR5”は独立に、水素、アルキル及びアルコキシからなる群から選択され、
UPLは不在であるかあるいは、O、S、S(=O)、S(=O)2、NR5、−(C=O)−、−(C=O)−N=N−NR5−、−(C=O)−NR5−N=N−、−N=N−NR5−、−C(=N−N(R5)2)−、−C(=NR5)−、−C(=O)O−、−C(=O)S−、−C(=S)−、−O−P(=O)2O−、−R5O−、−R5S−、−S−C=N−及び−(C=O)−NR5−O−からなる群から選択され、ここで2個の化学的に同等でない末端をもつ基は双方の可能な配置を採用することができ、
Vはニトロ、シアノ、アミノ、ヒドロキシル、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、−NH(CH2)pNH2、−N(CH2CH2NH2)2、
ジアゾアミノ、アミジノ、グアニジノ、グアニル、セミカルバゾン、アリール、ヘテロシクル及びヘテロアリールからなる群さら選択され、それらのいずれも場合により1個又は複数のアミノ、ハロ、シアノ、ニトロ、ヒドロキシル、−NH(CH2)pNH2、−N(CH2CH2NH2)2、アミジノ、グアニジノ、グアニル、アミノスルホニル、アミノアルコキシ、アミノアルキルチオ、低級アシルアミノ又はベンジルオキシカルボニルで置換されていてもよく、
−(CH2)pPL−アルキレン鎖は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよいかあるいはアルキレン鎖が不飽和であり、
pPLは0〜8であり、
q1PL及びq2PLは独立に0〜2である)、そして
mは1〜少なくとも約500である、ただし、
A1及びA2がチオフェンである場合は、極性基が3−(プロピオン酸)又はメトキシ(ジエトキシ)エチルであることはできず、そして非極性基がn−ドデシルであることはできないこととする]
のものあるいは許容できるその塩又は溶媒和物及び製薬学的に許容できる担体又は希釈剤である。
A1及びA2が独立に場合により置換されていてもよいo−、m−又はp−フェニレン(ここで
(i)A1又はA2の一方が1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基で置換され、そしてA1又はA2の他方が未置換であるかあるいは
(ii)A1又はA2の一方が1個又は複数の極性(PL)の基で置換され、そしてA1又はA2の他方が未置換であるかあるいは
(iii)A1又はA2の一方が1個又は複数の極性(PL)の基で置換され、そしてA1又はA2の他方が1個又は複数の非極性(NPL)基で置換されている)であり、
sが−C≡C−であり、
R1が
(i)水素、極性の基(PL)又は非極性の基(NPL)であり、そしてR2が−A1−R1(ここでA1は前記に定義の通りであり、そして場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよい)であるか、あるいは
(ii)A’−s−であり、そしてR2が−A1−s−A’(ここでA’はアリール又はヘテロアリールであり、それらのいずれも場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の組み合わせ物で置換されていてもよい)であり、
NPLが−(NR3’)qlNPL−UNPL−(CH2)pNPL−(NP3”)q2NPL−R4(ここで
R3、R3’及びR3”は独立に、水素、C1−C6アルキル及びC1−C6アルコキシからなる群から選択され、
R4は水素、C1−C10アルキル、C3−C18分枝アルキル、C2−C10アルケニル、C2−C10アルキニル、C3−C8シクロアルキル、C6−C10アリール及びヘテロアリールからなる群から選択され、それらのいずれも場合により1個又は複数のC1−C6アルキル又はハロ基で置換されていてもよく、
UNPLは不在であるか又は、O、S、S(=O)、S(=O)2、NH、−(C=O)−、−(C=O)−N=N−NH−、−(C=O)−NH−N=N−、−N=N−NH−、−C(=N−N(R3)2)−、−C(=NR3)−、−C(=O)O−、−C(=O)S−、−C(=S)−、−O−P(=O)2O−、−R3−O−、−R3−S−、−S−C=N−及び−(C=O)−NR3−O−からなる群から選択され、ここで2個の化学的に同等でない末端をもつ基は双方の可能な配置を採用することができ、
アルキレン鎖−(CH2)pNPL−は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよく、
pNPLは0〜6であり、
q1NPL及びq2NPLは独立に0又は1である)であり、
PLがハロ又は−(NR5’)q1PL−UPL−(CH2)pPL−(NR5”)q2PL−V(ここで
R5、R5’及びR5”は独立に、水素、C1−C6アルキル及びC1−C6アルコキシからなる群から選択され、
UPLは不在であるかあるいは、O、S、S(=O)、S(=O)2、NH、−(C=O)−、−(C=O)−N=N−NH−、−(C=O)−NH−N=N−、−N=N−NH−、−C(=N−N(R5)2)−、−C(=NR5)−、−C(=O)O−、−C(=O)S−、−C(=S)−、−O−P(=O)2O−、−R5O−、−R5S−、−S−C=N−及び−(C=O)−NR5−O−からなる群から選択され、ここで2個の化学的に同等でない末端をもつ基は双方の可能な配置を採用することができ、
Vはニトロ、シアノ、アミノ、ヒドロキシル、C1−C6アルコキシ、C1−C6アルキルチオ、C1−C6アルキルアミノ、C1−C6ジアルキルアミノ、−NH(CH2)pNH2、−N(CH2CH2NH2)2、ジアゾアミノ、アミジノ、グアニジノ、グアニル、セミカルバゾン、C6−C10アリール、ヘテロシクル及びヘテロアリールからなる群から選択され、それらのいずれも場合により1個又は複数のアミノ、ハロ、シアノ、ニトロ、ヒドロキシル、−NH(CH2)pNH2、−N(CH2CH2NH2)2、アミジノ、グアニジノ、グアニル、アミノスルホニル、アミノアルコキシ、低級アシルアミノ又はベンジルオキシカルボニルで置換されていてもよく、
アルキレン鎖−(CH2)pPL−は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよく、
pPLは0〜6であり、
q1PL及びq2PLは独立に0又は1である)であり)、そして
mは1〜約5であるものである。
R1−A1−s−A2−s−A1−R2
(Ia)
[式中、
A1及びA2は独立に、場合により置換されていてもよいアリーレン又は場合により置換されていてもよいヘテロアリーレンであり(ここで
(i)A1及びA2は独立に、場合により、1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよいか、あるいは
(ii)A1又はA2の一方が前記に定義された通りであり、そして場合により、1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよく、そしてA1又はA2の他方が基−C≡C(CH2)pC≡C−(ここでpは0〜8であり、そして−(CH2)p−アルキレン鎖は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよい)、
Sは存在しないか、あるいは−CH=CH−又は−C≡C−であり、
R1は水素、極性の基(PL)、非極性の基(NPL)又は−s−A’(ここでA’はアリール又はヘテロアリールであり、それらのいずれも場合により1個又は複数の極性(PL)の基、1個又は複数の非極性(NPL)の基あるいは1個又は複数の極性(PL)の基及び1個又は複数の非極性(NPL)の基の組み合わせ物で置換されていてもよく)であり、
R2はR1であり、
NPLは−B(OR4)2又は−(NR3’)qlNPL−UNPL−(CH2)pNPL−(NP3”)q2NPL−R4から独立に選択される非極性基(そこで
R3、R3’及びR3”は独立に、水素、アルキル及びアルコキシからなる群から選択され、
R4は水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール及びヘテロアリールからなる群から選択され、それらのいずれも場合により1個又は複数のアルキル又はハロ基で置換されていてもよく、
UNPLは不在であるか又は、O、S、S(=O)、S(=O)2、NR3、−(C=O)−、−(C=O)−N=N−NR3−、−(C=O)−NR3−N=N−、−N=N−NR3−、−C(=N−N(R3)2)−、−C(=NR3)−、−C(=O)O−、−C(=O)S−、−C(=S)−、−O−P(=O)2O−、−R3−O−、−R3−S−、−S−C=N−及び−(C=O)−NR3−O−からなる群から選択され、ここで2個の化学的に同等でない末端をもつ基は双方の可能な配置を採用することができ、
アルキレン鎖の−(CH2)pNPL−は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよいかあるいはアルキレン鎖が不飽和であり、
pNPLは0〜8であり、
q1NPL及びq2NPLは独立に0〜2である)であり、
PLはハロ、ヒドロキシエトキシメチル、メトキシエトキシメチル、ポリオキシエチレン及び−(NR5’)q1PL−UPL−(CH2)pPL−(NR5’)q2PL−Vからなる群から選択される極性基であり(ここで
R5、R5’及びR5”は独立に、水素、アルキル及びアルコキシからなる群から選択され、
UPLは不在であるかあるいは、O、S、S(=O)、S(=O)2、NR5、−(C=O)−、−(C=O)−N=N−NR5−、−(C=O)−NR5−N=N−、−N=N−NR5−、−C(=N−N(R5)2)−、−C(=NR5)−、−C(=O)O−、−C(=O)S−、−C(=S)−、−O−P(=O)2O−、−R5O−、−R5S−、−S−C=N−及び−(C=O)−NR5−O−からなる群から選択され、ここで2
個の化学的に同等でない末端をもつ基は双方の可能な配置を採用することができ、
Vはニトロ、シアノ、アミノ、ヒドロキシル、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、−NH(CH2)pNH2、−N(CH2CH2NH2)2、ジアゾアミノ、アミジノ、グアニジノ、グアニル、セミカルバゾン、アリール、ヘテロシクル及びヘテロアリールからなる群から選択され、それらのいずれも場合により1個又は複数のアミノ、ハロ、シアノ、ニトロ、ヒドロキシル、−NH(CH2)pNH2、−N(CH2CH2NH2)2、アミジノ、グアニジノ、グアニル、アミノスルホニル、アミノアルコキシ、アミノアルキルチオ、低級アシルアミノ又はベンジルオキシカルボニルで置換されていてもよく、
アルキレン鎖の−(CH2)pPL−は場合により1個又は複数のアミノ又はヒドロキシル基で置換されていてもよいかあるいはアルキレン鎖が不飽和であり、
pPLは0〜8であり、そして
q1PL及びq2PLは独立に0〜2である)、ただし、
A1及びA2がチオフェンである場合は、極性基が3−(プロピオン酸)又はメトキシ(ジエトキシ)エチルであることはできず、そして非極性基がn−ドデシルであることはできないこととする]
のオリゴマーあるいは許容できるそれらの塩又は溶媒和物を包含する。
PLが−O−P(=O)2O−であるものである。
い例により、混合物はラセミ体であっても、又は混合物が他方に対して一方の特定の立体異性体の不平等な割合を含んでなってもよい。従って、本発明の幾つかのアスペクトにおいて、本発明のポリマー及びオリゴマーはラセミ体である混合物として提供される。更に、式I及びIaのポリマー及びオリゴマーは実質的に純粋な立体異性体、ジアステレオマー及び光学異性体として提供することができる。従って、本発明の幾つかのアスペクトにおいて、ポリマー及びオリゴマーは実質的に純粋な立体異性体、ジアステレオマー又は光学異性体として提供される。
されることができる。このような複素環式基の例はピペリジニル、ピペラジニル、2−オキソピペラジニル、2−オキソピペリジニル、2−オキソピロロジニル、2−オキソアゼピニル、アゼピニル、ピロリル、4−ピペリドニル、ピロリジニル、ピラゾリル、ピラゾリジニル、イミダゾリル、イミダゾリニル、イミダゾリジニル、ピリジル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリダジニル、オキサゾリル、オキサゾリジニル、イソオキサゾリル、イソオキサゾリジニル、モルホリニル、チアゾリル、チアゾリジニル、イソチアゾリル、キヌクリジニル、イソチアゾリジニル、インドリル、キノリニル、イソキノリニル、ベンズイミダゾリル、チアジアゾリル、ベンゾピラニル、ベンゾチアゾリル、ベンゾオキサゾリル、フリル、テトラヒドロフリル、テトラヒドロピラニル、チエニル、ベンゾチエニル、チアモルホリニル、チアモルホリニル・スルホキシド、チアモルホリニル・スルホン及びオキサジアゾリルを包含する。モルホリノはモルホリニルと同一である。
1)与えられた、詳細に規定された三次元構造にフォールドしなければならないポリマーの主鎖が分子力学及び量子力学の場の計算を使用して規定される。ポリマーの主鎖はモノマーの反復配列から集成される。次にそのポリマーが所望の二次形態を採ることができることを示すために集中的な理論的研究を実施する。
2)モデル化合物(短いオリゴマー)をX−線結晶学によりフォールド物の構造分析のために調製する。
3)次に側鎖の基としてポリマーの主鎖上に官能基をコンピューターによりグラフトして、オリゴマー又はポリマーに所望の、面に対する両親媒性の特徴を付与し、そして多様性を最大にし、そしてポリマーの薬剤様特性を維持させる。次にカチオン性の両親媒性の構造物を生成するための官能基の最良の組み合わせをコンピューターにより選択する。
4)それらの構造を立証するために代表的オリゴマー及びポリマーを合成し、それらの生物学的活性を測定する。
5)生物理学的研究を実施して、ポリマーが所望の形態で膜に結合しており、そして作用機序がデザインから期待された通りであることを立証する。
6)所見に基づき、化合物の効力及び選択性を最適化するために構造物を再デザインし、
段階2〜4を反復する。
1.標的のポリマー主鎖と同様なねじれパターンを共有する簡単なモデル化合物を選択する。
2.各化合物に対して、説のBLYP/6−3IG(d)レベルにおいて完全な幾何学的最適化を実施する(多数の最初の構造が全体的最小値を得ることを確保する)。
3.B3LYP/6−311G++(dp)又は平面波CPMDを使用して前記の段階2で得たもっとも安定な幾何学構造における単一点のエネルギーを計算する。
4.関連するねじれを固定された角度に拘束し、段階2及び3を反復する。
5.幾つかの角度につき段階4を反復し、非結合相互作用を差し引くことによりねじれのエネルギーを得る。
6.その係数が力の場のパラメーターであるコサイン系列に対してねじれ角度に対するエネルギーを当てはめる。
適合したねじれを結合の伸長、湾曲、1−4(one−four),ファンデルワールス及びCHARMM(Brooks,B.R.,et al.,J.Comp.Chem.4:187−217(1983))から借用した静電気ポテンシャル及びTraPPE(Martin,M.G.,and Siepmann,J.I.,J.Phys.Chem.B.103:4508−4517(1999);Wick,D.D.,et al.,J.Phys.Chem.B 104:3093−3104(1999))の分子力学の力の場と組み合わせる。反対側に並んだ極性基及び非極性基を伴う周期的フォールドパターンを採用することができる形態を立証する。最初の構造はガウスのパッケージ(Frisch,M.,et al.,Gaussian 98(改定A.7)Gaussian Inc.,Pittsburgh,PA(1998))で得ることができる。次に平行化平面波Car−ParrinelloのCP−MD(Car,R.and Parrinello,M.,Phys.Rev.Lett.55:2471−2474(1985)プログラム(Roethlisberger,U.,et al.,J.Chem.Phys.3692−3700(1996)を参照されたい)を使用して、最小及び拘束幾何構造におけるエネルギーを得る。側鎖をもたないポリマーの形態は気相中で研究することができる。MD及びMC法は双方とも形態をサンプリングするために使用されるであろう。前者はポリマーの全体的動きのために有用である。バイヤス法(Siepmann,J.I.,and Frenkel,D.,Mol.Phys.75:59−70(1992);Martin,M.G.,and Siepmann,J.I.,J.PHys.Chem.B 103:4508−4517(1999);Vlugt,T.J.H.,et al.,Mol.Phys.94:727−733(1998))により後者は比較的大きいバリヤーにより分離された多数の局所的最小構造をもつポリマーの効率的なサンプリングを可能にする。
(1)極性(PL)及び非極性(NPL)基の部位特異的導入に適するポリマー主鎖又は枠組みを選択し、
(2)最初からの量子力学の計算を使用して分子力学の力の場のパラメーターを決定し、(3)分子動力学(dynamics)又は分子力学(mechanics)の計算を使用して前記主鎖のエネルギー論的に可能な構造を計算し、
(4)幾何学構造/構造的反復の周期性が配列の反復にマッチする前記主鎖のエネルギー論的に可能な構造を特定し、
(5)極性及び非極性置換基をもつモノマーを合成し、そして
(6)溶液合成又は固相合成により前記モノマーを含有する抗微生物性ポリマー又はオリゴマーを合成する、
工程により、面に対して両親媒性のポリマーを生成することができるポリマーの主鎖を特定するための計算法である。
法に従って合成される。
菌又は、所望される場合は、例えば、枯草菌(B.subtilis)、緑膿菌(P.aeruginosa)、肺炎桿菌(K.pneumoniae)、ネズミチフス菌(S.typhimurium)、淋菌(N.gonorrhoeae)、B.メガテリウム(B.megaterium)、黄色ブドウ球菌(S.aureus)、E.フェカリス(E.feacalis)、M.ルテウス(M.luteus)又は化膿連鎖球菌(S.pyogenes)のようなもう1つのバクテリア株を使用するミクロ−ブロス希釈法を使用して実施される。スクリーニングすることができる他の特定のバクテリア株はアンピシリン及びストレプトマイシン−耐性大腸菌D31、バンコマイシン−耐性エンテロコッカス・フェシウム(Enterococcus faecium)A436及びメチシリン−耐性黄色ブドウ球菌(S.aureus)5332を包含する。活性であることが認められる任意のポリマー又はオリゴマーは均一に精製され、再試験されて、正確なIC50を得ることができる。二次スクリーニングは肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)Kp1及びネズミチフス菌(Salmonella typhimurium)S5及び緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)10を包含する。伝統的に、ミクロ−ブロス希釈法は18〜24時間の間の単一データ時点を評価するのみであるが、増殖相全体にわたる細胞の増殖をモニターするためには測定を24時間に延長することができる。これらの実験はLB培地(タンパク質発現のための細胞を増殖させるために典型的に使用される濃厚な培地)中で実施され、活性の決定的な初回スクリーニングを表わす。塩の濃度、タンパク質及び他の溶質が抗生物質の活性に影響する可能性があるので、濃厚な培地中で活性を示さない物質は最少の(minimal)培地(M9)中で再試験されて、濃厚な培地が活性を限定しているかどうかを決定することができる。培地と活性間には相関は認められず、それは一般的な膜の破壊によると考えられる作用機序と一致する。
リゴマーの溶血作用を決定することにより測定することができる。溶血作用のアッセイはポリマー又はオリゴマーの存在下でのインキュベート後にヒトの赤血球の溶血の度合いを測定し、HC50値を決定することにより実施される。HC50値は50%のヘモグロビン放出をもたらすポリマー又はオリゴマーの濃度を表わす。例えば、Liu,D.,and DeGrado,W.F.,J.Amer.Chem.Soc.,123:7553−7559(2001)及びその中に引用された文献を参照されたい。更に、Javadpour,M.M.,et al.,J.Med.Chem.39:3107−3113(1996)を参照されたい。
ている被験者の特徴、例えば、処置される特定の動物、年齢、体重、健康、存在する場合は同時処置のタイプ及び処置の頻度に左右され、そして当業者により(例えば、臨床医により)容易に決定されることができる。
以下の一般的方法をフェニルアルキニル三量体のオリゴマーを合成するために使用することができる。
一連のフェニルアルキニル三量体のオリゴマーをインビトロの抗菌活性及びバクテリア又は哺乳動物細胞に対する選択性につき試験した。
s)、ノウサギ病菌(Francisella tularensis)及びペスト菌(Yersinia pestis)に対するフェニルアルキニル・オリゴマーの抗菌活性
強力な細菌戦の病原体に対する効果を測定するために、炭疽菌及びペスト菌に対するMIC100値を前記実施例2のフェニルアルキニル・オリゴマーの化合物3に対して決定した。
ーの抗菌活性
化合物3を大腸菌、黄色ブドウ球菌及びメチシリン−耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)に対する抗菌活性につきスクリーニングした。結果は表6に示す。
菌活性
ポリウレタンフィルム中への取り入れ後のフェニルアルキニル・オリゴマーの抗微生物活性の保持を研究した。製造経費を抑制するための、材料適用のための抗菌ポリマー及びオリゴマーの好ましい形態はポリマーである。しかし、フェニルアルキニルポリマーに対する構造/活性の相関を決定するためにもっとも信頼できるデータをもたらすために、この最初の研究においてはオリゴマーを使用した。
1種又は複数の本発明のオリゴマー(例えば、フェニルアルキニルオリゴマーの化合物3)を前記のように合成し、細胞培養物中でHIV複数を阻害するそれらの能力を試験する。感染アッセイには2種のウイルス:それぞれ、コレセプターとしてCXCR4又はCCR5を使用するNLHX又はYU2を使用する。感染の前日に3×104個の細胞/ウェルで48−ウェルのプレートにU87/CD4/CCR5又はU87/CD4/CXCR4細胞を播種する。培養上澄み液を細胞から除去し、記載された最終濃度のシュードタイプ化したルシフェラーゼレポーターウイルス単独又はシュードタイプ化したルシフェラーゼレポーターウイルス及びオリゴマーで置き換える。ウイルスと化合物を感染の約16時間後に細胞から除去し、細胞を洗浄し、次に培地を補充する。細胞を溶解し、感染3日後にルシフェラーゼ活性をアッセイする。結果は化合物の不在下で認めたルシフェラーゼ活性のパーセントとして表わされる。
カビ・真菌の幾つかの異なる属を本発明の1組のオリゴマー(例えば、フェニルアルキニル三量体の化合物3のような本発明の1種又は複数のオリゴマー)に対するそれらの感受性につき試験する。非フィラメント状(酵母)及びフィラメント状カビ・真菌双方を試験し、種々のタイプのヒトの感染症と関連する特定のカビ・真菌をスクリーニングのために選択する(表8)。それらの抗カビ・真菌活性につき1種又は複数のオリゴマーを試験する。抗カビ・真菌アッセイは増殖の完全な阻害をもたらす最低阻害濃度(MIC100)を決定するために実施される。すべての増殖アッセイは総量1mlの容量で実施され、増殖は濁度測定値により算定する。更なる抗カビ・真菌アッセイの条件は表9に示される。
MIC(最小阻止濃度)及びMFC(最小殺カビ・真菌濃度)値を4種のカビ・真菌、A.フミガートス、P.フニキュロスム(P.funiculosum)、C.グロボスム(C.globosum)及びT.ビレンス(T.virens)それぞれに対して、上記の実施例2における化合物3について決定した。化合物3のMIC値は酵母のC.アルビカンスについても決定した。結果は下記の表10及び11に示される。
本発明の幾つかの両親媒性ポリマー及びオリゴマーを合成し、ヘパリンの抗凝固効果を阻害するそれらの能力を試験した。ヘパリン中和作用は大部分、それらの疎水性よりもむしろポリマー及びオリゴマーの電荷及び電荷の分布の特徴に左右されると推定される。
ーの能力
低分子量ヘパリン(LMWH)のアンタゴニストとして働く、フェニルアルキニルオリ
ゴマーの効力を測定するために、化合物3を、LMWHのLovenoxによるファクターXa(FXa)活性の抑制に拮抗するその効力につきアッセイした。簡単には、Lovenox及びインヒビターの存在下でのFXa活性はDiaPharmaから購入された試薬を使用する発色アッセイで測定された。試薬はpH=8.4における0.02Mのトリスバッファー中に再形成し、最終アッセイ条件は:0.004IU/mLのAT、0.14nkat/ウェルのFXa、0.01Mのトリス、0.15MのNaClであり、最終容量は112μLであった。Schild−プロット分析(KBデターミネーション)のためのアッセイ設定において、変動する濃度のLovenoxをATにおいて5分間インキュベートした。異なる濃度のインヒビターをウェルの各列に添加して、固定されたインヒビター濃度曲線を形成し、そして軽度に震盪し、20分間インキュベートした。次にFXaを添加し、反応物を震盪し、10分間インキュベートした。次に凝固カスケードを開始するための基質(S−2765)を添加し、次に96−ウェルのプレートを震盪し、ThermoLabsystems Multiskan Spectrum上で405nmで7分間30秒毎に読取った。単一曲線Lovenox滴定実験(IC50デターミナーション)は同様な方法からなったが、固定濃度のLovenox(インヒビターの不在下の滴定曲線により決定された)を伴った。各曲線の分析をWindowsに対するGraphPad Prismバージョン4.00を使用して実施した。
Claims (15)
- 式Ia、
R1−A1−s−A2−s−A1−R2
(Ia)
[式中、
A1及びA2は独立に、アリーレン又はヘテロアリーレンであり、かつ、
A1又はA2の一方は、1個又は複数の極性(PL)の基で置換されており、A1又はA2の他方は未置換であり、
sは−C≡C−であり、
R1はハロであり、
R2はR1であり、
PLはグアニジノメチル、グアニジノエチル、グアニジノプロピル、アミノメチル、アミノエチル、アミノプロピル、アミノエチルアミノカルボニル又はアミノメチルアミノカルボニルである]
で表される化合物又はその許容できる塩若しくは溶媒和物。 - A1及びA2が独立に、置換されているo−、m−又はp−フェニレンである、請求項1に記載の化合物。
- A1及びA2がm−フェニレンである、請求項2に記載の化合物。
- ハロが臭素又はヨウ素である、請求項1に記載の化合物。
- 請求項1に記載の化合物であって、1個又は複数の極性(PL)の基で置換されているA1及びA2の一方が、さらに1個又は複数の非極性(NPL)の基で置換されており、かつ、NPLがn−ペントキシ、n−ブトキシ、sec−ブトキシ、tert−ブトキシ、プロポキシ、エトキシ、メトキシ及びフェノキシからなる群より選択される、上記化合物。
-
のうちの1種又はその生理学的に許容できる塩である、請求項1に記載の化合物。 - 式Ia、
R1−A1−s−A2−s−A1−R2
(Ia)
[式中、
A1及びA2は独立に、アリーレン又はヘテロアリーレンであり、かつ、
A1は、1個又は複数の極性(PL)の基で置換されており、そしてA2は未置換であり、
sは−C≡C−であり、
R1はハロであり、
R 2 はR 1 であり、
PLはグアニジノメチル、グアニジノエチル、グアニジノプロピル、アミノメチル、アミノエチル、アミノプロピル、アミノエチルアミノカルボニル又はアミノメチルアミノカルボニルである]
で表される化合物又はその許容できる塩若しくは溶媒和物。 - A1及びA2が独立に、o−、m−又はp−フェニレンである、請求項7に記載の化合物。
- A1及びA2がm−フェニレンである、請求項7に記載の化合物。
- A1がさらに非極性(NPL)の基で置換されており、かつ、NPLがn−ペントキシ、n−ブトキシ、sec−ブトキシ、tert−ブトキシ、プロポキシ、エトキシ、メトキシ及びフェノキシからなる群より選択される、請求項7に記載の化合物。
- 活性成分として、請求項1又は7に記載の化合物、及びの製薬学的に許容できる担体又は希釈剤を含むことを特徴とする、処置を要する動物における微生物感染症を処置するための製薬学的組成物。
- 微生物感染症がバクテリア感染症、カビ・真菌感染症又はウイルス感染症である、請求項11に記載の組成物。
- 活性成分として、請求項1又は7に記載の化合物、及びの製薬学的に許容できる担体又は希釈剤を含むことを特徴とする、微生物を殺す又はその増殖を妨げるための製薬学的組成物。
- 微生物がバクテリア細胞、カビ・真菌又はウイルスである、請求項13に記載の組成物。
- 請求項1又は7に記載の化合物、及びの製薬学的に許容できる担体又は希釈剤を含むことを特徴とする、動物における低分子量ヘパリンの過剰投与に対する解毒剤を提供するための製薬学的組成物。
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